Repository 'align_back_trans'
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Commit message:
v0.0.10 removed unused reference to muscle format
modified:
tools/align_back_trans/README.rst
tools/align_back_trans/align_back_trans.xml
b
diff -r 80e38b710ae9 -r 633f84270033 tools/align_back_trans/README.rst
--- a/tools/align_back_trans/README.rst Tue May 16 09:39:17 2017 -0400
+++ b/tools/align_back_trans/README.rst Mon Aug 21 06:25:24 2017 -0400
b
@@ -80,6 +80,8 @@
         - Use ``<command detect_errors="aggressive">`` (internal change only).
         - Single quote command line arguments (internal change only).
 v0.0.9  - Python 3 compatible print function.
+v0.0.10 - Remove unused reference to ``muscle`` format in wrapper, reported by
+          Björn Grüning (internal change only).
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b
diff -r 80e38b710ae9 -r 633f84270033 tools/align_back_trans/align_back_trans.xml
--- a/tools/align_back_trans/align_back_trans.xml Tue May 16 09:39:17 2017 -0400
+++ b/tools/align_back_trans/align_back_trans.xml Mon Aug 21 06:25:24 2017 -0400
b
@@ -1,4 +1,4 @@
-<tool id="align_back_trans" name="Thread nucleotides onto a protein alignment (back-translation)" version="0.0.9">
+<tool id="align_back_trans" name="Thread nucleotides onto a protein alignment (back-translation)" version="0.0.10">
     <description>Gives a codon aware alignment</description>
     <requirements>
         <requirement type="package" version="1.67">biopython</requirement>
@@ -10,7 +10,7 @@
 python $__tool_directory__/align_back_trans.py $prot_align.ext '$prot_align' '$nuc_file' '$out_nuc_align' '$table'
     </command>
     <inputs>
-        <param name="prot_align" type="data" format="fasta,muscle,clustal" label="Aligned protein file" help="Mutliple sequence file in FASTA, ClustalW or PHYLIP format." />
+        <param name="prot_align" type="data" format="fasta,clustal" label="Aligned protein file" help="Mutliple sequence file in FASTA, ClustalW or PHYLIP format." />
         <param name="table" type="select" label="Genetic code" help="Tables from the NCBI, these determine the start and stop codons">
             <option value="1">1. Standard</option>
             <option value="2">2. Vertebrate Mitochondrial</option>