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--- a/test-data/augustus/hubaInputs/GTF/augustusDbia3.gtf Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,7076 +0,0 @@ -# This output was generated with AUGUSTUS (version 3.1.0). -# AUGUSTUS is a gene prediction tool written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de), -# Oliver Keller, Stefanie König and Lizzy Gerischer. -# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008), -# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding -# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013 -# No extrinsic information on sequences given. -# Initialising the parameters using config directory /home/galaxy/galaxy/dependency_dir/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... -# fly version. Using default transition matrix. -# Looks like /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_2.dat is in fasta format. -# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. -# -# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 1 on both strands -# start gene contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS gene 553 34688 0.03 - . contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS transcript 553 34688 0.03 - . contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 553 578 0.41 - 2 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; -contig1 AUGUSTUS CDS 652 1047 0.25 - 2 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; -contig1 AUGUSTUS CDS 12541 12968 0.87 - 1 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; -contig1 AUGUSTUS CDS 32202 33826 0.89 - 0 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; -contig1 AUGUSTUS CDS 33880 34044 0.98 - 0 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; -contig1 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45017, name = contig2) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 2 on both strands -# start gene contig2.g2 -contig2 AUGUSTUS gene 7855 39627 0.09 - . contig2.g2 -contig2 AUGUSTUS transcript 7855 39627 0.09 - . contig2.g2.t1 -contig2 AUGUSTUS CDS 7855 7969 0.61 - 1 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 17035 18659 0.78 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 18713 18877 0.99 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 18940 19452 0.98 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 19507 20144 0.39 - 2 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 39396 39481 0.69 - 1 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS CDS 39575 39627 0.77 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -contig2 AUGUSTUS start_codon 39625 39627 . - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; -# coding sequence = [atgccatcggccaagaagccgccctccattctccattggggaaccactggagaccatgacaacaccgttggcatattgg -# gaatcggagttgaatggccaggagaagatgtggaagcatccgcgacactagaagcaggacatccttatgttaactgtgcgtcagcttttcaccttgcg -# ggactggggttgggatcaggagattttttgggcacccgaggaatgggctcactgggtgatctccatcatgcggctgtagcagcagcggctgcaggatc -# tctagccagcactgattttcacttcagcattgatggcaacaggcgattaagtagtcctcggccgcccggcggaagtattcgtgcaagcatcagcagaa -# aacgagcgctttcctcatcgccttattcggattcgtttgacattaactcaatgattcgattttcaccaaactccttagccacaattatgaatggctct -# cgaggaagcagcgcggcaagtggttcatatggtcatatttcagctagtgctattaatcctatatctcatgcacattcaacattggcaccacgtctaca -# gcatttgttacgtgcaagtgcaggtcttttaaatccgatgaatacacaacaagcagctgcggccgggttttctataagccacgctgcaagcgctgcag -# ccttaagcctcaacgacgttcatggtaatctaaatgatttaccaggccaaataacaccatcttcaacagcaagactagtagcggatgaacataaaatg -# gcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagccctcatcaacatcaggaagcgt -# 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ttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatggaccggctggagagcaggaaattg -# ataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaatgtttctcctttaagtggccca -# ctgcaaaatttgcagtttcccattggaaaggctaggaacgtgaatataacatcgtctagtaacgagaatactttaagaaagggaccttgccatgctac -# aatgaagactgaaatgacaatgaccagcgagcagcatccaaatgagagaataaatttggatgaagttgaagagcttatacttcccgatgagatgcttc -# agtatttaaatttggtgaaggacgatcaaaattatatggagaaagatgatgttgctataaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtg -# atagacgatccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaatag] -# protein sequence = [MPSAKKPPSILHWGTTGDHDNTVGILGIGVEWPGEDVEASATLEAGHPYVNCASAFHLAGLGLGSGDFLGTRGMGSLG -# DLHHAAVAAAAAGSLASTDFHFSIDGNRRLSSPRPPGGSIRASISRKRALSSSPYSDSFDINSMIRFSPNSLATIMNGSRGSSAASGSYGHISASAIN -# PISHAHSTLAPRLQHLLRASAGLLNPMNTQQAAAAGFSISHAASAAALSLNDVHGNLNDLPGQITPSSTARLVADEHKMAALSQKDFNDGNQRNRQRK -# STVTEQPSSTSGSVAQVEADSASSHLSDRCYNNIASTTKSIVGDVKTSRRCEDFISSGSASTPLNEYDCANADTTDIKDEPGDFIETNCHWRSCCIEF -# NTQDELVKHINNDHIQTNKKAFVCRWENCTRGEKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCFKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEYPGCSKAFSN -# ASDRAKHQNRTHSNEKPYICKAPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGAEFYANKKHKGLPLNDANSRLHRDSGQGRHNLQEHNIDSSPCSEELQVGKLIGM -# SSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLPIVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINS -# SMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSNITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRS -# SQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAINKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLI -# ATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQSEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSS -# SNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNYMEKDDVAIRFRLQMSSSSMRVIDDPSSSAGVDLRILSVQR -# HGKNPE] -# end gene contig2.g2 -### -# start gene contig2.g3 -contig2 AUGUSTUS gene 41706 42608 0.66 - . contig2.g3 -contig2 AUGUSTUS transcript 41706 42608 0.66 - . contig2.g3.t1 -contig2 AUGUSTUS CDS 41706 42171 0.93 - 1 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; -contig2 AUGUSTUS CDS 42268 42608 0.7 - 0 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; -contig2 AUGUSTUS start_codon 42606 42608 . - 0 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; -# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac -# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg -# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga -# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg -# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc -# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa -# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga -# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac -# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] -# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI -# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT -# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] -# end gene contig2.g3 -### -# -# ----- prediction on sequence number 3 (length = 40006, name = contig3) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 3 on both strands -# start gene contig3.g4 -contig3 AUGUSTUS gene 6691 7593 0.64 - . contig3.g4 -contig3 AUGUSTUS transcript 6691 7593 0.64 - . contig3.g4.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 6691 7156 0.95 - 1 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; -contig3 AUGUSTUS CDS 7253 7593 0.67 - 0 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; -contig3 AUGUSTUS start_codon 7591 7593 . - 0 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; -# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac -# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg -# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga -# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg -# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc -# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa -# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga -# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac -# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] -# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI -# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT -# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] -# end gene contig3.g4 -### -# start gene contig3.g5 -contig3 AUGUSTUS gene 29077 31134 0.18 + . contig3.g5 -contig3 AUGUSTUS transcript 29077 31134 0.18 + . contig3.g5.t1 -contig3 AUGUSTUS start_codon 29077 29079 . + 0 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; -contig3 AUGUSTUS CDS 29077 29111 0.4 + 0 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; -contig3 AUGUSTUS CDS 29169 29249 0.43 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; -contig3 AUGUSTUS CDS 30793 30942 0.65 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; -contig3 AUGUSTUS CDS 31113 31134 0.75 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; -# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt -# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat -# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaaggatcactag -# ccaagtcacctag] -# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV -# QDTTTNNRYPRITSQVT] -# end gene contig3.g5 -### -# -# ----- prediction on sequence number 4 (length = 55011, name = contig4) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 4 on both strands -# start gene contig4.g6 -contig4 AUGUSTUS gene 19075 51981 0.04 + . contig4.g6 -contig4 AUGUSTUS transcript 19075 51981 0.04 + . contig4.g6.t1 -contig4 AUGUSTUS start_codon 19075 19077 . + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 19075 19109 0.47 + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 19167 19247 0.44 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 20791 20940 0.57 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 31331 31523 0.57 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 36906 37059 0.52 + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 37833 37902 0.74 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 50913 51073 0.7 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 51131 51361 0.58 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -contig4 AUGUSTUS CDS 51833 51981 0.41 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; -# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt -# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat -# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaagaaacttgga -# tacaaaaaattcatcgaatacacaatcaaacgacgctaaggagacatcaaatgataaaaaaaaaccgcatatcaaaaaaccactaaatgcgtttatgc -# tctatatgaaggaaatgcgcgctaaagttgttgccgaatgtacactaaaagaatcggctgctattaatcagattttgggaagacggtggcatgccttg -# gggcgtgaagagcaagcgaagtattacgagttggcgcgaagggagcgacaactgcacatgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctc -# tcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacgacggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaat -# ggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgttatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacac -# ggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacgatgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagctgtctaagtggattgtc -# cagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctcttttgatcgtcaacgcagatc -# cgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaaccccaaatacctcaagtaca -# gtttcgccagttacagctaaaatgattgagccgacaatgttgtcggtgagtactcatgctgtaaatagcactgagtgccataaaggatcagatccaca -# agcaaatgcatctgtaaagactacaagcgctggcgcttccgaaactggcgtcattagcgtttcataa] -# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV -# QDTTTNNRYPRNLDTKNSSNTQSNDAKETSNDKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALGREEQAKYYELARRERQLH -# MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDEHGSQLSDDDDDDYDDDKLGG -# SCGSADESCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVSTSGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTAKMIEPTMLSVSTH -# AVNSTECHKGSDPQANASVKTTSAGASETGVISVS] -# end gene contig4.g6 -### -# -# ----- prediction on sequence number 5 (length = 50018, name = contig5) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 5 on both strands -# start gene contig5.g7 -contig5 AUGUSTUS gene 43345 45058 0.19 - . contig5.g7 -contig5 AUGUSTUS transcript 43345 45058 0.19 - . contig5.g7.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 43345 44665 0.2 - 1 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; -contig5 AUGUSTUS CDS 44724 44948 0.88 - 1 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; -contig5 AUGUSTUS CDS 45006 45058 0.94 - 0 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; -contig5 AUGUSTUS start_codon 45056 45058 . - 0 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; -# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg -# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat -# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt -# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag -# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt -# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt -# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg -# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt -# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac -# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc -# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt -# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata -# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg -# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt -# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct -# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag -# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] -# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV -# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV -# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG -# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM -# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT -# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] -# end gene contig5.g7 -### -# -# ----- prediction on sequence number 6 (length = 40015, name = contig6) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 6 on both strands -# start gene contig6.g8 -contig6 AUGUSTUS gene 13336 15049 0.08 - . contig6.g8 -contig6 AUGUSTUS transcript 13336 15049 0.08 - . contig6.g8.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 13336 14656 0.17 - 1 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; -contig6 AUGUSTUS CDS 14715 14939 0.91 - 1 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; -contig6 AUGUSTUS CDS 14997 15049 0.42 - 0 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; -contig6 AUGUSTUS start_codon 15047 15049 . - 0 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; -# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg -# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat -# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt -# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag -# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt -# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt -# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg -# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt -# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac -# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc -# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt -# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata -# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg -# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt -# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct -# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag -# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] -# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV -# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV -# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG -# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM -# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT -# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] -# end gene contig6.g8 -### -# -# ----- prediction on sequence number 7 (length = 50017, name = contig7) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 7 on both strands -# start gene contig7.g9 -contig7 AUGUSTUS gene 3332 5045 0.23 - . contig7.g9 -contig7 AUGUSTUS transcript 3332 5045 0.23 - . contig7.g9.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 3332 4652 0.41 - 1 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; -contig7 AUGUSTUS CDS 4711 4935 0.85 - 1 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; -contig7 AUGUSTUS CDS 4993 5045 0.52 - 0 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; -contig7 AUGUSTUS start_codon 5043 5045 . - 0 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; -# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg -# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat -# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt -# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag -# 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AUGUSTUS gene 38941 46896 0.08 + . contig7.g10 -contig7 AUGUSTUS transcript 38941 46896 0.08 + . contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS start_codon 38941 38943 . + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -contig7 AUGUSTUS CDS 38941 39182 0.69 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -contig7 AUGUSTUS CDS 39248 39354 0.65 + 1 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -contig7 AUGUSTUS CDS 39978 40351 0.32 + 2 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -contig7 AUGUSTUS CDS 40423 40623 0.3 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -contig7 AUGUSTUS CDS 44971 46896 0.35 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; -# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac -# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat -# 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[MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN -# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ -# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG -# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM -# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ -# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR -# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV -# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY -# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM -# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIGKDINSTSLQNKIHKPG] -# end gene contig7.g10 -### -# -# ----- prediction on sequence number 8 (length = 35012, name = contig8) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 8 on both strands -# start gene contig8.g11 -contig8 AUGUSTUS gene 8930 26669 0.02 + . contig8.g11 -contig8 AUGUSTUS transcript 8930 26669 0.02 + . contig8.g11.t1 -contig8 AUGUSTUS start_codon 8930 8932 . + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 8930 9171 0.51 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 9237 9343 0.59 + 1 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 9967 10340 0.24 + 2 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 10412 10612 0.22 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 14960 16832 0.58 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -contig8 AUGUSTUS CDS 26515 26669 0.46 + 2 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; -# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac -# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat -# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga -# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag -# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata -# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat -# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta -# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct -# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt -# 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TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV -# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY -# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM -# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIDSWAFTEVDDDDMLIVKYADDTAVMVRS -# PSIDIATLGLPEYVTKNGQPKGK] -# end gene contig8.g11 -### -# -# ----- prediction on sequence number 9 (length = 60018, name = contig9) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 9 on both strands -# start gene contig9.g12 -contig9 AUGUSTUS gene 8930 48218 0.01 + . contig9.g12 -contig9 AUGUSTUS transcript 8930 48218 0.01 + . contig9.g12.t1 -contig9 AUGUSTUS start_codon 8930 8932 . + 0 transcript_id "contig9.g12.t1"; gene_id "contig9.g12"; -contig9 AUGUSTUS CDS 8930 9171 0.57 + 0 transcript_id "contig9.g12.t1"; gene_id "contig9.g12"; -contig9 AUGUSTUS CDS 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tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat -# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga -# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag -# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata -# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat -# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta -# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct -# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt -# ttgcatttcccctcggtccataaatgtagccggaggcataaattgctgctgttttgacaagaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggg -# 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cagatagcattgttgataagaaaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaaca -# aagtgcaatagtaaccatattcccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcatt -# agttaacgaatcgagttccagttatgcagaaagtattctgccgacgagcgatagtttggccagtgtaaagaccacagacacatggacccataatgagc -# caacagatgtagatgctgagctaggaataaaccgcactcaggacgaaagctggcgccaacactacatattcgcaatggatggcggaacttggcaaatt -# ataaaagatcactttccagatgaaatggccattcttttaacacggggatcgatttacgcccgaatgtcacccgatcagaaacaggcactagttataga -# acttcaaaatttggactactgtgttgccatgtgcggtgatggtgccaacgattgcggtgcgctaaaggtggctcatgctggtatttcgctaagtgaga -# ccgaagcatccattgcgtcgccctttacttcacgtaatcccacgatttcggctgttttaaaagttattaaggaaggacgtgccgcattagtcacatcc -# tttggaatttttaaatatatggcagcatattcattggttcagtttatatctgttatggttctttattctatcgactcgaatttgacagacaagcagta -# tctttacgtagaccttggacttatatcaatttttgccttcttttttggtaaaactggatcatttgatggaaatttggtcgaacaagtgcctctcagtt -# cattgatatcttctactccattagcatcccttttacttcatctcactgttgtaactggatttcaagtaattgatcaacctctttttgtgagtccgacc -# ccaactttgccaacaccagctgcggatgtacgtccagaaataggtgttttgacatcaacagctaggacatttatacaggatggaacaacaactgaatt -# tgccactaaaattttaggaactacattaaatagtggtcgcctttacgcacaatatcttcgaaagagttctagagtcctgtatgaaaacgataagctat -# ttccatctgtagttactagttgggtaggtgaaggtgactctcatcagaccccactatttttacaaagtcacaatgatctttttaattccgatgacgcc -# gactggcaggatattgatgatagcctaggtgtaaatcgtggagaatttgtgggcaacacggattatgttatccaacaaagtacaaaagtaagagagca -# aagtagtccggactatcaggataaaccgttaagatatttaaaacctgtagccagcagcaatgtaacattaatctttgactctaaaagaaaagatgaaa -# taaataaattggttgataaggtgtcatcaattgaaaatttgaaaacgtatacaattaaaagtcactttgctgatttttctgcgccaaaacaaacaata -# actgtcttagatactctaagggaagaacgaaaatatgaaatgaaatcacgtatagaacaaaatgttgaagaacaaaagcataaaagtcaatctttcaa -# taaacaagttttagcatctataacatattatggatttgcggagtttaccactgtggttggtgatagtgtcattgtattttcacctagtactacacaga -# gtactcttcattttggacacgttacatcaattaaagggaagcctactttaaaacttatgtcaattcacgattacaacagtcaaactacccaaacatca -# ccgagtcctttaaagccggttccaacattaaataaaatcttgtccccaatgtcaagttttggggaagatatttttactagttcaagtgaggaaaagag -# tcattttaagaacgtattagttgcaacgtcaactattctttcaacgacaaaatttgaaaatgtattatccgagaaaatagataatagttcattttctt -# ttgacgacagtcttatatcaaattcaaatgagtttaagaatcttcagtcttcattctacaaaactaacgatacctcgaaaaatttaacaaatcacatg -# gaggcaaacattcaaaagcaggaaggcgctacaacggtattcattgatgatgatcctttcacaaattttgttgagcctaaaaattctactagctcaaa -# attaaatacagctgaccaagaaacagtcttagaacaaacagaaatatttaaaagaaatgaaattcatggaagtttggtctatccaactgttaccgacg -# tcaatagcgaaagctttggtaataaaccagttgttggaacaagtaatgagaataagaataacgttgcagaattatgcaaccatacaacttcacaagta -# tttcttacccagatgcttaagacaccgaatgttggcgatgataggattgttattgatgtcaatcctctttttgcttataacattgtagaaactactaa -# atactattgcatacaagcttcacaaacggaaaaaaaggtggaactaaatgatggtaatacgacccaagaaactgttttggagccaaataaaaaagtaa -# tgtctgctgagttaatagatgatgtagatgaaactacagttcgagaatcggaagactacgatgtgacaacagaaaatgattatgaaaatgaagaagag -# gactactatagtgttactgatgatgttgatttattatataaaacgctgtttactacttatacatatttgacaacattctttgaagggtctcgcacaac -# catatctagccacacagaaattataacaaatatagtttcttcaacactggcgtctaatgttgattttaagtcaaaaattttagataatattgctgaaa -# accagaaatctgaaaacacaattcggatggctggccaagaagcttcacctttattacacaaatttactatccctgttgagattgctagtctattaagc -# caggaaagtaaaataaatcctgccgaaaaagaaataaccaatcagttaataacaacctatctagacgattttaaatatagtaaaactttgtacacaac -# atatacatattatacatcgatttttacagataatgatactgaaatacaaactcgaaccgagatagtcacgaattacattactgaaaagatttcgaaca -# atcaaaccaattacattatgaaaagcagtgacaaaacatcaaagctaaatacctcagcatccgaaatagaaaaagaaaaccacatgacttttgaaata -# ggcgtaaatacgagcagtttgagcaatatggacagtacaaagtcttttattaaaaagagtcccctggacgaccaagtgagctcagaaagtaatacgga -# ggagattataccatcagcaacgtttcttcttcaaacaagttttacaacatttaccttttatacgacaatgtatgtagtattatcagttgatgatgaaa -# attcaagtcagtcggatggcgacacaattgttcgatggaaatccgattatgaaaatactacaattttcacattatctgatcaaaatcttcattctgat -# attaccacatactatactacttatacctattatactacatcctatgatgttaataagacaattatcgattcaagattcgaaaccattacaaatgtagt -# gacatctaaggggtattctattgtaatgtcaggcacctctgcaatagatcttatgcttaaacctagtcagcctgttacatcaatagataatcagatta -# gaactggtgtaccggattttgttttgtacgattataaacaaataattgatgcagatgaagtaagcactttgtattttacaacggaaattaaaacttca -# atgaacagtgagggacatgacattttagtaaccagtagcacatcccggttacaaatagacgagtccaaaaagtcaatcttagccacgctgtcagctaa -# ctcactagatgatggcttatccagccttaaattgtataaaacgggtttagtgaggctcattgaagggttagtggtaagcgataggtttacgcagtcga -# cgacattaactaaggagctaagctcagaaagtagttttgaagaagagaatgcaacagatgaagttgctgatgaggaagaaaacgctagacgcaatagc -# aaccctctccttagacttcgtcggccgataaatggacccagtggattttcgcccgttagccgtccaacttccatttccggaggagtttcgctcagaag -# aaaccctttatcagtccgtccaaaaatttccactacaacaaccacctcaacaacaacgacggtcaagcctcggcctcgaagctttcagaggcccattg -# gtcttcagcctagaataagaccacaaaacaccctttttccaccacgaggactattccaaaatcatcagaaggatgaaagttttaaggacgtaaaaaca -# aataatagtgattctacaaattactctgaattcgaagaagatgaagcaaaccacgatgaagaatataactctcaggaaaagattcaccgaaataagcg -# ctcttttcgaattttaaggagcgctagatataaaaacagagtacgtcgtcaaacagatacagtaaaaaaaaacagatttcgattccgtcggcaaaacc -# aaacatcgacatttacaaaagatgaattaaaacttatggactcggaaattcgggcagagtctacatcgtccccgagagataaatcatcttctagattc -# ggatcgagattttattctccacaaggccaagacctgcatgcgcaggtaacactaatggactccacaacagcgaagaatctaagaacaattcggcctac -# tagactgacaacaaaacgacctcaatttacattgagagaaaaagatgctactttaaaaggcactacacgttcaagtacaactaataactttcgacgtc -# aacagacaattcataatacatcagtaaggcgagctgttggacaaaatacaggaaactcaagcacccgcagactaaaaagctatgctaactacaacaat -# aaaaacaatgttgaccacggtcgattatcaagtacgacccgttcccgaaatggtaactctaacacgttaaatagaggaagaagtcggggtcgaaatcg -# aattgaatatccctctgattcgccctctatagacaatgaagttcaaactataacagttactcattttctaccatctgaggttacaattccagtagtta -# 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gtaaaggaaacagtggacacaagcgtaacaaggaaaatcaaatgacaaaggaaaatccagatccaagtgttgtaacgctatatgtatccggccgtagg -# cccggcgaatttagtacgatattatccacgagttcaaatgacacttcagtttcaaaaggtgaaacggcttctttgaaaatggatgttgggcttactga -# attaagtgatcgaactgcatcattagaaagcattgttggtgatgttgatctttggtatgcaaaatcaagtaggcaacccattcgaatgtcgacaacga -# taaactcagtggatgtctag] -# protein sequence = [MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN -# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ -# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG -# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM -# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ -# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR -# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV -# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY -# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM -# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIDQPLFVSPTPTLPTPAADVRPEIGVLTS -# TARTFIQDGTTTEFATKILGTTLNSGRLYAQYLRKSSRVLYENDKLFPSVVTSWVGEGDSHQTPLFLQSHNDLFNSDDADWQDIDDSLGVNRGEFVGN -# TDYVIQQSTKVREQSSPDYQDKPLRYLKPVASSNVTLIFDSKRKDEINKLVDKVSSIENLKTYTIKSHFADFSAPKQTITVLDTLREERKYEMKSRIE -# QNVEEQKHKSQSFNKQVLASITYYGFAEFTTVVGDSVIVFSPSTTQSTLHFGHVTSIKGKPTLKLMSIHDYNSQTTQTSPSPLKPVPTLNKILSPMSS -# FGEDIFTSSSEEKSHFKNVLVATSTILSTTKFENVLSEKIDNSSFSFDDSLISNSNEFKNLQSSFYKTNDTSKNLTNHMEANIQKQEGATTVFIDDDP -# FTNFVEPKNSTSSKLNTADQETVLEQTEIFKRNEIHGSLVYPTVTDVNSESFGNKPVVGTSNENKNNVAELCNHTTSQVFLTQMLKTPNVGDDRIVID -# 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SNTLNRGRSRGRNRIEYPSDSPSIDNEVQTITVTHFLPSEVTIPVVSGHVTEYKNIVTAKTSTELLGPNEYMKVLGTNGLSSTYLNREVSSINIAGAT -# EHTKYLLHESITSAVIFTPTTIRGRKTSFSHIIPSTAYSVENVVTTIPPQISDNAPLANILLSQLLLGNLNLPAHPLIGAVGQPNAASVVIPTEPITE -# YRTHTSTYVTTIFDGKSTILPVTFQGKKILTTVYDTTAQTITATEYSVDTIVSTPPSVQNIQSVGPAAHVNNLLLQQLLIQQQQESLSLAQSITNTLP -# PPIFLGEHLQDLDDFSRSLLKKDGIDADIGSVSNESQFTKSHRKKSRKGNSGHKRNKENQMTKENPDPSVVTLYVSGRRPGEFSTILSTSSNDTSVSK -# GETASLKMDVGLTELSDRTASLESIVGDVDLWYAKSSRQPIRMSTTINSVDV] -# end gene contig9.g12 -### -# -# ----- prediction on sequence number 10 (length = 43013, name = contig10) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 10 on both strands -# start gene contig10.g13 -contig10 AUGUSTUS gene 850 15075 0.07 + . contig10.g13 -contig10 AUGUSTUS transcript 850 15075 0.07 + . contig10.g13.t1 -contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; -contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 0.57 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; -contig10 AUGUSTUS CDS 1132 1326 0.85 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; -contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 0.61 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; -contig10 AUGUSTUS CDS 14882 15075 0.44 + 2 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; -# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa -# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca -# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacaggaaaccattttacttcctcataattcttttattacaaacatttttctaac -# cacgtgcacctatatcacaacatatgtggaaaatggaagctcgaatgtagtaaaagaaaaaatggttatatcaaacaccattacgcaagatcgaaagt -# atttgcatgcaagtaatcctatgataatagacatcactttttcaaggccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcatgtcacc -# acatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggtcaacaa -# tcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgccatacatt -# tggaaatggccaccgatcttagcatagacacattcctggcatgtcttcggcgtttcatgtcccttcgaggaaagtgctcacagatcttcagcgacaat -# ggaacgaatttagttgatcccaaacacgctttagatgagatgcaccgcaggagcacaaagcaatgtaacacaatcgttggccaatga] -# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQETI -# LLPHNSFITNIFLTTCTYITTYVENGSSNVVKEKMVISNTITQDRKYLHASNPMIIDITFSRPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVKTT -# ALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNAIHLEMATDLSIDTFLACLRRFMSLRGKCSQIFSDNGTNLVDPKHALDEMHRRST -# KQCNTIVGQ] -# end gene contig10.g13 -### -# start gene contig10.g14 -contig10 AUGUSTUS gene 21687 22382 0.44 - . contig10.g14 -contig10 AUGUSTUS transcript 21687 22382 0.44 - . contig10.g14.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 21687 22382 0.44 - 0 transcript_id "contig10.g14.t1"; gene_id "contig10.g14"; -contig10 AUGUSTUS start_codon 22380 22382 . - 0 transcript_id "contig10.g14.t1"; gene_id "contig10.g14"; -# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag -# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa -# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag -# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact -# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat -# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa -# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc -# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] -# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH -# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM -# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] -# end gene contig10.g14 -### -# -# ----- prediction on sequence number 11 (length = 35013, name = contig11) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 11 on both strands -# start gene contig11.g15 -contig11 AUGUSTUS gene 682 1377 0.49 - . contig11.g15 -contig11 AUGUSTUS transcript 682 1377 0.49 - . contig11.g15.t1 -contig11 AUGUSTUS CDS 682 1377 0.49 - 0 transcript_id "contig11.g15.t1"; gene_id "contig11.g15"; -contig11 AUGUSTUS start_codon 1375 1377 . - 0 transcript_id "contig11.g15.t1"; gene_id "contig11.g15"; -# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag -# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa -# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag -# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact -# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat -# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa -# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc -# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] -# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH -# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM -# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] -# end gene contig11.g15 -### -# -# ----- prediction on sequence number 12 (length = 56019, name = contig12) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 12 on both strands -# start gene contig12.g16 -contig12 AUGUSTUS gene 11355 43960 0.01 - . contig12.g16 -contig12 AUGUSTUS transcript 11355 43960 0.01 - . contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 11355 11375 0.49 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 11608 11710 0.88 - 1 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 11851 11866 0.34 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 15468 16080 0.24 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 20121 20293 0.61 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 20564 20662 0.67 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 28341 28409 0.33 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 33475 33622 0.51 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 38609 42222 0.43 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS CDS 43900 43960 0.66 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -contig12 AUGUSTUS start_codon 43958 43960 . - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; -# coding sequence = [atgcctaaaacaagccagaactttcgaatcaaggttaaaaagcgatattattcagaaagagtccccaaccttttaaaaa -# aatcaaatggaggacaactaccaacaataccaatgtaccctggtgatattccatcttattctccgccgtctcgagcattctttacaccgccacttccg -# ccggagtatcaaaacccttttgctgacaagcctaccttgcgtggaaccaataatgagggtctaattgcaattaataggcgtccgatcccaccccctag -# tttgatgcctagtcaagatcggatcccaattcgaccaccagatctgggtggcaatagtaacgatgctattgtcaatccattagcggatttaagttacg -# ctaattctggttttgatgaaaagcactctcttgattctagtggagctgtgcctgatgtgtccacaacagatcgtaaaaaagctctcaatacaccggca -# cgtgccagcggcgaagacgtattaaacgaaaaggcaaacagggtaaagggacacggctctcttgaaccagatgccaatgatcctagtaagagacaaga -# agttttacccaatataagacgtattctgggatcaaatggaaagaacagtgatataccagctgtgttgttaaagcaagttactcagcgaccccaaataa -# acatgcgccaaccgccgtcttcgccagttgtactgattgaaaagcctttaacgaacgaggaaaaaacagatgctgatggatcctccatggttagtcct -# aatattaatcagagcaagtaccaccctggtcagttggactactacgacaattctaatcagactataggaaccacaccatcagcagctgctgctattgg -# ggaagtatcggccacctcattttcttacgctactacaaacgcggaccagccaggacatacaggaaaagatactgacgctgttaagagtttggttccga -# gcctaggcgatcgcgatgctgtcgctgcctcagctgctgctgcttcagcacacagtacatggacctgggcctggaatattcacatctatctgtcagtt -# gttctgtttaccattttatcggtatattcgctatacaaactgctgacctataacaagcttacacatttgtttgcacagtcgtattttgtgtgcatcca -# tctcatacttattttgacctgcataatgagaatattttttctttgttttgatgcatacaacgttcatggttcctttaacatttttagctcagaactct -# tgctgaatctaccttcaacattcttaacagtagctttctctgtacttatgttgttcctcttccttaagtctttgaaccacaaaaacaatagatattca -# gctctgataaggccgctgacggtgattgtgggctgcggcgttcacgttgtgctttgcattacattgcactacgttgaatcctataccctaaaaaatca -# tcatttatattttcagcaacagcagcaacagcaatattttcgcaggcagcatcttcataatcagcaaggccaacttattgctacaattactccttcgg -# ctattttgcctccgcctccccgagtcttgacccttatatgtcagataatttatatatttatatgtctaagcttgggactgctttatctctacttgtat -# 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AUGUSTUS CDS 54300 54525 0.42 + 1 transcript_id "contig12.g17.t1"; gene_id "contig12.g17"; -# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa -# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac -# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact -# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgtgagcatttacc -# aactgtaa] -# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ -# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSVSIYQL] -# end gene contig12.g17 -### -# -# ----- prediction on sequence number 13 (length = 45015, name = contig13) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 13 on both strands -# start gene contig13.g18 -contig13 AUGUSTUS gene 5833 21375 0.37 + . contig13.g18 -contig13 AUGUSTUS transcript 5833 21375 0.37 + . contig13.g18.t1 -contig13 AUGUSTUS start_codon 5833 5835 . + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 5833 5864 0.99 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 5926 6048 0.94 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 8287 8491 0.58 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 8553 8681 0.61 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 11775 11852 0.66 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 11914 12134 0.55 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -contig13 AUGUSTUS CDS 21090 21375 0.7 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; -# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa -# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac -# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact -# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgaccaagatgatc -# tgccgtttcaaagaggtgaaattcttactgtaattcgaaaagacgaagatcaatggtggactgcccgaaattcgtctgggaaaattgggcaaataccg -# gttccttatatatgtcggcatgatgatgatgaagatccccttaaaaatgttgacttaaattttcgtggaagcacactaaagaggacggatttaaaccg -# aaaactgcctgcatacgcccgcgtaaaacagtcaagagttccaaacgcctatgataagactgcattgaaattggaaattggtgatataattaaagtca -# ctaaaacaaatattaatggacaatgggagggggaattaaatggaagaaatggtcacttcccattcacgcacgttgaatttgtcgatgattgtgattta -# ggcaataactccacagaaatacgaagtgactcgggaagaaatgtgccaattcggcgtcacttctcggagtcacttcggcgaaacttccaaaatcattt -# cggcgatatcgcattcggatcgcagaaacgactaccgtcgggaaaaaaatttgcctcttcggcggcccttgtcgaagtcacgaagacacttccaggag -# 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CDS 27307 27336 0.34 + 0 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; -contig14 AUGUSTUS CDS 33374 33489 0.69 + 0 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; -contig14 AUGUSTUS CDS 34228 34577 0.82 + 1 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; -contig14 AUGUSTUS CDS 35202 35415 0.67 + 2 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; -contig14 AUGUSTUS CDS 35658 36522 0.9 + 1 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; -# coding sequence = [atgtccgtctgtccgtatgctggaggattgctgtacgatacaccgacatcaacttcaagcagtcgggattttttgggtt -# tccatgtgcctcccagtttggatacggtcttattgctggacttgactctgttggaggaaatggaatggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaa -# attagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggatggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcaga -# tgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacagctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccaga -# agatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaaatcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgag -# tttttcgctttctcttggaatccagttttggctgcccaagacaataatccaaatagtcgttttgagtcgttagcaaccgagtgcaccctcaaaataaa -# cgacaatattgtcctcgttggagccagagacgttggaggaacactctacagagcagcgatcgagcccatactttcagaacgaaacgtcgatgtcaacg -# tcgcaacttcaggaacttcaattctccaactctatcacgagaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcga -# cacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaattcgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactct -# tcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgtatactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcga -# gaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccagaagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaa -# tcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctgggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacat -# tccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctgaaaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagaga -# agcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaagagaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaag -# gacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttgcaccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgagga -# cgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacacaaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaag -# aaaacaacaagagaaaaccgcaataa] -# protein sequence = [MSVCPYAGGLLYDTPTSTSSSRDFLGFHVPPSLDTVLLLDLTLLEEMEWRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKI -# VKPDPLPKGASAADEKQHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPVLAAQDNNPNS -# RFESLATECTLKINDNIVLVGARDVGGTLYRAAIEPILSERNVDVNVATSGTSILQLYHERFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSD -# NGGEFDCAEVRETLQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRI -# KHLRIVGSTCYVHIPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDE -# DKEEEDADLHKSEDEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] -# end gene contig14.g19 -### -# start gene contig14.g20 -contig14 AUGUSTUS gene 36874 37842 0.96 + . contig14.g20 -contig14 AUGUSTUS transcript 36874 37842 0.96 + . contig14.g20.t1 -contig14 AUGUSTUS start_codon 36874 36876 . + 0 transcript_id "contig14.g20.t1"; gene_id "contig14.g20"; -contig14 AUGUSTUS CDS 36874 37842 0.96 + 0 transcript_id "contig14.g20.t1"; gene_id "contig14.g20"; -# coding sequence = [atggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtttgacgtcttgacagctt -# ttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgcagattgaagaagagtctc -# tacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgaggcagatccatgtctcta -# catcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaagatttggaagaatttttgg -# acgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatggactaaaaattagtcaa -# caaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttggaaattacgacagcaag -# gaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccagacttggctttcagcatcg -# 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DEDKEEEDADLHKSEDEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] -# end gene contig15.g21 -### -# start gene contig15.g22 -contig15 AUGUSTUS gene 6867 7835 0.91 + . contig15.g22 -contig15 AUGUSTUS transcript 6867 7835 0.91 + . contig15.g22.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 6867 6869 . + 0 transcript_id "contig15.g22.t1"; gene_id "contig15.g22"; -contig15 AUGUSTUS CDS 6867 7835 0.91 + 0 transcript_id "contig15.g22.t1"; gene_id "contig15.g22"; -# coding sequence = [atggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtttgacgtcttgacagctt -# ttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgcagattgaagaagagtctc -# tacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgaggcagatccatgtctcta -# catcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaagatttggaagaatttttgg -# acgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatggactaaaaattagtcaa -# 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-contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42088 0.05 + . contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 0.86 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 0.44 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 0.74 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 1 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 26035 26127 0.97 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 0.78 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 0.68 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 0.94 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; -contig15 AUGUSTUS CDS 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cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca -# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] -# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS -# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS -# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK -# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ -# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY -# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM -# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK -# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] -# end gene contig16.g25 -### -# -# ----- prediction on sequence number 17 (length = 40013, name = contig17) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 17 on both strands -# start gene contig17.g26 -contig17 AUGUSTUS gene 3963 23615 0.14 + . contig17.g26 -contig17 AUGUSTUS transcript 3963 23615 0.14 + . contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS start_codon 3963 3965 . + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 3963 4227 0.84 + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 4327 5118 0.47 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 6881 7041 0.78 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 7101 7245 0.95 + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 10797 10878 0.81 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 18063 18206 0.61 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 22448 22582 1 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 23025 23102 1 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 23159 23346 0.98 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -contig17 AUGUSTUS CDS 23413 23615 0.74 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; -# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag -# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt -# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg -# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc -# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat -# ggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaaaaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggc -# aagaaagaaaagtgtacaaggttctgactcaaatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatc -# caccagcactcaatgatggattgaataaggctgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctata -# tatctgcaaaacgctcacttagaatggataagatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaaga -# agagcatactcctcatgaaatcaataggggaaacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaa -# aagctataaggacttctagcgggttgctttcttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaat -# cttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaatcaaaatcactatctaatgttggacaatttgtaagtaaaaaaatttggggaagtcgtttcaaaagcca -# aagtaaacgcaatttttcgaaaggactaaaggatttgccttctgtaaaatggcatccttcggacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggt -# ttcaaattgttgatactttattgataaggctgtcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattgga -# aatattgatgcggatatccgaaccggggacctctcgcatcagaggcagatgccataccagttgagctatcgcgtcatgttacgcgcggtcgtgattgt -# agacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgtcaccc -# ttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttgatgtt -# atctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaattagacga -# tccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgcctggatcatattaatcatttaaatggaaatcaagaaaaaa -# agaatgttctaaaaaaatcttctaaaagtagtttaattaatacaaagagatgtcaagaagaaaactttgaaattttcaccgctagtctgaaaatacct -# gtgccggaaaaagcgcacatacatagtaaagagtctatagaatgtagagatgataaaacggcacgccgaagaatttgtcagcctcgaataccaacaga -# cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca -# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] -# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS -# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS -# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK -# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ -# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY -# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM -# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK -# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] -# end gene contig17.g26 -### -# -# ----- prediction on sequence number 18 (length = 40012, name = contig18) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 18 on both strands -# (none) -# -# ----- prediction on sequence number 19 (length = 45013, name = contig19) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 19 on both strands -# start gene contig19.g27 -contig19 AUGUSTUS gene 29061 34294 0.14 + . contig19.g27 -contig19 AUGUSTUS transcript 29061 34294 0.14 + . contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS start_codon 29061 29063 . + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -contig19 AUGUSTUS CDS 29061 29126 0.74 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -contig19 AUGUSTUS CDS 29277 29928 0.98 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -contig19 AUGUSTUS CDS 31020 31348 0.59 + 2 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -contig19 AUGUSTUS CDS 33803 34126 0.31 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -contig19 AUGUSTUS CDS 34184 34294 0.34 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; -# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga -# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga -# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa -# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac -# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg -# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa -# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca -# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt -# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg -# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa -# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca -# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga -# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag -# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac -# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa -# tttcttactttcttctagctttgatgattag] -# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS -# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP -# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSAEQEKRGRKRSTSTKFDTSLIRKSKKEPFLSSKDL -# KNYMNASVTSRTIRNRLIEHGLKAHSARRVPFMSKRHTERRLCFAKNHQTRQNWKNVLWSDETKIDLFGSDGRPHIGQTNPALLQLISENQDAFLNML -# NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ -# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] -# end gene contig19.g27 -### -# -# ----- prediction on sequence number 20 (length = 50014, name = contig20) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 20 on both strands -# start gene contig20.g28 -contig20 AUGUSTUS gene 24058 29291 0.09 + . contig20.g28 -contig20 AUGUSTUS transcript 24058 29291 0.09 + . contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS start_codon 24058 24060 . + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -contig20 AUGUSTUS CDS 24058 24123 0.79 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -contig20 AUGUSTUS CDS 24274 24925 1 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -contig20 AUGUSTUS CDS 26017 26345 0.53 + 2 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -contig20 AUGUSTUS CDS 28800 29123 0.36 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -contig20 AUGUSTUS CDS 29181 29291 0.28 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; -# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga -# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga -# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa -# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac -# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg -# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa -# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca -# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt -# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg -# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa -# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca -# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga -# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag -# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac -# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa -# tttcttactttcttctagctttgatgattag] -# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS -# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP -# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSAEQEKRGRKRSTSTKFDTSLIRKSKKEPFLSSKDL -# KNYMNASVTSRTIRNRLIEHGLKAHSARRVPFMSKRHTERRLCFAKNHQTRQNWKNVLWSDETKIDLFGSDGRPHIGQTNPALLQLISENQDAFLNML -# NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ -# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] -# end gene contig20.g28 -### -# -# ----- prediction on sequence number 21 (length = 50011, name = contig21) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 21 on both strands -# start gene contig21.g29 -contig21 AUGUSTUS gene 14668 45952 0.09 - . contig21.g29 -contig21 AUGUSTUS transcript 14668 45952 0.09 - . contig21.g29.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 14668 14889 0.81 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 35839 35977 1 - 1 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 38420 38571 0.95 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 38633 38844 0.9 - 2 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 39233 39373 0.63 - 2 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 40330 40417 1 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 40474 40918 1 - 1 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 41250 41928 0.61 - 2 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 45245 45455 0.98 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 45584 45859 0.52 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS CDS 45947 45952 0.54 - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -contig21 AUGUSTUS start_codon 45950 45952 . - 0 transcript_id "contig21.g29.t1"; gene_id "contig21.g29"; -# coding sequence = [atgcgcgaggaagaggaacatcatggttggattgaaggattggccattcttatttctgttattgtagtagttatagtaa -# cagctttcaatgattactcaaaggaaagacaattccgaggtctgcaaaatcgtattgagggcgaacataagttttcagttatccgaggaggggaggtg -# tgccaaatttcagttggagatattctggttggagatattgctcaggtcaaatatggagacttgttgccggcagatggttgtctcattcaaagtaacga -# cctaaaggtggacgaatcgtccttaactggcgaatccgatcatgtcaaaaagggtgcagacgttgatcccatggttctatcaggcacgcatgttatgg -# aaggaagcggtaaaatggttgttactgccgtaggggttaactcccaagcaggcataatttttacgcttcttggcgccgcagttgatgagcaagaagca -# gaaattaaaaagatgaaaaagggtgaaaacgacggtcgcgcccaaacaaaagggacccaagcgctaactcaacgccaaccagtaccaagcgaaggaac -# aaaatctgaatctgagggaaatcatgtgccgcaatcctcctcgtcgtcagcagctgtagaaacaggacataagaaggaaaaatctgtgctacaagcaa -# agttgacaaaactagctatacagattggatatgctgggtctactattgccgtacttacagtcataattttgattattcagttttgtattaagacattc -# gttattgacgaaaaaccatggaagaacacttatgccaataacttggttaagcatttgataattggtgttacagtattagtagtagctgtaccagaggg -# acttcctctggccgttaccctatctttagcatactcggtcaagaaaatgatgaaggacaataatttagttcgccatttggatgcttgtgaaacaatgg -# gtaatgctactgccatttgctctgataaaaccggaactcttacgaccaatcgtatgactgttgtacaatcctacatatgtgaaaaattatgcaaggtt -# ttgccaacgctaagcgacataccacagcatgtgggaaacttgattacaatgggaatatctgttaactcagcttatacttcaaatataatggtaatagt -# ttttatttcatcccggtgtgcttttatctatggccatgagggtaccctggaaaagtttacaagggatatgcaggagcgtctaatacgggaagttattg -# aaccaatggcttgtgacggtctgcgcacaatatctgtggcgtaccgcgactttgtgcctggtaaagctgcaattaatgaagtgcatattgatggcgag -# cccaactgggacgacgaggaaaacattatgacgaatcttacgtgcctctgtgtggttggtatagaagatccagttcgtcccgaagtacctgacgccat -# tcgtaaatgccaacgagctggtataacggttcgcatggtaactggagacaacatcaacacagcacgatcaattgccagcaaatgtggtattttgcgtc -# ccaatgacgactttcttattctggaaggcaaagagtttaacaggcgtattcgggatagcaatggagatatccaacaacatcttattgataaagtatgg -# ccaaaattgagggttttagcacgatcatcaccaaccgacaagtatacgttggttaaagcaacagagtttccaactccagatctattactccgtaaacc -# ctatggccgcacaaaacccttaatatctcgcacaatgatgaaaaacatacttggtcaggcgctttatcagttggtaataatatttggactgctctttg -# 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-contig22 AUGUSTUS transcript 4664 35948 0.14 - . contig22.g30.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 4664 4885 0.97 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 25835 25973 0.99 - 1 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 28416 28567 0.98 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 28629 28840 0.91 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 29229 29369 0.65 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 30326 30413 1 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 30470 30914 1 - 1 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 31246 31924 0.76 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 35241 35451 0.98 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; -contig22 AUGUSTUS CDS 35580 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-# tatctctaagacgcaagcggcacatttatcaacaaatcatcgcaccaacttggagatatggaatccaaatttggggagtggcggctgcgtcccaccga -# aaacgtttccaaaccgtccagaacaaaacattaagacaaatcactggctttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacgg -# atgcgctgcttatggatttgttgtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactac -# aggccactaaatgggaatggaggaaaatgtatcctgagtcaccggatagtgggttgtcaccatgtcctcgattgggacacagttttaccatggttggt -# gaaaaaatatttttgtttggaggactagcaaatgaatcagatgaccctaaaaataatattccaaaatacttaaatgatttgtatatattggatactcg -# aggagttcacagtcataacggaaaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctcctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagta -# agggatctggaaatttaaatctcttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagatttgtggttattagatacagatacaatgacttgggac -# aatgtcacattagacactgtagaagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagttggtattcaaagtcgtctgtatgtttggtcagggcg -# ggatggttatcgcaaagcatggaacaaccaggttagggtttgttgtaaggacctatggtatttggaggtctctaagccactgtatgcagttaaagttg -# 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-contig23 AUGUSTUS CDS 9738 9889 0.81 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 10040 11101 0.84 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 11763 12261 0.57 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 12343 12872 0.44 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 13476 13707 0.97 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 13769 13935 0.62 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 15540 15809 0.64 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 18249 18612 0.69 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -contig23 AUGUSTUS CDS 18678 18820 0.99 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; -# coding sequence = [atgagcgccgttatccgcggctgtgttcgtgcagaggccgcgtggaaaacgaaatttaaaaatggaaggcaaaacgcaa -# aaaacactcttaagacgccttcaggagttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacggatgcgctgcttatggatttgtt -# gtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactacaggccactaaatgggaatggag -# gaaaatgtatcctgagtcaccggatagtgggttgtcaccatgtcctcgattgggacacagttttaccatggttggtgaaaaaatatttttgtttggag -# gactagcaaatgaatcagatgaccctaaaaataatattccaaaatacttaaatgatttgtatatattggatactcgaggagttcacagtcataacgga -# aaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctcctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagtaagggatctggaaatttaaatct -# cttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagatttgtggttattagatacagatacaatgacttgggacaatgtcacattagacactgtag -# aagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagttggtattcaaagtcgtctgtatgtttggtcagggcgggatggttatcgcaaagcatgg -# aacaaccaggttagggtttgttgtaaggacctatggtatttggaggtctctaagccactgtatgcagttaaagttgctctagttcgtgcttctactca -# tgcacttgagctctcatggactgcaaccacttttgcagctgcatacgttttgcagatccagaaaatcgatcagccaccaactgcaatttcgaaaccgt 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32549 0.1 - . contig23.g33 -contig23 AUGUSTUS transcript 20555 32549 0.1 - . contig23.g33.t1 -contig23 AUGUSTUS CDS 20555 21022 0.69 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -contig23 AUGUSTUS CDS 21361 21933 0.97 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -contig23 AUGUSTUS CDS 22038 22105 0.88 - 2 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -contig23 AUGUSTUS CDS 22166 22501 0.51 - 2 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -contig23 AUGUSTUS CDS 32411 32549 0.31 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -contig23 AUGUSTUS start_codon 32547 32549 . - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; -# coding sequence = [atgaagagcttttccagtaaccaccaactcgtgcaacatatccgggtgcacactggagagaagccgtacaagtgctcct -# attgtgatcgtagatttaagcagctgtcgcacgtccagcagcacacgcgcctgcacacagccctatcccaattcagtgaaataaatccgggaactagc -# 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gene_id "contig24.g35"; -contig24 AUGUSTUS CDS 2163 2498 0.48 - 2 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; -contig24 AUGUSTUS CDS 12408 12546 0.29 - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; -contig24 AUGUSTUS start_codon 12544 12546 . - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; -# coding sequence = [atgaagagcttttccagtaaccaccaactcgtgcaacatatccgggtgcacactggagagaagccgtacaagtgctcct -# attgtgatcgtagatttaagcagctgtcgcacgtccagcagcacacgcgcctgcacacagccctatcccaattcagtgaaataaatccgggaactagc -# agtgggaacggaaatgggagtggaattgccaacgatcaaatttctgcgcacactacatcggattcgagctgcgcgcagagctccaatcaggccactgc -# cggtggccccaacttaatcgacagctatttgggaaagcgaaggacagcaaatcatccttgcccggtgtgcggtaaacattacgtcaatgagggatccc -# ttcggaaacatctagcgtgccacgccgagacctcccaactaacaaacagcctgcgaatgtggccttgtagcgtttgccaggcagtctttactcatgaa -# aatggccttcttacccacatggagtcgatgcgcatggatccaaaacatcagttcgcggctcaatacgttttgtctcgagcggctgcggagcagcgaga -# acgcgaatccatgctagcggtaaccttggccgccagcagtggcactagcgacagaatggggatttcagatgccgcgaacgtcctgacaatgggaacac -# acaactccgaggggtctaactcgaagtgtccttccccttcggtgaactccgaatgctcttctaacggacgtttaacgtcatcaacagcatctgatcag -# gaccaagacatcgaccatgggctgagtgaaaacgagaacagcaaccagaacatcaccagcagcacaaataacaacaataattgcaccaacaacaacag -# cacggcctctaataaaatggttgagcttcgacttcagagttctggccagtataccatggatacggatctgcacgtggctaaccgaatgtcgttgatgg -# ccgcggctgctgctgccgttgctgcgtcacgaccgcaggacggagtggacaccacagcagtgccgagcgcggcagtccaagctgctgtggtcaatttg -# gccgctgccatgcgaatgaacaattccagcaacggccctgccgcctaccaacagcatagcgaatcatctgctgccgcatcgatcgcaatgaacatgaa -# cgtgcacatgatgcgtggttcacttgagccagaccctggcctaggaggaatgcatgcaatcgaagttctccaccagcagcagcaccatcagcagacgt -# ccaactactctcagcacgccatcagtcccaccaaccaacaggctcatccccacccccaggcgcacaacacaccccaccacctcccggatccggagaca -# gcgctccggatgcatcaggcagaggcgattttgcgctcgcacaccgaggcggcgttccgactggccactggcactgttcctgttcctggatccggagt -# aaaaagtgaggcagaccagcagcagaacagtaataacggcaacactactagcagtgccaccagcaacgaccaacagcaccgattccattcacactcgc -# atcagcaagagcaccaactgccatcgagctcatga] -# protein sequence = [MKSFSSNHQLVQHIRVHTGEKPYKCSYCDRRFKQLSHVQQHTRLHTALSQFSEINPGTSSGNGNGSGIANDQISAHTT -# SDSSCAQSSNQATAGGPNLIDSYLGKRRTANHPCPVCGKHYVNEGSLRKHLACHAETSQLTNSLRMWPCSVCQAVFTHENGLLTHMESMRMDPKHQFA -# AQYVLSRAAAEQRERESMLAVTLAASSGTSDRMGISDAANVLTMGTHNSEGSNSKCPSPSVNSECSSNGRLTSSTASDQDQDIDHGLSENENSNQNIT -# SSTNNNNNCTNNNSTASNKMVELRLQSSGQYTMDTDLHVANRMSLMAAAAAAVAASRPQDGVDTTAVPSAAVQAAVVNLAAAMRMNNSSNGPAAYQQH -# SESSAAASIAMNMNVHMMRGSLEPDPGLGGMHAIEVLHQQQHHQQTSNYSQHAISPTNQQAHPHPQAHNTPHHLPDPETALRMHQAEAILRSHTEAAF -# RLATGTVPVPGSGVKSEADQQQNSNNGNTTSSATSNDQQHRFHSHSHQQEHQLPSSS] -# end gene contig24.g35 -### -# start gene contig24.g36 -contig24 AUGUSTUS gene 20423 25562 0.54 - . contig24.g36 -contig24 AUGUSTUS transcript 20423 25562 0.54 - . contig24.g36.t1 -contig24 AUGUSTUS CDS 20423 20482 0.64 - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; -contig24 AUGUSTUS CDS 20543 20620 0.84 - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; -contig24 AUGUSTUS CDS 24621 25562 0.88 - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; -contig24 AUGUSTUS start_codon 25560 25562 . - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; -# coding sequence = [atgttcaagatggacgccgcagacttctggcagcatgcacgtgccccgttcagcctgcagtacaattcgccgaatcagc -# cgcaagcaccccaccacaccctgcaccaatcccttccgcaggagcacgaggtgttggccgacgtccatccaggaggcccagccaccggctcgggcgta -# gtaaacagcagcagctctattggcgtatccagcccccactctgctctgggcggcaaggccgagtccagccacattctgcagcagcactcagggcagca -# gtcctacgggggcgactccttccgaggctcacagtcgccccagctaagcagccaccacctgttgttcaacgcagctgcggcagctgctgcggcggccc -# acctgaagtccacggccatgcagaacaacctctcgccgatgagggaccaggcccagagtgaccatcgcaactatggccacagccccttgaccgccctg -# tgtgggatcaagcccaagcaggagatagacgccaagccgaccctccagccgctgaacgagtgccgccagccgctggcccaggcgcaatcgcaatccca -# 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25 (length = 75023, name = contig25) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 25 on both strands -# start gene contig25.g37 -contig25 AUGUSTUS gene 63496 72888 0.14 - . contig25.g37 -contig25 AUGUSTUS transcript 63496 72888 0.14 - . contig25.g37.t1 -contig25 AUGUSTUS CDS 63496 64309 0.62 - 1 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 64370 65052 0.57 - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 65106 65290 0.97 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 65762 67777 0.42 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 70910 71131 0.95 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 72321 72656 0.99 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS CDS 72717 72888 0.63 - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -contig25 AUGUSTUS start_codon 72886 72888 . - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; -# coding sequence = [atgctctcgacaacaatgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtg -# catctggagtagggatcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccggatcaa -# ataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtgataaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagt -# tgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggtacaccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcc -# tggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcctgctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgct -# aagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgaaacaggatctattaaagcgaaaggaatcgcttctggaagcggttgcggaacggggtcctc -# atctgctctttccgttggcattgttattaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaagggaaaatcactctc -# caaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgaccgatagtatcccc -# gaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattgaatctttaaataa -# cccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtggggctggtaacc -# ttttgacaggaactggcaatctaccatcctctggtggcagcaattgcttagattacatgcaacagcagaatcacatatttgtattttcaactcaactg -# gctaacaaaggagccgaatcagttttgagtggtcagtttcaaaccattattgcgtatcactgcacccagccagcgacaaaaaactttctagaagactt -# tttcatgaaaaatcctctaaagatgaacaagttgcagcgccacagtgccttgggtatgccatggataggcatgggacccggaggacaaactcccccta -# atcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaatagcaaacgtagt -# tctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaagcagcggtgccag -# tggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctggtgttgatttgg -# gccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaaccttacaccacaa -# 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13481 22873 0.21 - . contig26.g38 -contig26 AUGUSTUS transcript 13481 22873 0.21 - . contig26.g38.t1 -contig26 AUGUSTUS CDS 13481 14294 0.77 - 1 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 14355 15037 0.73 - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 15091 15275 0.98 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 15747 17762 0.44 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 20895 21116 0.95 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 22306 22641 1 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS CDS 22702 22873 0.67 - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -contig26 AUGUSTUS start_codon 22871 22873 . - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; -# coding sequence = [atgctctcgacaacaatgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtg -# catctggagtagggatcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccggatcaa -# ataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtgataaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagt -# tgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggtacaccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcc -# tggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcctgctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgct -# aagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgaaacaggatctattaaagcgaaaggaatcgcttctggaagcggttgcggaacggggtcctc -# atctgctctttccgttggcattgttattaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaagggaaaatcactctc -# caaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgaccgatagtatcccc -# gaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattgaatctttaaataa -# cccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtggggctggtaacc 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ccaaggaaatggaatcgttcggtgataacataaaaagtaggagaccaagcccacagggtcaaaggtcgccaggaaatggtcttacagaggcaaataca -# gaagctagatttgctgcagccagtcctggtgtgatttttaatcctcaccaacatatgcaaaacaatacaaatacctataaaataggaactcctaatat -# gcagatagagagacaagctcctgctcaaggaggttccgtacaatttagtaggcgttctgataatattccactaaatcccaacagtggaaatcggcctc -# cacaaaacaaaatgacacagaacttcgatccaatctcttctctggcgcaaatgtctcaacaattaacaagctgcgtgtctagtatgggtagtccggcc -# ggttctagtggaatgtctatgatgggcggaccgacagatatcaatatggagcatgcaatgatttcaggattagaaggaccaggaatggatgttattaa -# tcaaaataactgtcatccaatgaatgccgtcatgaactccatgggtcagcgaatgatgaatccaaagatgtgcgttccaggcggtccgagtagtctgc -# ctggcttcaaccctaattctcccaatggtgtgttaagagagagtcccctggggcctggtccagttcctggtcctgggccaatgaactctccaaacttt -# caaggggttttgcctcctggtgcaagaatgatgggtcgaatgccaatcggttttggttcgaatttcaatcctaatatacaggtaaaggcaagtactcc -# aaacaccatacagtacatgccagtaaggccgcaaaacgccagcaacaacaataacaatggtgctagcaacgttagaatgccacctagtctagagtttt -# tgcagagtggcgacggtggtccgggaatgccgggaatgatggtgggctcagggtcagggccaatgcttatgaactcttccggcgaccaccagaacaag -# atttcgaacaaccctggagcgggcaacggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatga -# tgtggcaatgaatattggccaaccgtctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtca -# acagacagattccgtttgcacatgggccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccg -# cctatgtttactgcatcacaacagtctaatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagt -# tggacctgcagtttcacaaggacagatccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaa -# tgcccactgctggaaatgtcgttccaacgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcac -# agtttccagcagcaattatacgcaacaaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaa -# cttatctccaactccagcgttctttgtgaacaaatga] -# protein sequence = [MLSTTMPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPDQIKVMPDEGAEKNGLSSSDK -# GVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKKNSVKDEDVETGSIKA -# KGIASGSGCGTGSSSALSVGIVIKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMGIEGV -# NCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQTIIAY -# HCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLSNEGE -# LMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKMNQFL -# FPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGGAAGP -# VTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQATGPVA -# PPQHTNSGTGSNASSSQVRSLQGPPPPYHSTQRSASVPIATQSPNPSSPNNLSLPSPRTTGAAMGLPTNSPSMDGATSLSGSAPPAISTTSQGGTTGV -# LSVNKNCFQSDAPSPSNQNRNRNNGSSGVLTHNLNSNPSTPLSHLSPKEMESFGDNIKSRRPSPQGQRSPGNGLTEANTEARFAAASPGVIFNPHQHM -# QNNTNTYKIGTPNMQIERQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDINMEHA -# MISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMPIGFG -# SNFNPNIQVKASTPNTIQYMPVRPQNASNNNNNGASNVRMPPSLEFLQSGDGGPGMPGMMVGSGSGPMLMNSSGDHQNKISNNPGAGNGINFFQNCNQ -# MGIIDDEGGLASHDVAMNIGQPSMIRGMRPHGMRPHAMAPRMQASVNRQIPFAHGPDGLDCVGDTSAFFNNATCNSTGPPMFTASQQSNQAKPQHLKN -# IPTGLCQNQTGLGVGPAVSQGQIQLQGQGQGQGQGQTLIGPSNNNLMPTAGNVVPTNGVSGINFVGPSSNDLKYAQQYHSFQQQLYATNTRSQQQQQM -# HQQQQSNMLTMPPNLSPTPAFFVNK] -# end gene contig26.g38 -### -# start gene contig26.g39 -contig26 AUGUSTUS gene 29102 36266 0.39 + . contig26.g39 -contig26 AUGUSTUS transcript 29102 36266 0.39 + . contig26.g39.t1 -contig26 AUGUSTUS start_codon 29102 29104 . + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 29102 29217 0.99 + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 29275 29409 1 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 31905 31949 0.84 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 32205 32279 0.64 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 32354 32492 0.97 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 34887 35151 0.77 + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 35660 35786 0.95 + 2 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 35888 35975 0.99 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -contig26 AUGUSTUS CDS 36033 36266 0.98 + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; -# coding sequence = [atgccgttgtttggcaaaaaggattccggcaagaaagccaaggcgaaggacataagggagctaaataagcaagtgtcaa -# tcgaggagaaatacaatcttcatgggcttttgggaactggggccttttcagaagtacgccttgccgaaagtaaagaaacccctggtgatcactttgct -# gttaaaattatcgacaaaaaagctcttaagggcaaggaggaatctctggagaatgaaattcgggttttaagaaggttcagtgcaaatcatttcgatgg -# caaatgtccaaacggaacgcgattaactcatccaaatatagtgcaactcctggaaacgtatgaagacaagtcgaaggtgtacctagttatggagttgg -# ttactggtggcgaactttttgaccgcattgtggaaaaggggtcctacactgaaaaggacgcttctcatctgataagacagattctagaagcggtagat -# tatatgcatgagcaaggtgtcgtccatcgtgaccttaagccggaaaacttactatactatagtcctgacgatgatagcaaaattatgattagcgactt -# tggattatctaaaatggaggattctggaattatggctacagcatgcggaactcccggatatgtcgctccagaagtgctggcacaaaaaccatatggaa -# aagccgttgatgtgtggagtattggagtaatatcgtatatcttattatgtggttaccctccgttttatgatgaaaatgatgctaatctgttcgctcag -# attttaaaaggagaatttgaattcgattcaccatattgggatgaaataagcgagtccgccaagcattttattaaaaatttgatgtgcgtatcagtaga -# gatgagatatacatgcaagcaagctctggctcatgcttggatttctggaaatgaggcaagtagcagaaacattcacggaaccgtgtcagagcaactaa -# agaaaaatttcgcaaaatcccgttggaagcaagcttactacgcggcgacagtgatccgacagatgcagcgaatggcgctaaacagcaatagcagtgca -# aattttgattctactggtgatttcagtaaccaaaaagactctaaaaactcaacagcagcgtctggatcacacatttccaatgttttatcagcgcagaa -# atcagcacaaagtgatgcacaagaagatggtgagacgctaggcagcacaaatggagcatcacagtag] -# protein sequence = [MPLFGKKDSGKKAKAKDIRELNKQVSIEEKYNLHGLLGTGAFSEVRLAESKETPGDHFAVKIIDKKALKGKEESLENE -# IRVLRRFSANHFDGKCPNGTRLTHPNIVQLLETYEDKSKVYLVMELVTGGELFDRIVEKGSYTEKDASHLIRQILEAVDYMHEQGVVHRDLKPENLLY -# YSPDDDSKIMISDFGLSKMEDSGIMATACGTPGYVAPEVLAQKPYGKAVDVWSIGVISYILLCGYPPFYDENDANLFAQILKGEFEFDSPYWDEISES -# AKHFIKNLMCVSVEMRYTCKQALAHAWISGNEASSRNIHGTVSEQLKKNFAKSRWKQAYYAATVIRQMQRMALNSNSSANFDSTGDFSNQKDSKNSTA -# ASGSHISNVLSAQKSAQSDAQEDGETLGSTNGASQ] -# end gene contig26.g39 -### -# -# ----- prediction on sequence number 27 (length = 50016, name = contig27) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 27 on both strands -# start gene contig27.g40 -contig27 AUGUSTUS gene 4094 11258 0.32 + . contig27.g40 -contig27 AUGUSTUS transcript 4094 11258 0.32 + . contig27.g40.t1 -contig27 AUGUSTUS start_codon 4094 4096 . + 0 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 4094 4209 1 + 0 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 4267 4401 1 + 1 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 6897 6941 0.78 + 1 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 7197 7271 0.56 + 1 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 7346 7484 0.96 + 1 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 9879 10143 0.76 + 0 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 10652 10778 0.98 + 2 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 10880 10967 1 + 1 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -contig27 AUGUSTUS CDS 11025 11258 0.98 + 0 transcript_id "contig27.g40.t1"; gene_id "contig27.g40"; -# coding sequence = [atgccgttgtttggcaaaaaggattccggcaagaaagccaaggcgaaggacataagggagctaaataagcaagtgtcaa -# tcgaggagaaatacaatcttcatgggcttttgggaactggggccttttcagaagtacgccttgccgaaagtaaagaaacccctggtgatcactttgct -# gttaaaattatcgacaaaaaagctcttaagggcaaggaggaatctctggagaatgaaattcgggttttaagaaggttcagtgcaaatcatttcgatgg -# caaatgtccaaacggaacgcgattaactcatccaaatatagtgcaactcctggaaacgtatgaagacaagtcgaaggtgtacctagttatggagttgg -# ttactggtggcgaactttttgaccgcattgtggaaaaggggtcctacactgaaaaggacgcttctcatctgataagacagattctagaagcggtagat -# tatatgcatgagcaaggtgtcgtccatcgtgaccttaagccggaaaacttactatactatagtcctgacgatgatagcaaaattatgattagcgactt -# tggattatctaaaatggaggattctggaattatggctacagcatgcggaactcccggatatgtcgctccagaagtgctggcacaaaaaccatatggaa -# aagccgttgatgtgtggagtattggagtaatatcgtatatcttattatgtggttaccctccgttttatgatgaaaatgatgctaatctgttcgctcag -# attttaaaaggagaatttgaattcgattcaccatattgggatgaaataagcgagtccgccaagcattttattaaaaatttgatgtgcgtatcagtaga -# gatgagatatacatgcaagcaagctctggctcatgcttggatttctggaaatgaggcaagtagcagaaacattcacggaaccgtgtcagagcaactaa -# agaaaaatttcgcaaaatcccgttggaagcaagcttactacgcggcgacagtgatccgacagatgcagcgaatggcgctaaacagcaatagcagtgca -# aattttgattctactggtgatttcagtaaccaaaaagactctaaaaactcaacagcagcgtctggatcacacatttccaatgttttatcagcgcagaa -# atcagcacaaagtgatgcacaagaagatggtgagacgctaggcagcacaaatggagcatcacagtag] -# protein sequence = [MPLFGKKDSGKKAKAKDIRELNKQVSIEEKYNLHGLLGTGAFSEVRLAESKETPGDHFAVKIIDKKALKGKEESLENE -# IRVLRRFSANHFDGKCPNGTRLTHPNIVQLLETYEDKSKVYLVMELVTGGELFDRIVEKGSYTEKDASHLIRQILEAVDYMHEQGVVHRDLKPENLLY -# YSPDDDSKIMISDFGLSKMEDSGIMATACGTPGYVAPEVLAQKPYGKAVDVWSIGVISYILLCGYPPFYDENDANLFAQILKGEFEFDSPYWDEISES -# AKHFIKNLMCVSVEMRYTCKQALAHAWISGNEASSRNIHGTVSEQLKKNFAKSRWKQAYYAATVIRQMQRMALNSNSSANFDSTGDFSNQKDSKNSTA -# ASGSHISNVLSAQKSAQSDAQEDGETLGSTNGASQ] -# end gene contig27.g40 -### -# start gene contig27.g41 -contig27 AUGUSTUS gene 17297 23825 0.08 - . contig27.g41 -contig27 AUGUSTUS transcript 17297 23825 0.08 - . contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 17297 17417 1 - 1 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 17475 17667 0.71 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 17767 17937 0.43 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 17997 18375 0.9 - 0 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 19175 20016 0.87 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 20080 20190 0.65 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 21431 23113 0.44 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 23173 23691 0.93 - 2 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS CDS 23771 23825 0.75 - 0 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -contig27 AUGUSTUS start_codon 23823 23825 . - 0 transcript_id "contig27.g41.t1"; gene_id "contig27.g41"; -# coding sequence = [atgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatggaacatgcaaatcggatcgagcccagtctta -# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg -# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc -# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga -# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt -# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat -# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag -# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat -# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat -# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt -# caaatagtcaaattctgaacatgaaaaagtctaagaagcgagtcaatcatggaaacagcttatctgatccaagtaaagtaaatatagaaaagatgttc -# aaaaagcagaataggcataagcaaaagagtgttcaacttgaaactcaaactttgagcgactttcccattgaagcggacatgaatacagaaaattttat -# cgcagctgatatcccttgtgcggaacctgtagtgttaaagcagattgagattggatcccaaagttctgtttttccagtacaaccaggaggaatacaac -# aaacacaagtatcattgcagtcaaaaaaaaatgcatcagaaccggaacgaagtaagctggatatatttaaaaaaatttctaagccgcgcactccccgt -# caggatggtggagcaactcaggtacctcctggaataggcgtacgtgtatttggaagtaccatgcctgtttcgacgttaattagtcttccatctgggac -# tactataacacctacacccccagtaggccagactccggaggacgcaaataatcctaattcgaaaattaaccaatatggtgtattgggccaaaagctat -# cttctcctaaagatgacatagaaatgtcaactattaatcccataaaggcaaagaagcggggccgaaaacctggaggaaaaaatttggtaaaacaaact -# cattttacatcacattcccttattgaatcgtctaaaaaggaaaagtcaacgcgtgtaggtgcttttaagctagcgtcatctgagacgctggtatcaca -# aaattccttaagcgtatctatgccaacagagcctctgaacctcagcagcacagatcaggcttcaatcgaatatttaccaaactttcacgcaaaaaagg -# 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actttattcagatagctccttctcagtcgtcatttccgcaattcaacttgccaaattttataggaggtgataagttcagtttggccggtggagctgat -# cttattcctttggcaagaatagattgcgggtcggcatattcatcccataaggtgccatctagcagcttaacagggggagtggcttcaggcgtaatccc -# tattttaccaaatcacatatctgaggaccagcagtttatgcctacatttccaaactacgaggatattagcattactccgaccggagcgttgtcactag -# atcccaaagtgcgcaaacaccataaaaagcctaaaaagattaaagaaggaaaaattaaaaaaaaaaaggataaaaaggataaatcaaagagaaaagat -# cgagttgccttagcgtctaataaaagtgaccgaaaaataaaagggcttgacaaaaagcaaaaaaaggaaaaaaagaaggacaaggaaaaacagatttt -# aatccaaattccggaagtcgacgaattttctagggcaccttttattaacaacttagattatggcttcactcaaagtgtacccgcgagtacacctgtat -# tgaaaaccagtccaatgtcagtaaaaccgccactatcggccacttgtgcgatgtctccaaaaatacagcagtctccaagtcaaataccaaaactaaca -# ctgaaactaagtggcaagtccacaacgtgtcctgaaaaagagaaagacacaacggatgctgtcaaggtgtcacagccaactatgtttccagtagaaaa -# taaagagcgtgagcgagataattccccggaactagcccggttctctccactggttaccgggccaccgaagaacaaacaatctgatacacatttattag -# 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"contig27.g42"; -contig27 AUGUSTUS CDS 49867 49889 0.99 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; -contig27 AUGUSTUS start_codon 49887 49889 . - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; -# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc -# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc -# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc -# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg -# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg -# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgaggg -# acaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaac -# 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AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG -# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPGLRRRRESAEGKYVTDQTQLQLKFQRPRSRTSSRTRGISNTMLGNFDDNNTVSGEKQRLIGTQ -# VVQNEESNNVPTSIYSAELQDKCNISPPPGDPKIENSARLRRYRHNLE] -# end gene contig27.g42 -### -# -# ----- prediction on sequence number 28 (length = 50013, name = contig28) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 28 on both strands -# start gene contig28.g43 -contig28 AUGUSTUS gene 2292 8820 0.12 - . contig28.g43 -contig28 AUGUSTUS transcript 2292 8820 0.12 - . contig28.g43.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 2292 2412 1 - 1 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 2470 2662 0.68 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 2762 2932 0.39 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 2992 3370 0.91 - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 4170 5011 0.87 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 5075 5185 0.67 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 6426 8108 0.49 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 8168 8686 0.89 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS CDS 8766 8820 0.7 - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -contig28 AUGUSTUS start_codon 8818 8820 . - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; -# coding sequence = [atgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatggaacatgcaaatcggatcgagcccagtctta -# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg -# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc -# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga -# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt -# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat -# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag -# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat -# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat -# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt -# caaatagtcaaattctgaacatgaaaaagtctaagaagcgagtcaatcatggaaacagcttatctgatccaagtaaagtaaatatagaaaagatgttc -# aaaaagcagaataggcataagcaaaagagtgttcaacttgaaactcaaactttgagcgactttcccattgaagcggacatgaatacagaaaattttat -# cgcagctgatatcccttgtgcggaacctgtagtgttaaagcagattgagattggatcccaaagttctgtttttccagtacaaccaggaggaatacaac -# aaacacaagtatcattgcagtcaaaaaaaaatgcatcagaaccggaacgaagtaagctggatatatttaaaaaaatttctaagccgcgcactccccgt -# caggatggtggagcaactcaggtacctcctggaataggcgtacgtgtatttggaagtaccatgcctgtttcgacgttaattagtcttccatctgggac -# tactataacacctacacccccagtaggccagactccggaggacgcaaataatcctaattcgaaaattaaccaatatggtgtattgggccaaaagctat -# cttctcctaaagatgacatagaaatgtcaactattaatcccataaaggcaaagaagcggggccgaaaacctggaggaaaaaatttggtaaaacaaact -# cattttacatcacattcccttattgaatcgtctaaaaaggaaaagtcaacgcgtgtaggtgcttttaagctagcgtcatctgagacgctggtatcaca -# aaattccttaagcgtatctatgccaacagagcctctgaacctcagcagcacagatcaggcttcaatcgaatatttaccaaactttcacgcaaaaaagg -# aaagaaaaaagtacaaactaaaatttgacacgggcttaccacaaaatgtaaaggacttcaacaacgtattttctgaaacaacatcctcaaccgtaact -# agttcaattcatcttatgaaacaaaaaaacgaagcgccctgtccggattcattaatgacagctcccaacactttgtctaatacatcattatatcctgg -# aaaccagacaggaatggttccattgcttccactattgcactttccaccgcgaccgggattgattccttctggacctggactttttcctgcagtaacag -# gtctggtcggctttggaaataataataacacagtcggtattgcaccattcatagcatttcctggtacagaaggatctgttgctgacaccgttagatgc -# ccaccaattaaagattctgctgatactgggaatgatcaactcctaagaagatccggacagatggacttacagattgatagaaactattgcaatgttgc -# tccgttggtgccagactcaatgaaattttctgagtgtaaaccagtatcttgcggtaatactgacatggaaaatacatttacaccttccaaatttaagg -# caaagccatcagtgcaggcttctggaaatcttggagatccgattgaggtatccgatgactcagacgaatcaatacaaaacagacaaattgttcaaaaa -# aaatctccattaacttctccaaaccacgctaaatcaagcttagtacaatcacagcaccaaacgtttgcaactccatcaccattatgcgaagacaagaa -# ccaaatggacttaaggaatgttttgccgaatacaagcccaagtgaatcaattaagaagttgaagaagtcagttaaactgaaccttcccgatgtaaaaa -# actttattcagatagctccttctcagtcgtcatttccgcaattcaacttgccaaattttataggaggtgataagttcagtttggccggtggagctgat -# 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contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 18492 18726 0.28 - 1 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 18790 18889 0.56 - 2 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 20325 20500 0.14 - 1 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 25303 25442 0.49 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 25666 26469 0.83 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 27412 27615 0.99 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 27678 28067 0.98 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 28384 28545 0.84 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 30540 31038 0.97 - 1 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS CDS 34862 34884 0.83 - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -contig28 AUGUSTUS start_codon 34882 34884 . - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; -# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc -# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc -# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc -# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg -# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg -# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgaggg -# acaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaac -# tacaggggaaggagcatagcaacttttccgtgggtcgattgccttataattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtatacc -# 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ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPGLRRRRESAEGKYVTDQTQLQLKFQRPRSRTSSRTRGISNTMLGNFDDNNTVSGEKQRLIGTQ -# VVQNEESNNVPTSIYSAELQDKCNISPPPGDPKIENSARLRRYRHNLE] -# end gene contig28.g44 -### -# -# ----- prediction on sequence number 29 (length = 50006, name = contig29) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 29 on both strands -# start gene contig29.g45 -contig29 AUGUSTUS gene 193 14875 0.08 - . contig29.g45 -contig29 AUGUSTUS transcript 193 14875 0.08 - . contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 193 266 0.67 - 2 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 316 491 0.1 - 1 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 5294 5433 0.52 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 5657 6460 0.78 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 7403 7606 0.98 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 7669 8058 1 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 8375 8536 0.86 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 10531 11029 1 - 1 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS CDS 14853 14875 0.83 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -contig29 AUGUSTUS start_codon 14873 14875 . - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; -# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc -# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc -# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc -# 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CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA -# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG -# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPEPICFIIVEGSSRSAETHQEGVRR] -# end gene contig29.g45 -### -# -# ----- prediction on sequence number 30 (length = 70018, name = contig30) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 30 on both strands -# start gene contig30.g46 -contig30 AUGUSTUS gene 28638 65517 0.02 + . contig30.g46 -contig30 AUGUSTUS transcript 28638 65517 0.02 + . contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS start_codon 28638 28640 . + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 28638 28655 0.18 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 33827 33869 0.95 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 33930 33948 0.96 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 44322 45962 0.97 + 1 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 47860 48041 0.96 + 1 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 49613 51223 0.99 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 57010 58428 0.87 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 58492 58712 0.89 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 58776 59129 0.92 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 59374 59514 1 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 59569 62496 0.74 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 64713 65304 0.85 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -contig30 AUGUSTUS CDS 65468 65517 0.64 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; -# coding sequence = [atgggtgtcactgagacggaatcgtgtataagtgatcgggactcacttaaccctgatcagggcaatcgttcctacggaa -# gctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaacttttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatac -# attattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttatgcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaa -# agatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatcaaagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctg -# gtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacattcctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgc -# caggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgcaagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgc -# gaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcgagtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagc -# cgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatgacaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgcccc -# 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-### -# -# ----- prediction on sequence number 31 (length = 40012, name = contig31) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 31 on both strands -# start gene contig31.g47 -contig31 AUGUSTUS gene 3754 25510 0.11 + . contig31.g47 -contig31 AUGUSTUS transcript 3754 25510 0.11 + . contig31.g47.t1 -contig31 AUGUSTUS start_codon 3754 3756 . + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 3754 3776 0.72 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 4315 5955 0.83 + 1 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 7853 8034 0.97 + 1 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 9606 11216 0.99 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 17003 18421 0.94 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 18485 18705 0.89 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 18769 19122 0.96 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 19367 19507 1 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 19562 22489 0.68 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 24706 25297 0.84 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -contig31 AUGUSTUS CDS 25461 25510 0.28 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; -# coding sequence = [atgtttaattgtgcagctatacgctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaactt -# ttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatacattattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttat -# gcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaaagatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatca -# aagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctggtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacatt -# 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atgaaatgccgaatttatcggaacctgaggctgcacataagaaacatgaattcctttataattattatatgcaaaatgaaacgaacacagaactgaaa -# aaacagtttcttatgcgacaacaacataagaaagcacagcagattcaacctcaagaacaaggaaatgagtctgatttggaaatggaattcttgactaa -# tttttatcagcagaacgaagcgaagaaggttagtaattacgactttttactgcagtactatcggacacaggaagaggcatccctgaagtcaaaatcaa -# agcaacagcacctctttagctccagtaaaaagccaactagcgagtttctattgcagtactatcaactgaacgagtcaaaaaagttttttcagttagtt -# gcctcgccccaaacaacgcctgatggcccaggctacaacccgtcatcgcagatgccaaaacccacgacagatgaagttagtaatgacatcggcgaaag -# atcattggagcaggcaacagaaacacaaaaagaagaacaaggagaaatattcagcgaagacaggccacgcgaggaaaatgctttatccttaggcaaaa -# gtgtaatggaaaagtttagcaacaacaacattaacattaacttagttcaagctgacccaaccgagacgaacggtagtcaatctgttgaaacaagacaa -# gagttgttaatggcaccttcaataattgcagtcaatgatgataaccaatatttgggctcaagatcgttacaaaaagaagacaaggaaaagtcacagta -# ttttcataatcttgaagacttcctggatgccaccatgatagagaacaactcccagaccttgacttttaatgatgatgagaaagctggccaaaaggacg -# 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"contig31.g48.t1"; gene_id "contig31.g48"; -contig31 AUGUSTUS CDS 35608 36030 0.43 - 0 transcript_id "contig31.g48.t1"; gene_id "contig31.g48"; -contig31 AUGUSTUS CDS 36290 36345 0.5 - 2 transcript_id "contig31.g48.t1"; gene_id "contig31.g48"; -contig31 AUGUSTUS CDS 36436 37153 0.58 - 0 transcript_id "contig31.g48.t1"; gene_id "contig31.g48"; -contig31 AUGUSTUS start_codon 37151 37153 . - 0 transcript_id "contig31.g48.t1"; gene_id "contig31.g48"; -# coding sequence = [atggccctttttgacgaggaggaggggtacgtcaatccagccatcgacaacgaaaggtacgaggacaagtacttgcagg -# caagtacattatttcgcaacctgattcgtacctgtgaagaagctcaggagaatggaagagaaggcaactttagacaatctggcaaccctgacgaggcc -# gcattaatggcgtcaggagtgggaagcgaaaacctagttcgttttcttgaacaacaacagcagctcaatgagcgtttggctgagcaacaagccacgct -# tttgagggcaaactcggcagcaactgtaatgcataataaactgccaaaaatcgacatcaagctgttcactggcgactacaaggagtggccacgcttca -# agaacatatacgagagcacaatccatagcaagcagcatttgacagcaatacaaaagttgcactacttaaaaacgtacatcactggagaagcggctgac -# 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AUGUSTUS transcript 3187 7142 0.08 - . contig32.g49.