Mercurial > repos > yating-l > bigbed_to_fa_340

view test-data/contigs.trf_4.nomask.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload
author yating-l
date Wed, 17 May 2017 16:49:32 -0400
parents
children
line wrap: on
line source

>trf_1
AATGATGCATTTAAATGCTGCATTTAAATG
>trf_2
ACAGACAGACGGACGAACAGACGGACGGACG
>trf_3
GAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTTGAGA
AGTGCCGCCGAAGTG
>trf_4
GAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTCGAGA
AGTGCCGCCGAAGTG
>trf_5
ATAATTTGTTTCATATTATTTCCCACCCAATTTTCGGATCGTTCCTATGA
CAGCTATATGATATAGTCGTCAGATTTTGTAAAAGTTTAATTCAAAACCA
AATAAAAAATGCTATTTCCAAGCGTAGAAGGTTATACGTTAAAAAACACC
GAAGATATAATTTTTCCATATTATTTTGCCACTAATTTTCCGTTTGTTCC
TATGGGAGCTATATGATATAGGTATCCGATTTTGATAAAATGTAATTCAA
AATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCATGCTTAGAAAGCTATATG
TTTAAAATAACCCAAAGATAATTTTTTCTTATTATTTTACCACTAATTTT
TCGATCCTTCATATGGCAGCAATATGATATAGTCGTCCGATTTCGATAAA
AATTGAATTCGAAATTCTGAACTAATTAAAAATGGTTATCTCCAAGCTTA
GAAGGTTATATGTTAAAAA
>trf_6
AACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTCGTATCAAATTTTATTAAAATCGG
CCGACTATATCATATAGCTCCCATAGCAACAATCGGAAAATTAGTGGTAA
AATAATATTCAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTATAACCTCCT
ACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTACGAATTACATTT
TATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATGGTAA
AATTAGTAGAAAAAACATGAAATAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTA
ACATATAACTTGAAAGCTTAAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATT
TAAATTTAAATTTTATTAAAATCGGAAGACCATATCATATAGCTGTCATA
GGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAATAAT
>trf_7
ATATATATATATATATATATATTTATATATATATATATATATA
>trf_8
GCTGAGGATGAGCTACAGAGCTGAGGATGAGATACAG
>trf_9
ATATATATATATATATATATATTTATATATATATATATATATA
>trf_10
GCTGAGGATGAGCTACAGAGCTGAGGATGAGATACAG
>trf_11
TATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGT
>trf_12
CAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATA
TAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCT
ATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGT
TTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAA
AAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAAC
A
>trf_13
TCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTT
C
>trf_14
TTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTT
CATATCATC
>trf_15
TTTTAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATACAGCTGCCAT
TGAACGATCGGAAAATAAGTGGTCAAATAATATGAAAAACTTATATCTTC
GGTGACTTTAACATATAACTTCCAATGCTTGGAAATACAATTTTTAATTG
GTTTTCAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATATATA
GCTGCCATAAATACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAATATAAAAAAATTAT
ATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAACTTGAAAATAACATTT
TTTAATTAGTTCTAAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGTTAACTA
TATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATA
>trf_16
TATGTATAAACAATGTTCATACTTATGTGTAAACAATGTTCATACTTATG
TGT
>trf_17
AATACAATACAATTTTTAATACAATACAATTTT
>trf_18
TATAATTTTGGGAATATAATATATTGGGAATATAATTTT
>trf_19
AATTATCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTT
AATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAATTAATTAAAAAATGTTTTTTTTAA
GCTTATAAGGTTATATGTTAAAAAACACTAAAGATATAATTTTAATTTAT
GTTTTCCGACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGTTATATGATATAAT
CGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAAT
GTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTCATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAA
TTTTTCAATATTATTCACCATTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTA
TAAGATATAGTCGACCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACT
AATTTAAAAGTGTTATATCCAAACTTAAAAAAGTATATCTTATAAAACAC
GAAAGATAATAATTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTACTCGATAGTTCCTA
TGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGAT
>trf_20
ACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACA