Repository 'osra'
hg clone https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu/repos/bgruening/osra

Changeset 17:b8c0edfefc91 (2013-07-19)
Previous changeset 16:d97d51e9bb95 (2013-06-01) Next changeset 18:f0f3b38c9cd1 (2013-07-20)
Commit message:
ChemicalToolBoX update.
modified:
osra.xml
added:
force_pre-commit_hook_temp_file
b
diff -r d97d51e9bb95 -r b8c0edfefc91 osra.xml
--- a/osra.xml Sat Jun 01 20:03:17 2013 +0200
+++ b/osra.xml Fri Jul 19 16:28:14 2013 +0200
b
@@ -53,10 +53,22 @@
     </tests>
     <help>
 
-**What it does**
+.. class:: infomark
+
+**What this tool does**
+
+OSRA_ (Optical Structure Recognition Application) is a utility designed to convert graphical representations of chemical structures into SMILES or SDF. It generates the SMILES or SDF representation of any molecular structure image within a document which is parseable by GraphicMagick.
+
+.. _OSRA: http://cactus.nci.nih.gov/osra/
 
-OSRA detects molecules in images and converts them to standard molecule formats. 
+-----
+
+.. class:: infomark
 
+**Cite**
 
+Igor V Filippov and Marc C Nicklaus - `Optical Structure Recognition Software To Recover Chemical Information: OSRA, An Open Source Solution`_
+
+.. _`Optical Structure Recognition Software To Recover Chemical Information: OSRA, An Open Source Solution`: http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ci800067r
     </help>
 </tool>