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 3187 3584 0.79 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 3715 4119 0.52 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 4175 4290 0.3 - 1 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 4736 5311 0.94 - 1 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 5370 5518 0.85 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 5597 6019 0.37 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 6279 6334 0.36 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS CDS 6425 7142 0.44 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -contig32 AUGUSTUS start_codon 7140 7142 . - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; -# coding sequence = [atggccctttttgacgaggaggaggggtacgtcaatccagccatcgacaacgaaaggtacgaggacaagtacttgcagg -# caagtacattatttcgcaacctgattcgtacctgtgaagaagctcaggagaatggaagagaaggcaactttagacaatctggcaaccctgacgaggcc -# gcattaatggcgtcaggagtgggaagcgaaaacctagttcgttttcttgaacaacaacagcagctcaatgagcgtttggctgagcaacaagccacgct -# tttgagggcaaactcggcagcaactgtaatgcataataaactgccaaaaatcgacatcaagctgttcactggcgactacaaggagtggccacgcttca -# agaacatatacgagagcacaatccatagcaagcagcatttgacagcaatacaaaagttgcactacttaaaaacgtacatcactggagaagcggctgac -# ttgattcgccatatgcaaattacggatgcagcttacgaggctgcttggacttgcctgattgatcgctacaatagaccacgtcacattgttaacactct -# gctggagacatttgtcaacttaccttcgaccgccagagcagatgtaatagttctgcgcaaggtgacggacggagccaccgaaattgtacgcggcctgg -# atgcatcagggcaaactcagggggactgctgggttatacactttattctcgaccgacgttgcgaggaatttgagctcagcaaaagtgagtcagacttg -# aactctaaggttattggttcgcaagcagcagtgcctacaacacacctacgagatgaaaggcgcatcccaagcgcacccgaagatgctacggtcaccat -# cagccatattgcacgggtacaagttgctgccacagctgaagccttgtgcaagggatcaacaaccgcaacacagccacaagggctacgaaagggtgcat -# tgccaacaggtttaatgtttctcaaaaacgcaaagggatcgcactccacctgccgtgtgcttttggacagtggttcggaactgtcatacatctccgag -# cggtgcgttcaggctctcagactggcacgctcgccgtcacgaatcttggtgtcagggacttcgtatatcaaggctgagacaactagaggctgcagcac -# actggacttgacgtcgaggatctcggatcacataatgaagtcgttggcgccagtcgacatactcctgggcagcgactacgtttggaccgtgttcaccg -# atcaaaagatgttcgacaatgagggcgacatcatcgccatttcaacaatatttggattggtcataacatctatcgtaaccaccggctgttcgagctca -# aggatggcaccatttctggcagtaagggtcctggatcagttagcccacgaccatcaacacgagtttcctacctctgcaaagatccagaaagagcagtt -# tcatgtggacgacgtactgacgggagcacataccgaaaaggagctcattcacaatcaaaatgagttaattcaattgatgaaatgtgctggtatggaac -# ttggaaaatgggtttcaaattcatcacgtatcgccgacaaagctctcgcggccaccgacgtacaaagaaaagggtccaattctacagcaaaggttctg -# ggcatttattgggatccagaagaggatatgttatccaacaaggtctgcctcacaacaaatccggacaacaccaaacgccaagtgctgtcagatgtggg -# acgcatctttgacccgctgggtattctgtcgccagtggtggtgcggtttaaaattttgttccaagaattgtggctgctcgatctcggctgggacacgg -# 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TKLILEYEHISNLHPGVSALFVIAPQKYWILGARNLIRNLVHSCIKCFYQPIHLELATDPSADSYLACLRRFMSLRGKCSQIFSNNEPNFVGAKRTLD -# EMQQLFSSQEHQRNVTQSLANGGIKWSFIPPHSPRWGGKWESSVRSVKLHLRRVVGKNVLTFEQMQTVIAQISAMVNSAAMLHT] -# end gene contig32.g49 -### -# start gene contig32.g50 -contig32 AUGUSTUS gene 9315 31071 0.09 - . contig32.g50 -contig32 AUGUSTUS transcript 9315 31071 0.09 - . contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 9315 9325 0.27 - 2 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 9382 9437 0.39 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 19927 22118 0.81 - 0 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 24947 25309 0.99 - 0 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 25407 25572 0.98 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 26120 26752 0.96 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; -contig32 AUGUSTUS CDS 29696 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cagtaacaacagcaacgagtgatattttgaataatgatcgaagggcttctttatgggcgcctcaccatgaccagtcgaggcaaacgcagcagcagtcg -# agtgagcctaagcaagagcctaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagcaccagcagcagccaccttctcaacatcc -# catggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatgaacggcagcaaattcatcaacaccagc -# atcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgaggagcctagcacagcgtttaaattaacg -# ctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaacaccaaattctcatagctcttccacaca -# ctctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccgatgagcttggattagcaaagaaccttc -# ttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacccagacacatctcgagctgagtggagac -# acacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattccccagtcaatcgacctatggagacggt -# aactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccctaagcggagaattataccaacacaccc -# atcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaaaaaaggggtcgcaaaaaaaagttggtg -# gctgacagtactcagatatcaacaccatcgagtcaacaagaaatgtctgccatgactgcaatttgcgaagatggtggtgttgatcacataaaagccat -# gaaaccaaaggaacgcaagaagcatgacagattcaatggaatgtctgaggacgaagtaattaaacggactattcccgatcacctgtgtgataacctcg -# atatcgttatagtaggaataaatcctggattgtttgctgcatataaaggtcaccactacgcaggaccaggaaatcacttctggaagtgtctttacttg -# gcaggacttactcaggagcagatgagtgccgatgaagaccacaaattgctaaagcaaggaattggatttactaacatggtcgcgagagccactaaggg -# gtcagctgacctcacaagaaaggaaataaaagagggcagccgaattttgctggaaaagcttcaaagatttcggccaaaagtagccgtttttaatggca -# aacttatttttgaggtgttttctggaaagaaggagtttcactttggtcggcaacctgatctcgttgatggcactgacacatacatttgggtgatgcca -# tcatcatcagcacgatgcgcacagttgcctcgcgctgccgacaaagttcccttttatgcggccctaaagaagtttcgggattttctaaacgggttgat -# accccacatcgatgagtccgaatgcgtgtttacagaccagcgaattcgacagtgtagcgagcagcaacaagttgaaaccagcggaaaaaataaacaaa -# 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----- prediction on sequence number 33 (length = 40016, name = contig33) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 33 on both strands -# start gene contig33.g51 -contig33 AUGUSTUS gene 4558 16069 0.21 - . contig33.g51 -contig33 AUGUSTUS transcript 4558 16069 0.21 - . contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 4558 4630 0.27 - 1 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 4925 7116 0.72 - 0 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 9945 10307 0.99 - 0 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 10405 10570 1 - 1 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 11118 11750 0.96 - 1 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 14694 14962 0.86 - 0 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS CDS 15284 16069 0.82 - 0 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -contig33 AUGUSTUS start_codon 16067 16069 . - 0 transcript_id "contig33.g51.t1"; gene_id "contig33.g51"; -# coding sequence = [atggcatcaaagcgtgatgtcagcttggcacagtcagatgggacagtgccgacggtgccattgacgccatcaaccccat -# acttaagtagttcagaaagtggcaacaatgaacaaggcaaatatatatctggcctgccgaataatcgtaaacgcctgaagctgtccactcttgaacta -# aacagcagccagggcagtgatgtggacagtccgattgagccagatttggatccgaatgcaagaatctcagaaagtaaggcggatgattatgctgatat -# ggaaaatcatctcccaggcaattgcaacagcgtcattgaaggggcatcatctggggacatctcaaagataaaaggtccagaaaaattagttcaattcg -# aaaagaactgctatgtgcccccggatcaggcgctggttactagtgtggaattggtagttccagctcctcagaactcatcgttaagcatacaggttggg -# cgctccgaggagacaaaacaaagcgcccttagagaaccctcggaagcttcgtcatcgaccattgataacaaactgcagtatagtacgtctggtcctta -# caactctagtagctccacaaatatattagcaaacgataaaatcgatggttgtgcaaatgactcttccaatttgaacttaagaactcctactaagttag -# cagtaacaacagcaacgagtgatattttgaataatgatcgaagggcttctttatgggcgcctcaccatgaccagtcgaggcaaacgcagcagcagtcg -# agtgagcctaagcaagagcctaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagcaccagcagcagccaccttctcaacatcc -# catggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatgaacggcagcaaattcatcaacaccagc -# atcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgaggagcctagcacagcgtttaaattaacg -# ctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaacaccaaattctcatagctcttccacaca -# ctctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccgatgagcttggattagcaaagaaccttc -# ttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacccagacacatctcgagctgagtggagac -# acacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattccccagtcaatcgacctatggagacggt -# aactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccctaagcggagaattataccaacacaccc -# atcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaaaaaaggggtcgcaaaaaaaagttggtg -# 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catcatcatgcccctcacttaatgggcgctataggggcgaacattaacaactcagagcccaatccgcatcacctttcccatcctcatccacctcctca -# ctcacatccgcatacaattcatccctcacatcatctgagcgtatttgatcacttgaaaccgtccgacataagtgggtacggcggtttttga] -# protein sequence = [MASKRDVSLAQSDGTVPTVPLTPSTPYLSSSESGNNEQGKYISGLPNNRKRLKLSTLELNSSQGSDVDSPIEPDLDPN -# ARISESKADDYADMENHLPGNCNSVIEGASSGDISKIKGPEKLVQFEKNCYVPPDQALVTSVELVVPAPQNSSLSIQVGRSEETKQSALREPSEASSS -# TIDNKLQYSTSGPYNSSSSTNILANDKIDGCANDSSNLNLRTPTKLAVTTATSDILNNDRRASLWAPHHDQSRQTQQQSSEPKQEPNSPLFGTHQSDH -# IQRQHQQQPPSQHPMECHANLHQSASISQQHEQHLQHERQQIHQHQHQPTQQHHPLHENYHDIIMEEFHEEPSTAFKLTLSPSNAKPENQDDGYETSA -# GDVLTPNSHSSSTHSVTPQHQMQHPNIVLIHQNQKKPDELGLAKNLLTGEAHADPATCSSNGIQGQLHATQTHLELSGDTRCSSHTSAVNPYSFMGEE -# MRMHSPVNRPMETVTTETARYASVPAPMSTSNGNQESLSGELYQHTHHSTSILEPTESSQCDLHSKPTPKKRGRKKKLVADSTQISTPSSQQEMSAMT -# AICEDGGVDHIKAMKPKERKKHDRFNGMSEDEVIKRTIPDHLCDNLDIVIVGINPGLFAAYKGHHYAGPGNHFWKCLYLAGLTQEQMSADEDHKLLKQ -# GIGFTNMVARATKGSADLTRKEIKEGSRILLEKLQRFRPKVAVFNGKLIFEVFSGKKEFHFGRQPDLVDGTDTYIWVMPSSSARCAQLPRAADKVPFY -# AALKKFRDFLNGLIPHIDESECVFTDQRIRQCSEQQQVETSGKNKQTHQTSLGDPQASLTFVGNCGGTSTGATECGNVTEEADDKLMPHLTGKMSFSN -# TATDRGTFSFTGDDRSMLPITNHNTAPNESTYLSVFGAQQTLPQQPIEKKKRGRPKKIKGQEIIDHSVGGKISIGGQHMPQHDFNNILNLSVIPAGGC -# IETPKKKRGRPKKIKPAIDNILSVKQLQHGNSNPNTTTGLSVNSMHPLSMEHIAASPQSSHQMPPSLYNTPPPSHLLYNASASPMASPALNCNYNQVH -# GHGTPPVGHATPVAQGSSPNIDPQNEHLTPQKQNQQGNMEAGLDMREHPHLGETPPPSSPNMCPAVDFDPPNEHSDPQVGAGEPNKTVELGHQQPPTV -# EKDQYGSPAHDAEANIAHPSEHYQQWASPHNQQSLQPAQKVTHQHLHHPIQHFQQEQSDNWQRYEQHNSNPYMLISAHHQNLSPRVGNQTQHNTPQPG -# HIVSDVSRKSLCGLESLVDQIPAIREHECSNIPLATAAAAAAAVESRLLGLQQQQQHQQQQQQQQQEQQHIQQQQQQSQQQHQQQQQHQQQHQQPKRC -# IPENSVQTESCRPSRENSNVSNNNFSVSSLAASALTARTENEAIYGNSGETRVISESSNSNNNNCGNSIEYSIHSPSGYHHHAPHLMGAIGANINNSE -# PNPHHLSHPHPPPHSHPHTIHPSHHLSVFDHLKPSDISGYGGF] -# end gene contig33.g51 -### -# start gene contig33.g52 -contig33 AUGUSTUS gene 25242 27266 0.36 + . contig33.g52 -contig33 AUGUSTUS transcript 25242 27266 0.36 + . contig33.g52.t1 -contig33 AUGUSTUS start_codon 25242 25244 . + 0 transcript_id "contig33.g52.t1"; gene_id "contig33.g52"; -contig33 AUGUSTUS CDS 25242 25284 0.92 + 0 transcript_id "contig33.g52.t1"; gene_id "contig33.g52"; -contig33 AUGUSTUS CDS 25334 25396 0.9 + 2 transcript_id "contig33.g52.t1"; gene_id "contig33.g52"; -contig33 AUGUSTUS CDS 25460 25572 0.99 + 2 transcript_id "contig33.g52.t1"; gene_id "contig33.g52"; -contig33 AUGUSTUS CDS 27141 27266 0.63 + 0 transcript_id "contig33.g52.t1"; gene_id "contig33.g52"; -# coding sequence = [atgtccgatttgggaagcggagatgaaggcatctcaggatcaaaatacaatgtcacaaacatagagggttcctcaagta -# ggaacgatttcgaatcctctgtaaaaggtggaagtggtgtggagcaggaattggctaccaaaatgcttcaaatacaatccaagcgattttatttggat -# gttaaacaaaatcggagaggtcgttttataaaagtggctgaggtgtcacaaaccattactagaggtggacctagatcgcaaatcgctttaccagccca -# aggcatgatcgagttccgtgatgcccttacagatttgttagaagagtttggagctaacgatggagggtaa] -# protein sequence = [MSDLGSGDEGISGSKYNVTNIEGSSSRNDFESSVKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEVSQTI -# TRGGPRSQIALPAQGMIEFRDALTDLLEEFGANDGG] -# end gene contig33.g52 -### -# start gene contig33.g53 -contig33 AUGUSTUS gene 33454 37281 0.72 - . contig33.g53 -contig33 AUGUSTUS transcript 33454 37281 0.72 - . contig33.g53.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 33454 34143 1 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS CDS 34200 34387 1 - 2 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS CDS 36532 36733 1 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS CDS 36795 36904 1 - 2 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS CDS 36967 37091 0.99 - 1 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS CDS 37184 37281 0.72 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -contig33 AUGUSTUS start_codon 37279 37281 . - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; -# coding sequence = [atggcgttcgccaatatttcgaggcgatttctaattccgggggtgtcccacttgaagctgcgaacgcaacttattccaa -# caggctcaagcgcgttaagtgggcatgaaagtcgccgtggagctgcaaaatggtacccagatcctgagttcatgaagcagtttagcggccctgtgatg -# tatcctgatgaggtgacatcgctttggaaagtacccccatggaacagcaaggttacgcctgtcgagaagtcagtgcgtaacttgaccctaaactttgg -# tccccaacatcccgcggcccatggagttctgcgcctggtactggagctggatggagagactgtgatgcgtgccgatccgcacatcggactgctgcacc -# gcggcacagagaagctcatcgagtacaagacgtacacccaggcactgccatatttcgatcggctagattacgtatccatgatgtgcaacgaacagtgc -# tattctctggctgtggaaaagcttctcaacatcgaggtgcccctgcgagcaaagtatattcgaactctgtttgccgagatcactcgaatcctgaacca -# tataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaacgccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgaga -# gagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtggtgtatcattggacatgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgca -# tcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgttgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcaga -# ggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcgaggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctgg -# tagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgctacgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaa -# tgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacgatgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttat -# ccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcctcccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtatacctta -# tatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaaagcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgctt -# gctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagtttttggggagatagatcgataa] -# protein sequence = [MAFANISRRFLIPGVSHLKLRTQLIPTGSSALSGHESRRGAAKWYPDPEFMKQFSGPVMYPDEVTSLWKVPPWNSKVT -# PVEKSVRNLTLNFGPQHPAAHGVLRLVLELDGETVMRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIEVPLRAKY -# IRTLFAEITRILNHIMAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLDMPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRI -# WVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYHLVDFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNKMPAGEIKTDDAKVAP -# PSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR] -# end gene contig33.g53 -### -# -# ----- prediction on sequence number 34 (length = 50012, name = contig34) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 34 on both strands -# start gene contig34.g54 -contig34 AUGUSTUS gene 230 2254 0.39 + . contig34.g54 -contig34 AUGUSTUS transcript 230 2254 0.39 + . contig34.g54.t1 -contig34 AUGUSTUS start_codon 230 232 . + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; -contig34 AUGUSTUS CDS 230 272 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; -contig34 AUGUSTUS CDS 322 384 0.95 + 2 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; -contig34 AUGUSTUS CDS 448 560 0.95 + 2 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; -contig34 AUGUSTUS CDS 2129 2254 0.6 + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; -# coding sequence = [atgtccgatttgggaagcggagatgaaggcatctcaggatcaaaatacaatgtcacaaacatagagggttcctcaagta -# ggaacgatttcgaatcctctgtaaaaggtggaagtggtgtggagcaggaattggctaccaaaatgcttcaaatacaatccaagcgattttatttggat -# gttaaacaaaatcggagaggtcgttttataaaagtggctgaggtgtcacaaaccattactagaggtggacctagatcgcaaatcgctttaccagccca -# aggcatgatcgagttccgtgatgcccttacagatttgttagaagagtttggagctaacgatggagggtaa] -# protein sequence = [MSDLGSGDEGISGSKYNVTNIEGSSSRNDFESSVKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEVSQTI -# TRGGPRSQIALPAQGMIEFRDALTDLLEEFGANDGG] -# end gene contig34.g54 -### -# start gene contig34.g55 -contig34 AUGUSTUS gene 8442 12269 0.69 - . contig34.g55 -contig34 AUGUSTUS transcript 8442 12269 0.69 - . contig34.g55.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 8442 9131 0.96 - 0 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; -contig34 AUGUSTUS CDS 9188 9375 1 - 2 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; -contig34 AUGUSTUS CDS 11520 11721 1 - 0 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; -contig34 AUGUSTUS CDS 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tataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaacgccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgaga -# gagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtggtgtatcattggacatgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgca -# tcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgttgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcaga -# ggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcgaggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctgg -# tagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgctacgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaa -# tgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacgatgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttat -# ccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcctcccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtatacctta -# tatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaaagcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgctt -# gctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagtttttggggagatagatcgataa] -# protein sequence = [MAFANISRRFLIPGVSHLKLRTQLIPTGSSALSGHESRRGAAKWYPDPEFMKQFSGPVMYPDEVTSLWKVPPWNSKVT -# 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-contig34 AUGUSTUS CDS 31647 31816 0.76 + 2 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -contig34 AUGUSTUS CDS 31870 31988 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -contig34 AUGUSTUS CDS 32298 32363 0.93 + 1 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -contig34 AUGUSTUS CDS 33140 33614 0.69 + 1 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -contig34 AUGUSTUS CDS 33680 33778 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -contig34 AUGUSTUS CDS 33859 33888 0.75 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; -# coding sequence = [atgtcagcgaatgttgagggtattcctagagctcgaaatcgggcaccagctactacgaataatcaacaaccagctatgc -# atcgaaagactaaaagcaaaagcaagcttgaaacatcaaaaaactttttcacgctacattcatcaaatgatagtgataaatatccatccgcagagaaa -# tcatcggcattagtggaaacagttgaaaaatgtaaaggaacttcttcgggaataggagtaaagacttcgcagcatttccaaattacaaaaaaccagag -# 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LGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYNECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEG -# LQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLRMAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQ -# ATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] -# end gene contig34.g56 -### -# start gene contig34.g57 -contig34 AUGUSTUS gene 39193 45655 0.2 - . contig34.g57 -contig34 AUGUSTUS transcript 39193 45655 0.2 - . contig34.g57.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 39193 39600 0.8 - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; -contig34 AUGUSTUS CDS 41289 41467 0.85 - 2 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; -contig34 AUGUSTUS CDS 42321 43243 0.26 - 1 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; -contig34 AUGUSTUS CDS 43929 45655 0.33 - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; -contig34 AUGUSTUS start_codon 45653 45655 . - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; -# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg -# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg -# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc -# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg -# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat -# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga -# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg -# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat -# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat -# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc -# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc -# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga -# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta -# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca -# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc -# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct -# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac -# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca -# ccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagatctcggcttaacatgccgcctgagc -# ggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaagcacggcaacggaagcgttgttagt -# ctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccggactcaaactgaatgagcgactgtc -# cccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcccgaacatccacggtaccccgcact -# cagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaagatttctgtccctgcctcgccaaaa -# tcgtccgtaacctgtgcgggcggaggatcgagccgcaatggacacaccagcgacatggaggagatcaacacgaaagatctggctcagcgcatctcggc -# agaactgaaacggtacagcattccacaggcgatctttgcacagcgtgttctctgtcgctcgcaaggtactttgtccgatctactgcgcaacccgaagc -# cgtggtcgaagctcaagtccggcagggagacatttcgaaggatgtacaaatggctccaggagcccgagtttcagcgtatgtctgctctacggatggcc -# gctgcacaaattcctcagcgaactttggggcctgggctggcacttggaccaacaacgggctccacatccgtcataccgaccgatttggattctcatgc -# cgggccagcaatgacaccaaatgctccgcccaatgaatcggcctcttcgtctgcatctacacctgtcacaaacgtgtccgttgcgaacgtcgttagtt -# gtcgtcgaaaggaagagcctcagatcgagcaaatgcctcagccaaaaaaaccacgactggtctttaccgatcttcaacgacgaacactacaagctatt -# ttcaaagagaccaaaagaccttcgaaggagatgcaagtgacgatcgcgcggcagctgggactagagcctacaacagtaggcaatttctttatgaacgc -# acgtcggagatcgatggataagtggcgggacgacgactccaaaaccagcatgcatttatcgcatagccgccaacaacaacgggacgagcaggaagagg -# acgagagccacagtcaaagtcagattcaaattcagagccataatccggctagcttaacacaggaaaactactccagtctacatacaacggccatgtcg -# cctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgaccatggagataccaatga -# tccaaactgcgacatgttgtga] -# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS -# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK -# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE -# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA -# 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[MEGCTRVSELLCKRYSDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKIERGR -# RLYEQNNQTEAVRTWRSALKGTCQPEDCFQLLGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYN -# ECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEGLQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLR -# MAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] -# end gene contig35.g58 -### -# start gene contig35.g59 -contig35 AUGUSTUS gene 14188 20650 0.27 - . contig35.g59 -contig35 AUGUSTUS transcript 14188 20650 0.27 - . contig35.g59.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 14188 14595 0.87 - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; -contig35 AUGUSTUS CDS 16284 16462 0.91 - 2 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; -contig35 AUGUSTUS CDS 17316 18238 0.29 - 1 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; -contig35 AUGUSTUS CDS 18924 20650 0.38 - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; -contig35 AUGUSTUS start_codon 20648 20650 . - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; -# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg -# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg -# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc -# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg -# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat -# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga -# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg -# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat -# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat -# 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+ . contig35.g60.t1 -contig35 AUGUSTUS start_codon 24546 24548 . + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 24546 24620 0.37 + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 31579 31759 0.75 + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 34131 34616 0.7 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 36623 37510 0.24 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 37571 37747 0.97 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 44148 44276 0.96 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -contig35 AUGUSTUS CDS 44340 44473 0.17 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; -# coding sequence = [atgaacgcaatagtcgagtgcctcgactatcagcctaagagatcaaaaaagaaagttggtgttcatgcaaataaatggg -# 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contig35.g60 -### -# -# ----- prediction on sequence number 36 (length = 45010, name = contig36) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 36 on both strands -# start gene contig36.g61 -contig36 AUGUSTUS gene 6039 42763 0.02 + . contig36.g61 -contig36 AUGUSTUS transcript 6039 42763 0.02 + . contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS start_codon 6039 6041 . + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 6039 6053 0.37 + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 0.93 + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9609 0.76 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 0.27 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 12564 12740 0.92 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; -contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 0.99 + 2 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contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS start_codon 8638 8640 . + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -contig37 AUGUSTUS CDS 8638 8643 0.95 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -contig37 AUGUSTUS CDS 8701 8987 0.52 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -contig37 AUGUSTUS CDS 11885 12254 0.97 + 1 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -contig37 AUGUSTUS CDS 12316 12519 0.99 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -contig37 AUGUSTUS CDS 12580 12756 0.79 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; -# coding sequence = [atgaagttggttaaaattgaacagctccccgaacgcggatcatggtcatccaaaatggatttcatactatctgtagtag -# gtctagcaattggcttgggaaatgtttggcgatttccttatttgtgctataaaaatggaggaggcgcatttatattaccgtacatcataacgttgttc -# ctagctggaattccaatgttttttatggagttagctcttggtcaaatgttgacaattggtggtcttggtgtatttaaaattgcacccatatttaaagg -# 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acatatttgccaatactggcaaaaactcaccgactgatttgccgccactaagtttatcgtcgtctacatggagttttaatcccaaccaaaatttccca -# agttggtctgataacagtcagcaatgtgccgcaacttctgagctttggacaagccccctaaataaatcgtcatcacgtggtccgccgcctggattgac -# ggccaattcaaataaatctggtaacggaggaaatagtagtacgtcaacaacatctactattacgggtggtgctaatggttggctacaggctagaagcg -# gcggtgttcaaacaacaaattcaacttggactggtaacaatacctcttggggctctagttggttgcttcttaaaaatctaacagctcagattgatggt -# tctactttacgcacattgtgtatgcagcatggcccccttcttagctttcacctatatttgaaccaaggaattgccttatgtaaatataccactcgaga -# ggaggcgaacaaagcgcaaatggcgttaaacaactgtgtcctcgccaacaccactatatttgctgaatctccaagcgagaacgaggtacagaacataa -# tgcagcacttaccgcaaacaccatcgtctgcaagctgtactggaactagtgctggtaacggcggaggcgtcagcactccacccaatagtgggctcagt -# agctcaggatctaatctatccggaaacaatagcaacggcaatggtaacggcaatggaagcagcagcgccagtggtggcgtttccggcaataatggtaa -# caacagtggaaacaccagttgcgccggcggcagcaacccgaacaccagtgtggcaacttcgaatctacttaattctagtggagggtctgtctcaaatt -# catccggtggtgctgctagctctggtacaggctctggagtaagtggaacagcgagtggtgctatattttcaaacaaacccggagaatataactcggag -# ttggcgtttagatacgctgttcacaggctaaatctggataaaagtctcttgcctgagacaaccgttgaatactacattgaatatgtaaatcgattgga -# ttcgtttgaggcagttcaaaaggcgtgcaaacttgtcggtgttggtgttcaagctgtttttagcccaactgactcggttttggcgacccatataaatt -# caatttgtgatgctctggacataccaagtatagggcggtctgctcatgacttttctattaacgtgtatccatcccagcaatatataaaccaagcgttt -# aatgatgtaatacactatctgaattggacccgatttggaattctgcatgaaaaagaatatgaaacctatgatctagaagattttaaatacaattttgt -# aaacataacatcatttcgattggtcgacattggagatgtaggtgtaaagcagattttaaaggacctccaatcatatagtcaccatatgattcagaaat -# catttttgaatccgcatgaaagaaaatccattgccctggagtcagagccagctttaatgtttgattctgtgtacgtttttgctattggattgcagaca -# ttggagcaatcacataccttaaatctattgaacatgacctgcgatgcggaaattccatggaacggaggcctaagcttaattaattacttaaatgcggt -# tgaatggaaaggtcttaccggtcctattcaatttaaagaaggaaaacgagtacaatttaaattggacttaataaagctaaaacaacactccattgtaa -# aagtcggagaatggacccctcatggacatcttaacataaccgaaccatcaatgttttttgattctggttccatgaatgtgactctggtagtcataaca -# atactggaaactccctatgtaatgatgcactacggcaagaattttacgggcaacgaaagattttatgggttttgcgttgacatattggaaaccatttc -# tcatgaggttgggtttgactacatactggatttggtaccggatagaaagtatggcgccaaagatccggaatctgctgcctttcttacaactgaacgta -# tgattaaccccatcgaaaacgcagaagacttggcatcacaaacggagatatcttatggcactttggatagcggatctactatgactttttttcgggac -# tcaatgattgaaacctacaaaaaaatgtggagaagcatggacaataagaaaaccacagcgtttaccagtacatatgaggatggtataaagcgggttaa -# tcagggtaattacgcctatttgatggaatccaccatgcttgattatatcgttcaacgagattgtaatttaacgcaaataggcggattgttggatacaa -# aaggatatggaatcgctacaccaaaaggttcgccttggcgggataaaatttcgttggctatacttgagctccaggaaaaaggtgatattcaaatgttg -# tatgataaatggtggaaaaacacagatgaaacttgcattcggcgaagcacaatcaaacaatcaaaagcaaatgcgcttgggctggagagcatagagcg -# tattatgattcccgttagaagtttgcaacgcagtgaaggagacgttttcgaacccctagaataa] -# protein sequence = [MREALFSQDGWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSS -# NLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGSGSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDP -# REIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSSSDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSG -# IGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGVSGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSG -# GIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQTRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLA -# QNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSGWSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKED -# VERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDGWRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQ -# KYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQNTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIHTWSTGRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAA -# TAYTDLVQEFEPGKPWKIKSIEDDPSITPGSVARSPLSISSTPKDADIFANTGKNSPTDLPPLSLSSSTWSFNPNQNFPSWSDNSQQCAATSELWTSP -# LNKSSSRGPPPGLTANSNKSGNGGNSSTSTTSTITGGANGWLQARSGGVQTTNSTWTGNNTSWGSSWLLLKNLTAQIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLY -# LNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVSTPPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNG -# SSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGVSGTASGAIFSNKPGEYNSELAFRYAVHRLNLDKSLLPE -# TTVEYYIEYVNRLDSFEAVQKACKLVGVGVQAVFSPTDSVLATHINSICDALDIPSIGRSAHDFSINVYPSQQYINQAFNDVIHYLNWTRFGILHEKE -# YETYDLEDFKYNFVNITSFRLVDIGDVGVKQILKDLQSYSHHMIQKSFLNPHERKSIALESEPALMFDSVYVFAIGLQTLEQSHTLNLLNMTCDAEIP -# WNGGLSLINYLNAVEWKGLTGPIQFKEGKRVQFKLDLIKLKQHSIVKVGEWTPHGHLNITEPSMFFDSGSMNVTLVVITILETPYVMMHYGKNFTGNE -# RFYGFCVDILETISHEVGFDYILDLVPDRKYGAKDPESAAFLTTERMINPIENAEDLASQTEISYGTLDSGSTMTFFRDSMIETYKKMWRSMDNKKTT -# AFTSTYEDGIKRVNQGNYAYLMESTMLDYIVQRDCNLTQIGGLLDTKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGDIQMLYDKWWKNTDETCIRRSTIK -# QSKANALGLESIERIMIPVRSLQRSEGDVFEPLE] -# end gene contig37.g63 -### -# start gene contig37.g64 -contig37 AUGUSTUS gene 48349 49385 0.52 + . contig37.g64 -contig37 AUGUSTUS transcript 48349 49385 0.52 + . contig37.g64.t1 -contig37 AUGUSTUS start_codon 48349 48351 . + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; -contig37 AUGUSTUS CDS 48349 48396 0.86 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; -contig37 AUGUSTUS CDS 48508 49026 0.9 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; -contig37 AUGUSTUS CDS 49314 49385 0.56 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; -# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt -# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa -# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc -# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc -# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg -# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagat -# cactgaggatggaggtacactcagtggcgaagcgcaccagaaagtgtgcaaagaaaactactgtatataa] -# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES -# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH -# LFEQCLEPEIDIEITEDGGTLSGEAHQKVCKENYCI] -# end gene contig37.g64 -### -# -# ----- prediction on sequence number 38 (length = 50017, name = contig38) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 38 on both strands -# start gene contig38.g65 -contig38 AUGUSTUS gene 3825 26473 0.01 - . contig38.g65 -contig38 AUGUSTUS transcript 3825 26473 0.01 - . contig38.g65.t1 -contig38 AUGUSTUS CDS 3825 3892 0.69 - 2 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 3950 4138 0.59 - 2 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 5479 5680 0.58 - 0 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 5744 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20229 0.93 - 1 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 22556 22833 0.2 - 0 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 24008 25485 0.93 - 2 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS CDS 26038 26473 0.85 - 0 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -contig38 AUGUSTUS start_codon 26471 26473 . - 0 transcript_id "contig38.g65.t1"; gene_id "contig38.g65"; -# coding sequence = [atgcgcgaagcgcttttttcccaagatggctggggctgtcaacatgtcaaccaggacaccaattgggaagtccccagtt -# cgccagaaccaaccaataaagatgcggccggaccaccaatgtggaagccaagcatcaacaatggaactgatctttgggaatccaatttaagaaacggt -# ggtcagccgaccgctcagcaagttccaaagccttcgtggggtcatacgccatcctctaatctaggcggaacgtggggagaggacgatgatggggccga -# cagcagtagtgtgtggacaggaggatcggttaacaacgccgggtctggatcggcagtgggagtgaaccaaggcggtgttaatgttggcccaggtggtg -# tagtctcatctggaggtcctcagtggggacaaggtgtggttggcgtcggactagggtcaactggtaacggatcaagcaatttatctggttcgactgga -# gttgtcgcaggtggcagcggaaactcaagcaatactggcaatggttggggagaccctcgcgaaattcgacctttagctggaggtggatctatggatat -# tcgaaacgttgatcatcgcggaggtaacggttcagggggatcttcgagcgatccccgcgacatccgaatgatcgatccacgggatccaattcgaggag -# atcctcgtggaatatccggtcggcttaatggaacatcggaaatgtggggccatcatccacaaatgtcgcacaatcaaatacaaaatattaataaaatg -# gttggccaaagcgtggcaactgctggtacgaatgttggaggaacatcaggatctggcatcggaccggggggacctggtcctggacctgtatcgaacaa -# tatcccaacacagtgggggccgtcccaagcggtaggcgttggtgtaagtggccccaaagacatatcgaagcagattagtggatgggaggaaccatcgc -# caccgccccagcgacgcagtattcctaattacgacgatggcacatccctctggggtcagcaaactcgtgttcccggtggaagcggtcactggaaagac -# atgactgattccattggtcgtagtggtcatctgatgcgaggtcaaaaccagtcgggtggcatcggtatcgcaggagttggcaatagcaatgttccagt -# tggagccaatcccaacaaccctttgaacagtgtagttggaccacagactcgcctgccatctgtgggaggcgtgcagcacaagcaagacggaggagcca -# tgtgggtgcattcgaacaatgttagcgccaggaataacgttgctgctgtcgccacttggggagatgacactcacaacgttagtgtgggcgcccccagt -# ggtggtggtgtaaccagcagtaattgggtggatgataaatctaacgccacactggctcaaaattcttggagcgacgcagcaccagttggagttggttg -# ggggaataagcaaagcaaactgccggccactagtacatcatctggttggagcactggagcaggtgtaggtgtggtggacggcgtagatctaggatctg -# aatggaactcacatggagggataattggaaaatctcagcaacagcaaaaactagcgggacttaatgtgggaatggtaaacgttatcaatgcagagatg -# attaagcaaagcaaacaatatcggatccttgttgagaacggatttaaaaaggaagacgtggagcgcgcattagtgactgccaatatgaatatcgaaga -# agcagccgatatgctgcgtaccaacacatctatggctatggatggttggcgtcgacatgatgaatcatcccttggctcatattccgaccacgcgagtt -# caacaagcagcagtgggtttgctggccgttacccagtgagcagtggacagccttcgatgtcttttcctcataataaccttatgaataacatgggtggt -# actgcagttactggaggaggaaacaataatgcaaacatgacagctttgcaagtgcaaaagtatttaaatcaaggtcaacacagcgttgctgtaggacc -# gcaaaacgttggcaacacttcagccgtatccgtcggatttggtcagaacacatcaaacgcagcagtggcagcagcagcttccgcaaatatagcagcaa -# atacaaacaatcaaccatcgggtcaacaaattcgcatgcttggacagcagattcatacatggtcaacaggacgcaacattggggatggttggccagat -# 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agctcaggatctaatctatccggaaacaatagcaacggcaatggtaacggcaatggaagcagcagcgccagtggtggcgtttccggcaataatggtaa -# caacagtggaaacaccagttgcgccggcggcagcaacccgaacaccagtgtggcaacttcgaatctacttaattctagtggagggtctgtctcaaatt -# catccggtggtgctgctagctctggtacaggctctggagtaagtggaacagcgagtggtgctatattttcaaacaaacccggagaatataactcggag -# ttggcgtttagatacgctgttcacaggctaaatctggataaaagtctcttgcctgagacaaccgttgaatactacattgaatatgtaaatcgattgga -# ttcgtttgaggcagttcaaaaggcgtgcaaacttgtcggtgttggtgttcaagctgtttttagcccaactgactcggttttggcgacccatataaatt -# caatttgtgatgctctggacataccaagtatagggcggtctgctcatgacttttctattaacgtgtatccatcccagcaatatataaaccaagcgttt -# aatgatgtaatacactatctgaattggacccgatttggaattctgcatgaaaaagaatatgaaacctatgatctagaagattttaaatacaattttgt -# aaacataacatcatttcgattggtcgacattggagatgtaggtgtaaagcagattttaaaggacctccaatcatatagtcaccatatgattcagaaat -# catttttgaatccgcatgaaagaaaatccattgccctggagtcagagccagctttaatgtttgattctgtgtacgtttttgctattggattgcagaca -# ttggagcaatcacataccttaaatctattgaacatgacctgcgatgcggaaattccatggaacggaggcctaagcttaattaattacttaaatgcggt -# tgaatggaaaggtcttaccggtcctattcaatttaaagaaggaaaacgagtacaatttaaattggacttaataaagctaaaacaacactccattgtaa -# aagtcggagaatggacccctcatggacatcttaacataaccgaaccatcaatgttttttgattctggttccatgaatgtgactctggtagtcataaca -# atactggaaactccctatgtaatgatgcactacggcaagaattttacgggcaacgaaagattttatgggttttgcgttgacatattggaaaccatttc -# tcatgaggttgggtttgactacatactggatttggtaccggatagaaagtatggcgccaaagatccggaatctgctgcctttcttacaactgaacgta -# tgattaaccccatcgaaaacgcagaagacttggcatcacaaacggagatatcttatggcactttggatagcggatctactatgactttttttcgggac -# tcaatgattgaaacctacaaaaaaatgtggagaagcatggacaataagaaaaccacagcgtttaccagtacatatgaggatggtataaagcgggttaa -# tcagggtaattacgcctatttgatggaatccaccatgcttgattatatcgttcaacgagattgtaatttaacgcaaataggcggattgttggatacaa -# aaggatatggaatcgctacaccaaaaggttcgccttggcgggataaaatttcgttggctatacttgagctccaggaaaaaggtgatattcaaatgttg -# tatgataaatggtggaaaaacacagatgaaacttgcattcggcgaagcacaatcaaacaatcaaaagcaaatgcgcttgggctggagagcatagagcg -# tattatgattcccgttagaagtttgcaacgcagtgaaggagacgttttcgaacccctagaataa] -# protein sequence = [MREALFSQDGWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSS -# NLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGSGSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDP -# REIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSSSDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSG -# IGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGVSGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSG -# GIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQTRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLA -# QNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSGWSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKED -# VERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDGWRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQ -# KYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQNTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIHTWSTGRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAA -# 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contig38.g66 -contig38 AUGUSTUS gene 33346 45275 0.29 + . contig38.g66 -contig38 AUGUSTUS transcript 33346 45275 0.29 + . contig38.g66.t1 -contig38 AUGUSTUS start_codon 33346 33348 . + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 33346 33393 0.97 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 33505 34023 0.97 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 37278 37517 0.72 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 37750 38701 0.82 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 40192 40343 0.58 + 2 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -contig38 AUGUSTUS CDS 44952 45275 0.9 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; -# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt -# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa -# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc -# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc -# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg -# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagtc -# gacatgcattgatacgaataaaggtgatatactgtgcaatgattcagaacactgcgaggatgtgtttattagtggcatacaaccggaaagtatagctc -# atagagatgggcgccttcgacagggtgatcaaattcttcgtattaacggcgtggatgttaaaaaccaggaagaggtagaaaatcagatagccgagagt -# agcaccgctgtaacgctcctagttagtcgaattctataccctgaagacgaggatgacgaagacattcattttgaatatgccaattcatttataccaga -# tgactacacaaatgtagtggataaattggataaggtattattaagccacgtacagtcttttgaagaactatcaaatgaaaccggcgagcattcatccg -# acttaaaagttcaaacttcttctctgccagacaaatttgtagaccaatccagcaagttgtgtggtaaaacaaagattcgtccggatgcaatccaaacg -# gataaccaaaaaactttaaagcaatctttaagcaaaaatcaagttcatctccaacatgagtacgacgaaagcgagcacatttacgagactattccaga -# agattctgagtctgaaccactttactgttccccgtatcaaagttcaaacggcaagtcgtcaatgggctgttgttcatccgcaatatcaacgactccgg -# ctgaagtattagaaacgacaatgcagcaacaaactcaacgagttgcacagtggttaggtttaaagccacaatatccgagaactattcacactcttgtt -# ggccgtcctgcgccactaaaattaacccaacaaccaaattgcagtcgtgtttttacattacgcagcacattgacaaacacaagccgatccagcagtag -# tggagttgcttacagtggttatggaccaaataatattcttggtgcaaacttagcttttggcgaagaggttgataactcctcaagtgcctataatactg -# gtggctcaaacaatagcgcctcgccgcatcaaaatactacaaatgctgatgatgatatcactgccaaccacaatctagagagcagagtgatcgatggc -# cgcagggaagctttagatacaactgctgtaagcagtatgttgcttttaccttttggtaaatccggtcgaatcggtctctgttcttcgaacatgtccac -# atcgtatgtcaacgagaaacaaggcaaggcaacctacgaaagtcaaattctcgttaaaagcaaccacaacgtattaggagtcaaacaaactgaggaat -# catatagccattgtccccagtttaacgcacccaatttgagtagctaccacttcgtaagtagtcaagaggttgcaaaccggtgtcatgattccacaaat -# tcaaaaccaaattctgcattgcttaacaatgaaaatagtgaagaaataccaatggtttggaaggttaagcggcgcccagatggaacgcgatacattgt -# aaagcggccagtacgtaatcgcccccaagttgctattcgaaaaaatgtgcgatgcaacgaacttacaacaacggaggaggatacagtatctgaagtaa -# aaattggtcgttattggacaaaggaagaacgaaagcgacacattgaacgagctcgagagaggcgtcaccatcagacacagcaacaacagctacagtaa] -# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES -# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH -# LFEQCLEPEIDIESTCIDTNKGDILCNDSEHCEDVFISGIQPESIAHRDGRLRQGDQILRINGVDVKNQEEVENQIAESSTAVTLLVSRILYPEDEDD -# EDIHFEYANSFIPDDYTNVVDKLDKVLLSHVQSFEELSNETGEHSSDLKVQTSSLPDKFVDQSSKLCGKTKIRPDAIQTDNQKTLKQSLSKNQVHLQH -# EYDESEHIYETIPEDSESEPLYCSPYQSSNGKSSMGCCSSAISTTPAEVLETTMQQQTQRVAQWLGLKPQYPRTIHTLVGRPAPLKLTQQPNCSRVFT -# LRSTLTNTSRSSSSGVAYSGYGPNNILGANLAFGEEVDNSSSAYNTGGSNNSASPHQNTTNADDDITANHNLESRVIDGRREALDTTAVSSMLLLPFG -# KSGRIGLCSSNMSTSYVNEKQGKATYESQILVKSNHNVLGVKQTEESYSHCPQFNAPNLSSYHFVSSQEVANRCHDSTNSKPNSALLNNENSEEIPMV -# WKVKRRPDGTRYIVKRPVRNRPQVAIRKNVRCNELTTTEEDTVSEVKIGRYWTKEERKRHIERARERRHHQTQQQQLQ] -# end gene contig38.g66 -### -# -# ----- prediction on sequence number 39 (length = 45019, name = contig39) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 39 on both strands -# start gene contig39.g67 -contig39 AUGUSTUS gene 1642 11470 0.04 - . contig39.g67 -contig39 AUGUSTUS transcript 1642 11470 0.04 - . contig39.g67.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 1642 2430 0.33 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 4470 4752 0.96 - 1 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 4821 5008 0.59 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 5076 5226 0.89 - 1 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 7553 7830 0.21 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 9005 10482 0.94 - 2 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS CDS 11035 11470 0.77 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -contig39 AUGUSTUS start_codon 11468 11470 . - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; -# coding sequence = [atgcgcgaagcgcttttttcccaagatggctggggctgtcaacatgtcaaccaggacaccaattgggaagtccccagtt -# cgccagaaccaaccaataaagatgcggccggaccaccaatgtggaagccaagcatcaacaatggaactgatctttgggaatccaatttaagaaacggt -# ggtcagccgaccgctcagcaagttccaaagccttcgtggggtcatacgccatcctctaatctaggcggaacgtggggagaggacgatgatggggccga -# cagcagtagtgtgtggacaggaggatcggttaacaacgccgggtctggatcggcagtgggagtgaaccaaggcggtgttaatgttggcccaggtggtg -# tagtctcatctggaggtcctcagtggggacaaggtgtggttggcgtcggactagggtcaactggtaacggatcaagcaatttatctggttcgactgga -# 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ggtggtggtgtaaccagcagtaattgggtggatgataaatctaacgccacactggctcaaaattcttggagcgacgcagcaccagttggagttggttg -# ggggaataagcaaagcaaactgccggccactagtacatcatctggttggagcactggagcaggtgtaggtgtggtggacggcgtagatctaggatctg -# aatggaactcacatggagggataattggaaaatctcagcaacagcaaaaactagcgggacttaatgtgggaatggtaaacgttatcaatgcagagatg -# attaagcaaagcaaacaatatcggatccttgttgagaacggatttaaaaaggaagacgtggagcgcgcattagtgactgccaatatgaatatcgaaga -# agcagccgatatgctgcgtaccaacacatctatggctatggatggttggcgtcgacatgatgaatcatcccttggctcatattccgaccacgcgagtt -# caacaagcagcagtgggtttgctggccgttacccagtgagcagtggacagccttcgatgtcttttcctcataataaccttatgaataacatgggtggt -# actgcagttactggaggaggaaacaataatgcaaacatgacagctttgcaagtgcaaaagtatttaaatcaaggtcaacacagcgttgctgtaggacc -# gcaaaacgttggcaacacttcagccgtatccgtcggatttggtcagaacacatcaaacgcagcagtggcagcagcagcttccgcaaatatagcagcaa -# atacaaacaatcaaccatcgggtcaacaaattcgcatgcttggacagcagattcatacatggtcaacaggacgcaacattggggatggttggccagat -# 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agctcaggatctaatctatccggaaacaatagcaacggcaatggtaacggcaatggaagcagcagcgccagtggtggcgtttccggcaataatggtaa -# caacagtggaaacaccagttgcgccggcggcagcaacccgaacaccagtgtggcaacttcgaatctacttaattctagtggagggtctgtctcaaatt -# catccggtggtgctgctagctctggtacaggctctggagtaagtggaacagcgagtggtaataccattaatggtggaacaggacctgcaaacactgct -# ggctcaaagagtagtgcaaacaatgtaactatagctggtgttcagtctagcgcttcaagcctagctaatagcaccaactcaacatggcgtcaaactag -# ccaaaaccaagctcttcagggtcaaagcaggccatcaggaagggaagctgactttgattatatatctctcgtttattccattgttgatgactaa] -# protein sequence = [MREALFSQDGWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSS -# NLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGSGSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDP -# REIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSSSDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSG -# IGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGVSGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSG -# 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transcript 18343 30272 0.16 + . contig39.g68.t1 -contig39 AUGUSTUS start_codon 18343 18345 . + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 18343 18390 0.93 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 18502 19020 0.99 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 22275 22514 0.72 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 22747 23698 0.81 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 25189 25340 0.52 + 2 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -contig39 AUGUSTUS CDS 29949 30272 0.53 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; -# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt -# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa -# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc -# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc -# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg -# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagtc -# gacatgcattgatacgaataaaggtgatatactgtgcaatgattcagaacactgcgaggatgtgtttattagtggcatacaaccggaaagtatagctc -# atagagatgggcgccttcgacagggtgatcaaattcttcgtattaacggcgtggatgttaaaaaccaggaagaggtagaaaatcagatagccgagagt -# agcaccgctgtaacgctcctagttagtcgaattctataccctgaagacgaggatgacgaagacattcattttgaatatgccaattcatttataccaga -# tgactacacaaatgtagtggataaattggataaggtattattaagccacgtacagtcttttgaagaactatcaaatgaaaccggcgagcattcatccg -# acttaaaagttcaaacttcttctctgccagacaaatttgtagaccaatccagcaagttgtgtggtaaaacaaagattcgtccggatgcaatccaaacg -# 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tcaaaaccaaattctgcattgcttaacaatgaaaatagtgaagaaataccaatggtttggaaggttaagcggcgcccagatggaacgcgatacattgt -# aaagcggccagtacgtaatcgcccccaagttgctattcgaaaaaatgtgcgatgcaacgaacttacaacaacggaggaggatacagtatctgaagtaa -# aaattggtcgttattggacaaaggaagaacgaaagcgacacattgaacgagctcgagagaggcgtcaccatcagacacagcaacaacagctacagtaa] -# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES -# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH -# LFEQCLEPEIDIESTCIDTNKGDILCNDSEHCEDVFISGIQPESIAHRDGRLRQGDQILRINGVDVKNQEEVENQIAESSTAVTLLVSRILYPEDEDD -# EDIHFEYANSFIPDDYTNVVDKLDKVLLSHVQSFEELSNETGEHSSDLKVQTSSLPDKFVDQSSKLCGKTKIRPDAIQTDNQKTLKQSLSKNQVHLQH -# EYDESEHIYETIPEDSESEPLYCSPYQSSNGKSSMGCCSSAISTTPAEVLETTMQQQTQRVAQWLGLKPQYPRTIHTLVGRPAPLKLTQQPNCSRVFT -# LRSTLTNTSRSSSSGVAYSGYGPNNILGANLAFGEEVDNSSSAYNTGGSNNSASPHQNTTNADDDITANHNLESRVIDGRREALDTTAVSSMLLLPFG -# KSGRIGLCSSNMSTSYVNEKQGKATYESQILVKSNHNVLGVKQTEESYSHCPQFNAPNLSSYHFVSSQEVANRCHDSTNSKPNSALLNNENSEEIPMV -# WKVKRRPDGTRYIVKRPVRNRPQVAIRKNVRCNELTTTEEDTVSEVKIGRYWTKEERKRHIERARERRHHQTQQQQLQ] -# end gene contig39.g68 -### -# start gene contig39.g69 -contig39 AUGUSTUS gene 33944 38144 0.14 + . contig39.g69 -contig39 AUGUSTUS transcript 33944 38144 0.14 + . contig39.g69.t1 -contig39 AUGUSTUS start_codon 33944 33946 . + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; -contig39 AUGUSTUS CDS 33944 33959 0.4 + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; -contig39 AUGUSTUS CDS 35584 36216 0.38 + 2 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; -contig39 AUGUSTUS CDS 37575 37861 0.92 + 2 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; -contig39 AUGUSTUS CDS 38064 38144 0.36 + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; -# coding sequence = [atgcagaagaaaaagtcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattcca -# 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[MQKKKSHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASI -# NSKESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSS -# LLLPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKP -# LSDGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQDLEVSMVILCKVVNRLREMNLRPCRQ] -# end gene contig39.g69 -### -# -# ----- prediction on sequence number 40 (length = 60015, name = contig40) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 40 on both strands -# start gene contig40.g70 -contig40 AUGUSTUS gene 560 57833 0.02 + . contig40.g70 -contig40 AUGUSTUS transcript 560 57833 0.02 + . contig40.g70.t1 -contig40 AUGUSTUS start_codon 560 562 . + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; -contig40 AUGUSTUS CDS 560 1202 0.6 + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; -contig40 AUGUSTUS CDS 2561 2847 0.58 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id 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-contig41 AUGUSTUS gene 4006 27824 0.06 + . contig41.g71 -contig41 AUGUSTUS transcript 4006 27824 0.06 + . contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS start_codon 4006 4008 . + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 4006 4013 0.39 + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 6193 6506 0.34 + 1 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 8605 8784 0.99 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 12469 12634 1 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 15417 15597 1 + 1 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 17904 18570 0.83 + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 25190 25363 0.96 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; -contig41 AUGUSTUS CDS 25897 26172 0.98 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; 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agaagctctagcgacccttgaggatgattatgagcggcccgtgttagaaaaatgtgaccctgtcaacttcgataacaacaaatcagagaaacctacac -# cagcaattatcacaccggacactaaacacccacaagtaaaattgccggtagaagaacctaaggaagagaagccaaaggtttccaggatgcaaccgcct -# tccccaggtgagccaccgaagatagaagtaatacgggagaagcgaccatctctagcaccggagccgccaagtcgccgtggatctcttatcccgccagc -# cgatactggacgtcggccgtctctgatcatcaatgatgagacccttagcatcatcgaaatcactgcgttggtcaaaatttag] -# protein sequence = [MGVAEDFAPSFVKKPQLHQEDDGNRLIFECQLLSSPKPDIEWFRSDNKLVEDGRTKFKIQPVEDNKYTVVLELDDVVE -# TDAGLYKVKAKNKSGEVSASINLNFTHKSTVSRRHSRKNPLYDRKKMENDYYLSAALTLIQYPPLFGSTTEQLLRNQYAIRSHGETILNESKRYKMSL -# TMDQKLYHMACLEISSVVSSDQGEYRAQAKNKHGSGVATINLNFESGSKKIPDGKSPRFPKKPTIRQEEDLLIMECVLEAHPVPDIVWYCSDKEISDN -# QRTKMTRKAITKDNYVLTLEIQNPTKEDGGNYRCNAINMYGESASDANGFAPSFIEKPRIIPNESGTLITMKCKCKAKPEPTVTWYRGQDMVEKSKKI -# KINTTVIAEDTYELTLEIKDPGATDGGTYRCNVKNEYGESNANLNLNIEAEPEPEGEGPTFIEKPRIVSENNGKLVIMECKVKADPKPDVIWFRNGEV -# IKESNKIKTFIEQRGDQYYIKLELLDPQLEDSGLYKCNIKNTLGELNANLTLNIEIVPVIKDKPKIIKIIKKRTVIIECTVASKFEPKCTWYKETNTV -# KESKRHVYLVEQTKDGEFAVKLEINDVEESDKGAYKLVASNEKGQAVSQVVNLVDIPEEERKPSKPEISRKLVDQKVSESKTFELLISLAQSDRKCKI -# EWYKGSTLIRETKDITTTFDGTTARLTFSSARTEHTSNYKVIVTNEVGKAESSCKITVEKGTKKKEEQPKEKDKSKAEKEKEEKVNKNINTSKCVQDT -# HQVLESVTAQEIQSKERQVVAKMEEHYINQKSSTQLNTASIVSVEEEISAEVRRQSVVKMQDEITVDDKRVSSRRTSLAVIEEQKPAEELPKLRKTSI -# AQVKEDAKPEVAKPKAKAKAKPKPKYEELPEIPDYERPQLEKYERSDFTPTDFGRELEIPNKMEKPILDSGKKESEAPVQKNGIPKKSEIIEKPAEEP -# KGLKIGKGKLPDEDDSRDGAILKPVIIEPEQADKPSVLDIIKQRRRSSIRNLMTKEPIQNESFLGVVLKPVIKDAKEQVAPQQAIQLTKANATEQLSH -# TKAIKAKVSDLKKPEALATLEDDYERPVLEKCDPVNFDNNKSEKPTPAIITPDTKHPQVKLPVEEPKEEKPKVSRMQPPSPGEPPKIEVIREKRPSLA -# PEPPSRRGSLIPPADTGRRPSLIINDETLSIIEITALVKI] -# end gene contig41.g72 -### -# -# ----- prediction on sequence number 42 (length = 70020, name = contig42) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 42 on both strands -# start gene contig42.g73 -contig42 AUGUSTUS gene 5165 63391 0.01 + . contig42.g73 -contig42 AUGUSTUS transcript 5165 63391 0.01 + . contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS start_codon 5165 5167 . + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 5165 5477 0.8 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 9073 9235 0.38 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 10487 10687 0.89 + 1 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 10759 11030 0.75 + 1 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 13576 13799 1 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 13861 14263 0.95 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15241 0.54 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 0.99 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 1 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 0.68 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 22829 23005 0.6 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 23315 23542 0.48 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 24367 24540 0.99 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 30507 30654 0.95 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 31052 31425 0.95 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 33445 34090 0.3 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 34314 34667 0.62 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; -contig42 AUGUSTUS CDS 35289 37001 0.84 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; 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-contig45 AUGUSTUS CDS 1628 2464 1 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 3943 4848 0.95 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 8005 8050 0.57 - 1 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 8173 8282 0.55 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 8374 8540 0.57 - 2 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 8630 8646 0.26 - 1 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS CDS 10174 10178 0.17 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -contig45 AUGUSTUS start_codon 10176 10178 . - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; -# coding sequence = [atgaggtacgtatcgttgaaagtgcgcaactgctgcgccctgagtgcctggaacaatcgattgttcagctccgccagcc -# 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"contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS CDS 28179 29141 0.91 - 2 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS CDS 29810 32428 0.65 - 2 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS CDS 34008 34293 0.9 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS CDS 34351 34524 0.95 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS CDS 34579 34914 0.91 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -contig47 AUGUSTUS start_codon 34912 34914 . - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; -# coding sequence = [atgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttaca -# acgtcagcactggagccctaaatagttcgattgcagcgcacagcctgggccacaacgcgacagcctcttcatcgcgtaatttatttccagaataccgg -# tacggtcgcgaggaaatgctttccttgttcgatcggaactgtatgctgccgcagatcctgccttcattcaaaaagctttttgtggaaaaggtccagta -# 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-contig48 AUGUSTUS CDS 2950 3075 0.98 - 0 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 3128 3282 1 - 2 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 8042 8116 0.96 - 2 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 8175 9137 0.84 - 2 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 9806 12424 0.59 - 2 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 14004 14289 0.98 - 0 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 14347 14520 0.93 - 0 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 14575 14944 0.67 - 1 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS CDS 16482 16537 0.35 - 0 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -contig48 AUGUSTUS start_codon 16535 16537 . - 0 transcript_id "contig48.g82.t1"; gene_id "contig48.g82"; -# coding sequence = [atggccaaaacgcttaaatctgtctgccgcccacataacatctactggaaaagccgcgtcaccgtaacattggaaaaga -# ggctactgaaaatgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttacaacgtcagc -# actggagccctaaatagttcgattgcagcgcacagcctgggccacaacgcgacagcctcttcatcgcgtaatttatttccagaataccggtacggtcg -# cgaggaaatgctttccttgttcgatcggaactgtatgctgccgcagatcctgccttcattcaaaaagctttttgtggaaaaggtccagtatccacttg -# ctttgacaccaagttccgaggaggacaacaaccaaaatgtgctcgggaatagctcgcgacctgcctggttgcagcgatcgtctggtggatttagtact -# gcctctcggggcactggacgtggtgggacagtcgatcggggccgaatacgcggcaaatctgtctatcatcctatataccaacgcccaagtggtcttta -# cgatgagggcttatcggtaatatctatcaaggctgaacgcacttggagtgaacgcaacggaactggtgattctgccgtgaccaacatctctagtagta -# gctcaggtgtccttgactggaacgggactccaagctcaagtcctcgaaaagacttctcaagtcatcatcgcaatatggagaactggcgacgatcacgg -# aatgaagacggctccggagacggtccagttggcattagtggtcccgacattggtggttggagaagcggtggtggcgcaggaagtactaatacaagttt -# 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"contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; -contig51 AUGUSTUS CDS 42313 42446 0.87 + 1 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; -contig51 AUGUSTUS CDS 45674 45733 0.63 + 2 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; -contig51 AUGUSTUS CDS 45795 46090 0.82 + 2 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; -contig51 AUGUSTUS CDS 46765 47091 0.33 + 0 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; -# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta -# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca -# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat -# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca -# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca -# 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ASTAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNA -# RGVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEP -# VSDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHTQRLKYISPQSQVVITA -# SLIAIQVLITMIWMVVEPPGTRFYYPDRTEVILKCKIQDMSFLFSQLYNMILITICTVYAIKTRKIPENFNESKFIGFTMYTTCIIWLAFVPIYFGTG -# NSYEVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPE -# ECECAEAFCNRVKN] -# end gene contig51.g87 -### -# -# ----- prediction on sequence number 52 (length = 40012, name = contig52) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 52 on both strands -# start gene contig52.g88 -contig52 AUGUSTUS gene 6895 17083 0.02 + . contig52.g88 -contig52 AUGUSTUS transcript 6895 17083 0.02 + . contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS start_codon 6895 6897 . + 0 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 6895 7576 0.42 + 0 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 0.97 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 0.82 + 1 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 15666 15725 0.52 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 15787 16082 0.85 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 0.33 + 0 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; -# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta -# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca -# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat -# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca -# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca -# gtgtctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttga -# tctatttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacact -# cggagggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgca -# gcagacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccg -# cattcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttgg -# aggatattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaa -# aggaacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccac -# tgagataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttg -# 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"contig52.g89"; -contig52 AUGUSTUS CDS 24806 25012 0.59 - 2 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; -contig52 AUGUSTUS CDS 27339 27713 0.95 - 2 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; -contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 0.94 - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; -contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30182 0.7 - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; -contig52 AUGUSTUS start_codon 30180 30182 . - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; -# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc -# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct -# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc -# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt -# atgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttgttgcccaga -# agtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgcaagcgttgc -# taatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttcaaaatgaca -# cgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgcaaactcctat -# cacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaacaatgaaga -# ccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaatagcaacgtca -# gtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactctgcaaacaa -# aatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttggataattccct -# aatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataataatgaacttc -# 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-contig52 AUGUSTUS transcript 32268 33026 0.91 - . contig52.g90.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 32268 33026 0.91 - 0 transcript_id "contig52.g90.t1"; gene_id "contig52.g90"; -contig52 AUGUSTUS start_codon 33024 33026 . - 0 transcript_id "contig52.g90.t1"; gene_id "contig52.g90"; -# coding sequence = [atgttgacagtggcatacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgcc -# gggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacgcccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgt -# cgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcggtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagc -# gaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaaaagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttac -# tcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggtatatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaaga -# ccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatgg -# tcgtacggtcaataaacagtattatctggaagttatgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggc -# 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"contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; -contig53 AUGUSTUS CDS 7332 7706 0.95 - 2 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; -contig53 AUGUSTUS CDS 7771 7900 0.97 - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; -contig53 AUGUSTUS CDS 9015 10175 0.58 - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; -contig53 AUGUSTUS start_codon 10173 10175 . - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; -# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc -# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct -# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc -# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt -# atgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttgttgcccaga -# agtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgcaagcgttgc -# taatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttcaaaatgaca -# cgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgcaaactcctat -# cacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaacaatgaaga -# ccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaatagcaacgtca -# gtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactctgcaaacaa -# aatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttggataattccct -# aatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataataatgaacttc -# caggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattggtattccgagtgttaaggatttagaagcgcaaatgactaaagtagacatgcggccggattat -# 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[MSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSGTNN -# GETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNTETE -# KDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQLET -# IDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTESEFN -# FDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIGIPSVKDLEAQMTKVDMRPDYVNTVGGPFSQVVQAEKPIP -# RDTEGFKKLLQQLGYQSRQHHPGNDVYHIINHSNITNHDHLESNQQHKINNCHSQHSALSVHGPNIPSNSHIFAQKRLETHHLMQSLICGDVSLDFLE -# KELGNPSTAPSTKEVIASVLREYSHNKRNPVSIGDHKMFTHSTFLQAQPVHPHYSEVLRKMTADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTA -# PIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGVNFAMSVCLSYRMNAEISAT] -# end gene contig53.g91 -### -# start gene contig53.g92 -contig53 AUGUSTUS gene 12261 24119 0.04 - . contig53.g92 -contig53 AUGUSTUS transcript 12261 24119 0.04 - . contig53.g92.t1 -contig53 AUGUSTUS CDS 12261 12946 0.16 - 2 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; -contig53 AUGUSTUS CDS 23027 23128 0.76 - 2 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; -contig53 AUGUSTUS CDS 23180 24119 0.31 - 0 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; -contig53 AUGUSTUS start_codon 24117 24119 . - 0 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; -# coding sequence = [atgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaa -# ctcgaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtatt -# gagcgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagc -# cgccgctgtggttggcgtaacggcggtagcagccgctactgtcggtgttcctttcaacttgcacggttctactgtcctgtcccctttgcactcgcttc -# ggaatgatcgggacctttccctaatgcccatctccagaaactttgtagtggactacatgtggcagcagaaggacggacactaccaacatcagtattca -# aagaaactcagtggcggtgaacccagcgagcaaagcctggacttcgagtcctgctcccgatcatggactagacctgacacgaatgtttcaataccgac -# 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acgccaagttcgatcgaatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatggtcgtacggtca -# ataaacagtattatctggaagttatgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttgcatcac -# gataatgcccctgctcacggccaaaaacaacaccacaataatgcctcagccaccatatttaccggatttggtcccatgtga] -# protein sequence = [MTLSGNTYDEKIIHAWEDVKAMFNGGTRKRLVGSSINNRNMGSPTPSAAVSSCGSPTSIERDPKEGDGESESPEFPQR -# QIDSQFNYSTVATAAAVVGVTAVAAATVGVPFNLHGSTVLSPLHSLRNDRDLSLMPISRNFVVDYMWQQKDGHYQHQYSKKLSGGEPSEQSLDFESCS -# RSWTRPDTNVSIPTGSSLRLSDNTPFNIKNESHSSICGIIKNRKLSAATSSGLSLSDYNIPSILNCSAFKPVVASTAIVSTSLYTRSSDSKRTDYINP -# TQSTRTTTVLTHNSISGSSHQIVGETISPILEKVTPNIEKKPTESALVNCLPRNVNDTDDDDEVVDIETTEDEDCREDANDEPRSGRPSTSTTDENVQ -# AVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMGRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIVQELLDDVNDDPDLLKRVIAGDESWVYGYDIETKAQS -# SQCKSPGEPRPKKARQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHQEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLREAIRKKRPELWKNNSWLLHHDNAPAHGQKQHHNNASATI -# FTGFGPM] -# end gene contig53.g92 -### -# -# ----- prediction on sequence number 54 (length = 35008, name = contig54) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 54 on both strands -# start gene contig54.g93 -contig54 AUGUSTUS gene 470 4114 0.08 - . contig54.g93 -contig54 AUGUSTUS transcript 470 4114 0.08 - . contig54.g93.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 470 541 0.28 - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; -contig54 AUGUSTUS CDS 2726 3123 0.65 - 2 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; -contig54 AUGUSTUS CDS 3175 4114 0.36 - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; -contig54 AUGUSTUS start_codon 4112 4114 . - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; -# coding sequence = [atgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaa -# ctcgaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtatt -# gagcgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagc -# 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contig55.g94 -contig55 AUGUSTUS gene 6802 33037 0.13 + . contig55.g94 -contig55 AUGUSTUS transcript 6802 33037 0.13 + . contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS start_codon 6802 6804 . + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 6802 6809 0.33 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 12258 12438 0.74 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 29483 29737 0.99 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 29800 29948 1 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 32756 32875 0.53 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -contig55 AUGUSTUS CDS 32929 33037 0.43 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; -# coding sequence = [atgcttctatattatgaaacaggatcaattaaacctcgagcgataggtggttcaaaaccacgagtagctacaaccccgg -# 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TGFNAMYSSIPQPIATMAENYKISICTTTPPKHSLQSCSCAPAATSAWRLCQQFSNDIIKYRGHFCRRFGACPDFNAKCIGPRGKQLLATSSVIVNL] -# end gene contig55.g94 -### -# -# ----- prediction on sequence number 56 (length = 55020, name = contig56) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 56 on both strands -# start gene contig56.g95 -contig56 AUGUSTUS gene 1802 28037 0.09 + . contig56.g95 -contig56 AUGUSTUS transcript 1802 28037 0.09 + . contig56.g95.t1 -contig56 AUGUSTUS start_codon 1802 1804 . + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; -contig56 AUGUSTUS CDS 1802 1809 0.26 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; -contig56 AUGUSTUS CDS 7258 7438 0.76 + 1 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; -contig56 AUGUSTUS CDS 24483 24737 1 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; -contig56 AUGUSTUS CDS 24800 24948 1 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; -contig56 AUGUSTUS CDS 27756 27875 0.59 + 1 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atcggacctcgcgggaagcaactactggccacgtcttcagtgatcgtcaatctttaa] -# protein sequence = [MLLYYETGSIKPRAIGGSKPRVATTPVVQKIADYKRECPSIFAWEIRDRLLSEQVCNSDNIPSVWFSNRRAKWRREEK -# MRTQRRSADNVGGSGRASTTNNPSGTAVNSTVATSNNSTPGITSSTLNVSERASSAIISNSIPETPNGPTVLGGDANAAHTTSESPPLQAVAPRLPLN -# TGFNAMYSSIPQPIATMAENYKISICTTTPPKHSLQSCSCAPAATSAWRLCQQFSNDIIKYRGHFCRRFGACPDFNAKCIGPRGKQLLATSSVIVNL] -# end gene contig56.g95 -### -# start gene contig56.g96 -contig56 AUGUSTUS gene 38038 53620 0.04 - . contig56.g96 -contig56 AUGUSTUS transcript 38038 53620 0.04 - . contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 38038 38205 0.98 - 0 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; -contig56 AUGUSTUS CDS 38270 38415 1 - 2 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; -contig56 AUGUSTUS CDS 38468 38598 1 - 1 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; -contig56 AUGUSTUS CDS 38660 39046 0.99 - 1 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; -contig56 AUGUSTUS CDS 39119 39314 0.99 - 2 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"contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS CDS 8647 9033 1 - 1 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS CDS 9106 9301 0.99 - 2 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS CDS 16730 17842 0.27 - 2 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS CDS 19888 21133 0.66 - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS CDS 22378 23607 0.21 - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -contig57 AUGUSTUS start_codon 23605 23607 . - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; -# coding sequence = [atgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaatagcaggtt -# ctcagacactggcagcaaatatttggtctgacaagacggctattcaaaatgaacccataaatatgactgatgttaatgcgacggtaaaggatgcaaat -# aaccatagtaccaccattacaaatgtagctacgtttgacacgaaattaaatcacttgttagtggacaccattactggacgagtctttgttggtggtgt -# 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AUGUSTUS CDS 31048 31359 1 + 2 transcript_id "contig57.g98.t1"; gene_id "contig57.g98"; -contig57 AUGUSTUS CDS 31413 32554 0.99 + 2 transcript_id "contig57.g98.t1"; gene_id "contig57.g98"; -# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg -# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt -# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg -# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga -# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag -# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac -# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt -# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc -# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt -# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg -# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc -# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga -# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg -# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt -# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt -# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] -# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ -# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG -# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE -# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY -# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS -# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] -# end gene contig57.g98 -### -# start gene contig57.g99 -contig57 AUGUSTUS gene 45155 52058 0.09 - . contig57.g99 -contig57 AUGUSTUS transcript 45155 52058 0.09 - . contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 45155 45219 0.46 - 2 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 47394 47486 0.71 - 2 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 49327 49453 0.99 - 0 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 49515 49624 0.85 - 2 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 49898 50170 0.92 - 2 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 51823 51917 0.97 - 1 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS CDS 51994 52058 0.99 - 0 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -contig57 AUGUSTUS start_codon 52056 52058 . - 0 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; -# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa -# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat -# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc -# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc -# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt -# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt -# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt -# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH -# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK -# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig57.g99 -### -# -# ----- prediction on sequence number 58 (length = 50011, name = contig58) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 58 on both strands -# start gene contig58.g100 -contig58 AUGUSTUS gene 5202 7547 0.98 + . contig58.g100 -contig58 AUGUSTUS transcript 5202 7547 0.98 + . contig58.g100.t1 -contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; -contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 1 + 0 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; -contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 1 + 2 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; -contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 0.98 + 2 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; -# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg -# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt -# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg -# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga -# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag -# 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"contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 0.76 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 0.97 - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24617 0.89 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 0.92 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 0.97 - 1 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27051 0.66 - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -contig58 AUGUSTUS start_codon 27049 27051 . - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; -# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa -# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat -# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc -# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc -# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt -# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt -# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt -# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH -# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK -# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig58.g101 -### -# -# ----- prediction on sequence number 59 (length = 40011, name = contig59) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 59 on both strands -# start gene contig59.g102 -contig59 AUGUSTUS gene 10148 17051 0.11 - . contig59.g102 -contig59 AUGUSTUS transcript 10148 17051 0.11 - . contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 10148 10212 0.53 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 12387 12479 0.65 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 14320 14446 0.98 - 0 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 14508 14617 0.88 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 14891 15163 0.94 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 16816 16910 0.96 - 1 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; -contig59 AUGUSTUS CDS 16987 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gagaaagctggtatcacgtctagcctactattgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacaga -# aacatacaagtttgttggaactactaaaggaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagcta -# actcgccatctactggctccactgttagaagcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatct -# gatcttgtggatttgactggcgattatgtgaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagacttt -# attagagctggctgcatacccacatccaaacaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagag -# ttatattgaaacagcttcctaagtttgatgataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaat -# caagcagctgctcagctgctaccgaacgctcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaagg -# acctgaaattgatgccatatctaaaaagtttacggatggcctaaaacggtgtaagccaaatactaagaaggaagaagaacggattgtctatattttaa -# agggaataggaaatgcaaagagcttaggtggcaacactgctgctgtccttagtgagtgcgcctccacgggccgttccaatcgtatacgtgtagcggct -# ttgagagcattttcaacaattgattgcaatggagcactgcgaactaaggctttggaactacttaagaaccgcaacgaggactcagagttacgtattga -# agcctatttgtcttcaatttcatgtcccaacgcagaggtggccaaccagatttcagatatagtcaattccgaaacagttaaccaggtaggaggattta -# tttcatctaatttaaaagccattcgggactcgacagacgccagccgtgagcagcaaaggtaccatttagggaacattcgagtgactaagaaatttcct -# gcggattacagacgatacagtttcaacaatgaagtttcctacaaactggaatcccttggccttggagctagttctgactatcaattaatttattcgca -# acatgggttcttaccccgatcatctcgtatcaatgttacaactgaaatttttggaactaacttcaacgtatttgaagcaagcgtacgtcaggaaaatt -# ttgaggatgtgctggaatattatctgggaccgaaggggttgttaaacaaagatttcaatgaaatagttaagatcattgaagttggaaacaacgcggct -# gctagtgctggtggtcgagcccgacgctcaattgccgacgatgttgctaagatatcgaaaaagtataaaacttacggtgctaaaagtgtgcaagatct -# caatttagatgtatcgttgaaattctttggttcggagttggcgttcttgagccttggcgacaacataccgagtactctagatgatatcataaactcta -# tctcaaattcatttgaaaaagcaaaacaagaactatcgatgtttgaaaagacactttccagtcaccacttattcctagatacagacctctcttatcca -# 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aataataaacaaagcaacttgccggctacatatgaccttcaagctaaaattgaaatgccaaagtccagcttaaaattcgtggatattaagagtaacgg -# aaaactattaaaaccatcaacggtcaataacaatgctgcttataatcttgaattttttgtggattccaaaactggtcagggacaattcgcccgtgtca -# acacagtgtggaacggtacgccaaatgaaggaaatttggattttgaagctcaaactaataaaatggagtctccattaaagttcaatggaaaatatcag -# cgagagcaatctggcagtttgaaggatggtgatcttagcggcaagcaaaagtacatagttaatgctcagtatggaaatcagtatgtgaagacggatgc -# atccgtttcttacggttccgagaaagtagatataacatatttgctggattccagcttcgaatctgcaaaggacataagccttaatatccacacactta -# aatctgtcgatgatttgacatatgtagtcactatacaagccaaacaggcagataagtcatacagtttggacactactttgtatcgttcgaccaataaa -# aaaggtgttgaaatccgattggatttgttaaaggaaaatccaattattatcaggagcatcctcgaaatattgggagagcgaaagggaaacctagcctt -# tgaagtacaaaacttaggcggattggacattaaattaaacagtgaagcttcttacgtcagcatagacgatttttatgtaattggcagctggagctcta -# aaaaattaaagctaaatgggtacgagcttgaagcacgagcacagggtaagaacataaaaattcaactaaagaatttaaatggcgtaatattcgtaggc -# 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"contig60.g104"; -# coding sequence = [atgttgaaaagtggagacgccaataatataaatggcattagcggcagacagataaatgcgaatgcgtacagaaaatcta -# catatctaatagatataaatcgtagtagtgatagtagcgccaatagtggcataaatggtgagatcaggcgcaatgcttatgattattttaacgattac -# agtgtttcgaccgatgagaaaaactattaccatgaaatctccagcaatggacatcattcaacggttcaaaacattgatgaagaaaaatcgaaaaggca -# ttacgagtcggttgttcatgaccaggaaattattgatcatgaagacttttttggaaatactcaggaaataattacatttgctgaagaagcgataaata -# ttacagagaagggaatagacaaagctattctgttccgggcttcttttgaagtcgacactaaacatttgggatggcaaaaattcgatttaaccgaaacg -# atccgtgagtggtataggcttagccgtaacgaaaaactgcgactattggttgattgcactggctgcaatggtcgatattcattacacctttttcaaac -# atcgaagctaagggacaactcatcagattcagataatttgagcccatatcccaatcgaccatttctcgtacttcacacagaatcagccaggacaagac -# gtgtaaggcgacgtgccgtggattgtggcggtgctttaagcggtcaatgctgcaaggagtccttttatgtatccttcaaggcacttggttgggatgat -# tggattatagcacccaggggatattttgcgaactattgccgaggcgattgcacggggtcgttcaggacaccagatactttccaaacattccatgccca -# ttttatagaagagtatcgaaaaatgggcctcttaaatggaatgcgaccctgttgcgctccaataaaattctctagtatgtcattgatttactatggtg -# atgatggaatcattaaaagagacttgccaaaaatggttgttgatgagtgtggttgcccttag] -# protein sequence = [MLKSGDANNINGISGRQINANAYRKSTYLIDINRSSDSSANSGINGEIRRNAYDYFNDYSVSTDEKNYYHEISSNGHH -# STVQNIDEEKSKRHYESVVHDQEIIDHEDFFGNTQEIITFAEEAINITEKGIDKAILFRASFEVDTKHLGWQKFDLTETIREWYRLSRNEKLRLLVDC -# TGCNGRYSLHLFQTSKLRDNSSDSDNLSPYPNRPFLVLHTESARTRRVRRRAVDCGGALSGQCCKESFYVSFKALGWDDWIIAPRGYFANYCRGDCTG -# SFRTPDTFQTFHAHFIEEYRKMGLLNGMRPCCAPIKFSSMSLIYYGDDGIIKRDLPKMVVDECGCP] -# end gene contig60.g104 -### -# -# ----- prediction on sequence number 61 (length = 40008, name = contig61) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 61 on both strands -# start gene contig61.g105 -contig61 AUGUSTUS gene 7236 17521 0.29 + . contig61.g105 -contig61 AUGUSTUS transcript 7236 17521 0.29 + . contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS start_codon 7236 7238 . + 0 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id 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AUGUSTUS gene 22556 47173 0.03 + . contig62.g107 -contig62 AUGUSTUS transcript 22556 47173 0.03 + . contig62.g107.t1 -contig62 AUGUSTUS start_codon 22556 22558 . + 0 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 22556 22614 0.22 + 0 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 31493 31690 0.91 + 1 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 36015 36481 0.93 + 1 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 39348 39433 0.83 + 2 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 40202 40454 0.87 + 0 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 46558 46665 0.95 + 2 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -contig62 AUGUSTUS CDS 47007 47173 0.63 + 2 transcript_id "contig62.g107.t1"; gene_id "contig62.g107"; -# coding sequence = [atgagaacggcgtcccggagtcaacgcgaaccgtttcgggtgggcggcgcggtggcgtcatattacgagactggtagtt -# ttaaggccggtgttattggaggttccaaaccaaaagtggccaccccgccggtagtagatgcaattgccaactataagcgcgaaaaccctacgatgttc -# gcttgggagatacgagatcggctcttggcagaagctatatgctctcaggataatgttcccagtgtttcttcgataaaccgcattgtaagaaacaaggc -# cgccgagaaggcgaaacatgttcatcatcaccaacagcatcatgtaccacagggtctgggtggcggacacattgccacagaaagtctagatagcagca -# caggaacgatcggcgaaccgcagcccccgagtggtggaactagcaatagcagtgctaattccgcaaacccaaacgcttctgcggcgacggttgcgacg -# cacgcatcaataccgacgtcaggctctgatactgtccaggtttcagtcggccaaatcaatgcaaacagcaatgacacaagcaatgggaatattaactc -# aacgactgagcaacgaacgactggatatagcattaatggaattctaggtatacaacatggacagcattctcacaacaataataacaacagtagcgtga -# gcaataacaataatacagatcccaccaattgtaaacgtaaaagaatcgaagctcatgacgaaaaccgtgacacaaatatacattccgaagatgatggc -# aaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatatttggcctgggaagtggtgtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagct -# aggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattttccacaaactcgatatctggatctggttcgggtc -# cgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctcaaagctcactttatacaccaacaattggaccatca -# attggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatggtggcgcatacggatcatatggctatggggctgg -# tgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgccagacctggtcaggtctcctttagctgcaactcggg -# ccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaagtgcgtgcacaaaatcagagtcctcagacatttttcttgtttaa] -# protein sequence = [MRTASRSQREPFRVGGAVASYYETGSFKAGVIGGSKPKVATPPVVDAIANYKRENPTMFAWEIRDRLLAEAICSQDNV -# PSVSSINRIVRNKAAEKAKHVHHHQQHHVPQGLGGGHIATESLDSSTGTIGEPQPPSGGTSNSSANSANPNASAATVATHASIPTSGSDTVQVSVGQI -# NANSNDTSNGNINSTTEQRTTGYSINGILGIQHGQHSHNNNNNSSVSNNNNTDPTNCKRKRIEAHDENRDTNIHSEDDGKRQRMGYSGDPLYPNIWPG -# KWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDTSMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYT -# QYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAASPGSGSACTKSESSDIFLV] -# end gene contig62.g107 -### -# -# ----- prediction on sequence number 63 (length = 55021, name = contig63) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 63 on both strands -# start gene contig63.g108 -contig63 AUGUSTUS gene 4369 17721 0.09 + . contig63.g108 -contig63 AUGUSTUS transcript 4369 17721 0.09 + . contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS start_codon 4369 4371 . + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 4369 4421 0.53 + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 4822 5122 0.55 + 1 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 0.77 + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 11546 11653 0.84 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 11995 12117 0.56 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -contig63 AUGUSTUS CDS 17609 17721 0.4 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; -# coding sequence = [atgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatcgctctgggcagtatgattttttgtg -# gccgagttttatcggacgccgccggcttcctattttggtatgccggggcctgcgatggtttcagcatcctggacagtgatggatccacctccatgggt -# tctggagtgcctccacagtgcccatcgctgtgtggatcaaggtgcacctgtgccttgttctgtttagtaaagtgtggactttttccagcacttacttg -# cgtgtatgcctggcgggacgtttgttggcgttcatgcgcccttggatttgttttcgtatccttctgttacaagctgaatatttggcctgggaagtggt -# gtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattt -# tccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctca -# aagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatg -# gtggcgcatacggatcatatggctatggggctggtgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgcca -# gacctggtcaggtctcctttagctgcaactcgggccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaaagtccgagttttctgactcggaact -# atcctctgacaaagcatctgtttgcattggatttatagttatagtcaaagctgaatcatcccaaactaagccatcatcaacaatctaa] -# protein sequence = [MMANGSVWDTVAILFIQIALGSMIFCGRVLSDAAGFLFWYAGACDGFSILDSDGSTSMGSGVPPQCPSLCGSRCTCAL -# FCLVKCGLFPALTCVYAWRDVCWRSCALGFVFVSFCYKLNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDT -# SMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYTQYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAA -# SPGSGKSEFSDSELSSDKASVCIGFIVIVKAESSQTKPSSTI] -# end gene contig63.g108 -### -# start gene contig63.g109 -contig63 AUGUSTUS gene 20635 28361 0.05 - . contig63.g109 -contig63 AUGUSTUS transcript 20635 28361 0.05 - . contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 20635 20703 0.21 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS CDS 22334 22879 0.68 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS CDS 26229 26336 0.84 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS CDS 26403 26903 0.91 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS CDS 26957 27099 0.99 - 2 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS CDS 28214 28361 0.36 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -contig63 AUGUSTUS start_codon 28359 28361 . - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; -# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat -# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg -# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca -# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa -# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg -# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg -# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc -# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta -# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa -# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag -# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta -# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa -# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat -# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat -# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct -# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] -# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE -# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE -# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF -# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI -# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF -# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] -# end gene contig63.g109 -### -# start gene contig63.g110 -contig63 AUGUSTUS gene 36899 51455 0.1 + . contig63.g110 -contig63 AUGUSTUS transcript 36899 51455 0.1 + . contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS start_codon 36899 36901 . + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 36899 36901 0.99 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 36954 37086 1 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 37151 37311 0.95 + 2 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 40574 40738 0.92 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 40795 40953 0.7 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 42037 42240 0.97 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 45152 45256 0.84 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 50734 51124 0.8 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -contig63 AUGUSTUS CDS 51178 51455 0.33 + 2 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; -# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat -# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa -# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga -# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca -# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc -# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac -# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc -# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat -# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta -# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt -# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa -# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg -# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg -# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt -# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga -# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga -# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] -# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN -# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL -# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR -# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG -# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL -# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] -# end gene contig63.g110 -### -# -# ----- prediction on sequence number 64 (length = 40016, name = contig64) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 64 on both strands -# start gene contig64.g111 -contig64 AUGUSTUS gene 5630 13356 0.04 - . contig64.g111 -contig64 AUGUSTUS transcript 5630 13356 0.04 - . contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 5630 5698 0.11 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS CDS 7329 7874 0.63 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS CDS 11224 11331 0.83 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS CDS 11398 11898 0.92 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS CDS 11952 12094 0.98 - 2 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS CDS 13209 13356 0.44 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -contig64 AUGUSTUS start_codon 13354 13356 . - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; -# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat -# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg -# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca -# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa -# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg -# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg -# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc -# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta -# 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ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF -# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI -# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF -# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] -# end gene contig64.g111 -### -# start gene contig64.g112 -contig64 AUGUSTUS gene 21894 36450 0.08 + . contig64.g112 -contig64 AUGUSTUS transcript 21894 36450 0.08 + . contig64.g112.t1 -contig64 AUGUSTUS start_codon 21894 21896 . + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 21894 21896 1 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 21949 22081 1 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 22146 22306 0.93 + 2 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 25569 25733 0.9 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 25790 25948 0.74 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 27032 27235 0.91 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 30147 30251 0.84 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 35729 36119 0.71 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -contig64 AUGUSTUS CDS 36173 36450 0.27 + 2 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; -# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat -# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa -# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga -# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca -# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc -# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac -# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc -# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat -# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta -# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt -# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa -# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg -# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg -# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt -# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga -# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga -# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] -# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN -# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL -# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR -# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG -# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL -# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] -# end gene contig64.g112 -### -# -# ----- prediction on sequence number 65 (length = 45013, name = contig65) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 65 on both strands -# start gene contig65.g113 -contig65 AUGUSTUS gene 1885 42915 0.02 + . contig65.g113 -contig65 AUGUSTUS transcript 1885 42915 0.02 + . contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS start_codon 1885 1887 . + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 1885 1887 0.99 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 1940 2072 0.99 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 2137 2297 0.9 + 2 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 5560 5724 0.89 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 5781 5939 0.71 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 7023 7226 0.91 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 10138 10242 0.84 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 15720 16110 0.97 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -contig65 AUGUSTUS CDS 42380 42915 0.14 + 2 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; -# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat -# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa -# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga -# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca -# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc -# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac -# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc -# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat -# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta -# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt -# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa -# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg -# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg -# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattgatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggtt -# caaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattatcaatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgca -# 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SIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHLSAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKML -# EMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNW] -# end gene contig65.g113 -### -# -# ----- prediction on sequence number 66 (length = 45011, name = contig66) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 66 on both strands -# (none) -# -# ----- prediction on sequence number 67 (length = 44531, name = contig67) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 67 on both strands -# start gene contig67.g114 -contig67 AUGUSTUS gene 7489 44111 0.03 + . contig67.g114 -contig67 AUGUSTUS transcript 7489 44111 0.03 + . contig67.g114.t1 -contig67 AUGUSTUS start_codon 7489 7491 . + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 7489 7901 0.25 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 39029 39189 0.97 + 1 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 39387 40028 0.92 + 2 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 40093 40223 0.99 + 2 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 40277 40759 0.98 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 41210 41355 0.81 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -contig67 AUGUSTUS CDS 43946 44111 0.16 + 1 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; -# coding sequence = [atgcaattgcaagcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgatgacctaaaac -# taaaagaacagcaccaagctaaaaaaatggcagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgaggatcgtgatctc -# ttgcagggacattatgctactataacccaagaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttgaaatggaagt -# ttccgatttaaactctgagtttcaattggatagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaacaattggttt -# ataaatttaatccaagttttcaaaaaaatggaagaaactgacctgaaagctataacgttcatgatggaaacctatactgttctatgcactttaaatca -# atatttgcaccgaagatagtttgtgaagaatttacaccactaaagccagagcttataatacgagagaatcaaccaatagaattaccaccggatgtcgc -# aagagcttccgataagccaagtcttggacttgacgaacttcaacagctaaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaa -# tcgattacctacaagaacggcaagattctgcacttactcatagcaagtcaatagggtccacgataaccaaacttcataagctcggaataactaattca -# aaatttgatgaactagataatattgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgaaatggtttttttgtgctccagaaagaa -# tattgaaagggaaaggccagtgggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaaggtgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcg -# aagaaaggaaacaggaaatacagagcatacgttctcgactatttttgggcaaacaagcaaaaataaaagaaatgtatcaattagctgtggctgaatca -# gaacatggcgttacatcggcgggtaagacccccgatattaatgtcataaatgccactcatcttataaaggatcgatttgagaatggtgaggtttttaa -# cgataataaagttcaattaaaggaagcaattcaagcggatgcggatgtgtttgaatctggaataggcaaagcatcgcgaagtatcttcatggagctag -# atgcaaatttaagttcaaacttaaataacagtcgtacccaaaataaccgtcccgataaaaagattgtgagatgtaatcaattgttgaaagagagtacc -# ggtgctgacattatcaaatgcgactcaaaaccagaagaagttaaagtcgccactgaagagttaacagaaagatttaaattctttgaaaaatatgcccc -# tgtcgaaaataaaaaaaagaaatttcgcatgactccgccacgtgacggtgttgtgaagatgccgtctcctgatttcgacacagagggttcaattcaaa -# cgcccttattcaatgataacgttttacaaaaaaccaaaacaacgtcaacaatattaagcaagtttcgcgaaatggaagagcaacaaatgaatgagaaa -# aacaaggaacgaagcccaaaaccattaaagtgttttactccgccaccagaaactgtcgaccatttcaatagatcagatactgaggaagaaaatgatag -# tgaaagcgatcagaacactgatgacgacgaaaaaagttttgcgaatgtgcttaacggttgcaacgaagatcaagggctttacgaggcccagaatgcag -# ctcgtgctaaacagttgcgggcgaagtttgaaaagtggcagattaacgaaatagagcgcgaactcaacgaaggaagtggagacacacaatcatcacag -# cttatttcaaatgagtccattgaaagtgcaagaaaacctgaaagctataacgttcatgatggaaacctatactgttctatgcactttaaatcaatatt -# tgcaccgaagatagtttgtgaagaatttacaccactaaagccagagcttataatacgagagaatcaaccaatagaattaccgccggatgtcgcaagag -# gttaa] -# protein sequence = [MQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHLSAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHI -# KKCKEKIKMLEMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNXPESYNVHDGNLYCSMHFKSIFAPKIVCEEFTPLKPELI -# IRENQPIELPPDVARASDKPSLGLDELQQLNVRSKFNVFENGCKEKIDYLQERQDSALTHSKSIGSTITKLHKLGITNSKFDELDNIEKTIDKINSST -# DEESEMVFLCSRKNIERERPVGLGEAMNDIRSKFEQGEVMTKEERREERKQEIQSIRSRLFLGKQAKIKEMYQLAVAESEHGVTSAGKTPDINVINAT -# HLIKDRFENGEVFNDNKVQLKEAIQADADVFESGIGKASRSIFMELDANLSSNLNNSRTQNNRPDKKIVRCNQLLKESTGADIIKCDSKPEEVKVATE -# ELTERFKFFEKYAPVENKKKKFRMTPPRDGVVKMPSPDFDTEGSIQTPLFNDNVLQKTKTTSTILSKFREMEEQQMNEKNKERSPKPLKCFTPPPETV -# DHFNRSDTEEENDSESDQNTDDDEKSFANVLNGCNEDQGLYEAQNAARAKQLRAKFEKWQINEIERELNEGSGDTQSSQLISNESIESARKPESYNVH -# DGNLYCSMHFKSIFAPKIVCEEFTPLKPELIIRENQPIELPPDVARG] -# end gene contig67.g114 -### -# -# ----- prediction on sequence number 68 (length = 25628, name = contig68) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 68 on both strands -# start gene contig68.g115 -contig68 AUGUSTUS gene 4505 24961 0.03 - . contig68.g115 -contig68 AUGUSTUS transcript 4505 24961 0.03 - . contig68.g115.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 4505 4621 0.17 - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 4681 4745 0.21 - 2 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 6427 6521 0.71 - 1 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 6581 6732 0.78 - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 13979 14147 1 - 1 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 14204 14334 1 - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 14386 14635 0.88 - 1 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 14704 14801 0.96 - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 17132 17391 0.26 - 2 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS CDS 24952 24961 0.2 - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -contig68 AUGUSTUS start_codon 24959 24961 . - 0 transcript_id "contig68.g115.t1"; gene_id "contig68.g115"; -# coding sequence = [atggataaatcttataacattgccctggcctaccgcgatgccaatggcattcagtacaacgaggccgtcgacgacggtc -# tggatggcgaaaccttgatcgagaccggaaccgccaacgacagcaacatcgactacgattgggtgccccaggagacgctgcgggcgctgcagaagtcg -# ccgcccaagtccaagacgcccaagacctcgcccaagcccggcaagcaggccagtcccaaggcagccagccagcagagtcccaagcagcgcaagattaa -# tgagctaagtcatgtaaacatacctgtaatgcttctcccagatgacttccgcgcatattcaaaaattaaggtagataatcacctattcaacaaagaaa -# acatgccatcgcatttcaaagtaaaagaatattgcccccttgtgtttcggaatctacgtgaaagatttggagttgatgatgtggactaccgcgagtcg -# ttaactcgatcccaacctatacaaatagactcatctggaaagtccggggcacaattttaccagagttatgataggttttttataatgaaaagtttaac -# atcggaagaaatcgagcgtatgcacgcttttttgaagcaatatcacccgtacgttgttgaaagacacggaaaaacactgttaccgcaatacttgggaa -# tgtaccgaatcactgtagaaagcgtgcagtattacttcgtagtaatgaggaatgttttcagctcacacttaacaattcacaaaaaattcgatttgaaa -# ggtagtaccgtggatcgggaagcatcggataaagaacttgaaaaacatttgccgactttcaaggacaatgattttataaaacaaaaagtgaaattgga -# cattggaaaggaagctaaagaaaagctgatgaacaccctaagcaacgatgtggatctgctaaccaagttgcacatcatggactactctttattggtcg -# gcgtgcatgactgtgtgcgtgccgaagaagaagcgctacaaggagataatgttacagctgccggtcgcagtgagaacagtgaaagcgaagaatgcgat -# agcggtgaacgctggacgtataacacgcctcccgattccccaagaggtgcacagtataaagaagtcgtttacgaagttgacatatatgacattccaag -# cattgaagaaaaacgtgaaatatattttattgccattatcgacgttctcactcaatatggcgtaaaaaaacaggcggcaaaagcagccaaaactgtta -# aatatggcagtaatgttgatggtatatcgacatgtgaccctgaacaatatgccaaacgattcttggaatttatggataaagcaatagaataa] -# protein sequence = [MDKSYNIALAYRDANGIQYNEAVDDGLDGETLIETGTANDSNIDYDWVPQETLRALQKSPPKSKTPKTSPKPGKQASP -# KAASQQSPKQRKINELSHVNIPVMLLPDDFRAYSKIKVDNHLFNKENMPSHFKVKEYCPLVFRNLRERFGVDDVDYRESLTRSQPIQIDSSGKSGAQF -# YQSYDRFFIMKSLTSEEIERMHAFLKQYHPYVVERHGKTLLPQYLGMYRITVESVQYYFVVMRNVFSSHLTIHKKFDLKGSTVDREASDKELEKHLPT -# FKDNDFIKQKVKLDIGKEAKEKLMNTLSNDVDLLTKLHIMDYSLLVGVHDCVRAEEEALQGDNVTAAGRSENSESEECDSGERWTYNTPPDSPRGAQY -# KEVVYEVDIYDIPSIEEKREIYFIAIIDVLTQYGVKKQAAKAAKTVKYGSNVDGISTCDPEQYAKRFLEFMDKAIE] -# end gene contig68.g115 -### -# -# ----- prediction on sequence number 69 (length = 44962, name = contig69) ----- -# -# Constraints/Hints: -# (none) -# Predicted genes for sequence number 69 on both strands -# start gene contig69.g116 -contig69 AUGUSTUS gene 30000 43409 0.03 + . contig69.g116 -contig69 AUGUSTUS transcript 30000 43409 0.03 + . contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS start_codon 30000 30002 . + 0 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 30000 30334 0.73 + 0 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 31328 31448 1 + 1 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 40335 40510 0.93 + 0 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 40569 40800 0.98 + 1 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 40859 41109 0.67 + 0 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 41958 42188 0.57 + 1 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 42238 42382 0.98 + 1 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 42438 42544 0.99 + 0 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 42702 42781 0.98 + 1 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 42839 43045 0.24 + 2 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -contig69 AUGUSTUS CDS 43387 43409 0.22 + 2 transcript_id "contig69.g116.t1"; gene_id "contig69.g116"; -# coding sequence = [atgattgatccaagttcgagtgaagaagaaggcgaagatgaccccattgctaatgtgtcatcgaaaggacgtcttacac -# 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caaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgaggaacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcg -# aaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaacgatataatcacaggaaattgatactgcggtctcacggatccttgtccaagttgga -# gggtgactctgaagatggttctacacaattaacaaagttggatgttgtacttacctttcaattggaagtgatcgttatggaggttaaaggtcttaaat -# cattagctcctaatcgcattgtgtactgcacaatggaagttgaaaatggagaaaagcttcaaacggatcaagcggaagcatcaaaaccaatgtgggat -# acgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgctggcattggaagataaggaact -# gggaaaagtaatccttaaacctacccctctttcatccaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacgga -# ttaagatagcttgccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatgga -# tatacagtagattacatagaagccgccagtgcaaatttgatgtttggcatcgatttaaacggtggacgatttttcttcaacgctgtacgtgagggtga -# tagtatttcctttgcttgcgatgatgagaatgaatgcagtttatgggtaatggccatgtacagggcaactggtcaatcccataagccaactccaccaa -# taacacaagataagaattcagcaatgtcaaaaattcaaggtgagtcacaagacaagtcgatctag] -# protein 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--- a/test-data/augustus/hubaInputs/GTF/dbia3.fa Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,66784 +0,0 @@ ->contig1 -AAAACTAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTGCCATACG -AACGATCGGAAAATTGGTAAGTAAATAATTAAAAATATTATATCTTTGGT -GTGTTTTTGGAAATAACATTTTTTAATATGTTTTGAATTTTGAATTAAAT -TCTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATACAAACGATCGG -AAAATTGGTGAATAAATAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTTATTTTTT -AGACAAATAACCTCCAACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTATAA -ATTTGATATTTTAATTTTATCAAAATCGGACGAATATAGCATATAGCTGT -TAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTCCGGTGTTTTTTACATATTATCT -TATACTATTGGGAAAATAGTTTATTATATTTTAAAGAATTTCCAATTAAA -CTCTAACATATAGCTTTCAAAGAAACGGTCAAAAAAGTAAAGAAATCATT -TTTTTTTAACATCACTGAAGCTAGAAACAATCCTTAAAAATGTAACATGG -TGTTAGTAGCATTGAAAATTGCTTATAACTGCAAAGGGAAAACAAACATC -GGCTTGCCGAATGTAATTTCCATTCTTGTTTGACTTGAGTTTATAACTTA -CAATTATGGTAAGGTGCCTGATTTTGGTTTTTGCCATACGGTATGTGGTA -GTTATCATTTTGCCGTGCTATAAGTGACATCACAGCCGATTCTTTTACTC -CATAATGGGCCAATGTGTTGAGGCGTTTCCATCCATTTATTGTTTTTGTA 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--- a/test-data/augustusDbia3.gff3 Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,9513 +0,0 @@ -##gff-version 3 -# This output was generated with AUGUSTUS (version 3.1.0). -# AUGUSTUS is a gene prediction tool written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de), -# Oliver Keller, Stefanie König and Lizzy Gerischer. -# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008), -# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding -# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013 -# No extrinsic information on sequences given. -# Initialising the parameters using config directory /home/galaxy/galaxy/dependency_dir/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... -# human version. Using default transition matrix. -# Looks like /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_2.dat is in fasta format. -# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. -# -# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 1 on both strands -# start gene contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS gene 641 23169 1 - . ID=contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS transcript 641 23169 . - . ID=contig1.g1.t1;Parent=contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS CDS 641 5409 . - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 13455 13545 . - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 17461 17543 . - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 23019 23169 . - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS start_codon 23167 23169 . - 0 Parent=contig1.g1.t1 -# coding sequence = [atgcacattcagttgtctactctcgcctttcaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtgatagacgat -# ccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaataggagctgtaggtgttgctgataaatgtagt -# gcggatgcagaagttttaccgctgcattttgttggtgcgccaggttcgaaactgatgtcgagtcatgcaattgcttttcctataagtagccgagaatt -# gaacttacagatatctctaagatttttaatatttgcttacgaatacgctagcgcatgcgaaatttacagccttccgcggtttccatcaacgcctcaat -# ttgtcgcagttccattggcggctaatgatgaaaatgcatcaacatatgcatttgtaggtcctgcacgatattcatggaaagaagaggatattttatat -# 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ID=contig1.g2 -contig1 AUGUSTUS transcript 23330 23599 . - . ID=contig1.g2.t1;Parent=contig1.g2 -contig1 AUGUSTUS CDS 23330 23599 . - 0 ID=contig1.g2.t1.cds;Parent=contig1.g2.t1 -contig1 AUGUSTUS start_codon 23597 23599 . - 0 Parent=contig1.g2.t1 -# coding sequence = [atgtgccacttcggcgacacttctcggagtcacttcggcgacactttcagatgtcgttcctggaagtggcaccgaagac -# acttcaagaagagtcgccgaactgacttctcgaagggtcgccgaaatgactccaagaagtgccgccgaagtggcacatttcttcgccgaagtgactcc -# aagaagtgccgccaaaatggcacatttcttcccgacgggagtgacttccgcgacccgaatgcaatatcgcggacgatagttttcatctcctag] -# protein sequence = [MCHFGDTSRSHFGDTFRCRSWKWHRRHFKKSRRTDFSKGRRNDSKKCRRSGTFLRRSDSKKCRQNGTFLPDGSDFRDP -# NAISRTIVFIS] -# end gene contig1.g2 -### -# start gene contig1.g3 -contig1 AUGUSTUS gene 26833 29171 1 + . ID=contig1.g3 -contig1 AUGUSTUS transcript 26833 29171 . + . ID=contig1.g3.t1;Parent=contig1.g3 -contig1 AUGUSTUS start_codon 26833 26835 . + 0 Parent=contig1.g3.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 26833 26874 . + 0 ID=contig1.g3.t1.cds;Parent=contig1.g3.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 27762 28167 . + 0 ID=contig1.g3.t1.cds;Parent=contig1.g3.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 29020 29171 . + 2 ID=contig1.g3.t1.cds;Parent=contig1.g3.t1 -# coding sequence = [atgaccaatgggacttcgctgcctttattgacatcctgccggtggtacaaactcttccaagatggccgggaagatgcca -# atgacgagcctcgctctggacgcccaagcacgtcaacaactgataaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcgaatcactatc -# agagaagttgctgaagatgtcggtatatcgcttggctcgtgccatgacattttatcaaatgttttgggcatgagtcgtgtgtcaacgaagtttgttcc -# aaaattgctgaattttgaccaaaggaaccgtcgcatgagcatcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtca -# taactggtgacgaatcatgggtatatggttataatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatggaagagcccagagggtataatgatttcagtcaga -# agtttgcaacgctgtgaaggagacgtttccgaccctatatatatattcttgatcagcgtcacaagacgagtcgatctagccatgtccgtctgtccgtc -# cgtctataggaactatcggggaaaaaattaa] -# protein sequence = [MTNGTSLPLLTSCRWYKLFQDGREDANDEPRSGRPSTSTTDKNVQAVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHDILS -# NVLGMSRVSTKFVPKLLNFDQRNRRMSIAQELLDDVNDDPDLLKRVITGDESWVYGYNIETKAQSSQWKSPEGIMISVRSLQRCEGDVSDPIYIFLIS -# VTRRVDLAMSVCPSVYRNYRGKN] -# end gene contig1.g3 -### -# start gene contig1.g4 -contig1 AUGUSTUS gene 30608 35231 1 - . ID=contig1.g4 -contig1 AUGUSTUS transcript 30608 35231 . - . ID=contig1.g4.t1;Parent=contig1.g4 -contig1 AUGUSTUS CDS 30608 30828 . - 2 ID=contig1.g4.t1.cds;Parent=contig1.g4.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 31729 33826 . - 0 ID=contig1.g4.t1.cds;Parent=contig1.g4.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 34107 34619 . - 0 ID=contig1.g4.t1.cds;Parent=contig1.g4.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 34707 35231 . - 0 ID=contig1.g4.t1.cds;Parent=contig1.g4.t1 -contig1 AUGUSTUS start_codon 35229 35231 . - 0 Parent=contig1.g4.t1 -# coding sequence = [atgggctcactgggtgatctccatcatgcggctgtagcagcagcggctgcaggatctctagccagcactgattttcact -# tcagcattgatggcaacaggcgattaagtagtcctcggccgcccggcggaagtattcgtgcaagcatcagcagaaaacgagcgctttcctcatcgcct -# tattcggattcgtttgacattaactcaatgattcgattttcaccaaactccttagccacaattatgaatggctctcgaggaagcagcgcggcaagtgg -# ttcatatggtcatatttcagctagtgctattaatcctatatctcatgcacattcaacattggcaccacgtctacagcatttgttacgtgcaagtgcag -# gtcttttaaatccgatgaatacacaacaagcagctgcggccgggttttctataagccacgctgcaagcgctgcagccttaagcctcaacgacgttcat -# 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NVVNSYALTSTSGLTAINKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLIATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPA -# GEQEIDKEIPNNILRRQSEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSSSNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELIL -# PDEMLQYLNLVKDDQNYMEKDDVAIRSTVPKTIKSNENLLLSKSNLNPIKKQIILPTSNFDVSINLQPNTSNLQTQEEHTMTTIGGLPSQREQNIVPH -# QHEKTKCRSFPQEIDKTINIDIGFKEQPYPSSAYQPQITKSNQNEIIDSSMTSLPELNPIFTKINSENVSKLHRDQNSEIQCGIVSASTEQRSGAVLC -# GIFLRNFCYFRDVSAAIDNTQSREQTVTCVCLHFSSVRFRLNVPTSCRAAPLRVAPLQCT] -# end gene contig1.g4 -### -# -# ----- prediction on sequence number 2 (length = 45017, name = contig2) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 2 on both strands -# start gene contig2.g5 -contig2 AUGUSTUS gene 7745 8002 1 - . ID=contig2.g5 -contig2 AUGUSTUS transcript 7745 8002 . - . ID=contig2.g5.t1;Parent=contig2.g5 -contig2 AUGUSTUS CDS 7745 8002 . - 0 ID=contig2.g5.t1.cds;Parent=contig2.g5.t1 -contig2 AUGUSTUS start_codon 8000 8002 . - 0 Parent=contig2.g5.t1 -# coding sequence = [atgcacattcagttgtctactctcgcctttcaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtgatagacgat -# ccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaataggaggtgacctccagtcgattcaacacaac -# tcaagtttcggtgcgataattcctggcgttcgcatgtcgcccctcgtcctcatcgggtcccgcgtctataactgcggctga] -# protein sequence = [MHIQLSTLAFQVQTADEFVVDARDRRSFIQRRCRPANSLRTASREESGIGGDLQSIQHNSSFGAIIPGVRMSPLVLIG -# SRVYNCG] -# end gene contig2.g5 -### -# start gene contig2.g6 -contig2 AUGUSTUS gene 8163 8432 1 - . ID=contig2.g6 -contig2 AUGUSTUS transcript 8163 8432 . - . ID=contig2.g6.t1;Parent=contig2.g6 -contig2 AUGUSTUS CDS 8163 8432 . - 0 ID=contig2.g6.t1.cds;Parent=contig2.g6.t1 -contig2 AUGUSTUS start_codon 8430 8432 . - 0 Parent=contig2.g6.t1 -# coding sequence = [atgtgccacttcggcgacacttctcggagtcacttcggcgacactttcagatgtcgttcctggaagtggcaccgaagac -# acttcaagaagagtcgccgaactgacttctcgaagggtcgccgaaatgactccaagaagtgccgccgaagtggcacatttcttcgccgaagtgactcc -# aagaagtgccgccaaaatggcacatttcttcccgacgggagtgacttccgcgacccgaatgcaatatcgcggacgatagttttcatctcctag] -# protein sequence = [MCHFGDTSRSHFGDTFRCRSWKWHRRHFKKSRRTDFSKGRRNDSKKCRRSGTFLRRSDSKKCRQNGTFLPDGSDFRDP -# NAISRTIVFIS] -# end gene contig2.g6 -### -# start gene contig2.g7 -contig2 AUGUSTUS gene 11666 14004 1 + . ID=contig2.g7 -contig2 AUGUSTUS transcript 11666 14004 . + . 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ID=contig3.g11 -contig3 AUGUSTUS transcript 13986 36983 . + . ID=contig3.g11.t1;Parent=contig3.g11 -contig3 AUGUSTUS start_codon 13986 13988 . + 0 Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 13986 14150 . + 0 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 16593 16638 . + 0 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 19590 19687 . + 2 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 23124 23235 . + 0 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 29024 29111 . + 2 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 30793 30942 . + 1 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 34889 36983 . + 1 ID=contig3.g11.t1.cds;Parent=contig3.g11.t1 -# coding sequence = [atgcctcacacacacagcaggcatggatcatctggagatgatttatgcagtactgacgaagtgaagatatttaaagacg -# aaggagaccgtgaagatgaaaaaatatcatctgaaaacttattagttgaagagaagtcgagcctaatagatttaactgaaagtgaggaaaagggtcaa -# aaaattgcgcggccggaccacagtcctgtttttaataaactcgatacacatgctcctagcttcaatatgggatatttagtttcaccctattcctatgg -# aaatggaactccaagtggattgcctgtcacaatggccaacaaaattggactacctccgtttttttgtcacaatacagacccgttaacgacaccacctc -# cagcacattgcggaattccaccttatcaacttgatccgaagactatgggcctaactcgaccagcgatatacccatttccaggaggtcaatatccttat -# tcaatgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatgtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcacca -# tgttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaaggtttattg -# aaatacctataatgcccaactgtggaacatccaatggtggaaggacatcggatttaaaagaaatatcaaacagcaaaagaagtagtcgccatgaagaa -# caacgattgaagcaacataagaaattctttaataatttaaaagcggttcaggacaatcttggtaactcccgtgatcaatataaggtatccactaacaa -# cagtactagtgatgattttgaaaacatctttgttgttccatcaagaagttcggcaggaatagcatcgtcgttatccgaactgctcttaagccagcatt -# ggcaaaacagaaagacaccagaaacagatagttatcaagaagaggtttttcgcaatcataatgaactattttcctgcatatacactaatagtatgcta -# aatcaacaaaaatgttcggagcagcagcttttggccacgcaacttttttatgcacggcttcttcacccacacttagcagaacaagaatccttttctga -# gaaattcactgatagcgccgcaaatatgattcatcacgcagaattaaaaaagcccatgattggacataatgaacttccacgaacccaatcttcgcaag -# ataataataacaatattgagttgacgaatgatttagaaaattgttcaagatgtggtgatcaaccaatatttaaatttactaaacttaaaaaaaatcag -# aaaactgtgcaaaagaatatgcaggaattggaaaattgtaattctattttaaataaagaacagaaaattagccaaagtaaggaatccaaatgcacaga -# tgactatgatctacaacacacgtgtgagtttatccgggaaaacaaaaacgtacttatcgacgttaaaaatagactcgaaaaactttctgtactatcag -# ctaaatttaggaaaagcctgagtgcgcgtcaatattatgttgatgtaaataatggttcggattcagcccttgaggcaactgtgggacgacaactagat -# gggaattgcaagtcaattgaaagcgtactggaacaagtaaaacggctttataataagtggagcagcgctgagctctactaccgtcgaagtttacaacg -# cttaggactcacatcagaagaaggtgttgaatgcagtcctacgccaacgcacattattatggctttggctgcaatagcattatcagaagaaaaggagc -# tatcagtgaaggaaaccactggtattgactcaaagctcctcgaaattgaaagcgtgtctataaaacctaaaacactgaacgaaatagaggatataata -# ttacaactatcttcagctgttaatatgcatcaatctagtgtaccttgcaccacacctgatgtatatagtgatggagtcaagagcgatttcgtagaaac -# aactttaatacccaattgcatttggcatactaataagcagagatttcggcataaagaggagggtgagcattgtaccaccgcagctgaaattattttag -# aatatgcttcattgtcttcatcatctaatgcaaacacgatacgcgtgcctgacacttttagatctgtttccaactttactgacgctatagaaaatttt -# agtgtcacaacacagtctcctaatattttaaacaacaatcgtgaaggctcagctgtgtcaatcatttccgatccttcattttttcctgagttttctac -# tgcaccttctacaccttcgacaagtagtaatagtggctgctcgactggaatagtatctggaatttttggattgggtcacaatcgcagaaaaccacgat -# tcgcaaggcgtattgaaactcagacttcagattcttctaaacctaatgttataaaagagagtgacgatcaggaattatctaaccatcttcttacttcg -# tcaaaatcaactaaaacagcaaataatttgtgccctcaaattcttacgactacaccttcaattaaaattgctgtgacaacgacgcaagaacgttcaat -# aagtaacatgttcgaagcacggctttgtgcattatcgacagatactggatccctcgagtctgaaattgtaccaatgctggatgctccgtatgacttaa -# gtattggaaccaagataaaacccatgtaa] -# protein sequence = [MPHTHSRHGSSGDDLCSTDEVKIFKDEGDREDEKISSENLLVEEKSSLIDLTESEEKGQKIARPDHSPVFNKLDTHAP -# SFNMGYLVSPYSYGNGTPSGLPVTMANKIGLPPFFCHNTDPLTTPPPAHCGIPPYQLDPKTMGLTRPAIYPFPGGQYPYSMLSSDMSQVASCDFPFRF -# SPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGVQDTTTNNRYPRFIEIPIMPNCGTSNGGRTSDLKEISNSKRSSRHEEQRLKQHKKFFNNLKAVQDN -# LGNSRDQYKVSTNNSTSDDFENIFVVPSRSSAGIASSLSELLLSQHWQNRKTPETDSYQEEVFRNHNELFSCIYTNSMLNQQKCSEQQLLATQLFYAR -# LLHPHLAEQESFSEKFTDSAANMIHHAELKKPMIGHNELPRTQSSQDNNNNIELTNDLENCSRCGDQPIFKFTKLKKNQKTVQKNMQELENCNSILNK -# EQKISQSKESKCTDDYDLQHTCEFIRENKNVLIDVKNRLEKLSVLSAKFRKSLSARQYYVDVNNGSDSALEATVGRQLDGNCKSIESVLEQVKRLYNK -# WSSAELYYRRSLQRLGLTSEEGVECSPTPTHIIMALAAIALSEEKELSVKETTGIDSKLLEIESVSIKPKTLNEIEDIILQLSSAVNMHQSSVPCTTP -# DVYSDGVKSDFVETTLIPNCIWHTNKQRFRHKEEGEHCTTAAEIILEYASLSSSSNANTIRVPDTFRSVSNFTDAIENFSVTTQSPNILNNNREGSAV -# SIISDPSFFPEFSTAPSTPSTSSNSGCSTGIVSGIFGLGHNRRKPRFARRIETQTSDSSKPNVIKESDDQELSNHLLTSSKSTKTANNLCPQILTTTP -# SIKIAVTTTQERSISNMFEARLCALSTDTGSLESEIVPMLDAPYDLSIGTKIKPM] -# end gene contig3.g11 -### -# -# ----- prediction on sequence number 4 (length = 55011, name = contig4) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 4 on both strands -# start gene contig4.g12 -contig4 AUGUSTUS gene 3984 26981 1 + . ID=contig4.g12 -contig4 AUGUSTUS transcript 3984 26981 . + . ID=contig4.g12.t1;Parent=contig4.g12 -contig4 AUGUSTUS start_codon 3984 3986 . + 0 Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 3984 4148 . + 0 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 6591 6636 . + 0 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 9588 9685 . + 2 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 13122 13233 . + 0 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 19022 19109 . + 2 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 20791 20940 . + 1 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 24887 26981 . + 1 ID=contig4.g12.t1.cds;Parent=contig4.g12.t1 -# coding sequence = [atgcctcacacacacagcaggcatggatcatctggagatgatttatgcagtactgacgaagtgaagatatttaaagacg -# aaggagaccgtgaagatgaaaaaatatcatctgaaaacttattagttgaagagaagtcgagcctaatagatttaactgaaagtgaggaaaagggtcaa -# aaaattgcgcggccggaccacagtcctgtttttaataaactcgatacacatgctcctagcttcaatatgggatatttagtttcaccctattcctatgg -# aaatggaactccaagtggattgcctgtcacaatggccaacaaaattggactacctccgtttttttgtcacaatacagacccgttaacgacaccacctc -# cagcacattgcggaattccaccttatcaacttgatccgaagactatgggcctaactcgaccagcgatatacccatttccaggaggtcaatatccttat -# tcaatgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatgtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcacca -# tgttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaaggtttattg -# aaatacctataatgcccaactgtggaacatccaatggtggaaggacatcggatttaaaagaaatatcaaacagcaaaagaagtagtcgccatgaagaa -# caacgattgaagcaacataagaaattctttaataatttaaaagcggttcaggacaatcttggtaactcccgtgatcaatataaggtatccactaacaa -# cagtactagtgatgattttgaaaacatctttgttgttccatcaagaagttcggcaggaatagcatcgtcgttatccgaactgctcttaagccagcatt -# ggcaaaacagaaagacaccagaaacagatagttatcaagaagaggtttttcgcaatcataatgaactattttcctgcatatacactaatagtatgcta -# aatcaacaaaaatgttcggagcagcagcttttggccacgcaacttttttatgcacggcttcttcacccacacttagcagaacaagaatccttttctga -# gaaattcactgatagcgccgcaaatatgattcatcacgcagaattaaaaaagcccatgattggacataatgaacttccacgaacccaatcttcgcaag -# ataataataacaatattgagttgacgaatgatttagaaaattgttcaagatgtggtgatcaaccaatatttaaatttactaaacttaaaaaaaatcag -# aaaactgtgcaaaagaatatgcaggaattggaaaattgtaattctattttaaataaagaacagaaaattagccaaagtaaggaatccaaatgcacaga -# tgactatgatctacaacacacgtgtgagtttatccgggaaaacaaaaacgtacttatcgacgttaaaaatagactcgaaaaactttctgtactatcag -# ctaaatttaggaaaagcctgagtgcgcgtcaatattatgttgatgtaaataatggttcggattcagcccttgaggcaactgtgggacgacaactagat -# gggaattgcaagtcaattgaaagcgtactggaacaagtaaaacggctttataataagtggagcagcgctgagctctactaccgtcgaagtttacaacg -# cttaggactcacatcagaagaaggtgttgaatgcagtcctacgccaacgcacattattatggctttggctgcaatagcattatcagaagaaaaggagc -# tatcagtgaaggaaaccactggtattgactcaaagctcctcgaaattgaaagcgtgtctataaaacctaaaacactgaacgaaatagaggatataata -# ttacaactatcttcagctgttaatatgcatcaatctagtgtaccttgcaccacacctgatgtatatagtgatggagtcaagagcgatttcgtagaaac -# aactttaatacccaattgcatttggcatactaataagcagagatttcggcataaagaggagggtgagcattgtaccaccgcagctgaaattattttag -# aatatgcttcattgtcttcatcatctaatgcaaacacgatacgcgtgcctgacacttttagatctgtttccaactttactgacgctatagaaaatttt -# agtgtcacaacacagtctcctaatattttaaacaacaatcgtgaaggctcagctgtgtcaatcatttccgatccttcattttttcctgagttttctac -# tgcaccttctacaccttcgacaagtagtaatagtggctgctcgactggaatagtatctggaatttttggattgggtcacaatcgcagaaaaccacgat -# tcgcaaggcgtattgaaactcagacttcagattcttctaaacctaatgttataaaagagagtgacgatcaggaattatctaaccatcttcttacttcg -# tcaaaatcaactaaaacagcaaataatttgtgccctcaaattcttacgactacaccttcaattaaaattgctgtgacaacgacgcaagaacgttcaat -# aagtaacatgttcgaagcacggctttgtgcattatcgacagatactggatccctcgagtctgaaattgtaccaatgctggatgctccgtatgacttaa -# gtattggaaccaagataaaacccatgtaa] -# protein sequence = [MPHTHSRHGSSGDDLCSTDEVKIFKDEGDREDEKISSENLLVEEKSSLIDLTESEEKGQKIARPDHSPVFNKLDTHAP -# SFNMGYLVSPYSYGNGTPSGLPVTMANKIGLPPFFCHNTDPLTTPPPAHCGIPPYQLDPKTMGLTRPAIYPFPGGQYPYSMLSSDMSQVASCDFPFRF -# SPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGVQDTTTNNRYPRFIEIPIMPNCGTSNGGRTSDLKEISNSKRSSRHEEQRLKQHKKFFNNLKAVQDN -# LGNSRDQYKVSTNNSTSDDFENIFVVPSRSSAGIASSLSELLLSQHWQNRKTPETDSYQEEVFRNHNELFSCIYTNSMLNQQKCSEQQLLATQLFYAR -# LLHPHLAEQESFSEKFTDSAANMIHHAELKKPMIGHNELPRTQSSQDNNNNIELTNDLENCSRCGDQPIFKFTKLKKNQKTVQKNMQELENCNSILNK -# EQKISQSKESKCTDDYDLQHTCEFIRENKNVLIDVKNRLEKLSVLSAKFRKSLSARQYYVDVNNGSDSALEATVGRQLDGNCKSIESVLEQVKRLYNK -# WSSAELYYRRSLQRLGLTSEEGVECSPTPTHIIMALAAIALSEEKELSVKETTGIDSKLLEIESVSIKPKTLNEIEDIILQLSSAVNMHQSSVPCTTP -# DVYSDGVKSDFVETTLIPNCIWHTNKQRFRHKEEGEHCTTAAEIILEYASLSSSSNANTIRVPDTFRSVSNFTDAIENFSVTTQSPNILNNNREGSAV -# SIISDPSFFPEFSTAPSTPSTSSNSGCSTGIVSGIFGLGHNRRKPRFARRIETQTSDSSKPNVIKESDDQELSNHLLTSSKSTKTANNLCPQILTTTP -# SIKIAVTTTQERSISNMFEARLCALSTDTGSLESEIVPMLDAPYDLSIGTKIKPM] -# end gene contig4.g12 -### -# start gene contig4.g13 -contig4 AUGUSTUS gene 36975 51981 1 + . ID=contig4.g13 -contig4 AUGUSTUS transcript 36975 51981 . + . ID=contig4.g13.t1;Parent=contig4.g13 -contig4 AUGUSTUS start_codon 36975 36977 . + 0 Parent=contig4.g13.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 36975 37059 . + 0 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 37833 37902 . + 2 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 -contig4 AUGUSTUS CDS 50913 51981 . + 1 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 -# coding sequence = [atgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctctcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacg -# acggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaatggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgt -# tatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacacggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacga -# tgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagtaataaaataggggatgacgacaccgagtctttaaatcaatctatgccaagcccag -# gctgtctaagtggattgtccagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctctt -# ttgatcgtcaacgcagatccgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaac -# cccaaatacctcaagtacagtttcgccagttacaggtacgacgggtccatcaccaagttcatcccatgaaagggccatgatgcttggaaatcgattta -# gtcacttgggaatggggttgagccctccagtagttagctcaagtagctgtaaccctgacacattttttcagcaacatcccacactttgtaataatgct -# ataatttcattgccatcgattggtaacagtagtttacaccactcttcaatgccaaacatttcccgaaaccctattggtgctaacccaagggatattaa -# taatccgttgagcattaatcagttaactaaaagacgtgaatatcaaaatgttgaattaatgaaagatagtagctcacagacgattgtcgctcatgcag -# ctacttctattattcatcatgtggcggcacatggctatcgcgcgaaccactctcttctaaatagcacttttagccaacatttccatcaacaattaact -# aaccatattgaaacagctaaaatgattgagccgacaatgttgtcggtgagtactcatgctgtaaatagcactgagtgccataaaggatcagatccaca -# agcaaatgcatctgtaaagactacaagcgctggcgcttccgaaactggcgtcattagcgtttcataa] -# protein sequence = [MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDE -# HGSQLSDDDDDDYDDDKLGGSCGSADESNKIGDDDTESLNQSMPSPGCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVST -# SGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTGTTGPSPSSSHERAMMLGNRFSHLGMGLSPPVVSSSSCNPDTFFQQHPTLCNNAIISLPSIGNSSLHHSSMPN -# ISRNPIGANPRDINNPLSINQLTKRREYQNVELMKDSSSQTIVAHAATSIIHHVAAHGYRANHSLLNSTFSQHFHQQLTNHIETAKMIEPTMLSVSTH -# AVNSTECHKGSDPQANASVKTTSAGASETGVISVS] -# end gene contig4.g13 -### -# -# ----- prediction on sequence number 5 (length = 50018, name = contig5) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 5 on both strands -# start gene contig5.g14 -contig5 AUGUSTUS gene 279 1979 1 + . ID=contig5.g14 -contig5 AUGUSTUS transcript 279 1979 . + . ID=contig5.g14.t1;Parent=contig5.g14 -contig5 AUGUSTUS start_codon 279 281 . + 0 Parent=contig5.g14.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 279 1979 . + 0 ID=contig5.g14.t1.cds;Parent=contig5.g14.t1 -# coding sequence = [atgctaaatcaacaaaaatgttcggagcagcagcttttggccacgcaacttttttatgcacggcttcttcacccacact -# tagcagaacaagaatccttttctgagaaattcactgatagcgccgcaaatatgattcatcacgcagaattaaaaaagcccatgattggacataatgaa -# cttccacgaacccaatcttcgcaagataataataacaatattgagttgacgaatgatttagaaaattgttcaagatgtggtgatcaaccaatatttaa -# atttactaaacttaaaaaaaatcagaaaactgtgcaaaagaatatgcaggaattggaaaattgtaattctattttaaataaagaacagaaaattagcc -# aaagtaaggaatccaaatgcacagatgactatgatctacaacacacgtgtgagtttatccgggaaaacaaaaacgtacttatcgacgttaaaaataga -# ctcgaaaaactttctgtactatcagctaaatttaggaaaagcctgagtgcgcgtcaatattatgttgatgtaaataatggttcggattcagcccttga -# ggcaactgtgggacgacaactagatgggaattgcaagtcaattgaaagcgtactggaacaagtaaaacggctttataataagtggagcagcgctgagc -# tctactaccgtcgaagtttacaacgcttaggactcacatcagaagaaggtgttgaatgcagtcctacgccaacgcacattattatggctttggctgca -# atagcattatcagaagaaaaggagctatcagtgaaggaaaccactggtattgactcaaagctcctcgaaattgaaagcgtgtctataaaacctaaaac -# actgaacgaaatagaggatataatattacaactatcttcagctgttaatatgcatcaatctagtgtaccttgcaccacacctgatgtatatagtgatg -# gagtcaagagcgatttcgtagaaacaactttaatacccaattgcatttggcatactaataagcagagatttcggcataaagaggagggtgagcattgt -# accaccgcagctgaaattattttagaatatgcttcattgtcttcatcatctaatgcaaacacgatacgcgtgcctgacacttttagatctgtttccaa -# ctttactgacgctatagaaaattttagtgtcacaacacagtctcctaatattttaaacaacaatcgtgaaggctcagctgtgtcaatcatttccgatc -# cttcattttttcctgagttttctactgcaccttctacaccttcgacaagtagtaatagtggctgctcgactggaatagtatctggaatttttggattg -# ggtcacaatcgcagaaaaccacgattcgcaaggcgtattgaaactcagacttcagattcttctaaacctaatgttataaaagagagtgacgatcagga -# attatctaaccatcttcttacttcgtcaaaatcaactaaaacagcaaataatttgtgccctcaaattcttacgactacaccttcaattaaaattgctg -# tgacaacgacgcaagaacgttcaataagtaacatgttcgaagcacggctttgtgcattatcgacagatactggatccctcgagtctgaaattgtacca -# atgctggatgctccgtatgacttaagtattggaaccaagataaaacccatgtaa] -# protein sequence = [MLNQQKCSEQQLLATQLFYARLLHPHLAEQESFSEKFTDSAANMIHHAELKKPMIGHNELPRTQSSQDNNNNIELTND -# LENCSRCGDQPIFKFTKLKKNQKTVQKNMQELENCNSILNKEQKISQSKESKCTDDYDLQHTCEFIRENKNVLIDVKNRLEKLSVLSAKFRKSLSARQ -# YYVDVNNGSDSALEATVGRQLDGNCKSIESVLEQVKRLYNKWSSAELYYRRSLQRLGLTSEEGVECSPTPTHIIMALAAIALSEEKELSVKETTGIDS -# KLLEIESVSIKPKTLNEIEDIILQLSSAVNMHQSSVPCTTPDVYSDGVKSDFVETTLIPNCIWHTNKQRFRHKEEGEHCTTAAEIILEYASLSSSSNA -# NTIRVPDTFRSVSNFTDAIENFSVTTQSPNILNNNREGSAVSIISDPSFFPEFSTAPSTPSTSSNSGCSTGIVSGIFGLGHNRRKPRFARRIETQTSD -# SSKPNVIKESDDQELSNHLLTSSKSTKTANNLCPQILTTTPSIKIAVTTTQERSISNMFEARLCALSTDTGSLESEIVPMLDAPYDLSIGTKIKPM] -# end gene contig5.g14 -### -# start gene contig5.g15 -contig5 AUGUSTUS gene 11973 36922 1 + . ID=contig5.g15 -contig5 AUGUSTUS transcript 11973 36922 . + . ID=contig5.g15.t1;Parent=contig5.g15 -contig5 AUGUSTUS start_codon 11973 11975 . + 0 Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 11973 12057 . + 0 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 12831 12900 . + 2 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 25911 26359 . + 1 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 30010 30157 . + 2 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 36067 36196 . + 1 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 36761 36922 . + 0 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 -# coding sequence = [atgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctctcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacg -# acggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaatggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgt -# tatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacacggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacga -# tgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagtaataaaataggggatgacgacaccgagtctttaaatcaatctatgccaagcccag -# gctgtctaagtggattgtccagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctctt -# ttgatcgtcaacgcagatccgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaac -# cccaaatacctcaagtacagtttcgccagttacaggaactggaaaaaaacccaaggcccaatacatacacatttcgtatcaaaataaaataggagaaa -# acgctatagtcgatgccatcgactatcaaacacccgttattcagctaatggtgcgatggagatatgcagcgaaacgactcattacgttgatattcgac -# cgtcacaatgtaatagtgctagaagaaatgcatagttggacccgaactttcgatgacaatgctttgctgttaatcttttaccttaccaaagtcaacag -# caagattctgcagaatgcggtaagcacacggcaaactacaggagcgatatacaaagagatgaatgaccgcatgcgaaaatcgacagtaaagcgtcatc -# agaatacccaacatgcgtacacttactcgcgtacgacgccgaaagtatttttcgacacggttgcaagatactcatttggttaa] -# protein sequence = [MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDE -# HGSQLSDDDDDDYDDDKLGGSCGSADESNKIGDDDTESLNQSMPSPGCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVST -# SGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTGTGKKPKAQYIHISYQNKIGENAIVDAIDYQTPVIQLMVRWRYAAKRLITLIFDRHNVIVLEEMHSWTRTFDD -# NALLLIFYLTKVNSKILQNAVSTRQTTGAIYKEMNDRMRKSTVKRHQNTQHAYTYSRTTPKVFFDTVARYSFG] -# end gene contig5.g15 -### -# start gene contig5.g16 -contig5 AUGUSTUS gene 41718 45058 1 - . ID=contig5.g16 -contig5 AUGUSTUS transcript 41718 45058 . - . ID=contig5.g16.t1;Parent=contig5.g16 -contig5 AUGUSTUS CDS 41718 41878 . - 2 ID=contig5.g16.t1.cds;Parent=contig5.g16.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 43689 44665 . - 1 ID=contig5.g16.t1.cds;Parent=contig5.g16.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 45006 45058 . - 0 ID=contig5.g16.t1.cds;Parent=contig5.g16.t1 -contig5 AUGUSTUS start_codon 45056 45058 . - 0 Parent=contig5.g16.t1 -# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactaggtccgatcactctagaagttcctcatt -# tcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgagagcataacctatacgaaagtgagggaaat -# ataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgtatcgttcgaatagtaacgcaaaacatacc -# gcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagttttctctacagcagtaccgcaggttcaag -# ctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttggttggatgttctaagctgcttggccaaggt -# gttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagtattcctgctccaaaagcttgtaccaaaag -# tatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattaccggtggtcaaacgcgtgcaacttgggagg -# atgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagcccgtttttggctgatggattgtcgcaatgtt -# gtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagtttgttgtcttcgctaaacgtctctctaaaat -# agaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaatactttacagaggttgcaaaaagtagggata -# ttgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccgacgaccgcccggtcggtcaagttgaaaat -# aagcggttgaaagagtggttgatcgatccgtggtatcaagaggtgttgttctggagaccgaagcgattccgagattatggcttgtattcgcaacatca -# tacggtgcgttctttattgtccaagttcgcataa] -# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDEL -# HTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRVRQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKA -# ITLSIPAPKACTKSMVNACYGNGNSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPF -# LVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCMTDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTDDRPVGQVENKRLKEWLIDPWYQEVLFWR -# PKRFRDYGLYSQHHTVRSLLSKFA] -# end gene contig5.g16 -### -# start gene contig5.g17 -contig5 AUGUSTUS gene 45583 49961 1 + . ID=contig5.g17 -contig5 AUGUSTUS transcript 45583 49961 . + . ID=contig5.g17.t1;Parent=contig5.g17 -contig5 AUGUSTUS start_codon 45583 45585 . + 0 Parent=contig5.g17.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 45583 45635 . + 0 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 48673 48804 . + 1 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 -contig5 AUGUSTUS CDS 49826 49961 . + 1 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 -# coding sequence = [atgttgactgactcgtccctagctacgcttcggtcttgcttaaatatgttaaggaacattgaaccagtggcatggttgg -# gctggaagacgtttctgagatgtgaagcaaaagtttcggtgcggacccagctgccagatgaacttcttatcggagtgactgtttcaattggagagctg -# agaattggattccggtctgaccggaacaacatgaaagtttccgtccccggtcagcgcaacaagtctgttgaccaaggcattcgagattttctccctaa -# tgagcctgttctgattcgttttctgctagaagcgcacatctattga] -# protein sequence = [MLTDSSLATLRSCLNMLRNIEPVAWLGWKTFLRCEAKVSVRTQLPDELLIGVTVSIGELRIGFRSDRNNMKVSVPGQR -# NKSVDQGIRDFLPNEPVLIRFLLEAHIY] -# end gene contig5.g17 -### -# -# ----- prediction on sequence number 6 (length = 40015, name = contig6) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 6 on both strands -# start gene contig6.g18 -contig6 AUGUSTUS gene 6556 38460 1 - . ID=contig6.g18 -contig6 AUGUSTUS transcript 6556 38460 . - . ID=contig6.g18.t1;Parent=contig6.g18 -contig6 AUGUSTUS CDS 6556 6707 . - 2 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 6857 6980 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 11739 11869 . - 2 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 13680 14656 . - 1 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 14997 15090 . - 2 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 21782 22112 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 26021 26962 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 28916 29941 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 32704 32811 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 37450 37586 . - 2 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 38424 38460 . - 0 ID=contig6.g18.t1.cds;Parent=contig6.g18.t1 -contig6 AUGUSTUS start_codon 38458 38460 . - 0 Parent=contig6.g18.t1 -# coding sequence = [atgacacttttgtttgctgcagtatgtagcctgccaggtttcaagacatcgatcgacatatgtatgattttgaggtatt -# tacgggtgtacaaaatttctagcgggataactaataaatcgggcaccactgatgaaatcgaagaaatattgatacggcagaatagcgatatctataat -# gatgcaacaatatcattcttacgtgctgcacgcagcggggacattaaaaagttaattgattatcttgaaagtggtgaaatatcaaatataaacagttg -# caatgcgaacggtttaaatgcacttcatttggctgctaaggatggatttgtggatatatgctgtgagttgctaaggagaggcatagcggttgataatg -# ctacaaaaaagggaaacacagcgttgcacattgcatctttggcaggccagcaagaggttatcaatcagcttattaaggccaatgccaatgtgaacgtt -# cagtcccttaatggattcacacctctttatatggcagcccaagaaaaccacgataactgttgtcgaatattattggcaaatggagcgaacccaacatt -# atctacagaagatggttttacaccacttgcggtagctatgcagcagggtcacgaaaaaatagtagctgtcttgcttgaaactgatgttcgcggtaagg -# ttcgcctcccagcacttcacatcgctgcaaaaaagaacgatgtaaacgcagccaaacttttactccaacacgatcaaaatgccgacattgtttccaaa -# tctggttttacaccgttgcatatagcagcgcattatggaaatgttgaaatcgccactttacttttaaataacgatgcagatgttaactatgttgccaa -# 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tctgtgtgcgcgaaacggtcaaagtgctcttcacatcgctgcgaagcaaaataatctggaaattgcactgcagttactgcaacatggtgcagacgttg -# tggttataagcaaaagcggcttttctcccttacatttggcggcccaagaaggacacgttgatatggtagaactactcctagaatatggcgctacaagt -# accgctgccaaaagcggcctgacaccattacatttggctgcacaggggggccatgttcatgtatgccgcattttgctggaacatggcgctaagatatc -# agagcgaactaaaaatggttattccccacttcacattgctgcgcataacggtcaccttgatcttgtgaaatttttgcttgagaacgatgctgacattg -# aaatgtcaaccaatgtcggctacacaccacttcatcaagctgctcaacaaggccacattatgattattaatctccttttacgcaacaaagcgaatcca -# aatgctttaacaaataacggtaatacagctctacacattgcaagtaatttaggatatataacggttatggaaacccttaaaactgtcacatcaacatc -# cattgttgataccaattcgggtgtgatacaagagaaatgcaaagtaatgtctccagaggttatgcatgaaactttgctttccgattgcgaagacgaag -# ttggcgatgatttgttggaccaaaatcattacaaatacatggcaactgatgatttaaaagctacttacattcaggagcaccaaaacttcgatactact -# aatcctgaacatgaccagactgatgtgtccgcttccccgatcgtcgaaaaagaaatacaacacaacggcatcaaatttataagaacatctgaaatgga -# actaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactaggtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagc -# gcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgagagcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaa -# cacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgtatcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacg -# tgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagttttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttga -# ccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttggttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcact -# gtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagtattcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaa -# tggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattaccggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgcttt -# cttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagcccgtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagc -# gaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagtttgttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttg -# 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LYSQHHTTGVGFPSLIEGHRRMRRLSEYLVNQMSILQPCRKILSASYASEFWKSPQATQTFRSEHYATACGIRSDRNNMIISVPGQRNNSVDQAVRDF] -# end gene contig6.g18 -### -# -# ----- prediction on sequence number 7 (length = 50017, name = contig7) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 7 on both strands -# start gene contig7.g19 -contig7 AUGUSTUS gene 1705 33038 1 - . ID=contig7.g19 -contig7 AUGUSTUS transcript 1705 33038 . - . ID=contig7.g19.t1;Parent=contig7.g19 -contig7 AUGUSTUS CDS 1705 1865 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 3676 4652 . - 1 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 4993 5086 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 11778 12108 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 16017 16958 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 18912 19937 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 22700 22807 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 27446 27582 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 28420 28523 . - 1 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 32797 33038 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 -contig7 AUGUSTUS start_codon 33036 33038 . - 0 Parent=contig7.g19.t1 -# coding sequence = [atgtgccacttcggcggcacttccagaagtgacttcggcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcggtaa -# gaagtatcgcagaagaagttcactcctggaagtgtcaacgaagacacttcaagaagagtcgccgaagtgacttcccaaagtgtcgccgaagtgactcc -# aagaagtgccgccgaagaggcacatttctttccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgcgatctcctactcctacgtttttgtgcaccttttggc -# cttcgcaagtactctaaatcaagaattcgtgcagatgacacttttgtttgctgcagtatgtagcctgccaggtttcaagacatcgatcgacatatgta -# tgattttgaggtatttacgggtgtacaaaatttctagcgggataactaataaatcgggcaccactgatgaaatcgaagaaatattgatacggcagaat -# agcgatatctataatgatgcaacaatatcattcttacgtgctgcacgcagcggggacattaaaaagttaattgattatcttgaaagtggtgaaatatc -# aaatataaacagttgcaatgcgaacggtttaaatgcacttcatttggctgctaaggatggatttgtggatatatgctgtgagttgctaaggagaggca -# tagcggttgataatgctacaaaaaagggaaacacagcgttgcacattgcatctttggcaggccagcaagaggttatcaatcagcttattaaggccaat -# gccaatgtgaacgttcagtcccttaatggattcacacctctttatatggcagcccaagaaaaccacgataactgttgtcgaatattattggcaaatgg -# agcgaacccaacattatctacagaagatggttttacaccacttgcggtagctatgcagcagggtcacgaaaaaatagtagctgtcttgcttgaaactg -# atgttcgcggtaaggttcgcctcccagcacttcacatcgctgcaaaaaagaacgatgtaaacgcagccaaacttttactccaacacgatcaaaatgcc -# gacattgtttccaaatctggttttacaccgttgcatatagcagcgcattatggaaatgttgaaatcgccactttacttttaaataacgatgcagatgt -# taactatgttgccaagcataatatatctcctctacacgtggcatgtaaatggggaaaactatcagtgtgtagtttgttattatctcgaggagcaaaga -# tagatgccgcgactcgtgatggcctgactccactccactgtgcctcacgttctggtcatgttgaggtcattgagcacttgttgcgtcaaaacgctccc -# atactaacaaagactaaaaatggcctgtccgcgttgcatatgtctgctcaaggagagcacgatgaggcagcgcgattattattgaataacaaggctcc -# tgtagacgaagttaccatcgattatttgaccgcacttcatgtggctgctcactgcggtcatgttaaagtagctaaactgttgctcgattacaatgcaa -# atccgaatgcccgagcacttaatggtttcaccccgcttcatatcgcttgcaaaaaaaatcgcattaagacggatataattcgaattttgctccgcagc -# gcaagagtggatgctattgcccgtgaaggccaaacgccattacatgtagcttctcgattaggaaatattaatataattatgttgttactacagcatgg -# tgcggaaattaatgctaaaactaacgacatgtattcggccttgcacattgctgcaaaagaagggcaagaagaggtagttcaagtgttattggataacg -# gtgctcaactagacgctataaccaaaaaggggtttactccattgcatttagctagcaaatacggaaaggcgaaaatagtcacattactaatagaaaga -# ggatgcgcggttaattttcagggaaaaaatgatgtgacctcattgcacgttgcaacgcactatgaccatcatgatgtggtagagatactattaaaaaa -# cggcgctttaccaaatctgtgtgcgcgaaacggtcaaagtgctcttcacatcgctgcgaagcaaaataatctggaaattgcactgcagttactgcaac -# atggtgcagacgttgtggttataagcaaaagcggcttttctcccttacatttggcggcccaagaaggacacgttgatatggtagaactactcctagaa -# tatggcgctacaagtaccgctgccaaaagcggcctgacaccattacatttggctgcacaggggggccatgttcatgtatgccgcattttgctggaaca -# tggcgctaagatatcagagcgaactaaaaatggttattccccacttcacattgctgcgcataacggtcaccttgatcttgtgaaatttttgcttgaga -# acgatgctgacattgaaatgtcaaccaatgtcggctacacaccacttcatcaagctgctcaacaaggccacattatgattattaatctccttttacgc -# aacaaagcgaatccaaatgctttaacaaataacggtaatacagctctacacattgcaagtaatttaggatatataacggttatggaaacccttaaaac -# tgtcacatcaacatccattgttgataccaattcgggtgtgatacaagagaaatgcaaagtaatgtctccagaggttatgcatgaaactttgctttccg -# attgcgaagacgaagttggcgatgatttgttggaccaaaatcattacaaatacatggcaactgatgatttaaaagctacttacattcaggagcaccaa -# aacttcgatactactaatcctgaacatgaccagactgatgtgtccgcttccccgatcgtcgaaaaagaaatacaacacaacggcatcaaatttataag -# aacatctgaaatggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactaggtccgatcactctagaagttcctcatttcggcaccc -# ttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgagagcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgat -# ttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgtatcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttt -# tgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagttttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttc -# cacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttggttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtc -# tcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagtattcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaa -# tgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattaccggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactg -# 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VEIATLLLNNDADVNYVAKHNISPLHVACKWGKLSVCSLLLSRGAKIDAATRDGLTPLHCASRSGHVEVIEHLLRQNAPILTKTKNGLSALHMSAQGE -# HDEAARLLLNNKAPVDEVTIDYLTALHVAAHCGHVKVAKLLLDYNANPNARALNGFTPLHIACKKNRIKTDIIRILLRSARVDAIAREGQTPLHVASR -# LGNINIIMLLLQHGAEINAKTNDMYSALHIAAKEGQEEVVQVLLDNGAQLDAITKKGFTPLHLASKYGKAKIVTLLIERGCAVNFQGKNDVTSLHVAT -# HYDHHDVVEILLKNGALPNLCARNGQSALHIAAKQNNLEIALQLLQHGADVVVISKSGFSPLHLAAQEGHVDMVELLLEYGATSTAAKSGLTPLHLAA -# QGGHVHVCRILLEHGAKISERTKNGYSPLHIAAHNGHLDLVKFLLENDADIEMSTNVGYTPLHQAAQQGHIMIINLLLRNKANPNALTNNGNTALHIA -# SNLGYITVMETLKTVTSTSIVDTNSGVIQEKCKVMSPEVMHETLLSDCEDEVGDDLLDQNHYKYMATDDLKATYIQEHQNFDTTNPEHDQTDVSASPI -# VEKEIQHNGIKFIRTSEMELKPDNVPIARPRVQLGPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTD -# RIVRIVTQNIPHFFAVVSRVRQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITL -# SIPAPKACTKSMVNACYGNGNSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVK -# FVVFAKRLSKIEAKFSVFCMTDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTDDRPVGQVENKRLKEWLIDPWYQEVLFWRPKR -# FRDYGLYSQHHTVRSLLSKFA] -# end gene contig7.g19 -### -# start gene contig7.g20 -contig7 AUGUSTUS gene 40037 46896 1 + . ID=contig7.g20 -contig7 AUGUSTUS transcript 40037 46896 . + . 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ID=contig8.g22.t1;Parent=contig8.g22 -contig8 AUGUSTUS start_codon 10026 10028 . + 0 Parent=contig8.g22.t1 -contig8 AUGUSTUS CDS 10026 10340 . + 0 ID=contig8.g22.t1.cds;Parent=contig8.g22.t1 -contig8 AUGUSTUS CDS 14960 16832 . + 0 ID=contig8.g22.t1.cds;Parent=contig8.g22.t1 -contig8 AUGUSTUS CDS 26536 26669 . + 2 ID=contig8.g22.t1.cds;Parent=contig8.g22.t1 -# coding sequence = [atgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgatatttgataaaaccgaac -# atgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaataaacactggaaacata -# acagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaatttattcagttcctggcagt -# aattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggggggtggtgcccaaatcatcaa -# caaatcagtttcaaatacctttaaaaaccgtggaccgcctgccttacgatcattttctttttggcatggtaacgtgtcactctataacaataatgaac -# ggtatattgatgggggatcctttggatttgaaaatgtttaattctacgggttggacaatagaagattcaaataacataccagataatgaaaaatatgg -# tattctttatccaactattttaagacaaccaaggatttgctcttccgacttgagatcatcggattcaaaaaaaaagagtcaaatcagccgtcaatcgt -# ctgtagacgatttattagcaactgttggtatctcgcaaaatcaaaaaaattttgatcatggaattgttcgagaatttccatttacgtcgagtcttcag -# cgaatgtccgttattactcgttgtctcagcgaccaagtatttaatgtttactgcaaaggttccccagagatgttacagacactttgcacaccgcaaag -# cctacccgataactattccgaacagctatcgacatttgctaaaagaggataccgaattattgccattgcattcaaacctcttgtgcaaaaaatgaact -# attcaaaaatacagcgcctatcccgcgaagaggttgaaagcaacttggaatttcttggttttgtggtactcgaaaatcgccttaagccagatactgct -# aaagtaatcaaagcgttaaactcagcaaagattcgaactattatgattactggcgataatattttaactgctatgagtgttgcacgtgattgtggtat -# tgtaagtgcatcacaagctgttataacagtgcatgcagatccgcttggaaatagtggaaatatacaaagcaataatacagatagcattgttgataaga -# aaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaacaaagtgcaatagtaaccatatt -# cccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcattagttaacgaatcgagttccag -# ttatgcagaaagtattctgccgacgagcgatagtttggccagtgtaaagaccacagacacatggacccataatgagccaacagatgtagatgctgagc -# taggaataaaccgcactcaggacgaaagctggcgccaacactacatattcgcaatggatggcggaacttggcaaattataaaagatcactttccagat -# gaaatggccattcttttaacacggggatcgatttacgcccgaatgtcacccgatcagaaacaggcactagttatagaacttcaaaatttggactactg -# tgttgccatgtgcggtgatggtgccaacgattgcggtgcgctaaaggtggctcatgctggtatttcgctaagtgagaccgaagcatccattgcgtcgc -# cctttacttcacgtaatcccacgatttcggctgttttaaaagttattaaggaaggacgtgccgcattagtcacatcctttggaatttttaaatatatg -# gcagcatattcattggttcagtttatatctgttatggttctttattctatcgactcgaatttgacagacaagcagtatctttacgtagaccttggact -# tatatcaatttttgccttcttttttggtaaaactggatcatttgatggaaatttggtcgaacaagtgcctctcagttcattgatatcttctactccat -# tagcatcccttttacttcatctcactgttgtaactggatttcaagtaattgttgacgatgatgacatgctcatcgtaaaatacgccgacgacacagcg -# gttatggtcaggagtccgagcatagatattgcaacattaggcctgccagagtacgtaacgaaaaatggacaaccgaaaggaaaatag] -# protein sequence = [MLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQTRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYK -# FEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKMFNSTGWT -# IEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQVFNVYCK -# GSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIRTIMITGD -# NILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTVGDQTLFR -# LESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIYARMSPDQ -# KQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVMVLYSIDS -# NLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIVDDDDMLIVKYADDTAVMVRSPSIDIATLGLPEYV -# TKNGQPKGK] -# end gene contig8.g22 -### -# start gene contig8.g23 -contig8 AUGUSTUS gene 30531 32551 1 + . ID=contig8.g23 -contig8 AUGUSTUS transcript 30531 32551 . + . 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ID=contig9.g24 -contig9 AUGUSTUS transcript 2758 3027 . - . ID=contig9.g24.t1;Parent=contig9.g24 -contig9 AUGUSTUS CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig9.g24.t1.cds;Parent=contig9.g24.t1 -contig9 AUGUSTUS start_codon 3025 3027 . - 0 Parent=contig9.g24.t1 -# coding sequence = [atgtgccacttcggcggcacttccagaagtgacttcggcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcggtaa -# gaagtatcgcagaagaagttcactcctggaagtgtcaacgaagacacttcaagaagagtcgccgaagtgacttcccaaagtgtcgccgaagtgactcc -# aagaagtgccgccgaagaggcacatttctttccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgcgatgtcgcggacgatagttttcatcttctag] -# protein sequence = [MCHFGGTSRSDFGDIAFGSRKSLPSVRSIAEEVHSWKCQRRHFKKSRRSDFPKCRRSDSKKCRRRGTFLSDGSDFRDP -# NAMSRTIVFIF] -# end gene contig9.g24 -### -# start gene contig9.g25 -contig9 AUGUSTUS gene 10026 26669 1 + . ID=contig9.g25 -contig9 AUGUSTUS transcript 10026 26669 . + . 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ID=contig9.g26 -contig9 AUGUSTUS transcript 30531 48218 . + . ID=contig9.g26.t1;Parent=contig9.g26 -contig9 AUGUSTUS start_codon 30531 30533 . + 0 Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 30531 30910 . + 0 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 31450 31633 . + 1 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 40172 40224 . + 0 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 40570 40692 . + 1 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 41154 41207 . + 1 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 41699 48218 . + 1 ID=contig9.g26.t1.cds;Parent=contig9.g26.t1 -# coding sequence = [atgacaaaccgcgacactttattatctaagagcaatgctctgatacaatcgtataaagaagacaccactctttttcaag -# aagaggaagactccgacgatgagcacgagctaactaatcttaattggcttttgcgaaatcaaaatttaacatggccgaaaacaattgattctagtaca -# agggaaactttaaataccggaacaaaagctgaaaaccgtatacctaactatacgcatattcatcggaaccaaataaaactgactagaggcggagacac -# 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ID=contig9.g27 -contig9 AUGUSTUS transcript 49864 58679 . + . ID=contig9.g27.t1;Parent=contig9.g27 -contig9 AUGUSTUS start_codon 49864 49866 . + 0 Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 49864 50088 . + 0 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 51436 52898 . + 0 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 54090 54199 . + 1 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 54752 55001 . + 2 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 58392 58446 . + 1 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -contig9 AUGUSTUS CDS 58644 58679 . + 0 ID=contig9.g27.t1.cds;Parent=contig9.g27.t1 -# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa -# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca -# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacagggcacaagctctgaaaactggaatttagagcgttttcgcccaatgctgaa -# tgtcgtagcaaacttaattaaaaaccaactaactaatacacaatatacgcaacttcatacacattcatttataaaaggcaaatcaggaacaacaacga -# aaaatcctatttatatacctttaaagcgaaatgtgaaaggcaaacccttaaacatgacgaatgcaaaaccaaatacggctgatttactcggaaaatta -# aaaattatggcattacatatacatcccccaatgacgtatgtactaaataagtgtctaaaacataatctaaaaaaactttcatcttccgtcggatataa -# aggaacatctatggtgtataggaacgcgttcattaatccaggtattcccattagacccggagaggttataacagccagcgctaatgttatatttggaa -# agccaagtattgagcaaaacattagaactacgataacgaatcgtcccttaacttcgataaattcgatttaccccagtgatgaaaggatccattccact -# atggtacacagttccttttcgtatgaaaatgaaattatgacagagtacgccactttattaaagcctccaccactgcctgcaaatcgactactacagta -# cacatcaacattccagtctcaaatgggaagaacgaggaatgctgcaaaaaattggttttcaccaattacagttttacaaaacaatccgatttatgatt -# actattcatctgagacacaaataaacttaaatactgacttttttgtatttcgaataccacaaattgttggtgaaagtcggccagctactgcaagttat -# actgtgtcaaacacgcttgactattctttaattcatgattgttctttcgactctttaaaaccaactttgtcttacatgacgcctatttctacattttc -# tacccttcaccaaattaaccttaaaaatgacgtcattagccatacaattaatatgcaagctcgccctctaacgtttaaaagggaatccgataatattc -# cgcacgcaacaaccgtaagaggtcatatggatagttttttaatttcacaaattaaaataccttttaatgacaaaaatgttgaagtccagttgacggcc -# aaccggaaaagagtttttcccgttcaatataaggacttaacgtcagatgagactaatattaaattggaacaacgaactaatatattaagcaactatga -# gaatgctcagcatttattttcctttaaggatattaaaacccatagcggattaaacaattatacttctatatacaaaaatgaatatttttctcaaacta -# cttctaacctcaatcattcagataatatgaatggtaaaccaataagacatgataatggaattcctaaagaaaatatagaacaatttacagagctagat -# caaaaagcagaaaactcaaacaaatcattgtactttttaagattgaacaaaaatgaattatgcgttacttatgctaataataccgagtcctcgagtct -# ttgtgaatgccgaccaagttttggacgcatgtttcccgaccgaccttgcagacattttgacgaatgtcgttacgaaaactttaacgactgttctactg -# atgccaactgttttaatttggttggcagctacacttgcagttgcaaagagggttacacagattcatctaataattatttatacccaggtcgacattgc -# tcaaataatataatcggctgcgatgattgtaactataatggcaaatgtatgaataagtcggatgaccacgggcatcaggggataaccttatgtaaatg -# cttttcttgattagatgagataacatttaatgagtacgcccataaacgaagcccattaaataagataccgcatgaatttgcaggattaagatctacat -# aa] -# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQGTS -# SENWNLERFRPMLNVVANLIKNQLTNTQYTQLHTHSFIKGKSGTTTKNPIYIPLKRNVKGKPLNMTNAKPNTADLLGKLKIMALHIHPPMTYVLNKCL -# KHNLKKLSSSVGYKGTSMVYRNAFINPGIPIRPGEVITASANVIFGKPSIEQNIRTTITNRPLTSINSIYPSDERIHSTMVHSSFSYENEIMTEYATL -# LKPPPLPANRLLQYTSTFQSQMGRTRNAAKNWFSPITVLQNNPIYDYYSSETQINLNTDFFVFRIPQIVGESRPATASYTVSNTLDYSLIHDCSFDSL -# KPTLSYMTPISTFSTLHQINLKNDVISHTINMQARPLTFKRESDNIPHATTVRGHMDSFLISQIKIPFNDKNVEVQLTANRKRVFPVQYKDLTSDETN -# IKLEQRTNILSNYENAQHLFSFKDIKTHSGLNNYTSIYKNEYFSQTTSNLNHSDNMNGKPIRHDNGIPKENIEQFTELDQKAENSNKSLYFLRLNKNE -# LCVTYANNTESSSLCECRPSFGRMFPDRPCRHFDECRYENFNDCSTDANCFNLVGSYTCSCKEGYTDSSNNYLYPGRHCSNNIIGCDDCNYNGKCMNK -# SDDHGHQGITLCKCFSXLDEITFNEYAHKRSPLNKIPHEFAGLRST] -# end gene contig9.g27 -### -# -# ----- prediction on sequence number 10 (length = 43013, name = contig10) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 10 on both strands -# start gene contig10.g28 -contig10 AUGUSTUS gene 850 16549 1 + . ID=contig10.g28 -contig10 AUGUSTUS transcript 850 16549 . + . ID=contig10.g28.t1;Parent=contig10.g28 -contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 2422 3884 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 5076 5185 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 5738 5987 . + 2 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 9378 9432 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 11823 12040 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 14155 14317 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 16317 16549 . + 2 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 -# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa -# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca -# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacagggcacaagctctgaaaactggaatttagagcgttttcgcccaatgctgaa -# tgtcgtagcaaacttaattaaaaaccaactaactaatacacaatatacgcaacttcatacacattcatttataaaaggcaaatcaggaacaacaacga -# aaaatcctatttatatacctttaaagcgaaatgtgaaaggcaaacccttaaacatgacgaatgcaaaaccaaatacggctgatttactcggaaaatta -# aaaattatggcattacatatacatcccccaatgacgtatgtactaaataagtgtctaaaacataatctaaaaaaactttcatcttccgtcggatataa -# aggaacatctatggtgtataggaacgcgttcattaatccaggtattcccattagacccggagaggttataacagccagcgctaatgttatatttggaa -# agccaagtattgagcaaaacattagaactacgataacgaatcgtcccttaacttcgataaattcgatttaccccagtgatgaaaggatccattccact -# atggtacacagttccttttcgtatgaaaatgaaattatgacagagtacgccactttattaaagcctccaccactgcctgcaaatcgactactacagta -# cacatcaacattccagtctcaaatgggaagaacgaggaatgctgcaaaaaattggttttcaccaattacagttttacaaaacaatccgatttatgatt -# 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atgccaactgttttaatttggttggcagctacacttgcagttgcaaagagggttacacagattcatctaataattatttatacccaggtcgacattgc -# tcaaataatataatcggctgcgatgattgtaactataatggcaaatgtatgaataagtcggatgaccacgggcatcaggggataaccttatgtaaatg -# cttttcttgattagatgagataacatttaatgagtacgcccataaacgaagcccattaaataaggtgcagatcaaacaagtgtctactcttatggaac -# aagcaacttgtgaacaattgatggtggctacaagctccagtttgtataaatatggaaagcgaacagcttcagaaattgttgccacacttaatacagat -# gagagtgctggacaacaaataaagaagtcattggacacaccagtgaaattacctgttcctttctcacctgatgaagcgcttgcactatgtggtggaat -# aaatgacgcaaagacctacacatactttgagatctgcgcctgccacggtttgtccaaaacaatgatgaaaacaattaatggattttcagatgcctcca -# tcaagccatattacgcagtcatctatagcccagtggtgcaagcagatggcactccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcat -# gtcaccacatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggt -# caacaatcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgtga -# 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SDDHGHQGITLCKCFSXLDEITFNEYAHKRSPLNKVQIKQVSTLMEQATCEQLMVATSSSLYKYGKRTASEIVATLNTDESAGQQIKKSLDTPVKLPV -# PFSPDEALALCGGINDAKTYTYFEICACHGLSKTMMKTINGFSDASIKPYYAVIYSPVVQADGTPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVK -# TTALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNVTSAISHSDRGSHSRREEMCHFGKSLRRLFLKCRRSHSWKCRRSDFEKCRRSG -# TFLPDGSDFRDPNAISPKSLLEVT] -# end gene contig10.g28 -### -# start gene contig10.g29 -contig10 AUGUSTUS gene 17334 17570 1 + . ID=contig10.g29 -contig10 AUGUSTUS transcript 17334 17570 . + . ID=contig10.g29.t1;Parent=contig10.g29 -contig10 AUGUSTUS start_codon 17334 17336 . + 0 Parent=contig10.g29.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 17334 17570 . + 0 ID=contig10.g29.t1.cds;Parent=contig10.g29.t1 -# coding sequence = [atgaaaactatcttccgcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcgggaagaaatgtgccacttcggcgac -# acttcgggaagtcacttcggcgactcttcttgaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgacttcgagaagtgccgccgaagtggc -# acatttcttcccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgcgatatcgccgaagttttaa] -# protein sequence = [MKTIFRDIAFGSRKSLPSGRNVPLRRHFGKSLRRLFLKCRRSHSWKCRRSDFEKCRRSGTFLPDGSDFRDPNAISPKF] -# end gene contig10.g29 -### -# start gene contig10.g30 -contig10 AUGUSTUS gene 21687 22382 1 - . ID=contig10.g30 -contig10 AUGUSTUS transcript 21687 22382 . - . 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ID=contig10.g31 -contig10 AUGUSTUS transcript 22421 22711 . - . ID=contig10.g31.t1;Parent=contig10.g31 -contig10 AUGUSTUS CDS 22421 22711 . - 0 ID=contig10.g31.t1.cds;Parent=contig10.g31.t1 -contig10 AUGUSTUS start_codon 22709 22711 . - 0 Parent=contig10.g31.t1 -# coding sequence = [atggcactcaagagacttgtcgacattgaaagtaagataagacgggatgccaactttgggcgggcttacaacttgatca -# tggaggcctacgtcaacaagggttatgcacggcgcctgaagcagcataaaggatctctgaattcagttccactcaaaggcccacaacagttcaagtct -# ctgccagccgtgatcttccattttcgggaaggagcagtcggaccacacagacataaaggagaagttttatcaggtgctgagccccacgatagatacgc -# gcgagatttctgttga] -# protein sequence = [MALKRLVDIESKIRRDANFGRAYNLIMEAYVNKGYARRLKQHKGSLNSVPLKGPQQFKSLPAVIFHFREGAVGPHRHK -# GEVLSGAEPHDRYARDFC] -# end gene contig10.g31 -### -# start gene contig10.g32 -contig10 AUGUSTUS gene 24618 27471 1 + . ID=contig10.g32 -contig10 AUGUSTUS transcript 24618 27471 . + . ID=contig10.g32.t1;Parent=contig10.g32 -contig10 AUGUSTUS start_codon 24618 24620 . + 0 Parent=contig10.g32.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 24618 24708 . + 0 ID=contig10.g32.t1.cds;Parent=contig10.g32.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 25731 25835 . + 2 ID=contig10.g32.t1.cds;Parent=contig10.g32.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 27079 27199 . + 2 ID=contig10.g32.t1.cds;Parent=contig10.g32.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 27285 27471 . + 1 ID=contig10.g32.t1.cds;Parent=contig10.g32.t1 -# coding sequence = [atgtgttacgagcttaacacccatacgagaaatacgtataacgcttttgtaaaatcacgactgatttcgaaagtattca -# tgagtgtcatggctcctttttgtattgcggctgaacaaaaagtgttgaaagatgaaactgccaatgttggtgaaatacgaatttttaaacgccttatt -# cctgctgatgttctgagagattttccggcgatgtgctttgcttccactcgatgcgctactgttgaaccagggaagacttgggacttaactccgttctg -# cggtcgttctacttgcgtgcaaaatgaggaaaatgaaacaaagcttttggaactagtagaagactgtggcccattgccactggcaaacgacaaatgta -# agttggacactgagaagacaaataaaacggcttcgtttccttactgctgccccatcttcacatgtgagcctggcgttgcattggaatatcctgaggtt -# ggaaaggaaaatgacaaaaagaatgttgagtga] -# protein sequence = [MCYELNTHTRNTYNAFVKSRLISKVFMSVMAPFCIAAEQKVLKDETANVGEIRIFKRLIPADVLRDFPAMCFASTRCA -# TVEPGKTWDLTPFCGRSTCVQNEENETKLLELVEDCGPLPLANDKCKLDTEKTNKTASFPYCCPIFTCEPGVALEYPEVGKENDKKNVE] -# end gene contig10.g32 -### -# -# ----- prediction on sequence number 11 (length = 35013, name = contig11) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 11 on both strands -# start gene contig11.g33 -contig11 AUGUSTUS gene 682 1377 1 - . ID=contig11.g33 -contig11 AUGUSTUS transcript 682 1377 . - . 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ID=contig11.g34 -contig11 AUGUSTUS transcript 1416 1706 . - . ID=contig11.g34.t1;Parent=contig11.g34 -contig11 AUGUSTUS CDS 1416 1706 . - 0 ID=contig11.g34.t1.cds;Parent=contig11.g34.t1 -contig11 AUGUSTUS start_codon 1704 1706 . - 0 Parent=contig11.g34.t1 -# coding sequence = [atggcactcaagagacttgtcgacattgaaagtaagataagacgggatgccaactttgggcgggcttacaacttgatca -# tggaggcctacgtcaacaagggttatgcacggcgcctgaagcagcataaaggatctctgaattcagttccactcaaaggcccacaacagttcaagtct -# ctgccagccgtgatcttccattttcgggaaggagcagtcggaccacacagacataaaggagaagttttatcaggtgctgagccccacgatagatacgc -# gcgagatttctgttga] -# protein sequence = [MALKRLVDIESKIRRDANFGRAYNLIMEAYVNKGYARRLKQHKGSLNSVPLKGPQQFKSLPAVIFHFREGAVGPHRHK -# GEVLSGAEPHDRYARDFC] -# end gene contig11.g34 -### -# start gene contig11.g35 -contig11 AUGUSTUS gene 3613 6466 1 + . ID=contig11.g35 -contig11 AUGUSTUS transcript 3613 6466 . + . 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-contig12 AUGUSTUS CDS 30236 30331 . - 0 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 32239 32318 . - 2 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 33475 33622 . - 0 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 38609 42222 . - 2 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 42778 42992 . - 1 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 43254 43558 . - 0 ID=contig12.g37.t1.cds;Parent=contig12.g37.t1 -contig12 AUGUSTUS start_codon 43556 43558 . - 0 Parent=contig12.g37.t1 -# coding sequence = [atgtctttgtcgcagtctatatcattagaagaattaagttctaaggacaatataacaaatttgcaagaaaagtccaata -# gaaatgataactttagtaacagcactggaagtaacatgatttctggaacgtcacctatagttcaaaaggattatttggaaaagttaaataacttcgag -# cgtagtgttgcagctgtattaataaaagtcgcttatgggacaacatctacaacaaagcgaagcataccggaaactagttattccttaggtccaactac -# 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tattggcaaaacgtcattatataccagcacagcagcaactaaaaatttgtcgaatgacccgcttttacatgcaaatgtaaacgcacaactgaatattc -# aaaatactggaaagcttcgttctgagttgtgcactgcctcatcagcttcggttgcttctgcatcttcgaactcatgcacaacgtccagtgcttctgat -# agtatgctagtagcagatcaaggttttcttcgatttcggtccatagaggatcaaaatagtgcacaaaatggaaacaatttagatggcgaaagggctgc -# tatatcttcccttcgtcttaaaagttgcagtgcgactaaccgtcgcatgagcatcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttac -# tcaaaagggttataactggtgacgaatcatgggtatatggttatgatatcaaaaccaaagcccaatcgtcacaatggaagagcccaggatcactagcc -# gagtcgttctacccatgtccgcctgtacggctgtttatactcagaccttcaaatgagatatttttcgatgtgccgtcacaagattttacccccttgag -# ccgaaaattgtcatatcagtatttggaactggattgcattaggcaaattaaactcagctgcgagacaatttaccttgatctttcattaagtgaaacaa -# atcgtccctggaaaattatattttatgcaaaaatgagtgtcctatccaaatatgttgactgttttgcagaaaaatgtgaacataatgggctaacaaaa -# cacgttttcagctatgctcttgtgactagtgctatattggcacttactatcaaggtgactatcccctacgcgaagaaaggaataactcaaaatggaaa -# 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LVPSLGDRDAVAASAAAASAHSTWTWAWNIHIYLSVVLFTILSVYSLYKLLTYNKLTHLFAQSYFVCIHLILILTCIMRIFFLCFDAYNVHGSFNIFS -# SELLLNLPSTFLTVAFSVLMLFLFLKSLNHKNNRYSALIRPLTVIVGCGVHVVLCITLHYVESYTLKNHHLYFQQQQQQQYFRRQHLHNQQGQLIATI -# TPSAILPPPPRVLTLICQIIYIFICLSLGLLYLYLYRILKRILRSKSQNYIHGYQNLSYAIHITIATALLFVLLAALQIFGAICISSSRQNNIVDVDW -# LQWGYQFSLRLIEIAIITLISWVTGLKTSAGHDTLNAVNVDVRMVGSGVGPMGAYSPENGGSTNNAIREKNVGNGTGTHNSNMTNFFLPCTSSSSQEQ -# FEGDYPAICNANTNLHTYTMRTGKLIYDDSYALNSIGPTPTGSSNSRPCEYQLQEPMYQRPYDTGSIGSAVNSQNGTDYGNKATQNYKQQHQMHFHEQ -# PTYMSTDYMTDAASDHYENPNFNLRTANSTKAEQMQKEMYDNNGVGSTLGSGSTQHQVVLLKNDNCYSEPHEQENKRYEFNIFERPVFKDKSGHNIQS -# NSDCFEDRQKITNGRVCERKFAGNGTLERNFYENKHPERRSSNSKNSCSSSNGGGRYASYSSYERGFFNGVCKSGTLGSIAGGGITLSGAVPGRSLEV -# PSPPTGSQRIIANGAQTLGISDRDRAQYYQRVSGRTSNLRSLQDGTGTDSFTSVPVRQHQLKPLSYEHNSEDEEEEEEDDIISGSNVECTNLINNDNG -# SVIADDSAPSSISIIGKTSLYTSTAATKNLSNDPLLHANVNAQLNIQNTGKLRSELCTASSASVASASSNSCTTSSASDSMLVADQGFLRFRSIEDQN -# SAQNGNNLDGERAAISSLRLKSCSATNRRMSIAQELLDDVNDDPDLLKRVITGDESWVYGYDIKTKAQSSQWKSPGSLAESFYPCPPVRLFILRPSNE -# IFFDVPSQDFTPLSRKLSYQYLELDCIRQIKLSCETIYLDLSLSETNRPWKIIFYAKMSVLSKYVDCFAEKCEHNGLTKHVFSYALVTSAILALTIKV -# TIPYAKKGITQNGKPKVHNGTLTPLEADISEEDLKLAEAEKLLVAQQQKKKSNDFVEPGLNQEFLKQLKMLSKIMIPQTLCYETGLLAVHTFCLISRT -# FLSIYVAALEGALVKFIVRKDVKQFALVLLKWFGIAIPATFVNSMIRFLEKLDWYVTHIVFTLKTKIIIEYRIWMDALKMRITGPALSVGVIALTAHI -# LRIVSPKFGQLVSEEANRYGYLRHIHSRIITNAEEIAFYGGHKVEMQQLRQAYNRLVNQMTTIFNQKLWFIMLEQFFMKYVWSGTGMIMVSLPILTGS -# DVGSASKPDSAITESRVSERTQYLTTARNLLISAADAIERLMSSYKEIVSLAGYTYRVAGMMDVFEETAQGLYCKASVIDNNQSKGIIEHRNGKPIAK -# GRIIYSDDPENMSINLRAVPVVTPNCDIVVPKLTLCIEPGVHLLITGPNGCGKSSLFRILSGLWPIYAGELQIPRPVKDIPCMFYIPQRPYMSIGSLC -# DQIIYPDTRDDMKRKEISENELRCILKLVSLEHIAQRYSILDFCLKFISDKFIIIFSDSFDVVRDWKDILSGGEKQRMAIARLFYHKPRYALLDECTS -# AVSIDVESSIYEIAKGMGITLLTITHRPTLWSVLICAKKILVKILGHGHHDGPFYAYNVPHWETVRIQGVLFRRSRHNGGNHGKTSGKKRKFFRRIAF -# SGSRYYCCTDGILFVIDSVDTERMEEAKMELMRTAKCPDNQMTTTTTSVQRLSQGGVRGVDVLHT] -# end gene contig12.g37 -### -# start gene contig12.g38 -contig12 AUGUSTUS gene 51846 55021 1 + . ID=contig12.g38 -contig12 AUGUSTUS transcript 51846 55021 . + . 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ID=contig13.g39.t1;Parent=contig13.g39 -contig13 AUGUSTUS start_codon 5833 5835 . + 0 Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 5833 5864 . + 0 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 5926 6048 . + 1 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 8287 8491 . + 1 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 8553 8681 . + 0 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 11775 11852 . + 0 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 11914 12134 . + 0 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -contig13 AUGUSTUS CDS 21090 21375 . + 1 ID=contig13.g39.t1.cds;Parent=contig13.g39.t1 -# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa -# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac -# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact -# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgaccaagatgatc -# tgccgtttcaaagaggtgaaattcttactgtaattcgaaaagacgaagatcaatggtggactgcccgaaattcgtctgggaaaattgggcaaataccg -# gttccttatatatgtcggcatgatgatgatgaagatccccttaaaaatgttgacttaaattttcgtggaagcacactaaagaggacggatttaaaccg -# aaaactgcctgcatacgcccgcgtaaaacagtcaagagttccaaacgcctatgataagactgcattgaaattggaaattggtgatataattaaagtca -# ctaaaacaaatattaatggacaatgggagggggaattaaatggaagaaatggtcacttcccattcacgcacgttgaatttgtcgatgattgtgattta -# ggcaataactccacagaaatacgaagtgactcgggaagaaatgtgccaattcggcgtcacttctcggagtcacttcggcgaaacttccaaaatcattt -# cggcgatatcgcattcggatcgcagaaacgactaccgtcgggaaaaaaatttgcctcttcggcggcccttgtcgaagtcacgaagacacttccaggag -# ttacttttgcgacacttcttgaagtgacttcggtgacacttccaggagacttttctttccgacgggagtcacttccgaatgcgatatctcgtacgaca -# gttttcaccttttag] -# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ -# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSDQDDLPFQRGEILTVIRKDEDQWWTARNSSGKIGQIPVPYICRHDDDEDPLKNVDL -# NFRGSTLKRTDLNRKLPAYARVKQSRVPNAYDKTALKLEIGDIIKVTKTNINGQWEGELNGRNGHFPFTHVEFVDDCDLGNNSTEIRSDSGRNVPIRR -# HFSESLRRNFQNHFGDIAFGSQKRLPSGKKFASSAALVEVTKTLPGVTFATLLEVTSVTLPGDFSFRRESLPNAISRTTVFTF] -# end gene contig13.g39 -### -# start gene contig13.g40 -contig13 AUGUSTUS gene 22152 43185 1 - . ID=contig13.g40 -contig13 AUGUSTUS transcript 22152 43185 . - . 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ID=contig14.g41 -contig14 AUGUSTUS transcript 1221 33392 . - . ID=contig14.g41.t1;Parent=contig14.g41 -contig14 AUGUSTUS CDS 1221 1483 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 4001 4089 . - 1 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 5485 5531 . - 0 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 7485 7777 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 17167 17460 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 21659 21886 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 24739 24807 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 27787 27900 . - 2 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 31568 32039 . - 0 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 32931 33392 . - 0 ID=contig14.g41.t1.cds;Parent=contig14.g41.t1 -contig14 AUGUSTUS start_codon 33390 33392 . - 0 Parent=contig14.g41.t1 -# coding sequence = [atgtcggtgtatcgtacagctgttgataggtgtcaacgaatttggattattgattctggtattgtcaatgctacagtca -# atttaaatcagatttgtccgccaaagattgttgtatacgatcttaaaaaagatgaactaattattcggtacaatttagaagcttctcaagtcaaacaa -# gattccctgcactctaatattgttgtggatataggagatcattgcgacgatgcgcatgctattgtatcggatgtatggagattcgggctggttgtgta -# tagcctttcaaagaaccgaagctggcgtgtaacaaattataatttctatcctgatccagttgcatcagattttaatatttacggattgaactttcaat -# ggctggatggtgttttcggtatgactatatcttacaatgaaaatatgatgcaacgcgttctttactttcatccaatggcaagttttaaggagtttatg -# gtaccgatggacctcctcttaaatgaatctctgtggaaatcaaacaatcaagataatgcgaagtatttcttttcgattggggatcggggctacaatag -# ccaatcatccacttctgcaattacaaggagtggcgtaatgttttttacacaagttcatcaagataatattggttgctgggacacatcaaaaccatata -# ctcgagcacatatagaaagatttttggaaaacggcccaaatttaattcaatttccaaatgacttaaaagtagataacgaagacgaccaaagtatatgg -# attataagtaaccgactaccaatatttctgtacagcaatttggactatggagaaataaattttcgaattttaaaggtgaaagtaaaaacggctataag -# caatagcatttgtaatccagaaaataggtacattaatggatctaaatcaacatttgtattaattgaagaagttataattttgttgactggcaagtttt -# tctttggaattgatatgttttataaactatgtggattaatgtgtttattgatcgttggacagcaagtcaaagcagcattggctaatgatgacatatgt -# ggaaaaattgaaaatctttgcgcccacatatgcgaaaacacgattgacgcatatcaatattacgaatgcaaagatggcagcgccaactgcaccatgag -# gagacaaccatgtgaaaatgggtttatcttaaaaaacggaagttgtactgatgttgatgaatgctctcatagcacgttaaacagctgtgatattataa -# accaccaaatatgcaataacactgtgggcagctattcctgtccatgccaaactggcttcaaattggatgctgccacgaatcagtgcgttgatgacgat -# gagtgtacacttagaacacataattgtcctttgaactacgattgccacaatacaaagggatcatttcgatgttatagaaaaagcaccacgacctcaac -# cacttcaacaacatcaacgacaatttcccctttgaagccagcaggatgggcaaataatagtcaatacctatccccattagctgtacatcagaattatc -# caggtttcaactttgacaatgccaattctgcaatatcgcgatttgactgcccctctggattttatagaaatattcgtggtgcatgtgtcgacattgac -# gagtgcgagagtggagaacacaactgcggagaaaaccaaatttgccgaaatcggaacggcgggtatgtgtgcacttgtccgataggtcatgaactcaa -# gcgactcagctctggtggtaaaacatgtgaagacataaatgaatgctcgaaggatcaacgtgtatgtccatccactgctcactgctttaacacgatag -# ggtcctactattgtgagtgcaaaagtggttttcaaaagaaagctgacaacaacaataacacacaatgttttgatatcgatgagtgtaacttgcaatta -# aaacgtaacattcttgcatcgtataggtacatttacagaatgacatatgcacgaacacccgtggaagctacaaatgcactaccattaattgcccatat -# ggatacgcaattgattcagaccaaaaaaattcctatgggagctttaagatatagttgtccgatccggctggttccgacgtatatactacctgcaatgg -# gaagaagacttttggaaaagttcaagcccgatagcttaaaaactgagagactagtttgcgtagaaacggacggacagacagactcgtctagtgacgct -# gatcaagaatatttatactttatggggtcggaaacgtctccttcactgcgttgcgaacttctgactgaaatcattataccctctgcaagggtataa] -# protein sequence = [MSVYRTAVDRCQRIWIIDSGIVNATVNLNQICPPKIVVYDLKKDELIIRYNLEASQVKQDSLHSNIVVDIGDHCDDAH -# AIVSDVWRFGLVVYSLSKNRSWRVTNYNFYPDPVASDFNIYGLNFQWLDGVFGMTISYNENMMQRVLYFHPMASFKEFMVPMDLLLNESLWKSNNQDN -# AKYFFSIGDRGYNSQSSTSAITRSGVMFFTQVHQDNIGCWDTSKPYTRAHIERFLENGPNLIQFPNDLKVDNEDDQSIWIISNRLPIFLYSNLDYGEI -# NFRILKVKVKTAISNSICNPENRYINGSKSTFVLIEEVIILLTGKFFFGIDMFYKLCGLMCLLIVGQQVKAALANDDICGKIENLCAHICENTIDAYQ -# YYECKDGSANCTMRRQPCENGFILKNGSCTDVDECSHSTLNSCDIINHQICNNTVGSYSCPCQTGFKLDAATNQCVDDDECTLRTHNCPLNYDCHNTK -# GSFRCYRKSTTTSTTSTTSTTISPLKPAGWANNSQYLSPLAVHQNYPGFNFDNANSAISRFDCPSGFYRNIRGACVDIDECESGEHNCGENQICRNRN -# GGYVCTCPIGHELKRLSSGGKTCEDINECSKDQRVCPSTAHCFNTIGSYYCECKSGFQKKADNNNNTQCFDIDECNLQLKRNILASYRYIYRMTYART -# PVEATNALPLIAHMDTQLIQTKKIPMGALRYSCPIRLVPTYILPAMGRRLLEKFKPDSLKTERLVCVETDGQTDSSSDADQEYLYFMGSETSPSLRCE -# LLTEIIIPSARV] -# end gene contig14.g41 -### -# start gene contig14.g42 -contig14 AUGUSTUS gene 33845 34843 1 + . ID=contig14.g42 -contig14 AUGUSTUS transcript 33845 34843 . + . ID=contig14.g42.t1;Parent=contig14.g42 -contig14 AUGUSTUS start_codon 33845 33847 . + 0 Parent=contig14.g42.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 33845 33923 . + 0 ID=contig14.g42.t1.cds;Parent=contig14.g42.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 34209 34843 . + 2 ID=contig14.g42.t1.cds;Parent=contig14.g42.t1 -# coding sequence = [atgaagcaaattatagcttcggtgttttttcacatatcattgtggacattccacgtcaagtggtgtgcgagaaaaagtg -# cacgttacgaagctctcaggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggat -# ggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacag -# ctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaa -# atcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgagtttttcgctttctcttggaatccaggtaacgatgtatcaacccacata -# gcaaaattgcgtagtctatggaacgatttaaatcaagctttgaaggctaaaaatgaaactgagctgccagatttaatacttgtttgtaaaacgctaca -# tattttgtcaaaaacctttgaaacgttccgtcaaagttggatgcttttgacaaaagaagaagaaaagactttcgacgaattaactaatcaaattgtca -# tgtttgagagaaatttcagaacaaaagaaaatgacgaaactgtataa] -# protein sequence = [MKQIIASVFFHISLWTFHVKWCARKSARYEALRRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKIVKPDPLPKGASAADEK -# QHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPGNDVSTHIAKLRSLWNDLNQALKAKNE -# TELPDLILVCKTLHILSKTFETFRQSWMLLTKEEEKTFDELTNQIVMFERNFRTKENDETV] -# end gene contig14.g42 -### -# start gene contig14.g43 -contig14 AUGUSTUS gene 35575 36522 1 + . ID=contig14.g43 -contig14 AUGUSTUS transcript 35575 36522 . + . ID=contig14.g43.t1;Parent=contig14.g43 -contig14 AUGUSTUS start_codon 35575 35577 . + 0 Parent=contig14.g43.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 35575 36522 . + 0 ID=contig14.g43.t1.cds;Parent=contig14.g43.t1 -# coding sequence = [atgtcaggcgatgtttgcggcccttttgaggattctttccagaagaagaggtatctggtagtttttaaggatcatttca -# ccaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaatt -# cgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgta -# tactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccag -# aagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctg -# ggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacattccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctga -# aaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagagaagcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaag -# agaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaaggacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttg -# caccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgaggacgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacac -# aaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaagaaaacaacaagagaaaaccgcaataa] -# protein sequence = [MSGDVCGPFEDSFQKKRYLVVFKDHFTRFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSDNGGEFDCAEVRET -# LQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRIKHLRIVGSTCYVH -# IPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDEDKEEEDADLHKSE -# DEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] -# end gene contig14.g43 -### -# start gene contig14.g44 -contig14 AUGUSTUS gene 36661 37842 1 + . ID=contig14.g44 -contig14 AUGUSTUS transcript 36661 37842 . + . ID=contig14.g44.t1;Parent=contig14.g44 -contig14 AUGUSTUS start_codon 36661 36663 . + 0 Parent=contig14.g44.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 36661 37842 . + 0 ID=contig14.g44.t1.cds;Parent=contig14.g44.t1 -# coding sequence = [atggacagggaaattgattccttacttcagaatgaaacttggaacttgacaagactccccagaggatcgaaagcacttc -# cgtgcaagtgggtctatcgagtcaaaacccaccccgacggaagtatcgacaaatacaaagctcgcttggtcatcaaaggattcgcccagagacgaggg -# attgattacgaccaaacttttagctctgtcgcaagaatggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtt -# tgacgtcttgacagcttttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgca -# gattgaagaagagtctctacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgag -# gcagatccatgtctctacatcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaaga -# tttggaagaatttttggacgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatg -# gactaaaaattagtcaacaaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttg -# gaaattacgacagcaaggaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccaga -# cttggctttcagcatcggatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaa -# caatcaacgttgggatagtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatct -# acatcagggatcatcatcatgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgt -# agcagccaatgaagctgcaaaataa] -# protein sequence = [MDREIDSLLQNETWNLTRLPRGSKALPCKWVYRVKTHPDGSIDKYKARLVIKGFAQRRGIDYDQTFSSVARMETIRSV -# LSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLRKHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVV -# YVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAVSTPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQA -# IGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFGGCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQR -# QAMVAISTTEAEIVAANEAAK] -# end gene contig14.g44 -### -# start gene contig14.g45 -contig14 AUGUSTUS gene 37866 44034 1 - . ID=contig14.g45 -contig14 AUGUSTUS transcript 37866 44034 . - . 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ID=contig15.g46 -contig15 AUGUSTUS transcript 1547 3385 . - . ID=contig15.g46.t1;Parent=contig15.g46 -contig15 AUGUSTUS CDS 1547 2032 . - 0 ID=contig15.g46.t1.cds;Parent=contig15.g46.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 2924 3385 . - 0 ID=contig15.g46.t1.cds;Parent=contig15.g46.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 3383 3385 . - 0 Parent=contig15.g46.t1 -# coding sequence = [atgtcggtgtatcgtacagctgttgataggtgtcaacgaatttggattattgattctggtattgtcaatgctacagtca -# atttaaatcagatttgtccgccaaagattgttgtatacgatcttaaaaaagatgaactaattattcggtacaatttagaagcttctcaagtcaaacaa -# gattccctgcactctaatattgttgtggatataggagatcattgcgacgatgcgcatgctattgtatcggatgtatggagattcgggctggttgtgta -# tagcctttcaaagaaccgaagctggcgtgtaacaaattataatttctatcctgatccagttgcatcagattttaatatttacggattgaactttcaat -# ggctggatggtgttttcggtatgactatatcttacaatgaaaatatgatgcaacgcgttctttactttcatccaatggcaagttttaaggagtttatg -# gtaccgatggacctcctcttaaatgaatctctgtggaaatcaaacaatcaagataatgcgaagtatttcttttcgattggggatcggggctacaatag -# ccaatcatccacttctgcaattacaaggagtggcgtaatgttttttacacaagttcatcaagataatattggttgctgggacacatcaaaaccatata -# ctcgagcacatatagaaagatttttggaaaacggcccaaatttaattcaatttccaaatgacttaaaagtagataacgaagacgaccaaagtatatgg -# attataagtaaccgactaccaatatttctgtacagcaatttggactatggagaaataaattttcgaattttaaaggtgaaagtaaaaacggctataag -# caatagcatttgtaatccagaaaataggtacattaatggatctaaatcaacatttgtattaattgaagaaggtcaatgttattaa] -# protein sequence = [MSVYRTAVDRCQRIWIIDSGIVNATVNLNQICPPKIVVYDLKKDELIIRYNLEASQVKQDSLHSNIVVDIGDHCDDAH -# AIVSDVWRFGLVVYSLSKNRSWRVTNYNFYPDPVASDFNIYGLNFQWLDGVFGMTISYNENMMQRVLYFHPMASFKEFMVPMDLLLNESLWKSNNQDN -# AKYFFSIGDRGYNSQSSTSAITRSGVMFFTQVHQDNIGCWDTSKPYTRAHIERFLENGPNLIQFPNDLKVDNEDDQSIWIISNRLPIFLYSNLDYGEI -# NFRILKVKVKTAISNSICNPENRYINGSKSTFVLIEEGQCY] -# end gene contig15.g46 -### -# start gene contig15.g47 -contig15 AUGUSTUS gene 3838 4836 1 + . ID=contig15.g47 -contig15 AUGUSTUS transcript 3838 4836 . + . ID=contig15.g47.t1;Parent=contig15.g47 -contig15 AUGUSTUS start_codon 3838 3840 . + 0 Parent=contig15.g47.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 3838 3916 . + 0 ID=contig15.g47.t1.cds;Parent=contig15.g47.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 4202 4836 . + 2 ID=contig15.g47.t1.cds;Parent=contig15.g47.t1 -# coding sequence = [atgaagcaaattatagcttcggtgttttttcacatatcattgtggacattccacgtcaagtggtgtgcgagaaaaagtg -# cacgttacgaagctctcaggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggat -# ggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacag -# ctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaa -# atcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgagtttttcgctttctcttggaatccaggtaacgatgtatcaacccacata -# gcaaaattgcgtagtctatggaacgatttaaatcaagctttgaaggctaaaaatgaaactgagctgccagatttaatacttgtttgtaaaacgctaca -# tattttgtcaaaaacctttgaaacgttccgtcaaagttggatgcttttgacaaaagaagaagaaaagactttcgacgaattaactaatcaaattgtca -# tgtttgagagaaatttcagaacaaaagaaaatgacgaaactgtataa] -# protein sequence = [MKQIIASVFFHISLWTFHVKWCARKSARYEALRRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKIVKPDPLPKGASAADEK -# QHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPGNDVSTHIAKLRSLWNDLNQALKAKNE -# TELPDLILVCKTLHILSKTFETFRQSWMLLTKEEEKTFDELTNQIVMFERNFRTKENDETV] -# end gene contig15.g47 -### -# start gene contig15.g48 -contig15 AUGUSTUS gene 5568 6515 1 + . ID=contig15.g48 -contig15 AUGUSTUS transcript 5568 6515 . + . ID=contig15.g48.t1;Parent=contig15.g48 -contig15 AUGUSTUS start_codon 5568 5570 . + 0 Parent=contig15.g48.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 5568 6515 . + 0 ID=contig15.g48.t1.cds;Parent=contig15.g48.t1 -# coding sequence = [atgtcaggcgatgtttgcggcccttttgaggattctttccagaagaagaggtatctggtagtttttaaggatcatttca -# ccaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaatt -# cgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgta -# tactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccag -# aagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctg -# ggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacattccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctga -# aaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagagaagcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaag -# agaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaaggacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttg -# caccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgaggacgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacac -# aaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaagaaaacaacaagagaaaaccgcaataa] -# protein sequence = [MSGDVCGPFEDSFQKKRYLVVFKDHFTRFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSDNGGEFDCAEVRET -# LQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRIKHLRIVGSTCYVH -# IPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDEDKEEEDADLHKSE -# DEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] -# end gene contig15.g48 -### -# start gene contig15.g49 -contig15 AUGUSTUS gene 6654 7835 1 + . 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ID=contig15.g49.t1;Parent=contig15.g49 -contig15 AUGUSTUS start_codon 6654 6656 . + 0 Parent=contig15.g49.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 6654 7835 . + 0 ID=contig15.g49.t1.cds;Parent=contig15.g49.t1 -# coding sequence = [atggacagggaaattgattccttacttcagaatgaaacttggaacttgacaagactccccagaggatcgaaagcacttc -# cgtgcaagtgggtctatcgagtcaaaacccaccccgacggaagtatcgacaaatacaaagctcgcttggtcatcaaaggattcgcccagagacgaggg -# attgattacgaccaaacttttagctctgtcgcaagaatggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtt -# tgacgtcttgacagcttttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgca -# gattgaagaagagtctctacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgag -# gcagatccatgtctctacatcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaaga -# tttggaagaatttttggacgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatg -# gactaaaaattagtcaacaaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttg -# gaaattacgacagcaaggaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccaga -# cttggctttcagcatcggatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaa -# caatcaacgttgggatagtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatct -# acatcagggatcatcatcatgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgt -# agcagccaatgaagctgcaaaataa] -# protein sequence = [MDREIDSLLQNETWNLTRLPRGSKALPCKWVYRVKTHPDGSIDKYKARLVIKGFAQRRGIDYDQTFSSVARMETIRSV -# LSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLRKHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVV -# YVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAVSTPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQA -# IGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFGGCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQR -# QAMVAISTTEAEIVAANEAAK] -# end gene contig15.g49 -### -# start gene contig15.g50 -contig15 AUGUSTUS gene 7859 14027 1 - . ID=contig15.g50 -contig15 AUGUSTUS transcript 7859 14027 . - . ID=contig15.g50.t1;Parent=contig15.g50 -contig15 AUGUSTUS CDS 7859 8109 . - 2 ID=contig15.g50.t1.cds;Parent=contig15.g50.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 13979 14027 . - 0 ID=contig15.g50.t1.cds;Parent=contig15.g50.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 14025 14027 . - 0 Parent=contig15.g50.t1 -# coding sequence = [atgtacaatattgcagcttataaggttttggacgataatacagatctaatagagtccaatcttgttgcaaagaatccgg -# agacgagtattgaggatcggcttcatcatcatatctgcgagttgttcctcagtcgggatttgttcgatcccaaattctccctcagccattctttccct -# gatgaagaaatgcttgttggctatgtgcttggttctgcgatggaattcggggttttgggccagccttatggcagcagaattatcgacctggagaatcg -# gggctcggttcaatctatttcctga] -# protein sequence = [MYNIAAYKVLDDNTDLIESNLVAKNPETSIEDRLHHHICELFLSRDLFDPKFSLSHSFPDEEMLVGYVLGSAMEFGVL -# GQPYGSRIIDLENRGSVQSIS] -# end gene contig15.g50 -### -# start gene contig15.g51 -contig15 AUGUSTUS gene 18680 42191 1 + . ID=contig15.g51 -contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42191 . + . ID=contig15.g51.t1;Parent=contig15.g51 -contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 36538 36768 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 37576 37938 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 39307 39606 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 41530 42191 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 -# coding sequence = [atggatcccgcttcaaatattgtggaaaatgtagttgaaccaaaaaatgacagtgctggtgtaattcaaatggctcctg -# aaaatattgaccactctatcgaaaatcagagcactacatcaacagatgataaagacgatgccgatttaataattgatgatagcgaatctgatgaatat -# agttcagatagcaaaaaaactgcagatgtagcagaaactgaggatttaattaaggttacagaaactgctaagacctcattgttatcagatgcggatgg -# cacagttgaaataaatgaaaacacagaaatgaaatctgaggaccccatcatagaagccttatctattaaatcagaccaggaaacttcggtttcagcca -# atacaaaagtcgataaaagctccaccgtttcggaggagaatccaaaggtggatgtaatagatgcgaataccataagtgtaatcttacccaatgcttca -# aaagcaaatgttccacaagatacatcaacaattataattgaagacgacgaagttaaaagaactgaagaagtggaagccgatgaacctaaaacatgtga -# actggctgccgaaaactctaaaaatgaagttgcgtcctctattgaaaacgttaatgaatttaaagaagttggtaaaaatgctgttgaagacaaagact -# taaatgtatttaatgaggctgacttcaataaccaaattctggacattatatcggacattgatataaatataaaggcccaggaaaaaataactcaactt -# aaagagcaagaactgaagcttatacagaaacagaacgaattggcaaatcaaatacatcagcaacaaatcttagctcagcagctgaatgccaaaaatac -# aaataaacaaagtcaatgccaacaacaaaatgcgcgtgatgtactaacactacatcaaaataatttcgtcgttaaatgccgccagtacacacgggtac -# tgaatgctctcgaagacaaggcaagtcagcaagaggggtcaaacaatacgaagcttacggtgcctataggtaaagaatccacaaatatatcaaagaac -# attgatttgcgcaaaatatttactcctgcgaccgatgctactgaaatattgcctaaaaataggaatgagagctccagtgacgttgtagatccatataa -# agagaattccgaaacgaattccacattggaacttagaaagttggaaaaaatgccgctaaagcttataatgaacccaaacggaagagtccgtgattata -# attcgctcaaagatttaattaacgttgaaactggcctgttatcgcctgacaattgcgctgaactaataactgcacttcaacttcatcaaggacgaggt -# gccgaactgtttgcaaaacgccgcagaaaggctgataattggatagtcgatgaaaccaatttagagactcaaaatcctccgtctggtattccagatta -# ccagcagtatcaacaaaaaccggctacatcaccaaacattttgccagcatattctgatgcaggaaaacatcgcgttcagttgaatattcatcaaaatc -# agttaattgaaaaatattcaaagccaggattgcaggtggttcagtctccttgggatgcagctttacaaactggttcggccagtacggcgtttttggaa -# gataaggatagcaaaagtcaatgtctttcccctgctgccgtatcaccaacaccgtacttccaaagtgatgtgcaaagtcgattatatgaactcgaaaa -# atttcaaaaattatttttggaacaccagccacttgaaatagaagtgttacggaacagagatagagctcaagctcataatagctgtaaagatgtaatgc -# taaaatttgaagttgaattatgtgataatgacaaacaagtcaaagatgtcctagatgagaaattaaatgtgcgagaattaatacaatcttttgaacaa -# cagaatatatcggaactaagccattctcaaaacggcctcgcagcaccaataaaatacgacaataaaggcaagggcttatacgtaccgaaagagatatc -# tctttctagctatgcagcacctccacagcagtacgccggtcacgatgcacattttgagtcgccgaacaatggctctgcttcgcgccctttatcaagga -# ccaacttttctacataccaaagttctgttggaaataatggaactggccagttcccaatatcaaaggcgttctcacccgaattaggcactgtaccgcca -# aggcagcagctgtacgcgccgtctagctatcaaagaatacccgcatttgaaaacgtcgcgcctcaggttaactttaaccctgcgcctttgacctttga -# taaaatggcaagatacgaacaacccaacagaaataattcgactagtgcaagctcacagtatcttaatgtgaaacaaaattcgcgagtgcgtaatgttt -# cgccaacaccatttggaattgtacgtaatgagcatacgtctggatcttctttttcaactgggtcaattggatctcccaacagatgtggaccattgcct -# ggcaggccaacttctccactatcgaacaaagttccaatctttaaccaatgtgccagaggatggggctctatttcagacaaacaacagacctatcaaag -# tccattctcctcaccacaaactggaaacttaccatacactgatttttaa] -# protein sequence = [MDPASNIVENVVEPKNDSAGVIQMAPENIDHSIENQSTTSTDDKDDADLIIDDSESDEYSSDSKKTADVAETEDLIKV -# TETAKTSLLSDADGTVEINENTEMKSEDPIIEALSIKSDQETSVSANTKVDKSSTVSEENPKVDVIDANTISVILPNASKANVPQDTSTIIIEDDEVK -# RTEEVEADEPKTCELAAENSKNEVASSIENVNEFKEVGKNAVEDKDLNVFNEADFNNQILDIISDIDINIKAQEKITQLKEQELKLIQKQNELANQIH -# QQQILAQQLNAKNTNKQSQCQQQNARDVLTLHQNNFVVKCRQYTRVLNALEDKASQQEGSNNTKLTVPIGKESTNISKNIDLRKIFTPATDATEILPK -# NRNESSSDVVDPYKENSETNSTLELRKLEKMPLKLIMNPNGRVRDYNSLKDLINVETGLLSPDNCAELITALQLHQGRGAELFAKRRRKADNWIVDET -# NLETQNPPSGIPDYQQYQQKPATSPNILPAYSDAGKHRVQLNIHQNQLIEKYSKPGLQVVQSPWDAALQTGSASTAFLEDKDSKSQCLSPAAVSPTPY -# FQSDVQSRLYELEKFQKLFLEHQPLEIEVLRNRDRAQAHNSCKDVMLKFEVELCDNDKQVKDVLDEKLNVRELIQSFEQQNISELSHSQNGLAAPIKY -# DNKGKGLYVPKEISLSSYAAPPQQYAGHDAHFESPNNGSASRPLSRTNFSTYQSSVGNNGTGQFPISKAFSPELGTVPPRQQLYAPSSYQRIPAFENV -# APQVNFNPAPLTFDKMARYEQPNRNNSTSASSQYLNVKQNSRVRNVSPTPFGIVRNEHTSGSSFSTGSIGSPNRCGPLPGRPTSPLSNKVPIFNQCAR -# GWGSISDKQQTYQSPFSSPQTGNLPYTDF] -# end gene contig15.g51 -### -# start gene contig15.g52 -contig15 AUGUSTUS gene 44931 45401 1 - . ID=contig15.g52 -contig15 AUGUSTUS transcript 44931 45401 . - . ID=contig15.g52.t1;Parent=contig15.g52 -contig15 AUGUSTUS CDS 44931 45401 . - 0 ID=contig15.g52.t1.cds;Parent=contig15.g52.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 45399 45401 . - 0 Parent=contig15.g52.t1 -# coding sequence = [atgagtcgtgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgaattttgaccaaaagaaccgtcgcatgagcatagctaaag -# agctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcataactggtgacgactcatgggtatatggttatgatatcgaaaccaaagcc -# caatcgtcacaatggaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcaccccaagttcgatcaaatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgatta -# ccatggcgtggtgcatctggagttcttaccatatggtcgtacggttaataaacagtattatctggaagttatgcgccgtttgcaagaagcaatacgaa -# agaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttagatcacgataatgcccctgatcactcatctttgcttatgagcgattttttggcctaa] -# protein sequence = [MSRVSAKFVPKLLNFDQKNRRMSIAKELLDDVNDDPDLLKRVITGDDSWVYGYDIETKAQSSQWKSPGEPRPKKAPQV -# RSNVKVLITVFFDYHGVVHLEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLQEAIRKKRPELWKNNSWLLDHDNAPDHSSLLMSDFLA] -# end gene contig15.g52 -### -# -# ----- prediction on sequence number 16 (length = 45017, name = contig16) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 16 on both strands -# start gene contig16.g53 -contig16 AUGUSTUS gene 5832 6209 1 + . ID=contig16.g53 -contig16 AUGUSTUS transcript 5832 6209 . + . ID=contig16.g53.t1;Parent=contig16.g53 -contig16 AUGUSTUS start_codon 5832 5834 . + 0 Parent=contig16.g53.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 5832 6209 . + 0 ID=contig16.g53.t1.cds;Parent=contig16.g53.t1 -# coding sequence = [atgaacgctgaaatctcggaaactatacaagcaaacttggcaatcaaattcctgggcttcctgcgcagcgcaagtttgt -# ttcagcggcatgcgacgcccactctacacccacaattcgagaaaatctgtagcgcctacagtatgataggatcaaaatttaaagtgaattgtatttgt -# ctcatcaatacctatcgactgaccaaaaaaacatgtgacatttttcactcccactctaacttccacaaacggcttaaacggcttgttttaaaattgat -# ttccgatagttcctatgggatctataagatacagttgtccggttccgtcatatatactacatgcaatagaaaaaagacttttgtgaaagtttcagccc -# gatag] -# protein sequence = [MNAEISETIQANLAIKFLGFLRSASLFQRHATPTLHPQFEKICSAYSMIGSKFKVNCICLINTYRLTKKTCDIFHSHS -# NFHKRLKRLVLKLISDSSYGIYKIQLSGSVIYTTCNRKKTFVKVSAR] -# end gene contig16.g53 -### -# start gene contig16.g54 -contig16 AUGUSTUS gene 10302 20749 1 + . ID=contig16.g54 -contig16 AUGUSTUS transcript 10302 20749 . + . ID=contig16.g54.t1;Parent=contig16.g54 -contig16 AUGUSTUS start_codon 10302 10304 . + 0 Parent=contig16.g54.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 10302 10409 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 14837 14950 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 20531 20749 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 -# coding sequence = [atggtgccgcctttgctcactccggacaacaaacgcaaccgtgagaccacttcagagcagtgtttgacgctgcacaatc -# cgaaggagtttctgcgtcgtttcgtgaccatcagtcaagatattaaagtgaagagtcacatcaagcccatcaacaatgagcaagatcgctacgccaac -# acgttcgggattgagttacaaggaatctccgaattgaaacaaaagaggagagaacttatacccgggattgcaagatggtggttacgtatccaggagtt -# cgacttatactcgtacatcgttcatcgagcaggaacacagatgaaccacttagacgcactcagtcgagctccattcgaaaatgctcgacgcataatcg -# acgaaatggattcaaatggaacagattcagagatttgccgcaggcataaaattgctaaattattctga] -# protein sequence = [MVPPLLTPDNKRNRETTSEQCLTLHNPKEFLRRFVTISQDIKVKSHIKPINNEQDRYANTFGIELQGISELKQKRREL -# IPGIARWWLRIQEFDLYSYIVHRAGTQMNHLDALSRAPFENARRIIDEMDSNGTDSEICRRHKIAKLF] -# end gene contig16.g54 -### -# start gene contig16.g55 -contig16 AUGUSTUS gene 23317 43120 1 + . ID=contig16.g55 -contig16 AUGUSTUS transcript 23317 43120 . + . ID=contig16.g55.t1;Parent=contig16.g55 -contig16 AUGUSTUS start_codon 23317 23319 . + 0 Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 23317 25126 . + 0 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 26889 26950 . + 2 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 27109 27253 . + 0 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 29072 29164 . + 2 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 29266 29369 . + 2 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 34338 34619 . + 0 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 36353 36384 . + 0 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 38071 38214 . + 1 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 42456 42590 . + 1 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 43033 43120 . + 1 ID=contig16.g55.t1.cds;Parent=contig16.g55.t1 -# coding sequence = [atgacgaccttgagaaaacctgtggctgccataaaaaagaggtcaggaccgttgaataaggcccttgaagaggtgaatg -# ataatttatttggatcgccaccttcagatgttcttagcatacgtcagcaaaataattttgcaagcaagcactcaggaggagttgcatctggcaatagg -# ctacgccgtcgtagcacaaaagacagagaaaaaaaacgagagcgctggcttttaacacgaaaaacttggagatatatgacagatgccggtcgtaagct -# tatccccgatagctacccggcagggtcagataactttgacttacttgaagaacattttcaacgagtgtgcttatctgaaccaagttttattttatgga -# atcgacgaacctcttacccgggagcaatcaacagctctaggcgaagattaaagcaattgtctaggcacgcatgttccagccataaggaaaatagcatt -# gagacaaaaaatagttattataacgcagatcgaactatcgaactattgcagacgtttttaaaacttcgcgatgcatacaaaacaacaacgctacttgg -# tacaaaaacagttagacctgaccaaacatcatcgcctagtgcacagagacctatttttggcaaaaagagtgaaaaagatcagacaatgtcctcggaca -# tgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaagtgggaattaagttggaaattagcgatttatcc -# gagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaacttcatcggaccctacattccaaagaaccgaataa -# aaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaagtatgtctagtaaaacatctgaggaccaaaagctaaaaaatc -# aaaatttccaatgtgtaaaaatatgtgatactagctcgaaaaattcaattaatttagatctcaactgtgttataaaaagcatcgagtttccaaacaag -# tgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattcaacttagcgaactaaaaagtttggcggaaca -# gtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggatggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaa -# aaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggcaagaaagaaaagtgtacaaggttctgactca -# aatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatccaccagcactcaatgatggattgaataaggc -# tgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctatatatctgcaaaacgctcacttagaatggataa -# gatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaagaagagcatactcctcatgaaatcaatagggga -# aacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaaaagctataaggacttctagcgggttgctttc -# ttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaatcttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaat -# caaaatcactatctaatgttggacaatttgacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggtttcaaattgttgatactttattgataaggctg -# tcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattggaaatattgatgatttgaaaaaaacatcaaaaaa -# acgacgtatcgctccgaaaaaaaaatctctgacaacgagcttttttgatattgggaagaaagatgaccaaacaagagacagaaaaggaagcgctaaca -# tagaggaccgatcagagcattatgtttttcggaaaagcggtagtaacccaggaagtgttatgaagcttaacgacaatgtgaggtcatgtgaaagtttg -# ccttctaaatccctggaattcggatacatggactcctccgactgttctagtggttcttttaatactattccaaaacctgcagcatccctaactcagtt -# tgaaattggagacactgaaccaagtttttataagacgtatcaagatcaattaatactcatggtaccaatgtttataattaactgtattgagtatttgg -# aagagaatggcttacaaaaggttggactttttcgagtaagcacatctaaaaaaagagtaaagcaactccaaacaacattgatcaaaaccatcaacagg -# attgtagacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgt -# cacccttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttg -# atgttatctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaatta -# gacgatccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacggtttgtataa] -# protein sequence = [MTTLRKPVAAIKKRSGPLNKALEEVNDNLFGSPPSDVLSIRQQNNFASKHSGGVASGNRLRRRSTKDREKKRERWLLT -# RKTWRYMTDAGRKLIPDSYPAGSDNFDLLEEHFQRVCLSEPSFILWNRRTSYPGAINSSRRRLKQLSRHACSSHKENSIETKNSYYNADRTIELLQTF -# LKLRDAYKTTTLLGTKTVRPDQTSSPSAQRPIFGKKSEKDQTMSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKK -# QQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSSLSSLKIGEHESMSSKTSEDQKLKNQNFQCVKICDTSSKNSINLDLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQT -# SFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDISQSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKG -# EINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQKQLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHS -# KLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQFDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEEL -# NIGNIDDLKKTSKKRRIAPKKKSLTTSFFDIGKKDDQTRDRKGSANIEDRSEHYVFRKSGSNPGSVMKLNDNVRSCESLPSKSLEFGYMDSSDCSSGS -# FNTIPKPAASLTQFEIGDTEPSFYKTYQDQLILMVPMFIINCIEYLEENGLQKVGLFRVSTSKKRVKQLQTTLIKTINRIVDMKIIEVDCLVDTGAAV -# SILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISMKLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQE -# KRFV] -# end gene contig16.g55 -### -# -# ----- prediction on sequence number 17 (length = 40013, name = contig17) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 17 on both strands -# start gene contig17.g56 -contig17 AUGUSTUS gene 517 741 1 + . 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ID=contig19.g60 -contig19 AUGUSTUS transcript 29061 34141 . + . ID=contig19.g60.t1;Parent=contig19.g60 -contig19 AUGUSTUS start_codon 29061 29063 . + 0 Parent=contig19.g60.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 29061 29126 . + 0 ID=contig19.g60.t1.cds;Parent=contig19.g60.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 29277 29928 . + 0 ID=contig19.g60.t1.cds;Parent=contig19.g60.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 33431 33496 . + 2 ID=contig19.g60.t1.cds;Parent=contig19.g60.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 33637 33731 . + 2 ID=contig19.g60.t1.cds;Parent=contig19.g60.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 33803 34141 . + 0 ID=contig19.g60.t1.cds;Parent=contig19.g60.t1 -# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga -# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga -# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa -# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac -# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg -# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa -# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca -# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagtcgatgagcactgtcctttgaaatctaatgtatctataattcagaaa -# attttacctaaatccgaagatccctttgaatttttaaggagccaacctcagtttctacaaatgcgttctttaatatatcaaaacccccaccttttaca -# tgccgtactgcagcagattggtcagacaaacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattg -# aaagcgaatcagaaacaaatgagtcagaagcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattg -# gaaggagctgttgcagcacaaagaacagccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagt -# ctcaaccattcgtctaaatcgccaagaccaggacgcaatagaaagggtatttaagatttaa] -# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS -# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP -# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSVDEHCPLKSNVSIIQKILPKSEDPFEFLRSQPQFL -# QMRSLIYQNPHLLHAVLQQIGQTNPALLQLISENQDAFLNMLNQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRD -# NAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERVFKI] -# end gene contig19.g60 -### -# -# ----- prediction on sequence number 20 (length = 50014, name = contig20) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 20 on both strands -# start gene contig20.g61 -contig20 AUGUSTUS gene 1546 5884 1 + . ID=contig20.g61 -contig20 AUGUSTUS transcript 1546 5884 . + . ID=contig20.g61.t1;Parent=contig20.g61 -contig20 AUGUSTUS start_codon 1546 1548 . + 0 Parent=contig20.g61.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 1546 1686 . + 0 ID=contig20.g61.t1.cds;Parent=contig20.g61.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 5687 5884 . + 0 ID=contig20.g61.t1.cds;Parent=contig20.g61.t1 -# coding sequence = [atgtcaatgttaaaattgagtttgatggatgatagcaaagcgaggaaagaagttcaccgcatttatccttcgcaggggg -# ctttaaagctttccaaaatgattgttttccagcgaagtcaaccttatataacaaacggattaatagtatatagtcggatcgagccggatcgggcaact -# ttatcttacagctcccataggaacaattgcaaggttatacaaactttggcagaaaatttgtttcgaagtcccctcggatttgactcatttttccgtgg -# gctgccccgtgcaagggacgcgtcccagggaaatcgcatcggaaattcgctatttttccattga] -# protein sequence = [MSMLKLSLMDDSKARKEVHRIYPSQGALKLSKMIVFQRSQPYITNGLIVYSRIEPDRATLSYSSHRNNCKVIQTLAEN -# LFRSPLGFDSFFRGLPRARDASQGNRIGNSLFFH] -# end gene contig20.g61 -### -# start gene contig20.g62 -contig20 AUGUSTUS gene 6767 29138 1 + . ID=contig20.g62 -contig20 AUGUSTUS transcript 6767 29138 . + . ID=contig20.g62.t1;Parent=contig20.g62 -contig20 AUGUSTUS start_codon 6767 6769 . + 0 Parent=contig20.g62.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 6767 6898 . + 0 ID=contig20.g62.t1.cds;Parent=contig20.g62.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 24274 24925 . + 0 ID=contig20.g62.t1.cds;Parent=contig20.g62.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 28428 28493 . + 2 ID=contig20.g62.t1.cds;Parent=contig20.g62.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 28634 28728 . + 2 ID=contig20.g62.t1.cds;Parent=contig20.g62.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 28800 29138 . + 0 ID=contig20.g62.t1.cds;Parent=contig20.g62.t1 -# coding sequence = [atgtcccggagaccggactgcgtaactgaaggaccgttactcaaggccgttactcaaggaaaatcattgtggacggcag -# tacacttaggggcgaagcgcagcgacgacagatttgtaaaaattcgatatcccgttttggacctgaagaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaa -# tatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattggatcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagt -# agtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaagttgacaaccactaagaatgtaaagtccccag -# aaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacacgtgaaacaatagctccagttccaagaccaatt -# tcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttgctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttct -# gtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataacccagaaagagccgttgagtacctcattaatg -# gaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatcacctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgt -# ccaccagaatcaaattcagtcgatgagcactgtcctttgaaatctaatgtatctataattcagaaaattttacctaaatccgaagatccctttgaatt -# tttaaggagccaacctcagtttctacaaatgcgttctttaatatatcaaaacccccaccttttacatgccgtactgcagcagattggtcagacaaacc -# cagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcagaagcg -# cgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacagccgc -# tggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagaccagg -# acgcaatagaaagggtatttaagatttaa] -# protein sequence = [MSRRPDCVTEGPLLKAVTQGKSLWTAVHLGAKRSDDRFVKIRYPVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDER -# TIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSSSVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAE -# SNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYPREQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSVDEHCPLKSNVSI -# IQKILPKSEDPFEFLRSQPQFLQMRSLIYQNPHLLHAVLQQIGQTNPALLQLISENQDAFLNMLNQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFS -# SELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERVFKI] -# end gene contig20.g62 -### -# start gene contig20.g63 -contig20 AUGUSTUS gene 42684 49963 1 + . ID=contig20.g63 -contig20 AUGUSTUS transcript 42684 49963 . + . ID=contig20.g63.t1;Parent=contig20.g63 -contig20 AUGUSTUS start_codon 42684 42686 . + 0 Parent=contig20.g63.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 42684 42812 . + 0 ID=contig20.g63.t1.cds;Parent=contig20.g63.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 46977 47147 . + 0 ID=contig20.g63.t1.cds;Parent=contig20.g63.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 49661 49963 . + 0 ID=contig20.g63.t1.cds;Parent=contig20.g63.t1 -# coding sequence = [atgtttgcctgtcaaaacatccaaaaatcgatgttttctgcaccattattgaccaattggctttcaaattactattatg -# aatatgacgaaaacacgaaacgcaaaatatgcaagaacataaaagagcatcaggaagaacagtatcagccagtattttaccccaccacctcagcttcc -# tcaaatcgagccccatcatctatcaatcgacaactttccgatgattatcaagtgaggattgcaaagcgtattggattaatgcagcatttgccaattgg -# aacatatgacggaagctcgaaaaaaatacacgcagaaggaattagacctggagaaattaagacgaacgccatccgattgctacgacgtgaggaggatc -# atcattatagccaagctacttccaagccggagaaaaactatcacagccacaagattgaagctctagcagtcgtggaatcctcggagcgattcaaatat -# tatatttatggcaagaagataaaggttatcaccgactctaataccctgaagacgtcgatagagaagagagaactgataccccgaagaaggtggttgcg -# tattcatgaattcgacagacatcgttcgctttaa] -# protein sequence = [MFACQNIQKSMFSAPLLTNWLSNYYYEYDENTKRKICKNIKEHQEEQYQPVFYPTTSASSNRAPSSINRQLSDDYQVR -# IAKRIGLMQHLPIGTYDGSSKKIHAEGIRPGEIKTNAIRLLRREEDHHYSQATSKPEKNYHSHKIEALAVVESSERFKYYIYGKKIKVITDSNTLKTS -# IEKRELIPRRRWLRIHEFDRHRSL] -# end gene contig20.g63 -### -# -# ----- prediction on sequence number 21 (length = 50011, name = contig21) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 21 on both strands -# start gene contig21.g64 -contig21 AUGUSTUS gene 2674 10166 1 + . ID=contig21.g64 -contig21 AUGUSTUS transcript 2674 10166 . + . ID=contig21.g64.t1;Parent=contig21.g64 -contig21 AUGUSTUS start_codon 2674 2676 . + 0 Parent=contig21.g64.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 2674 2802 . + 0 ID=contig21.g64.t1.cds;Parent=contig21.g64.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 6967 7137 . + 0 ID=contig21.g64.t1.cds;Parent=contig21.g64.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 9651 9874 . + 0 ID=contig21.g64.t1.cds;Parent=contig21.g64.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 9956 10166 . + 1 ID=contig21.g64.t1.cds;Parent=contig21.g64.t1 -# coding sequence = [atgtttgcctgtcaaaacatccaaaaatcgatgttttctgcaccattattgaccaattggctttcaaattactattatg -# aatatgacgaaaacacgaaacgcaaaatatgcaagaacataaaagagcatcaggaagaacagtatcagccagtattttaccccaccacctcagcttcc -# tcaaatcgagccccatcatctatcaatcgacaactttccgatgattatcaagtgaggattgcaaagcgtattggattaatgcagcatttgccaattgg -# aacatatgacggaagctcgaaaaaaatacacgcagaaggaattagacctggagaaattaagacgaacgccatccgattgctacgacgtgaggaggatc -# atcattatagccaagctacttccaagccggagaaaaactatcacagccacaagattgaagctctagcagtcgtggaatcctcggagcgattcaaatat -# tatatttatggcaagaagataaaggttatcaccgactctaataccctgaagacgacctttcatcaacaaggtgctgcgaacgacatatatcttgttga -# agatatccctcaagaacaagacactacaagtcggtttattcgtccgacaaaatataactctggtgtgacctgctaccagaggatgacgatttggaaga -# gtccaccacaagaattctgcgaggacgcagagaattgtcagaaaaggccgactgtgaacggcgcctaa] -# protein sequence = [MFACQNIQKSMFSAPLLTNWLSNYYYEYDENTKRKICKNIKEHQEEQYQPVFYPTTSASSNRAPSSINRQLSDDYQVR -# IAKRIGLMQHLPIGTYDGSSKKIHAEGIRPGEIKTNAIRLLRREEDHHYSQATSKPEKNYHSHKIEALAVVESSERFKYYIYGKKIKVITDSNTLKTT -# FHQQGAANDIYLVEDIPQEQDTTSRFIRPTKYNSGVTCYQRMTIWKSPPQEFCEDAENCQKRPTVNGA] -# end gene contig21.g64 -### -# start gene contig21.g65 -contig21 AUGUSTUS gene 14668 40830 1 - . 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ID=contig21.g66 -contig21 AUGUSTUS transcript 40938 45952 . - . ID=contig21.g66.t1;Parent=contig21.g66 -contig21 AUGUSTUS CDS 40938 41138 . - 0 ID=contig21.g66.t1.cds;Parent=contig21.g66.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 41273 41928 . - 2 ID=contig21.g66.t1.cds;Parent=contig21.g66.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 45245 45455 . - 0 ID=contig21.g66.t1.cds;Parent=contig21.g66.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 45584 45859 . - 0 ID=contig21.g66.t1.cds;Parent=contig21.g66.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 45947 45952 . - 0 ID=contig21.g66.t1.cds;Parent=contig21.g66.t1 -contig21 AUGUSTUS start_codon 45950 45952 . - 0 Parent=contig21.g66.t1 -# coding sequence = [atgcgcgaggaagaggaacatcatggttggattgaaggattggccattcttatttctgttattgtagtagttatagtaa -# cagctttcaatgattactcaaaggaaagacaattccgaggtctgcaaaatcgtattgagggcgaacataagttttcagttatccgaggaggggaggtg -# tgccaaatttcagttggagatattctggttggagatattgctcaggtcaaatatggagacttgttgccggcagatggttgtctcattcaaagtaacga -# cctaaaggtggacgaatcgtccttaactggcgaatccgatcatgtcaaaaagggtgcagacgttgatcccatggttctatcaggcacgcatgttatgg -# aaggaagcggtaaaatggttgttactgccgtaggggttaactcccaagcaggcataatttttacgcttcttggcgccgcagttgatgagcaagaagca -# gaaattaaaaagatgaaaaagggtgaaaacgacggtcgcgcccaaacaaaagggacccaagcgctaactcaacgccaaccagtaccaagcgaaggaac -# aaaatctgaatctgagggaaatcatgtgccgcaatcctcctcgtcgtcagcagctgtagaaacaggacataagaaggaaaaatctgtgctacaagcaa -# agttgacaaaactagctatacagattggatatgctgggtctactattgccgtacttacagtcataattttgattattcagttttgtattaagacattc -# gttattgacgaaaaaccatggaagaacacttatgccaataacttggttaagcatttgataattggtgttacagtattagtagtagctgtaccagaggg -# acttcctctggccgttaccctatctttagcatactcggtcaagaaaatgatgaaggacaataatttagttcgccatttggatgcttgtgaaacaatgg -# gtaatgctactgccatttgctctgataaaaccggaactcttacgaccaatcgtatgactgttgtacaatcctacatatgtgaaaaattatgcaaggtt -# ttgccaacgctaagcgacataccacagcatgtgggaaacttgattacaatgggaatatctgttaactcagcttatacttcaaatataatgggcttagg -# tgtgaagtaccaatccattcgagacgaaattacagaggacaaatttacccgcgtgtatacttttaactccgttcggaagagtatgggcactgtgattc -# cccgacctaatggaggataccgattgtataccaaaggggcttcagaaatcataatgaaaaagttcgaatctgtgctgaaacataagaatttataa] -# protein sequence = [MREEEEHHGWIEGLAILISVIVVVIVTAFNDYSKERQFRGLQNRIEGEHKFSVIRGGEVCQISVGDILVGDIAQVKYG -# DLLPADGCLIQSNDLKVDESSLTGESDHVKKGADVDPMVLSGTHVMEGSGKMVVTAVGVNSQAGIIFTLLGAAVDEQEAEIKKMKKGENDGRAQTKGT -# QALTQRQPVPSEGTKSESEGNHVPQSSSSSAAVETGHKKEKSVLQAKLTKLAIQIGYAGSTIAVLTVIILIIQFCIKTFVIDEKPWKNTYANNLVKHL -# IIGVTVLVVAVPEGLPLAVTLSLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTTNRMTVVQSYICEKLCKVLPTLSDIPQHVGNLITMGI -# SVNSAYTSNIMGLGVKYQSIRDEITEDKFTRVYTFNSVRKSMGTVIPRPNGGYRLYTKGASEIIMKKFESVLKHKNL] -# end gene contig21.g66 -### -# start gene contig21.g67 -contig21 AUGUSTUS gene 46292 47620 1 + . ID=contig21.g67 -contig21 AUGUSTUS transcript 46292 47620 . + . ID=contig21.g67.t1;Parent=contig21.g67 -contig21 AUGUSTUS start_codon 46292 46294 . + 0 Parent=contig21.g67.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 46292 46373 . + 0 ID=contig21.g67.t1.cds;Parent=contig21.g67.t1 -contig21 AUGUSTUS CDS 46875 47620 . + 2 ID=contig21.g67.t1.cds;Parent=contig21.g67.t1 -# coding sequence = [atgagctcgcgcagttgtttaagtgaaataccatattgcgccggtcttccatcgatagtggccatttgttattgtcgaa -# tctcagacatccccaagccaagctatgaagaaatgacctacgacaacagcaaaatgctgctggccagcttcgctgacgacgtctgctttctcagctcc -# tcgaacagtgagaccgagtcttcacaaacgctgcaaacctacctcaacgaattcgagaaatgggccacggcgaacaatatcaaaatcaacgaaagcaa -# atgcgtaaacgtttgctttacgttacgccgaaaaacaactccggtggtccacattaataatgtggacacagagcaagcgactaaggcgaaatacctag -# gcctcacactggacaaacgcctaaccttccgagaacatattgccagagtcgtcaaaatgtgcaacctaaagcggaaccaattattctggatgctaaac -# aagaaaagcaaactatctctaagacgcaagcggcacatttatcaacaaatcatcgcaccaacttggagatatggaatccaaatttggggagtggcggc -# tgcgtcccaccgaaaacgtttccaaaccgtccagaacaaaacattaagacaaatcactggctgtgagtggttcgttagcggccaaacgcttcacaatg -# acctaaacctgagtcttgttgaagaccaaatatcgttcttctcaagcaggtacaacgaccgtctaactgcccaccgtactcgtctagcccggagatta -# cagggggctatcccaattcgcaggctcaaaagaagacattttgggctgctcctaagagactaa] -# protein sequence = [MSSRSCLSEIPYCAGLPSIVAICYCRISDIPKPSYEEMTYDNSKMLLASFADDVCFLSSSNSETESSQTLQTYLNEFE -# KWATANNIKINESKCVNVCFTLRRKTTPVVHINNVDTEQATKAKYLGLTLDKRLTFREHIARVVKMCNLKRNQLFWMLNKKSKLSLRRKRHIYQQIIA -# PTWRYGIQIWGVAAASHRKRFQTVQNKTLRQITGCEWFVSGQTLHNDLNLSLVEDQISFFSSRYNDRLTAHRTRLARRLQGAIPIRRLKRRHFGLLLR -# D] -# end gene contig21.g67 -### -# -# ----- prediction on sequence number 22 (length = 60010, name = contig22) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 22 on both strands -# start gene contig22.g68 -contig22 AUGUSTUS gene 4664 30826 1 - . 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ID=contig22.g69 -contig22 AUGUSTUS transcript 30934 35948 . - . ID=contig22.g69.t1;Parent=contig22.g69 -contig22 AUGUSTUS CDS 30934 31134 . - 0 ID=contig22.g69.t1.cds;Parent=contig22.g69.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 31269 31924 . - 2 ID=contig22.g69.t1.cds;Parent=contig22.g69.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 35241 35451 . - 0 ID=contig22.g69.t1.cds;Parent=contig22.g69.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 35580 35855 . - 0 ID=contig22.g69.t1.cds;Parent=contig22.g69.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 35943 35948 . - 0 ID=contig22.g69.t1.cds;Parent=contig22.g69.t1 -contig22 AUGUSTUS start_codon 35946 35948 . - 0 Parent=contig22.g69.t1 -# coding sequence = [atgcgcgaggaagaggaacatcatggttggattgaaggattggccattcttatttctgttattgtagtagttatagtaa -# cagctttcaatgattactcaaaggaaagacaattccgaggtctgcaaaatcgtattgagggcgaacataagttttcagttatccgaggaggggaggtg -# tgccaaatttcagttggagatattctggttggagatattgctcaggtcaaatatggagacttgttgccggcagatggttgtctcattcaaagtaacga -# cctaaaggtggacgaatcgtccttaactggcgaatccgatcatgtcaaaaagggtgcagacgttgatcccatggttctatcaggcacgcatgttatgg -# aaggaagcggtaaaatggttgttactgccgtaggggttaactcccaagcaggcataatttttacgcttcttggcgccgcagttgatgagcaagaagca -# gaaattaaaaagatgaaaaagggtgaaaacgacggtcgcgcccaaacaaaagggacccaagcgctaactcaacgccaaccagtaccaagcgaaggaac -# aaaatctgaatctgagggaaatcatgtgccgcaatcctcctcgtcgtcagcagctgtagaaacaggacataagaaggaaaaatctgtgctacaagcaa -# agttgacaaaactagctatacagattggatatgctgggtctactattgccgtacttacagtcataattttgattattcagttttgtattaagacattc -# gttattgacgaaaaaccatggaagaacacttatgccaataacttggttaagcatttgataattggtgttacagtattagtagtagctgtaccagaggg -# acttcctctggccgttaccctatctttagcatactcggtcaagaaaatgatgaaggacaataatttagttcgccatttggatgcttgtgaaacaatgg -# gtaatgctactgccatttgctctgataaaaccggaactcttacgaccaatcgtatgactgttgtacaatcctacatatgtgaaaaattatgcaaggtt -# ttgccaacgctaagcgacataccacagcatgtgggaaacttgattacaatgggaatatctgttaactcagcttatacttcaaatataatgggcttagg -# tgtgaagtaccaatccattcgagacgaaattacagaggacaaatttacccgcgtgtatacttttaactccgttcggaagagtatgggcactgtgattc -# cccgacctaatggaggataccgattgtataccaaaggggcttcagaaatcataatgaaaaagttcgaatctgtgctgaaacataagaatttataa] -# protein sequence = [MREEEEHHGWIEGLAILISVIVVVIVTAFNDYSKERQFRGLQNRIEGEHKFSVIRGGEVCQISVGDILVGDIAQVKYG -# DLLPADGCLIQSNDLKVDESSLTGESDHVKKGADVDPMVLSGTHVMEGSGKMVVTAVGVNSQAGIIFTLLGAAVDEQEAEIKKMKKGENDGRAQTKGT -# QALTQRQPVPSEGTKSESEGNHVPQSSSSSAAVETGHKKEKSVLQAKLTKLAIQIGYAGSTIAVLTVIILIIQFCIKTFVIDEKPWKNTYANNLVKHL -# IIGVTVLVVAVPEGLPLAVTLSLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTTNRMTVVQSYICEKLCKVLPTLSDIPQHVGNLITMGI -# SVNSAYTSNIMGLGVKYQSIRDEITEDKFTRVYTFNSVRKSMGTVIPRPNGGYRLYTKGASEIIMKKFESVLKHKNL] -# end gene contig22.g69 -### -# start gene contig22.g70 -contig22 AUGUSTUS gene 36288 58827 1 + . ID=contig22.g70 -contig22 AUGUSTUS transcript 36288 58827 . + . ID=contig22.g70.t1;Parent=contig22.g70 -contig22 AUGUSTUS start_codon 36288 36290 . + 0 Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 36288 36369 . + 0 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 36871 37419 . + 2 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 42261 42308 . + 2 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 44786 45091 . + 2 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 48394 48568 . + 2 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 48769 48980 . + 1 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 49745 49896 . + 2 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 50047 51108 . + 0 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 51770 52879 . + 0 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 53483 53714 . + 0 ID=contig22.g70.t1.cds;Parent=contig22.g70.t1 -contig22 AUGUSTUS 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tgcgtcccaccgaaaacgtttccaaaccgtccagaacaaaacattaagacaaatcactggctaacccaacggtctgctgcttcgactggacggcagcg -# ctatttgtagatagattgtgggcccaactatttctttgggcgtacgagaatctacatctgaggatcagaaaacagaacatgtccttcaagctgaagat -# cataactgtgctactcgactttctattgatttggaggacaatgttgaccaccacgtggccaacaacttttctgggtttcgctggaagcgggttcttaa -# cccaacaggcccacagccgcgacctagacatggacatcgcgcgataaatatcaaagagcttatggtcgtattcggcggcgggaacgaaggaattgttg -# acgagttgcacgtatataacactgttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacggatgcgctgcttatggatttgttgtg -# gagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactacaggccactaaatgggaatggaggaa -# aatatacttaaatgatttgtatatattggatactcgaggagttcacagtcataacggaaaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctc -# ctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagtaagggatctggaaatttaaatctcttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagat -# ttgtggttattagatacagatacaatgacttgggacaatgtcacattagacactgtagaagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagt -# 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ID=contig23.g71 -contig23 AUGUSTUS transcript 3228 18820 . + . 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[MSAVIRGCVRAEAAWKTKFKNGRQNAKNTLKTPSGEIVGPTISLGVRESTSEDQKTEHVLQAEDHNCATRLSIDLEDN -# VDHHVANNFSGFRWKRVLNPTGPQPRPRHGHRAINIKELMVVFGGGNEGIVDELHVYNTVTNQWYVPVLKGDVPNGCAAYGFVVEGTRMFVFGGMIEY -# GKYSNELYELQATKWEWRKIYLNDLYILDTRGVHSHNGKWIVPKTYGDSPPPRESHTGISFASKGSGNLNLLIYGGMSGCRLGDLWLLDTDTMTWDNV -# TLDTVEENVPRARAGHCAVGIQSRLYVWSGRDGYRKAWNNQVRVCCKDLWYLEVSKPLYAVKVALVRASTHALELSWTATTFAAAYVLQIQKIDQPPT -# AISKPLNQNSLHQGTAAPAETSATVTENCSESALTFGVEATSTALKLEKNTTQASGPPETNIQPSVNDLLQSISPPSSPISRVHKKTSASVGGSSLSI -# SATSAHPQKSVISSTAVVAGNNTTTNSSAVSNILQKFRPALSSVRSSTTTTIAGGFSVADPLAMRVPSTMANVVLSSVASSSALRIVPSVTASQAVRL -# ASAHQSSNSGSGSVVNILKTVPSAAAQSQPTAQATTSIGTKQYFIQKPLTLAPNVQLQFVKTSSGGMTVQTLPKVSFNAPKGNTSHGISITNPQSASG -# TNQIQGSTLPGNQLQKPIVSGNVLKLVSPHTMASGKLIMKNSNILQMGKVTPNVMGGKPAFVITNKQGAQLGNQQIIIVTTGGSMRNVPANTIMTSAG -# GPTSGTNIVSIVSSTSTTATPLQAIGGQRTVISNQSGVKMVRNISTVQASTSVAVGQKPSGTPIHQKTALFIGGKAVTVMSTNASMATSGSISNKVMV -# LPGTSSTNTPASSAALSNRKSFVFNAGGSHRAVTLATKSVNAKLTPPAQSLKDSVSETYIPVTTIKDTDPMDDIIEQLDGAGDLRKLSGSEAQHGSGE -# 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ID=contig23.g73 -contig23 AUGUSTUS transcript 25215 31311 . + . 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ID=contig24.g76 -contig24 AUGUSTUS transcript 5212 11308 . + . 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ID=contig25.g81.t1;Parent=contig25.g81 -contig25 AUGUSTUS start_codon 544 546 . + 0 Parent=contig25.g81.t1 -contig25 AUGUSTUS CDS 544 561 . + 0 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 -contig25 AUGUSTUS CDS 3018 3343 . + 0 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 -contig25 AUGUSTUS CDS 8433 8517 . + 1 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 -# coding sequence = [atgacagcggcggcgcagaccattcgattccgagaatgtgtgcgagccaaatatgtctggcccatgccgcgcttcagat -# gcgttttcggtgcatcatcccttacgccaccccctgatagctttcgcatcggcagacatgcgaggggcagcaagtgctggtccggctgcactcggcgt -# tgctcgtcggctccgagtctggctccgggtccggtcatcgctgcactttccgcagtaacatcccttatatggcggcagggcggcagtgatgaccgctg -# caaccacccggtgaaccaccccacttaccccactgccgcctggctgcaaccaaagcagaccaggtcctgttcctatgaaaactataagatatacttgt -# ccgatccggctgtttccgacttatactctaaatgcaaagaaagaagacctttgtga] -# protein sequence = [MTAAAQTIRFRECVRAKYVWPMPRFRCVFGASSLTPPPDSFRIGRHARGSKCWSGCTRRCSSAPSLAPGPVIAALSAV -# TSLIWRQGGSDDRCNHPVNHPTYPTAAWLQPKQTRSCSYENYKIYLSDPAVSDLYSKCKERRPL] -# end gene contig25.g81 -### -# start gene contig25.g82 -contig25 AUGUSTUS gene 11809 55293 1 - . 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ID=contig25.g83 -contig25 AUGUSTUS transcript 63496 72873 . - . 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caccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcctggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcct -# gctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgctaagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgccgaaaaattggatat -# ctgttacgtagtcagaagaaaacaactattagacaacaaaaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaaggg -# aaaatcactctccaaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgacc -# gatagtatccccgaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattga -# atctttaaataacccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtg -# gggctggtaaccttttgacaggaactggcaatctaccatcctctggtggcagcaattgcttagattacatgcaacagcagaatcacatatttgtattt -# tcaactcaactggctaacaaaggagccgaatcagttttgagtggtcagtttcaaaccattattgcgtatcactgcacccagccagcgacaaaaaactt -# tctagaagactttttcatgaaaaatcctctaaagatgaacaagttgcagcgccacagtgccttgggtatgccatggataggcatgggacccggaggac -# aaactccccctaatcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaat -# agcaaacgtagttctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaag -# cagcggtgccagtggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctg -# gtgttgatttgggccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaac -# cttacaccacaacagcgtcagcaccgggaagagcagctcgcgaaactaaagaaaatgaatcaatttctttttccagaaaatgaaaattcagtaggaac -# aattgtaagttcacagatgcagaaaataccaggtgacctgatgatgggtattccgggtggcggaggatctataataaattctcaattgcggcaaatgc -# atatgccaggaaacgcgaagcaggaactttcgacgggtacaagctcagggctcccagaggaggttatgcttcctgtcgatgtcatatcagatataaat -# tctgcaatgggatgcaataacagtcaaaaaagcagtctgcaatgcggatctggaggagcagctggtcctgtgactggaacttctacaggggcgataaa -# cgtcaatatgcactgttcgagctctgtcacttcaagtggcaatatgatgggaagctcaacgaatatgctggcttcttttggtaacacaaactgcaatg -# ttaacgtcatcggatcggtaccagatatgtcaaaggagctttcaggtcaagatagcctcttgcatccactccaaggcactcaaattgagtggtcaaag -# atccaacagcaattctttgaagagcgcataaaggggggaaaagcgagacaagcgactggacctgtcgccccacctcagcacaccaactctgggacagg -# cagcaatgcgtcaagtagtcaaagacaagctcctgctcaaggaggttccgtacaatttagtaggcgttctgataatattccactaaatcccaacagtg -# gaaatcggcctccacaaaacaaaatgacacagaacttcgatccaatctcttctctggcgcaaatgtctcaacaattaacaagctgcgtgtctagtatg -# ggtagtccggccggttctagtggaatgtctatgatgggcggaccgacagatatcaatatggagcatgcaatgatttcaggattagaaggaccaggaat -# ggatgttattaatcaaaataactgtcatccaatgaatgccgtcatgaactccatgggtcagcgaatgatgaatccaaagatgtgcgttccaggcggtc -# cgagtagtctgcctggcttcaaccctaattctcccaatggtgtgttaagagagagtcccctggggcctggtccagttcctggtcctgggccaatgaac -# tctccaaactttcaaggggttttgcctcctggtgcaagaatgatgggtcgaatgccaatcggttttggttcgaatttcaatcctaatatacaggtaaa -# ggcaagtactccaaacaccatacagtacatgccagtaaggccgcaaaacgccagcaacaacaataacaatggtgctagcaacgttagaatgccaccta -# gtctagagtttttgcagaggtacgccaatccacaaatggcttctgtaggaaacggttctccgatctgtcctccatctagtggcgacggtggtccggga -# atgccgggaatgatggtgggctcagggtcagggccaatgcttatgaactcttccggcgaccaccagaacaagatttcgaacaaccctggagcgggcaa -# cggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatgatgtggcaatgaatattggccaaccgt -# ctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtcaacagacagattccgtttgcacatggg -# ccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccgcctatgtttactgcatcacaacagtc -# taatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagttggacctgcagtttcacaaggacaga -# tccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaatgcccactgctggaaatgtcgttcca -# acgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcacagtttccagcagcaattatacgcaac -# aaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaacttatctccaactccagcgttctttg -# tgaacaaatga] -# protein sequence = [MPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPGKSCTFLFLYEVPYQLSVLPDQIKVM -# PDEGAEKNGLSSSDKGVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKK -# NSVKDEDVAEKLDICYVVRRKQLLDNKKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMG -# IEGVNCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQT -# IIAYHCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLS -# NEGELMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKM -# NQFLFPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGG -# AAGPVTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQAT -# GPVAPPQHTNSGTGSNASSSQRQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDIN -# MEHAMISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMP -# 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aaactccccctaatcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaat -# agcaaacgtagttctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaag -# cagcggtgccagtggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctg -# gtgttgatttgggccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaac -# cttacaccacaacagcgtcagcaccgggaagagcagctcgcgaaactaaagaaaatgaatcaatttctttttccagaaaatgaaaattcagtaggaac -# aattgtaagttcacagatgcagaaaataccaggtgacctgatgatgggtattccgggtggcggaggatctataataaattctcaattgcggcaaatgc -# atatgccaggaaacgcgaagcaggaactttcgacgggtacaagctcagggctcccagaggaggttatgcttcctgtcgatgtcatatcagatataaat -# tctgcaatgggatgcaataacagtcaaaaaagcagtctgcaatgcggatctggaggagcagctggtcctgtgactggaacttctacaggggcgataaa -# cgtcaatatgcactgttcgagctctgtcacttcaagtggcaatatgatgggaagctcaacgaatatgctggcttcttttggtaacacaaactgcaatg -# ttaacgtcatcggatcggtaccagatatgtcaaaggagctttcaggtcaagatagcctcttgcatccactccaaggcactcaaattgagtggtcaaag -# atccaacagcaattctttgaagagcgcataaaggggggaaaagcgagacaagcgactggacctgtcgccccacctcagcacaccaactctgggacagg -# cagcaatgcgtcaagtagtcaaagacaagctcctgctcaaggaggttccgtacaatttagtaggcgttctgataatattccactaaatcccaacagtg -# gaaatcggcctccacaaaacaaaatgacacagaacttcgatccaatctcttctctggcgcaaatgtctcaacaattaacaagctgcgtgtctagtatg -# ggtagtccggccggttctagtggaatgtctatgatgggcggaccgacagatatcaatatggagcatgcaatgatttcaggattagaaggaccaggaat -# ggatgttattaatcaaaataactgtcatccaatgaatgccgtcatgaactccatgggtcagcgaatgatgaatccaaagatgtgcgttccaggcggtc -# cgagtagtctgcctggcttcaaccctaattctcccaatggtgtgttaagagagagtcccctggggcctggtccagttcctggtcctgggccaatgaac -# tctccaaactttcaaggggttttgcctcctggtgcaagaatgatgggtcgaatgccaatcggttttggttcgaatttcaatcctaatatacaggtaaa -# ggcaagtactccaaacaccatacagtacatgccagtaaggccgcaaaacgccagcaacaacaataacaatggtgctagcaacgttagaatgccaccta -# gtctagagtttttgcagaggtacgccaatccacaaatggcttctgtaggaaacggttctccgatctgtcctccatctagtggcgacggtggtccggga -# atgccgggaatgatggtgggctcagggtcagggccaatgcttatgaactcttccggcgaccaccagaacaagatttcgaacaaccctggagcgggcaa -# cggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatgatgtggcaatgaatattggccaaccgt -# ctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtcaacagacagattccgtttgcacatggg -# ccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccgcctatgtttactgcatcacaacagtc -# taatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagttggacctgcagtttcacaaggacaga -# tccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaatgcccactgctggaaatgtcgttcca -# acgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcacagtttccagcagcaattatacgcaac -# aaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaacttatctccaactccagcgttctttg -# tgaacaaatga] -# protein sequence = [MPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPGKSCTFLFLYEVPYQLSVLPDQIKVM -# PDEGAEKNGLSSSDKGVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKK -# NSVKDEDVAEKLDICYVVRRKQLLDNKKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMG -# IEGVNCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQT -# IIAYHCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLS -# NEGELMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKM -# NQFLFPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGG -# AAGPVTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQAT -# GPVAPPQHTNSGTGSNASSSQRQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDIN -# MEHAMISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMP -# IGFGSNFNPNIQVKASTPNTIQYMPVRPQNASNNNNNGASNVRMPPSLEFLQRYANPQMASVGNGSPICPPSSGDGGPGMPGMMVGSGSGPMLMNSSG -# DHQNKISNNPGAGNGINFFQNCNQMGIIDDEGGLASHDVAMNIGQPSMIRGMRPHGMRPHAMAPRMQASVNRQIPFAHGPDGLDCVGDTSAFFNNATC -# NSTGPPMFTASQQSNQAKPQHLKNIPTGLCQNQTGLGVGPAVSQGQIQLQGQGQGQGQGQTLIGPSNNNLMPTAGNVVPTNGVSGINFVGPSSNDLKY -# AQQYHSFQQQLYATNTRSQQQQQMHQQQQSNMLTMPPNLSPTPAFFVNK] -# end gene contig26.g85 -### -# start gene contig26.g86 -contig26 AUGUSTUS gene 24717 36266 1 + . 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ID=contig26.g87 -contig26 AUGUSTUS transcript 37743 38423 . - . ID=contig26.g87.t1;Parent=contig26.g87 -contig26 AUGUSTUS CDS 37743 37790 . - 0 ID=contig26.g87.t1.cds;Parent=contig26.g87.t1 -contig26 AUGUSTUS CDS 38271 38423 . - 0 ID=contig26.g87.t1.cds;Parent=contig26.g87.t1 -contig26 AUGUSTUS start_codon 38421 38423 . - 0 Parent=contig26.g87.t1 -# coding sequence = [atgaggtgtcattcgacgtcgggagcatttacatatatagcaatacctttcgatggtgctctggtgctcttcgtcacta -# cttggactgccgtttacggtggtataaatgggaaaatctttaataaaggtaactttaaggaacagaacttaaaggtagtatataagtcggaaacagcc -# ggatcggacaactatatcttatag] -# protein sequence = [MRCHSTSGAFTYIAIPFDGALVLFVTTWTAVYGGINGKIFNKGNFKEQNLKVVYKSETAGSDNYIL] -# end gene contig26.g87 -### -# -# ----- prediction on sequence number 27 (length = 50016, name = contig27) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 27 on both strands -# start gene contig27.g88 -contig27 AUGUSTUS gene 578 10290 1 + . ID=contig27.g88 -contig27 AUGUSTUS transcript 578 10290 . + . 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ID=contig27.g89 -contig27 AUGUSTUS transcript 11058 17813 . + . 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ID=contig27.g91 -contig27 AUGUSTUS transcript 23162 49889 . - . 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-contig27 AUGUSTUS CDS 43185 43550 . - 0 ID=contig27.g91.t1.cds;Parent=contig27.g91.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 44863 44922 . - 0 ID=contig27.g91.t1.cds;Parent=contig27.g91.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 45545 46043 . - 1 ID=contig27.g91.t1.cds;Parent=contig27.g91.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 49867 49889 . - 0 ID=contig27.g91.t1.cds;Parent=contig27.g91.t1 -contig27 AUGUSTUS start_codon 49887 49889 . - 0 Parent=contig27.g91.t1 -# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc -# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc -# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc -# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg -# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg -# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaagaggtataatgatttcagtcagaagtttgcaacgcagtggacacgatt -# tcgacaccataaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgagggacaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaag -# tagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaactacaggggaaggagcatgtatgtcgattcatcggatgt -# ggacgaaatgatcgttttaactatgtggtaatgcagcttcaaggaaaaaacttagctgagcttcgccgcgctcagccgcgtggcgcattttcgcttag -# tacaacacttaggttagggttacaaattctgaaggccattgaatctatacattctgtgggatttcttcatcgtgatattaaaccgagcaacttttccg -# tgggtcgattgccttataattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtataccactggtactggagaagtgcgttgtccaaga -# gctgcagctggatttcgcggcaccgttcgctatgcttctataaatgcacatcgcaatagggaaatgggacggcacgacgatctgtggtctctgttcta -# tatgctcgtggaattcgtaaacggacaactaccgtggcgaaaaataaaagacaaggaacaagttgggttgacaaaagagaagtacgaccacagaatac -# tgttaaaacatttgccgtcagatttaaagcaatttttggagcatattcaatctcttacctatgcagatcgaccggattacgcgatgcttatcggttta -# 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sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA -# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKRY -# NDFSQKFATQWTRFRHHKVVRKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHVCRFIGCGRNDRFNYVVMQLQGKNLA -# ELRRAQPRGAFSLSTTLRLGLQILKAIESIHSVGFLHRDIKPSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTVRYASINAHRN -# REMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRGVKESDPYDWE -# KVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYLSLEARSFSIIDAVFLQYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKF -# VDSNDAECANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPS -# SSNAGPAAGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSAL -# QQVTKGGALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKRYTLNITGIENYEALRI -# SIPHCWSEPAMGNVLRKDLEPPAVQQAAFDDTVYRMDIARNVCVRETYSDITPLDKAKPATSLVSRVVLPSPFKEDATFQLNTSNNSQAKLKHRRSLP -# NVSVADLFDDQPIHSNSDAMLAEDANKPWKVQTMACQRSNVALSSAVQENNGCISGRLEIRVIPKDPGISDKANIFCDEIEENAAVIALPSNTANKCK -# KQTYTDKTEACIEANPCSIHATGVNNLKINGKSETCNALNDQPNYKSGLNILHPFQANKIKCIRMYGWYANAARPYWTLPITQTIGYSCTLSAPLELL -# QDIMQKFTQEFARDLHCNMEHANRIEPSLRDAQLSMKNLNINIQELLDYIGNVEPVGFTRDVPHFPIRKAINMNFLKPGSAETLTRPVYIFEYLPPMQ -# DPEPRESQSEAQREFFQKQELVSKAEFNVTSSAEKLSTNQVDSSSPNAVINFSSNFLDSDVGRSVREMSSVVMTTGGFISPAIEGKLPEPFIPDIIGT -# S] -# end gene contig27.g91 -### -# -# ----- prediction on sequence number 28 (length = 50013, name = contig28) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 28 on both strands -# start gene contig28.g92 -contig28 AUGUSTUS gene 2984 7899 1 - . ID=contig28.g92 -contig28 AUGUSTUS transcript 2984 7899 . - . 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ID=contig28.g93 -contig28 AUGUSTUS transcript 8157 40724 . - . 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ID=contig28.g94 -contig28 AUGUSTUS transcript 40749 41220 . - . ID=contig28.g94.t1;Parent=contig28.g94 -contig28 AUGUSTUS CDS 40749 40888 . - 2 ID=contig28.g94.t1.cds;Parent=contig28.g94.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 41091 41220 . - 0 ID=contig28.g94.t1.cds;Parent=contig28.g94.t1 -contig28 AUGUSTUS start_codon 41218 41220 . - 0 Parent=contig28.g94.t1 -# coding sequence = [atgcgtatgccgtcgacagtcacactgaagcaagggaacgaggcggacgcagggcggaagatacagatgcttttcgggg -# aggagatgcttctccgtttcgtgcgtgtttcgttgttttgggatttattttacgccgactccgactcgtaccccattggtcacggcatatacataagt -# gaaaaaccttttgcgttgacctcccattccagccttgaccaggatgcggtcacagcaataactgccgacagcggatacgtgtaccaattatag] -# protein sequence = [MRMPSTVTLKQGNEADAGRKIQMLFGEEMLLRFVRVSLFWDLFYADSDSYPIGHGIYISEKPFALTSHSSLDQDAVTA -# ITADSGYVYQL] -# end gene contig28.g94 -### -# start gene contig28.g95 -contig28 AUGUSTUS gene 43652 49478 1 + . ID=contig28.g95 -contig28 AUGUSTUS transcript 43652 49478 . + . 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11029 . - 1 ID=contig29.g96.t1.cds;Parent=contig29.g96.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 20513 20715 . - 0 ID=contig29.g96.t1.cds;Parent=contig29.g96.t1 -contig29 AUGUSTUS start_codon 20713 20715 . - 0 Parent=contig29.g96.t1 -# coding sequence = [atggtcgctgcgtcgagccaccagaagaactgcaccagctccagctccacctccacggatcctcttccattgacaagga -# atgagaaccggaaatgcgcgcactgccgcaagtccttcatctcggctaagggattgagcagtcacgaagcgaagtgcactgcaggacgcaataatagc -# agtccaaaccatgttaaattttcaagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagcctccttgcaatcagga -# gcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctcgcgggtgctatcctgc -# aatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgccctgcagaggtcggcc -# actttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttgatcccggttcagaacc -# tgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatgacttctgaagatttgc -# tgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaagaggtataatgatttcagtcagaagtttgcaacgcagtggacacgatttcgacaccataaggtg -# gtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgagggacaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgcca -# gcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaactacaggggaaggagcatgtatgtcgattcatcggatgtggacgaaatgatcgtt -# ttaactatgtggtaatgcagcttcaaggaaaaaacttagctgagcttcgccgcgctcagccgcgtggcgcattttcgcttagtacaacacttaggtta -# gggttacaaattctgaaggccattgaatctatacattctgtgggatttcttcatcgtgatattaaaccgagcaacttttccgtgggtcgattgcctta -# taattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtataccactggtactggagaagtgcgttgtccaagagctgcagctggatttc -# gcggcaccgttcgctatgcttctataaatgcacatcgcaatagggaaatgggacggcacgacgatctgtggtctctgttctatatgctcgtggaattc -# gtaaacggacaactaccgtggcgaaaaataaaagacaaggaacaagttgggttgacaaaagagaagtacgaccacagaatactgttaaaacatttgcc -# gtcagatttaaagcaatttttggagcatattcaatctcttacctatgcagatcgaccggattacgcgatgcttatcggtttatttgagcggtgtatga -# 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cagtgatagctttaccatcaaatacggcgaacaaatgtaagaaacaaacctacacggacaaaaccgaagcttgtatcgaagctaatccctgtagcata -# catgctaccggcgtcaataacctgaagataaacggaaaaagtgaaacatgcaatgcgttgaatgatcaaccaaattacaaatcagcaaaatcccaata -# cggcagtcaaaatgtgcatcttgggccggtgctgacactacagtatattcatctaagacactggagcccagagacgcccttccggaaattcccttcaa -# tccccaaacaaacacatactccactgctttag] -# protein sequence = [MVAASSHQKNCTSSSSTSTDPLPLTRNENRKCAHCRKSFISAKGLSSHEAKCTAGRNNSSPNHVKFSRNDENASSPGD -# GNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANAENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKV -# PSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKRYNDFSQKFATQWTRFRHHKVVRKIGGGGFGEIYEGQDLI -# TREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHVCRFIGCGRNDRFNYVVMQLQGKNLAELRRAQPRGAFSLSTTLRLGLQILKAIESIHSVGFLHR -# DIKPSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTVRYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLT -# KEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRGVKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASN -# ASGTEYLSLEARSFSIIDAVFLQYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAECANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQV -# QKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPAAGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSA -# TSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGGALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQP -# NLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKRYTLNITGIENYEALRISIPHCWSEPAMGNVLRKDLEPPAVQQAAFDDTVYRMDI -# ARNVCVRETYSDITPLDKAKPATSLVSRVVLPSPFKEDATFQLNTSNNSQAKLKHRRSLPNVSVADLFDDQPIHSNSDAMLAEDANKPWKVQTMACQR -# SNVALSSAVQENNGCISGRLEIRVIPKDPGISDKANIFCDEIEENAAVIALPSNTANKCKKQTYTDKTEACIEANPCSIHATGVNNLKINGKSETCNA -# LNDQPNYKSAKSQYGSQNVHLGPVLTLQYIHLRHWSPETPFRKFPSIPKQTHTPLL] -# end gene contig29.g96 -### -# start gene contig29.g97 -contig29 AUGUSTUS gene 20740 46459 1 - . ID=contig29.g97 -contig29 AUGUSTUS transcript 20740 46459 . - . ID=contig29.g97.t1;Parent=contig29.g97 -contig29 AUGUSTUS CDS 20740 20879 . - 2 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 21082 21192 . - 2 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 21627 21815 . - 2 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 21935 22105 . - 2 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 22809 22855 . - 1 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 44160 44216 . - 1 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 46431 46459 . - 0 ID=contig29.g97.t1.cds;Parent=contig29.g97.t1 -contig29 AUGUSTUS start_codon 46457 46459 . - 0 Parent=contig29.g97.t1 -# coding sequence = [atggcaacgcagcaaggcaaagcctcgaacaaaaagcagaaggtatcactgcggacggcagtccacgtagtaacgaagt -# gtgcaagaaacgcgcctttaaaattctcctcggaattgggccagggctgtcgcgccggaggagatatcaagctggcatttgacctcttgggcttgcca -# ttaggcgacccaggaccacttctcgaggggtccacccgcgcactggtcttgaggcggggtccttcggttgggaccttcgttggaggtacttcaaccca -# cccgctcagtggacgagtggataaaggctgtgacccaagtattgaatatagtaaaacagcgacactttatgaattagcttttattagcgactccgtgt -# tcgtcatccggattgcgcctgtgaatgcccagggacccaggaaggtggcatatcgcctaggaggacgcacgctctttgcacctttacttcgagcagtt -# gagttggccagggaatcagggttcacactgaagcaagggaacgaggcggacgcagggcggaagatacagatgcttttcggggaggagatgcttctccg -# tttcgtgcgtgtttcgttgttttgggatttattttacgccgactccgactcgtaccccattggtcacggcatatacataagtgaaaaaccttttgcgt -# tgacctcccattccagccttgaccaggatgcggtcacagcaataactgccgacagcggatacgtgtaccaattatag] -# protein sequence = [MATQQGKASNKKQKVSLRTAVHVVTKCARNAPLKFSSELGQGCRAGGDIKLAFDLLGLPLGDPGPLLEGSTRALVLRR -# GPSVGTFVGGTSTHPLSGRVDKGCDPSIEYSKTATLYELAFISDSVFVIRIAPVNAQGPRKVAYRLGGRTLFAPLLRAVELARESGFTLKQGNEADAG -# RKIQMLFGEEMLLRFVRVSLFWDLFYADSDSYPIGHGIYISEKPFALTSHSSLDQDAVTAITADSGYVYQL] -# end gene contig29.g97 -### -# -# ----- prediction on sequence number 30 (length = 70018, name = contig30) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 30 on both strands -# start gene contig30.g98 -contig30 AUGUSTUS gene 4092 21514 1 - . ID=contig30.g98 -contig30 AUGUSTUS transcript 4092 21514 . - . ID=contig30.g98.t1;Parent=contig30.g98 -contig30 AUGUSTUS CDS 4092 4100 . - 0 ID=contig30.g98.t1.cds;Parent=contig30.g98.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 5972 6058 . - 0 ID=contig30.g98.t1.cds;Parent=contig30.g98.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 19157 19213 . - 0 ID=contig30.g98.t1.cds;Parent=contig30.g98.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 21428 21514 . - 0 ID=contig30.g98.t1.cds;Parent=contig30.g98.t1 -contig30 AUGUSTUS start_codon 21512 21514 . - 0 Parent=contig30.g98.t1 -# coding sequence = [atggtgtctcttttttgcatacttcagccctctctaactgaggtcgtcgtcagctcccatggcaacgcagcaaggcaaa -# gcctcgaacaaaaagcagaaggtatcactgcggacggcagtccacgtagtaacgaagtgtgcaagatctcatccacacagacggactcggagaccgag -# cgtcgcccaaccgctttctcaatgcataaacgtgggcggcagacagatgtaagctcgacttaa] -# protein sequence = [MVSLFCILQPSLTEVVVSSHGNAARQSLEQKAEGITADGSPRSNEVCKISSTQTDSETERRPTAFSMHKRGRQTDVSS -# T] -# end gene contig30.g98 -### -# start gene contig30.g99 -contig30 AUGUSTUS gene 36447 36866 1 + . ID=contig30.g99 -contig30 AUGUSTUS transcript 36447 36866 . + . ID=contig30.g99.t1;Parent=contig30.g99 -contig30 AUGUSTUS start_codon 36447 36449 . + 0 Parent=contig30.g99.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 36447 36866 . + 0 ID=contig30.g99.t1.cds;Parent=contig30.g99.t1 -# coding sequence = [atggatgaaaggatttgcattaaattttgtgtaaaaaataaaaataagtgctccgaaacacttgaaatgttggcagtgg -# catacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttccaagatggccgggaagatgccaatgatgagcctcgctctgga -# ccctcaagcacgtcaacaactgatgaaaatcgtcgaatcactattagagaagttgctgaagatgacggtatatcgcttggctcctgccatgaaatttt -# ttcaaacgttttgggcatgagtcgtgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaaaagaaccgtcgcatgagcatcgctaaagagc -# tgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaaagtcataa] -# protein sequence = [MDERICIKFCVKNKNKCSETLEMLAVAYGKTVLSKKNVYKWYKLFQDGREDANDEPRSGPSSTSTTDENRRITIREVA -# EDDGISLGSCHEIFSNVLGMSRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIAKELLDDVNDDPDLLKKS] -# end gene contig30.g99 -### -# start gene contig30.g100 -contig30 AUGUSTUS gene 39146 65517 1 + . ID=contig30.g100 -contig30 AUGUSTUS transcript 39146 65517 . + . ID=contig30.g100.t1;Parent=contig30.g100 -contig30 AUGUSTUS start_codon 39146 39148 . + 0 Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 39146 39477 . + 0 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 44322 45962 . + 1 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 47860 48041 . + 1 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 49613 51223 . + 2 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 53011 53280 . + 2 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 57010 58428 . + 2 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 58492 59129 . + 2 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 59569 62496 . + 0 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 64713 65304 . + 0 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 65468 65517 . + 2 ID=contig30.g100.t1.cds;Parent=contig30.g100.t1 -# coding sequence = [atgtttaaaccgaaagaacaacatatcgacagcgcactttctcaaaggccattcgcaaaccgagaagacttcgatctcg -# acttcgagaacttgagtatgaatattctagctgacttttctagctcttttagtttccaagatgtcagcgttgaagaatatatatactttatggagtcg -# gaaacgcttccttctatccaagtttggttcgcgagtcgcttttgcaaccgggccatttacattcctgaaaagaaagaacaagaattattctataagct -# aaaggtgcaatggaaaaacgagctgatcgcgcttagacctggtcctggtttcagtacctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagtt -# ctgatgtggaaacttttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatacattattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtct -# gctaaaagttgttatgcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaaagatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatca -# atatcatcaagatcaaagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctggtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcga -# gtccaaaaatacattcctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgccaggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaatttta -# atgtgctttatttgcaagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgcgaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagca -# gctacttaatcgcgagtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagccgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcct -# gtgctaccagcgatgacaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgccccactcttactccatctccgcatccagttctcggtaatgaggat -# gaggtggagctagagaacaagcaggaggctgagcagctccgggttctagaccagggcccggagcaagaccctgaaactgatcaggaatctagtagtag -# taaaatggcggcacctagtgcatatctcccattatcatcgcctaaagtagcagtaaaacctactgtgaaatgtggttccttaaactcagcaacagcaa -# agactaataacctatcaaaagtatcctcaaccagttcatctacgtcggcatacacatccggagagttctcattacccagtactgataatataagtatc -# aataagtcaaccaattgtaaccaaggagcagagccgccgtcttcctcttctttggaggtcgaaatgaaaatgggctctatgtctgcatcacctcaaac -# aaacgaatcggatgtcccctgctcagatcttatgcagctgcagcatgtggcggctggtggcacataccctcctcaagtcaattcattccacgcatcct -# tagcagcgctggccgccaatgaatcgaatgacagtcgggttaagctgatcacagagttcctccaacagcagctgcagcaacatcagcagcaaagttcc -# ttatttcccagccattgtcccgatcatccagacctaattggtgtagactgcaaaacctgcgaacttcttgacatccatcagcggtcaaggtcgccgcc -# 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tcacatgaccagcgagaaacacacccacaacatggctgtgctgcaaaacaacatcaagcacattcaggcgttcaacttcttgcagcaacagcaacagg -# gtgccgctggcaacgttcaaggacaaagctctggtggttttatgcccgaggttgcgttggccgatctcgcatataaccaagcgcttatgatccagctc -# cttcaccaacaacaacaacatcagcagtcaactaattccaaattgtcaccctcatgttcgcctgtaagcactccggatcagttttgcttctctcccaa -# gccaataaagattggtcacggagcaggagtaggcatggccctcggaatgccaattggaataagccaatgtaatgaaggacccggagacctggctggtg -# atccacatccgctgaccaaaactgataagtggcccacggctttctatagctgtctaatctgcgactgcttcagtacgaacaacttagacgatcttaac -# caacatttactcgtagacagatctcggcaatcctctagcgcctcatccgaaataatggttattcacaataacaactatatatgtaggctatgcaatta -# caagacgaatctcaaggccaatttccaactgcacagcaagacagacaagcacttgcagaagctcaactttatcaaccacatcagggagggtggatcgc -# gtaatgagtataagatgcagtatcaacaacagctggccacaaatgtggtgcaagtgaagtgcaactgctgcgacttccatacaaattctattcagaag -# ctgtccttgcacacacagcagatgcgtcacgacacgatgcgaatgatattccagcaccttctgtatattgttcagcaaagtcaaatgcacaagaagtc -# 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SPVSTPDQFCFSPKPIKIGHGAGVGMALGMPIGISQCNEGPGDLAGDPHPLTKTDKWPTAFYSCLICDCFSTNNLDDLNQHLLVDRSRQSSSASSEIM -# VIHNNNYICRLCNYKTNLKANFQLHSKTDKHLQKLNFINHIREGGSRNEYKMQYQQQLATNVVQVKCNCCDFHTNSIQKLSLHTQQMRHDTMRMIFQH -# LLYIVQQSQMHKKSLGTLEDDPQCSCPDEDQQSQSTKKLLLCQLCNFTAKNLHEMVQHIKGMRHMQIEQFICLQRRSENQEIPALNEVFRVTEWTMDN -# EVQKTKQFTPLRSVRFPYQMLGVVQARTAGIAPNHRTAVPEHRTPNPEPPAAKMNLAETQQTVAAPPPLLTAMRIYGNTHSSTTHRINFKPDVTFETG -# FNMSTTVTNEATPDTSYAAASSAACVSAVPDVSIFSPSSPSSCATPGVKSLGHHASPGLNNFVSGTPVPTTVFKCNLCEYFVQSKTDMASHIETDHPS -# AESDDFISIPTNTAALQAFQTAVAAAALAAVQHRCAAINAPTQESGQADKDLVANDSDGPIAIKRERLEEEDDPMTGIEDTKEVTHQATSSSTSESPK -# VLETQVGVQCPLCLENHFREKIYLEAHLTNVHSVTKDGLSRLLLLVDQKAWTNESEITDVPSIAPQAPYPNTEKEEAAPSPSESPSSANAIKCTTANN -# SSLPVGMQGLSCQQCEASFKHEEQLLQHAQQNQHFSSQNGEYLCLAASHISRPCHMTFRTISAMITHFQDSHMSLVISERHVYKYRCKQCSLAFKTQE -# KLTTHMLYHTMRDATKCSICQRNFRSTQALQKHMEQAHSEDRAPSGRSSSPQMPTLSSEEAHKLPLEETHASEREVTGKNVSPLRLDSQQNKEVRLST -# 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coding sequence = [atgtttaattgtgcagctatacgctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaactt -# ttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatacattattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttat -# gcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaaagatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatca -# aagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctggtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacatt -# cctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgccaggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgc -# aagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgcgaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcga -# gtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagccgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatg -# acaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgccccactcttactccatctccgcatccagttctcggtaatgaggatgaggtggagctagag -# aacaagcaggaggctgagcagctccgggttctagaccagggcccggagcaagaccctgaaactgatcaggaatctagtagtagtaaaatggcggcacc -# 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ctttaaggaggagaataacaaaaagtcagctaaggctcaaatcgctgctgctcaaatagcacagaatttaagctcagaagattcaaattcctccatgg -# atatacaccatgttggcatatgtccaccaggatcaacagtagttgctcaagccttggcaacggttggttctgcagctccattggcgggacagtacgca -# cagcaatcatttggcgctttaccctcaccacagcatttattcatcaaatcttcttctctaactgacttcagcccatccacgacccccacgccccccca -# acgagaacgcagcaacagtttggaccaaccacaacggtctcacaagtttgactgtgataaatgcgacatgcaatttaaccaattggagaaattgcgag -# agcatcaactattgcacgcaatgaatccagcaacaaatttttcagacgcaggacagaactctaattctgatggaaacttcggtccgttcggctgcata -# ctgcaaagcttacaacaagcagcagctcaacagacacagaaccaaccaccaccaacaaaaaaacggaaatactcggatagctcttcaaatgcagatga -# aatgccgaatttatcggaacctgaggctgcacataagaaacatgaattcctttataattattatatgcaaaatgaaacgaacacagaactgaaaaaac -# agtttcttatgcgacaacaacataagaaagcacagcagattcaacctcaagaacaaggaaatgagtctgatttggaaatggaattcttgactaatttt -# tatcagcagaacgaagcgaagaaggttagtaattacgactttttactgcagtactatcggacacaggaagaggcatccctgaagtcaaaatcaaagca -# 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ID=contig32.g107 -contig32 AUGUSTUS transcript 11518 14868 . + . 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ID=contig32.g108 -contig32 AUGUSTUS transcript 19560 31071 . - . 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aacagcagccagggcagtgatgtggacagtccgattgagccagatttggatccgaatgcaagaatctcagaaagtaaggcggatgattatgctgatat -# ggaaaatcatctcccaggcaattgcaacagcgtcattgaaggggcatcatctggggacatctcaaagataaaaggtccagaaaaattagttcaattcg -# aaaagaactgctatgtgcccccggatcaggcgctggttactagtgtggaattggtagttccagctcctcagaactcatcgttaagcatacaggttggg -# cgctccgaggagacaaaacaaagcgcccttagagaaccctcggaagcttcgtcatcgaccattgataacaaactgcagtatagtacgtctggtcctta -# caactctagtagctccacaaatatattagcaaacgataaaatcgatggttgtgcaaatgactcttccaatttgaacttaagaactcctactaagttag -# cagtaacaacagcaacgagtgatattttgaataatgatcgaagggcttctttatgggcgcctcaccatgaccagtcgaggcaaacgcagcagcagtcg -# agtgagcctaagcaagagcctgtgagtgttagctccgaactgtcataccagctgcagcatcgtcaatcggaactacttctgcaagttgagaaggagat -# ctcaggaacgggtgctttttctcaggcaattccattgcagcatcaacataataatggtattcatgagcaatatggccaaggagaggcgtcttctatca -# tgggaaaccagatgcatcaaagtttttatacacaaatgatgcatcagcagaatctacatccaagtcagcatcaacaaagcatgcatgaacattgtcct -# cgacttcagcagcatacaggttatacaagctatatcccccattatcagaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagca -# ccagcagcagccaccttctcaacatcccatggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatg -# aacggcagcaaattcatcaacaccagcatcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgag -# gagcctagcacagcgtttaaattaacgctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaac -# accaaattctcatagctcttccacacactctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccg -# atgagcttggattagcaaagaaccttcttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacc -# cagacacatctcgagctgagtggagacacacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattc -# cccagtcaatcgacctatggagacggtaactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccc -# taagcggagaattataccaacacacccatcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaa -# 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MLPITNHNTAPNESTYLSVFGAQQTLPQQPIEKKKRGRPKKIKGQEIIDHSVGGKISIGGQHMPQHDFNNILNLSVIPAGGCIETPKKKRGRPKKIKP -# AIDNILSVKQLQHGNSNPNTTTGLSVNSMHPLSMEHIAASPQSSHQMPPSLYNTPPPSHLLYNASASPMASPALNCNYNQVHGHGTPPVGHATPVAQG -# SSPNIDPQNEHLTPQKQNQQGNMEAGLDMREHPHLGETPPPSSPNMCPAVDFDPPNEHSDPQVGAGEPNKTVELGHQQPPTVEKDQYGSPAHDAEANI -# AHPSEHYQQWASPHNQQSLQPAQKVTHQHLHHPIQHFQQEQSDNWQRYEQHNSNPYMLISAHHQNLSPRVGNQTQHNTPQPGHIVSDVSRKSLCGLES -# LVDQIPAIREHECSNIPLATAAAAAAAVESRLLGLQQQQQHQQQQQQQQQEQQHIQQQQQQSQQQHQQQQQHQQQHQQPKRCIPENSVQTESCRPSRE -# NSNVSNNNFSVSSLAASALTARTENEAIYGNSGETRVISESSNSNNNNCGNSIEYSIHSPSGYHHHAPHLMGAIGANINNSEPNPHHLSHPHPPPHSH -# PHTMYVDQAHHMAHIPSVNVNSMYSASAYGTHPQHTTGEYSASHSHYSLGGTIQSTGQTSTATLHVPSPNYPFSHHPYGHTPPQANYPSYTHPHTHHP -# SHHSHPSHHLSVFDHLKPSDISGYGGF] -# end gene contig32.g108 -### -# -# ----- prediction on sequence number 33 (length = 40016, name = contig33) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 33 on both strands -# start gene contig33.g109 -contig33 AUGUSTUS gene 4558 16069 1 - . 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cgacttcagcagcatacaggttatacaagctatatcccccattatcagaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagca -# ccagcagcagccaccttctcaacatcccatggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatg -# aacggcagcaaattcatcaacaccagcatcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgag -# gagcctagcacagcgtttaaattaacgctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaac -# accaaattctcatagctcttccacacactctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccg -# atgagcttggattagcaaagaaccttcttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacc -# cagacacatctcgagctgagtggagacacacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattc -# cccagtcaatcgacctatggagacggtaactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccc -# taagcggagaattataccaacacacccatcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaa -# 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aaacgctgcattccagagaattcggtgcaaacggaatcatgtagaccgtcaagagagaatagcaacgtcagcaacaacaatttttctgtaagcagtct -# agctgcatccgctttgactgcaagaactgagaacgaagctatatatggcaacagtggagaaacccgagtcatcagtgaaagtagcaatagtaacaaca -# acaattgtggcaacagcatcgagtattctattcatagtccatccggatatcatcatcatgcccctcacttaatgggcgctataggggcgaacattaac -# aactcagagcccaatccgcatcacctttcccatcctcatccacctcctcactcacatccgcatacaatgtacgtggaccaagcgcatcatatggctca -# catcccttcagtaaatgtaaattcaatgtacagtgcatctgcatatggaacgcatccacaacatactacaggggagtattcagcatcacacagtcact -# atagtctgggcggcaccattcagtcgaccggacaaaccagcactgcaactttacacgtcccgagtccaaattatcctttttcacaccacccatatggt -# cacactccgccccaagcaaattacccaagctatactcatccacatactcatcatccttcacaccatagtcatccctcacatcatctgagcgtatttga -# tcacttgaaaccgtccgacataagtgggtacggcggtttttga] -# protein sequence = [MASKRDVSLAQSDGTVPTVPLTPSTPYLSSSESGNNEQGKYISGLPNNRKRLKLSTLELNSSQGSDVDSPIEPDLDPN -# ARISESKADDYADMENHLPGNCNSVIEGASSGDISKIKGPEKLVQFEKNCYVPPDQALVTSVELVVPAPQNSSLSIQVGRSEETKQSALREPSEASSS -# TIDNKLQYSTSGPYNSSSSTNILANDKIDGCANDSSNLNLRTPTKLAVTTATSDILNNDRRASLWAPHHDQSRQTQQQSSEPKQEPVSVSSELSYQLQ -# HRQSELLLQVEKEISGTGAFSQAIPLQHQHNNGIHEQYGQGEASSIMGNQMHQSFYTQMMHQQNLHPSQHQQSMHEHCPRLQQHTGYTSYIPHYQNSP -# LFGTHQSDHIQRQHQQQPPSQHPMECHANLHQSASISQQHEQHLQHERQQIHQHQHQPTQQHHPLHENYHDIIMEEFHEEPSTAFKLTLSPSNAKPEN -# QDDGYETSAGDVLTPNSHSSSTHSVTPQHQMQHPNIVLIHQNQKKPDELGLAKNLLTGEAHADPATCSSNGIQGQLHATQTHLELSGDTRCSSHTSAV -# NPYSFMGEEMRMHSPVNRPMETVTTETARYASVPAPMSTSNGNQESLSGELYQHTHHSTSILEPTESSQCDLHSKPTPKKRGRKKKLVADSTQISTPS -# SQQEMSAMTAICEDGGVDHIKAMKPKERKKHDRFNGMSEDEVIKRTIPDHLCDNLDIVIVGINPGLFAAYKGHHYAGPGNHFWKCLYLAGLTQEQMSA -# DEDHKLLKQGIGFTNMVARATKGSADLTRKEIKEGSRILLEKLQRFRPKVAVFNGKLIFEVFSGKKEFHFGRQPDLVDGTDTLSNGYLMVEALDYSVL -# PFSRYKSHPCESLKTVATTFPADVTVLAFFGTGSPCEFYCFVVAVFGEPGCGSSKTDYIWVMPSSSARCAQLPRAADKVPFYAALKKFRDFLNGLIPH -# IDESECVFTDQRIRQCSEQQQVETSGKNKQTHQTSLGDPQASLTFVGNCGGTSTGATECGNVTEEADDKLMPHLTGKMSFSNTATDRGTFSFTGDDRS -# MLPITNHNTAPNESTYLSVFGAQQTLPQQPIEKKKRGRPKKIKGQEIIDHSVGGKISIGGQHMPQHDFNNILNLSVIPAGGCIETPKKKRGRPKKIKP -# AIDNILSVKQLQHGNSNPNTTTGLSVNSMHPLSMEHIAASPQSSHQMPPSLYNTPPPSHLLYNASASPMASPALNCNYNQVHGHGTPPVGHATPVAQG -# SSPNIDPQNEHLTPQKQNQQGNMEAGLDMREHPHLGETPPPSSPNMCPAVDFDPPNEHSDPQVGAGEPNKTVELGHQQPPTVEKDQYGSPAHDAEANI -# AHPSEHYQQWASPHNQQSLQPAQKVTHQHLHHPIQHFQQEQSDNWQRYEQHNSNPYMLISAHHQNLSPRVGNQTQHNTPQPGHIVSDVSRKSLCGLES -# LVDQIPAIREHECSNIPLATAAAAAAAVESRLLGLQQQQQHQQQQQQQQQEQQHIQQQQQQSQQQHQQQQQHQQQHQQPKRCIPENSVQTESCRPSRE -# NSNVSNNNFSVSSLAASALTARTENEAIYGNSGETRVISESSNSNNNNCGNSIEYSIHSPSGYHHHAPHLMGAIGANINNSEPNPHHLSHPHPPPHSH -# PHTMYVDQAHHMAHIPSVNVNSMYSASAYGTHPQHTTGEYSASHSHYSLGGTIQSTGQTSTATLHVPSPNYPFSHHPYGHTPPQANYPSYTHPHTHHP -# SHHSHPSHHLSVFDHLKPSDISGYGGF] -# end gene contig33.g109 -### -# start gene contig33.g110 -contig33 AUGUSTUS gene 21001 30390 1 + . ID=contig33.g110 -contig33 AUGUSTUS transcript 21001 30390 . + . ID=contig33.g110.t1;Parent=contig33.g110 -contig33 AUGUSTUS start_codon 21001 21003 . + 0 Parent=contig33.g110.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 21001 21016 . + 0 ID=contig33.g110.t1.cds;Parent=contig33.g110.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 25460 25572 . + 2 ID=contig33.g110.t1.cds;Parent=contig33.g110.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 28285 28473 . + 0 ID=contig33.g110.t1.cds;Parent=contig33.g110.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 30235 30390 . + 0 ID=contig33.g110.t1.cds;Parent=contig33.g110.t1 -# coding sequence = [atgcagcaatcgaaaggtggaagtggtgtggagcaggaattggctaccaaaatgcttcaaatacaatccaagcgatttt -# atttggatgttaaacaaaatcggagaggtcgttttataaaagtggctgaggaatgtatttatcctaagaatataatatatatagtaaatacatatttt -# gaatttgagtgtgcaattaaaaacaaggaagaacgctatagtcgaggcacaagtaacgggtatctgataatcgagacactcgacttatcttttttcct -# tgttcactatggtttctatgcagaagctgctacatggatttgcgttaaaaataactttcgaacttcgataactattccggagaaatgttggatacgtt -# ttcgagatatttttaatgattattgcgagaaaatgaaaaaatcgtccgactctattactgccgaaatgaatctaccgacatcctcaaatagtcttaaa -# taa] -# protein sequence = [MQQSKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEECIYPKNIIYIVNTYFEFECAIKNKEERYSRGTSN -# GYLIIETLDLSFFLVHYGFYAEAATWICVKNNFRTSITIPEKCWIRFRDIFNDYCEKMKKSSDSITAEMNLPTSSNSLK] -# end gene contig33.g110 -### -# start gene contig33.g111 -contig33 AUGUSTUS gene 33454 34140 1 - . ID=contig33.g111 -contig33 AUGUSTUS transcript 33454 34140 . - . ID=contig33.g111.t1;Parent=contig33.g111 -contig33 AUGUSTUS CDS 33454 34140 . - 0 ID=contig33.g111.t1.cds;Parent=contig33.g111.t1 -contig33 AUGUSTUS start_codon 34138 34140 . - 0 Parent=contig33.g111.t1 -# coding sequence = [atgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgcatcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgt -# tgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcagaggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcga -# ggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctggtagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgcta -# cgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaatgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacg -# atgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttatccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcct -# cccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtataccttatatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaa -# agcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgcttgctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagttt -# ttggggagatagatcgataa] -# protein sequence = [MPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRIWVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYHL -# VDFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNKMPAGEIKTDDAKVAPPSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYL -# ISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR] -# end gene contig33.g111 -### -# start gene contig33.g112 -contig33 AUGUSTUS gene 34176 36727 1 - . ID=contig33.g112 -contig33 AUGUSTUS transcript 34176 36727 . - . ID=contig33.g112.t1;Parent=contig33.g112 -contig33 AUGUSTUS CDS 34176 34387 . - 2 ID=contig33.g112.t1.cds;Parent=contig33.g112.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 36532 36727 . - 0 ID=contig33.g112.t1.cds;Parent=contig33.g112.t1 -contig33 AUGUSTUS start_codon 36725 36727 . - 0 Parent=contig33.g112.t1 -# coding sequence = [atgcgtgccgatccgcacatcggactgctgcaccgcggcacagagaagctcatcgagtacaagacgtacacccaggcac -# tgccatatttcgatcggctagattacgtatccatgatgtgcaacgaacagtgctattctctggctgtggaaaagcttctcaacatcgaggtgcccctg -# cgagcaaagtatattcgaactctgtttgccgagatcactcgaatcctgaaccatataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaac -# gccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgagagagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtg -# gtgtatcattggtaatgcaaacggaaacatgttag] -# protein sequence = [MRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIEVPLRAKYIRTLFAEITRILNHI -# MAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLVMQTETC] -# end gene contig33.g112 -### -# -# ----- prediction on sequence number 34 (length = 50012, name = contig34) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 34 on both strands -# start gene contig34.g113 -contig34 AUGUSTUS gene 8442 9128 1 - . ID=contig34.g113 -contig34 AUGUSTUS transcript 8442 9128 . - . ID=contig34.g113.t1;Parent=contig34.g113 -contig34 AUGUSTUS CDS 8442 9128 . - 0 ID=contig34.g113.t1.cds;Parent=contig34.g113.t1 -contig34 AUGUSTUS start_codon 9126 9128 . - 0 Parent=contig34.g113.t1 -# coding sequence = [atgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgcatcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgt -# tgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcagaggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcga -# ggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctggtagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgcta -# cgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaatgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacg -# atgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttatccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcct -# cccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtataccttatatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaa -# agcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgcttgctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagttt -# ttggggagatagatcgataa] -# protein sequence = [MPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRIWVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYHL -# VDFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNKMPAGEIKTDDAKVAPPSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYL -# ISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR] -# end gene contig34.g113 -### -# start gene contig34.g114 -contig34 AUGUSTUS gene 9164 11715 1 - . ID=contig34.g114 -contig34 AUGUSTUS transcript 9164 11715 . - . ID=contig34.g114.t1;Parent=contig34.g114 -contig34 AUGUSTUS CDS 9164 9375 . - 2 ID=contig34.g114.t1.cds;Parent=contig34.g114.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 11520 11715 . - 0 ID=contig34.g114.t1.cds;Parent=contig34.g114.t1 -contig34 AUGUSTUS start_codon 11713 11715 . - 0 Parent=contig34.g114.t1 -# coding sequence = [atgcgtgccgatccgcacatcggactgctgcaccgcggcacagagaagctcatcgagtacaagacgtacacccaggcac -# tgccatatttcgatcggctagattacgtatccatgatgtgcaacgaacagtgctattctctggctgtggaaaagcttctcaacatcgaggtgcccctg -# cgagcaaagtatattcgaactctgtttgccgagatcactcgaatcctgaaccatataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaac -# gccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgagagagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtg -# gtgtatcattggtaatgcaaacggaaacatgttag] -# protein sequence = [MRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIEVPLRAKYIRTLFAEITRILNHI -# MAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLVMQTETC] -# end gene contig34.g114 -### -# start gene contig34.g115 -contig34 AUGUSTUS gene 13613 35714 1 + . ID=contig34.g115 -contig34 AUGUSTUS transcript 13613 35714 . + . ID=contig34.g115.t1;Parent=contig34.g115 -contig34 AUGUSTUS start_codon 13613 13615 . + 0 Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 13613 13664 . + 0 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 16163 16319 . + 2 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 17400 17419 . + 1 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 17659 18265 . + 2 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 19470 19780 . + 1 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 19851 20477 . + 2 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 31647 31816 . + 2 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 33680 33778 . + 0 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 34168 34359 . + 0 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 34926 35125 . + 0 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 35336 35714 . + 1 ID=contig34.g115.t1.cds;Parent=contig34.g115.t1 -# coding sequence = [atgcatatattttatggggtcggaaacgtctcctttactgctttgcatacggatgccaatactgctgcaatttcacgtt -# cggtattcgtacgacgtttatcaatagtacctggcttattgacatacaccattgacttgacgctgccaacaggaaataatctaccggcgtcaaatcgc -# aagaccaaaagaggactatttcgaaagataaaatggagcaagacacacactgagcttgacgactcacagcaaccactcttgttagccctctcaaatta -# caaaacgcgtcaccagcagaagcatcataaaattcacctaaactctggaagcccgttaaacatcgagctgtatatgtcagcgaatgttgagggtattc -# ctagagctcgaaatcgggcaccagctactacgaataatcaacaaccagctatgcatcgaaagactaaaagcaaaagcaagcttgaaacatcaaaaaac -# tttttcacgctacattcatcaaatgatagtgataaatatccatccgcagagaaatcatcggcattagtggaaacagttgaaaaatgtaaaggaacttc -# ttcgggaataggagtaaagacttcgcagcatttccaaattacaaaaaaccagagctaccgcaacagcaggattaaaaacagaacccgctcctattctg -# cttctccaaccccagcggtgagatgcaaaatgatgattccattgccaacgtttggcgcaacatcttttgttactctgctgactttaatttgtatggaa -# acggttttgctatcaaccatgtctagttgcgccaaaacgttctacatgcattggaatacatcgaacagcatatttcggattgataataccgatcatat -# aatcgatgttaataaaggcaatcttgcatttgagtttgaccaggttcatataatatgcccagtttatgaaccgggaacttttgaaaatgaaaccgaga -# aatatataatttacaatgtgtctaaagtggagtatgaaacatgtcgcataacaaatgcagatccgcgagtaatagctatatgtgataaacctcagaaa -# ttaatgttttttacaataactttccggccatttacaccgcagccaggtggcttggagttcctacctggaaatgattattacttcatttcaacttcatc -# tagggatgatttatatcggcgtattggaggtcgatgctccacaaacaacatgaaagtagttttcaaagtttgttgcgccgccgaagaaaagaacaaaa -# ccactgcgataagcaaatctatatcaggtgcagacactggaggagccataaatgtcaatatagcagctaatgatgacagtcatgatcatagccaaggc -# aataataacattgctattggaaccagtattggtataaatggaggcataatttctggaggacatcagtccgcgggaatgccaatcaatccaattaacgg -# caatgctaacataaatggcatagcaactactgttaattcaaacactgatcagtttaaccggataccacttcaaccaaacgtaatcggaagcaatgcag -# gtaccaacgccgctattcctggagttgttaatggtggaggcattattttaactcctggacatggtcatggaaacattaatatgctacaaccaggacgc -# ggcggaatgaatatggcttaccccggacatcaccacattcaaactgggatcagaataaacaatgtcccgacgcagcacagctacccacctcacaaggg -# taatgttaacagcaatacgaacggaaatgacctttgtcaattagatgaaagtttttcccgactggccggatatgggtccagtcctgacgtgggatccc -# gttccctctgggctggtcagggtgttttacggtcaggttctgtaatcagttgctttttgttctgccaacaaagcctcaagcagtacatagcaaaacgc -# aaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccacatacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacatttaccggaagaaaatggatat -# ggaccgtgcgttccggcaatacgaacaagctatgggtacgtcagccagtttgggggaccgcatggctcaaatggaggctatggacggagctgcccgtt -# gcctggaaacactacgtcttcaaaacaaaatctgcaactgcagaccgttggagtttaacactcggcttctggaagttgctagctcaattggcgcaaag -# tttctggttcgtaagatccgttgtcgcttggctttgatctaccgcgctttgggggacgaggatcaatacaatactcattttcgtttggcaaaccaaac -# ggacgctgcgcttggcttgaactgcggagcgtgtggggagttgttcggtcttcggccagaaaatttggaagctttgccatgtgcacatattcttcatg -# caaggtgtgcttacgaaatattacgacgtcgggacaaaagtacaccgcgatcatgccccgcctgtaataagatggtgagttcacgcacacatctttgc -# ggctccataccggtagagagtgaaagtaccgacggaggcagcgccgtcacggttaccctcaacgccaacgctctctcagtcgatggtctcctgggaat -# aggctccgacatcctcctaccctcggccgcgttttcccacgccaacaaaccggcaccggataacgagaactgctctttgttgtctcccaaagttatgt -# accacagcaacttatccttgacttcgttaagtatgcgcgcatctagcctgacgatcgacagcggtcaaaatgttacttcctctgtgtga] -# protein sequence = [MHIFYGVGNVSFTALHTDANTAAISRSVFVRRLSIVPGLLTYTIDLTLPTGNNLPASNRKTKRGLFRKIKWSKTHTEL -# DDSQQPLLLALSNYKTRHQQKHHKIHLNSGSPLNIELYMSANVEGIPRARNRAPATTNNQQPAMHRKTKSKSKLETSKNFFTLHSSNDSDKYPSAEKS -# SALVETVEKCKGTSSGIGVKTSQHFQITKNQSYRNSRIKNRTRSYSASPTPAVRCKMMIPLPTFGATSFVTLLTLICMETVLLSTMSSCAKTFYMHWN -# TSNSIFRIDNTDHIIDVNKGNLAFEFDQVHIICPVYEPGTFENETEKYIIYNVSKVEYETCRITNADPRVIAICDKPQKLMFFTITFRPFTPQPGGLE -# FLPGNDYYFISTSSRDDLYRRIGGRCSTNNMKVVFKVCCAAEEKNKTTAISKSISGADTGGAINVNIAANDDSHDHSQGNNNIAIGTSIGINGGIISG -# GHQSAGMPINPINGNANINGIATTVNSNTDQFNRIPLQPNVIGSNAGTNAAIPGVVNGGGIILTPGHGHGNINMLQPGRGGMNMAYPGHHHIQTGIRI -# NNVPTQHSYPPHKGNVNSNTNGNDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKEATKLSLISGDQATYTRS -# IRVMGDIYRKKMDMDRAFRQYEQAMGTSASLGDRMAQMEAMDGAARCLETLRLQNKICNCRPLEFNTRLLEVASSIGAKFLVRKIRCRLALIYRALGD -# EDQYNTHFRLANQTDAALGLNCGACGELFGLRPENLEALPCAHILHARCAYEILRRRDKSTPRSCPACNKMVSSRTHLCGSIPVESESTDGGSAVTVT -# LNANALSVDGLLGIGSDILLPSAAFSHANKPAPDNENCSLLSPKVMYHSNLSLTSLSMRASSLTIDSGQNVTSSV] -# end gene contig34.g115 -### -# start gene contig34.g116 -contig34 AUGUSTUS gene 39193 43230 1 - . ID=contig34.g116 -contig34 AUGUSTUS transcript 39193 43230 . - . 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gtacgccatgtccgcctaactcaaattcttcaaaaactgcatcaccattttgcaagtgtatgccgggatactatagacatccaagtgacggccgacat -# atgccttgttacagtccaccatctgcgcctacaaatctaacgttgttgtttgttgatcaaacgagtgccataatatcttggagcgctccaaccaagaa -# taaaacgaacacgggcaaaacgctgtctaataagtaccacagtgatattgtgtacaagatccggtgcaatatgtgcagcccaaatgttatgtacaatc -# cgtcaagtgacacatttaacgaaacgaaaataacattaacaaatcttgaaccggttacgacatatacagtgcaagtacacgcaaccaatagcgtgtcg -# catcttaccgacttaagccggcaccccaacgaatcgtcactaataacaaccaatgacacaccattttctaatgtgtcgtttttcaccattcccttgga -# tttgaatgaaataaagaccagtcacgcagaaattgtgtttactacagagtctgttttgctatctacagcttttaacttacgtatattggccataacta -# gtaaagatgccgatttggagtgggacaagccaattcaaagtgattctccacttgagttttatgaactgcgttggtttcccaagttagaattagatgtt -# attaataaaacagctttgaatacaaaggagacaaaggcacatatagaaggactgatggaaaataccgaatatggatttcaagtccgctgtaaaacaat -# aaatggttttggttcttatagtaatatgatttacgcccaaactcttcaatccgttgggtcagctacggtatacttcatgagatccaaacatcaggatg -# aacttgataaaaaatcgacaaatcatttacccttaccattggattacgctactaatgaagtgacgacacctctatttggaaatagtaggagttatgta -# gatccgcatacatatgaagaccctaatcaagccataagggaatttgctcgggaaattgatgcaaactatattactatcgaagctattataggtggtgg -# agaatttggagatgtctgccgtggccgcttaaaaatacctcccaattttgtacaggacattgatgtggcaataaaaactttaaagccaggatcttcgg -# aaaaagcgcgctgtgactttttgacggaggcttccattatgggacagtttgatcatcctaatgttatttatctacagggagtagttacacgctcaaat -# ccagtaatgattattacagagtacatggagaacggtagcttagacacatttcttcgtgtgaatgatggaaagtttcaaaccttacagctgatagtaat -# gcttcgaggtattgccagcgggatggcatatttaagtgatatgaattatgtacacagagacttggcggcacgaaatgttcttgtaaatgcccaattaa -# tttgcaagatcgcggacttcggtttgtcacgcgaaattgagaacgccagtgatgcctacacaacaaggggtggcaaaattccagtgcgttggactgcg -# ccagaagctattgcttttagaaaatttacttccgcatcggatgtatggtcttatggagtagttttatgggaggtcatgtcgtatggagagcgcccata -# ttggaactggtcaaatcaggacgtgataaagagtatagaaaagggctatcgtttaccagctccgatggactgtccagaagccctctaccagctaatgt -# tagattgctggcaaaagcaacgtactcatcgacccacatttgctagcatcgtttcaactctcgataacttggcaagacaaccgcagtcattattgact -# actcgaaactcaccggaatcagacggtactcatgttttagatacgcagcgtggtcaaaatattttcataagcaccgacctttggttggagaacattaa -# aatgtcaagatattgtcagcattttaaagaggctaatttaattaatgctcaacagagggtataa] -# protein sequence = [MNAIVECLDYQPKRSKKKVGVHANKWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTI -# RDCSLFPGNALSCKETFSLLFYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTENFAHFNETPTGKEITIIEKQNGTCVENAEPYEAPT -# YLCKGDGKWTILTGGCRCKAGYEPNNLNKTCTECPLGTFKSPEVTKCTPCPPNSNSSKTASPFCKCMPGYYRHPSDGRHMPCYSPPSAPTNLTLLFVD -# QTSAIISWSAPTKNKTNTGKTLSNKYHSDIVYKIRCNMCSPNVMYNPSSDTFNETKITLTNLEPVTTYTVQVHATNSVSHLTDLSRHPNESSLITTND -# TPFSNVSFFTIPLDLNEIKTSHAEIVFTTESVLLSTAFNLRILAITSKDADLEWDKPIQSDSPLEFYELRWFPKLELDVINKTALNTKETKAHIEGLM -# ENTEYGFQVRCKTINGFGSYSNMIYAQTLQSVGSATVYFMRSKHQDELDKKSTNHLPLPLDYATNEVTTPLFGNSRSYVDPHTYEDPNQAIREFAREI -# DANYITIEAIIGGGEFGDVCRGRLKIPPNFVQDIDVAIKTLKPGSSEKARCDFLTEASIMGQFDHPNVIYLQGVVTRSNPVMIITEYMENGSLDTFLR -# VNDGKFQTLQLIVMLRGIASGMAYLSDMNYVHRDLAARNVLVNAQLICKIADFGLSREIENASDAYTTRGGKIPVRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG -# VVLWEVMSYGERPYWNWSNQDVIKSIEKGYRLPAPMDCPEALYQLMLDCWQKQRTHRPTFASIVSTLDNLARQPQSLLTTRNSPESDGTHVLDTQRGQ -# NIFISTDLWLENIKMSRYCQHFKEANLINAQQRV] -# end gene contig35.g121 -### -# -# ----- prediction on sequence number 36 (length = 45010, name = contig36) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 36 on both strands -# start gene contig36.g122 -contig36 AUGUSTUS gene 3802 22863 1 + . ID=contig36.g122 -contig36 AUGUSTUS transcript 3802 22863 . + . ID=contig36.g122.t1;Parent=contig36.g122 -contig36 AUGUSTUS start_codon 3802 3804 . + 0 Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 3802 3827 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 4448 4493 . + 1 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9290 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 9408 9609 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 12645 12740 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19333 19428 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19774 20144 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 20992 21138 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 21203 21532 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 22855 22863 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 -# coding sequence = [atgcaggtatatcggtatcaatgcagttgttctgttagatacaaccagagaagctacattggagtggaccagtgggtcg -# aggagtcgttcacagatttcgtaaagggcataaattggaggagctacgtggtatgcgatgtggcatatcacaatgtcaacaactggttgtggtcgcct -# ttcatagatcgtggcccagcaaatcgactgtacattgaaatacaattcacaatacgagactgctctttgttcccaggaaacgctttgtcctgcaagga -# aacctttagtttactattctacgagtttgatgctgccactcgagagccgccgccctggcaaacagacagctacagacttattgctcgcatcgcagctg -# gagaaggtcgctttaatcaaaactctgatgtagatataaacacggagaattttgcccactttaacgagacacccacgggaaaagaaattactattatt -# gagaagcaaaatggaacatgtgtcgaaaacgcggaaccgtacgaggccccaacatatttatgtaaaggtgatggaaaatggaccattcttactggtgg -# ctgtcgttgcaaggccggctatgaaccaaacaatttaaataaaacttgcacagaatgtccccttggtacgtttaaatcaccagaggtaaccaaatgta -# cgccatgtccgcctaactcaaattcttcaaaaactgcatcaccattttgcaagtgtatgccgggatactatagacatccaagtgacggccgacatatg -# ccttgttacagtccaccatctgcgcctacaaatctaacgttgttgtttgttgatcaaacgagtgccataatatcttggagcgctccaaccaagaataa -# aacgaacacgggcaaaacgctgtctaataagtaccacagtgatattgtgtacaagatccggtgcaatatgtgcagcccaaatgttatgtacaatccgt -# caagtgacacatttaacgaaacgaaaataacattaacaaatcttgaaccggttacgacatatacagtgcaagtacacgcaaccaatagcgtgtcgcat -# cttaccgacttaagccggcaccccaacgaatcgtcactaataacaaccaatgacacaccattttctaatgtgtcgtttttcaccattcccttggattt -# gaatgaaataaagaccagtcacgcagaaattgtgtttactacagagtctgttttgctatctacagcttttaacttacgtatattggccataactagta -# aagatgccgatttggagtgggacaagccaattcaaagtgattctccacttgagttttatgaactgcgttggtttcccaagttagaattagatgttatt -# aataaaacagctttgaatacaaaggagacaaaggcacatatagaaggactgatggaaaataccgaatatggatttcaagtccgctgtaaaacaataaa -# tggttttggttcttatagtaatatgatttacgcccaaactcttcaatccgttgggtcagctacggtatacttcatgagatccaaacatcaggatgaac -# ttgataaaaaatcgacaaatcatttacccttaccattggattacgctactaatgaagtgacgacacctctatttggaaatagtaggagttatgtagat -# ccgcatacatatgaagaccctaatcaagccataagggaatttgctcgggaaattgatgcaaactatattactatcgaagctattataggtggtggaga -# atttggagatgtctgccgtggccgcttaaaaatacctcccaattttgtacaggacattgatgtggcaataaaaactttaaagccaggatcttcggaaa -# aagcgcgctgtgactttttgacggaggcttccattatgggacagtttgatcatcctaatgttatttatctacagggagtagttacacgctcaaatcca -# gtaatgattattacagagtacatggagaacggtagcttagacacatttcttcgtgtgaatgatggaaagtttcaaaccttacagctgatagtaatgct -# tcgaggtattgccagcgggatggcatatttaagtgatatgaattatgtacacagagacttggcggcacgaaatgttcttgtaaatgcccaattaattt -# gcaagatcgcggacttcggtttgtcacgcgaaattgagaacgccagtgatgcctacacaacaaggggtggcaaaattccagtgcgttggactgcgcca -# gaagctattgcttttagaaaatttacttccgcatcggatgtatggtcttatggagtagttttatgggaggtcatgtcgtatggagagcgcccatattg -# gaactggtcaaatcaggacgtgataaagagtatagaaaagggctatcgtttaccagctccgatggactgtccagaagccctctaccagctaatgttag -# attgctggcaaaagcaacgtactcatcgacccacatttgctagcatcgtttcaactctcgataacttggcaagacaaccgcagtcattattgactact -# cgaaactcaccggaatcagacggtactcatgttttagatacgcagcgtggtcaaaatattttcataagcaccgacctttggttggagaacattaaaat -# gtcaagatattgtcagcattttaaagaggctaatttaattaatgctcaacagagggtataa] -# protein sequence = [MQVYRYQCSCSVRYNQRSYIGVDQWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTIR -# DCSLFPGNALSCKETFSLLFYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTENFAHFNETPTGKEITIIEKQNGTCVENAEPYEAPTY -# LCKGDGKWTILTGGCRCKAGYEPNNLNKTCTECPLGTFKSPEVTKCTPCPPNSNSSKTASPFCKCMPGYYRHPSDGRHMPCYSPPSAPTNLTLLFVDQ -# TSAIISWSAPTKNKTNTGKTLSNKYHSDIVYKIRCNMCSPNVMYNPSSDTFNETKITLTNLEPVTTYTVQVHATNSVSHLTDLSRHPNESSLITTNDT -# PFSNVSFFTIPLDLNEIKTSHAEIVFTTESVLLSTAFNLRILAITSKDADLEWDKPIQSDSPLEFYELRWFPKLELDVINKTALNTKETKAHIEGLME -# NTEYGFQVRCKTINGFGSYSNMIYAQTLQSVGSATVYFMRSKHQDELDKKSTNHLPLPLDYATNEVTTPLFGNSRSYVDPHTYEDPNQAIREFAREID -# ANYITIEAIIGGGEFGDVCRGRLKIPPNFVQDIDVAIKTLKPGSSEKARCDFLTEASIMGQFDHPNVIYLQGVVTRSNPVMIITEYMENGSLDTFLRV -# NDGKFQTLQLIVMLRGIASGMAYLSDMNYVHRDLAARNVLVNAQLICKIADFGLSREIENASDAYTTRGGKIPVRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGV -# VLWEVMSYGERPYWNWSNQDVIKSIEKGYRLPAPMDCPEALYQLMLDCWQKQRTHRPTFASIVSTLDNLARQPQSLLTTRNSPESDGTHVLDTQRGQN -# IFISTDLWLENIKMSRYCQHFKEANLINAQQRV] -# end gene contig36.g122 -### -# start gene contig36.g123 -contig36 AUGUSTUS gene 24771 35069 1 - . ID=contig36.g123 -contig36 AUGUSTUS transcript 24771 35069 . - . ID=contig36.g123.t1;Parent=contig36.g123 -contig36 AUGUSTUS CDS 24771 25509 . - 1 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 27520 27709 . - 2 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 27853 27936 . - 2 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 34603 34678 . - 0 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 34827 35069 . - 0 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 -contig36 AUGUSTUS start_codon 35067 35069 . - 0 Parent=contig36.g123.t1 -# coding sequence = [atgccacggactgccagatacccgttactaaacatagtgtcgggcgagggagagggagatatgcaagtaccaaagcgac -# gtagccaggatagcattttcagttactgcgatctttgcgttcatacagacggagacacggctatggctagatcgactctgctagcaatccccataaga -# atgtatatactcgatgggtatttcgatgatcttgcgagctgtacttacctgctgtttgttggacgtaaatcgactttaaatgtgaaggactacagtgc -# aaactactccagtttggtccgatccgataatttgtcgttcaaaagtgccacgcccactttaacgtccgcaaatcgccaaaaacgcttatatctttctg -# ccgcccacgtgacatctactggaaaagccgcaattgtcgatgcaattattcgtgtgcgattcgtcactacgtggactaccatcatactaataataatg -# ttcttcgtgcagacgtctgtgcgtttcgtcacgagatgtactgtggcagatgtactgcggcagtggattgtaagacatgttggaaacaaaacctatgc -# gtactcatattccaaagttacatgacgaaggcttttagcgtctcgtaaaatagaatttgaaaatattgaacacgaagaaacgcgaactcagtggatag -# aattcgacgtgacaaaagcagttcgtagttggatgaacaaaagtcatgaaaatttgggaatagaaattcaatgtgataaatgcaaaaatataggtgct -# cgtatacttagcgactcagattcttcgacacaatcatcatctggaaaaccagcaacaccaaacaacgaacgcttcaacctcatgccagttctgaatat -# tatcggacatggggccttaaaagcaaaaaaagaagatgactcggacgttcaccatatcgttttgtctaataatagaagcgatgaatatgtacatcatc -# gttcaaaccaagaaatagcgtggaagggaaaatggaataacaactgttacaaattacatcagcgatgctgcagaaatccgttggatgttgccttcaag -# gacatcaaagggtttgagtttatattacagccaaaagtattcgatgcaggttattgccacggcagatgtcctccgcgtcacaatcccgcccaccacca -# tgctctgttgcaaagtcttatatggcaggaagatcataaccgagcaccccgtccgtgttgcgctccttcaaaacttgagatgctcgaaatattacatg -# ttgacgaagaccacagcgataagctcaaaatttccacgtggagtgatatgcaggttgtagaatgtgcctgttcttaa] -# protein sequence = [MPRTARYPLLNIVSGEGEGDMQVPKRRSQDSIFSYCDLCVHTDGDTAMARSTLLAIPIRMYILDGYFDDLASCTYLLF -# VGRKSTLNVKDYSANYSSLVRSDNLSFKSATPTLTSANRQKRLYLSAAHVTSTGKAAIVDAIIRVRFVTTWTTIILIIMFFVQTSVRFVTRCTVADVL -# RQWIVRHVGNKTYAYSYSKVTXRRLLASRKIEFENIEHEETRTQWIEFDVTKAVRSWMNKSHENLGIEIQCDKCKNIGARILSDSDSSTQSSSGKPAT -# PNNERFNLMPVLNIIGHGALKAKKEDDSDVHHIVLSNNRSDEYVHHRSNQEIAWKGKWNNNCYKLHQRCCRNPLDVAFKDIKGFEFILQPKVFDAGYC -# HGRCPPRHNPAHHHALLQSLIWQEDHNRAPRPCCAPSKLEMLEILHVDEDHSDKLKISTWSDMQVVECACS] -# end gene contig36.g123 -### -# -# ----- prediction on sequence number 37 (length = 50013, name = contig37) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 37 on both strands -# start gene contig37.g124 -contig37 AUGUSTUS gene 959 27476 1 - . ID=contig37.g124 -contig37 AUGUSTUS transcript 959 27476 . - . 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ID=contig37.g125 -contig37 AUGUSTUS transcript 28245 28706 . + . 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ID=contig38.g129 -contig38 AUGUSTUS transcript 13242 13703 . + . ID=contig38.g129.t1;Parent=contig38.g129 -contig38 AUGUSTUS start_codon 13242 13244 . + 0 Parent=contig38.g129.t1 -contig38 AUGUSTUS CDS 13242 13703 . + 0 ID=contig38.g129.t1.cds;Parent=contig38.g129.t1 -# coding sequence = [atggatcaaaggattttcatcatattttgtgtaaaaaataaaattaagtgctccgaaacacttgaaatgttgacagtgg -# catacggtgaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttccaagctggccgggaagatgccaatgacgagcttcgctctgga -# cgcccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcactgaacaaaattgttttggaaagtcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgt -# cggtatatcgcttggctcgtgccatgaaattctttcaaacgttttgggcctgagtcgtgtgtcagggaagtttgttctaaaattgctgaattttaacc -# aaaagaaccgttgcatgagcatcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaaagggtcataactggtga] -# protein sequence = [MDQRIFIIFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGETVLSKKNVYKWYKLFQAGREDANDELRSGRPSTSTTDENVQALNKIVL -# ESRRITIREVAEDVGISLGSCHEILSNVLGLSRVSGKFVLKLLNFNQKNRCMSIAQELLDDVNDDPDLLKKGHNW] -# end gene contig38.g129 -### -# start gene contig38.g130 -contig38 AUGUSTUS gene 16114 31258 1 - . 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ID=contig39.g132 -contig39 AUGUSTUS transcript 1111 16255 . - . 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coding sequence = [atggcggcacatgagggaatttccgcatacttttcccagcttaattcactggctggaaagattacgcgcgacataaaca -# gagtaagatcttcatacagtcgagatgcctggcttgcgttaactttaaatgagcaggaaaaaatattggacactcattttataaatcctgatatatac -# actaagtattataaaacgtctgaaacaaaccgttcagaacaagaatcgccgttaaaaacagctattccaaaaagtgattttcaacaatttccttatag -# ggacgttgtatattcatttaacggacaagatctgcacacatatatctaccaaaatgttggattaaaagtattacatgacgaaaataccagagattgcc -# gcgatgaacattcttacccatttagttatcgaacaaaatctcaaataaacatactatccaaaaaacctgataatgtctctgttgtacgagctgctgtt -# gatgtatcgaaacccctttattcaaaatttacaaacaactcaaaaataccggctctccaaatttatgttaacgataagtcagacgttaaacaaacaaa -# aacacaaatgtgtaaggaagaaaattacgtaaaaagtaaatgtgattatgataatgacgaactgttggactataatgaaaaatttcatttgctgttta -# gatttgagtcaaaaagcagtgtgtccaacgatttgtctgattatgaaaatgaatttaaagatctacgtcaagacgaacatgcaaaacttttaacaccc -# gaactgcaagtcccgaaaggtttcgattttctaaggtataagtgggtaaatatcgattaccaaacgaaattatcggtaatctactatgaagccaatta -# 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-# TAIPKSDFQQFPYRDVVYSFNGQDLHTYIYQNVGLKVLHDENTRDCRDEHSYPFSYRTKSQINILSKKPDNVSVVRAAVDVSKPLYSKFTNNSKIPAL -# QIYVNDKSDVKQTKTQMCKEENYVKSKCDYDNDELLDYNEKFHLLFRFESKSSVSNDLSDYENEFKDLRQDEHAKLLTPELQVPKGFDFLRYKWVNID -# YQTKLSVIYYEANYRLSFFQTKSERERESAKMLKDSEHTRNKSFFFKQVKEFIKIAINAYDNDVENQFDAGIVGNATFEVDDQLEHLSTMREALFSQD -# GWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSSNLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGS -# GSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDPREIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSS -# SDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSGIGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGV -# SGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSGGIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQ -# TRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLAQNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSG -# WSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKEDVERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDG -# WRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQKYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQ -# NTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIQLAIHSGFISSQILTQPLTQTTLNLLNQLLSNIKHLQAAQQSLARGGNANPMAVNVAISKYKQ -# QIQNLQNQINAQQAVYVKQQNMQQTSQQQQQPQQQQHPSVHLNNSGNDYLRGHDAIRRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAATAYTDLVQEFEPG -# KPWKIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLYLNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVST -# PPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNGSSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGIYTYIYGKFKFSV -# TTEIVCR] -# end gene contig39.g132 -### -# start gene contig39.g133 -contig39 AUGUSTUS gene 18343 30272 1 + . ID=contig39.g133 -contig39 AUGUSTUS transcript 18343 30272 . + . ID=contig39.g133.t1;Parent=contig39.g133 -contig39 AUGUSTUS start_codon 18343 18345 . + 0 Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 18343 18390 . + 0 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 18502 19020 . + 0 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 22275 22514 . + 0 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 22747 23698 . + 0 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 25189 25340 . + 2 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 29949 30272 . + 0 ID=contig39.g133.t1.cds;Parent=contig39.g133.t1 -# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt -# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa -# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc -# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc -# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg -# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagtc -# gacatgcattgatacgaataaaggtgatatactgtgcaatgattcagaacactgcgaggatgtgtttattagtggcatacaaccggaaagtatagctc -# atagagatgggcgccttcgacagggtgatcaaattcttcgtattaacggcgtggatgttaaaaaccaggaagaggtagaaaatcagatagccgagagt -# agcaccgctgtaacgctcctagttagtcgaattctataccctgaagacgaggatgacgaagacattcattttgaatatgccaattcatttataccaga -# tgactacacaaatgtagtggataaattggataaggtattattaagccacgtacagtcttttgaagaactatcaaatgaaaccggcgagcattcatccg -# acttaaaagttcaaacttcttctctgccagacaaatttgtagaccaatccagcaagttgtgtggtaaaacaaagattcgtccggatgcaatccaaacg -# gataaccaaaaaactttaaagcaatctttaagcaaaaatcaagttcatctccaacatgagtacgacgaaagcgagcacatttacgagactattccaga -# agattctgagtctgaaccactttactgttccccgtatcaaagttcaaacggcaagtcgtcaatgggctgttgttcatccgcaatatcaacgactccgg -# ctgaagtattagaaacgacaatgcagcaacaaactcaacgagttgcacagtggttaggtttaaagccacaatatccgagaactattcacactcttgtt -# ggccgtcctgcgccactaaaattaacccaacaaccaaattgcagtcgtgtttttacattacgcagcacattgacaaacacaagccgatccagcagtag -# tggagttgcttacagtggttatggaccaaataatattcttggtgcaaacttagcttttggcgaagaggttgataactcctcaagtgcctataatactg -# gtggctcaaacaatagcgcctcgccgcatcaaaatactacaaatgctgatgatgatatcactgccaaccacaatctagagagcagagtgatcgatggc -# cgcagggaagctttagatacaactgctgtaagcagtatgttgcttttaccttttggtaaatccggtcgaatcggtctctgttcttcgaacatgtccac -# atcgtatgtcaacgagaaacaaggcaaggcaacctacgaaagtcaaattctcgttaaaagcaaccacaacgtattaggagtcaaacaaactgaggaat -# catatagccattgtccccagtttaacgcacccaatttgagtagctaccacttcgtaagtagtcaagaggttgcaaaccggtgtcatgattccacaaat -# tcaaaaccaaattctgcattgcttaacaatgaaaatagtgaagaaataccaatggtttggaaggttaagcggcgcccagatggaacgcgatacattgt -# aaagcggccagtacgtaatcgcccccaagttgctattcgaaaaaatgtgcgatgcaacgaacttacaacaacggaggaggatacagtatctgaagtaa -# aaattggtcgttattggacaaaggaagaacgaaagcgacacattgaacgagctcgagagaggcgtcaccatcagacacagcaacaacagctacagtaa] -# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES -# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH -# LFEQCLEPEIDIESTCIDTNKGDILCNDSEHCEDVFISGIQPESIAHRDGRLRQGDQILRINGVDVKNQEEVENQIAESSTAVTLLVSRILYPEDEDD -# EDIHFEYANSFIPDDYTNVVDKLDKVLLSHVQSFEELSNETGEHSSDLKVQTSSLPDKFVDQSSKLCGKTKIRPDAIQTDNQKTLKQSLSKNQVHLQH -# EYDESEHIYETIPEDSESEPLYCSPYQSSNGKSSMGCCSSAISTTPAEVLETTMQQQTQRVAQWLGLKPQYPRTIHTLVGRPAPLKLTQQPNCSRVFT -# LRSTLTNTSRSSSSGVAYSGYGPNNILGANLAFGEEVDNSSSAYNTGGSNNSASPHQNTTNADDDITANHNLESRVIDGRREALDTTAVSSMLLLPFG -# KSGRIGLCSSNMSTSYVNEKQGKATYESQILVKSNHNVLGVKQTEESYSHCPQFNAPNLSSYHFVSSQEVANRCHDSTNSKPNSALLNNENSEEIPMV -# WKVKRRPDGTRYIVKRPVRNRPQVAIRKNVRCNELTTTEEDTVSEVKIGRYWTKEERKRHIERARERRHHQTQQQQLQ] -# end gene contig39.g133 -### -# start gene contig39.g134 -contig39 AUGUSTUS gene 35574 39037 1 + . 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ID=contig39.g134.t1;Parent=contig39.g134 -contig39 AUGUSTUS start_codon 35574 35576 . + 0 Parent=contig39.g134.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 35574 36216 . + 0 ID=contig39.g134.t1.cds;Parent=contig39.g134.t1 -contig39 AUGUSTUS CDS 37575 39037 . + 2 ID=contig39.g134.t1.cds;Parent=contig39.g134.t1 -# coding sequence = [atgtctacagcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattccatatcat -# ccttcaacttttcatcggtttcggtgtcatcgagctcctcctcattgtgtaaaagtggtattgcacctgtgttcatttcgctccaaaaaaaggataag -# ggtactattatgatgtcagcccaggtcaccccgaagatcttggctagcattaactcaaaggagtcaaatcttaaagcaaacaccgtacatcatcacga -# aatggctaatcaagccaaagtcaatgcgtcatctctaccactgtcagacgatccgcggacactgcaattggcgttggaactatcactagtaggattta -# acgacaatccaacttgctatgcgcaacctgctccacccctatcaatgcctttaagtgcacagagtgattttgaaataggtaccatcaatggcatgccc -# gcgttttctaaaacagacagcaccctgccacttccaccggcaccgagctccctcctattaccctgtgccggcaacgtcagcttagaagatcgatcaaa -# gaagtcgcagaatatgaccgagtgtgttccagtccccagttccgaacatgttgccgaaatagtaggccgacaaggttgcaaaataaaggctttgagag -# ccaaaaccaacacttacattaaaacgcccgttcgaggagaggagccggtgtttgtagtaactggtcgaaaggaagatgtgaacaaggctaaacgagaa -# attctttctgctgctgaccacttcagcttaatacgagcatcacgtaagcccttgagcgacggtcatagtggcagtttcgcaggaagtacgagtggatc -# tggaggtagtgcaatgccgcgcatgcagtctggacctccatgtatgccaggacagataaccatacaggtacgtgtaccttatcgggtggttggacttg -# ttgttgggcctaaaggtgctacaattaaacacattcaacaagagactcaaacttacattgtaacaccgtcgcgcgaaaaggaaccaatttttgaagtg -# actggcttgccagacaatgtagatactgcacgaaagcaaatagaagctcatattgcccttcgaactggaacaggatctggaagtgtcgatggtaatac -# tgtgcaaggtggtgaaccggttgagggaaatgaatttgcgaccctgccgacaataaattcattaacccaaatattaaatgataatttgaattcagata -# ttttgtcgtctatatacaaaaatgcaattccatctgcacaggattatgcaaaaaatataataaaaattgctgagaacggtagccattccgtaaagaca -# atgcaaggccatcatactggcaattgctttaaaaaaactgagttttctgatatggaaatagcagcaactataaaagcaactcaaatatcagacaaaca -# ttttccggaaaatgaagtttccatgccatcatcgaaggctaatgttgtattccgtaatacgcctagcaaaacattatcctactgtcctcccacaccta -# catcagcatcgattcattccaactctaatgctaatattttaacaagatcttgttcatctgcttcttcaacaacttcaacaaagagtaccaacaatagc -# gccaacacacctccagaaatattaagtatatggaaaaatataagtgattcaattgacgtcgacgagggtataggggagtcgcctagtatttggaacca -# acagggtaacattatacccacagcacactgctcacctacagtctcaattagtcctacggattcgctcttaggttttggtgagcattctgtaaatcaaa -# aaaatctgcatcagactaaggagccgactacatgtagcaacaagcaaaagacgcaagctattcaattgcaacctatcccggataaatttatgattcac -# cgcgaatgttttgtttgtaacgaaaatgatgttacaactgctttggttccatgcggccacaatatgttttgcatggaatgtgcgaatcaaatatgcat -# ttctatggaagcagtttgtccggtttgtaattctattgtttaccatgcaatgcgcattttgggataa] -# protein sequence = [MSTAHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASINS -# KESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSSLL -# LPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKPLS -# DGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQVRVPYRVVGLVVGPKGATIKHIQQETQTYIVTPSREKEPIFEVTGLPDNVDTARKQIEAHIA -# LRTGTGSGSVDGNTVQGGEPVEGNEFATLPTINSLTQILNDNLNSDILSSIYKNAIPSAQDYAKNIIKIAENGSHSVKTMQGHHTGNCFKKTEFSDME -# IAATIKATQISDKHFPENEVSMPSSKANVVFRNTPSKTLSYCPPTPTSASIHSNSNANILTRSCSSASSTTSTKSTNNSANTPPEILSIWKNISDSID -# VDEGIGESPSIWNQQGNIIPTAHCSPTVSISPTDSLLGFGEHSVNQKNLHQTKEPTTCSNKQKTQAIQLQPIPDKFMIHRECFVCNENDVTTALVPCG -# HNMFCMECANQICISMEAVCPVCNSIVYHAMRILG] -# end gene contig39.g134 -### -# -# ----- prediction on sequence number 40 (length = 60015, name = contig40) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 40 on both strands -# start gene contig40.g135 -contig40 AUGUSTUS gene 560 4023 1 + . ID=contig40.g135 -contig40 AUGUSTUS transcript 560 4023 . + . ID=contig40.g135.t1;Parent=contig40.g135 -contig40 AUGUSTUS start_codon 560 562 . + 0 Parent=contig40.g135.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 560 1202 . + 0 ID=contig40.g135.t1.cds;Parent=contig40.g135.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 2561 4023 . + 2 ID=contig40.g135.t1.cds;Parent=contig40.g135.t1 -# coding sequence = [atgtctacagcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattccatatcat -# ccttcaacttttcatcggtttcggtgtcatcgagctcctcctcattgtgtaaaagtggtattgcacctgtgttcatttcgctccaaaaaaaggataag -# ggtactattatgatgtcagcccaggtcaccccgaagatcttggctagcattaactcaaaggagtcaaatcttaaagcaaacaccgtacatcatcacga -# aatggctaatcaagccaaagtcaatgcgtcatctctaccactgtcagacgatccgcggacactgcaattggcgttggaactatcactagtaggattta -# acgacaatccaacttgctatgcgcaacctgctccacccctatcaatgcctttaagtgcacagagtgattttgaaataggtaccatcaatggcatgccc -# gcgttttctaaaacagacagcaccctgccacttccaccggcaccgagctccctcctattaccctgtgccggcaacgtcagcttagaagatcgatcaaa -# gaagtcgcagaatatgaccgagtgtgttccagtccccagttccgaacatgttgccgaaatagtaggccgacaaggttgcaaaataaaggctttgagag -# ccaaaaccaacacttacattaaaacgcccgttcgaggagaggagccggtgtttgtagtaactggtcgaaaggaagatgtgaacaaggctaaacgagaa -# attctttctgctgctgaccacttcagcttaatacgagcatcacgtaagcccttgagcgacggtcatagtggcagtttcgcaggaagtacgagtggatc -# tggaggtagtgcaatgccgcgcatgcagtctggacctccatgtatgccaggacagataaccatacaggtacgtgtaccttatcgggtggttggacttg -# ttgttgggcctaaaggtgctacaattaaacacattcaacaagagactcaaacttacattgtaacaccgtcgcgcgaaaaggaaccaatttttgaagtg -# actggcttgccagacaatgtagatactgcacgaaagcaaatagaagctcatattgcccttcgaactggaacaggatctggaagtgtcgatggtaatac -# tgtgcaaggtggtgaaccggttgagggaaatgaatttgcgaccctgccgacaataaattcattaacccaaatattaaatgataatttgaattcagata -# ttttgtcgtctatatacaaaaatgcaattccatctgcacaggattatgcaaaaaatataataaaaattgctgagaacggtagccattccgtaaagaca -# atgcaaggccatcatactggcaattgctttaaaaaaactgagttttctgatatggaaatagcagcaactataaaagcaactcaaatatcagacaaaca -# ttttccggaaaatgaagtttccatgccatcatcgaaggctaatgttgtattccgtaatacgcctagcaaaacattatcctactgtcctcccacaccta -# catcagcatcgattcattccaactctaatgctaatattttaacaagatcttgttcatctgcttcttcaacaacttcaacaaagagtaccaacaatagc -# gccaacacacctccagaaatattaagtatatggaaaaatataagtgattcaattgacgtcgacgagggtataggggagtcgcctagtatttggaacca -# acagggtaacattatacccacagcacactgctcacctacagtctcaattagtcctacggattcgctcttaggttttggtgagcattctgtaaatcaaa -# aaaatctgcatcagactaaggagccgactacatgtagcaacaagcaaaagacgcaagctattcaattgcaacctatcccggataaatttatgattcac -# cgcgaatgttttgtttgtaacgaaaatgatgttacaactgctttggttccatgcggccacaatatgttttgcatggaatgtgcgaatcaaatatgcat -# ttctatggaagcagtttgtccggtttgtaattctattgtttaccatgcaatgcgcattttgggataa] -# protein sequence = [MSTAHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASINS -# KESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSSLL -# LPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKPLS -# DGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQVRVPYRVVGLVVGPKGATIKHIQQETQTYIVTPSREKEPIFEVTGLPDNVDTARKQIEAHIA -# LRTGTGSGSVDGNTVQGGEPVEGNEFATLPTINSLTQILNDNLNSDILSSIYKNAIPSAQDYAKNIIKIAENGSHSVKTMQGHHTGNCFKKTEFSDME -# IAATIKATQISDKHFPENEVSMPSSKANVVFRNTPSKTLSYCPPTPTSASIHSNSNANILTRSCSSASSTTSTKSTNNSANTPPEILSIWKNISDSID -# VDEGIGESPSIWNQQGNIIPTAHCSPTVSISPTDSLLGFGEHSVNQKNLHQTKEPTTCSNKQKTQAIQLQPIPDKFMIHRECFVCNENDVTTALVPCG -# HNMFCMECANQICISMEAVCPVCNSIVYHAMRILG] -# end gene contig40.g135 -### -# start gene contig40.g136 -contig40 AUGUSTUS gene 5461 16682 1 - . ID=contig40.g136 -contig40 AUGUSTUS transcript 5461 16682 . - . 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ID=contig40.g137 -contig40 AUGUSTUS transcript 38703 57833 . + . ID=contig40.g137.t1;Parent=contig40.g137 -contig40 AUGUSTUS start_codon 38703 38705 . + 0 Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 38703 38793 . + 0 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 42478 42643 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 45426 45606 . + 1 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 47913 48579 . + 0 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 55199 55372 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 55906 56181 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 56309 56669 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -contig40 AUGUSTUS CDS 57239 57833 . + 1 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 -# coding sequence = [atggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgcaacaacttactaccatttaa -# ctgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacgacagaaaattgtcgaactg -# gcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaagatactatgaaacgggcag -# tataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaacgcgagtgcccgagtatat -# ttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaaccgtgttttgcgaaacctg -# gcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactggccgccaacagcagtggaaa -# catcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaactcttcggaaagcggcggcg -# cgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccggatcgggatcgggatcgctg -# gacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagctggtgcacggtaaccagca -# ggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagtgaaattcccatatcatcgg -# cttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaagcctgggaagtgccggccac -# ctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcctccggtgagggtgaaaactc -# caatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaatcgaacatcttttacaaatg -# accagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaagattggtttgccagaggct -# aggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaaattccacaggagctagtgg -# aacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcgggatcagctgcgggtcctt -# cagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcattgagagtaccggcagtcca -# acaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagtttgttcaccgggcccccatgg -# ggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgctatttcgcccagactcaatt -# ttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggtaacacccataccgagcttc -# aaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgccacatgagtctacgaccgcc -# gccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccggccaatctgggagcaaact -# gcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatcaaacttctcaacatcatcc -# agtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaaccacctgggtgttggacacag -# ctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgccaacaacgtgacatcttcct -# cttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtataa] -# protein sequence = [MEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNG -# CVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPA -# NSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESIYEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPH -# SSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGPSVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDG -# HQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERTHYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKL -# RNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNSLPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRH -# GEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNMHHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLT -# PPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYALPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPS -# PCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGKQQFFASCFYSPWV] -# end gene contig40.g137 -### -# -# ----- prediction on sequence number 41 (length = 60014, name = contig41) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 41 on both strands -# start gene contig41.g138 -contig41 AUGUSTUS gene 8694 27824 1 + . ID=contig41.g138 -contig41 AUGUSTUS transcript 8694 27824 . + . ID=contig41.g138.t1;Parent=contig41.g138 -contig41 AUGUSTUS start_codon 8694 8696 . + 0 Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 8694 8784 . + 0 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 12469 12634 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 15417 15597 . + 1 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 17904 18570 . + 0 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 25190 25363 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 25897 26172 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 26300 26660 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 27230 27824 . + 1 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 -# coding sequence = [atggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgcaacaacttactaccatttaa -# ctgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacgacagaaaattgtcgaactg -# gcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaagatactatgaaacgggcag -# tataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaacgcgagtgcccgagtatat -# ttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaaccgtgttttgcgaaacctg -# gcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactggccgccaacagcagtggaaa -# catcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaactcttcggaaagcggcggcg -# cgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccggatcgggatcgggatcgctg -# gacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagctggtgcacggtaaccagca -# ggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagtgaaattcccatatcatcgg -# cttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaagcctgggaagtgccggccac -# ctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcctccggtgagggtgaaaactc -# caatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaatcgaacatcttttacaaatg -# accagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaagattggtttgccagaggct -# aggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaaattccacaggagctagtgg -# aacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcgggatcagctgcgggtcctt -# cagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcattgagagtaccggcagtcca -# acaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagtttgttcaccgggcccccatgg -# ggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgctatttcgcccagactcaatt -# ttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggtaacacccataccgagcttc -# aaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgccacatgagtctacgaccgcc -# gccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccggccaatctgggagcaaact -# gcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatcaaacttctcaacatcatcc -# agtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaaccacctgggtgttggacacag -# ctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgccaacaacgtgacatcttcct -# cttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtataa] -# protein sequence = [MEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNG -# CVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPA -# NSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESIYEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPH -# SSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGPSVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDG -# HQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERTHYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKL -# RNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNSLPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRH -# GEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNMHHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLT -# PPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYALPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPS -# PCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGKQQFFASCFYSPWV] -# end gene contig41.g138 -### -# start gene contig41.g139 -contig41 AUGUSTUS gene 35171 40419 1 + . ID=contig41.g139 -contig41 AUGUSTUS transcript 35171 40419 . + . ID=contig41.g139.t1;Parent=contig41.g139 -contig41 AUGUSTUS start_codon 35171 35173 . + 0 Parent=contig41.g139.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 35171 35483 . + 0 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 37496 37526 . + 2 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 39079 39241 . + 1 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 39536 39677 . + 0 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 40202 40419 . + 2 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 -# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga -# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt -# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc -# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacatggtaagttttcaattcttgaaaacgaacgacaaatcgacggtttcgcgccgacattcg -# cgaaaaaacccgctatacgacaggaagaagatggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccac -# aacggagcagctgttaaggaatcaatacgccataagcttactgttgataaagacgtccattcatattttgcaacacttgagatactaaatgtaacagt -# tgaggatgctggcaaatacaaagtgaatgcaaagaacgaattgggcgaaagcaacgctacaataagcctgaatttcgacagcgacgaagcccccgtgc -# cggaaagcgcagaaggcattaagccaacttttactgaacgaccagtaattcgtcaaagcgaagatggcggaaatgtaacgttcgaatgtagatgcgtc -# ggagatcccactccaacagtcacatggtacgaaactaatattataataaatatctttaccatacgaaagagatcaaataaacagatccgaagtacccg -# gtag] -# protein sequence = [MGVAEDFAPSFVKKPQLHQEDDGNRLIFECQLLSSPKPDIEWFRSDNKLVEDGRTKFKIQPVEDNKYTVVLELDDVVE -# TDAGLYKVKAKNKSGEVSASINLNFTHGKFSILENERQIDGFAPTFAKKPAIRQEEDGKRLLFECRVNADPIPTIIWFHNGAAVKESIRHKLTVDKDV -# HSYFATLEILNVTVEDAGKYKVNAKNELGESNATISLNFDSDEAPVPESAEGIKPTFTERPVIRQSEDGGNVTFECRCVGDPTPTVTWYETNIIINIF -# TIRKRSNKQIRSTR] -# end gene contig41.g139 -### -# start gene contig41.g140 -contig41 AUGUSTUS gene 40727 55462 1 + . ID=contig41.g140 -contig41 AUGUSTUS transcript 40727 55462 . + . ID=contig41.g140.t1;Parent=contig41.g140 -contig41 AUGUSTUS start_codon 40727 40729 . + 0 Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 40727 41066 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 42768 42957 . + 2 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 43899 44269 . + 1 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 44418 45343 . + 2 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 46703 47044 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 47580 47624 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 47876 47998 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 48304 48399 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 50623 50937 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 52323 52448 . + 0 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tcttaaccttaacattgaagcggagcctgagccggagggtgaggggccaacgttcattgaaaagccgcgcattgtatccgaaaacaacggtaaattgg -# ttataatggagtgcaaggtcaaggcagatccaaaaccagatgtaatttggttccgcaacggagaagtcataaaggaaagcaacaaaatcaaaacgttt -# attgagcagcgtggtgaccaatactacattaagctggagctattagatccccaactagaggactctggcctttacaagtgcaacattaagaacaccct -# cggcgagctgaatgcgaatcttacattgaatatagaaattgttcccgtcattaaagataaacctaaaattattaagattatcaaaaaacgaactgtta -# ttatcgagtgcacagttgcatcaaagttcgaacctaagtgtacttggtataaggaaacaaacactgtaaaagaaagcaagagacacgtttacctggtg -# gagcaaactaaggacggagagtttgctgtcaaactagagataaacgatgttgaagagagtgataagggcgcttacaaattggtggctagtaacgaaaa -# aggacaagctgtatctcaagttgtcaatctcgttgatattcccgaggaggaacgcaagcccagcaagccggaaatctcccgaaagctcgttgatcaaa -# aggtttccgagtcaaagactttcgagcttttaatcagtctggcccagtcagatcgcaagtgcaaaatcgagtggtacaagggcagcaccttaatacgc -# gaaaccaaagacattaccaccacgttcgatggaacaactgcacgactcacatttagctcggcaagaacggaacacacttcaaactataaagtcattgt -# 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PDYERPQLEKYERSDFTPTDFGRELEIPNKMEKPILDSGKKESEAPVQKNGIPKKSEIIEKPAEEPKGLKIGKGKLPDEDDSRDGAILKPVIIEPEAI -# KAKVSDLKKPEALATLEDDYERPVLEKCDPVNFDNNKSEKPTPAIITPDTKHPQVKLPVEEPKEEKPKVSRMQPPSPGEPPKIEVIREKRPSLAPEPP -# SRRGSLIPPADTGRRPSLIINDEKRSDRRTWVYRLVYD] -# end gene contig41.g140 -### -# -# ----- prediction on sequence number 42 (length = 70020, name = contig42) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 42 on both strands -# start gene contig42.g141 -contig42 AUGUSTUS gene 5165 10413 1 + . 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ID=contig42.g142 -contig42 AUGUSTUS transcript 10721 63391 . + . ID=contig42.g142.t1;Parent=contig42.g142 -contig42 AUGUSTUS start_codon 10721 10723 . + 0 Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 10721 11060 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 12762 12951 . + 2 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 13893 14263 . + 1 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15337 . + 2 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 16697 17038 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 17574 17618 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 18298 18393 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 . + 0 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CDS 11722 14394 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 15580 25413 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 25485 26463 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 26524 26865 . + 1 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 27561 28603 . + 1 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 31746 32048 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -contig43 AUGUSTUS CDS 32749 33383 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 -# coding sequence = [atgtccaagaatcttattctgttgttgaagaggaaacagactgaccgaggtgtatatgttaacgtgagcatgctttgta -# attgttttctagactcgactgcttaccttacggttggcatcgaaggcagtccagcacctacattcaagttctacaagggagttagtgagattcttgag -# ggcggtcggtttaagttcctcacagatgggcagacaaacacaattaccttgtgtatgcgtaagtgcaagcccaacgatgagagcaagtacaagattgt -# 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aattcaatatgtgctgaaagtactgttgccagtataaaatcagccccgcctatagcatcactagaatcacaaacaaaatataatagtgatgatagtaa -# cagatgttttaataataacttacatgttggcttaaccaatgaaatcagtaacatcagccaaaaatccactgagtcggcagagttaaccaataaacttc -# cattactcggcgtggagtatcgtactggaattcggccatctccagacgctgctccaacaagtttagcggataaggacatacccaggattcaacaattt -# aaggaatggcatcaagttctccaattaaaatcctacaacaatgagcccttaatcgttttgccttacgttttgcttgaataa] -# protein sequence = [MVVNMDAVLSVICALEGTTITKEQLEATRLAKYINQLRRRTKNEHLARRAKSLLKKWREMVGIQQTAAEFVPHLSQIG -# SQPTQPALDSPKSTALVPDSHLSEPFTQSLPSQQVVPHMQANIDTSEPPPLDVHTELRTNFTNLVNNIHDCEHVEKFNITTLQNLKDRRHPALSRQVG -# SPQPIVNEQSVNSVFNLTHVSTEKINEASVVIDIVSDSDENDNNCASKREKSNLTVPVPLAIPTTPSYRQKKLKKDKKSKDREGQVAQNKRFGTKVSD -# AFVQSSLIADSDIFSLSNSSMSSIFSGDATLGNSQHKTRLSSSELTFTGRFKSVNQLDVSNYSNSSLLTGQNCVLRNNESGKLDEYSAYDSSASCSRL -# SPSTVEDVRKSENVINARLNNATANQMPTPVTSMGYDTNCRTEYLENTSQSQIPKRRGRKKGSKGVDALIAKESSSLSQQIFFGGSTVKKVKTTKELF -# NEIQSRKLSVSMQSSTSNLSNSSTNRELASRAIFPRPTSSCSEPPISDSDTLTSEPSHDSNKSQDIKETTSLDSNSNSLHTLVLERTPKNLMPMNFND 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number 44 (length = 50013, name = contig44) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 44 on both strands -# start gene contig44.g145 -contig44 AUGUSTUS gene 125 9977 1 - . ID=contig44.g145 -contig44 AUGUSTUS transcript 125 9977 . - . 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agcctccgcctttggatgtgcatactgagcttcggaccaactttacgaacctggtcaacaatatccatgattgcgagcacgtggaaaaattcaatata -# acgacactgcaaaatttaaaggaccgtcgccatcctgcactaagtaggcaagtgggttctcctcagccgatcgtaaatgagcagtcggtgaattccgt -# atttaacctaacccatgtgagcaccgagaagataaacgaagcttcagttgttattgacattgtatccgattccgatgaaaacgacaataactgtgcat -# cgaagcgtgaaaagtccaacttaacagttcctgtgccccttgcaattccaaccacgccaagctatcgacagaaaaaattgaaaaaggacaaaaaaagt -# aaagatagagaggggcaggtcgcacaaaacaaaagatttggaacaaaagttagcgacgctttcgtgcagtcttctctcatagcagattcagatatatt -# ttccctttcgaacagttcaatgagctcaattttttctggggatgctacattgggtaattcccagcataaaactcgattgagctcaagcgagttgacat -# ttaccggcagatttaagtctgttaaccaattggatgtttcaaactacagtaattccagcttattgaccgggcaaaattgtgtattgcgaaacaatgag -# tcagggaaacttgatgaatacagtgcttacgattcaagtgcatcatgtagccgtctatctccttcaactgtcgaggatgtaagaaagtctgaaaatgt -# aataaatgctcgattaaacaatgcaactgcgaatcagatgcctactcctgtaacaagtatgggttacgatacaaattgtagaactgagtatttggaaa -# acacctcccagtctcaaattccaaaaagacggggtagaaaaaaaggatcgaaaggtgtggacgcacttatcgccaaggagtcttctagcctgtctcaa -# caaatattttttggtggttcaactgttaaaaaggttaaaaccacaaaggaacttttcaatgaaattcagagcagaaagttaagtgtttccatgcaatc -# ctcaacaagtaatctttcaaattcttcaacaaatcgggaactggctagccgtgctatttttccaagaccaacgtcgtcctgctcagaacctccaattt -# cggatagtgatacgctcacttcagaaccatcgcacgatagtaataaatcacaagacattaaggaaactacttcattggacagcaatagtaattctctt -# catacattggtcttagaaaggactccaaaaaacttgatgccgatgaattttaacgatgttaccactcaactaatgcacctaattcacagcttgaacag -# cccaatgagtgaacttgaaattgaggaaatgtaccaagctcaaatagtaccatgtacttgcatagttatcgaggaagttcaaagttcattaaaagagc -# ccaaaaaagaagcttcagactctgatatcaacgatccagcaacaagttcaaattgtgataagaatatttctcgccacaagaatgaagaccaagttttt -# aattttgaaagtttggataatgttgaagtaggtgaaattcaaccaaaaacagtgaagtcaatatttgatctagattttgatgataacgacgatccttt -# gaatacaataatggatgaaattcaaaagccaatagttaaacttgaaaatataaaaaaaaacttggataccaaaaatgtatcttttagttcgcctgcac -# aaaacgtttcgttaagtttgctacatattaacgccgatgctcaagctgacaaaaatcatctagaaaaggagaacagcgaaacctacaatgaagtttct -# cctgtttttacggttcatgaggatcctgattgcgtagcaaagaataggttttatgtacaaaccaacagagtgacaagttttcacataaattcattgca -# taatttctacataccaaatataaatggcaattgggatagtgttgactcatctcctagttttcacaatttggactcgtacacagtgacgaatggagctg -# atgttgtacctaaatatggtcttcttacatcagataaaataaaaaaagatctaagttctttaaaatatataaaacctttcaaggcgaaacgttttaaa -# tcgtttatttcaccgtttcttggcgttgcaaagtgtttaccaacgtgtcgacgtgctaaacacaaagttaagaaatggcttaactcttcgattcactt -# cggacaaatttcacaacattttgaagtttccgaaattaaagcagaacataaatttaataattccagtccgctaaaggttaacattgatgttccgattt -# ctggtatcaacagccatattaaaaatcacgtgccaacacaagttaatcccaacatcaatatattaccatcacctgaaactttatttaatacgagctct -# gggaatgctttcagtaatagtttattaaaattggctaatgataataatcctgaaacaagcgatacaagtagtgataacgattatcaaggtgacagtcc -# tcatagtgctagtagttcaagcacttttagcttttctagtttaaaagaaactcaagactccataaatgaaaagcttaaaaataagaggattgaatcac -# tcggcacaaaagcaaagttacatcatcgaaataaaagaatatatgcaggcgatgatatgaaaaaaaaaaaacatttacaaaaagaatttaatattcca -# ggcaagcggataaagactgttttaaatggaaatttgtttaatctgagtagtaataacaacagcagtgatagcgagaatgaagcagagaattataatga -# aaacgaatacgaaaacagtaatagggaggaatatgccattgttcaacgcccactaggtgatggtggagctaccagcaatcatattgtattaacaataa -# agaaaactccaagcaaagtcaattctccagcaaactctatgaatgaagtttcacccaatacatcagatattggaaatttaaaaaagacgattcccaat -# tcttatgtgaaagatgcaactaaaatacgaaatacaactcatatttcgatgggaaaagggaaatcaatatcgaaaacacacaggtcagcttttcggtc -# ccggaacacccgctatcgccaagcagtccaaaaaaacgtaaaaggtcgcattaagactattgatttggaacttaaacatttatttcatttaaaaccaa -# aagccaacaatcatatttcagatttaaagcttcacaataaattgtttttccaccacgaattgtgcatagagaatgataggaagaagaaaaagttaaaa -# aaagttcatcttttggtgcacataacttag] -# protein sequence = [MVVNMDAVLSVICALEGTTITKEQLEATRLAKYINQLRRRTKNEHLARRAKSLLKKWREMVGIQQTAAEFVPHLSQIG -# SQPTQPALDSPKSTALVPDSHLSEPFTQSLPSQQVVPHMQANIDTSEPPPLDVHTELRTNFTNLVNNIHDCEHVEKFNITTLQNLKDRRHPALSRQVG -# SPQPIVNEQSVNSVFNLTHVSTEKINEASVVIDIVSDSDENDNNCASKREKSNLTVPVPLAIPTTPSYRQKKLKKDKKSKDREGQVAQNKRFGTKVSD -# AFVQSSLIADSDIFSLSNSSMSSIFSGDATLGNSQHKTRLSSSELTFTGRFKSVNQLDVSNYSNSSLLTGQNCVLRNNESGKLDEYSAYDSSASCSRL -# SPSTVEDVRKSENVINARLNNATANQMPTPVTSMGYDTNCRTEYLENTSQSQIPKRRGRKKGSKGVDALIAKESSSLSQQIFFGGSTVKKVKTTKELF -# NEIQSRKLSVSMQSSTSNLSNSSTNRELASRAIFPRPTSSCSEPPISDSDTLTSEPSHDSNKSQDIKETTSLDSNSNSLHTLVLERTPKNLMPMNFND -# VTTQLMHLIHSLNSPMSELEIEEMYQAQIVPCTCIVIEEVQSSLKEPKKEASDSDINDPATSSNCDKNISRHKNEDQVFNFESLDNVEVGEIQPKTVK -# SIFDLDFDDNDDPLNTIMDEIQKPIVKLENIKKNLDTKNVSFSSPAQNVSLSLLHINADAQADKNHLEKENSETYNEVSPVFTVHEDPDCVAKNRFYV -# QTNRVTSFHINSLHNFYIPNINGNWDSVDSSPSFHNLDSYTVTNGADVVPKYGLLTSDKIKKDLSSLKYIKPFKAKRFKSFISPFLGVAKCLPTCRRA -# KHKVKKWLNSSIHFGQISQHFEVSEIKAEHKFNNSSPLKVNIDVPISGINSHIKNHVPTQVNPNINILPSPETLFNTSSGNAFSNSLLKLANDNNPET -# SDTSSDNDYQGDSPHSASSSSTFSFSSLKETQDSINEKLKNKRIESLGTKAKLHHRNKRIYAGDDMKKKKHLQKEFNIPGKRIKTVLNGNLFNLSSNN -# NSSDSENEAENYNENEYENSNREEYAIVQRPLGDGGATSNHIVLTIKKTPSKVNSPANSMNEVSPNTSDIGNLKKTIPNSYVKDATKIRNTTHISMGK -# GKSISKTHRSAFRSRNTRYRQAVQKNVKGRIKTIDLELKHLFHLKPKANNHISDLKLHNKLFFHHELCIENDRKKKKLKKVHLLVHIT] -# end gene contig44.g145 -### -# start gene contig44.g146 -contig44 AUGUSTUS gene 11632 17081 1 - . ID=contig44.g146 -contig44 AUGUSTUS transcript 11632 17081 . - . ID=contig44.g146.t1;Parent=contig44.g146 -contig44 AUGUSTUS CDS 11632 12468 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 13947 14852 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 16977 17081 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 -contig44 AUGUSTUS start_codon 17079 17081 . - 0 Parent=contig44.g146.t1 -# coding sequence = [atgctcagcagcaccggaaccagtatcatacgctgcgcccgaagccgggtcggaaacctctttaaacttctgaatgaaa -# tacgacttattataccatctgaaaagacccattacgttagcatgaccgacattgatgcaagtgctcaacagcaacaacatctccaaaacgtgcagagg -# ttgcaacacgaaaactgccttcaggagttacacaatcaactgaacagccagttcggggcagctcgatttgcggccccaaatcctcaccaggcagtttc -# aattacttccggaaacttggttccatttcttccggccttcctacagcccccgatgcctgctcaacaacttttgcagttgattcccggccatgcgggtc -# cccaaactgtcgcccaccacggtcacccgcaaactgactcatccagcgcacacaaaatggctctagctcctatgtggtccactgcggcggtggcggct -# gcgcacattcaggccgctctggcggctgcagcggtagcggctgcaagtaatagtaatttttccagcaacaacaacgtgctggcttcatcgactagtgt -# taatgagccatcgagcacagactcctccgcatctgtaccattaatggagatcggagaaatgagaagaggcggaattggaggagccagcttgtcaaggc -# cagagtccccgggttacgaaaatccaccttactcaatcctctcttatagccacaacacacctccggaatcgccgcatggtcgaacagctgaatgttcc -# aagaactttgcaccttcgccggcggacaatcacagcatggcaagcctatccgaagcccaagactcggaaatggatgcaccattgaatctcagcaagcc -# aaagggatcgcccagttcttcgccaaacagctcttctcaaaaggaccacagtgaaagccttgctcctgtggtgtccagtccacccctaagctggcatc -# aagggcaaaaacattatgccgagatagaatcgcctcttttaaagagtcatggaagattatggaactcaacagtcgtcggttctgggggatcacgtgca -# acgcgcatgagtcgcgactcgttaaacagctgtggcacaaattcagaacgatctgctgccctggaacgtgaaggcaacaacgcaagtcaacttggccc -# tgtacctcggtcgccgtcatctcacccactgaggcaaggcaatggtcatgggcatggacacggccatagccacgggcacggacacagcaagccccata -# ttaaaagacccatgaatgcattcatggtgtgggcaaaggatgagcgaagaaagatattgaaggcatgcccagatatgcacaactcgaatatatcaaaa -# attctgggtgctcgctggaaggcaatgtctaatgccgacaaacagccatattacgaagaacagtcaaggctttcgaagcttcacatggagcagcatcc -# cgattaccgctacagaccacggccgaagcgcacctgtattgtggatggcaaaaagatgcgtatttccgagtataaagtcctgatgcgtaatcggcggg -# ctgagatgagacagctatggtgccggacaagcggagtcagtggtagctcgggaagtgcctgcgccgatgcctgtccaaagggacaccccggcggatca -# aatgcccaggcagcagtcgcagccgctgcagctgtgtaccacttgcaggatatggcatctgcagcagcgtccaccgttcatggcaatgactgtgggca -# cacacccccccaacagttcttctatcctccagaaagcttgtcaccgtctggtttttcatccgacgaaggagaattgccgtctcagcgtgagctggacg -# actaa] -# protein sequence = [MLSSTGTSIIRCARSRVGNLFKLLNEIRLIIPSEKTHYVSMTDIDASAQQQQHLQNVQRLQHENCLQELHNQLNSQFG -# AARFAAPNPHQAVSITSGNLVPFLPAFLQPPMPAQQLLQLIPGHAGPQTVAHHGHPQTDSSSAHKMALAPMWSTAAVAAAHIQAALAAAAVAAASNSN -# FSSNNNVLASSTSVNEPSSTDSSASVPLMEIGEMRRGGIGGASLSRPESPGYENPPYSILSYSHNTPPESPHGRTAECSKNFAPSPADNHSMASLSEA -# QDSEMDAPLNLSKPKGSPSSSPNSSSQKDHSESLAPVVSSPPLSWHQGQKHYAEIESPLLKSHGRLWNSTVVGSGGSRATRMSRDSLNSCGTNSERSA -# ALEREGNNASQLGPVPRSPSSHPLRQGNGHGHGHGHSHGHGHSKPHIKRPMNAFMVWAKDERRKILKACPDMHNSNISKILGARWKAMSNADKQPYYE -# EQSRLSKLHMEQHPDYRYRPRPKRTCIVDGKKMRISEYKVLMRNRRAEMRQLWCRTSGVSGSSGSACADACPKGHPGGSNAQAAVAAAAAVYHLQDMA -# SAAASTVHGNDCGHTPPQQFFYPPESLSPSGFSSDEGELPSQRELDD] -# end gene contig44.g146 -### -# start gene contig44.g147 -contig44 AUGUSTUS gene 21455 44459 1 + . ID=contig44.g147 -contig44 AUGUSTUS transcript 21455 44459 . + . ID=contig44.g147.t1;Parent=contig44.g147 -contig44 AUGUSTUS start_codon 21455 21457 . + 0 Parent=contig44.g147.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 21455 21722 . + 0 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 27693 27777 . + 2 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 38180 38239 . + 1 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 -contig44 AUGUSTUS CDS 44339 44459 . + 1 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 -# coding sequence = [atgagcgctgagatctcggaaactataagagctagaaaagtcagacttgacatgcagattccgggcttcctgcgcagcg -# caagtttgtttcagcggggtgccacgccaactctattacgccgatccgcgaaaatcagtagcgcctacagtttttatgatagaaacaaaattttaact -# gaaaaaatttgcaacgtccactctcacgctcacaaacggtttaaacgcttaaatctgtgtgccgcccatataacatctactgaaatagccggcgagtg -# gcgagtcttgcctgacgagtttatgtttcgaccatgtctaatgctcaacctatttgacgtatattgtcgagtgtgttgaaacgaaattttaactgtcg -# atacctatcgtttcgtcaaaacatttttccacacccactggacagcaaactcaaaccggaaaattcagaattcattagatcttttgcgcattgacaat -# aacaagcagcccatcatcatcgtcaatcatccccttcttttcagcgccgcattggacagataa] -# protein sequence = [MSAEISETIRARKVRLDMQIPGFLRSASLFQRGATPTLLRRSAKISSAYSFYDRNKILTEKICNVHSHAHKRFKRLNL -# CAAHITSTEIAGEWRVLPDEFMFRPCLMLNLFDVYCRVCXNEILTVDTYRFVKTFFHTHWTANSNRKIQNSLDLLRIDNNKQPIIIVNHPLLFSAALD -# R] -# end gene contig44.g147 -### -# -# ----- prediction on sequence number 45 (length = 50013, name = contig45) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 45 on both strands -# start gene contig45.g148 -contig45 AUGUSTUS gene 1628 7077 1 - . ID=contig45.g148 -contig45 AUGUSTUS transcript 1628 7077 . - . 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ID=contig46.g150 -contig46 AUGUSTUS transcript 2792 19528 . - . ID=contig46.g150.t1;Parent=contig46.g150 -contig46 AUGUSTUS CDS 2792 2902 . - 0 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 12474 12591 . - 1 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 18426 18548 . - 1 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 18842 19001 . - 2 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 19456 19528 . - 0 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 -contig46 AUGUSTUS start_codon 19526 19528 . - 0 Parent=contig46.g150.t1 -# coding sequence = [atgcggctgctccagcacgtgctggcattaaaaatgaatatagctcgaaagggccaaatggagaagtccacaatccgag -# ctgcgcggctaacttattctactaaatggacggcagtacacgtagtggcgaagtggcgcaagaagcgagcgaagacaagtactatatatagccgcaga -# attgaaaatctgatattatggtccgatcgtaaggatacaccaatcgtaaggttaagcgtcacaagaagagtcgacctagccatgtccgtccgtctgtc -# cgtccgtttctacgcaaacttgtctctcagttttgaagctatcgggctgaaactttcccaaaagtcttctttctattgcagagaccgccgatatgccg -# atatgccgcctcctgaggaagaacaaacaaatgagaaggaacgctccgatctagagatgattaaacaacttcaaataatacaaagtcgattactttgt -# cagcataaagatattcggaaagtttttgtggcgcaagatagaaataaagttcgcaaagatgtcttatatatgaagatatgtgttcagatgtgttccgt -# ttcttctgcggtatga] -# protein sequence = [MRLLQHVLALKMNIARKGQMEKSTIRAARLTYSTKWTAVHVVAKWRKKRAKTSTIYSRRIENLILWSDRKDTPIVRLS -# VTRRVDLAMSVRLSVRFYANLSLSFEAIGLKLSQKSSFYCRDRRYADMPPPEEEQTNEKERSDLEMIKQLQIIQSRLLCQHKDIRKVFVAQDRNKVRK -# DVLYMKICVQMCSVSSAV] -# end gene contig46.g150 -### -# start gene contig46.g151 -contig46 AUGUSTUS gene 20080 35855 1 - . ID=contig46.g151 -contig46 AUGUSTUS transcript 20080 35855 . - . ID=contig46.g151.t1;Parent=contig46.g151 -contig46 AUGUSTUS CDS 20080 20212 . - 1 ID=contig46.g151.t1.cds;Parent=contig46.g151.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 35704 35855 . - 0 ID=contig46.g151.t1.cds;Parent=contig46.g151.t1 -contig46 AUGUSTUS start_codon 35853 35855 . - 0 Parent=contig46.g151.t1 -# coding sequence = [atgctgcaaatagcgtcgatccgccgggacgacataagacgacagtcgacgggaatgcagcagggaaaactagttgtat -# tgtcgacgctaatgctgttgctttttttagccgatgcaacaaaaaaggaacaagacactcgaaataacaacagcatcgaccgattacattttttgaat -# tgtattccaatttctcaagagcggaagttaatatgtaggaaagcacagcagctaaatttccgcggtgtccggtacggcttcttccgacttttgtacta -# cctgcaatag] -# protein sequence = [MLQIASIRRDDIRRQSTGMQQGKLVVLSTLMLLLFLADATKKEQDTRNNNSIDRLHFLNCIPISQERKLICRKAQQLN -# FRGVRYGFFRLLYYLQ] -# end gene contig46.g151 -### -# start gene contig46.g152 -contig46 AUGUSTUS gene 37008 37634 1 + . ID=contig46.g152 -contig46 AUGUSTUS transcript 37008 37634 . + . ID=contig46.g152.t1;Parent=contig46.g152 -contig46 AUGUSTUS start_codon 37008 37010 . + 0 Parent=contig46.g152.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 37008 37634 . + 0 ID=contig46.g152.t1.cds;Parent=contig46.g152.t1 -# coding sequence = [atgtgcatgcgatctgccgaatcatacggaaagacttgggcaagtactgcaatattgttgcggttgcactcgaatctac -# atacatgcacggacttagaagaacatgcgtactcaaaaaccagtccgctgcgagccatcgcatacaagatctccaactcctctgagccagctactgat -# gagatactcctcccttgccgcgcctcctcgagcatcgagcagcgcgagcagcgaatttcgattccagttctgatcgcagacagcccctggcccctggc -# ccctggcccccggcccccggccaccttcccgaagacattctcgcgtggcaatgcacctgtcgcgaccaatgcttgtatgctgcagcaaccggcaccag -# agactacgatgaatcaggacggctggccgggccatgggccagagatctcagagcgttgggagaagctaacgacgtggcaagaggaaacattttacgac -# cgtcatggggagttcgtatactgccactgcgtaggtacacactgtactcacctttccttgcagagcccggttgagcctgagagattgcgcatctccga -# ggtgtactcctgtgaccaggcgcaagaaagaccgctttataagccgtttgcatgttag] -# protein sequence = [MCMRSAESYGKTWASTAILLRLHSNLHTCTDLEEHAYSKTSPLRAIAYKISNSSEPATDEILLPCRASSSIEQREQRI -# SIPVLIADSPWPLAPGPRPPATFPKTFSRGNAPVATNACMLQQPAPETTMNQDGWPGHGPEISERWEKLTTWQEETFYDRHGEFVYCHCVGTHCTHLS -# LQSPVEPERLRISEVYSCDQAQERPLYKPFAC] -# end gene contig46.g152 -### -# start gene contig46.g153 -contig46 AUGUSTUS gene 38592 42084 1 + . ID=contig46.g153 -contig46 AUGUSTUS transcript 38592 42084 . + . ID=contig46.g153.t1;Parent=contig46.g153 -contig46 AUGUSTUS start_codon 38592 38594 . + 0 Parent=contig46.g153.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 38592 38667 . + 0 ID=contig46.g153.t1.cds;Parent=contig46.g153.t1 -contig46 AUGUSTUS CDS 41933 42084 . + 2 ID=contig46.g153.t1.cds;Parent=contig46.g153.t1 -# coding sequence = [atgcttcagcgtggaagtcgtcggtttcccgcgatggctcgcgacgtaagagccagcacgaaccaacgtagccgaccta -# gttcggaatttaaaattggatcctatgaaaatcagacgactatatcatatagctgccatgggaaagatctgaaaattggtggaaaacaatatgaaaca -# aatcatagaatcggtgtttttgacatattagctggaaatatcgttttgtag] -# protein sequence = [MLQRGSRRFPAMARDVRASTNQRSRPSSEFKIGSYENQTTISYSCHGKDLKIGGKQYETNHRIGVFDILAGNIVL] -# end gene contig46.g153 -### -# start gene contig46.g154 -contig46 AUGUSTUS gene 42718 44331 1 - . ID=contig46.g154 -contig46 AUGUSTUS transcript 42718 44331 . - . 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NAQVLHQQAQSVVVPLAASVECVMESGSAGDLNKLEDQPRNDLDLINEYNLRMLLRGQPTVNQQQQPLLPTSGNENISGGDYITETQLLAAQNLMIPM -# WLPPSKQQQPDPQWPGLTNEKATLWEVGNLHEEPSEDQQLLMLRSSQSCFPDTVQSVPATTPSQVQPENNFKHSSSAELEQPHTTDNLKESHNQQLVQ -# SFASESEHQNKERNLHQQQIKHSSKQVLNVKQNVAQNLPIKRINEDDRKRELAEEKKRQKEERKRQQLEEEKRRAILESEEKARQMQEEKERQQQIQA -# QRRKALLATSVSPQSNKNDAIKSAEPQSASRLPSTSVAPWSLQSPNSNNTAPGLAEIQKAERRERRADQQRHQELLDKQLRANAAAAAEASDALLKWQ -# AAPAASPVMSLAEIQAEEAKRLANEIVDQQRRRELEQHQHVALSSAHVGTSGTTNIWGSANKAWNGSSLVPSLPIRSNTGTGLWDEPSGSSANNGSGT -# SIGSTVTAAAVLVAGLNSANKANQPAQNKSSTSFASPRNLRKSQTLPAIHNTGKTTKSATGQQQEKQKLIQVRACSKVAIASTEEKDKERKSNAKSHV -# PQSTDATISKVNEYEGEFTSWCMKSLDNMSAKVDGEGKESLDFARQFLERRSKYKSLQRAQNAHNDDMCKPAPAITPSTNDYADSKDHSRVDLAMSVV -# PSVPMNAEISETRRARTVNLSENLRLHNFLQRSILRFFNLPYIFFGCTHQENATIPNANVVQKPLAIQGRYSPLKS] -# end gene contig47.g156 -### -# -# ----- prediction on sequence number 48 (length = 65012, name = contig48) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 48 on both strands -# start gene contig48.g157 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ID=contig49.g161 -contig49 AUGUSTUS transcript 4420 12520 . - . ID=contig49.g161.t1;Parent=contig49.g161 -contig49 AUGUSTUS CDS 4420 4563 . - 0 ID=contig49.g161.t1.cds;Parent=contig49.g161.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 4928 5059 . - 0 ID=contig49.g161.t1.cds;Parent=contig49.g161.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 6707 12520 . - 0 ID=contig49.g161.t1.cds;Parent=contig49.g161.t1 -contig49 AUGUSTUS start_codon 12518 12520 . - 0 Parent=contig49.g161.t1 -# coding sequence = [atgaacacatctcagccgctgggccaagggattccaaaagagaaaagccagttccaaaagcgggactcaaaacccaaca -# ccgaggaaaggtttgccttcgcagaaaatgctttaaggagccagattcaaataaaggaacagttgcggcaccaacaacaatcaactatgtatgcgacg -# tcactagccaacactccagctgccgcatcagttgaagcacaattcctaaatcaaccaacagaaagacccaactacccgctgagggtgaattctctcca -# ccataaaaacctgaccgcagctgaaaaacaacaatcgcaaatgcaaccaccaatatgtaagtcgcctatgggtatggatgcgtcttattccagttacc -# aaaacaccaatggtagcatggtgtccataaaaagtgaacagcagttgtgtcaaatatacaattcgcagcaacactccgattacattatttcggattat -# atggataaaattgctacgcggattagtttacttgaaacagagttaaagtttgcttggcgtgcattggacttgctttctacagagtatggaaagatttg -# 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ID=contig51.g167 -contig51 AUGUSTUS transcript 30365 47091 . + . 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ID=contig52.g168 -contig52 AUGUSTUS transcript 357 17083 . + . ID=contig52.g168.t1;Parent=contig52.g168 -contig52 AUGUSTUS start_codon 357 359 . + 0 Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 357 541 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 6203 6297 . + 1 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 7178 7576 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 . + 1 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 13105 13211 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 15206 15454 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 -# coding sequence = [atgtttcaagacttcaaggcccagctccttatattcaaacctccagccgagtgtatgtctcggacttttgaggtaaccg -# tgtgggtgctcatccgattccgcatgtcggggctgtacatcattgtagccgattcatatcagctgattcgtgacaacacgctctgttttaagtgcggt -# ttgtggacgatcagaaaccgagtcgatctagccatgtccgtctgtccgtccgtccgtatggacgctgagatctcgaaatctagagctagagcagtcag -# acttggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggacactt -# ctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttcagtg -# tctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttgatct -# atttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacactcgg -# agggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgcagca -# gacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccgcat -# tcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttggagg -# atattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaaagg -# aacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccactga -# gataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttgttg -# tggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcaccac -# cataatcttgccggcagcgaagtcaagtttgatcgtcagggcgatggattggcaaggtatgatattttaaattatcaacgtctggaaaactcatctgg -# atatcagtataagggagatacctgttgctggatatgcgacagctgcgaatccttcgaatacgtatatgacgagtttacatgtaaggactgcggtccag -# gactttggccttatgcagacaagctttcctgctttgctttagatattcaatacatgcgatggaactccttatttgctctaatacccatggccatagca -# atattcggtattgctgtgacaattatagtaatgctactatttgcaaaaaatcacgatactccattggtgtacatcctcgtctttcacccggataaaaa -# cgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacacagg -# caggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggccaa -# tcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaatta -# a] -# protein sequence = [MFQDFKAQLLIFKPPAECMSRTFEVTVWVLIRFRMSGLYIIVADSYQLIRDNTLCFKCGLWTIRNRVDLAMSVCPSVR -# MDAEISKSRARAVRLGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISPA -# STAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNAR -# GVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEPV -# SDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHNLAGSEVKFDRQGDGLAR -# YDILNYQRLENSSGYQYKGDTCCWICDSCESFEYVYDEFTCKDCGPGLWPYADKLSCFALDIQYMRWNSLFALIPMAIAIFGIAVTIIVMLLFAKNHD -# TPLVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPEE -# CECAEAFCNRVKN] -# end gene contig52.g168 -### -# start gene contig52.g169 -contig52 AUGUSTUS gene 22432 33438 1 - . ID=contig52.g169 -contig52 AUGUSTUS transcript 22432 33438 . - . ID=contig52.g169.t1;Parent=contig52.g169 -contig52 AUGUSTUS CDS 22432 22673 . - 2 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 23377 23751 . - 2 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 . - 0 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30399 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 31600 31650 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 32272 33084 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 33335 33438 . - 0 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 -contig52 AUGUSTUS start_codon 33436 33438 . - 0 Parent=contig52.g169.t1 -# coding sequence = [atgtccatgccaaaagtcgaattgagtatcagtatcgcccaatctgaacttcgtaaacacgttttccgctggagcgaag -# ttatagatttcctcgtctctttatatagtatttgtatgaaattttgtgtaaaaaataaaattaagtgctccgaaacacttgaaatgttgacagtggca -# tacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgccgggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacg -# cccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcg -# gtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaa -# aagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggt -# atatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtca -# aagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatggtcgtacggtcaataaacagtattatctggaagtt -# atgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttgcatcacgataatgcccctgctcacggcca -# aaaacaacaccacaataatgcctcagccaccatatttaccggatttggtcccatcgctgttccgctcacgctgcaggaagtcaccaagcatcctgaga -# atggctggtacaccagagcagatcttttagctctacgatatgaaggtaaaagtcgacagcgcccgcactgtagaaatcgaactgagttacatacattg -# ggtttttggaaagtaaacttaaacgcagtttcactaagtgtagccaacaactactcaaatcaaaataagaaccggctatctccggaggcggatagctc -# gagcctaaattgctccaatagcgcttcaatgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacag -# aatcccttcaaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcata -# tcatcatctcaccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtg -# tgatgctgcaccaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacac -# gcttgaattatgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttg -# ttgcccagaagtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgc -# aagcgttgctaatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttc -# aaaatgacacgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgca -# 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atgcagatggtgcaagggaaatcatttggtattcctgacagttccgattctggcaatgtgattaaaaataatagcaacgcatctcccggctaccccag -# agatgaacggatgccatcaccaaccaataatcagttggcgcaatggttttctccagagcttcttgcaaaagcttcagctggaaaactgcctcttctga -# atatgaaccaagcgctaagtttagaagaattcgaacgtagcattcaacattcctcagccgtcgtgcacaattaa] -# protein sequence = [MSMPKVELSISIAQSELRKHVFRWSEVIDFLVSLYSICMKFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGKTVLSKKNVYKWYKLFP -# DCREDANDEPRSGRPSTSTTDENVQAVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMGRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIVQELLDDVNDDP -# DLLKRVIAGDESWVYGYDIETKAQSSQCKSPGEPRPKKARQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHQEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLREAIRKKRPELWKNN -# SWLLHHDNAPAHGQKQHHNNASATIFTGFGPIAVPLTLQEVTKHPENGWYTRADLLALRYEGKSRQRPHCRNRTELHTLGFWKVNLNAVSLSVANNYS -# NQNKNRLSPEADSSSLNCSNSASMSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSG -# TNNGETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNT -# ETEKDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQ -# LETIDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTES -# EFNFDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIELISQNTANHAMNPLITHGNSPTPLAFTPTSVLRKMT -# ADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTAPIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGIPDSSDSGN -# VIKNNSNASPGYPRDERMPSPTNNQLAQWFSPELLAKASAGKLPLLNMNQALSLEEFERSIQHSSAVVHN] -# end gene contig52.g169 -### -# start gene contig52.g170 -contig52 AUGUSTUS gene 34926 35273 1 - . ID=contig52.g170 -contig52 AUGUSTUS transcript 34926 35273 . - . ID=contig52.g170.t1;Parent=contig52.g170 -contig52 AUGUSTUS CDS 34926 35098 . - 2 ID=contig52.g170.t1.cds;Parent=contig52.g170.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 35222 35273 . - 0 ID=contig52.g170.t1.cds;Parent=contig52.g170.t1 -contig52 AUGUSTUS start_codon 35271 35273 . - 0 Parent=contig52.g170.t1 -# coding sequence = [atgccaacgtttccaaagcggtttatgggaacatttagacgggatggctccgacaactcctcgaaagttaaggctgacg -# atcccattatcctctccatatctagcttgatggaccgaactctggtttcccagattcctttgaaatgtggacggtataagatggcacaagattcttcg -# ttggcgaagaagtttcgttcttgcgttgctccatggctagcagcctaa] -# protein sequence = [MPTFPKRFMGTFRRDGSDNSSKVKADDPIILSISSLMDRTLVSQIPLKCGRYKMAQDSSLAKKFRSCVAPWLAA] -# end gene contig52.g170 -### -# start gene contig52.g171 -contig52 AUGUSTUS gene 36108 39112 1 - . ID=contig52.g171 -contig52 AUGUSTUS transcript 36108 39112 . - . ID=contig52.g171.t1;Parent=contig52.g171 -contig52 AUGUSTUS CDS 36108 36261 . - 1 ID=contig52.g171.t1.cds;Parent=contig52.g171.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 39006 39112 . - 0 ID=contig52.g171.t1.cds;Parent=contig52.g171.t1 -contig52 AUGUSTUS start_codon 39110 39112 . - 0 Parent=contig52.g171.t1 -# coding sequence = [atgtctaagatgagtaacgattttcggcccgaaatcaattctgaactattaaacgaatttattcaaagcaataaaaaag -# gggtggggaggatatggataaaagaacagtacaaccaaggaaaacatggaaggtccgtctccgaaaatgaatgcgagtccgaacgagcctttatcaag -# gcggatttcgatcgccgtacccgtttaaagagtaacatcgtcgaccaacttatgttctttaataaaatttatgatctcatttaa] -# protein sequence = [MSKMSNDFRPEINSELLNEFIQSNKKGVGRIWIKEQYNQGKHGRSVSENECESERAFIKADFDRRTRLKSNIVDQLMF -# FNKIYDLI] -# end gene contig52.g171 -### -# -# ----- prediction on sequence number 53 (length = 50013, name = contig53) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 53 on both strands -# start gene contig53.g172 -contig53 AUGUSTUS gene 2425 13431 1 - . ID=contig53.g172 -contig53 AUGUSTUS transcript 2425 13431 . - . 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tacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgccgggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacg -# cccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcg -# gtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaa -# aagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggt -# atatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtca -# aagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatggtcgtacggtcaataaacagtattatctggaagtt -# atgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttgcatcacgataatgcccctgctcacggcca -# aaaacaacaccacaataatgcctcagccaccatatttaccggatttggtcccatcgctgttccgctcacgctgcaggaagtcaccaagcatcctgaga -# atggctggtacaccagagcagatcttttagctctacgatatgaaggtaaaagtcgacagcgcccgcactgtagaaatcgaactgagttacatacattg -# ggtttttggaaagtaaacttaaacgcagtttcactaagtgtagccaacaactactcaaatcaaaataagaaccggctatctccggaggcggatagctc -# gagcctaaattgctccaatagcgcttcaatgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacag -# aatcccttcaaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcata -# tcatcatctcaccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtg -# tgatgctgcaccaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacac -# gcttgaattatgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttg -# ttgcccagaagtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgc -# aagcgttgctaatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttc -# aaaatgacacgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgca -# aactcctatcacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaa -# caatgaagaccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaata -# gcaacgtcagtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactc -# tgcaaacaaaatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttgga -# taattccctaatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataata -# atgaacttccaggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattgaattgatttcgcaaaatactgccaaccatgcgatgaatccgttaattactcat -# ggcaactcgccaactcctttggcatttactcctacatcagtactgaggaaaatgacagccgataaggaaacaactcaaacaccgagttcttctcatag -# ccaacagccacaatatcaaatgcatccacagcatgccaagcaacttagtgagacgcagccaacagcacctatagccgtgcagcctcgaatgatattgg -# gaggtggaaactttgtcattggcccaaataaccaaccaatatctcccaatttgcaacagtgccgaaatcaacagggaataaaatggactcctggtaat -# atgcagatggtgcaagggaaatcatttggtattcctgacagttccgattctggcaatgtgattaaaaataatagcaacgcatctcccggctaccccag -# agatgaacggatgccatcaccaaccaataatcagttggcgcaatggttttctccagagcttcttgcaaaagcttcagctggaaaactgcctcttctga -# atatgaaccaagcgctaagtttagaagaattcgaacgtagcattcaacattcctcagccgtcgtgcacaattaa] -# protein sequence = [MSMPKVELSISIAQSELRKHVFRWSEVIDFLVSLYSICMKFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGKTVLSKKNVYKWYKLFP -# DCREDANDEPRSGRPSTSTTDENVQAVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMGRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIVQELLDDVNDDP -# DLLKRVIAGDESWVYGYDIETKAQSSQCKSPGEPRPKKARQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHQEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLREAIRKKRPELWKNN -# SWLLHHDNAPAHGQKQHHNNASATIFTGFGPIAVPLTLQEVTKHPENGWYTRADLLALRYEGKSRQRPHCRNRTELHTLGFWKVNLNAVSLSVANNYS -# NQNKNRLSPEADSSSLNCSNSASMSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSG -# TNNGETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNT -# ETEKDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQ -# LETIDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTES -# EFNFDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIELISQNTANHAMNPLITHGNSPTPLAFTPTSVLRKMT -# ADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTAPIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGIPDSSDSGN -# VIKNNSNASPGYPRDERMPSPTNNQLAQWFSPELLAKASAGKLPLLNMNQALSLEEFERSIQHSSAVVHN] -# end gene contig53.g172 -### -# start gene contig53.g173 -contig53 AUGUSTUS gene 14919 15266 1 - . ID=contig53.g173 -contig53 AUGUSTUS transcript 14919 15266 . - . ID=contig53.g173.t1;Parent=contig53.g173 -contig53 AUGUSTUS CDS 14919 15091 . - 2 ID=contig53.g173.t1.cds;Parent=contig53.g173.t1 -contig53 AUGUSTUS CDS 15215 15266 . - 0 ID=contig53.g173.t1.cds;Parent=contig53.g173.t1 -contig53 AUGUSTUS start_codon 15264 15266 . - 0 Parent=contig53.g173.t1 -# coding sequence = [atgccaacgtttccaaagcggtttatgggaacatttagacgggatggctccgacaactcctcgaaagttaaggctgacg -# atcccattatcctctccatatctagcttgatggaccgaactctggtttcccagattcctttgaaatgtggacggtataagatggcacaagattcttcg -# ttggcgaagaagtttcgttcttgcgttgctccatggctagcagcctaa] -# protein sequence = [MPTFPKRFMGTFRRDGSDNSSKVKADDPIILSISSLMDRTLVSQIPLKCGRYKMAQDSSLAKKFRSCVAPWLAA] -# end gene contig53.g173 -### -# start gene contig53.g174 -contig53 AUGUSTUS gene 16101 24410 1 - . ID=contig53.g174 -contig53 AUGUSTUS transcript 16101 24410 . - . ID=contig53.g174.t1;Parent=contig53.g174 -contig53 AUGUSTUS CDS 16101 16254 . - 1 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 -contig53 AUGUSTUS CDS 20270 20483 . - 2 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 -contig53 AUGUSTUS CDS 23027 23128 . - 2 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 -contig53 AUGUSTUS CDS 23228 24410 . - 0 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 -contig53 AUGUSTUS start_codon 24408 24410 . - 0 Parent=contig53.g174.t1 -# coding sequence = [atgataacccgaagggaagcggagcgactctgcaagagttttctgggcgacaacacacctccgcggctccctgacgact -# tcgccttcaacgtccagcacaaatgtgcttggggctgccgcggatcgtttttaccttctcgctacaactcgtctagggccaaatgcatcaagtgctca -# tattgtgggatgtttttttcgccaaataagtttattttccactcacaccgcataacgaccaatgacaggtatgttcagcccgatgcggcgaactttaa -# ttcctggcgtcgacacatgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaactc -# gaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtattgag -# cgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagccgc -# cgctgtggttggcgtaacggcggtagcagccgctactgtcggtgttcctttcaacttgcacggttctactgtcctgtcccctttgcactcgcttcgga -# atgatcgggacctttccctaatgcccatctccagaaactttgtagtggactacatgtggcagcagaaggacggacactaccaacatcagtattcaaag -# aaactcagtggcggtgaacccagcgagcaaagcctggacttcgagtcctgctcccgatcatggactagacctgacacgaatgtttcaataccgactgg -# aagttctttaaggctttcggataatactccttttaatataaaaaacgagtcacactcatctatttgtggcattatcaaaaaccgaaagctatctgcag -# ctacgagcagcgggttaagcctctctgattataacattccctcgattcttaactgctctgcgtttaaaccagtcgtcgcttcgactgcaattgtgtca -# acctccttatacactagatccagtgactcaaagcgaactgattatataaacccaacacaatctacaaggacgacaactgttctaacgcataacagcat -# ttcgggttcgtcgcaccaaatagtagaaaagccaactgaatctgctttagtcaactgcctacccaggaatgttaatgataccgacgatgacgacgaag -# tcgtggatattgagacaacggaagatgaaggtaaagtagacacccatcaacaagcagtcccgtgcaagttaccccgcaggttcacaattcatcacgaa -# gtcgttgggcagagccgaatgaaaaggcagctaaaccgacgcgttctctctcggggaccgcgaatagaacgcacaaaaagtttcagtagtacatgtgg -# tggtactttgaaagaaagcaaatctatgatcgtccgaaaaattgaaaggtacaaccaaggaaaacatggaaggtccgtctccgaaaatgaatgcgagt -# ccgaacgagcctttatcaaggcggatttcgatcgccgtacccgtttaaagagtaacatcgtcgaccaacttatgttctttaataaaatttatgatctc -# atttaa] -# protein sequence = [MITRREAERLCKSFLGDNTPPRLPDDFAFNVQHKCAWGCRGSFLPSRYNSSRAKCIKCSYCGMFFSPNKFIFHSHRIT -# TNDRYVQPDAANFNSWRRHMTLSGNTYDEKIIHAWEDVKAMFNGGTRKRLVGSSINNRNMGSPTPSAAVSSCGSPTSIERDPKEGDGESESPEFPQRQ -# IDSQFNYSTVATAAAVVGVTAVAAATVGVPFNLHGSTVLSPLHSLRNDRDLSLMPISRNFVVDYMWQQKDGHYQHQYSKKLSGGEPSEQSLDFESCSR -# SWTRPDTNVSIPTGSSLRLSDNTPFNIKNESHSSICGIIKNRKLSAATSSGLSLSDYNIPSILNCSAFKPVVASTAIVSTSLYTRSSDSKRTDYINPT -# QSTRTTTVLTHNSISGSSHQIVEKPTESALVNCLPRNVNDTDDDDEVVDIETTEDEGKVDTHQQAVPCKLPRRFTIHHEVVGQSRMKRQLNRRVLSRG -# PRIERTKSFSSTCGGTLKESKSMIVRKIERYNQGKHGRSVSENECESERAFIKADFDRRTRLKSNIVDQLMFFNKIYDLI] -# end gene contig53.g174 -### -# -# ----- prediction on sequence number 54 (length = 35008, name = contig54) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 54 on both strands -# start gene contig54.g175 -contig54 AUGUSTUS gene 759 4405 1 - . 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ID=contig54.g176 -contig54 AUGUSTUS transcript 18124 33010 . - . ID=contig54.g176.t1;Parent=contig54.g176 -contig54 AUGUSTUS CDS 18124 18236 . - 2 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 23893 23998 . - 0 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 26241 26302 . - 2 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 27366 27501 . - 0 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 32660 32712 . - 2 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS CDS 32998 33010 . - 0 ID=contig54.g176.t1.cds;Parent=contig54.g176.t1 -contig54 AUGUSTUS start_codon 33008 33010 . - 0 Parent=contig54.g176.t1 -# coding sequence = [atgcatgcaaaagccgatagctcacatagggataatcgattattagacacccgttacatagaaaagttgtcagatgtta -# ttaatttgaacttgcgaattcgaaattttcctgagtgtggttggacgagtgcaagagcatcgattataaacgaggatgaggatggacgagagccgtgt -# gccgatgatgatgatgatgtaaagcgtctaaacatccagaacaacttctatcgtgaaataagcttacaagttcttctggtagttcagacgaagcgcac -# caggagggtgtgcgaaggcgactactatagatacacgaagaaattaaagtctgcagtaatcgtccgattgttacgactgacacaacaaccgaaaggtc -# agcatcggtttccgttcctcaatcctacattttctttaagcttgtcaatatcaacgaaaactgtgttccttattcagttttcgtaccttttatgtgat -# gcgatgttctag] -# protein sequence = [MHAKADSSHRDNRLLDTRYIEKLSDVINLNLRIRNFPECGWTSARASIINEDEDGREPCADDDDDVKRLNIQNNFYRE -# ISLQVLLVVQTKRTRRVCEGDYYRYTKKLKSAVIVRLLRLTQQPKGQHRFPFLNPTFSLSLSISTKTVFLIQFSYLLCDAMF] -# end gene contig54.g176 -### -# -# ----- prediction on sequence number 55 (length = 40015, name = contig55) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 55 on both strands -# start gene contig55.g177 -contig55 AUGUSTUS gene 7851 17334 1 + . ID=contig55.g177 -contig55 AUGUSTUS transcript 7851 17334 . + . 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ID=contig55.g178 -contig55 AUGUSTUS transcript 22643 33180 . + . 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ttcagggccaagtggacaaataaagataccgaaaggaataccagctgggggcattcgaatttccgtgattggtacccaattcaccagtattcaaaatc -# ccaacatttacgtagtatacaatggagagatatatgcaagccaatgccgagtgcaatcggatactgaaatggaatgctcatctccagctatcgacgtg -# gacagcaaaattattgaagcagaaaggccaatgcttctagaatatgggttccttatggataatgttttgcgggtacaaaatttatcgaagattcataa -# taaccatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttaa] -# protein sequence = [MNFILSVLLIATLGDKYDHRLNLIAGSQTLAANIWSDKTAIQNEPINMTDVNATVKDANNHSTTITNVATFDTKLNHL -# LVDTITGRVFVGGVNRLYQLSPDLELSETVKTGPQNDSVECSILDCPLNAVRSPTDNYNKVLLIDRATSRLISCGSLFQGTCTVRNLQNVSIIEHEVP -# DAVVANDANSSTVAFIAPGPPQHPVTNVMYVGVTYTNNSPYRSEIPAVASRSLEKTKMFQIASSAVTTGTRTFINSYARETYFVNYVFGFSSERFSYF -# LTTQLKHSHHSSPKEYITKLVRICQEDSNYYSYTEIPVECISDAQGGTKFNLVQAGFLGKPSSDLAQSLGISIQDDVLFAAFSKGDGNTPTNNSALCI -# YSLKSIRRKFMQNIKSCFNGNGMRGLDFISPSMPCVLTKLQTIGEDFCGLDVNSPLGGENPITSVPVAMFNTKLTSVAATSTSGYTVVFVGTADGYLK -# KVVVESSSVANEYASFPVDLGSEINQDMQFDNQNLYMYVMSETKVSKVKVFDCSDYKTCGECLGARDPYCGWCSLENKCSPRSNCQDDANDPLYWVSY -# KTGKCTTITSVVPHQLQRTTARTLELIIDHLPQLKENLICAFTTEDKALFTNATKKRNGVNCTTPRTDMLPQIEQGKHHFTAKLSVRTRNGPDLVSTD -# FTFFDCSTHSSCTRCVSSEFPCDWCVEAHRCTHDTAENCRNDILVTGVSRIGPSYRSGPGFCPTINATGDGSEVLVSGGTSKSIKVKVHIIGQFIVQT -# RFVCQFNIEGRVTSLNAQLLGDTIYCDSMEFQYTSRSPNLTATFAVIWGGSKPLDNPHNIHVVIYRCREMADSCGICLALAEKYNCGWCSSTNTCEVE -# EQCNKNKEGKTDWLNRSEICPNPEIHTFEPKTGPWEGGTNITIRGINLGKNYNDIYSGVRIAGINCMPFPQFYIDTKQIVCTVDSPGEQMYRNGKIVV -# QIGDYRGESKEDYEFVDPKILDFNPKFGPTSGGTEIHITGKHLNAGSRIQASINDHLPCKILSTDSSQAICRTSPSPGIIEGRLKMSFDNGPREFNDY -# NFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISVIGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCRVQSDTEMECSSPAIDVDSKIIEAERPMLLEYGFLM -# DNVLRVQNLSKIHNNHXXXXXXXX] -# end gene contig56.g182 -### -# -# ----- prediction on sequence number 57 (length = 60013, name = contig57) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 57 on both strands -# start gene contig57.g183 -contig57 AUGUSTUS gene 8025 17828 1 - . ID=contig57.g183 -contig57 AUGUSTUS transcript 8025 17828 . - . 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tgactataacttcaaatatgttctggatcctacagttgaacacgttagttcagggccaagtggacaaataaagataccgaaaggaataccagctgggg -# gcattcgaatttccgtgattggtacccaattcaccagtattcaaaatcccaacatttacgtagtatacaatggagagatatatgcaagccaatgccga -# gtgcaatcggatactgaaatggaatgctcatctccagctatcgacgtggacagcaaaattattgaagcagaaaggccaatgcttctagaatatgggtt -# ccttatggataatgttttgcgggtacaaaatttatcgaagattcataataaccattttgaactttatcctaatcccgaatattttatatttgaagaaa -# gggttaagtacttcaagagtgaatatttgacaataaatggccgaaacctagatcgcgcctgcaaagagactgatgtggaagtaaaaataggaaatgga -# ttttgcaatattacgtctctttcaagacaacaacttacatgtagacctcctcctgaagcaacggcaactaaaagcatcaatggaccagaagtaattgt -# tcgtattggaacttcgctggagtaccgtattggtatccttagctacgaatcatcaaacataattttggattggggagaaaacgtaatatttgcagtaa -# tagcgacaattgttatcttattgctgatttttgttgctttgctcgtggcatataaaaagaaaagttcagagtctaaccgggtgcttcgaaacatgcag -# gaacaaatggatatattagagttacgtgtcgcagctgaatgtaaggaggcgtttgcagaactccaaacagagatgactgacctcacaggggatcttac -# ctctggaggcattccgtttttggattatcgatcgtatgcaatgaagattctttttccgaatcatgaagaccacattgtactgcaatgggagcgacctg -# agcttcttcgaaaggaaaaagggttgcgtatttttggccaacttattatgaacaaaacttttctgctactttttattcgaaccttagagtcgaatcga -# tacttttctatgcgtgaacgagtaaatgtggcctcattaattatggtcacactacaatcgaaattggaatactgcacagatatattaaaaactttatt -# gggagacttgattgaaaaatgtatagagggaaagagtcacccgaaactcttattaaggcgaactgaaagtgtggcagaaaaaatgttaagtgcttggt -# ttacctttcttctgtacaagtttttgaaggagtgtgctggagagccgttatatatgctttttcgcgctgtaaaggggcaggtagataagggtcctgtt -# gatgcgtgcacacatgaggcgagatactctcttagtgaagaaaaactaatacgccagtccattgattttcgaccaatgaatgtttatgcaagcattat -# acaacagccaatattttgcaataacttagatatgttgcctccccataccgaaaatgtatccgtaaaggttttggattgtgacacaattggacaagtaa -# aagagaaatgcttggaaacaatttataaaaacattccatcaagccaaagaccgcgaaaagatgacttagacttagtggcatttggtgaaactgttctg -# agtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttccaagatggccgggaagatgccaatgacgagcatcgctctggacgcccaagcacatcaataac -# tgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcaaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcggtatatcgcttggctcgt -# gccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgagtcgtgtgtcagcgaagttttttccaaaattgctgaattttgaccaaaagaaccgtcgcatgagc -# atcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcacaattgagtggcgaacaggtgctacaggtcgagtcattct -# gtacgatgaggatgtaacatctaaaaccgaaagcgaatggaaaaaacttaacacattgcagcactataacgttccagacggcgctgggctgagcctag -# taccaaagcaaagttcaatttataactttagtattttgtcggataaaaatgaaaaatcgcacaagtatgaaactcttaatatatcgaaatacacctcc -# tcctctccgacatttagccgcgccgggagccctctaaataatgatatgcatgataatggtctaagatactggcatctagtgaaacaccatgatagtga -# catgcagaaagaaggcgagcgggttaacaaattggtatcagagatttacttaaccagactgttggcaactaagggtacacttcagaaattcgtagatg -# atctttttgaaacgatatttagcaccgctcatcgaggatcggcactgcccctagctataaagtacatgtttgactttctcgacgatcaagctcagtta -# catggtaaggactcaccaagctcgaaacttctatacgcgaaagacataccagagtatcgcaaatgggttgatcgttattatcgagacattcgcgatat -# gtccccaatatcagatcaggatatgaatgctatgcttgcagaagaatcaaggctgcacacaacagaatttaatacaaactgtgcactacatgagctgt -# acacatatgctgtgaagtacaatgaacagctaactgttacacttgaagaggatgaattttcgcaaaagcagagattggcttttaaattagagcaagtt -# cataacataatgtcggcagaataa] -# protein sequence = [MSVYRLARAMKFFQILGMSRVSAKFVPKLLNFDQKNRRMSIAQELLDDVNDDPNLLKRVMTGDESXXXXXXXXGIIEG -# RLKMSFDNGPREFNDYNFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISVIGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCRVQSDTEMECSSPAIDVDSK -# IIEAERPMLLEYGFLMDNVLRVQNLSKIHNNHFELYPNPEYFIFEERVKYFKSEYLTINGRNLDRACKETDVEVKIGNGFCNITSLSRQQLTCRPPPE -# ATATKSINGPEVIVRIGTSLEYRIGILSYESSNIILDWGENVIFAVIATIVILLLIFVALLVAYKKKSSESNRVLRNMQEQMDILELRVAAECKEAFA -# ELQTEMTDLTGDLTSGGIPFLDYRSYAMKILFPNHEDHIVLQWERPELLRKEKGLRIFGQLIMNKTFLLLFIRTLESNRYFSMRERVNVASLIMVTLQ -# SKLEYCTDILKTLLGDLIEKCIEGKSHPKLLLRRTESVAEKMLSAWFTFLLYKFLKECAGEPLYMLFRAVKGQVDKGPVDACTHEARYSLSEEKLIRQ -# SIDFRPMNVYASIIQQPIFCNNLDMLPPHTENVSVKVLDCDTIGQVKEKCLETIYKNIPSSQRPRKDDLDLVAFGETVLSKKNVYKWYKLFQDGREDA -# NDEHRSGRPSTSITDENVQAVKKIVLENRQITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMSRVSAKFFPKLLNFDQKNRRMSIAQELLDDVNDDPDLLKRV -# TIEWRTGATGRVILYDEDVTSKTESEWKKLNTLQHYNVPDGAGLSLVPKQSSIYNFSILSDKNEKSHKYETLNISKYTSSSPTFSRAGSPLNNDMHDN -# GLRYWHLVKHHDSDMQKEGERVNKLVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDDQAQLHGKDSPSSKLLYAKDIPEY -# RKWVDRYYRDIRDMSPISDQDMNAMLAEESRLHTTEFNTNCALHELYTYAVKYNEQLTVTLEEDEFSQKQRLAFKLEQVHNIMSAE] -# end gene contig57.g183 -### -# start gene contig57.g184 -contig57 AUGUSTUS gene 18753 29841 1 - . ID=contig57.g184 -contig57 AUGUSTUS transcript 18753 29841 . - . ID=contig57.g184.t1;Parent=contig57.g184 -contig57 AUGUSTUS CDS 18753 19819 . - 2 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 19888 21133 . - 0 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 22378 23621 . - 2 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 29751 29841 . - 0 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 -contig57 AUGUSTUS start_codon 29839 29841 . - 0 Parent=contig57.g184.t1 -# coding sequence = [atgggcgagaggaaaacaggcggcaaacgcttttcgtcgggactgtgtttcagcgacccatattcaaacaatgtacaag -# agttagaaagaagagcgattttggagatgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaata -# gcaggttctcagacactggcagcaaatatttggtctgacaagacggctattcaaaatgaacccataaatatgactgatgttaatgcgacggtaaagga -# tgcaaataaccatagtaccaccattacaaatgtagctacgtttgacacgaaattaaatcacttgttagtggacaccattactggacgagtctttgttg -# gtggtgttaataggttgtatcagctatcgcctgatttggagctgtccgaaacggtaaaaacgggaccccaaaacgattcggtagagtgtagtatactc -# gactgcccgttgaatgctgttcgcagtccgacggacaactataataaagttttgctcatagatcgtgcgacttctcgacttatttcatgcggatcact -# atttcagggaacatgcacagttcgtaatcttcagaatgttagcataattgagcatgaagtgcccgatgcggttgttgcaaatgatgctaattcgtcaa -# ccgtggcttttatagcaccgggccctccacagcatccagtgacaaatgtgatgtatgtcggagttacttatactaacaattcgccataccgaagtgaa -# atcccagccgtggcttcgcgctctcttgaaaaaacgaaaatgtttcagattgcttcttcggcggttacgactggaacgagaacttttattaattctta -# cgcacgtgaaacatattttgtgaactacgttttcggattcagctctgagcgattctcatattttcttaccacgcagttaaagcacagtcaccattcct -# ctcccaaagagtatataacgaagcttgtgcgaatatgccaggaagattcaaactattattcatacacggaaattccagtcgaatgtataagtgatgcc -# cagggcggcactaaattcaacttggttcaggccggtttcttgggaaaacctagctcggatttggctcaaagtctgggtatatccattcaggatgacgt -# gttattcgctgctttttcaaaaggcgacggaaacacaccaactaacaactctgcactatgcatttactcattgaaatccattcgtcgtaaatttatgc -# aaaacataaaatcctgttttaacggtaatgggatgaggggacttgactttatatcacccagcatgccatgtgttttaacgaaactacaaacaattgga -# 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gttacaggcgttagccggataggcccaagctatagatcaggtcctggattttgtccaacgatcaacgctacaggtgatggaagtgaagtactggtgtc -# tggtggaacaagcaaatctataaaagttaaagttcatataataggacaatttatagttcaaacgcgtttcgtttgccaatttaatatcgaaggacgtg -# taacgagtttaaatgctcaattgttgggtgataccatttactgcgatagcatggagtttcagtacacctcaagatcgcccaatttgacagccacattc -# gctgttatatggggtggttccaaacctcttgacaaccctcataatatacatgttgttatttatcgatgtcgagaaatggccgatagctgtggaatttg -# tttagccctagccgaaaagtacaattgcggatggtgttcttctactaatacatgcgaagttgaagagcaatgtaataagaacaaagaggggaaaactg -# attggttaaatcgaagtgaaatttgcccaaaccctgaaattcacactttcgaaccgaaaacgggtccctgggaaggaggaactaacataacaattcgt -# ggtatcaatttgggcaaaaattataacgatatttattcaggcgttcgaatagctgggataaattgtatgccgtttccgcaattttacattgacacaaa -# gcaaatcgtatgtactgtagatagtcctggagaacaaatgtacagaaacggcaaaatagtggtacaaataggggattatcgaggtgaatctaaggaag -# actacgaatttgttgacccgaaaattttggattttaatcctaagtttggtccaacttctggtggaactgaaatacatataactggaaagcacttaaat -# gcaggctctcgtatacaagcatcaataaatgatcatttgccctgcaaaattctaagcacagattcttcacaagctatatgtcgcacttcaccttctcc -# tggtatcattgaaggaaggctaaaaatgtcgttcgataatggtccccgagagtttaatgactataacttcaaatatgttctggatcctacagttgaac -# acgttagttcagggccaagtggacaaataaagataccgaaaggaataccagctgggggcattcgaatttccgtgattggtacccaattcaccagtatt -# caaaatcccaacatttacgtagtatacaatggagagatatatgcaagccaatgccgagtgcaatcggatactgaaatggaatgctcatctccagctat -# cgacgtggacagcaaaattattgaagcagaaaggccaatgcttctagaatatgggttccttatggataatgttttgcgggtacaaaatttatcgaaga -# ttcataataaccatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttaa] -# protein sequence = [MGERKTGGKRFSSGLCFSDPYSNNVQELERRAILEMNFILSVLLIATLGDKYDHRLNLIAGSQTLAANIWSDKTAIQN -# EPINMTDVNATVKDANNHSTTITNVATFDTKLNHLLVDTITGRVFVGGVNRLYQLSPDLELSETVKTGPQNDSVECSILDCPLNAVRSPTDNYNKVLL -# IDRATSRLISCGSLFQGTCTVRNLQNVSIIEHEVPDAVVANDANSSTVAFIAPGPPQHPVTNVMYVGVTYTNNSPYRSEIPAVASRSLEKTKMFQIAS -# SAVTTGTRTFINSYARETYFVNYVFGFSSERFSYFLTTQLKHSHHSSPKEYITKLVRICQEDSNYYSYTEIPVECISDAQGGTKFNLVQAGFLGKPSS -# DLAQSLGISIQDDVLFAAFSKGDGNTPTNNSALCIYSLKSIRRKFMQNIKSCFNGNGMRGLDFISPSMPCVLTKLQTIGEDFCGLDVNSPLGGENPIT -# SVPVAMFNTKLTSVAATSTSGYTVVFVGTADGYLKKVVVESSSVANEYASFPVDLGSEINQDMQFDNQNLYMYVMSETKVSKVKVFDCSDYKTCGECL -# GARDPYCGWCSLENKCSPRSNCQDDANDPLYWVSYKTGKCTTITSVVPHQLQRTTARTLELIIDHLPQLKENLICAFTTEDKALFTNATKKRNGVNCT -# TPRTDMLPQIEQGKHHFTAKLSVRTRNGPDLVSTDFTFFDCSTHSSCTRCVSSEFPCDWCVEAHRCTHDTAENCRNDILVTGVSRIGPSYRSGPGFCP -# TINATGDGSEVLVSGGTSKSIKVKVHIIGQFIVQTRFVCQFNIEGRVTSLNAQLLGDTIYCDSMEFQYTSRSPNLTATFAVIWGGSKPLDNPHNIHVV -# IYRCREMADSCGICLALAEKYNCGWCSSTNTCEVEEQCNKNKEGKTDWLNRSEICPNPEIHTFEPKTGPWEGGTNITIRGINLGKNYNDIYSGVRIAG -# INCMPFPQFYIDTKQIVCTVDSPGEQMYRNGKIVVQIGDYRGESKEDYEFVDPKILDFNPKFGPTSGGTEIHITGKHLNAGSRIQASINDHLPCKILS -# TDSSQAICRTSPSPGIIEGRLKMSFDNGPREFNDYNFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISVIGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCR -# VQSDTEMECSSPAIDVDSKIIEAERPMLLEYGFLMDNVLRVQNLSKIHNNHXXXXXXXX] -# end gene contig57.g184 -### -# start gene contig57.g185 -contig57 AUGUSTUS gene 30209 32554 1 + . ID=contig57.g185 -contig57 AUGUSTUS transcript 30209 32554 . + . ID=contig57.g185.t1;Parent=contig57.g185 -contig57 AUGUSTUS start_codon 30209 30211 . + 0 Parent=contig57.g185.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 30209 30272 . + 0 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 31048 31359 . + 2 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 31413 32554 . + 2 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 -# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg -# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt -# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg -# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga -# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag -# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac -# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt -# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc -# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt -# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg -# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc -# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga -# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg -# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt -# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt -# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] -# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ -# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG -# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE -# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY -# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS -# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] -# end gene contig57.g185 -### -# start gene contig57.g186 -contig57 AUGUSTUS gene 45155 52595 1 - . ID=contig57.g186 -contig57 AUGUSTUS transcript 45155 52595 . - . 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ID=contig58.g187.t1;Parent=contig58.g187 -contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 Parent=contig58.g187.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 . + 0 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 . + 2 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 . + 2 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 -# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg -# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt -# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg -# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga -# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag -# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac -# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt -# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc -# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt -# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg -# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc -# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga -# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg -# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt -# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt -# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] -# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ -# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG -# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE -# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY -# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS -# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] -# end gene contig58.g187 -### -# start gene contig58.g188 -contig58 AUGUSTUS gene 20148 48374 1 - . ID=contig58.g188 -contig58 AUGUSTUS transcript 20148 48374 . - . ID=contig58.g188.t1;Parent=contig58.g188 -contig58 AUGUSTUS CDS 20148 20212 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 20860 20916 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24630 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24708 24802 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 26616 26675 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 . - 1 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27139 . - 1 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 41472 41724 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 41873 42167 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 43056 43249 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 43362 43761 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 47702 47936 . - 1 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 48301 48374 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 -contig58 AUGUSTUS start_codon 48372 48374 . - 0 Parent=contig58.g188.t1 -# coding sequence = [atgcgttgcgggcgaactttgaaatcttcggtcccactagaagttcaaaaaattccatcggaacttaatattagggata -# gctcacagcataaacaagtaataactcaatttggaatggattctgtggaccagcaacttaaggagctgtcctttctaaaagactccccttcaaaaacc -# tcttcatctgctgccattggtcatgttaacgttgcggagctagttaacaaaatacgtcaaaggcaaagtgaatcttgtacgatgatggacggacctcc -# caagccaccaaagaaatataatgagttaccccaggttccatcaagtaaacaggtttcttgttcgcgggaaccgctgtattcaaaacctctttttggaa -# ttgacaaaacaatgaatggacccatgcctttcagaaaactcaacaattctaatttgggaattgctgaaatgtcaattaacagaaagacaactttggac -# aatccagcaatattggaacagcaattggaagctctggcctaccacaaacttcaaatggaaaaaaagggacttttaggagtgcaagttaaagcatcaca -# atctgcaaacagtttcgcagagtccccatcaggcacgctgagcaaaagcttaatatatggaaatataaatatagaaaaagcaaaacaaacaaaggaga -# taggtatttcttcaagtacctactcaaatgttcacaaaactgaacacgaagtagaggatgacctgctgccacctccgagcccagagagcgctgtgagc -# tcttcttatagcgagcttcggcaagcctctactgcttttaacaagccaacaggttctctgcaaaataagcataaaataattccttcgttacaaatata -# tgcaaaccaatatgagctgcaacatggtgctataatgaagagttctacttatgattcaatatatgagcctataaaccctcgtccttctggagacatgt -# tgcaccgggaaagatgtaatctgtatgggtcatccatcaatgataataatatttcaggcagtttcggtgacgtaaatatttcgaattcagtggaagcg -# agccattcgttattatacgcgaatgataactgtctaagcacatgctatattggaaaaactactcataaaaataatgaaaagggacttagtaactatat -# atctacagcccccgatccaatacaagaatttgaaaactacgactgtcaaataaacttacagggaaaaccattctacgcattagacggcaaaccatact -# gtgaatatgattatttacaaacactggaaaaatgttcggtttgcatgaagcccattttggaaagaattcttagagctaccggaaagccataccatcct -# caatgttttacatgtgttgtctgtggaataagcttagatgggctattatttacagttgatgctactaatcaaaactattgtattacagattttcatag -# aacaacccttaaaacacctgagaagggacttctagggactagtaaaagattcatagtcgcaatagattttcttaagtgtgccatcgcgatggctgcac -# cagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaatagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaact -# ggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagactttcaaaaactggaacgtgaagcaaggatctgccgaaaattaca -# ccatcccaacatagaggctgatgcatcacattgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctga -# aaccagagaatttactattagctagtaaggcaaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggct -# tggtttggatttgctggcactccaggatatctgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtggtgttat -# tctatatatacttcttgttggttacccaccattctgggacgaagatcagcatcgactgtactcacagattaaagcaggagcttatgattatccgtctc -# cagaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttattaatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaag -# cacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgtgcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaa -# gggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaatttttccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccg -# attcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagaagataaaaaaggaatcgttgatcgcagtaccacagtcatatcaaaagagccagaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MRCGRTLKSSVPLEVQKIPSELNIRDSSQHKQVITQFGMDSVDQQLKELSFLKDSPSKTSSSAAIGHVNVAELVNKIR -# QRQSESCTMMDGPPKPPKKYNELPQVPSSKQVSCSREPLYSKPLFGIDKTMNGPMPFRKLNNSNLGIAEMSINRKTTLDNPAILEQQLEALAYHKLQM -# EKKGLLGVQVKASQSANSFAESPSGTLSKSLIYGNINIEKAKQTKEIGISSSTYSNVHKTEHEVEDDLLPPPSPESAVSSSYSELRQASTAFNKPTGS -# LQNKHKIIPSLQIYANQYELQHGAIMKSSTYDSIYEPINPRPSGDMLHRERCNLYGSSINDNNISGSFGDVNISNSVEASHSLLYANDNCLSTCYIGK -# TTHKNNEKGLSNYISTAPDPIQEFENYDCQINLQGKPFYALDGKPYCEYDYLQTLEKCSVCMKPILERILRATGKPYHPQCFTCVVCGISLDGLLFTV -# DATNQNYCITDFHRTTLKTPEKGLLGTSKRFIVAIDFLKCAIAMAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTARDF -# QKLEREARICRKLHHPNIEADASHCIQQILESVNHCHQNGVVHRDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKE -# PYGKSVDIWACGVILYILLVGYPPFWDEDQHRLYSQIKAGAYDYPSPEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALKHPWICQRERVASVVHRQET -# VDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKEDKKGIVDRSTTVISKEPEAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig58.g188 -### -# -# ----- prediction on sequence number 59 (length = 40011, name = contig59) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 59 on both strands -# start gene contig59.g189 -contig59 AUGUSTUS gene 10148 38374 1 - . 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. 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ID=contig60.g192.t1;Parent=contig60.g192 -contig60 AUGUSTUS start_codon 18066 18068 . + 0 Parent=contig60.g192.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 18066 18087 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 22314 29494 . + 2 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 29560 29780 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 29847 31965 . + 1 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 32332 32526 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 -# coding sequence = [atgctcatcttttcctttgttgcggatgatgaatttttgaaatatttacctggacatttctatgactactccttcgaca -# gtattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccgggtcagcaaaaatttattcgaagggaaac -# tgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggattttgaacaacattcaaaaaccagttcagtt -# cacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaatattaagcgggcagttatatcattactgc -# 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agcacatattcacattcgacggtcagaatttcgcgtaccctggaaactgcaaatatattatggctcaagacagtgtggataataatttcacaattatc -# gtccagcttgcaaatggaaagcttaagggcattacgctcgtagatcgggatggtaactatgctgaagtagccgacaacctggcactgaagataaatgg -# aaaccttcttgagtacccacaacaattgtctggtcttcacgcatggcgtcggttctacaccgttcatttgcattcggaatatggagtaagcgtattgt -# gcaccacggatctaaaggtttgtcattttaatataaacggcttctacacaagcaaaacacggggacttctcggcaacggcaatgcggagccatacgac -# gactttttgcgaattgatggtactatagcaacagactcggccactctggggaacgattacggagttggtaaatgtgcagcagttgcttttgacaaaga -# ccaagtagaaagcccgaaaagagaggaaatatgtactgaaatatttggcattgaatcaccacttgccctcaactatatgacggttgactccaggcctt -# accgtaaggcatgtgacagggccattgctaaaatcgctgaaaaggataaggaggctgctgcatgtacgtttgctctggcctacggttccgcggtcaaa -# cagattaacaagtgggtgctattaccaccgcgttgcatcaagtgcgctggacctgtgggacagcgtgatcttggagatgagtttattgtcaagctccc -# aaacaacaaggcggacgtggtatttgtcgtcgatatcaatgtaacacctgtagtcctgtccaaccttgtagcgcctgcaatcaatgaaattcgagagt -# cgcttaagagccgtggttttacagacgtccaagtcggcgttgttgtatttgacgaatcgaagcgttatcccgctctactcacaagtgaaaatggaaaa -# atcaactacaagggaaacctggccgatgtaaagctcaatggagtaaagaacttctgtgacgattgcatcgagcaaattataacagaaaaacgaatctt -# ggatatttacaactcattaaaggaaatagtaaagggcattgcacctcaagccgatgaaaaggcgttccagttggcattggactatccattccgtgctg -# gtgcggcaaagagcattatcggggtgcgaagcgattcgttggaatacaaaaattggaacttcgacaagctgaaagtagccgaccaaaagaaaatgtta -# agccagattacgtcatcactggcggatactcttttcaagaccgaaatcgtcagtgaatgtcgttgtctgccgattcacggattgcacggccaacacaa -# gtgcgtcatcaagtcttcgacatttgttgcgaccaaaaagcccaaagctgcctaa] -# protein sequence = [MLIFSFVADDEFLKYLPGHFYDYSFDSILTIGLSSGAFSESDDTSLKVSGSAKIYSKGNCGYTLQLSSVKVSNTKESV -# EKRILNNIQKPVQFTLVSGHLEPQICSDSSDLDYSLNIKRAVISLLQSGTKTENEVDVFGQCPTHTSTSTVGNANIITKVRNLNRCAHREQINSGLVS -# GKVNEKAGITSSLLLQANYIKESKIVNSLLENVQLTETYKFVGTTKGNSEISAKVVTTLKLKNPTGTKANSPSTGSTVRSVIFQRPETYTSKNINALK -# TILSDLVDLTGDYVKKDSAKKFVEFIRLLRQSDSETLLELAAYPHPNKVLARKVYLDGLFRTSTAESARVILKQLPKFDDKEKLLAILSLNLVKSVDK -# 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ttacggatggcctaaaacggtgtaagccaaatactaagaaggaagaagaacggattgtctatattttaaagggaataggaaatgcaaagagcttaggt -# ggcaacactgctgctgtccttagtgagtgcgcctccacgggccgttccaatcgtatacgtgtagcggctttgagagcattttcaacaattgattgcaa -# tggagcactgcgaactaaggctttggaactacttaagaaccgcaacgaggactcagagttacgtattgaagcctatttgtcttcaatttcatgtccca -# acgcagaggtggccaaccagatttcagatatagtcaattccgaaacagttaaccaggtaggaggatttatttcatctaatttaaaagccattcgggac -# tcgacagacgccagccgtgagcagcaaaggtaccatttagggaacattcgagtgactaagaaatttcctgcggattacagacgatacagtttcaacaa -# tgaagtttcctacaaactggaatcccttggccttggagctagttctgactatcaattaatttattcgcaacatgggttcttaccccgatcatctcgta -# tcaatgttacaactgaaatttttggaactaacttcaacgtatttgaagcaagcgtacgtcaggaaaattttgaggatgtgctggaatattatctggga -# ccgaaggggttgttaaacaaagatttcaatgaaatagttaagatcattgaagttggaaacaacgcggctgctagtgctggtggtcgagcccgacgctc -# aattgccgacgatgttgctaagatatcgaaaaagtataaaacttacggtgctaaaagtgtgcaagatctcaatttagatgtatcgttgaaattctttg -# 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ID=contig62.g198 -contig62 AUGUSTUS transcript 22556 43045 . + . ID=contig62.g198.t1;Parent=contig62.g198 -contig62 AUGUSTUS start_codon 22556 22558 . + 0 Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 22556 22614 . + 0 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 22927 23122 . + 1 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 29365 29465 . + 0 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 31493 31690 . + 1 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 36015 36481 . + 1 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 39348 39433 . + 2 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 40202 40454 . + 0 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -contig62 AUGUSTUS CDS 42510 43045 . + 2 ID=contig62.g198.t1.cds;Parent=contig62.g198.t1 -# coding sequence = [atgagaacggcgtcccggagtcaacgcgaaccgtttcgggtgggcggcgcggtggcgtcgagtacccacgaaaatcaaa -# cttcatcttacgctgccagccgatggccagtgcttttccaaaccgtcaatcagaacttccttgttgcaatcataggacttatagagctgtatcggcat -# cgattacaggttcggtttaccgttacggtttgtggttgcggtgtgatacgaatgtcagttacagttaaagcttttccgaacgatatcgtttgccaccg -# catcctggctttccgtttgacttatttctggagcagtgggtgttgtgtagttaccgagaagcattttgcgctgttcaagaaatattacgagactggta -# gttttaaggccggtgttattggaggttccaaaccaaaagtggccaccccgccggtagtagatgcaattgccaactataagcgcgaaaaccctacgatg -# ttcgcttgggagatacgagatcggctcttggcagaagctatatgctctcaggataatgttcccagtgtttcttcgataaaccgcattgtaagaaacaa -# ggccgccgagaaggcgaaacatgttcatcatcaccaacagcatcatgtaccacagggtctgggtggcggacacattgccacagaaagtctagatagca -# gcacaggaacgatcggcgaaccgcagcccccgagtggtggaactagcaatagcagtgctaattccgcaaacccaaacgcttctgcggcgacggttgcg -# acgcacgcatcaataccgacgtcaggctctgatactgtccaggtttcagtcggccaaatcaatgcaaacagcaatgacacaagcaatgggaatattaa -# ctcaacgactgagcaacgaacgactggatatagcattaatggaattctaggtatacaacatggacagcattctcacaacaataataacaacagtagcg -# tgagcaataacaataatacagatcccaccaattgtaaacgtaaaagaatcgaagctcatgacgaaaaccgtgacacaaatatacattccgaagatgat -# ggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatatttggcctgggaagtggtgtatcaaggatgagcacaagctacttgccga -# gctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattttccacaaactcgatatctggatctggttcgg -# gtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctcaaagctcactttatacaccaacaattggacca -# tcaattgctttagcatttgacggaaactacacatcaatgactagcttggaaaatgacacctcatcagtcgcacaagtaaatattgacgttccagaaag -# caccgatccggctaacctttgcacgataagtacaaggattgtgcaagaccactcggataataatagtaaccgtgttaaggagccgcagccgaacattg -# atggggccagagaggaaaacaataaggaattggacaaacacaataccaattcggaatccagcgatcatatttcattgccgcatctaaatcagatagca -# gaagatcagttgatcagaggaaacagacgtcctcatttaaacaccatcacgcacccttctcctctaatactcctgcagccttcaacttcgtcacttag -# tggtcacgacgatcgatcagacattgaaccaaatctgcgtaataatgtaggcctttactcaacacctacagtgctaccaagttttaatcattactccg -# caggcaagttgaaaatatttgcaagcaacgcacatgagaaagttattccatga] -# protein sequence = [MRTASRSQREPFRVGGAVASSTHENQTSSYAASRWPVLFQTVNQNFLVAIIGLIELYRHRLQVRFTVTVCGCGVIRMS -# VTVKAFPNDIVCHRILAFRLTYFWSSGCCVVTEKHFALFKKYYETGSFKAGVIGGSKPKVATPPVVDAIANYKRENPTMFAWEIRDRLLAEAICSQDN -# VPSVSSINRIVRNKAAEKAKHVHHHQQHHVPQGLGGGHIATESLDSSTGTIGEPQPPSGGTSNSSANSANPNASAATVATHASIPTSGSDTVQVSVGQ -# INANSNDTSNGNINSTTEQRTTGYSINGILGIQHGQHSHNNNNNSSVSNNNNTDPTNCKRKRIEAHDENRDTNIHSEDDGKRQRMGYSGDPLYPNIWP -# GKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDTSMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIALAFDGNYTSMTSLEND -# TSSVAQVNIDVPESTDPANLCTISTRIVQDHSDNNSNRVKEPQPNIDGAREENNKELDKHNTNSESSDHISLPHLNQIAEDQLIRGNRRPHLNTITHP -# SPLILLQPSTSSLSGHDDRSDIEPNLRNNVGLYSTPTVLPSFNHYSAGKLKIFASNAHEKVIP] -# end gene contig62.g198 -### -# -# ----- prediction on sequence number 63 (length = 55021, name = contig63) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 63 on both strands -# start gene contig63.g199 -contig63 AUGUSTUS gene 42 8033 1 + . ID=contig63.g199 -contig63 AUGUSTUS transcript 42 8033 . + . ID=contig63.g199.t1;Parent=contig63.g199 -contig63 AUGUSTUS start_codon 42 44 . + 0 Parent=contig63.g199.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 42 67 . + 0 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 1003 1469 . + 1 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 4336 4421 . + 2 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 . + 0 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 7498 8033 . + 2 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 -# coding sequence = [atgttacagcttagtcatcatcgtagcattgtaagaaacaaggccgccgagaaggcgaaacatgttcatcatcaccaac -# agcatcatgtaccacagggtctgggtggcggacacattgccacagaaagtctagatagcagcacaggaacgatcggcgaaccgcagcccccgagtggt -# ggaactagcaatagcagtgctaattccgcaaacccaaacgcttctgcggcgacggttgcgacgcacgcatcaataccgacgtcaggctctgatactgt -# ccaggtttcagtcggccaaatcaatgcaaacagcaatgacacaagcaatgggaatattaactcaacgactgagcaacgaacgactggatatagcatta -# atggaattctaggtatacaacatggacagcattctcacaacaataataacaacagtagcgtgagcaataacaataatacagatcccaccaattgtaaa -# cgtaaaagaatcgaagctcatgacgaaaaccgtgacacaaatatacattccgaagatgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctct -# ttatccaaatatttggcctgggaagtggtgtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcat -# catcatattatgaggcttcaaacggattttccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtac -# gacagtatttcaacaatttcgcaatctcaaagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattgctttagcatttgacggaaactacacatcaat -# gactagcttggaaaatgacacctcatcagtcgcacaagtaaatattgacgttccagaaagcaccgatccggctaacctttgcacgataagtacaagga -# ttgtgcaagaccactcggataataatagtaaccgtgttaaggagccgcagccgaacattgatggggccagagaggaaaacaataaggaattggacaaa -# cacaataccaattcggaatccagcgatcatatttcattgccgcatctaaatcagatagcagaagatcagttgatcagaggaaacagacgtcctcattt -# aaacaccatcacgcacccttctcctctaatactcctgcagccttcaacttcgtcacttagtggtcacgacgatcgatcagacattgaaccaaatctgc -# gtaataatgtaggcctttactcaacacctacagtgctaccaagttttaatcattactccgcaggcaagttgaaaatatttgcaagcaacgcacatgag -# aaagttattccatga] -# protein sequence = [MLQLSHHRSIVRNKAAEKAKHVHHHQQHHVPQGLGGGHIATESLDSSTGTIGEPQPPSGGTSNSSANSANPNASAATV -# ATHASIPTSGSDTVQVSVGQINANSNDTSNGNINSTTEQRTTGYSINGILGIQHGQHSHNNNNNSSVSNNNNTDPTNCKRKRIEAHDENRDTNIHSED -# DGKRQRMGYSGDPLYPNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDTSMLYDSISTISQSQSSLYTPTIG -# PSIALAFDGNYTSMTSLENDTSSVAQVNIDVPESTDPANLCTISTRIVQDHSDNNSNRVKEPQPNIDGAREENNKELDKHNTNSESSDHISLPHLNQI -# AEDQLIRGNRRPHLNTITHPSPLILLQPSTSSLSGHDDRSDIEPNLRNNVGLYSTPTVLPSFNHYSAGKLKIFASNAHEKVIP] -# end gene contig63.g199 -### -# start gene contig63.g200 -contig63 AUGUSTUS gene 14454 29828 1 - . 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ID=contig63.g201 -contig63 AUGUSTUS transcript 35930 36187 . - . ID=contig63.g201.t1;Parent=contig63.g201 -contig63 AUGUSTUS CDS 35930 36187 . - 0 ID=contig63.g201.t1.cds;Parent=contig63.g201.t1 -contig63 AUGUSTUS start_codon 36185 36187 . - 0 Parent=contig63.g201.t1 -# coding sequence = [atgacgcagagctgcccgccgccgcttgagaaatacacactgaagcgatgtcgtcgggacgaatgtactataatcgata -# cattcgacttcataatcgacatcttcctttcctttttctttgagttcacttattgtcaattccattctattgaaattctacagaaattgcactccgtc -# actctgttttcaacccaatacttatctccccacgattgccgataccagccgaaagattccgaattcttcttcgagcagtaa] -# protein sequence = [MTQSCPPPLEKYTLKRCRRDECTIIDTFDFIIDIFLSFFFEFTYCQFHSIEILQKLHSVTLFSTQYLSPHDCRYQPKD -# SEFFFEQ] -# end gene contig63.g201 -### -# start gene contig63.g202 -contig63 AUGUSTUS gene 36376 54248 1 + . ID=contig63.g202 -contig63 AUGUSTUS transcript 36376 54248 . + . 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ID=contig64.g203 -contig64 AUGUSTUS transcript 123 14823 . - . 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ID=contig64.g204 -contig64 AUGUSTUS transcript 20925 21182 . - . ID=contig64.g204.t1;Parent=contig64.g204 -contig64 AUGUSTUS CDS 20925 21182 . - 0 ID=contig64.g204.t1.cds;Parent=contig64.g204.t1 -contig64 AUGUSTUS start_codon 21180 21182 . - 0 Parent=contig64.g204.t1 -# coding sequence = [atgacgcagagctgcccgccgccgcttgagaaatacacactgaagcgatgtcgtcgggacgaatgtactataatcgata -# cattcgacttcataatcgacatcttcctttcctttttctttgagttcacttattgtcaattccattctattgaaattctacagaaattgcactccgtc -# actctgttttcaacccaatacttatctccccacgattgccgataccagccgaaagattccgaattcttcttcgagcagtaa] -# protein sequence = [MTQSCPPPLEKYTLKRCRRDECTIIDTFDFIIDIFLSFFFEFTYCQFHSIEILQKLHSVTLFSTQYLSPHDCRYQPKD -# SEFFFEQ] -# end gene contig64.g204 -### -# start gene contig64.g205 -contig64 AUGUSTUS gene 21371 39243 1 + . ID=contig64.g205 -contig64 AUGUSTUS transcript 21371 39243 . + . 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ID=contig65.g206 -contig65 AUGUSTUS transcript 916 1173 . - . ID=contig65.g206.t1;Parent=contig65.g206 -contig65 AUGUSTUS CDS 916 1173 . - 0 ID=contig65.g206.t1.cds;Parent=contig65.g206.t1 -contig65 AUGUSTUS start_codon 1171 1173 . - 0 Parent=contig65.g206.t1 -# coding sequence = [atgacgcagagctgcccgccgccgcttgagaaatacacactgaagcgatgtcgtcgggacgaatgtactataatcgata -# cattcgacttcataatcgacatcttcctttcctttttctttgagttcacttattgtcaattccattctattgaaattctacagaaattgcactccgtc -# actctgttttcaacccaatacttatctccccacgattgccgataccagccgaaagattccgaattcttcttcgagcagtaa] -# protein sequence = [MTQSCPPPLEKYTLKRCRRDECTIIDTFDFIIDIFLSFFFEFTYCQFHSIEILQKLHSVTLFSTQYLSPHDCRYQPKD -# SEFFFEQ] -# end gene contig65.g206 -### -# start gene contig65.g207 -contig65 AUGUSTUS gene 1362 19234 1 + . ID=contig65.g207 -contig65 AUGUSTUS transcript 1362 19234 . + . ID=contig65.g207.t1;Parent=contig65.g207 -contig65 AUGUSTUS start_codon 1362 1364 . + 0 Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 1362 1445 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 1940 2072 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 2137 2550 . + 2 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 4510 4676 . + 2 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 5388 5441 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 5560 5724 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 7023 7226 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 9847 10054 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 10157 10242 . + 2 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 15720 16110 . + 0 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 19221 19234 . + 2 ID=contig65.g207.t1.cds;Parent=contig65.g207.t1 -# coding sequence = [atggtcggggcattagttccgggccgaaaacaaattgaatggaatatacaattggcaattattgaatcccaagaagaaa -# gcaaagtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcatacatgatattttcaatg -# cttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaatcggcctttaaatacgc -# gatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatgattcgtttcgcaccacta -# aaaaggtttgccgccagttggaagctggcgttcaagctatctttggtccaacagatgctcttctggctggtcatgtacaatccatatgcgaagcatat -# gatataccccacattgaagttcgaattgatcttgaatatagttcaaaagaattttcaatcaatttgtatccgtcacacactctcttaactctagcata -# tagagatattatgatgtacttgaactggacaaaggtggcaattatttatgaagaagattatggactatttaatttaatgcaatcatcgactgagacca -# aagctgaaatgtatataaggcaagcaagtccggactcctatcgtcaagtcttacgagcaatccgccagaaggaaatttacaaaattatagtggacaca -# aatccatccaacattaaaacgttttttaaatcgattttacaattgcaaatgaatgatcaccgatatcactatatgtttacaacgttcgacttggaaac -# gtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtcaatagcaaaagatatctagaggttattgatcaaa -# tgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacaggctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaa -# ggtcgccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttc -# ggatccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagaggagcgtccatatgttatggttaaagaagatacaa -# atcttaccggaaatataaggtttgaaggattttgtattgatcttctaaaagctatcgctcaacaagttggatttcaatacaaaattgaactagttccc -# gataatatgtatggagtttacataccagagactaattcatggaacggaattgtgcaagagttaatggaacgggcaacctcaatgacaattaactatgc -# tcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgtggc -# gttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaatcc -# accatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaaggatc -# tccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtgatg -# tttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggcactcgactatag] -# protein sequence = [MVGALVPGRKQIEWNIQLAIIESQEESKVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTE -# DERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPNTQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKVCRQLEAGVQAIFGPTDALLAGHVQSICEAYDIPHIEVRIDLEYSSKEFS -# INLYPSHTLLTLAYRDIMMYLNWTKVAIIYEEDYGLFNLMQSSTETKAEMYIRQASPDSYRQVLRAIRQKEIYKIIVDTNPSNIKTFFKSILQLQMND -# HRYHYMFTTFDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQ -# KVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTREERPYVMVKEDTNLTGNIRFEGFCIDLLKAIAQQVGFQYKIELVPDNMYGVYIPETNSWNGIVQ -# ELMERATSMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGGL -# LDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGTRL] -# end gene contig65.g207 -### -# start gene contig65.g208 -contig65 AUGUSTUS gene 23382 36522 1 - . 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ID=contig65.g209 -contig65 AUGUSTUS transcript 41742 43862 . + . 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ID=contig66.g211 -contig66 AUGUSTUS transcript 21735 29975 . + . ID=contig66.g211.t1;Parent=contig66.g211 -contig66 AUGUSTUS start_codon 21735 21737 . + 0 Parent=contig66.g211.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 21735 22034 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 22096 22904 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 23502 23700 . + 1 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 29826 29975 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 -# coding sequence = [atgaatgaaaaaagctcccgttcgcacactatatttactattactttggaacaatctccattttttaatagcattggga -# cagaaaatgacttaggaggaatacgacgtggaaaattaagcttagttgacctagcgggctcagagagacagcgtaaaactggagctcaaggggatcga -# ctcaaagaagcgtctaaaataaatttatcactttctgccttgggaaacgtaatttcatctttggttgatggtaaagcaaagcatgtaccgttcaggga -# ctcaaaacttacacgtctgctccaggattccttaggaggtaacacaaaaactttaatgatatcttgtatatcaccatcagacataaattatgatgaaa -# cgatatctacactcagatatgcaagtagagcaaagaatatttctaatagacccacaattaatgaagatcctaaagatgccaagcttcggcagtaccaa -# aaggaaatattaaatttgaaaagaatgcttgaagagactcaacaaaaaatgatttacagaaatgatgaacaaattaatttaattgaattatctatggc -# gaatttagatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggttcaaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattat -# caatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgcaagcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgat -# gacctaaaactaaaagaacagcaccaagctaaaaaaatggcagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgagga -# tcgtgatctcttgcagggacattatgctactataacccaagaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttg -# aaatggaagtttccgatttaaactctgagtttcaattggatagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaa -# caattggtttataaatttaatccaagttttcaaaaaaatggaagaaactggactccggatattgtattgcgtaattcttcatggaatgatgatcttaa -# aatttggaggattccagagatcgatttatttaaacttccccctactccgaaaacgggatttcatcgtattcattgttcaattagcgataataataatt -# ggaaacatactaactttcaaatcaaccgggatgcaaagaaatctgaaatatatgagaaaaatgaaaacctttctaaagaaaaatacaacatcgatgta -# caaagaaactattttagaaccagtcgacctaagctcaaagagtttggagaatttaagaacactttaatgcgatttaaaggagtatacgatacaactgg -# tagctaa] -# protein sequence = [MNEKSSRSHTIFTITLEQSPFFNSIGTENDLGGIRRGKLSLVDLAGSERQRKTGAQGDRLKEASKINLSLSALGNVIS -# SLVDGKAKHVPFRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMISCISPSDINYDETISTLRYASRAKNISNRPTINEDPKDAKLRQYQKEILNLKRMLEETQQKMIY -# RNDEQINLIELSMANLDVKSLNSKKEVQIIESGKNSDVPRKTTNSLSIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHL -# SAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKMLEMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNWTP -# DIVLRNSSWNDDLKIWRIPEIDLFKLPPTPKTGFHRIHCSISDNNNWKHTNFQINRDAKKSEIYEKNENLSKEKYNIDVQRNYFRTSRPKLKEFGEFK -# NTLMRFKGVYDTTGS] -# end gene contig66.g211 -### -# start gene contig66.g212 -contig66 AUGUSTUS gene 31363 40249 1 - . ID=contig66.g212 -contig66 AUGUSTUS transcript 31363 40249 . - . ID=contig66.g212.t1;Parent=contig66.g212 -contig66 AUGUSTUS CDS 31363 31425 . - 0 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 31737 31749 . - 1 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 33182 33301 . - 1 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 35518 35815 . - 2 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 35889 36646 . - 1 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 36707 36860 . - 2 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS CDS 40123 40249 . - 0 ID=contig66.g212.t1.cds;Parent=contig66.g212.t1 -contig66 AUGUSTUS start_codon 40247 40249 . - 0 Parent=contig66.g212.t1 -# coding sequence = [atggatcaaagcattgtaaatatggcatacgaacgttacggcatacttcttcaaaatgaacaatacgaagaagatatag -# tcaacgcaaaaggcattcaagcagtaaacgtccataataatagcaacgacggtatacagctaagcaatcacatcaacttgcacaacaataaagtattt -# gaatcagttattcagtcagaaccaaaagaaagtaataacgcaggttattctaatgtatgtcaaaaggcgctcttaaaacctgaagttatattttcctc -# taaaataaagaagaataccaactttggatatcaaatgaatatcaattgttataagaatatcggctatgaggaaaatcaaaaaatttcaaaggacgtga -# cacatagcctgccaagcaatagcaatgcaccagaagagttaggtactgtcagcagaacttcacctttcatggtctcagatacagcaatacttacttca -# actgggaaatcaagacggtgggagcaaaagctggttcaaattaaaactatggaaggggagtttagtgttacaatgtgggcatccggaatatctgatga -# tgaatactccggatcagaccaacatgctggcgattcagattttttgaaaggaaaaaacattgattttgatcatggcacgtcccagcgaacgaaagata -# tagagcaggttgaatctgtattacaggaagatgtatttattcaagaacctcaggcaattgaaatgcagccacactctattccaatcataaaacagttc -# acgaaagaggagggagttttttctagagaaaataatatttccacaaaggttcaaagtaaatcatcattaagtttcgaagatcccattttgatttcgga -# ttcctcaagtatacagctggtgaatgaaactaccggcatgacaattgataatcctgacaatactggcgatctgcacacattgactagctcagtggcat -# ttggtcttagctcacaggaaagacaacaaactgattgtttatcaacaccatcacaactaccataccacggcattacaggaccaaatggaagctctgat -# tcaagttttaatctttccgatgtcccagtgtcccatcaaaatgataaaaaaatagcttgtccccataaaggttgccataaaaatttcagagactcgtc -# tgcgatgcgcaagcatttgcacactcacggtcctcgtgttcatgtttgtgcagaatgtgggaaagcttttgtagaaagttccaagcttaaaagacatc -# agttggttcacacaggagaaaaaccatttcagtgtacgttcgagggatgtggaaaacgattttctttggattttaacttaagaactcatgtaagaata -# catactggagataggccatttgtttgtccatttgatgcctgcaataaaaagtttgctcaatccacaaatttaaaatcacatatattgactcatgcgaa -# agcaaacaccaatggaaagttgtccattgatcgtaacggttctgtcattgagagtgctaacgcggtcatcgataattgttag] -# protein sequence = [MDQSIVNMAYERYGILLQNEQYEEDIVNAKGIQAVNVHNNSNDGIQLSNHINLHNNKVFESVIQSEPKESNNAGYSNV -# CQKALLKPEVIFSSKIKKNTNFGYQMNINCYKNIGYEENQKISKDVTHSLPSNSNAPEELGTVSRTSPFMVSDTAILTSTGKSRRWEQKLVQIKTMEG -# EFSVTMWASGISDDEYSGSDQHAGDSDFLKGKNIDFDHGTSQRTKDIEQVESVLQEDVFIQEPQAIEMQPHSIPIIKQFTKEEGVFSRENNISTKVQS -# KSSLSFEDPILISDSSSIQLVNETTGMTIDNPDNTGDLHTLTSSVAFGLSSQERQQTDCLSTPSQLPYHGITGPNGSSDSSFNLSDVPVSHQNDKKIA -# CPHKGCHKNFRDSSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPFVCPFDACNKKFA -# QSTNLKSHILTHAKANTNGKLSIDRNGSVIESANAVIDNC] -# end gene contig66.g212 -### -# -# ----- prediction on sequence number 67 (length = 44531, name = contig67) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 67 on both strands -# start gene contig67.g213 -contig67 AUGUSTUS gene 6732 14972 1 + . ID=contig67.g213 -contig67 AUGUSTUS transcript 6732 14972 . + . 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ID=contig67.g214 -contig67 AUGUSTUS transcript 16360 25246 . - . ID=contig67.g214.t1;Parent=contig67.g214 -contig67 AUGUSTUS CDS 16360 16422 . - 0 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 16734 16746 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 18179 18298 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 20515 20812 . - 2 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 20886 21643 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 21704 21857 . - 2 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 25120 25246 . - 0 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 -contig67 AUGUSTUS start_codon 25244 25246 . - 0 Parent=contig67.g214.t1 -# coding sequence = [atggatcaaagcattgtaaatatggcatacgaacgttacggcatacttcttcaaaatgaacaatacgaagaagatatag -# tcaacgcaaaaggcattcaagcagtaaacgtccataataatagcaacgacggtatacagctaagcaatcacatcaacttgcacaacaataaagtattt -# gaatcagttattcagtcagaaccaaaagaaagtaataacgcaggttattctaatgtatgtcaaaaggcgctcttaaaacctgaagttatattttcctc -# taaaataaagaagaataccaactttggatatcaaatgaatatcaattgttataagaatatcggctatgaggaaaatcaaaaaatttcaaaggacgtga -# cacatagcctgccaagcaatagcaatgcaccagaagagttaggtactgtcagcagaacttcacctttcatggtctcagatacagcaatacttacttca -# actgggaaatcaagacggtgggagcaaaagctggttcaaattaaaactatggaaggggagtttagtgttacaatgtgggcatccggaatatctgatga -# tgaatactccggatcagaccaacatgctggcgattcagattttttgaaaggaaaaaacattgattttgatcatggcacgtcccagcgaacgaaagata -# tagagcaggttgaatctgtattacaggaagatgtatttattcaagaacctcaggcaattgaaatgcagccacactctattccaatcataaaacagttc -# acgaaagaggagggagttttttctagagaaaataatatttccacaaaggttcaaagtaaatcatcattaagtttcgaagatcccattttgatttcgga -# ttcctcaagtatacagctggtgaatgaaactaccggcatgacaattgataatcctgacaatactggcgatctgcacacattgactagctcagtggcat -# ttggtcttagctcacaggaaagacaacaaactgattgtttatcaacaccatcacaactaccataccacggcattacaggaccaaatggaagctctgat -# tcaagttttaatctttccgatgtcccagtgtcccatcaaaatgataaaaaaatagcttgtccccataaaggttgccataaaaatttcagagactcgtc -# tgcgatgcgcaagcatttgcacactcacggtcctcgtgttcatgtttgtgcagaatgtgggaaagcttttgtagaaagttccaagcttaaaagacatc -# agttggttcacacaggagaaaaaccatttcagtgtacgttcgagggatgtggaaaacgattttctttggattttaacttaagaactcatgtaagaata -# catactggagataggccatttgtttgtccatttgatgcctgcaataaaaagtttgctcaatccacaaatttaaaatcacatatattgactcatgcgaa -# agcaaacaccaatggaaagttgtccattgatcgtaacggttctgtcattgagagtgctaacgcggtcatcgataattgttag] -# protein sequence = [MDQSIVNMAYERYGILLQNEQYEEDIVNAKGIQAVNVHNNSNDGIQLSNHINLHNNKVFESVIQSEPKESNNAGYSNV -# CQKALLKPEVIFSSKIKKNTNFGYQMNINCYKNIGYEENQKISKDVTHSLPSNSNAPEELGTVSRTSPFMVSDTAILTSTGKSRRWEQKLVQIKTMEG -# EFSVTMWASGISDDEYSGSDQHAGDSDFLKGKNIDFDHGTSQRTKDIEQVESVLQEDVFIQEPQAIEMQPHSIPIIKQFTKEEGVFSRENNISTKVQS -# KSSLSFEDPILISDSSSIQLVNETTGMTIDNPDNTGDLHTLTSSVAFGLSSQERQQTDCLSTPSQLPYHGITGPNGSSDSSFNLSDVPVSHQNDKKIA -# CPHKGCHKNFRDSSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPFVCPFDACNKKFA -# QSTNLKSHILTHAKANTNGKLSIDRNGSVIESANAVIDNC] -# end gene contig67.g214 -### -# start gene contig67.g215 -contig67 AUGUSTUS gene 30493 43488 1 + . 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ID=contig67.g216 -contig67 AUGUSTUS transcript 44120 44521 . + . ID=contig67.g216.t1;Parent=contig67.g216 -contig67 AUGUSTUS start_codon 44120 44122 . + 0 Parent=contig67.g216.t1 -contig67 AUGUSTUS CDS 44120 44521 . + 0 ID=contig67.g216.t1.cds;Parent=contig67.g216.t1 -# coding sequence = [atgaacaacaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaatcgattacctacaggaacggc -# aagattctgcacttactcatagcaattcaatagggtccacgataaccaaacttcataagttcggaataactaattcaaaattcgatgaactagataat -# attgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgatatggtttttttgtgctccagaaagaatattgaaagggaaaggcctgt -# gggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaaggtgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcgaagaaaggaaacaggaaatac -# agagcatactttctcgactatttttataa] -# protein sequence = [MNNNVRSKFNVFENGCKEKIDYLQERQDSALTHSNSIGSTITKLHKFGITNSKFDELDNIEKTIDKINSSTDEESDMV -# FLCSRKNIERERPVGLGEAMNDIRSKFEQGEVMTKEERREERKQEIQSILSRLFL] -# end gene contig67.g216 -### -# -# ----- prediction on sequence number 68 (length = 25628, name = contig68) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 68 on both strands -# start gene contig68.g217 -contig68 AUGUSTUS gene 2750 3151 1 + . ID=contig68.g217 -contig68 AUGUSTUS transcript 2750 3151 . + . ID=contig68.g217.t1;Parent=contig68.g217 -contig68 AUGUSTUS start_codon 2750 2752 . + 0 Parent=contig68.g217.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 2750 3151 . + 0 ID=contig68.g217.t1.cds;Parent=contig68.g217.t1 -# coding sequence = [atgaacaacaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaatcgattacctacaggaacggc -# aagattctgcacttactcatagcaattcaatagggtccacgataaccaaacttcataagttcggaataactaattcaaaattcgatgaactagataat -# attgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgatatggtttttttgtgctccagaaagaatattgaaagggaaaggtctgt -# gggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaatctgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcgaagaaaggaaacaggaaatac -# agagcatactttctcgactatttttataa] -# protein sequence = [MNNNVRSKFNVFENGCKEKIDYLQERQDSALTHSNSIGSTITKLHKFGITNSKFDELDNIEKTIDKINSSTDEESDMV -# FLCSRKNIERERSVGLGEAMNDIRSKFEQSEVMTKEERREERKQEIQSILSRLFL] -# end gene contig68.g217 -### -# start gene contig68.g218 -contig68 AUGUSTUS gene 4505 14628 1 - . ID=contig68.g218 -contig68 AUGUSTUS transcript 4505 14628 . - . ID=contig68.g218.t1;Parent=contig68.g218 -contig68 AUGUSTUS CDS 4505 4621 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 6427 6521 . - 2 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 6621 6732 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 7104 7179 . - 1 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 9040 9119 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 13979 14068 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 14386 14628 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 -contig68 AUGUSTUS start_codon 14626 14628 . - 0 Parent=contig68.g218.t1 -# coding sequence = [atgccatcgcatttcaaagtaaaagaatattgcccccttgtgtttcggaatctacgtgaaagatttggagttgatgatg -# tggactaccgcgagtcgttaactcgatcccaacctatacaaatagactcatctggaaagtccggggcacaattttaccagagttatgataggtttttt -# ataatgaaaagtttaacatcggaagaaatcgagcgtatgcacgcttttttgaagcaatatcacccggacaatgattttataaaacaaaaagtgaaatt -# ggacattggaaaggaagctaaagaaaagctgatgaacaccctaagcaacgatgtggattttgtgcgggacggtaaaacaacgaaagcttttgtcgaaa -# ttgaacgattgtgtgggaaagagtttaaattattagtaagggccggcttctcgattcttagacgaagttatagatacctgtttgtccgacaaatctta -# aggcagggtaaacttgaactgctaaccaagttgcacatcatggactactctttattggtcggcgtgcatgactgtgtgcgtgccgaagaagaagcgct -# acaaggagataatgttacagctgccggtcgcactggacgtataacacgcctcccgattccccaagaggtgcacagtataaagaagtcgtttacgaagt -# tgacatatatgacattccaagcattgaaggcggcaaaagcagccaaaactgttaaatatggcagtaatgttgatggtatatcgacatgtgaccctgaa -# caatatgccaaacgattcttggaatttatggataaagcaatagaataa] -# protein sequence = [MPSHFKVKEYCPLVFRNLRERFGVDDVDYRESLTRSQPIQIDSSGKSGAQFYQSYDRFFIMKSLTSEEIERMHAFLKQ -# YHPDNDFIKQKVKLDIGKEAKEKLMNTLSNDVDFVRDGKTTKAFVEIERLCGKEFKLLVRAGFSILRRSYRYLFVRQILRQGKLELLTKLHIMDYSLL -# VGVHDCVRAEEEALQGDNVTAAGRTGRITRLPIPQEVHSIKKSFTKLTYMTFQALKAAKAAKTVKYGSNVDGISTCDPEQYAKRFLEFMDKAIE] -# end gene contig68.g218 -### -# start gene contig68.g219 -contig68 AUGUSTUS gene 17114 17867 1 - . ID=contig68.g219 -contig68 AUGUSTUS transcript 17114 17867 . - . ID=contig68.g219.t1;Parent=contig68.g219 -contig68 AUGUSTUS CDS 17114 17391 . - 2 ID=contig68.g219.t1.cds;Parent=contig68.g219.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 17804 17867 . - 0 ID=contig68.g219.t1.cds;Parent=contig68.g219.t1 -contig68 AUGUSTUS start_codon 17865 17867 . - 0 Parent=contig68.g219.t1 -# coding sequence = [atgaagctcgcaaacggtattgcaagggcatttgactcactgcggtttcttcggtacaccgatacttataacattgccc -# tggcctaccgcgatgccaatggcattcagtacaacgaggccgtcgacgacggtctggatggcgaaaccttgatcgagaccggaaccgccaacgacagc -# aacatcgactacgattgggtgccccaggagacgctgcgggcgctgcagaagtcgccgcccaagtccaagacgcccaagacctcgcccaagcccggcaa -# gcaggccagtcccaaggcagccagccagcagagtcccaagcagcgcaaggtcaagcgctggcgatga] -# protein sequence = [MKLANGIARAFDSLRFLRYTDTYNIALAYRDANGIQYNEAVDDGLDGETLIETGTANDSNIDYDWVPQETLRALQKSP -# PKSKTPKTSPKPGKQASPKAASQQSPKQRKVKRWR] -# end gene contig68.g219 -### -# start gene contig68.g220 -contig68 AUGUSTUS gene 18414 22745 1 + . ID=contig68.g220 -contig68 AUGUSTUS transcript 18414 22745 . + . ID=contig68.g220.t1;Parent=contig68.g220 -contig68 AUGUSTUS start_codon 18414 18416 . + 0 Parent=contig68.g220.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 18414 18589 . + 0 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 20787 21050 . + 1 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 21149 21485 . + 1 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 -contig68 AUGUSTUS CDS 22542 22745 . + 0 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 -# coding sequence = [atgacggaatctggaattgatttaggctttgatatggagttcgatctaaatattagtctgttaaatgataacgaaaata -# tggattttttacctaatgttaccgtagcaggtagttccgaaaatgtggagttttatgaattaaaatcatcaactcgctgtttacggtctgacgaaatt -# tccatggctattgaagtcggagaggaaccgccgactatacaaccaactgataatattggtaaagcatgttctgcatcagttctaagttcaactgaatg -# tgataatatgccttcggctactacaaatattagagtaactgttggtatcgacaaagatttagaaatgattctcgaaatggatccaagtattgtagatt -# taggagatattagcattgcagaaacaacagaaccgcggatagtgggtttacctccactttcgggtggaccaacatttaaaactgccacccccacttca -# cgaacccaactgaaacttcagttacaaagggagcaacatcaacagcagcagcagcaaatgatacagcaacagaccctgggttcgccagactcgaaaat -# gcacctattgtttggcaatgcacagggatccatggaatcggaattcattgacagcggtagtaccagcgcatgtggcagcgggtcatctagtttagaac -# aaatgtcccaattagtgcaaattgataatttaattgacacgtcaagtgcagttaaacttaaagttcctcttcaaagtattggtgtagatgtgcctccc -# caagtactgcagcagtataaactgttacacgaattaaataactttattagacttgaccgttctcttttacttcttattcgcaattgcctggttttaca -# tagcgtcgggtttaacatacgattacttgaagttggctgcgatcaatatcgatacttaacattataccagagttgccagattggtcgctttatcacag -# aagatacttgtagatgctag] -# protein sequence = [MTESGIDLGFDMEFDLNISLLNDNENMDFLPNVTVAGSSENVEFYELKSSTRCLRSDEISMAIEVGEEPPTIQPTDNI -# GKACSASVLSSTECDNMPSATTNIRVTVGIDKDLEMILEMDPSIVDLGDISIAETTEPRIVGLPPLSGGPTFKTATPTSRTQLKLQLQREQHQQQQQQ -# MIQQQTLGSPDSKMHLLFGNAQGSMESEFIDSGSTSACGSGSSSLEQMSQLVQIDNLIDTSSAVKLKVPLQSIGVDVPPQVLQQYKLLHELNNFIRLD -# RSLLLLIRNCLVLHSVGFNIRLLEVGCDQYRYLTLYQSCQIGRFITEDTCRC] -# end gene contig68.g220 -### -# start gene contig68.g221 -contig68 AUGUSTUS gene 23109 24707 1 - . ID=contig68.g221 -contig68 AUGUSTUS transcript 23109 24707 . - . ID=contig68.g221.t1;Parent=contig68.g221 -contig68 AUGUSTUS CDS 23109 24707 . - 0 ID=contig68.g221.t1.cds;Parent=contig68.g221.t1 -contig68 AUGUSTUS start_codon 24705 24707 . - 0 Parent=contig68.g221.t1 -# coding sequence = [atgagttgttttctcacgttaaaggaaaaacttattgagtcaccagtactggcgttatataatcacaaggacgatacgg -# aattacattgtgacgcaagcgctctaggatttggtgctgtactgttgcagaggaaagatgatggcaagttacatcctgtgttctatttctctaagcgt -# actacagcagatgaggctaagttacatagttttgagctcgagactttggcggttatctatgctcttcgtagatttaggatatatttgcaagggaaaca -# tgtaaaattggtaaccgactgtattgcacttaagttaacactccataaagcagaacttaacccgaagatatcaagatgggctttggagatggaaaact -# atgatcttgaaatatgtcacagagcgggaaataaaatgcagcatgtggatgctctcagcaggtacaataatattctaatagtggagaccaacagcttt -# gaggaaaatttagtcatctgtcaaggaaaggatttaaaaattaagaagcttaaaacgattttagagaaggcagaacttaaattatttgaaatgagaaa -# tggggtagtgtacagaaaagcaaatgacgataggatactattctatgtgccagaagaaatggaagatcaggtactatataaataccacaacgaaatag -# gacatataggaagagataaaatgatggacataatttcaaaaacttattggtttccaaatttaaaagaaaagtgcgttgcacatatagaaaattgttta -# aagtgtgtagcgttttcaccaaaatcaggtaaaggagaaggttttttgcacagtattcccaaaggaaacaaaccattcgagttaatacacattgacca -# ttatggtccagtagactcgtcaagagcaaaaaaacacatttttgtggtagttgacggattcacaaagtttgtaagactttattcaactaaatcaacaa -# gcactagggaggttataacggcattgaaagattactttagggcctatagtaggccaaaatgcataatttcagaccggggtagttgttttacatctaaa -# gacttcgaagaattcatggaagaatataatgtgaagcacatcaagatagccacaggctcaccacaagccaatggtcaagttgaaaggattaacaggag -# ccttggaccaatgatagcaaaattagttgatcaaagtaaaggtgtatactgggacaatgttatagataaaatagaacatgctttaaataatacgttgc -# acagaagtataagacaacttccgagtaaaatgctgtttggagtagaacaaaaaggaaagattgtggatgaacttaaggaaaagctagaggacataaat -# gaaaataagaaattagatagtttaacaaagataaggaaaaaagctgaggcccaccaaaagcaagttcaagattataatgaaaaattgtataacaaaag -# tcgagtaaaggctagaaattataaaaaaggagactatgtaatggtgaaaaattttgactcgactgttggaactgctaggaaactgattcccaaacata -# aaggaccatatgtgattgcaaaagcgatgcgcaatgacagattctattaa] -# protein sequence = [MSCFLTLKEKLIESPVLALYNHKDDTELHCDASALGFGAVLLQRKDDGKLHPVFYFSKRTTADEAKLHSFELETLAVI -# YALRRFRIYLQGKHVKLVTDCIALKLTLHKAELNPKISRWALEMENYDLEICHRAGNKMQHVDALSRYNNILIVETNSFEENLVICQGKDLKIKKLKT -# ILEKAELKLFEMRNGVVYRKANDDRILFYVPEEMEDQVLYKYHNEIGHIGRDKMMDIISKTYWFPNLKEKCVAHIENCLKCVAFSPKSGKGEGFLHSI -# PKGNKPFELIHIDHYGPVDSSRAKKHIFVVVDGFTKFVRLYSTKSTSTREVITALKDYFRAYSRPKCIISDRGSCFTSKDFEEFMEEYNVKHIKIATG -# SPQANGQVERINRSLGPMIAKLVDQSKGVYWDNVIDKIEHALNNTLHRSIRQLPSKMLFGVEQKGKIVDELKEKLEDINENKKLDSLTKIRKKAEAHQ -# KQVQDYNEKLYNKSRVKARNYKKGDYVMVKNFDSTVGTARKLIPKHKGPYVIAKAMRNDRFY] -# end gene contig68.g221 -### -# -# ----- prediction on sequence number 69 (length = 44962, name = contig69) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 69 on both strands -# start gene contig69.g222 -contig69 AUGUSTUS gene 2436 4481 1 - . ID=contig69.g222 -contig69 AUGUSTUS transcript 2436 4481 . - . ID=contig69.g222.t1;Parent=contig69.g222 -contig69 AUGUSTUS CDS 2436 4481 . - 0 ID=contig69.g222.t1.cds;Parent=contig69.g222.t1 -contig69 AUGUSTUS start_codon 4479 4481 . - 0 Parent=contig69.g222.t1 -# coding sequence = [atgccaatgggtatcaaaaatgcaccagctgtttttcaacgctttgttaataaaatcttcgatgatatgattagagaaa -# gcaaagtagtagtgtatatggatgatataatggtcgccagcaaagatattaatgaacatttagaaacattagatgaaatctttaaaaggcttacacag -# aacagattagaacttagaatggataaatgtgagtttttgaaagcaaatataaagtatttgggatttttgatttctgagaatggcattagggcagatga -# taagggcattgaagccgtaaaaaattttccagttcccacgaaggttcaggcagtacaaagttttttgggactttcttcatattttcgaaggtttataa -# aagatttctctacaatagcaaaacctttgtatgacttgttaaagaaggacaaaccatttcaatttggtgaagaagagatgagttgttttctcacgtta -# aaggaaaaacttattgagtcaccagtactggcgttatataatcacaaggacgatacggaattacattgtgacgcaagcgctctaggatttggtgctgt -# actgttgcagaggaaagatgatggcaagttacatcctgtgttctatttctctaagcgtactacagcagatgaggctaagttacatagttttgagctcg -# agactttggcggttatctatgctcttcgtagatttaggatatatttgcaagggaaacatgtaaaattggtaaccgactgtattgcacttaagttaaca -# ctccataaagcagaacttaacccgaagatatcaagatgggctttggagatggaaaactatgatcttgaaatatgtcacagagcgggaaataaaatgca -# gcatgtggatgctctcagcaggtacaataatattctaatagtggaaaccaacagctttgaggaaaatttagtcatctgtcaaggaaaggatttaaaaa -# ttaagaagcttaaaacgattttagagaaggcagaacttaaattatttgaaatgagaaatggggtagtgtacagaaaagcaaatgacgataggatacta -# ttctatgtgccagaagaaatggaagatcaggtactatataaataccacaacgaaataggacatataggaagagataaaatgatggacataatttcaaa -# aacttattggtttccaagtttaaaagaaaagtgcgttgcacatatgtttaaagtgtgtatgtgtttaaagtgtgtagcgttttcaccaaaatcaggta -# aaggagaaggttttttgcacagtattcccaaaggaaacaaaccattcgagttaatacacattgaccattatggtccagtagactcgtcaagagcaaaa -# aaacacatttttgtggtagttgacggattcacaaagtttgtaagactttattcaactaaatcaacaagcactagggaggttatagcggcattgaaaga -# ttactttagggcctatagtaggccaaaatgcataatttcagaccggggtagttgttttacatctaaagacttcgaagaattcatggaagaatataatg -# tgaagcacatcaagatagccacaggctcaccacaagccaatggtcaagttgaaaggattaacaggagccttggaccaatgatagcaaaattagttgat -# caaagtaaaggtgtatactgggacaatgttatagataaaatagaacatgctttaaataatacgttgcacagaagtataagacaacttccgagtaaaat -# gctgtttggagtagaacaaaaaggaaagattgtggatgaacttaaggaaaagctagaggacataaatgaaaataagaaattagatagtttaacaaaga -# taaggaaaaaagctgaggcccaccaaaagcaagttcaagattataatgaaaaattgtataacaaaagtcgagtaaaggctagaaattataaaaaagga -# gactatgtaatggtgaaaaattttgactcgactgttggaactgctaggaaactgattcccaaacataaaaggaccatatgtgattgcaaaagcgatgc -# gcaatga] -# protein sequence = [MPMGIKNAPAVFQRFVNKIFDDMIRESKVVVYMDDIMVASKDINEHLETLDEIFKRLTQNRLELRMDKCEFLKANIKY -# LGFLISENGIRADDKGIEAVKNFPVPTKVQAVQSFLGLSSYFRRFIKDFSTIAKPLYDLLKKDKPFQFGEEEMSCFLTLKEKLIESPVLALYNHKDDT -# ELHCDASALGFGAVLLQRKDDGKLHPVFYFSKRTTADEAKLHSFELETLAVIYALRRFRIYLQGKHVKLVTDCIALKLTLHKAELNPKISRWALEMEN -# YDLEICHRAGNKMQHVDALSRYNNILIVETNSFEENLVICQGKDLKIKKLKTILEKAELKLFEMRNGVVYRKANDDRILFYVPEEMEDQVLYKYHNEI -# GHIGRDKMMDIISKTYWFPSLKEKCVAHMFKVCMCLKCVAFSPKSGKGEGFLHSIPKGNKPFELIHIDHYGPVDSSRAKKHIFVVVDGFTKFVRLYST -# KSTSTREVIAALKDYFRAYSRPKCIISDRGSCFTSKDFEEFMEEYNVKHIKIATGSPQANGQVERINRSLGPMIAKLVDQSKGVYWDNVIDKIEHALN -# NTLHRSIRQLPSKMLFGVEQKGKIVDELKEKLEDINENKKLDSLTKIRKKAEAHQKQVQDYNEKLYNKSRVKARNYKKGDYVMVKNFDSTVGTARKLI -# PKHKRTICDCKSDAQ] -# end gene contig69.g222 -### -# start gene contig69.g223 -contig69 AUGUSTUS gene 7121 7887 1 + . ID=contig69.g223 -contig69 AUGUSTUS transcript 7121 7887 . + . ID=contig69.g223.t1;Parent=contig69.g223 -contig69 AUGUSTUS start_codon 7121 7123 . + 0 Parent=contig69.g223.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 7121 7273 . + 0 ID=contig69.g223.t1.cds;Parent=contig69.g223.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 7375 7887 . + 0 ID=contig69.g223.t1.cds;Parent=contig69.g223.t1 -# coding sequence = [atgcaggcgaagtcccacggattttctttatcagactaccacttaacatcagtttcggcgccagcacaagccaacgcat -# atcttaaaggttcaagtctgtctcctgtttctcgaagtcgtcgatcactttatgacttacctcttgaaaaaaaaatcgatgaactcatggaggattgc -# aagcatccagtacaaggtggcgatccgatgttgtcatcccatagtcacatgctatccgctccagagtcaccatcaacaaaggaattaaattgtgcgag -# ctttgaaccaaagattgtctcagatgttgctgatgtagccctttttagaggaaactcaaatttagtaggagatgactgttgcagtacttcatgctata -# ttcagcaccaggcaacacacgaggatcaccgaaatcattgccaccaccctagtatacgcggcattcacaatttatctgattcagttcaaaactctgat -# tttggtagactggaacattgtgaagatccgctgttgtcatcgtcccgaaggtctctaggtacagtagacgatgatccacatagtgctgttgatatgtc -# tgcggcgatgataaatgactcactatcctctttggtggatgacaatcacagtgagcccatgcttctcactcctgataccttagatattgacttgtaa] -# protein sequence = [MQAKSHGFSLSDYHLTSVSAPAQANAYLKGSSLSPVSRSRRSLYDLPLEKKIDELMEDCKHPVQGGDPMLSSHSHMLS -# APESPSTKELNCASFEPKIVSDVADVALFRGNSNLVGDDCCSTSCYIQHQATHEDHRNHCHHPSIRGIHNLSDSVQNSDFGRLEHCEDPLLSSSRRSL -# GTVDDDPHSAVDMSAAMINDSLSSLVDDNHSEPMLLTPDTLDIDL] -# end gene contig69.g223 -### -# start gene contig69.g224 -contig69 AUGUSTUS gene 14534 25353 1 - . ID=contig69.g224 -contig69 AUGUSTUS transcript 14534 25353 . - . ID=contig69.g224.t1;Parent=contig69.g224 -contig69 AUGUSTUS CDS 14534 14700 . - 2 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 14885 15025 . - 2 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 22869 22908 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 24478 24531 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 24631 25353 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 -contig69 AUGUSTUS start_codon 25351 25353 . - 0 Parent=contig69.g224.t1 -# coding sequence = [atggaaaacgttaacttctcatttcatgagcaaattataatgtctggacaacaaaaaagcgagttacaggaaaaaccaa -# aagtactcgtcgtttccccacaacaagtaatgattttatacatgcataagctgactccgtacgaacgtacggaaatactcagttacccacaaatatat -# tttattggtgccaatgcaaagaagcgccctggagtttacggcccaaataattctgactatgataatgagcaaggtgcttatattcatgtaccgcatga -# tcacgttgcatatcgttatgaaatgcttaagataattggaaaaggcagttttggacaggttattaaagcgtatgatcacaagactcacgagcatgttg -# ccttaaaaatagtacgcaacgaaaagcgttttcatcgtcaggcacaagaagaaattcgcatacttcatcatttacgtcggcatgataaatataatact -# atgaacattatacacatgtttgattactttacatttcgtaatcatacttgcattacgtttgagctgcttagcattaatctttacgaactgattaagaa -# aaatggattcaagggcttcagtttgcagttagtacgaaagtttgcacactcacttcttcaatgtttggatgcactgtataaaaatgacattattcatt -# gcgatatgaaaccagaaaatgtgttattaaaacaacagggtcgttctggtataaagtctatctcgaaagaaaacattcgactgccgcgagtaacatat -# gtccgatatcgaagtaaaaagtatactagatttgtggtaaagtatgcaacagttgcgtcaccccgtttaccatcaacgcattctgctggctccggcgg -# aataaatagtcaaagcactgaggacgtcgaggcatctaattattatccatcttcactttcatatttaccaaatatgaataaaaatgaaaataagcata -# ccggctatgcttttgattcgggttcgatggccatagatattgcacaagaatccttggttactctagctagctcgtatgcaatggagaagtcgatcgac -# attattgggaaaacgaatttgtctcttcattctaataagataaaagtgcagtcgaatgatttgtag] -# protein sequence = [MENVNFSFHEQIIMSGQQKSELQEKPKVLVVSPQQVMILYMHKLTPYERTEILSYPQIYFIGANAKKRPGVYGPNNSD -# YDNEQGAYIHVPHDHVAYRYEMLKIIGKGSFGQVIKAYDHKTHEHVALKIVRNEKRFHRQAQEEIRILHHLRRHDKYNTMNIIHMFDYFTFRNHTCIT -# FELLSINLYELIKKNGFKGFSLQLVRKFAHSLLQCLDALYKNDIIHCDMKPENVLLKQQGRSGIKSISKENIRLPRVTYVRYRSKKYTRFVVKYATVA -# SPRLPSTHSAGSGGINSQSTEDVEASNYYPSSLSYLPNMNKNENKHTGYAFDSGSMAIDIAQESLVTLASSYAMEKSIDIIGKTNLSLHSNKIKVQSN -# DL] -# end gene contig69.g224 -### -# start gene contig69.g225 -contig69 AUGUSTUS gene 30000 33463 1 + . ID=contig69.g225 -contig69 AUGUSTUS transcript 30000 33463 . + . ID=contig69.g225.t1;Parent=contig69.g225 -contig69 AUGUSTUS start_codon 30000 30002 . + 0 Parent=contig69.g225.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 30000 30334 . + 0 ID=contig69.g225.t1.cds;Parent=contig69.g225.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 31328 31448 . + 1 ID=contig69.g225.t1.cds;Parent=contig69.g225.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 33365 33463 . + 0 ID=contig69.g225.t1.cds;Parent=contig69.g225.t1 -# coding sequence = [atgattgatccaagttcgagtgaagaagaaggcgaagatgaccccattgctaatgtgtcatcgaaaggacgtcttacac -# atgcacccaagggcacaaacaccgtttccatattaggtggggtttcaggtcccggtgtaggatcaaatatggctatttctggttctaatggtgatttg -# gccgggaatcaaagacaatctaatataagttctattagtaaccgaaatgatgctggaaacgtggcaggagttggaggctcctctaacaaaaatgagca -# aatacatggtagccgagttgacggcggcaatcttgaggtgcccaacagctgtattcccagcggtgtttcgcaagaaactttaaatcaaagtattggat -# cgtcgagggccaactctttgccacggccattgtcaccatcaccatctttaaccagcgaaaagcctgacactggagatccacatgataagattccggag -# caggccaccaatcttcgtcacttcctaatttatttatcaactttagcccaaaagaagttcattggcagcaacatagtgtcgtag] -# protein sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG -# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHDKIPEQATNLRHFLIYLSTLAQKK -# FIGSNIVS] -# end gene contig69.g225 -### -# start gene contig69.g226 -contig69 AUGUSTUS gene 35284 35886 1 - . ID=contig69.g226 -contig69 AUGUSTUS transcript 35284 35886 . - . ID=contig69.g226.t1;Parent=contig69.g226 -contig69 AUGUSTUS CDS 35284 35460 . - 0 ID=contig69.g226.t1.cds;Parent=contig69.g226.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 35788 35886 . - 0 ID=contig69.g226.t1.cds;Parent=contig69.g226.t1 -contig69 AUGUSTUS start_codon 35884 35886 . - 0 Parent=contig69.g226.t1 -# coding sequence = [atgaaccagggttcgcctggaaaagtttcgtcgctgcggacccatctgcctgatgaatttctaatcagtgactgtttcg -# attggagagctcagatttggggtattttgggtaatctctttacatacgatccttcatctccctgtgtgtcggacagcccctgtagtgtggttaccttg -# gcaattaaaccattttttcttttcctggttggcggtgcagtatgccgaattgtggacgtcttcacaagatacacagactggtatgagcatactgctta -# a] -# protein sequence = [MNQGSPGKVSSLRTHLPDEFLISDCFDWRAQIWGILGNLFTYDPSSPCVSDSPCSVVTLAIKPFFLFLVGGAVCRIVD -# VFTRYTDWYEHTA] -# end gene contig69.g226 -### -# start gene contig69.g227 -contig69 AUGUSTUS gene 36877 44787 1 + . ID=contig69.g227 -contig69 AUGUSTUS transcript 36877 44787 . + . ID=contig69.g227.t1;Parent=contig69.g227 -contig69 AUGUSTUS start_codon 36877 36879 . + 0 Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 36877 36942 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 37429 37596 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 40859 41109 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42238 42349 . + 1 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42438 42544 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42702 42781 . + 1 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 44690 44787 . + 2 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 -# coding sequence = [atggggaacgcgagcagaagcaacatacgcaaccaaaacatccacaggggcctaggcattcttaccgacaaacaagaac -# gggaagaagaagaacgcaaacgacgaattcaactatatgtgtttatatcacgatgtatttcgtatccctttaatgctaaacagcctacggatatgact -# aagcggcaaacgaaaataactaagcagcaattagaaataataactcaacgatttcaactagactctgccgatgaacaagcagcggctataagacggga -# attagatggaagaatgcaacgtgtaggagaaatggagaaaaatcgcaaacttatgccaaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgagg -# aacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcgaaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaa -# cgatataatcacaggtgggatacgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgct -# ggcattggaagataaggaactgggaaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacggattaagatagctt -# gccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatggatatacagtagat -# tacatagaagccgccagtgttagttctgaatttcgaattaaatttgatcaaaatcggacaactatatcatatagctgccatagtaacgatcggaaaat -# tagtgggaaaataatatga] -# protein sequence = [MGNASRSNIRNQNIHRGLGILTDKQEREEEERKRRIQLYVFISRCISYPFNAKQPTDMTKRQTKITKQQLEIITQRFQ -# LDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHRWDTQGDFTTTHPLP -# VVKVKLYTENPGMLALEDKELGKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASVSSEFRIKFDQNR -# TTISYSCHSNDRKISGKII] -# end gene contig69.g227 -### -# -# ----- prediction on sequence number 70 (length = 55020, name = contig70) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 70 on both strands -# start gene contig70.g228 -contig70 AUGUSTUS gene 47 3510 1 + . ID=contig70.g228 -contig70 AUGUSTUS transcript 47 3510 . + . 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--- a/test-data/augustusOutput.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,1 +0,0 @@ -<html><body><p>The following generated by Hub Archive Creator:</p><ul><li><a href="./myHub.zip">./myHub.zip</a></li><li><a href="myHub/dbia.html">myHub/dbia.html</a></li><li><a href="myHub/hub.txt">myHub/hub.txt</a></li><li><a href="myHub/genomes.txt">myHub/genomes.txt</a></li><li><a href="myHub/dbia3/dataset_7.2bit">myHub/dbia3/dataset_7.2bit</a></li><li><a href="myHub/dbia3/groups.txt">myHub/dbia3/groups.txt</a></li><li><a href="myHub/dbia3/trackDb.txt">myHub/dbia3/trackDb.txt</a></li><li><a href="myHub/dbia3/description.html">myHub/dbia3/description.html</a></li><li><a href="myHub/dbia3/tracks/augustusDbia3.bb">myHub/dbia3/tracks/augustusDbia3.bb</a></li><ul></body></html> \ No newline at end of file
--- a/test-data/bam/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,20 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1193.dat -DEBUG:root:data_value: {u'index': u'/home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/_metadata_files/000/metadata_77.dat', u'order_index': u'10', u'name': u'HISAT2_Accepted_Hits', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Bam.Bam object at 0x17c0b50>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/904/dataset_1272_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track HISAT2_Accepted_Hits.bam (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/bam/bam.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,73 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai">HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam">HISAT2_Accepted_Hits.bam</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/bam/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/bam/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track HISAT2_Accepted_Hits.bam - longLabel HISAT2 Accepted Hits.bam - shortLabel HISAT2 Accepted - bigDataUrl tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam - type bam - visibility pack - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/bam/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/bam/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/bed_generic/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,32 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1199.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'TBLASTN_Alignment_to_proteins', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpmC5L13.sortedBed -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmphIusrY.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/905/dataset_1273_files/myHub/Dbia3/tracks/TBLASTN_Alignment_to_proteins.bb -DEBUG:root:typeOption: None -DEBUG:root:autoSql: None -DEBUG:root:tab option: False -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Bed.Bed object at 0x2cbbd10>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/905/dataset_1273_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track TBLASTN_Alignment_to_proteins.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/bed_generic/bed_generic.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/TBLASTN_Alignment_to_proteins.bb">TBLASTN_Alignment_to_proteins.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/bed_generic/inputs/TBLASTN_Alignment_to_proteins Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,40 +0,0 @@ -contig2 16199 18659 ci-PA 358 - 16199 18659 0 18 126,114,27,174,186,84,69,45,204,108,117,144,123,150,24,48,495,165, 0,126,240,270,444,630,726,801,846,1056,1167,1290,1440,1566,1722,1746,1794,2295, -contig2 18939 20598 ci-PA 604 - 18939 20598 0 7 510,210,432,84,63,45,174, 0,564,774,1278,1368,1434,1485, -contig2 18712 18877 ci-PA 964 - 18712 18877 0 1 165, 0, -contig1 31366 33826 ci-PA 358 - 31366 33826 0 18 126,114,27,174,186,84,69,45,204,108,117,144,123,150,24,48,495,165, 0,126,240,270,444,630,726,801,846,1056,1167,1290,1440,1566,1722,1746,1794,2295, -contig1 34106 35765 ci-PA 604 - 34106 35765 0 7 510,210,432,84,63,45,174, 0,564,774,1278,1368,1434,1485, -contig1 33879 34044 ci-PA 964 - 33879 34044 0 1 165, 0, -contig24 12402 12561 ci-PA 0 - 12402 12561 0 2 63,96, 0,63, -contig24 12402 12570 ci-PA 0 - 12402 12570 0 4 21,42,90,15, 0,21,63,153, -contig23 32405 32564 ci-PA 0 - 32405 32564 0 2 63,96, 0,63, -contig23 32405 32573 ci-PA 0 - 32405 32573 0 4 21,42,90,15, 0,21,63,153, -contig67 20513 20759 ci-PA 0 - 20513 20759 0 4 81,51,21,93, 0,81,132,153, -contig67 20531 20753 ci-PA 0 - 20531 20753 0 4 111,24,51,36, 0,111,135,186, -contig67 18177 18309 ci-PA 0 - 18177 18309 0 1 132, 0, -contig67 20471 20660 ci-PA 0 - 20471 20660 0 1 189, 0, -contig66 35516 35762 ci-PA 0 - 35516 35762 0 4 81,51,21,93, 0,81,132,153, -contig66 35534 35756 ci-PA 0 - 35534 35756 0 4 111,24,51,36, 0,111,135,186, -contig66 33180 33312 ci-PA 0 - 33180 33312 0 1 132, 0, -contig66 35474 35663 ci-PA 0 - 35474 35663 0 1 189, 0, -contig2 18711 20598 ci-PC 584 - 18711 20598 0 8 99,510,210,432,84,63,48,171, 0,228,792,1002,1506,1596,1662,1716, -contig2 18601 18889 ci-PC 0 - 18601 18889 0 5 63,36,51,54,45, 0,75,123,180,243, -contig1 33878 35765 ci-PC 584 - 33878 35765 0 8 99,510,210,432,84,63,48,171, 0,228,792,1002,1506,1596,1662,1716, -contig1 33768 34056 ci-PC 0 - 33768 34056 0 5 63,36,51,54,45, 0,75,123,180,243, -contig2 16199 18659 ci-PB 358 - 16199 18659 0 18 126,114,27,174,186,84,69,45,204,108,117,144,123,150,24,48,495,165, 0,126,240,270,444,630,726,801,846,1056,1167,1290,1440,1566,1722,1746,1794,2295, -contig2 18939 20268 ci-PB 560 - 18939 20268 0 4 510,210,432,51, 0,564,774,1278, -contig2 18712 18877 ci-PB 964 - 18712 18877 0 1 165, 0, -contig1 31366 33826 ci-PB 358 - 31366 33826 0 18 126,114,27,174,186,84,69,45,204,108,117,144,123,150,24,48,495,165, 0,126,240,270,444,630,726,801,846,1056,1167,1290,1440,1566,1722,1746,1794,2295, -contig1 34106 35435 ci-PB 560 - 34106 35435 0 4 510,210,432,51, 0,564,774,1278, -contig1 33879 34044 ci-PB 964 - 33879 34044 0 1 165, 0, -contig24 12402 12561 ci-PB 0 - 12402 12561 0 2 63,96, 0,63, -contig24 12402 12570 ci-PB 0 - 12402 12570 0 4 21,42,90,15, 0,21,63,153, -contig23 32405 32564 ci-PB 0 - 32405 32564 0 2 63,96, 0,63, -contig23 32405 32573 ci-PB 0 - 32405 32573 0 4 21,42,90,15, 0,21,63,153, -contig67 20513 20759 ci-PB 0 - 20513 20759 0 4 81,51,21,93, 0,81,132,153, -contig67 20531 20753 ci-PB 0 - 20531 20753 0 4 111,24,51,36, 0,111,135,186, -contig67 18177 18309 ci-PB 0 - 18177 18309 0 1 132, 0, -contig67 20471 20660 ci-PB 0 - 20471 20660 0 1 189, 0, -contig66 35516 35762 ci-PB 0 - 35516 35762 0 4 81,51,21,93, 0,81,132,153, -contig66 35534 35756 ci-PB 0 - 35534 35756 0 4 111,24,51,36, 0,111,135,186, -contig66 33180 33312 ci-PB 0 - 33180 33312 0 1 132, 0, -contig66 35474 35663 ci-PB 0 - 35474 35663 0 1 189, 0,
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--- a/test-data/bed_simple_repeats/bed_simple_repeats_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/Repeating_Elements_by_TrfBig.bb">Repeating_Elements_by_TrfBig.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/bed_simple_repeats/inputs/Repeating_Elements_by_TrfBig Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,602 +0,0 @@ -contig1 9130 9428 trf 163 1.8 164 86 2 438 36 12 13 37 1.82 AAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTCAACATACAACCTCCTAAGCTTGGAAATAACATTTCTTAATCAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTTATCAAAATCGGACAACTATACCATATAGCTGTCATAGGAAGGATTGGATAATTAGTGGTAAAATAATAT -contig1 15707 15757 trf 20 2.5 19 83 9 55 32 12 2 54 1.49 TATATCATTTATATCTCAG -contig1 16261 16302 trf 12 3.4 12 89 0 64 2 36 24 36 1.69 TCCGTCTGTCCG -contig1 23387 23483 trf 45 2.2 45 92 1 158 19 22 30 27 1.98 TCGGCGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCACT -contig1 23451 23520 trf 24 2.9 24 80 0 75 15 26 27 30 1.96 TTCGGCGACACTTCTTGAAGTCAG -contig1 24200 24233 trf 15 2.2 15 94 0 57 51 12 15 21 1.75 AAACAATGGAATGCT -contig1 29159 29628 trf 162 2.9 160 80 8 518 37 12 11 38 1.80 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--- a/test-data/bed_splice_junctions/inputs/Splice_Junctions_by_regtools.bed Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,40 +0,0 @@ -contig16 1808 11364 JUNC00000001 1000 - 1808 11364 255,0,0 2 89,80 0,9476 17 -contig16 11374 11605 JUNC00000003 1000 - 11374 11605 255,0,0 2 89,88 0,143 18 -contig16 11617 11783 JUNC00000004 1000 - 11617 11783 255,0,0 2 65,25 0,141 1 -contig16 11617 11844 JUNC00000005 1000 - 11617 11844 255,0,0 2 88,86 0,141 22 -contig16 11774 11977 JUNC00000006 1000 - 11774 11977 255,0,0 2 84,56 0,147 13 -contig16 11806 11956 JUNC00000007 1000 - 11806 11956 255,0,0 2 55,35 0,115 1 -contig16 11921 12673 JUNC00000008 1000 - 11921 12673 255,0,0 2 54,73 0,679 13 -contig16 11939 17275 JUNC00000009 1000 - 11939 17275 255,0,0 2 36,54 0,5282 1 -contig16 12723 17294 JUNC00000011 1000 - 12723 17294 255,0,0 2 88,73 0,4498 11 -contig16 12782 21003 JUNC00000012 1000 - 12782 21003 255,0,0 2 29,61 0,8160 1 -contig16 12796 21322 JUNC00000013 1000 - 12796 21322 255,0,0 2 15,75 0,8451 1 -contig16 17251 17490 JUNC00000014 1000 - 17251 17490 255,0,0 2 86,85 0,154 17 -contig16 17307 21307 JUNC00000015 1000 - 17307 21307 255,0,0 2 30,60 0,3940 1 -contig16 21007 21283 JUNC00000016 1000 - 21007 21283 255,0,0 2 54,36 0,240 1 -contig16 21250 22512 JUNC00000017 1000 - 21250 22512 255,0,0 2 86,58 0,1204 8 -contig16 21316 23083 JUNC00000018 1000 - 21316 23083 255,0,0 2 20,70 0,1697 1 -contig16 22206 25356 JUNC00000019 1000 + 22206 25356 255,0,0 2 39,46 0,3104 1 -contig16 27016 27178 JUNC00000021 1000 + 27016 27178 255,0,0 2 33,70 0,92 2 -contig16 27196 34369 JUNC00000022 1000 + 27196 34369 255,0,0 2 57,32 0,7141 1 -contig16 29103 29238 JUNC00000023 1000 + 29103 29238 255,0,0 2 61,18 0,117 1 -contig16 29358 34416 JUNC00000024 1000 + 29358 34416 255,0,0 2 11,79 0,4979 1 -contig16 34568 34768 JUNC00000025 1000 + 34568 34768 255,0,0 2 51,84 0,116 3 -contig16 34573 34763 JUNC00000026 1000 + 34573 34763 255,0,0 2 46,44 0,146 1 -contig16 34782 34954 JUNC00000027 1000 + 34782 34954 255,0,0 2 53,66 0,106 4 -contig16 35110 42519 JUNC00000028 1000 + 35110 42519 255,0,0 2 64,64 0,7345 4 -contig16 42508 43097 JUNC00000030 1000 + 42508 43097 255,0,0 2 82,65 0,524 6 -contig16 43273 43505 JUNC00000031 1000 + 43273 43505 255,0,0 2 81,85 0,147 12 -contig17 1242 2504 JUNC00000032 1000 - 1242 2504 255,0,0 2 86,58 0,1204 8 -contig17 1308 3075 JUNC00000033 1000 - 1308 3075 255,0,0 2 20,70 0,1697 1 -contig17 2198 5348 JUNC00000034 1000 + 2198 5348 255,0,0 2 39,46 0,3104 1 -contig17 7008 7170 JUNC00000036 1000 + 7008 7170 255,0,0 2 33,70 0,92 2 -contig17 7188 14361 JUNC00000037 1000 + 7188 14361 255,0,0 2 57,32 0,7141 1 -contig17 9095 9230 JUNC00000038 1000 + 9095 9230 255,0,0 2 61,18 0,117 1 -contig17 9350 14408 JUNC00000039 1000 + 9350 14408 255,0,0 2 11,79 0,4979 1 -contig17 14560 14760 JUNC00000040 1000 + 14560 14760 255,0,0 2 51,84 0,116 3 -contig17 14565 14755 JUNC00000041 1000 + 14565 14755 255,0,0 2 46,44 0,146 1 -contig17 14774 14946 JUNC00000042 1000 + 14774 14946 255,0,0 2 53,66 0,106 4 -contig17 15102 22511 JUNC00000043 1000 + 15102 22511 255,0,0 2 64,64 0,7345 4 -contig17 22500 23089 JUNC00000045 1000 + 22500 23089 255,0,0 2 82,65 0,524 6 -contig17 23265 23497 JUNC00000046 1000 + 23265 23497 255,0,0 2 81,85 0,147 12
--- a/test-data/bigwig/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,20 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1195.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'RNA-Seq_Alignment_Summary', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<BigWig.BigWig object at 0xfe0cd0>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/908/dataset_1276_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track RNA-Seq_Alignment_Summary.bigwig (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/bigwig/bigwig.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/RNA-Seq_Alignment_Summary.bigwig">RNA-Seq_Alignment_Summary.bigwig</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/bigwig/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/bigwig/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track RNA-Seq_Alignment_Summary.bigwig - longLabel RNA-Seq Alignment Summary - shortLabel RNA-Seq Alignme - bigDataUrl tracks/RNA-Seq_Alignment_Summary.bigwig - type bigWig - visibility full - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/bigwig/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/bigwig/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/changed_color/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,20 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1193.dat -DEBUG:root:data_value: {u'index': u'/home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/_metadata_files/000/metadata_77.dat', u'order_index': u'10', u'name': u'HISAT2_Accepted_Hits', u'track_color': u'#8064a2', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Bam.Bam object at 0x2282b50>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/918/dataset_1286_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track HISAT2_Accepted_Hits.bam (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/changed_color/changed_color_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,73 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai">HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam">HISAT2_Accepted_Hits.bam</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/changed_color/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/changed_color/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track HISAT2_Accepted_Hits.bam - longLabel HISAT2 Accepted Hits.bam - shortLabel HISAT2 Accepted - bigDataUrl tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam - type bam - visibility pack - thickDrawItem off - priority 10 - color 128,100,162 - group default_group -
--- a/test-data/changed_color/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/changed_color/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/common/dbia3.fa Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,66784 +0,0 @@ ->contig1 -AAAACTAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTGCCATACG -AACGATCGGAAAATTGGTAAGTAAATAATTAAAAATATTATATCTTTGGT -GTGTTTTTGGAAATAACATTTTTTAATATGTTTTGAATTTTGAATTAAAT -TCTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATACAAACGATCGG -AAAATTGGTGAATAAATAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTTATTTTTT -AGACAAATAACCTCCAACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTATAA -ATTTGATATTTTAATTTTATCAAAATCGGACGAATATAGCATATAGCTGT -TAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTCCGGTGTTTTTTACATATTATCT -TATACTATTGGGAAAATAGTTTATTATATTTTAAAGAATTTCCAATTAAA -CTCTAACATATAGCTTTCAAAGAAACGGTCAAAAAAGTAAAGAAATCATT -TTTTTTTAACATCACTGAAGCTAGAAACAATCCTTAAAAATGTAACATGG -TGTTAGTAGCATTGAAAATTGCTTATAACTGCAAAGGGAAAACAAACATC -GGCTTGCCGAATGTAATTTCCATTCTTGTTTGACTTGAGTTTATAACTTA -CAATTATGGTAAGGTGCCTGATTTTGGTTTTTGCCATACGGTATGTGGTA -GTTATCATTTTGCCGTGCTATAAGTGACATCACAGCCGATTCTTTTACTC -CATAATGGGCCAATGTGTTGAGGCGTTTCCATCCATTTATTGTTTTTGTA 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--- a/test-data/dbia3/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,60 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1184.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Augustus_Gene_Predictions', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gff3ToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp7sqcWp.sorted.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpp6ZdZ_.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1197.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'11', u'name': u'StringTie_Assembled_Transcripts', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gtfToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp66b4It.sortedBed.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpp6ZdZ_.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Gtf.Gtf object at 0x1ecae10>, <Gff3.Gff3 object at 0x1ecad10>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track StringTie_Assembled_Transcripts.bb (in group default_group) -DEBUG:root:We DON'T add in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track Augustus_Gene_Predictions.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/dbia3/gtf_gff_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,73 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb">Augustus_Gene_Predictions.bb</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb">StringTie_Assembled_Transcripts.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/dbia3/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/dbia3/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,22 +0,0 @@ - track StringTie_Assembled_Transcripts.bb - longLabel StringTie Assembled Transcripts - shortLabel StringTie Assem - bigDataUrl tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 11 - color 0,0,0 - group default_group - - track Augustus_Gene_Predictions.bb - longLabel Augustus Gene Predictions - shortLabel Augustus Gene P - bigDataUrl tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/dbia3/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/dbia3/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/default_color/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,20 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1193.dat -DEBUG:root:data_value: {u'index': u'/home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/_metadata_files/000/metadata_77.dat', u'order_index': u'10', u'name': u'HISAT2_Accepted_Hits', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Bam.Bam object at 0x2513b50>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/917/dataset_1285_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track HISAT2_Accepted_Hits.bam (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/default_color/default_color_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,73 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai">HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam">HISAT2_Accepted_Hits.bam</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/default_color/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/default_color/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track HISAT2_Accepted_Hits.bam - longLabel HISAT2 Accepted Hits.bam - shortLabel HISAT2 Accepted - bigDataUrl tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam - type bam - visibility pack - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/default_color/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/default_color/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/gff3/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,38 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1184.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Augustus_Gene_Predictions', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gff3ToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpIyQfQ1.sorted.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpALSFpV.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/909/dataset_1277_files/myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Gff3.Gff3 object at 0x1804cd0>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/909/dataset_1277_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track Augustus_Gene_Predictions.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/gff3/gff3_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb">Augustus_Gene_Predictions.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/gff3/inputs/Augustus_Gene_Predictions Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6937 +0,0 @@ -##gff-version 3 -# This output was generated with AUGUSTUS (version 3.1.0). -# AUGUSTUS is a gene prediction tool written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de), -# Oliver Keller, Stefanie König and Lizzy Gerischer. -# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008), -# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding -# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013 -# No extrinsic information on sequences given. -# Initialising the parameters using config directory /home/svc_galaxy/new/galaxy/tool_dependency/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... -# fly version. Using default transition matrix. -# Looks like /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/000/dataset_98.dat is in fasta format. -# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. -# -# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 1 on both strands -# start gene contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS gene 553 34688 0.03 - . ID=contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS transcript 553 34688 0.03 - . ID=contig1.g1.t1;Parent=contig1.g1 -contig1 AUGUSTUS CDS 553 578 0.41 - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 652 1047 0.25 - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 12541 12968 0.87 - 1 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 32202 33826 0.89 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 33880 34044 0.98 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 34107 34619 0.99 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS CDS 34674 34688 0.45 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 -contig1 AUGUSTUS start_codon 34686 34688 . - 0 Parent=contig1.g1.t1 -# coding sequence = [atggcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagc -# cctcatcaacatcaggaagcgtggcccaagtagaagcggacagcgcatcgtcacatttgtctgatcgctgttataacaacatagcaagtactaccaaa -# agtattgttggtgatgtgaaaacaagcagacgctgtgaagactttataagtagtggatcagcttcgactccattaaatgaatatgattgtgccaacgc -# tgatacgacggatattaaagatgaacctggagattttatagaaacaaattgtcattggcgaagttgttgtattgaatttaatacgcaagatgagcttg -# ttaaacatatcaataatgaccatatccaaaccaataagaaggcctttgtctgtcgatgggaaaattgtacccgtggtgaaaaacctttcaaagcgcag -# tatatgctagttgtgcatatgcgtcgtcataccggcgaaaagccacataaatgcacatttgaaggctgttttaaggcatattcacgcttggaaaacct -# aaaaacacatttacggtcacacacaggtgaaaaaccctatatgtgcgagtatccgggatgcagcaaggcgtttagtaatgcaagcgatcgtgcaaagc -# atcaaaatcgtactcacagtaatgagaaaccgtacatttgtaaagctcctggttgcacgaaacgttacaccgacccaagttctttgcgtaaacatgtt -# aaaacagttcatggtgctgagttttatgctaataaaaaacacaagggattgcccctaaatgatgcgaactctcgcctccaccgagacagtggccaagg -# tcggcataatcttcaagagcataatattgactctagcccttgcagcgaagaacttcaggtgggaaaacttataggcatgtctagtcccagtattaaat -# ctgaatctgatgaaagttcaccacatcatcagttgttaagtggagttcgagcttcagactgttttttaacatattcacaagatggtgccgccgaacat -# ataactttagatgacggctgggattgtgacgatgacgttgacgtggccgacttaccaattgtcttgcgtgctatggtaaatgttggcagcggaaattc -# gatggccccgaccattggagggggtgttgttgcgaggcagcgatttagaagtcgtttgcaaactaaaggaataaactctagtatggttatgcttggca -# acatccccgaaagcaatcgcaccattggaataagcgaacttaaccagcgtataacagaacttaagatggagcctggtaccgcttgtgatattacagtt -# ccattgaatacggggctggaaaggatttcagaagacttatcacaaaatcaatcaaatataacattaaataagcaaagcttctttaccgcttccggctc -# tctccaaggacattttcgtcgcgatagccagaactccactgcaagtacatattatggtagcatgcaaagtcgccgcagtagtcaatcatctcaggtgt -# cttctatatctacaatgcgtccaggcccatcgtacaacacaaccacagcttccctctatgatccaatttccccaggatgctctcgacgctctagccaa -# atgtctaatgtagtcaactcctacgcacttacatcaacatcaggattgactgcaattaacaaggacttaaatgcaaacagcagcccaaatgcttctat -# taataaaccgggtcttggtggtcagtactttggtttttacaataacagtcttcctccacctccatcgtctcatttaattgccaccaatttgaagcatc -# tgcaggacacagactctaggagttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatgga -# ccggctggagagcaggaaattgataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaa -# tgtttctcctttaagtggcccactgcaaaatttgcagtttcccattggaaaggctaggaacgtgaatataacatcgtctagtaacgagaatactttaa -# gaaagggaccttgccatgctacaatgaagactgaaatgacaatgaccagcgagcagcatccaaatgagagaataaatttggatgaagttgaagagctt -# atacttcccgatgagatgcttcagtatttaaatttggtgaaggacgatcaaaattatatggagaaagatgatgttgctataagtacgcatcatcaatc -# cgtaaattgcacaaaagaatcgccggctcagttatcttctccctcaaatgatattgtcgcccagtttaaccttccttcaataacgtcagcatctaact -# atggaaatcgctcaaaaggatataatggagaaaacggtgaagactctcaatctaagaactattttacgcatctgagcttcgattttatgaacaatgtc -# ttgtttgcgggtgccacaaataaaatacttaaacttaacgagaacctgcgtgtgctgtctgaggctgtcactggacccgtaaatgattcaccacaatg -# tcatgcaggaggttgcccggaggacatagagacatcgctggtcaacaattacaataaaattctcgtagtaagctacgctcacgatggcattcttatat -# cgtgtggtagcattcgacaagaggaacgacttctccacgaacaagttacccattctgttgtaattttgcacattttacaagatgatcttgatgaaaaa -# gtccaatgtcgtgtaaacgatttggataccatatcgcaagttaaattaaaaattttggacgcaatttttaaaaatactccgttttctatgagaccatc -# tgtgcacgaagttgacttagaatggaggcatggaagaggaggtcatctcacattacaagatgaagacctaactacaaaaacaataaatggatggaaac -# gcctcaacacattggcccattatggagtaaaagaatcggctgtgatgtcacttatagcacggcaaaatgataactaccacataccgtatggcaaaaac -# caaaatcaggcaccttaccataattttataagcaattttcaatgctactaa] -# protein sequence = [MAALSQKDFNDGNQRNRQRKSTVTEQPSSTSGSVAQVEADSASSHLSDRCYNNIASTTKSIVGDVKTSRRCEDFISSG -# SASTPLNEYDCANADTTDIKDEPGDFIETNCHWRSCCIEFNTQDELVKHINNDHIQTNKKAFVCRWENCTRGEKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCT -# FEGCFKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEYPGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKAPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGAEFYANKKHKGLPL -# NDANSRLHRDSGQGRHNLQEHNIDSSPCSEELQVGKLIGMSSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLP -# IVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINSSMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSN -# ITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRSSQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAI -# NKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLIATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQ -# SEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSSSNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNY -# MEKDDVAISTHHQSVNCTKESPAQLSSPSNDIVAQFNLPSITSASNYGNRSKGYNGENGEDSQSKNYFTHLSFDFMNNVLFAGATNKILKLNENLRVL -# SEAVTGPVNDSPQCHAGGCPEDIETSLVNNYNKILVVSYAHDGILISCGSIRQEERLLHEQVTHSVVILHILQDDLDEKVQCRVNDLDTISQVKLKIL -# DAIFKNTPFSMRPSVHEVDLEWRHGRGGHLTLQDEDLTTKTINGWKRLNTLAHYGVKESAVMSLIARQNDNYHIPYGKNQNQAPYHNFISNFQCY] -# end gene contig1.g1 -### -# -# ----- prediction on sequence number 2 (length = 45017, name = contig2) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 2 on both strands -# start gene contig2.g2 -contig2 AUGUSTUS gene 7855 39627 0.09 - . ID=contig2.g2 -contig2 AUGUSTUS transcript 7855 39627 0.09 - . 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ggactggggttgggatcaggagattttttgggcacccgaggaatgggctcactgggtgatctccatcatgcggctgtagcagcagcggctgcaggatc -# tctagccagcactgattttcacttcagcattgatggcaacaggcgattaagtagtcctcggccgcccggcggaagtattcgtgcaagcatcagcagaa -# aacgagcgctttcctcatcgccttattcggattcgtttgacattaactcaatgattcgattttcaccaaactccttagccacaattatgaatggctct -# cgaggaagcagcgcggcaagtggttcatatggtcatatttcagctagtgctattaatcctatatctcatgcacattcaacattggcaccacgtctaca -# gcatttgttacgtgcaagtgcaggtcttttaaatccgatgaatacacaacaagcagctgcggccgggttttctataagccacgctgcaagcgctgcag -# ccttaagcctcaacgacgttcatggtaatctaaatgatttaccaggccaaataacaccatcttcaacagcaagactagtagcggatgaacataaaatg -# gcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagccctcatcaacatcaggaagcgt -# ggcccaagtagaagcggacagcgcatcgtcacatttgtctgatcgctgttataacaacatagcaagtactaccaaaagtattgttggtgatgtgaaaa -# caagcagacgctgtgaagactttataagtagtggatcagcttcgactccattaaatgaatatgattgtgccaacgctgatacgacggatattaaagat -# gaacctggagattttatagaaacaaattgtcattggcgaagttgttgtattgaatttaatacgcaagatgagcttgttaaacatatcaataatgacca -# tatccaaaccaataagaaggcctttgtctgtcgatgggaaaattgtacccgtggtgaaaaacctttcaaagcgcagtatatgctagttgtgcatatgc -# gtcgtcataccggcgaaaagccacataaatgcacatttgaaggctgttttaaggcatattcacgcttggaaaacctaaaaacacatttacggtcacac -# acaggtgaaaaaccctatatgtgcgagtatccgggatgcagcaaggcgtttagtaatgcaagcgatcgtgcaaagcatcaaaatcgtactcacagtaa -# tgagaaaccgtacatttgtaaagctcctggttgcacgaaacgttacaccgacccaagttctttgcgtaaacatgttaaaacagttcatggtgctgagt -# tttatgctaataaaaaacacaagggattgcccctaaatgatgcgaactctcgcctccaccgagacagtggccaaggtcggcataatcttcaagagcat -# aatattgactctagcccttgcagcgaagaacttcaggtgggaaaacttataggcatgtctagtcccagtattaaatctgaatctgatgaaagttcacc -# acatcatcagttgttaagtggagttcgagcttcagactgttttttaacatattcacaagatggtgccgccgaacatataactttagatgacggctggg -# attgtgacgatgacgttgacgtggccgacttaccaattgtcttgcgtgctatggtaaatgttggcagcggaaattcgatggccccgaccattggaggg -# ggtgttgttgcgaggcagcgatttagaagtcgtttgcaaactaaaggaataaactctagtatggttatgcttggcaacatccccgaaagcaatcgcac -# cattggaataagcgaacttaaccagcgtataacagaacttaagatggagcctggtaccgcttgtgatattacagttccattgaatacggggctggaaa -# ggatttcagaagacttatcacaaaatcaatcaaatataacattaaataagcaaagcttctttaccgcttccggctctctccaaggacattttcgtcgc -# gatagccagaactccactgcaagtacatattatggtagcatgcaaagtcgccgcagtagtcaatcatctcaggtgtcttctatatctacaatgcgtcc -# aggcccatcgtacaacacaaccacagcttccctctatgatccaatttccccaggatgctctcgacgctctagccaaatgtctaatgtagtcaactcct -# acgcacttacatcaacatcaggattgactgcaattaacaaggacttaaatgcaaacagcagcccaaatgcttctattaataaaccgggtcttggtggt -# cagtactttggtttttacaataacagtcttcctccacctccatcgtctcatttaattgccaccaatttgaagcatctgcaggacacagactctaggag -# ttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatggaccggctggagagcaggaaattg -# ataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaatgtttctcctttaagtggccca -# 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SSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLPIVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINS -# SMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSNITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRS -# SQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAINKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLI -# ATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQSEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSS -# SNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNYMEKDDVAIRFRLQMSSSSMRVIDDPSSSAGVDLRILSVQR -# HGKNPE] -# end gene contig2.g2 -### -# start gene contig2.g3 -contig2 AUGUSTUS gene 41706 42608 0.66 - . ID=contig2.g3 -contig2 AUGUSTUS transcript 41706 42608 0.66 - . ID=contig2.g3.t1;Parent=contig2.g3 -contig2 AUGUSTUS CDS 41706 42171 0.93 - 1 ID=contig2.g3.t1.cds;Parent=contig2.g3.t1 -contig2 AUGUSTUS CDS 42268 42608 0.7 - 0 ID=contig2.g3.t1.cds;Parent=contig2.g3.t1 -contig2 AUGUSTUS start_codon 42606 42608 . - 0 Parent=contig2.g3.t1 -# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac -# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg -# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga -# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg -# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc -# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa -# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga -# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac -# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] -# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI -# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT -# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] -# end gene contig2.g3 -### -# -# ----- prediction on sequence number 3 (length = 40006, name = contig3) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 3 on both strands -# start gene contig3.g4 -contig3 AUGUSTUS gene 6691 7593 0.64 - . ID=contig3.g4 -contig3 AUGUSTUS transcript 6691 7593 0.64 - . ID=contig3.g4.t1;Parent=contig3.g4 -contig3 AUGUSTUS CDS 6691 7156 0.95 - 1 ID=contig3.g4.t1.cds;Parent=contig3.g4.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 7253 7593 0.67 - 0 ID=contig3.g4.t1.cds;Parent=contig3.g4.t1 -contig3 AUGUSTUS start_codon 7591 7593 . - 0 Parent=contig3.g4.t1 -# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac -# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg -# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga -# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg -# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc -# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa -# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga -# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac -# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] -# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI -# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT -# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] -# end gene contig3.g4 -### -# start gene contig3.g5 -contig3 AUGUSTUS gene 29077 31134 0.18 + . ID=contig3.g5 -contig3 AUGUSTUS transcript 29077 31134 0.18 + . ID=contig3.g5.t1;Parent=contig3.g5 -contig3 AUGUSTUS start_codon 29077 29079 . + 0 Parent=contig3.g5.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 29077 29111 0.4 + 0 ID=contig3.g5.t1.cds;Parent=contig3.g5.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 29169 29249 0.43 + 1 ID=contig3.g5.t1.cds;Parent=contig3.g5.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 30793 30942 0.65 + 1 ID=contig3.g5.t1.cds;Parent=contig3.g5.t1 -contig3 AUGUSTUS CDS 31113 31134 0.75 + 1 ID=contig3.g5.t1.cds;Parent=contig3.g5.t1 -# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt -# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat -# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaaggatcactag -# ccaagtcacctag] -# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV -# QDTTTNNRYPRITSQVT] -# end gene contig3.g5 -### -# -# ----- prediction on sequence number 4 (length = 55011, name = contig4) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 4 on both strands -# start gene contig4.g6 -contig4 AUGUSTUS gene 19075 51981 0.04 + . ID=contig4.g6 -contig4 AUGUSTUS transcript 19075 51981 0.04 + . 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ID=contig5.g7 -contig5 AUGUSTUS transcript 43345 45058 0.19 - . 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ID=contig6.g8.t1;Parent=contig6.g8 -contig6 AUGUSTUS CDS 13336 14656 0.17 - 1 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 14715 14939 0.91 - 1 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 -contig6 AUGUSTUS CDS 14997 15049 0.42 - 0 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 -contig6 AUGUSTUS start_codon 15047 15049 . - 0 Parent=contig6.g8.t1 -# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg -# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat -# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt -# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag -# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt -# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt -# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg -# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt -# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac -# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc -# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt -# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata -# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg -# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt -# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct -# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag -# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] -# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV -# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV -# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG -# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM -# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT -# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] -# end gene contig6.g8 -### -# -# ----- prediction on sequence number 7 (length = 50017, name = contig7) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 7 on both strands -# start gene contig7.g9 -contig7 AUGUSTUS gene 3332 5045 0.23 - . 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ID=contig7.g10 -contig7 AUGUSTUS transcript 38941 46896 0.08 + . ID=contig7.g10.t1;Parent=contig7.g10 -contig7 AUGUSTUS start_codon 38941 38943 . + 0 Parent=contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 38941 39182 0.69 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 39248 39354 0.65 + 1 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 39978 40351 0.32 + 2 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 40423 40623 0.3 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 -contig7 AUGUSTUS CDS 44971 46896 0.35 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 -# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac -# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat -# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga -# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag -# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata -# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat -# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta -# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct -# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt -# ttgcatttcccctcggtccataaatgtagccggaggcataaattgctgctgttttgacaagaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggg -# gggtggtgcccaaatcatcaacaaatcagtttcaaatacctttaaaaaccgtggaccgcctgccttacgatcattttctttttggcatggtaacgtgt -# cactctataacaataatgaacggtatattgatgggggatcctttggatttgaaaatgtttaattctacgggttggacaatagaagattcaaataacat -# accagataatgaaaaatatggtattctttatccaactattttaagacaaccaaggatttgctcttccgacttgagatcatcggattcaaaaaaaaaga -# gtcaaatcagccgtcaatcgtctgtagacgatttattagcaactgttggtatctcgcaaaatcaaaaaaattttgatcatggaattgttcgagaattt -# ccatttacgtcgagtcttcagcgaatgtccgttattactcgttgtctcagcgaccaagtatttaatgtttactgcaaaggttccccagagatgttaca -# gacactttgcacaccgcaaagcctacccgataactattccgaacagctatcgacatttgctaaaagaggataccgaattattgccattgcattcaaac -# ctcttgtgcaaaaaatgaactattcaaaaatacagcgcctatcccgcgaagaggttgaaagcaacttggaatttcttggttttgtggtactcgaaaat -# cgccttaagccagatactgctaaagtaatcaaagcgttaaactcagcaaagattcgaactattatgattactggcgataatattttaactgctatgag -# tgttgcacgtgattgtggtattgtaagtgcatcacaagctgttataacagtgcatgcagatccgcttggaaatagtggaaatatacaaagcaataata -# cagatagcattgttgataagaaaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaaca -# aagtgcaatagtaaccatattcccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcatt -# agttaacgaatcgagttccagttatgcagaaagtattctgccgacgagcgatagtttggccagtgtaaagaccacagacacatggacccataatgagc -# caacagatgtagatgctgagctaggaataaaccgcactcaggacgaaagctggcgccaacactacatattcgcaatggatggcggaacttggcaaatt -# ataaaagatcactttccagatgaaatggccattcttttaacacggggatcgatttacgcccgaatgtcacccgatcagaaacaggcactagttataga -# acttcaaaatttggactactgtgttgccatgtgcggtgatggtgccaacgattgcggtgcgctaaaggtggctcatgctggtatttcgctaagtgaga -# ccgaagcatccattgcgtcgccctttacttcacgtaatcccacgatttcggctgttttaaaagttattaaggaaggacgtgccgcattagtcacatcc -# tttggaatttttaaatatatggcagcatattcattggttcagtttatatctgttatggttctttattctatcgactcgaatttgacagacaagcagta -# tctttacgtagaccttggacttatatcaatttttgccttcttttttggtaaaactggatcatttgatggaaatttggtcgaacaagtgcctctcagtt -# cattgatatcttctactccattagcatcccttttacttcatctcactgttgtaactggatttcaagtaattggtaaggatattaatagtactagttta -# caaaataaaattcataaacccggttga] -# protein sequence = [MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN -# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ -# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG -# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM -# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ -# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR -# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV -# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY -# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM -# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIGKDINSTSLQNKIHKPG] -# end gene contig7.g10 -### -# -# ----- prediction on sequence number 8 (length = 35012, name = contig8) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 8 on both strands -# start gene contig8.g11 -contig8 AUGUSTUS gene 8930 26669 0.02 + . ID=contig8.g11 -contig8 AUGUSTUS transcript 8930 26669 0.02 + . 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[atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac -# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat -# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga -# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag -# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata -# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat -# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta -# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct -# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt -# ttgcatttcccctcggtccataaatgtagccggaggcataaattgctgctgttttgacaagaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggg 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ID=contig10.g13.t1;Parent=contig10.g13 -contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 Parent=contig10.g13.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 0.57 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 1132 1326 0.85 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 0.61 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 -contig10 AUGUSTUS CDS 14882 15075 0.44 + 2 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 -# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa -# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca -# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacaggaaaccattttacttcctcataattcttttattacaaacatttttctaac -# cacgtgcacctatatcacaacatatgtggaaaatggaagctcgaatgtagtaaaagaaaaaatggttatatcaaacaccattacgcaagatcgaaagt -# atttgcatgcaagtaatcctatgataatagacatcactttttcaaggccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcatgtcacc -# acatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggtcaacaa -# tcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgccatacatt -# tggaaatggccaccgatcttagcatagacacattcctggcatgtcttcggcgtttcatgtcccttcgaggaaagtgctcacagatcttcagcgacaat -# ggaacgaatttagttgatcccaaacacgctttagatgagatgcaccgcaggagcacaaagcaatgtaacacaatcgttggccaatga] -# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQETI -# LLPHNSFITNIFLTTCTYITTYVENGSSNVVKEKMVISNTITQDRKYLHASNPMIIDITFSRPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVKTT -# ALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNAIHLEMATDLSIDTFLACLRRFMSLRGKCSQIFSDNGTNLVDPKHALDEMHRRST -# KQCNTIVGQ] -# end gene contig10.g13 -### -# start gene contig10.g14 -contig10 AUGUSTUS gene 21687 22382 0.44 - . ID=contig10.g14 -contig10 AUGUSTUS transcript 21687 22382 0.44 - . 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ID=contig11.g15.t1;Parent=contig11.g15 -contig11 AUGUSTUS CDS 682 1377 0.49 - 0 ID=contig11.g15.t1.cds;Parent=contig11.g15.t1 -contig11 AUGUSTUS start_codon 1375 1377 . - 0 Parent=contig11.g15.t1 -# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag -# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa -# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag -# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact -# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat -# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa -# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc -# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] -# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH -# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM -# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] -# end gene contig11.g15 -### -# -# ----- prediction on sequence number 12 (length = 56019, name = contig12) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 12 on both strands -# start gene contig12.g16 -contig12 AUGUSTUS gene 11355 43960 0.01 - . ID=contig12.g16 -contig12 AUGUSTUS transcript 11355 43960 0.01 - . ID=contig12.g16.t1;Parent=contig12.g16 -contig12 AUGUSTUS CDS 11355 11375 0.49 - 0 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 11608 11710 0.88 - 1 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 11851 11866 0.34 - 2 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 15468 16080 0.24 - 0 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 20121 20293 0.61 - 2 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 20564 20662 0.67 - 2 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 28341 28409 0.33 - 2 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 33475 33622 0.51 - 0 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 38609 42222 0.43 - 2 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 43900 43960 0.66 - 0 ID=contig12.g16.t1.cds;Parent=contig12.g16.t1 -contig12 AUGUSTUS start_codon 43958 43960 . - 0 Parent=contig12.g16.t1 -# coding sequence = [atgcctaaaacaagccagaactttcgaatcaaggttaaaaagcgatattattcagaaagagtccccaaccttttaaaaa -# aatcaaatggaggacaactaccaacaataccaatgtaccctggtgatattccatcttattctccgccgtctcgagcattctttacaccgccacttccg -# ccggagtatcaaaacccttttgctgacaagcctaccttgcgtggaaccaataatgagggtctaattgcaattaataggcgtccgatcccaccccctag -# tttgatgcctagtcaagatcggatcccaattcgaccaccagatctgggtggcaatagtaacgatgctattgtcaatccattagcggatttaagttacg -# ctaattctggttttgatgaaaagcactctcttgattctagtggagctgtgcctgatgtgtccacaacagatcgtaaaaaagctctcaatacaccggca -# cgtgccagcggcgaagacgtattaaacgaaaaggcaaacagggtaaagggacacggctctcttgaaccagatgccaatgatcctagtaagagacaaga -# agttttacccaatataagacgtattctgggatcaaatggaaagaacagtgatataccagctgtgttgttaaagcaagttactcagcgaccccaaataa -# acatgcgccaaccgccgtcttcgccagttgtactgattgaaaagcctttaacgaacgaggaaaaaacagatgctgatggatcctccatggttagtcct -# aatattaatcagagcaagtaccaccctggtcagttggactactacgacaattctaatcagactataggaaccacaccatcagcagctgctgctattgg -# 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gaactcatgcacaacgtccagtgcttctgatagtatgctagtagcagatcaaggttttcttcgatttcggtccatagaggatcaaaatagtgcacaaa -# atggaaacaatttagatggcgaaagggctgctatatcttcccttcgtcttaaaagttgcagtgcgactaaccgtcgcatgagcatcgctcaagagctg -# ttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggttataactggtgacgaatcatgggtatatggttatgatatcaaaaccaaagcccaatc -# gtcacaatggaagagcccagccttcgagaccaagacttggcaaccgtctaatcctgaggagctcccggtgaaaagggacaggccaaaaaaactcgact -# ggtacgtcactcatatcgtctttactttaaaaaccaaaattattatagagtatcgaatttggatggacgcattgaaaatgcggatcacaggaccggct -# ttatctgttggtgttattgctctaacagcccatatattacgaatcgtgtcaccgaagtttggacagttggtatcggaagaagccaataggtatggcta -# cttgaggcacattcactcccgcataataactaatgcagaagaaatcgccttttacggtggtcacaaagtggagatgcagcagctacggcaggcataca -# accgtctagtaaatcaaatgactacaatttttaaccaaaaactttggtttattatgcttgaacaattttttatgaaatatgtttggtccggtactgga -# atgattatggtgtcacttcctattctgacaggcagtgacgtaggatctgcatcaaagcccgactcggccattacggagtcgcgtgttagcgaacgtac -# 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ID=contig12.g17 -contig12 AUGUSTUS transcript 51846 54525 0.42 + . ID=contig12.g17.t1;Parent=contig12.g17 -contig12 AUGUSTUS start_codon 51846 51848 . + 0 Parent=contig12.g17.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 51846 51877 0.84 + 0 ID=contig12.g17.t1.cds;Parent=contig12.g17.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 51939 52061 0.82 + 1 ID=contig12.g17.t1.cds;Parent=contig12.g17.t1 -contig12 AUGUSTUS CDS 54300 54525 0.42 + 1 ID=contig12.g17.t1.cds;Parent=contig12.g17.t1 -# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa -# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac -# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact -# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgtgagcatttacc -# aactgtaa] -# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ -# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSVSIYQL] -# end gene contig12.g17 -### -# -# ----- prediction on sequence number 13 (length = 45015, name = contig13) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 13 on both strands -# start gene contig13.g18 -contig13 AUGUSTUS gene 5833 21375 0.37 + . ID=contig13.g18 -contig13 AUGUSTUS transcript 5833 21375 0.37 + . 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ID=contig14.g19.t1;Parent=contig14.g19 -contig14 AUGUSTUS start_codon 27307 27309 . + 0 Parent=contig14.g19.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 27307 27336 0.34 + 0 ID=contig14.g19.t1.cds;Parent=contig14.g19.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 33374 33489 0.69 + 0 ID=contig14.g19.t1.cds;Parent=contig14.g19.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 34228 34577 0.82 + 1 ID=contig14.g19.t1.cds;Parent=contig14.g19.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 35202 35415 0.67 + 2 ID=contig14.g19.t1.cds;Parent=contig14.g19.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 35658 36522 0.9 + 1 ID=contig14.g19.t1.cds;Parent=contig14.g19.t1 -# coding sequence = [atgtccgtctgtccgtatgctggaggattgctgtacgatacaccgacatcaacttcaagcagtcgggattttttgggtt -# tccatgtgcctcccagtttggatacggtcttattgctggacttgactctgttggaggaaatggaatggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaa -# attagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggatggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcaga -# tgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacagctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccaga -# agatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaaatcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgag -# tttttcgctttctcttggaatccagttttggctgcccaagacaataatccaaatagtcgttttgagtcgttagcaaccgagtgcaccctcaaaataaa -# cgacaatattgtcctcgttggagccagagacgttggaggaacactctacagagcagcgatcgagcccatactttcagaacgaaacgtcgatgtcaacg -# tcgcaacttcaggaacttcaattctccaactctatcacgagaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcga -# cacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaattcgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactct -# tcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgtatactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcga -# gaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccagaagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaa -# tcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctgggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacat -# tccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctgaaaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagaga -# agcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaagagaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaag -# gacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttgcaccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgagga -# cgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacacaaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaag -# aaaacaacaagagaaaaccgcaataa] -# protein sequence = [MSVCPYAGGLLYDTPTSTSSSRDFLGFHVPPSLDTVLLLDLTLLEEMEWRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKI -# VKPDPLPKGASAADEKQHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPVLAAQDNNPNS -# RFESLATECTLKINDNIVLVGARDVGGTLYRAAIEPILSERNVDVNVATSGTSILQLYHERFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSD -# NGGEFDCAEVRETLQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRI -# KHLRIVGSTCYVHIPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDE -# DKEEEDADLHKSEDEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] -# end gene contig14.g19 -### -# start gene contig14.g20 -contig14 AUGUSTUS gene 36874 37842 0.96 + . ID=contig14.g20 -contig14 AUGUSTUS transcript 36874 37842 0.96 + . ID=contig14.g20.t1;Parent=contig14.g20 -contig14 AUGUSTUS start_codon 36874 36876 . + 0 Parent=contig14.g20.t1 -contig14 AUGUSTUS CDS 36874 37842 0.96 + 0 ID=contig14.g20.t1.cds;Parent=contig14.g20.t1 -# coding sequence = [atggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtttgacgtcttgacagctt -# ttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgcagattgaagaagagtctc -# tacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgaggcagatccatgtctcta -# catcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaagatttggaagaatttttgg -# acgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatggactaaaaattagtcaa -# caaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttggaaattacgacagcaag -# gaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccagacttggctttcagcatcg -# gatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaacaatcaacgttgggata -# gtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatctacatcagggatcatcat -# catgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgtagcagccaatgaagctg -# caaaataa] -# protein sequence = [METIRSVLSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLR -# KHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVVYVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAV -# STPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQAIGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFG -# GCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQRQAMVAISTTEAEIVAANEAAK] -# end gene contig14.g20 -### -# -# ----- prediction on sequence number 15 (length = 50014, name = contig15) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 15 on both strands -# start gene contig15.g21 -contig15 AUGUSTUS gene 2942 6515 0.26 + . 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ID=contig15.g23 -contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42088 0.05 + . ID=contig15.g23.t1;Parent=contig15.g23 -contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 0.86 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 0.44 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 0.74 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 1 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 26035 26127 0.97 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 0.78 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 0.68 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 0.94 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 36538 36768 0.63 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 37576 38003 0.64 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 38052 38166 0.94 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 41530 41966 0.76 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -contig15 AUGUSTUS CDS 42029 42088 0.72 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 -# coding sequence = [atggatcccgcttcaaatattgtggaaaatgtagttgaaccaaaaaatgacagtgctggtgtaattcaaatggctcctg -# aaaatattgaccactctatcgaaaatcagagcactacatcaacagatgataaagacgatgccgatttaataattgatgatagcgaatctgatgaatat -# agttcagatagcaaaaaaactgcagatgtagcagaaactgaggatttaattaaggttacagaaactgctaagacctcattgttatcagatgcggatgg -# cacagttgaaataaatgaaaacacagaaatgaaatctgaggaccccatcatagaagccttatctattaaatcagaccaggaaacttcggtttcagcca -# atacaaaagtcgataaaagctccaccgtttcggaggagaatccaaaggtggatgtaatagatgcgaataccataagtgtaatcttacccaatgcttca -# aaagcaaatgttccacaagatacatcaacaattataattgaagacgacgaagttaaaagaactgaagaagtggaagccgatgaacctaaaacatgtga -# actggctgccgaaaactctaaaaatgaagttgcgtcctctattgaaaacgttaatgaatttaaagaagttggtaaaaatgctgttgaagacaaagact -# taaatgtatttaatgagacacagcaaggcaaggaggcggaacaagtcactaaccaatctgaccttttaaatgacgacactacagaaagggatctaaga -# ttgtctagtcaggctgacttcaataaccaaattctggacattatatcggacattgatataaatataaaggcccaggaaaaaataactcaacttaaaga -# gcaagaactgaagcttatacagaaacagaacgaattggcaaatcaaatacatcagcaacaaatcttagctcagcagctgaatgccaaaaatacaaata -# aacaaagtcaatgccaacaacaaaatgcgcgtgatgtactaacactacatcaaaataatttcgtcgttaaatgccgccagtacacacgggtactgaat -# gctctcgaagacaaggcaagtcagcaagaggggtcaaacaatacgaagcttacggtgcctataggtaaagaatccacaaatatatcaaagaacattga -# tttgcgcaaaatatttactcctgcgaccgatgctactgaaatattgcctaaaaataggaatgagagctccagtgacgttgtagatccatataaagaga -# attccgaaacgaattccacattggaacttagaaagttggaaaaaatgccgctaaagcttataatgaacccaaacggaagagtccgtgattataattcg -# ctcaaagatttaattaacgttgaaactggcctgttatcgcctgacaattgcgctgaactaataactgcacttcaacttcatcaaggacgaggtgccga -# actgtttgcaaaacgccgcagaaaggctgataattggatagtcgatgaaaccaatttagagactcaaaatcctccgtctggtattccagattaccagc -# agtatcaacaaaaaccggctacatcaccaaacattttgccagcatattctgatgcaggaaaacatcgcgttcagttgaatattcatcaaaatcagtta -# attgaaaaatattcaaagccaggattgcaggtggttcagtctccttgggatgcagctttacaaactggttcggccagtacggcgtttttggaagataa -# ggatagcaaaagtcaatgtctttcccctgctgccgtatcaccaacaccgtacttccaaagtggtaggagggatataacggatactgtggaacctacgc -# actatagtcctctgaaagattataaaaatgccaatgcttctacaccgcaatcaatcaatgtaccctcgaatccccaaagggatcttgcatatacacca -# gccgttgctcagggctggggaggtcgcaatgtgaaactacctaaaggcttatacgtaccgaaagagatatctctttctagctatgcagcacctccaca -# gcagtacgccggtcacgatgcacattttgagtcgccgaacaatggctctgcttcgcgccctttatcaaggaccaacttttctacataccaaagttctg -# ttggaaataatggaactggccagttcccaatatcaaaggcgttctcacccgaattaggcactgtaccgccaaggcagcagctgtacgcgccgtctagc -# tatcaaagaatacccgcatttgaaaacgtcgcgcctcaggttaactttaaccctgcgcctttgacctttgataaaatggcaagatacgaacaacccaa -# cagaaataattcgactagtgcaagctcacagtatcttaatgtgaaacaaaattcgcgagtgcgtaatgtttcgccaacaccatttggaattatgtgga -# ccattgcctggcaggccaacttctccactatcgaacaaagttccaatctttaa] -# protein sequence = [MDPASNIVENVVEPKNDSAGVIQMAPENIDHSIENQSTTSTDDKDDADLIIDDSESDEYSSDSKKTADVAETEDLIKV -# TETAKTSLLSDADGTVEINENTEMKSEDPIIEALSIKSDQETSVSANTKVDKSSTVSEENPKVDVIDANTISVILPNASKANVPQDTSTIIIEDDEVK -# RTEEVEADEPKTCELAAENSKNEVASSIENVNEFKEVGKNAVEDKDLNVFNETQQGKEAEQVTNQSDLLNDDTTERDLRLSSQADFNNQILDIISDID -# INIKAQEKITQLKEQELKLIQKQNELANQIHQQQILAQQLNAKNTNKQSQCQQQNARDVLTLHQNNFVVKCRQYTRVLNALEDKASQQEGSNNTKLTV -# PIGKESTNISKNIDLRKIFTPATDATEILPKNRNESSSDVVDPYKENSETNSTLELRKLEKMPLKLIMNPNGRVRDYNSLKDLINVETGLLSPDNCAE -# LITALQLHQGRGAELFAKRRRKADNWIVDETNLETQNPPSGIPDYQQYQQKPATSPNILPAYSDAGKHRVQLNIHQNQLIEKYSKPGLQVVQSPWDAA -# LQTGSASTAFLEDKDSKSQCLSPAAVSPTPYFQSGRRDITDTVEPTHYSPLKDYKNANASTPQSINVPSNPQRDLAYTPAVAQGWGGRNVKLPKGLYV -# PKEISLSSYAAPPQQYAGHDAHFESPNNGSASRPLSRTNFSTYQSSVGNNGTGQFPISKAFSPELGTVPPRQQLYAPSSYQRIPAFENVAPQVNFNPA -# PLTFDKMARYEQPNRNNSTSASSQYLNVKQNSRVRNVSPTPFGIMWTIAWQANFSTIEQSSNL] -# end gene contig15.g23 -### -# start gene contig15.g24 -contig15 AUGUSTUS gene 44931 45338 0.66 - . ID=contig15.g24 -contig15 AUGUSTUS transcript 44931 45338 0.66 - . ID=contig15.g24.t1;Parent=contig15.g24 -contig15 AUGUSTUS CDS 44931 45338 0.66 - 0 ID=contig15.g24.t1.cds;Parent=contig15.g24.t1 -contig15 AUGUSTUS start_codon 45336 45338 . - 0 Parent=contig15.g24.t1 -# coding sequence = [atgagcatagctaaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcataactggtgacgact -# catgggtatatggttatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatggaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcaccccaagttcgatca -# aatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatctggagttcttaccatatggtcgtacggttaataaacagtattatct -# ggaagttatgcgccgtttgcaagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttagatcacgataatgcccctgatc -# actcatctttgcttatgagcgattttttggcctaa] -# protein sequence = [MSIAKELLDDVNDDPDLLKRVITGDDSWVYGYDIETKAQSSQWKSPGEPRPKKAPQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHLE -# FLPYGRTVNKQYYLEVMRRLQEAIRKKRPELWKNNSWLLDHDNAPDHSSLLMSDFLA] -# end gene contig15.g24 -### -# -# ----- prediction on sequence number 16 (length = 45017, name = contig16) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 16 on both strands -# start gene contig16.g25 -contig16 AUGUSTUS gene 23971 43623 0.15 + . ID=contig16.g25 -contig16 AUGUSTUS transcript 23971 43623 0.15 + . ID=contig16.g25.t1;Parent=contig16.g25 -contig16 AUGUSTUS start_codon 23971 23973 . + 0 Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 23971 24235 0.79 + 0 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 24335 25126 0.53 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 26889 27049 0.75 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 27109 27253 0.91 + 0 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 30805 30886 0.81 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 38071 38214 0.61 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 42456 42590 0.98 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 43033 43110 1 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 43167 43354 1 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -contig16 AUGUSTUS CDS 43421 43623 0.94 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 -# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag -# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt -# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg -# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc -# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat -# ggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaaaaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggc -# aagaaagaaaagtgtacaaggttctgactcaaatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatc -# caccagcactcaatgatggattgaataaggctgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctata -# tatctgcaaaacgctcacttagaatggataagatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaaga -# agagcatactcctcatgaaatcaataggggaaacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaa -# aagctataaggacttctagcgggttgctttcttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaat -# cttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaatcaaaatcactatctaatgttggacaatttgtaagtaaaaaaatttggggaagtcgtttcaaaagcca -# aagtaaacgcaatttttcgaaaggactaaaggatttgccttctgtaaaatggcatccttcggacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggt -# ttcaaattgttgatactttattgataaggctgtcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattgga -# aatattgatgcggatatccgaaccggggacctctcgcatcagaggcagatgccataccagttgagctatcgcgtcatgttacgcgcggtcgtgattgt -# agacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgtcaccc -# ttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttgatgtt -# atctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaattagacga -# tccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgcctggatcatattaatcatttaaatggaaatcaagaaaaaa -# agaatgttctaaaaaaatcttctaaaagtagtttaattaatacaaagagatgtcaagaagaaaactttgaaattttcaccgctagtctgaaaatacct -# gtgccggaaaaagcgcacatacatagtaaagagtctatagaatgtagagatgataaaacggcacgccgaagaatttgtcagcctcgaataccaacaga -# cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca -# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] -# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS -# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS -# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK -# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ -# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY -# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM -# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK -# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] -# end gene contig16.g25 -### -# -# ----- prediction on sequence number 17 (length = 40013, name = contig17) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 17 on both strands -# start gene contig17.g26 -contig17 AUGUSTUS gene 3963 23615 0.14 + . ID=contig17.g26 -contig17 AUGUSTUS transcript 3963 23615 0.14 + . ID=contig17.g26.t1;Parent=contig17.g26 -contig17 AUGUSTUS start_codon 3963 3965 . + 0 Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 3963 4227 0.84 + 0 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 4327 5118 0.47 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 6881 7041 0.78 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 7101 7245 0.95 + 0 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 10797 10878 0.81 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 18063 18206 0.61 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 22448 22582 1 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 23025 23102 1 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 23159 23346 0.98 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -contig17 AUGUSTUS CDS 23413 23615 0.74 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 -# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag -# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt -# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg -# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc -# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat -# ggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaaaaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggc -# aagaaagaaaagtgtacaaggttctgactcaaatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatc -# caccagcactcaatgatggattgaataaggctgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctata -# tatctgcaaaacgctcacttagaatggataagatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaaga -# agagcatactcctcatgaaatcaataggggaaacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaa -# aagctataaggacttctagcgggttgctttcttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaat -# cttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaatcaaaatcactatctaatgttggacaatttgtaagtaaaaaaatttggggaagtcgtttcaaaagcca -# aagtaaacgcaatttttcgaaaggactaaaggatttgccttctgtaaaatggcatccttcggacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggt -# ttcaaattgttgatactttattgataaggctgtcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattgga -# aatattgatgcggatatccgaaccggggacctctcgcatcagaggcagatgccataccagttgagctatcgcgtcatgttacgcgcggtcgtgattgt -# agacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgtcaccc -# ttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttgatgtt -# atctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaattagacga -# tccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgcctggatcatattaatcatttaaatggaaatcaagaaaaaa -# agaatgttctaaaaaaatcttctaaaagtagtttaattaatacaaagagatgtcaagaagaaaactttgaaattttcaccgctagtctgaaaatacct -# gtgccggaaaaagcgcacatacatagtaaagagtctatagaatgtagagatgataaaacggcacgccgaagaatttgtcagcctcgaataccaacaga -# cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca -# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] -# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS -# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS -# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK -# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ -# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY -# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM -# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK -# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] -# end gene contig17.g26 -### -# -# ----- prediction on sequence number 18 (length = 40012, name = contig18) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 18 on both strands -# (none) -# -# ----- prediction on sequence number 19 (length = 45013, name = contig19) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 19 on both strands -# start gene contig19.g27 -contig19 AUGUSTUS gene 29061 34294 0.14 + . ID=contig19.g27 -contig19 AUGUSTUS transcript 29061 34294 0.14 + . ID=contig19.g27.t1;Parent=contig19.g27 -contig19 AUGUSTUS start_codon 29061 29063 . + 0 Parent=contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 29061 29126 0.74 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 29277 29928 0.98 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 31020 31348 0.59 + 2 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 33803 34126 0.31 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 -contig19 AUGUSTUS CDS 34184 34294 0.34 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 -# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga -# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga -# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa -# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac -# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg -# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa -# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca -# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt -# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg -# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa -# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca -# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga -# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag -# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac -# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa -# tttcttactttcttctagctttgatgattag] -# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS -# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP -# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSAEQEKRGRKRSTSTKFDTSLIRKSKKEPFLSSKDL -# KNYMNASVTSRTIRNRLIEHGLKAHSARRVPFMSKRHTERRLCFAKNHQTRQNWKNVLWSDETKIDLFGSDGRPHIGQTNPALLQLISENQDAFLNML -# NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ -# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] -# end gene contig19.g27 -### -# -# ----- prediction on sequence number 20 (length = 50014, name = contig20) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 20 on both strands -# start gene contig20.g28 -contig20 AUGUSTUS gene 24058 29291 0.09 + . ID=contig20.g28 -contig20 AUGUSTUS transcript 24058 29291 0.09 + . ID=contig20.g28.t1;Parent=contig20.g28 -contig20 AUGUSTUS start_codon 24058 24060 . + 0 Parent=contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 24058 24123 0.79 + 0 ID=contig20.g28.t1.cds;Parent=contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 24274 24925 1 + 0 ID=contig20.g28.t1.cds;Parent=contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 26017 26345 0.53 + 2 ID=contig20.g28.t1.cds;Parent=contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 28800 29123 0.36 + 0 ID=contig20.g28.t1.cds;Parent=contig20.g28.t1 -contig20 AUGUSTUS CDS 29181 29291 0.28 + 0 ID=contig20.g28.t1.cds;Parent=contig20.g28.t1 -# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga -# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga -# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa -# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac -# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg -# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa -# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca -# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt -# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg -# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa -# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca -# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga -# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag -# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac -# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa -# tttcttactttcttctagctttgatgattag] -# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS -# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP -# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSAEQEKRGRKRSTSTKFDTSLIRKSKKEPFLSSKDL -# KNYMNASVTSRTIRNRLIEHGLKAHSARRVPFMSKRHTERRLCFAKNHQTRQNWKNVLWSDETKIDLFGSDGRPHIGQTNPALLQLISENQDAFLNML -# NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ -# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] -# end gene contig20.g28 -### -# -# ----- prediction on sequence number 21 (length = 50011, name = contig21) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 21 on both strands -# start gene contig21.g29 -contig21 AUGUSTUS gene 14668 45952 0.09 - . ID=contig21.g29 -contig21 AUGUSTUS transcript 14668 45952 0.09 - . 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ID=contig22.g30 -contig22 AUGUSTUS transcript 4664 35948 0.14 - . 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ID=contig22.g31 -contig22 AUGUSTUS transcript 36900 58827 0.07 + . ID=contig22.g31.t1;Parent=contig22.g31 -contig22 AUGUSTUS start_codon 36900 36902 . + 0 Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 36900 37419 0.7 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 48394 48703 0.99 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 48769 48980 1 + 1 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 49745 49896 0.78 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 50047 51108 0.88 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 51770 52268 0.6 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 52350 52879 0.45 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 53483 53714 0.96 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 53776 53942 0.77 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 55547 55816 0.78 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 58256 58619 0.78 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -contig22 AUGUSTUS CDS 58685 58827 1 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 -# coding sequence = [atgacctacgacaacagcaaaatgctgctggccagcttcgctgacgacgtctgctttctcagctcctcgaacagtgaga -# ccgagtcttcacaaacgctgcaaacctacctcaacgaattcgagaaatgggccacggcgaacaatatcaaaatcaacgaaagcaaatgcgtaaacgtt -# tgctttacgttacgccgaaaaacaactccggtggtccacattaataatgtggacacagagcaagcgactaaggcgaaatacctaggcctcacactgga -# caaacgcctaaccttccgagaacatattgccagagtcgtcaaaatgtgcaacctaaagcggaaccaattattctggatgctaaacaagaaaagcaaac -# tatctctaagacgcaagcggcacatttatcaacaaatcatcgcaccaacttggagatatggaatccaaatttggggagtggcggctgcgtcccaccga -# aaacgtttccaaaccgtccagaacaaaacattaagacaaatcactggctttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacgg -# atgcgctgcttatggatttgttgtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactac -# 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-contig23 AUGUSTUS CDS 18249 18612 0.69 + 0 ID=contig23.g32.t1.cds;Parent=contig23.g32.t1 -contig23 AUGUSTUS CDS 18678 18820 0.99 + 2 ID=contig23.g32.t1.cds;Parent=contig23.g32.t1 -# coding sequence = [atgagcgccgttatccgcggctgtgttcgtgcagaggccgcgtggaaaacgaaatttaaaaatggaaggcaaaacgcaa -# aaaacactcttaagacgccttcaggagttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacggatgcgctgcttatggatttgtt -# gtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactacaggccactaaatgggaatggag -# gaaaatgtatcctgagtcaccggatagtgggttgtcaccatgtcctcgattgggacacagttttaccatggttggtgaaaaaatatttttgtttggag -# gactagcaaatgaatcagatgaccctaaaaataatattccaaaatacttaaatgatttgtatatattggatactcgaggagttcacagtcataacgga -# aaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctcctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagtaagggatctggaaatttaaatct -# cttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagatttgtggttattagatacagatacaatgacttgggacaatgtcacattagacactgtag -# aagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagttggtattcaaagtcgtctgtatgtttggtcagggcgggatggttatcgcaaagcatgg -# 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ID=contig24.g35 -contig24 AUGUSTUS transcript 552 12546 0.12 - . 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atttcgaacaaccctggagcgggcaacggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatga -# tgtggcaatgaatattggccaaccgtctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtca -# acagacagattccgtttgcacatgggccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccg -# cctatgtttactgcatcacaacagtctaatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagt -# tggacctgcagtttcacaaggacagatccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaa -# tgcccactgctggaaatgtcgttccaacgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcac -# agtttccagcagcaattatacgcaacaaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaa -# cttatctccaactccagcgttctttgtgaacaaatga] -# protein sequence = [MLSTTMPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPDQIKVMPDEGAEKNGLSSSDK -# GVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKKNSVKDEDVETGSIKA -# 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MISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMPIGFG -# SNFNPNIQVKASTPNTIQYMPVRPQNASNNNNNGASNVRMPPSLEFLQSGDGGPGMPGMMVGSGSGPMLMNSSGDHQNKISNNPGAGNGINFFQNCNQ -# MGIIDDEGGLASHDVAMNIGQPSMIRGMRPHGMRPHAMAPRMQASVNRQIPFAHGPDGLDCVGDTSAFFNNATCNSTGPPMFTASQQSNQAKPQHLKN -# IPTGLCQNQTGLGVGPAVSQGQIQLQGQGQGQGQGQTLIGPSNNNLMPTAGNVVPTNGVSGINFVGPSSNDLKYAQQYHSFQQQLYATNTRSQQQQQM -# HQQQQSNMLTMPPNLSPTPAFFVNK] -# end gene contig26.g38 -### -# start gene contig26.g39 -contig26 AUGUSTUS gene 29102 36266 0.39 + . 