comparison datatypes/datatypes_conf.xml @ 0:af7b6c6ee439 draft

initial commit
author bgruening
date Tue, 25 Dec 2012 05:16:25 -0500
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:af7b6c6ee439
1 <?xml version="1.0"?>
2 <datatypes>
3 <datatype_files>
4 <datatype_file name="molFiles.py"/>
5 </datatype_files>
6 <registration>
7 <!--Cheminformatics Datatypes -->
8 <datatype extension="mol" type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF" display_in_upload="True">
9 <converter file="mol_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/>
10 <converter file="mol_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/>
11 <converter file="mol_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/>
12 </datatype>
13 <datatype extension="mol2" type="galaxy.datatypes.molFiles:MOL2" display_in_upload="True">
14 <converter file="mol2_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/>
15 <converter file="mol2_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/>
16 <converter file="mol2_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/>
17 <converter file="mol2_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/>
18 </datatype>
19 <datatype extension="inchi" type="galaxy.datatypes.molFiles:InChI" display_in_upload="True">
20 <converter file="inchi_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/>
21 <converter file="inchi_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/>
22 <converter file="inchi_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/>
23 <converter file="inchi_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/>
24 </datatype>
25 <datatype extension="smi" type="galaxy.datatypes.molFiles:SMILES" display_in_upload="True">
26 <converter file="smi_to_mol_converter.xml" target_datatype="mol"/>
27 <converter file="smi_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/>
28 <converter file="smi_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/>
29 <converter file="smi_to_sdf_converter.xml" target_datatype="sdf"/>
30 </datatype>
31 <datatype extension="sdf" type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF" display_in_upload="True">
32 <converter file="sdf_to_inchi_converter.xml" target_datatype="inchi"/>
33 <converter file="sdf_to_smi_converter.xml" target_datatype="smi"/>
34 <converter file="sdf_to_mol2_converter.xml" target_datatype="mol2"/>
35 </datatype>
36 <datatype extension="fps" type="galaxy.datatypes.molFiles:FPS" display_in_upload="True" />
37 <datatype extension="phar" type="galaxy.datatypes.molFiles:PHAR" display_in_upload="True" />
38 </registration>
39 <sniffers>
40 <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:SDF"/>
41 <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:MOL2"/>
42 <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:InChI"/>
43 <sniffer type="galaxy.datatypes.molFiles:SMILES"/>
44 </sniffers>
45 </datatypes>