Mercurial > repos > bgruening > chemical_datatypes
view datatypes/datatypes_conf.xml @ 0:af7b6c6ee439 draft
initial commit
author | bgruening |
---|---|
date | Tue, 25 Dec 2012 05:16:25 -0500 |
parents | |
children |
line wrap: on
line source
<?xml version="1.0"?> <datatypes> <datatype_files> <datatype_file name="molFiles.py"/> </datatype_files> <registration> <!--Cheminformatics Datatypes --> <datatype extension="mol" type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF" display_in_upload="True"> <converter file="mol_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/> <converter file="mol_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/> <converter file="mol_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/> </datatype> <datatype extension="mol2" type="galaxy.datatypes.molFiles:MOL2" display_in_upload="True"> <converter file="mol2_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/> <converter file="mol2_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/> <converter file="mol2_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/> <converter file="mol2_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/> </datatype> <datatype extension="inchi" type="galaxy.datatypes.molFiles:InChI" display_in_upload="True"> <converter file="inchi_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/> <converter file="inchi_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/> <converter file="inchi_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/> <converter file="inchi_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/> </datatype> <datatype extension="smi" type="galaxy.datatypes.molFiles:SMILES" display_in_upload="True"> <converter file="smi_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/> <converter file="smi_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/> <converter file="smi_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/> <converter file="smi_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/> </datatype> <datatype extension="sdf" type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF" display_in_upload="True"> <converter file="sdf_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/> <converter file="sdf_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/> <converter file="sdf_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/> </datatype> <datatype extension="fps" type="galaxy.datatypes.molFiles:FPS" display_in_upload="True" /> <datatype extension="phar" type="galaxy.datatypes.molFiles:PHAR" display_in_upload="True" /> </registration> <sniffers> <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF"/> <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:MOL2"/> <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:InChI"/> <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:SMILES"/> </sniffers> </datatypes>