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ID=contig27.g41 -contig27 AUGUSTUS transcript 17297 23825 0.08 - . ID=contig27.g41.t1;Parent=contig27.g41 -contig27 AUGUSTUS CDS 17297 17417 1 - 1 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 17475 17667 0.71 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 17767 17937 0.43 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 17997 18375 0.9 - 0 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 19175 20016 0.87 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 20080 20190 0.65 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 21431 23113 0.44 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 23173 23691 0.93 - 2 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS CDS 23771 23825 0.75 - 0 ID=contig27.g41.t1.cds;Parent=contig27.g41.t1 -contig27 AUGUSTUS start_codon 23823 23825 . - 0 Parent=contig27.g41.t1 -# coding sequence = [atgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatggaacatgcaaatcggatcgagcccagtctta -# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg -# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc -# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga -# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt -# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat -# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag -# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat -# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat -# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt 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aaagaaaaaagtacaaactaaaatttgacacgggcttaccacaaaatgtaaaggacttcaacaacgtattttctgaaacaacatcctcaaccgtaact -# agttcaattcatcttatgaaacaaaaaaacgaagcgccctgtccggattcattaatgacagctcccaacactttgtctaatacatcattatatcctgg -# aaaccagacaggaatggttccattgcttccactattgcactttccaccgcgaccgggattgattccttctggacctggactttttcctgcagtaacag -# gtctggtcggctttggaaataataataacacagtcggtattgcaccattcatagcatttcctggtacagaaggatctgttgctgacaccgttagatgc -# ccaccaattaaagattctgctgatactgggaatgatcaactcctaagaagatccggacagatggacttacagattgatagaaactattgcaatgttgc -# tccgttggtgccagactcaatgaaattttctgagtgtaaaccagtatcttgcggtaatactgacatggaaaatacatttacaccttccaaatttaagg -# caaagccatcagtgcaggcttctggaaatcttggagatccgattgaggtatccgatgactcagacgaatcaatacaaaacagacaaattgttcaaaaa -# aaatctccattaacttctccaaaccacgctaaatcaagcttagtacaatcacagcaccaaacgtttgcaactccatcaccattatgcgaagacaagaa -# ccaaatggacttaaggaatgttttgccgaatacaagcccaagtgaatcaattaagaagttgaagaagtcagttaaactgaaccttcccgatgtaaaaa -# actttattcagatagctccttctcagtcgtcatttccgcaattcaacttgccaaattttataggaggtgataagttcagtttggccggtggagctgat -# cttattcctttggcaagaatagattgcgggtcggcatattcatcccataaggtgccatctagcagcttaacagggggagtggcttcaggcgtaatccc -# tattttaccaaatcacatatctgaggaccagcagtttatgcctacatttccaaactacgaggatattagcattactccgaccggagcgttgtcactag -# atcccaaagtgcgcaaacaccataaaaagcctaaaaagattaaagaaggaaaaattaaaaaaaaaaaggataaaaaggataaatcaaagagaaaagat -# cgagttgccttagcgtctaataaaagtgaccgaaaaataaaagggcttgacaaaaagcaaaaaaaggaaaaaaagaaggacaaggaaaaacagatttt -# aatccaaattccggaagtcgacgaattttctagggcaccttttattaacaacttagattatggcttcactcaaagtgtacccgcgagtacacctgtat -# tgaaaaccagtccaatgtcagtaaaaccgccactatcggccacttgtgcgatgtctccaaaaatacagcagtctccaagtcaaataccaaaactaaca -# ctgaaactaagtggcaagtccacaacgtgtcctgaaaaagagaaagacacaacggatgctgtcaaggtgtcacagccaactatgtttccagtagaaaa -# taaagagcgtgagcgagataattccccggaactagcccggttctctccactggttaccgggccaccgaagaacaaacaatctgatacacatttattag -# 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atattccgctgagctacaagataaatgcaacatttcaccaccaccgggagatccaaaaattgaaaacagcgcgcgccttcgacgttataggcataact -# tagaataa] -# protein sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA -# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKVV -# RKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTV -# RYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRG -# VKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAE -# CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA -# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG -# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPGLRRRRESAEGKYVTDQTQLQLKFQRPRSRTSSRTRGISNTMLGNFDDNNTVSGEKQRLIGTQ -# VVQNEESNNVPTSIYSAELQDKCNISPPPGDPKIENSARLRRYRHNLE] -# end gene contig27.g42 -### -# -# ----- prediction on sequence number 28 (length = 50013, name = contig28) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 28 on both strands -# start gene contig28.g43 -contig28 AUGUSTUS gene 2292 8820 0.12 - . 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-# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg -# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc -# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga -# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt -# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat -# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag -# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat -# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat -# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt -# 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aaagaaaaaagtacaaactaaaatttgacacgggcttaccacaaaatgtaaaggacttcaacaacgtattttctgaaacaacatcctcaaccgtaact -# agttcaattcatcttatgaaacaaaaaaacgaagcgccctgtccggattcattaatgacagctcccaacactttgtctaatacatcattatatcctgg -# aaaccagacaggaatggttccattgcttccactattgcactttccaccgcgaccgggattgattccttctggacctggactttttcctgcagtaacag -# gtctggtcggctttggaaataataataacacagtcggtattgcaccattcatagcatttcctggtacagaaggatctgttgctgacaccgttagatgc -# ccaccaattaaagattctgctgatactgggaatgatcaactcctaagaagatccggacagatggacttacagattgatagaaactattgcaatgttgc -# tccgttggtgccagactcaatgaaattttctgagtgtaaaccagtatcttgcggtaatactgacatggaaaatacatttacaccttccaaatttaagg -# caaagccatcagtgcaggcttctggaaatcttggagatccgattgaggtatccgatgactcagacgaatcaatacaaaacagacaaattgttcaaaaa -# aaatctccattaacttctccaaaccacgctaaatcaagcttagtacaatcacagcaccaaacgtttgcaactccatcaccattatgcgaagacaagaa -# ccaaatggacttaaggaatgttttgccgaatacaagcccaagtgaatcaattaagaagttgaagaagtcagttaaactgaaccttcccgatgtaaaaa -# 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gene 18492 34884 0.02 - . ID=contig28.g44 -contig28 AUGUSTUS transcript 18492 34884 0.02 - . ID=contig28.g44.t1;Parent=contig28.g44 -contig28 AUGUSTUS CDS 18492 18726 0.28 - 1 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 18790 18889 0.56 - 2 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 20325 20500 0.14 - 1 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 25303 25442 0.49 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 25666 26469 0.83 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 27412 27615 0.99 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 27678 28067 0.98 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 28384 28545 0.84 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 30540 31038 0.97 - 1 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS CDS 34862 34884 0.83 - 0 ID=contig28.g44.t1.cds;Parent=contig28.g44.t1 -contig28 AUGUSTUS start_codon 34882 34884 . - 0 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acggcacgacgatctgtggtctctgttctatatgctcgtggaattcgtaaacggacaactaccgtggcgaaaaataaaagacaaggaacaagttgggt -# tgacaaaagagaagtacgaccacagaatactgttaaaacatttgccgtcagatttaaagcaatttttggagcatattcaatctcttacctatgcagat -# cgaccggattacgcgatgcttatcggtttatttgagcggtgtatgaaaagacgcggcgtcaaggagtctgacccttacgactgggaaaaggtggactc -# tgcaactattggcaacataagtacatcaggcaatccgccagttcctgttaaaaatgattacattcacgggaatataacacaaatgaccgtggcagcat -# ctaacgcaagcggaacggaatattatctacaattggaagataaagcaccaaatatgtttttaccaacaaaaccaaatgcagagtccgaaagtacagtt -# gacgtcgctcctaaaagtatatttgaagagaaattcgtggattcaaatgacgctgagtgtgctaataaagctttcctgtctggggaacaacagcaaca -# aaaatcgcaagtgaaaaagctgaatttgccagagtccgccaaccagcaagtacagaaactggaaaacgtagcaaacgaaaagagctccgaagacaaac -# gagcatcgcaggaaccgaaatcaacctttgggcgactccgtgtgcttacagctcctccaatgagtgtacatgatctaacaacggggggccacatccaa -# caagggactgatttatcaataaaacaagatccctcaagctccaatgctggtccagccgccgggaacagctcgtcctccaaacttgccattaaccagca -# tggtcaaatttttggaataactctcatgccacaagttaatcgacgttcggcaacgtctaccaatttaagaccatcttcctctggcggaaacacaaatc -# caattcatagaatcaatattggatcagcaggtggtggaggtggaactggaagcaacaccgccagaagcagtgttgcaggtgatcattcggtgactcaa -# tttgctttaatagacgacgagaatgtctcagcattacaacaggtaaccaaaggcggagctcttacgctggcatcacaatggaagagccagtttgatga -# ctcagaggacactacagataacgaatggaacagagaaccacagtcgcaacccaatttggagcaattgattaaactggatattccattgcccttaaatg -# aagccaagcatttttgccaaaatgtcgtcactgatacaggcatattaactaaacctccaatcgaagggaacgaaaaaccgaaaagcaaaatcccaata -# cggcagtcaaaatgtgcatcttgggccggtgctgacactacagtatattcatctaagacactggagcccagagacgcccttccggaaattcccttcaa -# tccccaaacaaacacatactccactgctttagaatatcctcctaatataacggatcttaccccaggtttacgtcgtcgaagggaatctgctgaaggaa -# agtatgtcacagatcaaacgcaactgcaattaaaattccaaagacctcgatcacgaacttccagcaggacccgtggcatttccaatacaatgttagga -# aattttgatgataacaatactgttagcggggaaaaacaaagacttatcgggacccaagttgttcaaaacgaagaatcaaataatgtaccaacgagtat -# atattccgctgagctacaagataaatgcaacatttcaccaccaccgggagatccaaaaattgaaaacagcgcgcgccttcgacgttataggcataact -# tagaataa] -# protein sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA -# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKVV -# RKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTV -# RYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRG -# VKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAE -# CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA -# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG -# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPGLRRRRESAEGKYVTDQTQLQLKFQRPRSRTSSRTRGISNTMLGNFDDNNTVSGEKQRLIGTQ -# VVQNEESNNVPTSIYSAELQDKCNISPPPGDPKIENSARLRRYRHNLE] -# end gene contig28.g44 -### -# -# ----- prediction on sequence number 29 (length = 50006, name = contig29) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 29 on both strands -# start gene contig29.g45 -contig29 AUGUSTUS gene 193 14875 0.08 - . ID=contig29.g45 -contig29 AUGUSTUS transcript 193 14875 0.08 - . ID=contig29.g45.t1;Parent=contig29.g45 -contig29 AUGUSTUS CDS 193 266 0.67 - 2 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 316 491 0.1 - 1 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 5294 5433 0.52 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 5657 6460 0.78 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 7403 7606 0.98 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 7669 8058 1 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 8375 8536 0.86 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 10531 11029 1 - 1 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS CDS 14853 14875 0.83 - 0 ID=contig29.g45.t1.cds;Parent=contig29.g45.t1 -contig29 AUGUSTUS start_codon 14873 14875 . - 0 Parent=contig29.g45.t1 -# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc -# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc -# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc -# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg -# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg -# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgaggg -# acaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaac -# tacaggggaaggagcatagcaacttttccgtgggtcgattgccttataattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtatacc -# actggtactggagaagtgcgttgtccaagagctgcagctggatttcgcggcaccgttcgctatgcttctataaatgcacatcgcaatagggaaatggg -# acggcacgacgatctgtggtctctgttctatatgctcgtggaattcgtaaacggacaactaccgtggcgaaaaataaaagacaaggaacaagttgggt -# tgacaaaagagaagtacgaccacagaatactgttaaaacatttgccgtcagatttaaagcaatttttggagcatattcaatctcttacctatgcagat -# cgaccggattacgcgatgcttatcggtttatttgagcggtgtatgaaaagacgcggcgtcaaggagtctgacccttacgactgggaaaaggtggactc -# tgcaactattggcaacataagtacatcaggcaatccgccagttcctgttaaaaatgattacattcacgggaatataacacaaatgaccgtggcagcat -# ctaacgcaagcggaacggaatattatctacaattggaagataaagcaccaaatatgtttttaccaacaaaaccaaatgcagagtccgaaagtacagtt -# gacgtcgctcctaaaagtatatttgaagagaaattcgtggattcaaatgacgctgagtgtgctaataaagctttcctgtctggggaacaacagcaaca -# aaaatcgcaagtgaaaaagctgaatttgccagagtccgccaaccagcaagtacagaaactggaaaacgtagcaaacgaaaagagctccgaagacaaac -# gagcatcgcaggaaccgaaatcaacctttgggcgactccgtgtgcttacagctcctccaatgagtgtacatgatctaacaacggggggccacatccaa -# caagggactgatttatcaataaaacaagatccctcaagctccaatgctggtccagccgccgggaacagctcgtcctccaaacttgccattaaccagca -# tggtcaaatttttggaataactctcatgccacaagttaatcgacgttcggcaacgtctaccaatttaagaccatcttcctctggcggaaacacaaatc -# caattcatagaatcaatattggatcagcaggtggtggaggtggaactggaagcaacaccgccagaagcagtgttgcaggtgatcattcggtgactcaa -# tttgctttaatagacgacgagaatgtctcagcattacaacaggtaaccaaaggcggagctcttacgctggcatcacaatggaagagccagtttgatga -# ctcagaggacactacagataacgaatggaacagagaaccacagtcgcaacccaatttggagcaattgattaaactggatattccattgcccttaaatg -# aagccaagcatttttgccaaaatgtcgtcactgatacaggcatattaactaaacctccaatcgaagggaacgaaaaaccgaaaagcaaaatcccaata -# cggcagtcaaaatgtgcatcttgggccggtgctgacactacagtatattcatctaagacactggagcccagagacgcccttccggaaattcccttcaa -# tccccaaacaaacacatactccactgctttagaatatcctcctaatataacggatcttaccccagaacccatttgttttatcattgtggaaggcagtt -# cacgtagtgccgaaacgcaccaggagggtgtgcgacggtga] -# protein sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA -# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKVV -# RKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTV -# RYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRG -# VKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAE -# CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA -# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG -# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK -# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPEPICFIIVEGSSRSAETHQEGVRR] -# end gene contig29.g45 -### -# -# ----- prediction on sequence number 30 (length = 70018, name = contig30) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 30 on both strands -# start gene contig30.g46 -contig30 AUGUSTUS gene 28638 65517 0.02 + . ID=contig30.g46 -contig30 AUGUSTUS transcript 28638 65517 0.02 + . ID=contig30.g46.t1;Parent=contig30.g46 -contig30 AUGUSTUS start_codon 28638 28640 . + 0 Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 28638 28655 0.18 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 33827 33869 0.95 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 33930 33948 0.96 + 2 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 44322 45962 0.97 + 1 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 47860 48041 0.96 + 1 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 49613 51223 0.99 + 2 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 57010 58428 0.87 + 2 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 58492 58712 0.89 + 2 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 58776 59129 0.92 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 59374 59514 1 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 59569 62496 0.74 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 64713 65304 0.85 + 0 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -contig30 AUGUSTUS CDS 65468 65517 0.64 + 2 ID=contig30.g46.t1.cds;Parent=contig30.g46.t1 -# coding sequence = [atgggtgtcactgagacggaatcgtgtataagtgatcgggactcacttaaccctgatcagggcaatcgttcctacggaa -# gctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaacttttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatac -# attattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttatgcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaa -# agatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatcaaagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctg -# gtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacattcctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgc -# caggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgcaagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgc -# gaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcgagtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagc -# cgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatgacaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgcccc -# actcttactccatctccgcatccagttctcggtaatgaggatgaggtggagctagagaacaagcaggaggctgagcagctccgggttctagaccaggg -# cccggagcaagaccctgaaactgatcaggaatctagtagtagtaaaatggcggcacctagtgcatatctcccattatcatcgcctaaagtagcagtaa -# aacctactgtgaaatgtggttccttaaactcagcaacagcaaagactaataacctatcaaaagtatcctcaaccagttcatctacgtcggcatacaca -# tccggagagttctcattacccagtactgataatataagtatcaataagtcaaccaattgtaaccaaggagcagagccgccgtcttcctcttctttgga -# ggtcgaaatgaaaatgggctctatgtctgcatcacctcaaacaaacgaatcggatgtcccctgctcagatcttatgcagctgcagcatgtggcggctg -# gtggcacataccctcctcaagtcaattcattccacgcatccttagcagcgctggccgccaatgaatcgaatgacagtcgggttaagctgatcacagag -# ttcctccaacagcagctgcagcaacatcagcagcaaagttccttatttcccagccattgtcccgatcatccagacctaattggtgtagactgcaaaac -# 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tgccagacaaaagcagcgtaagatttacgaaaaccagccgaacaattcgttgtttgaaaatgaggagacaaaaaaacaaaacattaactatgcgtgca -# aaaagtgtagtttggtgtttcaacgttactacgagttaatacgtcatcagaaaaatcactgctttaaggaggagaataacaaaaagtcagctaaggct -# caaatcgctgctgctcaaatagcacagaatttaagctcagaagattcaaattcctccatggatatacaccatgttggcatatgtccaccaggatcaac -# agtagttgctcaagccttggcaacggttggttctgcagctccattggcgggacagtacgcacagcaatcatttggcgctttaccctcaccacagcatt -# tattcatcaaatcttcttctctaactgacttcagcccatccacgacccccacgcccccccaacgagaacgcagcaacagtttggaccaaccacaacgg -# tctcacaagtttgactgtgataaatgcgacatgcaatttaaccaattggagaaattgcgagagcatcaactattgcacgcaatgaatccagcaacaaa -# tttttcagacgcaggacagaactctaattctgatggaaacttcggtccgttcggctgcatactgcaaagcttacaacaagcagcagctcaacagacac -# agaaccaaccaccaccaacaaaaaaacggaaatactcggatagctcttcaaatgcagatgaaatgccgaatttatcggaacctgaggctgcacataag -# aaacatgaattcctttataattattatatgcaaaatgaaacgaacacagaactgaaaaaacagtttcttatgcgacaacaacataagaaagcacagca -# 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PEQLNFLYECYQSESNPSRKMLEEISKKVNLKKRVVQVWFQNSRAKDKKSRNQRHYAHISDDNSYDGSSGKEVVSDLKTNGGPVEQDHESNLQDCQLC -# QVTQVNIRKHAFSVEHICKMKKLLEQTTELYAQSNGSGSDDNDSDREKRFYNLSKAFLFQHVVSNATSKANLTRGSGQDLEALPEENCMLNYDTASGD -# SKSHIQHSLPAEIVSEDVRKIAGNQELIQHLFNRNHITVTQNINSEQEHPFYKI] -# end gene contig30.g46 -### -# -# ----- prediction on sequence number 31 (length = 40012, name = contig31) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 31 on both strands -# start gene contig31.g47 -contig31 AUGUSTUS gene 3754 25510 0.11 + . 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-contig31 AUGUSTUS CDS 25461 25510 0.28 + 2 ID=contig31.g47.t1.cds;Parent=contig31.g47.t1 -# coding sequence = [atgtttaattgtgcagctatacgctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaactt -# ttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatacattattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttat -# gcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaaagatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatca -# aagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctggtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacatt -# cctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgccaggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgc -# aagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgcgaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcga -# gtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagccgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatg -# acaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgccccactcttactccatctccgcatccagttctcggtaatgaggatgaggtggagctagag -# 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ID=contig32.g50 -contig32 AUGUSTUS transcript 9315 31071 0.09 - . ID=contig32.g50.t1;Parent=contig32.g50 -contig32 AUGUSTUS CDS 9315 9325 0.27 - 2 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 9382 9437 0.39 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 19927 22118 0.81 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 24947 25309 0.99 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 25407 25572 0.98 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 26120 26752 0.96 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 29696 29964 0.86 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS CDS 30286 31071 0.8 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 -contig32 AUGUSTUS start_codon 31069 31071 . - 0 Parent=contig32.g50.t1 -# coding sequence = [atggcatcaaagcgtgatgtcagcttggcacagtcagatgggacagtgccgacggtgccattgacgccatcaaccccat -# 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ID=contig33.g51 -contig33 AUGUSTUS transcript 4558 16069 0.21 - . ID=contig33.g51.t1;Parent=contig33.g51 -contig33 AUGUSTUS CDS 4558 4630 0.27 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 4925 7116 0.72 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 9945 10307 0.99 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 10405 10570 1 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 11118 11750 0.96 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 14694 14962 0.86 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS CDS 15284 16069 0.82 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 -contig33 AUGUSTUS start_codon 16067 16069 . - 0 Parent=contig33.g51.t1 -# coding sequence = [atggcatcaaagcgtgatgtcagcttggcacagtcagatgggacagtgccgacggtgccattgacgccatcaaccccat -# acttaagtagttcagaaagtggcaacaatgaacaaggcaaatatatatctggcctgccgaataatcgtaaacgcctgaagctgtccactcttgaacta -# 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cagaatctcagtccgcgggtaggaaatcaaacccagcacaatactccccaaccaggacatatcgtctcagacgtttctcgcaagagcttgtgtggcct -# cgaatcgctggttgatcaaataccagcaataagggaacacgaatgcagcaatataccattggcaacagcagcggcagcagcggctgctgttgaaagtc -# gtcttttaggcttgcaacaacagcagcagcatcagcagcagcagcaacaacagcagcaggaacagcagcatatacagcagcaacaacaacaatcacaa -# caacagcaccagcagcaacaacaacatcaacaacagcaccagcaaccaaaacgctgcattccagagaattcggtgcaaacggaatcatgtagaccgtc -# aagagagaatagcaacgtcagcaacaacaatttttctgtaagcagtctagctgcatccgctttgactgcaagaactgagaacgaagctatatatggca -# acagtggagaaacccgagtcatcagtgaaagtagcaatagtaacaacaacaattgtggcaacagcatcgagtattctattcatagtccatccggatat -# catcatcatgcccctcacttaatgggcgctataggggcgaacattaacaactcagagcccaatccgcatcacctttcccatcctcatccacctcctca -# ctcacatccgcatacaattcatccctcacatcatctgagcgtatttgatcacttgaaaccgtccgacataagtgggtacggcggtttttga] -# protein sequence = [MASKRDVSLAQSDGTVPTVPLTPSTPYLSSSESGNNEQGKYISGLPNNRKRLKLSTLELNSSQGSDVDSPIEPDLDPN -# ARISESKADDYADMENHLPGNCNSVIEGASSGDISKIKGPEKLVQFEKNCYVPPDQALVTSVELVVPAPQNSSLSIQVGRSEETKQSALREPSEASSS -# TIDNKLQYSTSGPYNSSSSTNILANDKIDGCANDSSNLNLRTPTKLAVTTATSDILNNDRRASLWAPHHDQSRQTQQQSSEPKQEPNSPLFGTHQSDH -# IQRQHQQQPPSQHPMECHANLHQSASISQQHEQHLQHERQQIHQHQHQPTQQHHPLHENYHDIIMEEFHEEPSTAFKLTLSPSNAKPENQDDGYETSA -# GDVLTPNSHSSSTHSVTPQHQMQHPNIVLIHQNQKKPDELGLAKNLLTGEAHADPATCSSNGIQGQLHATQTHLELSGDTRCSSHTSAVNPYSFMGEE -# MRMHSPVNRPMETVTTETARYASVPAPMSTSNGNQESLSGELYQHTHHSTSILEPTESSQCDLHSKPTPKKRGRKKKLVADSTQISTPSSQQEMSAMT -# AICEDGGVDHIKAMKPKERKKHDRFNGMSEDEVIKRTIPDHLCDNLDIVIVGINPGLFAAYKGHHYAGPGNHFWKCLYLAGLTQEQMSADEDHKLLKQ -# GIGFTNMVARATKGSADLTRKEIKEGSRILLEKLQRFRPKVAVFNGKLIFEVFSGKKEFHFGRQPDLVDGTDTYIWVMPSSSARCAQLPRAADKVPFY -# AALKKFRDFLNGLIPHIDESECVFTDQRIRQCSEQQQVETSGKNKQTHQTSLGDPQASLTFVGNCGGTSTGATECGNVTEEADDKLMPHLTGKMSFSN -# TATDRGTFSFTGDDRSMLPITNHNTAPNESTYLSVFGAQQTLPQQPIEKKKRGRPKKIKGQEIIDHSVGGKISIGGQHMPQHDFNNILNLSVIPAGGC -# 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ID=contig33.g53 -contig33 AUGUSTUS transcript 33454 37281 0.72 - . 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ID=contig34.g54.t1;Parent=contig34.g54 -contig34 AUGUSTUS start_codon 230 232 . + 0 Parent=contig34.g54.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 230 272 0.99 + 0 ID=contig34.g54.t1.cds;Parent=contig34.g54.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 322 384 0.95 + 2 ID=contig34.g54.t1.cds;Parent=contig34.g54.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 448 560 0.95 + 2 ID=contig34.g54.t1.cds;Parent=contig34.g54.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 2129 2254 0.6 + 0 ID=contig34.g54.t1.cds;Parent=contig34.g54.t1 -# coding sequence = [atgtccgatttgggaagcggagatgaaggcatctcaggatcaaaatacaatgtcacaaacatagagggttcctcaagta -# ggaacgatttcgaatcctctgtaaaaggtggaagtggtgtggagcaggaattggctaccaaaatgcttcaaatacaatccaagcgattttatttggat -# gttaaacaaaatcggagaggtcgttttataaaagtggctgaggtgtcacaaaccattactagaggtggacctagatcgcaaatcgctttaccagccca -# aggcatgatcgagttccgtgatgcccttacagatttgttagaagagtttggagctaacgatggagggtaa] -# protein sequence = [MSDLGSGDEGISGSKYNVTNIEGSSSRNDFESSVKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEVSQTI -# TRGGPRSQIALPAQGMIEFRDALTDLLEEFGANDGG] -# end gene contig34.g54 -### -# start gene contig34.g55 -contig34 AUGUSTUS gene 8442 12269 0.69 - . ID=contig34.g55 -contig34 AUGUSTUS transcript 8442 12269 0.69 - . 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ID=contig34.g57 -contig34 AUGUSTUS transcript 39193 45655 0.2 - . ID=contig34.g57.t1;Parent=contig34.g57 -contig34 AUGUSTUS CDS 39193 39600 0.8 - 0 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 41289 41467 0.85 - 2 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 42321 43243 0.26 - 1 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 -contig34 AUGUSTUS CDS 43929 45655 0.33 - 0 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 -contig34 AUGUSTUS start_codon 45653 45655 . - 0 Parent=contig34.g57.t1 -# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg -# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg -# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc -# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg -# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat -# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga -# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg -# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat -# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat -# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc -# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc -# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga -# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta -# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca -# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc -# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct -# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac -# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca -# ccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagatctcggcttaacatgccgcctgagc -# ggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaagcacggcaacggaagcgttgttagt -# ctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccggactcaaactgaatgagcgactgtc -# cccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcccgaacatccacggtaccccgcact -# cagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaagatttctgtccctgcctcgccaaaa -# tcgtccgtaacctgtgcgggcggaggatcgagccgcaatggacacaccagcgacatggaggagatcaacacgaaagatctggctcagcgcatctcggc -# agaactgaaacggtacagcattccacaggcgatctttgcacagcgtgttctctgtcgctcgcaaggtactttgtccgatctactgcgcaacccgaagc -# cgtggtcgaagctcaagtccggcagggagacatttcgaaggatgtacaaatggctccaggagcccgagtttcagcgtatgtctgctctacggatggcc -# gctgcacaaattcctcagcgaactttggggcctgggctggcacttggaccaacaacgggctccacatccgtcataccgaccgatttggattctcatgc -# cgggccagcaatgacaccaaatgctccgcccaatgaatcggcctcttcgtctgcatctacacctgtcacaaacgtgtccgttgcgaacgtcgttagtt -# gtcgtcgaaaggaagagcctcagatcgagcaaatgcctcagccaaaaaaaccacgactggtctttaccgatcttcaacgacgaacactacaagctatt -# ttcaaagagaccaaaagaccttcgaaggagatgcaagtgacgatcgcgcggcagctgggactagagcctacaacagtaggcaatttctttatgaacgc -# acgtcggagatcgatggataagtggcgggacgacgactccaaaaccagcatgcatttatcgcatagccgccaacaacaacgggacgagcaggaagagg -# acgagagccacagtcaaagtcagattcaaattcagagccataatccggctagcttaacacaggaaaactactccagtctacatacaacggccatgtcg -# cctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgaccatggagataccaatga -# tccaaactgcgacatgttgtga] -# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS -# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK -# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE -# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA -# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC -# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES -# VPGVNGGTNWLQMHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSLTPTPPPVT -# DDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSSRNGHTSDM -# EEINTKDLAQRISAELKRYSIPQAIFAQRVLCRSQGTLSDLLRNPKPWSKLKSGRETFRRMYKWLQEPEFQRMSALRMAAAQIPQRTLGPGLALGPTT -# GSTSVIPTDLDSHAGPAMTPNAPPNESASSSASTPVTNVSVANVVSCRRKEEPQIEQMPQPKKPRLVFTDLQRRTLQAIFKETKRPSKEMQVTIARQL -# GLEPTTVGNFFMNARRRSMDKWRDDDSKTSMHLSHSRQQQRDEQEEDESHSQSQIQIQSHNPASLTQENYSSLHTTAMSPLGDFDEEADMDLELESHD -# FDLVDPDDHGDTNDPNCDML] -# end gene contig34.g57 -### -# -# ----- prediction on sequence number 35 (length = 48011, name = contig35) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 35 on both strands -# start gene contig35.g58 -contig35 AUGUSTUS gene 5595 8883 0.09 + . ID=contig35.g58 -contig35 AUGUSTUS transcript 5595 8883 0.09 + . ID=contig35.g58.t1;Parent=contig35.g58 -contig35 AUGUSTUS start_codon 5595 5597 . + 0 Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 5595 5643 0.26 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 6642 6811 0.31 + 2 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 6865 6983 0.72 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 7293 7358 0.7 + 1 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 8135 8609 0.57 + 1 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 8675 8773 0.97 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 8854 8883 0.72 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 -# coding sequence = [atggagggctgtacccgagtttctgaactgttatgtaaacgttactcagacctttgtcaattagatgaaagtttttccc -# gactggccggatatgggtccagtcctgacgtgggatcccgttccctctgggctggtcagggtgttttacggtcaggttctgtaatcagttgctttttg -# ttctgccaacaaagcctcaagcagtacatagcaaaacgcaagattgagcgaggaagacgtttatatgagcaaaacaaccaaacagaggccgtgcgtac -# ttggcgtagtgcccttaaaggaacctgtcagccagaggactgcttccagctactaggatacttgtaccaggcccacatggactggggcaaatttcgtg -# aagctattgaatttggccaccagcagcttggaatttcagaagaactggattcgccaaatatgcgtgctgagacgtacctaaacctcagcagagctcac -# gcttgtttgggaggcctggagcgatcactgagctatgctaggcactcactttacaatgagtgcggcactaaatgccgaagtggacttgtccatttgac -# ggttgcacgagtgtatcttgaaatgggtggattcaccagggcattggagggcttgcagggagcctacaagatagctacagccgttggagatccgtctc -# tagagttacaagtgtatgtcgcactgtctgagctttttggacggctccaggataacgataaaagcgcatcttatgcttctaaggcgtacgatttatct -# cgttccttacagctgggtgaccttaactcatgccaccatagagccgcgttattgcgaatggctgcatctctgcgaaagaagggcgagctcggagatgc -# acaggattattgcaaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccacatacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacatttaccgga -# agaaaatggatatggactctagaaacggtaaaaaacttgaagaatag] -# protein sequence = [MEGCTRVSELLCKRYSDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKIERGR -# RLYEQNNQTEAVRTWRSALKGTCQPEDCFQLLGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYN -# ECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEGLQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLR -# MAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] -# end gene contig35.g58 -### -# start gene contig35.g59 -contig35 AUGUSTUS gene 14188 20650 0.27 - . ID=contig35.g59 -contig35 AUGUSTUS transcript 14188 20650 0.27 - . ID=contig35.g59.t1;Parent=contig35.g59 -contig35 AUGUSTUS CDS 14188 14595 0.87 - 0 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 16284 16462 0.91 - 2 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 17316 18238 0.29 - 1 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 -contig35 AUGUSTUS CDS 18924 20650 0.38 - 0 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 -contig35 AUGUSTUS start_codon 20648 20650 . - 0 Parent=contig35.g59.t1 -# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg -# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg -# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc -# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg -# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat -# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga -# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg -# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat -# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat -# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc -# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc -# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga -# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta -# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca -# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc -# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct -# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac -# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca -# ccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagatctcggcttaacatgccgcctgagc -# ggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaagcacggcaacggaagcgttgttagt -# ctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccggactcaaactgaatgagcgactgtc -# cccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcccgaacatccacggtaccccgcact -# cagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaagatttctgtccctgcctcgccaaaa -# 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cctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgaccatggagataccaatga -# tccaaactgcgacatgttgtga] -# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS -# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK -# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE -# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA -# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC -# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES -# VPGVNGGTNWLQMHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSLTPTPPPVT -# DDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSSRNGHTSDM -# 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ID=contig36.g61.t1;Parent=contig36.g61 -contig36 AUGUSTUS start_codon 6039 6041 . + 0 Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 6039 6053 0.37 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 0.93 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9609 0.76 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 0.27 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 12564 12740 0.92 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 0.99 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19333 19428 0.8 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 19774 20144 0.54 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 20992 21138 0.65 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 -contig36 AUGUSTUS CDS 21203 21532 0.57 + 0 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gttaccgagaattttgcccactttaacgagacacccacgggaaaagaaattactattattgagaagcaaaatggaacatgtgtcgaaaacgcggaacc -# gtacgaggccccaacatatttatgtaaaggtgatggaaaatggaccattcttactggtggctgtcgttgcaaggccggctatgaaccaaacaatttaa -# ataaaacttgcacagaatgtccccttggtacgtttaaatcaccagaggtaaccaaatgtacgccatgtccgcctaactcaaattcttcaaaaactgca -# tcaccattttgcaagtgtatgccgggatactatagacatccaagtgacggccgacatatgccttgttacagtccaccatctgcgcctacaaatctaac -# gttgttgtttgttgatcaaacgagtgccataatatcttggagcgctccaaccaagaataaaacgaacacgggcaaaacgctgtctaataagtaccaca -# gtgatattgtgtacaagatccggtgcaatatgtgcagcccaaatgttatgtacaatccgtcaagtgacacatttaacgaaacgaaaataacattaaca -# aatcttgaaccggttacgacatatacagtgcaagtacacgcaaccaatagcgtgtcgcatcttaccgacttaagccggcaccccaacgaatcgtcact -# aataacaaccaatgacacaccattttctaatgtgtcgtttttcaccattcccttggatttgaatgaaataaagaccagtcacgcagaaattgtgttta -# ctacagagtctgttttgctatctacagcttttaacttacgtatattggccataactagtaaagatgccgatttggagtgggacaagccaattcaaagt -# 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ID=contig37.g62 -contig37 AUGUSTUS transcript 8638 12756 0.32 + . ID=contig37.g62.t1;Parent=contig37.g62 -contig37 AUGUSTUS start_codon 8638 8640 . + 0 Parent=contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS CDS 8638 8643 0.95 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS CDS 8701 8987 0.52 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS CDS 11885 12254 0.97 + 1 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS CDS 12316 12519 0.99 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 -contig37 AUGUSTUS CDS 12580 12756 0.79 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 -# coding sequence = [atgaagttggttaaaattgaacagctccccgaacgcggatcatggtcatccaaaatggatttcatactatctgtagtag -# gtctagcaattggcttgggaaatgtttggcgatttccttatttgtgctataaaaatggaggaggcgcatttatattaccgtacatcataacgttgttc -# ctagctggaattccaatgttttttatggagttagctcttggtcaaatgttgacaattggtggtcttggtgtatttaaaattgcacccatatttaaagg -# taaggcctttttcatattggacgcgcttattgtctgcacagttaattctagcaccagtatgtttgctggattcgtaatattttctgtaataggattta -# tggctcacgaacagcagagaccagtagctgaggtagcagcatcaggacctggactggcgtttcttgtttatccttcggcggttctgcagctgccaggt -# tctccaatgtggtcttgtctctttttctttatgctgttgctcatcggattggattcgcaattttgtacaatggaggggttcatcactgcgattattga -# tgaatggccacagctgctgcggaaacgcaaagaaatttttattgctattgtatgcgcacttagctatttagttggcttaacctgtattacacaaggcg -# gcatgtatatatttcaaattttggattcgtatgcagttagcggcttctgcttactgtggctcatattctttgagtgcgtctcaatatcttggtgctac -# ggagttgatcgattttatgatggaataaaggatatgatcggatactatcccacagtttggtggaaattctgttggtgtgttaccacccctgctatatg -# cttgggcgtcttcttctttaacatagttcagtggaccccaattaaatatttggagtatagttacccatggtgggcgcacgcttttggttggtttacgg -# ctttgtcatccatgctatatataccaatatatatgttctggctgtggaaacgaactcctggtgacttgagtgaggtaccctaa] -# protein sequence = [MKLVKIEQLPERGSWSSKMDFILSVVGLAIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFILPYIITLFLAGIPMFFMELALGQMLTI -# GGLGVFKIAPIFKGKAFFILDALIVCTVNSSTSMFAGFVIFSVIGFMAHEQQRPVAEVAASGPGLAFLVYPSAVLQLPGSPMWSCLFFFMLLLIGLDS -# QFCTMEGFITAIIDEWPQLLRKRKEIFIAIVCALSYLVGLTCITQGGMYIFQILDSYAVSGFCLLWLIFFECVSISWCYGVDRFYDGIKDMIGYYPTV -# WWKFCWCVTTPAICLGVFFFNIVQWTPIKYLEYSYPWWAHAFGWFTALSSMLYIPIYMFWLWKRTPGDLSEVP] -# end gene contig37.g62 -### -# start gene contig37.g63 -contig37 AUGUSTUS gene 18828 41476 0.01 - . 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RFYGFCVDILETISHEVGFDYILDLVPDRKYGAKDPESAAFLTTERMINPIENAEDLASQTEISYGTLDSGSTMTFFRDSMIETYKKMWRSMDNKKTT -# AFTSTYEDGIKRVNQGNYAYLMESTMLDYIVQRDCNLTQIGGLLDTKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGDIQMLYDKWWKNTDETCIRRSTIK -# QSKANALGLESIERIMIPVRSLQRSEGDVFEPLE] -# end gene contig37.g63 -### -# start gene contig37.g64 -contig37 AUGUSTUS gene 48349 49385 0.52 + . 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ID=contig39.g68 -contig39 AUGUSTUS transcript 18343 30272 0.16 + . 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sequence number 41 on both strands -# start gene contig41.g71 -contig41 AUGUSTUS gene 4006 27824 0.06 + . ID=contig41.g71 -contig41 AUGUSTUS transcript 4006 27824 0.06 + . ID=contig41.g71.t1;Parent=contig41.g71 -contig41 AUGUSTUS start_codon 4006 4008 . + 0 Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 4006 4013 0.39 + 0 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 6193 6506 0.34 + 1 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 8605 8784 0.99 + 2 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 12469 12634 1 + 2 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 15417 15597 1 + 1 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 17904 18570 0.83 + 0 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 25190 25363 0.96 + 2 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 25897 26172 0.98 + 2 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 26300 26660 0.98 + 2 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 27230 27824 0.48 + 1 ID=contig41.g71.t1.cds;Parent=contig41.g71.t1 -# coding sequence = [atggtatcgacgcgaattgcaccgtcgccatctggacgaattcacttttcaaccttgattcgccctgcaaggacctgcg -# cagcgtgcatccggcggaaaacaatacattaccggattaagcttggatgggccaggcaaaagtcgatcacgaatagcagtgcatcgctcaaaaagttg -# agaatacaaggaggttcgaggagacctcgtcgtataatgtttacattgcaaccaactccgacggctataggcaccgtagttcctccctggtccgcggg -# aacattgatagagcgtcttccgtccttggaagacatggctcacaaggacaatgtgattgctctgagaaatttaccatgtttgggtgccgctggtggaa -# gcggactaggcggtattgccggaaagccttcccctacaatggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgca -# acaacttactaccatttaactgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacg -# acagaaaattgtcgaactggcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaa -# gatactatgaaacgggcagtataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaa -# cgcgagtgcccgagtatatttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaa -# ccgtgttttgcgaaacctggcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactgg -# ccgccaacagcagtggaaacatcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaac -# tcttcggaaagcggcggcgcgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccgg -# atcgggatcgggatcgctggacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagc -# tggtgcacggtaaccagcaggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagt -# gaaattcccatatcatcggcttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaag -# cctgggaagtgccggccacctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcct -# ccggtgagggtgaaaactccaatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaat -# cgaacatcttttacaaatgaccagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaa -# gattggtttgccagaggctaggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaa -# attccacaggagctagtggaacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcg -# ggatcagctgcgggtccttcagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcat -# tgagagtaccggcagtccaacaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagttt -# gttcaccgggcccccatggggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgct -# atttcgcccagactcaattttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggt -# aacacccataccgagcttcaaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgcc -# acatgagtctacgaccgccgccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccg -# gccaatctgggagcaaactgcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatc -# aaacttctcaacatcatccagtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaacc -# acctgggtgttggacacagctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgcc -# aacaacgtgacatcttcctcttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtata -# a] -# protein sequence = [MVSTRIAPSPSGRIHFSTLIRPARTCAACIRRKTIHYRIKLGWARQKSITNSSASLKKLRIQGGSRRPRRIMFTLQPT -# PTAIGTVVPPWSAGTLIERLPSLEDMAHKDNVIALRNLPCLGAAGGSGLGGIAGKPSPTMEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLG -# GVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQEN -# VCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPANSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESI -# YEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPHSSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGP -# SVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDGHQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERT -# HYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKLRNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNS -# LPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRHGEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNM -# HHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLTPPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYA -# LPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPSPCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGK -# QQFFASCFYSPWV] -# end gene contig41.g71 -### -# start gene contig41.g72 -contig41 AUGUSTUS gene 35171 58958 0.01 + . ID=contig41.g72 -contig41 AUGUSTUS transcript 35171 58958 0.01 + . ID=contig41.g72.t1;Parent=contig41.g72 -contig41 AUGUSTUS start_codon 35171 35173 . + 0 Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 35171 35483 0.31 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 39079 39241 0.23 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 40493 40693 0.94 + 1 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 40765 41036 0.55 + 1 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 43582 43805 1 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 43867 44269 0.95 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 44418 45247 0.49 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 47876 47998 0.99 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 50623 50937 0.99 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 52323 52448 0.65 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 52835 53011 0.57 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 53321 53548 0.56 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 54373 54546 0.95 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -contig41 AUGUSTUS CDS 58917 58958 0.36 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 -# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga -# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt -# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc -# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacacaaatcgacggtttcgcgccgacattcgcgaaaaaacccgctatacgacaggaagaaga -# tggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccacaacggagcagctgttaaggaatcaatacgcc -# ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat -# aagcagtgtggtctcctctgaccaaggtgaatatcgcgcgcaagcgaaaaacaagcacggttctggagtcgcaactattaatcttaatttcgaaagtg -# gatcgaaaaaaattccagatggaaagtcgccacgctttccaaaaaaaccaacgatccgccaagaagaggacctactcatcatggaatgcgtattggaa -# gcgcatccggtcccagacattgtctggtattgctcagataaggaaatatccgataatcaaagaacgaaaatgacccgcaaggcaataactaaagacaa -# ctacgttttgaccctggaaatccaaaaccccacaaaagaagatggcggcaactatcgctgtaacgcaattaatatgtatggcgaaagtgcgagcgacg -# ccaatggttttgcaccatcatttatcgagaaaccaaggataatcccaaatgagtctggcacactaataacaatgaagtgcaagtgcaaggccaaacct -# gagccaaccgtaacttggtacaggggtcaagacatggtggagaagagtaagaagataaaaataaatacaacagttattgcggaagacacttacgaact -# gacattggaaataaaggatcccggggcaactgatggtggaacctacaggtgcaatgtcaaaaacgaatatggtgaatcaaacgccaatcttaacctta -# acattgaagcggagcctgagccggagggtgaggggccaacgttcattgaaaagccgcgcattgtatccgaaaacaacggtaaattggttataatggag -# tgcaaggtcaaggcagatccaaaaccagatgtaatttggttccgcaacggagaagtcataaaggaaagcaacaaaatcaaaacgtttattgagcagcg -# tggtgaccaatactacattaagctggagctattagatccccaactagaggactctggcctttacaagtgcaacattaagaacaccctcggcgagctga -# atgcgaatcttacattgaatatagaaattgttcccgtcattaaagataaacctaaaattattaagattatcaaaaaacgaactgttattatcgagtgc -# acagttgcatcaaagttcgaacctaagtgtacttggtataaggaaacaaacactgtaaaagaaagcaagagacacgtttacctggtggagcaaactaa -# ggacggagagtttgctgtcaaactagagataaacgatgttgaagagagtgataagggcgcttacaaattggtggctagtaacgaaaaaggacaagctg -# tatctcaagttgtcaatctcgttgatattcccgaggaggaacgcaagcccagcaagccggaaatctcccgaaagctcgttgatcaaaaggtttccgag -# tcaaagactttcgagcttttaatcagtctggcccagtcagatcgcaagtgcaaaatcgagtggtacaagggcagcaccttaatacgcgaaaccaaaga -# cattaccaccacgttcgatggaacaactgcacgactcacatttagctcggcaagaacggaacacacttcaaactataaagtcattgtgaccaacgaag -# taggcaaggccgaatcgtcgtgcaagattacagtggagaaaggcacaaagaagaaagaggaacaacccaaagaaaaggataagtcgaaggcagaaaag -# gaaaaagaggaaaaggtaaataaaaatataaatacatctaaatgtgtgcaggacacgcatcaggtcttagaatctgtaacggcacaggagattcaaag -# caaggaacgccaggtcgtagctaagatggaagagcattatataaatcagaaatctagcactcaactaaacactgcaagtattgtgtctgtcgaagaag -# agatctcggcagaagtacgacgccaatcagtagtcaaaatgcaggacgagatcacagtcgatgataaaagggtatcgtcgagaaggacatccctggct -# gtaatagaggagcaaaaacctgccgaagaactgccaaagctgcgtaaaacatctatcgctcaagtaaaagaagatgcaaagcctgaagttgcaaaacc -# aaaagcgaaagctaaagcaaaaccaaaaccaaaatacgaagagctcccagaaattccagactacgaacgtccacagctagaaaagtatgaaagatctg -# attttacgcccaccgactttggtcgtgaacttgaaataccaaacaaaatggaaaaacccatattagatagtggaaagaaggaatctgaggcaccagtc -# cagaaaaatggaattcctaaaaagtcggaaataattgaaaagcctgcagaggaacccaagggcttgaaaatcggcaaaggtaaactacccgatgaaga -# tgacagtcgagacggcgctattcttaagccagtcattattgagccagagcaggccgataaaccatctgtactagatattataaagcagcgacgtcgat -# cctctatcagaaatctgatgactaaggaaccaattcaaaatgaatcattccttggggtagttttaaagcccgtgataaaggatgctaaagagcaggtt -# gcgcctcagcaagctatacagttaacgaaggcaaatgcgacagagcagttatctcatacaaaggcaatcaaggcgaaagtttcggacctaaaaaagcc -# agaagctctagcgacccttgaggatgattatgagcggcccgtgttagaaaaatgtgaccctgtcaacttcgataacaacaaatcagagaaacctacac -# cagcaattatcacaccggacactaaacacccacaagtaaaattgccggtagaagaacctaaggaagagaagccaaaggtttccaggatgcaaccgcct -# tccccaggtgagccaccgaagatagaagtaatacgggagaagcgaccatctctagcaccggagccgccaagtcgccgtggatctcttatcccgccagc -# cgatactggacgtcggccgtctctgatcatcaatgatgagacccttagcatcatcgaaatcactgcgttggtcaaaatttag] -# protein sequence = [MGVAEDFAPSFVKKPQLHQEDDGNRLIFECQLLSSPKPDIEWFRSDNKLVEDGRTKFKIQPVEDNKYTVVLELDDVVE -# TDAGLYKVKAKNKSGEVSASINLNFTHKSTVSRRHSRKNPLYDRKKMENDYYLSAALTLIQYPPLFGSTTEQLLRNQYAIRSHGETILNESKRYKMSL -# TMDQKLYHMACLEISSVVSSDQGEYRAQAKNKHGSGVATINLNFESGSKKIPDGKSPRFPKKPTIRQEEDLLIMECVLEAHPVPDIVWYCSDKEISDN -# QRTKMTRKAITKDNYVLTLEIQNPTKEDGGNYRCNAINMYGESASDANGFAPSFIEKPRIIPNESGTLITMKCKCKAKPEPTVTWYRGQDMVEKSKKI -# KINTTVIAEDTYELTLEIKDPGATDGGTYRCNVKNEYGESNANLNLNIEAEPEPEGEGPTFIEKPRIVSENNGKLVIMECKVKADPKPDVIWFRNGEV -# IKESNKIKTFIEQRGDQYYIKLELLDPQLEDSGLYKCNIKNTLGELNANLTLNIEIVPVIKDKPKIIKIIKKRTVIIECTVASKFEPKCTWYKETNTV -# KESKRHVYLVEQTKDGEFAVKLEINDVEESDKGAYKLVASNEKGQAVSQVVNLVDIPEEERKPSKPEISRKLVDQKVSESKTFELLISLAQSDRKCKI -# EWYKGSTLIRETKDITTTFDGTTARLTFSSARTEHTSNYKVIVTNEVGKAESSCKITVEKGTKKKEEQPKEKDKSKAEKEKEEKVNKNINTSKCVQDT -# HQVLESVTAQEIQSKERQVVAKMEEHYINQKSSTQLNTASIVSVEEEISAEVRRQSVVKMQDEITVDDKRVSSRRTSLAVIEEQKPAEELPKLRKTSI -# AQVKEDAKPEVAKPKAKAKAKPKPKYEELPEIPDYERPQLEKYERSDFTPTDFGRELEIPNKMEKPILDSGKKESEAPVQKNGIPKKSEIIEKPAEEP -# KGLKIGKGKLPDEDDSRDGAILKPVIIEPEQADKPSVLDIIKQRRRSSIRNLMTKEPIQNESFLGVVLKPVIKDAKEQVAPQQAIQLTKANATEQLSH -# TKAIKAKVSDLKKPEALATLEDDYERPVLEKCDPVNFDNNKSEKPTPAIITPDTKHPQVKLPVEEPKEEKPKVSRMQPPSPGEPPKIEVIREKRPSLA -# PEPPSRRGSLIPPADTGRRPSLIINDETLSIIEITALVKI] -# end gene contig41.g72 -### -# -# ----- prediction on sequence number 42 (length = 70020, name = contig42) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 42 on both strands -# start gene contig42.g73 -contig42 AUGUSTUS gene 5165 63391 0.01 + . ID=contig42.g73 -contig42 AUGUSTUS transcript 5165 63391 0.01 + . ID=contig42.g73.t1;Parent=contig42.g73 -contig42 AUGUSTUS start_codon 5165 5167 . + 0 Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 5165 5477 0.8 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 9073 9235 0.38 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 10487 10687 0.89 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 10759 11030 0.75 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 13576 13799 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 13861 14263 0.95 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15241 0.54 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 0.99 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 1 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 0.68 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 22829 23005 0.6 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 23315 23542 0.48 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 24367 24540 0.99 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 30507 30654 0.95 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 31052 31425 0.95 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 33445 34090 0.3 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 34314 34667 0.62 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 35289 37001 0.84 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 38584 39303 0.66 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 39596 40359 0.57 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 40445 40580 1 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 40773 41663 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 41730 44402 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 45248 45529 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 45588 45887 0.77 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 45951 50220 0.4 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 50278 54041 0.5 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 54225 55421 0.91 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 55493 56471 0.51 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 56532 56873 1 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 57569 58611 0.9 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -contig42 AUGUSTUS CDS 62757 63391 0.99 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 -# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga -# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt -# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc -# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacacaaatcgacggtttcgcgccgacattcgcgaaaaaacccgctatacgacaggaagaaga -# tggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccacaacggagcagctgttaaggaatcaatacgcc -# ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat -# aagcagtgtggtctcctctgaccaaggtgaatatcgcgcgcaagcgaaaaacaagcacggttctggagtcgcaactattaatcttaatttcgaaagtg -# gatcgaaaaaaattccagatggaaagtcgccacgctttccaaaaaaaccaacgatccgccaagaagaggacctactcatcatggaatgcgtattggaa -# gcgcatccggtcccagacattgtctggtattgctcagataaggaaatatccgataatcaaagaacgaaaatgacccgcaaggcaataactaaagacaa -# ctacgttttgaccctggaaatccaaaaccccacaaaagaagatggcggcaactatcgctgtaacgcaattaatatgtatggcgaaagtgcgagcgacg 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IIDCKPSDSGKYSCKATNCHGSDETECVVIVEALDKSSSKRKVVSGDKAPKIVSHLESRFVRDGDAVTLACRIIGAEHFDVVWLHNNKEIKPSKDFQY -# TNEANIYRLQIAEIFPEDGGTYTCEAFNDVGESFSTCTINVTVPGDEPKHPAFVKFPTSVSLLEGEATTFECELDSELLNLVWVKDGKPIDETLSRYS -# FTKDDNRYAFTVAKCNMDDVGQYQAKAVARKGESICAFSINVHNADA] -# end gene contig42.g73 -### -# -# ----- prediction on sequence number 43 (length = 50016, name = contig43) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 43 on both strands -# start gene contig43.g74 -contig43 AUGUSTUS gene 584 33383 0.01 + . 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ID=contig43.g75 -contig43 AUGUSTUS transcript 39583 44773 0.09 - . 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gtacctaaatatggtcttcttacatcagataaaataaaaaaagatctaagttctttaaaatatataaaacctttcaaggcgaaacgttttaaatcgtt -# tatttcaccgtttcttggcgttgcaaagtgtttaccaacgtgtcgacgtgctaaacacaaagttaagaaatggcttaactcttcgattcacttcggac -# aaatttcacaacattttgaagtttccgaaattaaagcagaacataaatttaataattccagtccgctaaaggttaacattgatgttccgatttctggt -# atcaacagccatattaaaaatcacgtgccaacacaagttaatcccaacatcaatatattaccatcacctgaaactttatttaatacgagctctgggaa -# tgctttcagtaatagtttattaaaattggctaatgataataatcctgaaacaagcgatacaagtagtgataacgattatcaaggtgacagtcctcata -# gtgctagtagttcaagcacttttagcttttctagtttaaaagaaactcaagactccataaatgaaaagcttaaaaataagaggattgaatcactcggc -# acaaaagcaaagttacatcatcgaaataaaagaatatatgcaggcgatgatatgaaaaaaaaaaaacatttacaaaaagaatttaatattccaggcaa -# gcggataaagactgttttaaatggaaatttgtttaatctgagtagtaataacaacagcagtgatagcgagaatgaagcagagaattataatgaaaacg -# aatacgaaaacagtaatagggaggaatatgccattgttcaacgcccactaggtgatggtggagctaccagcaatcatattgtattaacaataaagaaa -# 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SDIGNLKKTIPNSYVKDATKIRNTTHISMGKGKSISKTHRSAFRSRNTRYRQAVQKNVKGRIKTIDLELKHLFHLKPKANNHISDLKLHNKLFFHHEL -# CIENDVGIKEKIINYSSSSSSYDDDSEAENTSTEEEEKVKKSSSFGAHNLEFETETSAGAAVQVKFESENDSILTSSNDSDIADEGEREEINYTVDEC -# NDFRNNNMLQSFNSICAESTVASIKSAPPIASLESQTKYNSDDSNRCFNNNLHVGLTNEISNISQKSTESAELTNKLPLLGVEYRTGIRPSPDAAPTS -# LADKDIPRIQQFKEWHQVLQLKSYNNEPLIVLPYVLLE] -# end gene contig43.g75 -### -# -# ----- prediction on sequence number 44 (length = 50013, name = contig44) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 44 on both strands -# start gene contig44.g76 -contig44 AUGUSTUS gene 1472 4761 0.08 - . 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ID=contig44.g77 -contig44 AUGUSTUS transcript 11632 20182 0.11 - . 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ID=contig45.g78 -contig45 AUGUSTUS transcript 1628 10178 0.11 - . 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ID=contig46.g79 -contig46 AUGUSTUS transcript 42718 44481 0.73 - . ID=contig46.g79.t1;Parent=contig46.g79 -contig46 AUGUSTUS CDS 42718 44481 0.73 - 0 ID=contig46.g79.t1.cds;Parent=contig46.g79.t1 -contig46 AUGUSTUS start_codon 44479 44481 . - 0 Parent=contig46.g79.t1 -# coding sequence = [atggctcactctgacttgggtgcttcgcaggcgaccacggccgaccaggatcacggggccacatcgaacaacagtcatg -# tgcctaagcaaactgtgccgagcatatatccccttggaacctcgcgaaacccgcaagctcaagccacgacaatggctctagagcaataccggctgcag -# ctgtacaactacgcccttaatattgaacgatttagatgccctcaatacggtggcaccggaggcgccgccacaagtgctccatggctgcatttaagccc -# ctacggaccccatatatcgggcaatattccagcagtcaatcgaatggccgcgctctcaacgatttcactcttcccccaatcgcaacggatctttcaac -# ccgaggagcctaaaccgcaacacagttacattggtcttatagccatggccattttgagctcaacagagatgaagttggtcctgtcagacatttaccaa -# tatattttggataattatccgtattttagaagccgcggtccgggttggaggaactccatcagacataatctctcattgaatgattgtttcatcaaatc -# cggtcgcagtgcaaacggcaaggggcactactgggcaatacacccggcaaacatggatgattttcgcaaaggcgatttcagacgtcgcaaggctcagc -# gtaaagtccgaaaacacatgggtctgtcggtagatgatgccagcactgactcgcccagcccgccgcccttggatctcacaaccccacctccgcccaat -# tcccagtcggcactgcaactgtcgtctctggcatatccttaccaccatcagtatataggccagttctttaaccgcaactcagcacccggcctgtcaca -# gtactgcgcagagcctgcaattgtgatgcaacgacagcaggccaaccaggtggatcaggcgatccaaccagcccaacttcagcagcaacatggccagc -# atcagcacattgcttatatcaactccaccacgacaacaaccattgcaaatatgttctcgcagacacggaagcgccagttcgacgtggcgtcgctactg -# gcacccgatgtgcagatcgttgacattgtctccgaagatcaagagtcctctgtcaggccatcgagcacggcgaggactacgactcaaacgcaccacac -# agtcatcaccaagcaaaccatacaccgggaagtggtcttgggactggaacaacctgtgactgaggcagacattgacactgatgtcgatgtagaagtga -# atgtggatgtggtcgacgaaagcatcaatccagatcccgatgcttatccggagacggatgaccaagaaaatggcagaggaaccgtgaagcaaatattc -# tccgtggaggacaataactcgtaccttagcgacggcaggctgtcttcgttcgatgccgaccccgaccacgatcccgaagaccttgaacagcacaacta -# ttcaatttccagctcggcagcaaggtccttgggcagtagcagtagccaacacgaggagtccagctcactagaggaatgtccactggcagagtccactg -# cagggcccttgactgtagcgagaccgcccacccttacagcagccattccaaatgcatatattgaactcaaccatgttgatccccacatgcttagtagg -# tactacgggacatacatggccgccgctgcccgaagagctagtatagaggcgtcgaaagcagtaaggccatcctcaataacgccacctccgaaaatcga -# agtagtctcacggaagtaa] -# protein sequence = [MAHSDLGASQATTADQDHGATSNNSHVPKQTVPSIYPLGTSRNPQAQATTMALEQYRLQLYNYALNIERFRCPQYGGT -# GGAATSAPWLHLSPYGPHISGNIPAVNRMAALSTISLFPQSQRIFQPEEPKPQHSYIGLIAMAILSSTEMKLVLSDIYQYILDNYPYFRSRGPGWRNS -# IRHNLSLNDCFIKSGRSANGKGHYWAIHPANMDDFRKGDFRRRKAQRKVRKHMGLSVDDASTDSPSPPPLDLTTPPPPNSQSALQLSSLAYPYHHQYI -# GQFFNRNSAPGLSQYCAEPAIVMQRQQANQVDQAIQPAQLQQQHGQHQHIAYINSTTTTTIANMFSQTRKRQFDVASLLAPDVQIVDIVSEDQESSVR -# PSSTARTTTQTHHTVITKQTIHREVVLGLEQPVTEADIDTDVDVEVNVDVVDESINPDPDAYPETDDQENGRGTVKQIFSVEDNNSYLSDGRLSSFDA -# DPDHDPEDLEQHNYSISSSAARSLGSSSSQHEESSSLEECPLAESTAGPLTVARPPTLTAAIPNAYIELNHVDPHMLSRYYGTYMAAAARRASIEASK -# AVRPSSITPPPKIEVVSRK] -# end gene contig46.g79 -### -# -# ----- prediction on sequence number 47 (length = 35007, name = contig47) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 47 on both strands -# start gene contig47.g80 -contig47 AUGUSTUS gene 2708 4471 0.7 - . 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ID=contig47.g81 -contig47 AUGUSTUS transcript 22954 34914 0.22 - . ID=contig47.g81.t1;Parent=contig47.g81 -contig47 AUGUSTUS CDS 22954 23079 0.9 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 23132 23286 1 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 28046 28120 0.96 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 28179 29141 0.91 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 29810 32428 0.65 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 34008 34293 0.9 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 34351 34524 0.95 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS CDS 34579 34914 0.91 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 -contig47 AUGUSTUS start_codon 34912 34914 . - 0 Parent=contig47.g81.t1 -# coding sequence = [atgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttaca -# 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ctgtacgactgttaagctcgaagacctcgccattgtgggctgtcaataatgtagttggtaatggtggcgatgacaatcttcctgaatgggctatggaa -# aatccatcagagttgggtggtagttttgatgctagtggagcctttcatggtgatgctgatcctcaaaataacaaaagtttaaaagccaaaggttttaa -# ctctgatcagagcttgtcaaaatctaaaagtgaaccccttaatgagaatgatagtgtaaacgataaaacttctgaagtctctttaacgaatttatcgg -# cttcgcaggaattacccgaaagccgtttgtctccagtaaactcaacaacaaaaacggatgtcatccatggggatatttcagatcgaatcaaagaagtt -# gccgatgaagtggaaaaacttataacagaagatgataataaaccctttacgaattcaaaccaacttcaaagtgatagcggtcactttcctgctgcgct -# gccaagcttgacagataatgagttgagcacgacaccgatttctgtgaatccttctatagtgcgacagcaagtagctaccaccatgcctatacaaatcg -# caactacaatttcagaagcaactcaaccatctcatcagcattcaactgttccgttttcaaatctggttgctatgcagcaccataacatgcaacatcag -# ccacatttttcaatggttcctacgccacatttgatcaatccaaatctcaatgaattatggttttatcgggatccccaggcaaatgtacagggtccatt -# cagtgcgatggagatgaccgaatggtaccgtgctgggtactttaatgaaaatttgttcgtgcgacgattctccgataataggtttagacccttgggcg -# 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ID=contig48.g83 -contig48 AUGUSTUS transcript 19507 60769 0.05 - . 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NSTKQTQGQQMDPTPTFITTSAENFSSESSTANVTMTSPPRLYKNAEDTLYAATVSNITDVNHFYSEGLIDSNSALEGNISDTYDESYNEMILTDKLV -# DEQIVGRDSGYGLTENPYSYHVSCVGQDDTTKACSQLHDIPIDTSFVIEQAEIKSGLVHFPESTTKKGGTTSGGMFGSILGKAAAAVQSATHAVNQGA -# SSVASVVSQKQSVVPTAHNIRDLSPNAIKRDSNRDSVGFNVMNVDYSYQLGNEESLSSHYENTGDDYENSNIKMHEYGTYTDNKAFVNYHSNGNQSQF -# QDDTAIFGQSKVIGNGTKILPTVPPAGSTGKKLPTVNGKSGLLIKQMPTEIYDDESELDELDGSPLIGKKPSYHIDSEQDDYYLGLQQTTPSNQANGY -# YEHVNNGYDYREDYFNEEDEYKYLEQQREQEKLHQPKNKKYLKQTKGVLSTTQPQSSLDFIDEGQDDDFMYENYHSEEDSGNYLDESSSGSVGPSEGR -# NLKMDSNGDASLASTSNQMKRDSFTNNSLHKLDTVVGESTSNLTGIIKEKMCSDLDERSEDINDQLSDLTDINKLTLLKKKSLLRGETEEVVGGHMQM -# IRQPEITARQRWHWAYNKIIMQLNPLGQGIPKEKSQFQKRDSKPNTEERFAFAENALRSQIQIKEQLRHQQQSTMYATSLANTPAAASVEAQFLNQPT -# ERPNYPLRVNSLHHKNLTAAEKQQSQMQPPICKSPMGMDASYSSYQNTNGSMVSIKSEQQLCQIYNSQQHSDYIISDYMDKIATRISLLETELKFAWR -# ALDLLSTEYGKIWVRLEKLENISIEQQSVVSNLMDLIGAANQEQQQSDFEGLDYPLFQDEDQLLPLVMNDTMGLAMVLEAEQSDPDYNKELHFGDHNH -# 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ID=contig49.g84.t1;Parent=contig49.g84 -contig49 AUGUSTUS CDS 1470 1532 0.77 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 1598 1672 0.97 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 4928 5059 1 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 6707 12505 0.93 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 20638 24656 0.44 - 2 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 24717 25701 0.61 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS CDS 25755 25760 0.96 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 -contig49 AUGUSTUS start_codon 25758 25760 . - 0 Parent=contig49.g84.t1 -# coding sequence = [atgacgcactatgcaaggcatgattactttcataatacccaaaacggtgccttatcctctgacaccggtcgatcacctt -# atagtcatattccttacagagcacagaacagcagagaatattatgccgagccgtacgatttaggcaatcatggactagaggaatatagtagtgagtgc -# 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ccatatttcaacacgtggacgactagcggtggcaattacctaccattcgaagttggacaaggtgctaatatttcaactcaatcctacacagtcacgac -# taaagctgaatcagtaatgtcaccattaacaagtttcatccctcctctgttcatatcttcgaattttaattccaagaatttaacggaagatatcgtat -# tttcaacaacaagttctcctcacgacaaaaacacaactgttagttacagttcatctaacaacgcgttcacaaaaactgtttacgtaaataatcccgaa -# gaggtgccagttaccacaagcgaaaacgctataccgccgtcatcggacttaacgttaaggtcaccatcgtcattagttcctattctatcttacacgga -# ttacatgaagcaatttgagttaccagatttgcctcagccaatcatggaactttcagaaaatatacctgttactcacagtgattctaattctgttccta -# tcaatgatattgctactaatgccgaattttcctgtcctcccaatgagttggatgttacaagtaaatgtagtgacccattaccttcgtatttgggtgaa -# ctttttgatgcatataacgtgcccagcctttcgattgagaatcaagaatctcccatcaagggtcaaattggcgatttatttaacattgcaatcgtacc -# ccaggtaccaattaacaccatagaatgttcagtagaccctccgaatcgatttaatttattgccagaggctgatgcggtagaaaaccatgcggtagcat -# tcgatgataatttttacgatagttttaatgttgacataaaagaactgacggcatctgttgcaaacattgaaccagaaaatggttcacgcaacttccca -# 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cgccgcggctgtaacctgtcggactctgaattagatatgccggactttactccatcggataacgataaaagctctataaccggaagtaaaattttaag -# aaatcatttcgaggatgaagtggatgaagattttgaccaatccacctgtgcctatgaggataacaaggaattgggtggttcaatggaggagttaaagg -# acagtatgccacataatttgtttgctgttctaggcgacctcaaaaaagttcaaagccccacaacaactattgctgtctcggcgacaattcccgttaag -# aacagttccattacaaatagtaataaaataagcactctggaaaatgtaaccattaaaatgccagagattctcttggagacaaaatcacaggcgtgcct -# tcaaaaactgaactcagtttatgctgacgactttggcgatgagaacgtacttggaaactcggtcagcatggatgcgaatgtccccaccctaagcattc -# tggaaacaactgaagatgtcggggatacagcattaagtacattcctgacaacgccaacagcaacaacaacaacaacagtccctcgtaatctcagttcc -# aatggtgttttgtgggtcacgcagcagtgtttagaccttccaaacaatactggctatgggtcgcgggaagatgacgataatcgaagccagcattctgc -# tcgcactctctcttcttcgcgcaggcaaagcactgaggatagcatagacacagacgacgaatacttttattatgagcttcggcagctggaggagcagg -# aacagcgctgtgcggaactttctggaattgcatctgccgaatcgcatgatgataacgaggtgctattttcccagatagggcaacttgtccaaaacgat -# tttaacggaggagcccgatgtcgatctgatgtctgtgaaaatgacctagaaactattaatttttctccaagtgaaagtgtgaagttacggatgtctga -# agtatttattgagcttaaaagcgtcgttaaattacagtcagacgtatttgctgacgctgctgttaaagagttggttgttgcaaaggcagcaggtgaaa -# aatttgcggcagtatgtgacatgcatagtgcttggcaggacgtaaacggcgatttccaagagacagcctcagaaatggattcgactgacgatgccgag -# atcgaaaataaaaaccatcgaaagttgcgacgattaaagaaaacacgcgatcgaaatgttaatatttctgacgatgcagccagttcaagttcgtcatg -# cctttctgaaaatgaatgtgaacacaagagtaaaaatagacctattgatcattgtattaataaatccgatggagaaaaggatgaaataaatagaccaa -# tcaaatcgacggcttctagtgagacatctggacctgatacgccggcagagataagcgatgttgagataagcgagacagaaaatgatctgagagatgat -# ggaaacccattgcttgacaatccagagtttctattggatgtaaatgaaaaatcgaatccacaatctggaaacaatttaaaaaaagaggccctagaacc -# ggctcagagtaatatgcagtcaatggagaatattaaaaccgaaccagttccacctaacacccctaaaatgttaattagtcaagaatcagattttgatg -# gatcccaggttataggtagcaatggtgaagcgggtcttggcagtagcaagtggaaattattaaaaactttaaaggagcgcaagatcgaggagaaaaat -# aatcaagataaaattaaagaagatgaaatgaccaaggacagggagaagaatggcggtggtactggagatattggattacgtaccaatggacatcctgg -# tgacaatcctttctacagtaatattgacagcatgccggatattcggcctcgcagaaaatcaattccccttgtttctgagctgacaatggctgctacaa -# aacgaaatgctggacttacatctgctgttccacgtgcaacgcttaacgacgaagaactgctatcacacaccattttattttactacaatatcactgaa -# gcggtgcgacgcgaagcggcatga] -# protein sequence = [MTHYARHDYFHNTQNGALSSDTGRSPYSHIPYRAQNSREYYAEPYDLGNHGLEEYSSECHLTSDRVLTTIDKRNNSYE -# YDYIECYEAQEQRDVESESIDNWNENHSGVGAQYGFEYANQKCTSAKVLPTLPVNKTGSGPSKPSATQMDIIFKTKGMCIEKDQRFGVCMAKADEYDL -# RILPGDYQNIYADNLNGYAGFAYPSTFLNNAVPAAPSRALPQTNRSSFYLGQDIFGLNADEAQREEQSKCDFGMDQAVTMDSGSTSYDVLEKMSRPYT -# SMLPLDYSDYHDSYYNTDNLSTYSDTPPTTNSQLKLQKQRKLSLMMAMTTASVIASDSILGNNISTNAATKASDRFLETECSGGIVTLSGPGAVTGTP -# PVALSTIIKTRKLPKVLPAPQFNSSLHLNSSTANALSSPVYSSDTAAEKSHRPKQLPKLPTSLPQIKPYSIHNSNLTTLSAADELPSYSLKSNTASSP -# LAITETVATTSYLSSTETKTCPSKKPNEVYLTKSIDDGLTPPWTPSPPTQLKQYFSPSAELPSQIVQKNSPTSHLPDIEKAKSDIKPDLHENLNESIL -# ECKKSPEPCSEPESALFNISEYPKPYTLDIIPFSGEKENHITNAASTSTTTHSYDDNGELCTELIKLQYSEPSGDSHLFPYFNTWTTSGGNYLPFEVG -# QGANISTQSYTVTTKAESVMSPLTSFIPPLFISSNFNSKNLTEDIVFSTTSSPHDKNTTVSYSSSNNAFTKTVYVNNPEEVPVTTSENAIPPSSDLTL -# RSPSSLVPILSYTDYMKQFELPDLPQPIMELSENIPVTHSDSNSVPINDIATNAEFSCPPNELDVTSKCSDPLPSYLGELFDAYNVPSLSIENQESPI -# KGQIGDLFNIAIVPQVPINTIECSVDPPNRFNLLPEADAVENHAVAFDDNFYDSFNVDIKELTASVANIEPENGSRNFPSSSVENSTDIDDKPSDEFI -# NEKTVGTRDLNQNLSSGQGGYYKPSQAQQKASVVASAATSVLGGISKGLKGGLDGVFSGVSSTVEVSQTTNSTKKGFSFNLASKLVPSVGGLLSSSSS -# NSTKQTQGQQMDPTPTFITTSAENFSSESSTANVTMTSPPRLYKNAEDTLYAATVSNITDVNHFYSEGLIDSNSALEGNISDTYDESYNEMILTDKLV -# DEQIVGRDSGYGLTENPYSYHVSCVGQDDTTKACSQLHDIPIDTSFVIEQAEIKSGLVHFPESTTKKGGTTSGGMFGSILGKAAAAVQSATHAVNQGA -# SSVASVVSQKQSVVPTAHNIRDLSPNAIKRDSNRDSVGFNVMNVDYSYQLGNEESLSSHYENTGDDYENSNIKMHEYGTYTDNKAFVNYHSNGNQSQF -# QDDTAIFGQSKVIGNGTKILPTVPPAGSTGKKLPTVNGKSGLLIKQMPTEIYDDESELDELDGSPLIGKKPSYHIDSEQDDYYLGLQQTTPSNQANGY -# 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-# ttgtactggagttggaatcactaataacagccaaattacattgaccagttcgcatataggaacaactatgggagtcgctctgggcacgactgcagcag -# gcacaacctacatgcacgagaaaaatattgttggcgttagcgtcagttgtgttgataccagtagaaagtatgatttcaaaaacagtagtttgataaaa -# aataatagcttccaagcagcggcagagtatgtttcaacgggaaacaatagttctggtaatagccgttcaaatccacaaagtggggcaatatttcgtgg -# accacctccaacggcgaataccccacgcggtgccaccagcggtgcaacacgccatgttcatgttcaacccatgtactcacagccccttcaccaaaata -# tggtgatacaacaatacacacaatataacccgcgacaacaaacatttccaacttctcacttgcaatatgcaccagccccaatgccctactaccagtac -# caatacgtgccaactattcaacagcagcctccgccacatactcgtagtgccgtatcggttagtacgaacgtcaatgtgggaaacactttgcaaccagt -# ccagtccggaccaaatgggcctctgacagctccaggatcaacttcgtcgcagctacaattgatcactagcacagtgcagccaggaacaaacaatgtaa -# tgggtgttggtggtcctggcagtggaatgggacagacaaactctaacacagataatgacttttcggagcaggttactcttccaaacactcccacagtt -# gtcttgtcagaaggtcaaatacgtattccacagcaagatactgttggaataaataatttaagcaatacaacatcacaaggatccgaaacacggacaaa -# 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number 51 (length = 50015, name = contig51) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 51 on both strands -# start gene contig51.g86 -contig51 AUGUSTUS gene 1559 30331 0.01 - . 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contig51.g87 -contig51 AUGUSTUS gene 36903 47091 0.01 + . ID=contig51.g87 -contig51 AUGUSTUS transcript 36903 47091 0.01 + . ID=contig51.g87.t1;Parent=contig51.g87 -contig51 AUGUSTUS start_codon 36903 36905 . + 0 Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 36903 37584 0.49 + 0 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 39880 40423 0.97 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 42313 42446 0.87 + 1 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 45674 45733 0.63 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 45795 46090 0.82 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -contig51 AUGUSTUS CDS 46765 47091 0.33 + 0 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 -# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta -# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca -# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat -# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca -# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca -# gtgtctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttga -# tctatttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacact -# cggagggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgca -# gcagacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccg -# cattcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttgg -# aggatattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaa -# aggaacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccac -# tgagataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttg -# ttgtggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcac -# caccatactcagcgccttaagtatattagtccacaatcccaggtggtaataacagcctctttaatcgcaatacaggttcttatcaccatgatttggat -# ggtagttgaacctccaggaactcgtttctattatccagaccgaacagaagtgatccttaagtgcaaaatacaggacatgtccttccttttttcacagt -# tgtataatatgattctcataacaatatgcacagtttatgctattaaaacgaggaaaataccagaaaattttaatgagtcaaagtttattggattcact -# atgtacaccacttgtataatctggctagcttttgtacccatatactttggaactggaaattcttatgaggtgtacatcctcgtctttcacccggataa -# aaacgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacac -# aggcaggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggc -# caatcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaa -# ttaa] -# protein sequence = [MKLTRDKIIILAIMLMLSPVANLKSLNNVHTQDTVSVSLPGDIILGGLFPVHEKGEGAPCGPKVYNRGVQRLEAMLYA -# IDRVNNDSNILPGITIGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISP -# ASTAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNA -# RGVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEP -# VSDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHTQRLKYISPQSQVVITA -# SLIAIQVLITMIWMVVEPPGTRFYYPDRTEVILKCKIQDMSFLFSQLYNMILITICTVYAIKTRKIPENFNESKFIGFTMYTTCIIWLAFVPIYFGTG -# NSYEVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPE -# ECECAEAFCNRVKN] -# end gene contig51.g87 -### -# -# ----- prediction on sequence number 52 (length = 40012, name = contig52) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 52 on both strands -# start gene contig52.g88 -contig52 AUGUSTUS gene 6895 17083 0.02 + . ID=contig52.g88 -contig52 AUGUSTUS transcript 6895 17083 0.02 + . ID=contig52.g88.t1;Parent=contig52.g88 -contig52 AUGUSTUS start_codon 6895 6897 . + 0 Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 6895 7576 0.42 + 0 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 0.97 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 0.82 + 1 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 15666 15725 0.52 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 15787 16082 0.85 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 0.33 + 0 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 -# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta -# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca -# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat -# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca -# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca -# gtgtctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttga -# tctatttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacact -# cggagggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgca -# gcagacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccg -# cattcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttgg -# aggatattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaa -# aggaacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccac -# tgagataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttg -# ttgtggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcac -# caccatactcagcgccttaagtatattagtccacaatcccaggtggtaataacagcctctttaatcgcaatacaggttcttatcaccatgatttggat -# ggtagttgaacctccaggaactcgtttctattatccagaccgaacagaagtgatccttaagtgcaaaatacaggacatgtccttccttttttcacagt -# tgtataatatgattctcataacaatatgcacagtttatgctattaaaacgaggaaaataccagaaaattttaatgagtcaaagtttattggattcact -# atgtacaccacttgtataatctggctagcttttgtacccatatactttggaactggaaattcttatgaggtgtacatcctcgtctttcacccggataa -# aaacgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacac -# aggcaggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggc -# caatcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaa -# ttaa] -# protein sequence = [MKLTRDKIIILAIMLMLSPVANLKSLNNVHTQDTVSVSLPGDIILGGLFPVHEKGEGAPCGPKVYNRGVQRLEAMLYA -# IDRVNNDSNILPGITIGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISP -# ASTAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNA -# RGVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEP -# VSDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHTQRLKYISPQSQVVITA -# SLIAIQVLITMIWMVVEPPGTRFYYPDRTEVILKCKIQDMSFLFSQLYNMILITICTVYAIKTRKIPENFNESKFIGFTMYTTCIIWLAFVPIYFGTG -# NSYEVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPE -# ECECAEAFCNRVKN] -# end gene contig52.g88 -### -# start gene contig52.g89 -contig52 AUGUSTUS gene 23254 30182 0.17 - . ID=contig52.g89 -contig52 AUGUSTUS transcript 23254 30182 0.17 - . ID=contig52.g89.t1;Parent=contig52.g89 -contig52 AUGUSTUS CDS 23254 23318 0.81 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 23377 23658 0.38 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 24806 25012 0.59 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 27339 27713 0.95 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 0.94 - 0 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30182 0.7 - 0 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 -contig52 AUGUSTUS start_codon 30180 30182 . - 0 Parent=contig52.g89.t1 -# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc -# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct -# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc -# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt -# atgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttgttgcccaga -# agtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgcaagcgttgc -# taatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttcaaaatgaca -# cgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgcaaactcctat -# cacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaacaatgaaga -# ccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaatagcaacgtca -# gtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactctgcaaacaa -# aatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttggataattccct -# aatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataataatgaacttc -# caggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattggtattccgagtgttaaggatttagaagcgcaaatgactaaagtagacatgcggccggattat -# gtaaacactgtaggaggaccattctctcaagttgtgcaagcggaaaaacctattcctagggacactgagggattcaaaaaattactgcaacagttggg -# ctatcaatctaggcagcatcatcctggcaatgacgtttaccatataataaatcattcaaatataactaatcatgaccatcttgagtcaaatcaacagc -# ataagataaacaactgccattcccaacactcagcgttaagtgtccacgggccaaacataccgagtaatagtcacatatttgcgcaaaaacgtttggaa -# acccatcacctaatgcaaagccttatttgcggggacgtttctctggacttcttggaaaaagagttgggtaatcctagcactgcaccttccacaaagga -# agttattgcgtcagtcctccgtgaatactcccataacaagagaaatcctgtgtccattggggatcacaaaatgtttacacattcaacgtttcttcaag -# ctcaaccagttcatccgcattattctgaagtactgaggaaaatgacagccgataaggaaacaactcaaacaccgagttcttctcatagccaacagcca -# caatatcaaatgcatccacagcatgccaagcaacttagtgagacgcagccaacagcacctatagccgtgcagcctcgaatgatattgggaggtggaaa -# ctttgtcattggcccaaataaccaaccaatatctcccaatttgcaacagtgccgaaatcaacagggaataaaatggactcctggtaatatgcagatgg -# tgcaagggaaatcatttggagtcaattttgccatgtccgtctgtctgtcttaccgtatgaatgctgagatctcggcaacttaa] -# protein sequence = [MSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSGTNN -# GETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNTETE -# KDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQLET -# IDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTESEFN -# FDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIGIPSVKDLEAQMTKVDMRPDYVNTVGGPFSQVVQAEKPIP -# RDTEGFKKLLQQLGYQSRQHHPGNDVYHIINHSNITNHDHLESNQQHKINNCHSQHSALSVHGPNIPSNSHIFAQKRLETHHLMQSLICGDVSLDFLE -# KELGNPSTAPSTKEVIASVLREYSHNKRNPVSIGDHKMFTHSTFLQAQPVHPHYSEVLRKMTADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTA -# PIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGVNFAMSVCLSYRMNAEISAT] -# end gene contig52.g89 -### -# start gene contig52.g90 -contig52 AUGUSTUS gene 32268 33026 0.91 - . ID=contig52.g90 -contig52 AUGUSTUS transcript 32268 33026 0.91 - . 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ID=contig53.g91 -contig53 AUGUSTUS transcript 3247 10175 0.15 - . 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ID=contig53.g92 -contig53 AUGUSTUS transcript 12261 24119 0.04 - . 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ID=contig55.g94 -contig55 AUGUSTUS transcript 6802 33037 0.13 + . ID=contig55.g94.t1;Parent=contig55.g94 -contig55 AUGUSTUS start_codon 6802 6804 . + 0 Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 6802 6809 0.33 + 0 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 12258 12438 0.74 + 1 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 29483 29737 0.99 + 0 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 29800 29948 1 + 0 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 32756 32875 0.53 + 1 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -contig55 AUGUSTUS CDS 32929 33037 0.43 + 1 ID=contig55.g94.t1.cds;Parent=contig55.g94.t1 -# coding sequence = [atgcttctatattatgaaacaggatcaattaaacctcgagcgataggtggttcaaaaccacgagtagctacaaccccgg -# tcgtacaaaaaattgcggactataaacgggaatgtcccagcatatttgcatgggaaataagggatagactgctgtccgagcaagtttgcaatagtgat -# aacattccaagtgtctggttctcaaaccgccgcgccaaatggcgtcgggaagaaaagatgagaactcagaggcggtcggccgataatgttggtggcag -# tggtcgagccagcacgacaaataatccttcggggacagctgtaaattccacagtagcaacgtcgaataactcaacacccggcattaccagctcaacac -# tcaacgtatcggaacgggcgtcatcggctataattagcaatagcatacccgagacaccgaatgggccaactgttctgggtggagacgctaacgccgca -# cacaccacctctgaaagtccaccacttcaggcagttgcaccgcggctacccttgaacactggctttaacgccatgtactcatctatcccgcaacccat -# agctacaatggctgaaaactacaagatctccatatgtaccaccacaccaccgaaacacagcttgcaatcctgcagctgcgcaccagcagccacctcag -# catggcgtttatgccaacagttctccaatgacatcatcaaatacaggggtcatttctgcaggcgtttcggtgcctgtccagatttcaacgcaaaatgc -# atcggacctcgcgggaagcaactactggccacgtcttcagtgatcgtcaatctttaa] -# protein sequence = [MLLYYETGSIKPRAIGGSKPRVATTPVVQKIADYKRECPSIFAWEIRDRLLSEQVCNSDNIPSVWFSNRRAKWRREEK -# MRTQRRSADNVGGSGRASTTNNPSGTAVNSTVATSNNSTPGITSSTLNVSERASSAIISNSIPETPNGPTVLGGDANAAHTTSESPPLQAVAPRLPLN -# TGFNAMYSSIPQPIATMAENYKISICTTTPPKHSLQSCSCAPAATSAWRLCQQFSNDIIKYRGHFCRRFGACPDFNAKCIGPRGKQLLATSSVIVNL] -# end gene contig55.g94 -### -# -# ----- prediction on sequence number 56 (length = 55020, name = contig56) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 56 on both strands -# start gene contig56.g95 -contig56 AUGUSTUS gene 1802 28037 0.09 + . ID=contig56.g95 -contig56 AUGUSTUS transcript 1802 28037 0.09 + . 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ID=contig56.g96 -contig56 AUGUSTUS transcript 38038 53620 0.04 - . ID=contig56.g96.t1;Parent=contig56.g96 -contig56 AUGUSTUS CDS 38038 38205 0.98 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 38270 38415 1 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 38468 38598 1 - 1 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 38660 39046 0.99 - 1 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 39119 39314 0.99 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 46743 47855 0.2 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 49901 51146 0.62 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS CDS 52391 53620 0.35 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 -contig56 AUGUSTUS start_codon 53618 53620 . - 0 Parent=contig56.g96.t1 -# coding sequence = [atgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaatagcaggtt -# 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gcactaaattcaacttggttcaggccggtttcttgggaaaacctagctcggatttggctcaaagtctgggtatatccattcaggatgacgtgttattc -# gctgctttttcaaaaggcgacggaaacacaccaactaacaactctgcactatgcatttactcattgaaatccattcgtcgtaaatttatgcaaaacat -# aaaatcctgttttaacggtaatgggatgaggggacttgactttatatcacccagcatgccatgtgttttaacgaaactacaaacaattggagaggatt -# tttgtggactcgatgtaaattctccgttgggaggagagaatcctattacttcagtgccggttgctatgtttaacacgaagttaacttcagttgctgca -# acgagcactagtggatataccgttgtattcgtgggcacagcagatggatacctcaagaaagttgtagtcgaatcttcatctgttgcgaatgagtacgc -# cagttttcctgtggacttgggctctgaaattaatcaggatatgcagtttgacaaccaaaacctttacatgtatgtcatgtccgaaactaaagtatcaa -# aagttaaagtgtttgattgctctgattacaagacatgtggagaatgcctaggtgctagagacccatattgcggttggtgctcattggagaataaatgt -# agcccacgatccaattgccaggacgacgccaacgatcctttatattgggtcagctataaaactgggaaatgtactacaataacaagtgttgtgcctca -# ccagctacagcgtactactgctcggactttagagcttatcatagatcacttgccgcaactaaaggagaatttaatatgtgcatttaccacagaggata -# 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ID=contig57.g99 -contig57 AUGUSTUS transcript 45155 52058 0.09 - . ID=contig57.g99.t1;Parent=contig57.g99 -contig57 AUGUSTUS CDS 45155 45219 0.46 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 47394 47486 0.71 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 49327 49453 0.99 - 0 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 49515 49624 0.85 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 49898 50170 0.92 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 51823 51917 0.97 - 1 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS CDS 51994 52058 0.99 - 0 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 -contig57 AUGUSTUS start_codon 52056 52058 . - 0 Parent=contig57.g99.t1 -# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa -# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat -# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc -# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc -# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt -# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt -# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt -# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH -# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK -# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig57.g99 -### -# -# ----- prediction on sequence number 58 (length = 50011, name = contig58) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 58 on both strands -# start gene contig58.g100 -contig58 AUGUSTUS gene 5202 7547 0.98 + . 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ID=contig58.g100.t1;Parent=contig58.g100 -contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 Parent=contig58.g100.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 1 + 0 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 1 + 2 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 0.98 + 2 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 -# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg -# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt -# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg -# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga -# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag -# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac -# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt -# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc -# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt -# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg -# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc -# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga -# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg -# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt -# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt -# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] -# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ -# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG -# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE -# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY -# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS -# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] -# end gene contig58.g100 -### -# start gene contig58.g101 -contig58 AUGUSTUS gene 20148 27051 0.14 - . ID=contig58.g101 -contig58 AUGUSTUS transcript 20148 27051 0.14 - . ID=contig58.g101.t1;Parent=contig58.g101 -contig58 AUGUSTUS CDS 20148 20212 0.52 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 0.76 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 0.97 - 0 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24617 0.89 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 0.92 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 0.97 - 1 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27051 0.66 - 0 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 -contig58 AUGUSTUS start_codon 27049 27051 . - 0 Parent=contig58.g101.t1 -# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa -# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat -# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc -# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc -# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt -# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt -# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt -# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH -# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK -# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig58.g101 -### -# -# ----- prediction on sequence number 59 (length = 40011, name = contig59) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 59 on both strands -# start gene contig59.g102 -contig59 AUGUSTUS gene 10148 17051 0.11 - . ID=contig59.g102 -contig59 AUGUSTUS transcript 10148 17051 0.11 - . ID=contig59.g102.t1;Parent=contig59.g102 -contig59 AUGUSTUS CDS 10148 10212 0.53 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 12387 12479 0.65 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 14320 14446 0.98 - 0 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 14508 14617 0.88 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 14891 15163 0.94 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 16816 16910 0.96 - 1 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS CDS 16987 17051 0.55 - 0 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 -contig59 AUGUSTUS start_codon 17049 17051 . - 0 Parent=contig59.g102.t1 -# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa -# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat -# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc -# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc -# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt -# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt -# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt -# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca -# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] -# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH -# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK -# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR -# W] -# end gene contig59.g102 -### -# -# ----- prediction on sequence number 60 (length = 50013, name = contig60) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 60 on both strands -# start gene contig60.g103 -contig60 AUGUSTUS gene 22241 32526 0.14 + . ID=contig60.g103 -contig60 AUGUSTUS transcript 22241 32526 0.14 + . ID=contig60.g103.t1;Parent=contig60.g103 -contig60 AUGUSTUS start_codon 22241 22243 . + 0 Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 22241 22251 0.2 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 22372 29494 0.15 + 1 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 29560 29780 1 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 29847 31965 0.97 + 1 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 32025 32145 1 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -contig60 AUGUSTUS CDS 32204 32526 0.98 + 2 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 -# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg -# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt -# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa -# tattaagcgggcagttatatcattactgcaatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtcca -# ctgtaggcaatgcaaacataataacgaaggttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaac -# gagaaagctggtatcacgtctagcctactattgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacaga -# aacatacaagtttgttggaactactaaaggaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagcta -# actcgccatctactggctccactgttagaagcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatct -# gatcttgtggatttgactggcgattatgtgaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagacttt -# attagagctggctgcatacccacatccaaacaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagag -# ttatattgaaacagcttcctaagtttgatgataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaat -# caagcagctgctcagctgctaccgaacgctcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaagg -# acctgaaattgatgccatatctaaaaagtttacggatggcctaaaacggtgtaagccaaatactaagaaggaagaagaacggattgtctatattttaa -# agggaataggaaatgcaaagagcttaggtggcaacactgctgctgtccttagtgagtgcgcctccacgggccgttccaatcgtatacgtgtagcggct -# ttgagagcattttcaacaattgattgcaatggagcactgcgaactaaggctttggaactacttaagaaccgcaacgaggactcagagttacgtattga -# agcctatttgtcttcaatttcatgtcccaacgcagaggtggccaaccagatttcagatatagtcaattccgaaacagttaaccaggtaggaggattta -# tttcatctaatttaaaagccattcgggactcgacagacgccagccgtgagcagcaaaggtaccatttagggaacattcgagtgactaagaaatttcct -# gcggattacagacgatacagtttcaacaatgaagtttcctacaaactggaatcccttggccttggagctagttctgactatcaattaatttattcgca -# acatgggttcttaccccgatcatctcgtatcaatgttacaactgaaatttttggaactaacttcaacgtatttgaagcaagcgtacgtcaggaaaatt -# ttgaggatgtgctggaatattatctgggaccgaaggggttgttaaacaaagatttcaatgaaatagttaagatcattgaagttggaaacaacgcggct -# gctagtgctggtggtcgagcccgacgctcaattgccgacgatgttgctaagatatcgaaaaagtataaaacttacggtgctaaaagtgtgcaagatct -# 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ID=contig61.g105.t1;Parent=contig61.g105 -contig61 AUGUSTUS start_codon 7236 7238 . + 0 Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 7236 7246 0.37 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 7367 14489 0.32 + 1 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 14555 14775 1 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 14842 16960 0.95 + 1 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 17020 17140 1 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -contig61 AUGUSTUS CDS 17199 17521 0.97 + 2 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 -# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg -# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt -# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa -# 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ID=contig63.g108 -contig63 AUGUSTUS transcript 4369 17721 0.09 + . ID=contig63.g108.t1;Parent=contig63.g108 -contig63 AUGUSTUS start_codon 4369 4371 . + 0 Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 4369 4421 0.53 + 0 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 4822 5122 0.55 + 1 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 0.77 + 0 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 11546 11653 0.84 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 11995 12117 0.56 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 17609 17721 0.4 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 -# coding sequence = [atgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatcgctctgggcagtatgattttttgtg -# gccgagttttatcggacgccgccggcttcctattttggtatgccggggcctgcgatggtttcagcatcctggacagtgatggatccacctccatgggt -# tctggagtgcctccacagtgcccatcgctgtgtggatcaaggtgcacctgtgccttgttctgtttagtaaagtgtggactttttccagcacttacttg -# cgtgtatgcctggcgggacgtttgttggcgttcatgcgcccttggatttgttttcgtatccttctgttacaagctgaatatttggcctgggaagtggt -# gtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattt -# tccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctca -# aagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatg -# gtggcgcatacggatcatatggctatggggctggtgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgcca -# gacctggtcaggtctcctttagctgcaactcgggccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaaagtccgagttttctgactcggaact -# atcctctgacaaagcatctgtttgcattggatttatagttatagtcaaagctgaatcatcccaaactaagccatcatcaacaatctaa] -# protein sequence = [MMANGSVWDTVAILFIQIALGSMIFCGRVLSDAAGFLFWYAGACDGFSILDSDGSTSMGSGVPPQCPSLCGSRCTCAL -# FCLVKCGLFPALTCVYAWRDVCWRSCALGFVFVSFCYKLNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDT -# SMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYTQYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAA -# SPGSGKSEFSDSELSSDKASVCIGFIVIVKAESSQTKPSSTI] -# end gene contig63.g108 -### -# start gene contig63.g109 -contig63 AUGUSTUS gene 20635 28361 0.05 - . ID=contig63.g109 -contig63 AUGUSTUS transcript 20635 28361 0.05 - . ID=contig63.g109.t1;Parent=contig63.g109 -contig63 AUGUSTUS CDS 20635 20703 0.21 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 22334 22879 0.68 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 26229 26336 0.84 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 26403 26903 0.91 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 26957 27099 0.99 - 2 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 28214 28361 0.36 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 -contig63 AUGUSTUS start_codon 28359 28361 . - 0 Parent=contig63.g109.t1 -# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat -# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg -# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca -# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa -# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg -# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg -# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc -# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta -# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa -# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag -# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta -# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa -# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat -# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat -# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct -# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] -# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE -# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE -# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF -# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI -# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF -# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] -# end gene contig63.g109 -### -# start gene contig63.g110 -contig63 AUGUSTUS gene 36899 51455 0.1 + . ID=contig63.g110 -contig63 AUGUSTUS transcript 36899 51455 0.1 + . ID=contig63.g110.t1;Parent=contig63.g110 -contig63 AUGUSTUS start_codon 36899 36901 . + 0 Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 36899 36901 0.99 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 36954 37086 1 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 37151 37311 0.95 + 2 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 40574 40738 0.92 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 40795 40953 0.7 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 42037 42240 0.97 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 45152 45256 0.84 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 50734 51124 0.8 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -contig63 AUGUSTUS CDS 51178 51455 0.33 + 2 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 -# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat -# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa -# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga -# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca -# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc -# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac -# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc -# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat -# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta -# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt -# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa -# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg -# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg -# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt -# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga -# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga -# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] -# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN -# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL -# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR -# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG -# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL -# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] -# end gene contig63.g110 -### -# -# ----- prediction on sequence number 64 (length = 40016, name = contig64) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 64 on both strands -# start gene contig64.g111 -contig64 AUGUSTUS gene 5630 13356 0.04 - . ID=contig64.g111 -contig64 AUGUSTUS transcript 5630 13356 0.04 - . ID=contig64.g111.t1;Parent=contig64.g111 -contig64 AUGUSTUS CDS 5630 5698 0.11 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 7329 7874 0.63 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 11224 11331 0.83 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 11398 11898 0.92 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 11952 12094 0.98 - 2 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS CDS 13209 13356 0.44 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 -contig64 AUGUSTUS start_codon 13354 13356 . - 0 Parent=contig64.g111.t1 -# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat -# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg -# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca -# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa -# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg -# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg -# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc -# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta -# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa -# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag -# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta -# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa -# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat -# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat -# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct -# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] -# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE -# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE -# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF -# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI -# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF -# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] -# end gene contig64.g111 -### -# start gene contig64.g112 -contig64 AUGUSTUS gene 21894 36450 0.08 + . ID=contig64.g112 -contig64 AUGUSTUS transcript 21894 36450 0.08 + . 