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author bernhardlutz
date Thu, 09 Jan 2014 16:11:17 -0500
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CLUSTAL W(1.81) multiple sequence alignment

hg17         T-GTGCTGAGTTGCCACAAAGTTGTCAAGTTACAATCCTTAG-ACATCACTGTAT---TC
echTel1      T-GTGCTGAGTTGCCAGATAGTTGTCAAGGTACAGGCTGTAT-AGATCACCCTATCCTTC
bosTau2      T-ATGCTGAGTTGCCACAAAGGTGTCATGTTACAATCCATAG-GCATCACTGTGTTGTTT
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oryCun1      C-GTGCTGAGTTGCCATACAGTTGTCAAGTTGCAGTCCTTAG-ACATCACTGTGTTGTTC
mm7          T-ATGCTGAATTG-CAGAACGTTGTCAAGGTATAATTTTTAG-ATATCACTATATGGCTC
rn3          TGATGCTGAGTTG-TACAACGTTGTCAGGTTACAGTTTTTAG-ATATCACTACATAGCTG
rheMac2      T-GTGCTGAGTTGCCACAAACTTGTCAAGTTAAAATCCTCAG-ACATCACTGTAT---TC
panTro1      T-GTGCTGAGTTGCCACAAAGTTGTCAAGTTACAATCCTTAG-ACATCACTGTAT---TC
monDom2      ----------------------TGGCAAGTCACAATCCTAAGTGTACCATTTTATCATTT

hg17         TTGAGAGGCGTAGACCTGAGATGTGCTTATTTTTAGATTTAAACTTGATCAGCACTTGAT
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mm7          TTATAAGGAGTGGGCCTGAGGGgtgtGTATTTAAGGATTTAGATTTGACCAGCACTTGAT
rn3          TTA-AAGGAATGGGCCTGAGATGTGT---TTTAAGGATTTAGATGTGACCAGCACTTGAT
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monDom2      TTATTAGCAATAAGCCAAGACTGGTC----TTATCTATATGGAATTACCAAGCACTTGAT

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panTro1      GCTGGGTTT-AAGAAGTGCAATATTAAAACAAAAGCCATGAGTCTTTTAAGCCCAGTGTG
monDom2      GCTGGGTTT-TATAAGTGCAATATTAAAGT--AAACCATGAGTCTTTTAAGCCCAGCATG

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monDom2      TGGAGTTGAGCATGCTGGGTTATAACTCAAAGGTA------------CAGC-------AT

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oryCun1      TAGTGACTGTTGGACTA-ATGCTTTAGTTCCTGCACTT-GG-ACAGAGCAGCACATTC-C
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rn3          CAGCCGTGGCTAGCCAA-AAGTCACAGCCTTAGGAACC-AG-AAAGAACAAGGCATGA-T
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panTro1      TGGCCATAGCTAGTCAAGAAGCTACGGCTTTAGTGACT-GTTGAAAGCCAGTGCATTATT
monDom2      CGATGGTAGCCAGACCAGGAGTAATGACTATAATGAAA-ATCAGAAGCCAGT-------C

hg17         TCATTCACTTGGA--CAGAAGCAGCACATTGTTCA
echTel1      ---GTCATGTGGA--CAGAAGC---ACATTGTCCA
bosTau2      TCATTCACCTGGA--CAGAAGAAGCAAATTGTCTT
canFam2      TCATTCACTTG--------------ACATTGTTGA
oryCun1      CTAAGCACAT-------------------------
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rheMac2      TCAGTCACTTGGA--CAGAAGCAGCACATTGTTCA
panTro1      TCATTCACTTGGA--CAGAAGCAGCACATTGTTCA
monDom2      TCCTTGATATGAATTCAGATGTGAGATATT-CCCA