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ID=contig65.g113 -contig65 AUGUSTUS transcript 1885 42915 0.02 + . ID=contig65.g113.t1;Parent=contig65.g113 -contig65 AUGUSTUS start_codon 1885 1887 . + 0 Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 1885 1887 0.99 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 1940 2072 0.99 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 2137 2297 0.9 + 2 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 5560 5724 0.89 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 5781 5939 0.71 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 7023 7226 0.91 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 10138 10242 0.84 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 15720 16110 0.97 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -contig65 AUGUSTUS CDS 42380 42915 0.14 + 2 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 -# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat -# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa -# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga -# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca -# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc -# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac -# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc -# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat -# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta -# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt -# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa -# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg -# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg -# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattgatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggtt -# caaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattatcaatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgca -# agcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgatgacctaaaactaaaagaacagcaccaagctaaaaaaatgg -# cagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgaggatcgtgatctcttgcagggacattatgctactataacccaa -# gaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttgaaatggaagtttccgatttaaactctgagtttcaattgga -# tagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaacaattggtttataaatttaatccaagttttcaaaaaaatg -# gaagaaactggtaa] -# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN -# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL -# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR -# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG -# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIDVKSLNSKKEVQIIESGKNSDVPRKTTNSL -# SIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHLSAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKML -# EMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNW] -# end gene contig65.g113 -### -# -# ----- prediction on sequence number 66 (length = 45011, name = contig66) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 66 on both strands -# (none) -# -# ----- prediction on sequence number 67 (length = 44531, name = contig67) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 67 on both strands -# start gene contig67.g114 -contig67 AUGUSTUS gene 7489 44111 0.03 + . ID=contig67.g114 -contig67 AUGUSTUS transcript 7489 44111 0.03 + . 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ID=contig68.g115 -contig68 AUGUSTUS transcript 4505 24961 0.03 - . 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ID=contig69.g116 -contig69 AUGUSTUS transcript 30000 43409 0.03 + . ID=contig69.g116.t1;Parent=contig69.g116 -contig69 AUGUSTUS start_codon 30000 30002 . + 0 Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 30000 30334 0.73 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 31328 31448 1 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 40335 40510 0.93 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 40569 40800 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 40859 41109 0.67 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 41958 42188 0.57 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42238 42382 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42438 42544 0.99 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42702 42781 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 42839 43045 0.24 + 2 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -contig69 AUGUSTUS CDS 43387 43409 0.22 + 2 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 -# coding sequence = [atgattgatccaagttcgagtgaagaagaaggcgaagatgaccccattgctaatgtgtcatcgaaaggacgtcttacac -# atgcacccaagggcacaaacaccgtttccatattaggtggggtttcaggtcccggtgtaggatcaaatatggctatttctggttctaatggtgatttg -# gccgggaatcaaagacaatctaatataagttctattagtaaccgaaatgatgctggaaacgtggcaggagttggaggctcctctaacaaaaatgagca -# aatacatggtagccgagttgacggcggcaatcttgaggtgcccaacagctgtattcccagcggtgtttcgcaagaaactttaaatcaaagtattggat -# cgtcgagggccaactctttgccacggccattgtcaccatcaccatctttaaccagcgaaaagcctgacactggagatccacatgcttttcttaaaggt -# gaaactcaaataatggcggatgaagcctttcaaaatgctgtacagagttatcacgacgtgtttcttaaatcggagcgagttttaaagatggtccaatc -# tggagcatcatcgcaacatgattttcgcgaagtttttcgtaacaacatagaaaaacgagtcagatctttacctgagattgatggtcttagtaaggaaa -# ctgtactaacttcttggatggcaaaattcgacataatattaaaaggaactggagaagaggactcgaagcgaccatctcggatgcagcaatcacttaat -# agcgagttaattctttcaaaagagcaattgtatgatatgtttcaacaaatattgttagtaaagaaatttgagcatcaaattttgtataacgccttgat -# gctagactctgccgatgaacaagcagcggctataagacgggaattagatggaagaatgcaacgtgtaggagaaatggagaaaaatcgcaaacttatgc -# caaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgaggaacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcg -# aaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaacgatataatcacaggaaattgatactgcggtctcacggatccttgtccaagttgga -# gggtgactctgaagatggttctacacaattaacaaagttggatgttgtacttacctttcaattggaagtgatcgttatggaggttaaaggtcttaaat -# cattagctcctaatcgcattgtgtactgcacaatggaagttgaaaatggagaaaagcttcaaacggatcaagcggaagcatcaaaaccaatgtgggat -# acgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgctggcattggaagataaggaact -# gggaaaagtaatccttaaacctacccctctttcatccaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacgga -# ttaagatagcttgccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatgga -# tatacagtagattacatagaagccgccagtgcaaatttgatgtttggcatcgatttaaacggtggacgatttttcttcaacgctgtacgtgagggtga -# tagtatttcctttgcttgcgatgatgagaatgaatgcagtttatgggtaatggccatgtacagggcaactggtcaatcccataagccaactccaccaa -# taacacaagataagaattcagcaatgtcaaaaattcaaggtgagtcacaagacaagtcgatctag] -# protein sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG -# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHAFLKGETQIMADEAFQNAVQSYHD -# VFLKSERVLKMVQSGASSQHDFREVFRNNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLTSWMAKFDIILKGTGEEDSKRPSRMQQSLNSELILSKEQLYDMFQQILL -# VKKFEHQILYNALMLDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHR -# KLILRSHGSLSKLEGDSEDGSTQLTKLDVVLTFQLEVIVMEVKGLKSLAPNRIVYCTMEVENGEKLQTDQAEASKPMWDTQGDFTTTHPLPVVKVKLY -# TENPGMLALEDKELGKVILKPTPLSSKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASANLMFGIDL -# NGGRFFFNAVREGDSISFACDDENECSLWVMAMYRATGQSHKPTPPITQDKNSAMSKIQGESQDKSI] -# end gene contig69.g116 -### -# -# ----- prediction on sequence number 70 (length = 55020, name = contig70) ----- -# -# Predicted genes for sequence number 70 on both strands -# start gene contig70.g117 -contig70 AUGUSTUS gene 47 47328 0.01 + . ID=contig70.g117 -contig70 AUGUSTUS transcript 47 47328 0.01 + . ID=contig70.g117.t1;Parent=contig70.g117 -contig70 AUGUSTUS start_codon 47 49 . + 0 Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 47 381 0.82 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 1375 1495 0.97 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 10382 10557 0.95 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 10616 10847 0.99 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 10906 11156 0.58 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 12005 12235 0.46 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 12285 12429 0.99 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 12485 12591 1 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 12749 12828 0.93 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 -contig70 AUGUSTUS CDS 12886 13092 0.66 + 2 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agcgagttaattctttcaaaagagcaattgtatgatatgtttcaacaaatattgttagtaaagaaatttgagcatcaaattttgtataacgccttgat -# gctagactctgccgatgaacaagcagcggctataagacgggaattagatggaagaatgcaacgtgtaggagaaatggagaaaaatcgcaaacttatgc -# caaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgaggaacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcg -# aaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaacgatataatcacaggaaattgatactgcggtctcacggatccttgtccaagttgga -# gggtgactctgaagatggttctacacaattaacaaagttggatgttgtacttacctttcaattggaagtgatcgttatggaggttaaaggtcttaaat -# cattagctcctaatcgcattgtgtactgcacaatggaagttgaaaatggagaaaagcttcaaacggatcaagcggaagcatcaaaaccaatgtgggat -# acgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgctggcattggaagataaggaact -# gggaaaagtaatccttaaacctacccctctttcatccaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacgga -# ttaagatagcttgccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatgga -# tatacagtagattacatagaagccgccagtgcaaatttgatgtttggcatcgatttaaacggtggacgatttttcttcaacgctgtacgtgagggtga -# tagtatttcctttgcttgcgatgatgagaatgaatgcagtttatgggtaatggccatgtacagggcaactggtcaatcccataagccaactccaccaa -# taacacaagataagaattcagcaatgtcaaaaattcaaggtgctcgcgttgcgccagacggcagcatttttctgtgggcgtcgttttttgttgcagct -# gcgacgcgaaactcctcgtcataccattggttccgtgtgggtgggcgcttgaacccaatggttgtttcagcagcagctcgcatggagtgggatatgtg -# cgcccagagtccgctggcatcaacatggagagggataggttggtggagcagttccgaaaggggacagccatatgaccttgtggatgtcgaggttccga -# aatctggtgctactcactaccatgtttcgtgccgtggcgaagtcaatcagcctgagaccgttgttcgagatggtctcatggaggctgaatcgaccgac -# ggtggggtcaaagatgcgttcgcgaccgagctttgcgttgaagtcccggaggataaacttcacgtcgtggtctggggatggtttagtcctggtcaagt -# tttcgtgttggacgaatattgcgctcgctatggtgtgcggggatgctaccgacatttatgctacctttctgatttactggatcgtgcagaaaagcaac -# acatgatagatccaacactaattcactattcatttgcgttttgcgcaagccacgttcacggaaatcgacctgatggggtaggaagcattacgcatgag -# gaaaaggaaaaattttctgaaatcaaagaacgcctacgtcagttactggagtttcaaataaccaattttagatactgttttcctttcggtcgccccga -# aggcgctcttaaagcgacattatctttactagagagagtgctaatgaaagacattgttacccctgttccacctgaagaagttcgtcaaatgattaaaa -# aaagtttagagacggcagcgcttgtaaattacacccgtctctccaataaagctaagattgaaggcacttttccgttcaagggacacgtgccagggaaa -# tcctatcggaatttcaaaatttttccaagcactttcctgtacacgggaaacgtcccagggaaagcctatcggaaaggtcccagggaaatcccgtcgga -# tattcaggatttgcgaggagaggttattgttccgcccccaaaaaaactagaggacctaattcacttagcagaactttgtgttgatctgttgcaacaaa -# atgaagagcactatggagaactgcgcaaacatgacaaaatggataaaattaaaatgcgtaaggaagatgatgatgtaccaaaaggccacaatgaaagc -# gatattgatttaaccgccaatactggactcagtagcacatcagacctggcttctgcagcatcaactaatggatcgtcatttcgttattataatttgag -# gaatgggcgttttcatcagcacctgcgagacacattcgcaccattagtcgtgcggtacgtggatctgatggaatcttcaatagctcagtcgattcata -# agggatttgaaaaagaacgctgggaaagtaaagggaacggatgtgccacctctgaagacttattttggaaactagatgctctacagtcgtttataaga -# gacctgcactggccagacgcagagtttcgacaacatttagaacagcgtcttaaaatgatggccgtcgatatgatagagcaatgtatacaacgaactga -# ttcgtcttttcagtcgtggctaaaaaaaaacattgccttcatatcaactgattatattttaccttcagaaatgtgcgctatggtcaatgtgatattag -# atgctaaaaatcaaagctttaaattgactactattgacggcattgatttgtataaatttcatgcaaaaattgacgaccaaatcgacaaagcgaatgta -# gctatgacacaaggtctaactggtaaacttatgtcagtgctagagtcgactttgtcaaaattagcacgatacgacgaaggtagcctaatcggctcgat -# tcttagttttacaaatgtatcgagctcgggaaaggatctcgggcaaggatatgtaaatttctttagaaataatatggatcaagtacgaggaaaaattg -# gcgacgatttatggaccctgaatttctttgagcagtggtactcgcagcagattaacatgctatgtaattggctttcggaacgtttggaccacgctctg -# cactacgctcaagtttcatctatttctcacattatcaagaaaatatattcagacttcgaattacaaggtgtattagaagataaattaaactctaaagc -# atatcaagcagtcgcacagcgaatggcgacagaggaagcgacatgtgctttgacaatgcctgatgttagcgaagatgaaccctgtgacgacattcgag -# aaggggaagaagaagatactggcgacgaatctacctctaacataccaaggggcttaccaaaaccaaaaattgctgccgctcaagctgctgctgttacc -# aacgttgttgccggccgtgtgggtaatttactcggcaaaggcattggcggccttagttcaaagttgggaagtggaagttggttttaa] -# protein sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG -# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHAFLKGETQIMADEAFQNAVQSYHD -# VFLKSERVLKMVQSGASSQHDFREVFRNNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLTSWMAKFDIILKGTGEEDSKRPSRMQQSLNSELILSKEQLYDMFQQILL -# VKKFEHQILYNALMLDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHR -# KLILRSHGSLSKLEGDSEDGSTQLTKLDVVLTFQLEVIVMEVKGLKSLAPNRIVYCTMEVENGEKLQTDQAEASKPMWDTQGDFTTTHPLPVVKVKLY -# TENPGMLALEDKELGKVILKPTPLSSKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASANLMFGIDL -# NGGRFFFNAVREGDSISFACDDENECSLWVMAMYRATGQSHKPTPPITQDKNSAMSKIQGARVAPDGSIFLWASFFVAAATRNSSSYHWFRVGGRLNP -# MVVSAAARMEWDMCAQSPLASTWRGIGWWSSSERGQPYDLVDVEVPKSGATHYHVSCRGEVNQPETVVRDGLMEAESTDGGVKDAFATELCVEVPEDK -# LHVVVWGWFSPGQVFVLDEYCARYGVRGCYRHLCYLSDLLDRAEKQHMIDPTLIHYSFAFCASHVHGNRPDGVGSITHEEKEKFSEIKERLRQLLEFQ -# ITNFRYCFPFGRPEGALKATLSLLERVLMKDIVTPVPPEEVRQMIKKSLETAALVNYTRLSNKAKIEGTFPFKGHVPGKSYRNFKIFPSTFLYTGNVP -# GKAYRKGPREIPSDIQDLRGEVIVPPPKKLEDLIHLAELCVDLLQQNEEHYGELRKHDKMDKIKMRKEDDDVPKGHNESDIDLTANTGLSSTSDLASA -# ASTNGSSFRYYNLRNGRFHQHLRDTFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHKGFEKERWESKGNGCATSEDLFWKLDALQSFIRDLHWPDAEFRQHLEQRLKM -# MAVDMIEQCIQRTDSSFQSWLKKNIAFISTDYILPSEMCAMVNVILDAKNQSFKLTTIDGIDLYKFHAKIDDQIDKANVAMTQGLTGKLMSVLESTLS -# KLARYDEGSLIGSILSFTNVSSSGKDLGQGYVNFFRNNMDQVRGKIGDDLWTLNFFEQWYSQQINMLCNWLSERLDHALHYAQVSSISHIIKKIYSDF -# ELQGVLEDKLNSKAYQAVAQRMATEEATCALTMPDVSEDEPCDDIREGEEEDTGDESTSNIPRGLPKPKIAAAQAAAVTNVVAGRVGNLLGKGIGGLS -# SKLGSGSWF] -# end gene contig70.g117 -### -# command line: -# augustus --strand=both --noInFrameStop=false --gff3=on --uniqueGeneId=true --protein=on --codingseq=on --introns=off --stop=off --stop=off --cds=on --singlestrand=false 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--- a/test-data/gff3/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track Augustus_Gene_Predictions.bb - longLabel Augustus Gene Predictions - shortLabel Augustus Gene P - bigDataUrl tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/gff3/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/gff3/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/gff3_multi_fasta/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,38 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1188.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gff3ToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpESpr1K.sorted.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpl9r8fF.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/916/dataset_1284_files/myHub/Dbia3/tracks/Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Gff3.Gff3 object at 0x1e8acd0>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/916/dataset_1284_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/gff3_multi_fasta/gff3_multi_fasta_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions.bb">Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/gff3_multi_fasta/inputs/Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,2081 +0,0 @@ -##gff-version 3 -##sequence-region contig1 1 45179 -contig1 GlimmerHMM mRNA 641 20329 . - . 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ID=contig1.path1.gene2;Name=contig1.path1.gene2 -contig1 GlimmerHMM CDS 22912 23136 . - 0 ID=contig1.cds2.1;Parent=contig1.path1.gene2;Name=contig1.path1.gene2;Note=final-exon -contig1 GlimmerHMM CDS 23431 23705 . - 2 ID=contig1.cds2.2;Parent=contig1.path1.gene2;Name=contig1.path1.gene2;Note=internal-exon -contig1 GlimmerHMM CDS 26810 26939 . - 0 ID=contig1.cds2.3;Parent=contig1.path1.gene2;Name=contig1.path1.gene2;Note=initial-exon -contig1 GlimmerHMM mRNA 29101 41509 . - . 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ID=contig2.path1.gene1;Name=contig2.path1.gene1 -contig2 GlimmerHMM CDS 2231 2376 . - 2 ID=contig2.cds1.1;Parent=contig2.path1.gene1;Name=contig2.path1.gene1;Note=final-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 2719 2819 . - 1 ID=contig2.cds1.2;Parent=contig2.path1.gene1;Name=contig2.path1.gene1;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 5059 5162 . - 0 ID=contig2.cds1.3;Parent=contig2.path1.gene1;Name=contig2.path1.gene1;Note=initial-exon -contig2 GlimmerHMM mRNA 7745 11772 . - . ID=contig2.path1.gene2;Name=contig2.path1.gene2 -contig2 GlimmerHMM CDS 7745 7969 . - 0 ID=contig2.cds2.1;Parent=contig2.path1.gene2;Name=contig2.path1.gene2;Note=final-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 8264 8538 . - 2 ID=contig2.cds2.2;Parent=contig2.path1.gene2;Name=contig2.path1.gene2;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 11643 11772 . - 0 ID=contig2.cds2.3;Parent=contig2.path1.gene2;Name=contig2.path1.gene2;Note=initial-exon -contig2 GlimmerHMM mRNA 13934 36373 . - . ID=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3 -contig2 GlimmerHMM CDS 13934 13985 . - 1 ID=contig2.cds3.1;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=final-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 16198 18659 . - 0 ID=contig2.cds3.2;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 18713 18877 . - 0 ID=contig2.cds3.3;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 18940 19452 . - 0 ID=contig2.cds3.4;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 19507 20144 . - 2 ID=contig2.cds3.5;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 31678 31795 . - 0 ID=contig2.cds3.6;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=internal-exon -contig2 GlimmerHMM CDS 36245 36373 . - 0 ID=contig2.cds3.7;Parent=contig2.path1.gene3;Name=contig2.path1.gene3;Note=initial-exon -contig2 GlimmerHMM mRNA 39405 43538 . - . 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ID=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1 -contig4 GlimmerHMM CDS 3984 4148 . + 0 ID=contig4.cds1.1;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=initial-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 6591 6636 . + 0 ID=contig4.cds1.2;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 7276 7394 . + 2 ID=contig4.cds1.3;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 8392 8432 . + 0 ID=contig4.cds1.4;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 9291 9307 . + 1 ID=contig4.cds1.5;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 9588 9685 . + 2 ID=contig4.cds1.6;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 13122 13233 . + 0 ID=contig4.cds1.7;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 13464 13533 . + 2 ID=contig4.cds1.8;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 18109 18283 . + 1 ID=contig4.cds1.9;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 18722 18782 . + 0 ID=contig4.cds1.10;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 19022 19109 . + 2 ID=contig4.cds1.11;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 20791 20940 . + 1 ID=contig4.cds1.12;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 24938 26941 . + 1 ID=contig4.cds1.13;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 28563 28613 . + 1 ID=contig4.cds1.14;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 31331 31523 . + 1 ID=contig4.cds1.15;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 31759 31924 . + 0 ID=contig4.cds1.16;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 35604 35644 . + 2 ID=contig4.cds1.17;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 36906 37059 . + 0 ID=contig4.cds1.18;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 37833 37902 . + 2 ID=contig4.cds1.19;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 39954 40085 . + 1 ID=contig4.cds1.20;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon -contig4 GlimmerHMM CDS 50913 51981 . + 1 ID=contig4.cds1.21;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=final-exon -##sequence-region contig5 1 50018 -contig5 GlimmerHMM mRNA 408 37153 . + . ID=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1 -contig5 GlimmerHMM CDS 408 1939 . + 0 ID=contig5.cds1.1;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=initial-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 3561 3611 . + 1 ID=contig5.cds1.2;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 6329 6521 . + 1 ID=contig5.cds1.3;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 6757 6922 . + 0 ID=contig5.cds1.4;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 10602 10642 . + 2 ID=contig5.cds1.5;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 11904 12057 . + 0 ID=contig5.cds1.6;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 12831 12900 . + 2 ID=contig5.cds1.7;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 14952 15083 . + 1 ID=contig5.cds1.8;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 25911 26859 . + 1 ID=contig5.cds1.9;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 36466 36760 . + 0 ID=contig5.cds1.10;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 36969 37153 . + 2 ID=contig5.cds1.11;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=final-exon -contig5 GlimmerHMM mRNA 43345 44908 . - . ID=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2 -contig5 GlimmerHMM CDS 43345 44665 . - 1 ID=contig5.cds2.1;Parent=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2;Note=final-exon -contig5 GlimmerHMM CDS 44724 44908 . - 0 ID=contig5.cds2.2;Parent=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2;Note=initial-exon -##sequence-region contig6 1 40015 -contig6 GlimmerHMM mRNA 6658 7144 . + . ID=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1 -contig6 GlimmerHMM CDS 6658 6751 . + 0 ID=contig6.cds1.1;Parent=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1;Note=initial-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 6960 7144 . + 2 ID=contig6.cds1.2;Parent=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1;Note=final-exon -contig6 GlimmerHMM mRNA 13336 36917 . - . ID=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2 -contig6 GlimmerHMM CDS 13336 14656 . - 1 ID=contig6.cds2.1;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=final-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 14997 15090 . - 2 ID=contig6.cds2.2;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 18113 18398 . - 0 ID=contig6.cds2.3;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 19779 19872 . - 1 ID=contig6.cds2.4;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 20931 21078 . - 2 ID=contig6.cds2.5;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 21782 22112 . - 0 ID=contig6.cds2.6;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 26021 26962 . - 0 ID=contig6.cds2.7;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 27027 27130 . - 2 ID=contig6.cds2.8;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 28828 29941 . - 0 ID=contig6.cds2.9;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 32704 32811 . - 0 ID=contig6.cds2.10;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon -contig6 GlimmerHMM CDS 36864 36917 . - 0 ID=contig6.cds2.11;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=initial-exon -##sequence-region contig7 1 50017 -contig7 GlimmerHMM mRNA 3332 26913 . - . ID=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1 -contig7 GlimmerHMM CDS 3332 4652 . - 1 ID=contig7.cds1.1;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=final-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 4993 5086 . - 2 ID=contig7.cds1.2;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 8109 8394 . - 0 ID=contig7.cds1.3;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 9775 9868 . - 1 ID=contig7.cds1.4;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 10927 11074 . - 2 ID=contig7.cds1.5;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 11778 12108 . - 0 ID=contig7.cds1.6;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 16017 16958 . - 0 ID=contig7.cds1.7;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 17023 17126 . - 2 ID=contig7.cds1.8;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 18824 19937 . - 0 ID=contig7.cds1.9;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 22700 22807 . - 0 ID=contig7.cds1.10;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 26860 26913 . - 0 ID=contig7.cds1.11;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=initial-exon -contig7 GlimmerHMM mRNA 32769 33038 . - . ID=contig7.path1.gene2;Name=contig7.path1.gene2 -contig7 GlimmerHMM CDS 32769 33038 . - 0 ID=contig7.cds2.1;Parent=contig7.path1.gene2;Name=contig7.path1.gene2;Note=single-exon -contig7 GlimmerHMM mRNA 37329 49928 . + . ID=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3 -contig7 GlimmerHMM CDS 37329 37570 . + 0 ID=contig7.cds3.1;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=initial-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 38750 38793 . + 1 ID=contig7.cds3.2;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 38894 39182 . + 2 ID=contig7.cds3.3;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 39248 39354 . + 1 ID=contig7.cds3.4;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 39429 39655 . + 2 ID=contig7.cds3.5;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 39848 40351 . + 0 ID=contig7.cds3.6;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 40423 40623 . + 0 ID=contig7.cds3.7;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 44971 46843 . + 0 ID=contig7.cds3.8;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon -contig7 GlimmerHMM CDS 49915 49928 . + 2 ID=contig7.cds3.9;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=final-exon -##sequence-region contig8 1 35012 -contig8 GlimmerHMM mRNA 2758 3027 . - . ID=contig8.path1.gene1;Name=contig8.path1.gene1 -contig8 GlimmerHMM CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig8.cds1.1;Parent=contig8.path1.gene1;Name=contig8.path1.gene1;Note=single-exon -contig8 GlimmerHMM mRNA 7318 33446 . + . 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ID=contig9.path1.gene1;Name=contig9.path1.gene1 -contig9 GlimmerHMM CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig9.cds1.1;Parent=contig9.path1.gene1;Name=contig9.path1.gene1;Note=single-exon -contig9 GlimmerHMM mRNA 7318 38632 . + . 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ID=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3 -contig9 GlimmerHMM CDS 40665 40692 . + 0 ID=contig9.cds3.1;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=initial-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 41154 41207 . + 2 ID=contig9.cds3.2;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 41626 48168 . + 2 ID=contig9.cds3.3;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 49775 50088 . + 2 ID=contig9.cds3.4;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 50146 50340 . + 0 ID=contig9.cds3.5;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 50911 54199 . + 0 ID=contig9.cds3.6;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 54256 54494 . + 2 ID=contig9.cds3.7;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 54562 54691 . + 0 ID=contig9.cds3.8;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 54752 55279 . + 2 ID=contig9.cds3.9;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 55372 55813 . + 2 ID=contig9.cds3.10;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=internal-exon -contig9 GlimmerHMM CDS 57513 57603 . + 1 ID=contig9.cds3.11;Parent=contig9.path1.gene3;Name=contig9.path1.gene3;Note=final-exon -##sequence-region contig10 1 43013 -contig10 GlimmerHMM mRNA 850 15075 . + . ID=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1 -contig10 GlimmerHMM CDS 850 1074 . + 0 ID=contig10.cds1.1;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=initial-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 1132 1326 . + 0 ID=contig10.cds1.2;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 1897 5185 . + 0 ID=contig10.cds1.3;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 5242 5480 . + 2 ID=contig10.cds1.4;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 5548 5677 . + 0 ID=contig10.cds1.5;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 5738 6265 . + 2 ID=contig10.cds1.6;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 8447 8561 . + 2 ID=contig10.cds1.7;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 10885 11146 . + 1 ID=contig10.cds1.8;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 11823 12040 . + 0 ID=contig10.cds1.9;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 12828 13008 . + 1 ID=contig10.cds1.10;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 13180 13398 . + 0 ID=contig10.cds1.11;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 14537 14774 . + 0 ID=contig10.cds1.12;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 14882 15075 . + 2 ID=contig10.cds1.13;Parent=contig10.path1.gene1;Name=contig10.path1.gene1;Note=final-exon -contig10 GlimmerHMM mRNA 17334 17940 . + . ID=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2 -contig10 GlimmerHMM CDS 17334 17563 . + 0 ID=contig10.cds2.1;Parent=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2;Note=initial-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 17910 17940 . + 1 ID=contig10.cds2.2;Parent=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2;Note=final-exon -contig10 GlimmerHMM mRNA 21687 22382 . - . ID=contig10.path1.gene3;Name=contig10.path1.gene3 -contig10 GlimmerHMM CDS 21687 22382 . - 0 ID=contig10.cds3.1;Parent=contig10.path1.gene3;Name=contig10.path1.gene3;Note=single-exon -contig10 GlimmerHMM mRNA 24696 27471 . + . ID=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4 -contig10 GlimmerHMM CDS 24696 24708 . + 0 ID=contig10.cds4.1;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=initial-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 25731 25835 . + 2 ID=contig10.cds4.2;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 27079 27199 . + 2 ID=contig10.cds4.3;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 27285 27471 . + 1 ID=contig10.cds4.4;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=final-exon -contig10 GlimmerHMM mRNA 30099 42172 . - . ID=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5 -contig10 GlimmerHMM CDS 30099 30244 . - 2 ID=contig10.cds5.1;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=final-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 31348 31714 . - 0 ID=contig10.cds5.2;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 34057 34150 . - 1 ID=contig10.cds5.3;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 36047 36093 . - 0 ID=contig10.cds5.4;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 41616 41718 . - 1 ID=contig10.cds5.5;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 41777 41874 . - 0 ID=contig10.cds5.6;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon -contig10 GlimmerHMM CDS 42107 42172 . - 0 ID=contig10.cds5.7;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=initial-exon -##sequence-region contig11 1 35013 -contig11 GlimmerHMM mRNA 682 1377 . - . ID=contig11.path1.gene1;Name=contig11.path1.gene1 -contig11 GlimmerHMM CDS 682 1377 . - 0 ID=contig11.cds1.1;Parent=contig11.path1.gene1;Name=contig11.path1.gene1;Note=single-exon -contig11 GlimmerHMM mRNA 3691 6466 . + . ID=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2 -contig11 GlimmerHMM CDS 3691 3703 . + 0 ID=contig11.cds2.1;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=initial-exon -contig11 GlimmerHMM CDS 4726 4830 . + 2 ID=contig11.cds2.2;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=internal-exon -contig11 GlimmerHMM CDS 6074 6194 . + 2 ID=contig11.cds2.3;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=internal-exon -contig11 GlimmerHMM CDS 6280 6466 . + 1 ID=contig11.cds2.4;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=final-exon -contig11 GlimmerHMM mRNA 9094 32965 . - . 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ID=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3 -contig12 GlimmerHMM CDS 51846 51877 . + 0 ID=contig12.cds3.1;Parent=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3;Note=initial-exon -contig12 GlimmerHMM CDS 51939 52061 . + 1 ID=contig12.cds3.2;Parent=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3;Note=internal-exon -contig12 GlimmerHMM CDS 54300 54504 . + 1 ID=contig12.cds3.3;Parent=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3;Note=internal-exon -contig12 GlimmerHMM CDS 54566 54694 . + 0 ID=contig12.cds3.4;Parent=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3;Note=internal-exon -contig12 GlimmerHMM CDS 54943 54981 . + 0 ID=contig12.cds3.5;Parent=contig12.path1.gene3;Name=contig12.path1.gene3;Note=final-exon -##sequence-region contig13 1 45015 -contig13 GlimmerHMM mRNA 5833 12716 . + . 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ID=contig15.path1.gene4;Name=contig15.path1.gene4 -contig15 GlimmerHMM CDS 44931 45401 . - 0 ID=contig15.cds4.1;Parent=contig15.path1.gene4;Name=contig15.path1.gene4;Note=single-exon -##sequence-region contig16 1 45017 -contig16 GlimmerHMM mRNA 5783 6209 . + . ID=contig16.path1.gene1;Name=contig16.path1.gene1 -contig16 GlimmerHMM CDS 5783 6209 . + 0 ID=contig16.cds1.1;Parent=contig16.path1.gene1;Name=contig16.path1.gene1;Note=final-exon -contig16 GlimmerHMM mRNA 10493 17535 . - . ID=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2 -contig16 GlimmerHMM CDS 10493 10561 . - 0 ID=contig16.cds2.1;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=final-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 11381 11463 . - 2 ID=contig16.cds2.2;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 11518 11682 . - 2 ID=contig16.cds2.3;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 11922 11975 . - 2 ID=contig16.cds2.4;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 12601 12811 . - 0 ID=contig16.cds2.5;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 17222 17337 . - 2 ID=contig16.cds2.6;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 17406 17535 . - 0 ID=contig16.cds2.7;Parent=contig16.path1.gene2;Name=contig16.path1.gene2;Note=initial-exon -contig16 GlimmerHMM mRNA 20474 20749 . + . ID=contig16.path1.gene3;Name=contig16.path1.gene3 -contig16 GlimmerHMM CDS 20474 20749 . + 0 ID=contig16.cds3.1;Parent=contig16.path1.gene3;Name=contig16.path1.gene3;Note=single-exon -contig16 GlimmerHMM mRNA 23317 43623 . + . ID=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4 -contig16 GlimmerHMM CDS 23317 25126 . + 0 ID=contig16.cds4.1;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=initial-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 26889 27049 . + 2 ID=contig16.cds4.2;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 27109 27253 . + 0 ID=contig16.cds4.3;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 29072 29164 . + 2 ID=contig16.cds4.4;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 29221 29331 . + 2 ID=contig16.cds4.5;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 30805 30886 . + 2 ID=contig16.cds4.6;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 33017 33107 . + 1 ID=contig16.cds4.7;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 34338 34619 . + 0 ID=contig16.cds4.8;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 34685 34835 . + 0 ID=contig16.cds4.9;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 34991 35174 . + 2 ID=contig16.cds4.10;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 42456 42590 . + 1 ID=contig16.cds4.11;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 43033 43110 . + 1 ID=contig16.cds4.12;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 43293 43354 . + 1 ID=contig16.cds4.13;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon -contig16 GlimmerHMM CDS 43421 43623 . + 2 ID=contig16.cds4.14;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=final-exon -##sequence-region contig17 1 40013 -contig17 GlimmerHMM mRNA 466 741 . + . ID=contig17.path1.gene1;Name=contig17.path1.gene1 -contig17 GlimmerHMM CDS 466 741 . + 0 ID=contig17.cds1.1;Parent=contig17.path1.gene1;Name=contig17.path1.gene1;Note=single-exon -contig17 GlimmerHMM mRNA 3309 23615 . + . ID=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2 -contig17 GlimmerHMM CDS 3309 5118 . + 0 ID=contig17.cds2.1;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=initial-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 6881 7041 . + 2 ID=contig17.cds2.2;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 7101 7245 . + 0 ID=contig17.cds2.3;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 9064 9156 . + 2 ID=contig17.cds2.4;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 9213 9323 . + 2 ID=contig17.cds2.5;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 10797 10878 . + 2 ID=contig17.cds2.6;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 13009 13099 . + 1 ID=contig17.cds2.7;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 14330 14611 . + 0 ID=contig17.cds2.8;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 14677 14827 . + 0 ID=contig17.cds2.9;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 14983 15166 . + 2 ID=contig17.cds2.10;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 22448 22582 . + 1 ID=contig17.cds2.11;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 23025 23102 . + 1 ID=contig17.cds2.12;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 23285 23346 . + 1 ID=contig17.cds2.13;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 23413 23615 . + 2 ID=contig17.cds2.14;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=final-exon -contig17 GlimmerHMM mRNA 26312 36998 . - . ID=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3 -contig17 GlimmerHMM CDS 26312 26334 . - 2 ID=contig17.cds3.1;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=final-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 28963 29116 . - 0 ID=contig17.cds3.2;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 30713 31824 . - 2 ID=contig17.cds3.3;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 31877 32056 . - 2 ID=contig17.cds3.4;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 33479 34076 . - 0 ID=contig17.cds3.5;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 34131 34286 . - 0 ID=contig17.cds3.6;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon -contig17 GlimmerHMM CDS 36948 36998 . - 0 ID=contig17.cds3.7;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=initial-exon -##sequence-region contig18 1 40012 -contig18 GlimmerHMM mRNA 1303 11989 . - . ID=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1 -contig18 GlimmerHMM CDS 1303 1325 . - 2 ID=contig18.cds1.1;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=final-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 3954 4107 . - 0 ID=contig18.cds1.2;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 5704 6815 . - 2 ID=contig18.cds1.3;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 6868 7047 . - 2 ID=contig18.cds1.4;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 8470 9067 . - 0 ID=contig18.cds1.5;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 9122 9277 . - 0 ID=contig18.cds1.6;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon -contig18 GlimmerHMM CDS 11939 11989 . - 0 ID=contig18.cds1.7;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=initial-exon -contig18 GlimmerHMM mRNA 18320 30118 . - . 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ID=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7 -contig20 GlimmerHMM CDS 46751 46866 . + 0 ID=contig20.cds7.1;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=initial-exon -contig20 GlimmerHMM CDS 46977 47075 . + 1 ID=contig20.cds7.2;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=internal-exon -contig20 GlimmerHMM CDS 47706 47868 . + 1 ID=contig20.cds7.3;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=internal-exon -contig20 GlimmerHMM CDS 49661 49963 . + 0 ID=contig20.cds7.4;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=final-exon -##sequence-region contig21 1 50011 -contig21 GlimmerHMM mRNA 2380 2466 . + . ID=contig21.path1.gene1;Name=contig21.path1.gene1 -contig21 GlimmerHMM CDS 2380 2466 . + 0 ID=contig21.cds1.1;Parent=contig21.path1.gene1;Name=contig21.path1.gene1;Note=final-exon -contig21 GlimmerHMM mRNA 6741 11405 . + . 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ID=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1 -contig23 GlimmerHMM CDS 3228 3333 . + 0 ID=contig23.cds1.1;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=initial-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 4779 5084 . + 2 ID=contig23.cds1.2;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 8387 8696 . + 2 ID=contig23.cds1.3;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 8762 8973 . + 1 ID=contig23.cds1.4;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 9031 9219 . + 2 ID=contig23.cds1.5;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 9738 9889 . + 2 ID=contig23.cds1.6;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 10040 11101 . + 0 ID=contig23.cds1.7;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 11763 12872 . + 0 ID=contig23.cds1.8;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 13476 13707 . + 0 ID=contig23.cds1.9;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 13769 13935 . + 2 ID=contig23.cds1.10;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 15540 15809 . + 0 ID=contig23.cds1.11;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 17576 17635 . + 0 ID=contig23.cds1.12;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=final-exon -contig23 GlimmerHMM mRNA 20555 32675 . - . ID=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2 -contig23 GlimmerHMM CDS 20555 21226 . - 0 ID=contig23.cds2.1;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=final-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 21361 21933 . - 0 ID=contig23.cds2.2;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 22038 22105 . - 2 ID=contig23.cds2.3;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 22166 22501 . - 2 ID=contig23.cds2.4;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 23512 23677 . - 0 ID=contig23.cds2.5;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 23850 24034 . - 2 ID=contig23.cds2.6;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 26014 26138 . - 1 ID=contig23.cds2.7;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 29840 29955 . - 0 ID=contig23.cds2.8;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 30045 30130 . - 2 ID=contig23.cds2.9;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 32411 32675 . - 0 ID=contig23.cds2.10;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=initial-exon -contig23 GlimmerHMM mRNA 38390 42829 . - . ID=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3 -contig23 GlimmerHMM CDS 38390 38648 . - 1 ID=contig23.cds3.1;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=final-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 40546 40623 . - 1 ID=contig23.cds3.2;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 42558 42829 . - 0 ID=contig23.cds3.3;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=initial-exon -contig23 GlimmerHMM mRNA 45599 48088 . + . ID=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4 -contig23 GlimmerHMM CDS 45599 45652 . + 0 ID=contig23.cds4.1;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=initial-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 47100 47148 . + 0 ID=contig23.cds4.2;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=internal-exon -contig23 GlimmerHMM CDS 48036 48088 . + 2 ID=contig23.cds4.3;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=final-exon -##sequence-region contig24 1 40010 -contig24 GlimmerHMM mRNA 552 12672 . - . ID=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1 -contig24 GlimmerHMM CDS 552 1223 . - 0 ID=contig24.cds1.1;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=final-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 1358 1930 . - 0 ID=contig24.cds1.2;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 2035 2102 . - 2 ID=contig24.cds1.3;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 2163 2498 . - 2 ID=contig24.cds1.4;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 3509 3674 . - 0 ID=contig24.cds1.5;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 3847 4031 . - 2 ID=contig24.cds1.6;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 6011 6135 . - 1 ID=contig24.cds1.7;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 9837 9952 . - 0 ID=contig24.cds1.8;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 10042 10127 . - 2 ID=contig24.cds1.9;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 12408 12672 . - 0 ID=contig24.cds1.10;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=initial-exon -contig24 GlimmerHMM mRNA 18387 22826 . - . ID=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2 -contig24 GlimmerHMM CDS 18387 18645 . - 1 ID=contig24.cds2.1;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=final-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 20543 20620 . - 1 ID=contig24.cds2.2;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 22555 22826 . - 0 ID=contig24.cds2.3;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=initial-exon -contig24 GlimmerHMM mRNA 25596 28085 . + . ID=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3 -contig24 GlimmerHMM CDS 25596 25649 . + 0 ID=contig24.cds3.1;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=initial-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 27097 27145 . + 0 ID=contig24.cds3.2;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=internal-exon -contig24 GlimmerHMM CDS 28033 28085 . + 2 ID=contig24.cds3.3;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=final-exon -contig24 GlimmerHMM mRNA 30126 38563 . + . 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ID=contig28.path1.gene4;Name=contig28.path1.gene4 -contig28 GlimmerHMM CDS 40606 40834 . + 0 ID=contig28.cds4.1;Parent=contig28.path1.gene4;Name=contig28.path1.gene4;Note=initial-exon -contig28 GlimmerHMM CDS 41863 42332 . + 2 ID=contig28.cds4.2;Parent=contig28.path1.gene4;Name=contig28.path1.gene4;Note=final-exon -contig28 GlimmerHMM mRNA 48486 48731 . - . ID=contig28.path1.gene5;Name=contig28.path1.gene5 -contig28 GlimmerHMM CDS 48486 48731 . - 0 ID=contig28.cds5.1;Parent=contig28.path1.gene5;Name=contig28.path1.gene5;Note=single-exon -##sequence-region contig29 1 50006 -contig29 GlimmerHMM mRNA 193 17769 . - . 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ID=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5 -contig30 GlimmerHMM CDS 39146 39424 . + 0 ID=contig30.cds5.1;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=initial-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 39475 39629 . + 0 ID=contig30.cds5.2;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 44322 45962 . + 1 ID=contig30.cds5.3;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 47860 48041 . + 1 ID=contig30.cds5.4;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 49613 51223 . + 2 ID=contig30.cds5.5;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 53011 53280 . + 2 ID=contig30.cds5.6;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 57010 58428 . + 2 ID=contig30.cds5.7;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 58492 58712 . + 2 ID=contig30.cds5.8;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 58776 59129 . + 0 ID=contig30.cds5.9;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 59374 59514 . + 0 ID=contig30.cds5.10;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 59569 62496 . + 0 ID=contig30.cds5.11;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 64713 65304 . + 0 ID=contig30.cds5.12;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 65607 65646 . + 2 ID=contig30.cds5.13;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=internal-exon -contig30 GlimmerHMM CDS 67233 67260 . + 1 ID=contig30.cds5.14;Parent=contig30.path1.gene5;Name=contig30.path1.gene5;Note=final-exon -##sequence-region contig31 1 40012 -contig31 GlimmerHMM mRNA 6659 32508 . + . ID=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1 -contig31 GlimmerHMM CDS 6659 6783 . + 0 ID=contig31.cds1.1;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=initial-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 7853 8034 . + 1 ID=contig31.cds1.2;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 9606 11216 . + 2 ID=contig31.cds1.3;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 13004 13273 . + 2 ID=contig31.cds1.4;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 17003 18421 . + 2 ID=contig31.cds1.5;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 18485 18705 . + 2 ID=contig31.cds1.6;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 18769 19122 . + 0 ID=contig31.cds1.7;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 19367 19507 . + 0 ID=contig31.cds1.8;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 19562 22489 . + 0 ID=contig31.cds1.9;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 24706 25297 . + 0 ID=contig31.cds1.10;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 32181 32356 . + 2 ID=contig31.cds1.11;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 32440 32508 . + 0 ID=contig31.cds1.12;Parent=contig31.path1.gene1;Name=contig31.path1.gene1;Note=final-exon -contig31 GlimmerHMM mRNA 35323 35987 . - . ID=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2 -contig31 GlimmerHMM CDS 35323 35808 . - 0 ID=contig31.cds2.1;Parent=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2;Note=final-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 35835 35987 . - 0 ID=contig31.cds2.2;Parent=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2;Note=initial-exon -contig31 GlimmerHMM mRNA 38034 39914 . - . ID=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3 -contig31 GlimmerHMM CDS 38034 38140 . - 2 ID=contig31.cds3.1;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=final-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 39393 39448 . - 1 ID=contig31.cds3.2;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=internal-exon -contig31 GlimmerHMM CDS 39745 39914 . - 0 ID=contig31.cds3.3;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=initial-exon -##sequence-region contig32 1 40014 -contig32 GlimmerHMM mRNA 5312 5976 . - . ID=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1 -contig32 GlimmerHMM CDS 5312 5797 . - 0 ID=contig32.cds1.1;Parent=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1;Note=final-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 5824 5976 . - 0 ID=contig32.cds1.2;Parent=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1;Note=initial-exon -contig32 GlimmerHMM mRNA 8023 9903 . - . ID=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2 -contig32 GlimmerHMM CDS 8023 8129 . - 2 ID=contig32.cds2.1;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=final-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 9382 9437 . - 1 ID=contig32.cds2.2;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 9734 9903 . - 0 ID=contig32.cds2.3;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=initial-exon -contig32 GlimmerHMM mRNA 12268 14868 . + . ID=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3 -contig32 GlimmerHMM CDS 12268 12400 . + 0 ID=contig32.cds3.1;Parent=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3;Note=initial-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 14432 14868 . + 2 ID=contig32.cds3.2;Parent=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3;Note=final-exon -contig32 GlimmerHMM mRNA 19560 21269 . - . ID=contig32.path1.gene4;Name=contig32.path1.gene4 -contig32 GlimmerHMM CDS 19560 21269 . - 0 ID=contig32.cds4.1;Parent=contig32.path1.gene4;Name=contig32.path1.gene4;Note=single-exon -contig32 GlimmerHMM mRNA 23284 39594 . - . ID=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5 -contig32 GlimmerHMM CDS 23284 23340 . - 0 ID=contig32.cds5.1;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=final-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 24947 25309 . - 0 ID=contig32.cds5.2;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 25407 25572 . - 1 ID=contig32.cds5.3;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 26120 26752 . - 1 ID=contig32.cds5.4;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 29696 31284 . - 0 ID=contig32.cds5.5;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 35135 35187 . - 2 ID=contig32.cds5.6;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon -contig32 GlimmerHMM CDS 39492 39594 . - 0 ID=contig32.cds5.7;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=initial-exon -##sequence-region contig33 1 40016 -contig33 GlimmerHMM mRNA 4558 6267 . - . ID=contig33.path1.gene1;Name=contig33.path1.gene1 -contig33 GlimmerHMM CDS 4558 6267 . - 0 ID=contig33.cds1.1;Parent=contig33.path1.gene1;Name=contig33.path1.gene1;Note=single-exon -contig33 GlimmerHMM mRNA 8282 22510 . - . ID=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2 -contig33 GlimmerHMM CDS 8282 8338 . - 0 ID=contig33.cds2.1;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=final-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 9945 10307 . - 0 ID=contig33.cds2.2;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 10405 10570 . - 1 ID=contig33.cds2.3;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 11118 11750 . - 1 ID=contig33.cds2.4;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 14694 16282 . - 0 ID=contig33.cds2.5;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 20938 20956 . - 1 ID=contig33.cds2.6;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 22380 22510 . - 0 ID=contig33.cds2.7;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=initial-exon -contig33 GlimmerHMM mRNA 25242 30390 . + . ID=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3 -contig33 GlimmerHMM CDS 25242 25284 . + 0 ID=contig33.cds3.1;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=initial-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 25460 25572 . + 2 ID=contig33.cds3.2;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 25920 26022 . + 0 ID=contig33.cds3.3;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 26958 27076 . + 2 ID=contig33.cds3.4;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 27141 27262 . + 0 ID=contig33.cds3.5;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 30074 30179 . + 1 ID=contig33.cds3.6;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 30235 30390 . + 0 ID=contig33.cds3.7;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=final-exon -contig33 GlimmerHMM mRNA 33024 37281 . - . ID=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4 -contig33 GlimmerHMM CDS 33024 33029 . - 0 ID=contig33.cds4.1;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=final-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 33092 33183 . - 2 ID=contig33.cds4.2;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 33492 34143 . - 0 ID=contig33.cds4.3;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 34200 34387 . - 2 ID=contig33.cds4.4;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 36532 36733 . - 0 ID=contig33.cds4.5;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 36795 36904 . - 2 ID=contig33.cds4.6;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 36967 37091 . - 1 ID=contig33.cds4.7;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon -contig33 GlimmerHMM CDS 37184 37281 . - 0 ID=contig33.cds4.8;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=initial-exon -##sequence-region contig34 1 50012 -contig34 GlimmerHMM mRNA 230 5378 . + . ID=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1 -contig34 GlimmerHMM CDS 230 272 . + 0 ID=contig34.cds1.1;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=initial-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 448 560 . + 2 ID=contig34.cds1.2;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 908 1010 . + 0 ID=contig34.cds1.3;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 1946 2064 . + 2 ID=contig34.cds1.4;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 2129 2250 . + 0 ID=contig34.cds1.5;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 5062 5167 . + 1 ID=contig34.cds1.6;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 5223 5378 . + 0 ID=contig34.cds1.7;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=final-exon -contig34 GlimmerHMM mRNA 8012 12269 . - . 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ID=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3 -contig34 GlimmerHMM CDS 17622 18265 . + 0 ID=contig34.cds3.1;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=initial-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 19470 19780 . + 1 ID=contig34.cds3.2;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 19851 20477 . + 2 ID=contig34.cds3.3;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 21634 21924 . + 2 ID=contig34.cds3.4;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 25170 25303 . + 2 ID=contig34.cds3.5;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 27428 27501 . + 0 ID=contig34.cds3.6;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 29518 29633 . + 1 ID=contig34.cds3.7;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 31647 31816 . + 2 ID=contig34.cds3.8;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 31870 31988 . + 0 ID=contig34.cds3.9;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 32298 32363 . + 1 ID=contig34.cds3.10;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 33140 33614 . + 1 ID=contig34.cds3.11;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 33680 33778 . + 0 ID=contig34.cds3.12;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 34168 34359 . + 0 ID=contig34.cds3.13;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 34926 35125 . + 0 ID=contig34.cds3.14;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=internal-exon -contig34 GlimmerHMM CDS 35336 35714 . + 1 ID=contig34.cds3.15;Parent=contig34.path1.gene3;Name=contig34.path1.gene3;Note=final-exon -contig34 GlimmerHMM mRNA 39193 44680 . - . 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ID=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2 -contig39 GlimmerHMM CDS 18343 18390 . + 0 ID=contig39.cds2.1;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=initial-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 18502 19020 . + 0 ID=contig39.cds2.2;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 22197 22514 . + 0 ID=contig39.cds2.3;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 22747 23698 . + 0 ID=contig39.cds2.4;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 25189 25340 . + 2 ID=contig39.cds2.5;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 26146 26370 . + 0 ID=contig39.cds2.6;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 29949 30268 . + 0 ID=contig39.cds2.7;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 33466 33514 . + 1 ID=contig39.cds2.8;Parent=contig39.path1.gene2;Name=contig39.path1.gene2;Note=final-exon -contig39 GlimmerHMM mRNA 35574 41017 . + . ID=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3 -contig39 GlimmerHMM CDS 35574 36216 . + 0 ID=contig39.cds3.1;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=initial-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 37575 38992 . + 2 ID=contig39.cds3.2;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=internal-exon -contig39 GlimmerHMM CDS 40979 41017 . + 0 ID=contig39.cds3.3;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=final-exon -##sequence-region contig40 1 60015 -contig40 GlimmerHMM mRNA 560 1677 . + . ID=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1 -contig40 GlimmerHMM CDS 560 1202 . + 0 ID=contig40.cds1.1;Parent=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1;Note=initial-exon -contig40 GlimmerHMM CDS 1580 1677 . + 2 ID=contig40.cds1.2;Parent=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1;Note=final-exon -contig40 GlimmerHMM mRNA 4227 16682 . - . 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ID=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3 -contig41 GlimmerHMM CDS 28424 28598 . - 1 ID=contig41.cds3.1;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=final-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 30447 30602 . - 1 ID=contig41.cds3.2;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 31183 31508 . - 0 ID=contig41.cds3.3;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=initial-exon -contig41 GlimmerHMM mRNA 35171 58924 . + . ID=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4 -contig41 GlimmerHMM CDS 35171 35483 . + 0 ID=contig41.cds4.1;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=initial-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 36372 36508 . + 2 ID=contig41.cds4.2;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 37207 37228 . + 0 ID=contig41.cds4.3;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 37496 37526 . + 2 ID=contig41.cds4.4;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 39079 39241 . + 1 ID=contig41.cds4.5;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 39536 39677 . + 0 ID=contig41.cds4.6;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 40202 40343 . + 2 ID=contig41.cds4.7;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 40493 40693 . + 1 ID=contig41.cds4.8;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 40765 41066 . + 1 ID=contig41.cds4.9;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 41145 41247 . + 2 ID=contig41.cds4.10;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 41508 41608 . + 1 ID=contig41.cds4.11;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 42768 42957 . + 2 ID=contig41.cds4.12;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 43159 43291 . + 1 ID=contig41.cds4.13;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 43867 44269 . + 0 ID=contig41.cds4.14;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 44418 45091 . + 2 ID=contig41.cds4.15;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 45128 45343 . + 0 ID=contig41.cds4.16;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 46167 46307 . + 0 ID=contig41.cds4.17;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 46703 47044 . + 0 ID=contig41.cds4.18;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 47580 47624 . + 0 ID=contig41.cds4.19;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 47876 47998 . + 0 ID=contig41.cds4.20;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 48076 48135 . + 0 ID=contig41.cds4.21;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 48304 48399 . + 0 ID=contig41.cds4.22;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 50623 50937 . + 0 ID=contig41.cds4.23;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 52323 52448 . + 0 ID=contig41.cds4.24;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 52639 52674 . + 0 ID=contig41.cds4.25;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 52835 53011 . + 0 ID=contig41.cds4.26;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 53321 53548 . + 0 ID=contig41.cds4.27;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 54373 54546 . + 0 ID=contig41.cds4.28;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 58116 58263 . + 0 ID=contig41.cds4.29;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon -contig41 GlimmerHMM CDS 58917 58924 . + 2 ID=contig41.cds4.30;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=final-exon -##sequence-region contig42 1 70020 -contig42 GlimmerHMM mRNA 1140 1502 . - . 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ID=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2 -contig42 GlimmerHMM CDS 5165 5477 . + 0 ID=contig42.cds2.1;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=initial-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 6366 6502 . + 2 ID=contig42.cds2.2;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 7201 7222 . + 0 ID=contig42.cds2.3;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 7490 7520 . + 2 ID=contig42.cds2.4;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 9073 9235 . + 1 ID=contig42.cds2.5;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 9530 9671 . + 0 ID=contig42.cds2.6;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 10196 10337 . + 2 ID=contig42.cds2.7;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 10487 10687 . + 1 ID=contig42.cds2.8;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 10759 11060 . + 1 ID=contig42.cds2.9;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 11139 11241 . + 2 ID=contig42.cds2.10;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 11502 11602 . + 1 ID=contig42.cds2.11;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 12762 12951 . + 2 ID=contig42.cds2.12;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 13153 13285 . + 1 ID=contig42.cds2.13;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 13861 14263 . + 0 ID=contig42.cds2.14;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon -contig42 GlimmerHMM CDS 14412 15085 . + 2 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ID=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1 -contig43 GlimmerHMM CDS 593 646 . + 0 ID=contig43.cds1.1;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=initial-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 983 1417 . + 0 ID=contig43.cds1.2;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 1628 1705 . + 0 ID=contig43.cds1.3;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 3383 4082 . + 0 ID=contig43.cds1.4;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 4306 4659 . + 2 ID=contig43.cds1.5;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 5281 6993 . + 2 ID=contig43.cds1.6;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 8396 9295 . + 2 ID=contig43.cds1.7;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 9588 10351 . + 2 ID=contig43.cds1.8;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 10437 10572 . + 0 ID=contig43.cds1.9;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 10765 11655 . + 2 ID=contig43.cds1.10;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 11722 14394 . + 2 ID=contig43.cds1.11;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 15580 25413 . + 2 ID=contig43.cds1.12;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 25485 26463 . + 2 ID=contig43.cds1.13;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 26524 26865 . + 1 ID=contig43.cds1.14;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 27561 28603 . + 1 ID=contig43.cds1.15;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 29343 29399 . + 2 ID=contig43.cds1.16;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 31746 32048 . + 2 ID=contig43.cds1.17;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 32749 33383 . + 2 ID=contig43.cds1.18;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=final-exon -contig43 GlimmerHMM mRNA 39583 49156 . - . ID=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2 -contig43 GlimmerHMM CDS 39583 42419 . - 2 ID=contig43.cds2.1;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=final-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 44160 44231 . - 2 ID=contig43.cds2.2;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 44291 44971 . - 2 ID=contig43.cds2.3;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 46441 47293 . - 0 ID=contig43.cds2.4;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 48708 48891 . - 1 ID=contig43.cds2.5;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon -contig43 GlimmerHMM CDS 49050 49156 . - 0 ID=contig43.cds2.6;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=initial-exon -##sequence-region contig44 1 50013 -contig44 GlimmerHMM mRNA 395 9144 . - . ID=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1 -contig44 GlimmerHMM CDS 395 520 . - 0 ID=contig44.cds1.1;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=final-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 1242 2407 . - 2 ID=contig44.cds1.2;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 4148 4219 . - 2 ID=contig44.cds1.3;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 4279 4959 . - 2 ID=contig44.cds1.4;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 6429 7281 . - 0 ID=contig44.cds1.5;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 8696 8879 . - 1 ID=contig44.cds1.6;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 9038 9144 . - 0 ID=contig44.cds1.7;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=initial-exon -contig44 GlimmerHMM mRNA 11632 14837 . - . ID=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2 -contig44 GlimmerHMM CDS 11632 12468 . - 0 ID=contig44.cds2.1;Parent=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2;Note=final-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 13947 14837 . - 0 ID=contig44.cds2.2;Parent=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2;Note=initial-exon -contig44 GlimmerHMM mRNA 16854 18627 . + . ID=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3 -contig44 GlimmerHMM CDS 16854 16926 . + 0 ID=contig44.cds3.1;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=initial-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 16985 17067 . + 2 ID=contig44.cds3.2;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 18082 18627 . + 0 ID=contig44.cds3.3;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=final-exon -contig44 GlimmerHMM mRNA 21455 27740 . + . ID=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4 -contig44 GlimmerHMM CDS 21455 21722 . + 0 ID=contig44.cds4.1;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=initial-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 21925 22013 . + 2 ID=contig44.cds4.2;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 25199 25326 . + 0 ID=contig44.cds4.3;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 25564 25722 . + 1 ID=contig44.cds4.4;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 25885 25941 . + 1 ID=contig44.cds4.5;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 27123 27162 . + 1 ID=contig44.cds4.6;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 27693 27740 . + 0 ID=contig44.cds4.7;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=final-exon -contig44 GlimmerHMM mRNA 30550 47582 . - . ID=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5 -contig44 GlimmerHMM CDS 30550 30677 . - 2 ID=contig44.cds5.1;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=final-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 37567 37756 . - 0 ID=contig44.cds5.2;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 37808 37912 . - 0 ID=contig44.cds5.3;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=internal-exon -contig44 GlimmerHMM CDS 47484 47582 . - 0 ID=contig44.cds5.4;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=initial-exon -##sequence-region contig45 1 50013 -contig45 GlimmerHMM mRNA 1628 4833 . - . ID=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1 -contig45 GlimmerHMM CDS 1628 2464 . - 0 ID=contig45.cds1.1;Parent=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1;Note=final-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 3943 4833 . - 0 ID=contig45.cds1.2;Parent=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM mRNA 6850 8623 . + . ID=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2 -contig45 GlimmerHMM CDS 6850 6922 . + 0 ID=contig45.cds2.1;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 6981 7063 . + 2 ID=contig45.cds2.2;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 8078 8623 . + 0 ID=contig45.cds2.3;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=final-exon -contig45 GlimmerHMM mRNA 11451 17736 . + . ID=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3 -contig45 GlimmerHMM CDS 11451 11718 . + 0 ID=contig45.cds3.1;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 11921 12009 . + 2 ID=contig45.cds3.2;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 15195 15322 . + 0 ID=contig45.cds3.3;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 15560 15718 . + 1 ID=contig45.cds3.4;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 15881 15937 . + 1 ID=contig45.cds3.5;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 17119 17158 . + 1 ID=contig45.cds3.6;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 17689 17736 . + 0 ID=contig45.cds3.7;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=final-exon -contig45 GlimmerHMM mRNA 20546 37578 . - . ID=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4 -contig45 GlimmerHMM CDS 20546 20673 . - 2 ID=contig45.cds4.1;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=final-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 27563 27752 . - 0 ID=contig45.cds4.2;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 27804 27908 . - 0 ID=contig45.cds4.3;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 37480 37578 . - 0 ID=contig45.cds4.4;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM mRNA 42096 44534 . - . ID=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5 -contig45 GlimmerHMM CDS 42096 42122 . - 0 ID=contig45.cds5.1;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=final-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 43859 44007 . - 2 ID=contig45.cds5.2;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=internal-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 44462 44534 . - 0 ID=contig45.cds5.3;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM mRNA 47223 48562 . + . ID=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6 -contig45 GlimmerHMM CDS 47223 47380 . + 0 ID=contig45.cds6.1;Parent=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6;Note=initial-exon -contig45 GlimmerHMM CDS 48457 48562 . + 1 ID=contig45.cds6.2;Parent=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6;Note=final-exon -##sequence-region contig46 1 50012 -contig46 GlimmerHMM mRNA 1660 12572 . - . 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ID=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1 -contig53 GlimmerHMM CDS 2425 2666 . - 2 ID=contig53.cds1.1;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=final-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 2725 3054 . - 2 ID=contig53.cds1.2;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 3370 3778 . - 0 ID=contig53.cds1.3;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 4799 5005 . - 0 ID=contig53.cds1.4;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 6122 6185 . - 1 ID=contig53.cds1.5;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 6277 6351 . - 1 ID=contig53.cds1.6;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 6471 6621 . - 2 ID=contig53.cds1.7;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 7332 7706 . - 2 ID=contig53.cds1.8;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 7771 7900 . - 0 ID=contig53.cds1.9;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon -contig53 GlimmerHMM CDS 9015 9302 . - 0 ID=contig53.cds1.10;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=initial-exon -contig53 GlimmerHMM mRNA 11537 30690 . - . 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ID=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2 -contig56 GlimmerHMM CDS 34254 34259 . - 0 ID=contig56.cds2.1;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=final-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 38270 38415 . - 2 ID=contig56.cds2.2;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 38468 38598 . - 1 ID=contig56.cds2.3;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 38660 39046 . - 1 ID=contig56.cds2.4;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 39119 39314 . - 2 ID=contig56.cds2.5;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 42325 42642 . - 2 ID=contig56.cds2.6;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 42829 42845 . - 1 ID=contig56.cds2.7;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 43625 43782 . - 0 ID=contig56.cds2.8;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 44006 44091 . - 2 ID=contig56.cds2.9;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 45924 47736 . - 0 ID=contig56.cds2.10;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 47840 47992 . - 0 ID=contig56.cds2.11;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 48826 49832 . - 2 ID=contig56.cds2.12;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 49901 51146 . - 0 ID=contig56.cds2.13;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon -contig56 GlimmerHMM CDS 52391 53620 . - 0 ID=contig56.cds2.14;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=initial-exon -##sequence-region contig57 1 60013 -contig57 GlimmerHMM mRNA 4241 23607 . - . 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ID=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2 -contig60 GlimmerHMM CDS 6088 6219 . - 0 ID=contig60.cds2.1;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=final-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 6286 6406 . - 1 ID=contig60.cds2.2;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 6466 6814 . - 2 ID=contig60.cds2.3;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 6867 7161 . - 0 ID=contig60.cds2.4;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 8050 8303 . - 2 ID=contig60.cds2.5;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 8356 8755 . - 0 ID=contig60.cds2.6;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 12696 12743 . - 0 ID=contig60.cds2.7;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=initial-exon -contig60 GlimmerHMM mRNA 18443 31744 . + . ID=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3 -contig60 GlimmerHMM CDS 18443 18518 . + 0 ID=contig60.cds3.1;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=initial-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 22222 22251 . + 2 ID=contig60.cds3.2;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 22314 29494 . + 2 ID=contig60.cds3.3;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 29560 29780 . + 0 ID=contig60.cds3.4;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 29847 31557 . + 1 ID=contig60.cds3.5;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon -contig60 GlimmerHMM CDS 31589 31744 . + 0 ID=contig60.cds3.6;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=final-exon -contig60 GlimmerHMM mRNA 33955 38754 . - . 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ID=contig63.path1.gene1;Name=contig63.path1.gene1 -contig63 GlimmerHMM CDS 1003 1486 . + 0 ID=contig63.cds1.1;Parent=contig63.path1.gene1;Name=contig63.path1.gene1;Note=final-exon -contig63 GlimmerHMM mRNA 4369 12161 . + . ID=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2 -contig63 GlimmerHMM CDS 4369 4421 . + 0 ID=contig63.cds2.1;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=initial-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 4822 5122 . + 1 ID=contig63.cds2.2;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 5190 5442 . + 0 ID=contig63.cds2.3;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 5599 5697 . + 2 ID=contig63.cds2.4;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 7498 7920 . + 2 ID=contig63.cds2.5;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 11546 11653 . + 2 ID=contig63.cds2.6;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 11995 12161 . + 2 ID=contig63.cds2.7;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=final-exon -contig63 GlimmerHMM mRNA 15926 33054 . - . ID=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3 -contig63 GlimmerHMM CDS 15926 15960 . - 2 ID=contig63.cds3.1;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=final-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 17594 17717 . - 0 ID=contig63.cds3.2;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 19057 19187 . - 2 ID=contig63.cds3.3;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 19270 19353 . - 2 ID=contig63.cds3.4;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 19425 19979 . - 2 ID=contig63.cds3.5;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 21715 22879 . - 0 ID=contig63.cds3.6;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 24636 24897 . - 1 ID=contig63.cds3.7;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 25155 25472 . - 1 ID=contig63.cds3.8;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 25711 25784 . - 0 ID=contig63.cds3.9;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 26229 26336 . - 0 ID=contig63.cds3.10;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 26403 26903 . - 0 ID=contig63.cds3.11;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 26957 27099 . - 2 ID=contig63.cds3.12;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 28214 28374 . - 1 ID=contig63.cds3.13;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 31124 31349 . - 2 ID=contig63.cds3.14;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon -contig63 GlimmerHMM CDS 32955 33054 . - 0 ID=contig63.cds3.15;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=initial-exon -contig63 GlimmerHMM mRNA 36087 52795 . + . 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ID=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2 -contig65 GlimmerHMM CDS 23382 23414 . - 0 ID=contig65.cds2.1;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=final-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 23537 23954 . - 1 ID=contig65.cds2.2;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 24021 24422 . - 1 ID=contig65.cds2.3;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 27407 27523 . - 1 ID=contig65.cds2.4;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 27589 27830 . - 0 ID=contig65.cds2.5;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 31753 31776 . - 0 ID=contig65.cds2.6;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 33002 33004 . - 0 ID=contig65.cds2.7;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=initial-exon -contig65 GlimmerHMM mRNA 37164 44203 . + . ID=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3 -contig65 GlimmerHMM CDS 37164 37235 . + 0 ID=contig65.cds3.1;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=initial-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 38418 38642 . + 0 ID=contig65.cds3.2;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 38929 38999 . + 0 ID=contig65.cds3.3;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 39651 39735 . + 1 ID=contig65.cds3.4;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 41433 42041 . + 0 ID=contig65.cds3.5;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 42103 42911 . + 0 ID=contig65.cds3.6;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 43509 43707 . + 1 ID=contig65.cds3.7;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon -contig65 GlimmerHMM CDS 44192 44203 . + 0 ID=contig65.cds3.8;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=final-exon -##sequence-region contig66 1 45011 -contig66 GlimmerHMM mRNA 3375 12997 . - . 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ID=contig68.path1.gene2;Name=contig68.path1.gene2 -contig68 GlimmerHMM CDS 20638 21050 . + 0 ID=contig68.cds2.1;Parent=contig68.path1.gene2;Name=contig68.path1.gene2;Note=initial-exon -contig68 GlimmerHMM CDS 21149 21485 . + 1 ID=contig68.cds2.2;Parent=contig68.path1.gene2;Name=contig68.path1.gene2;Note=internal-exon -contig68 GlimmerHMM CDS 21721 22125 . + 0 ID=contig68.cds2.3;Parent=contig68.path1.gene2;Name=contig68.path1.gene2;Note=internal-exon -contig68 GlimmerHMM CDS 24220 24318 . + 0 ID=contig68.cds2.4;Parent=contig68.path1.gene2;Name=contig68.path1.gene2;Note=final-exon -##sequence-region contig69 1 44962 -contig69 GlimmerHMM mRNA 450 4874 . - . 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Binary file test-data/gff3_multi_fasta/myHub/Dbia3/tracks/Multi-Fasta_GlimmerHMM_Gene_Predictions.bb has changed
--- a/test-data/gff3_multi_fasta/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
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--- a/test-data/gtf/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,38 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1197.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'StringTie_Assembled_Transcripts', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gtfToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp4nx0OH.sortedBed.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpaKvcsw.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/910/dataset_1278_files/myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Gtf.Gtf object at 0x2b0dd10>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/910/dataset_1278_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track StringTie_Assembled_Transcripts.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/gtf/gtf_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb">StringTie_Assembled_Transcripts.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/gtf/inputs/StringTie_Assembled_Transcripts Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ -# stringtie /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1193.dat -o /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1197.dat -p 1 -# StringTie version 1.2.3 -contig16 StringTie transcript 1751 17824 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; cov "14.618678"; FPKM "322160.531250"; TPM "866155.937500"; -contig16 StringTie exon 1751 1897 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "1"; cov "6.787892"; -contig16 StringTie exon 11285 11463 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "2"; cov "19.860081"; -contig16 StringTie exon 11518 11705 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "3"; cov "23.926477"; -contig16 StringTie exon 11759 11858 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "4"; cov "17.452721"; -contig16 StringTie exon 11922 11975 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "5"; cov "11.461867"; -contig16 StringTie exon 12601 12811 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "6"; cov "11.876496"; -contig16 StringTie exon 17222 17337 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "7"; cov "15.915709"; -contig16 StringTie exon 17406 17824 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "8"; cov "11.738873";
--- a/test-data/gtf/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/gtf/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track StringTie_Assembled_Transcripts.bb - longLabel StringTie Assembled Transcripts - shortLabel StringTie Assem - bigDataUrl tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/gtf/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/gtf/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/gtf_gff/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,60 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1184.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Augustus_Gene_Predictions', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gff3ToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp7sqcWp.sorted.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpp6ZdZ_.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1197.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'11', u'name': u'StringTie_Assembled_Transcripts', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling gtfToGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp66b4It.sortedBed.bigGenePred -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpp6ZdZ_.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+8 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Gtf.Gtf object at 0x1ecae10>, <Gff3.Gff3 object at 0x1ecad10>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track StringTie_Assembled_Transcripts.bb (in group default_group) -DEBUG:root:We DON'T add in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/911/dataset_1279_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track Augustus_Gene_Predictions.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/gtf_gff/gtf_gff_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,73 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb">Augustus_Gene_Predictions.bb</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb">StringTie_Assembled_Transcripts.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/gtf_gff/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,5 +0,0 @@ -name default_group -label Default group -priority 2 -defaultIsClosed 0 -
--- a/test-data/gtf_gff/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,22 +0,0 @@ - track StringTie_Assembled_Transcripts.bb - longLabel StringTie Assembled Transcripts - shortLabel StringTie Assem - bigDataUrl tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 11 - color 0,0,0 - group default_group - - track Augustus_Gene_Predictions.bb - longLabel Augustus Gene Predictions - shortLabel Augustus Gene P - bigDataUrl tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
--- a/test-data/gtf_gff/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/gtf_gff/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/only_genome/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,16 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
--- a/test-data/only_genome/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/only_genome/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/only_genome/only_genome.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,54 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
--- a/test-data/psl/__main__.log Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,36 +0,0 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### - -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1033.dat -DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'blastXmlToPsl', u'track_color': u'#00b050', u'group_name': u'Default group'} -DEBUG:root:Calling pslToBigPsl: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Hello -DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmp0NXyEzpsl -DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpG8McOt.chrom.sizes -DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/967/dataset_1334_files/myHub/Dbia3/tracks/blastXmlToPsl.bb -DEBUG:root:typeOption: bed12+12 -DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/testtoolshed.g2.bx.psu.edu/repos/remimarenco/hubarchivecreator/b40c942bbcc0/hubarchivecreator/bigPsl.as -DEBUG:root:tab option: True -DEBUG:root:Calling bedToBigBed: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [<Psl.Psl object at 0x155bb90>] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/967/dataset_1334_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group -DEBUG:root:We just added track blastXmlToPsl.bb (in group default_group) -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! ####
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--- a/test-data/psl/psl_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/blastXmlToPsl.bb">blastXmlToPsl.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -
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--- a/test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/inputs/stringtie_assembled_transcripts Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ -# stringtie /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1102.dat -o /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1103.dat -p 1 -# StringTie version 1.1.0 -contig16 StringTie transcript 1751 17824 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; cov "14.618678"; FPKM "322160.531250"; TPM "880020.875000"; -contig16 StringTie exon 1751 1897 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "1"; cov "6.787892"; -contig16 StringTie exon 11285 11463 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "2"; cov "19.860081"; -contig16 StringTie exon 11518 11705 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "3"; cov "23.926477"; -contig16 StringTie exon 11759 11858 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "4"; cov "17.452721"; -contig16 StringTie exon 11922 11975 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "5"; cov "11.461867"; -contig16 StringTie exon 12601 12811 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "6"; cov "11.876496"; -contig16 StringTie exon 17222 17337 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "7"; cov "15.915709"; -contig16 StringTie exon 17406 45020 1000 - . gene_id "STRG.1"; transcript_id "STRG.1.1"; exon_number "8"; cov "11.738873";
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--- a/test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,11 +0,0 @@ - track StringTie_Assembled_Transcripts.bb - longLabel StringTie Assembled Transcripts - shortLabel StringTie Assem - bigDataUrl tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb - type bigGenePred - visibility dense - thickDrawItem off - priority 10 - color 0,0,0 - group default_group -
Binary file test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb has changed
--- a/test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,10 +0,0 @@ -genome Dbia3 -trackDb Dbia3/trackDb.txt -groups Dbia3/groups.txt -description Dbia3 -twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit -organism Dbia3 -defaultPos contig25 -orderKey 4500 -scientificName Dbia3 -htmlPath Dbia3/description.html
--- a/test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,6 +0,0 @@ -hub gonrampDbia3 -shortLabel Dbia3 -longLabel Dbia3 -genomesFile genomes.txt -email rmarenco@gwu.edu -descriptionUrl Dbia3.html
--- a/test-data/stringtie_chromosome_end_coordinates/stringtie_chromosome_end_coordinates_trackhub.html Fri Dec 30 11:08:01 2016 -0500 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 @@ -1,70 +0,0 @@ - -<html> - <body> - <p> - The following has been generated by Hub Archive Creator: - </p> - <ul> - - <li> - myHub - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3.html">Dbia3.html</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/genomes.txt">genomes.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/hub.txt">hub.txt</a> - </li> - <li> - Dbia3 - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/groups.txt">groups.txt</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/Dbia3.2bit">Dbia3.2bit</a> - </li> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/description.html">description.html</a> - </li> - <li> - tracks - </li> - <ul> - - <li> - <a href="myHub/Dbia3/tracks/StringTie_Assembled_Transcripts.bb">StringTie_Assembled_Transcripts.bb</a> - </li> - - </ul> - <li> - <a href="myHub/Dbia3/trackDb.txt">trackDb.txt</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - <li> - . - </li> - <ul> - - <li> - <a href="./__main__.log">__main__.log</a> - </li> - - </ul> - - </ul> - </body> -</html> - - -