| Previous changeset 39:4a69515eed63 (2018-04-13) Next changeset 41:627cce51523f (2018-04-28) |
|
Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/Yating-L/jbrowse-archive-creator.git commit 12fb52d5b285935b2353d93a5aa291838df7893e |
|
modified:
TrackHub.py datatypes/Datatype.pyc datatypes/binary/Binary.pyc jbrowseArchiveCreator.xml macros.xml test-data/only_genome/__main__.log util/Reader.py |
|
added:
datatypes/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc datatypes/binary/__pycache__/Bam.cpython-35.pyc datatypes/binary/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc test-data/only_genome/JBrowse_Archive_Creator_jbrowsehub.html test-data/only_genome/myHub/.htaccess test-data/only_genome/myHub/names/0.json test-data/only_genome/myHub/names/1.json test-data/only_genome/myHub/names/2.json test-data/only_genome/myHub/names/3.json test-data/only_genome/myHub/names/4.json test-data/only_genome/myHub/names/5.json test-data/only_genome/myHub/names/6.json test-data/only_genome/myHub/names/7.json test-data/only_genome/myHub/names/8.json test-data/only_genome/myHub/names/9.json test-data/only_genome/myHub/names/a.json test-data/only_genome/myHub/names/b.json test-data/only_genome/myHub/names/c.json test-data/only_genome/myHub/names/d.json test-data/only_genome/myHub/names/e.json test-data/only_genome/myHub/names/f.json test-data/only_genome/myHub/names/meta.json test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta.fai test-data/only_genome/myHub/seq/refSeqs.json test-data/only_genome/myHub/trackList.json test-data/only_genome/myHub/tracks.conf util/__pycache__/Reader.cpython-35.pyc util/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc |
|
removed:
test-data/only_genome/myHub/Dbia3/css/custom_track_styles.css test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/0.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/1.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/2.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/3.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/4.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/5.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/6.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/7.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/8.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/9.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/a.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/b.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/c.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/d.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/e.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/f.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/meta.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-3.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-0.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-1.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-2.txt test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/refSeqs.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/trackList.json test-data/only_genome/myHub/Dbia3/tracks.conf test-data/only_genome/only_genome.html |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 TrackHub.py --- a/TrackHub.py Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ b/TrackHub.py Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -69,10 +69,10 @@ subtools.generate_tabix_indexed_track(trackDbObject['trackDataURL'], trackDbObject['dataType'], trackDbObject['track'], self.myFinalTracksFolderPath) subtools.add_track_json(self.trackList, trackDbObject['options']) - def terminate(self, debug=False): + def terminate(self, debug="false"): """ Write html file """ self._indexName() - if not debug: + if debug.lower() == "false": self._removeRaw() self._outHtml() print "Success!\n" |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 datatypes/Datatype.pyc |
| b |
| Binary file datatypes/Datatype.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 datatypes/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc |
| b |
| Binary file datatypes/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 datatypes/binary/Binary.pyc |
| b |
| Binary file datatypes/binary/Binary.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 datatypes/binary/__pycache__/Bam.cpython-35.pyc |
| b |
| Binary file datatypes/binary/__pycache__/Bam.cpython-35.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 datatypes/binary/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc |
| b |
| Binary file datatypes/binary/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 jbrowseArchiveCreator.xml --- a/jbrowseArchiveCreator.xml Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ b/jbrowseArchiveCreator.xml Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -1,4 +1,4 @@ -<tool id="jbrowse_hub" name="JBrowse Archive Creator" version="2.1"> +<tool id="jbrowse_hub" name="JBrowse Archive Creator" version="2.1.1"> <description> This Galaxy tool is used to prepare your files to be ready for displaying on JBrowse with Apollo plugin </description> @@ -331,16 +331,11 @@ <option value="off" selected="true">Hide advanced options</option> <option value="on">Display advanced options</option> </param> - <!-- TODO: Avoid redundancy here --> <when value="on"> <param name="feature_tracks_type" type="select" label="Choose JBrowse feature tracks type"> <option value="CanvasFeatures" selected="true">CanvasFeatures</option> - <option value="HTMLFeatures">HTMLFeatures</option> - <help> - Use CanvasFeatures by default. - CanvasFeatures are newer than HTMLFeatures. CanvasFeatures tracks are indexed Tabix GFF3 or BED files. - HTMLFeatures allow some additional features of Apollo: dragging the features and highlighting edges. HTMLFeatures tracks are generated by flat-file-to-json.pl script to convert range-based annotation data (genes, transcripts, etc) to range-indexed sets of static JSON files. - </help> + <option value="HTMLFeatures">HTMLFeatures (Create a large number of range-indexed static JSON files. Don't choose this option if you want to upload/transfer output JBrowse hub to CyVerse Data Store!) + </option> </param> <param name="debug_mode" type="select" label="Activate debug mode"> <option value="false" selected="true">No</option> @@ -364,15 +359,14 @@ <test> <param name="genome_name" value="Dbia3"/> <param name="fasta_file" value="common/dbia3.fa"/> - <output name="output" file="only_genome/only_genome.html"> + <output name="output" file="only_genome/${tool.name}.html"> <!-- Use macro to check the whole common structure without repeated code --> <expand macro="verify_hub_structure_no_track" test="only_genome" /> </output> </test> </tests> <help> - This Galaxy tool will create a jbrowse hub which including binary datasets and json datasets that can be used for - JBrowse visualization. + This Galaxy tool will prepare your files to be ready for visualization on JBrowse/Apollo. </help> <citations> </citations> |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 macros.xml --- a/macros.xml Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ b/macros.xml Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -1,32 +1,18 @@ <macros> <xml name="verify_hub_structure" token_genome="Dbia3" token_test="common"> - <extra_files type="directory" value="myHub/@GENOME@/names" compare="re_match"/> - <extra_files type="directory" value="myHub/@GENOME@/seq" compare="re_match"/> - <extra_files type="directory" value="myHub/@GENOME@/tracks" compare="re_match"/> - <extra_files type="file" name="myHub/@GENOME@/css/custom_track_styles.css" value="@TEST@/myHub/@GENOME@/css/custom_track_styles.css" /> - <extra_files type="file" name="myHub/@GENOME@/tracks.conf" value="@TEST@/myHub/@GENOME@/tracks.conf" /> - <extra_files type="file" name="myHub/@GENOME@/trackList.json"> - <assert_contents> - <has_text text="tracks"/> - <has_text text="css"/> - <has_text text="names"/> - <has_text text="formatVersion"/> - </assert_contents> - </extra_files> + <expand macro="verify_hub_structure_no_track" test="only_genome" /> + <extra_files type="directory" value="@TEST@/myHub/tracks" compare="re_match"/> </xml> <xml name="verify_hub_structure_no_track" token_genome="Dbia3" token_test="common"> - <extra_files type="file" name="myHub/@GENOME@/trackList.json" > - <assert_contents> - <has_text text="tracks"/> - <has_text text="css"/> - <has_text text="names"/> - <has_text text="formatVersion"/> - </assert_contents> - </extra_files> - <extra_files type="file" name="myHub/@GENOME@/css/custom_track_styles.css" value="@TEST@/myHub/@GENOME@/css/custom_track_styles.css" /> + <!-- trackList.json --> + <extra_files type="file" name="myHub/trackList.json" value="@TEST/myHub/trackList.json" /> + <!-- seq/refSeqs.json --> + <extra_files type="file" name="myHub/seq/refSeqs.json" value="@TEST/myHub/seq/refSeqs.json" /> + <!-- name/meta.json --> + <extra_files type="file" name="myHub/names/meta.json" value="@TEST/myHub/names/meta.json" /> + <extra_files type="directory" value="@TEST@/myHub/names" compare="re_match"/> + <extra_files type="directory" value="@TEST@/myHub/seq" compare="re_match"/> </xml> - - </macros> \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/JBrowse_Archive_Creator_jbrowsehub.html --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/JBrowse_Archive_Creator_jbrowsehub.html Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,17 @@ +<html> + <body> + <p> + The following JBrowse hub has been generated by JBrowse Archive Creator: + </p> + <ul> + <li> JBrowse Hub Name </li> + <ul> + <li> Dbia3 </li> + </ul> + <li> Track configuration </li> + <ul> + <li> <a href="myHub/trackList.json">Track settings</a> </li> + </ul> + </ul> + </body> +</html> \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/__main__.log --- a/test-data/only_genome/__main__.log Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ b/test-data/only_genome/__main__.log Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -1,16 +1,57 @@ -DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### +2018-04-20 07:39:49,692 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Start #### + +2018-04-20 07:39:49,693 - root - DEBUG - ---- Welcome in JBrowseArchiveCreator Debug Mode ---- + +2018-04-20 07:39:49,693 - root - DEBUG - JSON parameters: {"extra_files_path": "/home/galaxy/galaxy/database/jobs/000/514/dataset_596_files", "feature_tracks_type": "CanvasFeatures", "debug_mode": "false", "genome_name": "Dbia3", "fasta": {"false_path": "/home/galaxy/galaxy/database/datasets/000/dataset_595.dat", "name": "dbia3.fa"}, "tool_directory": "/home/galaxy/shed_tools/testtoolshed.g2.bx.psu.edu/repos/yating-l/jbrowsearchivecreator/4a69515eed63/jbrowsearchivecreator", "user_email": "demo@apollo.com"} + + +2018-04-20 07:39:49,693 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Creating the Track Hub folder #### + +2018-04-20 07:39:49,693 - root - DEBUG - Calling faToTwoBit: +2018-04-20 07:39:49,693 - root - DEBUG - ['faToTwoBit', u'/home/galaxy/galaxy/database/datasets/000/dbia3.fa.fasta', '/tmp/tmpzDAir8'] +2018-04-20 07:39:49,693 - root - DEBUG - --------- +2018-04-20 07:39:49,722 - root - DEBUG - +2018-04-20 07:39:49,723 - root - DEBUG - Calling twoBitInfo: +2018-04-20 07:39:49,723 - root - DEBUG - ['twoBitInfo', '/tmp/tmpzDAir8', '/tmp/tmpgN38vZ'] +2018-04-20 07:39:49,723 - root - DEBUG - --------- +2018-04-20 07:39:49,731 - root - DEBUG - +2018-04-20 07:39:49,731 - root - DEBUG - Calling sort: +2018-04-20 07:39:49,731 - root - DEBUG - ['sort', '-k2rn', '/tmp/tmpgN38vZ', '-o', '/tmp/tmpwk5mtf.chrom.sizes'] +2018-04-20 07:39:49,731 - root - DEBUG - --------- +2018-04-20 07:39:49,735 - root - DEBUG - +2018-04-20 07:39:49,755 - root - DEBUG - Calling prepare-refseqs.pl: +2018-04-20 07:39:49,756 - root - DEBUG - ['prepare-refseqs.pl', '--indexed_fasta', u'/home/galaxy/galaxy/database/datasets/000/dbia3.fa.fasta', '--out', u'/home/galaxy/galaxy/database/jobs/000/514/dataset_596_files/myHub'] +2018-04-20 07:39:49,756 - root - DEBUG - --------- +2018-04-20 07:39:49,881 - root - DEBUG - +2018-04-20 07:39:49,882 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Preparing track data #### -DEBUG:root:Calling faToTwoBit: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling twoBitInfo: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:Calling sort: -DEBUG:root:--------- -DEBUG:root: -DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- -DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [] -DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- -DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- -DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! #### +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - ----- End of all_datatype_dictionary processing ----- +2018-04-20 07:39:49,882 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Adding tracks to Track Hub #### + +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - ----- Beginning of Track adding processing ----- +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - ----- End of Track adding processing ----- +2018-04-20 07:39:49,882 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Creating the HTML file #### + +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - Calling generate-names.pl: +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - ['generate-names.pl', '--hashBits', '4', '-v', '--out', u'/home/galaxy/galaxy/database/jobs/000/514/dataset_596_files/myHub'] +2018-04-20 07:39:49,882 - root - DEBUG - --------- +2018-04-20 07:39:49,992 - root - DEBUG - Tracks: + DNA +Sampled input stats: + total namerec bytes 1120 + namerecs converted to operations 70 + total input bytes 0 + avg record text bytes 16 + operations made 551 + name input records 70 + operation stream estimated count 0 + namerecs buffered 70 + record stream estimated count 0 +Removing existing contents of target dir /home/galaxy/galaxy/database/jobs/000/514/dataset_596_files/myHub/names +Hash store cache size: 2684 buckets +Using 1 chars for sort log names (16 sort logs) + +2018-04-20 07:39:49,998 - root - DEBUG - ---- End of JBrowseArchiveCreator Debug Mode: Bye! ---- + +2018-04-20 07:39:49,998 - root - INFO - #### JBrowseArchiveCreator: Congratulation! Assembly Hub is created! #### + |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/.htaccess --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/.htaccess Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,10 @@ +# This Apache .htaccess file is generated by JBrowse (GenomeDB) for +# allowing cross-origin requests as defined by the Cross-Origin +# Resource Sharing working draft from the W3C +# (http://www.w3.org/TR/cors/). In order for Apache to pay attention +# to this, it must have mod_headers enabled, and its AllowOverride +# configuration directive must allow FileInfo overrides. +<IfModule mod_headers.c> + Header onsuccess set Access-Control-Allow-Origin * + Header onsuccess set Access-Control-Allow-Headers X-Requested-With,Range +</IfModule> |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/0.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/0.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_26-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"]},"mrna_scaffold_20-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"]},"mrna_scaffold_27-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"]},"mrna_scaffold_51-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_22-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_10-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_10-snap.1",0,"mRNA_scaffold_10-snap.1","scaffold_10",17333,17570]]},"mrna_scaffold_63-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"]},"mrna_scaffold_43-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_43-snap.3",0,"mRNA_scaffold_43-snap.3","scaffold_43",12425,28780]]},"mrna_scaffold_28-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"]},"mrna_scaffold_24-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"]},"mrna_scaffold_49-":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_7-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"]},"scaffold_63":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_63",55021,"scaffold_63",null,0,55021,20000]]},"mrna_scaffold_24-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_24-snap.4",0,"mRNA_scaffold_24-snap.4","scaffold_24",24345,25553]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_25-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"]},"mrna_scaffold_11-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_12-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"]},"mrna_scaffold_48-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_48-snap.2",0,"mRNA_scaffold_48-snap.2","scaffold_48",19506,21320]]},"scaffold_54":{"exact":[["scaffold_54",35008,"scaffold_54",null,0,35008,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_37-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_37-snap.4",0,"mRNA_scaffold_37-snap.4","scaffold_37",36581,41476]]},"mrna_scaffold_65":{"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_1-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"]},"mrna_scaffold_70-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_70-snap.2",0,"mRNA_scaffold_70-snap.2","scaffold_70",15540,15747]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_35-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"]},"mrna_scaffold_32-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"],"exact":[]},"mrna_scaffold_40-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_43-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_28-snap.1",0,"mRNA_scaffold_28-snap.1","scaffold_28",8156,8820]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_10-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_40-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_40-snap.4",0,"mRNA_scaffold_40-snap.4","scaffold_40",51250,57833]]},"mrna_scaffold_30-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_34-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_34-snap.3",0,"mRNA_scaffold_34-snap.3","scaffold_34",39192,45655]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_25-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-":{"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_1-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_1-snap.1",0,"mRNA_scaffold_1-snap.1","scaffold_1",22710,23322]]},"mrna_scaffold_33":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_23-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"]},"mrna_scaffold_46-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"]},"mrna_scaffold_52":{"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_63-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"]},"mrna_scaffold_63-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_63-snap.2",0,"mRNA_scaffold_63-snap.2","scaffold_63",11291,12436]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_68-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_68-snap.3",0,"mRNA_scaffold_68-snap.3","scaffold_68",17113,18239]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_50-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_50-snap.3",0,"mRNA_scaffold_50-snap.3","scaffold_50",33728,35091]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_21-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"mrna_scaffold_22-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"]},"mrna_scaffold_27-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_27-snap.3",0,"mRNA_scaffold_27-snap.3","scaffold_27",23161,23825]],"prefix":[]},"scaffold_35":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_35",48011,"scaffold_35",null,0,48011,20000]]},"mrna_scaffold_57-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/1.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/1.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_31-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.5",0,"mRNA_scaffold_31-snap.5","scaffold_31",35322,35829]]},"mrna_scaffold_1-":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_56-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_56-snap.2",0,"mRNA_scaffold_56-snap.2","scaffold_56",23992,24952]]},"mrna_scaffold_42":{"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_17-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"]},"mrna_scaffold_36-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_36-snap.1",0,"mRNA_scaffold_36-snap.1","scaffold_36",6038,8715]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_57-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"]},"mrna_scaffold_45-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_45-snap.2",0,"mRNA_scaffold_45-snap.2","scaffold_45",8277,9533]]},"scaffold_12":{"exact":[["scaffold_12",56019,"scaffold_12",null,0,56019,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_19-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_19-snap.2",0,"mRNA_scaffold_19-snap.2","scaffold_19",29726,30923]]},"sca":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"scaffold_25":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_25",75023,"scaffold_25",null,0,75023,20000]]},"mrna_scaffold_4-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"]},"mrna_scaffold_25-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_25-snap.1",0,"mRNA_scaffold_25-snap.1","scaffold_25",13519,13702]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_19-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"]},"mrna_scaffold_29-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_29-snap.4",0,"mRNA_scaffold_29-snap.4","scaffold_29",26212,26449]]},"scaffold_2":{"exact":[["scaffold_2",45017,"scaffold_2",null,0,45017,20000]],"prefix":["scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27","scaffold_28","scaffold_29"]},"mrna_scaffold_41-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_41-snap.1",0,"mRNA_scaffold_41-snap.1","scaffold_41",4965,5169]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_39-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_39-snap.3",0,"mRNA_scaffold_39-snap.3","scaffold_39",18342,20149]],"prefix":[]},"mrna_sca":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"]},"mrna_scaffold_29-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"]},"scaffold_44":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_44",50013,"scaffold_44",null,0,50013,20000]]},"mrna_scaffold_14":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"]},"mrna_scaffold_68-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_52-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_52-snap.1",0,"mRNA_scaffold_52-snap.1","scaffold_52",335,3532]]},"mrna_scaffold_52-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"]},"mrna_sc":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"mrna_scaffold_27-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_48-":{"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_32-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.2",0,"mRNA_scaffold_32-snap.2","scaffold_32",4651,5301]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_5-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"]},"mrna_scaffold_21-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"mrna_scaffold_23":{"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_21-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_21-snap.2",0,"mRNA_scaffold_21-snap.2","scaffold_21",40072,41048]]},"mrna_scaffold_17-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"]},"mrna_scaffold_37-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_47-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_29-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_64-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/2.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/2.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_69-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_69-snap.1",0,"mRNA_scaffold_69-snap.1","scaffold_69",42129,43564]]},"mrna_scaffold_55-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_55-snap.2",0,"mRNA_scaffold_55-snap.2","scaffold_55",28992,29952]]},"mrna_scaffold_16-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_19-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"]},"mrna_scaffold_1-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"]},"mrna_scaffold_32-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.5",0,"mRNA_scaffold_32-snap.5","scaffold_32",9410,9867]]},"mrna_scaffold_42-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_42-snap.1",0,"mRNA_scaffold_42-snap.1","scaffold_42",13658,15810]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_8":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"]},"mrna_scaffold_46-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_46-snap.2",0,"mRNA_scaffold_46-snap.2","scaffold_46",42717,44481]]},"mrna_scaffold_26-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_26-snap.1",0,"mRNA_scaffold_26-snap.1","scaffold_26",13480,14722]]},"mrna_scaffold_59-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"]},"mrna_scaffold_51-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_51-snap.1",0,"mRNA_scaffold_51-snap.1","scaffold_51",5388,7759]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_33-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_59-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"]},"mrna_scaffold_24-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_8-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_43":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_43",50016,"scaffold_43",null,0,50016,20000]]},"mrna_scaffold_29-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"]},"mrna_scaffold_40-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"]},"mrna_scaffold_24-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"]},"mrna_scaffold_29-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_29-snap.3",0,"mRNA_scaffold_29-snap.3","scaffold_29",20484,22399]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_10-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"]},"mrna_scaffold_65-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_65-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"]},"mrna_scaffold_39-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_39-snap.4",0,"mRNA_scaffold_39-snap.4","scaffold_39",35762,38144]]},"mrna_scaffold_12-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"]},"mrna_scaffold_35-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_35-snap.1",0,"mRNA_scaffold_35-snap.1","scaffold_35",6656,10709]],"prefix":[]},"mrna_s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"scaffold_15":{"exact":[["scaffold_15",50014,"scaffold_15",null,0,50014,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_57-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"]},"scaffold_22":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_22",60010,"scaffold_22",null,0,60010,20000]]},"mrna_scaffold_45":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"]},"mrna_scaffold_57-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_4-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.2",0,"mRNA_scaffold_31-snap.2","scaffold_31",16891,19270]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_61-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_5":{"exact":[["scaffold_5",50018,"scaffold_5",null,0,50018,20000]],"prefix":["scaffold_50","scaffold_51","scaffold_52","scaffold_53","scaffold_54","scaffold_55","scaffold_56","scaffold_57","scaffold_58","scaffold_59"]},"mrna_scaffold_2-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"]},"mrna_scaffold_22-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_22-snap.2",0,"mRNA_scaffold_22-snap.2","scaffold_22",30068,31044]]},"mrna_scaffold_69-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"]},"mrna_scaffold_29-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"]},"mrna_scaffold_49-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_24":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/3.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/3.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_2-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_2-snap.1",0,"mRNA_scaffold_2-snap.1","scaffold_2",7543,8155]]},"mrna_scaffold_70-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"]},"mrna_scaffold_24-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_24-snap.3",0,"mRNA_scaffold_24-snap.3","scaffold_24",12248,12672]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_62-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_32":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_32",40014,"scaffold_32",null,0,40014,20000]]},"mrna_scaffold_34":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_36-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_42-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"]},"mrna_scaffold_38-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"]},"mrna_scaffold_44-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_43-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_43-snap.4",0,"mRNA_scaffold_43-snap.4","scaffold_43",32149,33383]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_7":{"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_62":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_52-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"]},"mrna_scaffold_70-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_3-":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"]},"mrna_scaffold_3-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_46-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"]},"mrna_scaffold_11-":{"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_63-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_63-snap.5",0,"mRNA_scaffold_63-snap.5","scaffold_63",40108,42955]]},"mrna_scaffold_37-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_37-snap.3",0,"mRNA_scaffold_37-snap.3","scaffold_37",31370,32310]]},"mrna_scaffold_64-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_64-snap.1",0,"mRNA_scaffold_64-snap.1","scaffold_64",9874,11968]]},"mrna_scaffold_48-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_53-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_49-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_35-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"]},"mrna_scaffold_22-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_12-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"]},"mrna_scaffold_58-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_58-snap.2",0,"mRNA_scaffold_58-snap.2","scaffold_58",22270,27051]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_64-":{"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_27-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_27-snap.4",0,"mRNA_scaffold_27-snap.4","scaffold_27",42678,47390]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_48-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_48-snap.5",0,"mRNA_scaffold_48-snap.5","scaffold_48",55173,56462]]},"mrna_scaffold_15-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"]},"mrna_scaffold_21-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"mrna_scaffold_55":{"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_53":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_53",50013,"scaffold_53",null,0,50013,20000]]},"mrna_scaffold_40-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_40-snap.3",0,"mRNA_scaffold_40-snap.3","scaffold_40",45011,48590]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"],"exact":[]},"mrna_scaffold_3-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_64":{"exact":[["scaffold_64",40016,"scaffold_64",null,0,40016,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_38-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_38-snap.1",0,"mRNA_scaffold_38-snap.1","scaffold_38",1772,3942]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/4.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/4.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_56-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"]},"mrna_scaffold_33-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_62-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_4-":{"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_4-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_4-snap.1",0,"mRNA_scaffold_4-snap.1","scaffold_4",50291,52478]]},"mrna_scaffold_32-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.4",0,"mRNA_scaffold_32-snap.4","scaffold_32",6335,7142]]},"scaffold_23":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_23",50012,"scaffold_23",null,0,50012,20000]]},"mrna_scaffold_10-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_56-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"]},"mrna_scaffold_15-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_15-snap.1",0,"mRNA_scaffold_15-snap.1","scaffold_15",3544,6515]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_53-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"]},"mrna_scaffold_36-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_16-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_63-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"]},"mrna_scaffold_16-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"]},"mrna_scaffold_9":{"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"scaff":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_11-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_11-snap.2",0,"mRNA_scaffold_11-snap.2","scaffold_11",27740,29579]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_12":{"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_5-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"]},"mrna_scaffold_22-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_22-snap.3",0,"mRNA_scaffold_22-snap.3","scaffold_22",36899,37971]]},"mrna_scaffold_44":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_14":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_14",45010,"scaffold_14",null,0,45010,20000]]},"mrna_scaffold_24-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_2-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"]},"mrna_scaffold_62-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_62-snap.1",0,"mRNA_scaffold_62-snap.1","scaffold_62",46303,47448]]},"mrna_scaffold_29-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_29-snap.2",0,"mRNA_scaffold_29-snap.2","scaffold_29",18118,18425]]},"mrna_scaffold_29-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"]},"mrna_scaffold_49-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_49-snap.1",0,"mRNA_scaffold_49-snap.1","scaffold_49",7587,8572]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_16-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"]},"mrna_scaffold_46-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_41-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_38-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"]},"mrna_scaffold_25":{"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_38-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"]},"mrna_scaffold_31-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.3",0,"mRNA_scaffold_31-snap.3","scaffold_31",33197,33530]],"prefix":[]},"scaffold_4":{"exact":[["scaffold_4",55011,"scaffold_4",null,0,55011,20000]],"prefix":["scaffold_40","scaffold_41","scaffold_42","scaffold_43","scaffold_44","scaffold_45","scaffold_46","scaffold_47","scaffold_48","scaffold_49"]},"mrna_scaffold_65-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_42":{"exact":[["scaffold_42",70020,"scaffold_42",null,0,70020,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_20-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_26-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/5.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/5.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_18-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_18-snap.1",0,"mRNA_scaffold_18-snap.1","scaffold_18",35375,35582]],"prefix":[]},"scaffold_33":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_33",40016,"scaffold_33",null,0,40016,20000]]},"mrna_scaffold_70-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_70-snap.4",0,"mRNA_scaffold_70-snap.4","scaffold_70",50821,51082]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_44-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_44-snap.1",0,"mRNA_scaffold_44-snap.1","scaffold_44",11631,14528]]},"mrna_scaffold_40-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_40-snap.2",0,"mRNA_scaffold_40-snap.2","scaffold_40",34974,35178]]},"mrna_scaffold_48-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_48-snap.4",0,"mRNA_scaffold_48-snap.4","scaffold_48",42596,43581]]},"mrna_scaffold_35":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"]},"mrna_scaffold_33-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_33-snap.1",0,"mRNA_scaffold_33-snap.1","scaffold_33",4126,6762]]},"mrna_scaffold_63-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_63-snap.4",0,"mRNA_scaffold_63-snap.4","scaffold_63",36086,37766]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"],"exact":[]},"mrna_scaffold_64-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_57-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_57-snap.1",0,"mRNA_scaffold_57-snap.1","scaffold_57",7335,8488]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_24-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_24-snap.2",0,"mRNA_scaffold_24-snap.2","scaffold_24",3539,6182]]},"mrna_scaffold_56-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"]},"mrna_scaffold_20-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_20-snap.1",0,"mRNA_scaffold_20-snap.1","scaffold_20",15368,15575]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_33-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_17-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"]},"mrna_scaffold_30-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"]},"mrna_scaffold_35-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"]},"mrna_scaffold_37-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"]},"mrna_scaffold_36-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_41-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"]},"mrna_scaffold_6":{"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1","mRNA_scaffold_61-snap.1","mRNA_scaffold_62-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5","mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3","mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3","mRNA_scaffold_69-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_5-":{"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_32-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"],"exact":[]},"mrna_scaffold_34-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_63":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"]},"mrna_scaffold_62-":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_17-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"]},"mrna_scaffo":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mr":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_9-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_9-snap.1",0,"mRNA_scaffold_9-snap.1","scaffold_9",16294,18070]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_42-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_54":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"]},"mrna_scaffold_9-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_25-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_37-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_37-snap.2",0,"mRNA_scaffold_37-snap.2","scaffold_37",20921,22605]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_31-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"],"exact":[]},"scaffold_52":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_52",40012,"scaffold_52",null,0,40012,20000]]},"scaffold_65":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_65",45013,"scaffold_65",null,0,45013,20000]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/6.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/6.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_43-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"]},"mrna_scaffold_34-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"scaffold_55":{"exact":[["scaffold_55",40015,"scaffold_55",null,0,40015,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32":{"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"],"exact":[]},"mrna_scaffold_30-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_30-snap.1",0,"mRNA_scaffold_30-snap.1","scaffold_30",1209,1446]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_63-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_63-snap.3",0,"mRNA_scaffold_63-snap.3","scaffold_63",24879,26973]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_48-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_48-snap.3",0,"mRNA_scaffold_48-snap.3","scaffold_48",22136,23803]]},"mrna_scaffold_23-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_23-snap.1",0,"mRNA_scaffold_23-snap.1","scaffold_23",12860,13727]]},"mrna_scaffold_63-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_61-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"]},"mrna_scaffold_60-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"]},"mrna_scaffold_50-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_50-snap.2",0,"mRNA_scaffold_50-snap.2","scaffold_50",20389,22760]]},"mrna_scaffold_1":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"]},"mrna_scaffold_62-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_43-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_43-snap.2",0,"mRNA_scaffold_43-snap.2","scaffold_43",9962,11663]]},"mrna_scaffold_47-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"]},"mrna_scaffold_53-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"]},"scaffold_62":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_62",50017,"scaffold_62",null,0,50017,20000]]},"mrna_scaffold_23-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_54-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_54-snap.1",0,"mRNA_scaffold_54-snap.1","scaffold_54",2582,5547]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_33-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_64":{"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_65-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"]},"mrna_scaffold_64-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"]},"mrna_scaffold_63-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_27-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_27-snap.2",0,"mRNA_scaffold_27-snap.2","scaffold_27",6525,7750]]},"mrna_scaffold_49-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"]},"mrna_scaff":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_69-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_53":{"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_70-snap.3",0,"mRNA_scaffold_70-snap.3","scaffold_70",36591,39270]]},"mrna_scaffold_14-":{"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_47-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_47-snap.1",0,"mRNA_scaffold_47-snap.1","scaffold_47",2707,4471]]},"mrna_scaffold_34-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_34-snap.2",0,"mRNA_scaffold_34-snap.2","scaffold_34",31661,35714]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_4-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"]},"mrna_scaffold_58-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"]},"mrna_scaffold_68-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_68-snap.2",0,"mRNA_scaffold_68-snap.2","scaffold_68",13679,14995]]},"scaffold_34":{"exact":[["scaffold_34",50012,"scaffold_34",null,0,50012,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_61-":{"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"],"exact":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/7.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/7.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_52-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"]},"mrna_scaffold_59-":{"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_29-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_29-snap.5",0,"mRNA_scaffold_29-snap.5","scaffold_29",38634,38835]]},"mrna_scaffold_25-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"]},"mrna_scaffold_19-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_62-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"]},"mrna_scaffold_56-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_2-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_48-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_7-":{"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_39-snap.2",0,"mRNA_scaffold_39-snap.2","scaffold_39",6575,11470]],"prefix":[]},"scaffold_13":{"exact":[["scaffold_13",45015,"scaffold_13",null,0,45015,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_48-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_5-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"]},"mrna_scaffold_11-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"]},"mrna_scaffold_45-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_20-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_37-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_61-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_61-snap.1",0,"mRNA_scaffold_61-snap.1","scaffold_61",12494,17521]]},"scaffol":{"exact":[],"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"mrna_scaffold_43":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"]},"mrna_scaffold_60-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"]},"mrna_scaffold_56-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_56-snap.3",0,"mRNA_scaffold_56-snap.3","scaffold_56",37348,38501]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_50-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"],"exact":[]},"scaffold_24":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_24",40010,"scaffold_24",null,0,40010,20000]]},"mrna_scaffold_60-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"]},"mrna_scaffold_68-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"]},"mrna_scaffold_47-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_15":{"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.4",0,"mRNA_scaffold_31-snap.4","scaffold_31",34662,35312]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_34-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"]},"mrna_scaffold_16-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_16-snap.1",0,"mRNA_scaffold_16-snap.1","scaffold_16",38080,38640]]},"mrna_scaffold_23-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"]},"mrna_scaffold_22":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"]},"mrna_scaffold_68-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"]},"mrna_scaffold_59-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_59-snap.1",0,"mRNA_scaffold_59-snap.1","scaffold_59",12270,17051]]},"scaffold_45":{"exact":[["scaffold_45",50013,"scaffold_45",null,0,50013,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_22-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_22-snap.4",0,"mRNA_scaffold_22-snap.4","scaffold_22",52867,53734]]},"mrna_scaffold_65-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_65-snap.2",0,"mRNA_scaffold_65-snap.2","scaffold_65",5094,7941]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.3",0,"mRNA_scaffold_32-snap.3","scaffold_32",5311,5818]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_7-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_7-snap.1",0,"mRNA_scaffold_7-snap.1","scaffold_7",46305,48081]]},"mrna_scaffold_58-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_21-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_21-snap.3",0,"mRNA_scaffold_21-snap.3","scaffold_21",46903,47975]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_14-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_15-":{"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_58-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_38-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"],"exact":[]},"scaffold_3":{"exact":[["scaffold_3",40006,"scaffold_3",null,0,40006,20000]],"prefix":["scaffold_30","scaffold_31","scaffold_32","scaffold_33","scaffold_34","scaffold_35","scaffold_36","scaffold_37","scaffold_38","scaffold_39"]},"mrna_scaffold_69-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"],"exact":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/8.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/8.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_59-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_35-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_35-snap.2",0,"mRNA_scaffold_35-snap.2","scaffold_35",14187,20650]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_38":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"]},"scaffold":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}],"exact":[]},"mrna_scaffold_22-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_22-snap.1",0,"mRNA_scaffold_22-snap.1","scaffold_22",25270,26615]]},"scaffold_21":{"exact":[["scaffold_21",50011,"scaffold_21",null,0,50011,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_50-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_32-snap.6":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.6",0,"mRNA_scaffold_32-snap.6","scaffold_32",20020,21764]]},"mrna_scaffold_42-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_42-snap.2",0,"mRNA_scaffold_42-snap.2","scaffold_42",30624,39659]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_26-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_26-snap.2",0,"mRNA_scaffold_26-snap.2","scaffold_26",21858,22627]],"prefix":[]},"sc":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_51-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_51-snap.2",0,"mRNA_scaffold_51-snap.2","scaffold_51",18727,20090]],"prefix":[]},"m":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_50-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_56-":{"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_41-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"]},"mrna_scaffold_10-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_53-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"]},"mrna_scaffold_34-":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_46":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"]},"mrna_scaffold_8-":{"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_20-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_27":{"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_51-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"]},"mrna_scaffold_57-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"]},"mrna_scaffold_30-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"]},"mrna_scaffold_59":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"]},"mrna_scaffold_54-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"]},"mrna_scaffold_52-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"]},"mrna_scaffold_37-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"]},"mrna_scaffold_23-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"]},"scaffold_6":{"exact":[["scaffold_6",40015,"scaffold_6",null,0,40015,20000]],"prefix":["scaffold_60","scaffold_61","scaffold_62","scaffold_63","scaffold_64","scaffold_65","scaffold_66","scaffold_67","scaffold_68","scaffold_69"]},"scaffold_16":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_16",45017,"scaffold_16",null,0,45017,20000]]},"mrna_scaffold_55-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"]},"mrna_scaffold_10":{"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.1",0,"mRNA_scaffold_31-snap.1","scaffold_31",3892,11295]]},"scaffold_68":{"exact":[["scaffold_68",25628,"scaffold_68",null,0,25628,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_44-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_60-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"]},"mrna_scaffold_46-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_46-snap.1",0,"mRNA_scaffold_46-snap.1","scaffold_46",37007,37634]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_55-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_55-snap.1",0,"mRNA_scaffold_55-snap.1","scaffold_55",16789,17852]]},"scaffold_40":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_40",60015,"scaffold_40",null,0,60015,20000]]},"mrna_scaffold_56-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"]},"mrna_scaffold_40-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"],"exact":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/9.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/9.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_60-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_60-snap.1",0,"mRNA_scaffold_60-snap.1","scaffold_60",27499,32526]]},"mrna_scaffold_2-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_2-snap.2",0,"mRNA_scaffold_2-snap.2","scaffold_2",41075,42608]]},"mrna_scaffold_40-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"]},"mrna_scaffold_45-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"]},"mrna_scaffold_5-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_23-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_23-snap.4",0,"mRNA_scaffold_23-snap.4","scaffold_23",32251,32675]],"prefix":[]},"scaffold_67":{"exact":[["scaffold_67",44531,"scaffold_67",null,0,44531,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_60-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_33-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_33-snap.3",0,"mRNA_scaffold_33-snap.3","scaffold_33",14109,16069]]},"mrna_scaffold_57-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"]},"mrna_scaffold_26-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"],"exact":[]},"scaffold_31":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_31",40012,"scaffold_31",null,0,40012,20000]]},"mrna_scaffold_55-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"]},"mrna_scaffold_61":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"]},"mrna_scaffold_28":{"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_30-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"]},"mrna_scaffold_20-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_20-snap.3",0,"mRNA_scaffold_20-snap.3","scaffold_20",48652,49920]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_58-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_57-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_57-snap.3",0,"mRNA_scaffold_57-snap.3","scaffold_57",47277,52058]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_63-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_63-snap.1","mRNA_scaffold_63-snap.2","mRNA_scaffold_63-snap.3","mRNA_scaffold_63-snap.4","mRNA_scaffold_63-snap.5"]},"mrna_scaffold_28-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_28-snap.1","mRNA_scaffold_28-snap.2","mRNA_scaffold_28-snap.3","mRNA_scaffold_28-snap.4","mRNA_scaffold_28-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_49":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_28-snap.5",0,"mRNA_scaffold_28-snap.5","scaffold_28",46221,46458]]},"scaffold_19":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_19",45013,"scaffold_19",null,0,45013,20000]]},"mrna_scaffold_56":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3"]},"scaffold_9":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_9",60018,"scaffold_9",null,0,60018,20000]]},"mrna_scaffold_52-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_9-":{"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_58-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_37":{"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_55-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"]},"mrna_scaffold_17-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_17-snap.1",0,"mRNA_scaffold_17-snap.1","scaffold_17",18072,18632]]},"mrna_scaffold_3-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_27-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"]},"mrna_scaffold_10-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_50":{"exact":[["scaffold_50",40009,"scaffold_50",null,0,40009,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_35-":{"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_61-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_64-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_64-snap.2",0,"mRNA_scaffold_64-snap.2","scaffold_64",21081,22761]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_36-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_30-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_30-snap.4",0,"mRNA_scaffold_30-snap.4","scaffold_30",43899,51302]]},"mrna_scaffold_8-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"]},"mrna_scaffold_4":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4","mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5","mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4","mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"mrna_scaffold_21-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"mrna_scaffold_58-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_58-snap.1",0,"mRNA_scaffold_58-snap.1","scaffold_58",4540,7547]]},"mrna_scaffold_42-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"]},"mrna_scaffold_38-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_38-snap.2",0,"mRNA_scaffold_38-snap.2","scaffold_38",5918,7602]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_22-":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_59-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/a.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/a.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"scaffold_48":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_48",65012,"scaffold_48",null,0,65012,20000]]},"mrna_scaffold_45-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"]},"mrna_scaffold_15-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"]},"mrna_scaffold_15-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_54-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"]},"scaffold_60":{"exact":[["scaffold_60",50013,"scaffold_60",null,0,50013,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_51":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"]},"mrna_scaffold_3":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_10-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_10-snap.2",0,"mRNA_scaffold_10-snap.2","scaffold_10",21002,22382]]},"mrn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_35-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_70-snap.1",0,"mRNA_scaffold_70-snap.1","scaffold_70",12176,13611]]},"mrna_scaffold_8-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_8-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"]},"mrna_scaffold_65-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"]},"mrna_scaffold_23-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"]},"mrna_scaffold_43-":{"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_50-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_48-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_48-snap.1",0,"mRNA_scaffold_48-snap.1","scaffold_48",2878,14898]]},"mrna_scaffold_55-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_25-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_30-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_30-snap.3",0,"mRNA_scaffold_30-snap.3","scaffold_30",36585,36866]]},"scaffold_29":{"exact":[["scaffold_29",50006,"scaffold_29",null,0,50006,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_51-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_33-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_33-snap.4",0,"mRNA_scaffold_33-snap.4","scaffold_33",33453,37086]]},"mrna_scaffold_63-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_63-snap.1",0,"mRNA_scaffold_63-snap.1","scaffold_63",1002,2405]]},"scaffold_36":{"exact":[["scaffold_36",45010,"scaffold_36",null,0,45010,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_38-snap.5":{"exact":[["mRNA_scaffold_38-snap.5",0,"mRNA_scaffold_38-snap.5","scaffold_38",33345,35152]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_34-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_68-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18":{"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_48-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"]},"mrna_scaffold_18-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"]},"mrna_scaffold_17-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_36-":{"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_5-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_5-snap.1",0,"mRNA_scaffold_5-snap.1","scaffold_5",25289,27476]]},"mrna_scaffold_65-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_65-snap.1","mRNA_scaffold_65-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_14-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_14-snap.1",0,"mRNA_scaffold_14-snap.1","scaffold_14",33551,36522]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_23-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5"]},"scaffold_57":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_57",60013,"scaffold_57",null,0,60013,20000]]},"scaffold_":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}],"exact":[]},"mrna_scaffold_30":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"]},"mrna_scaffold_23-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_23-snap.3",0,"mRNA_scaffold_23-snap.3","scaffold_23",23542,26185]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_68-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_1-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"]},"mrna_scaffold_21-":{"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_46-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_28-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_28-snap.2",0,"mRNA_scaffold_28-snap.2","scaffold_28",27673,32385]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/b.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/b.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_37-":{"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_56-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_56-snap.1",0,"mRNA_scaffold_56-snap.1","scaffold_56",11789,12852]]},"mrna_scaffold_42-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"]},"mrna_scaffold_41-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"]},"mrna_scaffold_31-snap.6":{"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.6",0,"mRNA_scaffold_31-snap.6","scaffold_31",36346,37153]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_21-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_21-snap.1",0,"mRNA_scaffold_21-snap.1","scaffold_21",35274,36619]]},"scaffold_1":{"exact":[["scaffold_1",45179,"scaffold_1",null,0,45179,20000]],"prefix":["scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19"]},"mrna_scaffold_41":{"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_19-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_19-snap.1",0,"mRNA_scaffold_19-snap.1","scaffold_19",20371,20578]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_17":{"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_43-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"]},"mrna_scaffold_25-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_25-snap.2",0,"mRNA_scaffold_25-snap.2","scaffold_25",63495,64737]]},"mrna_scaffold_42-snap.5":{"exact":[["mRNA_scaffold_42-snap.5",0,"mRNA_scaffold_42-snap.5","scaffold_42",62157,63391]],"prefix":[]},"s":{"exact":[],"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_8-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_8-snap.1",0,"mRNA_scaffold_8-snap.1","scaffold_8",16294,18070]]},"mrna_scaffold_54-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_39":{"exact":[["scaffold_39",45019,"scaffold_39",null,0,45019,20000]],"prefix":[]},"scaffold_58":{"exact":[["scaffold_58",50011,"scaffold_58",null,0,50011,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_30-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_69":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"]},"scaffold_47":{"exact":[["scaffold_47",35007,"scaffold_47",null,0,35007,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_3-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_20-":{"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_27-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_20":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"]},"mrna_scaffold_19-":{"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_26":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_26",40013,"scaffold_26",null,0,40013,20000]]},"mrna_scaffold_41-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_41-snap.2",0,"mRNA_scaffold_41-snap.2","scaffold_41",15002,18581]],"prefix":[]},"mrna":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}],"exact":[]},"mrna_scaffold_15-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_45-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_45-snap.1",0,"mRNA_scaffold_45-snap.1","scaffold_45",1627,4524]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.1",0,"mRNA_scaffold_32-snap.1","scaffold_32",3186,3519]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_55-":{"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_11":{"exact":[["scaffold_11",35013,"scaffold_11",null,0,35013,20000]],"prefix":[]},"scaffold_70":{"exact":[["scaffold_70",55020,"scaffold_70",null,0,55020,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_32-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/c.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/c.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_23-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_23-snap.2",0,"mRNA_scaffold_23-snap.2","scaffold_23",20554,22091]]},"mrna_scaffold_42-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"]},"mrna_scaffold_43-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_43-snap.1",0,"mRNA_scaffold_43-snap.1","scaffold_43",1043,9651]],"prefix":[]},"scaf":{"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_49-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_11-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"]},"scaffold_28":{"exact":[["scaffold_28",50013,"scaffold_28",null,0,50013,20000]],"prefix":[]},"scaffold_56":{"exact":[["scaffold_56",55020,"scaffold_56",null,0,55020,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_45-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"]},"mrna_scaffold_7-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_14-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_30-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_30-snap.2",0,"mRNA_scaffold_30-snap.2","scaffold_30",13631,13832]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_55-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2"]},"mrna_scaffold_28-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_28-snap.3",0,"mRNA_scaffold_28-snap.3","scaffold_28",38127,38434]]},"mrna_scaffold_68-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_68-snap.1",0,"mRNA_scaffold_68-snap.1","scaffold_68",5692,6711]]},"mrna_scaffold_19":{"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_29-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"]},"mrna_scaffold_54-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_2-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffol":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_50-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_50-snap.1",0,"mRNA_scaffold_50-snap.1","scaffold_50",5162,6451]]},"mrna_scaffold_52-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_52-snap.1"]},"mrna_scaffold_27-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_30-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_30-snap.1","mRNA_scaffold_30-snap.2","mRNA_scaffold_30-snap.3","mRNA_scaffold_30-snap.4","mRNA_scaffold_30-snap.5"]},"mrna_scaffold_38-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_38-snap.4",0,"mRNA_scaffold_38-snap.4","scaffold_38",21578,26473]]},"mrna_scaffold_8-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_8-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_48-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"]},"mrna_scaffold_27-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_27-snap.1",0,"mRNA_scaffold_27-snap.1","scaffold_27",4093,4607]]},"mrna_scaffold_26-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"]},"mrna_scaffold_50":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"]},"mrna_scaffold_27-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_27-snap.1","mRNA_scaffold_27-snap.2","mRNA_scaffold_27-snap.3","mRNA_scaffold_27-snap.4"]},"mrna_scaffold_31-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"]},"mrna_scaffold_9-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"],"exact":[]},"scaffold_37":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_37",50013,"scaffold_37",null,0,50013,20000]]},"mrna_scaffold_47-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_47-snap.2",0,"mRNA_scaffold_47-snap.2","scaffold_47",22882,34948]],"prefix":[]},"scaffold_61":{"exact":[["scaffold_61",40008,"scaffold_61",null,0,40008,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_34-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_34-snap.1",0,"mRNA_scaffold_34-snap.1","scaffold_34",8441,12074]],"prefix":[]},"scaffold_49":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_49",30003,"scaffold_49",null,0,30003,20000]]},"mrna_scaffold_2":{"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.1","mRNA_scaffold_23-snap.2","mRNA_scaffold_23-snap.3","mRNA_scaffold_23-snap.4","mRNA_scaffold_23-snap.5","mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3",{"name":"too many matches","hitLimit":1}],"exact":[]},"mrna_scaffold_62-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_62-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/d.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/d.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_21-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"mrna_scaffold_12-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_25-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_25-snap.3",0,"mRNA_scaffold_25-snap.3","scaffold_25",71873,72642]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_43-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-snap.7":{"exact":[["mRNA_scaffold_31-snap.7",0,"mRNA_scaffold_31-snap.7","scaffold_31",39421,39878]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_31-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"]},"mrna_scaffold_3-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_3-snap.1",0,"mRNA_scaffold_3-snap.1","scaffold_3",6060,7593]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_3-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_3-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_31-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"],"exact":[]},"mrna_scaffold_41-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"]},"mrna_scaffold_42-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_42-snap.4",0,"mRNA_scaffold_42-snap.4","scaffold_42",42433,58788]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_4-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"]},"mrna_scaffold_26-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_45-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_53-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"]},"mrna_scaffold_11-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"]},"mrna_scaffold_40":{"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_44-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_9-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"]},"mrna_scaffold_38-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_2-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_1-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"]},"mrna_scaffold_4-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_4-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_65-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_65-snap.1",0,"mRNA_scaffold_65-snap.1","scaffold_65",1072,2752]]},"scaffold_10":{"exact":[["scaffold_10",43013,"scaffold_10",null,0,43013,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_12-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_12-snap.1",0,"mRNA_scaffold_12-snap.1","scaffold_12",18737,20576]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_46-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_26-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_26-snap.4",0,"mRNA_scaffold_26-snap.4","scaffold_26",31533,32758]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_54-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"]},"scaffo":{"exact":[],"prefix":["scaffold_1","scaffold_10","scaffold_11","scaffold_12","scaffold_13","scaffold_14","scaffold_15","scaffold_16","scaffold_17","scaffold_18","scaffold_19","scaffold_2","scaffold_20","scaffold_21","scaffold_22","scaffold_23","scaffold_24","scaffold_25","scaffold_26","scaffold_27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"scaffold_46":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_46",50012,"scaffold_46",null,0,50012,20000]]},"mrna_scaffold_5-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1"]},"mrna_scaffold_40-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"],"exact":[]},"scaffold_27":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_27",50016,"scaffold_27",null,0,50016,20000]]},"mrna_scaffold_45-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_45-snap.1","mRNA_scaffold_45-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_36-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_59-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_59-snap.1"]},"mrna_scaffold_39-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_39-snap.1",0,"mRNA_scaffold_39-snap.1","scaffold_39",1364,2304]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_31-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_31-snap.1","mRNA_scaffold_31-snap.2","mRNA_scaffold_31-snap.3","mRNA_scaffold_31-snap.4","mRNA_scaffold_31-snap.5","mRNA_scaffold_31-snap.6","mRNA_scaffold_31-snap.7"],"exact":[]},"mrna_scaffold_16":{"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_26-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"]},"mrna_scaffold_7-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_68":{"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_49-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_49-snap.1","mRNA_scaffold_49-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_41-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_41-snap.1","mRNA_scaffold_41-snap.2","mRNA_scaffold_41-snap.3","mRNA_scaffold_41-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaf":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"mrna_scaffold_61-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"]},"mrna_scaffold_60-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"]},"mrna_scaffold_41-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_41-snap.3",0,"mRNA_scaffold_41-snap.3","scaffold_41",21241,27824]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_51-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"],"exact":[]},"scaffold_59":{"exact":[["scaffold_59",40011,"scaffold_59",null,0,40011,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_47-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_43-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_43-snap.1","mRNA_scaffold_43-snap.2","mRNA_scaffold_43-snap.3","mRNA_scaffold_43-snap.4"]},"mrna_scaffold_1-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_21":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2","mRNA_scaffold_21-snap.3"]},"scaffold_38":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_38",50017,"scaffold_38",null,0,50017,20000]]},"mrna_scaffold_44-":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_42-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_42-snap.1","mRNA_scaffold_42-snap.2","mRNA_scaffold_42-snap.3","mRNA_scaffold_42-snap.4","mRNA_scaffold_42-snap.5"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/e.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/e.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_11-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_11":{"prefix":["mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_32-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_32-snap.1","mRNA_scaffold_32-snap.2","mRNA_scaffold_32-snap.3","mRNA_scaffold_32-snap.4","mRNA_scaffold_32-snap.5","mRNA_scaffold_32-snap.6","mRNA_scaffold_32-snap.7","mRNA_scaffold_32-snap.8"]},"mrna_scaffold_37-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_37-snap.1","mRNA_scaffold_37-snap.2","mRNA_scaffold_37-snap.3","mRNA_scaffold_37-snap.4"]},"mrna_scaffold_58":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"]},"mrna_scaffold_10-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2"]},"mrna_scaffold_47":{"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_16-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"]},"mrna_scaffold_15-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_15-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_20-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_39":{"prefix":["mRNA_scaffold_39-snap.1","mRNA_scaffold_39-snap.2","mRNA_scaffold_39-snap.3","mRNA_scaffold_39-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_70":{"prefix":["mRNA_scaffold_70-snap.1","mRNA_scaffold_70-snap.2","mRNA_scaffold_70-snap.3","mRNA_scaffold_70-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_14-sna":{"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_41-snap.4":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_41-snap.4",0,"mRNA_scaffold_41-snap.4","scaffold_41",43664,45816]]},"mrna_scaffold_35-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_35-snap.3",0,"mRNA_scaffold_35-snap.3","scaffold_35",31045,33722]],"prefix":[]},"scaffold_41":{"exact":[["scaffold_41",60014,"scaffold_41",null,0,60014,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_50-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"]},"mrna_scaffold_47-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"]},"mrna_scaffold_26":{"prefix":["mRNA_scaffold_26-snap.1","mRNA_scaffold_26-snap.2","mRNA_scaffold_26-snap.3","mRNA_scaffold_26-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_12-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"]},"mrna_scaffold_42-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_42-snap.3",0,"mRNA_scaffold_42-snap.3","scaffold_42",39970,41671]],"prefix":[]},"scaffold_7":{"prefix":["scaffold_70"],"exact":[["scaffold_7",50017,"scaffold_7",null,0,50017,20000]]},"mrna_scaffold_2-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_61-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_61-snap.1"]},"mrna_scaffold_51-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_51-snap.3",0,"mRNA_scaffold_51-snap.3","scaffold_51",28253,33540]]},"scaffold_20":{"exact":[["scaffold_20",50014,"scaffold_20",null,0,50014,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_29-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_29-snap.1",0,"mRNA_scaffold_29-snap.1","scaffold_29",7664,12376]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_44-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"]},"scaffold_69":{"exact":[["scaffold_69",44962,"scaffold_69",null,0,44962,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_11-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_11-snap.1",0,"mRNA_scaffold_11-snap.1","scaffold_11",276,1377]]},"mrna_scaffold_33-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_32-snap.7":{"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.7",0,"mRNA_scaffold_32-snap.7","scaffold_32",25335,26815]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_50-":{"prefix":["mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_17-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_17-snap.1"]},"mrna_scaffold_69-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"]},"mrna_scaffold_69-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"]},"mrna_scaffold_40-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_40-snap.1","mRNA_scaffold_40-snap.2","mRNA_scaffold_40-snap.3","mRNA_scaffold_40-snap.4"]},"mrna_scaffold_12-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_12-snap.1"]},"mrna_scaffold_16-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_16-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_25-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_25-snap.1","mRNA_scaffold_25-snap.2","mRNA_scaffold_25-snap.3"]},"mrna_scaffold_26-snap.3":{"exact":[["mRNA_scaffold_26-snap.3",0,"mRNA_scaffold_26-snap.3","scaffold_26",29101,29615]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_53-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_53-snap.1"]},"mrna_scaffold_49-snap.2":{"exact":[["mRNA_scaffold_49-snap.2",0,"mRNA_scaffold_49-snap.2","scaffold_49",20164,21453]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_22-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_47-":{"prefix":["mRNA_scaffold_47-snap.1","mRNA_scaffold_47-snap.2"],"exact":[]},"mrna_scaffold_35-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_35-snap.1","mRNA_scaffold_35-snap.2","mRNA_scaffold_35-snap.3"]},"mrna_scaffold_64-snap.":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"]},"mrna_scaffold_38-snap.":{"prefix":["mRNA_scaffold_38-snap.1","mRNA_scaffold_38-snap.2","mRNA_scaffold_38-snap.3","mRNA_scaffold_38-snap.4","mRNA_scaffold_38-snap.5"],"exact":[]},"scaffold_17":{"exact":[["scaffold_17",40013,"scaffold_17",null,0,40013,20000]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/f.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/f.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"mrna_scaffold_60":{"prefix":["mRNA_scaffold_60-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_19-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"]},"mrna_scaffold_48":{"prefix":["mRNA_scaffold_48-snap.1","mRNA_scaffold_48-snap.2","mRNA_scaffold_48-snap.3","mRNA_scaffold_48-snap.4","mRNA_scaffold_48-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_24-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"]},"mrna_":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_57-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_57-snap.2",0,"mRNA_scaffold_57-snap.2","scaffold_57",29547,32554]]},"mrna_scaffold_34-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_34-snap.1","mRNA_scaffold_34-snap.2","mRNA_scaffold_34-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_54-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_54-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_58-s":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2"]},"mrna_scaffold_30-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_30-snap.5",0,"mRNA_scaffold_30-snap.5","scaffold_30",56898,59277]]},"mrna_scaffold_24-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_24-snap.1",0,"mRNA_scaffold_24-snap.1","scaffold_24",551,2088]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_14-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_53-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_53-snap.1",0,"mRNA_scaffold_53-snap.1","scaffold_53",22587,25552]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_20-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_20-snap.2",0,"mRNA_scaffold_20-snap.2","scaffold_20",24723,25920]]},"mrna_scaffold_9-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"]},"mrna_scaffold_68-":{"prefix":["mRNA_scaffold_68-snap.1","mRNA_scaffold_68-snap.2","mRNA_scaffold_68-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_1-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.1","mRNA_scaffold_10-snap.2","mRNA_scaffold_11-snap.1","mRNA_scaffold_11-snap.2","mRNA_scaffold_12-snap.1","mRNA_scaffold_14-snap.1","mRNA_scaffold_15-snap.1","mRNA_scaffold_16-snap.1","mRNA_scaffold_17-snap.1","mRNA_scaffold_18-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2","mRNA_scaffold_2-snap.1","mRNA_scaffold_2-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.1","mRNA_scaffold_20-snap.2","mRNA_scaffold_20-snap.3","mRNA_scaffold_21-snap.1","mRNA_scaffold_21-snap.2",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"mrna_scaffold_19-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_19-snap.1","mRNA_scaffold_19-snap.2"]},"mrna_scaffold_32-snap.8":{"exact":[["mRNA_scaffold_32-snap.8",0,"mRNA_scaffold_32-snap.8","scaffold_32",29111,31071]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_40-snap.1":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_40-snap.1",0,"mRNA_scaffold_40-snap.1","scaffold_40",748,3130]]},"mrna_scaffold_33-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_33-snap.2",0,"mRNA_scaffold_33-snap.2","scaffold_33",10333,11813]]},"mrna_scaffold_64-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_64-snap.3",0,"mRNA_scaffold_64-snap.3","scaffold_64",25103,27950]]},"mrna_scaffold_23-snap.5":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_23-snap.5",0,"mRNA_scaffold_23-snap.5","scaffold_23",44348,45556]]},"mrna_scaffold_51-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"]},"scaffold_66":{"exact":[["scaffold_66",45011,"scaffold_66",null,0,45011,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_44-snap.2":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_44-snap.2",0,"mRNA_scaffold_44-snap.2","scaffold_44",18281,19537]]},"scaffold_30":{"exact":[["scaffold_30",70018,"scaffold_30",null,0,70018,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_51-":{"prefix":["mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_29":{"prefix":["mRNA_scaffold_29-snap.1","mRNA_scaffold_29-snap.2","mRNA_scaffold_29-snap.3","mRNA_scaffold_29-snap.4","mRNA_scaffold_29-snap.5"],"exact":[]},"mrna_scaffold_7-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"]},"mrna_scaffold_7-s":{"prefix":["mRNA_scaffold_7-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_44-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_44-snap.1","mRNA_scaffold_44-snap.2"],"exact":[]},"scaffold_18":{"exact":[["scaffold_18",40012,"scaffold_18",null,0,40012,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_46-":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_46-snap.1","mRNA_scaffold_46-snap.2"]},"mrna_scaffold_33-":{"prefix":["mRNA_scaffold_33-snap.1","mRNA_scaffold_33-snap.2","mRNA_scaffold_33-snap.3","mRNA_scaffold_33-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_14-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_14-snap.1"]},"mrna_scaffold_9-sn":{"prefix":["mRNA_scaffold_9-snap.1"],"exact":[]},"mrna_scaffold_69-snap":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_69-snap.1"]},"mrna_scaffold_38-snap.3":{"prefix":[],"exact":[["mRNA_scaffold_38-snap.3",0,"mRNA_scaffold_38-snap.3","scaffold_38",16367,17307]]},"scaffold_8":{"exact":[["scaffold_8",35012,"scaffold_8",null,0,35012,20000]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_5":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_5-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.1","mRNA_scaffold_50-snap.2","mRNA_scaffold_50-snap.3","mRNA_scaffold_51-snap.1","mRNA_scaffold_51-snap.2","mRNA_scaffold_51-snap.3","mRNA_scaffold_52-snap.1","mRNA_scaffold_53-snap.1","mRNA_scaffold_54-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.1","mRNA_scaffold_55-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.1","mRNA_scaffold_56-snap.2","mRNA_scaffold_56-snap.3","mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3","mRNA_scaffold_58-snap.1","mRNA_scaffold_58-snap.2",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"mrna_scaffold_24-":{"prefix":["mRNA_scaffold_24-snap.1","mRNA_scaffold_24-snap.2","mRNA_scaffold_24-snap.3","mRNA_scaffold_24-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_57":{"prefix":["mRNA_scaffold_57-snap.1","mRNA_scaffold_57-snap.2","mRNA_scaffold_57-snap.3"],"exact":[]},"mrna_scaffold_36":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_36-snap.1"]},"mrna_scaffold_64-sn":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_64-snap.1","mRNA_scaffold_64-snap.2","mRNA_scaffold_64-snap.3"]},"mrna_scaffold_37-snap.1":{"exact":[["mRNA_scaffold_37-snap.1",0,"mRNA_scaffold_37-snap.1","scaffold_37",16775,18945]],"prefix":[]},"scaffold_51":{"prefix":[],"exact":[["scaffold_51",50015,"scaffold_51",null,0,50015,20000]]},"mrna_scaffold_28-snap.4":{"exact":[["mRNA_scaffold_28-snap.4",0,"mRNA_scaffold_28-snap.4","scaffold_28",40493,42408]],"prefix":[]},"mrna_scaffold_22-snap":{"prefix":["mRNA_scaffold_22-snap.1","mRNA_scaffold_22-snap.2","mRNA_scaffold_22-snap.3","mRNA_scaffold_22-snap.4"],"exact":[]},"mrna_scaffold_18-sna":{"exact":[],"prefix":["mRNA_scaffold_18-snap.1"]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/meta.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/names/meta.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -{"lowercase_keys":1,"hash_bits":"4","track_names":["Gene Prediction"],"format":"json","compress":0} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AATTATTTTCTTACTAATTTCCCAATTGTCCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTATTTCGAAATTCAGAACTAATTAGAAAATTTTAATTCCAATCAGAGAAGGTTAAATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTATATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTGTATGATATAGTCCTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTAAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCTAGCTTAAAGGTTATATGTTGAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATCGTTCATATGGCAGCTATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAACTAAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTATTCATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATCCTTTATATGGCAGCTATGTGATATAGTCGTTCGATAATAAATATTTGATAAAATTTAATTCGAAATCCAGAACTGATTAAGAAATGTTTTCTGCAAGTTTAGAAGGTTATAAGTTTAAAAACACCGAAGATATAATTTTTGTTTAATTTTTTCCCAGATAGTTACAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAAAAGAATTTTGGCAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGAAAATATATATCTTATGGGGTCGGAAACGTTTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTTATTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGCTATAAAAAAACATAGTTTTATCAATTAAAATTTTCAAAAAAATTTGTTTGTTTTATTTTTGCGTATAACATTAAAAAATTTATTCATGTCTAAAGGGTACTAAAATCGTTGCAACCATAAAGTCACGAAAATTGTTTACTTAAAATAAAGACGAGTCGACGTTGGATGAAAATCAGATTCATTTTTTTTAAATCAACGGCGAATTTATTGAGTCAAGGGTGATTTTTTTATGAGTGTATTGCGAACTTGGTTAGTAATCGTAAGTACCTACTACCTATACATAACTTTTACTCTACCAGTAATTAGGTACCCTAGTCTAATTGTTTTAGATCATTAGAAAGCTATTAAAAGCCATCGTATCAACCATTTAAAAAACACTGAAATTTCAAGTTCTTTCTTCACTGCGCACAGTAGTACATGTAGTGGCGAAGCGCACCAAAGGCTGTGCGATGACAACTACTATATATAGCCGCAGAATTTAAAATCTGCTATGATGGTCCGTAACGAGTCGTAACGACACACCAATCAAAAGGTAAAACTTTAGAAATATCAATTTGTTTCGGAAAAAAGTGTAAAAGTGAAAATTTATAAAGTTGGTGTTGCTGGAGTCAGTGGAAATAAATGAACCAGTTTTTAACCTATATTTGTTCTTAATGAGAATACACGTCGTATGACGCCCCATTTGTTAAAATCCGATGTCCCATTAAAAAGTAATTCCAAAATTAATAAAATCATAAAAAATGTTATGTAATGATATAACAAAACCTGATACCATTTTAGAGTCCTGAAAATTCTAGACGGTGTTTAACATCTTAATACAAGAAACACAAGTTCAACCACCTTTGGAAAACAGGAAAAAACAAATGGCTACTGTACTGAATAAAACTTTTCTTCCTCATATTTGTTATTATTAGTTGAGGGAGTTTTATCGTCATAGTTTTTAATTATCTTGATCCCTTTTTGATAAGTTACATCGAATGAAAATCATTGATTAGAATCTTTTTTGATGGATTCATTTTCTACCCACATGTCAGTCCCAAACAAAGCGATCTATCATGAAAACCAAATCGATCAAGGTTTTTTTTAAATGCACCTGGTTCTTGAGGCCTTTCGTGTGTCCTTAAAAACTCGATAATTCTGTTTATAAACTATTTTAACTTGATACCCATTTTAATCCACCACAACTGATTTATATACCCTTGTAGACGGTCTTTATAAAGTATATGGGCACTTCTAATGAGTAGCTCAAGATGTTCGTAAGTTTTTAAAATAGAAGAAATGCAATAAGAAAATCCGTCTGAATCCGTTTTTTTTCTAGAATGTTCTATAATAAGAGTTAGAAAAGAATTTAAATTGAATCATACATTTTCAATAGTTATACCTGTTACTCGTAGATTTAAAAAGTACACTATACTTTTCGGACAGTATGTAGGAACATAATGTATATATATTCTTGCTCAGGATGTCTAGCCGAATTGATCTAGACTTGTTGTGAGATATATACAAACTATAAGAGCTAGAATTTTTTTATGTTTGAATGCAAGCTCTTGGGCTTGCTGCGCAGCGCACAAACCGCCCAAAACTGCGGCAGAGTAAAAATATATTTTTACTGAAATGTTTTCTCGTCAGTAACTACCGAATGACCTAAATACATTTTGCCACGCTCCCTATAACGCCCACACACCGCCTACAAACTTCCAAATTTTACCGATTGACCTAAAAAAAATTTGTAACGATCGCAGACGCTCAAAACGCTAAAGTATGTCTACATTACGCCTTACAATCTCGCTTTTCTGCACGTTTGTATTCACATCTCCCTTTTGCTCACCTTTTCTATGTAACGGGTGTCTAATAATCGATTATCCCTATGTGAGCTATCGGCTATATTTGTCCGATCCGGTTAGTTCCGACATACATATATGCTACATGCAACGACTTTTGCTGAGTGCTGATCAAGAATATATAAGAGCTGCACCTTGCTAAGACAATCTTGAGCTGCGCAGGAAGACCAATGATCTATAAACCAAATCCCAAAAATTCTAACTCTTGTAGATTACAAACTCTTAGCGTTCATACCGACAGACGGACATGACTAGATCGACCCGCTTAGCGATCCTATCTAAAATATACAATATAGCTAATGCATTCGGAAACGACTCTTTTTACCTTTTGCATGCATTCCAACGAATCTAGTTGCCTTTTTACTCTATAAGCAGCGGGTATCAGAATGGTTCTCAAAATCAGATGAAAAGTTGTTCTTAGCTTTTAATTAAGTTCGAACTACAGGTTACTACTCTACTGGCTATGCAGGTAGAGTATTTTTTCTTCTCTGTTTTTAATATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCGGAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGTAACAATCGAAAAATTAGTGGGCTAAGATCAAGTTCAAAGAGTCTTGATTAAGAACAAATTTATTTTTATCATTTTAAGATCGTTTATACCGGAAAAGGGTTTACATAGATCACATTTTTGGTTTAAATATGTCCCAGCTCTAAAAATGCCCAACTGTTTATTCAAAAGGTGCAGTGTATATATACATTGTGACCGCCACTTCGTAGGTAAATTTTAAAGATGTATGTAACTTAGATTTATCTCGTTTATCTATTTTATGCTTTCCATTCTTATTGTTCTTACTAGCACATATTAAAAAGGCAATTTTTACTTACAATATTTGTATGTATGTTGACTTATGAATTTTTCGTCCTTAAATCATTCCTGCAAGTTGATAAACTTAAAACGCTAATTTTAAGAAATATGAGTAATATATCTAAAGTTGAGGAGTTTTAAGGCATAGTCAGTTATAAAAGCAAAAAAACGTTTGGCCATAATTTTCAATCTGTGGTATTTTGAAAACTTTTGTTAGGAGACCTACATTGGATCTAAAAGTACCTTTTTAATTCTTGACATACAGCAAAATTTTGAAATTAAAATATTAATAGCTGCTTTCGCTCCAAACTCGCATTTTTTCCAAACCGACTTCAAATATCTTAGCATGCAATCTCTTTAGTTTGCTACCCCACAGTGATATATAAACTTAATTTTACATGAATAGTTTTTGCTGTCGTACTTTTATCGAAAACTT'..b'GGGAAGTATGAAACAGAAACAGCAGAAAGAAGCGTTTCTGACCCCATAAAGCACATATTGTTGATCAGGATTACTAAGCGAGTCAATCTATGTCTGTCTGTCCGTATTAACGCTGAGATTTTGGAAAAGCACCGACCACATCTTTTAATATTTTGAAAAGTTTTTAATGTGATTGTGTTGTTATTATAAACACACATCAACATGCCAAAAATGATTAAAGTCGGACGATTAATTTAAATGTTACAACCAAATATGATCAATGTTTTGCAGAGTCAATTGAGATGGAACACGACATGCATGCAGAAGCATGCGCGCGCCACCAATCGGTGATATACTCGTATGTGGTGGCAAGGATACGCAAGCTGCAAGCATATCTTTAATATTTCCCTCGCACTCCTTTTACATGAATAACGGGTATAGCGTTTCAACTTAATTTTCATAATATTGACAGATATTTTGCTAACTTCAATCAAATGTTGGAGCTGGCACCACATAGCTCGTAGTTTTTAGTAAAGTTTAGTTTTTCGATGTTTTCTAAGTTTCTATATTTGCAAACAAAAAAATAAGTATTTGTGTATCTATATTTCATGTGATGCGGCATAAGGTTTAAAATCGATAGCATTGCGAGTAAACCACAATAGTCCTATCCCTTTGGCTGTGGAAGCTTGTATATATATCTCTCTCGTTCACAAAAGCGGATTGGCTTGGGTGAAAAAGAGGTTGGCCAATCATGTAGCAGATATGGGGGTGGTTCAAGAAATGACGCAGAAACCCGGAGTTCGCTTAGGTAGTCCGAAGGAAGTAGGTTGTGTTTTAGTAGTTTTGATATCTGGCACCGTTTGCTCGAAAATGGGCCTCGTTACGCAACACATCTTATAAGTGGTAAAACTGATGTAACGGAGCACAGCTAGCTTGATACGTGTACAAGTAGGTGTGTTTCGGTAGATAAGTACATACGTATGATTGAGTACAAATAAGAAAACTGATTTTTTCTTTTTACATACTTTTTCTTTAAATGATATATTTTTTTGTAAGCATTGAACTGATATTAATTGCAGGTTTCATCCATTAATCGAGTCTTGCGCAACTTGGCCTCACAGAAGGAGCAACAAGCGCAGCAACAAAACGAGTCTGTTTACGAAAAGCTTCGCATGTTTAATGGCCAAACGGGAGGATGGGCCTGGTATCCAAGCAATACAACGACGGCACATTTGGCCCTACCGCCAGCAGCTTCGGTTGTGTCAGCTCCAACAAATTTATCTGGACAAGTCAATCGAGACGATGTTCAAAAAAGAGGCAAGTAAAAAAATTAAAATTATCAAAATCTAAAGGGATTAACACTAACAAGAAGGGAAGTTTGATGTTAAAAAAAAATTAGAGCGGAGTCAAATCGTACATGTTTGGCATGTAAATAAATATTAATATTAATAAAAAAATCCCAAGAACTTTGAAAATGTAGGTGACAACCCGGTTTTTGCGTAATGGGCGTTTGTTGGCGTTCTGTGTTTAAATTAAAGAAATTTGGTTGTCAAAAAATTTACGATATATAATAAATAAGTAATGGTTTTTTTACAATTCTGTGCTCCTTTACTGTTTCTTTATTTGTGGTATGGCCTGTCACCTGCAGGTGACACGTCCCATTTTACATTTAAATTATTTTCGATGAATTCTCTCTTATTAAATCGCCTCCAAATGACACATCCCAATCTTGTGAAATTCAGAATATTTCTAATGAGTTTTCGCATATAACATAATATAACAGAACTAATTTAAAAATGTTATTTACAATTTTGATAAAATTTAATTCAAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATAATATTTTAAAACTAATTTTCTGATCGTTCCTATTAATATTTACCTTCGGAAACATTTTAATAATAAACAATTTTTGTTTTTATTTTTCTGATGATCTAGTACAAAGTCATGCAGTACAATGCAAATCTCTTTTCTTGGAGACCCTCGGAGCTTGGCTACCGACGGCGCATTATTTTTTTTCGATGAAAATTGTATAAAACTCAAATTCTTGTACTTTTATATGCTAAAAAGTATCGTATCGTGTATCTTGATAATAGGAATTTTTTGGCTGAACTAACCATCATAAGGCACAAAAGAGAAAAGCACAAACTGTTGCTAAATAGCTTATTTTCTTATTTGGTTTACAAATCTTTTCTCTTTCGCTGTTTAAATACAATTTTTGATGCCCTCACGAACAAGTTGTAAGCACCACAGAAACAAAAGTATCAAATAATTGAAGTCGATATAATTATTTGGGATTTTTGTCTTGACTATTACCCTACCCTAAGTAATTATTGGAAATCATGGACTTTTCAAAATATATTTATAAAGTGATGTGTTTAACTTAAGAAGTTTTGACCGTGTATCACAACAACCCACGTAACCTTAATTTGACATTATGGATCGTTCCTAGAATTTAAATGTTCTTTTACAAAATAGTGACGAGTGAGGGATATAATTATCTTTTCAAAAAACTTACCGCAGCAGTTTTCCATAAATGGTATTCGGTAATGAAACAATATACGGCACCAATACAAAACGAAAAAACAATATAGCCTTGCACTTATAAGAAATAATCAACTTTAGCAACATCATGTGAAATTTTGAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTAAAAAAATTATTTAATTTTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATATTGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGCTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATTTAGCCATACTTGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGCCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGCTGAATCTTTCCCAAAAGTCTTGTTGTTAGCTCCCATAAAAACTATCGGGGAAAAAATCATATCATCATATAGCTGCCTTACGAACAATCGGAAAATTAATGGGAAAATATTATGAACAAATTATATCTTTGGAGTTTTTTAACGTATAACGTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGATCTGAATTTCGAATTAAAATCAAAGAACGGCTTAGGGAAGTAATGGAATATTTGTATACCCGTTAAGGGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCCCATAAATTATAGATATCTTTGCTCATGATCATTATCCGAGTCGATCTAGCCATGTCTGCCTGTCCGTATGAGACCTGATATCTCGGAAACTATAGGAGCTAGAACAGTCTAACTTGGCATGCAGATTCCTGGGTTTCAGCGGGGTGCCACTCCCACTCTAACGCCCACAATTCGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTATTATGATAGGATCAAAATTATAACTGAATTGTGTTTGTCTCATCAATACCTGGCACTATGTGCCACGCCCACCCTAATGCCCACAAACGGCTTAAACGCTTAAAACTGTCTGCGGCCCATATAACAGCTTCTGAAACAGCAGGTAGATGGCGCCCTAAAATATCGTTTTTCTAGTTATATATCTCAATTTTCCATTTGTTATCTTAAGCTGATTAGCGAGTATCGAGTGCCTCGATTTCTTCCAACCAATTTTCCGAAAAGCACTATTAAAATCTATGAACTATCTGAATACTACAATTTTATATTTACTTGGGGTTATATTTAAAAAAGCATTATATAAACCGTCTTGAAAAAATGACCCAACTTACTCGAACTTTAAAATACAACATTTTGGAGAAATCTATAATTATTCAATATTCGTTATTTAGTTTATGTATTTACCCCTGGTCTTTTTCCGTTCATTTTACCGAAAAAAGGAAATCGCTCTAATTTCTGTGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CACCTACGGTTTAAATGGGTTGGTTTCCGTCGCCGGTTTCTGTGACAGCCCTGAATGTGACTAACTAATTATAAGTGTGCACTTATAGCGCAGGGATATAAAATATAATAAAATTTATCAGCAAATGTAGACTAATTTGAAAGAAGTTGCAAGACTAGTTGACTGCTGGGCGGAGCGGTTGTATTGTCAAAGCGGCCAATTCCTTTCCCCACTCTTCAAATAAAAGACCCTCTGCTAAATAAAATTCAACCCCCTTTAGTCATAGCAATCACACAATTGCAAGTATTTTGTCACAGATGATCAAACATTAGGGCAAACAAATAGTTAATTTGTTAGTCATTTGTTGTTTGCTATTAAGACTTATTGAACCAGCTATTTTGTTCCTGCTTCTGAAACTTTATTGTTTTTGTTGTTCTTCAATCTATAAATTGGGCTAACATATGTCTTTATTGCCAGTAAACATCCACCGTCCCTTTCATGCCATTCTTTTTATTCTAATGTCGTTCCTTTGTCATAAGTATATCTGTAACTCGATTCAAAAACAATTATTTTAAGAAAATGAAGAAAGGAATATATAAGATACCTTTCCCGGGTAGAATTATATCAAGCAAAAAAACCCCTCAACAAGGTAAAAAGTTAGTTACGATCACACCTTCATGATTTTGTGGCGAAAATAATTTAATTAATATTCTTCCTTATCCCCGGAGCGCAACAAAAAAGACTAAGCGACATAAATACATTTTGGTCTTAATTTGTTTGTTCGAAATTAAATATCGTATTGCAATAGTTTTGAAACCGATCGGCCGATGGATGAGACAAATAAATGTATTTTTTCAAACACCTACTTACATACCATCAAGCTATGGTATCATCCTTTTTCAAAAATGTTTGACTTGCAGCGCAAATTTGACAGAACGGTCAGAAATAGATTAATCGCGAATTCGCAAGTTCCAATTGTGTCTCTCCGTTGTGATCAGCTAGCATCTAAAATTCTGGTGGACAATTTTTTGTGGCGCAGCGAATTACATAATATATTAGAAACATTATTGTATTAAAAAAAAAAACTAATAATATAGTTTTCTAAGAGTACATTTTTTAATCTTAATAAAAGAGAGCAATTGATATTACTTATAATTTTGTGTATTAAATTACTATTATAACGTAATAACTTAGTTAGTTTAGTTACAGAAATTTAGTCTGTTAAGTCTTATTTTAATATTCAAAACATTTCAATATTTATATTTTTAAAAGTTTATACTGATTTTACTCAAATAGAAAACATTAAATAGTCGAATATGTTTCGCTTTAGAAAGGGTATAGGTGTAATGGGACATGCCAACAGCGAAAAAAAAGATCAGATAATTTAAGTTTGTTATTAAAAGAGGACCAGGCAGTTTAAATTGTGCCTAGCGAAGCATATTTATTATGCTTATAAAAATAATTATACCCGTTACTCGTAGAGAAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAAGTAGGAGGAATCGTTTCCGACTCCATAAAGGATATATATTCTTGATCAGGATCACTAACCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCTGTCTGTCCGTAAGAACGCTGAGATCTCGGAAACTTTGTATAAGAGCTGCAACTGGCATACTTGGCATGCAGATACCTGGGCTTCCTTCGCAGCGCAAGTTTGCTTCAGTGGGGTGCTATGTCCACTCTAACGCCCACAATTCGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATAGAAACAAAATTTTAATTGAATTGTGTTTGTCTCATCAAAACCTATCGACAGACGGTGTAACGCTTAGATCTGTCTGCCGCCCACATAGCTTTGCTGGTTATATATCCCCATTTCCCATTTGTTATCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGCCATTCCACTATTGCATTCTTCCTATTGCATTCTTCCTGAGCATAACAGGTTTAAAGTGTTGTGCATTGATCTAAGTTTAAAGCACGTCTAATTTAAAGGTGTTTATGAGCTTTATACTAAAAAGTTTTGACAATAAAAGACCAGATAAAGTGGTCGTAGAAGCAACTTGCTTTTCTCCAAAGCCTTTAATTTAACTAAACGAGAAACAATGACACAGTGCTGTTAGTCACAAAATGTAGCTGTAAACTGTCAATACATGGCTTGCTTTGATTATTATATTATTAAAAAATTTCATCTTAGCTGGCTTATTAAAATAAGCTTTCACTTGGTCTAGGGAGTCTGAGTCCCTGTCAAAATTAACTTTCACATTGAGCCCCGAGAAAGTAAAAATTTCTTAGCAGGGACTTTTTCTGTTCAAGAAATCTTATCCGGCACTCGAAAAACCGGCCCTAGGTGAGTTAATTCGAATTTCACATAATTTAACGATTTTTGTTGGTAAAGGGTTGTAAAGGGCGAAGAAGGCGTGGCTAAAACTTAATTTATATATTTTTTTCAGCATTAAAATGTAATGAAACATTTGACTAAAATAAGTAATATCTATTTCTTAATATTTGGTTCAGACTTACAATATTCAGCAGACGTTTCGCACCCGAACTCTCACGATAGTACATCGGATGGTAATTCTGAACATAATTCATCTGGAGACGAGGACTCACAAATGCGTTTGCGTCTGAAAAGGAAATTGCAACGGAATCGGACCTCTTTTTCCAATGAACAAATCGACAGTCTCGAAAAAGGTATATATTTATTAAAAATCAAATCTAAATCAAATCTAATTATTAATAATCAAATCATAAACTGACTACATTTGAATGCGGCCATTTTAAAAAACCATTTTAATTTTACGAATAAAAGGAAATTATATACATACATTTTTTTTATTCTAGTTTCGAAAAACATTTTATTGACATGTTTATTTAACTATATTAATTACAATTTGAAGATTATATCGAATTTTTCGCTTCGTGGCTCGGCTTTGTGAATCCCCTGGTTTAACGCCTAATTTTACTGGTTTTTAATATTTTTTTTTAATCAACAGGGTCTGCTACGCTTAAATCACAAACATTTATAATAAGATTATAGCTTAAAGGGATATCATTTAGTTGTCTGGCAGTTATTCGAATGGGCATCCAAGTCTCTACCAAATATAACAGTCAAATTTTCAACCAACGCGGAACATGCTGTTGAAGAGAAAAAGTTAGAAAAAAGATTCCAAAAAACGATGACTGTTAAAGGCACGTTATCCTTTCACTGCTTTATATCAAAAACCCAAAATAAATAAAATAAACTTAAATTAATAATTAAGAAGTGGTAAAATAAATACTCCTTTGATCTTCATTAAATATATTTCCTTTTTTATTTAGAGATTATCAAAAGCTTGTTAAATAACTCAGAAATACAAACGCCATAAGGTTCTAATAGGAGCGAGCGGTTGGCTAGAGAAAATATTAGAGGGCTAGTGAGCTAGTAAGTAGTAACTTCAATATTTCAATATTTTAAAAACAAAAAATGTCTCAAAAAAAAAAAAAACTCATTGAAGGTGACAAATGAGGCCAAATTTAAATATTAAAAACAATTTTTGTGGGTGCAATACTTAAGAAATTTTTTTTTAATTTGAATTTGTTTTTATAAAAAAAATTTTCCATTTATAAAAAAAATTTGTCAAAAAAGAAAAGATTAGAGGATTTTATGCAAAAGTCGAAATTAATCGGATATCTACATATGAAGGTATAGACTTACAAACAGAGGGTACTTTTTGAAAAAGAACTACTTTTCCCAAAAAAATAAACCAAATTTATTAGTAAAAAAATTTTTTTTTTTGTCCAAATCCTGATACTTGTGTTTACTTATTTACCGAATAGTATTTGTAAAAAAAAGTTTCAGGCAAATCAAAAATGTCAACTTAAAAAGGTGTTCGGTTTGTAAAAGAAGGGCCCATAAGGCGAATCCAGCCGGATTAGACAACTATATCTTATAGCTCTCATAGTTTTGTTATGT'..b'TCCGACGCGGATACGGACAGTCTTAAATATGTATGTACCTATTTCAAAAATAGCTTGATTGCGAATGAAATTTTTTACCGCCTTTATTTATACCCTGCAGTTATGACCAAAATTCGCTAGTTTATAAGGCCAGATCTCAGATATATTTCTTAAACCTTTATCAAAACTACAAAGCGCCAAACAACAACGAAGTTATGAACACTAGTCCCTGTTAATAGGATTAAAATATCATGTATATTTTTCAAAATGCGCAAACCTGACAGCTAGTGTAGTTCAAAAATATGTATGTATACTTTGAAGGGAAGACATGTTTTTCGATGCCTTTCGACCGACATTATAATCCTAAAAATGTATAAAAATAACTTAAACTGGGTATACAATTATTTATAGGCATTGTAAATAAGTAACAACAACATATTAGTTATTAAGCAGCGTTTCCAATTTTTCCGGGTAGCATTAAGATAAAGTAATATATGGCTAAATTACTATTGCAATATAAAACGTAATTACACAATATCTATATTTTGAGTTTATGATGATTTCTGTTTTTCAATATTCTTCAATTATATTTTATGTTTTTAAAAACACGTAAAGTAACAAATTTATAAACATATACATGGATAAAAAAATTTTGTAATTGCGGATAATTGACGAACGAATGTAACAACAAACGAAGAGCATTGCATCGAATGAAGGAAATACACCAACATCTCATCCAAATACACACCTCCCCGAAAAAGCCTTCAGGTTTATACAACAAAAGTCGTATTTAATACTATATATGGTTCAAATTTATATTTAGAAATAATTATTGTAACATTTCAGAATATACGGATGTATATGATGTTCTTAAGAAAGATTTATTAAAATCGAACTTATATGTATGTCTTAATTTTTTATTTATTGAATCTTTAATGAAAAAAGGAAACGTTATAGGCCATGCCATCGACTATCAAGTACCCTTTACTCAGCTTAGGGGAGTGCGGGGGAAATGGATATAAAATCAAAGCGACTCTATACATGATTGCACAAATATTTGCATATAAATGCTTAAGAAATGACTAGCTAGCTATGTCCGTCTCACTGCGGCTGGTGACTCTGATCAAGAATATAAATACCTTTCACTCTACGAGAAATGGGTATAATAACAAAGCTACACCAAGTGTTATTTTGATAATTATGGGTGAATCTTGTACTTCACCTAGAATCAAGTTTTTGGAATCAATTTTATCCTAAATATGTGTCAAAAGTATACCACATTGTATGAAAGATGTTATTTCATCCTTTTAAGTGTCATTTGACCAAATCCACGGTCTCTCATTATTGTGTAGAAAAGGCGATAAATATTTCAGAGTTAAGGTTTATTAAATCAGGTAAGAAAAATCCATAAGCAAATAAAATAAAAAAATTTTAAAACAATTAGTTTACTTAACGTACCTGTGGTTCATGAAGAGGAGACGAGTAGGCGGCCTTGTAAGGATTACCAGTACGGGAGGCCTGTATAATCGGGAACAAACTTCGAGCCAAATCAAAGTCAGGCAGACACAGCCGTCTAGTCTAGACGTTCAGGACAACACAAGTTACCGAATTGGGAAAAAATCTGTTAAGTAGAAAATTGACAGGCATGGAACGCGAATCCTGCCGATCCAAACGTGAAGTTGACAGGTTGTGTCATCTAGGGTAAGCCTGGAAACCGCAGCCATTGGCTTCCTTGAGTCTGAGATGCGACCCAAATCAACGACAAGCCGAGTGCTTCGGAAAATTGTTCAGGGGAACAAGGACATTTCAGGAAGGCACAACGCACAGCAAGGTGATCTGAGTGATCGGGGTCACTAAGCAAGTCGATATAGCCATGTCCGTCGTCCTTTGTGAACGCTGTAAAATCGGAAACTTTAAAAGCTAGTGTGATATATCCGTGCTTAAATGATTTTAACTTCCTAATCGTCTGTTTGCATGTAGGTTTTAATGTGTAAGATCGTCACAAGGCATCCTTGACCGTTTTTTGTTGTTGCATGCCGCAAACTTTGACAATCGCTCTAAAAAAGGATCATGTCGATTGGAGCACGGAAAACGCCATTCCCCCGTATCTTTGAAGGCGTGCCAAATCTAATATAAATTTTCCCCCGTTTCTCGGGTAAAACTTGTCTTGTAGCGAAGAACAAGAAAAGAGCGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCGACATTGTGAGGGAGACATTTCTTGACCAGTAGCACTATACGAAATGATCTAGCCGCTCCCGTCTGTCTGTTTGTGTGCTAATCATTCTTTCAGTTTTAAAGTTTTAAGTTTTCAGACAACTACATTCTATAGCTCCCACATGTATGAACAAAAAATATTTTATTAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGACAAGCCGAAGTTATATATTTTTAAGGATTGTTGATAACTTCAGTTATATAAATAAAGTAGTCCGATTTTTATACCCTAGCAGGGGGTAGAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCTGTCTGTCCGATGACTCGGGAGTAGAGTTTTTTCACTTATAATTTTTGTTAAGAGCTGATAAACAATAAAAAGTGCACTTAAAAATGTCACAAATATGGGTTGTTTGCGGAAAGACCTGTTCTCACAATTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAAAGGACAATTTTACACAGTTTACAATTGTATATTTGTTCAAATATATTACACGTACGTATACACACACATAGATTAAAATACCATAATTTTCATATAAACGTTACTTAGAGAATACAAGTAGAAAGACGTTTCGTTTTTAAAGTTAGTCCGGCCTTCTTATATATATATACCCTTGCAAAATATATATAGCCATTACGGAACAAACAAGAATTGTCAGAAAATTAGTATGCGAGTTTGTAATAAAATTATTCAATTTAACTTATTGTTCCACTCCGCTTATTGTATAGATACATTTTAAATTGCCTATTAGACCATGATTTATTTCAGTACATTTATACATTATACGATTATTTTCATTATCATAATTTACTTTGAAGCAAGCACATTTAAGTTCTTCATACAGAACTTCGAGCATTTTGCAATATAAAATAATAAATTGTAATCAGAGGCGATGTTTAATATTTTCTTATTATCGTGAAATTCGTTTTAACGGTATGTATGTTTTTATACTAGAACGTTTTGTGCGATATGTTAAGTGGATTACGTAGCCTTTAATCCTAAAGAAACATAAAAAATATTTTATAAGCATATGTAATAATAGTATTTTTTTGCACAACCAGTACATATATGTGTATTTACTTAAAAACTGTTTATAGATTTCTTCAATTAGATTTTATTGCGCTGGATTAAAAAAAAAAATTAAACAATATATACGCCAGAATAACCATCGTTTTAAAAAATAAAACGAAAAAAAAACTTTGGAAAGCTGAGTCATGGCTGTACCCTTGCAATTATCAGCAATCCGACTGATACAAAAATTGAAGACTGGTGCAAAATCGTACATAGCAATTTAAATTCCGTTTGGTTTTTTAAGGTTAGGTTACATTTTTAGTTTTATAATCTGAATTCAAACTCATCAGTCCTTGTATTTGTTTTAGGTAATATATTTCATCTACGCAAATTTAAAAAAATTCGTAAGGGTTAGCTTGTTAGTGAAGGATTTGTCTACACATACAAATCTATGAGCATACGCAAAACTCTAAGCAAATTGTATTTGCTATGCTTTAAAATAGTAAACAAAGCTCTTAAAAGCAAAGCCATAGGACAGTTCGATAGATTTGTATTTTTGTAATATAAATTTTTAAAATAATCTCACAGCATTATGCGTAATATTTTTTTTCCAAAAAAGATGGGACTAAATTTGACACCTGCACTCTTTAAATATTTAAAAAAAAAACATAAATTTTCTGTTAAACTGTTACAATAATTACCGATTGTTCAGAAAAGATTGTATTTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/012/b57/e6/scaffold_55-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -AGCAAATTATACCTA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCAGCCAATTTTGAATTTTGCGAACGTAACCCCTTATTTTATACTGGATGGTTAACACTATTTCGCTTAACAAGAGGATTTCTAGAACCGTGACAGCCGTGTTAAGCGAGGCCAAGTGTACTTCAAAATGCTAGAAATTCGAAAAAGATAGATAGTTAGATAAAAATGGATAGGAGCAGCCGTTAAGGTCCAGAAGTTAATTTTAAAAGTAGCCCCCAATGTATTGGGATTTCGAAATTTCTTTTTAATATATATTTTAGCATTTTAAAAACATACATTTTGGTAAAAAATATAAAGGAATTAAAAAAGTTTTAGTAGTAAAGCTTTTAAAATAGATTCCATTGTTCTTCATAAATATTAATTTTGGATCTCATTGAAGCCACTGGGGGACTTGTCGAACCTTATTGTGCGGTTTGGCTTCTACCTCTAGCTCTTACAGTTTGGGTGGGCGGATCCCTGAATATCGCTCATTCCATTTAAAACTCTTGAGGGATAAACAATTATTATATAAGGTTAGTGTCCAACAAAGTATAATGTAGTTATCATGCGTGCAGATTCATGGGCATTCTGCTCAGTGCAAGTTTGTTTTGACAAGGTGACACGCCCACTCTAATTCCAGAAACGTAAAGCTCTCAAATCGTCCATTTAAACGGTGTTATTTAGGAAACTATGAAAGCTATAGATATCAGATTTATATTCCTTAGTTTCGTACGCAGCGCAAGTTTGTTGCGCTTATTTTCCACGTCGCATATGATTTTAACGCCCACAAGCTGCGCAAAGCTATGACGCACACAGTTTTGATGCTAGAAAACGACTTCCTTTCGTATGGCGAACCCAGTGTGCCTATTAGGATTTATCTCGAATTTTGTATGTGTATTCCCTTTAAAGAGGATCACCTCAACACGTTAACCTAACTTTTATCAATATATTGTCCGTTTTCGTTAATAGCGGTTTTTGGAAAATAACTTTGATAACAATAGAGGATATTTAAGAAATGGTTTTGTGTGCTATAAACTGTTTTTTACCTTTAGAAAAACTGAATGAGGTTACTTTTACTTTGAAATGAGCGCCATTCGTTATATGGAAACCATGGTCGCAAAAATACTGTCAACTCATAAATTCTTAGTTCGGGCACTTAACTTGATAATGCTTTTAACTTATAATAGACGTTTTAAAATCTTTATAGTATTCAATACCAAAATAACCTAATTGATATTTTTTAGTTTTATTTTATATATGAAGTTTTGTCTGCAATAGTTCTATAAACTTGCTTACTACACTTGCTTACTTTTCACATTCATTAGAAAGTACTCTTAAAGACGAACAGTATACATTTACAACGCTAAATTTCCTTTAGGTTCGCTTTATTTTACATATGTTATACACTTTTTTATTGTTGCATATACTTTTAATGCATGAACCAGAAACTCTTTTGAATAAGTCCATATCGAAATCTATATATACTGTTAATGAACATTCATCACCAACCAACTCTCGTTTTAATTAATTTTATTACAAATTTTAAATGTATGCTGTCTAGGCCTGCTACTTCGCGGTTTCAATTGGCCTCATCGTTTAATAACGAGTTAAAGAAAGGATTAAGACTTTTTACAGCAACGCCTATAATTAGGAATCATATATTAATATATTGATTATTAAAAGTATTATATTGTAATTTACCCTTCCCAGCTGACTGATCCTTTGAATCGCGCCACTTACAGAGCGATTCCTTCTGTATTACATAGGCATCATAAAGCTCGCCAATTAGTTCACTCAGCAATCCTGTAATGAATGATGATTAAAAAACAATGATTCGGAATTCCGAAAATTTCGCAATTGTTAAGCGATTACAGACGACCATTATTATGGAAAGTAAATACAATAATTAAATCCTCTTCAAGGATATTTGGTCTTACCTCTGGGGTGCTCCAAGCCGTGAACTAATAGTTGCATAGTATATAAGCATTCCAGTTGATGGTCTTCGTTAGAGTCAATGTATCTTTGCAAAACTGGTATGCAAAACTTTTGGAAGGTTTCGGACTCAAGTTTATAACTATTTTCCTTGTATTGAATCGAGAAATTACTCAATGTTTCGGTCAACCCCCTAATAAACAACTTATCAACCAGTATTATATTTCCCTTAAAAATATAAATTTCATATTATTGGACAGCTGTTTAAATGAAGATACAGTTCCTTACGTTACTATAATCAATAATGCAATCTGCCGTCGTTCCTTCCTTTAGCAAGTGCTCAATATGGTCTATCACATTTTTAACGTGCTTCTCTGGCGACTCTCGTTGCTCAATCACTGGCGATTTTGACTCGTTTTCTATATACTCCAGTCTCTGAAAACATTTGTGGTTCAAAAGAGATATGTCAATATAAAGTTGAACATTTTTTACCGATCGGCTCGATGTTAATGTATATAAATTCTCTCGCGACTAAACTCATTATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCGGAACCCTATAAAGTATATATATTCTTCGGATATCCGTCCGTCTGTCCGTTCGTTTCTACGCAAAATAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGATGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAAATCGGAAAACTATATATATATTATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGGAAAACATGAAATATAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATTTAACCTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATAATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTTGTGGGAAATAATAGGAAACAAATTATAGCATTGGGGCTTTTTGACTTATTAACTTATAATATTGGGAATACGAGGTGTGTTCAAAAAGTAAGGTGACTTTGTATTTTCAAGAAAAACTATTAATTTATTTATCAATATTAATGTTGTTCCCTTCAAAGTAATCCCCCTCAGATGCAATACACTTATGCCAACGGTTTTTCCAATCCTCAAAGAACTTCCCATAGCACTTTTCGGTATAGCCTTGAGCTCTTCAAGAGATGCAGTCTTTATCTCTTCAATCGTTGCAAATCTCCGTCCTTTCATAGGTCTCTTTAGATTTGGGAACAAGAAAAAGTCACATGGGGCCAAATCCGGTGAATATGGTGGCTGACGCATTATTGTGGTGTTGTTTTTGGCAAAAAAATCTCTCACAAGCAAAGATGAGTGAGCAGGGGCATTATCGTGATGCAAAAGCCATGAATTGTTTTTCCACAATTCTGGATGTTTCTTTCGTATTGCTTCTCTCAAACGGTTTATTTACCGTACGACCATATGGTAAGATCTCCTGATGCACCACGCCATGGTTATCGAAGAATACAGTGATCAAAACATTGACATTTGATCAAACTTGGCGTGCTTTTTTCGGTCTTGGCCTTCCCATTGTGACGATTGGGCTTTGGTTTAGATATCATAACCATATACCCATGATTCGTCACCAGTTGTGACCCTTTTGAGTAAATCTGGGTCGTCGTTGACGTCATCCAACAGCTCTTGAGCGATGCTCATGCGACGGTTCTTTTGGTCAAAATTCAGCAATTTTGGAAAAAACTTCGCTGACACACGACTCATGCCCAAAACGTTTGAAAAATTTCATGGCACGAGCCAAGCGATATACCGACATCTTCAGCAACTTCTCTGATAGTGATTCGACGATTTTCCAAAACAATTTTCTTCACTGCTTGAACGTTTTCATCAGTTGTTGACGTGCTTGGGCGTCCAGAGCGAGGCTCGTCATTGGCAGAGTTTATATCACTTGTAAGCATTTTCTTTACTCAGAACAGAACAGAACCGTATGCCACTGTCAACATTTCAAGTGTTTCGGAGCACTTAATTTTATTTTTTACACAAAATTAGATGCAAATCC'..b'GGAAAGCAAGAAACAATGTGGACGGCAGTCCACGTAAAAAACTAAAAGCATTGCATATTAAGACTTAGTGTGGGTGAAGTATAAAAGTTCAAATTTGGAAAATTAGATCTGTTTGGGGCGGGTGGAGTTAAGAAATATTAGTTCTACCACTTTTGAAAGAACTAGCTAGTTTGCCAAGAAAACAGCTGTAAATTGATACATTTTGTATACCCGTAACTTGTGAAGTAGTGAAGCTACAGGCTTGTGCGATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCGAAATATTATGTATACCTTTTAAACACGGATTGTCTAAATAATACCGTTTACAAATTATGGCCCAAAGATTTTTTTTTGCTTAGATTTCTTTAAGCCCTTTTCCTGATTTTTCAAAATCGGTTCTAACGATTTCAAATAAAATGTTAAGGTGTTTAGTCCTTGGGATTCCTCAACTGTTGGCATACGGCACATTCAGTTATAATGTTATAATTCAACAGAAATTGCCACATTTACCAGTTCAGAGCATCCTACACTACCTGAGCATTGAGTTTTTCTTTGTGCGAATCCAAACTCAATTTGAAGGTCCTGAATATTTAAGATGATCTTAAACAGCTCAATAGAAGAAGCATTAGCTTTACCACTTTTGGAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAATACAGCTATAAATAGCTAAACTTTGCAAACCGGTAACTTGTGAACTACTAAAGCTACATGTTATTAGAAAGGTGTTCTGAAATGTTAAACCCTTTCTAGCATGATTTGCTTAAATATAAAATATAAATATATATTAAAGTCTTGGTTTGCAATTCTTTTAGTTTTTTACGTAGACTGCAGTCCACATTGTTTCTTGCTTTCCCGAAAAACTAAATCACTTAACCTTAACAGCTGCTAATACATATGTACTCACACGCGCACGCAAATCTTGTTTTCAGAATTCTTGTTCCGCACATTTTCGTTTATTTTAAATCTATATATTCAAAGATGGAAAAACGATTAAGTCGAGTGCCTCGACTTTCAGTACCCGTTACTTAGCTTAAGGGAGCAAAAGGGAAATGGAGATATATAAGCAGCAAAGCTATATTGTAAAGCGCATTCTATCCACTATTTTAATATATGGTATATATGTATATATGTGGTGGTCTTTGAAAAATCCGAAAAAAGGGTTAAAAAATCTTGAACCATAATTTTTAAAGGTGGTATCGAAATACCTTTCTAACGACGTAAAGCCTGTAGCTATTTACGGGTAAAGAAAATGTAGCTATGTATTTATAGCTGTTTTCTCGCTAAAGTAGCTAGCTTTTCAAAAAATTTCTAACATTGAGCAGTTTTCATTTTAAGAGGACTCCGAAAATCTTGTTTTGCGTATTACTTTTTAACAGAGCACCCGATTTTGACAGTCGAGGTGTCATTCGACGCGGATTTTAGTTGTGTTAAAATAATTACATAATTAATGTAGTAAGTATAAGAAGAAAAAACTAAAGAAGAAAAAAATAAAATAAAATTATTAAATACAAAATTTAGAATTGGTAAAAAAAAATAATCGTTTGAACCTAATTAAATATATTTCCTTTATTATTTAGAAATTATCCGAAATACAAACGCCATAAAAGAGAGAACACCAAATGAGAGCGAGCGAGAAAATATCAGAGGGTTTAATACATTAAATTCGATATCTCGAAAACAAAAAATGGCTCCAACCTATAAAAAAAACGTATTTTAGGTGACAAATGGAAAAATATTTAAAAAAAAAATCGGTTAAATCGATACACGTGTTTACTTATTTACCGAATAGCATGTATAAAAAAGTTTCAGCAAAATCAAAAATGTTAACTTAAAATGTCTAAGATAACTTTCACAAGCACATATCGAAATAATCCAAAGCCCATTTGGGTTTCTGTGGTAAATATCGTGTTTTGGTCCTGTTATAGCGACTTACAGCTAGAAGACAAATTAAATTTAATTATGCAATAACTCTTACATCGATTTCACATCCAAAGGTTAATTTATGTCATGATAAAATGGAAATAGGTACCAAAACACGTTTTTAAAAAAGTTCGCATTGATTATTGGTAGAATTCATTAAACTTTTTATAATAGCATTTAAATTTGCCTGCATTTCTTCAATGGATAATTAAAAGCCAATTTAATCCACAAAAAAAATGTGGTGAATTGCTTTTTGCTAAGTTCTTTAATATTAATATTATTAATTTATTTTTAATTTTAGTAGCTATGCTTAAGCATCTTTTACTTTTGGATACCTAAAATACATTGCTAGATCGCAAAACTGGGTACACATTATCCAAGGAAGGGATTAAAGACCTTGAGTTCTTTTAACAAATTACTTGTTTATAAAAAATGCATGTTCTTAATACTTAGTATAATTAAGTTTATTTACGATTAAAAAATTATGAAAAATACCGTTATGAGCCGATCAAAAATTTAAATACTTTTTTTCTTTTCTCCAAACAAAAGATATCCTTTTACTCGACCTCTAAAGAATACAACTAGGTCTGTTTATTCTTAGGAAACCGTTAATTTAAATAGTAAGCCCTTCCCAACAATGCAAGAACTTTTAAAACATTGTACTTACTTTTTGCTTCTACCTCGTTGAGGTGTAGGTAATATTTCAACAGAAGGTGCATCAGACATCGCGGATACGATTGGAGTCTGTCCAACATCTTGGCGGCTTATTGGTATGGGTTCTGCAAAAGATAATTATATATTTTTATTAGCTTTGGATAGCTGGTGTAGCGATGCTTGTAAGTTATTCAGCCAACATCATTTAGTTAAGCAAAAGATGCCTTGATAAAATAATTGGATTGGTTTTTGTTTATTTTAAACCATAAAGTAAAGGTAGACTAAGCCTTTTGTACACATTTCAGATTCATAACATTCATTGTGAAAAATATTTGCATTGATTCTTGATATCTGAACAAGAATGGAAACTAGTTTGGCATACCGAATTTTTTCCCCCTTTCATGTCGTTCCTTTTTGGGAGAATTGTATGCTTTACAATTTTTAGAAAACTTAAAAATTATTACACAAGTGTTAAGACAACGTTCCACTACAATTTATGTTTAAAATCGAAATATAACGGATTAAATATTATTATCAGTGTAATTTTCTGATCATTCCTATGGAAGTTATATGATATAGTATTCAAATTTTTTATTAAATTTAGTTCTTAATTTCGAAATATCAAATAAATATGGCAGCTATATGACATAATCGTCCAATTTAAAATTTTAAAAAATGTTATTCTATTTTTCCTATGGGAACTATAAGATATAAGATACATATACAATCAGGAAATAGAAATAAGGCATTTGACAGATTACATCAGTTATTATTAGGAATATATACTTTATGGGATGGGAAACATATTTAAAATTAAAAATATACCTACCAACGGGGGTGTAAGACGCATTTGTCCGTGTTTCGGATCCTTGTGATGTTGTATTGCTTAAATTATTTATTCCAACAGTATCTTGCTGTGGAATACGTATTTGACCTTCTGACAAGACAACTGTGGGAGTGTTTGGAAGAGTAACCTGCTCCGAAAAGTCATTATCTGTGTTAGAGTTTGTCTAAAATGTTAAAATGTTTAAACATAATTGTTAGTCGTCTGAAATGTAAATAACTTGCCTTATCATAATCGTCTAATATATTTTTTTTAGTGGCCGGGTCGATTATTTGCAAGCGATGCTGATGGCGGCGCCTGCTTGCTGGTTGCACCTGCACAGGCTGCGACTGCACACTTGCTGGCATTACACCAACCCCAACCATTGGCGGAACACCCACCTGTCCCATTCCACTGCCAGGACCACCAACACCCATTACATTGTTTGTTCCTGGCTGCACTGTGCTAGTGATCAATTGTAGCTGCGACGAAGTTGATCCTGGAGCTGTCAGAGGCCCATTTGGTCCGGACTGGACTGGTTGCAAAGTGTTTCCCACATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GACGTTCGTACTAACCGATACGGCACTACGAGTATGTGGCGGAGGCTGCTGTTGAATAGTTGGCACGTATTGGTACTGGTAGTAGGGCATTGGGGCTGGTGCATATTGCAAGTGAGAAGTTGGAAATGTTTGTTGTCGCGGGTTATATTGTGTGTATTGTTGTATCACCATATTTTGGTGAAGGGGCTGTGAGTACATGGGTTGAACATGAACATGGCGTGTTGCACCGCTGGTGGCACCGCGTGGGGTATTCGCCGTTGGAGGTGGTCCACGAAATATTGCCCCACTTTGTGGATTTGAACGGCTATTACCAGAACTATTGTTTCCCGTTGAAACATACTGCAAAAATGCGAAAGGAAATAAATGATCAGTACGTTGAAAGGCAAGGGACATAAAATAAAAATTGTAATTATGGTAAAAATAATAAAGATTATGTAAAATAAGTGCAAAACAAAGGCAAACGGCGCTCTGATTACACAGGAGCACAAAATTAAACTTTGTGAAATTTCACGAGCCATTTCTGGTTTTCCATGATATTTGGCTGCACCTGAGTAAAAGTCACATACAAACTTGTTTGTATCACCTACACGTTTCTACGTTTTCGGTCATTTTTTTATTATTTGGCCAACATAACTGGACTAATATTAAACATTTTCTTTGGTTTTTATCAGAGAAATAGTAAAAATTGTGCGAGTTCCCTTACTCAGAAACACTCAAAAATATCATGGAAAAATATAAATGGCTCTTAGAAAATTTGGCTAAGAACCTGTAATTAACACAGGTTCTTGACCAAATTTTCTAAGAGCCATTTACATTTAGTTATACACGACCTACTAACAATATATGCAAAATGTAAAATAATGTACATGATAGATTCCCCAGTATAAATCACATTAGTATACGGACTGAAAAATTTACATAAACGCAATACACCCTTGTGATCAATATGTATTAATATCCTCGAAACTGCCTATGATACTGCAAATAAATTAACATAACTAAACGCAAGTTTTTAATATAAAAGTTAACCAACAAGATAATTAATTTGATTGGCATTTTAAATAAATGTTACCAAAGGGGAAGAACACCTTTTGAATTTCAAGACATTTTTCAGAATTGGGTACCGTACACAGAAGATTTTAAAAATGTTAAATTATAAAGTAAGGAAAGTAATAAAAATGTATGTATTGTGCGTCTGTTCCTAAAATCTGATGGTTTACCTCTGCCGCTGCTTGGAAGCTATTATTTTTTATCAAACTACTGTTTTTGAAATCATACTTTCTACTGGTATCAACACAACTGACGCTAACGCCAACAATATTTTTCTCGTGCATGTAGGTTGTGCCTGCTGCAGTCGTGCCCAGAGCGACTCCCATAGTTGTTCCTATATGCGAACTGGTCAATGTAATTTGGCTGTTATTAGTGATTCCAACTCCAGTACAAGAAGTCGTTCCATTTCCGACTCCGGTGGTAGAGTTACTTGATACTACTGATGCGCCGAGATTGTTGCCTTTTTTCGTAGTGTCCGGTACGTTCAGAAAACGAACGTTTCCATCTTGGCTTCCAGGTAAACCCCGCTGATTGGATAGGTTGTAAATGGCGGTCGAATTCACATCACCGGAATTCAGTTGACAACTATTCACGGTCATTATGTTTGAGCCATTACATATAACCGTTGACTGGTGGGCTCCAACTGGTCCAGACCCAGGTATGGATCTGTTTACAACGTTTGCATAGCTTTGTTGATGCTGCTGTGTTTGCTGAAGAAGAAGGGATGGTTGTTGCTGATGCGTCAAGTGCGAGGACTGTTGAGCATTCTGTGCTGTTGCCTTAAGAATGGAGACCACATTGTATGCCTTATTTATCTGAAACTGAGGCTGTGGAGTTTGATGGTTATGCTGCAGTTGCATAGTCTGTAGGGATTGTGGCTTTGAAGGTAGCACCTGTTGAGCATACTTTTTGGTCTTTTTATTGGCTGGCAAAATCTACAACAGATCACAAGAGTGGGGATATTTCCGGACTGTAGAATTTAATAGCAATAATTTGTAACTAAAACTTAGCCAGAGTATATAAAAAAAAGATAGTCGACTAAACCGACCTCACTTTACTCAAACAAACTTATAACCCAACTTAAAAAAATCTTTCAAATATCTCAGTCAGCTACATAGATGCTGTCTATATACTACTTTATCATTTTGTCAGGTTGCTGTTGTGAAAAAAATGAATTATGTTTCCAAAAACATTACTGTGTCTAGCCCGTCTGCCTGGCCGCTCCTTTTTTAATATTTCTTTAAACGTTTTTTGTACAATGTTCAGCATTTTTTGAATGTTTCCAATGCGGCAGTTTGTAATTTCGCTAAAATCAACATTTGTATTTCAATGTTATTATTCTTTAAAAAATATGTTTTTTATTGTAACATTTAAAAATGTTTTTATGTCAAATGTTACTCCGAGTAGAAATAAAGAAACCTAAATGATAAAAATATTTTGAGAAGTAAGTTCACAATCTGAACTTTTTGAAATATAGAAGATATTCTTCGAAAACTGTACACTGGAGATCTTTTCTAAAGAAGCAAGTGCAAAAAAAAACATTTGCTAATAAACATTTTTTTATTAATCACAAATTTTCTATAATAAAATTATAAAATTAAAAAGAAACGAAAAATATGGTATCATTAAAAACATGTTGGCTCTAATTTTAATAACATTTAACATCGACTATCGAATAGCCATTACTCAGCTAAGAGGAGAGCGAATAAGATAAGATTTAAACAATTTCTGGCATATGTATGAATATTTAGAATATTAAAAGAAACTTTCTGAAGCAAACTTGCGCTGCGCAAAAAGTGCAGCCAAAGCATGCCAAGTTCAAACTCTCCAGGTTTTACGCGAAGGGTCACATACTTTATGTGGTCTAAAACGCTTAATTGTACTTGTTATATTCTTTCGGACGAATCTTGTGTTCATTCTGTCAAACAAGTGCAAGGAAATTCTCATTTAAAAAAAAATTGGTGATTCAATTATGTCGAAAACTCAAGTTTACAATTGGTATAAATCGTTCAAAAGGGGCGAGACGAAGTGAACGATTTGTCACGTTCAGAACGTCCTTCAACCTCTTCAAATGAATAAAACGTCGACAAAACAAAGGTGTTGTTTTTTCGGAATTCTTACCGGAAGGCAAAACCGTCAATAAAGAATATTGTCTTGGCGTTATAAAGCGTTTAAGAAAGAATGTTCTTTGCTATAGACCTGATTTTTAGCGGAACAACAGTTGGATTTTGCACCACGACAAATCATCAAACAACCACCGTACTTTTCAGATATGGCAGCGTGTGACTTTTTCCTGTTACTAAACTTAAAAATTAAATTACGATTTCGTGGAACCTCTCTGATAGCATTGAAGACATAAAAACTAATTCGCAACGAGAACTGAAGGCTATCCCGATTAATTGTTGGAATACGTTTATTGAAGCGGGTCTTTTTTGAAGGGAATATAATAAATTTAGATTCATAAATTGTGTTTTGTTTCAAATTTCCTTGTACCTATTTGACAGAATGTACCCTTTTAATCTAGTAGTAACGGCGAGACATTGCAAAGCACTGTACTAAAAAAAGAAGCCCATACAGACACTAAAATGTGGTTAAATAAAATTTCGATAAATACAAAATTTAATTTATAAAGTAAACTTCATAACTATTTAAAATTTGACATTTTTAACAATTCTGCGACTTTAAGGCTTCTGTTAATAACGTAAAAACTAGAAAAAACAGAGAAGAACGCTTTAGTCGAGTGCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTTAAGGAAGCAAAAGGATAATCAAGATATATAAGCTTCAAAGCGATATTTTAGGGCGCCATCTACCGGCTTTTTCAGCCATTTGTGGGCGCTAGAGTGTGCGTGGTACCTTTTTTTGGTGAGTCGATAGATATTGATGAGACAGATACATTTCAGTTAAA'..b'TTTTTTTAGAAAAATTAAATTTTGGCATTACTGTTAATTTATTGACACGACAGTTCTAGCGCGTCAACAAAAATGATATCACTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTATACTATTCGTCAGAAAGCATTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCTCATAAAGTTTATATTTTCTTGATCAGGATCAGAAACCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGTATGGACGCTGAGATCTCGAAATCTAGAGCTAGAGCAGTCAGACTTGGTATGCAGATTATAGAAAAAAATTTATAATAGAAAAAAATTTTAAGTGAAATATATTTGTCTCATTATTGTTATCGATTGACCATTGATGTGCCACGCCCACTTTCACGCCCACAAACCTCCCAAAACTATGGTAGCAACAGTTTTTATGCCAGAAAAGGTTATTTTGCTGAAATGTATTTGCCTTATATATACTTTTCGATTGGAATAAAAAAATGTTTGACACGCCCACTCTAACGACCCAAACGGGTAAAACGCTTAAAACTGTTTTGCGCCCACACATACCGAAACAGCCGTTGGGGGCGCTTTACAGTTTTGCTTTCCTGCTTATATATCCCTATTTTCCTTTTGCTCTCTCAAGCTGAGTAACGGGAGGCACTCGACTACAGCGTTTTTGTTTGATTTCATGTTTTGAATGATATGGTTCTAGGTTTAGTGTAATAATAATTTTCAACATTGCTTTATAAATTATAAATTTTTTATATATATTCTAGTTTCAGGATTTCATTGGAAAACTTCTTTATAAGATCAGCAAGTATAAGCAATGCAATGCTATTAACGTTGTGGTCTTAAAAAGTTAAGAAAAAAAAAACTGAAGATGAAACTAACAAGAGACAAAATTATAATTCTGGCCATCATGCTGATGCTGAGTCCAGTAGCCAACTTAAAGAGTCTTAATAACGTACATACTCAGGACACTGTGTCGGTGTCTTTGCCTGGCGATATAATACTTGGTGGGTTATTTCCCGTCCATGAAAAAGGTGAAGGTGCTCCATGTGGACCAAAAGTATATAACAGAGGAGTACAACGCCTGGAGGCAATGCTCTATGCTATAGATCGCGTAAATAACGACTCTAATATTCTTCCCGGAATAACGATAGGGGTGCATATACTTGACACCTGTTCGAGGGACACATATGCCCTTAACCAGTCACTTCAGTTTGTAAGAGCTTCCCTCAACAACTTGGACACTTCTGTGTTTGAGTGTTCAGATTCGTCAAGCCCACAAATAAGAAAAAACGCTTCATCGGGACCCGTTTTCGGAGTTATTGGTGGATCCTACAGTTCAGTGTCTCTGCAAGTAGCCAACTTGCTGCGTCTGTTTCATATTCCCCAAATATCACCGGCATCAACTGCTAAAACGCTATCGGACAAATCACGATTTGATCTATTTGCTAGAACAGTACCGCCAGACACTTTTCAATCCGTAGCCCTTGTAGATATACTCAAAAATTTTAATTGGTCCTATGTATCCACGATACACTCGGAGGGATCTTATGGTAAGTCTTTAAAGGGTGTAAATAAATATCTTCATCAAATTAAAAAACATAAATATTAGAAAAAATCGAGTTTTTTATTTGATTTAAAGTAAACTATACAAATTATTCTGTACAAATAAATTTGTATGCCATATTTTTCGTAAATTAATACGTAAAGAACACTAGTGAACAAATACACAAAAAGTGTGAGTTGTGCGTTGTCGCATGTATTCTTTAGGAAACTTATAATTTCGCTTTATACTTTATTAAGAACAATTAAAAAAAGATGTTTGGTTTTAAACAACACAACGCTTTCTAAGGGAATAACATGAACATCCTTACGTTGGTCAATACTGAAATCCAATTTTTAGACAATGCAAAGCCATGGCACATAAAATTAACATAATTTTACCATAAATTTCCTCAAAATTTGGCTTGTTTGGTTCGTATGGACGGTAACTTTAAAGTTGTGCACGTCTTGATTAGCAGTCAACAGACGTCTTTCAATTTATGATTATCCGTTTAACCTTTTTTTTGGAGATCTAGATCAATCCATAGACCTTTCAATCGGAAGGTATTGATAAGATGAATACATTTCAGAAACATAATTGTTCTAGCATGAAAACTGTGGCCGGCACAGCTTTGTGTGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGTCAAAATTTGGGCTCAAACGATAGGTATTGACGAGATCAATACATTTCATTTTAAATTTTGTTTCTAACGGAAAGATGGACGTGGCCAGATCGAGTCAGCTAGTGATCCTGATCCAAAAAAAAAATATTTTGTGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCGACAAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGCGTATAAAAAGTAATCGTCGTTGTCTTATTAACTTCTACCTTGGGAAATATATTTTTTTCATATTTCAGAACTTTAAATAAATTTAAAAAAAACAAGATAGAAAGTTAACTTCGCCAAGCCGAAGTTTTAATACCTTTGCAGATATAAAAAAAATTAATGTTAGTAACACCATGTTCAATTCTTAAGGATTGTTGGATTGATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCATTCCTATGACAATTATATGATAGAGTCACCGGACTTTGATAAATTTAAATCAGAAATTCAAAGCTAATTAAAACATGTTTTTCCATGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAATATGTGATATAGACGTCCGCTTTTGAAGAAATTCAATTCGAAATTCTGAAATAATTAATAATAATAATAATAAAATATTTCTTATTCCCAAGTTAAGAAGGTTATACGTTAAAAATCACCAAAGATATAATATGTTCATATTATTTTTCCACCAATTTTCCGATCGTTCGTATGGCAGCTATGTGGTATAGTCGCCCGATTTTAAAAAAATTTAGTTCGAAATTAAGAACTAAGTAAAAAAAAAAGCGTAGGAGTTTATATTTCAAATAACACCAAAGATATAATTTTTTAAACATTTTTCCCGATAGTTCCTATGGGAACTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGATAGCTTTAAATCTGAGAGATTAGTTTGAGTAGAAACAGACAGACAGACGGATGGACAGGCGAGAATGGCTAGATCGAATAGTTTTGTAATAAGTTTTAGTTTTTGTAAAAATTGCTACAAAAGAAACTTCGGCTTGCAGGAGTTAGTTTCCGTTAATGTTTTTAAAATGTCATAAAGCTATCATAGGAACAATCGGATACCATTTATAGGTAGAACAATAAGAAAACAATTACAACTTCGTTATTTTTAATCTTATTTTCCGCTATATAGAATCTATTTATAGCTGCTAAGGAAGATTTGCAGATTAATGTCAAACTATACAAAAATTGTTTTTTTTTATTTTTGGCAAAAGTATACATTAATTTTGTTTTTATATATTTAATTTCAATATTGTAAAAGTAAAATATACATTCAGGATCTATTCGCAAAAACAACTTCGGCTTGCCTCAGTTAGCTTTCTTTCTTGCTTCTGGTAACATCATTTAATTCCAACAGGTACAATGGGCTTTTCCTCTGTTTGTGGTATAAGTATAGATAAGAAATTAAATAAATCAACAAGCTTATTTGTTAAAGAACAATTTTTCGGACATTTCGAAATGTTATAGGTAAACTTCTATTTTCTTGGAGATTAATTATTTGGAATAAATTGGTACAATTTTAACAACTAAACCATTTATTTAGCCTAGTCAACCAATAAGTCACAACAAATAATCTGAATATGTTTAAATCAATTTCTAGGTGAATATGGGATTGAAGCTTTTCACAAGGAAGCCACCGAACGGCACGTATGCATAGCGGTAGCCGAGAAAGTGCCAAGCGCAGCAGACGATAAAGTTTTTGACTTAATAATTGGCAAACT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/064/693/ff/scaffold_51-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCAAAAGAAGCCCAACGCCCGCGGAGTTGTACTCTTTACAAGAGCCGAGGATGCGCGCCGCATTCTTCAGGCAGCTAAGCGCGCTAATTTATCACAACCGTTTCACTGGATAGCAAGTGACGGTTGGGGCAAGCAACAAAAACTTCTTGAAGGCTTGGAGGATATTGCCGAGGGCGCTATAACTGTAGAACTACAGTCGGAAATAATCGAAGATTTTGATCACTATATGATGCAGCTGACGCCGGAAACAAATCAAAGGAACCCGTGGTTTGCTGAGTACTGGGAGGACACGTTCAATTGCATTCTCGAACCAGTGTCGGATCAAACAAATTCCCCAACCAGTATCGATTCCACTGAGATAAAGATCGCTACCAAGTCTAAAACAACATGCGAAGATAGCTTTCGGTTATCTGAGAAAGTTGGGTACGTTTTCAATAGAAGTATTAAGAATGTGACTTCGTTTGTACCCTTTTTATAACTCTGCAAAAGCATGTAATTTAATCCCTTGCATATTTCCTTATAATGCATCAACCTTCTAACTTATAACTAAGCTGGCTACTATATACATAGGTATAATATAATATATATAACAGGAAATAAATTATATCTTCGGCGTTTTTTAACATATAACCTAAGCTTGGAAATTGGTTTCCATTGTTCATTTTTATAACAATAGTTAGAAATTAAACATGGTGTTAATAACATTGAATATTTCTAATAACGGCAAGAGAACGCAAACCTCTGCTTGCCAAAGCTAACATCTCTTCTTGATATTGGTATTTATTTTACTTAAAGTTAGAGACCTTATGTGTTCTTTAAAAGAAATTCAAATTTTTAAAAGATGGTAATTTTGTAAAGTAAAAAACCAAATTAAATATTCATTCAGAAATCGGTTTAAATCTTTGTTTGCAATGAACGGAGCATCCGATTTTAACAAATGAGGTTTCAATCGACAGTTTTATATACGGCCAACCCCAACAGATCATTTATTCTAAATTTTTACTTTTAAACTTTTACCGCTCTTCCTCCCAAATTTAAATTAAAAACATAGCATTCAATCCTTTTAGTTTTTGCCATATATTTTGATTGATATTATTTTAAAGCTCAAACAATTAAAAAAAACACTATCGGTATCGAAGAACATAGGGATGTTGTCATAATGACATAATATAGGGTCAAAAAAGCTTTTACAAATAATGTAGTAATTTATTTAGAATCAAAATGTTGGCTTTAATTGATAGTGTCATGTCATTTTCACAAATACTTCTTAAATACTCAAGCATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTAACATGATTTCAACGCACTAAAGGAGACGTTTCCAGCCCGTAAAGTATATGTATATGTATATGGATGGAAACGTCTCCTTCTTAATCAGCATTACTAGATGATTCAATCTAGCTATGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTTAGCTTTATAGCTTAAAAGTTTTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATGAGTCGGAACGAGCCGGCTCGGACCACTATATCTTATAGCTTTTATAAAAATATTCGGAAAACAAAATTTAAAAAATTATATCTTTGTTGTTTTAAACATATAACCACAATACCATTTTTTAATTGGGTTTGAACTTTAAATTAAATTTTATAAAAATCGGACGATTATATCATATATCTGCCATAAAAACGATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAAAATGAAAAAATTTTATCTTCGGTGTTTCTAACATATAAGCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGTTTTGAATTTAGAATAAAATTTTATCAAAATCAAAATATCATATAGCTGCCACAGAAACGATCGATGTTTTTCGGTGCTTTTCAACAAGCAGCCTTCTAAGCTTGGAAACAACAATTTTTTATTAGTTTTGAATTCCGAATTAAATTGTATCAAAATCGGACTACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGCTGCAAAAATAATATGAAACAAATTAAAGCTTTGGGCCTCTTTGACATATTAGCTTATAGCATTGGGAATATAATTCTATATTCTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAACAATCGGACTACTCTAACATATACATAGATGTAAAAAAAACTGGTCTGAAAAAAAATGAATGAATTAATTTTTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAAGTGCAAGGGTATACAACTTTCCTTTCTTGTTAATTTTATTTTTACTTACAGATACGAACAGGAGTCCAAAACTCAATTTGTTGTGGATGCTGTATACGCATTTGCCTATGCACTTCATAATTTACATAATGATCGTTGTAATACACAAAGCGACCAAACGTCGGAACAACGAAAGCACCACCATAGTGAGTCTGTGTGGTACAGAAAACTATCGACTGATACGAAGTCCCAGGCGTGTCCCGACATGGCAAACTATGACGGAAAGGATTTTTACAACAACTACTTGTTAAACGTCTCGTTTATAGGTTGGGTTCTTTCTTTTTGTTTCAATATTCATACCTATCACTCGTAGAGTAGAGTCAAAAAGTAGGTTCCAGGTAGATGGAAGTTTCTGACCATATAAGTATGTATATATATTCTTGATGATCATTACTAACCGAGTCCATCTAGTCAAGTCCGCCTGTTCGTATGAACGCTGTGATTACAGTTTTTAAACAGCGCAGGTTGATTCATCGGAGTTTCAAGCTCACAATTTAAAGATATTTATTCATAATAAATTAATATTTAGTATATAGATTACTTCCTATCTTAATGATGAGAATTGTACTAATTTTATTATTATTTTAAAATATTTGATTAATTACAACAGTATTTAACTGGCATCGATACCCTCCGGTGGGTAGTGTGGCGTGATCGGTTGTGTGTGCCGCGCCAGCAGAAATTCCCTAGAATTACTTTTAATTGAATTTCAAAGAATGTAATGGGCATCTGATAGTCGAGGCAGTCGACTATAGCTTTTCTTTTTATTTTGTTATTAACTCTTCAATTACGATTTGATTTAACCCGAAAAGATCTTGCCGGCAGCGAAGTCAAGTTTGATCGTCAGGGCGATGGATTGGCAAGGTATGATATTTTAAATTATCAACGTCTGGAAAACTCATCTGGATATCAGTATAAGGTACGATTATAATATCAATAAATATTGTATTTAAATGAAACACATTTTCTGTCCAACGAATTCCTCCGTTATCAGATAATAAATAACCATTTTAATGCTCGTAGAGTTACTCGTATAAGTTTTTGTTGTATTTCTCTGAAAGTATGTCATAGGTAAAAAGACGCGTTTCTGGTGGTATTCTTTTTATCAATGTCCAACTACTTCCAAACTTTAGAAATCGGACTATTCATTCAAATTTAAAAGCAAATTATAATTAGTTCAACAAAAACACGAAGCAAGGGTTCGTGACGATCACAAGCCATCCACATACAAAGGTGCTGATATCAACATTTGTGACGAAATATGCGCTTGTGCATTCTGCCTGCTTCACCAAAATATTTAATCTTCTCGCATCAAAAGTATATTTTTTTGCTGATTGTTGAATAAGAGCATTTTAAAAGGTGTATTTAGTAGAATGTACAATCTTAAAAAAAGTTTATATCAGAACCCTTGTTTATTGATGGTGTGTGATCGTCACGACACTTACCTATTAAAAACGTGTTCATATCCGTGCAGAGGGTGTTACGATGACTTTTCTTAATTAGAAAATCTTTTCTTATACAGATAGCACGATTCTGAAGACTTAGTTCTTTAGAAGCTGTAAGCATTTAAAATCTAGCTGCTTTATGTAGATTTCCAAAAGTCTGTCTTAACAGGTCAAATTTTATACATAGATATACAAGTTTTTCACTTTCACTTTTCTATCTCCCAAAACCAATTTAAA'..b'CTAGCTTTTGTACCCATATACTTTGGAACTGGAAATTCTTATGAGGTATGTTTGTCCTAATTTGTTGTTACTCGCACCGTGATAATCAATTTCTTCTTTACTACACAATTGAAAATATTAAAAATGATCAATATCAACCAAAGAATTTTAACAATTGATCTTTTTTTTTCAACAGTATGTACTAATTTAACCTAAAATTGATCTAGATTAATAGCCTAATCGATCTAGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGCAGATATCTTTAAAAAAGCGAAGATGCCGCCAAATGCCCTATCTGATAATCAACGAACTCGACTACAAGGTGTCTTCCGGTTTTTCATTAAGTAGTTATAATTTCAAACAAGCTCTGCTAATAACTTTAGATTCCGAAATGCTGTGTGTTTTCCCTAAGTGTTTACGTTTTTATACTTATAATAAAATCATATAAACCTGAAGTCAAAATTAAATCTTTCAGAGCCTTTATACAGTCCCAAACATAATAATGGCTATCGAATTTACCGCCTTCGAGATTAATTCTAAGTAGTGCCTAAACAAATTGGAATCGCCTACTGCGTTCATTATTGCTTTAAGTTGTTTTACACTTTAAAACAGTTGCTACATATGTTAACAATTCTATTTTTCAGGTGCAAACTACTACGTTATGTATTTCAATAAGTCTGAGTGCATCAGTTGCTCTTGTTTGTTTGTATTCACCCAAGGTGTACATCCTCGTCTTTCACCCGGATAAAAACGTCCGTAAGTTAACCATGAACAGCACCGTCTACAGGCGTTCAGCTGCAACTGGAGCTCAGGGTGCGCCCAGCAGCTCCGTATATAGTCGCACACAGGCAGGCAACACTGTACCGACAGGAGGGGCGTTGGGTACTACAGCATCAAGTGCCCTTCAAACACAAAACAGCTCTAATCTTGACGAGCCTTCGGGCCAATCAGCTGTTGTTCACAAAAGCAGTGATTATAGTAATGGCGAATTCATGCCCGAGGAATGCGAATGTGCTGAGGCATTCTGCAACCGAGTAAAAAATTAAATTTTAAGCCGAGGAATATCACACTTGAATATTGGTCGACAACCGATGCTTTTTAGAAAAGACTAGTTATCCTATGGAAATGTACATCTTTAATTTAGATTATACTTCGCTAGTTAAACACGAAACGAAACTTATAATATCACGATTAAAGTAGAATAATAACCATATACTGGAATAGTTAAGTGTAAGAAAAATCTGTAGAGATTTATATATTAAGCAGCGCTCCCATTCGCCAAAATAGGTAGTCTATTTCATCTCGGATAAAGAATCTCAAGAAATTGTTGTTTTAACCAAAATGTTAAGGTTCTAAAGAATTTCGAAATAATTTTTTCCCATCACTAATTAAGAAAAATTGTACATTAAAAAATAAGAATACTTATTTATTAGCGTTTTCAACTTTGAGAACCATGTTCCTGATTTAACTGGATTGTTGTTTTCATTCAGTTTTAGTCTTATTTCTTTCAACTATGTATATATTAAGCAATAACACCTCCTAATCCTTCAAGGAGAAACAATAAAGTCGAGGCCTTCGACTGTTATATACCCATTAATCTGATTCATATAAAATCAAATTGCCAGGCATTTTGATTTGCGCGGCACTTACCACTGATGCTAGCGCCACGGTACCTTGCGGACTTTAGATGTAATACTGACCATGCCAAAGTCTGTTTAACTTATTTAGTCATTACGTTGGGTACAATTTTCAACATTTAGATACACCGAAAAAAAATCTTCAAAAAGGAGGAAGGCTGTCAGACTTTAGCGTTATTGGAGTTAGAGGAGCGGTGGCATTTTGCTGAATAAAACAAACGCTGCAGAAAATGTACATGTACTTGTTTTATACAATCCTTTTAGATTTTGCAGTTCAATATGTATATCAGGGAGGGTCGAATGAGGAGCCTGAAAATCGTATTTTAAAGGATTGTAAACAACATTGCCGAAGTCCAACAGCTTATATGTAGGATTGAAAATCAATTTACCAAAACAAAAAGTTGTCATGCCCACAAACCGATCAAAATCGTACATTTAAGCACTGATATCTCGCAGGTGTATTTCAGCAGGGTGTCACTCTCTCTCTTCGGATTTAAACAATTGGGGTGTCATTCGACGCGTATTTTCGGTAAAAATACAACAAGGCCAATAAAATGTGGCCTATATTCTCAACCGCCTAAAAATGTCATATTTTATAAATTTTCTTTTAATAATTTAATACAATATAAGGAAGTCGCCCTCCCACACCTTTCTTAAGCGCTTCGTTAATCAGTGGATCTTAATCCGCTTGTCAATACCTACTGCCACGGACTGTAAATAAATAGTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAATGTAAAGAAAATAAAATTTAAAAAAAATATATAATTTTTTTTAGCGTTTTTCTTGTTTTCAGTAGAAATAAAGCAATTGTTTCCATTTTTCCGTGCCATATTCAAATTAATTTACTAGAAACATGTTTATCTGACCATGTCCATGCAGATTCTATTTTCAAATACAGCGAAACTTTGTTTCGTCAGGGTGGCTCCCTAATTTTCAATGTTAGAATAAACATTAACAGAAATGTATAGCTCTCATCGATAGCTATCAATGAATCGAAAAAAGGTTTAAAACAAATCGACCCTATAGACGCTGATCTCTCGGAAAGTATGACATCATAAATTAAGGGACCACACTAACTCGTACCAACAACCAAAAAAGTCTTTAAACTCAAAACTTTAATGCCCACAAACGCCCTAACACTATAATTTGTCTTCGCCACATTACTATGTAAAAAAAAAGATAAAGATAGTATGATTTATATTTATAAGGTTATAATTATTTCAGTCACTAGTTTGCAATGCAGTAAAGGTTATTTGTTTTACCTTTCCTACCCGATTCGATATAGTTTTCCGATCCTGCATAAGAAATGAGACTTTTGGAAAGTCGGACAGCTTCAAACGTTTGCCTAGAAACGGACATGACTATTTTCACTCGTCTAATTATCATGAATATAAAAAAAAATATATATTTATTTAGCCATTTAGCCATATCTCTATAGAGATTACATTTTACTTTATAGAGTAGGAAACGCTTTTTGTTACATTTGTTCAGACGACTGTAAATTAATTATTTTATTCTACGAGTAACAGGTATAAAAAGTGAAAATTTACTTTTTTTAAGATCACATAATGATTTTAGGCTGATAAAACTGTATCATATCGACTACATTTCACTTTTCCTAAGATATAATAAATAAAACAAGAAAGGAAGTTGTATACCCTTGCAGTTATAATAAATAGTCAAAGTTTGTAACGCCATGTTTAATTTTTAAGGACTGTTGCTGGCTTCTGTGATATTAAAAAAAATTACTTCATTATTTCTCTGCCATTTCCTTGACAGCTTTATGATAGAGTCGTCCGATTTTTATAAATTTTAATTCGAAATTCTTAAATATATAAAAAATGGTATTCTTATATTTATAAGATAATACCGAAGCTATAATTTGTATCATATTAGTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATAAAAAGTGCTATTTTCAAGGGGGTTATATGTTAAAAAACACCAAACATATAATTTTTTTCAGAATATTTTCCCATCAATTTTTTGATTGTTACCATTACAGCTATATGATATAGTCGTCCAATTTTGAAAAAATTTAATACGAAATTCAGACTCTCTTAAAACATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGAGAAAACAGCGAAGTTATAATTTTTTAAAATTTGTTTTGCAATTGTTTCTATGGGAGCTATAAGATATAGTAGCCCTGTCCGACTGGTTCCGTCTTACATACTAACTGCAAAGGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTCAGCTCGATAGCTTTAAAACTGAGAAACTAGTTTTCGTAGAAACGGACGGACACACGGACA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATACATCAGAAACACTGTAAAGGCATTGCCTCATAAATATTTAAAGCTAGAGGCGTGGATTGCAGCAAATCAAAATGTTTTTGTAAATTTTTATCAGAAAATGGTTTTTGGCTTTTAAGTAAAAAAAGGGTGTGCAATTTTTTGAAATGCTTTTAAATCCATTTTTTTGTATGCATACATATATGATTGGGAAACAGTTGTGATCATTTTACAATGATACAGTCTCATACATACATTATACATATATTTGAATTTATGCTTATAACAACGTATATGGAGTTATACACAAAAATATCCATTGAGTAAAGACGCTTAATCTAATACACATGTTTTATATTTGAGTTCGAAAATAAGGAGAATTGTTTCATACAAGGGTTTCCCAGAAATCACCCTAGCGCCATTTTATGTAAAATATTGATTCACATAAAAAACTTGCCATGAATGAGCGCACTGCGAAATCCGTGCCCCCCTCGTAAATATTATTCATCGCTTCTATTAAGATGTGATAATCATTAGATTTCTTTTATGAATATTGTGTATCGAGACCTTTAATATAGAAATATACTTACAAAGTGCAAATAAATTTAAAAGGAAAATATAATAATTAATTTTTAATTGAAATGTTGCGTTTTTTACTTTTTTTTTTACTAGATCGATATGAAGGACCCTTGAAAATAACGTCAAAGACTCTTCGTAAGACATTTAACTGTACCTTCATGACAAGGTTGCATAAAAAAACATAATATATAATAAAAGTAACACATACATATACCAAGAGCGTCACTATAGTCGCTCGCAAGCTGAAACTCAAAAATATTAAAAAGTAAAAGTCAGCCGTAAGAGATACATGTTTTAATAACTCCATAAATAAAGCGCATATTGATGATATCTGCCTTTCTGTTTGTTGTCTGTACAGTCACATTTTTAGGACACCTTTATATTCTGATACATGCCATGCGACCAGAAAAGCAAAACTGATATACATACATATGTTGATTTAAGTCATCTAGTGAGTTTAACGTAATCGCATATTTTTAGTTAATTTGACTTAATTTTATATTTCAGTTAGCTAATTTGTTTTGTTTTTCATATACTTATTTTTTATCGAAATTTATAATGCTACATTGTAGATACCTAATGCTTTACAGTTTTATAAATCGTTAATGCTAACTGGAGTAAATTTTATTCGCCTGTATTCACACATTTTAATAAGCTTTCATGTGTGTGTATGTATTTAAAGAACAAGTATAAGCGGACTGCATAAACAAATGATTATTTGTATCATAGTAGGCGATTATTTTAAAAGATTACGTAAAGTGGTTGGAATTATTTTATTTCTTATTCCAATAGATACAAAGGTATTCATTTTATTTAAGTTTGATATCAATTTAAGTTAAATGATAAACTTATTTCTCCCCTTGAGAACATTTAAATTTACAATCTTATAATTGGTACAAAGATATTTACAATAAATATTCCATGTACCAATATTATGTTCAATTTTGTATATTCGTGTTATTTGTTCTTTTAATTTATAAAGTGACTATAGTTTTCTAGGGGACATCTGAAATGCGGATACATGCTTTTAATTGTATATTATTTTTAAACATAGAATAACAGGGGACACAAAACACCTGAAAACAAAGAAGACAATAATAAAATTCGGACTAACAACTTTATTCGCAAATACTATTGCGCCCTCTAATTATAAATATAGCACTTTTATTCATGTGCATAATGACAGTTTATATTCCATTGACTAACGCCCACTACTTTTGGGGTATAAAATCGAATGTAGTAGCTCCGCTTATTTTGGCAGTTGCACTTCGATGAAAGTGAACATTTTGCCATTTGTTGTCGCGTTTGTGCCAGACGCGGGTCTCCTCAGACTGATGAGTGTGTGCATGTCCTTGCCTTTATATACAAAAAAAAACAATTAATTTAAAGTTGATCATATCTTTGTAAAGTACTTACTTGTCAATATACTGTGTAAGTCTGACATAGGCAATGCACGCGGCCTCTTCACCCAATAAGTGCACGTGGGGATTTAATATAGTTGTGTTTATAGCTTTGCAATTTTTACCAAGAACTGAAATGATAATTTAATAACTATCTAACTATTATCTTACGAATATAACTTTAACTCACCATTTTCAAAGTAAAATTTATGAAAATCAATTCCTTCGACTAGATTACCCAAAGCTTCTGGCTCAAAGGCAGTAAGATGGGGATCACATATTTTGCTAAAGAATATAAAAAAATTTATGTTGAACTATTTAAAAAAAATGTTCGATCAGTTTCTAGACTCGTAACCTAATATAATGTGTTTTAATTATTTTTGGGGCGCATCGGCTTAATTACTGAAAATTTGGAAAAGCTCTGTAAAAAAGGGTACGAAAACCCGGGGGTACTTTTCGGGTTGTTGCACTTGCAAATATGAACTACCTAAGCCTTGCTTAACTTAGGCGCACCAGAGCGAAGCGGAGACTTAGGGAAGAGAGGGAGGGAGAGCAGAGTTCAGTGCAACCGAGATGCAGAGGCAGTGATCCTAACATTCTATATATTAATCACGATTCAACTGCTTACAATAAGTGCATTAACCTCAAAAACATCAAAAATAGCTTAAGGGGGTAGTTTTTTTTTTAATTTGCGGACTTACGTGTATCCATCAAAGTCGCCACTATTAATCGCTTCTATTAACTGTTCAGTAATTTTTATTATTTCTTGTCGTCTAGCTGCTTTTTTGAAAGAAAATGTTGTATTTAGGTTATTTAGGGTTCAATCGTTTAGTTAATTGTGCTAAAACTAGATATATATCCGTCTCATATTTGCATACCAATTAATGTAATAACACCCTGATTGATTATACAGTAATACACAGAAGTTCCACAGAAATCTTTTCAGTAATGTAAAGTTTTATTGATGTATGTAGTCAATACACTCTCTACCATTCAGTTCTCTGCGGTTCCTGTGGCACCCCGGTGTTTATATATTCCTAACGTAGCATACTAAATTCTAGCCATTAAGAGCCTTGAAACATGCGAAATACAAAATACTATGATAGACCGTAAGTATTATATTTGATTAAACTCACAGTTTAATGACTCTTTTTATACCCTTGCAGAGGTTATAATGATTTCAGTTAGAAGTTTGCAACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGGTCACTAGCCGAGTCGATCAAGCCATGTCCGTCTTTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTGAAGCTATCAGGCTGAAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGTAGGTAGTATATAAGTTGGAACCATATATATATATTTTATACCTCCCACAGGAACTGTCGGGGAAAAAATTAAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAGCATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTCATTTTTTATCAAAATCGGACGACTATATCAAATAGCTGCCATATGAAAAATTATTATTAATATTAAATTATTATTCGGAAAATTAGTTGTAAAATAATATGAAAAGATTATATTTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGCAGATAACATTTTTAAATTATTTCTGAATTTCGAACTAAATTTTGTAAAAATCGAAAGATTGGCTTCCAAAAGTCTTATTAAATTTTTATCAAAATCGGACGACTATATCTTATAGCTGTCATGGAAACAATCGGGAAATTAGTGGGAAAATACTATGAAAAAAGTATTTACTATTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGATTGCCAAAGTTAACTTAAAAGATAAAAAAAAATTTTATTTAAACTTTTAAAAACATTAGACAACTAAAAAAACAAAAAATAAAAAACAAGAAAAGCAGGTAACTTCGGCAAGACGAAGTTTTTATACCCTTGCAGTT'..b'AGAATTTGAAATATAATTAAAAAAACTATTTGGATCATATTCTCTTCAACGCCGATATATAACATTTGTTTTATTTTTTAATATATAATATTTCTGCCATAAGAATCGGAAAATTAATGTCAAAATAACATATAGAAATTTATATTTCGTTTTCGATAAGCAAATGGAGCATAATCATTTATGTTTTTATGGTGTAGATACTTCGGTTTGCCAAAGTTCGCTTTTTTTGCTTTTAATGTAACTTTTCCCCTTTTCTTATTTTACTTTATGACTTTAACAATTAAAAACGCAATTTTAAGACCCTATTGGAACATATAGGCGAACTTCGCTTTTCACTTTGATGTTTTTTTCGATTTACAGAATTAGAACTAGCAATTATATTTGTAGAAACTAATGGTATTATTTATTTTTTTTAAGCTGCTATACCCCGTTTTGGTAGTTATAATTGTGTAAAAACCCAATTATTTTCTTATTGATATAATATATTCAAAATGTGAAGATTATATCGATGAATATAACATTCAATTCTTCGACAAATCCTACAATCTCTGCAACAAAGTAATTCAAACGTTTCATTTTACATACCTATGTTGGGATGGTGTAATTTTCGGCAGATCCTTGCTTCACGTTCCAGTTTTTGAAAGTCTTAAGTAAATATAAAAGAGTATGGTGTTACTTATGTATTTATGTACTTTCAAAGGTAATGCGAGTATGAATAACAAAATATTAACAAGGATTTAACTGTTTTGTTTATGAAAATAGACCGACAAGACCGACATTCTTACCTCTTGCAGTTAACTTTTTTGTATTTATAATTTTTGCAGCAAATTCAAATCCAGTTGACTTTTGGACGCATCTTTTCACTATTGAAAATGCCCCTCTAAAACACAAGAAAAAAATGTTACATAATCGGATAATTATGGAAAACTTATTTTTATTGACTCTGTTTAACTTACTTTCCCAGTTCTTCTTTGATGTCGTAGTTGTCCGAAAAACGCGTACAGGCTGCTGGTGCAGCCATCGCGATGGCACACTTAAGAAAATCTATTGCGACTATGAATCTTTTACTAGTCCCTAGAAGTCCCTTCTCAGGTGTTTTAAGGGTTGTTCTGTAAACAATTAAAAAAATATAAATTAAAATGTTTAAGAAGTACAGGTATAAACATAGTTTAAAATTCAAAGTTTTAAGATAAGAGAAGCGTAAAAACGGTAGACGTAGCTAAATCATTCGTCTTTTACAATATCAAGAATATATTTACTTTGAGACTGGAAATGTCTCCTTAACAACGATGCAATATTCTGAATTCTGAATTTATGAAACACTATGGAACGGTAACAAAAATTTAGTTGGTTTAACAAAGGTTTCCGATTTCTTAGGTGCTAGTTCTCTAATGGATTAGTTAATCCATTTCTACTTTGAACTGGTGACGAACTGGTGTCAGTTGCACGCTGGAGACTCCCGCCATGCAATCACGACCGCCAACATGCCGATGTGGTAGTTCCAATCCTAGCTGCGAACCTAGGAAGAAGATTACTTCAGGTCAGTGCGCATCAACATGCGGTGGCCGACCGGCAATAGGTTCAGTGACTAGCTTTCGTTTAGGTCTCTATCGTGCTGATCAGGGCGCAACCTAAATGTAAGCAGCACTACATTTCTTGAATAATTAGGTTGGGCGTAAGTTTTTTAATATAAGCAATATAAAATAGTGTCTAATTATTGAAATGTATATATTTATTCGGCTTGGTCACACTTTTACACTGATTTTTCTCTCCAACTCATAGCTGCGTTTTGAGAAATAGACTAACGCAATAAAAACAATATATTGCCATTTAGATAAAAACTTTACAATTGATTTATTACATTTTATAATTTGGATTGCCAAAGAGTATATTATATCTTCAGTCAGAAGTTTGTAACGCAGTGACGGAGACGTGCCCTACCCCATAAAGTATATACATTCTTGATCAGCATCACTAGTCGAGTCGATCTATATCTATAACTCCCATAGGAATAATCGGGAAAAGTGTTTAAAAAATGATAACTTTGATGTTTTTTTTTAACATTTTAATAAATTCTCAATTTGGAATTAACTTTTATCGAAATTGGACGACTATATCCATATTTCTGCCATACAAACGATTGGAATTGTGGTCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTGGCCTTTTTGGGCGTTAGAGGGGGCGGGGCATTTGTGGGCGTTAGAGGGGGCGTGTCCCCTTTTTTTTGGTAAGTCGATAGGTATTGATAAGACAAATATGTATGTATATTTCACTTAAAATTTTGTTTCTTCATAAAACCTATAGGCGCTACATATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTAGAGTGAGCATGGCATCCTGCTTGCCCTGCGTAGGAAGCCCAGGAATCCGCATGCCAAGTATGAATATTCTACCTCATACAGTTTCCGAGATTTTAGCTGTCAAACGGACGGGCAGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTGGATCCTGATAAAGAATATATATACTTTTTGGAGTCGGAAACGCTTGCTTTTACCTGTTACATAGTTTCTGACGAATCCACGAGTGACGGTTATAAAAATTATATATTTGGTGTTTTTTAGCATAGAACCTCCTACGTTTGGAAAAAAACATTTTTTATTTAGGATGGAATTTACAATTTAATTTAATCAAATCGGATGACTATATCATAAAGCTGTTATAGGAACGATCAGAAAATTCGTGGGAAAATAAAATTAAACAAATTATAGCTTCAGTGTTTTGTAACATGTTATTTTATAATATTGGGAATATACTTTTTTTATTTTTAGGAATTTCCAATTAAATGTAATAAATATCGGATGACTCTAACATATAGCTTCCAAAGAAACGGTTAGAGAAATAATAAAACATTTATTTATTTTTAAAATCACTGAAATTAGCAACAATTCATAAAAATTTAACATGATGTTACTTACATTGATTATTTCTTATAACTGCAAACTTCGACTTTCCGAAGTTAACTTCCTTTTGCTTTTTTTTGGTTTATTAGAACCAATATTTATATGAACAAATGGTTCAATTTGGACTATTCTTTAAGAAGATATGCGTAAAAAGATAATTGTCTATTGGTGGCGCCGTGCAATCTTGGAAAAATGGCTTTGCTGCTTCTCCTTTAGGTAATTGATAGTCGGAGCATAATGTTCTCCCTTGTAAGGGTTCTAAAGATTTTTTCTCTGTAACAATGTTTTTAATCAGTGCAATGTACCATATTTCTTCTCTGTGTAATTGTTTCTCACTTAGATAAATTATACAAGTCAAGAAAACAGATTCTCTTACAAGTTTATCTGGTCTTTAACTTTATTGCACAGATAGGCAGTCTGAGTTCCAGTCAGACTCTAACATTGACAGTTGAGAAAACATAATTTTGTTAGCAGTAGAAGAAATCAACGAGAATAAACAGAAAAGTGAATTCTAGTTAACTGAAAAGTACTGTGAAAGGGCTGAAGAAGTTAAAAAACTATCAAAAAGAAAGATAATAAGTATCTATACCCTTTCTGGTCGCTTTCGTGGGAATATTGTATCTACAGACCTTTCCAAATTTTAGAAAACCAACAAGGATGAACGTTACAGTCGGGTGTCTCGGCTATCAGATACCCGTTATAAGCGTTTTCTACCCGAAAAAGTATATTTGATCTTGTTCAGCAACACAAGACAAAGCAGTTTAGACATCACCGTCTGTCCGTTTGTCCGCAAACTTTTCTTTCAGTTTTATTGCTATCGGGACAAAACCATCGCAAAAGTATGATTTCTATTGCAGGTAATATAGAAGTCAGACCTAGCCAGATCGGACAACAATATCCTTTAGTTTCAATAATAATAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGTCGAAATTATAAAAAATAATCAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAACACCATGTTTAAAAATTTCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CATGGTGTTACTAAATTGATTATTTTTGGTTGTTGCTGACTTCAGTGATATTAAAATAAATTATTTCATTCTTTTTTTTCAGACAATTTTTTGACATCTATATGTTAGAGTAGTTCGATTTTTATTAAATTGAATACGAAATAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATATTATAAAAAGCCCCGAAGTTATAATTTGTTTCATATTAATTTCCCACCAATTTTCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATAATATAGTCTTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAAGTCTAATTTGTTTTCCAATCTGTTATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGAACGTATGTTAAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTAAATTTTTTCCCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATAAACTACATACAATAGACAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACCTGTATAAAAACTTTATGGGGTTAAAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTATGACTGAAATCATAATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGGGAGTGCCTCAGGTCATGGCAAATCACGAGTTGACCTTGAGTCGACAATAACCGTACTTGCAATTTGTACATTATTTTTTTTATGTTTATAGAAAAGAAAGTTTAATAAATATATATCTATTTAAGGTGATAACATTATGTATAATGTATTTATTATTGCATCTTAAAACCTGCATTCTCACACACTTATTTAGGTCACATCAGTCTTTCGACTTAATAAATTTGTTTCCACAAGGAAACCTAGAATATGTTGTTAGAATATTAAATGTGAATTAAAACTTTTTGTCATTTAAGGACTGATTTTGAGCGACAGGTGTTTTTGGTTAATTTTTTTAAATCAAAAATTCTTGTTTAAGAGAATTTATCTGGGGCACAGTACTTTTATGTTTTTGTACGTGAGTATGTATCCTTTGCAGATTTCATATACTGGAGCTTTTTTGATTGAGCTTAATGGTAAAACGCCCCTTCCCGTTTAGCGAGGATATTCCGGGGCATTAGGTAAAACTTGTTGCAAATAATTCACTTGTGTAAAATCGAAAAAAACGGGGGCTTACCCGTCAAAAATCAATTTGCAGAAACTTAAAAAGCTTATTATTTTAAACGTAATTTTATTCGAGAGACAACTTGACTAGTAGTCAAAACTCAATAAGTTACTTGCGGCATTGTGTTAAAATAAATACCTTTAACATAAGTCAAATGAATTTAAAAAATCTTAAAGAATTACTAAACATGTACATACGCAGAATTTGTAGCGTATGAAATATACATACATCCATATGCACATAAATGGATACATACAATCGCAAAAGAACTTTTTTAGCTTGAGGTGAGGCAAATAAAATTACTTATTAACTTAAATATAACAAATAAGACCCTTGGTACGCATAAAAAATGTTTTTAAATATTTGTAAGGTTGTGCACACTTATATATACATATGCAAAAAAATGAACATATTTTAGATCGAAAATATGTACGTTGGAGTATATTTTTGAATCTGTGTTGACCCAGAATTGTATCAGGAGAATAATACACCGTTATAGATATGTACGTATTTTTATAAATATATGTATATATAAGTATACACAATGAACATACATATACAGTTTTTTTTTATCAATTGGATACCTATTTACTTGATGTATACGTCAGACGTCTGCACTAAAATCAATGTTTTCAACGTCTTTGCAACCTAAGTGATGTGCCTAAATTATTGTAAGAATCTTTTGGAATGACAATATGGGAAAATAATGTTCCGAAATGCACATAAAAATATCTACATGTGTATATATATTTTTTTAACGAACTGGGAGAACACGACGCGTTAAAGTCAGAAACCGAAAATCTAAAAACGTCTGTTTGCTTGAAAATCGAATTCAATACTGACTAACAAGATTTTGTGGTCGCGTTTTATTCGATGAAGTGCCAAAACGAAAAGCTTTTTGCCGACTTTTCAAACTGTCGTTCAATTGAAAACTTGTGCCTACGAAGGTCTTATTCAGGAGTATGCGCACTATAATGAATATGTATCAGTGTCCCGACCTACAGTTTGAAAAGTATTGCATGCAGGAAACTTGCTACTTCACTACCAAATCCTTTACAAGGTCTTTTTGACATATTATAATATTGGGAATATACATTTTTATATTTTTAAGAATTTTGAATTCAATTTAATAAAATGTTTGATTATTTTTTAAAACTGCAAGGGTATGCAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAAGTTCCTTTCTTGTTTAACATATAACCTTCTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTTAAATTAAATTTTATCAAAATCGGGAGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTAATGGGAAAATAATATATAACAAATTTTAGCTTTGGTGCTATTTGACATATAACCTTCTTAGCTTGCAAATAACATTTTTTAATAAATTTCGAATTTCACATTAAGTTTTATCAAAATCGGACGACTAAATCGTATAGCTGTCATAGAAACAATCGGGTAATTAGTGCAAAAATAATATAAAAAAATTATTTACTAAAATTGGTTATTATTTATAACTGCAAGGGTATACAAATTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTGTCTTGTTTATTGTCCTTTATAATCTGCGTTTAAATTTAGGATCCGACTGGCTTCAATAAAAACAAAAAATTGAAAACAACAAATAAAATGGATATTGCACTTTTAAAAAGAATAAAAGGAAATGCTGCAATAGCTACGGTGGCTACAGACTTTGTTATCAAGGACAAAGACAATGAGTAGCGACGGAGATCGTTTTTTTTCTTGGCCAGTATTTGTTAGGTTGAGTACTGGCCGTACACAGAAATTCCCTTAAAATTAAAAAAGGGATTTTAAGCGGCTTCGTTTAATAGGGTTGAAAATTCCTATAACGATTTTAAGCGGATGTGTGCAAAGACTATAAACAGCATAATTCTGTTGGCACATTCTCCGGAGGTCACTCGGCGGTCTTATACAAACTTGACCTCTAATAAAAATTAGCCAAAAAAATTTGCAAACCATTATTTTTTGAGGTGGCATTGTTGATATTTTAATAATATCGAAGTAATCGAACTTCCAATCTATTCTTAGAATGCTAACAGCTCCTGGACGAAGACAATAAGAAGCGATTTAGATATTTTTGAGTTAAATCGAATTTGGCCCAACGTTCATTTAAGGTTCATTTCAATAGATTTAAAAACAAAAATGCACTTTATTATAAATATATTATTTCGATTTCCTCTTGTCCGGTTTGTCCGGTTCAAGATGCCTGTGTAGAAAGGGATAGTTTCTTTAAGTGATCATACCATCCTGAGAAAACTCTTTATTTAATTGTTCTAAAACATCAACATCGTGGTAATAAATAGATATTGTTTGAGCATCTATTGGATTTCGTCTAAGCCACCATGTCGGATTTCATATTTACCTTAACGACCAGGTGTCCAAATTCGTATGGCTTTATTAAGCTTTTGCAATGAAAGCAATTTGTATAAGTCATTTTACTTAGAAATGTACTTTAGAAACTAATCTAAATCAAGAAATTTAATCCTACGATTTATAATAAGCGTTCCATACTAGACAAGAAAAACCACAATTTTTCGAGATTGGAATTTGTTCATATGTCAGTAAGACTGTATTGTTACTGTTACTGTTCGAAGTGCATGAACGTCCATATAATTATATATGTATATTCTATGTGCAAGGCCACGTCCAATTGGTTGGTGTAAACCTCTGAACCTTATTAAAGTATGATTAGTTTGATTATGATTACAGATTTTTGCGGATTGTGGGCGTGGTACCCAGCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCTAAAAGCCCAGGAATCTGCATGTCAGGTC'..b'TTTCTGTATACAGTGATGGAATAATAGAAACGAATATAACTATTTCTCTTTTTTTTTAAGTTCTACCTTTAGGAATATTTATGAAACCCATTGGGTTGGTAACATTGATAACGGTACTTAATCACAATCTCCTTTTTGAACGCTTTTCGTTTGCAATTTTTCTTAATCATGGAAATTTGTCAGAAGACCTCGTGTTTGGGTTGGAAAAAATAATAGAAACGCGATTGCATTTGGTCGAAATCTGTGGTTATTCTTCGTTTAAATTCAAATAAAAGGTATTGTTTTCAGTATTTTTATTACAAGGAGTGTTATTTTTTGTTCAATTTATCATTTAATATTGTTAAAAGCGTCAAAATGGGTCGTGGAACACATTGCACTATAGTAGAGAGGAATCTAATCCTCAAATTAAAGGCAGAAGGCCAATCCATGGCACAAATTGCAAAACTATTAGAATGCTCAAAAAAAAAGTGTTTTCTGCTATCCACTATCAAGCTGAACAGGAGAAACGTGGAAGAAAGCGAGCCACTTCTACAAAATTTGACACGAGCCTTATAAGAAAGTCGAAAAAGGAGCCATTTTTTTCTTCGAAGGATCTTAAAAACTACATGAACGCATCCGTAACGTGTGCTACAGACTATGTAAACATAATGAAGGAGGTTATGTTACCATATGCCAAAGATGAAATGCCTTTAAAGTGGGAATTCATGCAGGATAATGATCCCAAACACACATCGAAGCTTGCGAAAAATTGGTTCCAGGACAATAAAGTCCACGTTATGGATTGGCCAGCTCAGTCACCGGACTTAAACCCCATTGAGCATTTGTGGGGCATTCTAAAAAAACGTTTAAGTGGTTTTCAACCAAAAAATAAGGAGCATTTGTGGGAGAAAGTTCAGAAAGAGTGGTACTCCATTGAGCCAGCAATATGCTCCAATTTGGTGGAGTCTATGCCTCGTAGGTGTGCTGCCGTGTTGAAAAACAGTGGTAACGCAACAAAATATCAAAACTAAAAACATTTCATGGTAAATTTTGCTAATCTAGTCAATTTGGATAAAGATTAGTCATTTCGTTTCTATTTTTATTTCCAGGTCAAAAACATAAAACTTAACTTTAGTTAAATTTTTTAGCTAAATCAATGAAGTTAAATGAATTTTTGTTTTCTAGTATGTAAGATAGATGTATATATATTAAAGAAAAATCAAAACTTCCACTCATTACAACGTTCCTTATTAAAAATACGTATTTAAACCCAAAGTGAAAATTCGTTTTTATTATTTTTTCCATCACTGTATGTTATGTGGACTGCAGACATTTCAAGCGTTTTAGCTCTTTGGGGGCATACTGGTGGGCGTGGGCAAATATTTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTTTAATGAGACCAGCACATTTTAGCAAAAAAATGTCTAACATGACAATTGTGGCCACCACAATTTTTGGCGGGTTTGTGGGCGTGGCATGTTTTTTGGATCAATCGATAGGTATTGTTGAGAAAAATACATTTCAGTTAAAATTTTTTTCTATCATAAAAACTACTTCAGATGCCTAAGGCCCCAACATACACCGTCCTTCAAAAAGCAGCCGGAAAAACCTTTTTTGTCGGCTTTCGAACTGTATTACCTTTGGGTCTCCTTGCTATCACATAAAGTAAAAAATTACCTGGGGTAACTCATTATATTTCTTTGGTGGCTTGGGAGGTCCGTCCATCATCGTACAAGATTCACTTTGCCTTTGACGTATTTTGTTAACTAGCTCCGCAACGTTAACATGACCAATGGCAGCAGATGAAGAGGTTTTTGAAGGGGAGTCTTTTAGAAAGGACAGCTCCTTAAGTTGCTGGTCCACAGAATCCATTCCAAATTGAGTTATTACTTGTTTATGCTGTGAGCTATCCCTTAACGGGCCAAATATGTTCAAATTAATACTGCACTATAATACAAATCATTCGCACCTTTTTCTCTTCTGTGTTGGATTTAATTTGTAGTAAACCTGAGCAGCTTAATTTTGTTTACAACCGGGTTGTTTTAAACTTTATTTTTAAGAAATGTATTGATTTTATTCCTGGCACAGCTTAGGGTGGCGAGTAAAACCCAACATATCGATATATATTTCTTTATAGCAGAGTCACACTATTAGGCTACCCTAGAGTGGACCTTTTTTATAGATGAAGAAAAAAGGAATATGCTTAACAAAATCCTCGAATACAATTGCAACCTTTTATTCTCTTGGAAGTTGTTGGAAGTTTTAAATGCAAATACCTAATATTAAGTTCCGATGGAATTTTTTGAACTTCTAGTGGGACCGAAGATTTCAAAGTTCGCCCGCAACGCATGTAGAACGGTCTCACTGTCAAACAGTTGGCAAAGCCACAGTGTATGTTCAGAGGGTGTTTTTATTGTTTATTGTTAATTAGTAGTTTCAGAGTTCCTTCTCATGTAGCGGATGCTTAGCCATGTGCAGTCTAGCTCCGATTCTCTATTTGACAACGTGGGACTTTAAGGGGTGCAAGGCGGATCGAAACTGGGTTTGTCATGCCAGTTTTACCGACATAATGCTGTTGCCCTCTAATAGCTTAATCATTATCAAATTACAATAAATAAAAAAATTAAATTAAATTAAAGTATTATTCACATATCCAAAACCATGTTATGCAAAATGAGTTATTGAATTCCGACTACATAAAGAAATATGTACCTGAAAGGTACATAAGTTTACTTTTAGATATTTTTACATAAAAAAAATGTTAAGCCATTCTGAGAAAAAAAATATGTTTTCGAGAATTTTTCGTATTCCAGCGTATTCCAGAAGTTTAAATAAGTTTTTAAATGCTTCATTATTTTACTGTAAGCTGGTGTATGCACGTTTTGGTGTTACAGGAGCTAAATTTTGCCAAGAAGGACATAAACTTCAGGTTGGTCATATTCTTGAAAGTAATCACTGATTACTCGGTATCAAAGCAAGCAACCCAATGTAAACACTTTTTTTATTGTAATCGGTTTATGAGCCTAAAGCTTACCCAACATGGTGGGATAAACATATTAGCCCAGAATTAGAGTTATATTTAATATGGTGTTCACACATCACCACACATCAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGATAAGAAGGTTATGTTTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGATATATATTATTTTCCTACCAATTTTCCAATCGTTCCTATTACAGCTATATGATATAGTCTTCCGAATTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGTTTAGAAGGTAATATATTTTAAAAAACACCGAACATAACATATAATTTTTTCATATTATTTTATCACTAATTTTCCGATCGTATGATATAGCCGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAGAACTAATTATAAAATGTTATTTCTCAGCTTAGAAGGTTATATGAAAAAAATACGGAAGAATATGTATACTTTATGGGATCGGAAACGTTTCTTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGGGCACCCAACTCACACATATAACTGTAGACGGAGGTACAGGTTGTGGCGAAGCGCGCAATAGAGGGTGCTAAGACAACTACTATATACATATAGCCGCAGAATTGAAAATCTGCTTTAGAAATATAAATTTGTCTGGGAGAAAATGCGGTAAAAGTATAAAAGTAAAAATTTAGAAAATTGGAGCTGTTGGAGTGTGTGGGGATAAATGCTCCCGGCTTTTAATATAGTTTTATTCTAACTGAGAATACTCGTCACTTCACCTCTTCTTGAAATCTGATGTCCCGTTCAAAAGTAATTCCAAAAACAAATTTTTCTTCGTATTCCCAAAATTAAAATTTTGGTAGTTTTGTTTTGTGGGTTTGTCTGCATCCCATCTTAGTTATAGAATTTGGGGAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/089/d1b/cd/scaffold_59-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CCCAATGAGTG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTCTCCCTTTTAACCTAGTTGTATCTCACATAAAATACACGTCAAATGAAACCTAAACTGTCAAGATCGGATAATACGAAAAACAGGATTTTGTGGGACTTCTGAAAATGAGAAACTAATTTTGTTCTTGGGTTTGTCAGTTTGTCCGTTTCTCTTAACAGGATGTTTAGAATTTTAGAAATTTAAGAAGTGTTAAACAACTCATTATAAACAATAAAGAGAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAAGACTGAAGACCTTTAGTAACACCATGTACAAATTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGAGATATTAAAAAAAAAATTTCATTTTAGGACCATTTTTTTACATCTATATGTTAGAGTGGTCCGATTTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTTCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCTTAAGCTATATTTTTTTTTCATATTATTTTTCCACCAATATTTCGACCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATATTGATAAAATTTAAGTAGAAATTTATAACTAAAAAATATTATTTCCAAGCTTATAAGGTTATATGTCATAAAGCACCACAGCTATAATTTGTTTCATATTATATTCCCACAAATTTTCCGATTGTTCCTATGACAGCTATGATATAATCGATGCAAACAAGATAGGGACCATTTTTTAGTAATTCCGTCAATTATTGAGAAAATTGAAAAGATAAGTCTAGTAATTCTATCGGTTTCTTTTTTTCTTAGCTGTACCGCTGAGGCTATAGGGACTTTTAGGCATGGCAAAATATGAACCATTTATTAAATCGGACCATTGCTTTTGTGCTTCTCTCTCTATGTATCTTTCTCCCTAAAACTCCGCTTAGCTGAGTAAGGCGTGTTTGACGATCGATGCCATACACTAAGGTGCCATAGCCATGCCGACATACGGAGGTGAGGCAATCCAAAGGCGAGCATACTGCGTTCAGAGACACATACTCGCTGAGAAAAAAACGACGAGACAGATAAAATTGACTTGTTGGCTTCTTCAGATTTAATGCAAGAACAAAATGTATTGCTCTCGTCAATAACTATTAACTGGCCTAAAAAACAGCAGTGAAATCGCGAAAGCTATAAATGCTTCAATTTTGGGAGCACGAAACAGATTTAAAAAAGTTTATTTTAGTAGGGTGCCACGACCACCTATGCAGATCAAAGCTGAAATGCTCATTTAAAGCACTAAATTAAAAACTTATTGGAAGATTCGAGTTGGATTAAGGATTATTCCTTTTTGTCGCAATGTTATTTTAGGTAGGCAAGAAATCTGTCTATTAGGGTGAAAGCGGCTCCTTTATCATCCAACGCAAACTCTGCGCAGCAATTTTACTCATATAATATATAGAAAGGCACTTCTAGACGACTTGAAAATCCTGCACGCCTTCCTAATGTACCATTATGTTCAGGATACCTAGAAAGAGGTCCGTGGAAAACGAGAGCGTAACTTCCAGATGCACTACAGGGGTTGTCCCTTGATGTTTCATTTCAATGACGCCAATTTCATTGGGAATTTGGTACCCACCTTGGACTTTTTCAATCGCGTTTGTGTAGACTCAAGTGTTACTTTTAGATTAATAAGTATTCTATAATTGTATAAGGTACTCGGCCCTTATGCGAACTTGGACAATAAAGAACGCACCGTATGATGTTGCGAATACAAGCCATAATCTCGGAATCGCTTCGGTCTCCAGAACAACACCTCTTGATACCACGGATCGATCAACCACTCTTTCAACCGCTTATTTTCAACTTGACCGACCGGGCGGTCGTCTGAACACCACGCAGAAGCTGACACCTTGCGCTAGTCTGCTATCTTGCCCCGTTTTACTCCTTTTCCTTCGCTTTTAACTTGAAAAAACCTTAACACAAGATATCAAATCGCTTTACTGTTTTATTTTTATATATAAGTGTGATAAATTGTGTAGAATACATAAGCATATGCATCGGGTGGTCAACCATATCCCTATTATTGCAGAGTAATTTTAAACGTCATGCATTGGGCTTACCTTTCCAGCTTAACCATATTCTTTCCTCTTTGAGACTCGACTTGATTTTTAAAATCAACTTTACCACCATTGAAGCAACGTTTTTTCACTTTCAAGAATTGAAAATCTGCCATCGAAGTAGACATTGTGTATTCAAGGGGTAATTTTATGAAGTAAAAAATATAAAGTTGTCAGTCAAGTCCCTGTCAGAGTGAACTCTCCCATTAAGGCCTGAGAAAAACAAATTTTTTAATAGGATGAACCACACAGATTATCAGGACTGTCTGTTTTCCTCCAACTCTTTTTATGTTATGAGCTTTTAATGGCTTGAAACAACTATATGTTGGACCATATTACCCAATTTCCCCGTAAGATTAAAAACTATAAGACGATTTAAAGATGTATATTATTATTGGTTTAACAATTTAACAGATTAGTAATATAATTTTTACACCGAACAAGATATAAAAACTTAGATACAGACCATTAGATATAAATATTTTTCAAATAATAAGAGCAATGATTAAAGTCAATTTAAATATAAAAAAAACACATGTTATAAATAATAACTGCAAAATAATTAATTATAAGTGCAAGTATTTTGAATGATGTTTACCACCGGTTTTGGACAAACTCAATATTCATTTGTTGAAATATATTTTCCTGCAAGTAAAACAGTTTTTTAATACGATTTACAGTACGATATTACCTTTTATTACCTGGCTACTTTTTTCCTGAACTTAAAATTTAGTTTAATGCAAGCGACAATGTATTTTTTGCAGTGCTGAAATTATCTATGTATTCAAAAAATATCCTCATTAAATGGATGTACCAGTCGAATTAAGTTTTTATAAGAAAGCATACCTTATTCCTTTTGAAAGTTATCTGTTTTTGCTTCTGAAGTCGTCGTGGTTGGCTCTCTACAATCCACAGAGTTTTCTATTCCGGACGTTGCCATTTCTTGTTCCAACTTATCTGTCAAAAACCTTACATTATGTATACAATTTTCCACTATGTCCGTACGTCCAATTTTGCCAAGGGCTTCAGCTAATACATTTCCTGTGGAAATGCCCCCTTGTTTAAGCCATAATTGCAATGTTACCATGCTCTGCTGCATGCAATCATCACTATTGTACTCAGCTTTGACAAGCTCGATATCGGTCTCGGGAACACCCAATTCTTTAGCTAGCTCAGGCCAGTCACCACCTATTTGGCTACACACATCGATTAATGTTATATCAGCACTTTGAATCATTTCGCTGAATTTCTTATAAACTCCGGTAAAATCAATTTTTTTATATCTTTCTCAGACGGCGCTGTTTCTGTTCTTTTTTCTGAACTTAGCAGATCATTATAGTTCATGTTACCACTCAAACTCACACTCTCATTTATGTTTTCCAGATGCTTTGTCATAGTTTTTAAATCTACTGACACATTCAAAGTACAAAGAGGATTCTGTGGCAATTCATCAGGCCCAGCCTTTGGATTGGTCATAAAACAGATACGACCTTGTGGAAATTCTGGATCTTTAATATGAGCAATAAATGAGAGACGATTTTCGCAAAATGCTTGGAATTTGGTACTAAGTTGCTCACCGGTTTTTAAAACAGGGACGATACTACCAGCAAATTCTAGGTATATATTTTGATCCTGCAATACTTCAATATCCCTACTTTTTGCAACCTCTGTAAAGTATTCCTGTTGTTCAAGCGTCTTGTCCTCTTTATCATCTGTCATACAAAACACTGAAAATTTTGCTTCTATTTTAGAGAGACGTTTAGCGAAGACAACAAACTTTACAAGAAAAGGAACTTTGGTCAAATGACTGTAAAGTTCGCTTGCCATTCGTCCGGCGTCTACAACATTGCGACAATCCATCAGCCAAAAACGGGCTGAAACTGT'..b'TTGGATTCGCTTTGTTGCGTAAAAGGAGATTAATAATCATAATGTGGCCTTGTTGAGCAGCTTGATGAAGTGGTGTGTAGCCGACATTGGTTGACATTTCAATGTCAGCATCGTTCTCAAGCAAAAATTTCACAAGATCAAGGTGACCGTTATGCGCAGCAATGTGAAGTGGGGAATAACCATTTTTAGTTCGCTCTGATATCTTAGCGCCATGTTCCAGCAAAATGCGGCATACATGAACATGGCCCCCCTGTGCAGCCAAATGTAATGGTGTCAGGCCGCTTTTGGCAGCGGTACTTGTAGCGCCATATTCTAGGAGTAGTTCTACCATATCAACGTGTCCTTCTTGGGCCGCCAAATGTAAGGGAGAAAAGCCGCTTTTGCTTATAACCACAACGTCTGCACCATGTTGCAGTAACTGCAGTGCAATTTCCAGATTATTTTGCTTCGCAGCGATGTGAAGAGCACTTTGACCGTTTCGCGCACACAGATTTGGTAAAGCGCCGTTTTTTAATAGTATCTCTACCACATCATGATGGTCATAGTGCGTTGCAACGTGCAATGAGGTCACATCATTTTTTCCCTGAAAATTAACCGCGCATCCTCTTTCTATTAGTAATGTGACTATTTTCGCCTTTCCGTATTTGCTAGCTAAATGCAATGGAGTAAACCCCTTTTTGGTTATAGCGTCTAGTTGAGCACCGTTATCCAATAACACTTGAACTACCTCTTCTTGCCCTTCTTTTGCAGCAATGTGCAAGGCCGAATACATGTCGTTAGTTTTAGCATTAATTTCCGCACCATGCTGTAGTAACAACATAATTATATTAATATTTCCTAATCGAGAAGCTACATGTAATGGCGTTTGGCCTTCACGGGCAATAGCATCCACTCTTGCGCTGCGGAGCAAAATTCGAATTATATCCGTCTAAAATAAATAAAGACAATTACATAGAAAAGTAAAAAGAATATTGGGTTCCATCAGAATATACCTGATTAGCACGAGTGGCCAAATGAAGTGGTGTTTCTCCTCTTATTGTTGGTATATCTGGTCCAGCCTCTTGTTGTAGTAAGTATACTACAATATTCATACATCCTATAAAGTTTTAATTGTTTTTCTTTTAAGTATACTTATTTAAAGTTATTTAAATATATTTTGAGCTTTTTACATCAAATTTAATGAGTATACTTATATGCAGATTTAATAAAGGAGTCGTTACCGTCTCTAGTCTATCTGGACATATCCGTAATAGTATCTCAGTTGTAAAATTAAAATATAAACAAACCGGGTCAGGCTACAGTATTATATATCTCCCATATGATAAACGATAATCAACAGAAGGAGCTATTCGAGTCCATCGATACCATTAGATAGCCGTTAGCGCTAATAGGAGCGAGGGAAAACAACAAAACGTATTTTATAAGGTTACGTTATTGTTATACCCTTGCAGAGAATATAACGATTTAATTCAGAAGTTTGCAACGTTTCCGACCCCAAAAAGTATATATATTCTTGATTAGCGTCACTGGACGAGTTGATCTCGCCATGTCCGTCCGTTTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGGTGAAACTCTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGTATCGGACAACTATCGGGGAAAAAATTTTTATTTATTTATTATTTATTTATTTATTTTTATTTTTTATCTTTGGTGTTTTTTTAACATATACCTTTCTAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTGATCAAAATCTGACTATTATATCATGTAGTGGTAAAATATTATGGAAAAAATATATCTTCGGTGTTTTTTAATATATAACCTGGTTGGTTTTAAATTTCGAATTAAATAGTCGGAAAACATGAAATAAAAATTATATTTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTTTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTCTGAATTTCGAATCAAATTTTATCAAAATCGCACTATTTTATCAAAATCTCACGCTTTTGGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAACTTTTTATATTTTTAAGAATTTCAAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTGCACTAACAGATAGATGTCAAAAAAAGTGTCTAAAAAAAGGAATGAAACATTTTTTTTTTAATATTACTGAAGTCAGCAAGAATCTAAAGTTACTAAAATTGATTATTTTTTATAACTGCAAAGGTATACAAACCTCGGCTTGCCGAACTTAACTTCCATTCTTGTTTTTTTTTATAAAATTGTTACATTTTTATATGCTGAAAAATACTTTGTTTGAACCTTGCATTTTTTATTACAACCAGAGCTAGCCTGTCAGTCTCAGCTTAAAACAGGAAAAATTATAAATCGCAGTAGTCTCAGTTAAAAAAAATTTCTTTTGTGTCAAATCACCTTGGCTTCAGTAAGGTGAACCATGTTTATTATCTGGAATTACAAAGTTTGAAAACGAAAATTCCTTTCAAGTTCTGAAGAATTCGCATTTTGTACTACTTAGAACTGAACAGGAATTAAAGTGAAAAATATAAATACGTTTTAAGATTGTCTTATCGATTATATTTTCCATTCAAGGGTCCTAATTCAAAAATGGACCTCATTGGGTGCACTATTTAGGAGCTCTGGTGTTGTAACTTCAATACAAAATAAAAATTTAAAAAAAATACAACAAAATTTCTATCTGTAAATTGGTGAAAGCGGTTCGTAAATTTGAAAAAGTTACAATTTTGTCTTTAAATATACTTACCCATAAAACTAGCTACATGTAAGGGTGTCAGTCCAGATTCTGTGGTTGCACCAATGTTAGCTCCGTATTTAATAAGTAGTTCAACTACCTTAATGCGATTTTTTTTGCAAGCGATATGAAGCGGGGTGAAACCATTAAGTGCTCGGGCATTCGGATTTGCATTGTAATCGAGCAACAGTTTAGCTACTTTAACATGACCGCAGTGAGCAGCCACATGAAGTGCGGTCAAATAATCGATGGTAACTTCGTCTACAGGAGCCTTGTTATTCAATAATAATCGCGCTGCCTCATCGTGCTCTCCTTGAGCAGACATATGCAACGCGGACAGGCCATTTTTAGTCTTTGTTAGTATGGGAGCGTTTTGACGCAACAAGTGCTCAATGACCTCAACATGACCAGAACGTGAGGCACAGTGGAGTGGAGTCAGGCCATCACGAGTCGCGGCATCTATCTTTGCTCCTCGAGATAATAACAAACTACACACTGATAGTTTTCCCCATTTACATGCCACGTGTAGAGGAGATATATTATGCTTGGCAACATAGTTAACATCTGCATCGTTATTTAAAAGTAAAGTGGCGATTTCAACATTTCCATAATGCGCTGCTATATGCAACGGTGTAAAACCAGATTTGGAAACAATGTCGGCATTTTGATCGTGTTGGAGTAAAAGTTTGGCTGCGTTTACATCGTTCTTTTTTGCAGCGATGTGAAGTGCTGGGAGGCGAACCTTACCGCGAACATCAGTTTCAAGCAAGACAGCTACTATTTTTTCGTGACCCTGCTGCATAGCTACCGCAAGTGGTGTAAAACCATCTTCTGTAGATAATGTTGGGTTCGCTCCATTTGCCAATAATATTCGACAACAGTTATCGTGGTTTTCTTGGGCTGCCATATAAAGAGGTGTGAATCCATTAAGGGACTGAACGTTCACATTGGCATTGGCCTTAATAAGCTGATTGATAACCTCTTGCTGGCCTGCCAAAGATGCAATGTGCAACGCTGTGTTTCCCTTTTTTGTAGCATTATCAACCGCTATGCCTCTCCTTAGCAACTCACAGCATATATCCACAAATCCATCCTTAGCAGCCAAATGAAGTGCATTTAAACCGTTCTAAAATGACACAAGTTTTCAGAAATTTATAATTTTACCAAGCAAACATATTTTCTTTATATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCTAATCTATTAATCTTATTAATGAAGTTATTTACTAACCTATTTTTTATGAGTTTTAGTAACATAAGCAAAATAACATAATAAATTTAAAAAAAAAATTAGTATTTTTGAGAAAGAAGTTCAAAATATAAGTGTATCCTTCAAATGTTAGAACTTTGTAAAGATCGCTAACAATTTGAAAGCGCAAACACAGGATTCAAAGCTTAAAATATTTTGATTTTTCTGCGGAAATTTTTTTATAGGTTTTTTTAACAGTATTTTGTTCTGAGGCGAAAAAAGAAAAATAACCTAGGACTTTGAAGACTTTCAGTGAATATAACCGTTACTCATAAGTGAAAATTGATATAACCACGACCGTCATTCCCTTTGTCTGTCCGTCCGTATGAACGCTAAAATCTCAAAAACTATAAAAAGCTAGAAAGCTTAGATTTGGCATGTAAATTCTTGAGGCTGTCACGACTACTCTAAACGCACAGTCGCATATAATGCTGCAACCTCTCTTGCGGCTAGCCATATACACTAAACAAAATTGTTGAAATCGGACCATACTCTAAAAAGTTAAAACCAAATAAAATGTGAAGTCTTGTTTATTGTCCCTTTGCTGCTGGTATATTTCTCGTTGAAAAGCTAGTATTTTATGTTCGACAGTATAATTTGCTTTTTATTTCTTAAAAATGGTTTAATAGCTATAGAAAGGCTAAAAAATATTCGAATACACGGCGTGGCAGCCCGTCTTTGGCGCCCCTCCTCCTATTTCCCCAATCAACTCAAAACGCAATCCACGGAGTGGTCTCCTGACTTTTCGGCATAGCTAAAAGTCACACGGTGCCAAATCAGGCGTATACGTTCGTTGCAAAACGATATGCACTCACCACTAAGAAAATTTGCCATTAATCACTTGGAAACTTTTCATGAATATTATTTTTTAAACAAATCACCCTTATGTGTTAGTTTATATACTTTTTATTTTGTTTGCTTTCTTGTTTTTTATTTATAATTGTGCAAACAATAGTCTACTTTTTATAAAGCTAATAAACAGCCAATATGGTCATCGGCGCTGTGGAACGCGATGTACGGTAACATCTGGTTAAGGCGAGGAGGTTTGCGTTGAGGTTTCCTGCAACGCCGCTGTTAGCGAGACTTGTTGAGGGCTACAAAACAGCGGCTCCACTTGGTAAAGCACAAAACTACTCAAGAATTGGTCGGAATAATGAAATAAACAAGGTCTTTGTGACATAGGGATAATCGAATTCCTTCGACCACCTTTTGATAGATGCAAGCACACCCCTGGCTTTATTTACCGTGGTAGTAATGTAATCAGAAAATTTAAGTTTAGGATCCAAACAGACTCCAAGGTCACTCAAAGTATAAGTTAAATAGTGAGGGCTCACACAATAAAAGCTCGTTAGTTTACACTTAAAACCATTTAAATTTAATTCATTATTCATGCGCCATCTTTGAAATGCATTGAGATCGGATTGTAAAGCTAAACTTTGTGCGGGATCATTAAATTGCAGGCACAACTTAACGTCATCTGCGTACATAAGTACACGTGATTTCATTAGGACTAGAGGAAGGCAATTTATAAATAATGTAAGCAGGAGCGGACCAAGATGACTTCCTTGATGTACACCGGACTTAACTCGGATTAGGGATGATAAATTGTTTTTAAAAATGACCCCTTGAGTCTTGCCATTCAAATAACTTAAGATCCGCCTAAGAAAATCATAAGGAAACCCTAAAAGGTCCCATTTCCGAACTAAAATCGGACGGTTTACAGAATCAAACACCTTACTGAAATCAGTGTAAACCACATAAGTCTGACGATTTTCTAAAAACATTTAACACAAATGAAAAAGAAAAAAGTTTGTGCAATGGTCTACACAAAGTCTCAGCGCAATACTTGAGCACACATCCATACTCCGTCAGGACCAGGAGAGTAGACTTGTTTGACCCTTCGCAAATCTAAAAGAAGTGAGCTTTCACTTATAACAGGACAGAAAATAAAGTTTGATGTAGGCATGTCATATGGGTAAGACTGATCTGTAATGTAAAGTAAAAAACGTATATCTTTAGTGTTGACATATTAACTTATACTCTTGGAAATAACATTGTTTTAATATTTCAGAGTTTCAAATGAAATTAAAAACACAAGGAAGAACGCTATAGTTGAGTGTCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTCATGGAGCAAAAGTAAAGCGCCACCTACCCGCTATTTCAGTATATGCTATGTGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTGGCCGTTAGTGGGCGGTATCAATTGTTATTGATGAGACAAATACATTTTAGGTTAAAATGTCTTTCTAGCATAAAAACTGTAGCCGCTAAAGTTTTTTAGAGAGGGCGGCAAGACGAATCTAGAATACCCTTTTGTCTTCGAGTAACAGGTATAAAAAGAGGGACGACTATATCCTATAGCTCCCCTGTAAATAGTCCAACAAATACATTTTACTTCTACTTTTGGTAATCTTATTCTTTTAATACTTCAGACTTTCGAATATAATTATTAAAAAATCGGACACATATATATTTTTTTAAATTAATACAAGCACAGTTAGTTATATTCCTTTCCCGTTATATAATTTGTGACTTTTATTTGTAAAAATATTATTCATAACAATATATTAATTTGATTTTACGTTCAATACTTACCGCATTGCAACTGTTTATATTTGATATTTCACCACTTTCAAGATAATCAATTAACTTTTTAATGTCCCCGCTGCGTGCAGCACGTAAGAATGATATTGTTGCATCATTCTACAAAAAAATCAAAATATTTTGATATTAATTAGTAAGGTGCCACACAAATAGCTGTACACGACATTATATAATTATATAAAATACAATTTTAGCTGAATTTTTATTCGTACTTTATATATTTAAGACTCTTAAATGATTATCGTTAATTTTCACTTTTTATCTAGTATAAAGTTGAATTTATAGTTGTCTACGGTTGGTTGGTTGTGGGTTAGTTATTTTTTAACTTTAATAATATTTCTTTCCGAAACTGTATAGCACTTCTTATAGTGTCTCTAAACTTTTTGGCTAATAGTTCCAAAGCTTAACAGCCCATGCAAAGAAGTGATTTTCGCTCGAGGAGTAGTGGTTTCTTGTTAGTATTAGCTCTGGGTGACTGTGCAAAGTTGAGGAACGAAAACAAGTGATTCGGTTCCTTGATCGTGAATATTTTGTAGAGGAGAATAAGTGTCCTAAATTCGACCAATTTAGCAAAGTCTAATCAAAAGAATTGTTCGGCATGACTTGAAATTGAATAATGTAGTTTAATATTGAAAGAAAGTCTTGCTATAATGTTTTATTCTATGGTCAATCTATTCCTATTTTATGAGTAACAATTTCCAAATATTACAACGCCGTATAATAAAGAAGGGATTATTTAACTATGGGTTGGTAAAATATTCTGGATCAGTTTTATTAGCCGTAGTGGACAATACGTTTTCTCACCTGTATAAACAATGTAGTTTGATCATGAAAGGGTACTGTTAAACACAATTCCAAGGTTATTTGCTTAAGAAATAATCAATAAATAATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCCGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCAGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTACCGTGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTTTCTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCGTACAGCTACCATAGGAACTATCGGTTAAAAAATTAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAATTTTCTAAGCTTGGAAATAAAATTTTTAAATTATTTCTGAATTTCGAATTA'..b'GAAATGGTTGCTGAAGGATAGTTAATGTGGCTAATAAAATTGTCAGTTTGCTTGGGTAAAATTTAATTAATAAAAAATAATGTACCCCCTTTTGGAAAAGAAAGGAAATTAGAAAGGGGTATTCGGATTTGAGACGATTGTGAGAAATCTCTTAAAATCTATTAATTTGAACTCGAAATTAAAAAAAAAACATTAGTTGGCATTAGTATTTTGGCGAAACAAAAGTATATAATATACTCATAATTTTAACTTGCTTCTTCTAAATTTTGGCATCAAAAGGCAATTTAAATGCCGTTATAATGACACAAAAAATTAAAATAATTACAAATTCCGAAATGTTATGAATATTTTTTTTTTCGTCTTGGAACTTAAATCTATCGACTCAAAATGTTTAAAAAAAACTTTAAAAATGTATTTTGCTTATAATTTTCGTTTGCTTATGATTTCTTAAAATATTTATGACGACTAGTGTATATAGTCGAATATAAGAAACGTATTACTCTGTTGTCCAGTTTTAAAACAAAATAAAAAAATAAACTTCAAGCGATTGTTAATATTCCCTTGCAGATTATAGCCTGTTCGCACTTACGGGGCTTCCACTTAGCTACGTGCTAAAAACAGACAGTGCAAATCACTACAGATAATTTCAGTAAATAAATTGCATACGTCATTTTTTCAGTATTTTTTCGAATTTTTTACACGCGCAATTGGTGCTTACTCTCCTAAACAAGTTTGTATGTAGCAAATAAATTGCATACGTGATTTTTTTCTGTATTTTTATTTTTAATTTTGTACTCGCGCAATTTGCTCCTTCCTCTCCTAAACAAGTTTGTAAGGGATTTGAGGCGCGTTAAACGGAAAATAGATGAAAACGCGAGGCGTTCATGGTATCGGAGTTCAATAAAGCTAACAAAATAACAGAAAATATTATGCGGGCCTGCAGCATAAGAGCAACTGAGATAATATCTAAGCGTCCTTTTACACCCTTTATTTCTGTGCACGGCCCTAATTTGAACCGTACCTATGTACCATATTGTTAACAACAAATACCGGCACCACATTTTAAGATTCCATTATTTGGTCATAACTTTTTTATGAATGGTCCAAATTGAGTAATTTTTTATATAAAAAAAAAAAACAAATAAAGGACAAAACATTTATTATAAGCTTTTTATTTTTTTCTATTGTACCCGTAACTGGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTTGCCGGAAAGAATGTAACAGGTAGAATGAAGCTTGAGCCCATTAAGTATGTATGTATGTATATTGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTTCAAAACTTTGTTTTATCAGGGTGCTCCAGTCCAACGCATATCAGACAATTGGATTTTTAAGCGTATAAAGTCCATAATATTTCCAACTTTAAATCAATGTATACGTTGTATGTTGTATTTTCTTGAACCGATTCTCCTCAAGCAAAGGGTCATATTTTATTCTGTGAAAAGTAACAGTAAACAGGTTCCACCTGCGTCTCCGACCCTGAAATACCTCTTAATAAGGTAAACGGTCGTGACGATCGCACCGCCAAATTATTTATTTACAAAAGTTCTTATGTAAAATGTTGTTAGGATCGATGATTGTATATTCAAACAAATAAATACATAGCCTTTCTAACGTTTTACATTCTGTCCGCATAGGTAAAATGTCATACAACAGTTAAACCTGTATTAGTAAAGTCTACGCATAAAAAATTATAAATTGATGTAAATACATACATATGTCCAATGTGCATATGCTGTTGTACATACTAATAATTACAATAAATATTAAACATCTTAAATTGATGTATACATGCAAATATATATGTACACAAATATGTACATACAATTAAATAAGTATAAAAAGTATATTATTCAGTGCTACACATACCAACTGCACATACATATGAACGTACGATTCATATGAAGATACACACATATATACGTAATATACAAATATTCATATGTTCGTAAGCATTAATTGATGAAGATTGTCACTTATTGTATTCGTTAACGTCTTCGCGAAAGTTTATAAGTTTGTCAAATTTATAAATACATACATACATTATTGTTTTTGTAGCTAAAATATAAATAAGAGTCAGTTCCTTTTTTGCGTTATTTATTTATATTTAAATATGGATATATATATTTTTTTTATACATATTTGTGTATAATGTATAATGTATATGTACAAGAATACATATGTACAATTTTTTTTTTGGAAAGAGTTGGGCAATTACAAGCAATTGTCGAGGGCACCATAGAAATATAAACACATAAAACAATAAAGTAAAACCTGTACGACAAGTCTGCTTTAAGCGTTGCGTGTTTCTGACTCTTATCATCTGTTTTTATCTACTGCTGTAGCCTTTTCGATTAGGCGTTTCAGTAACAGCTCGTGGCTACAACTTTTTCATTAAAGTTGTCTGAATCTTTTTTGTTAAAGAGCCTCATCTAATTGAGCTAACGCACTTAGATTCAGGGCATTGTTAGTTTCAACAGAATTCCAAATATTTTATTTTTAAATTTGTTAAATATTAAAAATAATCATTAATAAAAATATAATCGGGTCCATTGCAGTGAAGTAAATTATTCAAATTTATATTTTTATTTATACTTAATATATTTTATTTAAACATGATTTGTATACATAGGAAATTAAAATACTTTTTTTTTTTAATTTTCGGGTTGGTAGAACAGCAAACTTTACAACAGAATTATGATTAAACACAAAGAGTCAAGAGGTATGCATTTAATCAGTGACTGTAAAATACTAAAAAGACGCCAATTTACTATTACCAAATTATTTAGTGCTTAGTATAGTGAGCTATTCATTTTTTTAAGATTCAAAACCATGTACTGGACTATTAAATCAAGATCAGGAGGATCAAATGAACGTAAGCGGATATCGTCGTTCCCATATACGAACTGCAATTTGCTGGGCCTGTATTATTTTAACTGGTGGCCTACTACGCCTCGTCTTACATTGGTGGCGTCATTTGTATCTATATGCCACATGCTCTCGATGTCCCTTGGAGGAGGCAGAACAAGTTTTGGTAACCGAGGATTATCAAGGAAAGCACAAGGTGTACCACGTAAAGCAAATTCGAGTACTTACTGCGAACCACTTTGAGTAAGTAAATGTTAATTCAAGTAACCTAAAATGTTGCTAAACTAAAACGCATTATCATTTATTAGGGCCCTATTGAAAAAGGAACGGCCGGACGCAGAACTCATGAATGTAGGGAGTGATGCAGAACACGCCGTGCAACTATCGGTTCATTTCACCTCAGCGCAATTCAAAAGTACGTAATTTATATAATTAAACGTCTATAAATATATATGTATTAACATCCTTGTTTTGATTGTAATTTTTTAGGATGTTCAGCCATACGAATTTTCCGCTGCAAGCAATTGGTCTATGCATGGAACAACAATCTGAATTGTTTCCAAAGGATAAATGGACTCGATCTTAACATTCCGTGTTCATATTATCACCAACAACGTGGATTAACTGCTAGAGAGCAGATTTCGAGGCGAATTGTTTTTGGGGACAATGAGATAACTGTTCCATTGCGAGATATCAAAACATTGCTTTTCCTAGAAGTTCTTAATCCTTTTTACGTTTTTCAAATTTTCTCAGTCATACTATGGTTTACATATGATTACTATTATTATGCTTGCGTTATACTTTTGATGTCAATATTTGGTATAACGATGTCTATTTTGCAAACAAAAAAGGCAAGTATAGCAACTTACAAATTCTTAAAATAATATTTTGTTTACATTAATTTTCAGAATCAAGACGTACTTCAAAAAACTGTATATAACACTGGTAATGCTTGGGTAGTTGATCCTAGGGGTCTTTCAAAGGAGTTTCCAACGCGTGCCCTGGTACCCGGAGACATAATCGAAATTCCTTCTTCAGGGTGTACTATGCAGTGCGATGCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/114/2f1/7e/scaffold_7-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTATTACTATCAGGAAATTGCATTTTAGATGAGTCTATGCTTACCGGCGAAAGTGTGCCAGTCACGAAAACTCCTTTACCATCAAAGCGTGACATGATATTTGATAAAACCGAACATGCCAGGCATACACTTTTTTGTGGGACAAAGGTCATTCAGACTCGCTATATTGGATCAAAAAAAGTATTGGCGTTCGTAATAAACACTGGAAACATAACAGCTAAGGGAGAACTAATACGATCTATTCTTTATCCCCCACCTGTTGACTACAAATTTGAGCAAGATTCCTATAAATTTATTCAGTTCCTGGCAGTAATTGCTTGTGTCGGATTTATTTATACGCTTGTAACAAAAGTAAGTTGGCACTATGATCTATGAATATAAATTAAATATTTAAAATAAATAAATAAAAATTATATATACAGATAATGCGTGGCACGGATCCCGTAAAAATAGCAGTAGAATCTCTGGACCTTATTACTATCGTAGTCCCACCAGCACTGCCAGCTGCAATGACCGTCGGTCGTTTCTATGCACAAAAGCGGTTAAAGGCTAGTGAAATATTTTGCATTTCCCCTCGGTCCATAAATGTAGCCGGAGGCATAAATTGCTGCTGTTTTGACAAGGTTCGTATACATGTATAAAATTATATTTATGAAAATGGGACATGCCAAAATAACGACAAAAATATTTACACGAAGAATTGAAAATCTACAGTAATGGTCCGATTGTTTCGAGTGATACATCAAACGAAAGGGATTGCAAAAACTAAAAGAATTGCATAGCAAGACTTTAATAAAATCAATTGGTGTGGGAGAAAAGTGGTGAAAGAGTTAAAATTTAAGAAATTTGATCCGTTGGGGATGGTGGTATGCCGCGGATGCTAGACGATGTTTAAAGGTTTAATATAAGAAACATTAGTTTCTTTCTAGTTTGGAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGGCTATGAATAGCTACGTTTTGTGTACCCGTAGCTTCTGAAGTACTGAAGCTACAAGCTTGTTCTATATGTAACTAGAAAGATATTTTAAAATACTTTGTTCGATTTCCTTAAATGATTTTTCGAAATACTTAGTTTATTGATTATGACCAAAAGTTTTTTTGTTCTGATATTTTTTAAAATTGTTTTCTTATTTCTCAAAAGCCGCTCTAACGATTTCGCGCTAAGCCTTAAAGGCATTTCCTCACGTTTTACATGCAACACATTGTTGTAAAAGCCCCGTTTTAAAATTTTGTTTTCTACAAAAATGGTTGCATGTACTATTTTAGAACCTGTAACACTGCATGAGCGTTAAACATTTTTTTTTACGTACCAACACAGATAAGGGTGTATTTTCCACTTAAAAACTTAAATACAATTTAATAATAATAATTTTCAAAAATACTTTTCGTTTTTCGTGCTCTTATTTTCGGAAAGTAAAGTTTGGTCGAAAGGTTTAGTTTTACCATTTTTTGACAAAACAAAAAATGTTACTTAAAAATATATTAAGAAGTTATATTTAAGGTAGGGTCGGAAGATCTTTAAATATAAATATAAGCACCAATGGTTACTGTAATGGTGGCTAATTAATGTCATTGATCCAATGAACTAAAAAAATGAAAATGAAAATCAAGATTTAAGGTTTTGGGCTTGGTTGACAATGTCAATGACATTCACTGGAAATGTTCTTATTTATTTCCGTTCATAGTTTGTAAAAAATTTTTACAAGAAAATTTTTAGCCAACTATCAAATAAAAATTGTGAATCTCTCAAATTATTCAAGCCGCAAAAAAAGCAATATACTGTAGTATTCTGTTAGGCCTGGACGTCCAAAATAAGGAAATTTTATCGGGGTGTTTTATTTTATTGGTAAATATACTACGAGAACAGTTGTACCTATATTCATAAGCAATTTTTTAATTTTCATTAAAAAAAGTTTAAAAAAAACATTTTTTACTGGTACAAAAAAAATTGTTCTAAAAGAAAAGTTAAGCTACCACAAAATGTTTTATTTAATTGTTATAGGTCAGAGCTTTCGATATATATCTGGTTGTGTAAGGTGTCTGAACGTTACTAGATCAGAATCACACGAACGTCTCCAAAATAACAGTTGCAACTACTGTCAAAACAGCTTACATTTAGTAGGTGAGCAATATTTGTACATGGAATTACAAAGTGTCTTTCATGATTTTTAAGAAATCAAAATGTGCTTATAATGTGGAAAAATGCTTACATAGCAGGGCCAAGAAGAGCTATACCAGCTTACTAAAATACATTTTGTTTAGTGTTTCAGTGTATAAATATCAATTACCACTGTTTTTTACTGTTGTTTATGAAAGCTCTTACTTCTTTCACGACTTGTTTAAAATGTTAATCTTGCGGATAACTATATGTCTTACAAAAATTATCCTAAGTAAACAAACAACTTGTATCTTTCTGCAGATTGCATAGCCATTTTGACCCGCATGACGCATAAACGCAATAAACCACGAAACCACACAATTTCTTAAATGACACTAATGAAATATATTTTCATTGGTATAGTTATACCCTATAGTGTATTTATGTTCTTAATCAGCTTGACTAGCCTAGCCGAGTCGACCTAGCCATGTCCGTATGACCGCTGTGATTTTGGAAACTTAAGTAGCTACATGCAGATTCTAGATATTCCTGCTCAGGAAAAGTTTGTTTCAGTAAAGATTCATGTCCACTCCAAATTGACCCGACAAAAGTTTTCCACGGACTTTGAGAGTAAGAAGAATATGTATTTCCAGTAGCATTACTTTTGGGAGATCTCATTAAATTAAACTACAATATTTATGTCAACAAATACCGAAATTAAATACCCATACCCAACAAATGAAAAACCCAAAGTATTAGGAACTGTTGCTAAAGATCTTATTAATTCTTGACTGTTTTAGCTTTTTACAAATTTTTGCTCTTGGAACTTTTAATAGTTTTTTATTTTTGTATTTGCTTAAGCTTTTTGTTTAAAATAATCAAGCGAACGAATAAAATATTGTAAATACATTGTCAGCATAATAAAAAAATTCACTATATTTCTTTAAAAATTTGTACGTGACCGTACACCCTATTCGTCTCCTTATTCTACACTCCCCCCACTCATTTTATTATACCCGTTTCTCGTTGAGTAAAAGAGTATAACTGTGGTCGGCAGTCTTCGTATTGACGAAGCCCACCACGAGAGTGTGCAAGGGGTCGACCACTATATATCTGATGTAATGGTCCGATCGCAACGAATGACACACAAAATATACTGTCAGTCATACTATTCGGATTATGCTTGCTTCATCAACTCCCATTTTTCTTCGTAAATCCATTAGGCGTGGAGCTGGTATAGAAAAGAAAGAAGGTTAGAAAATCAAAAGTCGTATTTTTTAATTATAATTAAAACATACCCATATTTCTGCATTGTTTTTATTCTTATAACGTTTTAAATTTTTTTTTAGCAGTTATCACTAAATTTGATCTTATTCAAAATCTTTATAATACTATAAATAAAATATCGTGTTTAATATGAAATCATATTAAATATAATTTGAAACGTTTCATCTTTTTTATGTCAGATGTGGCAGTAACTTAATCATCTACATAAAGAACTAAATATATTTTTTTATTCGTCACTCTTGATAAGAACATAAATACATTTTTCTTCTGGTAAATTTACAAGTCCATACTCTTTTAAAGCTTGTTTAAGTACCTCAAGCCAGCATTTTACTGCTTTTTTGTGTATTTTCATACACTATTAGCACTAGTTAATACACCTTTTGGCACTTTCATATAGATTTATTCTTTTAATTTTCCATTTAGAAAACACGTTTAATAGAAATGGATAATATGAAATGAAAACTTGCTATTCTAGCCATGGGGGCAAATGTTTTTAAAACGGAAACTTTCTATTAGGACCCTGAAAGCAAATGTTTCTTAATAATCTATAAGATATTTCTGCGTAAGAATAAAATCTGCT'..b'GATCAAACTCTGTTTCGCCTTGAGTCGACGAATTCATTAGTTAACGAATCGAGTTCCAGTTATGCAGAAAGTATTCTGCCGACGAGCGATAGTTTGGCCAGTGTAAAGACCACAGACACATGGACCCATAATGAGCCAACAGATGTAGATGCTGAGCTAGGAATAAACCGCACTCAGGACGAAAGCTGGCGCCAACACTACATATTCGCAATGGATGGCGGAACTTGGCAAATTATAAAAGATCACTTTCCAGATGAAATGGCCATTCTTTTAACACGGGGATCGATTTACGCCCGAATGTCACCCGATCAGAAACAGGCACTAGTTATAGAACTTCAAAATTTGGACTACTGTGTTGCCATGTGCGGTGATGGTGCCAACGATTGCGGTGCGCTAAAGGTGGCTCATGCTGGTATTTCGCTAAGTGAGACCGAAGCATCCATTGCGTCGCCCTTTACTTCACGTAATCCCACGATTTCGGCTGTTTTAAAAGTTATTAAGGAAGGACGTGCCGCATTAGTCACATCCTTTGGAATTTTTAAATATATGGCAGCATATTCATTGGTTCAGTTTATATCTGTTATGGTTCTTTATTCTATCGACTCGAATTTGACAGACAAGCAGTATCTTTACGTAGACCTTGGACTTATATCAATTTTTGCCTTCTTTTTTGGTAAAACTGGATCATTTGATGGAAATTTGGTCGAACAAGTGCCTCTCAGTTCATTGATATCTTCTACTCCATTAGCATCCCTTTTACTTCATCTCACTGTTGTAACTGGATTTCAAGTAATTGGTAAGGATATTAATAGTACTAGTTTACAAAATAAAATTCATAAACCCGGTTGATAGTAAATTTGGCTGTTCAATTTGTCATTTAAGCGCTTAAAAATATTTAAAAAAATGAATGTTTTCGAAAAAATTTACAGGTAATTTTTGTGATTCTGTGGGTCAATGCTAACCAAATTTGTTATCAATCGTATGGGAGCATATTGGGTGTACATTTTTTAAATTTATTATTACTTTTACTTTTATCCTATGATTCAAGGTTGGATTCATCTACACCAAGAGCCGTGGTTTAAACCGTTCCAACCTGCAGATGAGGACCATTTGGGTTGTTATGAAAACTACACCATGTTTTGCATATCTAGTTTTCAGTACATAATACTTGCTTTTGTTTTTTCCAAGGGTGCGCCATATCGAAAGCCACTGTGGTCAAATTTTCCACTATGCTTAGCATTTATTGTTAACTTATGCATTATTGTTTATTTGGTCATTTACCCAAGCGACTGGGTAGCAAACTTTTTTCAGCTCATTGTACCTCCTGTCATGAGTTTTCGATACATGATGCTTGTTTACGGAGCAGCAGCATTTAGTTGCCATATATTTGTCGAGTCTTTTTTGGTGGAATATATAGTGTTCAAAAAATACCAAGTTAAGCGGGATAAAAACTGGGTCACAGCAAAGCAAAAATACTTGCGTCTGGAATATGATATTTCCACAATAAAAAATTGGCCACCAATAACTGAAGTCTATGAACCTAATAATTGTTCCGACTGGGAAGTAGATCAGCCCACGTATGTCAGTTTGCATGCTGAACAAAATCATGACACGCAGTTTGGAAAATTTCCTGGATTTAATTAGTAAATTAATTTAAAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAAATATGTATAATTCTGGCGAGATATCTTGTATATTTTAAAATAACTAATGGCTTAAATCTAAGAACTAGCATAATAACATTATATTGAATTTAGTCAAAATTGTTTAGTTCCTACTTAGATTATCCACATAGTTTTGGTAAATTACTTATATAAAAGATAACTTTATATAAACAGGTCAAAGCAATTTTTTTGTATTATAGTAGGTGTATAACGACGGTCATATATATTTGCTTATAATTAAGCGTTTAATATGTTATAAATTTCATTTTGGCTGTACATTGTACTTCATTTAAGTTTATTTATTTATTTTTAACTATTCACTTATCTTTACTATATGTATTAGAGTACGCTGTAATTAAAAAAAATGTAAATCTTAATATTTTTGCCTATCATAAAAAATAAAAATTAGCAAAAAGGTGATTATGCAATCGACGGAAAGGGGCGCCACGGACATTGTATATACAGATTTTAGTAAGGCCTTTGACTTCGTTAACCAGTCTCCTTTTGTATTTAAATTAGATTAGCTTGGGTTTCCTGGTAATCTATTATCTTGGATTTCATGTTACTTGGGTGGCAGGACTCAGGGTTATATTGAAGAATACTGTTTCAAAATTGATCTACGTGCCATCTGGAGTGCATCAGGGTAGTCATTTGGGCCCTTTGCTGTTTACTTTGTTTTTTAACGATCTTCCCTCAATCATAACACATTTTTGTGTACTAATGTGTGCTGATGATGTTAAGCTGATGATAAATATAATGATATAGCGTCAGATATTGATTGCTTTTATGGAAGATGTGAGTACAACCTTTTAAATTTGAACTGCCTTAAATGCAACGTTATGGCTTTTTATAGGGGTACTCCTACGTTTATTAGTTACTTTCTTAAAAATAAGCCACATTCACCGTATATATTCAGTTAACGATTTAGGTGTTCTTCTGAACCATAAACTTAAATTTGACGACCACATTATGTCTACTGTTAACAAAGCCATGAGTGTTCTTGGGTTTATAAACCGTTTGTCAAAAGAATTTTATGACCCTTTTATGATCAAATTATTATTTACCTCCCTTGTCCGTCCTATTTTGGAACATAGTTCGTCGGTTTGAAGTCCACAATAACAAGTGCACATCGACCGTATTGAGTCGGTACAAAAAAATTCTTTTATTTGCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCAAAACGTAAGGCTACCTTCCTACCAGAGCAGAATACAATTGCTTAATTTGCCTACAGTTGTAAATTGTAGAACAATGCTTGGTACTATTTTTATACAACATCTAATAAGAGGTGACATTGATTCTGCAGAGCTTTTAAACCGCCTAACTTTCAATGTTCCTGTTGGACTAACACGAAATTATTATCCTCTAAATTTGCCACGATGTACATAAAATTTTTGTCTGCACGAGCCCTTTCGCGTTCTATGTAATAACTATAACAATCTCTATCATTTAATTTGCATTTCAACTTCTATCACGGTATTAAAAACTAATATTTTAACTCTTTTGCTTCATTCTTAGTTGTGCCTTTTATTGTCCCGTCTCTGTTTGTTTTATGTATCTTCCTCGCGAATTCGCATTTTTTTCCCAAATTGATAACCGCGCGTAATAAGCACGTGCTTGGTGTCGTTGGGACTCTTGTTTGTTCTGTTCGAAGTGCATCAACGTCCTTCATATATAATCTTTACTGTAAACTAAACCATTTGTCAATATGTTTCACTTCGTTTCTATATTTAATGCATCTCTAGCGACGTACTAATTGTCAGGACGTGTAACTATAAGGTATTAGTGGATATACAAGTTTTAGTTTTTTTTTACTTAAGAAAACTAGTTTTTTTAATATTGCAAATGGTACTATACTTTTGGTCAGAAGGCCGGAAAAGTCTACAATATCCTATAGCTCCCAAATGAACGATAAGATATAAACAACCAAATCATGTTGTTTTTTTTTAACCCATAAATTCTAAAAAGTTGGGGCTAAGCCTGCAACTGGCAGCACCAGTTTAATTCAGCAGGATGCCATGCTTAACCCTAACCCCACAAACGCACATACCACGATAAGAGCTGTCTAACGACCACATTTTTGAATTTAAATTAATTTTTTGATCTATGCTTACATAAAATTTAAATTCATTCGTATTCTTAGTTTTAAATTTATATTCAATTAAATTACAGCTATCATCCACTAGGTGCTGATATGTGTGGTGTGTGCCGTGCTTATAGAAAGGCATTTAATTGCATAAAATAATTTGTCATGCTTGCGTAAATCGATTTTTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCTTATATATATATATATATCGTCTAATGTTTTTAGGACCCTAAAACAACGTTTTGTGTCAAACTGACCAACAAAATACAATGTTTATTTTGAGAAGTCCTCAAAATTAAATGTCAATAAAGCATTTGCTTAGCAAAACGAATAATACCCGTATTCATATCCCGAGTAAAAACCTTACCCCCACTTCGTTTCAAATCTAGGACTACCAACTACCTTTAACTTCTCGATTCATCTTTCCATCTTTCTATAATTAAGATAGTACTACTTAATTAAATAATTAGGTATAAAATGCCAAAATGAAATTATGTATATAGTCACTAATGAATATCATATTATAATGATACTGATAATATTTGCTTTAAGCCAGCCTAAATAACTTTGGTTTTATAGTTTTAAACTTAAACTTTATTTTTTTTATAATTAGTAAAACAAGTTTCGCTCAACACTTTTATAAAATGTCTACCTCAGTTAGGGACTTCAATTTAACAAATTAATACCAACAATAATAATCGAAAAATAAGTGAGTGTGTTGGTTAGCGCTAGAAAACAAATAAATAACAATATTATGTCAACAAATACCGAAAACAATTTAAAGTTTATACCCTACAAAATGTTCGTCCCAAGATACTGTTGGATACATGTCACTTTCATAAGCCATAAAAAGAAATGAACAAAAAGAAAGCTACCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACATTTGCAGCTATAAGAAATAATCAACGTTATTAAGAATTAATTAACGTTATCCAGGTTTGTTGCTAGCTTCAGTGATATTAAAAAAATAATTTCACTGTTTCTCTGACCGCTTCTTTCACACCTACATGTTAGAGTCGTCCCACTTTTATTAAATTTAATTCAAAATTTTTAAAAATATAAAAATTGAAATGCACCGTATTATAAGATAATACGTCAAAAAACACCAAAGCTAAAATATGTTTCATTTTATTTTCCCACAAACTAAAAATGTTAATTTCAAGCGTAGAAGGTTATATATTTAAAAACACCAAAAATAAATTTTTTTAACTAGCTCCAAAAAAAGAGGACTTTTTGGAAAGTTTCAGCCCGGTAACTTTAAAACTGAGAGACTAGTTAGCGGAAAGGTAAGGGTAAAGCGGAAGGGTAAACGGACATGGCTAGATCGACCCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAACATACATATCTGCAAGGGTATAATAATAAAATAGTGACAATTTTACCCGACCGTGACAAAGACCAGAAGTTTTAAACAGAATCATCTGACATACAAATAAAAATTCTGATTCTGATATATTTAAAGGTGCGCGCAGACTTAGGCGGTGCGGCGCAACGCGGTGTTTTTTAGCGGGATTTTCGGGATGTTTCGGCTGCTATCGAGAATCGCCAGAGCCGAAAGCAGACTGTGACCTGCGTTTGCTTGGATTTTTCGTCCGGACGACTTCACTTGAAAGTACCTTCCTCATGCCGCTTCGCGTCGCACCGCTTCAGTGATATTGTAGTAAAATAAAATGGTGTGTGATAGCTGACATTTTTTTTCATTTTTTACAACAGTTTGGTTATGAATGCTGAGCTGAATTTTGACCTTACCAGTTCTTCGTCGTTAAGCGTTGCACGTGGAACAGCAGATGTAAGTCCAGCATTTCGTTTTGTAGCAGCCATTGTCTGAAGAGATGTAAAAATAAATTAGCCATCTAAGAGTACATTTGATGTATTCGTAAAATATAAAAATATTTAAGTCCTGTTTTGAGAACTTGGGTTTTAAAACATACTAAGCAAAAGAAGCTACTGCATTGCAACTCTACTGCAGGTACTTAAGTAAATTAGAATATGCTTTAAAGCTTCAAGAATAATTAGAGGAAGCGTAACAGGCAGAATGAAAATAGAAATAAAAGTCGTTGGAAAAATGCAAATTTCAAATAACTACAATCAAGAGTGCACGTATCTTTATGTACGAGTACATAATGTTTATTTTCTTAACTAATGCTACAGATTTTTATATTTAGAATCTTATCCATCTGAATACCAAGATTTATTTATTTTGCTTTCTAATAGATATGCGTTGCAAGCGTGTACGATTGTTATCTACCAACCGTGGTCTGGTCATTTTCATGCAAACTTAACAGATTACATTGATCCATTTTCGCGGGCGCATATTGTACCTGTGCCTGGTAGCCATTGATCAGAAGAATCAAAAATGATGTGTTACTCAAAGCAACTATATGCTTATTAAGACGATTATTGAATGATATAATCTTTGAAATCATGAATATATTATATGTGCGACCACACTTCTATAACATTTTGATGGCTTTATAAACGTAGATATTGTTTTTTTTAAATATCCGTATATTAATATACGCTTAAACAGTATTGACTTGTTGAAATTAAACGCTTGTAGTGCCACTTTTACAATTGTTTATTATTACATTAATTCTAAGGGACATTTTATGAGAGTTTAAAGGGCATATGGCTCCGAATGAACAGGTTACTCGAATAAATAAAAAAACCTCACTTAGTTTGTCCTTAATATTTTAAAAACAACAAATAATCTGAGTTCAGCGACAAAATATTTCCTCGCTAGAAGTATAAAAATAAATAAATTATAAAACTAATAGTTAATAAAAGCTCTAATTAAAGATAATTATATTTAAAATTGTAATACTCTGATTAGGTAGCAAAATAAAGTTTGCTACAAAACGCTATAAACGCAAATATGCTCCTAGCGGTCCGAAGTCTACGAATTTACTGTAAATTTATTATATGAAATAACAAATTTTGACCAGAAGAATATAAATTATACGGTCCCTAAGTGAGAAAAAAGTAAGTGGATTGACATAATTCGAAATAAGTTTCCAGATTAATGAAATTAAATGCTTTGCATTTTTATAGCATGCTTTTTTTAAAATTGCTTTCGTATAGATTTGTAAGTAAAAGATTGCAAGACTTTTTTAATTCCGTAAAGTGTAACTTAGTTATTTATGAAAACTATCCTGCAAAGGACTATTACTGCTTATTTAATAATAATAAAGACCGGATTTAATTTCAACTAAAAACCTTTTTGAAATACGTATAGATACAGACACGCTTTGTTTGAGGGTTAGGAAAAGCAGTCAAAAAATTGTTAATCAAAAACCAAATTTGCTTTCCCAACGCATACAATTTTTAAGGATTAAAAGGGTGATATGACGCCCTATAATGAATTCATACAATTTTGTCCGCATGCAGACCTTTTTATATTATAAACAAAAAAGACTTTGATATTTTTTACCTACGCTTTATTGTACATATTCTAAAATGATTGAAAGTTGTAAAATTTTTTTAATTTTTTAACCTATTTAAAATATTATATTATATTATATATTGCCAATATTATTTTTTCATACTTCCTCGATAGGAATTATGGCTTACATTTGTGTTTTATGAAGACTACGGTGCAAAACTACATTTAAAACAAAAAACAACAATAAGTGTTGCACTTGGCATGTATCAGTGAGCTTAAAATTTAAATAGAAAGTGGTTTGTAGTTTTAAAACGGCTAATAAAAATGTAATAAAATTGTTTGACTTGAAAGTCCATAATCTATACCTTGAGAACCTGCCGTCCAACAAGTCATCGAGGAAAGAAACCAACATTCGTATAGGAGTATGTAAAAGTAAGTAAATGGTCATAGATAAAAGGGTTAATATCATGTCCTTTAGTTCAAAGGATCTATGAACTATCATAAATCAGTGACGGATCCACAGAGAAATTTGGAGGTTAGACCACCCTGTTATAGAAGATTTTTTACTTTAGCCTAAAATCCCCACAAAAAAAATGTTGGATCCACCACTGTCACAAATATTTTTATATATACGAGTATATACGAGATTGCATAAATATGAATATGTGACCTGCGTATACCTAGTCGGAAGGGAGCACATTATGGTTATTTACCACAGAGCGGACTAGAAAGCAAGTATATATGTTCTAACT'..b'TTTGATCGGCTATACCCTATACCTAATCTTGGGGTTTTCTGTGCCATTTAAATTAAAATTAAATCTTTCTTTATTTCCTCGTCATTATAAAGATAGGGGTTTGGAGCGGTTTTTTGTGGGGTCACCAAGAAGCAAATTTTACAGTGAATCTATACCTATAAAGGATTTTATTCGATTTTCCCTCTGGTGCAAACTGATTAAAGAGTTAGTTATTTTCTTGGCTAAAATTATTTAAGACATTTCATTGTTTTATCAAATTTTAAAATTTGTAACGTAAAATAAATGTTCTTAAATAACGAAATAGCATTAATTGTTGGACCGCCCGTCGTGCAAATGGTTATATCTTTTTTCACTTTCGTTCGAATAACAAGGAAGTTCAACACAACATTAATTAAATTATACTTTAACAAAAAACAAGACCACCACCACTTCGGCTTGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGCTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATGTGTCAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATAACAGCTATTTGATTTAGTCGTCCGATTTATATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGCTATTTCCAAGCTTACGAGGTTATATGTTAAAAAACAACAAAGATACAATTATTTTTTAAATTTTTTCCGCGTTAGTTCGTATATGAAATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTTCAATAGAAAGAAGACCTTTGGGAAAGTTTTAGCCCGATAGCGTAGAAACGGACGGAGAGGCCAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTAAAAAACCATACCAGTTTTTGGGAATGCGTTTCTAAACTTACGACTGAGACGCCTGACGAAGCCACTAGCCAATAGAAAAAAAGAAACTGAAATGTAAAGTTTTCAATTAAACTTATGGATTGCCATAAAAATAAATCCTGCCGCGCCCAACTTAAAGCCCATAAACAGATGCCACTTTACAATCTTGCTTTGCTCCCTTTAGCTAAATAACGGGTATCTGATAGTAGAGTTCTGATATCAACGTCTGTGACGATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATTTATATTTTTAACTCGTAAAAAGTTTTTGTTTTATATTTAAACAAATCATGCTAGAAAGGGTTACACATTTCAGAATACCTTTCTAGTAACATGTAGCTTTAGTAGTTCACAAGTTACTGGTGTGCAAAATGTAGCTATTTATGCTTCTTCTATTGAGCTGTTTAAGATCATCTTAAATTTCCAGGACCTTCAAATTGAGTTTGGATTCGCACAAAAAAAGGTCAATGCTCAGGCAGAGTAGGATGCTCTGAACTGGTAAATGTGGCAATTTCTGTTGAATTATAACATTATTACTGAATGTGCCGTATGCCAACAGTTGAGGAATCCCAAGGACTAAACACCTTAACATTTTATTTGAAATCGTTAGAACCGATTTTGAAAAATCAGGAAAAGGGCTTAAAGAAATCTAAGCAAAAAAAATCTTTGGACCATAATTTGTAAACGGTATTATTTAGACAATCCGTGTTTAAAAGGCATACATAATATTTCGAAATACCTTTCTAACGACGTATCGCACAAGCCTGTAGCTTCACTAATTCACAAGTTACGGGTATACAAAATGTATCAATTTACAGCTGTTTTCTTGGCAAACTAGCTAGTTCTTTCAAAAGTGGTAGAACTAATATTTCTTAACTCCACCCCCCCCAAACGGATCTAATTTTCCAAATTTGAACTTTTATACTTCACCCACACTAAGTCTTAATATGTAATGCTTTTAGTTTTTTACGTGGACTGCCGTCCACATTGTTTCTTGCTTTCCCGAAAAACTAAATCACTTAACCTAACAGCTGCTAATGCATATTTACGCGCACGCAAATCTTGTTTTCAGAATCCTTATTCGGCACTCTTTCCTTTTAATGTTTAATCAAACATATTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACTACTATATCTTATAGCTCCCAAAAAATTTAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTTTAACATAGAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTACATTTTATCAAAATAGGACGACTATATTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACCTCGGCACCTTTTGGTCTGCGTCTTTTGGAAAAACGCGCTAATTTATCAAAAATCATTGAAAAGGTCCGATTTGAAATACCTACAGTTTCACTGTATTGCACTGGCTAAAGCAGTGTTACCTTACGGTGGTTAATACTGAAATTCAAATTTTAGGCGGAATTCTGTTATCAGCCTAACAATTCAAAGCCAAGCCAAAAAAATTAAATTTTACAATGGATTAGGTTCAAATATGGATTATTTGGTTCGTATGGACTTGTCGAATTTCTTTTTCAATATCAACGCCTTACCTTCATTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGGAGGGGACGTTTCAGACCTCATAAAGTATATATATCCTTGATCAGCATCACAAGACCAGGAGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCCGCTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACATTCCCAAAAGTCTTCATGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAAACGTCGGAACCGGAAAAATTAAAAAAATTATATCTTCTGTGTTTTTTCAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAGCATTGTTTAATAACTTCTAAATTTCCAATTAAATATTTTCAAAATCGGACGGCTATAACATACAGCTGCCACAGGAATGATCGGAAAATTATGGGTAAAATAATATGACAAAATTATATCTTCGATGTTTTTTTAACATATAATCTCCTTCGCTTGGAAATAGCATTTTTTAATTGGTTTTGAATTTCGAATTACATTTTATCAAAATCGAACAAATATATCATATAACTGCAATAGGAACATTCGGAAAATTTGTCGAAAATTTTGAAAAATGTTATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAGCCTTCTAAGTTTGGAAATAACATTTTTTAGTTAGTTAGCGATTGGAAAATTGGCGGGAATTTGGGAATATTATTTATTATATTTTTAAGAATTTAGAATTCAATTTAATGGAAATCGCACTACTCTAACATATAGATGTCAAAAAATGGATTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTCACATGGTGTTACTAAAGTAGATTATTTCTTATAACTGCAAATTTATACAAACTTCGGCTTAACGAAGTAAACTGCCTTTCTTGTCCCTAAGAAACTAAAATCAAAAAGAGACTCATACAAACACAAACAAAAAAATATCTTGCTTTTGGAATTACTTTTAAACGGGACATTTCAACAAATGCGGTATTATTCGACGCGTATTCGCCGATGTCAACATGAAAAAAGTCGGCGCAGCGTACAGGAGTGCTGACAAAAGGGTTCGTGCAACAAAGAGAGGCAGATTTATAAATATTTTCCATAATTTCTATTGTAACAATCGATACTTAGCAATTGTTTTCGGATTAATTCAGAATTTCTGTTTTTTTCCTCTTCCTTCTACGTCTTTTCGACGAATTAAGTGAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATATGTATCTGTTACAGCTGTACATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/118/62a/8c/scaffold_49-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCTGCCCTAGGAAATATAATAACTACTGTTAAAAACTGACGGACAGATGGTCGGACATGGCTAGATCGTATAAATAGATAGGTATAAATATAAGTAAGTGTAGTGTATAGTGACGAATGATTCGTTTTTATGTACTTTTCCAAAAGTTAATATTTTGAAAAAGTTTAAAAGCAGAAAGTGCCTGAAAAAGTTCTAGCAATTATTTTTTCACTTTGAAAATTTAAAGGTAAAGTGCCGTTTTGATCAAAACACACCCAACCTCTGTGCAGATGTGAAATTTGTTTAGTTTAATTTATTTTTACTTCAGGAAAAGTTAAAATTTACCAAGACGAAAAAAAATTTTGATATGCTCTTAAAAAATATCTACCTCAGTTCTGTGTTTAAATTTAACAGATTAAATTTTTCAATTTCTTGTTCACAAAAATCAAAAATTTTAAGCAAGAACAAATATTTTTTTAGTTATCGGCCGCAGTAAGAAAAATTAACAACATACAACAACTACTACGAAATCTTCATAAGTCTATCTAGCCTTAGTAAATAAGCTTATTTGATTACCTCCGTAAATGTTCTTTCTTTTTTGATTTTATTTCATAAAAAATACTTGTCAATGTTTTAAAAACAATTGTTATGTACTTACATTAAGCTGCATTATTATTTTGTTGTATGCCCAGTGCCATCGTTGCCTAGCCGTGATTTCCGGTTGTCGGATCATCTGCATGTGACCACCAACGACTTCTTCCGTTTCACCCCTCAAGAGTGATTTTTTCTTCAGCAGCGTTAGTTTATTTATGTCGGTTAGATCAGAAAGCTGATCATTTATATCTTCACTCCTTTCGTCAAGATCTGAACACATTTTTTCTTTAATAATCCCCGTTAGATTAGACGTTGATTCACCGACAACCGTGTCAAGCTTATGAAGAGAATTATTTGTAAAGGAGTCTCTCTTCATTTGATTGCTGGTTGAAGCCAAAGATGCATCCCCGTTCGAATCCATTTTTAAGTTTCGCCCTTCGCTGGGACCAACGCTTCCACTCGAGCTTTCATCTAAATAATTGCCGCTGTCTTCTTCACTGTGATAATTTTCGTACATAAAGTCGTCGTCCTGTCCTTCGTCAATGAAATCTAATGAGGATTGTGGTTGAGTGGTCGATAATACCCCTTTTGTCTGCTTTAGATATTTCTTGTTTTTCGGTTGATGTAGTTTTTCTTGCTCTCTCTGCTGCTCGAGGTACTTATATTCATCCTCCTCATTAAAGTAATCTTCGCGATAGTCATAACCATTATTGACGTGTTCATAATAACCATTCGCCTGATTCGACGGTGTCGTCTGCTGAAGACCCAAATAGTAATCATCCTGCTCACTATCAATGTGATAACTCGGTTTTTTGCCAATTAATGGACTGCCATCTAGCTCGTCTAATTCTGATTCATCGTCATATATTTCCGTTGGCATCTGTTTTATTAGTAACCCCGACTTACCATTGACTGTGGGCAGTTTTTTGCCGGTGGATCCTGCTGGCGGCACCGTCGGTAATATTTTTGTACCATTACCAATGACTTTAGATTGCCCGAAAATCGCCGTGTCGTCTTGAAACTGGCTTTGATTACCATTGGAATGGTAATTAACAAATGCCTTATTATCTGTATATGTTCCATATTCATGCATTTTGATATTACTATTCTCATAATCATCCCCAGTATTTTCGTAATGGCTTGACAGAGACTCTTCATTGCCCAGTTGATAACTGTAATCGACATTCATTACATTGAAACCAACTGAATCCCTATTCGAATCACGTTTTATCGCATTAGGCGATAAGTCGCGTATATTGTGGGCTGTGGGTACCACTGATTGTTTCTGTGACACGACTGATGCTACTGACGATGCACCTTGATTGACAGCGTGCGTTGCTGATTGAACAGCTGCTGCTGCTTTTCCTAAAATTGATCCGAACATGCCACCAGAAGTTGTACCTCCTTTCTTAGTCGTAGACTCCGGGAAATGAACTAGGCCACTTTTTATTTCTGCTTGCTCTATAACAAAACTCGTGTCAATTGGAATGTCATGCAGTTGACTACAAGCCTTTGTAGTATCGTCCTGTCCGACGCAAGATACGTGATAAGAATAAGGATTTTCTGTTAAGCCATACCCAGAATCACGTCCAACTATCTGTTCATCCACTAATTTATCAGTTAAAATCATCTCATTATAGCTTTCATCATAAGTGTCAGAAATATTTCCTTCTAATGCCGAATTGGAATCTATTAATCCTTCACTGTAAAAATGATTTACATCAGTAATGTTTGAAACTGTCGCAGCATATAAAGTGTCCTCTGCGTTTTTATAAAGACGTGGTGGAGAAGTCATAGTCACATTAGCAGTACTGCTTTCACTAGAAAAATTTTCTGCCGATGTGGTTATAAAGGTAGGAGTCGGGTCCATTTGTTGACCTTGTGTTTGTTTGGTAGAGTTGGAACTTGAACTCGAAAGCAACCCACCGACACTTGGTACAAGCTTAGAAGCCAAATTAAAGCTAAAACCTTTTTTGGTACTATTAGTCGTTTGTGAGACCTCAACTGTTGAACTGACACCACTGAATACGCCATCCAGTCCTCCTTTTAAGCCTTTCGAAATTCCACCGAGTACACTTGTTGCTGCAGACGCAACTACACTCGCCTTCTGTTGTGCCTGTGATGGCTTATAATAACCACCTTGTCCTGAGCTTAAATTCTGGTTTAAGTCTCTTGTGCCCACGGTCTTTTCATTAATAAATTCATCCGAGGGCTTATCATCGATGTCCGTACTATTTTCCACGCTTGAACTTGGGAAGTTGCGTGAACCATTTTCTGGTTCAATGTTTGCAACAGATGCCGTCAGTTCTTTTATGTCAACATTAAAACTATCGTAAAAATTATCATCGAATGCTACCGCATGGTTTTCTACCGCATCAGCCTCTGGCAATAAATTAAATCGATTCGGAGGGTCTACTGAACATTCTATGGTGTTAATTGGTACCTGGGGTACGATTGCAATGTTAAATAAATCGCCAATTTGACCCTTGATGGGAGATTCTTGATTCTCAATCGAAAGGCTGGGCACGTTATATGCATCAAAAAGTTCACCCAAATACGAAGGTAATGGGTCACTACATTTACTTGTAACATCCAACTCATTGGGAGGACAGGAAAATTCGGCATTAGTAGCAATATCATTGATAGGAACAGAATTAGAATCACTGTGAGTAACAGGTATATTTTCTGAAAGTTCCATGATTGGCTGAGGCAAATCTGGTAACTCAAATTGCTTCATGTAATCCGTGTAAGATAGAATAGGAACTAATGACGATGGTGACCTTAACGTTAAGTCCGATGACGGCGGTATAGCGTTTTCGCTTGTGGTAACTGGCACCTCTTCGGGATTATTTACGTAAACAGTTTTTGTGAACGCGTTGTTAGATGAACTGTAACTAACAGTTGTGTTTTTGTCGTGAGGAGAACTTGTTGTTGAAAATACGATATCTTCCGTTAAATTCTTGGAATTAAAATTCGAAGATATGAACAGAGGAGGGATGAAACTTGTTAATGGTGACATTACTGATTCAGCTTTAGTCGTGACTGTGTAGGATTGAGTTGAAATATTAGCACCTTGTCCAACTTCGAATGGTAGGTAATTGCCACCGCTAGTCGTCCACGTGTTGAAATATGGAAAAAGATGACTGTCACCTGAAGGCTCAGAATATTGCAATTTGATTAGCTCAGTACAGAGCTCCCCATTGTCGTCATAGGAATGAGTTGTGGTTGATGTACTGGCAGCATTGGTGATATGATTTTCTTTTTCTCCGGAAAAAGGAATTATGTCTAATGTATAAGGCTTTGGATATTCAGATATGTTAAATAAGGCTGATTCAGGCTCGCTACATGGCTCGGGTGATTTTTTACATTCTAAAATCGATTCGTTCAAATTTTCATGTAGGTCTGGCTT'..b'GACTTTTTTAAAATATATATATGTATATGATATATATAATAGGAGGCTGTCTACAGCTGATATACGTAAGTATGTGCATATATATAAGGAATAGTTTTCTAGATCTCTGCCGCCACAGTTACAGCATACAGCGGTCGGACGCGAACATAAAAAAATTGAAAACAAAATATCATTGTATTATGTTCCGGCCTCTGCTTCATATAGTTATGTAATATATACATTAATGTTACGGTTAATGTACGCGGTTATTATGAATATGCCCGAATTACCTTAAAACAAACGACAGAAAGACCTTGGAACACAATGAAAAGATACATGTAATTATGTACATACATGCATAATATTTTAATTTGCTATAGGAGATTATCATATTTTTAAAACCCCTTTTCAAATTGTTTAATTTTTCCTAAACTCAGATATCTCAGATTTCATATACGTTTGCATGTATGTACTTTTCTTAAGCTAAACTTTAAATGTATTAAAGCAAAAAAATTTGTGTATATGTTTACATATGTATTTACATACAAAAAGCGTTTTCTACATGTGCACTCAGCTAAACAACCATAAGTTTTAAGAAGTGTAAATCAACTGCATATTTTTAGGCTGCGCTATTTAGTGAAATACTAATGGCACTTGTTTCAAGTGGATAGATATCAATCTATTTTATTCCTTTTGCAACTTTTATAATATTTGTTTCCACTTGTTATTCACTTTTGGTTACAAGAAGTTCATTTCATATGACTGTAAATAAAACGTAATTGTAATATGCATACATATTTATATTACTTGAAAGTATTTTAAGCTCCTCATTGATATAATTCACAATAACTGAAAAATGGTTATTTCGTATTGTATAATTCCAATTCAATAAAAATCTCTGAACATGCGCAAAGCAAAATGTGGGTACTACCACATAGAAACCCTTTACTATGGTAAGCTGAGCAAGGACAGTATTTGAAGTTAATATACCTTTGTCACAGTACCAATACGATGTTTAATAATCCATTTTTTATACTCCAACAAACATATTATTCTAGGCGATTGATTTTGTTGGATGCCATTAGGATTGGCAAATCAGCTGTTTTCACATCATCGTTCTGTGAGTGCACCCATTTTCTTTTGAGCCGGTGGGATTTTATGCAACTAGCTGTTCATTTAAACGAAAAGGCGAATACGCGGCTCACGCATTTTGCCATGTCTGTGTTTTAGCGCGGTACTCAGATGAGTTAATTAAATACCAGATAAAATACCACATTTAGCAAGTAAAATTCGATGAGCGCCGTTAGCCGCGGCCTAAGGAATAAGAAATTTAATCTTTGGATGTGTTCATGCAGAAGCCGCGTGGAACCCGAACTCTGCGCGATCTCCGCCGTGCTCTCCATTCTTGGCCGCTAATGTGGAACTGAGAGCTCTCTGGCTAACGAACAGCTGGAGAAGCAATATCCCTTGCCATGATACAGGGCCCCTCCTGCAGTATCAGCGCTATTTACGAAAGTATATTTTTGCAAAGAAATATTTGAAAAATATGGCAATGGTAGCAATTTTCCGGACGTGTTTTGAAAAAAATTTGAATTGCGGTGCCCCTCATAAGTCGGTGCTGGATCATCAGAAAAAAACAAATCCAAGATTATTCTTAACGCTGTCGAGTCTTTAAAATTCAAATTCAAATAAAAATAAAATTGTGTGGGAAAAAATAGGCAAATATACAAATAAAAAAAACTCGACAGCGCGACCTTTGCAAATATGTACAGAAAGAGTGTTTAAAATTTTAAAGGATCGGTGCAGGTGCGTTCAAGTCTTAAGCCGTGCCCCATAGTTGCATAAAGAGTTCGAATAAGGGAGAGCCCGACCCAACAATGAAAACATGTTCAGGAGGGTTTTCGATTGGGAAATGCTTTTAATGGTTAGGAGAAAACGTAGCCAGGTCTTAAAAAAACACACAGTGGTTGGCCATTCCCGTAAATATATAGTCTCAAAGGTGATAATATTGCTTTCATCGGACACTGTTATTTGCCTCCGGGTGTTCTCAATATTTAATAATCGTTTATTGTTGTTCGACTTGAATTGTCGTTGGCCAACATTCAACAAAATTCCTTACAACGGAAAACTGTAACAGAAACCTTCTAAACTTATAAAAAGTATCACTAACTAATTTCCTATTCTTTCGACTCTTATCCTAAACTGAACAAATCGCTGATGATTGTTTCGTTAAGGCAGATAGACCCTCTGTTAGAATAGAATCCAATAAGAGGGTCTGCTTAGGACTTAGATATCATAGAATGATGCTCCCCTTGAGAGGTAAAAAAAGATTCATGAATACTTTTATAGTATTATAGCCATTTCGCTTCAGCGATAGAAATCCGCTTCAGCGGATGAGAAGTATGCGTGCTTAAGCGAAACAGGGGAGTATCTACAACGTTTAACGCGCCTCAAAACTGATACAAATTGAGGAGGGGAGGGAAGATTGCGTTACAAAGCTGCAACGTCGATTTTGTGATATAATCCAGATCTGTTTACCGGAGATACCAAACAGGGAACAGGTAATTATATTGTTGTTTATGTATTTATGTATTAAAGGTATTTTTGCAGCAAAAACGCTTTATCATTTTGATTGGCCTGGTAGCATCCAACTGTTAAAACGATTTCCTGTCAACGAGGAGGGACTGGAGGAGGGTTGTCATTTAGTCATAAGTCATTTATTTGCCAATTACATTATATATCTTTTTTCTTAATAGTTAATATGGAAACAACGAATATATTTTGTTAACACATTTTTTTCTTAAACATCAACACCTATGTTTCGCCCTCTCTAGAAAACAGAAGAAAGTACTGAGGTTGTACTTTCGCGATAAATTTCAAGCAACCGGTGCATGGGTGATCATAATTATGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTGCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCAGGCTGAATCTTTCCTAAAAATCTTATTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGCAAAAAAATATTTCTTTGATGTTTTTTAACATACAACCTCCTACGCTTGGAAATAACAATTTTTAATTATTTAAATCTAGTCAAGATAATTATAATTATTGCAAATCAAACTTTAAAAGAGAATATCCCTGAGCAGTGGCTTAAGTTTTTAAAATCCAAATGTTATTTTTAAATTTGGCCCCCAAATGATGTCGAATATAAAAAATTCTTTTCGGTTTATCTTATTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAATCTGTCCCTCCCATAACAGCCTTTCCCATTCCTATCATCAGTTCTTTTTCTGTTGCACTCTGGCACTTTATCTTTTGACGTTTGATTCCTCTCAACAAAAGTCGGCGCCATTACTCACAAATTTCACTTCTGTAGAAACCGATCCAATTAGTTTATCGATAGAAAAGATCCAAGAAGGATTCGCATATGCTAGCGGCTTGGAATAGTGCTTTTTAAATTCAGATCCGGTCATTGGACTACGACTTAAGCTTAGTTTAGAGAGCGTTTGAAAGAATATTTTTGTCTTATAAGGAGTGATATAAAGAAGCTTTAAAGGCCACCAAACAATCGAAAATTACTTATTTTTTTTTATAGAAAGCAACTAATAAAGAAAACATGTTGAATCAAACTGGCTTAAACTATGAATAAGCTTATGCATTTAAAATTTGATATGAATAGAAACATATGATCTCCTTACTTTTTCACACTTTAAAAATTCTATAAAGTTTAAGCTGTTAATTAATTATATGAAAATTTTTTTTCAATTTAATAGCAACTTTTAATTTTGAAAATATGAATGCTATGCATTTATTAATAACTTATGCATAATACATTTTGGTTAATTTTGAACAAATAAATAAAGCTTTAATAAAAGCAGACCAAATTTGAACAACAAAAATTTGTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAATTTTTTAAGAAGTGGTTTTTTCTTTTCAAGGTAGTTGGAATCAGTCGGATCGGAAAACTATATTTTACAGCTTCCATTGAAATAATTTTTAAAAATTATGTATTTCCTGTTTTTCAACATTTAACGTCCTATGCTTGGAAATAGAAAATTGTAATCAATTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATCAAAATCGGACTACTGTATCATAAAGCCGACGATCGGAAATTTGGTGGGAAAATAACATGAAATAAATTATAATTATTTATTATAAACAAATGGTCAGAAAAATAATGAAATAAATTTTTAAAAAATTTTGCGTTGTTTTAATATTTCTGAAGCTAGCAACAACCCTTAAAAATTTAACATAGTGTTACCAAAAATCATAGAATAAGGTTTATATTGTGCTGTTACAAACATTAATTATTTTTTATAACTGCAAGGGAATACAAACTTCGGCAAGCTGAAGTTAATTTCCTTTATTGTTTTTGTTTTTGTAATGTCTATCTCGACAAACAAATCAGTTATCTTTGAAATAAACAATAAAAAACAAAGTATATTAAATTATATTTTACTGATTGTATTTATTTTTAATATGTATGCTGGGAAACAAAAAGAAATAATTTTGCCACACTTTTGCCACGAGGCAATCCGTTTGTGAAAACAGTCATACTTAATTCCAACTCAATGTCCTGTGGCCCTTCCAGAGATTTTTTCAATAATACATTGACTTGGTTATTGCTTTTTAAAATGCTGTTAATTATATAATTATAAATATTACGATATTTTTATAAGTACTAATTAAAAAACAAAATACTTACTCAAAGTGCATAGCAGTAGCTTTTTCAATATTGCTCGTTGCTTGTATGCGAACAATCTTAAGATCAAAATCTATGTTATCATACCAAAGTGGACCTCTCAATGTGAATATTGTTCTACCCTCTGGAGCGATCATTAACTTGGAAACAAAGGTTATAAAATTATAGGTAAAAGCCGACGGCTGTATGTAACATTCTTCTCCCTCGCAGAAGTTAGTGTTTTGTCGACACCGGCTGCAAGTAAAAAGCATATAAAAACTACTGTGGGAAAAAAGTATCGAGCATTTTTTTACAATTCTAGTTTACATCCAAAAAATTTCAGATTATATATCGCATTTTCTAGAGTTATTTCGGGCTCCTGTACATGCTGGTGTTTGATTTTTGATTTGGTGGTGGTTTGATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTCGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATAAATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCTGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGCTTGAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTCCCATTGCAGGTAGTATATACGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTAAAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAATATTAAAAACAATTATATTTTCGGTTTTTTTAACACATAACCTTCTAAGCTTGGAAATACCATTTTTTAATTAGTTGTGAATTTCGAATTAAATTTTATCTAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGCCATATAAACAATCGGGAAATTAGTCGGAATAACATGAAAAAATGTATTAGTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTATCTTAAACGAGTTATAAAAAATCTTCCGTTTTATTCGTTCTTATGTGAGTGGACTGAAGTTCAGAATGAAAATAGCAGAAATGCAAAGGGCGATAAGATCCCTTTCCGCGGACTTTTTCAGCAATTTTAAGTTGAAATTGGTATTGAGTTTATTCGGGAGATAGAGATGCAGACAAAACTATGGAATGAGATTTGTCTCTAGTTTTTAAAATTAAGAGGAATAATTTCTTACTTTTGTCATTGTCTGGACCTGACATCATTGCTTTTCTTCTAATGACTTTTTTTTTAAGGGCAATCGATTGATATTCAAGAGACGAATACCTTTTAGTTAAATTGGTTTCTCTAGCATAAAAACTGAGACCGCCTAGAATAGGCGTGCAACATTGGCGTTTCAAAGGTGTGCTGCGTAAATCCCAACCCTGTAGCCTTGATAGTTTTCAAAATATCAGCATTCATATGAACGGTATGTGGGTGTTAGAGTGTCGTCAATAATTTCACCTGTTACTCGTATCGTAAAAGGGTGTATAGTAAAAGGATATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTTACAGGTAGAAGGAAGCTTTTTCGACCTTAGAAAGTATGCATGTTCTTGATCGGGATCACTAGCTGAGTCGATCTAGCTATTCCATTCGGACCGTCAGACTTGTAGCGCTTAATTTCACAATAATTTCCATAGGAAAAATTCAGGGTTTGGCGCCACGTAAACTTCTTCAGGGGGTTTAGCGGCAATTTTTTCGACGAAGCGTTCGCTGGAATTTCAGGAAGAAATATTCCCTTAGAAGCGAGCGCAAAACAATTTATTTTTTAAACAAATATATATTTATAAATTTGTTCTTCCAAAACATTTAAAACATAATCAATAGATAAAAACTTAGTTAACGTTGCTAGTGAAATAAAATACAATACTTAAATATGTCAAAATATGAAAGCATTAGCAGGTTGTAACTCTTAAATTGTCCAAATAATAATAAATAATATATGTGTAACGAACGATAACCTTTAATAGCATATACATAAATATATTTTAATGCAAAAAGTAAGTAAAAAAATATTTTTAGGAATTCGGATATTTTAAATATATTGAAATCGAATTTAAAAAAAGTGATTTATTGCATACTATTTTAAAATAATGGTAAGTATATTAAAAAATTGGTAAAGATTTAGTTGTATTTTTAAGAAAAGTAATTAAAACAAATTTAAGTTTGTATAAAAAAACACCAAATTGCAACTCAGGGATGCAACAATTCTATCGAATGCACTTGTCAATCCTCTCTACCGGATCAAAAAAGTATAGTTGCAACTGTTTTTAATGTGTTTCATAACAAAACTATTTTTAACTCTAGTTTTGCTAGCATTGTGACAGTATATTGCAATGGATATAAATGTAAATAAAACTAGTTTTAAAAGTATAACTGTGTTACCGGCGAAGCCTGTAATATTTGTACATGTGTACTTATATGTGTATTCGGTTTGGCGGCGGAATAATTTAATGCAAAATAAAAATGGTTAATCTAACAAAGAGTGTATTAAAGGTATTAACACTAGTTCATTATCATCAAACGGCATATTTTTACATTTTGTATTTATCATATTTACAGAAGCCATAACGTCTGACGGCTCTAGTTTCGGAGACTATACCAAAAATGTCAGTGAGGCGCTTCAAAAGCCAATGAATAGAACCTACAAAGAAGACGCCAGGACTAAGAAAATATTCAAAAAAGACTAAACTAATTTGTAGTTAGCAAACGTTCCTTACTCATATATAAGTATTAAAGGTAAGATAAGTCCAATATGTATTTTTACATTAAAAAAAACCTAAATTAAAATTATTTATTATATGAAAAACAAAAAAATTAAATTCGATTTAAATTTAATTTTGTTATTTTTTTAATGCCATTTTAAAAGAAAGTTTCTCTAAAAAGGCGATGGAAATTCGGGGGGCTAGGCACGAAAAATTAAGACACCTTGAATTTCCCGGGACTTTTTTCTACGTAAAACAAACATTTTGAACAGCCTTAATAAGAGCGAATGGACTTTGTCCACAATGGGGATCTGAAACCTGCAGACCATTTCCATAGAAAAAATGTACAAGTACAGGTCCGACTGGGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTGAGATCGGAAACTATAATAGCTAGCTTTTGCACTGAGAAATCGCGGTTTTTCTAGGATAATTTCTCCGCGAATTGTAAATACTACACGT'..b'TTGCATATGGTGTTACCAATGTTGATTGTTTCTTATAACTGCAATTTCTTATAACGGCTTGCCGTAGTTAACTTTTTTTTTACCTTTTTTCATTTTTCTTAAAAGCGTCTTTAACTATTTCGGCTAAGCCTTAAAGTGTATATCCATTGACATTTCCTCACGTTTTAAATGCAACATATTGTTGTAAAAGTACCGTTTAAGATTTTTTTTCAACAATAGTGGCTACATTTACTGGTTCAGACCCTATAACACTGACTGAGCGTTACACTTATTTTGCGTACCCATACGGCTTACGCTGTATGTTCTGCATAAGAAATTTGAATACTATTTATTTGATGAAAGTAGATTTATATTTTAACACAAAAACTTCTGATATCAAACAAAAACACCTCTGAACGATGTAAAAATCTAGAGACGATCGCACCTACGGCAAACAAAAGTTCTGATATCAACTTTTGTGACGAAAATGTATTAAGCGATCTACTAAATAATTACATTTAATTTTTTTTACATTAGCCACGCTACTATTCAATATGCTTGTGTTTAGCTGTACAGTTTTCATAAAGCGTGCCGAATGTAAAAAATAACAAAATGTAAATGTCAAAATAAGAATATTAAGGGTCAAATAAGGTTTTTCATACAATGTAATTTAGAGTCAAATTGATCCAAAAAAAGTGATTCTAGGTGTACTGTCATTTTTAACCACTTATTAAATTGACACTCAAAGATTTTGCCGGATAGTGGGCGTTAGAGTAGACGTGTTACCTTTCTAAAACAAACTTGCAATGCGCAAGAAGATCAGAAATCTGCATGCTAAATTTCTATTTAGCTTTTACAGTTTCCGGGATCTCTGCATTTATTCGGACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATACGACTCGGCTAGTGATTTTAATCAATAATATATTTACTTTATATGGTCGGAAGCGCTTCCTTCACCTATAAAATAATTTCCGACGAATCTAGTAACCCTTTTACTCGACGAGTAACGGTTATAATAAAATAAAAATGGCCACGGGCTAACTTTAAATTTAACTATAAACTTAATTTTTCAAATGTTAGTAGATAGTTAATTTAACGTTTTATTACTTTAAAGTTAATTTACTGTTGTATTTACCGACACATGCACCACGAATATTTCTATAAAATCCAGAGGGGCAGTCAAATCGCGATATTGCAGAATTGGCATTGTCAAAGTTGAAACCTGGATAATTCTGATGTACAGCTAATGGGGATAGGTATTGACTATTATTTGCCCATCCTGCTGGCTTCAAAGGGGAAATTGTCGTTGATGTTGTTGAAGTGGTTGAGGTCGTGGTGCTTTTTCTATAACATCGAAATGATCCCTTTGTATTGTGGCAATCGTAGTTCAAAGGACAATTATGTGTTCTAAGTGTACACTCATCGTCATCTTAAAAGAAAGACAAGATAATATCAAATGTAAAACTAAAAAACATTTAATTTAAATAAATATGTTAGGGTCGATTAACGTAGAGTGCGATATATAAGCCTTTAAAACCCTCAAGCTTTTTAATATTTTTGATCAAAGATGATCTTCCTAGATCAATCAGAAAATTGATTTAGAATTGTTATTTAACGTGTTCAATGAAATGCTAGTTGTCTCTTATTAAATAAAAACAAAAATGGAAGTTAGCTTAGTTTGTATACGGCAAGTCTTAGTTTGTATACTCTTGCTCCTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAACACCATCTAAAATATTTAAGGATTGTTTCTGGCTTCATTGATATTAAAAAAATGTCTATTATTTCTCTGACCGTTTGTTTGGCAACTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCAAAATTCAGAACTAATTAAAAATTATTATTATTCTAACCTTAGGTTATGTTAAACAAGAAAGGGAGTTAACTTCGGCAAGCTGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATAATATTTTTACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTTAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCTGCGTGACTAGACGGGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTCTAAGGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTATTTCTATTGCAGGTAGTATATTAGTCGGAACCAGCCGGATCGGAAAACTATCTCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAATATTTAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAACTTTAAAAGCTGGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTTATCTAAAATCGGTGGACTATATCATATAGCTGTGGTAAAATAATATGAAAAAATTATAGGTTCGGGGTTTTTTAACATACAACCTTCTAACCTTGAAAATAACATTTTTTATTTAGTTCTGAATTTCCAATTAAATTTTATCAAAATCGGATGACTATATCATATAGCAGTCATAAGAACAATCGGGAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAAAATTATTTACTAAAGTTGATTATTATATAACTGTAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTGATTTCCTTTCTTGTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATGGTTCCTATGACAGCTATATTATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAATTGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGTTATATGTCAAAAACCACCAAGGCTATAATTTGTTATATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGAACGTTCCTATGACAACTATACGATATAGTCTTCCGGTTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAACTAAAAAATGATATTTTCAAGCTTACAGGTTAAAAGTTAAAAAACACCAAATATATAATTCTTTCATAATTTCCGACTAATTTTCCGATCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATTGTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAATTCGAAATTCAGAACTAGTTAAAAATTGTATTTCCAAGAGTAGAAAGTTACATGTTAAAAAACATCAAAGACAATTTTTTCGTATTATTTTGTCACCAATTTTTCGATTGAAGAAGACTTTTGAGAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTATTTTGCGTAGAAACGGACGGTCAGACAGACATACGGACGGTCGGACGGACAGACAGACGGATAGGCGGGCATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAGTATATATACTTTATAGGGTCGGAAACGTTTCCTTCACTGCGTTATAAACTTCTGACTAAAATCATTGTACCCTCTGCAAGTGTGTAACAAGAAGGGGAGTTAGCTTCAACAAGTGGAACATGTATCAAAATATTGATACATTGATTTTATTCTTTAACAAAATATTATCATAGCCATATGTCTTAGACCGAAATATCAAATATCGATATTATTTGTAAATGATGCTTTGGTTCATTCTAAGGGTTTGTCACTTTAAAGCCTTAGCCGACGCCGACAAAACGCAATGCAGCGCTCAATTGCATTTAGCGAAAATTAAAGTTTTATGAATTTGTATAACCGTTCCTTTTGGATGTCAAACCGGATTGGCTGGCTGAATTGCTTATCATAAATAATCAACCCTAGGATTAAAGAAAATTTGTATCAACTTGTAAAATAGATTTCTGAGAGAAAGAAGATATCTCATTACACCCTTGCAGAGTGTTCACTTCGGAATAATCGGAAACAGATTTTAAAAATGTATATCTTTGGTGTTTTCTAACATGAAACCTCCTACGCTTGAATATAACATTTTTTAATAAGCTCTGAACTTTAATTTAATTTAATTTTATTAAAATC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GGACAACTATACCATATAGTTGCCACAGGAACAATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAGCAAATTAAAGCTTCGGTAATTTTTGACAAAATATCTTATACTATTGGGAATATCTCTTTTGTTTTTTGTTTTGAGAATTTCGAATTCGAAATCGAACAACTTTAACATATAGCTGTTAAAGAAACTGTCAAAGAATTAATAATAACATTTTTTTTAATGTTGCTTTGTTGTTTTAATATCACTGAAGCTAGCAACAATCTATAAAAATGTAAAATGGTGTAACTAACATATACTAATTTATACGATGCCGAATTCACGCTATTATTTCACGCTTTCAGCCGATTCGTGTGTGTATGAACGCCATTTCGAGAATTCGGCAACTATGATTTCAGCCTGAAAGCGTGAATTTGTGGTGCGCAACCAACTTAACGATATGCAGACCAGGTGGCAACGCTCTTTGGCTCTTGCATTAGTGCTCAAAAAGCAGTAACTTTGGATATTTATTTTTCGGTTCTTATTTGCCGACTGTAAACGAAGAATTTTAGTATATCCATCTCGTTGTTTGGTTTGTTTACATTTTGTAAAAGCGTGACCAGACTAAGGTACTACATTTTACACGTCTGGCATCTTTACTGAAAGCAAATCACGAAATGTTATGTGTCGTATAAACAGGGGTTATTTCTAAATCGCGTTTGTAAGAAATCGTGTTTCCTACATAGTAACAATACATTCTTTCCTATCACTGCAAGGTTATACGAACTTTGAATTGCCGAAGCTAACTATCTTTATTGTTTTTTTTTTTAAATTCAGAAACACCTAAATTTAAATTGCGGTAATACGAACGACATTTAAGGGTGTATAAACTTCGGACTGGCTAATTTAGTTTTCTATCTTGTTTTTTGTTACTAAGCAAACAAGTAACTAAGTTGTACAAAAACATATAAGCTTTAAATAATAAATATTTAAACAATATTATTAAAAAACAGGACGTGTTTGGGCCAACAACCCAATGTAACCCTTAAAACCCTTAGGCAAAAGAAAATTTAACAATTTCATAAACAAAAGTTAAATTGTGGGCCAGTAGGTATTCCTTTCTTTCAGATCTTTTTTATTAGTGGATAATACCGATTTAACGCGAGCTAAGTTTTTAGTATCGCTCTTCGTTGATACTAGAAAAAGAAACGAGTCGGAGGGGGCCATATTGGTCTATATCAGTGTGCGCTTTTAAATAAAATTTTTCAAATGTATAAAGGAGAACAAAATAGAATTGAGCTTTAGTTTCGGGACATTTTTGGATCATCTATTGAACAAATTTAATATAACTACGGTTGGTCGGTTGGTCTTACCATTAAAAAAAGGTTTATTTTATTAGTAGCTTTGAGAAGCTTTTTTAATATCTTACCATCACAATTCCCTGTTTGTGCATTTAAGGTGTAGCCTGTGCCGCAGCTTTGAAGCCTCTAGATAAAATAAGCTTAGTTACAAAGAAAACGTTTATCAAGGTTTTAATACCGTGCATATATATGATCCGATCGTGTTATCACATCTTTGAGTTGGCAGGCAGTTGTGGTTGTTTATTGAACATTCATTTATGTCTATAAAGGACAAACAAATTTGATTAAAACTATTATTAAGAAGAACAAGTCTTACTTACCAACGCACTGATTCGTGGCAGCATCCAATTTGAAGCCAGTTTGGCATGGACAGGAATAGCTGCCCACAGTGTTATTGCATATTTGGTGGTTTATAATATCACAGCTGTTTAACGTGCTATGAGAGCATTCATCAACATCAGTACAACTTCCGTTTTTTAAGATAAACCCATTTTCACATGGTTGTCTCCTCATGGTGCAGTTGGCGCTGCCATCTTTGCATTCGTAATCTAGATTATTAGGATATATATACAAATAAAAACACTTAGTGTTGAATTGTTGTATGGTTATACCCTTGCAGAGGAGGAGACGGTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCTCTAGACTCTCAGATTTAAAGCTATCGCGCTAAAACTTTTCCAAAAGTCTTCATTTTTTCTATATCTTATAGCTCCCATATGAATAATAGAGGAAATAAAAAAAGACCTATCTTCGGTGTTTTTTGACATATAACCTTCAAAGCTTGGAAATAACATTTTTGAATTCTTTCTGAATTTCAATTTTGAAATTTTAATTTTGCCCATGTCGGACGTCTGAGTTAAATAGCTGACATAGGAACGACGGGAAAAGTGGTGGGAAAATAATATGAAACAATTTATAGCTTCAGAGTTTTTTGACATATTTTTTCATAATATTGGGAATATAATTGTTTATATTTTTAAGACTTTCTTAAATAAAATTGGACGACTCTAACACATGGCTGTCAAAGAAACAGCCGGACAAATAGTTAAATATTAACATCATTGAAGCTAGCAACAATCTTTAAAAATTATTACTCTTAGTGCAAAAACCAAAATAACATTCTTGTATCTATTGGATGTTTTTAGTCTGTAAACTGGTGTTTTCAATGGTAAAACTACGGTATTTAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTAATAGAAAATAATCAACATTAGGAAAACCATGTGAAATTTTAAGGGTTGTCGCTGGCTTCAGTGATGTTAAAAAAAAAAGATTTTATTATTTTTCTGACCCTTTCTTTGACATCTGAATGTTAGAATCGTCCGTTTTTTATTAATTTTAATTCGAAATTCTTAAATATATAAAAATGATTTTCCCAATATTATATAATAATAATATGTCAAAAAACACCAAAGCTATAATTTGTTTCATATATTTTCCCACTCATTTTCGGATCTTATTTATGACAGCTAGATGATATTCGGTGTTTTTTAACATAAACCTACGCTTGGAAGTAACAAGTTTTGAATTTTTAATTAAATTTTAGCAAAATCGGACGACTATATCATACAACTGTCATAGGAATTTTATTTGCAATTCTAAAATATGATAAATATATTACTTGTATAAAATCTTTTTTAATGACTTAACTATAAAGTTGTTGGAATTTTCAAATTTTGTTTAGCAAAATGTAGTTTTTGAAAATGCTAAAAAAAGAAATTACGAAGTTAATATTAACTTTTGGACTTTAAAAGCCTAAGCCGCTGTTCCGATCAATATGATTTTCAGATCAATAGTTAATTTTATAGCCTAAAGGCATAAGTTTTATTTTTATAATTGACAATTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCTGTTTGTAGGTGTTAGAGTGGGCGTGACAAATTTTCTTTGGGTCAATCGATAGGTATTGATGAGACAAATACAGTTCAGTTAAAATTTTTTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCTCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTAAGAGTACGCGTGGCATCCCGCTTGCGCTACGCATGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAATTCTTACTGTTCTAGCTCTTATAGTTTACGAGATCTCAGCGGTCATGCGAACGGACGGACATGTCTAGAACGACTCGGCTAGTGATCCTTATCAAGAATATATATACTTTATAGGGTCGGAAATGCTTTTTTTAACATGTTACATATTTTTTGAATATTATAGCTTTATATCACTGAAGTCAGCAACAACTTTAACAATTTCATATTGTGTTACTTAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAATGGTAAACAAACTTCGGCTTGCCGATGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTATACTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTTCTTTTGTAGCTATATTATATAGTCGTCCGAGTTTGATCAAATTTTATTCGAAATTTAGAACTAATTAAAAAATCTTTTTTCCAAGCATATGAGGCTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATAAATGAAAAAAATGTTTTTTCCGATAATTCCTAAGGGAGCTATAAGATATAGTTGT'..b'TACCAACTTTGGCTGGGCAAGAAACCAAGAATCAAACATCTTCGAATCGTAGGATCGACGTGCTACGTACACATTCCATGCCAAAAAAAGGAGAATATGGACGAAAAAGCTGAAAAAGGGTACCTGGTGGGTTACGAGGGCGATGAGAGATATCGTATTTACTTACCAGAGAAGCACAAAGTAGTCGTGTCGAGGGACGTAAAATTTCAAGAGAAATTCAGCAATTGTGAACCAGGCGTCAACCTACCATTCCAAGATTTTGGATCCAAGGACGTCGTAGAAGACAAGGAAGAAGAAGACGTGAGCTTGCACCAGAGCAAGGACGAGGATAAGGAAGAAGAAGACGCGGATTTGCACAAGAGCGAGGACGAAGACACACTTCATGAGCAAGACTTGAAAGAAGACACAACCGAAACAGGAAGCGAAGACAATTACGAAACCGGAGTAGAAACAAGCTTTGACGAAGAAAACAACAAGAGAAAACCGCAATAAATGCGGTTGAGGGATCGTTCGAAGTTGAAGAGACCAGAGCATCTGGATGACTACGTAGCAGCAGCCGAGAATTTTGTGCTGGAGAGTCCAGATTCCTTCCATGAAGCCATCAACAGCAACGTCGAGTGGAAAAAGGCAATGGACAGGGAAATTGATTCCTTACTTCAGAATGAAACTTGGAACTTGACAAGACTCCCCAGAGGATCGAAAGCACTTCCGTGCAAGTGGGTCTATCGAGTCAAAACCCACCCCGACGGAAGTATCGACAAATACAAAGCTCGCTTGGTCATCAAAGGATTCGCCCAGAGACGAGGGATTGATTACGACCAAACTTTTAGCTCTGTCGCAAGAATGGAAACAATCCGCTCAGTGTTGAGCGTTGCAGCCAAAAATGATATGTTTTTGGTCCAGTTTGACGTCTTGACAGCTTTTCTATACGGAGAATTGGACGACAAGGAGATTTACATGCAACAACCTGAGGGATACGAGCAAGGACAGGGGATTGCTTGCAGATTGAAGAAGAGTCTCTACGGGCTTAAGCAAGGGCCGAGATGCTGGCAAGAAGGCTTCGGAGGTTTCCTGCGGAAACACAATTTCAAGGTCAGCGAGGCAGATCCATGTCTCTACATCAGGAAAAGAAATGGCAAAAAGGTTCTACTCGTTGTTTACGTAGATGACGGACTCGCCGCAGCAACAGATACGCAAGATTTGGAAGAATTTTTGGACGAGTTAAAATCAGAGTTCAAAATTGTCTCAAACAAGGCTGAGTGCTTCTTGGGACTCGAAATCAAGAAACAAGAAAATGGACTAAAAATTAGTCAACAAGGATATGCCACAAGGATATTGGAGCGATTCAGATTCTCGGATTGCAAAGCTGTTTCAACCCCACTTCTCAAGAATTTGGAAATTACGACAGCAAGGAAAGTATCAGAGACGACTGCGTTCCCTTATCGCCAAGCCATCGGAGCTCTCATGTACCTCATGCTTGGAACTAGGCCAGACTTGGCTTTCAGCATCGGATTTCTTTCAAGAACGCTTGAAAATCCTACAAAAGAAAACATTGCACAAGTAAAGAGGGTTTTCCGTTACATTTCCGGAACAATCAACGTTGGGATAGTCTATCGGAAACAGAAGAAGGGAATCCTCGAATGCTACAGCGATGCTGACTTTGGTGGCTGCACGAAGACTGGGAGATCTACATCAGGGATCATCATCATGTTTGCCTCAGGAGCCATTTCATGGAAAAGTCAAAGGCAGGCCATGGTGGCCATTTCTACTACAGAGGCTGAGATCGTAGCAGCCAATGAAGCTGCAAAATAAATAATTTGGCTTAAAAGATTGTTTCAGGAAATAGATTGAACCGAGCCCCGATTCTCCAGGTCGATAATTCTGCTGCCATAAGGCTGGCCCAAAACCCCGAATTCCATCGCAGAACCAAGCACATAGCCAACAAGCATTTCTTCATCAGGGAAAGAATGGCTGAGGGAGAATTTGGGATCGAACAAATCCCGACTGAGGAACAACTCGCAGATATGATGATGAAGCCGATCCTCAATACTCGTCTCCGGATTCTTTGCAACAAGATTGGACTCTACTGAAGGAGAAAAACACCATTTATTTTGCTTTATATAGAGTCATAAAATTTTCAAGTTTGTCAATTGAATTGTTATTTTTGAATTCTCACAAGGGAAAGTGTTGAAGATAAATGTTTCAAATTCAAAAATACCCGCCAAGTCGCTTTTAATATCATATCGATTGTATCGAATCAAAGAGAGTAAATAAACAAGAGTTTGAGTTTTCAAGAAATATCGTTTATTTACTGGCCTAAATAACTAAATTAGTAAAAGTTATAATAGTAAAAGTGTAAGAGTTAAAATTTGTAAATTTTGATCTGTTGGAACCAATGGGGATAATTACCCGCAGCTACCCACCTAGTTATATTCTCAATTAAAATACCCGTCGAATGACACTTTAACTGTCAAAATGCTACGTTCAAAGTATTACGCAAAACAAAATTTTCAGGGTCCTCTTAAAATTTTTTATTTTGTTTGGCATTTTGTCAGTTCTACACGATGTTTAACAGCTCAATATAAGAAACATTAGTTTTACCGCTTTTAGAAAACTAAACTAAAACAGCTATAGATCGCTAAATTTGGTATACCACTAACTTGTGAAGTATGTATGTACTATGTACGTCGATTTGTCTAAATACCACCGTTTTAAAATACTATGACGCCTTTTAAACAGGATTTGTTCAAATACAACCGTAATACCTTGTAAAAATAGCCGTCTCAAAGTTATTAATCAACAAAAATGGCCACATTTACCAGTTCAGAGCATCTTGCACTGCCTGAGCATTGACCTTTTATGGGCGTAACCAAACTCTATTTGATGGTATTGGAAATGTAAGATGATGTTGAACAGCCTAATAGAAGAAACTTTGATTCTAGCACTTTTGAAGAAACTAGCTAGTTTGGCGAAAAAACAGTTATAAATGGAAACACTTTGTACACCCGTAACTTGTGAACTGTTAAAGTTACAGGCTTGTGCTATATCTCGTTAGAAATGTATTTTAACTTTGTTCGATTTCCTAACATGATTTGGCAAAGTACTATCATTTAGTGATTATGGCGAAAAGTTTTTTGTTCAGATATTTTTTAGGTGCGATCGTCAACAGACTTTTACCTCCTTCAGAGGTGTTTGCCGAAGTTAACTAACTTTCTTTTTTTTTTAATTTAAGTTTAATTAGTTTAACTTTTTTATTTACCAAATTTCTTAAACTGCTTGCTAAACTATTGTTAAAAAGGTTTCGATAATAAACGATATTGGTATGCTAAAAGCTCAACTTAAAAGACCATAGCCTTCTCGAGTTATTGCTTGGTAAGAGACACGCGAGAACAAAAGACTAAGAAGCCGCGTGTTTGACTTTAAGAAATGTTTGCCTGAGGTAAGAATTTTTCCATATGTTATTTATATGTTTTTAGTATATATATTCTTGACGAATCCATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGGCCGTCTTTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCATTTTTAAAGCTATCGGTCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGAAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATAACTTATAGCTCCCATAGGAACTATCAGAGAAAAAATTAAAATAAATTATATCTTTGGTGTTTCTTAACATATACCTTCTGAGCTTGGATATAACATTTTTCAATTAGTTCTGAATTTCGAACTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATTATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTTTAACCTTCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAAATTCGAATTAAATTTTATCAAAATTATATAGCTGCCAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/124/0a2/74/scaffold_14-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -AGGAACGATCGGAAAATTAGTAGAAAAACATGAAATACGATATATATCCTTTGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTAAAATCGGACGACTATATGATATAGCTGTCATAGGAATGATCGGATAATTGATGGGAAATAATGTGAAACAAATAACTTTGGGGCTTTTTGACATATTATTTTATAATATTGGGAGTATACATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCTGCTTGTCGAAGCTAACATACTTTCTTGCATTTTTTTTATTAAATTTTTTATTTTTTCTTGTTCTTTATTTTATTAAGGGTCTGTCCATACGTAATCACGTTTTCGGTGATTTTTTAACCCCTCCCCCCTATTGATCAAAAGTAATCTTTCTATACATATATAAACTATTACGTAATCATTGTGTTTTTTCGGTGCATGCCAGTTGAAATTGAATCATTCAAAACGAAAACGTAAGCAATAATGACAGGGAACAATCGAAAATAGAAGATTTGAAGCATCCGATTTGGTTAGATCAGCTAGGTCAGCAGTGATCAAATTGTAGATGGTGAATGTGATCTTTTGGAAACAGAGTTCACATTTGAAAATGATCAGATAAGCTGTTGTCGGGTGGTATTTTGTCTAGAATCCCAACCGTTTCGAACGGATGGAGTCTATCGGAAGAGGTTACGCTAAAAATGGTCTTTTGTAATCAACACCATACTAGCGCCCATAATTTTGTAAGAATTTTATGCGTTTAGTTCCAAATATTAGTACACATAGATGTGTGCCAAAACTATTTAAGTCGGACCAATTACTAAAAAGTTATAACCAAATAATGAATTAATGAATAATGAAGATATTCATTAGAGTGCAAGAGGGACGGAGATATATTCACCAGTACCTTTTCGTTGTGTGAGTAACGGTACTTATAATCGACCATATCGTTTCTTGTTTGTTTTCAAATTGGTCAAGTTTTACCGATCTTTTCTATGTATTCGCCTATATTTTAAGATGATCTACATGCAAATATTTAAGGACCATTAAAAACCATTTCACCCGTTATAGTGCTGAAGTAATATTGGCGGCACCCTTAATAATACAATTTTTGTTACCCATTCAAAATTGATTGTTGTCGTTGCACAAAAGTTGAATATTCAAAGTCCAGGTATTTCCACTCATTAACGACCTCTAGTTTACTTTCACTCTGCAACGATTTTTGAGCATATTCATTGTCTTCAAGTTTTTGAGAAACTGGTTGAACAATAAAATTTCCGGTCTTTAAGAAAAAGATAAACATCGTAAATCTGCAAAATCTTGGCAAAGATATCATTATTCACTATCCACAAAAACTTGATTTTGTTAAATAAAGTGAGCAAGCGATCTGATCTACTAACACTTTACAACTGATTTCAGGTACCATTACATTTATTTTATAAGATTTATTAAGGTTCAAAGCTTAATTTTGAGCTGCTGCTTAAGCTTTTACGAAACGCAAAAGCTTAATCGACTTTGGTAAGATTTCGAGTGGAAAAGTTAACTTGTTTGCCTAACTTTTCCAAAGTAAACTTTTATTTAATTCATTAGTAATTATCGAACTGAATTAAACCTCGTAGACGCAAGGACAGTAGTACCGTTCCGTCCTCTAGGTGTTGCGGCTCTGGCATCAGTAATGTGTGCTGCGCCAGTATAAATGATAGTCGAGACACTAGAATATAAGGTTTCTTTAAATACTGGTCACTAGAAAAGTGTATTCGGTTAAAAATATTTAACAGGTAGTACACCCAGAAAAAAGATGGACAAAATTGTATGTCAGGCATGCCCTAAATGGACTTAAAGTTCATTTTTAGGTCATACACCTCCCAAAAAGTTTGCCACGCTTTTTTTAAGAACAAATAATCGAGCCACATTTACTACATTGAATATTTTTGGGCTTATGTGTTATAATATGGTACGTTTTGAAAAAAATTTTTCATGTTTACCTATGATAGTAGTACAAATTATTTATTTTATTTGTTTTTTAATAGTGAACTAACAAATTTTATCTTGCATCTAAATAAAAAATTTTTTTAATTGTCCGCGCTGGGTATCGAATCGGGGTCTTCTGCGCGAGAGTTCGATGCTTTACATATGTATGACTTCATTAGAAATATTAAAAATAGAATTGTATGTATAAAATAATTACTAATAAAAATAAATTAATTGTGTTTCCAGCAGAACTCGAACTTCGAACCCCGAGATCAAAAAGTTAGCTCCCTTGAGCCAAGTCCATATAATTTTATTACCAACAAGAAATGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAGTAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTTTTGAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATAATATTTCAAAAAGCTCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTACCACCAATTATCCGATCGATTCTATGACAGCTATATGATATAGTTGTCCGTTTTCGATAAAATTTAACTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGATTATATGTTAAAAAACACCAAAGATAAAATATTTTCAAAATGTCCGACTAATTTTCCGATTAATTCAATGGCAGCTATATGATATAATCGTCCGATTTTGATAAAATTTATTTCGAAATTCAGAGCTAATTTAAAAGTGCGTAGGATGTAATATGTTATAAAACACCAAAGATATATTTTTTTTAATTCAAGAATATATATACTTTATGGAGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCGCTCTAGTTTGTGCAAGGTGCTATCCGCACTCTAACGCAAACAAACCCAACAAAAAATTTTTACTCAAAGATTAGTCTCGATTGACCTAAAAAAGTTATCCACGGCTACAAACAGCCACAACGTATAAATCTGTCCCATCCCAAATATTAGCACACCATTGCAATTATAAGAAATAATCAACATAAGTAACACCAAAGATATATAAATTTAGATATATAGATATATATAATTATTCTTAATCAGTATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGGCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACTATGAGATCTCGAAAACTATAAGTACAAGAATAGTCATACTTTGCATGAAAATTCCTGGGCTTTCCACACAGCACAAGTTTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTCTAAAGCCCACAATCCGCGAAAATCTGTTGCGCCTACAGTTTTTATAATAGAAACAAAATTTTAACTGAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTTACCAAAAAAAGGTGACACGCCCAATCTAACGCCTAAAATGTCCAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACATCTACTAAAACAGCTGGTAGGTGGCGCCCTAAATTATCGCTTTGCTGCTCATAAAAATGTTCCACGCCCACCCTAACGCCCACAAACGGCTTAAACGCTTTATTTTGTCTGCCGCCCACATATCATATACTGAATAACATATACGGTCCTGCTCCTATCTGATAGTCGAGGCACTCTACTAACGTTTATCCTTGTTTCATATTATTTTCTTACCAAACTTGCGATTATTCCTATGGCAGCTATATGATAATAGTCGTCCAATTTTGATAAAATTAAATTCGAAATTCAGAGCTAATGTTATAAAACACCAAAAATATCATTACAAATGTTTGATCAAGGATATATACGAGTACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAATATTAGTCAAAATATAATTGTTAATTTGTACTTACTTAGATCTGTATTATCGTCCAAAACCTTATAAGCTGCAATATTGTACATACGCGATCGTTTTCGAATTTACTTGGACAACGATCCGAAGCATTTATCATAAATTGTGAAGGCATGGCTTGTCTGGAACTGCCCTCAATACGTCATAGCAAAGCACAGTCTTCAGATTTGAATGTGATCGAAAATTTATGGGAAATATTTGATATCGCATAAGGAAGGGAAATATTTTTAATTTGGAAATCGTTTTAAAGCTGTCTTGAACCTTTTTATGTAACTGCACGAGCAGTTTCTGCAAAACAACTTTATCCTTCAATGTTTCTTTTATAATGACCTTGAATGAAAAAATCAATTTGCATTTCAAAACTACGAGTACGTACAAATACACTACTAAGTGACTTTTAGAAATTGAAAAGGAAGAACGTGACACTCCATATGCACATTTCAAAAGTAAAAATTCTTCAAATTAAAATTTTTCAAAGTCAATCGTTTTACTTGTTCCTTTACTCACTTGTCTGATGGCCGGAAGGTAACACGTCTCGTGTGAACTCACTTATCAAATTCAAATTATTTCCAATAAGTTTTCATTCATAAAGTCCCCTTCAATGAGTTTTACCCTACAAAAATATTGATTTTAAAATACATTTTTTATTATTATTTATTTTTATTACATCATTATTATTTCCTTTATTTTAGTTAAATTGTGTTAATTAGGTTTTTTCTTGAATAGTTAGCCTAGTTTTGCGTTTTGATAATTTGTGTCTTACATTCGTCATTGCCTTCCTTTGGCAGGGTCCTACGTCTTAAAAAATTAAGTACTTTAAACATAGATCAACGCACAACACTTGCACTCAAGATAGCACTCACCTGACTTCATTATTTGAAATGCAATGTATGTAACGTGGTCTTACCGTCAAGCCGTCAAAAATTTGGAGCAATTAAAAAAAGACGAATCTAACAAGAAAGGAAATTAACTTCGACAAGATAAAGCTTGTTTACTTGTTATAAGAAATAATCCATGTCAGTTCCA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATTATTTTTTTTAGGCTAAGCACTTAACATCTTCCGTAATTCAAAACAATCAATTTAAAATTTACTCCAGTTTTGGCAGGATATGACCTCGAACCTTTTCGCATCGACACCGAGAATTGTTTTACTTTTCTTCGATTCTGCATTATCAAGGAAAAATATGCAATTGATATCAGTTAAAAAGAACCTTCAATGGTAGATAGGTAATCGGTGTAATGGGCGGCAGTCTTTTGGGTCGGTGCTGAATGCTTGCCTAAGTATGGACTCAACGGCTATAAGGGGTGTGCCAAGACTATCCGAATACAATACTGGGAAAAATGTTTTCTCTGCCGACTGGTCATAACGAAGTTTTCGCTATTTTGCATTACTTCTTACAAAACGAAACATGGCCCTTTAAACCACTTTCATTACATTAAAATTAAATTTTTGTTGAAATTTGTGAGGATATTTATTTTAAGTACATTAATGTCGCAGGGGCGAATAAAGGAAGTTTTACTTTTAATATGCATGACCGGATGACCATTTTTATTAACATCCAATAATATTTATATAATAATATTTTTATTATTATTCTTAATGAAGAAGAAGAATTGATGGAGATCATCTGTTTTTTTTTACATGTTAATCTTAAAGATATTAAAAAAAAAACACCCAGCACTGTGTTCTTTACACGATTTTCTTTTTCTTCGTATCCTCCGATTTGTATTTAACAAATATCGACCAATAAATTTAATATAAAATTATCTTTTGGAATCAATATAGAAAACAGTGGAAGACATGTTTCTTGCTTCCAAGCAGTTAACAGGTCGGGAAGAATTAATACGAGGTATGTACAGGTGTCGGAGAACACAATGGAAGAAGCAAGGTATAATCTTGCCACTCACGTTATGTCAAATGGAGTAGAACTAATTATTGCCTGTGAAAGGGAAAAACCTATGGAAAAGATCGTGGCAACTACCCAAAAACTTACAAATGTTATTAGTCGACTGATAATACAACAATTCGACAAGCCCTCGACTCTGGCTCCAAGTACATTAAAAAATCAGATGATTTTAACATTGCCTTCAATTAAACAGGTAAGATTTATTACAAAATATTGAATAATTTACAAATCGCGTTAATTCATTCTGCAGGAAACCATTTTACTTCCTCATAATTCTTTTATTACAAACATTTTTCTAACCACGTGCACCTATATCACAACATATGTGGAAAATGGAAGCTCGAATGTAGTAAAAGAAAAAATGGTTATATCAAACACCATTACGCAAGATCGAAAGTATTTGCATGCAAGTAATCCTATGATAATAGACATCACTTTTTCAAGGGTAAGCATCAAATCAATTGTAAAATTGCACGTCTTAAAACTTGTTTGTTATTTTTAATGTTCAGACTCCAGAACTAGTGGTTGGAATGTTCCCAACAAGATATCATTATTTTAACACAATACGTAGAGACCAACCGGATTCAACTCTAATGGTAGTCACTTCAAAATATACTGTTATAAATACAATCACGAGACCTGCACATTCTTTGACTTTTATAAATTCAGGCGACAATCTTTCGCCCACCACAAATACCTACATCAGTCAAATATTTTTTACTAAAACTGTCTACGGCAAAAACCAAACACCAACATATGGCACAAGTATAAGTAATCTTACACAAGTCGTTATTACAGAATCCCTTTCAGAAACCGGTCCAGCTTATATAAGTTCAATAGGACCTGAGTATTTTTCAATTTCGGACAAAAAAAAAAATTATTTACTTCGGTAATAGAAATATCTGACTATCTAATGATATACTCAACCAAGTCCTTATTAGAAACGAATACTCTATGTTCAGCAAAATTTAATAATAGTTTGACTATGGTAGCTTCATATGTTTCTTTGACAAAGACAGTCTGCGAAAGTGATCCAAAAGTATCTAACAATAACTTAAAGCTTCACACTAACACTATAAATAATATTGCTACCAATACAGTGGGTAGTTCGCTGATAAACTCAGATCTTTTATTTTCTATCAAATCCGCACTTATGCTTAAAAAGAGAAACAACCAACGCCAAACTATTGTAACAATGGCCACATTGGGGGCAGGTGAAACTATTAAAGTAACTGCCGTGAATATAATCAAAAAACCAAATTGGAAATATATTTCCACTTTGGCAAAGGCAAAGGAATATTGTAATTCTGAAATGAGTGATACATGTACATCTAATGACACAAAATCAACTTTTAGTTCAAAACTACCCCACTTTTCTGAAAATACTATAAATATATCAGAAAAAAGCAGCGTCATCAAGAACATTTATAGGAACAATATTACACAATTTTTATTAGAGGAAACTGAAAATAATGAAATGTTGATAAAAAATAAAAAACTAATAAAGCCTTCAATGTTCAGTTCATTAGTGTCTTCACAGGGCACAAGCTCTGAAAACTGGAATTTAGAGCGTTTTCGCCCAATGCTGAATGTCGTAGCAAACTTAATTAAAAACCAACTAACTAATACACAATATACGCAACTTCATACACATTCATTTATAAAAGGCAAATCAGGAACAACAACGAAAAATCCTATTTATATACCTTTAAAGCGAAATGTGAAAGGCAAACCCTTAAACATGACGAATGCAAAACCAAATACGGCTGATTTACTCGGAAAATTAAAAATTATGGCATTACATATACATCCCCCAATGACGTATGTACTAAATAAGTGTCTAAAACATAATCTAAAAAAACTTTCATCTTCCGTCGGATATAAAGGAACATCTATGGTGTATAGGAACGCGTTCATTAATCCAGGTATTCCCATTAGACCCGGAGAGGTTATAACAGCCAGCGCTAATGTTATATTTGGAAAGCCAAGTATTGAGCAAAACATTAGAACTACGATAACGAATCGTCCCTTAACTTCGATAAATTCGATTTACCCCAGTGATGAAAGGATCCATTCCACTATGGTACACAGTTCCTTTTCGTATGAAAATGAAATTATGACAGAGTACGCCACTTTATTAAAGCCTCCACCACTGCCTGCAAATCGACTACTACAGTACACATCAACATTCCAGTCTCAAATGGGAAGAACGAGGAATGCTGCAAAAAATTGGTTTTCACCAATTACAGTTTTACAAAACAATCCGATTTATGATTACTATTCATCTGAGACACAAATAAACTTAAATACTGACTTTTTTGTATTTCGAATACCACAAATTGTTGGTGAAAGTCGGCCAGCTACTGCAAGTTATACTGTGTCAAACACGCTTGACTATTCTTTAATTCATGATTGTTCTTTCGACTCTTTAAAACCAACTTTGTCTTACATGACGCCTATTTCTACATTTTCTACCCTTCACCAAATTAACCTTAAAAATGACGTCATTAGCCATACAATTAATATGCAAGCTCGCCCTCTAACGTTTAAAAGGGAATCCGATAATATTCCGCACGCAACAACCGTAAGAGGTCATATGGATAGTTTTTTAATTTCACAAATTAAAATACCTTTTAATGACAAAAATGTTGAAGTCCAGTTGACGGCCAACCGGAAAAGAGTTTTTCCCGTTCAATATAAGGACTTAACGTCAGATGAGACTAATATTAAATTGGAACAACGAACTAATATATTAAGCAACTATGAGAATGCTCAGCATTTATTTTCCTTTAAGGATATTAAAACCCATAGCGGATTAAACAATTATACTTCTATATACAAAAATGAATATTTTTCTCAAACTACTTCTAACCTCAATCATTCAGATAATATGAATGGTAAACCAATAAGACATGATAATGGAATTCCTAAAGAAAATATAGAACAATTTACAGAGCTAGATCAAAAAGCAGAAAACTCAAACAAATCATTGTACTTTTTAAGGTTTAATTCTACTAAAAAACGCGATCTTAACAGTACAACTACATTAAATATCTGGTCTTCAATGATTAAATATTTAAGTATAGCCATGCCTAAGAGTG'..b'AAAAAATGTTGCTTTTGTTTATTTTAGAAATAGTTATTGTTAAATTTCTCATGTGAACGAAGCTGGACATAAATAATATTATTAAGCATATTATTATTATTTCCGATATGCCAAGGACCGTGTCTACAAGTGCTCAAAGACCTTATCGAAAAAATAAATGCAAAATATTGCCTAACATGTAAAAACAAGTTTTTTTATTCAAGATTTCCAAGATTCCCAATGAAAAAGGCCCTTCTGGTATATTCTACAAGCGTCTGTTAAGTCACTTTTAAGTAACTTCCAAAAGTGACTTCGGCGATATCGCATTCGGATCGCGGAAGTCACTCCCGTCGGGAAGAAATGTGCCACTTCGGAAAGTCACTTCGGCGACTCTTCTTGAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTTGAGAAGTGCCGCCGAAGTGGCACATTTCTTCCCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCTCCGAAGTCACTTCTGGAAGTTACTTAAAAGTGACTTAACAGACGCTTGTAGAATATACCAGAAGGGCCTTTCCCCATTGGGAATCTTGGAAATCTTGAATAAAAAAATTGTTTTTACGTGTTAGGCAATATTTTGCATTTTTTTTTTCGTTAAGGTCTTTGAGCACTTTTAGACACGGTCCTTGGCATATCGGAAATGCTGCTTAATAATATTATTTATGCCCAGCTCCGGTCACATGAGAAATTTAATAATAACCATTTCTAAAATATTTATATTTAAAATAAAAATAAATTTGGAGGAATTACCTTTTATAATTAGGTGGAGAATCTTTGAATGCTTATTTCTCTGCAATCGGGCCAGGTAATGTAAAAATATCTTGAAGTAATTTTACAGATTCACGTAAATTCGCACTCTATGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGTAGAATTTTTCTGAGTCCATTTACCTCTTCGCTGCTTTTTCGTCACCATGTAAGCTTTAACTCAATCGCATTTTAAATTAACTAGCCCATCGGTTGTGGTTGCTTTAATCGTCTTTACTCAAATGAATCCTGGTTCTTTTAGACTACGGTTTTCTAGCTGTCGGTGCAGCGGCAGAGTAGCCGTTTTATATATTTTATATATAAGTAAAGTAACAATACGTATGGGAACCATGCTGACTCAGCTCTAAGCGCGGTATGCTAAGAGTGCAGATCATATTACGTTTGCACTTGAAATGGTTGTGGGCACTTGGCACGTCCCTGCAATCATTTTCTCTCGCGGAAGACACTTCTAAGTGAATTCTAGAAGATGAAAACTATCTTCCGCGATATCGCATTCGGATCGCGGAAGTCACTCCCGTCGGGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGACACTTCGGGAAGTCACTTCGGCGACTCTTCTTGAAGTGTCGCCGAAGTCACTCCTGGAAGTGTCGCCGAAGTGACTTCGAGAAGTGCCGCCGAAGTGGCACATTTCTTCCCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTTTTAATGTGTTTTTAATTTTAAATTAATTTTAAAAATTCCGAAAAACAAAGCAACACACAAATTTTATGAAAAACTGGACTGATCACAAGCAAATTGCGCAATAAACTGACGCTCGGTCGAAAAACAACAGCGTAGGTAAAAAGGGAGAGGAATTTTCAGAAATAAAGGGTAACGGCACTTATCGTGTCCTCCTTTTTCCCAGTAACTTTGTTTTTGTATCGTCTAACTATCGAAGGCACTTCTTTGCGTTCGAAATGTGCGCTATCGCCTTTCTATCTTCCAGAAGTGATATATGTATATTTTGTTTTTGTAAAATGTGTACTATCTTCTTTCTATCTTCCAGAAGTGACTTAGAAGTGATTTCTGGACGATAGGCATACATGTGTACTTCACGGCTCGACATATTACTAGGTAAATCATTTACATTCATACATCAAATTAGTTGCACTGATGCACGCGCGAAATTACATAGACGTTTTAACTTAATACAAAAAATTTCGTGATTTACCTTATCAAATGCTTTACTATAATCTAAAAGAGTCAAAAATGTTATGTTGTCAGTATCCATTTTTACCCTACCAACTATTTTTATTATAGCTGTTTTACAGCTTCTGCCAACACGGAATCCTCATTGCTTATCAGTTAGAATGTTGTTAGCTTTTAAATAATTCCTCATCTGATCGGGTACATCAGGTACTTTACAGTCTCACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATATCTTGCAGTTATAAAAAAAATTAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGATAATGTCAAAAACCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTCCCACCCAATTTTCGGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCAGATTTTGTAAAAGTTTAATTCAAAACCAAATAAAAAATGCTATTTCCAAGCGTAGAAGGTTATACGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCCATATTATTTTGCCACTAATTTTCCGTTTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGGTATCCGATTTTGATAAAATGTAATTCAAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCATGCTTAGAAAGCTATATGTTTAAAATAACCCAAAGATAATTTTTTCTTATTATTTTACCACTAATTTTTCGATCCTTCATATGGCAGCAATATGATATAGTCGTCCGATTTCGATAAAAATTGAATTCGAAATTCTGAACTAATTAAAAATGGTTATCTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAAATATCATTTTTTTTAAACATTTTTTCCCCGATAGTTCCCATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGACTCTCTGCAAGGGTATAAAGGGTATTAAGTTCATCAGGATTGGCATCGTATCGGGTGGTGTTGGATTTACCAATGCCTTCTTAATATCAGCCCATTTCTGCTGATTCGTTGTTGCCCTAGTAAATCTGTTAGAGAAATATTTATGTCTCTTGATTTATTAATTGTGAAACTTTTTTCTTAAAGTTTTATATTGCACTGCGTGCTGGCCTGTCTTATATCGCTCCATTTTTTAAATGCAGTACCCCGTTTGTCAATAAGTACCTTAATTGCTAAACTAAACCATGGAATTTCATGAGCCTTGGTTATTTTTGTCACAAGTAAGTTATACTCGTATTATCTTGTAAGACAGTGAGAATTAATATTTGTATAGTCATAAATAGAGACCCAGTCACATAAATTACATTCGGCACTTAGCAAGGCGTAGTAAATATTTTTTCAGTTAAGTCTGTATTAATATTATAAATTAAATAAATTATATCGTGTTTTGAAAACTTTGGCATTAAAAGTTGACTATACATGGAAATTTTATCACAGTCAGTTACAAAAAATAATTCAAGTAGTGTTTCACAGTGGTATGAAAAATTTGTAGGTACTGATAAGTTTACTAAATTTAAGACGATAATTTATTTTCCCTTAGCATATTGCTGTTGAAATCCGCAGCAAGGATAACATCCGAATAAGAGATAGATATAGAGGATAATATGTCAATTAAATTTTGATAGCCAATAAATCGGTGTGGTCTATAAAAGCAGCCTATCAAACTTTTTAATGAGTATAAAGTATTTGTGATCTGAACAAATATCCATTCAACGGAACTATCACTCGGATGTTTACAGAGGAACTTTGAATTGAGACGATTACTTACAGCGTGGCTGCCTCGGTCTGAACATAAGACGAAAACTACTTTTCGGACAAACATATAACATCGATATTTGAATTAACAAATACCTAAATTCTTTAATTATATTTACTAAGCTTTGCGCTTTAATATGGCATACACTCGAACTCGGCGTGCATACATTGTCAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCATCACAAACAAAGCAGACAATCAGTAACTCCTACGCACCTATTGCTTTTGCTATAATAATTAGTCCACGCACCACTATTAAGCAGAAAAAAGAGTCTTGAGAGAGAGTGAGTAACTAATAAAAAGAGTCGTAATTTTAAGAGTTAGAAAAATCTTAAATCTATAAAGAGAGAATATACGAATGTAAAGTACCTAGTTATAATTAGATTAGGATACAGGAACATATCAGCGCCGAAATTCCTTCACAATTCGCGAAGATTCCATCTATGGCAGATGACGAAGATGCAGAGCGTGACGGAAGAGGGAAAGCTGGCTTGTCAGCGCCAAGGTCTTGCGAGAGCGCTAAAAGCTGATTCTCACTGATTCTCACTGCACCGGACGTGGACTAGGCCTCTGCGGGCAGACACAGCAGAGAGCAGTCTGCGCTTTTTAAGCTTCATGCCTCTTTAAAAATTACATAGTGCTCTCTCAAGCTGCTCGTTAACGTAGAGAGCGGTTTGAGAGTCGAAGCCCATCATATGCAAGCTAAGTTGTTGTTTTGCTGTGCGGCGATAAGCTCCGATACAGCGCAGCAGAGTGCTATGCCCACCGGGTCTACAGAAGAGTTTTGTGCTTTTCTGTCCCGGAATAGCTCCATGATTTTCGGTGGCGGTGTTAGTTTAAGTGAGAAACAGAGCTGGTTATACAACACCTTCAAGTTTCTTCAAGTTTCCCCCTCAATAAATGGAATTCCATGCACGCGTAAGTCACACGCCTGATGTGCCATTTGCTGTGCCGCCAATTTTGCCTCGATCGAAGGAGACGTTTCTGACCCCATTAAGTATATATATTCTTCATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGTTAACGGGCTGAAACTTTCCTAAAAGTTTTATTTCGTTTGCAAGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTAACGGGGAAAAAATGTTAAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTATCTTATAACTTTCTAAACTTGAAACTCAATTTTTTTAATTATTGCTGAATTTTGAATTAAATTTCATCAAAATCGGACGACTATTATCATATAGCTATGGCCATAGGTAAATTTAACATTTCCTTCTTCTTAACATTTCCTTCCAGATTGCAATAAAGAGATTTGGTAGAAAAAGTGCAAGCAAATCATGTATATATAAATATGAATTAAACATTAAAACGCCTTTAAAAGTAGCTAAAAATTAAAAAAGATAATTTTTTCAGTTTTCGGGGAAATGATAAGAGGCTATGATTCCACTGTATTATGAAAATATGGCCATTTATCTATGAAAGTTTGCCAAAAATACCATGATTTTGAAGATTATGTTGTTTTGGTCCTGATTAACCATTTGCTGTAAATTACAGCAAAAGTGAATGGAGATCCTATTTTATAATTGATTTTTAAAATAAGAAAGGAAACTGACTTCAGCAAGCCGAAGTTTATAACCCCTTGCAGGTCGTTGCCGTGTATTTTATTTTGACTTAATTATCTGATGCTTAAAAATTTTAATTCCAAATTATGAAATAGGAAAGGGGAATATCTTCCAAGGGCGTCCTCTTAACTGACTGACGGGCTCTATCAGTTTCCGTTCTGCCTCCAAGCACTCAGAAGCTGTAAGACCTCGACCTCACACTCGTCCTTTAATCCACGACACCGTCGTATAAACCTGAGGATTAGGATCGTATGAACCTGACCGTCTGCCTGGTTCCTAATACGGCTGCTTGGAGCTCCAGGCGTGGGATAGTTCATCGGGAAGCATTTCGTCTTGGAACACATGAAGTAAGACGGCACATCATTGTCGTCATAAGTCGCCCTACAAAATGCAACTGCTGCGAACGCCGATCGGCTGGAGTCCACAAACAAATGTAGCTGCAGTTCACGTACGCATCCCGTGCCAAAGAAGTAGAGTGGACAGCGGAAATCGCTCACGTAATTCATTTCAAGCCTCCAGTTCTCAAACGCTTTGGCTAACTTATCAGCGGCTCGTCTCATTAAACTCCTCTCCTCCAAACCTCGTTCATCAGCAATTTGGCGGTTACCATGAAGAAGCTCAAGAATCCTATCGGGTCGAATGTCGTCATAGCTAGACTTAAGAATTTGCTCTTGGTGGTCTTGGTGGTATTTTACGCTGAATTTAAAGTCATCCGTCGCTGGGTGCCAGTGATACGCACTGATGGCCTGCACCGCGCAATGTTCTGCTTGGACGTATCTTGAAGGATTTATGGTCTTCACTGAGCACGGCGAACAAGCCGCTCCGAACGTCATCACCACCATTTCGTACAGATCTGAATCTCGGCGGTCATCTCCATTCCTCAACAGAAATCTCGCGCGTATCTATCGTGGGGCTCAGCACCTGATAAAACTTCTCCTTTATGTCTGTGTGGTCCGACTGCTCCTTCCCGAAAATGGAAGATCACGGCTGGCAGAGACTTGAACTGTTGTGGGCCTTTGAGTGGAACTGAATTCAGAGATCCTTTATGCTGCTTCAGGCGCCGTGCATAACCCTTGTTGACGTAGGCCTCCATGATCAAGTTGTAAGCCCGCCCAAAGTTGGCATCCCGTCTTATCTTACTTTCAATGTCGACAAGTCTCTTGAGTGCCATGTTATAGCTGTCTGGCAGGCTCACTTTATCATCTTTCCACAGCAATCCAGTTTGGATTCCCAAAGCCCGTGCATCGCCTAATTTTCTCTATTTCGAAATAGTCGTTGACTCGATCTCTGGATTCGTGAAAAAATCCGACTTCTTACAAGCCCAAAAACCACTCATCCAAGTTTGGTGGTGGTTGTATAAGGTCCTTCTGCTCCGAGGCTTAGTTGTGGCATTCAATTCGTCCTTCGTCGCGCTTGCGCCATGCATCCGTGTACCATGCGACCGCGATTGCTCCTTTTATTTGGCCATGGTCGACCATTGAGTTACGATGGCCGTTTGGGGTTGCCCACACCGTCATGCAGAAGGTAGTGATGCCTTATCTGGCATCCATAGACGTTACACTTCCCGTTTCTCTTGCAGAACCTGGACATGTAACCGTTCTGCAGGCACAAGAAACAAGTCTAATGCTTTCTTGCAAGCTCTATACGGGCTGCTGGTCTAGCATGGTTGAATTCCATACAGTCCTTGATAATGTGTTGCCCCTCGCGAATTGGACAGCCCCTGGAATAATCCTCGAACCAAACCTGGCCCTTCTGACTGGTTCTGGCGTATAATACCCTAATCCGTTACAGTCTGAACGTTACTCGGGTGTATAAGCGACTTGACTATGGTCGCGCTTCATCCTCCACGCAGTGCAATTAAGGTGCATTGGAATTCCCACGGTGCTTCCATTACCTGGCTGCAAAGTAGTCATCACAATGCATGGTGTCGAATAGGTTGGCGTTTTACTGTTTGTACTGAGTGTGACTTGTTTTTCTATTACCAGATTTCAACGCGTCACTGACTCAGCCGAATCCAGCTCCAGATTTTCATTCAACAATGGCTGCAGATCTCTACTCAACAGTGGCGGGAGAGCCACTTAAGCTCTGCCCTGGCGTTTTACTCAAACTTGCCTTCACCTGACGTTCCATTTTAAAGCTATATTTTCAAGGTTGCGAACCAGCAATTATGGCTGTTGTAGCGTCCTGGCCTGATCCATCAAGCTTTGAACCACCACACCGCTGCAACTCACCGCCCGATAAGCCCGGCACGTACCTCGAAGTTCCGACTCCCCTCTGTCCCTTGAAGTCAAGTTTAATTTAAGCCCTGAAAATTTGATATATTAATTATTTTCATCACTAACCTAATTACTAAAAAATAATCGGCGTCAATTTCTGCGGATTAGGTACAGGAAAAGTGTGACAATAATAAAATAAAACGAAAGAACAAGAAAGGAAGTTTAC'..b'TGTAATATCTACTTACTCAAATCCGCATTTTCGTCCAAATCCGTTGTGTCCACAAACAAAAAACTTGAATAAAAAAAATGAATTACAAAATAACAAGCGATGTCATCGTCAGTGCTTACATATTATATACATTTATATGTGCAGTGTATACAAGGGTGGTCAAAAGTATTTTCACTGGTGTCGCGTGGCTAGAACAACGGCCACGATCGACCTACTGGTAACCATATTCCGGTAGCTGGCAAAGTGCAACAGCCACCCGTTGACTCCAAAGATATTGGATACCGAGATATAGTAACCCTAGGTGGGAACACCTACTTTATCCGCTCCAAACTGGCAGCTAAGTAAAAGCTGTACTAGGGTATAAAAGACAATTAGAAAATGGGAGAGAACCCATTCTGGGGTCTTGCTGACGGAAGCCGCCGGCTCCAAGGAAAGGCGACCTTTCCAGGGCAGTCGTCCCCGGAGTCCTATCCTCCAGGATCAGCCACCAGGGTCCAGCAGCCCTTAAGGAGGATACCTATAGCTCAAAAGATTTTCATGTGTCGGACCACCGCCCCCATTATAATCAAAAAAGGAGCCAATATCAACCGCAAGGACGACATTCGACATACTGGGATGCTTGTAGCCGCAGTACTCGAAATTCTCATACGATCAGAGGCTTAGTGACCGACAGCATATGTCGAAAAAGTGGTGGGCAAAGCAAATAAAATAAAAAAACATGGGAAGCATTCAAAAATGCATTGAAATACATTTAAATCAAGTGAATCGGTAGTGCTGATCCTGATAAACAATTAGCGAAAACGAGTCTCACTACCAGCGTTACGGACGACGCGTGCCTCAGGCATATATATATTTTTTGTGTTTAAGTGAATTGGTATTCTTAACAGCAGCAGTCTTTTTCTTTTTTTTATTCGTGCAGTCTAAAAAGTTTTTTTTTATAGGCTGTTATTAATATGTGTGGACTAACGACTGACGACCTTTACGCTCTAATATTATTTTTTTAGGCACTTTAAATATTTATTTTTGTTATGTTGGAGAGGAGAGAGGCTTACCAAGATCCCACGACCCGAATACGACGTAGCTTATGCCTGCAAAAATGGTGCCTGAACATCGGACGCCTCTCCCTCGGCCCAAGTCCTTTTCAGGACTCAGGCACTAATATGCCTACATAAGAAAATATACTCGAAACTTGAACATGATTCGTTTAACATTTGGTATCAATTGAATTAATTTAAATGCCGTTTGAATGATACTATTCTTTTCTTAACTCATTTGATATTTATTGAAAAGAGCGAATTTTTGTGAAAATCTACTTTTTAAACTTTTTTCCTTGTCTTGAAAACTAAAATTTTTAGATGAAAAAAGTTTCTTAAAAAACAATAATAATAAAACTTGAAAAAGGATTTAAAAAAAAAATGTTGATTATATTTGTTTTGATTTTTTGAAAATGTTTACAAATACGTATTTTTCCGACATTGTTACCTTCAAAAAATCATAAAAAATATAAGAAAAATGATCTTTGAAAATATTTTTTTGCAAATAAAAAATACTTTTGACCACCCCTGTATGTAAGACCGCAGTAACACAAGATACACATTCCTGCGTAAATGTAACCACCAACTGCATTCTAAATATATATACAAATGTATGTACGTGCGGTTTTTGAGAATTGCATTAAAACACAAATATATTGATTCCTATAAGATTAGAATAATTATATGAAAACTACTCACCTGATTTTAAACACACTCATACTGAATCTTTTAATAATATTTACAATCTTCTTGTTTTCACATCCCGCAAAATTGATCCTATGTGTATGTATTGTCATTATCATGCTCACTTATTAAATTGGCACTCAAAATTTTTTTTCATTTCATTTATTTTATTGAAGTCATCAAATATCTGCCAACATAAACAAAGTACCCGTCTCACATTAAGTGGGCGGGGGTATAGACAGGTGGGTTGGGATGTTTTTTACATTCAGATATACAGAGCATTCAGTGAATATTAAATAGTACATTTCATTATACTACAAATGGATCATGTAAATAAAAATTCGTTTCACAAATATTTAAGGTGATACGTCGAAAGTGACTTACAGAAATGGACAACTGTATTTGACCGAGAAGGTAGCTTGAATTTACAAGATCAGTGATTAGTTTCTAAAGGAACATTACGCCGTGGAAGGTCCGACGATCCTTGAGGGAGGGCAGGTTCAGAAGCCGCAGTCTGTCCGCGTAAGATGGTAGGTTACGTTGGGTTTCCCAGTTTTAACCACGTAGTGCAAACAAAAGGAACTGTTTCTATACCGATGCGACAAGGTTCTGATACTTTGCATATTGAGGTGACCAAACACACGACATGGATATGGACAATGTTAGAGGTTGAGCTTTTAAAAGCTACTCTCTGAGTCCGGTTCGATAAATATGTCAAAATCCACTTAATCAACGTGATTAGAAAAGTATAAGATTAAGTTTTTCAATAATAACCGATAGTTCACGGAGTCGCAAGCCTTACTGAAGTCTGTAAAAATTACATCAGTTGGATAATTGTTTTTAAAAGAGTTTCTGATGATTGAAGTAAATTCCAAGAGATTCGTAGACGTTGAACTCAGTTTCAAAAAGCCATGCTGAGACGGGGACATAACTGAACTGCACTGGTTCTGTAGCTGAGTGTTAAACGTGATGACCCAAGTGTTGGATCATAAGGGGAGCCAAGAGCAGCAGCGCACGACGTAGAATTGGCAGCAACAGTTCCAAAGTAGCATCGGCACTGAGCCCGCCAGCTGCCTCTGACCGCAGAATTCTACCTTTAAAATTAGATTCAGCCTTTACAAACCAATCAGATAGATCCTAAAATCCTAATCCTAAATATTTGTCATAAATCCAGCAACAAATTGTGGGCTGTGATTTTGCCATTTAAAAGGCTTGCTTTGATGCAGCAGGCAGTATGTAGTATGTTGTTGTTATAAGCGTCAGTTATATACGCGTAGATAAACAGAGTAGATGTAGAAAACGCAGCGTGCAGTTTGGTCAGCGATAAGCTTTTCGTACGTGCGAATGTTTGCAGTAAAAAAGATAATACCGCAGTTACGACCAACAACAACACACTAGAGAGGCTTGCGGTAAACTCAAGAATAGAGTAGAACGACAAAGCGAAAACACAATCACATTTGATTGTAGTCTTTTAATTACGTATAAAGTCACTTTCTTTCGCTTTATAACTTTTCGTTAGGGGTGTATGCCTGCTTCAGCCGAAGCATTGACCAAAGATTTGCAAGACTCAGACAGATGTATGAGATCGTCGATAATAAACTAACAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCAGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCCGAAGTTTGTAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGTTATTTGTCAAAAAGCACTAAAGCTACAATTTGTTATATATTATTTTGCCACCATTTTTCCTATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTGACAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATTTTATTTCCTAGCTTAGAAGATTAAATGTTAAAAAAACCGAAGATATAATATTTCATATTATTTTAACACTAATTTTCCAATTGTTACTAAGTTTTGATAAAATTGAATTCGAGATTCAGGACTAATTTAAAAATGTTATTTCTAATCTTAGAAGGTTGTATGTTAAAAAACCACGAAGATTTAATTTTTTCATTTTATTTTACCACTAATTTTCCGATCGTTCATATGGCGGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTTTATATAATTTAATTTAAAATTCAGAACTATTTAAAAAATGTTAATTCCTAGCTTAGAAGTTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCATATGGAACCTGCAATAGAAAGAAGAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/152/d66/6d/scaffold_10-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATATCTTCATAACTGAGAGACTACTTTGCGTAGTAACGGACAGACAGACGGACGGACAGACGGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACATTTCCTTCGTTGCAAACTTCCAATTGCATTTTTATACCGTCCGCAATGGTATAAAGTCATAGAAGAAATCACCCATGACTCAGGTGTCGCGATGACGAAATATTCTATACTTTCTTAGGTGACATATCAAAGGACATATTTTTAAATTTTTTGCCACGTGTGATAAGGAAGGGATAAGACATGCGTGGTAACATGGCTGTCATCGAAAAATTGTCATGAAATGTCACGAGCGAAAAACGGACATCCCATTTGCTGAACAAATGTACATGCAATTTAAAAAAAAAAAAATTTCTTGAAATTTTTCTGAAGTGAATTTTTCAAATTTCTAACTTATATATTAATTATTTTTATTAAAAAATGAATAGTCAATTTTTACAAGCCAGATGCACGCGTAGAACCCACGAAACTTCACATATGTACACACATACTACGCAAAAGACTTTTGAATCGATCGCGAGCAAACGGTCCGAGAATGAGCAGACCAAGTGAAAACAGAAAAACTGTTCTTCGGCTGAGCGCGAGCCAAATTTGTATACGAGCAATTCAATCGGTTACTCTTGGACTTTTTACTCAAAGCCTCAGTGACGAATTCTTATTTTGAGACCGCACGAATCGGTTAACATTTATTTGCGAGTTATGTTGAAAACTGAAACTGAAAAGATAGGTATTAATGTGTTTGTAACGCCTAACCCATTGACAAACACCTAACCTTTATGTAGAACGCCAATCGATAGGTCGCCGATGGGTTATCCTATCTCTACCCAGACTTCTTATAATATTTATCTGTATGCTTTACAACTACATATATACAGTCGCTCGCATCTTAAGAAATAGCGTTACCGACCTAATAAAGTATTCAGCAACATAAGCCGAGTCGATCTATCTATCTCTGTCCGTACGAACGCAAAGATATCGGAATCTATACATCTGTAAGTAAGATCGTTGGGATTTGCATGCAGATTCTTGAGGTTTTGGGACATCGCCAGTTTATTTCAGAATCCCACGCCCACTCTGACGCCCATAAACGACAACGCTGAAAACAAACGCTGCTTGCGAAAACACTTTTAGAGAATTACTAAAAGAGTCAATGCAATGGTCCAAATCGGACCATCCATTAAAAGTTTAAAAGCAAGTTCGCCGTCGTTGCGGGTGATCAATTATTGCATATATCCATCTCCCTCGCTCTACCTTGAGATGACTATGTACTATTTGATTACTAGGATGCCTCACGCATATTCTGGGTAATATTAAAAAGGTATATTTTATTCTAGTTTCCCGTTTTTTGATGTTTAACCTAGTCGGTTATGGACTTTGAATGTCAATAAGAGGTAAATCTTGTTCTAGACACTTTTATTTTTCATTTGATAACTTGGTATTTTAATTATTCCCTTTAAATACACTGCTAAACAGCGTCAAAGTTTAAAGAACGCTGTACATCATTTAAGCAGTGAGCTTCTGTTTTTACTTACCTGATTATCAGGACATTTAGCGGTACGCATCAACTCCATTTTTGCTTCTTCCATTCGTTCCGTATCGACCGAATCGATAACAAACAAAATTCCATCGGTGCAGCTAAAACCAATTTAAGGATACATATGTAACAAGATTTTGAATAATGTTTTTATAATACCGTGTATAGCTTCTCCAAAGAGGTCTTAGTTTTTCTTGACCTCCAACATCCCAAACAAGAAAATGAACTCCTTTAGCCTTACCAATAGTACCTTGAACCTAAGAAATATAAGATTTTTGTATATTTGTGTTTAGTCAACGATTTCATAGTCACAAACTTTTTCGCAATTAAAACCAATAGTCGGCACCGTGTTTAAATACTGATCGAACTTAAGTCTGTATAATGCAGTGGTTTTCCCCGCAGAGTCCAAGCCTAACATTACTACATGGAGGGTTGCCTTAAAAAAACAGTATTTGTTATATTATAGTTTGGAAACAGTAGTTAAAATACCTGAGAAGGCAATGCGTCTAAAAAATTTCCGTTTTTTACCAGAGGTTTTACCATGGTTGCCCCCATTCTGTAAGTAAATACAAGTTTTACATTACTTATGCTCAATAAGATGTTCTTGTAATTCGATAACATAAGAGATGGCGATGAAGTAACCGATAAAATAAATTAGGTCCCATTTACACTAGAAGATTGAATCTCTTTTTTTTTTAGTTATTCTGTTTTGTGCTTTTGTGATTAGCGCGCCAAAAAAATAAGTTTCATTATCTTGTATTATTAAATCGTATTTCTATATGGTCTTTATGGATGCATGCACTCTGCTTTAGGAGCAGACAAGGGTCGGATGTTTAATATTCTTAAGTATTTTCAAAGAAATAAACAAAAACCACCCGAAGGCGATTCTAGTTAAGGCCTAGTATCCACATCGATGGAACTGGGAATAACTTATTAAAGAGAGTGAAAGGTAAATAAAAATTTACGTTTTCGATGGGTCCGTTCTAAAAAAAATTTGAGATGCGCAAGAACCAAGTCCCCAAAAAAAACTTTTGTAAGTTTCAAGATGTGAGCGTGACAGACACACAGACGCACATGTCTAGATCGACGAAATAATACTCCTTGAATGCGGACAGTCTCCCAGTGTGGGACCTGAACCACAAGAAGAAGGAAATTGCGCTTGTCATGGACAAAGTGACCATTTTGAGTTAGTAAATATTTGAAATAAATACAATACACAATGTATGAATGGATATAAGTTGAATGCTACGTTGATCAATCCCTAACGAGAATCAAGAGAAGGCAAGAAGGAATTGAACTGAAGAAAAAGCAAGCCGTGTAAACTTTGCTTCCCAATTTTATTTCCTGTCGGTCATGCTGTAACTTTTCAGCAAAACCACCAGTAATGCGCTTTCTG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGTGTTTTTTGTTGACTATACACATTATACATACATATACATTAAACATATATTGATCATATATTCATTCGAAGCCTCTAATGAATGAGCCGAAAAATGTCGTGGAATAACACCATGACTTATATATTCCAAAAGGGTAACTACTTGTACTTGTACTTGATTTCTTCTCTATCAAACTGAATATGTTTAAGAAAAATTTAGTTTTACTCAGATAAAACGAGAGCGAAAAGAATACATGCTTGTAGAAAATTGTCCACTAAAACACCTGGTGGCGTATTCTTCAATTTTGTGACGAAATAATATTATACAACCTACTAAATAAATAAACTTTAAAATTTTTCTCAATCGGGACGCTTCGTCTAAATCGTACAGCGAAACACAGTCATATTATATTGCAACTTCCCGCTTATACCATTGCAAAGGGTATAATGATTTTAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGAACCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTTCGTACGTCTGTCCGTCCGTTTCTACAAAAACAAGTCTCTCGGTTTTAAAGTTATCGGACTGAAACTTTGATGAAATTCTTTCTTTAGCAGGTAGTATATAAGCTTGAACCAGCCGGATCGGAAAAAATATTAAAAAATGATATTGTTTTTAATGATTGTTTTTTAACACATAAACACCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAGTTATTTCTGAATTCCGGATTAATCAGACGAATATATCATACAGCTTCCATACGAACAATCTGAAAATTTTTGGGAAAATAATATGAAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGGTACCCGTTACCCAGCTTAAGGCGGCAAAAGGTGATGAAGATATAAGCAGAAAAGCTATATTTTAGGGCGCCACCTACCGGCTAGTTCAGTAGATGTTATGCGGGCGGCAGACAGGTTTAAGCTTTTAAGCCGGTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTATAAGTAGCAAAGCTATATTTTAGGGCGCCACTTAGATGTTATATGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTAGCCATTTGTAGGTGTTAGAGTTGGCGTGGCACCTTTTTTTTAGTGAGTCGATAGGTATTGATGAGACAAATACATTTTAGTTAAAATTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTTGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGAAACAAGCTTGCGCTGCGCAGGAACCCCAAGAATCATGCCAAGTCCTACGGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGAAGGACATGGCTAGATCGACTCGGTTAGTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTAAGGGCTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTACATACATACTTTCTGACGAATCTATTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTATCTTTGGTGTTTTTTATATTATCTTATATATTTGGAATATCATATATATATTTTTAAGATTTAGGAATTCAATTTTAATAAAAATCGGACGACTCTAACAAATAGCTGCCAAAGGAAGCTAGCTTTTTGTCACTGAAGATAGTGTTACTAACTTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTTTACAAACTACCTTACCTTCCTTTCTTGTTTTGAGTTTAAATTTTGAGCGAAGCATCAGGCTTTAACAAATGAGATGTCATTCGACGAATAGTAAGTAAGAATACAACCAGACTAATGCGTTTGTGTATTCATCTACAAATGCCCAACAGATCACATTTTCTAAATTTTTCAGATTTGCATTTTACATTCACCACTCTTTTCCCCAAAATAATTGATTTGATCTTTTAATTTTGCAATACCGTTTGATTTAGGTATCCCTCGTAACGATATCACAAAATATTTGCATTTTTTCGTGAATATATCGTAGCTGCCTTCGCACACTCTACTGGTGCGCTTCATCACTACGTGAACTGCCTTTCACATATTAAATGAGACTAAAATAAGGTAAATATAAACGATTAAACATTTGACAAGAAATTATGTGTATGATGTGGTATAAAAATTGAAACGAAAATGTAACGGAACCGATATAACGTAAATAGATTGGTGAAATTAAGTTAATTCTTGACTTTAAACCGATAAGTTAGTACTTACATTAAGTCATGTAGTACATTAAGTCAATTACATGTACATACATATGTATGGACATTAAATAGTAATCAGACTGTTCTGATAAAAATTTCTAAATATCTACAAAATTGTAAATTTTAACAACAAATTAAAAACGTTAATGAAAATAAAGGTAACATAAAAGAGCTTTAACCAATATAAAAGTTTATTTATTCCTACGTATGTATTTATGAATGTATGTATGTACATAAAGGTTCATTTTATTTTTCCTTCCACCTCCAGCTTTCCCATCACAGCTCTTTAGCGCTGCGGAGCCCAATGACTTTATTTTCTTCTCCTTTTCTTGGCCCAGTACAAATTTTAAAGGCTTAATTAGTCAGCGGATCGAAACCCAAAAGGGAAAAAATGTTCGTCTTTAGCGGCGTTCACTCATACATGTATACATACATAAATGAATGTACAACCCGATCGTGTCTACATACATATATTCGTATTTCATACTGGTACACGAATACATACCTACTTTTTAAATCCAGTTTCTTTCTCCATTAAGCGACAAAGCAGGCACAGATTGAAGCATCATCATTATGAAGAAATTGAGCCAAGTTGGCATTTAAAATTATGTTGTCAATCGAAACAGAAAAAAGGGGAAACTGCTGAAATAACAAAATTAAGTGAAATGTTTTAAGCCTACTTACAAATATACATACATATGTCTATTTGCCTTACAAATTGTGTGTACATCTATGTATACACAGTGTATACAAAAAACATGCAATTATAGACAATTATTTATATATATATTACACTTTATAATTTAAATAATTGGACAACCACTTTAATGGTTTGTTTCTATCTACATTCGCAAATTATGACATTGTTTTCCCCTCAATTAGAATGAAACCTTTAATGCTTTTAAAGTTGGTGTTGCATACATACTTGTACATATGTATTTATTAACATAATCAGAATGACTTCACACAAATGTATATATGTACATACATTCACATATTTATGTATTCTTTAATAGTATTTCCAAGCAAGACGAACATATTCTCCTGTATGCATACATACATACATATGTACATACGTACATATATGTTCGCATTAGGGCGGACCTCAGTTTTATTTAATAGCCTAATTTTATTATAATGCACAATGTACAATATCAAAACAGTAATTCTGCAGTTTAAAGCAAGGAAGAGCTCTATAGTCGAGTGTCTAGACTATTAGATACCTGTTACTCAGCCTTTAGCTGAGCGGAGCAAAAGAGAAATAGAGCAGCAAAGCTATATTTTACGGCGCGACCTACCAGCTATGTACATATTTCAGTAGATGTTTTATGGGCGACAGAAAGATATAAGCGTTTAATCCGTTTGTGGGCGTCGATAGATTTTGATGAGACAAACACATTCCAGTTAAAATTTTGTTGCTATCATAAAAACTGTAGGCGATACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTGACACCCCACTGAAACAAACTTGGGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATCATGCATGGCTGTTCTAGCCTTTAAAGTTTCCAAGATCTCAGCGTTCATTCGAAAAGACGGATTTTGATAGATCGACTCGGCTAGTGATCCAGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGGCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCGACAAATCTAGTATACCCTTTAACTCTACGAATAACAGGTATAATTAAAGTGATGGTTGGATGTTCTCTTAATTACTGACTAGTTAAAAGGTAACAAAAAATT'..b'TTCCGATCGATGCTATGATTTTATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAAAACCAAATAAAAAATGGCTAGATCGACATAGTGACGTTAATATCAATGAAGCCAGCAACAATCCTTAAAACGTTGATTATTTCTTATAAATGCAAGGGTATACTATTTTGCTTGCTTGCCGAAGTAAACTTCCTTTCTTGTTTACATTAAAGCGTATCATACATATATATTCTTATATGAACCTATCTTGATCTTGTTACTCTTCAATTTACGGGTATAAAAATATACTTTCTCTAATCTAAAATTTAATAACACTTTTACAAACTTTGACCTTTATTTATTTACCTCGATGATTGCTGAAGTATCTTATTCGCTTTAAAACAGTGTTTCAATGGAGAATCACAGCAACCGTCGGGGTAGTTTTTTTTATGTTTAAACGTCTAATCAGCATTATATATTTTAACTTATTTTTAAGCGATAACGAGCTATAAAAGGTTGACGTCTTACCAAATATGTTTTATAACTTATCAATATTAATATATTTGTTATTTAAAATTTTATTTTTTTCTTTGTAGGAAAAGGGTCAAAAAATTGCGCGGCCGGACCACAGTCCTGTTTTTAGTAAGTATATTTTAATATACAAATTAAACTTTCCTGGTTATCGAATGGATTGCTATAGTCGAGTGCTTCGACTGTTACATAACTCAGCCTAAGATAAAAAAAGGGTAGATTTAGATTTACAAGCATAAAAACGCCTCCTACCTGTCCCCAAAAATACCCAGTTTTATTATTTTCTTATTTTGCATTATCAAGTAATTAAATTATGTATTATAAAAATAAAAAATTTAAATTAATTGTACCGGAGCATGATTTTTTAAAACGTTATATGCGCTTGATAGTTATAGCTCTTTCTTTTTCTCAAAACAATGTTTTTATAACATGGTGGATGGTGAAATGTTTATTGTACAACATTTTAAGAATGTTGTGTTGAAATTTCATGTCAATCGGAAAAAACCTGAAAAAGATATGACCATTTAAATGACAGGCCGTTTATGCCGGTCTTTAGCATTCAAAATTTTAAACCGTTCTTCTAAAAAAAAGAGTAGGTTTTTTTTTAAATTAAATAAGCGAAAAGGATTCACTGTACGTAAAAGTTTGTGTAGCAACCCCCAACAATCATAAGGAGTGCTAATTTATATGTAGGTATACATACAGTGTAGGCAGTGTAGGTAAACAATGCATACAAATGTGTCTTGGTAGCCAATACAAGCTTGAACAAGGTCTGCCTAAATGTGCTTGTGTTGAGTTGTACCGGCAGAGAGTTAAACGTTGTTAAAACTAGAGTGAAAGAGATAGTGAATTTGGTAGAGACGAAGGAGGTAAGGTGCGTCAGATAAATAACCGGCTACGTTGATTTAAAGTTTGGCATCCACCGTTTCATGGTGCTAACAAGGTGATGAAGATCGTTCACCGACACGCTACTTTACTTCTTTTATGTTCTGGTAGATGTGTATTCTGTATGCGTAATAAATGCACAAAACTCCTAATACATATAAACAAAGTGTTTTAAAAGCTACATCAAGTTTAATAAAGCGCCGATAAACATTTTTATGTGTTTGCAAACTAATACTAATCATATAATATTTACATTTAAAAACGTAAAGAAAAAGTATTTACGAATCAATATTTTTCTCTGTGTATCCTTGAAATTTAATGATTTTTCGCGGAATTCTCAGTCTTGAGCTTTCTTAGCTTAAAGTTGCTATGTTGGCGATCGCTGGTTCTCGACTTGGTAACTTATATAAAACCAAAGTAAAATTTGTATAAGTTACTCCTTGATAAAAGAGTAAATATTTTTTTTTCGAAATTTTTCCTTCGAATTAAATGATTAGACATTAAGTGTACAGGTTTTTCTCATATAAACATATATAAACATATATATTGGATAAATTAAATAATTAACTTCTAAGTACGAAAGTAGCAACAAATTACAAAAAATATAAATATATGACTATTTATATAAATAATGGATTAAATTAAACAAGTTTTGTTGCTAATTTGGAAATCGAACTATTTAGAAACTAATATCTACAAAAACCCATATAAAATTATGTTTGTTTATTTTGATCAGTCTACAAGAAATAAAATTATTATTTATTTTATACACCCAAAAATATATCTTTGAGTGTCAATTTAATAAGGGTGGTTGAAAATGACATGCATCATTTTTTGGGATCAATTTGATCCTAATTGAGTGTCAAATGTGTACTACATTGTATAAAAAATTATATTTGACCATGCCATAGTTACTTTGAAAACGATAAAAGCTTTTTTCGATTGTGCGAGTCTCGAACTTTGCTCAATTACTGGTTTTAGAACTTAACGCCCGCGAAAAACGTTGTGCGACAGACCAGCTGGTAAGGCCTCTGTCACTGATCTGAAAGGTCTCTGCTTCAAGTTCGCACCGAAGCAGAGCCTTAGGTATTTAAGAATAATATCTAAAATTTGCGTATAATTGTAATAACAAAACTGTTTTATTTGATTTAAGACTTCAAATATAACAAAGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACCATCAGATTCCAGTTACTCAGCTTAAGGGAAAAATAATAATGGAGATATATAGCAGCAAAGAAATATTTTCAAGCGCCACCTATATATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGCCGATCTAGCCATGTTCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTGAAGCTATCGGGCTGAAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACAATCGGGGAAAAAATTAAAAAAAATTATATCTTTCGTGTTTTTTAATGTATATCTTTCTAAGCTTGGACATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTGCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACATTCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTGTAATATATAACCTTAGCTCGGAAATAGAATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGATTAAATTTTATCAAATTTTATCATCTATCTGTCATAGGAAAGATCCGAAAATGGGTGAGAAAATAATATAATATATTCTATAATTATAAATAATATTATAAAATTGGGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATATGGAATTAAAATTGGTAAAAATCGGACGACTTTAACAAATAGCTGTAAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATGAAATAATCTTTTTTTAATATCACTGAAGGCAGCAACAATCCTTTAAAATTTCACATGGTGTTACTAACGTTTATTATTTCTTATAACTTTTTTTATTTTTTTAATAAAATGTTTTGCTTTATTCCAGATAAACTCGATACACATGCTCCTAGCTTCAATATGGGATATTTAGTTTCACCCTATTCCTATGGAAATGGAACTCCAAGTGGATTGCCTGTCACAATGGTAAGAATATAAATTTCCGATATTTTGCATTTTTTTTCACATGCAGACATGTTGGCTATTCTACGCATATTTGCTTAAGAAATATTATAGTTAGTTTTAATTTTTCATTTTTTAATGAATAGGTGTCGAAGATAAACATTGCAGCGTAACTAATACATTAATAATCAAGATTCTATGTCTGTCCATACAAACACTAAAACAGGAAATTATTCCCCTTCTTGTTACTGTGGACGGAAGTCCAATTAGGGACGATACCGATTGAAAGATGTAATACAGTGATCAATTTATTTTAAACATTAAAACTTTTTCAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATAATTTATTAAAAAGAAATTGATGAAAATAAAAAATAAAGGAAATATGATTCGGCAAGCCAAAGTTTGTATACACTTGCAGCTATAAGAAATAATCAATTTTAGTAACACCATGTACAATTTTTAAGGATTGTTGCTGGCTTTAGTAACATTAAGAAAAACAATTATTTCATTATTTTGCTCTCGACGACGAGGTCTAAAAAGAGAATGAAATAATTTTTTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTGAAATGGTCTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATGCAAAATTCGGCTTGCCGAACTTAACTTCCTTGCTTGTTATCTTTAGTTTTGTAACAGATCTGATAGTCGAAGCTCATGACTCTGGCGTTCTTTTTTTTTCGCAAGGTGATTTTACTATCCACGTCTATATTACAATAATTAATGTTTTTTCGTTACCCAGTGGTATCTGTAAATAAACTGAATATAGTTGGTTAAAGGGTAAACGATGCATTTGTGTGTTATGTGAGATTATAAGCCTTCAGAATACTACTCCATTGTTGTCAACTCAAATGAAATCTTTAAAAAATTGGGGTTACTCTCGTATTTGTATTTAAAACAGCCTTAACAAGCTTTTGGTGGTTGTTTTTATGGTTTTTATTTAGCTCCGCAATACTTTTTACAACTTTATAAAACCGGAAATTTCTTGATATTTTATATTTTATATGAATTCATGAAACTATTTGTTTAAACAAGTTGTGTTTTTAAGAAAAGGTTTCAGAAAAATAAATACAAAGGAAACAATATCAATTGGATTACTACAGCTTGAGATAAGGATGTTTAAACAATAGAAATTTAAAAAAAATTTTTTTTTAGCAAAATATATCAGTATAAAAGTACGAATATATTTAGAGTAAACAATGAAAAACGCTATATATATATTTTTTTTTTGGGCACCACCTACCGACTCTTTCAGTAGATGTTATGTGGGAGGCAGCCAGATTTAAGCGTTTAAACCGTTTGTGGGCGTAAGAGTGTACGTGGCACCTTTTTTTGGCGATAGGTATTGATGAGACAAATAAATTTCAGTTTAAATTTTGGTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTATAGATTTTCGCGGATTGTTGGCATTAGAGAGGGCGTGGCATCCCGCTGAAACAAACTTGCCTTCATACGGACGCACGGACAAACGAACAATGCTCGACTAGTGATCAAGAATATATATATATTTTAAGGGATTATATATTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTTTACCAGTAACGAGTTTAGAGTTTCCAAAATATTTTCTCAATCTATATAAAGAAGTCAATATATATAAAAAACTAAGTTTGTGAAATTGAATGAAATGAAATTAGTAGTTCTAAGATTATATTTTCAGCTTTACGTATTCTAAGCGAACGGGTATGATCAAAACCAAAATTGTATATATGGGACAATTTAAAGCAAGTATATACCGTTCACATCACTGGTATCAATGGGGGTGGAAACACACTTTGTGAAGGGCGGCACGTTTCATATTAGAAGCGGCGACATCAAAGGATTTTTTAGTTTCACTGAATCGTTTGCCGTTGTACTCAGCAGCTTGTTTTTATTATTGTTTATGTGTTGCTTGTTTGTTTCTATTTTATTCGCCAAGGCGTAATAAGCAAGACTATTATCAGTGATAAATTGAAAGTCCATATTTACGCTTGATTTAAAAATGGGAGTTTGGTATTAATGTATTATTTTCTCTTTGCGTATTGCTTGCTTTTTTATTATAATACCAGATTCTTTGCATATATTTGATATAAATTTCAACGAAAACAAGAGGTATCAGGTTCCACTTTTTAGTTAACGAAAAAATTAGTTTGTCTACTACAGCCCACGCTAAAACGAAATTTTTAAAAATGCCGCTGGACCGACTTACACTTTTACACTATCTGGGATCTGTTTGCTGAGTTCAAAATTTGGTTACTCGTTACTCGTAGAGGAAAAGGGTATACTATATTCGTCGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTGAGGCAACCAAAATTTTGACACAAACTGCCCAAAATTGTGACAGCCACAGTTTTAACGCTAGAAACAACATTTAATTGACATTTATTTGGCTCTTGCATACCTATTGATTGACCTACACGGACAAATGGATAAGAATAGATTGACACGGCTAGTGATCCCAAAAAAGAAATCTAGTTTATGGGTTCCAAGACGCTACCTTCTAGCTGTTCATCCTTTACCCAAATACCATATACAAGTAACGGGTATAATTGAAAACAAGACGGGAATTTAAGTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATAACTTTGCAGTTATAAGAAATATTCAACGTTAGTAAAACCATGTGAAATTTTTAAGAATTGTTGCTAGCTTCAGTGATATTAAAAAAAATTTTTTTTATTAATTTTCTGACCGTTTCATTGGCAGCTATTTGTTAGAGTCGTCCTATTTTTATTAAATTTAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATATTATAGGATAATTGTCACTCACTCAAGTTATAATTTGTTTCATATTATTTACCCATCCAAATTTATAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTATGAGGTTGTATGTTAAAAAACACCAAAGATATGTATAATATTTTCATTTTATTTTCCCACCAATAGTCGTCCGATTTTGATCAAATTTAATTTAAAATTCATAACCAAATAAAAAATGTTATTTTTAAGCTTTGGAGCTTATATGTTAAAAAACATCGTATTCCTATGGGAGCTTTAAGATATGGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAGGAAAACTTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACCAGTTTGCGTAGAAACGGACGTCTAGTGATGCTGATCAAGAAAATATATATCTTATAGGGTAGGGTTTGCATTGCAAACTTCTGACTTTGATCATTATACCCTCTGCTAGGGTATAAAAAACTGATTTCAAATTTTCGTTTTTGGTGTAAAATGTATTCGATTAATAATGAGTTTTTTGTTTATTAGGCCAACAAAATTGGACTACCTCCGTTTTTTTGTCACAATACAGACCCGTTAACGACACCACCTCCAGCACATTGCGGAATTCCACCTTATCAACTTGATCCGAAGACTATGGGTAAGTTAAAACTAAAAAAGTAATAATTAATATATAAAAATTATAAGAACACTTAGTTTTGTAATGTAATGTTGTTGTTATTCCGTCGGTATTATTTTCAAACTAAATCTGTTCATAAGACATTTCGATTCCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTGACCAACAGAGACTTCATAAAATGAAATGTTTTATTTTTGTTTCAGCAAGTGAATTGCTCAGAAAAATACTTAAGTGTGAACCCCTGTTCTTAGCTGTGCGTTTAAGGTTGAAAATGTAAAACAACCATAAGCATATCCTGCGGTGCCCAAGCACTGTTTTTGTTGGCCATAATTGATTTACATTAGTGGACATGCGTATTTTGACAAAGAAAACATAAATGTTCTCAAATTTTCAACATACTGTACATGGGAAGATCATCTTAATTTCCGTATTTACAGATTGAACTTTTTCAAGAAAGGTATTACCCTTTTAGTAAACGATATCTGTATGATAGCACAACAAAACCGATGACACATACTTTTGTGTGTTGTTTTATTCTTGCGGCTTGTCAGTGGCCCTTTTAAATTTCTATAAAGTAACCCCGCCACAAGTTATTGACTTTTTCACCCTAGTCACCATTCACGAAATTCATTCAAATTATGAAGTAATAATTGCTTATGATGCGATTTCATTTGTACACATAAAAAATTGTTAGGAAATGATTCTGTCCCTCGTTGTTTG'..b'TTATGGCTTTGGCTGCAATAGCATTATCAGAAGAAAAGGAGCTATCAGTGAAGGAAACCACTGGTATTGACTCAAAGCTCCTCGAAATTGAAAGCGTGTCTATAAAACCTAAAACACTGAACGAAATAGAGGATATAATATTACAACTATCTTCAGCTGTTAATATGCATCAATCTAGTGTACCTTGCACCACACCTGATGTATATAGTGATGGAGTCAAGAGCGATTTCGTAGAAACAACTTTAATACCCAATTGCATTTGGCATACTAATAAGCAGAGATTTCGGCATAAAGAGGAGGGTGAGCATTGTACCACCGCAGCTGAAATTATTTTAGAATATGCTTCATTGTCTTCATCATCTAATGCAAACACGATACGCGTGCCTGACACTTTTAGATCTGTTTCCAACTTTACTGACGCTATAGAAAATTTTAGTGTCACAACACAGTCTCCTAATATTTTAAACAACAATCGTGAAGGCTCAGCTGTGTCAATCATTTCCGATCCTTCATTTTTTCCTGAGTTTTCTACTGCACCTTCTACACCTTCGACAAGTAGTAATAGTGGCTGCTCGACTGGAATAGTATCTGGAATTTTTGGATTGGGTCACAATCGCAGAAAACCACGATTCGCAAGGCGTATTGAAACTCAGACTTCAGATTCTTCTAAACCTAATGTTATAAAAGAGAGTGACGATCAGGAATTATCTAACCATCTTCTTACTTCGTCAAAATCAACTAAAACAGCAAATAATTTGTGCCCTCAAATTCTTACGACTACACCTTCAATTAAAATTGCTGTGACAACGACGCAAGAACGTTCAATAAGTAACATGTTCGAAGCACGGCTTTGTGCATTATCGACAGATACTGGATCCCTCGAGTCTGAAATTGTACCAATGCTGGATGCTCCGTATGACTTAAGTATTGGAACCAAGATAAAACCCATGTAATTTTTTATTAACTATATACTTTTATACCCTTGCAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGAAACGCAGTGAAGGAGGCGTTTCCGACCCCATAAAGTAGATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACATGTCGATCTATCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCTGCCCGTTTCTTAGTTGTAAAGCTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTACTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGACGGATCGGACAAGCTCCCATAGGAATAATCGAAAAATCATTTGTTTAATAATATCTTTGGTGTTTTTTCACATATTTAATTCTAAATTTCGAAGTAAATTTTTCAAAATCGGAAGTCTGTATCATGTAGCTGTGCGGAATATACCATGAAAAATGTATATCTTTGGTGTTTTTGGACATATAACCTTCTACGCTTGGAATAACCATTTCTTAATTAGTTTTGAATTTGGAATTTATTTTATTAAGATCGGGCGACTACAACATATATCTGCCATAGGATCGGTTGAAAAATTGGTGGGAAAAAAATATTGAAGAATTATATCTTTATTGTATTTTAGCATATAACCTCCAACGATTGGTAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAAATTCGAATTTAATTGTATGAAAATCTGTAAAATCTAACATGTAGCTGTCAAAAAAACGGTCAGAAAAATAATGAAATATTTTTTTTTTGTTTTAATATCACTGAAGCTGGCAACAATCCTTAAAAATTGTACATCGTGTTACTAACGTTAAATTTTTCTTATAACTGCAAAGGTATCCAAACTTCGGCTTGCTGAAGTTAACTTCCGTTCTTGTTTCTTTTTATAAAGATCGCATGTAAATTTGTGCCCTCATAGGAACAACCATCAAAGTAACCCAAAAAAGAGAACGCTATTGTCGATGTCGTCGACTATGAAGTAGCCTTTACTTAGCTCAATGGAGATGGTCTATAGTTATAGGTTTGGAAACGCTCCCTTCTACCTGTTACATGTTGTCCGATCAATGCAATATAGCTTTTTACTTTTCAGTAAAAACTACATTTCTACAAAAACGAAAAAAACCTAGCACAACACAATTAATCTGTAAAGTATAGAAACTCAGTTTCATGATTTTATTTTAAAAACTCTGAAAAGAATGCTCTAAAACGATTATTTATATACCCGTTATTCGTAAAGTAAAGGGGTATTTATTGATATTGATGTGGGCAATCTTACCATTCTCCCAAATTTCAAAATAGTACATTTGACCTTAATATCTCAAAAGCTATCAAAGATTCAAAATTTTGATTTTTGATTTAGCTTCGTAAGCAGCGCACTTTTGTCTCGTCAATATCTATTGATTCATCTAAAAAAGTTTACCATCCCACTCTAATCCCACAAACGTCCATAACACTTTTATCTGTCTTGCATCATATATTAAAATCGCGGGTAGGGGGCGCTTTACAATCTCTCATTGGTGCTTGTATATCTCCGACTCTCTTTTGCTCCATTTGGTTGAGTAAGGCGTGTTTGATAGGTGAGAAACTCGACTTTAGCGTTCTTCCTTAGCCAAAAATCGTCGGCGGTTTGTGTGACACCCTTGATTGAGAAAGAGATTCCGTAAGAACTTAATGATATTGGAAATTTTAATAACTTGAAATTTGGGATTTAACAAGCTTTTCTATTGGTGCCTACTCAACGAGTTCCACGTTCACTCTCACCAATCGCATAACCCGGTAGAAATTAAATGCTTCTATATTTATTTATTTAAATTTATTTAAATTATTTAAATTTATATATACTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTTGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCTTACAGCTCCCATAGGAATTATGGAAAAAAAATGTAAAAAGAATTATATCTTTGATATTGTTTAACATGTAACTTCCTACGCTTGGCGGAAAAATAATATGACAAAATTAAGTTTTTGGTGTTTTTATACCGGTTACTCGTTGACTAAAAGGGTATACTATATTCGTCAGAAAGTATGTAACAGGTAAAAGGAAGTGTTTCCGACCCCATAAAGTACATATATTCTTGATATTCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATTTCCGTCTGCTCGTCCGTTTAATTATTTTTTTATTAGTTCTGAATTGAGGTTTTAATTTGATCAAAACCGGGCGACTATATTATTTAGTTTTTATAGGAAAGATCGGAAAATGGGTGGGAAAATAATAAGAAACAAATTATAGATTCAGTGTCTTTTGACATATTATCATTTAATATTGGGAATATATTTTTTTAAATTTTTGAGAATTTAGATTTAGTTTAATAAAAATCGAACTACTCTAACATATAGATGTAAAAAAAATAGTCTGGAAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTTTTAATATCACTGTAGTTATCCTTACAAATTTCTCATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGCTATACAATCTTCGGCTTATCGAAGTTAAATTCCTTTCTTGTTTTATTATTTATCGACCTACATTAGAAATCTTCGACGAATTGCACAACTCTGTAGCGGCCGAATCGAAATAATAATTAAAATGATTTTATTTTGTCAATAGTCGTGTCAACTCAATCCACGAATGATTGTTTGAAATCGATGGATAATAACGAATGTGTAAACTCTGATATCATGGGTAAACCCTGAGCATGAAGAAGGTGGGAAGTTCTAACTATGCGAACAAACTCCGGACTGGAAGCAAAGAACAAAGTCAGGAAATGTACTAACATTTTTTTGAACATGGTTAATTTTATTTTATTAACCACATGTTTTTCCATTATCTCAGGCCAAAAATCTCGCGATATGGGGAGGTTAAGATCGATAGCTGTGGTGCCGGGGAAAGTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/162/f35/67/scaffold_3-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TACTAT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATATAACGTTACATGTATCGGCTTTACACAGAATAAAAGATGTTTTTACTTAGGAATATTTTAAGGACTAATATTTGAGGTAAGGTCGCAAAATATTTAAATATAAATAAAATGCACTCCTAATCGACGCTGTGATGGTGGTAAATTAATGTTAGGGAACCAATGAGTAAATCGTAAATTATGTTTTGCCTAGACTGAAAAACCAATACTTGTGTTTTGAAAAGTAAACCAAAAAAAAAAATTGAAATAGAATACAGTGCCCGGTTGTATATGTGAATTTTATTTTGGGCAACTCCTTTTTCGTTACAGAGAAAAAAAACCAAAAATAGAAAGCTTGCATTTTTTTTTACATTTAATTCTGGCAAACTTACAAAGTTTACAATTGTTACACATATTGTATTACAATTGAATACTTGTTATATGTGCTAAGCCTTATTACTCATTCCAGCCCGTAAGCTTTATTAATTCGTATTCGTGTTTTTTGACATTCATACTAATGTACACTAGGGCGGTCCACATTTGTTGTTAAAAAAGTTTAGAGCTTATTCGCACTATTGCCGTTGATCAAATTTATAACTTTCAAATAGGTGGTTTTGACATGGTTTTAGTTGAATTTTTACCACCGAATATATTTCGGTAATTTTCGTCTACTTTTTATTAACATTGCCTGAGAAACTTGAATTAGAGTTGGGGGTAATTGCCTAATAGTAGTAATTTTAAATACAACTTTGAGGACGTTTCATTCAACAACATTTTTGTTTTTAAATACAAATGAAGGGCTGAGAACATGATTTAATTTTTTGGACCGGCCTAATGTACATATTTTCCCCTCAACATTACATTCTGCTAGAATACAATCGCTTCCAATTAGATTTAAATTTATATTTCAGAGCACTCGCATTTTGATTCGATTGTACAGTTTAAAAGTTAATTAGGTTAGTGGGGAGTAATGTTTTGACTGATTGTACAGTTTGACGATAAATTTTGTAAATGTTATTTTGAAAATATTTATTCAAGATCACCAGCATATTAAACACCAGCAATATGAAAGAACGGCCTACTGCCGGAATAGGAATACTATTAAGTTATAATAACAACATAGCGATGTGTTTACTTAATATACACCAAGTCATTTAAATAATTAACTCGAAAGCAATTATGAAAATATACGATTAAGTGAATTACTATGTGTTCTTATGTATTTTAGTGGCTTCTATTACACTACGTTCGAGTATTTGGACGCATACAAATTTGACATTTACATATGAATTTAATTAAGTGTATATATTTTACAAATATTAAACGATACTAACTATCTATTTGAGTACGTCTTAACTGGATTAAGTTTTTATTTCTACAGCATTGGTGCGTAAATGGCACAAAAATTGCAAGGTTCCCAAGACCGAATGTCTTGTTAACTATGGTTTCACAAATTATCTATATTTATACGAGTGTAATGGCACTTGAACTGAAACTTATATAGCTAAATCAAACAGTGACTATCCTATCCGTTTTGTATTTACAAAGCTGATTATACTTGATATTTGCCTCCCTTTCTATAAGGTCAACTTGTACGTCTTGTCAGAATTGTCACTATCCCGGTTTTGGCTGTTGGTAATCGCCATCTTAGTCGTCCAGCTCACGCTGAGACGGCAATTCTCCTTCGTCGGATGAAAAACCAGACGGTGACAAGCTTTCTGGAGGATAGAAGAACTGTTGGGGGGGTGTGTGCCCACAGTCATTGCCATGAACGGTGGACGCTGCTGCAGATGCCATATCCTGCAAGTGGTACACAGCTGCAGCGGCTGCGACTGCTGCCTGGGCATTTGATCCGCCGGGGTGTCCCTTTGGACAGGCATCGGCGCAGGCACTTCCCGAGCTACCACTGACTCCGCTTGTCCGGCACCATAGCTGTCTCATCTCAGCCCGCCGATTACGCATCAGGACTTTATACTCGGAAATACGCATCTTTTTGCCATCCACAATACAGGTGCGCTTCGGCCGTGGTCTGTAGCGGTAATCGGGATGCTGCTCCATGTGAAGCTTCGAAAGCCTTGACTGTTCTTCGTAATATGGCTGTTTGTCGGCATTAGACATTGCCTTCCAGCGAGCACCCAGAATTTTTGATATATTCGAGTTGTGCATATCTGGGCATGCCTTCAATATCTTTCTTCGCTCATCCTTTGCCCACACCATGAATGCATTCATGGGTCTTTTAATATGGGGCTTGCTGTGTCCGTGCCCGTGGCTATGGCCGTGTCCATGCCCATGACCATTGCCTTGCCTCAGTGGGTGAGATGACGGCGACCGAGGTACAGGGCCAAGTTGACTTGCGTTGTTGCCTTCACGTTCCAGGGCAGCAGATCGTTCTGAATTTGTGCCACAGCTGTTTAACGAGTCGCGACTCATGCGCGTTGCACGTGATCCCCCAGAACCGACGACTGTTGAGTTCCATAATCTTCCCTGGAAAGACAAATAAAAAACGCATTTTTAGTTCCGAAATTTAGGCATGGAATCTTTCTTTGCCCTGACTACTACTTTTATTAGTTTGAAAGTATGTTACAGGTGGAAGCATTTTTTTCCGACCCTATAATGTTTTGGTACTTCAGCCCAAAAACTTCGTTACTTGGGTTACCACTTCATCTTTAAGATATGGTACGTTTGAGTGCTTTATATATTTTATGTATTAGGTTGTTATACTTTTTTGGAAAGCTCTTTTCACGAGCTAATGTGTTTGATTGACTGTTTTTTCGTTTTAGTCAATCGTGAGTTATAGAGTCGCAAACAAACGGCATATGTTTCAGTTCTACTACGATAAAGGCAAAAATGCATCTCAAAGCGCCAATAAAATTTGTGCAGTTTTTGGAACCGACACAGTTTTCAGTTCTAACGCACTACGTTGGTTTCAACGTTTTCGTTCTGGTGTAGAGATGGTCCGTAGGAAATTTTGATAAAATCGCTGAATTGGCCGAAAGAGACTGGCATAGAAGCAGCCGTAGCATCGGCCAGGAGCTGTGCATAAGCCATTGAACAGCTATAGCCATTTGAAGATAAATTAAATAATAAAAAGAAACTGGTAGAAGATAGCGCAGGTCATGGTAGTTAGACAAGCTTTCCATGTTGAAATCGCTGGAACCCATCACCACCACTTACGGCGAAGTTGGATGTTAGCTGATGGAAGATGTGAAAGAAAGGAAAAGCTGGCGGAGCCTTCAGCATCCATCGCCGAGATGCCGGGTTACTTCCTGCTCCCAACTCCAGAATGGGAAACCCATCTATGTAAATCTTAGCTGGTGAGCTCAAAAAACTTCGTTCACGTTTTTTCGACAAATAAATGTATCGGTAGATTTTATATATTTTTAGAGTATGGATGGGTATTGATAAGAAGAACACAATTTCATTTAAATTTTCCCAAAGTAGCAAGACAATTTTGGCGCTAGACGATTTCAAGTGTTATTGTCGTTTATGGGCGTGTCACCCTGCTGAAACAAACTTGCGCTGTGCAGAAAGCCCAAGCCTTTTTTTGTCAAATCCCAAAATTCAACCTTTTATAGTTTCCGTGATCTCAGATGGACAGAAGGACAACGGATATGGCTAGATCGACTCTGCTAGTAATCCCGATCAAGACTAAATACGGAAAGGCTCTTTGTTACATACTTTCCGACAAATCCAGTAAACCGTTTTACTCTACGAGTAACGGCCATAATAAGGACCCTATAATCTGGAAAAATCATTCACAGAGTAATTTTTTAATTTAATTTTTTTTTTTTTACAGTAAAGCAAATTATTAAAACCAAACATTAAAGTTCTGATATCGACTTTTGTGACGAATAATGCTGGTACATACAGTACCATACGTACAATATACGCTTTTACTCTCAAAGTAACGGGTATAATTATACTCAAAGTAAGTAAAGTTGTATTGAAAGCGTGGTACTTACATGACTCTTTAAAAGAGGCGATTCTATCTCGGCATAATGT'..b'TTGGGGTTTTCTAACATATAACCTCCTATGTTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGTTCAGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAAAAATGGTCTAAAAAAAAGAATGAAATAATTATTTTTTTAATATCACTAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAAATGCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTAAACTTCCTTTCTTGTTTTTAGACAAATATTATAAATTACCTTCTAGCTTGTAGCATTGAAGTTTAATTTTAATTTAATTGAAGTTTTAGTATTTATAGCTGTTTTCTTGCCAAATTATCTAGTTTTTTTTATATTGAGCTATAATACACAGTAATACAAAAATCGTTTTATTTCGTCATTGACGATGTTAAATTAACAATGTCTTAGTATATATATAAATTGTTCTTAGTTTACTAAAAATCGAAACGATCTTTTCATAAAATACTCATACGGGAACGACCTGCAAGGGTATAGAAACTTCGGTTTAACGAATTACTTAAGGAAAGGTTTCTTGACTTTACAGAAAATTTCCTCGGACTTTCTGAAATGTAGGATACATTTTATTTTAAGTGTAAAAAATTTAAAAGCGGAAAGAGGCATGTATGCTTTCCCTACCGCAGGCTTTTAAGACCAAAGTTGGGCCAGCAAGCCTTTTGTGTTTTTATTATTGCATACGCCTGACCCCAAATGATGAATAAATAACAAAAAGAAACAGACACCCCCACTAGCACATTGAGGAAGATATAGTACAACTTTGAGATATAAAATGAAGTAGTCAAATACTCTGTATGATGTGGAAACCACCACATTGCATACATGCATACATAATGGACTAAGAAAACCCATTCGTAAGGTACAAAAAAGAAAACTTCTTTACACCCTTTCTTCTGCACCTATACATTCTTAGGATATATGAATTTTAATTTTGTTTGTAATACCGAGAGATCTATATATATATATGTTCTTGGAAACGAAACTGCGCTCTTTTATTAATTTTGTTTGTAATACCGAGAGGTTAACTTACACTATAAATGAGAATTCCTTTCTTTAAAAGGGGAAACAATTTATTGTTGACGGTGCTCCCTTGCGACTCGGTAAAAACGAGGTATTTACAGATGCTTGTATGCTCGCGAGGTGGAAACTGACTTTTTCGGGTTATAAAGGGAGCCCCTTTTAAGAGCCTTTAGCTCTTTATTTGAATTTTTCAAAAGTTGGTAACGCAGGGAAAAAGGCATTTCCGACTCTTTACAGTACATAATCTTGACCAGCATCACTAAAAGTGTCAACATTTTTATATCCGTCTGTCCCTTTGTCCGTATAAACACTGACAGTTGGTATTAAGAATGCATGTTCTAGATATTCTTGCTCAGCGGGCACTAGGTTGGTCATGGTGCTACACCCCATGTAACGAACACGAACGAATTTGTGCTCATGACAAAAGTATACCATTTTGCTAGACGCCTCTTAAAGAAGGTAAGCTTAAGGCTGGTTCTCGATTTCTTAAATTACTTCTTCCTTTTTTAATTCTTTTTTACAAAAAGAAAGTTTTTCTTTAAAAATATGAATAATAAGCCGATCCATTTTTGGATAAAACGGTTTTCTCCTTATTTTCAATTTTATTTAGGCGAGTGGCGAGTCTTGCCTGACGAGTTTATGTTTCGACCATGTCTAATGCTCAACCTATTTGACGTATATTGTCGAGTGTGTTGGTAATGGATGAAGATTGATGACGGCGATTGATGATCGTTATTATCCATATTATTGGGTGGGGTGGGTGCTTTACTTGGTGCCGAACAACGTGTTGACAGACCGTATCACACAGCTACTCTTATCCATGGGGAAAGCCATGGTCCAGGTTTTGGATCAACCTTACTTACGAAGGTTGCAGCTTATGTGAGTGCGCCCCAGCTCTTCATTTGTGACCCCATTGTCTGGCAGGAACAATGGGCGTTGGATGTCCCAATACATTGACTGTGTCGCTACTTTGGCAACAAAACATCGACAATGAGCTTCTAATTTGAATGCTATTTCGTCTTTTGTTGACAGAGATTTAATCATCTCTTTCTGGGCGGGTCTGGAGCTGCCTGGCATTTTCCCATCATTAGAGCCACCATTGTTTTCGGGCTTAAATGAGCGCTTTATTATCATGGTGGGTGATGGGTGGTCAGAAGAATGCCCTACTCACTACATACGCGAACGCCACAACAATCTTTTAAAAATTGCGATGCGATTTACAACGGTTTTCAATACTTCGAAGACGGCTTGCCTGACAATCCGAGTCGACTAGTTCAGCTATAAATGCAGTGGTAACAATTTCTTCAAATCATATTTTCAATTCCAATTTCCATTTCCCCAATCTATCCCGAATTTCCTGCCCGAGAGCAACCGTGTGGCAAGATGCGAACGACATGTGGAAGCTTCGTGCGTATCCCGTTTGCATTGCGAACGTTAAATAATTTGTAATTGAATTGACGCCGACGCAGGATGCAGGCTTCAGTGTGTCGGGGACTGTTGAAGGGAAGGGACGCTGAGGTGGAACAAAGTTACAAATTGTCGTGCAAAGAAAGAAAAAACAATTACCCAGCAAACGATGGGCGGTCCAAGATGAAATGCGCTGCTATTGAAGAAGTGAATTCTGTTCCGTGGACCGCAATCTCGTCTCTCATGTGACGCGACCTTTGCTCTGCCTCTGACCAAGACATTTGCACTTGACATTAGCCGCGCGGGTGGGCCAAGGGTTGTTTTGCAGCTTTGTGGGCTTGTATCGTAATTAGAATAAAGCCAGAAGTTGAGTGGCGGTCTTTGCAGCAACCACACCGGCTTTGCCACTTCCACTGACTTTTCTCCCCGGAAAACACAAATCATTTATTTGTATTCTCAAACCATTCAATGACTTGCACGTGCAACTGCATCACCCCTCTTAGAGCACACTCCCTTTTTCGTGTGGAGTTATAAGGGCCATCAGACAAGCGTTCAAGTTATATCCGCTTGCCATTTTTTTACGAAAGGTCCATCCACAAAATCACTGAAAACACCGAAAGGCACAGGTGTGTTTTTATTTAAACAAAAAAGATAAACTTGCAGGATATGGTCATTTGATTTCGATTAACATTTTGCTACAGAAGCTGCACGTCAGACAACTGAGAGCTAGTTTCGAAAACAACCGGTATGTAAAACAAAACCAACTTGGATTTATCTGGATACAGTAAGACAACCCGGTGTCTTAACATTTGCTGAAGGGAGGTGGAAATATGCACTGTTTCTAAGATTACACACCACGCCACCTACCGTCGGTTCCTTTATTTGCCTTTGACTTGTCACAGAATGCTCCGATTCAAAAATTTCTTGTGATATAACCAATGTATCGATTATAACCACAAGATCTTATTTTTACTTTTAAAATACTTTCAAATACGTGGGCTACAGAGAGTTTTTCGACGAATAAAATAAATATACAGATTTAAGCGCTTTAAGCGTTTGTGTGAGAGTGGCATGGCACATATTTTTTAGGTCACTCGATAGGTATTGATGAGACAAACACATTTAAGTTACAATTTTGTTTCTATCATAATAACTGTAGGCGCCTCATTGTGGGCGTTAGGGCGGTCGTGTCACCCCGCTGAAACAAACTTGCGCCGCGCAGGAAGCCCAGGAATCCGCATGCCAGATTTGACTGTTCTACCTTTTATAGCTTCCCAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAATGATCCTGATCAAGAATACAAATACGTTATGGGGTCGGAAACGCTTACTGCTACCTGTTACATACTTTCCAACTAATCTAGCATACCCTTTTACTCTAGAAGTAACGGATATAACTAGCAACTTGTAGTCGCGTGCGTTAGATATACAAGAGTTTAAGTGTTGCTGCAGGCAGAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CGTCGACAGAGGAAATCTCAATACTCACGAATCAGGCAAGTGGCCACCACTGTGGTGAACGCTGTGAACGAAACGTATAAGCCGTGCAGTGCGGGGACAGTTATTAACCGCACACAATTTATATCTGACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTCGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATAATTTGTTTCCCGATCGTTCCTATGACATCTATATGATATAGTCGTCCGATTTGATTAAAAAATGTTATATCCAAGCGAAAAAGGTTATATGTCAACAAGAAAGGAAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGACATAAGAAAAAAAAAAAGAAACTTTAGTAAATAGTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGTAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTTTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTGGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTGTTTTGCAGGTAGAATATAAGTCGGAACCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTTTAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGGAAATAACTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTGAGTAACGAATGTATGATAGTCCTTTATTTATTCTGATGCTTCTTTCGTGACGATCGATACACCAATCAAAAGTAATGCAAAAACCATGAAAATAAGTAAGAATGAAAACTCTTTAATGTTGAAGGTGCAATCGCCGCTACCTCTTACCTCAATAAGAGGTTATGTTGGTTTATACCAATAATTTTGAAAATCGATTTTGCAAATCTGACTTTGTTGAAGAGTTAAAGCTCTGGTTATATGGAAAAAAAGCTAACGCAAACCGTTTTCCCTGCAAGTCGTGACATACACACTGTGCAATGTTAAAACACCACCATTACTAACGAAATCGTAAATTAATGGAAGCGACATAAAAGGAGCAGTTTATTATTGTAATTGAGTTGAATTTCATTTTAATTTTACGGCATTTTGCTCAGTGAGAAAAAAATAGGTCGAATCAGATTAATCAGTTTTGCATTGTAATTTAATATTTTATTCGCTTGTATAAGATATCATTTTTTATAATTCTGCAAAAAAGCTGAATTATTCAAAAGAAGAACAACAAGCCATTAACTCGGTAAAATGTTGTTTCCCGTTGGGTTTGTTTTCAATATTTGTTTTATCTTTCTCATCATTGGATCTAAGATTTTCTCTAGCAGAACCCGCTATTGATTTTCTGGCGTTGAAAAAGGAAATACTGGAAGAGGCCCCTCGAAAACACTTGTGAAACCTTTTCGCAAACAACAATGCGGCACGGTCTGCACGACAATGCCAAATTATTCAATAAGAAAAGGCTCAACGTAAAGAAAACTTTTTTTACAGTCATCCGCCAGGACTAAGGACTGAGGAGTTAGTCAATGAAGCGATGACACAGCGTGTCATCTGTGTAATTTGCAGCCCTAATGCCACCGGCTCACCTCCTGTTACTCCTCGCTTTTAGTATACCTTATTCCATTCGAATATTAACGGTTTTTGTTACAGCTTTCGGCGACGGGAGAAATCGCCTGGGAATTCGGATTCGTCAACTACGCGGCTGAATGTCTCAGCTGGTGGTTGCGGGATTGCGGTTGCTTCAATTTTTATCAGATTAAGCCTTGTTGGCAGACGACACACGAAGCGTGCCAATGAATTTTAATAGCAATAGCCACAGCAATAGCAACGTCAGTACCAATCTGAACAAAATCTTCGGTTTTCAGGCATTGACAGTTCGATAAAGGTTCGCCACGCATACTTTCTAATAAAATAGTAATAGAAAATGATATTAATTGGATTTTGATTAAACGCCCTTTTTCTACCTTAAGCGAAATGAACGGTTCAGGATTGAATTGCCTTATTGTGTTTTCTATACCTTCAACAAGACCATCATTAGTCAACTAAGTAAAGTGCGAGAGAGATGGAGATATGTAAGCAGCAAAGTGATTGCTCACAATGTTGCACACCTGCGACATCTAGCTTAGAATTCTTTAGGTGCTTGTAGCTTTTTAATGGGTGGTCGGTCAGACCGACTAGTCTAGTGGTGCTGTCATATACAATATGGGTCGGAAACATCTCGTTCACTGCGTAGATAACTTCAGATTTAGCTGTACTCTCGGCAAGGGTATAAAAAGTAAGAAGTGAGTGCTTTCGACTGGGAGCGGCAGGTTGCTGATACGTTATCAACTGGGCCGTTCATGAACTGCAGGGTAACTTCTTTAACATCTTAATTGCCTACCTGTGTGACACACACGTGCGTACAACTTGCTAGTCTCCATGCTCAAACTAATTGCATAGGACATACACGCACTTCACCACCGATTTATTTGCTCTTTCAGGAGTCATTAGCTGCGCAAAGAGAAAGGACATGAACCCTATTCAAAGTCCTCTCCTGAAATGTTACAGGGATATAATAGGGGATATAAAAGATATTTGAGGGTGTTACATGTAGGTGGTTAATTATAATCTTTGCTGTCAAGCACTTGGCTTTCCCAATACACCACATTTTAAGAGTCCCATACCTCTGTTTTTACGCTCCCATAAAAACTTTACTTATTTGTAATAGATATACATATAAACTGTTTAATAATAATTGCATTTTTGTTTTTACTCAAGATAATACTCATTTGTTAAGGAAAATCACATAGGATTTTGATCTAATCGAGATTAGCCTTTATTTTAAGTACACAGAGAAAAAAGCAGTCTAAAGTTTTAAAAAATGTTCTTAAAGTGGTTCTGAAAATTAGTAAAGGGTTTTTTCCTTTCTTGGAACCATGAAAAAATATACTTTCATATTCATACAGAGGAAATATTAGAACAGTACCCTTTTGATTGTTTGTTGTTGTAACCTCAATTTTCACATGTCAATTTTATCATATCAAAGTGATACGAAATAATATCAACTACAAATGTTAATATGAATCCGTATCATATTGATATGAACTCGAATCAATTTAATATGTTTTTTTATGTCAAAAGTAAAATCGAAAAGTGTTTCAAAAAGTATGACCGTGCCCTCGTATTTTTTGTGTATTTGTGGTAATTTGACACATTCTTTTGACTGAATTCCCGCGGTAGCTTTGACTTTCGACGAGAAGATTCCTATTAAAAGTGAGAAATTTGGAGCTGCTTGTGATAGCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATATTAGATTCGTCGAAAAGTATGTAACGGGAAGAAGGAAGCGTTTCCGACCCGATAAATTAAACATGTTCTTAATCAGAATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTATGAGCGCTGAGATCTCGCAAACTGTAAGGTAATAGATTCGGATTTGGCATGAAGATTCCGGGGCATCCTGTGCAGCGCCAGTTTGCTTAATCGGGGTGCCATGCCCACAATCCGCAAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATATATATCTCCATTTTCCTTTTGCACCCTTAAGCTGAGTAACGGATATTTGAAAGTCGAGGCATGAAAGAGTAATATGATATTGGACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGATGTTTGTATACCCTTGCAGTTTTAAGAAATAATCAACGTTAGTAACATGTGAAATTTTTAAGGATTGTTGCTAGCTTCAGTGATATTATTTCATTATTCCTTTGACCCTTTCATCAACAGCTTTATTTTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAAATTTAATTCAAAATTCCTAAAAATATAAAAATGTTATTCCCAATATTATAGGTTTATGTCAATAAAC'..b'TTCCTTTCAACTGTTAGCGAAGTTAAACTTTCAGTTATTAGAAAATCCATTTTTGTTCCCGTGGGACTTATGGTGGCCAAGCGTTGAAAGTGTAAAAGTAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGTAAACCGAAGTTTATATACCCTTGCAGTTGTAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAACTTTTTAAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTTAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTCCCATCAATTATCCGATCGTTCCTATGATAGCTATAGTCGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTATAAAATGTTATTTTTAAGCTAATAAAGTTATATGTTAAAAACACCAAAGATATAATTTTCATTTTATGTTTTCCGACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGCAACTATATGATATAGACATCCGATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTTTTTCCAAGCGTAGGAGGTTATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACCACTAATTTTTCGATTGATCCTATGGGCCTATCCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTATTTTAAAAATGTTATATCCAAGCTAAGAAAGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGGTATCATTTTTAAAAAATGTTTTTCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGATCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAAATTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAAAGAAATTATTATACCCTCTGCAAGAGTATAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTCCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTAAAATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTACTCTAACATATAGATGTCAAAAAATTGGTCTAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTTATTATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTCACATGATGTTACTAAAGTAGATTATTTCTAATAAATGGAAGAGTATACGAACTTCGGCTTTCCGAAGTTACCTTCCATTCTTGTAAAAAACTGTGCGCGCTTTCCTAATATAGTTTTATGACTTGGAACGGCACGGCACGCTGCAATTCAATATGTATGTGTCGAATGAAGAAGAAAAAGAAAAAATGTAGAAAGTGTATTTATTTAGTATTTTCGTCACAAAAGGTAATATTAGACATTTTGATTGTTAAAGGTGCGATCGTCACTAGATTATGTAACTATTTATAATCTTATTCTGCACTCATTAAAATTTTTTAGATGATGGCTCAAAACTTACCTGACAAAGTAATCGACTTTGTATTATTTGAAGTTGTTTAATCATCTCTAGATCGGAGCGTTCCTTCTCATTTGTTTGTTCTTCCTCAGGAGGCGGCATATCGGCATATCGGCGGTCTCTGTAAGATTTTGAGATTATTAGCAGATGTTTTCAAACAAAATATGGGAGAGAGCTATAGTCGACAGCCAACAATCTTTACATCAAGGCACCTTAGTATTACAAGTTTTCGACTATCTTGAACCTTTTACCCAAGTAAAATCTTTTTGATTACACTCAAGTAAAATCGCCACAATAAGGGGCTAATAGTAAAATGTTCTTGATTTTATGGTATTTTTGTTTTAAATTAAACAACTTACTTTTTAATAAAATCGTCTTAATCGCAGCGACAATAAAACTCACGACACTGAGGTATCATTTGAAAGTTATACACCCAAACACCTACACCTACTTTTTATGAACAATGAAAATTTTATAACGAAACATGTTTTTATTGTAGACGTTATTTCTAGAGAGAAAGTGTATAAGGAAGAAGGAAGCGTTGGGGCCACTTAAAGTTGATATATTCTTATCAGGTTACTAGCCGAGTATGAACGCTGTGATCTTGGAAACTACACTGGTCAGCATAAGTATTTTGACGATAAACACGAAAGGAAGTTATCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGGTATATCCGACTTTGATACACTTTAATTCGAAGTTCAGAACTAATTAAAAAATGTTACTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATACATTTTTCATATTTTCCGACTATTTTTCCGATTTTTTATGGCAGCTATATAATATCGTAGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACCAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACTGAAGATATATATTTTTTTAATTTTTTCCGCGATAGTTCCTATAGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCCGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAATACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGGTTGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGGCAGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATACTTTATGGGGTAGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATATCTACATGATTTATGAAAAATTGTTTTTAATTCAATTAAATTGCCTTTCCACTGATATCAAAGTTTACAAGAAATAAGTCTAAACTACGAGTATATTTAACTTTTGTTTCATCAAACTAATTAAGCATACCGTTTTAAAAAAAAAAGAAGAAAAAGCGGTATAGTCGAGCGCCTCGACTTTCAAATACCAGTTACTCAGCTTGAGGGAGAAGTATAAAAATGTAGATATGTTAGCAAAGAAATATTCTAAAGCACCACCTACCGGCTATTTTGGTATATGTTATGTGGGCGGCAGACAATTTTAAGTGTTTTAGCCGTTTGGGGGCGTTGGAGTGGGCGTGGCAAATATTTTTTAGATCAATCGAAAGGTTTTAATGAGACAAATACATTTTAGCAAAAAATGTCTAGCATGACAACTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCGGTTTCTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGATAGTATGTAACAGGTAAAAGGAAGCGTTTTCGACCCCATAAAGCAAATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCGTGTCCGTCTGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGAACGCTGAGATCTCGGAAACTATAAGAGCTATAATATTCATACTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCTACGCAGCGCAAGTTTGTTTGCGGGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAATGGCCAAAACGCTTAAATCAGTCTGCCGCCCACATAACATCTACTGAAAAAGCCGGTAGGTGGAGACCTAAAATATCGCTTTTTTGCAATATATCTTCATTATCCTTTATTTATTTATTTAGAAAATGTCTTCCGCTTAACTTTACCGCGATCTTCAGTGATATGAAAATCAAAATGATTTAATTATATCTCTGACTTTTTCTATGACAGCTATATGTTATAGTGGTCAGATTTTTATATATCTTAATCCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATATATCAAAAAACACAGAATTTATATTATATATATATTATATATATAGTCGAGCGCCTCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTTGAGGGAAAAAATAAAAACTTAGATATACAAGCAGTAAAGAAATATTATAAAGCGGCACCTACCGGCTGTTATGGTATATAATATATATATATATATGGGCGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTATCTGTTTGGGTTTGTTGAGTGGGCGTGGCAAACATTTTTTTAGGTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/183/066/a7/scaffold_45-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AATCGATAGGTTTTGATGATTCAAATACATTTTAGTTAAAAATTAGGCGCTAAGATTTTCGCGAATATATATACTTCATGGGTCGGAAACGCTTCCTTTTGCCTGTTACAGACTTTCCGAGGCATCTAGTTTACACATTTACTCTACAAATAAAGGGTATAAAAAACCATAGATATCATTTACAAAATTTTATTTTCCGATTATTCCTATGGGAGCTATCGGATGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAAAAGAAAGAAGACTTTCATAAAACTTTCAGCCAGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTCGTAGAAACGGACAGCCAGATTGACTCGTCTTGTGATGTTGTTCATGAATATATATACTTTATGGGGTCGGGCGCTCCTGCACTAGCATTATTTTTACAAAAGTATTAATCTGTATGAAAAAATAAAAACTGCTATAATTGGGGTGTTGCCATGGGCGGTGGCATCGACTATTATATATACCCAATACTGAGCCAAGGTGAGTGGAGAGGAATGGATATATGCTTGCAGAAAATCGGCTGTTTTTACTAACACGCCACCTATCAGCAGCTAGCATATATTGCCCCCTACCGTCTATAGGCTTGTTGGTGTTTTGTTTTTGTACGATTAACTTATCTTGGTCATATTGACCATTACCCATTTATTTATTACGAGATATTTGGTCAATTAGAAAAATTAGTATTTTATTACGTTTTCCCTGATTTACTTTTAGCACTTTTGTGAACCAATACTAAAAATTAAATTATTATAAGAAATATTGTCTCTAAAAATTACGTTTTACACCAAATTTGTAAGTCGTCATCTTATACAAACGTGAGGCAACACGGCGAAACCCCGATTGGGTTAGAGATTTGACTTCTTTTTTGTGATATAGGGGTCCAACTATATCAGGAATTACCATCAACATTCTTGGATTCAAGATGTTATTTTGTAAGCTAGTTTTGTTGACACCGTTCATAAAATGTGTATGTAGTCTCAGAGTTCTATACACTTTTTGTAATAAGAAATAACTAAAATACAAAAAATAAGAGAATCAAACGAAAATCTACATGAAATGTAATGTAATGTTTTTTTTTTTTTATATCAGAATTTTTGTTTTAGTCACCAATCAAATCATTAGTCAATTTTACCCAAAGTCGTGAAATTGAAGTATATTAAAATTTCTTTGCGGAATCCGTTCGGCTTGTATATGTGTTTTTCAAGGTCACCGTATAAAATCCCTTGGTTTACAAAACTAATACTAACATATTAGGGGTGTTGTGATAGCTACAAGGCCTTCGACTAAAATTTTAGTAGTTACAATAGTTGATAAACCATTATAATTTTATCTAAAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGGAAGCCGAAGTTTGTATACCTTTGCAGCAACAACATGTGAAACTTTTTTTTAGGATTTTTGTTGATTTTAGTGATGTTAAAAATAAATTATTTCATTCTTTTTTCAGACCGATTTTTATTGCATTGAGTTCGAAATTCTTTAAACATTAAAAAATTTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAGCACCGAAGATCTAATTTGTTCATATTTTCCAACTAATTTTCCGATCGTTTCTATGACAGCTATATGATATAATCGTCCAATTTTGATAAAATTGAATTAAAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATGCAATGGTATAAATATTCATTGGCTTACATCTAATCTTCACCTTCCTGTTATGTGGCAATCCACAATGTACGTAATTATCCTCTTAGGATTACCAATTTGGACAAACTTCCTATTTGAATTGGCAATCTAATCTAATTACCTGCACAACAGAAAAACAATTTGGTTTAAAGTGGTCGGGAGAGAGGGAATGACTGGCAACCTTTCGTACATGCGCACAAAGTCAGTACATTATTAAAGGTTCTTCATTGCCAAACAAAAAAATAATAATACCGTGCTATTACAAAACGCGTGACGCTCGGCATAGATGGTTTTATGGCATGTCTGTTTTTGCATGCGTGACAACCCAAATGAAAATTGTTTGAAGTCAATTGTGATTTCACATATGCCTTTCACTCATTTGTAGTATGGGCAATCAACTGCAGGTATAAAAATATGAACTAAAATTTGGTTCCTCACTTTATGCAATAAAATAAATACATTTTTGTTGATTCATTATACCTTTGCAGAGGGTATTATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGACAGGTTTCCGACCCCATAAACCATATATGTATAATCTTGATCAGCATCCCTAGACGTGTCGATTTAGCCAGTCAATTATACCTTACAGCTCCCATAAGTATAATCTGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACGAATTATAGCTTCGGTGCTCGGAATATCATTTTTCTTCGAATTAAATTTAATAAAGGTCGGACGACTCTAACATATAGCTGCCCAAGAAGCGGTCACAGAAAAAATTAAATAATTACTTTAAAAAAAATTGCTATGTAGATGATCGTATTTTCTTTTACTGTAGGATAAAGAATGTTTTAACTTTTTAGAACTACCAATTTAATTTTACACAAAAATGTGAGGACTACAATATTTTTTTTAATATCCTTCAGTTATAGCAATTTTTGAAGCAACATTTTTTAAATTTAATCCAATACGTTCTTTTTGTGTGCAAAGGTAATTTTTCACAGTTTCAACTGCTGTAAAATGTTATTATTATTAGCAAAATTAATAATTAATTGGAAACCAATTATACATTAAATATTAAGTTGACTGTCCAATACTCACAAGTAAAGAAGAGGCACTTTCAAGATTTAATCTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTTTAACCCACAATCCGGGAAAATCTGTAGCACCTACAGTTTCTATGATAGAAACGCCCACAAACGGTTTAAATCTGTCTGCTGCCCACATAACATACTGAAATAGCCATTAGGTGGCGCCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTATATATCTCCATTCCCTTTCGCTCCCTTAAGCTGACTAACGGGTATCTGATAGTCGTTGCACCCGACTATAGCGTTCTTCCATGTTTCTTATCAAATTACTGTTGTATAGTTTTGAGCATGAAGAGAAATGGGTTGCTTTTTTTCGCATATCAAAAGTTGAGTAATCTCAAGGGCTAAAAATTTAAAAGAAATCGTTTGATTCAATTTTGAGAAAAATAGTCAATATAGAGTCGTCCGATTTTATATAAAATTTAACTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTTTATATTAAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTTAATTTTTTCCCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGAGAGACAAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACGGACATGGCTAGGTCGACTCTTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGACTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGGGAACGGAACGGAACATCGGATTTCAACAAATGAGATGTCATGTCGCGTACTCTCAGTAAGAATAAAAATAGCCTGAAAACCGGGGGCATAAATCCTCACCGTATCCAGCAGATCCAATTTTTTAAATTTTCACATTTACCGCTTTTATATCTGAAGCCTTGGTTGCAAACTTCTTACTTTTTGATGATACCTTAACCTTACGATTGGTGTATCCTTACGATCGGACCATAATATCAGATTTTCAATTCTGCGGCTATATATAGTACTTGTCTTCGCTCGCTTCTTGCGCCACTTCGCCACTACGTGTACTGCCGTCCATTTAGTA'..b'TGAGTTTCCATGTACTCGTATAAAGGGATACGGCGCAGCAGCACTACGCCTCGTGCGGATGGAGTCGCAGTGAGCGGAAGTCATCATTATAAATAAAATGTTCAGTTCAAAGCGAATAGGGAAAACAATCATTTGTTGGTGGTGGGGATGGCAATGCTGGGTCTAGTGCGTGGGACAGAAGCTGTGTGGATCTTCCGTGCGTATAATACCAAATATACATTGTGGATGCAGTATGCAGATTTATGATGACAAAATTTACTTCCTTGTTGTATTTTGAAGAAAGCCCCCTTGTTATGAATGGCTTAGGGCTCAATACTTTGTTATAGTTTTAATGTTGTTTACCAATATTGGCATATATAAATGAATATTAGAAACCTTACTTCTTAAAGTGTTAGGATTATCTCTCTTGGAAGTCTTGCAAATTTGGAAAATGTAATTTGAATGTTACTTTTTATTATTTTCTTTATTGTGGTAATTGGCTGGACTAGCATGTAATTGTCAGCCTATACCCCAATAAGCACGAAACAATTATTCTTGGTGGACTTCTTAAGAAGTCCAAGATTCATGCAATTGGTTTTTAAAAATGCGGTATTGCTATAAAAATAAAGTAGGCCTAAAAAATTCGTCAAAACGAATATCAAACCAAAACACACGCTTAGTGAGGTAAAAATAACTTGGCAGTGCAATCGTCCCTAGATTTTTACCTTGTTAATAATAGATGCTTTTGTTTGATTTTTGTTTCAAACATCGTTTTTTATTTACTTTACCAAACGTCATCAATAACAACCTGAATGATTTCAATACCATGAAATAAGGTATGGATATGCACAAAATAGTTCAATGTTAAAAAAAAACAAGAACCTTGCAGTCATAAGAAATAATCAACGCTAGTAACACCGTGCTAAATTTTTAAGGATTGTTGCCAGTTTCAGGTATATTAAAAAAATATTTATTTCATTACTTCTCTGATCATTTCTTTGACAGCTATATGTTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAAATTTAATTCCAAAATCTTAACAAAATAACAAGAAAAAACGATATAGTCGAGTGCCTTGTCTATGAGATACCCGTTAGTTAGGAGCAAGAAAGAACTGGAAATGTACAAGCACCAAAGCGATGTTGTAAAGCGCCACCTACCGCGCCACCTACCGCGCCACCTATATGCTATGTGGGGTGCGCATGAAGCCCAGAAATCTGCCTGCCAAGTCTCACACCTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATTTCAGCCTCACTCGGACAGACCGACGGACGGACATGATCTACTCGGCTAGTGATCCTGAACAAAATTCTACGAGTAACGGGTTTAAAAAGTTAAGTAGTACTTTTATTTTTATTACATTTATAAGTCTTAACTTAAATACTAAAATCTATTATTTCAACATTAAATAAGTGAAATAAAGTTGTACAATAACATAATAAATTTAGTTTTCAGGTCTAAAAAGCCTTATTTTAGAAAAAGTGAGGTAAAGTGTACTTTTGTACTAACTGAGTAAAAGAATTAAATAGTCTATAAGGTAAAAACGTTTCATAAGATCTGAAATCTCTTTGAAGATATATTTACACAAGATGAAACGAGCACCACAACTAATTAATTCCATAAAAAGGTCCCAAAAACAAGCTACCAGCCCCTTTGGTTTTGACAACTAAAACTGCTAGAAACAATATATGATTTACCAGCGCTGCCACCTCTTTGTAATCCACCTCTTTAAGACGCAAAAAATGTGCAGCTGGGTCTTGTGGTACATGTGTATATAACCCTATTTACATATGTAACACAGAGTTAACTAGAAAATCGTCAACAGTTGTCAGATCCTTTCCGTCTACCTAGGAATGTGAACGGATCAGGGCTCTTACAACTCGCAGTTCAAAGGGAGCTTTGCCTTTGTGTTTAGGGCTGTTTTGTTACTGAATGCGCTTTGTGTGTTTATTGTTTGTTTGTTGATGGTGCACTTGTTTGGTCAAAAAGCCGCAAACAAAAGGCTGACTGGACCGCGCATAGCTTACAAAGGACTACATTTTCTGCTCCGTTTATCCGGCAGTCCAGACTTCCATCCGCCGACAGATTTATGTATTATTTATGCCTGCTTATGTTTGTGCATTTCTATCTAGCACCAGCCATCCCTTAGAGAGACTCGAAAATTTCCTTTCGTACACATATACTTAAGGACATACAGCGCTCTTTTTATTCCCGTTAGCTCTGACTTGCCATAAGTTAGTAACATGCAAGTGTCGATCGGTGGCGGATACTCTATAACCTAGCCTACAAACGTACATGAAATTAAATTGTGCGACGGGGAAACACAAATGCAAATAATTTACTATTTCTTATAGCTGTATATGTGCTTCTTTGTACTTTCTTTTTATTATACCCTTGCAGCATCATAATCTTGGGGAGCATCACTGGGAGAGTCGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTCTGATTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGCTGTAAAGATGTCGGGCTGAAACTTTCCTAAAAGTCTTCTTTCTGTTGCAGATAGTATATAAGACGGAAGCAGCCGAATCGAACAACTATATCTTACAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTAATAAAAAAAAGTATATCTTTGATGTTTTTTAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAGCATTTTTTAATGGTTTTGAATTTAAAATTAAATTTTTTCAAAATCGAACGATCGGAAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTATGGTGCTTTTTGACATAGAACCTTCTAAGCTTGGAAAGAACAATGTCTTATTTGTTATGAATTTTGAATTAAATTTTATTAAAATCGGTCGACTATATCATATAACTTTCATAGGAACGATCGGAATTGGTGGGATAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTTGCGGGTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAAGTTTTCATTTTTTAAGAATTTCGAATTGTGTATTATTTTATTGCAACAGATTTTAAAATATTGAAACTATTTGCCATTTGAAAATTACCTTTCTTGTTTACTTAAAAATTAGATAACCGTTAGATGGAGATGTACATGCGGAAATAAAGATCGTAAAAGTTAACCTGCCTGTTATCAGAATATGGTTATGTTGGGGCAGACAGATTTTAGCGTTGTGGGCGTTCGAGTGCAACTTGCGCTGCGTACCAAGCTAAGGAATTAAAATCTATAATCCTTTTTCTTTATCCTTTACCGTTTCCAAAATCTCAGCGTTTGTGGACAACAACTTGGCAACATTGATTAGGTCAATCAATAGGTTTTGACAAAAGCAATGAATTTTATTAAGCAATTCTTAGCCCACCGCTTTGGTCGGCTTTTGGGAGTTACAGTGGGCGTGGCACGTTCGCGTAACAAACCTGAGCTGGTTCCGAAACTAAGGAAAAATCTGAAATATAAGCCATCTAGCTCCATCTAGCACAGCGTCTACACAGACATACGGGCATGGCTGGATGGACTCGACTTGATGCTGATCAGGAATATATATACTTTGTGGGATTGGAGAGGCTTCCTTTTTCAAATACAATATAACCTTTAGTCTACAAATAACGGGAATTAAAATATATGTCTTGAAATATGTCCTTGCAATCAAATGCTCATTAATATTTTCTTCGGATGTGAATTGTTTTCTTATTTGAAACTTATCCAAAATACATTTTTACAGAAAAACCGACAAAAAAATTTCTTCACGTAAGTTTGGGGGCCGCCCATTTAGACAACTAGTACCTATTAAAAATACATAAATGAGTCAAATATCACGCACGTTAGAACTCATACACCCCAAAAGTTTTCAAAGCAAGGTCAACAATATTTTAATGTTCAAACCAGGGTCAGGCCACGTTACCGCCCCCAAGTCCTTTTGTGATTATTACACTTGTCGCACCCCATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCACTACGGTGCAATCTTCTGACTAAAATCATAGTCATAATACCGTCTGCAAGGGTATAAACAATAGAATTTTGGTGCAATACTTAACAAGCGTGTTTCGACTTATTTCCGAATTTGTTTATTAAGATTTTTATGATAAGTTTTTTGCTGCAGGAGGTACTAGTCATTTGGGTTCTTCTATGTAGTAAGTAACATCACTTGGTTAAGGGAAACTACGCGGTCGAAATCGAAATTTGTTTTTACTGCAACAGCAGTATATGCAATAAGGCCCAGCTTGGCGCTTCATGGTGAGCGTTATTGTCGTATTGGTGAATTGTGGTCAATAGTGGCCAAGCACACCGGCAGTGACACAACAGATACTTACCGTTTTTATTACATTATTTCTAACTCTTATTACTGAGGGTTGCCGAAAATCTGGACCTAATGGAATACTTTTTCACAGAGAAAACTTGGTATGTAATTAGGACGATTGAGCGCACCTCCAACGACCTCGCAATTGCTACAAATGGCACTTAAAAACAAAATATCAAAAACAGCCCACTTAAAAAATATGTTTAAAGCCTATCTTTATTTTTTAATTTAACAAATTATTCTCCTTATGTATTACAAAGTCTCCTTTTGCTTACAGTCTATTTTAGTAGTATGTATATATTAGCATTGTGATACAGAATAGTATTTATTTATATTAAACACTTTCATGTTTATCTAAAATACAAACAGCGCTAGCGTAAGATCATATTCACAGCCAATTCTTACAAATATTTATAATATTGTATAGTTTTTGCACATGCCCATTACCAACGACTTAAAATTATTATTGTACTAATAATTTAAAAATTTTAAATTGCTTAGATGTTGTTGGTAAATTGCAGTTAGACTAGACTTACAGGCAAGCAAAAACATTTATGAGTTTCATTGAACTTGGAAGCCTTAAAATTCAAATTTATTTAGTGTAAAATTCTTTTTTATTTTATTAAAGCTATCTTTAATGGTAAAAAATATACAATTTTTTAAACCGTAAAGTTACAGTTTGTTTTTAAAAATAGATGCCGACTTAATGTGACCAACATTGAGTGAACAAACTTATAATGAGTTTACCCATTATTAACTTGCCTAAAAATTTTTAAGCATTATCTTTTCGCTAAATAAGTAAGCCGTATTTTTTAAGCAGATATGATAATTTGATTTTTCAAAGTAAGCAATATGTCTTAAGAAAACTAACGCAAGAAAGGAAGCTTATATTATATAAAATTAGTGATGCTGATGTTGTCAAAATCGTATTCTTCACTGCTTTGCAAACTTCAGACTGAAATCATTGTACCCTCTGTAAGGATATAATAAATAAAATGCATAACCTTTGCAATTTAAATCATATAAGTAAATTGGGAGGCTATTTTATTTGTTTATTATAGTTCAGCAAAAAATTCAAATAGATTTTCGGTTTTTCAAATTCATAACTTTTGCCAGATTTTTAAAAGTTCCTTGTACAAAATGTATAGCACAATATTAGCACAATCTTGAAATACGTGTTTACTTTTTTATTGAATACCAGATAACAAATTAGTAGGCAAATCAAAAATGTTCTTTAATAAAATGCGTGTGGTATGTAATAGAAAGACACCTATATATGGGTTTATTGTAAACAATTTTACACATTTAATAATTTTCAAATCAATTGATTCTTGCCATTTAAACAAAAAAAGTTCATATTAGATACAAAACTCATTTAAAATATATTAAAACATATTAGAAAGAAATAATAAAAGTAAGAAAAATAAAACAGCAGTATTTTAATTGTTTGAGTATTAAATATAATGCTTAAATTTTTGTCCAAATCCTAACTTCAAATTTGTAAAATCAATCTCAGGCACTTATAATAAACATTTCCTTATTGTGTCTTTACTTCTCATTTGATTATTCAATTTTTGTAATTAATGTAATATTTTTATAGGCCTAACATAGTTTAGAATTATAAAGTGTACGAAAGTCAAAGTATTTTCGAATTTTCTTTTATAATTAACAACATATTTACTTTACTAAGCAATTTGTATATATAAAGAATTATATGACCAGTTCTCTTTTTTATTCACTTTTTAGTAAACCCATGAATAAAGATGGCTTAGTTATAGCTACTATTGTCATAATATTGGCTTCTTGTGTACTCTTTATTTTCGATATTGTTTTATATATTCAGCATTAAATCCAAAAGTTACATATTAATGTAGTGTGGTAACTTTCAATTGGACGTTAAATTACAATATCTGAAATTAAATATATGCAGTATAAGTTTCGTCTAGTTATAGCTATGCATTCCAGTTATACAACATTTTAAATGTTTTCTCCCCTTTCCAATAAAATCTTAGAAATCTAGAATTTAAAATAACAAAGATCCCACATATTAATCAGTACGTTACAAGTAAATCTTTATTTTCTTCCTTGTTTAATATTTCAAAAAGCCACATAGATGGCTTTGATAGTTACTAGAGCCCTGCAATCATTTTTAAAGTTCATCCATCTATAGTGACAATCTTAAAACACATTAAACTTATTTACTGCTAGTTATAAAAGTAAATAAAAATTGCAAGGTTTTTGGAATTTAATTTAGATCGATGTGAAGATAAAATTTTTGGAAAGTTTCCATTTGCTACTAATTGGTTTTCGAACTCTTCTCAACAAAAATATTAAAATACGTGAAAATAAATTTAGGTTTGACAACTTTTATTCTTGTCTATTCCAACTTAAATCAAGGCTCATTTCTCAATACTTAAGAATTACACTGTGTTACAAAAGAAGACTTTTTTACCTCGATGGCTTCTAGATAATCGCATTTGCTTTAAAAGTAATGTATAATATATAAGCATTTATAAACGTACTTATAAGCAATAACATAAAAGTTGAATAATTGTTATTTTATTGCTTTCTTTGCCCTGCAACTACAGGCGAACTTATTCTTGGTTTGTTAGTTTGTCGAACATTTATATTTATAAACAAGTGAAGACATACATCTGCGGATATAATAGAAGTAATATATTAGTAGTAGTACCACCAGCCTTTATTTTAAACACAGTTTTCTGTAAGGTATTTTAGCCTGATTGACTTTTCCTAATTTAAATATCTTTTCTAGGGGAATTGTATAAGTTACATTGCAAAAACCAACCTTTAAAAATTAAGGGCAGTGGCACTCTTGCTAATATAAGCGCAGATGTATATATGAATGTCTTCTTTCGTTCATAACGATAAGAATGGCTTTGCAGTCAAGGTCAAGAAAATACTTTCAGTCACTTAGTTTTTTTATTTTTTCCATTACAATTTAATCAGTTAATGTAGCAACGTACATAACCCAACTTGATTTAAATGGGATTTTAAGAACACTTTAAGTGCATTAGGGGACATTGTAATTAATTGTTTTTAAATCTATATGCTATATGTTTTGAAAATTATTTTTCAGTAGAAATTCTAAATGAGATCCTTTACAATTATTTAACTTTGTGAATCGACTACACCGAATTAAGCTTTTATTATATTTGTCTCTTATTTAATTTCTGTGCTTTTTTACGGGTATAAATGTATTCGAATCAGTCGTTGATTTGCAGTACTTTAATTTAAAAAAAATATATATACTAGCATAGAAAGGTTAGTATAAATATTAACAGCTATAATGAAAATAATGTGAATCTGGTATTAATGTATAAATTATTGTATATACTTAAGGAACTATTAACCTATTATAGATTCGCTCACAAATATTTTTGCACGCCCAAGCCGAAGAGTTGAAGGGTTTTTATTTCATTGAGCTTAGATCATGACACATAGTCACGGCTTGTATACTCATCTATATAACGTCCAGTCGCTGAAATGAGTTCTAAATTAAATTCAACATTAGTCACGCCTAACGAAATTATAAACTTACAATCTTCCATTAATATAACTTGGGTATTTTCTATATTTGTACTAGATACAGAATGTGGAATTACGCTATGC'..b'AGATTCCCGAAACGGTAGATTACCTAAACTCTTCAAAAATACTAAGAAAAAGAATTGAAATACTAAATTTTCTTGCCCGTGACGTCCGCCAAGACGATTGTAGAGTCTTAGCATTAACCAAAATTTCTCTTTGCACCTGATTTTTTTTAGCATAAGCATATTTTAAGTACTCTTGCCACCTATGTTAATGCTTTTCTCTATATGTATGTGGCTCTTTCGCTCTGTGTTTTTCAGTGAACACGGTTTGGTTAACAGTAAGAACAAATTTAAACAGGAAAGAACGCTATAGTCGAGTGCTTCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCTTTATGGAACAAAAGGGGAATGGAGATATACAAGCAGCAAAGCAATTATTTAGGGCGCCAGCTACCGGCTATTACAGTAGATATTATGTGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTAACTGTCTGTGGGCGTTAGAGTGGGGGTGGAACATTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGACAAACACATTTTAGCTAAATTTTTGTTTCTATCATAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAATACAAATACAATATACAAATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGCAACATCGTGTGGAATTTTTAAGATCGTTGCTGTGTATAGAGATATTAAAAAAAAAAATTATTTCATTCTTTTTTTTGGCCAATTTTTTGACACCTATATGTAAGAATAGTGAGATTTTTTAGAAAATGAATTCGAAATTCCTTAAAATATAACAAATTATATTCCCAATATTATAAAATAATATGTCATATTATTTTCCCACAAATTTTCCGATCGTTCCTGTGGCAGCTACAGAATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAAATTTAATTCGGAATTCAGAATTTATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTTATATGTCAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTTTATATTATTTTCCCACTACTTTTCGTTTTCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCAAATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTGAAGATTAAATAAAAAATGTTATTTCCAAATGTTATTTATTTATATGTTTAAAAACACCGAAGATATACTTTTTTTTAATTTTTTTCCCTGATTGCTCCTTTGGGAACTATAAGATATAGTTGTCCGATTCGTCTGGTTCCGACTAATATACTACCTGCTATAGAAAGAAGACTTTTGGAAAACTTTTAGCCCGATAGTTTTAAAACTGAGAGAATAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTTAATTTGAAATTCAGAACCATTAAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCGGAGGTATAATTTTTGAATATTATTTTACCTCTAATTCCGATTGCTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAAATCGAAATTCATAACTAATAAAAAGATGTTAATTCCAAGCATATAAGATTATATGTTCAAAAACAGCGATAGTTCCTGTGGGAGCTATACGATACAGTTGTTCGATTCGGCCGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAGCTGAGAGATTAATTTGAGTAGAAACGGACGGACAGACTGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAGTGACGCTGATCAAGAACATATATACTCTATGGGGTCGTAAACGTCTCCGTCACTGCGATGCAAACTTCTAATTGACATCATTATACCCTCGGCAAGAATATAAAAATTTAAAAATATATATATTTGGTGTTTTTTAACATATAGCCTCCATTTTTTATTAGTTTTTTTTTTTATATCAATTTTTTATATCACTGAAACTATCAACATTCCTAAAATATTTCATATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTCCGGTAACTGCAAGGGTCCTAGACAAGAAGCCAAGCGGAACTTTTTGAACTACATGGACATGCTGCCGGGCGTCACCACGCAAGAAAAGTTTTACTAAGCATTTTTTTAACGGAACCACCAGTAATATGATCTCCGTCATGGTCTCCTTTTTTTTTGGACTTCTCTACCACGAGATACTTTGCAGTTTATGTGGAGCTGAAGGACACAGTGGCTTTTTTTGGGAAGATGAAATAAGGTCGGCCGCTACAAGACAGCTGGAAGAGCCATTACCAGCCATTACCAGCTATTGCCAGGTTACTGGGCGCCTTCCAACAGCTCCGTTTCAATCTCGGCTACAACTTCCTCAAGGCTTATATCGGCGTGTTGGAAATCGGAATTGCACTGCAAATGGTACAGAGAAAATGTCAAGCATCAGCGACACTAGAAGGAATCTTTAAACTACTTATTAAGATAAATGAAAAGAAACTACCTCTTAAAATAAATAAAGATAAATAAGAAAATGTTTAAATTCCATTTATTTTTATTTCTTTGTGCAGCTCAGACTCTTCTTTTTTTTCAATTTTTCGTGGCTTGACAGAAAGACAATGCTCCACGCAATGCGGGTAAGCTATATATTTTTTTTTTGCTGATAAAAAATTTTAACAAAGAAATAAAATTTTTACGGTTTACTTAATTACCATTATTACAAAATATTTCAGAAAAATAAAAAATGACACCCAAAAAAAGTTCTTCGGTTTGTCAACGTCGATCTAGCCATGACCGCCCAAACCGTGGCTGCTAAATTCTAGGGTAAAATGTTAAATTAATTTAACATATTTGAATTAATTTGTTTTGGCCAATGCCTGACTTACATATGTCACTCAGTGTACTGACTTCGGCCCATTTTAGGTAAGCAGTCCAGACTGGGCAGTTACCGTTAATAATGAAATGTTTCCTTCGAAGTCAGATATATTTAATTTTTTGACATGGTTCATCACTAGGTAATTTAAATCAGATGTAGCAAGATTCTAGAGTGGCTGTTTTAAACACTGATCCATAAATTTATCGAGTCTCCTCCGTATCGGTAAAACAGTAGTCATTCTACAGCATAATTATGGATTGGTTCTCAATATAATGCGATGATAGGGATGGCGCTTTAACGTTAACAAATTACCAAAGAAGAGACGCCAACTAAACTGCTTGATAGCAAATACCATATAATAAAGATGTTGTATTATCTGAAAACCCATCAACCATGTTTTTAAGGAATAAACTTCGTTCCTGACTCTTATTGAATGCTTTATTTGCTGCTATGAATAAATTATTTTAATAATATTTTAACAGGTATATAACAAATATGTAATTTCAAGGTGGGTTGTATTTTCGATTTTTCGTTTTTTAAACTCAGTTTCAATTATCAATTATAAATATATTTTTTTTGCAATTCTTTCATCTCTCTCTTACTTTCTTATTTTTTTCTCGCAGTTGACGCTTATTCCGGCAATGGTTGGCTAATAGTATAATTTGTATATTTACTTTTAAAAATGGTTTATGTTCTGATTTATTGTGCTAATGCAATCCTTTTCTATTTAAATGACCTAGATTTCTATATTACGATACAGTATGCGATTAAAGAATATGTAATAATAATATATCTTTTTTCCATTTTATTTAGTTTAAAACCATGTAACAATGTCTTTTCTTCTTTAAATAGACTTTTTGATGTTATAGTTTAACAATTCAATCGTATTATATACATTTTTAATAAGTTTTGGTTTTTATTCACTGAGTTTATCAGATGGCTTCCACGGAATTAAACATACATATATCGATAAGCGCTTCAAACTTTCTTTTCTGATATAAATTATTATGTCAGCCCTTGTACCATTTGCGTTCATGTGCTAAATTGCCTAAATCGAGGCAAAAAAAAGTTTCCCAATTTTTTTGTCCTTTTTAATTTAATTTGTTAACCGCCTTAAATATTAAATGTTTACAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTTTGAAATCACGAATATAACTAAAAATAAATTATAAAATGTTTTAAAAGTATATAAATAAATTGAATGACAAAGTATTTGTATAAAAAGTAACAAAATTAACTTTGTCAAGCGAGTTACTTTCACTGTGCTTTATCATATAACATTTCTTATTACACATTAATCAAAATGTACTGTTTTTCGCTTTTTTGTGTGTTGCTCTCACCCTGAATCCCAAAGAAATGAAGGAAAAGTCCGTTTCTGTTGCAGGAAAGCTTTCGTTGAAAATCTAGACATGTCAGTCAGTCCGCCCTTATGAGACAGTCAACAATCGCGAACCCATTGGTTTTAAAATCTCTCAGTTATAAAACATTTTCGTGATCATTCAACACATCGAAGCCTTACACAGCGTTATTATTTAAATTAATTTTTTTAAACAGATGTTAAAATGTTTAATAATTTCTATTATATAACAATGACCTTACAAACATTTCTCTACATATAAGCACGTATAAAACTATTGCTCTTATCAGAACAATTACATTATTTAAATTGTATGGTTTTTTTATAATTGTATTTTTTCAAACAATAACATTAGTTTTGTGCAGATTTTAACTGTTTTTCTTTCTCTTTAAATTAGTATGATATTGCTATATATGCAAGTATAAATCATTTTATGTACATCTATGTACGGGTTTCTCCGGTATACTTACTGGTGTTAATATTATGTTTTTATGTTTTTATTGATTTAATATTTAATTTACTCAGGTTTTAAACGGTGCCATTGGACTACAGTTTGTCTTGGCTTTGAGATCATGTCTTGCCAATGTTTAGTTTCTGATGCTCCAGAACCGTTTTTACCTTTAAACAACATTCAAAATTATATATAATAGTTTGTTAAAAGTTGCATTAAGCACTATTTCAATTTTTATTCTTACCCGCTAATAATATTCGCCCTATCAACTCGTTCCTTCCTATATTATCAAAATCCATAACCATAACATCCAAGGAACATTCTCTTATTTTTTCCCAAGGAACGTTAAAGCTAAAGGATTCATTAAATACTGGATTTAATGTACATGTGAATATAGGCGTTTTTCTTTTCTCTACCCTTTTGTCTCCGAATTGAAGCCAAACCTTTACGTAAGGATCTGAAGGTATTATAAAATGCAAAATATTAAGTTATATATTTTATTTAATAATACTAGTAACGAGATAATTAATACTGTGGGCAAAAGTTCTGATATCATCATTTGTGACGAAAATGTATTATAGGTTCTACTAAATTAATCCTTTTTCTTAATTTTTTACATTCGCCACGCTGCTATTCAATATGCTTATGTTTAGTTGTACAATTTTCTTAAAGCGTACGAATGTAAAAAATATTAAGAAAATGTATTTTCTTAGAAGATTGTATAATTAATTTTCGTCGCAAATGTTGATATCAGAACATTTGTTTGCTGTAGGTGTGATCTTCACTAGAAATTTACCTCGTTCAAAAGAGTTTTTGTTCGATAATACTTACCGGATTTTCCATTTATATCCTTAGCTTTTAAATTTCGTGCTTTTATCAATGTCAATGTTAAAATTGAGTTTGATGGATGATAGCAAAGCGAGGAAAGAAGTTCACCGCATTTATCCTTCGCAGGGGGCTTTAAAGCTTTCCAAAATGATTGTTTTCCAGCGAAGTCAACCTTATATAACAAACGGATTAGTAAGTGATTACTGTTCATAAGAAAAAACTATTTCATTTATTATTTACCTGGCAAAGCGGAAGAAATACTTCTCCGATGGAGTCATCTCTTGAGAACCGATCGTAGTCGAACACATGTAAGTGTAAAACCTACACCATTTGTTTGGTCCATTTTAAACAAAAACCAAATTTTACGGTTTACTTATATTATTAAATTTTGGTGATTTTTAACTAATAAAATTAAATTAATTTTAATTAAGTTGAAAGTACTAAGCTGCCGGAATCGAAATGTTACTCTTTTGTCCAGTTTACAAAAAGTCAATTTCCTCGGAGAAAAATTAAAGTTTGAAATTATAGATTAAGTTTTGGCAAATGTTGCTAAGCCTTGCTCTTGGTATTATATAAGTCGGATTTACACATTTGCGTCTTAAAGCTCTTAATGAATATTTATATAGGACACTTACATCCTAAAGGGCATAAAGTGCTATAGGAAAACTAAAAGTAACAAATTAAAACGTTGTTGTTCATCGACATATTTTTTTCCGCTCCCGAAAGACAACCAAAAGCACCTCCTAACGAGGTAAATTACCGAAATCATTTTTTTTTGACGAAAACTAAATAAAAGTGTATAACATTACCCATCCCCCGCAGTTCTTATTTATAACGACAATTACTTCTATAGTCACAGGCACGTGAGCGCGAATACTTAATAATCAACCAACTCCATAACATTCATACAACAGTAAGAGATGCCTGAATATAAACCAACAATTTTTTTACATTTGTTCCTTTTAAAAATAGGTTTCCTTGAAAAAAATATTACCCTAAAATGTTTTAAAACTAACCAAAATTTACAAAATATTCTAAACTAAAAATTAGACACGAAAGAACGCTATAGTCAAGTGCCTATCAGATACTCGTTACTCAGCTAAAGGGAGTAAATGGGAAATGGAGATCTAGAGATTGTAAGACGCCACCTACCCGCGATTTTTATGGTAACGTGGGTGGCTGACATAGTCGGCGTTAAAGTGGGCGTGGGCCATTAGGTACTGACTTGACTAATATATTTAATTTTTGGGCGGTTTGTAGGCGTAGGAGTCGGTGTTGCCTGTTCGTAGAAGATGGCGATGGAGTGTATTACGCCCCCGTCTCACTAGTGTCCATTTCCTCATTTGCTTAAAAAGTTTAAGTAAATAGTCCGATAGTACAGTTGTAATAATAATCAAAACAAAACAACATAAAGGTGTATAGCCTTGAGATTTCTCTACTTTTGACACATTGTTGTAAAAAGTCCAGTTTTACAGTTATTATTCAATAAATATAGCCACACCTTTTTATGTGTATCAATATTATATTTTAGTCTTAACATAATTTTAATAGTTATAAATTGAATAGCACAACTTTTCGGAAAGTATATGTTTTGTATGATTTGAACAAAAACAACTCTTAACGGGGCACCTTCAACAAACAAACGCCCTGATATCAACTTTTGTGACGAAAATTTTGTTCGAAGATCTACCAAATAAATACACTTTCTAAATTTTTACGTTACGCACTCTCCAAATTAATATGCATTTGTTTATGCCGAATGAGTTGATATCAGAACTTATGTTTGTGAAAAGAGCGATCGTCACTATATTTTTACCTGTGTATATAAGAAGTTTGGGTTTGATTTAATGACAGAGAATATTAAAAGGAAATATGAATATTATTTTTTGACTTGATTTAAATATTTTTAAATTATTATGATATGGATTCAATAAAACGTTTTTATTTAATTTAAATATATAATACGACACATTTAAAATCAGTATCCAGATATTTACTTTGATTTTTCTTCAGCGCGTTTAAACTTCTATAAAATATTTTAAGATGTGGCCTTTATCGGCTCGGAAGCGCTTCCTTCTACCTGGTAAATACTATTTGACATACATACCATCTTTTTACTTTATCAGATTTACAAAATCCTGCTACATTGAAAAAGCCTATGGAGATTGTTAAATTTATACTTACACGAGACTGAAGTTTTTGAATGGGGAATCCTTCAAAGTAAAAGGTTTCATTCCAACGAGGATTTAGGGTTCGCCTTTTTATTTTGGTTTCCAATCTATGTTTTTTATCTGGTAATAAGGTTACTCGAACGTAAGGATCGGAAGTTCCACTTAAATCTTTCGCAGGAAGCTCTTTTCCTTGAAGAACTTTTAAAATTAATGTTGTATTTTGAAAATCATATTCCAAGGAAAAATGTATTTGTCCAACATTTTCACTCGGATCGTTGCTGTCAAGGTACATGTCTGACATCGAGATACT'..b'GTCACTGACGCAAGGGGCCGTCTAACCAAACATGATGACACCGCTGTGATCAATGACGCCAATGATCTTTCGATCCTTTACCACTTTCACAAAGGACCTCAACCATGTGCCGCTTCGTCACTTCCATCGACCTCTTCCGCTTGTTGCTCTTGCTGGTGGTCATAGCAATGTAGAAGTCTGGTATTACCGCCTTTGCCCAGGATATGTATTCTTAGATTAAGTGGTAATCCTCCTTTGACGCTTGGTCTTCACGTAAGGGGCTGGTGGCCAGCAGTTTAAGGATTCGGTATGCCTTCTTTCGATTCAGTGGTCCTGCCTAGTTAGGTGGCACTCGTTGACCCTGGTGCTTTCCACAATTCAGCTTTCGCACTTCTCTCAGGTTGGACTGGCTGGTTAGCCGTTCCTACGCTGGTGGGAGGATTGGGCTGGTCATTGTGGTGTTTTGGAACTATTGCGTTGTTGCGTTGTTCGTTGGCCTTCGCAGGAGTTAAAGTCACATGGACTTTTTAAGAGTGTCGGGCTCTTGTTTTCTTATTATGTAAATCGACTTTGGATTCTCAATAGTTAAATCCCGCGAGCTGCCGAAAAGGGACGAGTGAACCCGGGCAGTAGGCGGCAGCACAACTTTTGGCTGACACGTCAGACGAAATCCCTTCCGCAGTCTTGAATAGGGACAAAAGGAAAGCGAGGCCGCCTCGGCTTTGTATTGGAGAGAAAACCTCAAACAGCCTTGTTAATATAATAATCGATCTGATTTGTAAAGATAGCTTTCACGAAATCCTTTTGACTAAAGGAGACATACATAAAAAAAGGTCCAAGTCAAAAGCGAAAAAAGCTTTAAAAAATTGACGGAGATCCTAGACGCCAAACGCAATCGCAACACCAAGAAGGCAAAACATAACACCTAACTCAAAGCACACGCATGCAGAAATGAAGCAGCTAATTCTGGATCCCGGTGCGAATGGCAATTACTTCGATCACCATCTGCAAAGTAACAGTTAAAAGAACCTTTACGCCGACTCACCAAGGCACTAAGATTCCAACAACGCTATATAGAACAAGAATCTCTATACAGCTCAAAATTCCTACTATAGAAAGCCCACTCAAACCTAAGCCCTCCAACAGTAACGGTTACGCCAATAAGGACCCCTGCAGGCTGCTAGGCCCAAAGCGACAAGGACCGATCCGATACACCCCACCGATACCTCCCCACCTTAAAAATGTATTCCAGCCAAATCCAGCAACAAACGTGCAAGATCGCAAACTGAAGACGACTTTCCTTAAAGAACTCCCACTATGAGCATTTGACAGAGTGTGGCTTGACGTCCTCTTAAAGTCATAAATTTACAACAGGATATTTATTGTGAGATGCAATACTTCCATGTCAGCTGAACATAACATCTGATATTCCTACGAGCAGACAACTGACTATGTCTACGTTTGCCGACAACACCGCGAACCTCAGACGATCTAAATGTCCGCAACAAGCTTCAGCGCAAATTGTAGCCCATCTAGGTGTAGTAGAGAAATGGCTCTCAGACTGTCGTAAAAAAGTAAGTGAGTAAAAATGTGAACAAGTAACCTTTACCTTAAATAGAAGAAATGGCCCAAACCTTATACTAAACAATACCGCGCATCCTCAGTCTGATAAAGTAAGACGGCTTACCCGGCGTACGTATATTTAAGCTAAACGAACTCACTTAGGGCTGAAGCCAAACAGTCTGCTTTGGCTTATAAACTCCAGCTCCCCCTCAGTCTGGACTACAATTCTGTTTTGAAACCAATATCGGTCTGTGATTCGATTCATGTTTTTGAAAGGAAAATAGTGCATCGATATCAAAGAGCGCTTGGATTCTGTGTACGTTGACTCTTCTTCTTCGATTGAGGTTTTTCATGAGCCACGCCCAGGTGCCCCGAAAAAGGCTACCACAGAGGACAACGTGACAGAATTCCACGATCTCGTATTGGCAGACCGCCGATTGAAGACGTGCGAGATATCTGAGACAGTAGTCAAAAGACCGCGTGGGTCATATCCTGCATGAAATTTTGTGCATGAGATAGCTGTCGGCGTGATAAGTGTCGCGTTTGCGTTTGTCTTGACCGTCGACGAAACATGGATCCACTGGTACGTATCAGAGACCAAAGAGCAGTCGAAACAGGTGACTTCACCCAGCGAACCTGCTCCGAAAAAGGCGAAGTCTGTCCCATGGACCGGAAAGGTGATGGCCAACGTTTTTTGGGATTTACAATGTGTGTACATGACTACCTGAAGAAGGATAAAACGGTTACAAAGCTGTACTATGCTGAATTATGAGGCCGATTCGCCGCCAAATTGCAGAAGAAAAAAGTGCTCTTTCCTCATGACAACACACACGCAGTGATGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTAGATTATTTTGGTAGGTAAGGTAAAGCGCTTTGATAACATTCTAAGCTTGGAAATAATATTTTTTAAATAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTTTCAGAATTGGTCGATTGTATCATATAGCTTTCATAGAAATTATCGGAAAATTAGTGGGGAAAATAACATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCAAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATCAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGATTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATAGAAAAATTGCGGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATGTTGCGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTCGGAATAATCTAACATATAGATGTCAAAAATGGTCGAAAAACAAGAAAGAAATAATTTTGTTTTAATATCACTGAAGCCAGCAACAATCCTTAAAAATTGCACATGGTCTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTAGACAAATCATTGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTGTACTATAATAAGAAAATTTATTAGAGTTTGAAGAACTGTAAGTTAGTCATTAAACAGAATCAGGAAAATATACTTAAGAAATCAAACAACTTACTTTTTAAAAACAACCGCTACGAGAATATTACTCACGATCATTCGATTTGCAACGAAAAAAACTACCTCTGCACCAAAAACACAACAAACTTTTCATATCTCAATAAGACTAAGAACATTAAAAAACTGAAATGTAAAAGTATTATACTAATTTGAATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTTATTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCGGACCGTCTTTCCGTCTGTCCGTCCGTTTTTACGGAAAAAAGTCGGACAACTGTATCTTATAGCTCCCATATAAATGATCGAAAAAAAAATTTTCAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTTTAACATATTTTCATATCTTAATAAGATTAAGAACATTAAAAAACTGAAATGTAAAAGTATTATACTAATTTGAATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTTAGTCAAAAGTGCGAGGGAAAATCAGGAAATCAGTTTTAATTTTACTGTTGCCACCTATCGACTTCAAGAGCGTACTTACATCACCTAGCGCCATCAAGCGTATTAGTGAAAACGGCTTATTTGCTGCAAAAGGTGTGCAATCTCATATGACTGTAAAATATTGATCATATTGGTAATCAGAACACAACTGCATATGTATATCGGCCGAAGCCGAGCTTATCTAGACTTATTTTAAGTAAGGAGGATTGCCTTGACCGAACAAGACTACATTTTTTGTGCAACTTCTGAATCTACCCTGCAAGAAAAAGGCCGACAATTCACTTCTATGTCACTTCTGGAAGATAAAAAGACGATAGTAGACATTTTAAAATATACATATACATAAAATTACAAATAACTTCAAAGTCACTTCTGAGTTATGGAAAGGCGATAGCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1bf/6ee/5f/scaffold_18-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CACATTTTATAA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATGGTAATTATAAGACAGATCGTATGATCTACTTTTTAAGGGGTCGGAAACGGTTTTATTCCTTCTTGAAAACTTTTCAACGAAAACCACCACAAAACCCAACGACTGTACTTTCGCCTTTACTATTCTTACCCCGTTCCCACCAGAAGCAGCGGGAGCCACCCATGGGGTTAGCATTTTCTGTGCCGCCGCTCTGCTTATACACGCTGTATGGAACAGCGGCTTTGCTGAGCAAATCACACACAATGGTTTGATCGGCAGATTTGCAGTATCAAACAGTGTGGGCTTTGTCGAAGGCCGCTCGGAAAGCAGTGACAAGTATACATTTGCAAACGAGTACTACTAAATTAGGTGAAGATAGATATTAGTTATTTTGTTGGCTCATTTTACAGTTTCGGCGAATAGGAATAGAAAGCCCGGCTCCACCGGAACTCAAAAGCACAGCATGGTTTCCCCTAATTGCGAATGAGTTGTCGCGCGAAGTGCTTTTGGCCTCCTGTTAAGTGATAGTCGTCAAACGGAAGGCAAGGGGAAGGCGTCGTAGGTGGTCAGTGGTAAGGGGCGGGAAGCGCGGTCTCGCTATGCTCGTAATAATTGAAGCATATTCACAATGCTTGCTTTTTCCAGAAAGGGCGTATGTGAACCCCCCATGGGCGTGCTGCACCCACATTCAAAGCTGGCTTCCTAGGGATTCCCCTTTAGCCCTTTCCAACGCTTTCCCTTGTTTATATTTGGTTGGATGGCCAAATGCTTGGCTGGTCATCGCCGGCCCTGGTACGGCTCTCAGATGGTTTTTGGTGAGTTGGGTCTGGCGGTGCTTTAATTGTTTAATGGATCGTTACTTGAATTCCCAGTGGGGGACTCATGGTGCGTCTGTGCTAACTGGTATTTTCAAGTGCGATAATTGTAGCGTTTTATTACGGATTAAGCAAATTTTCTGTAAATTATATCTCAGGGACAATGTCACATTGGAGATGAGGTGGCTCGTGAGACGGATAATGTATTGCATGCAAATTTAAGGGAATAAAGTCGGTTGCCGTTGAGGTTACGATACCAAGGTTAAAACCTTTTTATACCCTTTACTCTTAGTGTAAAAGGGTAAATTGCCTTCCGAAAAAAGCGATCAACAGGTAGAACGCGTTTTCGATCCCGAGCTGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGCATAAAAGCTAGCATGTTGGGGTCTGGCATGGAGATCCTTGATCTTCCTGTTTCAGCAGGGTGCCACGCTCACTCAAACACGCGCCAGCTATAGTAGCACCAAAACCCTTCTAGCGCGCACACTTGTAATGTTTTTCCAATATATGCTGAATACTTTATGGACAAGAAAAAAATTATCATTATTTTTTACATCCGCAATAGCTTAGCATATTTTCCCCCAAGAAAACCAATTTTCTTAAGACTGGATCATTTTCATCACTCATTAGGTCCAGATTGGAATATGCTTCGTTTGTCTGTAGTCCGACTGGTTCCAAACACATCAATCGGATTGAGCGTATGCAAACACAATTCCTAATTTTTTCCCTTCTTTCCTTAAATTTTAATTACCCGGTCCCCTCTTACTCTGCGAAATGTCTTCTTCCCTAAAGATCGGTCGAAGTAGCGCACTAGATTTTATTCGGACCTGCTGTCCTCCGGCTGGACCCATGCTCCACAGAAACTTAATTAAGAAAACCTTTACAATTACCTTTCGTCAAGTAGCAAGTTAAGGTACCCACTGTTTGCGAAATAAATAAATAAATGTGTCTTTACACTTCTTCATTTCTTAATAGAAATTTTACTGTAAAGTCGGCCTGGAATCAAGAAATATCGACCTACTACGGGGGTCAATGGCGACTGGTTATAAAAACAAGGGAGAACGTTATATTCGAGTGCCCCGACCCGTAACTCAGCTTAAGGGAAATGGAGATACATATATAAGACGCAAAGGGATATTGTGAAGCGCCACATATTTCAGTATATGTTATGTGGGAGGCAGAAAGAATTAATCGTTAAAACATTTTGCGGGCGTTAGAGCGGGCGATTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAAATTGTGCAAACTTGTGCTGCGTAGGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTCTAAAAATTCTAGCTCTTATAGTTTCTGAGATATCAGCGTTCATACGAACGGACGGACAAAGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAATGGCCAAAACGCTAAAATATGTATACCGCCCATATAACGTCTACTGAACAAGCCGGTAGATGGCGCCCTAAAATACAGCCTTGCTGCTTATATATCTTTATTATCCTTTTGCTCCCGCAAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTCACATGCTTTTTGTCGTTTTTAAGGCTAAATTAAAACACAATTTTAAGAGGGTTTTTGGTGAACAGCATAACTCGTGACTGGATCATAAGAATCAGAAATTAAATAAATGCTTTGATTTTGATTTTAGCCTAAAAACTCGATATATTAGTTATCTTCTTTAATTTTCGTCCGATTGACATGAAATTGTAACACCAAATTCTTGAAAAGCGAAAAAGGAGAAATTAAAAATAGAGTTCTGTTTAAGGATCTTAATCTATGGAATATTTTCTTCTTATTTGCTTTGGTGCTTTTTGGATTCCGGACGGTCTCGGGCGATACAACAGCTAGACGCCCCTTCTTTCGTTCCCCACCCCTAAAACACAATTGCGTGACCGTGTGAAGTCTTGTGGACAGGCGATAAGAAGAACGACGCTTTTTTATGTCAGCACAAAAGCAACTGTTGCCGCACACACGATGGCTGCATGTAACAGCCATCTGGAATAGGGAGTTATTTCTTCATCTTAGATCTAAATAGGTGGTGGGAGTAGTGGTAAGTCGTTTGTTAGATGAGTGGCAGGCTACCAGTCTTCGTGCGCCATAATTGCTTAGCTTAAAGAGTAAAGCGTTTTAAATGCGTAGATGACAAAATTCTGCAAAATGCCCTATGGGTATGGGAACCAAACCACGACCAATGTCCGATTCTTGGAAAGGTATTCCGTCTGTTTTTAACTCAGCTGAAGTAAGTATTAAAAACGGCGAAAAGAGTTCTCAGTCTTATACCGACATGGCCTACTGCTGAAATCAATCCCACTCTTTTTAATATGCGTCCGGCCTTTGGAGGCGGTCTGAGCTCGCAGCTGAAGCAGACTAAGCCGAAGCGGAAAAACTTTTCACTGCACGAGCATGTGCCGTGTCGTTGGCACGTGCCACGTGGCGATTGCCTGAGCTGCGTTCCAGCCTCAGCGGCAGTGCGAAGATAATATGATGATTGCAAGGCTGCTTCAGTTTCCTGCGGGGGATTTGCTTTCATGTGCTACCATTCAGCCTAATAAAAACATTTGTTTCCTCTACATCAGTCAATTTATGATCTAATCTGCGCATATTAAATCTGGAATATAATAGAGCGTTTGTCAGCCGAATGATATTAAAGATTTCGTCTTACCTGAAACTCTAAAAAGTATGTGTATAAATTACGAATGTCGAATGTCTTGACTTTCACGTACCCCTTACTCATTAAGGGGGCAAAGGGGAAATGGAGATATGTAAGGGGCAAAGTGATATTGTAACGCGCCACCTACCCGTTTTTGTGGTAAACTTTCAATCAATAGGTTTTAATGAGTCAAATACATTTCAGTCTACATTTTTTTCTTTATTAAAACAAGACGCGGATTTTTGTCAATAATATTTTTAAGAATTTTCTTTTCTTAATTAGTTTGTGAGACACGCCTAATGATATGATATGATAGCTTTGCCAGAGCCCTGAAAGAGTTTTTAGAAAAAAACAAAGTCATATAAATATCTACACGTTTTAACACGATCTTTAGCAACAGCTCTTGGAACTATGATTTTTTCCTCTCACCCCACGTAAGTGTCACCATCCTTTTACCCTT'..b'GGATTCGGGTCGTTCTCGAATTTAGGGTGAGATTCGAGTCGTCCATTTTGGGCCCGATGGCGGGGGATACTGCGGAAAGTATTTAGGCAGCAACCTTTCTTGAAGCTCGACAAAAGGGGTAACATTCTTTGAGTGGTAGCTACTGAATATTGTCTTTTCCAAAGGCCGCTGCACATGCACTTGTGCCAAAAAACGCAAAAGTTGCTATAGGAATCCGGTGAGCCTAAGCACTGTTTAGGTGAAAGCTGGAGCTCATTTTAAAACAAGAAGGGAAGGTAGCTTCGGCGAGACGAAGTTGGTATATCCTTGCTTTTGGCTTTTAGAATGTTAAAAAAATAATATCTGAAATATTAACATTATGTTACATCTTAATTTATTTTTGATTTTGTTTAGCCGAAAACAAAGTATAAAGATATGAGTATTATTTGATCTTCATTTTTCATTTTTTCTATGTTTTCCCTTCGTTCCTATGCAAACTGTAAAAAAAATTGTTTCCGGAATTTTCAAATGTTATAAGAATCATACTTCCAGGAGTAGATGGTAATATGTCAGAACACAACTGCTCTAATTGGTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTATAATGAAGGATGATAATGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATTTAGTCATGTCCGTCTGAACGTCCGACCGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGACCGCCTGTCCGCCCTTTTTTACGCAAACTAGTCTCATAGTTGCAAAGTTATCAGGCTGAAACTTTTCTATAAGTCTTCTTTTGCAAATAGTATATAAGTCGGATCCAGCCAGATCGGACAACTATATCTCATAGCTCCCAAAGGAATAATGCACAAACAAATTTTTAAAAATTGCATCTTTTTGTTTTTAAACATATAACCTGCTACGCTTGAAAATATCATTTTTTAATTAGTTTTAAACTTCCAATTAAATCAAAATCAGACGACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATACTATGAATAAATTATACATTCCATATACATAGCTGTCAAAGAAAAAGTCAGAGAAGTAATGAAATAATTTTTTAAATTTCACTGAGGCTAGCAACAATCCAAAGCAAGGGTATACAAACTTGGCTTGCCGAAGCTAACTTTCTTTCTTGTTTGTTATTCTTTTTAAATATTGTTCGATTATTCCTTGGGAGTTATGGTATATATCTTATATACTATATATATATATATATATCCGATCCAGCCAGCTCCGACTTATGTACCACCTGCAATAGAAATCCCGATAGCTTCAAAACTGGCAGAATCGGACAGACGGACATGGCAAGATGGCTCGAACGAGTCGTCTAGTGAGCGGTCATGGGTTCGGAAGTTTCTTCACTGCGTTGTAAAATCGAATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGAGTTTCAATGTTGTTCGCATACCCCCTGGCAAAGGACATTCTGCCTAATTTTTCCACTCAAGTGCACTTTTCTCTGTTGTTCTTCCTCGCTCACTCGCTCATTTATGTTTTGCCGATTATTCTTTTCTTTTTCTTCTCCTTTCCTTTTGAATTTGTTTGAAAAGCGTTGTCAAGCGCAGGCACAGCATTAATACAATAAGAAACTGAATAAATTGCAATCCAAGGCAAACAAACGTGCGTTGCCCCTGAGTCTGACTGAGATCAGAAATAGCGAAATTACAAATACCGATTCGGATTCAAGACTCCTGGCAAAGCTCACAAACCGGGCTCACACCCCTTAGAGGACTGTTTGCGTAGAAAACTGAGCATCACCTCTCGGTTCAACGCTCATATGTTAGCCTTAGTTTTGTAAATAGCAAATCTTATTTCTAGGTATCCTCCATAAACCGTGTTTTGCGAAACCTGGCGGCCCAGAAGGAGCAACAAAGCTCGGGAACTAGTAGCTCTGGAGCCGGCCCCGCAAACTCGAGCAGCGGAAAACTGGCCGCCAACAGCAGTGGAAACATCACCAACGGCTCGAACGGCACGAGAGTCACATTGACCTCCTCCACTGATCTCATGCAGACGGCCACGCCGTTAAACTCTTCGGAAAGCGGCGGCGCGAGCAATTCCGCCGAGGGGAGCGAGCAGGAGTCGATTTACGAGAAGCTTAGGCTCCTAAACACACAGCACGCCGCCGGATCGGGATCGGGATCGCTGGACCCAGCCATAGCAGTCCCGTTAGTGGGTCAGTCGCCCAGCCATTTCGGACCCCATTCTAGCCACCCACTCAACCAGCTGGTGCACGGTAACCAGCAGGCTCTTCAGCAGCAGCAGAGCTGGCCGCCGCGCCACTACTCCTCTGTACCTTGGTACCCTTCCTCCCTGAGTGGCAGTGAAATTCCCATATCATCGGCTTCCAATGTCGCGCCGATGGCGTACACGTCGGGGCCTTCAGTCGCCCAGCCTCTAAGTCCGTCGAACGACATCGCAAGCCTGGGAAGTGCCGGCCACCTGAGAAACTGCCCCGTGATCACGGAGGACATTCATCTAAAGAAGGGTGAGTTCTAAGTCTATGTATCACTCCACTTCAATCCTGGAAATGAATACATGCAACGTTGGGTGGCTCGTCGCCTTTTATCATTGTCAGGAACCCAATAGCCGACCAATTTTCCTGGGGAAAGTATTTTTTGTTGAAATGTAATCGTAGAACATATAGTGTCGGCAATAAAATGCTGCTTTGCTATTTACTTATAACATGTTATTTGAAAATATTACAAACGAAACTTAACAAAATGTTGCCGTGCCACTGTAGACGACAGTACACGTAGTGACGAAGCGCTCAACAAGAGTGGTGTATGAGAGTTGAAGCGGCAGAGTTAAAAGTCTCCTGTGAAGGTCCGGTCAGAACAAGTAATACACCGAGCGACAGGTACTGCAAAAACTAAACGGGCTGAATACTTTTGAACTTTTTTATACTTTTAAAACGTAAATGGTTGGTTAAATGTGCTGGGTAAGCACCATTTTTTACGATGTGCTGCTGCTGGAACCGGCGGGTATGATTGCCTCAGTTTGATTTCTCGCTCCACAGCGGTCAGCAGCCTCCCGTTAAGCGGGCATAGAATACAAAATGTGATTGTTCTCCGCCGCCACACGTACAGTGTATAAAAGCGGTTGGCACTCACCTATCTATGATGTGCCATCACACAAATGGTACACACAATGTCTCTTCACTGTCTGTAAACCAATAGTCTACACTGCTTTGCTGTTGCGAACACAACTGAAATCGAAAATCGAATCGTTGCAGTACTTTAAAGCACCTTTATTTTCAGTTGAAAGCAAGTGTATATCAGAGCACAGCCCAAGTCATTTTATTTTACTCTATGTACGCACGAACTAACTCGGCATTTGCAAATTTTTGTTTGCTGATATGCCGTTTTATCAGTTATAGAAGTCTACTCCTAGACCAGAAGGTTGTCGCGTCGTGCGTAAATGCGACGAGCACGTGACTTGTAATACACTTGGTTCTGATTGTCTCACACATCGCAAGCCGTTAAAGGTTTTTATAAAAAAATAGGAAATCATATCGATCTTTATAGAAGGTAAGGTAATTTCACCAGCTTTTTTATTATCTTTTAAACCTTTAGCCATTTATTATGTGTGAAAAGTGAAATGAACGTGAAAATGTAGAAATTTTGATGTGTTGGATCCGGTGGGGATAAATATTTTTTTGTCAGTTTGTCCGAAAACGTGGTTCTGGTCGAGGTTAAACAGTTCAATATAAGAAATTGTAGATTTACCACTTTTGGAAAAACTCGCTAGTTTTCCGGGAAAATAAATACAATTGCTTTAGTAGTTTACACAGTACGGGTGTACATGTATGTCGGCATGCCACCACTTTTTTAAAAACACTTTTAGTTCATAAGTTAGCTAAGTAAAGTTGATGGAATGGAGGTAACCTTATCTCTTGACTTTCAGTACATAATTTAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTACATTTCAGGCGAAGTTCCTTCCATTATGTTTTATAGTTGTTTACCTTTTTCTAGTTGTCAACAAATATAGAGTTCCATACGTAAAAAGAAATCAGTAATGTCTGATCTTAGCTATCAGCCAAATGTACCACAAAAAACCCGTTTGTTATCATACCCCTGCAGAGGGTATTACGATTTGACTAAGATGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACTTTTCCGACCCCATAGAGTATATATATTGTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCAAGCCCGTCTTTTCGTCCGTTTCTACGCTGAAATTTTCCCAAAAGTTGTTTTCTTTTACAGGTAGTAGATAATTCGGAACCAGTGGGATCGGACATCTATACATTATAGCTCCTATAGGAATAATCGGAAATACAATTTTTTTAATAATATCTTTGTTGTTTTTAAACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTTTACTAGATGTGTCGGAAAGTATGTAATAGGTGAAAGTAAGCATTTCCGACCCCATAAAGTATATACATCAGGATCACGATCCGAGTCGATATAGCCATGTCCGTCCGTATGAAATCTCTGAAACTAAGCTAGAAGGTTGGAATTTGGCATATAGATTCCTGTAGATTATTTTTTAATAAGTTCTGAATTTCGATTATAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCCTAGGAGCCATCAGAAAATAATATGAAACAAATTATAGTTTCAGGATCGATATCAACTTTTGTGACGAATGATGCTTTTGTATTCGACTAAAAAAATTCACTTTCTAAAACGCCCATGGGCATACGGTGCAACGTTTGCGGCAGGTCCAATTTTCTAAATTTTAACTTTTACACTTTCACCGCTTTTTCTCCAAAACAAATTCCTAATTCTAAAGTTTTGGTATGCAATCTTATTGTTAGTTGTTGCAATACCTTTTGATTGGTGTAACACTCGCTATGATCGGACCATCATGGCAGATTTTCAACTGATAAGTGTGGTTGAAAATGACAGTACAACTAGGATACATTTTTATAACCGTTACTCGTTGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGGAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGAACAAGATCACTAGCCGATTCGATATAGCCATGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGGAAACTATAAAAGCTAGAACAAACTTGGCATGCAGATTCCGGGCTTCCTGCGCAGCGAAGTATGTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTCTACGGCCCACAATCCGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAATTGTTATGATAGAAACAAAATTTTAGCTGAAATGTGTTTGTCTCATCAACACCTATCTGATTGACTGACCAAAAAAAATGTGTCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACGGTTGAAACGCTTAAATGTGTGCCTCCCACATAACATCTACTGAAATAGCCGGTAGGTGGCGCCCTAAAATATAGTTTTTCTACTTATATATTTCCATTTCTCTTTTGCTCCATTAAGCTGAGTAACGGGTGTCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTTTTGGGTGTAGTTGTCTTCGCACGCTCTATTGCGGGCTTCGCCACTACGTGTAGTGCCGTCCACAGTGATAAAGTATGAAAATGTCAAATTATACATTTTATTTTTTAAAATTCATTTTGCAGATTTATTGTACGTTAAGTACCTTGAAATTAGTAACGATAATACAATTTAAGTTGGAATAACTTTTATTCATTAAAAACTGAACCTTTTCTGCTAGTTTTTTTTTAAGTACGCGTAAGGGCACTTAGGTTATTATTAGAACACAAAGGTGTGTCGTTTATATAGCGTTTACAAAGTGGCTAAATAGAAAATGTAGAATTTTGATTACAGTACAAATTATCGACTTAAAGCTAACAAAGAACATGTGTGTCAGAATTGTCAGTGCTATTGCGACCCCCTTCCTGCTCTTTCCCAAGTTTCCCCCTTTTTATCAAGAATAGCTATGGGGCAACCACTGCGGTTACCACTACCGTGGTTGACAGGTTTACCCTTAACCGTGTAGTTTGCTATAATGCGATTTACAGACTCATTTTACAGGCGATGACACTTCATTAAACGACAAACCGTGAGGGTGGTTGTGGTTAGAGATGGGTTCACGGTCAGGACTCGGATGGTTGGGGTTGGATTGGATGCTGGTGAAGATGAGGGGTGCATAAATAGATTACACCAAATACATATTTATAAAATTGTATTTCAAATCCTCGTTCCAGAGCGCTGGCCTTATCAAGTTTTGTCTATAGCGCATTTAAGTGTGAGAGTTTCGCACCACCGTCCCTAAGCACAGCATTGAACGCCAACTCCAACTCATCCTCTCAGGTCACCCAGTTTCGTTCTCCAGATACCGTCGCAGATCTTGTTGGATTATAGCTCGTGTTCTGGTTTTGGTTGCCTGGCATCTGACGCCGACTGTCACTGTAACGCTGTTGTCGCTGTCAGAACATTGCAATTCGCTAGCCAGTGACATGTGCTTTGCGGAGATACAGGACGGAATATGTCCCGCGGCTTGTCTGTGGGCTATCAGCGTCTATTTGCTTTGTCAGATTCACTAACATTCAACGTCAACTCCACCCGAACGCTGAACTGCTTGTGTGTGCTAGAACAAACCTTGGCCCAAGCTGACCCAGGCCGACACATAAATGATTAGCAATCCTTTTGATGTCGCCGCTGGTGTATTGCTGTCGTAACAGCTGTATTCTAGCTCAATGTGTTTTCATATGTATAATGACTCTCCTTAATCAATCATAGTTTTCATTATCTGTTATCCTTAGCTCGTCGAAGCCTAAAATATAACCGCTATAAATGTTACAATAAAACAAGAAAGGAAATTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATAGCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTATTTGAAGCCTTTAGAAGATGAAAACGATCGGGCCGTTGCAATCGGATCGTGCAAGTGACTTCCGTCGAAAAAAAAAACACGTCTGGAATTGACTTTATAGCAAATCTTTTCCACTAGCATACCTACACCGATTTTAACAATATAGCATTAAATAGATTAACTTGCTATTGGGGAAACGCTTGGGCGAAAAATAATAGGGTGTGTAACAAGGGGGGCCCGAGGAGCTTTCATACTACTTTGTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTGTATTGGTTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAACGAGACGTTTCCGACCCTAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCCAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGGCCGTCTTTCCGTCTGTCCGTCTGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTATAGCTATCGGGCTGAAACTTTTCCAAAAGCCCTCTTACTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATAACTTATAGCTCCCATAGGAACTATCAGAGAAAAAATGAAAAAAAATGATATCTTTTGTGTTTTTTAACATATACCTTTCTGAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATCTCAAACTAAATTTTATCAAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTTAAATAATATTGAAAAATTATATATTCGGTGTTTTTTAACATATATCCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAGTCGGACGAGCATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTCAACATATAAACTTATAAGCTTGAAAATACCATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTAT'..b'TTTACGCATCCAGAAAATATAATACTAGCTATGTTTTTTGAAAACGTAAAGTATATACGCGATCAGGCCTTTATGAAATAATTATATTATATAAAAAATCATTATGATTATACGCGATCAGGCCTTTATGAAATTATTATATTATATAAAAAATCATTATGATTCAAAAGAAAATTTAAACAATTTTTTTTTGGAAGATCCAACAATACCGTGCCACATTCAAGGAACCTACGGCACACTGAAAAACATTGCGAGATCAAAAGCCATTTTAGACCATAAGTTTGTTCCCCAATATTGCTTAGAATCCATTAAAAATTACGTTCCCCCTATTCTATTTTTAGGCTTCCAATTCGAATCGCCCAAACGTTTAATGGAAAAAATTTCGGTTAATCTGCTTTTCTTTAATCATATCATTATCAGTCTGAAGTTCCAATGCAGTGATAGAGACATTTTAGAGGCGGCAGAAAATATCGATAAAGTATCAAAAGTATTTCAGAGTTTTGATATTTTTGTGATGAACCGATTACACGAAATATATCGAATCAATTACAATTTTTAAATCCCCCTGTGATTGTTTACGAAACAGGAGCATAAACTCATATAAAACATAACATTGTTCGAAATTTTTAGAAATATACTCGGATTTCTTTACTTTTGTGAATATTTTTTCAAAAATATCAATATAAATTTAGTTTGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTTTTTCAAGCGAAGGACGTTGTATGTTAAAAAACACCGAAGATGAAATTTTTTTTTTTTAATTTTAGTTCCAATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGTTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAAAAATAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCACGAAAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTGGAAACGGACGGCCAGACGGGCATGAAGAGATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATAAAATCTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTCCACTGCATTGCAAACTTCTGACAGAAATCATTGTACCCTCTGTAAGGGATAAAAAGACGATTAAATCAAAAAATTGTAAAAGATGTTTATTTCTTAATATTTACGGCTCAAACTTTTATTAATTTATTACCCATATTTTTAATCCACTGTTATGTAAACTGTAGCTGCTGACGAACCAAAAGAAAAGTAAGCTAACCTTGATGATTTAACTGGTTCAGTGCTATCTTTTGGCATACGTGAACCTTGATAAATACGTTTAGTTAATTTATTATTATTCTTTTACCGAATGATAAACGCCTAAAAAATACGCTTTAAGCTTATTTGATTAAAATACCTTAAACGATCTCAGAATATTAGCATGATCATCTAGAAAACGCTTTACATTTTATAAATGCTCTAATTTTTCTTTCTATACTACTCAATGTAATATTTGGTGTTTAAAATTGAAAACAGATGGTAAGTTTTCAATTCTTGAAAACGAACGGTAAGTAAAGCTATCACATGAATTCGTGTTCAATGTGTAGAGCTAAAAATTTTTAAACTAATAACTAAATGTTACAATTTATTTTTGTGACTCCAAAAACAGATTTTTAATTAAAAAGTTCTAAAAGATTAGATAAAAAAATATTGAAGTAAAGTTTTATTAGCGTAATTCATTTTTTAATATCTAATATCTAGATGACATACCCTAAACAAATATTTTGGGTTGAGATACACTTTCAGTTTCTGTACATGCATACATTGTATTAATTAATTGTCAAAATACTATACTTATGCGACGCTTTTTCAGTAAAGTAATCTACCCTTAAAACAAAAGTTCTTAAATTAACTTTATTTTTGAACCTTTATCAAAGTTATGAAGAAGACTTGATCTAAACATGCCGACTTTTCTTTTGTCTGCCCTATTCTACTCGATCATTTTTCCTTTTACACTTTACGTTACTTTTTTATATTTAGGAAATATCACTTCAAAAATTGGCCGATTCCAACTTTCTTTTCTAGGAATCATCCGGAAAATACTTAATTGAAAACAACTTGCATGTAATTTTGTGTTCAATTCGTGTAAGCTGTGAAACACCTAAAAGTTCAAAATAAAAACAACAGAAACCCCATAGTCGATTTCGTCGACTATATGCCACCAGTTACTCAGCTAAGATAAGTGCGAGAGGGACATCGTTTTTTCCACTAACTTTGGCATGTAGATAAATATTGATAATAAGAGCACAATCTTATTTTTCCGAAAGTAAAAAAAATGTTAAATGTGGAAAATGGGCGGTTTCTACTGAAGCAAACTTGCGGTGCGCAAGAAGCTCAAGAATCTACATGCTGAATTCCAACTTCATATGTTTTATAGTTATCTATAGTTATATCGGCTGTTTTTTGTGGGCTTCATAGTGCATGCTCCTGAGAAAAGCTTGGGCTGCGTAAGAAAACGATTCGATTATTTGCGAACATGCCACGCACACACTAACGCCCGAAAACCGCCTTAAACTGTGGAAAACGGCCGAATGCAGATGGCGCTTTTATGTGCTCTGCAACTTCTGGTTCTCCCTAGTTGAGTAACACATACCTAATTGTCGAGGTTTACGACCATAGCATTTTATCTTGCTGAACCCTTAAAACAAACGTACCACATAATAAAATATACGTTTAAACATTGTAAGCTGGTTTAGTTTGTTCTTCTGGCTGTTTATGCGAGTTTGCCAGTGCTTTCGATTATTACGTTGCCTCTCGGCAATTGACATCTAAAAATATGTGCTTGGTTTCCACAGCCTTTACAAAGATTAAATTTTTTACTGGGACTATTCTTCATGTATTTTAAATGGAACATTTTATGAGGCTATCGTATTTTCTAAAAATCAATTTTGGACCCACATTATTTTGTCGTTATGTTGTTATTTTGTTGTTATGTTAATAAACTACTAATTTTGCCAACTATTTATTGCACTTTTTAACCAAGCCTACCATATGTAATGCTTCTCATATTTGAATAATAGGAATAAATGATCGTAACTTGACTTACCCAAACGTTGCAGACAAATCGACGGTTTCGCGCCGACATTCGCGAAAAAACCCGCTATACGACAGGAAGAAGATGGAAAACGACTATTATTTGAGTGCCGCGTTAACGCTGATCCAATACCCACCATTATTTGGTTCCACAACGGAGCAGCTGTTAAGGAATCAATACGCCATAAGGTAATTTATAAATACACAAAATCAAGGCGGTTTTTGACCTTCGAGCTCAGGAGATTTAAACTTTAACTTTTTTTAACTAAAGACTGCAGAAGTCATTTATAATGTTGATGAATCGGCACTTTTCCTGGTGAGATTTTCTGGTTCAGTTAAGGATAAATCCTAAAATTCATTTTAAAACTTCAGATTGTTTTGAGATTACTTAAACTTGAGAGTGTACAAACCATGATCGAATGTTATTGATTGTATCGCGTTTCGTTTAAAAGGATGAGTGTTATTAATAATATACTTTTTCAGCTTACTGTTGATAAAGACGTCCATTCATATTTTGCAACACTTGAGATACTAAATGTAACAGTTGAGGATGCTGGCAAATACAAAGTGAATGCAAAGAACGAATTGGGCGAAAGCAACGCTACAATAAGCCTGAATTTCGACAGTAAGTCCTAATTGTTTATATCCTATTTCCTTGTTGCACTTGAATTTCATTAACCATCATAATTGAATTTTTTCGGTTTTGCTAGTTTGCCGCAAAAATATCTTTATTAAGTATAAGCAATAACCCCTAATTTGCTAAAAACTTTTAGACCTTATATTTAAGAGATATCTGGATAATAACTTTGAATTTTTTTCGACTTTGATCGAAAGCTAAAGGTATTGCCCCATATCGGTAATGCTTAGAATAAGAGTAGTTGACTCCTAGCTATGTCTAGGGACTTGTTTAACTCCCCAATTACAAGCCATAAAACGAATTGTCAAAAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGTAAATCTGCCCGCATTCGTTGTTTGACGCAGTCGGTGATGAAATCAAAATAATAATACACGAATACATATAAGTATACATATGTACATTTCTAGCTTTATTTAAATAGTTTGTTAGAATATATTTCCGCCTTGCCCCGTGTATTGGAACTGACCTTGTCATTTGCAAATTGTGTTACATGGATATTTCAACTCTATAGGCGACGAAGCCCCCGTGCCGGAAAGCGCAGAAGGCATTAAGCCAACTTTTACTGAACGACCAGTAATTCGTCAAAGCGAAGATGGCGGAAATGTAACGTTCGAATGTAGATGCGTCGGAGATCCCACTCCAACAGTCACATGGTACGAAACTAATATTATAATAAATATCTTTACCATACGAAAGAGATCAAATAAACAGATCCGAAGTACCCGGTAGAATGAGAGCCTCATAAGCGATTTCCGTTTTAAACAAATTATTGTGTTTCAATCAAAAACTTTCCTTCACAAAGGTCCCATGGCGAGACTATACTAAACGAATCCAAACGCTACAAAATGTCACTGACAATGGATCAAAAACTATATCACATGGCGTGTCTCGAGATAAGCAGTGTGGTCTCCTCTGACCAAGGTGAATATCGCGCGCAAGCGAAAAACAAGCACGGTTCTGGAGTCGCAACTATTAATCTTAATTTCGAAAGTGGATCGAAAAAGTAAGGCAACAAAAACGCATTAGAGATAATCAAATGATATCGAAAGTTATACTCCTTCCAACTCAATACAGAATTCCAGATGGAAAGTCGCCACGCTTTCCAAAAAAACCAACGATCCGCCAAGAAGAGGACCTACTCATCATGGAATGCGTATTGGAAGCGCATCCGGTCCCAGACATTGTCTGGTATTGCTCAGATAAGGAAATATCCGATAATCAAAGAACGAAAATGACCCGCAAGGCAATAACTAAAGACAACTACGTTTTGACCCTGGAAATCCAAAACCCCACAAAAGAAGATGGCGGCAACTATCGCTGTAACGCAATTAATATGTATGGCGAAAGTAATGCAAACATTGCGCTTAACTTTCAAGGTACTAAACTAACTTTTCTTTGTTATATCGTGACTTTTATAATCATATTATATTACATAAATGTAATCATAATGACAGAGTTTTTTTACTTTACGTGGAAAGTATACGAGCAAGCACACTTCTTGGCGAGCACAGACAACTTAAAAAGCGTCTTAAAAGTTATACAAAATAAACTGACTAGGTCAGAAATTACTTATATTATTTCATCCATAAAATATTTTCATAATTAGCCAAAATAAGTGTTTTAGTATTAAAAGTATTAATTTTTTACATATTTACTTAAAATCATGCTGATATATGGTAAATAGTGACATACAAATTATTGTGTTGTACATAAATATATGAGTGCTGTAAATATTAAATTTATTATATTACATTATTAGGCACAAACTATTACCTACTTTTTAAATTTTTCCTTAAATGTTGCCCTTTTTTTATAAGCAAACCCAAGAGGGGTTTGGGGGTGTGCTACGAGAATCTCAATTCACCGCCAACACACAAAAAAAACTATCTAAAATCAAATTTTAATACCCTTGCAGACGGTAAAAAAATACAAATTATAAATAGGTTTTTTTTTATTGGCAAGCCCATACGGTAGTAAATTGAATTGTAGCAATATTTCTGGAACTAGTTTCAAAAAATCGGAATGATCTGTACGACCTGAAAGGGTATAAAGACATCGGTTTGCCGATGTTAGCTTCCTTTCTTGTTTTTTTTTACTCCTTTTGTTTTTATTATGGTTTATAATACATAGTTACATGCAACAAATTTATAGACTAGATAAGTACGCCTCATTAAACTATTTAGCTATCTGCGCCGGAAATTAATCTGGGGCCGCAACTTCGGTCACACAATCATATTATTGATTTGATGATTTTCATTAAAGAAAATAATAGGACTTGAAAATTAAGGTATATGAAGTGTATACGAGTGTCTTCAAAAAGTAAGGTGACTTTTCACACAGAACACTTTTAGCGTGTGCCACTGTCAAGATTTCCAGTGTATCAAGTGCTTATAATACGTCCGTCTATCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGTCTCACACTTTTCGAAAAGTTTTCTATCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCCGGCTGGGTTCGGACAACTATAGCTTATAGCTCCCATAGGAAAGATCGGAAAATTTTTTTTCTAAATCATATCTTTGGTGTTTTTCCTACACTTGGAAATATATTTATTTAATTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATGTTATCAAAATCGGACGACTATATCAAAAAGCTGCCATAGGAACGAACTGAAAATGGTTGGAAAAATAATACGAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCCTGGACTATGAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGTGCAAGAGGGAAAAGGATATATATAAGCAGCAAAGCGATATTTTAGGACGCCACCTACCGACTGTTTCAGAAGATCTTATGTGGGCGGCAGGCAGATTAAAGCGTTTAAACCGTTTGTGGGCGTAAAAGTGGGCGTGGCACATTCTTTTAAGGTCAGTGGATAGGTATTGATGAGACAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTCTATCATAAAAACTATTGTCGCTACAGATTTTGACGGATTTTCAGCGTTACAGTGGGCGTGGCACCCCCATTATTTGTTCTAACTCTTGTAGTTTCCGAGATCTCAGCGTACACACAGATAGACATACCGACGGACAGACGACGGATTGAAATACAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGCTTGGGAACGCTGCCTTCTACAATTTACATAGTTTCCGACGAATTGGACGACTATAACATTTACCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATGAAATTATTTTTGTTTCTAATATTACTAAGGCTAGTAACAATCCTTAAAAATTTAACATGGTGTTACTAATGTTTATTATTTTGTGTAACTTCGAGGGTATACAAACATCGGCTTGCCGAATTTAACTTCCTTTCTCGTTTTTTGCACTAAATTTTATGCAAAACTTTTGATGCACATTTTCGATAGCGAAAGTCGCAGAGCACGCAATACCCTTATAACTTGGAACTTAGTACAGATGCCAACAAAACAAAACAAAAAAACCGATAATCAAAAATACGCAGTCCGCGAATTAAATCACCTTTCTTCCTCAACAAAGCTCGTAAAAAAAATTGAGGTGTTAATATTTAACTTCTTTAAAAATAGTAATTTGCACAGGGAATATAAAAATTTAACAATTTAAGTTAACATTAAATATATGTTTAATTTCTGAATTATATTCAATAATCTAAAAGAAAACAACAACAAATTATATTAACATGTTTAAAAATTAAAAGGTACGAAAAGTTTATGCTGATTTTACATATTTTTTTGTAAGCATTAAACATTATGTTTTGTGGCTTTCGACTAATGAAAAAAGATATTAAAGCCTTACTTGTTTTCGGTGAACAGGTGCGAGCGACGCCAATGGTTTTGCACCATCATTTATCGAGAAACCAAGGATAATCCCAAATGAGTCTGGCACACTAATAACAATGAAGTGCAAGTGCAAGGCCAAACCTGAGCCAACCGTAACTTGGTACAGGGGTCAAGACATGGTGGAGAAGAGTAAGAAGATAAAAATAAATACAACAGTTATTGCGGAAGACACTTACGAACTGACATTGGAAATAAAGGTGAAGTATCTAGAAGCGTACCCCATAGCAAACAATTACGAATCCAAATACTTATTTTAAGGATCCCGGGGCAACTGATGGTGGAACCTACAGGTGCAATGTCAAAAACGAATATGGTGAATCAAACGCCAATCTTAACCTTAACATTGAAGCGGAGCCTGAGCCGGAGGGTGAGGG'..b'TAAAGAAAAAAAATGTGTGTGGTTAAAATATGGCTTGGTCAATTAACTGTGGTAATATTTGATTAAGTGTATGGATTTATGAAATTTACTATGTAGCTAATTTATATATGTATTTACTGTGTTCCCTTTTATGTACCTACCATATATGCAAAATGCCCTTCAAACTAAACAACAATCAACCCGCCAACCAACAATCTATCAACACAACTTCATTTAATAACAATCCAACAAAATATGTTCTTACAATCTCAACAATAAAACATTAAATACTCCAACGCACACCCTTTGCACAACAACACTCGTACACCCACTCCGCAAATCCTTCATCAATCAACAACCCAAAACAGAAGAAACTCCGTCCCGGCGAAGTAATGGACACGCGGGTAAGAAACCTCAATATATTAGCTGTTGTTTAGCTATATTGCTATTAAACATTTTAAGAAGTGAAAATGTTTTGCTGGCATACCTAATTCCAAGCGAGAGAGTTGATGCTCTAACAGCACTCTCTTCAATATCGCGAAAAACAGAAAAGAAGGATATCGATATTGTAACATATGAACCACACTTTTATTTATGCCTTCCGCTAATTTGATACTGAGATAAGTATGAAAAATAACAAAGAGAATAGAACAAAAATGTTCGTGGTTTAAAAATAGGGCACATGGGCCCAGATATACCCAGCATATTTTTATTTTTATGGTAAAGAAATATGTTGACAAACAAAATCTAAAAATAAGTCAAAGCTGTTAGCTAAAAAAATTTGTTGATGTACAAAATACTTTCTATTGCATTGCGACATAGCACTGTGCCTGCCGTTGGGCTTATATTTATTTTTTTCAAACATGCCCTTCGTGTGCTTAAAATACATGTATGCTATTGACATATGTGTATATAAATGTATAAACGCGAATTTTATATATTTTTATATAATATATACGGTTGATTCCATTGAATGATGCAGCCTAAATAAATTATAGTTTTGATTCATAAATATTCAAATATATTATTGCCACTGAGCAGACAACATCTAGTTCAATATCTACTAAAGAAATAATTAGAATTATATGCACGTTCGGCTCGGTAGAATGTGACGATTTGTATTTCTAATAAATACTAGTTATTTTTGGTATGTGAACTATAAAAAATAATTTAAATTTTTTAAAAAAAGGTTACATTATCTATTATATTCTCCCTAAAAGCTTATGAAAAAAACCCAATGTCTACATACATTGATTAATAAATTAAGTACTTACAAGTCGATTTTATTCCAAGATATATGATAGAGTGTAAACTACATTGCTCAGCATTATAATACGATTCAAAAATATTACAGTTGTTAAGGCCAGGCGAGGTCGGTGAAGGACAGGTGAGATTTAGCTGCACAGCGTTGTTGCATAAATAGTTTTGTTAGTAGAACGTATTTATAACCTTTGGTAATTTGCATTACATTTCAAGACGAAAATGCACATACTTTAAAACGGAATACAAAAAAAATATGACACCGGTTCATTGACTAGATACTCATTTAAAAATACATTTTTCATAATATTACCGGAGCCTCACATATTTTCCTGTAGAAGTAAAACGGGCTATAATTTGTTTAACTAAACTTTTAAAGAGATTAATAAAAAACGTAGTATCTAATCTAATTGCATCCATTTTTTATTGTATAAGCTGACAAACCCAATTAAATACATTGGTTTCTTATTTTTCGTCTTCATATTAAATTTTTATTTTATAATTATCAACTTTCCTATTGGTTGCAGTATTAAAGCAGCATGTACACATTTCGTTTGGTGTTAGAACGAATTCTTACACTTTAATTTTTTTTTGCGTTCTGATTTCTCAGTTTAGTTTACGGTTTCCTTTGCATGAAACCATCAATTTTGTGTGAGTTTATTTCTCGGAAAAAACCTTTCAGTTTCCCCTTCTTACGATAATCATGATAGAAAATCACGTCTTTCTATAAATGTAAAATTTTAGTTTGAGTGTAAACTAAAATCCATTTGGACACTACGCTTTATTTTATAAAATAAAACCAAAGTAAAGTATTTTTCCACTTTTTATTTTTCTCAAATACGTTAGCAAAAGCAACCGCGACCCGGAGAAATGGGGGACACTAAACAGGTCTCGATACTGTGGTCGATTTTATCGATCATTATTATTCTTGTTCGCTTGCTTTTTATTGATTATGGTATTGAATGGAAGTTTTATTATAATGAACTAGTAGGACGTATGTAATATTTAGTGTAAAAATTGTAAATATTAATTTTTTTAATTCAGTCACATTATAAAAATCTAAAAAATTATTAACCCAAAATTTTTAAACCAATTTTTGTACCAAAGATTTAATTACAATAAGAATATTGAATACGTTTAAGAAAACTCGTAAAAATTTCGTGGTGTTTTAAAACATATATTTGAAATTATAAATAAACCAAATTGTCGCGATTGTTTCTGAGAATTTCCGAATATATTCACTTAAACTATTATATCTGGCGAACGGAAGCCACGATTTTAATGAGTCAAAAGCTAGTGGAGTTGGGTTTATGTGGCACGATTTTAATGAGTCAAAAGCAAGTGGAGTTGGGTTTATGTGGCCGATTACGAGAAAAATTATTAATTTAATTAGCAATAGCGTTTTTAAATCCAAAATAAGGTTTCAGTCAAAGTGGGATTATTGCCAAGTTATTAAGCTACATTTTTTATTAAAAAATTATTCAAATTTCCAAACTAGACACCCACTTTCTTACAATAGTGGGCAAAAATGAAATCGATTTTACCGCAAAGTTTAGAATTTTGTCACGAGACAATATAATTTATTTATGGAAAATTTATGAAATTTATGAACATTTTTTTTATTATCATATATTTTTAAACTTCCAGACCCTTAGCATCATCGAAATCACTGCGTTGGTCAAAATTTAGGAAAAGCGGTCTATCTGAAAAAAAAGTTGGATTTTATTAACTTTTATAGTTTATAAGGTTAGAAACACTTCCTTCTACCTAGTGGATATTTTCCGACAAATCTAGTACATTCTTTTAATCTACAAGTAACGGGTTTGTTACATTGGTTTCCTCAATACACTTCGGTTAACCAAAAAAAATATATTTGCCACGCCGATTAACGACCATAATTATAAAATCTATGTGGCGCCTTTTTTTTAAAGATTTTGTTGATGGGATTTTTTCTTGTTATCAATACTTATTTACAAATCGTTTAACTTATACCATTTATTGATAAGTTATGATAATGTGATCGTCAATCGGATAATTAATGTCATAATAACTCGGAAGCAGTTAGATTTCGTTTTCGGTAAACATATACGGTAGTAAATTTACGAGAATGACCTGCAGGAATAAATTTCGGTTTGCCGAAGATAACTTCCTTTCTAGTTATTTATTGTTTTTATTATATTGGTAATATTAACCCTTACTTCTAGAGTACAAGGGTATACTATATTCATCGGAAAGTATGTAACAGGATGTTTTAGCAGGGTCATACGCCCGCTCTAATGCCAACAATTCGGGAAAGACTATCGCCTACATCTATAATGCTAGAAACAAAATTTTAACTGAAATTTAATTATCTATTCTTTGAGCTCAAAAAAATTTTGCCACGCCCACTGTATCGCCCACAAATCATCCAAAACTGTGGTGGATTCATTTCTAACGTTAGTAAACGGATTAGTCATATCTATTGATTGGACTAAAAAAAGTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACGAGTATCCAAAACGCTTAAATCAGTATGCCGCAAACATTACCATATATTGAAATACCGGGTAGGTGGCGCTATACACTATCGCTTTACCGCTTATGTATCTCCATTTCTCTTTTGCTCTTTTAAGTTGAGTAGCGGGTGTCTGATAGTCGAGTCACCCGACTATAACGTTTCTCCTTGTTTTTTATATTATCGACCATTCATTTATTGTGTTTCTTAATGGACTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/1f5/da2/be/scaffold_41-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TAAACGCCCAAGAC \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCACACTTTTTGTAAGAAGCTTGAACGCATTTCTATCACCTAATCTAATTTATATTAAATATTTACCACAGGAGAAGGTTGTTTGGCGGTTAAAATGAATGGTATCAGGTCTAACTAGAAGGTGACGGATTGAGTCTCAAGAGTAGAGGCAATCACATAGAACGTGCTGAAAGGAAAAGGAGAGGTCCGAAACTATTTGCCATCTACGAAGTTGTATATATAGGTCGTGATGTCCGATTTGGGAAGCGGAGATGAAGGCATCTCAGGATCAAGTAAGTAACATGTTTCCCAATAAACTTGTAAAACGCTCTAATTTTTCAGAATACAATGTCACAAACATAGAGGGTTCCTCAAGTAGGAACGATTTCGAATCCTCTGTAAAAGGTACAAAGTCGGGAGATTAATATCTCGTATTTTTAAAACTCACTATTTTCATCGTCGTTTTAGGTGGAAGTGGTGTGGAGCAGGAATTGGCTACCAAAATGCTTCAAATACAATCCAAGCGATTTTATTTGGATGTTAAACAAAATCGGAGAGGTCGTTTTATAAAAGTGGCTGAGGTAACTTTGAACTCTAGCTAATATTTTTGCGAACAGATACGGACGGATCTAGTATACCTAGTAATACTAGGTTTGTATACAAATAATCTAGGGTGTCTCTCTTTTAATCTATTTTCTTTTAAGGTATAAATAATTTTCATTTGCTGATGCATTACTTGTCCCAACAAGCGTAAAGGCTTTGTTTTGTTTAAATAAAAAAATCAACACACAAGATATTAAGTCAGTTTCAAAATAGCATACTTTAAAACGACTTTAAATTTGAACATCTTATTCAAAAATGTTGACCCTCATTAGAAACTATTTCAAATTTAGACAATTTTTATATATGAATTTTTTAAACATTTCAGATTGGCGCTGATGGCAGGCGAAGCCAAATTTATTTGGCCCTTTCAACTGCAGCCGAGTTTCGTGATCATTTGTCGTCTTTTAGCGATTACTATGCTTCTCTAGGTATTTATAGTTTTAATAAATAATCATTACGAATGAATTTTTGCTGGACCTGGACTTCCTCCCGATCTATATTTTTCAAGAGAGCGCCATACCTCTTTTTGAGCGGTTTGAATAGGCTTTTGCGCTCTTTTAACACATTTATATTTTATACTGCGTCCATGTAAAACCCTTCAGTGCCTCGACTGTCAGGCAGATATTGCCATATGTAATAAAATAATACTAACAGTAAAAAAACCTTTGAATATGCAGGCGCTGAAAGCTAACTAATTTTAACTTTAACAAGAAAGGAAATTATCTTTGGCAAGCCGAAATTTGTAAACCCTTGCATTTATAAACAAAGAAGAACCCTATAATCGATTGCCTCGACTATCAGATACCCATTACTCATCTTAAGGGGGAAAAGGGAAATGGAGATATATGAGCAGCCAAGCTATTTCAATATATGGTAATGTGGGCGTCAGATAGAACCGCCTGGTTCCTACCTATAACTACCTGCGAAAAAAGAAGAATTTTAAGAAAGTTTCAGCCTTATAGTTTTAAAACTAGAGAGACTAGCGGACTGACAAACAGACGGACATGGTTACATCGACTTGTCAGGTGATGCCGATCAAGAATAGACACACTTTATGGGACCAGAAACGTCTCCTTCACTACTTTGCAAACTTGGGCTCCAAACTCACTCTGCTTATAAGAGAATCTGAATACCAGTGCTTGCCAAACATTTATAAAGTCGGACCATTAATAAAATCCACTTGATGTGGTTCGATGATTTTTTTTGCGGAACGCCCAAATATTTATAGCCTCAGAAATAGAAATGTATCCGTTCCAAATGATACCTACTCAGTTTAAGCGGCCCAAATCGAATAATATTTACTATTCTTCTACATTTTAGAATAAATAAAGTAATTAATAATAAAAAGCTATTCAAAATGCAGGCCCCCCCAATACTGACAATTTACCAGAGGATGGTAAATTGAAATCCGAGATGATGATCAAAGATTATAGGAGATATTACTTGGACTTGAAGGAAAATGCGCGCGGACGATTTTTAAGGGTAAAATGTTCAATTTGAAAATTTGTACCTTGCATAATGTTACATTACCATTTTAACCCATTAGGTGTCACAAACCATTACTAGAGGTGGACCTAGATCGCAAATCGCTTTACCAGCCCAAGGCATGATCGAGTTCCGTGATGCCCTTACAGATTTGTTAGAAGAGTTTGGAGCTAACGATGGAGGGTAAAGTATAACAAAAATAACTAAGTAGAATGTAAAATGTTATGTATGTCTCGGTAACGTGTAGCTTTCGAGCGTATTGAGTCTTTTTTGGGGGATCCGAGCTCTGCTCTTCCTCTTCCTGGTCACAGCAGTCTTGTAGGCAACACACAGATTGCCTGCGTTGATCCCTGTAGGACAGAACCCCGTGCGCACTTTTTTTATTCGTTCTTAAGCATGGCTTAATAAGAAGAAGGTCAACGTCTAACAAATGATGTTCCGCAGGGAAGCCACCTAGAACCTCTTCTGTTTGAAGTATTCGAAAATGTCTTGCCTCGAGTAGCTCTCTCCTCTCATGTTATGATGTATGTATGTTGACGACGCTACCAATTCCCTGGCAATTGTCCAATCACTGAGTACTGCTAGTGTGGTTGGTCACCTCTATATGCTAAGTATGAAGTATATAAAAAAGTTTTAAGCGTTTTAGTCGCTTGGGATCGTTAGAAAGGGTTGGAAACGCTTCCTTCTACGTGTTTCATACTTTCCGACGAATCTTGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGGATAACAAGAAAGAACCCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATTGTTACCTGTCAGAGAGAGAAATGAGAGATGGAGATATATAAGCAATAAAGCGATATTGTATAGCACAACCTTCCCGCTATTTCAATATACGAGTATGCACCCAAAAAAATCCTTGAGTGTCAATTTGATAGGTGTGATTGAAAAAAACTAAACTGCTAGGTTCGATTTCTTGGAATCAATTTATTCCTAAATGAGTGTCAGAAGTATACTACATGAAAAATAGTATTTGATCCCAATTAGTGTCATTTTGACCAAAGCCAGGGTCTTTTCGATACCAATAATTGTCTTTCTATTTTCGAAATTCGAACTGCGCCTATCGCAGTAGTTATCGATAAATCAATGTGAGCTCAATATTGTGTACAAGACGACAGATGTTTCAGTGCAAGGTGACAGTGTTTATTAAATCAATTATATTCTTAGGAATGTATTTATCCTAAGAATATAATATATATAGTAAATACATATTTTGAATTTGAGTGTGCAATTAAAAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGGCACAAGTAACGGGTATCTGATAATCGAGACACTCGACTTATCTTTTTTCCTTGTTCACTATGGTTTCTATGCAGAAGCTGCTACATGGATTTGCGTAAGTACACAATAACAATTATATTTTGCCTAAGAAAACAAAATAGTATACAAAAATCTTTCCTGTAGGTTTGCATAAATTTAAATCGCGTATCCTCGTACACCTGGTCGATGGCAGCAAATTTATAATATTAAAAATATTATAAAACACACTATAACTACAATAAAAATCCAAATTTGTATTAGAAAAATAAAAAGAAATTATTGGTGTTTTGGTGCGAAATCAACATTTATTCGTGTCATATTGATACAAAAATCGTATCAAGTTGACCCTAAAAATTACATTCTTATAACCCGAATGAGTATAAACTAGGCGCGAAATAGTGTCAATGTGACCACATATTCGTACTAAAAAGTGCCAATGCGTAGGCACCAAAAAGTGTCAAATTGATATTTTCAAAAATATCAAAATGAAATGAAAATAGGTCAATTAGTTATTCTTCTTTGACACCAAAATAATGGCATATTGATAAGATCTTTTTTGGGTGCCGTAAAGCGTTTAAAACATTTGTGGGCGTAAAA'..b'TACGAACAAATTATTTTACTGATTTAAATTGCTATAAATACATTATCAGCACGATAAAAGAAATCATTTAAACTTATTTCGTGTACAATACAACGTGTGACAACCCAATTTTCTACGGTTTTAAGCATAAAGATGCCAATACTGCTGCAATTTCACGTTCGGTATTCGTACGACGTTTATCAATAGTACCTGGCTTATTGACATACACCATTGACTTGACGCTGCCAACAGGAAATAATCTACCGGCGTCAAATCGCAAGACCAAAAGAGGACTATTTCGAAAGATAAAGTACGTTTTTGCTCAGACCAATGCAACTATTCCCGTGGTCAAGAGCTGAAGGCCCTTCTTGGGAAAATTTGATCCTGTAAGGATGTAGGCCAAAAACTTTTAGATAAATTTGCCACAACGCCATCAATGTTATTTGGGTCTTCCTCAATTGATGAGCTAGCTATCCTCGACTATACGGCACTTTGTCAAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATATCCTTGCAGCTATAAGAAATAATCAACGTTAATAACACCATGTTAAATTTGTAAGGATTGTTCCTAACTTCAGTGAATCTAAAAACAAAATTATTTCTTTATTTCTTTGACCGTTTTTTGACAGAGTCGTCCGATTTCGATAAAATTTCGATAAAATTTAAATCAAAATTCGTTAAATTATAAAAAATAATATTCCCAATATTATAAGGTAATCTGTAAAAAAACACCGAAGCTCTAATATTTTCATATTATTTTTCCCAACAATTTTTCGATCGTTTCTAAGACGGCTTTATAAATAAAATTCCAAATTCAGAACGCATTAAAAAATGTTATTCCAGGCGTAGGAACTTATATGTTAAAAATCACCAAAAAATCACCAACTTATATACTACCTGCAAAAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCTGATAGCTTTAAAACTAATGGACTAGCTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGAGATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCCAGAATGTATATACTTTATGGGTTTGGAGACGTCTCCTTCACTTCGTTTTAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCAGTAAGGGTATTCAAATCGTATAAAATAAAGGCAAAGGATTTTGAAATTTATTAGCTTTCTGTGGAGAAACTTTAGAAAGTTGGCACACTAATCCAAAAGAGATTAAAGATAACGTTAGGACCCGTGTCAGTCTAAAACATAAGTGTTTAATATTTTGTTTTTGTCATATAGTTGAAAGCGGGGTGTAATATAACAAAGATTAATAAGTAATAATTTCGGAATGTTACAAATTTTTTTTTTTAAGTTTTTAAATGTATTATTTGTTTTTTGCAGATGGAGCAAGACACACACTGGTATGTGACCAGACGGATATAGCTGAAACTACTCATCATATTTGTATGACTCAGCTTTTGTACAGATTAGGGCATTTAGCAAGCTATCAAGAATATAAACAAAAAGAAAAAAATTGGTATCGGAATGCAAGAACAGTTTAAAGAGCTACGCCTTACTGTGTGGTCAAAGTCACAGATTCAACATAGTAATCAAAGGTGCAGTATGGTGGCATGTAAAAAACGCTTAACTTCCACTAAAGAGCTTGACGACTCACAGCAACCACTCTTGTTAGCCCTCTCAAATTACAAAACGCGTCACCAGCAGAAGCATCATAAAATTCACCTAAACTCTGGAAGCCCGTTAAACATCGAGCTGTATATGTCAGCGAATGTTGAGGGTATTCCTAGAGCTCGAAATCGGGCACCAGCTACTACGAATAATCAACAACCAGCTATGCATCGAAAGACTAAAAGCAAAAGCAAGCTTGAAACATCAAAAAACTTTTTCACGCTACATTCATCAAATGATAGTGATAAATATCCATCCGCAGAGAAATCATCGGCATTAGTGGAAACAGTTGAAAAATGTAAAGGAACTTCTTCGGGAATAGGAGTAAAGACTTCGCAGCATTTCCAAATTACAAAAAACCAGAGCTACCGCAACAGCAGGATTAAAAACAGAACCCGCTCCTATTCTGCTTCTCCAACCCCAGCGGTGAGATGCAAAATGATGATTCCATTGCCAACGTTTGGCGCAACATCTTTTGTTACTCTGCTGACTTTAATTTGTATGGAAACGGTTTTGCTATCAACCATGTCTAGTTGCGCCAAAACGTTCTACATGCATTGGAATACATCGAACAGCATGTAAGTAGAATATATGTCATTTTGGACGGCAGTCCACTTTGACGAAGTGCACCAGGAGAGTATGCAAAAGTGGCAACAATATTGGCAAAAACATAAAAATGAATTTATCTTCGGCAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATCAATAATCAACGTTAGTAACACCATGAGAAAATTTTTAAGAATTGTTTATGGCTTTAGTAATATTATTTCTCTGACCGCTTCTTTGACAGCTATATGTTAGAGTCGTCCAATTTTTTTTTATTAATTTTAATTTAAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATTTTCCCAATATTATAGAATAATATTTAAAAAAAAAACACCGAAGATATAATTTGTTTCATATTATTTTCCCACCCATTTTTGGAACTTTACTATGAAAGTTAGATGCTGTTGATCAAATTAAATTCGAAATTTAGAACTAACTAAAAAATTTAATTTCCAAACGTAGGAAGTTGTATGTTAAAAACACCATAGATATATATATATTTTTAATTTTTTTACTACCTGCAATAGAAAGATGAAGTTTTGAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTTAAACTGAGGGACTAGTCTACTGACGCTGATCAAGAATATAAATGCTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCAGTGCGTTGCAAACTTCTGAATGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAACTTCTGAAGATAAACAAAAACACCTCTTAACGAGGTAAACATGTAGTGACGATCGCACCTTCAGCAAACAAAATTTCTAATATCAACTTTTTTGACGAAAATGTTTACGATCTGCTAAAGAAATACGTTTGCTTAATTTTTTACATTCGGCACGCTTTGTTAAAATCTAAACCCAAGCATTTTGAATACAACATTTTTAAAAATTAGATTAGAAATTAGAGTACCACGTGACATCAATAGTTTCAAGGATGTTGTATTAACTTTGTTAAGTTTTTCAATAACTTTCCCAATAAGTTTGTGGGACACACAACTTAGAAATATTTTGTGGGTGTACATTTTATATTATTGCATTTGTCATCAACTGCCAAGCCGCCAAAAGTTGTTCAAATTGGACTATTAGTGAGTAAGTTTATTAGGTTAACTGAATAACGATATTTAAGACACTCGATTCAATTTTTTGAAATATTTTTTTTTATAAATATTTTTAATCTTACCCACAGATTTCGGATTGATAATACCGATCATATAATCGATGTTAATAAAGGCAATCTTGCATTTGAGTTTGACCAGGTTCATATAATATGCCCAGTTTATGAACCGGGAACTTTTGAAAATGAAACCGAGAAATATATAATTTACAATGTGTCTAAAGTGGAGTATGAAACATGTCGCATAACAAATGCAGATCCGCGAGTAATAGCTATATGTGATAAACCTCAGAAATTAATGTTTTTTACAATAACTTTCCGGCCATTTACACCGCAGCCAGGTGGCTTGGAGTTCCTACCTGGAAATGATTATTACTTCATTTGTGAGTTCGGTTATATTTCTACTATTCAAAGATAAATACTAATAACTCTTGATTATCTCTTTATACTTAGCAACTTCATCTAGGGATGATTTATATCGGCGTATTGGAGGTCGATGCTCCACAAACAACATGAAAGTAGTTTTCAAAGTTTGTTGCGCCGCCGAAGAAAAGAACAAAACCACTGCGATAAGCAAATCTATATCAGGTGCAGACACTGGAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAGCCATAAATGTCAATATAGCAGCTAATGATGACAGTCATGATCATAGCCAAGGCAATAATAACATTGCTATTGGAACCAGTATTGGTATAAATGGAGGCATAATTTCTGGAGGACATCAGTCCGCGGGAATGCCAATCAATCCAATTAACGGCAATGCTAACATAAATGGCATAGCAACTACTGTTAATTCAAACACTGATCAGTTTAACCGGATACCACTTCAACCAAACGTAATCGGAAGCAATGCAGGTACCAACGCCGCTATTCCTGGAGTTGTTAATGGTGGAGGCATTATTTTAACTCCTGGACATGGTCATGGAAACATTAATATGCTACAACCAGGACGCGGCGGAATGAATATGGCTTACCCCGGACATCACCACATTCAAACTGGGATCAGAATAAACAATGTCCCGACGCAGCACAGCTACCCACCTCACAAGGGTAATGTTAACAGCAATACGAACGGAAATGGTACGTACATTACAAAGTATTGATTATTATTACGAAGAAGAAAGTAGAGGTAACTTTGGGAAGCTTAGACTATGCTTACATTTGTCAGCTTTTAAATATACCCAAATGTTGTTACAGGCGAACGGATTATTGGTTTGTGCGTTTTTTTAACATAACTATTAACGGAAAAGGCAGCTATGTATACACAGCAGCTGTTATCATAACATAACATTATTTTTTAAGATTTATTTTTGCAACATATATCGATTTCGTCAAATAAAACAAGAAAGGAAGGTAACTTCGGCTAGCCGATGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAATGTTAGTAATAGCATGTTACATTACAGACTATAGTTCTCTGATCGTTTCGTTGACAGCTATATGCTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAAATTTAATTCGAATTCTGATTGAAATCAGAATACCTTCTGCAAGTATATACAAATATCATCCGGTCTCCGGTTTTATCTTAACCTTTTATTTTTGTTTTAATTTGCGAATCGAAATGAAGCGAAGCGAAACTTAGGCAAATTTATGAAAAGTAAAAGGCAAAAATCGTAGCGGTTAGAAAAGAACTGTATTTGAGGTGCAACCACCGGTGCAGAGACAATTCCATAGTCGAAGACCTTGACTATGAGATACCCGTTACTCACCTTATTGAGCACCATTTTATCCTTATCCTGATTACAATAAAACCCCATCTAGAGTCTTTAGGAATGGAAGCTAGATGACGTGCAATATATCTCTCGGAAGCGAAGAATCTTCATGCTTAATCCCAATTTTCTAGCTTATATGGATCTCAGCGCTCATACGGACGGACATGGCAAGATAATCTTGGCTAGTGATTCTGATTAACAAATATATATTTAATGGGGTCGGAAACGTTTACTTCTTCCTGTTTCATAATCTTTGACGCCTTTAGTGTACCCTTTTTTTTACGAGTAACGAGTGTAAACATAAAATATTTGTTAATTTGAAGCCTTATGAAGCAACATTCAAACTCAGGAATAACGATGTAAATGTCATGTGAATGTAAAAGTAAAAACTTCCTTTCTAATTACAATTTTTGTGAATTTTAAAGATATTACTTTCTTAAAATTAAAAATAAAGGTATTACAAAAAAATATTTTCAGATGACCACCACCATTACAACAAACATCCCAACGAGGTTGTAAAGAACGAAGAGCTAACATACAATAGAGGCACAGCACAAGCAGCAAAACACGTTCTCGCCTTATGGAACTGGATCTTGCCATCTTTTCCAATGCCATCAGTTCCATCTTGCTGTTTGTTTGCGTATGGGATAAACTCATCTTTAGTATTAAGCATTGTCGCGATTCTCGGTATCCACTACCTAGCGGGAAACATGTTACAAACCACGTGTCAGCGGTATAGACCTGGAATTAGAGAATTGCCTCCAGGATGTAACTATGGCTTGTTTGACCAGTAAATTTTAAATGAACATCAGCTTTTGTATGGCCCTACTCAGCATTTATGTTTTAACAATTCCACAGTCTTTAACTTTTGTCACTTTTCATTGAACTACGGTATATTGACAGTGATAAAAAGTAGTGGTTTGGAAAGGTTGGTAGAATCAGTCCATATGCTTACTGATATTGATTTGGAAATTATTGTAATTGATCGAGTTAGTCTAACTCAAAATTTAATATAATAGATCAGATAGAAAGGAGAAAGGTGAAATAGATTTAATAAGTAAAACAATTAAATATATCAAGTAAATTAACAATTAGAAATAGTGGTCTTGATATAACTGATACCGCATAAGAATAGAAGGAGGATAGTGGAATGTTATTGCAAAACAGATCAGATGCAATCCAAAAGCCAAGGTATAAAAAGCACTATCTATTTTGCCATGAAGTGCCTAGCCACTATGTCTACTGTCCTCCTTTAGATTGTTTCCTGGTTTTCTTAAATCAATAATTTGGGTATACAAGGAATGTAATGTATACCGACCTGCAGCAATCATAAAGCGATGAAGCGATTATCAAATCTTTACAGCTATAGCTATAGATGACTGAGTGAATGTCAGTTTAAATGATCATTCCGAAAATCTCTTGTCTTGTCTAGGGACACACTGGAACAAATGACCATAAATATGAAAAAATATTTTACAAAGAGAGTTGCATGCCTTCGGAATGGCTTAGGTGGAATACAATTTTCCTTGTCACAGGAAATCTAATAACCCAAAAATGTTGGAAAAAGCCACATACTTAATATTATTAAGTTCTCGTGCAAGACCCTGTACGAAGAATACTTCGACTGAAATTAAAAAAATTTATTAGCATCGCTTATTAAAAAGCACGTAGTAAGATAGGTATAAGCTATTTAAATACAGTATAATGCAGATGGCAAATGACTACGCATATGTAAATGTAATCGTATAAGATCAAAGGAAACTGATGTATGTATGTTTAGTATGCATTGATGTATATTTAAAATCGTGGTAGGTATTTTAAATATGGTAAAGGTGAAATTCAAAGAACTCAACTATAAGTTTTATGTTCTTTTTTGTTTTGTTTTTATTTGATATTTCTTTTAAAATGATACCATTTTATTTTGTAAATGAACCAAGCAGTATAGAGAAGTGATTCTTAACATTAATAAAATATATATGTATATATATGCAAAATACACATAATTACTTATATACAAGAAATGTTTAGGTGAAACGTTATAAACTTTGTAAATTTAATATAAATTAACTTGCAATTAAAACAGAAAAATTAAAAAAGTGGATGACTTGAAAATCGTATAATATATAAAAAATATATTGGGGCACTTGTGCTACCTTTGTGAAAATAAAAAGGTTAAAATTTGTATACATAGTCTATATATAGTGAATAATTTAATATATTATATCGTGATTATGTAAGCGTGGGTATAATTTAATCCGATAAACATGTGTTGAAGCTGTCGGAAAAAAAAAATTTTGTCTCAGCGAGTTAACTATTTACAAATTATAATTGAAGACACAGTAAACAGACTTCATCCAGTATTTCATCGTAGGAGCGTAATCTAAAATTTTGATTTCTCTGCGACTAAACTAAAAAATTGTGTTTAGTGTAAGCTTTCAATTTTCTCATGATTGGCGTTATTTAACATTTACTTGTGCAATTCAGCCTTAAACAATTACAAATCTTTCAATTTCCAGACACTTTGAGCTCTGGGTGAATTGTATTCTTGTACTGCCACAGCAAACCTGAACACTAAACCGAATTTATTACGATCCAAAGGTATAAGCCGAAACCTAGATTCAGTCCCGTTCTATGAGTAAATACCTTAAAAATATGCATCGCTCTACTTAGGCCTGACTTTCTGTCAATGTGTTGATTGCTTATAAAGATACAAAGCATTTTTTATATTTTATAACTTTACAAGCTGTTTTAACTTTGACAGGATAATGAATACGGACCGTACTGTTACTTAATCAATTACTTAATATCATACTTACAAGCAACATT'..b'TGTATTGTTCATGTTTTAAGATAAAAGTATTTGCAGGTACAATTAGATTGTTCTTATATATGTATGTATGTGCACACAGAAAACATATATAAGCTGAAATAAATCATTACTATGTGTTACTAACACATATTGTTAAAAACTGGAGCTCCCACTAATAAAGAAATTAATTCTTGTCAATATTATAATTTTGTTTTATTCAGTCTAGATGATGGATACTGAAAATAGAAAGTAATGTCTCTTTTATATTTGTACTTTTGAGGGCTTTATGATAAACTTAATCAATTTTATTTCCGAAATCGTCACAAGGTTTCAAATAAGTTACGCTCAAGCTTAAACTTAGTTTGGGTCTGACAAAGAGTAAAGCCGAAGTCAAATGCAATCAAGGGACAATTGAAAATATATTCGATATGATATGTCCTGCAACCAGCACCAGATCCAATCCATTTGCTCTCTAAAGCGACAGATCGTCAATTAAAAACGGAAGTGACGGAGACTAAAACGAAGCATTGGACGTGATAATTATGTCATATTTATGAACCTGCCAACACTCCACCTTTCTTCTTATCAGTAGCTAATAATATTCATAAGCATAAACTAGCCTACTCCGAAACATAAATTTAAAACAAGAGTAGCGCTACAGTTTCTTGCTCAGTTTTCAATTTCGAAGAGGCACCTTACGTAGCACAAGAATCCCAAGAACTGCATTCTTTATCCATAAATTACAGCTCTTATATTATCCGAGATCTCAGCGTTTCCACGGACATACGGTCGGACATGGCTAGATCGACTCGGAAAAATATACATATATTTTACACACCTTCAGACGATTCTAACATACCCTTTGCCCTAGGCGTAACGGACACAATTGACATGGTATTGTCTTAGGCTGTTATGCATCAAAAATTCATCAACTTCTAATAGACATTGTTATCTAAAAACTGTTGTTACCGAATTTGTATGTTGAGGGAAACCGGGAATCTGTCTAGAAAAATCGGGATTTGACATATACAGATAAAGAAAAATTCAAGTTAAGTTTGCCATTAATTTATTATTGCATTGCTTGATTTTTACATAAATACTTAATTTATGAATGTGCCTAAACATGTCTACCTCTCATTCGTAGAAGGTTTCTGACTTTTATTTAATCTAAATTGACTAGCATACTTCGAGAGGCGTATTCTTATTGTAATATATCCTACAGATATCAACATAGTGCCGGCTTTAATGACTTTTGAGTATTGTTAAAACATTTGAAATTGCTTAAGTGTGAATCAAAATTTGTGGTTTTTCCATTTAGTAAGCGGGTTTTTATTGGATATCTTCAAACTTAACTGGAAGGGTTATTTGAATAAATATTTTATTTACAGTTTCTTATTTTAATAATCCGATTTATAATGTATTAATATTCACGATTTTGAGTCGCTTCCTTCCGATATATTCACATAAAAAATAATATTTGGCCGTTATTTTGTTTTTTTTTTTGTAAGATTAATACAAAGGTACATTTTAATATTTTCAAATGCGGATGAGTATGCTATAATGTGATAGTGACATAAATAATGCTACATTATAATATTTGCACAGGCTGGGTAAATTAATTTTTTTTATTATATAAATTTGACTAGATACAGTTACTTTAACTTTATCATTTATGTTATGATTGGGTTCTTCCATTTACATATTATAAATTGTATTCAATCTAATATATCTACATACATACACATATCTGCTGTACCAAAAACACCTTATCCATTGGCCTAAGGCCAATTGCATTTTTTTTAAGTTAAGAGTTAAAAGTTGCTTTCATTTAATATATTAAAAGTTTAACTGGCTGCGATCGATATAAGCACGAAACCGGAAATTATTGAAATTTTCTATGAGCGCGATTGCACTAAATCGACAGATTGTAAAAAAGCATATCTAGGTTCTAAGAACCCTTCTTTTTTCACGGTTCATTTAGTTGTTTTTCTTCACAAATAAAACCAGCTTATTGTTGGAATCCTTGAAAAGTACTGCTGCCCCAGTGATACATATAAGAAATCATTATAACTACTACCAATTAATAGCTTTAATAAAACTAAGAACACGGAAAACAAGCTAGCTCAATTCATCTTTTAATATTCTTCAGCCGATTTATAAGGAAAAAAATCCTTCAAAAATCGAAAAAAAAACTATATTTCCCTTTATAAGCCGTAACCCAATGAAGTGTGTTTTCTAGATGCACCAGGATATTTAATTTTACAAGGATAGTCTTTATAGTTTTTTCTGGCGATTTACATGATAAAATCGGTTGAACAAACTATAACTACCTTTTCAAAGTATACTTGAATAACTATAATAGCAAACAATATACACTGCTCAGAATAATTATTTAGCGAAACAAAAGTTAAATAAACTCATAATTTGAACATACTGCTTTTAACCTTCGGGTAATTAAAATGCCGTTTAAATGATTTTTCTCCTCGTCTTGAGAACCTACATTTTTTGATTCAAAAAGTTTCTTCAAACAAAAATAATAGTAACATCAAAATAATTTTTAAAAATCATATCCGTTACTCGTATAGTAGCAGGGTATAATAGATTCGTCGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGTATATCTTCAATCGAAAAACCAGTTACAATTGTAATGAATCTAAACTTAAATTCCATAAATTTACTATTTTTGATTTAACTATCCGTGAGCAGTGAACATTTTAAAGAATGCGGAAATGTTTTACTTTTTTTTGTGCTCAGCAGACTATCATTACCTTTAGGTCATCCAAGCAATTGGAGACGCCCATATCATCTATAAAGAAATTGGTCTCGTGCCCGTGTACATCTGGGCGAAAACTTGGCTTCATCGTAATCTTCTCATCTGATAGCCGCCTGCTTTTGGCCAAATGGGCCGACAGGCCCTCAACCCTGTCGGCATCACAGCCACCCTCGCTATTGCTACCAATATTATCCGCGTCGTTGCTTCTCAAAGTGTGACTATTATCGACTTCCCTTGCTCTCTTTGAAGGAACCGTGTGCGTTTGAGACAAAGTGCGGGTGCGGGTGCTGGTGCGGGTGATGTGACGAGTGCTGGCACACCTTGTAAATGACTTTGGACTCAATGCTTTGGGCTTGTTGCACGTTTGGCGTCTGCTTCGGATATGCCGTCACAACATGTCGCAGTTTGGATCATTGGTATCTCCATGGTCATCTGGGTCCACCAAATCGAAGTCATGACTTTCAAGCTCCAAGTCCATATCAGCTTCTTCGTCAAAGTCTCCAAGAGGCGACATGGCCGTTGTATGTAGACTGGAGTAGTTTTCCTGTGTTAAGCTAGCCGGATTATGGCTCTGAATTTGAATCTGACTTTGACTGTGGCTCTCGTCCTCTTCCTGCTCGTCCCGTTGTTGTTGGCGGCTATGCGATAAATGCATGCTGGTTTTGGAGTCGTCGTCCCGCCACTTATCCATCGATCTCCGACGTGCGTTCATAAAGAAATTGCCTACTGTTGTAGGCTCTAGTCCCAGCTGCCGCGCGATCGTCACTTGCATCTCCTTCGAAGGTCTTTTGGTCTCCTAAAAATTTAACAATATATTTTTTAAACAGCTTTGATAAATTAAAAGATTATATTATCCAAAGCCACTAAGCACAGACAAGGAAAAAAAAGCCATTGTTAAATGAAAATTCCGGATCTATAATATTTTCGCCTTTCTACATAGAAAATAAAAACCAAAAAGGAAGTTGACTTCACCAAGCCGAAGTTGGTATACCCTTGCAGCAATAAGAAATAATCAACGTTAGTAACACCATGTGAAATTCTTAAGGATTGTTGCTGGCTTCAGTGATTTAAAAAAAAATTATTTTATTATTTTTTCTATTTCTCTGACCGTTTCTTTGATAACTTAATTTTAATTCGAAATTCTTAAAAACATAAAGAATTATATTCCCAATATTATAGAATAAATGTCAAAATTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/207/6c0/f6/scaffold_34-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACAGAAGCTATAATTTGTATCATATTATTTTCCCACCCATTTTCGGTTTTTTCCTTTGAAAGCTGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAATTTTATTTCGAAATTCGGAACCAATTAAGAAATGTTATTTCCATGCTAAAAGGTTATATGTTAAAAAATACCGAAGATATATTTTTTTAAAATTTGTTTCCCCGTTAATTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGCTATCCGATCCGGCTGGCTCCGACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCTTTAAAACGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGACCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCGTTATACCCCCCGTAAGTCCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTATGATTTATATACTACCAGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGTAAAGATATGTAAAACAAAATTTCGGAACCCTTCGTTAAAATCTTAGAGCTGAACACAGGTTTATTGATGTGCAGCGTTCCGAATTATATTTGTTTATTTGAACTTTCGTCAAAAAAGTTGATATCAGAACATTTATTGGTTAAAGATAAGAGGTGGTTTTATTGAATATTAGAAGTTATGATTTTAAACGTCAATGATAAAATTGATCTACTTTTTTAAAAGCGTAAAGATACGCAGAAGAGAAAATGTTGAAAGTTCAGGCAGAGTCAGATGTTCTAAACTAGTAGATGTGGCAATATTTCTTAAGTAATAGCTTTAAAACGTGACTATTTACTACAATGTGTTGTAAGGCAAAAGCAAATAATGTGTAATTCGATGGAAATGATCCCCAACGACCTCTTTCCCGCAAATTAATTTGTTAACGACTTGGTATGCGATCCTAGTTTATGGAGATTTTTATTTTTTCGTGTATATACTTTCGCACACTCTTCTAGCTGTCCACAGCGACATTATTACATTTCCCAATATCTATGGACGTGGCAAATTAAGTAAAATCGGATCTTTATTTTATAAATTAAGAAGGTAAATCTACTTTGGTGGTAACCACTATATTAATCAAACGAATTTCTCCAAACGCCAAATTCCATTAGAATTTTGTATAGGGTTTTACTGGATCTTTTCCTTATTTTGAGAGCTTGATAATTGATACCTACTTTGAAAATAGCTTGTAGTGTTCGTCGTTGAAGATCGGTAAAGACCAGTCGTGGTTTTTTTGGCTGAGGCATTTGCTCGATCTGAGGCTCTTCCTTTCGACGACAACTAACGACGTTCGCAACGGACACGTTTGTGACAGGTGTAGATGCAGACGAAGAGGCCGATTCATTGGGCGGAGCTGATGTTTTGTCAGGTTGGTAAATGGACGCCGTTCCAGAACATTGTTGAATAAAATAAAAGAAGTAATTTAATTGGTTATTAAAAAGAACTGAAAAAATTAATATATATCTTCAGTTTTGACTTTAATATTTATTTTAGGTTAAGCGTACAAAAACGCTTCCTTCTTCCGTTTACACACTTTCCGACGAATCTAGTATATCCTTTCACTGGCACTGGCATCGGAATTTTGTTTGAATTCAAATTTAACAAGGAAAAACGCTATAGTCGGGTGTCCTGACTATAAGATACCCGTTTCTCGGCTTAAGGGAGCAAAAGGATAATGAACATACATAAGCAGAATATTTAGGGCGCCACCTACCGGCTTTTTCAGTAGATGTTATGTAGGCGGCAGACAGATTGAAGCGTTTTGGCCATTTATGGGCGTTACAGTGATTTTTTTTGGTGAGTCGATCGGTATTGACGAGACAAATAAATTTCAGTTAAAATTTTATTTCTATCATATAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGCATTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGACAAACAACAAACTTTCGCTCCGTAGGAAGCCCAGAAATCTGCAAGCCAAGTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACAGACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAGAAAATATATACTTTTATGGGGTCGGAAACGCTTTCTTCTACCTGCTATACCCTTTTACTATACGAGTAAAGGGTATAAAAACTGAATCTGGATTCAATAGTTGAGACTATGTTTTTAGCCATAGCTCACCATCCTACTCACCATTTGGTGTCATTGCTGGCCCGGCATGAGAATCCAAATCGGTCGGTATGACGGATGTGGAGCCCGTTGTTGGTCCAAGTGCCAGCCCAGGCCCCAAAGTTCGCTGAGGAATTTGTGCAGCGGCCATCCGTAGAGCAGACATACGCTGAAACTCGGGCTCCTGGAGCCATTTGTACATCCTTCGAAATGTCTCCCTGCCGGACTTGAGCTTCGACCACGGCTTCGGGTTGCGCAGTAGATCGGACAAAGTACCTTGCGAGCGACAGAGAACACGCTGTGCAAAGATCGCCTGTGGAATGCTGTACCGTTTCAGTTCTGCCGAGATGCGCTGAGCCAGATCTTTCGTGTTGATCTCCTCCATGTCGCTGGTGTGTCCATTGCGGCTCGATCCTCCGCCCGCACAGGTTACGGACGATTTTGGCGAGGCAGGGACAGAAATCTTGGCCTGCTGGCTGGAACCTTGAAAGCCGTTTAGGAGAGCTGATTGGGGCTGGTTGCGGATGGCACACACTGAGTGCGGGGTACCGTGGATGTTCGGGCTACACTGTTCTGTCGTCACGGTGTTGCTTTCTTGATCTTTGTCCAGGAAAAAAGGTGTTCTTTGCCCTGGGGACAGTCGCTCATTCAGTTTGAGTCCGGCCCCTGAATCGTCTGTTACGGGGGGAGGGGTTGGAGTGAGAGACACTACAACTGGCAGATCGGCAGACAGACTAACAACGCTTCCGTTGCCGTGCTTCCAATCATCTGACTTCCAGTCCGCAGGGCAAATAGGAGTGGCCGTAGGGAGGTGGCGATTCATGTGTCCCCGCTCAGGCGGCATGTTAAGCCGAGATCTTCGTTCTAGCGGAATGTGGAACCGAGCCTCCAGGTCAGCCGGCATATGAAGCCGCACCTCCTGCTCAGGGTGCATTTGGAGCCAATTCCTTTAAATATACAATATTGTTTTAAAGATTATAACTTAAAATTTATATAAAGGTTCGAAGATTTACGCTGAAATACGAATTCCTAAAAATAACGTCTAACGCCAAGCGTAAGAGGTTATATGTTAAAAAAAATAATTTTTTTAAATTCCGATTATTCCCATTGGAGCTAAGAAATAATTTCTTTAATTGGTTCCGATTATTCCTATGGGAGCTATAAAGTTGTCCTATCCGGCTGGTTCCGACTTATATATTACCCGCAAAAGAAAAATGACTTGGGAAAGTTTAAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGCACAGACGGACGGACAGAAGGACATGGATAGATCGACTCGTCTAATGATGCTGATCAAAAATATATTCTTTATGTGGTCGGAAACGTCCCCCTCACTCTTGCAAGCTTCTGACTTAAGTCATTATACCCTCGACAAGAGCATAATTCGCTGAAGTATTCAATCTTTTTAAAGTCTGATAATTTTAAAAAAATTTAGCCTATATAAAATCGGTGACCAAACAAGCGATCATATATAGGTAAGGCCAGCGGCTAACATTGATTATAATTTTAAAAAATACTTTAAAGGCCTGTCGGAGAATATAAATGAAGCGTTCTTTATAGTCTTTGGAATAGCTTTTAGCGGTATACATACGTTCCTCCGTTGACACCGGGAACGCTTTCTGCTCCAGAGATGTGATCAGAGTAA'..b'GTAGGTGTTGCTTGCACTTTTCTAATACATTTCCATTTTTTGCATGTGAACAAATTGGCTTAAGTTTTCTTATTTAATATAAAACTAATATAGCCTTTTTTGAAAATATTTACCCAACTTCCAAATGACCTTAAAGCTACATTTCAGTAGCTAGGCGTCGTTTGACTTTTTTTTTGACATATCGAAACACATTTATGCAAAGCACTATTACACAAATCACTCGGACGGGAAGATTTTGAAGGAAAATTTCGTTCTGTTCCTTTACAGGATCTTTCGAAAGGCCGAGCTCAAATCCGAATTATTTGGGGCTCATTCCAAACAGGATGTCTTTTCCAAAAGAGGGCAGCTTTTGACTGGGTGAAACTGATAGAAACCTATGGGCTCTGCCGCAACGCCTTGTTCATGTGCACAACTGAATCCTTCGGCTAGAAAATTATCTTCGCTTCTTCGTGTATACACATATGTACACTTCACATGTGGGTGGTTTTTCCGAAAGTTTGTTATGTGACTGCCGTGTTCCATTAAGTCTCAGCCTCGCGCGAATTATACTTAATTCGAACTGAACGGAACCAAACCAAACAGAACGGAACTAAAATGAACGGCCACAATGCACCACCATCGTGCTAAGGGTTGCCACAGGCAGATAGTACACCATAAACCCCACCCCTAAGGCCAGCTCATGCGCAGTGCAAGAAGGTGAACTGGATTCCAAGTTACAATTGCTCAATTCTCCGCTTACTACTTTTGAAACGTTATATTTTGTATAGGAAAATAACTAAAAACCCATAAGTAACAACGAGTATTTTTTTAATCTAGTATTGTTTTTATTGTTCATGCCGTTTATAAAATGAATCGGACACTCCAGTTCCGTAGATCCCATTTCGTCGAGCATTTTGGCTTTCCCTTTTTAAAATGACAAATGAATATGTTTTGTTCTAACAGAGTTATTGCGCTTCCAATGCTGCAACTTTGTGATTCTTTCGAAAAATTTGGAATTTTCAAGTCAGAAAATACTCGAAATTTATCACTGTGGACGGCAGTAAACGTAGTGGTGAAGCGCACCAGAGAGTGGGCGAACAACTATTATGTATAACCGAGGAATTGCAAATCTGCTATGATGGTCGGCAAACCTTTTACGAAATAATCAATGTTAGTAATGCCTATTAAATTTTTTTGGATTTTTGCTAGCTTCAATGACACAAAAACCATTTTTTTTTTCAATTATTTCATTATTTCTGTGACCGTTTTTTCCGCTACATGCTAGTTTGGTCAGAGTTTAGTTTTTTTTAGAAATTCTTAAAAATACCAAAAAAAATTATATTTCCAATGGTATAAAATAATATATCAAAACATACTGAAACTATAATTTGTTTCATATTAATTTCCTTAACAATTTTTATACTTGTTACTATAAGGGTATACTAGACTCGCCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATGTATTCTTGATCACGATCACTAGTCGAGGCGATCTCGCAATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGAATAAACGCTGAGATCTTGAAAACTATAAAAGCTAGAACAGCCAAACTGATGCAGATGTGCAAATGTGCAACGTCCACTCTTACGCCCACAAACGGTTAATGCTTAATGCTTAAGTCTCTCTGTCGGCCACATAACGTCTACTGAAATAGCCGGTAGGTGGCACCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTATATATCTCGACTATAGCGTTCTTCTTTGTTTGAAGTCTCATTTAACATTGCAGCTTTGTTATTAGAATTAGGAGAAAATTAAATTTTTTTTAAATATTAAAGACGTACTCTGCTTTGGTTCATACTTGAGCCTGGGACCTTCCGGATCAGAGATAGACGCCACACCATCTGCTCTATCCACTATGGGAAATTTGACCACCTTTTCTGGCCAAAATTAATAACTTCCTCACTTTCAATGATATCAAAGAAAAACTTTGGCAATCGTTGTTTATTAACAATTTATATTAATGTTGTGATAGAAACAAAAAATATATATAGAGTTTAAATTTTTATCATTTTTTGTTCAATTTAACCGCTAAAGGCCGGTTAAATAAGTCAAAGGTTGCGTTCAGAACTTACCTTTAACGTCTAAACAAAAATGTACTGTATACTTTCTGGCGACAGCGAAAAAAAGGATTCAAGTTTGAGGTTATGATCTAAAAAATTAAATTCCTCCAATAATCGTAAAAAGTGTTTTTCTAACTACATCCATTTTAACTGGAGTTCCTCACTCTTTAAATCCCAATAGGTCTGGTAAGTGGACTCCGCTGAACTCTCTTTGTATCTCAACTTAAAAATTAGTTTTTTTAGTCCCACAATCGAAAAAGCTCATTTGGTTGTATGTTAAAAAAACCAAATTATCATTTGTTTCATATTCTCTTTCACCAAATTTTTCGATCGTTTTTATGACAACTGTATTCAGAACTAATTAAAAAAAAGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAACTACCGAGGATATAATTTTTTCATATTATTTTCCCACCTATTTTTTTATTATTCCTATGTCAGCTATATGATATAATCGATCTTGATAAAATTAAATTCAAAATTCAGAACTTATTAAAAAAAATTATTTCCAAGCGTAGGAGTTAAAAATACCAAAGATAAACCCTTTTTAAAAGGTTTTCTATCGAATTATTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGAAAGAAGACCCCATTCCGACCCCATTAAGTATGTATATATATTCTTGATCAGGATCACAAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGTCTGTCCGCATGAACGCTGAGACCTCGGAAACTATTAGAGCGAGAAGACTTAGACTTGGCAAGCAAATTCGGCAGGGTGCCACGCCTACTCTAACACCCACAAACCCCACCAGCCTCGCAATGACGTCAGAGCCAAGCAATGAAAAAGGCATTTGTGAAGGTGTGTGTCTAGACCGAGCTGCTCGCAAAGCGAAAAGCGCTATGAGAGGGCATAGTAATAGGGGTGCGGGAGGTGTATTCTCGCTCTATGCATTAGCCCTCTCTCTATTCTGACCTACAATCTATTCACATGGGCCCAAAAGAGATAGAGAAGATCATTGACGCAGTGTTGAAAAGCATGAGAAGGCAGTGAAAGAACCGAAAACTCGTGCATGTAACTTTTATAAATTCGTTATTTAAAAGTTGGGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGACACTCTCTTGTTTTTTTTTTATTTTGTTCGAAATCCTAACAAATATTTAATGAATAATATTTTGAAAAATTAGAAGTTAATATATTTAAAAAAAACAAAAGCTATAATTCTTTAGAATTTGTACATTTATTTTTTGTTTTTTTATTCGAAATTATATGATGAAATAATGATATTCCATAGATTAAAAGTCAATATCGGCCTAAAAACAAGGAAAACCGCCTTAGATAAAACAAGAATGAACGCAATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGCCTAAGAGATCAAAAAAGAAAGTTGGTGTTCATGCAAATAAAGTAAGTTCTCGCTAAAAAGCTTTTATTTACATTGTATTAATAAAACATTTTTGGCGGAACCACCAGTAACACGATATCCGTAGTGCTCTCTATTGGGGGAACACCACCAGCTTCTTGACAGCTAATGTGGAGCTGGAGGACGCGCCGTCTTCTTCAGGGAGGGAGAAATAAGGCCTCCCGATAAGGGGCGGCTGGAGGAGCCATTACCAGCCATCGCCAGCAGACAGATGACATAAAGATGGCGAAGCATCTGCGACACTAGAAGAAAGTCTTAACTACTTATTACATAAATAAATAAAATTGCGTTGAACGTTCACTTAATTTGTATTTTTGTGCATCAGCAGACTCGTTTTTTTCAGGCTAATACTGAGCCTTTGTATAAGTGTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTTAAAGAAATGTTGGTTTAATACGTTTCCGTTATCATAATTTAATTTTTCTTCTATTCCATTATATTTAATTACTCCCTTAGCTGTATCAATTACCGCTCCTCTTTGTTTTAATAGGTTATAGCCGACCAGTAAATCTGAGTCTAGCCCATCTATTTCATAAAAAGTATATCGCGTATCAAAAATAGTTATCATATGATAATATTTAATTATTGAATATCCATTCACTGTAGATACTCTTTTGTAAATTGGAAGCTCGTTCTTATTTTATTCTTATTATTTATTTTTGCATCTTTTCTAATTAAGTAGGGTAAGCCTACTCCTGACGTTTGTTTAAAAAATGGTTCTCCTCAATGTTATTTAATCTCATCGTCTTGTTAGCCGGTTGGTTAACAGTTCCAGTTGGTACCCTTTTATTTTGGGCTTGGCCTTGCTGAGTGTTCTGGGTCTCACATTTTTTTGTTTGATCCCACTTGTTCTGACCTGACCTGAACCTGGATAGACTCGTCTACCTCCATTGGTTCCGGATTATTTTGTGGCTGCCTATAGGTGTTCCACTGTTTTTGTTGCTTATTATTAAATCTACCCTGATTCCAAGAATTATTTTTATTCTGATTATAATAACCGTAAGTATTTTTGTTCTGGTAGTTGTCATGATTGAACCTTAAATTATTATTGTTTCGCTGGTTACTATAACTATTGTTTTGCTGTCTAGTTTTGTGGTTGAAATGTGTTTGTCCATTTCCACTAGAGTTTGGCTCGCTATGTTTTCTCTGAGTAGTAGAGAAGCTATTTGCGAAATGAGCCCGCATGTTGTTGCTTTCCAGTTCCTGAACTATGACCATTGCATTTTGTTTCCTATGTTTCTCATTCATTTCCGCTGTTATAGGTTTGTTTCTACCGTAGGTCATAATAGTTTTATTAATTAGCAGAGTTAATTTTCTATTAACTGCACCATAATAATCCATTATGGATAATTTTCCCTGACTCAATACACTTAATTCCTGTTCAATAATGTGAATTGGACGTTTGTCGCTAAAGACGAAGTCAAGTCTGGCCATTATGGCATCGAAATTTAATACAGTACCGTTATGGGTTAAGGCGTCGTTTGCCATTCCTGTTATTTTGTTTCGTAATATAGATAAGGCAGAATAAAATCTTTCACTCCCTCTGGCATATTGCCCCATGTCTACTTCTGCCGATTCTCTCCAGCTTACATATTTATCCTCTTCACCTTTATATTCCCTAACAGATTTGATAATCTCATAAGAGGTGTCGCATTTTATATTCGGATCTACAATCTCTGTCTGATAATCCTCAACCGTTTTAATTTTGTGAGAAAGCTGCGATCTTAAGTTAACGATCTCCTCCTTTAATGGATTTAATTCAAGATTTACAATTTGCTTAATTAAATCTCCTACATTTAACATATAACATTTGTTTGTTATTGCCTGAAGGCTTGTATTTTCTTGTGGATTCATGTGGAGTTTTTTATTTGCTCCAGTCTGGCTTGTTGAAGGTTCTGGCATTTTTAGAACTCTTTCAAAATTTGAAATTAACTTTTCTACTTTGTATATTTATATTTCCTTTCTTACAAATTTTTCATAAAATAATAATAAAAAATTGTTTGATAAAAATAGTGTCGCTCACGAATCGTCCTTATTTTCTTCTCTTCTCGTTGTTGTTTTTCCTGTTGGGGTCGTCCTTATCCTGAATGATGATCCTGATTGGGGTCGTCCTTCTTTTTTTCTGTTTATAAATTATCTCGGGGTCTTCCTTCTTTAATTAGGTCTTTCTTCTTTCCAATTTTTGGCGAGGGATTGCCCTTCAGCCTGTTTTCTTAGAAAGTTTATAGCAGTATAAACTGTTACACGAATTAAATAACTTTATTAGACTTGACCGTTCTCTTTTACTTCTTATTAGCAATTGCCTGGTTTTACATAGCGTCGGGTTTAACATACGATTACTTGAAGTTGGCTGCGATCAATATCGATACTTAACATTATACCAGAGTTGCCAGATTGGTCGCTTTATCACAGAAGATACTTGTAGATGCTAGAGACTATTGAATAGCTAGCCGTTACATTCAAATACTAGTTAATATACACTTACATCGAAAGGTTAGAGTTACCTATACATATACATAGCAGAGTTGTACATTGTTATACTTTTAGCAAGTCACTAATCCTACTACAATTCGGCCATCCTGACTGGTTGATCACCTGATCAAGACATATTGACTTAAAATTTATGCCTATTTATCTTTACAATATATAGATACTTAAGTGGTATTTCTCGTTATAGGGTACATTTTTATTTTCTGTTTTTTAGTCTTTTTAGTTTTTATTCAATGTCTTAAATTTTGCGCACTCCAAACACCTAAATAAGGACTACGTGCTACTTGAAAACCTTCGACGTCTTTTAATAAGAATCTGTCATTGCGCATCGCTTTTGCAATCACATATGGTCCTTTTATGTTTGGGAATCAGTTTCCTAGCAGTTCCAACAGTCGAGTCAAAATTTTTCACCATTACATAGTCTCCTTTTTTATAATTTCTAGCCTTTACTCGACTTTTGTTATACAATTTTTCATTATAATCTTGAACTTGCTTTTGGTGGGCCTCAGCTTTTTTCCTTATCTTTGTTAAACTATCTAATTTCTTATTTTCATTTATGTCCTCTAGCTTTTCCTTAAGTTCATCCACAATCTTTCCTTTTTGTTCTACTCCAAACAGCATTTTACTCGGAAGTTGTCTTATACTTCTGTGCAACGTATTATTTAAAGCATGTTCTATTTTATCTATAACATTGTCCCAGTATACACCTTTACTTTGATCAACTAATTTTGCTATCATTGGTCCAAGGCTCCTGTTAATCCTTTCAACTTGACCATTGGCTTGTGGTGAGCCTGTGGCTATCTTGATGTGCTTCACATTATATTCTTCCATGAATTCTTCGAAGTCTTTAGATGTAAAACAACTACCCCGGTCTGAAATTATGCATTTTGGCCTACTATAGGCCCTAAAGTAATCTTTCAATGCCGCTATAACCTCCCTAGTGCTTGTTGATTTAGTTGAATAAAGTCTTACAAACTTTGTGAATCCGTCAACTACCACAAAAATGTGTTTTTTTGCTCTTGACGAGTCTACTGGACCATAATGGTCAATGTGTATTAACTCGAATGGTTTGTTTCCTTTGGGAATACTGTGCAAAAAACCTTCTCCTTTACCTGATTTTGGTGAAAACGCTACACACTTTAAACACATACACACTTTAAACATATGTGCAACGCACTTTTCTTTTAAACTTGGAAACCAATAAGTTTTTGAAATTATGTCCATCATTTTATCTCTTCCTATATGTCCTATTTCGTTGTGGTATTTATATAGTACCTGATCTTCCATTTCTTCTGGCACATAGAATAGTATCCTATCGTCATTTGCTTTTCTGTACACTACCCCATTTCTCATTTCAAATAATTTAAGTTCTGCCTTCTCTAAAATCGTTTTAAGCTTCTTAATTTTTAAATCCTTTCCTTGACAGATGACTAAATTTTCCTCAAAGCTGTTGGTTTCCACTATTAGAATATTATTGTACCTGCTGAGAGCATCCACATGCTGCATTTTATTTCCCGCTCTGTGACATATTTCAAGATCATAGTTTTCCATCTCCAAAGCCCATCTTGATATCTTCGGGTTAAGTTCTGCTTTATGGAGTGTTAACTTAAGTGCAATACAGTCGGTTACCAATTTTACATGTTTCCCTTGCAAATATATCCTAAATCTACGAAGAGCATAGATAACCGCCAAAGTCTCGAGCTCAAAACTATGTAACTTAGCCTCATCTGCTGTAGTACGCTTAGAGAAATAGAACACAGGATGTAACTTGCCATCATCTTTCCTCTGCAACAGTACAGCACCAAATCCTAGAGCGCTTGCGTCACAATGTAATTCCGTATCGTCCTTGTGATTATATAACGCCA'..b'AGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACTCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAACGTCCCTAGACGAGTCGATATAGACATGTCCGTCTGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGCTGAAACATTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAACAGCATCAGACAACTATATCTTACAGCTTCCATAGGAAGTATCGGGGACAACATTTTGAAAATATTATATCTTTGGTGGTTTTTAACATATGTCATTCTAAGCTTGGAAATAACACTTTTAATTAAGAATTAAATTTTATAAAAATTGGACGACTATATCATAGCCATAGGAACAATCAAAAAAAGTTAGTGGTAAAATATTATAAAAAATTATATCTTCTGTGCTTTTCAGCATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGTTTTAAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATTTATATAGCTGCCATAGAAACGATCTCAAAATTAGTCGGCAAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCCCCTGCGCTTGGAAATAATATTTTTTAATTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTGATGACGTCTATATCATATCGCAAAATTAGTCAGAAAATATGAAAAAAATTATATCTTTCGTGTTTTTTCACATAAACCCTTCTAAGCTTGGAAATAAAATTTTTTAAATTTTTAAAAATTTCGAATTCATTTTAATAAAAGTTGGACTACTCTAACATATAGAAGTAAAAAAAATGGTCTAAAAATAGAATGAAATCATTTTTTTTTAACATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATGTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAAATTCCTTTCTTGTTTTATCTTAGATCTTATAGCTTCCATAGTAATAATTGGAATAAAAATTATGAACATTATATCTTACGGGTTTTTTAACATATAACCTCCCACTCATAGAAATTCAATTTTTTTGATCTGAATTTCAAATTTAATTTTATCAAAATCGCACGACTTTCATTATTTTTCTGATCGTTTCTTTAGCAGCTGTATGTTAGAATCGTCCGACTTCCGACTACATACAGAATTTATATTTTTCATCAGGACCACAAGACAAGTCGACCTAGCCACTTAAGCAAAAAAAAACTGTTTAAACTGTTCCCCTAAAAAAAGTGGCACGCCCACAAACGGTCATGTTGCTTAAATCTTGTTGCCGCCCACATCACTATGTATTGAAATAGCGGGTGCTTCACAATATCGCTTTCATCCTTATACACTAGTCGGCGTAAGTATTTTGACAAAACAAAAGTTAAGTATACTCGTAACTTGAACTTCATCATTTAAACGGCATTTAAATGACCTTTCCGTTGATGCCAAATGTTAAACGAAGCAAATTCAAGTTACGAGTATACTTAACTTTTGTTTTGTCAAAATACTTATGCCGACTAGTGTATAGCTCCATCCAGTATCTGATAGTTGAGAAACTCGACTGTAGCCTTCTTCACTGTTTAAAACTGCCTTTGCCGGAAAACAATTAAAAATCCCCAGTCGGGAAATCGGTACTGTATTAATAATTATTTTTAAAGAAACTATTATATTAATTGCCACATTGAATAATTCTTTTGGGTATCATTCAAAAGTTCGGAAAAGATATTATAATGTGCTTGTAATACAGTAACAAGACTTTTGTACCCAACACCATTTTTGCCTAATAAAAATTGCAAGCAAAACTTCACGAAATCGTTGATAAAGCAATAAGACTTCTGAAAGTAAATTTGTTGCGATACTTAAAGTTCCAATAAAATGTACTGCAAGTTACACACATCACCAAAAAAACTATTTATAAAAAATAATCAACTTTTGTAAAACCATAAGACATTTTTAAAGATTGTTGCTGACTTAAGTGATATTAAAAAAAATTATTTCATTCTTTTTTTCAGACCGTTTTTTTGACATCTATATGTTAGTCCGATTTTTATAAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATAAAAAAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATAGTTTCTATGACAGCTATAAGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCAAAATTCAGAAATAATTAAAAATGTTATTTACAAACTTAGAAGGTTATATGTCAAAAAACACCAATGATATAATTTATTAATATTTTCTGACTCATTTTCCGAAACGTCCGGAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCATACTTCTGACTGAAGTCATTATAAAAATTAGGTCTTTGGTCCTATTTAACAAATAACCTCCTACGCTTGGAAATATCATTTTTTTATTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTGATCAAAATCGGAGGACTATATCATATAGCTGTTATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGCTGTTTGACATATAACCCTCTAAGCTTGGAAATACAATTTTTTAATTATTTATGAAATTCAAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATGGGAAAATTGGTGGAAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGAGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGCATATAATTTTTTATATTTATAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTCGGACTTCTCTAATACAAAGATGTCAAAAAAAAGGTCTGAAAAAAATTGTATATAAAAGGGTATACTAGATTCGTCCGAAAGTATGCAACAGGCAGAAAAAAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCCTTGAGATCTTGGAAACTATAAAAGCTAGCTTGGCGTGTAGATTCCTGAGCTTTCTGCGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGTTGGGTGTCACGCCCACTCTAATCCGTCGGACGACTAACTCATATAGCTGCAAAAGGAACAATCGGCAAATTGGTGGGAAATTAATATGAAAATATTATATCTTTGGTGTTGTTTAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATCGGACGACTATATCATACAGCTGTCCTAGGGAAAATCGGAAAATCGGTGGGAAAATAGTATGAAACAAATTATAGCTTCGGTGTTTTTTGACATATTATCTTGTAATATTGGAAATATCCTTTTTTATATTTTAAAGAATTTCGAATTAAATTTAATACAAATTAGACGATTCTAACATATAGCTGCCAAACAAACGGTCAGTGAAGAAATAAAAAAAAAAATATCACTGAAGCCAGGAACAGTCCTTAAATATTTCTCTTGGTGTTACAACGTTTAGTATTTCTTATACGTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCTTTTCTTGTCCTTTGTTGATCTGCCCACTTTTTCTTAAACTGAGTGATGGCAGCTCTGAAACTAACTATAAAAAAAGCTATTTCCAAACTTAAAAGGTTATATCTTAAAAAATACCGAAGATATAATTATAATAATATAAATTATAATAATTTTTCCCCGAATGTTCCTATGGGAGATATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTTTGATTTATGTACTACCTGCAATAGAAAAAAGACTTTTGGAAGAGTTTCAGCCCGATAGCTGTAAAATTAAGAGACTAAATTGCGTACAAACGGAAACGACTCGTCTAGTGACGATGATCAAGAATATATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TACTTTACCTATACTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGATCTATGTATCTTCACAATGAACGATAAATTTTGACTTGACGAAAAAAGAAGTTAATATACCCCGGGAGTAATAAAGCATAAACACCTTTTAACGAGGTAAGGGGTCGTGAAAATGCTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATCTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTTTGATTTATGTAATACCTGCAATAGAAAAGACTTTTGGAAGAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTGAGAGACTAAATTGCGTACAAACGGACAGACAGACGGAGAGACGGACATGGCTTGATCGACTCGTCTAGTGACGATGATCAAGAATATATATACTTTACTTATACTGACTGAAATCATTATAACCTCTGCAAGGGTATATAAATGATCTATGTATCTTCACAATGAACGATAAATTTTGACTTGACGAAAAAAGAAGTTAATATACCCCGGGAGTAATAAAGCATAAACACCTTTTAACGAGGTAAGGGGTCGTGACGATCGCACCTTCTACATACAAAAGTTGGGATATTTAATTTTGTGACGAAAAATTATTGTAAATTTGACTAAATAAACTTTTTTATATTATTGTATTGTATTAAACTATTCGTGTGTACATAAACACATTTTCAACCAAATCTATAACATGCGAATGGAAGAAAATAAAGGCTTTATAATCGGTCACTTATCTGAGCTTTGTGACATAGAAGTTAGACAAATTTTTATTGTATTTGTTATTATTATAATGTTCAAAAATTTTTTTTTAATTTTGGGTGACACCAGCGCCCAGAAAGTTAGTCAAGAACATGCGGGTTTAAAAATGGAATTGAATAAGTTCTTGCGCTAAAGACCCCAACGGCCAATTACTTAGCTGAAATTTTAAACTTGCTTAAGAGAGCAAAAGAGAAATGGAGATATATAAGGAGCGCCTCCTACCCGCTATTTCAATAAATGGTAATGTTGGCGGCGGACAGATTTAAGCGTTTCGGCCGATTGTGAACTAAGTTTTTGGGTCACTCGATAGGTATTGATGAGGCAAATAGAGCTTAGTTAATATTCTTTTCAAGCATGAGAACTGTAGGCGCTGTAGGATTGTAGTTGATTGTATAGATTGAAAATATTTAATTAAAATCGGTTATAGACGATCACGAAATATTAGACAGAACTAATGTTATGGTAGTCTTTAAAACAATTAGTTTATATCCATAATATAATGAAAAGGAATTTTTTACATACGGAATTAAATAAATTAATAAGTGGTTCCAAAAATAATACAAATCGTAGACTACAAATTTGACATTCCATCAAAATACTAAAGGCAAAACTTCAGAACATTTTATTAGACAATAACAAAGAAAAGGTACATTTTGACTGTTTCGGTACCAACTATTCTGAACACATCATTAACAGTAGAAACTACTGTCACCACCTGCCGACCCAGTAGAGGCATAAGATTTTGATTCAAATAGCCCCAGAATATAGGAAATACATTTTACAAATTTCACCATTTTAAAATTGGCCAATTTAACAAAGTGATCATTTGAAGTGTAAGCCATTAAGGGAATGTATAAAGGGGGAAAAGACACCCAAACGAGTAAAGCAGTCGAAAAACTTATCTCAGAAATCGAAATTTTACGAGAGGTACTCGAAGCCTCTTTTGAGGGATAACCAGCCTAACACGCTTGTAAATTCAGCACCAAGAAGCAATCAACACAATGTTTAAAATTTGCGTGCATGGACCATTAAACTATCATAGAAGCTCAAACTTCTCAACTATGGATGAAGCAACCGCAAAGTACTTACAATGTAGTACTGAATCGACAGGTCCTTGTTGAATTTTATAGGTTTACCTTTCGTTAAAATATAAAAATAAAAAATGTATAAACAATGACTTCCCAATACCCTGTGACGGCATATTGGCAAGAGACTTCATAAAAAGTTCAATATTCATCTTGATTTTTGTTTAATAGCTCGACAACAGAGTTTAAATTATGAATTTAACACTCCAATTACACATTTAATTAATTAATAATATACTTATACCAGTACAATCAGAAGTTGTTAGACAACTTTACATAACACGAAGAAATACCTATTAAATATCAGGGTGTAAATGATAGCCACTTTAACTGGTTCAAATAATGCATTTGTCCGAACTCTACATGCAAATGACAGAAATGATATTCTAAACATCTCTTAAATCGAGTAGAAACCATTACAAAATTAACAATTACTTAAAAACCTAGAGCATATCCAAACTAACAACAATTTTTTTTTAAATATTCAAATATTATCAAGTGTGATAATAATAATCCAAGTATGAACAGGAGAAAAAAAAGATCGATATATACCCGTTGCTCAGCTTAAGGAGAAAGAGGAAATGGAGATAAAGAAGCAGCAAAGCGATATTGTAAAGCGCCACCTATCGGCTATTTCAGTATGTGTTATGTGAGCGGTAGACAGATTTAGGCGTTAAAGCTGTTTGTGGGCACTTAACAAAAAAAATGTTTCTAGCTTGAAAACTGTAGCCCCCACAGTTTTGGTGGTTTGACCCAACTGAAACAAACTTTCGCTGCGAAAGAAGGCCAGGAACCTGCATGCCAAGTCTGAATATTTTAGCATTTATAGTTTTCGAGGTCCCAGCGTTCATACGGACAGGCAGACAGACGGACTGACGGACATGGCTAGAACGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAGAATTTATATACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTGCATACTTTACCACAAATCTAGTATACTTTTTACTCTACGAGTCAAACGGCAAAAACTGGTTTTTTCCAACATTGACCTCTCTTTTATTTTTTTAGGAAATCTGAAAAAATGTTTCCAAACACCGCACTTCAATTTCTTTTTCCGTCGTTAACAAACTGCTGCTAACATTTCGATACAATTTGTCTTTTTTCAAGCCTTCTTTACATGGACGACTTCCCGAAATGGTATAAATGTAACAACGTGTAAGGAGACAATTTCGAATTTGGTTTATCACCACTCCATGCACAAATACACTTTATTGACTACTTTTTGCATGTCTGGAAAAAAGTTACGTTTTGCCACGATAGTGGGAAATTCAAGCAAATTTGTGGAAAAGTGTAGGAAAACTAGTTGACAAACCATTGACAGAGGATAATAACCTATGTATAGGTCTAATTATAGTAATGCGGATAAGATTTGTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATCTCAGTCAAAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAACTATATATATTCTTGATCAGCGTCTCTAGACGAGTCGATCTATGTCCGTCCCACCATGTCCCTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGACTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCTGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAAGGATAGGGGAAAAATTAAAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACCTTTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATAGCTGCCATAGTAACGATCGGAAAATTGGTGGTAAAATAATATAAAAAAATTATATCTTCGGTGGTTTTTAACATAAAACCTTCTAAGTTTGGAAATAACATTTTTAAATTATTTCTGAATTTCAATTTAAATTTTATCAAAATCGGAGGACTTTATTTTATAGCTGTCATAGGAACGATCGAAAAATTTATGGGAAAATAAAATATAACAAAATATAACTTTGGTGCTTTT'..b'TCTTTAATGGGGTCATAGGTCTCGGCTACTATCCGAAAAAATTGAAAAAACACAATTCCTTCATCCTACAGACTAATTAGTTAGTTATCGTGTCTGTATAAGTTTTTCGAAAAATGCCTTCTAACCCGCATAACACCATATCTAGGAGCACACAATGTTATCCGGGTTCATAAATTTGAGTTTCATCAAAATCATGGATTAAAATCACAGAATAAAATCTCAAATACGCACAGACTTTAAGCACCGGGAATGGTGCAGCGCAAAATACCTCTATGTATTTCAAGCCTTTGATCGAGTATAGATAGATAGCCTTATGCACTAAAACAAAACACACTTGCCTGATTACTCTTAAAAGCTATTTGAGTCGTATCTTACTACTAAACCCTCGCAGTAAGGTGGAACACAACAACATCCGACGACTACATTATCAAAGCTGGATGCAAGGAAGAGCGCTAGGGCCTACTCTGTTCCTCCTATACACAGCTGATATTAATACAAATGAGCAGCTAACACTCCAATTCTAAGTCGCTCGCGGTGCCCAGGCCGAGCCACAACACAGCTAGTAAATCACCTTCCGTACACATAACGTTTACTCTCAACAGGCAAACATGCCCTACACTATCATTAAATAGTACGCAGATTCCTCAAGTCAACGAAGCAACGTACCTCGGCGTCCACCTTGGCAGACGACTAACCTGGAGAAGTCCCATTAAATGCAGGAAAGTGCTTCTAAAACTAAAAGCCAGCAGCTTCCACTGGATTCTTAATGCTCGTTCCCCCTGCGTCTCGACTTCAAGCTTTTGCTCTACAACACCACTCTCATATAACTTCCAGGGGAACGCGAGCATGGGGAACGCGAGCAGAAGCAACATACGCAACCAAAACATCCACAGGGGCCTAGGCATTCTTACCGTAAAAGATAAAATAGACGAACAAAGAGCATCCTACAATGAAAAACTCTATGAGCAGCCCAATCACCTCGCAAGAGGCTTGACTTGGATTTCCAGCCGATCCCATCTATAACGCAACGACCTGCCAAGCCAGCAATAACTTTAGGGCCCCCTTAAGCACAATACCAGTCATATGATTGTTAGTTAGATTAATTAGTTTTGGCGAAGGTATGAATATTTTAGGCGCAAGTTTATTTGAGTACCTTATTTTCAAGCCCACACATCACACAAAACTTAAAACATGTTTTTTTAAGTAAATCTTATTGATATTAAACATACTGCTTATTGACAGATGGTTGGATAACTGGATGGTAAAACAATAGCTATTTATTTTAAGAAAAACAAAAACCATGTACTAATCAGTCTATATAGTTTATTTTTAAGGCTGGACATTCTTTTTTGCTGTACACTAGCTTTATTATTATTAAAATCATCATCTTTATTTCAGGACAAACAAGAACGGGAAGAAGAAGAACGCAAACGACGAATTCAACTATATGTGTTTATATCACGATGTATTTCGTATCCCTTTAATGCTAAACAGCCTACGGATATGACTAAGCGGCAAACGAAAATAACTAAGCAGCAATTAGAAATAATAACTCAACGATTTCAAGTAAGGTGGTAGAATTGCAAACAATTTTGATGAATGTTTAATTTTGTTTAAAAAATATGTAATTTGTTTGTTAGTTTCCCTTTTTCATAAATTGCCAACTATTTTTGACAAATGTAGTTAATGGCGCGACTGTACTTGTTTAAAGACATAAAGTTTTACTGGTTTGGAATGTTGTTGTTAGAATGTTCATTTGCATATATCTTTTGAACAGAGTTTCAGATGACGCTTGTAAAAATAGTCTAAGGAACTCGGGCATCTTTATCAGCGGCCCAAAATATGTCCAATATTTTCAATTCTTACTTTAACACTTAGTGCTTTTTTTCTCAAACTGATCAAACTTTTTAAAATATGCAATCTTTTTAGATTTTTCGATAACTTTTTTTTTAACTTTCACAGCAGATTTTCTTTTTTACGTGTATATATATGGGCCGTTCTTTTACAAACCAAACGAATTTGACAAAAACAAAATGTTCAAATTTTTGATTTGCCAAAAACTTTTTTCACGTATACTATTCGGAGAACATGTAAACACGTGTTTTAGGATTTGACAAAAAAAAATTGTATTTCGAATTTTTAAAAGGTTGTAAAAAAAAACCTAGTTTTCTGTAGTTATTCGATTGATTTTATGTCTTTTGCATAAAATACTCTACTCTTAATTAATTTTTTTTAACACAATTATTAATTTTTAAAAAGAAAACAAATCTGAATTAAAATTTTTTTTTTGTAACTATTGCTTCCAGCCTTCTTTTATGGAAAACTTATGGCGTTTGTATTTCTGAGTTACTCAAAAAGCTGTTAGTTATTTCTAAATAAAAAAGATCGTGGCAAGTTTTTTTTTGGTCGATCAATAAGTATTAATGAGACAAATACTTTTAAGCGAAAAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGCCATTTTTAAGGATTTTTGCTGGCTTCAGTGATATTAAATAAAAATGATTTCTTTCTTATTTTTAGACACTATTTTTGATATCTATACGGTACAGTAATCCGATTTTTATTAAATTGATTTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAATTGGTTATTTCCAAGCTTAGACGGTAATATGTAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTCATATTTTCCGACTATTTTTCCGATCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCAATTTTGATAAAATTTAGTTCGAAATTCAAAAGCAATTAAAAATTGATATTTTTAAGCTTAGAAGGTTATATGTTGAAAAACACCGAGTATATAATTTTTTCATATTTTCCGACTAGTTTTCCGCTCGTTTCTATGGCAGCTATATGTATAGTCGACCGATTTTGATAAAATTTAATTTGAAACTTAAAACCAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTACCACTAATATTTCGATTGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATACATTTTATTTTGAAATTTAAAACCAATGGTGGTCGTGGCACCTCGCTGAAACAAACTGGCTCTGCGCAGGAACCCCAGGATGGACGAATCTAGTAATTAATTAGTGTTTTTTAACCTTCTAAGCTTGGAAATAAACAATTTTTATATTTTTCAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTACTTAACATATAGATGCAAAAAAGATGGTCTAAAAATAATAATGAAATAATTTTTTTTAATATTACTAATGTCAGCGACAATCCTTAAAAATGTTACATGGTGTTACTAAAGTTGATTACTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTAAACATTTTTTTCCTATAATTCCTATGGGAGCTGTAAGATGTAGTTGTCCGATACGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGTAATAGGAAGAAGACTTTTGGGAAAATTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGATAGACATACAGAAGGACAGACGGACATAGCTAGATCAAGTAGTCTAGTGATTCTGATCAAGAATACTTTATGGGGTCGAAAACGCCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGAACGAAATCTGCAAGGGTATAAAAATTAAGAATAGAGTTCCTTTAAAGTTATTCATTTTTGTTGGCCATTCCTGATACACTTGTTTAATGTCTTATCAAATAGTCGAATTAAAAAATATCTATGAAATCATACATTTATTATAAAAAACTATAAATGCTTACTAGAAATTGATTTTATACCTGTATTATTTTTTCTCCATATAGTTGATCAGATTTGGTGTTAGCTAAGACTTTATTACAATCCATTACTTGCTGTTCCGACCCTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/23b/048/0e/scaffold_69-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TAAAAATATTCAATTGTAGATTTTCTATTGAATATCAAAACTGGCGGCCAGTTTCGAAGATTTCGTAACAATTCATTTAAATTCCAACATCGAATTTTTAAATACAGAGCTATGCTCAATTATTGTATTTTCCTCCCGAATAGTCGATCTGCAGTTTGCATGTCTTTCTCGCACTCCCTTTAGCTGCTTAAAGCTTATCCGATAGCGCTTTCCTTGTTATTTTATTATAGTTGTAACAAATAAATATATTATACGAATCCGACATTAAAAAGTCTGTAACAATCAATATATCGGAAAATTTTCGAGATAACTTGATAGAAATTTTTTATTTTAGGCTTTTCTTAAAGGTGAAACTCAAATAATGGCGGATGAAGCCTTTCAAAATGCTGTACAGAGTTATCACGACGTGTTTCTTAAATCGGAGCGAGTTTTAAAGATGGTCCAATCTGGAGCATCATCGCAACATGATTTTCGCGAAGTTTTTCGTAACAACATAGAAAAACGAGTCAGGTATTAATCTTGTATAATGAAGATATGAATATAAATAAACATTACAATTTCGTTTTAGATCTTTACCTGAGATTGATGGTCTTAGTAAGGAAACTGTACTAACTTCTTGGATGGCAAAATTCGACATAATATTAAAAGGAACTGGAGAAGAGGACTCGAAGCGACCATCTCGGATGCAGCAATCACTTAATAGCGAGTTAATTCTTTCAAAAGAGCAATTGTATGATATGTTTCAACAAATATTGTTAGTAAAGAAATTTGAGCATCAAATTTTGTATAACGCCTTGATGGTAAATTTTTTTTTTAATGAAAATCCTAACATTCAAGTAATAAATATTTAAATTTTAGCTAGACTCTGCCGATGAACAAGCAGCGGCTATAAGACGGGAATTAGATGGAAGAATGCAACGTGTAGGAGAAATGGAGAAAAATCGCAAACTTATGCCAAAATTTGTTCTTAAAGAAATGGAGTCACTTTACGTCGAGGAACTTAAGTCGTCAATCAATCTTTTAATGGCTAATCTTGAATCTCTTCCAGTATCGAAAGGAAATATGGATAGTAAATATGGACTTCAAAAACTTAAACGATATAATCACAGGTTATTTAATTTACTTTCATAATAATTAAATATTTAAATAACTATGTTCTTCCACTCTTGCTTCTTGTATTGACTTACAGTACACCGTCATTTTTGTAAGTTACCACAACCCATTATAATATTATTTGAAGTACCTCTTCTTAATCTAAACTAGTTAAAAAATACACCAATATAGATCTATATATAGCCCTTCGAATCGAAGAAAACTATTAAATTAATTAACAGGATTATGAACCAAGACATTAAGTCTGTCCGTATGAACGAGATCTGACGACGTTGAGTTTTTAGATGGCTGCTTAGTGCAACATTGTGGCACTTTCACTTTAGTCCCACAAATCGCGATATTCTGAAATTTTTGAATGTATGAAATACTTGAGATATAAAAAGGCCCAGGCTAAAAACGTTATTTACATTCAATATAATTGGGAGGCCTTTTTTCAATCTGGGAGGTCAACATTATCGAAAGACCAAGGCTGCATTCGTATAGCATTTTGAGGATTTTATTTTTTAAACGGGTGTTATTATTATTATATTAAAATTTCTATCTACTGCCTAATAATTTACTAACAGAAGAATAATTTACTAACAACTCTATATGGAAAAAAATTATTATTTCTGCTGGAAAATGTAAAATTTATTTATATTATTTATACATAACATAATTTGTTAATGTGTCAGTCTCTTGTCTAAATCATTAATGGGTCTTGACTTTTAGATATATCAATAGGGTAAATAAAATATTTTGAATAAATCTGTTTGTATTTTGACAATTTTTAAACTTCTAAAAAATAATTAAAATAAAGTTGTATTCTATTATAATATATCTTTTGTGGTTTCCAAAACAAAAGGAAATTGATACTGCGGTCTCACGGATCCTTGTCCAAGTTGGAGGGTGACTCTGAAGATGGTTCTACACAATTAACAAAGTTGGATGTTGTACTTACCTTTCAATTGGAAGTGATCGTTATGGAGGTTAAAGGTCTTAAATCATTAGCTCCTAATCGCATTGTGTACTGCACAATGGAAGTTGAAAATGGAGAAAAGCTTCAAACGGATCAAGCGGAAGCATCAAAACCAATGTAAGAGAATGTCATTTAAATGCTTTATCTTACAATCTTTTTTTAATAGGTGGGATACGCAAGGTGATTTTACAACCACACATCCACTGCCAGTTGTCAAGGTCAAATTGTACACAGAGAACCCCGGAATGCTGGCATTGGAAGATAAGGAACTGGGAAAAGTAATCCTTAAACCTACCCCTCTTTCATCCAAAGTGAGATACCCTGAAATACACATAATTTTATATTAACTTGTTGTCCTTGTTTTAGTCACCTGAGTGGCATCGAATGGTCATTCCAAAAAACCTTCCTGACCAAGATATACGGATTAAGATAGCTTGCCGACTTGATAAACCTTTAAATATGAAACACTGTGGGTAAGTACATTACAAATTCAATAATTTGCGAGTTAAAAAGGTCTGAATTATACTTCTTAAGGCACCTTTATGCAATCGGGAAATCAGTTTGGAAAAAATGGAAAAGACGATATTTTGTTTTAGTTCAAGTATCCCAATATACTTTTGCCATGTGTAGTTATAAGGAAAAAAAATCCGAGCCGTCTGAGATGATGCAGCTTGATGGATATACAGTAGATTACATAGAAGCCGCCAGTGGTAAGTAAATTCTTTATGATAAAAATGATTTATTATAGCATGAAAATTTATTTTTAGCAAATTTGATGTTTGGCATCGATTTAAACGGTGGACGATTTTTCTTCAACGCTGTACGTGAGGGTGATAGTATTTCCTTTGCTTGCGATGATGAGAATGAATGCAGTTTATGGGTAATGGCCATGTACAGGGCAACTGGTCAATCCCATAAGCCAACTCCACCAATAACACAAGATAAGAATTCAGCAATGTCAAAAATTCAAGGTGGTACGTTATATAAAATATATTTTTCTTCTAAATTTGTGCTCGCAAAGTTCTGTATGGTTTCAAGACATATTATTTGTTGTTAATTTTTCTAAAAACACTGTAAGCCAAGTGTACCGTAGTTTTCGAACCCATGAGAAATAGTTAGGGCGTGTCGTCAGCAGGATTTAAAAGTTTCCAAATGTTTAATAGCCCAATAATATTGTAGTAGAAGAACACGACTCTAAAAAAAATAGATCAGGATATTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGATAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAGTCACAAGACAAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCAGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTTTTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTTCTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGGGCAATCGGGGAAAAATAATATAAAAATTATTTTATATTATTCGTGTTTTTTAAAATATACTTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCCTATAGCTGCCATAGGAACGATCGAAAAATTAGTAGAAAAACATGAAATAAAAATTATATCCTTTGTATTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTGGGTGTTTTTTAACATATAAAATATAAGCTAGGAAAGAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGTTATAGGAACACTCGTAAAATTGGTGGGAAAATAATATTAATCAAATGATAGCTTTGGAGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAACTTTTTATATTTTTAAGAATTTTGAATTTAATTTAATAAAAATCGGAATATTATAGCTTCGGTGTTTTTATACCCCTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGATACGTTTTCGATCCCATGTCCGACTGTCCGACCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGTTGAAACTTTCCTAAAAGTCTTCCTTCTATTGCAGGCAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCATATAGCTTCCATAGGAACTATCGGGAAAACAATTTTAAAAAAATAATATCTTTGGTGTTTTTTAACATTTAATCTTCTAAACTAGGAAATTAAATTAAAAAATGTAATTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTGTATCATACACCTGCCATATGAACGATCGCAACATTAGTAGTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTTAATATATAACCTTCTAAGTTTGGAAATAACATTTTTAGTTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTGATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTGCCATAGTAACGATCGGAAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAAAAATTATTTACTAAAGCTGATTATTTCTTATAACTTCAAGGGTATATAAACTTGCTGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTGACATAATTTTCTAATATAATGGGAATATAATTCTTTATATTTTTAAGAACTTTTAATTAAAATTAATAAAACCCGGACGACTCTAGCATATAG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACTTTTTTATAAGCAGCAGAGCGATATTTTAGGGAGCCACCTATCGGCTATTTCAATTGATGTTATGTGGGTGGCAGAATGATTTAAGCGTTTTTGACATTTGTGGGCGTTACAGTGGGCGTGGCACCCATCTGAAACAAACTTGCGCTGCGTAGGAGGCCCAGGAATCTGCATAGTTTCTGAGATCTAGGCGTTCATACGGACAGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCAAGTGTTCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGAAGTCGGAATCGCTTCCTTCTACCTGTTGCATACTTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTAACGGGTATAATAACTAAGTTGTGGACACCCGTAACCTGCGAACTACTGGAGCTAAAAGCTTCTGCCATACGTCGTTGGAAAGGTATTTCGAAATTCTATGTACACGTTTTAAACACTATTTGTCTAAATACGAACGTTAGAAAATTATGGTCCAAATTGCGTATCCTAACCTCTTTTTTTAAGGTCCTGGAAATTTAAGACCGTGTTAAACAGCTCAACAAGAATCTTTAACTTTACTTCTACCACTTCTGGAAAAACTAGCTAGTTTGAAGAGTAAACAATTATAAATAGCTACATTTGTACACCCGCAATTTGTGAACTACTAAAGCTACAGACTATATGTGCTATGTGCTATATGTCGTTAGAAAGGTATTTTAAAATACTTTGTTTGCTTTCCGAACAATATTTGTCTAAATACTACCGTTTACAGATTGTGAGCTAAAGTTTTTTCTTCCGGTGTTTTTTAAACTCTTTTCCTTTTTTTGAAGTGCTTTAACTGTTTCGGGTATGCCTTAAAGTGAGCACTCATCGTACTCATCAGGTTTTACAAGCTTGCTGAATTAAAAAAGTGTAACTTAAAGAAAAACATTTATTTTACTTAGACTAGTACCCCAAAAATTATAGCAGACAACACCAAAATACGGCGTCAAAGCGCCAAATGTGTAAGTACATGCATAATGTTGTGTACGCACACATGCTCGCCTACCCACTGGCGTGTGTGTGCGCACATACATACAACTGAGGGACACCGGGGATGCTTCTGTTTCATCACCGTGGATGATCTCGTTTTTTACGTACCTACGGCTGTGTGTGTACACATAACTGCGTTTTTTGTTTTCGCTTTTTTAATTTTACTTGGGGTGGTGACGGTGGTGTTCCGACTGCACAAGCAGGCGGAAGGTGGCAAAGAGTGCCCATTCCGCCCCTTCTGTTAGTCCCGAACCCTGTACCCTGTACCCTGTACCCTGTACCCAGAGCCCAGAGCCCAGAGCCCAGAGCCCAGGTTCCAGGTCCTGTTCCCCTTGCTGGTCGTCGTTCCCTGTTTTCAACGCCACTTTGCCTTTCCTCTGCACCACCACCAACTTCATTATAATTTTGTCGGGGTAGTTTTTTTTGTGCTCGTGGCTGTGGCTCTCGACGTTGGCTCAGAAATACCCTACGCGGCTGCTGGTATTTCGGACTGGAGCGCTTGGTCGGGAAGGTGACTCGCACGAGACCAAGCCCAACGACTAGAATAGCACCCCCAAAGTTTTTTGTCGGTCTGTGAAAAATTGGATAAAAAATTCTTGGCAGTTTTAGCATCTGAAATTTCCAGCATTGAATTATGGAAAATCGATTTTTTCGGTTTTGCAAAAATGAAAGGACATCTACCCTCTTCACATAAATATGTATTTGACGGTACCTTCATACATTAATATGTGCACGTATATATGTTGTGCGAGAGTTCTTGATTTGTGTACATTTTGCAATTCATCGGACTTATTTAACGATGCCTCCTGAAATTAGAGAAGTTTTCTGCTCTAGCTTCTGTGGCAATATGGAAAGAGTGTGCTAGCAAATCCGCTCCCCGTTAATAAGGGAAGACATAATTTCATTAATATTTAGGAAGGTGGAGGTGTGTCTCGGAGACCACAGTAAGCAGTAAATCATACGACTTGCGGTGGTCACGAATTGCTTTGTTCCGAGAAAACAATAATTATTCCTTAATAAATACTTATCCAAGCGTGCAAGCAAATATAAACATGACTATAAAATATGCACCGAGAGATCAAGGCTCTCCCCAATTTATTTATATTAAAGGGGGTTCATTCTTAGTATGGCGGTGCGGTGCCTTCAAGTTTCTACCTAAAATGTCTATAAAAATCAACAAATTTCGAAATCAGACGTTTTTTGATTCGGAGTGAGGTTGATTTGTAATCTGAAGTGAAAGCTCTGAAGGGCTTATGCACACAAAACTTTCATGGCAGATAGTTATGCAACTATATAAATGGTACTATCTTAGGAAGTTGTATATGTTTATACTCGTTACCCGTAGAGTCCACCCGTATGAGCGCGGGGATCTCGTAAACTGTACATGCTAGAATGTGGGAATTGGTATGCAGATTCTTGGGGCTCTCTAGCGCCCACATTTTGATTGTCAATATTTATCCATAAAAATTGTCCAAATGGGACCAACCATTACCAAGTTAGTCGAGGCACTCGACTTGTACCTAAAACAACAATCTGTTGACAACTCAGAACAAATGTTTACAATCTATTGGCTATTTCTGTATGAAAAAAACTTTTTTTTTATATATTAATTTAGTAGTTTAAAAAATGTTTTCAATTTTTAATTGTAATAAGAGTGCTCTTTATTCTGTTTCGTGCTTTTGTATAATAAATCAAATGGATATTTAAAGAAAACTTTCTAAAAAACAGATTGTATAATTATTATATAAACATTTTTATTGGTGTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTGTCGGTCTCAAACATATTATCTTTTACTATTTGGAATATCAATTTTTGATTTTTAAGAATTTCGAATTAAATTTAATCGGATCACTGTAACATATAGCTGTCAAAAAAATGGTCAGGGAAATAATGAAATAATTTGTTTAACACCACTGAAGCCTGCATAATCCTTACAAATTTAACATGTTGTTACTAACGTCGATTACTTCTTATAACTGCAAGGGAATACAAACTTCGTCTTGTCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTATTGTGTTTATTACTTAACAATTTTATTTCTAGTTGATTTTGTTATTTTGAAGGTTTCAAAAATATATACAATGAGAACATTCATTAACAAATTATGAAAAAATTTTGTAAACGCCGATAGGTGGTGTTCTAGATATTGGACAAAGTTGCTTTGAATCTTGAATGTCCTTATCTACATTTTTCTAACTTCGGATAAGTTAATTTTGAATTTAAACATTTCACCTCGTTAAGAAGTGTTTATCGTTGATAATACAAATATAGGTGTTTATAGGATTTGCGTTCAGAATATCTGTTGTCGAACAATCCTGCGATGTTGTAGTATAATATTTTTAATATGCACTTCTTATTTAAGTAAGATTTAAACTCATGGCTCCCGATTCAAATCTCGAAAGCCCGTTCGAGGGGTTGGTTTAGCGCTGGATTTTTCCCTGTCTTGCTTTCCTGCTTGGAAGTGAGATAGTGCTCAAACGCCGGCTGGCCCAAGTTAGCTTGCTGCTTCGATATTAACGCCGTTAATCGTATATCTCGGCACGCACGGACGGCGAAATGAAGGTCAAACAGTTGTCGGCGCAACACACCCCCATAGCCAAACACCCTAGCCAGCTGGCCATCTCGGCTGCCCATCGAAATGTTAAGCAGGCGACGTACAAATTAAGTTCCTGTAAATTTCCGGCTTGCAGCAAGGTAAATTAAACAAAGGCAATTAATGTGATTCGTGATTCTGATGCTGACACGGCGATGGAGATACTTCCTCCAGGCGAGCTTTGCCACCTGCACTTGTGTGCTTCGATGAAGAGTTCCATGGCCCGCCCTGTAATAAAACAGCAATTTCGGAGAAGGTAGTGTGCGTGGATTTGCCAGGTAGATAGTAAATTGTATACAAATAA'..b'TCATAGGAAATATAAGCATAAATATAAATATATAAATATAATATATATATATATCCATGTCCGTCTTCATAGGAGTTATCGAAAATCTATCAGACAACAAATATATTCAGTGATTTACAATTTTCCAACTACAATATATATGGATTCTATAATTTCAATTTGATTTCCAAATTCTACAATATTAAATTCATGGTATGATTTTAGCAGCAAGAGCATATAAGCTGTGGCTCGCAGAGGGCAGCTTTTTTAATGGGTGGTATAGAACTCCATACACCAAGGCTCTTTAGACATTAACCGACTTTGTCTGGCATATGTATATATTTACATTGTCATAATAGTTGACGATTAAAATTAAGCATTTGTATAAAATACCAAAACTGGTTATCAATCGGATATTTCTGAATATCAATTTTTGTCCCTTATTTTGCCATATCGTATATTCGAACATGGCAAATTGATATTTTCGAAAATATAAGTATGGTATTGTTTATACCAGATTGAAATGCCAACATATCAAATTTGAAAGGAAATTATGGTAATTTTATTACCAGTATTTTTATACCCTTGCAAAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATATAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACTAGTCGTTCTAGCCATGTCCGTCTATCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACATTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGGAAAAATTGAAATTTCCTACGCTTGGAAATAATTTGTTTTAATTGGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTTCCATAGAAACGATCAGAAAATTAGTTGGAAAATATGAAAAAATTATATCTTGTCCTTTTTAACATATAACCTTCGAAGCTTGGGAATAACATTTTTTAAATTTTTAAGAATTTCGAATTCATTTTAATAAAAATCGGACTACTTAACATATAGATGTCAAGAAAATGTTCTAAAGAAAAGAAATAATTTATTTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATCTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTTTTATATCTGCAAGGGTGTACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTCTGTATCAAACTGATATGCTTTCATATTAAACTGATCATTTATATCAGATTCATATGTTTGTAACATCAATGTAATATCAATTTAAATTATTCAGTTTTTTTACTGTAAACAATAATTATGTATAACATCTTGCTTAAATTATTTGTTTTTGATATATTTCATCTCCGTTGCAAAACTCATTTTGCAGACTTATAAATGTATGTAAACTCATGCAGGTTTGCGTCAGTCCTTCTTAAGTTAGGCAATTATTACGTATATACAATCAAAAATGGGATAATAACCGTTTGCAAAATAAAAAAACAGTTCCAAATGTATCATTTTTACCGCGTGACCGCGGTAATTCAGTCAAAAAATGTGTCAAATACCATTAGTACACAAAAACTACGAAAGAACGGTAATACTTTTTTCAAACACTTTTCGATGCTACGGTTGAAAACATAACAAATTCATACGAGTTTAAAATAATATAATACGGATTCATATCAACATTTGTTATTGATATGATTTCGTATCATATTGATATGGATGCGTAACATTTTAATATAAAAAAAGTAATAAAAGTAGTTAATATATTTACCAGCCAATTGTACAATCAACGTTTTCCCAAGAAGGAATTAGATAAAAGAAGTGCAGGGAAAAGTATATTTCAAGGTTGCACACTTTATTTGCTTATCCCTTTTTAAAGAGTAGTCCTAACTAATTTCTTTCCACTTGTTACGTCGAATCTAGAATACCCTTTTACTCTACAAGAAAGTGATAATAAACGTTAACTGCGTCGCAATGCATTCTGGCTGAAACTATAATTAAGCAAAAACATTTCCTACACAGGGAAAATAAAATTCCAAAATGGTCATCAATCCGTTATTTTTGCATATCAATTTTGATCATATTTTCGAACATACAAATTGATATTCGAACATATCAACATGGTATTTTCATGCGCATACATCAAGTATTTTTAACACCAGTATGGTACTTTTCAATATACAATATTTCACAGAAAAGTGTCGAAGTATTAAATAAATAAGTAAGAATCAAATAAAATCAACAAAATACAATTGAATATGAGATACTTACCATTTGGAAAACATAATAAACAACACAAATGTCTAAATTTTTTATAAAAACTTTTCGTCTAATGTTAGAGTGACCGCGTCAATTCAATCAAAAAATATATTTAATACTAACTTAATATCATAAATATACAAAAACGACAAGGGCACGGTAACACTTTTTTTCGAAAACGATGTAACGTTTGATATGAAAAACACATTAAATTGATACGGGTTCATAACAATATAATACGGTTTCATATCAACACTTTTAATTTATATGAATTCGTATAATAATGATTTGTTTTCGTAACATTTTAATATGAAAAAAAGTGATATGGGAAAATTGAGGAGACAATATCAATCGGGTATTGTTCCGTTTTTTCCTCTGTGTAGGAAGGTAAAAATCTAGTGACGATCGCACCTACAGCAAACAAAAGTTCTGGTATCAGGGCTCAAGGCCTATGCTGCTTAAAATTTAATGGGAAAACGTTGGAGCAGTTTTCAGAAAAATCAAAAAAAAGTTTTGACCATATTTTTAAACTGGGGTATTTATTCAAATCATGTTAGGAAGGCCTACAAAGTATTTGGCAATACCTTTCACCGGTTACAAGTTTACAAGTTGCGGTTGAACAAAATACAAACTAACAAACAAACTAGCTTAAACATCATTTTGGGAGAAACGGACAAACTGACAAACAAAATACAATTTTTTATGTCCACCGGCCTCAACAGATCCAATTTTTTCAATTTTCACCGCACTTTCTCCCAAACCAATTGACATTTTTCTAATTTTTCGTGTGCACTCGCACACCTTGCACACTTCGTTACTACGTGGACTGCCGTCCGCAGTGATACCTTCTGCTTTTTGCTAAGCAAATCAATAAGTTTATTGGAGAGCGTTCCGTGAAACTCAGTTCACTTTCTTTCATAGTAAATATAAGAAGGCCATATGAGTTTGCCGTTTCTATTTTGCAGCTAAAGAGTATATGACACATTTCGACTCGTAGGTTATGGGGGTGCAAAAACGAAATGATACTTTGAATAGATTACACACATAATTTGTGTTCCTGTGGGAATCGGGCTTCGCCCAAGCGCTCCAATTAACAGCAAGCGGAAGGTCGTGCCGAGTCAGCCTTTGGGCCCTGTTAATTACAAGCAGCCATCTAATTAGCCAATGACGATGGAGCTGTGAACAGCAAGGGAGATTGGGTCTGCTTTTCGCATTGGGTCGGATGCTGAGGTTGGTTCAACGAACGAGTCGAGCTCCACCGAAATAAGCCGAACGGAAAAGAACAAAGCAGAGCAGAGCCGGACAGAGTACCCCGTCAGCGCAGTAATTAGGCGCAGACAAAGCAATGATGACGACAGCGAAACCGACAGAGAGCTTAATGCCCGCGCTCTTTCGATGTTAAATCTCGGATGATGCCAGCGCAGAAACAGTGGGAACGCGGGCAGGAACAGCGGAAACGGAATCGAAAGAAGAGCAAAGCAGCTGTGCGCGACAACCGCCAAAGCGCGACTTGATTGGTCGGTTGTCGCTTGTTACAGTCCTCATCTCTCTCTCCGCTCCTCTCCACTTCGCTCCGTGTCGCCACTCTACTCCTCCTCGCGTTTTCTCTCCTCCTCGTCGACTCTTCGCCGCACGCCCGCACCTG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCGCCCCAATCCTTTGTGGGTGTATTTGGTTCGCTGTTTGTGCTGCCCGACATGTGTGGGTGGCTGGGGTTGCCGCTGGCTGGGTGGGTGCTTCCAAGAGTACAGTTAATTGACGCCTTTCGAATAGCACCCCATTCGCGTTGTCACTGGCTGGGAATCGGCATACGTGATTCGTTGTCTCGACCCAACCCTGTCCAGAGAAGCGAAGGAGCACTCGCTTCGGCGAAGTCTTAATTACTGAGCCAACCAATTAAGCACTGACTCTTGCACACTCCAACGGTCTCACTCTCACGCTATCGCTCTCCGCCTGGCACTACATATGTAGTTGCCTCTTCCCCGCGCTCATCGCACACACAGAACAGAAGACTGAATTATGTGCGCACTGATACTGGGCCTCGTATATATGTACGTGGATGAGGCGGCTATGTGTGCTCTACGGGCGCTCGCATGGGAACCAATTAAACGAAAGTTCTGCCTGGTAAATACGTAGGTAAATAAGCAAGCTTGGGCATGTGCTCATTATGCATGAGTTAGACATGTCCCCACCTAATTGCTGTGTTCGCGCCCCGGCTAGCGCGCACCACCCACTGTCGGATGTTGGATGTGGGTTTCAAAATCCATCATCCCTCAATCAACCTTAGTTCCGCCTGCACCCCACCGAATGCCTTTCCCGGCCAAGGATAAAGGCAAATTTCAAGGAAAAGACGCAAAAATCGATAACGACGAACAACGAAATTAAAATAAAAAGGCTACGGAATCACAATAAACAACAAACGAGAATGGGAATTCTTCTCTCCGAAGATGTTGTTCATGTACGTGCTCGTGTGTGCTCATATACTTTGCCCATGTAACATTTACAAATCGAGCCGGCGTGCATGAGCGAGTGTGCCCCTGAGTAGTTGTGTGAGGGGAGAGTGTGTCTGCATGTGTGCATGCGAATGTAAATGAGCTGAGTGGGAGAACGTCTTGGGGCGGTGGTGTGGGTTTGTGCGCTCTCGAACGGGGGAGCTCGTTGCAAAGGCTTCCGTTTCTAACGAGCATTTGCAATGCAATTTAAGGCATTTAAAACCAGCCGATAAGAAAGGCAATTGCTGCAGAGTGCCACCAACACTCGAGCAGCTTAAGGGCGAGGGTGGCTCGTCCCAAAAGGAGAAACGAGTCTCAAATGAGAAAGGTGCGGAAACAAATAAAATGAAAAATATCCCCGAGCCCGAAATGTGTATAAAGAAAAACCGCTAGAGGAGCGAGTGGGACGGACTGAGAGAGAGCAGACGAAAAGAACAACAAGGCTCCTTAGAATACCAAGCTCGCGTAATTGTGTTCCTTAGCTCCCATCTCCTTCTCGCACCCCTCGCCCCAAGCCCCGAGTCCGTCCCAGGCGCTCCGGACCGGACCATAACCATGACCGCACTCGAACCCACACCCACTTCGAGGCTTTGCCTTGCTGCGTTGCCATGGGAGCTGACGACGACCTCAGTTAGAGAGGGCTGAAGTATGCAAAAAAGAGACACCATCCTCTGCTGGGCAGACGGGACTCCGGGAAACTGGCAGTGGAAAGCCAGCGCAGGCAGCGCAAGCAGCGCATTATGTATAAATTATTTATTTACATTTACATTATATTGGTACTCGCGCAATGCCTGTTGGCGGCGGAGGGGCGGTTGTGGGCGGTTGTGGGCGTACCGACGCTTCCCCTGGGACGGAGACGAACGACGGTCGCCACGGTGTCTCTGTCTCCTCAGGAAGGCCTCTGCCCCAGCGGGGGCGAGGACTGCCGCAAAGCTGGCTGCGTGAGCGCGCATACAATTACAACTAGCGAAGGAAAAGGGGTACGCGACAGAAACTCAGGCAACAGCAGGATGGAATGGAAATTATCACGGTGCCGAAAAGGAGCCCGAGCACAAAGCCGAGACCGAGCATTGTCCTCGGGAACCTGTTTTAAGTTTGCTGCTCTGATGCTCTGCTGCTCTGCCGCTCTTCTGCTCTGCTGTGCTGTTGTTGCGGTGGCGCAAGTTTCTCAAATGGCAAAACTGATTTTCTGCCAGACGGGCGACTAGTAGGGGGTGTTCGCAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGTGAGAGAGAGAGGGGGAGACGCCTTGGTAATAATAAAGTTCGGCTCTCTCCATCTCCCGCTCTTCGATGTGCTCGTCAGAATTAATTAAATTAAGAGTTTCTCTCTCGCGATTTCTCTCCCGCACTGCCGACCCTCCCATTGCTCCAGCGCCTTGTGTCGCATCTCTTTCTATCTCTCGAACGCTTACACTCACCTATGTGCATATAAATATGCGGGCGAAACCCATCTGCACGAGCAAGAGCGGGACGGTGTACGTTGGCAATGATTTAGTCGTTCTCATTGTTTTTTGCTTGTTTGGATAAATGAGATGGGATTGGTAGGGGTGGAGAGCTGATGCTGCTTTACTGCCTGATTTTTCCTTTCTCTCGCGCTTTTAAGCTCAGCTCCGCTCTCAATTATTTCAGCTCGGTTGTAGGTAACCCCAAACTAATCCCGAGCACAGTGCGCGTCAATGAATGTGGATGTGGATGTGGATGGGAGTGTGAACGCTCGGTAAAAAACAAACAAGCGTACCGAATAGGCGTGGCGTAAAAAATGGACCGATGCAGACTCTGACTTTGATTGCGACTCAGAAGAGCGCCGAGGACCTTGCGATACAAATCTGCATATCATATGTAATTGCCAGCCATTAAATGCGCTCCCAGCGCATGTGTACAAACACGTTCATAACTGTGCATGTATACACAGATGTGAGCCTGTTGGCTAAATCTTTGTGTTCGGGTCTTCGTATGCAAACATTATGCATGCAGCCCACAAACGCACATATCATCTTGCGTATGTGTGGGTATCCTCCCGCTCCCCTCACCGTTGGAAAACTTTTGGCTCACACAGAAAGTGGCATATAAATCGCACTCGTCCAAAGGCAGAGAGCATGTATGTGTGCGGCGTGTGAGCTGAACATTTCGCACACCACTGTGGTCTGCGACTGCCGCATAGCATCTTCTGATTGGTCGTTTAAATGTGCGCTGAGTGCTCCCGCAACCCCACCCCTGCCTTCCCCGCAGCTCCACCCCCGCGCCACATCTCGCCTGGTTGCTCTCCCCTCGGCGACTGCATTAATTACGATTGCCACATAAATACATACAGCAGCAGCGCTCCGAGTATTTTAATTGGTCGACCAGTTTTCGGAGTGGGGCTAGGTTGAAATAAGAGATTAAAAGACAGAATACTCGAGCTTGTCCTCCTTCTGAGACGTTACTCATGTACATATATCAATACGCGAGATGAAACTATAATATTTATATTACTTACTTATCTGTATTAATGGGAAACAGCGATAAGGCATAACAAACAATTACTTTATATATATAAATATTATAATTAAATTCTTATAAAATGGCTCCTTTTTGCAGAGTGGCTTTACTGTTTTCTGGGCATAAGGTTATTTGGATCTGGATCTTTTCTCAAGATCTATCCTAAAACCCATTAACGCACACAGAAACCTATATGTATAGTAAATTAACTATACTGGAAAATTGTAATTCTACTATAAACAAAAACGAAAGCTTTCTTTTGCAAGACGGAGGTTCTACACTTTTTTGGATAAGCCCATGTAAAGTCCATTAAAGTGATATTACAGAATCCGTATATGCATATACATGCACAGATTTCGATATAAACATGCATTTGTATGTATATAAAAAAAAGCAATTACAATGGGCATTTATATAAAAGACATATTAGTATTTGTTGCTGTAAAATATTTTGAAAATTGGGATTTGGCAGAGTAAGTTTATCACTTTAACGTCCACCCTAACCACTTTGCTGGCAAGTGAACAATTTCATTGATATCCCAAAACCGTGCTTGCATTATTTACATTTGAAAAAAACCTGTCTTAACGAGGTAAGGGGTCGTGGCGATCACGCACTGTCAACATACAAAACTACTG'..b'TTTTGTTTCAATAATTATTCAAGTAGTTCACAATAGCAAAACTCTAATTCTCGTAAACTTAATGGATTTCTTTTATATCTAAATTGAAATTAAAAACAAGAAAGGAAGTTAGCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATAGCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCCATAATTTTATTAAACTGAATTTGAAATTCTCAAAAATATAAAAATTTATACGAGGTGTGTTCAAAAAGTAAGGTGACTCTTCAAATTTCGCGGGCAACATATTTTTCATAATCGATTTTTTTGTTTTGTTATGTTGGTACACTCTTCCCTAACATCTGTACCAAGTTTCAATTGAATCCCCTTTTTTGTTTAGTTGTGAGAGGCGTAAAGGTAACAAGTTGTTTTGCGTGCTCAGCGATTTTGCTATCGAAAAATATGGATGAAAGGATTTGCATTAAATTTTGTGTAAAAAATAAAAATAAGTGCTCCGAAACACTTGAAATGTTGGCAGTGGCATACGGTAAAACTGTTCTGAGTAAAAAAAATGTTTACAAGTGGTACAAACTCTTCCAAGATGGCCGGGAAGATGCCAATGATGAGCCTCGCTCTGGACCCTCAAGCACGTCAACAACTGATGAAAATCGTCGAATCACTATTAGAGAAGTTGCTGAAGATGACGGTATATCGCTTGGCTCCTGCCATGAAATTTTTTCAAACGTTTTGGGCATGAGTCGTGTGTCAGCGAAGTTTGTTCCAAAATTGCTGAGTTTTGACCAAAAGAACCGTCGCATGAGCATCGCTAAAGAGCTGTTGGATGACGTCAACGACGACCCAGATTTACTCAAAAAGTCATAACTGATGAAGAATTATGGGTATATGGTTATGATATCGAAACCAAAGCCCAATCGTCACAATGGTGAGCCAAGACCGAAAAAAGTTCGATCAAATGTCAATGTTTTGATCACTGTATTCTTCGATTACCATGGCGTGGTGCGTCAGGAGTTCTTACCATATGGTCGTACGGCCAATAAACAGTATCATCTGGAAGTTATGCGCCGAGGGGGATTACTTTGAAGAGGACAACATTAATATTGATAAATAAATTAATAGTTTTTCTTGAAAATACAAAGTCACCTTACTTTTTGAACACACCTCGTATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAATAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGGTCCTATGACAGCTATATGAAAAAGTCGTCCGATTAAATTAATTAATGAATGAAATGAATTAAATTCGAAACTAATTATACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGAAGTTATAAGAAAAAATCAACTTTAGTAACATTATGTGAAATTTTTAAGGATTGTTACTGACTTCAGTGATATTGAAAATAAATTATTTCATTCTTTTTTTAGACCATTGTTTTGACATCTATATGTTAGAGTAGTCCGCTTTTTATTAAATTGAACTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATGATATTTCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATTATTTGTTTCATATTATTTTCCCACCAAATTTCCGATCGTTCCTATAACAGCTATATGATATAGTTGTCCGATTTTAATAAAATTTTATTCGAAATTCAGAAATAAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAAAAGGTTATACGTTAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTTAATTTTTTATCCGTTATTTCCTATGGCAACCATATCATATAGCTGCCATAGAAACGATCGATAAATTGGTGGAAAAATAATTAGAAGCAAAACAGGAAGTTAGCTTCGGCAAGCCGGAGTTTGTATACCCTTGCAGTGACATCAGTGCAGTGGTTTCAGTGAGATTAAAAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGTAAGCCGAAGTTTATATACCCTTGTAGTTGTAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTTAATTCGAAATTATTAAAAATATAAAAATATTAATTTATATACTAATATGTTAAAAAGCCCCAAAGCTACAATTTGTTTCATATTACTTCCCATCAATTATCCGTTCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTCAAAACCCAATAAAAAATGTTATTTCCAATCGTAGAAGGTTATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATCAAATTTAATTCGAAATTCAGAAATAAAAATATGGTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATACGTTAAAAAAAAACCGTAGATATAATTTTTTATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATACACTGCGTTGCAAATTTCTGACTGAAATCATTATACCTTCTGCAAGGGTATTAAAATTATATCTTTGGTGTTCTTCGACATATTGTCTTATAGTATTGCGAATATAATTTTTATATTTCCTTCGAATTTCGAATTAAACAATCGGACGACTTAAACATATAGCTGCCAAAGAAACGGTCCGAGAAATAACGAAAACAATTTTTTTTAACATGTCTGAAGCCAGCAACAATCTTTAAAAATGTAACATGCTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAATTACAAGGGTATACAAACTTCGGCTTTTGGAAGTTGGCTTGAATAAATGCATGAATTTGACCGTGTCGCATAAATAAATTTTATTTCACTCTTTTAAATAATAATAAAGTCCATAGCAAAAACGTAGTAATACTGTGATAATAGGAGATATAATTATGTTCAATAACAACAACAAAATGTTGATTTGGTACCTAAGTTTATTACAAGTTCCTTAGATACATAAAAGACCCGTTGGGAATTATAAAGAAAGTATTGTATGTTTATTATTTATTTGTATTACCATCCATGTATGTAAACTTAATAATAAAATGCTTGCCGTAAGGCATAAATATATATATATATATATAATTCGAAGCTGAAACCGATAACAATTCATATCAAAATCGAGGTCGTATCGATGTTTAAACCGAAAGAACAACATATCGACAGCGCACTTTCTCAAAGGCCATTCGCAAACCGAGAAGACTTCGATCTCGACTTCGAGAACTTGAGTATGAATATTCTAGCTGACTTTTCTAGCTCTTTTAGTTTCCAAGATGTCAGCGTTGAAGAATATATATACTTTATGGAGTCGGAAACGCTTCCTTCTATCCAAGTTTGGTTCGCGAGTCGCTTTTGCAACCGGGCCATTTACATTCCTGAAAAGAAAGAACAAGAATTATTCTATAAGCTAAAGGTGCAATGGAAAAACGAGCTGATCGCGCTTAGACCTGGTCCTGGTTTCAGTACGTCAAGAGTTGTTTGCATACCAACTCAACTGTAACCTTAACTGAAAGCACAGCCGAATCCAAAGTCGAAGCCAAAGATTGTAGTCGAACTCGCAGGCAGAATCAAAACGAAACACCACCGGGCTGGGCCGCGCCGCATGCCACTCGATGGTGGTGCCTGATATATCACGGAATTTGTATGTGGGTGTACTGGCTACATAAGCATAAGCCAAAGGCTGCGAAGGCGACTGAGTGAAACCAGTTGAGGAATATGAAGAACAGATAACGACGACTCCAGAGAAATAAAGACATACAACAAAAAGGCACGCGCGAATAGTCCGAACGAATCAAAGAAGGGACGGATGCGGATCGGGGGTGTGGGGATGGCAGCAGGAAAACCTTGACTTCCTTTGTTTTGTGCAAAGCCAAAAGCCAGTGAACTTTTCTATTAATGCCTACACCATTCAAAACGAGACAATAATTTTGTATGGTAAGCATATAAGTTGTGACGGGACAGCAAAATCCTCTTCACGCAAAACGGCCGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTAAAAATAGGTTGCTTAGGTTTGCAGTGCAAACTATAAAATCATAAAATTACTGTGTAGCCAAATTCTGTTAAATATGGCCTCGACCATCTGATACCCGTTACTCAGCCGGGTTAAGGGAGAGAGAGTGAGAATGCCACCAGCAAAGCAACAACTTTTAGAATTGCACACTGCTACAACTGCACTTAAAGAAAATAACCACAAATTTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTAAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCTAAAAGTATATATATTCTTGTTCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCGTGTAAGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGAAAACTAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAATATTATTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCGTGTTTTTTAACATTTAACCTCCTACGCTCGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATATTGAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCCGAAAATTGGTGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGTTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATAGGGAGAATATACATTTTTATATTTTTGAGAATTTTGAATTAAATTTAATAAAATTATTGATTTTTTTTTATAATTGCAAGGGTATACAAACTTCTGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCTTAAAATAAAATACGCTTTTTCCTAGTGACATCTTATAATAATAAGAAAACACAAAGACGGCGATGTAATGTAGAAGGTTCTTGTTTGATCTCTTATTTATCAACTTTTTTTCTATCCTCTACTTAAGCTCGTGGCTTATTTTGTTAAGGCCAATTGGAACTGATATAATTACTGCTATTTAACTGTAAGTTACAAATTAGAATTATGAAAACCAAATAATTAACCATTCTAAGAAAAGCATCAAATTCGCTAACGGTTTCCAACACCCAGAAAAGTTAAGAACAAAAACAAGAAAGGATGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTCGCAGTTATAAGAAATAATCAATTTTAGTAAATAAATTTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTCCTGTCTATATAATATAGTCATGCGATTTTGATAAAATCTAACTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTGAGAAGGTTATATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTATATATTATTTTACCACCAATTTTCAGATCGTTCTGACTGAGATAACCATACCCTCTGCAAGGGTATAACAAGAAAGAACGCTATAGTCGACTTCGACGGGCGGTTGGTGGGTGTTAAAGCGGCTAGTGATCCTAATCAAGAATACATATATCTGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTTCTTCTCAGTTTGAAAAAAACGTAGAAAATTGAGAGCATGAGGAGTTAAAGACGGGATGTCCTAATATTATCGGCTGTTATCGAAGTGAGCCTCTAATTATTTTTTCGTTTTGTTAGATGAATGTAAATGGAATAAAAACCGTATATACATTTTTAAAGCCGTCAAAACGAATATCTTCTTTTCCCCTTTGCTCCCTTAAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGACGCACTTAACTATAGCATTATTCCTCGTTTTTGTTGACAATTGTTCATTATTGTTCAAGAATTGATTCAAGTAGCTGGCCAACGGTAACATCTGGTGTTTTCTTGGGTTTTAGGTTTATAATATGCATAATTAAAATTGTTTCTTGTTACTCTTCCTATAATGAATATATATTGATTAATATTATTTTAACAATTTATTTTTACTGTCATGGCACCAGGAGAGTTTGAGATGGCGATTTCTGTAAATGTATACCCGGAGAATTAAAAATCTGATTTGATAGTGATATGAAAGGTAACGCAAAACTAAGAATATGGCTCATTAACCCTTAAGAAATTTTATTTAGTTTTTGAGAAAGAACAGTAAAAGTATTACATCCTTACGAGCTTATTTAGAGCTGATAAGTAATCAAAGTTTCGGACCATCGATGTTTTTGAACGTAAACATCGATGAAACATCGATCTTTTCAGTTAAAGCATAAAATCAACAGTCAACATGTTTATTTATAGAGATCATGTGGTTTGTTCTTGTTATAAAACAAGACCCTATCAACGATATTTGATTTTTAAGCAGATATCCTGTCGGATTCAATCTGGTTGCATATCGACATATTGCTTTCTCTGTACTTCTTGAAGATCTCTTTCAAACCAGCGACGTTTTCTTCTGGGGTTTTGTTCTATGCTGTATTTTACTCTTCTTATCTCTTTATCGCTAGATAATGTTATTAAAATAGTAAAACAACAACAACAAACTTAATGGGTACATAAAAATTGCCGACACTTTAATGTTTTTGCATACTCGTGAATACACTTTAACTTGTATTTAGAATTTGACAAAACTGAAATATGCGTGACAAAAACTAATTTTACTTACACTTTGTCCTTAATAAAGACATATTAAAAACTATCGATAGTGGCCAAAGAAACATCGGTGCATAAAAAATGCATGAAACGTCGATGGTATCGATAGTGGCATCGATTGTATTCCAGCTTTGAGGCAAAGCGTCGCGACGATCATGCTCAACAGTATATATAGGTTTTAGTGAATAAAAATGCTTGTACATTTCATTAAATATAATTATTTCTAAAAAAAAAAGATTAAAACGTTGCCCCCCTCATTTTTTTTGGATAGGAAAACATTGTAACTGAAATGGAAGGGTATCGTCAATAGCTATCGCTATTGACGGTTGCCAAAAAGTCATAGAAAAAGGTATAGATCTTTTAAAGACAATTCAATTATTTCCATAATACATAATTAAAACTTAGTTGTTCAAAACCGGTAAAAGTGGATGTCTTTGTTGTATAATAACTTACAAAAGTGATATTCTTAACAATATGTTAACTATGCCAAATGTTGATAAATCTTTAAAGCTACTTGCGGCCTTTCATCTTAATTGAAACATTTCTCTCAAGCTTTTTGAATTTTAAGAAGCTAGCTTCGGCGAGATTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAAATCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAAAGCTATTTCCAAGAGTAAACTATAATTTGTTTCATATTATTTTTCCACCAATTTTTCGAACGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCATCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTTAAAAACAATTAAAATTTGTTATATGTTCTTATGGGACCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCTATAGGCTATAAGATATAGCCTATAAGATAAGATATAACACCTGCAATAGAAAGTAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCTGGTAGCTTTAAAACTGAGAGTCTAGAAACGGACAGACAGACTGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGATTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGAGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTTAAATCATTATACCCTTTGCAAGGGTATTAAAATCGATGCTTTCCTTTTAGTTTTGCGATATATCTCGGTTGGTGTATACTACCCCAGTCGAAGCAGAGCAGATGTTTAATTGTGCAGCTATACGGTAGTTGCCTTCGCACACTCTCCCAGTGCGCTGCCAGAATAAAAATTTACACAGAAATGAACTGTTTTTATGCCCATAGATTGACCACCCCCACTCTAACGACCAAAAAATGCAACATGCTGTATAAGCCGCTAGGTGGCCTCGCATTCTTGAAAAAACGTCGGAAACGTCACGAGGCATTTGACTACAGCGTTCTAAT'..b'CAGTAAAGAAAATTAGTGCATGTAATATTGGCGGGCAATAGTTTTTCAACGCTGTATATTAATTCTATTTTCTCATAAGTCTGCGATTAACGCTCTATGGCGAAGCCCGTATGCGTAAGGTACATTTTTGGGCAGTTTTTACGCATATTCCATTTTTATAGCGGTCATCCTAACATTTTAGATTAATTTTTATTAATTAAGTTGAGTAACGGGTATATAAGAGTCGAGACACTCTCGCTTTTTCGTTTTGCTTATCAATACGAAATCCGCGGCCGCATTGTTGAAGCTAGAGAGTATTTCTATAATCAAGCCCTTATGAAGCCCATATTTGATTCAGCCGATTGCCACGCCCATTCTGACGTCCACAAATCGCTCACGTTTGAGGCGAACAACTTTTTGAATTTTTTAACATTTATTTTATTTGTCAATATCTATCGACGTTTCGAATGTGGAGTCAATAAGTAAAGGCTGAGGAACGGGAATATTGTACTTTCTCTGTCAATTGTAGTGATAAGGATCAATAGCAGAGCCAATCTTGCGATGTCCAGTCTGACTGCTTGAAAGCTGTGATCTTGGAACTATAATTAAGTTTATTTTTCAGATTTCGATTTCTTAGCTTTCTAAGCAACTCAAGTTTGTATACGATTGTACAAAATGAGGAATGCGTAAATGAAAAGTAAATAAAAACGTAAACATCGAAACACCGCCTCTACTTGAAGGTATATTTATTTCGAGTTAATCGACCATTAGAGGTTTCTCTTGTTTTAATTTGTATCACATAAATTTGGTCTAAAACTTCAATATTCGAAAGGTTTTTGGATCTTTAGGCAACAATAATAGACATAGAAATTAGTCGAAATACGAAAACATGTTGCTAGGATCTATAGTATGCGTCACAATTTATTCAGAGCTGCAACGTAATTAATTCCTTTACATCTTACTATAATTCGTGTTTTCACCAACATTTTCAACATTTCAGATGTTACATTCGAGACTGGTTTTAACATGTCGACTACTGTGACCAACGAAGCCACTCCGGATACCAGCTATGCTGCGGCGTCATCTGCGGCATGCGTCTCTGCAGTTCCTGATGTCAGTATATTTTCACCGAGTTCTCCCTCCAGTTGCGCGACACCGGGTGTCAAGTCTTTGGGTCACCATGCATCTCCAGGCCTAAATAACTTTGTTTCGGGTACCCCTGTTCCAACTACAGTATTCAAGTGCAATCTCTGCGAATACTTCGTTCAATCAAAAACCGACATGGCGTCTCATATTGAGACTGATCACCCATCTGCTGAGAGTGATGACTTTATAAGTATACCAACCAACACGGCCGCTCTGCAGGCTTTCCAAACAGCTGTTGCAGCAGCTGCTTTGGCTGCGGTGCAACATCGGTGTGCCGCTATTAATGCTCCGACACAGGAGAGCGGTCAAGCAGACAAGGACTTGGTCGCGAATGACAGTGACGGCCCAATAGCTATTAAACGGGAGCGTCTTGAAGAAGAGGATGATCCCATGACAGGTATAGAGGATACCAAAGAGGTTACCCACCAGGCAACATCTTCTTCAACTTCAGAGTCGCCAAAAGTCCTGGAAACTCAAGTCGGGGTACAGTGTCCCCTGTGCCTAGAAAACCATTTTCGGGAAAAGATATACCTAGAGGCCCATTTGACAAACGTTCACAGCGTTACCAAAGATGGTCTTTCTCGGCTCTTGCTGCTAGTGGATCAGAAAGCCTGGACAAATGAAAGCGAGATCACTGATGTACCAAGCATAGCACCTCAAGCTCCTTACCCTAATACCGAGAAGGAAGAGGCAGCACCGTCACCTAGTGAGAGCCCCTCCAGTGCCAACGCAATTAAGTGCACTACAGCAAATAACTCAAGCCTTCCAGTGGGAATGCAAGGACTTTCCTGCCAGCAGTGTGAGGCAAGCTTTAAGCACGAGGAACAGCTGCTTCAGCATGCGCAACAGAACCAACATTTCTCTTCACAAAATGGAGAGTATTTGTGTCTTGCAGCAAGCCACATAAGTCGTCCGTGTCATATGACTTTTAGAACCATCTCAGCTATGATCACCCACTTCCAAGACTCACACATGAGCCTAGTTATCTCCGAGCGCCATGTCTATAAGTATCGATGCAAACAGTGTTCATTGGCGTTCAAAACTCAAGAAAAGCTTACCACGCACATGCTCTACCACACAATGCGGGATGCCACAAAATGCTCTATTTGTCAACGCAACTTTCGCAGTACGCAGGCGCTTCAGAAGCACATGGAACAGGCGCACTCAGAAGATAGAGCTCCATCAGGCAGGTCAAGCAGTCCACAGATGCCAACATTGAGTTCTGAGGAAGCACACAAGCTTCCTCTAGAGGAGACACATGCGTCAGAAAGAGGTATAAATATTTCTAACAACATTTTGGAACTCCATTAAATCAACCTTTGTTGATTTGTTTCAGAAGTTACCGGTAAAAATGTGTCACCGCTTCGATTGGACTCGCAACAGAACAAGGAAGTAAGGCTTTCAACACCTAGCCCAATGTCTGTGGATTCTCAGGCCCAACAGCAATACCTGGCTACCTTTGCAGCTCTGCTCAAGCAGCAGCAGGGTAACTCAGAAACTGTTGGCCTCCATTCCGAAGCGTTGTCCCTATCTGGAGAGTTTTCCCAACATCTGCAGGTATGGCTGTTTCAAGGAACTTTTACCAGTAAAGGTCATGACACTAATAAATATTTATTTCAGGGTCTGCAAAATCTGCACAACCTTCAGAATATGCAACAGCAGTTCGGCGCCGTTGCTGCTGCATCGGGACTACCGATAAATCCGGTAGATATGCTTAATCTAATGCAATTTCATCACCTGATGTCCCTGAACTTCATGAACCTGGCTCCCCCTTTGGTATTCGGTGGCGGTGCCGCCGGAAGCAATGCAGATCCCGCGTCATCAGCCCAAAATAACATCATTACCTCGTCCTCCATAGCAGCTTCTTCAGGGCTTGCTGATGTTCAGCTCACCAGTGGGGTAAACGCTTTGCCGGTAGACTCTTCTAAAGCTACTTTAGCTCAACCTCAGCACAACGTCAACTCGAACAATCAGGTACTTTATTGAGAGTAGATAATTTTAACATATATCTACATAGAAATGTCAATCTGCCTTAGAAAATAGAATTTTAAATACATCTGATTAAATCACAATTTGTATCATTATTGTCACATGTTTTAAGCATTCCGTAATCCGTACATAGCTAGCAGATAATCATAAAACATTTTAAGAAACACGTCTATTATCTTAATTTTAAAGTCTTAGCCTTCTCATTTTATAATCTTTTTAATTTTAACAGCTGGCCAGCAACCAAAAGCGAGCACGCACGCGAATCACAGATGATCAGTTAAAGATTTTACGAGCACATTTCGACATAAATAACTCCCCCAGCGAAGAGAGCATTATGGAAATGTCACAGAAAGCAAATCTACCAATGAAAGTAAGACCTCGAAAGCTATCAATAAAACACTGATAACAACATTCCTTATTGCAGGTGGTTAAACACTGGTTCCGAAACACGCTGTTTAAGGAAAGACAACGCAATAAAGACTCTCCCTACAATTTTAATAATCCACCGTCGACTACTCTTAATTTGGAAGAGTATGAACGTACAGGTCAGGCCAAAGTTACACCTTTAAATGATGCCAGTAGCGTCTCATTATCAGCGGCAATGACCACATCAACGATTTCATCGGCACCATCTACAAACACCAATTTAAGTTCTATAGAAACGGCAACTACAAGAGTAAACACTGTTGGAAAATCAATGCAAACAGCGCCTGTCTTATTCCCTGCTACCGTCCCAATCTCAACACCTGTATCTCGCCCAGAATCAACAAACTCGAGCGGCAATGTATCCGATTATTTAAGTAACAACTTGTTTTTTGGACAGCACGGGGGCAAGGAGCAGGGACTGCTATATCCT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/271/b04/ef/scaffold_30-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTGGAAGGACAAATAAAGTCAGAGCCTCAGGACGATATGATTGGCTCAAATGATTTTGCATTCCAGACAAAGCAGCACTCAAACTTTAGCTTTATAAAGCAGCAACACGAACTTTTGGATCCCCATGAACAATCCATTACGACTCAAGACACGGATATGTCGCAGGACCAATCCTTACTTGCCGGCTCTTCGCTTTCGGCTCACTGTCAAGGTCAACAGCAAACAAATATTTTTGAAACAAAATCGGAAAGTGAAAGCTCCGACGTAATATCGCGCCCTCCTACTCCAAACAGTGGAGCTGCAGGAAGTCTTTACGGCACCATGAATGATTTAATAAATCAGCAATTGGAAAACATGGGCAGTAACATGGGGCCACCAAAAAAGCTCCAGATTGTTGGAAAAACATATGACAAGACTTCAACGCCAATTTCAAGCTCGATCAGTGCTAGCACCCAGTTTGAAAGTAACTCTTCGAACTCGTCAAGTTCCTCATCATCGACATCGGGTGGAAAGCGGGCTAATCGCACACGTTTCACAGACTATCAAATAAAGGTTTTACAGGAGTTTTTCGAGAATAATTCATACCCAAAAGACAGTGATCTCGAGTATTTAAGTAAGCTTTTGTTGCTCTCTCCTCGAGTTATAGTAGTTTGGTTTCAAAATGCCAGACAAAAGCAGCGTAAGATTTACGAAAACCAGCCGAACAATTCGTTGTTTGAAAATGAGGAGACAAAAAAACAAAACATTAACTATGCGTGCAAAAAGTGTAGTTTGGTGTTTCAACGTTACTACGAGTTAATACGTCATCAGAAAAATCACTGCTTTAAGGAGGAGAATAACAAAAAGTCAGCTAAGGCTCAAATCGCTGCTGCTCAAATAGCACAGAATTTAAGCTCAGAAGATTCAAATTCCTCCATGGATATACACCATGTTGGCATATGTCCACCAGGATCAACAGTAGTTGCTCAAGCCTTGGCAACGGTTGGTTCTGCAGCTCCATTGGCGGGACAGTACGCACAGCAATCATTTGGCGCTTTACCCTCACCACAGCATTTATTCATCAAATCTTCTTCTCTAACTGACTTCAGCCCATCCACGACCCCCACGCCCCCCCAACGAGAACGCAGCAACAGTTTGGACCAACCACAACGGTCTCACAAGTTTGACTGTGATAAATGCGACATGCAATTTAACCAATTGGAGAAATTGCGAGAGCATCAACTATTGCACGCAATGAATCCAGCAACAAATTTTTCAGACGCAGGACAGAACTCTAATTCTGATGGAAACTTCGGTCCGTTCGGCTGCATACTGCAAAGCTTACAACAAGCAGCAGCTCAACAGACACAGAACCAACCACCACCAACAAAAAAACGGAAATACTCGGATAGCTCTTCAAATGCAGATGAAATGCCGAATTTATCGGAACCTGAGGCTGCACATAAGAAACATGAATTCCTTTATAATTATTATATGCAAAATGAAACGAACACAGAACTGAAAAAACAGTTTCTTATGCGACAACAACATAAGAAAGCACAGCAGATTCAACCTCAAGAACAAGGAAATGAGTCTGATTTGGAAATGGAATTCTTGACTAATTTTTATCAGCAGAACGAAGCGAAGAAGGTTAGTAATTACGACTTTTTACTGCAGTACTATCGGACACAGGAAGAGGCATCCCTGAAGTCAAAATCAAAGCAACAGCACCTCTTTAGCTCCAGTAAAAAGCCAACTAGCGAGTTTCTATTGCAGTACTATCAACTGAACGAGTCAAAAAAGTTTTTTCAGTTAGTTGCCTCGCCCCAAACAACGCCTGATGGCCCAGGCTACAACCCGTCATCGCAGATGCCAAAACCCACGACAGATGAAGTTAGTAATGACATCGGCGAAAGATCATTGGAGCAGGCAACAGAAACACAAAAAGAAGAACAAGGAGAAATATTCAGCGAAGACAGGCCACGCGAGGAAAATGCTTTATCCTTAGGCAAAAGTGTAATGGAAAAGTTTAGCAACAACAACATTAACATTAACTTAGTTCAAGCTGACCCAACCGAGACGAACGGTAGTCAATCTGTTGAAACAAGACAAGAGTTGTTAATGGCACCTTCAATAATTGCAGTCAATGATGATAACCAATATTTGGGCTCAAGATCGTTACAAAAAGAAGACAAGGAAAAGTCACAGTATTTTCATAATCTTGAAGACTTCCTGGATGCCACCATGATAGAGAACAACTCCCAGACCTTGACTTTTAATGATGATGAGAAAGCTGGCCAAAAGGACGAATCGGTTCACAAAGCCAAAGAGATGGAAAAACGGTCTTCTGTGTCTCCGGTTAATGTTGCATCCAAACAAAACAAGCGGCTACGTACAACCATACTTCCGGAGCAACTGAACTTTTTGTATGAATGCTATCAATCCGAGTCAAATCCAAGCCGAAAAATGCTTGAAGAGATATCTAAGAAAGTAAATCTGAAGAAACGTGTAGTGCAAGTAAGTATTAAATATATAAATTGGAAAATATTGGATATATTTTATTAGATTTTAAAACCAGGCAGGGTAAAGAGTATAAGATCAACATTTTATCCAATAAAAGATCTCTGATTATATATAATAAATACATATATTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATAATTTCAGTCAAAAGTTTGCGACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAATATATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCCCTCTGTCCGTCCATTTGTACGCCAACTAGTCTCTCAGATTTTAAAGCCATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCCGATAGAAGTGGTGTTTTTTATTATATACCATCCTTAGCTTGGAAATAACTTTTTTTAATTAGTTCTGGATTTGAATTAAATTGTATTTAAATCAGACGATTATATCACAGAGCTGTCATACGAACGTTTGCAAAATTGGTGGCAATCCTTGCAGTTATAAGAAATAAATTTTTCAACTTTTTTTCCTATGACAGATAAATGATATAGTCGTCCAATCTTATTAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTGTTTCCAAGCTAAGAAGGTTATTTGTCAAAAATCAATCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTGATAAAATTTAATTGGTAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATTTTAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGCAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATTTATAATTTTAAAAATAAAAAATTTATTTTCCCAAAAAGCCCCAAAGCTATATTTTGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATGACAGCTAAATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAAATCGAAATTCAGAACTAAATAAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTAAATGTTAGAAAACACCAAAGATATATATTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGTGCTGTAAGATATAGTTGTCCAATCCGGCTGGTTACGACTACCTGCAATAAAAAAAAACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCCATAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGATCAAGATGATCAAGAATATATGTACTTTATGGAGTCAGATACGTTTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATTAAAATCGTAAACACACTAAATTGGTTCAACTTTATATAAAACTTTTTGTCGATAAAAGTGCAAACCCTTTTAGTTGAGTAGGAATATAAGCATTTAAAAGTTTGTCATT'..b'TTATTTTATTGAAATCTACTTACTATCGAGTTGTGTTTTTATTGTTATTCAGTTTTAGTTATAATTTGACTTTGGTTTGGACTGTTAAGACCACAACATTTTCAGTTGGAGTAGAGTAACGAAATCGTTTATAATAATTTATCGATCGGTGAAAGCTAAATAAGTAACTCTTATTTTATTAGTTATAGGTGGAAAGTAATTGGATTGCGTATATGGCCTTATAAACGTGGAAAGTGGTTTAACGTAGGTAAGCAGTTTCGCTGAAATTTATTTTCACACTCTAAACATTTTTTACCTTACAGACTGCGAATGGAAAATTATTGCATTATGAGATGCAATAAAATGTACACGAAAAAAAACACAAGCCTAAACTAACCATACTACGAAAACTAAAAAGTTCCTATTTTACAGAAATTTATAAAAACATTGACATTCCATGAACCAAATGAATATAGAAAGATGTATTCAAATTCTTGTGAAAAAATATTTCAACATTAGTAAGAATTTCTTAACTATACGGAAGTGTTCCTAACTATTCAAAATATAAATTAGTTGTAATCTTAAAGTATACACGAATGAGGCAATCCAAAAGAATTGGAAATGAAGAGCTAAGTCTTGATAAGTCGAAGAGACAAGGCAGCTCCATAGATACATATATAACGAACTAGATTTAATGAAACGTAAACTGAGTTCCTAGCAGTTGATTGCTTTATGCCTTTGTTTTTTATATTAGAATGTAATGGACTATATTGAGATCTGATTTGGCATGCAAATCTCCTAAAATCATTTTAAAAGCTGAAGACATGCGTGGTTCCTACTAAATATTCGGTAACTGTACACGATAAAACAACCGCTTTTGATTAATATTATTATGTCAAAATTATGCTGAAAGTAAATGTGCCAATGTTTTACTTTGCAATGCATGCTTATAGCATAGAAGAACATTGTATCTCAAAAGCTATATTGTACTCGATTTCCATATTAATAGCGGTTCATTCCATTTCAAAAGGGAAGATAAAGTAAACGGTTTAAAGGAAAACATTAGTTTTTACTGTTTGTTTGAACCTATAAGATAGTTTCGTTGTTAAACATTTGTTACCGCGTATTAAATTATTTTCTTACTCAACAAAGTTTATTTGTTTTTTCTAAATATGTTTTCTTTAAACTTTCCATTTATGCTTTAGACAAAAAACAATAAATGTATACTTCTAGGGGAGAGCCAGAAGTTACTATTTTACAATTGCACTATTTTTTTATAAAAGCTTTTAAAACAAATTTTTGAATGTAAAGAAAAATCGAATCTTATTATTGTACCGTTATTTAAATTTATAATTTAAAAATTTCCCTGCCATTAATATTTTAAAAAAGGATGCAACAATAAAACGAAGGAAATAGTATTAAAATATTTCCTTTTTTAACCAATTTAAAATTACACACATTTAGATTTATTCAATTTCATTCCGCATCACGTACATTTATTCGTACTCGTATATGATTAAGTGTATTGTTAACTGCAAATAAATATAGATATGTTGCGAGACATAAGAAAAATGTAATAAAAAGTTCCTATAGACTTAAATAAAAAGATATACAAATATATTTACTTGTAAGTTTGGAAATAACTATAAATGACATTATTTTCTGTTTATCTAATTTTAAATTTATGTTAGTCAATTTATAAAAAAAAATCAACATATGTCCATATTAACGTTAGAATATTTAATAAAAAAAACGATAAGTGTTTAAAATCCATTAATCATTTTATAAAATAATTATTTTCATACCTACGTACTTAAGCATTCATAATTGCCAACAACCACAGATTTACATGTATGGACATAAAAGCAGAATTACACTGACATAAAAAATGAAACTAGATCCTCGCAATTATACACATGTATTTGTTAAAAAAATAAACGAAAGTACCGTGCGACCCTACACAGACACACAGAATAATATGAGATTTTAAAGGGGATAACAGTACTTTCATTGCTCAATTGATAACCCTCATGCATGCATATGTGTGTATGTATAAATATATAACATATCACCATATACATAACTAGATTAAACTCCACAAAGGTTCGTCTGTTTGATTATGTCTATATTACTTTTTTAAACGAAATTTTGTTGAATTGATTTAACTTTTTATTATTATTGGGCGTGACAAAAAAATAATTTTGGCCGAAATCCGGGAATTCAAATTACCAACAGTAATTCAAATTCTACCAAAATCTTCTAGAGAAGATTTTTGTGTTGCACCTGAGTTTTATGTTATTATTATTTTTTAATTATTTGGTTTCATCCGAGCGTTTTCAGTTGTCATATATATTTTGTTTGTTAATAAAAATACTGGACAGATTTATGGAAATCATATTCTTACGTATGTAGAACTATGCAAATAATAAATGGATTCGAACTATATTCATGCTATACAAATACTTCATACATTGAGTATAAGTAAACTTTAACGTACAAGTAAGTTTGATGTCAACATATGTATTAATCAGAGTTACTACGAATATGGTGTAAAACTTGCAAAAAAGGAAGTAAAAAATAAATATTTATAAAGTTCCTATATATTTAATAATTGGCAAAAGATGTGCATATATTATAAAATTATACCTTAATAAAGATATGAGCAAGAAGCAATTGTGTTTTGTTCCACGACAGCTGGTGAATTTTTAACGATTACTGAGGGGGTTATATAAGACCATAAATAAAAGTTATTTGTGTATTTTATTTTAAATGGACTACATCTAATTTAAATGTCAAAAGTAGCAGCCTTCTTTTTCTTGTCGGAGCTGCAGTTTTAAAAAAATTGTGGGTCTCATAGTAGGCGTGGCAACTCAGGAATCTGCATACCAAGTCCCATTGAGATCTCGGCTACCTATGCGTTCGGAAACGCTAGTCTCTCATAATAAAAAAGAGAATGAAACTTTTCCAATAATCGTAATAAGTATTTATAAAACTACAGAGTAAGAAACTTATAAGAGACACCATTTGCTCTGACGCTCTCTTTGGAGACTTTGCCAAAGATGCCACCCAGGTGACAAGAGCCAATTTCCCTAGTTTTTTTTTAATATCCCAAGTAGCCTTCTAATTTATTGCCGCGGTGAGTTTCATGAGATATTATATATCTCAGCTGGTATCAATCAATGTTTTGTTTTTGTATTAGATCTTCACCACTATGGCCATACAGTAAGAAACTTATAGAGCCACCATTTGCTTTGCCGTTCTCTTTGGAGACTTTGTCAATGCCACCCAGGCGAAAAGAACAAATTTCCATAGTTTTTTAAATATTGGTCCCACTTGGGAACACAACAACCATTGTGTAGACACCTTAATAGGTCAGGTCAGATTTAAAGGGATTTAAGAAGTTGCAATTTCTTGTGCGAGAAGCAATATGACAACAAAATAGTGGCAGTACTGAACATAATCCAATCGAGAAGACCTTTAGAAGGAGGATGATAAGTCGGACTTCGATCCCTACGTGAGCATCCTGCATGCTACCACATATTCTCCGAGCCATCTGCAGTGCAGTTCCAATTCCCGATATGTTTTTAAGAATTTCGAATTAATTTGAATAAAAATCGGACTACTGACTGTCAAAGAAACGATCGGAGAAATAATTAAATTATTATAAAAAAAAACAATTTTTTGTAATATCACTGAAGCTAGTAACAATCCTTTAAAATTAAAAATGGTGTTACTAACATTGATTATTTCTTATAACTGCATTTTTTTTCTACTGGGTTGCTGAAGTTAAGTTTCTGTCTTGTTCCCGGCGGAAATCGTTAACGGCCTATTGCCTCACTCCTATGGTTAGCTCGCGGTATTCGTCGATGTGAATACTACACCCAAAAAAAATCTTTGAGTCTCAATTTGATAGGTGTGGTTGAAAATGACAATACACCTTGGATCAATTTGATCCTAAATAAGTGTCAAAAGTATTATTGTATTATATATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACCATCGGATAATTGATGGAATATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATACATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTAAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTACAACTGCAAGGGTATATAAACCAAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTAACATATAACTTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTAAATTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGAGGACTATATCATATAGCTGTCATAAGAACGACCGGGAAAAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCCGCTTGCCGAAGATAACTTCCTTTCTTGTTTATTTTCCATTTTTTTCTTTTAAATGGCTTACAGGAATTTGTCTGTATTGAAGGAATTTAAGTGCAAGGAAATACACAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGTGGGCGTGGAAGCCCAGGAATCTGTATGCCATTTTGACTGTTCTAGCTCTCATAGTTTCCAAGACCTCAGAATTCGTACGGCCGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTTGTGATCCTGATAAAAAAAAATATGATGCCTCGCTATAACGGTTCTTCTCAAAGGGGACAAGACAAAAGCTAAGAAACTGGCGACGCAGCTGTGTGTCGCGCCACACTTTCTGTACTGTACACAGACAACGGATCTAACGGCACCTCGCTAGGCGAGATGAGAGAAACAACAAAACTCAAAGAGGCAAAACATAAGATGATGAAATAGTTCGATCTTCTATGGTATTACAAATATTTTTATGGTTATATTAATTAATACTTATAAGTGACATAAAGCCTACCAAAAAAGTGACACAGAGCCCTACGGTCGGGTATTTGACACACGTATACTGCAAGATTAACGTTACGCTATATATACGTTTGCCTTTGCGGAATCTTACATTGACTACAAACTCGAGTTAGCTCAGGTCTTTTTTGCTTGTTCATACACCATGATGCATATCGCAGTTCCTCAAAAATTTCGGTCCAAAAGCAACGGGTTGGTGGTGAATAACTCCATTCTGTTTCTGCAATCACTCCTTGAATGGACTCATCATTGACGCCCGCTTTAATTAACGAAGCCCTTTGGAGGTGTCGAAAATTAAACCAAAATTCGAAAAACGCGACAACCGCAGCCACAAAAATTCCAGCCATCAGAACCACAAATACACCACCTGTAAGGTTGCAACATTCATGTAATTAAACTAAAATAATATAGAGAATAACTTCGAAAGCCGAAGACTAATAAAAAATTATTGAATTTACCAAATATTTCTTACGTTACTCAACATTTACATAACATTTTTTTGTTTTCCGCTACCCAGTCGTAAATGACAGCATTTAAGCTGCGTTCTTTTATAATGAAATGACACCAAAAAGATGTTCCGGATGTGAGTGCGGGACCCGGTGCATTCTTCTGGAAATCATAAACTAAACACATTCTGGGTGCACTCTTTTTTAATGCACCTGTAACAGATACCCAGGAAGGCACCTAGAAGAATTCAAAAATCAAATATCTGAAAGGAAGGAAGGAACACATAAAACTGGATTTCAATTTCATAATTATTCCCGTTACTCTTAGATTAAAAGGGTATCCTTGATTCGTCAGAAAGTATAAAGTATATATATTCCTGATCAGAATCACTTGCCGAGTCGATAGCCATGTCCGTCTGGCCGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGAAACTAAAAAAGCTAGAAGAGTCCAACTTGGTATGCAGATTCCTGGGCTTCCTAGGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGCGAGCTGTCACGCCCACTCTAAAAGAAACGGTACTCTTAAAAAATAAACGAAAAACAGAAAAGGGGAAGATGCCAAAAACCACGCTCACATAAAATATCGCCTTTCTGCTTGTATATCTTCATTATCCTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTGACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATCCTTGTTTTTATTTGTATTTAACATTTACTTTTAATCGGATTTGCTGTGCTTCTGGGGGTTTGCTGCTTTCTGCTTTGGTGTTTGTTTTTTTCACCTAACTTTATAACATTCACTTATTTTCGATTTTGAAAGATATAAATAATATTATTATAATTAATATTACATATTGATACACATGTATTGATTACGAATATACAATTTATTTATTTTAGCACAATTACAATGTGCAAAAAATAATTAATGTTTAATTTCATGAATCTTTTTTTGTTTGTATGTTTAATGGGCACATGTACAATCGTAATTTTTACTGCTCACTTGTGTATATTTACCTTTGTGTTTTTTATTTTCGCTATATTGTTCATATTGAACTATCTTAACTGCACTTAACTTACATTTGATGACAAAATATTGATCTAAAATTTGTGGCACAGAGCCACTAAATTTTTAAAACTCGAGGCACGAACTTCACTTTTCACAATAAAAATTGCAACTGACAAGATATGCAAGAGACGAGAAAAACGTTTTTTCGTTTTCTAAGAGTACCGTTTATATATATATATTGAAAAACACCCTGATGGCACCCAGCACATTTGCCTTTGTAAATTTGCACGCGTGCTGTTTTGCGTAAAAAATATACGACCCAGAACTATGTATTTTTAAAAACCTTCGCGAACTTACGACTGGGTTGTAACGAAATATAAATCCGTATTTACAGTCACTGTACATCAAACAAAACAAGAAAGTAAGTCCGCTTCAGAAAGCCGAAGTTTGTACACCCCTTCCAGTTATAAGAAATAATCAATTTTAGTAACACAATATTCAGTGATATAAAAAAAATATTTTATTAATTTTTATACCCTTGCAGGGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATTTACATTCTTGATCAGCGTTACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCAGTCCGTTTCTCCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCGGGTTGAAATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTTGGAAACAGCAACAGATCGGACAACTTAATATTATAGCTCCCATAGGAATGATGGGAAAATATTTGTTACAATTATATCTTTGGTGTTTTTAAAAATATAACCTCATGCGCTTGAAAATAACATTTTTTAAATAGGTCGGAATTGGTGTTAATAAAATTGATTATTTGACTGCAAGGGTATTTAAACTTCTGCTTGCCGAAGGTATTTGTTTAGGGTCGTCCAGTTTTTGTTAAACAATTAAAAATTCTTAAAATTACAATAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATAAGCTAAAAAAACAACAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTCCCATCGCTTCTACGGCAGCTATAGTCGTCTAATGTTTATAAAATTAAAAACGAAATTCAAAACTAGTTAAAAAAGTTATTTTCAAGTGTATGAGGTTATATGTTAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTAATTTTTTTTAAGATTATTCCTTGAGACCTATAAGTTGTCCGATCCGACCTATAAGTTCCTGCAAAAGGAAGTATACTATTGGGAATGTTTTATTCAGATAGCTTTAAAACTGAAAGACTAGTTTGCGTAGAAATAGACGAACAGACGGCCAGACACATAGACAGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGCGATGGTATGTATTTATTCTAGGGGTTCGAAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTAACGGGAATCATAATACGCTCTGCAAGGGTATAAATATTATAAATATATAAAATTTAAATATAGGACTAATACACACCTATGCTCTCCAGCCCAAGCGCATTTGCTTTTG'..b'ATCCAATATATGTTATCTATAAATCAAACTTGGACATCATTGGTTTGAAATTAGATAATTACACTAGACTTTGTCCCTTAATGCTACCGGCACACGATTTCAGTCGTTACTGAAAATTTGAATTTTCCATAAATATATGTATAGATCTGGCAATACATAATATTTATTACAGTATGTTTTACCATGCACACATACACATATACACCGTTGTCATTTTCTCCCCGTTTCCCCAGTTAAGCTTTGGGCGCCAGAGTCAAAACACTTTTACATAAATAGGGAGGTATGCTTTTTTTGTAGCAAACCGTATAGCATTCTTTGACATCATATATATGTATATCTATATGTCGGATGTTTGTTTCTGTTTTATATTGGTTAAATTTAAACTTACATACACAAGTTTAGATCTATGAACGATGAAGAAAAATAAATCTACGGGCATACAAAATTCTAAGTCCATTCGTCTATCAGTCGATCCACTTTTATATTCCTCACAACATGGTCTTGCTTTCCATACATACTTAGTATCGAATCATTTGAAGCTTTTGGGTGTGTGTCTTGAGTCACAGAATGCGATAGTCAATGACCAATGACCAATGGAACTGGTCATTGATCTTTTAGTCATCAACAATGGAATAAACGAGAGATATATAATCAAAGTCAGCTTCCCTTCCTGATGGCCTGCTTTGACCCTGAAGAGCTTGGTTTTGGCTAGTTTGACGCCATGTTGAGTTGGTGCTATTAGCTAGGCTTGAAGCGCTAGACTGAACACCAGCTATAGTTACATTGTTTGCACTACTCTTTGAGCCAGCAGTGTTTGCAGGTCCTGTTCCACCATTAATGGTATTACCACTCGCTGTTCCACTTACTCCAGAGCCTGTACCAGAGCTAGCAGCACCACCGGATGAATTTGAGACAGACCCTCCACTAGAATTAAGTAGATTCGAAGTTGCCACACTGGTGTTCGGGTTGCTGCCGCCGGCGCAACTGGTGTTTCCACTGTTGTTACCATTATTGCCGGAAACGCCACCACTGGCGCTGCTGCTTCCATTGCCGTTACCATTGCCGTTGCTATTGTTTCCGGATAGATTAGATCCTGAGCTACTGAGCCCACTATTGGGTGGAGTGCTGACGCCTCCGCCGTTACCAGCACTAGTTCCAGTACAGCTTGCAGACGATGGTGTTTGCGGTAAGTGCTGCATTATGTTCTGTACCTCGTTCTCGCTTGGAGATTCAGCAAATATAGTGGTGTTGGCGAGGACACAGTTGTTTAACGCCATTTGCGCTTTGTTCGCCTCCTCTCGAGTGGTATATTTACATAAGGCAATTCCTTGGTTCAAATATAGGTGAAAGCTAAGAAGGGGGCCATGCTGCATACACAATGTGCGTAAAGTAGAACCATCAATCTAAAAATGTTAAAAATACAAATACCATAAGTTATTTATTTGTTTTATTTAATATTGAATGAAAATGGAACATGGACCTTAATTACTTATTATATTTCGGTTATGCTTTTAATGATATTAGTATATAATTACGACACAAATAAAACAAGACAAAACCTACTGCAGCTACCAAATATACGATTGCAAAGCGTCCCCCTTTTACAATTTTTCAAATTACTTGTTATACCCTTGCAGACGGTATTATAATTTTAGGCAGAAGTTTGCAACGCAATCGTTTCCTACCCCATAAAGTATATATATATATATATATTCTTAATCAGCATCACTAGACTAGTTTTAAAGCCATCGGGCTGAGCTGAAACTTTCCCAAAAGCCTTATTTATTTTGTAGGTAGTAACCAGCCGGATCGGACAACTATGTCTTATAGCTTTCATAGAAATTATGGAAAAAAAAAAACTATTTCTCTATTGTTTTTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACACGTTTTAATCAGTTCTGAATTTCGTATTTAATTTTATAAAAAATGGACGACTATTCATATAGCTACCATAGGCGGAAAATGGGCGGTACATTTTTTGGACATATTATCTTATACTATTAAGAATATCATTTATTGTATTATTAAGAATTTCGAATTAAATTGAATAATAATCGGACGACTTTAAATATAGCTGTCAAAAAACGATCAGATATTAATAAAATAAAAAAAATTTTTTTAAAAAGACAAAGCTAGAAACAATCTTTAAAAATGTAACATGGTGTTACTATTTTTTATCATTTCTTATAACTGCAAGGGTGTACAAACTTTAGCTTGTCGAGTTGTCCTTACCCTTTCTTGTTTTTAATATGCACTTAAAATAAATAATGATAAATAGTTGTATGCTCTTATAACTGCAAAAATATAAAATTTGTTTAGCATTTGATAATGTACCACCGCCTTACTGTTCTACCTGAAAGTGAGTGACCCTGAAAGTTGTACTCTCCATAAGTAAGTTCTATGAAATGTCTCGTTTTGCACCAAATCCAATTATGGGGTCATATTATATTTTCTGTCACCACTGTGCAAACGAAATTTTTCAGGCTTGGAAACTTGAACTTTGACAAATACTTTTTCAAAAACCTATATTTTTAAAAGTAAAAAAGCAAATATTTGTTAAGCATATTCCTTTAAGTATTCGATAGTAAAATTACAACGGAATTAAACTCTACAGCTGTTGTCGTAAACCAAATTCTTTTTAAGTTATAGAAACAGTATAAACCTCTAAACCCCTATTTATTTACAAATAAACAATGGAAAACCTTACACTAAAAAAGGCTACATCATTTCTGGGTTTAAATTGAACAAATTAAGTTGTTTAATTTCTTTTTCATAGTAATCCTATATAGGAACTTTAACTCCAGGCCGAAGGCCTTAGCTGTTAATAGTTACCTTTAAAAAATAAATACATTTCTAGTTTACAAACACCAACAAATATAGTTGTTTTTATAGAAAAGAAAAATCACAATAAACAGCCAGATTAGAAAAAATAACAAAATTACATTTTCCCTATTTGTGAGTATTGAACAGTCAACATATTACTTTATGGACAAATTTTGTCATCATTTGTGTTCAATTTTTGTATATTTCCATTAACTTCTTAATTTTTTACGGATGTAACGACTTAATTTATCCTATATTCATCAACAACACCATGTCGCCAACTGGTATAAAATGTTAATATTATTAAGAACAAATTTTAATCGAACATAATTGGAAAGAAATTAGTCCATCAACTAATAAAAAAATGTACTTTTGGCTGTATGTCAACAAAGAACAAAAAAAATTTAATCTAGACACTCCGTTCTGTTAAACATATAATAAAGCCACTTTAAGTAAAAATACAAATTTGACGTTACTTTTTTTTGTAAGATTTATCGAGTTTGTCAACTTACGTACTCGCCACTGACCCTACAATACCCCGCAATAATTCAAATGTCTATACAAATGTGTTAAAATATAAACGGGTCTTTAAACATACCTGAGCTGTTAGATTTTTAAGAAGCAACCAACTAGAGCCCCAAGAGGTATTGTTACCAGTCCAAGTTGAATTTGTTGTTTGAACACCGCCGCTTCTAGCCTGTAGCCAACCATTAGCACCACCCGTAATAGTAGATGTTGTTGACGTACTACTATTTCCTCCGTTACCAGATTTATTTGAATTGGCCGTCAATCCAGGCGGCGGACCACGTGATGACGATTTATTTAGGGGGCTTGTCCAAAGCTCAGAAGTTGCGGCACATTGCTGACTGTTATCAGACCAACTAGACCGTTTTAAAAAATAAGTTTAATTTTTTTTATTTTTTTATTTATTGTAACACTTTTAAATTACCTTGGGAAATTTTGGTTGGGATTAAAACTCCATGTAGACGACGATAAACTTAGTGGCGGCAAATCAGTCGGTGAGTTTTTGCCAGTATTGGCAAATATGTCAGCATCTTTTGGCGTCGAACTAATGGATAATGGAGATCTAGCAACGCTTCCAGGAGTAATACTGGGATCGTCTTCT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATGCTTTTGATCTGAGAACCCTTAAGAACAAATTTCTGCTTGGATATGTTTCGGTTTTATGGAATTCAACAGTTTTACCTTCCATGGCTTGCCTGGCTCGAACTCTTGGACCAGGTCCGTGTAAGCAGTTGCTGCTGAAGTTGGCTGAGCAACTGACCAGTCTTTATTCTCGTTATCAGATGAGGGATCTGGCCAACCATCCCCAATGTTGCGTCCTGTTGACCATGTACTATAAAATCGATGACAAAATGTTACAGTGAATAGAAATGTTTCAAGAAATAGTTGTTTCTATTTTAAATCATAATATAAGAAAATAAAAGTACTAGGAAGAAACTCAATTCAAAAGTACGAGTATGTCCAAAACCAGATTTCGGGGGACACAAAACAAACATCACATATACACACAATGTAAAACTTGTTTCACTCCGTTTTTTAGTTTGATAAGTAGCTTGACATTAAAACTTGTTCTACGAAAGATTAATTAATTTCATTTGTATTATTTATTTTTACATACCTATCATTCTGAAGGCCCAAAGAGCTTATGTTGCTTGCATTGCTCGTTAAGTTTTGTTTAGTTGCACCCGGGGCACGGGAAAATTCCGCACTATCAGAGTTGATGTCCTTGTCTAATACTGGAAGCTTCCACTGATTTAATCTGGATTGTTGATTGGACGCTCCTTGATATCCACTTGGCTGAAAACATTTCCTTGATTTCTTAAAACTGCTTTACACATTATTTATTATTGACTATTGAGACACTTCTGATTTCGAGATCAGCATTTTTATGTATCAATCAATAAAAGCATTTTTATTCGGACAAAGCATTTATTTACTCGGACACAACTTAATCCATATGATCGCAAAAAAGCCTTTATAGTTATGGTCGTTTGTGCCGTTTTTGTTACAGTCGATCGATACATATTGAATTTAACAATTTTGTTCTACCAATAAACCAGTTGGGTTTTTAAACCTGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACCAAATTCGTCGGAAAGTATGCAACAGGTAGAAGAAAACGTATCTGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACAAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTTCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACACTGAGATCTCAGAAGCTATAAGAGCTAGAACAGTAACACTTGACATGTAGATTGTTTTAGCGGGGTACTAAGGTACTAAGTTTTTAAAACTGGTAGCCACGAATCTAAAAATAAAACACTTGACCGCTCGTCTTTACATTAATAGAATATGCCTTGTGGATTTCTAATTAAAGCAATTGGAATAAGCCCCGTAGTTTTTTAATTCAACAAAAATGTTTTGTTTTGACGGCTTAGTGTAAAGTTTCATGTAGGCGCTAGACGTTGTGCCCGATTGTGGCCGTTTAAGTAGTTGTGGCACCCAGCTGAAACAAACGTGCGCTACGCAAGAAGCCCAAGAAACTGCATACTTAATCGAAGTTTATACAGAAACGAACTTGGCAAGAATATTTATAATTTATAGAGTAGGTACCGCTTCCTTCTACTTACTCTTACTCTACTAGTAATGAGAATTAAAACTTCACATTAAGAAACCAATGTCCCTTAGCAGGAACGTTATCCGTCTGGATAAGGAATATCTTACTATTGAATAATTATATAGTTAGGGTGTTCTTACCTTGCTTATATTGAGCTCAGAAAAATTACTTGGCAAATTACTTATTGCATCGTGTCCTCTTAAATAGTCGTTGCCTGAGTTATTTAAATGTACAGAGGGGTGCTGCTGTTGCTGGGGCTGTTGCTGTTGTTGCGAAGTCTGTTGCATGTTCTGCTGTTTGACATAAACAGCCTGTTGTGCATTTATTTGGTTCTGTAAATTCTGAATTTGCTGCTTGTACTTAGATATAGCCACATTCACTGCCATTGGATTTGCGTTTCCTCCGCGAGCAAGGGATTGCTGAGCTGCTTGGAGGTGCTGAAAGCAAAAATGTTATTTCAGAAAAAATTAAGCACAATGTACAAACAACGTGTTAGGGAACATGAGTTCCAAAAAAAAGAAAAGAAGCTCACTTCAACAAGGTGACAAGTCATTACATATCAACCCGGAAACCACCGTTGTTTATTTTATTTTTGAAAAAATTAATTCTTTTTCTCGTAATCGATTATAAGAAAATCCAATTGCTTTTCATTCATGTGAAACGTGTCTTGTTTTCGCAAAATGTAATATGGTGAACATTCTTACGTAGATAGCGTGTGGCGGGGTTGATATGAAGCGTCCCGTATATTAATAGATCCAATCTATATCATCGAGACATTTCGATATATTTAAATACAAATCTAAAAGGGGTGGCAAAGCTAGCTACTTTTCTTGTTTAACAAAATGCAAAGTTAAAATTGTATATATTTGAAAAATTTAAAAATATATATGAGTTTATAAATGTATAAAGTTACCTTAATATTGCTAAGAAGTTGATTTAATAGATTAAGGGTAGTTTGAGTAAGCGGTTGTGTCAATATCTGACTAGATATGAAACCACTATGAATGGCCAACTGAATCTGCTGTCCAAGCATGCGAATTTGTTGACCCGATGGTTGATTGTTTGTATTTGCTGCTATATTTGCGGAAGCTGCTGCTGCCACTGCTGCGTTTGATGTGTTCTGACCAAATCCGACGGATACGGCTGAAGTGTTGCCAACGTTTTGCGGTCCTACAGCAACGCTGTGTTGACCTTGATTTAAATACTTTTGCACTTGCAAAGCTGTCATGTTTGCATTATTGTTTCCTCCTCCAGTAACTGCAGTACCACCCATGTTATTCATAAGGTTATTCTGCAAAAGAAAATATTTTCAAACAAACCTTTTGTATTTTTACCAACCACGCCACATTAGTAAGTTTTTGTTAAGATTTCCTTAACCTTTTTAACCGTATAATTATGTTAGAACATTTGTGCGATTCTGCATAATGCAGCCAGATAATTATTAAGATAACTAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGCATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAGCTCTAGTAAATAAATTGTTTCCCGATCGTTTTTATGACAGCAATATGTATAGTAGTCCGACCTTATTAAAATTTAATTCGAAATTCAGAAGGTTATATGTTAAAAAGCACCAAAAGCTATAATTTGTTATTTATTATATTAACCAATTTCCCGATCGTTCCTATGACAGATATTTGATATAGTCTTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCCAAATTCAGAAATAATTACAAAATGTTAATTCCAAGCTTAGAAGATGTGTTAAAAACTCCGAAGATATAATTTTTTTTAAGTTTTTCCCCGATAGTTCCCATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCGGGCTTATTCCGACTTATATACTTCCTGCAATAGAAGGAAGACTTTTGGGAAAGCTTTAAAACTGAAAGACTAGTTAGCGTAGAAACGGACGGACAAACAGACGGATGGCTAGATCGACAAGAATATATTTACTTTAGGGGTCGGAAATGTTTTCTTCACTGCGTTGCAAACTACTGACTGAAATCATTACACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAACGCCGATAGACGGCCTCGACTTTTAGATACCCCTTTATTAACTAAAGGGTGTTTGAAAGAAATGTTAAAATGCATGCAGCACATCGGCTGTTTCAGAGATTGCTCACTTTATTTGCCTCTAATTTTTTATAGAATGGTCTGATCTTGGCATGTAAATGAGTTTTGATAACCAGAGCCAGATGCCACTTTCACTTTTACGAACGTTTAACCGCAAAGCAAGTTAATTTCAAAATGGTGAAGCCTAAATGTGTAATGCAATCTCGGAAAAAGTCGCTTTGTTGCTTGAGTCCCTTGCGCTTCCTTAAGCTCGGCAACGGGTCGAAGCACTTGACAATAGCAAAAGTCCTTGTCGTCGCGAAACACG'..b'GGAAAATAATATGAAAAAATAAGATCTTTGGTGTTTTTTATAACCATATATCCTCCTACGCTTGGCAATAACATTTTCTAATTAGTTCTGAATTTCGAATGAAATTGTATTAAAATCAGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAATGACCGGAAAATATATGGGAAAATAATATGGAACTAATTATAGCTTCGGTGTTTTTTGACATATTATCTTATTATATTTGGAATATAATTTTTCATATTTTAAACAATTTCGAATTAGCTGTCAAGGAAACGTTCACAGAAATAATAAAAAAAAATTTTACGGATAGTACGGATAGCCGGACTGGCTAGATCTTGAGATCTTTAACGTGTCTATCACTGTGTTGCAAACTTCTGTCTAAAAAACATTATAAGGTCCTAGTTTCTTTTCTGGCTAAGAAAAGTAACGTTGGCATAAGTCGCTTGGAAAACGCAACTCGTTCTAGCTTTTTCCATCCGAAATAAAAAACCCAAAAATTATTTTATATTTTCAATACTATAGCTTCCAGTTAAAGCAAGAAAATAGACAAAAAAAACTCTTTTTTTTATCAGAAAATTGTCTTTATATTGTTCAAAAAGTATATTAATAATAACTTTTAGTTTTTTTTAGGTTTAACTAGGAGACAATTTCATCTCGAATACAATAAATTTTGTCTCTTTCCGATAATACGTTTCCTTTTTTCCCTATCTTTCCCGCAAATTAGATAAAATCGTAAATTAAAAACCAAGAAATCGCACGATTAAGTTTTCCGGACGCTTTTATAACTGCTCGATTCTTGCAGAAATTTTAGGCACACATTCTTGGGTAGCCATTTATGCAAGAAAAAATACATTTTTTATGCCCCAGGCTCCCCTCTTAAAAATACTTCGCGATAGTGATGATATCTGAACATTGTCTATTTTGTTCTTTGTACTTTGGTAAGAAAGATTATTGATCCAAATGTATTTGTTCAAAGTGTAACATTAAATTAGTGTTGTAATGTGAAAAAATGTTCGGCAACGATATTTTTGTCGAAATCGGCATTTCTCTTAATTTTGTCTCAACTCGACTTTAGCAATCTCCATTGTTGTTGGCGCAGCTGTATATTTGTCTGAGTAAACAATGTATGCAAAAAACTAATTATTTTATGTTTTATATTTAAAGGAAGTAACCCTCATTAAAGCGGTTGAAAATTCAACGAACACTCAAATCGGGCTGATTATTTGCTCATCTGGATTTCAGTCGACATGCATTGATACGAATAAAGGTGATATACTGTGCAATGATTCAGAACACTGCGAGGATGTGTTTATTAGTGGCATACAACCGGAAAGTATAGCTCATAGAGATGGGCGCCTTCGACAGGGTGATCAAATTCTTCGTATTAACGGCGTGGATGTTAAAAACCAGGAAGAGGTAGAAAATCAGATAGCCGAGAGTAGCACCGCTGTAACGCTCCTAGTTAGTCGAATTCTATACCCTGTAAGCTTGCGTTATTTTTCACAAGTGCATAATTAAAATTATTTTTAAATTTATCAAGAGTAGAATTAATGGCCGTTTTTATACACCATAACGGACAAAATGAAATGGCTTTAAAATGTCCAGCCCTGAAAAGTTTTTATATTTGTACCTTGTATTTTAATTAAGCACTGCTCAAGGGTTTCAATTGCTTTTTATTTAACCAATTAATAAATTTTTAAACTGATTTAAATAGGAAGACGAGGATGACGAAGACATTCATTTTGAATATGCCAATTCATTTATACCAGATGACTACACAAATGTAGTGGATAAATTGGATAAGGTATTATTAAGCCACGTACAGTCTTTTGAAGAACTATCAAATGAAACCGGCGAGCATTCATCCGACTTAAAAGTTCAAACTTCTTCTCTGCCAGACAAATTTGTAGACCAATCCAGCAAGTTGTGTGGTAAAACAAAGATTCGTCCGGATGCAATCCAAACGGATAACCAAAAAACTTTAAAGCAATCTTTAAGCAAAAATCAAGTTCATCTCCAACATGAGTACGACGAAAGCGAGCACATTTACGAGACTATTCCAGAAGATTCTGAGTCTGAACCACTTTACTGTTCCCCGTATCAAAGTTCAAACGGCAAGTCGTCAATGGGCTGTTGTTCATCCGCAATATCAACGACTCCGGCTGAAGTATTAGAAACGACAATGCAGCAACAAACTCAACGAGTTGCACAGTGGTTAGGTTTAAAGCCACAATATCCGAGAACTATTCACACTCTTGTTGGCCGTCCTGCGCCACTAAAATTAACCCAACAACCAAATTGCAGTCGTGTTTTTACATTACGCAGCACATTGACAAACACAAGCCGATCCAGCAGTAGTGGAGTTGCTTACAGTGGTTATGGACCAAATAATATTCTTGGTGCAAACTTAGCTTTTGGCGAAGAGGTTGATAACTCCTCAAGTGCCTATAATACTGGTGGCTCAAACAATAGCGCCTCGCCGCATCAAAATACTACAAATGCTGATGATGATATCACTGCCAACCACAATCTAGAGAGCAGAGTGATCGATGGCCGCAGGGAAGCTTTAGATACAACTGCTGTAAGCAGTATGTTGCTTTTACCTTTTGGTAAATCCGGTCGAATCGGTCTCTGTTCTTCGAACATGTCCACATCGTATGTCAACGGTAGGTACACCAATTAAATATAGTAGATTTAAGACTCGTAGATTTGGGGGCCCTTTTACGCAGTGAGACTATGTGCCTAAATTCATGTTTGCCCTCCGTATTTGACAAAGAATTATATTGGATTTGAGGAAAAAATATCAAAGTAGTAGAATGAGTGCGAAAAAACTCAGCTCAGTCACTGTAATTTCTTGAACGAATTATTTTTAACCTTAAGTAGTTAAAATAGAAAACAGTTCCAGATTATGATTATGACTATTAGGTAACCGTTACATAGCTAAAGTGAGTGCAAGGGTGATGCACATATGCACATTTTATTCGATTTTTACATTATTATGAGTGGTGCGATTTCGACCATTTTTGGCATGTAGAAGGGTATTGAAATCTAATACACTTTTTCAAACTATAAAAAAATGTAGTAGCTTATTAAATGTAGTAAATTATTATTATTATTTTATTCCATTTGCATCTAATAGACTGGCTTGTATTAAAGAAAAAATGTGTCTAAACCAGTATTACATATTTTTAAGCGGCATTGCTGTGCATTTGCATTTACTGTGTTTATAGTAAATGTGTACTACCGAGTCGTGTTATATCTCTCTGAACAAAAAAGCCTTGCAGTTATAGGAAATAATCAACGTTAGTACATGTTACATTTTTAAGGATTGTTGCTAGCCTCAGTGATTTTGATTAAATTTAATTCAAAATTCATAAAATATAAATATTAAATTCTCAATATTATGAAATAATATGTCAAAGAACACCGACGCTATATATTGTTTAGTCGTCCGATTTGATCAAATTAAATTCAAAATTATGAACTAATCAAAAAGTGTTATTTCCAAGCGTATGAGGTTATATGTAGTCCGATCCAACTGGTTCCGATTTATATACTTCCTGCAAAAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAACCGGAAAGTTTTAAAACTAAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGATGGAAAAACGGGCATGGCTTAAAGGTACAATTCTCAAAGTTATTCGGCGTTAGAAAGTGTTGAAAATATATCATGCTTACTTGAATGACAAAATCTATGAAACACTTAATTGTCATCATTTGTCATCAAAAACTAAAGACTAACGTTTTTTGTAATTAATAAATTATTAAAACTAAAAGTTGCAGGTTGAACTTTCGATGCATAACAAAGCATACTTTATTTAAATTCCGGGAATATATGATTTAATAATTTAGTGTGCCAACGGCATTATATATTGATTTAATTGCTATTATATGAGAGTATGAGTATTACTGTTCATTGTTTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/29c/08c/dd/scaffold_38-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAGAAAAAATAATAATATATCATTAATATTTGGTTGATTATAATCAAAAAATGTTAGGCGATCGATAAGGCGAGGAGATTTCTGATAAATAACTTGCGGTGGGTATGAACCTTATCATACACTTTTTCTGTGATTTGTCAAACTCGGTGACAGCACCGATAAATACTAATGTTAATTACATTATATTTCAGAGAAACAAGGCAAGGCAACCTACGAAAGTCAAATTCTCGTTAAAAGCAACCACAACGTATTAGGAGTCAAACAAACTGAGGAATCATATAGCCATTGTCCCCAGTTTAACGCACCCAATTTGAGTAGCTACCACTTCGTAAGTAGTCAAGAGGTAAGTGCTATTTGGTCTACCAATTCTTTTGTCGACAAAGTGGTCCCAAGTAAAATCAGAAAGTTAAAATTAAAAAACCGTTGCTAAAATAATACTACATGTAGTATAAGAGTCTTGGTATTAATTTAACCACAAATAATTTTAAATCTTTACTTTCTATTCAAAGGTCTCTTCTTAAGAGTATAAATGTAATACTTTGTTTTTTATTTATTTAACTTGCGGTTTCGGTGTGTTTATCCAGAGCAATTAGTTTTTTTTTCGATTTTAAGCGGGTGTGTCAATTTAATAAAGCAAGCATGGGCTTCATAGCCTCTTGCCACTATTCAGATGCCTATATAAACAGATAGGCAAAAAACATGCATCAAGAAAGATAGAACAAAAATTATATAATGGGATTTTCATTCCCTTTAGATGTAATACTCTTTTTGGCCATTCAAGTAAGCAAATAAATGCTTCTTATATTGAAGAGAAAGGGTTGCTCTTTTTACCGCCTAATATCTTCCAAACCATAATTTTTATGACAAAAAGTATTATATATAAAAAATTGAAGTCTCTCAAGGTTTTTAAGACTTAAAACTTATAAAAAAAACGTTTGATTCAATTTTGAGAAATGGTTAAAAAAGTGTTAAAAAAAACAGACAATTTTCTTTACAAAGACATATAGTCTCCGTGGTATTAGTTGTTAAGAAACTATAAGCCTTTCAAATCTGGTTTATTTTTCCGCTCAACTAGTGGGGTTTTCCAAAAGTCGTAGAACGGCAAATGAATTTATTCTAGAAGTGGGACTACTTTTTTTCCCATTCAGTTCCGCACTAGGCTCGTCAGACGTGCTTTTTGTGATTTTTTTCTGCCGACGAAAGAGGTAGGGCAAAATAGAGAAGAAGAGCTTCGGAGATTTTCTTCCTTTTGGCGCTCGGAGAGACAGCCTTTGGCCGGTTCTTGTTATTTTTTTTTGCTTCTCTCCGTCGTGTTCAGAAAGAAACCAAAAGAAGAAGAAAACTTTCTGCTTCCTCTTATGAAAAGAGAAGCTGTAGGCTGTTTAAATTGTGCGCTGCGACACATTTTGATTTATAAATAAGAGTGATATTTTTTTAAAATAACAAAGTCAGGTAAGTCCTACCTTCAGTAAGATGTTCTGCGTTGATCCACGTTTAAAATAGTCCCTTTTTGAGATTATAGGTTTTACAACATAACCTGGAAAATCAAGTTTCGTAACATGAAAGGGGTGAGGTAAAATGTTTTTGCCAATAAAAATCCTGAAAAAGGTTTTACACAGTTTGAAAAGGTAAATATACAAGTAAAACACATATTGTTAAAGACATGCCCTTTTTTTAGGAGCGTTGGAAAGGGATTCGGAGCATTCGGGGAAATGTTTAAAGAATGCGATGACGAACGTTAAAAAAATAAACAAAAAAAAAACTAGATTTACTAATAATAACTGTAGTTCAACAGAAAACTTAAATAATACAATTTAAGTAAACTAAGGTAAAATGTAAATAAATATGTATGTATTTTAAATTCAATATTTTAATAGGTGAAAACTCATAGGAAAAATGTCGAATTTTCAAAATGATTTCACGTGTGGTCTGTCAGGTGACATGCCATACAACAAATGAGTATAAGGAACAAATGAAATCCGAACTTCAGTAATTTTCATTTGAATTATTACTTGTGAGTAAGCGGACATCCCAAACTATTTTCTATCACTTGTACAAGCTGACATGTCACTCCGTAATCACAGTGTAATTCACAAGAGAGATTTTTTTCCGAACTAAAAGGAAACTCCATGACTGGTACATACATACATATATATAAAGTTTTGGTATGTATTAACGTCATAAAAAGAATACGATTTAAAAATAGACTTGTATTTTTGTTTTAAATGTATTTATTATAAAACAAATTTATAAATTTATAATATTTAAATTAAAACTAAATATAATAATTATTTTATATTAATTTATAATAATTTATTTATATTTTATTAATTATTAATCTATATTTAAGTTATTAGCATTCTAGTGAAGGAACATTATTTTATTTCCCATGGGTTCAGTGGTGACAAATTTTTGACCGTTTTCGCTTAATAAATTGTTGGCAAAAGAAAACATCCTTTCCGATGCATTAAATTCTCAATCACTCGCGAAGAGTACATCCATAAACTGTTCCTGCTTGATAAGAGTAAAATATAAATGTTTTGCTATCTTCTTCTGTCCTATAAAGTATATTGTACAGTAAAGAATGAGTGCAGTAAATTTAAGAACAGTACACTACTGTACAGATCTGTTACATTCTTCCAGAAGATTTTTTCTATCTCGGGCTGCTAATACACCCCTAGGGTCCCCAAGACACTGAAATTAAAGCGGGATGCATACAAACCCACAGCCTAAAGAACAAACATTTTCATTTTGGGAAGAAGAAGATCTTGTTTTTGGAATTACTTTTGAACTGGATATTGGAGCAGTTCCAAATTTCTAGATTTTAAACAAATTGATATTTCTACAGTCTTTGTATGGAATTTTTCCTTTTGCGTTTTGTGACCATCATAGCAGATTTTTAATTCTGCGGCTATTGTTACTTAGCTTAAGGAAGCAAAAGGAAAACTCGTTTTTTCAATATATGCTTTTGGCCATTTGTGGGCGTGGCAAACTTTTCTTAGGTCAATCAAAATGACCCCTCGATTGACCTAAAAAATTGTTGTCACGCCCACTCTAACGCTTACAAACAGTTTAAACGCTTAAATCTGCCTGCCGCCCACAAAACATATACTGAAATAGCCGGGAGGTGGCGCTTTACAATATAGCTTTGCTGCTTAAATATATCACCTTTTCTCCCTTCAGCTGAGTCACGGGTATCTCATGTTTTCAATTAGCTTTGTGGCGATCATGCTTTCTGCCATCTGGCATCTCTGAAAACCCCTCAGAATAGATATATCAAGCTAGAAAAGCTCTCCAAAAAATAGTAATCTGAATTTCATCACATTTCAACAACTCAGAAACACTCAGTAACAGTAACAAATTACAGAATATACATAAACCATAATTTAAACCTAACAGTTCTGCGTTTTACTTAAGTGCAAAACTCACTGTGGTTTTTAAATTTACGTAAATGCAATTATATCAGAGCTCTAGTGAGAAATTAAGGATCCAAATTGTAGGAACCTACCGACTTGTTATACACGTTGTTCGTGATGTAAAAGCGTGCATTATACTCGAAGAAAAGGATGGTTGAATGTTTGCCGCCCTCATAACCATATACTATTATATATCTCCTATTCCATGTTGCTTTTTTACCTGATTAGCGGCTATCTGATAAAGCTCTTGTTCTTGATCAGGCTCAATAGACAAGTCAATCTAGCTATGTCCGTCTGTTCGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCCCTCAGTTTTAAAGCTATCTGACTGAAACTTTGCCAAAAGTCTTCTTTCCTTTGCAGATAGTATTTAAGTCGGAACAAGCTCTTCGGTGTTTTTTAGTATATAAACTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTAAATTATTTCTAAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGATGACTTTATCATATAGCTGTCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAAAAATGATAT'..b'GTGCTAACATTAAAGTAACTAGAGTGCCATTTAGAGAGCCTAAAATTCATTTTCACCACTCGAATTTTTTTCGCAGATTTAAAGAACTTTTCAGTTTTGAATGCACTCCAAATTCTGTGATATAAGGCCAACAGCCATTTCAAAAAAGCCTATATAGACAAAGAAATATCGTTTAATTGCCAAGCTAACCTTTACTTGAGCACAGTTCTCATCATAAACAATCAAAAAATTATTTATCAAAATCGAAGTCAAAGTTACACTATTAGGTGTCAAAAAGGATTTTTCATTTCAGACTCATCTAGTAATGATGGTAAAGAATATGTACATTTTAAGGGTCCCCTTCACTGCGCTGCAGCACAATCGAAAATCCAAATAAATTTCAGTTTTCTTTTAGCAAAATAAATTGCATTTTTAATTTTAAATTGTCTAGCGGCAAACACACTGTGATAATGTGTGTTTGTTTCTCATTCCTATATTATTCCTATATTGCTAGATTTGTCTGAAAGTATTTAACAGGTAAGAGAAAGCGCTACCCGAGGGGATTTAGCCATGTCCTTCTGCCTTTCTATCCCTATGTAAATTTAATGTAAAGAATGTATTTATGTGGTATTGTTGAAGGTGCGACGTCACTGTACTTTTACCTCGCTAAGAGGTGTTTTTGTATGATATCAGAAGTTTTTGTTTTAAACATAAATTATATAATCCATATACCTTCCCAAAATTCGTAGAATTCAGGTTTTTTATGCGGAACTGCTTATAAGAATTTAAATGATTCCTCGTCCCTAAAATAAAGTATGGATACGCACAAAAAATTCCGAAGATCCTAAGTTTCGATTTTTGAAACGGTTGTAATGAGACAAATCATGTAAGAATAGTGTACAAAGCGTTTCATAATATCTCTCTTATAACAAATATCACCTATAGCTTAAGTTCTTTAAAATTTATGAGTATTCAAAAATTAGCTGTTTGTGGCTGTTTTCTCGACAAACTAGCTAGTTTTTCCAAAGGGGTAAAACTAATGTTTCTTATATTGAGCTGTTTAACATCATCTTAAATTTCCAGGAACTTCAAATAGAGTTTATATTCGCACAAAAAAGGTGAATGCTCAGGCAGTGTAAGATGCTCTGAACTGATAAATGTTGGCACTTTTGTTGTTTAATAATTTTGAACAGGCTATTTTTACAAGCATGTGTCTTATACCAAAAGTTTACGAATCTCAAGAGCTATACAGCTTAACATTTTATTTGAAATCGTTAGAACCGTTTTTGAGAAATCTGAAACAAATCAAAAAGTAAAAAAAAACATTGCCCCCTAATTTTTAAACGGTGGTATTTAGAAAAATCGTTTAAGAGCCGTACATAGTTTTTAGAAATACCTATCTAATGACGTATAGCACAAGCCTATATCTTCAGTACAGTATATTCAGTATATTCTTGCGAAACTGGCTAGTTTTTCCAAAAGTGGTAAAACGAATGTTTCTTATATTAAGCTTTTTAACATCGTCTAGAATTTTCAGAACTCTAAAATAACGTTTTGGGACAAACTGACAAACAAAAATTTTCATTTTGAGAGGACTCCGAAGTTGAACGGAGCATCCGATTTTGACAGTATAGGTGCCGTTCGAAACGTATTTTAAGTAAGAATACGACTAGGTGAATTTATTCCCACTGGCAACAACAGATTAGATTTTCTACATTTTTACTTTTACACTTTCAGTGCTCTTACACCCATGTCAATTAATTTTTTATTGTCCTGGTATGGAATCCTTTTAGTTTTTGCACTACTTTTTGAAACAATCGGACGATTACTGTATATTTTCATGTCTTCGTGTATATATGTATAGTAGTCGCCTTCGCACACCTTCCTGGTGCGCTCCGTCACTAAGTGGAATGCAGTCCATTTTTCACTAGTCGAAAGAAAACATTCTTTGTAGTATTTTTGAAGATTTCAGAGTTTACTGGCAATCTATCCATCTACTCCGTGACATCTGCAGTGCAGTTCCGATTCCCAATATGCCCAGATGGGCCTTGAGGAATGCGGAATGGCAACGGACCACTGTACACTGGTACTGCAGCGAACATTCTGGCAATGGCTTCCCCAGCTGTCCCTTAGCGGGCGCCTTTATTGCTTTATAGCTCGGGTTTCTCGTCGATGTGAGTACTAGGCTATATAACAAGGAAATACTTGAAATTTGGCATGTAAATTCCTGATCTTCAGGGCAGGGTGCCTTGCCCATTCTGACAGTACAACCCCTGCAGTTCAAGTGCTTGAATCCACAGAATACTTTGCAAATCCAATTAGGTAGAAAATAAAGCGGAGATAAGTCCGGTTGCACAGATTGCACCTTTAGGGTACAATATCAACTTTTCTGATGAAAATATATTTTAAAATAAATAATTAATTGTTTATTTTTCAACACAGTTATAATCGGGGGTGTCACAGAAATTCCCTCCATCCAAACTTCCCCTGACAAGCGAATCTTGGTGTCACAGACGTCACTTTCGGTTTCTAAATCCCCTGTATTTTGATAAACGTTATGATACAATAAACAAATGCTTACCAAGAATAAAACATTATTTAAGACAACACTAATGAAATCTTTAAGCCATCTGCATTCTATAATTTTTATATTAACTTCGGGTTATATTTATTTATTTATTTAAATTACCTAAAAAAAAAGCGTTTGAAAATCGTCCAGCCTGACATTGGTAACGTTAAAATAGCAAATTTTGGAATTGCTATCGAAATCTTGTGGTAATGTGTAATGTATAAAATATATTATTGGTAAAAATTGCATTTAAAAAAAAGTATAGTAACAGAAAAGAAATTATAAAAACATTACGCTTTTGGCAGCACTGTCCTTAACAATTTCAAATTTTTGGCGGATAAGAAGCAAGCTATGCAGAAGAAAAAGTGTAAGTAAAAGTAAACAATGTATCCAGTCCTGGTCATTTTTCGGTAATTTTTCCGAAAAAAAAATCACTTGAGTTTCTGTGACACCTAGGGCTTACGGTCCCCAATCCGTCGCCGGTTTTTGTGACATCCCTATAAAGCACCCCATTTTGGGCGACTAGGAAAAATCCCTGCCTAAATCGTTTTTATACCCTATACTTTAGACTAAAAGAATATAATATATTCGGGGAAAAGTATATAACAGGTTAACCGTTTAGGTATTATAAAAAAATTTTAACTGAATTGTATTGCTTTCGAGAATTCCTAGAAAGAGTTAAAGAGCTGGTGTCTCAGAAGGTGTCTATGATTCCTTAACTATCTACTTAACGTAAACGAACGTGCCATGCACGCCATACCAGGCGACACCAAGCATGGGAAACCCGAAATAATATATTTATAATGTAGTCTACTCCAGTGTGAACGTAAATTTATTCGCAGATATTACCACATTGATCAACACTCAAGAAATAATGGTCTGAAAATAGTTTTTGGGCCATTTGTTAGGTTTGTTATTAGGAGCAACACGTAAGAATTACTGAACAAAAACACTGAAATATTGAATCGTATGAAGCGTAACAAGGCGATTTTTCCCTTCTTTTTCGTTGAAAGGGAATTTGGTCGTTTAAGCGGAAAACCCATTTGTGTGAATAGGGTATAAGGCGAGATTTAATTACAATAGATATCGATAGTTATCGGGTCTTATTGTGTTCCGCATCTAATGCAGATAGCCGGCTAAGTAATTTGATTGAATTCTGGTGCGCTAAATCAACAATAACATTTTGATTATTGTAAAATTCATTTTCGGTGTATAAATCCATCTGAGGACGCTGTTTGGTAGTTTATGTTTCTCTACTTCGCACTTGTATACAAAAGGCGTGTCGAGACTCTGCCGGAATGTGTACCTGGCCATCCCAGTTTTCTAGTGTACACACGTTAATTTTGGGCTACTTCATTACTAACTGCTACTAATAGAAATAGTCGTAAGATAATGCGTGGGCTACAAATTTCTGGATGGTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATTAATTTGTTTTTACTTTCGTCGTCGACTTCCTTTCCGGGTCCACTTTTGGGTAGCGAAACCAAAGTTCTTAGGTTATGCTGTAGTACCTATAAAAATGGACGTGCATACTTTATACACAACATCTTGAACTTAAGGGAGCACTTACCTGACTTAATTATTTTCAAAATATATCACTTTTATTAATAAATTTAATATGTTTCGCAGCGAAAATGTAAATAGTGTGCTTCTTCTTCTTCTTTTGTTGCACCCTTTCTTAATCGAAACAATTTAACTTGTACTCCTTAAATAATTTATACAATATGTATTTTTTTAATGTTAATATTAAAATTATTTAATAATTTAAATAAATTTGTACGTACTAAATTTCTATAAACTAAAAAATTGCATAATACATAAAAGAAAATTCAGTTTACTTATCTCGAAATACATTAAAGGTGCCCGCACAGTGGGCGGTGCGGTGCGGCGCGGCACTGCTACCTGCTCTTTTTACCGCGTAGTGAAGCTTGTATCGGGTGTTTTTTTTTTTAGAGGTATAGAACTTTAAGTTGCATTAAAACAACGATAGATTATTCGATTGACATGAATTTTTTTTATTCGAAAGATAATCTTGTGGCATTACATTCATTCATTTTATATATGATTTCTGGCATATGACCGCCACGGCTAGTGAAACGTGTCTTTCAATAAATCGGACAACATCCGAGCCAGCCGTGGCCGTCATATGCCAGAAATCATATAAAAAATGTAATGCCACAAGATTATCTTTCGAATAAAAAAAAATTCATGCCAATCGAACAATCCATCGTTGTTTTATTGCAACTAAAAGTTCTATACCTCTAAAAAAAGCACTCGTTATATAATTAAATGTAAGATCGCACACCGACGCGGCGCGTCTCGGTTCGAAGCAGGGCGTTACTGCTCGAAGAAGAATTCGGAATCTTTCGGCTGGTATCGGCAATCGTGGGGAGATAAGTATTGGGTTGAAAACAGAGTGACGGAGTGCAATTTCTGTAGAATTTCAATAGAATGGAATTGACAATAAGTGAACTCAAAGAAAAAGGAAAGGAAGATGTCGATTATGAAGTCGAATGTATCGATTATAGTACATTCGTCCCGACGACATCGCTTCAGTGTGTATTTCTCAAGCGGCGGCGGGCAGCTCTGCGTCATGCCGCGCCGCGCCTCGCTAGTGTGCGCTTACTTTAAAGGTCTGCGCACACTGGGGCGGTGCGGTGCGGCTCTGCTCCTTTCTGTTTTGGAAGCCCACACACTGACTCTGCGCATCTCGGTCCGACGTAGGGCTGAAGTTTGCCGCGCCGATATATTGTGTTCTTGGTATCTTCCGGCTGTTATCGACAATGGTCGGGGCATTAGTTCCGGGCCGAAAACAAATTGAATGGAATATACAATTGGCAATTATTGAATCCCAAGAAGAAAGCAAAGTGTGCGCAAACCTTAATGCTTTTTGAATATTACCTGAACTTAACGGAGAGACGCAACAATAAAGGAATAGCTGAAGGTTGTCTTTCTGAGAGGCGCAGGAAGGCAGACTTTCATATACTCTTCTACGCTGCGCCGGATTATCTGCTAACGTCGACAGCGGCACACAGTTTTAGGCACAAAAAAAAACAAAAAGCTTTTTGCCGACTGTCATGTCACTCCGAGCCTACCTCAGAACTGAAGAGAGGTACTCATTTTTTGGGCTTCTTAAAGCTTTAAGCTCAAAATATTGGGGTTGGTTTTTCTGTGTTTTCAGTGGTGGTTTTTCTTTACCTGTAAATGTTTACGTTTCTTCTGTTAGACACTAATGTTTTTTTTCAAACGTTAAGAATTTATCATTACGACTTGCGGAATGACTGATTGCCAATTTCATATAAAATAATGGTAAGCCACCCTCTAGACCCACTATTTTACTATAATATTTTTATATTATAAGGTACGGAAAAAACGCGACACTTTAGAAAAGAAAAACATAATAGACCGAAGCACCCTTAACAGGATATGTTTCTCATACATGATATTTTCAATGCTTATAATTGCAACCGCCCTTCCTCCAGTGATACGCGTAGGTAAGCTTAATGTAATTTTTTAGTTATCGAGAACTTCTTTTATTTACTGTTAATATCTTAATAGGTGCCATATTTACCGAAGATGAGCGTGAAAGCAGTATCGAATCGGCCTTTAAATACGCGATTTACCGGATCAACAAGGAAAAAAACCTTCTTCCCAATACACAACTTGTATACGATATTGAGTATGTGCCCCGAGATGATTCGTTTCGCACCACTAAAAAGGTTTGCCGCCAGTTGGAAGCTGGCGTTCAAGCTATCTTTGGTCCAACAGATGCTCTTCTGGCTGGTCATGTACAATCCATATGCGAAGCATATGATATACCCCACATTGAAGTTCGAATTGATCTTGAATATAGTTCAAAAGAATTTTCAATCAATTTGTATCCGTCACACACTCTCTTAACTCTAGCATATAGAGATATTATGATGTACTTGAACTGGACAAAGGTGGCAATTATTTATGAAGAAGATTATGGTAAATATAATTTCCATTTTTATTAGGTCCCTTGTACTTCGGTTTTAAAGCGTTTCCGAACCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATTACAAGCCGCGTCGATTTAGCCATTTCCGTCTGTCAAAGAGTCAGACTTGGCTTAGAATATGGTACAAAATTGAAAAAATTTATATTAAAAACTTCATCTTATAGGCTTAATAAAATCGGCCGCCATTTGAAAAATACTTGGCAGAGTCCTTGTCAGAGCTAGCGATTACTTTGATGATCGTGAAAATCTAATTTCTTTGTCCTCCCGATAAATGTGAACCTACTGAAGTGTGCGGTACCGATCGCAACTTTGACATGCAACAATTTTAATACCTATTTGTTTGACACAAACACAACATATACTTCTTATATCGTGGAGAGCAGATCTTTTTATACCCGTAGCTAACTACCTAATTTTCAATTGGATGTGTACATCAAAGCTTTATATGCAAAAGAATGAGAAAGCAATATTAAAACAAGAGCGCCTTGTCGCAGACACGGGAATGCTTAGATGGCAGGACGATCGCGTCACGGCGATGGACGTGTTGGCTGCTAGATGAGATGTGTTACGAGGCCTACTCCCAGAAGTAGGAAGTAGAACCGCGGAGTTATGAGTGCGTCGATAACTGATTTATTCTTAAGTTGGTACTTGCTTATATACTACTTGGAACACGGAAGTTTATTGACAGGTCAGTGGTTTTCGATGATGGTAGCAGTTAGCGTAGCTGACTCGACTGACACTGCAACAGTGTGCTGAACATTTGGTGGGTCAGCGTAGTGAGACGTAGAGTAAACCGTTGACATTGAATATAACATGTTGGTCAGCAATTTTCATAACCAGTGGGTGACGGTGAGCGCATGGTTCAGATTTGTTGGGTGCTGGTACTGATTTGTTGGGTGCTGGTCATGTTGAGCACCCTAGGGTGCGAACAACGCACTTCTGCAATCTATATTGAACAAATTTACTTTCTAACTTTAAAAAATTAAGTGACTGCTACCAATTTTGAAAACTGCTCAGTCTATCGAGGAAAACTTTTTTTTTTATAGTATTCTCGAATTTTCCCTTTTCTTCCTTTAGCTGAATATCGCGTTTTTCATAGTCGTCAGACTCAACTTAAGCGTATTTCCTTTTTCTTATTATCTTTCCAAGGAATTCCTCCTATTCCAGATAACTTCCGAAACGTAATAGTTTAAAAATATATAAGTTCATAAGATCATCAGCGACTCCACTAGGTGCGGTTTAGTCCGCATTAATATTTGATGAATTCCGCAAAGGGAAAACTGTAGACGGTGCACCTACAGAGAAATATTGAGCGATTGACGACGTCTGATTTGACTACATGTACGAATAAATGTAGTATTGTGTAAAATGCAAGGGTGAAACCAGAAGGTTGTTGGACA'..b'GAAAAATACGGGTGATGTTTGCAACAGAGACGATAAGAGCAAGGAGTCCAAGGCCAATGCACTAGGAGTAGAAAATATTGGTAAGATTTTTTAAGATTTTCAATGAAAAACAGTAATTATTATCGTATTTTAGGTGGAGTATTTGTTGTCCTTCTCTGTGGACTTGCACTTGCCGTTGTCGTGGCTATATTTGAGTTTTGCTGGAACTCCAGAAAAAATTTAAATACCGAAAATCAATCTCTGTGCTCAGAAATGGCCCAAGAACTTCGTTTTGCAATGCACTGCCACGGATCAAAATCAAAGCATAGACCACGTAAACGGAATTGCTTAAAGTGCTCATCAGGACCAACATACGTTCCGAGTAATATGAGTATTCCAAATGTCGGCGTTCACTATAATTATTTTAATTAAATTGGATTCTGCTGACAGATATTTATTGAAATAAATAGGAAAATTTAATTATTTTTTTATTTATACAACTTAAAATAAAATTTAACTTAAGAATTAATTAGTAATTTGATAAATTTTAAAACTGCAATTCAATTTTGGGACTTATACATTTTTTGTTACAGGTTTTTGACCTTTTACTGTTAGGGGCTGTTAGGTAAAAGCAAGGTTAACGTTGCTCCGCGTTGAAGTTGCAAGTGAGAAATCACACTTGGCGACTACATAAAAAAATGTACAAAACTTATTACCTAAAAAGGCCTGACAACTCTCGCTTCTGTTCAAACCATATCTAGAAGTTCACAATGTAGTCCCGGAAATTTTTTCGAGAACTAATAAGCGCTTCAACCGGATAACATTTGAAACTCATGAGATACTCTTCGATTTCTCCTACGCGTTCAATAGAGTGAATTTCTTATGCACCAAATTAAAATATGACTGCCTGTTTGCTCAGGGAACGGGAGTGTATGTATATGGAACTTCGCGAACCCACTGTTTTTAATTGTGCATTTATTTCAAGGGCTTTTTTATTCAACAATGTTACCAACTCTCTCTTTTTCCAGAACTTTATCCATATTACATTGGTATTTAGAGTTAGTATTTATGGTAATCTAGTATTATTTTTAATTTAGAATTTTGTTGTAATTTTAGTATGATCGTTGCTTGCCGACCTGTTAGAGGTAATTTATGTTTGCTGTTTTATGTTCCTTCTCACAAATTTGGATATTCGGGCATAGCAACGAACATAAAAAAACATACAAACAGTGAAATGACCAAACACTGTCAGAAAACACAGATATGTAACTGAACAGATATGTAGTACCTTTAGAGAGTATTCGAAGTGGGATGCAATGCAACAGCACTTATTGGGTGAAACATCCATGCTACAATTAGGTAAAGTATCGCATTGGGGGCTACTCCGTTTATCCAATACACTGCTGACTATTCAATATTTAGGCAATGCTATTTCATGGTTTCTTGAAAGCGTGAAATAAAATTTGCCCCTGTTTATGCGACACAGCCGAATTAATGCTTTTATTTAATCTTAGATGACAATCAAACGGTTATTTTCTCCATTCGTAAACTTGCATGTTATAGAGAAGAAGTTAGTTCATTAACATTTTTTTAATAGTCAAAATATGTCCTTCTATAGAGTTAACAACTCCGTAAATTATATAGACTTAACAGAGTTGAGTGGTCTCCGCTTTGCGGTTGAATTTATGAATATTCAACTTTCATGTGTTGTCGAAATTATGAAACGGAATTTATGCTCACACTTCGGCTCGTTTCATGAAATTAAAGCTTGAAGTGGCCATCTTATAAACGCAGTAATTGTTATCCGATCCGGCTCGTTTCGACTTATGTATGTATATACTACGTGCAATAAACGTAAAACTTTAGCGAAGGTTTCATCCCGTTTCCCTTAAAGCTTATAGACTATTTTACGTAAAAGCTGATAGACAGGCGGACTTGGCTAAGTTAATTTGGCTAGTGTTGCTGATCAAGAATGTATGTAGCTTACGGGGTTGGAAAGTCTCCTTAACTGTGCTGCAAACTTCTGACTGAAATTAAACTATTGACTATTATATACCAGCAAAAATAATTTTCATACTGTTTTCAGTATCAATTAAAATGGCCGCAATGTTAAGCTGGGATAATGCATAAGATAATGATAATAAATTAGAGGCCTATTATCCACTCAATATTTACTGACTATACCCTTTCTTACTTGTCCTTTGAATGTCCTACTTGCGGCACCTAGCCCACCAAGCATAAAGCACAAACTGGTGGCGACTCTAGCGGCTATTAGTGAAAACTGCTGATTTGTGCAAGCACAACTGAATTTGCAAAATATTGAATATATTTGGCTTTAACGATTCCAATCATATTTGACATGTATATGGGTATTGATAATAAGTACACAATATCAAATCAAGAAGCAAAAAGCTTAAGAATCACATACCAAGCCCCAACTTTCTAGCTTTTACAATTTCCAAGATTTCAGCGTTCATACGGACGGACAGACAGACGGAAATGGCTAGATCCACTCGGCTAGTGATCCTGGCCAAGAATGTATATTCTTATAACAGCCTTGATATTTGCTAGTTTAACTTATTTTTAAGCTTCGACATTGCATTTCTGAGACATTTGTCCGGGAACAAAATTAGGAAATGTGTTTAACAAAATGTGTTTTACTAGAATATTTGTACATTAAGCTTTTCAAACTGTGTATGTAAGAATTTCTAAGTTAATTTGTACAATACGCGTAAAATAATAGTAAAAGTAAATAGGTTTAAAAAATTTTAACGATAGATGCAATTTGTTCGAATGAGAGAGTTAGCAATATTGCTTATATACATGTATACAGGTATAGTCTTTATATATAGCGTTCTGTCTGGTTTCATTTCATTTGTGTAGTCATTTTTTTTATTAAATGGTGACATTATATTCGTATACTAAAACACTTATCACCTAAAAAGAGGTATTTTAACAAGAAAGGAAGCTAATTTCGCCAAGACTAAGTTTTTATCCCCTTAAACCGCCCAACACTGTGGTGTTCACGCTAGAACATTTTTTTTTGCTCAAATGTATTTGTCTCATCACAACCACTTTAACGCCTAAAAACGATTTAAACGCCCTTATTCGTCTGCCGCCCACGTAGCACATACTGATATAGCCGGTAGGTGGGGCTTTACAAAATCGCTTTAGTGCTTATATATCTCTCTTTTTTATTTGCTCCCTTAAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTACTTGCTTAAGCTTTAACTGTAAGAGCCACAGCCTTGGGCTGCTTGCGTGCCATGTTCGCATAACAAGCTTGGCGCTGATCAACAATTAAGGAAACTAATTCTGATTCAGCAATCACATGTTCAGATTTTAAATTTAAATTCCTTATCATACCACGCCGACAGTGACACACATAAACCAGTTACAAATGAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGACGAAGATTGTATACCCTTGCAGTTATAAGACATAATCAACGTTAGTAACACCATGAGCAATTTTTAAGGATTGTTGCCGGCTTCAGTGATATTAAAAAAATGTATTTCATTATTTTTTTTGACAGCTATATTTTAGTTCCCTCCGATTTTTATTAATTTTAATGCGAAATTCTTAAAAATATAACAAATTATATTCCCAATATTATAGAATAATATTTAAAAAACAACGAAGCTATAATTTGTTTTATATATTTCCCCTCCCATTTATGGATCTTTCCTATGAATTTAATTTTATCAAAATCGGATATATTTTGATAAAATTAAATTTGAAATTTATAAGTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTGTATGTTAAAAAACAAAGCTTAGGAGATTATATGTTAAAAAACACCAATGATATCATTTTCTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCAATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGTCCGATAGCTTTCAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACTGAGGGACACTTTTGCCAAGGCTAGATTTACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATAATATATATATATATAATTCTTTATATATAATTCTTTATGGGTCGGAAACCTATCCCTCACTGCGTTGCAAACTTGTGACTGAAATTACATACAAGCATTGATATAATTACTGGATTTTAAAAACGACGTGAGTTATACCTACACTGTTTTTTAAAAAAATACAAAGTTTTATTAAAACAAATGTGCGAAGTGAAACAAACATTACCCATAATTAATATATAATACTTGTATCGTTTTATTTTGTTACAATTTAATGTTCAGCATAGTTTACAATAAAAGTTTTTTCTGAATGAATTACTTTTTCATTTTTGATTTATTAAACACCAACCATGCGTAGACAATTTCAAGATTTTTTAAATGATATTATTTTGATGATTTAAACATGCCGTTTTTAATTTTTGATTTTTCTAAAGTATTCTATTGTCTGTTTATAAAATTCTAGATTATTGTCGCGGAACTTACGTTTACATTTTCTATGTACTTAATACAAGCACTACAACATGTTTAAGTGTAATAATACTATTGCATGCGTTTACCAGCACACATATACACAATATTTTACAACTTTTATTTCATGTCAGGTGTTGGCTACCTTTATTTTCTTTTATTTCTTTAATCAGTTCATGATCTCATTCATACATCTGGTATATCATAAGTCGAGTTCTGCTAAGACCGATGTAACTGCGATTTATTCTAGTAAAAGTATCCATTATAATTTTGAAACACAATTAAAAGATTAATAAATCTTAATGATCATTTCCTAATTCAGGGGGTCGAACTGCATCAGAAAATAATACTAATCCTAGTAAAGGTATATTGTTAAGCAGTTTATCAGAAAGTTTTTTACTTCTTGCGAAAGTGAAAAAATGTCAACCTTCCTTAATATGTCAAAGTTTGGGAAATGTTAAAATTAAATGTATTTGTTTTATAAATGGCCATAAAGGATTAGCCCTAATAATTTGGCTTGTAATTGTTGTGCTGGTGAACTCGGGCATTCTGTACGAAGTTGTTATTCTATAAGTTATTATAATGAATAATGTGACAGTATTAGAGAGATTTTGATTTGAACACCAGGCGATTTTAGATTGATAAAAGCTATCAGTGGGACGCAGTTTTAATCTAGGTAACGTCTCAGCAAGTATTATCATATTACATGAGTTATTTCATTCTATGCTCTTTATATACATACATATGCAATAGTTTATAATAGGCGAATATGTACTTTATTTGTTTATTAAAAGTTTGTATAATAGTTCGATATGTTACATTTTACATGCCTTTTTGCATAGATCATTTTAAGTAAGCTAGCTTAAACAACCCAGCCAAACTTAAATCGAATATTCAAAAACTTCGAATAAATCTGGTGATTAGCGTACATTTTTACTCTAAATTGTTTTTAACGATTGTTGACATGTTTTTAAAAGGGTTATGTAATAATAAGCACAATGCCGAACCAACGATCCAAAAACTAAATATGTTTTGTGAAAGTATGTGCTGATTGTATTGCGTTTACCGGATATTGTATTTTAAATAAATAAGTACAAAAGTCTAAATAATGTTTATTTTATTGACATCCCGTTTTGGCTGAAACTTTTTTTATTATTTCATCGAGTATCTGGAAAGTAATGTCTACTTATAAATTGTGATATGTTTTTAGTAAATGATTAGTAAGCTTTAACTTTAAGTAGGTACTTCCGTGAAAGTAGAATTGGTTAGCATTTAAATGTTAAATTGATATTGACTGAATAGGCCATAATATCTTATTTGCAATTGATTGTTATTGGTTGGAAGCATTTTTTGTTGGATTCCAAACGTAACATTACCTAGGTACGTAAACATGTAATCTCTCAAAAAATATATGTATGCTATCTGACAGGAGCTTTACGTTCTGCCATTTTGCACTTCTCATAAAACCTATCAGATATCGGTAGGTCTGCTCGAATTATGTATTGTATTCTTAATTGAAAAGTAAAAAAAAATTAGTCTGTGAATAAAATAAAATCACCTGAACTATAAAAATGCATAAAGGTATAAAAACTTCGATTTTCTGAAATATATATGTAGTTTAAAGTATTTAGTTGTGTTGTTATTAAAATGGTTTTGCAGGTATACAGAAAAGGATAATGGCGGACAAATTAAATACTTGAACAAGCCCACAACTTCAATTTTTGCATAATATTAACAATGTGGCTTAACTATTCATTATAAATCCGGAAATAATTTACCGATTAACATTGACATATACAGGCCTTTGTATACCACAATAAAACTAATAAGAAGAACTTTAATTTAAATTCGAATATAACTTAATCAAAGTGGCAATATTGAAATCTGTGCATTGACACTTTGATTAACATTCAAGTGTATTTACAATTTAGATTTAATTATACGTTTAAAAAATTCATAATAGACTCCGTTTTTTCAAAAACATTTTGACAACTTATAGGTACCACAGTTATTTTAATAATAATCGTAATCGTATAACCCCATCTCAAATTCATCAGTTTCTGGTTTTTGTTCATTCAACATTTTTAAATAATCATTCTCTAAAGATATAAAATAATTCTTATCTTTTGGCTTATTGTCATGTCCGTGTATATCAAATTGGCGGCCTAGCACATATCCTTTAGATGTAAATTCACTTTGGTCTATTTCCGGTGAAGGCTTCTTAAAAGGCCATGCCGTTAGTCCTCTCAAAATCCGATGGAAGTGATCGTTACTTAGCGGCTTTAATGTAGAACAATTAAAGGGGTTAACTGTATACAACTGTACTTTGCAATTGGCAACAGAAAGTATAAACTAAAATAACTGAAATGCACACTTTTAAAAAAAAACATATATGAATTTAAATTAGTTTATTAATTTTTTTAATATTTAATTTGATTTGTACGTGTATTTTTGATTAGCTATTATAAATATATATACAAATATACCTAAGAAAACAAAATCTACTGTTATGGTGACGATCGTACCTAAGATACCGTAAATACTATAAATGGTTTTGTGAGAAAGAGTAGTGAAAATTGGATCTGCTTAAGGCCATGGAGATAAATGTGCAAACTCTTTTATTCTTACAAAAATTACGCGTATTTTTGTAAAACACATAAGTTTGATGCTACGTACAAAAGTTTTTCGTAATACTGGATTTTCTGGCATTCTTTAAAATGAAAATTGTATTTTGTTTATCGGTTCGTCCCAAAACTTTTTTTAAGTTTGGCGGAAAACCTGGTTTAAAAAGCTACATTTAATAAACTACTACAGACTTGTACTCCCAAATGTATTTTTCAATCCGATTTTAACATTTTTTCGACTTTAGAAGGCTAACGAAAGTAATCAGAGCTACAGCGCACTATCTAAAGAAGAAAAAAAATGTAAACGACCCAACCAAAAGGTGTGCTAGCGGACTGGGTTAACCCTTACCAGTTTTGAATTAAAGAGGCAGGAACTTTAAAATAGTTGTTTTTTAATTATTTACCTCACTTAAAAGAGATCGATTTCGCTCTCTGAAATGCGATTTTCGTATTGGGTATGTCCTTGGAACACCAATGACGGAATGATCTCTTTCGGTGGAATCAATGGAAAAAAGCTCAGTTGATGGAATTTTTATGCGGGCTGCTCGATTATTTCCAGGAAACAAAGTCTTGTGTTCCTTATTAGATAGACTTTCTTTTTTATTATAAGAAGATGTATTGCCGATGCGTCTTGTGGTAGCTTTGGCGCCAGTCCTATGTCCATTTTTATTACTTTTGTCGTTCTGAAAATTTTGCTCATTTATAATTGACATGCGATTAACGTCACTATATTGGTAACTATTTCCATCAGGGCTGCGATTTTCATCCATTAATATAGAATCCGATGGACTACCAGTTTGAGGATTATAATTCAGTAGAACGCTGTTGATTAGAGATATTTAAGGCAAAA'..b'ATTAACATCAAATTGTTCATTGTCAATTTTGCTATAGTTATAGGTTTTGGTATCACGCATGTGACTGATTTGGTACCACACGATTAATGGGAGCTCTACCTGTTTCAGTCAATACTCCGGTCGTAACATGCCGCGTTGGAATCAGTACCTGTCGATAAATATATAAATATAAAATAAGAAAAAATATTTTTGCAGCTACTATTATTTTTGCAGTTACTATTATTTGCTTGTCACGACAAGACAAAAAATTTAAAAAGTCGATTTTCACAAAAATTTTGAGTTTTTATTAAGTATTGAATGGGTTAAGAAAAGAAGTGCATCATTTAAACGGCATTTAAAATACCGTTCCATTGATGCCAAAAGTTAAACGAAGCAAGTTAAAGTTACGAATATATTTCACTTTTATATATGTCAGAATACTTATGTCAGGGTTGTACGGCTTACCAATGAATTTGAAGTTATGGCTGATCTGTTAGAGCTCGTATTTGTCATGGTGCACAATGATCCGCCTTTTCTTGGTCCTTTTCCAAATTTTCACCTAAGATTGCAGTCAAATAAAATTGTGGTTTGCCACTGCTTCCACGAACTTTCGTATGATTTGGCTCGTCTTTGTACCTATCTTATAGCCGTTTTTTAAAGCATCAGAATTGTATCATTTAAAATTTATTTGCACCAATCCGCATGTATGCAGAAGAAAGAAATACCCAAAGCTGGCTGTATCTATCAAGGTATGTCACTCTTCCATTATCAGTTCACGCACTACATGGATGTTCTCTGGCGCAACAGTGTTAGGACAACCTTTACATTCTTCGACTTTGAGAAAGCGCTGTTTTAAATTCAATGAATCAATTCTTAAAGATTTAGGTACATAAATGCAATCTTGTGATAATCCAAACGTAAAAATGCGCACGGTGTGGTTGAAAATATGATAATTTCTCAGTGTTTGAAGAAACGGGGCAGTAGGTAGGGTGAGTTTTAGGGATATCTCTCATTTGGTTTTAGCACAATCTTTAAATAATAAATAAAATTCGAAGCTTTACCATAAGTTTTCAACTTAAAGCTTTTCGTAGCTTTTACATATAGTGCACATATTTTGAACACGCAATAAGACATGTTTTGACTAACGTACAAAAATGAGTGAAAATATTAAAGTTGTAGTTCGTTGCCGTCCTATGAACCGAAGTGAAAATGAAAATAAGTGTGAAGTAAGAACAATAAATACAATTGAAATAACTGTGATATTGGTTATGAAATCTAATCATTTCACAAATATTCTAAGCTATCGATTTTTATTGCTTTCCTTTTATAGGACAATAGAAAAGGATGTAGTTGTTGGCCGCGACTATCATATACCTGTTACTCAGCTAAGGGTAGTGCTAGGGAGGTGGAGTCATGAAAGCAGCAAAGCGACATTATTGTCGATTCCTTTTTATACCCTATGATTTCAGTCAGAAGTTTGTAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCAACACCATAAAGTATATATTTTCTTGATCACCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCTATGTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTTTGTACGCAAAATAGACTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCAGAAACATTCCCAAAAGGCCTTTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCTTATAGACCCATAGGAACTATCGGAAAAAAATGAAAAAAAAATATATTTTTGGTGATTTTTAACAAATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGATTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAACCGGATGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGATTTATTGTCTTATAATATTGGTAATACAATTTTTTATATTATCAAGAATTTCGAATTCAATTTGATAAAAATCAGACTACTTTAACATATAGATGTAAAAAAAAAAGTCTGAAAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTCTTATTTTAACTTAATACGGTCAGAAACGGACTCTACAAGGGTATAAAAACAAAATTGTAAAAAATAAAAGAAGAAAGAAAATTTTTTAGGTCAGTCTATAGATATTGATGAGACAAATACATTTCAGATACATTTTTTTCTATCATAAAAACTGCAGGCGCTACAGATTTTCGCGGAGAGTTGGCTCAAGAATATATATACTTTATTGGGGTCGGAAACACTTCCTTCTTACATACTATCCGAAAATCTAGTATATCTTTTTATTTTACGAGTAACGGGTTTAATTAGTTCAAATAATGTGCAGTATAGCTGTTATAATTTATAAACTATGTTATTTAATTTCAGAACATTGTTGAAATAAATGAGTTCGCAGTTTCCGTGACAAATCCTTCGGCTCGCCTCACTCCTAAAAAGAGGTTCTTATTTGATAGTGCTTATGATATAATCACAAAAACTGAAGTTATATATAACGAAATGTGCTATTCGTTAGTAGAGAGTACCATCGAAGGATATAATGGAACCATTTTTGCTTACGGCCAGACAGGTTGTGGAAAAACACATACAATGCAGGTACTAGTTTTAAAATATATGGCTAAGCTACGTTATTAGTGTGTATTCATTATATATAAATATATTTAACTAAATTGTGACCAGTGCAATTTTGACATTAAGTTTGATTTTAGTACTAACAATAACAGATTAATATAATAAAGACATTTAAATAAGTGTTTATACAAATATTTAGTTCCTTTATTTGAAAAGTAAATAGGAAGCGTAAACGTTTTCGAACATATAAAACATAGATTTCGTAATATCTTAAACTCGTGATATAAAATTTGCTTTCATTCAATCTCAGCTGACAGAGATGACGGACCAATGGAAAAAATGTGACCGATTATTAAACCGACTATTTTATCTCATTTGCATGTAATAAACTTGCTTATATAAAGAAAAAGTGTGTCGAAACCGTAGAAGTGGTTTTCTATTTTTATTTTTTATAAGCAAAATTAAATTAATTTTCTTGTCATTAACTGAAAAAGAAAAACAACATTTTAAAGTAAGACGATTTCATGTTCTTCTCTTGATCTGGCAACTCCGATAACTACTTAGAGATACCAGAGGTTAATTGTCACCACGCTTTAAGGTGGAAGTCTTAAGGTGCGCGTTCTACCTTTTTTTTTAATGTCACTGAAGCTAGCAACAATCACTAAAATTTTCAAATGGTGTTACTAACGTTAATTATTTCTTATAACTACAAGGCTATACAAACTTCGGCTTGCGGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCTTTGGCGGCTTTAATTGTATTTGTATTTAGTACTAGTTCTTTTTAATTGCAAGGTACTACACATCCCATAATCAGTGTATTTGGTATATTATGGAATCCTCTCTTTTTATTGCATTAAAAACATTGGGACCCCGCGAAAGCTTCTGTACGAGAAAGAGAAAGTGCCCGTGCGTACCCTAATCTCACAAGAAACATTCAAGAAAGCAAAGAAAAAAGTCGATTATGAAATCTAATGTATCGATTACAGTACACTTGCCCGGGCAACTTCTCTTGAGTGTGCGTTCCACAAGTGGCGTCGCGCAGCTCAGCGTCGTGCCGCCCCGCGTCGCACCGCCACAGACCTTTGTGCACACGGCCCTCGTCATACAATATTATTATATTATGTCATACTAAAGATTGGAAAATGGATGGGAAAATAATATGAAACAAATTTAGCTTCGGTGTTTTTAAATACTGTCATAAAATATTGGGAATATAAATTTTTATGTTTTTAAGAATTTCGAATACAATTTTATTCAATTTTTCAAATTCAATTTAAATGAGAAAGTAAAAAATAACTTAATTAATAGAAATAAGACAGACCTAGCTTAGTAGTTCAAAGAAACGGGTTTATGAAAGTTATAGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2a0/604/25/scaffold_65-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TGTTTTCCCTTCAAGCTAGAGTTTTTCCAAAAGTAATAGCACTAAAGTTTCTTATATAAAGCCCTTTATTGGCATACATTTTTCAGGGCTTTAAAATAACGTTATGGGGCAAAGTGGCAAACAAAATACATTATTTTGGAAGATCCCCCAAAATTCTCTTTTGCGTTTGGTTTTTAGGCTCAGCTGATTAACAGAGCATCGGACATCGGATTTAACAAGTTAGGTATCATTCGATGCGTGCTTTAAGTAAGAATCCTACTGAACTAATGGACTGTTGCATTTATCCCCTTCGGCCCCAACCAAAAGTAAAAGTTCGATTTCATACAAATTCATTTGTGCTTTTAAGACATAAAAGATCAACATTATAGAATCAACAACACGATAATGCACGGTCCCAGTCATTTTGTTAAAAACTCGGCGCATATCTTTCGAAACTACCGTGTTCGTTTAATTTGGGATCGAGTGACTTTTGGCTTTTCCTACAAATCACGGGACTGAGGATATAAAAGCAAAATCAAAGAAGACTCTGATGGAAAATACTTAAAGGAACTAATTGGCATAAGTGTCTTTTATCGGACACAAATACACTTTTTTTTGTGCACAGTAACTACTCTTCAGTTCCTAAAAGAAAAAGCTGACGTGTCAGCTTGCAAAAGTGAAGAACATGTTATACTCCATATAGACAACTGTATGGGATGTCCCCTGTTTAACAAGTGAAAATTCAAATGAAAATTGTATAAAGTTACTGTTCCTCATACTTATTTTTTGTATGGCCTGCCACCTGCAAGTGACACGTCCCAAGAGAAATCAATAATTTGAATTTAAAATACATACATTTTTATTTACTTTTTACTTAATTTTAATCAGATTGTGTTAGTTTTCTGTTGAATTACAGTTGTTAATTAGTTTTTTCGTTCGTCATTGTCTTTCCTAAACATTTGCCGGATGCTCCGAATCCCTGTCTAACGCTCCCGACACAGTGTTTAAGGCACAAAAAAAAATAAATTAAAGCTTTCACTCCAAGCCTACTGCAAAACTGAAGGGTATATGCAATACAAAAAGGCCTTTTGGATTCATCCTATTAGCTTTAAAACATTGTGTAGAAATAGACAGGATGACGAACAATTAGTCGGACGTGGCTAGACAGATTAAGAATAAAACATATAAGCAAACCTTTAGAAGATTGTGTGATTATTACAATAATTTATTTATTTTGTATCCCTTTTTCTTCCTAACACAAGGGCAATGAAAAAGCCTTTTGGATTCATCCTATTAGCTTTAAAACATTGCGTAGAAATAGACAGGATGACGAACAATTAGTCGGACGTGGCTAGATAGATTAAGAATAAAACATATAAACAAACCTTTAGAAGATTGTGTGATTATTACAATAATTTATTTATTTTGTAATCTTTTTTCTTCTTAACACAAGGGCAATGAAAAAGTAAGCAGCGGTAGTGGAATAATTCCTAAATGTTTTGATCACATATTCGAGACAATATCAATGGCAAATAACGTCAGATATTTGGCCCTCGTTAGCTACTTGGAAATTTACAATGAAAATATTCGAGACTTGCTTAATACAAATGAATGTACGAACATGATAAATCATTCTCTTAAAGAAATTCCAGGTATTGGTGTTTCAGTTCCCACTCTGACCACCCATCCCGTTATGAATGCACGCCAATGTTACGATTTGCTTATCTTGGGAAACAAAAACCGCGTTACTGCAGCAACGTCAATGAATGAAAAAAGCTCCCGTTCGCACACTATATTTACTATTACTTTGGAACAATCTCCATTTTTTAATAGCATTGGGACAGAAAATGACTTAGGAGGAATACGACGTGGAAAATTAAGCTTAGTTGACCTAGCGGGCTCAGAGAGACAGCGTAAAACTGGAGCTCAAGGGGATCGACTCAAAGAAGCGTCTAAAATAAATTTATCACTTTCTGCCTTGGGAAACGTAATTTCATCTTTGGTTGATGGTAAAGCAAAGCATGTACCGTTCAGGGACTCAAAACTTACACGTCTGCTCCAGGTAACGGTACATCAAGAATATATAATAAATATATATATATAACTTAATGTTTTTAATACAGGATTCCTTAGGAGGTAACACAAAAACTTTAATGATATCTTGTATATCACCATCAGACATAAATTATGATGAAACGATATCTACACTCAGATATGCAAGTAGAGCAAAGAATATTTCTAATAGACCCACAATTAATGAAGATCCTAAAGATGCCAAGCTTCGGCAGTACCAAAAGGAAATATTAAATTTGAAAAGAATGCTTGAAGAGACTCAACAAAAAATGATTTACAGAAATGATGAACAAATTAATTTAATTGAATTATCTATGGCGAATTTAGATGTTAAAAGTCTAAATTCAAAGAAAGAGGTTCAAATAATTGAATCAGGTAAAAATTCTGATGTTCCGCGCAAAACCACAAATTCATTATCAATAGAGACAATACAATTCAAGGAAGAAATGCAATTGCAAGCCCGAAATCGCATAGACTCTATTAAACGCACTCTAGTTGGAGGTGAACGTGTTGATGACCTAAAACTAAAAGAACAGCACCAAGCTAAAAAAATGGCAGCACAACGTCACTTAAGTGCTATCGCCTATGCATTAAACAGAGTTCAATGTGAGGATCGTGATCTCTTGCAGGGACATTATGCTACTATAACCCAAGAAATAAATATAAAAAATAATCACATTAAGAAGTGTAAAGAAAAAATTAAAATGCTTGAAATGGAAGTTTCCGATTTAAACTCTGAGTTTCAATTGGATAGAGAGGATTATTTGGACGAAATACGAAATCTTGGTCGTCAAATAAAGTTTTATCAACAATTGGTTTATAAATTTAATCCAAGTTTTCAAAAAAATGGAAGAAACTGGTAAGAGCTTATCCTGTATTATTAACCAATAATAAACCTCTAACACCTCTCGAAGAGGGTATATATTATATAAATTATATTAAAGTTTGCAACTCAGTAAAGATAACATTTCTTCTTATACGTAATATAAAGATCGGTAAACTTGAATTTTTTGGAATCGAGAACGGAAATTTAAAATGAAGTACGAAAGATTCCAGAGTGAAGTTTTGGAATTGTAAGACGATGTCCTCGGTCCTATTTCTAAAGACACTGTTTGGCTTCAAAGTTTTGATGAAGAGTGACTTAAGGCAGTCTATAGATACTTGCATTTGAAACTTAAATAATTTGTTATTAAAAGAAAGTGCGTATAATTAATTTCAAGGACGATTCTCAACATATTTATTCATCTTTTGCTCTACTTTTCCTGGGTGACCATGTCTCCGAACTTTTAATAACATTTCGATATGTCTATATCCCAACCTTATGAAAGGATGAGTTTGTTAATTATTTTTTTTTGGGCCGCAATATATTTTTATATTTTTTTCCCTGTCAATATGTAGCTGAAACATTTATCCGAAACCCTTTTTAATTATAATTCTTATTATAATTTTCAATCAGGACTCCGGATATTGTATTGCGTAATTCTTCATGGAATGATGATCTTAAAATTTGGAGGATTCCAGAGATCGATTTATTTAAACTTCCCCCTACTCCGAAAACGGGATTTCATCGTATTCATTGTTCAATTAGCGATAATAATAATTGGAAACATACTAACTTTCAAATCAACCGGGATGCAAAGAAATCTGAAATATATGTAAGTAATAAATACAAATATTCTTCTAATAGCACCACGTTTACCAATTTACCACAGCTAAATTATTTTTTTGGTTTACTCTGTTTATACTTCACACTTAGAGGAAAACCCTAAGCGTTATTGATTTCAGTATTGAAGATTTAGAAAATTATTGATTATCATAATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTGTTATTATTTCTATTATTATTATTATTATTAATTTTAGTATTATTTTTATTTTTATTACTATTATTTTTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTTTTTTTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTTCTATTATTTATATTTTTTTTAATTTTATTATTATTTTTATTACTATTTTTATTATTATTATTATCATTATTTTTATTATTATTATTATGTTATTTTCATTATTTCTTTGACCGTTTCTTTTACAGCTATGTGTTTGAGGCGTCCGGCTTTTATTGTTTATTTATTTTTATTATAAAAAACGATATTCCGAATATTATAAAATAATATGTCAAGAAACACGGAAGCTATAATTTGTTGGTGGGGATAATTACCCAAAAAATTGGATGCTCTGTCAAAATGATTACGCAACACAAGGTTTTAGGGTCCATTCAAATTGAAAATGTTATTTTTTATGTCAGCTTGTCCCAAAACGTTATTTTACAGTCCAGAAAATTCTAGACGATGTTAAACATATGTATATATATAATATATGTTAGCAAAATTATTTACGTGAAGTACTGTATATAAAAACCGAATGTAAAAAATATAGGAAGTGTATTTATTTAATAGATTGTATATTACATTTTTGTCACAGAAGTTGATATCTGAATATTTTAAGCTCGTTAAGAGGTATTTTTGTTTGATAATATATAGTCGTCCGATTTTAATTTAATTTAATTCAAATTTCAGAACTTATTAGGTTAGGTTTTGCATACCTTATATGTTAAAAAACACCAATGTTATAATTTAAAAAAAAGTTTTCCGATCATTCCTATGGGAGGTTGTGTTTTTGTTATCAAAAACCATCTACACAGCGAAAATTGATTAAATCGCTTGAATGACATAAAACATTACATTGCCCGAGGATCAAAGCAATTAAATCATTATTGAGTCATGGAAGTCACTATTAATTTCCATTATTTGAAAGAGAATAAGCGGACATTTAATCTGTATAAGTTATGTCGAATCTTTTTTTCATGGTTGTCCTTCATAAGTTTTGTCATGGTCATTTTTATGTCAACAACACT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATATAGTAGCTCGAGATAGAAAACTTTTGTTCTACGACTTTTAGAAAAGCCCGCTAGTTTAGCGGGCAATAAAAAGAAAGCCAGATATAAAAGGTGTAAAATTTCTAAACAATTAATGCAACGGAGACGTGCTATATGTATCTGAAATAATAATTTAATTTACTTAATATATAATAAAATATATAATAATAAAATATTTCTTTAATGCGAGACCCCAAAATATTTTTTTGAAGGGAGCAGCATGAGAACATTTCAGAAAGTGTATTTATTTAACAAGCATTATTCGTCACAAAAGTCGATATCAGACCTTTTTTACGTTTATGGTCCCCTTTTAATTTCTTCGAATGGATTAACAGGCTAAATAAGTAAGTAAGAATTGTGATGTAAAATGTGATCAACTTTTTAAATTAGGAATTTTGAACAAAGTGACTGTTGGCATAGAGAATTCTTAAACAAATTTACGATTAAAATTCAAGACCTGTACCATTCTAAGGCCTTAACAAACCATATTTGGACAATTTGAAATGGCACATTTTTATTAAAATTTAATGCTCAGTTTAAAAGCTGGTTCAAAAACGAAACTTAAAGGCTATGTGCTTAAATGTTGATAAAAAGGTAATGGAAATGTCTTCTTTGCTTAAATTCTCCTAATACGAAAGTTTTAAGAATATAGAGTTAAGTTTTATGTGCCCTTTTTTTAATATTTTCTGAAACCCAATTTATTTTTTATTTTCGAAACTTAAAGTTGAAAAGATTTCTCAACTTATGGTGTATAACACTTTTTTTTATTAAAGCTAGCATTAGGAAAATACTGAACGAGAAACACTGGAGAGGCGCAAAAGAGCTACATTTCCTCAAAAATGGACAAACACTTATAAAATAAAGGGCAACAACATTCTTTTGAAGATACCATTACTACCATTACTTTAACGTCAGCTATACGCCTATAGCTGTGTCGCTTTATACCTTTGCAGAGGGTATAATGACTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGAAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAAACGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTTGTATCTCAGCTTTGAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATTTTATAGCTCCCATAGAAACTATCGGGGAAAAAAAAAATATTATTAAAATTAAATTATATTTTCCGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTATAATTAGTTCAGAATTTTGAATAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATACCTGCCATATGAACGATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAGTATGAAAAAATTTCTTTCTAAGCTTGGGAATAACACTTTTTATTTAGTTCTGAATTTCAAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATATTAACTATAGGAAAATTAGTGGTAAAATCATATTCAAAAATGTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATACAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTAGTGGGAAATAATTAGTGCGAAAATAACACGAAAAAAATGACTAACGTTGACTATTTCGTATAACTGCATGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGTAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTCGTTTTGTAAATCCATTAAAAAATCTAAAGAAATTTTGAGTATGGGTTTCTAAAGATAGGGAGTGGTACTTTTTAAATGCTTGGACGAATTATCCAACCAATAATCCGATCTTTCTGTAATTGCGGTTAAGCATGTAGTTTCCTGAGCTTCTTGCGCAGGGCAAGTTTTTTTCGACAGGGTGCCATACAGTCTATAACCCCCAACAAGGTAGAAAAAAACTGAAATGTATTGGTGTAATCAATACCTATCGAATGGCCTAAACAAATTTTCCCGCTACCACTCCTAAACACAAACGGCCAAAACGTTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACCAAATATTGATATATCGGGAAGGATGCGCTCCACAATCTCGCTATGCTGCCATTACCGTCTTCCTTTTGCTCCATTTAGTACTGAGTACTTACTTTACTTAGTTACACATATAAAAGCGACGAGCGATATTGTTTAAGTATATTTATATACACTAAGGGTGTACCTCTGGTGGGTGAAATTTATAAGTTTTAAATTTCTACAATACATATCGTACCAATGGAGATAAGTATAGTTTTGATAAAACGTTAGAATCAAAAATCGGGTTCCTTATTATTATAGTCTGTTAAATAACAGACCATCCCGTACCGTTATAGCTCCCGCATTCCTGATTATTACTTACCTAGAACAAAACACCAATATAGAAGTAACATTTTTTCAAACTGTAATTTTTTCTGCCCGGTCATACTGCCAGTCATTTTGCGTGCTTATCGAGCAGCGTTTTGCTTTCAAGCAACTTTTAATTAGAGATTAAAGTTTCTTATCAGGCGTTAACTGCAGTTCACGAGCGAACATTCATATAATGATCTTTTAAAATATCATGAATATGTATTTTTAAATAATAAACGTTACTTAACTTTGGGACCACTGCTCTTCGGTTTGTTTAAAGTATGAGTAAATTAATTTCTTCCAGTTCTATCTTGAAGTGCCAACTATGTTACAGATCAAAAGCACAGGAACGAATGTATGTTTGTACATATTTAATCTTTTCAATAAACAAATATAATGTCTTTCCTTACATGAAAGCGTTATAAGGCAACCCGTGAAGATTACATCAGTCAATTTGATTTTTCAACTCTGTCCAAATTGTCTCGAATAATTGAGAGTAGGTAAAAGTTACTAAGCTATGGTCGAGTTAGTAGAAGTCCGATTATTATGAGATAATACAAAGTACTCGGCTTCAGCCTGAGCACCCTTCCCTAGTGATAAAGAAATGTTCCGCGGAACGAACCGCTCACTTGAATGCTCATCTTTTCCTTTGTTGGTATGTGTAGTGTACTTGTGTACTTAGAAGGCATACACTTACATGTATGTTTATACTTAAATACTATGTACGACAACTATGTACTACATGAGCAGATGTGGGTTCTCGATTTATTCGAGGTATTTAAAGTGAGTGTTTTCACGTAATCCGGCTTAATTTGTAGTCAGTGGTCATCTTATTCGTATCGGTTCAATTCGGTCGGTCTATGTGTTTTTCAATTTAGGAAATATAAACAAAGTGAAATTGTATCTGTGCTGTTTAAGGTAAAAATACTATATATTTTTGCTTTAAAAAAGAAGTAGACTTTCAAATAGTGTTATTTACATCCTAGGCTTTCCCCAAGGGGCCAGGCGTGATGGCTAGGATAAAAAACAATTGCGTGCTGATTGGAATCCTCCTGACTGTGCTTTTAACAATAGCAGCAAGGGGCGGTAAGTGTTCAAAAAATAAACAGAAGGAAACCGTTCACCTTTCAAGAACTCTAGGATCTTTGCTTTACTTACTTCCTTTAAATAACACTAGGGTACAGCCAAAAATGTTAAGCTTTAAGTCGTATTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATTATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAAAAGAGTAGACGTTACCGACACCATAATATATATATATTTTTGTTTAGAATCACTAGACGAGTCGATCTAGCTTTTTTATGTTTTTAAGAATTTTGAATTAAATTTGATCAATATCGGACGACGCTAATTTATAGCTGTTAAAGAAACGGTCAGATAAATATTGAAAAAACTTTTTTTTATAAAATTTTGCTTCATGGTTTTAGTATCAACAATCCTTAAAAATTTAACATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTTGTATAACTGCAAGGGTATAATATCACATAAAGTGAAA'..b'GATCTAAAGGTTTGTCATTTTAATATAAACGGCTTCTACACAAGCAAAACACGGGGACTTCTCGGCAACGGCAATGCGGAGCCATACGACGACTTTTTGCGAATTGATGGTACTATAGCAACAGACTCGGCCACTCTGGGGAACGATTACGGAGTTGGTAAATGTGCAGCAGTTGCTTTTGACAAAGACCAAGTAGAAAGCCCGAAAAGAGAGGAAATATGTACTGAAATATTTGGCATTGAATCACCACTTGCCCTCAACTATATGACGGTTGACTCCAGGCCTTACCGTAAGGCATGTGACAGGGCCATTGCTAAAATCGCTGAAAAGGATAAGGAGGCTGCTGCATGTACGTTTGCTCTGGCCTACGGTTCCGCGGTCAAACAGATTAACAAGTGGGTGCTATTACCACCGCGTTGCATCAAGTGCGCTGGACCTGTGGGACAGCGTGATCTTGGAGATGAGTTTATTGTCAAGCTCCCAAACAACAAGGCGGACGTGGTATTTGTCGTCGATATCAATGTAACACCTGTAGTCCTGTCCAACCTTGTAGCGCCTGCAATCAATGAAATTCGAGAGTCGCTTAAGAGCCGTGGTTTTACAGACGTCCAAGTCGGCGTTGTTGTATTTGACGAATCGAAGCGTTATCCCGCTCTACTCACAAGTGAAAATGGAAAAATCAACTACAAGGGAAACCTGGCCGATGTAAAGCTCAATGGAGTAAAGAACTTCTGTGACGATTGCATCGAGCAAATTATAACAGAAAAACGAATCTTGGATATTTACAACTCATTAAAGGAAATAGTAAAGGGCATTGCACCTCAAGCCGATGAAAAGGCGTTCCAGTTGGCATTGGACTATCCATTCCGTGCTGGTGCGGCAAAGAGCATTATCGGGGTGCGAAGCGATTCGTTGGAATACAAAAATTGGGTAAGGGCAGCTTTCTGGGCTTAACAGTTTTCCGAAGTCTTATGAATTTTGTTTTTTAGTGGAAATTTGTTCGAGCTCAATTGACTGGATCTGTTACCAAGTTTGACGGTGCACTTCTCCATCTTATTGCACCAGTAAAGGCACTCACACTAGAGGGAGTGCCGGCTGAAAAATTAATTGGTAGGAATTTAATCTATGCCAATCTATTTGAGTCATAAGTTACATTTATATTTTTCAGGCTTCAACTCTCGTTTGGTGGCTACCATAGATGGGAAGGATCAAAAGAAGCGAACCAAACTACAATTCGATAATGACATGGGCATTGACTTCGTCCTTAATAACGGTGGTTGGGTTTTTGCAACGCAGAACTTCGACAAGCTGAAAGTAGCCGACCAAAAGAAAATGTTAAGCCAGATTACGTCATCACTGGCGGATACTCTTTTCAAGACCGAAATCGTCAGTGAATGTCGTTGTCTGCCGATTCACGGATTGCACGGCCAACACAAGTGCGTCATCAAGTCTTCGACATTTGTTGCGACCAAAAAGCCCAAAGCTGCCTAAAATGATTTCAAGTTTTAGATTTAATCCTTTTGGCAATGAACGGAAAATCTATAACCAAAAATATAAGTGAATAAAACTAATTAATAAAAACGTAAGAACGCAAATTGTAACATAAAAACAAAAAGATTATACTTTTCGGTTTATAGGACCTTAATTTTATTAAGACCAATTTCGAGATAGATCTTTTGTTTCCATGACTGTGTACGTTCAAAAACTGTTTACGAAAACAAAGCGAAATGTTTTGACGTGCACGTACAGAATGGGGAAAACATAGCATCAAAGTAATTTTTTTGCTGATAGGCTTTTTTGAGGATGCCCCGTATATTATTGAACAGGATCAATAGCTAAGTCGATCTGGCCATTTCCGTCAGTCCATATGAACACAGTGACATTGGAAACTAAAATAGCTAACTTCTAAACTAACTTCTAACTCCCACATTTTTAAAGATTTTTATACCCGTTACCCGTTGAGTAAAAGGGTTTACTAGATTCATCAGAAAGTATGTATCAGGTAAAAGGAAGCGGTCCCGACTTCATATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCAATATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCAGTCCGAATGAACGCTGCGATCTCGGAAACTAAAAGAGCTAGAATATTCATACTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCTAAGCCGCGCCGTATATACTATCGACTCACCAAAAAAAAAAACTTCCACTCTAACGCCCACAAATGGCCAATACGCTTAAATCTTTCTGCCGCCCCAATAATATCTACTGAAATAGCCGCTAGGCGGCGCCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTATCGGATCATTCATTACAAAATTTATGAACAATAAAAGTGCAAAAGCTTGCACCGGTTGTAAGCTGAAACGCAATAGTCGATGCGATGGAGATGGAAATATACAGCAAAGCGTGTTTTCAGAATTGCGCTCCCCGCTTAACTTATTGACTTATGTAAGGTCCAATTTCGACCATTTTTGGCATAAAAATATATATCGCTACTAGATGGGCTAGATGTTCGCAGTTGGTGATCCTGACCAAGAATATATATATAGTTTTTATCAGGGAATCTCTGAGTAGGGTATAAAACCAATGTTTATTACACAGTAAAGAACAACTAAATGCTGAAGTTTTCATTTTGGGATTGTAAATTTATTAAAAGCGGGTATTTACCATATTCAAAGATATTTTAGTTTTAGTTGCATGATTCTTAAAGTTTTAGATTTAATTTAGGCACTTTCACAATTTAGGGTAAATATATAAATATTGTCATTATGTAAAATAAAATACAATTGAGGCTAATCTATTTCAATAACACATCATTTTTGTTACTGAAATGTACTTATTTTAAAAAACTCCCATTTTGACATAAAATGTAACCGAGGACATTTATGACTATGCCTACCGGACGGAAAATGGAAAATTTAAAGGCAGATATCGAGCAAGCTGTGAAAAAATAAATTTAAAAATTATTAAGTAAAGTAGGATATTACAATGAATATTACTTACGCTAAGGGCAACCACACTCATCAACAACCATTTTTGGCAAGTCTCTTTTAATGATTCCATCATCACCATAGTAAATCAATGACATACTAGAGAATTTTATTGGAGCGCAACAGGGTCGCATTCCATTTAAGAGGCCCATTTTTCGATACTCTTCTATAAAATGGGCATGGAATGTTTGGAAAGTATCTGGTGTCCTGAACGACCCCGTGCAATCGCCTCGGCAATAGTTCGCAAAATATCCCCTGGGTGCTATAATCCAATCATCCCAACCAAGTGCCTTGAAGGATACATAAAAGGACTCCTTGCAGCATTGACCGCTTAAAGCACCGCCACAATCCACGGCACGTCGCCTTACACGTCTTGTCCTGGCTGATTCTGTGTGAAGTACGAGAAATGGTCGATTGGGATATGGGCTCAAATTATCTGAATCTGATGAGTTGTCCCTTAGCTTCGATGTTTGAAAAAGGTGTAATGAATATCGACCATTGCAGCCAGTGCAATCAACCAATAGTCGCAGTTTTTCGTTACGGCTAAGCCTATACCACTCACGGATCGTTTCGGTTAAATCGAATTTTTGCCATCCCAAATGTTTAGTGTCGACTTCAAAAGAAGCCCGGAACAGAATAGCTTTGTCTATTCCCTAATAATAAAATTCATAAGGAAATTTGTAAAATCATAGAATATCATCATTTTAATATTACCTTCTCTGTAATATTTATCGCTGTTGATAATTGAAAAACCCAGATTTTTATTCTATGGTGGGGTTTATTTGCCCGCCATTTTCTTTTAGTATTTAGCAAATGTTCTTCCTGCAAATGTTTTGCTCTTTCGATCCAGAAACTGTGTGGCTTGTCTATCCGTATGTGAATCTGGGCGCTGCGAATCGATAGTTTTTGGTTTGGAACACGGTGATTTTGGGGCGAAAATTCAAGGATTCTATACT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTTGATATTGGGTTCCTTAAAGTAAACGTATTATGTCATTTAAAGATTATTAGTACATGAAAAATACAAGATTTAGGACGGATTGTAACAAAGAATTAGGATAAGATCGTTTAATGAAAGGCAATCGGCACACACATGAATTGCGTCTAAGGTTGGTTAAATAAGAGGTCGACAAAACCCCTATAAAATCCGCTATAGGGAATATCGTAGAAAAAGCAATCAAACTCGGGCATTAGCCCGAGATCAAAAAGAATTTGTATACATTTGCAGTCTAGATGGAATTCTGCCAAAAGTTTGTAAAACAGAGGAGGAGAAATTTCGGATCTCAAAATGTATATGTATTCTCGATCTGCATCAAGAGGCAAGTCCGTCTGTCCATATATCACAAATTTTGAAAGTGGATTAATTTGTCACTGATGTCAGCCTAGGACAGGCCGATGTAAATTTTAAAATCATTTGTAATACAATTTTTGCATGTCCTTTAGTTCAGGAGAAGGCTCGGTGTGACATCTCAGAAGGCAAGAATGTTGTTTTTGTCAAAAACACTGTGTCGCGTAGAGGACTGCCGACGAATAATGTCGAGCAACAGATATTTGGAGATTTCGCTCTCTTCACCACACGGTATGTAAAAGGAATCGTTTGCCGATCCCATTATGTATATATATTATTGCCCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGACTTTCCGTATGAACGCCAAGATCTCGAAAACTATAAGAGCTTATGAGACTTGTCTTTGTTTCAGCAGATTGCCGTGCTTAATTTATCGTCCACAAACTCTTTCTAATATTTGAAAAGCTTTAAATGTGTTTGTATTCTTATTCAATGCCCATCTACATGCCAAAAACAATGAAAATCTGACAATTCATTTAAATTTATAACCAAATATATTTAATTGATTGAGATTGATTAAATTGACTTACCTTCTTCAGCAAATGTAATTATTTCCTGAGTATTTCCAAAAAAGTCTTCATGATCAATAATTTCCTGGTCATGAACAACCGACTCGTAATGCCTTTTCGATTTTTCTTCATCAATGTTTTGAACCGTTGAATGATGTCCATTGCTGGAGATTTCATGGTAATAGTTTTTCTCATCGGTCGAAACACTGTAATCGTTAAAATAATCATAAGCATTGCGCCTGATCTCACCATTTATGCCACTATTGGCGCTACTATCACTACTACGATTTATATCTATTAGATATGTAGATTTTCTGTACGCATTCGCATTTATCTGTCTGCCGCTAATGCCATTTATATTATTGGCGTCTCCACTTTTCAACATCTGAGTTATACTGCCATGGTGGATTTCATGTTGTGTTGCAGATTTAGACGAAATACGAGAATTCATTTTTAATGGACGTTTTTCTGTCCATCTCGTCAAAAATAAGTTCTTCCCATCGTCTTTCTGTATATGTTGTCTTTTCCGGCCTGCAGACCGATTTCTCAAAACTGGATCATATGCATTCCCTTTACTTATGTTGAAGTTATAATCGAATGGGGATCGAAATTGATGTTGACTACTAGGAAAGGTCCTTTCGCCCCGGCCACTGAACCTATGTGTTTCGGGTAGCGTTAACGTCCGTGGTCTGGAGTTCTGTTGATCAAAATCATTACCACTGCTCTCAAATGCATTGTTGAACCGTCCACCATCTGCACGATATAATGTTTCCCAAATAAATTGCTTAGGTAGGGGATGAGATACATTGGGTTTGTGGCTGAGACCAAGCTTCGTCAAAATTTGCCGTTTAATTGACTCCAAGCGAACTTGGTCACTCGGTGCAATGTTGTTACGCGGTTGATTAGTTTTTTTGTTGAAGTAATTGTTGGTATGGTATTTGTTGTAGATGTTGTATTCTGTGTGTGGATTATCTGTGTAAATGTGATAATTGTAAAGTGTTATGTAAGTTATTTATTATAATTTTGTTTGTTTTTGCATTAGTGTAGTGGAATTTACTATAAAGAAAACAAAAGTTAAATATGCCCATTATTTGAACCTACTTCTTGTTCGTTGGTCGTCATAAGTATTTTGTGGAAAAAAAAGTTAAATATACATGATTATATAATTAACTTACTTATGAAATTAACTTACTTATTTTAACATTTGGCAGTATTGCAAAGGTAATATAAAGGGCGTTTGAATGATGCAATACTTTTCGTAACCCATTCTTTTATTATCAAACAATTTATATTATGTTAATGAATCACTATATGTATACCCTTGCAGAGCGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGCTATCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGTACAGCTATGTCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAAATTTAAAAAATCATATCTTTCGTGTTTTTTAACATCTACTTTTATAAGCTTGGATAACATTTTTAAATTAGTCCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCAATAGGAAGAATCGGAACAATCGGAAAATTAGTGCTAATATAATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTGATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTTGTCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGGAAAAGATGCAATATTAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGAAAATAATATTTTTTAATAAGTTCTGAATTTCAAATTAAATTTTATCGAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGCATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACTTATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTCAAATTGAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTCTCTTGTTTTTAATTAGTTATAAATGGGTTATGAAAAGTCCTAAATCTGTCAAACGAAATTTAAATAACTTTTTCATTCGACTCTACACATTTTTTTGTTTTGCAAAATAGGTTTGGCGACTAGTATATGTAGAAGAGAATTTTGGTAAGTTCAAGTATTAGCTTTTGATTGTTTTTGTTTTGTTATTATTTTGTCGTTAATTTTGATATCGGCTAATAAGCTTTCTCTTAAGCAAAAAACCTACATAACAAAGCCCAAACGTGGTTAAAGGATTCACATTACAAAAATATATCTTAGTAGTGCATAGTCACGCTTTCTCCTAAAAAATTGCATTGAGTTTGAAATTAGAGATTTTCCTTGTTGGAATGCATTCCCTAGCTTATAACTTGATATTTTCCTTCCAGTTAGTTGGAAATAAACTCTTCTTGTGAAAACACACACACCGGTTTGTGCTTTTACTGCCAGATTAAAGGGTTATGAAATAAACTTTGTGTTATTCAAAAGACAACTTTGAGTAATTAGACCGACAAATTAGAATACTAAAGGCATGAGAAAAGCTAAAAGAAACTATCAGCTGAGTGGCCTCTACGTACTATAAAAGTTTCTTGAAAGACACTTCATAAAATATAACCACACCAAGAAAAATTTAGAAAAAAAACCGAGATAGATTCTTCCCATTTTTAGCCTTTTCAACGTGAGGAGACGTAAAAATGAGAGTGAGAGATAACGAAAACTGGGCATATGAATGTGTTGCTGGAAGTTAATTTCTTCGTTTTTGTTCAAAGTGTGCGGTTGAGTTGATGAGTGATATAGAAAGCGACTAAGAATTTGCGGGTCTACTTCGCGAGTTTGACTTAATAGAGGCCCTTACCCACCTGAAATGTAAGAAAAGTCATATTTTTTTTTCAATT'..b'CTGTTAACGACAAACATGAATTTACTTATACTCTTTCTATGGTCTGATGAATGTACCGTGCATTGCGCTGCATCTTCTGACTAGAAGTGTGATCTTTTGAAACTAATTACGCACAAGGTTTTTGCAGTTTGTTCAATCGATGCAGTTTGTTATTGATCCATGCCAACATATGTAAAAGGAGAAAGGTTTTGCTTGGATTTTTTGTTGGCTCTTTACTGAAGAGTACATAAGCAGTATATTGGCTGTCGGAGTGGGCTCTAACCATTAATACATTGACACATACGCATATGTTTAAAGCAAAGCGTAAATTACTTTGCTACTAAAAACACTCCTAAAGCACTCGTACATTTTGAGCATGAAGACCGTACAAAGCGAAAACGGGAGTAGGCTCTCATACCTTCTGTTTCACTGACCTAACGCTGAATCTTTTCTTCTCTCTCTCCGTCACACATTCAGTGTGGTGATCATATTTCAAGCCCAGCTTTTGCGTCCGACCAAAACGCTATGTCTCCCGATTAGTCGAATGGCAGTTTGAGCGCAAATGAAACCGACCAACCGTATAGCCGTCTTGGGCCGAGTTTTGAGCGCGAATCAAAAAATATATAAGCCACCATAAACACACTCAAAAAAGTGGTCGCTTGAGTTTGAGCGATGTAAAAGCGGCTTCCGCCGTCCATTGCCATTCAACAATTTAGTTTCGCTCGAGATCTCTTGGCGTACGCTTCAAGATCCACCTGAAACTCGCGTTGTTTCGTGGACTCATAGCCAACAGGTGGAACGCGCTGTATTCTTACCTGCCAAGTAACGTAGAGCGTACAAAGTATATAGAAGTGATAAAGATTTATAATATAAGTGATAATAAGAGTGTACCTATCGAAACTAAAAGAGTGATTTTAAATTCGTCCTCCACAGAGTTTAATACCTACAAAGTGTCGTTATATAAATTTGGTTATGACACACACATTTAATGATTTAAGACGTTAAAAATACAAATACCGACCTAAAAATATTCAGTAAGTTCGCTTGCTATTATTACTATTATTAATGTAAATATTTTTACCAATTTAAATAACATTTTGCGCATAATTTTACTCATCTGACTTTTGCTGTTGCCCGTTTTCACGGCTTCTATGCTGAATCAAACTCCAATATTTTATTTTTACCCACGCTCCTGACCTTGAGCTGCTTATTTTCTCTGTTTTCATAGACTGCCTTAGCTAAGTTTTCTGACTCTCCATTATTCGGTTGGAGTGTGTGAAAATAAGGCTATGTTTCCCACTTTTAATTTTGTTGAATTGAATGTAGTATAAGTAGTATTGCCAGAAAGTGAGTTTGTATAGAAAAGAACAAAGTCTATAAGCCCGAATGACCTCGAAGCAGGACCGCCGTGCTCGACCGTGACTTTTGTTTGTGGTACCAAAGATATCGCGATTTTCCTTACTTTAAATTTATAGTTCAACAATCTTCTTAACAATTAAGGATTTCATGCGCCGTTATTTAAACATAATTTAATCGTCTTTTCATTACAACATTTATTTTCTATGTATAAAAGTTAATATCTATATAAAGACGAATTAAAAATAATTTTTCAATTACGGCGCACAAATACTTAATTGTTAATGTTGAATGAACCATAATGCCGTCTGTCCATATGAACACTAAGATCTCGGAAACTAAAAGAGCTAGAATGTTGGGATGAATCATGTAGATTTTTGAGCTTCCTGTGCAGCGTAAGGTACGTTACGTTGCGTGTTTGTAAATGTTTTATCTCGTATTATTTCTTATAATGTTTAAGGCCAGAAGATGTGTATAAAAACTCAGAGGTATTACTTTTATTCGGTCATCGATCTGCCAGACTTCCACTTTTTTCCGAACTTCTGTTAACATAATATAAAGAATGAATTAAAAAGGGTCGATAACGGTGGAAAGATGTAAGCAGTTGCGCCAAAAAAACCTTCATTTTAACACTCAAGTTCATTGTGATAGCAACATAGAATGTAAATACGTACTGTTCTCCCACAAAATGTGTGTGCTGGCCGATTGGCTTATGATAATTTACGTGAATAATATACAAAACAAAAATGGCTTACCTAAAAAATATAAAAGAAAGATTAGGAGAGCCGGCTTTGGGGTACCTATGTATTTATATTAAGCGACTTAAAAAGTAAGAAAGAAACAGATGGCCTAGTCCATAACCCGAGCTGACTCGACTACAGCGACCCTTAGGGGAGTAATAGTTCCAAAAAGGTCAATTAACAACAGGTGAATGAGTGCTAGCAAACACGTTTGCGCGGGTTCGGCCTTCATCTGGCGTGTAGCCTGTGCACCTTGCAGGGCAGGCGTCAGGCTGCGACGACGAACCACAATTAAATGAGCGGGAAATGCTGTTGCGCATTTTAAAGCCTTACAGAAATGTATGTTGATTGCGTTTAGATAACTGAAGGACGCAAATATTCTTAAATTTAGTAATGTGTGTCTCAGAAATACATTTTTTTTTCCAAAATGTTTGGAAGTATAATTTAAACTAGCTAGGGACAACACGTTTTTTTGTTTTTAAGTATGAAAACATTTTTTATTTAGCCCTTAAGTGCCTTAAAAAAATAACAAAAACCTTCTTCCGTTTAAATCATAAATAAATAGTGTAATAAAATAAACAAAATTGGTTGGGTGTTTTAGTATAGTTATGTAACAATGTTTAGATTAAGCTGGCCAACAGGTTTCCAACAACGTACTTGGGTAGTTAAAAGACATCATTCCTGTCCCAGTCTCTTAGCTTAAATTGGACTAATTGCTTTAAATGCTTATATAATGTTTAACATGTTTTTATAAATTGTTTTCTGAATTTTATTACTAAATTATTTTTTGACCCAAAGTAACAACAGCTTTTTGATAAATATAACTCGTAATTAGGAGTAAACTGTTGGGATAAATATTGTAGTAGCACCACTTATTTTTCCATCTGGACTAAGAGGATATGAATTTTAAGAACAAGTTATGAAAAGCGGAATAGACAACATTCTGAAAAAACTTCGTTATTAAAAATTGAATTGACTCAATCTGCTACAATTGGGGATTGGTAGCCCTAGCATCCGACCTAATCTCGCAAGAGCAAAAATAGGGACTCTGCCTGCTTAATTGTGAAAATTTCTGAAAAAACCTGGTTCGTCCTTTATTCTTCAGTCTCCCTCTCTAGCCCCGGCCAAGAACATTTCTTACTTATTTTGGGAACACCTTAACATAATTTAACCTTGATGCAATCAAGAAATAAGGATAAATCGGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCATGCAGTCATAAGAAAAATTCAACGTTAGTAACACCATTGTTAAATTTTTAAGGATTGTTGCTAGCATCAGGGATACAATATATCTTAGCTGCTTTTGTTTCTATTTTTCTTTGGCTCCCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGTGGCACTCGACTGTAGCGTTCTTCCTTGTTTAACATTTAACCTTCTACTCTTCGAAATAACATTTTTTGATAAGTTCTGAATTTCTAATTTAATGTTAACAAAATCGAACGACTATATTATATAGCTGGCATAGAAACGATCGGGAAATTGGTGGGAAAATAATGTGAAACCTAGCTTCGGTGTCGGACGACTCTAACATATTACCAAAGTTAACTTTCTTTCTCGTTTCTTACTAGCGTCACTTATCGTATACCTGCTTCACCTGCTTCCAGTTTCCATCATTTTTGGCATTTAGGGTGGTATTGAAAGTATGAACACAATCGCATTTAAATATTCTAATATAAAATTTGACCGCTAGACGGTTTCCAATAAATTAAACTTGCGATGCGCAGGAACCTCAAAAATCTGTATCCCAAATCTCAATTGCCGATCCTGACCAAGAATATATAAATGAGTTTGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTATATTCTTTTCGACGAGTCTACTCTATGAAACTCTAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/2d6/bc0/3c/scaffold_61-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -GAGTAACG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTAAAAAATACTGGAGAGGTAATTATTTGCATAAACATGACTGCAAATGATAAAAAGGTATTTCTTAAAAGTTCACTATATGCATTTCTCGACACAGGGTTTTCTTTCTACTTCTCAAGATATATTTTTTACAGAGTATCAATGTGAAATCACTACTTGAAATCATACATTCCTTGGTCCTAAATTCTGAACCGTTACTTTTTACGATTTAGAGATAGTATGGGAGCGTCAGTGTGGGTGTGGCATCTGACGCTGCTCACGAAGCACACAAATTTGCTTGCCAAATCCCAAAAGTCTAGCTCGTATAGTTCCAAAATCCAGACAGGCTTCGCTGTATTGAATCGGCTATGAATAGTAACAACTTTTTAGGTTCGGAAACTTTTTTGGGTAAAAAATATTATATTGTACAACAGATCTATATTAAAGTACACAAAAATATACAAATGTGATTTTTACTACGATAATTTTCCTCACTTTTTATACGATATACATATGTGGGACACAATTGATCATAGGTAATTTACTAAAAGATATTAAGCATTCGATTACTTTATACTCAATTTTTAATTTGTCGCTTTTTTAAATTATGAAAATAAATAATGTTTTAATAATAAGGAGTTTCGTTTTAAATGTGTAGAGAAGCTCGGGCTGTTTTTAATGGGCTCAAAGTCGAACAAACTTATGGTCTCAAATGGCGATTGAACCACCACTTCTCTCCAACAAACAAGAATAAAATTAGAAAATACTTTTTTGGGTTAAAAATATTATTCTTATTAAAATATATATATTTTACTAAAATAATTTTCACCAAAAAATAAGTATTATTCCAGGGGGGACTAACGCCATTGCTTCTAAGATTACCTTCCCCGTAAAATTTTTACGGTCTGATATCATCCCCCTGGAGTAAAGAAGGTAGTCCCAAAAAACTGTAATACATTCATAAAAACATATATAGGTTATAATTTTTATTAAGAAAATAACTTGTTATTATGACCAAGCCATGCCCTGTACGTCTGGATAACCATGAAAAAACTGCACACAGACCAGGAGTGGAATTGAAGATGGTTGTTTCTAAAACCAAAACCGTAGTGTCAGAATAAATTTCGACATTTTTAAAGCCACCAACAATAATGTTGGGTTTGATTCATCTACATATTTTTGAATGGGTTTGTGTAAAACCGATATTTGGTTAAATATTTCTGTGACACCCCTGTATTTGACTAGCCCGACAGAATTTTTATCATTTTGTTGTTTAGGCCATGACAGTATTTTATTTCGATAAATTTGATTTTTCTAAGTATGGAGTCGGTCAATTAAGATTTTTAACGACCATATATGTAGATGACACTTGAATCTAAATGTCTATGTAAAAAGTATGTAAGTTGTTCAAACAGTTTTGGATCGAATATGCGAATAAAAATTGGAATTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGACCACATAAAGTATCAAGAATATGTATATCTTGATCAGCATCCCTAGACAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTATCCGTCCGTTTCTACGTAAGCAAGTATCTCAGTTTTAAAGCTATTATGTCTTCAATGCTTTTTAATATATAACCTCCTACGCTTGGAAATATAATTCTTTAAATAGTTCTGTATTTTGAATTAAATGTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATATCTGCTATAAAAACGATCGGAAAATAATATGAAAAAATTATGTCTTTGGTGTTTTTAACATATACTACGCTTGAGAATAACTTTTTTTAATGAGTTATCAATTTCGATTTAAATTTGATCTAAATCGGACTACTATATCATACAGCTACCAGAGGAACTATAGGAAAGTTTGTGGGAAAATAAAATTAATTATTATTATTAATTATAATATTGGGAATATATTTTATTTTTTTAAGAAATTAATTTTAATAAAAATTGGACGACTCTAACATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATGAAATATATATATTTTTTAATATTACTGAAGATAGCAACAATCCTTAAAAATATAAAATGGAGTTACTAATGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATATACATTTCGGCTTGCCGAAGTTACCTTTTTTTCCTTTTCTCACTTAATCAAATAGGTTATACTTAGTAAAGCCTTATATATCGAAACAAAATGCTGTCAGGCGTGGCCAAAGGATGGAATTTCTGTCTAACTAAATAAAGTTGTCAAATAAAAATAAATTACTTTTTCTTATTTCTCCTTTTTTTTTTCTCAGACACATGAACTCTTTTTTTTGTCACACAGACGCGACAGAACCAATCGTCGTTGTCCTTAGGAGCAAAAGTAATGCCCACACAAATCCTAAAATAAAAAATCATCATAAGTAAACTTAACAGATCGGGGGTAGTATTATCATACCAATGATACCACGCATCACAGCCATCACATCCAATCATAGCAGAACCGTCGTCTACCTTCCCACAAGCCGGACAAATCCATATACGGTTACCCTCGGCGTCGACGTATGACGATGGACGATTTGTTTCTGCAATATGTGAATTCTCTTCTGGAACATTTGCTGGTGAACTAAGCGAGCAAGATTTTGGACCTCCTGATGAGAGTGAGTTATTCATGGTCGTATTAGATGTCAACATCAATTGCTGTGGTAACAAAACTGAGCTAGCCGAAAGCGTTGACGACGCAACATTACTGTTACTAGGGTTCGACATCCAACCGGCTGAGCTGGACGAGTTTTGACTTGTGGATATCTGTGAAGTTCGCGTAGCCATTGGGAAAGGTTCCTGTATTACTTTCATAGAGTTACCGGAACATATGTTTAAAAGGGGTCCTGCACTTGATATGCCTAATAAATGTGTATCAGCTGTAAATAATATGAACGTTTTGTCATTTTACTAAAGTTATGAACAAAACCCTACATACATTGTTTGTTCTTCGGTGGCCCGGTAACCAGTGGAGAGAACCGGGCTAGTTCCGGGGAATTATCTCGCTCACGCTCTTTATTTTCTACTGGAAACATAGTTGGCTGTGACACCTTGACAGCATCCGTTGTGTCTTTCTCTTTTTCAGGACACGTTGTGGACTTGCCACTTAGTTTCAGTGTTAGTTTTGGTATTTGACTTGGAGACTGCTGTATTTTTGGAGACATCGCACAAGTGGCCGATAGTGGCGGTTTTACTGACATTGGACTGGTTTTCAATACAGGTGTACTCGCGGGTACACTTTGAGTGAAGCCATAATCTAAGTTGTTAATAAAAGGTGCCCTAGAAAATTCGTCGACTTCCGGAATTTGGATTAAAATCTGTAAAGATAAGGGAAACATTTGCAACAAATCGATGAAAAGCTGGAACTAGTGAATACTACAAAAAGTATCCTCGCAATAAGCACATCAGACCGAAAAAAATAAATTATTTAAGGGAATTGGAAGTTTATGTACCCTTACAGTTGAACCAAAACTAAACCGGTATTTTGGATAAATATGATCTATGATAGTTATTGGCTTTTCTAAAAAACTACCGATATGATCAATAAATTTTAGAAACATATTGACAGCCGATCTTAACTTGCCTTGTAAGGTTGAGCAAACTACGTTAAATTCGAAAGTATATCGCATCAGAGGTGCAATATTTCTTGCGAAGTTTTTTTTTTTAATTTGGCAAAAACTTGTAATAAAGGGACCATATCCTTAAATATTATTATTAGTACGTTCAATGTGTTCATATTTTTTGTCAATTTTTTTTAAAGTTTTAATATAGTTCCATTAAAAATATTTATAAATTGTTTTTCGTTTTAGTTCAGTAGATTTAAATGTATTCTGCCCGAATAATATTATTTAAAATGTAATTCGATTTGATTTCTTCCATAAAAAACAATTATATTCAAATTTTGCCTGAATTACTTGCGTGAGTGTTTT'..b'ATACTGAAGCTAAATTTTCATTTTCTTTTCACCTTCTTGATTTAGTTCTTAGATCATAACTCTTGCAAGCAATTGTAAAACTAAATTTACAATTGTTGTAACTTATGCAGACAGACATTTTTGTTTATTTTTTGGCAAGCGGCGCTTTGTTTTCTTTGATATTAACTTTAAATCTTCACTCAAATCGAAATAATAATTAATAAGCATTCAATGAAAAGTTGAATATGACAAAGATAATAAGACCAAACAACGCTTAGCCAAAAAGGCGCAGAGATGTTTCATTTTCTTATATTTCGGTTAGAAGGGAATCCTAAAGCAACACATATTAAGTAGTCATTACAATGTACACAAAATTGTGAAATATCTTCTTAAACTCAATTGTATTTTTACAGCAAGCACTTCAAGCGATAATGAACGTCCAAATGGAAACTCGCAACCACTCTGAGCAGATCGTTGTAAAAATACAAAATACCACACCAAATCTTTGCCTATTTTGCCAACCTATAAATAATTTATAAAAGTATCTCCAAGTGGCAGCCTACCGTTTACTAATAAAAACAGAAATAATAGTCCAAATAATTATAGTTCAAATTAAAAAGTTTTGGTTGAAAGATTAAAAAACAAAGTCTGGAAAAATGTGAATAAAATATAAAACATATTGCTTTCCTTTTTTAATTTTGTTTTTCCAAAAAAAAAAAGTAATGTATTTTTTCATGCCGAAGCAGAATTATCAGAGTTAATATTACACTTTATTGAGGTTAGCCACATCTGTTACATTTGCAATAATAGCGTAATATATACAATAAATTAATAACGATATTATATTATATTTTGTATACTAAAAAGTTTAAAAACTTAGTTTCATAGAAAGCACTTCGTAAAGTTCGGGGAAAACAAGACTTGCACTCATCCCTAAAATTAAAATTACAACTGGAGCATTGCAAATTGATGCATGTATAACTAAATAACAAAGTACAAATTAAAACAAATGGAGGATTCTATGATTGGTAGCATTAGTAATAACTGAAAATTCTCCTTTCCTAGATTATTTGAACTTGATTACAACAATATATCCTTACTCCATGAATAATAAATTATAATTTTACATATGGTATTTAGCTAGTAGAGAAAACGGTTGAGGCCTCAAAAATGTTTTGTATGGTTATTCTTAATTGGTAAATGTATTTCCTAATTGTAAATAATGGCCTGAATTTGTATGAATAAATCATTCTTTGATAACATAAATTATACGAGGAGCCTCTGTTAACCTATTTCTTATGACATAAAGCATTAATTATTTCTCTATCGTTTTGGAGATACAGCCATTTGACAAGTAAATTATTTCATTTCATAAAAACAATCGAAATTAAATTCAATTTATTTTAAAATCTCAATATTCTGCCTCAATCAATATTTTCTGTACAAAAATTTAGTTTGCTTAAAATCTATATTTTTAAATTATATTTCAATGTTTACAAGAACAATATTATAAAGATAATATAGCAATGTCTGCTTATTTGGTTCCAAAGAAATCGGGTAACGCAAAATTCGTTTAGTATTACCTAAGAGCGCGAATACTACTCAAAAGCGATTCAGCCTTTCTGTTTATAATTTAAAGAAATTATAAAAAAAAATTAATGATATAAAAAGTTTATAAAAATAAAAATGTATTTATAAGAATTTTTTAAGAAAATTGAATAGAAATTCATATTTTAAGACATTTATATCAAATAACTTTTTAGAATAGTAATTTTGGTCAATTACCAAACACAACAAGTTTGACGGATTATTCTTTTATTGCCTTATTGGTTGCACCTTTAATAATATCAAAATTTGTAATTTAACTCAGGCCTTCAAAACCTAACTTTTGTTCAACTCAACCAATGAGATATATAGGTTTTATTAGCACTGCCCATCCGAAAGTTTGAGAACCAGCTCCAAATAGTTTTGTAGAACGTCACATTCATTGGCATGGGAACAAACGAAGCCACTGACACCGACACGTTTTAAAATAGTGAGTAATACCTTTGGAAATAAATTTGATATTAGTAAGGTTCTTTTCCGCTTCTGAAAAATCCATAGAATCTGTATGCATTATAATATCGCTTATACGGACAGACAGACGGAAAAATTATTCACTTTATAGGTTGGGAACGCTGCCATCTTCCGTTTGCATTATTTCGACGAATCAAGTATGCAATTTTCATCTACGAGAAAGGGTATAGGTACTTTATATAACAATAATTCACATTTTAGTTCTGTAGAAAAGATAAAATGTTGCAGAATACTGGTTTACACTCAAAAAATAAATCAAGATGTTCATGCTTCTGGTTTCGTTTGTCAAACAGCTGTATGAAAAATAGGAGTTTAACTTAGGACCCAAATATAGCTTAGATCCAAAATATCATAACTGACTGTTCTCAAGAGCAATTTACTTTGCTGCTGACTTGAAGGTATTTATTTATTCTAAGTTATGCCTATAACGTCGAAGGCGCGCGCTGTTTTCAATTTTTGGATCTCCCGGTGGTGGTGAAATGTTGCATTTATCTTGTAGCTCAGCGGAATATATACTCGTTGGTACATTATTTGATTCTTCGTTTTGAACAACTTGGGTCCCGATAAGTCTTTGTTTTTCCCCGCTAACAGTATTGTTATCATCAAAATTTCCTAACATTGTATTGGAAATGCCACGGGTCCTTTGAAGATATTTGAATGTGATTAGAATTTAATGTATGAATAATACAAAATTACGGGCATACCTGCTGGAAGTTCGTGATCGAGGTCTTTGGAATTTTAATTGCAGTTGCGTTTGATCTGTGACATACTTTCCTTCAGCAGATTCCCTTCGACGACGTAAACCTAAATAAATAAAACAAACTTATAAAATAGGATAATCAATTTTCGACACAAAAGTTGATATTAAAACTTTTGTTGGTTGAAGGTGCGATCGTCACTATATTTTCGCCTCGTTAAGAGGTGATTTTGTTTTATATCAGAAGTTTTCCTATAATCCATAAATTTTCCTAAAATTCGTAGAATTTAATTTTTTAATGAAAACTGTTTAAAAGAATTTAAATGATTCCAAGAACCTAAAATAGATTAAAACAGACAGTGCTAGATGTTTTGAATGAGTAAATGTTGCCATTTTTGTTGACTAATAACTTTAAAGAGAACTTTTACAACAATTTTTGGGCTATCCACTTTAAAAAATTGCCCAAAACCGTTAGATAAAAAAAATTGAATAACCTCAAGGGCTGTACACCTTTAAATGTCATTTTAAATCGTTACATCCGTTTTTGAGAAATTAGAAAGGAAAAAAAAATTTAACTAAAAGACTTGGCCCAAAGGTTTAGACCAAGCCTATAGCTTTAGTACTTCACAAGTTACGGGTGTACAGAATTTAGTTATTTCTAGCTGTTTTCTCGCCAATCTAGCTAGTTTTTCGAAAAGTGGTACAATCAATGTAACTTTTATGAAGCTCTTTAACATCATAATTTCTAGGTCCTTCAAATAGAGTCTGGCAAAAGAAAATGTCAATGCTCAGGAGGTGTAAGATTCTCTGAACTGGTTTTTTAAGAATGTGTCGTATGCACGGGCTATACACCTTTACATTTTATTTGAAATCTTTAGAGCCGTTTTTAAAAAATCAGAAAAAAGGCTAAGCAAAATCTAAATAAAAAAAATTGGCCCATAATTTTTAAAGGGTGGTGCTTAGACAAATCATGTTCAAAAGGTGTACGTAGTATTTTCGATTTTTGTACTTCATAAGCTATGAGTATACAAAATGTAGCTATTTATATCAGTTTTCATGCTAAAGTAGCTAGTTTTTCCAAAAGTGGTATAACTAATGTTCCTAAAATGAGATGTTTAACATCGTCTAGAATTTACAGGTCTCTCATATAACGTTTTGGACAAAAATACAAAACAAACAACATAAAATTTTCCTTTTGATATAATCGTGAAAATCTTG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTTGCGTATTACTTTTGAACTGATCATCTGATTTTGACAGTTGAGGTGTCACTCGGCGCATATTTTAATACAACTAGGTGAAAAGCGGTTATTTGTCCCCACCGACCCCAACAGATTAGATTTTTAAAATTTTAACTTTTACACTTTCACGGTTCTTTTAAGATTACTGTACATTTTAATTTCTTCGTGTTATATAGTAGTCACCGTCGCACACCCTCCTGGTGCGTTTCGGCACTACGTGAACTGCCTTCCACAATGATAAAACAAATGGGTTCTGCGTGAGCAATTACAAATCTAAATACAACATGTAAGCTGGGACCAACCTGGGGTAAGATCCGTTATATTAGGAGGATATTCTAAAGCAGTGGAGTATGTGTTTGTTTGGGGATTGAAGGGAATTTCCGGAAGGGCGTCTCTGGGCTCCAGTGTCTTAGATGAATATACTGTAGTGTCAGCACCGGCCCAAGATGCACATTTTGACTGCCGTATTGGGATTTTGCTGGGATTTAAAAGCGGAAGATCACATCCTGAATCAGTTTCCCTGTAACTGTCAGTGCTGCCTCCTGTAAACGGAGTTTTGTAGTCACCTGATTTGTAATTTGGTTGATCATTCAACGCATTGCATGTTTCACTTTTTCCGTTTATCTTCAGGTTATTGACGCCGGTAGCATGTATGCTACAGGGATTAGCTTCGATACAAGCTTCGGTTTTGTCCGTGTAGGTTTGTTTCTTACATTTGTTCGCCGTATTTGATGGTAAAGCTATCACTGCAGCATTTTCTTCTATTTCATCACAGAAAATATTTGCTTTATCAGAAATGCCAGGGTCTGGATTTGCGGTTGTAGTATTTTTAATAGGTGCCAGCGCATCATAGTAAACAGAATCGTCCAGATGAGAGGTCTCTATCCAAGTGAATTTAAAAAATATGTTACTACTTATTTACTTCAAAACTAATTATAGAAACGATATAAGGTTTTTAAATTTTATTAATATGGTCAATACAAAAACAAACCTAGTTCAGCACTAAGCAACATCACGATTAAAAACAAAAACGATATTGTTTAAAGAATTCTTCAGAGCCCGTACTGCATTTTAAAGGGATAGACAACGTTTAGACGTTGTGATAGTCGTTTTTCTTAACAATGCAAAATTTTTACCAATAAACCATACATCTCATATTAAGTCAGAAGATAATTCATTGCTTTTATGTCACTTTTTTTTTATGTCAAAGTTATTGTGTCGGTTAACCACTTTTTAGGACGTTAAGGCGAGTTAAGTTGTTTTTAATAATTACCTTTTGGGATAACACGAATTTCCAGTCGGCCACTTATACAACCGTTGTTTTCTTGGACTGCTGAACTTAAAGCTACATTACTTCTTTGGCAAGCCATTGTCTGTACTTTCCATGGTTTATTGGCGTCTTCAGCCAACATTGCATCAGAATTCGAATGAATCGGTTGGTCGTCAAATAAATCGGCAACCGACACGTTAGGAAGGCTTCTTCGATGTTTCAATTTAGCTTGACTATTATTTGAAGTATTTAACTGAAACGTGGCGTCCTCTTTAAAAGGGGAAGGAAGGACAACCCTTGAAACTAAAGAAGTGGCAGGCTTAGCTTTATCCAATGGAGTGATATCTGAATATGTTTCTCGAACACAAACATTCCTTGCTATGTCCATGCGATATACCTAAAAGTTAAAGTCAATATTGGTATAGCACGCCTTTTGTTCTGTAGTAAAAACAACATACAAATTTCTATTTATCTATTTTATGCGTTTTTAACTATTAATTGGTTTACGGATTTTATATTAAAACACCTAAAATGTCTTCCGCTTTCTTTATTTTTAATTATTAATATGCTTACTGTGTCATCAAATGCTGCTTGTTGCACAGCCGGTGGTTCCAAGTCTTTACGTAATACATTACCCATTGCAGGCTCAGACCAACAGTGCGGTATGGAGATTCTCAACGCTTCATAATTCTCGATTCCAGTTATGTTTAATGTATATCTGTGAAAAAATTAGTAACTATATTTTTGAAACTTGAAACGCAAAAGATCGTGTCCCTTTAGATCGTTCCTTTAACAGTAAGTATTAAAAAAGGATGAACCCTATAGTCGGGTGCCTCGGCTATCAGGTACCCGTTATTCAGCTTAAGCCAAAGGGAAATGGAGATATATTAGCAGCAAATCGATTTTGTAAATCGCCGACGTGTATGTTATGTTGGCGGCAGACAGATTTGAGCTTTTTGGACGTTTGTGGGCGTGACAAACTTTTTTCAATCGGTCGGTATTGATGAGACAAATACATTTGTTTTCTAACATAAAAACGGTTCGTGGATTGTGGCCGTTAAAATGGGCGTGGCACACAATAATACGAAAAAAACCATGTTTTTTTTTCCCTGACGGCACAGTTAAAATGTATTTACTCAACGAATGGTACATTAAAATATCAAATTTTTACAAAGAAATATTCAACAAGAAATGAAGCTAACATGGCTAGATCGACTCGTTTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACGTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATATGGCAATGGTAGCAATCGTCCGAATGCTTTTCTTGAATTTGAATTGAAGTGCGGTGCCCCCCATAACTCGTTTTGAGTCTTCTAGTTTTTTTCGTTTCCGAGATCTCAGCGCTCACACGGACGGACGGACATGGCTCGGCTAGTAATCCTGACCAAGAAAATATATATGATCTTTATGGTGTCGGATACGTTTCCTTCTACCTGTTACAAACTTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGGGTAACGGGAATAATAAGGAACAACCACGACTATCAGATACTTGCTAAAGTGAACAACAGGAATAGGTATTGATGGATTTTACGTTTATTTTTATTTTAATTTTAGGTAACACAGTTTTGGCCGATTTGTGGGCGTCAGAGGTAGTGTAGTCTGGTCGGAAAAACGGATCGGAAAAAATATCGTCATCAAAAGATACTTTAAAACAAGTGAAGAAGTTAGCTTCGGCAGGCCGAAGTTTGCCTACCCTTACAGTAATAAGAAAAATTCGATTTTGTAAAAAGTCGGCTTATTATTAAAAAAATCTTTTTTAAACCATTATATTATTATTTGTTAGCATGTTAGGGTCATCTGGTTTTTATTATGATTGCGATGGTTACAAATGATGGTTTGGAAGAAAGAGTGGTAAAATAAAAATGTGGATTTTTCTCTTTGAACCAGTGGGGATCGTTGTACTCTCACTTAAAATACGCATCGAATAACACCTCAACTGCCAAAATCGAATGCTCTGTTCAAATTTAAATTTTGCTAAATGTCGTTAGAAAGTTATTTCGAAATAGTATACTATATATATTTTATTATTAAAATATTATACTATTAGCATTTTTTAAGCTTTTCTTCTGATTGCTCAAAACGGCCCTAAAATTTCAAAATAAATTTTAAGCTGTTTAGTTCTTGAGATTCTTTAACTTTCAACATATGACACGATGTCGTAAGAAGTCCCGTTTGAAAGTTATTAATAAAAAAATGGCTTCCTTTGCGAGTTTACAACACTATTGAACTTTTTTGTACGTATCTAAACTCTATTTGACGGTCCTGGAATTTTTTGAATATGTTAAACAGCTTAATATGAAAAAACTCCATAGTTTGGAGGGAAAACAGCCTTACAAAACATAAATTGGTACGCCCGCTTATGCCGTTAAAAAGGGATTTTTGAAATACTTTGTACGCTTTCCTAACATTATTTGTCTAAATACCATTGTTTAAGGATTATCGTCGATATTTCTTAACATTTTTTCTATTTCTCTAAAGTGGCATTAACGATTCTGGGCTAAGCCTTAAAGTGTGTACCCATTGCATTCCTGAACGTTTACAGCATGAACACATTCTTGT'..b'ACCGTTCATCTGATTCCATTCAAGCTTGGTCTTGGTGTTTCCATGTGAAAGTGACAGATTTGTTTGGGTTTTAAAGGACGGACGGAAAATTGAAAACTGATTTGCCTTCTTCTAAAATGTATACTTCATTATGCAACTTTGAAAAAATATGTTACTGCAAATTTGAAATAAATGTTTACTTCTTCAGTATTTTATTAAATATTCAGTATATTTTTAAGTTGTTTTTGCGTTATGTAACGGTTTTAAGACCCGTTTACAAGAATAGTACATAAAATTGGTTAATTATTTAAGAAGAAGACCAGTTATGGGTATTATTTGGATTTTACATAGTGATGAACAAAATTGGAGTCATCATAGACCTTATATAAATATATATAGAATATTCATACTTGGCATGAAGATTCCTAGGCTTCCTACGCAGCGCAAGCTTGTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAAAATCTGAGAAAATCAGTAGCGCATACAGTTTTTATGATAGAACCAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTCACAAAAAAAAGGTGCCACGCCCACTCTGCTGATTCATCAGTAGACCCTATATAGATGGTTTCCGCTTCAGAGACTTTTTATCCATAAGAAATACACGTATTACAATAGATATCACTCGCTTTGGCGCAAATCGATTTAGTATCTCATCATTTTGTAAAGATATGCATTTTAACTGCAAAATTGTTGTTATGGCCTAGTACTTAACCTAACAAAAACGGGGAAAAATTTTTTTTACCATTATTTTTACAAATTTACGGTCGTGCTGGCTTGAATACAAACAAACACTTGTAAACAATAAATAAAATAATATTGCACTTCCATAAAGAATAGGACTAAACGCAGAAATAGCTACTGCGTACAGCAATAGTTATATTGGACGAAGACAATAAGAAGCGCATAGATATTGCTGGGTCATCCGTATTTGGCTTAACGTCTAAAAAAAGGACGAATTTTAACAGATGTTATATATACAAAATTAACTATAGACTACATTCTAAGAATAGATTGGGGGTTAAAAATTCCAATAATATAAATTAATGGCTTTTTCGACGTTGATGCCGAGCAGCTCGATAGGCCAAGAAATAATTAAAATAATTATTTCATGAGTGGTATTTTAGTATTTTTTTATATAACCCTACCAAGCGCCATGAAAAGACTGTTTTCGACTTAGCGAACTGGCTCAACATAGAGTTAAAATTATTATTGCCTAAACATTTTAAAAAATTTTAATAAAGATAATAAATAAAGTAATATATTCTCAAAAAATAAATATTGTATTACATAATAGCGTTATTGTAACTATTATACGAGAGAACTGAACTTTTGTCACGTACTGCCCTTCAATTCCGAAAATATCACAGTGAAATCACTTCGGATATTCTAAATTTAAACAACGAGTTTTCCCTTATGAAATCCCTTGTAAGTGACACATCCCAAGTGAAATCACTTTGGAAATTCGAAATATATTTCTATTGAGTTTTAACCTATCAAAACATTGCATTTAAAATACATTAATTTTTATTTACTTTTTACTTAATTTAAATTAGATTGTCTTAGATTGTTTCTAAATATTGGTTTCTTCGTAAACACTTATCCGGGTCCTCGTACTCACAGTTTTCGTCAGAAAAAAAAACAAAAAAGCTTTTTGGCGTCTCACATGTCACGGCAAGCCTTCTGTGGAAGTGAAGGGTTGTCCAAGCGGTCATGTCACTCCGGATTCACAAGAAGTTAAACATAAAAAGCATCACTCTACTCCTAAAGTGCAAATATCTGTTTGCTCTTGGGAATTCCGTGATTTCGGAAATTTCACGGCTTGCGACGGCCACTAACCGCCCAAAAATTTAGTTTCTGCAGTATGAGCGCTATAATTTTTTTTGCTAACGAGTGTTGCACCCAACATTTTTTTTGCCACGCCCAATCTTACGCCCTTTAGCCTAGAACTTACATCGACAAAAACTGCAAACCAACCAGAGAAATGAATGGCGAATAGGCAGCTAACGCTTTTCATCGGGTCTGATTCAGATGAGCTAAGGAAATACTAGAAAAAATACCAAAATGAATTTCGATGGGTGCCGTAAGTCGCGGCTCAAAGTGGTCATCCTCCCCGGAGTGTCCACGCAAAAAAAGTAAATACTAGGCTAAAGAATATCGTTACGTTGTACTTAAATAGGTTCTCTATTGAAGAGCCGATGGACAACGCGTTTCCGTTGGCGAAGAAAAAAAAGGCCGGCTAGGCGCCTTCCTGCTGTATCAGCGGTACAACTTTATTCCCATCCCGGCTATGACTCCCCGCAAAGCCCATGTCGGGATATTGGGAATGGGAACTGCACTGCAGAAGATGGTGAAGCATCTGCTATACTAGAAGTAAGCCCTAAACTACTTAATAATAAAAATAAAAAAATTGATGTTGTTGATAATACAACCATTCTATATGTATTTTGCAAGTGAACTTTGAAAATTTCGGTCACCCTACAAAGAATAATAAGATTTTTTGACTAGTGAAACTTTGATCTTAAGCCTAGTACTGACATCGACGAAAACCGCGATCTAACCATAGAGTGAGCGAGGTTCGGCGGTTCTGTTTTTACTCAAATTAGCTAAGGATATACCAGAAAAAACCTGATTTTACAACTAAATTTTAATGGAAGTCGTTAAGGCCATACACTAAGGCCATACCTGCAGTATTAGCAATAAAACTCCGTCCCCATCCCGTCTCAAAATGCCCCGGAAGTGCACTGCATCGCACGGAGAAGATGAAGAGAAATAAAAAAATGGCTTTAAGCATTCCATTCATTTTGATTTTTTTGAGCACAACCATATGCGTATTATTTTAATTTTCCGTGGCGTGGCAGTAAGACCGTGCTATATGCATTGCGGGTGAACTTTGAAATCTTCGGTCATACTACTCAAAATACGATTTTCCACGTAACTCTTAGCTAATCTGAGGCTATCTAGGCTTTAACTCCTAAATCTGTTTGCCGCCCACATAACATATACAGGAATTTAGGGTAGGTGGCGTTTTACAATCTCGCTTTGCTGCGTATGAATTTCCATCTATCCTTTAATCCTTTTAGCTGATTAACGGGTATCTGAAAGTCGAGGAACTCGATTATAGAATGTTGTTGTGCCAAATAAAGAAAATTTAATAATTCCTCTCCCACAAAGCTTTATCTGTTTGTTACTTCAACTACCATTTTAATATACCTGTTACAAAGCATTTGTTTTTCTCTACAGCAAAAAATGTCTACACTCAGGACAAACTTTCGGGTTGGACTGTCTAAAAACAAATAACAGGCGGAAAGAAGTTTTTCCGACCCTATAAAGTATATAATCTTGATCAGGATCACAAGCCAAGTCGATCCAGCCATATCCGTCGTTCGTCCGTCCGTATGAACGCAGAGATCTCGGAAATCATAAGAGCTAAAATATTCAGACTTGACATGTAGATTCCTGGGCTTCCTACGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGCGGGGTGTCACTCTAACGCCCACAATCCGCCCAAATGCTAGACATTCTTTTTGCAAAATGTATTTGTCGTTAATACTTATCGATTCACCTCAAAAAATTTGCACCGCCCACTCTAAAATGCTTAAAACTGTCTGCCTGCCACATAACGTATACCGAAATAGCTAGTGGTGGCGCTTTACAATATTCCTTTGCTGCTTGTATATCTCCATTTTCATTTTGCTCCTTCAAGCTGAGTAACGGGTAAGTGATAGTCAAGGCCCTCGACTATAGCGTTTTTCCTAGTTAATATTGTCTAATGTGATTTTGTGATGCTAATCAAGAATTAAAGTATTTATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGCCTGTACGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAACCTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/30d/bbd/9c/scaffold_28-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCCATAAGTATTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAATCGGACAACTATTTATGCTCTCATAGGAACAATCGGAAAAACAATTTTTTTAAATTATATCTTTGGTGTTCTTAACATATAAGGCTTTAAAATATAATTCCTTTAATAAGTTCGAAATGTCGAATTAAATTTCATATTATTTATTATCTTTGGTGTGCATATTTCCTTATAAGCTTGGAAATAAACTTTTGATAAGTTCGGAATGTCGAATTTAATTTTTATCAAACTCAGACGACTGTATCCCAAAGCTGTCGTTCCTAATGCGGAAAATTGGTGGGATAAAATTATGAAGCAAATAATAGCTTCGGAGTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATCATTTTTTATATTTTTAAGACTTCGAACTTAATTTAATAAAAATCGGACGGTTAATATAAAGCTTTCAGAGAAACGATCAGAGAAATAACGAAATAATTATTTTAAACGTCACTGAAGCTAGTAAGAAACCTTGAAAATTTAACATGGTTTGGACTGCTATTATTGCGTCCTGCAGTGCACTTCGCTTCGTGACTGCTCAATCCCTTAGCCGAGATGAAGGACTTGCGGCAGTGCGCGCATTTCCGGTTCTCATTCCTTGTCAATGGAAGAGGATCCGTGGAGGTGGAGCTGGAGCTGGTGCAGTTCTTCTGGTGGCTCGACGCAGCGACCATGGTCGTGAACGGCTGTGTGTGGCACTATAATTGGTACACGTATCCGCTGTCGGCAGTTATTGCTGTGACCGCATCCTGGTCAAGGCTGGAATGGGAGGTCAACGCAAAAGGTTTTTCACTTATGTATATGCCGTGACCAATGGGGTACGAGTCGGAGTCGGCGTCTGCGCATGTGTTTTAATGTCAAAGAAGAAAATGAGTGCGGGGGTGTAGGGATGCAAGTGTATAAGCATAAACTGATACCGATCCTCGATTCAGATTCAGATTCAGTTTATTTTCTATGTGAATTCCTATTATTCAAATTCAAATACTTTTAAAGTTTTTCTTTGCTAAGAAACCAAAAATGTCCCAAAATTTCAGACTCACAAAATAAATCCCAAAACAACGAAACACGCACGAAACGGAGAAGCATCTCCTCCCCGAAAAGCATCTGTATCTTCCGCCCTGCGTCCGCCTCGTTCCCTTGCTTCAGTGTGACTGTCGACGGCATACGCATCGATACTGCGGCCCATTAAAAGTGCACCAAGCCCAGCAGGTGGAAAACCTGGCCAAACGAGTTGACAGAGTCCCCGAAAATGGTGGTGATGCTGGGTGGGCTTTTGCCGTTCTCACAAAAACTATTCTAATCTTACCTCAGACTCCAACACACTTGACGACACATCTACGTCTACTGAAATATGTAATTAAAAGTGGAAGGCGTCTCTTTTGTGGAAGGTGTCTTTCTGTGGAAGGTGTCTTTTTAGAAATGTAAGTCGTGTACTATCGTTTACAGAATGCCTTACTTTACCTTACTTTACTTTACAGTTTAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACACAACATATACCAAGATGGCCGGTAGGTGACGCCCCAAAATTATCGCTTTGCGTTCTTCCTAACATGCATCTCTTACACCCTGATTCCCTGGCCAACTCAACTGCTCGAAGTAAAGGTGCAAAGAGCGTGCGTCCTCCTAGGCGATATGCCACCTTCCTGGGTCCCTGGGCATTCACAGGCGCAATCCGGATGACGAACACGGAGTCGCTAATAAAAGCTAATTCATAAAGTGTCGCTGTTTTACTATATTCAATACTTGGGTCACCTTAAACAAGTTTATAATCTTTTTTTAATTATTTCAAGAGTTTTTGGAGGAAAGCGATCAAAGTCCTGGATTGAGCGATAGGCCCACAAGTCCAAGGCCTCGCCTCATACATCACGTACAGCCTTTATCCACTCGTCCACTGAGCGGGTGGGTTGAAGTACCTCCAACGAAGGTCCCAACCGAAGGACCCCGCCTCAAGACCAGTGCGCGGGTGGACCCCTCGAGAAGTGGTCCTGGGTCGCCTAATGGCAAGCCCAAGAGGTCAAATGCCAGCTTGATATCTCCTCCGGCTGCAAAAGCAAGTCCTTATAACGTAAAATGCTGGACAGGATCGTTGCAGATTCTCAACCCTCTGACGGTCGCTGACCATGTTGTTGCAGAGGCTCTGTACCTTGCAATCCTTTTTAATGGTGCACCATTCGTAGTTTATTCGGGAGTAAATAACGCCCCGGGGATCACGGACGATAAGCAGCCTTCGCCAATTTGGTCTAGAAAACTACCATGTTGATGAACGGATAGTGCTTGCGAATGGCAACCATCGTCTCCGGATTCCAGCAGATCTCCTCGTTGTAGGTCTGACACATTTTCGCCTGGGCTCCGTAGAAGCGTCGAAAGACAGTCGCTTTCCCCAGAGGATCATTTGCCCAGACTTGTTGTAGTGGCAGTTGTACAGCGCTGGTAGTGCTGGTGGGCCAGGTTGTCCAGCAGGGTCAGGCTCCTGATCCCCAAATAACGCGCCTTGTGGGCCAGAACTGGGCGTCGTTAGTTAGTCATAAAAATAATGTTTTAATGTTGCGCCATCTATAGCAGGTTTGTTAAATAGCACCGTCTGCTAACACGCCATCTGCCCTGCCGCACAAAGATTTCAATTCGCCCCGCATTTCTACATGTGCCTAAGCTCGCCTCATTTCCAATTTACAAAAGTTTATGTGAGTAACAGGGCGCCACCTATCAGTTTAGAAAATATCAAAAAATACTTATTTTTCGACGTACCGCGACAGCCCTGGCCCAATTCCGAGGAGAATTTTAAAGGCGCGTTTCTGTGGATTTTAAAAGTGAAAGCAGAGTACAAGTATTACTAAATCTCCTTATAATGCGATAACCACCAAGGTATACAAAATTCGGTACCGCATTAGGATTTTAGTCAAAAGTTTGCATCGCAGTAAAGGAGTCTGTCCAAACTAGTCTGTCACTATTAAACCGACATAAAATGTTCTTAACAAGAAAGGAAGTTGTATATACCTGCAGTTATAAAAAAAATCAACTTTAGTAAATACTTTTTTCAAATTTTCCAACTAATTTCCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATGAAATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCAAAATTCAGCACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCAAGCAACAAGGTTATATGTCAAATAGCACCAAAACTATAATTTGTTATATATTATTTTCCCATCAATCCCGAAATTCAGAAATAATTATAAAATTGTATTTCCAAGCTTGTAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTCTTTCATATTATTTTACCAATAATTTTCCGATCGTTAATGGGGCTGCGTCCGATTTTGGTAAAATTTAATTTAAAATTCAGATCTAATTAAAAAATGTTATTTCCTAGCTTAGAAGGTAATATGTTTAAAAACACCGAAGACATAATATTTTTACAATTTGTTCGCCGATAGTTCCTAAGGGAGCTATAAGATATAATTGTCTGATCCGGCTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCATCTAGTGACGCTGATCAAGAACATATATGCTCTATGGGGTCGGAAACGTTTCCTTCACAGCGTTGCAATAAAAAGGTACTTCGTTTTCTGTTGCAGATCCCCGTGGACGTCAGGACCCGTAGTGACAAAGTAAACAAAGGAGACTTTTATAGATACACCAAGAAATACTTAAAACGAATAAAAAATGTGCCGATTCGTACTTAAAATTGTATATAAATCATTATAATTATAACTCTTTTTACTAAAAATTGAAATTTAATCAAATAAAGCGTGTTTTCTGGATGGTTACAAGGTACGTCTTTGGACTCAAGGAT'..b'CATAATGTTGTGTACGCACACATGCTCGCCTACCCACTGGCGTGTGTGTGCGCACATACATACAACTGAGGGACACCGGGGATGCTTCTGTTTCATCACCGTGGATGATCTCGTTTTTTACGTACCTACGGCTGTGTGTGTACACATAACTGCGTTTTTTGTTTTCGCTTTTTTAATTTTACTTGGGGTGGTGACGGTGGTGTTCCGACTGCACAAGCAGGCGGAAGGTGGCAAAGAGTGCCCATTCCGCCCCTTCTGTTAGTCCCGAACCCTGTACCCTGTACCCTGTACCCTGTACCCAGAGCCCAGAGCCCAGAGCCCAGAGCCCAGGTTCCAGGTCCTGTTCCCCTTGCTGGTCGTCGTTCCCTGTTTTCAACGCCACTTTGCCTTTCCTCTGCACCACCACCAACTTCATTATAATTTTGTCGGGGTAGTTTTTTTTGTGCTCGTGGCTGTGGCTCTCGACGTTGGCTCAGAAATACCCTACGCGGCTGCTGGTATTTCGGACTGGAGCGCTTGGTCGGGAAGGTGACTCGCACGAGACCAAGCCCAACGACTAGAATAGCACCCCCAAAGTTTTTTGTCGGTCTGTGAAAAATTGGATAAAAAATTCTTGGCAGTTTTAGCATCTGAAATTTCCAGCATTGAATTATGGAAAATCGATTTTTTCGGTTTTGCAAAAATGAAAGGACATCTACCCTCTTCACATAAATATGTATTTGACGGTACCTTCATACATTAATATGTGCACGTATATATGTTGTGCGAGAGTTCTTGATTTGTGTACATTTTGCAATTCATCGGACTTATTTAACGATGCCTCCTGAAATTAGAGAAGTTTTCTGCTCTAGCTTCTGTGGCAATATGGAAAGAGTGTGCTAGCAAATCCGCTCCCCGTTAATAAGGGAAGACATAATTTCATTAATATTTAGGAAGGTGGAGGTGTGTCTCGGAGACCACAGTAAGCAGTAAATCATACGACTTGCGGTGGTCACGAATTGCTTTGTTCCGAGAAAACAATAATTATTCCTTAATAAATACTTATCCAAGCGTGCAAGCAAATATAAACATGACTATAAAATATGCACCGAGAGATCAAGGCTCTCCCCAATTTATTTATATTAAAGGGGGTTCATTCTTAGTATGGCGGTGCGGTGCCTTCAAGTTTCTACCTAAAATGTCTATAAAAATCAACAAATTTCGAAATCAGACGTTTTTTGATTCGGAGTGAGGTTGATTTGTAATCTGAAGTGAAAGCTCTGAAGGGCTTATGCACACAAAACTTTCATGGCAGATAGTTATGCAACTATATAAATGGTACTATCTTAGGAAGTTGTATATGTTTATACTCGTTACCCGTAGAGTCCACCCGTATGAGCGCGGGGATCTCGTAAACTGTACATGCTAGAATGTGGGAATTGGTATGCAGATTCTTGGGGCTCTCTAGCGCCCACATTTTGATTGTCAATATTTATCCATAAAAATTGTCCAAATGGGACCAACCATTACCAAGTTAGTCGAGGCACTCGACTTGTACCTAAAACAACAATCTGTTGACAACTCAGAACAAATGTTTACAATCTATTGGCTATTTCTGTATGAAAAAAACTTTTTTTTTATATATTAATTTAGTAGTTTAAAAAATGTTTTCAATTTTTAATTGTAATAAGAGTGCTCTTTATTCTGTTTCGTGCTTTTGTATAATAAATCAAATGGATATTTAAAGAAAACTTTCTAAAAAACAGATTGTATAATTATTATATAAACATTTTTATTGGTGTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTGTCGGTCTCAAACATATTATCTTTTACTATTTGGAATATCAATTTTTGATTTTTAAGAATTTCGAATTAAATTTAATCGGATCACTGTAACATATAGCTGTCAAAAAAATGGTCAGGGAAATAATGAAATAATTTGTTTAACACCACTGAAGCCTGCATAATCCTTACAAATTTAACATGTTGTTACTAACGTCGATTACTTCTTATAACTGCAAGGGAATACAAACTTCGTCTTGTCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTATTGTGTTTATTACTTAACAATTTTATTTCTAGTTGATTTTGTTATTTTGAAGGTTTCAAAAATATATACAATGAGAACATTCATTAACAAATTATGAAAAAATTTTGTAAACGCCGATAGGTGGTGTTCTAGATATTGGACAAAGTTGCTTTGAATCTTGAATGTCCTTATCTACATTTTTCTAACTTCGGATAAGTTAATTTTGAATTTAAACATTTCACCTCGTTAAGAAGTGTTTATCGTTGATAATACAAATATAGGTGTTTATAGGATTTGCGTTCAGAATATCTGTTGTCGAACAATCCTGCGATGTTGTAGTATAATATTTTTAATATGCACTTCTTATTTAAGTAAGATTTAAACTCATGGCTCCCGATTCAAATCTCGAAAGCCCGTTCGAGGGGTTGGTTTAGCGCTGGATTTTTCCCTGTCTTGCTTTCCTGCTTGGAAGTGAGATAGTGCTCAAACGCCGGCTGGCCCAAGTTAGCTTGCTGCTTCGATATTAACGCCGTTAATCGTATATCTCGGCACGCACGGACGGCGAAATGAAGGTCAAACAGTTGTCGGCGCAACACACCCCCATAGCCAAACACCCTAGCCAGCTGGCCATCTCGGCTGCCCATCGAAATGTTAAGCAGGCGACGTACAAATTAAGTTCCTGTAAATTTCCGGCTTGCAGCAAGGTAAATTAAACAAAGGCAATTAATGTGATTCGTGATTCTGATGCTGACACGGCGATGGAGATACTTCCTCCAGGCGAGCTTTGCCACCTGCACTTGTGTGCTTCGATGAAGAGTTCCATGGCCCGCCCTGTAATAAAACAGCAATTTCGGAGAAGGTAGTGTGCGTGGATTTGCCAGGTAGATAGTAAATTGTATACAAATAATGTGATATAACAATTGGCAGCTTCGATGTTATTGATCGTATTAGGATTATACAACTACATATAATAATTCGGGAAATCTATTGTTCTAAAATCGGATAATCAATACATATTAAGTCGACTGCGTTAAAAATAGAAAAAAAGGTTACTTTAGAAAAATATTTACAAAAATTTTGCCACGCCCACTCTGTCGCCCGCATAATATATACTGAGATAGCCGGTAGGCTTTGCTGCTTATATATCTCCATTTCCCTTAAGCTGAATAACGGGTGTATCACAGTCGAGACTCGACTATGTAATACAATTCGGACTACTATATCTTAAAGCAGGACCAACTTCGGCTTGCCGAAGCTAGCTTCCTTTTTTGTCTTATAGTGGAAGTGGGAACAAGGATGAACGCCATAGTCGACTGTCTCGACTAGCAGATACTCGTGACTCAGACGGATTCATGCGAGAAATTGATTTCATTCCTTTCTATTCTCTATGAGGTTGGTAGACAGTACCTGTTACTTGCTGTTTTTAAGCTTACAGTGCATTTTAAAGCACATGGCAAATACTATTTTATTCATTTTTAACCAAATCACTAAGAATTACATCTTCTAAATACACAAAAAGGTCTGAACACTTAAAGTTTTAGCACGGAAATCGTGTACGGTGCTATTTTTGTTGCTGCAACTGTATTTGTTGAAACTCGAAGCAGTCGGACGGACATATCTAGATTGAATAAATTGACAATGCTCTCAGCAAGGGAATTCAAATATATTGTGGCTATATGTATACGTTTTCTCACTAAGTAAGCTGCTGTTCACAGAAAACTCAATCCAGAAATTAGCGACAGCAACCGCTGAACCATAGAAATTGTATGATTTTGCTTGAAAATCGAGTAAATATCGATTTCCGTAATTTGGCTATTTCTATTCATCATATTCAAAAGAATGCCCTAATGGGTGCCTAGGCGGCTGCACTGACTTCTTTATTTAGCTGTGTCATTGAAACATAATTAATTTCGACATGGTAGCAGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAACCTGTTCTTTTGAGGCATTTCAATGTTCAGAGTCTTTTCACACTAAAAGTGCTTTGGGTAAAAAATAAAGAGACACATTGTAATTCTATTTTAAATTTGTTTTGCCACTTACTGGTCACTGAGACTGACAGGTTAGGGAAAGATTATTGAGCATATACTGGAGGCTATGCCCATACCCTTTGCAGCCAAGAGAGAAAACTAGATTAAATGATTTTCGCGCATTAATCTTTACTCTTATAATAAACGTAAACATAACACGAAAGTTTTACATATATTTGTCTGTCGACATCGACTTTACTTTTTATTATTGCACACTAATTGGGGTCGCTGTTTAACTTAGGGTTGTGTTGCCTATTTAATCTTACATACAAACATAATCTCATTTACATCAATACCTCGTCCATAAATTAATTTATTTATAGAGGCTTAAGTGTTCGTATGTATCCATATTGTTTCACTGCAAAAGACGCAATAGGAAAATCGTTGTACTTGATTTTGTATCTGTATCCTCAAGCTACGTCTGCCCTGGAGGGTTCAATCGCCGAGCTTCATGAGCTCGATGGCAGTTGGTGCTCTTGCTGATGCGAGTGTGAATGGAATCGGTGCTGTTGGTCGTTGCTGGTGGCACTGCTAGTAGTGTTGCCGTTATTACTGTTCTGCTGCTGGTCTGCCTCACTTTTTACTCCGGATCCAGGAACAGGAACAGTGCCAGTGGCCAGTCGGAACGCCGCCTCGGTGTGCGAGCGCAAAATCGCCTCTGCCTGATGCATCCGGAGCGCTGTCTCCGGATCCGGGAGGTGGTGGGGTGTGTTGTGCGCCTGGGGGTGGGGATGAGCCTGTTGGTTGGTGGGACTGATGGCGTGCTGAGAGTAGTTGGACGTCTGCTGATGGTGCTGCTGCTGGTGGAGAACTTCGATTGCATGCATTCCTCCTAGGCCAGGGTCTGGCTCAAGTGAACCACGCATCATGTGCACGTTCATGTTCATTGCGATCGATGCGGCAGCAGATGATTCGCTCTGCAAATTTGGCACATTCAAATTTGGAGATCGTTGAGAGCGGGTGTGGCTGTTGCTGGGGTGAGTATGCACCAACAAATGGGACAATTGTTGCTGTTGGTGCTGAGGCGCCTGCTGCTGCTGATGGTGATGAGAGTGTGCATGCGTATGCGGATGTGAGTGCGGGTGCGGGAGTGGATGGTGTGACTGAGTGTGATCACCGTGCTGAAAGTTAAATAAAATTCTAATATAGTGACCAGGAATTCCCATCAACAGCACAAAGGTTGATCAATTTCATAAAAGATGCGTTAATAAGGCGACCAAAATTGAATCGTGTTTTCCCTGATTATAACACTTACATGCTGTTGGTAGGCGGCAGGGCCGTTGCTGGAATTGTTCATTCGCATGGCAGCGGCCAAATTGACCACAGCAGCTTGGACTGCCGCGCTCGGCACTGCTGTGGTGTCCACTCCGTCCTGCGGTCGTGACGCAGCAACGGCAGCAGCAGCCGCGGCCATCAACGACATTCGGTTAGCCACGTGCAGATCCGTATCCATGGTATACTGGCCAGAACTCTGAAGTCGAAGCTCAACCATTTTATTAGAGGCCGTGCTGTTGTTGTTGGTGCAATTATTGTTGTTATTTGTGCTGCTGGTGATGTTCTGGTTGCTGTTCTCGTTTTCACTCAGCCCATGGTCGATGTCTTGGTCCTGATCAGATGCTGTTGATGACGTTAAACGTCCGTTAGAAGAGCATTCGGAGTTCACCGAAGGGGAAGGACACTTCGAGTTAGACCCCTCGGAGTTGTGTGTTCCCATTGTCAGGACGTTCGCGGCATCTGAAATCCCCATTCTGTCGCTAGTGCCACTGCTGGCGGCCAAGGTTACCGCTAGCATGGATTCGCGTTCTCGCTGCTCCGCAGCCGCTCGAGACTGCAATTTGAGATTAGATTGGGATCATTTTTAATTTTCAAAAAAAACTGAAATCGCGAAACAACTTCGCAGATTCCGTTTTTGCTAAGCAACTTGTAACGTACCAAAACGTATTGAGCCGCGAACTGATGTTTTGGATCCATGCGCATCGACTCCATGTGGGTAAGAAGGCCTGCATAAGAGAAAAGCGATTACATTCCTTACACAATGGGTCAACGACTCTGGGAGGTACCATTTTCATGAGTAAAGACTGCCTGGCAAACGCTACAAGGCCACATTCGCAGGCTGTTTGTTAGTTGGGAGGTCTCGGCGTGGCACGCTAGATGTTTCCGAAGGGATCCCTCATTGACGTAATGTTTACCGCACACCGGGCAAGGATGATTTGCTGTCCTTCGCTTTCCCAAATAGCTGTCGATTAAGTTGGGGCCACCGGCAGTGGCCTGATTGGAGCTCTGCGCGCAGCTCGAATCCGATGTAGTGTGCGCAGAAATTTGATCGTTGGCAATTCCACTCCCATTTCCGTTCCCACTGCTAGTTCCCGGATTTATTTCACTGAATTGGGATAGGGCTGGCAAAATGACACAATTAACGTTGTATATTAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGCCGTATACTTAATCATACAATATACGTGGGGAAACCCATCGTAACCCGCCATCTTACGCGGACAGACTGCGTCTACTGAACCTGCCCTCCCTCAAGGATCGTTGGACCTTCCACGGTGTAATGATCCTTCACTAACTAAGCGCTAAGCAAACTACCTTCTCGGACAAATGCAGTTCTCCATACCTATAAAGTCTACTCGTCACTTTCGACCTATTTCCCTAATATTTGAAAAAAGGGATTTTGAATTACATGATCCATTTCGCGTTATATGTTCGCAATATAATAAAGAGTAATTTTTGATATTTACTGAATGTTCGTAAATGTAAATGTAACAAACATAATAACCCATCTGTCTTCACCACCGCCCACTTGATGTGAGACGGTTACTTTGTTTTTTTGACAGATATTTGCTACCTTAAATTAAATAAATAAAAATATATATAAATAAATGTTAGTAACATGTTAAATTTTTATTTTTTAGCAAAGAAAGCTATATGTTAAACAAGAAAAAACGCTATAGTCGAGTCAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAATAGGTATGGAGATATATGTACATATAAGCAGCAAGGCGATATTTTAGAGAGTCACCTACCGGATATTTTGATACATGTTATGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTAAACCGTTTGGGGCGTTAGAATGGCCGTGGCACATTTTTAGTCAGTCAATTTCAATTAAAATTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGATTAACGCCAAAAAGATGGCGATTAATATATATACATAAAAGATAATAAAAAGGTATCGAAAAAATCATAAGAACGTATTATACTCCACGAGTATGGGTACAATTTTTAAAAAATACTGTTTAAATATGGACTATAAAACTATTAGTCGTAAAACTATGTCATCATTTTCTTACCTGATCCACTTGGCGGGGGGCTTTTTTCTTTATGAACGTGCTTCATGTGGGCCACAAGGGCTTCGGTGCCAAGGAAAAGTTTATGGCACACAGGACAGGACGTAGCGTTTGGGCCACCTATTAGTGCGGCGTGCTGCTGCAAGACACCAAGATGCAGCTGTAGCTCCTGTTCGAAACGCGCGGTGTTTTCGGTTGCAACAGGATTTTTGATGGGTCGAAAGGGCAAGGGATCGACACGAAGATCAGGTTCGAGGTAATGGGCGATATCGGAGGGTTTAATACAAAAGGCAATCAAAAATGCGACATGTCAGGCAGCTTTGAAGACAACGTGTGCTTACCTTAGATGTGTGGGTGCGCAGGCTAGACTCAGTGGCGAATCCTTTGCCACAAATATTACAGTGAAAGGGGCGGTTCTTTGCACGTTCAACCTGAGCGTCGTGGTTTCGTAGATGCTGCTGCAGATTCGAAAGCTGT'..b'CTAGATCGACTTGTCTAGTGATAGTGAATATATATACTGGGTTATGGGGTCGGAAACCCCTGCGAGGGTATAAAAAAATACACTTTAAGTTCTTTTTAACTTATTAATAATTTTAGGCATTAACTGACATATTTCAACAATTTAGCAATTAAACAATTTTGCCAATAATATTTGTAGTATCTAACCTGCTTAAGCCATCTATGCACATACGAATAAGTGCACTGGAAATGAATTTCCTCTTTCTATCTTCTTCTCGTTTTTTCGAAACTATACATTTCTCATGACATGTATTATTTCCTTTTTTTAAATAATTAGGGAGTAATTCAGTGCGGGGTTTGGTATTCGCCAAAAAGGTTAGAGCTAGGTGCAATGTGGTAGCGAGGAAAAAGGCGAGGCTGATTTCGTGTAGCTCTCTGGTTGGTTGGCGAGCAAGCGATGGTTTGTTTCCACTGGCTCTAGCAACCTTACATCGTATCGCCAGGGCCACTCGGTTTTGTCCGAGACAGACTGCACTTTTTATTCCCTTGGCCCAGTAGGTAGCTGGATAGCAAGGACATCACGACTACAGCCGTCTGACTTCGTCCCCTACCCCCAGACCATGAATCGCGTAAAAATGAAATGCAAACACACCCAACGGTCGGCGTTTTCAGGTTCAGCCAACAGGCAGGGAAATGGGGTTGCGATTAAATAAAAAGTCCTTGCATTTCTTGGTAGCTATATGTCGCCCGATTCCCCAGATGTGTTCCCTAGATAGACTTTTTTTGTGGGAATAGAGATAGATATTACGGTTTGCTATGTCCGATGTCGCTAGCTTTTAAGCTGCTCAAATTTTTTACAAACGAGAGAACATTGTCATATTTTAACCATTTTTCTGTCCGTCCGACTGTCAGCTATCGGTCTGAAACTATCCCAAAACCCTTCTTTCTGTTGCAGGTAGTACATAAGTCTAAGGTAAAATAATACATAAAAGACATGTTTTTGTGATTTTTTTCCTGCCGACACAAATGTATTTACTCAACGAATGGTATAATAAAGTATGGCATTCAAATAATGTCTTATACATTTTTTACAAAGATATATTCAAAAATGGCAATGGTAGCAATGGCTCGGACGTGTCTTGATAAAAAATTGAACTGCGGTGCCCCTCATAACTCGGTGCTGGATCATCAGAAATCAAAAAATCCAAGTCCATTTGTTAGATAATAGTTTGCCCAGATAACGCTCGATTTTTTTTAATTCCAATTTTTGAATTTTTTTGAAGAATTTGAAGTGAAAATTCCAATTTTTAGGAAAATATCGGATAATTTGTCATTGTAAAACCAAAATTAAGAAGAAAAAACTCGACAGCGTAACCTTGTAAAATATGTACAGAAACAGTGTTTAAAATTTTAAAAGGATCGGTGCAAGAGATTTGAAGTTATGGGGGACACCGACTTTGAAAACGTGAGTTGTGGGAAACACGCTTTAAAGTTTTAACACAAAATACAGTGTAGAATAAAAATAATAAAACTCATAACTTGATCAATTTTGCTTTAATTGACTTTAATTAACTGCAAATTTTGACACAATTTTACCCCGATAGGTTTGAAGCTGAGAGATCAATTTGCGTGGAAACGACCTGACGGACAGGTCTAGGCCACTGATTTTTTATTTTAAGGTTTCAATTTATGTGGCCTTTAACTGCATCAAATATGACGATTTCGCCCTAAATATGAGAAAATAGATATTTCATGTTTCTGAGTTCAACCAATAAGTATTGGCAAACCACGGTTGGCGCACATTCGGACTATGTCTTAATCAAAAGGTAAGAAAATATGAAATATGACGCTAAATTGCACACCTCAACCTCAAGATCCCCTATTTTCTAAGATCACAGCGCTCAAATGGACACACGGACATGGCTAGATCGACACAAAGACCCGATCCTGATCAAAACTATGCAATACAGCTTCGCTACTCTCAGTTCAGGGTATAAATATAATACAAGCTTTTGTGAAGATGTAAAATTGAGGGTGCCGCCCAAAACTATGCAATGACTTATTTGGCACACTGAGGAAAATCCAGTACATGTAGATGGCTGAACTCTGAACTGGAAATAGTTTAACTCTGCCCAATAAAGATTTTCATTTACTTTAATAATATTCTGAACATTGTCGAATGAAATTGAAACACGAAATCTTAGAGAACAGGCAACATGTCATTTTTAAGTCCTCCATTCGTTTTGGTTTTTATTTTCGCTTCCTTCTTCTCGCAGTCTCTACCCTCAGCCTTCCGCCCTCTGCCAGCACTCGACCCCTAGTGCCAGGGACGCAAACTCAAAGAGGGATGGACTTAGGTCCACCGGACCTCTTTCGCTCTATCTTAGGGGTAGCAGGAGGCGGTAACCATCGCTTCTTTTCGCTTCGCTCGGCGTGTGGTCGAGGTGAGTGAAATAAAAATGGTTGAAAAAACGTGAGGGGTGGACAAATGAGTTCGTGCGGCTGGGGGAGAGTTCGTTGGTTCGTATGTAGCAGCACACACACGTAAGCAGGGACTGGCGAATGTGTTTATGTCTGCGCCTCAGTCGTGGAAGACAAAACATCCGAGGGAAGGTCAATTGTTCGGGACGCCGGTGTCTTTAAATGAACGCAAAAGCCGTTGTTGCCGTGCTGTTTTCTGAGTGATTTCAGAAAGGCTCTTGTGAGAAAACGTTCGACTATGCTGTACACATTGCCCATGAAACAGTGCACTGGAAACTAGATAGGGCTCAACCAAGCGCGGGGGGGTTTTCGTGGGCCCGGAGCTTTTACAATCAGTTGATTTTTCTGCATGTTGTGATACCCTTTAAATGCATGTTTTTCCTACAGCCCCCTTATGGCCAGATTTTATGCCAAGGCTGAGTTGGCAAGGCAAAGTCTTATACCGCTGAGGCCCGATAAATTCCCAGATAAATTTACACTTTTTTTCTAAAACAAAGTGTGTGCATTTTTTTCTTATCCAATTTATCGAAAATTAAACTACATAAATGCTTAGGACAACTAAATTTACCCTTTGTGCAGGCCTGTGGGCGTTCAATTATTTTTATGTAGTCGGATATAAGAAATACTTGAATAGCTAGTTTTCGATTCTAACGGGAGGTGTTTGGTATAAAATAAGTGACGTAAAATGGTGGTTGGTATGTTAAAGGTCGGGAAAGTAGGCCTACAAATGCATAGAAAATATTTGAGGAAACACATTTTTTGTTAATAGTTGTGAACTAAATGCATTAAACCGATAACTCTAGTTTGAATTTTAATAAAAACATAATGCTCTCTTTAGGTTCGCATCATCATTTTGTTCAAAGTTTGATGCGATCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAAGGGAAGTGCACGGAGAAAAAGTGCATATAAGCAGCAAATAGTCTCTTTCCAATATTGCACACTTGATTAGTCCATATTAAAAGCCTTTTTTTATCAATAACATATTTTTAAAATGTCGGTGCCTGACGGGTTATATGGTTATGGTCTTTTGCGGGCGTAGAGCCCGGCTGAAACAAACTTGTGCTGTTCAATAAGCTCTACACTCCTAGCTTTTAGAGTTACCGAGATCTAAGCCTCGCAGCGGTCACACGGATGGACAGACAGCATGTCTAGATCGACTCGGCAAGTAATCCTGATCAGGAATAAGTTGACCTTTTAGGGTCGAAAGCTTTTTCCTGCTGTTATTATATTATACGAGTAAAATGATGATACTCTGCAAAAAGCATCATTGTTCAGGCTTAGGGCTCGTAGCGCACTGAAGGATTCTTGTAAGTGATGCTCACACAAGGCAAGTCGATATAGGCATGTCCGTCTGTCAATCTGTCAGGATGTATACCTTCTTATAGCCCCTAATCACACCAGTCCCGAATAAACGTTGACCTGCGGAAGGGTGCTTCTCAACCGGTAAAAGCTCAATGTTCCAATGTACCCAAAAAGATTTGTAAATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGAGAAAATAAAATAAAACAGTGCATAATATTACTGATACATACATTTAATTTATAAATAGTTTGTCGTTGCTTACATGTTTTTAAACAATAAACTTAAAAAGCCATTAATAGTAGAAATGATACATAATACAAACTATTTTTAAGAAATAAACATTTTACTTGCAAATCAAAGTTGAGGAAGCGGGTGTCGACGTCTGGCTTTCTATTCGCAGGTGAGGTGTTGTTTAGCAAAATCAGCAATATGTTATATGTTATGTGTTATAAAAGTTACGAGAGGTTTTTAAACTCTTTTCGCAACCAAACTGAATAAGCCCACTAAAATATTTTAAAGGAAAATAAGTGACAAAATCTAACTCTAGACAGCAGTTTCACACTTCCCCCAGCCCAAGAAATAACGATCGTGGGGCGCCCAAATTAAGGCTAGTTATTGGTAAGTAAGTGTTCGGTGATGTGATGGGATGTGCTGTTCTGCAGCTGAAGCTGAGATCGTGTCTTTGACGAGGAAGAGTACTATACACAACGGAACAGATGCCAACTCACTCGTTGCAGGGTTGACCAACATTCTTCAAGGGTGCGTTCACTGATCGCGGCTGCGCTGCTCGACCGGGATAGCTGAAGCTGAAAACAATCGAAGGGACACATTTTAATCATAAGTTAGCTGGCGAACAATGTTTGTTTCTTATATGGGAAAGATAGGCGGGAAATATGAAATTACTAGGTTAAATGTTGACATTGAATATATGTTTTTTTCATAAGAATACTTGGACTTCCATTTTCAGTGCTATTTACTTCGAAAGGTTCTAGTGTTGGCACTAGATGCAGAACGTGGAGTGATTTACTTTTAGTGTTTCTGGCTCTTAAAAACCTAATTTCATCATCATTTTAGGATATTTAAAATGTTCCCAGACCAATATATCACGTATAAAGGTTGCATTATTCTCCACTTGTACTCAAACCCATTTTTGTGCCATTTTCGACGGCGTTCCTAAAGTGGGTTTAAGTATTACGTGTTTAGCTTGTCTAGCTAAAATGTTGCACTACCGCTAAATATTTTGTTATTGAAACCTGATTCACCTTACACGCCAGAGGTGTTTTAAGATGGCACCTATTCTATATCAGAAACTAGATTACTTCTTATCGGTAATTAGTATTTTCTCTTGTTGGTTGCTCACGCCACGGCTGCAGTAATTATAGAAAAATATTTCTACTTAGAACTCTAAAAACAAAAGCGGGCATTTTTAGGTGGTGAAATAAAAATTAAAAATTACATCGTGCTCCTTTTCACAGTCAAGTGTCATTGTATACGATAGCGATCTAAATAGCCGATCGTAAAGCGAAACAAAACGGAACGGAACGGAACGAATACAACACAGTTCCTTTGCGGTGTGTATATTTTTGTTTTTATCCAGTGATTAATTTTGGGGACAGGTTTCCTGGCTTGCGAACTGTGCGGCACTTGGCTCGCATGTCAGGCGGATCTTAGCACTGGCTAGCTGCTCCAGCGACACAGCCCCTGAAGGACGCAATATCGGCTCAATTTGTTGGATCGGCAAGAGAGTTGTTCAGCCGCGAATGCCCTTCAGAGGTGCAGAGTATCGGTGGTCAGTGCAGTAAGTCACTCGGACTCGCGACCACGAAGTAGCTTGCGAACGAACGCACTGATTTTAGTTTCGTGAGGATATTTAGCTACGCGAAGCAGCACACCACGGAGCACACAACCTTACGGTCTGATGTCCTTTGAACTTCTGCCGGCACGGCGAATTATCATCGGCAAACGGGACACTGCGTGACTGCCAAGGGGTTCTTCTTAAACTATCCCGCTGCTGCCTCGTCGTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCGCTGCCGCTGCCGCGGTCGGGCTTCTAACTCGGCATCTCTTTCTCTATGCGCTATTATTGTTTTCTTGAGGAAACAAGCGCGGAAAGGACGGAGTTTTCAAAAAGGACGGAAGGAAAAAGCTCCCGAAAGAAGGCATCTGCATCTTGCGCTCTCTTCTCTCTTTCCCTGAGAAGGCAGAAAGGAAGGCGGGCGGGGCAGGGACGACAAGTCGAGGGAAACAAAATTATGGCAGCGGCGGAGTTTACGTCTGTGCTAGGAACAGTGGGCTGACTTTTATATCCTTGTATACCTAAGTGTGCGGGCGCGTGTGCGTGTGCGTGTGGTGCTATAGAACTGAACCTGAACTTGCATCCCCGTCTCGGTCCCCAAGACTCGCCTTACAAGTCAACTGAGGCTAAGAATTTCGCACACTTTCGCGTACATAGAGGGAGAGGCTCGACAACGGGGGTTACTTCGGTGCTTCAAGAAGAAGCAAAGCTAAAACTAAGCAAGGATAAGAACCGCTCTCTGCCGGCACCCGCACTCTCGCCTACCATCTCTCTCGGACCTTCGCTCTCCCTTGCTCTTACTGCCAACTATAGTAACTTAACATAGCCATTCCACACCACACCACTCCACACCACACCACCATTTTCCATTGCCCCTCTCTAATTTTCGACCGCTTTCCCCGAACTAGTCGGCACACAGAAAGATATACCGGTGGCCAACGGGTGGTAGTTTAAGATAGCAAAAGAGAAGCGCTGCCGCTATAGCTACCGACTGCCGACTCGCGAAGAAAACTGGCTGCTGTCCCGCTAAGTACGAGGTAGATTCTTGAGACTTGAGCGAGCTCGTGGACGCAATGTTCCCCTCTTGAGTTGAGCTGGAACGAGGGCAGCTTTCAAAATTTCCCTGCTGGAATACGGGGTTGTTTTGATGTACTCTTAAAATAGAAGCGGACTGAATTAGGGGAAAGGAGAAGAGCGGCATGGATAAAGAGAAAATTGTTGAAGCTTGAATAAAACATAAACTCGGGTTCACTCTTACTGAAAGAAGTGGTCAAAACGAGTTCACTTTAAAACTTTTTACTTTTTGTGCAAATAAAAAAGAAACTTCCAAGGTCGTTAGTGACATAGCCAGCCTACCTTTTCACCACTTCTTAAAGGGTTCCACTAAAATATTAAAAAGCTAAACATTTAAATACCTGCATATTGAGTGGTTTTTGCTAGTTTTCTTAAAAATCTGAAAGTGATTTATACCAATGCGGGTTATAATATAAAAATATTTTTCATCAGGCTCACTAGCCACTAGGTTGATCTGGCAATGTCCACGCTAGGACTTGGACTTTTCATGTACGCTCCTGGGCTTCGTGCGCAGCGCAAAGTTGTTTCAGCAGGGTGCCACGCGCAGTCTAACGCCCACAAACGTTCAATACGCTTGAAATCTAAATATTGAATAACTAAATAGCTAACTGATTAATTAAATAATTAACTAAATAACTAAATAGCTAAATAAATAACTAAATAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATACCTAAATAACTAAATAGCTAAATAAATATCTAAATAGGTAAATAAATAACTAAATAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATACCTAAATAACTAAATAATTAATTAAATATTAACTAAATAACTAAATAGGTAAATAAATAACTAAAAAGCTAAATAATTAATTAAATAATTGACTAAATAACTAAATAGGTAAATAAATAACTAAAAAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATAACTAAATACCTAAATAAATAAATAGCTAAATAATTAATTAACTAAATAACTAAAAAACTAAATAACTAAATTGCTAAATTATTAATTAAATAATTAACTTAATGTATCATTAAAAACATTTTAGTCGAACAAATTATATCAGAACTTTTTAAGCTGATATCAATTAACGACCAAATTTTGAATGGTTTACATCGGTTTATTAGGTTATGCATCGAGCCGAGCCACTATAGAATTGCTTCGTTTTTATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAGGTATATATATTCTTGATCAG'..b'TGGCATATATGTCTATACATATAGGTGCATGTGTGAGAACGGTCATAATGGTGCATTTTCGCTCTGTGGCAACACGCTCAAATTAATACTTATAAATTAATAAACACGTTGCGCGCATCTTCCCCTGTCTCGCTCTTTGCTTATGTACCTTTACCTATGTGGAGTTCTTATATATACAGAGAACATATATATTGAACACCAAACCAGATTGAACAGATTACCAAACATACAAAAAGCTTAGATTATAAACATTATTCTTTCAAAATTTAGTTTCAACATTTCTTAGTCACAAATAACAACGTTACACTAAATTGGATGGATTGATGATAAAATATGTATCCGCTTTCCCATTCAGAAATGATATAAAAAGTGTAGGCGCTACAGATTTTCTCGGATTGTAGGCGATAAAGTGGGCATGGCACCTCGCTGAATCAAACTTGCGCTGACGGCTTTAGCTTTTATAGTTTTTGAATCTGAGCGTTCAAACGGACAGACAGACAGACGGAAATGCCTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTTTCCTTCTACCTGTTACATACATTCCGACGAATCTAGTATACGCTTTTATTCAAAGAGTAACGGGTATAACAAAAACACTACTTAACGAGGTTTGAATATAGTGACGATCGCACCTTCAACAAATAAAAGTTCTGATGTCCACTTTTGTGACGAACATGTAATACACGATCTACTAAATAAATACACATTCTACTGTTACGGCTCGCCTCGCTAAAATCAAACAATTAAGCAATGGCATATTGATTGCAGAAGTCCCCCAAAATGTTGTTTTGCGTATTACTTTTGAACGGAGTCTCCGACTCTGACAGTTGAGGGGTCATTGAACGCGTATTTTTAGTGAGAATACAACTAGGTTCATAGGATGTATTTATTTCCACCGGCCCCAACAGATTAAATTTTCTAAATTTTCAATTTTACACCTTCACTGCTCTTTTTCCCAACGGTGTGTATACAATTCGTTTATATTTTGCAATATTTTTCGATTGGTGTATCAGTCGAAACATTTGGACGATTACTGTAGATTTTCATTTCTTCGTGTATATATAGTAGTCGCCTTGGCACACCCTCCTGGCAAAAAAGCAGTTTACTGTATTTTATGGTTGTCATCGGAAGGATCGGAAAACTAATGTTAAAATAATATAAAACGGCAAAAAAGAATCGGTACTATATATAAATGGAACATTATCTTAACATTTTTGTAATAATTGTTTAATCGGAAAACTATCTTTATACAAAGTCGTTCAAATCTGTTTTTGTCAAACTTTCGGGTTTTCCCCAAATTTATAAAACAAACGTTATCCCACCTTTTGGCTTTCTTTCTTGTCTAGAGGTACGCACGTAAAGAAAGTGGCCTGGAGGCCATTTTTAGTGTCGGTTTCACAACGAAATACAAGGTTTTTACCCAATCTTAAATGTTCAAATTAAAAACGAATTGATTTATAACCCAGCCTATTAAAATCTGTGAAGGATGGCTACCAACCATTAGACATCATCGCGCCCATGTACAGTGCACCGATGCAAGCAGCCGTGAAATGTGTAAATGCAATTTGTTTTGCATAAATAAATGCTAAGTACAAAAAACGCAGCTCCTTAGTGCGTTGGTATTCATGCATGCGCCTACCTTTGTGTGGGTATATACTGGAAATAAATACGCGTACATAAGGATTCACTTATATAATGTTTACATTTATGGGACCTTCTTGTTTGTTTGCTGTGACCATTGTGACTGTAAGGTAAATTGGGACCAAACCGACTAGTAGGGCCTGTATGAAGTACAAGGCAAGAAAGGCAGTTATAAACCCTTGCAGATATAAGAAATAATTAATATTAGTAGCACCATGTTACATTCTTAACGATTGTTGCTAGCTTCAGTGATATTAAAACAAGAAAATAAGCTTACTTCGGCAATCCGAAGTTTGTATAGCCTTGCAGTTATAGGAAAGAATCAACATTAGTAACACCATTTTAAAATTTTAAATATTGTTGCTAGCATCAGTGACATTAAAAAAAATTATTTCATTATTTCTCTGACCATTTCTTTGACAGCTATATGTTAGATTCGTCCGATTTTTATTAATTTTATTTCAAAACTCTTAAAATATAAATAATAATATTCACAATATTGTAGAATAATAGGTCAAAAACCACCGAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTTTTCATTTTCGGATCTTTCCTATGACAGCTAGATGATATAGTCGTCCAATTTTTTTAAATTTAATTCGAAATTCAGAACATATTAAAAATGTTATTTCCAAACGTAGGAGGTTATATATTGATAAACACTAAAGGTATAATTTTTTTAAAATATTTTCCCCGATAGTTCCTATGAAAACTATAAGATATACTTGTCCGATCCGGCTGTTTCCGACTTATACTCTAAATGCAAAGAAAGAAGACCTTTGTGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTAAGAGACTAGTTCGCGTAGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACTTCTGACTTAAATCATTATGCCCTCTGCAAGGGTATAAAAACTCCGAAGCAATAATTTGTTTCATATTATTTTTGTACCAATTTTCCGACGCTATATGGTATAATTATCCGATTTTGATAAATTTAAATTCGAAATTCATAACTCATTAAAAAATTTTATTTCCAAGCGAAGGAGGTTAAGTTGTTGAAAATCACCAAAGATTTAATTTGTTTGCCGCAGACCGATTTAAAGTTTTTGCCGTTCGCGGGCATACAAACTTTTTTTTAAGTTAATCAATAGGTATTGGTAAGACTAATACATTTAAGAAAAAAATTGTTCTAGCATTAAAACTTTGGCCAGGAGAGTTTTGGGCCTTTTGAGGTCGTTAGAGTGCGTTTAATCGAAAGGTATTTATAAGGAAAATACAATTCAGCAAAAACAAGAAAGGAATTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATACAAAAAATTCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTTTATTCCTAATATTATAAGACCATATATCAAAAAGCCCCAAAGCTAGAATTTGTTTTACATTATTTTCCATTAATTATCCGGTCGTTCCTATGACAGCTTTATGTTATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATATTATTTTCAAGCTTATAAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATCTAATTTTTATTTCATGTTTTTCGACTAATTTTCCTATTGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTGCGATTTTGATAAAATTTAACTCGATATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGGTATAAGTTAAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAAATCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCAAGCCTAGAAGGTCATATGTTAAAAAACACCAAAGGTATAATTTCTTTAAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATGTAGTTGTCCGATCCGGCTGGATCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAAACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGAACGGACGGACAGGCGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTTGGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAAGGTATAAAAATGTTCTGGCATGAAAATGGTGGCCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/396/df1/b7/scaffold_24-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CCACAGTTTT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATCACGAATATAACTAAAAATAAATTATAAAATGTTTTAAAAGTATATAAATAAATTGAATGACAAAGTATTTGTATAAAAAGTAACAAAATTAACTTTGTCAAGCGAGTTACTTTCACTGTGCTTTATCATATAACATTTCTTATTACACATTAATCAAAATGTACTGTTTTTCGCTTTTTTGTGTGTTGCTCTCACCCTGAATCCCAAAGAAATGAAGGAAAAGTCCGTTTCTGTTGCAGGAAAGCTTTCGTTGAAAATCTAGACATGTCAGTCAGTCCGCCCTTATGAGACAGTCAACAATCGCGAACCCATTGGTTTTAAAATCTCTCAGTTATAAAACATTTTCGTGATCATTCAACACATCGAAGCCTTACACAGCGTTATTATTTAAATTAATTTTTTTAAACAGATGTTAAAATGTTTAATAATTTCTATTATATAACAATGACCTTACAAACATTTCTCTACATATAAGCACGTATAAAACTATTGCTCTTATCAGAACAATTACATTATTTAAATTGTATGGTTTTTTTATAATTGTATTTTTTCAAACAATAACATTAGTTTTGTGCAGATTTTAACTGTTTTTCTTTCTCTTTAAATTAGTATGATATTGCTATATATGCAAGTATAAATCATTTTATGTACATCTATGTACGGGTTTCTCCGGTATACTTACTGGTGTTAATATTATGTTTTTATGTTTTTATTGATTTAATATTTAATTTACTCAGGTTTTAAACGGTGCCATTGGACTACAGTTTGTCTTGGCTTTGAGATCATGTCTTGCCAATGTTTAGTTTCTGATGCTCCAGAACCGTTTTTACCTTTAAACAACATTCAAAATTATATATAATAGTTTGTTAAAAGTTGCATTAAGCACTATTTCAATTTTTATTCTTACCCGCTAATAATATTCGCCCTATCAACTCGTTCCTTCCTATATTATCAAAATCCATAACCATAACATCCAAGGAACATTCTCTTATTTTTTCCCAAGGAACGTTAAAGCTAAAGGATTCATTAAATACTGGATTTAATGTACATGTGAATATAGGCGTTTTTCTTTTCTCTACCCTTTTGTCTCCGAATTGAAGCCAAACCTTTACGTAAGGATCTGAAGGTATTATAAAATGCAAAATATTAAGTTATATATTTTATTTAATAATACTAGTAACGAGATAATTAATACTGTGGGCAAAAGTTCTGATATCATCATTTGTGACGAAAATGTATTATAGGTTCTACTAAATTAATCCTTTTTCTTAATTTTTTACATTCGCCACGCTGCTATTCAATATGCTTATGTTTAGTTGTACAATTTTCTTAAAGCGTACGAATGTAAAAAATATTAAGAAAATGTATTTTCTTAGAAGATTGTATAATTAATTTTCGTCGCAAATGTTGATATCAGAACATTTGTTTGCTGTAGGTGTGATCTTCACTAGAAATTTACCTCGTTCAAAAGAGTTTTTGTTCGATAATACTTACCGGATTTTCCATTTATATCCTTAGCTTTTAAATTTCGTGCTTTTATCAATGTCAATGTTAAAATTGAGTTTGATGGATGATAGCAAAGCGAGGAAAGAAGTTCACCGCATTTATCCTTCGCAGGGGGCTTTAAAGCTTTCCAAAATGATTGTTTTCCAGCGAAGTCAACCTTATATAACAAACGGATTAGTAAGTGATTACTGTTCATAAGAAAAAACTATTTCATTTATTATTTACCTGGCAAAGCGGAAGAAATACTTCTCCGATGGAGTCATCTCTTGAGAACCGATCGTAGTCGAACACATGTAAGTGTAAAACCTACACCATTTGTTTGGTCCATTTTAAACAAAAACCAAATTTTACGGTTTACTTATATTATTAAATTTTGGTGATTTTTAACTAATAAAATTAAATTAATTTTAATTAAGTTGAAAGTACTAAGCTGCCGGAATCGAAATGTTACTCTTTTGTCCAGTTTACAAAAAGTCAATTTCCTCGGAGAAAAATTAAAGTTTGAAATTATAGATTAAGTTTTGGCAAATGTTGCTAAGCCTTGCTCTTGGTATTATATAAGTCGGATTTACACATTTGCGTCTTAAAGCTCTTAATGAATATTTATATAGGACACTTACATCCTAAAGGGCATAAAGTGCTATAGGAAAACTAAAAGTAACAAATTAAAACGTTGTTGTTCATCGACATATTTTTTTCCGCTCCCGAAAGACAACCAAAAGCACCTCCTAACGAGGTAAATTACCGAAATCATTTTTTTTTGACGAAAACTAAATAAAAGTGTATAACATTACCCATCCCCCGCAGTTCTTATTTATAACGACAATTACTTCTATAGTCACAGGCACGTGAGCGCGAATACTTAATAATCAACCAACTCCATAACATTCATACAACAGTAAGAGATGCCTGAATATAAACCAACAATTTTTTTACATTTGTTCCTTTTAAAAATAGGTTTCCTTGAAAAAAATATTACCCTAAAATGTTTTAAAACTAACCAAAATTTACAAAATATTCTAAACTAAAAATTAGACACGAAAGAACGCTATAGTCAAGTGCCTATCAGATACTCGTTACTCAGCTAAAGGGAGTAAATGGGAAATGGAGATCTAGAGATTGTAAGACGCCACCTACCCGCGATTTTTATGGTAACGTGGGTGGCTGACATAGTCGGCGTTAAAGTGGGCGTGGGCCATTAGGTACTGACTTGACTAATATATTTAATTTTTGGGCGGTTTGTAGGCGTAGGAGTCGGTGTTGCCTGTTCGTAGAAGATGGCGATGGAGTGTATTACGCCCCCGTCTCACTAGTGTCCATTTCCTCATTTGCTTAAAAAGTTTAAGTAAATAGTCCGATAGTACAGTTGTAATAATAATCAAAACAAAACAACATAAAGGTGTATAGCCTTGAGATTTCTCTACTTTTGACACATTGTTGTAAAAAGTCCAGTTTTACAGTTATTATTCAATAAATATAGCCACACCTTTTTATGTGTATCAATATTATATTTTAGTCTTAACATAATTTTAATAGTTATAAATTGAATAGCACAACTTTTCGGAAAGTATATGTTTTGTATGATTTGAACAAAAACAACTCTTAACGGGGCACCTTCAACAAACAAACGCCCTGATATCAACTTTTGTGACGAAAATTTTGTTCGAAGATCTACCAAATAAATACACTTTCTAAATTTTTACGTTACGCACTCTCCAAATTAATATGCATTTGTTTATGCCGAATGAGTTGATATCAGAACTTATGTTTGTGAAAAGAGCGATCGTCACTATATTTTTACCTGTGTATATAAGAAGTTTGGGTTTGATTTAATGACAGAGAATATTAAAAGGAAATATGAATATTATTTTTTGACTTGATTTAAATATTTTTAAATTATTATGATATGGATTCAATAAAACGTTTTTATTTAATTTAAATATATAATACGACACATTTAAAATCAGTATCCAGATATTTACTTTGATTTTTCTTCAGCGCGTTTAAACTTCTATAAAATATTTTAAGATGTGGCCTTTATCGGCTCGGAAGCGCTTCCTTCTACCTGGTAAATACTATTTGACATACATACCATCTTTTTACTTTATCAGATTTACAAAATCCTGCTACATTGAAAAAGCCTATGGAGATTGTTAAATTTATACTTACACGAGACTGAAGTTTTTGAATGGGGAATCCTTCAAAGTAAAAGGTTTCATTCCAACGAGGATTTAGGGTTCGCCTTTTTATTTTGGTTTCCAATCTATGTTTTTTATCTGGTAATAAGGTTACTCGAACGTAAGGATCGGAAGTTCCACTTAAATCTTTCGCAGGAAGCTCTTTTCCTTGAAGAACTTTTAAAATTAATGTTGTATTTTGAAAATCATATTCCAAGGAAAAATGTATTTGTCCAACATTTTCACTCGGATCGTTGCTGTCAAGGTACATGTCTGACATCGAGATACTTTTGTTC'..b'ACGCAAGGGGCCGTCTAACCAAACATGATGACACCGCTGTGATCAATGACGCCAATGATCTTTCGATCCTTTACCACTTTCACAAAGGACCTCAACCATGTGCCGCTTCGTCACTTCCATCGACCTCTTCCGCTTGTTGCTCTTGCTGGTGGTCATAGCAATGTAGAAGTCTGGTATTACCGCCTTTGCCCAGGATATGTATTCTTAGATTAAGTGGTAATCCTCCTTTGACGCTTGGTCTTCACGTAAGGGGCTGGTGGCCAGCAGTTTAAGGATTCGGTATGCCTTCTTTCGATTCAGTGGTCCTGCCTAGTTAGGTGGCACTCGTTGACCCTGGTGCTTTCCACAATTCAGCTTTCGCACTTCTCTCAGGTTGGACTGGCTGGTTAGCCGTTCCTACGCTGGTGGGAGGATTGGGCTGGTCATTGTGGTGTTTTGGAACTATTGCGTTGTTGCGTTGTTCGTTGGCCTTCGCAGGAGTTAAAGTCACATGGACTTTTTAAGAGTGTCGGGCTCTTGTTTTCTTATTATGTAAATCGACTTTGGATTCTCAATAGTTAAATCCCGCGAGCTGCCGAAAAGGGACGAGTGAACCCGGGCAGTAGGCGGCAGCACAACTTTTGGCTGACACGTCAGACGAAATCCCTTCCGCAGTCTTGAATAGGGACAAAAGGAAAGCGAGGCCGCCTCGGCTTTGTATTGGAGAGAAAACCTCAAACAGCCTTGTTAATATAATAATCGATCTGATTTGTAAAGATAGCTTTCACGAAATCCTTTTGACTAAAGGAGACATACATAAAAAAAGGTCCAAGTCAAAAGCGAAAAAAGCTTTAAAAAATTGACGGAGATCCTAGACGCCAAACGCAATCGCAACACCAAGAAGGCAAAACATAACACCTAACTCAAAGCACACGCATGCAGAAATGAAGCAGCTAATTCTGGATCCCGGTGCGAATGGCAATTACTTCGATCACCATCTGCAAAGTAACAGTTAAAAGAACCTTTACGCCGACTCACCAAGGCACTAAGATTCCAACAACGCTATATAGAACAAGAATCTCTATACAGCTCAAAATTCCTACTATAGAAAGCCCACTCAAACCTAAGCCCTCCAACAGTAACGGTTACGCCAATAAGGACCCCTGCAGGCTGCTAGGCCCAAAGCGACAAGGACCGATCCGATACACCCCACCGATACCTCCCCACCTTAAAAATGTATTCCAGCCAAATCCAGCAACAAACGTGCAAGATCGCAAACTGAAGACGACTTTCCTTAAAGAACTCCCACTATGAGCATTTGACAGAGTGTGGCTTGACGTCCTCTTAAAGTCATAAATTTACAACAGGATATTTATTGTGAGATGCAATACTTCCATGTCAGCTGAACATAACATCTGATATTCCTACGAGCAGACAACTGACTATGTCTACGTTTGCCGACAACACCGCGAACCTCAGACGATCTAAATGTCCGCAACAAGCTTCAGCGCAAATTGTAGCCCATCTAGGTGTAGTAGAGAAATGGCTCTCAGACTGTCGTAAAAAAGTAAGTGAGTAAAAATGTGAACAAGTAACCTTTACCTTAAATAGAAGAAATGGCCCAAACCTTATACTAAACAATACCGCGCATCCTCAGTCTGATAAAGTAAGACGGCTTACCCGGCGTACGTATATTTAAGCTAAACGAACTCACTTAGGGCTGAAGCCAAACAGTCTGCTTTGGCTTATAAACTCCAGCTCCCCCTCAGTCTGGACTACAATTCTGTTTTGAAACCAATATCGGTCTGTGATTCGATTCATGTTTTTGAAAGGAAAATAGTGCATCGATATCAAAGAGCGCTTGGATTCTGTGTACGTTGACTCTTCTTCTTCGATTGAGGTTTTTCATGAGCCACGCCCAGGTGCCCCGAAAAAGGCTACCACAGAGGACAACGTGACAGAATTCCACGATCTCGTATTGGCAGACCGCCGATTGAAGACGTGCGAGATATCTGAGACAGTAGTCAAAAGACCGCGTGGGTCATATCCTGCATGAAATTTTGTGCATGAGATAGCTGTCGGCGTGATAAGTGTCGCGTTTGCGTTTGTCTTGACCGTCGACGAAACATGGATCCACTGGTACGTATCAGAGACCAAAGAGCAGTCGAAACAGGTGACTTCACCCAGCGAACCTGCTCCGAAAAAGGCGAAGTCTGTCCCATGGACCGGAAAGGTGATGGCCAACGTTTTTTGGGATTTACAATGTGTGTACATGACTACCTGAAGAAGGATAAAACGGTTACAAAGCTGTACTATGCTGAATTATGAGGCCGATTCGCCGCCAAATTGCAGAAGAAAAAAGTGCTCTTTCCTCATGACAACACACACGCAGTGATGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTAGATTATTTTGGTAGGTAAGGTAAAGCGCTTTGATAACATTCTAAGCTTGGAAATAATATTTTTTAAATAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTTTCAGAATTGGTCGATTGTATCATATAGCTTTCATAGAAATTATCGGAAAATTAGTGGGGAAAATAACATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCAAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATCAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGATTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATAGAAAAATTGCGGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATGTTGCGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTCGGAATAATCTAACATATAGATGTCAAAAATGGTCGAAAAACAAGAAAGAAATAATTTTGTTTTAATATCACTGAAGCCAGCAACAATCCTTAAAAATTGCACATGGTCTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTAGACAAATCATTGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTGTACTATAATAAGAAAATTTATTAGAGTTTGAAGAACTGTAAGTTAGTCATTAAACAGAATCAGGAAAATATACTTAAGAAATCAAACAACTTACTTTTTAAAAACAACCGCTACGAGAATATTACTCACGATCATTCGATTTGCAACGAAAAAAACTACCTCTGCACCAAAAACACAACAAACTTTTCATATCTCAATAAGACTAAGAACATTAAAAAACTGAAATGTAAAAGTATTATACTAATTTGAATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTTATTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCGGACCGTCTTTCCGTCTGTCCGTCCGTTTTTACGGAAAAAAGTCGGACAACTGTATCTTATAGCTCCCATATAAATGATCGAAAAAAAAATTTTCAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTTTAACATATTTTCATATCTTAATAAGATTAAGAACATTAAAAAACTGAAATGTAAAAGTATTATACTAATTTGAATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTTAGTCAAAAGTGCGAGGGAAAATCAGGAAATCAGTTTTAATTTTACTGTTGCCACCTATCGACTTCAAGAGCGTACTTACATCACCTAGCGCCATCAAGCGTATTAGTGAAAACGGCTTATTTGCTGCAAAAGGTGTGCAATCTCATATGACTGTAAAATATTGATCATATTGGTAATCAGAACACAACTGCATATGTATATCGGCCGAAGCCGAGCTTATCTAGACTTATTTTAAGTAAGGAGGATTGCCTTGACCGAACAAGACTACATTTTTTGTGCAACTTCTGAATCTACCCTGCAAGAAAAAGGCCGACAATTCACTTCTATGTCACTTCTGGAAGATAAAAAGACGATAGTAGACATTTTAAAATATACATATACATAAAATTACAAATAACTTCAAAGTCACTTCTGAGTTATGGAAAGGCGATAGCACACATTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATAAAAACAAGAAGGGTCGCGATCGCGAATAAGTAACTTCTAAGACACTTCTGGACGATAGTTAGATGATAACACAAAAACAAAAAGGGTCGCGATCGCGAAAAAGTATCTTCTGGGACATTTTTGGACAATGATAGATGATACAAAAACAACGTTACTGGGAAAAAGGAGGACACGATAATTGCCGTTACCCTTTATTTCTGAAAATTCCTCTCCCTTTTTACCTTACCAGTTTTCTATAAAATGTGTATGTTGCTTTGTTTTTCTGAATTTTTTAAATTGTATAACACATTAAAATGCATGCAAAGATTTCCACCTAATTATAAAAGGTAATTCCTTAAAATTGATTTTTATTTTAAATATTTAAATTTCTTATGTGAACGGAGCTGGACATAAATAAAATCATTAAGGACCATTTCTGACATGCCAAGGACCGTGTCTACAAGCGCTCAACGACCTTATAAAAAAAATAAATGCAAAATATTGTCAAACATGTAAATACAAGTTTTTTATTCAAGATTTCCAAGATTTCCAATGGGAAAAGGCCCTTCTGGTATCTTCTACAAGCATCGGCTATGTCACTTCTAAGTACTTCCTGAAGTCACTTCGGCGATATCGCATTCGGATCACGGAAGTCACTCCCGTCGGGAAGAACTGTGCCACTATTGGATTAGTTATAAAATTGGTGGAAAAATAATATAAAACTAAATATAGCTTCGGTGTTTTTTGAAATATTATCTTATTATATTGGAAATATCATATTATATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTTGGACGACTCTAACATACAGTTGTCAAAGAAATAATTTTTTTAACGTCACTGAAGCTAGCAACAATTCTTAAAGATTGAACATAGTGCTACTAACATTTATTATTTTGTATAACTGCAAGGATATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGATAACTTCTTTTTTGTTTGATTACATTTTAATTACAAAAGTTGATATTAAAACTTTTGTTTGGTAAAAGTTGAAAGCGATCGTCACTATATTTTTAACCAATTAAGAGGTGTTTTTGTTTGATATCAGAAGTTTTTGTTCTAACATACATAAGTCATACGATTCATATACTCTCCCAAAATTCCTAGAATTCAAGTTTCTTATGCGGAACTGTTAATAAGAATTTAAATAATTACAAGACCGTAAAATAGAAATAATAGGCAGTGTTAGATGTTCTGAACTTGTAAATGTTTCCATTTTCGTTAAACAATAGCTTTACAGAGACATTTTTATAAAATCTGAAGAAAGACTAGAAAAAATCGTTTGGTGTTTTTTAACATTTAACCTTCTACGCTTCAATATAATATTCTTTAATTAGTTCTCATTTTGTAATTAAATTTAATCAAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATACGAACGATCGGAAAATTGGTGGAAAAATAATATAACAAATTATATCTTTGGTGTTTTTAACATATAAACTTATACCCTTGGAAATAACATTTTTAATAAGTTCTAAATTTTGAATTAATTTAATCAAAATCAGACGACTATATTATTTAGCTGTCATTGGAAAAATTCAAAAATGGTTGGGAAAATAATATAAAACAAACTAATTTATATATTTGACATATTATTTAATAATATTGGGAATATAATTCTTTATTTTTATGAATTTCGAATTAAAATTAGTAAACATATATAGCATATAGGTTTGAAAGAAAAGGTCAGAAAAGTAATATAATAGTTTTCTTAATACTACAGAGACTAGCAAAAATACTTAAAATTTAAAATTATGTTACTAATGTTGATTATTTCTTATAACCGCAAAGTTAACTTTTTTCTTGATTTAGTAAGCAGTAAGCAAGTTGGTAACGTGGACGCCCACTTACCGCCTAAAGCTGTGGCTCTTTAACATTTAACCAAAATATAAAATCATTTGCAAGTGACACGTCCCAAGTAAAATCATTACGGAAATTTCGAATTTTGTCAGTTTTCATCTAATGAAATATTCATTTTAAAATACATACATGTATATTTACATTTCATTTCATTTTATTTAAATTGTATTATTTAAGTTTTCTGTTTAATTAGAGTTATTGTTAGTTAGTCTTTTTTTGTTTTGGTAATTGGTTTTTTACGTTCGTCATTGTTACCTCGCTCCGAATCCCTGTCTAACGCGCCTGTAACTGTGTAAAACCCTTTGCGGGATTTTTATTGGCACAAAACATTCTATCACGCCACCTTCGGGTAACGGAACCAGAATTTTTTAGGTTCTGTTGTAAGAGCTATAAAAAATATCAAATAGGGACGTACTTTAAACGTGGATCAACGCACTACGTCTTGCACTTAAGGAAGCACTTACATAACTTGATTTTGAAACTTGATTTATTAATAAATTAAAATGTGTCGCAGCGAACAATTAAACAGCAGCTGCTTCTCTTTTCATAACTCAAACAGAATGCACCAGGTCTTCTTCTTTTGGTTTCCTTCTGAACATAACGTTGAGGCGGAAAATAAACCAGCCGAAGGTTGTCTCTCTGAGAGCCGCGGGCAGAAAGATTATAAGATACAGAAAGAGAGGATAGTCTCCGAAGATCTGCCTTTCTTTTTATAGCCGGACCGCTTTCGTCGGAACTCTTCCACGCTGCTCCGAATTCTCTTCTGACGTCGCATCAGCATACAGTAGGCATAAAAAAAAAAAGCTATTGCTCTTAGACTTGGACTTGTTAGAAATGGTAGTTTTAACAAAAAAGAATATGTATATAAAGTGATTGTCCATAACTTACGCTTGGATCCATTTAAATATTTAAATATCATAGTGGTGTTTTCCGGTAAAATGATTAAATTTTCGGAAGCGTTGTATCATGAAACCAGCAAAACAACATTACTGATGGATCAGTAATTAGTGTTATTTCTGCTGAACGGAGCCGTATTTCTTAAAAATCTGTTTACATTGAGGTAACCCTTTGATCGGACTATGTGAACTGTTCATTGTTTCGATTTTAACGCAGAATATTCATATACTTTCTTTCGAAATATTATGGCATGGTACAGAGGCGTATTCATATTTTGTTTTAAAAAGTTGATTTAAAACCATTTGATTTTATGGCAATAAGGTGCATGAATATGATTAAACAGCTATATTTTGGCGTACCCATACCCGTAAAATATATAAAAAGGTTGATCAGTATCACTAGGCGAGTCGATCTAGTCAAGTCCGTCTTTCCGAACGTAGCATGTGAATTCTTGCGCAGCGCAGGTTTCTTTCAGCAGGTTGCCACTCCCAGAACGCTAGAATCTTTCAAACACCCACATTTTTTTTTATTTAAATAACAAGCCAAAAATTATTGAAATTTGACCAATATTTGAAAAATTATAACCAAAAAATAATTTATATAGCAACAAGTAACGAAAATTTTTAGTCGATGGAATTGACTACAACATATTTGTCTTATTTGATATATATAATTTGAAAAATTCATGTTTGCTGAGTATATAAAAACAAATTTTTAATATATATTAACCATAACCATTTTCAGAGACTTAAATAAAATAAGTCTTCGGAAGAACACGAAAATTAACACAAGATTATCAGAAATTTTAAATGTACATGTTAATTCTAAAATCTACTGCTTACTGCAGGATGAAGGCATTGAAAAAAATGTTATCTTTATATGTTTTAAAATCCTGTGTCGAGTAGTAGCCCCACCTTCAGTTGCCTATAAAAAGCTATTCTAGCCAATAATCAGGCACCATTGTTTTTGCATCTAGTATATGCGGGTTTTTACACAACATACCTGATGCAAACGCGTTTGCTAGTGAGAATGTATCTGCGTTACTTATCGAAAAATCAGAAAAATACCGAAAAGTGTGAATTAGGCTTAAGACGACACATTGGTATGTTTTTGAATAGGGTGGTATACTCATTCGGTCCATTTGCGGCCACCCTGATGACAAATCATTTTTGCGTGAACG'..b'GGCAATGGGTTCTGCAGCTGTCTTTTAGCGGTCTGTTTTTTCCTGCTTCTGGTGGCGTTTAATGAGTACATTGCATCCGAGGTCTATGCGACGACAAGTTCTGAAGAAAGTCCGCAGGGAACTTAAAACCAGCTTCTAACAATTATCTAAGCATAATATATATATAAAATGGTTTAAGATTATTAACGAATGAAAAATGAATTTTTCTTAATTTCCTCCATTTTTTATATTTCGTTTCCAAGCCAAAGATCAAACTTCTTTTTCTTTCTTTTCAAAAAAAATCAAGAAACGGCAAGTACATAAATTAAAAACCTCTTAAAAAAATCGGACAATCGGAAAATCTACTTTACGAAACAGTATTCGTAGCGACTTTTTTCCATTCTCTTTCTAGCACCTACTTGTAATAGAAGAAAAAGTCGCTGAAGTTTCGCTTCCACTGTGTGATAAGTGTATAAGAATCGGAACTAGACCATAATGGACATGTATATACATTTGCTTGTAAATGTTATATCCAAATCCCACTTCAAGAAATAGAATTTTACGATGTACACAAACGTTAAGTGGTTTATATGTATTAGATGTGTGCCTTACGGTCATACAAACAAATAAACGTTGTTGATACTGCAATATTTTATATCAAATTGGTAAATACTCGGGACACAAGGTAAAATTTGTTATTTAATACATAGGACACAAAAAATGATTTGGTTTTTCAAGGTTCAAGGTTGTATGATTGAATTCATTTGTATGTACATATGTACTTAAGGATCTATATATAAATGTTTTACTTTTCTTATTCTTCAGACACTGTTAAATGTGTACATAGCTGTGTGCATCCTTAGTGTGAAATGATGTGTTTAAGTGAATAAACCAGCAGTTACAAATTTGAGGTAAAACAGAATGAAAACAAACAATACGAATTAAACGAATTGTAGCAAGCGAAAGTGAGCAAGCGGCTTACAGTGAGTGCATAAGTTTACGTACCATACGTATTTAGCTATATACATGGCTCAACCAAAGGTACTCTTTGTAGGACAAGTGACTTAGTTTCGTAGAAAAGGTATTTTGACTCGGGAAAAGTCTTCGAAAATATCTCCTTAATTTACCTTATCAAAGCATCATCAAACATTCTTATCTAGTTTTGTAAAAAAATTATAAAATAATATATATTGAATATTTTTGTGAAATTTACCTTATGCGGAATACAAATTTAGACCCTTTACTCATAGAATAAAAAAAATATTGTAATCGTCAGATGGTATTAGACCCAAGTGTACATTTTGATTATGGACGCTAATATATCGGAATCTACAAAACCGTTGCAAATTGGCGGCGATTGTGCAGATAGATTCTAGGGATTCCTATGAAGGGCAAGTTTATTTTAGAGGAGTGCCTCGCACGGCCATAAACATAGTAATTTCCCTATTCGAAAAATCGAAATCTTTGTAGTTATACCGTTTTTAGAATTCCTCCGCAATGCATATAGCATGGTCTTATTGTCACAAAGCGCACAAATGAATGGCAATAATATATGTAAATAAAAAAGTACAGGGGTGGTCAAAGCATTTACGCAACCCAAAAGTTGAATATACTCATAGTTTAAACTTAGGACTTATTGAAAATCATTTTGATTTTTTGTATAATTTTTTGAATTTAACAATGTCAGAAAGAAGAAGTATGAAAAAATGTACGTGAAGTAAGTTCAGATTATAATATATTTATTTTTTTAATAACTAACTATTGACCATCGCTGTTGTTTCTTCATATTTCTCTCCACCATGGCACCATCTTCCGAACGAATGCTGTTTAGCTTCGATTCCAAATGAGGGGTGCCATGGAAATCTCTTTAGTCGGCCAGCATTATAGCAATGGCTGGTGATGGCTTTCACTTCTTAGCGGTATGCTTTTTCCCCCATGCCAGTTATGTGTAATTAATTTAAGTAATTATTTAATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTAATTGAAGTTTTCTTTTTATGTATTTGTTGGACAGAGTTTTTTTTATTATACGTTCTATTCTCGTTGACATTGACTTCGAAACTACGCTTAAAGTTTATAGAGGTACAGCATAATTGACTGGCGCCTCGTGTTAACATAACCGTTCGATGGCTTATCTTGAGCTTAAGCATGTTGATAAGATCCACAACGTTATCTACATAAGCGAGCGAAACAACGGCGAGAGAAACTAGCCCAGAATAACTACATTATAAAAAGTTGTATATATAGAGAATAATATAGATATATAACTCCTCCCCTCTTAAGAATGATTAACGTCCTAGTTAATAATTAACATTTATCTAAAAATAACAAATTACAATGGTTTTAAGTGGTGTTTATACAAATAAACTTTTTCGCTACGACTATCATTTGAATTAGCATTTTCGTTCCTTTCGTATTCATTTAAGTACTCTCAATTTCTTATTAATTTCAATCGCTTAAATTTAGATCTGTGTCGTCTTATATTTCGATTGTTAATATATTCCTTATAGTGAGTATCATCAATCTTAGATATTTGTTTAGTTTTCCTAAATGGGTTATCAATTTTTAATTTTCTTTTTAGTTGCATATCTACTTTGGCAAAAGCTGTATTTATATCATGTTCCTTTCTCTCTTTATTTAATCGTTTTATTATATCTGCCTTATTTTGTTTTACGTCTACTTCTGGCTCTTCATTAAATAAAAATATTGATGCTGGAGTTTTTCTAGTAACACCATGAATAGTTTTGTGTTTGTAATTAAAAAAAAATTCTTTTATATCCATTTCAACAGTTTCTAATTTGTTTTCCGTTCTACTTATACGTATTTTTTCATTTTTTGTTCTATGACAACGTTCAATATCAGCTATTCCATTTTTAGAGCTTGTTATTTCAATGTTTATATTTTCTTTTTCTAACCATAAGGCTAAAGCTCTACTTATCATACCTGAATCTTGATCCATTTTCAGTACCTTGGGTTTACCTAGAAAATGAAATACCTTTAACAATGCTTTTTTTGTTTCAATCCAATTAGTAGATGTGGTTTCGGTGGCTAACAAAAATTTGGATTTTAGGTCAATACAAGTTAAGAAAGATCTACTATTTGTAAAGAAATAATCAATAATGTATTTATCTCTAATTTGACGTTGGAGTAATTTCATACGGTAAATCTGTCCGCCTGTTTTCATGTTTACTTTAATTACACGTATTGCATTCGTTAATTATGTTTTGTATTAATTTTATGTAGTCTGGGTAAAAATATGAGTTTCTAAAGTCTAATATCATTTTTTGAATTCCTTGATGAATTCTATCTTCATATATTTTAGTAATGAGGTCTTTAAATTCTGAATAGCTACTTATGTTGATAAGATTTGTTGTAGCTTTATAGAGTTTGGTTCCAGTGTTTGGTCGAATTATTTTTATATATTCATTTTGAAAAATAACAAAATCATCAATATTTTTCAACAAAATAGTAGAGGTTCGTCCACAAATGGCTTCTAGTATTATATCGTTTGCCTTTGCACTGGTCATTTCAGAATAAAATATTTTGCGATTACATTTTTTTTCTGCTTCGACTTGTTCCTTGTCACTTTTTAAAAATGTTAATTGTCTTTTATAAATATTAAGAGGACGCTCTGTGATTGAAATACCTAGAAAGCCATCTTCTTCTGCCCTATGAATTGTAGGGTCTAACGATTTAAAATCTTCAGTTCCAGACAAAAGTGAATCTGATTCGTGGTTCTTAAAGTTTGTAGCCGCTTCTTGACTCTGTTTACTCTGGAAAAAGCGTCTGCTACAAAATGTTTTTTGCCTTTAATGTGCTCAATTTCAAAGTCGTTTTCGTTTAGTCTGATTTTCCACCTTTGTAACTTCATGTTTGGGTCTTTTACATTGTGTAACCAAGCCAAATTGTAATCAATAATTTTAATTTGTTAAATGCGTTTTTTATTCTATGTTATTTATATCGATTGACTGTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/3e0/035/ae/scaffold_20-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTTTTTTTAAACATTTTGAAATAGGCCTAGTAATTTTAGCAAAGTTTAGAATGAACTTTCTATAAAAACCACATAAACCGAGAAAGGATTTTATTTGTTTATCTGTTTTCGCGATGGGAAAATCTAATATGTCTTTTATTTTGCTTGGGTTCGGCCTAATACCATTAGATGTTATCATATGATCAAGAAAGTTTGTTTCGCGTGTTAGAAATTCGCACTTTTCCAATTGTAATTTTAAATTAGCTTCTTTTAATTTATAGAAAACTTTAATAATTGAAAGGATATGTTCCTGCACTGACGTAGAAAAAATAACGATATCGTCAAGAACTAAATTTTTAAGAATCTCGTTCATACACCTTTGAAATGTAGCCGGTGCGTTTTTTAACCCAAAAGGCTTTCGAGTGTACTCATAGTGACCGTTTTGTGTTGAAAATGCGGTTTTTTCTATGGACTCCGGGTTCATTTCGATCTACTGACATTTTCCAAGTTTGTCTAATATTTCATCAATATTAGGAATTGGGAATTCGTCGCTAATAGTAATATTATTTAAGTGTCTATAATCGATCACGAAGTGAAATTTCTTTGTCCCCGAGGCATCATATTTCTTTGGGACTATCCATATTGGACTACAATACGGAGAAGAATTTTCGAATTATACCCTGACTTTTTAATTCTTTTATTTGCTTCTCGACCTCATCTCTATAAATGTATGGGTATCTGTATGGTTTTACATAGACAGGATGTTTAGTTTTTCTTATGTGTTTAATGGTATGTGTAAAGCTCAAATTTTCACCTTCAACAAATTGTATATCTCTATAAGTTTTTATTAAATGCATTATTGATTTACTTTCTTCACTATTTAGGTGACTAATTCGAATTTTATTGGAATAATTAATTTCTTCGCTAAGCGCATAGTTAAAGACATTATCCTCCAATTTCTCGTTCGAATTGTCGACTTTTTTAATTGGGATGTAATTATGTTTAATTTCTTCTTTCAGACAGTTTGGTAAATTAATATTGTAACTAGGTTTTTTAGAGGTGAAATTAAAAGTAATGTTATTTAACTTTACATATTCCTCTTCGAAGTTTATATGAGCATTAGTAAATTCAAGTATATCTCTTCCAATAAAAATATCACATCTTGTCGAAAATCATGGATAAAAAAATTTAATTTTCCAGGTTTCCCAGTTAAAGCTTTGGCGATTATTTCTCGTACGGTACCCAAAATGACTTTTCCTATCATTGTATATATTACTTTCGGGTTTGTTTTATGCATAAAAGGAGTATTTAATATATGTGGCCTAATAAGACTAATACTAAATAGACATAAATATTTTTGTTCATTTATTTGTACTCAAATTGTGGAATTCTTTGATCGACCGAGGCTTCTACTAGAAAATTTTCGTCAGTGTCCATCGCTTCGACTCGCTTATATCGACCGGAATCTGACATACGTTTTCTTATCCGTTGTCGATATACTCAAAATTAGGAAGCATTTGAGGGTTGTTTAAATATTTCTTATTTGAATAATTTTTATGTTGCTGCATATTGTTATTATAATTTTCATAAATTCCAATTTCTTGAGCAACACGTCTTAATTTACTTGGGGTGCTAACATCAAATCTACACACTGACATATGTATTCGGTCTGGTAATTGTTTTCGAATAATTTCACAAATAGCTGAGTTCATTGCTTCTGTGAAAATGTATTTATTATTTATACTGCCATCTAAATGTAACTTATTACAAAAATGGATGATTTAGGTCTAGTTCATCGACAAATTTTCTAAAATTTCCAGAATACTTAATTTCGTAAATATCGAAAAGTAATTGAGGGATTGGTGTTTGGGTGTTATACTCCTCGATTAGTAGATCTTCAGATCCGTTCAGCCGCGTGGTGTTGATCGCATGAGCAAGTGTTGAGCGTTTCCAAGGATGAGGTTCTCGAGGGTTCCATAAATACTGCTGGACTGGACTGGGTTATTGGTGGGGTACAGGTCAATTTGGTGTTCGACTCTTTTGATGAAAAGGGCCAGGTAGAGGATGTCGCCATCAAACGGACTTGTCGGATTGTCGAATTTGTGTTAAGCATTGGGATAACGCTTGATCCGAAAGGACATGTTTTCCTGCCATCCTGTGCTGTTCTTATTCGCAATTTAAACTTTTACTCAGCTGGCCGATTTTTGTTTAAATTTCTTTTGCGAATATTCGTTCGTTGTGCGTTGTAAATGCACGTTTTCGGGATCTGTTCACGAGGTTCTTTTCCGGGTCTGGTTTTTTTTCAGATCCTACCGACTGCGCCAATTATGTGTAATTAATTTAAGTAATTATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTAATTGATGTTTTCTTTTTATGTAATTGTTGGACAGAGTTTTATTACACGTTTTATTCTCGTTGACATTGACTTCGGAACTACGCTTAAAGTTAAAGCTTATAAAGAAGTACAGCATAATTGACTGGCGCCTCGTGTAAACATAATCGTTCATTCGATGGCTTATTTTGAGCTTGAGCATATAGAAAATAACTTTAATACTAATTAATTTTTTATATATATATATTTAATTGCATACTTTTAGGATAAGGAAATCTTACAATATATTTTATTTAACAAATCAATTCAAAAATTTACAATTAAGCTATATATGTTTTTCAATTTTACATCGATGTTTGCCTGTCAAAACATCCAAAAATCGATGTTTTCTGCACCATTATTGACCAATTGGCTTTCAAATTACTATTATGAATATGACGAAAACACGAAACGCAAAATATGCAAGAACATAAAAGAGCATGTAAGCCAGAAAGTTGCAAAAAGTTTAAGCTTAAATTTAAAACATAGAAAAAACATTCACTGGTATTAATAAATTAGTTTCATCAAAGGGTAAGACGGCAATCACAACATTTTCTTTATCTGAAATCTCAGTCTACACCAAAATACACCACTCGAAAAATCGTTAATTTTAAAATGATAACACAACACATAATGACATAAAATGTACTCAGTTTTATAGTAAATACCATTATTTTCAATACTCATTTTATTTGACGTCGATTGGTCGATTTTATAGTAGAAATTATTATTTTTGTGAAAGTTTTTTTTTTAATTGAAATATTAAGCAAGCGCAGAGTAAAAACAAGCGCCGGAAAATTTTGACGTGCAATTTCTCGGTTTTTTATTTTTTTACGATTTTACCAAATTGGTAGGTAAGATAGGAAACTATTGTATTCCTTATAAAAAACACTTCTTGTTGAACCTAAGAAAAATTTAGAAAGTTATGATACCCCCACTTTTTAAACAATCTAAAGTAAACTTTTTGAATAAAATTAAAACTTTTTTGATTTGCCAAAAAAAATTAATTTCTCATTTTTTAATAATATTTAATTGAACAAATTTAAGAAGACTGTTAAAAGTCGCTAAAGATCGCTTCAGGCAATGTGACCACGCACTCAAATCAAGTCAGAATATCAGCGTTTTTATTAAGTATTTTTTACGGGCTTTTGTATGTCGTTTTTATTATTATTCATTATTTTAGAAATTGTTCATTATTAATCTATAGAAAAAAACAAACTGCTTTTTACCGCGGCGCAAAAAATAAGCAATTTAAACTTTTGGTGTGAACGTGCAGAAGCGGTGGAAACATAAAAAAACGTCAAAAAAGGTCGTCTCATCGAAGAGGTTCCCCATCATTGTGGGACTAGATCCCAAAGACTAAATAACGCAGCAGAGCCAATGCGCAGAAGAATGGAAATGGCAAAGCATCGGCGTCACAAAAAAGAAACCTTAAGCTACCAATTAACAGAAATAAAAACATTTTTTGAATATTGATTTTGTTTTTATTTCTTGTGCACGGAATTTAAAATTGCTCAAATTTTTGTTTGTCAAAAAATTAAGCAATAAGAGCATGCTACTTTAATAACTTCGGTGACACTAATGAATACGATTTTTCGACTAGTGAAACTCA'..b'AAAATTTTATGTATGTCTTATCAATACCTAACGATTGGCCTTAAAAAAAAAATATGTTGACACGCTTAATCTAAGGCCCACAAATGTTTTATACGCTTAAATCTGTCTGCCGCTCACATAACATATACTGAAATAGGTGTCGCTTTACAATAACGCTTTGCTGCTTATATATCTTCCTTCTCTTTTGCTCCCTTAAGTTAAGTAACGGGTTGATTATTTCTTACAACTGAAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGGTTACTTCCTTTCTTGTTTTATTATTAATGTGGACGGCAATCAATGTATGACGAAGAGCACCAGGAGGGTGTGCGAAGGCAACCACTAAATAAACGATAAAATGAAAATCTACAGTAATAGTCTTATTGTTACTAGTGATACATCAATGGAAAGGTATTGCAATAACTAAAAGGATTGTATACCAAGACTTTAATAAAATCAATGGGATTCGGACAAACAATTTGAAAGTGTAAAAGGGAAAATTTGTAAAACGGCACGCTGCAGTTCAATTGGCCTTTGATTGAATTTGATTTTAATAAAGCGTGCCGAATGTAAATAAATGTAGAAAGTGTATTTGTTTGTTTACATTTTCGTCACAAAAGTTGATATCAGAAGTTTTGTTTGTTAAAGTTGTGGTCGTGTCTATATTTTTACATCGTTACGAGGTGTTCTTGTCTTGAGACACGATGCCGGCGACATTTACTAGCGTCATGTATTCTGAAATAATAAACTTAGCGCTTCGAAGAGGATTTCAAATCTTTGCCAGCGAAAAAGAAAACCTTTATGACAAACGTACTTTGCGGTGCGAATTGAAATTGAATGGTCAATATAATAACTAGTATCTGAAAGTAGATCTTGTTTTGTATATATTTATATGTACCCATTTAAAATTTCTTGAAAATTTCTTTTCAGCAGGAAGAACAGTATCAGCCAGTATTTTACCCCACCACCTCAGCTTCCTCAAATCGAGCCCCATCATCTATCAATCGACAACTTTCCGATGATTATCAAGTGAGGATTGCAAAGCGTATTGGATTAATGCAGCATTTGCCAATTGGAACATATGACGGAAGCTCGAAAAAAGTACGAGAATGTGTAATTTGCATGGCAGAATTCTGTGTTGATGAATCCGTGCGATATCTTCCTTGCATGCATATTTATCATGTTAAATGTATAGACGATTGGTTGTTGAGAAGTCTTACATGTCCCAGTTGCTTGGAGCCGGTTGACGCTGCTTTACTAACGAGTTATGAATCGACATAGCGTTTATAAAAGAGTAGTATATTTATAATGGTCGCTTTAAATTATTTCGGGAAAATAAAAAGTTGGTCCAAGCAAAGGTTATTATTTGATACGTTTCAATTGGATTACATTTCTTAAAATTAAATGTTGCTGTCTTTAATCAAAACCATTTATATTATTGAGTGAAAGCCGATAATAATTGTTATTGCAGCACTGGATAAGTCAAATATGTAAAAACTATTTTGTTGAATTTTGTATTGATGTATGTAAGCATTCTGCTTGAATTTCACCCGAAGAGAACACTAGATCGTGTACATATATCTATATTTATATAAGTGAGTGTATAAAGGATTTGATAATAAAATTAAATTTTGTTTAAGTACGAAATTGTTTCTTTAGTATTGAAATGTACGGAGAAGGCTCGAAGGGGAAGGGCATTGTTGCACTTTATCAACGTTCAGCGCAAATTCCACTGAGAAGCCCTGAATTCAAAACTCGTTCAAGAACGCTTGTGTCTGGACACGACAGAAGGCTGATAATGGTGCTGCTGGTGTCAAGAAGTGTACCAAGTCCCACGGGCTCCATCTAGAATTTGACGTAGTGCAGATACAAGTGTGAACAGCGCCTAATTTAGTATATATTCAACCACCCTATAATAGTGTCGATAAGTTTCTTTTGTTAGTGTTATCAGACTCTGTAGTTATAAAGTATTCGAGATAGAGTCGTACTCAAGAACACATAAAGTTACATTTTGATTTGTAATAATTTATTCAATCTCATCATCCTAAATAAAACCTACACCACTTGTAAAGCTACCCCTTCTTAGTTCAGAAGTTGGATCAGTTTGGTTGTATGTGTGAAGCGGATTTGTGCCGTGCCAAGAACTCTAAGAAAACCAGCGATAATCGTCGACCTGGAAAGTTTGTAATGGGAAATAGCAGATTTTGGTTGTGTTTCAGTTCTACGTGGCAGGCGGATTCAAGCAAAACGGGAATCTCAGTGAACCCGTGGACTCAAGCAAAGGGGTAAGATTAGGTACTTTTAGTTGTCTCGGTCGCAAAGAGGACTGTCAAAAAAATTCCGGGGGATTGCCAAAATGTCGAAAATAGCAGATCTGAAGGGCGAAGTATTAAGATTCCTGTTAAGATCTAGAAGAGTGTTAGTTTCGGACACCAGAGCCAAATTGGTTTAGAGACTCATAGTTTGAACAATCGGAGGATATCGAGCTGCCACCATCAGTGGGGCTCACCATTCAGCAAGAAGAAGCGATATCAGCAGAAATTTCTCAATTGCTACACGAGATAGAGAAACTAAAGAACATGCTAGCTCAATTAGTTACCATTCAAATGGGAAACGCAGCACCTGCACAGGCAGAAAATCATCAGCAGCAACAGGAGCCAATAGTCGATTTGGATATCGACGATATCAACTACGAGAGGAGTATTCCTGTACAGGCTACCAACAACGTAAAGCAAACTTCAGTTAAGGAAATTGCTAACACCTTGCCAGAGTTTGATCCCAGCCATTTCAGTCAACAAGTTCATTGATCGATGCTATTCAGGACGATATAGGCGCAAAGTTCAGAAGTTAAAGGAGTGCTGTAAAGAAGTACTGTTTCAGGATGCCAGCCTTTGGGATGCGGTACAAACTCAGCGAGGCCGCGATCATTAGATATATTGGCTCCGGTCTACAGCATCGATTATTGCAAAACAGTATTGTAGCAATTACTATCTCAACAATAAAACAACTTCGTGATGCAACCGAGTCTTATTTTGTCAACAGAGTTCGTTCGACTACGAGTAAGATTCACGAGACGAGACGTATCTTCACAGAAGCGATGACTTAGGCATAGGAACAAAATTTTCGAGCCAAAGAAGAATATCGTTGGCAGAATGGTCGACGAGCTGCTAAAGCAGAGTACTCCATTCTCGGTGGCGCTCATCAAGAAGCCGAATGGTATCGATATAATGCGTCGATTTCCGCCGCCCGAATGAGCTGATAAAGAAGGAGAATTCTCAGAGCCGAACGTCGAAGGGCGTCTGCAGGAAGCGAAAAGATTCAAATACTTCTCATCCCTGGACCTCAACATTGGATACTATCAGATAGAGAAAGCACCAGAAACCCGGATCATTTTTAACCACAGACGGATTATACGAGTTCAAGCGACTTCCGTTCGGTGCGTTCGCACCTGCTGTTTTATAATCGACTCGTGACAGAGTTACCAAAAAAAAGTGCAGAAAGGCGACAAAGGTGACTCACTACATGAACGACATCATTATCGGCAGCCAAACATTTGATTAAATGTACAAAAAGATGGATTATTGAAGCAGTCAATAACATTCCTTGGTCACCAGATACACGCAGAAGGAATTAGACCTGGAGAAATTAAGACGAACGCCATCCGATTGCTACGACGTGAGGAGGATCATCATTATAGCCAAGCTACTTCCAAGCCGGAGAAAAACTATCACAGCCACAAGATTGAAGCTCTAGCAGTCGTGGAATCCTCGGAGCGATTCAAATATTATATTTATGGCAAGAAGATAAAGGTTATCACCGACTCTAATACCCTGAAGACGTCGATAGAGAAGAGAGAACTGATACCCCGAAGAAGGTGGTTGCGTATTCATGAATTCGACAGACATCGTTCGCTTTAAAGGACCTTTCATCAACAAGGTGCTGCGAACGACATATATCTTGTTGAAGAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTGTAGTTTTGAAGACAAATAATTGCGACCGAGGTTATTTTTGACCATGATTGATCCAAGTTCGAGTGAAGAAGAAGGCGAAGATGACCCCATTGCTAATGTGTCATCGAAAGGACGTCTTACACATGCACCCAAGGGCACAAACACCGTTTCCATATTAGGTGGGGTTTCAGGTCCCGGTGTAGGATCAAATATGGCTATTTCTGGTTCTAATGGTGATTTGGCCGGGAATCAAAGACAATCTAATATAAGTTCTATTAGTAACCGAAATGATGCTGGAAACGTGGCAGGAGTTGGAGGCTCCTCTAACAAAAATGAGCAAATACATGGTAGCCGAGTTGACGGCGGCAATCTTGAGGTGCCCAACAGCTGTATTCCCAGGTTGGTATTAATTTAATTTATTTCAAAATAATAACAATACGCTCCCAAAAAAACTATAAAACAATTTCGACTACTGACTCAAACAAAATGGATTTTAAAGTCGAGAATTCATATAGTATTTTTACCCGCTACTAAGGGTGTCGACATGTATGCAATAGGTAGCCCTTTAAAGTAAATATTATTTTAATATGGATTAAGAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTATGCGTCCATCCGTGTGAGCGCTGGATCTTGGAAACTTTAAAAGCAAGATTGCATTCTGCATGGACATTCTTAAGGTTCTGAAACAGCGCAAGCTTATTAGCATGATTCTCTCCCCACTCTAACGCCTTAAACGCACACACACCCACTTTAAAACCTGTCTAGCGCCCACATATGTAAAGATTTTAAAGAAATGTAAAAGCAATTTTATTTTTATTATCAATATAGATATTGATGATGATGATCGTCATACCAAAAATGGTCGACTGTGTCAGTGTGAACAGTCGCTTCGCTATCTCCATAGCACTTTTATCTGAGTAAAAGTGCTGGTAAAAGTGATAATCGATCCTATCGACTACAGCGTTTGCTCTTGTTTTATATTGGAATTACAAAATGATAACTGGAGGTTCATATTAATTTAATTTATTTAATAGTAAGCCGAGTAGAAAACAAAAACACCACATAAAACAAAAACACCATAAATAGATTAAAAACTAGTTAGACTAAACTTGTCTACTTACGAAAGTTTTAAAACCAAATTTGTGTGGTAAAATTTATATACAACTGACTAAAAAAATATTTTTTATAAAAGATAAATAATATTATTGTTTTTGGACCAAAAAGTAAAGTTAGTAAACTAACTTGAGATACCATGTCCAATAATCCTTCTTCCTGTGTCATACTTTTTAATAAATACACATTTTATACTACAAATAACGGGTTTTCATATCCTATCCTACTATAATATACTTTTTTTTCGTTTATTAAGCGGTGTTTCGCAAGAAACTTTAAATCAAAGTATTGGATCGTCGAGGGCCAACTCTTTGCCACGGCCATTGTCACCATCACCATCTTTAACCAGCGAAAAGCCTGACACTGGAGATCCACATGTAAGTGCCACGCAAACAAAACTTTGATAATAATATAAATAAAACAAGAGACGAAGCTATCTTCGGCATCTCGAAGTGTATATACCTCTAAAGTCATTAGAAATGAGAAAAGAAGTTAACTTCGGAAATCCGAGTTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATATTCAACGTTACCAACGTACCAAGTTCAATTTTTAAGCATTGATTTTAACTTCAGTGATACCAAAAAAAAAATTTTTATTATTTCTCTGGCGGTTTCTTTGACAGCTATATTTTAGAATATACCGATTTAAATTAAATTTACACCGCTAACGCAGCTGTATGATATAGTCGTCCGATTTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATATTAAAAAACACCAAGGGTATAATTTTTTACCCTGGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGTAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTATTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGCTAACTTCCTTTCTTGTTTATTTTGAGATGTCTTCCAAAATCTTGTAATACGTAATACTTTTGAAGGGAGCATCCGATTTAACAGTTGAGGTGTCATTCGACGCGTATTTTAAGTAAAAATACAATTAGGTGAATAGCGGGGGTACCACCACTATTTCTCCCAAACCACTTAATTTTCTTAAAGTCTTGGTATGCAATCCTTTTAATTTTTGCAATACCTTCTGACGATTACTGTAGATTTTTATTTTTTTGTGTATATATAGTACTCGCCTTCACACACCCTTCTGATGCGCTTTGTCACTACGAGGACTGCCGTCCACGGTGATACAAGTTTTAATGAAATCGTTATAAGCAGTTTTTAGTACTTTGTGGTTTTTAGTGCGCCTATGAAATTGGAACCATCACATTTTCAACAGTATTTTGATGATGATTTAATATTTTTTTGGTATTTGTTTACTTTATATCGTTATTCCTTTCCTTTCTACAGCCGATAACTTTAGAACAATTATTTTAATTGAATGTTATGAGTTAGAATTTAATATATGCAATTTTAACAACTTAAGACCAGAATTTAGGTAGACAGTACCTTAAACTTTTGATTAAATTTGTACTCTAGTATTGTAAATTTTTAGCCTTTCTTTGAACACAAATAAATGCTAATTACATCTGCATAGATTTTAGTGTATATTTATCAGTTCTTTGACTTACCCTACAACTTTTACAAAAGAAAAATTTGGTTTGCGCTTAAAGCTGAAAAATGTACTTCCACTGGAATTTGACCACCAAGATTTTACTCATTCTGGCATCTAATGTTTTTAAAAAATGTTCATTCCACAAACGATTGAATAAATATATTTTTGTGTATTTTCATACCCTTGTAGAGGGTATATTGATTTCAGTCAAGAGTTTGCAACGCAGTAAAGAAGACTTTTCCGACCCTATTGCGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACAAGTCCAATTAGGCATGTCCGTCTATCCGTCCGTCCGTTTTTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTAAAAGCTAAGTTTTTACCATATAACCTCCTAACATTTTTTAATTTGGTCTGAATTTTGAAATAAATTTTATCAAAATCGGACGTTTGTATCATATAGCTGCCATAGAAACGATCGAAAAATTTGTGGGGAAATAATATGAAAAGTATAAGGGGTATAGAAACGTCGGCTTGCCGAAGGCAACTTACTTCATGTTTTTAATGAAAGTAAAATAAATTTGTTTTATTTAGAAAAACGTGCTCAAGTGAAAACACAAATTCAAATAACATGATTTTATTTATCTAGGATAAGATTCCGGAGCAGGCCACCAATCTTCGTCACTTCCTAATTTATTTATCAACTTTAGCCCAAAAGAAGTTCATTGGCAGCAACATAGTGTCGTAGCTCACAGCATTACCTATCGATAATTTCGAGTGAGGAGTCCGGTCTCTTTCTTCTGTCAATCTTCTTTTTTGTACGACTTTCTCTATGTCCGCCTTCAGCAGCCTCAAAACGGTGATTGCTTTTAACTTGAAATACTAAAATCGACATAGCTTTAGACTCAAAATCGAGAAGGTAAATTCTCAAGTCAATCGTTCGGTTTTGTCGAATCAAATATATTTAATTTTAATGTTCATTCTAGCTTTAAAATTGTAGGAGCCACGGTTTTGATCGGTTCGTGGGCAATAGAGTGGGAGTGGAATATTTGTGTGTATAAATCTGAGAAATCACACAGACAGACAATCGTTTTTTCTTTATTCTACAAAATATTAATTTTTTTCATATAAAATGTCATATATAAACTTCAATTGTTCAGAACTTTCTAGTGATTGCTTTATTTTTCTAGTATTCAAAAGTGATTTGGGTCACAAAAGCA'..b'CATGGTGGCATATAGGCGTTCCCTCGTCGGGCGATCGGATGCAGCTTTATAATCGACAAAGAGATGGTGTGTGTCAATGTTATTCTCGGGTTTTTTTTCCAGGATTTGGCGTAATGTGAAGATCTGGTCTATGGTGGACTTACCAGGTCTGAAGCCGCACTGTTAAGGTCCGATCAGTGTGCTTGTATACGGCTTCAGTCGTTCACATATTACGCTCGATAGGAAGTTGTATGAGATGGTAATCAGGCTGATTCCCTGGTAGTTGGCTCATATCTTCGGGTCACCTTTCTTCAGAACGGGACAAAGGACACTGAGATTCCAATCGTTGGACATGCTTTCTTCTAGCCATATTTTGCACAAGAGCTGATGCATGCACCTTATCACCTTCGCCGCCGGCCGTGAACAACTCTGCAGACAGTCCATCAGCACCGGCTGCTTTGTTGTTTTTGAGCCGCATTATAGCGACTCGGACCTCGTCATGGTTAGGTAGTGGTATATCCACATTGTCGTCGATTTGTGGTATCAGGTTGCTTCCTCCAATGGCGGGATTGGTGCCGTCATCGCCTGCTAGCAGCTTGGTGAAATGCTCCCTCCATAACCTCAGCGTGCACTACGTATCCGTAAGCAGATTTCCCTTTTCATCCCGACAGTTAGATGCTCCGGTCTTAAAACCTTGTGTCAGACGGTTGACTTGTTGGTAGAATTTTCGAACATCATTCCTGTCTCGAGCACCTTAAGTTCCTCGCACTCTCGCTTTTCTTGCTCCCGTTTTTTCCGTCTGAAAAGTCGCCTCTCTTCCTTCCTTTTCTCCCTGTAACGTTCACACGTAGCTCGCGTTGCGCCAGACGGCAGCATTTTTCTGTGGGCGTCGTTTTTTGTTGCAGCTGCGACGCGAAACTCCTCGTCATACCATTGGTTCCGTGTGGGTGGGCGCTTGAACCCAATGGTTGTTTCAGCAGCAGCTCGCATGGAGTGGGATATGTGCGCCCAGAGTCCGCTGGCATCAACATGGAGAGGGATAGGTTGGTGGAGCAGTTCCGAAAGGTGAGTGGAGTACGCTATTGCTGTGCGTTGCGATCGCAGCCTATTGACGTCAAGCTTTCGTTGCGTGATCAGGGGACAGCCATATGACCTTGTGGATGTCGAGGTTCCGAAATCTGGTGCTACTCACTACCATGTTTCGTGCCGTGGCGAAGTCAATCAGCCTGAGACCGTTGTTCGAGATGGTCTCATGGAGGCTGAATCGACCGACGGTGGGGTCAAAGATGCGTTCGCGACCGAGCTTTGCGTTGAAGTCCCGGAGGATAAACTTCACGTCGTGGTCTGGGTAGGGGTCGTATGTGTCCTCGAGTCTCGCGTATAATGCATCCTTAACAGCATCGTCCTTCTCCTCCGTCGGGGCGTGCGCGCAAATTATGCTAAAATTGAAAAACCTAGCTTTGACGCCGTTCACTCACTGGGGTGAAATTGATGACGTGGTGGCGAAGTCTCCAGCTTACTACAAATCCGCATCCAAATTCGCGCCTCTCCGCATGGCAACTGTAGTAGATATCGCAGTTTGCTCGCTTGGAGCAACCGACCCCGTTGTCTTTTATAAGTTCAAACCAATTTTTTTCTGGGTGTAATAATTAGGTGTGGCTGACAACAACAACATACCAGCTAAGCGGCAACATACGCAGCTTGGCGATCGAGAGCAGAACATACTGCTCTGGTCAAAGATCCACCGCTCTCTACCTTATTAGCTGTAGACAAGCATTTATACATGCTCCACGCCGCGTATGAACGCTAAGATATCTACAAAAGCTAATACTTTAAGGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTCCGTTGCAAACTTCTGACTGAAGTCATTATACCCTCTACAAGGGTTTAAAAATAATTACAAGGGTGTTTCTATACCCTTATAGTAAAATGTTAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATCTAACCTTCTACGCTTGGAAATAACATTTTATAATTAGTTTTGAATTTCTAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATACAGCTGTCATACGAACGATTGGAAAATTGATGGCGAAATAATATGAAAAAATTATATCTCTGGTGTTTTAAACATATACCCTCCTAAACTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATGAAAACCCGACGACTGTATCATATATGTAGCTGTAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTTGGGCTTTTTCACATATTATCTTATAATATTGGGAATATATAATAAAAATCGCACTACTCTAAAATATAGATGTAAAAAAAAATGGTCTAATAAAAACAATGAAATAATTTTTTTTTAATGTCACTGAAGTCAGCAGCACATGGTGTTACTTAAGTTGATTATTTCTTATAACTCCAAGGGTATACAAACTTCTGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTTATAATTTTAAGAATTTCGATTTAAATTTTATGGAAATCGGACGACTTAAACATTTAACTGTCAAGGGAACGGTCAGAGAACTAATAATTTTTGAATATCATTGAAACTGTTAAGAATCCTTAAAAATGTAATCGTTGATTGCCAGGGTATACAATCTGAGGCTTTCTGAAGCTAACTTCCTTTCTTGTTTTTTTATACCCTTGCAGACGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCACTGAAGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAATATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGGCGAGTAGATCTAGCACTGTCCGTCCGTTTTTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTTCTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGTCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGAAACTATCGAGGAAAAAATTAACAAAAAATTATATCTTTAGTGTTTTTTAACATATACCTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTGGTTCTGAATTTCGAATTAAATTCAATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATTTAACACATAGCTTTCTAAGCTTGGATATAATATTTTTAAACTGGTTCTGAATTTCAAATTAAATTCAATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAAAAATCGGAAAATTAGTGAGAAAATAATATTGAAAAATTACATCTTCGGTGGTTTTTAACTTATAACCTCCTACGCTGGGAAATAACATTTTTTATTTATTTATATTATATAGCTGTCATATGAACGATAGGAAAATAAGACGGAAAACATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGATGTCAAGGAACGATCGGATAAATAAATGGAAACAAATTATAGCTATGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATACATTTTTATATTTTTAAAAGTTTCAAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTTGTCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTGTTTTTCTATTAATGGCCTATATAATAAATATTTATATTATAGATGCAGACAAAGCACGGAAACACGGGATGGAGGATTTTATAAGCACAGATCCTTGCACATTTGATCATGCTACTCTTTTCAAAACGTTACAAAACCTCACACTGGAGTATAGGCTTAACGACCCCTATGCTTCTTTGGTAAGTTAACCTAACTCTAATTTACATAGACGTGTAAACATTTTATGGGGCGGATGCAGGGAAAGAGAAATGGAATTGAGCTTAGTTTGAGCTAAAGTAGGTTAGCTGCTATTTGATATAGTGTAGTATACCTTTTCGTAGAGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAGGAAGTCGAATTCAAAAATAAATTACATGCTTATATACTATTTCGAACACGAAAGTTTAGTCATATGAAAATTGGCTCGAGATGTAGAAGGTTAGTGAACTGTCTTTTCAACAGCACAAGGTTTTTGAAAAATTTGCTAAATTTATAATAAGCAAAGCGATATTGTAAGGCGCCACCTACCACTTTTTAAATATATGGTAATGTGGGCGGCAGACAGATTAAAGCGATATGGCCGTTTGTAAGCATATAAGGTAATATGGCCGTTTGTAAGCGTTAGAGTGGCTGTATCACGTTTTTTTTTAAGTCAATCGATATTGATGACACACAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGAGTTAGAGTAGGCGTGGCAAAATGGTTCAATCGATAGGTATCGATGAGACCAATACATTTCAATTCAAATTGGTTTCTAGCATAAGAGCTGACACTCTACTGAAAAAAACTTCCGCTGCGCGGGAAGGGAAGGAATTTGCCTGCCTCTTCTCTTCTGGGTTTTTAAGTTCCCAGATCTCAGCGCTCGTACGAATAGACGGACATGGCTAGATCGACACGACTAGGCTCCTGATCAATGAATATATATACTTTTGGGGTCGAAAACGCTTCCCTTTGCTTGTAACATTCTTTCCAACAAGTCTAGTATACCCTTTTACTCTACTAGTAACGGGTAGGCTAAAGTTTCTATCCTCTTGCAGGTCAATCCCATGGAGGCAATGTGTGTACAGAACTTTTGGACTAAAAATGAATTAGAGAATTATGAACATATTGTTCTATTTTAATTATTTCACGTATACGAGGTGTGTTCAAAAAGTAAGGTGACTTTTCAAATTCGCGGTACACTCTTCCCTAACATCTGTACCAAGTTTCAATTGAATCCCCTTTTTTGTTTAGTTGTGAGAGGCGTAAAGGTAACAAGTTGTTTTGCGTGCTCAGCGATTTTTCGCTATCAAAAAATATGGATCAAAGGATTTGCATCAAATTTTGTGTAAAAAATAAAATTAAGTGCTCCGAAACACTTGAAATGATGACAGTGGCATACGGTGAAACTTTTCTGAGTAAAAAAAATGTTTACAAGTGGTACAAACAACTGATGAAAACGTTTAAGCAGTGAAGAAAATTGTTTTGGAAAATCGTCGAATCACTATCAGAGAAGTTGCTGAAGATGTCGGCATATCGCTCGTGACATGAAATTTTTTCAAACGTTTTGGGCCTGAGTCGTGTGTCAGGGAAGCTAGTTCCAAAATTGCTGAATTTTGACCAAAAGAACCGTCGCATGAGCATCACTCAAGAGCTGTTGGATGACGTCAACGACGCCCAGATTTACTCAAAAGGGTCACAACTGGTGACGAATCATTGGTATATGGTTATGATATCGAAACCAAAGCCCAATCGTCACAATAGGAGAGACAAGACCGAAAAAAGCACGCCAAGTTCGATCAAATGTCAATGTTTTGATCACTGTATTCTTCGATTACCATGGCGTGGTGCATCAGGAGTTCTTACCATATGGTCGTACAGTCAATAAACCGTTTGAGAGAAGCAATACGAAAGAAATATCCAGAATTGTGGAAAAAGAATTCATGGCTTTTGCATCACGATAATGCCCCTGCTCACTCATCCTTGCTTGTGAGAGATTTTTTGGCCAAGAGCAACACCACAATAATGCCTCAGCCACCATATTCACCGAATTTGGCCCCATGTGACTTTTTCTTGTTCCCAAAACTAAAGAGACCTATGAAAGGACGGAGATTTGCAACGATTGAAGAGATAAAGACTGCATCGCTGGAAGAACTCAAGGCTATACCGAAAAGTGCTTATGGGAAGTGCTTTGAGGATTGGAAAAACCGTTGGCATAAGTGTATTGTATCTGAGGGGGATTACTTTGAAGGGGATAACATTAATATTGATAAATAAATTAATATTTTTTCTTGAAAATACAAAGTCATCTTACTTTTTGAACACACCTCGTATGTTAACCAAATACGGAATTTTAATTTTTTTTAAAGCCTGAAGTATTAAAATAATGGAGTACTCAAGAGTTGAAACTGGTTTGCCACAACACAAAAGTTACATTTTGCTATAAATAAATAAATAATTACTCGACAAAGATCCCACTTTTTGGAAAAAAAAAAAATATTTTCCCGAGTATTTAAGATAATAGTTATAGATATAGTACTCACATCGACGAAGACCTAACCATAGGAGTGAGAGAGGGCTGCTTTTCGCAGGGTCTGTTTTTGACCGCGGTACTCAAATGAACTAAGGAAATACCAGAAAACTAAGGAAATACCAGAAATATCATATTTAGCGATTAAATTTCGATTGACGCTGTTAGTCGTGGCCCAAATAAGAAATGGAATCTTTGACTGTGTTTGTGCGGAATCGGTTTGGAAACCAAAATGTAACAATGAAAGAAAAAAAAGAAAAACCCCCTCCAACAAACGTGTGTCCGTCTATCATGGCTATATCGACTCGCCTTGTGATCTTGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGGTCTATCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATTGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAGCAATCGGGGAAAAATAATATAAAAATTATTTTATATTATTCGTGTTTTTTAATATATACTTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTCGAATTCAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTTTAACCTTCTACGCTTAGAAATATCATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTTGAATTTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGAAAAATTAGTAGAAAAACATGAAATAAAAATTATATTTGTATTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTATTAGTTCTGAATTTCGAAATTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAATTTTTTATAACTTGAAGAAGTTCTAATTCAATTTAATAAAAATCGGATTAATCTAACATATAGATGTCAAAAAAATGGTCTGAAAAAAATATTGATGCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATATAATTTATATATTTATTTATATATTTTATATTTTATATTTATATAATTTATTTATATACCATCTTCAAAGTAATAAAAACAAAAGAATCATTTGAATGATCTTTAAACCAAAAACTTCTGATAATAACTTTATATGTTGGAAGTGCGATCGTCACAAAATGTTTACCTCGTTGAGTTTGCTTGATTCCAAATCAACCGTAGTTTTGTTTTTTTTTTTAAATGCTGTTTATTGTCATTCAAACTTAAAAGACATACAAAATTATTACAAATATTTATCTAGAGCGTCATGGCACCAAAAAAGGTGATTTACGGTAAACATCATAGCACAATACAGAGTTAAATGAAACATACAAATTAGACCGCGCTTAAAAGATAATAGAACTCCGCTGGTATCGTCGAAGCATCGATTACTAAAAAACAGCTGTTAAAAAGTTTTAAGCAAATAACGATGCAAGAGTGCGCAGGGGCGTGTTGTGTCTTGTTGTACAGCCGCTTTGCTGTTTACATAATCTTCCTCGCAATCCCTTTTAAATAAAAAAGTCTACCTGATAGTG'..b'AGCGCTGCAGACTTTCCTACCATTAATGTATAATAGCTAAAAAAAAAGTTGTGTATATTGTTGGAAGTGATAACTATTAAATATTTTTCTAAAGTTGTGTTAAATTTTTAGTTTGGTTGAAAACATGAAATACAATATATGTACATAAAATATACTGTCTATACATTTTTAATACAACATTTGTAAACAAGGATCTGCTGGTGTGCAAATGTTGTGTTTTTTTTTACCTGTTTAGTTCCCTTTTTTTGCCGCACGTTTGACAATTGCACGAAAAAACGAAAATATGACAGAAATGTGACTATGTTTGTTCGAAAAGGCTACCTTTTATATTTTACATTCCCTTGCTTGATTGCATAATGTTTTTAGCAATTTAGATTTTAGCAATATGGCTTACCTAATTGTAAACAGTTCTTTAGGCATTCATTTTTAAAAATTAAAATTTGTTTAATTAAGAATTGTTGTTGTAAGGTATCTTGAGAAAATTAGAATTTTCTTACACAAAAAATTGTTGTTGCTACTGGCTTCCACTTAAGTTAGTGATGTAAAACCAATAAAGTGAAAATGAACAACAAGCACATTGGGTAAGCCATGTTGCTAAAACCCAAATTGCTAAAAAAGAAAAAATGTTAAATGTAAATAGTTTTTATTTATACAATTGATTTGTAAATGACACAGAGAAACTACAGTTTTATTTTTAGTGAATAGTTTTTAGTGGTAAAAAAATATTGAGAAAAACATCTTTCTAGTTTTTGTTATGATGTTATGATGATCAGGTTAACCTTCACATACTCATCTAAACAAATACAGCTAAATTCTTTGGTGAACTGGTGAAATATCTTCTATGTGTGCAAATATAGTTAACATTTCTTTTAAAACTGTTGTACTTTGAAAATGTTGCCTGTAATCTTATATTAATTCTACATTTTTCATCAACAATTAATAATTAAACATTCATTTTCTTTAGGCTTTTGCATGGTTTAGCGACTTGCTGGTTGAACACGCGGAGATATTTTGGTCTCTTTTTGCAGTTGATATGGATAGAGTCTTATCAGAACAAGCTCCTGATACATGGGATTCGTTCCCATTGTTTCAAATTTTAAATGACTATTTAAGAGCTGATGGTAAGTTAATATTTCTGAATTTCTTTAAAAAAAATTATTTAAAAAAACTATATGGGTCATTCGCTGTTATCCTGAAAACTATAGGAACTCCAAAAATTTTGAGATCTCTCTAGCATCAATAAGTTCCATACCACAGGTGGCGGTGTATAATATTGCTTTGCTTGTCTTATATCTTAATCTCCCTTTTGTTTTACCGAGACACTCGACTAGTTATACCCTTGCAAAGGGTCGGTAGTTTGCAAAGCGGTAAAAGAGACTTTTTCGACCCCATAGTGTCTATATTCTTTATCAGCATTACTACGCAAATTAGGCAACACCTATCGATTGCGCTTTTTAATCCCGCTTTGCTACTTTTAAATCCATCTCCCATTTGTTTCCTTTAGTTGGGATATCTGATAGTTGATATACCCTTGCAGAAGGTATACAAATTTCAACCAAAAGTTTAAAGCGGGGTGAAGGAGACGTTTCCGACGCCGTAAAGTATGTATGTTCTTAATCGGGATCACTAGCCGAGTCTATTTATCCATGTTCGTTCGTTTATCACAATCAAAGCACCAGGAGATATACTTAATCAAATAGGGAGAAATATTTTAAAATGTTTTGTATATCAAAATCCTGATACACGAGTTTTTTTATTTACCGAATAATCATTATATTATCTGCAAGGGTATAAAATTTGGCTAAGATGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGAAGATTTAGCCATGTCCGTCTTTCCGACTACAACATATTCACTAGTCGGCATGAGTATTTTGACAAAACAAAAGTAAAGTATCAAAAAATTTAAATTTTCAAGACGAGGGAAAAAACTTAATAGATAGATTTTTACACAAGTACGGAATTTTCAATAAGTTCTGAATGGGTTAATAAAGGTATTAGTGCATCATTCAAACGGCATTTAAATGACTTTTCCATTGCTGCCAAAAGTTAAATGATGCACGTTCAAGTTACGAGTATACTTTACTTTTGTTTTGTCAAAATACTTAAGCCGACTAGGGTAGCTATCGAAAAAAAACGGTCACAGAAATAATGCAATAATTTTTTTTAATGTCACTGAAGTAAAAAAATGTCTCAATGGGTGACTATCTTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAGACTTCGACTGGCCAAAGTTAATTTCCTTTCTTGTTAAGAAAATATTTTTGATAATTTAAATTGGTCATATTTTACATATTAAATTTAAAATTTTATTTCAGATAATTTGAGGAATGGGCGTTTTCATCAGCACCTGCGAGACACATTCGCACCATTAGTCGTGCGGTACGTGGATCTGATGGAATCTTCAATAGCTCAGTCGATTCATAAGGGATTTGAAAAAGAACGCTGGGAAAGTAAAGGGTAAGTATAGCTTTAAATATTTAATTATCACACAAATTAAAAAATATAATTTGATAAAAGATATATGCACAAATTGCAACAATATTCATAGATTATTCGTAAAAAATTGGCAAGTTAATTTAAATAAATTTTGTATTAAATTAAACTCGTTAACTGTCCGAATTGAAAGATATTTTGGAAGTCAGATTGGCAAGGTCACACATACGTACATATATTAATTAAGCTCGAATTTCATATTCTGCATATAAACGCAGTATTTGTGTTGTATTTATATTTATATTCTATAAAACTTTAGGATTAACGCTGCTTTGAACCCTGCAGCATTAAACAATGCTGCCCAGGCGCTCAATACAGCAGCTCTCAACCCATCAATGCTACTCAGCGGCAAAAAAGATCAAGTAAATTTTTATGTGCCGAAGTTACCAAAGCAATCTAATTCAACAGCGGCCAGCGACGAAATGAGGTTTTTAAATAAAAAAAATCAATTAATTTATAGAAGTAGATTTTCAAGTTATGTGCATTTGGTTTTGCATTTTGTGTTCTGCCAAATTTTTAGCATTGCCGATCTTATAGCTTATCAGCATTAGCATTTCACAAGATAGTAAGCCAATCTTACATTCTAGAAAGTTGTAGAACTTAGAAATACTAAGTTATATATTATTATGAAAATGATTTCCTTGTTTATTATTTTATATTTATAGCGTTCTTAAGTGAAAATTTGCATACCAAAATACTTTGATATTTTTAACTACATTTAATTATAGAATTTTGTACTTGGTCCTTATGTTAAGGATCGTAGGGGTCAACCAATTGTCTTTTAGTCCGTCAGTTTCCACAGTTATAATTTTCAAATGAGATGCAGATATTATACGGCGTACGGAAAGTGCTTTAAATCGAACCATTAGTTAAAAGGTTTATTTAACTGTTTAGGTGAGTTACGGGTATATAATAGTCAAGGGGAGCTAGAAAGTTAGGACTTGGCATGCAGTTTTCTGGGCTTCCTGCGCAGCTAAGGTAGTGGTCGCAGTTTTCATGCTAGAAACAAATTTTTAACTGAAATGCATTTGTGTCATCAATACGTTTCGATTGACCTGAAAAAGGTGTTCCGCCCACTCTAACGTCCACAAACGCTCAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCGCATACCCCACATATTAAAATAGCAGGTAAAAGCGCTCTACAATATCGCATTCCTGCTTATTTATCTCCCTTTCCCTTTTCCTCTCTTTAGCAGAGTAACAAGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGATTATAGAGATCTTCCTTGCTTGTTTTTGATTTTGCAGGCGAAGAAACAAAATTCAAATTATTTGATGATACCATTTATTTTTATTAAACCTGAAATGATTTCTTTTCATCCATTTGTTATTACTATAAAGATTTCTTCGTCATAAGCTTAATTAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/437/7c1/eb/scaffold_70-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGAATTTTAGATTTTATTTTGTTGATTTTTTTATTTTACCTAAATAGTACTTTTCGTGAAATTTCCGTGCTTTTTAATCCCCAAACATAGTACATATTACAATTAGTATTAAAATCGTTGGTTTTGATATATATTCTAGCTTCTTATTTATCAATATTGGATTTTTTTAAACATGTTAAGCTACGTTTATATTTTTGGTGAACTTAATTGGATTTTAATCTTGTCCATCTTAAAAAGCCTTCATACTGTACATAAAAATGTTAAGCTTATTGACAATATTTAAAAATGAAAGGTGCGTGTATTCTTCTATTATTCTATTAACAAAAGCTATGTTCACCAACCCGGTGTTGACATACCCTCACAGCTTAACAGACATCATGAATATAAAATCATACTTTTACTACATAAACCGTTTAACCCGAATTAAAAAAATTAAGAATGAAATTAATTAGATCGTATAATACATTTTGTCACAAAAGTTGATATCAGATCTTTGGGTTGCTGTAGGTGCGATCGACACTAGATTTTGACCTCGCTCAGAGGTGTTTTTTTTATATCAGAATTTTATTTGTTAAAAATCAATCATTAAATTCAGCTACTTTCATAAAAAAAAATATTGTTCAAGTTTCTTATGTGGAAGATACACCTTAATTCGCATGGATACGCAAAAAAAAGTTTAACGCACAGGCAGTGTTATAGGTTCTGAACTAGTACATGTAGCCATGTAATAAAAATTTTAATACGCGGCTTTTACAACAATGTGTTGCATGTTAAACGTGAGGAAATGTCAATGGGTAAACACTTTAAGGCTTAGCGCGAAATCGTTTAAGCCGGTTTTGAGATATAGGAAAAAAGTTTAAAAAATGACGGAACAAAAACTTTTGGTCATGATCTTTAACCGATAGTATTTTGACAAATCATGTTAGGAAATCGAACAAAGTATTTTAATATACCTTTCTAACGACATATAGCATAAGCCTGTAGCTTTAGTAGTTCACAAGTTACGGGTCTACAAAATTTATCTATTTATAGCTATTTTCATCCCAAACTAACTAGTTTTTTCAAAAGTGGTAGAATCAAAGTTTCTTCTATTGAGCTGTTTAACATCATCTTAAATTTCTAGGACCTTCAAATAGAGTTTGGATACGCACAAAATTAAGCTATTTATAGCTGTTTTCTCGCCAAACTAGCTAGTTTTTCCAAAAGTGGTAGAACTAATGTTTTTTATATTGAGCTGTTTAACATCATCCTTCATTTTCAGGACTCTAAAATACCGTTTTAGGACAAACTAATAGTAACGCATACTTTTGAACGGAGCATCCGATCTTGACAGTGGAGGTGTCATTCGACGCGTATTTTTCATTGAGAATACAAATAGGTGAATAGCCGGCGTAGTTATCCTACCGTCCCAAACAGATAAAATTTTCCAAATTTATAACTTTTAACTTAACTTATACAATTTCACCACTTTTTCTCCCACACCAATTGATTTTCTTAAAGTCTTGGTATGCAATTTTTTGGTTTATGCAACACAATAGGACGATTACTGTAGATTTTCATTTCTACGTGTATATATGTAGTCTCCTTCGTACACTCTCCTGTCTCCTTCGTCACTACGTGGACTGCCGACCACAGTGATCCTGAACACTCTAGATTTTGAAGATTATTTGCCAAAGATTTCACAATTTTCTGAAGCTATTTTAAACAAAAAACATTTATTTCTTGTACAAAACAAAGCAAGAAATGGTCTAAAGCAAGAAATGATCGTGATGCCCATTTTTGACTAATTTCATGTTTGTGTACTAAACAAAGCAAAAAAGTTTAAAACACGGAATGTTATACCGCGTTAAATTCGTTATTAAATTCTAAATCAATTGGCATTTTAATCTAAAAGTTATACTCTTGGATCTTGGAGATCCTTTATGTGTATAAAGTAGCTTAAGATATAAAACGTTTGTTTTAAGACCTTTGGAAAAAACCACTAGTTCAGCGGGAAGAAAAATATATAGGAATTTATACAAGTATTATACGGATTCATACCAACATTTGTAAATGATATGAATTCGAATTATTTCGATATGAAAGAAGATATATGTGAAAATTCAGGAGGCAATACCTTACGGGAATTGTTCTGTTTTCTTTCTTAGTGTAAACTCCGTACTTAGAGCTAGATTGTTTGCTACTCCTTAAGCTGCGGTGTTCTAAAGTTTTATTAGTAAAACCATTTTAACTGAAATGTATTGCTCTCGTCAACACTTATTTATTGATCTGAAACAAGTTTGACACGCGGACTATATCAAGATGGGCCAATTAGGACATGATGTCATGTATGACAAAAATTACCAACTTGAAATCGACATGGCATTAACAATTCCTTGATATCGAAAATTCCTATCGGTATCGGTATATTCTAATGAAGCTCTTCAAAACTAAATCACAAAACAAGACTATGGGGCTCTTCTCAAAGACTAAATTTTATTTTGTTTGGCAGTTTGTCCCAAAACGTTATCATTGTGGACGGCAGTCCACGCAGTGACGAAGCGAAGTGACGAACCGGGAGGTTCTGCGAATGTGACTACTATATATAGACGAAGAAATTAAAACCTACAGAAATCGTCCGATTGCTTCGAGTGATGTATCGAAGGTATTGCAAAAAACTAAAAGAATTGCATACCAAGATCTTAAAAAATAAAATGGTTTGGGAGGAAAAGTAATAAAATCGTAAAAGTTAAAATATACAAATAAATAAATTGTGTATACCCATAACTTGTGAACTACTAAAGCTACAGGCTTGTGCTGTACGTCTTTAGAAAGGTATGTAATAAACGATCAACTTAATAAACACACTTTATATATTTTTTACATTCGGCACGCTGCAACTCAATATGTTATTGCTTAGTTCTTTGATTTTAATGAAGCGTGCCGAATGATATTAAAATTTTTTTTTGTTGAAGGTGCGATCGTCACTATATTTTTACCTCGTTTAGAGGTGTTTTTGTTTTATTTTAGGGTCCTGAGAATTCTAGATGGCGTTAAACAGCTTAATATAAAAAACTTTAGTTTTACCATTTTTCGAGAAACTCGCAAGATTGGCGGGATATAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGCGTCCCATAGGTATAATCGAACATTTTTTTGTTAAATATATATTTGTTGTTTTCTAACATATGATTCCCTACGCTTGGAGAAAAATTTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATCATATCATATAGCTTTCTTAGGGAGGGTTAGGAAAATAAGATTAAACAAATTATAGTCTCGGCGTTTTTGACTTATTATCTTACAATATTGGGGATAACATATTATCTTATAATATGGGAGCGCGAAGGCTCCTCGCCCATAATATTGGGAATAACATATTATTTTATAATATGGGAGCGCGAAGGCTTCTCGCCCAACCATTATTTTTCAGCAATTTAAGTTTGTACAAAATTTACCTTGTGTTTCAATTTTGGGTGCGCTAGACTGTAATTTTTGCTTATGTTTCTGGCAACGCCAAGAAAGAAAGAAATACGTTAAATAGGCTACAGATGTACGTATGTACGTATGTTTACTTACTACTTATAAACAAGGAAAATTACTTAGCCAACAAGAAATTATGATATACAAACACAATGGGAGATATTAAGGCGCCACCTACCTGATATTTCAACAATAACACATAATATTGTGTTAGCAGACAAATTCAAGAGTTCTGGCCGTTTGTGGGTGTTAGAGTGTGCGAGGCCAACTTTTTTTTAGGTCAATCGGAAGGTGAAGAAAAAAAATCATATTTCTTTTAGCATGAAAGCTGTGGCTACCAGATTTTTGGGCGAATTGTGGGCGTTAGAATGGGCTTGGAAAGGTTTTTTTTTTAGGTAATCGATAGGTATTGACAAGACCAATACCAATACAATTGTTTCTAGCATAAAAACTATAGGCACTACCGTTTTG'..b'TTCCCTGGTGTGAGAAACAATATATCAAATAACAGCGCACACGGAAATCGGCGATTTTCTACTCACCCGCTGGCTGGTGGCTCTATTATTCGGCCTACTGCAGGAGCTGAGACTCGAACTGCTGCCCCACTGGACCCGTTGGATAGCGTCGGCACTTTTCTGTTTGGTGCCATTCACTGGTCACTAGTAGGACCGCTCTGCCTATTAAAATAGGAGTGCTGCTTAGAATTTATTTCAGCAAGACAGCCGTAAGATATATATGAATAGTATTTAACGGCAGTGGCAGAGGCCTTTACAATATAAGGCTTTACGGGATTTTAAACAATGAAAAACAAAAATATTTTTATAGAGTCGAGATAAAATACTTTTTACAATAAATACTAAGTATTTTTAAAAGATAAAAATATTTAAAAGTAAATACTGAATATTTTAACAGGTGTTAAGTACTGGGAACTGTGACTAAGGACGGCGGTATATCGCTACCATAATATTTTTAAAGGAACTGAATACTGAAAGATGTGACCAAAATGGTAGAATATCGCTAACGAAAATCACAGACGCAAATATCGATAGTGGCCTAGAGACCCGATATCGCCGCCGTGATTATCGATGAAACTACAGCTGAGCTGCTTGTTTACATTCTAAAGTTAAAATTTTTAAAAATTTCCAATACAAAAAAAAATTCTTCGTATTAACACGGCTGTTTGCCGGTAAGATCTGAAGTGGATTCAAGTTGCAGCACCCTCAGGAAAAGAATAAATTATTATAATATAATAATATAATATAAAGAATTTAAATTCGAACCAAACGCGGTATGTCACTCTTCATTTAGAGAATTTGTGGCTTTGTTTTGTACAAAAAACTATTCTTTTTTCTTGAAAATTAGCATCAAGAATTTATTGCCAAAACAGAACGCAATTCTGCTAAATCTGGTTACCCTGCCAAATGGCTGGCCGTTCTGTGCATTCAATAACACAAGCTAACGGCTTACGGCACATTCGGAAAGATCCAAAAGAATTTCTATTCCGGCATTTTTTATGTATTATCGTCCAATTTTTGTATGTGTATTCATTCTTTTGGCTGTCCGTTATTAAGCTTTTCTTATCCACATAAGCTGACCAGCTGCCAAAAAGCCGACCGTTTTGTGCAGCCAATAACCCAAGCTAACTATCAACAGCAATTTCGAAAAATCCAGAAGAAGCTATCCTTCGGCAATTTTTTCTTATATTATAATTTTTTTGTCACAATTTTTTGTCAAAAAATCGACAATAATTAAGTGTTTACATTTTAATGCGATTTAATTGGAAATTTGAATTCGAATCAAACGCGGTGTCACTCTACATATGGACAATTTGTGGCTACAAAATTAGTTGAAAGTGCATGTTTTTTTTTAAGTGAAATAAAACAAAAACAGCAATAACAGGCCAAAATGTTGTTTTATAAATAAATACTTACATATCCGCATATAAATATGAATGAAAAAAAAAACAGCAAGACTGGGCCAAAATATTGTTCTTTAATATGTAAATAAATACATATCTACATATACATATGTGGACAAAAGTGTTAAAATTAGTTAATAGTGCATGTTTTTTAAATGAAAAAATAAAACAAAAAAAGCAAGCAAATATAAATTATATTCCACACACATTTACAATAATTTCAAACTACGCTAAAAATACCCAACAGAAAAAACATAGAAAGGTAAACAAAATACAAGAATATCAAAAAAAATCTAATTTTCACGTTGTTGTGGCCGGTACCACCGGTCATACATACATATAGATACATATTTAGATTCTCACAAAAAGAATAGAAAATTACCGCTAATTTCCTTATATACGTTTTTGTTTTCAGTGTTTTGAAATAGTATTTTTCAAACAAAAAACAATACAAAAGGGTTAAAAAAATTGTTCGATTGGCTTTAACATACTAATTAAAAAAAATCACAATTTTTTGGCAAAATATCGAAAAAAATTAAGTGTTTACATTTTTATGCGAATTATTTGGAAATTTAAATAAGAACCCAACGCGGTTTGTCACTCTACATATGGACAATTTGTGGCTTTGTTTTGAACAAAAAATGAATTTTTTTTTACTCAAAATTAACAAGAAGAAACAGTAATGCGGGTTTTGATCGCAATTCTGCTAAATCGAATTTCCGTGCCCAAAGGCTGACCTTTTTGTGCAGCAAATAGCCCAAGCTAATAATCTACAGCAATTTCTTAAAGACCGAAAATGTATCAACTTCGGCAAAATATGAAAATTTAACATTTATTTTTCAACATTTTTTGCCAAATAATCGACAAAAATTTCAGTGTCCCGATTTGGATGCGAATTAATTGAGGACAATTGTGACTTTGTTTTGTAAAAAAACTATTTTTTTTACTGAAAATTACAATCAAGAATCTAAGGCCAAATCAGAATATTTTCACTGCGGTTTTTTGATCGCAATTCTGCTAAATCGGGTTCCGTGCCAAAAAGCTGACTATTTTTTTTACTGAGAATTAGCATCAAGAATTTATTGCCAAAACAGAACGCAATTCTGCTAAATCGGGTTGCCCTGCCAAAAGGCTGGCCGTTTTGCGCATTCAATAACACAAGCTAACGGTTTACAGCACATTCGGAAAGATCCAAAAGAATTTCTATTTCGGCATTTTTTATGTATTATCGTCTAATTTTGGTATGTGTATTCATTCTTTTGGCTGTCCGTTATTAAGCTGCTTTTCTTATTCACATATTCAATGGCGCAGTACATAAAAAGAATGAACCGTGGTTTTCTTGCCCTCTCCATCTCCCTCTACCACTTCCCCTCTCAACAACTATCTCACGCACTCTGTCCCTTCTCGTCTCTGTCACCCTCTCTTTACCTACCTCACTCTGGCACACTCTCTCTACCTATCTCACTCTGTCACCTTCTTCTACCTAATTCTCTCTGTCGCGCTCGCTCTCTCAACATGCCTTTCGCACCGTATCTCTTCGTTTCTCTGTATGCTTGCTCTCTTAATTTAAGTTTCTCTTTCTTTGTGTTCAATATCTTTCGCGCTCGTGACTCCTATTGACCGGACTCTGAGCGGTGCTCATTAAGAGTGGAGTTTTCGATGATGGCGGGTGGCGCGAACGAGAATTTTTTACATAAAGGTAAGTTGCCAATTCTTTTTTAAATGTGACATACAGCATGCATATTTTATTTATTGTAATTATATGTGAAAGAATAAAATTATATGTACTTTTATCTAATCTATTGCATCTATTTTTTCACAGGTAAACGAGTCACACGAGAAGTAAAACACAAACACAAGGATCAAAATAAAATTCAGGTGAGTGAACGAACGTGTTGAAAGTAGTTAATAGTGCATGTCTATTTAAGTGTAAGAAACAAAAAAGACACAAATGGGCCAATAATTCGTTTCTTTAATAGATAACTGCCTATATTATGTTCAAACTATGCTAAAAAGACCCAAAAGGAAAACATAAAGTATATACCTTGCAAAATGAATAAAAAGAAATCATATATATTCATATACGTTTGACCGGTACCACCGGTCATACATACATAAACATAAACACAAAAAGACTAGAATATAAATACCATATTTTTGATTGGCTTAAAAATGGCACAAAAAAAAGATAAAAACTAGAGTGTCTAGCTTTAAGTGACAATCGACTCGGAAAATGATCAAGAAATAAATGAAAAATTTGTCTTGCGGCTTTTTGGTCGCAATTCTAAATCGGTTTGTATGTATGTCACTCTTCATGTATACAATTTGGTGGCTTTGTATTCCACAAAAGTCACAGTAGTCACAAAAGTTTTTTTTACTGAAAATTACCATCAAGAGTCTATGGCCAAATCAGAATATTTTCACTGCGGTTTTTTATTTCAATTCTGCTAAATCGGGTTTCCGTGCCAAAAAGCTTTTGCAGCCAACAACAATATTCAATTTTTTGGCAAAAAATCGACAAAAAAATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTACTTTTGAACTGATCATCTGATTTTGACAGTTGAGGTGTCACTCGGCGCATATTTTAATACAACTAGGTGAAAAGCGGTTATTTGTCCCCACCGACCCCAACAGATTAGATTTTTAAAATTTTAACTTTTACACTTTCACGGTTCTTTTAAGATTACTGTACATTTTAATTTCTTCGTGTTATATAGTAGTCACCGTCGCACACCCTCCTGGTGCGTTTCGGCACTACGTGAACTGCCTTCCACAATGATAAAACAAATGGGTTCTGCGTGAGCAATTACAAATCTAAATACAACATGTAAGCTGGGACCAACCTGGGGTAAGATCCGTTATATTAGGAGGATATTCTAAAGCAGTGGAGTATGTGTTTGTTTGGGGATTGAAGGGAATTTCCGGAAGGGCGTCTCTGGGCTCCAGTGTCTTAGATGAATATACTGTAGTGTCAGCACCGGCCCAAGATGCACATTTTGACTGCCGTATTGGGATTTTGCTGGGATTTAAAAGCGGAAGATCACATCCTGAATCAGTTTCCCTGTAACTGTCAGTGCTGCCTCCTGTAAACGGAGTTTTGTAGTCACCTGATTTGTAATTTGGTTGATCATTCAACGCATTGCATGTTTCACTTTTTCCGTTTATCTTCAGGTTATTGACGCCGGTAGCATGTATGCTACAGGGATTAGCTTCGATACAAGCTTCGGTTTTGTCCGTGTAGGTTTGTTTCTTACATTTGTTCGCCGTATTTGATGGTAAAGCTATCACTGCAGCATTTTCTTCTATTTCATCACAGAAAATATTTGCTTTATCAGAAATGCCAGGGTCTGGATTTGCGGTTGTAGTATTTTTAATAGGTGCCAGCGCATCATAGTAAACAGAATCGTCCAGATGAGAGGTCTCTATCCAAGTGAATTTAAAAAATATGTTACTACTTATTTACTTCAAAACTAATTATAGAAACGATATAAGGTTTTTAAATTTTATTAATATGGTCAATACAAAAACAAACCTAGTTCAGCACTAAGCAACATCACGATTAAAAACAAAAACGATATTGTTTAAAGAATTCTTCAGAGCCCGTACTGCATTTTAAAGGGATAGACAACGTTTAGACGTTGTGATAGTCGTTTTTCTTAACAATGCAAAATTTTTACCAATAAACCATACATCTCATATTAAGTCAGAAGATAATTCATTGCTTTTATGTCACTTTTTTTTTATGTCAAAGTTATTGTGTCGGTTAACCACTTTTTAGGACGTTAAGGCGAGTTAAGTTGTTTTTAATAATTACCTTTTGGGATAACACGAATTTCCAGTCGGCCACTTATACAACCGTTGTTTTCTTGGACTGCTGAACTTAAAGCTACATTACTTCTTTGGCAAGCCATTGTCTGTACTTTCCATGGTTTATTGGCGTCTTCAGCCAACATTGCATCAGAATTCGAATGAATCGGTTGGTCGTCAAATAAATCGGCAACCGACACGTTAGGAAGGCTTCTTCGATGTTTCAATTTAGCTTGACTATTATTTGAAGTATTTAACTGAAACGTGGCGTCCTCTTTAAAAGGGGAAGGAAGGACAACCCTTGAAACTAAAGAAGTGGCAGGCTTAGCTTTATCCAATGGAGTGATATCTGAATATGTTTCTCGAACACAAACATTCCTTGCTATGTCCATGCGATATACCTAAAAGTTAAAGTCAATATTGGTATAGCACGCCTTTTGTTCTGTAGTAAAAACAACATACAAATTTCTATTTATCTATTTTATGCGTTTTTAACTATTAATTGGTTTACGGATTTTATATTAAAACACCTAAAATGTCTTCCGCTTTCTTTATTTTTAATTATTAATATGCTTACTGTGTCATCAAATGCTGCTTGTTGCACAGCCGGTGGTTCCAAGTCTTTACGTAATACATTACCCATTGCAGGCTCAGACCAACAGTGCGGTATGGAGATTCTCAACGCTTCATAATTCTCGATTCCAGTTATGTTTAATGTATATCTGTGAAAAAATTAGTAACTATATTTTTGAAACTTGAAACGCAAAAGATCGTGTCCCTTTAGATCGTTCCTTTAACAGTAAGTATTAAAAAAGGATGAACCCTATAGTCGGGTGCCTCGGCTATCAGGTACCCGTTATTCAGCTTAAGCCAAAGGGAAATGGAGATATATTAGCAGCAAATCGATTTTGTAAATCGCCGACGTGTATGTTATGTTGGCGGCAGACAGATTTGAGCTTTTTGGACGTTTGTGGGCGTGACAAACTTTTTTCAATCGGTCGGTATTGATGAGACAAATACATTTGTTTTCTAACATAAAAACGGTTCGTGGATTGTGGCCGTTAAAATGGGCGTGGCACACAATAATACGAAAAAAACCATGTTTTTTTTTCCCTGACGGCACAGTTAAAATGTATTTACTCAACGAATGGTACATTAAAATATCAAATTTTTACAAAGAAATATTCAACAAGAAATGAAGCTAACATGGCTAGATCGACTCGTTTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACGTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATATGGCAATGGTAGCAATCGTCCGAATGCTTTTCTTGAATTTGAATTGAAGTGCGGTGCCCCCCATAACTCGTTTTGAGTCTTCTAGTTTTTTTCGTTTCCGAGATCTCAGCGCTCACACGGACGGACGGACATGGCTCGGCTAGTAATCCTGACCAAGAAAATATATATGATCTTTATGGTGTCGGATACGTTTCCTTCTACCTGTTACAAACTTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGGGTAACGGGAATAATAAGGAACAACCACGACTATCAGATACTTGCTAAAGTGAACAACAGGAATAGGTATTGATGGATTTTACGTTTATTTTTATTTTAATTTTAGGTAACACAGTTTTGGCCGATTTGTGGGCGTCAGAGGTAGTGTAGTCTGGTCGGAAAAACGGATCGGAAAAAATATCGTCATCAAAAGATACTTTAAAACAAGTGAAGAAGTTAGCTTCGGCAGGCCGAAGTTTGCCTACCCTTACAGTAATAAGAAAAATTCGATTTTGTAAAAAGTCGGCTTATTATTAAAAAAATCTTTTTTAAACCATTATATTATTATTTGTTAGCATGTTAGGGTCATCTGGTTTTTATTATGATTGCGATGGTTACAAATGATGGTTTGGAAGAAAGAGTGGTAAAATAAAAATGTGGATTTTTCTCTTTGAACCAGTGGGGATCGTTGTACTCTCACTTAAAATACGCATCGAATAACACCTCAACTGCCAAAATCGAATGCTCTGTTCAAATTTAAATTTTGCTAAATGTCGTTAGAAAGTTATTTCGAAATAGTATACTATATATATTTTATTATTAAAATATTATACTATTAGCATTTTTTAAGCTTTTCTTCTGATTGCTCAAAACGGCCCTAAAATTTCAAAATAAATTTTAAGCTGTTTAGTTCTTGAGATTCTTTAACTTTCAACATATGACACGATGTCGTAAGAAGTCCCGTTTGAAAGTTATTAATAAAAAAATGGCTTCCTTTGCGAGTTTACAACACTATTGAACTTTTTTGTACGTATCTAAACTCTATTTGACGGTCCTGGAATTTTTTGAATATGTTAAACAGCTTAATATGAAAAAACTCCATAGTTTGGAGGGAAAACAGCCTTACAAAACATAAATTGGTACGCCCGCTTATGCCGTTAAAAAGGGATTTTTGAAATACTTTGTACGCTTTCCTAACATTATTTGTCTAAATACCATTGTTTAAGGATTATCGTCGATATTTCTTAACATTTTTTCTATTTCTCTAAAGTGGCATTAACGATTCTGGGCTAAGCCTTAAAGTGTGTACCCATTGCATTCCTGAACGTTTACAGCATGAACACATTCTTGTATAAAGTCA'..b'CTGATTCCATTCAAGCTTGGTCTTGGTGTTTCCATGTGAAAGTGACAGATTTGTTTGGGTTTTAAAGGACGGACGGAAAATTGAAAACTGATTTGCCTTCTTCTAAAATGTATACTTCATTATGCAACTTTGAAAAAATATGTTACTGCAAATTTGAAATAAATGTTTACTTCTTCAGTATTTTATTAAATATTCAGTATATTTTTAAGTTGTTTTTGCGTTATGTAACGGTTTTAAGACCCGTTTACAAGAATAGTACATAAAATTGGTTAATTATTTAAGAAGAAGACCAGTTATGGGTATTATTTGGATTTTACATAGTGATGAACAAAATTGGAGTCATCATAGACCTTATATAAATATATATAGAATATTCATACTTGGCATGAAGATTCCTAGGCTTCCTACGCAGCGCAAGCTTGTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAAAATCTGAGAAAATCAGTAGCGCATACAGTTTTTATGATAGAACCAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTCACAAAAAAAAGGTGCCACGCCCACTCTGCTGATTCATCAGTAGACCCTATATAGATGGTTTCCGCTTCAGAGACTTTTTATCCATAAGAAATACACGTATTACAATAGATATCACTCGCTTTGGCGCAAATCGATTTAGTATCTCATCATTTTGTAAAGATATGCATTTTAACTGCAAAATTGTTGTTATGGCCTAGTACTTAACCTAACAAAAACGGGGAAAAATTTTTTTTACCATTATTTTTACAAATTTACGGTCGTGCTGGCTTGAATACAAACAAACACTTGTAAACAATAAATAAAATAATATTGCACTTCCATAAAGAATAGGACTAAACGCAGAAATAGCTACTGCGTACAGCAATAGTTATATTGGACGAAGACAATAAGAAGCGCATAGATATTGCTGGGTCATCCGTATTTGGCTTAACGTCTAAAAAAAGGACGAATTTTAACAGATGTTATATATACAAAATTAACTATAGACTACATTCTAAGAATAGATTGGGGGTTAAAAATTCCAATAATATAAATTAATGGCTTTTTCGACGTTGATGCCGAGCAGCTCGATAGGCCAAGAAATAATTAAAATAATTATTTCATGAGTGGTATTTTAGTATTTTTTTATATAACCCTACCAAGCGCCATGAAAAGACTGTTTTCGACTTAGCGAACTGGCTCAACATAGAGTTAAAATTATTATTGCCTAAACATTTTAAAAAATTTTAATAAAGATAATAAATAAAGTAATATATTCTCAAAAAATAAATATTGTATTACATAATAGCGTTATTGTAACTATTATACGAGAGAACTGAACTTTTGTCACGTACTGCCCTTCAATTCCGAAAATATCACAGTGAAATCACTTCGGATATTCTAAATTTAAACAACGAGTTTTCCCTTATGAAATCCCTTGTAAGTGACACATCCCAAGTGAAATCACTTTGGAAATTCGAAATATATTTCTATTGAGTTTTAACCTATCAAAACATTGCATTTAAAATACATTAATTTTTATTTACTTTTTACTTAATTTAAATTAGATTGTCTTAGATTGTTTCTAAATATTGGTTTCTTCGTAAACACTTATCCGGGTCCTCGTACTCACAGTTTTCGTCAGAAAAAAAAACAAAAAAGCTTTTTGGCGTCTCACATGTCACGGCAAGCCTTCTGTGGAAGTGAAGGGTTGTCCAAGCGGTCATGTCACTCCGGATTCACAAGAAGTTAAACATAAAAAGCATCACTCTACTCCTAAAGTGCAAATATCTGTTTGCTCTTGGGAATTCCGTGATTTCGGAAATTTCACGGCTTGCGACGGCCACTAACCGCCCAAAAATTTAGTTTCTGCAGTATGAGCGCTATAATTTTTTTTGCTAACGAGTGTTGCACCCAACATTTTTTTTGCCACGCCCAATCTTACGCCCTTTAGCCTAGAACTTACATCGACAAAAACTGCAAACCAACCAGAGAAATGAATGGCGAATAGGCAGCTAACGCTTTTCATCGGGTCTGATTCAGATGAGCTAAGGAAATACTAGAAAAAATACCAAAATGAATTTCGATGGGTGCCGTAAGTCGCGGCTCAAAGTGGTCATCCTCCCCGGAGTGTCCACGCAAAAAAAGTAAATACTAGGCTAAAGAATATCGTTACGTTGTACTTAAATAGGTTCTCTATTGAAGAGCCGATGGACAACGCGTTTCCGTTGGCGAAGAAAAAAAAGGCCGGCTAGGCGCCTTCCTGCTGTATCAGCGGTACAACTTTATTCCCATCCCGGCTATGACTCCCCGCAAAGCCCATGTCGGGATATTGGGAATGGGAACTGCACTGCAGAAGATGGTGAAGCATCTGCTATACTAGAAGTAAGCCCTAAACTACTTAATAATAAAAATAAAAAAATTGATGTTGTTGATAATACAACCATTCTATATGTATTTTGCAAGTGAACTTTGAAAATTTCGGTCACCCTACAAAGAATAATAAGATTTTTTGACTAGTGAAACTTTGATCTTAAGCCTAGTACTGACATCGACGAAAACCGCGATCTAACCATAGAGTGAGCGAGGTTCGGCGGTTCTGTTTTTACTCAAATTAGCTAAGGATATACCAGAAAAAACCTGATTTTACAACTAAATTTTAATGGAAGTCGTTAAGGCCATACACTAAGGCCATACCTGCAGTATTAGCAATAAAACTCCGTCCCCATCCCGTCTCAAAATGCCCCGGAAGTGCACTGCATCGCACGGAGAAGATGAAGAGAAATAAAAAAATGGCTTTAAGCATTCCATTCATTTTGATTTTTTTGAGCACAACCATATGCGTATTATTTTAATTTTCCGTGGCGTGGCAGTAAGACCGTGCTATATGCATTGCGGGTGAACTTTGAAATCTTCGGTCATACTACTCAAAATACGATTTTCCACGTAACTCTTAGCTAATCTGAGGCTATCTAGGCTTTAACTCCTAAATCTGTTTGCCGCCCACATAACATATACAGGAATTTAGGGTAGGTGGCGTTTTACAATCTCGCTTTGCTGCGTATGAATTTCCATCTATCCTTTAATCCTTTTAGCTGATTAACGGGTATCTGAAAGTCGAGGAACTCGATTATAGAATGTTGTTGTGCCAAATAAAGAAAATTTAATAATTCCTCTCCCACAAAGCTTTATCTGTTTGTTACTTCAACTACCATTTTAATATACCTGTTACAAAGCATTTGTTTTTCTCTACAGCAAAAAATGTCTACACTCAGGACAAACTTTCGGGTTGGACTGTCTAAAAACAAATAACAGGCGGAAAGAAGTTTTTCCGACCCTATAAAGTATATAATCTTGATCAGGATCACAAGCCAAGTCGATCCAGCCATATCCGTCGTTCGTCCGTCCGTATGAACGCAGAGATCTCGGAAATCATAAGAGCTAAAATATTCAGACTTGACATGTAGATTCCTGGGCTTCCTACGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGCGGGGTGTCACTCTAACGCCCACAATCCGCCCAAATGCTAGACATTCTTTTTGCAAAATGTATTTGTCGTTAATACTTATCGATTCACCTCAAAAAATTTGCACCGCCCACTCTAAAATGCTTAAAACTGTCTGCCTGCCACATAACGTATACCGAAATAGCTAGTGGTGGCGCTTTACAATATTCCTTTGCTGCTTGTATATCTCCATTTTCATTTTGCTCCTTCAAGCTGAGTAACGGGTAAGTGATAGTCAAGGCCCTCGACTATAGCGTTTTTCCTAGTTAATATTGTCTAATGTGATTTTGTGATGCTAATCAAGAATTAAAGTATTTATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGCCTGTACGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAACCTTTCCCATAAGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAATCGGACAACTATTTATGCTCTCATAGGAACAATCGGAAAAACAATTTTTTTAAATTATATCTTTGGTGTTCTTAACATATAAGGCTTTAAAATATAATTCCTTTAATAAGTTCGAAATGTCGAATTAAATTTCATATTATTTATTATCTTTGGTGTGCATATTTCCTTATAAGCTTGGAAATAAACTTTTGATAAGTTCGGAATGTCGAATTTAATTTTTATCAAACTCAGACGACTGTATCCCAAAGCTGTCGTTCCTAATGCGGAAAATTGGTGGGATAAAATTATGAAGCAAATAATAGCTTCGGAGTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATCATTTTTTATATTTTTAAGACTTCGAACTTAATTTAATAAAAATCGGACGGTTAATATAAAGCTTTCAGAGAAACGATCAGAGAAATAACGAAATAATTATTTTAAACGTCACTGAAGCTAGTAAGAAACCTTGAAAATTTAACATGGTTTGGACTGCTATTATTGCGTCCTGCAGTGCACTTCGCTTCGTGACTGCTCAATCCCTTAGCCGAGATGAAGGACTTGCGGCAGTGCGCGCATTTCCGGTTCTCATTCCTTGTCAATGGAAGAGGATCCGTGGAGGTGGAGCTGGAGCTGGTGCAGTTCTTCTGGTGGCTCGACGCAGCGACCATGGTCGTGAACGGCTGTGTGTGGCACTATAATTGGTACACGTATCCGCTGTCGGCAGTTATTGCTGTGACCGCATCCTGGTCAAGGCTGGAATGGGAGGTCAACGCAAAAGGTTTTTCACTTATGTATATGCCGTGACCAATGGGGTACGAGTCGGAGTCGGCGTCTGCGCATGTGTTTTAATGTCAAAGAAGAAAATGAGTGCGGGGGTGTAGGGATGCAAGTGTATAAGCATAAACTGATACCGATCCTCGATTCAGATTCAGATTCAGTTTATTTTCTATGTGAATTCCTATTATTCAAATTCAAATACTTTTAAAGTTTTTCTTTGCTAAGAAACCAAAAATGTCCCAAAATTTCAGACTCACAAAATAAATCCCAAAACAACGAAACACGCACGAAACGGAGAAGCATCTCCTCCCCGAAAAGCATCTGTATCTTCCGCCCTGCGTCCGCCTCGTTCCCTTGCTTCAGTGTGACTGTCGACGGCATACGCATCGATACTGCGGCCCATTAAAAGTGCACCAAGCCCAGCAGGTGGAAAACCTGGCCAAACGAGTTGACAGAGTCCCCGAAAATGGTGGTGATGCTGGGTGGGCTTTTGCCGTTCTCACAAAAACTATTCTAATCTTACCTCAGACTCCAACACACTTGACGACACATCTACGTCTACTGAAATATGTAATTAAAAGTGGAAGGCGTCTCTTTTGTGGAAGGTGTCTTTCTGTGGAAGGTGTCTTTTTAGAAATGTAAGTCGTGTACTATCGTTTACAGAATGCCTTACTTTACCTTACTTTACTTTACAGTTTAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACACAACATATACCAAGATGGCCGGTAGGTGACGCCCCAAAATTATCGCTTTGCGTTCTTCCTAACATGCATCTCTTACACCCTGATTCCCTGGCCAACTCAACTGCTCGAAGTAAAGGTGCAAAGAGCGTGCGTCCTCCTAGGCGATATGCCACCTTCCTGGGTCCCTGGGCATTCACAGGCGCAATCCGGATGACGAACACGGAGTCGCTAATAAAAGCTAATTCATAAAGTGTCGCTGTTTTACTATATTCAATACTTGGGTCACCTTAAACAAGTTTATAATCTTTTTTTAATTATTTCAAGAGTTTTTGGAGGAAAGCGATCAAAGTCCTGGATTGAGCGATAGGCCCACAAGTCCAAGGCCTCGCCTCATACATCACGTACAGCCTTTATCCACTCGTCCACTGAGCGGGTGGGTTGAAGTACCTCCAACGAAGGTCCCAACCGAAGGACCCCGCCTCAAGACCAGTGCGCGGGTGGACCCCTCGAGAAGTGGTCCTGGGTCGCCTAATGGCAAGCCCAAGAGGTCAAATGCCAGCTTGATATCTCCTCCGGCTGCAAAAGCAAGTCCTTATAACGTAAAATGCTGGACAGGATCGTTGCAGATTCTCAACCCTCTGACGGTCGCTGACCATGTTGTTGCAGAGGCTCTGTACCTTGCAATCCTTTTTAATGGTGCACCATTCGTAGTTTATTCGGGAGTAAATAACGCCCCGGGGATCACGGACGATAAGCAGCCTTCGCCAATTTGGTCTAGAAAACTACCATGTTGATGAACGGATAGTGCTTGCGAATGGCAACCATCGTCTCCGGATTCCAGCAGATCTCCTCGTTGTAGGTCTGACACATTTTCGCCTGGGCTCCGTAGAAGCGTCGAAAGACAGTCGCTTTCCCCAGAGGATCATTTGCCCAGACTTGTTGTAGTGGCAGTTGTACAGCGCTGGTAGTGCTGGTGGGCCAGGTTGTCCAGCAGGGTCAGGCTCCTGATCCCCAAATAACGCGCCTTGTGGGCCAGAACTGGGCGTCGTTAGTTAGTCATAAAAATAATGTTTTAATGTTGCGCCATCTATAGCAGGTTTGTTAAATAGCACCGTCTGCTAACACGCCATCTGCCCTGCCGCACAAAGATTTCAATTCGCCCCGCATTTCTACATGTGCCTAAGCTCGCCTCATTTCCAATTTACAAAAGTTTATGTGAGTAACAGGGCGCCACCTATCAGTTTAGAAAATATCAAAAAATACTTATTTTTCGACGTACCGCGACAGCCCTGGCCCAATTCCGAGGAGAATTTTAAAGGCGCGTTTCTGTGGATTTTAAAAGTGAAAGCAGAGTACAAGTATTACTAAATCTCCTTATAATGCGATAACCACCAAGGTATACAAAATTCGGTACCGCATTAGGATTTTAGTCAAAAGTTTGCATCGCAGTAAAGGAGTCTGTCCAAACTAGTCTGTCACTATTAAACCGACATAAAATGTTCTTAACAAGAAAGGAAGTTGTATATACCTGCAGTTATAAAAAAAATCAACTTTAGTAAATACTTTTTTCAAATTTTCCAACTAATTTCCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATGAAATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCAAAATTCAGCACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCAAGCAACAAGGTTATATGTCAAATAGCACCAAAACTATAATTTGTTATATATTATTTTCCCATCAATCCCGAAATTCAGAAATAATTATAAAATTGTATTTCCAAGCTTGTAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTCTTTCATATTATTTTACCAATAATTTTCCGATCGTTAATGGGGCTGCGTCCGATTTTGGTAAAATTTAATTTAAAATTCAGATCTAATTAAAAAATGTTATTTCCTAGCTTAGAAGGTAATATGTTTAAAAACACCGAAGACATAATATTTTTACAATTTGTTCGCCGATAGTTCCTAAGGGAGCTATAAGATATAATTGTCTGATCCGGCTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCATCTAGTGACGCTGATCAAGAACATATATGCTCTATGGGGTCGGAAACGTTTCCTTCACAGCGTTGCAATAAAAAGGTACTTCGTTTTCTGTTGCAGATCCCCGTGGACGTCAGGACCCGTAGTGACAAAGTAAACAAAGGAGACTTTTATAGATACACCAAGAAATACTTAAAACGAATAAAAAATGTGCCGATTCGTACTTAAAATTGTATATAAATCATTATAATTATAACTCTTTTTACTAAAAATTGAAATTTAATCAAATAAAGCGTGTTTTCTGGATGGTTACAAGGTACGTCTTTGGACTCAAGGATACATAAACA'..b'ATTTATGTTCACATACTCGTACACAGGAAATAAAATTGTAAAAGCTTCGATATTAACCGTTTTACGCTATAACGAGGAAAAACGCTACCGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACCCGCTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAATGGAAGCCGAGATATATATCGACCCGGCGAGTGGTCCTGATAACCTGTTCCATAACTTCCGACAAATCTAATATGCCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTGTAAAAGAGTTTAAGTTGGGTCCTAACCTCTTTAGAACGAGTATAAACGTCCGTCCGTATAAACGCTAAGACTCTCAAATCTATCAAATCTAGAATGTTGAGATTATTATGCAAAATCATGAGAATTGTTTCAACAAAAGACGTTGAGCAGAAAAAAATGTAACAGCTGTTTCTTCGCGTCTTCGGTGTTATATTTACTTTGAAGTTGGTTAAGGGAGTAGCGGGCACATCAAATCAAGACATTCGACTGCGGAGTTCCTTCTAGCTTGTCTTTACTTTAGGGTCTTGGTCAAGACTTGCTTAAATTAATCGCGTTATGGTGTGACTACGAGGTACACATGTTCAGTTTCAATTCTAGCCCTCAAAACCTCATTTTGTTTTCTGTTAGACGTCCGATCTAATAAAACATTTTTTTCCGACTCAAAGTCGGAAACCTCGCAAGACTTTGTTTGATCACCTGTATTTACTTAAAATATACAAGCCGGAGGCGTATGCATACTGCATATCTGAGAACTCATGTCTATGTTTGTGGACTCGTACGCACAAGGTAATTGTACATCGATAAGTGATAAACACGAAACGGTGGGTTTCCATCTAATCACAAACAGCAAACAGCAAACAGCAAACACATGCACCTCCAGAAATGCAGTGGACTCAACTGTTTATGGTTGACCAGCTTCTCACATTTTCACCCGCTCCCTTTTAAATCATTTAACCATCTCTTCGGGGAGTGGTCGCAGCTCATCCCAATAAATTTCTTATGCCTGGCCCCGGCCTCACGCAGTTGTTCGTAAATGACTTGTATAATTCATCAATATTGAGTTACTGTTTGTCAAAGTTGTGAGTGCTTTTCAGTTAAGGAGTTACCAACCAAAACCTCGACTCATTAAGCAGATTCGTGTCTTTTGGAAAACTTCTTCTTATCGTCAGACGAAGGTACAATCAATATTATGATACTCGTCTTAATGCCTCCTAAACTTTTATTTTGTGCTTTACCTTACCGATTACCTGTTGAGTTTCATCCAGTTTGGCCTTTTCAAATACCTACAATGTCTGTCAATAAAAAGTCCTCTAGCCAGAACTCGCACCTCGAAGCACAACATTTTAAGTTGTGTCTAGAGGAGGCGTGGCACCCTGTTAAAATAAACAAGCAATATCCACGAATCCTTTGGGTTTGCAGTCTGATTCCCAATTTCCAGCCTAATAGTTTCTGAGATCTCAGCACTCACATGCCTACATATGTTGGCCAGCTATTAAAAGTAGAGCACAGCCTAAGCACAATCGTTGTAGCTCATTCCAATGTAACGAATAAATTTAAAAACTGAGATTGTGTCCTTGTTTTTCTAATTTGACTGAGTCTATATGAAACAAGAATAATTTGGTAGGTTTCAACTATAAAACTGTAAGGACCATCATATTCTGCGCAGATGTTGAGTCGATTCTCCCTGCCAGTTCAATTACTATAACCATTTTTGATCATTCTTGGTACAATAGGATGTGGAACTGGTCCGTGGTGGAACCTTCAACATCCGTCGGCAATAACACGAAAATAATGAAAGATGATTGCCCAAGCTGCACCCACACAAAACAAAGGTACGCACACAAACACCCTACACAGGCAGAGGAAGGGGACGGATGAGAGAGCATAAAGCACATTGGTACATTGTTTTATCACCTCCTCTTCCATCTCGCTCTTTCGTAATTACCACTCTGCGTGGCAATAATTACCCCATTACGGAAATCTCGCAGAGACTCTCGGTCTCTCTCGAATCTCGCTTATACGCATGACTCGATTTTCTTGGGGTTCGGTCCGACTCGGCTTTGCGAGAGCAAGAGAAAAGCAGAGCCCGAGAGCGCCGGAGAGCGAAGAGACAATGAGCAGAGCAGCAAGTAAACAACTAAGCCAGGCTCTTGGCTCAGTCGAAAAAAAACGTTGAATGAGTCAGATGCGGGTCGGATGGTGAGTTCTGAGTTCTGAGTCCTGAGTTCTCAGATGATGCCGTTTCGCTGTAGATCCGCACGACGACGTTTCCCGCTGGCGTAGCCGTGATTGTGACTGTGACTGCGACTGCGACTGTTCGCTGGTTTTTGTGACATAAGTAAAAGTGCAAGCAAAACACCAGGAGTGGAGCCCTCGTCCACGCCATCGAAAAGTGCTTCCGGATACACAGCCCCGCGTTACAGACTAACCAATCTGGCTCCCAAGGACGGTGGTATCTGCTTTCGTGTAGGTGCGCGCCGTTATCGCGCGTCTACCTGAGTTGCCCGCTCAGCACTCACACGCTCGATCGTGCTGTGCGCACAGTGTCGTTCAGTGCCCAGAAAAATTGAAAGGAATTAGGGACATGAATGGAACAGCGGACAATGACCGTTTCAGCCAGCCCCAATCCATCGCAGAGTGAGATCGCTGCGCGCCTGCCCACCTGCGCCCTCCGCAAAAGGATTTGTTTGTTTCTAACGACTGTCAACGGAGCGGACGTCCTCCACAAGTCCGCGGAGCACACTGCGCTGCGCCACTACCCGCGGCCTCATCTAACCGCCGCATTCTGCATAAGTGCATGCTAACGGAGCATGCTAACGGTGCATGCTAACGGTGCAGTCCTGGGCACAGAACAGTACTCTCGCCCTCACCCTTGCTGTGCCTGTGTGTGTGCTTGCGAGTTGTGTGCCTGGCCACAACAACACTGCACCCTTCGCCGCCAGAGCAGAGTTTCATTTCGATATTACTGAAAAGAGATGGCGAATCGCACCGTACTGGAAAAGGTCGGGGCGAGGAGCCCGGGGAATCGTCCGGGGAAAGTTTTTTACTTTTAATTGCATTATGGCCCAGCCGATCCAACCGAGCCGAGCCGAGGCGAGCCGAGCCGAGCCGTTCCGAGGGTGCGCGAACCGAGGGAGGGAGGTCGGGGGAAGGAGGGCAAGGCAGCTAGAAAGAGCGCGCGCAGGAAAGGGTGCTGGGCGGATACGGCTGTTGGATGTTCTCCATGAATCGCTTTCAACGATTTAATGAGCACGTGGTCCACGAGAGAAGTGTATGCAAAAATGAATGCCTCCTCTCTCCCAGGCTCAGGCTCTGTCTCTGTTCGGTTTCTGTTTCTGTTTCTGTGTCTGTCTCTCTCTGTCTCTGTCGCGCTGGCTCTCCCCTCTCTGCCAGGCCCATTAAAACGTGTGTGGGGGAGGGGTGGGCATGGAAAGTCGGAAGGAATGGGCTAAGTTTCCACTTGTGACTGTGTCTGTGCGTGTGTGGAAATGTGTGCATAAAAAAGAGACAACTGTCTCGCTTGCGCCATAAGCAGCCAACTAGGAGTAAAAGTGTTGATATTAAAAATGCAAAACGCAAAAAGTTGGCAAATTAAATCGCTGGGCGTAACGCGCGCGTATCTCGTATCACCCAACCACACACACCCTTACACTCACCCACACACATCATTTGGCTAACTCGTTCGTTTCGCTCTTCTCCACGAACACATACATATGCGTGCACACAACAGAGCACATAGTGTATATACATATGTGTATAGGAGTATAGGAGTATGTGCGAATACATGAGGAGTGGAAACTACACATTTTCGTCATACAGTCTGCCACTTTTTTGCACGAAATACGCAGCGTTGCTCAAAACGCAAGAAATGCACATACCTACGATCGAATCTGTGTGCAACAAACTTCAGTGTTAACTGGCAGCACTAGGTCGATCACCTTTCGCCTGTCACCTGCCACCTGACACTGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/47d/c8d/0a/scaffold_29-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCACGGCAATTACACCCACATACATGTGTGTACACATACAGACACTCGCACACCAGGGCCCTTAATTTTGGCTCCTTTCGATCCCTACCTTCGCCCGCGTCTTCTCCCTAACATCCGGCTTCTGTATCCTGCCAATGCCTATTTACCACATGTCCCTTGTTGATAATTTCACACAAATGCGGAACCAAACCCGAAAACCCTAGGGGAACGATGATGCTTAAAAGTGTGTTTGGATTTCCAGTTCCTAAAGTTGACTTGGGTAATTTGCATTCGAACGTCTTTACTGTCGTTTCTGGTACTCTCTTTTTGAAAACTCCTACTTAACTTAGTTTTTTCCATTATTGGCTTTTTTAATATAGGCTTCAAAACCCAGTAAGCAAATTAAATACACAAATTAGACGAATGTGATAATTAAACAAAAACGGATGGAAATGGATTTTGCTTTATTGGAATACGAAAGCAATCTTTTGACTGTCGAAACCTTGTGATCAATACATTTTACAAAATCAATTTTAGGTGCCGCAGGCCAACGAATTAACTCCCCCACGTCTAAAAGCGCTCGATTCGAAAGTTCCTATATATTTAAGCCTAAGGATAAAACATAACATAGTACAAAACTATCGCCGCTAACTTAAAGTAATTACCAACTGAACTAGAAAATAACACAACATACTCAAATTGAAACCGCAAAGAAATACATACGAGCAAGCAAAACAGCAGTAAACCGAAATCTACCGAATTCCAAATTCCTTCTTTGAGGGTCTAGCATTCCAGTCTGCTTATAATGGATTGAACGGCTGCTCAAGACCTCAGGTAAGTACATACAGACGATTGCATTTACTTAACAACGGTATTAAACGTTTTTTAAGTTTTCTTAGAAAACTTTTAACTTAAGCGTCTCTGTTTAATGGTGTGGGTCGCGTCAAAACAATTGTCTCGGCGCCATTTTCATTTGCATTTAAGGGTGAATGTCAGAAAAAGTGTATATAAAAAAATATGCCTCAAATGCATGTTTCTAAACCTTTCCAAAAAATCATAGGAAATATAAGCATAAATATAAATATATAAATATAATATATATATATATCCATGTCCGTCTTCATAGGAGTTATCGAAAATCTATCAGACAACAAATATATTCAGTGATTTACAATTTTCCAACTACAATATATATGGATTCTATAATTTCAATTTGATTTCCAAATTCTACAATATTAAATTCATGGTATGATTTTAGCAGCAAGAGCATATAAGCTGTGGCTCGCAGAGGGCAGCTTTTTTAATGGGTGGTATAGAACTCCATACACCAAGGCTCTTTAGACATTAACCGACTTTGTCTGGCATATGTATATATTTACATTGTCATAATAGTTGACGATTAAAATTAAGCATTTGTATAAAATACCAAAACTGGTTATCAATCGGATATTTCTGAATATCAATTTTTGTCCCTTATTTTGCCATATCGTATATTCGAACATGGCAAATTGATATTTTCGAAAATATAAGTATGGTATTGTTTATACCAGATTGAAATGCCAACATATCAAATTTGAAAGGAAATTATGGTAATTTTATTACCAGTATTTTTATACCCTTGCAAAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATATAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACTAGTCGTTCTAGCCATGTCCGTCTATCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACATTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGGAAAAATTGAAATTTCCTACGCTTGGAAATAATTTGTTTTAATTGGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTTCCATAGAAACGATCAGAAAATTAGTTGGAAAATATGAAAAAATTATATCTTGTCCTTTTTAACATATAACCTTCGAAGCTTGGGAATAACATTTTTTAAATTTTTAAGAATTTCGAATTCATTTTAATAAAAATCGGACTACTTAACATATAGATGTCAAGAAAATGTTCTAAAGAAAAGAAATAATTTATTTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATCTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTTTTATATCTGCAAGGGTGTACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTCTGTATCAAACTGATATGCTTTCATATTAAACTGATCATTTATATCAGATTCATATGTTTGTAACATCAATGTAATATCAATTTAAATTATTCAGTTTTTTTACTGTAAACAATAATTATGTATAACATCTTGCTTAAATTATTTGTTTTTGATATATTTCATCTCCGTTGCAAAACTCATTTTGCAGACTTATAAATGTATGTAAACTCATGCAGGTTTGCGTCAGTCCTTCTTAAGTTAGGCAATTATTACGTATATACAATCAAAAATGGGATAATAACCGTTTGCAAAATAAAAAAACAGTTCCAAATGTATCATTTTTACCGCGTGACCGCGGTAATTCAGTCAAAAAATGTGTCAAATACCATTAGTACACAAAAACTACGAAAGAACGGTAATACTTTTTTCAAACACTTTTCGATGCTACGGTTGAAAACATAACAAATTCATACGAGTTTAAAATAATATAATACGGATTCATATCAACATTTGTTATTGATATGATTTCGTATCATATTGATATGGATGCGTAACATTTTAATATAAAAAAAGTAATAAAAGTAGTTAATATATTTACCAGCCAATTGTACAATCAACGTTTTCCCAAGAAGGAATTAGATAAAAGAAGTGCAGGGAAAAGTATATTTCAAGGTTGCACACTTTATTTGCTTATCCCTTTTTAAAGAGTAGTCCTAACTAATTTCTTTCCACTTGTTACGTCGAATCTAGAATACCCTTTTACTCTACAAGAAAGTGATAATAAACGTTAACTGCGTCGCAATGCATTCTGGCTGAAACTATAATTAAGCAAAAACATTTCCTACACAGGGAAAATAAAATTCCAAAATGGTCATCAATCCGTTATTTTTGCATATCAATTTTGATCATATTTTCGAACATACAAATTGATATTCGAACATATCAACATGGTATTTTCATGCGCATACATCAAGTATTTTTAACACCAGTATGGTACTTTTCAATATACAATATTTCACAGAAAAGTGTCGAAGTATTAAATAAATAAGTAAGAATCAAATAAAATCAACAAAATACAATTGAATATGAGATACTTACCATTTGGAAAACATAATAAACAACACAAATGTCTAAATTTTTTATAAAAACTTTTCGTCTAATGTTAGAGTGACCGCGTCAATTCAATCAAAAAATATATTTAATACTAACTTAATATCATAAATATACAAAAACGACAAGGGCACGGTAACACTTTTTTTCGAAAACGATGTAACGTTTGATATGAAAAACACATTAAATTGATACGGGTTCATAACAATATAATACGGTTTCATATCAACACTTTTAATTTATATGAATTCGTATAATAATGATTTGTTTTCGTAACATTTTAATATGAAAAAAAGTGATATGGGAAAATTGAGGAGACAATATCAATCGGGTATTGTTCCGTTTTTTCCTCTGTGTAGGAAGGTAAAAATCTAGTGACGATCGCACCTACAGCAAACAAAAGTTCTGGTATCAGGGCTCAAGGCCTATGCTGCTTAAAATTTAATGGGAAAACGTTGGAGCAGTTTTCAGAAAAATCAAAAAAAAGTTTTGACCATATTTTTAAACTGGGGTATTTATTCAAATCATGTTAGGAAGGCCTACAAAGTATTTGGCAATACCTTTCACCGGTTACAAGTTTACAAGTTGCGGTTGAACAAA'..b'ACGAGCATTTGCAATGCAATTTAAGGCATTTAAAACCAGCCGATAAGAAAGGCAATTGCTGCAGAGTGCCACCAACACTCGAGCAGCTTAAGGGCGAGGGTGGCTCGTCCCAAAAGGAGAAACGAGTCTCAAATGAGAAAGGTGCGGAAACAAATAAAATGAAAAATATCCCCGAGCCCGAAATGTGTATAAAGAAAAACCGCTAGAGGAGCGAGTGGGACGGACTGAGAGAGAGCAGACGAAAAGAACAACAAGGCTCCTTAGAATACCAAGCTCGCGTAATTGTGTTCCTTAGCTCCCATCTCCTTCTCGCACCCCTCGCCCCAAGCCCCGAGTCCGTCCCAGGCGCTCCGGACCGGACCATAACCATGACCGCACTCGAACCCACACCCACTTCGAGGCTTTGCCTTGCTGCGTTGCCATGGGAGCTGACGACGACCTCAGTTAGAGAGGGCTGAAGTATGCAAAAAAGAGACACCATCCTCTGCTGGGCAGACGGGACTCCGGGAAACTGGCAGTGGAAAGCCAGCGCAGGCAGCGCAAGCAGCGCATTATGTATAAATTATTTATTTACATTTACATTATATTGGTACTCGCGCAATGCCTGTTGGCGGCGGAGGGGCGGTTGTGGGCGGTTGTGGGCGTACCGACGCTTCCCCTGGGACGGAGACGAACGACGGTCGCCACGGTGTCTCTGTCTCCTCAGGAAGGCCTCTGCCCCAGCGGGGGCGAGGACTGCCGCAAAGCTGGCTGCGTGAGCGCGCATACAATTACAACTAGCGAAGGAAAAGGGGTACGCGACAGAAACTCAGGCAACAGCAGGATGGAATGGAAATTATCACGGTGCCGAAAAGGAGCCCGAGCACAAAGCCGAGACCGAGCATTGTCCTCGGGAACCTGTTTTAAGTTTGCTGCTCTGATGCTCTGCTGCTCTGCCGCTCTTCTGCTCTGCTGTGCTGTTGTTGCGGTGGCGCAAGTTTCTCAAATGGCAAAACTGATTTTCTGCCAGACGGGCGACTAGTAGGGGGTGTTCGCAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGCGGGTGAGAGAGAGAGGGGGAGACGCCTTGGTAATAATAAAGTTCGGCTCTCTCCATCTCCCGCTCTTCGATGTGCTCGTCAGAATTAATTAAATTAAGAGTTTCTCTCTCGCGATTTCTCTCCCGCACTGCCGACCCTCCCATTGCTCCAGCGCCTTGTGTCGCATCTCTTTCTATCTCTCGAACGCTTACACTCACCTATGTGCATATAAATATGCGGGCGAAACCCATCTGCACGAGCAAGAGCGGGACGGTGTACGTTGGCAATGATTTAGTCGTTCTCATTGTTTTTTGCTTGTTTGGATAAATGAGATGGGATTGGTAGGGGTGGAGAGCTGATGCTGCTTTACTGCCTGATTTTTCCTTTCTCTCGCGCTTTTAAGCTCAGCTCCGCTCTCAATTATTTCAGCTCGGTTGTAGGTAACCCCAAACTAATCCCGAGCACAGTGCGCGTCAATGAATGTGGATGTGGATGTGGATGGGAGTGTGAACGCTCGGTAAAAAACAAACAAGCGTACCGAATAGGCGTGGCGTAAAAAATGGACCGATGCAGACTCTGACTTTGATTGCGACTCAGAAGAGCGCCGAGGACCTTGCGATACAAATCTGCATATCATATGTAATTGCCAGCCATTAAATGCGCTCCCAGCGCATGTGTACAAACACGTTCATAACTGTGCATGTATACACAGATGTGAGCCTGTTGGCTAAATCTTTGTGTTCGGGTCTTCGTATGCAAACATTATGCATGCAGCCCACAAACGCACATATCATCTTGCGTATGTGTGGGTATCCTCCCGCTCCCCTCACCGTTGGAAAACTTTTGGCTCACACAGAAAGTGGCATATAAATCGCACTCGTCCAAAGGCAGAGAGCATGTATGTGTGCGGCGTGTGAGCTGAACATTTCGCACACCACTGTGGTCTGCGACTGCCGCATAGCATCTTCTGATTGGTCGTTTAAATGTGCGCTGAGTGCTCCCGCAACCCCACCCCTGCCTTCCCCGCAGCTCCACCCCCGCGCCACATCTCGCCTGGTTGCTCTCCCCTCGGCGACTGCATTAATTACGATTGCCACATAAATACATACAGCAGCAGCGCTCCGAGTATTTTAATTGGTCGACCAGTTTTCGGAGTGGGGCTAGGTTGAAATAAGAGATTAAAAGACAGAATACTCGAGCTTGTCCTCCTTCTGAGACGTTACTCATGTACATATATCAATACGCGAGATGAAACTATAATATTTATATTACTTACTTATCTGTATTAATGGGAAACAGCGATAAGGCATAACAAACAATTACTTTATATATATAAATATTATAATTAAATTCTTATAAAATGGCTCCTTTTTGCAGAGTGGCTTTACTGTTTTCTGGGCATAAGGTTATTTGGATCTGGATCTTTTCTCAAGATCTATCCTAAAACCCATTAACGCACACAGAAACCTATATGTATAGTAAATTAACTATACTGGAAAATTGTAATTCTACTATAAACAAAAACGAAAGCTTTCTTTTGCAAGACGGAGGTTCTACACTTTTTTGGATAAGCCCATGTAAAGTCCATTAAAGTGATATTACAGAATCCGTATATGCATATACATGCACAGATTTCGATATAAACATGCATTTGTATGTATATAAAAAAAAGCAATTACAATGGGCATTTATATAAAAGACATATTAGTATTTGTTGCTGTAAAATATTTTGAAAATTGGGATTTGGCAGAGTAAGTTTATCACTTTAACGTCCACCCTAACCACTTTGCTGGCAAGTGAACAATTTCATTGATATCCCAAAACCGTGCTTGCATTATTTACATTTGAAAAAAACCTGTCTTAACGAGGTAAGGGGTCGTGGCGATCACGCACTGTCAACATACAAAACTACTGATATTGACTTTTGAGACGGATAATTATTCGAAATATAATTAAATGTTTCAGCTTCTTACATCAAAGGTATATTTTATTGAAGCGTGTCGAATGGTAATATTTTAGTATATAATTATAATATTTTATTACAGTATTTAACAAGTTAAAATATCTTTTCAGATACATAAAGCACGACTCCATAGCATTATTTGTTAGTTTCTAAACAAACAGCCTTTTAAAACCGTTTTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTTCCGTTAAATTAGCTCTTTTTTTGCAAAAGTCGTAGAACAAAAGTTTCATAATATTTTCCCACCAATTTTTCGATTGTTCGAGTCACAGCTGTTTGATACAGTCTTCCGATTTTTATAAAATTTAATTCAAAATTCAGAAGTACAAAAAGTGTTATTTTCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAACATAGAAGAGCGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTTTTAGATACCCGTTACTCAGTTTATAGGAGCAAAAGAATAATGAAGATATATAAGCAGCAAAGCGATATTTCTCCTTCACCGCGCTGCAAACTTCTGACTGAAATCATAATAACTTCTGCAAGGGTGAACAAAAGGATTCATACAAGCCCACAAACAAACGTTTTCATTTTAAGAAGAAGAAAATCTTGGAATTACTTTTGAAAGGAACATTGGATTGAGGTGCCATTCGAAGCGTATTCTCGGTAAGAAGAAAACTACTTTAAAGCCGTGGGCGTTTAAGTTTTCACTTTTACGCTTTATCTCCCAAACAAATTGAAAATTTCTAAAGTGTTGATAAGCAATCCTGTTAGTATTTGCGATTCATTTCAATTAGTGTATCCCTCGATCATCATAGCAGATTTTGAATTCTGCGGGCTTATATCTTTGCAAACTCTCTGGTGCCCTTCGCCCTTACGTGTACTGCCGTCCACAATGATAAAACTTGAAGCTCTCTTACGTATATAAGAACGAGTCGAAATTTCTTTAAAGCCAGACAAGTTCATTAAGTTTAATAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACATTTTGAAATAGGCCTAGTAATTTTAGCAAAGTTTAGAATGAACTTTCTATAAAAACCACATAAACCGAGAAAGGATTTTATTTGTTTATCTGTTTTCGCGATGGGAAAATCTAATATGTCTTTTATTTTGCTTGGGTTCGGCCTAATACCATTAGATGTTATCATATGATCAAGAAAGTTTGTTTCGCGTGTTAGAAATTCGCACTTTTCCAATTGTAATTTTAAATTAGCTTCTTTTAATTTATAGAAAACTTTAATAATTGAAAGGATATGTTCCTGCACTGACGTAGAAAAAATAACGATATCGTCAAGAACTAAATTTTTAAGAATCTCGTTCATACACCTTTGAAATGTAGCCGGTGCGTTTTTTAACCCAAAAGGCTTTCGAGTGTACTCATAGTGACCGTTTTGTGTTGAAAATGCGGTTTTTTCTATGGACTCCGGGTTCATTTCGATCTACTGACATTTTCCAAGTTTGTCTAATATTTCATCAATATTAGGAATTGGGAATTCGTCGCTAATAGTAATATTATTTAAGTGTCTATAATCGATCACGAAGTGAAATTTCTTTGTCCCCGAGGCATCATATTTCTTTGGGACTATCCATATTGGACTACAATACGGAGAAGAATTTTCGAATTATACCCTGACTTTTTAATTCTTTTATTTGCTTCTCGACCTCATCTCTATAAATGTATGGGTATCTGTATGGTTTTACATAGACAGGATGTTTAGTTTTTCTTATGTGTTTAATGGTATGTGTAAAGCTCAAATTTTCACCTTCAACAAATTGTATATCTCTATAAGTTTTTATTAAATGCATTATTGATTTACTTTCTTCACTATTTAGGTGACTAATTCGAATTTTATTGGAATAATTAATTTCTTCGCTAAGCGCATAGTTAAAGACATTATCCTCCAATTTCTCGTTCGAATTGTCGACTTTTTTAATTGGGATGTAATTATGTTTAATTTCTTCTTTCAGACAGTTTGGTAAATTAATATTGTAACTAGGTTTTTTAGAGGTGAAATTAAAAGTAATGTTATTTAACTTTACATATTCCTCTTCGAAGTTTATATGAGCATTAGTAAATTCAAGTATATCTCTTCCAATAAAAATATCACATCTTGTCGAAAATCATGGATAAAAAAATTTAATTTTCCAGGTTTCCCAGTTAAAGCTTTGGCGATTATTTCTCGTACGGTACCCAAAATGACTTTTCCTATCATTGTATATATTACTTTCGGGTTTGTTTTATGCATAAAAGGAGTATTTAATATATGTGGCCTAATAAGACTAATACTAAATAGACATAAATATTTTTGTTCATTTATTTGTACTCAAATTGTGGAATTCTTTGATCGACCGAGGCTTCTACTAGAAAATTTTCGTCAGTGTCCATCGCTTCGACTCGCTTATATCGACCGGAATCTGACATACGTTTTCTTATCCGTTGTCGATATACTCAAAATTAGGAAGCATTTGAGGGTTGTTTAAATATTTCTTATTTGAATAATTTTTATGTTGCTGCATATTGTTATTATAATTTTCATAAATTCCAATTTCTTGAGCAACACGTCTTAATTTACTTGGGGTGCTAACATCAAATCTACACACTGACATATGTATTCGGTCTGGTAATTGTTTTCGAATAATTTCACAAATAGCTGAGTTCATTGCTTCTGTGAAAATGTATTTATTATTTATACTGCCATCTAAATGTAACTTATTACAAAAATGGATGATTTAGGTCTAGTTCATCGACAAATTTTCTAAAATTTCCAGAATACTTAATTTCGTAAATATCGAAAAGTAATTGAGGGATTGGTGTTTGGGTGTTATACTCCTCGATTAGTAGATCTTCAGATCCGTTCAGCCGCGTGGTGTTGATCGCATGAGCAAGTGTTGAGCGTTTCCAAGGATGAGGTTCTCGAGGGTTCCATAAATACTGCTGGACTGGACTGGGTTATTGGTGGGGTACAGGTCAATTTGGTGTTCGACTCTTTTGATGAAAAGGGCCAGGTAGAGGATGTCGCCATCAAACGGACTTGTCGGATTGTCGAATTTGTGTTAAGCATTGGGATAACGCTTGATCCGAAAGGACATGTTTTCCTGCCATCCTGTGCTGTTCTTATTCGCAATTTAAACTTTTACTCAGCTGGCCGATTTTTGTTTAAATTTCTTTTGCGAATATTCGTTCGTTGTGCGTTGTAAATGCACGTTTTCGGGATCTGTTCACGAGGTTCTTTTCCGGGTCTGGTTTTTTTTCAGATCCTACCGACTGCGCCAATTATGTGTAATTAATTTAAGTAATTATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTAATTGATGTTTTCTTTTTATGTAATTGTTGGACAGAGTTTTATTACACGTTTTATTCTCGTTGACATTGACTTCGGAACTACGCTTAAAGTTAAAGCTTATAAAGAAGTACAGCATAATTGACTGGCGCCTCGTGTAAACATAATCGTTCATTCGATGGCTTATTTTGAGCTTGAGCATATAGAAAATAACTTTAATACTAATTAATTTTTTATATATATATATTTAATTGCATACTTTTAGGATAAGGAAATCTTACAATATATTTTATTTAACAAATCAATTCAAAAATTTACAATTAAGCTATATATGTTTTTCAATTTTACATCGATGTTTGCCTGTCAAAACATCCAAAAATCGATGTTTTCTGCACCATTATTGACCAATTGGCTTTCAAATTACTATTATGAATATGACGAAAACACGAAACGCAAAATATGCAAGAACATAAAAGAGCATGTAAGCCAGAAAGTTGCAAAAAGTTTAAGCTTAAATTTAAAACATAGAAAAAACATTCACTGGTATTAATAAATTAGTTTCATCAAAGGGTAAGACGGCAATCACAACATTTTCTTTATCTGAAATCTCAGTCTACACCAAAATACACCACTCGAAAAATCGTTAATTTTAAAATGATAACACAACACATAATGACATAAAATGTACTCAGTTTTATAGTAAATACCATTATTTTCAATACTCATTTTATTTGACGTCGATTGGTCGATTTTATAGTAGAAATTATTATTTTTGTGAAAGTTTTTTTTTTAATTGAAATATTAAGCAAGCGCAGAGTAAAAACAAGCGCCGGAAAATTTTGACGTGCAATTTCTCGGTTTTTTATTTTTTTACGATTTTACCAAATTGGTAGGTAAGATAGGAAACTATTGTATTCCTTATAAAAAACACTTCTTGTTGAACCTAAGAAAAATTTAGAAAGTTATGATACCCCCACTTTTTAAACAATCTAAAGTAAACTTTTTGAATAAAATTAAAACTTTTTTGATTTGCCAAAAAAAATTAATTTCTCATTTTTTAATAATATTTAATTGAACAAATTTAAGAAGACTGTTAAAAGTCGCTAAAGATCGCTTCAGGCAATGTGACCACGCACTCAAATCAAGTCAGAATATCAGCGTTTTTATTAAGTATTTTTTACGGGCTTTTGTATGTCGTTTTTATTATTATTCATTATTTTAGAAATTGTTCATTATTAATCTATAGAAAAAAACAAACTGCTTTTTACCGCGGCGCAAAAAATAAGCAATTTAAACTTTTGGTGTGAACGTGCAGAAGCGGTGGAAACATAAAAAAACGTCAAAAAAGGTCGTCTCATCGAAGAGGTTCCCCATCATTGTGGGACTAGATCCCAAAGACTAAATAACGCAGCAGAGCCAATGCGCAGAAGAATGGAAATGGCAAAGCATCGGCGTCACAAAAAAGAAACCTTAAGCTACCAATTAACAGAAATAAAAACATTTTTTGAATATTGATTTTGTTTTTATTTCTTGTGCACGGAATTTAAAATTGCTCAAATTTTTGTTTGTCAAAAAATTAAGCAATAAGAGCATGCTACTTTAATAACTTCGGTGACACTAATGAATACGATTTTTCGACTAGTGAAACTCAACCGATCTGA'..b'ATATACGAAAGGATGTATCCGCCATAATTATACATGTATCGGTTAATGTAAAATGTTAAAGATATAAGCATAAGTATTTAATTATGAAAGATAAGGATGTGTTAACTCTAAGATATGCAGTAAGTAATAATTCTGGAAAGGACGCAACAGGAATTTTTTAAAACAATGAGCAGGGAAACGGTATCTGAAAGTGTTACAAAATGTATTGTTAGCCCAGCTTTAATATAAGTATATGAACGCACATATACGTACGTATTTAACCAGAGTTTTAAGACAAAATATCAATACAGATGCCTTAATCTTTAGACATTTTTAATTGCAGCATTTTATTTTATTGAATTTACCAAATGATGACTAAGTACACCCTTTTCTAAAACGTGTTTCCATATATTATCAAGCGCCTTTAAATGAATCTTTGTTATAACTGCCTAAATATTTTTACACTTTCTATCCCAAATTTTTTTTTTACTATATTTTACTGATACCACCGTGCTTATATTTTTAAATATAAATGTCTTTGCATTTGCGATTTATGGTTCATTACTCATCCTCATACTCATTAGTTATAGTCCGTTTTTTAAAAATGTACAATTCCACAATACATTTTTATTGGGAGTAACCAATTTTCAAGTTTCCAAGGTATAATACCTGGAGCAGAACAAAAAATACTGATATGCTCAGAAAATATGAAACTCTGCGTACAAACGTTCCACGCAGAAAGAAAATACGTAAAATTTGATTTTTCGTTAGTAATAAAATACTACAATAATACAATTTTTGGGAAAATACGAAGTTATTATATAAAAATCATGCTTCCATTTTCTAAATAGTAAAGATAAATATTATGGTTACAGAACATAATTTTCGGGATTCAGGATAGCAAGCTATTTAATATATGACAATAAATGTTACATCTGCGGGATTATACAATAAACATGCACTTTTGTAAAAATACGCTAAATAAATTCACTTTTTTCTAATTGCGGTTCCTAAAAGACTTAACATTTTAATCAAGCAATGACCCATGTGTTTTCCTTAAAAAACTTCATACTGAAATAAACATTTGAGTTTCCTCTTTATATTGGGCTAGGGCTCACATCTGGGATTATGTTTAGAAAATAATGGCTAGTGGGATTTAAAAGTTGAATTTCTGATGGACCTCACTACGATATTATACACACTATCTCAAAGTAAATACAACACCAAATTTAATGGAACGCTTATTTTGATTAAAGACAACAACGAAAACTAAACTATTTAAATTCGAGTTTCATTCTGTCCATTGGAATGTTTTGCTTCGGTGTTATTACAACGGATTTGTTGTTGCATAGTGTGTGCAATTTCTAAAAAGCTTTGGCTTGAGGCATTGGCGGGTATGTTTGTGGATATTGATGGGTGTTGGGAATTTAGTCCGTTGTGCAAAGTACGCTGATGCTGTTGCGGGTCTTCGTCAATATAAGATATATCCGACAGTAGCATGGCGCTTGACACGTTCTGTTGAGGCTGCGTTGGTTGTTTTGGTTGCTGTTGCTGATGGTGCTTGATGTAATTGGGGCTCAGCAGATTTAAATTGTACAAGGGGTGGCCCACTGGAACCGGCATTCCCGTCCGAGGGCTGCGTAAACTATGCAAGCTATGCATCGATCGGCGCTCATTTAGGTCTTCCAATGTCGAGCGAAAAGCACGAATCACACGCAACTGAAACAAATAAAATTAGACAAAAAACGAACAGAAACAGGAACGTAAACAAAGAAAACAAATAACGAAATAGCATTACAAACATGGGTATATACGCATTGACTTTTAGTTTTGTAAATTCATATTTAAACCATTACTCGCAGGTTTAATTTTTAAATAACTAAATTAAGCGGGAACCAAATTGTAATATTTCGGTGTCAAACAAGCATTTAAAAAAAATATTTAAAACATTTCAGATCTGTAATATAAGCTCTATTGCGATGCCCGTTAGGAATGTGTAGTCATACTTAGGTGTATTTAGTTGTTCATCATGCGTGCGAAGGATTTTATGTTTACATAAGCGGATTCGAATTAGGAAAGTTAGACGCTAATGTGGACGAATATAAATCCTTATAAATCTTGTTGCTTTCTCCTTTTTAATATATAAAGAAAAAACAAGTAATCTAACCAAAGAGTTAATATAACCAAAATGCACTTAGACAACTATTATCAACAAGTGAAAATCAATTATAGGTTTAATATAAAAGGGGCATGCTTTTGTAATCAACATTTTTAAACATTATTTTTATTCATTTTAGTAATCTGTTAAAGGCAACATTAAACGAAATTAAAAATGTATAAGATTTATACAAACGTAAGGACACAAAAATACTATGTTTTGACATACGACATTATATTATCGCCCACACGTGTTCAAAAAAAACCAATAAGTGGCAAACTGTCGTTTTGACTCAAAGAATTTAACTTTGAACAAACGTCAAAAAAAAAGACAAAGACTAATCACCACAAAATCCCTATTGATCCCAAAATGTAACCCGGAACCGGAGTATAGATGGAATGGTAGTTTTAACTTAACTTGAACAATAATACTGTCTAAAGTAAGGACATATTACTGTTATTTTTGTCTTTTTTTTATCTGAGTATCCGGTCTTTTTCATTTGTTGTGTGCGTGACAAGAAACAACCACAGGGATAGGAAAGCTTTCAGATTTGTTTTAGCTTTTATGAAGAGATTATTGGACTACGAGTTTCTTAAAATTGTGTCGCAATGAAAACTTTCACGTTTGGGGGCGTTGTCTTGAGGTAAAATCCATTTAGATTTTGTAGCGTTTCGTCTTCATCCAAAAATAGTCCGGATAATGTCAACATGAGTAATTAGTGTACCTTTATAAAAAAATGTATCTTTTAAAAATATTTACTCTGTTTTTAAACCTAACAGATTTTGCCTAAAAAAAATAAATATAAATTTAATTTACAATTCTTATACCTTCATTAAGATATTTGTTATATTTTTGTAAGTTTTGAGTACATTTACGAGTAAATATATAGTTTTGATGCACAGGCATCACATTTTTCCCTACTTTTGATGGCAACCTCTGCTAATATTACCACTGTTGTAGTTCATTAAGAAATTTTAAATTTGGTGAAATACCTAATTCTTACCCTTATCCAGGTTGGCATACAAAATTCGATTTGAAGGGCAATCATAATTCAGTAAAAATATATTAGATATTAAAACGAACAAAAAACAAGTTAAAACTTACTTATAAATAAATAGTTCTTAAAAGTTTAGAGTACTTCTGGGTTTTTTTTTCAATAATTTTTTTTATAATTGATGTCTATGAAACGAGTTTTCCTATGCCACCTATTACGTTAAATGATTACGCGAATGAACAATTGACAGGCAAAAAGGAAGTCTCCGAACCTACAAACCTCATAGGGAAATGTTCAAAGATGTCTCAGTTTGAGAGAGAAACGCCATATGTCTTTCAGCAAAGCAATAAAAGCATGAAAAGTAGGATGATGCCCTTTGTTTATAAAAAATATAAACTATTGTCAAGATGGTCAAATTAAAATTCATGGGTGCAAAAGAAATCAGTTTAGCAAAAAGTCGACTAAAATGTATATTTATTCACATAAAATAGAAAAATCTTATGATAACATTATGTGAGACCCTCATAATTTATGGCATTCAAAAAATTTCAAAAACTTATATTTGCTTAGCACTATTTCCTACCCTAATGTAAAAGTATTAAATCGCCTTCAAAACCACGCTCGCTAAACAAACGAACGTGAGGGGAGAGTATGACAGAGGCTTACAATATTTAATTTTTGTTTTGCATACCCAAACTATTTAATAATGTGACCCTGAAACTTCAGAAGCAAATTCAAAATATTTTCAAAGTTACAAAAGAAATAGTAAATTTTTATATAATTTTTAAGATTTTACCTAATTGGCGAGAAAGATTGTGAAACAAATAAACGTCCTGTAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAACGAGACAAAATTTATTGTATTCGGGATAAAAGTATCTTCTAGTTGAAACCAAAAAAGCTTTAGAATGTTATATAACCCCACTTTTTAAACAATCTTAGGTAAATTTTTTGAAAAAAAGTAATTTTTTTAATGTTGAATTGTATTACTTCAATTTTTATTGTTTAATTAGGAGCTTTTTAAAAGTATAAAAATATACAAATATTTTTTTTCTTTATTGCACACACATGCACAGTCGAGGTGTCTCGGCAAAATACTTGTACCAGAAATATATTTAACTTACAAGTTTTGAGAAGACTGTTAAAATAAATAACAATAAAACCTGAATGTTTCGTTTCAATTATATATTTCTTTCCTTCCCAATCAAAAACTCGGAAAATATATATTTCTTAAGATTCTAAATTAAGCTTCTATTTTTAACAATATAACTAGTCAATCAATCAATCAAAAAATATGAAAGATGCATTAGGTGAGTCGCACACGTATTGAAAAACAACATTAAATAACCAAAGATTTATTAGTGTTGCCAAACGAAATTGCCCACTGACACCATAAATCAGACATAGAAAACCTAACCTTCAGGCTAAAATGCTACTTTGGTACTGAAATGTGTGCTTGCATAATTGCGTGTGGAAGTGCCGCATAGAGGTAAGGAAAATTTAGGAATATGCGGGGAGGACTTTACACTTAGCCGCAAATGTACTAATTGTATATATGACTTGATTCATACTGCTACAGTTTTTACTTTAATCGACGTGCATGGTGGTTCGTTAATAATGTTTTAAGGTAGAGAAACAATAATATTTTAATTACGTACGTTTGAATGCCCTTTAGAAGTGTAGAGTTGGATTATCGTTTGTATTGAAGGTGGTTGTAGAAGATAGCTCAGTAGGTATCAGAGAAAATTACTAAACATACAGAATTTGAAGCGGAGCAGAAGACCCTTTTAAGACGCTGTTGCTGTTGTTGTTGTATATTGCAGTTTAAAGTAGTAATAGCTAATCTTGTTTGACGAACAAAATGGTTGTTTTCATGTATTTATAGTTGTTTTAGCAAAATAGTAATTATTCAAATCCATTCAATTGGTTTAAGCATTACTTAAAATTAGCTCAATTTGTAAGGTTGATTTAACAACATATCCTAACCGGGAAATATTTGAATTTATTTATTTTAATATATTGTATACATTCGGTAGTCCCATTTAAAATGTTGATACTTACATACGTCCCCTGATAACCAATATTCAAAAGAGGTATCTCTTACTGTATAGACAAATACCATAAGTGCATATGAACGAAGTCAATTTTCGGCTCAGGCTGAGGTTCACATAACGTTACTAATGCTCTATGGTCTACTATGTATTGCTGCATTATTATTTTAATTTACAATGTACATTTAAGAAAGTTTGATCAATATGGGCTTTATAAAATGTAATGACATACACATACTTTTTTATATCACTTAGATTAGTTTTCGAATTTGCGAGGATAACTGCAGGTTAGTTTCAATATTACATGTATGTAGAGCTTGATGATCATTTTTATTGCAATTGTCAATTACACCTCAGTCTCTCGTATTGGTTCCGCCGGCTTTAAAATTGCAAAAATTAATAACAAATATCTGATAATTACATTTGAAACAAATAATCGAAATTGAAAGCGGATCAATCAATAATTGTAACGTGTTTAAAAAAGGAGAATCAAATTAAAATTGTACTTTACTTATATGTGTACATGTAAATGAATGTATGCATGCACGGCTTTGTCATGACAAAAAAAAAAACAAAATTAAATGTCGGTTCCTGTTGAAATTTTAGCCTGCCAAATATGTTTGAAGTAGTATAATAAACAGGTATAGTCTCAATTCTGTTCTGTTTTATTTTATTTAAGGCAACGGTGAACAAAAAAACAATTATGTACGTATAAGCCGCACCGGTCGCACATAGAAATGTATTCGTGAAAGTAACCTTTGGAACCGTTTTCTTAGCTTAGAAAATTCAAATAATGTGAAAGTTGGAAAATAAATGTTCTTTCGCAATTTGAACCATAGAGAAAATTTTGGAATGTCGTGTTAAGGTTATAGTTTGTTATTTGTACCGTAAGCTAATACAGTAAAACCGCTCAGGATGTCGAAATCGTTTTATTTAGTTTAATTGGTGGAAAAGTCCGAAACTGATAAAGGGAGTAAAAATTGAATATTAATTTACTACGATACTTTCGTTAGGTGGCCAACAATAGTTGATCAGTGATACCATGGTATTTGACATTGGTCCTTAAGGGGTTAACCCATTACACGCTTTCGAAAAATCGAACGTTTTTGTAAGCTACAAATATTTTTTTGTATTGTTGTTATTCCAAACATACAGCGCTTAGAAGGAATGCCCGGTAGAGCGCTCAAGGGAGAACTTGAAATATTAAACGCGTTTTTCTCAAAACCACCCTTTTTCACCCGCCATATGTTATTATCGTGTAAACTTAAGAATAGGAAAAGGCCACTGCGATTAAGACAACTCCAAAACATCGTTGACTACGCATTTTTCTCTTGATGTGCGGGAACAAAAAGAAGTCATTAGGGGCCGTCTTCTCTTGCTCGTTTTTCAAATTTCTAGAAAGACTTTAGGCAAAGAAATTATGGTGTACCACTCAGAATTGACCGTCCTACGTTGCTCAAATGGAACAGTCTCTACATAAACAAGGTAAGCCACATGACGATATTGCTATAACAGTTCGCGGACGGCAGTAATGTTCTCTGGCCCAAAGAATGTTTTTGGACGACCTTCGTCTTCGAGAAAGCGTCGGACACGAGTGAATACATTAAATCTGTTTTTCACGGTGCTATTCGATCGATTCACTCTGCCAAGGCAACTTTTTGATTGTTCGATATTCGATATCAAAAGTATTCACACATGAAAAAGTTGTTTGAGCCCTTATCAATAAAAGTCCAAATTTTTTTTTGACAAAAGTCCAAACTGTTTTAATGCGGCTTGAATTGATCTATGCCAGAGAACTAAATAGCAACTTAATTATACGATTTCCCTCTATGAGTTATGGGTATAAATTTGCATACTAATGGAGCTTATATAAAAACTAAATCTTGTTTCTCTACTCATAGGTCTCGCAAAAATAACAATATTCTGCATAATAAACATAGCCCATGGCTAAAATGAAATTAAACACTTTAAGTTAAACATACGCTTTTATACTTCAATTAGATGGAACCCTTTAATTTAAATATACTTGTTTAGTTAAATCCTGTCGCACTATAAAATATTACACAACCATAAATTTGTAACAAACTCTTTACCAGTTCCGACAGTGTCGCATTTGGGAATCAGTTTCCAGATTAATAATCAACACTTGATTTACATTTCGCAGTTTACGAATTAAGGATGAAACCGTACTGACAGCGAATGAATGCCTGGCAAGGCTTGTAAAATGTCTTCACCCGCACGTGTTTTAACAAAGGTATAAGTACATAACAAAACTTGTAGATTTTTGTGTGAAACTTGGTATACAATTTCTCAATTAAAGCAAACGAGAACGCTATAGTTTGCTAACCAGTCCAAAGAAACTGAAACGTCGTTTTGGTGCGCACACTTTTTAAGCTAACATCAAGACAGATGGTGCCCACATTTGATACAGTCAAATCAAAAAGTTTATTGCATCCAAATGTATTATGATTTCAGTTAGAAGTTTGCAACGGAGACGTTTCCGATCAGCATCACTAGACGAGGAAATCTAGCCATGTCCGGAAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAACAAAAAACTATTACTCTTATGTACCCTTATGAATTTAAAAATAAATTTAATAAAAATCAGACGACTCTTGCATCTTACTGTCAAATAAACGATCAGGTAAATAATAAAATAATTACTTACAAAAAATTTTACTTTGTTGCTTGTATTTTCTTTTACTTAGGATAAAGAATATTTTAACCTTTTCATAACTTGGCGGTCAGCCATG'..b'CCCTTTAGCATTTGCACTGTTTTTTATATTTAACTAAAAATAGAAAATGAAAAAAAACGGAGGATTCCATATTTTTTTTTTTAAATGCTAAACTTACGAGACTTACTTCCAAGTTTCCTAACACTTTATGAATTAGTAGACTGTAACTAAGTTCTATCAAATGTCGGAATTCAACATTCATTGACTGTTTTTAAACCAACTTTAACCAACAAACACGTTTGGTTTAGTGCCTTAATGTACGTAAGAAACAACGGAATTTGGTCGAAAAAGATTTCTGTGACACCCCCGATAGGAATTTTTTATAATTTAAAGAAAACCAACCTTTTATGTATAAGGTTATATAACAGTAAAGAAAACTTTTCCAAACATAATAGCGGCAGTAGATGCAACGAATGGGTACACCTAATGCTTAAGAAATACGAAATGGGGTAAACACCTTTTGTTCAAATTTCACAGATCGACAAATCCAAAACTTTTTTTTGGCAAAATACCAAACACTACAAAATTTGAAACTGGAGAACTTTTCATCACGGGACACATTTTCACGTAAATTATATTACGAGTTAATTACATCTTGACATTGCTTCATATTTTTTTTAGATTTCGCTTATTTATTTACGTTGTTTTTATTTATTTATATATTCTCAGGTTAGGAGGTAATTGAAAATTTTCAAATACCTATATTTTAATTGAAGCTATAGCTAATGTGGCCTTATGCTACGCCTATGTAAATAATTAAAGGATACATTGTTTTATATTCCCAACATAATTAGACAAGTAACTTAAGCCCATGAACCAAACAATATTAGAAATATAATTTTTCTATAACTGCAAATCGGCTGTAAAATACCGTAAAAACGAGGAAAAACCCCGTTTGAACAATCAAAGTTCCAAACTGAAGTTTACATAAGTACATATAAAACAAATCATTTACAAAAGAATAGATTTGTTGAGGTCTTTAATGTTTTGTTTCATAATAATTTCTTTGTCGATCGACTTTATTATAATCCAATTCTATTTCTGTTAGCCCAAAACAAAAGACCTATAATTTTGGAAGAAATGTGTCTTGAAAATGATTTTGTAAAAATCGGATTTAAAAGACTCTTAACAAAACTTAAAGATCGAATAAATTGGTACGAAATGCTATTTTGATTATTCTGGCAAGTTTTAACCAAAAAGCTATTTTTGGCAGGCAGAAGTTTTTTATGACTTAAATAAAATATATATATAATATTAAGGAAATGCTTTTAATCTAATCAAGGTGTGCATAACAAAAGAACGATTTTCCAATTTTGTATCTCGGTATACATTAGGCAGTCAAAAATAGCTTTAAGCTTTGTTTTTCAAATTTCACCCGATCGTTCCTATGAGACCTATAGAAGGTGGTATTTGGGTCGGTCATTTTCACGTCAATATCTTTTTCAATAATAGCTTTATCTGCTAAATATCTGAGCTCGGAAACTGTGTAGAAAGGTATACTAACAACGGTGATGCTAATCAAACGTCTCCTCTACTTTGCAGATTTTTAAACCACTGCAAGAGATTTGGGGCTACCGAAGGGGCACATCGGCCCCCTACATTTGACAGTTGTAGCTCTTACGGTTGGGCTATGCGCTGATACCCTTAATTTTTAAGTGTTTTATTTTATTTATCTTAAGATACTCTCTTTACTTAAACTCCTTGAATTAACGAAACGAAAAGATCGGGTAATCTTTGACCTTTTGCTGACAGAAACGGCAAACAGTTCTTTAAAATTCAAGAAATTAAGCGTGTTTTCTCACACCATATTAAAATGCAACCAAAACCCCGTGCGCCTATAGAATTTATAGTCTTGTTGGTATACATTCAAAGGCTAGTATGTGGGCGGTTTTAAGTCGTGTTTTTGCTTTTGATACTGTTTCTGAGACCTGACATACTGAAATTTTTTGAATTAAATAATTTTAACATACTTATACATACTTACATTCGGTTAAGAACTTAAAATATCTAAATAAATCTTTCCTTCTAACAATGTTGAATATTTTTTTATTTTATCATAGTATAAAAAAAGTATCTTATATCCGTCATAATTATTTGTACGAATAAAGTCTGTTGAACAAATAGTTTATTTTGACTGCAAAACATATTTATATAACATATAAACATAATTATATATTTAAAATACATGCATTTTAAAATTAATTTTTATAAAGTATAAAGTTGATAGCCTCCAGCAGTAACCAGAAAATAGATATTTATAATTTAATTAGCTAGAGCCTAGAGTCTTAGAGCTAACCAGCACTTAATTTTAGACTGATATAATGCACGCAAATAAATTTGAGCATAAGTCAATATCCATTTATTTATAAGTGCGTATTTGTAAGCGTAATAACGTTAAACATTTACTCACGATAATATTTTTGGTAATTTTCTGGTAGGCACTGAGGTAATCAGCTGACCCCAGACAAGAGTACCGATTCCAAAAAATATACACCAGAGCCACTGATCTAAAGACAAAGCCTTGGTCGAGAAAGCCATTTTTCCATATTGAATTATTAACACCTTAAAATATTTATAATAGATACATAGACCAAAATTTAACGTTTTTTTCAATGAAGCGTACCTGTGATATCATAGTGAAGATCCATATGGTGTAAAATATGGGATTTGTAAGAAGTCCTTCAATAACGTTACGTTGCCCGTGAATTTTTCTTGCGTTTATTTCGTTAAATAATGTCATCATGACAAATGTATTAAAGATAATAGTAAAGTGCTGTGTTGGTCCAGCATTAAGTTCTTGTCCACGTCCAGATTCAATATCAAGAATTAAATCGCCTACAATGCATTCAAGTATATTACAAAACAAGAAAGGATGTGAACCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAATGTTAGGAACACCATGTACAATATTTAAGGATTGTTACTAGCTTCACTAATAATTAAAGAAATTTTGTTTTATAATTATTTTTATTATTTTTCTGACCGTTTCCTTAACCTGCAGAAGAAAGAAGACTTTTTGGAAAGTTTTAGCCCGATAGTTTAAAAAATGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAATGGACCGATAGACGGACATTGCGAGAACGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATAAACTTTATGGGTTCGAAAACGTCTCTGCAAGGGTATAAAAAGTATTAATATAACTTACCGACAAAGAGCAGTCCAAATATTATTACCAACTGATAAAGCGCCTGACCAAGTATGTTTTTCATCATTGTGCGAGATATTAAGGGTTTTGTGCGGCCATAGGGTTTACGGAGTAATAGATCTGGAGTTGGAAACTCTGTTGCTAAAGCAAGTGATGCCAGTGTATCCATTATTAAATTGACCCACAACATCTGTACCGCCTATAGTGTTGTTTCTTAGACTTGCATACAATATATAATATAATATAACTTACTTTAAGAGGGGAATCTTGCACGGCGCACGCACCAATAAATGCAACAATTACAGCGACGACATTGACCGTTAACTGAAACTGCAAAAACTTCGCTATGGAGTCATATACGTTTCGTCCCCACATTACAGCTTTTACAATGCTGCTAAAATTATCGTCAGTTAATATAATATCAGATGCTTCTTTAGCAACGTCTGTTCCGGCAATTCCCATAGCAAATCCAACGTCTGCTTTTTTCAAAGCTGGGCCATCATTTGTTCCATCGCCAGTTACAGCCACCACTTCTCGGTTTTCACTAACAGTACTGTCAATAATGCCTTGAAACATATAACAATGAAATAATAATAAAAACAATTTTAATTTTGTCTTGTTCCGATTTAACAGCTAGTTTTGTAGACTTTCTCGAGTATCTGACAAAGTCTCTAATTTGTCCAAAAAATTAAAAAACAGACCAGATATTACAGAATTGTAACTTAGTAGATTGTGTAAAACATGCGTTATGTTATCGAGCTTATCAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/490/705/38/scaffold_21-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATAATTTTGTAGCTGTGTTTAAAGTTTCAAATATACTATAAAAGAAAAATTATAACATGTACCTTGTACACATTATAATAGCTCTATCTATAAAAAAAATGACCCGAAAATACGAACATTTTTGGAGCGTAAATCCTACACATTCCAATCAAAAAACGAAAAAATAATTGTTTTAACAGCTTAACTAACTGATGAAACATTTTTAAAAATGTTTTTCTAATATCTGCCAAAATACACATCAAACTATATATAAACTTTCATTTTTTGTTTCAAAATATTGAATGTGTGTAGGAAGATTTGAATATTTAAAAAAAGAAGCGTAAACAAACCTTTAACCAACGTATACTTGTCGGTTGGTGATGATCGTGCTAAAACCCTCAATTTTGGCCATACTTTATCAATAAGATGTTGTTGGATCTGGTAAAAAAAAATAAAAGGTTAAAAAAGATAATAAGCTTATTAAGGCAGCTTACATCTCCATTGCTATCCCGAATACGCCTGTTAAACTCTTTGCCTTCCAGAATAAGAAAGTCGTCATTGGGACGCAAAATACCACATTTGCTGGCAATTGATCGTGCTGTGTTGATGTTGTCTCCAGTTACCATGCGAACCGTTATACCAGCTCGTTGGCATTTACGAATGGCGTCAGGTACTTCGGGACGAACTGGATCTTCTATACCAACCACACAGAGGCACGTAAGATTCGTCATAATGTTTTCCTCGTCGTCCCAGTTGGGCTCGCCATCAATATGCACTTCATTAATTGCAGCTTTACCAGGCACAAAGTCGCGGTACGCCACAGATATTGTGCGCAGACCGTCACAAGCCATTGGTTCAATAACTTCCCGTATTAGACGCTCCTGCATATCCCTTGTAAACTTTTCCAGGGTACCCTCATGGCCATAGATAAAAGCACACCTACAATTAATATGAACAGTTATAAATTCTTATGTTTCAGCACAGATTCGAACTTTTTCATTATGATTTCTGAAGCCCCTTTGGTATACAATCGGTATCCTCCATTAGGTCGGGGAATCACAGTGCCCATACTCTTCCGAACGGAGTTAAAAGTATACACGCGGGTAAATTTGTCCTCTGTAATTTCGTCTCGAATGGATTGGTACTTCACACCTAAGCCCTGGACAAAGCCCAAGAGAGCACACTCGGTTTTGTTGCCAACTTGGATTGGTAAATCTCCTGGGTTGTGTCCACTCTTTTTTTAAAACATTTAAAATATATTAATACGAACCGGGATGAAATAAAAACTATTACCATTATATTTGAAGTATAAGCTGAGTTAACAGATATTCCCATTGTAATCAAGTTTCCCACATGCTGTGGTATGTCGCTTAGCGTTGGCAAAACCTTGCATAATTTTTCACATATGTAGGATTGTACAACAGTCATACGATTGGTCGTAAGAGTTCCGGTTTTATCAGAGCAAATGGCAGTAGCATTACCCATTGTTTCACAAGCATCCAAATGGCGAACTAAATTATTGTCCTTCATCATTTTCTTGACCGAGTATGCTAAAGATAGGGTAACGGCCAGAGGAAGTCCCTCTGGTACAGCTACTACTAATACTGTAACACCAATTATCAAATGCTTAACCAAGTTATTGGCATAAGTGTTCTTCCATGGTTTTTCGTCAATAACGAATGTCTTAATACAAAACTGAATAATCAAAATTATGACTGTAAGTACGGCAATAGTAGACCCAGCATATCCAATCTGTATAGCTAGTTTTGTCAACTTTGCTTGTAGCACAGATTTTTCCTTCTTATGTCCTGTTTCTACAGCTGCTGACGACGAGGAGGATTGCGGCACATGATTTCCCTCAGATTCAGATTTTGTTCCTTCGCTTGGTACTGGTTGGCGTTGAGTTAGCGCTTGGGTCCCTTTTGTTTGGGCGCGACCGTCGTTTTCACCTAAATAGTGGGAAAAAAGTATTTTTATAATATGCACACATTAAATTAAGCTAAAATTGGCTTAATAAGCTATGCCATACATAAACAACTTAAAAAAAAAATTAACACGTTTGATTTTAAAGAAATATATATGCGAACCAATCTTCTCCTTATACTCTTGTAGAGGCTATAGATTTCGTCATAAGCTTGTAAAGAAGTGTATATTTAAAATAAATATGTTCTTGATCAGGATTACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGGAAACTATAAAAGCTATAATATTCAGACTTGGCATGCAGATTCCTTGGCTTTTTGCGCAGCGGAAGTTTGTTTTAGCAGGGTGCCACGGGCGTGCCACTTTAACGCCTACAACCCGCCCAAAAGTTCGGTGGTCACAGTTTTAAAGCTAGAAAATATTTTTTTGCTAAAATGTATTTGTCTATCGATTGGACCCAAAAAAATTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAAAAACGGTGAATTCCGATTATTCACATAGCCGGAAAGGCTTTACAACAAAATGCGACAAAGTTCAGAAGAGCCAAATGACGAATTATTCAAAAATAGAAAGGGTATTTATTCAGTGGACATTACAATTATGTTCGTCACAACTGTTATATGTTAAAGGTGCGATCGTCTCTTGTTCTTACCCCGTTACGAAGTATTTTTGTTTTTATCAGAAGTTAATTGATTTCACAATGTTAGATTCTAAATTTGTATACCTGAAATTGTCTACATGAAACATTGCTTGGCGAAATGTAAACTTTTAAGTATATATGTTCTTTACCAGCATCACTAGCCAAGTCGATCTAGGTATGTAGGTCTGTCCCTGTGAGCGCTGTGATCTCGCAAGTAGCTCTATTTTATGATGTTAACGTGCCGCGCCCACTCTTACTCGCACAAACTGTCGACGGATGTGACGCCCACAAAAAGTTTCTAAGGCCCCCTCTTACCCCCACACGCCTATATACATTTTTGTGACAAACATTTTTAATAAATAACAAGGAAGAACGCCATAGTCGAGTCTCTCGCTTATAGATACCCGTAACTCAGATAGAGAATCAAAAATATACAAGCGGCAATGCGAGATTTTTAAGCGTCACCTACACATCCTTTCATTATATGACGGCCGTGTGACAAATTTTGGCGATAGAGTGGGAGTGGAAAACTGTTTTTTAGGTAGATCAATGGGAACTGAAAAGAACAGTGCAAATTTCACTAACAATTTTTTCCTAGCACTAAAACTGAAAGCCAACCAATTTTGGGCGGTTTGTGGGCATGGCACGTCGGTGTAAAAAACTCGCGCTGCGTATAATGATTTGAAATCTAAATCTAAAATACTAACTTTCTAGCTCTTATACTTTTCTAGATCGACTTGGCTTCTGATACCGATTAAAAAAATATATATATACTTTGGGGAGCTGTTTTTTTTTGACAAAATACCAAAAATGTTATATGTTTTCCTAACTAATATTGCAATGTTTTTGTTTTGGGATGCGCTTTTTATCGCTTGATAGCTTCCAAACTCCAAAGTTGAAGAATCTCAAGGGTTATTCAGCATTTGATAAAAAGCTTTTGAACAATGTCTTTAACGCAAATTTCGTAAAAAAAAAACTTAGAGTAAACTATACTCTCTTCTTGACATATAGCATAATTTTAAATATATATAGCTGATGCCCTCCCAAAGTATCAGTTTCCATTACATATATTTAATTTGACAACATAAAGACTAGATATTAAAATGAAACGCCGGTCCCAATATCCTGGTAAAATCGCTTTAAACCGAATTTAAAGTATACAGTAGACAGTAGATTTAAAGAAAAAAATGTACTTCTATTTAAGATTTTTTTAGACGCGGTTTTATATAACAGAAATTGTGAAATTTTTCGGAATTTGACGGTAAATCTCAAGATGAGGACAATATTTAGCAAGGCCGCCATGTATTAAATGTGTCAGCGAAAAAATTTAAGATAAGTCCAATTAAGTGGGCTATATAATTCA'..b'CAGACTAGTGTCAAAAAGGTTTTTGGTGGCTTTGGTGGAATTACGTTTGAACCAAACGTTTCCCGCCTATGCTCTTCGTCAGCTTTCGATCCACTTAACCCTAAAGATACACTACGAACTGTAAAACGTATGTCTACATTATAGTGTGCATAACTTGCCTTCATTGGGAGATGTGTATAACTTTTTACATAGTTCATGAATACCACCAAATTCCGCAATTTTATTTACACCTTCCCGACCCCGATGCTCCATGAGCTCGCGCAGTTGTTTAAGTGAAATACCATATTGCGCCGGTCTTCCATCGATAGTGGCCATTTGTTATTGTCGAATCTGTAAGTAAAAATAAAGCTATAAGCTAGTAATGACAAAAAAGTGTCCTCCAAAACGTTATGTAGCTTATTCGCTTAATAAAATTAGCTTAATTTTAAACTAACTGACTAGACTTGGCAACCTAAGAGAGGGTTCTATTATTTTATAACAAAATTTCAGAGTTTAGAGGATTTCCTTTTAAACATTATTCACTACCCAACCCAACCACAAAATGGTTGGGACTTTTGATTTAATAGGTTTTTAGTAAACATTGCACTTTTATATCAAACAAGCGAGAACGATATAGATGTGTCCCCCAAAATTTCCGTTACTCAGCTAGGGGAAAAGAGATGGCGATATGTGAGCGGCAAAGCGACCGTTTTCGATTTTACGAAAGGGATCTAGCCTCACAAACAGAGATTTTTGCGTCCAGTCCAGAGACGCAATCTCTGCAAATGTTGCCATTGCAGCTGGCGTCCCCCAAGGAAGCGTCTTAGGACCGCTACTGTACTCCATCTTTACAGCAGACATCCCCAAGCCAAGCTATGAAGAAATGACCTACGACAACAGCAAAATGCTGCTGGCCAGCTTCGCTGACGACGTCTGCTTTCTCAGCTCCTCGAACAGTGAGACCGAGTCTTCACAAACGCTGCAAACCTACCTCAACGAATTCGAGAAATGGGCCACGGCGAACAATATCAAAATCAACGAAAGCAAATGCGTAAACGTTTGCTTTACGTTACGCCGAAAAACAACTCCGGTGGTCCACATTAATAATGTGGACACAGAGCAAGCGACTAAGGCGAAATACCTAGGCCTCACACTGGACAAACGCCTAACCTTCCGAGAACATATTGCCAGAGTCGTCAAAATGTGCAACCTAAAGCGGAACCAATTATTCTGGATGCTAAACAAGAAAAGCAAACTATCTCTAAGACGCAAGCGGCACATTTATCAACAAATCATCGCACCAACTTGGAGATATGGAATCCAAATTTGGGGAGTGGCGGCTGCGTCCCACCGAAAACGTTTCCAAACCGTCCAGAACAAAACATTAAGACAAATCACTGGCTGTGAGTGGTTCGTTAGCGGCCAAACGCTTCACAATGACCTAAACCTGAGTCTTGTTGAAGACCAAATATCGTTCTTCTCAAGCAGGTACAACGACCGTCTAACTGCCCACCGTACTCGTCTAGCCCGGAGATTACAGGGGGCTATCCCAATTCGCAGGCTCAAAAGAAGACATTTTGGGCTGCTCCTAAGAGACTAATATGAATATATTATTTACTTGAAACTAGTCGTAATTTGATCTACTCCTATATACTAAGTTGAAAACTATTTATAATTTATAATTAAGAGATTATTTACTTAAGAAAACATTTAGGTTAAAGGCTTTAATTAGATCTGTTCCTGGATTATATTAAATAAAGATGTTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAACTAGATCCACCTTGAGTTGACAATTTTTGTTTATACAACGCTGATAGGAAGCTAGCTTCTTTTCCCATTTTATAAGAAAAATATATTAATTTATTTATTTAACAACTTTAATAAATTATTTAAAATTAGGATGCGTTTAGCCTTGGTTGGTCGTAAACCAGGGTATGACGGGAATGACGCATTATGGATTTGATCAAGATAAGGAAATGACTGCATGAACCGTCGTAAATACGTATCTTGCTGAAAGTGGATTCCGTCCAAGTACAATTTCTTGGCGCACTGATAAGCCTTAGATAACATAATGACGTCAAAATAAGCAATACCAGTGAAATCCACATCTAACCGAAGTAATCGAAAAATTTGTTTTATAGTTGTTTTACTTATTATTACTCTATTGTAACTTTATTATATTAGTAAAGACAATAAACGTTGCTTTAAATTTTTATAAACCCGGTTCTCGTTCTTAATTAATCTATCTAGAATTCAATTTATTGAAAGTTCCACATCATCCTGGCCACTCCCGTTTATTTTTTACGCGTGCACAGTACCACCTGGAGATCAAAGGACATACTTCTTTAGACATCCTCATAAATATTTCGACAATATTACCACTCCATGTACGAAATACTCAGCGAAAGGATGGTAACATTTAGTTTACTTAAACTATTATATCTAGCCAAAGAGCCAATAAGGTCCCACTTTAACGCATTTTATTTTGCAGGTTTGTAAAGAGAAACTTTTATTGTTTAATAATTTTGTAAAAATACGATAGTAAATTGAAATGGAACATCATATTCATTTTACATTACTTTATTTACACTTTTACCGCTCTTTTTCCCAAACTTATTTACTTTCTTAAGGTCTTGGTTTGCAATCCTTTTAGATTTAGCAATACCTTTCGACTGATGTATACTTCGAAACAATTGGACGACTACTGCAGATTTTAATTTCTTTGTATGTATATGTATAGTAGTCGCCTTCGCATACCCTTCTGGTGCGCTTTGTCACTACTTGGACTGCAGTCCATATGGAACTCTGAACATAAAATGCTTCCACTGAAACGATCTTCCCACACACATAGAGCAAGAACATCTTCAATGACGTCTCGGGTAGTAAATAAATGTAAAATTGTAAATGTAAAATGGTACAAATGCTAACAAAAAGTTTCTTCGCCTTTACTGGAAAGTATATTTATGTTGAAGTTGATTTGCTGAGTATAGGTGAAGGGGACAGTGTCGGGAAGAATTTGTATGAAAAAGGGGAAAAAGTTGCTCAAGTGTTTATTACTAAACATTTTCAAAATATTATAAAAAATATAAGAAAAATGATTTTTGAAAATTTTTTTGCAGAGACTTTTATTTCTGTTTGGACAAACTTTATCCATCAAAAAATTTAAATTTGCAAGACTAGGAAAAAAATTCCAAAAGTAGATTTTCACAAAAATTCGGATTTCAAAATAATTATGCCGACTGGTGAACGTGTTTCTTTTAAAGCTTTAAGCCATTTTTTTACATTAAGTCATCCTATTTTTTTTTAAAGCTTTGTTCGTGTTCTGAATTATTAAAACAGTAACATTCCCAAAAAGTAGAAGTATATAAGTAAAAAAATAACAAAGTTAAAGGTTTTTACATTAGTTAAAATATTTTTTGTCTCGTTCAGACTTACATATATACTATACACATTAAAATAAAACATTTCCCGATAGCTTTTATACAGACAAACTAGTTTGGGTATCAAGAATATATATACTTTAAGGAGTTTGGAATGACCCCAAAGACATTAAAAAATGCCGGTAAAAGTGTACCTGAAAAGTTGGTTTGAGAAAAACGCCACTTCAGTACAAAATGGCGTGAAAATAAAGCTTTTAAACCCTTGCAGATGGTATAATAATTTCAGTCAGAACTTTGTAACTCAATGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTTTTGATCAGCGTCACTAGACAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGTCTGTCCATTTCTACGCAAACTACTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGAAGTATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATTGGAACTATCGGGGAAAACATTTTAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CGGTTACAGTTACAGTTGAGATATCAAAGTTGCGCCCAGTAAACAACTACAGATAACCTGGCGGCACGCGAGTCATAGAAAAACTAATTTGGCCGCCGCCTCGGCCAAGTATAAATATGACTGTTGCTGGGGGTTCAGACACGTCTCGTTTAGAAATAGAACTTGTACACAAAAGTGGAGTCGGCTTGAAGTCGAGTCATCGCCGTCGCCATCGTCATCGTCCTCGTTGGCTCAAAGTAAGCCAAACGTCTTCGTTCCTGGACTCAGCGCCAAAACCTTCGGCAAAATATCTTCGTCCCGTCTTCGGGTCCTCCAGCACCAGCATCTCGCTCAGCAGCACGGCTCCGTTTCCACGGGTTTCAACGCTCTCTCTTAACTTGCTCTTAGCCAGCAAATCGGACAACACCGGGATGCCGGTGGGGCAAGCACGAAATAGTTGTAGTTAGAGGGGCCTTGGAGGACATCACACGATCAATGAGTGGCCTGTTGATTCAGTAATTACCTGGGACATAAACATTGATCCTCTGTTGTGGTTACAACACGATGACAGCGGCGGCGCAGGTGACGGGGAGCTACCACCAAGTGAAGTGCTCGCAGAATATCTTGCTCCTAGGGACTTTTCAGGCGACGATTTTATAGTTGGTGTGGTTATGGGCTTAGTATAAGTTGTTTTTGATGTGTTATTGAAAGTCCTTTAAACATAAGGCCGGAATAAGGCACACGTTACGGTGTCGCGATATATTGATTATGAAAACTCATTAATCGCCTATTTTCGGTGTAACTTCCTCCAAACAGCCATGGAGCCAAACTGATTTATTTTATACTTGGATTTTCTCTTTCTTACTAGCTTAAATTTTTTTAAATTTACATCACAATTTGTTACCCGATACCTTTACCTATTTTTATGCCCAGGGTTTTCACTAAACTATCGGATTTCCGTTTTTCGCAACTACAGATATTTATGTTCCTCCTCCTCCTTATTTAGGGTATATAAAAATATAGTTTTATAAAATTTGGAAGTATTTCGAGGATCTCCAAAAATGGACTATAAGATTTGTTGTTTCAATCGACCTAAATGTATACCCAGTTGAAAAAATCTCCCATTATTCTGTTGTTCTATGAAATTGTAATGGCTTAATTAGTGGTGTTATACAACTATACTACTTATATTTTAGTTTACGTACAGTGACCTACAATAATTTCCGTATCTCTCTTCAGGTTTAATCAAATAATTACAATTATTGTTTTTGAAAATTGTTTGTATTGCTATAGGTTTATCCTGATTTTTGTGTTGGTGTGTAGTTGCATGAGAATGCCACGGCATGAATATAGCCAGTTTTTTGTAAAGTGCTAGCTGTAGGGTATGTGATATTCCAAACTGTCTGTTCCGGTGTCAGTGTGTATTGAGTAAGCATTCAGGGAATGTATTTTGTAGCTGTGGGAATGTACTCTTTGTCACGAATTACTTATATCGGTGTAGCCCGAAAACCCAATTCTTTGGTCTATATGTTTAATTAAATAGCTTTCTTAGCTGTTAGCTATTAATACAATTAAAATTACTTCTTTATTATATACAAAAATAAATTTGTATCTTATCGATCCGTAGCCTCTGTCGGATTTTTTCAAGTCTTCCCGCAATCCTCACTCAAACCTACAGAAGTGTATTTCTTTGAAAGATAAAAAGCATATTCTGATACAATTTTTTATAATACGTTTTTGAGTTTCGTTAGTACTTGTAATAGTTGTATAATAATTCTTCGTAATTTATTTATGTGGTTTTGTACTTTTGATTTCAATTTTGCAACACTTTTTTGTTGTATATTATTTTTTTTGTTTCATTTTTCTAACATAAAAATTTGTTATGGTTTTAGCGGTTTGTTCTCGTTGGTCGGCTTTTATGTTGGTTTATATCAAATTGGTTGTTTTAATTTTCTTGGCCTGTGATGAAGTTGATGGTGTTATTCCTTGTCGGTAATGTGTTAAAAAATGAGAGATTTAATGGCATCTGTTCTATTGCTTTTATAACTAAAAGATGGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTGAGTTAAGTTGGGTGATTTTATCTCTTGTTACGGATTCTGCTTTTATGTTAAAAACGTTTTCTGGTCTATTGTTTTTTTAAATTATGATGATCTGTAATTAAACGGAAAGAAAATAAAGGGTTTTGTCAGACTTTTAATCTGATTAAAGCCAAACAAAAATGAAAATGCACAAGAGTAGAACACTTTGGCAACGCAATTCGTTCGTTCTTTAGACCCTCTCGATCAATTAGATTCTTTAGTTAAGTTAGCTTAATTGTTTAACAATCCACAGTCATTTAATATTTTGCTTATGCACATTTGATAAAATAAAAATGCTCCGCGAGGTCAGGACGATCCGCAGTCGGCTGTTCTACTCCATGGAATACTGCGTTTGTGAATGCCGCATCCAAAATAATTGAGAATAAAAATCATCTTCCCAGCAATACGTTGTTTGGGAAGCTGGAGAATGGCGAATCCAGAGCGCAGAAGGGAAAAGGGACAGGCGGGCCCCGAGTGGGAGAATGACTGGGAGTCAGCGGTGTGCTTATTATAAGATAAAAATTGTGTGTGTTAAACAAAAAGTGACAGCAGCGGCAGCGACTGCAGCGACAAAGCGACGGATGTGGATTCAGGTCCTTGCACTCTGCACTGGACGGGGGCCAGTGCAGCGCCGGCGCTCTCGGCAACTGCAGTTGCAAGCCAGTTGTTTGTGCACTTGCAGTTGCAGTTGCACACTGGAAGCAATGCTAGTACAAATTATTTTGAAAATCAGCGCAGCCCTTGTGACGCAACATTACTGCCAACAATTAGGCGGCTCAGAAAGGTGTTAAAAACAATCAAGCGCGTCAAAATAAGCAGCCTTACTCTTACACGGTTAGAGCTACTTTACGCGGAACCGTTTCCAATCCAGAGGGGGTAGGTGTTTCATGATTTTTTTTCGAGTGCATAAAACTGCATGCTGTCGGTGCCCACAGACCATTCGATTCCGAGAATGTGTGCGAGCCAAATATGTCTGGCCCATGCCGCGCTTCAGATGCGTTTTCGGTGCATCATCCCTTACGCCACCCCCTGATAGCTTTCGCATCGGCAGACATGCGAGGGGCAGCAAGTGCTGGTCCGGCTGCACTCGGCGTTGCTCGTCGGCTCCGAGTCTGGCTCCGGGTCCGGTCATCGCTGCACTTTCCGCAGTAACATCCCTTATATGGCGGCAGGGCGGCAGTGATGACCGCTGCAACCACCCGGTGAACCACCCCACTTACCCCACTGCCGCCTGGCTGCAACCAAAGCAGACCAGGTCCTGGTGGGTGGTATGAAAATTTGTTCATGATTTAATGTCTACTTCAAGGCCTCTCCAGCACCTCCTGGCCGGCCCCAGCTCCCACCCCTGCTCTCACCTCTGTCCTCGTCCAGCCATCTCCCTTCCTCTTCATGGTTACCGACTGTTTCTGTCTAGCTTGGGCTGTACATTTGTGGATGTGCGTGTGTGCAATCGGGATGCATTTCTGGTCACGGTGCAGCAGTATGCATTTTAATGATTATGTGACGTCCTTATGTACACACGCATACATGTGGGCAGCTCGCAAAGTACATACGCAGCCGGCGAACACTATCGAACCCCGACTGATTTTAATGCGTGTACATAAGAAGCCTGAGTGCTGCTGCATGTGCATTTTTATGTAAAGTTAGTTGCCACCGCTGCTGTTCAATCGATTTTAGTCTGAGCTCCAACCGAAGCATATCGATTTTCTCCACTCCTGTACATGAACTGGCATCAATCAGAAGTGAGACCCTTGTTTCGAGGCTCTAAGCTGCAACTAAGGGCAAAAAATGTGCATACTTGTATTCATTAGCAATCCAGGTCTACTCGTATCTATGTAGGTTGTAGCAGAAGGTGAAGTTCAAATCTTACTGCCGAGAAATTATACATAAACCAAAGGTA'..b'CACTATTGACGTAGTTACGTTCACGTGATGCGTGTGCATTGTTATTGGTAAAGTAAATAGTTGAATAACTATCAAAAATAGATGTTCTAACGTACAATAGTTATTTACATCCTTACAATTTTCACAAAAATAATCATAATATTTAAAGAATCAGATATCGACAAGTTTCTTATTTTAATTAATACTTTATTTTTAAACTTATAAACTAATAAAACTACTTCCAATATTTTTATCTTAATGATTTATGAGTAAATGACATATTACAGGAGTTCCCGCTGGTCTTGATTAGTTAGTTCTACTTAGAAAAATTCTAATGATTTAAAATTCAAAAATATTGCAGTTTCGATATTTTGGCAAACGCATATTTAAAAAACACACATACATTTTGTTGATATATTATCAACAACCTTAAAAGACTTTTCTTAAAGCATACACTTCCACGCTAGCTGAAAGTCCCTGTGCAAATTTCGAGGCGCAATTCCAAATGACATTTTTATTATAAATTGGATGAATTTAATTATTTGATAAACTTGCTCGAATGGAACTTCCTTTGGCTTCCCAAAGTTAGCTTCCTTTCTTGTTTAAATAAAAATTTATAAATTTTAAACAACATTTTGAATTTGCTACTCCACTCTTCAATGGATGGAATGTGGGAACAGCAAATAATTTAATAAATGACTACACATTCTATTACTCATTCAACGCTCTGTGCTTGCCCATTTCAGGAAGGGGTGAATCAACAGGCAGTTAGCTCAATAAAGACCTTTTCAGTGAAAAGTTTCTGGTGGGTGGAGAATTTTTTAACCATTGCTGTTTTTTACGTGGTCTTCATTTTTATTTCCATTTGTTTTTTAACGGCATTGGTAAGCATTTTTTCCTCTGTTTGTTTTTTTCCAAATACGGTTTTAAGACCACCGACTCAGCTCTGGAGGAGTGCAAATCTGACCCTCAATTATCGTGTTACGAACTCGCCAAGTGAGTATGTGTTTCAGCTCTCCATTATTGCGAAAAAAGGAAAAAAATTTAAATTAAGGGCTACTAAGTTTGGGATATAAGTTATACCAGTTTTCACACATCTATAATTTTCTTTACCACTTAAGACAAAATCTTATTTTTATTCACATTTTTACCGCTTTCAATGCTGATGGTTGCGAACACCTCTCTGCAGAAACCCAGTACGCATATAACAAATGAACTTAGAATAATCAATACAACGTGGTCGTCATAAATAAAAAGAAATAAATTATAAAACAAGATTGTGTAAGTAATTACCTTTCAGGCCGCTCCGAAGCACATAAAACAAAGCACTAAGCCCACCTTCATGAGCAAATACGCTGTGGGAGAATAAAAGCATCGATTATAAGAGCGAGCGAAGTAACATTTTTTGAGTTGGGGCCAAAGTTGGAATTGCAATCGAAAACCGGAATTGAGTTAATTAAATTTCAAAAAGAGTGTGCCAACTTGTTTTAACGCTTCCGGCTGGGCCAAGACTAGCCAGATAAAGCTGAGTGCTTCGGCGTTTGCTTTTCGTAAAGGAGTGCATTTAGCAAGCCTCCTTCATAGCTTGTGCATATTAGTCAGTAGAATTCTTTGACAACGCAAATTGAATAGAAGGCAGTTAAGTAGACGGGATCGCGCTCATGACCGAAACCTCCGGCAATAATTCGATGTGATAAAAAAACGTTTAACGAGGCCTAATCGCCAATACCGTTTAGTGGGGGAAAATCGTCAGAAAAAATCCTTGCGGCCATCGCTGCAATGTGCGGCAGTTAACCTCGCCCCACGGTCTGCCCATGCGGTCCTGCGAGCATGTTTTTTGTGCTCAAACATTTTCACACTTGCGATTTTGAATGGCAACTGAAGCAACAGGATTCACATCAGCATTTTTTCGCCGTTCTGTTCTCTCTTCTCCTGACCCGGCTTACCTTCCGACCTGGCACCCTGTCCACCCCAAACCTGGCCCTCTGCTGGTCTGGCCGCATGTTAATTAACACGAATTGTGGTACTCCTGAGCCACTGGACAGACCTGCGGTCGTGGGCTGGTGCGGCGTACAATATTTGTCCAACAACATAATGTGTTTTTTTAATACCACGTGAATGGTGTACTCAGTTGGTCCCAGGTCAGTGATTGACCAATGAGTGTTGAAAAAATTCTGTGAAAAACCAACCAAACAGTTAAAAGTCGGAAAATCGCGGCAATTACTCTCTCGATCCCTTGCGAGTTGCGTGCCGAAATTTGTCCACTTATTTCCATTTTCAGTGCTTTTTCTGCTGGTTTTTTCTTGGCAAAGCTTTTAAAGGCAATCGGATTAAAAAGTAGATTAATTGCTTTGCGGCTTTGCCGTTTTATACCCTTGCAGAGGATATTATAATTCATACAGAAGTTTGCCTTGCGTGATTTTAAGGCGCCACCTAGGGGCGATTTCCTCACCAGGATTCCTAACCGAGTCGACCTGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGATGGCAACGACTAGCCTTCTCTCTGTTTTGTTCTGTAATTGTCTAAGCGGTATTTTAATGGGGTACATAGGGGTTGAAAATAAAAAGGAGCAGGCAAATATGAACAAATGCGAAGCATACTTTTACGCGGCACACACTTTAATATTGAATTATTAATAACCTTGCCTTAAAGTATACTCCAGTCTTGTGATCAGGGTTCGCTTGATTTGCACTTTTCACATGTGGGACGAAGAAAAACTTTGTGTGGAACGTGTATTTTTATTTGGAACGTGTATTTTTAAAGAGCGAGACAAAAATAATAATAATAATAACGTAACAGAATGTTTAAATTATTTTACTTGTTCACTGGTCGGCATAAGTAATTTGACGAAACAAATGTAAAGTATACTCATAATTTGAACTTACTTCTTGTAGACTTTGGCTTCAATTGAAAGGTAATTTAAATGCCGTTTGAATGGTTCAATACTTTTCTGTACCCAGATCTTATTGAAAAGGAAGAATTTGTGTAAAAATTGACATTTTAAACTTTCTTACTCGTCTTGAAAACTAACATTTTTTCCTGATATAAGTTGCCACTTACCCGCTTTTTAAGGCAGACAGATTTGTGGGCGTGGCACATTTGTTTTAGGTCACTCGATAGGTATTTATGCGACAAACACATTTCAGTTACAATTGTAATTATTGTCATAAAAACTGAAGGCGCTACAGATTGTCGCGGATTGTGGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCATAGTATACGAGATTTCAGCGTTCATACGGAAAGGCAGACAGACAGACAGGCGGACAGATGGACATGGCTAGATCGACTCGGTTAATGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGAAACGCTACCTACTATCTGCTACATACGTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTACTCTACGACTAACGGGTATAATGATTTCAATATTTCTCTGACCGTTTCTTTGACAACTATATGTTAGAGTCAACCGATTTTTCTTAAATTTAAGTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTTCTTATATTATGAGATAATACGTCAAAAAACACCGAAGCTACAATTTGTTTCATATTATTTTCCCTCCCATTATATTGGGATTGTATCTTATTTTTTTAATCAGGGGTATGCTGATATATCGAATAAAAGGCAGAAGAACAGAACAAGGCAAGGAATTTCTTGACCAGTTGACCACCACCGTAGGAACATGTTATTCTAATGCAAGACAACTCCAAGTGATATGAAATTCGTGTTCCTGGAGAAAAGCCAACTGGTTTTGTATGATTCGACTGCTGGGAAAGCAAACCAGTTTTCGGACTTTGCCCTTGCCAGCTGGACTCGCGAAATTGCTGAGTAAAATATCATAGCTAACGCTAAAATAACAAAAATAAAACTGAAACCGGCTCCGAGAGGTTGCACATATTTCCCAAAGCTATTGCCCCTTTTTCTATGTTTTTCAACCCTTTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCTTTATATTTAAAGCGTGAGTTTTATAGTTTTTTTTTGATTTTTTTATCTTATTTGCATATTTTTTATGTGGCAGGAAACTGGACACCAGCTTGACCCGTTCCTGTGCTCGGTCGACATCTGCCTGTACCGAAATCACATTTAATGTAACAAATCAGGTCCGTTATTCGATGAGCCTGCAGGAAGTATTTTAGTCTCTCAGTTTAAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGACGGAACCAGCCGAATCGGACCACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACCATCAGGGAAAAATTAAAAAAAAATTTTTTTTAACATATACCTTTCTAAGGTTCGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTAGTTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAATTTCTAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTATTTTGGCTTAGAATTTCGAATTAAACTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATAAAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTCGGAACACATTTAATAAAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTTAACATATAACCGTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTTAATTTCGAATTAAATTTTAATAAAATCTGACGACTATATCATATAGCTGTTATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTTTCTTATTATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAAAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAGCTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTAACTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTGATTAAAATCGGACGACTATATCATATATCCCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAAAATTTTTTATTTGGTTATGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATACAAATTTTATATTTTTAAAAATTTCGAATTCAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATTCAAACTTCGGCTTGCCGAGGTTAACTTCATTTCTTGTTTCATATTATTTTCCTACTAATTCTCCTATTGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTGTGATAAAATGTAATTCGAAATTCTACTAATATAAAATGTTGTTTCCAAGCTAAGAAGGCTATATGTCGAAAAGCACCAATACTATAATTTGTTATATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAAAACCAATAAAAAATGATATTTCTAAGCTTAGAAGATTATATGTGAAAAAATACCGAAGATATAATTTGTATACCATTGCAGAGGATATAATGATTTCAGTCAAAAGTTTGCAAAGCAGTGAAGGACACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATTAGCGTCAGACGAGTCGATTTAGCCATGTCCGTCCGTCCGTCCGACCGTTTCTACGAAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCAGGATCGGACAACTATATCTTATAGGTCCCATAGGAACTATCGGGCAAAAAAATTAAAAACAAGAAAGGAAGTTAGCTTCGGTAAGCCGAAGTTGCTATAGTAAATGCATACACCAACCTCTTCCCGTGCACTGTGTACCTACGTGCACTGATCATCATAGTTTTATGAATTTACCATGTAGTCTAAAAAACAAAACCAAACTTGGATTTAATTTTCATTCAGTTTTTAAAGCAACAAAATATAGGGATGGTTGCTTACCAATATTTATCATATACTAAATTGTATTTTATAAATCCACCCCTTCTTCGTTTCTTTCTTACACAGAAGGTCGCCATTTTTATTTGGTTAAAGAGTCAACCAAACAAAACCACCACCTTTCTGGAAATCGAAAAGCAACAGCAAATCTTCTGGCGATATTTAATAAGTTAGGAATAGAGAAAAAATAAGTTAGAGCTGTTTTTTAAGTTTTAGTCTTAAAGAATTATTTAACAAATAAGTGTTTTGAAATCCCTTTGGGTTAATTACATCATCGATAAAAGCATAAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAGCCGGACAGACGGATTTCGATAGATTGACACGCCTTGTGATGCTGATCAAACATATATATACTTTATTGGTTCGGAAACGTCTTTTTCACTGCGTGCAAATATCTAAATGAAGTTATTATTAGACGATGGTATCCAAAACTTCTAATATCAAACAAAAACGCATTTTAACGAAGTAAGGGGTCGTGGCGATCGACAACCATCAAGTATCAAAAGTTCTGATATCGGCTTTTGTGACGAATAATTCTTGTTAATTTGACTAAATAATTACACTTCCTAAAGTGTTCTCGTTCTGCCAGCTACAGCGCAAATAGAGACCTTTGCTTATGCAAATATTTTATTTATATGAAATTCATTAGGAACAACCTGCAGTCATTATATAAATTGTTAATACTTACACGCAGTATAAAATAAAATGGAATTTGAACCAAAAAATGACTTGAGTTAAGGTAATATGGACTCTATTTTGACCACCAACTTATTTTAAGCCCGTCATGATCAAACCCAGATGGTTACCCGTTACTCAGCTAAATAGAGCAAAAGCGAAAAGGAGATATACAAACAGCAAAGCGACACCTACCCGCTTTTTCAATATATGGTCCTGTGGGCGGTAGGCAGATTTATAATGTGTGAGGCAAACTTTTTTTTAACTCAATCGATAATTGTTGACGAGATCAACATATTCAGATAAAATTTTTTTAATTTTTTAAAAACTTCAGGATTGTGAGCGTTAGATAATGAGTAGCACCCTGCTGAACAAACTGATTCGAACAGGGGTTACTTAGTTTCTAATTCTAATTTCTAATAACATTGCTAATTGCATGTGTCTTAGCGAACTATTTTACGTTGGTAAGGGCTCTGCCATTGAGAAAAAGGTCCTCGTTCCCACTGGTATAAATGAGTTGGACGTTTTTTGTTGTAAAATTCATTTAATAATAATATAAAAATTTTCAAATAATAAAAAAAGGAAAACCTGCAAACGGGGCGGATTTGAACGGGTCAAAAAAATCGGGAGCTTACTCAGTTCCGCTGTTCAGTTGCATCAACCGACGCACCAATTTTTGCGTTTTAAAGATGAACCGAAAGAAACATGTGAATGTGAAAACCGGATCCCGTCTATTTATGGACCATATTTTAAACCATATATAGCGTGGTGACATTACACATTACAAACGAACATATTTTTGATTAATCTAGTCAAAAAATGTATCATTAGGTAATCTTCTAATTAAAATTTAAGTGACAAATGCCTTTCCATATATTTTGTAAACGTAAGAATATGACATAAAGACACTCCTATTATAAATGGGTTGTTTCAAAAACAAATGTTTACATATTTTATTTCCAGAAAAAATTGTTAGAGCTTTGTTATATGCTACTTTTTGGTTTGTGTACATTGGTCAATTCGACAAACTTA'..b'GACATTTCCTCACGTTTTACATAAAACACATTGTTGTTTAGGTCCCATTTTTATACCCTTGCTGAGGGTATAATGATTTCAGCCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCGAGTATATATAATCTTGATCAGCGTCACTAAACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTAAGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGTCTGAAACTTTCCCAAAAGTCGTATTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCAGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCAGGGAAAAATTAAAAAAAAATTATATCTTCGGTTTTTTTTTAACATATACCTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTATGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCAAGATCAAGAATATATTTACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTATGCAAGGGTATACAAATTATATCTTCGTTGTTTTTAACTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGATTTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTCGAAAAACATGAAATAAAAATTAGATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAACTTGAAAATAATATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATAACATAAAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATTTGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGCGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTGTATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGACTGCCGAAGATAACTTCCTTTCTTGTTCAATATTATTTTAACACTAATTTTCCGATTGGGAGCTATATGATTTAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTTTAAAAATGTTAGATCCAAGCTTAGAAAGGTTTATGTTAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTTAAAATTTTTCCCTGATAGTCCCTATGGGAGCTATATGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAATAAGACTTTTGGGATAGTTTCAGACCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAAAAACGGATAGACAGACGGACATACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGCGACGCTGATCAGGAATATATATACTTTATGGGGTCGAAAACGTTTCCTTCACTGCGTTGCATACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGTAAGGGTATAAAAGCCAAAGATATAATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGTAAAAGGAAGCGTTTTCAACCCCATAAAGTATATATATCCTTGATCAGGATCTCTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCATCCATCCGTATGAACACTGAGATCTCGGGGTGCCACTCCCACTCTAACGCCCACAATCCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGTTAGAACCAAAATGTTAACTGAAATATATTTGTCTCTTCAATACCTATCGACTCACCAAAAAAGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAATGGCCAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACATCTACTGAAATAGCGAAGTAGGTGGCGCCCTAAAATATGGCTTTTCTGCATATATATCTTTATTATCCTTTTACTCCCTTAAGCTGGGTAACCGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTGCTTGTTTAAAATTGTTTCTTTCGATTATTCTGATGGAAGCTATATGATATAGTTGTCCATTCCGGCTGATTCAGACTAATTTACTTCCTGCTTTCAAACTGAGAGACTTGTTTGAGGATGGACAGACGGACATGGCTATATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATTATGCACCCCATCTTAGTTATAGGATTTTGGGTACCCTATGGGTGTACAAAGTGGCTCAAGATAGAAAACATTTGTTCTACGGATTATAAATGCCAATAATTAAACTAAACAACTAATGATACGGAGACGTGCTATACGTCTCTGAAAAGATCATTAGGTAATTTAAATAATTACTAAACACTCTTCCTATAGTGAAATTGTCCTAATATAATTGACTTACTTAATGATATTCGCAAGAATAAAATGTAATATTTAAAAAACACCAACATCATTTTTTTTTAATTTAGAAAGTGTATTTATTTAGTCGAATAAACAAATATTATTCTTCACAAAAGTCGATATCAGAACATTTGTACGCCGTTAGTGCGTGATCGCCACGACCCCTTATCTCGTTAAGAGGTGTTTTTGTTTGATTAAAAGTAAAGACACGTCCGTAGTTTAGCGAACCACCCCAGAAATTCAACCACTTAAGATTCTTATTCAATTACGACTCTGAACATTTATAAAAATGTTCAATCTCAAAGTTTTTTGTACATTTTTGTGGGTGTTATTTATTCCAATATTTATAATTGAATTTAATAATTTTTAATTTATAATTTTTTTAATACAAACCCATCAATAATTATCATGAAAGTTAAAACTACACACTGCTTACTTATAACTGCGAGCCTGCTTATGTACATCGGACGGAGACATTATTTTGCATTCCATGCGCCTTGTGTTTTTTCCGCGAAAACAAAATCTTTAGAAACTTCAACCAATGCCAAACCAGGGGTTGGGTTTTCTCCTCCAAAGTGCTTTCGTCTGCTCCATTCTACTCCTCCAACTATTCGATTCCCAGACTATTCCCCTCTTTTCTTTCTTTTCCTTCCAAGTAAGCATTGCCGGACGTTTCTGGCTTCGCTGCTTAACATAATGAGGGTGTTTTTGTATGTATACGCACCGACACACACTGAGAATTTTATGTGGAGACCTATGTAAGTACATGGCCTGGGAACCTTAGAAGTACATGGACGGATTTAGTATACATTTTACTTATTTGTATATACAAACATACATGTGCGTTGAGTGCTTCCAAACGTGTGCCAAACTTTCTTCGCCCCTAAATTTAGCGGCTAAATTGCGTCGACGTCAAAGGTCCTTTTCAGCAATGTATTTGCGGCTTTGCGCAATCAATTTTCTATGTGTGCGTCAAAATTCTTAAAATCTTTCCGCCATTACAATTTTAATTTTACGATTCCGGGTTAATGCTTGGAAGGCAAACTCACCCCTATCCCAAAACCCGCCCCACCCAACCATGTTGTTCCTTAACGGCGTGCGCGACAGGCTGCGAGACCACGCCCCTTAAATAGCCAGCGAGAATTTTCGTTGGCGTTGAGAAAAATTTCCCTCAACCTAAACTGTACATAGTGTAGATACGCCTTTTCTTAGGAAAAGGAAAGGTAAAGATAGTTCCTAAGTTTCTGAATTCTCCAAGTCGGGCAAAAGTTATAAGCAAATAATGGCAATATGTCAATATTGTAAATAGTCCCTTTGCTGTCCACCTCCATCTCCCTCGCGCTCCCCTTAGCTGAATAACGAATATTAAATAGTCGATAACATCAACTGTACTTTCAATAAAACAAAAATCTTTTAATATTTGTTTCTGTTAAAATTGTTGTATGTGTTTTGTCTACTCCTTGTTTAACGAATTTTTCTATCGTCAGGACATAAAATTGTATTTTAGTTAGTCTTGAGAAATTTGTATATTAAGAACGCCAACGAGTATCAAACACATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCTTTTTGAATGCACTTGCAGTTTGAACTAAAGTAGGATTGCTATCCCTTGCAGAAGGTATAAGGACTTCAGTCAAATGCAATAAAGAAGACTTTTCCTACCCCATAAAGAATATATATTCTTGACCAGCATCACCAGACAAGTCGTTCTAGCCATGTCTGTCTGCTGTGTTCTGTCCGTTTCTACGCAAGCTTGTCTCTCAGTTCTAATGCTATCGGGAATGTCAAAAAATCGTATTTCTATTAATTATAATAGTATACAAGTCGGAACGAACCGGATCAAACATTTATATCTTAAAGTTATCGTGGAAATGATAAAAAAAATATTCTAAATGTTTTTGTGGTCGTATAAGTTTTTCTTTAACCAGTTTCCTAAGTGAATATTGGATCGAAGAAAAACATCTCTTATCAGAAAAAAATGTACTATCATATTTCGGGGAATATGTTTGTTCCATTAAATAATTACGCTTCTAATATTTTCTCATTCTGCACGCTGCATCACATATGTCTGTGGAGATGAGAAAGTGTTCGATATTGATTTTTAAGTTATTTTATGATCGTCTAATTAAAATAAAAACAAGAGAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGTATACCCGTGCACTTATAAGAAATAAACAAAGGTAGTAACACCATGTACAATTTTTAAAGATTGATTCTAGCTTCAAAATAATTATTTCTCTGACCGTTTCTTTGACAGCAATTTGTTAGAGTCGTCTTATTTTATCAAATTTAATTCGAAATTCTTAGAAATACAATAATGATATTGCCAATAGTATAATTATTTGTTTTATATTATTTTCCCATAAGTTTTCCAATCGTTCCTTTAAGAGCTATAAGATATAGTTGACCGATCCGACTGGTTCCGAAAAAAATAAAGAAAATTGTTCAGAATGTTTCACAAACGGACGGACGGACAGAAGGACTTTGCTAAGCCAACTCATCTAGTGATGGCAATCAAGAATATATATTCTTTTGGGGTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTAAAATCATAATACTCTCTTAATAATTCGCTGCAAACGATAGTCACCTGACATAAAAAGAATCAGACCATGCATGAAGCAAAAAAAAAATGTAAACAACCCATAAGTAATTTATTTAAATCAATATTCATGAACGCCCTATTAATAAAGTGTAGTCTAGTTAAACGGCTGCGATGCGAATACACCCACTATTTCTTATATCCTCTGCATTAAACTGACTGACTGGAATTCACTAAGCAGGTTCTTATTCTTCCCAATCTGCTGAAATGGCTCTTAGACTGCAATAAGAGATGGCATGTGCTCTTTAGAATTGACCACTGACCAAATGCGCTAGAAAGCCATGCGCATGCTTTACCAAATCGTCTCGTTGGCATGACCAACCGCTCAGACCTCATCCTTCAGTTAATTGCCATTTTGGGTGGCCCCTATTAGCTCCATCAATGGCAAAGGAATCTCTTGCGGCTGGACAACCTTGTCCTTGAACCCTATAAAAATAATTTATGTACATTTTGCTAATATTCAACTGGACTTGAACCTATTGCAAAGATCCATAGGACACCACTACACGTGTTTGTTCTAGAGGTGGCAGTGCACCATACGTTTTAGTCTATGTGATCTGCAATTCGTTTATGATAGTGCGCATTACCTTGGGTCTGGCTCATTCGCACACAAACTTTTAAATATCGCCCATATGAAAGCTGATATCATAAAATCTATAAAATCTAAAGAGTTGTGATTTCAGATTTAAATTTCCAAGTAGTGCAAGTGTGTTACACGGATGTGCCACAGTTTCATTATAAACAAGAAAGGAAGTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTTTACCCTTGTTGTTAAACTTTCAACTTTAGTAACACCATGTGACATTTCTAAGGATTGTTGCTGGCTTCAATGATGTTACAAAAAATTATTTCATTTTTTATTTTTATAACATCTATATGTTAGAGTAATCCGATTTTTATTCCCTTTCTTGTTTTACCCTTGCAGAGGGTATAATGAATTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAATGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATGTATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCCGTTTCTAAGCAAACTAGTCTCTCAGTTTGAAAGTTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTACAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCGCATAGGAACTATCGGGGAAGAAATTAAAAAAAAAGTTATATCTTTGGTATTTTTTAACATATACCTTTCTATATATAAAAAAAAGTTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTATTTTATTTTTATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACTTATTATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGATAACTTCCTTTCTTGTTTCATATTATTTTCCAATTTTACGATCGTTCCTACGACAGCTATATGATAGTCCTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATACAGAACTAACTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGCTATATGTTAAAAAACACACGATACGACTTATATACTACATGCAATAGAAAGAAGACTTTTAGGAAAGTTTCAGCCAGATAGCTTAAAAAATGAAAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGAACAGACGGACGGACAGACAGACAAGTCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATAAAAACTGAACTTATTATGGCCATCTAACCAATCCGAAGTTCTGTTTATACATAATTCCAAACTAGGTCTAGTGAACCAAGACTCCGTAGTCCAACTCTAAAAAGGTAGGACCGTACCTAAAACCTATATTCCGAAAATTCATAGCATGCTTAAGCTGGAAGTAAAGCGCAAAGTAAATTAGTTTATTTTGAATTCGTTTAAACAGAAGACTAACTTTTGAGCCACTTTGGTACTAATACAGTTCTTAACAAGATTTGAAGCTTTGGGTTAATTTTGTTTTCATAAGGGAATGCTTTTGCTGTCCGAAATCCTCCCGTGAGAACTAATGTCGGACTTATAAAGGGTGGAAACGGTCAGGCGTCTTCACTACTGACAGCGGTCAGTATTTTTTGGGTTTAATTGTCTTTTTGTACCCCAAGAAAAGGAAAACTATGAGAACATTTTCTGGACTAACTGGTTTAGGCTTAGTTATCTTTTCTGGGAAGGAAATGTACCGTAAAACTGGCTTTTTTGCCTTTATTTTATAAATGCGCATTAATCAAGTCGTCGGTACTGAGATAGTGCACAAGAAGTATTCTTAAGGAGATAGGGGGGCTTGGTAAACCTGAAAGTACGAAAAGCACCCCTAAAAGTCACTATCTGACAAGAACAGGCTTTTGATGGTAAATCGCGAAATTTTCGCTGAAGCTGCATTTAAAAACATATGGGTGGGAAGGAAAAGGTTTCCTTTTCTTAGTCTGAGCAAAATACATATGAAGTCAAGCCAATGGGAAACAAGCGTAGTCCTACACATCGTCTTAGCGTTTGCTTGCTATTGGTGAACGCTATTTTCCGCGGTATTCTTGGCGTTTCTCCCTTTCAAGAAATGTAGAATATTTATTTTACTTTTACTACTATGTATTAAAGGCCAAAAATTCTCTGGTGACACGAAAGTTTAAGAAGTATGTTTTTACAAAAACTAATTTATCGCTCGAAAAATATTATAAAATTTTTTAAGGGCATGGCTAATTTACATTTTTTTACATTTATCAAAATAGAAAGTTATTTTCATTGGTTCTAAAAATCTAGTTTAGTAAAAATGTTCAGAACAGTCAAA'..b'ATATTTTTTTTAGGTCAGTCGAAAGGTATTGATGAGAGAAGCAGAATTCAGTTAAAGGTTTGGTCGTAGGCGATACAGATTTTCGTGGATTGTGGGCGTTAAAATGGGAGTGGCACCCCGCTGACTTGACAAACGTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAAGAATCTGCATGCCAAGTCTTATAGTCTTAAAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCAAACGGAGAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAAAATATATTTACTTTATGGGGTCGGTTCCTTCTATCTGTTACATACGTTCCGACATATCTAGTATTCTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAACTATTCCATTATTTCTCTGACCGTTTCTTTGACAGCTGTATGTTAGAGTCGTCTGATTTTCATTAAAATTAATTCGAAAGTTTTAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTTCCCACCAAACTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATCTTGATAAAATTAAATCCGAAATTCAGAACTCATTAAAATATGTTATTTCCAAAGATATAATTTTTATAACCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCATTCCGCATTCCGCTAGGTGGTGCCGTTTCAAATATGAAATTGTGAGTATTCGCTTCGCTGGATAACTCCATCTCTATCACACTACTAATTGAGAATCGGGTATTTGTTAATATTTATTTTCTCTTGTTTTATAGTGTAGCGAGCAGAATGAATAAACAAAGTAGAGTGCTATAGTCCATAGCCTCGACTATCAATTACCCGGCCCTGTTTTAATGTTTCTGCGGTTTGGGCGTTAGAGTTGGCTATCAATAGTTATTGACTTTTGTGTGCGTCAGAGTAAGCGTGGCATGTTCACATAACAAACGTGCACAGCTACGAAGATGAGATAAGCAAACTAAAATCTGAACCCTTTAGCTTTTTGAGATTCCAAGATCACAGCATTCACAAGGACAGACGGACGAACGAAATAAATATACTTAGGGTTGGAGACGCCTCCTCTTAGCCCAAATATAATACAGCATTTACGAGAGATTTTATTTAGTAAAATTAAAAGTCAACATCCTTCCCAAAATTTAATACCTAAACTTTTATAGTAAGAATTCATTTTTTTTTATTTGTTTAGAGCTTGGAAATCTTAGGGGCTAGAAAGTATAACTTTATTTTGATAAACAATCTAGCACGTTTTTCAAAAAATGAGCCTAAATCTTGAGCAGTCTTATACAATAATCCAATAATAATATTTCGAAATCTGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGAGATAGAATTTTGTAACAATATTATTCCGATAAGTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGCTGTCCGATCCGACTGGCTCAAACTTATATACTACCTTCAAGGAATGAAGACTTTGAGGAAAGTTTCAGCCCAATAGCTTAAAAGCTGAGAGACTACTTTGCGTTGAAACGGACGGACATGGCAAGATCGTCTCGCCTAATCAAAAAAATATATATATTATAGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTACGTTTTAAACTTCTGACTAAAATCTAGCCCTTTTAGTTTTCAAGACCTTAGTGTGCAGAAGGACATGAATAGATCGACTGGGCTGGCGAACCTAATCATCCTGTTACATACTTTCTGACAAAATTAGTATACCCTCTTACTTTGCAAGTAATGGTAACAACAAATCGGGCAGAGAAACGTCCAAAGTTCGTCCAACACTATTAGCATTTTTAGTGTTTTAAGCCTTTTCTAGAATAGGTCGGAATTACGAAGACTATCGAACTCTTAAGACCTACTAACTCTTGCTTGGTTTGTTATAATAAGAAAGTATTTTTACCACCACATACATAACACACATTTTAAGATAGGCACTTGCCAAGCTGCCCTCGTTTTCAGAATGAATGTATTTATTTTTTCTCTACACCATTTTGTTTGGTCCGCAGAAATAGGAGTCTCCCATTTGTTCTCCTTTTTATTATTTTTGTTTTTGTAATTCCCAAACTCTTCCACAAAATGAGGGTGGATTTATATTGTGGATGGTTCGAACGAATGCTCGGCCAACCATTTTGTTTCGCTCACTCCCAGAGTACCCACCCCCATCAGCACCAACATAATTAGATGCGGCATCTTAAAAAAGCAGCAATCGGTGTCTTTCTGTGCAAAATTTACAATAATTTGATTCATATATTTACAAAAAATAAAATAAAGTAATAAAAGAAGGCCATTCTCTCATCCCATTAAATATTTCCTTCTGATATCCTTAATGCATATTTTAAAATAAAATAGATGCTGTTAGACGCTGCTAGATGCCTAAGACTTGATTTTTATATTTTATTTTTGTTTTAATTTTGTTTGTTGAAGATGAGATTGTCACTATGTTTTTGTTTGATATAGGAAGTTTTTGTTATATATTTAAACAAATCATGTTAGAAAAGCGTACATTTCAAAATACCTTTCTAAAAACATGTAGCTTTAGTAGTTCGTAAGTTACTGGTGTACAAAATGTAGGTCTATTTAAGATCATCTAAAATTTCCAGGACCCTAAAATTTAGTGTAAGTGTCAGATGCTCTGAACTGGTAAATGTGGCCATTGTCGTATGTCAAAGCTAGTTTTTTAAATTTCCAGAACCTTCAAATAGAGTTTGGATACGCACAAAAAAAGGTCAATTCTCAGGCAGTATAAGATGCTCTGAACTAGTAAACGTGGCCATTTTTGTTGACTAACAACTTTGACAAGGGTATTTTTACAAGAATGTGCCGTATTCAAAAAGTTAAGGAATGTAAAAGCCTATACACCGTAAAATTTAATTCGAAATCGTCAGAGCCGTTTTTAGAAAATCGAAAAAGGGTCTTGGTATCCAATTCTGTTAGTTTTTGCTACTTTTCTATTGATGTATCACTCGAAACAATCGGACGATTACTGTAGATTTTCGTTTCTTCATGTATATATAGTAGTCGCCTCCGCACACCCTCCTGGTGCGCTTCTACGTGGATTGCCGTCCACAATGATAATATGTCAAGAAAAACACCGAAGCTTTAATTTGTTATAATTATTTTCCTGTGGCAGCTGGTCGTCCGATTTGGAAACGTCTCCGGGTTGGAAACGTCTCCTTCCCTGTGTTGTAAACTTCCGACTGAAATTATACTACTTCGAGATGTTTTACCTCATGAAAAGGGCTACTCCTTATTTTCCTTTTTCAAAAAAGCTGACAAATCAAGAAAAGAAAGAAACAAATTTATATATTGTGCGAGTAGTTTTTTTTGAAAGTTTGATGCCTTTGCGAACCACCTAAAGTTTAAAACAAAAAATTTTGTTTCTCGCATTTATTAATTTTGTACAGAAAACCACTATATATGATGGTGATCTCATTTGACATTAAAAGTCCTGTCTTATGAAAATATGTATACGACAATAATACATAATGTGATTTATTACCGTATGACCGAACCCTTAGTTAAAGTAAAGTTTTAAATTTAAACCTTTAACTTTCCTTTCAGTTTCAAACAAAGAGTGCCTCGACTATCAGATACCCGTTTGACAAGAAATTTGAAGATAAGCTGTGGAAAATCAACTGTTTTCGGGATTGTAGTGCTAATTGATATGACAGTTTAGGGACCAGATGAAGCGTAATCAATTCCTGCAGCCAGATCCCGCCGGGATATGAAATATAGTGGATAAAAATGTATTTTATTTATATTGAGGCGAACAACACACATACACAAATTTATTGGTAAAATTGACCAATTGTTAATTATGGCCAAAAAATAGTTACTATTACGTAATACTACGAAAAATAGTTATGTTCTTATAAAAATATGTACAATTAAATAGCTATTTTGGGTGAATTTAATATTATATTACTTATAGATAACAATAGAAAAATTCACTCAAAATAAAAACAGTTGTTTAATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/4e6/ac1/21/scaffold_25-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTCCTTTTTTTATAAGTACATGACTTTTAGATTGTACGTCACTTAATTTATGTATACGGCGTGTTAATTTATTAGCAAAATAAAAATATTTTGTCAAAACTGCATCTTAAATTTTACACAGTTACTTGCTTGCATGGATGTTTGTTGAAGACTTTACAAAAAGTTTTGTTTAAAATTAAGTGTTCATTTTTTAGAGTTTTGCTTGGAAGTCTAGGTAGCCGAGACACCAAATCCAATTGGGAATTATAAACAACTTATTGAAGGATTGGTAATGTTATTGTTGCATACTTTTGTGTGGAAGATTTAACGTTAGGATAAATATTTGTAATAGTTAATGAACTATTAAAATAGAGAATACACATATGTTTTGTGGTATTAAAATTAAATATCAAACAAATCAAGAAAATACATACACAATCCTTTTTATTCCTCTGGAGAAGGTATAACGATTTCAGTCAGAAGTTCGCAATGCAGTGAAGGAAACGTTTCCTACCTCATATACTATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTTGATATAGATCCGTCTGTCCGGCTGTCGGTCTCAAACTACTACCACATATGTCGTAAAGAGCTGGCTCGGAAAACTATATCGTATAGTTCCTAATTAAATAATCAAACAAGGAAGTACAAAAATGTAAAATAAATATAGTTTTGGGGTTTGACATATTAACTTCTAAATAACTAACAACTATTGGCAAACCTTTATGGTAGTAAATTTAAATGTGACGGTAGTTTAATATTTCTTTGATTAGTTTTTAATTCCCTAAAAGTCGGACATCTCTTCACTTACCATGCTGCCACGACCGAAAGACCTGAAAAGCTAATTATAATTATTTTACTATCTGCATTGGTCACTTCTATAAAGCTTATCTTTTTATATGTATATAAGCAAACAAAATTAATCCTAATTACACTTCTCAAACTCTTTAAGTCTCACAAACTCTCGCTAAATCAAGAAAAACTAAGGAATCTAAGTAGGAGATTCGAAGCCTTTAGCTCAGATAGTTTCGGAGTTGCGTTTTCCCAGAGAGGCGGACATGGATAGATCAACTCTGTTTATCATGACCAAGAAAATAAATTGGTCGACACCGACAGCTTCAAAAACGTAACTGAAATATCCTTTTAGGTCTGCTAAAAAATTTTGGGAGTCCCGAATTTTTTGGCAAATAAAATAACATCTTTAAACAGGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATATCTTTGCAGTTATAAGAAATCAGCAACTTTAGTAATACCATGTGACATTTTTTAGTATTGTAGCTGACTTCAGTGATAGTAAAAAAAAATCATTTCATTATTTTTTTCAGACCATTTTTTTACATCTATATTATTTATTAATTAAATTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCTATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATTATTTGTTTCATATTACTATCCCGCCAATTTTGCGATCGTTTCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTATTTTGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATATAAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTTTTAATTTTTCTCGATAGTTCCTATATATATATATAGATATATATACTACCTGTAATAGAAAGACGACTTTTATGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCATATACGGACAGACGGACATGGCTTGATCGACTCGTCTAGTGACGTTGATCAAGAATATATATACTTTAAAGGGTCGGAAAAGTCTCCTTCATTTCAAACTTCTGACTGATATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAACAAGATTTTCTTCTTTCCAAAATGAAAATGTTTGTCACTTTTCATTTCGGGAAGAAGAAAATCTTGTTTTTGGAATAACTTTTAAGCGGGACATCGGATTTCAACAAATGAGGTGTCATTCGACGCGTATTCTCAGTATAAAGGAAAAAATAATAAAAAAAAAAAATAATAATAAAAAAGCGCTTCGGCACTACGTGTACTGCCGTCCACAGCGATGTAGCCATTTATAGCTGTTTTCCAAAGCGGTAGAACCAATGTTTCTTATATTGAGCTGTTTAACATCGTCTAGAATTTTCAGGACTCTAAATAACGTTTTGGGACAAACTGGCACCCTGACCAACAAAATAATAATTTAATTTTGAGAAGAGCTCCAAAATCTTGTTTTGCATATTGTATTAAACGGAGCATCCAAATTTGACAGCCGCATATTTAAGTGAGAATACAACTAGGTTTAAAGCGGTGGTAGTTATCCCCACCGCCCCCAACAGATTCAAATTTCCAATTTTTTTTTACATTTTCACCACTTTTTCTCTCAAACCTATTAGTTGCAATTCTTTACTTTTGGCAATACCTTTCGATTGATGTATCACTCGAAACAATCGGACGATTATTATAGATTTTCATTTCTTCGTGTACATATACAGTAGTCGCCTTCGCACATCCTCCTAGTGCGCTTCGTCACTACGTGGACTGCCATCCACAGTGATAATATTGGTAATACATTTTTTGTATTTTTATGAATTTCGAATTTAATTTACTAAGCTCTAACATGTAGCTGCACAGAAACGGTCAAAGAAATAATGAAATAATTATAATTATAAAACTACCTTATCTAACTTCCTTTCTTGTTATTTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCAATCTATCCATGACCGGCTTTCTGCCTGTCTGTGCGTCCATATCAACAAAATTGTAAAAAGTGTAAATTATTATTGAAGACGGACAGTCATTAAAAATCTTTAGGCAAATAAAGGAATCGCCGCTACGTGTCAAAGTTTCAAGGTGCGCAAACTTATCATCGCCCATTTTCCTCGCACTTCCTTGAGCTAAGTAGCTGGTTTATTCTTGTGTATATTTTGCCCAAAATTGATGCATACCAAAGGTTTTGTTTTTCATTATATTTTTAATGGAAGAATTTACAGTTCTCTTAACTTTGATTACAATTAAGTTGAGAGTAATATATATTAATAGCGTTTTACACATGTATAGTTCCTTAATTGCATTTAACACAGAGAGCAGCATAATAATTAATAACAGAAAAAAGCTGCATATAACTAAAATTTCGATGTTTATTTATTTTTACATATTCATGAGACAATTACCTATCATGTTCAAATATGTATCGAAATCTGTCTAGTCGAGTGGATGCTATATTTACCTCATATGTGACTTGTCTAAATGGTGCAAAATTATATATTTTATTTCATACGTTCTTATTTGCATTTACAAATAATTATTTTCTCCTTTGCAAAAACATCTACGGTAAAATAAGCTTAGTGAAAATCTTATTTAGAGATTGATGTCTTATCTTGGAGACTAGTAAACAATACATGGCGAGGGCGGCAGATCTATTTGTATTCATTTGTTCACAAAGAACGCTGGAGTTGGAGATAAGTTGGGCGGCATGGTTAACATGTTACTCTGCTGCTGCTGATGCATCTGCTGTTGTTGCTGACTCCTGGTGTTTGTTGCGTATAATTGCTGCTGGAAACTGTGATATTGCTGTGCGTACTTCAGATCATTTGACGAGGGGCCTACGAAATTAATGCCAGAAACTCCGTTCGTTGGAACGACATTTCCAGCAGTGGGCATTAAATTATTATTGCTGGGCCCAATTAATGTCTGACCCTGGCCCTGCCCTTGACCTTGACCCTGGAGCTGGATCTGTCCTTGTGAAACTGCAGGTCCAACTCCCAATCCAGTTTGATTTTGACATAATCCGGTGGGTATGTTTTTTAGGTGTTGCGGCTTAGCCTGATTAGACTGTTGTGATGCAGTAAACATAGGCGGTCCCGTGCTGTTGCACGTAGCGTTATTAAAAAACGCAGAGGTATCTCCGACGCAG'..b'CAACGGAAAGAGCAGATGAGGACCCCGTTCCGCAACCGCTTCCAGAAGCGATTCCTTTCGCTTTAATAGATCCTGTTTCTGTTGAGATATGATCAAACGCTATAATTGATAGCCTGATGGTAAGAATGCTCTCGGCAAATCTGGTTTTTTTTAGTAATACACGCAGCTTATAGCGCCCCTAACGGCTTGTGGTGTCATCTCAATTGAATTTGAAATATTGATTATTATTTGGTTAAACGCAGGTGGGTCTCAGTTTTAAAAGCGTTTTTGGGCGTTAGAGTAGGAAGTAAATAATGAAGGGGAAAAGGGAAGCAAAAAGCTCCAAAATTTGCAGGCCAAATTCCTACATTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGTGATCATACGAAAAGACGGTCTACTCAGCTTAATTGTAATATTATTTGCTAATATGTCATGACCTAGTCAATAAAAAAAGTCTTGGTACCAAATTTAAAGAGAAAAATATTACCTTTTTGTTGTCTAATAGTTGTTTTCTTCTGACTACGTAACAGATATCCAATTTTTCGGCTACATGTAATAGGAACAGTAAACATTAACATTAATGTGTTAAACTAACATAAAACTTGTTGGCGTCACAGTTTGTAGACGTTTGAATGGCGTGGCTAACATTTTTTACAATACATTTCTGTTGATTTTTTGTAACATAAAACTTTTGGGATCACAAGGTCGTTAGAGTATATCTGTCATTTTTCACTAACAAACTTGCTCTGCGTACAAAGCCAAGGAATCTTCGTATTAAATCGTAACCCTCCCTCTAAGCGTTACCCATATAGACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTAGTGATTCTGATCAAGAATATATTTATTTTTTTTAGGTCGGAAACACCATATTATTCCTATTTAAATTTATTTAAAAGGTATAAGCAATTAATAATTTATATTTTGCAAATTCAATTGGCTAATACGCCACCAAGCCGCTAGTCGCTTTATACTTGACTAGGTGTGTTAATTAAAAAAAAACAGATTTGATCAATATAGCTCAGCCCCCTTCGCAATTCTTTCAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGTCAATCGACTAAAACGTTTCTTGTTTTATATAGTATAACATGTAGCTAAAAGCCCAGGTTAAAACAAGAGAAACGTTATATATTTTAAGCCTTAAATAAATCATTTTGGAAAACAATATTACTAAAGACCAAAGCTGTTCTTGGTATTTAAGCTAGAGTAAATCTAAAGACCGGCTTACCGACATCCTCATCCTTTACACTGTTTTTCTTTTTCTTAGCATGCTCGTCACTATCGACCAATTGAGAAATTCCCATTGTAGCAGGCACACTACTGCTATTCGAGAGTTCACTGGTATTGTTCGGTGAGGCAGCCAGGCACGAGTTAACGCTGTTTGAGGAGTTCTGCCTCAGTGTCGGTGTACCAACAGCAGACGTCAAGGAAGAAGATTGTCCCTCGGATGGAATATTTGCAACTCCTCCGGCTCCGCTGCTGCCAGCCGAAGGGCCCACACCTTTATCACTACTTGAAAGTCCGTTTTTCTCTGCTCCTTCGTCTGGCATAACTTTTATTTGATCTGGAAGCACAGACAATTGGTATGGGACTTCGTAAAGGAAAAGAAAGGTACAAGACTTACCCGGAGACAGAGTGGAACAGGTTTCATTTTTAGTGGTCTTTGGAGAGCTCCTGCTGGTGCCGGCGACCCCATTCCCGATCCCTACTCCAGATGCACTTGTTGAAGCATCGGCGTTCGGATGCGACTGTGACTGTGTTTGGGCTGGACTGTGGGGCATTGTTGTCGAGAGCATTATGGTCAAGCCTTCATGGACCAAATGTATGTCTCCCTACAAATCGAACTTTCTTAGACCGCGGTGGTGTCTAAATGCTCGAGAACTTTAAGATAGCCATTGTTCTGGCTGTTTGGGGTTTCTGGTAGTTGGAAAAAAGTACATTAACTACTGACCGCACGCACACTATCGAACTTATGCGTGAGTTTTCCAATCCAAAATTTTACAGAAAACAGAGCACCATGTCTCAGTTTCGATCATTATAAGCGCTAGCAGTGGTCTATGACTTATTAATATGCTTTAAAATTCTTTTGTATTCAACTTGTGCAGTTTCACAATTTTATGTATACATATGTATGTTATCAACACGTTTAAACAACTTATTCGATCTTAGTTCAGTACGTAAAAATGATAAATCTCGTATTTTGCACACGGGCTTTAAATATTCACTGTCATAATTGGCAAAGCTCCTTGTAAAAACAAATTCATGTGCATAACTATCGAAAAAGTAAAATATAAAAATAAGAAATTACTGTCTTTAAGAGTGACCAGCCCACGAAAATGTACATAAACCAGGGTTGCTGATATACATCAAAATATCGATATTTGTTTCTAATAATTTATGTCGTGACATTTTTTGTCCAAATATCGAAATTGAAATAATTGACTGGTTAGCCGTGAGAAAAATGAATGTGAACTCGTATAATAAGAACAACAAAAAATACACAGCAAAATGCAAATAATAAATAATAGCCATAATTTCAAATCGCGTTCCCAACCTCCTCAAACCATTTTAATGAACGTATGTTGGACAGTTGTTTGTACCCTAGTTCATTTATATTTTATTTTCAGAAATGTCAGCAATTTAACTTTTTATTTCTTTGTATTTTTAAGTTTTGTAACGCAGTCTAACCCGATACTTGGTATTTGGAAGAAAAAAACCGTTCTTTTATCCTTTTCTCAATTCGTTCGAAATGGTTGGGATATTGACAAACGAAAGTCGAATGGTAGATGGTGGATGGATCTTTGTGGGAAGCCGCTATTAGAAGCTGCAGAAAAACGCCTGTCTGAACAGATTTATCTGGAATTAATAAGTGTAAAAGCTTATGCACACTGTCACTTTTTGTCGCTGTTGCAATTTAAGGCGGTATGGCATCAGCACTCCAAAGGCAGTGCAAAATGAGTTGTTGCTAAAAAAAAATATGATAAACAACGCAAAACTAAAAACAATTTGACCGCTAGTGAATTGTTTCCAGCGCCAAATTATTTCCTTATCAAATTAATTATGGTTGAGATTTCAATCTAGGCAAGCGGGTAAATAGAATTTCCACGAGCTAGAACCGTTTGGACCATTATGAGAATTTTTAAGCGGCTGCAATGTAATCAGATGATATTAGTGATGTGTCAAAAGTCTTTATTTCTATTCCATAGCTCGCCTTTCATCGGAAGAACCGTCTTGGTTAGGTTTGTGGTATTGGTCTAGTCTAGTGTAAAAAATTATAAAACCTTAAACAAAATATTTATTTTTATATTTTTCCCAGGCACTCGTGTGCCAATGGTAAAATAAACACGGTTAAGTCAATAGCGTCATAACTGCACCTTTAATTGTAACCTTGAAGCTACAGAGTTTGTCTTTAGATTTAAAAGTTTAAGTACATGATCATCTTTATAAGTCAAAAAAATTGTATCATATAAATAATCAGAAGAATTCGGATTTCCTTTTTCCTAGAATATTACCCAAAAATGACCAAAAATTAAATAATTATCGCATTTTATTTGATTTATTTTGAACATTTTTCATTAAGTTTTAAACTTATTTTATGCTTATTTTTTTTAATTATAAAAGGATACTTGTTTAAAGCGCATGTTGTACAAAATAAAAGAAAACAAGGAAGAACGCTGTAGGCGAGTGCCTTGACTATCAGATAACTGGTACTCAGCTTAAAAGACCAGATATATAAGCAGCAAAGCTTCGCTGCCGGCTTCTTATCCGGAAAAAATAAGACAATTTTCACGACAGTGCTGTCAACATTTTGCAAAGACGACATGTTTTTATAATTTTTCTCAATAACTAAAACTGTTTAAACATAACATTTTTACCAAAAGTAATATGTATTTTTCACTACAATACTAACTACCGTACTATAAATAATTCG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAGGTTGCTTAGGTTTGCAGTGCAAACTATAAAATCATAAAATTACTGTGTAGCCAAATTCTGTTAAATATGGCCTCGACCATCTGATACCCGTTACTCAGCCGGGTTAAGGGAGAGAGAGTGAGAATGCCACCAGCAAAGCAACAACTTTTAGAATTGCACACTGCTACAACTGCACTTAAAGAAAATAACCACAAATTTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTAAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCTAAAAGTATATATATTCTTGTTCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCGTGTAAGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGAAAACTAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAATATTATTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCGTGTTTTTTAACATTTAACCTCCTACGCTCGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATATTGAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCCGAAAATTGGTGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGTTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATAGGGAGAATATACATTTTTATATTTTTGAGAATTTTGAATTAAATTTAATAAAATTATTGATTTTTTTTTATAATTGCAAGGGTATACAAACTTCTGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCTTAAAATAAAATACGCTTTTTCCTAGTGACATCTTATAATAATAAGAAAACACAAAGACGGCGATGTAATGTAGAAGGTTCTTGTTTGATCTCTTATTTATCAACTTTTTTTCTATCCTCTACTTAAGCTCGTGGCTTATTTTGTTAAGGCCAATTGGAACTGATATAATTACTGCTATTTAACTGTAAGTTACAAATTAGAATTATGAAAACCAAATAATTAACCATTCTAAGAAAAGCATCAAATTCGCTAACGGTTTCCAACACCCAGAAAAGTTAAGAACAAAAACAAGAAAGGATGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTCGCAGTTATAAGAAATAATCAATTTTAGTAAATAAATTTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTCCTGTCTATATAATATAGTCATGCGATTTTGATAAAATCTAACTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTGAGAAGGTTATATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTATATATTATTTTACCACCAATTTTCAGATCGTTCTGACTGAGATAACCATACCCTCTGCAAGGGTATAACAAGAAAGAACGCTATAGTCGACTTCGACGGGCGGTTGGTGGGTGTTAAAGCGGCTAGTGATCCTAATCAAGAATACATATATCTGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTTCTTCTCAGTTTGAAAAAAACGTAGAAAATTGAGAGCATGAGGAGTTAAAGACGGGATGTCCTAATATTATCGGCTGTTATCGAAGTGAGCCTCTAATTATTTTTTCGTTTTGTTAGATGAATGTAAATGGAATAAAAACCGTATATACATTTTTAAAGCCGTCAAAACGAATATCTTCTTTTCCCCTTTGCTCCCTTAAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGACGCACTTAACTATAGCATTATTCCTCGTTTTTGTTGACAATTGTTCATTATTGTTCAAGAATTGATTCAAGTAGCTGGCCAACGGTAACATCTGGTGTTTTCTTGGGTTTTAGGTTTATAATATGCATAATTAAAATTGTTTCTTGTTACTCTTCCTATAATGAATATATATTGATTAATATTATTTTAACAATTTATTTTTACTGTCATGGCACCAGGAGAGTTTGAGATGGCGATTTCTGTAAATGTATACCCGGAGAATTAAAAATCTGATTTGATAGTGATATGAAAGGTAACGCAAAACTAAGAATATGGCTCATTAACCCTTAAGAAATTTTATTTAGTTTTTGAGAAAGAACAGTAAAAGTATTACATCCTTACGAGCTTATTTAGAGCTGATAAGTAATCAAAGTTTCGGACCATCGATGTTTTTGAACGTAAACATCGATGAAACATCGATCTTTTCAGTTAAAGCATAAAATCAACAGTCAACATGTTTATTTATAGAGATCATGTGGTTTGTTCTTGTTATAAAACAAGACCCTATCAACGATATTTGATTTTTAAGCAGATATCCTGTCGGATTCAATCTGGTTGCATATCGACATATTGCTTTCTCTGTACTTCTTGAAGATCTCTTTCAAACCAGCGACGTTTTCTTCTGGGGTTTTGTTCTATGCTGTATTTTACTCTTCTTATCTCTTTATCGCTAGATAATGTTATTAAAATAGTAAAACAACAACAACAAACTTAATGGGTACATAAAAATTGCCGACACTTTAATGTTTTTGCATACTCGTGAATACACTTTAACTTGTATTTAGAATTTGACAAAACTGAAATATGCGTGACAAAAACTAATTTTACTTACACTTTGTCCTTAATAAAGACATATTAAAAACTATCGATAGTGGCCAAAGAAACATCGGTGCATAAAAAATGCATGAAACGTCGATGGTATCGATAGTGGCATCGATTGTATTCCAGCTTTGAGGCAAAGCGTCGCGACGATCATGCTCAACAGTATATATAGGTTTTAGTGAATAAAAATGCTTGTACATTTCATTAAATATAATTATTTCTAAAAAAAAAAGATTAAAACGTTGCCCCCCTCATTTTTTTTGGATAGGAAAACATTGTAACTGAAATGGAAGGGTATCGTCAATAGCTATCGCTATTGACGGTTGCCAAAAAGTCATAGAAAAAGGTATAGATCTTTTAAAGACAATTCAATTATTTCCATAATACATAATTAAAACTTAGTTGTTCAAAACCGGTAAAAGTGGATGTCTTTGTTGTATAATAACTTACAAAAGTGATATTCTTAACAATATGTTAACTATGCCAAATGTTGATAAATCTTTAAAGCTACTTGCGGCCTTTCATCTTAATTGAAACATTTCTCTCAAGCTTTTTGAATTTTAAGAAGCTAGCTTCGGCGAGATTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAAATCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAAAGCTATTTCCAAGAGTAAACTATAATTTGTTTCATATTATTTTTCCACCAATTTTTCGAACGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCATCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTTAAAAACAATTAAAATTTGTTATATGTTCTTATGGGACCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCTATAGGCTATAAGATATAGCCTATAAGATAAGATATAACACCTGCAATAGAAAGTAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCTGGTAGCTTTAAAACTGAGAGTCTAGAAACGGACAGACAGACTGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGATTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGAGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTTAAATCATTATACCCTTTGCAAGGGTATTAAAATCGATGCTTTCCTTTTAGTTTTGCGATATATCTCGGTTGGTGTATACTACCCCAGTCGAAGCAGAGCAGATGTTTAATTGTGCAGCTATACGGTAGTTGCCTTCGCACACTCTCCCAGTGCGCTGCCAGAATAAAAATTTACACAGAAATGAACTGTTTTTATGCCCATAGATTGACCACCCCCACTCTAACGACCAAAAAATGCAACATGCTGTATAAGCCGCTAGGTGGCCTCGCATTCTTGAAAAAACGTCGGAAACGTCACGAGGCATTTGACTACAGCGTTCTAATTTTTATG'..b'GAAAATTAGTGCATGTAATATTGGCGGGCAATAGTTTTTCAACGCTGTATATTAATTCTATTTTCTCATAAGTCTGCGATTAACGCTCTATGGCGAAGCCCGTATGCGTAAGGTACATTTTTGGGCAGTTTTTACGCATATTCCATTTTTATAGCGGTCATCCTAACATTTTAGATTAATTTTTATTAATTAAGTTGAGTAACGGGTATATAAGAGTCGAGACACTCTCGCTTTTTCGTTTTGCTTATCAATACGAAATCCGCGGCCGCATTGTTGAAGCTAGAGAGTATTTCTATAATCAAGCCCTTATGAAGCCCATATTTGATTCAGCCGATTGCCACGCCCATTCTGACGTCCACAAATCGCTCACGTTTGAGGCGAACAACTTTTTGAATTTTTTAACATTTATTTTATTTGTCAATATCTATCGACGTTTCGAATGTGGAGTCAATAAGTAAAGGCTGAGGAACGGGAATATTGTACTTTCTCTGTCAATTGTAGTGATAAGGATCAATAGCAGAGCCAATCTTGCGATGTCCAGTCTGACTGCTTGAAAGCTGTGATCTTGGAACTATAATTAAGTTTATTTTTCAGATTTCGATTTCTTAGCTTTCTAAGCAACTCAAGTTTGTATACGATTGTACAAAATGAGGAATGCGTAAATGAAAAGTAAATAAAAACGTAAACATCGAAACACCGCCTCTACTTGAAGGTATATTTATTTCGAGTTAATCGACCATTAGAGGTTTCTCTTGTTTTAATTTGTATCACATAAATTTGGTCTAAAACTTCAATATTCGAAAGGTTTTTGGATCTTTAGGCAACAATAATAGACATAGAAATTAGTCGAAATACGAAAACATGTTGCTAGGATCTATAGTATGCGTCACAATTTATTCAGAGCTGCAACGTAATTAATTCCTTTACATCTTACTATAATTCGTGTTTTCACCAACATTTTCAACATTTCAGATGTTACATTCGAGACTGGTTTTAACATGTCGACTACTGTGACCAACGAAGCCACTCCGGATACCAGCTATGCTGCGGCGTCATCTGCGGCATGCGTCTCTGCAGTTCCTGATGTCAGTATATTTTCACCGAGTTCTCCCTCCAGTTGCGCGACACCGGGTGTCAAGTCTTTGGGTCACCATGCATCTCCAGGCCTAAATAACTTTGTTTCGGGTACCCCTGTTCCAACTACAGTATTCAAGTGCAATCTCTGCGAATACTTCGTTCAATCAAAAACCGACATGGCGTCTCATATTGAGACTGATCACCCATCTGCTGAGAGTGATGACTTTATAAGTATACCAACCAACACGGCCGCTCTGCAGGCTTTCCAAACAGCTGTTGCAGCAGCTGCTTTGGCTGCGGTGCAACATCGGTGTGCCGCTATTAATGCTCCGACACAGGAGAGCGGTCAAGCAGACAAGGACTTGGTCGCGAATGACAGTGACGGCCCAATAGCTATTAAACGGGAGCGTCTTGAAGAAGAGGATGATCCCATGACAGGTATAGAGGATACCAAAGAGGTTACCCACCAGGCAACATCTTCTTCAACTTCAGAGTCGCCAAAAGTCCTGGAAACTCAAGTCGGGGTACAGTGTCCCCTGTGCCTAGAAAACCATTTTCGGGAAAAGATATACCTAGAGGCCCATTTGACAAACGTTCACAGCGTTACCAAAGATGGTCTTTCTCGGCTCTTGCTGCTAGTGGATCAGAAAGCCTGGACAAATGAAAGCGAGATCACTGATGTACCAAGCATAGCACCTCAAGCTCCTTACCCTAATACCGAGAAGGAAGAGGCAGCACCGTCACCTAGTGAGAGCCCCTCCAGTGCCAACGCAATTAAGTGCACTACAGCAAATAACTCAAGCCTTCCAGTGGGAATGCAAGGACTTTCCTGCCAGCAGTGTGAGGCAAGCTTTAAGCACGAGGAACAGCTGCTTCAGCATGCGCAACAGAACCAACATTTCTCTTCACAAAATGGAGAGTATTTGTGTCTTGCAGCAAGCCACATAAGTCGTCCGTGTCATATGACTTTTAGAACCATCTCAGCTATGATCACCCACTTCCAAGACTCACACATGAGCCTAGTTATCTCCGAGCGCCATGTCTATAAGTATCGATGCAAACAGTGTTCATTGGCGTTCAAAACTCAAGAAAAGCTTACCACGCACATGCTCTACCACACAATGCGGGATGCCACAAAATGCTCTATTTGTCAACGCAACTTTCGCAGTACGCAGGCGCTTCAGAAGCACATGGAACAGGCGCACTCAGAAGATAGAGCTCCATCAGGCAGGTCAAGCAGTCCACAGATGCCAACATTGAGTTCTGAGGAAGCACACAAGCTTCCTCTAGAGGAGACACATGCGTCAGAAAGAGGTATAAATATTTCTAACAACATTTTGGAACTCCATTAAATCAACCTTTGTTGATTTGTTTCAGAAGTTACCGGTAAAAATGTGTCACCGCTTCGATTGGACTCGCAACAGAACAAGGAAGTAAGGCTTTCAACACCTAGCCCAATGTCTGTGGATTCTCAGGCCCAACAGCAATACCTGGCTACCTTTGCAGCTCTGCTCAAGCAGCAGCAGGGTAACTCAGAAACTGTTGGCCTCCATTCCGAAGCGTTGTCCCTATCTGGAGAGTTTTCCCAACATCTGCAGGTATGGCTGTTTCAAGGAACTTTTACCAGTAAAGGTCATGACACTAATAAATATTTATTTCAGGGTCTGCAAAATCTGCACAACCTTCAGAATATGCAACAGCAGTTCGGCGCCGTTGCTGCTGCATCGGGACTACCGATAAATCCGGTAGATATGCTTAATCTAATGCAATTTCATCACCTGATGTCCCTGAACTTCATGAACCTGGCTCCCCCTTTGGTATTCGGTGGCGGTGCCGCCGGAAGCAATGCAGATCCCGCGTCATCAGCCCAAAATAACATCATTACCTCGTCCTCCATAGCAGCTTCTTCAGGGCTTGCTGATGTTCAGCTCACCAGTGGGGTAAACGCTTTGCCGGTAGACTCTTCTAAAGCTACTTTAGCTCAACCTCAGCACAACGTCAACTCGAACAATCAGGTACTTTATTGAGAGTAGATAATTTTAACATATATCTACATAGAAATGTCAATCTGCCTTAGAAAATAGAATTTTAAATACATCTGATTAAATCACAATTTGTATCATTATTGTCACATGTTTTAAGCATTCCGTAATCCGTACATAGCTAGCAGATAATCATAAAACATTTTAAGAAACACGTCTATTATCTTAATTTTAAAGTCTTAGCCTTCTCATTTTATAATCTTTTTAATTTTAACAGCTGGCCAGCAACCAAAAGCGAGCACGCACGCGAATCACAGATGATCAGTTAAAGATTTTACGAGCACATTTCGACATAAATAACTCCCCCAGCGAAGAGAGCATTATGGAAATGTCACAGAAAGCAAATCTACCAATGAAAGTAAGACCTCGAAAGCTATCAATAAAACACTGATAACAACATTCCTTATTGCAGGTGGTTAAACACTGGTTCCGAAACACGCTGTTTAAGGAAAGACAACGCAATAAAGACTCTCCCTACAATTTTAATAATCCACCGTCGACTACTCTTAATTTGGAAGAGTATGAACGTACAGGTCAGGCCAAAGTTACACCTTTAAATGATGCCAGTAGCGTCTCATTATCAGCGGCAATGACCACATCAACGATTTCATCGGCACCATCTACAAACACCAATTTAAGTTCTATAGAAACGGCAACTACAAGAGTAAACACTGTTGGAAAATCAATGCAAACAGCGCCTGTCTTATTCCCTGCTACCGTCCCAATCTCAACACCTGTATCTCGCCCAGAATCAACAAACTCGAGCGGCAATGTATCCGATTATTTAAGTAACAACTTGTTTTTTGGACAGCACGGGGGCAAGGAGCAGGGACTGCTATATCCTGTGGAAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GACAAATAAAGTCAGAGCCTCAGGACGATATGATTGGCTCAAATGATTTTGCATTCCAGACAAAGCAGCACTCAAACTTTAGCTTTATAAAGCAGCAACACGAACTTTTGGATCCCCATGAACAATCCATTACGACTCAAGACACGGATATGTCGCAGGACCAATCCTTACTTGCCGGCTCTTCGCTTTCGGCTCACTGTCAAGGTCAACAGCAAACAAATATTTTTGAAACAAAATCGGAAAGTGAAAGCTCCGACGTAATATCGCGCCCTCCTACTCCAAACAGTGGAGCTGCAGGAAGTCTTTACGGCACCATGAATGATTTAATAAATCAGCAATTGGAAAACATGGGCAGTAACATGGGGCCACCAAAAAAGCTCCAGATTGTTGGAAAAACATATGACAAGACTTCAACGCCAATTTCAAGCTCGATCAGTGCTAGCACCCAGTTTGAAAGTAACTCTTCGAACTCGTCAAGTTCCTCATCATCGACATCGGGTGGAAAGCGGGCTAATCGCACACGTTTCACAGACTATCAAATAAAGGTTTTACAGGAGTTTTTCGAGAATAATTCATACCCAAAAGACAGTGATCTCGAGTATTTAAGTAAGCTTTTGTTGCTCTCTCCTCGAGTTATAGTAGTTTGGTTTCAAAATGCCAGACAAAAGCAGCGTAAGATTTACGAAAACCAGCCGAACAATTCGTTGTTTGAAAATGAGGAGACAAAAAAACAAAACATTAACTATGCGTGCAAAAAGTGTAGTTTGGTGTTTCAACGTTACTACGAGTTAATACGTCATCAGAAAAATCACTGCTTTAAGGAGGAGAATAACAAAAAGTCAGCTAAGGCTCAAATCGCTGCTGCTCAAATAGCACAGAATTTAAGCTCAGAAGATTCAAATTCCTCCATGGATATACACCATGTTGGCATATGTCCACCAGGATCAACAGTAGTTGCTCAAGCCTTGGCAACGGTTGGTTCTGCAGCTCCATTGGCGGGACAGTACGCACAGCAATCATTTGGCGCTTTACCCTCACCACAGCATTTATTCATCAAATCTTCTTCTCTAACTGACTTCAGCCCATCCACGACCCCCACGCCCCCCCAACGAGAACGCAGCAACAGTTTGGACCAACCACAACGGTCTCACAAGTTTGACTGTGATAAATGCGACATGCAATTTAACCAATTGGAGAAATTGCGAGAGCATCAACTATTGCACGCAATGAATCCAGCAACAAATTTTTCAGACGCAGGACAGAACTCTAATTCTGATGGAAACTTCGGTCCGTTCGGCTGCATACTGCAAAGCTTACAACAAGCAGCAGCTCAACAGACACAGAACCAACCACCACCAACAAAAAAACGGAAATACTCGGATAGCTCTTCAAATGCAGATGAAATGCCGAATTTATCGGAACCTGAGGCTGCACATAAGAAACATGAATTCCTTTATAATTATTATATGCAAAATGAAACGAACACAGAACTGAAAAAACAGTTTCTTATGCGACAACAACATAAGAAAGCACAGCAGATTCAACCTCAAGAACAAGGAAATGAGTCTGATTTGGAAATGGAATTCTTGACTAATTTTTATCAGCAGAACGAAGCGAAGAAGGTTAGTAATTACGACTTTTTACTGCAGTACTATCGGACACAGGAAGAGGCATCCCTGAAGTCAAAATCAAAGCAACAGCACCTCTTTAGCTCCAGTAAAAAGCCAACTAGCGAGTTTCTATTGCAGTACTATCAACTGAACGAGTCAAAAAAGTTTTTTCAGTTAGTTGCCTCGCCCCAAACAACGCCTGATGGCCCAGGCTACAACCCGTCATCGCAGATGCCAAAACCCACGACAGATGAAGTTAGTAATGACATCGGCGAAAGATCATTGGAGCAGGCAACAGAAACACAAAAAGAAGAACAAGGAGAAATATTCAGCGAAGACAGGCCACGCGAGGAAAATGCTTTATCCTTAGGCAAAAGTGTAATGGAAAAGTTTAGCAACAACAACATTAACATTAACTTAGTTCAAGCTGACCCAACCGAGACGAACGGTAGTCAATCTGTTGAAACAAGACAAGAGTTGTTAATGGCACCTTCAATAATTGCAGTCAATGATGATAACCAATATTTGGGCTCAAGATCGTTACAAAAAGAAGACAAGGAAAAGTCACAGTATTTTCATAATCTTGAAGACTTCCTGGATGCCACCATGATAGAGAACAACTCCCAGACCTTGACTTTTAATGATGATGAGAAAGCTGGCCAAAAGGACGAATCGGTTCACAAAGCCAAAGAGATGGAAAAACGGTCTTCTGTGTCTCCGGTTAATGTTGCATCCAAACAAAACAAGCGGCTACGTACAACCATACTTCCGGAGCAACTGAACTTTTTGTATGAATGCTATCAATCCGAGTCAAATCCAAGCCGAAAAATGCTTGAAGAGATATCTAAGAAAGTAAATCTGAAGAAACGTGTAGTGCAAGTAAGTATTAAATATATAAATTGGAAAATATTGGATATATTTTATTAGATTTTAAAACCAGGCAGGGTAAAGAGTATAAGATCAACATTTTATCCAATAAAAGATCTCTGATTATATATAATAAATACATATATTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATAATTTCAGTCAAAAGTTTGCGACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAATATATATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCCCTCTGTCCGTCCATTTGTACGCCAACTAGTCTCTCAGATTTTAAAGCCATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCCGATAGAAGTGGTGTTTTTTATTATATACCATCCTTAGCTTGGAAATAACTTTTTTTAATTAGTTCTGGATTTGAATTAAATTGTATTTAAATCAGACGATTATATCACAGAGCTGTCATACGAACGTTTGCAAAATTGGTGGCAATCCTTGCAGTTATAAGAAATAAATTTTTCAACTTTTTTTCCTATGACAGATAAATGATATAGTCGTCCAATCTTATTAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTGTTTCCAAGCTAAGAAGGTTATTTGTCAAAAATCAATCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTGATAAAATTTAATTGGTAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATTTTAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGCAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATTTATAATTTTAAAAATAAAAAATTTATTTTCCCAAAAAGCCCCAAAGCTATATTTTGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATGACAGCTAAATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAAATCGAAATTCAGAACTAAATAAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTAAATGTTAGAAAACACCAAAGATATATATTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGTGCTGTAAGATATAGTTGTCCAATCCGGCTGGTTACGACTACCTGCAATAAAAAAAAACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCCATAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGATCAAGATGATCAAGAATATATGTACTTTATGGAGTCAGATACGTTTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATTAAAATCGTAAACACACTAAATTGGTTCAACTTTATATAAAACTTTTTGTCGATAAAAGTGCAAACCCTTTTAGTTGAGTAGGAATATAAGCATTTAAAAGTTTGTCATTGAGTTTG'..b'CTGTAGCGGAGAGTGGTGGCGATTGTGGATTACATGTGAATTTGGATTCATACTTTCGTGACACATGCCCAGGCTTAAGGCAGTTGAAACACATGGATTTGGCCTTAACAAATGTGCGTCTCTGCTCGACTGACAATTCAGAAAACCGTGAGCAGGCGTAGATCTTGTGCTTCTTGGAGTTACACTTTACACAAGAGGTTGCTTCCATCGATACTAAAGCGTGTGCCGATCGCTTTGCCTTGCCATGTTGTGGACCCACCTTAGAGTTCAAGTCTGACTCACTTTTGCTGAGCTCAAATTCCTCGCAACGTCGGTCTTAAAACTTGTGAAGATCATCCACAGACGGAGATTCCAGATCCCGGCTTCCTTCGATCCATTTGCGACGGGTTTCAGCATCGATCTTACCGAGAATAAAGTGTATAACCCAGCAGTCCCCCTGAGTTTGCCCTGATGCATCCAGGCCGCGTACAATTTCGGTGGCTCCGTCCGTCACCTTGCGCAGAACTATTACATCTGCTCTGGCGGTCGAAGGTAAGTTGACAAATGTCTCCAGCAGAGTGTTAACAATGTGACGTGGTCTATTGTAGCGATCAATCAGGCAAGTCCAAGCAGCCTCGTAAGCTGCATCCGTAATTTGCATATGGCGAATCAAGTCAGCCGCTTCTCCAGTGATGTACGTTTTTAAGTAGTGCAACTTTTGTATTGCTGTCAAATGCTGCTTGCTATGGATTGTGCTCTCGTATATGTTCTTGAAGCGTGGCCACTCCTTGTAGTCGCCAGTGAACAGCTTGATGTCGATTTTTGGCAGTTTATTATGCATTACAGTTGCTGCCGAGTTTGCCCTCAAAAGCGTGGCTTGTTGCTCAGCCAAACGCTCATTGAGCTGCTGTTGTTGTTCAAGAAAACGAACTAGGTTTTCGCTTCCCACTCCTGACGCCATTAATGCGGCCTCGTCAGGGTTGCCAGATTGTCTAAAGTTGCCTTCTCTTCCATTCTCCTGAGCTTCTTCACAGGTACGAATCAGGTTGCGAAATAATGTACTTGCCTGCAAGTACTTGTCCTCGTACCTTTCGTTGTCGATGGCTGGATTGACGTACCCCTCCTCCTCGTCAAAAAGGGCCATTTGGTCGCTGATGGACTCGAATTCCTTCCATACGTTGTTGAGCCCACCAAATGACACATGTATTTCATCAATCTCTCATTTTGATCCCGCACGTGGATCTTGCGACGCCGTTAGCAAACGCGCAATGCTTGCCTTCGCACGGCTTCTTGCTGCCTTCAACAGTTTCAACTGATCCATGTTAATTAGTAACTAAATCCGGCTCGAAGGAACAAAGATATGGTGTAGAATAAAAACGTTTTATTTCCCGAATTTTTGAGTGGACTGCATTCTTTTTTTCATTTCCTTCGTGTCCCATGCGTTCAATTGTATTCTTAAAACTAAGTCCTAAAAAATCTCTAAATGGTCACCACTTACCCATATAGATATTAAAAGCATCCATATAGATATTAAAAAATGGCAAAGTTAGTATTTCATATACCGGGGGAATAATAAGATTCAAATTCAAATGAAATTGCAAAGCGTTTATCAACAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTAAAAATTCTTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCAAGAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATGACAGCTGTATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAAGTTAATTCGAAACTCAGAACCAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGATTATAAGTTAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTTTAATTTTTCCTTGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACATATATACTACCTGCAATAGAAAGATGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCGGATAGCTTTAAAACTGAAAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGAAAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGGATTTTTATATAGTTTTTATTGGTTAAGTTCTTTCAAGTTAGATCCCCAATCTTAAACTGATTTTACAAAATGCATTATTCTTATAACTATGGCTCTTAACGGTGACAGCGATGAGAACAGCGAAAGTGTACTTTGATTAAGGATTTTTATTTGGTCAAATCTGTGGCCCGATGAAACATTTTCTAGGCTGTATCTTTTGTTTAATTAATTCGGATTGACCAAAGCTTTAATGCTAAGAAATGGGTTCTCAGGCTGGACCCTTTGTTTAAATGTAATAATATTGCGGGAGAAGTTTTTACATTACTGGTGCCGTCGATCGAAGGCGTGGGAAAGATTTGTGTCTAAGGGGTTAAATATTTATGTCGGATTGATTTGAATAACTGCGATAGTAGGCTCTGGACTTTTGTTATTGACAATTGGAATAATGGGTATTTCGGGATATACAGGTTGTATGTTGGGTTTTGTATCCAGGGTATTTGCGTATACGTCACTTATATGAATTATTTTTTAATGCAATTTTGTTGTATTTTTTAAGCAACTGCTTGATTGCTATATATTTGGACGAAAAGCAAGAAAGGTAGTTAAGTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCTTTTCAGTTAAAATTGATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATTGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAAATTATATCTTTGATGTTTTTACCGTATAACCTCCTACGCTTTTAAATAACATTTTTAAATAAAAAATTTAATTATATCATATACTTTCCATAGAAACGATCGGAAAGTTAGTCGGAAAATGTGAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACATTCTAATCTTGGAAATAATCGGAAAAAGTGTGGGAAAATAATATAAAACAAATTATATCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAAAAATTTTTCAGTAGTTATGAATTTTGAATTAAGTTTTATCAAAATCGGACACCATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCTCTATTTTGTAAATTTTGGGAATTATGTGGTTTTGTGAACCATCTTTTGAGGTAAAATTCAATGACTATGAGTTGTGGAATACGTATGTTTTTCTTGATGCCCTGATTATGTGGTCGGTCCAAGTTAAGGTACTGCTGAATAGGGTTTTATGGTAAAATCGTAGGGGAAGGAGTCCACAACTCTGACTCACCTCTGTTTTTGGTTCGGGTTGTTGCATTTCTAGTTGAACTTCCCGGGCATATCAATCTGTTTGTAAAATAATCATATTTATTTAATTTTCATACTTGGTGTATTTTGAATACACATGCCTGCGTAATATATATATACTTATGTTCCTATAAACATTTTTTTAAAAATAGCATACCCTTTTTGTGTTTATAAAAACTTGAACCACCTCCAAAACCACTGAAATACTAATATCATTGTGGACGGCAATCCTAGTAGTGACGAAGCGCACCAGGAGAGTGTGCGAAGGCTACTTCTTTAGTAGTATTTATATAAATAATTTATTCAATTAGATCTAACCAATTTAATTCGCTTACGTTGATCCTACTTTAATTTTGTAGAAATGTAGTAGTACTAGGCTTCCCTCTAGTGTCGCGGATGCATCGGCATCGTCTCTGCGCCATCTGCAGTGCACTTTGTACCACTGATACTCCAGAAAGATACCCAGCATCCTGGCTATGACTGGTAAAGGAGCCGGCACGTCCATCAGCCCCACATTAGCTGCCAAGTTGCTGGTGGTAGGGAGCGAAGTCCCAAAGGTGGTGCTTCTTCTCAATGGGCTTCTCTATTGAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/501/c34/79/scaffold_31-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTATCTGCTCCC \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGAAAGAAGTTGAATAAAATAATTCAAAAAAGAAGTTAAATAATTATGTCCTTAAATTTCAGAATTCGGGAACGCTTTGAAAATATGAATATTTCTGACTCTCAACTGGCGAACGCACCAAGAAGTCTAATCAAACGTTTTGTTGTATGTGTACAAAATTAATTAAAACTATTCGACTTATCAATTTATTTTAGTAACGCAATGAACGCCTGATGGTCTAGAACGACGAAGTATCATAATTATTGCGAATTAACCATAAATCACGTAATAAGAGGATCCCCAGAAGCTTCGAGATAATATCGTATATTTTATATGTCTTATATAAATACATTTTTGACATTTTGAATGTGGCAAATACAATATGATTTTAATACTTTATATTATTGCTTTATCCATGAATTCCAAGAATCGTTTGGCATATTGTTCATGATCATTTCGATATGCCATTAACATTACTGCCATATTTAACATTTTTGGCTGCTTTTGCCGACAGAAATGTGAAACATTACCTTTAAGTCAGTTTTTACGCTATATTTAGTAAGAACCCCAATAATTAAAACACAAAATATTTCACGTTTTTTTGCAATATAATTGAAACAGCTATAGTTTCGAAGATAAATAATATATATAAAATAATTTGGTGGTAGTCTATCTTTAACTAGAGGTATTTTGCTAAAAATATGTAGTTAGAAATTTAGAATACTTACGCTTTAGACAAAACGGCTTATATACATATGCTTAGCGGGATAATAAATAGAAGTGTCGTTTTTCGTGCCAATTTTGAGATAAAGTTGAGGCACAATATGATTTCTGTGAGGTTAAGCTCCCTTATTAAAGCGGACAAACAAACTATATGTATCGGACAAATTTTTACTTCAAGGTGTGATAGTTATACCCTTTACTTATAGAATAAAAGGGTATACTAGTTTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAAAAGTTAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTAATCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTATGTCTGACCGTCTGTCTGTCTATCAGTATAAACGCTGATATCTCGGACACTATAAAAGCTAGAACAGCCTACCTATCAACTGATCCAAAATGTTCCACGCCCACTCTAACGCCCACACACGAAGTTAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACGGTAGGTGGCGCCGTAAAATATCGCTTTGTTGCTTATATATCTCCATTTCCCTCTTCCTCCCTAAAACTGAGTAAGGGGTATCTGATAATCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTTATTTCTGTCATCAATGTCATAGTATTAGCAGTAAAATGTGTCTTCGGCCTAAACTCGAGGGAAAAATTACAAGAGATTTTTATCTATAGTCAATGCTATCAGCTAAATTTTAATGTTTTTAAATCTTTAAAAATTTGGGCGTGGCGCTATCCAAAAACCTCAAAAATCTTCACGCCAAATTTTAACTTTCTGGATTTTATGGTTTCTGAGATCTCAGCGTTCTTACGTATGGAGAGACCAACTTGGCTAGAACGACTCGGCTTGTGATGCTGAAAAAGTAGCGATTTGCCATAAAATAATTTTAATCCGACACAACAGATAATGTGTCCTCGGAAAGGTACATGTATTTACCTGCAGATTTGCCTAACAGTTCTATAATTGAATTCTCAAATGTAAGCTTTTTTAGCAAAAACCAAATCGATTCTAAGAAAATATGTTTAAGTACACCACCTTGTATAGAAAGCTCAAATTAGTCAAGAAATTCGATTTTAAAGTCAAAAAAGTTGTTTATATGCTTTAAATGGTCCCAGTTTGCCGAACCGTAATTTAATGTAGACTTTTTGTTATTACGGTTAAATATATACTAACTAAATTCGTAAAGCGTAACTCGATCAAATTCAACACCACGTAGATAACAACTTTTCTTGGTGAGTTAGGAACAGTTTTGTGATGATGATGACTGATGTTGTAAGTTGTATGAATTGATTTTGTAATGTTTATTTATTTATTTGACAGCGCTGCGAGTGTACCCACACAGTTTTGAATGTATGTCGAAGCAAAATGAAGCTGCACCAATATTAAGATAACGTTCCATTTCGATTTACTGAAAAAGAATTATGTATCAAACAACACCAAAGTTATATTTATATTTATATTAAAAAATTGTTATCAATTTGTTTGATCTTGCTATGGGAGTTATATGATAGAGTTGACCGATTCGGCTCGTACCGACTTATCAACTATCTGCTTTAGAAATAAGACTTTTGAGTTTAGTTTGCGTAGAAACGGAAGGACAGAAAGACGGACATGGCTAGATCTGTGATCTAGTGATGCTGATCAAGAATCAAGATCCGTATGAATGCAGAGATCTCGGAAAATCGGACCATTCATTAAAAAGTTAAACAAAGTGTGAACTCTTGTGTACAGTCGTTTTGCCCTTGCCAAGTAACGGATATTGATAGTCTGTGGCATCGACTATGACCTTCTCTTTTATTTTAAAATATATTTTATGGCATTTTATGATCTGTTATAATATCCCACAGACCTGAAAGCTATAACGTTCATGATGGAAACCTATACTGTTCTATGCACTTTAAATCAATATTTGCACCGAAGATAGTTTGTGAGGAATTTACACCACTAAAGCCAGAGCTTATAATACGAGAGAATCAACCAATAGAATTACCGCCGGATGTCGCAAGAGGTTAAATAAAACAATGAACAACAATGTGCGCTCAAAATTCAACGTTTTCGAAAATGGTTGTAAAGAAAAAATCGATTACCTACAGGAACGGCAAGATTCTGCACTTACTCATAGCAATTCAATAGGGTCCACGATAACCAAACTTCATAAGTTCGGAATAACTAATTCAAAATTCGATGAACTAGATAATATTGAAAAGACCATTGATAAGATAAATTCGAGTACCGACGAGGAAAGCGATATGGTTTTTTTGTGCTCCAGAAAGAATATTGAAAGGGAAAGGTCTGTGGGCTTGGGAGAAGCAATGAATGATATTAGATCAAAGTTCGAGCAATCTGAAGTGATGACAAAAGAAGAACGTCGCGAAGAAAGGAAACAGGAAATACAGAGCATACTTTCTCGACTATTTTTATAAAATTATAATTTTATTATAAATGCCTTTCATCTTATAAAGTATTGATTTGAGAATGGTGAGGTTTTTAAAGATAATAAAGTTCAATTAAAGCAATTCAAGCGGATGCGCGTGTGGTTGAATCTGGTATGCGTATATTTAGTACAAAGTCGCCATTGAAGAATCAAGAGAAAGATTTAAATTCTTTGAAAAATATGCCCCTGTCGAAAATAAAAAAAGAAATTTCCCATGACTCTGCCACGTGACGGTGTTGTGAAGATGCCGTCTCCTGATTTCGACACAGAGGGTTCAATTCAAACGCCCTTATTCAATGACAACGTTTTACAAAAAACCAAAACAACGTCAACAATATTAAGCAAGTTTCGCAAAATGGAAGAGCAACAAATGTATGAGAAAAACAAGGAACGAAGCCCAAAACCATTAAAGTGTTTACTAACTAAAGAATGTATATATTCCTGATCAGGATCTCAAGCCGAGTCGAACTTTATAGAGTTATAAGTCTATGAACCCTTGCTAGCATCATCTGAAAACCACTTTAACACACACAAATCACAAGTTTTTTTGTAAATTTTAGATTAGTTAATTTTTGTATATTTATTGTTATACCAAAAATGGTTTTTGTTAAACCGTTAAGTAATATACTAAATTATCAACATGTCTAAGGTGTATATAGTAGCCTAGGCACTCGTCTGATTGCTCTCTCTTTATTCTAAATTGTACGTTGTGATAAGCCTTTTGCTGACGGAAAATAAGATTCGAAAAGTTAGATTCATTAAAATCTACATCAGTTAATAAAATAATAATAAAAATTGTATCGTTTGCAGGCCCAGAATG'..b'GGGCCTCATTTGAAATATTGGATTATTTTTTGGTCACTCGATAGTGGGAAAAGGGGTTAATGTCGAAATAGCGTGTGTAATGTTTTTATAGACAAATGCTTTCTTTATTGCCCTTAGCCAGTTGATCAAAATTGATTTATCCCTTAAGGTGAGCGCAGTAAAAATGTAATAGGGACCCTATAGAGTATTTTAGACACCTTCCGGTTCTTTGACTATATACATTTTTAAGCAACTTAGTTGTTCAATGTGGGACATGGATTTCGTTTTAAATAGTTTTTTCTTTAGATAAATATTGTGTGTTATTTTCAGCAGTTGACCAAGGTTGCCATAATTGCCTTAAGCACATTCATGCTGGAGGGACATTTGGATTTTTATACCCTTTCAGTGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTTTATGTATTCTAGATCAGCGTCACAAGCCAAGTCGACGTAGCCATGTTCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAATAGTCTTTTTTCTACTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATTGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATTGGGGAAAAATTAAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATACCTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTAATCAAAATCGGAGGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAATGGTAAAATAATATTCAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTAAAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGGCTATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGGAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATGTTCTTGGTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGATATGTGCAGTCTTGAGCGGATTGAACCTAGTCATCGCCAGCGCTTGACCTTGCGCTGCTTGGGACTCTGCTGGCTGGCTGCCTTGGGACTGGCCTGCTTGCCGGGCTTGGGCGAGGTCTTGGGCGTCTTGGACTTGGGCGGCGACTTCTGCAGCGCCCGCAGCGTCTCCTGGGGCACCCAATCGTAGTCGATGTTGCTGTCGTTGGCGGTTCCGGTCTCGATCAAGGTTTCGCCATCCAGACCGTCGTCGACGGCCTCGTTGTACTGAATGCCATTGGCATCGCGGTAGGCCAGGGCAATGTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGCAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGCAACAAATTATAGGTTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTACGAATTCAATTTAACTAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAATTTCGGCTTGCCGAAGATAACTTCCTTTCTTGTTTTAACTGAACGAACAAAAACGGATAAGTCCAACAAGATTGAAGTCGCATCGAAATGTTATCAATCTTCATAAATGAACTGCAACTTACCATCAACTCAAAATATAAGAGAAGCTATAAGAACACTATCGGTGTACCGAAGAAACCGCAGTGAGTCAAATGCCCTTGCAATACCGTTTGCGAGCTTCATTCAAGAGCTAGTTATTTGAAAAGTTTTTATTGTTATCAAAGGATGGGAACAAAATTTAAAGTTTGAAAACAGCCCTAATCAGTCGTCTATAACCAGTAGCTTCCGCAGGAACGGTAGGGTCAAACTTGAAAAATCAAAAGTTGTGGGTATGTGAGGTAAAGAGTTGAGCTCAGCAATGCCAAAGAAGAAAACAAATATTTCGTCACTTATAAAAAGTTATTATTCCAGTGCCTTAGGTCAAAGAATAAAAAAATGTGTTTTCATATATTTTCTCCGATTACTTACTGACATTATTCCCATCGCTATGAAAAGCACGGTATACATGCGATCACTTACTGTCATTTTCTCACCACTATTGAAAGCTCTAGACATGTTATGAAATTTTAGGTATTCATAAGTGGATCCGCCTGTTCGACTGCGATGACGCGTGCATATGTCAATTTAAGAAATAGCTAAACATAAAACTGTTCCGATTTAGTTACTGAAAATATAATATTTACATTTTAATAAATAATTGATCAATTGTTAAGTTCTCTTATCGCGAATATGACGGAATCTGGAATTGATTTAGGCTTTGATATGGAGTTCGATCTAAATATTAGTCTGTTAAATGATAACGAAAATATGGATTTTTTACCTAATGTTACCGTAGCAGGTAGTTCCGAAAATGTGGAGTTTTATGAATTAAAATCATCAACTCGCTGTTTACGGTCTGACGAAATGTAAGTATCTTGTAAAAGAAATATGAATGTACATTGTACATATGTATGTATATTAAAAACCAATTTATAATATACTTTGGCAATACGTAAGCTCATGTTAATTTGTAATATAAATTACCAAAAACCAATTTATATTATACTTTGGCAATGCGTAAGCCCATGTTAATTAATAATAAGATCATGAAGTTATTAAATTTATATTTTCATGATCGGTATATACGCATATACTTACATACGATATACATACTATTATATTAACGTACATATGTGTATATGTAAGCTTGATATTTGAAGTATGATTAGCACTACTTTATAATCTTATCAGACAAATATGGACACACATATATATATGCATGGTTACGGTTAGATACATACACAGGTTCGCATGGAGGTACTTATGTATGCATTCATGTATATTGAAACCAAACACGAAATTTAGGCATATACATACATATATGTTCATGAGATGGCATTCCTTGTTTGTCGGCTTTTTTAAGATCAGTTTCAGATTACTTACAAAAGTAACATTTATTTATTAAAAAGACGGAAAGATAAAATGGTACACTACAGTTGTGTAAATTACATTGTTCGGACAGTATCACGGTTGCCACAGAAATCACTGCAGCGCTTAGTCATGTATAATTTATATTGATGCACATAACGAACCCATATTCCTCTTCGATTTCCGTATGCTAGGATGGTCAGAAATATTTTCACAAAATAAAAGTGAAATATACTCGAAACTTGAAATTGCTTCGTTTAACTTTTAAATTCCGTTTGAATGATACTTACTTTTCTTAACTAATTCAATGTTTATTGAAAAGGCTGAATTTTTCTGAAAATCTACTTTTTTAAACTTTTTCCCTCGTCCTAAAAAATAATGTTTTTGGATGCAAAAAGTTTCTTAAAAAAAAATAATATAAAAAAAATAAGCTTATACTTGTTTTGATTTTTTGAAAATGTTTAGAAATACGCATTTAAGCCATATTTTTCTCTTTTACATAAAAAATTTTTTACATTGTCACCTTCAAAAAATCAAAAAAATATAAGCAAAACTATTTTTGAAAAATAGTTTTTGCAGTTACTATTATTTTTGTTTGTAGAAATTTTTTAAATAAAGAAATTAAAGTTTTCAAGACAAGGAAAAGAAAAAATTTAAAAGTAGATTTTCACACAAATTTGAAATTTTTAATAACTACTGAATGGGTTAAGAAAGGTAGTGCATCATTCAAACGGCATTTAAATTACTTTTCCATTGATGGCAAGTGAGGGAGTTTGTGAAAATATACATACCCCTGTATGTATATATACAAAATGATATATATATTTAATTTATAATTCCGAGTCCCCACTTTCATACTTATATACATAGATATAAAGTTTTATAATATTAATACAAAATTTTAATTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/54b/778/98/scaffold_68-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CAAATTATCAAAATTGTAAATATATATATCTCGCACCCTATTTAAAATTTTTGTATGGATTATACACATATAAACATACTTATAAACTTATACAATTGGTTGTTTTCTCTTATAAATGCAGAGTCCGTACATCAATACATATTTACATAGATATGCAGATATATAAAATAATACAAAATTTAAGGTGGTTTTTTATTTGAAGAGAAAATGTTTAAACTCTTAAAGGGAAAAATCTTGTTTACAAGTATGAGAACCATTTATTAGTTTTCTAAATCTTGTTGGAGGCTTGGAGAGATAAATACAGTCAGCTTATATACATAAATAATTGAAGTTATATATACATAAACCCTAAAACATTCTCTTGGAGAGGCAGATATAGGTATTTCAAAAGAGAAACCTCACGTTTTTGTCGTCATTTTTTGGTATTATTTTCCGAAAGCATGCGTACAACAGGCCCTCTTTTCACATTTGTCTGCTAAATCGACGATCAAGGTCTTTGTAACTCTCTTAATCGTTTGTCAATTGTTTAAAAATGTTTTCTTACTGGAGCAAAAAAAGTATTCCAAGCAAAGTTGAAATTATAGAGTCGGAAAAAAAATTTTCCATAAGCGAAAATACTTTACCAACAGGAGTTGAAATGGAAAGGCAGAAAATGGTACAGCCGACTGTTGATAAGCATGCCCTGGAGTTTCAAGATTTTCTGAGGCGCGTTCAAACGTTACAAATGTCACACATTGGGGCAAACGAAAAACAAGATTTTACTGCCCATCGGTCCAATTTACGTAGTTCCATGGCTATTGAAGTCGGAGAGGAACCGCCGACTATACAACCAACTGATAATATTGGTAAAGCATGTTCTGCATCAGTTCTAAGTTCAACTGAATGTGATAATATGCCTTCGGCTACTACAAATATTAGAGTAACTGTTGGTATCGACAAAGATTTAGAAATGATTCTCGAAATGGATCCAAGTATTGTAGATTTAGGAGATATTAGCATTGCAGAAACAACAGAACCGCGGATAGTGGGTTTACCTCCACTTTCGGGTGGGTAGGTACATATATTGACTATTAATTGGAGTCAAACACTTATATTTCCATTTTTTTAAATGCTTGAAAAATGGATACATTTTTATATTTGCTTAACAGACCAACATTTAAAACTGCCACCCCCACTTCACGAACCCAACTGAAACTTCAGTTACAAAGGGAGCAACATCAACAGCAGCAGCAGCAAATGATACAGCAACAGACCCTGGGTTCGCCAGACTCGAAAATGCACCTATTGTTTGGCAATGCACAGGGATCCATGGAATCGGAATTCATTGACAGCGGTAGTACCAGCGCATGTGGCAGCGGGTCATCTAGTTTAGAACAAATGTCCCAATTAGTGCAAATTGATAATTTAATTGACACGTCAAGTGCAGTTAAACTTAAAGTTCCTCTTCAAAGTATTGGTGTAGATGTGCCTCCCCAAGTACTGCAGGTAAATAATATATTCTGTTAAAAAAAAAATTGTACGAAAACAAATTACAGGTCAGTACAGTTCTTGAAAACCCGACCAGGTATCACGTTATTCAAAAGCAAAAGAATCAAGTAAGACAATATCTTAGCGAATCCTTTAAGCCATCTATGTGGAGTTGCCATAACAGCGATGTAAGTGTTTAAACTCGATTGACTGGAACCTAAAATTAAATTTTGGTATATTTTGTAAACCATAGATTAAAATGGCAAATAACTCTGCTTCAACTGGTAATCTTCAAAGTGCGTCAATAGATAAAAGTCTTCCATCGGAGCGTACAAACAGTTTTGGGTGCGATACGGCGAATAGTGCTAAAAGAAATATGCATTCTGATGACCCAATGCCAATTTCGTCCTTCGGAACCACTTTTTCAAGAAGTGATAACCTAAATCCCAATATTGACCAAGTTTCTGGAGAGTCAGCCATGTCACAAAAAAACAACCAATTAGGATTTGTTAAAGCTCATTCAGGCCAAAATTCTTCAACACGACCTTCTGCAGGAATGATTAATTCAATAAGAATATCCAGCACAGCAAGTTCGTTACAGAGTACTTCAGCTCCCATTTCACCTAGCCTAAGCTCAGTTGCGACCAGTGCCTCGGAGGTAAGTAAAACCAGTATAAACTGGGGTGAAACATTTGTACACTCTTGCAGAGGGTTTTATGATTTTAGTCAGAAGTTTTCATATATAAAATATATATTCTTGATCAGCATTATTAGCCCTGTCCGTTTGTCCGTCCGTTTCTTACGCAAACTAGTCTCTCAGGCCTGAAGTTTTCGGCCTGAAACTTTCCAAAAAGTCTTTCTTCCTTTCCAGGTTGTATATAAGTCGAAGCTAGCCGGATCGGAAAACTATAGCTTATAGCTCCCATAGAAATAATTGGAAAAAAATGTAAAACAAAACAAGGAAGATAGCTTAGGAAAGCCGAAGTTTGTATACCCATGCAGTTATTAGAAATAATTCTTAAATTCTTAAGGATTGTTGCTAGTTTCAGTGATATTTAAAAAATATATTTATAGCAGTATAAACTGTTACACGAATTAAATAACTTTATTAGACTTGACCGTTCTCTTTTACTTCTTATTCGCAATTGCCTGGTTTTACATAGCGTCGGGTTTAACATACGATTACTTGAAGTTGGCTGCGATCAATATCGATACTTAACATTATACCAGAGTTGCCAGATTGGTCGCTTTATCACAGAAGATACTTGTAGATGCTAGAGACTATTGAATAGCTAGCCGTTACATTCAAATACTAGTTAATATACACTTACATCGAAAGGTTAGAGTTACCTATACATATACATAGCAGAGTTGTACATAGTTATACTTATAGCAAGTCACTAATCCTACTACAATTCGGCCATCCTGACTGGTTGATCACCTGATCAAGACATATTGACTTAAAATTTATGCCTATTTTATCTTTACAATATATAGATACTTAAGTGGTATTTTCTCGTTATAGGGTACATTTTTATTTCTGTTTTTTAGCTTTTTTAGTTTTTATCCAATGTCTTAAATTTTGCGCACTCCAAACACCTAAATAAGGACTACGTGCTACTTGAAAACCTTCGACGTCCTTTAATAGAATCTGTCATTGCGCATCGCTTTTGCAATCACATATGGTCCTTTATGTTTGGGAATCAGTTTCCTAGCAGTTCCAACAGTCGAGTCAAAATTTTTCACCATTACATAGTCTCCTTTTTTATAATTTCTAGCCTTTACTCGACTTTTGTTATACAATTTTTCATTATAATCTTGAACTTGCTTTTGGTGGGCCTCAGCTTTTTTCCTTATCTTTGTTAAACTATCTAATTTCTTATTTTCATTTATGTCCTCTAGCTTTTCCTTAAGTTCATCCACAATCTTTCCTTTTTGTTCTACTCCAAACAGCATTTTACTCGGAAGTTGTCTTATACTTCTGTGCAACGTATTATTTAAAGCATGTTCTATTTTATCTATAACATTGTCCCAGTATACACCTTTACTTTGATCAACTAATTTTGCTATCATTGGTCCAAGGCTCCTGTTAATCCTTTCAACTTGACCATTGGCTTGTGGTGAGCCTGTGGCTATCTTGATGTGCTTCACATTATATTCTTCCATGAATTCTTCGAAGTCTTTAGATGTAAAACAACTACCCCGGTCTGAAATTATGCATTTTGGCCTACTATAGGCCCTAAAGTAATCTTTCAATGCCGTTATAACCTCCCTAGTGCTTGTTGATTTAGTTGAATAAAGTCTTACAAACTTTGTGAATCCGTCAACTACCACAAAAATGTGTTTTTTTGCTCTTGACGAGTCTACTGGACCATAATGGTCAATGTGTATTAACTCGAATGGTTTGTTTCCTTTGGGAATACTGTGCAAAAAACCTTCTCCTTTACCTGATTTTGGTGAAAACGCTACACACTTTAAACAATTTTCTATATGTGCAACGCACTTTTCTTTTAAATTTGGAAACCAATAAGTTTTTGAAATTATGTCCATCATTTTATCTCTTCCTATATGTCCTATTTCGTTGTGGTATTTATATAGTACCTGATCTTCCATTTCTTCTGGCACATAGAATAGTATCCTATCGTCATTTGCTTTTCTGTACACTACCCCATTTCTCATTTCAAATAATTTAAGTTCTGCCTTCTCTAAAATCGTTTTAAGCTTCTTAATTTTTAAATCCTTTCCTTGACAGATGACTAAATTTTCCTCAAAGCTGTTGGTCTCCACTATTAGAATATTATTGTACCTGCTGAGAGCATCCACATGCTGCATTTTATTTCCCGCTCTGTGACATATTTCAAGATCATAGTTTTCCATCTCCAAAGCCCATCTTGATATCTTCGGGTTAAGTTCTGCTTTATGGAGTGTTAACTTAAGTGCAATACAGTCGGTTACCAATTTTACATGTTTCCCTTGCAAATATATCCTAAATCTACGAAGAGCATAGATAACCGCCAAAGTCTCGAGCTCAAAACTATGTAACTTAGCCTCATCTGCTGTAGTACGCTTAGAGAAATAGAACACAGGATGTAACTTGCCATCATCTTTCCTCTGCAACAGTACAGCACCAAATCCTAGAGCGCTTGCGTCACAATGTAATTCCGTATCGTCCTTGTGATTATATAACGCCAGTACTGGTGACTCAATAAGTTTTTCCTTTAACGTGAGAAAACAACTCATCTCTTCTTCACCAAATTGAAATGGTTTGTCCTTCTTTAACAAGTCATACAAAGGTTTTGCTATTGTAGAGAAATCTTTTATAAACCTTCGAAAATATGAAGAAAGTCCCAAAAAACTTTGTACTGCCTGAACCTTCGTGGGAACTGGAAAATTTTTTACGGCTTCAATGCCCTTATCATCTGCCCTAATGCCATTCTCAGAAATCAAAATCCCAAATACTTTATATTTGCTTTCAAAAACTCACATTTATCCATTCTAAGTTCTAATCTGTTCTGTGTAAGCCTTTTAAAGATTTTCATCTAATGTTTCTAAATGTTCATTAATATCTTTGCTGGCGACCATTATATCATCCATATACACTACTACTTTTGCTTTCTCTAATCATATCATCGAAGATTTTATTAACAAAGCGTTGAAAAACAGCTGGTGCATTTTTGATACCCATTGGCATTCTTAAAAACTCGAATTGTCCTAGTGGTGTTACGAATGAAGTATATTTTACAGATTCCTTATCAACAAAAACATGAAAATATCCATTTTTAAGATCTAACTTTGAGAATACTTTTTTGTCAACTAATTTATCTAATAAATCATCTATGTGTGGCAGAGGGTAATTGTCTTTCAGCAGTGCTTTGTTCAGTTTCCTATAATCAATGCATAATCTAATCTCACCTGTTTTTTTCTTCACTAATACTATCGGAGATGCAAATTCTGATTCGCTTGGTCTTATTATCTCACTTTTCAAATATTCGTCTAGTAATTTTTGAAGCTTGTCCTTTTCTGTATATGATAATCGTCGAGGACTGCAACTGAAAGGTTTTGCATTATCTAGACATAGTTTCATTTCTGCTCTAATCATTGGTTTTTCAGGTCTAGTTGCTTTCACATAACTGTTTTCCAGTATTTTTAAGAAACGACATT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTATTATTAATTCCGTTTTTTTAATATTATGATATAATACAACTGCAACTTAAGGGTGGAAACTTCGAGGATTTTTTTGGGAAGTAAAAAATATTCGAATAAAACGAAACTTTAAGGTTTTATTGTTATATATTTTAACTGTATTCTAAATTTTTTTAAACTAGATATATGTCATATTATGCCTGGTGCAAGCATTTCCCATCAATTCGGTAAAATCGTAGAAATGAAAAACAGAAATCCCCGTCAAAGTTTTCCGGCCGCTTGTATACCTGCTCGACTCTTGCTTACCATTTCTTCTGTAACTTAAAAAACATTTTGAATTTACTTCTGAAATTTTGGCTACACATTCTTGAAGAGTTTGGGTAGACATGGAAATATACTTATAATAGTCGACTTTAATTTTATTTTAAAGAAAAAATCTCGCAAACAGCCAATTGGAATGAACGCTATGTTGTATATTATTAATGTTTACACTGAATAAAATATTTAAGTTACTTATTTAGGGCCTAACGTGGTTGGTGATGCAGATCAAGAATATAAAAATTTTATAGGATCCTTCACTTTTTACCATAAAAGTGACAGTCAGTAATGACAGGACCTGACTTCTAAAATCACTGAGGACCTTTCGCAACAGGGACGGACACCTAACCAAATTTTCTATCGCGCGGTTCCTTAAGTTTGAACTAGAAAAATCGAAAAAGTTTTTATCGGTATCAAAGCAACCACAGCTGTCGTTAAAATGATACTGTTTAGGGGCAAAAAAGATAATTCTTATAGTTTAGAAAAAAAAAAATTATAAAAAATTTGACATTTTCACTCTAATTTCACTCAACTTTTTTCTGTGTAATAATGCTGTATTGGAGGATATTGGAGAAACTTGACTGTCCCAACTTGCAAACTATGTTATATAATTAAAATTACATGAATAGTATCAGCTGCAAGGATTTACAATCGTCGGCATAAAAAACTATCTTCATTGAAATGACCTTATGAACATTTAAACTGTCGCGTAATTGTTACTGAGCGCCAGCAAGCACCTAGTTGGAACTGGTTCCAATGAAGCTCCTAAAACAAAAATCACTTTCTCAAGGCATTACCGCGCAGCCTCCTGCAATACCAAAAAAACCCACCACCAATCAGACTTCTTCCAACTTGGACTAGTATATGTTCTTGAGTGCTAAAAGTACACATACATAATTAAGAGATTTTTCTTATGGATTCTACGGAGATGTGAAGCTGTAAAGCTAATAGTCAAAATTCGGTGAAATGTTTTATCGGTAAATGATGTTTTCGGTAATATATACAAATGAGTTTCAAGTGGTCCAGAAAATTTCTATGACAGACAGATATTCAAGAAGGTCAATCATATAACTCCTGTGTACGAGAAGGATTTTAAGCTGGTTCAAGGTACAACGAATGACGTCAAAATTTGAGTTTACTGGGCATGAAAGCATATGTATGTTAAAATATCTAAAAATAAGGATAGCAGTCAGTGGTTTGGATATTTTCACATTCTTTTTATTTGAGAAAAGATTGTAGGTTTGACCTGTATATAAGTACTGCAAATCATTGAAAGGTTTTTTATTTAAACAGCACTGGTTGCACATTTGTTAACAATGCACTCTTATCTATGGACTACGAACAAATGGATTTTCGTATTCTTTCTTTCGTGCTTCTTTTTTTTATTTAAAAACTAATAAATAAAGTACTTGTACATGCAAATCAATGTACATTGATTTTTTCAAATCAAAAACAAGAGCCTTACTCCAAAAATTGTGAATACGCAATTTCTTTAGAACTTTCTTGCAGAAGTTTTAAAGAACACAATTTTTCTACTTAAATCGAAGTTTTTACTGATGTGGCGACTGGCTTTTAAAAAAATTAAAAGTGTGCATTTTTTAGCGTATCGCATATATTTTAAAGCGTATCGCATAGCACGGTAGTGCTTCAATCTACAAGTAGAGGCATTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTACCGTACGTTCGCTGTCAGAGAATTTTAGGAAAATGAAAAATTACAATTACAATTTTAAAAGCGAAACTTATGGCTGTGGCTTATGAATTTTACCAGCTTTGCCTAGCATAAATATTGGTGACTGTAACTATGTAATGTGTTTACAAAAGTTGAAGAGTGCCTCTTTGATACCGAAATCGGTTTATAAGCACTTGGCGCCCAAAAACAACCTAAAAACGTTTCTTCACTAGAACCTTTTTGAGTGAGTTTAAATCAAGAAGCTCTACTTTATCCGAAAACCAAAGTCACCTCCGTTTAGCAACTGGACAATGTAATTGTTTGAACTTATGTGATGTGTCTTCTCGAATACAGTTTCATAAAATACCTTTTACATGTGTAATTGTACTTCTTTAATAGGAAAAATACAATTTATGATATCTTATTTTCAGTGTTATTCCAATAGGTTAGGAGCAAAGAAGCTTGTCATGTCATGGGAGAGCATTGATTCTAAGGATCTGCTTAGGTATTAAAATATATTTCATTTACAAACTTACATATATGTGTGCTTATTGAAACCTATTTTTACTTTTAGCATCCCACCTAGCCAGAATCTGTCTGCAACACATTTATTAACTTCACCTGATGGATCTCGTTACCTGTTGGAAAATTCAAACGGTTTGAAACTCTATTATATACACTTGCTTGTTTTACTGTGGCAATGCGCATTTTTTAAATTGAATTGAAATTTCTCGGGCCCAATATTGTGGGATAGTTCTTTTTTTCTAAGGTGCGTTTTTATACTTTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTGAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATACATTCGGGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTTTGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCGGGCTGAAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTTTATCGCAGGTAGTATATAAGTAGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGCACTATGGGAAAGAAGTCGATTTTTTTGGCATAAACTCTAGTTTTAAAGAAAAAAACTTGAAATTTTTTTTATATAATATTAAGATTAATGGGTAATTTCGGATTTTGTTGCTTTTTGAATCGGACCATTGCCTTCATCCACCCCCCATTATAATTAATGTACAGTTTAATCAGATTCCTCTTCCTCTAAATGTATTTCCAAACAATCACTTTCATTATCGTAATCGGATTTATCTTCGGACGAGCTTACGAAGGTATCTTTGTCCTTTTCATTCATTATTGGCTCCTCAAAAAGATAGATAACCTCTGCTGGAAGACGCTTTTTTTGTTTTGTCCTTGGGTGATGCGGAGATTAGAGAGTAAAGGGTCGGACGAATCCATAGCCCTGTGAAACATATCAGACATATTGTCAATGCGGCTAGATTTTCTTCCGTGATGCTTTCTGTCAGCTTTAAATAATTTATGCCTTGCACCCGATGCACCTCTTCCCAAAGAGCCAACTGGAACGATTGATCCTTGTATGATTTTATATCCGTGTACTAACATTTTGTGTACAGTCGGAGACATGGGGTACCAAGGATAGCTCGACATGTATGTGGTGAAAGTTTCAAAACAAAATTGGAATTTTTCAGAATTTATGGGATAATTACAATTTATAGCAATCAAAATTATGTAAAGGCGATGAATCAAATGGTGGTCTACTCCTAAAATCGAAGACAATTGTTTTGAATCAGAGAATGCTCTTCTCGTTTCCGTCATTACCGTTGCCCATACCATTTTGCCTCGGCTTGTCTACATGAAGTCCCATATCTTTCCAAAAAGAATTTTGAATTTGCTGTTTGTGTTTGTCCATAACTTTGACATGCCTTTTTTTTTAGCTCGATTCTATATGATAATTTAAGTAAAAATTAAAAGCAACGTATCCACGCATGAAGGGGGATTATTCCATATTGATCCGTATTTGG'..b'TTTTTCGTGTATATACTTTCGCACACTCTTCTAGCTGTCCACAGCGACATTATTACATTTCCCAATATCTATGGACGTGGCAAATTAAGTAAAATCGGATCTTTATTTTATAAATTAAGAAGGTAAATCTACTTTGGTGGTAACCACTATATTAATCAAACGAATTTCTCCAAACGCCAAATTCCATTAGAATTTTGTATAGGGTTTTACTGGATCTTTTCCTTATTTTGAGAGCTTGATAATTGATACCTACTTTGAAAATAGCTTGTAGTGTTCGTCGTTGAAGATCGGTAAAGACCAGTCGTGGTTTTTTTGGCTGAGGCATTTGCTCGATCTGAGGCTCTTCCTTTCGACGACAACTAACGACGTTCGCAACGGACACGTTTGTGACAGGTGTAGATGCAGACGAAGAGGCCGATTCATTGGGCGGAGCTGATGTTTTGTCAGGTTGGTAAATGGACGCCGTTCCAGAACATTGTTGAATAAAATAAAAGAAGTAATTTAATTGGTTATTAAAAAGAACTGAAAAAATTAATATATATCTTCAGTTTTGACTTTAATATTTATTTTAGGTTAAGCGTACAAAAACGCTTCCTTCTTCCGTTTACACACTTTCCGACGAATCTAGTATATCCTTTCACTGGCACTGGCATCGGAATTTTGTTTGAATTCAAATTTAACAAGGAAAAACGCTATAGTCGGGTGTCCTGACTATAAGATACCCGTTTCTCGGCTTAAGGGAGCAAAAGGATAATGAACATACATAAGCAGAATATTTAGGGCGCCACCTACCGGCTTTTTCAGTAGATGTTATGTAGGCGGCAGACAGATTGAAGCGTTTTGGCCATTTATGGGCGTTACAGTGATTTTTTTTGGTGAGTCGATCGGTATTGACGAGACAAATAAATTTCAGTTAAAATTTTATTTCTATCATATAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGCATTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGACAAACAACAAACTTTCGCTCCGTAGGAAGCCCAGAAATCTGCAAGCCAAGTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACAGACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAGAAAATATATACTTTTATGGGGTCGGAAACGCTTTCTTCTACCTGCTATACCCTTTTACTATACGAGTAAAGGGTATAAAAACTGAATCTGGATTCAATAGTTGAGACTATGTTTTTAGCCATAGCTCACCATCCTACTCACCATTTGGTGTCATTGCTGGCCCGGCATGAGAATCCAAATCGGTCGGTATGACGGATGTGGAGCCCGTTGTTGGTCCAAGTGCCAGCCCAGGCCCCAAAGTTCGCTGAGGAATTTGTGCAGCGGCCATCCGTAGAGCAGACATACGCTGAAACTCGGGCTCCTGGAGCCATTTGTACATCCTTCGAAATGTCTCCCTGCCGGACTTGAGCTTCGACCACGGCTTCGGGTTGCGCAGTAGATCGGACAAAGTACCTTGCGAGCGACAGAGAACACGCTGTGCAAAGATCGCCTGTGGAATGCTGTACCGTTTCAGTTCTGCCGAGATGCGCTGAGCCAGATCTTTCGTGTTGATCTCCTCCATGTCGCTGGTGTGTCCATTGCGGCTCGATCCTCCGCCCGCACAGGTTACGGACGATTTTGGCGAGGCAGGGACAGAAATCTTGGCCTGCTGGCTGGAACCTTGAAAGCCGTTTAGGAGAGCTGATTGGGGCTGGTTGCGGATGGCACACACTGAGTGCGGGGTACCGTGGATGTTCGGGCTACACTGTTCTGTCGTCACGGTGTTGCTTTCTTGATCTTTGTCCAGGAAAAAAGGTGTTCTTTGCCCTGGGGACAGTCGCTCATTCAGTTTGAGTCCGGCCCCTGAATCGTCTGTTACGGGGGGAGGGGTTGGAGTGAGAGACACTACAACTGGCAGATCGGCAGACAGACTAACAACGCTTCCGTTGCCGTGCTTCCAATCATCTGACTTCCAGTCCGCAGGGCAAATAGGAGTGGCCGTAGGGAGGTGGCGATTCATGTGTCCCCGCTCAGGCGGCATGTTAAGCCGAGATCTTCGTTCTAGCGGAATGTGGAACCGAGCCTCCAGGTCAGCCGGCATATGAAGCCGCACCTCCTGCTCAGGGTGCATTTGGAGCCAATTCCTTTAAATATACAATATTGTTTTAAAGATTATAACTTAAAATTTATATAAAGGTTCGAAGATTTACGCTGAAATACGAATTCCTAAAAATAACGTCTAACGCCAAGCGTAAGAGGTTATATGTTAAAAAAAATAATTTTTTTAAATTCCGATTATTCCCATTGGAGCTAAGAAATAATTTCTTTAATTGGTTCCGATTATTCCTATGGGAGCTATAAAGTTGTCCTATCCGGCTGGTTCCGACTTATATATTACCCGCAAAAGAAAAATGACTTGGGAAAGTTTAAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGCACAGACGGACGGACAGAAGGACATGGATAGATCGACTCGTCTAATGATGCTGATCAAAAATATATTCTTTATGTGGTCGGAAACGTCCCCCTCACTCTTGCAAGCTTCTGACTTAAGTCATTATACCCTCGACAAGAGCATAATTCGCTGAAGTATTCAATCTTTTTAAAGTCTGATAATTTTAAAAAAATTTAGCCTATATAAAATCGGTGACCAAACAAGCGATCATATATAGGTAAGGCCAGCGGCTAACATTGATTATAATTTTAAAAAATACTTTAAAGGCCTGTCGGAGAATATAAATGAAGCGTTCTTTATAGTCTTTGGAATAGCTTTTAGCGGTATACATACGTTCCTCCGTTGACACCGGGAACGCTTTCTGCTCCAGAGATGTGATCAGAGTAAACGAATTTTTCTGCATTGACATCTGCGTCTCCGCTGTCTCCTCCAGAGATGTGATCAGAGTATGAAAACTTCTCGCCATTGACATCGGTATCTGCACTATCTCCTCCAGATATGTGGCCGGTGTAGGGAAACTTCCCCCCATTGACATCGGCATGACCATGGGGGTGTTCGTGAGCTATTGCTGATTCTTTTTTTTGCCCGTTGTGGTTTAGCTGCAGTTGAGATGAGTTAGAGACGCGTGCCGAAGCCGAGGCATGCAGATCGCACGAGACCAAGTAGCTATTGGGTGGGGGTGAAATCATTGACGATAGCTTCTCATATGAGGAATATGGAGATTGTACACCGCTCAACACGCCCAGACTTAAGTGCCCACTTCCCATGGGCATGGTAAGGGCAGGGAATGAGGAGGACGCCGGATTACCACTAATGATTAAACCCGTCCCAGCAGCATCGGTGGAATGGTTGGTAACCTCTCCACCGTCGACCACTCCTCCAACTCCTTCTCCACCATTGACATCCGCGTCGCCGCTGTCTCCTCCAGAGATGTGGCCGGAGTACGCGAACTTTTCGGACATTGTCGATATAGGCGGGAGTGGTTGGATAGGGGTCAGGGTGGCGTAAGATGTCTGACTGAACCCAGGCGGTGATAGTCGATCATTTACCGAGGTCAGCGTCTGATACGAGCTGTGGCTAAGCATCTGCCCTCGACTGCGAGAGTCCCGATCATCGTCGTCCTCTGGATCCCCGTCTCCCTCTCCATCGGCATCTCCTTCGCCGTCCACCTCTTTGTCGCTGTCCTGCGAGTGGACGATGACCGACAGAACCTCGCCATGATCCGCCTCCAATCCCATTTCCAGCTGAGCTGATCTGTGGTGTAGACCGTGAAGCGCCTGAGAATGAGCTTGGTGATGCGGATGGTGGCTAGTTAGGCCGTATTGCTGCTGCTGTTCCAAGAGCTGCTGATGATGCTGGTTCAGCGTTATCCCCTCATCGTCGCAGCCGACGTCGTCGGAGGAAATATCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCCATTTCATCCACGTCCACGCCAAGACTTGCATTTACATTCGCCACTTCCACGTGCATTCGAATGCGCTTATGGCCTTGATCCACGCTCTTCGATTGGGCAATAAGTAGCTTCTGCTCCTGCTTTATCGCCATCTCTTGGGAGAGAACCGATTGGGACATCGAATCTACTGTCAGACCATCCAAGCTAATGTCGGACGCTACAAAGTCCACTGGGCTGCTACTCACTATGCGCTGCGGGCATTGCTGCGTGTTTTGACTATTTTGCTGGAGCAACCCGAAGGGCAATGGCATTCTCGGATGCATCTGCTGGGACACAATTTGAAATGTTGTCTGTCTATTGCTGTGGCCCATTGAGTCGATAACCATCACAACAGAATCAGATCCCGATCCCGAAACCAACCCGGATCCAGATCCAGATCCAGGCCGGTGCTTCTTCCCTCCACTAGATCCGTCCGTTCTTGGGCAGGAAGTCATCGTTTGCAGGGAAATCGCCAGGTCCTCGCCGGAATCAGGTTCTCCCTCCTGATGTTCGTGGTGCGGATGAGACTGACGCTCCGAGTTGTGCCCCACAGAGATGAAATCTGTTGCATCTTCAACCAGATCCTGGCTAAAAGTCTGGTGGTCAATTATTTCACTTATGGACTCCATCCCCTCAAGATGTCTCTTGGATTACGTTATCTAAAAATAATAAATTAAGTTAACCACAAATAAGCGTTTAAAAGGAAGTCGGTTTTTATATAATGTTCTATCAGCTTTTCCAAAGCAACTTAACTATGTCTGTAAGAAATGTCCAAATTTAACAAATTATAAAACAGATTGAAACAGAAATTGAAAATTACAAGCCATAATATAATACATTTAAACATAAGCTCCATCTCCTATATATGCTACTTTTTAACGTGTTTTTTGTTATTAGCTGCAAAGAATATTTTTGTCGTTGCCATCGTCGCCGACCTTAAGGGTTGCTCCGTAAATACACAAACATAGATACACGTAAGTGTATTACCGCACTCACACATACTCATGAGGCAAGGGGTAGGTGTTGCTTGCACTTTTCTAATACATTTCCATTTTTTGCATGTGAACAAATTGGCTTAAGTTTTCTTATTTAATATAAAACTAATATAGCCTTTTTTGAAAATATTTACCCAACTTCCAAATGACCTTAAAGCTACATTTCAGTAGCTAGGCGTCGTTTGACTTTTTTTTTGACATATCGAAACACATTTATGCAAAGCACTATTACACAAATCACTCGGACGGGAAGATTTTGAAGGAAAATTTCGTTCTGTTCCTTTACAGGATCTTTCGAAAGGCCGAGCTCAAATCCGAATTATTTGGGGCTCATTCCAAACAGGATGTCTTTTCCAAAAGAGGGCAGCTTTTGACTGGGTGAAACTGATAGAAACCTATGGGCTCTGCCGCAACGCCTTGTTCATGTGCACAACTGAATCCTTCGGCTAGAAAATTATCTTCGCTTCTTCGTGTATACACATATGTACACTTCACATGTGGGTGGTTTTTCCGAAAGTTTGTTATGTGACTGCCGTGTTCCATTAAGTCTCAGCCTCGCGCGAATTATACTTAATTCGAACTGAACGGAACCAAACCAAACAGAACGGAACTAAAATGAACGGCCACAATGCACCACCATCGTGCTAAGGGTTGCCACAGGCAGATAGTACACCATAAACCCCACCCCTAAGGCCAGCTCATGCGCAGTGCAAGAAGGTGAACTGGATTCCAAGTTACAATTGCTCAATTCTCCGCTTACTACTTTTGAAACGTTATATTTTGTATAGGAAAATAACTAAAAACCCATAAGTAACAACGAGTATTTTTTTAATCTAGTATTGTTTTTATTGTTCATGCCGTTTATAAAATGAATCGGACACTCCAGTTCCGTAGATCCCATTTCGTCGAGCATTTTGGCTTTCCCTTTTTAAAATGACAAATGAATATGTTTTGTTCTAACAGAGTTATTGCGCTTCCAATGCTGCAACTTTGTGATTCTTTCGAAAAATTTGGAATTTTCAAGTCAGAAAATACTCGAAATTTATCACTGTGGACGGCAGTAAACGTAGTGGTGAAGCGCACCAGAGAGTGGGCGAACAACTATTATGTATAACCGAGGAATTGCAAATCTGCTATGATGGTCGGCAAACCTTTTACGAAATAATCAATGTTAGTAATGCCTATTAAATTTTTTTGGATTTTTGCTAGCTTCAATGACACAAAAACCATTTTTTTTTTCAATTATTTCATTATTTCTGTGACCGTTTTTTCCGCTACATGCTAGTTTGGTCAGAGTTTAGTTTTTTTTAGAAATTCTTAAAAATACCAAAAAAAATTATATTTCCAATGGTATAAAATAATATATCAAAACATACTGAAACTATAATTTGTTTCATATTAATTTCCTTAACAATTTTTATACTTGTTACTATAAGGGTATACTAGACTCGCCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATGTATTCTTGATCACGATCACTAGTCGAGGCGATCTCGCAATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGAATAAACGCTGAGATCTTGAAAACTATAAAAGCTAGAACAGCCAAACTGATGCAGATGTGCAAATGTGCAACGTCCACTCTTACGCCCACAAACGGTTAATGCTTAATGCTTAAGTCTCTCTGTCGGCCACATAACGTCTACTGAAATAGCCGGTAGGTGGCACCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTATATATCTCGACTATAGCGTTCTTCTTTGTTTGAAGTCTCATTTAACATTGCAGCTTTGTTATTAGAATTAGGAGAAAATTAAATTTTTTTTAAATATTAAAGACGTACTCTGCTTTGGTTCATACTTGAGCCTGGGACCTTCCGGATCAGAGATAGACGCCACACCATCTGCTCTATCCACTATGGGAAATTTGACCACCTTTTCTGGCCAAAATTAATAACTTCCTCACTTTCAATGATATCAAAGAAAAACTTTGGCAATCGTTGTTTATTAACAATTTATATTAATGTTGTGATAGAAACAAAAAATATATATAGAGTTTAAATTTTTATCATTTTTTGTTCAATTTAACCGCTAAAGGCCGGTTAAATAAGTCAAAGGTTGCGTTCAGAACTTACCTTTAACGTCTAAACAAAAATGTACTGTATACTTTCTGGCGACAGCGAAAAAAAGGATTCAAGTTTGAGGTTATGATCTAAAAAATTAAATTCCTCCAATAATCGTAAAAAGTGTTTTTCTAACTACATCCATTTTAACTGGAGTTCCTCACTCTTTAAATCCCAATAGGTCTGGTAAGTGGACTCCGCTGAACTCTCTTTGTATCTCAACTTAAAAATTAGTTTTTTTAGTCCCACAATCGAAAAAGCTCATTTGGTTGTATGTTAAAAAAACCAAATTATCATTTGTTTCATATTCTCTTTCACCAAATTTTTCGATCGTTTTTATGACAACTGTATTCAGAACTAATTAAAAAAAAGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAACTACCGAGGATATAATTTTTTCATATTATTTTCCCACCTATTTTTTTATTATTCCTATGTCAGCTATATGATATAATCGATCTTGATAAAATTAAATTCAAAATTCAGAACTTATTAAAAAAAATTATTTCCAAGCGTAGGAGTTAAAAATACCAAAGATAAACCCTTTTTAAAAGGTTTTCTATCGAATTATTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGAAAGAAGACCCCATTCCGACCCCATTAAGTATGTATATATATTCTTGATCAGGATCACAAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGTCTGTCCGCATGAACGCTGAGACCTCGGAAACTATTAGAGCGAGAAGACTTAGACTTGGCAAGCAAATTCGGCAGGGTGCCACGCCTACTCTAACACCCACA'..b'GAGCACTATGATTTTGATGCACAGGCTTGAGGAATAGTGGTTCGAGTCCTCCCCGTGACAAATTTATTTATATTTTTTTATTTAAAGTCTGAAATCAATTAAGTAGTGCAGCTTTTTTATTACAATTATAAGAAAATTTTAGATATTATTCATAAATACTTAAGGCGTACTCTGCTTCGGTGGGTACTTGAACATAGGACCCGCTGGATCAGATACAGACGCTTTAACCGCTGTTCGTTTTCGCGGGCGTTAAGTTCTAATGTCATGAAAACCAAAAGGTACTAACGCGGTATAAAAAATCCACGACACACCACTTCGAGTCGAAATGCAACACACTTTTGGTTCTATTTTTCGTTCTTTCCGTTCATTTTGAGATTATTGGGTTTCTGAGAACCAATTCAATTTAATTTAGGAACCACGTTCTTGTTTTGAAAACAGTTTCGATTTAACCAATTTTTAAGTACAAACTTAACAGAATTCAAACACAAAGAGAACATTTTTTTAAACTCAGTTGAGACCGTCAGAATTATCTCTTCTTTTCAAACTAAGCAGGTAATTTTATATATTTTAAATTTAAAATTATTATTTTCAGAATGTCCCCTTGGTACGTTTAAATCACCAGAGGTAACCAAATGTACGCCATGTCCGCCTAACTCAAATTCTTCAAAAACTGCATCACCATTTTGCAAGTGTATGCCGGGATACTATAGACATCCAAGTGACGGCCGACATATGCCTTGTTACAGTCCACCATCTGCGCCTACAAATCTAACGTTGTTGTTTGTTGATCAAACGAGTGCCATAATATCTTGGAGCGCTCCAACCAAGAATAAAACGAACACGGGCAAAACGCTGTCTAATAAGTACCACAGTGATATTGTGTACAAGATCCGGTGCAATATGTGCAGCCCAAATGTTATGTACAATCCGTCAAGTGACACATTTAACGAAACGAAAATAACATTAACAAATCTTGAACCGGTTACGACATATACAGTGCAAGTACACGCAACCAATAGCGTGTCGCATCTTACCGACTTAAGCCGGCACCCCAACGAATCGTCACTAATAACAACCAATGACACACCATTTTCTAATGTGTCGTTTTTCACCATTCCCTTGGATTTGAATGAAATAAAGACCAGTCACGCAGAAATTGTGTTTACTACAGAGTCTGTTTTGCTATCTACAGCTTTTAACTTACGTATATTGGCCATAACTAGTAAAGATGCCGATTTGGAGTGGGACAAGCCAATTCAAAGTGATTCTCCACTTGAGTTTTATGAACTGCGTTGGTTTCCCAAGTTAGAATTAGATGTTATTAATAAAACAGCTTTGAATACAAAGGAGACAAAGGCACATATAGAAGGACTGATGGAAAATACCGAATATGGATTTCAAGTCCGCTGTAAAACAATAAATGGTTTTGGTTCTTATAGTAATATGATTTACGCCCAAACTCTTCAATCCGTTGGGTCAGGTAAATTGTATCCACTTATACATTGACGGTAATAATTAAACAAAGTGTCCTTTATAACAGTATACGACGATTCCGTGCAATTACGATTTATTGCTGGTGCCATTGTGACGGGAGTACTTTTTCTAGTGATTTTTATAATAGCTACGGTATACTTCATGAGATCCAAACATCAGGATGAACTTGATAAAAAATCGACAAATCATTTACCCTTACCATTGGATTACGCTACTAATGAAGGTTAGTTTTTAAATATTAATTATGTATAACTATTATCAAGTATAATATTTAGAAATATAAGCCCGTTTTTAGTAGAGTAAAATTGGGATAATGTTTTTTTTTATTATTTTTCCAAAAGTGGTAGAACTAATGTTTCTTGAGCTGTTTAACATCGTCTAGAATTTTCAGGACTCTAAAATAACGTTTTTCGATAAAATAATAAACTGACTGATTGTACGTCTGTCCGTCTGACTTCCGTCCGCTTCTACGCAAATTAGTCTCTCAGTTGTAAAGCTATCGGGCTATCCAAAAGTTGCGAAAGTCTGACTGAAATCATAATACCGACTGCAAGGGTATAAAAAGTGTATCTTTGTGTTGTTTAACATACATCCTCCTAATATTGGAAATAACATGTCTTAGTTAGTTATTAATTTCAAACATAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCAAATAGCTACCACAGGAACAGGAACGATTGGAAAATTTGTGGGAAAATAGAAATAAACATGGTTTTTTGATCTATTATCTTATACTAAAAAGAATTTAATTTTTTTTATTATTATGAGTTTTGAATTTAAAAACTTTAAATTACCGGCGATCGAAAAATTAATTACATTTTTGTTGTAATAGTAATGCCTTTAAAATAAGGGGTAAGTAGTGCGATTTTTTCTGTTTTCAGAGGTAAACTTTGAAACTAGTTTGTGGTGCTTTTTGGTTCAATGGGAAAGCTCTTTAAAAGAAGGGATGTTTGTAAATGTTTGTTGGATATTTTGCAAACATTTCCGAGGAACTGAATAAACTGTACATGTATCTTTGAGGACTTCTTAAATAAGTAATTCTTTTACTAACTAGAGAGAAGATAGATGGTTTTTTTTTCCACGTACGGCGTCTTGTTGAACAAAATAGCCATTAAATATTAATAACTAACTTTTTGAGCAAATTTTTTTGGTCGACGCCAAAAAAACTGACCCACTGAATCAGGATGGGCAATTTAATTTCACTTAAAAAAATTGTTTTTTTATCCAATTAAAGAAAAAACTTTATAAAACTGCACTTTAAATTTGTTATCAATTTTAAATGATTTTCTTATCATAAAAAAAATTAAAATATTTTTCCTACGACTAACAAAGGTTAAAAACTGACCTTTTTAAAAAACAAGAAAGGAAGTTAAATTTGTCATTCCCAAATTTGTATACCCTTGCAGTTAAAAGAAATAATCAACGTTAGTAACACCATGTTGAAATTTCTAGGATTGCTGCTATAAACAATAAAAACTATTTTATTATTTCTCTAAAAATTTCTTCGACAGCTAAATGTTTGAGCCGCTTTTTATTCAATTTAATTCGAAATTCATATAAATATAGAAAATTGTATTTCCTATATTATAAGATAACACATACATATGTCAAAAAACACAGATGCTATAATTTGTTTCAAATTATTTTCCAACAAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATGTATATAATAAAATTGTACGATTTTTATAAAATTAAATTCCAAATTTAGAACTAAATAATGTTATTTCCAAACGTAGGAGGTTATATTTAAGAAAAAACCAATGATTTAATTTTTTGATATAATTTTCCTACCAAGTTTCTGATTGTTTCTATGAAAGCTGTATAATATATTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAATTCGAAACTCAGAGTTATATAATAAACGATATTTCCAAGCGTAGGTTATATGTATTTATATAGGTTACCAAAGATGTTGTTTTCTGTTTTCATATTATTTTCCCAGGAATTTTCCGACAGTTTCTATGGCAGTCCGATCCGGCTTGTTCTGACTTATATACTACCTGAAAAGGGGAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCGCGTTAGCTTTAAAACTGAGACCCTGGTTTGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATTTATTTTATTACTTTATGGGGTCGGTCTCATTCACTGCGTTGCAAGCTACTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAACAAGATGGTCATACTGAAACTAATACATAAATTATATGGTCATACTGAAAGTAATACATAAATTAAATTATTGAAGTAGATAGTTTACTATATATCTAAAGGGGAGGATACCTTTAAGCAATTTACCCTTAAAATTACCATGCAATTTTATGTTACTGATGTAAAAGAAAATGTTCTTTAGAACAGGTAATAGAGTTTCGAAGGTCCAATAGCTATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/577/1f0/60/scaffold_35-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAGTTGAGATACTAGTTTCAGAATCTTTAATTTCAGCGCATGTTTGTTATCCGAATGTGCTATGCCCGCTCAAACGCTGACAACGTTAAAGTTAGAATGATTTTGCAAAGATGTCCAAGAGATTTCGTTGTGGGTATCTCTACCCGCCTACATTTGTTCAAACGGTCCAAGCGGTATGATCCCCTATGTGCAGAAGTTTTCGAATAGCTGCCTTAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGAAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATATAACCTTATGAGCTTGAAAATTATTTAATTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAACATATAGGATATAGTCATAGCAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTTTATCTTATAATATTGGGAATATAAAGTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTCAACTTCCTTTTTTGTTAGACTATTTTTTTAAACAATATTTTTGTAAAATTAAATTTTTTTATTTTTACTTATAATTTGTTTTATATTTTATAATTTTAAATTATGTTTTTATAGCTAAAATTTTTTTTGATTTACCACTTGGGACTTTAGGAATTAATCGCTCCTCTAGATATATATCTTTTGTTTGTAAATTACATATTACAAATTTGAGAAAAAATCGAATAAATTTCTAACAACAAAACTGAACACAATGTTCGTACCCAAGGGTGCTTAACATTACCAGCACCCAACAAATCAGTACCTGACGCACGGTATCACCCACTAGCTATAAGAATTGCTGATCAGTATGTTATATTCAATGTCAACGGTTGACTCAACGTCTCAACGGCGCACTGACCCACCAAAGCGGTCAGAACATTGTAGCAGAGTCAGCAGAGTCAACTACGTTAACTGCTATCATCATCGAAAACCACCTATTGACCTACTCTAGAATATGACTCATCTCAGTAAACTTCCGTGTTCTATGTAGTATATAAGCAAACCAACTTTAGAACAAATCAGTTATCCGCACTTATAACTCCGCGGTTCTACTTCCTACTTCTGGGTATTGACCTCGTAACACATCTCAACTAACCTCCGGTAGCTCAAACCTCAAAAGTTTTTGCTACCTTTAGTGATATTCAGAACTGATTAAAAAACCGTATTTCCAAGCGTATGTTAAAAAAAGGACCTTCAAAAAGAGTTTGGATACTCACAAAAAAGGGTCAATGCTTAGGCAGTGTTAGATGCTCAGAACTGGTAAATGTGGCAATTTGTTTTTATTTATAACTTTTACAAGAATGTGTCGTATGCCAAAAGTTGAGGAATCCCTTTCTGGTGCGCTGCGGTCCACGATGATTGTTGTCAGTGGAACTATGTAGGATCGGTTGAAAAAATCGAATCGTCGGTAGTGCTAACAGCTGACCAACCGGCCATGTCTTTTTGTAGGTTACTGCGTTATTCAACAGCTGACCCCAGAAATTATCCATTGTACATGTCGATGGCCAAAGCTGTAACAATTTTACTAGTTCCTTAAACCGAATTGGAAAAATAAATTTTAAATATTTGAACCTTTTTAGTTGACTTTGTGGTCGGCTTGCCGATTTAAGGTAATTTTAAAACTTAAAGGCCCAGTTGGGTATAAAAAAAGTCGGATGATCGACTAAATATTTTTTGATTTTTAAAACTATATCAATCCTTTTTTCAATATTATTCTTGTTTTTATTTTTAGTTAATTCTATGGATACTACTCCAATTGTCAAAACACTTCACTTAAACGGTATATCTTTTCGTCAATTTATATATTTCTCTTATCCTCTAAGTCGAATTAACTGGTTATTGGGGTTGCATGTTTTTATATACTACTATATATTTTATATTAACAAGTTTATTACGACATCTATTGTCAGATGTTTGACTAATTTGTCGAGCTCCTTCGGTGGAGTTACTTGTTTAATATAAGCATTCGCCTAAGTAACAAAGTAAACATGTGATCTAAAAATCAAACCAACCTGTCACGATTGTGGAATATAACTCGAGATTAAATTAGAAGCGGTATTTTTATCTTTTTTGTAATGTCTTAGAAGTAGTTCTATGAATGGTTATCCAGACTTCTTTGTGGACACGATAATCTTCTCACGCAAACACCGTGTCAACCTATATATGTCAATTAAAAAAAAGGATTTTTACTCTCTTCTCTATTCAAAAAGCTGCCTTGATTTAAGGTGCGTTTAGCAGTTAAGACGTTAACCATGTTTTTGTCTTACGTTGAACGTGAGCTGGCAAAGGCCAACCAGAGCAATTGCCTATGCTTTCCTCATAGGACGCTGGCGACCGCTACTTTAAAACAGAATATTTTCCATCACTACTCACAACAAGGTCGCCCACAGCTTTGCTGACGAATATCAAGATTGACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGGAAGCCGAAGTTTGTATTAAGAGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCAATCTTGATATTCGTTATAAGAAATAAGCAACTTTAGTAACACCATGTACAAATTTTAAAGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTCAAAAAAAATTATTTCATTCTTTTTTTAGATTGAATTCGAAGTTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTATAAGATAATATGTCACAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTACACATAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAAATTAAATTAGGTATAATATTTTATTTATTTTATTCCTAGCCATATCTGTCTGTCCGTATGAACGCTGAGATCTGGGAAATTATAAGAGCTAGAACAGTCAAGCTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCTGAGCAGCGCATGTTTCTTGTTGCTTTAAACCTAAAGCGCCCACTCTAACGCCCACAATTCCCAAAAATCTGTATGATAGAAAAAAATGGTAACTAAAATGTGTTGTCTCATCAATACCTATTGACGCAAAAAAATGTGGCACGACCACTCTATATTATTTTATTATTTTACTGACCTTTTCTTTGACAGCTTTATGTTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAATTTTTTTTTCGAAATTCAGAATAAATTAAAAAATGTTATTTTCAAACCTAGATATAAATATAAGATAGAATAAATTTTATATATTATTTTCCGACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTACGATTTTGATAAGATTTAATTCAATATTCAGAATTAATTAAAAAATTTGTAATGTTATAGGAGGTTATTTGTGGAAAACACCAAATATACAATTAAAAAGATTTTTTCGATTATTCCTTTGGGAGCTACATATAAGATATATATGTCCAATCCGTTTGGTTTTGACTTATATACTACCAGCAAAAGAAAGTAGACTTATGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTAAGAGAATAGTTTGCTTAGAAACGGACGGACAGATGGATAGACGGACAGACGGACGGACAGAAGGACATGATTAGATCGACTCGCCAGTGACGCTGATCAAGAATGAATATACTTTATGGGGTCGGAGACGTCTCCTTCACTGCTTTCCAAAAATGTAACTTTAAATCATTTCAATTTCTTTTGTATGACAGTCCTTTCTTTGTATTCATACTCTTTGGGAATAGCTTTTATACATACTTTCCGAGATCACAGCGCTCTTACGGAAATTGGTATTTGCCTCTTAGGGTCTAAGCAACAGCCGCTATTTTCGTTCCGTTCGCGCTCTTGGTCTCGGATTTTTGTTTGGACAGTAACACACAAATCGGTCCCTCAGAGACTGGTCAATACATTTTTTACAAGAAAATCATTAAAAAGAGGGAAAACATGAAAGTGATAGGCCGTTTTTTATATCCTTTCAA'..b'TAAAATGTAATGTAATATGTTATAAAAAAATACTTTTTTATTTATATTATTTAATCGGATTACTGGTAATTTTATAAAGCTTCTTATTTTCCATTGTCGTTTTCAGTGACGACACCTCTATTTGGAAATAGTAGGAGTTATGTAGATCCGCATACATATGAAGACCCTAATCAAGCCATAAGGGAATTTGCTCGGGAAATTGATGCAAACTATATTACTATCGAAGCTATTATAGGTAAGTTTTTCTCACAGGTCAAATGATTTTGAATTCATAATAATAAAAATACAAACTTCTTAGGTGGTGGAGAATTTGGAGATGTCTGCCGTGGCCGCTTAAAAATACCTCCCAATTTTGTACAGGACATTGATGTGGCAATAAAAACTTTAAAGCCAGGTAACGTAATTTTTCTAAGCTATAAGGGATACTTCTAGAGCTTTGAAAATAATGCTTTTTATGTCCTAAATGTCAAAAAAACATTATCAAAGAGACACTTCTAGACCGATGAAAAAAATAATTTTATGTCCCAAATGTCCTAAAAATTATTAAAGATGGCTTGAATAGGAGCTTATTAAACAACAAGGTATAAGCAATATTTTTGTTTAAGTAGTCTTTTAAAAAAAAGCTTAAATTAAACTTAAATGATTACAGCTAAAAGGTGTAAAACAAAAATAATTAAAACCAAAACACACAACACCTAGGAATGTTTTTCACAAATCTAATAAATACTTATTTAAACAGGATCTTCGGAAAAAGCGCGCTGTGACTTTTTGACGGAGGCTTCCATTATGGGACAGTTTGATCATCCTAATGTTATTTATCTACAGGGAGTAGTTACACGCTCAAATCCAGTAATGATTATTACAGAGTACATGGAGAACGGTAGCTTAGACACATTTCTTCGTGTGAATGATGGAAAGTTTCAAACCTTACAGCTGATAGTAATGCTTCGAGGTATTGCCAGCGGGATGGCATATTTAAGTGATATGAATTATGTACACAGAGACTTGGCGGCACGAAATGTTCTTGTAAATGCCCAATTAATTTGCAAGATCGCGGACTTCGGTTTGTCACGCGAAATTGAGAACGCCAGTGATGCCTACACAACAAGGGTATGTATAGGAAAAGGGATATTTTGATTTTTTTAAAGTATGTAATTTGTTAGAAATTAAAATTAAAGCAGAATTGAATCATTGGCATGACTGAAACAATTGCCAATTACCTCTTACCTAACCTAGCGATTACTCTTCCAACGCTCTTTATTTCTATATCTTTGCGAGGGTATAACGAGTTTAGCCGCACCGCACTGAAGGACACGTTTACGACCCCATACAATATGTATTTTCTGTCGTCTGTCCGTCTCTAGGTAAACTAGTATTTCAGTTTAAACTTGAAATTAAATGAAACCGTTTTAAAAGTCTTGCTCAGCTAGTTTAGTTGGATTGTACGGTAATTTTAAAATGAAGAAAGTCTATATTTCTTGTCGTATTTTTTCGTGTTTTCACAATATTAACAAATGTTATACAGTCACTAAGATGGTACAAATTTTAAAGTTTGCCGAGTTGGAGAATTCTTGGAGCATTTACAAAATATTATTTTGTAAACTTGTCTTTTTAATATTTCCATCTAATATCCATCTCTCCAGCCAACAATTTTTCAAATCTGAATCTAAAATGTTTCTTATAGATTATATTAGTGATTGTTCAGCCAATCATTTTTAACATTTTCTAATTAGACGTCTTTTTGGATTAAAAAAATTATAAACAAAAAATTTTTTTTCGGGTTTACTCCGATACACGCTATTACTTACTTACCGACTAGTATACGTAAAAAGGTTTCAGGCTAATTCAAAATGTGGCCAACAAAAGGGGGTCGATTTGTAAATGGACATTTGTGAATTTCCTCTTTTGATATATTTCCCATAAAAACCAGTAATTTGTATATTTTTGGTATCCAAAGGGTGGCAAAATTCCAGTGCGTTGGACTGCGCCAGAAGCTATTGCTTTTAGAAAATTTACTTCCGCATCGGATGTATGGTCTTATGGAGTAGTTTTATGGGAGGTCATGTCGTATGGAGAGCGCCCATATTGGAACTGGTCAAATCAGGTAAAAACTAAACCTAACAAAACTAAAGTATTGTACTTAAAATGACTTTATAAATTTTATATAGGACGTGATAAAGAGTATAGAAAAGGGCTATCGTTTACCAGCTCCGATGGACTGTCCAGAAGCCCTCTACCAGCTAATGTTAGATTGCTGGCAAAAGCAACGTACTCATCGACCCACATTTGCTAGCATCGTTTCAACTCTCGATAACTTGGCAAGACAACCGCAGTCATTATTGACTACTCGAAACTCACCGGAATCAGACGGTACTCATGTTTTAGATACGCAGCGTGGTCAAAATATTTTCATAAGCACCGACCTTTGGTTGGAGAACATTAAAATGTCAAGATATTGTCAGCATTTTAAAGAGGCTAATTTAATTAATGCTCAACAGGTAAGATAATCAAATTAAAATCTGCTCGGAAAAGTTACTTATTTAAATATGTAAATGCAGATTTCTAGGTTAACAGCTCAACAATTGTCGGATATGGGAATTACTTTGGTGGGTCATCAAAAAAAGATTTTACACCAAGCCCGCCAACTGGACACTATAATATAATCGTTTTATTTTGACTTAGTAGTCTATGATGTACATATAAATAATATGATATATATTATATACACTTCATATATATATATAAAAAGAACAAATAACACGTGTGAAATACAAAAACACAAGAACACATTAAATAGTTTAAGATTTTTATAGGTTCTTTTAACTAGAACTTTAGAATATATGATAGAGAAAAGTATTGATTTGCGTCGCTTATACAAAAAGCTTACTTTATTTATGAGTATCAATGGTTTATCATACAGTTTTCAGGCTTAATATATATGTATATCGTCGCTTTTAATTGCTCAGCTATTTTTTTAAGTTTTTTGTTGTGATATAAGTGACATAAACAAAATTATTAATTTTAACTAAACTTTAATTCATTGCTTATTTTGCATATAACATTAAAAACTCAATAAAAGTACATTCGTGCGTACGGTACGGTTTTCCGACCTAATGATTAGAATTATAACTATTTTTTTTACTAAAAGCTGTACAATTATGGTGGGCCGAAGATTAAGAGCTAATTAGTTTTTAGGACTCTGTCTTATAATTACACAAACTATACTTCCGATTTAAAGGGGATATTTTTGGATAATTGTGTGTAGAAATTATTCCCATCTTCTTCCCTTCATTTTCATCTCGATGTGTCACTCTTAATTTTGTTAAACATTTTTCTTTAAACTATATACAACTAAAGAAGCTAATCTTTGGTGAAGCTTAAATCACCAAGACATAAAAAATCGAGTTTTTAAAACATATATTTTGAAACAATTAACTATAGAACTAAATAATTTGAACTCCAAATTATATAAAGATGTTGAAAATTTAAAAAAAATTATTTTTAGGACTAAAATGAAAGGGTACAACAGTATTTTAATCAATAATTCATTAAAATAATAAAGGATGCATGTTTATAGTAAATAGTGGCAGTATAAATGATTATGCAAACACAAGACAAGTCGCAAAGCAAATAACCGTAGATGGATATAAAGCTGTAGATATTGATACACATCGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGTGGTCCAGGGCTATATTGCTGGTATTGATATTGAAATAAATTTTGGCCCAGTAATGATATTAGTTTCACCGTTTTACAAATTAAAATTTCTGATGTTTTTATAACTAAAATTTGTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGATGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCCTGATCAGCATCACTAGACGAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGTTATCGGCCTGAAACTTTCCGAAAAGTTTTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTCTATTTTATATCTGTAACCTGCTCTCTATGCACCATCTGAATTTCTAGTAGAATTTTTCGGTGCTATTTTCTGCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTTGATTTACTTTGTATTTGTTCGTACTGAAAGTTGTTAGTGTTGCACAAGCCACGCTCAGTCGATAGAATATTTTTTTCTCTCTCTCGTGCTCTCTTACGTTTTGATAAATTTTCGCGATCTCGCGTTCTTATTTTTTTTGTGTGTTTTGTGCTTTTGTGATTTTTGAATTTAATCCCAGTGCCAAATTTACATCGAGGTATTTTTGATATTTTATTTCATTTGTTTGTCTTATAATGGCCCTTGTCTGTTCTAAGAAAAACTGCACACTTGCGTCTTCTACGAAAGAGCCCTTTATTTTTTGCTGGCTCTGCGATTCGATGATGCACGACAAATGTGCAGGATTCACCGGCAGAGTTGGTAGCAGCAGTTCCTGTCGACACAGGGTTAAGCGAACCAACTGTGCGTATTGATACAGCTAGCTCAAGTGTAGCCCATGTTTCCGGACTAAAAGCTTCTGTACTGGCTAAGTCAAAGAAATCAGTGCCGACCGTTCCTATAGGTACTGTAGGCACCGATCTTGGATCTCAGCCTAGTGAGGTTCAGACTGCTGCTGGGGAGCGTAAGAAACTTTCACTGGTGTCCTGATTGCCGTTACCTCTAGCCTAACATCTGAAAGAACTCTCATTCATATACCCAATGAAATTGAATTTCTAAGTGTAAAAGTTTCTTTGCAATCGTTATCTGTTTTTGTTACATGTTCCACCTGGCTCTGACCTAGTAATTTATGAGCATCATCTGTCTGCAATAAAATCTGTTTTATCCCTTCTTTCTAACAGAGACCTTTTGATTGTTTAGGTAACTTTAACCTACCTGATATTTCTTGGTCTCCTCCTACTGACTCATTTGTCGCTATGCCGTTATCCGCGCATGATTTTGTGGATGGCCTTTTAGAATTATCGTTACAGCAAGTAAGCTTTATAAAAAATTCCTTAAGAAGACAATTAGATCTTGTGTTTGTTTCAGACCCATCTGAAATCACGCTCTTGTTGTACCTGAAGACCTATATCATCCTACTATGGAACTGACAATTTGCCTCCCCTGCTCTGATACCCTCTATCCTTTAGTTTCTCCAATTTAAATGAGATGTTTTCGTAAATGTAACTATAATAAACTTAACGATATGATTTCTCATTATATTTTTTCGAAATATGTTGTGGCTCGAACAGATTTTAATGTTCTCAACAGTCATTGCTACTCTCTGTATCTAAGTCGATGTAAATTTGAATTTTCAAACGATCCGAAACAATTTTACAATTTTGTCAATGCCAAGCGTAAGGCATCGGCGTTGCCTTCATCGGTACGTCTAAACTCAATGGAGGCATCGACGGATTCTGAAATTGCTGATTTATTTGCTGAGTTTTTCCAAACTACTTTTAGTTCGACAGCTTTGTCAAATTCTAACTACCCTAATCCATTAAATAGGGCAAATTGTATCTTCTCCCCTGTAATCACCGAAAGCTCTCTCGTAAGAGATTTAGCGACAACAACGCCAACATTTTCTCCCGGTCCAGATGGACTTCCTGGATGTGTGGTTAAGTTTTGTGCGTTAACCATTTGTAAACCGACTCATAAACTTTTTAATTTGTCTATTTCATCATAAGTTTTTCCTTCTATTTGGAAGAACTCTTTTATTATTCCACTCCATAAAAAAGGTGCGAAGGCAGATGCCCAAAATTATAGAGGTATTTCTAAATTGTCAACAATTCCTAAAGCATTTGAAGGTATTATCACTTCTCATTTGCAACATTTATGTTCCTCGCTTATATCACCGTGTCAGCAAGGTTTTGTTAAGCGAAGATCGACCACCACCAACCTTCTTGAATTGTCATCTATTGTAATAAATGGGTTTAAGAAAAAAATGGAGACTGACATTGTATATACAGATTTTAGTAAGGCCTTTGACTCCTTTAACCACTCACTTCTTTTATTTAAATTAGATCAGCTTGGGTTTCCTGGTAATCTATTATCTTGGATTTCAAGTTACTTGAACGGTAGGACTCAGAGGGTTAAATTCAAGAATGCTGTTTCAAAATTGATCTACGTGACATCTGGAGTGCGTCAGGGTAGTCATTTGGGCCCTTTGCTGTTTACTTTGTTTATTAACGATCTTCCCTTAATCATAACACATTCTCGTGTACTAATGTATGCTGATGATGTTAAGTTTTGTTTATCATATAATGATATAGCGTCGGCATTTAACTTACAGTCGGATATTGATTGTTTTCATGGATGGTGTGAGTACAACCTTTTAAATTTGAACTGCCTAAAATGCAACGTTATGACTTTTTATAGGGGTACTCCTACGTTTATCGGTTACTTTCTTAAAAATACGCCACTTGACCGTATTTATTCAGTTAACGATTTAGGTGTTCTTCTTGACCCTAAACTTAAATTTGACTGCCACATTATGTCCACTGTTAACCAAACCATGAGTGTTCTTGGGTTTATAAAGCGTTGGTCAAAAGAATTTGATGACCCCTATACGACCAAATTATTATTTACCTCCCTTGTCCGTCCTATTTTGAAATATTGTTCGTCGGTTTGGAGTCCACAATATCAAGTGCACATCGACCGTATTGAGTCGGTACAACAAAATTTCTTTTATTTGCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCAAAACGTAAGGCTTCCTTCCTACGAGAGTAGATTACAATGCTTAATTTACCTACACTTGTAAATCGTAGAACAATGCTTGGTACTATTTTTATACAAAATCTTATAAGAGGTGACATTGATTCTGCAGAACTTTTAAGCCGCCTAACATTCAACGTTCCCGTTAGACTATCACGAAATTATTATTCTCTAAATTTGCCACGATGTACATCAAATTTTTGTCTGCACGAGCACTTTCGCGTTCTATGTAATAACTATAATAAACTTTATCATTTAATTTGCATTTCAACATCTATCCCGGTATTAAAAACTAATATTTCAAATCATTTGCTTAATTCTTAGTTATGCTTTATATTTTCATTTGTGTTCCGTCTCTATTTGTTTTATGTATGTATCTTCCTCGCGAATTCGCATTTTTTGCCCAAATTGATAAAAGGGCCCCGCGCGTAACAAGCACCTGCTTGGTGTCGTTGGGCCACTTGTTTGTGCTGTTCGAAGTGCATCAACGTCCATATATATATATAGCACAAGCCTCTAACTTAGGTAGTTCACAAGTTGCGAGTACACAAAATTGAGCTATTTATAGCTGTTTTCTCGCAAAACTAGCTAGTTTTTCCAAAAATGGTAAACATCATCTTAAATTTTCATGATCCTAAAACATAATTTTGGGACAGACAAACTGACATACGGAATTATTATTCCATTTTAAGAAGTTTATTTGAGAAGTCTGAACGGAGCATCCGATTTTGACAGTTGTCATTGTGTCATTCGACGCGTATTCGAAGTGACAGTACAGGTGAATCCTCTTTTTTTGCAATACCTTTCAATTGATGTATTACTCGTAACCATCGACGATTACTGTAGATTTTCATTTCTTCGTGTATATATATTAGTCGCCTTCGCCACCCTTCTGGTGCGCTTCGCCACTACGTGGACTTCCGTTCACAGTGATGGTGTCAACTTATAAATAAAAAATTATATGCCCAATAATATAATATCTCAAAAAGCCCAAAAACCTATAGTTTGTTTCTTATTATTTTCCCACCAATTTTGCGATCGATTCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAAATAATTTAAAAAGATTATTTCCAAGTTTAAAAGGTTATATGATAAAAAACACCAAAGATTTAATTTTTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCGGTCCCATGGCAGATATATGATTTAGTTGTC'..b'TCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTAAACGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTTGTATCTCAGCTTTGAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCTCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATTTTATAGCTCCCATAGAAACTATCGGGGAAAAAAAAAATATTATTAAAATTAAATTATATTTTCCGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTATAATTAGTTCAGAATTTTGAATAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATACCTGCCATATGAACGATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAGTATGAAAAAATTTCTTTCTAAGCTTGGGAATAACACTTTTTATTTAGTTCTGAATTTCAAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATATTAACTATAGGAAAATTAGTGGTAAAATCATATTCAAAAATGTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATACAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTAGTGGGAAATAATTAGTGCGAAAATAACACGAAAAAAATGACTAACGTTGACTATTTCGTATAACTGCATGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGTAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTCGTTTTGTAAATCCATTAAAAAATCTAAAGAAATTTTGAGTATGGGTTTCTAAAGATAGGGAGTGGTACTTTTTAAATGCTTGGACGAATTATCCAACCAATAATCCGATCTTTCTGTAATTGCGGTTAAGCATGTAGTTTCCTGAGCTTCTTGCGCAGGGCAAGTTTTTTTCGACAGGGTGCCATACAGTCTATAACCCCCAACAAGGTAGAAAAAAACTGAAATGTATTGGTGTAATCAATACCTATCGAATGGCCTAAACAAATTTTCCCGCTACCACTCCTAAACACAAACGGCCAAAACGTTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACCAAATATTGATATATCGGGAAGGATGCGCTCCACAATCTCGCTATGCTGCCATTACCGTCTTCCTTTTGCTCCATTTAGTACTGAGTACTTACTTTACTTAGTTACACATATAAAAGCGACGAGCGATATTGTTTAAGTATATTTATATACACTAAGGGTGTACCTCTGGTGGGTGAAATTTATAAGTTTTAAATTTCTACAATACATATCGTACCAATGGAGATAAGTATAGTTTTGATAAAACGTTAGAATCAAAAATCGGGTTCCTTATTATTATAGTCTGTTAAATAACAGACCATCCCGTACCGTTATAGCTCCCGCATTCCTGATTATTACTTACCTAGAACAAAACACCAATATAGAAGTAACATTTTTTCAAACTGTAATTTTTTCTGCCCGGTCATACTGCCAGTCATTTTGCGTGCTTATCGAGCAGCGTTTTGCTTTCAAGCAACTTTTAATTAGAGATTAAAGTTTCTTATCAGGCGTTAACTGCAGTTCACGAGCGAACATTCATATAATGATCTTTTAAAATATCATGAATATGTATTTTTAAATAATAAACGTTACTTAACTTTGGGACCACTGCTCTTCGGTTTGTTTAAAGTATGAGTAAATTAATTTCTTCCAGTTCTATCTTGAAGTGCCAACTATGTTACAGATCAAAAGCACAGGAACGAATGTATGTTTGTACATATTTAATCTTTTCAATAAACAAATATAATGTCTTTCCTTACATGAAAGCGTTATAAGGCAACCCGTGAAGATTACATCAGTCAATTTGATTTTTCAACTCTGTCCAAATTGTCTCGAATAATTGAGAGTAGGTAAAAGTTACTAAGCTATGGTCGAGTTAGTAGAAGTCCGATTATTATGAGATAATACAAAGTACTCGGCTTCAGCCTGAGCACCCTTCCCTAGTGATAAAGAAATGTTCCGCGGAACGAACCGCTCACTTGAATGCTCATCTTTTCCTTTGTTGGTATGTGTAGTGTACTTGTGTACTTAGAAGGCATACACTTACATGTATGTTTATACTTAAATACTATGTACGACAACTATGTACTACATGAGCAGATGTGGGTTCTCGATTTATTCGAGGTATTTAAAGTGAGTGTTTTCACGTAATCCGGCTTAATTTGTAGTCAGTGGTCATCTTATTCGTATCGGTTCAATTCGGTCGGTCTATGTGTTTTTCAATTTAGGAAATATAAACAAAGTGAAATTGTATCTGTGCTGTTTAAGGTAAAAATACTATATATTTTTGCTTTAAAAAAGAAGTAGACTTTCAAATAGTGTTATTTACATCCTAGGCTTTCCCCAAGGGGCCAGGCGTGATGGCTAGGATAAAAAACAATTGCGTGCTGATTGGAATCCTCCTGACTGTGCTTTTAACAATAGCAGCAAGGGGCGGTAAGTGTTCAAAAAATAAACAGAAGGAAACCGTTCACCTTTCAAGAACTCTAGGATCTTTGCTTTACTTACTTCCTTTAAATAACACTAGGGTACAGCCAAAAATGTTAAGCTTTAAGTCGTATTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATTATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAAAAGAGTAGACGTTACCGACACCATAATATATATATATTTTTGTTTAGAATCACTAGACGAGTCGATCTAGCTTTTTTATGTTTTTAAGAATTTTGAATTAAATTTGATCAATATCGGACGACGCTAATTTATAGCTGTTAAAGAAACGGTCAGATAAATATTGAAAAAACTTTTTTTTATAAAATTTTGCTTCATGGTTTTAGTATCAACAATCCTTAAAAATTTAACATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTTGTATAACTGCAAGGGTATAATATCACATAAAGTGAAACTTTCTGGGAAAGGTACATCTGTTGCTTTTAAATAGTGCTCATTGTCGGGTGGATAATGGAATTCTCAGAAATTAGCTCTTAAACACAACATTTATGTAGTATTTTTTTAAGAACAATAATTTTTTCCCCTTTAAACACAATTATTTCACAATATATAGATCGACTCGGCTAGTTATCCTAACCAAGAATATATATACTATACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAAAAATGTATAAATTTGTCACGACCGAGACTCGAAACACTAACCCTCACGTTCATCATGACAATGCGCCAGCAATGTGAGCCACAAATTAATTTTATTTTTAACTTGCGGCAGGATATTTTCTTATACAAATAAGCTTTCTGTAAAAAACTTTTACCAAGTGTCTAATGGATCCTATATTAGAGTCAATTTTATGATTTTCGTATTAGAGAGTTTTTAACACTCAATAGAGTCACATTGACATCTTAATAAAGACATATTGATAACCATTTTTTGGGTATATCGATTAATCTTGATTGTAGTGTGCCAAATGAACAAATTTTAGCAATTGTATTTATTTAATAGATTTTATCATTATCCACGTAGTGATGAAGCACACCAGAGGGTGTGCGAAGGCGTCTACCATATATAAACGAAGAATAATAAACTTTAAGAAAATAAATTTGTTTGAGACAAAGAGCGGTGAAAGTGTAAAAGTGAAAATTTTATCTGTTGGGCCCGGTGGGGATTTATATGTATAGAAAATAGAAATTGTATCTTATATGTCGGTAGGTCCCAAAACGTTATTTTAGAGTCCTGATTCTAGACGATGTTAAACAGCTCTATATAAGAATCATTAGTTCTATTACTAATGTAGTAGTGATGAAGCACACCACAGGGTGTGCGAAGGCGTCTACCATATATAAACGAAGAATAATAAACTTAAAGAAAATAAATTTGTTTGAGACAAAGAGCGGTGAAAGTGTAAAAGTGAAAATTTTATCTGTTGGGCCCGGTGGGGATTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATATGTATAGAAAATAGAAATTGTATCTTACATGTCGGTAGGTCCCAAAACGTTAGTTTAGAGTCCTGATTCTAGACGATGTTAAACAGCTCAATATAAGAATCATTAGTTCTATTACTTTTGGAGAAAGTACTGAAGCACTTTACTGGCGTAAAGTACTGAAGCAACAGGCTTGTGCTTTGCGTGGTTAAAGAGTTATTTCAATATACTATGTACGCCTTTAGACACGATTTGTCTAAGAACCACCGTTTTAAAATTATGGTCCAAAGTTTTTTTTATTTAGATATTTTTTGCCTATTTGCTGATTTTTCAAAAACGCCTCTAACGATTTAAAAAAAAAATTGTAACGTTTTTTATCTCAAAAATTTTGGGATACGTCACATTCTTGTATAATACCCGTGTCTAACATTTCCTTTCTTTGTGCGTATCCAAACTCTACTGTTTGAAGGTCCTTGAAGATGAAGATGATGTTTAACAGCTTAATAGAAGAAACACTGATTATACCACTTTGAAAAAGTTATTAGTGTGGAGAGAAAACAGCTATGAATAGCTAAATTTGTACACCCGTTACTTGAGTACTACTAAATCTAACAAATTAGGCATCAAAAGTTGATGTCAAAACTTTTGTTTGCTGTAGGTGCTATCGTCACTAGTTCTCGTTCAAAAGTGTTTTTTGTTTGATACGACCTACTAAACAAATACACTTTCTACATTTTTCACTTTCACGCTTCATTGAAGTGCAATGTGTCTTTTAAATCGGTGCCTTTTCTTCAACATAATTCAAGAATCGAGAAATAAGAAAAAATTTCATTTTAACTTTTTGGGAGCATAGGGTATTTTGGGCGATATACGAAATGACAGGGAGAAAGAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAATAGATATCTATGCGTTTGAGCCTTGTCTTGCTTGTCGATATCGCCACCTAGTGTGTGATGCCAACTATTGCGTCCTAGCGGCTTCGTTGCGTATTAGGGAAAACAGCCAATTTGCTGCATTTGAGGTGCGGTCTCGATGAAATTTGAAAACATTTAATATAATTGGTTAGAATTGTTTAATTAATAATCCGATATACAAATAAAAACTGTTTCAAATTTTAAGAAAACGTTAAAAAGATTAGTGCCCTTTTTTGAAACGCTAAATTATATCTTTTAAAGCTTGTAATTAATTTTATTCATACACTAAAAAAATATGCTCTTAATTTATAAAATTCGCCGTTATTTCAAAAGAAATCATAGGCGATTTTATATATGCTAAAAAACCTTAAAATTAAGAAAAAATTTCTTGAAATAAGATAAATATGATTTTTTAAATTAAGGAATTTGGTTGGTTTTGAATGCCAATTTTGGGCTGTAAATAGATAAACCGGTTTCTTATTCTAATTACAATTATTCCATGGGTATAGTCAATATATTTTTATATTTATTAATAATTTTTTTTATATAACCATATAAATAACATTGCAAAATATTTTTAGCTCAGACAACACCGACTTGAAATCGAAATCGCGACTGTTTACAGTCAGACGTCTAAACCATTCGTCCTCGCTTGCTTCGTGCTATGTAAAGTCTAAAGTGGTCGAGGTTTTAATATACCAATAACTTTTATTCGAATCAAAACCTTTTAAACAACCGTTAAAACAATGAAAGTGAAACTAATAAGAATATAAATTAAATAAATTTAAATAAAGAAAATTAAATAAAGGGTGTACTTTGTACGATTGTGTCCGGTCGGTCTTTATAAAATTTATAAAAAACGTAACTTTTCCCTTAAAATATGGGTATTTCCTTACTAAATTTAAGTACGAATTTACTTTAATTATTTAGGAAAAAATCGCATTTAGTTGAAGAAAAATTTTAGGGATTCTTCTTTTTCCTCTTCTTCTTTACAAAAAAATGTATAACAAAACTACGTAAGTTTTAGAAATTCTTTCTATAATCAAGAAATAATTTATTAATTTAATTACGTTTTAAAGTCACGGCGATTTTCTCAAATTGAGGGTAATTCTTTTTGAGTGTACTTATTCCCATGAATTGATTAGATGCCATTCTACAGATTTAAATTTAAGGTATTATTATATCTTTAGTAGATTATAACTTTTGAACATTTAAGTAGTTCAATCTTGGTAAAAGGGCATTAATGTCACCAAACTGTATATTTAAATATTTTTCATAGCCGAGAACTAATTTAATGTTTTTTGTAATTATAGAAAACACTTGCAATACAGGATGTACGAAATGTAAGTCACATCAATAAAAAATGTATATATTAGTATACTAACATTTCTTTATCTCCTCGTAGCGGATGATGAATTTTTGAAATATTTACCTGGACATTTCTATGACTACTCCTTCGACAGTATTCTAACCATTGGACTGAGTAGCGGGGCTTTCAGTGAATCCGATGACACCAGTCTGAAAGTATCCGGGTCAGCAAAAATTTATTCGAAGGGAAACTGTGGGTATACGTTGCAGCTAAGTTCCGTGAAGGTGTCCAATACAAAAGAGTCCGTAGAGAAAAGGATTTTGAACAACATTCAAAAACCAGTTCAGTTCACGCTGGTTAGTGGACATCTGGAGCCACAAATTTGTTCAGACTCCAGCGACTTGGATTACTCGCTGAATATTAAGCGGGCAGTTATATCATTACTGCAATCTGGAACAAAGACCGAAAACGAAGTTGACGTTTTCGGCCAGTGCCCCACTCATACTTCGACGTCCACTGTAGGCAATGCAAACATAATAACGAAGGTTCGCAACTTAAACAGATGTGCACATAGGGAGCAGATTAACAGTGGTCTGGTGTCCGGGAAAGTGAACGAGAAAGCTGGTATCACGTCTAGCCTACTATTGCAGGCAAATTATATAAAAGAGTCAAAGATTGTGAACAGTCTTCTTGAAAATGTTCAGCTGACAGAAACATACAAGTTTGTTGGAACTACTAAAGGAAATTCGGAAATTAGTGCAAAGGTAGTCACAACATTAAAACTAAAAAATCCTACCGGAACAAAAGCTAACTCGCCATCTACTGGCTCCACTGTTAGAAGCGTGATTTTCCAAAGACCAGAAACCTACACATCGAAAAATATAAACGCTCTGAAAACGATACTATCTGATCTTGTGGATTTGACTGGCGATTATGTGAAAAAAGATAGCGCTAAAAAGTTTGTAGAATTTATTAGGTTGCTTCGCCAATCTGATAGTGAGACTTTATTAGAGCTGGCTGCATACCCACATCCAAACAAAGTCTTAGCCCGCAAGGTATACTTAGATGGATTGTTCCGTACTAGTACCGCAGAGTCAGCCAGAGTTATATTGAAACAGCTTCCTAAGTTTGATGATAAGGAGAAACTACTAGCGATACTGTCTTTAAACTTGGTTAAAAGTGTGGACAAGGAGACACTCAATCAAGCAGCTGCTCAGCTGCTACCGAACGCTCCTAAGGAATTGTATCTAGCTGTGGGTACCTTGGTTGCTAAATTTTGTTTAGGAAAAAATTGCCAAGGACCTGAAATTGATGCCATATCTAAAAAGTTTACGGATGGCCTAAAACGGTGTAAGCCAAATACTAAGAAGGAAGAAGAACGGATTGTCTATATTTTAAAGGGAATAGGAAATGCAAAGAGCTTAGGTGGCAACACTGCTGCTGTCCTTAGTGAGTGCGCCTCCACGGGCCGTTCCAATCGTATACGTGTAGCGGCTTTGAGAGCATTTTCAACAATTGATTGCAATGGAGCACTGCGAACTAAGGCTTTGGAACTACTTAAGAACCGCAACGAGGACTCAGAGTTACGTATTGAAGCCTATTTGTCTTCAATTTCATGTCCCAACGCAGAGGTGGCCAACCAGATTTCAGATATAGTCAATTCCGAAACAGTTAACCAGGTAGGAGGATTTATTTCATCTAATTTAAAAGCCATTCGGGACTCGACAGACGCCAGCCGTGAGCAGCAAAGGTACCATTTAGGGAA'..b'CAACCGACTCGTAATGCCTTTTCGATTTTTCTTCATCAATGTTTTGAACCGTTGAATGATGTCCATTGCTGGAGATTTCATGGTAATAGTTTTTCTCATCGGTCGAAACACTGTAATCGTTAAAATAATCATAAGCATTGCGCCTGATCTCACCATTTATGCCACTATTGGCGCTACTATCACTACTACGATTTATATCTATTAGATATGTAGATTTTCTGTACGCATTCGCATTTATCTGTCTGCCGCTAATGCCATTTATATTATTGGCGTCTCCACTTTTCAACATCTGAGTTATACTGCCATGGTGGATTTCATGTTGTGTTGCAGATTTAGACGAAATACGAGAATTCATTTTTAATGGACGTTTTTCTGTCCATCTCGTCAAAAATAAGTTCTTCCCATCGTCTTTCTGTATATGTTGTCTTTTCCGGCCTGCAGACCGATTTCTCAAAACTGGATCATATGCATTCCCTTTACTTATGTTGAAGTTATAATCGAATGGGGATCGAAATTGATGTTGACTACTAGGAAAGGTCCTTTCGCCCCGGCCACTGAACCTATGTGTTTCGGGTAGCGTTAACGTCCGTGGTCTGGAGTTCTGTTGATCAAAATCATTACCACTGCTCTCAAATGCATTGTTGAACCGTCCACCATCTGCACGATATAATGTTTCCCAAATAAATTGCTTAGGTAGGGGATGAGATACATTGGGTTTGTGGCTGAGACCAAGCTTCGTCAAAATTTGCCGTTTAATTGACTCCAAGCGAACTTGGTCACTCGGTGCAATGTTGTTACGCGGTTGATTAGTTTTTTTGTTGAAGTAATTGTTGGTATGGTATTTGTTGTAGATGTTGTATTCTGTGTGTGGATTATCTGTGTAAATGTGATAATTGTAAAGTGTTATGTAAGTTATTTATTATAATTTTGTTTGTTTTTGCATTAGTGTAGTGGAATTTACTATAAAGAAAACAAAAGTTAAATATGCCCATTATTTGAACCTACTTCTTGTTCGTTGGTCGTCATAAGTATTTTGTGGAAAAAAAAGTTAAATATACATGATTATATAATTAACTTACTTATGAAATTAACTTACTTATTTTAACATTTGGCAGTATTGCAAAGGTAATATAAAGGGCGTTTGAATGATGCAATACTTTTCGTAACCCATTCTTTTATTATCAAACAATTTATATTATGTTAATGAATCACTATATGTATACCCTTGCAGAGCGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGCTATCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGTACAGCTATGTCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAAATTTAAAAAATCATATCTTTCGTGTTTTTTAACATCTACTTTTATAAGCTTGGATAACATTTTTAAATTAGTCCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCAATAGGAAGAATCGGAACAATCGGAAAATTAGTGCTAATATAATATTGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTGATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTTGTCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGGAAAAGATGCAATATTAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGAAAATAATATTTTTTAATAAGTTCTGAATTTCAAATTAAATTTTATCGAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGCATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACTTATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTCAAATTGAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTCTCTTGTTTTTAATTAGTTATAAATGGGTTATGAAAAGTCCTAAATCTGTCAAACGAAATTTAAATAACTTTTTCATTCGACTCTACACATTTTTTTGTTTTGCAAAATAGGTTTGGCGACTAGTATATGTAGAAGAGAATTTTGGTAAGTTCAAGTATTAGCTTTTGATTGTTTTTGTTTTGTTATTATTTTGTCGTTAATTTTGATATCGGCTAATAAGCTTTCTCTTAAGCAAAAAACCTACATAACAAAGCCCAAACGTGGTTAAAGGATTCACATTACAAAAATATATCTTAGTAGTGCATAGTCACGCTTTCTCCTAAAAAATTGCATTGAGTTTGAAATTAGAGATTTTCCTTGTTGGAATGCATTCCCTAGCTTATAACTTGATATTTTCCTTCCAGTTAGTTGGAAATAAACTCTTCTTGTGAAAACACACACACCGGTTTGTGCTTTTACTGCCAGATTAAAGGGTTATGAAATAAACTTTGTGTTATTCAAAAGACAACTTTGAGTAATTAGACCGACAAATTAGAATACTAAAGGCATGAGAAAAGCTAAAAGAAACTATCAGCTGAGTGGCCTCTACGTACTATAAAAGTTTCTTGAAAGACACTTCATAAAATATAACCACACCAAGAAAAATTTAGAAAAAAAACCGAGATAGATTCTTCCCATTTTTAGCCTTTTCAACGTGAGGAGACGTAAAAATGAGAGTGAGAGATAACGAAAACTGGGCATATGAATGTGTTGCTGGAAGTTAATTTCTTCGTTTTTGTTCAAAGTGTGCGGTTGAGTTGATGAGTGATATAGAAAGCGACTAAGAATTTGCGGGTCTACTTCGCGAGTTTGACTTAATAGAGGCCCTTACCCACCTGAAATGTAAGAAAAGTCATATTTTTTTTTCAATTTGTGTTAAATTTATAGCTTAAACAAGGTTAATAATGAAATAAAAGCTGAATAAAATCTAATATGCATTAATAAAAAGTGTAGTGGGAGCGAGAACGATTTGTTTAAAATCAAGAAGGGTTCATTTCGAAATCAAGACAGAATATTCTTAAAAGCGCAGGTCTTTGAAACCGAGAAAAATTTCGATCTCGGTTAAGAATATTTGAGTATGAATCGTTCTTGGCTCACTTTTGCAATCGAAAAACCTAAGATCGAGGACGCTGAGCACGGATATTTCTTTCACTGCAGTTATTAAATATATTTTTGAGTAGTAAAGATGGCCTAGCTTCAGTTGAAATTTACACAAACGAAATATTACTGACAATTCAAAAATTATTTTTGAGCCTTTTAGAACATTTTGAAGCTTTTGTAATGGTTATTCAGGTTAGGCATATACAGGACTAGTTTGAAACTCATTGCATTAAACTTAAAAAAAAAGTCAAAAGATACGAAACGGCAGAAACAGCGAGAGATGTAGTATTTCGTAATAATTTGATTCACATTACGATATTTTTGGGGTTAAAAAAAGAAAGAAAGAAGAAAATCTGTAGCGTCTACAGCGTATGATAGAAACAAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTCACCAAAAAAAAAGGTGCTACGCCCACTTTAACGCCCACAAATGGCCAAAACGCTTATATCTGGCTGCCGCCCACATAACATCTACTAAAAAGCCTGTAGGTGGCGCTGCTGATATATAAGCAGTTCATTATCCTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCCCTCGACTATAGCGTTCTTCCTTATTTAACATAGGATGTTACGCTTGGAAATAACATGTTTTAATTGGTTTTGAGTTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAAAAACGATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAACAAGAAACGAAGTTAACTTCGGCAACC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5a6/cf0/aa/scaffold_60-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CGAAGCTTGTATATCGTTGCAGTTTCAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAAATTAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATTGTTTTCCGACCAATTTTCCGGTCGAACTTTCGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCATTATTTCCCACCAATTATCCGCTCGTTCCTATGCCAGCTATATGATATAGTGGTCCGATTTCGATCAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGCTATAAGTTAAAAAACACTGAAGATATAATTTTTCCATATTATTTTACCATAAATTTTCCGATTGTTCTGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTAATATCCAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACTAAAGATATAAATTTGTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCGTCTGTGCGTCCGTCTGTTTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTTTTTTTCTATTGCAGGTATTATATAAGTTGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACAATCACTGAGCAATATCGCTAAGCAACAATCCTTAAAAAATTTTACATGATGTTACTAAAGTGCAAGGGTATACTAACTTCGGCATGCCGAAGTTTCATTCCTTTTTTTTTAAGACTTGGTATGGAATCATTTTGGTTTTTGTGATACCTTTCGGTTGATGTAACTTGTAACGATTGAACGATCACAGTAGATTTTAATTTTTTTGTGTATATATATTAGTTGCCATCCCACACTCTCCTGGTGCGTTTCGTCTCTACATGGACGTCCACAGTGATTTATGCAAGCCTGCGTCTGATTAAGAACTTTACCTTTGTCGTTGTAAATGTTGAGTTTTCCTCCTTCATGACACAAGGTGCATCCCTTGTGAGTCTCCAGATTGGAAGCGAAGTAATTGCCGCTGCTGATCCCATTGCAGTTTATTAGTTTGACTTCAAACCAAACGAGCCCAATAAGAAGCCAAACAAGATTCGCTTTATTGCGTTTAATCTTTGAGCAGTTCCGAATTGAACTTTGTGTTGAAGACCAAGGTGATATTATTTCTTTCAGAGGTGACACTAAAACGCTTCTTTCTGAGCGAGCTAACAGTTTGACTTCTGGTACTGTGTCATAATTCACTCTATAGTTTGTCTCTGAAGCTTGGCAGGTACCGTCGCTAGGGCCTAGTTGAAAGACGCCCTCGTTATTGTTCATCCGTTGATCAGCCCAAAGGTGTTTTTGCGGTTTGCGTTGAACTTGTTGCCTTTTATCGCAAACCGCATGTCTGTTCCTGTGCCGCCTGCGCCTGCGACGACGACGTCTTCTTCGTTGTCGTTTGCTGTTGCGACTACTGCAAAGCATTCTGCACAGATTGTTGGACTTCACCTGCTGATCATTATTTATCTCGAACGAAGTATACCCATAAATAAGCTTCAGCTTTAAGTCCGAAGTGCTGCTGGTTGTTTCGTTTGGCGTCGTAGGAATCGGGACATGGACTGCTCTACTGCTGGTCCTGTTTCCATCTGAGACTCCAGGCTGGCCAAGTACCGAGAAGATATCCAGAAGAATGCAGCTTGTTAGGAGAGTAGTTGCCCAGCGCGCCAGCACTAAAATGGCGCCCACAATCTTTGACACGCGTGAAACTTCGGGGTCAGGAACTTTCTTGCGCGTTGCAGCCGGTTGGAGAAATGCTTTTCGGGAGCCATTGCCGATGCAGCAGTTAAAGCTTAAGCAGCAGCAACACTTAACGACGACAACACAGCATCCCTGGCGACAACAGAGGCATTGGCAATTGAAAAAGCATCTGTTGCCTTTAAAAAGCGTATCAGACTGCAATTGATGGGGGTCGGAAGCGAACCGCATCTTTGATATTTGGCAACGGATAATACTGGCAGTGTACCTCAGAGTAGATGTAAGAGTAATGGCAGTTTTAAAATGTTGGTATCCAACTTCTGATCCATTGCAAATCTTGTTCAATGGGGTTGTGCTTATTCATTTTTTCCTGTAAAAAAATAAACATCAATTTATTGGTTTCTAAGTTGAGACTGGCATTTATTATGATTAAGTTTTACATAAGAAATCCGTCCTTTAAAAGATTGAATTTTATTTGTTTTATTTTTTTTGATTAAACATTTTAACTTTAAACTTCCGGTTGCCGCAGTTAGTTCTGCTATCTTTCTTCTAATCATTTAATCTAGTAGGAGTGTTTTGAAATCAACAGTAAGTTTTCTTGACTTGGATTTGTGAGAACACATTGTTCCCGATCTCGTATATCAGGAAATAAGCCTTTTCCTTCCTGGAAAAAATTAAAGAGAAATTCTCTCTGAATTTTTTTCGGGAAGCCTCCGATGTCTTCCTCGACTTTAACAGACCCGAAATTTTAGTCGCTGCCCTTCCTAGAACGTCGTACATAGTCAGTATTTGATAATCTCATAGTTTCCTATAAAAGTGAAAATGCAATATTCAAAGTAAATTGTTATGTATGTTCAATGTAAGAAAGGACCGTTCCATTTTTATGGGGCCGAAATCCTTAAAGGATTCTCACCAATATTTTCGAACGATAAGAAAGGTTTGTTTTGGTATATTTGCAATTTAATTAACAACTTTTATAGTTTAAAAATTTTAGAAACTCGTATGTTTTAAAGATTTTTGTAGACCAATGGAATCCGTTAAGAACGCAAAATGACATTAATTTTTTACAAGCGCACGTTTGCGTCATTGGGCACAATATTTTTGGTCTTCAATTTCTAAAGAGAAAGTGATAAAGACAATTTCGACATATAAATATCAGCATTAACAAGAAAGGAAGTTAGCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAATAATTTTTTTCAATTCGAATTTCCTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTTACATTATTTCCCACCAATTATCCGCTCGTTCCTATGCCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTCCCAAGCGTAGGAGGCTATAAGTTAAAAAACAACGAAGATATACTTTTTCAATATTATTATACCACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATGTTATTCGAAATTCAGAACTATTTTAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTTTAATTTTTTTCCCCGATAATTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCTGATCTGGCTGGTTCCGACTTATATATTACCTGCAATAGAAAAAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCACGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATTATTTATGGGAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCAAACTTCGGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGGTTAAGTCACGTCCGTCCGTCCGTTTTTTCGAAAACTAGTCCTTCAGGCATTAGGCCTTTGCGTTGAAACTTTTCTAAAAGTCGAACGTTAACGTAGAACCCATTACGTAGCTATCAGATGTGTCGAAGTATAAGAATTCGCGCTTGCGCATAAACTCGTCAGTGAAAATCCTAAAGATCTATGACGACAACAAGTGCAAAA'..b'CAAGTAAATAACCCAAGGCGACACTCATTCAGCCGAAGTTGAGACGAGACGACGCCAGACTGGTCACATACAAGTGCGGCCACGAAAAGGGGCGATATCCAAAAATATGTGTTGTACTGCAATAAGAATATGAACTATTTACATGTCCACTTTCATTATGTGTATAACATGTTTTAAAAACATGCTTTAAAAAATATATCTTTGTATTTGTAACATATCTTTTAAATGATCAAAAACTGCTATTATTTAGTTACTGGTAAATTCTTTGAGACAACTATTAGTAAACACTGCCTGTTAAAAACTATATGATTGTTCACATTATTTTAATTTATTTTGCTTTTGTTTTAGCAAGGAAAGAACTGACGGACGACGGTCTGAATGACATTGCATACTTTATGAGGCATGACATACCACTTGAAGCTTTTGAAAGCTTTCATAGCGTTGCCCCCTCTTTAAAAAGTGTAATGTTCTGTGCTCCCAGAGCACAATCGATGTTTTAGACATCATCGATAAGAATTATGACGATATTGCAATAAGGGCAAATACAGGCGCGGAAAATATATATATGTTTTCTTATTTAATTTATACCATTTTCAGAAATATATAGGGTAAAACAAAAACGTAAGAAAACTATTTGTCAAGAATATATTTCTATAAAAACTTCTTGATCTGGCTTTAAAATAGCTAAACATTTTTTCCCATTCTGCTGAATTCCTCACCCTTAACGTCTAGTACTCACATCGGCGAAAACAGCGAACTAATCATGAGAGAGAGAGAGACGCAAGTGGCGGGGTTCCATCACGGTAGTCAGATGACCAAAGAAAATATCAGAACTAAGGATGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAAAGGGAAACGGAGCAACAAAGCTATATTTTACGGCACATTCTACCGGCTATTTCAGTAGATGTTATGTGGGCGGCAGAAAGTTTTTAGCGTTTAAGCCGTTTGTATGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTATTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAAACAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTCTATTATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTGACACCACGCAACAAATATGCGGAACTGCATGCCAAGTTTGGCTGTTCTAGCTTTTATAGTTTCCAAGATCTCTGCGTTCATACGGACAGACGGACATTACTAGATCGTCTCGGCTAGTGAAGCTGATCAGGAATATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTATATACTTTCCGACGAATCTAGTATACCTTTTTATGGGAAAGATCCGAAAATGGGTGGGAAATTATTGGTAATTGGGAATACAATTCTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTGAAATTAATAAAAATCGGCGACATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATAACAATGACAATACTTAAAAAATTTCACGTGGTGTTACTAACGTTGATTATTTCTTAAACCTGCAAGAGTATACAAACTTCGTTAACTTCCCTTCTTGTTTAAAAATATTTTTTTGATAATTCCAACGGAGTTATGGGATATACATACATAATTTTAAAGGTATCGGGGTGGAACCCTCACAAAAGTTTTAATTCAAAGGAGTTTCTGTCGGAATTAAAACTTTGAAAAAATAGGTAAGGCGTTACTTATACAGTCAAATAGCGGGTATTCTTAAGCAGAAAGACTAATCGGTTCGATCTGCCTGCCAGTCCGTATAAACTCCGATATCTCCAAACTTTTAGGAAAGAATTGTAATGCTTTCTGCAAGAGTATGGTAATAAATATAGTTTGTAGTAGAAATAAGCAGTATATAACATAACAGAAACAACAATGGCAGCTTCAGTACCTAAAGTTAGCAGTCAACAACAACCAAAAGAAACGGCGGAAAAGCTGTCTCGGTTGGCTTGCAGACCGTGAAAAGCCACGAGCCACGATTGAAATACCGAATTTCATACCAAAAACATATGAGTACCGATTGTTAATATCAAGAGCTATCAAGCGCAGTTCTACAAATACATATATGAACATACCTATGTGCTTAAAAATACATACATTTAGACAAACATATGTACGTACAAACTATTGCTTCCAGTTTCTTATGTGTAATGAACGACCGCATCGTACAGCGAAAGCTAATAGACAAAAGTATAAAGATAATAAATGTGGAATTTTTTGAATCCAAAATAAATGAACGAATTTATATTTGAATCATAGCTTTTGAGATCATTGAACTTATTGCGAGTGTGTTCAAGTCAACTTAAGTATTTACATTAACGCACATTTTAACCGCTTTACATACATAAGACGAACGGAAAAATGAACAAAGAACCCGATCGGAGGGTAGGTTTTTTATTTCCAGCACGACCACGGTCCGGTCTAACAGGTGTTCCATTTATAAAGCGCGGGCATCGTCAGTGACACGGAATTTTTTATTCTGGAAAACAGTAAGGGATGAACACCTTTAAATATACATACAGTTGTGCACTACCTAACTATAAAACAGTTCTCTGATCAAAATAGCTTTACATTTTAGATTATTTGTACTATTGCATATATATATTGCTTTCATTAATTTATTTGCTAGTCAGCAAACATTTTCTAAAGGTAGATATTGCTTTCATTAATTTATTTGCTAGTCATTCAGCCTACAGTCCTCGCCCCCGATTTTCGCGTAGAACGCTTAAGAATTTACAAGAAGAAATAATGGCGCGGACTACCATGGTTCTCTTCTAATTTTATTTTAATTAAAGAAAGAATAGAGGAACTTTCTACGATTTTATATGTTCAATCCAATAGTCCGTACACTAGAGTACGAAAATCCCGCCAGTGATGATATCCTTGAAGGTAATAATGAGTTCTTATTATCATACACTAAAAATAAAATACCTTCTTACTAGTTTTTCGAGTTTCTAGCTTACTTCACTAGCAGCAGCAACCTCTTGATTTTGAGACGGTCGAGTGAACTTCTTCTCCCTTCCGTGTTGTTCGCAACGGTAGTCGAAGATTGCTCGGCACGCGCCGTTTTCGTTTTAATAGCCGTACACCAGCAACCAGAGTTAGGTCGACTTCTAGTGATACCGACTTAACTTTTTCTTAGTCTTACCTAAGACTGTCAAATCTCAAAACTTAGTGCATGCAGTATGACAAACGCCAACACAAAACATTGTATGTTTTATAGAAGGCTCGACTGTACTATTAAAAATGACGATCTTCATATGGTTTTTCTTCAAACGTGTATTCATTTGTATATACTTGAAATTTTCTACATATGTACTTGGTCGCTGTTGTCAACCTGTAGAATGCAGGTTGCTCAATGTAAAAACGAAACTCGATCAAATAAGCAAAAAGGGGGTTGATTATTCTCGTAAACAGCCTTAGCTTCCGTCCGACACAATTTACTCAAATGGTTTACACAATTTTTGTATGCAATATTTGGTGTCCGGTGGATAAATTCCGCAACAAACCGCTCATTTTTATACTATTGCAGGGGATATAATAATTTCAGTCAGAAGTTGGCAACGCAGTCAAGAAGAGGTTTCCGACATAAAGCATTTATGTTCTTGTTGAGCATTATTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGGCTGTCCGTCCTTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCATCTGTGCGTCCGTTCCAACGCAAGCTAGACTCTCAGTTTAAAAGTTACTGGGCTGAAACTGTACCAAAAGTCTACTTTGTTTTGCAGGTAGGTAACAAAAACCTCCTACGCTTGGAAACAACATATTTAATTAGTTCTGATTTAGTTTATTTAAAAAATTGGGCGTCTTTATCATATAGCTGTCACAGGAACGATCTAAAAATTTGTGGGAAAATAATATAAAATAAATTATAGCCTTGTGTTTTGTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGAAAAAAATATTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGAGTTTACAAACTTCGGCATGCCGAAGCTAACTTGCTTTTTTGTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGCAATCCTATTAAAATGTTGTAGTCGTTGCTCATTAGCTGCTTGCATATTTTCATCTTCTTTAGCTAATAAACGGGTATCTAATACGAATACCAAGGTCTTGACTACAGCGGGACACTTTACATGGAATACGATTTTTTGACTAATTAAATAGTTATTCGTCTGAGCATTGGTCTTAAATTAATTTTACTTCTTTAATCGAGTTTCCTATATAAATAATTCAATTTTGTCGAATGTGGAACAGAATTGTATTATTACCCAACATTTTTGTTTTGCAGCATACTTACACCATTTTTATTTTAAAAACAATCAAATTTATCCTGCGAATAAAATGTAAAGCGGCATATAGATACCCCTTTAGTCTACTAGTAACGGGTAAACTAAATCCATTACGCCCGTTTAATAGAACTGCTTACCGCTGGTCCAGACTGATCTAATATTTTTAATTTCCATTGGCTCTAATAACACGTTTACAACGGTTGCTTGAATGGAACTTACTCCTTTAATGCGTATTTTCAAACAGCTCAGAAAAACTTATGATTCTTTCGTATTATGATTTCAGTCGGAAGTTTGCAACGCAGTCGAGGAAAAATTTCCGACCATATAAAGTCTATACTTTTTTGATCAGCATCATTAGACCAGTCAATCTAGCCAAGTCCATTTGTACGTCCGTCTGTTTCTACGCAAACTACTTTGTCAGTTTTAAAGTAATCGGGCTGTTTTCGGAAAAAAATCAATTTGCATATTGTTTTCTTCAAGGGTTTCGGCTTTTTAAGTCAGATCGTCTGTTTCTCCAACAGCCATTTCTTAAAAAAGATTATAATAATAATTTAAATATTAAATAAAAACCTTAATATTTTCGTTACTTTCCTTAATTTCAGTAAAAAGTAGTTTAAATGCAAAAAAAAATGAATAGGTTTTGAGGAGATCGACACATTAGCACAAAAGGTAGGGAGTCCCAGCTCTCTAACTTTGAAAGTTTTCGAGTTATCAGCGTTCATATTTAAGATTTTTTGAGGTTTGTGGGCGAGAAAACATTTTTCTAGGAGTGTAAATATGAAGTCACGGTTTTTACGAGCGAAAATAAGGAATTTTAATCTGAAATCTGCACTCTTACGCATTTCGAGATCACAGCGTTCACACGGACAGACGAATATAGTCATAAACAACAGTTAAATATATACTCATCATTTTAGCTTACTTCTTGTAAGTTTTGACATAAGTGGAAATATAACTTAAATGCAGTTTGAATGAATGTTTTAATTTTTAAACATATTTATATTTATTAATGCATTTAAAACTAGAAGTCATAATTTTATTTAACTTCTAAGAACAAACAAAAAATTAATAGAGCTTTAGGTAAAGGTAGGATATAGGATTTAAAATAAGAATACAAGAGGGGAAACTTTCATAATTAAAATTAATGTCATGAGTCGCCAAAAAGACAAAAAACTAATTTAAGGGTAAACATAATGAAATACTTAGCTGTATATATCAATTTCCTAAATGCTTTTCAGTGATTCAAATTTTCCAAATCTGAATCCAAAGTATCTATTTCTGTTTCAAACTTTTAGGTACGCCCGCAACCGTCTCCCTTAAATCGTATTCAGGATAATAAAAGTAAACTTAAATTAACAAATAAAGAGAATGTTTTTAATAGCACACTTTCAAGTTTACAAATTTAGAGCTTATACGGTCGATTTAAAAATTAAATGTTTACATATTTCGATATGTCTCTTAATCTAAGTTTTAATTTTATAAAATAATAAATCAACAACAACTTCTGCTTTATTAAATAACTCAAATGATTTGGCTATTTCAAATCCTTTAATTAATTTGTAAGCTTAAAATATGGGGACGGAGAAACCTCCTTCTATGCATTAGCGACAGAATGCTGTTGAAGTTTGTTAGACAATGTGCATGTTACATTCTTAAGTGAAGGTTGACAAATAATAAATTAGGGTAGGTCCTATTTGTATAAATTTGTATGTCTATATGCTTTTATTATGGTTATTATGGTTTATAATTGTACTATACCTTAGCTATAACTTGTGTTCGCGCTAATTTTACGTGTTCCTGCAAACTATATTGCGCACGTCCACTGACTTAGTTTTTACAATAATAAAAATGCAACATAAACATTTTTCGCAAAATCATATCGCGTCTTTACAATAATGTGTGCATGCATATATGCGGACTGTCATTTGAACTGATTTAACTGTTGGATAATTCTTGGTTTAGTAGTTTATATTTTAAAAGCACATTTACATATTTTAGTTCCAGTTTTGAGAAAAAATTCATGGCATTACGTAATTCATTGTTGAAATATATTGGTGTTATCCCATTCAAGTTGATTGATGTGTGCAAACCCGTCCTTTAAAGCTAAATAAAATAGTCTGTATCAAGCCATTAAAAAAAATATATTAGTAAATACTTTACCATCTTCGTCTTCAGAGTCCGAGTTTTCTGACTCGGAACTATCCTCTGACAAAGCATCTGTTTGCATTGGATTTATAGTTATAGTCAAAGCTGAATCATCCCAAACTAAGCCATCATCAACAATCTAAAAATTTAAAATGAAAATATATTGATCGTCAATTGTGTCAGTTGGGATCAATTAAATCAAGGGAAAACGCTATAGTCGAGCACTCGACTATCAGATACCCATTACTTCATCTTTTTAAGTCAATGTATTATATATAGGTATTTTTAGGACTAATACAATTAGAAAAAAATGTATCTGGCTTGAAACGTTAGTCTGGACGTTAGCCTGCTGAATCAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGAACCTGCGTGTGAAATCCGATTCCTCTAGCTCTTATAGTTTCCAAGTTCTGAGCGTTCATACTGTCAGACAAATAGACGGACAGACGTACGGACGGAAAGACGGGCATGGCTAGATTGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGATTATACCAATACTCTTTATGGGGTCAAAAACGCTTTCTTCTGCTTGTTAAATACATTCCGACAAATCTAATATACGCTAACGGGTGTAAATGTATTGGTTGAAAAAAGTTTTGTGGTTTGGACAACGCTCAATCTGCAACGAACTTGCTTGACTTAAGCTTAAAATCTAAAAGTCAATAATATGTGTTGTTTTTTGGCCTAAGGTAATTAATTTTCATATACCTTTATGTTTAAGCTCTAGTTAAATTACATATTTTTTTCTTCTAATTTTAAATTATAATTTGCTTAAATTTTAAATTGAGTTCTAGAATTTTTTTAGACAAACTAACTTTAATCTCATTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATATTTCAGTCAAAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCGACCCCATATAGTACCTATAGTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTTTCAATTCTAAAGCTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGCCGGAACCAGCCGGATCGGAGAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGAAAAAAAATATATCTTTTGGTTTTTTAACATATTTCTTTCTATGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAATTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGTTTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGATGGGAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGCGGCTTTTTAACATATTATCTTATAATATTGGGAACATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTTTGATTATTTTTACAACA'..b'CTGCGTTGCAAACCTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGGAAGTCGATTATGAAATCGAATGTTTTGATTACAGTATATACGCCCCGACGACTTCCCTTGTGTGTGCGATTATCAAGCGGCGACTCGCCGCATAGCGTCGTGACTTAATCATACAGCTGTCATACGAACGATCGGATAAATGACTAAAATGACCGGTAAATTTTGTTTTCGTCAAACTAAGGGTTGTATTTCCTAAACTAGTTTTTAGTTTTCTAAAAGTCGATGCGCTCTTGACATACAATGCAAGGGTACAGCCACCTGAAAGGGTATAGAAAATTCAGCTCGCCAAAGTTTTCTTGGTTTTTATTGTTATGGTTGTTTGTAATCGTAAGAGTGGGCGTGGCACCCTGCTGAAATAAACTTGCACTGTCCAGTTCACTAATCTAAATTCCGAATCCTAAATTTGTAGTTCTTATAATTTTTGAGGTCTCAGCTTTCATATGAACGGACAGGCAGATATGATCAAAAATATAAATACTGTTACAATAGTGCAATATGGTTTTAACTGCAAGAATATATTCAGTGAAAATTTTAAATTTTTTTGGCAGTGAATGTTCTAAACGTGAAGTTTTTAGAAATCAAGCTCCATCAAAGAAAGTTTTTTCATGATTTGTACCTTTAATCATTTTATTGATATGCTTTTAAGAAAAAGTTGGAAAAAAGATTCCGAAAAACGATGACTGTTAAAGGAAATTGATCTTTTCATGCTGTATACCAAAAAACCCTCAAGTTAGCTATAGCTAAGTACTATTCATTACAAGAAAAATCGACTTGTGTTAAAATAGTTGCATAATATATGTAGTAAAAATATTGATATAAAACGTAAAAAACAAATAAAAAAGAATTAAATCAAAAATTTATAATTTATAAATAAAAACTCTTTTGATCATAATTAAATATATTTCCTTTTTTATTTAAAAATTATCAATAGTTCGTTAAATAAATCAGAAATACAAACTGCTGCTGGAAATATCATTTAATTCGATATCTTGAACCTAAAAAAGAATCCCACATATAAAAAAAAACCGTTTTGGTTTGTAAAAGAACGGACCTTTTGTACATATGCCTTTCTAAAAAAGTAAAAAGTGAGAGATTCACTGTCCCCAATTAATTAATGTTCTCGATTTGTATAGCCTTGATTTGTTAAATGATGAAGAATATAAATTCTAATGTTCCCTAAATTCTGAGCCTTAATATTTAAGTTTAGCTGCATGCTGAGATACAAAAATGTGTTCATTTGTATGTGCATATAATGTATGTATATGTTCGTAAAAATGTTTGTATGTGTTTGTATCTATGAGATACACACTCTGTAATGGATTTACTAAATTTACAATTCCTATGTTTGTAAATAGTAAACCAGTGATAATGTGGTCTGTGTGTATATATTCTCTAAAACTGTAAATAACGTATGTACATCAACTGGTTTTTGAAACAGTTACGATAATATTAGAATGGTACACTTTTGGTACACTAGTTATTTTGTTTCTTTGTGTAATTCCTTACTTCTTGTTAGTAAAATGCCAACTTCACAAACCAATTTATAGTTTAAATAGAGTTTTTCTCAATATATTGGCAATGTTTATACGACATTTTTAAATACTCGTGTAGAAATGATTAACACTTAAAATGGGCTAAAAAATACGAATTACAGGGCTGCAAAATCAAACTGTAGTACATGAGATTATGCATTATATCCTATTCAGACAGACGGTCAGCGACCAATTCCTGTTTTATGCCTAGTATTCACACCTACGAAAACAGCGAGCTAACCATAGGAGTGAGCGTGAGGCAAATACGTGGCTAACGCTTTTCGTTGGGTCATTGGGTCTGCACTAAGCAAGAAAATACCAAAAAAAATACCGGATTTAGCGAGTGAATTCCGATTGCGCCTGTGCTCGCAGCCCAGAAAATATGAAAATTTGAGCCTAGCAGTTAGTGAGCACTGAAGATGGCGAGGCATCCATTTTTCGCGGCTTGATCCTAAATGTACAACAGGTGAGCACTGAAATCTTCGGTCACACTGCAAAGAATATTATTTTTCGACTACTGGAACTTTCAGCCGATCTGAATAAGAGGCTTTAAAAGAACATTTTCAATTTACTACTAGAAAATGCAAACATAAATTATACTAGCTTACAAAATTTTTTTTAAAAAGACTGTATTTATATCTATAATTTTAAGAACTAGTAATGATCGAACTCTGAAAAGAAAAAGTAAACTTAAAAAGTCGATCGTGTCAAAAAGTTGTACTATATTGTATTTTGAAAATTTTGAATTCTGTATTTATCATTGAAACAAAATCACCTCTTGACGAGGTCAAAAACTAATAACGATATCACTCTCAACATCCAAAAGTTCTGATATCAAGTTTTGTAAATGAGAAAGTTAATATCATAATTAGGTTTTGCGAATCAGAAACTTGAGTGAGCAACGTCAAGCAAGTCAATGTCAATGAGATACAGCCGTCAAAGTCTGCTAAGAGGACAGCATTAGTCTCTGATTTGGTACCAATCTAGCCAAATAGGCAGTTAAGTTGTGTGGAGTCTCGGTCGACTGTTGCGAGGACTGCTTTAGCTACGTCGAACGGTTGTCCAAATAACCAAGCATGACTTGTGCAGTCCATTTTTACCAAAATCCTGAGAGCCCGAGACCCAGTTAAGCAAGACATCGCTGCATCGCAGGGCCACCGCCAAGTAAGAATAACGCCGAGCAGCGCAGGACGTCGACAGCAACACCGCTGCACGCAATATTGCCGAGGAAACCACCCAGAATCAGGGACTGCTGGCGTAAGACAGACTGTTGCCCGGATCGTCAAAAAGGACTGAGTGGGCTTCTGGCGGCACAAGCCTGCACAGTGCAAGGGACGGGAGGCTAAGGCCGGCAAGGGAATTGTATTGAGAACTCGGAGCTTTTTCACCCTTCTCTGGGAACTGCAACCCTTTCCTTGCAAACATAGAAAATCAGTTCGTAGTAACTACATATTGCAGATCCAAAAATCCTATGTTAATAAATTAAGTCACAGGTATTCAAATTCCTTTGTTTATTTTTTTCATTATAAATATAAAAATGTAATGCTGTTTATATAACCAGTTTAGGTGATATATGTTTTAGTTTAAAATATAAATTTCACCCTTAAATTGCTGAATTGGGTACATTGAGTATAATGTGAACTAGACCGCGGAAAACTTAAAAAATGTGAAAAAATTTAACAAATATCTTACAATCTGTAAGGCGTCTGTTGATATCGCAACAACTCGATCAAGACGTGTCCCTTAAAAAAAATTATTTAATTATTTCTCTGGCCGTTTCTTTAACAACTACATGTTAGAGTCGTTATTAAATGTAATTTAAAATTCTTAAAAGTATAAAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAATTACCGAAGCTATAATTTGTTTCGGATTATTTTCCCATCAATTTTCAAATCATTCCTATGACATATATCAATATGACGACAAAGTCTAAAAATAAAATGGTTAGAAAATCGTATTACATAAGTATATAAATTAATGAATACATACCTTGCAAAATTAAAAAGTCAGTAAAAATAGAATTAATAATACAATTATAGATGCAAAGAAAAGAAAACTGAGATACTTTTAGACAAACATAAAATAATAGGTAACTGAAATAAATATTTTTAATCAAATAAACAAAAAGCTTATTTTTTAAATAAAGTACACCTTCTTGGGAGACCCAATGTTTATTAAACCTTGATCATACGGTTAGCCAAGACGGAAAGCGTACTGAAAGATTTGAGGAAATACCATACAAAATTTTGAGATTTTGTGAATGAAATGCAATGGACGTCGTTATTGGGCTGTGCAACTTGTTATTTAAGTTTTCTGTTGAATTACAGTTATTGTTAGTTAGCCTAGTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTTGTTTTATTAATTTGTTTTTACTTTCGTCGTCGACTTCCTTTCCGGGTCCACTTTTGGGTAGCGAAACCAAAGTTCTTAGGTTATGCTGTAGTACCTATAAAAATGGACGTGCATACTTTATACACAACATCTTGAACTTAAGGGAGCACTTACCTGACTTAATTATTTTCAAAATATATCACTTTTATTAATAAATTTAATATGTTTCGCAGCGAAAATGTAAATAGTGTGCTTCTTCTTCTTCTTTTGTTGCACCCTTTCTTAATCGAAACAATTTAACTTGTACTCCTTAAATAATTTATACAATATGTATTTTTTTAATGTTAATATTAAAATTATTTAATAATTTAAATAAATTTGTACGTACTAAATTTCTATAAACTAAAAAATTGCATAATACATAAAAGAAAATTCAGTTTACTTATCTCGAAATACATTAAAGGTGCCCGCACAGTGGGCGGTGCGGTGCGGCGCGGCACTGCTACCTGCTCTTTTTACCGCGTAGTGAAGCTTGTATCGGGTGTTTTTTTTTTTAGAGGTATAGAACTTTAAGTTGCATTAAAACAACGATAGATTATTCGATTGACATGAATTTTTTTTATTCGAAAGATAATCTTGTGGCATTACATTCATTCATTTTATATATGATTTCTGGCATATGACCGCCACGGCTAGTGAAACGTGTCTTTCAATAAATCGGACAACATCCGAGCCAGCCGTGGCCGTCATATGCCAGAAATCATATAAAAAATGTAATGCCACAAGATTATCTTTCGAATAAAAAAAAATTCATGCCAATCGAACAATCCATCGTTGTTTTATTGCAACTAAAAGTTCTATACCTCTAAAAAAAGCACTCGTTATATAATTAAATGTAAGATCGCACACCGACGCGGCGCGTCTCGGTTCGAAGCAGGGCGTTACTGCTCGAAGAAGAATTCGGAATCTTTCGGCTGGTATCGGCAATCGTGGGGAGATAAGTATTGGGTTGAAAACAGAGTGACGGAGTGCAATTTCTGTAGAATTTCAATAGAATGGAATTGACAATAAGTGAACTCAAAGAAAAAGGAAAGGAAGATGTCGATTATGAAGTCGAATGTATCGATTATAGTACATTCGTCCCGACGACATCGCTTCAGTGTGTATTTCTCAAGCGGCGGCGGGCAGCTCTGCGTCATGCCGCGCCGCGCCTCGCTAGTGTGCGCTTACTTTAAAGGTCTGCGCACACTGGGGCGGTGCGGTGCGGCTCTGCTCCTTTCTGTTTTGGAAGCCCACACACTGACTCTGCGCATCTCGGTCCGACGTAGGGCTGAAGTTTGCCGCGCCGATATATTGTGTTCTTGGTATCTTCCGGCTGTTATCGACAATGGTCGGGGCATTAGTTCCGGGCCGAAAACAAATTGAATGGAATATACAATTGGCAATTATTGAATCCCAAGAAGAAAGCAAAGTGTGCGCAAACCTTAATGCTTTTTGAATATTACCTGAACTTAACGGAGAGACGCAACAATAAAGGAATAGCTGAAGGTTGTCTTTCTGAGAGGCGCAGGAAGGCAGACTTTCATATACTCTTCTACGCTGCGCCGGATTATCTGCTAACGTCGACAGCGGCACACAGTTTTAGGCACAAAAAAAAACAAAAAGCTTTTTGCCGACTGTCATGTCACTCCGAGCCTACCTCAGAACTGAAGAGAGGTACTCATTTTTTGGGCTTCTTAAAGCTTTAAGCTCAAAATATTGGGGTTGGTTTTTCTGTGTTTTCAGTGGTGGTTTTTCTTTACCTGTAAATGTTTACGTTTCTTCTGTTAGACACTAATGTTTTTTTTCAAACGTTAAGAATTTATCATTACGACTTGCGGAATGACTGATTGCCAATTTCATATAAAATAATGGTAAGCCACCCTCTAGACCCACTATTTTACTATAATATTTTTATATTATAAGGTACGGAAAAAACGCGACACTTTAGAAAAGAAAAACATAATAGACCGAAGCACCCTTAACAGGATATGTTTCTCATACATGATATTTTCAATGCTTATAATTGCAACCGCCCTTCCTCCAGTGATACGCGTAGGTAAGCTTAATGTAATTTTTTAGTTATCGAGAACTTCTTTTATTTACTGTTAATATCTTAATAGGTGCCATATTTACCGAAGATGAGCGTGAAAGCAGTATCGAATCGGCCTTTAAATACGCGATTTACCGGATCAACAAGGAAAAAAACCTTCTTCCCAATACACAACTTGTATACGATATTGAGTATGTGCCCCGAGATGATTCGTTTCGCACCACTAAAAAGGTTTGCCGCCAGTTGGAAGCTGGCGTTCAAGCTATCTTTGGTCCAACAGATGCTCTTCTGGCTGGTCATGTACAATCCATATGCGAAGCATATGATATACCCCACATTGAAGTTCGAATTGATCTTGAATATAGTTCAAAAGAATTTTCAATCAATTTGTATCCGTCACACACTCTCTTAACTCTAGCATATAGAGATATTATGATGTACTTGAACTGGACAAAGGTGGCAATTATTTATGAAGAAGATTATGGTAAATATAATTTCCATTTTTATTAGGTCCCTTGTACTTCGGTTTTAAAGCGTTTCCGAACCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATTACAAGCCGCGTCGATTTAGCCATTTCCGTCTGTCAAAGAGTCAGACTTGGCTTAGAATATGGTACAAAATTGAAAAAATTTATATTAAAAACTTCATCTTATAGGCTTAATAAAATCGGCCGCCATTTGAAAAATACTTGGCAGAGTCCTTGTCAGAGCTAGCGATTACTTTGATGATCGTGAAAATCTAATTTCTTTGTCCTCCCGATAAATGTGAACCTACTGAAGTGTGCGGTACCGATCGCAACTTTGACATGCAACAATTTTAATACCTATTTGTTTGACACAAACACAACATATACTTCTTATATCGTGGAGAGCAGATCTTTTTATACCCGTAGCTAACTACCTAATTTTCAATTGGATGTGTACATCAAAGCTTTATATGCAAAAGAATGAGAAAGCAATATTAAAACAAGAGCGCCTTGTCGCAGACACGGGAATGCTTAGATGGCAGGACGATCGCGTCACGGCGATGGACGTGTTGGCTGCTAGATGAGATGTGTTACGAGGCCTACTCCCAGAAGTAGGAAGTAGAACCGCGGAGTTATGAGTGCGTCGATAACTGATTTATTCTTAAGTTGGTACTTGCTTATATACTACTTGGAACACGGAAGTTTATTGACAGGTCAGTGGTTTTCGATGATGGTAGCAGTTAGCGTAGCTGACTCGACTGACACTGCAACAGTGTGCTGAACATTTGGTGGGTCAGCGTAGTGAGACGTAGAGTAAACCGTTGACATTGAATATAACATGTTGGTCAGCAATTTTCATAACCAGTGGGTGACGGTGAGCGCATGGTTCAGATTTGTTGGGTGCTGGTACTGATTTGTTGGGTGCTGGTCATGTTGAGCACCCTAGGGTGCGAACAACGCACTTCTGCAATCTATATTGAACAAATTTACTTTCTAACTTTAAAAAATTAAGTGACTGCTACCAATTTTGAAAACTGCTCAGTCTATCGAGGAAAACTTTTTTTTTTATAGTATTCTCGAATTTTCCCTTTTCTTCCTTTAGCTGAATATCGCGTTTTTCATAGTCGTCAGACTCAACTTAAGCGTATTTCCTTTTTCTTATTATCTTTCCAAGGAATTCCTCCTATTCCAGATAACTTCCGAAACGTAATAGTTTAAAAATATATAAGTTCATAAGATCATCAGCGACTCCACTAGGTGCGGTTTAGTCCGCATTAATATTTGATGAATTCCGCAAAGGGAAAACTGTAGACGGTGCACCTACAGAGAAATATTGAGCGATTGACGACGTCTGATTTGACTACATGTACGAATAAATGTAGTATTGTGTAAAATGCAAGGGTGAAACCAGAAGGT'..b'TAAATGGTGGAAAAATACGGGTGATGTTTGCAACAGAGACGATAAGAGCAAGGAGTCCAAGGCCAATGCACTAGGAGTAGAAAATATTGGTAAGATTTTTTAAGATTTTCAATGAAAAACAGTAATTATTATCGTATTTTAGGTGGAGTATTTGTTGTCCTTCTCTGTGGACTTGCACTTGCCGTTGTCGTGGCTATATTTGAGTTTTGCTGGAACTCCAGAAAAAATTTAAATACCGAAAATCAATCTCTGTGCTCAGAAATGGCCCAAGAACTTCGTTTTGCAATGCACTGCCACGGATCAAAATCAAAGCATAGACCACGTAAACGGAATTGCTTAAAGTGCTCATCAGGACCAACATACGTTCCGAGTAATATGAGTATTCCAAATGTCGGCGTTCACTATAATTATTTTAATTAAATTGGATTCTGCTGACAGATATTTATTGAAATAAATAGGAAAATTTAATTATTTTTTTATTTATACAACTTAAAATAAAATTTAACTTAAGAATTAATTAGTAATTTGATAAATTTTAAAACTGCAATTCAATTTTGGGACTTATACATTTTTTGTTACAGGTTTTTGACCTTTTACTGTTAGGGGCTGTTAGGTAAAAGCAAGGTTAACGTTGCTCCGCGTTGAAGTTGCAAGTGAGAAATCACACTTGGCGACTACATAAAAAAATGTACAAAACTTATTACCTAAAAAGGCCTGACAACTCTCGCTTCTGTTCAAACCATATCTAGAAGTTCACAATGTAGTCCCGGAAATTTTTTCGAGAACTAATAAGCGCTTCAACCGGATAACATTTGAAACTCATGAGATACTCTTCGATTTCTCCTACGCGTTCAATAGAGTGAATTTCTTATGCACCAAATTAAAATATGACTGCCTGTTTGCTCAGGGAACGGGAGTGTATGTATATGGAACTTCGCGAACCCACTGTTTTTAATTGTGCATTTATTTCAAGGGCTTTTTTATTCAACAATGTTACCAACTCTCTCTTTTTCCAGAACTTTATCCATATTACATTGGTATTTAGAGTTAGTATTTATGGTAATCTAGTATTATTTTTAATTTAGAATTTTGTTGTAATTTTAGTATGATCGTTGCTTGCCGACCTGTTAGAGGTAATTTATGTTTGCTGTTTTATGTTCCTTCTCACAAATTTGGATATTCGGGCATAGCAACGAACATAAAAAAACATACAAACAGTGAAATGACCAAACACTGTCAGAAAACACAGATATGTAACTGAACAGATATGTAGTACCTTTAGAGAGTATTCGAAGTGGGATGCAATGCAACAGCACTTATTGGGTGAAACATCCATGCTACAATTAGGTAAAGTATCGCATTGGGGGCTACTCCGTTTATCCAATACACTGCTGACTATTCAATATTTAGGCAATGCTATTTCATGGTTTCTTGAAAGCGTGAAATAAAATTTGCCCCTGTTTATGCGACACAGCCGAATTAATGCTTTTATTTAATCTTAGATGACAATCAAACGGTTATTTTCTCCATTCGTAAACTTGCATGTTATAGAGAAGAAGTTAGTTCATTAACATTTTTTTAATAGTCAAAATATGTCCTTCTATAGAGTTAACAACTCCGTAAATTATATAGACTTAACAGAGTTGAGTGGTCTCCGCTTTGCGGTTGAATTTATGAATATTCAACTTTCATGTGTTGTCGAAATTATGAAACGGAATTTATGCTCACACTTCGGCTCGTTTCATGAAATTAAAGCTTGAAGTGGCCATCTTATAAACGCAGTAATTGTTATCCGATCCGGCTCGTTTCGACTTATGTATGTATATACTACGTGCAATAAACGTAAAACTTTAGCGAAGGTTTCATCCCGTTTCCCTTAAAGCTTATAGACTATTTTACGTAAAAGCTGATAGACAGGCGGACTTGGCTAAGTTAATTTGGCTAGTGTTGCTGATCAAGAATGTATGTAGCTTACGGGGTTGGAAAGTCTCCTTAACTGTGCTGCAAACTTCTGACTGAAATTAAACTATTGACTATTATATACCAGCAAAAATAATTTTCATACTGTTTTCAGTATCAATTAAAATGGCCGCAATGTTAAGCTGGGATAATGCATAAGATAATGATAATAAATTAGAGGCCTATTATCCACTCAATATTTACTGACTATACCCTTTCTTACTTGTCCTTTGAATGTCCTACTTGCGGCACCTAGCCCACCAAGCATAAAGCACAAACTGGTGGCGACTCTAGCGGCTATTAGTGAAAACTGCTGATTTGTGCAAGCACAACTGAATTTGCAAAATATTGAATATATTTGGCTTTAACGATTCCAATCATATTTGACATGTATATGGGTATTGATAATAAGTACACAATATCAAATCAAGAAGCAAAAAGCTTAAGAATCACATACCAAGCCCCAACTTTCTAGCTTTTACAATTTCCAAGATTTCAGCGTTCATACGGACGGACAGACAGACGGAAATGGCTAGATCCACTCGGCTAGTGATCCTGGCCAAGAATGTATATTCTTATAACAGCCTTGATATTTGCTAGTTTAACTTATTTTTAAGCTTCGACATTGCATTTCTGAGACATTTGTCCGGGAACAAAATTAGGAAATGTGTTTAACAAAATGTGTTTTACTAGAATATTTGTACATTAAGCTTTTCAAACTGTGTATGTAAGAATTTCTAAGTTAATTTGTACAATACGCGTAAAATAATAGTAAAAGTAAATAGGTTTAAAAAATTTTAACGATAGATGCAATTTGTTCGAATGAGAGAGTTAGCAATATTGCTTATATACATGTATACAGGTATAGTCTTTATATATAGCGTTCTGTCTGGTTTCATTTCATTTGTGTAGTCATTTTTTTTATTAAATGGTGACATTATATTCGTATACTAAAACACTTATCACCTAAAAAGAGGTATTTTAACAAGAAAGGAAGCTAATTTCGCCAAGACTAAGTTTTTATCCCCTTAAACCGCCCAACACTGTGGTGTTCACGCTAGAACATTTTTTTTTGCTCAAATGTATTTGTCTCATCACAACCACTTTAACGCCTAAAAACGATTTAAACGCCCTTATTCGTCTGCCGCCCACGTAGCACATACTGATATAGCCGGTAGGTGGGGCTTTACAAAATCGCTTTAGTGCTTATATATCTCTCTTTTTTATTTGCTCCCTTAAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTACTTGCTTAAGCTTTAACTGTAAGAGCCACAGCCTTGGGCTGCTTGCGTGCCATGTTCGCATAACAAGCTTGGCGCTGATCAACAATTAAGGAAACTAATTCTGATTCAGCAATCACATGTTCAGATTTTAAATTTAAATTCCTTATCATACCACGCCGACAGTGACACACATAAACCAGTTACAAATGAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGACGAAGATTGTATACCCTTGCAGTTATAAGACATAATCAACGTTAGTAACACCATGAGCAATTTTTAAGGATTGTTGCCGGCTTCAGTGATATTAAAAAAATGTATTTCATTATTTTTTTTGACAGCTATATTTTAGTTCCCTCCGATTTTTATTAATTTTAATGCGAAATTCTTAAAAATATAACAAATTATATTCCCAATATTATAGAATAATATTTAAAAAACAACGAAGCTATAATTTGTTTTATATATTTCCCCTCCCATTTATGGATCTTTCCTATGAATTTAATTTTATCAAAATCGGATATATTTTGATAAAATTAAATTTGAAATTTATAAGTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTGTATGTTAAAAAACAAAGCTTAGGAGATTATATGTTAAAAAACACCAATGATATCATTTTCTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCAATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGTCCGAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5d0/134/b3/scaffold_64-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -AGCTTTCAAACTGAGG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAATTTCATATGGTTTAAGATGCAACGCTATTAGACCTTTAGCTTGCATAAATTAAAAAATTGTATTTCAAGTACATATTTATTATTTCGGGAAAGTTTTACAAGTGACAAAATCATGAACAGCAAAGCAGTGCCTTTAACAGATGCAATCAACCCTTTGTCAACGGATCCGTTTCCATGTTTATTTCCGTTGAACGTTGTTCATTACATTTATCCTTGAGCCAACGAAATTGCTATTGTCGTATGTCAACCTTCTTTTTTTAACTGAATTTAAATCCAAAGTTTATTTGTTGATGCTCACTGGAAACCTCACCCTTCGAAATATTTGAAAATGTACAGCATTAAATGTCGTGGTTCAAATAAACTTTGAGAAAATATTTCATTGCAGTGTTTCTTGGCGTGATTTGTATAGCTAAATTTAAAGAATTTTTTTCTGTTATCCGTCTTTTAATCGTCTTTTTATATATAAGCAACTTAGAACAAAATTCAGACTGTCACCTTTCCAAAAGTATACAATATCTTTCACTAGCGCCACTACCAAAGGTGCTATGCAATCAATCACTACTGGGCAATACTTATAAACCAGACCAACCATACCATTTAGTTAGGGAAATTAATGTTCAACTTATACATATTTATTACCCTATATTCAAGACCTTTTTGTCTCCATATCTCATGTTGAATTTTTTTTAAATAAATGAGTAACACTAATCAGACATATATTAATAGAATAAGTTCCCACGCAAAACAAAAATGGCTCAATACTCAAATGCAATAAATAACTTCATTGATATTTTTATTGTGATTTTATAATGTATAACCGAATCTTTTCGGTGGGAATGCTTTAATGAAAGCAAAACCGTAATTAGATTATAACTTCCTATAATGAATATAACACAGGTTTTTTCCTTACTGGAAACACAAAAACACTCATGAATAGTAGGCATTTGATCGATATGCACAAGCAGCAAAATAGGACTTAGCCCTAACATATATCTATGTACACAAAAGATATACATATATATGTATCCAATATATGTTATCTATAAATCAAACTTGGACATCATTGGTTTGAAATTAGATAATTACACTAGACTTTGTCCCTTAATGCTACCGGCACACGATTTCAGTCGTTACTGAAAATTTGAATTTTCCATAAATATATGTATAGATCTGGCAATACATAATATTTATTACAGTATGTTTTACCATGCACACATACACATATACACCGTTGTCATTTTCTCCCCGTTTCCCCAGTTAAGCTTTGGGCGCCAGAGTCAAAACACTTTTACATAAATAGGGAGGTATGCTTTTTTTGTAGCAAACCGTATAGCATTCTTTGACATCATATATATGTATATCTATATGTCGGATGTTTGTTTCTGTTTTATATTGGTTAAATTTAAACTTACATACACAAGTTTAGATCTATGAACGATGAAGAAAAATAAATCTACGGGCATACAAAATTCTAAGTCCATTCGTCTATCAGTCGATCCACTTTTATATTCCTCACAACATGGTCTTGCTTTCCATACATACTTAGTATCGAATCATTTGAAGCTTTTGGGTGTGTGTCTTGAGTCACAGAATGCGATAGTCAATGACCAATGACCAATGGAACTGGTCATTGATCTTTTAGTCATCAACAATGGAATAAACGAGAGATATATAATCAAAGTCAGCTTCCCTTCCTGATGGCCTGCTTTGACCCTGAAGAGCTTGGTTTTGGCTAGTTTGACGCCATGTTGAGTTGGTGCTATTAGCTAGGCTTGAAGCGCTAGACTGAACACCAGCTATAGTTACATTGTTTGCACTACTCTTTGAGCCAGCAGTGTTTGCAGGTCCTGTTCCACCATTAATGGTATTACCACTCGCTGTTCCACTTACTCCAGAGCCTGTACCAGAGCTAGCAGCACCACCGGATGAATTTGAGACAGACCCTCCACTAGAATTAAGTAGATTCGAAGTTGCCACACTGGTGTTCGGGTTGCTGCCGCCGGCGCAACTGGTGTTTCCACTGTTGTTACCATTATTGCCGGAAACGCCACCACTGGCGCTGCTGCTTCCATTGCCGTTACCATTGCCGTTGCTATTGTTTCCGGATAGATTAGATCCTGAGCTACTGAGCCCACTATTGGGTGGAGTGCTGACGCCTCCGCCGTTACCAGCACTAGTTCCAGTACAGCTTGCAGACGATGGTGTTTGCGGTAAGTGCTGCATTATGTTCTGTACCTCGTTCTCGCTTGGAGATTCAGCAAATATAGTGGTGTTGGCGAGGACACAGTTGTTTAACGCCATTTGCGCTTTGTTCGCCTCCTCTCGAGTGGTATATTTACATAAGGCAATTCCTTGGTTCAAATATAGGTGAAAGCTAAGAAGGGGGCCATGCTGCATACACAATGTGCGTAAAGTAGAACCATCAATCTAAAAATGTTAAAAATACAAATACCATAAGTTATTTATTTGTTTTATTTAATATTGAATGAAAATGGAACATGGACCTTAATTACTTATTATATTTCGGTTATGCTTTTAATGATATTAGTATATAATTACGACACAAATAAAACAAGACAAAACCTACTGCAGCTACCAAATATACGATTGCAAAGCGTCCCCCTTTTACAATTTTTCAAATTACTTGTTATACCCTTGCAGACGGTATTATAATTTTAGGCAGAAGTTTGCAACGCAATCGTTTCCTACCCCATAAAGTATATATATATATATATATTCTTAATCAGCATCACTAGACTAGTTTTAAAGCCATCGGGCTGAGCTGAAACTTTCCCAAAAGCCTTATTTATTTTGTAGGTAGTAACCAGCCGGATCGGACAACTATGTCTTATAGCTTTCATAGAAATTATGGAAAAAAAAAAACTATTTCTCTATTGTTTTTTATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACACGTTTTAATCAGTTCTGAATTTCGTATTTAATTTTATAAAAAATGGACGACTATTCATATAGCTACCATAGGCGGAAAATGGGCGGTACATTTTTTGGACATATTATCTTATACTATTAAGAATATCATTTATTGTATTATTAAGAATTTCGAATTAAATTGAATAATAATCGGACGACTTTAAATATAGCTGTCAAAAAACGATCAGATATTAATAAAATAAAAAAAATTTTTTTAAAAAGACAAAGCTAGAAACAATCTTTAAAAATGTAACATGGTGTTACTATTTTTTATCATTTCTTATAACTGCAAGGGTGTACAAACTTTAGCTTGTCGAGTTGTCCTTACCCTTTCTTGTTTTTAATATGCACTTAAAATAAATAATGATAAATAGTTGTATGCTCTTATAACTGCAAAAATATAAAATTTGTTTAGCATTTGATAATGTACCACCGCCTTACTGTTCTACCTGAAAGTGAGTGACCCTGAAAGTTGTACTCTCCATAAGTAAGTTCTATGAAATGTCTCGTTTTGCACCAAATCCAATTATGGGGTCATATTATATTTTCTGTCACCACTGTGCAAACGAAATTTTTCAGGCTTGGAAACTTGAACTTTGACAAATACTTTTTCAAAAACCTATATTTTTAAAAGTAAAAAAGCAAATATTTGTTAAGCATATTCCTTTAAGTATTCGATAGTAAAATTACAACGGAATTAAACTCTACAGCTGTTGTCGTAAACCAAATTCTTTTTAAGTTATAGAAACAGTATAAACCTCTAAACCCCTATTTATTTACAAATAAACAATGGAAAACCTTACACTAAAAAAGGCTACATCATTTCTGGGTTTAAATTGAACAAATTAAGTTGTTTAATTTCTTTTTCATAGTAATCCTATATAGGAACTTTAACTCCAGGCCGAAGGCCTTAGCTGTTAATAGTTACCTTTAAAAAATAAATACATTTCTAGTTTACAAACACCAACAAATATAGTTGTTTTTATAGAAAAGAAAAATCACAATAAACAGCCAGATTAGAAAAAATAAC'..b'CGATTCTTGTTCTGAACGGTTTGTTTCAGACGTTTTATAATACTTAGTGTATATATCAGGATTTATAAAATGAGTGTCCAATATTTTTTCCTGCTCATTTAAAGTTAACGCAAGCCAGGCATCTCGACTGTATGAAGATCTTACTCTGTTTATGTCGCGCGTAATCTTTCCAGCCAGTGAATTAAGCTGGGAAAAGTATGCGGAAATTCCCTCATGTGCCGCCATTTTTTACCTGAAAGTAAATGGGTAAATGCTCTTAGTATTAACCAAATAATTAACAAAAATCGATTTATGTGGTGGAGGTGGATGAGAGTGTGACGGCGTCAGTGCTACACCATGTTCATATGTCAGAAAATGTATGTTTGAATTGCGAGTCGCACTGGCTTTATTCAGAGTGGAGTAACCTAGCATAGGAGGGGGCCTTGACTCCGCTGAAACCAACCTTGTACTAGAATCTTTAGAACCTACGTGATAAATACAAACTTTTTAGCTATTATAGTTATTGAGATTTCAGCGTTCATACGGACGATTTTTATAAGGTTTTTGGTTAAGTAATAATATTGATAAGAGCATTTCACTCTAATTAATATTTTCTTTCCACATTATGGCGTTATGGTGGGAGTGGCGCTGTGCCAAAACAAACTTGCGATGCGCAGGAATCTGTAGAATCGACACCTTTAATTCCAACCTTTTGTCTTGGAAGACTCCCGAGATCTTGCCGCTCATACGGACAGGCGCCAGGCATGGCTAGACCCACATATGTACGTACAAATGTATATGTATTATTACAGATACATATATTCTTTACCATGATTCAAAATAACGCTTATAGATAGGCTATACCCTATAACTGCCATTGAGCTGTATCAGGACCATAATTTTCGAAATTGATTATTGGTTCAGGCGTGTAAAGTCTACCAAATTAATTCCACTGTCAGAACAGGTACCTTAAATTTTATACTTACATGGGAGAGGTGTTTGGAAATATATTTCAACTCCAACTAGGGTTCTAATTTGTTTTCCTTTTCTCCGGCGAGTTTACTAAAATAAAGGGCTGGAAAAACTTTAATAAAGCAAAAATAAAGAGAACAGATTTCATGTATTAAAAATAATACAATGTTCACACCAGAGACGCAATATCAATTGCAACCATAGTTATTTCCCACCAAATCCACCACTTTTCGGAAAACAAGCTAGTTTGCCGAAAAAACAGCTATAATACAGCTATATTTTTAATACTCATGACTTGTGAAAGGTATTTCGAAGTACTTGTATGCCTTTTAAACTCAATTTGTCTAAATACCACCGTTAAAAACTATGGCAAATGTTTTTTATAATTTAGATATTTTTAGTCTTTTTTTCTGATTTCGCAAAAACGGCACTAACGATTTCAAATAGAGAGATTTCTCAACTTTTGACATACGAAACATTCCTGTAAAAATACCCGTGTCAAAGATATAAAATAACAAAGATATTGTGAGTATTTAGTGAGTATTTAGTGGACGGACACCTGAGGTAAGCTGCTAGTTAAGATGTATTACAAGGCTTATTCTCAGAGGTAGAAATTCAATTTATGTATAAGTGATTTATTCATAAGTTCTTACTTGCTTATAGGTTTCGAAGTTTCGTTGATGGTAACAGTTTGCGTAGTTGGCTCGGCTGACACTGCAACAACGTTTTTAAATACCAGCGCTTAAAAATTATGATAAAAATATTTTTTATTCAAACTTTTTGTTTAGCTTTTTTTCTGATGTTTGATAACTGCTCAAACGATTTCAGGTAATAAATTTAAGTGGCTAGCCCAAAAAATTGTTGTAAAAAGTTACCCTATAAAGTTTATTAATCAACAAAAATGGTAGCAATGGCAGACAATATAACACACATATTATATGACTTGTGTTTAAAACAAAAACTTCTGATATCAAACAAAAACCTCTGAACGATTGATTTCAGATCTTCTGTTTGTTGAAGGTGGAATCGTCACTATATCTTTAACCTCGTTTTGAGGTGTTTTTGGTTGTAACAAAATACTTTTTTTTTTTTATTTCAAACATGAATCGAATTTGTTCTGATATGCATTACAAGACAGGAACGCCAGGAAAATTTAAAATTTTTAAATTTTAAAAAGCTGGAGTTTTTAGCAATTGTTGTGTATGGGGTCGATTAAATTTGACTATCGCCAATGCTTATCGAGCTGGACATTAAAGATGTCTTTAAAATAAAGTGACAGGCTGGTCACACTTTAAGCAGTCGAAAAATTATGTATACAATTAAATAAATATACAATGAGTTGTTGTTAATTAACCAGCAATATGAATAATTGCATTGTCGAGGTGGAGTACGAATATGTTGTGTTAAAAGTAAGTTTACAATTTGGGGAAAACATTTGTACGGTTCCTTTTGCCCTAGAAAATCTATATTGGTATCCTTAAAACATTGTACAAACCCTTTAAAAACCTTTTTTTTTATAGATTAACGGTTATGATATTAGCCATTTGCCGTGGTATGAAGCGGTTCAAAAGTTCCTTCAAGCCAAAGAAACGATAGTAGTTGAATTGTGCAGACAGAAGCACAATGAGTTAGATTGCACCAACGCTAAACTATCAGATGTGGATAAAACCGTTCCGAATGCTCTGCAATCAACCACATGCGAATCAGATTTATCTGCCCAAACTGAAAATACAGCCAATGCGGTGCCTACAGCAACTGCAAATGACTCTCAGCTAGTGGACGCTACGTCAATAATACCAGCACCTTTGGATGTAACAGCAAAAAAAAGTCCTGTTATTTTGACTCTGCGTGCTTTAAGCCATGAAGAACGTTTGGGCAATGCTACAGCATTGGCCGCTTCGAAGGAAACGCAAACGCAACCTGCCAACGACACAGATGTTTTGAGGGATCATGATTTTGTTCAGACTATAACCAACCACTTCATTGAGCAGGAACACCACTTGTTTGAACAATGCCTTGAACCGGAAATCGATATTGAGGTAGTTTGGTCACATATAAGCTTTAGCTTTTTTAGTTTAGGACTGTATAAACTTAAGTTCTTGACTGATTTAGGAACAATATATAAATATGATGTTATCTTTTGTCGATGACATGAATTGATTTTAAGGACCTTTTAGTTAGTGTAACATTTATCGGATGCTAAGGAACTCTGACTTCTTGCTAAGTATTTTTTCTTATGTTTTTGCTTATTTTACAAAACCCTACAAGGATGAAATTATTTAGTCTTGGATATTCTATCTTTATGTCACTATAGTTTATTGTTCAGATCACTGAGGATGGAGGTACACTCAGTGGCGAAGCGCACCAGAAAGTGTGCAAAGAAAACTACTGTATATAACTGCAGAATTGAAAATCTGCTAAGATGGTCCGAAAAAGTGATTATCCTATCGAAAGGAATCGCAAAAACTAAAACGATTGCACCAACCTTTTTAATTTGTTTTAGAAAAAAAGCGGTAAAAGTGTAAAAGTGAAAATGTAGAAAATTGGAGCTGATGCAGACTGTGGGGATACTGAGACTATGCGTCGAATGACACCTCATTTGTTGAAATCCGATGTCCCGTTCCAAAGTAATTCCAAAAAATAATTTTTTCTTCCTAAAATGAAAATGTTTGTCTCTTTGGTTGTGGCTTTGTATGCAATATGCATATGCATATCCTTTGGATATATAAAGTTGCTAGAGATAGAAAACTATTGTTCTACGACTTTTGAAAAAACACGCCAGTTTAGCGGGAATTAAAAAAGATTTGAAAGACTTATAGTTTCTAAACAACGGTAGACATGCTATAAGTCTCTAAAAAGATAAATCAATTAGCTAAATACTCTTCTATTAATTAAGTTGTCTTAATAAAACTACTTTTCTCAACATGGAATCGAATGATTTCTTTTTATACCCTTGCAGAAAGTATAATGATTTCAGTCAGAATTTTGCAATAGAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAAAGTATGTATATATTCTTTATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGCCAAGTCCGTCTGTCCGTCTACGCAAACTAGTCTTTCTTCTTTCTATTGCAGCTAGTGTATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATAACTTATAACTCCCTTAGGAAAAAAATTTATTTTTTTAAATTATATCTATGGTGTTTTTTAACATATAACCTCATACGCTTGGAAATAACATTTTCTAGTCAGTTCTGAATTTGGATTAAATTTGATAAAAATAGACAACTATATCATATAGCTGACATACGAACGATCGGAAAATTGGTGTGAAAATAATATGAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTGTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTACTAACACCATGTGAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCCGTGATATATATAAAAAAAAAAAATTATTTCGTTCTTTTTATCAGACCATTTTTTTACATCTATATGTTACAGTATTCGGATTTTTATTAAATGGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATGATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTAATTTTCCGATCGTTCCAATGACAGTTATACGATATAGTCGTCCGATTTCGAAAAAAAATTAAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCCTAAAAGGTTATATGTTATTAAATATATAATTTTTTCATATATTCCGGCTAATTTTCCGATCGTTTCTATGATGAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTTTTTCCAAGCGTAGGAGGTTATTTGTTAAAAAAAACACCGAAAATATAATTTTTTTATATTATTTTACCACACATTTTCCAAAATACAAAAAAAAAAATACAATTTTTTAATTAATTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATTTGACGATTTAACATATAACAACAATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAAAAATAAGATCTTTGGTGTTTTTTATAACCATATATCCTCCTACGCTTGGCAATAACATTTTCTAATTAGTTCTGAATTTCGAATGAAATTGTATTAAAATCAGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAATGACCGGAAAATATATGGGAAAATAATATGGAACTAATTATAGCTTCGGTGTTTTTTGACATATTATCTTATTATATTTGGAATATAATTTTTCATATTTTAAACAATTTCGAATTAGCTGTCAAGGAAACGTTCACAGAAATAATAAAAAAAAATTTTACGGATAGTACGGATAGCCGGACTGGCTAGATCTTGAGATCTTTAACGTGTCTATCACTGTGTTGCAAACTTCTGTCTAAAAAACATTATAAGGTCCTAGTTTCTTTTCTGGCTAAGAAAAGTAACGTTGGCATAAGTCGCTTGGAAAACGCAACTCGTTCTAGCTTTTTCCATCCGAAATAAAAAACCCAAAAATTATTTTATATTTTCAATACTATAGCTTCCAGTTAAAGCAAGAAAATAGACAAAAAAAACTCTTTTTTTTATCAGAAAATTGTCTTTATATTGTTCAAAAAGTATATTAATAATAACTTTTAGTTTTTTTTAGGTTTAACTAGGAGACAATTTCATCTCGAATACAATAAATTTTGTCTCTTTCCGATAATACGTTTCCTTTTTTCCCTATCTTTCCCGCAAATTAGATAAAATCGTAAATTAAAAACCAAGAAATCGCACGATTAAGTTTTCCGGACGCTTTTATAACTGCTCGATTCTTGCAGAAATTTTAGGCACACATTCTTGGGTAGCCATTTATGCAAGAAAAAATACATTTTTTATGCCCCAGGCTCCCCTCTTAAAAATACTTCGCGATAGTGATGATATCTGAACATTGTCTATTTTGTTCTTTGTACTTTGGTAAGAAAGATTATTGATCCAAATGTATTTGTTCAAAGTGTAACATTAAATTAGTGTTGTAATGTGAAAAAATGTTCGGCAACGATATTTTTGTCGAAATCGGCATTTCTCTTAATTTTGTCTCAACTCGACTTTAGCAATCTCCATTGTTGTTGGCGCAGCTGTATATTTGTCTGAGTAAACAATGTATGCAAAAAACTAATTATTTTATGTTTTATATTTAAAGGAAGTAACCCTCATTAAAGCGGTTGAAAATTCAACGAACACTCAAATCGGGCTGATTATTTGCTCATCTGGATTTCAGTCGACATGCATTGATACGAATAAAGGTGATATACTGTGCAATGATTCAGAACACTGCGAGGATGTGTTTATTAGTGGCATACAACCGGAAAGTATAGCTCATAGAGATGGGCGCCTTCGACAGGGTGATCAAATTCTTCGTATTAACGGCGTGGATGTTAAAAACCAGGAAGAGGTAGAAAATCAGATAGCCGAGAGTAGCACCGCTGTAACGCTCCTAGTTAGTCGAATTCTATACCCTGTAAGCTTGCGTTATTTTTCACAAGTGCATAATTAAAATTATTTTTAAATTTATCAAGAGTAGAATTAATGGCCGTTTTTATACACCATAACGGACAAAATGAAATGGCTTTAAAATGTCCAGCCCTGAAAAGTTTTTATATTTGTACCTTGTATTTTAATTAAGCACTGCTCAAGGGTTTCAATTGCTTTTTATTTAACCAATTAATAAATTTTTAAACTGATTTAAATAGGAAGACGAGGATGACGAAGACATTCATTTTGAATATGCCAATTCATTTATACCAGATGACTACACAAATGTAGTGGATAAATTGGATAAGGTATTATTAAGCCACGTACAGTCTTTTGAAGAACTATCAAATGAAACCGGCGAGCATTCATCCGACTTAAAAGTTCAAACTTCTTCTCTGCCAGACAAATTTGTAGACCAATCCAGCAAGTTGTGTGGTAAAACAAAGATTCGTCCGGATGCAATCCAAACGGATAACCAAAAAACTTTAAAGCAATCTTTAAGCAAAAATCAAGTTCATCTCCAACATGAGTACGACGAAAGCGAGCACATTTACGAGACTATTCCAGAAGATTCTGAGTCTGAACCACTTTACTGTTCCCCGTATCAAAGTTCAAACGGCAAGTCGTCAATGGGCTGTTGTTCATCCGCAATATCAACGACTCCGGCTGAAGTATTAGAAACGACAATGCAGCAACAAACTCAACGAGTTGCACAGTGGTTAGGTTTAAAGCCACAATATCCGAGAACTATTCACACTCTTGTTGGCCGTCCTGCGCCACTAAAATTAACCCAACAACCAAATTGCAGTCGTGTTTTTACATTACGCAGCACATTGACAAACACAAGCCGATCCAGCAGTAGTGGAGTTGCTTACAGTGGTTATGGACCAAATAATATTCTTGGTGCAAACTTAGCTTTTGGCGAAGAGGTTGATAACTCCTCAAGTGCCTATAATACTGGTGGCTCAAACAATAGCGCCTCGCCGCATCAAAATACTACAAATGCTGATGATGATATCACTGCCAACCACAATCTAGAGAGCAGAGTGATCGATGGCCGCAGGGAAGCTTTAGATACAACTGCTGTAAGCAGTATGTTGCTTTTACCTTTTGGTAAATCCGGTCGAATCGGTCTCTGTTCTTCGAACATGTCCACATCGTATGTCAACGGTAGGTACACCAATTAAATATAGTAGATTTAAGACTCGTAGATTTGGGGGCCCTTTTACGCAGTGAGACTATGTGCCTAAATTCATGTTTGCCCTCCGTATTTGACAAAGAATTATATTGGATTTGAGGAAAAAATATCAAAGTAGTAGAATGAGTGCGAAAAAACTCAGCTCAGTCACTGTAATTTCTTGAACGAATTATTTTTAACCTTAAGTAGTTAAAATAGAAAACAGTTCCAGATTATGATTATGACTATTAGGTAACCGTTACATAGCTAAAGTGAG'..b'TCAATGGCATGCCCGCGTTTTCTAAAACAGACAGCACCCTGCCACTTCCACCGGCACCGAGCTCCCTCCTATTACCCTGTGCCGGCAACGTCAGCTTAGAAGATCGATCAAAGAAGTCGCAGAATATGACCGAGTGTGTTCCAGTCCCCAGTTCCGAACATGTTGCCGAAATAGTAGGCCGACAAGGTGAGTATTATCGACAACCCTGCATTAAAGTGTTATATTATTTTTTTTAAGGTTACAATGTCGGAACAAATTAGTATGAAAAACAGATAATGCTAATATTAAGCAAAATGATTTTTGAAAATTTCTTTTTGCAGTTACTATTAGTTTTGTTTGGAGAAACTTTTTGCATCGAAAAATTAATGTTTTCAAGGAAAAAAGTTTAAAAAAAAACGAATTTTTTACACAAATTTGGCGTAATATGTACTGAATATGTTAAGAAATGTATTGTATCCTTCAACAGGAAATAAATTACCGATTTATTCATGCCAAAATTTACTAGAAGTAAGTTTAAATTATGAGTTTGTTTAACTTTTGTTTTGTCAAAATACTCACATAAGCAGACCAGATTAAAGCTAGAAAAGTCGGACTTGACGCGCAGATTTCTGGGCTTCTTGCAGAGCAAGTTTGTTTCAACGGGGTGCCATGCCCACTTTAACGCCCAAAATCCACGAAAAGCTGTAGCGCCTTTAGTTTTATTGCTAGAAAATGATATGTATTTGTCTCACAAACACCTATTGATTAACCTAACAATTTGCCACGCAAACACAAACCGCCCAAAACTGTGCCAACCAACGTTTTCATGCTAGAAAAAGCAACATTTACTGAAATGAATTTGTCTCATCAGTACCAAGGAGTGTAAATGAAGACCATTTTAGCTCTAGCCATGTTCTGCCCACCGCCCACATTTTTAAGCTAGAAGGTTGAAATTTGACATTTAGAGTACCAAGTTTCCGCCCACTCTTACAATAACATTTTCGTACTTTTTTTTTATTAGTTCATATTTATCGATTAAATATTAAATTATAAGGCTTCTTATCGTTTTCTAAAAACCGGTAACCCCTAAGATATTAAAACATCTAAACTATATATCCTATACCCGTTTCTTGTAGAATAAATGGGTATACTAGATTAGTTAAAAACTCCAAAAAGTGTACATATTATGATCAGGATAACTAGCCAAGTGGATCTAGCCACATCCATCTGTCTGACCGTCTTTGTGAATAATAAATATAATATTAAAATTATAATACACAAATTATATTTAGATAAATTTGGGTTTGGTATGTTCCTGAGCTTCCTGCGCAGCCCAAGTTTTTTTCAGCAGTGTGCCGCAATTTTTATTCCAGAAAAATTGTTGAACTTAAATGTGTTGGTCTCGTAGACACCTATCCTTTGACCCAAAAATTTAAATGTGTTGCCCCCATCAATAACGCCCAAAAATGAGGCGCCCACAGTTTTCATGCTAGAAAAAACGTATCACTTTACTTGGCCACGTCAAATAGTAAAAAAAACGTCCAATCAATTTTTTTTACTTTTAGGTTGCAAAATAAAGGCTTTGAGAGCCAAAACCAACACTTACATTAAAACGCCCGTTCGAGGAGAGGAGCCGGTGTTTGTAGTAACTGGTCGAAAGGAAGATGTGAACAAGGCTAAACGAGAAATTCTTTCTGCTGCTGACCACTTCAGCTTAATACGAGCATCACGTAAGCCCTTGAGCGACGGTCATAGTGGCAGTTTCGCAGGAAGTACGAGTGGATCTGGAGGTAGTGCAATGCCGCGCATGCAGTCTGGACCTCCATGTATGCCAGGACAGATAACCATACAGGTACGTGTACCTTATCGGGTGGTTGGACTTGTTGTTGGGCCTAAAGGTGCTACAATTAAACACATTCAACAAGAGACTCAAACTTACATTGTAACACCGTCGCGCGAAAAGGAACCAATTTTTGAAGTGACTGGCTTGCCAGACAATGTAGATACTGCACGAAAGCAAATAGAAGCTCATATTGCCCTTCGAACTGGAACAGGATCTGGAAGTGTCGATGGTAATACTGTGCAAGGTGGTGAACCGGTTGAGGGAAATGAATTTGCGACCCTGCCGACAATAAATTCATTAACCCAAATATTAAATGATAATTTGAATTCAGATATTTTGTCGTCTATATACAAAAATGCAATTCCATCTGCACAGGATTATGCAAAAAATATAATAAAAATTGCTGAGAACGGTAGCCATTCCGTAAAGACAATGCAAGGCCATCATACTGGCAATTGCTTTAAAAAAACTGAGTTTTCTGATATGGAAATAGCAGCAACTATAAAAGCAACTCAAATATCAGACAAACATTTTCCGGAAAATGAAGTTTCCATGCCATCATCGAAGGCTAATGTTGTATTCCGTAATACGCCTAGCAAAACATTATCCTACTGTCCTCCCACACCTACATCAGCATCGATTCATTCCAACTCTAATGCTAATATTTTAACAAGATCTTGTTCATCTGCTTCTTCAACAACTTCAACAAAGAGTACCAACAATAGCGCCAACACACCTCCAGAAATATTAAGTATATGGAAAAATATAAGTGATTCAATTGACGTCGACGAGGGTATAGGGGAGTCGCCTAGTATTTGGAACCAACAGGGTAACATTATACCCACAGCACACTGCTCACCTACAGTCTCAATTAGTCCTACGGATTCGCTCTTAGGTTTTGGTGAGCATTCTGTAAATCAAAAAAATCTGCATCAGACTAAGGAGCCGACTACATGTAGCAACAAGCAAAAGACGCAAGCTATTCAATTGCAACCTATCCCGGATAAATTTATGATTCACCGCGAATGTTTTGTTTGTAACGAAAATGATGTTACAACTGCTTTGGTTCCATGCGGCCACAATATGTTTTGCATGGAATGTGCGAATCAAATATGCATTTCTATGGAAGCAGTTTGTCCGGTTTGTAATTCTATTGTTTACCATGCAATGCGCATTTTGGGATAATTTTCATTGTAATAATTTATTAGTTTATTGCTCATTTTGTTTAAGAGTTCATTTTAACTGGTATATTTATACGTTTGAAAATTGTGTATGTCCTTGCAGGCGCTATAAGACATTTCCCGTCACAAAATGTAAATATATTCTTTATCAGCATAACTAGAAGAGTCAATCTAGCCATGTCCGTTTGTCCGTTTCTCTGCCCGTTTCTATCCTGCACGTCCCATTCGAAAATCAAATAAAAAAAACCTTAAAAAATTTAAAACTTCTAATTTTGGTTTATTTCTGCATATATTGAAAATTAAAAAAAATAACGGTCGCTTTTCTCATATAGCTTCCATAGGAACGATCGAATAATTATTCTCAAAATAACACAAAGACCGCTATATATTGTTTTCGGTAAATTAAAATGGTAATAGTTAATTAAATAGGAACATTATCTTAGTATCACTGTATTAAGTATTTATAAAAACTTTCGATGTTTGCTTCCATTCTTGGTTTTATTTTTTTAATTTTGCCAAAATAGTAATGTTGTTTTAGCTTTGGTTTTTTGGTACATTTATAACACTTACAGCCAAAATGTCAAAAACAGGATAATAGTAGTTCTTCGTACAGTTGAATCTTTAGATCACGAAAAACTACGTCAAACTATTCGTATTTTAATTGAGCACTGGTTTTTTTTAATTTTATAAAGATAATTTTTTAATATTTTGAGTTGCGGTCAAAAAATTACCGAGTAATATCGATTGTCGATTAAAACGACGTTTAAAACAAATATTACGTTGGGCAATACTAAAATTCAAATTCCAGCAGCAATTCTGTTATTGGCTTAACAATGCAAACCTATTATTTTATTATGGATTTCTTCCAAATATGGCTTGTTCGGCTTGTATGGACGGTAACTTTAAAGTAGTGCACAAGTTTTTACGATATCAACAGACGCTTTACAGTCACTGACAGTTTTTTAGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/5ec/7bc/4b/scaffold_39-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -AACTGCTGAGCTGTTGGTCACAATATATGCAACGCATTTACCAAAAACGACCTAGGGTATGTTTAAATGTTTATCCTAAAAAAATGTTTAGCCTGTTTTATTTTAAATAATGTTAAATCGGTCCTTTTCTGCTATTTTTATACCTAGGCAGAGGGTATTATGATTTCGGTCATAAGTCTGCAACGCAGTGAAGGATACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATACTCTTACATTTTTATATATAGCCTTTTCCGCCCGTCCCTCCGTTTCTACATAAACAAGTATCTCAGTTTTAAAGTTTATTAGGCTTAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTATAGTGCAGGTAGTATATAAGACGCAATCTGCCGGATCACGCAACTATATCTTATATCTGCCGTATGAATAATCAAAAAAAAATATTTTAATTGGAAATGACAGTTATTAATTAGTTCGGAATTTCGAATTGAATTTTATCAAAATCGGACGACTACATCATATACCTGGGGACGACCGGAAAATTGGTGGGAAAACAATATGAAAAAATAAAGCTTCGTTTTTTTATTATCTTATACTATTCGGCATATAATTTTTTTAATTTTAAGAATTTTAAATTAAGTTGAATCAAACTCTAACTTGTAGTTTTCAATTAAACGGTCAGAGAAACAACAAAATAATTATTTAAAAAATATATATTTTTAAATATCACTGAAGATAACAACAGTCTTTAAAAATGTAATATGGTGTTACTAACATTACTAATTTCTTATAAGTGCAAGGGTACTCAAACTTCGGATTGCCGAGGTTAACTTTCTTCAAGTCAATGTCGCCCTAAAATAGAAAAAATGGAAATGATTTGATAATAATTATTAATGTAATATACAAATTATTACTGGGGTTCTAACAAAATTGAAAAAAATTACAACAAAATAATAATTACTTTTAAAGTAATATCTTTTTGTTTTATATATTTTCTAAAGTTGTATTTCCGAAGTTTTCAAAAAATCATCACAGAATAGGTAATCCGATTGTAGCATTGTTATAAATAAAAACACTAAAAAAATAAGTATTACATTTAGATTTCTATTATAGTTTTTATTGAATTTTATTTAATTATATTATATTTTTATTTGCCAAACACACCTTTAACAAGTCTAAAAAACATTGCCGTTCCAATCGAAGTTAAAGTTTCGGTAGGTCCTAGCATATTTATTTAATATAGGTATGGTTGGATGTCAAATGTCAGCCAACTACTACCTTCTTTTCAAAACTGTAACATAAAAAAGTAAAATGCTTTTAGTATAATTTTAGGCAAATAACGTCATTATGGTGTGCGAATGTTTACTTTTAAAGAATAAAAACACACTGGATATATATGTAGACCATGTAGATTGATCATTTTCCAACCTGTGTTGAGGTAATATATGTCGGACTTTTTATACCCGGTATACTAGATTTGTCTGAAAGTATGTAACAGGCAGAGGAAGCGTTTTCGACCCCACAAAGTATATAAATTCTTGATCAGTATCACTAGCCGAGACGATCTACCCATGTCAGTCTGTCTGTCCGTCCGTATAACCGCTGAGATCTTGGAATCTATAAAATCTAGAAAGTTGGGATTCGGAATGTAGATTCTAGAGCTTCCATGCCCACAAACGACCATAGCACTAGAAATCGTCTAGCACGCACATTTATTAATATTATCTAAAAGTTTAAATGCGATTGTGTTCTTTAAATGTTAAAGCCAACATATTTAATATGTTGCAAGGTCAATTGAGCTTGCACACCACATGCAGCAAATCAGCAGTTCTCACTTATACCCCGATAAAGGCGCCACCAGTTGGGCTTATGCTTGGTAGCGTTGGGTGCAGCAAGTATGCGCTGGTCTCCTTTCCTGGAGACTCCATCCGTCTTGCACTCCATTTAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGATGAAATCGACTATAGCATGTTTTCTTGTTTTGTATTAAACTTACTTTACTTCTTTCTTTATTAAGTCAAAAACCCATTGAAACCGCCATTTAATGCAACCTATGACTTATATAGCCCCTAATCTTCAAGGACTAATTTGAAAACCAAAGAAATTAATATGAATCCCCTGTATACTTTTTGAAAAGATTGGGACCCGAACGCGTTTTTTTTGGATTTAGAAACAGAAGCTCAGCCTTAACCCTTTTTTAGTAGATAAAATGACAGCCGATTTCACAAAGCCTTCTAAGATGCAATTTTCCGTACCCTTAGATACACAAAACCAGATAATTCAATAATCAAAGCAAGCCCTGTTATTTTGATTTTATGTTCAAAGACAGAATGACGTTGCGTCGTTATGGTTGTTATAGTTGACGCGGATATATGCGAAAAAAACTTGCGCTGAATCAAAATGATAAGAAAAAGGAAAAAAAAACCGAATCTACAAATTTGAAACATTTTTTGTATTACTTTTCCTAATGTTCCTATAAGATCTACATGATTGTCGGAAGTTGTACACTATTTTAACGTTAACTAAAATATATGGTTTTATATAGATATTTTAACAAATAAATAGTTTTGAACGATCCAAATTGGATCCGTTTTTGCTTTAATAATCAGAAAATTTTGCGGTATAGGATTATTAAATTGAACAGTACAATTAATCAGTACACTTCTTAGGAAGTTTATACAACATGATTAAGGTTATTGAGTAAATCAACAAAACTAGGAATATACAATACAAATTTAACTAATTATTATTTTTTGTCTTGCAATTTAATAATCAATGGTTACATTTCTCTATACGTCATTCTTGTGCGTAGAATAGTTCCTCGAGTCCTCATTAAGCGCAAAAAAGAATGTACCCTTAAAGCTATTCAGTTTTCTCGATACCTTAAATGTATCTGAGTGAGAAACAATGTCGACGTGCCGTTAATCATAGAATTAAAATGTCAAACAATGAGGTGTTTAATGTACATAGGCCTAAAAAAATGTCCTTGCCTAGCACCATTTTACCATTAAAACTTTTCTAAGTATAATTTATTACTATTCTAAAGTTCGTCAGCCCTGGTAGTTTCGATAATAGTATAGGAAAATCACACATTCTTAAAAGTTTTTGGTTTTGTGTAAAAGAATGGCCATTTAACATTTATACGTTTTTCGTCACTAAATAGTAGATTTCAAATAGTCGTTCTTGCCTTGCTATCTTATCTTATAATTCATGAACAGTTTTTATAAATCAAATACAACCTTTTTTTTTACTATTTTTCAAAGGAAGGAAGCTGTTTATTAGGTTTTGATAAAATGTTAAAGTTTTAAGAAAAATGAGAATGTTCCAATTTAATTTACTACTCAAGATGATTGCCGAAGTGGTCAGTAGTTCATTCGTAATCAAAAATAACAAAGTTATTAATGTTTTTTTTAGTATTTTCTCATTAGTTATCTGATCATTTCTTTGGCAGCTGCAGTATATAGTCGTTCGAGCTTTTTACTTTTTTTTTATTATTAAAATAATGAGATTTCTAAGAGTGTAAGTTAATATATCAAAAAATATCAATACTATATATTTTTTACATTTTTATACCCTTGGAAAACATTTAGGTTAAAGGCTTTAATTAGATCTGTTCCTGGATTATATTAAATAAAGATGTTAATTAAAAAAAATATACCCTTGGAGGGGGTATAATGATTTCACTCAGAAGTTTGCAAAGCAGTGAGGTCTCCGAACCCATTAAGTAAATATATCCTTGATCAGCATCACTAGACCAGTCGATCTTGGAATGTCTGTCTTTCCGTTCGGTTCTAAGCAAACTAGTATCTCTGTTATAAAGCTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCTAGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATCCCTTATAGCTCCCATAGGAATAAAAAAACTGAGAGATTATATTTGATCAAAATTGAACGACTATTTTATATAGCTGTCATAGGAATTATCGGAAAATAGGTTCGGTGTTTTTTGACGTATTATCTTATAATTTTGGGAATGTCATTTTTTATAGTTTTAAGAATTTCGAGTTAAATTTAATAAAAATCGGAGGACTCTAAGATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATTAAATATTTTTTTAATGTCACTGAAACTAGAAATAATTAAAAATTGCACATGGTGTTAAAAATTGCACATGGTGTTACTAACGTTAAGTATTTCTTATTACTGTAAGGGTACACAAACTTCCATTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTGTATTTAAATATTTTAAATGTGCAATATTTTCTATTTCCAATCCGGTTCGCTCCGACATATATACTACCTGCAATATAAATAATACTTTTTGGAAGAGAGACTAGTTTCCGTAGGAACGGTTAAACGGACGGATGGACAGACGAACATGGATATATCTACTCTTTGAGGCCGATCAATACTTTATATACTTAATGGAGAGTATATAAATAAGTGAAAAGTTATACTTAAAAAGTTTAACTTATCGTAATAAATGACAACCAAAAAAAGAAAATTCTGTCAGGCTGTGTAATCATTTTAGCAGTTTAGGCTTTATTTATGTTCGATAGTAGAGTCTCTTATCTTAGTTGGCTTTGTAAAGTCTGCTGTAATTTCATTAAAAAAAAACAAATTTGTTGGTCTGTTCTTTGATTATATGTAATAATTTGATAAATACCATAAAGTTATCATATAGCTTTCATAGGAACTATCGGAAAATAATGTCTAAATAATCAAATACCTTTCTATTACGTTTGCGGTAAATTGAATTGGAATTCAAATGAAACATATTCGTAATATTTTTGTAATTAGATTTCAGTTTTCTAAAAATCTGAACACACAATGCTCCCACGTCAACGACCTGCAACGGTATAGAAACTTTTAGGTTATTTTCTTGTTTTCAATTAAATGAAGTTAATTTTTTTTATATTTTACCCAGTCTAGCCAAATACATTTTGTCAAAATAAAAGATAT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGCTTTTTTTCTAGTTGAGTTCCTTTCTTCTTCATCCTTCACCAGCAACAATTTCTGTCTCATGGGTGAATTCGGATAAAAATTTTTAAAAATGTCATTTATAACTTCATGTATAACCCATTTTATAGTACCCTTTTTGTATTTAAAAAAATGGTTTTTAAGGTTATCTATTGGTGTATCATTATCGTTTATTTTGGCTTGTGTATGTCCTTCCTCTAACATCTGTCCGCGTGCTCTGAAGTTTTGGACAATGCTCCTAAAATATTAAATTTGTTCATTTTTTTCTGTGTCCAAAATAAAATAAATTTTGATCTTCAAAACAATTTTAATTCATCCAGGAATTATATATTAACATTTTTGTTAACTATATATATCTATATATAGAAATTCATTTGTAATGTTTGTTAAGTTTTTTAAACAGAAACAGAATTTTCTAGATTTTTTAGGTATTTATCCAGGGTGTCGAATAGAAACATTTGTTTATTTAATATATCATTATTGTATTTATTTAACCAAACATACATTTCATGTCAAAAGCTTATATCATATTATATCTCATTATATCATTTATATCTTTAGTATATTCATTATACTTATATTCATCCCTTATTCATTATATTAGTTCGTCGCAATCGTCACGACTCTTTACCTTGCACAAAAAAGATGTTTTGTTCAATATTAGAAGTTCTTGTTTTAAAAATAAATTTATTGAATTAAAATTAAAGTTCCTTTCAATTTTGCTGTTATACTAATCATACATGAGTGGTGTTAAAAGAGTTATTTATTACGAAAATATTTAGTCGATAACAAACTTATAAATGCTTTTCTTTTAATTAAAAAGATATCTAATGGCTGTCAAGTAAGCTTAAAATGTTTTCGATACTGAACTGAAAGGGATTGCTTCTTTTATCGGTCAATATCTTCCAAACCGTAATTTGTATGACAGAATCTATATAGTTTTAAATTTTTATATCCTTGCAGAGAGTATATTGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGAATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATATCCGTCTGTTCGTACGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAAATAGTCTCTCAGTTTAAAAGCTTTCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGCCTTATTTCTCTTGCAGGTAGTACTTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGATATCTATATCTTATACTTCCCATAAAAATTATAATTATGTGTTTGGTGTTTTTTAACATATACCCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTTAATTAGTTCTGAATTTTGATTTCAATTTTATCAAAATCGGACGTCTATATCAAAGTCATAAATTGGTGGATCGAAAAATTGGTGGGAAAATAAAATGAAAGTTAGTAATCCCCTTCTAGTAATGCTGCGTCCAGCAGCTAGTGGCGTATTGCTAATTTTCAGCATGTGATGTGCAAGCTCAATTGAGATTGCAAAATATTGAATATATTTGGGTTTAACTTTTAAATGTGTAGTTCGATTATTTTTTGGCACGTAGATGGGTATTGATAATAAGAGAACAATGTAATTTACTTTTTAACATAATATTAAAAAATGTGCGAGCTAGATGGTTTCTATTGTTATGTTATTTGTGAGCGTTGGCACCCTGCTGACAAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCTGAAAAATCTACATACCAAATGTCAAACTTATAGCTTTTATAGTTTCCAAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACAAATGGACAGACGGACATGGATAGATCGACTATGCTATTGATCCTGAACAAGATTGTATACTTTACTGTATTGTACTCTGTCGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTTATAAATATATACCTTAATATGATGTTTTCATTTTTTTTTCAGTTTTTTCTAATCTATTTTAATGAACAACAACGTAATTTCTACCAAAAAGGGCGTTTACCCGCCACTTTTCGTGACAGATGAAGAGAGCCGAAGTGTCTCGTGCGAACTTCGCGAGAAGTGCAATAAAGTCGATTAATTAAATGGAAACAAAACACAAAAACTAAACAGGCTAATTTCAAATAAGCAAATTTTATATTATAAAATATTAATTACTGAGCTATGAACAAAATAAAGAGCGACTAAGTAAGAAAAAACGACCCTACTGTCGGTCGAAAGCCAAATCATGCCAACGACGTGGAGTTAACAATGCGAAACCCCTCACCATCAGTTTCGAACCTGGCGCACCAACAAAATGCAGCGGTAAAACTTCTGCATCCGCACTACATTTATCAGCAACACCTACAGCTACGGCAAAAAAAAAAAAACAACAACATCCACAGCTGCAGCCGCAGGTCTAAATACAACTGCAACAAAAACCACGACAACGAATCAAAACAAAAACAAAATTCAGCAAGCGGGGGTGGACATATAGACCGGACTAGCTTTTACCAGAAAATGAACCAGGCTGTTTTCATTAGGGAGAAAATCTCGAATGCCTTGGTTAACGGGGACGGAAACTTTCATGTTGTTCCGGTCACAAAACGGGATATATGTACATGAAACCAAGCTGCAGACCAAATATGAAGAACATTTCCGAGTTGTATCACAATACCTGAAAAGAAAACTAGAAAAAGCTACTACACTTACCAAGTAAAAAGAAGCAAGGACCTGCAAGTGGTACTAAAAAAAAATCGAGCCCGACGTAATTGCCAAGGAAGTTATCGATACTCTCAAGGAAAACGGGTTTTCTACAAGGAACGTCAGTAACATTATTAACATGAAAAAGGAGCCGCACCTATTCTTCATGGTCGAGCTGGAGCCAGACAGCAAAGTCTTGAAGAAAAATGAAGTGCACCCCATTTATAACCCGGTAATACTTATTGAACCGAAGAATTAACGTGAAAGAGTAAAATAAAAGGAACGTCCCAGTGCAATGCACAAATTGTCAGGACACACCAGGGGATACTGTTCACTTTGAACAGTCTGAAAATTCGGCTTACTGCCCTGCCCCCAAACAAAAAAAGCGTTAACTGCCAAGGTAAGCACACTGCAAACGACAAGGGCGATATACAAAGAGATGAAGGACCGCATGCGAAAAGTGACAGCAACGAATCATCAGAATACCCAAAATACGTACACTTCCTCGCATGCACCGCTGTATGTATTTTTCGGCAAGGCTGCAAGATCCTCATTTGGTCAACTAAATACAGAAGGGCTTCTCATACGCCGACGTCCTTCGATCAGGGACAGAAAACCCTTTCCAGTTTAATCCAGGAAACGCTCAGCAGATCCAAGTACAGTCACAAAGCACTCTGGAATCTATGGTGGTCACCAAGTAACAAAGTATGATGGAATTTATGTCATTCATGAAAACGACCATGAAAACACTGGTACAACATCCTCGTAGTAGAGAGGGTGCTATCTGGCGGATTAAAAAAAAATTAACTGGACTACAAGGGTTTGCTCTACATCTTCACTCTCAATCCGTACATATGACTCCCACATATGGGGAACACAAACATTATTCAGCGCTTTCAAATTAAAATCCTGAGAACTATCATTGGGACACCATGGTATATTCGGAACCAAAACATCCACAGGGACCTCGGCATTCTTACCGAAAAAAAGAAATAGACAAACAAAAGCGTCCTACAATGAAAAACTCTCTGTGCACCTCAATCGCCTCGCAAGAGGCTTTACTTGGGTTTTCTGTCAATCCCGTTTAAAACGCAACGATCTGCCAAGCCAGCAATAACTTTTGGCCCCCTTTGGCACAATACCAGTAATATGACTGTTAATTAAATTAATTAGTTTAAGATTTGATATACTTATTGCTAGTATCCAAAGGGAGAAGATTTAATAAATAAATAGCATAACAAAATAGGTGCTTTTTTTTACAAATCTTTTTTTT'..b'GGGCGAAATCATTTATATTATTAAGATTTTCGACCGAAATTTAAAAATTGCAGTACAAAAATTATGTAAATTTTGACATGGTTTGCAATTCTGTTGGTAAATAAATAGGGTTAATATTGTGACTGACTTTTGTATATAGATAGAATTCTTTTGTTAGATTTTTCTACAGCATCATATGAAGATATCTATTCTCCTCCAACAAAGAAGTCAGGGATGTTGTCATATCGTTGATTACCAAATTTGTCCCGGCATACGGATGTGTAGAACTGCTAACATCAGACCACAATGTATTATTTGATTGAATTTGATCGCCAGATGAGTTGTTTGTATCCACCCAGTTCTGACAACTTTGTACGTATTCCAAAGTGCGCTGGTATGTATCTGACACCATTGAGCTCGTATTACTCCCACCAACCGTCGTTTGTGTGTTCGGCTGACCAGAAAATTTTGAATAGGTTAAGGGTAGATTCTTTAAGGTGGAAGTTTCTCCATCGTTATTTATGTTTATAGAAGGAGACATTTGAGACTGACTTACTATGCCGCATTGAATCTCGCTATTTTGGTCTCTATGTAGTTTGGAAACATTTTCTGAGTTTATTTTTGTAAATATTGGATTTAGCTCGGGCAAGCTTGTCATTGATGAGTCAATGATTTCATTTTGATTTGATTTAGTTATCTGTGGTTGATAGGCTGATGATGGGTATGGTTGTTCCTTGAAACCAATATCAATATTTATAGTTTTGTCTATCTCTTGGGGAAAGCTTCTGCATTTCGTTTTCTCATGCTGGTGTGGCACTATATTTTGTTCCCTCTGGCTAGGTAAACCCCCAATCGTTGTCATTGTATGCTCTTCTTGCGTTTGCAAGTTCGATGTATTTGGTTGTAAATTTATTGATACATCAAAATTCGAAGTCGGTAGTATAATTTGTTTTTTTATTGGATTTAAATTTGACTTTGAAAGTAATAGGTTTTCGTTTGATTTTATGGTTTTAGGTACAGTTGACCTTATAGCAACATCATCTTTCTCCATATAATTTTGATCGTCCTTCACCAAATTTAAATACTGAAGCATCTCATCGGGAAGTATAAGCTCTTCAACTTCATCCAAATTTATTCTCTCATTTGGATGCTGCTCGCTGGTCATTGTCATTTCAGTCTTCATTGTAGCATGGCAAGGTCCCTTTCTTAAAGTATTCTCGTTACTAGACGATGTTATATTCACGTTCCTAGCCTTTCCAATGGGAAACTGCAAATTTTGCAGTGGGCCACTTAAAGGAGAAACATTTGTTAGTGTATCCAAACTTATGTTTGGCATTGGCTCAGATTGACGTCGTAATATGTTATTCGGGATTTCTTTATCAATTTCCTGCTCTCCAGCCGGTCCATTGTAGTCTAAATGTAGAGATGGCGTACAATTGGGAATGGAAAATCGACCGCCAGTTGTGTTGTGATAACAACTCCTAGAGTCTGTGTCCTGCAGATGCTTCAAATTGGTGGCAATTAAATGAGACGATGGAGGTGGAGGAAGACTGTTATTGTAAAAACCAAAGTACTGACCACCAAGACCCGGTTTATTAATAGAAGCATTTGGGCTGCTGTTTGCATTTAAGTCCTTGTTAATTGCAGTCAATCCTGATGTTGATGTAAGTGCGTAGGAGTTGACTACATTAGACATTTGGCTAGAGCGTCGAGAGCATCCTGGGGAAATTGGATCATAGAGGGAAGCTGTGGTTGTGTTGTACGATGGGCCTGGACGCATTGTAGATATAGAAGACACCTGAGATGATTGACTACTGCGGCGACTTTGCATGCTACCATAATATGTACTTGCAGTGGAGTTCTGGCTATCGCGACGAAAATGTCCTTGGAGAGAGCCGGAAGCGGTAAAGAAGCTTTGCTTATTTAATGTTATATTTGATTGATTTTGTGATAAGTCTTCTGAAATCCTTTCCAGCCCCGTATTCAATGGAACTGTAATATCACAAGCGGTACCAGGCTCCATCTTAAGTTCTGTTATACGCTGGTTAAGTTCGCTTATTCCAATGGTGCGATTGCTTTCGGGGATGTTGCCAAGCATAACCATACTAGAGTTTATTCCTTTAGTTTGCAAACGACTTCTAAATCGCTGCCTCGCAACAACACCCCCTCCAATGGTCGGGGCCATCGAATTTCCGCTGCCAACATTTACCATAGCACGCAAGACAATTGGTAAGTCGGCCACGTCAACGTCATCGTCACAATCCCAGCCGTCATCTAAAGTTATATGTTCGGCGGCACCATCTTGTGAATATGTTAAAAAACAGTCTGAAGCTCGAACTCCACTTAACAACTGATGATGTGGTGAACTTTCATCAGATTCAGATTTAATACTGGGACTAGACATGCCTATAAGTTTTCCCACCTGAAGTTCTTCGCTGCAAGGGCTAGAGTCAATATTATGCTCTTGAAGATTATGCCGACCTTGGCCACTGTCTCGGTGGAGGCGAGAGTTCGCATCATTTAGGGGCAATCCCTTGTGTTTTTTATTAGCATAAAACTCAGCACCATGAACTGTTTTAACATGTTTACGCAAAGAACTTGGGTCGGTGTAACGTTTCGTGCAACCAGGAGCTTTACAAATGTACGGTTTCTAAAAGATTTTAATCATAAATTATTTTTATTGGAGGAGGGTTGTGCGCTTACCTCATTACTGTGAGTACGATTTTGATGCTTTGCACGATCGCTTGCATTACTAAACGCCTTGCTGCATCCCGGATACTCGCACATATAGGGTTTTTCACCTGTGTGTGACCGTAAATGTGTTTTTAGGTTTTCCAAGCGTGAATATGCCTTAAAACAGCCTTCAAACTAAAAACAATCACAATCAATTAGGCCTGAAAATCAAATATTTTAAATAAAAGTAATCTTACTGTGCATTTATGTGGCTTTTCGCCGGTATGACGACGCATATGCACAACTAGCATATACTGCGCTTTGAAAGGTTTTTCACCACGGGTACAATTTTCCCATCGACAGACAAAGGCCTTCTTATTGGTTTGGATATGGTCATTATTGATATGTTTAACAAGCTCATCTTGCGTATTAAATTCAATACAACAACTTCGCCAATGACAATTTGTTTCTATAAAATCTCCAGGTTCATCTTTAATATCCGTCGTATCAGCGTTGGCACAATCATATTCATTTAATGGAGTCGAAGCTGATCCACTACTTATAAAGTCTTCACAGCGTCTGCTTGTTTTCACATCACCAACAATACTTTTGGTAGTACTTGCTATGTTGTTATAACAGCGATCAGACAAATGTGACGATGCGCTGTCCGCTTCTACTTGGGCCACGCTTCCTGATGTTGATGAGGGCTGCTCAGTGACAGTACTTTTCCTCTGACGATTTCTCTGGTTTCCGTCATTAAAGTCCTTTTGCTAGAAACATCAAATAAATAAAATGTATGACTTTATTAAACAATTCTAAATTACCGAGAGTGCTGCCATTTTATGTTCATCCGCTACTAGTCTTGCTGTTGAAGATGGTGTTATTTGGCCTGGTAAATCATTTAGATTACCATGAACGTCGTTGAGGCTTAAGGCTGCAGCGCTTGCAGCGTGGCTTATAGAAAACCCGGCCGCAGCTGCTTGTTGTGTATTCATCGGATTTAAAAGACCTGCACTTGCACGTAACAAATGCTGTAGACGTGGTGCCAATGTTGAATGTGCATGAGATATAGGATTAATAGCACTAGCTGAAATATGACCATATGAACCACTTGCCGCGCTGCTTCCTCGAGAGCCATTCATAATTGTGGCTAAGGAGTTTGGTGAAAATCGAATCATTGAGTTAATGTCAAACGAATCCGAATAAGGCGATGAGGAAAGCGCTCGTTTTCTGCTGATGCTTGCACGAATACTTCCGCCGGGCGGCCGAGGACTACTTAATCGCCTGTTGCCATCAATGCTGAAGTGAAAATCAGTGC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGCTAGAGATCCTGCAGCCGCTGCTGCTACAGCCGCATGATGGAGATCACCCAGTGAGCCCATTCCTCGGGTGCCCAAAAAATCTCCTGATCCCAACCCCAGTCCCGCAAGGTGAAAAGCTGACGCACAGTTAACATAAGGATCTAGAAATTATAAATATTGATATGTAAATGTTTAGTAAGGACACTATGTATAGTGACATAAAAAAACAATACCATGAAATGAAGTGGTTGAACCATTTCTTTGAAGAGAATACAATTGCTCCATATATCCAGGGATTCTATAGGCTGGATGAAACTCATGTGCATGAGGCTGTCCAGTAACATTTAAGCTATGAACGTGTTGGCCCTGATGATTCTGATGGTGGCCAGTAGAATTAGCAAGAAGAGTGTTTCCATTACATATGGGTGGTTGAATAGTCGTTGCTGTTTTAATTGAATCAGAAGCTTCAACCGTTTGTATCATGGATGGAACTGTAACTGAGCTGGAAACGTCTGTTGTGTGTACGTGGTTAATGCATGGGGATACTGGTAAGACTGTTGCAGCGGCAGCAACGGCAGCAGCTCGCCTGGATGCTAGAAACTGCAGTTCAGAATATCTACAAGAAAGTAATTTTAGTTTTTAAATTATTAATTTCCATTTGTAAATATTATTTTATTTACTTATAGCCTACTTCCTTTGTCACACTTAAATGTTTTACTATTTTACAGTTTATAATAAAAACAAGAAGAACGCTATAATAAGTGCCTCGACTATCAGATACCTGTTACTCATCTATAGGGAGATGAATATATACACGCGGCAAAGCCAAATGGAATACATTTCAGTTTCAGTCAACTGTCGCCGCCACAGCGGGAATCCACATGACAAATTCCAAATGTGCCAAAATATCTAGCATTTGTAGTTTCCGAGCTCTCAGCGTTCATACGGACGGCAGACAGAATGCCAAACGGACATTACTCGACTGGGCCAGTGATCCCAACATTTTCAGGGAATAGAATATTATAAAAGACTGGAAGAAAGGTCCATATACAATTTATCGTTCTCTTTGTTTATTTCGGATCTTGATAGCGGCAGATGAAACCGAAAAGTTTTCATATTTTAGATATTTGCAGGAATTCTAGAATCTGCATACCAGTTAACGCCATTGCGAAGATGCACGTCGGTTATAACTCTACTTTTTAACTCACTCTTTTTAAATATTAGCGAATTTCGTATTCAATTTTGATAAGACTGACGACTATACCATATTGCTGCCATAGAAATCCGTAAAAATAATAAAAACAATTATTCGTTATTTTTAATTATTTTTACTAATTCTCCGGTACATATCATTTTCTTTAATATTTTAGAATTACTAATCAAATTTTTAAAGAATCACAATTTTAATAGGAAGGATTTGATCAATAATGTAAAAAGACCTAAAGCTTCGTCTTTTGTACACCCTTGCAGAGTTTGTAATGATTTGTAATGATTTTTTAAATGAATATGGTTCACTGAAATTAGTATTTAGTTTTTCTTTTATAAATTAGTAAGCCCTATACATACAAAAATCCCTTAGAATCGACCTACAACATTTTTCAAGGTTTCTGTATTATACGTATCTTCATTACTTGTCCAAAAGTACACACAATTTTATTAACTATAAAAAATTGTTTATATGGATATGTTTTTGCTATGCTTAATATTTAAAATAACTTTCAACTAATGTGTGTATTTTGTTTTTGTTAAAGAAAAGAATTGATTAATTATAAGAAATAGTTATCTTAACGTAAAGTTTTTCAAACAAGAGTGTGCAACCATAACATTACAAAATTTCAATGCTAAACAATCAATGTGTTTTTTATAACTCCCAACTGGGTCTTGGGTCTTGTACAAGAAAAACTCTGAAAAATAATGACTAAATCATATATTTTGGAAGTATCAATATTCTGGATGCAAATTTCAAAGTAAATTTTCAAAACTCTTTTGTTGTTTCCAAGCTTAGGAGAATTATGTTAGAAAACACCTAAGATATAATGCTTAAACATTTTTTTGGAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGAAAAGTTTGCGTAAAAACGGACGGAAAGATGGACTTGGATAGAACGAGTCATCTAGTGAAGCTTAAGAAAAATATATATACTTTATGGGGTAGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATAATACCTCTGCAAGCGTATAACAAAGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCTTCGACGATATGATAATGTTGGAGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTGGCCATTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGCAACAAAATTTTTTAAGTCGGGAAGCCCAGAAATCTGCATGCCGAGTCCCATTCCTCTAGCTTTAATAGTTTCCGAAATCTCAGCGTTTGTACGGACGGGCAGACGGACAGACGGACGGACGGACAGACTAACATGGCTTGATCGAATCGGCTATCTTTTATATGATTGATGTTTTAAACAAAAGCTATTATCACTGTGAACGGCACTCCACGTAGTCACGAAGCGCACCAGGAGGGTGTGCAAAGGCGACTACTATATATACGAAGAAATGAAAATCTACAGTAATAGTCCTATGGCATATACATCCATACAAAGGTATTTCAAAGGTATTGATACGAGGATATATCATAATACAAATAATGCATATTGAAAGGATTTAAAACAAAAAAGGAAGTTAACATCGGCAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGTAGTTATAGAAATAAACAACTTTAGTAAATAATTTTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTTCTATGACAGCTAATGATATAGTCGTCCGATTTTGATTAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATCTTACTTCCAAGCTGAGAAGGTTATATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTACATATTATTGTCCCACACCGATCGAATTTGAAATTCAGAACTAAATAAAAAATGTTATTTCTAAGATTAGAAGGTTATATGCTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTGACTACAGCTATATGATACAGTCGTCCGATTTTGATAACATTTAATTCGTAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATATCCTCCGAAGATATCATTTTTTTTTAATTTTTTCCCCCTATGGAAGCTATAAGACATAAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAATGTACATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGGCGAGTCGATCTATCCATGTCCGTCTGTCCGTCGGTCCGTCTGTCCGTCCGCCTGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAACGCTATCGGGCAGAAACTGTCCCAATCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTTGGAAGCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCTCATATGAACGATCGGGGAAAAAACTTTAGAAAAAATGTTATCTTTGGAAATAACATTTTTTGAATTAGTTTTGAATTAGGAATTAAATTCTATCAAAACAGGATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAACATGAAACAAGAAAGGAAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAACTGAATTAGAAATTCTTAAAAATATAAAATTTTATATTCCCAACATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACAAATTAATAAAAACTAAAGTTACTTATATTAGGATTAAACAAATTTTAACCTAAAATAGAGTTTGGGTATCGAGAACAAATTGGAGTGCTAAGTTACTTTAGTATATAGCATTTTTAATACAATTAATTTCCAAAAACCAATGTTTTATTTTTTAAATGAATATGGTTCACTGAAATTAGTATTTAGTTTTTCT'..b'TAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTATAAGTAGCAAAGCTATATTTTAGGGCGCCACTTAGATGTTATATGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTAGCCATTTGTAGGTGTTAGAGTTGGCGTGGCACCTTTTTTTTAGTGAGTCGATAGGTATTGATGAGACAAATACATTTTAGTTAAAATTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTTGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGAAACAAGCTTGCGCTGCGCAGGAACCCCAAGAATCATGCCAAGTCCTACGGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGAAGGACATGGCTAGATCGACTCGGTTAGTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTAAGGGCTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTACATACATACTTTCTGACGAATCTATTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTATCTTTGGTGTTTTTTATATTATCTTATATATTTGGAATATCATATATATATTTTTAAGATTTAGGAATTCAATTTTAATAAAAATCGGACGACTCTAACAAATAGCTGCCAAAGGAAGCTAGCTTTTTGTCACTGAAGATAGTGTTACTAACTTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTTTACAAACTACCTTACCTTCCTTTCTTGTTTTGAGTTTAAATTTTGAGCGAAGCATCAGGCTTTAACAAATGAGATGTCATTCGACGAATAGTAAGTAAGAATACAACCAGACTAATGCGTTTGTGTATTCATCTACAAATGCCCAACAGATCACATTTTCTAAATTTTTCAGATTTGCATTTTACATTCACCACTCTTTTCCCCAAAATAATTGATTTGATCTTTTAATTTTGCAATACCGTTTGATTTAGGTATCCCTCGTAACGATATCACAAAATATTTGCATTTTTTCGTGAATATATCGTAGCTGCCTTCGCACACTCTACTGGTGCGCTTCATCACTACGTGAACTGCCTTTCACATATTAAATGAGACTAAAATAAGGTAAATATAAACGATTAAACATTTGACAAGAAATTATGTGTATGATGTGGTATAAAAATTGAAACGAAAATGTAACGGAACCGATATAACGTAAATAGATTGGTGAAATTAAGTTAATTCTTGACTTTAAACCGATAAGTTAGTACTTACATTAAGTCATGTAGTACATTAAGTCAATTACATGTACATACATATGTATGGACATTAAATAGTAATCAGACTGTTCTGATAAAAATTTCTAAATATCTACAAAATTGTAAATTTTAACAACAAATTAAAAACGTTAATGAAAATAAAGGTAACATAAAAGAGCTTTAACCAATATAAAAGTTTATTTATTCCTACGTATGTATTTATGAATGTATGTATGTACATAAAGGTTCATTTTATTTTTCCTTCCACCTCCAGCTTTCCCATCACAGCTCTTTAGCGCTGCGGAGCCCAATGACTTTATTTTCTTCTCCTTTTCTTGGCCCAGTACAAATTTTAAAGGCTTAATTAGTCAGCGGATCGAAACCCAAAAGGGAAAAAATGTTCGTCTTTAGCGGCGTTCACTCATACATGTATACATACATAAATGAATGTACAACCCGATCGTGTCTACATACATATATTCGTATTTCATACTGGTACACGAATACATACCTACTTTTTAAATCCAGTTTCTTTCTCCATTAAGCGACAAAGCAGGCACAGATTGAAGCATCATCATTATGAAGAAATTGAGCCAAGTTGGCATTTAAAATTATGTTGTCAATCGAAACAGAAAAAAGGGGAAACTGCTGAAATAACAAAATTAAGTGAAATGTTTTAAGCCTACTTACAAATATACATACATATGTCTATTTGCCTTACAAATTGTGTGTACATCTATGTATACACAGTGTATACAAAAAACATGCAATTATAGACAATTATTTATATATATATTACACTTTATAATTTAAATAATTGGACAACCACTTTAATGGTTTGTTTCTATCTACATTCGCAAATTATGACATTGTTTTCCCCTCAATTAGAATGAAACCTTTAATGCTTTTAAAGTTGGTGTTGCATACATACTTGTACATATGTATTTATTAACATAATCAGAATGACTTCACACAAATGTATATATGTACATACATTCACATATTTATGTATTCTTTAATAGTATTTCCAAGCAAGACGAACATATTCTCCTGTATGCATACATACATACATATGTACATACGTACATATATGTTCGCATTAGGGCGGACCTCAGTTTTATTTAATAGCCTAATTTTATTATAATGCACAATGTACAATATCAAAACAGTAATTCTGCAGTTTAAAGCAAGGAAGAGCTCTATAGTCGAGTGTCTAGACTATTAGATACCTGTTACTCAGCCTTTAGCTGAGCGGAGCAAAAGAGAAATAGAGCAGCAAAGCTATATTTTACGGCGCGACCTACCAGCTATGTACATATTTCAGTAGATGTTTTATGGGCGACAGAAAGATATAAGCGTTTAATCCGTTTGTGGGCGTCGATAGATTTTGATGAGACAAACACATTCCAGTTAAAATTTTGTTGCTATCATAAAAACTGTAGGCGATACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTGACACCCCACTGAAACAAACTTGGGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATCATGCATGGCTGTTCTAGCCTTTAAAGTTTCCAAGATCTCAGCGTTCATTCGAAAAGACGGATTTTGATAGATCGACTCGGCTAGTGATCCAGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGGCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCGACAAATCTAGTATACCCTTTAACTCTACGAATAACAGGTATAATTAAAGTGATGGTTGGATGTTCTCTTAATTACTGACTAGTTAAAAGGTAACAAAAAATTTCTGCAATTGAGGAATGGTGATATTTGGATGGTTTTCAGGTTTTTAACAAGTTTTGAAATTGTTAAAATTTTGGGCAATATTTTGTATCGAGGCACCTTATGATAGTGCCTGTGACAATAATGATTCATGGTACAACTATACAAGGTGGTCTCATGGCTGCATCCCTTTCATTTGCAAGTATTGCTAACGGACTGCATTTTTATGACGTGACTGCCTTGTGTAGTTGTACCATGCTATGACGATGCTTCATGCATTGTGGGTGAACTTTGAGAACTTTGGTCACACCACAAAGAATACGATTTTCGTCAAGTGAAAAGACGAATGTGCTAGTGCACGAAGACTTTAAATAAACGGAATCTTTAGAGGATGTTTTTATTTATGTTAGTTAGTATCTTACGTCCTGCTTCTAGTGTCGCGGATGCTTCCACATCTTCTCCTGGCCATTCAACTCCGATTCCCAATATGCCAACGGTGTTGTCATGGCTGTTGCGTGGAAAGTTACCAAGCATCCTGAAACGGTTACTGGCTCCTCCAGCTGCCACTTTTTTGTTTCTTCATATGAAAGATAACTCTTACTCTCCAGTGGTTCCCCAATGGAGAATGGAGGGCGGCTTCTTGGCCGATGGCATATGTGGAGTCCAGTCCCACTGATTGGTTTATCTTCAGGACGTTTGGTATAGTCCTACAAGAATGGGCAACAGCTTGAATTAAGCATTTAAGCATACTAGAAAAAGGTTTTGGGCTTATAAACATACGTGCAAAGTCACCTTTCACGATCTGATAAACTACTTTTGGAGCACCACTATTAAACTTTTATTTAACTTATTTCTTGAATCCACAAGTTTTTTCTTGAGCGAATGGCAAATTGTTTGGGGTCCAACGAGAACAATATTTATTAAGATTCAGGTCCTTAAGGAAAATCAAATATCCAAGGATGCCTTTACTACGGTATGTAACATAGCGATCTTGCATTATAAGTTCACGCACGGCATTAATGTTCTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/612/805/f1/scaffold_2-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TGTAACAATGACTTTTTTTAAGCGAACTTCGGCTACAATTGAATTTAAGCAGTCACAGTGCTTTATCGCCATTCAAAAATTAATCTTAATCGATGCGCTCTTATCTATGAAATTTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTGACCTGTAGTGGCCGCAGTTTTCATGCTAGTAAATATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAGGGTATACTAAATTCGTCAGAAAGTATGTAACAGGTAAAAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATTTTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGGAAACTATAAGAGCTAGAATATTCTTACTTGGCATGCAGATTCCTGGACTTTCTACGACTCGCAAGTTTGTTTCAGCGGGGTGCCACGCGCACAATCCGAGAAAATCTGAAGCGCCTACAGTTTTTATAACACAATTTTAACTAAAACTCATCGATACCTATCGACTCACCAAAAAAAAAAAGGTGACACGACTACTCTAACGCAGGCCAATTTTTTTTTTTACTATAACGTTTACTAATTTCAATAAAGTGTAGTTTGACGTTACATTTGGAGTTTTTGGATTATTCTTTTATTTTTAGGTTCATACTGTTTCTACAATATTTCTCTACGCAAGAATGCTATAGTTAATAGTATATAGTTAATTATCAAATAAGCACCTTGAGGTGTTTTGACAAATCTTTAAAACTTGCTCGGTACAAAAACATAGGAAAATAAGTACGTAATTTTTTAAAGAAATCGTTTATTCTCTTAAGCTGTTTATTTTAACTAACGTAATGTAACAAACTAAGCACTATGTAGATTTCAAGGGACGTTGTTAGTTGTGGGCGCTGCATTAACGAGACGGTGGGCCAAAGAGGTGTTCCAGGGGCTGAACACAATTCGTGCCATAACATAACCAGCATAATACAGTAGCAGACAGCAATACAGTGGCTTCTAATTTAGTTTGGGTATATTCAAAATTCAAATTCTTGAATTTTCCGCATAGAATATTTGGGTTACTATCTATACTGTAAAGTACCTGTAAAGAAAAAAATATAGCATAGGTTAAACACATAAAATCAATAATGGCAAGATATCAGTAAACATTTTTATCAGTACTTGGGAAGTCATCAAATAATGGCAGAGACGAAAAATAACATATCATCATATTTTAACTTAGCAAAAATAAAATATGCAACTTTTGTTTAAGCGCAATATGTGCAATAAATGAAAACGTTTCTAAATAACAATTATAAAAAATATTTACTAATTGTTATTTTAAAACTAAATGCCACATTGTTCGAAGAAAACTATATATAAGTTTCATATCGCATATTTTATGATCGCGAAGCAGGATACATTTTTTTATTTTGCATACCCGTTTTTCGTAAATTGTTTCTTCGATTTAATCATGCGTCTCTTGCGAAAATCCTGGACATAATAAACAAATAAATAAAAATATTAAAAATTGAATTTTTTACATACCTCGCATACCAGATCAGAAACTGTGGACAGCAATATACCTAAAATATATAACTTTCCCAAATCCCACAAATTAACACAAAGCCCCCTCTACATAGTTTATGCAATTAGTAGAATAATGTATTTCATCTTCGAATGCAAATACATTAAAAAATATGCATTTTATTCACTTTAGACAGCTTCCTGCACTGGGGGCTCATAACCCTCGGGGCGGTCAACTACGGCTCCTTCGGTGGAAACGACGGCATCGACAGATTTGCCGCCACCATCACCATGCAACTCCAAGAGCTTTGAGACATCGAAACGCGGCTTCTTCAATACCTTGACTTTACGAATGTAAACATCATGTAATGGATAGATACGCTGGCAGCTTTTTTCAATATCTTTTGCAATGGAATCCAATGCCAGTTTGTTAACAAGCTGCTTCAAATCAGCACCACTAACTTCGTTAGTAATAATGTCAGTCATGCGAGCGCGAATCTTGCGGACCTGCGACTGTTGAGCATAGCATGTTTTGCGCTGAGACTGCTGATCCTTGGCAGTAAATCCAATGCAAAACACTCGCAGAAGGTAACCATCGACAGTCTTGGCTTCAACAATCGCTTCAATAAGAGTTTGCCACTTTTTAACCATTGACCTAAGCAGAAGTTTAAATTTTAGTAAGCAGAAGTATTACGTTTTGCAGAAATACATACATAATGAACACAATTCTGCTCAAATAACATTCACTTACCTGTACTTGTCTGTAGTTAGATCCATGCCATGGAAGTTGCAAAGCACGTTTCGGTCTTGAACGTCTTCGGCAATAAGACGGAACTTGCGGAATGAGCGCTCCGGATCTATATCCTTTTGCAAATCTGCCAGAGACACTTCAAAAACGCGACCCTTTAGATAGTCCGACGCTATTCTTTGGCCCTGGGTGCGGTTCACAAGCGTTTTACCGATTTGACGGGTTTGGAACATATTCGGGGCTTTCACATCGTACCAATCCTTGCGTGAAAAGGGGTCCACTACCTTCTTTTTACCACCCTTCTTGCCACCCTTGGAAAGACCTTTATTTTTGCCGACTGCCATCTTCAATGAATAAACCGGAAAAGGTCGAGTCACGTTGACTGTAGATGTCAAAAGAAGGAAGTAAGTGTTGGAAAAAGTGAGACAGTGTCATTTCATGACTTACTATTAAAATATTTACAAATTATACCTTGTATCCGCTGCTACAGTGAAATAATTGCGTACACATGCGCAAAGTTGACTCAAAACATTCTTTATACCATCTGCACATGACTATTCGGGAGGTGGATACGGTTTTTTCTCAAAAAATACGTTTTTCCAATCACTGTATCTGTTTTTTTCTGGACCTGCCAGCAGCCTGCCAAGTTTAGTGTAATTCATTAACATATGGTATGAATATATTTTTACTTTAGATTGCAAATTACAAAGAGACAGAACAGCTGTTGCAAACGCATTTGCCAATAGCTATCAAAAAATTCTGAAAAATATCAAAAAGTACTCAGAACTTACATCGATAAAAAGCGCGAGCTTACTATAGGAGTGAGCGAGAGGCAAATACGCTGCTAAAGCTTTTCGTAGGCTCTGTTTTTACCAAGGTACCCATTTGAGCTATGGAAATACTAAAAAAAATACTACATATTGGGAAAGAAACTTCGATGAGCGCCGTTTTTGGGCCGCGGCTCCCAATGAATTAGAAATTTGATCTGCAGAATAATGATCGTGCTGTTGATAATCCATTAAGAAGGATCCGGGCGTGTCCACGCAAAAAATTTTAAATTCTAGGTCACGTTGTAATTATGGAGGGATCTTTTTAGCAAAACCACCAGGAATACGATCTTCGACGAGTTTTCTATTGGGGAGCCATCGGACTCCACCACAACAGCTAATGCGAAGCTGAGAACGAGCCGGCACGAGGACGCCGACAGCGACAGCAAGATGACCCTTCACTAGCCACTGCCAGGATGCTGGTCGCTTACATCCACCATCTACCATCCTTGACCGGTTGATCAATACGGTTTTGCCGTTCCGATTATTTCACACTTCGTTCCCCAACCAAATTTGACTTTAATGCGATAGTTATAGGTTCTTCCCACAGAGATCCTTTACCAACTACCATAAAATTTGGTTAGACTAGCTAGATCAGCTGGTGGTACTGATGAAGGTGCTATGTGGGAATCGAAGTTTTTTGGTAGGGTGACCAACATTTTCAAAGTTTACCCGCAAAGCAGGTACGTAGGACTAAGTCTGTTTAATTTGTTAAAAAGGTCAATTAAAAAATTAGGTCAATTTAAAAAAGCAATATCTGCTGGCGCACAAATAAAAGAAGATAAATGAAGTGTTCAAAAGATGACTTTATTTATGTTAATTAGTACTTTAAGGCTTCCTTTTCGTGTAGCGGGTACCTCTCCGCGCCATCTCTCGAATTGGAAGCGGAGCTGTCACCCACAAAAAAAACCTGGAATGGTGGGCGGCTTTTTTTTCCTGCAAGACTTATAATTTTCTGTGGATTTGCCTTGTTGTGATATTGCTTCATGTGGGGCAAGTTGCACAAAAGAGTCTGGACGGTTTGTTCTTTTTTACCTGCACAGACTTACTGAAGGCGTCTTTGCCGAAGTCTTTGTCTTTCCTTCCATTTCCTTCCGATATTTACATCGTTAGAATGTGTTTTTGTTAGGTACCAGAAGTTTTGGTTTTATACATAGGAATTTAAGTTTCTTGATTGGAACTGTATAACATCTTAAATGATTCAAGACATTACTAATGAATATTCATACGCATAAAAAAAGTTAATTGCTCAAGAAGTGTTAGAGCTCTGACTGGCAAATGTGGATATTTTGGTTGGTTAAGAACTCGAAACCGTCACTTTTTAAAACAATGTTTTGTATGCCAAAGGTGAGAACTCTCAAAAAAATCTGAAAATTTAAAAGTTTTTTTTAGTTATTTTTAAACGATGGTATTTAGAAAAATCATTAGGAAGTCGTAAAAATGAAAAAGACATGTATATCTACATTCTCCTGGAGCGCTTCGTCCCTACGTGGACAAACCAAAGAAAAAGCCAATTGCAAGATAATGTCAAAAAGCAGCAAAGCGACTTTTTCTGAGATTGCACGCCGCGCTACCTAGCGTTAAATTTTTTACTTGCTTATTAAAAAGAAACAATTGAACTTAATGAAATGGGAATAATGGGGTTAAAGAGAAATAAGAGGTTCTTATGACCAGATCGAAAAATTATATCTCATATCTGGAAAAAAAAGAACACACGTCGGATTCAACAATTTAAATAAATTTAGTTTAGCGTTTTAGAATAATAACTTCAGCTGTTGAAAATTATAATTCCAACTATCTCGTTTTAAATGTCTAGCTTTTAGAGGTATATATCTACTATAAAGGGTTCATTTCCTAATTTTTGTAACTGTAATATGTATCGATAGATGGTGGTGTCAACCCTAGTTTAGCGAGTACACACACCTT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAGCTCCCATAGGAACTAACGGGGAAAAAATGTTAAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTATCTTATAACTTTCTAAACTTGAAACTCAATTTTTTTAATTATTGCTGAATTTTGAATTAAATTTCATCAAAATCGGACGACTATTATCATATAGCTATGGCCATAGGTAAATTTAACATTTCCTTCTTCTTAACATTTCCTTCCAGATTGCAATAAAGAGATTTGGTAGAAAAAGTGCAAGCAAATCATGTATATATAAATATGAATTAAACATTAAAACGCCTTTAAAAGTAGCTAAAAATTAAAAAAGATAATTTTTTCAGTTTTCGGGGAAATGATAAGAGGCTATGATTCCACTGTATTATGAAAATATGGCCATTTATCTATGAAAGTTTGCCAAAAATACCATGATTTTGAAGATTATGTTGTTTTGGTCCTGATTAACCATTTGCTGTAAATTACAGCAAAAGTGAATGGAGATCCTATTTTATAATTGATTTTTAAAATAAGAAAGGAAACTGACTTCAGCAAGCCGAAGTTTATAACCCCTTGCAGGTCGTTGCCGTGTATTTTATTTTGACTTAATTATCTGATGCTTAAAAATTTTAATTCCAAATTATGAAATAGGAAAGGGGAATATCTTCCAAGGGCGTCCTCTTAACTGACTGACGGGCTCTATCAGTTTCCGTTCTGCCTCCAAGCACTCAGAAGCTGTAAGACCTCGACCTCACACTCGTCCTTTAATCCACGACACCGTCGTATAAACCTGAGGATTAGGATCGTATGAACCTGACCGTCTGCCTGGTTCCTAATACGGCTGCTTGGAGCTCCAGGCGTGGGATAGTTCATCGGGAAGCATTTCGTCTTGGAACACATGAAGTAAGACGGCACATCATTGTCGTCATAAGTCGCCCTACAAAATGCAACTGCTGCGAACGCCGATCGGCTGGAGTCCACAAACAAATGTAGCTGCAGTTCACGTACGCATCCCGTGCCAAAGAAGTAGAGTGGACAGCGGAAATCGCTCACGTAATTCATTTCAAGCCTCCAGTTCTCAAACGCTTTGGCTAACTTATCAGCGGCTCGTCTCATTAAACTCCTCTCCTCCAAACCTCGTTCATCAGCAATTTGGCGGTTACCATGAAGAAGCTCAAGAATCCTATCGGGTCGAATGTCGTCATAGCTAGACTTAAGAATTTGCTCTTGGTGGTCTTGGTGGTATTTTACGCTGAATTTAAAGTCATCCGTCGCTGGGTGCCAGTGATACGCACTGATGGCCTGCACCGCGCAATGTTCTGCTTGGACGTATCTTGAAGGATTTATGGTCTTCACTGAGCACGGCGAACAAGCCGCTCCGAACGTCATCACCACCATTTCGTACAGATCTGAATCTCGGCGGTCATCTCCATTCCTCAACAGAAATCTCGCGCGTATCTATCGTGGGGCTCAGCACCTGATAAAACTTCTCCTTTATGTCTGTGTGGTCCGACTGCTCCTTCCCGAAAATGGAAGATCACGGCTGGCAGAGACTTGAACTGTTGTGGGCCTTTGAGTGGAACTGAATTCAGAGATCCTTTATGCTGCTTCAGGCGCCGTGCATAACCCTTGTTGACGTAGGCCTCCATGATCAAGTTGTAAGCCCGCCCAAAGTTGGCATCCCGTCTTATCTTACTTTCAATGTCGACAAGTCTCTTGAGTGCCATGTTATAGCTGTCTGGCAGGCTCACTTTATCATCTTTCCACAGCAATCCAGTTTGGATTCCCAAAGCCCGTGCATCGCCTAATTTTCTCTATTTCGAAATAGTCGTTGACTCGATCTCTGGATTCGTGAAAAAATCCGACTTCTTACAAGCCCAAAAACCACTCATCCAAGTTTGGTGGTGGTTGTATAAGGTCCTTCTGCTCCGAGGCTTAGTTGTGGCATTCAATTCGTCCTTCGTCGCGCTTGCGCCATGCATCCGTGTACCATGCGACCGCGATTGCTCCTTTTATTTGGCCATGGTCGACCATTGAGTTACGATGGCCGTTTGGGGTTGCCCACACCGTCATGCAGAAGGTAGTGATGCCTTATCTGGCATCCATAGACGTTACACTTCCCGTTTCTCTTGCAGAACCTGGACATGTAACCGTTCTGCAGGCACAAGAAACAAGTCTAATGCTTTCTTGCAAGCTCTATACGGGCTGCTGGTCTAGCATGGTTGAATTCCATACAGTCCTTGATAATGTGTTGCCCCTCGCGAATTGGACAGCCCCTGGAATAATCCTCGAACCAAACCTGGCCCTTCTGACTGGTTCTGGCGTATAATACCCTAATCCGTTACAGTCTGAACGTTACTCGGGTGTATAAGCGACTTGACTATGGTCGCGCTTCATCCTCCACGCAGTGCAATTAAGGTGCATTGGAATTCCCACGGTGCTTCCATTACCTGGCTGCAAAGTAGTCATCACAATGCATGGTGTCGAATAGGTTGGCGTTTTACTGTTTGTACTGAGTGTGACTTGTTTTTCTATTACCAGATTTCAACGCGTCACTGACTCAGCCGAATCCAGCTCCAGATTTTCATTCAACAATGGCTGCAGATCTCTACTCAACAGTGGCGGGAGAGCCACTTAAGCTCTGCCCTGGCGTTTTACTCAAACTTGCCTTCACCTGACGTTCCATTTTAAAGCTATATTTTCAAGGTTGCGAACCAGCAATTATGGCTGTTGTAGCGTCCTGGCCTGATCCATCAAGCTTTGAACCACCACACCGCTGCAACTCACCGCCCGATAAGCCCGGCACGTACCTCGAAGTTCCGACTCCCCTCTGTCCCTTGAAGTCAAGTTTAATTTAAGCCCTGAAAATTTGATATATTAATTATTTTCATCACTAACCTAATTACTAAAAAATAATCGGCGTCAATTTCTGCGGATTAGGTACAGGAAAAGTGTGACAATAATAAAATAAAACGAAAGAACAAGAAAGGAAGTTTACTTCTACAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGATATAAGAAATAATCATTAATAACATGTTAAATTTTTCAGAAATGTTGCTTCAGTGATATTAAAAACATATAATTATTTCATTATTTCTCGTTTCTTGGAGCTATATGTTAAGTCATCCGATTTTTATTACATTTAATTCGAAATTTCTAAAAATACAAATAATTATATTCCCAATAGTATAAGATATTATGTCAAAAACGCAGCTATATGATATAGTAGTCCGATTCCGATAAAATTAAATACAAAATTCAGAACTTATTAAAAAATATTATTACCAAGCTTAGAAGGTTATTTGTTAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTCCGGTTTGTGAACTTTATAGTATGCGTGGCACCCTGCTGAAATAAACTTGCGTTGCGAAAGAGATCTTAGAATTTATATGGACATACGGACGGATGAACAGAAGGACATCACTAGGTGGACGGAAACGATTCCTTCTACCTGTTACTTTCCGACGAACCTAGTATAGCCTTTTACTCTTTTTTTATAAATATTTATCTTTTTTATTTTATAAATTTCTATTTGTGATATCTCATAGGACATATTCTGAATTTCGCAAGCTAGTTTATGTGTTACGAGCTTAACACCCATACGAGAAATACGTATAACGCTTTTGTAAAATCACGACTGATTTCGAAAGTATTCATGAGTGTCATGGGTACGTCACTCGTAAAAAGCTGACATTTTTATGGTGATTCAGCAGGCCTTTTGCGAATAAAATTTTTGAACTGAAAGGTATATTTTATAGGGTCAAAATAATGAATAATGGAAAAAAAATAAAAATGTTTTTTATTTAAAATCCCTAAGTATGTAAATTATTTAATTCGGGTACATTGTTGAGAACTTTCTTTCCACGAGTAACTCGGATAAGTGGATTCGGTGGGCCGAAGCGTTTCCAACCCTAAATAGAATATTATATCTTAATCAGTATCACTAG'..b'CACTTTAAATATTTATTTTTGTTATGTTGGAGAGGAGAGAGGCTTACCAAGATCCCACGACCCGAATACGACGTAGCTTATGCCTGCAAAAATGGTGCCTGAACATCGGACGCCTCTCCCTCGGCCCAAGTCCTTTTCAGGACTCAGGCACTAATATGCCTACATAAGAAAATATACTCGAAACTTGAACATGATTCGTTTAACATTTGGTATCAATTGAATTAATTTAAATGCCGTTTGAATGATACTATTCTTTTCTTAACTCATTTGATATTTATTGAAAAGAGCGAATTTTTGTGAAAATCTACTTTTTAAACTTTTTTCCTTGTCTTGAAAACTAAAATTTTTAGATGAAAAAAGTTTCTTAAAAAACAATAATAATAAAACTTGAAAAAGGATTTAAAAAAAAAATGTTGATTATATTTGTTTTGATTTTTTGAAAATGTTTACAAATACGTATTTTTCCGACATTGTTACCTTCAAAAAATCATAAAAAATATAAGAAAAATGATCTTTGAAAATATTTTTTTGCAAATAAAAAATACTTTTGACCACCCCTGTATGTAAGACCGCAGTAACACAAGATACACATTCCTGCGTAAATGTAACCACCAACTGCATTCTAAATATATATACAAATGTATGTACGTGCGGTTTTTGAGAATTGCATTAAAACACAAATATATTGATTCCTATAAGATTAGAATAATTATATGAAAACTACTCACCTGATTTTAAACACACTCATACTGAATCTTTTAATAATATTTACAATCTTCTTGTTTTCACATCCCGCAAAATTGATCCTATGTGTATGTATTGTCATTATCATGCTCACTTATTAAATTGGCACTCAAAATTTTTTTTCATTTCATTTATTTTATTGAAGTCATCAAATATCTGCCAACATAAACAAAGTACCCGTCTCACATTAAGTGGGCGGGGGTATAGACAGGTGGGTTGGGATGTTTTTTACATTCAGATATACAGAGCATTCAGTGAATATTAAATAGTACATTTCATTATACTACAAATGGATCATGTAAATAAAAATTCGTTTCACAAATATTTAAGGTGATACGTCGAAAGTGACTTACAGAAATGGACAACTGTATTTGACCGAGAAGGTAGCTTGAATTTACAAGATCAGTGATTAGTTTCTAAAGGAACATTACGCCGTGGAAGGTCCGACGATCCTTGAGGGAGGGCAGGTTCAGAAGCCGCAGTCTGTCCGCGTAAGATGGTAGGTTACGTTGGGTTTCCCAGTTTTAACCACGTAGTGCAAACAAAAGGAACTGTTTCTATACCGATGCGACAAGGTTCTGATACTTTGCATATTGAGGTGACCAAACACACGACATGGATATGGACAATGTTAGAGGTTGAGCTTTTAAAAGCTACTCTCTGAGTCCGGTTCGATAAATATGTCAAAATCCACTTAATCAACGTGATTAGAAAAGTATAAGATTAAGTTTTTCAATAATAACCGATAGTTCACGGAGTCGCAAGCCTTACTGAAGTCTGTAAAAATTACATCAGTTGGATAATTGTTTTTAAAAGAGTTTCTGATGATTGAAGTAAATTCCAAGAGATTCGTAGACGTTGAACTCAGTTTCAAAAAGCCATGCTGAGACGGGGACATAACTGAACTGCACTGGTTCTGTAGCTGAGTGTTAAACGTGATGACCCAAGTGTTGGATCATAAGGGGAGCCAAGAGCAGCAGCGCACGACGTAGAATTGGCAGCAACAGTTCCAAAGTAGCATCGGCACTGAGCCCGCCAGCTGCCTCTGACCGCAGAATTCTACCTTTAAAATTAGATTCAGCCTTTACAAACCAATCAGATAGATCCTAAAATCCTAATCCTAAATATTTGTCATAAATCCAGCAACAAATTGTGGGCTGTGATTTTGCCATTTAAAAGGCTTGCTTTGATGCAGCAGGCAGTATGTAGTATGTTGTTGTTATAAGCGTCAGTTATATACGCGTAGATAAACAGAGTAGATGTAGAAAACGCAGCGTGCAGTTTGGTCAGCGATAAGCTTTTCGTACGTGCGAATGTTTGCAGTAAAAAAGATAATACCGCAGTTACGACCAACAACAACACACTAGAGAGGCTTGCGGTAAACTCAAGAATAGAGTAGAACGACAAAGCGAAAACACAATCACATTTGATTGTAGTCTTTTAATTACGTATAAAGTCACTTTCTTTCGCTTTATAACTTTTCGTTAGGGGTGTATGCCTGCTTCAGCCGAAGCATTGACCAAAGATTTGCAAGACTCAGACAGATGTATGAGATCGTCGATAATAAACTAACAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCAGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCCGAAGTTTGTAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGTTATTTGTCAAAAAGCACTAAAGCTACAATTTGTTATATATTATTTTGCCACCATTTTTCCTATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTGACAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATTTTATTTCCTAGCTTAGAAGATTAAATGTTAAAAAAACCGAAGATATAATATTTCATATTATTTTAACACTAATTTTCCAATTGTTACTAAGTTTTGATAAAATTGAATTCGAGATTCAGGACTAATTTAAAAATGTTATTTCTAATCTTAGAAGGTTGTATGTTAAAAAACCACGAAGATTTAATTTTTTCATTTTATTTTACCACTAATTTTCCGATCGTTCATATGGCGGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTTTATATAATTTAATTTAAAATTCAGAACTATTTAAAAAATGTTAATTCCTAGCTTAGAAGTTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCATATGGAACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATATCTTCATAACTGAGAGACTACTTTGCGTAGTAACGGACAGACAGACGGACGGACAGACGGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACATTTCCTTCGTTGCAAACTTCCAATTGCATTTTTATACCGTCCGCAATGGTATAAAGTCATAGAAGAAATCACCCATGACTCAGGTGTCGCGATGACGAAATATTCTATACTTTCTTAGGTGACATATCAAAGGACATATTTTTAAATTTTTTGCCACGTGTGATAAGGAAGGGATAAGACATGCGTGGTAACATGGCTGTCATCGAAAAATTGTCATGAAATGTCACGAGCGAAAAACGGACATCCCATTTGCTGAACAAATGTACATGCAATTTAAAAAAAAAAAAATTTCTTGAAATTTTTCTGAAGTGAATTTTTCAAATTTCTAACTTATATATTAATTATTTTTATTAAAAAATGAATAGTCAATTTTTACAAGCCAGATGCACGCGTAGAACCCACGAAACTTCACATATGTACACACATACTACGCAAAAGACTTTTGAATCGATCGCGAGCAAACGGTCCGAGAATGAGCAGACCAAGTGAAAACAGAAAAACTGTTCTTCGGCTGAGCGCGAGCCAAATTTGTATACGAGCAATTCAATCGGTTACTCTTGGACTTTTTACTCAAAGCCTCAGTGACGAATTCTTATTTTGAGACCGCACGAATCGGTTAACATTTATTTGCGAGTTATGTTGAAAACTGAAACTGAAAAGATAGGTATTAATGTGTTTGTAACGCCTAACCCATTGACAAACACCTAACCTTTATGTAGAACGCCAATCGATAGGTCGCCGATGGGTTATCCTATCTCTACCCAGACTTCTTATAATATTTATCTGTATGCTTTACAACTACATATATACAGTCGCTCGCATCTTAAGAAATAGCGTTACCGACCTAATAAAGTATTCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/622/a56/fb/scaffold_11-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCAACATAAGCCGAGTCGATCTATCTATCTCTGTCCGTACGAACGCAAAGATATCGGAATCTATACATCTGTAAGTAAGATCGTTGGGATTTGCATGCAGATTCTTGAGGTTTTGGGACATCGCCAGTTTATTTCAGAATCCCACGCCCACTCTGACGCCCATAAACGACAACGCTGAAAACAAACGCTGCTTGCGAAAACACTTTTAGAGAATTACTAAAAGAGTCAATGCAATGGTCCAAATCGGACCATCCATTAAAAGTTTAAAAGCAAGTTCGCCGTCGTTGCGGGTGATCAATTATTGCATATATCCATCTCCCTCGCTCTACCTTGAGATGACTATGTACTATTTGATTACTAGGATGCCTCACGCATATTCTGGGTAATATTAAAAAGGTATATTTTATTCTAGTTTCCCGTTTTTTGATGTTTAACCTAGTCGGTTATGGACTTTGAATGTCAATAAGAGGTAAATCTTGTTCTAGACACTTTTATTTTTCATTTGATAACTTGGTATTTTAATTATTCCCTTTAAATACACTGCTAAACAGCGTCAAAGTTTAAAGAACGCTGTACATCATTTAAGCAGTGAGCTTCTGTTTTTACTTACCTGATTATCAGGACATTTAGCGGTACGCATCAACTCCATTTTTGCTTCTTCCATTCGTTCCGTATCGACCGAATCGATAACAAACAAAATTCCATCGGTGCAGCTAAAACCAATTTAAGGATACATATGTAACAAGATTTTGAATAATGTTTTTATAATACCGTGTATAGCTTCTCCAAAGAGGTCTTAGTTTTTCTTGACCTCCAACATCCCAAACAAGAAAATGAACTCCTTTAGCCTTACCAATAGTACCTTGAACCTAAGAAATATAAGATTTTTGTATATTTGTGTTTAGTCAACGATTTCATAGTCACAAACTTTTTCGCAATTAAAACCAATAGTCGGCACCGTGTTTAAATACTGATCGAACTTAAGTCTGTATAATGCAGTGGTTTTCCCCGCAGAGTCCAAGCCTAACATTACTACATGGAGGGTTGCCTTAAAAAAACAGTATTTGTTATATTATAGTTTGGAAACAGTAGTTAAAATACCTGAGAAGGCAATGCGTCTAAAAAATTTCCGTTTTTTACCAGAGGTTTTACCATGGTTGCCCCCATTCTGTAAGTAAATACAAGTTTTACATTACTTATGCTCAATAAGATGTTCTTGTAATTCGATAACATAAGAGATGGCGATGAAGTAACCGATAAAATAAATTAGGTCCCATTTACACTAGAAGATTGAATCTCTTTTTTTTTTAGTTATTCTGTTTTGTGCTTTTGTGATTAGCGCGCCAAAAAAATAAGTTTCATTATCTTGTATTATTAAATCGTATTTCTATATGGTCTTTATGGATGCATGCACTCTGCTTTAGGAGCAGACAAGGGTCGGATGTTTAATATTCTTAAGTATTTTCAAAGAAATAAACAAAAACCACCCGAAGGCGATTCTAGTTAAGGCCTAGTATCCACATCGATGGAACTGGGAATAACTTATTAAAGAGAGTGAAAGGTAAATAAAAATTTACGTTTTCGATGGGTCCGTTCTAAAAAAAATTTGAGATGCGCAAGAACCAAGTCCCCAAAAAAAACTTTTGTAAGTTTCAAGATGTGAGCGTGACAGACACACAGACGCACATGTCTAGATCGACGAAATAATACTCCTTGAATGCGGACAGTCTCCCAGTGTGGGACCTGAACCACAAGAAGAAGGAAATTGCGCTTGTCATGGACAAAGTGACCATTTTGAGTTAGTAAATATTTGAAATAAATACAATACACAATGTATGAATGGATATAAGTTGAATGCTACGTTGATCAATCCCTAACGAGAATCAAGAGAAGGCAAGAAGGAATTGAACTGAAGAAAAAGCAAGCCGTGTAAACTTTGCTTCCCAATTTTATTTCCTGTCGGTCATGCTGTAACTTTTCAGCAAAACCACCAGTAATGCGCTTTCTGACGAACTCTACCTTAAATTACATAGGTAAGTTGTTGATGTAATATTGTATAATAATAGTAGCATAAAATGTTTGCTCCTATAGGAAGAAGCGAAAAAAGTTAAGAGAAAGCTGGATTGCCATGATGCTGTGTATTAGTTTTCTTAATGACATTAATGCAAAAAATTCCTTAACGGTCGGCCTTATTTCCTCCTCCCTAAAGAATCCAGTGCATCCTTCAGCTTCACATTGTCGGCCAAGTAGATGGTGGTGATAAAGTCCAGTGTTCCCCTAATGGAGAGCATGGCAGAGATCGTATTACTGGTATATTAGCAGGACGTGACCAACATTTTTTTGCCCAGAGCTTACATTATATGCATAAAAAGGACCGTCGTGATGTCCATGTCCAAGTATTTTTACTAGTATTTTCTTAGCACATATAAGTACCGACCTAAAAAACAAACCCGATGAAAAGCTTTAGCCGTCTATTTGCCTCTCGCTCACTACCATGGTTATGTTGCGGTTTTGATCGATGTGAATACTAGCTTTATGTTTCCATCCTTAGGCAGCGGCTACTTCGATCGTCGAAATTCACTAGGTAAATGCGGTATTCGTTTGGTATTACCTTAAACCCCCTTCCGACAGAGTCCATCCGTTTGATGCGGATCTAACTGTCTGTCTGGCTGTTTATTATTATTTTTTTAATTAATTTACAAACTATAACATACGGAACATGTCTTCTATGCATTATATATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGTCTTTTTATTGAATACCTGAGGATTTATAAATTTAATCAGCATTGTGGAGCACGCGAAAAACAATTTAAATATATTTTTTCAATAATTGAAATTGAATAGTTGAATTTAATTGAATAGTTTAAAGTTGGCAAGGCGAGCAAACTTAACTTATATGTATGTATATGGTACTAAGAAAGGAATAGTTCCTTTTGTTGCTCATCTTCATTCATTTTTCTAAACTGCCAGTTGCCAAGGCCGTCGAACTCCAATATATGTGTGTGGTATTTCCTAAAGCAGAATGTTTATTTAATTAGGACAAAGTTCAAATAATTAATTCTTACCATAAGGTAGGCCTGTGTGTTATAGTCAACAGCGTAATTCCCATGCCTTTAGCAATTTCATATATTGAGCTTTCAACGTCTATAGACACTGCGCTCGTACATTCATCAAGTAGGGCATAACGTGGCCTAGAAGAAAAACATACATTAATTCAATGCTAGAATAAAGGTATACTAGTATAAATATATACTATATCACGCGAATTGTTATCTTTAAAGTCGTTACGCTGATGTTGACTAGGGTTGCAAATGCTTTTGTTTTTTATTCATTCAATTAAAATTTAGTAAAAAAAATTATGATTTTCGTTCCCGAACCTCTAAAGTCAACATCTACCTAGAAGGAACATGCTTTCAAGGCTTAAAAAAATCTATTTTCCTTTTTAGCGCAAATGTATACCCAAACTATCCAAATTCGAAATATTTTTAAAGTTACAGGCGAAATTGTGAGTAAGGCCGAGCGGCTGGAAAACTTTGAAGTGCGATTTCTCGTTTTTCATTATTACAAATTAAGGGAAACGTCCTATGAAAACGAGATAAAATTTATTATTTTCGGGATTTAATAATCTTATAGTAATATACTTGGTTTAACTAATAAATATACTTTAAAAAAAAAACATATTTTTGTTTTCTTTATTCAAATGAAAAATGCGACCCTCATTATAAACGCCGCACGACACATGCACAATGGAGGCGCCTCGGCGAAATGCTTATACCAGGAATAATATGACAGATATTTTAATAAAAAAATATAACAATTAAACCCGAAAGTTTCGTTTCAATTAAATTTTCCTTCCTTCCCAAAAAAGTCCTCGGATTTCTGTAATTGAATTGTTTTTGCAATACCCAAAGATTTATATAAAACATTTCTAATATCAGCTTTGGAGTCAAA'..b'GCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAACGAAAAAAAATGATATCTTCGGTGTTTTTTAACAAATAACGTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGAAATAAAATTTTGTTTATGGGTTTTAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATACAGCTGCCATTGAACGATCGGAAAATAAGTGGTCAAATAATATGAAAAACTTATATCTTCGGTGACTTTAACATATAACTTCCAATGCTTGGAAATACAATTTTTAATTGGTTTTCAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATATATAGCTGCCATAAATACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAATATAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAACTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTAAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGTTAACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAACATGAAACAAATTATAGCTTTGGTCCTTTTTGGCATATTATTTCATAATATTGGGAATATAAATAGAAAAGTTTTAAATCTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGATGGACAGACGGACGGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACATTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATCATACTCTCTGCAAGGGTATAAATATGGCTGTCAAAGAAATGGTCAGAAATAAGGAAATCATTTATATACTCGTTACTCGTAGAGTATAAAAGAATTCTAGATTCGTCAAAAAGTACGTAACAGGTAAAATGAAGCGTTTCCGACGTAGTAAAGTATATTTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATATAGCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTGTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTACTCTCTGCAAGGGTAAAAAAAAGGTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCAAAACTTGGAAATAACATTTCTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTGATCAAAAGCGGACGACTGTGTCATATAGCTGCCATAGAAACAATCGGTAATTTAGTAGGAAAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTAGAAATAACATTTTTAAATAAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCACAATAGCTTTAAAACTGAGAAACTAGCTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATTGTCTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGTTGCTATCTTCTAATTGATATCAGGGTATAAAAAACATCAAACAGAATGCTGCTAACACTTTTTTTGTTTATAGGTTCGAGACAATTTAACAGGCAGGCTAAGACTCTGTCGCACGATTTTAACTGAACTATAGAGATCCAAAATAAAGTTTCGAAACTCGAAATAAGTTTAGGACAAACAACCTTCAAAATGTTAGCAATATAACTGATTGTCCATATAGGTCTTCTTAGATATTAACAGTCAATTAGACCAACCGACTTGTAAAGATCACTAAATAAAATAAAACTTAAAAAAATAATTAAATTTATTTTTTAGCAAAATAAAAACCAAAAAAAACTTCTTTTTTAATGCAATAGTAACTCTTGAAAGGTTACTGAAAACATCATAAAGATATCTTTAACCATTCCAAAGATATAGAATAATGACTGAGTGCAACAAAGATCGACGAAAATCAGACCTACGGAACGGGGTGGCACGCTTGGCAGATTTTGACTCAATAATAATGTCATTTAGATTTACGGCAAGTTACCTTAGAAACTTAGTTATGATACACAATAAAATTTCACTTGCTTTAATTCTTACACTTCTGAATAAGCAATATGAACTATATTAGGAAGAATCCCGCTACAAAATTTAAGTCCGTATTCGCCGCGTTTTGTAAATATACTAGTTAGTAAGACTTTAACGAATTTTCTCGATAGAAAGAATTGAATTGAAAGGTCCCCCAACGATTTGATAAGGCCGACGTCGTATTGCCTTTGCGGATATCTAAAAAGAGTTTTCACAGCCATATTTTTTATGTTTTATATCTTTAAAGTATATAATGTATAACAAAAAATAATTTCAAGTAAGATAACACTTTCATACATATATACTTATCCGCAAATACATTTTCAAACGTAGCTGGGCCAAATATTGAGTAACTTTTCAATAAAAAAGATAATAACCGTACTAATCTAAGCACCGTTTTAGTGGATTAGATTACCAATATACAGTCGCATATTGCACCTTGTACCTACTCACGTAGTAAGGGAAGTAACTAGAAAAATAGGAACATTAAATATTTCTTTGCATACATACAACTTCTCAACCCGCTACTCAGTACAAAACTTCACATAAACATATAAAAATATTTGAAAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACCCGTTAATGAAGATATATAAGCAGAAAAGCGATATTTTAGGGCGCCACCTACCGGCTTTTTCAGTAGATGTTATGTGGGCGGCAGACTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGACATAATTTTTTCATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAGATTTAATTCGAAATTTAGAACTAATTAGAAAATGTTATTTCCTAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAATATATAATATTTGTTTAATGTTTTCTCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAATATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAAACGAAATAAAACTTTAAGGAAAGTTTCTGCCCGATAACTTTAAAATTGAGCGGACGGACAGACGGAAATGGCTAGATCGAGTGGTCTAGTTATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTCTCCTCTTAAGGAAATAATGTTTTAAATATTCAATTTTTGTAATGACAACAAAGATTTTAACAAGCGATATACACAAGTATGTATAGTTGTAAGTATATGTTAGTAATATAATTCGCGAAAGGTAACTGATAAACGCGGGTTCGCACAGCCAAAGTAAAAGAAACCCAAAGAATTAAGATTAAATGGCGGAAGTTTAAAGATTATTAAGATTAGACTTTGGAACGTAGTTATCTCCATTTTGACCAAAATAGTTTTTTGTAAAGAAGAATAAATTGAGCTGAATGGCAGCGAGTCTTAATGACTAGAACAAAATGGATTGTGATTCGCTTACGCCATTTATCCTAAAAACTGTCAGTTTAAAGATTGTTTTTATACCAGTTACTCGTAAAGTAAAAGGCTATACTATAATCGAGAATAAGAGAAAAAGTTACAAGTAAAAGTATATATATTCCTAATCAGGATCACTAGCCGGGGATCCGTCCGTATGAACGGTGAGAGCTCGGAAACTATTAACTAATTTTCCGATCGCTCCTATGGCATCTATATGGTATAGTCGTCGGATTTTATAAAAATATATACCAAATTCCGAACTAATTAAAAACGTTTTTCCAAGTATGTAAGGTTATATGCTAAAAAAAAACATCAAAGGTATATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGACTCGATCTAGCCATGTCCGTCAGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACCAAAGATACATTTTTTAAATATTATTTTTCCACCAATTTTCCGATGTCGATTAAATTCAATTCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTGAGTTTCGAATTAAATTTTATCAGTCGGACGACTTTATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGTTAAAATAATATTGAAAAATTATATCTTCGTTGTTTTTAACTTATAACCTCCTACGCTTCGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAACTAAATTTGATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTCGAAAAACATGAAATAAAAATGGTATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAATATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATAACATAAAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTAGTGGGAAATAATGTGAAACAAATTATAGCTTTAGGGCTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTATATAACTGCAAGGGTAGGGAAGGTAACTTCCATTCTTGTTTGTTTTTTTTGTCTGTTTTTTTTATTACTTTTTAACAAAATTATAACCCTGTTTTATATTATTAATATTATAAATAGTATTATTTTGTTCGTACCTAGTAGGAATCTAAGAGCTTCAATCTTTATGTATCAATCTATGCACAGACGAATTACGTTCTAAACTAACCCATTTGCCGCTTTATTGCTTTAAGGGATTGTAATAAAGAGGCCTTTTTTATGTAATTCTCTTGATTAAGTAATTAGTTAAGATCCATTTAAATAGCCAGTTAAAAAATTGAAACCTGTCGTCGAAATATATAAATATATTTAAACATTAGGCATATATTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTAAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAATATATATATTCTTTTGACATATTATCTTAATATATTGGGAATAAAATTTCGAATTCAATATAATATTAACAATTGGACTACTCTAACATATAGATGTAAAAAAAAATAGTCTGAAAAAAGAATGAAATATTTTTTTTTAATATCAATGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTCACATGTTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAAGTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACCTTCCTTGTTTTAAAAAAAAGAATGGCCATAATTCCCACAAACCATTTTAAACTAAATCTAATCATAATTTGACATGCCTATGTCCCTTTATGATATTCCATTTTTTAATCTTGGTCATATATGCTCTCTTCTTGTTTATATTATTCTATGTGCCTGTGAATACGGCTTAGTATAGTATGCTGATCAGCCATGATTAGCCACTTTTATTTGAAAATTTGATTGGTAGATATACTAGCTGCAGCTAAGCTAGACAAATATGATTAAAATAGTCCCCAAAAGTACTTCTAAAAAATAAGATTCAAATTTGTTGTATCTTTTTTTTTAAACATTTTTAATAACATTGACCTTCTTCAATTAATACAAATGTTGATTTAGATCCATTAATGTACCTATTTTCTGGATTACAAATGCTATTGCTTATAGCCGTTTTTACTTTCACCTTTAAAATTCGAAAATTTATTTCTCCATAGTCCAAATTGCTGTACAGAAATATTGGTAGTCGGTTACTTATAATCCATATACTTTGGTCGTCTTCGTTATCTACTTTTAAGTCATTTGGAAATTGAATTAAATTTGGGCCGTTTTCCAAAAATCTTTCTATATGTGCTCGAGTATATGGTTTTGATGTGTCCCAGCAACCAATATTATCTTGATGAACTTGTGTAAAAAACATTACGCCACTCCTTGTAATTGCAGAAGTGGATGATTGGCTATTGTAGCCCCGATCCCCAATCGAAAAGAAATACTTCGCATTATCTTGATTGTTTGATTTCCACAGAGATTCATTTAAGAGGAGGTCCATCGGTACCATAAACTCCTAGAATCAAAATGAATAACAATGTTTTTATTTACTGTTTTAGTTATTACTTAATACACAGTCTTAATAATTACTGAGGTGGACAACATTTTGAGTTTTTCAGTACTAAAGACAAAAAAAAATTGAAAGGATTTCAACTGATTATTATTACTGGAAACTGCACTAAAAAAAATCGTTATCAATATGCCATTATTTAGATGTCAATATGATTCTATTAACTGTCAAAAAATCATTGATGAGAAAAACATGAAATTAATCCTAATATTGGGTTATTTTGCCACTTGAAAAAAGTTTTTAAGAAAAAGCTATTGTCAAAGCTTTTCTATCATAATAAAGCATTTTGCATTTGGCCCGCGGGAAAAAATTGAGTTCGCGGCTTAGAGGGCTAGCGATTCGCTGAATGCGCTCTGTAAAATCAATATTGTGAAAAATCTTTGACCGGGCCCCTCTTATTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGTAACGTTTCCGACCCAATAATGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTTATATTTTCGGGGTTTTTGATCATATAACTTTCTAAGCTTGGAACTAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTACATTTTGGGAAAGTTTCAACCCGATGGCTTCAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAACTATTGTAAAGTTGTACTGTTCTGATAGTCAAAATGCAATTTCTGTAACAGATTAAATGCGTACTTGCACAATCCGTATTGCCGCGAAATATTACAAGCTTTATTCCATATGTATCTTAAACTATCTTATTAAACGTTCCAAATAAGTTTTTATCGATACACACAACTCACCTTAAAACTTGCCATTGGATGAAAGTAAAGAACGCGTTGCATCATATTTTCATTGTAAGATATAGTCATACCGAAAACACCATCCAGCCATTGAAAGTTCAATCCGTAAATATTAAAATCTGATGCAACTGGATCAGGATAGAAATTATAATTTGTTACACGCCAGCTTCGGTTCTTTGAAAGGCTATACACAACCAGCCCGAATCTCCATACATCCGATACAATAGCATGCGCATCGTCGCAATGATCTCCTATATCCACAACAATATTAGAGTGCAGGGAATCTTGTTTGACTTGAGAAGCTTCTAAATTGTACCGAATAATTAGTTCATCTTTTTTAAGATCGTATACAACAATCTTTGGCGGACAAATCTGATTTAAATTGACTGTAGCATTGACAATACCAGAATCAATAATCCAAATTCGTTGACACCTATCAACAGCTGTACGATACACCGACATCAACTTCAAGCAGTCGGGATTTTTTGGGTTTCCATGTGCCTCCCAGTTTGGATACGGTCTTATTGCTGGACTTGACTCTGTTGGAGGAAATGGAATGGTACCCAAGCTAGCAGGCACACCATCTTTCCAACGGGGTGTAGTCACAAAGAGGCGGTTTTGATGGACGTCAATTCCCAAAGGTAAATTATTTTTCGGTACAAAGTCTCTGTAAATAAAAATATATTATTTATAAAAGTAATCTCGTATTTCCTAAAAATGTTACCTTATTTATAATAAAAATACAATAAATTTAAAGGAGCTAGGAGTAACTTCCCTCTCTGTAAAATCCACAAGGTAGAACACTGAAGTTGAGTGCATCGACTACCGGAAAACCATTATTTCTAAGGTTGCATACAATCAAAAAAAATCAGACTTGAATCAAGAAATATTTCTTGAAATTTCGGGGAAATAATATGAAGCAAATTATAGCTTCGGTGTTTTTTCACATATCATTGTGGACATTCCACGTCAAGTGGTGTGCGAGAAAAAGTGGTAAATGTTGAAGATAAATGTTTCAAATTCAAAAATACCCGCCAAGTCAGAGGGCGCTTTAAATAT'..b'TTGTTTGTCAGTTTGTCCCAAAACGTTATTTTAGAGTCCTGCAAATTCTAATCAATGTTAAACAGCTCAATATAAGAAACATTAGTGCTACCACTTTTGGAAAAACTATCTAGTATGGCGAGTATAGCCCTTGACGTATGAAAAGGGCACCTTGTTGTAAAGTAAAGTCTTATTAAGTTTTAAATTAACAAAAATAGACACATTTACCAGTTCATAACACTGCCTGACCATTGACCTTTTTTGTGTGTATCCAAACTCGTAGACATTTTAGATGATGTTAAACAGCTTGATAAAGGACCTTTAGGTCTACAACTCTTGGAAAAACTCTCTAACTTCACAAGATCTATCTATAGCTGTTTTCCTTCCCAATTAGCGAGTGCTGTTTAGCGTCATCCAGACTTTTCTGAACTGAACTGAAAGACCTTTTATACAAATATCACCAAGTATCACTGTGGACGGCGGTCCACGTAGTGACGAAGCGGACCAGGAAGGTGTGCGATGGCGACTACTATATATACACGAAGAAATGAAAATCGACAGTAATCGTCCGATTGTTTCGAGTGGAACATCAATCGATAGATATTGCAAAAACTAAAAGGATTTTATACCAAGGCTTAAAAAAAACAATGGTGAGGTAGAAAAAGTGGTGAAAGTGTAAAAGCAAAAATTTGGAAGATTTGATGTTAGCGGGCCGGTGGAAAGAAGAAAACAGCTATAAATAACTACATTTTGCATACCACTAACTTGCCAAGTACTAAAGTAACAGGCTTGTGCTTTACGACGTTAAAAAAGTATTTCGAAATACTATGTAAGCCACCCCCAATAACACCGTTTAAAAATTATGGTCAAAAGTTTTTTGTAAAGCTTTTTTTCTGATTTCTCAAAAAGGAATCCAACGATTTCATATAAAATTTGAGGGTGTATAGCCCATGAGGTTCCTCAACCTCTGGCTACAACACATTCTTGTAAAAATAGCCGTTTCAAAGTTATTAATCAACAAAAATGGCCAGTTCAGAGCATCTTACACTGCCTTATTTTGTGCGAATCAAAACTCTATTCGAAGGTTTTGAAAATTTAAATGATATTAAACATCTCAATATAAGAAACATTAGATCTACCACATTTGGAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAATAAAGCTATAAGTAGCTAAATTTTGATAACAGTAACTTATTAATTACTAAAGCTACATGTTTTTAGAACGGTATTTCGAAATGTGTATGCCCTTCTAAGGTGATTTGCTTAAATATAAAACAAAAATAACATAATTAAGTTAAAATAATAAGTTCTGATATCAACTTCTGTGTGCTTCTATATAAAGCAAGGAAGAACGCTTTAGTCGAGTGCCTCGACTAACAGATAACCGTTATTCAGTTTAAGGAGGCAAAAGGGAAATGGAGATATATAAACAGCAAAGCTATATTTTAGGGCGTGACCTGCTATTTCAGTAGATGTTATGTGGGCGGCAGGCAGATTTAAGAGATTAAACCGTTTGTGGGCCGTAGAGTCGGCGTGGCACATTTTTAGGTCAGTCAATACAATACCTATTGATAATATGAGACAAACACACTTCAGTTAAAATTGTTTCTATCACATAAACTTTAGGCGCTATAGATCGTTGCTGATTGTGGGCGTTATAGTGGGCGTGGCACCCCTCTGATTCCAATGAAACATGTCAAAATAATATGCATTTTTCGGTAAAGATATACATATATATTAAAGTTAACGTTATCGTTAGCTTCCTTTATCACTTTTCTGAAAATCGGAAAGCTCTAAAAACGGAAAGGGAAGCTCTGTAAGGGCTTGCCGAAGATAGCTTCCATTCTTGTTTTTATTTAGTGCCGATGACGGGAAATTAATAAATGAAACAAATTGCTCAATATACTAAAATGGTCCGATATTTAGAGAAACCGTTTTTCATTCATATGTTTTGCGAAATCTAATAATCTTTTTAAAACTTTAAAAGTGATTAATGAATTGAAACATTTCTGTTAATGAAATCTGTATACGGCATTACTCTGATCACTTGAAATAGTGCAGAGATGCTTTAGCTTTTAGAGTCTAGTGTATTCGTAAAGGTATATTTATAAAAAAAATTGTTTGTGTTTGTTATTTTTTGGTGTGTGTGAGATTTAAATTTAAATTTTCCGAAATGTTGTATGTGGAAGAGTCGGTTTTATAGTAAATAGCCAAAATGTGGACAGTGTGGAAGCTATCTTTGTTGTGCACTCATATTCTCGAAATACATAGACGTATGTATACGTGTTCATTCTTTTGGTCTATACAGATTTTAGTTTTATTATTATCTTTCAATAATTCGATTGGACAGTATTGTATGCAGTAAACATTTTCTACTCTGAGCACTACTCAAAAATAAGCAGGTAAAAGTAAGTATGTGAAAAATATACAAGAAAGAATAATTATTTTATTATAAAATATTGTTTATGTTTTCTGCATTTATTGTATTGCGTAAGAACAGCACCACTAAACTTTTGCGATACCTCGTGTTTATATAGTAGATATATTTGAAAACGATAAATGCTGCAATTTAAGCACCTGTTGCTGTTTTCCCTGATATCATACTTACTTAATTAACCTTATATTATTTTATAGATTGTAAAAGATTTGAGAAATGGATCCCGCTTCAAATATTGTGGTAAGTATGATAAGTCTATAAAAATCGGTTACGATGCATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAAAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACACATTAAAGTATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCTATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCTGGCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTTTTTCAGTTTTAAAGCTATCGGAATGGAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAGGAACAATCGGGGAAAAAATTTAAAAAAAATTGTATCTTCGGTGATTCTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCAAACTCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAACATAATATGAAAAATTATATGTTCAGTGTTTTTTAACATATAACCTCCGACGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTGGTTTTGAATTTCCTATTAAATTTTATCAAAATCAGACGACTTTATCAAACATTATATAGCTTTCATTGAATTAATCGGAAAATTAGTCGGACACTTTTAAAAAATTTTATTTTTGGTGTTTTTTAACATATAATCTTCTAAGCTTGGAAATAAAATTTTTAATTAGTTCTGAATTTCCAATTAAATTTTATCGAAATTGGACAACTATATCATATACCTGTCATAGGAACGATCGGTGGGAATCGGTAGTATGAAAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATAATCATATAATATTTTAAATATAATTTATTTTATTTTAAGGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAAATAGGACCACTCTAACATATAGATGTCAAAAAAGTGGTCTTAAAAAAACAATGAAATAATTTTTTTTAATGTCACTGAAGTCCGCAACAATCATTAAAAATTGCATGGAGTTACTAAAGTGGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTGGCCGAAGTTAAATTCCTTTCTTATTTTTAAATTAATTCTTTATTTTACATAATGTAGGTATATTTTTTATCCTATAAGAAAAAAAAATTTGATACCATAAATGTAGCATTAGTAGAAACGTAAATATAAACTATATTTTTTCTGATTCAGTCAAGTATCAGGTTTTTAATAGGTTTGCTAATCAAAATTAAATGTATGTGTATGTTAAATTTGTTTAACGTGAAATGAAAAATCATTTTTTTTACCAGTTACTCGTAGCGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAAAGAGAAAATTATATTCTGAGATTAGTATGCAACAGGAAGGAGAGCCCCAACTCCGTAAAGTATACATATTCTTGATTATATTCATTAGCCGAGTAGATTTAGCTATGTCCGTATGCCGTGTCAAAGCTGTAATCTTAAACTATAAAATTAAGCTTGCTGTGCAAATTTAAGCTCACACGCGACCCAAAACATTGGCTTTTACAGTATTAGTGCTAAAAAGAAAATTGTATTTAGCATATACTTACGATTGAATTTAAAACTTTGGCGACCACATTTTATTGCTGAAACAAAACCTAAATAATTAATAAACTGAAACCTATTGTTCTCGCCAATGCTTGTCAATAGAGCTGGAATCGATTCTTTACTTTTCATAATCGATGCATTCAATCCTTTCGCTTCAAAAAATCGATTTAATCGACTATTTAAACTAACACGGTTGAAAAAGAAAATAAACATTCAAATTTAATTTATTTGTTGAAAATACCAAACGCTGATAAGAAACTTTATTTTACACATTTATTGTTTCAATATTATATAGAGATCATATACACATTCATTAGGGATTGTTTTGATAGTACAAAAATATGATTTTATGAAACAGAATAAATTCTCAAAAAAAGAAAGTTCGTCACGCCCATTGTAACTCTCTTTTCATCGTTTTTTGCGTTATATTTTGGGATTAAACTTACATATATGTAGTAGGGTTGATATAAGGCTGCTGGGCGGGAAACCTTCGCAGATTAAGGGGTGTCTGATCCTAAAAGAGGTCCAATATTTTCTTCTTTATTTATTTTTATTTATTAAAAGTAAAGTTAACAAAGACGTTTCTTTCACAATCTTAAGGAAAATGTAGTTGAACCAAAAAATGACAGTGCTGGTGTAATTCAAATGGCTCCTGAAAATATTGACCACTCTATCGAAAATCAGAGCACTACATCAACAGATGATAAAGACGATGCCGATTTAATAATTGATGATAGCGAATCTGATGAATATAGTTCAGATAGCAAAAAAACTGCAGATGTAGCAGAAACTGAGGATTTAATTAAGGTTACAGAAACTGCTAAGACCTCATTGTTATCAGATGCGGATGGCACAGTTGAAATAAATGAAAACACAGAAATGAAATCTGAGGACCCCATCATAGAAGCCTTATCTATTAAATCAGACCAGGAAACTTCGGTTTCAGCCAATACAAAAGTCGATAAAAGCTCCACCGTTTCGGAGGAGAATCCAAAGGTGGATGTAATAGATGCGAATACCATAAGTGTAATCTTACCCAATGCTTCAAAAGCAAATGTTCCACAAGATACATCAACAATTATAATTGAAGACGACGAAGTTAAAAGAACTGAAGAAGTGGTATTTAAAAAACGCACGCAATCGTTGACGGAAAGAGTATTTTTCTTTACAAACTAAATAATATAAATAACGTTCATGCTTCTAAAAAACAGCTTTTTTAACATTATATTAATACAGCGATTAAATTCGTTTAAAAAGTTAAGCTCTCGAAAATAAAATTCCTTTCGCGTCGAAAACCATTTTTAAACATATTTAACTGCTAACTGCTAATTCCAAGGAAATTCTTAAAAATGGGTGCTTTAATAAAATATAATGTGTTTAAAACTTACTTTGTATTGTACTCATCATTTTTTGGTGTGTATTTCAACATGTCCTTTCAAACAGTAACCATTTTCTTTGAAGTTGACAAAGTAGTCCATAAACCAACAAATTTCACTTCTGACTTATTTTTCTTTTTTTCTAAAAAAATATTTCTTTGTCATTTTGTTTAACAGTTTTAAATTTTCTATACGTTCGATAAAGTAATGCAAACACCATTTATGCGGTGAAAAATAATAGGCAAACAACGGTAGCCCAGAAATCTTTTGAATATTTTCAAATTAGAGACATCAAAATTCTTAAGGACAAACAAATGGAAGAAAATGTTTTTTTTTTAACGCTGCACACGATTAAAAATTTTTTAGTTTTTAGTTTGTACAACAAGGACATAACATAGGAAATAACAGCAATTTTGTTTTCTTTTTGCCCATATTTTTTTGCTGCAAGTAAAAAACAGGTTGCTAAGGCTAACATTTTATTTAGTTTAAAAGCTTATAATTTTATTATATTATTACCAGGAAGCCGATGAACCTAAAACATGTGAACTGGCTGCCGAAAACTCTAAAAATGAAGTTGCGTCCTCTATTGAAAACGTAAGTTAAAGGTTATTAGCCTTTATTGTTAGCCTTTTTACTCTGATGTTTAAGTTCTGCAACAATTTTGTATGGTATTTTAAGTTAATATATAACATGGGTAATAATAAAATTAAAAAAAAAAATGCCCTTTCTTCTAATTGAGCTTTGAAAAGCACCACTTGTTATTTAATCCTAACTAAGCATACATATACTATTATGAGCGCTTGTATTATATTTTTAACGGAAAGAATAGGCGTATAATTTTCTGGTTTCATAGATTTTTCAAAACATTGGCAATTTTAAGTAGTTCGCATGTTTCGGGTGTACAAAATTGAACAATTTATAGCTGTCTTCTACAAATAATTTTTCTTATATTGGGCTGTTTAATATCGTCTATAGTTTTCAGGACCCCAAAATCTTGTTTTGCGTATCAAACAAAAGCACTTCTTAACAACGTGAAAATAAAGTGACGATCGCACCTTCAACAAACGAAAGTTCTGATATCAACTTCTGTGACTTCCACAATGATTACTTTTAAACGGAGCATCCGATTTTGTGTAATTATCTCCTCCGGCCTAAACAGATCATATTCACTTTTACACTTTCACCGCTCTTCCTTCCAAACCAATATATTATCTTAAAGTCTTGGTATGCAATCCTTTTAGTTTTTCCAATACTTTTCCATTGATGTATCATTTTCATTTCTTTCTATATATATGCAAAAGCGACCTCCTAGTGCGCTTTGTGACTACTTGGACTGCCGTCCACAGTGGTATAAGTTCAAGAATTTACCAAAGCTGGGTTCGCATTGCAGATTCTTCAAAAGATTTATTGTTGTGGCCTTGTCTCAACCTTGCCAACAAATGGTATGACTATATCTAGCCAAGCTGAATTTTATACATTTTGAAAGTTTTCTCAAAGAATTCATACTCAGACCTCTGCGTGGTGGTTAACAGCTCGCGGCGAGTCCGAGTAAAGGTCAATAGTTCGGTTTCACAAAAAAATAAGTAATTTAATTTTTTTTGAGCCTAGGACACCCTTTTTTGTAATATTAATGAACCCATTTTCTCTAAATAGCTGACTATATACTCTTGTGGGCAACAAGTAAGGTAAATTTGTAAGGAAATATTTATTTATTATTTTATTTTATATCAAAAATCAAACCTCGGTGTCTTTGGATTTTGCACAAGCAAATTTCACAAGGTTTAATTTGGTGTTCCTGTGTTATTCCCAAAAGCAAACATTACGGGGGCTTTTTAAACTTTTGTGACGAAAATGTGATATACGACCTACTAAATAAATAGATTTTCTTTATTTTTTACATTCGGCACGCTTTATTAATATTGTACAGCTAAACACAAGCACAATGAATAGCAGCACGCCAAATGTAAAAAACATTACAAAATGTATTTAATGCTGGTAAAGAACACTGAAAAAATCAAAACCTAAAAAATTTAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAAAAAATGTTTTTTCTAAAGCTATAATATATCTTGATCAATTAGTGAAAACATCATAAAGATATCTTTAACCTTTCCAAAGATTTGGAATAATGGCTGAAATAAACTTTTTCTAACAAGTGCCAAAAATGCCATATTGTGATTTCCTTTTGTCGTTGTGAACTGGAAAAGCAACAACGTTCGATTAAAATCGGACCTTTGGAACAGGGGTGCAAATAGAGTTTGGCGACGCACAAAATAAGGTCAATGCTCAGGGAGTGTAACAACATTTTTGTTGATTAGCACGGGTATTTTTACAAGAATGT'..b'GTGGGCGTGGCAAAATTTGTTTAGTTTTTAGGTTTTTTTGTTTTTAGGTATTGATGCGACAATTTCATTTTAGCAAAAAAAATTCTATCATGAAAATTGTGGCCACCACAGTTTTGGGTGGTTTGTGGTCGTTAGAGTGTGCGTATCACATTTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGACAATACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTGTGTCATAAAAACTGTAGGCGCTTAAGAGTTTCTCGGATTTTGGGCGTGGCACCCCGCTAAAACCAAATTGCGCTGCGCCGGAAGCGCAGCATGCCGAGTCTGACAATTTTTGCTCGACTAGGCTAGTGCTCAAGAAGATATATACTTCATGGGGTTGAAAACGCTTCTTTCTACCTGTAACATACTTTCAGACGAATCTAGTAAAAGCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAATATAGTTAACTAGTAGCTCTCGTTATTAAGTAAAAACATTCACAATCGTTTAAATATTCAGGGAATGAGAGCTCCAGTGACGTTGTAGATCCATATAAAGAGAATTCCGAAACGAATTCCACATTGGAACTTAGAAAGTTGGAAAAAATGCCGCTAAAGCTTATAATGAACCCAAACGGAAGAGTCCGTGATTATAATTCGCTCAAAGATTTAATTAACGTTGAAACTGGCCTGTTATCGCCTGACAATTGCGCTGAACTAATAACTGCACTTCAACTTCATCAAGGACGAGGTAATTTGTTTAAGTTTATTTGAGAACTGATTATACCAACACAGTATTTTACGATCTTAAGCATAAACACTGTTACATTATATTAGATCTCATCTGTTTTTTTCTCGCAAAATAATAAAAAGAGTATTTATTTAAAGAAGATTCTTTTTTATAAATCGCTAAGTAAATTTAAAATATGGTTTTTATTCATAACATAAGTGGAAAGCTGTAACCACACTAGATAAAATACCTTTTTGAAGAAATTTGTCAAAGTGTTTTAGGATTTATAAGGGCGTCATCTAAAAGCGGGCAGCAGAGAGATAACATTTAGAAGTGAATGCCGCAGCGGCAGATAAAATCATGAAGTTAGGGTCATTAACTGGAACATCAATATCCAGTGGAGAACTCAGATTACTTACTTTACTTGCTGAAATTGATCCAAAGTCCTAAGCAGAGGTGAGGTCAAAGGACTGATGCGCTGTTAGTAAATTAAATCCAAAAGTCTGGGTAAGTAAGCCACTTATGAATCAGAGGTGCCCCAAATGAACGTTGCATTTAATAAGACATAAAATACAAAGGCGTAAGAGCTCAGCAATTCAAATCAAATTTAAAAACAAAAAATATAAATTATAGAAAAGCTTAGATTAGACCAGAAATTATTTTTTATTAAAAAGACCCATATGTTATTATTATTTTAATGTTTTTACTTTTACGTACATGCTATGCTTTTTTTGACGCTCCCGCCGCCGCTCTTACCGCCGCTACCACCGCCACCAACGGCTGCAATACAACCAACCCACAAACCGCTATCTTTTTATGTATATGAAGGTGCCGAACTGTTTGCAAAACGCCGCAGAAAGGCTGATAATTGGATAGTCGATGAAACCAATTTAGAGACTCAAAATCCTCCGTCTGGTATTCCAGATTACCAGCAGTATCAACAAAAACCGGCTACATCACCAAACATTTTGCCAGCATATTCTGATGCAGGAAAACATCGCGTTCAGTTGAATATTCATCAAAATCAGTTAATTGAAAAATATTCAAAGCCAGGATTGCAGGTGGTTCAGTCTCCTTGGGATGCAGCTTTACAAACTGGTTCGGCCAGTACGGCGTTTTTGGAAGATAAGGATAGCAAAAGTCAATGTCTTTCCCCTGCTGCCGTATCACCAACACCGTACTTCCAAAGTGGTAGGAGGGATATAACGGATACTGTGGAACCTACGCACTATAGTCCTCTGAAAGATTATAAAAATGTATGAATTTTCTAATTATTAAACGTAAATAATAGTATCATTTTTCAGGCCAATGCTTCTACACCGCAATCAATCAATGTACCCTCGAATCCCCAAAGGGATCTTGCATATACACCAGCCGTTGCTCAGGGCTGGGGAGGTCGCAATGTGAAACTACCTAAAGGTTAGTATGGATTTACGAATACGTCTTGTGTTCGTATTCACACAAGAGATTTTATGACAATTATTTAAAAACAGGTTACTGGAAAATAAATCTGAATAAGCCGATAGATAACATTTAAAGAAATCGCGTACATGGAACTTTTAAAATAATAAACCTATAGAGATCAGCATCACCAGCTCAGTCGATCTAGCCCTTTCTGCCTGCCCGTTCTTACGGCTGTCCGTACTTCAGTTCTACTCTTTCTGCGCAAGCTAGTCACTCAATTGAAAGACTATATAAATATACATACATGTATGCATATGAAACGCTCTCAGATATACTATCGGATTGCGGGTATTTTGCTCACCGACTATTCACTCACTATTGGTGTGGCTCACACAGCCACGTATTTCCTTTTTTTAATTTTTTAATTTTATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAATGTTATTTCCAAGCTGAGCAGGTTATATGTCAAAAAGCACTGAAGAAATAACTTTTTTTAATTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTAAAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTAGCCCGATAGCTCTAGGACTGACTAAACTGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGTCGGACAGACGGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAATATATATATACTTTATGGAGTCGGAAACGTTTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACTCTCTGCAGAGGTATAAAAAGAGCTTGTGTGCTAAAATATAAGTTTGGGAAGCTATAGCTATAGAGGAAGCTAGGGTATTGGTGGTTATGCGCGATTGGAGATATTATTTTTTAGTTATTGAGCGCCTGGTACTACTTCTAGGGGATTCTCAGATCTCTTAGTTCTGTTTCAGGTCGTAAGGAACAATAAACTATGGATATTCTTACTTGTTGTTTTCTTTGCTAATTTAAATATTTCAGAATCTTTGCAATATTCCATAACTGAATCATCGCCACAGACTCGCCTCCAATTTTACTTAAATAATGATAACCTGACTTCCAATTTTGCCATAGATGTGCAAAGTCGATTATATGAACTCGAAAAATTTCAAAAATTATTTTTGGAACACCAGCCACTTGAAATAGAAGTGTTACGGAACAGAGATAGAGCTCAAGCTCATAATAGCTGTAAAGATGTAATGCTAAAATTTGAAGTTGAATTATGTGATAATGACAAACAAGTCAAAGATGTCCTAGATGAGAAATTAAATGTGCGAGAATTAATACAATCTTTTGAACAACAGAATATATCGGAACTAAGCCATTCTCAAAACGGCCTCGCAGCACCAATAAAATACGACAATAAAGGCAAGGGTAAAATATTTTTTTATTGTTTTGTGTTTAATATAAACAGTGTATGAGAATCTTATAAGAACCTTAGTTTATGCGTTTAATCAACTAGAAATAGCCTAGTCCGTAGAGCTTCTGCATCTTTGATGAATTTTACATTACATTTACATTCAAATTTGACACGTTATCTGATCCAAGGCTAAAGATAGTTTAACTATAATTTAGAAATTCCGTACAAATCGAAGATTTGGTACTTTGACCAGGATTTTCTATGAATTTTTGAAGATTTAGGGCTATGATGAAAATAAATTCCTATTTAAGAAATGAAAGTGTACCAGCAAGTATTTTTTTCTATTTTTATAAATATATATTATTATTATATATTTATTATTATTATAAATGTATTATTTATATATAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/654/792/e2/scaffold_15-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATTTATTAAAGCTAGCTATAATTTCAATGTAAAACCATAAAAAAAGACAAAAACAAAAATTAAAATATTTGAATAAAAATATTGGTTTAGTTTATTACAAAGTTAAAAATTAAGCCTATGTCATATAGACGAGTATAAAATATGCCTAAAACATTAAATACACATTTTTTAACTTTGTCCTTATTTAAATACGACCTAAAATATATCGTACAAAAGAAGTCCGAACATATTTATATATGTAAGTACAAATATTAGTTTACTATGTTTCTAGTCCATATATATTTAGTATTTATGGCACCCCCAGATCACGATAAAAATAATATTATTTATATCGATTATGATATTCAAAATCAAGAGAACGGCTTGTTCAATAGAGCATTCATAAGAGGCTTTGACAGAGACAAATATATTTAAATGCCATTTACATGAATTTTTTTGTGGATAAGAAATATTTCTATAAAGTAACATTAAATTGTTTAGTTTTTTGTTCAAAGCTAAAATCAAGCCAAATACTGCGTTTTTTTTAAATTTTCTCCAACGAATCCCGAGTCCAAAAATAAAGTTTCACTCGTGAATATCGCGTGACATGTCAGTTTGCACGCATAAAAAATATTGCCTTCCTCAAACATTTGTCTGAATCCTTAGCAATCGCTCCTGATTAAGTGTAAGGGCAGCTTTAATTAATTATTTACCTTTTAGAACGGTATATAGCCTTTCGTGGGATTTTTATTGGCATAAAACATTTCAATATGCTAATTTCGGCTAACGGAACTAGAACTATCAGGATAAAACTCATAATCACCTTAAAAATGAAAGTATTTTTAACTAAGATCAATGCACAACATTTTAAACTTAATGTTCCACTTACCTGTCCCTAACATCACTTTCACTATAACAAATTGAATCTAATATTCCATGAAACCGGTTGAAACCGATGTTAAAGCGTATTGTGGTTAACCGATTCAAACAAAAGTTAAAATTAGTTGCATGTAATATTTATTTTTTTAAAGGCGGTTTTCTATCATTGAAAAAATTTGAAGTTTTTGTTTTAATGTCATATTCGAAAGACTTGGACGATGGTAATGAGAGTGCGTTTTAAGCCAGAATAATTAGATAACTCAATTGACGTAGGCAACATAGTTCAATGTGTGAAAAAACATCGTATTTGCATTCTCAGCTATACCGCGGAACCTGTAGGTGATTAAACACAAGTTTGTATAAGACTTTTACTCAGAAGGACCCAAAAAACCTTGGAAAACTAGGAATGGTTAGTGAAAATTTCACAAAGTACAATTTTGTGTTCCTGTGTTATACTCGTATGAAAACTTGAACGTATGTTTAAGCACTACATAAAAGTTTTAACAGAATTCAAATCCTTGTGTATGTACATATATATGAAGTGTGAATCAAAATATTAAATTTCAGGAACATATGTAACGTCTGTTTATGTTGAAACTTATTGTATCATCATTTCAAAAAAGACTGTATTGCAATAATTTATATTTCGTGTTTCTATTTGATTTTTACAGGCTTATACGTACCGAAAGAGATATCTCTTTCTAGCTATGCAGCACCTCCACAGCAGTACGCCGGTCACGATGCACATTTTGAGTCGCCGAACAATGGCTCTGCTTCGCGCCCTTTATCAAGGACCAACTTTTCTACATACCAAAGTTCTGTTGGAAATAATGGAACTGGCCAGTTCCCAATATCAAAGGCGTTCTCACCCGAATTAGGCACTGTACCGCCAAGGCAGCAGCTGTACGCGCCGTCTAGCTATCAAAGAATACCCGCATTTGAAAACGTCGCGCCTCAGGTTAACTTTAACCCTGCGCCTTTGACCTTTGATAAAATGGCAAGATACGAACAACCCAACAGAAATAATTCGACTAGTGCAAGCTCACAGTATCTTAATGTGAAACAAAATTCGCGAGTGCGTAATGTTTCGCCAACACCATTTGGAATTGTACGTAATGAGCATACGTCTGGATCTTCTTTTTCAACTGGGTCAATTGGATCTCCCAACAGATGTGGACCATTGCCTGGCAGGCCAACTTCTCCACTATCGAACAAAGTTCCAATCTTTAACCAATGTGCCAGAGGATGGGGCTCTATTTCAGACAAACAACAGACCTATCAAAGTCCATTCTCCTCACCACAAACTGGAAACTTACCATACACTGATTTTTAAAAATTGCTGCACCAGCTTAACGATTTACGACAAATTTACTGACAAATTTATTTATAATATTTAATATTTATTGTGTTCTGTTTATTTGATTTTGTAAAATAATAATGGTACTACAACGGAGATCGAAAAAAATTATTTCATTTTTAAAACTTGTTTTGAAATCTTTATATATTTTTTTATTTTGGGGGCATTGGAATTTCTGCATCTGATACAATAAAGCTTAATATCTTATTATCATTATTTTTGTAAGCGAATATGTTTCTGAGTAGCATATTATTAACACTTGAGTGTCGAAGAACTGTATGCTTCTTCCCGTATTAAAATTAATGAAATAGAAGGACAGAAGAAAGCAAATGGAAGTTTTGATATTTATTAAGAGATGTTTTTTCATTTCTATGGAAATAGAATTTACTAATCCAATTGGTCACCAGCACGAGAGCTAACTGCTTTTATGCAGCGTAACAATAAAATATTTTGGCTGATGAAAGTGTAAAACGTCTTTTATAGTCTCAGGTTTGGCATTCCTTATTATACAGTCCCGACTGTATCGAACAAAAACTAAAGTCTTCCATCAGGTATGTTAAGCGGCGGACAGGCCAAATTAAATTAAAAACCACAATTAACCTAGAAATACAGGTGTTTTATATATCAAACCTATATACACTAGATTTAAGCAATTCAGGGCAGGGGTATAGTTTGAGACATTTTGCAGTTGTTAGGTAACCGCAGTTTGGTTTTTAATATTCAAAAGAAGTATTTATCGCAGCGACTCACACCCCATTTCGTGTTACGCTTCACCTACGAATTATACAATACTGCATTTAACGTAGTTAGTTTTGAATCTGCCGTTGATATTCGCGGTTTGGAAAAAAATTATTTTTGTTTTGTACCTCTCCATAAGTTTGGCTAAAAATTTTTAAATTCTAATGGTCCGACTCATTTTAATGAGTACTCTCAGATTTAACAGGAAAGGAAGTGAGCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCATTTATAAGAAATAATCAATTTTAGAAACACGTGACATTGTTGCTGAATTCAGTGATATAAAAAATTATTTTATTCTTTTTTTAGACCAACTTTTTTACATCTATATGTTACAGTAGTCCCATTTTTATGAAATTGAAATCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAAATAAACCCAATATGTCAAAAAGCCTCAAAGCTATAATTTGTTTTATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCAATCTTGATAAAATGTAATTCGGAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCTATGCTTGGAAGGTTGTGTCAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTCATAATTACCAACTAATTTTCCGATCGTTCCTTTGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATAATCAAATAATTGTCCGAAACCGGTACCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGGAGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTTTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTCATGGGGTCAGAGACGTCTCCTTCACTGCGTTGAAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAATGATGTTAACTTATTTTATAAAATTAAGATCGAAAAAAAAAACAAT'..b'ATACCCATTTTTAAGAGTTAATCCCAAAAATTCAGAATTAGTTTGAGATAAAGAGTGGTGAAAGTTTAAAAGTGAAAATTTACAAAATTTGATTTGCCACATTAACCTAGTTAGACCCCTCAGCTGTTAAAATAGGATGCTCCGTCCAAAGTAATACCCAATTTTCTGTTTGTTAGTATGTCCGTTTGTCCCAAAATGATGCTTTACGATCCTCAACAATTTTAAATTATGTTTAACAGCTCAATAAAAGAAACATTAGTTCTACCACTTTTAAAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAAAACAGCTCTAAATAGCTCAATTTTGTACAGCTTAACTTGTTAACTACTAAAGCTATATGCTTTTATATATTCCGATTTTTGCATCTTTTTTTCTGATTGCTCAAAAACGGCCTTTAAACTTAGAGTTGTATAGTTCTTGAGATTTCTCAACTTTTGACGTATGACACATTGCTGTAAATAGTACCGTTTGAAAGTTATTAATAAAATAATGGCCACATTTACCAGTTCAGAACATTGCCTGAGAATTGAAGTTTTTTGTGCGTATCCAAACTCTATTTGACCTTAAAATTTTCATCACAAAAGTTAGATTTTTACCTCGCTAAGAGGTTTTTTTGATATATACTGTATGGGGTCGGAAGCGCTTACTTCTGCAAAAAAATGTTTCGGGTTTTCTTTTTTTAATATATCAACATTTTTCTTAATAATAGGAGAAATAAAGGATATTTTATTTCACGAGATAAACTAGTTTAAAATAGCATAGATCTTTTTTCCAAAAGCATACATTAAATATTTGATGAACACCTGGTCGTAAAAAAATGTTGTTCTAGTTGAATCCCGCACAATATGACAGTAACCCGAAAAAAGCGTCGTCTGAAAGGTGTTAAGGAGAGGTCTGACTTATTCCCCAATTCCCTCATATTAAAGTAATGGGTCTGACTTGGAACTTCATTTCCGGAGATCAAGAGGTAGTTACGCTTTTCGTCCCCAGAACATAATGTTAATACTTTCAAAAACCAGGTTTTGGGAGTGTCCTAATCGGCGTGGAAATTGCTTCGACAGTTTATACTTTGAAAAACCATAAAACCACTTTGATAATAAGTATAATTTTTATTATTAGGCTAGAAATTAAAATATATATGCCGTTAAATTTAATATGAGAAAAGTGCAAGAAAAGTATAACAAGAAAGGAAGTAAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTTTATACCCTTGCAGATATCTGCAAGGATTATTGCTAGCTTCAGTGGTATATGATATAGTCTTAATCAAATTTATTTCGAAATTCAAAACTAATTAAACAATTTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTCAAGGTTAAAAAACCTCAAATATATTTATTTTTTGTTCCGCACCCCGCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCTGGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTTTGAATGTTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACAGACGGACATGACTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCATGAATATATATGGGGTCTGAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTCCGACGAAAGTAGCATACTTATATAAGTTTTACTTATTGGTTTATTAACATATTTGGATACAATAACAATAGCCATCTGTAGCATACTTTGTATAATATGTATGTATCGTCCAATCGTGTGCAGATAAATATTCCGGAACCAAAAAGTAAAAAAAAACCGTAAAAAAGCATGTAAAAACTAAGTTTTTCTTTTTGTTTTATCGATTAATAGGTTAAGGAAGATGGTTAGCCTACCTATTTCGTCATTCTTTTTTATTTGCCATTTCAATATAAAAAATCCAAAATAATCATTATGAATGAAAAAATAATTAAAAAGAACAGCAATAAACATGTTTTTAATAGATTAGATTAGATAATAGAGTTCTTAAATTCACAAGAAGTCAAGGAAACGTATTCTTCTTCATGTCTTTATGAAACGAATATCAGAATAAGTAGCCTAGTTCATTTAGTCATATCCGTCGGTCCAAGCGAATGCTAACATCTCCGAAATTATAAAAATAACTAGTTTGGATATGGGTCATGCAGATTCTTACATTTCCTGTACAGCACAAGTTTGTTTCGTCGAAGTGCCACGCCCACTATTTCTTCTAATACGCGAACTCAATCTGTCTGGAGCCCAAACTTTTGAATATTGTGTCAACATTTAATTTTGTTTTGAATATCAACATGAGAATTATTCTTGGTGAATATCTTTATAAAGGTGTGCCAATGGTTTTAACTTGACCATTTATTTAAATTGATTACCTGAGTAAAGGTTATCTTAAATTCGAGGCACTCAACTAAAGCGATCTCCCTTACTTACCCTTAAACTATTAATTGTTATTCTGAAAACTTAAATTCGATAGCTAAATGCCTTATTCAAAGTTCTCGTAATGTTATTTTTAACAGAAAGATTCCGTAAATATTTATTTTAAGTGACGACCAGATTATCTCGTTAAAGTTCGAGACGTGTAAAACTTTCTGAAAGTTTAAGAGCTGAACCAGGGAAGGTCTTCTTTATAGAATCGAAAACACTTCTTCACCTATGCACTATTAAGTCAAGAACATATATAGTTTATGGGGTTGGAAACGTTTCCTTTACTGCGTTGCAAGCTTCTGACAGAAATTATAATACCCTCTGCAAAAATAAAAAATTGCGGTTACAGTGTTGCACTATGATAAACACAGTGGGAAGTACGTAAAAACATGGTTACTAAATCGAATCGGTCCGAAAGGTTTCCCTTTTAAGGCCCATACTGCACACTGGTGCAAACATATTTTTTAAACATCTTTACTTTGTTAAACAAAAACAGAAGTCCCATAATTGCCCATTTATTTGGAAATATGTTTAAAATATATTGATATATACATAATACATGAATATTTATTAAAGTTATTTATTTCATATGACTATAGGAATTACATTTAATTTTTGTATTTAATATAGCTTGTGTTACAAGGGGTCCTTTGGAACACGCTGTGATCTGAAAATAGTATTTAAATAGTTTATAAATGCATTAGTTAAACAAGAAAGGACGTTGGCTTTGGCAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGCTATAAGAAATACTCTATATTAGTAACAGCATGTTAAATTTTTAAGGATTGTTCCTGGCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATGTACTTTATGTGGTCGGAAACGTGTCGTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGAATGAAATCATTATACCCTCTGCAGGCGTTTATAAATTTGTACAAATGGTACAAACTCTTCCAAGGGAAGATGCCAAGAGCTAACGAATGATGAAAACGTTAAAGAAGTAAAGAAAATTAATTTCGCAAATCGCATCACTATCACTGAGGATGTCGATATATCGCCAGGCTCGGACCATGATATTTCCTCTAATCGAAATTGCTAAATTTAGACCAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCTGAAGTTTGTATACCCTTGCAGACATAAGAAATAATAAGCTTTAGTAAATAATTTTTTCATATTATTTCCCACTAATTTCCCGATTGCTCCTATGACAGCTATATGATATAGGCGACCGATTTTGATACAATTTAAGTAGAAATTCAGAGCTAATTAAAAATTTTATTTCTATGCTTACAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGACCTAACTATAAAATGACATTTCCAAGCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAACACACAGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTAATACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGCAGTTATATGATATAGTCG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAACTGGAAAAAAACCCAAGGCCCAATACATACACATTTCGTATCAAAATAAAATAGGAGAAAACGCTATAGTCGATGCCATCGACTATCAAACACCCGTTATTCAGCTAATGGTGCGATGGAGATATGCAGCGAAACGACTCATTACGTTTATTGTCTTTTTTTTTATTTGCTTATAACTTGTTGTTAGTATACACTTTTACTCAACGAGTGATGGGTATAAAATTCTTTTACACTTCTGCAAGAATATGCAATTGTTTTTTATTATATAAATGAATATGAATCAGAACAATTTTAAAATTTTTCTTTTTTGGAGATTTATTGAGGGCCCAATTCTACTTTTTACTTCCGAAAGATTTACGTTTGTTTTCTTTCCGAAAAGTCTTCACGAAATTTTTGATCCCTTTCTACCTCATTGCCCCTTTTTTTAATTTCTAAATTTGTTGTACTTTTTGGGACATTTTGAATAAATGGTACACTATAATAACAATGTTTTTTCTCTTCATTTTTTAAACTTTCTTCTTTTGCTTGAAATATCACTCAGCCTTGTGTTGCCCATGCTGGACACGTTTGCAACAGGAATTTTAACGGCTCTTTTTATTTAGTAAAATAGAGAAGGTGGACCCTTATTCCTGTAAAAGTTCGATGGATAATCTGCAGAGACGTTAAACATAAAAGCTTTTGTCGTACACCAATTTTTTCACTTTTAAAAGTTATATGGTAAGATGGCGAACTGATAAATATATACTAAAACTCTGGGTAGATTTACAAATAATTTGATTTTTCTTTAGGAAAGGTTGAAAATGTGCCATGATGGCATAACAATTTAACTTTACACTTAAAAAATGTTTACCTCAGTTCTGGACTTAAACTTATCTATTTATCTTAGTTGGTTTCCATAAATATTTGTTCTATCACTGCTTAATCACATGTAAGTTGAATAGGTTCTTTTGTTTTTGATCAAAACCTTTCTTAAAAATATTATTTCACATACATTGTCGGCACGATAGGAGAAATCGACTATAATTATCATATGAGATTTGACATGTTCAACACCTTACCCTACATTCCCCTATTATAGGGATAGAGTGACAATATCAATTTATCACAATAAAGGGCAAATTAAAACTCCAACAAAGTTAAGGTTTTGTTAAGAGACTGCCGCTTCAGAAGTGAAATACTTCATACCAAAATTGAGCTTGATGAAGAGCATTTCCCAACATACAATAAAGATATTATTATGTTAAAGAAAATGCTATAAATGTTATCGAATTCACTACCGAATAATATCGAAATATTTTTAAATTATTATATTCGTGGAAAATTAGTAGTTCATGAAACCAGGATATCAGGAACTAGGAGCTTTCAACCATAAAAATAAAAGCGTTGTTTTCGGTTTTAAACAAACACCTTTTGCAGGTACCTTCTACATACTTAAAATACCACTTCTACCCAAATTCAGTTTTATCAGAAAACCAAAACTCTTTAATTTTGGTTTTTTAAACAATTATTTATTTTTGAGGAAGATTCATCTATAATACTAGGATTACAAAAAAATTAAAACGTATTGTTATTATTTTATAAATTTATGTGTCGCCCTTGAAAAAATTATGTTCTAGTAGGCGGGGTCTACATACTCTTTGTAAATTTCTGTGCCTATGTATTTACATCGAACTGAAATCGGTACATATCTTTTAAAAATCAAATTATTTACTTATGAATAAATACGCGGCATTATTTTTGTATACCCTTGCCAAGGTTATAATGATTATAATCAGAAGTTGGCAACGCATTGAAGGGGACGTATCCGACAAGTTGATATAACCAGGTCCGTCTGTCCATTCGTTTCTACGCAAACTAGTTTCTCAGTTTTTAAGCTATCTGGCTGAAACTTTCCCAAAATTGTTCTTTCTTTTACAGATAGTATATAAGTCGGATCCAGCCGGATATAGTTACAGTTAGTTAGTCCGGTATAGTTATATCTTATAGCTCCCATAGGAATAATCGGAAAACAATTTTTTAAATATATTTTTGGTGTGTTTAAACATACAACCTTCTACTCTTGAATATAACATTTTTTTTTAATTTCGAATTTAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATTTGTTATAGGAACATTCTTTTTAAAATAATCATTCTTACGGTTGATAGCATCCCTTGGCGCACTAAGTAGGCTCATATTTCATTAATTAGAAATACCCATGAAGCACAGCAAGAAGTTAAAAGGTTATACTAGACTCGTCAGGGAGAAGGAAGCGCTCCCGGCCATACATATATCAGGACGATTAACCAAGCCGTTCTAGACATGTTCGTCTATCCTTCTGTCTTTCCGGTCAAAGGAACGCTAAGATCCCGGATGCTAAAAAGCTAGAAAGTTGGAATAAGGTTGTTTATTTCAGCAGGGCACTCTCTGGCACTCTTACATAACGCTAAAATGTGCCTAGCGGCAAATTTATAAAGATTTTGGGAAAATTCTAAAATTTTTTTTTTGATTATTAATGTTTATCTAATGTTTAATCGGACCAGTCTTATATAAATTTGATGCAAAATATTTGAATTCTTGGTTGTAGTCACTTTACTGCTCACATAACTCCATCTCCTTCGCAATCCCCTAAGCTAATTTAGATATTTGATAGTCAATGGCATCGAGTATAGTGATCTCTCCTGTTTTTTTCATTGAATCTTAAAGAACATGTTTTATTTGTATAATGTAAATTGTTCTAAAAAAAGGTTAAAATAAAGGAATATAGAAGGCCTAGAAATTCAATAAAAATATTGCTGTGATAAATTAAATTTCGATTTATATAGGGCTCTAGTCACGGTTATACATATATATAAATGTATAGTATACATATCATACAATAATATTACATATTAGGGCTTGCTGATTTGAATGATCCCAAAAAAGTGATAAATTGGTAAAGGAACGGAATATATGGACAAATCTAATCAATATTGCCAAAGAAACTATGTCTTAAGAATGACTTGATCCTCCGCTTTTGGCAGATAAAAATAAAAACAAACTATCTAGTAGTCTAGACTTCAAATCATTGGTACGGACCAAAAATGTTATGTTTCTAAGCATTTTTTTTTTAAATCTATGTGTCCAACAAGTTAGACCCTCCGCAATTGCAAAATAAAAATTTTGAGTTTTGTTTCGTTTCCGAAAAAAAATATAATAGTAGCCATATCAGATATTCAAGTAATGACATTAAAAAAATTTATTCAAACAGAACAATAATTTGAATTTCTCCAATTTACCCAAAACCCATTTATTTTTCCTTGCAAATGCGGATGTTCAAACGTGGTTTATTGGAATTGCGCCCAATTTGTGTTCTGCCCTAAAAGATTAATTTAATTGATCGCGCTTATACCAGTGTTTCAAATTCAAGACTACTAAAATATTTTTATTTAAACAGTATTTTGTCTTGTCAATGCGGTTGGTTATATGAAGTTTTAAGGCTAGTATATGTGACTCTATTACTTAGAATTGTACATAGATAACTTCTCCCTTTGATTTGAAGATCTTAAAATCGACTAATCCTTATACATTTATATAAAAATATATACATATAAATGGATCATTACCTTTAAAACCGGCCTACTAAAACCGAATTTTTGTGTCATGTTTTTCATATGGTAATCTTTGAAAACTTGTGAACCAATTTTAATGACGAACACTTAAAGTTTTATTAAGTCAAATTTTAAAATATTTATAGTTTTCTAAGTAAAATGGGAAATTTAGTTTTAGAGGGTCTGTTTTCTAAAGATTGATACATTTACCTATATATTTTTAAAGAACTTAATTGCAAACAAGTATAAAGAATCTGTGTTACAATAGTTTTGTGGTCTTGGGTATATAAACAAACTAATGTATTATTTATGTAATCAGATGAATGTATATAGCCATTGCTTCTTTGAAAGACTGCTTATCACATATTACATATGTTTGATCCGATCATT'..b'TACTTGCACCAAATAAATAGTAATTAAGTTTTTTATGAGGAGCGTACACCCTAAAACTTATGGATAGACAAAAAAAAAGTTAACCGCTGAGGCAGTGTACAGTGTACAGAAACCGTATATTTGCAAAATATTCATAAAAATAAATAAATAGTACCTATAAAAGCTATATGTATGATACAGTCATCCGATTTTAACATAAACCAAGAAAGGAAATTAACTACAGCATTCTCACGTTTTTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAGTCAACGTTAGTAATACCATGTTTAATTTTCCATTGTTGCTAATAGCTTCAGTGATACATAAAAAAAAATTTTTTAATTATTTAATTAGTTTTCTAAACTTTTTATCGACAGCCTAAAATTAGAGTCGTCCGTTTCTTGTTAAATTTAATTCGAAATTGTTATAAATAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGACGAAGTTTATATACCCTTGCAGTTTTAAGAAATACAATTTAATTCGAAATTCACAACTAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATACTTTTTTTTTATATTTTTCCCGATAGTTCCAATGAGAGCTATAAGTTATAGTTGTCCGGTACGGCTGGTTCCGACTTATGTACTACCTGCAATAGAAATAGACTTTTGGGAAAGTTTAAGCCCGATAGCTTTATAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACAGACAGACGGTCATGGCTAGATCGACTCGTCTAGAGACGCTGATCAAGAATATATATCCTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCTTATGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATTATAAGATAATATGTCAAAAAAATGCGCGAAGGCGACTACATATATACGAGTACAAAAAGAAATGTAATCTCACTTAAAATACGCATCGAATGAATCTTCAAAATCGGATGCTCCGTTGAAAAGTAATATGCAAAACAAGATTTTTGGAATCTTTCAATATGAAAATTTTATTTTGTTTTTAAGTTTATCAATTTGTAACAAATCCTTATTTAAGAGTCCCGAAAATTCTAAACGATGTTAAACAGCTTAAAATAAGAAACAATAGTTCTAATACTCAAAAAAAAAAACTGGTTTAGCGAGAAAACATATACTCGTATAATTAGCTGCATTTTGTATACCCGTAGTCTCTGAAGTACTGAAGCTACAAGCTTGTGCTATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCAAAATAATATGTACGCCTTTTCTCATGCTGAACCAATAGTAGCTATTACAGCATTCGTTTTAATTCTTTTTCGAAGTGCAATATACATTTTATTAGTTGTTTACAATTTTTTGTTTGTATTCAAGCCTCTGTGACCGTAAATAATGATGATTGACCTCATGATACTTAACAAAAAGTTTAGAATTTCCGTTTAATTCCATAAATCATCTTGTATATAAAAAACATTTTTATCGAAAAGAAACCACCAAACGGTCGCACACCCACATGAACACAGTTAAGAAAAAGCAAAAAAAAATTACGTCTAACCTTCGCTTTATTATTTATTGATTTGACACCTTTATCTTATTTTAAACTCATTGACATACATTTTTATACGTGAACGTATACATAATCAATAAAAAAAAAACGAGTTAAAAATTTATTGACGATCGAGCCTGTGTTCTTGCGTTCGATGTGTCTTCTCCAGGTTAGTCGTCTGTCAAGGTGGACACCGAGATACGTTGCGTCGTTGACATGGGGAATCTGCGTATTATTTATTGAGGGCATGTGCCTCCCCCTGGGGGCATTTGTGCCTGTTGAGAGTAAACGCTGCGTTTCCATTTTTGTTCATTTATTCTAATCCACCAATCAGATAGCAACCTCTCTACAATGAGGAGGTGGTTTGCTAGCTGTCTTATCACTCGGTCTGGGCACCTCGTGCGACTTCAAATTGCGGTGTCGTCAGTGAACGTAGTTGTTGTTAGCTGCTCGTTCGTGGGAATATCTGCTGTTTATGGGAGGAACAGAGTAGGCTAGGGCCTACGCGCGCATCCGTGCGAGACTCCAGCTATGATAATGTAGTCGTCGGATGTTGTTGCGTTGCACCTTAATGCGAAGGTTCTGTTGTATAGATACGACTCAAGAAGCTTGTGAATGTAATCAATCAAATGTGTTTTGATTTTGTGCATGAGGCCATTTAGCCATACGGAGGCTTGAGATACATCAAGGAATATTGCACTGCAGTATTCCCGATGCTCAAAGGCTGTGCGTACTTCTGATTTTTTTCTGTTAACTTGTTCGATTGTTCCATGGCTTTGACGAAAGCCAAACTGATGAGCAGGGATAACATAGTAACATGTAAGATGACGGAATTGTATGGTCCTTTCCGGGCTTCGGTATCATAATGATAATAGATTTTTTTTTATTTTTTCGGATAGTAGCCGAGAGCTATGATCCCATTGAAGATTTTACAAATAACCTCAATGGCATTGTTTGGAAGTTCAATTTCGGTTTCAGTTCCCCAATGACTTTCGCGATATCCTTTGGCTGAAACAATGGTGGCAGGGAAACAGATTCAGATTTGATTTGTGGTAGGAACATTGAACCAGTGGCATGGTTGGGCTGGAAGACGTTTCTGAGATGTGAAGCAAAAGTTTCGGTGCGGACCCAGCTGCCAGATGAACTTCTTATCGGAGTGACTGTTTCAATTGGAGAGCTGAGAATTGGGTGAGCCCTCCACAAAGGATGTTTTGTACTAGTTGGTGAAAGTTTTTTAATGTTCCGTAGCTATGCATTTTCTGTTTCTTGCTTTACAGCTCGATTTGGTTTGATGACGGCGATCTGTTAGTTTGCCAGGCGCCTCTTTTCTAGGACTAGCCGTTCAATTGCAGCCCGTGCCTTGGGTTGTTGATATAGTGGCTGCCTTTAGAAATACTTGTTCAAGAGCATCGGTAGAGTCGATGTCCGCATCGATGTTTAAGTGAGGGGTTAAATTGATGTGTGAGCTTACATACTTTTAATATTTTAAAAAATTGGTTGTGTGCGAAGTCAGCCTGTCGGGGTGATCTATAGTTCGTGTGCTTTGAAGAAGAGTTATTAGCACTGGCGAATGGTCTGACGACAGGTCCGAAAGCGCTTCGGCTCTTATTATATTGCGGGGAATGTTTTTGTCACCGCAAAGTCTATTAGGTCTGGAACGTTCCTAGGGTCTGTTGGCCAGTATGTGGGGCTGCCAGGGGAGACATAGTCAAATTTGTTGTTCGGTTTTATGATTGCAAGTGCGGTAGAAAATGTAGCCTCTTATTTGGAAGTTGTATTTGTTTGTCAGGTGCTTATCTACCAGTAGCATAATGTCGACATGATTATCATTCAGGAACTGTGTTACTTCAAGGTTGTGCCGTGAAACGCCATTGGCGTTATACATTGTTATTCGTGGATTTGCCATCTGTTATTTGGACTGCTTAGCTGCAAGTAGCATGCATGGTCGTTTTCATGAATGACATGAATTCCATCATACTTTGTTGCATGGTGACCATCATAGATTCCAGAGCGTGACTGTACTTGGATCAAATGAGCGTTTTCTGGATTAGACTGGAGTGGGTTTCCCTTCCCTGATCGAAGGGCATAGGCGTATGAGAAGACTTTCTGAGTATTTAGTTGACCAAATGAGGATCTTGCAACTTGAACAGTAAGCCATGGTGTGTCCATACCCCTAACAATTTGTGCATTGCATTGGGTCGTTCTTCAGATTCCGGTCTGACCGGAACAACATGAAAGTTTCCGTCCCCGGTCAGCGCAACAAGTCTGTTGACCAAGGCATTCGAGATTTTCTCCCTAATGAGCCTGTTCTGATTCGTTTTCTGCTAGAAGCGCACATCTATTGATGCTGGATCTCCCGAGTAATTTATTTTCTATTTGGACACGGTTTATTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CAGAGTTGTTACCTACTGCGGTATTCTGCGGGCTAATCTTACGCTTGATATGGAATAAAGACAAATTTAGTGCGGATGCAGAAGTTTTACCGTTGCATGTTGTTGCTGCGCCAGGGATCAAAACTGAAGGTGGGGGGTTTTGCATTGTTGAATCCATGCCGTCGGAGTAGGGGTATTACGGGTATACAAAATGTAGCTTTTTATAGTTGTTTTTTCGATAAAACTAGCAACTTTTTCCAAAAGTGGTACAACTAATATTTCTTATATTAAGCTCTTCTAAAATAACATTTTGTGACAAACAAAATAAAATTTTCATTTTGAGAGGACCCCGAAAATCTTGTTTTGCATTTTACTTTTTATTGGAGCATACGATTTTGTCAGTTGAGGTGTTTTGTAGCGGAATAGCGGGGGTTATTTATGACCATCGGCCCTAACAAATCAAATTCCATATTTTCACTTTCACACTTTCGTCTCTCTTTCTCCCAAACCAATTAATTTTCTTTAAGCCTTGGACGATTGCACTAAAATTTCATTTATTCCTGTACATACAGCAAACTTAATCCTCTTTTATCTGTCTTTTTTCTTAGGCTCACTAAGTAACTCAGCAACGAAAAGCTTTGTTCGTATTAAGCGTTTAGTAAGAGAGAAAATAGTGTGTAACAAAACAAAATAAAAACTAATAGCCGAGTTTAAAGTCAGTGGAACTGAAGGCCCGGCAATACAAATTTTTTTTAGTTAGCCATAACATTTTTGACATTTAGAGTTACGAAAAAGAAAATTAAAACATGATCTTTAAAAATGTATCTCAAAGATTATGTAATATATGTAATTTTTCGGATCATTCCTATAGAAATTCTTTGATATAAAGTATACATATTCTCGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGTTATGTCCGTCCGTCTGTACCTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCCCTCAGTTGTTGATCGCGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCCTTTTTCTATTGCAGGTAGTACATATAAAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTAAAGCTTCCATAGGAACTATCGGGAGAAAAATTTAAAAAAAATTATATTTAATGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTAGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTTGAAATTAAATTTTATCGAAATCGGAAGACTATATCGCTGTCATAGGAACAAACGGAAAATTAGGGGTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACTTATAACCTTCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTATTTTGTTCTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGTTGTCATAGCAAAAATTGGTGGAAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATGGGGAATATAATTTTTTAAGTTTTGAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAATAAAAATTGGACTACTCTAACATATAGATGTCAAAAAATGGTCTGAAAAAAGAATGAAATATATTTTATTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATACTTAATAATTTCACATGGCAAGGGTATACAAACTTGGGCTTGCCAATATTAACTTCCTTTCTTATTTTTATCTCTGAACTTGAAACGATTGGTCTTCAAAAATAAATCGTACTTTTAACGTACTCAACTTATTTAAGCTAAAATTGTTTATTTTTTTGCGGAAGTGAACTTTTTTTTTAAGATTACCTTTTTCGACGATCGGGGAAGCGGACACATCAGTCTGGTCATGTTCAGGATTAGTAGTATCGAAGTTTTGGTGCTCCTGAATGTAAGTAGCTTTTAAATCATCAGTTGCCATGTATTTGTAATGATTTTGGTCCAACAAATCATCGCCAACTTCGTCTTCGCAATCGGAAAGCAAAGTTTCATGCATAACCTCTGGAGACATTACTTTGCATTTCTCTTGTATCACACCCGAATTGGTATCAACAATGGATGTTGATGTGACAGTTTTAAGGGTTTCCATAACCGTTATATATCCTAAATTACTTGCAATGTGTAGAGCTGTATTACCGTTCTGAAAGAATATTTAATAACTCATTAAAACATACAGCAAAGGCTTAATGTGGGTATGAAAATTGTATGTCGCCCAATGAGTTGTATAGCGTAAAAAATTAAAAAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAAAAACCCGTTACTCAGCTTAAGGAAGCAAAAGGAAAATTTAGATATATTAGCAGCAAAGCGTTATTGTAAAGAGCCAAAAATCTTGCTTTTGGTATAACTTTTGAGCGGAACGTTGGATTTTAACATATGAGGTGTTATTCCACGCGTATTTTGAGTAAGAATAAAACTAGGCTCATAAATAAGCAAAAAAACATATAACTTATATATAATCAATATTTTTGAGGTTTATAATTAAACAAAAACATTTCTGATCGAGGTAAAAACCAAGTGACGACCAAATAAAAGTTCTGATAATAACTTTTGTGACAAAAATGTTTTATACGACCAACTAAATACACTTTAATTAATTTTTTACACAAACACAAGTATATTGAATAGCAGCGTGCCAAATGCAAAAGCGATTAGGAAAAAATTCAAAATACCAATATTTAGCTACTTAAAGCTGATTTCTCGCCAAACTAGCTAGTTTTTCCAAAAGTGGTAGAAGTAAAGATTCTTATATTGAGCTGTTTAACATAATATAAAATTTCAGGTCTCTAAAATAAAGTTTAAACTAGGAAACAAAATCTTGTTTTACGTATTACTTTTGAACGGAGTAACCGTGTCGCGTATTTTAAGTAAGAAGACAACTAGGTGAATAAAGGGGGTATTTATCCCCATCGTCCCCAACAGATTAAATCAAAGTCTTGGTATGCAATCTTTTTATACCCTAGCGATCGGAAAATTGGTGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGTTTTTCACATATAACCTCCTGTTCTCGGAAATAACATTTGTAATTGGTTTTGAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTTGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATAATTTCATATATTTTTTATGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACCACTCTTACATATAGATGTAAAAAAAATGTCTTAAAAAAGAATGAACATTTTTTTTAATATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGATATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTGCCTTTCTTGTTATTATCTGCAATACCTTTCGATTAATGCATTCGCAACAATCGGACGATTACTGTAGATTTTCATTTCTTCCTGCATATATAGTAGTTGTCTTCGCACACCCTTCTGGTGCGCTTCGTCACTACGTGAACTGCCACCCACAGTGATAAAAATAAAAAATAATAATTATTTCTGAGCAAAAAAAAAAAAAAATGATTATTAAATAACTAATCATAACAGCAATAAATTTTTCTAATTTGTATTTGATCAAAATTAAAGTCATTTTTAAACCACAGTTTTTGGGATGTAAATGTACAAGCATGGTTGGCTTTAAGCAAAATAGTATCATCTGCAAGTATCATGCAATAGAATCATCTGCAAGGATGCGGAAGGCCAATATAACAATAAAACAAGGAAAACCGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTTTCAGATACCCGTTAGTCAGCTTAAGGGAGCAAAAGAGAAATGGAGATACACTAAACTAAACTAATAAACTAAAGTTTAATATACTCATAATTTGAACTTACTCCATGAAAAGTTTGGCATTATACGAAAGGTATTTTAAATGCAGTTTGAATAATACAAAACTTTTCTTAACCCATTCAGTAATTATTGAAAAGGACGAATCTGTGTAAAAATCTACTTTTTAAAC'..b'TTACAAGCCAAAATATCTCCCTAGCAAACTAAAATTCAGCGCCTTCAATAGAACAAACAATCTACTTTGTCAGAAGGAATAACATGCCTATGTTGAGAAACACCTTTTTATACCCTTGCAGAGGATATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGATATTAGTTTCTCACTAATTTCCCGATTGTTCCTATGACAACTACATGATATAGTCGTCCGAGTTTGATAAAATTTAATTCGCAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATGTCCAAGCTTAGAAAGATATATATTAAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTAAAATTTTTCCCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATACATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCATTGCAAACTTCTGACTGAAATTATAATACTCTCTGCAAGGGTATAAAAAAAGTGAGCACACACATTTCTATTTGTATACACACAAAATTGAAACCCAATTAACTTTTCCTATAAAGATCTAAATAGAATCGCCCACACACTTAAAGCCAGTTACAATAAAAAACATTTGTACCTACAAATGTTTGTAATTTTGGACTTTTATACAGATATGTAAAATATTTATTTAAGATAACCGAAAATATTTCCAATTATCGTACTTATTACCTGTTTTATATTTCCATTAAATTTGTCTGAGGTCATGCCATTATTTATATTCATGGTCTGCGCACAGTTTTCAGTATTATGGATTTTGTTCTCGACTCGTACCTCACCAAGTGTCATGATTATGATTAACGTTCAAGGCCTGAAAAGCAAACAATATTTGGCATAGAAATATTAAAATGTTCTTATTAATTTGTTTATTCGAGGGAGACTTACATACATACATATGTATGTACATATGCATGCAAAAATACAAACACGAACGTAAAAGGAATACATAAATGTGTTTCCTAATAAGATAACTGGTTTAATGACATTTATTTTAGCACATTGTCATTAAAATATTTGTAACTTTGTTATTTAATTAAGTCTTCAATCATTTTTTGTGAACGGAATAGGAATGACGTCACCACGTATAACAATAATTTCGTTTTTACAAATTCTTTGGTATAACGGATCCATAAGGTAAATAGTTACTATTATGAAAAACACACTGATTAACTATTTTTTTTATAATATCTTGACCTAAAATTTCAATACGCATGAATATTATACTATTTTTAGAGGAAGTATTTTGATAGGTACATACATAGATATCGCTATTCTGCCGTATCAATATTTCTTCGATTTCATCAGTGGTGCCCGATTTATTAGTTATCCCGCTAGAAATTTTGTACACCCGTAAATACCTCAAAATCATACATATGTCGATCGATGTCTTGAAACCTAACGAAGTTTGACAGTTGAGACTTCAGATATTTTATCCTGAAACCTAGTACTCACATCAACGAAAACCGTGAGCTAAAGATAGGAGCGAGGAGAGGCATATTTCAGCACGTAATTCAGATAAGCTAAGGCAATAACAGAAAAATACCAAATTTATCAAGAGAGTCCCGCGGCCCAACGAATAAGAAATTTAATCTTTGGCTGTTTTCATTAGACAAAATAAAACAAAGCACTCCAAAAAGTCTTCATTGGTTGCAAATTTAAAATGACGCCAATATGTCGCCCAACAGGTCTAATTCACAGAATAATGGCAGTCCTGGAGAAAAGCCTATTAAAAGCATGTCCAACTAAACTTCTCTCCCCATGTGGAGATTCTGACGGGTGTGTTCACGCTATTGCGATCTCTGCCGTGCTCTTCATTGGACAGCTTATGCGGAGCAGAAGAACGGGATGGGTTCATTAAGGAGGAGGGCGGCCCTGCTACGGAACAGCTCGGGGAGCCACTACCAGCCATTGCCAGGATGCTAAGCGCCTGTTTGCACCGTCTGTCTGCAACGGTTCAACTCAGTTCCCATTCTTCAATTCCACCAATATCCAGTCGGCATAATGGGAATCGGAACTGCACTGCAGATGTCACGGAAAAATTACCAAGAAAGTGACCAAATGGATACATACACTATCAAATATTTGATAATTATCGAATCTTATTTCACTTATTTTGACCATTTTCCAATTAGTTTTAAACTAAATTTATGTTTTTTTCAAAATTACAAAAAGAATACGTGTTAAAGCGCATATTGTAAAAAATAAAAGAAAAAAGTGAAAAATGTTAATTACCTGGCAGGCTACATACTGCAGCAAACAAAAGTGTCATCTGCACGAATTCTTGATTTAGAGTACTTGCGAAGGCCAAAAGGTGCACAAAAACGTAGGAGTAGGAGCTGCAGAAACGTGCTCTGTCTGAACAAAGTATAATCTATATCAAAGTTCCATGCTTCTGATATTAACCAATTATTTTTTCTAAAAATCACCGTTTTTGGATGTACTTAAAAATATCGATATATAAATTACAATATATTGATAGTTTTCCAAAAAAACTTATCTTCGAACTCTTAATGTTTTGGGCAACCCCACTTGGTTGTTACAGCGTGGCTTTAAAGTATAAAAGTACAACCATTTATGTCACGTTTAAATATTATTATGTAAAAAAAGTATATTTTTTAATACATATAGAAGTTTTTATAAAAATATAGAATTTATGAGCCTTTTAATATTATGTGTGTTGCTTTGAGTGTATGTATTTTTTAAAAATGTTCTAGATACAAAGTGTGCTGCCATTTTATAATCTATAAAAATTCTTTATTACTGTGTAATTCAATATAGAATATAACACTCACTTTGGATATGATAATGTTATGTCACGCTGGTTGATTGTTTTAGATGGTTAATCATTACTATTGGTATGCGATACGCTTATAGAGAATTCACGACTTATGATAAAATAATTTAATAAAACATGCAATCTAGCAAAGAAACTGATCGATTTTCCGTGCCAATTTTGTAATATTAAAGAACGTTATCCCTCTTCACGGAAGGAAGTAACTTAATATATAAAAAAAAAAAATAAAGAACGTTACATACATATGTATGTATCTAAGTATCCACAGAATGCGGCACATTGCATAGTGGGGCGAGTAAGTAAAAAACGAGCCCTAATCAACGGATTTGATATTGGTTGGTTATTGTTTAAATTGCATTTGAAGACTTAAAAACATCATTTCAAGACATTTGTTTAACTAATTAAAAAATAATGTTTTATATTGAAAGAATATATAATTAAATTACTTTAAAAAGTTTTCCCAATATTTATTTTAAATTGCCTTGCTTTTTGAAACAAATAAAAATTTCATGTGTTAAACACTTTAAACTTTTCTTAAAAATCAGAAAAAAATTCTACAAAATAATATTTTTTTGAAACCCTTTCGAATTATGAGCAAGTCCGAACTAACGATAAAACATTAAATAATTTTATTTTTGGTGGAGTTGGTTAATAAAAAATACTTATGGAATATGGACAACGATATACTTTTTGGGTTTTCCATCTCCCATTTCACTTTTAAGTTTATGCTGCAGCGAAAGAAATTTTCGAATTGTAGTTAGAACGTGCGCCAGTACACATAAAGGGAAAAATGGTTCTTTTAATTTTGTTCTCAATATTTTAACCTCGAAGATCAATCTCCCATGTATTTTTTTTTAGAAGAGGTTGTTTAAGAGTTGTTTTCAAACATGATTGCAAATACATATTTGTTTAATAGTGCAGATATTACATGCAACTATTCGGCGCATTCATAAGAGAACTCATTAGAGGCTTAGGTAAAATATGTATATAAGGTATTTACACCTGTTACTCTTAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/664/5c1/e8/scaffold_6-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -ATTAAGGGGATATAT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GATCAAGACTGTATACACTTAACGTTGTTAGAAACACTTCCTTCTACATACTTCCTGTGGTATCTAGGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGGGATTTGGCATGCATTCTTGAGGTTCTGGGACAGCGCAAGTTTATTTCTTATTCTCTTAGCCTGTCTAGCGCCCACATATTTTAAGATTTCTAAAAAGTGTAAATGCAACTTAATTTTGATTAATCAAAGCTTATATTGTTTAACTATATCCTAGGTCCAATTATTGTGGTTTAACTTTGTATCTGACCTGAAAGTCTTTAACAAACATTTCAAAAAAGTTTATTTTTGAGAAATAATTATCTTTTATTAAATTAAAAGGAATATCAAAGTCAGGATAAAAAGTATCTGAAGCGATTTCTTTTTTGAGAAAAGACTGCTTAATTGAGTTATACGAGCTTCGAACTGGTGTTGTAATTGGGAGGTTGCGACAGATGTTTGAGCAACACAATTGAAACCAGATACCTGTTTATTATCTGATAAAACTGGTTGCATTTTCACATCGAGGGTGTGCAGAATTTTATTCTTGGTGGTGTTTCTCAACAACTATGCTCAACGCCCAACGTTTTCGCACTTGAGAGCAAACACTTTACTTACATCCCTTAAACGACTTCTTCATAAAGTCATTATTGTTAATTAATAAAAAATATATACTCAGATAAAAAATTAATACATACTACTATTTTGCCTTGCGGTGAGTGACATGTGTCGCTCCTTGCGATATTTTGGATAATTTAATTGGAAATAGCTTTATGTAGTTAAAGTACACAAACAAAAAGGTGTTAAAATTAAGAAACAGTTATTTTTTGGTGGGGCATAACCTAAAATATTTATTAATTTAATTTGTTTAATTTTTAGGAAAATAAAAAAAATGTGTTTAGGGTTTAATGCAAAAGAAATTAGGTTAATCGGATGACTACAGCTGTAGATCAAAATTTCCAAACAAAATCACTTTTTTGGTCGTTTCTGCAAACATTCCCATTTTTATACCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGACGGGTTTCCAACCCCATACAGTATAGATATTCTTGATCAGAATCACTATCCGAAGCTATACAGTCATGTCCGTATGAACGCTGAAATCTTGGAAATTATAAAATATTGAAGAATTAAACTTGTCATACAGATTCCTGTTTGTTTAGGAGGATGCCACTCCCAACCACTTACCGGCCAAAACTACGGCACTCCAGTTTTCCAGCAAGGAAAATTTTTTTAGCTGAAATTTATTTTTCTTACGCCCACAAACGGCCAAACGCTTAAATCTGTCAAAACATGTACTGAAATAGAGGTTAGGTGGCGCTATACAAAATGGATTTGTTGGTTATATATCTCCATTTCCTTTTCGCTCCCTTAAGCTGAGTAAAGGGTAGCTGATAGTCGAGGCACTCGAACATAGCGTTCATCCAAGCGTTTCTGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTTTAGGTCAGTCGATAAGTATTGATGAGACAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTTTATCATATTTTTATGTATAGTAGGCGCTAGAGATTTTCGCGGATTGTGAACGATCGAGGGGACGTGGCACCCCACTGGAACATACTTGGGCTGCGCAGGAAGCTCTTATAGTTTCCGAGATTTCAGCGTTCAAACGGACAAACGGAACGACGGATAGACGGACTCGGCTAGTGATCCTGTTCAAGAATTTATATACTTTATGGGGTCGGAAACGGTTCCTTCTACCTGTGTTACATACATTTCGACGAATTTAGTATACCATTTTACTCTACGCGTAACGAGTAAAACTAGAGAAAAGGATATAGTCGATGACATCGACTGTTCACAATTGCACACCCACAGTGGCGACGCCTAATGTCGAGTTTATAACTTTTTAACGGATGGTCCGATTTCGACCATTGGCATAAGTAGGTAAAATTGAATTTAAACTTGTGTGGGCTTAAGACAGGAATACGACTGGGCGTGTTGGTGTTGAATCTACACGCCAAGTCACAACTTTCTAGCTTTTATAGTGTTCGAGATCTCAGCGTTCATATGGACTGAAAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGGCACGGCTAATGATTCTTATTCAGAAAATATCTACTTTTTAGGGTCGGAAAGACCAATTCTACCAAATACATACTTTCCGGCCAATCTAGTATGTCACTGATAAGTTACCAGCTTTAGCGAAGATTACTAAACGATCGTTTAGAAATCTCCTCGCCTACACTCCCTCTGCGATTCTTAACCTCATGCACAACTTTGCACCTAGTTTAATCGGATAAAAGATTAAAATTTTCAAAACCCGTGTTTCTAATATCACAAAATTTCGGATGCATTCAGAGTTATTACCAAGAAGCCTTGACTCTGTGTTGTATTATTTTCCGTTCAAGTGGAAAAAGACAAAAGTCATTAATTTGTTTGATTGCGTACTGTATACATTTTTGAGTGCACAAATTTTATACAACAACGACAAAATAATAACGGCAACGATAATGCTTGTACCAGGCGGAAACAGTACCAGCTGAAAGCGACAGAGCCGCAACTATTGTACATTTTTCGAGACTCACCCTTCTTTTGTGCTTTATTGCCGGGGGCTGGGCAATACAACCCCAACAGCTCAGACCGACATAGCATACGAGAAGGGATCGCGTGACGAATATTTATTTGGTAATAATAATTGAGTAACAACGATTTTTTGTTCTGTGTATATATATATATATATTTTTTTTAGGTGTATCAGGGTTTAGCGCATATTCATTTGGGACTTAACATTTAAATTAATTCTGCAGTTTATAAGATTTGTAATTTTATATAAAATTAGTAGTTGTCGTTGTCCTTTCCAGAGTGGTTATGGTCCTTCGACATAATCACGTACGCCAACATTTATGCGACCCTCAGCGGCGGTGACTGAAAACCCCAGAATGCGGGCGTCCATTTTAGTCATCTTATTCTTCTTAACCTTTTTCTGCTTGTTCTTAAGTAAGGAACAATTAATAAGTTAAGTGAATTGAATTTTATTGACTCACCTTGCTGTCAGCATAGTCATTTGTCGATGGTGTTATGGCGGGTGCCGGTTTGCACATATCATCATTGTGTGCATTTTGGGCACGTTGCAAGCTTTTGTACTTGCTGCGCCGTTCCAGAAATTGTCTTGCGAAATCCAACGACTCTTTTCCTTCACCTAAAAGATTTAATTTGGTTAGCCAAATTGGTTTTGTTTGCTGTCCGCGTCCGTCTATCCGTCATGCTGTACTTTCCTAAATGTTGGACCTGACTATTTTGCAAACTTAATAAAATATACACGTTATTAAGCTAACCACTTAACTTATTAACTAACGGTATCAAATATGCAATGAAAGATTTTCTAATTAATAGAAGAGTATAAAATAAAAAACAGAACGTTACAGTCGATCACGTGCTAAAAACCGTAGTATCTCCTTAAAACAAAAATTAACCAATTTTAAACTAAAATCCCAGGGACATTCTTTTGAACCTGCACCTAGCAGGCAGCGCCACTACTACATTACACTGGGGTATTACTATCCGTGCTAGGCGCATTTAATTCTTTACTACTACATTTCTCTTCTTAATTTAGTTATTCATAACTTTTAAAGCAATATTGTGATTGGTATGATTAGGGGCATGTAAATAAACATAGATCAATACAACAACTCCAGAAAGACATAAGCGTCATGGGTGTGGAGTGGGCAAGTGAGCACTGAAATAAACTTGCGCTGCGCAAGAACCCCTAGTTTTTGTATATTTAATCCCAATCGTAACTATTTATAGATTCCGAGATCTTAGCGCACATGCAGGCAGACGGACATTATAGGGTAAACAAAGCAAAATAATTGAAATTTCCCCTTAATTTACAAGACATT'..b'CTACAAAAATTTTGCTTATCAATATAAATTGGTCCTAAAAATGTATTTTTTATGAACAAAGTTGGTACATATTGAAAATTTATTGTAGCCTTGCAACAATAGATTCCATTGTACTTACGAATTTTATACCCTCTTTCCACAGCGATTTATCCACCCTTTGTTGCATTCCGAAAAGTTCTTCAGTTAAGCCTGGTACTCAGCTCAGCTAAGAGTTTCAACTGGCGAAAAGTCTTATTCTTTGGAGTGTGACCAACGATTTCAAAGTTCACCCGCTCATAATATAGCAGGGCCTTACTGTCAAGCATCGACAATTTCAAACCATTTAAAAAAAAGAGGGAAGAACGCTATAGTCGTGTGCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCACAAGGATAATGAAGACATATTAGCAGAAAAACGATATTTTAGGGCGCCACCTACCGGCTTTTCCAGTAGATGTTATGTGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTGGCCATTTGTGGGCGTTAAAGTGGGCGTGGCACCCCGCTCAAACAAACTTGCGCTGCGTAGGAAGCCCAGGAATCTGCATACCACGTATGAATATTCTAGCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACAGACGAACATGGCTAGATCGACTCGGCTACTGATCCTGATCAACAATATAAGTACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTCCGAGGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAACAAGTAAATAAAAAACAATTTACTGGTTCAAAATATATAAAAATAAATGGCATCAAAAGAATATTTTTATTATTGGTAAGCAAAATTGTATGCCCCTTTCTGGTGTCGGGATACATATGTAGGTTGTTGCATTCGCTCTTCAATAAATTTCTCTACAAATAAGAAAATGTAACCATTAAATAATTTAAATATTATTTATATTCGAAATTTTTTTTTAATATTCGAAAAATTATATATAAGATTTTCTGTCACAGTTCTTAACTCAAGATATTTTACGGGATTTCGTTACGTAGCCGTTTACCCCAATCGATATTCAGAGGTGGTAAAAATTATTTTTACAAAATATATACAAAATATTTATACTCGTAACTCGATCTTGCTCCGCTTAACTTTAACATTCCGCAAGCGGCGTCGCGCAGCTTGCCGTCGTGCCGCAACGCGTTGCATTGCCCCAGTGTGGGTCTTTATGGTAGTGTTTCATCTGACTGAGGAGCACATCCCAAAATCGTCAATCTCGCCCTTGTTCCACCTGGGAATGGCTCTGCGGTTTGTGACAGTTTGCTCCTTTCAAAGAGTAATTGGAAAGTACTCGGACCAGCTGCTAACCTATGTTTACCCCTTAAAATTTGCAAAGTTTATTCATTTAAATTAATATACAATAAATAGTTCAATTTTACTTAAATGTTTTGGCATTTTTTACGACAGTGCTGCCCACTTTTTACAACTCAAATCTTCTAACATGGTATACCAGAAATAGAGTTTATTTTTTACTACAATATTAAGTACCGTACTATAAATAATTCGTTGACACAACGTTTTGATAACTACTCCGAAACTTGGTAGTTTAAAATTCGAATTGGTACCACTGTCAGGCTGAACGGCTTGCAGACTGTTTTTTTTTTTATTCATTTTTTTGGGTTGGAAGAGATTTTTGCTGAAATGATTTCCTGTCATCGCCGAGGAACTTCTTAAAGAACACATCCACATTTTTCTGCGCTTCAATCCCATAAATATGCTATCGAAAATCCGAAAAATTCCAAAATTACCGCGGATTAAAAACTGGGCTCAGAATTACCTGTTTCGCATTATTAAGAAGACGAATCTGATGTTGCACAAAGTAATATCAACTTAGTTGATAAAAAGAAAAAGTAAATGTCCTCGTTTATTTCAAGAAAAAAGATTAACTCCTTTTACCGTTGGGAGCTTTCAACTAGCTTTCTGCAAATGTATCCCTCATTTGGTTCAAGCAAGATGATTATAAAAGAAATCTGGAAATATTCAATTCTTTTTGCGTCGTAAACGATGCAGGCGAACCAAGACGACAGTGGGAAATAACTGGTCCCAATAAAGTTTTCAGATTTGCTCCAATCGGATATAATGAATTTTCTTGGGTCACGCAAATTTGGTACAGCGTTTACAAAGCGAGAAAAAGACAGAAAGAGTTGCCTACAATACTTATGCTAATTAGTTTATAAATAAATATATATATATATTTATATACATATATAATTGAATATTGCCTTCTTTGTCCTTCCTTGTTTGGGTATATAAATGTTTACAGAAAGTACATTTATAAAACGGTGTTTTTTTTTTATAAATAAAATTATTTGCGAAAAGTTGTAAATGACTCAAGGATATTAATTGTCCATATTTTCAAAAATGAAACTGAATTCGATATTGTACGACCATGTAAATTCTGGTTCTAGCAACTAGAAAAGTTTTTCAAATTTAAAGCTTTCAAAGTAGTTTGGAAAGGTAACAAACGGATTTCAGAAATAAAACCAAGTCAAGGCCACCCATATGAAAAAATATATTTAATTGAATGTAGACCACCCTAAATGTAAAAATGAAATTTTTTTTAAATTTCAAACAATAATAATGAACTAAAACCGTCTTCCCATACTACAGCTTAAAGAAATGTGAACACTAAATAATTTGAAAACCGTAAGAGGGTACCAGCAAAAGACTGGATATCCTTTATACACCAAAAAATAAGGATTAGACCCCGCCCACATCACATCAACTTGCATTAAAGGTGATGTTAGACAGGTTGATTTCCAAATAAACCTTTTTTAACTATGATGAAGTGTTGATATTTATTTTGACATTTTAACTACTATTTTAATTTTATTGCAATAGAAAAAAATAAAAATTCACATGGACTTAGATTTTTTGTGAAGTATGTATCTTTAACAAATGTTTTCGAGAAATTCCAATTAATATTTGTACAGGTACTTATTTACACAAATAGGAATGTGCGTTTAGTGAGTTTTAAATATACATATGAAAAATGAATTTCAAAATGAAATATGTCTGCAACTGGACAGCATTATGTACAAATGTAGAGACGTACATAAATATGTATTGCCAGAAGGTAGCATGATCATTTTTGTGTGTGATTGCGAATTTAAATAAACGTTGGATATTTGGTGTGGGCCATTTCTTAAACGTGACAGATTCACGATAAAAATCTAAACGTTACAGAGCCTTTCTTTTATAACATACATAGTTTTCAAAGATTGAGGAATTATAACTATATTTTATAATTTGTGTATGACTTTTTTTATATGAGAAAGCTGTTCATAATAAAAAAATTAAATAAAATAAATAAAGGTAAAGTTGTTCTGTAAAATTAAATTTTTGTAATATTTAACATTGTTGGTGTAGTTCTAGAGATTGGGTAGTACGGGATGCCATACTTAGGTGCCCATTGTTGGCTCCTGCCTTATTTCCGATTTTAGCTTAACAAATTCCTTGGCTACTTCATCATTATTACGTTGTGACAAGATTCGTAAAATGGTCCAACCCGTCTCGTCCATTTCAATACGCCTCATTAAAGGTAACCAGCATGCGACGGAGCCCTGTAAATCAAAATATAAATGTGTATAAACTAAATTGTTTAAAATTAAAAAAAAAAACCTTTTCCGATATATCTTTTAGTGGAATTACAGCAACGCCTACAAGTCTATCGTCACGTGCAAAACAATAGTCCTTAACGCAAATGTGCAACTCAAAGAAGTCTAGCTGCTCTTCATTTCCAATGGTGCTAGAAAAAAAATTATTTAATTCTCAATTGTAAAATTTATGTTTTGCAATTAAATACTTACAAGCTAAAAGATTCGTTGTATTTGGGTGACCAGTTGTTGGATTTTGACTTTGTAGCGAATTTTCGTTTTTTTTCTTGCAGGTGTGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCCGATTAGATTAATGTCAACAAATGGACGAAACATTCCTGACGGTATTTGCCATTTAAGATCATTAGCAGCAACGACTAAGGATGAGAAAACAAAATGTTATATAAATTTTTCAATATTTAGTTTATATTACCTTTCACATTCACTTTATGTTCGCCAGTACCAGGATGGGAAAACAAGTCTATTTGCACAGAAATTTCACCGACACTTTCCTCTGCGTTTTCAGGATCAACTGAATTGTAGAATTGTATAAATCGTATAAACAAAACATATATTATCAATATTATCTGACTTCTTTTGGTTTTAAGAACGTAAATAAATAAAAGGTTCTGATATGGGTGAGCCTCTTAAATAATATTTTTTAAAAATCGTAGCAAAAGAACAAAAAATGTACAATTTGATTACGTTTTGACCCTCTACTTACCCTCGTGGACTTGGCTAGATATAAACGTTTTGATTAGGGTGTCGGTCATTTGCGTATATAAACTGAGAGCGTAACGTAGACTTTGCAGTTCGGAGGATTTTTCTAGAAATGTCTTTTTCAGTCCATTGCCACCGGCGTGGAAATATTGTTTTATTGTATCTAAGGCAACGTCAAGAACGGCACATTGTTTTGGTGACAAATTTTTTTCGACTTCCTTCGATATGTCCATTACACCGCTAAGGGCACTTTTGACATCTTGTTTGCCTGCCATATGCGACTTGAACAATCTTCCCATGTCTTCAATTTTTGCATTGGATGCTAAATTTTTGGCATTATCAGTAAGGTGTTTAAACATCATCTATTCAAAAAAGTAAGCTTAAATTTCATGACCTAAAAATTTTGCATTAGTATACGAACGGTTTTATCAGTCATTGGTGGTAGAACAATGGTTTTCTCTAATATTCGCATTACGATTTTCCATAGCTCTTTTAGTAATCGCTTCAGTACTGTTTTTTCACATGACTGTGCATAAAGTGTTAAAGAACCATCGAGCAAATCCATGAGCGGTCTTAAAACTTCATCTGCTTCAACGGCGACGGCGTTCCTTTGGGCTGCTAGGTTACCAGCCGCCAGAGTTCCACTACCTCCCTTAATAGAAAGCAGCATGTCACCTAGTTCTCTCACCGACTGAGTTATCCGTGGCTCCAAACTAAATGGTAATAAAATTCAAAATAAAAAGTTATCTATTGTACTCTATTCTTGGGTAGCAGTCCAACCCACCTGATAGCAAATTGTGATGCCAAATCGTCCAACGCCGAGTTAAGATTCTGTTGAAGCTCTTTCAAAATATTGGCTGCATCCTCCTCTAGCTTATCTCCTCCCATAGACTCAAACATTTTTTCCAATTGCACCCTTAGTTGTTGAATATTGTTCATAAGTATGCAAGCCTGTAGCCGCAACGGCAGATGAAATCGGTTAATAATAAAAAAGCGTAGGTATTCAACACCCGGCTAATTTTTTTTTCCATTTTTCTACTCACAATTCTTTCATCCTTCATATGATCTGGAAACTCTACTTTTACAATATCCGCATAAGCTATAAGCACTTTTACGATTGTTTTAGCAAAACGCCTCATGTAACGTTTCCAAATTTCTGGATCAGGACACTCGAGTTTGCTAACAACATCGAAACATTGCGTCAATTGCGTAAAGACGTCGACAACCGAATTTGAAAAAAGCGCGTGTTCGCTGCTCTTTTGAAACTGCAAAATAGATATTGCAGATATTTTATCATTTTAGTTTTGGTTATAGAATTAAAGAACTTAAAACAATAAACCGAACAAGAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGATGTTTGTATACCCTTACAGTTATAAGAAATAATCTACGTTAACACCATGTGAAGTTTTTGGGTTTTGTTTGCTGGTTTCAGTGATTTTAAAAAAAATTATTTCAGTATTCCGTTGACCGTTTCTTTGACAACTATATGTATTACATTTATATTATTTTCCCACCCATTTTCGGATCTTTCCTATTGCGGCTATATGATATAGCCACCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCCAAACTAATTAAAAATATCATTTTATGAGGTTATATGTTAATAAACACTACAGATATAATTTTTTTTTACAATTTTTTTCCCAGTAGTTTCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTAGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACACACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATTGACTTGTCTAGTGACGCTGATGAAGAATATATATACTTTATGTGGTCGGAAAGGTCTCTGTCACTGCTTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCTTCTGCTAGGGTTTAAAAAGCTTACTGAAGGCGACGTTTCTTAGTATATCACTAGACGAGTCGATCTATTTGTCCGGCTGTCCGTTTCTAAGGGTACTTGTTTCTCTCTTGAAACTAGTTAAATTCTTTAGAACTATTATATCTTTTTTAATTTTTTATTAAATTTTTAATTTTAGTTAAGAAACATTTGTTTATATAGTAATTGGTAATAACTTATTCTAGGACAGGTAAAACTTCATTACCTATCATGAGCGTTCAGCAGAACAAACATTCAGTTATCATGTTGTTCTGCTGAACGCAACTATTCATTTACATTTTTTTACGCAGCCAAAATTTCTCACGAACCATTTCTATTAATCCCTACTGAAAGTCCCTTTATGTGATGGAAAAATGTTTTTAGACGACTTTTACTCAGGTGCACTCAAATTTCATGGAGAGTAAGAGATGGTTCGTGGAAATTTCTTAAAGTTCAATTTTGTGTTCATGTGTAATTAATAGGAAAACAATTATAGTTTCGCTTATAATATTTGTACAAATTTAATAAGATTTGGTTTTAATCTTAAATCTCTGCATAAAAAAATTATTCAAATCGGACTATTTGTTAAAAAAAATTAAAACCAAACCGAATAAATACTAAGCAAATTTGTTTGAGTGCAAGAGGGGGATTGCAGACTGCATGTTGCAGAGTCAGAGATTACACTCCACACAAAAGCGGCCCCTATGTTTCACTCTACATGACAAGTTAGTGAAATAACTTAAACAGCCGATAGGTGGAGTTTTTGTGTTCCAGAAATCTCACTCTCCCTTTAGCTGAGTATAAGCATCTGACAGTTGAGGACGTCGACTATAGAGTTTCTCTTTTTTAAATAGGAGCAATAGGAAATAGTTCGAACTGGCTTGTTCCGACTAATAGTATACACTTCCTGCGCATGAAATAAAACCAATGGAAGGGTTTATGTCGATAGCTTTATAACTTATTAATTAAAACAATTCTTTACGTCAATCTTTTCAGACTACGTAATATCGATTTTGAATGTTAAATCGGATGACTATTATAACCATAGCTGTCATAGGAACTGTGGGTATAATTATAAATAATATTCCGAATACACGGTTTTTATAGTATATCAATTTGTGCATAAAGTTTCCTAAAGAGTTCTTACCCCGTCTTTTTTGTCACGTTTAAATGCGCCGTGAAGGTATTCCAGTGACACATCGTCATTCTCATTAAGCCACTGCATCACAAAAGGCTCGAACCATGCTGGGTAATCGGGGACGGCACCTTTGTAGGGAGGCACCTCTTTAACGTAGTTACTATATAGCCATTTAACTCTAAAGTGAAGATTCATATAAGCCGACGACTTGCATAGACGGTGCTGCTCGTGCTCTTCAAGTGCGTACTTCATGTCGACAGCGAAAAGATGCCACATGGAGGATGCTGATAACTGCACGTTTGTGTTCAAGTAAATGTGTTATCCTTCGATGAAAAAAGGGTGAATGGTAAACCAACCTGGCCAATATTTAGTTCCTGGGGAAATTGGTTTAAAACGGCTCCATAACTGTTCTTATCTTCATCTATAACCGA'..b'CAAAAATAAATTTTTTTAACTAGCTCCAAAAAAAGAGGACTTTTTGGAAAGTTTCAGCCCGGTAACTTTAAAACTGAGAGACTAGTTAGCGGAAAGGTAAGGGTAAAGCGGAAGGGTAAACGGACATGGCTAGATCGACCCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAACATACATATCTGCAAGGGTATAATAATAAAATAGTGACAATTTTACCCGACCGTGACAAAGACCAGAAGTTTTAAACAGAATCATCTGACATACAAATAAAAATTCTGATTCTGATATATTTAAAGGTGCGCGCAGACTTAGGCGGTGCGGCGCAACGCGGTGTTTTTTAGCGGGATTTTCGGGATGTTTCGGCTGCTATCGAGAATCGCCAGAGCCGAAAGCAGACTGTGACCTGCGTTTGCTTGGATTTTTCGTCCGGACGACTTCACTTGAAAGTACCTTCCTCATGCCGCTTCGCGTCGCACCGCTTCAGTGATATTGTAGTAAAATAAAATGGTGTGTGATAGCTGACATTTTTTTTCATTTTTTACAACAGTTTGGTTATGAATGCTGAGCTGAATTTTGACCTTACCAGTTCTTCGTCGTTAAGCGTTGCACGTGGAACAGCAGATGTAAGTCCAGCATTTCGTTTTGTAGCAGCCATTGTCTGAAGAGATGTAAAAATAAATTAGCCATCTAAGAGTACATTTGATGTATTCGTAAAATATAAAAATATTTAAGTCCTGTTTTGAGAACTTGGGTTTTAAAACATACTAAGCAAAAGAAGCTACTGCATTGCAACTCTACTGCAGGTACTTAAGTAAATTAGAATATGCTTTAAAGCTTCAAGAATAATTAGAGGAAGCGTAACAGGCAGAATGAAAATAGAAATAAAAGTCGTTGGAAAAATGCAAATTTCAAATAACTACAATCAAGAGTGCACGTATCTTTATGTACGAGTACATAATGTTTATTTTCTTAACTAATGCTACAGATTTTTATATTTAGAATCTTATCCATCTGAATACCAAGATTTATTTATTTTGCTTTCTAATAGATATGCGTTGCAAGCGTGTACGATTGTTATCTACCAACCGTGGTCTGGTCATTTTCATGCAAACTTAACAGATTACATTGATCCATTTTCGCGGGCGCATATTGTACCTGTGCCTGGTAGCCATTGATCAGAAGAATCAAAAATGATGTGTTACTCAAAGCAACTATATGCTTATTAAGACGATTATTGAATGATATAATCTTTGAAATCATGAATATATTATATGTGCGACCACACTTCTATAACATTTTGATGGCTTTATAAACGTAGATATTGTTTTTTTTAAATATCCGTATATTAATATACGCTTAAACAGTATTGACTTGTTGAAATTAAACGCTTGTAGTGCCACTTTTACAATTGTTTATTATTACATTAATTCTAAGGGACATTTTATGAGAGTTTAAAGGGCATATGGCTCCGAATGAACAGGTTACTCGAATAAATAAAAAAACCTCACTTAGTTTGTCCTTAATATTTTAAAAACAACAAATAATCTGAGTTCAGCGACAAAATATTTCCTCGCTAGAAGTATAAAAATAAATAAATTATAAAACTAATAGTTAATAAAAGCTCTAATTAAAGATAATTATATTTAAAATTGTAATACTCTGATTAGGTAGCAAAATAAAGTTTGCTACAAAACGCTATAAACGCAAATATGCTCCTAGCGGTCCGAAGTCTACGAATTTACTGTAAATTTATTATATGAAATAACAAATTTTGACCAGAAGAATATAAATTATACGGTCCCTAAGTGAGAAAAAAGTAAGTGGATTGACATAATTCGAAATAAGTTTCCAGATTAATGAAATTAAATGCTTTGCATTTTTATAGCATGCTTTTTTTAAAATTGCTTTCGTATAGATTTGTAAGTAAAAGATTGCAAGACTTTTTTAATTCCGTAAAGTGTAACTTAGTTATTTATGAAAACTATCCTGCAAAGGACTATTACTGCTTATTTAATAATAATAAAGACCGGATTTAATTTCAACTAAAAACCTTTTTGAAATACGTATAGATACAGACACGCTTTGTTTGAGGGTTAGGAAAAGCAGTCAAAAAATTGTTAATCAAAAACCAAATTTGCTTTCCCAACGCATACAATTTTTAAGGATTAAAAGGGTGATATGACGCCCTATAATGAATTCATACAATTTTGTCCGCATGCAGACCTTTTTATATTATAAACAAAAAAGACTTTGATATTTTTTACCTACGCTTTATTGTACATATTCTAAAATGATTGAAAGTTGTAAAATTTTTTTAATTTTTTAACCTATTTAAAATATTATATTATATTATATATTGCCAATATTATTTTTTCATACTTCCTCGATAGGAATTATGGCTTACATTTGTGTTTTATGAAGACTACGGTGCAAAACTACATTTAAAACAAAAAACAACAATAAGTGTTGCACTTGGCATGTATCAGTGAGCTTAAAATTTAAATAGAAAGTGGTTTGTAGTTTTAAAACGGCTAATAAAAATGTAATAAAATTGTTTGACTTGAAAGTCCATAATCTATACCTTGAGAACCTGCCGTCCAACAAGTCATCGAGGAAAGAAACCAACATTCGTATAGGAGTATGTAAAAGTAAGTAAATGGTCATAGATAAAAGGGTTAATATCATGTCCTTTAGTTCAAAGGATCTATGAACTATCATAAATCAGTGACGGATCCACAGAGAAATTTGGAGGTTAGACCACCCTGTTATAGAAGATTTTTTACTTTAGCCTAAAATCCCCACAAAAAAAATGTTGGATCCACCACTGTCACAAATATTTTTATATATACGAGTATATACGAGATTGCATAAATATGAATATGTGACCTGCGTATACCTAGTCGGAAGGGAGCACATTATGGTTATTTACCACAGAGCGGACTAGAAAGCAAGTATATATGTTCTAACTATGCTAAAATGAAAACGCAAATACCAGGTTTTATTTTAATTCCCATTTCTTTTGCCACGAGTCTTTTTCATACAGTCATATTACATTTTAATAGCAGTATAAATAAGTATTAAGTATTAAGCTGTGTGAAAAAACCCAAAGCCTATTCACACCGCCACTTAAAGTGGGTGGTTTGGTTTTTTTAAATGGGTTCTTAAACTTTCGACTGGGTTAAAGGTCAACAGAAAATATTTTTAAAAGATTCAGGTTGATACAGACAAAATGAGAAAGAACGCTATAATCGAGTGTCTCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAAAGAGACCAAAAGGGAAATGGAGATATATAAGCAGAAAAGCGTTATTGCGCAGCGCCAATTACCAAATATTTCAATGTATGATAATGTGGGCGGCGGACAGATTTAAGCGTTGTGACCGTTAGTCGGCGTCAACGTGGACGTGGCAAGATCGATGGCTCAAACGATAGGTATCGATGATTCCAATATATTTCAGTTCTAGCATTAAAGCTTTAGGCGCTATAGTCTTTCGCGAATTGTGGGCCTTAAAGTGGGAAAACTTGCGCTGCGTAGAAAGCCCAGTAATCTGCATGCCCAGTCTGATTCATCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCAGCGTTTATACGGTTGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTTGGCTAGTGATCGTAATCAAGATTATATATATATTTTATGGGATCGGAAACGCTTTCTTCTTCCTGTTACATACCCATACATTATTTCTGACGAATATAGTATACCCTTTTACTCTACGAATAACGGGTATAATAAAGTAGTATAGGCTATTTTAAAGACAGTTGCAAATATTGCTTTCGTTCGTATAAACGCATTAACAAATTCCACCACCACTGCTGCTCAGTGCAGTGCTATAATAAAGAACTTACCAGCTCAGAAACAAGGGGAATTGATTTTCTGCGAGGCCGAATATCCGGCATGCTGTCAATATTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTGTAGAAAGGATTGTCACCAGGATGTCCATTGGTACGTAATCCAATATCTCCAGTACCACCGCCATTCTGAAATATCATTAAATATTAATAAAAAAGTGTTCATTTGGAATCCTTAAGTTAGGGTTTGTGCCAAATAAAAACAAGAAAAAACGCTAGCAACGGAGATGGAGATATTCAATCAGAAAAACTTCTGTCCCCAATAGAAAAGGGACATTTACGCCTGGCGAGAACCCACCAAAAAGTTTAGTACGTAAGAACTTATAACATAATATCGCTATAGTCAAAGTTTCTTGACTAATAGATATTCGTTATGCACTAAAGAGAGCGCAAAGCAAATTAAGAAATGACTGCTAGGCACCACCAAACCGCAAATTCAATAGGTAGAAACAGCTTTTAAATGATTTTCCGATTTGAACAATTTGTAATTAGGTATGTATTGATAAACAAATCAAACTTTGTATTGAATTACAGTTATAATTTTTTTTTATATAGAAACGTTAAACAAATTTTGTCGTTTGGCGCGTTTTATTTTTTTTGGGTCGATCCATAGGTATTAACGAAACCAATACATTTGGGTTTAAGATTTTGTAATCGCTAAACTATAATGTATCGTTTAACAGATACATTATAGTTTAGCGATCCTTTGTTTATCACTAAAAGCGAGGTGCCACTGTTTTGGACGGTTTGTGGGCGTGGCATATTCGCATAACAAAGTTGCTCTTTGTGGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCAACATTTTTTTAAGTCAATCTATAGATATTGACGAGAACAAAACATTTCAGTTTAAATTACTTTATTTTTTTAAAAATTGTACGAGCCACTGCGATGCTGATGAAGGATATGTATTCTTTCTTCCCTATGGCTAAAAGCCCCATTCGGACCTGTACTGCCAACGACTAGACCGCTGGAAGGCAGCACTCATACAGTCATCACCTCGGCTCTGATGGGAGGTTTTTTTGCATCCACCGTATAGTCCTGATCTCGCACGATCACAACTTGTGATTTTGTGGTCCAGTGAAAATTTGCTATCTGAGTTTTTGCCAATAGGAAAGCAAGCTTCTATAGAAGGGGCATTATGATGTTGGGAACGCGTCATCGAACAAAACGGGTACTATTTGACTTCAATCGCATTATTGTTACCTATTTTTTGAACAATTGAAAATTTAATGAAAATACTGCAAGGCTTTTTTGACAATCTAATATATAAGTCGGAACAATATATAGATAAGGCGGAAGACCAATTTAGATATAGACCAATATATATAAAAACTACGGCCGGTATACTGTTTTTATGGGGCAAATTAATTTTAAGGAACTTATCCAAATTTTTTTTAAGCAAGAGGGACGATTTTAGGTAGAAAAAGCCATGTTCTTTTTAAAATGCCAAATAAAAAAATGTCGTTTTCAAAACTGCGATTTGGGTAAACCGAAGCCCCAATGTTTGGAAATGTAAATGGAAAAAATAGGAATTTTTTTATTTTGGTGAACAGGATTTTTTGTCGATTTTTGGAGGTATCCTATTCGTTACCATTTGGTTTTAATAAAACATTTTTTATCTTATCAAATGTGACCGTTAATCTTATTTTCGGAAAACGATTCCGAAAAAATCCGACCCCAAAACAACAAAATTACTGAGAAGATTACACTAAGTATAAATTAAATATTTGTTTTGTCTGTCATAAACATAGCTTTAATTACCTTCTCCCTGTCCTTGGTCATTTCATCTTCTTTAATTTTATCTTGATTATTTTTCTCCTCGATCTTGCGCTCCTTTAAAGTTTTTAATAATTTCCACTTGCTACTGCCAAGACCCGCTTCACCATTGCTACCTATAACCTGGGATCCATCAAAATCTGATTCTTGACTAATTAACATTTTAGGGGTGTTAGGTGGAACTGGTTCGGTTTTAATATTCTCCATTGACTGCATATTACTCTGAGCCGGTTCTAGGGCCTCTTTTTTTAAATTGTTTCCAGATTGTGGATTCGATTTTTCATTTACATCCAATAGAAACTCTGGATTGTCAAGCAATGGGTTTCCATCATCTCTCAGATCATTTTCTGTCTCGCTTATCTCAACATCGCTTATCTCTGCCGGCGTATCAGGTCCAGATGTCTCACTAGAAGCCGTCGATTTGATTGGTCTATTTATTTCATCCTTTTCTCCATCGGATTTATTAATACAATGATCAATAGGTCTATTTTTACTCTTGTGTTCACATTCATTTTCAGAAAGGCATGACGAACTTGAACTGGCTGCATCGTCAGAAATATTAACATTTCGATCGCGTGTTTTCTTTAATCGTCGCAACTTTCGATGGTTTTTATTTTCGATCTCGGCATCGTCAGTCGAATCCATTTCTGAGGCTGTCTCTTGGAAATCGCCGTTTACGTCCTGCCAAGCACTATGCATGTCACATACTGCCGCAAATTTTTCACCTGCTGCCTTTGCAACAACCAACTCTTTAACAGCAGCGTCAGCAAATACGTCTGACTGTAATTTAACGACGCTTTTAAGCTCAATAAATACTTCAGACATCCGTAACTTCACACTTTCACTTGGAGAAAAATTAATAGTTTCTAGGTCATTTTCACAGACATCAGATCGACATCGGGCTCCTCCGTTAAAATCGTTTTGGACAAGTTGCCCTATCTGGGAAAATAGCACCTCGTTATCATCATGCGATTCGGCAGATGCAATTCCAGAAAGTTCCGCACAGCGCTGTTCCTGCTCCTCCAGCTGCCGAAGCTCATAATAAAAGTATTCGTCGTCTGTGTCTATGCTATCCTCAGTGCTTTGCCTGCGCGAAGAAGAGAGAGTGCGAGCAGAATGCTGGCTTCGATTATCGTCATCTTCCCGCGACCCATAGCCAGTATTGTTTGGAAGGTCTAAACACTGCTGCGTGACCCACAAAACACCATTGGAACTGAGATTACGAGGGACTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGGCGTTGTCAGGAATGTACTTAATGCTGTATCCCCGACATCTTCAGTTGTTTCCAGAATGCTTAGGGTGGGGACATTCGCATCCATGCTGACCGAGTTTCCAAGTACGTTCTCATCGCCAAAGTCGTCAGCATAAACTGAGTTCAGTTTTTGAAGGCACGCCTGTGATTTTGTCTCCAAGAGAATCTCTGGCATTTTAATGGTTACATTTTCCAGAGTGCTTATTTTATTACTATTTGTAATGGAACTGTTCTTAACGGGAATTGTCGCCGAGACAGCAATAGTTGTTGTGGGGCTTTGAACTTTTTTGAGGTCGCCTAGAACAGCAAACAAATTATGTGGCATACTGTCCTTTAACTCCTCCATTGAACCACCCAATTCCTTGTTATCCTCATAGGCACAGGTGGATTGGTCAAAATCTTCATCCACTTCATCCTCGAAATGATTTCTTAAAATTTTACTTCCGGTTATAGAGCTTTTATCGTTATCCGATGGAGTAAAGTCCGGCATATCTAATTCAGAGTCCGACAGGTTACAGCCGCGGCGCAGAAGAGAGTTGTGCCGTTTGTAAGTCTTCGCCCTTTTCACTAGGTTATTCATTTTCGACGAAAGTGACTTTTTGTCTGTATCAGTATCACTTGGAGTAGGTTCACCTGAATCGGAACCTAATAAAACAGGAGAGTCGGGATGGGACAGCCGCCGCACGAATGGGACTCCTGTCGCTCTTCGAATAAGACGCATTGGTAGCTTTTGTAATCTTTTGGATAATTGAACCTGGCTTCCGCTTACGTTGGACCGCTTGTGCGAAATTAACGGACACGACCCTGCCTGGCCACGAGGCTGTCTTTGATTGCCTTGACTTTGCACATCACCGGGTAAAGACTGCGATCGATTAAACTTCGATGTACGCTTAAGCTTTAGATTACCTATTAAAAGGGTATTTAGCTTATTCCACACCTTTAGTGGCTTAGCAGGCGAATGTCTTGTTACAAACTGTTGGT'..b'AACGCTTCCACTCGAGCTTTCATCTAAATAATTGCCGCTGTCTTCTTCACTGTGATAATTTTCGTACATAAAGTCGTCGTCCTGTCCTTCGTCAATGAAATCTAATGAGGATTGTGGTTGAGTGGTCGATAATACCCCTTTTGTCTGCTTTAGATATTTCTTGTTTTTCGGTTGATGTAGTTTTTCTTGCTCTCTCTGCTGCTCGAGGTACTTATATTCATCCTCCTCATTAAAGTAATCTTCGCGATAGTCATAACCATTATTGACGTGTTCATAATAACCATTCGCCTGATTCGACGGTGTCGTCTGCTGAAGACCCAAATAGTAATCATCCTGCTCACTATCAATGTGATAACTCGGTTTTTTGCCAATTAATGGACTGCCATCTAGCTCGTCTAATTCTGATTCATCGTCATATATTTCCGTTGGCATCTGTTTTATTAGTAACCCCGACTTACCATTGACTGTGGGCAGTTTTTTGCCGGTGGATCCTGCTGGCGGCACCGTCGGTAATATTTTTGTACCATTACCAATGACTTTAGATTGCCCGAAAATCGCCGTGTCGTCTTGAAACTGGCTTTGATTACCATTGGAATGGTAATTAACAAATGCCTTATTATCTGTATATGTTCCATATTCATGCATTTTGATATTACTATTCTCATAATCATCCCCAGTATTTTCGTAATGGCTTGACAGAGACTCTTCATTGCCCAGTTGATAACTGTAATCGACATTCATTACATTGAAACCAACTGAATCCCTATTCGAATCACGTTTTATCGCATTAGGCGATAAGTCGCGTATATTGTGGGCTGTGGGTACCACTGATTGTTTCTGTGACACGACTGATGCTACTGACGATGCACCTTGATTGACAGCGTGCGTTGCTGATTGAACAGCTGCTGCTGCTTTTCCTAAAATTGATCCGAACATGCCACCAGAAGTTGTACCTCCTTTCTTAGTCGTAGACTCCGGGAAATGAACTAGGCCACTTTTTATTTCTGCTTGCTCTATAACAAAACTCGTGTCAATTGGAATGTCATGCAGTTGACTACAAGCCTTTGTAGTATCGTCCTGTCCGACGCAAGATACGTGATAAGAATAAGGATTTTCTGTTAAGCCATACCCAGAATCACGTCCAACTATCTGTTCATCCACTAATTTATCAGTTAAAATCATCTCATTATAGCTTTCATCATAAGTGTCAGAAATATTTCCTTCTAATGCCGAATTGGAATCTATTAATCCTTCACTGTAAAAATGATTTACATCAGTAATGTTTGAAACTGTCGCAGCATATAAAGTGTCCTCTGCGTTTTTATAAAGACGTGGTGGAGAAGTCATAGTCACATTAGCAGTACTGCTTTCACTAGAAAAATTTTCTGCCGATGTGGTTATAAAGGTAGGAGTCGGGTCCATTTGTTGACCTTGTGTTTGTTTGGTAGAGTTGGAACTTGAACTCGAAAGCAACCCACCGACACTTGGTACAAGCTTAGAAGCCAAATTAAAGCTAAAACCTTTTTTGGTACTATTAGTCGTTTGTGAGACCTCAACTGTTGAACTGACACCACTGAATACGCCATCCAGTCCTCCTTTTAAGCCTTTCGAAATTCCACCGAGTACACTTGTTGCTGCAGACGCAACTACACTCGCCTTCTGTTGTGCCTGTGATGGCTTATAATAACCACCTTGTCCTGAGCTTAAATTCTGGTTTAAGTCTCTTGTGCCCACGGTCTTTTCATTAATAAATTCATCCGAGGGCTTATCATCGATGTCCGTACTATTTTCCACGCTTGAACTTGGGAAGTTGCGTGAACCATTTTCTGGTTCAATGTTTGCAACAGATGCCGTCAGTTCTTTTATGTCAACATTAAAACTATCGTAAAAATTATCATCGAATGCTACCGCATGGTTTTCTACCGCATCAGCCTCTGGCAATAAATTAAATCGATTCGGAGGGTCTACTGAACATTCTATGGTGTTAATTGGTACCTGGGGTACGATTGCAATGTTAAATAAATCGCCAATTTGACCCTTGATGGGAGATTCTTGATTCTCAATCGAAAGGCTGGGCACGTTATATGCATCAAAAAGTTCACCCAAATACGAAGGTAATGGGTCACTACATTTACTTGTAACATCCAACTCATTGGGAGGACAGGAAAATTCGGCATTAGTAGCAATATCATTGATAGGAACAGAATTAGAATCACTGTGAGTAACAGGTATATTTTCTGAAAGTTCCATGATTGGCTGAGGCAAATCTGGTAACTCAAATTGCTTCATGTAATCCGTGTAAGATAGAATAGGAACTAATGACGATGGTGACCTTAACGTTAAGTCCGATGACGGCGGTATAGCGTTTTCGCTTGTGGTAACTGGCACCTCTTCGGGATTATTTACGTAAACAGTTTTTGTGAACGCGTTGTTAGATGAACTGTAACTAACAGTTGTGTTTTTGTCGTGAGGAGAACTTGTTGTTGAAAATACGATATCTTCCGTTAAATTCTTGGAATTAAAATTCGAAGATATGAACAGAGGAGGGATGAAACTTGTTAATGGTGACATTACTGATTCAGCTTTAGTCGTGACTGTGTAGGATTGAGTTGAAATATTAGCACCTTGTCCAACTTCGAATGGTAGGTAATTGCCACCGCTAGTCGTCCACGTGTTGAAATATGGAAAAAGATGACTGTCACCTGAAGGCTCAGAATATTGCAATTTGATTAGCTCAGTACAGAGCTCCCCATTGTCGTCATAGGAATGAGTTGTGGTTGATGTACTGGCAGCATTGGTGATATGATTTTCTTTTTCTCCGGAAAAAGGAATTATGTCTAATGTATAAGGCTTTGGATATTCAGATATGTTAAATAAGGCTGATTCAGGCTCGCTACATGGCTCGGGTGATTTTTTACATTCTAAAATCGATTCGTTCAAATTTTCATGTAGGTCTGGCTTTATGTCTGATTTGGCTTTTTCGATGTCAGGTAAGTGACTTGTTGGTGAGTTCTTTTGGACAATTTGGGATGGAAGCTCCGCTGAAGGACTGAAATATTGTTTTAATTGTGTTGGAGGGGATGGGGTCCAAGGCGGCGTGAGACCGTCATCGATGGATTTGGTCAAGTATACTTCATTGGGTTTTTTACTAGGACATGTCTTTGTTTCAGTAGAAGACAGGTATGAGGTTGTTGCTACTGTTTCTGTGATTGCTAGTGGTGAAGATGCCGTATTTGATTTCAACGAATATGATGGTAATTCATCTGCGGCAGATAACGTAGTCAAATTCGAATTGTGGATTGAATATGGTTTTATCTGCGGTAATGATGTTGGCAGCTTTGGTAGCTGCTTAGGTCGATGACTTTTCTCTGCTGCAGTATCTGAAGAGTATACAGGGGAACTTAATGCATTGGCGGTTGAGGAATTTAAATGGAGCGATGAATTAAACTGTGGCGCTGGTAGAACCTTTGGCAATTTTCTAGTTTTTATTATTGTAGACAGAGCTACAGGCGGGGTGCCCGTAACGGCACCAGGACCACTTAAAGTGACTATTCCACCAGAGCATTCCGTCTCCAAAAATCGATCTGAAGCTTTTGTAGCGGCGTTGGTACTAATGTTGTTTCCTAGTATAGAGTCTGTTTGGAATTCAGTAGGTTTCTTAGAATGCTTTGAGTGAACTGCCACTCTAGTCTCACCAGATGCTATTACAGAAGCTGTAGTCATCGCCATCATCAATGAAAGCTTTCTCTGCTTTTGTAACTTGAGTTGTGAATTGGTAGTTGGCGGGGTGTCGCTATATGTTGAAAGATTGTCAGTATTGTAATAACTATCGTGGTAATCACTGTAATCCAAAGGTAACATGGAAGTGTATGGTCTTGACATTTTTTCCAAAACGTCATATGAAGTGGAACCAGAGTCCATAGTAACAGCTTGATCCATCCCAAAGTCGCATTTAGACTGTTCTTCCCTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/668/11a/1a/scaffold_48-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TGTGCCTCGTCTGCATTTAATCCAAATATATCTTGACCTAAATAAAAGCTTGACCGATTTGTTTGTGGTAAAGCACGCGATGGCGCCGCTGGCACTGCATTGTTTAAGAATGTCGATGGGTAGGCAAAACCAGCATATCCATTGAGATTATCGGCATAGATATTCTGGTAGTCACCAGGCAGAATACGAAGGTCATATTCGTCTGCCTTGGCCATGCAGACACCAAAGCGTTGGTCTTTTTCTATGCACATACCTTTCGTTTTGAAAATTATGTCCATTTGAGTTGCACTTGGTTTTGATGGGCCGCTCCCAGTTTTATTAACTGGCAGAGTAGGCAATACTTTCGCTGAGGTACATTTTTGATTTGCATATTCAAACCCATATTGAGCTCCGACACCCGAGTGATTTTCATTCCAATTGTCGATAGACTCCGATTCAACATCACGCTGTTCCTGCGCTTCATAACATTCTATGTAGTCGTATTCATAACTATTGTTTCTTTTATCTATTGTAGTCAGTACTCTATCACTGGTGAGGTGGCACTCACTACTATATTCCTCTAGTCCATGATTGCCTAAATCGTACGGCTCGGCATAATATTCTCTGCTGTTCTGTGCTCTGTAAGGAATATGACTATAAGGTGATCGACCGGTGTCAGAGGATAAGGCACCGTTTTGGGTATTATGAAAGTAATCATGCCTTGCATAGTGCTAAAAAGAGGAGTTATTAGTCTTTAACAAATCTGTGTTTGCCAAACACTTACCGTCATATTTCAAAAATTATTTCCTCGCACTGTTATCTGGAACCTATTTCTTCTACGTGATATTGATTAATACTCTTCCAGTGAATGTGATGCATTGTAGCGTCGGCCGGACATCAGAGAAGAGCAACCTTTAAATACATTTTTTTTAATTACCTCAATGTACACATGCCTTTACTGTTTACAAAGTTTTTAAGTTGGCGTGTTGCTTAGACATGTGGTTCTTTGAAGCACAGTATTGCCGGTGCATAGAAACAATTATTTTATTTCTTCTTTAGCCCCGACTTTTTTAAAATATATATATGTATATGATATATATAATAGGAGGCTGTCTACAGCTGATATACGTAAGTATGTGCATATATATAAGGAATAGTTTTCTAGATCTCTGCCGCCACAGTTACAGCATACAGCGGTCGGACGCGAACATAAAAAAATTGAAAACAAAATATCATTGTATTATGTTCCGGCCTCTGCTTCATATAGTTATGTAATATATACATTAATGTTACGGTTAATGTACGCGGTTATTATGAATATGCCCGAATTACCTTAAAACAAACGACAGAAAGACCTTGGAACACAATGAAAAGATACATGTAATTATGTACATACATGCATAATATTTTAATTTGCTATAGGAGATTATCATATTTTTAAAACCCCTTTTCAAATTGTTTAATTTTTCCTAAACTCAGATATCTCAGATTTCATATACGTTTGCATGTATGTACTTTTCTTAAGCTAAACTTTAAATGTATTAAAGCAAAAAAATTTGTGTATATGTTTACATATGTATTTACATACAAAAAGCGTTTTCTACATGTGCACTCAGCTAAACAACCATAAGTTTTAAGAAGTGTAAATCAACTGCATATTTTTAGGCTGCGCTATTTAGTGAAATACTAATGGCACTTGTTTCAAGTGGATAGATATCAATCTATTTTATTCCTTTTGCAACTTTTATAATATTTGTTTCCACTTGTTATTCACTTTTGGTTACAAGAAGTTCATTTCATATGACTGTAAATAAAACGTAATTGTAATATGCATACATATTTATATTACTTGAAAGTATTTTAAGCTCCTCATTGATATAATTCACAATAACTGAAAAATGGTTATTTCGTATTGTATAATTCCAATTCAATAAAAATCTCTGAACATGCGCAAAGCAAAATGTGGGTACTACCACATAGAAACCCTTTACTATGGTAAGCTGAGCAAGGACAGTATTTGAAGTTAATATACCTTTGTCACAGTACCAATACGATGTTTAATAATCCATTTTTTATACTCCAACAAACATATTATTCTAGGCGATTGATTTTGTTGGATGCCATTAGGATTGGCAAATCAGCTGTTTTCACATCATCGTTCTGTGAGTGCACCCATTTTCTTTTGAGCCGGTGGGATTTTATGCAACTAGCTGTTCATTTAAACGAAAAGGCGAATACGCGGCTCACGCATTTTGCCATGTCTGTGTTTTAGCGCGGTACTCAGATGAGTTAATTAAATACCAGATAAAATACCACATTTAGCAAGTAAAATTCGATGAGCGCCGTTAGCCGCGGCCTAAGGAATAAGAAATTTAATCTTTGGATGTGTTCATGCAGAAGCCGCGTGGAACCCGAACTCTGCGCGATCTCCGCCGTGCTCTCCATTCTTGGCCGCTAATGTGGAACTGAGAGCTCTCTGGCTAACGAACAGCTGGAGAAGCAATATCCCTTGCCATGATACAGGGCCCCTCCTGCAGTATCAGCGCTATTTACGAAAGTATATTTTTGCAAAGAAATATTTGAAAAATATGGCAATGGTAGCAATTTTCCGGACGTGTTTTGAAAAAAATTTGAATTGCGGTGCCCCTCATAAGTCGGTGCTGGATCATCAGAAAAAAACAAATCCAAGATTATTCTTAACGCTGTCGAGTCTTTAAAATTCAAATTCAAATAAAAATAAAATTGTGTGGGAAAAAATAGGCAAATATACAAATAAAAAAAACTCGACAGCGCGACCTTTGCAAATATGTACAGAAAGAGTGTTTAAAATTTTAAAGGATCGGTGCAGGTGCGTTCAAGTCTTAAGCCGTGCCCCATAGTTGCATAAAGAGTTCGAATAAGGGAGAGCCCGACCCAACAATGAAAACATGTTCAGGAGGGTTTTCGATTGGGAAATGCTTTTAATGGTTAGGAGAAAACGTAGCCAGGTCTTAAAAAAACACACAGTGGTTGGCCATTCCCGTAAATATATAGTCTCAAAGGTGATAATATTGCTTTCATCGGACACTGTTATTTGCCTCCGGGTGTTCTCAATATTTAATAATCGTTTATTGTTGTTCGACTTGAATTGTCGTTGGCCAACATTCAACAAAATTCCTTACAACGGAAAACTGTAACAGAAACCTTCTAAACTTATAAAAAGTATCACTAACTAATTTCCTATTCTTTCGACTCTTATCCTAAACTGAACAAATCGCTGATGATTGTTTCGTTAAGGCAGATAGACCCTCTGTTAGAATAGAATCCAATAAGAGGGTCTGCTTAGGACTTAGATATCATAGAATGATGCTCCCCTTGAGAGGTAAAAAAAGATTCATGAATACTTTTATAGTATTATAGCCATTTCGCTTCAGCGATAGAAATCCGCTTCAGCGGATGAGAAGTATGCGTGCTTAAGCGAAACAGGGGAGTATCTACAACGTTTAACGCGCCTCAAAACTGATACAAATTGAGGAGGGGAGGGAAGATTGCGTTACAAAGCTGCAACGTCGATTTTGTGATATAATCCAGATCTGTTTACCGGAGATACCAAACAGGGAACAGGTAATTATATTGTTGTTTATGTATTTATGTATTAAAGGTATTTTTGCAGCAAAAACGCTTTATCATTTTGATTGGCCTGGTAGCATCCAACTGTTAAAACGATTTCCTGTCAACGAGGAGGGACTGGAGGAGGGTTGTCATTTAGTCATAAGTCATTTATTTGCCAATTACATTATATATCTTTTTTCTTAATAGTTAATATGGAAACAACGAATATATTTTGTTAACACATTTTTTTCTTAAACATCAACACCTATGTTTCGCCCTCTCTAGAAAACAGAAGAAAGTACTGAGGTTGTACTTTCGCGATAAATTTCAAGCAACCGGTGCATGGGTGATCATAATTATGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTGCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCAGGCTGAATCTTTCCTAAAAATCTTATTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGCAAAAAAATATTTCTTTGATGTTTTTTAACATACAACCTCCTACGCTTGGAAATAACAATTTTTAATTATTTAAATCTAGTCAAGATAATTATAATTATTGCAAATCAAACTTTAAAAGAGAATATCCCTGAGCAGTGGCTTAAGTTTTTAAAATCCAAATGTTATTTTTAAATTTGGCCCCCAAATGATGTCGAATATAAAAAATTCTTTTCGGTTTATCTTATTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAATCTGTCCCTCCCATAACAGCCTTTCCCATTCCTATCATCAGTTCTTTTTCTGTTGCACTCTGGCACTTTATCTTTTGACGTTTGATTCCTCTCAACAAAAGTCGGCGCCATTACTCACAAATTTCACTTCTGTAGAAACCGATCCAATTAGTTTATCGATAGAAAAGATCCAAGAAGGATTCGCATATGCTAGCGGCTTGGAATAGTGCTTTTTAAATTCAGATCCGGTCATTGGACTACGACTTAAGCTTAGTTTAGAGAGCGTTTGAAAGAATATTTTTGTCTTATAAGGAGTGATATAAAGAAGCTTTAAAGGCCACCAAACAATCGAAAATTACTTATTTTTTTTTATAGAAAGCAACTAATAAAGAAAACATGTTGAATCAAACTGGCTTAAACTATGAATAAGCTTATGCATTTAAAATTTGATATGAATAGAAACATATGATCTCCTTACTTTTTCACACTTTAAAAATTCTATAAAGTTTAAGCTGTTAATTAATTATATGAAAATTTTTTTTCAATTTAATAGCAACTTTTAATTTTGAAAATATGAATGCTATGCATTTATTAATAACTTATGCATAATACATTTTGGTTAATTTTGAACAAATAAATAAAGCTTTAATAAAAGCAGACCAAATTTGAACAACAAAAATTTGTTT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCTTGTAAAACAGTTACACGAAAAAAAGACTAAGAAAAAAGATCGGTGCATAATTACCTATATGCATGTGTCTTAAGTTATATGTTGAGTGTTGTGGTTGTTGGTCTCGGAGAGGGTAAGAGCAAAAAAGAAGTTACAAGGGGTGAGTGACACAAAAGTTGTAAGATAGGGGTTGGTTATGAGCGCGGTATTCGTTGTGTTCTGAGCTTTGACATCGCGGCTAACAGGATTCGAAGAGAGGAAATATTATTTTGCCTACCAAAAAACCATTATCAGGAAGGTGTTCCGAATTGAAGTAAATGTCCCAAAGTCGCGACTTAGTACCAGGTGTTTATTCTTAAGTGCGTTGAACAGGCATATACCATTTCACACATTCGTAGCTATCAGTCCCATAATCACGCGTATGTATACCAAATGCACTTTTGGCCTCTTCTATATTTGCAGACAATTCACAAGCGGAAAAGCTACGAGTATTGGTACCACTTTTAAATTGACTTTGGCTTGAAAATGAGGCCTAACGGGGAAGTCTTGTACTCAAACGTTGAATAATGCAGTGACATGTCTACAGCACACATAAGCACGGAATTCAGTGGGCTTAAAAGAGTGAGTTCAACTTCTGCATCGAATTCCATATCATCCTTCAACTTTTCATCGGTTTCGGTGTCATCGAGCTCCTCCTCATTGTGTAAAAGTGGTATTGCACCTGTGTTCATTTCGCTCCAAAAAAAGGATAAGGGTACTATTATGATGTCAGCCCAGGTCACCCCGAAGATCTTGGCTAGCATTAACTCAAAGGAGTCAAATCTTAAAGCAAACACCGTACATCATCACGAAATGGCTAATCAAGCCAAAGTCAATGCGTCATCTCTACCACTGTCAGACGATCCGCGGACACTGCAATTGGCGTTGGAACTATCACTAGTAGGATTTAACGACAATCCAACTTGCTATGCGCAACCTGCTCCACCCCTATCAATGCCTTTAAGTGCACAGAGTGATTTTGAAATAGGTACCATCAATGGCATGCCCGCGTTTTCTAAAACAGACAGCACCCTGCCACTTCCACCGGCACCGAGCTCCCTCCTATTACCCTGTGCCGGCAACGTCAGCTTAGAAGATCGATCAAAGAAGTCGCAGAATATGACCGAGTGTGTTCCAGTCCCCAGTTCCGAACATGTTGCCGAAATAGTAGGCCGACAAGGTGAGTATTATCGACAACCCTGCATTAAAGTGTTATATTATTTTTTTTAAGGTTACAATGTCGGAACAAATTAGTATGAAAAACAGATAATGCTAATATTAAGCAAAATGATTTTTGAAAATTTCTTTTTGCAGTTACTATTAGTTTTGTTTGGAGAAACTTTTTGCATCGAAAAATTAATGTTTTCAAGGAAAAAAGTTTAAAAAAAAACGAATTTTTTACACAAATTTGGCGTAATATGTACTGAATATGTTAAGAAATGTATTGTATCCTTCAACAGGAAATAAATTACCGATTTATTCATGCCAAAATTTACTAGAAGTAAGTTTAAATTATGAGTTTGTTTAACTTTTGTTTTGTCAAAATACTCACATAAGCAGACCAGATTAAAGCTAGAAAAGTCGGACTTGACGCGCAGATTTCTGGGCTTCTTGCAGAGCAAGTTTGTTTCAACGGGGTGCCATGCCCACTTTAACGCCCAAAATCCACGAAAAGCTGTAGCGCCTTTAGTTTTATTGCTAGAAAATGATATGTATTTGTCTCACAAACACCTATTGATTAACCTAACAATTTGCCACGCAAACACAAACCGCCCAAAACTGTGCCAACCAACGTTTTCATGCTAGAAAAAGCAACATTTACTGAAATGAATTTGTCTCATCAGTACCAAGGAGTGTAAATGAAGACCATTTTAGCTCTAGCCATGTTCTGCCCACCGCCCACATTTTTAAGCTAGAAGGTTGAAATTTGACATTTAGAGTACCAAGTTTCCGCCCACTCTTACAATAACATTTTCGTACTTTTTTTTTATTAGTTCATATTTATCGATTAAATATTAAATTATAAGGCTTCTTATCGTTTTCTAAAAACCGGTAACCCCTAAGATATTAAAACATCTAAACTATATATCCTATACCCGTTTCTTGTAGAATAAATGGGTATACTAGATTAGTTAAAAACTCCAAAAAGTGTACATATTATGATCAGGATAACTAGCCAAGTGGATCTAGCCACATCCATCTGTCTGACCGTCTTTGTGAATAATAAATATAATATTAAAATTATAATACACAAATTATATTTAGATAAATTTGGGTTTGGTATGTTCCTGAGCTTCCTGCGCAGCCCAAGTTTTTTTCAGCAGTGTGCCGCAATTTTTATTCCAGAAAAATTGTTGAACTTAAATGTGTTGGTCTCGTAGACACCTATCCTTTGACCCAAAAATTTAAATGTGTTGCCCCCATCAATAACGCCCAAAAATGAGGCGCCCACAGTTTTCATGCTAGAAAAAACGTATCACTTTACTTGGCCACGTCAAATAGTAAAAAAAACGTCCAATCAATTTTTTTTACTTTTAGGTTGCAAAATAAAGGCTTTGAGAGCCAAAACCAACACTTACATTAAAACGCCCGTTCGAGGAGAGGAGCCGGTGTTTGTAGTAACTGGTCGAAAGGAAGATGTGAACAAGGCTAAACGAGAAATTCTTTCTGCTGCTGACCACTTCAGCTTAATACGAGCATCACGTAAGCCCTTGAGCGACGGTCATAGTGGCAGTTTCGCAGGAAGTACGAGTGGATCTGGAGGTAGTGCAATGCCGCGCATGCAGTCTGGACCTCCATGTATGCCAGGACAGATAACCATACAGGTACGTGTACCTTATCGGGTGGTTGGACTTGTTGTTGGGCCTAAAGGTGCTACAATTAAACACATTCAACAAGAGACTCAAACTTACATTGTAACACCGTCGCGCGAAAAGGAACCAATTTTTGAAGTGACTGGCTTGCCAGACAATGTAGATACTGCACGAAAGCAAATAGAAGCTCATATTGCCCTTCGAACTGGAACAGGATCTGGAAGTGTCGATGGTAATACTGTGCAAGGTGGTGAACCGGTTGAGGGAAATGAATTTGCGACCCTGCCGACAATAAATTCATTAACCCAAATATTAAATGATAATTTGAATTCAGATATTTTGTCGTCTATATACAAAAATGCAATTCCATCTGCACAGGATTATGCAAAAAATATAATAAAAATTGCTGAGAACGGTAGCCATTCCGTAAAGACAATGCAAGGCCATCATACTGGCAATTGCTTTAAAAAAACTGAGTTTTCTGATATGGAAATAGCAGCAACTATAAAAGCAACTCAAATATCAGACAAACATTTTCCGGAAAATGAAGTTTCCATGCCATCATCGAAGGCTAATGTTGTATTCCGTAATACGCCTAGCAAAACATTATCCTACTGTCCTCCCACACCTACATCAGCATCGATTCATTCCAACTCTAATGCTAATATTTTAACAAGATCTTGTTCATCTGCTTCTTCAACAACTTCAACAAAGAGTACCAACAATAGCGCCAACACACCTCCAGAAATATTAAGTATATGGAAAAATATAAGTGATTCAATTGACGTCGACGAGGGTATAGGGGAGTCGCCTAGTATTTGGAACCAACAGGGTAACATTATACCCACAGCACACTGCTCACCTACAGTCTCAATTAGTCCTACGGATTCGCTCTTAGGTTTTGGTGAGCATTCTGTAAATCAAAAAAATCTGCATCAGACTAAGGAGCCGACTACATGTAGCAACAAGCAAAAGACGCAAGCTATTCAATTGCAACCTATCCCGGATAAATTTATGATTCACCGCGAATGTTTTGTTTGTAACGAAAATGATGTTACAACTGCTTTGGTTCCATGCGGCCACAATATGTTTTGCATGGAATGTGCGAATCAAATATGCATTTCTATGGAAGCAGTTTGTCCGGTTT'..b'CATCTAAGGAATCAGTTAAGATGTCGCCACCATAAGTGTCATTTGATTTAACATTTTCTGGGACTGTTGATTTTTGCAATAAATGAGATTCATCTGTACTTTCCATGCGACTCCAAGCAGTGTTTTTCGAGGAGGCATTATAACCTTTATAAAAATTGTCTATTATGTTTTGTGGTACTGATATTGGTTTTGTAATATTGGGAAGTTTTTTTAAATTTAAGCGCATAAGTATATGCATTTTAATTGACTCTAAACTGTCCACCTTGGCCTTCTCCCGTAATTGTCGGTGTAGCATGCTTTCTATATTGAGTAGGGTATTGCGGTACACGGACACGCTTTGAACTTTTGCGAAATCTCCTGAAACTGATTCCTTTGGCAAAGAGGAACTTCTTTTGCCCTGCTTACTTTGTACTTTCATTTGGAATAAATCCATACTTTCTTTAACTTTATCTTCTGCAGATATCGGTGAAGATCCGTTTTTTTCAGACAGCAATACGATTTCTGGACTAACGCTGCCGTTGAAAGAGTTACTGAAGCTTTCTTTTTCAGTCTGAGCATAAGCACTGCATGCAGCCGCTAGGATTACAAGTACGGCGACAGCAAGGCATCGGTTTACAAGGAAATTACATTTCGAACGTCCAATTACAATCATTCGTCCGCTTATTTTTCTTTTGCAGTCACATAACAATCTGCAAGGAACTGCACACCTGATTTCGTTGGGGTGTAGTCTAATGTGAAAAGCTGTGATGAGTTGGTTTTCTTGAACTTTTTCATTGAATGCGTTATTATCTTTTGATATGGATGGATGATATAGATCGTAAGTCTTATATTTTTTCCAACCGCGGCATGATTTGGACAGCATGATTTTTGATCAAACCCTTGTGGTGTGCTGAAAAAGCTTTTATTTATAAATACATTGTTAAACAAGAAAGACCGCTATAGTCGAGTGCCTCAACTATCAGAAACGTGTTACTCAGCTTAAGGGATCAAAAAGGAAATGCAGATATATAAGCAGCAAATATAAGCAGCGTTATTGTTAAGCGCCACAGAGCTTTTAAACCGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGAAAATTTTTTTTAGGTCAATCGATAGGGATGGTTTTTTTCCTATCTTTCTATTTTGTTTCTATCATTAAAACTTTAGGCGCTTCAGATATTCGCGGATTGTAGCCGTGGCAGTTGAAATAAACTTGTGCTGCGCAGAAAGCCCAGGGGAATCTGCATGCCAAGTCTGAATATTCTAGCTCTTATAGTTTCCGAGCTCTTAGCGTTCATACAGACGGACGGGCAGACGGACATGGACATCTGACGAATCTAATATACCTTATTACTCTACGGATTTTTTGTTAAATTTTTATATTATAATGGCTTTTTAGAGCGGGTGTAAAAAATCGGGATAACCGATGCGCAGGATAGAGGGTTCCGATTTAGAATTCGTAACGCGGACATGTCACGACCACAAACCGCCAAAATCTGTGGCTTCTACATTTAGGTCCTAATAAAAAAGTAACTGGAATATATTGTTCTTCTCAATACGAATCAATTAAAGCAAAGAAAAAATCTCCCTTTTGCTCTTTTTATCTGAGTAACGTGTATAAAACTTTTTTGGCTTTTGACTTTAACTAGATGCGTATTTATGTGAGACAAAAATATATATTGTCTTACTGAACTCAAACAGCGTAAAGTTTTTGTCGTTCAATAACTTTCAAACTGTTATTTTTTGACAAAAAGTTATATATTTAGAGTGGGAAATCGTTTGAACAAACTTTAAGAAAATGGATTAAAAAAAACATTTAGCTATAACATTAAATCTTTCGTATCAAAACAATTTAAGCGGCGATATTTGAATATTAAACGACCTATTTAGCGTCACATCACGAAACTGAAGCATTAGTCGTTTGGGAACCATACCCCTTGATTTTTATACCCTCGGACTGCTATATCATATAGCTGCCATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTCACATATAACCTGCTAAGCTTAGAAACAAGCTTTTTTAATTACTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGATTATATCATATAACTGCTATAGAAACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAATATACAAAAATGTTATTTTTTATGTTTTTTAACATATATAGGTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAATTCAGAATCTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACTACTATATCATACAGCTGCTATAGAAACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTCAACATATAAATTTATAAGCTTGAAAATACCATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGGCATAGGAACATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAATCAAATGATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATACTATTGGGAATATAAATGTATATATTTTTTAGAATTTCGAAATTTATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCAAAGTTAACTTCGTTTCTTGTTTTTTTAAATTTTCCTTTAAACAAGCAAATATTACAAACAAATTTTTAAATTACAACTCCGGTGTTTTTTGACATGTTTACTTCCTAAGAGTATCATTTTTTATCATGAGAAGCTCGCTGTCTTGCTTTTTATCATTCCAAAAGCAACCACAGGCTACAGTTGTCTGACCCAGTTCCTTCCGAACTAAATATTACCTGCAATAAAAATAAGACTTTTGGGAAAGACTATAATGAATTACCTAAATTCTTTATCAAACTCACAATCTGCGTCGAATAATGATTCTAAAGGCTTAATTCAGCTGTCTCCCACTACCTTTTTTGGCCAAGTACCCGGTAGTCAAAGCGCTTCCTTCTTTTTGAGACATTAACGGGCTAGCTTGCATATCTCCATCACTCAAGATGTATATATACCCGTTTCTTGTAGAGAAAGGGGTATACTATATTTGTAGGAAAGTATATGAGAGGTAGATGGAGGTTTTTCCGACCCTATAAAGTTTCCTCAGCTCCTTGAGTAAAGTGAGTTTATTTCAGCAGGGTGCCACGCCAACTCTATTCCTACAAAACGACCATAATGCTCAAAGCTATCTGGCGCCCACATATATTATTAACATTAATATTAATATGGAAAAGTGATTTTAAACAATTTTGTGTTTCTTTATGTTTTTATTTTAAGAGCTGCGCCTAATCAAATTATATACAACATATTTTAGTTTACAATTATAATGTCACCATTGTCCAACATTGGTCCAATAATTGAATCACCAAATGTTTTATAAATGTTTCTGTTGAAAATATTTTTACTTCCTTCTCGTCATCTAGAGATCCAACTCTACCAGGAACTACGATCATCCTTCTTCTGGCATTTTGGCTGTAAACAATTGTAGTCGATGACATCGCGGACGGACACGCTTAGCAGCTGATTTTTTGTACAAGTTTTACATTTATAGGTGGAGCCAGTTTTAAAATTCCAAAGCTTTACCTGAATAATGTGTATTTGTTATTTGAGACATTGTATTTATTTTTCATGACTCTCTTGTTGTGATTTAATTCTTAAACAATAACTTTAGTTTGTCATGAAATTATAGTCGTTCGAACTCATATTGAACAAGAAAGGAAGTTTACTTCGGCAAACAGAAGTTTGTATATTCTTGCAGTTATAAGAATTATTCATTGCAAGTAACACCATGTTCAATTTTTTAGGAGTGATGCCGGCTTCAGTGATTAAAAAATAATTATTACTTTATCATTATTTCTCTCACCGTTTCTTTGACAGCTATAAGTAAGAGTCATCCGATTTTTATTAAATTTAATTCAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCTTAAAAATACAAAAAATGATATTCCCAATAGTTTAAGACAAAATATTAAACACCAAAGATATAATTTTTTTAAAATTTTTTCTGAGCTAAAATATACAGTTTTCCGATCCGGCTGATTACGATAACTTTAAAACTGAGATATTATATATATACTTTAGGGGGGCGGAAACGTCTCCTTAATTGCGTTGCCAACTTTTGACTGAAATCATTATACTCTCTGCAAGGGTAACGTTTTTGTGTTCTATACATTTTTCATGAGTAAGATGCACTGAATAAATGTATTGGTGTTCCTAGATTTTGGGAGTACGAGGCTATTAAATTTAAGCTCAATATACACATATACTTTGCCCTTAAACTGAAGAAACTGACAACGAAGCAGTTAATATCCAAGTATCACCCGAGTTTAGTTTAAATTACTGGTGCTGGTCGTCAGTAAGTATTCATGTCATTATTTGTAAATATGTTAACACATGTTAATATGTACATGAATTCCCAGTATTTTGGACGTAATTCCTATGCTTTCAAAATATCAAACGCAACAATACTTACGTCAATTCAACTATGAATGTATATACCTTAAATCTTTTACCCTTACTAGCTTATATTAAAACGATATCAAACTTCGAAAATCTTTCTATGAATGTGGCAAAAGAAGTAGCAGAAACCTTTAGCACCGACAGACTTAAAAAATATGAAGCTAAAACTCATACTATAGGCATTGTTTGGGATCATCTTGTCTTGGGAGCAAAATGCGTCAATGGGAAAACGACCACCCTAATGTGCACACAAACATACAAGTAAGTTCATGCATGTGTATGTATACACATATGCAAAGATCGTTCATAAACGTTTCCCATGAGTCCTCCTGATGACCACTCTATTGTATTCAATTAAAACCATTTATAAACATAATAAATTGTTGTGCTCTTGAACTTCAGTTCATCGTTGAAAGTGCAGTATTCCCCTTTTCAAACAGAGCAACGCCAGTCAGGTACCATAAATGTACCATCATAAATATACACATGCGTGCAAATAAACACATATGCATGTATGGAAGTGTTTGTATAAAAATATTCGTGTATGTACTTAAATATTTTAGCGATAACAAACATTTATAGGAACACGTACCAATTGTACATAAGTACATATATAATCATCTATTGGTATTTATTTATATTCTTACACATGTACAACCGAATTCTATTTTGAACACTAAGCAATTGTGTGTATGAACATGTACTTATTAAATGTTTTATATTGAACTAACAGTTGAGCTATGGTTTGGAACATATTTCACTTGCTTCGCGTTATTATTATTACGAGAATACACTGCCGAAAAGCACATAGTTAATTTTAGTTTGCAAGAATAGCCAAATACGAAGAATTAATTGAGTTTATTCCATAGAAAAGCAAAATATGGAAACCGGAGATTCTGTTCTGCTGGCTGTGCGGTTGAATGACGAGGTGGAACTGACCAGCTGATCAGTCGTGATACTGTTCCACAGCATTTTACTACACAGAATATTGGAGATTTTAAATCAGCTTAGCTATGGACGTGCAAATAGGGACCTGAGACATCCTTTCTTAGTTTGGTGCGGTATTGTAACCAAATATATACTCCCTATTTTGATCTTACGTCAAAACATTTGGTTCCTTTTGAGGACTGGTGCCACGCTGATGTTAACTTTTAAATTTTTCCGGAACCCGCCAGATAGCATCGGAAATATCGATAACTCACCGTTGCATTTTAATCAGGTTCCGTATTTTTAGTATTTTATCGGTGAGGCAGGGCTTTTTCTCAGATAAACTAATTAAATACCAGAAAAAGTACCAGCACCCTGAGTAATTTTGAATAATTGCTTGTCAGAAGCCGCGCAAAGGAAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACTCTTGAAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTCTCCAAAATTTCTGATCAAAGAGAAGATTCAAGAATGTGTGAAAGGATTTCAGAAATTAAAAATACCACCATGTTTTCGAGCAATTGCCAAACACTATTCCATGTTTTCCTCAAACAAAATATAAATTGTTGGTTAATAATGATGAAATTAAGTAATAATTTTAACATCCGTTATGCGTTGGAAGGTGCCTACAACAAGGTAAACGTTTTCTTGATCGGATCCATTGTCCGTATGAATTAGGATATCGCAATGAAATAAAATCTAATAAATGTGGTATTAGGCATACAGAGACTAATCATTTTTACACAGCGCAAGGTGGTTTCATCTGAATTTTAGCTTTTGTAAACATTTAAATGGGAGTTTGTTTTGAACAAACTACATATCTATTGACATGGCAAAAATTTTTAAAATCATCCAATCAAAGTTGGGTAAACTTCCGAATAGTCCCGAATCCATGTGTTTTTGGGGCATCTTTGAACAACAAGCTTTGATCAACCTGGTTAAGGAATGATAGCAAGGTATTATTTTATCAAAAACGGGCCCAAAAATACTATTACCAGTCCAATTATACCTTGAGAATCCTGTGTTAATAATATCTGCGTATAAATTTACGGATACACTGGCTTGAGTACAAACGAAATATTGAAAACATCGAATAAAATGGAAATTGCACTTCTAAACCAATAGAAGCGAATGCAGTAATTGCTTGCTACTGTTGTTACAGCATTATTTATCATGGACGAAGGCAATAAAAAACGACCTAGATCTTGTTGGGTTCATCCGTATTTGGCCAAACGTCTCAAGAAAGGACGAATTTCAACAGATGTAATAAATGCAAAAATGAAAAATGGTCTACATTATAAATATATTGTTTCGGTATTCTCGTGACCGGTGTTGGCTTTTGTTTCTAATATTGAATAGATTGGGGGTAACAAAAATCTGATAATATTAAATCATTGTTATTATTATTATTAATATCCCAAAGCAGATTTGCTGTACGCATATCTCTTGCACTCCGCTTAGCTTAGTAAAGAGAAACTAATAGTCGAGGCCATCGTTTGTTTGCTCTTGCTCCAATTGATAAATTTTCAGATTGTCAACATTGGCTTGGCTTATTAACGTGCTACACGCATTGTGGGTGAACTCTGAAAATTGTAAAGAATACGGTTTGGTGAAACTGTTATATGATCAGAGGCAATATCGATGTTTTTTGCAATATCACTGTCGACGGCAGTCCACGTAGTGACATATACTATGTATATATACACGAAGAAATGAAAATTTACGGTAATTGTCCGATTGTTTCGAGTGAAACATTAATCGAAAGATATTGCGAAAACTAAAAGAATTGCATAATTTGGAAGAAAGAGCGTGACAATGAGAGTAAAAATTTAGAACTCCCAATTCGTTGGGGCTGGTGGGGATAAGTACTTCCCGGTTTTTATCTAGTTGTATTCTCACTTAAAATACACGTCGAATGACATCAACTGTCAAAATCGGATGCTCCGTTCAAAAGTAATACGCAAAACAAGATTTTAAGGGTCCTCTCAAGTTGGAAATATTATTTTGTTTCTCAGTTTGTCCCAAAACGTTATTTTACTGTCTTGAAAATTCTAGACGATGTTAAACAGCTCAATATAAGAAGCATTTGTTCTACCACTTTTGGAAAAACTAGGGAGTTTGGCGAGAAAACAGCTACATTTTGTTTACATGTAACTTGTTAAGTACTGAAGCTACCGGCTTGTGCCATACGTGCCATAGGTATTTCAAAATACTATTTACGCCTTTTAAAACGATTTGTCACAAAAACACCGTTAAAAAATAATGGTCCAATTATTATTTTTATTGATTTTTTTTTAGCCTTTTCTCAGATTTTCCAAAAACGGCTTTAACGATTTCAAATAAAATGTTAAGGTGTTTAGCCCTTGAGATTCCTCAGCTATTGTTATACGACACATTCTTGTAAAATAGTTGTTTCAAAGTTCAGTTCAGAGCATCTTACACTGCCTGATTATTCAGCTCCATTTAACTTT'..b'CCGGAATCCGTTCGTGTAAATATAGTTATATTGTGAGTGTAATAAAGTGGAGTACAAAAAATGAACAAGTGAACTAAAACAAAAGCAGCTGCTCAGTTTAATTTGAGTTCTCGAGTTCGCCACTCTCGTGTCCCCATTGCGCCACCAACAATAGGTTTTTGATCACCACAGGACGCGAATTGCACCGTCGCCATCTGGACGAATTCACTTTTCAACCTTGATTCGCCCTGCAAGGACCTGCGCAGCGTGCATCCGGCGGAAAACAATACATTACCGGATTAAGCTTGGATGGGCCAGGCAAAAGTCGATCACGAATAGCAGTGCATCGCTCAAAAAGTTGAGAATACAAGGAGGTTCGAGGAGACCTCGTCGTATAATGTTTACATTGCAACCAACTCCGACGGCTATAGGCACCGTAGTTCCTCCCTGGTCCGCGGGAACATTGATAGAGCGTCTTCCGTCCTTGGAAGACATGGCTCACAAGGGTAAGCGCACTCCCGCTCGATATAAACGTAGTATATTTCTCAAGTGTGTCAACAAGCCTCAGTTCTATATTGGAAATCACAAGGGGGTCTCAATATTTATTTGAATTTGCCCTTGAGTTTCATCCACACAGGATGGCCGTAGATATCTGGCGTAGAACTGCAAAAGATTGGATAGCCAAAGCTACATTAAGGGATTGTAAAATCATAAATCGTTCCGATTGCCAAACAACAATCTTCCTAATGCTTAATTGCTTTATAGCGGAGTCAATCTAGCCGAGTCCGTCTTTCCAGTTGTTCTATAAAAGCTAGATATTGCAAGTGGATTATTTTTGCAAAATTTTTTATAATGTCTATAATTCACTATTCGTCAAAAAGTTATAAGTGCGCTGCATATCTCAGTGTAACCGCTGGCACTTGCCGAGTTTTTGAGTATATATGTACAAATCGGGGCTCAAATTGTATTTTGTCATCCCGAACGGAGTTTTTGATAAATTGACCACTTTTCAGGCAAACAAAAAATAACACTTTAGTCGAAGCAAAGACTATAGAATTCCAAAGCTTATATTATCTTTGGTCGAAGACACCTCGGTTGTGAGCAGATCGCAACATTGATCGACAGAACGTGATCGCGTTTACTCTTACGAAATCTGCAAAAATGTAGGCGCTAGCAGGCCCTAGAGCTATGGGCGTTTGTGGATGTTGGATTGGGCGTGGCACTTCAAAGAACAATTTGGATGCTTTACTCAGTCGGAAACGCTGTTTTTTTGATATTTAATTTGATACCCGTTAGGTATATCTATTCTTAATCGTCATTACTAGCCGCGTCGATCAAGCCAAGAAACTGTTAGAGCTAGAGGGCTCAGATTCCTTCGTTTGTCACGCCAAAAAGCCACGCCTACTTTAACGCCCAAAAACCGACCAAACTCTGGTTCCTACAGTTTTCATGCAAGAAGGTAAAAAAATATTTCTTAAATAAATTTGACTCGACAATGCCTATCGATTTAGATAACTTACCCCCACTCTTAACTCTGTCTGCTTTTCACGAAACCGAATATTGAAAACGCGGATAGGGGGTCCTACAATCTCTCTTTGCCGCTCGTTCACACCCCCTTTACTCCCTTAGCACAGGCAGAAGGAAGCTTTTCCGACCCCATAAAGTGTATGCTTGATCAGGATCACTACCCAATCGATCTAGCCATTTCTGTCTGTCCGCATGAACGCTCAAATCTCGGAAAGTGTAAGAGCTAGACTATTGGAAATTCACATGCAGATTCTTGGGCTGGAAACCTAACGCCCACAATTTCTACATTTTTAACTACACCCAAAAAAATTGTTATTAGGAGGGCATTATTTAGGTGTCAATGTGATACTATTGAGTGTTAAGAATGTTTGCTACGAAAGACTAATAATGGATAATGTTAACACTAGGAAAAAGTTTTTAAGGAAAAGTTTCCGTTACAATTCTTATTCTTAAATACTTAAGGCGTTTTCTGCTTCGGTGCGTACTTGAACCTGGGACCTTTCGGATCAGAGATTGGCGCCTTACCAGCTGGTCTTTCGCACAACATTTTTCGCGGGCGTTAAGTACTAATGCCATACAAACCGATACTTGAGCAATGTTCGAGAGTCGCACAATCCAAAAAAGATTGTTTTGGTCTCGAAGTATCCATGGCATGGTCAAGATGACAATATTTAGGGTCAAATATAGTTTTCCATACAATGTAGTGTACATTTGACACTTGTTTAGGATCAAAATGATCCAAAAAAATTTATCCTAGGTGTATTGTCATCTTCACCTACACCTAACAAATTATTAAAGATTTTTTGTGGGTGTAGTCTAAGCATCTATTAAAGGGTATGCTGTATTCCTCGAAAAGTATGTTCCAGGGAGACGACAGTATTTCCAACTTGTAAAGCATATATATATTCCTTCAAGCGATAAACGGCTATAACAAGTTAAAATAATAATTTGGTCAGTTATCTGCCTAAAGGGCTCCCTTACTCCCTTACAATTTAAAGCTAAACACTTTAAACATTTAGACTTAGTATTAATATTTTGGTCGTACTTATAGATAAATATCGCTATCTTTTCTTATAGACAATGTGATTGCTCTGAGAAATTTACCATGTTTGGGTGCCGCTGGTGGAAGCGGACTAGGCGGTATTGCCGGAAAGCCTTCCCCTACAATGGAAGCTGTGGAAGCCAGCACAGCGTCACAGCCCCATTCGACATCGTCCTACTTCGCAACAACTTACTACCATTTAACTGATGATGAATGTACGTTTTTATGTGTAATACCTTTTCCCCTTCCACTTGTCTATATCCTCTATATTACCGGTCTTCCTGTTACAGGGTATTTGTTCCCCTAATATTTAAAATAACACTAAAGCAACTTGCGCATAGACAAGTCGAAAAGTCTGTTTAATTACAACACGAACCCTAGCGTCTATTCCTTTATTATGCTGATCGGCGTTGATAACACTGGTTCACAAAAATGTAGAGCTCAGCTTTAAAATCGCATCTTCTAGATTAATTCATCGTCACATAAAAAATATCAAAGAATGGTGCCCGGGGCTTTCACGAAAAACATATTTTTTTTGTTATACTAAAAAGTTTATAGTATATTGTAGGTCAATATTGATGCAAGGACTAGAAAAAGTAACAATCATTTAATTGGTTTGTCAAACTTAAAGTGCCATATCTTTCCATTTTTAAAGCAGGTTAACCGAAATGCAAATGTGATGCATACTGTTTGAAAGCACATAATGACTTCGATATATTTAATGAATGTTCTTCCGCTGAATATGCAGAGAGCAGATACGAAAATTGATTTAAAGAGTGCTTTCACAACTAAGCATTTAACAACAATATGAAAATATGAAAAATTTAAGCATGTAACAACTTAAACAATATGAAAAATTTGGCGGCAGCTCATGGTAATACTTATTTCGAGTGCTTTTGATTTAATACCGATTTTGCAAAGTGGGTCCTAACATTTGAAGGGCTGACCAATGTTTTGAATCACTGGTGAATAATAATTTATGGAATATTTGGAAGTATGAAAGTAATACTAAAAAGAAAACTCCCTATTATGAAGAAAGTATAACCAATTTTGAACTGGGTAGCTTTAATGTTAAAAACTCCAATCTAAAAAAGTTATTTGTACATTCACATATTGCCCCTTGGCAAATGGTTTGTAATTTTATTTATTTATTTATATCCGAAAACATTTTCAAAATCTTTCTTTAAAAAAGTTATTGAGTTTACCAGCGCGTACAGGTATGCAAAATTAGTAGACAAATACCAGAATTTAACGGCGAACTTTGTTGGCTGTTAGCTTCTGTAGTCAGAATAAATCTTTCATTTACAAATTTTCAAAAAATAGGCAAGGAAGAACTCCTTGTTAGAGTACGACAAACGGCTAAAACGCTAAAATCTGTTAAATACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTCTAGCATAAAAGATTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGCGCTACAGTCTTTTGCGAACTATTTAATATTTCTTGGCTCAAACGATATGTACCAGCCAAACAAATACATTTCAGTTAACAAATTTTTAGCGTTACAACTAAAAAAGGTTAAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTGCATACTTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTAAGTAGCACGTCCAAAAATCCCGTTGCCTTAGGCACCAATCTATCCCAAATGGGCTTTAGAACCGAGCTATGCTTCTGTGATCCAAGCGTTCAAGTATGGCCAACCGAGGGCCTTCTGGCAAATTTACACGTTACGAACCTTACCGGGCCACGTTTTCACACCCAAAACTGCACTCTACCGTGTGGGGCCCTCAATAGAACATTCTAATTAATAACAAAACAGATCGATTAAGCGTTCTGCAAAATCTCCGGCCGGTGCGAATTCTAAATCACTCTTGTAATTTTCATTGTGGTGGTAGCCATGTACCGAAGGGATCGCCTGCTTAACTCAACAAAATAAAGATGTCTCGCTGAATTTGTTCCACCACTGAATAAGTGTCATGAAGATTTGTTATTGGTGTGAAAACAGCTCAATGTCTGGTAGCCCATGCACACAGCTCAATGGAATGTCATTGCATTGTTTGGAAGCTGACTTAAAATCGCGCACATGCTGCCAATTATAGTTGGACAAAGAAAAGAGCTGATCACCGGTGACAATTGCGATCGGCATAGACTTTCAAGACGGTGATGGGCCAGACAATACGAATTGCGGAGTAGCTTATCGACATCCCTCAAATCCCATTCCCTATCACAAACTCATCCCTAGACTGCCGAGCTGTTAAGTACTCTCCGCCAGCTCAGTCCTTTGTTGTGCTCGTGAATCAATGCAATAATTTTCCACCTTTAATGATCTTGAAGTGTGTGTTCCTTGTCGACGACCGTTTCGTGTCATGTTGTTACAAATGGAAACAATTATTGGCACTGAAAGCCGAAGTCGAGTAAATACAAACACACACAATGCACTCAAAAATGCCAAATGAGCCTCTTTAGCGGCTGCCGGGAACCAACGCGCTTAGGCATTGTACCCATGCGCATACCGAAAGCCATCCCCATGGCTGACCCAGTCTTTGTCGAGCCACCCCTCGACCCTGTACGTTTTTGGTGGCAAGGAAAAATGTGTGTCTGTCCTGAATGGACCAGTCCCCTAGAGGGTCCAGCTCCAGTCCCTCTGGCTAAGCCATTGTTTGCCCTGCCGACGGATTTGTGTTGCAATTACATTATTAATCCCACTGGCAAGATTTTTGGGAAATTGTGTGCCCTGTCACACCGGCAAATGGAATTCAGCAAGCAATCCAATTTTGCAGTCCCTGCGCAAATGCCGAAAGGACAACACAGTCACTTTATGCCCTTGCTTGTAGGGGCCGGCGCAATTTAGTACCCGTTGTCGGTTCCACAGTTCAGCTATTTGAGTACACGTGTGAAGTGACCGATGCATCCGTGATAGAGGATCCAAAGGTCACAATCCTCAAAAAATTGGCCAGATACATTTCCATATTGTGGGAGATGAAAACCGACAGTCGGGGCTCATCATTGGAAATCAATCACTAGACGAATTCCAGTTCGAATCTGAAAACCACTCGGATTAGCCCTTTGTCCCAGCTGACTCTTCCTGCATGTATCTAGGTTTTGCTGCTGCTTCGCTGATTTCACTACCAATAAAGCGGTAAATTGATACGGAGATTTGGGATTTTATTTCAATAAGTCCCAATACTCGGAAATTTGTATAAAGCCCTTTCATTCTCATGCTTGACCTGAACATCAAGAATGCCCTTCTCAGCCTCTTTCCATTTTCTTTTTGTGGCCTTTTTCGTTCTTTAGATAAATACACATAGAAGATATTCGCTTTTTATTTAAACCTTTAAAGGCACTGCATTTTTGGATTGACATAGCGTTTTATCAAATAAGAGTTAGGAGCTTTGGATTAGAGAAAGTAAAGCTTACAAAACCATAGGTAAGCATCAACCGTTAAGTAAGAAACTAGCTGTCATATTTTTTTTAGTGTATCATGGGCGCATCGAGTTAAGGAAAAATGTGCAAGGGTGTGTGCCTATTAATACTGAATTGTTCAGACAAAAAGGACCAATTTGGTCGGCGAATATAAATTGAGATGCTACGTCCCGAGTTAAAGGCTCGAAAAAAGATACCATAAAGTTGTCTCCCCTTTAGCACATCCGTCTCGAATTTGGGTCTACCAATGTGTTTTGACATCCTTAAAAGCGTGGCAAACTAAATTATCTGCCTCATTGCCAAAAGCTTATATGAATGTGTGGAAGTATACACTCGCATCCGTGTGCGCATCAGTGGGCAGAAAGTCACACATTGACTGTGGCAGTAAAAATCGGACTGAGCACTATTAACATTAGATATACAACTTATAAAAGATAAAACTGCGTGTACTTCTTCGCTTTATTCCCTTGTATTTTTGCAGGTCACAGTGGAGTAAATCAGTTGGGTGGAGTTTTCGTTGGCGGAAGACCTTTGCCAGACTCGACACGACAGAAAATTGTCGAACTGGCCCATTCTGGAGCAAGGCCCTGTGATATTTCTCGGATTCTTCAAGTGTCCAATGGATGTGTGAGCAAAATTCTCGGAAGGTAGGGTCATATTACCCAATTCATTTTTTATCAGCTACTCGCAAAGAGGAAGTTTATATTGTATTCGTCGGAAAGTACGTAGCAGGAAAAAGGATGCGTTTCCGAAACATGGAGACTATGCATGCGTGCATATTCTTGAGGTACCAAGGGTGTTACATCCGAGTGCCAACGTTTGCTTGAGCCGAGAGACAAGCTTACGTAAACGCTCAAAAATCGAGAAAGCGCGTGGCACCCATATTTTTGAAGGTTTTTTTTAATTAATAGTTATAAATTTACAGGAACAGGCACTATTGGGCCTGCTTACTTATTTCCTCCTTAGTTTTATAAGACATTCAAGTTTATGAATCAAAAAGATGTACCTAGGTGCGTAAACGAATTTCTGCGTTTCATGATTGCTATAATTGGTAAAAATAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAACACCATGTTAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCACTAATTATTAAAATAAAAAATTATTTCATTCTTCTTTTAGACCATTTTTTTGACACCTATATGTTAGAGTAGTCCGATTTTTATTATTACTTAATATATATATTCCCTATATTTTAAAATTATATGTGAAAAAGCCCCAAGCTATAATTTGTTTCTTATTATTTTGATAAAATGTAATTCGAAACTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGGTTATATGTCAAAATGCACCAAAGCTACAATTTGTTTCATATTATTTTACCACCAGTTTTCGATCGTTCCTATGACAGCTTTATGATATAGTCGTCCGTTTTGAATGAATGAAATTTGATTCGAAATTCAGAACTGATTTAAAAATGTGATTTCTAATTCAAGAAGGTTAAAAACATTAAAGATATTTTTTTTCAATATTTTCCGACTAATTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATACAGAACTAAATAAAAAATGATATTTCCAAGCTTAGAAGGTTAAATGTTAAAAAATACCAAAGATAAGATTTTTTTATATTATTTTTCCATTAATTTTTCTATTGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAATTCGAAATTCAAAACCAATTTGAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTTTTATTAAAAACACCAAAAATATAATTTTTTTTTCATTTCTTCCCTGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTTAGGTCCGGTTGGTGTCGACTTATATACTAACTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGGCCGATAGCTTTAAAACTGA'..b'AAGCTCCGAAACCAGAGAAGAACACCAAATTCCACAGGAGCTAGTGGAACCTCTTCCTCAACATCAGCCACTGCCTCCTTAACAGATAGTCCCAACAGCCTAAGTGCTTGTTCCTCTTTGCTGTCGGGATCAGCTGCGGGTCCTTCAGTCAGTAAGTACATGTATGGCAGGAGCAACACCGCTATCGCATTTCTTTATTTTTCTTCCCTTTACCCAAATTGAGACCTTGTCAATGAAATAAGCTCAAATGAAAATATAAAATCTGGTTTCCTACTTAGATACCATTAATGGTTTATCCTCGCCGAATTCATTGCCCACCGTTGCCAGTGTCCCAGCGGTTGGTACTGGCATTGAGAGTACCGGCAGTCCAACACCGACCTTGCATATTCGATCTGCCTGCTCCTCTGACACAGCCGCTGGACGTCACGGTGAAGACTGTAGAAGAGTTTGTTCACCGGGCCCCCATGGGGTTGGAGGCCAGCAAAGTAGCCATCATCACCAGAGCAACGGGCACGCCCATGCCCATGCACATGCGCTTGTTCCTGCTATTTCGCCCAGACTCAATTTTAACAGTGGCAGTTTTGGCGCGATGTATTCAAACATGCATCACACGGCCTTATCTATGAGCGACACTTACGGGTAAGCATACTTAGAATAGACAGTAGTGAACCATTTCACCTAAAATTTAATGTACTCGTAAAGCAGCCAAATCTGTGCCTAAATATTTTTTGTAGCTCGTTTCGCGCCATGCCAAGGTCACGCTTCTTAAGAATTTTGGACATAGGGAATTCAAATACATGCCAGTCCAAACGCAGAAAGTCAAGGCACATGAATAATTAAAGATAAATGATATACCTATCATTTATAACATTAACATTATTTATTTTAAAAGAGAGTGCCTCGACTATCAGATACGCGTTTCTCAGCTGAAGCGAGCGAAAGAAAAATGGATATATGGTCGGGATGAAAGCCTCATTTACCTTCGCATTCTAGTGGACTACTACTAGTTAACTAATTCAGGGTAAAACTTATATTAGGACGGATAAGACGGACCCTCAAAACTTGTTTAATAATTAACAAAAATCCAAATCCCTTATCGTGGGCAGTCATATGCTTTAGGTGGTCTTTCCTAGAACTTTTTAACTGTCTTATAATATGGAGAGGTTTTAAAGAAATAAACACAAAAATCGTTAACTTTTTCTTTGCAGAACGGTAACACCCATACCGAGCTTCAACCACGTCGGATCGTTGGCCCCACCATCACCAATATCGCAACAAGGCGATCTTACGCCACCATCTTTGTATCCGTGCCACATGAGTCTACGACCGCCGCCAATCGCACCGCCACACCACCACATAGTGGCGGGTGAGATGGGAAACCCTGCGGGAGGCGTTGGCAACGTCCAACCGGCCAATCTGGGAGCAAACTGCAGTGGATCGGGATACGAAGTTCTGTCCGCCTACGCGTTGCCCCCTCCCCCGTTACCATCGAGCAGTGCATCTGCATCAAACTTCTCAACATCATCCAGTACTAGCGCTAATGTGACCTCCCATCACAACATGCCCCAAGAACCATGCCCCTCACCATGCAACTCAAACTCAAACCACCTGGGTGTTGGACACAGCTCAGTATTCGCGACCGACTCGATTTCGCCGGCTGTATCTTCATATGCACATATGAGCTACAACTACGCTTCGGCTGCCAACAACGTGACATCTTCCTCTTCCGGCGAAGCTCCAGCGCATGTTGCTCCAGGAAAGCAACAGTTCTTTGCCTCATGCTTTTATTCACCTTGGGTATAAGCAAAGAAGAATGATGCAGTCAGAGAGGCATTTCTTAATGGACTATTTACATAATTATAAGCCAACCTCTATCCACTAGAGGTCATAATAAATCGAATTTACATATCTCTTAAAATATAATAGAGTTTGTAGAAGAATACATATGTATCTATAGATTATATAGTTCCGCCCATTAAATTCAATCTTTAGTGTAGAACAATTGGTGTAAATTAAATGATTTAATTTTGAAAAATGGAGACAATCAAATCATTTTTTTTAGTACACTCGACTTGAAAACTACAATACTAAACCAATAACATATTTTGTTTTCATTTTTCATTGAAAAATGCCCAATTCATTGCGGGTTTTTACTTGGGAGCAATGTAGCTGAAAATATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTTTATAAGAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCACATGGAGCCTGTCAACGACTCGGAACTCGGCAATTGATCTTATCTTGGAAAGAAATTGTAATAAAAAATTAAAAAAAAATAGTAAGCGACAGCACTTGGTGTGATGCCGATACCCAAAATTGGCAAGGAATGTTTCTTCTGCTTTAGCTCTTAGCCCTATTAGCTGTTTCTACAACAACGGTTCCTATAAAACCCAATGTGCATTGGATCGATGAGCGCCGTTAACCACGGCCCAAAGAGTAAGACATTTGACGTAGTGTTCGTGCAGAAACCTCGTGGAATCAAAATTAAACAAGAACTGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTAAAAAAAGAATCAAAAATTTTATTAAAATGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGATACAATTTTAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCTACCAATTATCCGATGTTCCTATGCCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTTATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTATATAACATTTTTAAATTACTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAGTTGGAAAATTAGTCGGAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTAGTGTTTTTTAACAATAACCTTCTTAGCTTGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGTTAAAAAACACTAAAGATATAATTTAACATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATAAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCATAACATATAACCTATATGTTAAAAAACACTAAAGATATAATTTGTATTTCATGTTTTCCGACTAATTTTCCAACTTTGATAAAATTTAATTTGAAATTCAGAAGTAATTTAAAAATGTTATATCCGAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTTTAAAGTTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGAAGCTATAAGATATAGTCCAATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAAAAAGAAGACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTAAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGATAGACGGACATGGCTAGATCGACTCTTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGATCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACCGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATAGAAGAAGACTCCTTTAGGAGTTCAGTGAAGATTTGGAAAAGCCAAGATGTTGCCCATTATTGTCGGAATTGAGAGTGCTGGGGATAATTAAATCGACAAGGACTTCTCTCTCTAAATGGACATTCTGCCAGGCGCGTTCACGCAAATTAAGTAAGTTCTAGGTAAAAAAGTTTTCGTTACGTTGACCACGGAGAAGATGGCCACTCAAACCCAAAAATAAGAAATTCTTTTAAACAATCCATTTAGTTTTATTTCTTTGCGGAGGGGCAGAATTTTCTTTTTTAAAATGCTTAGCCGTACTAGTTTAAAAGCATACTTTCAGGATAGAGCAGTAAGTACTTATTACTTTTTATTTATGATAACATTTTCAGTATTATTATAAAAATTACAATTTCCCTTATTCTTTTTTGAAAAATGTGTTTTGAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/685/a92/28/scaffold_40-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TATACTGATTATTGA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATATTCCCTTGCAGAGGGTACGACGACTATCTCACAAAGCTGCCTTTGGAGCGACTGTAAAATTGGTGGGAAAATAATATAACTAAATTATATCTTTGGTCTTTTTTAACATATAAACTTATACGCTTGGAAAAAACTGTCTTTAAATAGTTTTGAATTTAATTTTATTAAAATCGGACTGCTTATAATATGGCTTTCATGGGAACGAGCGGTATGAAAAAAATTATAGCTTCGGGGTTTTGGATATATTATCTTATAATATTGGAAATATACTTTTTTATATTTTTTTGAATTAAGAAATAAATTTAATACAGATCACACTACTCTATCATACAGCTGTTAGGGAAACGGTCAGAAAAATAATGAAAATATATTTTCAATGTCACTGAAGATAAGAATAATTTTTTCGGCTTGCCGAAGTAAACTTCCCTTCTTGTTTTTTCACGGAAATAAATATTTTTCATGTATATGCGGCATCGATATTAAAAACGTAAGATATTAAAATTCTTATTAGAAAAAAATATCAGTCAAGGCAGGCGTTCTGCCCTGTTTTAATTTTGTTTAAAAAATTTTGCTTGGGACATGTCACTCATGACGTTTTTAACCGGTTTGTTCAACGATTTTGTTTTCCTTTTCCTTCTAATAGTTTTAAATATTATTTGCGTTTAGCATAACTTGTATTTGCGTATAATATAACTTTATTTAGTTACAGAAAAGACGTTTTCGAACTCAGAAAGTATATATATTCTTGATCTAGATCACTAGCCGAGTCGATTTAAATATTTCCATGTCCACACCATAGATCTTAAAATGGCTCCATAAGCCTGTTCAGTTGCAGCAATGTTAGCAGCACTAATAACCTATGCACACAGCCGTTTAAAATCACTTTTGCAATTCTTAGCTGATCGATGAAGCGAACAGCTTATCAGCTTAAGCTGATCCAAAAGAAGATCGTGCAAGTTGGTTTTCCGAAAAAAGCAAGGTTCGATAGTTCTTCGCAGACAAAAAATTAATTTTTCTTTTAAAAGATTCCCGAAACGGTAGATTACCTAAACTCTTCAAAAATACTAAGAAAAAGAATTGAAATACTAAATTTTCTTGCCCGTGACGTCCGCCAAGACGATTGTAGAGTCTTAGCATTAACCAAAATTTCTCTTTGCACCTGATTTTTTTTAGCATAAGCATATTTTAAGTACTCTTGCCACCTATGTTAATGCTTTTCTCTATATGTATGTGGCTCTTTCGCTCTGTGTTTTTCAGTGAACACGGTTTGGTTAACAGTAAGAACAAATTTAAACAGGAAAGAACGCTATAGTCGAGTGCTTCGACTATCAGATACACGTTACTCAGCTTTATGGAACAAAAGGGGAATGGAGATATACAAGCAGCAAAGCAATTATTTAGGGCGCCAGCTACCGGCTATTACAGTAGATATTATGTGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTAACTGTCTGTGGGCGTTAGAGTGGGGGTGGAACATTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGACAAACACATTTTAGCTAAATTTTTGTTTCTATCATAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAATACAAATACAATATACAAATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGCAACATCGTGTGGAATTTTTAAGATCGTTGCTGTGTATAGAGATATTAAAAAAAAAAATTATTTCATTCTTTTTTTTGGCCAATTTTTTGACACCTATATGTAAGAATAGTGAGATTTTTTAGAAAATGAATTCGAAATTCCTTAAAATATAACAAATTATATTCCCAATATTATAAAATAATATGTCATATTATTTTCCCACAAATTTTCCGATCGTTCCTGTGGCAGCTACAGAATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAAATTTAATTCGGAATTCAGAATTTATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTTATATGTCAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTTTATATTATTTTCCCACTACTTTTCGTTTTCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCAAATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTGAAGATTAAATAAAAAATGTTATTTCCAAATGTTATTTATTTATATGTTTAAAAACACCGAAGATATACTTTTTTTTAATTTTTTTCCCTGATTGCTCCTTTGGGAACTATAAGATATAGTTGTCCGATTCGTCTGGTTCCGACTAATATACTACCTGCTATAGAAAGAAGACTTTTGGAAAACTTTTAGCCCGATAGTTTTAAAACTGAGAGAATAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTTAATTTGAAATTCAGAACCATTAAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCGGAGGTATAATTTTTGAATATTATTTTACCTCTAATTCCGATTGCTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAAATCGAAATTCATAACTAATAAAAAGATGTTAATTCCAAGCATATAAGATTATATGTTCAAAAACAGCGATAGTTCCTGTGGGAGCTATACGATACAGTTGTTCGATTCGGCCGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAGCTGAGAGATTAATTTGAGTAGAAACGGACGGACAGACTGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTAGTGACGCTGATCAAGAACATATATACTCTATGGGGTCGTAAACGTCTCCGTCACTGCGATGCAAACTTCTAATTGACATCATTATACCCTCGGCAAGAATATAAAAATTTAAAAATATATATATTTGGTGTTTTTTAACATATAGCCTCCATTTTTTATTAGTTTTTTTTTTTATATCAATTTTTTATATCACTGAAACTATCAACATTCCTAAAATATTTCATATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTCCGGTAACTGCAAGGGTCCTAGACAAGAAGCCAAGCGGAACTTTTTGAACTACATGGACATGCTGCCGGGCGTCACCACGCAAGAAAAGTTTTACTAAGCATTTTTTTAACGGAACCACCAGTAATATGATCTCCGTCATGGTCTCCTTTTTTTTTGGACTTCTCTACCACGAGATACTTTGCAGTTTATGTGGAGCTGAAGGACACAGTGGCTTTTTTTGGGAAGATGAAATAAGGTCGGCCGCTACAAGACAGCTGGAAGAGCCATTACCAGCCATTACCAGCTATTGCCAGGTTACTGGGCGCCTTCCAACAGCTCCGTTTCAATCTCGGCTACAACTTCCTCAAGGCTTATATCGGCGTGTTGGAAATCGGAATTGCACTGCAAATGGTACAGAGAAAATGTCAAGCATCAGCGACACTAGAAGGAATCTTTAAACTACTTATTAAGATAAATGAAAAGAAACTACCTCTTAAAATAAATAAAGATAAATAAGAAAATGTTTAAATTCCATTTATTTTTATTTCTTTGTGCAGCTCAGACTCTTCTTTTTTTTCAATTTTTCGTGGCTTGACAGAAAGACAATGCTCCACGCAATGCGGGTAAGCTATATATTTTTTTTTTGCTGATAAAAAATTTTAACAAAGAAATAAAATTTTTACGGTTTACTTAATTACCATTATTACAAAATATTTCAGAAAAATAAAAAATGACACCCAAAAAAAGTTCTTCGGTTTGTCAACGTCGATCTAGCCATGACCGCCCAAACCGTGGCTGCTAAATTCTAGGGTAAAATGTTAAATTAATTTAACATATTTGAATTAATTTGTTTTGGCCAATGCCTGACTTACATATGTCACTCAGTGTACTGACTTCGGCCCATTTTAGGTAAGCAGTCCAGACTGGGCAGTTACCGTTAATAATGAAATGTTTCCTTCGAAGTCAGATATATTTAATTTTT'..b'GAGGCAAATAGGCAGTTAGTGCATTTCGTCGGGTCTGTTTTTCAGCGCGGTAATCAGATGAGCTAAAGAAATACCAGAAAAATACCAGATATAGAGATAATGTCCCATTTCAATTTACTACTCTAACGTAATGTATTATTTTGACATAATTTACAGGATAGTTTTTGTGGGGAATCTTTTTCGAAATTATGAAATATTAAAAAAAATAACTTCTCAAGAGTAGATGTTATATGTCAAAGAAACTTCTTCACGATTTAAAAAAATTTTTTTTTTTTTAATATTGAAATGTATTACATTTATAACTAAAAAGTGGAAGATGGAAAGCAATATAATATATGCGTGCGTCTGGGTGTGTATATATGTACTTTTAGCTGGCGGGGAAAATTATATTCGTTTAAATACACACCCGCCTCGAACATCCAAGTATAATTCTAATACTCACTGATATTCTTTTGTGGAAAAATTATAAAATTTGCAAAACTCTTGAAACAGGCCTCTTGAGAAAACCACAACAAAAAATGGTAGGTAGCTTCGGTAAATAGAAGTTTCTACACAATTACAGGTAGTCCCCGTGTGAGCACAGAGTGTTTAGAGTTTTTATTTAAGAAAACTAATCGCACGAAATTCACTATCTTCATTATTCGCGTTTTCCTTATTTTTGTGATTATGATTTCAATCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCAACCCCATAAAGTATATTCTCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACACGAACTAGTCTCACAGTTTTTTTTTGCACAATTATACAATTTGGCCTGCAGATGCCTGGGCTCAGCGGGATGCCACTCCCACAAAACGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATAGAAAACAAATTTTAACTGAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCCATTGATCCAAAAATGTGCCACGCCCACTTTACCGCCCACAAACCGCCCAAAACCGCCCAAAACTGTGGTGGCCAAAGTTGACATGATAGAATTTTTTTTGTGCTGAAATATATTTGTCTCATAAAAAATAGATATCCATTTTCATTTTGTTCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTATCTTGTAATTGAACTACATTAAGCTGTGAAAGTAATAATGTAAAATTGGTGGTTCATTTAAAAGATACACCTAGTAAGCACAAATTCCTTTGAATAAAATCATGCGTTTCGCTTTGCGTAAAAATGTATCCTAGAATTTTTTTCTTTAACAATGAATTCCCGCTGGCAAAGAGACCCAGTTATTAAAATAGCTGGACTTTTGTGCATTTTCTTGCATTTATGTAATGCGAGATTGTTTCGCATATGTAATAAATTGTTTTTTGTGTTTAGAAATATATTTATTTCTTTAAAAAAATGTACAAATTTATTATTATTATTAATTTTATGTGAAGTTTTTAAAATATACTTCTATATGCCTGCCTTAATATGCACTATATTATTGCATATGGATTAGACCTTTTAGGAAAAACAGGGCATCTCTAAAGATAGGAACAACAACGGCTTAGCGAAACCATTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTCCTGAAGGCTTGGTCCTTTTATGTGTTTTTTACTTGCCTTTACCCTTTTCAGTTGTTTTCAGTTTAGATTCCCAGGCAAGTCCCCCACTGACCAATAATATTTTAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCGGTTATAAAAAAGAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCAAAATTCTTAAAAATATAAACATTTATATTCCCAATATAATAAGATAACATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTCGTTTCATATTATTTTCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATGACAGTATATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTATTTAAAAATGCTATTTTCAAGCTTATAAAGTTATGTGTTAAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTTTTTTCATATTTTCCGACTAATTTTCCGATTGTTCATATGGCAGTTATATAATCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATGCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATTTATATTTTACCACTACTTTTCAGATTGTTCCTGTGGGAGCTATATGATATAATCGTCCGATTTTGATCAAATTTAGTTCGAAATTCAGAACTAATTAAGAAATGTTATTTCTTATCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACTCCGATGATATAATTCTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATAGGAGCTATTAGATATATTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATTTACTACCTGCAGTAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGACAGACGGACGGACAGACAGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAGAAATATATATATTCTTTATGGGCTCGGAAACGTATCCTTCACTGCGTTGCAAATTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATAAAAAAAAAGAAACTGAAATTATATTTGCTGCCCAAACCGTGATGAATGCGTGTAGTTTTTAGGTAAACAAGCGCTCGAAAGGGTGCTTAAAAAAGCTCTACAATTTGTAAATGGTCTTTTTATACCTTTGCAGAGGGTATAATGATTTTAATCAGAAGCAGTGAAGGAGACGTTTCTGACCACATACAGTATATATATTCTTGATCAGCATCAGTAGACGAGTCGATCTAACCATGTCCATCTGTCAGTCTGTTTTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGACGACTCTAACATATAGCTGTCAAAGAAAAGCTCAGAAAAATAATAAAATAATTTTTTTTAATACCACTGAAACTGGCAACAATCCTTAAAATTTAAAATGGTGTTACTACTGTTGTTCATTTCTTATAAGTGCAAGGGTATATAAACTTCGGCTTGCCGAAGCTAACTTTTTGTCTTCTTTTGTTTATCATTAACATGTTTTTATATTGAGGCTTAATAAAAATATTTATGAAACTAAAAAAAGCTTTGTTTTCCATGTCTTAGGAGATTTTCATTGTTTTTCGGGTTGTGATTTGGCCACGTGCGTCTGGAATTGTGTCATGTTGAACAACCTCTGCCTAAGGAGGAGCATTCAATACTACGGTGTCCAGGCACCCAGGTTGCGGTAGCCATATTGTTCAGAGATTTGCGCACGCAGAGAAAGTTGAAGAGTTGAAGAAGTCGAGAGCTATGAGAGCTGCTTGACTGTCCGAAAAGTCTGTCTGTGTCGTAATGTTTTTATGTATCCAGGTGGGAGATGGCTTCCTTGATTGACAAGACTTCCTTGGAAAACACTACAGTGGTCTGGTAGGCGGAATGAGACTTTTATGTCCAGTTCGGAAGAGACTTCTCCATTTTCAATAGGTGTGGGAGGTTGTTCCAGTCTGTAAGTATGGTCGGTCCACAGTCCGCTGTCCACCTAAAGAGGGGATAGAGATGTATCCATCAGGTTGCAGAGAGTTTGAGGAAATTTACCCTGCAGTATGATAAGCACGTCATCCGCGTAGGCATCAACTTTAGTACCCGAGTGTTTTACTTGAGCAATACTTTTTTGGCTTTACTACAGATGCCAGTGAAGTATAAAAAGGGTATCTAGTTCTTGACCGTTAAGTACGTGCGTCTCATGTAGAAGACAGATGGAAAGTCTTTGATTAGTAATGTTATCGGCGGAAGGAAAAACTAGAGTTATTGTAAATTCTATGTACCGGTGATCTGAAAATGAGTTAGACCCCCAACTCCCACGCGTTGAGCTGGTTAAGCAGGTAGCACTTATACATTAAGCACTTATACATTAAGTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCCTATTTCTAGTGATAAAAGTTGGGTCATTGACTTTTTTTTGCAAATGAATAGGTTTAATTGAAGAAGAAAGTGATAGAGTAACTCACCCCGTTTCGTTTGAGCTTGCGCTTCCCCATTGCATGTGGTGTATGTTAACGTCCCCTCCCAGGAAGAGTTCCTTTGTATGTATGAGTTCTCGTGGTATGGTGTTTGATGTCGTCGTTACCCAAATTTAATGTTCCTATAGTGTGATGAGTGTGTGCGTTTAACTCCAGTGTGACCGTGGTGATTGAATGCAGGTTCTGGTTTTACCCTAACCCGTGCTTTAAAAATGCTTGTATAGAGGGGTTGATATGCCACAGATGTTTTTAACAACAATATATGGCTCTTAAATGAGGACTGCATATGCTTTGCCTGTTACAAGGCGGATGAGGGGGGCAACGGATGCTGCCTTGATGTGGTGCAGATAAATCTTTAGATACTGAAACATCTTTTTGACCGTGCTCGGGCTGAGAACCCTCCTCCTCCTCAGCGCCCCGGTCGGGTCATGCCCTGAGTGCACAGCTGCTTCATGGTTGGCCTTCTCGTGTTCCATTTCGTCGGCACTCGGGGTTCATCCAATGCGCAGGCAGCCAGGTTGTCTAGCTAGCTTGTCTGTGTCATAAATGCAAAGCTGCACCATGACGAACCCATAGTTAACCCGGTTCTGTTGCGCTGCGAGGGGTTCCAAGCAGGCCTGGTTCAGGAGGATCGCCACGTTCATAGTGATGCGCTCGGTTTTCTTCACCTTAACCACTTACCAACCATCTGTCGGAAGCTTCGGGTTAAACCTCGTCAGCAGGCAGCCACACCCTAGCTCTCGGTCGAGAAGGGATGTCTGGAGCGTCGCAAACTATCAGCTTGGCTCCGGGGTAGACCTCGCCAGCCTTGCTGATGGCAGCCTTTTAAGGCGCTGCTGATCTTTCGTCCTCACAGGCAATCAGCTTCAAATTACCCTGGTACTGTGCAATCGCGGACCTGGGATTTTGTCCAGCACTTTCATGGTCACTGACGCAAGGGGCCGTCTAACCAAACATGATGACACCGCTGTGATCAATGACGCCAATGATCTTTCGATCCTTTACCACTTTCACAAAGGACCTCAACCATGTGCCGCTTCGTCACTTCCATCGACCTCTTCCGCTTGTTGCTCTTGCTGGTGGTCATAGCAATGTAGAAGTCTGGTATTACCGCCTTTGCCCAGGATATGTATTCTTAGATTAAGTGGTAATCCTCCTTTGACGCTTGGTCTTCACGTAAGGGGCTGGTGGCCAGCAGTTTAAGGATTCGGTATGCCTTCTTTCGATTCAGTGGTCCTGCCTAGTTAGGTGGCACTCGTTGACCCTGGTGCTTTCCACAATTCAGCTTTCGCACTTCTCTCAGGTTGGACTGGCTGGTTAGCCGTTCCTACGCTGGTGGGAGGATTGGGCTGGTCATTGTGGTGTTTTGGAACTATTGCGTTGTTGCGTTGTTCGTTGGCCTTCGCAGGAGTTAAAGTCACATGGACTTTTTAAGAGTGTCGGGCTCTTGTTTTCTTATTATGTAAATCGACTTTGGATTCTCAATAGTTAAATCCCGCGAGCTGCCGAAAAGGGACGAGTGAACCCGGGCAGTAGGCGGCAGCACAACTTTTGGCTGACACGTCAGACGAAATCCCTTCCGCAGTCTTGAATAGGGACAAAAGGAAAGCGAGGCCGCCTCGGCTTTGTATTGGAGAGAAAACCTCAAACAGCCTTGTTAATATAATAATCGATCTGATTTGTAAAGATAGCTTTCACGAAATCCTTTTGACTAAAGGAGACATACATAAAAAAAGGTCCAAGTCAAAAGCGAAAAAAGCTTTAAAAAATTGACGGAGATCCTAGACGCCAAACGCAATCGCAACACCAAGAAGGCAAAACATAACACCTAACTCAAAGCACACGCATGCAGAAATGAAGCAGCTAATTCTGGATCCCGGTGCGAATGGCAATTACTTCGATCACCATCTGCAAAGTAACAGTTAAAAGAACCTTTACGCCGACTCACCAAGGCACTAAGATTCCAACAACGCTATATAGAACAAGAATCTCTATACAGCTCAAAATTCCTACTATAGAAAGCCCACTCAAACCTAAGCCCTCCAACAGTAACGGTTACGCCAATAAGGACCCCTGCAGGCTGCTAGGCCCAAAGCGACAAGGACCGATCCGATACACCCCACCGATACCTCCCCACCTTAAAAATGTATTCCAGCCAAATCCAGCAACAAACGTGCAAGATCGCAAACTGAAGACGACTTTCCTTAAAGAACTCCCACTATGAGCATTTGACAGAGTGTGGCTTGACGTCCTCTTAAAGTCATAAATTTACAACAGGATATTTATTGTGAGATGCAATACTTCCATGTCAGCTGAACATAACATCTGATATTCCTACGAGCAGACAACTGACTATGTCTACGTTTGCCGACAACACCGCGAACCTCAGACGATCTAAATGTCCGCAACAAGCTTCAGCGCAAATTGTAGCCCATCTAGGTGTAGTAGAGAAATGGCTCTCAGACTGTCGTAAAAAAGTAAGTGAGTAAAAATGTGAACAAGTAACCTTTACCTTAAATAGAAGAAATGGCCCAAACCTTATACTAAACAATACCGCGCATCCTCAGTCTGATAAAGTAAGACGGCTTACCCGGCGTACGTATATTTAAGCTAAACGAACTCACTTAGGGCTGAAGCCAAACAGTCTGCTTTGGCTTATAAACTCCAGCTCCCCCTCAGTCTGGACTACAATTCTGTTTTGAAACCAATATCGGTCTGTGATTCGATTCATGTTTTTGAAAGGAAAATAGTGCATCGATATCAAAGAGCGCTTGGATTCTGTGTACGTTGACTCTTCTTCTTCGATTGAGGTTTTTCATGAGCCACGCCCAGGTGCCCCGAAAAAGGCTACCACAGAGGACAACGTGACAGAATTCCACGATCTCGTATTGGCAGACCGCCGATTGAAGACGTGCGAGATATCTGAGACAGTAGTCAAAAGACCGCGTGGGTCATATCCTGCATGAAATTTTGTGCATGAGATAGCTGTCGGCGTGATAAGTGTCGCGTTTGCGTTTGTCTTGACCGTCGACGAAACATGGATCCACTGGTACGTATCAGAGACCAAAGAGCAGTCGAAACAGGTGACTTCACCCAGCGAACCTGCTCCGAAAAAGGCGAAGTCTGTCCCATGGACCGGAAAGGTGATGGCCAACGTTTTTTGGGATTTACAATGTGTGTACATGACTACCTGAAGAAGGATAAAACGGTTACAAAGCTGTACTATGCTGAATTATGAGGCCGATTCGCCGCCAAATTGCAGAAGAAAAAAGTGCTCTTTCCTCATGACAACACACACGCAGTGATGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTAGATTATTTTGGTAGGTAAGGTAAAGCGCTTTGATAACATTCTAAGCTTGGAAATAATATTTTTTAAATAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTTTCAGAATTGGTCGATTGTATCATATAGCTTTCATAGAAATTATCGGAAAATTAGTGGGGAAAATAACATGAAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCAAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATCAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGATTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATAGAAAAATTGCGGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATGTTGCGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTCGGAATAATCTAACATATAGATGTCAAAAATGGTCGAAAAACAAGAAAGAAATAATTTTGTTTTAATATCACTGAAGCCAGCAACAATCCTTAAAAATTGCACATGGTCTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAA'..b'ACATCGTCTTTAATTTATAGGACCTTCAAATAGAGTTTGGATACGCACAAAAAAGGTCAATGCTGAGTCAATGTAAGAAGCTCTGAACTGGTAAGTGTACCCATTTTTGTTGATTAATAACTTTTACATGGGTATTTTTACAATAATGTGTCGAATGCCAAACATTTAGGAATTCCAAGGTTTATACACCTTAAAATTTTATTTGAAATCTGTGACGAACCTGCCTAGCAGTCGCTTACGCCACAATCATTATAACTACTGTTATAATATCTTTAAGAGAAATACCGTGAAGTACAATAAATATTAATACACGTTAAGAATAATTTGGTTATATTTAAGATCAGAACTCGGGGTAGCAACGCCAACCGATAGTTAGCCAATAAATTATTTAATTAAATACTAGAAAAGCAAACAAGCTATAATACGAGTAGTAGGTAAATACTAGAGATCACGAGTGCGGGAAAGGCGGAAAAGTTATCGCGGAAAGGGTAATTTGGTGTGATTTGGACACGGCTTAGCGAGGCTTCGAAAAACCACGTGTGCTTCGCGAGCTTTTCCGCCGTCTTACTACCTAACGCCCGCAAAGTTTCCTCCCGGCTTGGCCTCGCCCGAGGGTCCAGCCCGGTGAATTTTTCGCGGTTTTTCGGTGGTTTACCAATTTTCTAGTAAAGGACTCATGGATCCGACTGAGATCTGTACCCCGGCCAAGAAAGCATCCTAACAAACAGGCAATCAAACCGAACAGTAATCGATTCCCGTTCCGGTACTGGCCCATATCGAATCGACTCATTCGGTAGACGATTCAATTTTGGTATTGATGTTTTGGTACCGGTACAGTTAAACAATTTCAATTAGTTATGGCAATGAATACATTGGAATGATTTATGTTTTATTAAGAAAATAAAAACTTTATTTGAAGGCACATTAAGAATAATTCAATGGATCCAAAATCGTAGAGATGATTATACTTATAATGATAATAAATTTACGAAAACAAGTTAATTATTTGGAAAACATGTAATTGGTTCTCAAAAGATTGATTGCGTTTAAATTTTTCATGTCCATCGGTTTCTGAGCGGATTCATGAATACCTTGCGAAATTGTGAACAACTCTGGGAACTTTTCGAAAGAATTACTATTTAATAATGTCTGTTGACTTAGAATGGCGCCTCTGTTTTAGAAAAAATGAAATGGACACACGGGCAACTGGTTTTATGAAATCCGGAATCGTTTTAGTAGGCACACTATTTTTCTTAGTGAGGGGTTGGTTACTACTCCTTTGCTCCTCAGTTTAAATCATCAATGTGATATGAGATCGCTTATGTGCTTTGATAAATAAGTTCCATGTTTATCCAATAAAATGCATACGAATTTGTGCATAAATATGTATTTGTATTTATGTAAGTAATTAAGCAGTTCATTATACCCGTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGTAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCGTCACATGACGAGTCTATCAAGCCATGACTGTCTGTCCGTCTGTCTGGACTCTAAAGTAACGTTTTGGGACAAACCGACAACCAAAATTCATTCATTTAATTCAATTTATTTTGAGAAGAGCCCCAAATAATTTTTTTTTTGCTTATTACTTTTGAACGGAGCATCCGAATTTACTTCTACTTTTGGTCTTTCACCACCTTTCTCCCAAACCAATTGATTTTCCCAAAGTCGTGATATGCAATTCTTTTAGTTTTTGCAATACCTTTTGATTTATGTAATACTCGAAACAATTGGTCTTTTACTGCAGATTTTAATTTCTTCGGTTATATACTTGTAAAGTAGTCGCCCTCGCACACCCTCCTGGTGCGCCACTACGTGGACTGCTGCCCACAGTTATTGCGGGACAGCAATGACCAGCTCCAGAAGTAATTCGTTTAAAATGACATTTGGCCAATAACTCTTTCTTCCGTCACGATAATGCACACTGCACTAGCTTTTCTATACCATTTCTTCAAAAATTTGACCCATATCGTTTCGCAACCACCATATCCGCTGAAGAGACCAGTCAACTAAACATTAGCTTTGGTTTTCAATTATCATTAATGGCATTAAAAAAATAATGATACTTTAAACAAATCCCATTGGCATTGAAAAAAAGGAATGCTACTGAAAACAATTTTATTAAACTAAAACCAATTACACCAAATATACATTAAAGTGACATTTACAAAAAAAGTGCTACCATACACTTTTATTACCATGTCTTAAATTGAACCCTTAGTTGCGGAATATGTCTACACAAAAGATCTCGCGATTAATCGCATCTTTTTACTCTCGACCAAGAATCGGTATCTTTCTGAAGTTCGGCTTGTTATATTTGACCCGATAATGACGCATAAATAAATAGCAAATTCTTCCAACAAGTTTACTAAAAAGTATTTGAACGAATTTAACACAAATTTAATTGCATTTAGACGAGAAGAAACCTTGGTTTGTTCGGCCTGGTTGATTAAAGTGTGCAAAAAAATGTATTTTAATTGTAAATGTAATGTAAATAAAATGTAAGATTTACTTAAAAATTACTCATATGAGATGTACTTGCCAGAATTCTTTTATAAAAATGTATATCCACTGCCCAACTTTGGCAAATCTCGTATCACTCAATATGAATGTCGCTAAAAATACCAAACTAAGTAAAATTACATATCTTGTGGCGCCTCTAGCGGCTAGTGGCGTATTCGTGAAAACTTCCGATTTGCTGCATGTGGTGTGCAAGCTCAATTGAATTTGCAGGGTATTGGCTCTAACTTTTAAATGAATAGACCGATTTGAATAATTTTTGGCATGTATATGGGTTTTGGTAATAAGAACACATAATTTAAATTTACTCAATATTTTAAAATTTGGGCGATAGATTGTTTTTAGTGTTATGGTCATTTGTGGGCTTTAGAGAGGGCGTGGTACCCCGCTAAAACTAGCTTGCGCTGCGCAGGAAGACCGGGAATCTGCATGCCAAGTTTGACTGTTTTAGCTCTTAACCGGTATAATAAATAAATTCTTTTGGTTTGACTTCAAAACTCTGAAACGAAGTTGAAGTTGACTCCCAAAAGAATATAAACAAATTATAATTAAATAAATAATTAATAAAAAGTGCAGAAGTGAAAGTATTTTTGCCACCAGTGTATGTTCATTTTACCAAAACCCTTTAAAATTTTGTTTTTATTATTTAATCGCCTTGATCATTTTACACAACTTGGCGGGAGTGTTAAAAAATTTATGAACGGTTCTTAACGTGCATTTTTACGCGAATACCAATGTTCCTGTTGCACTTCTGTATGTTGCATATTATCCCTTAATTTGTACACAATCTTATTTGATAGGAATGTTGGTAGGCATCCTAGTGCCTATGTCCAAATGTTATAACTAGCGGAAGTAGCGCACCACAAATCATAATTATTAATTCACTATATTTTAACGCTTGAATACTACTGCTCCCATTTTTGTCGTTCGTAACATCCCGAGATTCCTCCAGCAAACGATAATTATGCTGTTCGTTCTGAGACAACCCCCCTTGGGTAAGTTCTGGTAAAACATGAACAGTGGCAACGTACAAAAACGTCCCGGCGGAAAAGAGCATAGCTATCCCAGTGGCGTTTACAGAATTTAGCGTCTCCTTCTGCTCCTGGCCGATCCCAAAATACGTTAAAACAGTCAAAAGCGGCGCCGATAAGGAAAACAATGCCAGGTGTTTTCGAATTTGTTGCCTGTCGACTTTCTCATGCAGTAAGAAGGTTACCAACCCAAAAGCTGCTGGTGCCTTATGAAGCATTATAGCTAAAAACACAATTATTTCAACATCCTGATGGCTTGTCGTGGCAGCTGCACCTAAAGCAACCCCATCAGCTGCAAAAATAAAAACTAATTTATAGGGCTTCCAAAGAAATGGAGTGTGA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6cf/1de/c9/scaffold_19-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTACCTGCAGCATGAACCACCAATCCAAGAGTCAAGGTAGTATTGTTTTTTTTGTCACTTCCGACATTGTTTTTCCGTTGTGATATATCCACCAACATCATAAAGACAAAACCCAGCACAAGAGAAAGTCCAATAGTCTGCGAGTAATCTTGGAGCTCCGGGTCAGGAGTTCGTTGTTGAGGTCGCGTATTACCCGAATACAATGATCTTATACCTTCTGGTATTATAACGGCTAATGCAGTGCCCACTAATAATCCAGCGCCAAGCACTGTGACAAATTTAAGTTTTTCCTTGAGGGAATATATTGCGATAACAAGAGTTAATGCATATTCTAAAACTTAATTGTCAAGATATACAGATATCTTTTCTGCCGGAATTTAGGGGAAATGTACGGTAACATCATTGAAGTTTCCCCAGATTTCTGGGACACCCGCATGTAAAAATACAAACCTCACTCAATTTCATCAACATCGGTATGCTCCCTGCCAAATACGATCCAATAAGCATGACCAAAACTAGTAATATAAGAATTATTGTCTCTTCAGCCATGATTCCCCAACTTGATTTAAATTGGACTAGTTCATCAACGTTTACATGTTTTTGCCAACTCAATTTATAATTAGGGATGAACCATTTCTAGCTTTACTTTTTACTCACTCTCACAAAACGGCAACGCAACCAACTGTGGGACGTTATAGCCTCTTCATACGGAAAGTGCTTGTGCAACAGCAACTCTCTTCTCTTTCATCAAATCTTTCTATTGAATTATAGAATTTATCCGGTATACTGTCATCAGCTGGGTTTGTTAATAGAAAATTAACCAATGAGACCAACATAAAAATGACCAGTCTGTAATAAATAAGTAATTTATTGCTTCCAACCCATCCCACAGAAGCTTTGGTTTCTTTTTTTTCTAACGTAAACTGCTCAGATTATTAACATGCTGACATGGGCTTTGAGGGCGTGCGAGCTGGCTAGAACAGCGTTTTTCCGCTGGTATTGCAGGAAATCACCCAGCATCCTGACAATGGCTGGCAATGGGTTCTGCAGCTGTCTTTTAGCGGTCTGTTTTTTCCTGCTTCTGGTGGCGTTTAATGAGTACATTGCATCCGAGGTCTATGCGACGACAAGTTCTGAAGAAAGTCCGCAGGGAACTTAAAACCAGCTTCTAACAATTATCTAAGCATAATATATATATAAAATGGTTTAAGATTATTAACGAATGAAAAATGAATTTTTCTTAATTTCCTCCATTTTTTATATTTCGTTTCCAAGCCAAAGATCAAACTTCTTTTTCTTTCTTTTCAAAAAAAATCAAGAAACGGCAAGTACATAAATTAAAAACCTCTTAAAAAAATCGGACAATCGGAAAATCTACTTTACGAAACAGTATTCGTAGCGACTTTTTTCCATTCTCTTTCTAGCACCTACTTGTAATAGAAGAAAAAGTCGCTGAAGTTTCGCTTCCACTGTGTGATAAGTGTATAAGAATCGGAACTAGACCATAATGGACATGTATATACATTTGCTTGTAAATGTTATATCCAAATCCCACTTCAAGAAATAGAATTTTACGATGTACACAAACGTTAAGTGGTTTATATGTATTAGATGTGTGCCTTACGGTCATACAAACAAATAAACGTTGTTGATACTGCAATATTTTATATCAAATTGGTAAATACTCGGGACACAAGGTAAAATTTGTTATTTAATACATAGGACACAAAAAATGATTTGGTTTTTCAAGGTTCAAGGTTGTATGATTGAATTCATTTGTATGTACATATGTACTTAAGGATCTATATATAAATGTTTTACTTTTCTTATTCTTCAGACACTGTTAAATGTGTACATAGCTGTGTGCATCCTTAGTGTGAAATGATGTGTTTAAGTGAATAAACCAGCAGTTACAAATTTGAGGTAAAACAGAATGAAAACAAACAATACGAATTAAACGAATTGTAGCAAGCGAAAGTGAGCAAGCGGCTTACAGTGAGTGCATAAGTTTACGTACCATACGTATTTAGCTATATACATGGCTCAACCAAAGGTACTCTTTGTAGGACAAGTGACTTAGTTTCGTAGAAAAGGTATTTTGACTCGGGAAAAGTCTTCGAAAATATCTCCTTAATTTACCTTATCAAAGCATCATCAAACATTCTTATCTAGTTTTGTAAAAAAATTATAAAATAATATATATTGAATATTTTTGTGAAATTTACCTTATGCGGAATACAAATTTAGACCCTTTACTCATAGAATAAAAAAAATATTGTAATCGTCAGATGGTATTAGACCCAAGTGTACATTTTGATTATGGACGCTAATATATCGGAATCTACAAAACCGTTGCAAATTGGCGGCGATTGTGCAGATAGATTCTAGGGATTCCTATGAAGGGCAAGTTTATTTTAGAGGAGTGCCTCGCACGGCCATAAACATAGTAATTTCCCTATTCGAAAAATCGAAATCTTTGTAGTTATACCGTTTTTAGAATTCCTCCGCAATGCATATAGCATGGTCTTATTGTCACAAAGCGCACAAATGAATGGCAATAATATATGTAAATAAAAAAGTACAGGGGTGGTCAAAGCATTTACGCAACCCAAAAGTTGAATATACTCATAGTTTAAACTTAGGACTTATTGAAAATCATTTTGATTTTTTGTATAATTTTTTGAATTTAACAATGTCAGAAAGAAGAAGTATGAAAAAATGTACGTGAAGTAAGTTCAGATTATAATATATTTATTTTTTTAATAACTAACTATTGACCATCGCTGTTGTTTCTTCATATTTCTCTCCACCATGGCACCATCTTCCGAACGAATGCTGTTTAGCTTCGATTCCAAATGAGGGGTGCCATGGAAATCTCTTTAGTCGGCCAGCATTATAGCAATGGCTGGTGATGGCTTTCACTTCTTAGCGGTATGCTTTTTCCCCCATGCCAGTTATGTGTAATTAATTTAAGTAATTATTTAATTTAATTTAATTTTATTTTATTTTAATTGAAGTTTTCTTTTTATGTATTTGTTGGACAGAGTTTTTTTTATTATACGTTCTATTCTCGTTGACATTGACTTCGAAACTACGCTTAAAGTTTATAGAGGTACAGCATAATTGACTGGCGCCTCGTGTTAACATAACCGTTCGATGGCTTATCTTGAGCTTAAGCATGTTGATAAGATCCACAACGTTATCTACATAAGCGAGCGAAACAACGGCGAGAGAAACTAGCCCAGAATAACTACATTATAAAAAGTTGTATATATAGAGAATAATATAGATATATAACTCCTCCCCTCTTAAGAATGATTAACGTCCTAGTTAATAATTAACATTTATCTAAAAATAACAAATTACAATGGTTTTAAGTGGTGTTTATACAAATAAACTTTTTCGCTACGACTATCATTTGAATTAGCATTTTCGTTCCTTTCGTATTCATTTAAGTACTCTCAATTTCTTATTAATTTCAATCGCTTAAATTTAGATCTGTGTCGTCTTATATTTCGATTGTTAATATATTCCTTATAGTGAGTATCATCAATCTTAGATATTTGTTTAGTTTTCCTAAATGGGTTATCAATTTTTAATTTTCTTTTTAGTTGCATATCTACTTTGGCAAAAGCTGTATTTATATCATGTTCCTTTCTCTCTTTATTTAATCGTTTTATTATATCTGCCTTATTTTGTTTTACGTCTACTTCTGGCTCTTCATTAAATAAAAATATTGATGCTGGAGTTTTTCTAGTAACACCATGAATAGTTTTGTGTTTGTAATTAAAAAAAAATTCTTTTATATCCATTTCAACAGTTTCTAATTTGTTTTCCGTTCTACTTATACGTATTTTTTCATTTTTTGTTCTATGACAACGTTCAATATCAGCTATTCCATTTTTAGAGCTTGTTATTTCAATGTTTATATTTTCTTTTTCTAACCATAAGGCTAAAGCTCTACTTATCATACCTGAATCTTGATCCATTTTCAGTACCTTGGGTTTACCTAGAAAATGAAATACCTTTAACAATGCTTTTTTTGTTTCAATCCAATTAGTAGATGTGGTTTCGGTGGCTAACAAAAATTTGGATTTTAGGTCAATACAAGTTAAGAAAGATCTACTATTTGTAAAGAAATAATCAATAATGTATTTATCTCTAATTTGACGTTGGAGTAATTTCATACGGTAAATCTGTCCGCCTGTTTTCATGTTTACTTTAATTACACGTATTGCATTCGTTAATTATGTTTTGTATTAATTTTATGTAGTCTGGGTAAAAATATGAGTTTCTAAAGTCTAATATCATTTTTTGAATTCCTTGATGAATTCTATCTTCATATATTTTAGTAATGAGGTCTTTAAATTCTGAATAGCTACTTATGTTGATAAGATTTGTTGTAGCTTTATAGAGTTTGGTTCCAGTGTTTGGTCGAATTATTTTTATATATTCATTTTGAAAAATAACAAAATCATCAATATTTTTCAACAAAATAGTAGAGGTTCGTCCACAAATGGCTTCTAGTATTATATCGTTTGCCTTTGCACTGGTCATTTCAGAATAAAATATTTTGCGATTACATTTTTTTTCTGCTTCGACTTGTTCCTTGTCACTTTTTAAAAATGTTAATTGTCTTTTATAAATATTAAGAGGACGCTCTGTGATTGAAATACCTAGAAAGCCATCTTCTTCTGCCCTATGAATTGTAGGGTCTAACGATTTAAAATCTTCAGTTCCAGACAAAAGTGAATCTGATTCGTGGTTCTTAAAGTTTGTAGCCGCTTCTTGACTCTGTTTACTCTGGAAAAAGCGTCTGCTACAAAATGTTTTTTGCCTTTAATGTGCTCAATTTCAAAGTCGTTTTCGTTTAGTCTGATTTTCCACCTTTGTAACTTCATGTTTGGGTCTTTTACATTGTGTAACCAAGCCAAATTGTAATCAATAATTTTAATTTGTTAAATGCGTTTTTTATTCTATGTTATTTATATCGATTGACTGTCCTTTTTTTAA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTATTTCTTCACGTTCTCCTTCATCTGCTATATCGCTATCGTTTGAGGAAGTTAAAATAGAATCATTCTCACTTTCAAATTTGACCTGCACCGCTGCACCGGCACTCGTTTCAGTCTCAAATTCTAAGTTATGTGCACCAAAAGATGAACTTTTTTTAACTTTTTCTTCTTCCTCTGTGGAGGTGTTTTCCGCTTCGCTATCGTCGTCATAACTTGAGCTGCTGCTGCTATAGTTTATTATTTTTTCCTTTATACCTACATCATTCTCTATGCACAATTCGTGGTGGAAAAACAATTTATTGTGAAGCTTTAAATCTGAAATATGATTGTTGGCTTTTGGTTTTAAATGAAATAAATGTTTAAGTTCCAAATCAATAGTCTTAATGCGACCTTTTACGTTTTTTTGGACTGCTTGGCGATAGCGGGTGTTCCGGGACCGAAAAGCTGACCTGTGTGTTTTCGATATTGATTTCCCTTTTCCCATCGAAATATGAGTTGTATTTCGTATTTTAGTTGCATCTTTCACATAAGAATTGGGAATCGTCTTTTTTAAATTTCCAATATCTGATGTATTGGGTGAAACTTCATTCATAGAGTTTGCTGGAGAATTGACTTTGCTTGGAGTTTTCTTTATTGTTAATACAATATGATTGCTGGTAGCTCCACCATCACCTAGTGGGCGTTGAACAATGGCATATTCCTCCCTATTACTGTTTTCGTATTCGTTTTCATTATAATTCTCTGCTTCATTCTCGCTATCACTGCTGTTGTTATTACTACTCAGATTAAACAAATTTCCATTTAAAACAGTCTTTATCCGCTTGCCTGGAATATTAAATTCTTTTTGTAAATGTTTTTTTTTTTTCATATCATCGCCTGCATATATTCTTTTATTTCGATGATGTAACTTTGCTTTTGTGCCGAGTGATTCAATCCTCTTATTTTTAAGCTTTTCATTTATGGAGTCTTGAGTTTCTTTTAAACTAGAAAAGCTAAAAGTGCTTGAACTACTAGCACTATGAGGACTGTCACCTTGATAATCGTTATCACTACTTGTATCGCTTGTTTCAGGATTATTATCATTAGCCAATTTTAATAAACTATTACTGAAAGCATTCCCAGAGCTCGTATTAAATAAAGTTTCAGGTGATGGTAATATATTGATGTTGGGATTAACTTGTGTTGGCACGTGATTTTTAATATGGCTGTTGATACCAGAAATCGGAACATCAATGTTAACCTTTAGCGGACTGGAATTATTAAATTTATGTTCTGCTTTAATTTCGGAAACTTCAAAATGTTGTGAAATTTGTCCGAAGTGAATCGAAGAGTTAAGCCATTTCTTAACTTTGTGTTTAGCACGTCGACACGTTGGTAAACACTTTGCAACGCCAAGAAACGGTGAAATAAACGATTTAAAACGTTTCGCCTTGAAAGGTTTTATATATTTTAAAGAACTTAGATCTTTTTTTATTTTATCTGATGTAAGAAGACCATATTTAGGTACAACATCAGCTCCATTCGTCACTGTGTACGAGTCCAAATTGTGAAAACTAGGAGATGAGTCAACACTATCCCAATTGCCATTTATATTTGGTATGTAGAAATTATGCAATGAATTTATGTGAAAACTTGTCACTCTGTTGGTTTGTACATAAAACCTATTCTTTGCTACGCAATCAGGATCCTCATGAACCGTAAAAACAGGAGAAACTTCATTGTAGGTTTCGCTGTTCTCCTTTTCTAGATGATTTTTGTCAGCTTGAGCATCGGCGTTAATATGTAGCAAACTTAACGAAACGTTTTGTGCAGGCGAACTAAAAGATACATTTTTGGTATCCAAGTTTTTTTTTATATTTTCAAGTTTAACTATTGGCTTTTGAATTTCATCCATTATTGTATTCAAAGGATCGTCGTTATCATCAAAATCTAGATCAAATATTGACTTCACTGTTTTTGGTTGAATTTCACCTACTTCAACATTATCCAAACTTTCAAAATTAAAAACTTGGTCTTCATTCTTGTGGCGAGAAATATTCTTATCACAATTTGAACTTGTTGCTGGATCGTTGATATCAGAGTCTGAAGCTTCTTTTTTGGGCTCTTTTAATGAACTTTGAACTTCCTCGATAACTATGCAAGTACATGGTACTATTTGAGCTTGGTACATTTCCTCAATTTCAAGTTCACTCATTGGGCTGTTCAAGCTGTGAATTAGGTGCATTAGTTGAGTGGTAACATCGTTAAAATTCATCGGCATCAAGTTTTTTGGAGTCCTTTCTAAGACCAATGTATGAAGAGAATTACTATTGCTGTCCAATGAAGTAGTTTCCTTAATGTCTTGTGATTTATTACTATCGTGCGATGGTTCTGAAGTGAGCGTATCACTATCCGAAATTGGAGGTTCTGTAAAGTAAAAAACGTTTTTTGAAATTATAATTATAATTAATTATAATTAGGTATTTGCTACTTTTGTTGTATACTGTTTATCGCTAGACCGACTCTCTTTTCTTTATATTCCTTTATGCTTAAATACTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCCGACCCATAACGTATATATATTTTTGATCAGATTCACTAGACGAGTCGATCTGGCCATGTGCGTCTGTCCGTCCGTCTGGCCGTCTGTCCGTTCGTTTCTACGCAAAGTAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCCGATCGGAGAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTTAAAAAAAAAATACATTTACATAATATGAAACAAATTATAGCCTTGGGGCTATTTGACATATTATCTTATAATATTGGAAATATAATTTTTTTTAGAGCTTTGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTATTGGAAAAATAATACGAAAACATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATACAACCTCCTACGCTTGGAAATAAACTTTTTGCATTGGTTCTGAATTTGGAATTAATTTTAACAAAATAGGACGACTATATCATTTAGCTGTCATAGGAAGAATCGGAAAAGTTGTGGAAAAATAATATAAAAAAATGATATCTTTGGTGTTTTTATCCTATCCTCCTATGCTTGGAAATAACATTTTGTAATTGTTTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATTACACAGCTGTAGACCGACTCGTCTAATGATGCTGATCAAGAATATTTATGGGGTCGGAAAGTCTTCTTCACTGCATTGCTAACTTTAGACTGAAATCGAAATACCCTCTGCAAGGGTGTACAAAAAACATAAAAGAACGTAAATTTACTTTTAATTTAATTTTAAACTAAGTGAGAATGCTGTAGTCGATGCCATCGACTATCATATATCCATCACTCAGCTAATGGTAGTGCGAACGAGATAAATGCATAAAAATAGGAAAGCGTCTGCTCGCAAAATTATACATTTTATTTGCTTATAAATTAATCGTCCGAGCTTAACAATTGTTGGCATGTAGTACAAACAAAACAAAACGAAATCTCTCTAAAAAAAAGTGTGGGTGCTAGACGGGGTCTTAGCTTTTTCAGCGTTTGTTGGCATGACATCTTGCAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCTTAAAAATCTACATGCCAATCCCAAACTTTTTAGCCTTTGTAGTTTTCGAGATCTCACCGTTCATCCGGGCGGACATGGATAGATCGACTCGGTTAGTGACCCTGTTCAAGAATCAGAAACGGTTTTTTCTAGCGCACCGTATAAGATAAGATGGGGTCGAAAACACACTTTTGTAACCCTCTGCAAGGGTATACAAATTGTTGACTCAGGAGTGTGTGACTTTTGAGTCTGGAAGATATCGAAACAGTAAACGGTCGTTTGCTTTGGTTTGGCAGTTTAC'..b'GCCTGTGAAACAAAAGAAATAAATAACTAAAATATGTTTATTTTCAGTATTATTAATTGACTATTTCAATAAATTCAAAATATATTAATGATAAACAAGGAAGAACTCAATTTTTTCGGTAGGTATTGATGAGACAAATACATATCAGTTAAATTTTTTTTCTATCATAAAAACTAGAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTAGAGTGGGGGTGGCACCCCTGTTCTAGTACTTATAATAACCGAGGTCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACATAGCTAGTTCTACTCGGCTAGTGATCCTAATCAAGAATATAAATATTTCATGGGGAGGAAAACTCTTTATTTTACCTGTTACATACTTTCTGACGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTACAAGTAACAAGTATAAAAATAGGGTTTTCGAATTTTTTAAATATATCGTATCGATAATACTTGGGTTTTGAAAGAAAATGACCGTGCCATTGCCAAACTGTCAGCTGTACCTATACTATTTTCCGGCGACCACCAATCTTAAGTTCTCATATTAGATTATAAAGTTTTTCAAAGTGATGATACATTTACCGATCCTGGCAGGGATTTCGATTCTGTAAATACCATTCTGTTCTACTTCTTAAATGTTCATATGTCCTTCTTAAACAGAAATAGTTGTATGATACACTATACCGCTCTCAGCGAGTTGAACGTGAACTTTGAAAACTTTGATCACATAATAAGTAAGTTTATAAGTTTACCACACCCACTCTAACGCCCATAACGCATATATATGTCTGCCAAGTATTGAAATCGCGGTCAGATGGCGATTTACAATCTTGCTTTGCTGCTTGTATATTGCCATCTCCGTTTTCCTCCCTTTCGCTCTGTAATGGGTATATAAGAGTCGATCCACTCAACAATAGCGTTAATTCTTTTTTTATACCTTTTCAGATGGTATAATAAGTCGTATTTCATTCAGAAGTTTAAAGAGGTTTCCGACCCGGCTTCGGGCGCAGCGTATGATACTGGTTCCGGTGCTGCTGAGCATTCAATGCCTTTTTCAATTATAATCTTAGTTATTCATAACTCATATTTCTATAGTATGGCGATTGTTGTCATTATAAGCATATAGACAGGTAATAAGTGTAATAATTAGTCAACTCAATTTTAATTTGCGACTGTGTGTGGACGCTAGACAATCTTCAGCGCTGTCTGCACTATAATGCCCAAACATTCGCTGCGCAGGATGTCTAAGATCTGCTCTCTTAATCCCATCATTTTAGCTCTTATATTTCCGATGTATCACAGTTCCTATGGACAATCAATTAGGCGTTTCCGATCCTAGAAATTATCTACTATAATTTCTTGCTCTTTCAAGTAACGGTTAACGGAGTAACGGTTATCTGATGGTCCTTGTTATGTTTGTGTTCCCTGATCAGGCTAAAAGATCTTGACAATCGGGCGACCACCGTATAAAATAGCCCCTATCGTAGCAAATGTGTCAGTTTGTGCTTTGCAACGAACAACATTCATTTCCAACGTTGTTTTTAAAGAAATTTCTAAAAATATCCATAGCGCAATTACTCTATTAATCTATTTTAGCAAAATACTACATCACTGTGATCGGATGTTTTTCTTTGATTTCATAATAATTGCGGCCTAAGAAGGCTTTTATTATCAATAGTTGATATCAGAATCTACCAAACGGGATAGTTATTTTAACCATTCTCAGCAGTTTAAGGATTGTCGGTGACACATTACAAGGAAGTCTTAGCACATCATTTTTGTTTGTCGGCTTGTACATTCTTTTTACTTTTTAATTATCAAATAATCACTCCATAATGAACATTTTGGGAGGCACCTGCTTCACTCACTTACACTGTTCCTAAATTCACAAATGTTTTAGTGTAAATTATTATTTGCTATCCACTCCCACACTAGCTATGGCTCTTGGTAAATGTAGCAGGTGGCTCACCTCGCGCATCGTCAAGAGTTGTGCCATTACAGCAAGCAAGTCAATCCTGTCGAGCAGTTCAAAATTTAAATAGGGAGGATGGCCCGAAAGGTCTGTGCCTGATTGGCCAGGGCGACGCGACACAATAGCAAATCGCAGCGTGACGCGTATCCGTATCGGTATCAGTACCCGTAAACGTCACTGCCAAGCGACAGCGTTCCTCCACCTCCACCTCCACGTCCACATCCACCGACACTCAGAGCTCGCTGCTCTCCGAGGCAGCGTTCGGCATACATGGGCTATCCATTCGGACAGGGTATCCAAATCCAAACGAACGTGCTGTTTTGCCTCTCGGGCCCGCGATTCCACCTGCCGTCTCTGTGCACTTACGCTCGCCTCGTCGCCACCGCCTTGGCATCTGCTGCATCTACTGCTCCGGTCGAGCCATCGCGGAAAACTGAGGAAGCTGACGGCGCTGGAGCACCCGAATATGAGGCTGTGGCTGGCGGAGCTGAACAATCGATTGTTCCAGGCACTCAGGGCGCAGCAGTTGCGCACTGTGGGCCGGAACGGCTTACAAGCGGACACAACCTCCGTTTACGAAAGCGGGCTGATTGGGACCTCTGGGAACGTTTTATAAACATACCTTTCAACGATACGTACCTAAAAAATGTTTATAATAAATTTAATAATACTAACGAGGCTTTGAAATTGCCCCTGCGGTTGGACATATTTCGCATTTTTAGGGCAATTCTTCCTCTTTCGTTCCGGCTTCAGGGAAGTCTAATCATTTGTCAATATTGGGTCACAAAAAAAAGAAAAACATAGGGGCATCATTTGTGTGTCAACTGGATTAGTTTTGCTCAAGTTATTTGAGTAATTGAACTCCCGGCCATTAAGGACAACGATAGCTCGCACACCCACTGTGCAGCTCAACGTTTTACTCTCTTATCGCTCTTCTCTTCTCTTTCTGCTACTCTTCGCTTCGCAAACCGACGGCAGGGCAGGTCCGCTCTTTCCATCAGCACTCCCACCCTTTGAGGTCACAAAACTGCTCGCCGAGTTGGTTGGTTGGGGATTGCCGTAAATGTGTGTGGGCGTGGATTCAATTGTTCTGCACATACATATTGTTGCACGAATTACGAGAATTGTCTCTCTCGCTCCTTGTTTTTCGACCAATGCTCTCCTGCCTCTCTCCCGCTCAGGGAACAACAGGCCCCTAGCACCACCCCGCGCCCCAGACCCCCTCCTTGTACATCTGTCTCTGTCCCACCAACGCACGCCGTCGAGTGAATACATGAGTGCCGAGAAACAAAAACCTTTTTGTTTCTGCTCGACTCCGAAATCGATGGAAAGAAAGCCAAGGAAAGGGCATTGTCCAACACAACCGTACATATATGTACAGCGGAGCTCCGCCCCTTTTCGTGCAGCGACGTCGCAAGTGGTGGTGGTTACTGCTCCGCTTGTCTCAGCCAATTGTCTCTTCAATTATTTGCTATTTTATTGCAGCATTGCGATTCGGTTGGCGGGCGGATAGCGAAAACCGGTAACGTAAGTATGTTTGAAGGAAGCACATGCCTATGTGGACGTGACTTTGCAACATACATGTGGGTATGTACATGCCCTTCGGCTTTGCAAAGCTTTTCCACTACTTCGGCCATGTACGCTTGGGCGTAGATTGTAGCTACTAGCTACTAGCTACTAGGCAGGCATTAACCTGGTGGTGGCTCGAGCATACTTTGTAAGACAATTTGCTGCACAAACCCACATTGTTGACCCCCAATTACATAACGCATCCGAAACGTGGGGAAAATAAAAATATGCCTTTCCTAAATATGCATGTTGTGGATAAACGAGTATTTATTTATTCGCCCAAAAATTGATTTGCCCGGTTGTGATACATAACTGTCTGTCCCAGTAATTGGAGAGGGGTTCGGCGGTGTCGGACTGAAATTCGAACATATATATACACCCAGAAAAAAATGTCCAAAAATTCCCATAAATCTGGCTCTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTGACCTAACATTTGGGCCTAAAATTTGGCCATTTTGGGCCAAAATGTGGGCATTTTTGGCCTTGATTTTGGGTAACGTGCTGCCTAAAACTACTGTAGGTTAGCTTAGGTCTGCTCTGGACCTCCCTAGCTGGTATCCGAACCGGGGACCTTTTGCATCAGAGGCAAACGCCTTACCTCATATGTAAGGCGTCGGACTATGGCGCAAAAAACACGGTTCCTGAAAATCAAATGTACAAAATGTATTTATTTAGTAGATCGTTTATATATTTCCGACACAAAAATTGATTTCAGAACTTTTGTTTGCCGAAGGTGCGATCGTCACTATATTTTTACCTCGTTAAGAGGTGTTTTTGTAGAGTATGGATACGCATAAAAAATTCAATGATCAGACGGTGTTAGGTGTTCTGAACTAAAAAGTGTGGTTGATTTGCAACCATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGTAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGACATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTTAGTTTTGAAGCTGTCGGGCTTAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGGTAGGTAGGTAGTATATAAGTCGGAGCCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTACAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAATTAAAAAAAATATATATCTTCGGTGTTTTTAAACATATAACCTTCTACGTGAAAATAACATTTTTTAATTACTTCAAAATCGGAAGATTATATCTTATATAATTAAAAAATGTTATTTTTAAGCTTATAAAGTTATATGTTAAAAAACACTAAATATATAATATTTATTTCATGTTTCCCTACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGGAAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAACTCAAAACAAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTGGGGGTATATATTAAAAAAAACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACAGACAGGCGGACATGGCTAGATTGACTCGTCGTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTGTGGGGTCGGAAACGTCCTTCATTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAACACTAAAAATATAATGTATACCCGTTACTCGTAGAGAAAAATGGTGTACTAGATTCTTCGGAAAGTTGTAACAGGTAAAATGAAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGTTCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTCTGCCTGTTAAACGTATGAGCGCTGAGATCTCGGAAACTATAAGAGCTAGAAAAGTCAGACTTGACATGCAGATTCCGGGCTTCCTGCGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGCGGGGTGCCACGCCAACTCTATTACGCCGATCCGCGAAAATCAGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATAGAAACAAAATTTTAACTGAAAAAATTTGCAACGTCCACTCTCACGCTCACAAACGGTTTAAACGCTTAAATCTGTGTGCCGCCCATATAACATCTACTGAAATAGCCGGTAGGTGTTGCCCTAAAATATCGCCTATATATATCTCCATTTCCCTTTTGCTTTCTTTTTATTTAACACGAAATGTAGAACTATTTAAAAAATTTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTAATATATTAAAGAACACCAAATATATCATTTTTAAAATTTTTCCCGATCATTCCTATGGGAGCTATTTGATTTAGTTGTCTGATCAGGCTGGTTCCGACTGAGGGAGCAAAAGGAAAATGGAGGTACACTGACGAGCAAAACTGTAACACGAGTTCAATGTTTCAACAATGTTTCTGTAACATTTTTCTAATGATCGCATTTTGAAGATCTTAGTAGGTTAGAAACCATTTGATATCAGTAAAAGAAAATGGCACGCCAAACTGTAAAAAATTTAAATGTTACAGTTTTGCACTCACAATGGCAATGCTCTGCTTTTTAGTTCTAAAGCTTAACCGTGAAATGTTATGTGGCCGGCAAACAGTTCTAAACGTTTTAGCCGTTTGGGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAACATTTTTTTATGTGAAACGCTAGGTATTGATAAGACAAACACATTTAAGGAAACAAAATTTTATAGCATGAAAACTGTAGCCGCCACAGTTTTGTGCGTGTGCGTAGCATATTTTTTTGGTTAATCGATAGATATTGATGAGACAAATACATTTCAGTTGTTCTATATCATAAAAACTGTAGGCACTACAGATTTTCGCGTATTGTGGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCCCACCGACAAAACAAATCATGCCAAGTCTGACTGCTCCAGCGTCGGAAACACTTCCTTCTGCCTGTTACATTCTTTCTGAAGAATCTAGTATACCCTTCTGCTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTTTGCCCCATAACTTTAAAACTGTGGTATTTAGACCAATCTCGTTTGAAAGGCGTACAAAGTATTTCAAAATTCCTTTCTAAAGACATTTTGGACAATCCTGTAGCTTTAGTAGTTCACAAGTCACGGGTAAACAAAACAAAACATAGCTATTTCTAGCTGTTTTCTCCCCGAACTAGCTTTTTTTTTTCAAGAGTGGCAGAATTCATTTTTATATTAAGCTGGGTAACATCGTCAAGAATTTTGTGGCCTCTAAAATGTGGACGGCAGTCCACGTAGTGACAAAGCGCACCAGGAGAGTGGCGAAGGCGACTACTCTATATACATGAAAAAATTTAAATCCACTATGATTGTACTATTGCTACTCAAAAATCAAAGGGAATGCCTACCAATACTTCAAATAAATTAACTAGTAATTGTAATAATATATAATTTTGATTTGAGCTTTTGGGCTGTTGGTGATAATTATAGGTGTTAACGAGAAAAATTAAAAAAAAATTGGTGTAGTTGTATTCTCACTTAAAATACGCGTCGAATGACACCCATATGTCAATATCAGGTGGTTCCTTTAAAAGTAATACGCAGAACAAGATTCTAAAAATGAAAATTATCCCAAACCACGTGAAACAGCTTAATGTAGGAAACTTTTGGAAAATCGCTAGCTAGTAGTCGCTAGCTGTAACTTGTGAGCTACTAAAGTTATAAACTTGTGCTATATTTAGAAGGGTTTTTTGATATATTTTGGTGCGCCCCTCTGACATTAAGCGAGGTGCCACGATTTTCCAAAAATATGTGCCTCGCCCACTCTAACGCCCACAAACCTCTAAAAACTGTTTCGTCAACACCTCTCGATTGTCTTAAAAAAAATTTGCAACATACACTCTAACGCCCACAAGCGGTAGCGAAGCGATATTGTAACACGCCACCTACCAGCTATTTCAGGGCATTTTAAGCAGACAGACAGATTTAAACGTTTTGCCTGGGCGTTAGATTAAAAAATACTAAGTACGTCTTTTAACATGATTTTTCTAAGTATCACCGATTTAAATTATTCAGAACGTTTTTTTATTTCGATTGTTTTTATTTTTCCAAAAGAGCTTATACAATTTTGGGTTAAATGCCAAATATGGAAGAACGCTGCAGGCGAGTGGCTCGACTATCAGATACCCTGTACTCAGCTTGAGGAAGAAAAGAGAATTGGAGATATATAAGGAGCTAAGCGATATTTTAAAGCGCCACCTACCCGCTCATTCATTATATGCTCTGTGGGCGGAAGACGGATTTAAACTTTTTTATGTCAATTGAAAGATATTGATGAGATATATTTCACCCAACAACTTTTTAATTAAAATGAAAACTGGGCTGAGCAAAAAGGTCAAGAATC'..b'TGTAGCGCTTTACACTATCGCTTTGCTGCTTACTATATCTTCATTTCCCTGTTGTTCTTTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTTATAAATACGTAAAGACGTAGTGAGAAGTATTATTACAAAAAAACATTTTAGGTCTTATATGTCATAACAATTGTGAGAGAAACCCTGGTTCGGACACCAGCTAGATCCAGAGTACTCATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATTTGTTGAACTCGAACCCTGAGAACAAAAAAGTGTCGGGACGTACCATCTGTTCCGCAGAGCCAAGTCTATATGGAAAATTATTCTAGACAAAACAAATCCTTGTTAGGAGAAACTTTTTGAATCAAAATTTAATTTTAGTTTTCAAGACAAGGAACAAAATTTAAAAAAAATTCATTCAAACGGTATTTAAATTATCTTTCCATTGATGCTAAAAGTTAAACGAAGCAAGTTCAAGTTACGATGATATATTTCGTTCTTGTGTAAATACTTTTGACCACCCCTGTATATATTTTATGGGGTCAAACTTCTGACTTAATTCATAATTAGGTAATAATTATAGTTTTAAAATATAATTAAGAGTAAGAATTAATTACCATGTCGTTCTTGAAGACAGAACATTTAGCCTACAACAATTTCGCACAAAGAAATATGGAGTAGGTTATTTTTAATAACTAATAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTATATATCCTTGCAGTTGTAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAGTTGAATTCGAAGTTCTTAAAAATATTTATGGTTATATGTTAAAAAACACAAAAGATATAATTTTTGTTTTCCTACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAACTCAAAACAAATAAAAAATGTTATTTTCAAACGTAGGGGGTTGTAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTAATATTATTTTACCATTAATTTTCCGATTGTGGCTATGGGAGCTATATGATAAAGTCGAAATTCAGAATTAATTTAAAAAAGTTTATATCCTAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGATCCGATCCGGCTGGTTCCGATTTATACACTACCTGCAGTATAAAGAAGATTTTTGTTAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCTACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAAAATATATTTACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTTCTTTACTGCGTTGCAAACTTCTAACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGCTCTATGTAAATACGGATTTGCACTTTGTCAGAATAGGCGTACATCGTAGAATTCCAAAACAAACCGGAAATACGTTTGATAAATTTTCTGAAAATATTCTACATTAATCAAATTGTGCTAACCTTGCAAAGCCATTGCAATATCATAACATGACAACCTCTCCGCTGAACGAGCTTGACAACTCGGGATGGTGGAGGAGAATGAGGAAGAAGTAGTATATAAATATGCTTGTATGTGCGCGTAGAAATATGCAGTCGTAGAGCTAGGGAGTGCTACTTCTGGGGAATAGAAATGGGAAGAAAAGGCAGAGTTCTATTTTTAAAAGAAAAATTTATGAATGAAAACAGAAACAGAAAATCATACCGCAGAAGAAACGGAACACATCTGAACACATATCTTCATATATAAGACATCTTTGCGAACTTTATTTCTATCTTGCGCCACAAAAACTTTCCGAATATCTTTATGCTATTAGAGACAGATAATTTAAAAGATTAAAATAACCTTTAAAGAAATAAACAAAAATATGTTAACACAAATCAAGTTAGGAATTTAATAAAAAACAATATAGAACGTTGTATCCGAGTGTCCGTGAACCAGATAGAACCAGAAGTGGTAGAGTGTGACAGATGCCTGGGCTTCCTGCGCAGCGCAAGTTTATTTCAGCAGGGTGCATCGCCCACTTTAACGCCCCCAGTTTGGGAAAAAATGTAGCGCCTTTAACTTTTACGCTAGAAACGAAATTTTAACTGTCGATACCTATCGTTTCGTCAAAACATTTTTCCACACCCACTGGTAACGCTTACAAATGGCCAAAATGCCTAAATCTGTCTGTCGCACACATACCATATATTCAATAGCTGGTAAATGACGCTTTACAATATCGCTTTGCTGCTTATAAATCTCTATTTCCTTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAAATTATTAAAAACTTTACATTTTTCAGTAAAGTTCTACTGTATGTAGAAAAAAGTAAAAAAGCTAGACGTTTTAGAGCTTCTTCAGCTTATTGTTTCAGCAAAGTGCCACGCCCACTTGGATGACCATAGCACTAAATTATATGGCAAAATTATTGAAATCGGACAATTCGTTTTACCCGTTACTCGTAGAGTGTATTTATTTAGTCGAATGTAAAAGCGTTACTCGTCATAAAAGCCACGACCCCTCACCTCGTTTAGAGGTGTTTTTGTTTTGTTTGATATCGTAAGTTTTTGTTTTAAAAGCTAGCTAAGTGGGAGTGAGTAGTAAGTGTGACTGTGAAAGTTTGAAATTGGCATGCAGATCCTTGTGGTTTTTGGACAGCGCAAGTTTATTTTAGCAGGATGCATCGTCCTATCAGAAAATAACGCCTACAAACGCCCACACACCCACTCCCTAGCGCCAACATTTTTGAAGACTTTGAAAAAGTGTAAATGCCAATTTATTTTTATATTCAATATCTATATCATGCCAAAAATGGTCGAAATCTGACCATCAATAGGGTTTTTTCTTAGAGGTAATGAAGAAAAAAAGATCGGCTACATGTATGTTTTTCCATTTCAAAGGCACATAGAGGAAGATTGACGTATTTTAAGTACTTAAAACATTTAATTTCATTAAAAATATTAACAGAATATTTATATTTTTGTTATTTTTGTTGGTGGTGATGGTGTGATTGTGGCGGTCTTAAACGTGGACAGATTTTGAAAACTAAGTATAAATATACGAATACAAAAAAGTGTATTCCTGGCTGGAAAACTTATAAGTGAGAGCCACATCTGGGGCTATCATCTACCGTTTTCGATAAGCTTCTCTTTTTAAGCAAAAACAAACATGCAAATAATACGGAACATGTATAAGGATAGTAAAATAATGATACAAAGTAAGGATTGTAATCAAAGGACAGTAATGTAGGGACATGTAGCGATATTTTTCCCCAAAAACATAGAAAACATCGATATAACGTCGATCAACATCGATATAAAAATCTAGTGAAGATCGCATGTATTTATGTATTGTATTTATTTTTTCAAAATCTGTTATGCGAGTGCATAGTTTTAGTTTTTGCAATACAATCTACGATTACAATCGATTTTTATTCCTTCGTCTATCCACAGTAGTCGGAGTTGCCGGCGTGGCGGATAATAAACTTGCGGTGAATCTAAAGTTAAACTCCCACCCCGCTAGCTCACATTGTTTATCAGATTACGCCAATATTAAGACAATATTATAACAATATTAAGCGTTATATAAGTAATTTGACTAATGTTTAAAATATAATTGCCTTGGACTGAATTTTTGGTACAGAAAACTACCATTTAAAGCGAAGAGCTCATTTGACTTTAAAAGAGTCCACCCTATTGTACATATTTACTATATTAGATAAATGTAATTTGCCGTCATCTCAAAAAGCGAATAATCTATATATATGTGTGAGTGCCATAAACACTGGCACATGCAGTAAATGAGACCTATATAAATATAGAAAACTAAAAAAAAGATGAACAATATACTATCCCAACGCTTCATATAGATTATTGCACGTACAAAACCTATATAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/6f3/756/31/scaffold_44-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAACTTTTTTATATATGTAAGTACAAAATCCGTGAAAGGCGCTCGTCTGCTTTGCCACCCATTTCCATCTTCCGTCCATTTCTGAAGAATCTGTAAGCCAATTCATAGAGTGGGCGAAAGAAAAAGGAAAAATCTCTAATAAAAATTGATCAGCCAGTTCATATTTTATACACACGACAACATAAAAATGCTGAACTCATCCATAAATGTCATAAAATTCATATATATTGCTGTAAAATGTTCATTGTCATTGCTGAAATGATTTAGGTCAGACCAAATCTTCAAATGCCTGTGTTGGCCTTTCTTATTATCTTATTTATCATTGCCAACATATAAGCAGCTAAATTTGAATATGCGTGTAGCTCCACGTTAACACTACTTTGCATATATACACCCGCTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGTGTTCGAAAAAATGTAATTGGTTGAAGGTTGGCAACATTTTTGGTTGGGGCGGACTAAAATGCTGTGTTTGTAATAAACATAATAAGAAAACACTCATTAATATACAAGATAAATCCTCCTCTCCTCTGTCTAATTAGTAATTCAAAATGATGTTGTTTTTTGCCCTATAAAATAAAAATTTTTAACAATAAGATTTTCGTTTAAACTAAAAAAGGCAAGGCCCAGGCTGGATACCTGCACAAGACGTGCGATGGAGATGGCAATATGCAGCAAGGATAGTCCGTTTTCGACAGTTTTCAGCATGAAGATAGATATAGATACTGAGAACAAAATTACATTTACACTTAGTCACAGTGCTAATATTATTCTAAATAAATTGTCGACTCGCTTGTGAGATTTGACCTTATAATACTTGTCACCTACCATACACTCCCCTAATAAATGAATTTAACAACAACAATTTAGCAAGAGGATTGTGGTTTGAGTCTTGCTAGAGTAAGTAAGTCGGATAAATTGTTTTGTTGTTAAAATCATTTATACTCTTAGAAATCTTTCTGTAAAATAGCACTAAAATAAAGGAAATTGTCCTAAAACGGGAGTCAATGGCGACAATAAGGGCAACATGTCTAAAAATAGGTATGAATTGGTCTTACATGTCGGGCGATTTTAAAATATATATCTACGTTAGAGTTTCTTGAATGTAGCACAATTTGTCCCTTAGCCCTAAAATATAAAAAACAAGAAAGGAACTTAACTTTGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCATGCAGATATAACAAAAATAAACAATAATTTTATTAAATTGAATTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGACAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAAGTTGTTTCACATTATTTCCAACCAATTATCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTTGAAAATCAGAACTAATTTAAAAAAGTTATATTCAAGCTAATAAGGTTATATGTTAAAAACCACAAAAGATATAATTTTTATTTCATGTTTTCCTACTAATTTTCCGATCGTTCCTACGACTATGATATAGACGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATCTAAAAATGTTATATCCCAGCAAGGTATATCTTAAAAAACACGAAAGATAAATATTTTTTAAATTCGATCCGGCTGGTCTCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGATTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAGACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGGTCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACTTCTAACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAAGGTATAAAAAGTGGACGGCAGTACACGTTGTGCGAAGACAACGAATATATAAAGTCGCAGAACAGAAAATCTGCCATGATGGTCCGTTCGTAATAAGTGATACACCATTCGAAAGATATTAAGATATTAGAAATATCAATTTGTTTGGGAGAAAAAGCGATGCAAGTGTAAAAGGGAAAATTTAGGAAATTGAAGCTGCAGTGGGTATAAATGCCCCCGACCTTTAACCTAGTTTTATTCTTACTGAGAATACGCGTCGAACGACTTCTCATTTGTTATATCCCGATGACACGAACAAAAGTAAAAACAAGATTTTTTCATCTTTCGAAAATGAAAATGTTGGGCTTGTATGCATCCCAGATTAGTTTTAGGGTTTCGGGAACCCCATGGGTATATAAGGTAGATCGAGTTAGAAAAGTTGTTTTAGGACTTTTGGAACACACTAGCTTAGCGGAAAAAAAACCAGAAAGGAAGTAAGCTACGGCAAGCCGAATTTTTTATACCCTTGCAGTTACCAGAAATAATCAACGTTAATAACACTATGCGCTTTAGTTATATTAAAAAAAGTACTTCATTACTTTTTTCGCCGTTTTTTTGATACCTTCGTATATTTTAGAATCTTCCGTTTTTTATTAAATTTAAATTGAAATTCTTAAAAATATAAATAATGATATTCCCAGTTCTTTAAGATAATATGTCAAAAAACACCGAAGCTAAAACTTTTTTCATTTTTTTTTCCCACCAGTTTTCAGATCGTTCCTATGAAAGCTATATGATATAATCGTCCGATTTTGATTTAATTAAACATGAATTTCAGAACTAATTAAAAAATGTTTTTTTTCAAGCGCTGGAGTATAAATATGTTAAACAACATCAAAAATGTAATTTTGTATGCTATTTTCCGATCGTTCGTATGACGGCTATATAATATAGTCGTCCGATTTTGATCACATTTATTTTGAAATTCAGAATTAATTAAAAATTTTATTTCCAAGCGTAAATTATATGTCCGTTAAAATTGATTATTTGTTATAACTGCAAGGGTATTAAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAAGTTCCTCTTTTGATTTTAATTAAAAAAATACAAAAGTTTTGATAACGAGTTTTGTGACGACTAATGCTTGTTAGTTCAACTAAACAAATACACTTCCTTAAAGGTGTTTATTCGGAACGCTTCAATAAAATATTCCTTTAATGATAGCACCTGAAATATTTGGATGTAGCACAGAATGAAAACACTTTAGGAAGTGTATTTATTTAGTAAAAACAACAATCACCAATTTAACAAAAATCGGATTACTCCACCATATAGATGTCAAAAAGATGGTCTAAAAAAATAATTAAATACCTTTTTAAGCCAGCAACAATCTTTCAAAATTTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATTATTGCACGGGGTATACAAACTTTGCATGCCGAAGTTAACTATCTTTCTTGTTTTAGAATACTTTATACTTTTACGAAATTCTTAGAATTCAAGTTTCTAATTGTTTATAAGAATTTAAATGATTCCAGGACAATAAAATGGAGTATGGATACGCACAAAAAAATCAATGATTAGGCAGTGTTAGATGTACTCAACTAGTAAATGTTGCCATTTTTGTTGATTAATAACTTTAAAGCGCAGCATTTTACAACAAATTTTTTTATGTCAAAAGTTAAGAAATCCAAAAGGGATCCACTTTAAAGTTTAAGCCGAAATCGTTAGAGAAGTTTTCGAAAAGTAGTTCAAAATTAAGCTATCTAAAGCGGTTTTCTTGCCGTACTAGCTAGTTTTTCCAAAAGTGTAAGAACTAATGTTTCTAATATTGAGCTGTTTAACATCGCCTAGATTTTTCCGGACGCCTAAAAACCGTTAGAACTAAGCTGACAAACAAAATTTAATTTTCATATTGAGAAGTCCCCCACAATCTTGTTTTGCGTACTACTTTTGAACGGAGCATACGAATTTGACAGTTGAGGTGTCTTTGGACGCGTATTTTATGTAAGAATACAAATAGATAAATATTAATTTTTCCCAAGCCCAAACCTTCTTCCTCCTGGTGCGATTCGTCACTGCGAGGACTAAAGACCACAGT'..b'ACTGTTAGCGAAGTTAAACTTTCAGTTATTAGAAAATCCATTTTTGTTCCCGTGGGACTTATGGTGGCCAAGCGTTGAAAGTGTAAAAGTAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGTAAACCGAAGTTTATATACCCTTGCAGTTGTAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAACTTTTTAAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTTAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTCCCATCAATTATCCGATCGTTCCTATGATAGCTATAGTCGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTATAAAATGTTATTTTTAAGCTAATAAAGTTATATGTTAAAAACACCAAAGATATAATTTTCATTTTATGTTTTCCGACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGCAACTATATGATATAGACATCCGATTTTGATAAAATTTTATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTTTTTCCAAGCGTAGGAGGTTATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACCACTAATTTTTCGATTGATCCTATGGGCCTATCCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTATTTTAAAAATGTTATATCCAAGCTAAGAAAGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGGTATCATTTTTAAAAAATGTTTTTCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGATCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAAATTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAAAGAAATTATTATACCCTCTGCAAGAGTATAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTCCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTAAAATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTACTCTAACATATAGATGTCAAAAAATTGGTCTAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTTATTATCACTGAAGTCAGCAACAATCCTTAAAAATTTCACATGATGTTACTAAAGTAGATTATTTCTAATAAATGGAAGAGTATACGAACTTCGGCTTTCCGAAGTTACCTTCCATTCTTGTAAAAAACTGTGCGCGCTTTCCTAATATAGTTTTATGACTTGGAACGGCACGGCACGCTGCAATTCAATATGTATGTGTCGAATGAAGAAGAAAAAGAAAAAATGTAGAAAGTGTATTTATTTAGTATTTTCGTCACAAAAGGTAATATTAGACATTTTGATTGTTAAAGGTGCGATCGTCACTAGATTATGTAACTATTTATAATCTTATTCTGCACTCATTAAAATTTTTTAGATGATGGCTCAAAACTTACCTGACAAAGTAATCGACTTTGTATTATTTGAAGTTGTTTAATCATCTCTAGATCGGAGCGTTCCTTCTCATTTGTTTGTTCTTCCTCAGGAGGCGGCATATCGGCATATCGGCGGTCTCTGTAAGATTTTGAGATTATTAGCAGATGTTTTCAAACAAAATATGGGAGAGAGCTATAGTCGACAGCCAACAATCTTTACATCAAGGCACCTTAGTATTACAAGTTTTCGACTATCTTGAACCTTTTACCCAAGTAAAATCTTTTTGATTACACTCAAGTAAAATCGCCACAATAAGGGGCTAATAGTAAAATGTTCTTGATTTTATGGTATTTTTGTTTTAAATTAAACAACTTACTTTTTAATAAAATCGTCTTAATCGCAGCGACAATAAAACTCACGACACTGAGGTATCATTTGAAAGTTATACACCCAAACACCTACACCTACTTTTTATGAACAATGAAAATTTTATAACGAAACATGTTTTTATTGTAGACGTTATTTCTAGAGAGAAAGTGTATAAGGAAGAAGGAAGCGTTGGGGCCACTTAAAGTTGATATATTCTTATCAGGTTACTAGCCGAGTATGAACGCTGTGATCTTGGAAACTACACTGGTCAGCATAAGTATTTTGACGATAAACACGAAAGGAAGTTATCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGGTATATCCGACTTTGATACACTTTAATTCGAAGTTCAGAACTAATTAAAAAATGTTACTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATACATTTTTCATATTTTCCGACTATTTTTCCGATTTTTTATGGCAGCTATATAATATCGTAGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACCAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACTGAAGATATATATTTTTTTAATTTTTTCCGCGATAGTTCCTATAGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCCGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAATACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGGTTGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGGCAGACAGACGGACATGGGTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATACTTTATGGGGTAGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATATCTACATGATTTATGAAAAATTGTTTTTAATTCAATTAAATTGCCTTTCCACTGATATCAAAGTTTACAAGAAATAAGTCTAAACTACGAGTATATTTAACTTTTGTTTCATCAAACTAATTAAGCATACCGTTTTAAAAAAAAAAGAAGAAAAAGCGGTATAGTCGAGCGCCTCGACTTTCAAATACCAGTTACTCAGCTTGAGGGAGAAGTATAAAAATGTAGATATGTTAGCAAAGAAATATTCTAAAGCACCACCTACCGGCTATTTTGGTATATGTTATGTGGGCGGCAGACAATTTTAAGTGTTTTAGCCGTTTGGGGGCGTTGGAGTGGGCGTGGCAAATATTTTTTAGATCAATCGAAAGGTTTTAATGAGACAAATACATTTTAGCAAAAAATGTCTAGCATGACAACTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCGGTTTCTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGATAGTATGTAACAGGTAAAAGGAAGCGTTTTCGACCCCATAAAGCAAATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCGTGTCCGTCTGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGAACGCTGAGATCTCGGAAACTATAAGAGCTATAATATTCATACTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCTACGCAGCGCAAGTTTGTTTGCGGGGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAATGGCCAAAACGCTTAAATCAGTCTGCCGCCCACATAACATCTACTGAAAAAGCCGGTAGGTGGAGACCTAAAATATCGCTTTTTTGCAATATATCTTCATTATCCTTTATTTATTTATTTAGAAAATGTCTTCCGCTTAACTTTACCGCGATCTTCAGTGATATGAAAATCAAAATGATTTAATTATATCTCTGACTTTTTCTATGACAGCTATATGTTATAGTGGTCAGATTTTTATATATCTTAATCCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATATATCAAAAAACACAGAATTTATATTATATATATATTATATATATAGTCGAGCGCCTCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTTGAGGGAAAAAATAAAAACTTAGATATACAAGCAGTAAAGAAATATTATAAAGCGGCACCTACCGGCTGTTATGGTATATAATATATATATATATATGGGCGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTATCTGTTTGGGTTTGTTGAGTGGGCGTGGCAAACATTTTTTTAGGTCAATCGATAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCCTATGTATATAAATGTAATAGTCGAATACCTCGTTACCTGGCACTTAAATAATATAATCAACAATATTTATTCCTAAGCTTATTTTAATAAACTAAAACCAACCCATTATAGAATATTTTCTGATAATAATTAATGAACCTCACAAACTTTTGTTTGTATTAACAAAACTTTTATACTTCCGAGTTTTTGGTTTTAAAGTTACGTGATTTCCGACTTCGAAACATCAACTTAAGTTATCTTATGTTTCTGGCAATGCGGGAAACAACATTTCCATTTACGTACCATTTGCATATTCAACTTTTTGATTGCCCACATTTAGATATACATTAAGTACAGAATGAAGCGGCAATGCGAAATTCTTATACCCTTGAAGTCAAACACAAGTACGATTTTTGATACAGTTTTGGTTGAATATACTAGCGTTTGTAGTCCGAATAAATAATAAATATGCAGATTTATTTACATATTTATACCCGGTATTCATAAAGTATAAAGTTTTCCCCGTAGACGGTAGTCCACTTAGTGACGATGCGGTGGGATAAATATTCCCGCCATTAACCAAGTTCTCAAATATTCTCACCTCAAATACGCATTAAACCACAACTGTCCAAATCTATTCTTAGTTATTTGCTTTTAATGAAGCGTGCGGAATGGAAAAAGATTGATCGTATTTTCGTCATTAAAAGTTGATATTGTTGTTAGCTTGTACCGAATGCATTATGTTCTTGCGCATGAACGTCGAGTTCACAAAAAATACATTTTTATAAAAAAGTTCGCTGCCGAATCGAATTTCTATTGTATTTCTTTCCTCCAGATACCTACAACTATTTAAACAAACCAAAAAACAAATCTAAAAACACACGATATCTCTATCAAGCAAAAACAACTCTTAACGAGATTACAAACTAGCTTGTGTGCTTAACGTTAATAATTTTATATTTACTCCCACTTACAAGCCTTTTTCGTCGCAAAACTGTGTACCAAAAAAAAAGTTCAAATTGTGATCATCACGACCCTTTATCTCGTTTGATCGGCTATACCCTATACCTAATCTTGGGGTTTTCTGTGCCATTTAAATTAAAATTAAATCTTTCTTTATTTCCTCGTCATTATAAAGATAGGGGTTTGGAGCGGTTTTTTGTGGGGTCACCAAGAAGCAAATTTTACAGTGAATCTATACCTATAAAGGATTTTATTCGATTTTCCCTCTGGTGCAAACTGATTAAAGAGTTAGTTATTTTCTTGGCTAAAATTATTTAAGACATTTCATTGTTTTATCAAATTTTAAAATTTGTAACGTAAAATAAATGTTCTTAAATAACGAAATAGCATTAATTGTTGGACCGCCCGTCGTGCAAATGGTTATATCTTTTTTCACTTTCGTTCGAATAACAAGGAAGTTCAACACAACATTAATTAAATTATACTTTAACAAAAAACAAGACCACCACCACTTCGGCTTGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGCTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATGTGTCAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTATAACAGCTATTTGATTTAGTCGTCCGATTTATATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGCTATTTCCAAGCTTACGAGGTTATATGTTAAAAAACAACAAAGATACAATTATTTTTTAAATTTTTTCCGCGTTAGTTCGTATATGAAATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTTCAATAGAAAGAAGACCTTTGGGAAAGTTTTAGCCCGATAGCGTAGAAACGGACGGAGAGGCCAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTAAAAAACCATACCAGTTTTTGGGAATGCGTTTCTAAACTTACGACTGAGACGCCTGACGAAGCCACTAGCCAATAGAAAAAAAGAAACTGAAATGTAAAGTTTTCAATTAAACTTATGGATTGCCATAAAAATAAATCCTGCCGCGCCCAACTTAAAGCCCATAAACAGATGCCACTTTACAATCTTGCTTTGCTCCCTTTAGCTAAATAACGGGTATCTGATAGTAGAGTTCTGATATCAACGTCTGTGACGATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATTTATATTTTTAACTCGTAAAAAGTTTTTGTTTTATATTTAAACAAATCATGCTAGAAAGGGTTACACATTTCAGAATACCTTTCTAGTAACATGTAGCTTTAGTAGTTCACAAGTTACTGGTGTGCAAAATGTAGCTATTTATGCTTCTTCTATTGAGCTGTTTAAGATCATCTTAAATTTCCAGGACCTTCAAATTGAGTTTGGATTCGCACAAAAAAAGGTCAATGCTCAGGCAGAGTAGGATGCTCTGAACTGGTAAATGTGGCAATTTCTGTTGAATTATAACATTATTACTGAATGTGCCGTATGCCAACAGTTGAGGAATCCCAAGGACTAAACACCTTAACATTTTATTTGAAATCGTTAGAACCGATTTTGAAAAATCAGGAAAAGGGCTTAAAGAAATCTAAGCAAAAAAAATCTTTGGACCATAATTTGTAAACGGTATTATTTAGACAATCCGTGTTTAAAAGGCATACATAATATTTCGAAATACCTTTCTAACGACGTATCGCACAAGCCTGTAGCTTCACTAATTCACAAGTTACGGGTATACAAAATGTATCAATTTACAGCTGTTTTCTTGGCAAACTAGCTAGTTCTTTCAAAAGTGGTAGAACTAATATTTCTTAACTCCACCCCCCCCAAACGGATCTAATTTTCCAAATTTGAACTTTTATACTTCACCCACACTAAGTCTTAATATGTAATGCTTTTAGTTTTTTACGTGGACTGCCGTCCACATTGTTTCTTGCTTTCCCGAAAAACTAAATCACTTAACCTAACAGCTGCTAATGCATATTTACGCGCACGCAAATCTTGTTTTCAGAATCCTTATTCGGCACTCTTTCCTTTTAATGTTTAATCAAACATATTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACTACTATATCTTATAGCTCCCAAAAAATTTAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTTTAACATAGAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTACATTTTATCAAAATAGGACGACTATATTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACCTCGGCACCTTTTGGTCTGCGTCTTTTGGAAAAACGCGCTAATTTATCAAAAATCATTGAAAAGGTCCGATTTGAAATACCTACAGTTTCACTGTATTGCACTGGCTAAAGCAGTGTTACCTTACGGTGGTTAATACTGAAATTCAAATTTTAGGCGGAATTCTGTTATCAGCCTAACAATTCAAAGCCAAGCCAAAAAAATTAAATTTTACAATGGATTAGGTTCAAATATGGATTATTTGGTTCGTATGGACTTGTCGAATTTCTTTTTCAATATCAACGCCTTACCTTCATTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGGAGGGGACGTTTCAGACCTCATAAAGTATATATATCCTTGATCAGCATCACAAGACCAGGAGATCTAGCCATGTCTGTCTGTCCGTCCGCTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACATTCCCAAAAGTCTTCATGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCT'..b'AGAAAAACTGAATGAGGTTACTTTTACTTTGAAATGAGCGCCATTCGTTATATGGAAACCATGGTCGCAAAAATACTGTCAACTCATAAATTCTTAGTTCGGGCACTTAACTTGATAATGCTTTTAACTTATAATAGACGTTTTAAAATCTTTATAGTATTCAATACCAAAATAACCTAATTGATATTTTTTAGTTTTATTTTATATATGAAGTTTTGTCTGCAATAGTTCTATAAACTTGCTTACTACACTTGCTTACTTTTCACATTCATTAGAAAGTACTCTTAAAGACGAACAGTATACATTTACAACGCTAAATTTCCTTTAGGTTCGCTTTATTTTACATATGTTATACACTTTTTTATTGTTGCATATACTTTTAATGCATGAACCAGAAACTCTTTTGAATAAGTCCATATCGAAATCTATATATACTGTTAATGAACATTCATCACCAACCAACTCTCGTTTTAATTAATTTTATTACAAATTTTAAATGTATGCTGTCTAGGCCTGCTACTTCGCGGTTTCAATTGGCCTCATCGTTTAATAACGAGTTAAAGAAAGGATTAAGACTTTTTACAGCAACGCCTATAATTAGGAATCATATATTAATATATTGATTATTAAAAGTATTATATTGTAATTTACCCTTCCCAGCTGACTGATCCTTTGAATCGCGCCACTTACAGAGCGATTCCTTCTGTATTACATAGGCATCATAAAGCTCGCCAATTAGTTCACTCAGCAATCCTGTAATGAATGATGATTAAAAAACAATGATTCGGAATTCCGAAAATTTCGCAATTGTTAAGCGATTACAGACGACCATTATTATGGAAAGTAAATACAATAATTAAATCCTCTTCAAGGATATTTGGTCTTACCTCTGGGGTGCTCCAAGCCGTGAACTAATAGTTGCATAGTATATAAGCATTCCAGTTGATGGTCTTCGTTAGAGTCAATGTATCTTTGCAAAACTGGTATGCAAAACTTTTGGAAGGTTTCGGACTCAAGTTTATAACTATTTTCCTTGTATTGAATCGAGAAATTACTCAATGTTTCGGTCAACCCCCTAATAAACAACTTATCAACCAGTATTATATTTCCCTTAAAAATATAAATTTCATATTATTGGACAGCTGTTTAAATGAAGATACAGTTCCTTACGTTACTATAATCAATAATGCAATCTGCCGTCGTTCCTTCCTTTAGCAAGTGCTCAATATGGTCTATCACATTTTTAACGTGCTTCTCTGGCGACTCTCGTTGCTCAATCACTGGCGATTTTGACTCGTTTTCTATATACTCCAGTCTCTGAAAACATTTGTGGTTCAAAAGAGATATGTCAATATAAAGTTGAACATTTTTTACCGATCGGCTCGATGTTAATGTATATAAATTCTCTCGCGACTAAACTCATTATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCGGAACCCTATAAAGTATATATATTCTTCGGATATCCGTCCGTCTGTCCGTTCGTTTCTACGCAAAATAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGATGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAAATCGGAAAACTATATATATATTATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTAGGAAAACATGAAATATAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAACATTTAACCTTATAAGCTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATAATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTTGTGGGAAATAATAGGAAACAAATTATAGCATTGGGGCTTTTTGACTTATTAACTTATAATATTGGGAATACGAGGTGTGTTCAAAAAGTAAGGTGACTTTGTATTTTCAAGAAAAACTATTAATTTATTTATCAATATTAATGTTGTTCCCTTCAAAGTAATCCCCCTCAGATGCAATACACTTATGCCAACGGTTTTTCCAATCCTCAAAGAACTTCCCATAGCACTTTTCGGTATAGCCTTGAGCTCTTCAAGAGATGCAGTCTTTATCTCTTCAATCGTTGCAAATCTCCGTCCTTTCATAGGTCTCTTTAGATTTGGGAACAAGAAAAAGTCACATGGGGCCAAATCCGGTGAATATGGTGGCTGACGCATTATTGTGGTGTTGTTTTTGGCAAAAAAATCTCTCACAAGCAAAGATGAGTGAGCAGGGGCATTATCGTGATGCAAAAGCCATGAATTGTTTTTCCACAATTCTGGATGTTTCTTTCGTATTGCTTCTCTCAAACGGTTTATTTACCGTACGACCATATGGTAAGATCTCCTGATGCACCACGCCATGGTTATCGAAGAATACAGTGATCAAAACATTGACATTTGATCAAACTTGGCGTGCTTTTTTCGGTCTTGGCCTTCCCATTGTGACGATTGGGCTTTGGTTTAGATATCATAACCATATACCCATGATTCGTCACCAGTTGTGACCCTTTTGAGTAAATCTGGGTCGTCGTTGACGTCATCCAACAGCTCTTGAGCGATGCTCATGCGACGGTTCTTTTGGTCAAAATTCAGCAATTTTGGAAAAAACTTCGCTGACACACGACTCATGCCCAAAACGTTTGAAAAATTTCATGGCACGAGCCAAGCGATATACCGACATCTTCAGCAACTTCTCTGATAGTGATTCGACGATTTTCCAAAACAATTTTCTTCACTGCTTGAACGTTTTCATCAGTTGTTGACGTGCTTGGGCGTCCAGAGCGAGGCTCGTCATTGGCAGAGTTTATATCACTTGTAAGCATTTTCTTTACTCAGAACAGAACAGAACCGTATGCCACTGTCAACATTTCAAGTGTTTCGGAGCACTTAATTTTATTTTTTACACAAAATTAGATGCAAATCCATTGATCCATATTTTTCGATAGCAAAAAATCGATGAGCACGCAAAACAACTGCTTACCTTTACACCTCTCACAACTAAACAAAAAGAGGGATTCAATTGAAACTTGGTACAAATGTTAGGGAAGAGTGTACCAACATAACAAAACAAAAAAATCGATTATCGAAAATATGTTGCCCGCGAAATTTGAAAAGACACCTTACTTTTTGAACACACCTCGTATATATTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAGTTCAATTTAATAAAATATTGATTAATTTTTATAGCTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTGTTATTATACCCTTGCAGAGGTGATTTCAGTCAAAGTTTGCAACGCAGTTTAGGAGACGTTTCCGACCACATAAAGTATATGTATTCTTGATCTAGACGAGTCGATCTAGGCATATCCGTCTGTCCTCCCGTTTCTAGTCGCTCAGTTTTAAGGCTTCCAAGCTAAAATTTTTTTGGGTTTTTTTTTACATATAACATATTAAATTAATTTGAACTTCGAATTAAATTTTTTCGGATGACTAAATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTCGGGGTTTTTTTTTAATATTATCTTAGAATATTGGGAATATCAATCAAATTTAATACAAATCGGACAACTTTAACATATAGCTTTCAAAGAATATTACTGAAGCTAGTAATAATTATTAAAACTTTAACATGGTGTTACTAACGTTGATTACTTCTTTTAAATGCAAGGGTATACAAACTTCCGTTCGCCAAAGTCAACTTCCGTTGATGTCAAATCAAAACTTTTAAGATATTTATTTTAATTAAGGCCATGTTAGTCATATAAATAAATTTGAACTGTTTTTGAATATTATACAAAATATTTAAAGCTGATTCGAAGAAAAGCATATTTTTACGGTTACCTCATTGTAACTAAGAAAAAAAATGTTGTGAAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGATTTAATCGAACTGAATAATGTGGTCTTTATAGACTCATTAAAAACCTTTAACAATGTTTGTTTTTAATTATCTTTAAAATTAAGTAAATAATTCTAGAATATTGAGACTCATTTTGTTTCTAGCCCAAGCAACTATTGTTAAGCTAAATTCTTACGTATAAACAAACTCACATTGGATTTAATAAAGTCAGAAACTTCACTTTCAGGCATAAAATCTGACCATTTAAGATTGAACTTGCTCCACATACTCCGAGCAAATTTCGGACCAACATCTTGTGTACAATATATCAAGTATGTTTTAAGGAACTTTTTAGCCACGCTTGATGGACTGTTGTCTTTTAAATTTTTGTTCCACACATCTGATAGTGTCAAGATCTTTTTCACAATTAATGGTCCTATAAAGAAAAAACAGTTAACAATGTTTTGATTAAAATTTAAGACTGTAAACTTATTAGTCGGTTACTAGCACCAAATATCAGTGACCATCGATAGATAATGCCTTTTAAAAACATCGATCTCTCTAACTTAAAATGTTAGCTATAAAAAGGCGATAAACACAACTGATACATTATGCTAGTAAACACGACCAATGACTATATTACCAGCAAATTGAAGAATGTATAGCCAAAGCTCTGGAATATCAACAATTAAATCGTTTGCGTACTCGCTAAATTCATTGTACGCCAGTCTGAAGTGATCCACAGAGATGTAATTCTGTTGAATAAGTTGGAAAACAGCAATGGCCAGATACCGCCTGTACTGTTTACCGACATTCGCTAAATGCAAATAATCTGTCAATAAGTAATATAAGAAACTACAGCGCAAATCCTCTGGTACTCGATTCATGCATGAAACTACACCGGGCGTTACTGCTTTAGAAGCGGCGGCAAGCTCTATCATTTCTGAGACAACTGATTTGATGAGCTTAAGTTCAGTTTCACCAGCCTCCTTAAACACTGCCACTGGAGCAACGGAACGACTACCCTGGGAGAACGTTGCGGATGTAGGAGACTGCTGTTCACTTCCTCGGTAAAGTCCACCCGTGTTGACATTAGAGCTGACCAGCGATGTCGGTGTCTGTAAGATAATTTAATTATTGTTGGGAATATAAAATTAGTATGAAAAAAAAACTGTGGATTAAGCTTTGATGCTAGAATGGTTTTGTCAATACCTATCGACCTGTGTTCTAGTATAATTTTCACTACAGTAAAAAAAAAATATTAATTTTTACTCACTTTGCCAGCATGTCGTGTAGGTGGTGCCTGTTGCGTGTATTTTGAATGACTAGTAGATTTTTGAACCGTTGAGCTTAATAAACTGCGACCCTGACCGTGCTGGCCAGCGCGGGAAGACGAGTTTTCTCGAGATCCTTGAGAAGATCCAGTTCTTGAATGTATACCTTTAAAAATAATTTTCAATAATTTTAAATTATTAAAATCTTAATGAAATAATTACCTCTATCAAAACGATCGCGCTCTATTGATCCTTTATTGTATGATCCTTTATTTCTGGGTCCACTGCGATCTCTATCACGATCCCTATCACTGCCATTTTTATCAATTAGCGAAGATAGCACAGCGAAAGGATTAGATGGTGTTGAAGTAGACGCAGATGATTGTCTTGTTGTGTTGCTGGGCCAAAGAAATTGTCCCAATCCGCCCATCTTTTTGGTCTCTAAGTTTTGATCAGAAAGTTTAGACTGAAATATTAAAAAAAATATATTTACATAAATTATAAATGCAAAAGTAACATTTATCAGGAATAAAAACTAAAAGTAGGTATCATACCGACGATACTATACTACTACTATACCATTCATTTTAAACTTAACATAATCTAAGTTAACATATTAGAAAAGTTCTTAAACGTTTCCTTTGTTTTTACTAATAAATGGTACATATCTCAAAACATGCGCCGTTCGAATTCTGCCTGTGAATAAGCTCTTTCGTTTCGAATCTGTGGGGTAAATTCACATGTGTTTAATCGGGGGCCATCTGGACAAATTAACCTTCGGACCCCATGGGAGCATAAAATCGTAAGAAATGTGGGTGTAGGCGGGACTAAGAAGACGCCTCGCTAGACCGTGGACGTAGACGCCTCGCTTGATCTTGGCCAGGAAGGCCAACCACTAACTGATACCAAGGTTAACGGAAAAACCCACCCACTAATAGAGACTTTCCTAGAAAAAAGGAGGAGGTAAGATACATGAGAACAAGGCATGTTTCATAAAATTCTGACTATAATTAAATATTAATTAATTAAATATTTTGTTTGCGTTTTACAACTAATTGTGTAAGGTAAATACAAGAAAAACATAAATTCTTACCAGACCCTCCAGTTTATTACTGTCAACTGCTTGCGATCGGCTTCCTTTACTGGTCTGCACATGCCAAGTATTGTCATCATTGTTCCCATTGGAGTGACCAGCTCCACCAGTGTTATTTTGCTGCTGATGTCGCAGATTCCCGTTGTCACTACGTTGACTGTGGCTGCCACCATAACCGCTACCAGAACGAGAATCACCATATCGAGTGTTGCCACGATCATCCCGTTTACCAGAACCGCCCTGCGATCCTACAGGTGTAGTGCTGGAAAGTGTACCAAAGTATTGCGCAGAAAGCTGTTCGTTTTTTGCCTCCTTTTCAATTTGCCCCATAGTTTTGGGTGCTTCATTGCGCGAAGTTTGCCATTTATTCTTGCGTAAATCAATTACATCTTGAAGCATAAAACGCACTCGAGAGCTTACTTTGGCTCCATCTTTGTCAGTTTTCGATGCGATTGCCTGCATCTTGGTTATAGATTTTTCCAATGAATAACACCTACTTGGATCCTTTGAATTTACTGGGGTCTGCTCAAACTTAGCACCCACAGTTGTGAGCAGCTTGCAAAGGCATTCAAGCATGTCTTCAGAATGAGGATTAAGAAGTGTATCGATGCAAGAATATATTATTTTGCCTGTCAACATGGATATTTTAAAAAGCTCGCCGATAAATCTTACTGTGCCGCCTGAGCGTCGTCGTATTTTTCGTTCTTCCTCTTCTAAGAACGCCTCAAGTTCAGCTTTTTCGTTTGCATCTTTACATTTCTTTATTTTATCCACAATTGGTTGTAATTTTTTTTCTTTTGCAGTGCTCTGTGAAACGTTCTGCGTGAATTCCCGTTCCGTTTTGTCTAACAAAGCATTTCGGAAGTGTGCCAAATTAGATTTTGTGCCGCTTTCCATGCGCTCGTCTCGACCCTTTACTTCCGAAATTAGACGATGGCAAAGTCTGGCATAGGATACAGAAAAGTTTGGCTCATCGATTGCTTTTTCAAATACCAGTACAATAACTTCGTCCATTTTTTCGGGCGTATCAATTTTCAATTTTATTATCTCCTCGACAAGCGTATCGAACCTTTCTGGGGTAAGCTTGTTTAGAATACCTCGAACCCGACGTATTAATTCATCTTTTTCATGTGTTGATTTTGCTTCGCTATCACCATCTGACTTGTTTAAGCCTCGTGGTCGCCAGGCATTTTCGTTCTCACTAAGTTTTACATCTTGATTTAAAGATAAATTAACATGGATCATTCCCTTCATACTGCTTCTGCCGCCACCACCCTGGACACCTGACATCGATATTTGCTTGCCAATATAATTTCCTCCAGATTCACTGCTACGGTTTCCAATTATTCCAACCATCGACTGTACTCGTTTATTATTATTATTTCGGATAAAGGATGGCATTAAGTTCGGTTGCGGAAGAATTGATATATTTTTAACTTCTGGTTGTTTACGGGAGGCCTTTACCTCCCGTAACTGTAATAACTGCTCTCGATTGTATTGTTTCTTGCCGGTTGGATTGCTGGGCGACCACTGACCCTCATTATAGTTTATAAAAGATGATACGGTTATTCCTGTTCCTTCAAGTTTTTGATCAGTAGACTGGAGTCGGTCCTCCAAGTCCTCCTCTGGCTTGGAATCTGTACTTGTACCGGA'..b'CAACAAGATAATTAATTTGATTGGCATTTTAAATAAATGTTACCAAAGGGGAAGAACACCTTTTGAATTTCAAGACATTTTTCAGAATTGGGTACCGTACACAGAAGATTTTAAAAATGTTAAATTATAAAGTAAGGAAAGTAATAAAAATGTATGTATTGTGCGTCTGTTCCTAAAATCTGATGGTTTACCTCTGCCGCTGCTTGGAAGCTATTATTTTTTATCAAACTACTGTTTTTGAAATCATACTTTCTACTGGTATCAACACAACTGACGCTAACGCCAACAATATTTTTCTCGTGCATGTAGGTTGTGCCTGCTGCAGTCGTGCCCAGAGCGACTCCCATAGTTGTTCCTATATGCGAACTGGTCAATGTAATTTGGCTGTTATTAGTGATTCCAACTCCAGTACAAGAAGTCGTTCCATTTCCGACTCCGGTGGTAGAGTTACTTGATACTACTGATGCGCCGAGATTGTTGCCTTTTTTCGTAGTGTCCGGTACGTTCAGAAAACGAACGTTTCCATCTTGGCTTCCAGGTAAACCCCGCTGATTGGATAGGTTGTAAATGGCGGTCGAATTCACATCACCGGAATTCAGTTGACAACTATTCACGGTCATTATGTTTGAGCCATTACATATAACCGTTGACTGGTGGGCTCCAACTGGTCCAGACCCAGGTATGGATCTGTTTACAACGTTTGCATAGCTTTGTTGATGCTGCTGTGTTTGCTGAAGAAGAAGGGATGGTTGTTGCTGATGCGTCAAGTGCGAGGACTGTTGAGCATTCTGTGCTGTTGCCTTAAGAATGGAGACCACATTGTATGCCTTATTTATCTGAAACTGAGGCTGTGGAGTTTGATGGTTATGCTGCAGTTGCATAGTCTGTAGGGATTGTGGCTTTGAAGGTAGCACCTGTTGAGCATACTTTTTGGTCTTTTTATTGGCTGGCAAAATCTACAACAGATCACAAGAGTGGGGATATTTCCGGACTGTAGAATTTAATAGCAATAATTTGTAACTAAAACTTAGCCAGAGTATATAAAAAAAAGATAGTCGACTAAACCGACCTCACTTTACTCAAACAAACTTATAACCCAACTTAAAAAAATCTTTCAAATATCTCAGTCAGCTACATAGATGCTGTCTATATACTACTTTATCATTTTGTCAGGTTGCTGTTGTGAAAAAAATGAATTATGTTTCCAAAAACATTACTGTGTCTAGCCCGTCTGCCTGGCCGCTCCTTTTTTAATATTTCTTTAAACGTTTTTTGTACAATGTTCAGCATTTTTTGAATGTTTCCAATGCGGCAGTTTGTAATTTCGCTAAAATCAACATTTGTATTTCAATGTTATTATTCTTTAAAAAATATGTTTTTTATTGTAACATTTAAAAATGTTTTTATGTCAAATGTTACTCCGAGTAGAAATAAAGAAACCTAAATGATAAAAATATTTTGAGAAGTAAGTTCACAATCTGAACTTTTTGAAATATAGAAGATATTCTTCGAAAACTGTACACTGGAGATCTTTTCTAAAGAAGCAAGTGCAAAAAAAAACATTTGCTAATAAACATTTTTTTATTAATCACAAATTTTCTATAATAAAATTATAAAATTAAAAAGAAACGAAAAATATGGTATCATTAAAAACATGTTGGCTCTAATTTTAATAACATTTAACATCGACTATCGAATAGCCATTACTCAGCTAAGAGGAGAGCGAATAAGATAAGATTTAAACAATTTCTGGCATATGTATGAATATTTAGAATATTAAAAGAAACTTTCTGAAGCAAACTTGCGCTGCGCAAAAAGTGCAGCCAAAGCATGCCAAGTTCAAACTCTCCAGGTTTTACGCGAAGGGTCACATACTTTATGTGGTCTAAAACGCTTAATTGTACTTGTTATATTCTTTCGGACGAATCTTGTGTTCATTCTGTCAAACAAGTGCAAGGAAATTCTCATTTAAAAAAAAATTGGTGATTCAATTATGTCGAAAACTCAAGTTTACAATTGGTATAAATCGTTCAAAAGGGGCGAGACGAAGTGAACGATTTGTCACGTTCAGAACGTCCTTCAACCTCTTCAAATGAATAAAACGTCGACAAAACAAAGGTGTTGTTTTTTCGGAATTCTTACCGGAAGGCAAAACCGTCAATAAAGAATATTGTCTTGGCGTTATAAAGCGTTTAAGAAAGAATGTTCTTTGCTATAGACCTGATTTTTAGCGGAACAACAGTTGGATTTTGCACCACGACAAATCATCAAACAACCACCGTACTTTTCAGATATGGCAGCGTGTGACTTTTTCCTGTTACTAAACTTAAAAATTAAATTACGATTTCGTGGAACCTCTCTGATAGCATTGAAGACATAAAAACTAATTCGCAACGAGAACTGAAGGCTATCCCGATTAATTGTTGGAATACGTTTATTGAAGCGGGTCTTTTTTGAAGGGAATATAATAAATTTAGATTCATAAATTGTGTTTTGTTTCAAATTTCCTTGTACCTATTTGACAGAATGTACCCTTTTAATCTAGTAGTAACGGCGAGACATTGCAAAGCACTGTACTAAAAAAAGAAGCCCATACAGACACTAAAATGTGGTTAAATAAAATTTCGATAAATACAAAATTTAATTTATAAAGTAAACTTCATAACTATTTAAAATTTGACATTTTTAACAATTCTGCGACTTTAAGGCTTCTGTTAATAACGTAAAAACTAGAAAAAACAGAGAAGAACGCTTTAGTCGAGTGCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTTAAGGAAGCAAAAGGATAATCAAGATATATAAGCTTCAAAGCGATATTTTAGGGCGCCATCTACCGGCTTTTTCAGCCATTTGTGGGCGCTAGAGTGTGCGTGGTACCTTTTTTTGGTGAGTCGATAGATATTGATGAGACAGATACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTTTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGAATTGCATGGCACCCCGCTGAAACAAACCGTCGCTACTTAGGAACCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTATTGTCACTGTACTAGAACGCGGTACCATCTTAACGAATATTTTTTTATTAAGGGGTCGTTCAGTGAATTTTCTTTTTTTATTAAAAAAAATGTTTGGCTGTTTAAACTTTATTCGGACATTGAAAAAAAAATAATTACATACATATGTAGATGGAGGAACCAGCACAGAAATATTTTGTAAACGAATGAGGCATATTCAAGTGGTAAAGTCGTATTAACAGCAAATAATGTGTGAAAAGGGATAACATTTAACAGATTACATTGTCAGCTAGACTTACCATGTTTTGTGCTGAATGGGGCTGCATGATTTTAGCTATATCTGATTGTGTTGATATAGTTGGTATAGCTTGTTGCATTACGTATATATAATCCTAGTGAGTTACTTATGTAGAAAATCGTCAAAACGGTCAACCTAGCCGTTTCATTGACGATTTCTGGGGCGATTTTGAACCCACTAAAATAGGTCGTCACACAACCATTTGATTCTGAAAGAGATAATATTAAAAATTAAATAAATGTTAAGCTGCCACTTGTAATATTTTTACCTGGAAATAAAGTGGTTTATCACTTCCAGAAACGTATCTGTAAGTTATAGGAATGACACGTATAAAAGATCAGTGAATTTCTAAAAACAAAGTTTCCTTTTATTAATGCAAGCTTGTCGTTAATAATGGTAATACTTAACAAAAGCCTAATTCAAAATTTAATAGTATTCTTAGTCTTCAAACCTTGAAATTAATTCCCTTTTTCAATCTGTTAGCCTTAAACCCAATCAAGCCTTTTAGCTTTGCATATTTGCCGACGTTGCTGCTGTGCAGATGGCCGTAAAATGTGCAAGATTTAAACGTAAAATTAATATTCACAAATAAGGTGAAAACATGCAAATGTGTTTATCATCTGCGTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/714/1a3/69/scaffold_50-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -ATTTCGGAG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CAAGACTCTAAAATATGTTCTGCATACTCACAAAAACCAAATACAATAAACTTTTGTCCAAAAATTTTAAACGATTGTATAATATAATAATATATAACAAAAACGTACAAAGTACTAGCGATATATAGCACAAGCCTGTAGCTTTAGTAGTTACAGGTGTACAAAATATAGATATTTATAGCTGTATTCTCGAACTAGCAGTTCTCGCAGTTTTTTTCAAAAGTGGTTAATGTTGGTACGCAGTCCTTTTTTTTTGTGCAATACCTTTCAATTTTTCGGACGATCATAGATTTGCTTTCTTTCAAAGTACCACCACATGTACTACTGAAACTTTTTGTGCGTTCTATTCGCGGTCCCCGAGAGAGAACGCGTCGGTTTAGCTGCCTTTTCATTCGGCTCTGCCCAACGACTTCGTGATGAATTGTGAACCTGCGGGGTAACTTGCACGGGACTGCTTGTTGATGGGTGTCTACTTTACCTGTAGCGGCAGAGAGTGGGCAGAACTATCTGCCATGCCCCGCAGCATAGAAGCTGCCGACCTCTGAATTAATGATGTCTTACAGGTATTGTAAAGCAAGTTATTTATTTTTAATTTTATTTATTCTCAAATTATTTTAATTATATTTTCAGGCACCGATACTCTAGAAAATTAGCTTTCCCCGATCAGATTTTTATCATGAGCATTCGTGTGAAAGTTTAAATAATGCAATCAAGATGTTGCTGTAAATTGTCATACTTATTTATGATTTTATATAAAATTACTTAAAATCTAAACATTTTTCATTTGCGGAAGTTTCATAACAACATAAGGTTCCACTGCTGCCGACCGGATAATTCCACTTGTTAGACTCTGCCAGAGTGTTAGGGCTGAAGGTTGCTGGCCGAGAAGGTTGCGGGCGAAAAGCGTGCAAGTGTGACTTCAAAAAAACTGGAAAGGCAACACGCTGCTGTATTTCCATGCTCGATGATATTTCTTTTGCAGCTAAAGACTTGGAATGCGATTTATCGCTAACCAGTTTTGAAACTGTATTTTTAGAAAGACTTCGATCCTGCTGATTTTTTTCGTTTTTTCGGCGAGCTTTAGTTCTTAAATGAGCATTAAATCCTTTCGTGTTCTGAAACAAATATTATTAAGACAACGTAGCATTACAATTTCATTAATTTGATTTAATGTGTAGTACCTTAAAATGCGAAGTACTCTTGATTTATACGGACCTTCAACTAAATATAATTTTATATTTAGGCTAAAGTACGATTACAGTTCAAAAGTAGGATGAATGCTATAGTCGTGTGCCCCGTCTTGTAGATACCCGTTACTTAGCTTACTAACTTTAAAATAAAATGTACTATTCTCATGTTATTTACTTTAAAATTTTAGAGAATCAATCAATTTTAGGCGAAGCTTATTTTACATAACCACGTGCAGAATGTGTAACAAACTTTGTGAAACTCCGAAGGAAATGTTTTCCGACAACGGAAAGGAAATGTTTAACTCCTAAAGTCTGCCGCATCTTAAGCGAAGAAGACGAGAAACACCTCTTCCAAATAAAAACTCTCTTTTCGATTATTCACCTTTCCATCTCCCCTGCACTTCCTTTAGCTGAGTAACAGGTATGTGATAGTAGGGGCAGTCGACTATAGCGTTCTGTCTTGCTTTTAAAGAACTTTCCCCATTGATATAGAACATATGAACAACGAGAATAAATTATATGCCTTTAAATATAATTTTAAAAAGAAAATTAAATAATATGTTTCTATAAAGTTTTGGGAAATCTAACACGGTATACCTATTTTCAATGTATACGCAGAGCCAAAAATAAAATCAATCCCACTCAATTCTGTTTTGTTGGTTAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAACACCATGTGCAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGTTATTTTTTCAGAACATTTTTTGACATATATGTGTTAGAGTAGTCCGATTTTTATTAAACTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATGTTATAAGATAATAAGTCAAAAAGCCCCAAAACTATAATTTGTGTCTTATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATCACAGCTATATGATATAGTCGTCCGGTTTAGATCAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCTAAACTTAGAAGATTATATGTTTAAAAGCACCAAAGATATCATTTTTTCATTTTCTCTGACTTTCTCCGATCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTGAATTCGAAATTCAAAACCAATTAACAAATGTTATTTCCAAGCGCAGGAGGTTATATGTTAAAAAACTCCAAAGGTGTTAGTTAGAGTTATAATATATACTTGGCCGATCTGGCTGATTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTGTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTGAGAGACTAGTTTGCTTAGAAACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGACTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATATTTTATGAGATCGAAAACAACTCCTTCGCTACGTTGCAAACTTGTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGTAGCTTTCTCATTCTTACCTCGGATATTGTAACTTCATTATCGCCTAACATGATTTTTGCATTTGGAGATGAACCACACATTCGTAATGTTTCACTTTGAAAAACTGATAGGGAATGACTTGTATTTTCGATTGCGCATCTACTGGCATTGAACTCTAGTTGATCCTCAGCGTCTGTTGTAATGACATCTACATCAATGTCTGCTTCTACATCAATATTTGTACTTGTAGACGGAGAAGGGCTGGTACTTTCGCTTTCAAACACAATGTCGGGTGGCGTACGAGAGGCGTCAACGTGTTGAGCCATGAATTTACCTTCATCTTCCGTTGTCTCAATATCCACGACTTCGTCGTCATCGTCGGTATCATTAACATTCCTGGGTAGGCAGTTGACTAAAGCAGATTCAGTTGGCTTTTCTGAAAATGGTATTTTTTAATATGTTGACGGGAAGGAAATATTTGACTTACTTTCTATATTGGGTGTCACTTTTTCTAAAATTGGCGAAATGGTCTCACCTACTATTTGGTGCGACGAACCCGAAATGCTGTTATGCGTTAGAACAGTTGTCGTCCTTGTAGATTGTGTTGGGTTTATATAATCAGTTCGCTTTGAGTCACTGGATCTAGTGTATAAGGAGGTTGACACAATTGCAGTCGAAGCGACGACTGGTTTAAACGCAGAGCAGTTAAGAATCGAGGGAATGTTATAATCAGAGAGGCTTAACCCGCTGCTCGTAGCTGCAGATAGCTTTCGGTTTTTGATAATGCCACAAATAGATGAGTGTGACTCGTTTTTTATATTAAAAGGAGTATTATCCGAAAGCCTTAAAGAACTTCCAGTCGGTATTGAAACATTCGTGTCAGGTCTAGTCCATGATCGGGAGCAGGACTCGAAGTCCAGGCTTTGCTCGCTGGGTTCACCGCCACTGAGTTTCTTTGAATACTGATGTTGGTAGTGTCCGTCCTTCTGCTGCCACATGTAGTCCACTACAAAGTTTCTGGAGATGGGCATTAGGGAAAGGTCCCGATCATTCCGAAGCGAGTGCAAAGGGGACAGGACAGTAGAACCGTGCAAGTTGAAAGGAACACCGACAGTAGCGGCTGCTACCGCCGTTACGCCAACCACAGCGGCGGCTGTGGCTACAGTACTATAGTTAAACTGGCTATCAATCTGTCGTTGTGGGAACTCTGGAGACTCCGATTCGCCGTCGCCTTCCTTGGGGTCTCGCTCAATACTCGTTGGGGACCCACAGGAGCTCACTGCCGCAGAAGGCGT'..b'CGTAAATGTTTACCAAAAACGAAATTTGATATTAACTTTTTCATAAAAAATGTTGGAAAATTTTGCATGAGGAAATTTAAGTAAAAAGGGAATAGAAAAAATTCTGAATTTTATGTTATTTGAGCCATTAATTATTTACCAGTAAACATTCGCAATATAAATATTTTAACATATTTTCTGTTGGATGGTTTCTTAAATAATTTCTAAATTTGTAATTTGTTGTATCTTTTGTAACTACATAAGATTTTCATTTCTTCGGGTATATAAGGTAGTCGCGTAAGGTAGTTTCGTACACCCCTCTGGTGCGCTTCGTCACTACTTGTACTGCTGTCCACAGTGATGGTGCTGATGGTTACTAGAAAAATTGCTCGCAATCACTATAGACGTGTGTTTTTTTCCCACCGATTAGGTGATCGTTCCAAGCGTAGGAGATTATATGCTAAACAAGGAAAAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCGGATACCCGTTACTCAGCTTAAGAGAGTAAAAAGGAAATGGTGGTATATAAGCAGAAGAGTGATATTGTAAAGCGCCACCTACCAGCTATTTCATATTCATATTGTGAGCGGCTGTCAGCGTTAAGCGTTTTAACCGTTTGTGGGAATTAAAGTGGGCGTAGCTTCCTTCGCTGCGCAGGAAGCTGAGGAATCTGCATGCCATGTCCGAATCTTCTAGCTTTTATAGTTTCATGCGGACAGACGGAAACGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGGTGCTGATCAAGAATAATAATTGCGAAACCAAACTTTGGCTTGATGAAGTTAATTTCCTTTCTTGTTTTACTTATTAATTGCCGCATTATTTGGTCCTTTTTGTTATGATGACTATCTAGTCTTTTCCCAAACCCATTGCTATGTGACAAAGAATTTTATGAAGCATTTTATTGTCCACTTTTTTTATCAGCTATCTTTATGCTGTACCGATAAGTGAAAACTAAGTGTCTCAACATTCTGAAATACTTTGCTGTCCGAAAAATTCTGTGCTAACTTTTTAAAGAAGTTAAAAAACGAGCCACCCGTTTAATCCAACGATTTGTAATCTGTAATACAAGTTGTCGTCTATACCAATTGATTGCAAGTTTGTTAAGCGATTATGTTACGAACACATCTTCAATCTCGAGTGTTTTATGGTGGGCGTGGAGTTCTGTGCTAATAAACTTGCGTTGCGCAGGGACCTCAAGAATGTGCATGCCAAAAAAGTGTATGTATTTATTCTGAAATTGGTAAGCACTAGACTATATCGCTCCCTCTTGTCTTGAGATCAACTAAGAAGTATTGACGAGATCATTTAATACATTTAAGTTAACAGTTTTTATTTTAGCATTAAAACTTGTGGGCGCCATCAGCACACCTAACTGGGTTTGCAAAACTGGGGAATTTGAATCTGAAATCCCGACCCTCTCGCTCTTTTAGTATTCGGGATCACAGGGTACACACGGACAGGGGCCAGACGGACATGGCTAGATATATACATAGATACTTCACCGCTACCTTTTACCTGTAACATAACACAACTGTTAACTGTAACTCCTCGTATAAAACTTGTGTAGAGGGAAAAATATACAGGTATCCATAACATTCTGGCTGAAAATGAACAATTAGCATAAGACTTACTTACCGATGTCATTTCTAAAGTATTGTCGTTTTTGCCTTCCTTGGGTGCACGTTTACAATTTTTAATCGTTTTTAACACTTTAGGCGTTTAACGGATCTAAGACCTTCTTATTTTATATTTGCAGTCCATCAAATAAATAATATTTTCAACTAATTTTAATAAACCAATTGCCCCAAATTTAAGCTTGGTTTAGTCGTAGGCGTAGTTTTTGACGCACCTAGTTACATTTTTTTTTAAGGTAAACGCGATTCAATGCACTTATGTACATTCACTTGCTCTCAAAGCTGATATTATATTTTTTCTTTAAAAATTTGCTTCCATTTTCATTATATTATATCTGGTATGAGTACCTGAATTTACAACGTATTGTTCTGAAAAAAGGAAATGTCCACTCAATTTTCACTAAAACTTTTAACACATGTTCGTTTTTTCTCTGAGCACTAGAACATCGCATCACATAAAAGGTACGAAAACTGAATAAGGAACACAGTTTTCGTTGATATTGACAAGCTTAAAGAAAATGTAGGATTGAGGAACGGAAACCGATGCTGACCTGTGAAATCGGGAAAACAAAATATACTTAGCCGTATTTCAGCCAATAAGAGACCGAAAACAAAGGAAGCACCACAGGAAAAGGGCGATATATATATACACGAAGTACAAACAACCCAATAAGATAGAGCTCTCCGATTCCGGGGGCGTTTCCGAAGGACCGCGCCTGCGCTCTTTTGTATTAAAAGTTAGTCAAATTCACCCTGCGCTGGATGTGGTGCAATTTTAAATATTTAACTGTTGAATGTTGGTTTTAATTAAATTAAATTTGCCTTAAGATATCGGATAATTTTAATACAAAAATGGTCTCGCAAGAGGCAACTGACTTTTCATATAACTTTTAGAAAGACAAATTATTTTTTCTCTAAAGTGGTGATTTAATTGCATAGAAACACGGAAGAACGTAATAGTCGAGTGCTTCGACTACCAGATACCTGCTACTCAACCCAAGGCCAAGCCTAAGAGCCAGCGGAAAATGGAAATGTATATATACTAATAGAAAACCGATTTTGGAAGGCGCCACCCACCCGCTTTTGTGGTCGTTAGAGTGGGAGTGCCACTCTTTTTTCAGGTCAATCGATAGGTATTGGTAATTTAAATAAATTTCAGTTAAATGTTCTTCTAGCATAAAAAACGTAGGCGCTATAGTTTTTCGCAAATTGTGGGCGTAAGGGCGTAACAACCTTGAAACAAACTTGCGCTGCGCACGTAGCCCAGGAATTTGCATGCCAAATCCCACCCTCTAGCTGTTATATTTTCCGAGATAGTTCACTCAAAACAAACTTAACGTACTTTAAGTAAGTGGTATAAAAAGTGCTGCTGCAAGTGATGCTTATCCAATCTCAGCTGACTCTGCAAGATATTGATCATATTGAGCTCTGCATTTTCAATGAATCTCCTCAATTTATTTAAATTTTTCCAAAATATTTAAAGTTGTGGGCGCCAGACGGCCTCTAGTGTTTTGATCGTTTGCGGGCTTTAGAGTGCGTATGGCACCCTGGTTAAACCAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCCTACGAGTCTCAATGCCAAATAACTAGCTCTTATATCTTCCGAGATCTCAGCGTTCATGGACTGATAAGGAATATATCGGAAAAGCTTTCTTATATCTGTTATACGGATCTCTCGGATCTAGAATACCCTTTAACTTTGTGAAATTAAAAAACTGTTTCATCTATTTCCTGGAAAAGCTTGCAGACACTTCAGTGTGGTGCATATAGGTGCATTCCTGTGTCCAGCTTACACTTGCATTCTGGAAAAATTCAACAGGTACCTTATTTTTGGTCCCGCACCAGTGTATATAGAACAGAAAGATTCTTTACCTCTTGCACACGTTTTTATGACCACTTCCACTTATATACAATGCTCGGTTTGGCGAACTTAATTTAAGTACTACATTGCCCATTGTTCTTTGCTCGCGCAGTAGATTCGGGATCGATGCCGCAGGCGGACTGTTAACCGTACGTTTTTTCAGAAATATAAGTAGCTAACTAATTAAAGCTGTCTACATTTCTCAACCCCTTACTACTGAAAATCTACCGTAACAGTCCGATTCCTAAGAGTAATACACCAATCGTACAATAGGGAATATGTCTTGGTACTAATAGATTTAATTAATTAAATTTGGGACGAATATATTTCGGGATTGCTCGTCTAATTGTAGCCTGCTTTCTGGCGCCGTAGAAAAGCAATAATGCCACAATAATACGTTTTATATTTCCTTCAGCGTTGCCACGTTTCGGCCATTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/762/c67/70/scaffold_54-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATTGCGCCCTTAAGTTAAAAAAGGTAAAACATGGCAACGCTGAAAAAAAGTTAAAATTTCGTTCAAAGCGCGCGAATTAATTATTCACATTTAAATTATTATTGAATATTTTCTGTTATAGTGTGTGCGACCTTTCGATCGGACCATCACATCCTCGTGCGCTACACCACTACGTGCACTGCCGGCTTATACTCAGCGGTTTCAATTTCACCGTATTTTTGTTGCTGGCGGGAAACAAGAAAAATAGCCAATATTCAAACACAAGTACTGGTGTGAAACTAGGGAAAAATCGCCCTCAAGTGGTCGGTGGCAAAACTACCATAAGCTTGAAGGTACAAAAGTAGCATGCACGGTATATGGGTAGAAAGGGGATCGTCTATGGCATGTTTTGAGAAATTTGATTTAAAGTGAGGGGTGCTAAGCACATAGAATTTCCGAATTTGTTGTTTTTGCATGTAGTCGAGTGCCTCGACTATAAGACACCCGTTTCTGAAACATTTTTTTTAGGTCAGGTTAAAGGTTTTATTGAGACAAATACATTATACATATTACACAAATACAAAAACAAATTGTTCTTGTGGGCGTTAGAATGGGCGTGGCACGTTTCTTAGGTCAATCCATACAAATACATTTCAGTTAAAATTTTATTTCTGTTATAAAAACTGTAGGCGCTACATTCGAAAATTCCGGGCGTGGCAAACAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATGTGCATGCCAAGTCTGACTGTTCTAGCTCTTACAGTGTCCGAGATCTCAGTGTTCATACGGACAGACAGACGGACGGACTGTAATGGCTTGATCGACTCGGCTAGTTATCCTGATCAGGAATGCATTTAATTTATGGGATTGGAAACGCTTCCTTCTACGTGGTAGGTAATACACCTTTTTACTCTAAGAGCAACGGGTATAAAAGCCCCTTTTTTCCAAGTTCCACCATTCCTCCGTCGTTGGTAACTCTCGACGCTAATTTGACGAACATTAGTTTTCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAAACGGACATGGTTTAAAACATCGATGCTTTCATTTGTATCTATTTGATCAATCTATTCGCTGTTGTCTGCTTCCACCATTATATACATCGCCTCGGTTAGTGGTTCTGATTTGGAATATAGAGTTGCAAACGTTTTTTCTACCTGGTATATACTTTCAGACCCTTACTTAATACTTAATACTCGAATTTTGAGTAATAACGGTTGCTTTTGTTACATTTTTATTTTTTGACTGTAGAGTAAGTAAGGCAAGGCAGATAACATTTTAATTCGCCGTATTCATAATCTACATTCTTCGATTCTGTAAACTCGATGTATTCGTTTTATTAACATCTTTTTTGAAGACACCTTCCCCATTTGTGGAAAATGATTTTGTTTTGTCGGGAGTGTGTATCGGCTTTCTACGTGACAGCAAGTAAGCTTTTTACATTGTGGTTCGTGGCATAGTATCCAAGGGTTCAGTTTCTGGATAAAACAGCTGTTCTTATGTCCGTCAGCAATCGAAAAATCTAAACTGCAAATTTGTTAAGAAAAACTATCCATCGATCTACCTACTTAGATCTGGGACCCGAGGACTATTAGAATTTCAAAAATACATAGAAAAATCTTGTCCGCACAGTTCTCTTTTAACTGCCCCCCTCACAGAGAATGTGCCAATATGCACTATACGCGTTAAACTTCGTGTCAAAATCAACCCCACATCGCCTAACAGCGGAACCAATTTGTATTTTTCGCATATAACAAATCCCTTATACGAGCCGATTGGTGATCCCAACAACCCACAGTTTTTGAGAAAACAGCACTCAACAATACTCATAGAGAATGTGCCAATGTAGACGGCATATGGGCAGATTGGGGAGAAAATTTCTCAACAGAGGGAAATCAAAGGGAATTATATCGATATATCGTCAAGTGACGACGCAAAAACTCAATGGAGCCATCTGGCAACGTATTGGAGTCTAAAGTCGGAAAAGACATCTTTTTTGAATGTTCTCATTTTAAGGTATAATTCATCATTCTTCCGTCTGCATTCTCGCGCTTTCCTTATAAGTGGCGGTGACCAAATCACCGGATCGGATCGGAAAGCATATTCCAATTTAAAAGCGGTCACCATAACATTTTTAGCTAACTTGTGTAAGATGAGTAACGGGTACATCGACAGGCTTTTTTTTTGTTTTGTGAATGCTTAAATTATTATCTTCTGAACTTCAAAACGTAAATCCTTCAAGGTTGAAATGGATATTCATTCTTCAGGCATCTATTAAACGTTAAAACTTATTCATACTAATAATAATAAAATACGGAACTAATGTCTCGGTATAACTTCATGTATGACATTTCCATTTTCAATAGAGTTCACAAAAAATATTAAGAAATATTGTCTTAGACCATCTAGTGCTTTACTTCTAATTAAAGAAATCCAGTCTCAAAATGCGCTTTAGCGACTTCCTTCCGAAATTAAATTTATATATGCAGCAGTTTTAAAAATTATTAAAACTCGTTTTACGGACATCATTTTTTCCGTATAATAATCGAAAAAAGGAAGAATTCACAAGGATGAAAACCAATCTTAGCATAGATTAAATTGGAAACAAAAGAAAAACAAATTATAAAGTATATTAGTACACTCTAAGAAACTTTTGAAAAAATAGTCCAAGCAGCTAGGTATTTGAGGAGGAAGCACAAACGAAAACTAAGATTTATAAATCCGATGGACGAAGAAAGCAAAACAGAATTTGTGGTTTTCCAGACGTTGTTCAAAAGGGCACAGAGAGTTCGGATCGCAGCATTTTATCGTTGAATTATCCCATCGAATTATTATGCGACTTGAAACCTAAAGAAGAATTTTTAGGCGGTGCTGTCTGCAAAGAAGAAAGCGATTCTAACTCATCTTTATTTTTTTTTATAAAATTAAAAAAAATAAATAAAATATAACAAATAAGGAGAATAGTGAATAGTTCAGGTGTTTATAATTTATTCCAAAAAATACGTCAAAGTTCCCATAGTGCATTCGGTACCAAATAACTATTTTCGTTAGAGAACATCATTAGACATAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTCGATCATAAGATACCCATTACATAGTTAACTAGCGTTACAATAAATGTAAAGTCAACTTTTAGTTCAATCTATTGGCTGGAACGTCATTGAGGACTCTCTTGCTAGATAAAGGCGTAAATGTCTTAATAATAATAATGACCAACTTGAACAATTTTTCGGCGATCCGTATGGTACTGTCAAGTGTAATAAAATATAACTTTTATAAATGGTAATCTTTGAAAATGTAGGCGCTACACAATGGTTGTTTGTCAACCTTATGGTGGGCTGGCACCCGGGAGGTATATAAGCAGCAATGCTATATTTTAGGGCGCCACCTACCGGCTATTTCAGTCGATTTTATGTGGACGGCAGACAGACTTAAGCGTTTTAACCGTTTGAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGGCAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGCTTTTATCATAAACGCTGTGGTCGCTACAGATTTTCTCCGATTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGAAACCCAGGAATCCGCATACCAAGTTAGACTGTTCTAGCTCTTCTAGTTTCCGAGATCTCAGGGTTCATACGAAGAGACAGACGTGGCTAGATCGACTCGGCTTTATGGGGTCGGAAACGGATCATCCAAATTTGAGGTAATTATCCTCACCGGCCCCAAACGGTTCAATTTACTAATTTTCACTCTCCCAAACTAATTGATTTCCTTAATGTCTTGCTATGCAATTCTTATAGATTTTACAATACCTTTCGGTTGTTGTGTCAGTCGTAACAATCGGACGATTACTGCAGACTTTAATTTCTTCGTGTATCTATAGTAGTCGCCTTCGCACACCC'..b'TTGAGTCAAGGGTGATTTTTTTATGAGTGTATTGCGAACTTGGTTAGTAATCGTAAGTACCTACTACCTATACATAACTTTTACTCTACCAGTAATTAGGTACCCTAGTCTAATTGTTTTAGATCATTAGAAAGCTATTAAAAGCCATCGTATCAACCATTTAAAAAACACTGAAATTTCAAGTTCTTTCTTCACTGCGCACAGTAGTACATGTAGTGGCGAAGCGCACCAAAGGCTGTGCGATGACAACTACTATATATAGCCGCAGAATTTAAAATCTGCTATGATGGTCCGTAACGAGTCGTAACGACACACCAATCAAAAGGTAAAACTTTAGAAATATCAATTTGTTTCGGAAAAAAGTGTAAAAGTGAAAATTTATAAAGTTGGTGTTGCTGGAGTCAGTGGAAATAAATGAACCAGTTTTTAACCTATATTTGTTCTTAATGAGAATACACGTCGTATGACGCCCCATTTGTTAAAATCCGATGTCCCATTAAAAAGTAATTCCAAAATTAATAAAATCATAAAAAATGTTATGTAATGATATAACAAAACCTGATACCATTTTAGAGTCCTGAAAATTCTAGACGGTGTTTAACATCTTAATACAAGAAACACAAGTTCAACCACCTTTGGAAAACAGGAAAAAACAAATGGCTACTGTACTGAATAAAACTTTTCTTCCTCATATTTGTTATTATTAGTTGAGGGAGTTTTATCGTCATAGTTTTTAATTATCTTGATCCCTTTTTGATAAGTTACATCGAATGAAAATCATTGATTAGAATCTTTTTTGATGGATTCATTTTCTACCCACATGTCAGTCCCAAACAAAGCGATCTATCATGAAAACCAAATCGATCAAGGTTTTTTTTAAATGCACCTGGTTCTTGAGGCCTTTCGTGTGTCCTTAAAAACTCGATAATTCTGTTTATAAACTATTTTAACTTGATACCCATTTTAATCCACCACAACTGATTTATATACCCTTGTAGACGGTCTTTATAAAGTATATGGGCACTTCTAATGAGTAGCTCAAGATGTTCGTAAGTTTTTAAAATAGAAGAAATGCAATAAGAAAATCCGTCTGAATCCGTTTTTTTTCTAGAATGTTCTATAATAAGAGTTAGAAAAGAATTTAAATTGAATCATACATTTTCAATAGTTATACCTGTTACTCGTAGATTTAAAAAGTACACTATACTTTTCGGACAGTATGTAGGAACATAATGTATATATATTCTTGCTCAGGATGTCTAGCCGAATTGATCTAGACTTGTTGTGAGATATATACAAACTATAAGAGCTAGAATTTTTTTATGTTTGAATGCAAGCTCTTGGGCTTGCTGCGCAGCGCACAAACCGCCCAAAACTGCGGCAGAGTAAAAATATATTTTTACTGAAATGTTTTCTCGTCAGTAACTACCGAATGACCTAAATACATTTTGCCACGCTCCCTATAACGCCCACACACCGCCTACAAACTTCCAAATTTTACCGATTGACCTAAAAAAAATTTGTAACGATCGCAGACGCTCAAAACGCTAAAGTATGTCTACATTACGCCTTACAATCTCGCTTTTCTGCACGTTTGTATTCACATCTCCCTTTTGCTCACCTTTTCTATGTAACGGGTGTCTAATAATCGATTATCCCTATGTGAGCTATCGGCTATATTTGTCCGATCCGGTTAGTTCCGACATACATATATGCTACATGCAACGACTTTTGCTGAGTGCTGATCAAGAATATATAAGAGCTGCACCTTGCTAAGACAATCTTGAGCTGCGCAGGAAGACCAATGATCTATAAACCAAATCCCAAAAATTCTAACTCTTGTAGATTACAAACTCTTAGCGTTCATACCGACAGACGGACATGACTAGATCGACCCGCTTAGCGATCCTATCTAAAATATACAATATAGCTAATGCATTCGGAAACGACTCTTTTTACCTTTTGCATGCATTCCAACGAATCTAGTTGCCTTTTTACTCTATAAGCAGCGGGTATCAGAATGGTTCTCAAAATCAGATGAAAAGTTGTTCTTAGCTTTTAATTAAGTTCGAACTACAGGTTACTACTCTACTGGCTATGCAGGTAGAGTATTTTTTCTTCTCTGTTTTTAATATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCGGAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGTAACAATCGAAAAATTAGTGGGCTAAGATCAAGTTCAAAGAGTCTTGATTAAGAACAAATTTATTTTTATCATTTTAAGATCGTTTATACCGGAAAAGGGTTTACATAGATCACATTTTTGGTTTAAATATGTCCCAGCTCTAAAAATGCCCAACTGTTTATTCAAAAGGTGCAGTGTATATATACATTGTGACCGCCACTTCGTAGGTAAATTTTAAAGATGTATGTAACTTAGATTTATCTCGTTTATCTATTTTATGCTTTCCATTCTTATTGTTCTTACTAGCACATATTAAAAAGGCAATTTTTACTTACAATATTTGTATGTATGTTGACTTATGAATTTTTCGTCCTTAAATCATTCCTGCAAGTTGATAAACTTAAAACGCTAATTTTAAGAAATATGAGTAATATATCTAAAGTTGAGGAGTTTTAAGGCATAGTCAGTTATAAAAGCAAAAAAACGTTTGGCCATAATTTTCAATCTGTGGTATTTTGAAAACTTTTGTTAGGAGACCTACATTGGATCTAAAAGTACCTTTTTAATTCTTGACATACAGCAAAATTTTGAAATTAAAATATTAATAGCTGCTTTCGCTCCAAACTCGCATTTTTTCCAAACCGACTTCAAATATCTTAGCATGCAATCTCTTTAGTTTGCTACCCCACAGTGATATATAAACTTAATTTTACATGAATAGTTTTTGCTGTCGTACTTTTATCGAAAACTTACGTCAAAATACACACATATTTAAAAAATACCCTTAAATTTTATGTTTAAAATTTGCGATTACAGAAGCTTATTTTTCTTTTTATTTCTACATACATGGTGACATATTACTATATGATTATACAAATGCATATACTAAGTACTCGATTCATAGTCAAGTTACAACAGACGGCAGTTTAATTTAAATCTTATCTATAACTTGCATAGGCAGCAAATTAAATTATTGTATAACAAATGTTTCGGCAATTTTCATGAATTCAAAACCATTGAGTTGAAATAATGAAAATCCCAAAAAACAATCAAAGGGATACCCATACCCAATTCTGAACCCTGCTATATCCAGCCCCTTGTCCTGCTCCGTTCCTTATTTCCTTCCATCAGAAATACATCCCTAGCCCTACGAATGTATTTGGGTCTGCCCCTGGACCTGACCCTTTTGTATATTTGACTTGGTCTTGGGGTGTCGTCTGTGGAACGCGTGCGTGATTGTTGGTGAGCCACACACATTTGCGTCACTTCAACATCAATATGAAAAGTAGGCGTATCTCTACTGATAAAGTTAAATTAGCGCACTCAGATGATCCATCTCTTTATTTATCTGAGTTTTCGGATTTCTGTAGTTGGCAGTTCCGACATAGCTCTCATGTTCGATTTGAGAACTTTGACTCTCCAGATTACCACGTAAAAAGAATTTGAGAAGTAAGGGAGTAAAATTTTAAATATTTTGTCTGAAAACTTAGTCATTACTTGTGCTAACTAACCCATTCAAGTTTAAAACATTAGGACTTCTGACTGATTTTATGAATTTAATCCTCTACCAGCGTTCTAGTTTTACAAAAAAGGTTCAAATTTTATAATTGCGCACGCTGGTTTTCGACCGTGTTGAAATGAACAAATGCATTGTTTCATTATTTTAACAACGAATGCAATAATAAACAACACAGAAATAATTTAAGCAACAATGCGATGCCCTAGGATGAAGACGACGACAATTACAATGAGGATTTAGCCGATGCTGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAAAAAAAATTATTATTCTGTGAATGTCCGTAAAATCTGTTTTACCATCCAACTCAGAAAAGCTGTATTATCCGTTTTTATTAACAGAACGCAGTATTAAAAGGTTAAAATCATCTAATTCTTTCCACTATATACATATTCGCATAAGCATAAAACCGTCTTGGGCCAGCGCCCATTTACGTTTTTTATAAAATACTTTGAGTTATTTAAAGTCTTGGAATGTTTCAAAGTTTATAGTTACATTCAAGCAAGTATAATTGTTCTTTATTTTTGATTACCCAATCAAGACCTAAAACTATTCGAATTTGTTTGCAAGCTTTGATGTGAAAAATGCTTCAGTACGATTGTGATCCAATTGTTTTCGCGTTGTTTAAGATAATGGTGCACTCACATATATATGTACATATATCTACCTATTTCTTAGAAATCAGAGAAAATATTTGTTCCCTTTGGATAAACCACGCCCCTACAACAAAATGTAAGCCAAGTACTTTTATACGAAACATGAAATATTTTTACAAAATGATCCAGTACTGACATTTGTTTGCAAATAATGATGTACTTCGATGCACTTTGAATATCGTACATATTGATATATATATAAAGATTTATAGGGAAGGGTTCACAAATGTATGTATGTCACTATAAAATTACGCATATTAATTCTTACAATCATACTAACGCCACAAGAAAGTAAACTCTGTGATTATAATACTTCCTACAATGTGTACACTCAACAAAGAAGCAGACTACAATTTTGGTAGCGTAGCGGGGTCGTTTTTGATTTTGTATGTATATCTGAATCATTGGGTGGAGAGCACTTCTTTTATAGAAATTAGTAAACACGGCTTACAGATTTCTTGGTGGAGACACATTTGATAAGTATCAATTCATTACATCCCAAAACTTTTAACATGGTATCTTTTTAATTTGTATTTCACTACTCATTATATTACACATAATTGTACAAAAACGTTATCGATATTACTATGCGCGACTAGCAACAACTAGAGATGAACCATGTAACTAACACAACCCGTATCGATCAATATCGATTGGTTGGATTTATATCACGGCTACACTTATACCTCTGCACACAGCCGCTTAAAATCACTATTAAATTTAAGCGGACTCTTATTGTATTAAATTTAAGCGAACAAATAATACATTTTTTAGGGTCAGTCGAAATATGTAGTCGAACGCACAAGCAGAACCACATGATATATAATTACTTACTTCATAGTTTTTTCATAGTAATTATACTACTGATTATGATGTGTTCAACAAAACTATCGTAATAATTCCATTAGTGATCACATTTCATGTTGTCTGTCGATAAGTACCATTCACCAATGGCACGCTGATCAATGTGTGCAGTCGAGTAGATGCACTTCCTGTAAAACTTTAAGCCTAATTAACAATGACAAAATCCGAGAGCTAACCGTAGGAGTGAGTGGCTAATGCCTTACAGTGCGGTACTCCCAGCTATGGAAATACCATAAAAAATACCACATTTAGCGAGTGAATTTCGATGAGAGGCTTTAGCCCTAAGAATAGGAAATTTTATCTTTGGCAGTGTTTCTGGCGATTATATAGAATAATATATTTATTATAGAATATATATATATTATAGATTATATATTCTACAATAATATATAAAAAACACCGAAACTATAATTTGTTTTATATATTTTCCCACCCATTTTCCGGTATTTCCTATGATAGCTAGATTATACAGTCGTCCGATTTTGATAAATTAAATTTGAAATGTAAAACTAATTATAAATATATATATATAATTTTAATTTATTATTTGACCACCAATTTTGCGATCTTTCGTATGGCAGCCATATGATTCTGAAAAAATTTAATTCGAAAATCACAACTAATTACAAAATGTTATTTCCAAGTGTAGTATATAATTTCTTTTTTTAATCTTTTATGTTCGATCCGTCATTTTCCAACTTATATACTACTTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCTGATAGCTTCAAAATTGAGGGACTAGTTTGCCTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGACAAGACCGACTCGTCTAGTTATGCTGATCAAGAATATATACACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTCTTACACCCTCTGCAAGGATGTAACAAAGAAGAACGCTTCGGTCGAGTGCCTCGACTCAGAATGCCGTTACTCAGCTTAAAAGAGCAAAAGGGCAATGGAGATACATAAACAGCAAAGCGCCACCTAGCCGCTATTTCAATACATGGTAATATGCCGTTTGTGGGCGTTAGTGTACATTCCAAAATATTATTTTTATGGTAGAGCCAATACCATATTATCGTTTGCACATTTAAAAGGAAATAAATCGGACTGCATGGTTCTGCACGCTATTGACAAAAAAGGCATTTATGTTAATAATTTATGTTACCCTATCAACCACCGTTTTGGTCGGTTTGTGGGCATAAGAGTGGTCGTGGCGCTATACTAAAACTTGCAATGCGCAAGAATGTTTCTCTAGAAGCTACATATGTTCAATATACGTTTCACATGCTTAATCCCTTTCGGCAGTTATATACTGTGTTTATACGATGCCGAATTCACGCTATCATTTCACGCTTTCAGTCGATTCATGTGTATATAAACGCCATTTCGTGAATTCGGCAAACAACGAAAATTGACTATGATTTCAGCCGGAAAGCGTGAATTTGTGGTGCGCTACTAACTTAACGCTATGCAGACCAGGTGGCAACGCTCTTTGGCTCTTTCATTTATGCCCAAAAAGAACTCAGTAACTTTGGAAATTAATTTTTCGGTTCTTATTTTTCGATTGTAAATGAAGAATTTTAGTTTATCCATCGCGTTGTTTGGTTTGTTTACATTTTGTAAAAGTGTGACCAGACTAAAATACCAAATTTTACACGTCTGGAACCTCTAATGAAAGCAAATCACGAAATGATATGTGTCGTATAAACGGGGGTTATTTCTATATCGCGCTTTTAAGAAATCAAGATTCCTATCGTATAAACATAGTAATAGTTTCCAAGATACCACCGTTCATATGGACAATTTTTGGCAGTTTTTCGGCGTTTGAGTGCATCTGACATTTCTTGTTTACGTCCAACGAAAGGTTTGTACGAAATCAGTTCATTTCAAAGTAAAATTTTATTCTAGCACTAAAAATTTAGGAGCCGTTAGAGTGGGTCCATAAAAGCACTTTACTGTGCGGTAGTAACATAAAATATCTGGACAATAGATGTGCAGAACGAAAGTACGCTAAGAGTTTATAATGTCCCTTCAGTTCCGAAAGCCTGAGAAATGCCTTGTAAATACGGAGTGTCGTGTCTGCTTGCTCGAGTGAATAACAAGTGATGCTCCATATAGAAAATTGTATGGGAAGTCCGCTTTTTCACAAGTGAAAATACAAAGTAGACTTTTTCGAACGTCCCAAGTGAAATCACTTCAAAATTCTATATTTTTCCAACGAGTTTTCACTTCTAAAATCTATTGCAAGTGAAACGGCTCAAGTGAAATCACTTCGGAAATTCTGAAATTTTCCATAAATATTAAATTATCAAGAAATTTAATTTAAAATACATACGGATTTATCTACAGTTTGCTTCATTTTATTTAAATTATATTTTTTATTTTTCCGTTAAATTACAGTTATTGTTCGTAGATCAGTTCTTTGTTTTGTCAATTTGTTTTTGTTTGTCATCGCCTTACGCAAACAATTGTGCGGGTCCTCGAAATCCCTGGTTAATGCACTTGTAAAAACCCTTTGCGGGATTTTTATTGACATTTTCAAATAAAATATCATTTTTATTAATAAATCAAAATGTGTCGCAGTGCACATTTGAACTCAACAGATTGCACCAGGTAATCTTATTTTGGTTTCTTTCTTAACATAACTGTCCTACGCTACGCCGGCTTCTC'..b'CAATAAGTATCTATCGATTGACCTTAAAACAAATTGGCCACGATTATTCCTGTCCGCCGCCCACAAAATCTTTGTTGAAATAGCAGGTAGGTGGCGCTTTACAATATCGCTTTGCTCCTTATATATCTCCAATTTCTTTTTGTTTTCTTAAGCTGAGGACCGGTATCTAATAGGCGAGGCTCTCGACTATAGTGTTCTTCTCTGTTAAATTTATTAAACAAAAACACCTCTTAACGAGGTGAAAATCTACTGACGATTGCAACTACAGCCAACAAAAGTTTTGATATCAGCTTAGGTGAAAAAAATGTATTATAAGACTTACTAAATACATACATTTTCTTAATTTTTTACATTCGGCACGCTGTTTTTAAATATGCTTCAATGAAATTTATTTATTTAGTAGATCGTATAATACAGTTTATTTTAAATCCGTAGATCCTTTTTTCTGCAAACAGAAAAGAAGTGTAATAAAATCGGAACAAAAAACTTTTGTTCATAATCTTTAAACGATTGTATTTAGACGAATAGAGTTAGGAAAACCTTCAAAATATTTCAATGTACCTTTTTAGATCTAGACCTGTAGATTTAGTAGTTCACAAGTTACGGGTGTACAAAATTTAGTTATTTATAAAATTGGTAGAACTAATGTTAATTATATTCATCTGTTTAACATCATTTAAAATTTACAGGATCCTAGAACATCACTTTAGGACAAACAGATTTATGTTTACATATGTATTGTTTTGCCAATTTTGCTTTTTACATTTTCGTCATTTTTTTTTCCAAATCAATTGATTTTTTTAGTCCTTTTAGTTTTTGCATGTATCACTCGTAACCATCGGACGATTTCTTTAGGTTTTCATTTTTTTTTGTTTATATAGTAGTCGCCTTCGCATACACTCCTGGTATGCGAGGACTTCGCTTTACATAAGAAAAAAAATATAGATGGAATAATATATTTTTAGAGTCACTACATATCAATATCTGTTTAAAAGAAGATTGTATTTTTGCACGTTAACACTATATTCTATTGTGGTTAGAAAGGTTTTTTGTAATATCTTTATCTATGGCGGTATTCATATCTTTGCAAGTCTTCACAAATTATTTTTAATCTTCTTAATTATGTTGTCCCCTTGGTACATTTAATTTCCTAATTTCTTTTAATTTTTTCACTTTTTTATTTTATTTCGAAAAATGTAATGTACTTCCTATTTATAGCACTTAATTTTATAATAAAAGTTCTAGTATGTCAGGCTATCTGAAAAAAATCTTCCTAAGTTTAATTTTTTGTTTGTACAAAAAACTTTAATATAAAATGGAGATTGGCTTGATTTATAATACAGAAATGTTAACGCAAAAAATAGAAGAAATCAAATAAATAGTTATGTTGTCCACCTGGTACATTTAATTTCCTAATTTCTTTTAATTTTTTCCACTTTTTTATTTTATTTCGAAAAATGTAATGTACTTCATATTTATAGCACTTAATTTTATAATAAAAGTTCTAGTATGTCAGGCTATCTGAAAAAAAATCTTCCTAAGTTTTATTTTTTGTTTGTACAAAAAACCTTAATATAAAATGGAGATTGACTTGATTTACAATAGAGAAGTGTTAACGGAAAAATTAGAGGAAATCAAATATATAGGAGAGAAGCGTCGTTTTTGCAGTAAATGCATTGAAAATTATTACGTTTCTAGTAATGATTCTTAACTCATCAGAAAAGTGCAAAAGGCATTATAAGTACATAGGTCATTGCATATAATTGGAACATGGTTAGCATGCACTTAAACAAGCAGGCGATTATAATTTTCTAATTGACAAATACATTTTTGTTGTGTATTCATGGATCTGGAACGTGCTTCTGAATTATAATTAGCTGAACAATTTTTCTTCGCTTTTCTTTTATGTTAAGACCACCTCAAAATGTGAATTTATTTTTTGATCATTTTGGACTTGGAACTCGAAATATTTTTTGGTATACATACATACCTGACGAGCACTGCGAATTTCCTGAATTTTGCTGGCATGTTTTTGCAGGACACAGTATCCTTATATCTAAAACGCACATTTAGTTTTGTATAAAAATCAATTTTTTATACAAATTGTAAGTGTTTTTAATAAAATCATCACAAAATTTTTCGTAATTAAAACAATAAAAATTATAATAAGTGGTTAGGAATATGGGATGAATTGTAGTCTACGAAGTGGGCGAAAATGGGTTTGCACTAAATACAATTTTCTTTTATGAACTTTTATAAATTTTAACACATTTTTAAAATTCTGCTTATAAGAATAATGGATGTCAAATACTTAAAATACTTGTATACTGACATTCATTCTTTATTAAAAGATGCCCGACTTAAGTCTTTACTGTAATCTTTTTTTATGAACTTGGTATATTTAAAAAAATATTTAGAAACTAGGTTTGAGCCAAACTTTTTTTTAAAGAAAACCTTAATTTAGCATTTCATAAGCTGAAGACATTCACCCGTATAAAATAAGTTTATAAATAATTTGAAGAACATTAGGACATGAAAGATAAATTAGAAAACTAATTAAATACTCACCAATAAGCGAGATAAAAACTTTGATTGATCTTTTTATTTAAATATGTAAGTATTTTTGTGTAGAGATAAACCAAAAACCAAAAAAGCAGAAAAAATGTAACTGTAACAATAATTTTTCGGTTATGCATCTAATTTGGAAGTTCACATTCTAAACATGAAAGGACGATATAGTCGACCACGTCTTGAAAGATAATTATTCCCCCAAAGATTAAAAGATCATAGTTATTTTCATAATAAAATCAATTGATGTGCCGTTGTGAGGCACCTTGGGCCTGCACAGACAAAAATTATAGCAACTGGCTTTAACAATTAGAGTAAAAATGAATTTCCTTTCACAAAACTCGTGAAAAATAGTGAATAAAACACTGAAATACTGCATTTATTTGCGGCTCGATATTCCGGTTTCCAGTTTACATTTACGATATTCTTAGCTCAGTAGGTAAATACAAGTTAGTTTGTTTGTCCGTCTGTCCGTTTAAACTCAATGCTTACGACAGTAGCATTCGCTCTTGTTATTGTCTCAATTTCTATAATGACCTTCTTGTGACCCCATTTCGTAGGTTAGCTGCCTTACCTCTTAGAGTGCTTACTTTTTTAGTCTGTGTTCGTGGATTCGATCTCCAGAGAAGAAAATATTATTCTTCTAAATAATATATATTGTCAATATGAGAACAGCGTTTGCACGCACATATTTTTTTATAGGTTTAAAGTCATCTAAAATATAAGAGCCTGCTTCTTTAGGGACTTCAAAAAAAATTTTTTTTGCATAATTGTCTACCCAAACTATCCAAGAATGTGTCCCTAAAACTTGAGAAGCAAATTCAAAATATTTTGACAAGAAAATACAAGGAAAACTTTTACGATTTTACCTAATTGGCGGAAAAGACAGGGAAAGTAAACATGGTATGGTTAATTTTGCTATTCACACTATACGGTTAATGCCAGAGAAATTATTTCATTAGCATATTAATGTACAACATTTAAACTAGGTTTTATAAAAAAAATAAATGAGCCGTTGGCAGCCAGCTCCGTAGGCGCTTCCAAGAAAATAGGTTTTTGAAGTGTACAGCATAACGCTACAATATAAATATATTATAATATTAAAATTAATCACTAAAAAACTCGAAGTCAATATTTGTAGATTTACGTTATATTGCGTATGTAAGTTCAGAAACAGTGTGCCACGATTTCAAGTTTAGAAGACCGGTCTGGACAGCCCCTCGTTCAACTGGTCATAACTCTTTCAATTTCGTCCGATTGACACGATAGATATATATATTTCTTGCAGCATGTCGGTAAGGAAATTATATACAGTTTACTTGTCAAGCGAACATAAAATCATTTTTCGTCACAAAAGTTGATATCAAAACTTATGAATATTCAAGGCGCGATCGTCGTTAGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCTTTTATCGTCAAGAGGTGTTTTCGTTTTTTGAAAATTTCCATTGGGACAGATAGTGAAAGTGTTCTCTAATGAATTCAAAAGAATTCTTCCGACTTCCCTATTTTGTAAAATAAAAAAGAAATGAAATCTATTGGAAAAATGTTCTACCACCGCTTGGTGATATCTGTAATATCGGTAATATCTGTTTTCGTTGACGAATACTGGATTGCTAGATAAACATGAACACAAATTAAAAACCCTATAATGCGACAACTTCGTTCGGTATAACGTTTCCATAAATCGAATCCAGGTCACGATGCATAAAGTTTTGATATATCAACGTTAAGGATTCGCAATAAGGATAATTTAGTAGTAATATTATAAACATCAGGATTTTATTTAAGTGATGTTTAGTCCGTTCAGCTGAATTACTATTCCATATTAATCGTCAATAATATTATATTATTATTATATTATATTATATTATAAAGGTATTTTGCTTGCATTAAAGTTTTAATCCAATTGCAGGAGATTCAAAGCTGAAATGAAAAATAAGACTCTTGGCAATCGGCAAAAATCTTTTGAATATAAAATATTTGTTTTGTGAATAACCAAAAGCGCTTGCTCATGCTAACAGTTTTAAATTTTTATGCCAATAACATACGCAATATAACCTATACTAAATTGTTCATTGAATTAACTTTTCGAAATCATATTAGCATAGCGCTTTACATTTAGTACTTTATATTATCTCATTGCAATAGGACGGATGGTGATGAAATGAAGGTGCATTATAAATATTTGATGTTTCTTATAGAAATAAGAGAACAAATTGTGTATATTACAAGAAACTCATAAATGCAGGATTGGATTTACCTTCTGGCTCTTTTGATATGACTGTGGTACTGCGATCAACGATTCCTTTTTTATCTTCTAGGGAAAACAAAAAAATGTATATTTAAAGTTGCAAGTGAACCAATATGTCCCTTAGTTAATTCTGATAAGGTAATGAGTTGTGTTCGTATTTATAATGCCTCCAATTTTCCGGATTCTCCTCAACTCAACGTCGGTTAGTTTATGTCAAATTAAATGTAAAAAAATACTTTTGGTATTCATGATATGTTACTTACTTACAAAATTTTAGATTAAGATGGAATTCAAGAAACATCATTAAGTTATAATGTTGAAATTCAAATGCTCACTATAATGAGAAAGTCTGTTCAAGGGATATTTGCAATTATGCCAATTAAACATTATGTGACCTAAATGTTAATAAGTGCTGTTTTATTTTTCAGGGTTGCACTGGGCTTACGCTCAAAGCTTTGAAATCTAAAACAATGTTGTTTCCTTATATTGTATATATATAAATGGTTTTATAAAACTCGTATTTATCAGTAATTTTGAAAAGAAAAATTCCCTGAAGTCGGAATTTATTAAAACAAATATACAATAAATATATGTGCCCAACAGTATTTTTATATGTGAATCTAACTATTACAAATAAAATAATAGGTACCTTCATAACGTATTATGAGCTTCACAAATTTTTTTATTAAAACATGTTAATTGTCTCTCTAGAATTTTTTTATGCAAACTTTACAGTTTAATTTATATAGTTGAGCAATCCAGTTTGCCAACGTCGGATGAAACGTATTAATAACAACGTGCCAAAATAGTTATAAAATCAAACTTCTTACAATAGTTTCACGAATAAAATTATGAATTGATTATCTATCCATCTATGAATAAACTGTATATGTAAGTTACAACCCAGCTTTGTATAGTTTTGATCAAGTTATATACAGTTTATTATAATGGCAGCCGGCAAGGGTAATTAAAACTTCATTCTTCATGGATTAATAGCTTAGTGAAAAGGGCATCAAAATATATTCACAACATATATATGAAAATATTTAATTTAAAGTTTGATACTTCAAGAACATGCACTTTTTAAAAAATGTATTCGACAAAAAGGACAGGGCCGGCTTTTTTGGGAATAAATAAACGCCATGCGATTTTTGTACGCACAAACACTTTTAGTAGTAAGTAACATTTGGAATTATTTTAGATAAACTTTTTTTGAACTTAAAGTCTTGTCATTTATGTTTAATTCACTGGTAATCCCCGTCTCCTTACTTTCGATTAACTAAAAATAAAACTATTATATTCAATGTAAATGATGAATCGAACTATACAATTAACATAAATATCTATGCAATTTTACGGCTTAGTTGTATTTTTTTTTCTTAAATAAGCTTCACTTAGCACTGTGTATTTGGGCAAAGCTCTACCGGTTGATTGTGATTCCTGACATAGCTAATTTACTAGCGTTCGCGAAAACTTGACATATTTTGTTTGCTATAAATGAATGCGAAAGTTAATAATATTAATTATAATATTTACCTTTAATATCATCGTCTTCAAGGGTAGTGCTAGAAGAATCGGTAGATTCCTTGACTTGAGATCCGTCACCCTTCTTGGTGATCATACTTCTGCCTGTAAAATACACATATACGTTTTCATTAAAATCATAATTTTACTTAGAGGGTCAGAAAAACAAACTCGTTTTAGGTCAATCCATAAGTATTGTTGACACAAATACATTTCATTCAAAATGTTTGTATAGACTAAAACCTTGAACGCCTCAGTCTGGCGCGCATTGTAGGCGTGGAATCCTGGTCGGTTTTAACAGAACTCCACGGAGAATTTAATTTCGTCATCATGAAATTAATTGCTTGATACAACTTTAAGATAAATATAAAGCACGCTAGCTTGCCCACCCTAACTTTGTCTGTCTAAAAGAATCAGTTCTAAAAAATGGAATATTACAAAAAAATTAAATTTGTTTTAATTCTGCAAATATAAGACTGCTTAATATAATAATAAAACATTATCTGCATAGTTTTCCTTTAATCCTTTCGTCATTTTTTCCCAAGTGCCTGGTTCTTTTGCACTTCTTAACATTTGCTACCTTGAATAGCTTCCCTCCACTAAAAACATTTTAATTTTAATTTTACATATGTTGATTCAGATAAGCCTGAGAAAAAAACGTGGGTAACATAAATTTATTTGTTGGTTAAATTTTTACAAACATTTTTCAGTTGTTTAAAATATAGCATACCCATTTGTTTAAAAAAACTGAATATGTTTAAACAATGCCAGATATACGTATATTACTTAGAATAAATGAATACACGAATTCGGTCGTTCCGCCTATTTCGATTTCACGCATTCAAGGTGTGAAACGTTTTAGTATTCTTTTTATTTTTTTTAACAATCCTAACCTCATTGACATACGAATGTATTTAACATACATTAAACATCAAAATACAAAAATGTTTTGGGCTATATCATGTTCCGTTCCATTGCTAAAATGAATTCGGATACTTTTTCGTTCTTCTTCTTACAAAAATGTAAAATAAACAACCCTGCTCCGACAGATTCACATGGATTCAAATTTTCCAGACCTGTTACGAGACTCACTTGCAAAAAAATAGCACGGATTCAAATTTCCCTCTGTTGTTTACTGTTCAAATGTGCAATTCGCTGTCGGTGTTAAGCTCGCAAGTTTAAATAATTGTTTAAAAATACTTCACTGTTCTTTAAACTGGACGGATTTGTCTAAAACGTGATAGGGTACGCATAAAATTATAATTATTTGAGATGAGATCTGAAAATTATATATTTTCTTGGTAGTACTACGGTAAGAAAGATTAATATTCCAACTGTTTTTATTTAAAATTGTTATTGTGCAAAACATTTACGACAAAGCTATTTTTTCGGCCTTGTAAACTCTTTCATTCATTTCCGTGTGGTAAGTGGATATATATACATACATCTAACTAAAAGTGCCCCTCCCCTATAGAAGGCAAATACTTCTCATGTTTAGTTGTAAATGCTCTCCCTGTCTATGCTTCCGCTTTGTCATATTAAAAAAGAGAATTGACATTAATTGAAAAAAATTGAATGTTAACGAATTAATTTCCGAGTGAAAACCGA'..b'AATTCCTTAAGAAGACAATTAGATCTTGTGTTTGTTTCAGACCCATCTGAAATCACGCTCTTGTTGTACCTGAAGACCTATATCATCCTACTATGGAACTGACAATTTGCCTCCCCTGCTCTGATACCCTCTATCCTTTAGTTTCTCCAATTTAAATGAGATGTTTTCGTAAATGTAACTATAATAAACTTAACGATATGATTTCTCATTATATTTTTTCGAAATATGTTGTGGCTCGAACAGATTTTAATGTTCTCAACAGTCATTGCTACTCTCTGTATCTAAGTCGATGTAAATTTGAATTTTCAAACGATCCGAAACAATTTTACAATTTTGTCAATGCCAAGCGTAAGGCATCGGCGTTGCCTTCATCGGTACGTCTAAACTCAATGGAGGCATCGACGGATTCTGAAATTGCTGATTTATTTGCTGAGTTTTTCCAAACTACTTTTAGTTCGACAGCTTTGTCAAATTCTAACTACCCTAATCCATTAAATAGGGCAAATTGTATCTTCTCCCCTGTAATCACCGAAAGCTCTCTCGTAAGAGATTTAGCGACAACAACGCCAACATTTTCTCCCGGTCCAGATGGACTTCCTGGATGTGTGGTTAAGTTTTGTGCGTTAACCATTTGTAAACCGACTCATAAACTTTTTAATTTGTCTATTTCATCATAAGTTTTTCCTTCTATTTGGAAGAACTCTTTTATTATTCCACTCCATAAAAAAGGTGCGAAGGCAGATGCCCAAAATTATAGAGGTATTTCTAAATTGTCAACAATTCCTAAAGCATTTGAAGGTATTATCACTTCTCATTTGCAACATTTATGTTCCTCGCTTATATCACCGTGTCAGCAAGGTTTTGTTAAGCGAAGATCGACCACCACCAACCTTCTTGAATTGTCATCTATTGTAATAAATGGGTTTAAGAAAAAAATGGAGACTGACATTGTATATACAGATTTTAGTAAGGCCTTTGACTCCTTTAACCACTCACTTCTTTTATTTAAATTAGATCAGCTTGGGTTTCCTGGTAATCTATTATCTTGGATTTCAAGTTACTTGAACGGTAGGACTCAGAGGGTTAAATTCAAGAATGCTGTTTCAAAATTGATCTACGTGACATCTGGAGTGCGTCAGGGTAGTCATTTGGGCCCTTTGCTGTTTACTTTGTTTATTAACGATCTTCCCTTAATCATAACACATTCTCGTGTACTAATGTATGCTGATGATGTTAAGTTTTGTTTATCATATAATGATATAGCGTCGGCATTTAACTTACAGTCGGATATTGATTGTTTTCATGGATGGTGTGAGTACAACCTTTTAAATTTGAACTGCCTAAAATGCAACGTTATGACTTTTTATAGGGGTACTCCTACGTTTATCGGTTACTTTCTTAAAAATACGCCACTTGACCGTATTTATTCAGTTAACGATTTAGGTGTTCTTCTTGACCCTAAACTTAAATTTGACTGCCACATTATGTCCACTGTTAACCAAACCATGAGTGTTCTTGGGTTTATAAAGCGTTGGTCAAAAGAATTTGATGACCCCTATACGACCAAATTATTATTTACCTCCCTTGTCCGTCCTATTTTGAAATATTGTTCGTCGGTTTGGAGTCCACAATATCAAGTGCACATCGACCGTATTGAGTCGGTACAACAAAATTTCTTTTATTTGCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCAAAACGTAAGGCTTCCTTCCTACGAGAGTAGATTACAATGCTTAATTTACCTACACTTGTAAATCGTAGAACAATGCTTGGTACTATTTTTATACAAAATCTTATAAGAGGTGACATTGATTCTGCAGAACTTTTAAGCCGCCTAACATTCAACGTTCCCGTTAGACTATCACGAAATTATTATTCTCTAAATTTGCCACGATGTACATCAAATTTTTGTCTGCACGAGCACTTTCGCGTTCTATGTAATAACTATAATAAACTTTATCATTTAATTTGCATTTCAACATCTATCCCGGTATTAAAAACTAATATTTCAAATCATTTGCTTAATTCTTAGTTATGCTTTATATTTTCATTTGTGTTCCGTCTCTATTTGTTTTATGTATGTATCTTCCTCGCGAATTCGCATTTTTTGCCCAAATTGATAAAAGGGCCCCGCGCGTAACAAGCACCTGCTTGGTGTCGTTGGGCCACTTGTTTGTGCTGTTCGAAGTGCATCAACGTCCATATATATATATAGCACAAGCCTCTAACTTAGGTAGTTCACAAGTTGCGAGTACACAAAATTGAGCTATTTATAGCTGTTTTCTCGCAAAACTAGCTAGTTTTTCCAAAAATGGTAAACATCATCTTAAATTTTCATGATCCTAAAACATAATTTTGGGACAGACAAACTGACATACGGAATTATTATTCCATTTTAAGAAGTTTATTTGAGAAGTCTGAACGGAGCATCCGATTTTGACAGTTGTCATTGTGTCATTCGACGCGTATTCGAAGTGACAGTACAGGTGAATCCTCTTTTTTTGCAATACCTTTCAATTGATGTATTACTCGTAACCATCGACGATTACTGTAGATTTTCATTTCTTCGTGTATATATATTAGTCGCCTTCGCCACCCTTCTGGTGCGCTTCGCCACTACGTGGACTTCCGTTCACAGTGATGGTGTCAACTTATAAATAAAAAATTATATGCCCAATAATATAATATCTCAAAAAGCCCAAAAACCTATAGTTTGTTTCTTATTATTTTCCCACCAATTTTGCGATCGATTCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAAATAATTTAAAAAGATTATTTCCAAGTTTAAAAGGTTATATGATAAAAAACACCAAAGATTTAATTTTTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCGGTCCCATGGCAGATATATGATTTAGTTGTCAGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTATTTTCAAACGTAGCGTGTTTAAAAACATCATAGATATATATTTTTTTTAAATTTTTTACCCGATACTTCCTATGTATATGATATAGTTGTCCGATCCGACTGGTTCCTAATTATATACTACCTGTAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAATATATATTATTTAATATCAATGAAGCCATCAAGAAGCCTTAATAATTTCACATGGTGACACTAACGTTGATTATTTCTTATAACTACAAACTTCGGTTTGCCGAAATTAATTTATTTTTTTGTTTTAAATTATATCATTGGTGTTCTTTAACGCTACGCTTGGAAATAATATATTTTGATTAGTTGAGAACTCGAATTTAATTTTACCAAGGTCGGACGACTATATCCTTTGGAACAAGCGGACATACATATCACCGTGGACGGTAGTCCACTTGTCGAAGCGCACCAGGAGGGTGTACGAAGGCGATTACTTACTATCACGAAGAAATGAAAATCTACAGTAATCGTTCGATTGTTACTAGTGATACATCAATAGAAAGGTATTGCATTTAGTATATGAAGAATTGCATACTAAGATTTTAAGAAAATCAATTTGTTCTGGTAAAAGGGTGGGGAAAGTGTAATAGTAAAAATTTAATGTGTTGGGGCTGGGGATAAATACCCCACTATTGACCTAGTTGTATTCTCTATTAAAATGCGCATCGAATGACACCTCAACTGTCAAAACAAGACTTTGGGAGTCTTCTCAAAATAATAATTGTATTTTTTTGTCAGTTTGTCTCAAAACGTTATTTTAGAGTCCTGATTCTAGACGATGTTAAACAGCTCAATATGACAAACATTAGTTTTACCACTTTTGGAAAAACTATCTACTTCGGCGAGAAAACATCTATAAATAGCAAAATGTTGTATACTCATTCCTTGTGAACTACTGAAGCTACAGGATTTGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/7f9/a2b/5b/scaffold_58-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTATACGTTGTTAGAAAGGTATTTCCCTTTGAACTCGATTTGTGTTAATACCAACGTTTAAACGGCTAAAACGATTTAAAATTAAATTTAAACAAAATTTGACACATTTACCAGTTTAGACCATATAACACTGCGTGAATATTGACTTTTTTTGCGTATCTAAACTAAATTTTAATTATTTAAAAATGTTACCCTTTAAAGTTATTAGTCAACAAAAATGGAAACGTTTACTAGTTCAGAACATATAACACTGACTGAGCTTTTGATATTTTTGTGTATCAATTCTCTTTTATATTAATTAATTTCTTATAAACAGTTTCCCATAAGAAACTTGAATTCTACGAATATTGGGAAAGTATATGTGTTACATAATTTATGTTTAAAACGAAAACCTCTGATATTAAACAAAAAAGGTGTTAAAGGTGCGATCAATAATGAAATATTTATTTTTTTTTTAAATTTAGCTTTGTTTATTTTGATCGTATTTTCTTTAACACTGCTTTCCTATAACTGCAGGAGTATACAAGCTTTGGCTTGCAAAGTTAACTTTTTTCTTGTTTTGATCGAGTTTACCAGCCGAGTCGGTCTAGTTATGTCCGCGAATTTTCTCAAATATTTTAATTGAAATGTATAGTTCTTGAATAAGAAAGTGACACCCACAAACACCCATAGTGCTTAAATCGCGTGTAGGAATAGTTGCCTTTATAGAAATTTGCAACTATCAGAATTTATGTTCATACATGGAAGACCGCTATAGTCGTTCAGTGCCTCGTAATAGTGATTTTACAAGAGAGGCAAATAGCAAATTCATTTCTTTAGTTTATTTTTCATCAAATATGTAAACACAGCAGCCTGTGGGAAAAATTTTACCTGACACCTAGTTTATAGATATTTTGTCTAATAGTGAGATGATTTGCTAAAAGGGTCATATTTCTTTGAACATATTAATAAATAAATAAAATGCCTAAATTATGCGTTTTCGTTTAGGTATTATCAATTATTCAATTTTAGGTTGTGTTGTTAAATACTCTGCCTTATAAATTAAAATAAAAAACGGGTTTTTAACAACTCAATAGTACGATAATAACTATTTTTAATGTTCCGATGTCATGCGCTTTGTTAAAGCCTGAACACGTTGGGCATTGCAGCTCTTACATAAAACGTGATCATCTAGGGGATAACATCCGCGGCCTTCAGCTTCAGATGACAGTAATAGCCCACAGTCCTAATATATTTAAAAACAAATTAGATATTATAATTTTTTTGTTAAAAAGTAATTAAGTTACGTTACCTCGCACTTATAGCACTCGAGGTGAAAGCTTCGATCTAAGGCCACCACTCTGACCGTTTCTTCTTGTCCAGCATCTGGCATGATTGGTTGTTTGCAGACACAACAGCGAGGAGCAAATTTTCTTTGATTTTATATTAATGAATCAATAAGGCATATCGTTCAACAAATAAAACTACCTACCTATGAAAATCTGTAATACAATAGTTTTGATTAGTAGCATCAACTGTAAATAATAGCCCATCTAAGCTTATTCCACAGACAACACATGTAAAACATTGAGGATGGTATGGCTTTCCGGTAGCTCTAAGAATTCTTTCCAAAATGGGCTTCATGCAAACCGAACATTTTTCCAGTGTTTGTAAATAATCATATTCACAGTATGGTTTGCCGTCTAATGCGTAGAATGGTTTTCCCTGTAAGTTTATTTGACAGTCTGTGCAAGTAAAGCATGAAATATGGTATATTTGATCCATTGCTGTACACCCACTACTCTCTCCTAGTACACGTGAATTGCATTTAACACATCTACCTGTTAGAAGAAATGGATGTTTTATTAAAAAAATTTTTATATCTTAGCTTACCGTAGTTTTCAAATTCTTGTATTGGATCGGGGGCTGTAGATATATAGTTACTAAGTCCCTTTTCATTATTTTTATGAGTAGTTTTTCCAATATAGCATGTGCTTAGACAGTTATCATTCGCGTATAATAACGAATGGCTCGCTTCCACTGAATTCGAAATATTTACGTCACCGAAACTGCCTGAAATATTATTATCATTGATGGATGACCCATACAGATTACATCTTTCCCGGTGCAACATGTCTCCAGAAGGACGAGGGTTTATAGGCTCATATATTGAATCATAAGTAGAACTCTGAAACAATTAATAAAAAAGATTTTTTAAACCTTTTTTCTATTTCACTTTGTTTTAGTTTTACTTTTTAAAACGATAAATTTGTATTCAACCTAAAATCGCTAATATTTGCTAAAGATAAAACAATGGTTTATTAACATTGATATGAAACTATCACAGTAACCATTAGAAATAAATTTTGTTTACAATTTAATATTTTCTGACCCCAACAACAATTTTCGATTTTTCAATGAATTTAGGAAATATTTAATTATTAGTTGCAGTAAAAGTTGATATCACAACTTTTGTTTCTATAAGGTAAAATTGTCAATATTTTTTAACCTTGTTATTAGGTCTCTTTTAAGATATATAAAGAGTATTTAAGTCGAGGTACTAGACTATAGCGTCCGTTATGTATATATATAATTTTTTATATACATATATATATATATATTTAACATAAATATCGTTTTGCAGTATTTTAAACTTGTACTAAAAAAACAAACAAGGAATTAGTTAGTAACCAACACTAAAACTATGTTATATAAAAGAAAAGGGCGATCCTTTTGATAAGCTTTTTGTGGCGCATTAATTAAGAAACAGCTGTAGTATACAGCAGCCTGATCTAAACATTTTCATTCTTCAAGTGCTTTTATTAACACTGTTAAAAAGAGTGCATCTGGTTTAACGCCCTTTTTCCAAGTTGATGGAGTCGTCTCGTGTTGAGGTCGACAAAGTCGAATTTTTTATTGCATTAATCATATCTAAAACTTATGTAGAACATGTTGTTAAAAGGATTTTTATTCGACAAAATTACAGTGCGCTATTCTTATTTCTACTTTCAAACCACGACTTTAACCAAGGCTTTAACACGGGCCGACCCCTTTAAATAATACAAAAATTGTTTACCTTCATTATAGCACCATGTTGCAGCTCATATTGGTTTGCATATATTTGTAACGAAGGAATTATTTTATGCTTATTTTGCAGAGAACCTGTTGGCTTGTTAAAAGCAGTAGAGGCTTGCCGAAGCTCGCTATAAGAAGAGCTCACAGCGCTCTCTGGGCTCGGAGGTGGCAGCAGGTCATCCTCTACTTCGTGTTCTGATAACAAATTTGTGCAAACGGACAGCGTTTTACGTGACGGGCTCATGTCTTTGAACTCTACATGATTTAGTTATTAATTTAATACATATTTTTTAATATAATAACTTACCAGTTTTGTGAACATTTGAGTAGGTACTTGAAGAAATACCTATCTCCTTTGTTTGTTTTGCTTTTTCTATATTTATATTTCCATATATTAAGCTTTTGCTCAGCGTGCCTGATGGGGACTCTGCGAAACTGTTTGCAGATTGTGATGCTTTAACTTGCACTCCTAAAAGTCCCTTTTTTTCCATTTGAAGTTTGTGGTAGGCCAGAGCTTCCAATTGCTGTTCCAATATTGCTGGATTGTCCAAAGTTGTCTTTCTGTTAATTGACATTTCAGCAATTCCCAAATTAGAATTGTTGAGTTTTCTGAAAGGCATGGGTCCATTCATTGTTTTGTCAATTCCAAAAAGAGGTTTTGAATACAGCGGTTCCCGCGAACAAGAAACCTGTTTACTTGATGGAACCTGTTAAAAAGACACACATACTACATGTATACAGCCATATTTTAAAAACATTTTATTTATATTTAATTAAAAATATACAAAATAATATTATATATAATTTAAACGTCCCGTGCGGAGCGACAAATGCCTCTCGAACGGTGCTTTAAACATTCGCGCTGTGACGCGCTGCGTCAGTGTGCGGGCTTCCATTTTATTAAATACAAACTTCTCTAAGCGGTAGA'..b'AGTGATGGAATAATAGAAACGAATATAACTATTTCTCTTTTTTTTTAAGTTCTACCTTTAGGAATATTTATGAAACCCATTGGGTTGGTAACATTGATAACGGTACTTAATCACAATCTCCTTTTTGAACGCTTTTCGTTTGCAATTTTTCTTAATCATGGAAATTTGTCAGAAGACCTCGTGTTTGGGTTGGAAAAAATAATAGAAACGCGATTGCATTTGGTCGAAATCTGTGGTTATTCTTCGTTTAAATTCAAATAAAAGGTATTGTTTTCAGTATTTTTATTACAAGGAGTGTTATTTTTTGTTCAATTTATCATTTAATATTGTTAAAAGCGTCAAAATGGGTCGTGGAACACATTGCACTATAGTAGAGAGGAATCTAATCCTCAAATTAAAGGCAGAAGGCCAATCCATGGCACAAATTGCAAAACTATTAGAATGCTCAAAAAAAAAGTGTTTTCTGCTATCCACTATCAAGCTGAACAGGAGAAACGTGGAAGAAAGCGAGCCACTTCTACAAAATTTGACACGAGCCTTATAAGAAAGTCGAAAAAGGAGCCATTTTTTTCTTCGAAGGATCTTAAAAACTACATGAACGCATCCGTAACGTGTGCTACAGACTATGTAAACATAATGAAGGAGGTTATGTTACCATATGCCAAAGATGAAATGCCTTTAAAGTGGGAATTCATGCAGGATAATGATCCCAAACACACATCGAAGCTTGCGAAAAATTGGTTCCAGGACAATAAAGTCCACGTTATGGATTGGCCAGCTCAGTCACCGGACTTAAACCCCATTGAGCATTTGTGGGGCATTCTAAAAAAACGTTTAAGTGGTTTTCAACCAAAAAATAAGGAGCATTTGTGGGAGAAAGTTCAGAAAGAGTGGTACTCCATTGAGCCAGCAATATGCTCCAATTTGGTGGAGTCTATGCCTCGTAGGTGTGCTGCCGTGTTGAAAAACAGTGGTAACGCAACAAAATATCAAAACTAAAAACATTTCATGGTAAATTTTGCTAATCTAGTCAATTTGGATAAAGATTAGTCATTTCGTTTCTATTTTTATTTCCAGGTCAAAAACATAAAACTTAACTTTAGTTAAATTTTTTAGCTAAATCAATGAAGTTAAATGAATTTTTGTTTTCTAGTATGTAAGATAGATGTATATATATTAAAGAAAAATCAAAACTTCCACTCATTACAACGTTCCTTATTAAAAATACGTATTTAAACCCAAAGTGAAAATTCGTTTTTATTATTTTTTCCATCACTGTATGTTATGTGGACTGCAGACATTTCAAGCGTTTTAGCTCTTTGGGGGCATACTGGTGGGCGTGGGCAAATATTTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTTTAATGAGACCAGCACATTTTAGCAAAAAAATGTCTAACATGACAATTGTGGCCACCACAATTTTTGGCGGGTTTGTGGGCGTGGCATGTTTTTTGGATCAATCGATAGGTATTGTTGAGAAAAATACATTTCAGTTAAAATTTTTTTCTATCATAAAAACTACTTCAGATGCCTAAGGCCCCAACATACACCGTCCTTCAAAAAGCAGCCGGAAAAACCTTTTTTGTCGGCTTTCGAACTGTATTACCTTTGGGTCTCCTTGCTATCACATAAAGTAAAAAATTACCTGGGGTAACTCATTATATTTCTTTGGTGGCTTGGGAGGTCCGTCCATCATCGTACAAGATTCACTTTGCCTTTGACGTATTTTGTTAACTAGCTCCGCAACGTTAACATGACCAATGGCAGCAGATGAAGAGGTTTTTGAAGGGGAGTCTTTTAGAAAGGACAGCTCCTTAAGTTGCTGGTCCACAGAATCCATTCCAAATTGAGTTATTACTTGTTTATGCTGTGAGCTATCCCTTAACGGGCCAAATATGTTCAAATTAATACTGCACTATAATACAAATCATTCGCACCTTTTTCTCTTCTGTGTTGGATTTAATTTGTAGTAAACCTGAGCAGCTTAATTTTGTTTACAACCGGGTTGTTTTAAACTTTATTTTTAAGAAATGTATTGATTTTATTCCTGGCACAGCTTAGGGTGGCGAGTAAAACCCAACATATCGATATATATTTCTTTATAGCAGAGTCACACTATTAGGCTACCCTAGAGTGGACCTTTTTTATAGATGAAGAAAAAAGGAATATGCTTAACAAAATCCTCGAATACAATTGCAACCTTTTATTCTCTTGGAAGTTGTTGGAAGTTTTAAATGCAAATACCTAATATTAAGTTCCGATGGAATTTTTTGAACTTCTAGTGGGACCGAAGATTTCAAAGTTCGCCCGCAACGCATGTAGAACGGTCTCACTGTCAAACAGTTGGCAAAGCCACAGTGTATGTTCAGAGGGTGTTTTTATTGTTTATTGTTAATTAGTAGTTTCAGAGTTCCTTCTCATGTAGCGGATGCTTAGCCATGTGCAGTCTAGCTCCGATTCTCTATTTGACAACGTGGGACTTTAAGGGGTGCAAGGCGGATCGAAACTGGGTTTGTCATGCCAGTTTTACCGACATAATGCTGTTGCCCTCTAATAGCTTAATCATTATCAAATTACAATAAATAAAAAAATTAAATTAAATTAAAGTATTATTCACATATCCAAAACCATGTTATGCAAAATGAGTTATTGAATTCCGACTACATAAAGAAATATGTACCTGAAAGGTACATAAGTTTACTTTTAGATATTTTTACATAAAAAAAATGTTAAGCCATTCTGAGAAAAAAAATATGTTTTCGAGAATTTTTCGTATTCCAGCGTATTCCAGAAGTTTAAATAAGTTTTTAAATGCTTCATTATTTTACTGTAAGCTGGTGTATGCACGTTTTGGTGTTACAGGAGCTAAATTTTGCCAAGAAGGACATAAACTTCAGGTTGGTCATATTCTTGAAAGTAATCACTGATTACTCGGTATCAAAGCAAGCAACCCAATGTAAACACTTTTTTTATTGTAATCGGTTTATGAGCCTAAAGCTTACCCAACATGGTGGGATAAACATATTAGCCCAGAATTAGAGTTATATTTAATATGGTGTTCACACATCACCACACATCAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGATAAGAAGGTTATGTTTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGATATATATTATTTTCCTACCAATTTTCCAATCGTTCCTATTACAGCTATATGATATAGTCTTCCGAATTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGTTTAGAAGGTAATATATTTTAAAAAACACCGAACATAACATATAATTTTTTCATATTATTTTATCACTAATTTTCCGATCGTATGATATAGCCGTCCGATTTTGATAAAATGTAATTCGAAATTCAGAACTAATTATAAAATGTTATTTCTCAGCTTAGAAGGTTATATGAAAAAAATACGGAAGAATATGTATACTTTATGGGATCGGAAACGTTTCTTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGGGCACCCAACTCACACATATAACTGTAGACGGAGGTACAGGTTGTGGCGAAGCGCGCAATAGAGGGTGCTAAGACAACTACTATATACATATAGCCGCAGAATTGAAAATCTGCTTTAGAAATATAAATTTGTCTGGGAGAAAATGCGGTAAAAGTATAAAAGTAAAAATTTAGAAAATTGGAGCTGTTGGAGTGTGTGGGGATAAATGCTCCCGGCTTTTAATATAGTTTTATTCTAACTGAGAATACTCGTCACTTCACCTCTTCTTGAAATCTGATGTCCCGTTCAAAAGTAATTCCAAAAACAAATTTTTCTTCGTATTCCCAAAATTAAAATTTTGGTAGTTTTGTTTTGTGGGTTTGTCTGCATCCCATCTTAGTTATAGAATTTGGGGAACCCAATGAGTG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCTATATGAAATAGTCTTCCGATTTTAAAAAAATTTAATTTGAAATTCAGAAATAATTTTAAAATGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTACACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGATTTACTCAAGTTGTTTATTTCTATAACTGCAAGGGTATGCAAACTTCGGCTTTCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTAAAATTCTTTTTGCAGTTACTATTAGTTTTGTATTTTAGAGTCAAAACGTATAAGTTTAATGTTAAGAATCGACTTAAATCGTACTTGAAAATTATAGGAATTTGTATATAAACATATCTCCGTTTTACACACGCATATCTGTTTTAAATATTCTTATTCTCATTAGTTTTACTTATTCGAACGTTTTCGTTCAATTCAATGCTCAATTAAACGCCTTTTCAAATTTTCGGTAGAGAACATGAACTTAAATAAAAACTGGCAACTATTGCCAGTTTTGTAAAATGATTGGGTAAAGATATATTTGGTATATTGTTAGAATGCGGTCACACTTAACGTATTTCCATATGCCAAGAAGCGAGGCAGAAAGTTGTCCATAACGTTAAAATGGACACAGCAGGCTTTATTTCCGAAAAAAATTGTATGCAATATTTATTTTTAAGAATCGATTATATAAACGAACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGCTGAGATCTCGGAAACTGTAAAAGCTAGAGGAACTTGGCACGCAGATTCCTGGGCTTCCTCCTGTGCAGCACAAGTTTGTTTCAGCAGGGTGACATTCCCATTCTACCACTGACAATTCGGGAAAGACTGTAGCGCCTACAGCTTTTGTGCTAGAAACAACATTTTATTACCTATGTAAATGTAATGGGTTGGGTAAATGTATGGGTTGACTTGGATGGACTTATAACAAGTTTGCCACGCCCTCCTTACACGACCACAAACCGCCCAAAACTCGGCCACAGTTTCGATGCTAGAAAAAATCTCCCGGCAACCATTTGTTATGTAGCGCTTTACACTATCGCTTTGCTGCTTACTATATCTTCATTTCCCTGTTGTTCTTTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTTATAAATACGTAAAGACGTAGTGAGAAGTATTATTACAAAAAAACATTTTAGGTCTTATATGTCATAACAATTGTGAGAGAAACCCTGGTTCGGACACCAGCTAGATCCAGAGTACTCATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATTTGTTGAACTCGAACCCTGAGAACAAAAAAGTGTCGGGACGTACCATCTGTTCCGCAGAGCCAAGTCTATATGGAAAATTATTCTAGACAAAACAAATCCTTGTTAGGAGAAACTTTTTGAATCAAAATTTAATTTTAGTTTTCAAGACAAGGAACAAAATTTAAAAAAAATTCATTCAAACGGTATTTAAATTATCTTTCCATTGATGCTAAAAGTTAAACGAAGCAAGTTCAAGTTACGATGATATATTTCGTTCTTGTGTAAATACTTTTGACCACCCCTGTATATATTTTATGGGGTCAAACTTCTGACTTAATTCATAATTAGGTAATAATTATAGTTTTAAAATATAATTAAGAGTAAGAATTAATTACCATGTCGTTCTTGAAGACAGAACATTTAGCCTACAACAATTTCGCACAAAGAAATATGGAGTAGGTTATTTTTAATAACTAATAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTATATATCCTTGCAGTTGTAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAGTTGAATTCGAAGTTCTTAAAAATATTTATGGTTATATGTTAAAAAACACAAAAGATATAATTTTTGTTTTCCTACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAACTCAAAACAAATAAAAAATGTTATTTTCAAACGTAGGGGGTTGTAAGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTAATATTATTTTACCATTAATTTTCCGATTGTGGCTATGGGAGCTATATGATAAAGTCGAAATTCAGAATTAATTTAAAAAAGTTTATATCCTAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGATCCGATCCGGCTGGTTCCGATTTATACACTACCTGCAGTATAAAGAAGATTTTTGTTAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCTACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAAAATATATTTACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTTCTTTACTGCGTTGCAAACTTCTAACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATGCTCTATGTAAATACGGATTTGCACTTTGTCAGAATAGGCGTACATCGTAGAATTCCAAAACAAACCGGAAATACGTTTGATAAATTTTCTGAAAATATTCTACATTAATCAAATTGTGCTAACCTTGCAAAGCCATTGCAATATCATAACATGACAACCTCTCCGCTGAACGAGCTTGACAACTCGGGATGGTGGAGGAGAATGAGGAAGAAGTAGTATATAAATATGCTTGTATGTGCGCGTAGAAATATGCAGTCGTAGAGCTAGGGAGTGCTACTTCTGGGGAATAGAAATGGGAAGAAAAGGCAGAGTTCTATTTTTAAAAGAAAAATTTATGAATGAAAACAGAAACAGAAAATCATACCGCAGAAGAAACGGAACACATCTGAACACATATCTTCATATATAAGACATCTTTGCGAACTTTATTTCTATCTTGCGCCACAAAAACTTTCCGAATATCTTTATGCTATTAGAGACAGATAATTTAAAAGATTAAAATAACCTTTAAAGAAATAAACAAAAATATGTTAACACAAATCAAGTTAGGAATTTAATAAAAAACAATATAGAACGTTGTATCCGAGTGTCCGTGAACCAGATAGAACCAGAAGTGGTAGAGTGTGACAGATGCCTGGGCTTCCTGCGCAGCGCAAGTTTATTTCAGCAGGGTGCATCGCCCACTTTAACGCCCCCAGTTTGGGAAAAAATGTAGCGCCTTTAACTTTTACGCTAGAAACGAAATTTTAACTGTCGATACCTATCGTTTCGTCAAAACATTTTTCCACACCCACTGGTAACGCTTACAAATGGCCAAAATGCCTAAATCTGTCTGTCGCACACATACCATATATTCAATAGCTGGTAAATGACGCTTTACAATATCGCTTTGCTGCTTATAAATCTCTATTTCCTTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAAATTATTAAAAACTTTACATTTTTCAGTAAAGTTCTACTGTATGTAGAAAAAAGTAAAAAAGCTAGACGTTTTAGAGCTTCTTCAGCTTATTGTTTCAGCAAAGTGCCACGCCCACTTGGATGACCATAGCACTAAATTATATGGCAAAATTATTGAAATCGGACAATTCGTTTTACCCGTTACTCGTAGAGTGTATTTATTTAGTCGAATGTAAAAGCGTTACTCGTCATAAAAGCCACGACCCCTCACCTCGTTTAGAGGTGTTTTTGTTTTGTTTGATATCGTAAGTTTTTGTTTTAAAAGCTAGCTAAGTGGGAGTGAGTAGTAAGTGTGACTGTGAAAGTTTGAAATTGGCATGCAGATCCTTGTGGTTTTTGGACAGCGCAAGTTTATTTTAGCAGGATGCATCGTCCTATCAGAAAATAACGCCTACAAACGCCCACACACCCACTCCCTAGCGCCAACATTTTTGAAGACTTTGAAAAAGTGTAAATGCCAATTTATTTTTATATTCAATATCTATATCATGCCAAAAATGGTCGAAATCTGACCATCAATAGGGTTTTTTCTTAGAGGTAATGAAGAAAAAAAGATCGGCTACATGTATGTTT'..b'TAACTAAAATACAAAAAATAAGAGAATCAAACGAAAATCTACATGAAATGTAATGTAATGTTTTTTTTTTTTTATATCAGAATTTTTGTTTTAGTCACCAATCAAATCATTAGTCAATTTTACCCAAAGTCGTGAAATTGAAGTATATTAAAATTTCTTTGCGGAATCCGTTCGGCTTGTATATGTGTTTTTCAAGGTCACCGTATAAAATCCCTTGGTTTACAAAACTAATACTAACATATTAGGGGTGTTGTGATAGCTACAAGGCCTTCGACTAAAATTTTAGTAGTTACAATAGTTGATAAACCATTATAATTTTATCTAAAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGGAAGCCGAAGTTTGTATACCTTTGCAGCAACAACATGTGAAACTTTTTTTTAGGATTTTTGTTGATTTTAGTGATGTTAAAAATAAATTATTTCATTCTTTTTTCAGACCGATTTTTATTGCATTGAGTTCGAAATTCTTTAAACATTAAAAAATTTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAGCACCGAAGATCTAATTTGTTCATATTTTCCAACTAATTTTCCGATCGTTTCTATGACAGCTATATGATATAATCGTCCAATTTTGATAAAATTGAATTAAAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATGCAATGGTATAAATATTCATTGGCTTACATCTAATCTTCACCTTCCTGTTATGTGGCAATCCACAATGTACGTAATTATCCTCTTAGGATTACCAATTTGGACAAACTTCCTATTTGAATTGGCAATCTAATCTAATTACCTGCACAACAGAAAAACAATTTGGTTTAAAGTGGTCGGGAGAGAGGGAATGACTGGCAACCTTTCGTACATGCGCACAAAGTCAGTACATTATTAAAGGTTCTTCATTGCCAAACAAAAAAATAATAATACCGTGCTATTACAAAACGCGTGACGCTCGGCATAGATGGTTTTATGGCATGTCTGTTTTTGCATGCGTGACAACCCAAATGAAAATTGTTTGAAGTCAATTGTGATTTCACATATGCCTTTCACTCATTTGTAGTATGGGCAATCAACTGCAGGTATAAAAATATGAACTAAAATTTGGTTCCTCACTTTATGCAATAAAATAAATACATTTTTGTTGATTCATTATACCTTTGCAGAGGGTATTATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGACAGGTTTCCGACCCCATAAACCATATATGTATAATCTTGATCAGCATCCCTAGACGTGTCGATTTAGCCAGTCAATTATACCTTACAGCTCCCATAAGTATAATCTGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACGAATTATAGCTTCGGTGCTCGGAATATCATTTTTCTTCGAATTAAATTTAATAAAGGTCGGACGACTCTAACATATAGCTGCCCAAGAAGCGGTCACAGAAAAAATTAAATAATTACTTTAAAAAAAATTGCTATGTAGATGATCGTATTTTCTTTTACTGTAGGATAAAGAATGTTTTAACTTTTTAGAACTACCAATTTAATTTTACACAAAAATGTGAGGACTACAATATTTTTTTTAATATCCTTCAGTTATAGCAATTTTTGAAGCAACATTTTTTAAATTTAATCCAATACGTTCTTTTTGTGTGCAAAGGTAATTTTTCACAGTTTCAACTGCTGTAAAATGTTATTATTATTAGCAAAATTAATAATTAATTGGAAACCAATTATACATTAAATATTAAGTTGACTGTCCAATACTCACAAGTAAAGAAGAGGCACTTTCAAGATTTAATCTTTCAGCGGGGTGCCACGCCCACTTTAACCCACAATCCGGGAAAATCTGTAGCACCTACAGTTTCTATGATAGAAACGCCCACAAACGGTTTAAATCTGTCTGCTGCCCACATAACATACTGAAATAGCCATTAGGTGGCGCCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTATATATCTCCATTCCCTTTCGCTCCCTTAAGCTGACTAACGGGTATCTGATAGTCGTTGCACCCGACTATAGCGTTCTTCCATGTTTCTTATCAAATTACTGTTGTATAGTTTTGAGCATGAAGAGAAATGGGTTGCTTTTTTTCGCATATCAAAAGTTGAGTAATCTCAAGGGCTAAAAATTTAAAAGAAATCGTTTGATTCAATTTTGAGAAAAATAGTCAATATAGAGTCGTCCGATTTTATATAAAATTTAACTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTTTATATTAAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTTAATTTTTTCCCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGAGAGACAAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACGGACATGGCTAGGTCGACTCTTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGACTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGGGAACGGAACGGAACATCGGATTTCAACAAATGAGATGTCATGTCGCGTACTCTCAGTAAGAATAAAAATAGCCTGAAAACCGGGGGCATAAATCCTCACCGTATCCAGCAGATCCAATTTTTTAAATTTTCACATTTACCGCTTTTATATCTGAAGCCTTGGTTGCAAACTTCTTACTTTTTGATGATACCTTAACCTTACGATTGGTGTATCCTTACGATCGGACCATAATATCAGATTTTCAATTCTGCGGCTATATATAGTACTTGTCTTCGCTCGCTTCTTGCGCCACTTCGCCACTACGTGTACTGCCGTCCATTTAGTAGAATAAGTTAGCCGCGCAGCTCGGACTGCAACAATTTACACACACATGCCTGTTTTGTGGGCGTTGGAGTGGGCGTGGCAAACTGACTTTTTGAGTCAAATTTTTTTTCAATCAATCAATAGTTGATAAGACAAATACTCGTACATTTAATTTAAAAAACTGTATGCGCAACAGTTCTATGCGGATTGTGGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCACCCTGCTGAAATAAGCATGAGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATCTTGCCCACTCCTCCACCTTTTCCTTTCTTGGTCATTCTTGATCGTAAGTGCTCTGCACTGCTAAAAATGCATACTAAGTTCCTAATTTTTCCTACCTACATCCGATTTACCTATTTTTTTTTAAATACCCAGTATTTTTGGTAAGCGTGTTCTGATCAAAATTCTTTGCGTTTCTTTAATTTGCAAAGTGGAAAACGGTCTTTTAAAAACGTCTGCAGAACTCACTTGTGGACTTCTCCATTTGGCCCTTTCGAGCTATATTCATTTTTAATGCCAGCACGTGCTGGAGCAGCCGCATTAGGGCTACTACCACCGCTCGTAAACAATGACCGCCACAAGCAGTAGAGAAGGCCACATGTCATGAGAAGCTTAGGACCTCAATTGAAAATTCATTATTGCACCAGGATGTTTTTTATGCCCTTTGGGTGTGTTTGTGGCGATTGAAAGAGGGGGAAAATAATATTTATTGTGTGCACCTTGGAACCCACAACAACCAACCACGTGCCTACTTAGCTAAATCGGACACAGTTGGCCTAAAGTAATGAGAAACAACTAAAAAGAAACAGCAAATCGATTTATTCAAAAATTCAGAAAGGGTTTATTATATCCTACCAACATAAGTATACTGAAGTTGTGTGAAAGTGTTTGATTTGACTCAAATATTGCAAGTATGTCAGGGAGATAACGTTATTTTTAATAGGGGCTAGGAACATCCACTACAGAGATTTACCGTGTTATACCCTTGCAGAGGGAAAAGAGACGTTTCCGAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCCATAAAGAGTGTTTATTTGATCAAGCCATGTCCGTCTTTCCGTTTCTACGAAGTTCGGGATGGTTTCATCCTTATTTCTATTGCAGGTAGTACAAAAGTCGGAAGAAGCCGTACCGGACACCGCGGAAATTTAGCTGCTGTGCTTTCCTACATATTAACTTCCGCTCTTGAGAAATTGGAATACAATTCAAAAAATGTAATCGGTCGATGCTGTCAAAAAAAACTTTTGTAATTTGACCCAATAGATACCCATTTTACAATTTTCTCATTCGACACGCAGCCAAATAAACTTTCCTTTGAAGCGAGAAGTATAGTATTTTTCCGAAACGGGCATTTAAAAACGCCGGCACAAACGTCGTTCTTCCTTGTTAACTTTTCATAAAATGCAAAAAAGATACCGCTGAAGCTAAAGTAATTTCTCTTGTACGCAAACATTATTTGGTTTCAGTAATTCTTTTTTAATTTTATCAGAACAACCAATTTCCATATGAAAATTTCTTTTTAGTGGAGTAATTTAAACGTTCACATTTGTGGGTGTCATGGGTAACAATTTAAAACTAAATAGATTCTAGGCTTTGAACAAAACGTCCAAGCTGCGGATCAAATGGAGCGCTGGCATTTCGTACATTCATTCACAAATAGTAGCGATGTCTTAACTTTTTGAGAAACGGGCTTGTCGCTTCCCAACAACATCCGCCATCCACTCGGGATGTAACTTACGCGCGTGCCGAAACTAATTTGTTATTTATTCGTTAGTTATTTTCGGTTCCTGCTGCTAGCCCTTTGCGTCGCATGAGTATTTGGGCATACGAATGTACAACCTTCATAGAGGATACAACCTTGTTAGCCTATAGTCGTTTTCGTCTATGTAGGTGTCTATAACTATTGAAACTTTAATATGAGAGCAAGAACCAGCTTTAGGACTATCTCGAAAGAAACCAATCCATTGAAGTAAATTTGCGGAAGCTATTTGTAAGTGTGCAAGTCAATATTTGTGTCTACAAGTGTATGAGAATACACATCCACATAAGTGTGTGAGTTTCCATGTACTCGTATAAAGGGATACGGCGCAGCAGCACTACGCCTCGTGCGGATGGAGTCGCAGTGAGCGGAAGTCATCATTATAAATAAAATGTTCAGTTCAAAGCGAATAGGGAAAACAATCATTTGTTGGTGGTGGGGATGGCAATGCTGGGTCTAGTGCGTGGGACAGAAGCTGTGTGGATCTTCCGTGCGTATAATACCAAATATACATTGTGGATGCAGTATGCAGATTTATGATGACAAAATTTACTTCCTTGTTGTATTTTGAAGAAAGCCCCCTTGTTATGAATGGCTTAGGGCTCAATACTTTGTTATAGTTTTAATGTTGTTTACCAATATTGGCATATATAAATGAATATTAGAAACCTTACTTCTTAAAGTGTTAGGATTATCTCTCTTGGAAGTCTTGCAAATTTGGAAAATGTAATTTGAATGTTACTTTTTATTATTTTCTTTATTGTGGTAATTGGCTGGACTAGCATGTAATTGTCAGCCTATACCCCAATAAGCACGAAACAATTATTCTTGGTGGACTTCTTAAGAAGTCCAAGATTCATGCAATTGGTTTTTAAAAATGCGGTATTGCTATAAAAATAAAGTAGGCCTAAAAAATTCGTCAAAACGAATATCAAACCAAAACACACGCTTAGTGAGGTAAAAATAACTTGGCAGTGCAATCGTCCCTAGATTTTTACCTTGTTAATAATAGATGCTTTTGTTTGATTTTTGTTTCAAACATCGTTTTTTATTTACTTTACCAAACGTCATCAATAACAACCTGAATGATTTCAATACCATGAAATAAGGTATGGATATGCACAAAATAGTTCAATGTTAAAAAAAAACAAGAACCTTGCAGTCATAAGAAATAATCAACGCTAGTAACACCGTGCTAAATTTTTAAGGATTGTTGCCAGTTTCAGGTATATTAAAAAAATATTTATTTCATTACTTCTCTGATCATTTCTTTGACAGCTATATGTTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAAATTTAATTCCAAAATCTTAACAAAATAACAAGAAAAAACGATATAGTCGAGTGCCTTGTCTATGAGATACCCGTTAGTTAGGAGCAAGAAAGAACTGGAAATGTACAAGCACCAAAGCGATGTTGTAAAGCGCCACCTACCGCGCCACCTACCGCGCCACCTATATGCTATGTGGGGTGCGCATGAAGCCCAGAAATCTGCCTGCCAAGTCTCACACCTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATTTCAGCCTCACTCGGACAGACCGACGGACGGACATGATCTACTCGGCTAGTGATCCTGAACAAAATTCTACGAGTAACGGGTTTAAAAAGTTAAGTAGTACTTTTATTTTTATTACATTTATAAGTCTTAACTTAAATACTAAAATCTATTATTTCAACATTAAATAAGTGAAATAAAGTTGTACAATAACATAATAAATTTAGTTTTCAGGTCTAAAAAGCCTTATTTTAGAAAAAGTGAGGTAAAGTGTACTTTTGTACTAACTGAGTAAAAGAATTAAATAGTCTATAAGGTAAAAACGTTTCATAAGATCTGAAATCTCTTTGAAGATATATTTACACAAGATGAAACGAGCACCACAACTAATTAATTCCATAAAAAGGTCCCAAAAACAAGCTACCAGCCCCTTTGGTTTTGACAACTAAAACTGCTAGAAACAATATATGATTTACCAGCGCTGCCACCTCTTTGTAATCCACCTCTTTAAGACGCAAAAAATGTGCAGCTGGGTCTTGTGGTACATGTGTATATAACCCTATTTACATATGTAACACAGAGTTAACTAGAAAATCGTCAACAGTTGTCAGATCCTTTCCGTCTACCTAGGAATGTGAACGGATCAGGGCTCTTACAACTCGCAGTTCAAAGGGAGCTTTGCCTTTGTGTTTAGGGCTGTTTTGTTACTGAATGCGCTTTGTGTGTTTATTGTTTGTTTGTTGATGGTGCACTTGTTTGGTCAAAAAGCCGCAAACAAAAGGCTGACTGGACCGCGCATAGCTTACAAAGGACTACATTTTCTGCTCCGTTTATCCGGCAGTCCAGACTTCCATCCGCCGACAGATTTATGTATTATTTATGCCTGCTTATGTTTGTGCATTTCTATCTAGCACCAGCCATCCCTTAGAGAGACTCGAAAATTTCCTTTCGTACACATATACTTAAGGACATACAGCGCTCTTTTTATTCCCGTTAGCTCTGACTTGCCATAAGTTAGTAACATGCAAGTGTCGATCGGTGGCGGATACTCTATAACCTAGCCTACAAACGTACATGAAATTAAATTGTGCGACGGGGAAACACAAATGCAAATAATTTACTATTTCTTATAGCTGTATATGTGCTTCTTTGTACTTTCTTTTTATTATACCCTTGCAGCATCATAATCTTGGGGAGCATCACTGGGAGAGTCGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTCTGATTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGCTGTAAAGATGTCGGGCTGAAACTTTCCTAAAAGTCTTCTTTCTGTTGCAGATAGTATATAAGACGGAAGCAGCCGAATCGAACAACTATATCTTACAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTAATAAAAAAAAGTATATCTTTGATGTTTTTTAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAGCATTTTTTAATGGTTTTGAATTTAAAATTAAATTTTTTCAAAATCGAACGATCGGAAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTATGGTGCTTTTTGACATAGAACCTTCTAAGCTTGGAAAGAACAATGTCTTATTTGTTATGAATTTTGAATTAAATTTTATTAAAATCGGTCGACTATATCATATAACTTTCATAGGAACGATCGGAATTGGTGGGATAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTTG'..b'GTCGATTATCAAAATACGGTAACCACAATCTGAAGAGAGGAGGGAGAATATTAAAACACGCACTTTAGGAAATCGTTTCTTAAATCTGCTCTTAGGGTATTCCGAGCTTCGGTCCCGAAAGCTAGCCTTTTTCCTGTTTAGTTCGTTGCTGCTAATTTTTTTCTGTGGGCCAGTTTTGCCAGATCTCTCAGGCAGAACTGGATAAACAACCTGTCATGTTGCCCCCGTACGTACTCCCCAAGATGAACTTAATGATCGTGCGTGCAAATGGGTAAGAGCTGTGGATCTTTTAAAAGTGCATGCTGCATTTCTGCAAATAAATGACTATTGCAGATACTGGCGCAGTTGATAACATATACTTCAGCGCATACGGTTATACAAACTGTAAGACACAAGCCGCACAATGGACAAGCAGGCTTTTTTAGCTAACTGAATGCGACATTTGATTTGTGAGACAACAAGTCGGCCGCAAACCTTAGTATACCCGGACAAGTACTCTCTACTGTTACCCTGGAATATGTATTCGCGTGTATAAGTCCACTTCAAGATAGGCACAACCTGGATCGGTGTTAGCTTGTGTTCCTTTCGCGAGGGCACCACACGCTTCAACGGTGGGTAGTAGTGGGGGCACGGGCGTGTATCATTGTTTTGCCATTGATTGTCTCTTTGATGTAGCCGTGGACCTTATTGTAAGCGCTGCGGATGCCACACGGCACCTTTCCTGTACAGTCCCCAGAATTTATGGCGTCCCACGGTGACACAACCAGTAAACAAGCCCAGCAGACAATCGCACAACGATAGCAAAAGCAGTAGCTCAAAGGGCCGAGTATGCATGACATCCGAAGCCAATAACATACGCCGATTTGGCCGATGCGAAACTAGTCACTAGAAGGTGTGGGCCAAAGCTCAATTCAAGCTCAATCGAAGCTCAGTTTCGGTGTATCCTTCAGACGAAGGAAGAACGCAAGAACGCGAGTATGTGCATGCGATCTGCCGAATCATACGGAAAGACTTGGGCAAGTACTGCAATATTGTTGCGGTTGCACTCGAATCTACATACATGCACGGACTTAGAAGAACATGCGTACTCAAAAACCAGTCCGCTGCGAGCCATCGCATACAAGATCTCCAACTCCTCTGAGCCAGCTACTGATGAGATACTCCTCCCTTGCCGCGCCTCCTCGAGCATCGAGCAGCGCGAGCAGCGAATTTCGATTCCAGTTCTGATCGCAGACAGCCCCTGGCCCCTGGCCCCTGGCCCCCGGCCCCCGGCCACCTTCCCGAAGACATTCTCGCGTGGCAATGCACCTGTCGCGACCAATGCTTGTATGCTGCAGCAACCGGCACCAGAGACTACGATGAATCAGGACGGCTGGCCGGGCCATGGGCCAGAGATCTCAGAGCGTTGGGAGAAGCTAACGACGTGGCAAGAGGAAACATTTTACGACCGTCATGGGGAGTTCGTATACTGCCACTGCGTAGGTACACACTGTACTCACCTTTCCTTGCAGAGCCCGGTTGAGCCTGAGAGATTGCGCATCTCCGAGGTGTACTCCTGTGACCAGGCGCAAGAAAGACCGCTTTATAAGCCGTTTGCATGTTAGATATATTTATAGAACAATTATTATAGATGATATACAGACTATCATATGGCACTTTTCAAAATTCACATTACATGGCTGCTTCACATCGGAGAACCTCGGCTCACGGCACAGCTCGGATGTCCCCGGAGCACGTCACAGGCACTGTATCGTATCTACAGCTCAACTTCGAGCACCGCAAGTGTGTCCCTAGTCAACCCGGCTGCCAACAGATATTCTGGCATCTGCGACTCGTCGGCGAACCACCTATTGGCAGCTCACACTTAGTCTTGTGTGCGTCTCATCCCCTGCAATAAACACTTTGGAGTCGGCACTCTAACTGCAAGTGTGGCTCTACGAGGCGCCTTCATTGCGGCATAGCGCTGAGCTTTGCGCCCTCGGCTCGAGGAACCGATCCTGCAGTTTTTCTGCGGGAACCGCTTGCGGAGTTCAATGGCATTTGAGCACCGACATCGGGGTCCTGCACCGCGTTGCGTCTGGGTTTCAGTGCTCTGTCCCCCGCTCAGGGTTGTCGACGCAAGTGCCGTCACCCGAAGACAACCAGTGACCAACGGAGGCTGGAAACGCGTGCACTAGGTGCCTGGGGCCTGACGGACATTGTTCCGAGGTCAGTTGTAGTTACACGAAAACACAAACACACCGCACAGCGAAAGGCGCATGCATTGGGCCCGTGCTTGCAGGAGAACAGCTTGGGCAGTTCTTCGCCATCAGCACCTGGCGGGCGCAGGACAAACATCGTCCTGGCCACAGGCGTGGGAAGCCATGCAGCATAGGGTTGGCACGGGGCCTCGGGATCGGCGCGCGCTCGTGGAATGTGACCCAGGCCACAGTGCACCAGAAAATGAGTCGGCTAAACGGCGCGTTTCGAATCACCACTGCGTAGCGATGGTACGATGTTCACGGTGCGCAACTGGTGCGCTCTGAGCGCCTCGAACAGTCGGTTGTTCTGCTCCGCCGCGAATGCTTCAGCGTGGAAGTCGTCGGTTTCCCGCGATGGCTCGCGACGTAAGAGCCAGCACGAACCAACGTAGCCGACGTAAGCCCCGTACGTGCAAGGGAGTGAGGCGAGCTACAGCTTCCGCTCCGCGCTCTCCAAGAAGCGCGCTGCTGCGTAGCACTCGCTCTCTTAGCTTGAGGGAGGGTTCTCTTCGCCTGTTCCCAGAGAGGCACGTTCATGGGCAGCGGCCAACGATTTGGCGGCGGGTTATCCAATCGCCGCGCATTTTTCAGACCGCCCACGCCCCGCGCCCCGCGCCTCGCTCACAGTTTGACACTCACGCGCATACCCAGTTTGGCAGCCGCTGCATTGCGAACTCAAACAGTTGTGTCTCCTCGATGGAGAGCGGGCTGGGGACTTCCTCGCCCTACACTGCATTGATGACAGGGGCAGTAAAGAAGCTGATAGGTTGTTGATCGAATTGAGGGAAAACTAAGAAAAGGAAATCCACTGAACAGAAAGTGTATTGGTGGTCTCGTCAAATCTGCATTTCAGATCTTTGCGCAAAAATTGACTTGAAACTATGAGCAACGAAGGCAGGAATTTCGGAAACCGCATTGCATATGCACCTTTGAAGGTCGTTCCATCGGAGTAAAAATAATTAAGGAACAACTTGCTCAAAATCAACGCACCCTTCTTTTTATGTACCCTTTACCCGAACATCAGTAAAAGGCGAAGTAAGAAGCCATCAAAGCGATCGACTGTTATAACATTTGCATTTGAAGTGCTTCAAAAGTGCAAACAGAAAGCTTTTCGTTCACAATTCGGGGACACACAAAACAAATTTTGCTGTCTCCCGTATGTAATACTTTCTTAGTATCGCATATATGCACTGAAACACCCACTTTGGATTACATTTTTATATGCAGAGAATCGAAGACTTCAGTCAGAAAACGACAGCATAGTAAAGGAGGCGTTTCTGACCCCACAAAGAATATATGCACGTATATTATAATATTTATCATTATCAGTGGACGAGGCGTCTGTCTGTCCGTGAGTCCTTTTATATGCCAACTTGGGTCTCAGTTGTAGCGCTATCGGGATGAAACCTTGCCAAAAGCCTTATCTCTATTGCAGGTAGCACATATGTAAGTCGGAACGAGCCGGGTCGAACGACTATATTCTGTAGGCCTTATAAGAACGATAAAGGAATATTTTTCATAAAAGATATAACCTTGGTGTTTTTCGGATATATATTTCTGTCTCGGGAGTATAATTGGATGCCCTTATCATATATGTACATATGTAGCTGCCATAGAACAATACAAAAACCGATACAATTTGTTTTCGGTCAACATAGAAGTACGGCCGTAAATTGAAATGTGACACTTTCTAGGTTTTAGTTTACTGATATCAGCCAGTACCGCCAGAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/813/937/1d/scaffold_46-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCTCATTTAATTCGCTTCGATATTATTTACATTCTTACAAGGTTAGTGTATCAGCTTTCGAAGTATTGATACGGTCGTTGTCTTGGCTTGTGATTTTCGAAGAGGTGCTGTTATTGTCTATTACTACGTTTGTAAACATATAACCGAAATATATGGTTTGCAACATTATAGAAAGTGGAAACAGCAAGAACACATCAGCCCAGACGGAAACCGTTGCTGCTAGATAAGCCGAGACATGGGCCGGATGGGAGATAGGAACATCAGCCGAGACAGAAACCTTTTCAATGACCTAAAAAATACCCAAATTCATGGTAATTTTTGAAATAACTAAATTTACTCGTAGAGTAAAACGGTATCTAACAGGTAGAGGGAAGCATTTCAAAAAGGGTTTAAGACTACTAAGTAACAGATTATATAATAAACTTGTCTATTTGATCCCAGGCTGCCCGAAGCATTGCCAACCCTACCGATACCTAAGCGTTATACGCGATAGAGTAGGCGTGGCAAAAGTTCGATAAGTACACTATGTTTCAGCCAAAAAAGTAAAAACAGTCTCTAACTTGCTAATAATCAATAATAGCAGGACTGTGGGTAGACCCACTGGATGGGAATAATTTACCTTAAAGTCTAACCAACTGTCACATCGTTCGTTATCAAAACGCACTGTAACTAGGGCATCCATATATATCAAATACCACTTCCTATTCGCTTTCGATAATAATTTAATTACAGAGGGTTTTATGATTTCAGTCGGATGTTTTCGACCCCATAAAGTATACATATTCTTGATCAGCAGAGTCGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCTTTCAGTCTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCAAAAGTGTTTCTTTTGCAGGTAGAATATACATAAGTAGAAGGCAGCCGGATCTGACAACTATATCTTATAGCTCCCATTGGATATTCGGAAAAAATATTTATTAATCTATGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTACGCTTGGAAACATAACTACTTCTTAATTAGTTCTGAATTGCAACTATCGTTTTATCAAAATAAAAAGAACAATTTAAAATTTGGTGAGAAGATAATATAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGTATTAACGTAAACGTAAGTTTACAATAAACAAGAAAGGAAGCTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGCATACCCTTGCAGCTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGACAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTGTAATTCGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCCATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATACTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTTCTTCCACGCAATGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAAATATAATTTCTCAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTTCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCTGATTTTGATAAAATTGTATTTGAAATTCAGAACTGATTTAAAAATGTTATATCGAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACGAAAAATATACTTTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGCTTCCGACCTATATACTATCTTCAATAGAAAAAAGACTTTTGGGAAAGTTTGCGAAGAAACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGGCTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCTGAAATGTTTCCTTCACTGCAAGGGTATAAAAATTACATCTCTGATGTTTTTTGACATATAACCTCAATTTTTTAGCTAGTTCGGAATTTAAAATTGGATCCTATGAAAATCAGACGACTATATCATATAGCTGCCATGGGAAAGATCTGAAAATTGGTGGAAAACAATATGAAACAAATCATAGAATCGGTGTTTTTGACATATTAGCTGGAAATATCGTTTTGTAGTTCTAAGAATTTAGAGTTCAATTTAATAAAAATTGGACGGCTCTAACATATACCTTTCAAAAAAACGCCCCGAAGTTAACTTTCTTTCTTGTTTATGTATTAACATATATTTGTAGGTGCTGTCACCCAATACATTCAGGATCTTTTGAGCAATCTTCAAGCATCTCTGTTTGATCAGGACTGCATCCAGTATGTACCTTAATCAGTAGTTAAAACATACTCGGAGGTGTCATAGAAATCTTTTCCAACCAAACACGGTTGGTTTAGTGCATTGATGTACGTAAGAAACATAACGCACTTGGGTTGGAAGAGATACCTGTGAATTACTCCAACTGGGGTCTTTCTGAAGATTGGGCTTTGTTACTTTATTATCGAAATGAGTAAGATTTACAGTAAACTGGATTTATACAAGATAAGTCACCTAATTTATTTTGCCATCTACGAAGTTTAACAATAGTTTAACATTTATTAATGCTTGTTAAAATACAAAACTACGTTGAAAGAACCCTAGTTAATAATTAGAGGTTTAGGTATGTACTTGTATTGCAGGGTGGGTCGTCAGTTTTTGTTATATATTTGGACATTGGCTCTCCACATCTTTGATTACGTTGCAACAGAATCTACTACGGTCTTTTACTTCCGTGAGACTACTTCGATTTTCGGAGGTGGCGTTATTGAGGATGGCCTTACTGCTTTCGACGCCTCTATACTAGCTCTTCGGGCAGCGGCGGCCATGTATGTCCCGTAGTACCTACTAAGCATGTGGGGATCAACATGGTTGAGTTCAATATATGCATTTGGAATGGCTGCTGTAAGGGTGGGCGGTCTCGCTACAGTCAAGGGCCCTGCAGTGGACTCTGCCAGTGGACATTCCTCTAGTGAGCTGGACTCCTCGTGTTGGCTACTGCTACTGCCCAAGGACCTTGCTGCCGAGCTGGAAATTGAATAGTTGTGCTGTTCAAGGTCTTCGGGATCGTGGTCGGGGTCGGCATCGAACGAAGACAGCCTGCCGTCGCTAAGGTACGAGTTATTGTCCTCCACGGAGAATATTTGCTTCACGGTTCCTCTGCCATTTTCTTGGTCATCCGTCTCCGGATAAGCATCGGGATCTGGATTGATGCTTTCGTCGACCACATCCACATTCACTTCTACATCGACATCAGTGTCAATGTCTGCCTCAGTCACAGGTTGTTCCAGTCCCAAGACCACTTCCCGGTGTATGGTTTGCTTGGTGATGACTGTGTGGTGCGTTTGAGTCGTAGTCCTCGCCGTGCTCGATGGCCTGACAGAGGACTCTTGATCTTCGGAGACAATGTCAACGATCTGCACATCGGGTGCCAGTAGCGACGCCACGTCGAACTGGCGCTTCCGTGTCTGCGAGAACATATTTGCAATGGTTGTTGTCGTGGTGGAGTTGATATAAGCAATGTGCTGATGCTGGCCATGTTGCTGCTGAAGTTGGGCTGGTTGGATCGCCTGATCCACCTGGTTGGCCTGCTGTCGTTGCATCACAATTGCAGGCTCTGCGCAGTACTGTGACAGGCCGGGTGCTGAGTTGCGGTTAAAGAACTGGCCTATATACTGATGGTGGTAAGGATATGCCAGAGACGACAGTTGCAGTGCCGACTGGGAATTGGGCGGAGGTGGGGTTGTGAGATCCAAGGGCGGCGGGCTGGGCGAGTCAGTGCTGGCATCATCTACCGACAGACCCATGTGTTTTCGGACTTTACGCTGAGCCTTGCGACGTCTGAAATCGCCTTTGCGAAAATCATCCATGTTTGCCGGGTGTATTGCCCAGTAGTGCCCCTTGCCGTTTGCACTGCGACCGGATTTGATGAAACAATCATTCAATGAGAGATTATGTCTGATGGAGTTCCTCCAACCCGGACCGCGGCTTC'..b'TACACCTCATTTGTTGAACTCGGATGTCCCGATTGTTATTCCAAAAACAAGATTTTCTTCTTCTTGTCATAAATATGTTTGTCCCTTTATTTGTGGGTTTGTATGCATCCCATTTTAGTTTTAGGGTTTTGGGAACCCTATAGGTGTAAAAAATATCTCGAGATATAACACGTTTGTTTTACGACTTTTTGAAAAACCCGCTAGTTTAGCGAAAAATTATAAAAAATCTAGATTTTGAATGCTAATCATTTCTAAACAACTAATGCTACAGAGACGTGCCATATATCTGTGAAAAGATCATTTGACAAATACTCTTTCTATGGTCAAATTGTCCGAATATAGTCGATTTAGAGTTATGACAAAAAGAGATTTTTTAAAACAGCTTGTTGACTATTTTCTCAAAATTGAATCGAACGATTTCTTTAAATTTTAGGTCTTATAACCCTTGAGATTACCCAACTTTTGATATATGAATGATTAAAAAATAAATTATTAAAGGACCGTAAAATGTTATGTAATGCTATTATCAAATCTCTTATACATAAGATTATTACAGCGAAAGGGAATGGGATCCCAGTTTATAATAAATTTTAAAAACAAAGAAGGAAACTATCTCTAGGCAGCCGACGTTTCAATACCCATGCAGGTCGTTCCATGGAAGCATTGTAGGTCGAGAGCTTTAGTTTTTAGGTTTTTAGAAAACTAAAAACATACTTCAGAAATAGAGAGATTCCGTCTTATTTCTATTTACTACCGTATATGCTTGCAGAAAACGAAACTTAACGGTGTTTGTATTATTTTAACATTATATATCCGATCCTTCCTATTGCGGATTTGGATTTGGCTAGATAGACTCGTTTTGTAATGCTGCTGAAGAATATTTATACTTTATGGGTTGGGAAACGTCTTCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTCAATGAAGTTATTATTATCCAATGGTATAACCAAAACTTCTGATATCAAACAAAAATAACTCTTAACGAGGTAAGAGGTCGTGGAAACCGCGAACTATAATCGTACAAATGTTTAATGCTTGTTATTTCGACTAATTAAATACACTTTCATAAATGTTCTCATTCTCTTGTTTGAAGAATTTCGAATTTAAATTAATAAAAACCGGACGACTCTAACATATAGCTGACAAAGAAACGATAGAGAAATAATGAAATAGTTAAAAAATTCACAGTGTGTTACTAACGATGATTATTTCTTATAACTTCAAGGGTATACAAACTTTCGTCCACCAAACATCCGATCTCGACAGTGAGTATATAACGAGGCGAAGTATTTTTATCCTCAAGTTTTCACACTTACACAATCACCGCTCTTTCTTCCAAACCAAATGATTTTCTTAAAGTCTTTCGATTGATGTGTCACTCATAATAATTAAACGAATACACTAGATTTCCTCCTGGTGGGCTTCGTCACTACAAGGACTGCTGTTTACAGTGGTTATTTAATAGAATAAGTTAGCCGCGCACTCTGCACTCCCTTAGCGCCGGCAGCGTATTAAGTTTTCTATGTATTCTATGCGAATACATAGAAAAACAACGACGAATCTTGAGTCGGGGGGAGGGGTGCCTTTGACTAGCCAGACTGAGACTGGTAAAGGCAGAAGAAAATGCAATTCAGCAATTCACGTATATCGTCTGTCCAGAACAACGGCCACGATCGACCATACGGTAAAAGTGCAACAGCCGGCCGTTAGCTCCCAATATAGCTGATACCAAGAAATAGTAATTCTAGGTGGGAACACCTAGTTTATCCGATCAACACTGGCAGCCAAGTAAAACCTCTAGTAAGGCATGAAAGACCTTAGACGATTAAAAAAAGGGAGAATCCATTCTGGTGTATTGCTGATAGTAGCCAACAGGTCCGAGGAAAGGGCACTTTCCCAAAGGGAGTCGAAGACCAGCCACATCAAACAGTCCTTGAGGAGCTCATAAATAGCAGCTCGAATGAGATTTATGAACCGCAACCGCCATAAAGAGGTCATCCGAAATATTGGCTTCTTCTTCTTCGCAGTACTGGTAAATACGTATATTTATTCATATATATCCAATAAATATTTTAGAAATATATCCATTTATATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTCAGAACCCATTAAGTAGTTATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGCTTCTACGCAAGCTAGTCTCTCAGTCTTAAAGCTCTCGGGCTGAAACTTTCCGAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCAGAGAATTAAATTGTGTTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGCCAGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAAAATAAATTTTTATATTTCTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATTAAAATCGGACTAGAATGAAATAATTTTTTTTAATATCACTGAAGCCAGCCACAATCCTTAAAAATTTCACATGAAAGAGGGGCAAGTCCAACAGTTTTATAGACTGCTGTTAGCTTTTCAGCGGCGAGTATCGTCCTTGTATTGCAAGAGGCTTCTGAACGACGTTTGCGTTCGGTATAGTCGCATTTTCCTGATGTGTGCACCTAAATGGGGGTAAATTCGATGAAATTATTTTAATATTGGCCGATATCTACATTACACAATAAATTTATACTGTGAAAAAGAATTCAAAGCCATGGTGTGCTAGAGCTATAGCGGGGGGGTGTGCTGACACGAGAAATGAAGTAGGTCAAGAACAATGACATAACTTTCGATGAACAACCTTGACAATAGGGGATCGAATTGCAAGGCTGGCGGCGTTCCATTGTCACACGAATGTGTCCAGAGGAGGGAATATGGCCGCAACACAGCCGATCCTGTTGCGATCAAGCGACAGCTAAGTTTATGGGGCATTGTGGCTGGTAACGACTGGTTATATATTGTCCAGACACTTGAAATATTTATTTTCATTAATGTAATAAATATATAATATATTATAATAATATTAGTAGATCACCTATTACATTTTCTTCACAGAAGTTGATATAAGAACTTTTGATTGTTGAAGGTGCGGTCGTTACTATATTTTTACCTCGTTAGGAGGTGTTTTTGTTTGATATCAGAAATTTTTGTTTTATATTTAAACAAACCATGTACACATTTTAAAATACCTTTCTAATATCATGTAGCTTAAGTAGTTCATAAGTCACTGATGAGCAAAACTATGATATTTACGGCTCTTTTCTCGTCAAACTAGCTAGTTTTCCAAAAAGTTTTGCTCGTATTCAGCTGTTTAACATCATCTTCAAATGGAGTTTGGATTCGCATGCGAAGGCATTCGCATGCTATGAACTGCTAAGTGGCAATTTTTGTTGATTAATAACTTTGAAACGGCTGTTTTTACAAGAATGTGTCGTATGCCAAAAATTGAAATCTCAGAAATCTCAATGGCTGTACAACTTAACATTTCATTTAAAAAGGTTAAAATTAAAATTTTAAATAATAAAATAAAAATTCAATAATAAAATAATAATAAGGAAAATAAATATGAAATCCCATCTATCTAGACGAGAGACGGATATGTATAGATCGACTCGGATAGTGATTGAGAACATATAAGCTGTATGCAATCGGCGACGCTACCCTTTACTTCACTTTTTTAAATTTTAATTTTTCACTTTTATCGCCAATTTTACTAACCCAGCCGTTTTCTAAAAAGTCATCGATTGAAACAAAGTAAGAATAACATTCAACTGCTCTTTCTCACGTTCTGATCAGAGTATCATAGCACATTGTCTTGCGCACACTCGGTGCAATAAGTGCAAAGTAAAAGAGGTTTTTATTACGACCGCCTTCGTATCTTACTGTGCG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTAATCGTAGGAAAGTAAAGAAAGGTAAATGATGTATGTATATATTGGGCGTTAGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCTTTTTTTTGGGAGTTAGGTATTGATGAGACAAATACATTTCAGATAAAATGTTGTTTCTTTCATAAAAACTGTAAATACTTTTAGGGGTTCTGAAACGTTTCCTTCTTGCAACGCAGTGAAAGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTTACGAGTCGATCTAGACGACTATATCATATAGCTGTCAGACGAAAGATTGGAAAATTAGAGGGAAAATAATATGAAAAAGTGATATCTTTGGTGTTTTTAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATAAGTTTTGAATTTTAAATTAAATTAGCTGCCATAAAAACTGGTGGGAAAATACTATGAAACAAATTATAGCTTCGGTGTTTTTGGACGAATTATCTTATAATATTGGGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTAAATTTAATAAAAATTGGACGATTATTTTTTATAAGTGCGAGGGTATACAAACTTCCTAACAAATCCAAATCAATAAAAATCAATCGAAAGTTTTTAAGAATTGATGTTTTAATATATATTCTTGCACAAATTTTTCATTGGTTTTGCTAGCATAACAAAACACATAAATCGTCTGAATAAAAATGCGAATACTTTAAATAACATAGCAAGTAATTTAAGATATATTATACAAAAATACTGTGCTTTGCTTATTGTCGCGAACTACAAACGTAACAAACGTATAATGGTTACATATGTATTGTGGTTTTTACTTAATTCATTGCAATAGAATTTTTTATGTATAAACTTAACCATGAATGACTTTAAGATAAAGTGTAACTATTTAAAAGTTTTAAGATGTGCACTTCCCCTTTAACCCCACAAATCGCAAAGAACAACAACATCAACGTTGAACTGAAATTTACTCAAAAACTATTGACTTTTGTAAAAAAAAGTTAGACCAGTTCCTTCCCTGCCAAATAAGACTCACAGCTAAAAACAGAGTTTTATACCAAATCGTGATACTGTAACTAAGCATTTCAGACCGCTTGCATATTTATAGAAAAGCAGCATTTTCTATAAATACAAACGAGAAATATTTAAAGGAATATTTATTTTTTAATTCCAGATATATTAAGTCGATGCACTCGATCGTAGATTTTTATTACTTTCTTGAAAATGTGATTTCGATTAAATATGTTTATTTCACTTTCTATTTCAGATAAATGCATTATCGTTAGGATAACAGCTATAAAACATAAGCTTTTGCATTGTTACTTATTACTATGCCTTTGTACGGTGTTCCCAATGAAATGAGTAATACCGTAAAATTTTATGACAAAAACATAACATACATTCGAAATATAGAAATGTTTATCATGTGGCGTTCTATTTTTAATTGTAAGTCAATTAACAATAAACAATAAAATTTGTGGTTCCGTACGACGGAGTAAAAATTGTTATTATATACAAAAACATAAGAAATCATAATATATTGACTTTGACATTGTCGTATAAATCACACCTGGCAAACTAAGAAATTGATCCAAGGCATTGCATCGTAATGAATTCACTTCAAAGTGCTATAAAGAAGAAACTCGAAAAAAGTGGGCTATTTAAAATAAATTGGCTCCAGCTGTTATACAGTGTATTCACATTAACGGCTAAAAGGTTGATTGACACGTTGCCCAGTGAGGCAAGATTAAAATTAGAGATTCTACAGAAAGAGTACATCAAGCAGTTCTTTTTTGAAAAGCGCGTGGGAAGCGGAGGAACTTGCTTAAAGTCATTTCCGTGCTTTGGATGATTAATAAAGAACCGGAGTAGAATCGTTGCAGCAGAAAGGCAGACTCTACATCTCTCAGTTCAATTTGTGTTCAGAGATCATCAGCGCAAGAAAACGCGTTTTAAACTATTAACGGCTTATCATGTTCCATTTAGAATTATTGCACTATCTTGTTTCAGATTTCTGCATAAATTGAAAAGACCAAACTGTGCTAAAATGATGCTAAAAATAATTCGTGGTTTTCTATATTGCTTAAGAAAGATATTTTATAAAGGCCAGATGTGCAGCTGACATTTCTTGGTGACTCAAATTTCTTAAGTCTTAAACCGAATAGCATTGCAATTTGTTCAAGCTTTCGTTTACTGCTGTCACTGGTAATTTGTAATTGTGTAAAAAATGTTTACTAGTCAGTACAAGTCTACAGATTCTCGCAATGAGACGTTGCAGCTTAATTCATTACCAAATTTAGATAAAAATTCAAAATTTGATGTTTTGGAATTTGAAACGGAGGAGGATCTTCAGTTCCCTCAAATTGCCGCTAAAAATAAACTTTTAAAACTAAGTTGGTGGAATTCGCCAGCTGAAGTCCATGAAATCGAGGCCAATTTAAAGCACCACAGAAAAAATGATAACGGACGCAACAATAAAACGGAAAAGCTAGAGAATAATAATTCGTTAGTTAATGGTTGTGTTAGCACTCCAGCAAGATCCGTTTCGTTACTCCAATATATTCGTCCAGACCAGGAACGCGTCAGTGAAGCACAGGAAACAAACATTCTCGAGCCCAGCGTTGATGAATTATATCCGAGGGATTCACACCGTCTTGTTGATGGTATGTATGAGTCCTAACAATTTATTTATATTTGAATATCCCCTGCCAGCATTTTCTATCGCGGAATACCCTTCTAAGTGACTTCTAGAAGATGAAAACTATCGTCCGCGACATCGCATTCGGATCGCGGAAGTCACTCCCGTCGGAAAGAAATGTGCCTCTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCACTTCGGCGACACTTTGGGAAGTCACTTCGGCGACTCTTCTTGAAGTGTCTTCGTTGACACTTCCAGGAGTGAACTTCTTCTGCGATACTTCTTACCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTCACTTCTGGAAGTGCCGCCGAAGTGGCACATTTCTTCCCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTCACTTCTGAAGGTTACTTAGAAGCGACTTAACAGACGCTTGTAGAAGATACCAGAAGGGCCTTTCCCCATTGGAAATCTTGAATAAAAAAACTTGTTTTTACATGTTAGGCAATATTTTGCATTTATTTTTTCCATACGGTCTTTGAGCACTTGCAGACACGGTCTTTGGCATATCGGAAATGCTGCTTTATAATTTTATTTATGTCCAGCTCCGTTCACATAAGAAATTGAATAATAACCATTTCTAAAATAAACATAGCAACATTTTTTTTATATTTAAAATAAAAATAAATTTGGAGGAATTACCTTTTATAATTAGGTGGAGAATCTTTGAATGCTTATTTCACTGCAATCGAGCCAGGTAATGTAAAAATATCTTGAAGTAATCGTACAGCTTCACGTATATTCCCACTCTTCGTTGAGTTGGACATTTTAATGTGTTATAAAATTTTAAAAATTATGAAAAACAAAGCAACACACAAATTTTATACAAAACTCGACTGATAACAAGCAAAGTGCGAAATAAAGTGACGCTCGGTCGAAAAACAAAACCGTAGGTAAAAAGGAAGACTAATTTTCAGAAATAAACACTTATCGTGTTCTCCTTTTTCCCCAGTAACTTTGTTTTTGTATCGTCTAACTATCGTCCAGAAGTGACTCAGAATTTACTTCTTCGCGATCGAGACCCTTGTTTTTGTAAAATGTGTGCTATTTTCTAACTATCGCCCAGAAGTATCTCAGAAGTTACTTCTTCGAAATGTGTGCTATCGCATTTCTATCTTCTAGAAGTGACTTAGAAGTTACTTCTAAGCGATATATGCATATTTTGTTTTTGTAAAGTGGTTCTATCGTCTTTCTATCTCCAGAAGTGACTTCTGGACGACAGGCGATAGAATTATCGCC'..b'GTTGGTGATCAAACTCTGTTTCGCCTTGAGTCGACGAATTCATTAGTTAACGAATCGAGTTCCAGTTATGCAGAAAGTATTCTGCCGACGAGCGATAGTTTGGCCAGTGTAAAGACCACAGACACATGGACCCATAATGAGCCAACAGATGTAGATGCTGAGCTAGGAATAAACCGCACTCAGGACGAAAGCTGGCGCCAACACTACATATTCGCAATGGATGGCGGAACTTGGCAAATTATAAAAGATCACTTTCCAGATGAAATGGCCATTCTTTTAACACGGGGATCGATTTACGCCCGAATGTCACCCGATCAGAAACAGGCACTAGTTATAGAACTTCAAAATTTGGACTACTGTGTTGCCATGTGCGGTGATGGTGCCAACGATTGCGGTGCGCTAAAGGTGGCTCATGCTGGTATTTCGCTAAGTGAGACCGAAGCATCCATTGCGTCGCCCTTTACTTCACGTAATCCCACGATTTCGGCTGTTTTAAAAGTTATTAAGGAAGGACGTGCCGCATTAGTCACATCCTTTGGAATTTTTAAATATATGGCAGCATATTCATTGGTTCAGTTTATATCTGTTATGGTTCTTTATTCTATCGACTCGAATTTGACAGACAAGCAGTATCTTTACGTAGACCTTGGACTTATATCAATTTTTGCCTTCTTTTTTGGTAAAACTGGATCATTTGATGGAAATTTGGTCGAACAAGTGCCTCTCAGTTCATTGATATCTTCTACTCCATTAGCATCCCTTTTACTTCATCTCACTGTTGTAACTGGATTTCAAGTAATTGGTAAGGATATTAATAGTACTAGTTTACAAAATAAAATTCATAAACCCGGTTGATAGTAAATTTGGCTGTTCAATTTGTCATTTAAGCGCTTAAAAATATTTAAAAAAATGAATGTTTTCGAAAAAATTTACAGGTAATTTTTGTGATTCTGTGGGTCAATGCTAACCAAATTTGTTATCAATCGTATGGGAGCATATTGGGTGTACATTTTTTAAATTTATTATTACTTTTACTTTTATCCTATGATTCAAGGTTGGATTCATCTACACCAAGAGCCGTGGTTTAAACCGTTCCAACCTGCAGATGAGGACCATTTGGGTTGTTATGAAAACTACACCATGTTTTGCATATCTAGTTTTCAGTACATAATACTTGCTTTTGTTTTTTCCAAGGGTGCGCCATATCGAAAGCCACTGTGGTCAAATTTTCCACTATGCTTAGCATTTATTGTTAACTTATGCATTATTGTTTATTTGGTCATTTACCCAAGCGACTGGGTAGCAAACTTTTTTCAGCTCATTGTACCTCCTGTCATGAGTTTTCGATACATGATGCTTGTTTACGGAGCAGCAGCATTTAGTTGCCATATATTTGTCGAGTCTTTTTTGGTGGAATATATAGTGTTCAAAAAATACCAAGTTAAGCGGGATAAAAACTGGGTCACAGCAAAGCAAAAATACTTGCGTCTGGAATATGATATTTCCACAATAAAAAATTGGCCACCAATAACTGAAGTCTATGAACCTAATAATTGTTCCGACTGGGAAGTAGATCAGCCCACGTATGTCAGTTTGCATGCTGAACAAAATCATGACACGCAGTTTGGAAAATTTCCTGGATTTAATTAGTAAATTAATTTAAAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAAATATGTATAATTCTGGCGAGATATCTTGTATATTTTAAAATAACTAATGGCTTAAATCTAAGAACTAGCATAATAACATTATATTGAATTTAGTCAAAATTGTTTAGTTCCTACTTAGATTATCCACATAGTTTTGGTAAATTACTTATATAAAAGATAACTTTATATAAACAGGTCAAAGCAATTTTTTTGTATTATAGTAGGTGTATAACGACGGTCATATATATTTGCTTATAATTAAGCGTTTAATATGTTATAAATTTCATTTTGGCTGTACATTGTACTTCATTTAAGTTTATTTATTTATTTTTAACTATTCACTTATCTTTACTATATGTATTAGAGTACGCTGTAATTAAAAAAAATGTAAATCTTAATATTTTTGCCTATCATAAAAAATAAAAATTAGCAAAAAGGTGATTATGCAATCGACGGAAAGGGGCGCCACGGACATTGTATATACAGATTTTAGTAAGGCCTTTGACTTCGTTAACCAGTCTCCTTTTGTATTTAAATTAGATTAGCTTGGGTTTCCTGGTAATCTATTATCTTGGATTTCATGTTACTTGGGTGGCAGGACTCAGGGTTATATTGAAGAATACTGTTTCAAAATTGATCTACGTGCCATCTGGAGTGCATCAGGGTAGTCATTTGGGCCCTTTGCTGTTTACTTTGTTTTTTAACGATCTTCCCTCAATCATAACACATTTTTGTGTACTAATGTGTGCTGATGATGTTAAGCTGATGATAAATATAATGATATAGCGTCAGATATTGATTGCTTTTATGGAAGATGTGAGTACAACCTTTTAAATTTGAACTGCCTTAAATGCAACGTTATGGCTTTTTATAGGGGTACTCCTACGTTTATTAGTTACTTTCTTAAAAATAAGCCACATTCACCGTATATATTCAGTTAACGATTTAGGTGTTCTTCTGAACCATAAACTTAAATTTGACGACCACATTATGTCTACTGTTAACAAAGCCATGAGTGTTCTTGGGTTTATAAACCGTTTGTCAAAAGAATTTTATGACCCTTTTATGATCAAATTATTATTTACCTCCCTTGTCCGTCCTATTTTGGAACATAGTTCGTCGGTTTGAAGTCCACAATAACAAGTGCACATCGACCGTATTGAGTCGGTACAAAAAAATTCTTTTATTTGCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCAAAACGTAAGGCTACCTTCCTACCAGAGCAGAATACAATTGCTTAATTTGCCTACAGTTGTAAATTGTAGAACAATGCTTGGTACTATTTTTATACAACATCTAATAAGAGGTGACATTGATTCTGCAGAGCTTTTAAACCGCCTAACTTTCAATGTTCCTGTTGGACTAACACGAAATTATTATCCTCTAAATTTGCCACGATGTACATAAAATTTTTGTCTGCACGAGCCCTTTCGCGTTCTATGTAATAACTATAACAATCTCTATCATTTAATTTGCATTTCAACTTCTATCACGGTATTAAAAACTAATATTTTAACTCTTTTGCTTCATTCTTAGTTGTGCCTTTTATTGTCCCGTCTCTGTTTGTTTTATGTATCTTCCTCGCGAATTCGCATTTTTTTCCCAAATTGATAACCGCGCGTAATAAGCACGTGCTTGGTGTCGTTGGGACTCTTGTTTGTTCTGTTCGAAGTGCATCAACGTCCTTCATATATAATCTTTACTGTAAACTAAACCATTTGTCAATATGTTTCACTTCGTTTCTATATTTAATGCATCTCTAGCGACGTACTAATTGTCAGGACGTGTAACTATAAGGTATTAGTGGATATACAAGTTTTAGTTTTTTTTTACTTAAGAAAACTAGTTTTTTTAATATTGCAAATGGTACTATACTTTTGGTCAGAAGGCCGGAAAAGTCTACAATATCCTATAGCTCCCAAATGAACGATAAGATATAAACAACCAAATCATGTTGTTTTTTTTTAACCCATAAATTCTAAAAAGTTGGGGCTAAGCCTGCAACTGGCAGCACCAGTTTAATTCAGCAGGATGCCATGCTTAACCCTAACCCCACAAACGCACATACCACGATAAGAGCTGTCTAACGACCACATTTTTGAATTTAAATTAATTTTTTGATCTATGCTTACATAAAATTTAAATTCATTCGTATTCTTAGTTTTAAATTTATATTCAATTAAATTACAGCTATCATCCACTAGGTGCTGATATGTGTGGTGTGTGCCGTGCTTATAGAAAGGCATTTAATTGCATAAAATAATTTGTCATGCTTGCGTAAATCGAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/81f/dec/ef/scaffold_8-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTTTTGCATACCTTGAAAACGATAAAAGCACTTTACGTTCGGACATCTTATTCCTGTCGCATCCATACGAACGGATAAAACTAGATAAGCTTTTTTTGTTTATGCGTATTCTGATAAGGAAAAATGCGCTCTCTCGTCGTAGAAACAATCGGTTAAAATAAATAAATGCGAAAGTTAACCCTATTAGCATATTATAAAAAATCTTTAATAGCCTTTGCCGATACTAAACTTTAAAGAAAAATCTTCCGATCGGGCGACTATAAACTAAATATGACAAACTAAATAATTGTTATATAGTCGTTAATAGTTTTGGTCTGAAATTTGGAAGGCATTTACTCGACCGTAGAAAATATCAAAGCTATTGTTTTGCACCATGCAGATAAGATACAACAACTCCAACCAAAGAAAAGGGCATATACATACATACAGCGGATAAATACATTCGCTATTAACCCAGTTGTATACGTTTAAAATACACGTCGAATGACACCGTAACAGTCAAAATCGGATGCTCCTATCAAAGGAAATACGCAAAGAAAAATTTTATGGGATTTTCTACCACTTTTGAAAAAACTAGCTATAAAATAGCTACATTCTGTACACCCGTATCTGTGAACTATTAAATTAGAGGTATTTCGAAATCCTTTCTATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGTGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATTTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCCGACCCCAAAAAGTATATATATTCTTAATCAGAATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTGAAATCTTGGAATCTATAAAAGCTAGAACAGCCAAACTTGGTATGTGGATTCCTGGGCTTCCTGCGCAGCGCAAGTTTATTTCAGCAGGGTGCCAATACCTATCGACTGTCCTAAAAAAAAGTGTGCCACGCCCACTATAACGCCCACAAACGGTTTAAAAGCTTAAATCTTTCTGCCGCCTACATAATATCTACTGAAATAGCCGATAGGCGGCGGCGAAAATATAGCTTTGCTGCTTATGGACTAACGATTTCAAATTACATTTTAAGGTGTTTGGGTGTTTCTTAGGGCCTTCGAGATTCCTCAACGTTTGACATACGAAACGTTTTTGTATAAAGTCCCGGTTTTAAGTTAATAATCAACAAAAACGGCTACATTTACCAGTTCAGAACATCTAACACTGTCTGACCATTGACCATTTTTATGCTTGAAATTTATGATGATGTTAACAGCTTAATATAAGTAAACTTAGTTCTACCATACTTAGAAAAACTTTTTAGTTTGGGGAAAACCGCTATCAATAGCTAAATGTTGTACACCCGTAACTTGCGAACTACTGAAGCTGCAGGCATGTGCTATAAATCGTTAAAATGGTATTTTAAAATATTTTGTACGCCTTTCTTACATGACTTCTCCAAATACCACCGTTTTAATTATGGCTAAACTAATTTTTTGTTCAGCAAATGTAAATTTTTTTTGAGTTCTCAAAAACGTTTCTAAAGATTTGGGGTTGAACTTCAAAGTTTATAGCTCTTGGAATAACTTAACTTTTGGCACAGACAACATTTTTTTTTATTTATTAATCAACAGATGGGGCTTGGAATCATTTAAACTGTTATAAACAGTTCCGCATAAGAGACTTAAATAGTACGAAGTTCGCTAAAGTATATGGGTTTTATATCAATAAACAAAAGTATTGATATAAACTTTTTTGACGAAAATATTCTTTACTATCCACTCAATAAGTCGAGTCCCATCATCTCGTCGTCGAATTTGAGCAAAAGCTAAACTTCGACACGGGTTAACCTTAAGTACTAAAGTGCCTCAACAACCTATCCGATAATGTATCTTCCTAGCAGGCACTTACTTTTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGAGAAACAAAAATTTAACTGAAATGTATTTGTCTTATCAATACCTATCGACTGACCTAAAAAAATGTGCCACGCCCACTCTAACGGCCACAAACGGTTTAAACGATTAAATCTGCCTGCCGCCGACCTAACATCCACTAATATAGCCGGACATCATAACTTTTGTATGCTGAAGGTGCGACCGTCACTTGATTTTTACCTCGTTAAAAGGTGTTTTTGATTGATGTGAGAAGTTTTTGATTTTAAAATTAATCATGTCATTTTGCTACCTTTACAAAAATCATATTCAAGTTTTTTATGTGGAACTGTTAATAACAATTTAAATGATTCTCAGACCCTTAAGTGAATGGAAAACGCTTAGGCAGTGTTAAAGGTTCTGAACTAATACATGTGGCCATTTTTGTTAAATACAAATTTTAAAACGTGACTTTATACAACAATGTGTTGCATGTATAACGTTAAGGAATGTCAATTAGTATACACTTTAAGGCTTAGCCCGAAATCGTTAATGCCGCCGTTGAAAAATGGAAAAGTATGAAAGGAAGTTAGCTTCGGCAATACCCTTATAATATATAATATACCCTTGCACATATAGGAAATAATCAACTTTATTAAATAATTTTTTCATATTGTTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCATCCGATTTTTATAAAATGTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGGAATATGTCAAAAAGCACCGTTTATGTATTTTTTTTTAAATTGTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCCATCCGGCAGGTTTCGACTTATATATTGCCTGCCATAGAAAGGAGACTTTTGGGAAAGTTTCATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCAGGTTTCGACTTATATATTGCCTGCCATAGAAAGGAAACTTTTGGGAAAGTTTCATCCCGAAAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACCGACGGACATGGCTAGATCGACTCTTCTGGTGACGCTGATCAAGAATATGTATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAATCTTCTAATTGAAACTATTATACCCTTGCAAGGGTATAAAAATCAGAACAAAACAACCTTTTCACATAATTTTTAAACGGTGGTATTTGGATAAATCATGTTTCAAAGAAGTAAATGGTATTTCAAAAAACCTTTTTACGATATTTAGCATGAGTCTGAATCTTTGGTAGTTAGCAAGTAAAGGGTGTATTAATTTTAGCTATTTAAAACTTTTTTCGCGCCAAACTAGGTAGTTTTTCCAAAAGTGGTGAAACTAAAGTTTCTTATATTAAGCTTTTTAACATCATCTAAATGTCCAGGACCAGGTCAAACGGAGTTTGGATACGCACAAAAAAGTTCAATGCTCAGGCATTGTTTTGAACTAGTAAATGTGGCCATTTTTTAATTCAAATAAGGAACCTCAAGACATTACAGCTTTAAGATTAATTTGAAGAGCTGTTTTTGAGTAATCTAAAAAAAAAACTGATAAAATCGGAATAAAAAAACTTTTTCCCATAATTTTTAAACGTCGGTATTTAGACAAGTCATGTTTGAAAGACGTAAATAGTTAAATAGTGAAATATTTTACGACATTTAATTTTAGTTTCCACTTTTATACAATTTTTTTTAAGCTCTTGCTCTTGCTTGAGGAGGACATTTTATAAGGTAAAATTTGAGTTATGGTCAGAAAATATTTAGCTTTTGCAAATTAATGTTAATTAACCAATGAGTAATGCATACTTTTTAATATTGCCTACTAGAAAGATTTTAGATCAAAGCAAGGAGGAAATCTCTAGACTTCCTAGTTTCCGAGATATCAGCGATAATTTAGACGGTTTTTTGAAGTTTGTTGGCACATAAAACTTGCGCTTCATACGAAAATAAGAAATTAAACTCTTAAACTACAACTCTCTTAAAATTTTTTGAACAA'..b'AGCCAAACAGACATAGCCATGTTTCTCTTTCCGGCTGTCCGTGTAAGCGCTGTGATCTCGGGAGCTATAGAGTTCAGATTTTTATTTCTAGATTTCTTGCCACACTCACAAACATTTGAAAGTTAGGAAACAATTGTAACCACCCTCCAACCTTCCCACTCTAACTAGCGTCAACTTGAACGCTGATATCTCCGAAATTCTCAGAGATTCCTTAGCTTCGTACGCAGCACATGTTTCTTACGCTAATGCGGCCCGCATAATTTAACGCCCACAAACTCCGAAAGCGCTCAAATCTGCCTGCCCCTTCTTTTTCGCTGAGTAACGGGTATCTGTTAGTCCAGGCACTCGACACAGCGTTCTTTCTTGTTGTTTAATAGAATCAAATTGCGATTTTATTTATTTTATAGGGATTTAATAGAATACGAAAAGTTTGCATCTAAGTATGAAACCGACGTGACTGAGAAACCACCTTTTAACTACTCACATATAATTGGGATGGCTATGCTAAAAAATGGTCGCATAACTTTACAACAATTATGTGCTTGGATAGAAGCTAAGTTTGCATTCTTCAGAGTCAGAAAGAAATGGAATGTAAGTACTTTTAAAGTGTAGTTTGTTAAATGTGTTAATTAATTGAAAAACGATTTATAGAACTCCATAAGGCACAATTTATCTCTACATCACTGCTTTCGTAACAGAAAAAGAGAAGAAAAAGGAAAAGGCGGCTACTGGGAGTTGGGTGTTGACCCTAAGAAGTGTGACCGAAAACGCGTTCGTAATAGAAAACTATGTCACACAAAGCTTAATCACATCTCCAAATACCATAGTGAACAGTTAACTCATAAGCAACTAGCTAAATCTTCTCAACCCTGCTTTTCAAGGTTTTGTAAGAAAAATAGCGTGTCAAAAATATCAGACACAAATGCTTCAAAAAATATATCGGCAACGTTTACGAATGATAATTTTGCGGAGTTCTTAAGGAAAGGTACAACCGATGAGGTAAATGAAATTCAACATGAAAAACATCCGATGCAAACAATAATTAAAGATGATATATTTCAAAAAAAGCTTAACACAATTATAGTAAGCGCTGGAGAATTCATGGCAGAGCCTCAAAGCCTAAACTGCTTAGTTTCCCACAGGATAGACAGTAGCAACACGGTAAGAAATACACTATATACAAAAAGATAAATTATAATCTAAAAATAAACAAATTTTAAGCAGGTGTCTGGAGAAGACGATTTTTGTACATTCAATAACTTAAATAGTTATTCGGATATGACTACTGTGTTTGCATCGAATACAGCTATCTTAGAAGACCGAAATATGACTGATGAATCCAGTCCTAGCCATCCGTGCAACATAAGAGTTAATTATGATTATACTAACTTCCGGCCCCTAGTAGACTCCATTGACGAACAGTTCCATTACCTCCATAATAGTTCTGAATATAGCCGAAATGATGATATATTAGATAACCTTCTTAATGTTTGTGTTACGCACTATTAAAATCAAAATGCAAAGTTTCAAATTTATTTGATCATCATATAAGCGCGTTGCTCTTACACGTAGTATCGTTGTCATAAGGTATTATTTTGCACAACCACTTCAATAAATTAAAACACGATCATTTTATTTGATTTTCAATACGTTACATATTTAAAAAACTTGGGAGTACTTTCTGCAGTCGACTGCGGAGCCATACAACTTATCTGTCGAACGAAACGACGGCAGAAGCGAACGCATTAACGGCAGAGCTGAAAGAAACGGTGACATAAAAGGTGTTCTATGTGTATAAGTTTTTAAGCAGCTGTGAATAGTAGGACATAGTTATAGGTTCGACAGCACAAAATTAAGAACATTTAATTTTATTTTAACAAATAGGGAAGGTAGCTTCGGCAAGCCGACCCTTGTCGTGACTATGTACACTAGTCGGGATGAGTATTTTAACGTTATTATCTGTGAAGAAAATGGCCGCTTTCAGCAGAGCAACACGATAAGTGATTACTGACGGACCAGTTATCAATCATCAAGTTTGTTTTTCTTAGCGCTGATGATACATAATGATGACTACAATGTAAAATATTACACCTGGTAAATTCCACTATGCTATTCAAGTGTTTTATATTTTGGTCCTAGAGTAAATTAACCTTTACTCGTTGTGCAGATTAATTATTCTCTTGAAAGGATAGTTCTTTGAGCCAAAAATGTATGATATTGTAGAGGAGGAACATTTTCTCTGCCATTTTTAATCTAAGGGTGAGAAAAAATTATATTTTTAAATAATAAATATTTCTATTAATTATTTACAAACTATAAACATATTTTTATTATAATTATAAAATAAATTAATAAAATTAAATTATTTTCAGTTGGTAATTACAGTCGAATAAAACTTCAATAAAATGCGCTTTTTTATTTATTTATGTAATTGTGCTAAATAAAGAAAATTTAAAAACACTGAACAGGCACATTCTATTAGTAAAGCTACAGTTTTTTCTTATGAGATTTATTAAGTTTCCGGCGTTTCAAAATCATATCATAAAGAGCTTCTAGGCCTTCTTGAAGTCCCTCGCCAGTTATCGCACAGGTCGGTTGTATATACCACCCCCTAAAGTGCATCGAGTTGGAAAAGGTCCTGTTATGTTTTTTGTTATGAAAACAGTTTTTACCATCACGCGAATTTTTTTGGTCCTTCACATCAGAACCTTTGCCAGAATGCGGATATATGAATGTAGACAACGCCTCTCCACTTAACGTAGTCCTTTGTTCGTCACTTTCAGGAGCAGGTTTAATGTGAATCATTGATGAATGCAGGTGATTTGATCTTTGCTCTGTTAACGAGGTTTCTGTAATACTTTGGTTTGACTTGCTACATCCGATTAAATTGATGGTGGAAGAAGAGTCGGAACAAGTTAGCATCGATATGTTCGGCACTGGGTTATAAAGCTCGTTCAGTCCTAAAAGTTTTTCCAGCTCCATTGCACCACACGCGTTTGGAAGATCTTGCTTATTTGCTAATATCAGCACTGGAACACCCTTTGAAAAACATAAAAAATAAAGCATTTCGTTTTGTTATAGTTTTTATTTTATATTAACTTCGTTTCAATGTAATCGTCCGATTGTTTCAAGTGGTACATAAATTGGAATGTATTGAAAAACTAAAAGAATTGCATACCAAGACTTTAAAAAAAATTTATTGATTTGGAAAAAAGTGGTGAAAATGTGAAATGTTAATCTTGGAAAATTTGATCTGTTGGAGCTGCTGCGGACACCCCCGGCTATTCACCTAGTTGTGTTCTCAATTATAATACGAGTCGAATGACACCTCAAAATCGGATGCTCTGTCAAAAGTAATACGCAAAATAAGATTTTCGCGGTCCTCTGAAAATAAAAAATTTATTTTACTTGTCAGTTTGTCCCAAAAGGTTATTTTAGAGTCTTGAAAATTCTAACTAGAAAAACTAGCTAAATTTTGTATACTTGTGAAGTACTGAAGTTACAGGCTTGTGCCATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCATAATACTATGTACGCCCTTCAAACACGATTTGTCTAAATACTACCGTTTAAAAAATTATGGGCTAAAGTTTTCTTTATTTATATTTTTATTAAAGCCTTTTTTCTGATGTCTTGAAAACCGCTCTAACAATTTTAAACTACATTTTAATGTGTATAGCCCTTGAGATTCATAAACTTTTGGTATACGACACATTTCTGTAAAAATAGTCGTTTCCAAGTTATTAATAAACAAAAAATGCCACATTTACCAGTTCAGAGTATCTTACATCTTAATATACAATCTACTAAATAAATACACTTTCTACATTTTTTACATTCGGCACGCTTTAATAAAATCTAACAACTTAGCAATGGCATATTGAATTGCAGCGTGCCGAATATAAAAAATGTAGAAAGCGTAATTATTTTGTATATTACATTTTCGTCAAAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GGGTGCATGTGTACTTTATCCTTTAAGAGATTTTCTGCACGTTATTAACATGCAAATACCAACCACTTTGCAATAAGACTTAAGAATGGGGATTATATTAGCTTTAATATTTTCCCGAATTAGGCTATTGTCAACAGCATTAGAGGAACAAACACTGCCAACTAAATATGACTTAAGTGATATGTTCGCAAATCGACTTCAATTAAATATGCAAATGAAGCGCAAATATCATTATTAAAGGATATACATACATATATTGAAAGTCAACTGTCCTGGGCCTTCTGCGCAGTTTGTTTCAGTTTGTTTTGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAGCCCGCGAAAATCTGTAGCATTTAAACTGAAATGTGTTTGTCAAAACAATCAATACCTATCGACTGACTAAAAAAAATGTGTTACGCCCACTTGCTCGCCCACTTACCTACAACATTTTTGACACGCACACTCTAACGCCCTCAAGCGGCTAAAACGCGTATAACTGTCTGCCGCCCACATAACATACACCGAAATAGCCAGTAGGTGGCGCCTTACAATATTTGCTGCTTTTACATCTTCATTTTCATTTTGCTTCCTCAAGCTGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGAGGTACTCGACTATAGCGTTCGACTTGTTTACACTCGGCACGCTAAAGTTTAGTTAAGTTTCTTTTATTATCATCTTAAATTTTCAGGGCCTCCAAACGGAGTTTGGAGGGCACATAAACAGGTCAATGCTCATGCTGAGTAAGATTTTCTGAACTGGTAAATGTGGTCAATTTTGTTGATTTATAACTTTGACGCAATGTGTCGTATAGTATGTCGAGATAAGGAATCTCGAGGGCTTTATACACTACTATTTAATTCAAAATCGTTAAAGCCGTTTTTAGGTAATAAAAAAAAGATTAAAAAAGTCAAAATAAAAAAAAAACTGGCCCACAATCTATATTTATTTTTAAACAAACCACGATTAAAAGGAGTACACAGATCTCTACACCAGTGTGGCGCGACTGATCTAAACTAGAATATGCGGCTGTTATATTGGCCTTCGAGGTCCGTCTAGACAAAAAAGATGTTTTTTTATAAGAAGTTTTTGATTTTGGACGAATTTTTGGTGGGTTGAATACTAAGCCAGACAAAATAAAGAATAAAGGTGCGCGCACAAGGGGGCGGTGCGGCGCGACGAATGTACCGTAATCGATACATTCAATTTCATTTCGACTTCTTTCTTTGCTTTCTTCTTGAAATTCACTAATTGTCTATTCCACTCTATTTGTTTTCGGCCCTGATGATGCCCGACAATTGTCGATAACGGCCGGAAGATTCCGAGAATACAAGATATCGGCGCGGCAAACGCCGCTTGAATGCTTCTTCGTACCGAGACGCGCCTCGTCAGTGTGTGGGCTTTCATATAATTACATGCAACCTTCTCTGCTCTGCATAAACAGCGAGGAGCCGCGCCGCTCCTTACCGCCCCAGGGGGCAACATTTTTGCCTCCTCTTAAATCTGCACTGATTTCTTGAAGGCGTCTTTGACGTAGTTTTTGTACTTTTAGATTTCAACCGGCTTCTGCAGGAACACAGGCAAAGATAAAATGTCTTATTCAAAGGGCTGCGGCCAGCGGCGTTCATCAAAATTAACTTGCTAAATCTGGTATTTTTTCTAGTATTTTAGCTAAGCTTAAGAAAAATTGAGAAGCTTAAAAACTTACTCCATCCTTATGATATGGATTTCATGATTTCTTAAAAACGTAATATAAAAGTTACCCATGTCAATCTCAGCTGCCAGATTATAAATATGCTAAAAAAATATGGCATGTAATAAATATGCTGGTATGAAGGAAAAGGTATGTCCAAACACACAATTACATATATTTTGAATCGCCAAAGCAAAACGTGATTTATTTTTCTTGCCACTGACTGAAAAAATTATTTTTAGAAGTAAGACTTAAGATGATCTGGCAACTCGGATATTTATCTAAAATTAGCACAGTTTAAATGTAACTGTATAAAGATTTATGTTTGAAATCATGAAACGGACAATCGGCCTAAGTCAAGAAATGAATTCATGATATGGGCATCGCATAAACGCAGTGTGAGAGACTAGCTTGCGTAAAAACGGGCACACTTACTTAGCTTAGCGTCTTCTTCACTGTGTTGTATTGTGGCTTACGTTCCCAGCAAAAAACGTGGATAAATCATATTTAATTTCTGTTAAAAAGGATAGTAATGCAATGCAAGTAACACGCACATTTGACCAAAAAAAAGCTTTTCGCTTTGCCTTAAAAAAGCGTCCCAGAATAATTTTGTTCCAAATTCTTCTGTTGAAATAAAACATTTTAAAACTAAATATAAGCTTTTTGCCATAAAGATTTCAAATAAAAGTACAACATCTTAAAATGTAAGTTTTGTCTGTGAGGTGTTGCGCTTCCTAGAGCCCATACTCAGAATTCACTTGCGTAGGAATAAGGGGTAAACGCTTTTTGGAATAATTGACTTAACGACTAACCCAATATAAAGCTCGATAAAGTGTGAAATCGGAATGCCCGCACAATCTCCGTAGTGCTGGGTATAAACGGACATACATTTTCCCGAAAGTATGTATATGCATTCATAGATATTATGTGTTGTTGGCAAAAGCAAATCGCGCCTGCGCTGTTGCACAAAAAGGCCGCTGGCTGTTTGTGGCAGCGCGGATGCCTTGCTGATCAAGAGTACAAAATCTTCGGACCTTTCAGTAATAGAGAAAAGCTCGTGGGGTTCGCTTCGTTTTCGCAGAAAATATTATTTCGCGCTGTGCTCCTTCTGTGTTACCTGTAGCCTAGTTGTACGTACCAACCGAGAAATATATAAATATTATAAACATTTGTTCGTAAAATTGATAATTATAATATAATACAAAAACTTTGGGACTAGGCCTAAATAACATTAAAACTTGTTTCTCTTCTATATAGTTACTTCGTGAAAACTCATAGTTATTTTAAGGACGATTGCTCATACTACATGTATGCACAACTAATGTATACATACATACATAGGTGTTCGGATAACCAGTTCCCAATTTTTCCAATTGAGTGTGTTGGGGCACTACAGTGCAAGCACTTTGAAATTCTTTTCAAGTGAAGTAAAGCTAAAATTGCAAATACTACCCATAAATTAACAAGAGGAGTTAAGTGCGATTATGATTCCAATAATATACATACGAACAAAAAGTGAACGTGTTCCATACTATACAGAAATTTTTGTTCTATTCGTGGCGTTGTGTAACACGTTGTTGTTTATAAAAATAGATCATGAAAAATCACAAAAACCGTGATGAAAAATTCGAAACAGTATATGGCTGTGCAATCTTGAATGTGTTCGTTTAAAATACAACATCTAATTTAGTCTTTGGGTATCAAAAATAGGTTAAAACACAATGCTGTATAAATTTAATGATGTGCAATGGATACACTCGAAACACTTTAAAGCCGATAATTTCCTGCATTCCTCATACCTTACCGTTTTGTACAAGTCTTTGACTATGTACTAATATGCATGCGTATATTTATATATAGCCATGTATCTATGTTTGAATAAATAAAGATAGAGTCGTGTGAGTTCTGTATTTGTATGTACAGGTTTTTTTCACAGCCGGTGACTGAGAACGACTAAAAATAAACATGCAATACATAAATATTCGTTTATTCGGTAAAATGTTTTCCATTAACAACATTTATGCTGAATGGGAAAAAGGATCGAATTTCCGTTTTCCAAAACGTGGTGGGTCGTGTGCAACTCAAAATCCCTAAATACGCGTATATCATTCTTTGTCATTGCGATTCTGTTGAAGCTTAAATTTACACTGATTTAACAGTCTAAATATTTAAGTTTATTTTAATTTAAGGTCATATTATTACCTCGCGTTTTCCAATTTATTAGGTTCCAGGCTTTCAAACCATGTTTACAAAAAGTCAAAAAGTTCAAAGA'..b'TTGTTAGCCTAACTGGACACATTAAAAATATTATCAAAACAAAAGAATCAATTAATTAATTATTTAAGAGATTTGGTTTAAAAATCTAAAACTCACAAATCGTTTAAAGTGTATTCTTTTTACCATACAGTGCGGCGTAACTTTATATCAAATACCGAAATTAAAAAGGAAAAGTGCATCAAATTCTCCTCTGGATATATCTCAGTCGAATGCATCTAAGGACCTATTTGGTGTTACATTAAAGCCTGTTAGCCAGTTTACTAGTGATGAGGTTCGCAGTATATTCTCCGAGAATTTTGAATGTTATCAAATTGTTAATTTATCAATTTTATACTGTTATCTATTTTTCATGATTTTCTATTCCTTCCTGCAGATAAAGGTTTCTGCTTTGCCGACTCTTTTTCTATTTTCCATTTCTAAAGTAACAAATCGAATTAATTTTTCTAAATACAGCTCTTAGAGTGCAGTTCACACAAATAGCAGAAAATCTGCTTATATTTTTATTTAACCGACTTGTCTTCAAAGCAAGGCTTTTTCGTCAAACTATACCTACCCCATCGGTTTTAAACCATCTTACTAATATATTTTTCTAATTTGTCCGAACTCTCATTCTGGTTAATAACAATACACTTTTATACACTCAAATAAAAAACACAACAAATAAAGGCGATTGAAGAGGAAGAAAATTCATCCGATCGATCTATTATAAATACGGAAAAGCAAGAAAAAGAAGGAAGGAACGTCGAAGAAGAAGTAAAAAGCGGAAAAAAAAATAACAAGGGCGATGAAGATGAAAAGTCAAAAGTAAAAGAAAATCCAGTTGAACCCCAAGAAACCGAAGCCCTTGAAACTCGTGAGCCAAATAAAACTAATACCAAACCAAAGTCCGAGCAAACAAAGCCGAAGCTCACTGACAAAAAAGACAAGGTAGCTCAACCAGAAGCCAAAACGAAAAAAGATAAATCAACTGCAGAACCATCTAAAGACAATAAGCAAGACCCTAATGAGGTAAACCTTCTTGCATCTGCGGTTCAACTATTCTGCTTCAATTTTTTGCCAACCACCAAGACACATTTACAAATCCAAAACATTAACTAGCATGTACCTACTAATTTATAATTATACCCGTTACTCGTATTTTAAAAGGAGGTTTTGTATTCGTCGGAAGATATGTTACAGGTACAAACACGAATTTCCAATCTTATAAAGTGTTCATATTTTTCTAAATCCGTCCGTCCGCCTGTCTGTCCGTATGAATGCGCAGCTTTTGGAACTATAAAACTAAAAAATTGTTATCAGTCATATCGATTATATGCGTTCTTACGTGCGCTAGTTTTCTTCAAGTACAACTAAAAGCACTCATTTTTAAGATTTAAAAAAAATTATTTTAGCTAATATTTTATTAAGCAACTAATAAATTAATTGGGTTAGTAACGGGTATATAATAGTTGAGGCAATCGACTATAGCTTCTCTCTCACTTTTTTATTTTCGTGTGCCTAAAAGTTATATAGTAGCTATAATATTTTTAAATTTCATTCACAGCAAAGAGCAACGGAACAAATAGGTTTAAAAAAAGTGGAACGAAAGGTAAGAAACGAAAAATATCAAATAATATACATATTAAAAAAATAACAAAAACACTTGAGAACAAAAGGAAAAATGATCATTCAAAACATTTATTGTTTATCCGCGGTTTCATAAATATAACTTTAAGTTAGTTGTATTTTAAAATTATATTCTAAAAATTTACTTTTATGCGCAAACTATGAGAAGTAATTTTTATAATCATGTATGAATATATTGTGTTATATGAGTGTATTTGTTTTAATGTTGCCCAGGCAAGTATTGTGTCTGTCGAAGAAGAGATCTCGGCAGAAGTACGACGCCAATCAGTAGTCAAAATGCAGGACGAGATCACAGTCGATGATAAAAGGGTATCGTCGAGAAGGACATCCCTGGCTGTAAGTAATTCTATACAATTGTGTTGTTCTGTTGAACGCTAACAGTAAAATGTGTCCACTTTCGTATTAAACATAAGGTTGAAGACTCTAAATCTGAATCCCGGCGGTCGTCTGTCGCTGACAAGAAACCATTGGAGGTATGTAGCGAACAACAAATATCAAAAGATTCCTAAGTATACTGTTTGAATGTTGCTTTGATGTTGACGACAATTTTAGTGTCAACCCCAAGAATTACTCTGTCCTTAGATTAAATTGCTTTAATCCCCATATATACACCTATAAGAAAAATATTTCCACTGCAACAGGTTGATAGTAAGCAAGTTGACGATAACAAAAACCCGCAAGCATTAAGAGAAGAGATTCCCAAGCTAAAACCCACTGACAAACGTCGAACCTCAAAGGTAAGCGGCTTAATTAAGAATCAGTCGAATGCTGTGTAACTGCTTATTATTTTTTTATTTTTATGCTTTCTGTGATAAATTAGAACTAAAAGGTGTTTCTTAAGATTAACCTTAACTTTCTGTGTTACTCGTAGAGTTAAAGGGTATATTATATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGATCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCGCTAGCCGAGTCGAACTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGTCTGTCCGTATGAACACTGAGATCTCAGAAACTATAAGAGCTTCCTACGCAGCGCAAGTTTGCTTCAGCGGGGAGCCACGCCCACACTAACGCACACAATCCGAGAAAATCTGTAGCGCCGACAGTTTTTATGATAGAAAAAACAGAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGATTGATCCAAAAAAAAATTTACCACGCTCACTCTAACGCCCACAAACCTCCCAAAACTATGGTGGCCACAATTGCCATGCTAGAAATTTTTTTTTGCTAAAATGTATTTGTCTCATCGATACCTATCGAAACGAATAAAAAGCTTAAAACTGTCTGCCGCCCATCTGCTGCTTATTTATCTCCATTTCTATTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAACGGGTACCCGATAGTCAAGGCACTCGACTATAGTCTCCTTCCTTGTTTTTAAATAAATGTTTTAATAAAATATTTTTCTTTATCTTTAAGCCTCAATAATTCATTAGTGCGTATTGTTAAATCTGATTTTACTAATTACCCCCTAATGTCTTTAATTTAATGGCTTTGTTATTGAATATAACATCACCTAAATTACACTATTATAAAATAAAATAATATTTATATTTCCACCTTTAAAATATTTATAATATCCTTATAAAGGGTTTAAGGATATTATAAAAGTAAAGAGTATAATGACTTCAGTCAGAAGGACAGGTAGTGAAGGAGACATTAACGACCCCATAAATTGTATATTCTTGGTCAGCATCACTAGACGAGTCTATCTAGCCATATCCGCCTGTCCAACCGTCTGCCAATTTCTAGGCAAACTAGTCTTTCAGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTATGGCTGAAATCATAAAACCCTCTGCAGGAGGAAAAAATCAAACGACGGCTGCCATAGGAACGATCGGATAATTAATGTCAAAATAATAATACTCATTTGGTCTAGTCAAATGCGTTCGGGCTTAGCTTAAGCTTAGGAATATATATAACAAGTTGAGAAAAAGCTTATCTTACTTAATGAACACAAAGAAAGCAAAATGTGAAATGCAACGGTGAGAAAATCTACTGGTCGGAAGGAAGAGCAAGCGCTTACCATATGGGGGTTATGTATATCGGAGACGACACAAAGTTGAAGAATCGCGAGAGGATCTAGAAGAGCAAACAAGCTGAAAATGGGTACAACTGCAATGTGTCTATGGAGACAGAAAAGAGTTTATAGGTACTTACGTATTGAAAAAATATAATTATATCCCAAACAAATATTAAAAAAATATATATAAATGTGAGCAATCTGTAAGGTGATTTTGTTTGTAAAATAAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGTATTGTTTGATCTTTTTCATTAATTTTATTCCCTTTAAATAATAATTTCCTCATAAAATGCACTTATATAAAAATGTTTCCAATCCTCAAGACATGCCAAATAGCTATCTACTTAATTAAATCGAAACGAGTTTCCCGGAGTGGATCCAAATCTCTCGAATGCGGTCCAAAAATGCACCCTTTGTTCCTTGGAAAAGTCATATCTTTTACTGATATAAGAAATTGACATGAAATCGGTCAGAGATGTCATTACCAGTCCTTCCAATTCAAAAACAAATAAACAAAAATAGCTCAAAACGTTAGGCCCGGAAAGATTAAATTGAAAATGTATCTCAATTTTTGCCCACAGTAGCATTAATTATGACATCATTTTAACTAGATCCAATGAGTAATTTAAAATTTCGTCCTTAAAATTGAAGCCAAGTCCAAGATCGATTATGTTTATTGAAACGACTATAAAGGATAAACCGATTGTGGGTACATTTTAATGCAAATGCAAGATTGGTTAACTATATGTTGGATCTATATTTGTTTCTCTTTATTTTATCTGTTTATTGTGAGTGCTCAATTTTGTTCATACACCATGTTAATTGTTTTCATTCCATGTGGAATAGGTAATAGAGGAGCAAAAACCTGCCGAAGAACTGCCAAAGCTGCGTAAAACATCTATCGCTCAAGTAAAAGAAGATGCAAAGCCTGAAGTTGCAAAACCAAAAGCGAAAGCTAAAGCAAAACCAAAACCAAAATACGAAGAGCTCCCAGAAATTCCAGACTACGAACGTCCACAGCTAGAAAAGTATGAAAGATCTGATTTTACGCCCACCGACTTTGGTCGTGAACTTGAAATACCAAACAAAATGGAAAAACCCATATTAGATAGTGGAAAGAAGGAATCTGAGGCACCAGTCCAGAAAAATGGAATTCCTAAAGTATGTATGGTTAACTCGATATTTAAGGGCAGAGGGTATTCGTTAAGAAGTATAAAATATATAGATACGTTCTTGATGAGGATAATCGCTGGGGTCTCGGAAATTATAAAAGACTGTATTTGAACCTAGTGCTCTATAATATCTGTTTGGCGCTCATATTTGGTAAGATTTTGTTTCAGTGTAAATTGAAATTGATCTTAAAAGTCAAAACCTTTCCAGAATATTTCCAGTCGCACCATTGTCTTAAAGGTTATGAATAACTAGCTTACCATTTTGAAGCCTACGCTGCTTGTCAGCCACTTTAATTGCTTATGATATTTTAGTATAATATGAAGGGTTTGATATAGTCTCGAAGAATCATTGAAAGCCTCACAAAAGTTGATATCAGAACTTTTTTTTACTGTAGGTCGTCACTAGATTTTTAGCTAGCTAAGAGGTGTTTTTTGTTGAATATAAACATTAAAACGTGACTTTACAAAACAATTTGTTAAATGAAAATGTTAGGGAATGTCAATGGGTATACACTTCAAGGCTAGCTCGAAATCGTTAATCCGCTTTTGAGAAATAAAATAAAAACAAAATCACTTTTGACAATAATCCTTAAAGATGTCATTAAGAGAAATCATGTTAGGAAAGCGTACAAAGCATACATTAAAATACCTTTCTAGCACAAGCCTGTAGATTTAGTAGTTCGCAAGCTAGTTTTTTTGTTCCTATTGCTCTTAAACGGAGCATTTGGAGTCTTAAGTATCATTCGACGCGTATTTTAAGAAAGAATACAACTAGGTTTATAGCGTAGTTATAATTCTAATACGGTAATTATCCCCACCGGCCCCAAAATAGATCAAATTGTACAAATTTTCACTTTTACACTTTCAAAACTCTTTCTCCCAAGCCAGTTGATTTTTTGAAAGTTTTGGTATGCAATCGTTTTAGTTTTGGCAATATCTTCCGATTGATGTATCACTCGTAGACATGGGACGAATATTGTAGATTTTCATTTCTTCGTGTGCATGTAGAAGTCGCTTTCACACATCCTAGTGGTGCGCTTCGTCACTATGTGGCCGTCCACAATGATATGTGTAATATTTAAAAAGTAATCTCAGCCTTGATACATAATTTTGGGTCAAAAGGGTTAAAAAGGCTTTGCAGTGTAGAGCTCTAGGGGCCACTAGCGAAATGCGATCGAAATTTATTTAAGTGTTAACAGATAGTCGAGGCAATCGACTATAGCATTCATTTTGTTTTTTTTTAAATAATATTATCTATGTAGTCGAGGCAATCGACTATAGCATTCATTTTGTTTTTTTTTAAATAATATTATCTATGTATATATATATATTATGTGTTATAACATTTTGTCTGGTAACTGTGTATGTATACAGAAGTCGGAAATAATTGAAAAGCCTGCAGAGGAACCCAAGGGCTTGAAAATCGGCAAAGGTAAACTACCCGATGAAGATGACAGTCGAGACGGCGCTATTCTTAAGCCAGTCATTATTGAGCCAGAGGTAATTTAACTGCATTTGTGGCACACAAAAACCATTTCACTACAAAAACGCAACTCTATGTGACGTAAAGTACAAAATGTAAAATAATTGTTGCTATAACGTTTTTTTCCCGTTTTTGTTTGTATATTGTTTTTAACGTTGTTCTATTATCTTTCCCATTGCACCCTTGTTCCACGGCACTTTTTTAAAGGATAAATCTGAGATCGGAAATAAAAAACCCCATGAGGTAAGTTAGAAAAAACTGTATATACCGAAACACAGACTGAGTGCCCACATTTTTTCGGGTGACCCGATTATACAAAAAATAAAATCATATTTTCATTCTGCAAGGAATAAAACCCTTACACGTACTAATTCTAAAAACCATTCACTAAAATTGAACCTAGCAGGCCGATAAACCATCTGTACTAGATATTATAAAGCAGCGACGTCGATCCTCTATCAGAAATCTGATGACTAAGGAACCAATTCAAAATGAATCATTCCTTGGGGTAGTTTTAAAGCCCGTGATAAAGGATGCTAAAGAGCAGGTTGCGCCTCAGCAAGCTATACAGTTAACGAAGGTAACAGCTATGAAACGTTCGTGCAAAAGACGGCTCTTCTATAAATATCTCTGTTTCATTAACATAACAATTTACAATTTTTAAAATCTTTTGTACTTTGAACTTCGGGTACCTCTACACCCAATTTATAACTGATTAATCTAAGAAATTCTCCGCTGGCTCGCTCTGTCTGTCTCTTTCCCTGTCACTCTCTCTTTCTCTGTTTCTTTGTCTGTACTTTTAATTTCTACCCTTGACTATCTGTCTTCTTATTTGGTACAATGTATCCTAATGCTCCCTAATGCCCTTCCTATATCCACAAAATCGAAGGCAAATGCGACAGAGCAGTTATCTCATACAAAGGCAATCAAGGCGAAAGTTTCGGACCTAAAAAAGCCAGAAGCTCTAGCGACCCTTGAGGATGATTATGAGCGGCCCGTGTTAGAAAAATGTGACCCTGTCAACTTCGATAACAACAAATCAGAGAAACCTACACCAGCAATTATCACACCGGACACTAAACACCCACAAGTAAAATTGCCGGTAGAAGAACCTAAGGTAAGCATGGACGTTTTCAGTTCGATTTGATACTCCCCAGTGAAAACCTGGTTCGTACGATTTTATACTATATACCCACGAGTTGAATATATATGCACCTTTGAATATTCTTATTTATAAATCTTTTCGAAACACAAATATAAAATGAAACAAACACAAAAAGACAGTTTAATAAGAGGTATTTATATGTATCCACACATTTTATACGTTATTTATATACTCATAGATATATTTATATGAATATATAGTGTGTAAAAAATGTATACATAAATAAATGCTTATATTAAATGAGTTGAAATATCTTTTGTCAAAAAATATGCAACTATTTCTCACAAGCTGTTTGATGTCTGTCTCTCATTGTCGCTCTGTCAAAACGGTTCCAAAACATTTTAGTTTATTTTAATATTGGTTTTTATTAAAAAAAAATTGATCAATAATAG'..b'AGTCCGTGCTGTTAATAAGGCAGGTCCAGGTGAGCCTAGCGACAAGACTAAATCGATTATTGCAAAATGCCGATTTGTAAAGCCCTTCATTGTTGGGGACGGTCTCAAAAACATTACCGTTAAGAAGGGACAAACCATTCGATTCGATATTAAATATGACGGTGAGCCAGAACCAACAGCCACTTGGGTAAAGGGAACCGACAACCTAAAGTTTGACAACCAGCGCATTTGTCTAGACCAGATGGAAAGGAACTCATCAATCACTATTAAAAAATCCGTCCGAAAGGACACGGGAAAATACAAATTAGTACTGACAAACAGCTCAGGTACTGTTGAGTCCGAGGCTCAAGTTGTGGTTCTTGACAGACCACTTGCTCCTGGGGGACCGTTCGAACCGGAAGAGGTGCGCGCCAATCATATTAAAATGAAATGGAAGCGTCCAGAGGATGACGGCGGTTGTGAAATTACTGGATATGCTTTAGAGCGCATGGACGAAGAGACAGGCCGCTGGATACCTGCTGGCGAAGTAGGTCCAAACGAGACTTCGTTTGACTTTAAGGGACTGACGCCAAACAAAAAATACAAGTTTCGCGTCAAGGCCATTAATAAAGAAGGCGAATCAGAGCCACTTGAAACATCCGACTCAATAGAGGCAAAGAATCCCTATGATCCCCCCAGTGCGCCCAGCCAGCCAGTTATCGATGATTACGACAACAAGAGTGTTCTTTTAAAATGGAAGCGACCGCCGTCAGATGGCGGTCGACCAATAACCCATTATGTCGTCGAAATAAAAGATAAATTTTCACCCACCTGGAGTGAGGTAGCAAAGACTGAGGATGCAACTCCTGAGTGTACGGTGGATGGTCTTAAGGAAAAAATGGTGTATCAGTTTCGTGTTAGAGCCGTTAACAAGGCAGGCCCCTCCGAACCTTCCCAGCCCACCGATAATCACCTGTGCAAGCACAAAAATCGTAAGTATTTTCATAAGTACATTCTATTCCAGTTCATCTGTAGACTTGCTTTGGCTTAACATGTTAACACATCATGCAAAACCTATTTTAGGTTTAAAAAATTATTACTTTCAGCTATATTAATTTTCATATATGTACTGTCGTAATGACGAATTTTAGTTTAATTTCCCTCCATAATTTTAGTTCATTTTCACTTTTTTTGTTGTATATTTTTTCTTTAAATTTAAGATAAGTTGTAAATTTGATGACATCCAGGTTTGGCAGTCCTGTTACTGGTAGAGCACCTTAAAACTATAAATAATTTTTTAATACCAAATTTTTAATTATAATTTTATAGACAGAAGAAAGCTTTTTATATATATTCACAAGCCGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCGATCCGTGTGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGGAAACTTAAGAGCTAGTCAGACTTGGCATGCAGATTTCTGGGCTTTCAGCAGCTGCCGCGCCACAATCTGCTGTAGATACAGCGCCTACAGTTTTTATGAGAACCAAATTTTAACTGAAATGTATTTGTCTTTGTGCCACGCTGAGTAACGGGTACCTGATAGTCGAGCCTCTCGACTCTAGCGTTCTTCCTTCAACGATAAATAGTTAAATACCCAGAGATAGTTTTGAGCTGATTCTACCTTTTCATGCTGAAATCTTAACCCCATAAAGAAAAGCGAATAACAAGGAAAAAGAGCTTAATGAGCTTAAACTTTTAGTGCTATTAGGATATTGGCTTAGAAATATTCACTTCCTAAGCCACCAGCTCGATCGTGCTTAGACTCACCATGATAAAGTCATTCGATTTTTTATTTTATTCGAGACCCTCAAATATAAAAAGTATGATTGTTCCAAAAATGGAAGTTAATATGTTCAAAAACACTGAAGTTAGATATTAAACAGAAAATGTGCTAATTTAATGACGATATTAATTTTTGTGTCGAAAATGTATATGGTTTCTATATGGTTTGAAGCTCAAAAGATGAAAGTTGAAATTATTAAGTAATATTTGTGTTCGCAAACTCAAATTCTAGGTACAAGAAATGCGAAAGTTGTTATTTTAGTAGTGTATCGACGATCTGTGGGACAACTGCGAATCAAAGTCTCTACCAAACTCGCTTTTACGATACAAATAAAACAATCTAATTTTGTATACAAAAATTTAGATTTAAACTAAAAAACATAATCCTGCGCATGCAACGCTTTAATTTATATCAACTCTATTAGTTTACGACTACATTTGGAAATTACATCAAAAAACTCCCATCAGCTTTACTGCCAGCGCTTATACTGTGTATGTATTAATATATAAACGCTTGAAATACCCATTAATTTCAAATAAATTTAAAATTAATTCACAATAAAAATACTTTTAGTCAAACCACAAATCGATCGGTCTACTTTCAAACGAGTAACAATAAAGAGTGGCCGAACTCATAAATGGTCAGTTGACGTAATTGGCGAGCCAATACCAGAACTGCACTGGAGTTGGAGAGATGATATTCCATTAACTAACGGGGACCGAATAAGGATAGAAAATGTCGATTATCACACAGACTTTACAATTAAAAATGTTTTGCGAAAAGATAGCGGTTTCTACACATTAAAAGCGGAGAACCGCAATGGCATTGATCGCGAGACCGTGGAATTAGTTGTTCTAGGAAAGCCCAGCTCGCCAAAAGGTCCCCTTGCTGTTAGCGACGTAACTGCAAATGGATGCAAACTGCAATGGAAGAAACCTGAAGATGATGGTGGAGTACCTATTAAGGAATATGTCGTTGAAAAGATGGATACGGCAACAGGAAAATGGGTTCGAGTTGGCAGATCTCCTGGAGAGAAGGAACCACCAAGTTTTGATGTAACCGGCTTGAATCCCGGATCAGAGTACATGTTCCGCGTTTCCGCCGTTAACGAAGAAGGCGAATCTGAGCCCCTAACTACTTTGGTAGGCGTTGTGGCAAAGGATCCATTCGATGAGCCTAACAAACCAGGAACGCCCGAAGTTACTGATTATGATAATCAAAGTGTGACTTTGAAATGGACAGCACCCAATAATGACGGAGGAGCCCCGATTCTGAAATACATAATTGAGAAAAAAGATAAAAATAAACCCGATTGGGAGAAAGCCCTAGAAATACCGGGAGACCAACTTGAAGCCACAGTCGCAGGTCTTCAGGAGTACGGAGAGTATCAGTTTCGTGTTGTAGCAGTCAACAAAGCCGGACTCTCGCCCCCATCAGATGCTAGTGTTCCTCAAATTGTTAAGTACAAAAAATGTAAGTCTTGAAAACTTTTCTGAATGATGCAGTCACTTCTTGCGCTTACAAAGGGCAAGCATGGAAAACATCATTGGCTTGCTTTATTTTATCAGTTGTTTAGGTTTTGTTAATATTCAATGTCCTTTAAGTATGCTCTACGAAATCAGCTGTTATTATATGGAGCCAATAATTCTTGGCAGGGAGTCTGAGTTCCTGTCAGTGTTAGGTCTCAGAAAGCCCAAACTTTTCCTGGATTTTGTGAAATTTTATTTTATTTATTTTGTATTTTATTTTTTGTTCTGATCCACAGTAAAACCTCGTATAGACCGAACAAACTTAAAGCCTTTGTTGATTCGCGCCGGAAAGCCAATTAAGTATGACATCAATGTTCGCGGTGAGCCTGCTCCCACAATTACATGGTATCAAAATGATACAGAGCTTAAACCAGAAGCACTACCTAGCAATAGCGAAATCAAGAATATACCATATAACACAAAGATTTCAATTATTGATACACTTCGTAAACATACTGGCATCTACAAAATAAAGGCTGTAAATGAACATGGCGAAGATGAAGCTACAGTTGAAGTCAATATTCTAGCTCCTCCAGGCAAACCCAAAGGCCCATTGGATGTCAAAGATATTACAAAAGACAGCTGTAAGCTAAAATGGAAAAAACCTGAAGATGATGGTGGGAAACCCATTACAGCTTATC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGGTTGAAAGGTTTGATAAAAATCAAGGTCGATGGGTACCTGTCGGTAGAACTTCTGCTAATGATACCGAATTTGATGTCAAGGGTCTTCAAGAAGGCCATGAGTATCAGTTTCGTGTCAAGGCAATCAATGAAGAGGGGGAATCCGAACCCCTGGAGACCGATGGCAGTATCATAGCGAAAAATCCCTATGATCCCGCTAGTAAGCCAGGTACACCTAACATTAAGGACTACAACGAACATATGGTAAAATTGAAGTGGGAAACACCCAAGTCTGATGGAGGAGCTCCAATCACTGGTTACATTATTGAAAAAAAAGATAAGTTCTCCCCTATGTGGGATGAGATAGTCAGCACCAATGTAAGTAAAAAAAATTACGATTATCCCGTCTTTTAAATAAAAGCTTTATTCAAAAAACTGTGTTTAAAAAATATTCTACTTTAAGACATCCACCCCTGAAGCAATCGTTGAAGGTCTCAACGAAGGCAATGTTTACCAGTTTCGAGTGCGTGCAGTTAATAAAGCTGGTCCCAGCGAGCCGAGCGATGCAACGGAGCCTCATTTGGCTAAGCCGAGAAATCGTAAGATTGTTTTTTTTACAAGAACTTCATGGGTAGTTTTAATATATGTCGACTGCGTTCACCTATGAGTTAAGCCAAAAGCAAATCACAGATGTTTCATTTAAGACTACATAAACCGGCTTAGTTAATTATATTTTTTAACCCCTTTTTGTCCAATGATATTAATACTAAAAATGATATTTCTAATTTTAGTAAAGCCATCTATAAACAGAGAAAAAATGAAGGCAATCAAGGTTCGCGCTGGGCAAACGGTAAAGTTTGATGTGGATGTTAAGGGAGAACCGGCACCTACTTTAACTTGGTTCATAAAAGAAAGCGAGTTAACGCCCACCGGTCAAGTGCGCCTAGAAAATGAAGACTACAATACAAAACTGACATTGCTAGATACGTCACGCAAACAAAGTGGCGAGTATAAGCTACGAGCTGAAAATATAAATGGCGTTGACGAAGCTGTGGTCGAAGTTATTATTTTGGATAAGCCTTCGAAGCCTGAAGGGCCACTTGAAGTCTCAGACATACATAAGGAAGGTTGCAATCTTATGTGGAAAAAACCGAAGGATGATGGAGGTGTTCCGATTACTGGCTATGTAGTAGAAAAAATGGATACAGCCACTGGAAAATGGTTACCGGCCGGTTCGGTTGATCCAGAAAAAACGGATATTGAGATTAAGGGTTTGGATCCAAATCATCGGTACCAATTTAGAGTTAAGGCTGTAAACGAGGAGGGCGAATCAGAACCTCTAGAAACTGAATCAGCCATTACTGCTAAAAATCCATTCGATGTGTCTGCTCCACCTGGCCTACCTGAGTTTGAAGACTGGGATGAGCATCACGTCAAACTTAAATGGGAACCACCAATTCGAGATGGCGGCTCTCCTATTACCAACTATATAATCGAAGTAATGGATAAGGATTCAGGCGAATTTGTAAAAGCCGTTGAAACAGATAGTCCAGTTTGTAAAGGCGTTGTTAAGAAGCTTGAAGAAGGACAGCAATACAAATTTAGGGTTCGTGCCGTTAACAAGGCTGGCCCATCTGATCCATCCGAGCAGACTAACTGGCACACAGCCAAACCGCGATTTTGTAAGTAGCTAATACTGTTTATATTGCTTCATTTTAATTTAACATTTTTAAAATTTTATAATTTAGTGAAACCTCATATTGACCGAACCAACTTGAAACCTGTAACCGTTAAAACTGGGCTTTCAATAAGTTTGGACATTAGCATCAAAGGAGAACCAGCTGCGAAAGTTGAATGGTTATTTAATGCATTACCCCTAACAAGCAACGAGGATAGTGTGAAAATTGATAATGTTGACTACAACACTAAATTCTTCGTAATGCGTGCCCAAAGATGTCAAAGTGGTAAATACTTAATTAAAGCTACAAACGAAGTTGGTGAAGACGAAGCAGAACTGGAAGTCACCGTTTTGGGTAAGCCGGGAAAGCCCAAAGGTCCCCTTCAAGTCAATGATATAACGAAACACAGCTGCAAGCTCAAGTGGGAAAAACCAGATGATGATGGCGGCACTCCTATCGACTATTATGAAATAGAAAAACTTGATCCACACACTGGTCAATGGTTACCGTGTGGAAAGAGTACAGAGCCTGAAGCGAAAGTAATTGGTCTTCATGAAGGAAAACCATATAAGTTTAGAGTAAGAGCTGTAAATAAAGAAGGGGAGTCTGAGGATTTGGAAACAGATAAACCAATCATTGCGAAAAATCCATTTGATGAACCTGACAAACCTGGCAGACCTGAACCTACAAATTGGGATAGAGATTTTGTTGACTTAGCTTGGGATCCACCAAAGAACGATGGCGGCGCACCAATCCAAAAATATATTATTCAAATGCGGGATAAGTCAGGACGCGCATGGGTTGACGCTGCTACTGTACCAGGAGATAAGAGCAGTGGTACCGTTACCGGCGTAGAAGAGGGCCATGAGTACGAATTCCGCATTGTTGCCGTCAACAAGGCAGGACCCAGTGACCCCAGCGACGTCTCAAAAACAGTGGTGGCTAAACCTCGTTTCTTAAAGCCACACATTGACCGCAAGAATCTGCAAAAAAAAGTAATGCGCAGTGGACAAATGCTTCATATGGACGCTGCAGTTAAAGCTGAACCTCCAGCTAAAATAACATGGACTTGCAACGGAACTGAAATCAAAACTTCAGACAACATAAAAATAGAAAATGAAGACTATAAAACCACATTTATAATACCAAAGGTGAAGCGCACTGATCGAGGCGTATACATCGTTACGGCCAAAAATGATTCGGGTTCAGACACCGTAGAAGTAGAGCTAGAGGTGCTTTGCAAGCCAAGTATTCCAAAAGGACCGTTGGCTATATCTGACGTAACGGCTGAAAGCGTTCATTTGAAATGGGAAAAGCCTGAAGATGATGGCGGAGAGCCAATCGAACAATATGTCGTCGAACGAATGGATACGGAAACAGGTCGATGGGTACCTGTTCTTACAACTAAGACACCTAAAGCCGATGTTACAGGCCTTACAGAAGGCAAGGAATATCTTTTTAGAGTGAAAGCAGTCAATTCGGAAGGCGAATCCGAGCCCTTGGTAGCAGATATTCCTACAAAAGCGAAGAATCCCTTCGATGCTGCCGACACTCCAGGAAAGCCGCAAATCACTGATTGGTCTGCTAACCATTGTGATCTTAAGTGGAGGGCTCCGGAAGATGATGGCGGAGCATCTATCACCGGCTATATACTGGAAAAGAAGGACCCCAATACAGGAAAATGGCAAAAGGCTCTTGAAACAAATACACCCGATTGCAAGGCCCGCGTAAATGACTTAATCGCTGGCAATAAATACCAGTTCAGAGTTAAGGCAGTTAATAAGGCAGGAAAGAGCAAGCCCTCAGAACCATCGGACCAAATGATAGCAAAGGATCGATTTGCACCACCCAAAATTGATAGAACCAACATTAAGGATATTACCATAAAGGCTGGACAACACATTCGATATGACATTAAAGTTTCTGGAGAACCTCCGGCAACTAAAACTTGGCTTCATAATAAAGCCCGCCTTGATAAAGACGATAGTGACTACAATATTGACATGGAGTCATATCGCACAAAACTGGCAGTCCCATTTTCAAAGCGATTTCATTCAGGAAAATATACGCTTAAGGCGGAGAATGAATCTGGACGCGATGAGGCTTCATTTGAAGTCATTGTGTTAGATAAGCCGGGGAAGCCAGAGGGACCTCTACGAATCACAGATGTGCACAAGGAAGGGTGCAAGCTTAAGTGGAATGCTCCCATAGACGATGGAGGTTTACCAATAGAGCACTACATTGTTGAAAAAATGGACGTCGAAAGCGGCCGATGGCTGCCATCAGGTCGCTTTAAGGAACCTTTCGCAGAGTTAAATAACT'..b'TGAACCTTCAGACCCTAGCAGTCTAATCAAGACAAAGGAGTCTATTAAAAAGAAACCAAAAGAACGTAAATTGGAAACCGATGCAAATGGCAAAAAAATTCGCGGTAAAGCAGATGGCCCAATTAAAGACTATGATTCATATGTGTTTGACATTTATTCAAAGTTCGTTCCGCAACCTGTTGAGATCTCTCAGCAAAGTGTTTACGATAAGTATGATATCCTTGAAGAAATAGGTACGGGTGCTTTTGGTGTGGTGCACCGTTGTCGTGAAAGAAGCACTGGAAATATTTTTGCTGCTAAGTTTATTCCAGTATCACATTTAGTTGAGAAAGACCTTATTCGCCGGGAAATAGATATCATGAATCAGCTGCACCATCAAAAACTTATTAACCTGCACGACGCTTTTGAGGACGATGATGAAATGGTTTTAATACTTGAATTGTAAGCAAAATCTATATCTTTTTTGTTGTAACATTAATACCTAAAAGCGGTTTTTCATAGCTTATCTGGAGGCGAATTATTTGAACGCATTACCGCAGAGGGCTACGTGATGACGGAAGCTGAAGTTATAAACTATATGAGGCAAATTTGCGAGGGCATCAGGCATATGCACGAGAAAAATATTATACATCTGGATATAAAGCCAGAGAACATTATGTGCCATACTCGTTCAAGCACAAATGTAAAGCTTATCGACTTCGGATTAGCGACAAGGCTAGATCCAAATGAAGTTGTCAAAATTACAACCGGTACGGCAGAGTTCGCTGCACCGGAGATCGTTAACAGAGAGCCCGTCGGTTTCTATACTGATATGTGGGCCACCGGAGTACTGGCATATGTTCTGTAAGTTATCAATTAAATTTATTTATTCACTTTAAAAATTAAAAACGTTAAGCAAGGAAAAACGTTACAGTCAAGTGCCTCAACTATCAAATAGCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAAGGGAAATGGGGATATATAAGCTGCAAAACGATATTGTAATACCAATACAAAATACGAAAATATATAAAAAATACAAGATAGCCACACTGCCGAAAAACAAACCGAGTACAACTTTTAAGAGTTCCAACTCTATGTGACACATACAGGCGCGCTCCGGTTTTCATTTCAGTTTTACATTTTGCCTTTTGAGAAAAATGTTTCGATTTAATTTTTACGTGTTTTTCGGAAAGTATTGCTTCATAGGAATGTTTTACGTTATCGGTTTACTTAGACAAAATGAACTTGAAAACAAATTTGTTACTTAGGAATATATTTAGGCGTAAATTATTTTACTGCTTAAAACAATTTAAATGATTCCGAGACCCTATAATAGAGTATGAATAGGCACAAAAAAAGTTAAATTCTCAGCCATTGTTAGATACTCTTAAAACAAGTAATCTCAAGGGTCTAAAATGTTTTTGAACTTTGTAAGTTAACAGACGAGCTAACAGAACAAACCATTATGATATTTTTTTCCAGTTTCAACCACCGAAAAGAAACATTTAAACACATTTTTAAAACTTATCCTTTTTTAGGTTAAGCGGATTATCACCTTTCGCTGGTGATAACGATGTCCAAACACTCAAAAATGTTAAGGCATGCGATTGGGATTTCGATTTAGAATCATTTAAATACATATCTGAAGAGGGTAAAGATTTTATAAGAAAATTGCTTGTTGCCAACAAAGAAAAGCGTATGACTGCACACGAATGTCTTCTGCATCCTTGGCTTACTGGAGATCACAGGTCTATGACACGGGCAATTAACCGTGATCGTTATCTCGCCTACCGTGAAAAACTTAGAAAGAAATATGAAGATTTTGAGAGATATCTGTTGCCAATCGGACGCCTATCAGAATACTCATCTCTGAGAAAGTTGCTTATGGAGAAATATAAAATACATGACGCCGTTTTCGATCGTCGTCAAGCAGCGCCACGTTTTGTGATTCGACCATCGTCCCAGTTCTGCTACGAGGGTCAAAGCGTGAAGTTCTACTGCCGGTGCATTGCCATTGCTACTCCCACTCTTACCTGGTCTCACAATAATATTGAGTTGCGGCAGAGTGTCAAGTTTATGAAGCGCTATACTGGGGATGACTACTACTTTGTCATCAACCGAGTTAAGTTAGATGATCGAGGAGAATATATTATTCGTGCAGAAAATCACTATGGCTCCAGAGAAGAAGTCGTCTTCCTGAATGTTCAGCCCTTACCAAAAGAACAGCCACGGTATCGAACGGAATCAACTCCGGTTCGCAGACGTGAACCGTTGCCGTACACTTTCTGGCAAGAAGAGTCCGAGACGGCGCCCAGTTTCACATTCCTTTTGCGGCCACGCGTCATGCAGGCCCGCGACACATGCAAACTACTTTGTTGTTTGAGTGGCAAGCCAGTGCCTACTGTTAAGTGGTACAAGGACGGCAGAGAGCTCAGCAAATATGAGTATGCGATGACTCACTCTGATGGAGTTGTCACCATGGAAATAATCGACTGCAAGCCATCCGATTCAGGAAAATACAGCTGTAAGGCAACAAACTGTCACGGATCAGACGAAACAGAGTGTGTCGTGATTGTTGAAGGTAAACTTAAAAAAAAGACTTTCAAATAATACATAAAAGAATTTTTGAATTTGAATTTTAAATTTTTAAATTTTCAATAAGACTTATATTTTGTATTTATTTGTTTAAGATGTTGCTTTTAATTTCTTGTCCACACCTTATACAAATCTGTTTTTTTATTTTTGAAAAGGTATTTAAATATTCTATATTTTGGTTAATCAAATCTTATATTTAGTAATTGTTTTTTAAGTTAAATGAAAGATTTTTAATATCAAAATAAATTACAAATCATAATTAATAATTGGATTTAATCTTAATTTTTGTGCTCGTTCATTTCAAATAAACTTATTATATTGCTTAAAAAAAGAAATTAATTAAAAAAAAATAAAAACACTAAAGTGGCTTTCCTCGAATATCTGTTGATAAATTTTAAAATAAAACTACAGGCCAGTTCTATTGCGTTGTTACTTAGTTGTTCATAAATTTAAAAAAATAGTGCGCTAATAACACATTAATTATAGGTTTTAACAGATTTTTAAGGAAACTAGAAACCGTGCAAGCTCAGACCTTTAAAATTGTAATGGGTCTAGGGTTTCTTATATTCACACACATTGATTTAGGGATGCGAACAAACCATTATATCCCTAATATATCCCTAAGATATATAATATATATCCCTATATATATATTGTTATATGGTATTTTTTTAAATATGCATTACAATTTTAAATACTACATCTTAAAATTCAACTTTTCCCAGGAGAATGGGTTACGCCTGAGCAGGCTCAACTTGCACACAATTTCCTTTACTCAGGAGGTAAATGATTATAACGAAATGAACCAAAAATTTAAACACATATTTACCTTCAGCATGCCCTTTAATACCTAAAGTGAACACTTTATAAATTAAATCATACTTTTAAGAAAGAAAGAGATAAGAAGCTAACTTCTGGAACCCAAAGTTTATATACCCTTGCAGGTATACATATTGCACATGTTAGGCTAAAGGGGTAAAGATTAAGATAACGAAGAACGCTATAGTCGAGAGCCTCGAATATCGGATACCCGTTACACAGCTTAAGTAAGCAGGAACAGATTTAACTGTTTTGGCCGTTTGTGGGTGGTAGAGTGGGCGTGGCAAACTTTTTATAGGTCAATAGATAACTATTGATGAGACATACATTTCAGTTAAAATATTTTTTTAACAACAAAAATGTAGCCGAAACAGTTTTTGGCGGTTTGTGGGCGTCAGACTGGGCGTGGCAACCTTTTTATGCCCTTGCAGAGGGTGTAATTATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAATGAACGAAACGTTTCCAGCCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGATGGGTCGATCTAGCTATGTCCGTGTGTCCGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/865/4f3/04/scaffold_42-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCGTCTGTCTTTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGATTGAAACTTTCCCAAAAGTCCTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGGCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATGGCTCCCATAGGAAAAAAAATTTGAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATGACCTTCTAAGATTGGAAATAACATTTTTAATTAGTTATAAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGATGACTATATCATATAGCTGCCATAGAAAGGATCGGGAAATTAGTGGTAATATAAAATAAAAAAATGATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTGGAAATAAGATTTTTTAATTGGTTTTCAGTTTCGAATTAAATTTTATAAAAATTTGAAATTTAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTAAATGTTAAAAACACCAAAGATATATTTTTTTTTAAATTTTTCCCCCGATATAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGTATTTTATACAACCTTCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCAATAGCTTAAAAACTGAGGGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACATGGCTAGATCAACTCGGCTAGTGATCCTGATCCAGAATATTTATACTTCATACAACTAAAACTGTAATTAATAAATAAGATTCAAGAGCCGTTACTTTTTTTATGGGGGTCATAAAAACTTTTGCTTGAATCAGTAGAAGACGGATTTACTAAAAAAAAACTTGTCCTTTTTAAACCATTTTCGGTCAGAGTTTAAATTCCAAAATTGTTCTCTGTCAATCTAATGAAAAACAGCTGTGAGAAAAAAAAAAACTTTTTTGTTATCTACCTCTGTATATTGTCAAATATGACTTAAGTCACATCGTCTTCGGAATGTAACATTTTTAATATATTTGAGTTACTTGGATACGCAAGTTTAATCTGCAAATTCTTTATGTAATGTAAATGTAACGATGTAATCTAATATGTAACGGGCGCAACCCCTAGGTGATGAAAATAAGTTTGCAGGACTTTTAATTATCCAGAAAAAAAGAAATGTTTCGTAGAAATTCAACAAAGTATAATTTTTTATGTCGCGTGTGATCGCATGTTAAATATTAGGAAAAAATGTGTAAGATAACGTAAAAGAAGGGCAATATAAGGGCAATTAGTTTTGGTAATTCTATATTGGTTATCCCATAAATATGTACAATCCCGTCTGAATTGAAATAAAATACTAATATAAAATTTCCACAATCCAAGTTAACTATGATCTTGCACAAAAAATACTTACATTTAAAACATACTAAACATTTTTTCGTTCTTTTTACTAAAACAGATAGAAAATATATAGAACAGCCAATTAAGCCAGCGCCTCCACCAATTGTAACATCCCGCCAGTTTACCTCATCTTCAATCCAGAGCACATCGGAATCTAAGGCAAGCATTAAAAATTGTATATCTTGATAGCATATTTACTGATCAGTTCTAGGCCGACCAAACCACTGTTTCCAACACAAGTTCTTCAAGCACTCAGAATAGCATTTCAAGCAAAAAGAAGTATGCGTCTAATAGTTTACAGGCCCCTGGAAGCCCGTCTAGATCACGAAGTGCAACTAAAGAACTTATACGTATGTATATATTAAACATACATGGAGTTATAAACTACTTATAATTACTCTATGAATATAGTTCCCCCAGATGATTCATTAATGTGTAAGCCAGAGTTTACGAAGCCCCTACACGATCTAACTATCCGTGACGGTGAACAGTTGATTCTTACATGTCACGTGAAAGGCGATCCAGAGCCTCAAATCACTTGGTCAAAGAATGGGAAGTCGATATCATCTTCTGATATTATGGACTTAAAGTATAAAAATGGAATTGCAACTTTAACCATCAACGAAGTTTTCCCGGAGGACGAGGGAGTATTTACTTGTACAGCCACAAATTCTATTCGTGCTGTGGAAACTAAATGCAAACTAACAATAAAGCGTGAGTTGTTGTCTTTTAAAATAAATTTTTTGTATTTAGACCGCTGCGGATTAAAAAGATAAACTCGTTGCCTACTATAAACGAGGGTCGATCAGAAAAAAATGGCTAAAAGTATATATACTTTTGATCAGGATAAATATGCGAATCTATCTAGCCATGTCCGTGTGTCCGTTTTAACGACAAATTATTATTTTTTCTTTTATTTCCGCAAAATTTGGCAATGACCAATTGCTTGAAAATTGATCAGGAACCATTCAGGGTTTTTTTTTATATTATATATATTTTATATCTACCAATTTTCTGATCCTTCCTTTGGCAGCTATTTGAAATAGTCGTCCGGCTTTGAAAAAATTATAGGACATAATAATTACACCCAGAAGTTTGCAACGCATTGAAGAAGTTGCTTTCGACCTATATATATATTCTTGATCTAGCCACGTCCATTGCTCGGACGGCTCTGTCATATAGCTGCCATAAGAACCATCGGATAATTATTGTCCAAACAATCGTTTTAGGCAGTCATATACGGTAGTAAATGGAAATGGGACGTTATTTTACATTTCTGTAGATTTAAAAGTTCTTGACCTACCCTGCTCCCACGGGCACAAACTCCAAGGTTATAAAATTTTCGGCTAGCCGAAGTAAATTATCTTTCTTTTTACTTTATAATACCAATAAAAATGTTTCTATATGATTTTAGCGCTGGATAAGAGCTCTTCCAAACGAAAAGTAGTTTCCGGCGATAAAGCGCCAAAAATTGTAAGTCACTTGGAGTCGAGATTTGTTAGGGATGGCGACGCAGTTACCTTGGCCTGTCGCATTATTGGAGCTGAACACTTCGATGTGGTATGGTTGCACAATAACAAAGAGATAAAGCCAAGCAAGGATTTCCAGTATACCAACGAAGCCAATATATACCGATTGCAAATCGCCGAAATTTTCCCCGAAGATGGCGGCACCTACACCTGCGAGGCCTTTAACGATGTAGGCGAATCGTTCAGTACCTGCACTATAAATGTAACAGTGCCTGGAGACGAGCCTAAGCATCCGGCATTTGTGAAATTCCCCACATCAGTTTCACTTCTTGAAGGAGAGGCTACCACATTCGAGTGCGAATTAGATTCAGAGCTTCTTAATTTGGTTTGGGTTAAAGATGGCAAGCCCATTGACGAAACTCTTTCACGATACTCATTTACAAAAGATGACAACCGATACGCTTTTACAGTTGCGAAATGTAACATGGACGATGTTGGCCAATACCAGGCGAAGGCCGTTGCCAGAAAGGGAGAAAGTATATGTGCATTCTCGATAAACGTTCACAACGCCGATGCCTAAGCCAATTTTGCAAGTTGTTATATTTAATTAACCGACTACATAAAATGTGCATATATATTATATACATATGTATTAGGAGTATGCCATAATTAGACTGCTCATGAAAAGTCGCTTTCATCATCCAAACATCTATACATATACATAGGCGTTTATGTATATAAATATATGTAAAGTTTATGCATTTCAAGCATATCGTCCGAAATCGCTCGATATGAGATATTCACGTGCATCCACTTAACTCAAGCATTATATGTAAAATACTATTAAACGCAAAATAACGTATAAGAACAATTAATCCAACTGTCTACCATTACAATTTTACAATTGGCAATGAACTCACAGATACTGTTCGGTAATGACAAATCCTTCGCTGCTTGCGTGACTAATGGCATCCTCAACAATAACATCTAAAACATTAGACATTCAAGTAGTTGATTAATCGTTAATTATCGTACAAAGTTCTGTATAACTTTCAAAATATAAAGACAAATGTGAAATATGCGGGCGGTAATTGACAAAAAAATAAATGTAACATTTTCAAAAAAAAAACTGATTACTTTTTTTGTTAGAGGAAAATAATTGAACTTAGAC'..b'ATCAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAAGGGAAATATGATGGACGTTAATGCACTTCAAACAGTACCAGCACGTGCTTGTTACGCGCGGAGCCCTATTATCAATTTGGGCAAAAAATGCGAGTTTGCGAGGAATATACAAATAACAAATGGAGACGGGACACAAATGAAAATAAAAGGCACAACTAAGAATGAATCAAAAATAAGTTAAAATATTAGTTTTTAATACCGGAATAGAAGTTGAAATGCAAATTAATTGATAAAGGTTGTTATAGTTATTTCAAAGAACGCGAAAGGGCTCGTGCAGACAAAAATTTGATGTACTCGTACATCGTGGCAAATTTAGAGGATAATAATTTCGTGTTAGTCTACGGGAGCGTTGAATGTTAGGCGGTTTAAAAGATCTGCAGAATCAATGTCATCTCTTATAAGATTTTGAATAAAATTAGTACCAAGCATTGTTCTACGATTAACACGTTTAGGTAAATTAAGCAATTGTAATCTACTCTGGTAGGAAGGTAGCCTTACGCTTTGACCTTAGTTAAAAACTAAACTAAAAACTAAACTTAAAAAGTAAACTACGCAGGGCAAATAAAAGAAATTTTTTGTACCGACTCAATACGGTCGAAGTGAAAATATTGTATCTCCAAACCGACGAACAATATTCCAAAATAGGACGAACAATGGAGGTAAAAAAAAATTTGGTCATCAAATTCTTTTGACCAACGCTTTATAAACCCAAGAACACTCATGGTTTTGTTAACAAAGGACATTACGTGGCAGTCAAATTTAAGTTTATGGTCCAGAAGAACACCTAAATCGTTAACTGAATATATACGGTCAAGTGGAGTACTTTTATGAAAGTACCTAATAAACGTAGGAGTACCCCTATAAAAAGTCATAACGTTGCATTTAAGACGGTTCAAAGTTAAAAGGTTGTACTCACACCATACATGAAAACAAATTAATATCTGACTATAAGTTAAATCCCGAAGCTATATCTTATATGATAAACAACGCTTAACACGAGAATGTATTATGATTGAGGGAAGATCGTTAATAAACAAAGTGAACAGCAAAGGGTCCAAAAGACTACCCTGAGGCGCTTCAGATGTCACGTAGATCAATTCTGAAACAGCATTCTTCAATATAACCCTCTGAGTCCTACCATTCAAGTAACAGGAAACCCAAGCTAATCTAAAAGAGAGTGTATGTATAGAGTATAAAAAAGTAAATAAATCAGCAATTTCAGAATCCGTCGATGCCTCCATTGAGTATAGACGTACCGATGAGGGTAATGCCGATGACTTGGCATTAACAATGTTGTAAAACTGTTTTGGATCGTTTGAAAATTAAAATTTACATCGATTTAGATACATCGAATAGCAATATTGTCAAGAACATTAAAATCCGTTCGAGCCACCATATATTTCGGAAAATCTGGTGGTCTACCCGCTTTTTTAATACTTTTTATAAGTCCTAGATTTAAGGTTTTTAAGTCTTTGAAGCCCATTGGTAAACCAAGGAGGCCTGTTTAGGTTTGAAAGAAACCTATCAGGTACGGATTTATTAAAAAACGTATTTTATTAAAAAACGTATTTTAAACTGTATAGAATAGTTCAGTAGCACTTTGAATGTCTGTACAATTTTACAAGGCTGTCCAATTATAATGAGAAATCATATCGTTAAGTTTATTATAGTCACATTTACGAAAACATCTCATTTTAGTTTGAGAAACTAAAGGAGAGAGGGTATCAGAGCAGAGGAAATTGTCAGTTCTATAGTTGGATGATATCCGTCTTCAGGTACAACAAGAGCGTCAATTCTACATACTGTGATTTCAGACGGGTCTGAAACAAACACAAGATCAAATTGTCTTTTTAAGGAGTTTTTTATAAAGCCTACTTGCTGAAACGATAATTCTAAAAGGCCATCCACAAAATCATGGGCGGATAAAGGATAGCGACAAATGAGTCAGTGGGAGGAGACCAAGAAATATCAGGTAGATTAAAGTTACCTAAACTATCAAAAGGTCTCTGTTAGAAAGAAGGGATAAAACTGATTTTATTGCAGACAGATGGTGCTTATAAATTACTAGGTTAGAGCCAGGTGGTCAGAGTCCCCAAACACTTTGATACGCCAAAATTAAACTTATTAGTTTTTTGGCACAGTGTTATTTCCTCTCGGTTTATTTGGAACAAATTTTTTAATTACTTAATCATCATTAAGTAAAAAGCTTTCAGAAAGTAAAACATTAAAAACATTAGGCAGAGCAAATATTTTAAAAGACGATATTCTACGAGCTTATGAAAGTCGAAATTGTTCAACTGCAATATCTTCTGATAAGAATTTTTCACGCATAAATCCCAAAACATCCTCAGATGTGGTATCTGAGGTAAATATAGAAACAAATAATTGCTTCCTTTGTGGACCAACTGAAAGTTTCTTACGCCCCCCAGCAGCAGTCTGAATCTCACCTATATATTCACTATATAGGCATGGTCGGCACCGATTTCTTTGACTTAGCCAGTACAGAAGCTTTTATTCCGGAAACAGGGACTAGCTGTATCAATACGCACAGTTGGTTCGCTTACCCTTGTGTCAACGGGAACTGCTATGGGTTGGATTCCATAGTCGTGTTAACGGCGGTTAAGCTGGCTTTTTTGCGTTTAGGCGACTCGGTTAATAATTTTTATACCCTTGCTGAGGGTATAAAGATTTCAGTCATTTGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGAGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCAAACTTCTAACTGAAATCGGGTCTAATTATTTCAGTTAGAAGTTTGTTTCTGCAAGGGTATAATAGTTGTTTAGGTTTGTTTAATAGCTTGGTTCACGATGATGAGACACTATCGAAAGTCGAAATGTTATATTATCTGCTATCCTGTTTTGAAAATGAAGCGTTAGGAACAGTAAAAGTTTACCAGATCAAGCAGGGAAATAATGATATTCCGTTCCTTATGTTCTTCAAAACCAAGTCCCAACAATGCACGCGCCGTCTACGACAACGTTACGATTTCTAATCGAATCTCTCTACGAACAAATTATAGCTGTAATGTAATGTTATTAATTTCCGCGGTTGCCATTTATGAATTAGAATTTCTTACCCAAATTATTGAGAAACATATTAAATGTATAGCTAGTTTATTTACAGTTATTATACATTAGTTTGTTTTATTATTATCTTAAATATTTACTGAAAATGTTCAAATTTAAATCATATAAAATAATTTTTTTACTGTAGAATGTAACAAAAGTTCGTATTGCGTTCGCAATATTTTATAATTATTATGTTTATTTTTATCAAACGTATAATTAACCAACAGTGCTGTGATCTAATCAAAAGTGACTTATACGCAACAGAAGATTATAATTAAGTTGATAACTGTTTAAAGGTATTAAATTTTGCTACACGCTTTTACTTTTGTATCTTCTTGTATTGGAAATGCTATCACACAGCGTGAGGGAAACTTTGAATTTATTCAAGCAAAACGTAAGGCAAAACGATTAAGGGCTCATTGTTGTAGGATTTTAATTGGAGAACTTGATGCCATTCCTTAAATTGTTGAATCCTGGGTATGTCCTTATCCGCTAAACTTGTTGGAGCAGCGTCTGGAGATGGCCGAATTCCAGTACGATACTCCACGCCGAGTAATGGAAGTTTATTGGTTAACTCTGCCGACTCAGTGGATTTTTGGCTGATGTTACTGATTTCATTGGTTAAGCCAACATGTAAGTTATTATTAAAACATCTGTTACTATCATCACTATTATATTTTGTTTGTGATTCTAGTGATGCTATAGGCGGGGCTGATTTTATACTGGCAACAGTACTTTCAGCACATATTGAATTAAAAGATTGTAGCATGTTGTTGTTTCGAAAATCGTTGCACTCATCCACTGTATAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCATTTTCACATGGGCCAATGTAATATAAATAATTGTGTAATCTAATAAATAAAATAAATAAAAATTTAAACACTCAAAGTCTTTAAAATTAAAAATAAGTTCTTTCAAAATTTGGTAAAATTGCGGAATAAATGTTATCGAATATCGCAATTTTATGTCACTATCGATATTTCAGTGTGACCGCTTGAATTATTGGTATAGTAATTGTATAAAAAGTATATTTTTATAGGAAGCGGTATAAATTATCGATAAATCCGCAGTCACACTGTGCTCTTTAAAAAAATTTGATCAATTCAACGCGGACGTGGGTACGTTTCTAGGGCGTTTTAAATTTGATAATCATTTTTGAGCGGTAACGAATATTAATAAATACCTTATGTTGTGCCTGTTCGTATAAAAATGTAAAATTTCGCCTGATCTTAAGTACAAAATACATAAATAAATTAAGTTGCAGTCGTGGTTTCGACGAATTGTGCTTTGGTGAATAAATATTGCTGCATTAGTATAAGTGTATGTAAATCACAAACAAATATATGAGTGTTTATCGGTATCCGTGTGGAGGCATACATATACATGTACATATGTGCGATCGAAGCTGCGTCGGTACTCGTTGACTGGCCAAAGAATAAAAGCTCGTTCAAGTGTGTTCATAATAAAATATACATACAAAACATGGTGTCTGATTAATTAAAGCGTGTATGCCCCTTAATTGTAAAACACTTCCAATGAGTATTTGTTTCTGATTTAACAGTGTGTTTAAAATAACACATTACTCTATGCCGACGGCATGTTAAATATTTCTTAGTAAACTGAGATTCAGAAAAAATATTCGTATTATTCAAATCTCGGAAGTTAAACAAAATTTTATAGTAAGTACAATTAGTACTATATAAAAAAATGTCGAATTTTTTATTTATTTATTTGTACACTGTTACCAAAAGTTTAAACTTAAGGTACAGGGGGAACCGGCCGTAGTTGCTAAGACTTTCTGCCGCTTTTTGATTTTTTAATTTAAGTGTCTTTTACTTATTTGGTGTTAAATTTTAAAATACCCACTAACTTTTTACTTTAGTTTAAATGTGGAAATCACACTGTATAAAATGTACACTTGTATATGTATGTACGTGTGGGTATACATAGGTGCGTATATGTACATACATGCATACATACGTATATGTGTAAGCATGCTTCTCGATCCTCTGTTTCGAATCTAGAGAGCCGACAGTACTAACACAATAAAACCATAGCACGCACACCCTGAGTTTTGTTTATTTATTTGCTGAAAATACAATTTTCTGTATTCTGTTTTACGCATATATGTTTTGTTTAGACTGTGTCGTTTTCTTCTCTACCTGTTGATATACCACAATTTGTCTCTAAATAGAAACTCGTTGTGTCATTAGTCTTAAGCCGATGCGTATTCTGTTTTTATTGTTTTTGGGATGCCCTAGCGTCCTCGGCAAAGTTTTTACCTTAACTACAAGTTAGCTATTTCCGCCTGCGTGCACTACCTACCTACTTAAAAATCTCGGGCGACGGTTCAACCGCTCAGGCAGGTAGTAAACATAAATGTATACATGTGGCTAAATCCGAAAATTAACAATGGCACATATATATGTATTTGTTTTTCCGGATCATTTAGTTCTCAGGCAAGTAAAAGTCCTTGCGGGCCAACAAAAAATATTTTCAATGGAATGGATGCGCCAATTCGCTTGCACGTTAAAAAAATATTATAGTAGAAAAACAACAAATCATCTAACACCAGTAATGGTGACGTTTTCAACATCTTTCTCTTGCACAAAAATTATGTAAATTTATTTGTACCCTTTTTAATTAGTGTTTATAACACTTATTTACATGACACTTACTATATTTATAGACAATTAGTCAATCTCACTATCATCAATCAAATTAGGAAATACCTTTACCCGTTAGTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTATATTCGTCGGAAAGTATGTAACATGAAGAAAGCGTTACCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCGAGTCTGTGCGTCTGTTCGTCCGTCCGTATGAACGCTGAAATCTCGAAAACTATAAGAGATAAAACAGTCGAACTTGGCATGTAGATTCCGGGGGTTCCTACGCCCACTCTCTCGCCCACAATCCGCGAAAATAGAACAATAATTTTTACTGAAATGTATTTGTCTTATCAATACCTATCGATTGACATAAAAATTTTTTTTCCGACTACAAACCGCCCAAAACTGTGGTGGCCACAGTTGTCATCCTAGACATTTTTTTTGGTAAACTAAATTTGTCACATTAAACCCTTTCGATTGGGCCAAAATAGGAATAGCATGCTTCAGTGATATTGAAAAAAGGTTTTTTTCCAATTATTTCATTGTTTCTCTAATCGTTTCTTTAAATTTAATCCGAAATTCTTGAAAATATAAAAAATGATATTCTCAATATTCTAAGATAATATGCCAAACACCGAAGCTATAATTTGTTCTTATTATTATACCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTTAAATATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTAAAAAAACACCGAAGGTAAACATACACCAAAGATATAATTTTTTTTAAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGAAAAGTTTCAGCACGATAGATTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGAACATGGCTAGATTGACTCGTCTTGTGATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGAGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATCTGAAATCATCACCCTTTGCAAGGGTACAAAAGAGGAATAAAATATTTTTTGTATATCACTGAAGTAAGCAAGAATCCTTAAAAATTTCACATGGTGTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACCGAAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCAAAGCTAACTTCGTTTCTTGTAATTCTGCTATTCAATTTGCTTGGGTTTAGTTGTACGATTTTGATAAAGCCATGTTTGAAATACTGACTGAGTGCAATTTTTTTGAAAAAGTACCATAAATGTACCACTATAGCTACGGAAAAATTAAAATTTTGCAGAACCTTTCAATGAAGATTTTGCTTTGTTGTTGTAAACTGGAAAAGTAAAAAGTTCGATGAAAATCAGATCTTCGGAACAGGGCTGGCACGCTTGTCGGCTTTGACTCATATCAATTTCAACTTGTCTAAGTTACCTTTCTTTTTTCGTTCGTTCTATATAAACTTTTTACCCTTAAAGAGGAATTAATATTTCCTTTTTAGAACAATATCCATCAGGATGCCATAAATTATATTAAGTTTCCCTGTCTCCCTCACTTTTATAGCGAATCAAAAAGATAAGTAATTTGCCAAAGCAAGTCAAACTCACGCCCAATCGAAACTTGTCCTACTAAAAAAGATCATTGAAAACACAACAAAACCGCTAAATTCGTTCTTATCCTTAAAAGCGGAACAGTTTGACATAATTGACATAAGTTTGACAGAAGCAGGCAGCATACCATTAAGGTCTGCACGTTTATGACGATTTCAACTTATTGATCAAATTTGCAACTAAAACGCACTTGCTAAGAATACTGACCACAAAGATTATTAGATGTAAAGCAAATAACTGGTTTTCGTCACCAATTAATTGTTTATTTTTTTTGTTACATTTCAGAAACGTTAAAGATTATGGATCACTTCAAAATACGGTACATTCAAATGCAGCGTTCTGCAGTGAGGGAAGACTTTCGCGGTTGACACAACTTAGGCAATATCAACAAAACCGTTACAAACCTGGAACGGAGTAAAA'..b'ACACAAATAGGGGCGTTTTCCTTTTTAAGGATATACAGAGAGACCGCCCTCTGTGCGAAGTGGTTAAAAGCACTTCGTTCATGACTTGAAACTACCCCCATAAACCTTAATTGTAAGCCTTGGTATTACTCCCTTTACATTTTTTCAGATTTTCCAAAAACGATATGAGCCATTTAGGTAAAAAGATTCAAATAGAACATTTTGTAAACTAGATTTCTTATATATGTATTTTATGCCCTTGCAAAAAGTTTTATAATTTTGGTAAAAAAAAATTTACCACGTTTTCAACCCTGTAAAGAGTATTTTTCATACTCTGCGATCTGAGTTTAAAGTTTATTATTTTTAAACTTTTCATTCGATTTAAACTAATTTAATGCATTTTATCTTAAAAATGTCCCTGGTAGGCCTTTTATCTATACTTTATCATAAAGAATACTTTATTATTTGAAGACAGATAGATAAATAGATTGGCGAGAAATCAGATATAAAGACATGATTTGTCTAAATACCACCGTTTAAATCTTATTTGAATTTTTTTGATTATTGGGAATCCTGATCTTTTGATATACAAAACATTGTTGTAAGATTTACTAGTTCAGGACATATAACACTGCGTGAGCCTGACATTTTGGGTGCGTATCCATACTCTATTTAAGGGACTTGGAATCATTTAAATTGTTATAAGTAGTTCCGCATCAGAAACATGAACTCTATTAATTTTGGGAAAGTAAAAACATATTTTTAGGCGGTCGTCCCGTGTTAAAACGGTAACAACTTAAAATAATTTTTTTATATCATTTTTTTTTTTATATATATTTTTTTTCATTTATATATTTTTTTCTTTATATATTTTTTCTTTACATATTTTAAGGCAATCCACAATCAAGATTTTGTACTTTATATAAAGGAAGTTTAGTACAGTATACGGTATGGTACAAAACAATCCCCTATTGAAATTGATAGTAGTTCACAAAATCCCTTTTAAGGGTTGCGCGACAGACGAGAAAAATGTCAGGGGAGAGCATTGCTAATAGGGCATGACCCCTTCAATGGTTCTACTGCGGGCAAAAAAAAATAACATAATGCCAAAAAACATGTTGCACAACCACATAATAATGACATCTTTCTGTCGCTAGATTAATTCATGGATGCTATCGCTTTCTAAGGGACGCGATATAGCCCGCGGGTTATTGCAGTAACCGTCTCGTCACCCCTCTTAGTTTGAACTCCTGCCGCAGTATAACAATTGAACTTGAAAAGACAACAATAGAACAAATGTTAAGGACAAGAACAAAAGAGACAACACTGAAGCGTAAAATAGAAAGGACAACAAATTTTCAATTAAAATAGAAACGCCTTGGATTTAAATCTAAAATTGTTTAATAATCCTATATATACACATACATTTTACTGTTGATAAGAAAACAAATCAATTCCCTTCTGTACAAAATTTGTATATGACAGCATTAAACTTTTTGTTGTATTTTTAATACAAACGGGACTACTTTTGAAATAATACCCGTTACTCGTACAGTTAAAAGGGTATACTAAGTTGGTCCTTCACAGCGTTTTGATCTTCTGATTAAGATCATGACACCCTCTTCAAGATAATTACAAATTATCTTCGTTGGTTTTGGATCATAGTCTTCCTTACTTTGAGGTATACCTTTTTTTAATGTTTTAAAACATAGAATTTTATCATATAACAAGAAAGAAAGATAATTTCGGGAATAGGAGATTTAAAGATTCTAGACCCTTGCAAATGGAAGCATTATATGTACAGAGGTTTCCGTTCATTAGTAAACTAAAAATAAGAAAGAATGCTATAGTGGAGTGCCTTGATCATCAGATAATTGTTACTAAGATAAAGGGAGCAAAATGCAAATGAATATATAAAAACACTATGTCAATATATGGGAATGTGGGCGTTGGAGTGGTCATGGCACACTTTTCTTTAATGTTCGATAGGTGTTGATGAGACAAATACAATTTAGTTGAATTGTTTTTCTATCAAGAAAACTGTGCAATTCACAGTCTTGGGTGGTTTGTGGGTGTTCAAAAAAATGTTATTCTCCTAGCATAAGAACTGTACGCGCTATATTGTGGGCTTACAGCCGGGGTGGCACCCTGCTGAATGAAACAAACTGGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATTTGCATGTCCCAATGCCCTAGCTTTTGTACGAACAGACGGTCAGGGCTAGATCGACCTGTTACCCACTATTCGACAAATCTAGTATAGAAATTAAAGAAATGAAGAAATTACAGCTTTAAAATAAAGTCGTACGGTTTTTTTTTTTAATTTTATGCGTAATTATAAAAAAAACAAAAAAAAATAGTTTGTCAAAAAAAGCACACAACTTATAATTTTTTATATTTTTAAAAAACGTTTGTTTGATTATACGTATGGAAGCAAAAAGATATAGTTTTTCGATGCAATAAAAATAAAAAATCTTGGGGAGGTTTCAACCTGAAAGTATGATACTGGTACGCGAGGAAATAGCCAAACGGATATGGCTAGATCAACTTACCCAATGCTGCTATGGTGCTATGGGTTCGGTAAAGCTTCCTCCTACTCGCTTTGCTTCTTGTATATCTAAATCTTCCTTTTGCCCCCTTTAGCTAAGTAATGGGTCAAGGCACTCGACTATTGCCTTCTTCTTTTTTCTTATAGAGAGTTAACATTAGAGAATCAGATTCCACTGGGATCCAGACGTATATGCCTTCTCTAAATGGTAATGGTACACTCTTTTTCAGTGTTCATAATATTTTGTTATTTTTGTGAAGATATATTGACGCACCAAAAGTTGATTAAATCGGACCAGCTAATTTCGTTAGCTGAATAACGGGTAAAAATAGTCGAGTAACTCGATTAAAGCGTACTCTATTATTATTATTATTATTTTTTTTTTTTTAGAAAATATTGCTCACATTTCAGAATTCATGTTTTATATTTTTTAAACCTAATTTGCAGGCCTAACTCGACCAGCGATATACCCATTTCCAGGAGGTCAATATCCTTATTCAATGCTAAGTTCTGATATGTCTCAAGTGGCTTCATGGTATGTCTTCTATAAAACGTTTTTAGTTATAATATAAATACCTAGTTTTATTTATAGGCACACGCCCTCTGTATACTCTGCATCTAGTTTTAGGACTCCTTATCCTTCCTCCTTACCGATAAATACTACACTTTCAAGGTAAAAACACGTTTTGTAACATATGTATACTAAGCCACCCATGCTCTTACATTTATCAAGCCATTTTAATACTAGCGCTGTTGTGTAGCTATTATAAATCAATAAGAAGGATAACAATAATAGAGAAATGGTAATAGCAATAAAAGGATTGGCTTAAAGCTTTTTTAATTAATATGAATGATAACGTTCATCGTTAGTGCATATAAACTATTTTGAATTATTATATTTATGATGTATTATGATGATTATAATTATGATGTATGATGTAATAACTGATTTAATTTAATAACTTACACAGGTAGACAGCCATAATTTTCCACGAACCAATTATAGTTTACATGATAATAGATCCTCCTAAGTAAAAGTCCCATAGAAACTTATCTTACCTACAGTTTCCATGGTGTATCTAAGAAGATGAAAACCGATGTTTGCCAACATATGGAAGTATTTTTATACACGTTACTCGCATGGTAAAAAGGTTAACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAAGAGGTAAAAGGAAGCGTTGCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAAGATCACTAGCCGAGCAGTGTTTCTTGTCAGAATGAGATCTCGGACACTATAAAAGCTAGTTGATTCGGACTTGGCATGCAGATTGCTGGGCTTACTGCTTTGCGCCAGCGAGCTGCCATGGCCACAATCCGCAAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGGTAGACAAAATTTTAACTGAAATGATTTTGTCT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATCAATACCTATCGAATGATGTAATAAAATGTTGCCACGCCAACCCTAATGCACACAAACGTCGAACACTCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACATATACTGAAATTCCATTTTTATTTTGATCCCTTAAACTAGAGTAACGGGTATGTGATAGAGGCACTCGACTATAGTGTTCCATAGCATCCAGAGACAGAATAGACTATTTTTTAGTAATGCCGTAATGTATTCGGAGCGTGGTTCAGCAAAAATATGTAAGATAATTCCAATAACGTAGGCAACGTGATTTAATATGAGGACAAACATCGGTTTTTTGTATTATATTATATTATATTTTATTCATGAGGACCCAGCAATCGTGAAAAACTAGGAATGGTTCGTAGAAATTTTACAAAGTTAAAGTCCATCTGGTTTTAGTTTAATATAACACAAATCCAAGTTTGCATCAAAATTATTAGCACGACAGGCATGCAAAATTTTAATCAAGCAATTAATGAGTTTAGTATACCACGTTTTAAATAAAATTATTTTGGTAAAATTGGTAATACACGATTGAAAACATTTTTATAAGGCTCTGCAGGACGACTGCAATGCTTCTAGCCTATACAATTACATTCTTTTTTTTGTAAAATTTTCTCTTCGGTCAGATTTATGTTTATTCCACATATGCATACCTTAAACTTTTTTTTAAATTTATAATATGTTTATGTGGTGGCTGAGTTTTTATTACACGTCCCGTGTAATAACAGTATTCCCATAGAATAGCTCTTATTAATGCTTTATTTGCAGTGACTTCCCTTTCCGATTTTCGCCTAGCCTTTTACCTTCAGTGCACGCCACGTCGCACCATGTTTTAAATGCGCATACTGCTATTGTGGGAGTTAACTCCAAACAAGAATGTGGTGTTCAGGATACAACAACGAACAATAGATATCCAAGGTAAGTGCAGAAAGTGGAAGTTTTTTAACAAAAATGCAATAAACTGGAAAATAACAGAAATTATAAGATAATGATTAATTTAAATTTACTACTGTATGTCTACAAGTTTACAAGTTTTTCCAAAATTAAATTGTTAATTCTGAAGTATTAAACCTTATAATCCCAATCAGGATCACTAGCCAAGTCACCTAGTCATATCTGTCCTTCTGTCCGTCCGTATAATAGCTGAGATCCCAGAAACTATAAAACTAGAATGTTGTTATACACGCATAATACAACGCATACCAATGCGTTCTTGAGATTAAGAAACAGTGGAAGTGTATTTTAGTTGGGTACCACGCCCACTTCAACGTCCATAACGCTAGATCTCGTCTAGGGTTTCAATTTAATGTTTTTGTCCTAAAGTAAATGGAATTTGTTTTTTAATATTAATAACCGTCTACATTCCAACACATACATACATACAACTTTTTCAAAATAATGTGTATAGGCTTAATTTTAGTCCATATCTTAATCTCATTCTCAGTCCCCTCACCTAAGTAACAGGTATTTGATAGTCGATGCTTGATTTAATACATTTTATTTAAGAACTGTTAAGGGGCTTTATAAAGTCGAGTTGTTTATATAAAAATGTTGTTGCAACAAATTATTTCTACTTTAAATTTACTGCGCTTTTGACATTTCAATTTAATGGGTGGGCGATTTACATCCGCCATCTTTAATTTACCAATGGCTTTCTTCAATGCACATACTCCCTTACACAAGCATAAGGTACAAATAGACAGGTTTTCGGATATATATAAACTCACTCATTGGTCCTCTCAGTGACATAGCGCCTGCGCATTTTTGTCAACCCTTAAAATGAACGTTTGAATTTTATTTCCCCTTAGTTTTAAATTTCGAAGTCCTATATTTTCAAAAATTACCAAGTACTTCAAGGATATTAAAATATAAGAATAATTTCAATACATTTTTGTATGCCGCAAATAAGTAAAACCTATATTAAGCTTCTTGTAGACCCCTTCTTACTCTTATTAATAAGAGATAAAACCACACCCACTTCTATGACCAGCCGCCCCATCACAAAAACTATTTATATGGTAATTTCCACAAAAAAGTTAATCAGCCGAAGTTCATTTAAAGAAACTTGCTTATAATAGAAAAATTATAGAATATAGAATAGAATAGAAGAAAAAGTACTTATTATTTGTTTTATTTTAATATTGGCACAAATATAGTGTTTATTTATTTCACTTGTGAGACTTAAACTCTCCACTAAGTAAAAATTCAGGCAAATCAAAAATGTGATCCAGGATCCAAACCGAGTTGATCTAGCCTTGTCAGACTGTCCATGTAAATAATGTGATTTCGGAAACTGAAAACTCGGAATCATTAATTATTTAGTAGATCATATATTACATTTTCGTCACAGAAGTTGATATCAGAACTTTTGATTGTTGTGCCATCGGCACTATATTTTTACCTCGTTAAGAGGTGTTTTTGTTTGATATCAAAAGTTTTTGTTTTATATTTAAACAAATCATGTTAGAAAGGGGTACACATTTTAAAATACCTTTCTAATAACATGTAGCTTTAGTAGTTTATTAGTTTTTAATAATTTGAGAGGACTCCGAGAACATCCGATTTTGGCAGTTGTGGTTATCATAGGACGCGTATTTTAATTAGGAATACAAATAGGTAGATATCACTTTTACACTTTCACCACTTTTTCTCCCACACCAGTTGATTTTCTTAAAGATGGTGTGTAATTATTTTACTTTTTAGATTGATGTTAGCTCGAAACAATCGGTTACTGTAGATTTTCATTACTTCGTGTATATTTGTATAGTAGTCGCCTTCGCACAGCCACACTGGACTGTCGTTCACAGTGATGAATGACCACATTTTTATACTCGTTACTTGTAGAGTAAAAGAGTATACAAGATTCGTGGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAAACTTTTCCGACCCCTTAAAGTACATATTTATATTTAGGATCACTAGTCAAGTCGATCTAGCCATGTCTGGGCTTTCTACGCAGCGCTAGTTTGTTTCAGCGGGGTTCCATTCACCCGCAATAACGCCTACAATCCGCGAAAATCTGTATCGCCTACAGTTTTTATGATAAAAACAAAATTTTAACTGAATTGTGTTTGTCTCATCAATACCTATCGACTGACCAAAAAAGATAGCCACGCCCTAGCTTTGGTGCTATTTGACATATAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAATTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATTGGACGCCTATATCATATAGCGGTCATAGGAACAATCGGGAAATTATTTGGAAAATAATATGAAAAAATGATTCACTAAAGTTGATTATTATATAACTGCTCGGGTATACAAACTTCGGCTTATGTGCTAACGCCATTAATTTCATCGTTTTTAGTCGATGTATATTTTTTCTTTTTCCATACCTGTAACTGCATTATAGCTTTTTGAAACACCATTCTCGCTACGTTACGCAATTTATTCCAAAGCTCATGATACTAATATCGACCGTCCCTAAAACTTTCAAGCATATCCAGTTTCAAAACCGTAAGGCCAGACTAGCTTTGAAAATACTTTGTACGTAAAATATTCGTACGAAGTATACAATCCTGTAAATTTACATGTAAAGAATATCTCGAAATGTACACCAATATATGTCTACGTAAAAACAAACAATTTTTTCTTAATGTAACCTTCTAAATTTATATTACTATGTCAACTCTAATACATAATCGTCTAGTAATTAAAATATGTTTTATTTGATTTGCAACAGGGTTACAAATAATAATATGGATGAGAGTTTGCTATAAAATGAGCGTGTGCGCAATAGCTCTTACGCAGTTATTTTAATTCGTGTCGCTGAGTTGGCTTGGTCTCTTGTTCGGATAGAGTTCGTACCTTTATCGTTAAGTTTTATTTGTAATGGCCGAAAGAGAGTAATTCGGAAAATTGTTGTGACAGTATATACAATTTTG'..b'TAATAACAGAATAGATGACAATTTTATCATCTGTAGTATTTTAAAGCAACAACTAACCCTAAAACGGGTACCGCTCCAACAAACACAACTTGCCAAGGAAGATAGTTCATTCAAAACTTTATTTAAGTAACCCATTTGTTCTCATATTTTTACAATTTGCAACAAACTACAAAATTACAGTTTTACCATGGTACACGCGTTATAGGTTCACCTTAAAATTTTTTTTAGATGAGTTCCAGACATAACGACAAAGCTCAGGCACAAATCAAAATCCACCGCTAGTTTGCGTATTTGATTACGTAAGAATTCTGTCCGAACTTTTCGAAAATTGCGTCGATGAAAAAGCATATAAACCTTTTGTCGCCTAATCAGCAAAACAGTTGAAAAATAGCCTTCGTAGTAAAACACATACGTATTTTTTGATTTAACTGTAATTTTTAAGATTTATATAATGGCTTAACTGATCTTGAGATCTGATCCCAAGATCTTGATTACGTTTTGTCAGACTAATAAATGTATGAGTTAATAAAATGTTCACATAAGTGTTCGTCCGGAGAACAAATAGTACAATCGAACACTTTTTTTCTAATTAAAATATTTATAAAAATAGTTATATTTGAACTATAAGATAATGTGTAAGAAACAGGGCTGTAAGCTAATTAATCCTTCAACGTGAGCTCAATTGGCATTATTGATTTTTTTTTTAAGACATAGACTGTGCCAAGTTATAGGTATTTAAAGCCCTGTTTAAAGACATACACTTCTAAAGCAAATCATTAAATTGGCTAATTATGTATTTCATAATACCGATACATTTTGCCTATTATTATTATATATTATATTTTCGCGAAACATCGCGTTTATCCCACTCCCAGTGGCATGCCTTGGGGCGTGAAGAGCAAGCGAAGTATTACGAGTTGGCGCGAAGGGAGCGACAACTGCACATGCAAATGTATCCCGATTGGAGCTCTCGTACAAATGCCTCTCGGGGCAAGAAACGGAAGCGGAAGCAAGATACCAACGACGGAGGTTAGATACATTTTCATAAACTATTCTACGAAGTAAAGTCAGCTTATATAAAATCAGAAAAGATCAATGTAATATAAATAAAATAATAAATACAAATATGATTATATTGATAGAGCACCTATTCAATTTTGATTCATGCTAAAATTCATGAGTGTAAATAATTCTTTCTCATTTACACATGTAATCGCATATAAATCGGAATTGAATTCGGAAAATTTATTAAACCAAAAAAGATTGGCAAGCGGCATACATAAACTATTGTCAGTATAGAAGTATTCAAAATTCAATAGAAACCCGATTAGCAAACTTATAAGAAAAAGCTGTATGTGGATAAAAACATGTGTTAAATTCAAATATTTACTTAAGTGGCATGAAAATGTAAATAATTATTATTTCCCTGTACAATAAAATTTATGTATTGCATGTATAAGATATAAATTAGTAAGTTGTAAATTTAAGAACATTTTAAATTAGCATAGAAACGTCTGCATGTATTTATATATGTAGTCTTTTGTTAAATAAGCTAAGAACATTTAACATTTGTATTCAGTAAATTAAGTAGCCTTAATATTTTTCTCCAGAAATTGAAAGAGTAAAACTTTAAATTTATTTTTTAATTGTTTGTTGAACGAGTTTATAGAGATAACTCATATTAGTGTTTTCTTTATAATCACATCACTAATTATCGCAAAGTAGCTTACTAACAAATCATTTACAATTTCATAATTCACATTTTTTATATATTTAAATTACAATTGCCTTTACTTCCCTAGGTAACAATATGAAAAAATGCCGAGCTCGATTTGGTCTGGATCAACAGAATCAATGGTGCAAACCTTGCAGGTATGTTTCAGCTGGTATACAGTGCCTTGTACCTACATTTTTCAAACGTTACTACAAAGGACATTACAAGATTCACGCAAGCTTTATTTTTCTAATAAAATAAATAAAAAAACTGTCATTTGTTTTTGTTTTGCTTTTCGGATAACTTAGGTGATATCACGCAATTAAATTGTTTTGTTTAATATTAAATGCGTTACCGACATACACAAAAGTAAAAGTAGCCTGTTCAGCATACAAAATGAACACTGTACACTCTGTCCAAGTGTATGTAGCAATTAAGCTGTTGTTTGAGGTTTTTATATAAATCTAATTTGGATACAAACCCCAAAGTGTTTAATATTTTCTAATTCTTATAGTTAGGAAATATCTAAAAAAAAATAAATAAAATAAAATTTTGTATGAAGAAACAAATATTATTATAGAAACCAATTTTTAACAGGTTTATATACTGTATAAAGGAAAATTAATTAAATGTCATTAAGAGAACATTGTTGTTTGTGTGCGTGAACTGATAAACAAAAGATTGCTATGTGAGATAGAGGCATTTTTGCCCACATTTGATTGGCATGAACACCTAGCCCTAAAAGGATTATTCTCGGTGGAAACCCAACATTTTGATAATCGCTCAAAAAAAAAGATTATAGATAAAAGAAATTTTGTAAAAAAAAATACAATAGCGGTTCTCCAAAAGTCATAAGATTGTCACAGGTTGCTTATAATGGATATATGCTTATAAGCCAGAAATAAAAGAGCAATTGATTGTGGAGGTCTTTGAATAGGGATCAAATCATACTAAAATCGATTGTGGTAAAAGCACTTCGAAGCCAATGGTCGCCTGTTTCCTCGGTAAAACAGGTCATTGGACGACTATTACGCTTAAGTCTGGCACACCAGAACTTGTTTGCTTGAAGTCTTCGAAGAAAATCGAAAAATAAACAAAGAAAAGAAGCAAATATTTGTTTTTAGATTTACCCCAGATACCACATTTGAGGATTTTTTGAAATTTATACGTGAAAAATTCCCATTCGAAGATATTGCAGTTGAATAATTTCGATTTGCATACGCCCGTAGGACGTCGTCTTTTAAAATATTTTCCCTTCACTGTGCCAAAAAAAACTAAATATGAAGCTACCCAAGCTTTATGCTAACTCCTCTGCATTTACTGAAGATATTTTAGCTTTTACGGAAGCTTGGCGGAAACCAGGGATATCCGACTCTGAAGTTCTGTCTAATAATTGTAATTCTTATAGGACCGATTGCCACATTTCTAAGTGTGAAAGTTTCCTTGCAATCTTTACCTGTTTTTGTTACATGTTCTTATATTCCACCTGACTCTGACCTAGTAATTTATGAGCACCATCTGTCTGCAATAAAATCTGTTTTATCCCTTTTTTCTAACAGTGACCTTTTGATGATTTAGGTGGTTCTGATTTCTGATTTAGGTGACTTAATATACCTGATATTCATCGGTCTCCTCCTACTGACTCATTTGTTGCTATGCCTTTATCCGCCCAAGATTTTGCGGATGGTCTTTTAGTATTATCGATACAGCAAGTAAGCATTATAAAAAATTCCTTAAGAAGACAATTAGATCTGAAATCACAGTATGTAGAATTGACGCTCTTGTTATACCTCTACCCATATCAACCAACTATGGAACTGACATTTTGCCTCCCCTGCTCTGATACCCTTCCTTCTTTAGTTTCTCCAACTAAAATGAAATGTTTTCATGAATGTGACTATAACAAACTTAACGATATGATTTCTCATTATAATTTGACAGTCTTGTACAATTGTACAGGCATTGAAAGTGCCACTGAACTATTCTATACAGTCTTAAATACGTTTTATAATGAATGCGCACCTGATGGGTTTCTTTCAATCCTAAACAGACCTCCTTGGTTTACCAATGCGCTTTAAAGACTTAACCTTAAATCTAACACTTATAAAAAGTATAAAAAATCGGGTAGACCAGTAGATTTTTCGAAATATGTTGTGGCTTGAAAAGATTTTAATGTTCTCAACAGTCATTGCTACTCTATGTATCTAAGTCGATGTAAATTTGAATTTTCAAACGATCCGAAACAGTTTTACAATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/884/ba0/c4/scaffold_4-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTGTCAATGCCAAGCGTAAGGCATCGGCGTTGCCTTCATCGGTACGTCTAAACTCAATGGAGGCATCGACGGATTCTGAAATAATGTATGCTGATGATGTTAAGCTTTGTTTATCATATAATGATATATATCAAGTGCACATTGACCGAGTCGGTACAAACAAAAAAATTCTTTTATTTTCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCGAAACGTAAGGCTACCTTCTTACCAGAGCAGAATACAATTGCTTAATTTACCTACAATTGTAAATCGTAGAACGAGCTCTTTCGCGTTTTATGTAATAACTTTAATAAACTTTATCATTTAATTTGCATTTCAACTTCTATCCCGGTACTAAAAACATATAATATAATATTTTAACTCATTTGTTTCATTCCTAGATGTGCCTTTTATCCCGTGTTCCGTGTGTCTATTTGTTTCATGTATCTTCCTCGCGAACTCGTATTTTTTTCCCATTGACGGACATAACCAAATTGACTCTACTAGTGAACCTAATCAATAATATATAATATATACCTGTTACATACTTTCCGACGAATTTAATCTACACTTTTATTATACACTTTATGAATAAAGGGGATAAAAAATGTCTTTGTGATCAAAAGGCGATTTTTATTACCTGGGAGTGCTCATTCTAAGGCACGTTTTATTCCAAAGAAGAAAGTAGTAGAAGAGATTTTTTGATGAACATTGTTTTTAAATACATTAAATTATTAAAGTGTAAAAAAAAGCCGGGCTTCGGTTTTTCACATTCACATTTTGAATTGTTTTACTTTTCACAAAACGAAAAATTGTTCTTGCATTGTGAAAAGTAAAAGGCTTTCTACCTAAAATCGTTTTCAGTTGTTAAAAAAAAATAAGCGTTACTCATTGATTCATTACTATTAATTTGCAACCCACACAGTATCTGACCCCTTCCAAACACTAACAAAGTTTACATACATTTTTACAATAGAAACACAGTTTCCATGCAAATTTCTTTGAAGTCCTTTCTGACCATGCGGATTATATCTTATCTAAGTGTCTTAAATCTAATATCAGTTTCTTTTTTAGACAAAAAATAAAAAGCTTGCGTGAATTTTGTTTACATTAAGTGATATACTTTTTAGAAAATATGCACCTATTAGAACTATTATAAAACCGTCCACATTTAAACACACTGACACAAGAACATAGTAGGTATACACCATCATATATACTAAAAAGTTAATTATTACAACCAAGTTCAGGAACATTACTAATAGCACGAAATTCAACCCTCTAGAAAATTTTAATTTGCTTCTAGTATACATTTTTAAGTTATAAATTGTATCAGAAAAACGTCCCTCATACTTTTAACTAGATACTATATATAGATTATAAGTTATTCATATGTTCCCCATTTTTTATTTTAGTAATTTTGGCAAACGCTTACAAGGGTCTAGAGAATGGCAATAATTGGTTATAAATGTATAACTGTTCGGCAGGTTCGGTTTTCTACTAGGCACCGAAAACCTTTTTTGAATTGCTTGAAACTTTTAAAATATTCTCTGAACTTATTTACTGAATAGTAAATGTAGAAAAGTAGATTTATAACCCGTGCAGTTTATCAAAACTTTTAAAGAGGGTTCAATGATTTCAGTCAGATGTCAGAATGTGTACCATGTTCCACAGTGGAGGTAAGGGTTAGGTTTTATGAAAAACCAGTTTTAAGATTAATTTATCCCCTAAGAGCTCTGCGGCACATTGCTTCCTCCTTTAATCCTTTTACCGACATACACTGGTCGGAATTAGAATTTTGACGAAACAAAAGTTAAATATATTCGTAGTTTTAACTTACTTCTTGTGCATCATTTAAAAGATAAGTTAAATACCGTTTGAATGATACAATACTTTTTTAAACCCATTCACTTATCGAAAAAGACAACATTTTTGTAAAAATCGAATTTTTATTTTTTTTTCTCGCCCTAAAACTTAAATTTTTTTAATGCAAAAATAGTAAGTGCAAAAAAATATTTCATAAATCAGTTTGTTTTAAAAAAAAAATGGGTTAAATGAATTTTTCTAAACATTTTCAAAAAAAAAAATATTTTTCACTTTCACGTTTGTACCGTCAAAATACTTATGCCGACCAGTTCATTAACAAAGGATATTTCCGATGCCAAACTGAGACATGTCATGGGTCAAACCCTTATGTACTTAATGTGGGGAAAAAATGACATAATTTTTTTTGGAAAAAGGATTTTTTTTTATTTAAATTTATTGTAATTCACTCCCGATAAAATTCCACTTAAAACGCGTTTGCCTGAGTGGTTTTTGAACAACATACACCCATGCTCGTTTGGGAAACAAGCTAATTTAAATGAACAATTCTCCGCTCAACAAGTAAAATTCAACGATCGCTATTTTGTAGTGGGGTTTAACATAAATCTATTTTATGTTTCTGTTACGAATAGGATATAAAGAGTGTCCTTATTAAGAGAAAAGTTATTATCAAAAAAAGCCTAGTAACAAATATAAAAAATTATTAAATGTATGTTAAAAAAAAGATTGCGTACTATTTTTGTATTGGCTTTTTACTTTTATATCCATGATGTTTGATTTCATTCTTAGCATACACCTTTTGGGACCAGTGGCAAAAAAGGGAAATTCCTCGTTAAAATTAAGTTGGGGTCAAATATAAAAAGAAATTTGAAAACAAATTTTTAGGTAGAGAAGGGAAACACAATAACATATTTTTTCCGCAGCAGTTAAAAGTTTTATTTACCATATCATATGAAATCATATCTTTCACATAACATTAAATTACTGTAATACTATACACGTTTAAAGCGCTAGAAGGAAAGATAGTATTTTATAGCTTATTTTATCTGCAGGTACAGAAGCAGAAAACTTTTAACAAGGTTATCTGACAACGGATTTGATAAAAAAATGGCTTTGCGGGGTATACGATTCTGGGAGGTAAATGAGTTTGTTTGCTTGATCTACCTATTTACCAAAAAAGATTATATTGTTGTTAAAGGATTTTTTACTTTTCATTTATTTTGTGTCTCTGTTTTTGTCCAAAATTGTAAGAACGCTAAAGTCGAGTGCCTCGACTTGGGTCTCTGTTTTTGTCAAAAAATTTTAGGATCGCTATAGTCAAGTTCCTCGACTACCAGATACCCGTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTAGAGTAGGCGTGCCACCCCGCTGAAACAAACTTGCACTGCGTAGGAAGCCCAGGAATCTGCATACCAATTATGAATATTCTAGCTCTTATAGTTTCCGATCTCAGCGAGATCTCATCTATAACGACTCCGCTAGTGATCCTAATCAAGAATATATATACTCTATGGGGACAATTTCGACAACAATTATTAAAAATGTAGCATGGTGTTACTAACATTAATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATGCAAACTTCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGGTTATAATATTTATACGCGTTCCTTATAGAGTAAAAGGGTATACTAGAAGGGAGCGTTTCCGTTTTTTATTTTTGGCTCTCTTTATCAGCGTGCCGAATGTGGTGGTAATGACGTCATGTTTAAAAGGCGTTCATAGTATTTCAAAATACCTTTTTTAACGACATATAGCACAAGCTTAAGTAGTTCACAAGTTAAGGGTGTACAAATTGTATCTATTTATCAGGGACCGTAATTATTGTAAGATTTATTTTAAAACTTAAAAAGTAATCATTAATTTTGTCTATCAAATATAATATTTTTTTCTGATTTGCATTTTTATACCCTTGCGAGGATATAATGATTTCAATTTGCAACGCAGTAAAGGAAACCTTTACCACCGACCCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCTCTAAACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTT'..b'ACTGGGAGGAAGTTGTGGAAGCGCTGACGAAAGTAATAAAATAGGGGATGACGACACCGAGTCTTTAAATCAATCTATGCCAAGCCCAGGCTGTCTAAGTGGATTGTCCAGTTTACAGAGCCCATCGACAACAATGAGTTTGGCGAGCCCACTTAATATGAATACCAACACTGCAACTAATGCTCTTTTGATCGTCAACGCAGATCCGCCGACTTCACAACAACGGCCAACATCTGTGTCTACATCAGGATCGAGTAGTGGGTCAACTAGTAGCATCAGCACAACCCCAAATACCTCAAGTACAGTTTCGCCAGTTACAGGTACGACGGGTCCATCACCAAGTTCATCCCATGAAAGGGCCATGATGCTTGGAAATCGATTTAGTCACTTGGGAATGGGGTTGAGCCCTCCAGTAGTTAGCTCAAGTAGCTGTAACCCTGACACATTTTTTCAGCAACATCCCACACTTTGTAATAATGCTATAATTTCATTGCCATCGATTGGTAACAGTAGTTTACACCACTCTTCAATGCCAAACATTTCCCGAAACCCTATTGGTGCTAACCCAAGGGATATTAATAATCCGTTGAGCATTAATCAGTTAACTAAAAGACGTGAATATCAAAATGTTGAATTAATGAAAGATAGTAGCTCACAGACGATTGTCGCTCATGCAGCTACTTCTATTATTCATCATGTGGCGGCACATGGCTATCGCGCGAACCACTCTCTTCTAAATAGCACTTTTAGCCAACATTTCCATCAACAATTAACTAACCATATTGAAACAGCTAAAATGATTGAGCCGACAATGTTGTCGGTGAGTACTCATGCTGTAAATAGCACTGAGTGCCATAAAGGATCAGATCCACAAGCAAATGCATCTGTAAAGACTACAAGCGCTGGCGCTTCCGAAACTGGCGTCATTAGCGTTTCATAACAGATCTAACTGTATTTTTACACTTCATTATTTATAAGTGTGCGAAAAATAATTCCAATAAATAACCGTGCAATAATTATCTTGACATACATTCGCCATCTTATGAAACCAGAGGCCATTTATAAATAGTGCCAAGATTAACATCGCAATATTTCTTCTTTTTTATTTCGACTTTATAATAAGTTCACAAAGTTTTAGGATTTATTCACAAAAACCGATAACATCAACTTAAATAGAGGCCAACTATAAATATTTCTTAAAATAAACCTGAGACAAATCCCAATTTAAGAATGCCAAATAGATCAGTAAATAAACAGACAATATAAATTAACTCTATCAATCCACTACTTACGATAAATGACTTTAATTTTTTTTATGTTTAATTAATGAATTTAAACAATATTATGGAGACATTGCGGTCTAAATACTTACACACAATAATTAATTTTTATTTTTTAGAATAAACTAAATTTTTCTTGAAGATGCCGGTGTCCTAAACATATATGGTCACAAATAAATAGTTAATGCAGCCATTTTCCTATATTTACTGGCTTTTTGTCGTATTCAAATTAAGATCTTTTAATCTTCTTGTTCTGGCTTATGCTTTTATAAGAGTCAATATTTAGTTTCTCAACTCTCTCTTTAAAATGAGATTAAAGTAATGCATGCATATTGTAACGCTTACAAAATTTAAAACTAGGATTTTCTTATGTTGTCATTACCTGTAGCTTTCCTAAATTTGGTTAGACCTACAGTTATCACACAACTTTTTATGTTAATTAAGGTTAGAAAGTCACTTCCATTTGAGGTAATACTGCTTGTGTCTCTATCTGAAGGTTTGTTTTGAAGATGGTGAACATATACCGTACATTTGATAGCCGACACACTCGACTATAGCGATCCTTACTTTAAGCAATGATTGCGGTAAGCTTTACAAATTGGTAATGCTCGCACTTACGCAAAATTCAAGGTTCAGATTAAAATTGCTTTAATAAGATGGTTGACATTTCTGTAAGCATTTAAAGAGCCCTTTTATAATGGGACATAACTTTTTTAACACGAATCCAAACGATAATATTTATTTGGAATAATACTTTTCTTAAACAATTGTTTAATTTCAGCAATAAACTCATAGTTAAAGTCATATATATCACATTATGAATATTTTAATTAATAACATCCATTCGAGATTCCTGACAGTCTTTTTATATGCTGACATTAAAGAGATATTACTTCCATACCAAGTACTTCACATGCACTGGCGAAATTAAAATTTTTTATTTGAAGTTATTTTTAATTCACTTCTAAAAACAAAAGAAATGATAATATAAGCGCCGGTTATTCACATATTTATAAACATTTTTGATTTACAAGAGGTATATTTCGGTAACCAATACGATTTTTCTGAACTTTTTCTGCTAATTTTTTAACAAAATATCATCTGCAAGAAAGAACATTTAATTCATGTTTTTTCAAAATTGATTAAGAATACATTTCAAATGAGATGTGAAATAATATTTATATATACAATATAAAAACAAACAAAATGTAAATAGGTAACATTTTCATATAGAAGTACTGATAATGTTTACGAATTTATTGACCATAAGACCTGATAGCCATTATTCCATTAAAAATTACATTTCTGATAAAAAATACAATTCTTACATTTTAATTTTCACATTTATATGTACTTTTATACTAGTCTGCATTCAGTTATTAAACTTTAAATAAATTGATTTATTGTGTAGAGATGCACGTTTTACGTAAATATTGGTTTTATCGTAAATGTTTGCTGAACATTTATATTATATTAAGCAAAAATGTTTGTTAGTGTGTTTGTAATTCAAATTTTTTCAGTTTTCATTTTCTTAAAATTGTAATATACCTTTACGTTACGTTACGTTATGTACATCTGTACTTAATAAACATGTCATGATTCGTAGGTTTGCAATAATTCAAACAATTTATTATGGGAAACAGAAAGCACTATGACTAGAGCCTAATGTAAATTTAAAACAAACATCATATTTCGTAAAAAATATATGAATGTTTGTTTGTAATAATGAATAAAGTATAATTCAATCGGTTAGGTTGGTAAAAAAATACTACATTCACGGGTTTAATTTTTTGTATATCTAATATAATACTATTTAAATATTTTATAAATATTTTTATGAGACCATTTAAAGTATATGTGAAATAAATATGTAGCTATTCAGTCGGACAATCGAAAAGCAGTAAAAAGTGACAACAATAATAAACACCATGAGATACATCAAATTAAAAGGATCGAATGTTAATGCGAGTTTAGTTTCTTTTATTTTCGCATATTTTTAAATTTTACTTTACGGAACGCAAAAATAGATATTATGCAATTTTTTTTAAAGGAAAACGTAAAAAGTTTTTTGCGTTATGACATGTAACAATTTTAAATCTAAAATTGTGTGAATTAGTAAGTCTTGGTTAAGACCCCACAATTCGTTTTATCAAATGGCATATTACATCACATGCAAACGCAGATGTCAACATGAGAAAAAGCGGGTACCAAAACATCGCAGCAACAGTGGGATGTAAAAACCAAACAAAAGCTTCGTAATTTCCTTTGAGTGGACTAATAATTCTTCTTCTAGGCTAGCCTTACGCAAGACGTTTCAATCGTGCTTTTCTCGGAACCACGATTCTTAGACCGGCAATAACAATAAGCCAAAAGGTTATAACTTTTTTTTACTGTTCTACGTTGTAACATAAAGGTTTTGATCAAAGATTTTTTTTTGATTCGTCGTTAAATGAACATTCTATTTAATTGTGTTAGTTCTTTCGCTCTAAAAGTATATTTTGAGACGCACTTACAGATTACATTTAGTAAGTATTTCTCTATCTGTTGTCTTCCCATAATGGTCTTAGCTGGAGATTTTTAAAAAATTTTGCATAAAAGCAATGTAACTCTTTAGAAAATTGCATTAATTAAAAGTACTATTATTGGTTTTCTTAACCGATATTTGATTTTTATTGCTTTGAAAAATGAAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TATAAGCGGCAAAAAAATATTGTAAAGCGTCACCTACCGGCTATTTCGGTATATGTTTCGGGGCATAAGAGTGAGCTTAGCAAAACATTTTTTAGGTCAATCAAAAAAAAAAAAAAATTTTAACAAAAAAATTTTTTTTTGGCATGTCAACTGTGGCCACCGCAGTATTGGGCGGATGGTGGGAGTAGCACTTTTTTTGGGTAGTTCCAAAGCCATTGTGAAGGCTATTGCGCAAGGATCAGCCGTTTTCTTGCAAAACGCCACAAGATAAAATCTAAATCGTAATCTAAATTCCAGTTGTCACCAGTTATCGTCTAGACGCAGAGCCTGAATTTAGCTAGAGCATAGGGAGGATCAGCTGAAACCAATCGCTTAATATGGCCGAGCGACTTCCAAGCGGGAGAAGAACTATTACAGCTATGAACTTGAGGCTCTAGCCGTCGTGAAATCGTTGGAGCGATTTAAATGCTTCATTTATGGCAAAAAGGTACAAGTTATCACCGACTAAAAACGTCGATGCAGAGGAGAGAACTTATACCCGGGATTGCAAGATGGTGGTTACGTATCCAGGAGTTCGACTTATACTCGTACATCGTTCATCGAGCAGGAACACAGATGAACCACTTAGACGCACTCAGTCGAGCTCCATTCGAAAATGCTCGACGCATAATCGACGAAATGGATTCAAATGGAACAGATTCAGAGATTTGCCGCAGGCATAAAATTGCTAAATTATTCTGACACTGACGAGTATGTAATCGAGAAAGATCGCTTGCTTCAAAAACATAACAACAATTTGTTATGGGTTGTCCGGAAGCACAGGAGGTAATATCCCCACCGGCTCCAACAGATCCAGTTTTCCAAATTAAACCTTTTACACTTTCACCACTTTTTCTCCCACACCAAATGATTTTTTTTAAAGTCTTTGCAATACCTTTCGATTAATGTATCACTCGAAACAATCGGACGATTACTGTAGATTTTCATTACTTCGTGTAAATATATAGTTGTCTCTTTCAGACACCCTCCTGGTGCGCTTCGTCACTACGTGGACTGCGGTCCACGGTGATAAGAAATCAAAACGTTTTTGTAAGTACAAATTAAGAAATAAATAATAATAAATTAAAATAAATCAACACAATTTTGTTTTAGTTTCAAGCAAAATTTTTCTTGTGACTCATTTAAATTAGCTTTGTTTTTTTCAATTGTTAATTTATTTGTATTCATATTTTAGGATACCTCCGATAAATTAAATTTCATTTATCCACTGTTTGCTGGCAAAAATGTGCCAACTACGATTTTGGTAGTCGTCTACATAGGCCCCTGTGCTGAAAAAATCGAGAAAAAATTACCCTCGATGGACCGAGATTTTTTAGGAATATACGTGCAGAAGATTATCGGCTGAAATGAATGGTTCTTTTGCAATAGAACTTAAAGTTTCGTGTTTTGCTATAAAACCAAGTAGCATTTTTTAGAATTATAAGGTTTGTGCTATAAAAAACAAGTAGGATGTTGCGGTGTTTTGCTTTCCATTCGTTGTTAAAAAAAAGAAGCATTTAAAGCAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCATCTTCAAACGCTTTAATCGAGTGCCTCGACTATTAGATACCCTTTACTCAGCTTAAGGGAGAAAAATAAAAATGGATATATATAAGCAGCAAAGAAATATTCTTAAGCGCAACCTACCGGCTATTTTGGTATATGTTATGTGGGCGACAGACCGTTTAAAGCGTTTTAGCCGTTTGGGGGCATTAGAGTGGGCGTGGAAAATACTTTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTTTATTGAGACAAATACATTTTAGCAAAAAAAATTTCTAGCATGACAACTGTGGCCACCTCAGTTTTCGGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGTCGTTGCAAATATCGATAGGTATTGATGAGACAAATACATTTCATTTTGTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGTATTGTGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCACCCCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGTCTAACGCTTCTAGCTTTTACAGTTTTCGAGAGCTCAGCGTTTATACAGACAGACAGACGGACATGGTTAGATCGACTCGGCTAGTGATCAAGAATATATATACTTTATGGTGTCGAAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTTCGACGAATCTAGTATACTTTCTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATGTAGAAATGTAACATTTTTGTCGTAAAAGTTGATATCAGAACTTTTTTTTGGTGCGACAATCACTATATTTTTACATCATTACGAGGTGTTTTTGATTACTAAATAAACCAGTAATTTCTATAAAATAAATATATTAAAATAAGTTAAATAAGAATAATAATAAAAATGTATCCAAAATTCGGAAATTCTAACGAATACCTGTACTGAAATCAAAATTCCCTCTCCAAAGTGTATAAAAAAATAAGTCAAAAAAAAAATTTTTGTAAAACACAAGTCAGGTACGCTAGAAAATATATTGTAAAACTATCTGTTAAACAAGAATATTTTTGTGTATGTCCGCAAAAATCTTGTTTATAAATATAAAACATGTTCCATGCTCTTAAGTGTGTTTTTCAGAAACAAAAATTTTATATGTATGTGGCTATATTCGTACATATGCTTGTCGGTTGTATACCAAAAATAATGTCTTGTGAACTTCGGAATCTCTTCATGTGTTTTCAGAAAATAATTTTCCTTCTTTTCATATGTACATGCTCTCTCGCCAGGCATTTGATGTTATTTTGAGTGCTCTTATGTTTAACACTGTTAAAAGTTGTAATATAAAATCACTGAACCATTAAAAATGTTATAATAATTACACTTTATAATTTTTCGGGACCTAAAAAATTACATATAATATACACGTACATATCAATTTTGTTGTATATCGCAATCGCACATAAAAAACATGCATTTATAAATAAACGAGTGTGCTTACATAGCTTCTTTACTGGTGTCGGAATAAAATCATTTTTAAATCTCCGTTCAAAAATTTGAAAATATTTTTAGTGTTTAGTCATCTAAAAATTAGTGAAATTAATTTATTGTTCTCTTATGTGTTAAGCATATATGATTATATAAAATTGTTCAAACACAATAGATTATACTACTTCACGCCTTTACAAAGAATATACTGCAGAAAGGAAGTATTTATTGTCACTAAATTATATAATTCACAACGGACTTTATGTGTCAACATAATATGGACTTTCCAAAAAAAAACGAAGAACCCGCCAAGTACATGACGACCTTGAGAAAACCTGTGGCTGCCATAAAAAAGAGGTCAGGACCGTTGAATAAGGCCCTTGAAGAGGTGAATGATAATTTATTTGGATCGCCACCTTCAGATGTTCTTAGCATACGTCAGCAAAATAATTTTGCAAGCAAGCACTCAGGAGGAGTTGCATCTGGCAATAGGCTACGCCGTCGTAGCACAAAAGACAGAGAAAAAAAACGAGAGCGCTGGCTTTTAACACGAAAAACTTGGAGATATATGACAGATGCCGGTCGTAAGCTTATCCCCGATAGCTACCCGGCAGGGTCAGATAACTTTGACTTACTTGAAGAACATTTTCAACGAGTGTGCTTATCTGAACCAAGTTTTATTTTATGGAATCGACGAACCTCTTACCCGGGAGCAATCAACAGCTCTAGGCGAAGATTAAAGCAATTGTCTAGGCACGCATGTTCCAGCCATAAGGAAAATAGCATTGAGACAAAAAATAGTTATTATAACGCAGATCGAACTATCGAACTATTGCAGACGTTTTTAAAACTTCGCGATGCATACAAAACAACAACGCTACTTGGTACAAAAACAGTTAGACCTGACCAAACATCATCGCCTAGTGCACAGAGACCTATTTTTGGCAAAAAGAGTGAAAAAGATCAGACAATGTCCTCGGACATGACTCT'..b'TAAACAATTAAAAACAACATTTCGCGGGCACGTCCGATTCCATACCCAGTCAAAACAAAACCGCCATCGGGCGGTGAGCCTAAATACTTATCGGACTACCCTCGTATCACAATACTATTTACAGTAGATTTTCATTTCTTTGTGTATATATACACTAGCAGGCTTTATGGTGCAAACTGCACGAAAAGTCTTTTGTAACTAAAATCGATCCTGAGCGTACTTATACTTCGTGATACTCGATCTTTGTAGTCCCAGACTTTTCAACAAATTAATTAATAAGGTTTTTCCAGAAATGGCTTTTGACTTTTTTATAGCTCCAAACAACATTGATCAAAACCATCAACAGGTAAATTCTTTTTTTGAAACGATCCGTACTTATAAGCTTCTCAAAGTACGTCTCCGAACAGTACAGAAGCAAGTCATTTTTTTCTTACACTAAATATCATATCTAAAATTAAGTACATTTAAAATAGTTTTTTTATTTTGTCGAATATAAAATCATTTTCGTCACAAACGTCCACTATCGAATTAGAAATAATTAGGTGTACACAAGTACTTTGTCTTGCCTGGTTATCGTCTTATCCTTTTCTTTGCCTTTTCTGAACACAATGATTCCTTGGCGAATATATTGTGCGTGTTCTATTTACCATTATGTCATCGCTGTCTAAGATTTTGTGGAACTTCATATCATCATCTGGTATAACAGTGATACTTGACTGAATTGTCAATCATATTCCGAATGATGAAACCTACGTCAGGTTTAGCGATTTCTCTCAAAACTATCTGAGGACCAATTTGACTCCCAACTCCTACGTAGCCTTAAGAGCACACGCCTACGAATCAAACACAATTCAGCAACAAGTCCTTTTAATTCTCAATTTATGCAAATCACCGCTTTTAATTTCAAGCTCGAAGAAAAACACTCTCACGATGGGCTTAAAAGGCTTTATCATTCTGAATGACATTGGTTGCTCTATCTGTTTTGACCTATACTTGTGCCTTACACTGTGCTACTGGTTATTTTGGATGATCACATTTGAAACCTTACCAGTCTCTCTTTTTGCAAAGAAATTGGTTGTGCTATTTCCATAAATGTATGCAGGAATTCCTGCACGGATCTACTCTTTTGCTTCTGTGGATAAACTTCTTTTGAGAATAACTTTATTCCTAACTGCTCGAACAAACCAATTTCCAATTACCTCAGTCTTTGATATTCCTTGTCAACGCACAAAAATACATGTAAGATTTGTTAATAGTTTAAGAATTACCACAGCAGAAAGCGTGAGGAACATATGGAAGAATGTCAAGAAAGTGGGGAAAAATGGCAGCAAAAAAAGGAAAATAAGAAGATTTCGCCAATGATTAAAACCCAATCGATTGCTGGAAATACAAGAACTCTTCAGGAACTTATTCATCAGCTTTCTTTAAAAATAGATGAACAAAGTAATAACAGTTGAACTATTACGGCTGAAGGTTTTGCAAAAATCATCCATGAGTTCCAGTAAAACATTTGTTTGACAATTTCGAGAAGAACGCTCAAGCCTATGATCTGAACATCAAGCAATGTATATACAGGTTCTTGCCAAGATGACAAAAAAAGCAATGTTGTTCTTGGATGTAACCTATGTACGCCAATACTGGGAGCTCTGCAATTTGCTAGAGGCTGAATTCACTATTCACACAATTCGTCAATATATGTTCAGCGCCTACGTTCGGGATCAAAAAAATATAAGCAGGAAACATATTTTGAGTATATTCTGCAGATGAAATTGAATTATAAATGTACGGTCTGTAGTTCGCTACATCATGGATGGCTTAATGTTCAGAAGTGACTTTAAAAACACGCTCTACAGTTGGAATTCCTTCAGAGCTGCAGGAGCCGTATGATGTTTTCGAATGCGTCGGCGCGAAGAGCCCGAATCTGTTTCAACCAAGAGAAGGTATTTGGACGTCAACTCAGAAAGTCTAACACCAAATAAACGAAAGAAAGAGTCACTGATATAATTGTGGATGCTTCAATAATTTGCGAAAGGATTGTAGACATGAAAATCATAGAGGTGGATTGCCTGGTGGATACCGGAGCTGCTGTCTCCATATTGAGCAACAGGGTCTTTGATCAAATTCCGAACGTCACCCTTGAGGGATGTTCGTCAAAGCTGCGCAGATTGGTAAAAAGGTTGGTTGCTTTTTGTGTGACGTTGCATTGGATGAGTAAATAACTCAGCACAAGTTCTTACGAGTAGTTGTTCAGGTTGAGGACATCGAGTATGACGTTCTGCTTGGATTTTACTTCGTTTCGAAGCCAAAGGGTGTAGATTCCCAGCCAGAAAACAAATGAGTATTTATAACAATAATAATACAATTTACGAAATCGATGTTACTCTCCAGTCCTCATAGAAAGTGTTGACGCTTATTAAAACCTATACGACCTCTACATAGAAAGATTCACATATAGAAACAACGAAGAATCTTAAGTCGGTGGGAGTGATGCATTTGACTAGTCAGACTCAGATTGCTGAAGGCAGAAGAAAATGAAATTTGGGAATTCGTTTCCAGAAAAACGGCCACGATCGACCTGCTGGTAACCTACTCTAGTAGCTAGCAAAGTGCAACAGTCGGCCGTTGACTTCCAAGATAACTGATAACGAGGAATAGTAATCCAAGGTGTCTTGCTGACGGAAGCCGCAAAACTCCGAGGAAAGGCTACTTTCCCAGGGGCAGTCGTCCACGGAGTCCTATGCCACCAGGATCCGACAGCCGACAGCTGTGTACATCAAATCAATCTAAGCTAAAGTGAACCAAACGGCAATAGACTCATATATTGCAACCGGAAAAGAAATGAAGATTAAAAACATTAGAGGCATTCAAATGCATTGAAACACATTAAAATAAAGTGAATCGATAGACGAAGTACGGATCCTGATGCAAAATTATACAAAAAAAAAATTTCTCCACCATTAAAAAGGGGAAGCCGGTTCCTTTCTTAAACCATACTTCTATAAATATTCGTACAGTCTCATACAGTTTTATAGGCTCCTATTAAGTTTTCAGCGGTGAATATCAACCTTGTAGTCATGTGCTCAATTGTGGTAAATTCGTTTCTTTCCGATAGTAACAAAATTTTCAATTAAATTAATTTCATGTGCCGACATACATATTACGCATAAATTTATAATGTGTAAAAGAAATCAAAACCATTGTATGCTAGAACTTTAACAAGGGGGGTGTGCTGATGCGAGAAGAGAAGCAGGACAAGAACAATGACCAAACTTTCGACGGACAACCTTGGCAATAGGCACGATCCATTGTCACACGAATGTGTGAAGGGGAGGGAATATGGCCGAACCATTGCGATCAAGCGACAGCTAAGCTTGTGGGCAGTGTGGACTAATTTTATTTTTCAGGCACTATAAATATTTATTCTCAATATGTTGGGGAGGAGAGAGAAATCAATATCCCAATGAAGCTTAAGATCGTCCGGATGGTGAGATTCTTCCGTTTCGTCCGTCGCCAAGCCGTTTTGCAATATCCGAGGAGAAGGATGTGTAAGAACAGATCGACGAGTTGTTAGCTACGGGAATCATACACCCATCTACATCAAACTTTACCAGCCGAATAGTTTTGGAAAACAAAAAGGATGGCACACGTCGTTATACGTTGATTTCCGGAAATTAAATTCAATGGTAGATGAACAAAGATATTCTCGCTTTATACATGAATGTTATTCCGCTGATACCGTGGAAAGTTGTTTACAGAAAATGGCTCTAGTCTTGAATACAGCTCGAGCCTTTGGACTGCAGAATAAATGTAATTTTCTGCAAACTCAAATTTTGTTTTTGGTTCGCAACATTGAGAAAGGAAATCTTTGGCCAGGCGAAGACAAAACGGCAGCGGTCAGCAAGTTTTCGAATACCTAAAAACGTCGAGGCAGTTTAAACATTTCCGGCATGGACGGCATTTTTCAGAAAAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTGTTTTCGTTTCGCCATCAAGAAATTCAGACACGATTTGCGGTTAGTCACAGATTGCATTTAAACTCAGTGAGTATGAGCCTCGACTTTGAGAGTGATTGAAGTCAACGTGTTTTGCCTTAGTCGTTGCCCCGACCGGGTATTGCTGGTATCTTTTGCGCTTAAAGTGGGCATCAAAAATGCTGAAGGAAGATACGAAATGTTAAAGGAAATTGTGGAACCTTTATCCGATCGACCATATGAAGAGTTTTAAGGATGTTAATGAAAATTTCTTTTTGGTAGTACCGAAAGCTATGCAGAAGGAAGTTACCACCATACTGTTCATTTTGCTCTCAAAACAACTGTGCACGCTGTACAACAACTTTATTGGATTCCTCATTTCGAGCAAAAATTACACCATATTGTTAAAAACTGTGTTAAGTGCATGCTGTTTAATAGGAAACTTGGCAAAAAGGAAGGACTCCTTAACTGATCATTTGGGTCCAATGGATGCCACCGGAAAACAGTATAAGTACATATTTGCGATGGTAGATGCTTTTACAAAATGTATCTGGCTTTTTCCTACGAAAACCACCATCTGTGAGCAAATCTATATATGCTTATATCTAACAGCAGTAATACCATCAGAAGCAGGAAAATACCAAAAAGAAAGCGTCAGGAAGATATGGAGGAATGTCAAGATAAAGGCGCAAAAATGACAGCAAAAAAAACGGCAGTTGGGAAGATAGAAAAAAAGGGAGTGCAAGTGAAGTAAAAGAAAAAGCACTGACTTGTGTCTTTTTATTTAAGTTTAATCTAATATTTGAATAAAACCGAGTCGAGTAAAACACCTCGCCTCACAAGTATATATTTAATTTAAATGTATAGCTAAAATTGCATTCCGTTATTTTACATTTTTAACTTTTCTTGAAAAAAACTAAATAATTCTGAAAGCTGCATAGAGTTTTAGTATGTACTTAAGAATTCTCCTTGACATTCAACTTTTAAAACTAAAAAAAATGTGGTTCGCCAAGAGTTGTAGGATCAATTTACGCTGAAATTTAACAATTAAACTCTTACAGAAATAAGCCCTTAAATCTTTTAAAAATATTGATTCTTGCAAAGTAACATCGAATCTTAAGTCACTCTATACTGCCCTCTATGTATATACAGTGAATAACTTCATCTTAAACTATTCATGATTATTCAGTTCTAATTGTTAGGAGAGCATTTTTATTTTCCAACTAACGAAAACATAATTTTCAAACGCTGGCTCACCATTTCTTGAAAGTTGATTAGGAAATTTTTTAGACACGATTTTGGATTATATAGGTAAACTTCTATGCAAGCAGGCATCAGGAAAAGATCAATGAAATACCTTTCTAACGACTTATACAATCCTGTAGCTTTAGTAGTTCACAGGTTACGGGTGTACAAAGTTTATTTATACCTGTTTATTTTGCCAAACTTACAAACTATAAGTTTTATTTCGAGAAATCACCCAAAATCTTGTTTTGCGTTTTACTTTTGAACGATGTTGAAAGTTGAGGTGTCATTTGACGCGTACGTTGATTGAAAATACAACTAGTTGAATAAAACGCAGTTTATATATCCACTGGCCAAAACAGATTACATTTTATAAATTTTCACTTTTACACTTTCACAGCTCTTCTTAAACTAATTGATCTTCCTAAACTCTTGGTATGCAATCCTTTTAGTTTTTGCAATACCTTTATAACAATACCTTTATAACAATACCTTTCTAACAATTGGACGATTACTGTAAATTTTTTATAATAACTTTTTGTATTTTAAAGAATTTTACATTGAATTTAATACAAATCGTATGACTCCGACTTATAGCTGTCATAGATACAGTCAGTAAAAAAATAAAACAACTATTTTTAAAAATATTTAAAAAATTGTCCTTTGTTGATTTTGCTCATATTTGCATTGTAAAACTCTGAGATATAGAACATTTTAACGTTTCAGAAATGTATAGCAACAATCCCAAACAATTTATAAAAGTGTTACTAACATTGATTATTCCTTATGACTGCAAGGGTATACAAACTTCCGATTGCCGAATTAAACTTCCTTTATTGTTTTATTTAAAGTCTGAAATCGTTTAAATGCAACTTTGTATTGGAACTGATAAGGAAATTTGAGATATTATTCTTAAATACTTAAAGCGTACTCTGCATCGGAGCGTATTTGAACCTGGAACCCTATCGCACAACATTTCCCGCGCACAATCCAGCTTTTATTAGTATCGAAGTAACTATGGCTTTTTGATTTTTCATTCAATCTAGTATACTCTTAGGGTAAAATTGATCCCAAAAACTTGATCCTATGTGTGGTGTCATTTTCACGAACATTAACTTAATTGACACTTAAAGATTTTTGTTGGGTTTACTAGTGGTATTGGTATAATTTTACATTTGTTTTAATTTGTATGTTTTTGTCAGGACCATGATCAATCACTATGAAGAAATTTTTAAGATATCAGCAGAATTGCTTGATGTTATCTATACCCGAGTGATGGAAGCTTGCCCCGAACAGTTATACGAGTTGATATCAATGAAATTAAATGGATACGAATGGTAAGATCTGTTTGGTATATAATGTTAATAGCAGTGTACATAACCTTGTATCAAGTTGCTTTCCTTTGGATTGGTTGGCTTTCATCTATTAAATCCATTTTTTGAAATTGGGTTTCTATTATTTACTCCTATATACATGCCAACAATGATTAAAATTGAACAATTCACTTAAAATAAGATCAATATTTTGCAAAGTCAATCGAAATTGTACACCGCTAAGCCGCTAGGAACGCAAGAATGGCGGTGGCGCTATAGCTGTTTTGGTAAAAAAAAAATAATTAGCTGGAAGCATAAGTTCAACTTCCCTCCCGCACTGCATGTTGTGAGTAACGGATATCTTTTAGTCGATGCCATCGACTATAAAGTTCTCCCTTGTATGGATTACTTTTATATCATTTCAAGGTTTTAAAAACCATTTTTAACATATTATCGTTTTTTTTAGGAACCTAAATCAATTAGACGATCCGCAGCCAAGCAGTTTAGGAGATGTCATGTTTGAGCCTGCAGTTCAAGAAAAACGGTTTGTATAATTTATTTAACTTTTAAGATTACATCTTCTAAACAATATAACCATAGCCTGGATCATATTAATCATTTAAATGGAAATCAAGAAAAAAAGAATGTTCTAAAAAAATCTTCTAAAAGTAGTTTAATTAATACAAAGAGATGTCAAGAAGAAAACTTTGAAATTTTCACCGCTAGTCTGAAAATACCTGTGCCGGAAAAAGCGCACATACATAGTAAAGAGTCTATAGAATGTAGAGGTCAGTATTCTATAAACTATTTTTTAGTAGCTCATTAAGAACTGTCTTTATACATTTCAAACTTAGATGATAAAACGGCACGCCGAAGAATTTGTCAGCCTCGAATACCAACAGACATTACTACAATGAGTTCAGATGTCGTCGAACTGGAAAAAAAAACGAAAGCAGCTACATCAGATGATATCTATCAATCAGAATTGCGGGAAAAGGCCATTTATAAGCAGCAGCACTTAAAATCTAGCACAAGGCCAGTAAATCAAGGGCTCTAAAAAATCATTATTTAAGACCACTGCAGTCAGCATGGAATTCCACGGACAAAAATTTCACCTTTAAATGCAAGGATAAGGGTCTGGCTATTCACTACGTAATCAAGTTTTCGGTGATGATAGGGTTGCATTCAATACTTAAAACAGGAATTGAAGCGAAATACATTTTTGAATAAATTCTGTAAATAAAAAATATATTTATAAAATGATTATGTAATCATTGTGCTATGATAAATGATAAATCCAATAGCAATGTTTGCAAATTAAAGAGCTTTTTGAAAAATAAATGCAATATCTTAAAAAATATTACTTACTTCCAAAAGGAGTACGTGCTTTTTTCTTACTATTACGATACTTACTATTTTAGTAA'..b'ATCCTCTTTTTCGTCCGTCCTGCAAAGTAACATTTAACTGAATCAAGAAGAAGTTTTATCAGACGGCAATAATATTTTCTCGTTCGTGCATTAAAACACCAGCAGAAAGATCGCTATAGTCGAGTGCCTTGCCTAGCAGTTACTTTTATTTAGCTAAAGGGAGATGAGGTGGATGGAGATATACAAGAAGAAAGTCAGCTATTCCCATGATTTCACACCAATGGCCACTTAGCGTTCATGCTTTCACAAACAGACAGGCATTGCTGACGGGACTGGAGATCCAGATCAAATTGAACATGCTTTATAGGGCCGGAAGCACTTTCTTCAATTTGTCTATTGTACCCATTTGCTCTACGATTAAAGGTATAAAAATGGTCTTTATGTCTTATTCTTCACCAAAATGTAAACATTGCTTGCGCCTAAACAAGTTTTCAAAACATTTTTTCCACTCCGATTAAGACACCTCCAAAACAAGGTTTTTGAAATCTTTAACCGCATCTTATGGCATTTTTCTCTTAATGTGCGGGAATAAAAGGAAGTCATTTGATACAAAGTTAGGTTCTAATTGGCAATCATTAAATTATTACATTATCAAGACAATTTATGGATATGTAATGAGCAAGCTTAATAAACATAAACATTGATACATTTTTAATTAAATACATTTTTAAATATATATATCTTTATTACGCATTAAAATAGAGTGCATTAAACATTTCGTTTCCTGATCATCCAAATTTGTTTTCATACCTGACAACAATGTTAGTAATATCCGATAAATTGAAAATAGTAAATCATTTAAGTGACTTGGGTCGTTTATAGTCCTAAATTTTCACAAGCAAAATATATTACCAACTATTGGTTTAAGCAACGACGGTATATTTACGTAAAAAATTGGAAAAAGTACGAATCTTTACCTGTCCCGATGATGAAGTTTGCAAATAAGAAGAAACGTCCGTCTCGATCATACAGCCTCTTAAAGTATCTGGTATAAACATACCTTAGATAGTGTTTTATTCATCGAATTTATTTATCCGTGGAATCCATTGAAAGGGATCTAAAAATATAACTAAGTTAAAAATATTTTTTAGGGTTTTAATTCTAAGAAACAACAAGTAACACTATTGATTTCACCATTCCACCGATAAGTGTGGTACTTGATGGTGATTTATCGCCTTACAATAAACGTAGTTCATTGGCACATTTCAAGAAAATTATACCTTCTGATACCGTTTACGATAAAAAATTTAGCGTGCCTAACAATGTTGCCTGAACTTATTATGAATATTACATTTAGCTGAAGACTATCATTTAGCTGCCCTAGGAACGATCTGAAAATTGGTGGAAAAATGTAAATGTATGAAAAAAGTAATAGCTTCGGTGTTTTAAGATATATTTTCTTATATTATTGGAAATAAGAATCTTAAATTAAGTTTAATAAAAATCGGACGACTGTAACATATAGCTGTCATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGTAGCGAAGGATACGTTTCCGACCCCATAATATATATATAATATATATATATAGTATATATATATTCATGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATTACCGTCTGTCCGTCTGTACGTCCGTTTCTACACAAACTAGTATCTCAGTTTTAAAGCTACCGGCCTGAAATGAAGTATATATGTCGGAATCGGCCGGATTGGATAACTTTATCTCATCTGGGAACTATCATATAGTCTCCTAAGCTTGGAAATAACATGTTTTTATTAGTTCTAAGTTTTAAATTTATCAAAATCGGACGACTATATCATAAAGCTGCTATAGGAACGATCGGAAAATAATGGGAAAATAGTATAAAACAAATCATATCTTTGGTATTTTGTACCATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATATTTTTAAAGTTCTGAATTTTGACAATATTTTCTATCATAAATTTCTTTTACTGATAACAGTTTCAGGGACTTAAAAAAAGTACCTATCCGGTAGACATGATAACTTTAGACAGAATCATCCAAAAATTATAATCAAAAAAAAAATTTTAATTTTTACAAAGATTAAAAAAAACGACTTTTATTAATATTTTTCGTTTTTAATTTTTTAATCCCCCTCCCCCTTACGACCTGAAGAACATATATTCCAGAGATTATTTTTCCTAATACACACTTCTAATCTAGACTTCTTAAACTAATTTAATATATGAGTAAGCCCAACATAAGTATGTAGTACATAAGTATTGGCGGACACTAAATAGTAATTTGATCCAGTATTATTTACATATTTTTTTTAACATCCCTTAATTAAAATAAAATTATTTAAAGTAATGAAGGACGGTTTAAAAAATTAATGTAGTTTTCAATCGCTTATAGCTAGAGCTTGTGCAATCCGGGCTGTTCCGGCATGCAATATATCCTAGATTTTCAAGAAAATTTAGATCTAAACTGAGAAAATCGAAACAGACAGCCGACAGACATGGCAAGATCAACTTATCTAGTGATGCTGATCAAGGGTAGGAAATATCTGTTACTGCGTTGCGAACAGCTGACCCCAAATAAAATACAAAATGATATCAATATATAATTCTAGCCACAGCAATTTTAAAAGTGATTTACAAAATGTTTGTGCCTGCCTAAATTGTTTTATACAACTAAAAAAATATTACACAATCGAAACTTTTAAACGCCCACATGATAATCAGCTGTATTCTTTCATTTAATAACTTTATGGATTGTAATGTAATAACATATTTGTTCCCTATACGAACAAGGTTTTTCATTTTGTAAAACACACAATTTCATGTTTTTAATGCACATACGTGTATATCTAGAAAGGTCGTAACACAGTCAAGAATGACAGAAAAGCTGTGTTATGCAAAACGAGTACCTAAAGACTAAAATGAAAATTGGCAAATCACAGATGACTGCGTGGATTTCTGTTTTCGTCAACTGCTAGACTCTTTGAGAGACATATGTATGTTCACGAATCCATATTAATCAACAAATACATAACCGTACCAAAGGGCCCGAACCAACAAATCGTTCTAAAAATGGATACTCCTGCTCTGAGCAAACTGGAACTAAATGAGAGAGCTCATTGAAATTCTTAGTGCGCATGTTACAAGCACAGTAAAAATTCAACGTAAGAATCAAGCAGAAATCTTTAATTTGAAGAACAAATTCTAAAACTATAATGAACTCCAAAAACAATTTTCATATAAAATATGATAGATAAAAATGAAAACTGTAAACTGTAAAACTATAAAGGAACCCCAGAAAACAATTATACAAAATAGTTTAATAGCCTTGAAAGTAGTAATCTGTTTTATTATCTATTCAAAATGTATTTATTAAAAGTTTGATTTTAAATACAGAAAATGTTGGTTTTGCTTTCTGGTTTTACGGCTGGCAGTGTTTCATTAATTACAGCGTTTCCTAGCAATATTGCCACATAACCTGTCCATCAGCTATGGTATTTATGTTATTTTTATCTTTAAAAAAATAAAACTTTCTTACCTTTATCACAATTAAATAGTTTTACTTTATAGAAAAACTGTAAAATTACTGCGCCGATTTACTTTTAACTCTAATTACAACGAAACTTTTAAAATAACAATTTAAAGACAAGACCTTTTTAATATCTTTAAAATTAAATTAAAACTATTTTTAGGTCTTGACCGTACAAAATTGCTTAAATGTTTAACTTAAGTATACATAGATTTGCATTCGGGGAAAAGTTTTTAACAGGTAGTAGGAAACGTCTTCGATCCCACTCAGGTCGAGTCGATCTACCGTTTCAATCTGCCCGTTTGATCGCTGTGAAACTATAGAGGCTAGAGACTTTAACCACCCAAAACTGTGGCGCACATGGTTTTAATGTTTTTAGTTCTAGGAAAAATTGAATATTCATTACCAATTAATTATAATTAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8b4/9f3/ce/scaffold_17-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TATTTATTTATTG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGTTCATACCACTAGAATAAAATTATCAATTAAGTGTTTTTAATGTATGCCAATAAAACGGGTAAAAGGCCCAATTGTGCAGCGGCTTGGTAGTGTATTGGTGAAAACAGTTCATTTGCTTTTCCGACCCCATAAGTTATAAATATTCTTGATCGGCATCACCAGCCGAGTCGATGGTTTTTGCTTTTGCTTTCTTAAGCTAAGTAAAAGCACTTCCTTGTTACTTTACTAGTAACGGGCATAAATTATTAATTAATATAATTTTCTTTTTCAATTTGTTTGAAAAGAAATTAAAATAGTAACCAAACTAAAATTTCTTTATTCTTCCTTTATTTTGCAACAGGCTGGGAATTAGTTAATCTTATAGTTTCACAAAAAAATAAGGAAAAACGCTTTCTATCTTGAAAACTTTCACCGCCACAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTACAGTGGGCGTGGCACCCTGCATGCCAAGTCTGACTCTTCAAGCTTTTATAGTTCCCAGATATCCGCGTTCATACGGACGGACGGACAGACGGAAGTGGCTAGATCGACTCGGATAGTGATCCTGATCAAGAGTATATCACTACGGACAGGATAGTAGGCGAAGGCGGCTACTATATATACTCGAAAGAATTAAAATCTAAAATAATCGTCCAAAAATTTACAAAATTTGATTTGCCACTATTAACCTAGTTAGACCCCTCAGCTGTTAAAATAGGATGCTCCGTCCAAAGTAATACGCAATTTTCTGTTTGTTAGTATGTCCGTTTGTCCCAAAATGATGACTTACGATCCTCAACAATTTTAAATTATGTTTAACAGCTCAATAAAAGAAACATTAGTTCTACCACTTTTGAAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAAAACAGCTCTAAATAGCTCAATTTTGTACAGCTTAACTTGTTAACTACTAAAGCTATATGCTTTTATATATTCCGATTTTTGCATCTTTTTTTCAGATTGCTCAAAAACGGCCCTTAAACTTAGAGTTGTATAGTTCTTGAGATTTCTCAACTTTTGACGTATGACACATTGCTGTAAATAGTACCGTTTGAAAGTTATTAATAAAATAATGGCCACATTTACCAGTTCAGAACATTGCCTGAGAATTGAAGTTTTTTGTGCGTATCCAAACTCTATTTGACCTTAAAATTTTCATCACAAAAGTTAGATTTTTACCTCGCTAAGAGGTTTTTTTGATATATACTGTATGGGGTCGGAAGCGCTTCCTTCTGCAAAAAAATGTTTCGGGTTTTCTTTTTTTTAATATATCAACATTTTTCTCAATAATAAAAGAAATAAAGGATATTTTACTTCACGAGATAAACTAGTTTAAAATAGCATAGATCTTTTTTCCAAAAGCATACATTAAATATTTGATGAACACCTGGTCGTAAAAAAATGTTGTTCTAGTTGAATCCCGCACAATATGACAGTAACCCGAAAAAAGCGTCGTCTGAAAGGTGTTAAGGAGAGGTCTTACTTATTCCCCAATGCCCTCTGACTTGGAACTTCATTTCCGGAGATCAAGAGATAGTTACGCTTTTCGTCCCCAGAACATAATGTTAATACTTTCAAAAACCAGGTTTTGGGAGTGTCCTAATCGGCGTGGAAATTGCTTCGACAGTTTATACTTTGTAAAACCATAAAACCACTTTGATAATAAGTATAAATTTTATTATTACGCTAGAAATTAAAATATATATGCCGTTAAATTTAATATGAGAAAAGTACAAGAAAAGTATAACAAGAAAGGAAGTAAACTTCGGCAAGCCAAAGTTTTTATACCCTTGCAGATATCTGCAAGGATTATTGCTAGCTTCAGTGGTATATGATATAGTCTTAATCAAATTTATTTCGAAATTCAAAACTAATTGAACAATTTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTCAGGTTAAAAAACCTCAAATATATTTATTTTTTGTTCCGCACCCCGCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCTGGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTTTGAATGTTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACAGACGGACATGACTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCATGAATATATATGGGGTCTGAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTCCGACGAAAGTAGCATACTTATATAAGCTTTACTTATTGGTTTATTAACATATTTGGATACAATAACAATAGCCATTTGTAGCTTACTTTGTATAATATGTATGTATCGTCCAATCGTGTGCAAATAAATATTCCGGAACCAAAAAGTAAAAAACATAAAAAAGCATGTAAAAACTAAGTTTTTCTTTTTGTTTTATCAGTTAATCGGTTAAGGAAGATGGTTAGCCTACCTATTTCGTCATTCTTTTTTATTTGCCATTTTAATATAAAAAATCCAAAATAATCATTATGAATGAAAAAATAATTAAAAAGAACAACAATAAACATGTTTTTAATAGATTAGATAATAGAGTTCTTAAATTCACAAGAAGTCAAGGAAACGTATTCTTCTTCATGTCTTTATGAAACGAATATCAGAATAAGTAGCCTAGTTCATTTAGTCATACCCGTCGGTCCAAGCGAATGCTAACATCTCCGAAATTATAAAAATAATTAGGAGGATATGGGTCATGCAGATTCTTACATTTCCTGTACAACACAAGTTTGTTTCGTCGAAGTGCCACGCCCACTATTTCTTCTAATACGCGAACTCAATCTGTCTGGAGCCCAAACTTTTGAATATTGTGTCAACATTTAATTTTGTTTTGAATATCAACATGAGAATTATTCTTGGTGAATATCTTTATGAAGGTGTGCCAATGGTTTTAATTTGACCATTTATTTAAATTGATTACCTGAGTAAAGGTTATCTTAAATTCGAGGCACTCAACTAAAGCGATCTCTCTTACTTACCCTTAAACTATTAATTGTTATTCTGAAAACTTAAATTCGATAGCTAAATGCCTTATTCAAAGTTCTCGTAATGTTCTTTTTAACAGAGGAAAGAAAGATTCCGTAAATATTTATTTTAGGTGACGACCAGATTATCTCGTTAAAGTTCGAGACGTGTAAAACTTTCTGAAAGTTTAAGAGCTGAACCAGGGAAGGTCTTCTTTATAGAATCGAAAACACTTTCTTTCACCCATTGCACATTTCTCAACGAATGCTGATATACTTTCCTCTAAAAATTTTAGTCAAAACTTTGCTATACATTATAATAAAAAAGTTTTACACACAATGTGAATAGTTTGTTTAGCATTTATATACACACAAGTGTATCACCACATACATATGTATTTATGTATATTTCGATTAAGAGAACTAACTATTGCTTACTGCTACATTTACACATTTGATATATATGTATCACATTATTTTTTTCATAACATATTTTAAAACCCACTAGGAATTACATGAATTAAATTATATTTAATTATTTTGTTAATAATCTTGGTTTTACATACTTAATTATTAGTTTTTGGGATGACAATTCATGGGTAGAATATTGAGATTTACACATATATATTGTACTTATAACAGTATAAAAAATATTACCAGTTTTGTCCATGCCCTCTTGCAAATATCCAAATCCTACACAGTTTCGGATAAATCCATTATGCACGAGTACGCTTGCTTGCACAAATGCACAAAACAAGTTTTTGGTTTTTTTCACTTCGGATTAAACAGCATATACATACATATGCATTCAGATGTGTACACATAGGCAATACATTTACGTATACTTGGGAAACACAACTAGATGAATAGTTTTGATAACCAATCAACATTATTATCTTCCATTAGAATAAATTCTCACTCTAAACATAAAAATTAAAGATTATTAACATAAACAATTCAACTTATTATCAGGCTCGACTTTTCACTGTGTGCAACACATCTACAAAATGGCGGATTCATAATCGATGAACAGTCGGTG'..b'GCAGAAGTTAGTGTTTTGTCGACACCGGCTGCAAGTAAAAAGCATATAAAAACTACTGTGGGAAAAAAGTATCGAGCATTTTTTTACAATTCTAGTTTACATCCAAAAAATTTCAGATTATATATCGCATTTTCTAGAGTTATTTCGGGCTCCTGTACATGCTGGTGTTTGATTTTTGATTTGGTGGTGGTTTGATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTCGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATAAATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCTGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGCTTGAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTCCCATTGCAGGTAGTATATACGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTAAAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAATATTAAAAACAATTATATTTTCGGTTTTTTTAACACATAACCTTCTAAGCTTGGAAATACCATTTTTTAATTAGTTGTGAATTTCGAATTAAATTTTATCTAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGCCATATAAACAATCGGGAAATTAGTCGGAATAACATGAAAAAATGTATTAGTAAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTATCTTAAACGAGTTATAAAAAATCTTCCGTTTTATTCGTTCTTATGTGAGTGGACTGAAGTTCAGAATGAAAATAGCAGAAATGCAAAGGGCGATAAGATCCCTTTCCGCGGACTTTTTCAGCAATTTTAAGTTGAAATTGGTATTGAGTTTATTCGGGAGATAGAGATGCAGACAAAACTATGGAATGAGATTTGTCTCTAGTTTTTAAAATTAAGAGGAATAATTTCTTACTTTTGTCATTGTCTGGACCTGACATCATTGCTTTTCTTCTAATGACTTTTTTTTTAAGGGCAATCGATTGATATTCAAGAGACGAATACCTTTTAGTTAAATTGGTTTCTCTAGCATAAAAACTGAGACCGCCTAGAATAGGCGTGCAACATTGGCGTTTCAAAGGTGTGCTGCGTAAATCCCAACCCTGTAGCCTTGATAGTTTTCAAAATATCAGCATTCATATGAACGGTATGTGGGTGTTAGAGTGTCGTCAATAATTTCACCTGTTACTCGTATCGTAAAAGGGTGTATAGTAAAAGGATATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTTACAGGTAGAAGGAAGCTTTTTCGACCTTAGAAAGTATGCATGTTCTTGATCGGGATCACTAGCTGAGTCGATCTAGCTATTCCATTCGGACCGTCAGACTTGTAGCGCTTAATTTCACAATAATTTCCATAGGAAAAATTCAGGGTTTGGCGCCACGTAAACTTCTTCAGGGGGTTTAGCGGCAATTTTTTCGACGAAGCGTTCGCTGGAATTTCAGGAAGAAATATTCCCTTAGAAGCGAGCGCAAAACAATTTATTTTTTAAACAAATATATATTTATAAATTTGTTCTTCCAAAACATTTAAAACATAATCAATAGATAAAAACTTAGTTAACGTTGCTAGTGAAATAAAATACAATACTTAAATATGTCAAAATATGAAAGCATTAGCAGGTTGTAACTCTTAAATTGTCCAAATAATAATAAATAATATATGTGTAACGAACGATAACCTTTAATAGCATATACATAAATATATTTTAATGCAAAAAGTAAGTAAAAAAATATTTTTAGGAATTCGGATATTTTAAATATATTGAAATCGAATTTAAAAAAAGTGATTTATTGCATACTATTTTAAAATAATGGTAAGTATATTAAAAAATTGGTAAAGATTTAGTTGTATTTTTAAGAAAAGTAATTAAAACAAATTTAAGTTTGTATAAAAAAACACCAAATTGCAACTCAGGGATGCAACAATTCTATCGAATGCACTTGTCAATCCTCTCTACCGGATCAAAAAAGTATAGTTGCAACTGTTTTTAATGTGTTTCATAACAAAACTATTTTTAACTCTAGTTTTGCTAGCATTGTGACAGTATATTGCAATGGATATAAATGTAAATAAAACTAGTTTTAAAAGTATAACTGTGTTACCGGCGAAGCCTGTAATATTTGTACATGTGTACTTATATGTGTATTCGGTTTGGCGGCGGAATAATTTAATGCAAAATAAAAATGGTTAATCTAACAAAGAGTGTATTAAAGGTATTAACACTAGTTCATTATCATCAAACGGCATATTTTTACATTTTGTATTTATCATATTTACAGAAGCCATAACGTCTGACGGCTCTAGTTTCGGAGACTATACCAAAAATGTCAGTGAGGCGCTTCAAAAGCCAATGAATAGAACCTACAAAGAAGACGCCAGGACTAAGAAAATATTCAAAAAAGACTAAACTAATTTGTAGTTAGCAAACGTTCCTTACTCATATATAAGTATTAAAGGTAAGATAAGTCCAATATGTATTTTTACATTAAAAAAAACCTAAATTAAAATTATTTATTATATGAAAAACAAAAAAATTAAATTCGATTTAAATTTAATTTTGTTATTTTTTTAATGCCATTTTAAAAGAAAGTTTCTCTAAAAAGGCGATGGAAATTCGGGGGGCTAGGCACGAAAAATTAAGACACCTTGAATTTCCCGGGACTTTTTTCTACGTAAAACAAACATTTTGAACAGCCTTAATAAGAGCGAATGGACTTTGTCCACAATGGGGATCTGAAACCTGCAGACCATTTCCATAGAAAAAATGTACAAGTACAGGTCCGACTGGGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTGAGATCGGAAACTATAATAGCTAGCTTTTGCACTGAGAAATCGCGGTTTTTCTAGGATAATTTCTCCGCGAATTGTAAATACTACACGTTGTTACTTTGGCACTTACTTTTTTTGGTCTGAATCAATTGCGTATCCATATGGGCAATTAATGGTAGTGCATTTGTAGCTTCCACGGGTGTTCGTGCATATGTCATTCTACAAATAAATGAGAAAAATATAACTTGTTTTGTTAATGATTGATTAGTCAAAATATCCAAAAATATAAACATCCTCGGAATTATGGGCAGAACTCAAATATATTTGTAAAAGTAACATATATTTCCTGACAAATGACTTCGCGCGACCAAATTATATTCCCAAGAGTAGAAGATAATATGTTAAAAAACACTTAAAATATTTTGTATCATATCGCAAATGACATCATTCCAGCACGCATTCTTTCAATATAAAATGACATCAAAAAGTGTTGGCTCTGTCAATTCCTTTTACACGGGTATGAGGCCAAAAAGATATATTCCATTGGAATGCACCTAGACGCAACAAACTTAACACATTCTAAGTGCACTCTTTTTTAATACATCTGGAAGCAACTAACTAAACACATTGTGGGTGCCCTCTTTTAGTGCACCCGTAACATGTACACAGGAATGCACTATCGCTTTCAAAAATCAAATAAGCTTTCGCAAATAATAGATAAATTTATATGGATTTCAATTTTTTTTAATTTTAATTTTTATTTCAATATTTAAATTTAATCGGACTTGCTTTTCTTTTGTACGGAGGCTTGCTTGATGATTATCTGTTTGCTTTTTTTCACTTCCTCTTTACTTCTTGCCCTTGGTGTGCACACCCCTTTCTTGCGATTCTGAAAGATATGATAATAATAAAATATTATATACATACATACATTAATTACATATATTAATTACGAATATACAATTCCTTCGGTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAATCAGAAAGTATAAAACAGGTAAAAGGAAGCATTTCCGATCTTATCAAGTATACATACATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGGAAGTATAAGAGCTAGAATATTCATACTTGGCATGCAGATTCCTCGCTTCCTACGAACGTTTGTTCAGCGGAGTGCCACGCCCTTTCTAATCCGCGATAATCTGTAGCGCCTAAAGTTTTTATGATAAAAATTGTAACTTAAAATGTATTTGTCTCATCAATACCTATCGACTCACCAAATTAAAAGGCTGCCACGGCCACTCTAACGCGCACAAATGGCCAAAACGTTTAAATCTGTCTGCCTCCCACATAACATCCACTGAAATTGCCGGTAGGTGGCGCCATAAAATATAGCTTTTCTGCTTATATATCTTCATTTCCATTTTGCTCTCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTATTTTCACTTTATTGTTCATATTGAACTAAATTAACTACGCTTAACTGATCTACATTACATACACTTGACTTACCTGTAAATGTACCTATACGATGCAAGAATGTTACGTTTTAATTGCAACTGAGAAATGCAAGAGACGAGATAAACACGAGCTCTTTTGCATGTTCCCTTTTCTCTTCCCTGCAAGCAAAAGGTTGATAATTATATCGCCTATCGTCCAGAAGTCACTTCTTAGTAACATCTGGAAGATAGAAAAACGACAAACATAGACACACGCGATAAAAAAACATTTTACAACAACAAAAAGGTCCGCGATCGTGAAGAAGTAACTTCTTTAAAACTTCTTCTTCTAGATGATAGAACCCATTTTACTAAAACAAAATTATTGGGAAAAATTCCTCGGGTCCACCTTTTGACCCACGCTATTATTTTGAGAATAGAATAGAATGACAATTTTTTTATTTCATATGTAAGTAAATAAAATTATTAATCAGCATTTCCGGTATGCCAAGAACCGTGTCTACAAGCGCCCAAAGGCCTTATAAGATAAATAAATGCAATATAAGGAGGAACGTGTAAAACAAGTTTTTTATTCAGAATTTTCAATCGGGAAAGGCCCTTCTGGTAACTACTTCAAGCGTCTATAAAGTCACTTCCTATTAACTTCCAGAAGTGACTCGGGAAGAAATGTGCCAATTCGGCGTCACTTCTCGGAGTCACTTCGGCGAAACTTCCAAAATCATTTCGGCGATATCGCATTCGGATCGCAGAAACGACTACCGTCGGGAAAAAAATTTGCCTCTTCGGCGGCCCTTGTCGAAGTCACGAAGACACTTCCAGGAGTTACTTTTGCGACACTTCTTGAAGTGACTTCGGTGACACTTCCAGGAGACTTTTCTTTCCGACGGGAGTCACTTCCGAATGCGATATCTCGTACGACAGTTTTCACCTTTTAGAAGTCACTTAGAAGTGCCTTCCGCGATAGAAAATGCTTTCAGGGCTTTTTCTTTGAGTATCAAAAGTATAGTTCCAAACCTTCTTTCGGGTTTCATATTTGTTTTTTAAATTTCCAGTAAAATACACGTGAATGCACTACATTCATATACCACAAGTCTTACATTTCATTGAACTTGGTGAGAACCGTTGCCCTAGAGAAGCTAATAACATCGATGCATCGAACATCGAGATTTTTCGATGTTTTTGTTGATACCGATGTTAACCGATGTTATAAGTTGGCTTATAAACGGTTTTATTATAGTCGAGGCGTACGACTATAGCGTTCGCTTCGTTTCAATCTGTGTTTCCAGTTTTAGCCCTGAACATAGATAGAGGAATTCTAAAAAAAACGAAACCCAGGAAGCTCTGTGGCTCACACTGCTGTTTCGTAACCAGAGTTCCAAAATTTTGTTGTGTGTGTGCAGAGCTAACATTGCTTGTCCAGTCCAAGCTAAAGTTGCCGGAATATTCATTTTAAATAAATGCTGCAAAACGGCAAACTTTTACTGTAAATAATACTAACGCAGGGCAAATTTTTTTGAAAAATAGGTGCATAGCTGAGTAAGTAAAAAGCACAGAAACAGGCTGAAAATCGTGGACTGTATCGACTTGCCTGGTTGTCCACCAAGTTAAAAGTTGTTATCGCAAATTTTAAAATTTATTATCCTTTCTTGACCTAATGCAATACATACCCTGCCTGTACAAACTTGATTATTGGAATTAGTTGCACATTCATCTATATCCCGACACGTGTTCCCGTCTGGAGACAACAAATAACCACGTGGGCAGGAGCATTGGTAGGATCCTGGAGTGTTGATGCATAATCTTTAAAATAATAACAATAAATTTCAGTTGCAATATAATCGATAATTACAAATAAGAAAAATATAATACCGAAGAATCGAAAATAACGTTAAATACATACCCCATACATAGCTTATAATCCTTATGTACTTCGCATTCATTTATGTCATCGCAAGTGCGGTTATCCTGGCCTAGTTGGTACCCGGGGTTACATGTACATCGATATCCTCCCCAAAAATTAACACACTTTTGTTGGCAAAGACCCGGAATTACGTTACACTCATCGATATCAAAACATTGTGTGTTATTGTTGTTGTCAGCTTTCTTTTGAAAACCACTTTTGCACTCACAATAGTAGGACCCTATCGTGTTAAAGCAGTGAGCAGTGGATGGACATACACGTTGATCCTTCGAGCATTCATTTATGTCTTCACATGTTTTACCACCAGAGCTGAGTCGCTTGAGTTCATGACCTATCGGACAAGTGCACACATACCCGCCGTTCCGATTTCGGCAAATTTGGTTTTCTCCGCAGTTGTGTTCTCCACTCTCGCACTCGTCAATGTCTGTCAAGTAAAGAAAAAATGTTAATGTCTCTAATTTATAAGCACCAAACTTAAAGATAAACACTAGTTTGAAGCAAAAAAATGTCCGAATTTGTTATTATAGGTTCCCTTTTTACTCTGCTGTAACTGCTGTTTATGAGATGTTGGGTTTTTGTGTTGTTCAAAGGCATTGCAAAATACCTGTACTCATGAAAGAAATAGTTTATGTAAAGTAGTACAAATCAAAGAACTTTTGTTAACCTTGCAAAGGGTGATTTAAATCAGATGATTTCTATGCAATCGAATTTAAAAAACATAGTTTCGGTATTGCTTGTCATAATAGCTTCTTAAAGTTTCGAATTCAATTTTATTAAATGGGATAGGTAATCTAGGATTGCATACTAGCCCTTAAAGATAAAAAATTGGTTTGAGAGAAAGAGCGGTGAAAGTGTAAAAGTAAAAATTTGGAAAAGTTGATCTGTTCGGGCGGATGAAGGTACATATACACCCCCGCTATTTACCTAGCTTAATATATATATATATCATGATTTGTCTAAATACCACCGTTTAAAAACAATGAACACAAGATTTTATATTCGAATTTTTGTTTAGCTTTTCTTTTGATTTTCCAAAATTGCTCCAACGCACTATGGGAAATTTGACCACTTTTTGTGGCATTAATTAATGTCTTAAAAGCAAAGCAATATTTAAAAGATTTGTTTTTTGAATTAAGTATATAAAATTTAAAGGAAATTAAAAAATTAATATGGGCGTGATTCCGCCTTTTTTTAAAGAAATAATTTTTTTAGAAAAAAAATTCTTTACTGTTTTTTTTTAAAGACTGAACGTTAAATAAAAAAAAAATGTATTGGTATTTTTTTCACCCATTTTTAGGACAAATCGCAATTTTACTTTTAATTACCATTATAATTCTTACAAAAATACTAAAATCCCTTATATCTACGTTAAGTAAGTGAAATGATGTTGTAAAATATTTTTAAATTAATTAATATTTAATAACAAGGAAGGTTACGTATTGTTTTTTTTAAGCTAACGTTGGAAGTGAAACTTACTAGAAAAAAAGCGGGAAATATACTGTATTAGGTAGGGGTCTTAAAAGCCAAATTTTAGCAAAAGTGCACTTTTATACTAACTGAGTCTAATGAGAATTAAATGCTCTACAAGATGAAAAAGGTTTTAGAGGTGGAGCGAGCTGGA'..b'TTAAAACCCTTAGGCAAAAGAAAATTTAACAATTTCATAAACAAAAGTTAAATTGTGGGCCAGTAGGTATTCCTTTCTTTCAGATCTTTTTTATTAGTGGATAATACCGATTTAACGCGAGCTAAGTTTTTAGTATCGCTCTTCGTTGATACTAGAAAAAGAAACGAGTCGGAGGGGGCCATATTGGTCTATATCAGTGTGCGCTTTTAAATAAAATTTTTCAAATGTATAAAGGAGAACAAAATAGAATTGAGCTTTAGTTTCGGGACATTTTTGGATCATCTATTGAACAAATTTAATATAACTACGGTTGGTCGGTTGGTCTTACCATTAAAAAAAGGTTTATTTTATTAGTAGCTTTGAGAAGCTTTTTTAATATCTTACCATCACAATTCCCTGTTTGTGCATTTAAGGTGTAGCCTGTGCCGCAGCTTTGAAGCCTCTAGATAAAATAAGCTTAGTTACAAAGAAAACGTTTATCAAGGTTTTAATACCGTGCATATATATGATCCGATCGTGTTATCACATCTTTGAGTTGGCAGGCAGTTGTGGTTGTTTATTGAACATTCATTTATGTCTATAAAGGACAAACAAATTTGATTAAAACTATTATTAAGAAGAACAAGTCTTACTTACCAACGCACTGATTCGTGGCAGCATCCAATTTGAAGCCAGTTTGGCATGGACAGGAATAGCTGCCCACAGTGTTATTGCATATTTGGTGGTTTATAATATCACAGCTGTTTAACGTGCTATGAGAGCATTCATCAACATCAGTACAACTTCCGTTTTTTAAGATAAACCCATTTTCACATGGTTGTCTCCTCATGGTGCAGTTGGCGCTGCCATCTTTGCATTCGTAATCTAGATTATTAGGATATATATACAAATAAAAACACTTAGTGTTGAATTGTTGTATGGTTATACCCTTGCAGAGGAGGAGACGGTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCTCTAGACTCTCAGATTTAAAGCTATCGCGCTAAAACTTTTCCAAAAGTCTTCATTTTTTCTATATCTTATAGCTCCCATATGAATAATAGAGGAAATAAAAAAAGACCTATCTTCGGTGTTTTTTGACATATAACCTTCAAAGCTTGGAAATAACATTTTTGAATTCTTTCTGAATTTCAATTTTGAAATTTTAATTTTGCCCATGTCGGACGTCTGAGTTAAATAGCTGACATAGGAACGACGGGAAAAGTGGTGGGAAAATAATATGAAACAATTTATAGCTTCAGAGTTTTTTGACATATTTTTTCATAATATTGGGAATATAATTGTTTATATTTTTAAGACTTTCTTAAATAAAATTGGACGACTCTAACACATGGCTGTCAAAGAAACAGCCGGACAAATAGTTAAATATTAACATCATTGAAGCTAGCAACAATCTTTAAAAATTATTACTCTTAGTGCAAAAACCAAAATAACATTCTTGTATCTATTGGATGTTTTTAGTCTGTAAACTGGTGTTTTCAATGGTAAAACTACGGTATTTAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTAATAGAAAATAATCAACATTAGGAAAACCATGTGAAATTTTAAGGGTTGTCGCTGGCTTCAGTGATGTTAAAAAAAAAAGATTTTATTATTTTTCTGACCCTTTCTTTGACATCTGAATGTTAGAATCGTCCGTTTTTTATTAATTTTAATTCGAAATTCTTAAATATATAAAAATGATTTTCCCAATATTATATAATAATAATATGTCAAAAAACACCAAAGCTATAATTTGTTTCATATATTTTCCCACTCATTTTCGGATCTTATTTATGACAGCTAGATGATATTCGGTGTTTTTTAACATAAACCTACGCTTGGAAGTAACAAGTTTTGAATTTTTAATTAAATTTTAGCAAAATCGGACGACTATATCATACAACTGTCATAGGAATTTTATTTGCAATTCTAAAATATGATAAATATATTACTTGTATAAAATCTTTTTTAATGACTTAACTATAAAGTTGTTGGAATTTTCAAATTTTGTTTAGCAAAATGTAGTTTTTGAAAATGCTAAAAAAAGAAATTACGAAGTTAATATTAACTTTTGGACTTTAAAAGCCTAAGCCGCTGTTCCGATCAATATGATTTTCAGATCAATAGTTAATTTTATAGCCTAAAGGCATAAGTTTTATTTTTATAATTGACAATTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCTGTTTGTAGGTGTTAGAGTGGGCGTGACAAATTTTCTTTGGGTCAATCGATAGGTATTGATGAGACAAATACAGTTCAGTTAAAATTTTTTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCTCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTAAGAGTACGCGTGGCATCCCGCTTGCGCTACGCATGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAATTCTTACTGTTCTAGCTCTTATAGTTTACGAGATCTCAGCGGTCATGCGAACGGACGGACATGTCTAGAACGACTCGGCTAGTGATCCTTATCAAGAATATATATACTTTATAGGGTCGGAAATGCTTTTTTTAACATGTTACATATTTTTTGAATATTATAGCTTTATATCACTGAAGTCAGCAACAACTTTAACAATTTCATATTGTGTTACTTAAGTTGATTATTTCTTATAACTGCAATGGTAAACAAACTTCGGCTTGCCGATGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTATACTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTTCTTTTGTAGCTATATTATATAGTCGTCCGAGTTTGATCAAATTTTATTCGAAATTTAGAACTAATTAAAAAATCTTTTTTCCAAGCATATGAGGCTATATGTTAAAAAACACCAAAGATATAAATGAAAAAAATGTTTTTTCCGATAATTCCTAAGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATAATCCTGGTTCCGACTTTTATAGTACCTGTAAAAGACAGCAGACCTTTGGAAAAGTTTCAGTCCAATAGCTTTAGAACTGAGAAATAAGTTTGCGTAGGAACAATCGGGCTGAGATACTAGTTTGCGTAAAAACGGATGGACAGACGGGTTTTTGTGGGTTTTAAAGTGGGCATGGTTCTTTGCTAAAAAAAATTTGCGATGCGTAGGTTTCTCAAGAATAGATTGGTATTGACGAGTACTATACATTTCAGTTGATTTTTTTTCTAGGATTGAAACTGTAGGGTCTAAAGTTTTGGGCGGTTGTAAATAAATAAGGTTTGTAAATATATAATCTTTTTATCGACAAGAAACGGGTAAAAAAGTTTAAAATTAAAAGATGCATACCTTACTTTATGCACATTAAAATCAGCAATATTTTAAAATCTTGACGGTACGATTTCATTCCCCTTATAATTTTCGGTTTTTACATGAAATATAATTTTAGTATAAACAGAAATTTACCTTTACAATCATTGTGTTCATTTCCCGGCGGACAATTTTTGGCATTCACATTTAGGCAGTGGTATCCGCCTTTTGTATTAAGACAGTATTGGGATAACGTACATTCATGAGCATTTTCCCTACATTCATCAATGTCAATGCAGTTGTTTTCCAGTTTGTCTAAACTGTAGCCCCTGGGACATATTTCTGGTTCCACCAAAGAGCATGTTACGTTGTTATCATCTAATTTATATCCGGGGTGGCACTTACATTGATATGCGTCAATCGTGTTTTCGCATATGTGGGCGCAAAGATTTTCAATTTTTCCACATATGTCATCTAAGAATGTAGAGTAAAATGAAATATTAAGATTTTAAGTCAGGCGCATTAACTACTTACCATCATCGGTTAAGACAATAGTACCATTTATGTCCTCTTTAGAATCCAATTGAATCTCGCCACTATCAATTGTAGAATTGTCATTTCTTTTTTTATCTTTATCTGAGTTGTAATACGTATCTGCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/8c2/437/d7/scaffold_13-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CCTTCGTTACAACAAGCTCGATATGATTCGATTGAGGAAAGAAATGAAAATAATGGGTCCTTACAATTGACCTTACTAGCTTTAACTGCCAACCCAATTTGACAAGAACGACAACATGTTGTATAATAAGTAGTAGTCAAATTTTCTTCTCTGTCGCAGCGAGTGCCGTCCAAAGCAGCCAGCCGACCTAGCTCACAACTTTGATGATCCAGTTCTTGAGAACAGCAGACTTCAAGTGTGGAGTGACACAGTCCAAGCCAAAGTTGGGGAATTATTATTGGGGATATATCGATGTTTGTGCAAGAGGAAGTCGTTCGCGCATGCCGAAGCCCACTTATGCAGCATTTTCTTATATAATCCGATATGTTTTCTAAAAAAAAATGTATGTAGCGATAATCTGTGGGACTTATAGGAAACGATACATGAACATACTAATTTAAGCCTTTATCTTCTAAAACTTAAATTTTAAATAATTCATAAAAATATTTCTTACCTATTCAATCAAAAACAGTTTTTGACGAGGTAACTTAAAAGGAGTTTTGATGTCAACTTTTGTAACGAAAATTGAAAGAATCCATTAAATTATTTAAGTCAAAAGTTAGCAAGAAGACGTTTCCAACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCATTAGACGAGTCGATCTAACCGTGTCCGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCTCTCCATCTAAAGCTATCAAGCTGAAACTTTCCCAAAAAGCGGCTTTCTTTTGCGATAGTACATAAGTCGGAACCAACAAGATCGGACAAATAAGTCTTACAGCTCCCACAGAAATTATCGAGAATCTGTTGGTGCCGGTGCGGATAAATATCCCCCAAGGTTTTGGGGGACTTCTCAAAATGACAATTTTATTTTATTTGTCCCAAAACCTTATTTAAGAGTCCTGAAACTTCTGATGATGTTAAACAGCTCAATATAAGAAACATTACTTCTAGCACTTTTGAAAGGACTAGCTTTTTGGCGCGAAAACTGCTGTAATTGGCAAAATTTTGTATATCCATAACTTGTGAAGTACTGAAACAACAGGCTTCTGCTTTATGTCGTTAGAAAGGTATTTCGAAACACTTTGTACGCCTTTTAAAAACGAATTTGTAAATTTCAGCGTTTGAAAACTTTGGCCCAAATTTGTATTTAATTTACTTTTTTTTTTTAGGTTTTTTTTTCTGATTTTAACAAAAACGGCTCTAACGATTTTAAATAAAATGTTAAGGTGTGTAGCCCTTGAGATTCCTCAACTTAAGGATATATTCTTGTAAAAAAATGTTGTTAATCAACAAAAATGGCCACATTACCAGTTCATAACATCTTACACTGCCTTTTTTGCTCGTTTTTCAAGGTCCTGAAATTTAAGATGATGTTAAGCAGCTTAGTAGGAGATACGCTACTTCTACCACTTTTGGAAAAACTAGTTATTTAGGCGTGAAATAAATAAATAGTTTAATTTTGAAACCCGAAATTTGTGAACTACTAAAGCTACATGCTTGTGCTATGTGTCGTTAGAAAAGTATTTTAAAATACTTTGTTCGATTTCCTAACATGATTTAATGATTATGACCAAACGTTTTTTTGTTCCGAGATTATGTAAACTTTTTTCCTACTTCTCAAAAGGGGCTCTAATGAATTCGGTATACATCCATTCTCATATGGTTGTCCGATCCGGAAGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAAAGAAAGAAGACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGGCTAGAACGATCAAGAATATATTTTCTTTATGGGGCCGGAAACGTCCCCTTCACTGCAAACTTCTGACTGAAATAATTATACCCTCTGCAAAAGTATACAAATCGAACGACTTATCATACAGCTTCCATATGAACTATAGAATAATTAACGTACAAATATACGCTTTTTATTGCGTTTTTTGGCAAACATGTTCCGTAGTAAGTTGAAATGGGACGTTATCTTAATATTTCATTAATTTAGTTTAAGTTTTCTAAAAACATAAAGGCATTGACCTACAATGTTCTTACGAAAACGTCCTGAAAGCGTATGGAAACTTCGTCTTGTCAAAGTATGATTACCGAATCAACATATGTATTAAGACCTTCGTATTTTTTGGATATTAATTATCTAGTTTTAATTGTACTCGTTAATCGTAGTGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCAAAATATATGTAACAGGTAAATTGATGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTTATGATCGGGATCACTATTCAAGTCGATCAAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGCTGGAGGATTGGTAATTGGCATACAGATTCCTGGGCTTTCTGTGCAGCGCAAACACTGTAGCGCCTTCAGTGTTATGCTACAGCATAGCACAAATGTAATTTTATAAAAATTGTATAAAAAGGTTGCCACGTCCACGTCTTTGCAAAGGTTTGATCACGATAGCTTGAAAACTAAAAGATTAGTATGCCTAGATCCTGACAGGCGGACGGACAGACCGACCTGGCTGGCTATAAATATGTACTTTATGGGATAGGAATCGAGTCCTACATATATTGCGTTGCTCATTACTGACTAAAATCATTATACCCCCTGTAAGGGGGTGGCCGGTTTGATTTGAAATGTCCGATATGTAGATATATGTATGTACGTGTGTACATACATACACGTGTACAGGGCACATGCATGCATAAATTCATATGTACATACATATGTATTAACACATAAGAATGCAGTTACTTACCATTAGCCAATGCTGCTTTGACTTGCTGTCCAACGATCAATAAACACATTAATCCACATAGTTTATAAAACATATCAATTCCAAAGAAAAACTTGCCAGTCAACAAAATTATAACTGAAAGAGATGAAAGGAGCTATAAATGAACAAGCCTGGCAATGAGTGAAAAACAACGAATGTTCGTGTGCCCACGCTTTCTGGAATTATCTCTCACTCGTAGGCCCCTTAATATGTATGTATGTATGTATACATATGAGTATATATACGTACGAGTGTGTGCATATGCACATAGGAAAGCAAATATACAATTTTAGAACAAAGACACACACGCAGCGGAGTGTGGGCCCCTTGGCAAGATGCACATACTTTTGTAAGTAACGATGTGTATATACATAGGTAAGTAGATATGAGTTCACACATGAAGAAAAACAAGATTCACACGTGTTTGTGTGTTCGTATGTACATATGTACAAACAGTAATTTGTTTAAATAATTACTGTTTGTATAATTTTATCTTTGCACTGAAAGACTAATCACTTCTCGACTCAGGTTGTGGGGGCCGATCTGGAAGAAAAATAGTCCTGCATTTATTGAAGAGTTATTCTTATTAGGTGGTACATTTTATAAAAATGAATTTGCAATTCTTAACCATACAAACATACAATAAGATTTCCATAAGCTTTTTGCCCATTTCTATAGGATATTTAAAAAAAGATATGTATGACCATTTGAATTAGGGGCGTCCGAAACCTGTTTTTGGTGCCCAAAATTTTGAATTCGAACACTTTAAAATGTAATATACCGATCACTTTGTACCCAATTCCGCATATAGTGACGCCGAATTTTTTTCAACATTTTTCATATACCCAGTGACGTGATATTTCGGACCCCAAAAAGTATACATATTCTTGATCAGCATCAGTAGCCAAGTCTATCTAGCAATGTCTGTCTTTCAGTCTGTCCGCCTGTTTATATGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTTGGAAACTATAAGCGCGCGAAGACAACTACTATATTATAGCCGCAGAATTGAAAATCTGCTATTATGGTTCGATCGTTAGGAATGATACACCATTCGGAAGGTGAAAATACGCGTCGAATGACACCTCGTTTGTTGAAATCCAATGTCCCGTTCAAAAGTAATTCCAAAACAAGTTTTTCATCTTTTTCCCAAAATGAATTATTTTAGGGTTTTTGGAACCCTATGGGTAATTGAGTTACTTGAGGTAAAAAACATTTGTTCTACGACTTTTGGAAAACCCCGCTAATTTGGCGGAAAATCAAAAAAAGCCAGATTTAAAATGTGAATGATTTCTAAACAACTAATGCTACGATAACTACGATGCTACGATGAATATAATAATTTTAGAGTTAAGACATAAAGATCTTTTTTAAAACCACTTTTTGACTAGTTTCTCAAAATTGAATCGAAGTATTTATAAGTTTTTTATCGACTTAAACTTTTTAAAAATAAATTATTATAAGCCCGTAAAATGGTGTGTATACCAAACCTCGTAGTTAAGTATTACAGCAAAAGCGAGTGGAATTCCCAATTTATAATTGATTTTGAAAACAAGGAAGGAAACTATCCCGTGGAGGCATTGTAGTCGAGAGCTTTCCGATTTTTAGAAAACTGAAAACTAACTACAGAAATACTAAGATTCCGTCTCATTTCAATCAAAGAAACTTAACGGTATTTGTATTATTTTGACAATAATTAACAGATCCTTTCTCTTGAAGTTTTTTATCGACTTTTTTTTTACATTTTTATTCAAAGCTGTAAAATAACAAAAGAATTATATTCCCAACAGTAGAAGTTAATATTTAAAATTTTTAAAATGGTTTTGGGAATGTATCCTGAAAGCTTCAAAACTGAGGACTAGTTTGACGAATAAAATGTTCTCATTCGGCACGCTTCAATAAAATATTTCTTAAATGCGATAACCTGAAATATTTTTGTTAAGCGGGCAGAAAGAGAACATTTTAAAAAGTGTGTTTATTTTGTCGAATAAACAATCATTATTCGTCACAAAAATCGATATTAAAACTTTTATGCGTTTATGCCGTTTATGCCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCTATAGGAACTATTGGAGCAAAAGTTTAAAAAAAATTATATCTTCGCTGTTTTCTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAGATACCATTTTCTAATTAGT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GGTGGATGGTCGTCCTCATCAGGGACACAGACTGAAGCTTAAATCGCATGGTTGTAGCTGGAGCTGCCACTTCACTGGGCAATTAGTCATTCGACCGGAAAAGAAAAAGGGGAGCTTCAGCAAAAATGATCAAACTAAATGTTGTGAGCTCTGAACCCTAACTTTAGCAATTGGATTTAGTATTAAGGCAAGAAATTGGTAGCGCGTCTACTGTAACTCACCAAGGCCGGCGGAAAGTTGAGATTTTATTCTGCGATAGGGCCACAGGTTTATGACAGAATTAAGTAAATAGTAGAAAAGTCAAAATAAAGGCTCGGGTTAAAAAAAATCTTTGGAAATATCGCGCATTAACATCTAAGTTTCATTCATATGTGCAACAATACGCAGGACCTAAAACTTTGAAGCAGCGAAAAAATCATCGAAGCTACGCAATACAAAGAGAAGCTGCCGACCTCTGTTTTAAATGCTATTGATACCAACCGTCGCGTATTTCCGTAAAAAATGTAAATTTTGCACTACGTGTTTAATTTGTTTTAATTCTTTGTGTTTTTAGATTTTATTAAATAGTATTTTAAAGTAAGTTGAAGTTATAACTTTATATAATTTGGCATTTGTACAGCGCCCAAGCCATACCCTTCTTTAATCCAATACAACAAGTGTTGTTGACAGCATCAGTTTCCGCATTTCATTTTGTGTCATTAATTTTGGGGTCGGAGAAACCACATTGTGAAAAATAACAGCTGATCCCCCTTTTCCTTTTGATTTTGTGCTCGACATGCTTGTTCGAATCGTCGACTGGAACTAAATTTTGACATGTGATAAGAATTTTTCAGATAAATCTCGATGAGCAAGGCAATGTGGTGGGCCGAAGTGCTAAGTTCCCATTCTTCTTCACAGAGCTATTCGTGAAAGTTAACTTATGATCATGGTATTAAGATATCTACATAATACCACGCGCTAAGAACTTATTTTGTTCATCCTGAGTTGCAACCCTGCCTGAAATCCCATTGTTACATATATATACATTTTTACTGTTTTCAAAATTATGCATGGGAGTTTTAGCACTTGCATCCTTATTTATGTATATGATTTTTTTTAACCACTCCGTCATGAAACCCCCCACCAAAAGTTTACATTAAAAAAAGTGAAACGCACTTAAAATTTTTGAGTAGAGATAAAGTTCAGGTCTTAGTCATAAACTAGCAGGATTTTCCGATTAACGACAGTCCACTTAGTGGAAAACGCTAACCTTAACAGTATTCGAGAAAATCTGTTGTGATGGTCCGATCGTAACTTGTAATTTTCAATTTGTTTTGGAGAAAAATCAGTATATGTAAATAGTTGTAAAATTTGAGCTGGGGCTGGTGGTGATTAATGCTCGGGTTATTAGCCTAGTTTTATTCTTACGTTTCGAACAACACCTCATTTGTTAAGAATTAAGAATGCCTAATATTTTAGATAATCGTGGGCCTCAAAAATAAAGCATTTTACCTAAAAAAAAGTTTACTACTAAAAAGGTTTTAAATGAATGTTTCTATTATATATTGATGTTGGACCCAACCAAAAAAATTGTGTATGTTTCTATTATATGTACTAGGTACTATTATAAGAAAAACAATTTTTCAGCCGTATATTACTACATTTAATATTTTAGGCCATGTATGACCTAAAAATGGGGTACTTTTTGAAAAAATGTTTTATGTAGGCAGGACTCAAACTTCGAACCCCGAGAACAAAGTAGTTTCGGCACGAACCCATTGTTCCCCTGAGCCAAGTCTATATAATCTTATTTTGTGGCAAAATGCTTCTGTAAGTTAAAAAATATATATTTTGATACTATGTATACTAGTTTAGGCATCAGGCCACGTCTATCTGTTTGTCCCTCCTTATAAACGCTTAGATCTAATAAACTCTGAAAGCTAGAATTTGGAATTTGGAATTTTAGCTGAGTCGATGGCATTGACTATAGCGTTCTCACCTGTTGGTTTAAGTGTCTAACAACTTTAAAGGTGTATATTAATAACTTTTGTTCTACGACTTTTGAAGGAAGCTTTCTTTTGATCTTAAGTGGGTTGGTATTTAAAATGTTTACAACATAGAGGAGAAGATAATGAAGCTAAAAACCAGTTTATTGCTAAAGTAAATCCAATATAATATTCTAAAGAAATCGCTTTGAAATGAAAATAAAGCTTACAGGTATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAGGGTATACTAGATTCGTCAGAAATGATGTAACAGGTTAAGGGAAGCGTTTCCAACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCCGCCTTTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTGGGATCTCGGAAACTGTAAGAGCTAGAATTTTCATACTTGGCATGCAGATTCCCGTGCTTCCTACGCAGCGCAAGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAATCCGCGAAAATCTGTAGCGCCTAGTTTTTATGATATACACAAATTTTTAACTGATTTGTCTCATTAATACCTATCGACTCACCAAAAAAAGTGCCACGCCTACTCAAACGGTTAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCTCACACATAAAATCTACTGAATAGCCGGTAGGCTGCGCCCTAAATATATCGCTTTGCTGCTTATGTATCTCCATTCCCCTTTTGCTTCCTTGAGCTGAGTAACGGGTATCTGACAGTCGAGGCACTCGACTTCCTTGTTGTATCATTAAAGTTCCTTGGCTATACTTGTGTTCATTTTTTACAGTTTCCGCACCACACCATATAAAATAAATTAACGTTTTTTCACACATTCCAGGAAAATCAGATTCGTCACCTTCACAATGCGCCATGAAATTTTTGGCACACGCAATAGGAATGACAAAAAGTCGATACCAGAACATTCCCCTTTGAAGAACCCCGCACTGAATGCCGTCACTAAAATAATGGGAAAAGTGGGGTGGAGGAGGAATGGATTCGTTGGTGCGTGTGACTTCAAAAATCCTAAAAACGTGTCGGACAGGATGTTGAGTGCAAGTAAGCTCAGTGGTGGCTTTTTGGGGGTGGTTAAGGCTCTGGGATGCTGTTACTTGGTGGTTTAATTTCTGTAAATAATAGATACCGAATCTGAAAATGCAGACAGAAACCTGAACAGCCAGACTCTCTTACGGGATTTCTTAAGCTTTAGTCAGAAGCTATGCATTTTTTTAATTGCAAAATGGTTTCAAATCCGTGAACATTTTACTGGATAACCTTCCTTCTAAATATTTTTTTTGTTTTGTAACAATTTAGCATTTTACGTTCAATTATAAGTTTGCCAAATCATCGAATGTTTTAAATTCGATTTTTAAGTTTTTAGGTTGATGCATTTTAAGAGCAAAAGGCTTAGGCCAAAAAATGCAGTAAAGTTGATATCCTCATAAGCCAGCATATGCATACGCAGACGGATAAAAACATACATATATATACACATCTAAGTTTATATAATTTAAGTTTTATTTGCCACCGTTATTATCACTGAATTCAATTCATAAAGTTAAAGGTGCCTCCCATCCATAGCCATCTCTCTCCCACTCAACTCCCATTCGCGAGCTGCACGTTCTTTTTCCAACCCCCATTTCCATTTTCTCATTCCCTATATGTCACTACAGCTATCTCTCTTCGTGACACGGGAAACAGCGGAGTCGTTGGCCCCGTGGACTGCAAAATGAAAGAGACAGGCAGATAAATTTTGTCAAAATGGCTGGTCGATGCTTTCGCCGTTGCTCTTGCCAGTGTTTTTTCGCATGAGAGCTCATTAACGTTTCGCTTGGCTAAGTGCGCGCCTCGTCACTGAAACCAGTTAGTAAAAGAAATTTTTGTTCAAAGTAAAACCGATAGCTACGTCACGATTTGATCATTTCGAATGCAAATTATTCTCAGATTAATAAACTAGGTCGCCATCCGTGGCGCTGCCGCCGGGCTGCGGATCCGTAC'..b'TATATTAGAAACATTATTGTATTAAAAAAAAAAACTAATAATATAGTTTTCTAAGAGTACATTTTTTAATCTTAATAAAAGAGAGCAATTGATATTACTTATAATTTTGTGTATTAAATTACTATTATAACGTAATAACTTAGTTAGTTTAGTTACAGAAATTTAGTCTGTTAAGTCTTATTTTAATATTCAAAACATTTCAATATTTATATTTTTAAAAGTTTATACTGATTTTACTCAAATAGAAAACATTAAATAGTCGAATATGTTTCGCTTTAGAAAGGGTATAGGTGTAATGGGACATGCCAACAGCGAAAAAAAAGATCAGATAATTTAAGTTTGTTATTAAAAGAGGACCAGGCAGTTTAAATTGTGCCTAGCGAAGCATATTTATTATGCTTATAAAAATAATTATACCCGTTACTCGTAGAGAAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAAGTAGGAGGAATCGTTTCCGACTCCATAAAGGATATATATTCTTGATCAGGATCACTAACCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCTGTCTGTCCGTAAGAACGCTGAGATCTCGGAAACTTTGTATAAGAGCTGCAACTGGCATACTTGGCATGCAGATACCTGGGCTTCCTTCGCAGCGCAAGTTTGCTTCAGTGGGGTGCTATGTCCACTCTAACGCCCACAATTCGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATAGAAACAAAATTTTAATTGAATTGTGTTTGTCTCATCAAAACCTATCGACAGACGGTGTAACGCTTAGATCTGTCTGCCGCCCACATAGCTTTGCTGGTTATATATCCCCATTTCCCATTTGTTATCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGCCATTCCACTATTGCATTCTTCCTATTGCATTCTTCCTGAGCATAACAGGTTTAAAGTGTTGTGCATTGATCTAAGTTTAAAGCACGTCTAATTTAAAGGTGTTTATGAGCTTTATACTAAAAAGTTTTGACAATAAAAGACCAGATAAAGTGGTCGTAGAAGCAACTTGCTTTTCTCCAAAGCCTTTAATTTAACTAAACGAGAAACAATGACACAGTGCTGTTAGTCACAAAATGTAGCTGTAAACTGTCAATACATGGCTTGCTTTGATTATTATATTATTAAAAAATTTCATCTTAGCTGGCTTATTAAAATAAGCTTTCACTTGGTCTAGGGAGTCTGAGTCCCTGTCAAAATTAACTTTCACATTGAGCCCCGAGAAAGTAAAAATTTCTTAGCAGGGACTTTTTCTGTTCAAGAAATCTTATCCGGCACTCGAAAAACCGGCCCTAGGTGAGTTAATTCGAATTTCACATAATTTAACGATTTTTGTTGGTAAAGGGTTGTAAAGGGCGAAGAAGGCGTGGCTAAAACTTAATTTATATATTTTTTTCAGCATTAAAATGTAATGAAACATTTGACTAAAATAAGTAATATCTATTTCTTAATATTTGGTTCAGACTTACAATATTCAGCAGACGTTTCGCACCCGAACTCTCACGATAGTACATCGGATGGTAATTCTGAACATAATTCATCTGGAGACGAGGACTCACAAATGCGTTTGCGTCTGAAAAGGAAATTGCAACGGAATCGGACCTCTTTTTCCAATGAACAAATCGACAGTCTCGAAAAAGGTATATATTTATTAAAAATCAAATCTAAATCAAATCTAATTATTAATAATCAAATCATAAACTGACTACATTTGAATGCGGCCATTTTAAAAAACCATTTTAATTTTACGAATAAAAGGAAATTATATACATACATTTTTTTTATTCTAGTTTCGAAAAACATTTTATTGACATGTTTATTTAACTATATTAATTACAATTTGAAGATTATATCGAATTTTTCGCTTCGTGGCTCGGCTTTGTGAATCCCCTGGTTTAACGCCTAATTTTACTGGTTTTTAATATTTTTTTTTAATCAACAGGGTCTGCTACGCTTAAATCACAAACATTTATAATAAGATTATAGCTTAAAGGGATATCATTTAGTTGTCTGGCAGTTATTCGAATGGGCATCCAAGTCTCTACCAAATATAACAGTCAAATTTTCAACCAACGCGGAACATGCTGTTGAAGAGAAAAAGTTAGAAAAAAGATTCCAAAAAACGATGACTGTTAAAGGCACGTTATCCTTTCACTGCTTTATATCAAAAACCCAAAATAAATAAAATAAACTTAAATTAATAATTAAGAAGTGGTAAAATAAATACTCCTTTGATCTTCATTAAATATATTTCCTTTTTTATTTAGAGATTATCAAAAGCTTGTTAAATAACTCAGAAATACAAACGCCATAAGGTTCTAATAGGAGCGAGCGGTTGGCTAGAGAAAATATTAGAGGGCTAGTGAGCTAGTAAGTAGTAACTTCAATATTTCAATATTTTAAAAACAAAAAATGTCTCAAAAAAAAAAAAAACTCATTGAAGGTGACAAATGAGGCCAAATTTAAATATTAAAAACAATTTTTGTGGGTGCAATACTTAAGAAATTTTTTTTTAATTTGAATTTGTTTTTATAAAAAAAATTTTCCATTTATAAAAAAAATTTGTCAAAAAAGAAAAGATTAGAGGATTTTATGCAAAAGTCGAAATTAATCGGATATCTACATATGAAGGTATAGACTTACAAACAGAGGGTACTTTTTGAAAAAGAACTACTTTTCCCAAAAAAATAAACCAAATTTATTAGTAAAAAAATTTTTTTTTTTGTCCAAATCCTGATACTTGTGTTTACTTATTTACCGAATAGTATTTGTAAAAAAAAGTTTCAGGCAAATCAAAAATGTCAACTTAAAAAGGTGTTCGGTTTGTAAAAGAAGGGCCCATAAGGCGAATCCAGCCGGATTAGACAACTATATCTTATAGCTCTCATAGTTTTGTTATGTTAGTACACTCTTCCCGAACATCTGTACCAAGAATTAAGTGTATATCATTCATTGTTTGGTTGTTAGAGGCGTAAGGGATATAAGTGTATCGTGCTCGGCGATTTTGCTATTTTCGGTCTTGACACGACTGGGTTCCTCCTTTGCGACGATTGGGCTTTGGTCTCGTCATTATAACCAAAGCGTTAAAGAAAATTTCATGGCACGAGTAAAGCGATATACAGACATCCAGCAACTTCTCTGATAATGCAAAAGATTGCAAAATTCGCCGAGCACTTATAACCTTTAGAGATTTTTTTTGTTTTATTTTTCTTTATTAACAGACAGATAGCCAATTTTTGATTTGACTTAAAAAATTTCACAAAATATCCCTAATTCTTTTAATATGTAAGTAATCTGTTCCTATAAATAACTGTAATTTAAAAATATAACCTTCATTTGACGTGCATTACAGAATTTGAACGAACGCACTATCCGGATGTTTTTGCGCGCGAAAGACTTGCAGATAAAATTGGTTTGCCAGAGGCACGTATTCAGGTTTGTCTTTCAGTTTTGTTTAATTATATTCTGTTTGTAGCCGTACTTTGCAAAACTCAATTTTTTTTAATTTTTACATTAAACATTTATTTTATTGTATGGATATAAGCTTAATTGTTTTATAAAAATTTATAATTATGAACTTGTCTAGCCAACTTAACTTATAGTCCGAGAAAAACCAATTTTGACCGACAGATATTGTCAAAATAAATCAAATAAAACATAACTTATTTTGCAAATTCAGAACTTTAAGAAAATAAAACTTAAAAATATTTAATAGACAAAACATTGGAGTTAGTTATTAGTTTTAATATTTTACTATTGTCCTACTTTTAAGGATAATAAGCTTAGAACTCATTGTTATGGGAATAATTTCTTCAAAATAAGCCCATATGGCTTAATACGAAATTTGCAGTTTATAAATGATGTAAGTTTTACATAATACTCCGCCGAAAATGTTCAATTATGTAATACAATTTTAAGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TAATTATTTTAATACCATAGTTTTAGGTATTGTATGACCTTGACCCGTTTTTGGACAAGATTTGTTTATTGGTACTATGGTATATGCGGATCCAATTTTAACTTTATATATTAAAATATGTGAGCGCCAGACAGGTGAAAGCGCTTGCAGAAAAATTCCTATAATGGTGTATTGGAAAAGGTGTATTTGTATTTGGCCGCATTTGGCAAGGATTTAATTTTAAAAATACTTATTGAACTTTAAATTAAATTAAGGAAACTTATTAGAAGTTGATTAAACAAAATATTACCTAACAACATTGTTTATAGTCTAATGTTAACATCATAATAATAATAACGTTATTGAATTTGCAAAACACATTTAATTACATACCTTTTCAATCAGCAGCAAAGCAAGATTGTAAAGCGCAACTGAGTCGCATTTTTATTATAAAGTTATGGGAGACAGACAGATATCTAAACATTATGGGCATTAAATAGGGCAAACTTTTTTAGGTCAATCGTTAGGTGTGGAAGAAACTAATAAATTTCAATTAATTTTTTTTATTTAGCATCATTAGCGTATCGAACCATATTAAAATTCTCAATGCCGAAGTCTTCTCGTTTTGCAAAGGGCCTTTTGAGATGTTCGATTTCGAGATGAATTGTTCATGATTCGAATTGCCGTTCTCGACATCGAATTGATCTTGGTTTCGAGATGAATCTTTTTTGAATTGATCTCGGTTTCGAGGTGAATCTTACTTGGATTCAACATCGATTATTTTTGTAATCCCCACGTTGTAGGTGGGGAAGGGTCTTTACAAAGTTTAACGCGCGGCACAGGTCATCGTGACCAATACGTATCAGTTTAAATTAGTTTCCTACACCCAAAAAAAAGCATCATCAATGTGTCCTTATTTAAGTGTCAATGTGATACTATTGAGTGTAAAAAAATATCTGATACGAAGAAGATCTAATTCGCACAATTTTAGTGTCATTTTGATATTTTTGAAAATATGAATTTGATTCATTTTGCTGTCGAATAGACACATTGACACTATTTTGCAGTAATTTCAAACTAATTCGGGGTACAAGAAGGGCATTTTTTGTGTCAAGTTGATACGATCTTAGTATCAATATAACACAAATAAGTTTTTGGTTTTACATCCAAAATTAAACAAATAAATTATTTTTTTAAAATTAAAGTTAATAATCTTATATATATATATATATATTTATATATATATATATAAATATATATATAAATACATATATGCCCGTACACAGTGTATATGGGTAGATACACATTCCTGCGTAAATATGTATGTATGTAACCAACAGCGTTCTAAATATACATACAAATGTATATACATGTTGCTGTATCTGAGAATTGCATAAAACCATTAAAATATTCATTTCTATATGATTAGTAAAATTATATATTACAAAAACACCTCTTAACGAGGTTAAAATATAGTGACTTTTGTGACGCAAATTTAATCTACGGCTTCATTAAAATCGAACAACTAAGCAAAGGCATATTGAATTGCAGAATGTAGTAAATGTAGAAAGTGAAAATGTAATAAATGTATGTAACTATATAAAGCTGAGACAGTATCAGATGTTCTGAACTAGTATATGATGCCATTGGTAATTTTTCCAAAAGTGGTATAATCAATGTTTTATTCTATTAAACTATTTAACATCATTTTAAATTTCCAGGACCTTCAAATAGAGTTTGGATACACACAAAAAAAGGTCAATGCTCAGGCAGTATAACATGTATAACATGCTCTTTAATTTTCAGGACTTAAACTTTCATTTTGAGGGGACCCGAAAATCTTGCTATGCGTATTACTTTTGAACGGAGAATCCGAATTTGACAGTTGAGTGTATTTTAAATGGGGATGCCAGGGGGGATAAAAAACCCTTGCTTTTCACCTAGTAGAATACAACTATGTGAAGAACAAGGGTTTTGGTATGCAATTCTTTTAGTTTTTGCCAAATCTTTCGATGTTCATTTCGTCGTGTATGTATAGTAGTCGCTTTCGCACACCCACCTGGTGCGTTTCGTCACTACGTGGACTGCCGTCCACAGTGATGAGAGCTACTCACCTCATTCAAAGACCACTAATACTGAAATGTTTGATATAGAATAGAAAGACATTTATTGGTATTGAAGAGACCCTGGAATTGGTCAAAATCACACTAATTTTGATCAAATACGATTTTTAATACAATGTAGAATGTTTCTGACACTCATTTAGGATCAAATTGATCCCAAAAAAGTGATCCTAGGTTTATTGTCATTTTCACCCCCGCTTATCAAATTGACACTCAAAGATTTTTTTGGGTCAGCATACACAAAAAAGGAAGTTAGCTTCGGCAGGCCGAAGTTTGTATGCCCTTGCAGTTATAAAAATAGTCAACGTTAGTAACACCATGTTAATTTTTAAGGATTGTTGGTAACTTCAGTAGCATTAAAAAAAATTATATCTATATATGTTAGAGTCAACCGATTTTTATTTAACTTAATTCGAAAAAATATAAAAAGTGTTATTCCCAATATTATAAGATATATGTCAAAAAACACCAAAGCTATATTTTTATTGCTAAATTTTATTTCCAAGCATAGGAGGGTATATGTTGAAAAAAGTGTGATTCCCAATATTATAAGATATATGTCAAAAAACACCAAAGCTATATTTTTATTGCAAAATTTTATTTCCAAGCGTAGGAGGATATGTTGAAAAACACCAATGATATCATTTTTTTTATAGTTGTCCGATCACTCGGTCTCGTATGCACTCATGACAAACTTGTGTCAGTTTCTTCCGATTTTGAAAAAATGTAATTCAAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTATAAAACACACTTTTCTAACATGACTTGTCTAAATACCGTATTTTTAACAAAAATTGACGAAATTTATTTTTTAAAAATACATTTTCTTAATTTTTTACATTTTGCACGCTATTTAACATGCTTTGGTTTAGATTTTTATAAAGCGTTCCGAATGATATTTATAAAGCGTTCCAATTATTGCAATACTTTTTGATTTGTGTATCACTTGCTACGATCGAACTATTACATTAGTATATTACAGTACACTTCCCTTCACAGTGATAATTGTACGTTATTAATGTCTAAGGCTCAATGGTTTAAGGCAGTGCGTGGTTCTTGAAAATGTAGTTTGTAACGTAATTGCACAGCACTTCAACTCTAAGAGTCAAGTGTATGCTACGAAGCGGACGATTTAAAAGTCATCCCTTAAATGTAATATTCACCCCTATGGCTACTGTGTTGTTTATCACAAAATGTTTTTGTCGTCAGTGTGAGATGAAATATTCATCGTTACGCTCTCCATTATTTGTTTAAGTGAATAAAAACAATTTGACTGTAAAAACACTTGAAACTCATTGCGATTTTTCTCATTGAGTAGTAATAACGGGTTCAAATCAGGATTGTAAGTTTGGAGGACCTAAGGGGAAACATGTCAACTGGAGTGGGAGTGGCAACAATAAAGCTAAGCAATAAATGTCACACTCAAAAAATATTAAACATTGTAATCCCTATTCACCCCTTTTGCCTCACTAAAGCTGAAGTTCGCTTTATTTCGTTTGGGTGATGCTGCAAGTTAAACCGCATACAAAGGGTGTTTCGGCTCTTACGATGAAATGCGTGACCAATGAAATAGGTTCATTAGACTGTGACTGTTTGTTAATCAACATACATACACGAATTTTTTTGAATAAACAGTTTTTCCTTGCTGAACCAGGTGCATATGCAAACATTAACTATTTCTTCTAATGTTTTGGTAATACTATAGAAAAGGTGGATTATCTCAAAAATATTAAAAATTTATCCAGTACCGCGATTTCCTAAGATAATCAACGGGAGAAAACGATATAATCAATAGCATCGAGTATTTTATACCCGTAACTTAGCTAAAAGGAG'..b'CATTTACTTAAAAATAGGAAAACGAAGACTATTAATAATTTGTATGATGATGGTGTACAACTCAATGACGCTATAAGACGGAAAAATATCTGCTTTAACTCTACAAAATATATTCTCATGAGCTGAATTAACATGATAATACCGAGCACTTTTTTGTGGCATATACATTTTTAAGAGAAATGAAACGTACTGATTTCAGCAACTTTTTGTTTATGGTAGCATGTATATTGAATATATTCCAATAAATTATTTATACATATGATAAATGATAATGAGAGCCACAATTACAGTTCGCTTGGTTCACTTATTTGTATAGGTGAAAGGTCTTAACACTTTGTTTGTACCCTGTCATAGGGTACTAAACTTTAAAAATCACCGTAATGGCACTCTACTTTTTTTATTCCTCTCTGGTCTCTCCGAGTCTCCATTTCATTTTTTTAAGACTCACATATCCGCTTATGACTCGAACGAAAAAAAACGAAAAAATGAATTATTAGTTAAAATATTTGTGTCTTTAACAATATGTAAAATGAACCATCATTCCTTTTAGGCAGAAGAATAGAAACAATAAATAATTCGAGAAGATATAGTGCTTTCATTGTATTCGACTCATTTTAATATTGCAAATACGAATTATTTATTTATCCTTTCTATGGGTGCTCTTTTAAACGTACATTAAAACCTTGATATTAGGGGCAACACAATTTGAACACACTTTATTTAACATTTGGCCAACTTTTATGTATTTTTAAACGGTTATAAGAAAACGATTCAATCAAACCACGTTATAGTATGGCTGTCTATCATTTCTTTAAAATTAGAACTTTGAATATCTTTACAAACCCGAGGACCAAGTAACTAAGTTTTCACAAAAATAACATTGTCGTTTGTGTGTATATTAAAAAAACCTTTTCAACTTATATAAAAAATAACCGTCAATCTCTTTTGTTTACACACACTAATTTTTTAATTTCTTTGATTTTAGATGTGTTTTCCGTGATGATTAAAATCACAAAATTTTATATCTATGTATATATCGTATCATTAGGAATGTGACTTAGGATCATGAACTGCGGTTCAAAAAAAGCAATACATGAATATTCTTAATCTGCAATCTTTAACATAGGTAAGAAACTATATAAATATTAATCAATTACTTTATTTTAAGTTAAAATTAAAGTCAGTCGATATTTCAGTTGGATTAATTTATCTTGAATATTAAATCTTACAGAGTATTACTTATTTCAAATACATACATACATACAATACCACACTATTTAAGCATTAAATGAGCAAATACGACATTTACAAATGATTTTTATAAATTGCATCTGAAAGAAAAAAAATTTATTATAAATTTATATGTAAACTGATATTGGTAGTGTATAATCTAGTACCACGCTTGTTTTGAAAAAATCGGTGATTATGATAGACTTTATATATAAATATTTTATCTCAACTCAAATTTTTCTTTAATCTCAGCAAAATATGGAAGGTTGAACGTGCCATTAATGAAAATTAGGGTATTTTGAAGATTAAAGTATTTATTGAAATGACCTAAAATCCTATAATCACTACTAAAATAAATTTTAGCTGAAAATGTATATTAGACTGACGCGTAAGAGTGGGTACTAAGTCTTGTTCACTCAAATAAATCTTAATCTGAACTCTAAACTCTAGATATTTTCTATATTTGGATACTTGCCTAAAAAATTATAATACTGCCAAAATTAGTATGAAGTTTAACCTTGGAAACAATGTGGTTTGATATGGAACGTTCCATATATTATCTTATTTGGATACATGGCGAAAAATAATGATAATACTGCCGAAAAAGATAAATCTTGGAAACAATGGGGTTTGATCCCAAGGAGTGCCCTGATTGATATGGAACGTTCCATATATTAAAACAATACTGTTTAGTAGATACAAATTTGTAGAACCATCACCTTATAAATGAGCTCACTTTTGTGTTTCTTATGTCAGCGTGGTAGGATGAGAAAATTCTTATTCTGCCGACATTATGTTATGAACTTGCTCTAATTTAAAAGCCAATCTCTGCTTTTGCGAAAATTCATCCTCTTCAAGTGTAACAGTTAGCTGTTCATTGTACTTCACAGCATATGTGTACAGCTCATGTAGTGCACAGTTTGTATTAAATTCTGTTGTGTGCAGCTGAAACAAGAGAAGTAAAAAATATTTATTCCAGAACAGATTTATGAAGCTTTTGGAAACTAACCCTTGATTCTTCTGCAAGCATAGCATTCATATCCTGATCTGATATTGGGGACATATCGCGAATGTCTCGATAATAACGATCAACCCATTTGCGATACTCTGGTATGTCTTTCGCGTATAGAAGTTTCGAGCTTGGTGAGTCCTTACCTGCGAAAGATTAAAATGTAAAACTGTTTTTATTTAGCACTGTTCTACTTACCCAACCGGTGATCAGAAGTTGAACAAGAGTCCATAAATGTTTGTGCCACAACTGACAAGCAGGAATCCACTATATTTGACTTGTGTATGTCAAAGACAAAATTAGGATTTTTAATCAAGTTTACCCAAAAGCTAAGAATTAAACAAAATGAATTATGATTAATCGTCTAAGGAATAATAAATAAATACTTACCGCAATGGTAAGCTGTTACTTTTCCAGGTATGCACAACTTCTGGGTCAGTTATACCATGTAACTGAGCTTGATCGTCGAGAAAGTCAAACATGTACTTTATAGCTAGGGGCAGTGCCGATCCTCGATGAGCGGTGCTAAATATCGTTTCAAAAAGATCATCTACGAATTTCTGAAGTGTACCCTTAGTTGCCAACAGTCTGGTTAAGTAAATCTCTGATACCAATTTGTTAACCCGCTCGCCTTCTTTCTGCATGTCACTATCATGGTGTTTCACTAGATGCCAGTATCTTAGACCATTATCATGCATATCATTATTTAGAGGGCTCCCGGCGCGGCTAAATGTCGGAGAGGAGGAGGTGTATTTCGATATATTAAGAGTTTCATACCTAAGATTGATAATAAAATATTTAAATTTGATGTTAAAAAATGTATATTGCTTTCTTAAAATAATATCTTACTTGTGCGATTTTTCATTTTTATCCGACAAAATACTAAAGTTATAAATTGAACTTTGCTTTGGTACTAGGCTCAGCCCAGCGCCGTCTGGAACGTTATAGTGCTGCAATGTGTTAAGTTTTTTCCATTCGCTTTCGGTTTTAGATGTTACATCCTCATCGTACAGAATGACTCGACCTGTAGCACCTGTTCGCCACTCTAAAACAAAAGTGGTAGACATAAAATTTTTTTAATAATTTGTAAATCTGAGAGAAGTGAAATAGAGTGTATACTACATATGTCATCCGTACTTTTACAAAACGTACGGATTTCGCAAAAAAAAAATGTAATTTTTCTTTTGCTTACGTATACTATTTCGTAAATAATTACCACGCCCTGAAAATGGGCTAAAAAAATGTTGTGCAGTTCAAAAACAGTTTGTATTAAAACACTGAAGTAAAAAAATACCGTCTGTTAAAACATTTTTATCTCCATCTATAGTAATCTATTTGACATCGTTTCAAGTCGATGTGACATAGCCGCGTCCGTATCTCCTTGTGCCCGTTTCTACGCAAAGAAGCCTCTCAGTTTGGCAAGCCGAAGTTTTTATAACCTTGCAGTTATTGTAACAAATGTTAGTTACACCATGTTAAATTTCTATACCTTTTTTGTGTAAAACTAAATTCGTAATTCTGAAAAGTTAAAATATTCTATATACCAGAGTAAAAGAAAATAATTTTATATGATAAAGGTAAACATCATCAACATATTTTAGTAAATGAGAGTGAGTTAGAGGGAAGATCATTTATAACCAGAGTAAAAATCAAACGACCTTCAATTTTTTGTTATTATTATTATTACTATTACAAAATATGTCACTTTGTGATCGATCTTTACTTAACAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/982/206/5c/scaffold_56-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACCGTCAACATGGTTTTGTTAATGACAGAGATTAGCACAATTGTTGCAAGTAAGAGGTAATAATGTGTTTTCATGTTTTAGGAATTGCAGACAAATTACAGATTCCTCTATAGTTGTGGACATCCACCTTCGCACCTTTTTTTTGAAGTGGAATAAAATAATCATTCCAGATAGTAGAAAAAACATGATGATCTAGACAAATGAAAACTTTTAAGAATGGATTTACATATGTTTCGGGTACAAAACCTAAGCACACACCCCGGGAGTCCATCTGGCCCAGGATAGAAGGTTAGCGTTACAGTTTCTAAATCACTTAAAAGTGAAGAGTAAACAGGAGAAAAAATACGAATTACCCTATCACAACTATAAGTAGCTTGGAAGATTTCAGCAAAAAAATTTGCAAATTAAGGATCCGTAGATGCCTTAATTCAGTTTAAAATTGTACATTTAAATGTGGGATAATAAATTGAAAAGATCCAGATCGGACAACTATATAATATAGCTCCAATAAGAATACAGTTATACTTTACTTATACTTTTGGGAATAATATGGATGCCATAGAAACTATCGAATAATTAATGTCAACATAATACAAATACCGTTATATTTCCTTTTCCGATAACAGTAGTAACCTAAAATGAAGCAAGAATGGAATGTAAATTCGGCAAGCCGTAGTTTGTTTACCCTTGCAGTAATAAGAAAAAATCAACCAAGCTTAGAAGGTTGTAGGAAAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTTTATATGTTTTCATCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTGGTCCGATCCGACTGGTTCCGACTACATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTGCAGTCTGATAGCTTTAAAACTAAGAAACTAGTTTGCATAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATACTCGTATACTGTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTGCGTTTCGAATGGTATTATTTTAGAAAGTGCATTTATTAAGTCGTATTAACAAGCATTATTCGTCCCAAAAGTCAATATCAGCACTTTTGTATGTTGATATCGCGTGATCGCCACGACTCCTTACCTCGTTAAAAGGTGTTTTTGTTTCATATCAGAAGTTTTTGTTATACCCTTGCATAATACTTTCAGTCAGAAGTTTGCAGAATAGTGAAGGAGACGTTTCCGAACCTATAAAGTATATATACATTCTTGATCCGCACCACTAGGCGAGTCGATCTAGCCAAGTCCGCCTGTCCGTTTGTTCACAAACTAGTCGCATAGCTCACATGGATTTGATAAAAAACTTTTTTAAAATTGTTTAAAAAATTATAATATTGGTGTAAGGACCATTAAATATATACTTTCTTTCTTGGGAATATCATTATAGTATTATTTCAACATTTTTAATACAAATTTTAAAAAAATTTAAAACTTTATCGTGCAGCTGCCACAGACAATCGGATAGTAAATGACAAAATAATAAAATACGGTTATGTTTTGTTTTCGGCAAACATATACGGTAGTAAATTGAAATGAGACGGAATCTTACTGTGTCTGAAGTTTCTTTTTAGTTTTTTAAGAATCGAAAAGATTTCTACCTACAATGCTTCCACGGGAACGACCTGGAAACTTAGGCTTCCTGAAAATAATTTCCTTTCATGTTTTAAATCAATTATAAAATAGGATTTCCATTCGTTTTTACTTTAATAATCATATACAAGGTTTGGTCAAAAAGTAAGGTGACTTTGTATTTTCAAGAAAAACTATTAATTTATTTATCAATATTAATGTTGTCCCCCTCAAAGTAATCCCTCTCAGATACAATACAGTTATGCCAACGGTTTTTCCAATCCTCAAAGCACTTCCCATAGCACTTTTCGGTATTGCCTTGAGCTCTTCAAAGATGCAGTCTTTATCTCTTCAATCGTTGCAAATCTCCGTCCTTTCATAGGTCTCTTTAGTTTTGGGAACAAGAAAAAGTCACATGGGGCCAAATCCGGTGAATATGGTGGCTGACGCATTATTGTGGTGTTGTTTTTGGCCAAAAAATCTCTCACAAGCAAAGATGAGTGAGCAGGGGCATTATCGTGATGCAAAAACCGTACGACCATATGGTAAGAACTCCTGATGCACCACGCCATGGTAATCGAAGAATACAGTGATCAAAACATTGACATTTGATCGAAATTGGCGTGCTTTTTTCGGTCTTGGCTCTTCCATTGTGATGATTGGGCTTTGGTTTAGATATCATAACCATATACCCATGATTCGTCACCAATTGTGACCCTTTTGAGTAAATCTGGGTCGTCGTTGACGTCATCCAACAGCTCTTGAGCGATGCTCATGCGACGGTTCTTTTGGTCAAAATTCAGCAATTTTGGAAAAAACTTCGCTGACACACGACTCATGCCCAAAACGTTTGAAAAAATTTCATGGCACGAGCCAAGCGATATACCGACATCTTCAGCAACTTCTCTGATAGTGATTTGACGATTTTCCAAAACAATTTTCTTCACTGCTTGAACGTTTTCATCAGTTATTGATGTGCTTGGGCGTCCAGAGCGATGCTCGTCATTGGCATCTTCCCGGCCATCTTGGAAGAGTTTGTACCACTTGTAAACATTTTTTTTACTCAGAACAGTTTCACCAAATGCCACTGTCAACATTTCAAGTGTTTCGGAGCACTTAATTTTATTTTTTACACAAATTTTTATGCAAATCATTTGATCCATATTTTTCTATAGCAAAAAATCGCTGAGCACGCAAAACAACTTGTTACCTTTACGCCTCTCACAACTAAACAAAAAAGGGGATTCAATTGAAACTTGGTACAAATGTTAGGGAACCAACATAACAAAACAAAAAAATCGATAATCGAAAATATGTTGCCCGCGAAATTTGAAAAGTCACCTTACTTTTTGATCACACCTCGTATGAGGTTTGTTAATAGCATTACATACAATTTGCTGGGCTTTAAATAATTTAGTTTTAATCGATGAAAAACTTAAAAATGCTTTCCTTTTGACTAAAAAATATATAATAACAATTTTTTCTTATCAAATTACTTTTGCTTCGGTTTCGGCATAAGAGAAAAGTTTTGCTCTTTTTAACTTTAAATATCTTCCAAACGGTAATTTTTATGACAAAAAGTGTTATATAATATCTTATGTTAAGTAATCTCTAGGGCCATAAAATTTAAAATTTTTTTTTAGTCAACAAGTGGTTTTAAAAAAAACTTTTTGTCATAAATCTAAATCTTTTACATTCAGAGAATTTTACAATACGAATCCAATTAAATTATATTCATATATAGCATATAGCAAGTCTCTGCAGCATCAGTTTATTTTAAAAAACTGTAAGCCTTATAAATCAGGCTTTTTTGCATTTCCCGCTAAACTAGCGGGCTTTTCAAAGTCTAGCAACAACGTTTTCTATCTCGAGCTATTTCATACATGCTCAGGGTCCCCAAGACCCTAAAATCAAAACGGGACACATACAAACCCACAAGTTCCAAATTTCTAAATTTTCACTTTCGCACTTTCACCCCTGTTTCTCCTAAACTAATTGATACTCACGAACTCTTGGTATGCAATGCTCGTAGCATCGTCAGCGTTTCGTCACTACCTGTACTGACGTCCACATCGATTCGTGGGCGGTGTGTAACATGTAGAAGGAAACCTTGCCGACCCCATAGAGCGTATATGATCTGTCTGTCTGATCGTCTGAATGAACGCTGAAAATTCGGGAACTATAACAGCTAGAAAGTTGGGACTTGGCGTACAGATTCTTGAGTTTACTTAAGCAACAATAACTTGTCTAGCTACCACGTCTTTTAACATTTTGTAAAAACTTAAATAAGATTTTGCTTCTATTATCAAAAATTTTTCAGTCCAAACGATTGCATGTTTTTCAGTTAAGCCCAAAATAGTCGTA'..b'AAACATAGCAACCGGCACTGAAGTAATAGGATTCTCTCCTCCCAACGGAGAATTTACATCGAGTCCACAAAAATCCTCTCCAATTGTTTGTAGTTTCTGAAAAAATATTAATATTATTAATATAAGGTGAATTTGTTTTGGATTTTCGTGGTATGGTGCACTAGAATTTCTTTGAGGATATCGGGATAAAATGGATTTGGAAAAATTTAAAAGATTTTTCATTTTACAAACAAAATTATCATACTTTTCGGTACATGTTATATGATGTTATATGGGCGACAGACAGTTTTTAGCGATTTAGCCGTTTGGGGGCGTTGGATTGGGCGTAGCAAACAGGTCAATCAAAAGGTTTTAATAACACAAATACATTTTAGCAAAAAACAAGAAGTTAAGTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACACTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATAATTGGTTCCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATCGTCTTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCCAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGTTAAATGCTTAAAAAACACCGAAGATATTTTTTTTTTTTTAATTTTTACCCCGTTCCGGCTGGTTTTGACTTACATATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAATGTTTCAATCCGAAAGCTTCAAAACTCAGAGACTAGTTTGCATAGAAACGGACAGACAGACGGGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAGTATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTTTTCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGAATACAAAATTGTATAGCATGACGACTGTGGATACCACAGTTTTGGGCGGTTTGTTGGTGTTAGAGTGGGCATGGCATATTTTTTTTTTTGCTGTGGGCGTTAGAGTGGGCTTGGCACCCTACTGAAATAAACGTGCTCTGCGCAGAAAGCCCTTTTATAGTTTCGGACAGACGGACATGGCTAGATCAACTCAGGTTGTGATCCTGATCAAGAATTTAGAGTAAGCTGGCAAAGGGACTCCATCGGATAATCAATGGACAAATAAGAGGAGAGTAATTATGGCTTCTGTCTCTTTAATTTTCTAAAAATTGTAAAGCTTTATTTATATATTATAGCATGTATAAACTTCGACTAGCCGAAATTAGTTTTCGTTTTTGTTTGTTGTATTCAGACAATCAAAAGTTACACTATCGATCATTTTGCAGCTCTATTTCATCATATTGAGATACATATGTAGTTTTTACTTACCGTTAAAACACATGGCATGCTGGGTGATATAAAGTCAAGTCCCCTCATCCCATTACCGTTAAAACAGGATTTTATGTTTTGCATAAATTTACGACGAATGGATTTCAATGAGTAAATGCATAGTGCAGAGTTGTTAGTTGGTGTGTTTCCGTCGCCTTTTGAAAAAGCAGCGAATAACACGTCATCCTGAATGGATATACCCAGACTTTGAGCCAAATCCGAGCTAGGTTTTCCCAAGAAACCGGCCTGAACCAAGTTGAATTTAGTGCCGCCCTGGGCATCACTTATACATTCGACTGGAATTTCCGTGTATGAATAATAGTTTGAATCTTCCTGGCATATTCGCACAAGCTTCGTTATATACTCTTTGGGAGAGGAATGGTGACTGTGCTTTAACTGCGTGGTAAGAAAATATGAGAATCGCTCAGAGCTGAATCCGAAAACGTAGTTCACAAAATATGTTTCACGTGCGTAAGAATTAATAAAAGTTCTCGTTCCAGTCGTAACCGCCGAAGAAGCAATCTGAAACATTTTCGTTTTTTCAAGAGAGCGCGAAGCCACGGCTGGGATTTCACTTCGGTATGGCGAATTGTTAGTATAAGTAACTCCGACATACATCACATTTGTCACTGGATGCTGTGGAGGGCCCGGTGCTATAAAAGCCACGGTTGACGAATTAGCATCATTTGCAACAACCGCATCGGGCACTTCATGCTCAATTATGCTAACATTCTGAAGATTACGAACTGTGCATGTTCCCTGAAATAGTGATCCGCATGAAATAAGTCGAGAAGTCGCACGATCTATGAGCAAAACTTTATTATAGTTGTCCGTCGGACTGCGAACAGCATTCAACGGGCAGTCGAGTATACTACACTCTACCGAATCGTTTTGGGGTCCCGTTTTTACCGTTTCGGACAGCTCCAAATCAGGCGATAGCTGATACAACCTATTAACACCACCAACAAAGACTCGTCCAGTAATGGTGTCCACTAACAAGTGATTTAATTTCGTGTCAAACGTAGCTACATTTGTAATGGTGGTACTATGGTTATTTGCATCCTTTACCGTCGCATTAACATCAGTCATATTTATGGGTTCATTTTGAATAGCCGTCTTGTCAGACCAAATATTTGCTGCCAGTGTCTGAGAACCTGCTATTAAGTTCAGCCTGTGGTCATATTTATCTCCTAGAGTTGCTATTAGCAGCACACTAAGAATAAAATTCATCTCCAAAATCGCTCCTTCAAAAGGGCGTCCAATTCACGTATTAAGTTAAAAGTCCAGATGCAGTTGACAGTATATTTCCCTTTTATGTTTCCAGTGATTTATTATTTATTATATTGTTTAAATTGCTGGTATTCCTGGTCTTTTGTATATCCACTTATCCACAATTGTTTTCCATTTGTAGCAGTGACTATTATTACAGAAAAGCAAGGAATTTATTTATTGTTATGAATAGCAACATCATTGAATCTGCAAAATCGTATAAAATTTAAAAAGGAATTAGAATTAAAAATATTGGTTGCACATAAAAGACAATTGTTTTTTATGTTCAAATTAATATTATTTCATTCTTACTTTGCAAAACTTATTTAGGGTACGTAACAAACAAAACTTTAAATGGGGTTAAAACCAAATTTACCATATACAAAAAAGTGTTCAAATTGTTTATACAAAAATGGTGATTGTTACTGGATTCAGTATTTTCAATAGTAGATCGGTAGGTAACAATTTAATCGAGTTTCAATACCGTAAAAAACAAGTGGACTTGAAAAAATACTTTGCAACTTTATATAACTGCAACCTGAAAGGCGTGACGACTGAATGACTAAAAATTTTTATGAAACCCTTTAAGCCTAATGATACTAAATAAAGTCTGAAGATTAGAAAAATTTTATTTTAGTCAAATTTTGTAATATATATAGAATAGAATATTACTGAATCAGTTGCAAAATTGGTATGAAACCTTTAAAGCTAAATGCTACTAAATCCGTCGATTTTGATTAAATTTAATTTATTTCACATTTTTTTTAGCCAATTTTTCGATTGTTTCTATGGCAGCTATAGGCAGGCGTAGGATATAGCGTAGGTTATACATATGTTAAAAAACGGGAAAGATATTATATTAAAGATTATTCCAATGGGAGCTATAACATATACTTGTCCGATCCGGCTGGTCTTGACTTACATAATACCTGCGAAAAAAAAAGACTTTTGGGAAAAGTTCAGATTAATAGCTTTAAAACTGCGAGACAAGTTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGAAAATGGCTAGATCGCCTCGTCTACTAATGGTGATCGAAAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGAGTCCTTCACTGCGTTGCAAGGTTATAAAAATTCTAGCATAGTTGAGGTATAATTCGATCGCTGTATAAACCTTTTTCGACCGGACTATCGTAGCAGTTTTTCAATTTATGGCCAAATATAGTAGTTTCCACGCCAACACTACCGGTGCGATTCGTCACTACGTGTACTGCCAACCACTGTGATATAATAGAACGGACTTTTGGAATCCTTTATAAAGCCTGTTGCTTCTAATCAAGAACATATACATTTTAAACACCAGAAACTTTGAAACTAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TACTTGAATAGATGCAGCTTGGGGTAGCAATTCTTTCCATTTCGTCCAAAAACATAGCTGAGGTCCTGGTAAGATGTCGTCCCAGCCTATGCCTGTACGCCAAATTTCCTGAAGAAGTATTTTGAGGCAAAAAGTGTAGCAGGATAGAAATCCTAATGGTACAAATATGGACATCAACACTTGCAGTACCTCGCGTTTGGTTGGCAAGGCTTCTTCCGAAAGGTCGTTTCTTTTCATTCATGCAAATCTGAAAAAAAATGTAACCATGTCAGTTCCTGGTTTCCAAAACATACCGAGCACTTTTCTGAAACTCCGAGTTCCATTGGCGATTGCAGATCGAAGGAATCGCCCTGCAAATGTTTCAAGACTTCAAGGCCCAGCTCCTTATATTCAAACCTCCAGCCGAGTGTATGTCTCGGACTTTTGAGGTAACCGTGTGGGTGCTCATCCGATTCCGCATGTCGGGGCTGTACATCATTGTAGCCGATTCATATCAGCTGATTCGTGACAACACGCTCTGTTTTAAGTGCGGTTTGTGGACGTAAGAGTGGGCGGTGCCATTTTTTTTGGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGACAAATAAGTTTTAGCAAAAAAAATGTTTCTAGCATGACAATTGTCGCCACCACAGTTTTGGGCGGTTAGTGGGCGTTAGAGTGGACAAATACATTTCAGGTAAAATTTTTGTTCTATCATAAAAACTGTATGCGCTACAGTTTTTCGCGGATTGTGAGCGTTAAAGTGGGCGTGGCACCTCTCTGAAACAAACTTGACCTACGCAGGAACCCCAGAAATCTGCATGCCAGTCTGACAGTTCTAGCTTTTATAGTTTCCGATATCTCAGCGTTCATACGGACAGATGGACGTGGCCAGATCGAGTCGGCTAGTGATCCTGATCCAAAAAAAATATATTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACCTACTTTCTGACAAATCTAGGATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAGAAGTAAGAAAACTATCTTCAGCAATCCGAAGTGCGATGGTTCTGAGGCAGCTGTACATTTTTATTCAAAAATCGGAAATATTTAAAGAATGATATTCCTAAGAGCAGAAATTAATATTAAAAACAAGAAAGGAAGTTCACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAATTAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCAAAACAATTTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAGAAAGCCCCAAAGATATATTTTGTTTCATATTTTTTCCCACCACTTATCCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATACAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTGTTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAACACCGAAGATATAATTTTTCAATATTATTTTACGACTAATTTTCCAATTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGTTGTACGATTTTGATAAAATTTAATTTGAAATTCAGAACTAAATTAAAAATGTTATATCCAAGCTTGGAAAGGTATATGTTAAGAAAAACCAAAGATATAATTTTTAAAATTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGACATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATACCTGAAACAGAAAGAAGACTATTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTGAGAGACTAAAACGGACGGACAGGCGGAGATGGCTAGATCAACTCGTGTAGTGATGCTGATCAAGAACTTATATACATTACGGGGTCAGAAACGTCTACTTTACTGCCTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATAGTACTCCCTGCAAGAGTACCCTGCACTCGACTGCAAAGTCGGCAGAGCAGCCAGCGACTCAACAGAGCCAAATGACAGCCGCGATCTTTCGGCACAAAAATAATGTTTTTCTCTCTCTCTCACGATTTGTCTTCCCTGAAAAATGCGGGTGAAGGCAAATAGAGCGAGCGATTAAAGCGACTAGCTTTGGTACACCGTTGCATTTTAAATAATGCAACATTTTTGGTAAATGGAAATATGTACAAACAAATGAAATAATTGGTGTGGGCTTTTAATATATATATTGTTTTTTTTAGTTAATAAGTTTATCATTAAGTTGTTAATAAGTTAATTTTTAATTTATATTTTTACATAACGATTTGCAAAGTCGAACATGTCCATAAATACCCTGCTTTTGTGTGCAACGGAACATTCATAGACAAACTGGACATGCCCAAAAAAACAGAACAATAACGGATTAGCGGAACTATTCCCACGTAAGTCTCCCGGAGACCAATAATTTTTTTAACAGTGAAAGTAAGTACAAGTTAATGTACATTACAAAATTGGGAATACAAGAAGAAACAAGAAATGGTGCATATTAATAAAGAAAAATAATATTACGAATCTGTTAAAGAATCTTAAAATCCTTTTAAGTTCAAACTTTCTGGGAACCAAAAATATGAGATACTTGTTTTAAAACGAATGGTTGGGATTTAAACCTTCAAACTCTGTAATCTCAAACTTCTCGTATTATTACTTCCTGGAAAAGTCTTTCTTTTTTCCGCAACTTTATATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTTAGTCAAAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGGAGTTTCCGACCCCATAAAGTATGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTTGACGAGTCGATTTAGCCATGTTCGTTTGTAAATCAATAGACAGAAAACTAATTTTTCTGATGCTAATGCAGTCGCTCAGGTGACCCCCTCGCGACGCGATGCGAACCCAGATTCTGGCGAAGAGGTGCTAAAGACCCTGTTATCACCGGGAATAGTAAATTAAAAGTAAATAAATAATAAATATAACCAAAATTTGTTTTTATATTTATATGAACCTGTGCCTTGTGTCCTGCTTAAATAAGCGTTCAACCTCTGCTAAGCCCGTGTTCTTCCTTTTACCTAAATAGGCACGAAAGGGTGCTTCAAAAAGCACTGAGTCTGTGCTCATTGTCTAGCACTGCTAAATCATAGGACATGCCTGCGTTAATATAAGCAGTAATTTTCAAAGAAATTGAGCACTTAATGAGCGCTCAGTGATTCGGCGCTTATTCAGCGCTCAATAGTACTGCAGGGTAGTTCCGCGCGGCGGCTCTGCACGCTGGCAAAACACGAAGCCGCTTACTACGATTATGGACTTCAGGAGCAGCTGGCGGACAAATAAACAATATAAGGAAATGTGGTTCCTTACAAATGTTATTGCTGTGGTCGTGAACGGGGTACCAGCAAAGTGCAGCACCCCCCTTGGCTGGTGTTTATTTGCCACCGCTGCATACTTCTGCCGGCCTTCAGCTCACTGCTCCGCGACCTGTAACAGCTGCTATATTTTAGATAGCCATTTTATTTTTTTTTTTTAGTTTTAGTTCCATATGATCTTTAGGATCATATAAATAAGATATGACAGACTTCAGATTGTTATTTTCTGGCATGTAGCAAATAAAATTACCAAACGATAAGACAAGCATATGTATGTAAACACAAAGCTGGTGTTGCCAGACTCATAGACTGTTTTTTTTAAGTACTGAAGCGTTCCGTTAAGGTGGATTGGAACGGTTTGTTATTTTAATATTTTTATTCCGCATATACCGCCCAGTGAATTACAAAAGGACGAACGTTTCCAAACAAAGTATTTTTGTTCAAAAAACGTATTGTAAAATATGAAAATAAAAACTAAAAAAACTAAACGTCCCATTTTAATTAACTACCGTGCATGTTTGCTAAAAACGAAAAAATACTCAGACAGTGTAAGATGCTCTGAACTGGTAAGTGTGGCCATTTTTGGTAATTAAAAACTTTTAAACGGTCATTTTTACAAAAATGTGTCATACGTTAAAAGTTGA'..b'AATCTGGCTAGCTTTTGTACCCATATACTTTGGAACTGGAAATTCTTATGAGGTATGTTTGTCCTAATTTGTTGTTACTCGCACCGTGATAATCAATTTCTTCTTTACTACACAATTGAAAATATTAAAAATGATCAATATCAACCAAAGAATTTTAACAATTGATCTTTTTTTTTCAACAGTATGTACTAATTTAACCTAAAATTGATCTAGATTAATAGCCTAATCGATCTAGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGCAGATATCTTTAAAAAAGCGAAGATGCCGCCAAATGCCCTATCTGATAATCAACGAACTCGACTACAAGGTGTCTTCCGGTTTTTCATTAAGTAGTTATAATTTCAAACAAGCTCTGCTAATAACTTTAGATTCCGAAATGCTGTGTGTTTTCCCTAAGTGTTTACGTTTTTATACTTATAATAAAATCATATAAACCTGAAGTCAAAATTAAATCTTTCAGAGCCTTTATACAGTCCCAAACATAATAATGGCTATCGAATTTACCGCCTTCGAGATTAATTCTAAGTAGTGCCTAAACAAATTGGAATCGCCTACTGCGTTCATTATTGCTTTAAGTTGTTTTACACTTTAAAACAGTTGCTACATATGTTAACAATTCTATTTTTCAGGTGCAAACTACTACGTTATGTATTTCAATAAGTCTGAGTGCATCAGTTGCTCTTGTTTGTTTGTATTCACCCAAGGTGTACATCCTCGTCTTTCACCCGGATAAAAACGTCCGTAAGTTAACCATGAACAGCACCGTCTACAGGCGTTCAGCTGCAACTGGAGCTCAGGGTGCGCCCAGCAGCTCCGTATATAGTCGCACACAGGCAGGCAACACTGTACCGACAGGAGGGGCGTTGGGTACTACAGCATCAAGTGCCCTTCAAACACAAAACAGCTCTAATCTTGACGAGCCTTCGGGCCAATCAGCTGTTGTTCACAAAAGCAGTGATTATAGTAATGGCGAATTCATGCCCGAGGAATGCGAATGTGCTGAGGCATTCTGCAACCGAGTAAAAAATTAAATTTTAAGCCGAGGAATATCACACTTGAATATTGGTCGACAACCGATGCTTTTTAGAAAAGACTAGTTATCCTATGGAAATGTACATCTTTAATTTAGATTATACTTCGCTAGTTAAACACGAAACGAAACTTATAATATCACGATTAAAGTAGAATAATAACCATATACTGGAATAGTTAAGTGTAAGAAAAATCTGTAGAGATTTATATATTAAGCAGCGCTCCCATTCGCCAAAATAGGTAGTCTATTTCATCTCGGATAAAGAATCTCAAGAAATTGTTGTTTTAACCAAAATGTTAAGGTTCTAAAGAATTTCGAAATAATTTTTTCCCATCACTAATTAAGAAAAATTGTACATTAAAAAATAAGAATACTTATTTATTAGCGTTTTCAACTTTGAGAACCATGTTCCTGATTTAACTGGATTGTTGTTTTCATTCAGTTTTAGTCTTATTTCTTTCAACTATGTATATATTAAGCAATAACACCTCCTAATCCTTCAAGGAGAAACAATAAAGTCGAGGCCTTCGACTGTTATATACCCATTAATCTGATTCATATAAAATCAAATTGCCAGGCATTTTGATTTGCGCGGCACTTACCACTGATGCTAGCGCCACGGTACCTTGCGGACTTTAGATGTAATACTGACCATGCCAAAGTCTGTTTAACTTATTTAGTCATTACGTTGGGTACAATTTTCAACATTTAGATACACCGAAAAAAAATCTTCAAAAAGGAGGAAGGCTGTCAGACTTTAGCGTTATTGGAGTTAGAGGAGCGGTGGCATTTTGCTGAATAAAACAAACGCTGCAGAAAATGTACATGTACTTGTTTTATACAATCCTTTTAGATTTTGCAGTTCAATATGTATATCAGGGAGGGTCGAATGAGGAGCCTGAAAATCGTATTTTAAAGGATTGTAAACAACATTGCCGAAGTCCAACAGCTTATATGTAGGATTGAAAATCAATTTACCAAAACAAAAAGTTGTCATGCCCACAAACCGATCAAAATCGTACATTTAAGCACTGATATCTCGCAGGTGTATTTCAGCAGGGTGTCACTCTCTCTCTTCGGATTTAAACAATTGGGGTGTCATTCGACGCGTATTTTCGGTAAAAATACAACAAGGCCAATAAAATGTGGCCTATATTCTCAACCGCCTAAAAATGTCATATTTTATAAATTTTCTTTTAATAATTTAATACAATATAAGGAAGTCGCCCTCCCACACCTTTCTTAAGCGCTTCGTTAATCAGTGGATCTTAATCCGCTTGTCAATACCTACTGCCACGGACTGTAAATAAATAGTAAAAAGTAAAAAATTTAAAAATGTAAAGAAAATAAAATTTAAAAAAAATATATAATTTTTTTTAGCGTTTTTCTTGTTTTCAGTAGAAATAAAGCAATTGTTTCCATTTTTCCGTGCCATATTCAAATTAATTTACTAGAAACATGTTTATCTGACCATGTCCATGCAGATTCTATTTTCAAATACAGCGAAACTTTGTTTCGTCAGGGTGGCTCCCTAATTTTCAATGTTAGAATAAACATTAACAGAAATGTATAGCTCTCATCGATAGCTATCAATGAATCGAAAAAAGGTTTAAAACAAATCGACCCTATAGACGCTGATCTCTCGGAAAGTATGACATCATAAATTAAGGGACCACACTAACTCGTACCAACAACCAAAAAAGTCTTTAAACTCAAAACTTTAATGCCCACAAACGCCCTAACACTATAATTTGTCTTCGCCACATTACTATGTAAAAAAAAAGATAAAGATAGTATGATTTATATTTATAAGGTTATAATTATTTCAGTCACTAGTTTGCAATGCAGTAAAGGTTATTTGTTTTACCTTTCCTACCCGATTCGATATAGTTTTCCGATCCTGCATAAGAAATGAGACTTTTGGAAAGTCGGACAGCTTCAAACGTTTGCCTAGAAACGGACATGACTATTTTCACTCGTCTAATTATCATGAATATAAAAAAAAATATATATTTATTTAGCCATTTAGCCATATCTCTATAGAGATTACATTTTACTTTATAGAGTAGGAAACGCTTTTTGTTACATTTGTTCAGACGACTGTAAATTAATTATTTTATTCTACGAGTAACAGGTATAAAAAGTGAAAATTTACTTTTTTTAAGATCACATAATGATTTTAGGCTGATAAAACTGTATCATATCGACTACATTTCACTTTTCCTAAGATATAATAAATAAAACAAGAAAGGAAGTTGTATACCCTTGCAGTTATAATAAATAGTCAAAGTTTGTAACGCCATGTTTAATTTTTAAGGACTGTTGCTGGCTTCTGTGATATTAAAAAAAATTACTTCATTATTTCTCTGCCATTTCCTTGACAGCTTTATGATAGAGTCGTCCGATTTTTATAAATTTTAATTCGAAATTCTTAAATATATAAAAAATGGTATTCTTATATTTATAAGATAATACCGAAGCTATAATTTGTATCATATTAGTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATAAAAAGTGCTATTTTCAAGGGGGTTATATGTTAAAAAACACCAAACATATAATTTTTTTCAGAATATTTTCCCATCAATTTTTTGATTGTTACCATTACAGCTATATGATATAGTCGTCCAATTTTGAAAAAATTTAATACGAAATTCAGACTCTCTTAAAACATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGAGAAAACAGCGAAGTTATAATTTTTTAAAATTTGTTTTGCAATTGTTTCTATGGGAGCTATAAGATATAGTAGCCCTGTCCGACTGGTTCCGTCTTACATACTAACTGCAAAGGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTCAGCTCGATAGCTTTAAAACTGAGAAACTAGTTTTCGTAGAAACGGACGGACAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACGGACATGAAAAATATCGTCTAGATCATAATACCCTCTGCAAGGGTATGCACGTCTATTGGTAGACAATATAAAATTGTGCTCCAAGCGGAATGGAAGTTCTCGACAACCCAACGACAAATAACATCAAAATAAATAACAAATATATCAAAAGTTTTCTCATTGGTTAGGATATGCATAAAAAGTTCAACATGTATAATATGTGAGAAGTAGGATTACTGTTCCTATATATAAGGTTTGTTAACTATTGGGAAAGTTTTAAATCGATAACTTTTAAAATGGGTAAACGGCACAGAAACGAATAAAATATACTTTATAGGATCGGAATATTCGCCTTTATTATTTTACAAAATGTATAGAACAGCTGACGTATATAATTGCCATTATACCCTCTTTTTATATAAGAAAAAAATTGTAAACAATCTTTCAGTGGTAGTTTTTAGTATATGGGGTGCAAATTTTATTTATAAATAATAATCAAAATATATTCAGTTTACTTTACTACTAACTGGTATCAATGTGCACGGCGGCCCACGTAGTGACAAAGAGCACCAGGAGGGTGTGGGAAGGCGACTACTATATATACACAAAATGAAAACCTACTGTAGTCGTCCCATTGTTTCGCGTAATACATCAATCAAAATGTATTGCAAAAACTAAAAGAATTGCATACCAAGACGTTAAAAAAAATTAATTGGTTTGGGAGAAAAGGAAAATGAAAATGTAAAAGTTAAAATTTTAAAAATGTGATTTGTTGGGGCCGGTGGGGATAATTACCACCACCACCATTGCCCCCCTATCGACCTAGTTGTTCTACCACTTTTCGAAAAACTAGCTAGTTTGACAGCTATAAAAACTATTGAAAACTTTTAATAAAGCGTGCCGGATGAAAACAATGTATAAACTGTACTTATTTAGTGAATCGAAATAAGTACTTTTGTTTGTTGAAAGTGCGATCGTCACTATATTTATACCTCGTTAAGAGGTGTTTTTATATTAAATATATGTTTCTCAATAAACATGACACAATAAACTTTTTTGAAACACATTTGTGTATTCGATTGCCGGTGCATCTCTCCATATATCATTCTATGCCTAAGTTGTTGCCGTGACGGATGCTGCTGATGTTGCAAGAAAAGCTGATGCCATCCAACCGGAGATGGAATGTTTTGATGCACATGTTCCGTATTTAAAATTGATTCCACAGTGTGTTTATTAACTTATAAAGGATGGCTTTTAAGACCAATAAAAACGAAAACTGAAAAATTACAAAATATCAATTTAGTGGTAAAAATTTTAACTCAATAGGTTTGATATAAGTAAGATTTAAAACAAATCTAGAAAATTCGAATTCGCACGTATGTATTTAAAACTGGGATTGGCTTAACAGCTTTAAAATGAAAGTGTTCTCATTTCTGCCTCACTTTAAAAATAAAATGTTTTAATTACTTTAAAAAAATTTTATTTTTCTTTAGAGTTAATAACTAATTTAAAGCCATTATCATATCGTGTTTGTCTATAGATAATTACTCCTCTTAATGCTAGTCGTAGGTAAGCTGACCTTTAACGTAAGTATTATGTTCGTGTGTCGCACACACCTAATAACTTATATACAGACAGTTAAAAAATGTTAAACAATGGTGGAATTCCTATAAACGATTTGGATTTACCTACGATTAGTTTAAGGAAAAATCACTTTTTTTGCCATTTCAAAGTTCATAAAAAAGACAATTATATAACAGAAAATAAATGAACTTTCGCACAAAATAATTTAAACTATTGGGTTGGTGTTTTAAAATAAGCAAAGACTATAATGTGTAATCCTAACACTATCCAAGTACAAAAACATTATAAAAATATACAGTGAATGAAAAGCATACAATTTAATGTTAAGCTATCAGTTAGAACAAAATATTGTAATTTCTTTAACATTTTGTTATCATTTCCTTAAAGTAATTTTTTAGTTTCTATCTTTGTCAAACACATACTCTACATAAAATATTAATAAAACACCTATCATTAACGTATTTGTGCCACAAACTGGAGCATGAGCAGCGAAAATACCTCTTAAATAAAATGTGTAAAAATATTTAAGGCCTATTGACCCCGCTCAGACAAGGAATTAAAGTCCACATTTTTTTTTTAAGCTTATATAATTCATTGTGTACTATATACAGTAAAATATTTTTTTACAATATGATCAACTACAATCTTCAAATACATATTTTAAATAGTTTGAGTAAATTTGTATTAATTTTTAGAAAACTACAGTTATATGCTCCGAATTGAAATGCAAAAACCATTTTAAATAGAGTCGTGCAAGTATACACACATTTCTAAGCATAAACAAAAACTAATTTAAAACATTAAAATATTAGATTTAATTTAATTTCTAATTATACTGCTTTGAACTTCAATCTTTCTTAAAGAATTAATTGTGCACGACGGCTGAGGAATGTTGAATGCTACGTTCGAATTCTTCTAAACTTAGCGCTTGGTTCATATTCAGAAGAGGCAGTTTTCCAGCTGAAGCTTTTGCAAGAAGCTCTGGAGAAAACCATTGCGCCAACTGATTATTGGTTGGTGATGGCATCCGTTCATCTCTGGGGTAGCCGGGAGATGCGTTGCTATTATTTTTAATCACATTGCCAGAATCGGAACTGTCAGGAATACCTAAAAATTAAATACGATGTTTGGTGAACTAAACAAAGTGTAATAGCAAATTTTGAACCTGGTACTGGTGATGACATTTGTGGATTCGATTGCCGGTGCATCTCTCCATATAGCATTCTATGCCTAGGTTGTTGCCGTGACTGATGCTGCTGATGTTGCAAGAAAAGCTGATGCCATCCAACCGGAGATGGAATGTTTTGATGCACATGTTCCGTATTCAAAATTGATTCCACAGTTTGACCAGATTTAAATCTGTGTTGTGTTTGTTGTTGCTGCAGCTGCTGATGATGTGAGTGAACTGGCTGCATTTCGATTTTGTGTGTAGTAAAAGTTAATGCAGGATTTGGTTGTGGCATTGAATTAAGACCTCCTTTTAGTATAGGGCGACCTAAAATAATAGGAAGTGAATTGTAGTCATGTAAGTCAGTTAGTTACAAAACCAAAAAACCGTTTATTTGAGGTTCTTTCAATTTCCTATTTGCTTCCATAAGATCAGTAGTCAAAACTATAGCGTTTTTCTTTGATTTAACATCCATTTTTCCCTTAAATGTTCCTAGGGCACCTAATTTCTTTCTAACTTTTAAGTTGCCGAGATCTCAGCATTCATACGGTAAGACAGACAGACGGACATGGCAAAATTGACTCCTGATAATATAATAAAATAAATTATACTAAAGGTTCAATAAAATTTCTTTCTACTTACCAAATGATTTCCCTTGCACCATCTGCATATTACCAGGAGTCCATTTTATTCCCTGTTGATTTCGGCACTGTTGCAAATTGGGAGATATTGGTTGGTTATTTGGGCCAATGACAAAGTTTCCACCTCCCAATATCATTCGAGGCTGCACGGCTATAGGTGCTGTTGGCTGCGTCTCACTAAGTTGCTTGGCATGCTGTGGATGCATTTGATATTGTGGCTGTTGGCTATGAGAAGAACTCGGTGTTTGAGTTGTTTCCTTATCGGCTGTCATTTTCCTCAGTACTGATGTAGGAGTAAATGCCAAAGGAGTTGGCGAGTTGCCATGAGTAATTAACGGATTCATCGCATGGTTGGCAGTATTTTGCGAAATCAATTCTATAACAAAATAAGCAACCACGTTGTATAAGATCTATCAAAAATGATATTCAAGAAACGTACTAATGCATGTTGTAGGAATTCTTAAAGACCTTTTTTATATTCGTTTTAAGTTTTCATACCCTTGATTTTATGATTTTAGCATAGCACTGCAGTGGTGCTCATACATATATTCCAAAAACAAATGTTCAAGCCTAACGAGCGTTTACAGTGTCGTTGTAAGCAGTGCGT'..b'GTATTAAAAATAAAAAACAAAACCTTTATTCATTTAGAAAATAAAAAATTTAATTAAAAATAAAAAAAAATTTTAAATTAAATGAGATCATAAATTTTATTAAAGAACATAAGTTGGTCGACGATGTTACTCTTTAAACGGGTACGGCGATCGAAATCCGCCTTGATAAAGGCTCGTTCGGACTCGCATTCATTTTCGGAGACGGACCTTCCATGTTTTCCTTGGTTGTACCTAACGTAAAAAAAGAATATAAATAAAAAATTTACATATAAGTATTTGCCGCTACACGTGGGACGTACCAAAGACATTAGAATATGAAGATAAATAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTGGTGCTGGCTCTAGAGCTGGCTCCAGGCTCTCTTGCTGAAAAGAGAGAGCGCTCTAGAGCCAGCTGCTCTCATACACGCATACAGCGATAAAACACGATTGGATGTGTGAACATGTATTCTCGTGCATTGTTATTGTTCATATTTCGCTGCAGCCCGCTTATTGAGCAGGTTGATTATTTTTGTATTTATTTTATTTCATATTTTGATTTTAGAATAAGTAAAATTATAATAATAACATTTATGTATGTATTTCTATAATAACTATTTAAATTATTTATGAAAAGGAGAATCAAAATGGGGTAACAAAAGTCATTATTAAATTAAAATTAAATGGCATAACATCATTTAACGAAACGTTATTTTAATTTGAAATACTGAAAATCTAAATTGTAAAATTTTTCACTTTACTAAATAATTTAAATAGTTAATATATTAATATGCTTTTTAATATCTAAAACAGTTATAAAATTAATTATACTAGTAAATACTTTGAATATTCAAAAATGGTAATATATTAAATATACGTACTATTAAATACATTTAATGATTAGAATTGTTAAAATAATAAATATGCTATTAAATATATTACAAATTTAAGATATACTACCAAAATATAAAAAAAATTTAATGGCACAAAATCATTCAACCAAATGGAAAAAAATAGCAAAGATCAGTGGCAACAGGTCCAGCCTGTCCCACTGCCAGAAATCTAGGCGCGACTTCCCCCGCCTTAAATTGTTTAGGTTTCCAGAAAAAGATCCAGCAATCTTAATGAAATGGGCGGAAATGTGCCAATTTTCTGAAGACTTTGTGGCGACCACTTCACTGTTTTTATGCCAAAGTAATTTCTCCCCAGGTGATATTGGGGTAAAATATCTAAGGAAAGGATCAGTTCCCGATCGCAACCTAATTAAAGATTGCAGTCCCGATAATGATGATATTGATTTTTATGTTCTTAGATGGCCCACACGAAAAAAACCTCACAGTCCCCGGCTGAAGTTTGTCGTCAGTGCCATAAAAGCACAAAAACGTTAAAAGAGTTTCAAAAAAAATATTTAACTTAATAAAAATTGTCTGATGAAAGACAAGCACGGATTAAGACGTTCAGAAAAGAAAATTTGAATTTAAAACGAAAGATGATCAGGTTGAAAGCCAAGTCTGAAAAAAACATACTTTCGGAAATAGACAAAAAAAAATAAACGTCAAATGAAAAAATACTATCAAAAATGCTTCCTAAGGAAAAAAAGGGAACAAATATGAGATGAAATGATTCTGAAAAATGGTTCGCTGAGAGCATTTATTACAGGTTGACATCGACATATATGTTTTTAAGCGACTCGTTACAATTAAATATTCCCAGTCCATCGTCGTTGCAAAAGTGGAACAGTACAAAAAAAGTACAGCCGGGAGACAATTAAGGAGATGACTGAATCTGATAAAGAATGCATACTGACTTGTGAAGTTGCAATAACGAAAAACTTAACTTATAACGTGTCTGTTGATATAATTGATGGCTTAGAGCATTCACATGAACGCTTAAATAAAATGGGAAGCTACATTTGGGTATTTGTTATATGGGGCATTTTAAAAAAATGGAAATTTATATTAAATTATTTCGTACCCGAAACAAACAGAAACATTAATATAGCTGAAAATATTGGGTTTAAAGTAAGGGTTGTACCTCATTGTGCACATGTACCTCAAGTCACTAATAAAAAACCTTGAAATGTGCACATCAAATTAACAATGTTGTTTGGAATAAACTGAAGGAAATGCAGGAATACCTAAGGAACATAAAATACCATGGAAATAATATATATTGTCTTGATGGCTTGATCCAAACTACTGAGGCTATGTTTGGACTCGTCGAAGATATATTTAAAGACCACAAGGACCACTTTTTCTTTTTAATTAGTCGAGTAAACCAGGACCCTCTTGTAGAAATTTTCAGTTAATGAATTTAATATAATCATTGCCAAACTAATATCTTTGGACATTTTTAAATTTTCCCAAAAGTCGAATTGCGAAGCAGATGATGTTATGTTACCAGTAGAGTTTGATTCAATTATATATAAACCTTGCATTGAAAACAAAGAAATACAGCAACAAGGCAATGAAAGGTACTTTGAAAAAAAAATGATACTTTTTTGTCCAAAGATGTACCTATTGAATTAACATCTAATAGATACTTAAATTAACATCTAACAGATACATTGTTGGATACATTGCAAAAGGATCAAGTTGCGATAAATGTATAAAGATCTTTCTAAAAGAGACAGAGGACTTAACAGCACCATCAGGGCTTTTTATAAATAATGAATGTTATGGGCATAAAGTAGATCTTTTAAACAAACTTATTAAAGTTTTACTATTTAAACGTTGCAAATAGACTGTGATAGCTGATAGACAAAAAAGCAAGCTAAACTCAGAATTCTATCTCATAAGTTAAAGATTAAATCATTTTTATGTACATATATAACTCATACCAAAAATAATATAACCGATTAAAAATTGAAAAAATAAAATAATAAATATATTTTTTATGTACTTTAATAATAAATTTAATAAATAAATAAATAAAAAGGAAATATTTTTTAATTATGTGTTTTACTCACTGTTCTTTTATCCATATCCTCCCCACCCCTTTTTTATTGCTTTGAATAAATTCGTTTAATAGTTCAGAATTGATTTCGGGCCGAAAATCGTTACTCATCTTAGACATTATATTGGTCTTTGGACGTACACATTATATTGGTCTTTGGACGTACACAAAAATAAAACATTATAAATATAATAATTGTAACAATGTTACAAACAAATTACAAACCTTTCGTGTGCCTTCTTCTTTAAACAGTGATGGCCCTAGAAACATCGATGGTCCAAAAAAACATAGATTTTTTGAAAATTTGGAAAAACATCGGTGCATCGATGATTCCATCGATGTTTCTGAACCTGTAGTGATGAAATCCCTCAAAGAGTCTTACACAGTTTGCAAAGTAAGTATAAATGTATACAAGTAAAACACATTTTTTTAAACACTGCCCATATTTTTTTCGGGAGCGTTGGACAGGGATTCTGGGGTCCCGGATCAATCTTTAAGAAAAGCTATGACAAACATTAAAAACGAATTATTAAAAAGAAACATAGATTTAAGAATAACTCTAATTCTACATAAAATTTAAATCATAAAATGTAAATAAAAAATATGAAAAAGTAAATGAATATGTTTGTATTTTAAATTCAATATTTGAAAAGGTAAAAACTCAATGGAAAAATCAAGAATGTTCGCTTTTAATACCAACGCAACCAGAGTGCATCGCGATTAATTAAACTAAATTATTTTGAATGCTCAGTGTAGACAAATAAATATAAATTTAAATTGGCGTCCAATTTATTAACACCTAGTAAGGCGCGAAAAAATTTGGGTATATCTTCAGCATCTTTTTATTCTTTGTGCAACCTCAATGAATTTTTGTCACAAAAGTTGTTATCAGAACTTTTGTTTGTTGAGGGTGCGTTTGTCATTAGATTTTTACCTCATTAAGAGGTGTTTTTGTTTGGTATCAGTTTTTGTTTTAAGCAGCAGCTGCTAATAAGCTGCTAATAATAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/9f4/fc2/45/scaffold_52-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTTAAATAATTC \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGTACCACTGTCAGGCTGGACGGTTTTTGGACGTTTTTTTAGCTAATTTTTTGAAATGCGTATTTTTTAAATATAACGCAAAGTAAATATAATAATTGTTGTATGCATGTAGGTCTTAAATTAGTGTTGCCTTAAATACAGGTGTATTCTTGGCAAGAATTTGTAAGTTGGTTTATTTTTTCAAAACGTCTTTCAAAATACGGAGGATTTAGAAACCGTTAAAAATTACGTCTGTGACACTGAGATTTGCTTTTCGGGGGAAATTTTGCTGGAAGTGATTTCGATGACACCCCCCATGGTCCATCGTCTTACTGGTAGCTCAACAAAAAGATTTTTAACAAAGAGGCAGCTAATCAAGTTTGTTTGGCCCAATCTCAACCAATTTGAATTTAATTTTGTTTTCCTAACGGACTCTTCGCAAACACAACCAATGATTAAATTTTTTATACATCGTGTCGATGCCAATGGCATCCACTCTCTAAATTATATATAATTTCTGGTATCTCCTTACCCCATCTGAGTCCAACGCTGAAGCAGACTCGACAAAAGCTTTAGCCGCCTATTTTGCTCACGCCTATGGTTAGCTCACGGCTTTCGACTAAGTAATTACTAGGCTAAAGCTCTTGGTCAAAAACAGATTCACGGTGACCGAAGGTTAACGAGTTCATCGCCAATGCATGTAGCATGGTCCTAGCGTAAATCAGCTGGATTTGTTGACAAACTCATAAGAAAATAATAGATCAATTTTAAAAATACCAGTCTTCTGCTTTATAATGAAATCAAACAAAAAGTCATTGAAATGTTCAAGGAATTGTTTTTATTAAAGAAAATAGTTTAAAGATTCCTTCTTGACCCACCAAAGTATCGTTACCGCCTTCTTAACATTGGCAGCATATTTCGACGCATGCTGTTAGCTTCGGCTCCCAATATGTAGACATGGGCTTTGAGGAAGTAGGAGACAGATCGGGGTTGTTCAACCGTTTCTGCAGGAAGACGCCCTGCATTCTGGTAAGGGTGGGTGAGGCTTCTTCCAGCTTATGTTCCCTAGAGGCCTATTTTCTTTTCCATATTAAAGAACATAAAGAATTATATAAATATTATTGCAAGTATTTCTTACTTCCGTCTGTAAGTCCAAAACGTTCTAGAGTTTTGCGATGTTCGCGTGCTTGTAGCTTTCCCGCATCTATTGTCTAGGCAATATATATGTTGTATATAATTAGTAATATTCATTTTAATGAATAATGCAAATTTGAGCTGCCTTCTACAATGTTCGGTTCTCCATAAAAACACAGCTTCAAATGCTTCAAATCCCCAAAAAAAAAGTTCCCAAAAAAAACAAGAAAGAACTCTATAGTTCAGTGCCTCGACTTTCAGATACTAGTTACTCAGTTTAAGGAACGAAGAGATAATGAAGTTATGTGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTTGGCTATTTGTTGGCGTTAGTGGCACCTTTTTTTTTGTGAGTCGATTGGTATTGATTAGACAAATACATTTCAGTTAAAATTTTGATTCTATCATAAAAAAAAATTTCCGAGATCTCTGCTTTCATACGCACGGACAAACAGACTGACAGACGAACATGGCTAGATCGACTCAGCAAGTGATCTTATATATCACTATACATACTTTATGGGTCCGGAAACGCTTCCTTTTACCTGTTAGATACTTTCTGAAGAATCTAGTATAGTAGTAACGGGTATGTAAAATTGATGGCATTTACTCTTTACAATAAAAAATTCAACTGACAAGAAATGCAAGAGGCAAGGATTACTACTATTTGTTTGTCAAGAGAACAGTACCAAAAAAAAAACGACCGTAAAATACGACCATCGATAACCTTGTGGTTTCATTATTGTTCTTTTGCTTGTAATCAGTCCAGTTTTGTATAAAATTTGTGTGTTGTTTTGTTTTTCGGAATTTTTGAAATTGTATAACACATTAAAATGTCCAACTCAACGAAGAGTGCGAATTTACGTGAAGCTGTACGATTACTTCAAGATATTTTCACATTACCTGGCTCAATTGCAGTGAAATAATCATTCAAAGATTCTCCACCCAATTATAAAAGGTAATCCTCCAAATTTATTTTAATTTTAAATATAAAAAATGTGGCTTCTTATTAAATTTGTCATGTGAACGTAGCTGAACATAAATAAAATTATTAAGCAGCATTTCCGATATGCCAAGGACCGTGTCTACGAGCGCTCTAAGACCTTATGGAAATATAAATGCAAAATATTGTCTAACATGTGAAAACAAGTTTTTTATTCAAGATTTCCAATGGGGAAAAGCTCCTCTGGTATTTTCTACAAGAGTGTGTTAAGTCACTTCTAAGTAACTTCCAGAAGTGATTTCGGCGATATCGCATTCGCATCGCAGAAGTCACTCCCGTCGGGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGGCACTCCCCGGAGTCACTTAAGCGACACTTTCAGACTCCAGATATCGCGGACGATAGTTTTCATCTTCTAGAAGTCACTAGAGGTGCCTTCCGCGATAGAAAATGCTTGCAGGGAGATATCCAATAGCTGCGCAGTGAAAACTACCCACACAAGTGAATAGTAAAATTTCATTGAATCCGTTCCAACCGCCGTTTTAGAGTAATCGGGTTATGGATTCACTCGATAACAAAGAGAATAAAATGTCAATGTATATATATCTCCTTTATAACTATGAATACTTTTTTTCTATGGAAAGACAAAATTCTTTGAATCATTAATTTATCGGAAAAGAGACATTTTTTATTGCAAAGGAATCGATATGATTCAAATAAATACATTTTGGTATATACTTTAATAACAATAATTATTAAGATGAAAATTTATAATTTATTTAAAGCTAAATAACAAGCTTCATTTTTGCGGCTTCTTCGCGTATTCAATAGTAACCTTAAAATATAAAATAATAATATAACACACTTGGGAGACTGTTTCACTTTTGGGCAATACTAGATCCCGGATCACGAAAAAAAAACTGTCAATAAAAGTACAACTGGCTCCAGTGTTGCGTTGAAAATAGCTTGTTTGGGGTAAAAAAAAAATATTTTTTACGAGAAGATTTAAAAAAAAGTGCATCGAACATTAAAATATGTAAATAAAAAGATACACACGTCCAACTATAGAGACAAAATATGACATTCTTACCACCCGCAGTTCTTGTTTCAAAAAAGCTGAAAATGTTGGGAAAAAAGCCAAAATGACAACACTGCTACAATGGTTGCGCCAGCGCCTGAAAAAAATCAATAAATCAATACTCAAAGTAATTGTATTTTCTAGCGTGCCAGCTTGTAAAATAAGCATTATTAAGCGTCAATGCACAAATATATGCAGGCCGTAAGATAAGCTTTAAACCGCGTTATAAATGTGACTGTGTGTATTTGTTTAATACTGAACCCAAAAAGTACGTAGCAAACTGTAAAAATAAGGTTTTCAGAATAGTACAGACAATAGCGTAAACAAATTAAATTTAGCTGGGAAATCAAAAGAATTGGTTAAGCAAGTTTGTTATCATATGCTTAATGGAGTATAAATTCCGAAAATTCTGTGTACAGATTTGTATAAACAATACGCGCTGGGAGCAGCTTTATTTAACAGTGATTGTATTTTTCGAACTTTTCAATATGGGGAACTTAAAAAATGATCTGTGACTTTTTTATGATTTAGTTAAAAGCAATTGTTAGCCCAAGTAAATATTTGTTTTAAACTTCAGGAATCATAAAGTTCTTGCGGATTCAAGCGCTTATATTATATAGGGTTAATGTTTCGCGAGTGTGTTGTTTTCGAACACAAGTGTACGCAATATAGGGTAATCAGCTAAAATGTAACCTTTGGCAGCAGAGCTTATTAGCTAAGAGAATTATTAAGCCCCGAAACGAAAACAACTGCATTGCTTTGTGTCAAGCTGTATGAGCGGCTGTGCTGATAAGGTTTGTGTCGTTCAAATA'..b'GAAAAAACTGCACACAGACCAGGAGTGGAATTGAAGATGGTTGTTTCTAAAACCAAAACCGTAGTGTCAGAATAAATTTCGACATTTTTAAAGCCACCAACAATAATGTTGGGTTTGATTCATCTACATATTTTTGAATGGGTTTGTGTAAAACCGATATTTGGTTAAATATTTCTGTGACACCCCTGTATTTGACTAGCCCGACAGAATTTTTATCATTTTGTTGTTTAGGCCATGACAGTATTTTATTTCGATAAATTTGATTTTTCTAAGTATGGAGTCGGTCAATTAAGATTTTTAACGACCATATATGTAGATGACACTTGAATCTAAATGTCTATGTAAAAAGTATGTAAGTTGTTCAAACAGTTTTGGATCGAATATGCGAATAAAAATTGGAATTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGACCACATAAAGTATCAAGAATATGTATATCTTGATCAGCATCCCTAGACAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTATCCGTCCGTTTCTACGTAAGCAAGTATCTCAGTTTTAAAGCTATTATGTCTTCAATGCTTTTTAATATATAACCTCCTACGCTTGGAAATATAATTCTTTAAATAGTTCTGTATTTTGAATTAAATGTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATATCTGCTATAAAAACGATCGGAAAATAATATGAAAAAATTATGTCTTTGGTGTTTTTAACATATACTACGCTTGAGAATAACTTTTTTTAATGAGTTATCAATTTCGATTTAAATTTGATCTAAATCGGACTACTATATCATACAGCTACCAGAGGAACTATAGGAAAGTTTGTGGGAAAATAAAATTAATTATTATTATTAATTATAATATTGGGAATATATTTTATTTTTTTAAGAAATTAATTTTAATAAAAATTGGACGACTCTAACATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATGAAATATATATATTTTTTAATATTACTGAAGATAGCAACAATCCTTAAAAATATAAAATGGAGTTACTAATGTTGATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATATACATTTCGGCTTGCCGAAGTTACCTTTTTTTCCTTTTCTCACTTAATCAAATAGGTTATACTTAGTAAAGCCTTATATATCGAAACAAAATGCTGTCAGGCGTGGCCAAAGGATGGAATTTCTGTCTAACTAAATAAAGTTGTCAAATAAAAATAAATTACTTTTTCTTATTTCTCCTTTTTTTTTTCTCAGACACATGAACTCTTTTTTTTGTCACACAGACGCGACAGAACCAATCGTCGTTGTCCTTAGGAGCAAAAGTAATGCCCACACAAATCCTAAAATAAAAAATCATCATAAGTAAACTTAACAGATCGGGGGTAGTATTATCATACCAATGATACCACGCATCACAGCCATCACATCCAATCATAGCAGAACCGTCGTCTACCTTCCCACAAGCCGGACAAATCCATATACGGTTACCCTCGGCGTCGACGTATGACGATGGACGATTTGTTTCTGCAATATGTGAATTCTCTTCTGGAACATTTGCTGGTGAACTAAGCGAGCAAGATTTTGGACCTCCTGATGAGAGTGAGTTATTCATGGTCGTATTAGATGTCAACATCAATTGCTGTGGTAACAAAACTGAGCTAGCCGAAAGCGTTGACGACGCAACATTACTGTTACTAGGGTTCGACATCCAACCGGCTGAGCTGGACGAGTTTTGACTTGTGGATATCTGTGAAGTTCGCGTAGCCATTGGGAAAGGTTCCTGTATTACTTTCATAGAGTTACCGGAACATATGTTTAAAAGGGGTCCTGCACTTGATATGCCTAATAAATGTGTATCAGCTGTAAATAATATGAACGTTTTGTCATTTTACTAAAGTTATGAACAAAACCCTACATACATTGTTTGTTCTTCGGTGGCCCGGTAACCAGTGGAGAGAACCGGGCTAGTTCCGGGGAATTATCTCGCTCACGCTCTTTATTTTCTACTGGAAACATAGTTGGCTGTGACACCTTGACAGCATCCGTTGTGTCTTTCTCTTTTTCAGGACACGTTGTGGACTTGCCACTTAGTTTCAGTGTTAGTTTTGGTATTTGACTTGGAGACTGCTGTATTTTTGGAGACATCGCACAAGTGGCCGATAGTGGCGGTTTTACTGACATTGGACTGGTTTTCAATACAGGTGTACTCGCGGGTACACTTTGAGTGAAGCCATAATCTAAGTTGTTAATAAAAGGTGCCCTAGAAAATTCGTCGACTTCCGGAATTTGGATTAAAATCTGTAAAGATAAGGGAAACATTTGCAACAAATCGATGAAAAGCTGGAACTAGTGAATACTACAAAAAGTATCCTCGCAATAAGCACATCAGACCGAAAAAAATAAATTATTTAAGGGAATTGGAAGTTTATGTACCCTTACAGTTGAACCAAAACTAAACCGGTATTTTGGATAAATATGATCTATGATAGTTATTGGCTTTTCTAAAAAACTACCGATATGATCAATAAATTTTAGAAACATATTGACAGCCGATCTTAACTTGCCTTGTAAGGTTGAGCAAACTACGTTAAATTCGAAAGTATATCGCATCAGAGGTGCAATATTTCTTGCGAAGTTTTTTTTTTTAATTTGGCAAAAACTTGTAATAAAGGGACCATATCCTTAAATATTATTATTAGTACGTTCAATGTGTTCATATTTTTTGTCAATTTTTTTTAAAGTTTTAATATAGTTCCATTAAAAATATTTATAAATTGTTTTTCGTTTTAGTTCAGTAGATTTAAATGTATTCTGCCCGAATAATATTATTTAAAATGTAATTCGATTTGATTTCTTCCATAAAAAACAATTATATTCAAATTTTGCCTGAATTACTTGCGTGAGTGTTTTTTTTAGCACAGCTACACATCCATCCATATGTTTTTTTAATTGTTGAAGCGAACTGAATCCATTATTATTTTGAAGAAAACATTTAGTGTATTACTTCAAGGTAAAGGAACCTTGTACTTCCATATCTCAATCAGGAAATAATTGCATTCCTAATGATTTATTTTGATATAATGGAATTATCACCAACCTGTTTTTCCTTGTCCTTCTTTTTTTCCTTTTTTTGCTTTTTGTCAAGCCCTTTTATTTTTCGGTCACTTTTATTAGACGCTAAGGCAACTCGATCTTTTCTCTTTGATTTATCCTTTTTATCCTTTTTTTTTTTAATTTTTCCTTCTTTAATCTTTTTAGGCTTTTTATGGTGTTTGCGCACTTTGGGATCTAGTGACAACGCTCCGGTCGGAGTAATGCTAATATCCTCGTAGTTTGGAAATGTAGGCATAAACTGCTGGTCCTCAGATATGTGATTTGGTAAAATAGGGATTACGCCTGAAGCCACTCCCCCTGTTAAGCTGCTAGATGGCACCTTATGGGATGAATATGCCGACCCGCAATCTATTCTTGCCAAAGGAATAAGATCAGCTCCACCGGCCAAACTGAACTTATCACCTCCTATAAAATTTGGCAAGTTGAATTGCGGAAATGACGACTGAGAAGGAGCTATCTGAATAAAGTTTTTTACATCGGGAAGGTTCAGTTTAACTGACTTCTTCAACTTCTTAATTGATTCACTTGGGCTTGTATTCGGCAAAACATTCCTTAAGTCCATTTGGTTCTTGTCTTCGCATAATGGTGATGGAGTTGCAAACGTTTGGTGCTGTGATTGTACTAAGCTTGATTTAGCGTGGTTTGGAGAAGTTAATGGAGATTTTTTTTGAACAATTTGTCTGTTTTGTATTGATTCGTCTGAGTCATCGGATACCTCAATCGGATCTCCAAGATTTCCAGAAGCCTGCACTGATGGCTTTGCCTTAAATTTGGAAGGTGTAAATGTATTTTCCATGTCAGTATTACCG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CAAGATACTGGTTTACCTACAGTTAAATGAAGTTGATCTTGTTTGTATTATATCAATTATATATTTACAATAAACTTACACTCAGAAAATTTCATTGAGTCTGGCACCAACGGAGCAACATTGCAATAGTTTCTATCAATCTGTAAGTCCATCTGTCCGGATCTTCTTAGGAGTTGATCATTCCCAGTATCTTGAAAATAGTAATTTATATTTTTGTTGTTTACTTTTACCGAATAAATCTAGGGTTTCGTTCTTACTTAAAATCAATAGAGTATAAACTTTTTCAACATAATATTTATTCTAAATGAGCATTATATCATGTTGCCATATCCATTTATTAGATGTATTCACTTCCGTTTGTATTCCCAGTTTCAAAATCATAATATGAAAATTGAAATTTTTAAGCCTCCCAAAAAAATAATAAAATGAGTCCATATATACTGTGAACAAAAAGTAAGTTTTCGTGTTGTGATGCACTATGTATTCTTTCCTCTCGACTAGTAGTAGTAATATAATTTTGCGTGAGACAATTCGTCTTAAGGACCAGGATTATGGGAAATAGGCACACAGATTTAAGCGTTATGGCTATAAATTTTTTTTAGGTCAATCAATGGGAACATCACTGGTGGATGAGCATCAGGAGAGTGCGCGTAGGCGACTACCATATATAGCCGCAGAACTGGAAATCTGTGACCGTACTAATAAACCCATTATAGAAAGTGTCTTTATTTAGTCGAATTTACAAGTATTTTTCTTCACAACATTTGATATCAGAACTTTTATATGTTGATGGTGCGTGATCGCCGAGACACCATACCTTATTAAGGGTGATGCGTTTGATGCATTTCAGACTCATTTTTATTTTAGAATAAAAAATGTGGGCGCCACAGTTTTGTCCGTTTTGTTAGGTCAATCGGTATGTATTGACGAGAACAATACATTCTAACAGTTAAACTATAAAGTATTGGACGTTCGTGTAACAAACTTGCGGTGCTTAAGTAAAAAAGAAATTTTAATCTGAAATATTAACGCAGTAGTTTCCAAGATATCCTATACAATTGAAGGTCGTTACCCTTGGCAGCATTGCGTATATCTTTCTGAATTTTACAGAACTAAATAATAATTAGAAAAATATAAAGATAATGTGATACTTCACTTTATCATTTTGCAACTAATAACATTGTAGTCCGATTTTTTTTAAATTAAATTCTTAATTCAATAATATTTAACAAGTCTTTTGTTAAATATTAGAGGAGAACATAATATTAAATATGGAGGATATATATATATTTTCGTGTTATACCCAGGACGATATAGACGTCTGATATTCTTTTAATTTTATTTAAAATTGTGAAATACTAGAAGAATGATGCAGAAACAGACGCTTATTATTAAAACGCATATAATTATATAGTTATGATTTTACGTACCAGCAGAATCTTTAATTGGTGGGCATCTAACGGTGTCAGCAACAGATCCTTCTGTACCAGGAAATGCTATGAATGGTGCAATACCGACTGTGTTATTATTATTTCCAAAGCCGACCAGACCTGTTACTGCAGGAAAAAGTCCAGGTCCAGAAGGAATCAATCCCGGTCGCGGTGGAAAGTGCAATAGTGGAAGCAATGGAACCATTCCTGTCTGGTTTCCAGGATATAATGATGTATTAGACAAAGTGTTGGGAGCTGTCATTAATGAATCCGGACAGGGCGCTTCGTTTTTTTGTTTCATAAGATGAATTGAACTAGTTACGGTTGAGGATGTTGTTTCAGAAAATACGTTGTTGAAGTCCTTTACATTTTGTGGTAAGCCCGTGTCAAATTTTAGTTTGTACTTTTTTCTTTCCTTTTTTGCGTGAAAGTTTGGTAAATATTCGATTGAAGCCTGATCTGTGCTGCTGAGGTTCAGAGGCTCTGTTGGCATAGATACGCTTAAGGAATTTTGTGATACCAGCGTCTCAGATGACGCTAGCTTAAAAGCACCTACACGCGTTGACTTTTCCTTTTTAGACGATTCAATAAGGGAATGTGATGTAAAATGAGTTTGTTTTACCAAATTTTTTCCTCCAGGTTTTCGGCCCCGCTTCTTTGCCTTTATGGGATTAATAGTTGACATTTCTATGTCATCTTTAGGAGAAGATAGCTTTTGGCCCAATACACCATATTGGTTAATTTTCGAATTAGGATTATTTGCGTCCTCCGGAGTCTGGCCTACTGGGGGTGTAGGTGTTATAGTAGTCCCAGATGGAAGACTAATTAACGTCGAAACAGGCATGGTACTTCCAAATACACGTACGCCTATTCCAGGAGGTACCTGAGTTGCTCCACCATCCTGACGGGGAGTGCGCGGCTTAGAAATTTTTTTAAATATATCCAGCTTACTTCGTTCCGGTTCTGATGCATTTTTTTTTGACTGCAATGATACTTGTGTTTGTTGTATTCCTCCTGGTTGTACTGGAAAAACAGAACTTTGGGATCCAATCTCAATCTGCTTTAACACTACAGGTTCCGCACAAGGGATATCAGCTGCGATAAAATTTTCTGTATTCATGTCCGCTTCAATGGGAAAGTCGCTCAAAGTTTGAGTTTCAAGTTGAACACTCTTTTGCTTATGCCTATTCTGCTTTTTGAACATCTTTTCTATATTTACTTTACTTGGATCAGATAAGCTGTTTCCATGATTGACTCGCTTCTTAGACTTTTTCATGTTCAGAATTTGACTATTTGAAGCGTCATTTTGGCTCTTCGAAAGTTTTTGAAACATTTTTAAAGCTTTTCGCTGGGACTTTTCTTGAGACTTTCCGAAAGAGATATTTGATTTAACGATTTGACCATGTTCGATTGCTAGGTCCGGTTTCGGTTTTCTGTTCTTCTTTGATATTGTAGCAGTCAAAGCGGATGACATCGGAAGGCTATTCGAAGAATATAACAACGATGCATCTGCGCTATCACTTATCAATAATACAGCATTGTGATTGAAGTTTTTAGTTTCTGAATTTATTGTTCGTGTGTTTACTGCGTCTTTTTCAGATGTAATCAATTCTTTTTCAGAATGTTCCAAATGGCTGACAGCTATCAACGACGGAGGCGGTGCGTCTAAACCTTTAAATTTTTCTAGAAACACAGAATACGTGAATGTCTTACAAAAGGTCGCCAAAAAGGCTAGGACGTACCAATTATATCCGGTATAAAGGGCTCTGGCAGTTTTCCTTCGATGGCTGGACTAATAAATCCGCCTGTAGTCATAACAACGCTGCTCATTTCACGGACTGAACGACCAACATCCGAGTCTAAGAAATTCGATGAAAAGTTTATCACCGCGTTGGGAGAAGAGGAATCGACTTGATTGGTGCTTAGTTTTTCCGCCGAACTTGTCACATTGAACTCTGCCTTGGACACTAATTCTTGTTTTTGAAAAAATTCCCTTTGAGCCTCGCTCTGACTCTCCCGCGGCTCAGGGTCTTGCATTGGCGGCAAATACTCAAATATATAGACGGGACGTGTCAGAGTTTCTGCGCTTCCAGGCTTGAGAAAGTTCATATTTATAGCTTTTCTGATGGGAAAATGGGGCACATCCCTGGTGAAACCGACAGGCTCCACATTCCCAATGTAATCCAACAGTTCTTGAATATTAATGTTAAGATTTTTCATACTGAGCTGTGCATCTCTAAGACTGGGCTCGATCCGATTTGCTAAAATAATAAATATGTATGTATGAATATGTATTCATAACAAAAAAGTTCATCAAGGCGAGTCGTAAACTGCACCTACCATGTTCCATATTACAGTGCAGATCTCGGGCAAACTCCTGCGTAAACTTCTGCATTATGTCTTGCAACAACTCTAATGGGGCACTCAGTGTGCAGCTGTAACCTATAGTTTGTGTTATCTGCGCAATAACAACAAGAGCCAAGTCTGAAGCATATTTGTCTGCCATTGTTATTCTTTATATGTACGTCTCCTTTGTGTACACCCACGAATGC'..b'TAAGCAACATCACGATTAAAAACAAAAACGATATTGTTTAAAGAATTCTTCAGAGCCCGTACTGCATTTTAAAGGGATAGACAACGTTTAGACGTTGTGATAGTCGTTTTTCTTAACAATGCAAAATTTTTACCAATAAACCATACATCTCATATTAAGTCAGAAGATAATTCATTGCTTTTATGTCACTTTTTTTTTATGTCAAAGTTATTGTGTCGGTTAACCACTTTTTAGGACGTTAAGGCGAGTTAAGTTGTTTTTAATAATTACCTTTTGGGATAACACGAATTTCCAGTCGGCCACTTATACAACCGTTGTTTTCTTGGACTGCTGAACTTAAAGCTACATTACTTCTTTGGCAAGCCATTGTCTGTACTTTCCATGGTTTATTGGCGTCTTCAGCCAACATTGCATCAGAATTCGAATGAATCGGTTGGTCGTCAAATAAATCGGCAACCGACACGTTAGGAAGGCTTCTTCGATGTTTCAATTTAGCTTGACTATTATTTGAAGTATTTAACTGAAACGTGGCGTCCTCTTTAAAAGGGGAAGGAAGGACAACCCTTGAAACTAAAGAAGTGGCAGGCTTAGCTTTATCCAATGGAGTGATATCTGAATATGTTTCTCGAACACAAACATTCCTTGCTATGTCCATGCGATATACCTAAAAGTTAAAGTCAATATTGGTATAGCACGCCTTTTGTTCTGTAGTAAAAACAACATACAAATTTCTATTTATCTATTTTATGCGTTTTTAACTATTAATTGGTTTACGGATTTTATATTAAAACACCTAAAATGTCTTCCGCTTTCTTTATTTTTAATTATTAATATGCTTACTGTGTCATCAAATGCTGCTTGTTGCACAGCCGGTGGTTCCAAGTCTTTACGTAATACATTACCCATTGCAGGCTCAGACCAACAGTGCGGTATGGAGATTCTCAACGCTTCATAATTCTCGATTCCAGTTATGTTTAATGTATATCTGTGAAAAAATTAGTAACTATATTTTTGAAACTTGAAACGCAAAAGATCGTGTCCCTTTAGATCGTTCCTTTAACAGTAAGTATTAAAAAAGGATGAACCCTATAGTCGGGTGCCTCGGCTATCAGGTACCCGTTATTCAGCTTAAGCCAAAGGGAAATGGAGATATATTAGCAGCAAATCGATTTTGTAAATCGCCGACGTGTATGTTATGTTGGCGGCAGACAGATTTGAGCTTTTTGGACGTTTGTGGGCGTGACAAACTTTTTTCAATCGGTCGGTATTGATGAGACAAATACATTTGTTTTCTAACATAAAAACGGTTCGTGGATTGTGGCCGTTAAAATGGGCGTGGCACACAATAATACGAAAAAAACCATGTTTTTTTTTCCCTGACGGCACAGTTAAAATGTATTTACTCAACGAATGGTACATTAAAATATCAAATTTTTACAAAGAAATATTCAACAAGAAATGAAGCTAACATGGCTAGATCGACTCGTTTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCGTTGCAAACGTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATATGGCAATGGTAGCAATCGTCCGAATGCTTTTCTTGAATTTGAATTGAAGTGCGGTGCCCCCCATAACTCGTTTTGAGTCTTCTAGTTTTTTTCGTTTCCGAGATCTCAGCGCTCACACGGACGGACGGACATGGCTCGGCTAGTAATCCTGACCAAGAAAATATATATGATCTTTATGGTGTCGGATACGTTTCCTTCTACCTGTTACAAACTTTCCGACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGGGTAACGGGAATAATAAGGAACAACCACGACTATCAGATACTTGCTAAAGTGAACAACAGGAATAGGTATTGATGGATTTTACGTTTATTTTTATTTTAATTTTAGGTAACACAGTTTTGGCCGATTTGTGGGCGTCAGAGGTAGTGTAGTCTGGTCGGAAAAACGGATCGGAAAAAATATCGTCATCAAAAGATACTTTAAAACAAGTGAAGAAGTTAGCTTCGGCAGGCCGAAGTTTGCCTACCCTTACAGTAATAAGAAAAATTCGATTTTGTAAAAAGTCGGCTTATTATTAAAAAAATCTTTTTTAAACCATTATATTATTATTTGTTAGCATGTTAGGGTCATCTGGTTTTTATTATGATTGCGATGGTTACAAATGATGGTTTGGAAGAAAGAGTGGTAAAATAAAAATGTGGATTTTTCTCTTTGAACCAGTGGGGATCGTTGTACTCTCACTTAAAATACGCATCGAATAACACCTCAACTGCCAAAATCGAATGCTCTGTTCAAATTTAAATTTTGCTAAATGTCGTTAGAAAGTTATTTCGAAATAGTATACTATATATATTTTATTATTAAAATATTATACTATTAGCATTTTTTAAGCTTTTCTTCTGATTGCTCAAAACGGCCCTAAAATTTCAAAATAAATTTTAAGCTGTTTAGTTCTTGAGATTCTTTAACTTTCAACATATGACACGATGTCGTAAGAAGTCCCGTTTGAAAGTTATTAATAAAAAAATGGCTTCCTTTGCGAGTTTACAACACTATTGAACTTTTTTGTACGTATCTAAACTCTATTTGACGGTCCTGGAATTTTTTGAATATGTTAAACAGCTTAATATGAAAAAACTCCATAGTTTGGAGGGAAAACAGCCTTACAAAACATAAATTGGTACGCCCGCTTATGCCGTTAAAAAGGGATTTTTGAAATACTTTGTACGCTTTCCTAACATTATTTGTCTAAATACCATTGTTTAAGGATTATCGTCGATATTTCTTAACATTTTTTCTATTTCTCTAAAGTGGCATTAACGATTCTGGGCTAAGCCTTAAAGTGTGTACCCATTGCATTCCTGAACGTTTACAGCATGAACACATTCTTGTATAAAGTCACGTTTTAAAGTTTGAATTCAACAAATATTGCCACATGTAATAGATTAAACTTTTTTTGCGTAACTATTAATATTAGGGTCGTAGAATCATTTAAATTGTCATTAACAGTTCTAAATAAGAAACTTGAGATCTATACTTTTTGTGAAAGTAGATGATTTATAATATTGGATTTAAAAAGAACAAGAAAGGAAGGTAACTTCGGCAAGCCGAAGTGTGTATACCCTTGTAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATACTTCTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCTCGATTTCGTCCGATTTTGATATATAAAAATTTGTGATTTTAAACAAAACAAGGAAGAACTCTATAGTCGAGTGCCCCGTTAATCAGTTTAAAGGAGCAAATGGAAAATAAGCAGCAAGGCGACATTAAAAAGAGCTTGCGCTGCGCAGGAATCCCGGGAATCTGCATGCCAAGTCCGAATCTTCTAACTTTTATAGTTTCCGAGATCTTAGCGTTCATAGGGACAGACGGTCAGACGGACGGAAGAACATGGCTTGTCGATTCGGCTAGTGATCCTGATCAAACTTCTGACTGAATCGAAAGACAATTATATTTCGTTTTCGGCAAACATATACGTTATTAAATAAGGAAGAACGCTATAGTTGAGTGCCTCGTCTATCAGATACCTGTTACCATTGGAAAGCACATCCAACCTGCTATCTCGGTATTTGGTTTGTGGGCGACAGACAATTTTAAGCGTTTTAGCCGTTTTGAGGCGTTAGAATAAGCTTGAAAACAATTTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTTTGTGAGACAAATAGATTTCAGCAAAAAATGTCTAGCATGACAACTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCGGTTGTGGGCGTGCCACATTTTTTTTTGGTCAATCGAATTTTGTTCTATCCTAAAAACTGTAGGCACTACAGATTTTCGCGGATTGTCGGATTTAGAGTGAAACAAACTTGCGCAAGAAGCACAGGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a06/4a0/0d/scaffold_27-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATCTGCTAGGTCTGACTGTTCTTGCACTTATACTTTCTGATGAATCTAGTATACGCTTTTACTTTACGAGTAACGGGTATAATTATAAAAATGATACGTTATCCTAACTAGCCATCAGCGTCTGTTCGTATGAACGCTGAGATGTCAGGATGTATACGAGCTATAGGATTGAGGTATTAGGTCCTTCACCGCGTTTCTGACTGAAATCATAATACCATCCGCAAGTGTATTACAAATGTTATTTCTTCTTATTATATATGGACACAAAAATTTACCATGTAGGTATATATGTATGCGTGGGACTTACCTTTTCGGTTTTTCGTTCCCTTCGATTGGAGGTTTAGTTAATATGCCTGTATCAGTGACGACATTTTGGCAAAAATGCTTGGCTTCATTTAAGGGCAATGGAATATCCAGTTTAATCAATTGCTCCAAATTGGGTTGCGACTGCGAGTTGAAATGTACGTGGTAACTTTCATGTATTCTTATAAGTGCGTTAATACATTTTGCAACATGTGGCAACAATTGGCTTTCAACTACGCATGATTGCAATTATTATTATTTTAAAATAATTTTATTAATATTAACGAGAATGGTTGAAATGGTTAGTCACGATTACAGGAAGACATTTTAAGCGTTCCATATATGTATTTTAAGTAGTGGTTATTACCTGTGGTTCTCTGTTCCATTCGTTATCTGTAGTGTCCTCTGAGTCATCAAACTGGCTCTTCCATTGTGATGCCAGCGTAAGAGCTCCGCCTTTGGTTACCTGTTGTAATGCTGAGACATTCTCGTCGTCTATTAAAGCAAATTGAGTCACCGAATGATCACCTGCAACACTGCTTCTGGCGGTGTTGCTTCCAGTTCCACCTCCACCACCTGCTGATCCAATATTGATTCTATGAATTGGATTTGTGTTTCCGCCAGAGGAAGATGGTCTTAAATTGGTAGACGTTGCCGAACGTCGATTAACTTGTGGCATGAGAGTTATTCCAAAAATTTGACCATGCTGGTTAATGGCAAGTTTGGAGGACGAGCTGTTCCCGGCGGCTGGACCAGCATTGGAGCTTGAGGGATCTTGTTTTATTGATAAATCAGTCCCTTGTTGGATGTGGCCCCCCGTTGTTAGATCATGTACACTCATTGGAGGAGCTGTAAGCACACGGAGTCGCCCAAAGGTTGATTTCGGTTCCTGCGATGCTCGTTTGTCTTCGGAGCTCTTTTCGTTTGCTACGTTTTCCAGTTTCTGTACTTGCTGGTTGGCGGACTCTGGCAAATTCAGCTTTTTCACTTGCGATTTTTGTTGCTGTTGTTCCCCAGACAGGAAAGCTTTATTAGCACACTCAGCGTCATTTGAATCCACGAATTTCTCTTCAAATATACTTTTAGGAGCGACGTCAACTGTACTTTCGGACTCTGCATTTGGTTTTGTTGGTAAAAACATATTTGGTGCTTTATCTTCCAATTGTAGATACTGTAAAAAAACTGTGAAATAAACAAAATTTTGTATAATTTAAAACTTACAGAATTGCCGTATACCGGCGCGGAATTGTTTTGATTCGTAGAGGAAAAAGATGCAGCCCCTTTTTGAGGTTGAGAGTTCTTTGTATGAACCTGCACATCATGGCTTCCCATCCCTACCATTGGTGACTTGATTGGTACACTTTGCATGTGTGGTATTGCCGCTTGAGAGTTTATAGCTAACGCGGCCTGCTGCTGGAGCATTCCTTTCGGTGTGATATTTTGATTATTTGCAGTACAACCAAGTTGTACGTTGGCTTCTCCTGATGTTTTTGGTTGAAATGCCAGTGTGGTTGCGTTGCAGTTTTTATCAACCTTTAAAAAAGAATAACATTTTTATTTAGATGAACTGAAGGCTTCATAGTGAGTTACCTTTTCTTTAATATGTAAGGGCTCGGTCGCTGTAATATGAGCGGTTTCGATATCACCTCTCTTTCTGACCTATTTAATAATTTAAACAAATGATTTTTCATTAATCGAAAAAGCAAAAAAGATTAGAAATAACTAAATAATGTCAATAAAAAAGGTAAACATAGTCAGCACTAACACAAGTTTTCCCCATCTAAAGGGCTTAGTACATACTTGAAGTAAAGGGCAACACACACACGCGCGATTTTTAAGATGGCATTCTTGAAACTTCGCTGAAGAATAATACTTATAATTTACTTGCATTAGTTTGTCAAAAAAAAAAAAAATGTTTGACTACCTGCGTCGATTATACTAAAACTACGCGCTTCCAGCGACAACTAGCGAAAATACCGCAAAACTTTTTGACAGCCTAATAATATTTTTTTTATATTAGTAAAAATAAAATTCATCATATGTTATCTGTTTGACACTTTGCTTTAGCATATGAAGTAAAATATCACCTTATCCAGCAGCTTTGAGCACTTACATATTCCGTTCCGCTTGCGTTAGATGCTGCCACGGTCATTTGTGTTATATTCCCGTGAATGTAATCATTTTTAACAGGAACTGGCGGATTGCCTGATGTACTTATGTTGCCAATAGTTGCAGAGTCCACCTTTTCCCAGTCGTAAGGGTCAGACTCCTTGACGCCGCGTCTTTTCATACACCGCTCAAATAAACCGATAAGCATCTATAAGTGTCAACAATTTTATTTCTTAAACAGTTCCTAGATTCGTGTAATATTTGTGTTACCGCGTAATCCGGTCGATCTGCATAGGTAAGAGATTGAATATGCTCCAAAAATTGCTTTAAATCTGACGGCAAATGTTTTAACAGTATTCTGTGGTCGTACTTCTCTTTTGTCAACCCAACTTGTTCCTTGTCTTTTATTTTTCGCCACGGTAGTTGTCCGTTTACGAATTCCACGAGCATATAGAACAGAGACCACAGATCGTCGTGCCGTCCCATTTCCCTATTGCGATGTGCATTTATAGAAGCATAGCGAACGGTGCCGCGAAATCCAGCTGCAGCTCTTGGACAACGCACTTCTCCAGTACCAGTGGTATACTGACGTGCCAATCCAAAGTCTAGCATATAGACGCGTCGACAATTATAAGGCAATCGACCCACGGAAAAGTTGCTCTAAAATGCAAAAATTGGTTGACTAACTTGTATACTTTGAGTATCCCGAAATATTAAAAATCAAATGGTTTTTAATAGTACGGGGCCAGGATCTTAGGAAAATAACTATTACCGGTTTAATATCACGATGAAGAAATCCCACAGAATGTATAGATTCAATGGCCTTCAGAATTTGTAACCCTAACCTAAGTGTTGTACTAAGCGAAAATGCGCCACGCGGCTGAGCGCGGCGAAGCTCAGCTAAGTTTTTTCCTTGAAGCTGCATTACCACATAGTTAAAACGATCATTTCGTCCACATCCGATGAATCGACATACATGCTCCTTCCCCTGTAGTTTCTTTAGAACGGCTACTTCCATTTTAAGCACCTGCTTAGGCTGGCGGGCGGATTCTACTTTAAGGGCGACTTGTTCTCGAGTTATAAGGTCTTGTCCCTCGTAAATTTCTCCAAAACCGCCTCCACCGATTTTACGCACCACCTGCATGGTAAGAAACAAACATTTTTATGTAAATTGGTGTCCATTTGAACTTATTTCAAAATTATAGAAGAAATCATGAATAAATACTTATTTATGATGCCCATCTAAGAAAAATGTAATTCTGTAATCGTCTTTTAACTACCCGTTTCTCAGTACTGAAGTACGATGGAGATGGTGATATGCAAGCAGCAAAGAGATTCTAGTCAAGATAGCACACATTATTTTTATGTAACTTTTTAATGAATGGTACAGTTGTGGCATGTAGACATTTATTTATAATATCATCTTCGGTAGTAAATTAAACTGGAAAGTAATCTATAGGTATTTAGTTTTCAAAAATCCGAAGGGGTGTAGAAACTTTGTCTTTTCGAAGCCAGCTTTTGTCAGCGTCTCATTGCTTTAATATTCCAAAAAAAAAAGTTAACTTCGGCA'..b'AAAAATAGTAGGAATTGCATTGTAATGCATAACTTTCTTACGCATTCATATATTTTTGAACATGGTTTAAGAGAGACTTACAGATTTATGAGGCATCGTCTACCTCTCACTTAAATATCACCTAAATATTATTATTATCGTTTCTAAACACAGCAACGAAACATTTTTTTAAACAAGTGCCAGATTTTGGCAGCCTGCAAAGTGGCCGAATGAATAGCAAAAAAATGTAGCGTTCATTTTAATCTTTTATGTCATTTCCAAATCGAATCAATCGGCAACAATAGGATTGCCAACAAAATACAATATATGTACCTAGCAATCGATATTTTCAAACATAAAATATATAGGGTATTCCCTGAAAAGCTGGTTCAGTTAGGTATAGCTGGTAAACCATCGATAGTAACTGTATAGATGTTTTCTTCGAATCCAATCATGGTATCGAGATAGTTTCTAATTAATTAATCTGAATGCAGCAACAAATAACTGACGCAAAAGCAATTAATCGGTATAAACAAGCCGTAGGCGTGAGAAGAGAATTGCACACTGTGTGTTCTCTATAAAAAATGATATGGTCCTAAATAACATGGGGATATTTTTAAGGTCATTAAAATTAATATAGAATAAGATTTCCAATCAGGCAAGCGAAGAAGGCACCAGAGAGAGTCGAGGCCACTTAATAGAAAATACCCCTTACTCACAATTACAAACCGCGCCGCCTAGCGAAGACTATACTACTATGTATATAGCCGCTCGTAACGAGTGACACCAATCGAAAGGTATCGCAAAAACTAAGATATTAGAAATATCGATTTGTATAAGTAAAAATTTAGAAAATTGGAGCTGCTGGATCAAGTTTCTGGATACGGTGGGGATACACTTGCTTTCAACCTAGTTTTATTCTAGCTGATAATACGCGTCGCATAACACCTCATCCGATGTCCCGTTCAAAAGAAATTCCAAAACCAAGATTCTTCCTCCCGAAATAAAAATGTTAGCCCCTTTGCTTTGGGTTTGTATGTATCCCATCTTAGTTTTCGGGTTTTGGGAACCCTATGGGTGTATAAAGTAGCTCGAAATAGAAAACTTTGTTCTACGACTTTTGGAAGGACTAGATTAAGATTCTAATAATTTCTAATCCAACAATGCTACGGATACTATATGTTTCTGAAAAGACATTTAGAGTTATGAGAAAAATTTATTTTTTAAAACCACGTTATAAATATTTCCTCAAAACAAAATCGAACGATTCCTTTTTAAATTTTAAATCTTATAGCCCTTGAGAAGAATTTAGAAGATTTTAAGCGATAAATACAGCAACCCATTACTCTTTAGTATGAAGAACATTTTGTTGCTTACCCATAATCTGTACGCTTGTTGCTGCGCGATCGCCTCGACCCCTTATCCTGTTAAGAGGCGTAAGGGTGTTTGCAGTCGTTGAGTATTCACAGAACCATGCACGCCAAATCCCAACTTTCTCGTTTTATAGTTTTCAAGACCTTGGCATTCATACAGACGGACAGAAAAACAGGTAGAAGGGAATGGCTAGATCAACTCGATCGTGCTCCTGATCAAGAATATACGCTTTATTGTACCTGTTACATACTTTCCTACGAATCTAGTATACCATTTTAGTCTACGAATAAGGGGAAACTAATTTGGGCTGTTGGAGCCTTTTGAGTATAACCCTTCCTCGTATACGATTCTCGATACGATCCTCTATAACGCAACCACAAATGTATGTTTTAATTTAAAATCCTTGGATCCTCCTGAGTAAAAGTCCAGGGTTCCACAATATAGCCCACATATTGATTTAAGTGGCCCACATAAATTCACATTTTTAATTTTCCTTTAATACATGGTCCGATATTGGATTCAAAGAGATTTGAGGATAGTTTTTATTAGATTTGCTATTTTCTCACTAAGGAAGAAATCGGTAATACACGGTAATCGATTAAAACTACACACAAGAACTAAATTAATAAAAATAATTGAGTTACTTCTAACTAAAGTTTTATAGTATATATATATTTTTAATAACTTTAACTTTGCAAAATTGAAGCTGTTGCTACTAAATTCCTAGGTTGTTAGAATACTCGCCAAATAACACCTCTAACACCCCTAATGTTCAAATCCCATAAAAATGCAATGAAAAAATTTGTCCATTTTTTGTGGGTTTGATTTGGGATTAAACAATTTTGATATACATTCGGAAAAAACGCGCTAGTATAGCGGAAATAAGAAAAAAACTTGATTTCAAAGGCTTAAAGTTTATAAAAAACTTATGTTACAAATACGAGCTATATGTGAAATACCTAATCGTACTAGCATTGCATAAATTGTCTAAATACGATAGATTTAAAGGGAATGGTAAGGTAAATATTTTTATTTTTAAGCACTTTTTAGATATTTAGTTAAAATTGTTAAAATATAAATCAATTTTATCCTTAGGCAAGGATAAATAAATTGACAACTTCAAAAAAATTTAAATTTTAACACTGATATTTTGGAAAGTAGCAAAGAGATAATTAGTTTTTTAAATTAAAATTTGTCGGTCTGAAAAGAAGCGCAACATGCCGCGCCCACTCTATCGCCCAAAACTGAATTGTATTTGTCTCTTTAATACCTATCCACTGACCTAGAAAAGTTTGCCACTAACTACTTAGGCAAGGATAAATACTAGTTGCCCAAAATGGTTACTCCGGCGCATATTATTTTAACTTTCTGAATAGGTTCAATAAGAAAAACAAACGACGTGATGCGATTTTTCGAACATTATAATCCGTGAATGCTTGACAACATTAATATATGTCTATCGGGAACAAAATATTTTAATATTTATTTTAATAATATTTAAAAAAAACTCGTTTTTTTTAGACAAAAACTATGATGTCGAACATGCTTTTTTAAATATCAGCAAGTTATATAGGAGGGCGTGTTGAAACTTATCGATTTATTTAAGAAAATCATGTGGTCTAGTAATTTTTATTAAAACAATTCTCGTAAAATCAAAATGATGTAATTTGTATAACTTTATATTAAGGAATATCACTGTTAACTTTCGTTCATTGTTTTCGGTGTCATAGGAACGCAATATTTCTATTTCCACCCTTCACAAAGAAACATCCCCATTTGTATGACAGCTTAATATTCAAGGCAAATATGTTAAATGTAAAAAGACACATAGTTTATGTTTTTGATTCGCAAATATTTCAGTAGTGATTTCAAACGTCCAAGTTAAGGAATTTGGGAAAATTAGATGTGGGGGAAAATTAATACACAACTAAATGAGAAATTTGTACACATTTTCATTTCTTACATTTCATTTCTTGCTTAAATTTTGCTGATATAACCTACCAAGCGAATATGGCTTTTAGTTTATTTGTTACGGTGTCATCAAAGATTAGAAACCTTTTTTATCTAAAAAGTCCTTTTGTTGTTAGTGTATAAAACAGGGTTACAAATCGTCCCTTATTTAACTTCGATTTTCAGATTTTTCGCACACTACAGCAACATTTAGCTAATTAATTTATGTATGATTTGATTGCTATTATATATTTTAGCATTTTCACGGAACTAAAATACAAATATCGATTTGTTAGCTTCAGTAAGCTTTTCCATCCAAGTAAAGTTCTCTTTTAAAGCCAGCTGACAAGGAATAAGCTCAATTTTCCAGGCGGGGATTGCGCATGCTCCCTTATTTGTGAAGCGAAAGGTCCTATTCGATTTGTAAGCTTTCTATCGAATAACAATTTACGATTGGCGATCGATTGTTCATTTAGTGCAATAAATTATAAATTGTATTCAATAAATTAGAACATACCTGAGGTAATCTTGTAAATGCATGTTGGCTGAATATGGGTTGTTCCTAAACGTGCTTATTTATTTATTCTCAGGTTAAAAGGCAATTGCAAATGGGAACGTGGCTTGCAACCATTTGTGCTCTGTTTTCAAATTTTACAGTGCCTAAAAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACCTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTGTAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACACTCGGAAAGTTAGTCGTAAAATAATATTGAAAAATTTACGCTTGGAAATAACATTTTTATTTTGTTTTGAATTTGGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAACATAAAATAAACATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAATATTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATAAAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTCGGAAATAAATTATAGCTTTTGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATACATTTTAATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTACTGATTATTTTTTATAATTGCAATTGTGCAATACAAACTTCGGCTTACCGAAGTTAACTTTCTTTCTTGTTAAGAGTATAAGACGCGAGTACTTGAAATTACGGCCCTAAATTCTAGATGTATTAAAGGGTAATAAAAAATAGAAAACATATTTTAACATATTTTAAATAGTCGTCCGATTTAAAAACTTCTATAAAACACAACAAAAGTAGATTATATTTGGGAAAGTCTGTCGCAGGTATCTTAAAAACTGCAAGACCAACAAAAGGTTGCAAATAAGGAATATATATACGAATATACTTTATCGCTTCTCCTTTAGTGCAAAACTGCAAACAAGGATATAACGATTTTAAAAGGGTAATTTAAAATACCCAATTTCAATTATGTAAAAAAATATTTTTTCGCGTGCGCTATAAATTTTAAATTAAACAGTAAACTATCATATTTACTCGATAAGATTAACTTAAGAACTGTAAAAAAATTGGTGGGACATAGCAGCTATAAATAGCCTGTTTCTTTGGATATAATTTGTTTCTACACCATTTCAAAATTCAGAGTCTTCGAGATACTTTTTAAACCATCGTTGCCCCACTCTCCCCATTTAACTGGAAGTAAAAGTTTCAACCCAATGAGGGCTACTAGTATCATGAGCACAGCTGTGAAAGTCCTGAATGTTTATCAGAGTGATGAGGTATGAATAACTTCCATAAATAGATATACTCGCATTTATACGTCTTGAAGAACTTCTACTGATGCAAAATGCATATAATGCCTGCATATGCGTTTGTTTCAACCGAAGGGAATGTCATATTTGAACCATCGGCACAAGTTCTTGCGAACATAACAAGCGAGGTCCACCGTTCTTTTTCCTATACATATGTATACATATATTTAAAGTCTATATGCATACATATGTATGAAGGCACGCAGTTTTTCTTGTATACACTATACCACGCCTTGTAACAAAAAAAAACTATAGCATACCATTGAACTATAATTTAGCCATTTCTTGTTTAAATCCGAGGGGGAAAATATAAGACCGACAATAGTATGTTCATTTACGTATCAGAGCCTTGTTTAAAAAAGCAGGCACCATGTCATTTATATCAATGCTCCACAACCAGGAATCTTACGTCATACGTCACGACATGAGCGACATAGATATTTGCACTTGTATTGGCCACATTGGCAATGGAATAAGATATACATACGTCTGTATGGGGAACCAAACCTTCAAGCAAGAACACATTATTCTTATACACACTAATATATTGATTCTGGCTACCGTTGATGATATCAGTCAATCTTAAGATTTTTAAACAGGCGAATGGAGTAGGTGTGTATGATTGGATACGCTTACAATAGCATGATATCACTCCAGTGTTCTGATTTGATCATATTAAATGATATTTTCAATTATGTTTAATGTTTAACTTTTTTGTTGGTATACATACACAATTAGTAATTTCTTTAATTGTACACGACTCAAGTAATAACGCCGCGAAATGTAGCTAAATAATTAATCTAAATGCTGACACTCCACTCCGCCTTATTTTTCAGCAATATTTATACTCGACAGATTCAGGTATCGATACATCGAAACGATTCACTATCGAATCATTTTCGATCCACCGCAAGCTTAGTATCGATATATTTGCAGAGTACACTAGCAAAATAAAACTTAAGTGTTAAAATGCTTCACCTAGATTTTTTTGAAGAACTGACTGACCTCTGCGGCCTTAGAACCCAACGGTCTGCTGCTTCGACTGGACGGCAGCGCTATTTGTAGATGTGAGCGGTTTTTAAGAGTTTCTGACTGCCTGCTATCTGCAGCTCAGCTGTTTGTCTTGGTTATCGCAGATATCAAACTTAGCATTTGTTTGATTTTGTTACGTTAGCACTGCGGCGTCCATCTATTTGTGCGATAAGCAGCATGAACACTTCCATACACTCGCGGGTAATGTTTGTATATATTTCTCGTTTACAAAGTTAAACATTTTTCTATAGAAAATGTATGTAGCAATCATCGCACAATCTTAGTTTTTCGTCAAGAAGATCTTACCAATCGAAGCCCTAAGAAATTTACCTATTTCTTGAAACCCAACTTAGTATAATTTTTGTGAATTCTTTATTTAATATTTTTCTTTCGATAGTTAACATACATATTTCAATCTGTTGAGACTGAACAACTTGATATTTATGTTACATCTTCTAAGTATAGCACAGCTTTAGGCACAATAAACAATTTCTTATGACGTAACCGAATTGATTACGTTAAATCAAAGTGACGACACAGATGAAGCGGCTTGTTGCATTCAATTGTTTAGTGATGCCCAATTAAATATTTACATATACCAGGGCTCCACAGCAGTCAAAAAGTGTCCATTCAGAGTGAGTTTCTTTTATAAATCAATATACATTTTAGACAATTTAGCGATACATGTTTTTCTATTTATGTATATAAGTGTTATTAGATATGCACAAGACCACATCTTTAAAATAATAATAATTTTAAATATTTTATTTATCTTGTACAATTTAGGTAATTTAATTAGCTTTCATTTAATGTGTATAGCGAACCTATGGCGCCTCATAGCTCCACCAAGCCTGTTGCACTAGTTGGTGCCCCTAACGGCGATTAGTAAAACATCTGATTTGCGACATAATATGTAATTTGAATTTACATAACAAAAAATTAATTCAGCAAGTTAATTTCGATGAGCGCCGTTATCCGCGGCTGTGTTCGTGCAGAGGCCGCGTGGAAAACGAAATTTAAAAATGGAAGGCAAAACGCAAAAAACACTCTTAAGACGCCTTCAGGAGGTCAGTGCAGATTAAAACAGGACCCTAAGATGTTGCCCACAAAGAGTAATACCACAACAGGGTGAATCTGCAAAACAGTGGAAATGCTGGTGACAATCCAATCAAGAATGTTACATAGATTGAGGGTGACCTTAGAAATCTACGGTCACACCACTAGGAATACGATATGGTGACTAGTGAAAATCTTAGCGTCTGAGTACTACGCTTTCAAGATGCAAGGTTTGAGTCCTCACTAACTTTCGAAAACACGGCTCTATAGGTAATTCTCGAAAAATTGGTGAATAAATTGAAAAGTCAAACTGGTGGTTTTTCCGCGTTGTAATTTAAAAATCAGTTAGTTTTGTTATATCTGGTGATTTTAAAAAATAAATCGGGTTATTTATATTCATAAACATATTGTTTTCAGGATGTCCGTGTATTGGGGTGATTGTTCTTGAAACTAAAAGAATTCCTTTGAAATTGCGATTCCGAATTTTAGCAATTGAAGAAAGCTCTAATCAATTGTCTCTTTGTAATATTTTATAAGTATGGTGCTTAATTTATAAATATGGTAAGAAATAGTTAAAATCGACTTTCCTTAATGATTCCTTATTAAATATTGGTTACCGCTCGTACTAAAATGTTTCACTGTAGTCATGGATTTTAATGA'..b'TAGTTGAACAGTAAAACTTAATGTTATATAATTAATGCTGTGTGGTTTGGCTGGTAGGTATGAACGAAGGTACGAACGAAGTATATTAAAAATTGAAAGTCCCGTATCTTGAGATGCTCCTGGTGTCACTCGCCTCTGGTCGTTCGCCCCTTAAATGTCAAAACCTGTCGACAGCTCGCCGTTTCTGGCTGGTTCTCTGTAACTCTGTGTTTCGGTCCGTTGCTGCTTTCTTGCTTTATCCCCTTGTTCTTTGGCGAAGACTTTTCACTGCTGATCCTCTTGTGGAATGTGGTAGGTAGGGGCGTCGTCCCGCTGCTGACAAGTGGCATTTCATCTCTTGTCCATGGCAAAGAGCAAAGTCTGTTGCACTCCGCCCTCCTACGCTTGGAAATATAATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTTGAATTTAATTTTATGAAAATCGGACGACTTTATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACGAATTCAATTTCATAAAATTATTGATTATTTTTTACAACTGCAAGGGTATACAAACTTGGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTTTTAATATTTCAAATTTGTTTCCATACAAATACATAGATACATACATACACACGATATATAAACTTTTTTTAGATTACAAATTCTGATGTCAAAATCTACAACTTATCAAAAAGAATTTAAGTTTTTCAATGCATTTGTTGCATACTTTAATCAACTAGGTTAAGGGGTAGGAACAAGATTTCATTTTCTAGACCTTCCTAAAGTACATATTTCTAATTTTTAGAAAACTAACAAAAGCTACTTAAATTTTAAGTTATGTTACGTTTGGATTCCTCTGTGAACATTAGGATATTCGTGTCCTATCCAGCTCGTTCCAGCTCATATACTATCTGCAAAGATAGTAGCGATAGTTTTTAAACTGATAAACTCGTTTGTCTAAGAACTCAGAATAAAAGAATACTTAAGCATTGTAAAGATAAAATCGTTTTGATCAGAGCAGCAGTATAATGTTTATACCCGTTAGTCGTTGAGATACGAGATTCGTCGGATATGGAGCACCAAGCAGAAAGACGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATCCTTGATAATCGTGACTAGCCGAGTCGATTTTGCCACAACCACTTAACGTCCACAAACCGCCAAAAACTGTGGCGGTCACAGTTGTCATGTTAAAAAATGTTAGGTGAAATGTATTAGCCTTATCAATACCTATCGATTAACTTTAAAAAAGTTTTCCACGCCCACTCAGAACGCAATTGCTCAGAACGCTTAAATCTGTCTGCCGGATGGTGGCGCTTTACCATATTACCACATTTCCATGCCAATATATCCTTTTTTGTTCTCTTAAGCTGAGCCGACTATAGCATTCTTCCATGTTAAATATAAAAATGTTATATTACTTTTTCATTCCGAATGCTGGTGTATGGTATATTATATCAGTCGAGTAGTATGAACCGATCTTTTAAAGTATATATTTGTTATGTCCAGAATCACTATCCGCGCCATTTAGGTATGTCACTCTACGACCGTAACGAAAAACTTGTATAGCGCCCGCATTTTTAATGATGAGCATTTAAGAGCCTGAAAATTGAATGAGACATGGAGATTCCAGCTCAAAGCAAGTTTGTTTTGGATGAATGCCAAGCCCACCCTGTTTATTTTATTTGTAACCGTCTGTCTGTCTGTCCTTCTGTCCGTATGAACTACGGAAACTATAAAAGCTAGAACAGTCGGACTTAGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCGCAGCGCAAGTTTGTTTTAGCGGGGTTCCACGCGCACAACGTCCACAATCTAAAGCGCCTACAGTTTTTATGATTAAAAAAATGTTAACTGAAATGTATTCGTCCCATCAACACCTGTCGGCTCACCCAAAAAACAATTTGCCACGCCCACAGACCGTCCAAAATTGATATCTGATAGTCGACGTGTATATCCTTGGCTGACGGCTGACTTACTAAAAACTTCTCAAATAATAAAGAGGTTGCTCAAACTAAACAAATATTTTTAAATTATATTTAACATCTTTTTATATCCGATTTAAAAAAAAAAACTCTTTTTTCTAAAGACGTCTTAGGAGAAGCGTAGTTACCATAATATCAGATCAAATAGTCTCAAAATTTGTTTTCTCTTTATTTGCCGTAGATATCAAGTTTTAAAACTTGTTTACCAGGCTTTCCGGGTGCCCCGTCGGCCATTAAGATTTCGAAGGATGTTAAGGAGGGCGCCCACTTAACATGGGAACCACCGCCAGCTCAAAAAACTAAGGAGATAATTGAATATTCAGTATACCTCGCAGTAAAACCTACTGCCAAGGATAAGGCATTGTCCACTCCTCAGTTGGCTTTTGTTCGGGTGTATGTCGGTGGCGCAAATCAATGCACGGTGCCTAACGCTTCACTGTCCAACGCACATGTAGATTGCTCAAACAAACCAGCAATTATTTTTCGGATTGCTGCTCGAAATCAAAAGGGCTATGGACCAGCTACTCAAGTTAGATGGCTGCAGGGTAAGGCCTCATTAAATTACAATTTTAAAGTGTTTGACTTGTGTGTTACTTCAATTTTTTTACAGATCCCGCAACCGCGAAACTGCAAGCACCCTCAAGTACACCAAATCTAAAACGAGTACAGGAGAAAACAACTGTTGGAGCCAGCAGCGCAGCCAATTCCTTTTGTTCGCCAAACAAGCGTGGACGCAACGGATTGCATGAATAACCGACCGATTAAGTATAGATTTAGATTTATATAGAAGTATAGCAATAATGGGATAATGTAAGCTCGATAATAATATTTAAATAATTACAGCTTCCCAGTAATGAAAAATAGATAGTTGGGCTCTATGCTGTATTCAAAGAGATTTACAACGATACTTGATTATTGATTGCAATTAATTAAGTGTTCTAAGAGTTGACAAGAAATTATGCATGTACATTAGGGCTGTTTGGCTATAACTATAACATTGAAATATAATTATTTATTGACAATTTTACATGAAACTTAAAAGATAAAAAAGCGACTTAAATACGTTTAATGAAGAATTTGTCCTCCGGAAAACAATAAATATATTATGAAACATCAGTTTTCTTTTAATTGAATGATTTACTACTTAGAGCTTCGTCAACCCTTATGTACATGCTGAACTACTGTAAAATGCTACGTGAAAAATTCCCATAAATTTTACCTTCAAAAAATGAGTTGTATCATACTTGTTAGATGGGATGACAAATTCAATTTCAACGTTTTAATTATTCGTGCATCGAACATGGCGAATGACACTAAAAAAGTATGACTTTTGCCGTAAAGAACGAAAATACACATTTGGGAAGTTTCGAAATTAAAAGGTTAACGTGACTAATATGGATTTCTGAAGAGAAACTTTTAGAACCCTGTATAGGACTCAATAGTCTTCTTCAGAAAGTTTAATGTTTTAGAGAAATATTCTATAAATTTCATCCCTGATGTATAATGGTGGTTGGTATGTTAAAAACTCAGGAAAAGATGTCTCTAAAGCAGTGGTTAGATATTCGCAGGCCTTACATTTTGGGCTAGTTCTTTTCTTCTTGAGATAGCAGAGCTGTTAATGACAACTCGGCCAAACTGCATCTCCATGTCATTGTCAGTAATATATTTACGTATGTGTTTATTTATAGACCAAGAGTGCATTTTACTATTGTACTTTGCACGATAAATTTAAAAAGGGGATTAAATCGATTTAGAAGAATAAATAAAGATTTATTAATTTACAAACAAATTTACCTTATTGTTGGACACAGCCTCAGAGCCTCCCAGACGTATAACATCCAATTTGGAAAATACAGCATTCTGGATTTCGATCTCTTTTAATGAATTAACCCCAAAACGTGTGCTAAAATGCTGAACTTTCTATTGTTCAATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CAGTAACCTGTTCTTTTGAGGCATTTCAATGTTCAGAGTCTTTTCACACTAAAAGTGCTTTGGGTAAAAAATAAAGAGACACATTGTAATTCTATTTTAAATTTGTTTTGCCACTTACTGGTCACTGAGACTGACAGGTTAGGGAAAGATTATTGAGCATATACTGGAGGCTATGCCCATACCCTTTGCAGCCAAGAGAGAAAACTAGATTAAATGATTTTCGCGCATTAATCTTTACTCTTATAATAAACGTAAACATAACACGAAAGTTTTACATATATTTGTCTGTCGACATCGACTTTACTTTTTATTATTGCACACTAATTGGGGTCGCTGTTTAACTTAGGGTTGTGTTGCCTATTTAATCTTACATACAAACATAATCTCATTTACATCAATACCTCGTCCATAAATTAATTTATTTATAGAGGCTTAAGTGTTCGTATGTATCCATATTGTTTCACTGCAAAAGACGCAATAGGAAAATCGTTGTACTTGATTTTGTATCTGTATCCTCAAGCTACGTCTGCCCTGGAGGGTTCAATCGCCGAGCTTCATGAGCTCGATGGCAGTTGGTGCTCTTGCTGATGCGAGTGTGAATGGAATCGGTGCTGTTGGTCGTTGCTGGTGGCACTGCTAGTAGTGTTGCCGTTATTACTGTTCTGCTGCTGGTCTGCCTCACTTTTTACTCCGGATCCAGGAACAGGAACAGTGCCAGTGGCCAGTCGGAACGCCGCCTCGGTGTGCGAGCGCAAAATCGCCTCTGCCTGATGCATCCGGAGCGCTGTCTCCGGATCCGGGAGGTGGTGGGGTGTGTTGTGCGCCTGGGGGTGGGGATGAGCCTGTTGGTTGGTGGGACTGATGGCGTGCTGAGAGTAGTTGGACGTCTGCTGATGGTGCTGCTGCTGGTGGAGAACTTCGATTGCATGCATTCCTCCTAGGCCAGGGTCTGGCTCAAGTGAACCACGCATCATGTGCACGTTCATGTTCATTGCGATCGATGCGGCAGCAGATGATTCGCTCTGCAAATTTGGCACATTCAAATTTGGAGATCGTTGAGAGCGGGTGTGGCTGTTGCTGGGGTGAGTATGCACCAACAAATGGGACAATTGTTGCTGTTGGTGCTGAGGCGCCTGCTGCTGCTGATGGTGATGAGAGTGTGCATGCGTATGCGGATGTGAGTGCGGGTGCGGGAGTGGATGGTGTGACTGAGTGTGATCACCGTGCTGAAAGTTAAATAAAATTCTAATATAGTGACCAGGAATTCCCATCAACAGCACAAAGGTTGATCAATTTCATAAAAGATGCGTTAATAAGGCGACCAAAATTGAATCGTGTTTTCCCTGATTATAACACTTACATGCTGTTGGTAGGCGGCAGGGCCGTTGCTGGAATTGTTCATTCGCATGGCAGCGGCCAAATTGACCACAGCAGCTTGGACTGCCGCGCTCGGCACTGCTGTGGTGTCCACTCCGTCCTGCGGTCGTGACGCAGCAACGGCAGCAGCAGCCGCGGCCATCAACGACATTCGGTTAGCCACGTGCAGATCCGTATCCATGGTATACTGGCCAGAACTCTGAAGTCGAAGCTCAACCATTTTATTAGAGGCCGTGCTGTTGTTGTTGGTGCAATTATTGTTGTTATTTGTGCTGCTGGTGATGTTCTGGTTGCTGTTCTCGTTTTCACTCAGCCCATGGTCGATGTCTTGGTCCTGATCAGATGCTGTTGATGACGTTAAACGTCCGTTAGAAGAGCATTCGGAGTTCACCGAAGGGGAAGGACACTTCGAGTTAGACCCCTCGGAGTTGTGTGTTCCCATTGTCAGGACGTTCGCGGCATCTGAAATCCCCATTCTGTCGCTAGTGCCACTGCTGGCGGCCAAGGTTACCGCTAGCATGGATTCGCGTTCTCGCTGCTCCGCAGCCGCTCGAGACTGCAATTTGAGATTAGATTGGGATCATTTTTAATTTTCAAAAAAAACTGAAATCGCGAAACAACTTCGCAGATTCCGTTTTTGCTAAGCAACTTGTAACGTACCAAAACGTATTGAGCCGCGAACTGATGTTTTGGATCCATGCGCATCGACTCCATGTGGGTAAGAAGGCCTGCATAAGAGAAAAGCGATTACATTCCTTACACAATGGGTCAACGACTCTGGGAGGTACCATTTTCATGAGTAAAGACTGCCTGGCAAACGCTACAAGGCCACATTCGCAGGCTGTTTGTTAGTTGGGAGGTCTCGGCGTGGCACGCTAGATGTTTCCGAAGGGATCCCTCATTGACGTAATGTTTACCGCACACCGGGCAAGGATGATTTGCTGTCCTTCGCTTTCCCAAATAGCTGTCGATTAAGTTGGGGCCACCGGCAGTGGCCTGATTGGAGCTCTGCGCGCAGCTCGAATCCGATGTAGTGTGCGCAGAAATTTGATCGTTGGCAATTCCACTCCCATTTCCGTTCCCACTGCTAGTTCCCGGATTTATTTCACTGAATTGGGATAGGGCTGGCAAAATGACACAATTAACGTTGTATATTAAACAAGAAAGAAAGTTAACTTCGGCAAGCCGTATACTTAATCATACAATATACGTGGGGAAACCCATCGTAACCCGCCATCTTACGCGGACAGACTGCGTCTACTGAACCTGCCCTCCCTCAAGGATCGTTGGACCTTCCACGGTGTAATGATCCTTCACTAACTAAGCGCTAAGCAAACTACCTTCTCGGACAAATGCAGTTCTCCATACCTATAAAGTCTACTCGTCACTTTCGACCTATTTCCCTAATATTTGAAAAAAGGGATTTTGAATTACATGATCCATTTCGCGTTATATGTTCGCAATATAATAAAGAGTAATTTTTGATATTTACTGAATGTTCGTAAATGTAAATGTAACAAACATAATAACCCATCTGTCTTCACCACCGCCCACTTGATGTGAGACGGTTACTTTGTTTTTTTGACAGATATTTGCTACCTTAAATTAAATAAATAAAAATATATATAAATAAATGTTAGTAACATGTTAAATTTTTATTTTTTAGCAAAGAAAGCTATATGTTAAACAAGAAAAAACGCTATAGTCGAGTCAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAATAGGTATGGAGATATATGTACATATAAGCAGCAAGGCGATATTTTAGAGAGTCACCTACCGGATATTTTGATACATGTTATGGGCGGCAGACAGATTTAAGCGTTTAAACCGTTTGGGGCGTTAGAATGGCCGTGGCACATTTTTAGTCAGTCAATTTCAATTAAAATTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGATTAACGCCAAAAAGATGGCGATTAATATATATACATAAAAGATAATAAAAAGGTATCGAAAAAATCATAAGAACGTATTATACTCCACGAGTATGGGTACAATTTTTAAAAAATACTGTTTAAATATGGACTATAAAACTATTAGTCGTAAAACTATGTCATCATTTTCTTACCTGATCCACTTGGCGGGGGGCTTTTTTCTTTATGAACGTGCTTCATGTGGGCCACAAGGGCTTCGGTGCCAAGGAAAAGTTTATGGCACACAGGACAGGACGTAGCGTTTGGGCCACCTATTAGTGCGGCGTGCTGCTGCAAGACACCAAGATGCAGCTGTAGCTCCTGTTCGAAACGCGCGGTGTTTTCGGTTGCAACAGGATTTTTGATGGGTCGAAAGGGCAAGGGATCGACACGAAGATCAGGTTCGAGGTAATGGGCGATATCGGAGGGTTTAATACAAAAGGCAATCAAAAATGCGACATGTCAGGCAGCTTTGAAGACAACGTGTGCTTACCTTAGATGTGTGGGTGCGCAGGCTAGACTCAGTGGCGAATCCTTTGCCACAAATATTACAGTGAAAGGGGCGGTTCTTTGCACGTTCAACCTGAGCGTCGTGGTTTCGTAGATGCTGCTGCAGATTCGAAAGC'..b'TGGCTAGATCGACTTGTCTAGTGATAGTGAATATATATACTGGGTTATGGGGTCGGAAACCCCTGCGAGGGTATAAAAAAATACACTTTAAGTTCTTTTTAACTTATTAATAATTTTAGGCATTAACTGACATATTTCAACAATTTAGCAATTAAACAATTTTGCCAATAATATTTGTAGTATCTAACCTGCTTAAGCCATCTATGCACATACGAATAAGTGCACTGGAAATGAATTTCCTCTTTCTATCTTCTTCTCGTTTTTTCGAAACTATACATTTCTCATGACATGTATTATTTCCTTTTTTTAAATAATTAGGGAGTAATTCAGTGCGGGGTTTGGTATTCGCCAAAAAGGTTAGAGCTAGGTGCAATGTGGTAGCGAGGAAAAAGGCGAGGCTGATTTCGTGTAGCTCTCTGGTTGGTTGGCGAGCAAGCGATGGTTTGTTTCCACTGGCTCTAGCAACCTTACATCGTATCGCCAGGGCCACTCGGTTTTGTCCGAGACAGACTGCACTTTTTATTCCCTTGGCCCAGTAGGTAGCTGGATAGCAAGGACATCACGACTACAGCCGTCTGACTTCGTCCCCTACCCCCAGACCATGAATCGCGTAAAAATGAAATGCAAACACACCCAACGGTCGGCGTTTTCAGGTTCAGCCAACAGGCAGGGAAATGGGGTTGCGATTAAATAAAAAGTCCTTGCATTTCTTGGTAGCTATATGTCGCCCGATTCCCCAGATGTGTTCCCTAGATAGACTTTTTTTGTGGGAATAGAGATAGATATTACGGTTTGCTATGTCCGATGTCGCTAGCTTTTAAGCTGCTCAAATTTTTTACAAACGAGAGAACATTGTCATATTTTAACCATTTTTCTGTCCGTCCGACTGTCAGCTATCGGTCTGAAACTATCCCAAAACCCTTCTTTCTGTTGCAGGTAGTACATAAGTCTAAGGTAAAATAATACATAAAAGACATGTTTTTGTGATTTTTTTCCTGCCGACACAAATGTATTTACTCAACGAATGGTATAATAAAGTATGGCATTCAAATAATGTCTTATACATTTTTTACAAAGATATATTCAAAAATGGCAATGGTAGCAATGGCTCGGACGTGTCTTGATAAAAAATTGAACTGCGGTGCCCCTCATAACTCGGTGCTGGATCATCAGAAATCAAAAAATCCAAGTCCATTTGTTAGATAATAGTTTGCCCAGATAACGCTCGATTTTTTTTAATTCCAATTTTTGAATTTTTTTGAAGAATTTGAAGTGAAAATTCCAATTTTTAGGAAAATATCGGATAATTTGTCATTGTAAAACCAAAATTAAGAAGAAAAAACTCGACAGCGTAACCTTGTAAAATATGTACAGAAACAGTGTTTAAAATTTTAAAAGGATCGGTGCAAGAGATTTGAAGTTATGGGGGACACCGACTTTGAAAACGTGAGTTGTGGGAAACACGCTTTAAAGTTTTAACACAAAATACAGTGTAGAATAAAAATAATAAAACTCATAACTTGATCAATTTTGCTTTAATTGACTTTAATTAACTGCAAATTTTGACACAATTTTACCCCGATAGGTTTGAAGCTGAGAGATCAATTTGCGTGGAAACGACCTGACGGACAGGTCTAGGCCACTGATTTTTTATTTTAAGGTTTCAATTTATGTGGCCTTTAACTGCATCAAATATGACGATTTCGCCCTAAATATGAGAAAATAGATATTTCATGTTTCTGAGTTCAACCAATAAGTATTGGCAAACCACGGTTGGCGCACATTCGGACTATGTCTTAATCAAAAGGTAAGAAAATATGAAATATGACGCTAAATTGCACACCTCAACCTCAAGATCCCCTATTTTCTAAGATCACAGCGCTCAAATGGACACACGGACATGGCTAGATCGACACAAAGACCCGATCCTGATCAAAACTATGCAATACAGCTTCGCTACTCTCAGTTCAGGGTATAAATATAATACAAGCTTTTGTGAAGATGTAAAATTGAGGGTGCCGCCCAAAACTATGCAATGACTTATTTGGCACACTGAGGAAAATCCAGTACATGTAGATGGCTGAACTCTGAACTGGAAATAGTTTAACTCTGCCCAATAAAGATTTTCATTTACTTTAATAATATTCTGAACATTGTCGAATGAAATTGAAACACGAAATCTTAGAGAACAGGCAACATGTCATTTTTAAGTCCTCCATTCGTTTTGGTTTTTATTTTCGCTTCCTTCTTCTCGCAGTCTCTACCCTCAGCCTTCCGCCCTCTGCCAGCACTCGACCCCTAGTGCCAGGGACGCAAACTCAAAGAGGGATGGACTTAGGTCCACCGGACCTCTTTCGCTCTATCTTAGGGGTAGCAGGAGGCGGTAACCATCGCTTCTTTTCGCTTCGCTCGGCGTGTGGTCGAGGTGAGTGAAATAAAAATGGTTGAAAAAACGTGAGGGGTGGACAAATGAGTTCGTGCGGCTGGGGGAGAGTTCGTTGGTTCGTATGTAGCAGCACACACACGTAAGCAGGGACTGGCGAATGTGTTTATGTCTGCGCCTCAGTCGTGGAAGACAAAACATCCGAGGGAAGGTCAATTGTTCGGGACGCCGGTGTCTTTAAATGAACGCAAAAGCCGTTGTTGCCGTGCTGTTTTCTGAGTGATTTCAGAAAGGCTCTTGTGAGAAAACGTTCGACTATGCTGTACACATTGCCCATGAAACAGTGCACTGGAAACTAGATAGGGCTCAACCAAGCGCGGGGGGGTTTTCGTGGGCCCGGAGCTTTTACAATCAGTTGATTTTTCTGCATGTTGTGATACCCTTTAAATGCATGTTTTTCCTACAGCCCCCTTATGGCCAGATTTTATGCCAAGGCTGAGTTGGCAAGGCAAAGTCTTATACCGCTGAGGCCCGATAAATTCCCAGATAAATTTACACTTTTTTTCTAAAACAAAGTGTGTGCATTTTTTTCTTATCCAATTTATCGAAAATTAAACTACATAAATGCTTAGGACAACTAAATTTACCCTTTGTGCAGGCCTGTGGGCGTTCAATTATTTTTATGTAGTCGGATATAAGAAATACTTGAATAGCTAGTTTTCGATTCTAACGGGAGGTGTTTGGTATAAAATAAGTGACGTAAAATGGTGGTTGGTATGTTAAAGGTCGGGAAAGTAGGCCTACAAATGCATAGAAAATATTTGAGGAAACACATTTTTTGTTAATAGTTGTGAACTAAATGCATTAAACCGATAACTCTAGTTTGAATTTTAATAAAAACATAATGCTCTCTTTAGGTTCGCATCATCATTTTGTTCAAAGTTTGATGCGATCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAAGGGAAGTGCACGGAGAAAAAGTGCATATAAGCAGCAAATAGTCTCTTTCCAATATTGCACACTTGATTAGTCCATATTAAAAGCCTTTTTTTATCAATAACATATTTTTAAAATGTCGGTGCCTGACGGGTTATATGGTTATGGTCTTTTGCGGGCGTAGAGCCCGGCTGAAACAAACTTGTGCTGTTCAATAAGCTCTACACTCCTAGCTTTTAGAGTTACCGAGATCTAAGCCTCGCAGCGGTCACACGGATGGACAGACAGCATGTCTAGATCGACTCGGCAAGTAATCCTGATCAGGAATAAGTTGACCTTTTAGGGTCGAAAGCTTTTTCCTGCTGTTATTATATTATACGAGTAAAATGATGATACTCTGCAAAAAGCATCATTGTTCAGGCTTAGGGCTCGTAGCGCACTGAAGGATTCTTGTAAGTGATGCTCACACAAGGCAAGTCGATATAGGCATGTCCGTCTGTCAATCTGTCAGGATGTATACCTTCTTATAGCCCCTAATCACACCAGTCCCGAATAAACGTTGACCTGCGGAAGGGTGCTTCTCAACCGGTAAAAGCTCAATGTTCCAATGTACCCAAAAAGATTTGTAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/a70/964/14/scaffold_23-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATAAGAGAAAATAAAATAAAACAGTGCATAATATTACTGATACATACATTTAATTTATAAATAGTTTGTCGTTGCTTACATGTTTTTAAACAATAAACTTAAAAAGCCATTAATAGTAGAAATGATACATAATACAAACTATTTTTAAGAAATAAACATTTTACTTGCAAATCAAAGTTGAGGAAGCGGGTGTCGACGTCTGGCTTTCTATTCGCAGGTGAGGTGTTGTTTAGCAAAATCAGCAATATGTTATATGTTATGTGTTATAAAAGTTACGAGAGGTTTTTAAACTCTTTTCGCAACCAAACTGAATAAGCCCACTAAAATATTTTAAAGGAAAATAAGTGACAAAATCTAACTCTAGACAGCAGTTTCACACTTCCCCCAGCCCAAGAAATAACGATCGTGGGGCGCCCAAATTAAGGCTAGTTATTGGTAAGTAAGTGTTCGGTGATGTGATGGGATGTGCTGTTCTGCAGCTGAAGCTGAGATCGTGTCTTTGACGAGGAAGAGTACTATACACAACGGAACAGATGCCAACTCACTCGTTGCAGGGTTGACCAACATTCTTCAAGGGTGCGTTCACTGATCGCGGCTGCGCTGCTCGACCGGGATAGCTGAAGCTGAAAACAATCGAAGGGACACATTTTAATCATAAGTTAGCTGGCGAACAATGTTTGTTTCTTATATGGGAAAGATAGGCGGGAAATATGAAATTACTAGGTTAAATGTTGACATTGAATATATGTTTTTTTCATAAGAATACTTGGACTTCCATTTTCAGTGCTATTTACTTCGAAAGGTTCTAGTGTTGGCACTAGATGCAGAACGTGGAGTGATTTACTTTTAGTGTTTCTGGCTCTTAAAAACCTAATTTCATCATCATTTTAGGATATTTAAAATGTTCCCAGACCAATATATCACGTATAAAGGTTGCATTATTCTCCACTTGTACTCAAACCCATTTTTGTGCCATTTTCGACGGCGTTCCTAAAGTGGGTTTAAGTATTACGTGTTTAGCTTGTCTAGCTAAAATGTTGCACTACCGCTAAATATTTTGTTATTGAAACCTGATTCACCTTACACGCCAGAGGTGTTTTAAGATGGCACCTATTCTATATCAGAAACTAGATTACTTCTTATCGGTAATTAGTATTTTCTCTTGTTGGTTGCTCACGCCACGGCTGCAGTAATTATAGAAAAATATTTCTACTTAGAACTCTAAAAACAAAAGCGGGCATTTTTAGGTGGTGAAATAAAAATTAAAAATTACATCGTGCTCCTTTTCACAGTCAAGTGTCATTGTATACGATAGCGATCTAAATAGCCGATCGTAAAGCGAAACAAAACGGAACGGAACGGAACGAATACAACACAGTTCCTTTGCGGTGTGTATATTTTTGTTTTTATCCAGTGATTAATTTTGGGGACAGGTTTCCTGGCTTGCGAACTGTGCGGCACTTGGCTCGCATGTCAGGCGGATCTTAGCACTGGCTAGCTGCTCCAGCGACACAGCCCCTGAAGGACGCAATATCGGCTCAATTTGTTGGATCGGCAAGAGAGTTGTTCAGCCGCGAATGCCCTTCAGAGGTGCAGAGTATCGGTGGTCAGTGCAGTAAGTCACTCGGACTCGCGACCACGAAGTAGCTTGCGAACGAACGCACTGATTTTAGTTTCGTGAGGATATTTAGCTACGCGAAGCAGCACACCACGGAGCACACAACCTTACGGTCTGATGTCCTTTGAACTTCTGCCGGCACGGCGAATTATCATCGGCAAACGGGACACTGCGTGACTGCCAAGGGGTTCTTCTTAAACTATCCCGCTGCTGCCTCGTCGTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCGCTGCCGCTGCCGCGGTCGGGCTTCTAACTCGGCATCTCTTTCTCTATGCGCTATTATTGTTTTCTTGAGGAAACAAGCGCGGAAAGGACGGAGTTTTCAAAAAGGACGGAAGGAAAAAGCTCCCGAAAGAAGGCATCTGCATCTTGCGCTCTCTTCTCTCTTTCCCTGAGAAGGCAGAAAGGAAGGCGGGCGGGGCAGGGACGACAAGTCGAGGGAAACAAAATTATGGCAGCGGCGGAGTTTACGTCTGTGCTAGGAACAGTGGGCTGACTTTTATATCCTTGTATACCTAAGTGTGCGGGCGCGTGTGCGTGTGCGTGTGGTGCTATAGAACTGAACCTGAACTTGCATCCCCGTCTCGGTCCCCAAGACTCGCCTTACAAGTCAACTGAGGCTAAGAATTTCGCACACTTTCGCGTACATAGAGGGAGAGGCTCGACAACGGGGGTTACTTCGGTGCTTCAAGAAGAAGCAAAGCTAAAACTAAGCAAGGATAAGAACCGCTCTCTGCCGGCACCCGCACTCTCGCCTACCATCTCTCTCGGACCTTCGCTCTCCCTTGCTCTTACTGCCAACTATAGTAACTTAACATAGCCATTCCACACCACACCACTCCACACCACACCACCATTTTCCATTGCCCCTCTCTAATTTTCGACCGCTTTCCCCGAACTAGTCGGCACACAGAAAGATATACCGGTGGCCAACGGGTGGTAGTTTAAGATAGCAAAAGAGAAGCGCTGCCGCTATAGCTACCGACTGCCGACTCGCGAAGAAAACTGGCTGCTGTCCCGCTAAGTACGAGGTAGATTCTTGAGACTTGAGCGAGCTCGTGGACGCAATGTTCCCCTCTTGAGTTGAGCTGGAACGAGGGCAGCTTTCAAAATTTCCCTGCTGGAATACGGGGTTGTTTTGATGTACTCTTAAAATAGAAGCGGACTGAATTAGGGGAAAGGAGAAGAGCGGCATGGATAAAGAGAAAATTGTTGAAGCTTGAATAAAACATAAACTCGGGTTCACTCTTACTGAAAGAAGTGGTCAAAACGAGTTCACTTTAAAACTTTTTACTTTTTGTGCAAATAAAAAAGAAACTTCCAAGGTCGTTAGTGACATAGCCAGCCTACCTTTTCACCACTTCTTAAAGGGTTCCACTAAAATATTAAAAAGCTAAACATTTAAATACCTGCATATTGAGTGGTTTTTGCTAGTTTTCTTAAAAATCTGAAAGTGATTTATACCAATGCGGGTTATAATATAAAAATATTTTTCATCAGGCTCACTAGCCACTAGGTTGATCTGGCAATGTCCACGCTAGGACTTGGACTTTTCATGTACGCTCCTGGGCTTCGTGCGCAGCGCAAAGTTGTTTCAGCAGGGTGCCACGCGCAGTCTAACGCCCACAAACGTTCAATACGCTTGAAATCTAAATATTGAATAACTAAATAGCTAACTGATTAATTAAATAATTAACTAAATAACTAAATAGCTAAATAAATAACTAAATAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATACCTAAATAACTAAATAGCTAAATAAATATCTAAATAGGTAAATAAATAACTAAATAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATACCTAAATAACTAAATAATTAATTAAATATTAACTAAATAACTAAATAGGTAAATAAATAACTAAAAAGCTAAATAATTAATTAAATAATTGACTAAATAACTAAATAGGTAAATAAATAACTAAAAAGCTAAATAATTAATTAAATAATTAACTAAATAACTAAATACCTAAATAAATAAATAGCTAAATAATTAATTAACTAAATAACTAAAAAACTAAATAACTAAATTGCTAAATTATTAATTAAATAATTAACTTAATGTATCATTAAAAACATTTTAGTCGAACAAATTATATCAGAACTTTTTAAGCTGATATCAATTAACGACCAAATTTTGAATGGTTTACATCGGTTTATTAGGTTATGCATCGAGCCGAGCCACTATAGAATTGCTTCGTTTTTATACCCATGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAGGTATATATATTCTTGAT'..b'TTTCCTGTATTATTCTTATATAAGGTTTGGTAAGAGCAAAATATCAAAATTTTTCTTGGGCATTCAAGTAATTAATGAAATTCTTTTTAAAGTAAACAGAAAGAGGTTATTTTTTATCGCTCATTATTTTCAAAACTGTAATTTTTATGACAAAAAGTGTATATATCAAAACTTGAGTAATCTTAGGACTATAAGATTTAAAATTTAAACAGCAAACGTTTTACCCAATTTGAGAAATAAAGCAACAAATTGTTTTAAAAAAACTTTTTGCTATAACTCTACTTCGGTTATGTATATTTAGACATTTTCAATATAGGTAAAGTATCTAGCAAATTGAGTTACCTTTTCAAAGTCATATAGCACGACTCTGTAGTATTTGTGTTTGGAAACTGTATTTGATTTTCCGCTAAGATAGAGGGGTTTTCCAAAAATCTTAGATCAAAAGATTTCTAATACACCCATAAGGTTCTTAATACACCTATAAGGTCCCCAAGACTCTTAAATAAAAAAAGGAATTCATACATACCCAAGAACAAAGGGACAAACATTTTCATTTTGTGGAGAAGAAGAAAACCTTGTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCTGTGAAGGAGACGCTACCGACCATACTTGTATATTCTTGATCAGCATCGTCAGCCATGTCCGTCTCACCGTCTGTATGTCCGTCCGTCCGTTTTTACTTAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAGGCGTCTATCTTTTTTCTTTTGCAGGTAGTACATAAGTCGGAAAAATTACAAAAAAGTATATCTTTGGAGTTTTTAACATCTAACCTCGTTCGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGAAGACTATATCATATATGTAGCTGTAGTTGGAACGATCGGAAAATTGGTGGAAAAATAATATGATACAAATTACAGCTTCGGTGTTTTTTGACATATAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAGAATCGGACGACAACATCATATAGCTGCCATAAGAACGATGGGAAAATTGGTGTGCAAATTATATGAACAAATTATATTTTTGGTGTTTTTTAACATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTCAATAAGTTATAAATTTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATCTAGCTGTCATGGGAAAGATCCGAAATGGGTGGTAAAATATATGAAACAAATCATAGCTTCGGTGTTTTTTACATATTTTTCTATTATATTGGGAATATAATTTTTAATATTTTTGAGAATTTAACGTATAAATTAATAAAACTCGGACGACTCTAAAATATAGCTGTCAAAGAAAAATAACGAAATTATTCTTTTTAATGTCACTGGAGCCAGCAAAACTCCCTAAAAATTTCACATGGTGTTACTAACGTTGATTATTTTTTATAACTGCAAAGGTATACAAACTGATCGTTCGGACATGGCTACATCGTCTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATATAAAATTATTTCTTTCTTTTTTCAGACCATTTTTTGACATCTTTATGTTAGAATAGTCCGATTTTTATTAAATTGAATTTGAAATTTTTAAAAATATTTAAAATTATATTCCCAATATTGTAAGATATATGACAGCTATGTGATATTGTCGTCCAGTTTTAATAAAATTTAACTTAAAACTCAGAATTTTTTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAATACGGAAGATTTAATTTATTCATATTTTCCGACTAATTTTCCGATAATTTCTATGGCAGCTATATTATATAATCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTGGCAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCGTAGAAGGTTGAATGTTAAAAAACACCAAACATATAATTTTTATACCCTTGCAGATGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGAAACGCAGTGGAGGAGATCATTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTTTGAACAAACTAGTCCCTCAGTTTTTAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGTAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATTGGGGAAAAAATTAAAAGAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTCATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGAATACTATATCATATAGCTGCCATAGAAACGATCGGAAAATTGATGGGAAAATAATACATAACAAATTATATCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACAATCGGGAAAGTAGTGGGAAAATATATGAAACAAGATAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAATCATTTTATTAAATTCAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATATGATAATATGCCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACCAATTATGCGATCGTTCCTATGGCAGCAATATGATATAGTCGTTCGATTTTGATAAAATTTAATTCGCATTAAAAAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATAAGTTAAAAAACTCCGAAGATATAATTTCTATATTATTTTACCACTAATTTTCCGGCTGTTCCTATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAATTAATTTAAAAATGTTATATCCAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAACACGAAAGATATAATTTTTTTTAAATTTTTTCCCCCGATAGTTCCTATGAGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAAACTTTCGGGATAGTTTCAGGGCGATAGCTTTTAAACTGAGAGACAAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACAGACGGACATGGCTGGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATTGAAAAACGGATACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATTATTTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAATTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTAAATACTAACGTTGTTTTTCTAAGATCGTTCGTTCACGAGATTTATTTCTTTAGACTCAAGAGTTAATCCAAGAAGTTAAGCTTAACTTCATTCTTTTATAACATGTATATAAAATCATTTTTCGGGTTATAGGTATGTCGTTGTCACGAAATTAGCAAATTGGAGAAAAGGTGAATATAAATGTTTTCACTTAGACTGTTAAAGTATTATCTCAAACCTGTAGTTACGATGACATTCCAAATAACACTTGGAATGAATAAAAACTTGGCTATTCGGAGCTGCCGCACTAATTCTCAACAAGTTTTACTTTACACTATCACAATTTTTACGTTAAGGGATGTCGACAATACTTTCCGACCTTGTTTATCACTACCATTTTCAAAATTAGAAACAAATTATGTTTGATTAACAGTAAAAACTCATATTTTGCTTTCTGCATTTAGGAATTTGATAAGATACAGAAACCAGGGACTGTAAATATGAGTTGGAGTTATTTGTGGTTTTTATGGTACATGGCCTACGCGAACTTTTTGGGATTTCGACCGCTCTACCTCTATACGAGGATATTCTTGTAGTGGCAGATGAGTAAAATAAGGAATATCTGTGTGCACGGCCTCGATTACGGTTACGGTTACGGTTACAGTTACAGTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GACACTTTTGCCAAGGCTAGATTTACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATAATATATATATATATAATTCTTTATATATAATTCTTTATGGGTCGGAAACCTATCCCTCACTGCGTTGCAAACTTGTGACTGAAATTACATACAAGCATTGATATAATTACTGGATTTTAAAAACGACGTGAGTTATACCTACACTGTTTTTTAAAAAAATACAAAGTTTTATTAAAACAAATGTGCGAAGTGAAACAAACATTACCCATAATTAATATATAATACTTGTATCGTTTTATTTTGTTACAATTTAATGTTCAGCATAGTTTACAATAAAAGTTTTTTCTGAATGAATTACTTTTTCATTTTTGATTTATTAAACACCAACCATGCGTAGACAATTTCAAGATTTTTTAAATGATATTATTTTGATGATTTAAACATGCCGTTTTTAATTTTTGATTTTTCTAAAGTATTCTATTGTCTGTTTATAAAATTCTAGATTATTGTCGCGGAACTTACGTTTACATTTTCTATGTACTTAATACAAGCACTACAACATGTTTAAGTGTAATAATACTATTGCATGCGTTTACCAGCACACATATACACAATATTTTACAACTTTTATTTCATGTCAGGTGTTGGCTACCTTTATTTTCTTTTATTTCTTTAATCAGTTCATGATCTCATTCATACATCTGGTATATCATAAGTCGAGTTCTGCTAAGACCGATGTAACTGCGATTTATTCTAGTAAAAGTATCCATTATAATTTTGAAACACAATTAAAAGATTAATAAATCTTAATGATCATTTCCTAATTCAGGGGGTCGAACTGCATCAGAAAATAATACTAATCCTAGTAAAGGTATATTGTTAAGCAGTTTATCAGAAAGTTTTTTACTTCTTGCGAAAGTGAAAAAATGTCAACCTTCCTTAATATGTCAAAGTTTGGGAAATGTTAAAATTAAATGTATTTGTTTTATAAATGGCCATAAAGGATTAGCCCTAATAATTTGGCTTGTAATTGTTGTGCTGGTGAACTCGGGCATTCTGTACGAAGTTGTTATTCTATAAGTTATTATAATGAATAATGTGACAGTATTAGAGAGATTTTGATTTGAACACCAGGCGATTTTAGATTGATAAAAGCTATCAGTGGGACGCAGTTTTAATCTAGGTAACGTCTCAGCAAGTATTATCATATTACATGAGTTATTTCATTCTATGCTCTTTATATACATACATATGCAATAGTTTATAATAGGCGAATATGTACTTTATTTGTTTATTAAAAGTTTGTATAATAGTTCGATATGTTACATTTTACATGCCTTTTTGCATAGATCATTTTAAGTAAGCTAGCTTAAACAACCCAGCCAAACTTAAATCGAATATTCAAAAACTTCGAATAAATCTGGTGATTAGCGTACATTTTTACTCTAAATTGTTTTTAACGATTGTTGACATGTTTTTAAAAGGGTTATGTAATAATAAGCACAATGCCGAACCAACGATCCAAAAACTAAATATGTTTTGTGAAAGTATGTGCTGATTGTATTGCGTTTACCGGATATTGTATTTTAAATAAATAAGTACAAAAGTCTAAATAATGTTTATTTTATTGACATCCCGTTTTGGCTGAAACTTTTTTTATTATTTCATCGAGTATCTGGAAAGTAATGTCTACTTATAAATTGTGATATGTTTTTAGTAAATGATTAGTAAGCTTTAACTTTAAGTAGGTACTTCCGTGAAAGTAGAATTGGTTAGCATTTAAATGTTAAATTGATATTGACTGAATAGGCCATAATATCTTATTTGCAATTGATTGTTATTGGTTGGAAGCATTTTTTGTTGGATTCCAAACGTAACATTACCTAGGTACGTAAACATGTAATCTCTCAAAAAATATATGTATGCTATCTGACAGGAGCTTTACGTTCTGCCATTTTGCACTTCTCATAAAACCTATCAGATATCGGTAGGTCTGCTCGAATTATGTATTGTATTCTTAATTGAAAAGTAAAAAAAAATTAGTCTGTGAATAAAATAAAATCACCTGAACTATAAAAATGCATAAAGGTATAAAAACTTCGATTTTCTGAAATATATATGTAGTTTAAAGTATTTAGTTGTGTTGTTATTAAAATGGTTTTGCAGGTATACAGAAAAGGATAATGGCGGACAAATTAAATACTTGAACAAGCCCACAACTTCAATTTTTGCATAATATTAACAATGTGGCTTAACTATTCATTATAAATCCGGAAATAATTTACCGATTAACATTGACATATACAGGCCTTTGTATACCACAATAAAACTAATAAGAAGAACTTTAATTTAAATTCGAATATAACTTAATCAAAGTGGCAATATTGAAATCTGTGCATTGACACTTTGATTAACATTCAAGTGTATTTACAATTTAGATTTAATTATACGTTTAAAAAATTCATAATAGACTCCGTTTTTTCAAAAACATTTTGACAACTTATAGGTACCACAGTTATTTTAATAATAATCGTAATCGTATAACCCCATCTCAAATTCATCAGTTTCTGGTTTTTGTTCATTCAACATTTTTAAATAATCATTCTCTAAAGATATAAAATAATTCTTATCTTTTGGCTTATTGTCATGTCCGTGTATATCAAATTGGCGGCCTAGCACATATCCTTTAGATGTAAATTCACTTTGGTCTATTTCCGGTGAAGGCTTCTTAAAAGGCCATGCCGTTAGTCCTCTCAAAATCCGATGGAAGTGATCGTTACTTAGCGGCTTTAATGTAGAACAATTAAAGGGGTTAACTGTATACAACTGTACTTTGCAATTGGCAACAGAAAGTATAAACTAAAATAACTGAAATGCACACTTTTAAAAAAAAACATATATGAATTTAAATTAGTTTATTAATTTTTTTAATATTTAATTTGATTTGTACGTGTATTTTTGATTAGCTATTATAAATATATATACAAATATACCTAAGAAAACAAAATCTACTGTTATGGTGACGATCGTACCTAAGATACCGTAAATACTATAAATGGTTTTGTGAGAAAGAGTAGTGAAAATTGGATCTGCTTAAGGCCATGGAGATAAATGTGCAAACTCTTTTATTCTTACAAAAATTACGCGTATTTTTGTAAAACACATAAGTTTGATGCTACGTACAAAAGTTTTTCGTAATACTGGATTTTCTGGCATTCTTTAAAATGAAAATTGTATTTTGTTTATCGGTTCGTCCCAAAACTTTTTTTAAGTTTGGCGGAAAACCTGGTTTAAAAAGCTACATTTAATAAACTACTACAGACTTGTACTCCCAAATGTATTTTTCAATCCGATTTTAACATTTTTTCGACTTTAGAAGGCTAACGAAAGTAATCAGAGCTACAGCGCACTATCTAAAGAAGAAAAAAAATGTAAACGACCCAACCAAAAGGTGTGCTAGCGGACTGGGTTAACCCTTACCAGTTTTGAATTAAAGAGGCAGGAACTTTAAAATAGTTGTTTTTTAATTATTTACCTCACTTAAAAGAGATCGATTTCGCTCTCTGAAATGCGATTTTCGTATTGGGTATGTCCTTGGAACACCAATGACGGAATGATCTCTTTCGGTGGAATCAATGGAAAAAAGCTCAGTTGATGGAATTTTTATGCGGGCTGCTCGATTATTTCCAGGAAACAAAGTCTTGTGTTCCTTATTAGATAGACTTTCTTTTTTATTATAAGAAGATGTATTGCCGATGCGTCTTGTGGTAGCTTTGGCGCCAGTCCTATGTCCATTTTTATTACTTTTGTCGTTCTGAAAATTTTGCTCATTTATAATTGACATGCGATTAACGTCACTATATTGGTAACTATTTCCATCAGGGCTGCGATTTTCATCCATTAATATAGAATCCGATGGACTACCAGTTTGAGGATTATAATTCAGTAGAACGCTGTTGATTAGAGATATTTAAGGCAAAAATGTAAG'..b'TCAAATTGTTCATTGTCAATTTTGCTATAGTTATAGGTTTTGGTATCACGCATGTGACTGATTTGGTACCACACGATTAATGGGAGCTCTACCTGTTTCAGTCAATACTCCGGTCGTAACATGCCGCGTTGGAATCAGTACCTGTCGATAAATATATAAATATAAAATAAGAAAAAATATTTTTGCAGCTACTATTATTTTTGCAGTTACTATTATTTGCTTGTCACGACAAGACAAAAAATTTAAAAAGTCGATTTTCACAAAAATTTTGAGTTTTTATTAAGTATTGAATGGGTTAAGAAAAGAAGTGCATCATTTAAACGGCATTTAAAATACCGTTCCATTGATGCCAAAAGTTAAACGAAGCAAGTTAAAGTTACGAATATATTTCACTTTTATATATGTCAGAATACTTATGTCAGGGTTGTACGGCTTACCAATGAATTTGAAGTTATGGCTGATCTGTTAGAGCTCGTATTTGTCATGGTGCACAATGATCCGCCTTTTCTTGGTCCTTTTCCAAATTTTCACCTAAGATTGCAGTCAAATAAAATTGTGGTTTGCCACTGCTTCCACGAACTTTCGTATGATTTGGCTCGTCTTTGTACCTATCTTATAGCCGTTTTTTAAAGCATCAGAATTGTATCATTTAAAATTTATTTGCACCAATCCGCATGTATGCAGAAGAAAGAAATACCCAAAGCTGGCTGTATCTATCAAGGTATGTCACTCTTCCATTATCAGTTCACGCACTACATGGATGTTCTCTGGCGCAACAGTGTTAGGACAACCTTTACATTCTTCGACTTTGAGAAAGCGCTGTTTTAAATTCAATGAATCAATTCTTAAAGATTTAGGTACATAAATGCAATCTTGTGATAATCCAAACGTAAAAATGCGCACGGTGTGGTTGAAAATATGATAATTTCTCAGTGTTTGAAGAAACGGGGCAGTAGGTAGGGTGAGTTTTAGGGATATCTCTCATTTGGTTTTAGCACAATCTTTAAATAATAAATAAAATTCGAAGCTTTACCATAAGTTTTCAACTTAAAGCTTTTCGTAGCTTTTACATATAGTGCACATATTTTGAACACGCAATAAGACATGTTTTGACTAACGTACAAAAATGAGTGAAAATATTAAAGTTGTAGTTCGTTGCCGTCCTATGAACCGAAGTGAAAATGAAAATAAGTGTGAAGTAAGAACAATAAATACAATTGAAATAACTGTGATATTGGTTATGAAATCTAATCATTTCACAAATATTCTAAGCTATCGATTTTTATTGCTTTCCTTTTATAGGACAATAGAAAAGGATGTAGTTGTTGGCCGCGACTATCATATACCTGTTACTCAGCTAAGGGTAGTGCTAGGGAGGTGGAGTCATGAAAGCAGCAAAGCGACATTATTGTCGATTCCTTTTTATACCCTATGATTTCAGTCAGAAGTTTGTAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCAACACCATAAAGTATATATTTTCTTGATCACCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCTATGTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTTTGTACGCAAAATAGACTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCAGAAACATTCCCAAAAGGCCTTTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCTTATAGACCCATAGGAACTATCGGAAAAAAATGAAAAAAAAATATATTTTTGGTGATTTTTAACAAATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGATTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAACCGGATGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGATTTATTGTCTTATAATATTGGTAATACAATTTTTTATATTATCAAGAATTTCGAATTCAATTTGATAAAAATCAGACTACTTTAACATATAGATGTAAAAAAAAAAGTCTGAAAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTCTTATTTTAACTTAATACGGTCAGAAACGGACTCTACAAGGGTATAAAAACAAAATTGTAAAAAATAAAAGAAGAAAGAAAATTTTTTAGGTCAGTCTATAGATATTGATGAGACAAATACATTTCAGATACATTTTTTTCTATCATAAAAACTGCAGGCGCTACAGATTTTCGCGGAGAGTTGGCTCAAGAATATATATACTTTATTGGGGTCGGAAACACTTCCTTCTTACATACTATCCGAAAATCTAGTATATCTTTTTATTTTACGAGTAACGGGTTTAATTAGTTCAAATAATGTGCAGTATAGCTGTTATAATTTATAAACTATGTTATTTAATTTCAGAACATTGTTGAAATAAATGAGTTCGCAGTTTCCGTGACAAATCCTTCGGCTCGCCTCACTCCTAAAAAGAGGTTCTTATTTGATAGTGCTTATGATATAATCACAAAAACTGAAGTTATATATAACGAAATGTGCTATTCGTTAGTAGAGAGTACCATCGAAGGATATAATGGAACCATTTTTGCTTACGGCCAGACAGGTTGTGGAAAAACACATACAATGCAGGTACTAGTTTTAAAATATATGGCTAAGCTACGTTATTAGTGTGTATTCATTATATATAAATATATTTAACTAAATTGTGACCAGTGCAATTTTGACATTAAGTTTGATTTTAGTACTAACAATAACAGATTAATATAATAAAGACATTTAAATAAGTGTTTATACAAATATTTAGTTCCTTTATTTGAAAAGTAAATAGGAAGCGTAAACGTTTTCGAACATATAAAACATAGATTTCGTAATATCTTAAACTCGTGATATAAAATTTGCTTTCATTCAATCTCAGCTGACAGAGATGACGGACCAATGGAAAAAATGTGACCGATTATTAAACCGACTATTTTATCTCATTTGCATGTAATAAACTTGCTTATATAAAGAAAAAGTGTGTCGAAACCGTAGAAGTGGTTTTCTATTTTTATTTTTTATAAGCAAAATTAAATTAATTTTCTTGTCATTAACTGAAAAAGAAAAACAACATTTTAAAGTAAGACGATTTCATGTTCTTCTCTTGATCTGGCAACTCCGATAACTACTTAGAGATACCAGAGGTTAATTGTCACCACGCTTTAAGGTGGAAGTCTTAAGGTGCGCGTTCTACCTTTTTTTTTAATGTCACTGAAGCTAGCAACAATCACTAAAATTTTCAAATGGTGTTACTAACGTTAATTATTTCTTATAACTACAAGGCTATACAAACTTCGGCTTGCGGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCTTTGGCGGCTTTAATTGTATTTGTATTTAGTACTAGTTCTTTTTAATTGCAAGGTACTACACATCCCATAATCAGTGTATTTGGTATATTATGGAATCCTCTCTTTTTATTGCATTAAAAACATTGGGACCCCGCGAAAGCTTCTGTACGAGAAAGAGAAAGTGCCCGTGCGTACCCTAATCTCACAAGAAACATTCAAGAAAGCAAAGAAAAAAGTCGATTATGAAATCTAATGTATCGATTACAGTACACTTGCCCGGGCAACTTCTCTTGAGTGTGCGTTCCACAAGTGGCGTCGCGCAGCTCAGCGTCGTGCCGCCCCGCGTCGCACCGCCACAGACCTTTGTGCACACGGCCCTCGTCATACAATATTATTATATTATGTCATACTAAAGATTGGAAAATGGATGGGAAAATAATATGAAACAAATTTAGCTTCGGTGTTTTTAAATACTGTCATAAAATATTGGGAATATAAATTTTTATGTTTTTAAGAATTTCGAATACAATTTTATTCAATTTTTCAAATTCAATTTAAATGAGAAAGTAAAAAATAACTTAATTAATAGAAATAAGACAGACCTAGCTTAGTAGTTCAAAGAAACGGGTTTATGAAAGTTATAGTTGTTTTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCTTCAAGCTAGAGTTTTTCCAAAAGTAATAGCACTAAAGTTTCTTATATAAAGCCCTTTATTGGCATACATTTTTCAGGGCTTTAAAATAACGTTATGGGGCAAAGTGGCAAACAAAATACATTATTTTGGAAGATCCCCCAAAATTCTCTTTTGCGTTTGGTTTTTAGGCTCAGCTGATTAACAGAGCATCGGACATCGGATTTAACAAGTTAGGTATCATTCGATGCGTGCTTTAAGTAAGAATCCTACTGAACTAATGGACTGTTGCATTTATCCCCTTCGGCCCCAACCAAAAGTAAAAGTTCGATTTCATACAAATTCATTTGTGCTTTTAAGACATAAAAGATCAACATTATAGAATCAACAACACGATAATGCACGGTCCCAGTCATTTTGTTAAAAACTCGGCGCATATCTTTCGAAACTACCGTGTTCGTTTAATTTGGGATCGAGTGACTTTTGGCTTTTCCTACAAATCACGGGACTGAGGATATAAAAGCAAAATCAAAGAAGACTCTGATGGAAAATACTTAAAGGAACTAATTGGCATAAGTGTCTTTTATCGGACACAAATACACTTTTTTTTGTGCACAGTAACTACTCTTCAGTTCCTAAAAGAAAAAGCTGACGTGTCAGCTTGCAAAAGTGAAGAACATGTTATACTCCATATAGACAACTGTATGGGATGTCCCCTGTTTAACAAGTGAAAATTCAAATGAAAATTGTATAAAGTTACTGTTCCTCATACTTATTTTTTGTATGGCCTGCCACCTGCAAGTGACACGTCCCAAGAGAAATCAATAATTTGAATTTAAAATACATACATTTTTATTTACTTTTTACTTAATTTTAATCAGATTGTGTTAGTTTTCTGTTGAATTACAGTTGTTAATTAGTTTTTTCGTTCGTCATTGTCTTTCCTAAACATTTGCCGGATGCTCCGAATCCCTGTCTAACGCTCCCGACACAGTGTTTAAGGCACAAAAAAAAATAAATTAAAGCTTTCACTCCAAGCCTACTGCAAAACTGAAGGGTATATGCAATACAAAAAGGCCTTTTGGATTCATCCTATTAGCTTTAAAACATTGTGTAGAAATAGACAGGATGACGAACAATTAGTCGGACGTGGCTAGACAGATTAAGAATAAAACATATAAGCAAACCTTTAGAAGATTGTGTGATTATTACAATAATTTATTTATTTTGTATCCCTTTTTCTTCCTAACACAAGGGCAATGAAAAAGCCTTTTGGATTCATCCTATTAGCTTTAAAACATTGCGTAGAAATAGACAGGATGACGAACAATTAGTCGGACGTGGCTAGATAGATTAAGAATAAAACATATAAACAAACCTTTAGAAGATTGTGTGATTATTACAATAATTTATTTATTTTGTAATCTTTTTTCTTCTTAACACAAGGGCAATGAAAAAGTAAGCAGCGGTAGTGGAATAATTCCTAAATGTTTTGATCACATATTCGAGACAATATCAATGGCAAATAACGTCAGATATTTGGCCCTCGTTAGCTACTTGGAAATTTACAATGAAAATATTCGAGACTTGCTTAATACAAATGAATGTACGAACATGATAAATCATTCTCTTAAAGAAATTCCAGGTATTGGTGTTTCAGTTCCCACTCTGACCACCCATCCCGTTATGAATGCACGCCAATGTTACGATTTGCTTATCTTGGGAAACAAAAACCGCGTTACTGCAGCAACGTCAATGAATGAAAAAAGCTCCCGTTCGCACACTATATTTACTATTACTTTGGAACAATCTCCATTTTTTAATAGCATTGGGACAGAAAATGACTTAGGAGGAATACGACGTGGAAAATTAAGCTTAGTTGACCTAGCGGGCTCAGAGAGACAGCGTAAAACTGGAGCTCAAGGGGATCGACTCAAAGAAGCGTCTAAAATAAATTTATCACTTTCTGCCTTGGGAAACGTAATTTCATCTTTGGTTGATGGTAAAGCAAAGCATGTACCGTTCAGGGACTCAAAACTTACACGTCTGCTCCAGGTAACGGTACATCAAGAATATATAATAAATATATATATATAACTTAATGTTTTTAATACAGGATTCCTTAGGAGGTAACACAAAAACTTTAATGATATCTTGTATATCACCATCAGACATAAATTATGATGAAACGATATCTACACTCAGATATGCAAGTAGAGCAAAGAATATTTCTAATAGACCCACAATTAATGAAGATCCTAAAGATGCCAAGCTTCGGCAGTACCAAAAGGAAATATTAAATTTGAAAAGAATGCTTGAAGAGACTCAACAAAAAATGATTTACAGAAATGATGAACAAATTAATTTAATTGAATTATCTATGGCGAATTTAGATGTTAAAAGTCTAAATTCAAAGAAAGAGGTTCAAATAATTGAATCAGGTAAAAATTCTGATGTTCCGCGCAAAACCACAAATTCATTATCAATAGAGACAATACAATTCAAGGAAGAAATGCAATTGCAAGCCCGAAATCGCATAGACTCTATTAAACGCACTCTAGTTGGAGGTGAACGTGTTGATGACCTAAAACTAAAAGAACAGCACCAAGCTAAAAAAATGGCAGCACAACGTCACTTAAGTGCTATCGCCTATGCATTAAACAGAGTTCAATGTGAGGATCGTGATCTCTTGCAGGGACATTATGCTACTATAACCCAAGAAATAAATATAAAAAATAATCACATTAAGAAGTGTAAAGAAAAAATTAAAATGCTTGAAATGGAAGTTTCCGATTTAAACTCTGAGTTTCAATTGGATAGAGAGGATTATTTGGACGAAATACGAAATCTTGGTCGTCAAATAAAGTTTTATCAACAATTGGTTTATAAATTTAATCCAAGTTTTCAAAAAAATGGAAGAAACTGGTAAGAGCTTATCCTGTATTATTAACCAATAATAAACCTCTAACACCTCTCGAAGAGGGTATATATTATATAAATTATATTAAAGTTTGCAACTCAGTAAAGATAACATTTCTTCTTATACGTAATATAAAGATCGGTAAACTTGAATTTTTTGGAATCGAGAACGGAAATTTAAAATGAAGTACGAAAGATTCCAGAGTGAAGTTTTGGAATTGTAAGACGATGTCCTCGGTCCTATTTCTAAAGACACTGTTTGGCTTCAAAGTTTTGATGAAGAGTGACTTAAGGCAGTCTATAGATACTTGCATTTGAAACTTAAATAATTTGTTATTAAAAGAAAGTGCGTATAATTAATTTCAAGGACGATTCTCAACATATTTATTCATCTTTTGCTCTACTTTTCCTGGGTGACCATGTCTCCGAACTTTTAATAACATTTCGATATGTCTATATCCCAACCTTATGAAAGGATGAGTTTGTTAATTATTTTTTTTTGGGCCGCAATATATTTTTATATTTTTTTCCCTGTCAATATGTAGCTGAAACATTTATCCGAAACCCTTTTTAATTATAATTCTTATTATAATTTTCAATCAGGACTCCGGATATTGTATTGCGTAATTCTTCATGGAATGATGATCTTAAAATTTGGAGGATTCCAGAGATCGATTTATTTAAACTTCCCCCTACTCCGAAAACGGGATTTCATCGTATTCATTGTTCAATTAGCGATAATAATAATTGGAAACATACTAACTTTCAAATCAACCGGGATGCAAAGAAATCTGAAATATATGTAAGTAATAAATACAAATATTCTTCTAATAGCACCACGTTTACCAATTTACCACAGCTAAATTATTTTTTTGGTTTACTCTGTTTATACTTCACACTTAGAGGAAAACCCTAAGCGTTATTGATTTCAGTATTGAAGATTTAGAAAATTATTGATTATCATAATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTATTATTATTTCTATTATTATTGTTATTATTTCTATTATTATTATTATTATTAATTTTAGTATTATTTTTATTTTTATTACTATTATTTT'..b'GGTAGTTTCATTCACCAGCTGTATACTTGAGGAATCCGAAATCAAAATGGGATCTTCGAAACTTAATGATGATTTACTTTGAACCTTTGTGGAAATATTATTTTCTCTAGAAAAAACTCCCTCCTCTTTCGTGAACTGTTTTATGATTGGAATAGAGTGTGGCTGCATTTCAATTGCCTGAGGTTCTTGAATAAATACATCTTCCTGTAATACAGATTCAACCTGCTCTATATCTTTCGTTCGCTGGGACGTGCCATGATCAAAATCAATGTTTTTTCCTTTCAAAAAATCTGAATCGCCAGCATGTTGGTCTGATCCGGAGTATTCATCATCAGATATTCCGGATGCCCACATTGTAACACTAAACTCCCCTTCCATAGTTTTAATTTGAACCAGCTTTTGCTCCCACCGTCTTGATTTCCCAGTTGAAGTAAGTATTGCTGTATCTGAGACCATGAAAGGTGAAGTTCTGCTGACAGTACCTAACTCTTCTGGTGCATTGCTATTGCTTGGCAGGCTATGTGTCACGTCCTTTGAAATTTTTTGATTTTCCTCATAGCCGATATTCTTATAACAATTGATATTCATTTGATATCCAAAGTTGGTATTCTTCTTTCTGTAAATTAACATATATCAACACTTTTATATGTTTAGATATTTAAATAAATGTACTTACATTTTAGAGGAAAATATAACTTCAGGTTTTAAGAGCGCCTTTTGACATACATTAGAATAACCTGCGTTATTACTTTCTTTTGGTTCTGACTGAATAACTGATTCAAATACTTTATTGTTGTGCAAGTTGATGTGATTGCTTAGCTGTATACCGTCTGAAAAGAAAAGTTATTTTAAAATTACTTAAAAGAGCGTAAATGGCAATGCTGAACCTGTTACACTAGTGGCTAAAGGACTAATAGATTTGAATTACGATTTTTATATTATTTGACTAAAAGGTCTACGAGCAATCTTCATGAAAACATCTTTCAATATATTTTCTGTTATTATAATGATACCGAAGCCCGAAAAACCACACAGTTCCGTCATTCTACAAACAAATTAGTTTATTAACAAGTTACTTGAGTCGTATCTGTACAACAGAACCTTCGCAGTAAGGTGCAACACAACAAGATCTGACGATTACATTATCGAAACAGAAGTCCCACAAGGAAGCGCAAAAGGGCATACTCCGTTCCTCCTATACACAGCGGATATCCCTACGAACAAGCGGATATCTCTACGTTCGCTCACGACACTGCAGTTTTAGGTCGCTCGAGGTGCCCAGGTCGAGCAACTACGCAGATAGCCAATCACTTCCTCGTAGAGGAAAGTGGTGGCAATCTGACTGGCGTATTTAAATAAGCATGCCCTCCACTGTCATTGAATAGTACGCAGATTCCCCATGTCAACAAGGTAACGTATCTCGGCGCCCACCTTGACAGACCACTACTCTGGACATCGAACGCAAAAAGTACATATATAACTAAAGATCAGAAACTTCCACAAGGTTCTGCTCTACAGTCCATCTGGACATATGTCTCCCAGCTATAGAGAAACGCGAGCACCAGCAACATAAAGAGCGCTTAATCGAAAATCCTGCGAACTATCACTAGGGCACCATGGTATATTCGCATCCAAAAGGGAACTGGGCATTCTTGTCAAGCTGGGTTTCCAGCAGATCCTGCCTACGACCTGCCAACCCAGCAATAACTTTCGGGCCCCCATACCACAATGCCAGTCTTATGTTAGTTAAATTAATTAGTCAGGGTATTCCCTAAACTGTTGAATTGCTGAATTGTTGAATTTTGGTCAGCTGTCAACGTCAAAGTCAAAGTCAACTTTCAGAAATTTCAGCCATTCGACTACCTCGGGGCTGTTGAAAGTTTTGTTAAATTGCTGAAAACCAGAGTGGTTGCTGTTCTTGGCTAAAAGTAAGAGGGTAATTCTGGTCATTTGTAAGCATGGAGGAATAGGTAAATACAAATAAAGGAGTTCTGATAAAATACTGCCTATACCAGTTCTAATAGTTTAGTTTTTTTGGCTTATTTTCGGAATTTTCTTATTTTAAACATAATCTTTGGTGAACACAGCCTGGCAATTTAACAATCTGACAAAAAGTTGACATCTTAAAATTGAAAATTTAACAGTCGTTGCCTTTATTGCTGAAATTTTCTTTTGCCTATGTATGTATCCAAAGAGAGAAGATTTCAATTATTATTAACTTAACGCAATCCTGGCACTTGTTGTAGCTTCGGGACCGATGTTCCAAAACATATATTATAAACACGGCTATAACAACATCTAACTTTTCAGATAAATAAAAATTATCTAAAACAAGAAAGGGATTCAACTTCGGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACGCTAGTAACACCATGTTAAATTCTTAAGGATATAACGGTGATATACAAAAAATTAATTTCAATATTTCACTGATCGTTTCTTTGTAAGTGTTGTCCGATTTTAATTAAACTTAATTCCAAAGTCCTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGAAAACTCCAAAGCTATAATTTGATTCATATTATATATAATATAGTTGTCAGATTTTATTAAAATTAAATTCGAAATTCAGAACTCATTAAAAAATGTTATTTCCAAACGTAGGAGGTAATATGTTAAAAAACACCAAACATATAATTTTTTTATATTATTTTCCCACCAATTTTCCTGTTATTTCTATGACAGCTATATGATATACTTATCCCATTTTTATAAAATGAAATTCAAAATGTAGAACTAAAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGTGATGTGTTCAAAAACACCAAATATATAATTTTCTTACTTTTTTTCCTAATATTCTTACTGGAAAAGAAATAAGACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAATGGACGGACAGACGGACATGGTTAGATCTTCTACTACTCCCCAAGGAAAATAAATATTTACTCATGGAAAGAATTTCTAGCCTTCAAAGTTATTCTAAAACTTAACTAAAACCCTTAAATACATACATATATTATAAGATTTGATGTAAGCGTTTAAACGGACGGATAGATAGATGGACAAAGATAGTGATTCTGAAAATTAACGTATATACCATATTTGGTCGAAATCGCTTCTGTACGGTGTGACTCATTTCTACAATTAATACTGCAAAAATAAAATAAAATTATAGTTAAATTGATATCAAATTTTATATATATATCCAAAATAGAATTTATACAAAGTAGCATTTATTGACCAAAAAACTGAAATAGAATAAATAATCAAGCCGATCTTATGAATTGCTTGTCAATAGTTCTTACACTGTGAAATATTTCACAGAAAATATCCCTGCATAGGCCGATTTTTCGTATGAGAGCTATAGTTAACCGATCTATTTTCAAACATCGGTGCACATTGGGCGACGATAAAATTCGATAGTTTTTAAACGGTATTGAAAAGGATGTACAAAAGGACATGTTTATATGGACTTGACTAAACTCCAGAATATAACTATAACGGGATTCTCGTAGTCACCGTATAGGAACAAAATTGGTGTCAAAATATAAAAAGTTAAATGTTTCAAATTTAAGCTAAGCTAAACTCAATTCTCAAAAGCTTAAAAAAGCATTTCTCTATGTGCCAGTTTTTGAACTGTGGCCTATGTCTATTTTTAAATCAGCAACACCTTTCACACAAATTGAGCGCTGAATGAGAGCCCGGTAATGACCTTCTTACAGTGATTCAGTGCTTAAAATGCATGGAATGGTGCATACATGACTTAATCACCTGCGTCGTTCATTCTGATCATAAACCTTATCGGGGGCGGCACTGCTTTTGGCGCAATTCATAAGTATGTACATTAATATACATTTTGGTTGGCACTCCGTATTAGATCCTTTATATTATCTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b30/f55/9f/scaffold_66-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTATCAATACCAATTTAAAAATATATATTGGATCCCGAAAAAAATTGATATAAACTAACTTGATAAAAAATTAAAGCTTAAAATGAATAAAAAATTCGTCTCCTAATAAAAGCCAAACTTACCGTTGCTATTATTATGGACGTTTACTGCTTGAATGCCTTTTGCGTTGACTATATCTTCTTCGTATTGTTCATTTTGAAGAAGTATGCCGTAACGTTCGTATGCCATATTTACAATGCTTTGATCCATTGAAATGTTCTGTTTACAGGTAGTATAAAAGCATTTCATCAGCATGCATTGATGCAGGCACTTGTTATTTTTATTTATTCCCCGAGCGTTGGACTCCCTGAGTTTACTATTGAACCTGAAAGGACATTAATTTGTATTTCATATAAGAAACGCAGACTTTTACCAGAGGTTGGGCTCTTGTGTATTTAAGTAAGTTCCATAATTAAACTATGTCGTTGGATGTTTTTCAAGTTAGGCAATTCACAAATATTTGATATTAAACTTACCTCGTAGTTATATTTCTTCATTGCAAACTTAAGAACATAACAACCAGCACAAGAAATAGGATGCCGAACAAAAAGTTAAGCTAGATTAGGCTTTTCGATACATGTGTAACTTTTATTTAAGTTTCACGAATAATTACTAAACTGTCATTCATTAAAAGTTTATATAGTTTTTATACTTAAAACAAAATAAAACCAAAAAGAATGTAAGCAAATTTTATAAAACCGATAACAGATGCCGTGAAATATTGATAGTGGTATTCAGGTTGTTTAGTATTTAATTTAATAAAATCACGGGCTTAAAAAATACTAAACAACAGTATTTTAGATAAGAAATGTTATGACTAGTTCACACATTCTGAAGCTTCTGTGCGATATATTAGATTTTGTTAGAAGTTGTAATACTAAAATCGGATAGCTATTTACATAAAGGATTGCTAAAGCGATCTGAATCGATCTGATCGGCTTAAGCTTCGAAGGGTGAGAACGTGCAAACTCAGTCAACTCGAAAATATGTAAAACAAAATAAAATTTAAACGATGACACATAGAATGTTTTAGCGCACTATTTTCATTTTCATGCAGCCAAACGTAGTAAAATTGAATAGGAACTATTCTACGCCAACTGTAACCACATTAATCAACATTGGACCCTCAAGAAATATTGGACCAAAAATAGTATTTTATTCTGTCCCAAAAAGTACTATTTTTGGACCATTTGTTTTTGAGGGTCCAGTGTTGATAAATATGGTATAAATTTGCAGCCACACTGGCTTGAATACAAACACCAAATTTTAAACAACAATTAAAAACAACGATAATGTATATTACACTTCTATAAAGCATAAAAACGAACGCTGTAATATCTACTGTAGTTACAGCATTAGTTATCATGGACGAATATATTAAGAATGGACTTAAATCTTGTTGAGCTCATTCGTATTTGGCCCAACGTGTTAAGAAAGGGCGAATTTCCACAGATGTAATAGATGCAAAAACAAAAATAGACTACATTATAAATATATTGTTTCGGTTTTCCCTTGCCGGGTGTCTCCTTTTGTATCTATAAATACATTGGGGGTTAACAAATTCCGATAATATTAAAATATTGCATACATGGTTATAACAGCATTTCCACGTTGACACAAACAGCTGAGCAGTATTTTAGAATTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTGAGGATAAAGACAAAAACTTCAACCAAAGTTTTGCCACCAACAATTTTGTGCCTTTTTTTATATGAAGTTTTTGGTTTCGGATTTTTTGTTGGGTCGTATACTGAGTAGTACTCAGTTAAAAAATACCGAGACGTGAGTACTCAATCTAACAAAAACTGGACAAAAAATACTATTTTCAGACCAATTTGTTTTGAATGTCCAGTGTTGATAAATGTAGTAATATCTGCGTTTAAGTTTACGGTTACACTGGCTTGATACAAGGAAAAATGTAATACCTATCACTCACAAACGGCGAGCTAATTATAGGAGTGAGCGAGAGGAAAATAGGCGGCTAACGCTTTTCGTAAGATTTGCTTTTCAGCGCGGTACTTAGAGAGAGGGAAGCCCCCTCCCGCACCACTAGTATTTTTTTCTTTATTAATCTAATAGGAATTTGATTATTAAAATTGGTATTTAGAAGTATAAGAAGAGTTAGAGTGGGTGCCGAAACAGTTAATTTCTTTAATTTGTAGTTTGTAGCTTGTTCTATTTTTGTCGTTAGAGTCCTAACCGGTACAAATAAATTAATACTATTTAATAAAGTGGGGTAATCAATATTGCCACCCAGTTAGTCCAATACGAAGAGCAGCAGGATTAGGATTCTTCGCTCTTGAATTGAGGTCAGATGCTCAAGACGACATATACATACGTATGAAAGAAATGACTCCTGTATACATATTGACAGGTATTTAGAATTTTGAATTTTAAATTTTAAAGCTACCCATCAATCGAACAAAACAAGCCATATTTTGAAAAACTCCGTTTTATGGTTTGTGATCTAGAGGACCAACTCGACCAGGAACTAGCATCAATCTTCTTTGGGCATTTTCAATATATATTATAAGCATTTCCCAGCAGCAAATTTTGGTTTGTATCAATGTTGGTATTTTTTTCAAGCATCAATACCCCAACACCTATTAAAAGTGAGAAAAATAGAAGGCGAGATTGTATTGTATTGAGTTTTAATTATTTAAGCCTAGTACTCACATCGAAGAAAACCGCATGTTTTTCATAGGAGAAAGCGAGAGAACCGTTCCCATCCTAACTCTAACTCTCCCAAGGCGCTTGTTGGCACAGAATTGGAACCGCACGGTAATGATGGCGAAGTTTCCGCAACACTAGGAGGAAGCTCTAAACTACTAATTAACATAAATAAAAATATTCTCTAAAACCTTCCATATTTGTATTTCTTTCTGCACCACTTCAATTTTTTGCAACTTGACAGTGAGACCATACTACTTGGATTGCGGGTCAACTTTAAAATGTTCGGTCACACTACAAAGAATACAATTTTTCTCAGATCGGCTGAAGCCCAATATCCACTAGTAGTTTTAGTATTTTTCTCTAGGTAACGCGAAAGGCAACGCTGTGGCTGTTCTGGCATTGCTGGCTTTGTTTTGTCGACAAAAAAAATCAGCAATTTCTAAGAATGTTTTTATTAGTAATTACTTAATGTCAACATGGGCCTTGCGGGAGTGGTAGCCGCATTAATACGGGGATGTTCCGTTGATGCTGCAGAAATGGCAATGGCTCCGTGCCGTATAGAAGACAACCCGTCGTCTTGCTCCGCATTAGTTGCCAAATAGCATGTGTTGGGAAGCTCGTCGAAGATTGTATTGCTGCTGCTAAAATAATGCCTACATACAACAAAAATTAGATTAACCAGAGCAGCGTTGAAATAAAAATAGTCCAACGAAAAGGGCTAGCCGCCCATTTGCCACTCGCTCTCTCCTATAGTCAGATCGCGGTTTTTATCGATGTGACTGGTCTTTAGAATTATTAGCTTCGTTTGAGGCTCCTATAATTTCATTATCTAACATTTTAGGCGGCAAACATTGCCCTTTTCAATACCTATCAGTTGACCAAAAAATGTTTCCTCGCCACTCTACCACCCACAAACCACCCAAAACCGTTAGTATAGTGAGGTAAGTAACTCCTAAATCTATTTGATGGACACATTTTTAAAGATTTGTAAAATTGAAATTTTTATTTGAGTAACGGGAATTTGCCTCCCGAACATACATAGCTTTATTCGTTGGTGTACGAACCTAACAAAATAAAGAGTCCTGCTAGTTTTTTTTTTTTGATTTTAGATAATCAAGCTATTCATTTTCCCCAAAAGCTTTAGAATACTTTTTGAAAAAAGCTTTTACTCATTTAAAATTAACTCAACTTATAGCTACATTCAGAAAATCGGACAACACTTAAAAACATAGTGAGTCTACATAGAAGCAGTCTATATTGTTTGCTCTTCAACTTCTGAACGCCGATCTTTAGTACATTTACATATATTAAATATGTGATGAGCTAATTAAAAGAAACAAAAACTATGAAATACTGCATTTGGCACACAAAAACTGTATCATAATACAATTAAAACTTACAAAGATAATAATCAACTAAACCGGATGAAAACATACACATTGTGTAAAAACATTGTTGAATCACAATCAAAAAAAAAGGATAAAAAGCTTATTTTGGTATGTTCCTCAACCTTTTTTTTAATCTGCAAAACATAAAATATTTAATTCGTATTACCTGGGTCATATACAAAAACATTCTTTGTATATTTTGTTTCAGTCAAGTGTGTATCCATATGTACACTTAAAAATTCGCAGAAAAGCTTCCCAATTATATAAGCATTTCAGGTGTAGTGAATCTCGATTTCTTCCAATCAACAACACACCCAACATATTTTTTAAATTTTATATTAATTACGTTTCATAAATATATATAGCATATAACTGCGAAGTTATAACTCAAATTTTTGAAACCATTATAAATGGAAAACGGAATAAATTCAAAATGTATAACAGCGAAGTATAGGTAAATGTCTACAAAAATCAACATTTGACCTATTTATGCATATGCATATGTATTAGAGGCGGATTTGCTGGCATTTAAAACGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTAAAATATTCATTAGGATTCATATTGGCCTGCAGATTCCTGGGCTTCCTACGCAGCACGGTGCCACGCCCTCTCTAACGCCCACAATCCCCGAAAATCTGTAACGCCTACAGTTCTTATGATAAAGAAAATTTTAACTAAAATGTGTTTGTCTCATCAATACCTATCGACTGGCCTTAAAAAACTGTGCCACGCCCACTCCAACGCACACAAGCACATCTACTAAAACAGCTGATAGGTGGCGCCCTAAGATATAGTTTCGTTGCTTATGTATACATCTCAATTTTCCTTTTGCTTGCACACATTAAAATCGAGTCCGTTTGGCCGTTATATGTGCT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATCACCTGAATGATTTTGGTTTAAGGGCTAAGTGGCACTTTTACACCCCCGCTATTCATAAAATACGAGTCGAATATCACCTCAACTGTCATTATCGGACGCTCCGTTCAAAAGTAATTCGCAAATAAGATTTTGGGGGACTGCTCAAAATGAAAATTTAAGTTTGTTTATCAGTTTGTCCCAAAATTTTATTTTAGCGTCCTGAAAATTCTAGACGATGCTAAACAGGTCAATACATCACAAATTCTAACTCATTTGGAAACCCTTGTTAGTTTTGCGAGAAAACATATATAAATCATATTTTGTACTTTTTTGTATCCGTAACTGGGTGTATAGCCCTTAATATTCCTCAACATTCAATATACCTCACATACCTGTAAAAATAACCATGTCAAAGTTATTAATCAACAAAATTGCCACACAAATTAAATAAAACATGTTATTTCCAAGCGCAGGCTGTTATATGTTAAAAAGCGTAAAAAATATCATTAAAAAAATTTTTTTATATACTACTGGCAAAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGTCGGACGGACGGACAGACATGGCCATATCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCATGAATATATATACTTTATGGGGCCGGAAACGTCTCCTTCACTTCTGACTGAAATCATTATAACCTCTGCAAGGGAATAAAAATCGACGCTACGTGGCGTCATTGCAGGTGTGCAATTTTGACCCTTCGCTTCTCTGCATATCTCCAGCTCAATCGAAATTTCAACTGAGTAACGAGTATTTGATAGTTTCCTCATGTTGTTATACAAAAACAGGTTTGTGGAAAAGATTTATGTCGCGTAATATAGGTCCTTGGTGATGTAGACATTTCAGCTTAAAAAGACACCACAAAGATTAAATAACAGTTTTTTGCTTTTAATGTTCAGGCGGACATCGGACATCGCCACCAAGCTAGTATAGGAGTACATATGTAGCCTGACAGACACCACTTCAAGGACCCCGAAAACACCCACACTTATGCAGACATTTCTGCCCCAAGTAAATAACCCAAGGCGACACTCATTCAGCCGAAGTTGAGACGAGACGACGCCAGACTGGTCACATACAAGTGCGGCCACGAAAAGGGGCGATATCCAAAAATATGTGTTGTACTGCAATAAGAATATGAACTATTTACATGTCCACTTTCATTATGTGTATAACATGTTTTAAAAACATGCTTTAAAAAATATATCTTTGTATTTGTAACATATCTTTTAAATGATCAAAAACTGCTATTATTTAGTTACTGGTAAATTCTTTGAGACAACTATTAGTAAACACTGCCTGTTAAAAACTATATGATTGTTCACATTATTTTAATTTATTTTGCTTTTGTTTTAGCAAGGAAAGAACTGACGGACGACGGTCTGAATGACATTGCATACTTTATGAGGCATGACATACCACTTGAAGCTTTTGAAAGCTTTCATAGCGTTGCCCCCTCTTTAAAAAGTGTAATGTTCTGTGCTCCCAGAGCACAATCGATGTTTTAGACATCATCGATAAGAATTATGACGATATTGCAATAAGGGCAAATACAGGCGCGGAAAATATATATATGTTTTCTTATTTAATTTATACCATTTTCAGAAATATATAGGGTAAAACAAAAACGTAAGAAAACTATTTGTCAAGAATATATTTCTATAAAAACTTCTTGATCTGGCTTTAAAATAGCTAAACATTTTTTCCCATTCTGCTGAATTCCTCACCCTTAACGTCTAGTACTCACATCGGCGAAAACAGCGAACTAATCATGAGAGAGAGAGAGACGCAAGTGGCGGGGTTCCATCACGGTAGTCAGATGACCAAAGAAAATATCAGAACTAAGGATGAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAAAGGGAAACGGAGCAACAAAGCTATATTTTACGGCACATTCTACCGGCTATTTCAGTAGATGTTATGTGGGCGGCAGAAAGTTTTTAGCGTTTAAGCCGTTTGTATGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTATTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAAACAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTCTATTATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTGACACCACGCAACAAATATGCGGAACTGCATGCCAAGTTTGGCTGTTCTAGCTTTTATAGTTTCCAAGATCTCTGCGTTCATACGGACAGACGGACATTACTAGATCGTCTCGGCTAGTGAAGCTGATCAGGAATATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTATATACTTTCCGACGAATCTAGTATACCTTTTTATGGGAAAGATCCGAAAATGGGTGGGAAATTATTGGTAATTGGGAATACAATTCTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTGAAATTAATAAAAATCGGCGACATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCAGAGAAATAATAACAATGACAATACTTAAAAAATTTCACGTGGTGTTACTAACGTTGATTATTTCTTAAACCTGCAAGAGTATACAAACTTCGTTAACTTCCCTTCTTGTTTAAAAATATTTTTTTGATAATTCCAACGGAGTTATGGGATATACATACATAATTTTAAAGGTATCGGGGTGGAACCCTCACAAAAGTTTTAATTCAAAGGAGTTTCTGTCGGAATTAAAACTTTGAAAAAATAGGTAAGGCGTTACTTATACAGTCAAATAGCGGGTATTCTTAAGCAGAAAGACTAATCGGTTCGATCTGCCTGCCAGTCCGTATAAACTCCGATATCTCCAAACTTTTAGGAAAGAATTGTAATGCTTTCTGCAAGAGTATGGTAATAAATATAGTTTGTAGTAGAAATAAGCAGTATATAACATAACAGAAACAACAATGGCAGCTTCAGTACCTAAAGTTAGCAGTCAACAACAACCAAAAGAAACGGCGGAAAAGCTGTCTCGGTTGGCTTGCAGACCGTGAAAAGCCACGAGCCACGATTGAAATACCGAATTTCATACCAAAAACATATGAGTACCGATTGTTAATATCAAGAGCTATCAAGCGCAGTTCTACAAATACATATATGAACATACCTATGTGCTTAAAAATACATACATTTAGACAAACATATGTACGTACAAACTATTGCTTCCAGTTTCTTATGTGTAATGAACGACCGCATCGTACAGCGAAAGCTAATAGACAAAAGTATAAAGATAATAAATGTGGAATTTTTTGAATCCAAAATAAATGAACGAATTTATATTTGAATCATAGCTTTTGAGATCATTGAACTTATTGCGAGTGTGTTCAAGTCAACTTAAGTATTTACATTAACGCACATTTTAACCGCTTTACATACATAAGACGAACGGAAAAATGAACAAAGAACCCGATCGGAGGGTAGGTTTTTTATTTCCAGCACGACCACGGTCCGGTCTAACAGGTGTTCCATTTATAAAGCGCGGGCATCGTCAGTGACACGGAATTTTTTATTCTGGAAAACAGTAAGGGATGAACACCTTTAAATATACATACAGTTGTGCACTACCTAACTATAAAACAGTTCTCTGATCAAAATAGCTTTACATTTTAGATTATTTGTACTATTGCATATATATATTGCTTTCATTAATTTATTTGCTAGTCAGCAAACATTTTCTAAAGGTAGATATTGCTTTCATTAATTTATTTGCTAGTCATTCAGCCTACAGTCCTCGCCCCCGATTTTCGCGTAGAACGCTTAAGAATTTACAAGAAGAAATAATGGCGCGGACTACCATGGTTCTCTTCTAATTTTATTTTAATTAAAGAAAGAATAGAGGAACTTTCTACGATTTTATATGTTCAATCCAATAGTCCGTACACTAGAGTACGAAAATCCCGCCAGTGATGATATCCTTGAAGGTAATAATGAGTTCTTATTATCATACACTAAAAA'..b'TAATTAGTTTATTCAGCTACACAAATAGTTTAATATTGGAAATCAATCAGACAATAAAAACTTTATAAGACCCTCTTGAAAGTCCAGGAATCTGCATGCCAAGTCTGACTGTACTAGCTCTTTCCGAGAGTTCAGCGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTAAATCGACTCGGCTAGTGATCTTGTCCAAGAATATATATACTTTTTGAGGTCAGAAACGCTTTCTTACATGTTACATACTTTCCGGTGAATCTAGTATACCCTTTTGCTCTACTAGTAACGGGTATAAAAATCTTACATGGAATTCTGCGTCGGCGTGTACTTGTACCGATGACTTCTCGCCGCAGAGACAGACACGTTACCAATTGGTATATTAAAAAACTTTTCTCGCTGTTCTGACTTTAAATGTAATTATAAGCGATAATTGAGCACAGGGTTTTGACATTATGACATTAGGACTATGAAATAATATTTTTCATTTATTTAATACTTACCCTAACATAAAAAGATTATAGTCGGGTAAATGTATATATTTTCTAAAAAGTTCTTATTAGCTACGCTGCAAAACTGTAAAACGTAGTACACGAATTTACAAGCAAACGCAGAGAAAATAATTTTTTTAATTCGGGTATTATTATAATTATTATTTTTTTGTCAACTAAGAACGTAAACTAGATTTTAACAATGTCGTGCCATTCGACGCATATATTTTTAGCAAGAACACGTCAGAAAACATTCTTGTTTTCCAAAGTTTGCTTACAATCCCTATATTGTTTAGCAAACCTTTCAAGCGGTTAATCAATTGTATAGGACATATGATTAATGCAGGTTTTTAATTCTTATCAATTAATATAGTAGTTGCATTCGCACAGTCGTGTACTGTCGCCGTCAGTAAATGCTTGCTTTAGAAAACCGCCAAGAAACGTTACAGCCTCATGTAAACCGGAATTCGGAACTTTTTAAAAATTTTTCTTTGCTTAGGTATAAATGTGCCTGTTACATTTGTGCCTAGGAGTTGAGTATTTTATTTTTTATTTTATATAAATTTATACCGTTGCAGAGGGTAGAGGATTATATTATAAAAAAACAGCGAAGATATAATTTTTTTAATTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTCTAAGATATAGTTGTCCGATCTAGCTGGTTTCGACTTATATACTACCTGAAATAGAAAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAAAACTGATATTTAAGTTCAATGATTAAATTGTTAGTGTAAAAAATAAAAAAAGGCTGACAACGTTATAGCCAATAGCCTTGATTATCGAATACTCATTAATCAGTTGAAGGGAACCTGATAAAGTCTGTTCCAATAATTACGAACCAGGCTACTGCACCACCTAGTCGATTCTTTTATGTAAATGGTAATTTATGATCAAAACATAATTACATTTACAGCAAAAAGTATGCTATATCTTTCCAAAAGAACATTTTACATTTTCTTGTTTGGTGCATGGCGACCGGTCTGTAAGAATATGATATTCCATAGATGGCGCAAACACTTGAATAATGAAGTCGACGACCCCATGTTAATCCTATTTAAGCCACTCAAGAATTTAAGGCTATTAAAAGTGTTCTTGCTTGTCTCATTTATTGAATATTAACCAAATACATTCTTATGCATTCTTAGACTTATATTTAATGAAGAAAATTTAAACCGACAGGTTGTTTTCAGATTTTCAAAAAAAAGTAATATATTTGCCTTCACTATTTACACATAGTGGCGATCTCGCATTAGGAGATTGTGCGAAGGCGTCTACTATATTTAACCGAGAAAAACGCTTTAATCAAATATATACAATAAATTTATATGTATACCTTTGAATGGAGATGCCTAAATATTTTGCTAAAGTGGGCGGTTAAAGCAAACAAACAATTTAAAAAGTGCATTTATTTAGTTGAATGTACAAGCATTTTTAGTCAGAAATATCTATTTTATATCATATTACGTTATTTTTATCATACAGAAATAGTATTTTACTTGTAAAATAACGCATACTAAATTAAATAAATACGCTTTCGCGTCAAGCTACTTACAACATAAAGTTTTGAAGTTTTTTAAAATCAAACCCACAAACCAAACCAAAACCAGATTGATTTACTTGGAAAGGAACGCTCCGTTTGTTTGCAAACTTTATTCTTTGGCTTATAATCTTAGGGTCAATCCGTTCGGTTGGGAATTTTGAAAAATGTGAAACTGCGAATCACACAGAACTCATCCACCACCTGCCATCGAATCATTATAAATGAGCACAACAACGCTACGCAAACAACTGAATCCGACTAATAAGTCTGCAAATTTTAACCAAAATGGGGAAAAAATAAGAACAGATGTCACCCAATAATGTGTAAATGGTAACAAAAAAGTCCAGGGAAAATAAAAGCGTGTTTATTGAATATCATTTTATTTTTAAATTGACTTAATTATTCCGTATTTTACGAGTTCGTTGATTTTATCTGCATAGACCTCCTTAGTTTTCCATCGGCATAGATAAGTCCGAAAAATTGCGAAACTAGCTTGGAAATTTTTGGAACAGCAAAACTTTATGGACCATACGTTCAACGGATGATAGATGGTGGATGAATCTCTGTGGGAAGATGCTATTATTATTATTATTTGAATTTTAATTCTTAATTCCCTAGCTCTAATACTTACTGAGATCTCTACGTACGGGCATAAGGACGTGGCTATATCGCCTACTGTTCATAATTAATAAAGTATTTATGTGCTTCTTAAGGTCGGAAATGCTTCTGAGATTGTGCTAACTTAACAACAAGTGGTGAAAGTGTAAAAGTATTAACCAAGGTATTCTCATTAAAAATACACGTATTTTAAAACAACCTTCAGTTCCTAAACAAGTTTCACTTGTAAATAATTAGTGTCATGTCATTTTGCACGAGTGAAGAACAAGTTACACTCCATATAGACAATTGTATGGAATGCCCGCTTTTTCACAACTGGAAATTCAAATAAAAACAAGGAAGCACGCTATCAGATACCAGTTACTCAACTTACTGGAGCAAAAAGGGAATGAAGATATACAAGGAGCAGACAGATTTAGGGCGCGGTAAATTTTTTAGGTCAACCGAGAGTTGTTAATAAGACAAATACATTTCATACGTATGTACATAAAAACTGTTTGCATTTTTCGTGGATTGTGGGCGTTAGAGTGGTCCTGGCACTTTTCTGAAACAAACTTGCGCCGTGCAAGAAGCTCAAAAATATACATTCCAACTTTCTAGCTTTAATAGTTTCCGAGATCTCAACGTTCATACGAACGGACATGGCAAGATCGACTCGACTAGTGATCTTGATCAAGAATATATACACTTTATGGGGTCGAACGAATCTGGTATACCTTTGTACTCTACGAGTACCGTGTATAATTACTGCGGATTTCACTTGTTTTTTATACTCGTTTGTCGTATGGCCTGTTACCTACAATTGAAATCATCATTCCTAACTGAAATCACTTCGAAAATTCTGAATATGTCCAATGAGTTTTTACTCATGAAATCCCGTGCGAGAGACACGTCATTTCGGAAATTCTGAATATTTTAATGAGTTGTAACCTTTAAAATTTTGAATTTAAAATACATTCCTTTTGATTTACTAACTTAACTTCATTTTTATTAGATTGCTTTATTTAAGTTTTCTGTTGTTTTTTGTTTGTCCCTGTCCAACGCTTCTGAGTAAGTTAACGGAATTGGTTTTAAAAAAATTTTTTTACTTTTATATTTATATATTTACCTTTTTGAACTGTGTAAAATTTTGCGGGCTTTGTATTGGCACAAAAAATTTCATCATGCCACATTTTGGGTAACGGAACCCGAATTTTCTGTTTTATTTCAAATCACAATAACGGTCTGCGCACACTGGGGCACAAGCGGCGTTAGCCGCGCCGATATATTGTATTCTTGGAATCTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCGGCTGTTATCGACAATCGTCAGTGCATGAGTTTTGGGACGAAAACAAACAGAATGGAATAGACAATTGACAATCAGTGAATTATAAGAATAAAGAAGTCGAATTGAAATCAAATGTATCGATTACGGTAATTCGCCTCGACGACTTCGCTTGAGTGTGCGTCCCGCAAGCGGCGTCGCGCCGCTCAGCGTCGAGACGTCACGAGCCGCACCGCCCCAGTGTGCGCAGACCTTAATGCTTTTCAAATATTGGGATATTTACATGTCCCTGCGCAACAACAATTGTTTCGCCAAAATTTCGGTGGCTAGCTGAACATACCGGAGCCAGGAGGCTCTCTGAGAGCCCCGGGCGAGCAAATTATAAGGCACAGAAAGAGAGGAATCTCTGAAGATCTTCCTCTCCTTGTTGCACGACCGAAGTACAGTGGTGTCATTTTTTTCGAAGCAAAAAAAGCTGGATCAACGAAAAAAAAAGCTAAATAAAGCGGAAAACCAGAGAAAAAGAGTTAAGAAAAAAACTGTGCTGTTCGTTTCTTAATAATAAACCCTTAGTTTGATACTTAACATAAAATATATAATACACATTAATTACAAAAATTAAAAATTATAGGATACTTAAGATATTGTCAACATTATCGGAATCATCGGTTGGGTAAAAATGCTTTTGTTCAATTTTATTTAGGCAGCTGGGTGGTATACTGTAGATAAGACAGCACTTATTGTGTCGACGCAGCCCATACCTAAAATTTTAAGTAAATTTATTTATAATTTAAAAATTAAAATAAATTTAAATTTAAATTTAATTTAAATAAATTTATTGTATCATCGACATTTTCCCACTCTACCAGGGTTATGACGTCGTACAGACGTTCTAAATTTTCTCAAAAGGCCAGAATTCCGGCTGCCCGCTGTTTTCATATTTTTCCCGCAATCATACTTCAAAAAAAGCCAAATCTGCCCGGGAAAAAAGCGGGAATGACACCACTGTCGAATGGAGCCGAACTCTTCTACGCTGCGCCGGCTTCTGCTAACGTCAACAGCGGTGCAGAAAAAAAAACAAAAAGCTTTTTGATGTCCGATATGTCACTCCGAACCTACTGCAGAACTGAGGAGTACTCCGATCTTACCTAATTTGTCTAAATATGTACCACCGCTTATTAATTCAATTATTTTGTTTTTTTTTATTTCTCTAATGATATGCGCTAACCCTTTAAGTGTATATCGCTTGACATTCCCCAACTTACTGCTGTAAACAGTCGCGTTTACTTATTCAGAACATCTAACAATCCCTGAGCATTGAACTTTTTTCTGCTTATCCATATGTACTTTTATTAAAATTCTTAGTTTCATATAAAGTGTAGTTAACAGTTCCACACCAGAAATTTTAATTGTTGATGATATGAATGATTTTTAAAAACAAACCTTCTGATAAAAAACAAACTAGTCACGAGGTACAAATCAAGTGACAATCGCACTTTCAACAAACAAAAGTTGTGATTTCACCTTTTTGGGCAAGCACTATGTTTTTACCTTGCTAAGAGGTGTTTTTGTTTAATTGAACAACAATTAATCGCACTAGTAATCTGTCTGTCAAATTTTAGCTCTATAGCAATCAGAATGCCAGAGCTCGATACCGCGAAACGGAAACGCTTTCGTGGTATAGTTTTTCAACGAATGCAATGTTCTCTCTTACTGTACGGCTATGGTATATAAAAATTCCGTTTTTTGATAAAAAATGATGGTACAAAAAGGTACCTTACTAAATAAAGACGATCATGAATAGTTTTAATGCGCGAGAAAGCATTCTTAGTAGTTTTGAAGTAAGCGGAAAACTTTTGATATTGCCAAGACACGCTCTTTCCCTACAGTCACGCTGCAAAATATTAGGTTTAATTTTATAATATTTTCGAACATAAAATACTTTCTAAAATTTCGATGGGCAAGTGCCGACGTGCTTGTGCAAAGCAACGACAGCCGACTCGTTCCAGTGTGTGAAAGAGACGTCGAAATACGCAGAGCCAACACTTAGTGTGGCTGGCAGAAAGGTGTGCTGTGATTGGTGCCCTGCTTTCTTTGTTACTATTGGTGGATTACGAGGTTGTCCGCCTACTCCACTCCACTCCACACTCAAGTTTATGAACTTTGAAGCCCCTTTTTAGAATTGTCCAAGACGGACTCGGTGCTCAAGTAAGAATATGCTTTTAATATTGTTAATAATTTTAAGGTTTAATGTTTAATATTTAAAAAGTAATACTACCCATGAATCATGACCTAACCACGGAAGAGAAAATGTTTAGGCTGCGCACGGCACAAACGCGATATCTGATGATTCCGTTGCTTGGTCCCTTGTTGGCTGCCACAAGCTGCAAAACCCAAAAAAAACAGCTGCCTTAAAATAAACACCTCTGTCAATCCATTCACCCAAATACTATTGCAGGGCTGAACAATCGGATTGGCCACCACAAGAGCAGCCTCCCAAATTGTCGTTTGTGGCGATGCTACGCCTTTGCCTGACGCTCGGCTTTGGGCTGTCTTTATTGGCTGGCTGCAGTAAGATGAGAACGGCGTCCCGGAGTCAACGCGAACCGTTTCGGGTGGGCGGCGCGGTGGCGTCGTAAGTGTAAAAGGGACCAAGTATTTCCAAGGACATGCAAACGCCCGCGCCATCCCACACTGAGTAGAGATAGGGATAAGTAAAAATAGTAGAAGTAGATAAGAATAAGGAAACCGTGCGCAGAATCTCTGCGGCTGGCATCAAACAGTCCGGAAAAAATGGTTAGCAATATTTTACGGTACGCAAAACGAAAGAGAAAACACACTTTTAAATAAAAGAAGAAAAAGTAATGTCAACGGTCGAAAAGGAATCCTGGGACAACTGAATAAGCCACAGCAACGCGAGTGTTCGGTCTACTTTGCTTATGCAAAGGAGTACCCACGAAAATCAAACTTCATCTTACGCTGCCAGCCGATGGCCAGTGCTTTTCCAAACCGTCAATCAGAACTTCCTTGTTGCAATCATAGGACTTATAGAGCTGTATCGGCATCGATTACAGGTTCGGTTTACCGTTACGGTTTGTGGTTGCGGTGTGATACGAATGTCAGTTACAGTTAAAGCTTTTCCGGTAAACAAATTGTAATAAAATGGTGATCAAAGTGAATACGATATAGTGATTGTGCCTAAAGTCTTGGTTTGCTTCAAAAAAGGTTACAATACAACTCCTTCGTCAATACCAAAGCTCCAAAAAAATGGACCTATCTACAGCCTATCGCTACAACCAGAATATGATGGAATATTATACATGTAATACTCTCTACTCTTTAAATAGATAGATACAAAACATTTGTTGATCACACACAAATCCAAAGAATTTTAAATTTCCACGATTTTTTTGTACTTTTTTGGGTTGTGCCGTTCTAAATGATATTTCTTAAGACCTTGATTTATTGGTTTCTATATATAACCGAGAAAAGTGCAACAATAACATTTTACATTCTTCTGATATTAAGATTCAAAAGGTTCATTGTTAAATGACAATTGAGGCATGAACAATTGTTCTTTGTTCATAGTTCTACTGCAGAAGATATCATGCTGAGTGCTCAAAGCCAAGTAAATGTGTAAAATCCTCTCAAAATTTTCAGCCGATATCCAATGTTTACAAATCCTAATTCGTTCTAAAAAAAATTATTATTAATGAAATAACAATAATCAACGCTACCTCGACTATCAAAAACCCGTTACTGATCTGAAAGGAGTGCAATAAACAAGAACGGAAGCTAGCATCAGGGAGCCGAACTTATAGAAAGTTCCTTGTAGGTCGTACCTTTTAGAGCATTTTTGTAAAAAGCTTTACAATGTTTAAAAATTTATAAAACTAATTACGAAATATAAACATAAAGTCCCAGTTTAATTATATAACGTAAATGTTTGCCAAAAACGAAACGATGTGTTTATTTCTTTGACATTTTTTAACCGATCGGTCCT'..b'GCCGCCGAGAAGGCGAAACATGTTCATCATCACCAACAGCATCATGTACCACAGGGTCTGGGTGGCGGACACATTGCCACAGAAAGTCTAGATAGCAGCACAGGAACGATCGGCGAACCGCAGCCCCCGAGTGGTGGAACTAGCAATAGCAGTGCTAATTCCGCAAACCCAAACGCTTCTGCGGCGACGGTTGCGACGCACGCATCAATACCGACGTCAGGCTCTGATACTGTCCAGGTTTCAGTCGGCCAAATCAATGCAAACAGCAATGACACAAGCAATGGGAATATTAACTCAACGACTGAGCAACGAACGACTGGATATAGCATTAATGGAATTCTAGGTATACAACATGGACAGCATTCTCACAACAATAATAACAACAGTAGCGTGAGCAATAACAATAATACAGATCCCACCAATTGTAAACGTAAAAGAATCGAAGCTCATGGTAAGTTTCTATTATAACATCTCAGTTAAGCAATAATACATCTACAACTGTACAAATAGGTTACAAGTAAATAAAATTAGATCTAAAATTGGTTTTCATTCGCCATTGCGCCTTTTCGCAATAATGAATTATTAATATACTTATACCCATGGGTACTGTGAAGCTGTGCGCTTCTTAATTGTTTATTCGTCAAATCCCAGTCGGTTAATTTACATATCAGAAAACCAAGCCAAGCCCAGATTATATTGTTTGGAAGAAAACAATATTGCGTGCAAAAGCGAATAGTCTTCTGGTATCATTAAATCAGATGTCTTGTACCGCATGTTGGGCAGAGCAATTAGATATTATCTTAATTGATTGTGGGGGTTGCTGATGTAACCACCCATATCACCAATATCTTAGATGGGTTTTTGATAATAATGCCAAGCTGTTCAAATTATCTATTTCTCAGGAGTCCCTGCCGGTTTCAATAAATATCCCTTAATGCATCGTAGATGAGAAGACTTTGTGTCTGAGTCAGAGTTTTTACATATTTTTTAGAGTTATTACCAAGTTATCAGATCTTAAAAGGACTCTATCGTTGTGCCATTGAATGGGCAATAAAATTCTACATAAAAATCCCATATCGACTTATTGGTGATTTTATTCAAAGATCCCTAAAATTGGTATTTTACTCGCTTTAACTGTTGTTCACTTGTGGCATGTGAATAAAATAAAGCAGATCGATGCAGGAAACGTACCACAAAATGTGAAAAAGGGTTGGTTTCCAAGTGACCTACGTGTGGCCATATGTCAAAGTTGATTCAGCATCAACTTGTAAAAGAGCAAAATCAATTTAACCTTAATATATTTTGTTATAAAGAATAAAATAAATTATACCTAATATTTTTTATTTTATTTAGCCATTTTTTTTTTCTAGTTAAAACTAAACACTAAAAAATATACGATTAAGAAAATACCTGATTTGGGCAAAAAAGGCCTCCGTCTACCGGGTACATACATTCAAAAGAATAAACCTAAAACCAATAAAAATAGCATTACAATTAGCCTAACTACTAATTGGCTTGTTTTGTTTTTGGCTTAAATCATCATTATTCTCTTTAAGCGCCGACAGTTCTTTCGCTATCATTTTTCTTCCCCTGCTTATGTATAGACTACAAACATTTTTTGTCAACATAAACAATCTTAAAACGTATTGTGTATATTTTAACTAAATGTTTGCATTATTTGTTATATAAAGTAGATGGTCCGAATAGCTCTGTTTAAAAAAGTTATTTTTCCACAAGTATTTTTCCTAACTATTTAACAACGTAGTTTGCAGGTGTTGGACGTTGCTAGCTTTTATAGTATCCCAGGTCCCAGCGTTCGTACGAATAGACAGACTTGGTCGACTCGGCTTGTGACCATGATCAAGAATATTTATACTTTATAGAGTCAGAAACGCGTCTTTCTACCTGGTAGATTTTTTTCAATTAATCTTGTAAACCCTTTTACTATACGAGTAACCGGTATAAAAATGTAATAATTATACATTCGACCACTTGGTAACATTAGTTTACAAAATAAAATTTTTAAAATACTTCAAGAAGGTATATGGTAGTCACTGGTGGAGTAACCACCTAGATAACAAGAAAGAAACTTAACTTCGGAAAGCCGAAGGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAACTTCAGTAGCACCATGTGAAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTAAAAAAAATTATTTCATTCTTGTATTCAGACCATTTTTTTTGACATTACAGATGTATATGTATATGTTACAGTGTTCCGATTTTTATTAAATTGAATTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAAAATAATATTCCCAATATTATAAGATAATACGTCAAAGAAGCCCCAAAGATAAAAATTTTATACCCTTGCAGAGCGTTTAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCACATATAATATAACAAAGTTCTTAAAAGGAACTAGGAAGAACACTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACCCGATATTAAGCTTAAAAGAGCAAAAGAGAAATTGAGATATATAAGCAGCAAAGCGATATTGTAAAGCGCCCACTACACGCTATTTTAATATATTTTATTTAGGTCAATCAATATACATTTCAGAAAAAAAAGCATGAAAACTGTGTCCGGCACAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGCAACAAAGCTTTATTTGGTTGGTATAGGTATTGACGGTATTTTCGCATTAAAGATGCAGGCGCTACAGTCTGCCGCGAATTATAGGCGTTAGAGTGGGAATGTTACACTGCTGTAACAGACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGAAATCTGCATGCCAAGTCTTTCTTATCTAGCTTATATAGTTTTCGAGATCTCAGCGTTCATGTGGACAGACAGACGGACTTGGCTTGATCGCCTCGGCTTGTGATCCTGATCAATAATATAGTTTTTAGGGTCGGAAACGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTCCGACGAATATAGTATTCCCATTTACACTACGAGTAACGGGTACAAAAATAAATGTTCGTTAATCTTAAAGGTCCGACCAATAACCTATTATAATAATAGAAAGGAATGACACGTCAAAAAAGGGTGTTTGGTACTTATATTTACATTACCGCCAACGGCAAAGTGACTATTACTCATAAAATTACTTAGCCGGCACGTGACAAACTTGAGCACCACAAAATGAAAAGGAAATATCTAGTATAAGCAGTAATAAAAATATAATTACCTAAGTAATGTTAAACCAACTTACTTTTTAGACGAAAACCGTGACACAAATATACATTCCGAAGATGATGGCAAACGGCAGCGTATGGGATACAGTGGCGATCCTCTTTATCCAAATGTAAGTGTACAATTTAATTTACTTAATTCTGTGCCTCGCGATTTTTGTGACTTTACAAATATGTAATTAAAATCTTACTTCTATAATGGTTTGGATAAAAAAGCAGCATTAACTAAAAGTTTTCCGTCATGTACAGAAAACGGAGTTAAAGCTAAGAGTATTCGACAAAATTACTTGAATGTGGAAATGTGAAAAGGAGTGTATTAAATCACTGAGACGCCAATTGGATTTCCAAGATTTCAGCTTTCATATAGACAGACACGACGAATAAACAGAAGGACATGACTAGTAGGACTTGTCTTTTTGAAAAATTCATACATTCAGCTTGTAACAGAAGGATACGATTATGACCCTGTATTTTAAGAACCAGCTGATGTGTACGTATCACCAATTTTGTCAGCGCTCTGGGCAGTATGATTTTTTGTGGCCGAGTTTTATCGGACGCCGCCGGCTTCCTATTTTGGTATGCCGGGGCCTGCGATGGTTTCAGCATCCTGGACAGTGATGGATCCACCTCCATGGGTTCTGGAGTGCCTCCACAGTGCCCATCGCTGTGTGGATCAAGGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b46/291/86/scaffold_62-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GCACCTGTGCCTTGTTCTGTTTAGTAAAGTGTGGACTTTTTCCAGCACTTACTTGCGTGTATGCCTGGCGGGACGTTTGTTGGCGTTCATGCGCCCTTGGATTTGTTTTCGTATCCTTCTGTTACAAGCTGAATGTATGAATTTTTCAAAAATTAATGTACCAATACCAAGTCAAAAATATGTTACTTCCCGTTTTTCCAGATTTGGCCTGGGAAGTGGTGTATCAAGGATGAGCACAAGCTACTTGCCGAGCTAGGCAACTTGACAGCAGGCACCGGAAACTGTGCATCATCATATTATGAGGCTTCAAACGGATTTTCCACAAACTCGATATCTGGATCTGGTTCGGGTCCGACGCCGTCTAGCAGTGATACGTCTATGTTGTACGACAGTATTTCAACAATTTCGCAATCTCAAAGCTCACTTTATACACCAACAATTGGACCATCAATTGGTAAGTCATCCCTCCAATACAAAAATTAGTATTTGTGTTCTTAATATTTTATTATGTAACTTTAATTTAATTTAATTTAATAATCTTCCTTTAAGTACGGTATGTCTATTTATTTTCCTTTACATTTATTTTCTTTTGTAAATTTGACCGATGTAGGAGGCAGTCCGCTTACACCTCTAGTCCCTATAAGCATGCATGAAATGAAACTTAGTGCGAATTCAGTGCAGGAACAGACAATCGCCCCGTTTTACACAGGTAAGACAGACTACTTAAGGATACGCACATAAAAGTATTAATTCCTTTGAAAAACGTTGTGTATTTATGGCCTATATGTTATCCTTCCGTATGTTATTATTGATTCATATTGTGGTTCAAGTAGCAGTTTATTAAAATGAAATAAAAAAAAATGGTTATGGCAACTTCAAAATTGTATTTACATCCTTTACATGTAGAATAAAAAGGTATACTAGTTTCTTCGGAAAGTATGTAACAGAGCGAAGAAAGCGTTTCCAACGCTATACAGTATACATTTTCTTGATCAGGATTGTTAGCAGAGTTGAATTAGCTATGTCCGTCCGACCGTGTGAATGCTAAGACTTTGGAAACTACAGAACCTAGAAAGTTGGTATTTATATCCATGAGGTTCCTGCATAACGCTAAAACCTCTCGATGTCACTTCTGCGTCTTCCCGATGGGAGTCACTTTCGCGACCCGAATGCGATATCGCCAGAGTTACGCTTGGAAGTCAATGAGAAGTTAGTCAACAGGCGCTGGTAGAAGATACCAAGAAAAGCCTTCCCCAAATAGAAATCATCCCTGGGCATGTCGGAAGTGCTGATAAATAATTCTATTCATGTTGACATAACAAATTTCATGTCATTTCTAAAAGAAACAGAAACAAAATTATTTTTTGCTTAGTCAAAATAAAATAGGTATGATAGGTAAATAATTTGTAATTGTTTTGAGATGGACATTTTAAAATGTTCCATTATTACAAATATTAATAAAAACCTTATATATAATATTTTAATCTCTTATTTTTTATCCTATTTTCCAAAAAACATATTTTCAAAACATCAATTGAATTGTGCCGCAAGTAACGTTTAATATCTGCGTAAAAGCAACTAAACGACCACAAATGCCAATTCTAAAGTCGGAAAACATCCTTGCTAGAAACCAACAAAACCTACGGTATTTTTTTTATATTCCATAACAGCTAATGAGAAAGCAGTCGTAACACAAGCGGAAAATATATCCATTTTTACACGCAATAATATCTCTTTGTCTTAATCATCAGCAAATCATTATCATGTTTAATTCTTCATAAAGGAGTCTAAATAAACTAATGAAATAATTTTTTTTAATATCACTGAAGCCAGCAACAATCCTTAAAAGTTTTACATGGTATTACTAAAGTTGATTATTTCTTATAACAGAAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTTTTGTTTTATATTATTTTCCGACAAATTTTCCGATTGTTCCTATGGCAGCTACATGATGTAGTCGTCCGATTTTGATATAATATAAATTATTAATATTAATTTCTTAATTTTTTTTCCTATTATTCCCATGGAGCTATGTTAGAAGATATGTCCGGCTGGTTTCGAATTATATAGTACCTGCAAAAAAGAAGAAAGTTTCAGCCTGATAGCTTGAAAACTGAGAGACTAGAGATGGACAGACAGATGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTAGTGATGCTGATCTAGAATATTTATACTTTATGCAAACTTCTGACTGAAATCATTAAACCCTCTGCAAGGGTATAACAATAAAACCATAACTTTGCTCAATTGTGTGATCTTTTTGTTTTTGTGCTTCCAAGCCATCTGCTTTTTGAAAACTATTTTAACGTTATACAAGTTTTACGAATGGTGAAAAACTATGTATGACCTTGCATACATACGAAAATATTTAAGCCAGTGGTAGAGGGCGTTTAACAAGGGAGCTTTAAACACAAGCGATTCTTATACTTTTTTTGCATATATGTGTATTAGCTTTAGCATTTGACGGAAACTACACATCAATGACTAGCTTGGAAAATGACACCTCATCAGTCGCACAAGTAAATATTGACGTTCCAGAAAGCACCGATCCGGCTAACCTTTGCACGATAAGTACAAGGATTGTGCAAGACCACTCGGATAATAATAGTAACCGTGTTAAGGAGCCGCAGCCGAACATTGATGGGGCCAGAGAGGAAAACAATAAGGAATTGGACAAACACAATACCAATTCGGAATCCAGCGATCATATTTCATTGCCGCATCTAAATCAGATAGCAGAAGATCAGTTGATCAGAGGAAACAGACGTCCTCATTTAAACACCATCACGCACCCTTCTCCTCTAATACTCCTGCAGCCTTCAACTTCGTCACTTAGTGGTCACGACGATCGATCAGACATTGAACCAAATCTGCGTAATAATGTAGGCCTTTACTCAACACCTACAGTGCTACCAAGTTTTAATCATTACTCCGCAGGCAAGTTGAAAATATTTGCAAGCAACGCACATGAGAAAGTTATTCCATGACTTTATAATTCTTGCACTTTTATATTTTGCACTAAGCCGGTGTTGGGAAATATAAAATCAAAATAATCGAAAAAGATATAAACTTCTTTATTGTAAATACATGTATGAGGTTTACGCATCCGGTTGAAATTGAACTAATAAGGTGTTCCTGGAAATCTAAATTATAGCTTATGATCGACGTCAAAAGCCGAGTGAAAGAGATTTGAGTAAAATGGCATTGCTATACGTTTCAAGCTGATAAAACAAAAAAATTATTTTGTGACGCAGAAATAAAAACCACTAAGTGTATTTCAAAAAAAGTTCATTCTTTTCAAACTGAACTGAAAGGGGTTACACTTGTTATCCAATATCTTCCAAACTATAATTTTTATGACAAAAAGTGTAAGTGCTGTATAGCTTGAAATTCAGCAAGGAAGAACGCTGTAGTCGGGTACCTCGACTATCAGATCCCCCTTTAGACAGCTTAAGAGGTCAAAAGGAAAGTAGAGATTTATAAGCAGTTAAGAGTATTTTATAGCGCCATCTACTCGCTATTTCAATTTATGGTAATGTGGGCGGTGGTGAGATTTAAAAGTTTTAACCATTTGTGGGCGTTAGAATGGGCGTGGCCAAACTTTTTTTAGGGTAATCACAATGGTATTGATGAGACAAATGCATTTCAGTAAAAATTTTTTCTAGCATGAAAACTATGATCTCCACAGTTCTGTGCGGTTTGGGGGCGTTAGAATGGTACCCTGATGAATGAAACTTGCGCTGCGCAGGAGGAATATACATGCCAAGAGATCTCACCGTTAATACGGACGGATGGTCAAACGGACATGGCTAGTTCGACTCGGCTGGTGATGCTGATCAAGAACATGAAAAAGAATGTGAATAAATTTATGGTGTCGGAAACGCTATCTTCTGTATTTTACATACTTTTCAACGAACATAGTAT'..b'CCGCCACGCTTACAAGGATGACTGTTACAATTGCGTTATTTGACTTATTCGGAGGCGAATTAATTCTTTAAAAATTGCTTTAGGCCATTATTAAAAAAATATAACAAATTATATATAACTGTAATTAATAGTAATAAATATTCAATTAGTAAAAATAACTACAAAATATTTACAAATTACAATTACAATTTTACAAATTACAGGACTAGGAACGTAGTTCAAATGTCTTCTTTTATAATTTTTTGTTAAATTGAATATGAGTGGATCTTACGAAGATGATATTCGTATATAGAAGCAAATTTCAGGTTGTCCTTTATACTTATGAACTCTACCAGGCCTTTAACCTCTAAATTTAATGAACCAGTTTGAACTTTAAATGTATATTTTTAATTTTTTTACTTAAGTATTTTAAGCAATTTTATTTAATTTTTTTTTTGAGCTTGACGTACAGTTAATGTTTATGTTTACGTTATTTAATACAGCTCTTTAACATTTGTTCTTTAATTGCAGGCTGTAGTTCAGTTGTGCCCAGCACAGATTACGCCTACAACCCCGCCTATACACAATATGGTGGCGCATACGGATCATATGGCTATGGGGCTGGTGGGGGCTTGATAAGTAAGTAATAAATATCGATTGCACTTTTAGTTTTTCAAATCCAGCCAGATGACTTATTCGCGAAAGAAATTTGCGGTGAAATCCCAATTTTCGAGATCACTGCGTTGACATGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTTGACTAGTGATGCTGATCAAGAATATTTATACTGGGGTCAGTTCTTCTACCTGTTACATATTTTCCCCCGAAATATCACCTCGAAGTGTAGCCAGTTGCGAAAATGTTGGTATCTTTTAGTACCTAGTAATAACTCAACTACTAGTTTAACCAGAAATTTGCGGTTTCCTAAGTCTAGCATTAAATGTGCATAATTATTTCAGATTCATCCTACTACTACGAGAGCGGACAACCTCAGTCGACATTGACGCCAGACCTGGTCAGGTCTCCTTTAGCTGCAACTCGGGCCAACTCCCTGGCTTCCGCTGCGTCGCCAGGAAGTGGAAGTGCGTGCACAAAATCAGAGTCCTCAGACATTTTTCTTGTTTAATGTCGTTATTTGGCATTCGCAGCGTAAATGGTTGTTAAAATTATATTTTATAACAATTTGTATTACGAAGATTTCTTGTTCAAAAGGTTTCCTTTTATTGTTTTTAATTTTAAAATCTGTTTTTGTAAATATTACCACCAACCTAAAAACAGAGAAAATCAATTAATCCAATTCAAAAACAAACCAGTCTCAGAAACAAAGCAGTTTCAAGCAAGTTTAAATGAAAAGAATTTTTAATTTTTCTTAACCAATTGCACATATAATAAGACTTGTAACTAAAAAAAAACGTATTATCTTTGCTCTCCGTGTAATAATGGGTTTTTGCAATAAGTATACATTTACATTTTAATATTCTTACGTTTGTACGTACAACAAAATCTTGAACTGACGAAATTATATAAATTGTTTATTTATCGGTGGTGTCACAAAAACCGTGCAGCCTTGAATGAGGGTGAGTTTCTTGTGTGCATCAATATGAACTACAGAAGATTTCATCATCGCGCGATTTCTGTGGTACCCCATCATTAAAAGATTTTGTATATACGTAACAATTTATATTCAAACTTGCATTTATTGATCAAATTAGGTTACAACTTTAGGAGGCTTATAAAAATAACGAAAGAAGTGAAGTATTTGAAATATTACAAAAATAGTGTACTACTCTGATACATACGAAACCAAAATGTCCATTAGGGCGATATTCAACCAAAAACATTAAAACAAAAGTTTTTAAAACTTTTAAAATATTTATTTCCATTAACTTTTCGTTATTCTTAACATTTCAATAATAATTCATGTAAAAATGTACATAATTAAATGATTCATTTAACATATTATTGAGCCACGAAATGCACTCAGAATTTAAGTTCAAAAGAATGTGCACAAAAATAACATTGCTGTACATGTACATTGCTTAAAATGTCCTGTAGTGTTAAAAAAAAGCACAAAGATTCATACAGCGCGCATTAAGCCCCGAGCTGTATTAAATTAGTTTACAAATAATGTATAATGTAGCCCGAGTTGGAATCAATTGCAATTTTTTGTCAATCCTATTTTTTATTTTTAGGCAAATATAAAATAAATGCGTAAAAATTTTATATAATTTGTAGTATTTTTAAAAATATTATCGACTTAGTAAACTTCATGAAAAGTCCTTTACAAATAGATAAACAAATTACACAGGCCAACAGAAACATTCTTGCATTTGTGAAAAGAAAATGTAATTTTAGTATAACTCATATTATTAATTAAAAAAATTTAACACTTACATATGTATGTTTGAAGGAAAATAAAAATGTCTGGTGTTCTACATACTTAATCATACTAAAGTGCGAGTGCAAACCAAGCACAAAGCCTAGTTCTCCTGGCCTGTGTAATATACATATCTAAAATTTAAAACGTTTATTATTTTGTTATGGCAGAATATTCAAGCAATTAAATATCATACGTGGTGTTATTTTTTTTTGAAACTCGTATTCAAATGCATATATTCTGATCTGAAATACTCTAGTAGATTTCGAAACCAACATTTCGATTGTATCTGAATTCATTGAGCTATGTATTTAGGCTTAAACTAATTTTAAATTACAGATTATTATAAGGAAGCACAAACCAAATTTAAATATATTAAGAAATAAATATCTGTGTATCTAAATAAACCATAATAAGAACAAGGTTTACTTTAATGTAAAACGTTGTATTTATTTTACCACCAATTTTTTTCCTAATAAAATCAGAAATCTTAACCTGATGAAGAAAATATAGGTATACTTTAAGGGGCCGCTTCATTCTACCTGTTATATACTTTCTCTTTTAGTTTACAATGGGTATAAAAACTTATGGACATAAGCATCTTCTAATGTTTAAGAAAGAAAGAGGACTTGCTTAAACAATTTTGTATCTTAAAAACAAACAAAATAAATCACAATAAATCACAACTAAGGGATGTGCGAAGAAGCTGGATTTATTTATCGAAGATTACCCAGCCCGCAACAGCAGCACCAAGCGACGATTCCTTTGTTTGATTATACATTTTTAAAGTTTTACTAGTCGGGAAATCGTACTCTTTGTAATGATCTCGCATTTATTGCCAATATACCACCTTCTGCAACACCAGCAGAACAACTCCGTCTCCAATCCGATTTCCCTCGCCTCAAGGATCATGTTGGCACACTGGGAATCGGATCTGAGCAGCATCAGATGTAAAGAAGATGATGGTTTCAGGAGGGCAAAAAAGAAACAACATCTTTACATAAATGATTTTATACCCTTGCAGAGGTATAATGATTTCAGTCAGGAGTTTGCAACGTAGTGAAGAAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATTCACTAGACCAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCGTCTGCGCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCGAACTAGTCTCTGACTTTTGAAGCTTTCGGACTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTACATCTTATAGCTCCTATAGGAACTGTCGGGGAAAAATTTTAAAAATATATATATAAACATATTACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATAAGTTCTGGATCTCGAATTAAATTTTATCAAAGTCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATATGAACGATCGGAAAATCAGTGGTAAAATCATATTCAAAAATTATATCTTCGGAGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAATATTTTTTAATTAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACAATCGGGGAATTAGTGGGAAAATAATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCATTCAGGTTTCGTTCTTGTGTACAAATATTTACTTTTCTCCCTTTTTGAGTTTCTTCTATGTAAGAGGATGTTTATTAAAACCCAGGAAAACATTTTATTTGCACTTCTTCAAGCTTGTTACTACGATTTGTGCAGATTATGGTTTTCTTAGACCAATTGTAACGTTGGATGAAATTGGAAAATGAAGGAATTTATTAAAAGTTATGTTGTGCAAAAGCACTGCAATATTTGCTGTGCAATGGAGTTTTACTCGTGTTGAGTCGCTTTACTAATTTTATTTTCGGCCACAGTCAGTCGAGCTGTTGAAGAAGTCTTATTCGCTGCTGTTGACTTGCAAAAAAAATCAAAGATTCCTAGAGTAATAACCCTGCAGTACCATTCAGCACTTAATGAGCATTGTACCAAAGCGTTTGTCACTAAGCGCTCGATCAGTGCTCAATTTGTTTGAAAATTACTGCTTAAATTAAGATTGGTGTGTCGTAGGATGCAGCACTGCTCAACAATGATCACAGATTCACTGCTTTATAAAGCGCTGAGCACAGATTCAGCAAAGGTTGAGCGGTGGTTTAAGCTGAAGAAAAAGCACAAGCTCAGCACAGTTGAAGCGCTTAGCAGATATATAAATATAAAATATAATTTTGATTTTATTTTATGGCAACTCCAGCATCTGGGGTCTGTAAAGCCTTCCGCTTCGAGGAACTCAGGAACTCACGCACCGCATAACCTTCTGCAACACCTTTTCGAAGGCTCCGAGGGCTCCAGCTGAGTGACTTCAAATGCCCCCTACTGGCTATTTTCGACGATTTTATATGGGCGGCAGGCAGATTTAAGCGTTTAAGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCATTTTAAGGTCAGTCTATAGGTGATGAGATAAGCACATTCAGTTAAAATTCTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGTTACAGATTTTCACGGATTGCCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCCCTCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCCAGAATCTGGATGCCCATTTTGACTGTTCTAGCTTTCTCGGCGTTCATACGGACAGACATACCGACGGACATGGCCAGATCGACTGGGCTAGTGATCCTGATCAACAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTCCTTCTATCTGTTACATACTCTCCGACGAATCTAGTATAGTACGAGTAACGGATATAAAAATAATTCTGTTTGGCAGTTTTTCCGTTTGTCCCAAAATGATGTTTTGCTTTCGCAAAAGACGCGCCTACAGGGGTTATGCTAGAAACAACATTTTAATTTTTTAATCATGCTAGTAAAAAAATGTCAACTGAATTGTATAAGCCTAGTCAATACCAATCAAAACAGTTAAAACAGTTGGCCCGCCCACTCCAACGCAAAAACGCTTAATTCCGCCTGCCGCTCACATTTTATTGAAAAAGCTGGTAGGTGGCGTTTTACAATATCGCTTTGCTGCTTAGAAATATCCATTTCTCTTTTGCTCTCTTAAGCTGATACTGATATTCGAAGCACTTGACTTCATTATTTGTCTCAATACAACCGTTTAAAAATTATGGGAAATTTTATTTTATTCCTATTCTTTTTCAGATTTTTTTGATTGCTCAAAAACGGCTCTAATTATTTCAAATTAAATTTAAAGATGTATAGTTCTTGAAATTCCTAATCTTTTTATACCCTTGCAGAATTTTTTTATGATTTCAGTCAGAAGTTTGAAAAACAGCGAAGGTGTTTCTTAACATATAACCTCTACGCTTGGAAATAGCATTTTTTAATTGGTTTTGAATTTCGAATTCAATTTTATCTAAATCGGACGATTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGAAAAATTGGTGAGAAAATAATATAAAATATGAAAGAAAGTTAGCTTCGGAAAACCGAAGTTTGTATAAACTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACATTAGTATAAAACAGATATTAGTTAGAGTCGTCCAACTTTTATTAATTTTAATTCCAAATTCTTAAAAATATAAGGAATTATATTTTCAATATTATAAGATAATATGTCCAAATTTTTAAGTTATTCCAATGATCGAACAAAAACACCTCTTGACGTGGTAAGGGGTCGTGCCGATTGCGCACCATCAACGTAGAAAAGTTCTGATATCGACTTTTGTTACGAATAATGCTTGTTTATTTGTCTAAATAAATACACTTTCTAAAATGTTCACATTCTGCCCGCTTCAGCCAAATATTTTAGGTTCTCGGATTAAAGAATTATTTTATTGAAGCGTGCCGAATGAGAACATTTTATGAAATGTAACTTTTAATTACAAAATGTCTAATAAGAATAATAAGAATTTGTTCTTATCAAGTTACTGATGCATAGTTTTGGGCATGCAAATAACAAATAAAATGCGTTTCATACTAAACAGAAGTAGGTTGCTCTTTTTATAGCTTAATATCTTCCAACCCGTAATTTTTATGACAAAAGTTATAATGTATCAAAAGTTTTGTAATCTCAAGGGCTTTAAAATTTAAAATGTAAAAAGAAATTTTGAGAATTGGTTTTAAAAAATAACTTCTTGTCATATCTCTAAATCTATTATATTTAGACAATTTCAGAATAGGAAGTGTATTTAGCAAATTAAATTACTTTTTCAGTGCTTCTCCGTAGAAATTATAAGCATTTAAAATCTATTTTTTTTTTATTTTCGGCTAAACTATCGGGTTTTTCCAAAAGTCGTAGAACAAACGTTTCCTATCTTGATCTACTTTATTCACCCATAGGGTTGCTAAAACCTTAAAACTAAGATGGGACGCATACAAACCCACAAGCAAAGGGACAAACATTTTTATTTTGGGAAGAAGAAAATCTTGTTTTGGAATTACTATTGAACCGGACATCGGATTTCAACAAATTAGGTGTTGGACGCGTATTCTCAGTAAGAACAAAACTAGGTAAAGGCCGCAGTCACGTATCCCTACCTTATCCAGCAGATTCAATGTTCTTCACTTTTACACTTTCACCGTTTTTTCTCCCAAACAAACTGATATTTCTAAAGTCTTGGTGTGCAATCTTCTTACCTTTCGATTGATGTATCATTCGTTACGATCGGACCATAAATGAAGATTTTTAATACTGCGGCTGTATATAGTAGTTGTAGTCGCTCTCTTGCGCACTTCGCCACTACGTGTACTGCCGTCCACAGTGATTTTAGAAGAAAATTGCAGCGATCATAAAAGAAACCCTTCGCTTTGTGTTTTATTTGGTGATACAGTGCGTTTTAATAAATAACCAAGCAAATGAAACGTCCGCTTATTAAGTTGGTATATGGCTAATTTACAAATAATAACCATTTATACATATATATGCTTCACACATTCTTCCCTCTGTGGACTTTTGTCCACATAGGTGACGAAACACCACATATAACATGTGGTAAACCGAAAGTTTAATATTAAATATGTTATTTGTGCCCTAGACATAATAAATTTTCAGCGAACAATTGAGAGTAAATCATTGGAGATTAGATATTTCCATTGTCATTGTTTATTTCATAATTAAATAAAAATCTGATAAATCTACTACTGTGGCCAAAAAGTTTCGTGAATTTTTCTTTTTGCTTTTCGTGCAGTGTCGCACTATGAAGGAATTCACCCACTGTTAATAAGGAATATTATTTTACCGCGCTGTTGGCTATATTTGGTATGTGCCGAGAGTGGGATCTTTAAAGGGGATAAAATTTACTTACAATAGAAAAAGAGTGTAAATTTCATACTTAAATTTTTTTAGAAGGTAGTATGATGTTTTTGGTGTTTGGATATGACGGTAATACATTATGCTATAAGTAACTATCGAATTTATTTTAGGTTCTTCTTTAATATTATTTTATTCATTTATAAATTTTGTTTATTATTGTTGAGTCAAGATCGTATGTATATCGTTTTTATAACATTTTGTT'..b'GAGTTAGCTCAGGTCTTTTTTGCTTGTTCATACACCATGATGCATATCGCAGTTCCTCAAAAATTTCGGTCCAAAAGCAACGGGTTGGTGGTGAATAACTCCATTCTGTTTCTGCAATCACTCCTTGAATGGACTCATCATTGACGCCCGCTTTAATTAACGAAGCCCTTTGGAGGTGTCGAAAATTAAACCAAAATTCGAAAAACGCGACAACCGCAGCCACAAAAATTCCAGCCATCAGAACCACAAATACACCACCTGTAAGGTTGCAACATTCATGTAATTAAACTAAAATAATATAGAGAATAACTTCGAAAGCCGAAGACTAATAAAAAATTATTGAATTTACCAAATATTTCTTACGTTACTCAACATTTACATAACATTTTTTTGTTTTCCGCTACCCAGTCGTAAATGACAGCATTTAAGCTGCGTTCTTTTATAATGAAATGACACCAAAAAGATGTTCCGGATGTGAGTGCGGGACCCGGTGCATTCTTCTGGAAATCATAAACTAAACACATTCTGGGTGCACTCTTTTTTAATGCACCTGTAACAGATACCCAGGAAGGCACCTAGAAGAATTCAAAAATCAAATATCTGAAAGGAAGGAAGGAACACATAAAACTGGATTTCAATTTCATAATTATTCCCGTTACTCTTAGATTAAAAGGGTATCCTTGATTCGTCAGAAAGTATAAAGTATATATATTCCTGATCAGAATCACTTGCCGAGTCGATAGCCATGTCCGTCTGGCCGTCCGTCCGTATGAACGCTGAGATCTCGAAACTAAAAAAGCTAGAAGAGTCCAACTTGGTATGCAGATTCCTGGGCTTCCTAGGCAGCGCAAGTTTGTTTCAGCGAGCTGTCACGCCCACTCTAAAAGAAACGGTACTCTTAAAAAATAAACGAAAAACAGAAAAGGGGAAGATGCCAAAAACCACGCTCACATAAAATATCGCCTTTCTGCTTGTATATCTTCATTATCCTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTGACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATCCTTGTTTTTATTTGTATTTAACATTTACTTTTAATCGGATTTGCTGTGCTTCTGGGGGTTTGCTGCTTTCTGCTTTGGTGTTTGTTTTTTTCACCTAACTTTATAACATTCACTTATTTTCGATTTTGAAAGATATAAATAATATTATTATAATTAATATTACATATTGATACACATGTATTGATTACGAATATACAATTTATTTATTTTAGCACAATTACAATGTGCAAAAAATAATTAATGTTTAATTTCATGAATCTTTTTTTGTTTGTATGTTTAATGGGCACATGTACAATCGTAATTTTTACTGCTCACTTGTGTATATTTACCTTTGTGTTTTTTATTTTCGCTATATTGTTCATATTGAACTATCTTAACTGCACTTAACTTACATTTGATGACAAAATATTGATCTAAAATTTGTGGCACAGAGCCACTAAATTTTTAAAACTCGAGGCACGAACTTCACTTTTCACAATAAAAATTGCAACTGACAAGATATGCAAGAGACGAGAAAAACGTTTTTTCGTTTTCTAAGAGTACCGTTTATATATATATATTGAAAAACACCCTGATGGCACCCAGCACATTTGCCTTTGTAAATTTGCACGCGTGCTGTTTTGCGTAAAAAATATACGACCCAGAACTATGTATTTTTAAAAACCTTCGCGAACTTACGACTGGGTTGTAACGAAATATAAATCCGTATTTACAGTCACTGTACATCAAACAAAACAAGAAAGTAAGTCCGCTTCAGAAAGCCGAAGTTTGTACACCCCTTCCAGTTATAAGAAATAATCAATTTTAGTAACACAATATTCAGTGATATAAAAAAAATATTTTATTAATTTTTATACCCTTGCAGGGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATTTACATTCTTGATCAGCGTTACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCAGTCCGTTTCTCCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCGGGTTGAAATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTTGGAAACAGCAACAGATCGGACAACTTAATATTATAGCTCCCATAGGAATGATGGGAAAATATTTGTTACAATTATATCTTTGGTGTTTTTAAAAATATAACCTCATGCGCTTGAAAATAACATTTTTTAAATAGGTCGGAATTGGTGTTAATAAAATTGATTATTTGACTGCAAGGGTATTTAAACTTCTGCTTGCCGAAGGTATTTGTTTAGGGTCGTCCAGTTTTTGTTAAACAATTAAAAATTCTTAAAATTACAATAAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATAAGCTAAAAAAACAACAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTCCCATCGCTTCTACGGCAGCTATAGTCGTCTAATGTTTATAAAATTAAAAACGAAATTCAAAACTAGTTAAAAAAGTTATTTTCAAGTGTATGAGGTTATATGTTAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTAATTTTTTTTAAGATTATTCCTTGAGACCTATAAGTTGTCCGATCCGACCTATAAGTTCCTGCAAAAGGAAGTATACTATTGGGAATGTTTTATTCAGATAGCTTTAAAACTGAAAGACTAGTTTGCGTAGAAATAGACGAACAGACGGCCAGACACATAGACAGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGCGATGGTATGTATTTATTCTAGGGGTTCGAAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTAACGGGAATCATAATACGCTCTGCAAGGGTATAAATATTATAAATATATAAAATTTAAATATAGGACTAATACACACCTATGCTCTCCAGCCCAAGCGCATTTGCTTTTGATTGTTTGATTGTGCTTCGCCGAATGCAAGTTTCATCTGTGTTTTTCCACCATTTATCATACAACATTTGAATATCACCTTTTTCCTGGAGCTCAAGTATAGCCAACGAAATTTTATCCCGCCAAGGCGAACCTTTTGGTGTAGCGATTCCATATCCTGACAAAATTGACAACAGAGATATTTGTATATATATGTATACAAGCCAAAGTTTATGTTACCCTGTAATGTCCTGTAATGCTAGTTAAATTACAGAAATCGTATTTGGCAACCCAAAAATTATAATTTGACCCGTAACACGTTGATCATGCCCGTCTGTCTATTAGCACGTATGGACACTGGGATATCAAAATCGACAGCCATGATTATATATATAGAAAAAATACTTTCTCTATTTGTGGGTATTGAACAGTCAACGTATTATTTATTTGACAAACTTGTTTCCAATTGTGTTCGATTAACATTTGTTCTTAATAAGAATAACATTATATAGCACAATCCAATGAAAATCCAATTTTTAGGACAGGACTTGAAAATGATCTTAACGCATAAATAGCAAACATTTTGTTTAAAGTGTGTGCTGTTAATTAAGAACACCTCTTAACGAGATAAAAATATAGTGACGATCGCACCTTCAACAAACAAAAGTTCTGAGATCAACTGTGACGAAAATGAATATACAATCTTCTAAATAAACAAAATAAAATTTCATTTTGAGAGGACCCTGAAAATCTGAATTTGAAAGTTGGTGTCATTCGACGCGTATTTCAATTAAGAATTCAACGAGCTGGATAACGAAATAGCGAGAGGTAATTATCCCCACCGGCCCCAACAGATCAAATTTTCTAAATTTTAAAAAATTTTACACTTTTATCCCACACCAATTGATTTTTTTAAAGTCTTGGTACTCAATTCTTTTAGTTTTTGCAATACCCGTTCATTGATGTTCAATCGATGAGTCGAAACAATCGGTCGATTACTAAAGATTTTCATTTCTTCGTGCATGTATAGTAGTCGC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CTTCGCACACCCTCCTGGTGCGCTTCGTTACTACGTGGACTGCCGTCCACAGTGATTTATGTGCACAGATCATTTTTGCTAAATAGAGATGTGTATTTTTGTTATATTTATTTGATCATGTTTGTATAAATTATAGAACGTTTCTGGGTAACGCAAACTCTTATTTTACAAAATGTCATCTGCATGCCACAGTGAACCCGCCAATTCGCATTATTAATCTAATTATTAATAATAACCTCAATAACTCAGTATGGAGGTGGCACAGAAATCTCTTCCAACCAAACACGGTTGGTTTAGTGCATTCGTGTACGTAAGAAACAAACCGGATTTTGGTTGGAAAAGATTTCTGTGACACCCCCGTATATGTATATACTACTCTGAAGAAATTTGTATACCCTTGCAGAGCTTACAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTAACTGCCTTTCTTGTTAAAAGTACTTTAACCCTTTCTTACCTTTTGTATCCAACAATCCGCCTATTTGCGTTAAATTACAATCTCGTTGAACGATATAATCAAGCATGGTGGATTCCATCAAATAGGCGTAATTACCCTGATTAACCCGCTTTATACCATCCTCATATGTACTGGTAAACGCTGTGGTTTTCTTATTGTCCATGCTTCTCCACATTTTTTTGTAGGTTTCAATCATTGAGTCCTAGTACATATTAAGAAAAAAGCTTGTGAATTTCAAAATTAAGCTAATATTCCTATAAATTACCCGAAAAAAAGTCATAGTAGATCCGCTATCCAAAGTGCCATAAGATATCTCCGTTTGTGATGCCAAGTCTTCTGCGTTTTCGATGGGGTTAATCATACGTTCAGTTGTAAGAAAGGCAGCTAGATTAGCCGTGTAAGACGCTACAATAATTAGGGAAAAAAAACCCCAAATACTGCTAATTATCCTTGTTGACATCGCTCTCGGATAAATATCGGTTGATTGTTGCATAAGAGTTTCGATGGTAAACCAAAAACTGTCAGATAAGGAAAACTGATTGCCAATTGAAATATTTTCTAAGTCGCAGGGGTGGATATACTTCCACTCAAGGGGAGAAAGTTTTCCCACAATATATATACAAACTGATACCAGAAAATATGCAATCAGCACATATATCCAGATCTCTATTGCCAATGGATTCATAAAAGAAAACAACCTTGTTGGCTCTGAGCTCGGGACCTGAAATACAAATACGATTAGCATTAAGTTCAAATATCCAACTGTTATAGACCGTCTTAAACCTTGAATAAAATACTTATCCCCAAATTCATAAACGGTTTAGTGAAATCAATAACGCTTTCTCTTGCGTATGTGATAGTCATTGATCCAACGGCCAAGTCTGCTTTCTAAGAATAAATAAATATTTATTAAAAGAAGGCACAAGTTTGTAACCAACGGACATATTTCATTAGCTGAGCGACCATTCCGTTCCATTCACCAGATTCCGGATCTTTGGCGCCATACTTTCTATCCGGTACCAAATCCAGTATGTAGTCAAACCCAACCTCATGAGAAATGGTTTCCAATATGTCAACGCAAAACCCATAAAATCTTTCGTTGCCCGTAAAATTCTTGCCGTAGTGCATCATTACATAGGGAGTTTCCTGAAAATAAACTTTACAAAATCAAAATTATATTTTATGGCTCTTCATTACAGACCAGTATTGTTATGACTACCAGAGTCACATTCATGGAACCAGAATCAAAAAACATTGATGGTTCGGTTATGTTAAGATGTCCATGAGGGGTCCATTCTCCGACTTTTACAATGGAGTGTTGTTTTAGCTTTATTAAGTCCAATTTAAATTGTACTCGTTTTCCTTCTTTAAATTGAATAGGACCGGTAAGACCTTTCCATTCAACCTGTTGGATAGTTTGTTCATGTATAAGTTGCAAAGGGTTTAATAATTGCAGTCATAAATATTTAACATGTAGAATATTTTAAAATCAAACACAGGCAGTTAAAAACGAACATAAACATTAGATACTAGACTCCTGCATCAATTAATATATAAGGCCTTTTGAATCATTCACCCTGAAAAAGTGTACATGTTTTGCTGTTTTAAAATATTTTTAACGACAAATACATTTCTTATTTAGCAACTCTGAAAAAGATTTTGAAGCCGCAGATTAAAAATGGACATATATAAGCAGAACAGAAATATTATCAAGCGCCTTCTTCCGGCTATTTTGGTATATGTTATGTGGGCGGCAGTCAGTTCTAAGCGTTTTAGCTTTTTGGGGCGTTACAAATATTTTTTTTAAGTCAATTGAAAGGATTTAATGAGACAAATACATTTTAGCCAAAAAAAAATTCTAGCATGACAACTGTGACCACCACAGTTTTAGGCGATAGAGTGGGCGTGGCTCATTTTTTGGGTCAATCGATAGGTATTGATAAGATAACTACGTTTTAGCAAAAACAAATTTTCTAGCATCATAATTGTGGCCACCACAGTTTTGGGCGGTTAGTGGGCGTGGCACATTTAAGTTACAATTTTTGTTCTTTCATCACGCACCGCATTTAAGTAATTAATTAAGCTTAGGCCTCCGTTCCATGGAATTTCCGCATCGCAGGTCATGTTCAATAGATTTAAGGTATGTGATTGCTCCAATGTCTGCAATCCAATAGCAAAAACGTACACAGAATCAAACATTAAAGCTGGCTCTGACTGAAAGGTAATTACTTTATTAAGTAATGTGGTTACAACAAATTTCCATTAAAACCTACCTCCAGGGCAATGGATTTTCTTTCATGCGGATTCAAAAATGATTTCTGAATCATATGGTGACTATATGATTGGAGGTCCTTTAAAATCTGCTTTACACCTACATCTCCAATGTCGACCAATCGAAATGATGTTATGTTTACAAAATTGTATTTAAAATCTTCTAGATCATAGGTTTCTAAGTCAAAGCTAGTAAACAAATAATGGTATTTGTATTCATTCATTTGTTGCTGTAGTATCTACATTTGGACACATGCATTATAAGAGAAAAAATATAAAAAAAGAAAAAAACACAGTTTTTAGCACTTATCGTTTCAAAGTAACTGAAAAACACGACCATTACACATATAGGTGAAGCGGTGACAAAGAAAATATTAAATTTCCAATAAAAAGATACATTTGCAACTAGAAAGGAAGCTACCTTTTTTTTCAATTTTTCGATTTTAAGAAAACTTGAAACTAATCCCAATTAACGTTCCATTTCCGTTTACTACAGTAAATTTTTTGTCGGAAACATAAAGGAAAACATAACGGTATTTTTACTTTGTTCACATTAGTTATTCGATCTTTTCGATGGCAGCTTTACGATAAAGTCTTCCAATTTTTTTAATATTTCGTTTAAAATTTCGAAGTATTAAAAAAACAATATGCAAAGATTAGTGTATAATGTCAAAAAACATCAAACTTTTATTTATTTTCACCCATACCCTCGAACTATGCCACCAACTTATTAAGTGCACCGCAGTCCATTCAGAATTAGTAAGGCTTTTATATCGTTTTCATTTCTTAAATCGGCAACTGAGAAAAATTAAATTTCATCACGACCAAGGCAAGTGAAAAAGAAAGCCAAAGCAAAAAAGATTATACAGGAAGTGTTCAAAAAGTAAGTTAATTTGTTAAATTTCGCGGGCTATTAAGAGTGTAACAAAACAAAAAAAAATAATTGAAAATTCGTAGTTCTATACTTGTGAGCAGGGCTCCCAAAATATGCTCAAGCATTTTTCTTTAGCCCGTCAGACTCAGATCAAAACGGATACAAATGATCAATCTCAGTCTCTTGAGCAAAGACATTTTTATACCCTCGCAGAGGGAGAAGGAGACGTTTCCGACTTCCTTTCTTGTTTTGTTTCATTTTTGTTAGGTGTCTGAACAGAAGAAGAAAACAATATTTTTCATTATATTATAGTTTATTCTATAAATTGTTTTTTTATTCTGAATTAAGTTTTACAA'..b'GAAGAAAACGTATCTGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCACAAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTTCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACACTGAGATCTCAGAAGCTATAAGAGCTAGAACAGTAACACTTGACATGTAGATTGTTTTAGCGGGGTACTAAGGTACTAAGTTTTTAAAACTGGTAGCCACGAATCTAAAAATAAAACACTTGACCGCTCGTCTTTACATTAATAGAATATGCCTTGTGGATTTCTAATTAAAGCAATTGGAATAAGCCCCGTAGTTTTTTAATTCAACAAAAATGTTTTGTTTTGACGGCTTAGTGTAAAGTTTCATGTAGGCGCTAGACGTTGTGCCCGATTGTGGCCGTTTAAGTAGTTGTGGCACCCAGCTGAAACAAACGTGCGCTACGCAAGAAGCCCAAGAAACTGCATACTTAATCGAAGTTTATACAGAAACGAACTTGGCAAGAATATTTATAATTTATAGAGTAGGTACCGCTTCCTTCTACTTACTCTTACTCTACTAGTAATGAGAATTAAAACTTCACATTAAGAAACCAATGTCCCTTAGCAGGAACGTTATCCGTCTGGATAAGGAATATCTTACTATTGAATAATTATATAGTTAGGGTGTTCTTACCTTGCTTATATTGAGCTCAGAAAAATTACTTGGCAAATTACTTATTGCATCGTGTCCTCTTAAATAGTCGTTGCCTGAGTTATTTAAATGTACAGAGGGGTGCTGCTGTTGCTGGGGCTGTTGCTGTTGTTGCGAAGTCTGTTGCATGTTCTGCTGTTTGACATAAACAGCCTGTTGTGCATTTATTTGGTTCTGTAAATTCTGAATTTGCTGCTTGTACTTAGATATAGCCACATTCACTGCCATTGGATTTGCGTTTCCTCCGCGAGCAAGGGATTGCTGAGCTGCTTGGAGGTGCTGAAAGCAAAAATGTTATTTCAGAAAAAATTAAGCACAATGTACAAACAACGTGTTAGGGAACATGAGTTCCAAAAAAAAGAAAAGAAGCTCACTTCAACAAGGTGACAAGTCATTACATATCAACCCGGAAACCACCGTTGTTTATTTTATTTTTGAAAAAATTAATTCTTTTTCTCGTAATCGATTATAAGAAAATCCAATTGCTTTTCATTCATGTGAAACGTGTCTTGTTTTCGCAAAATGTAATATGGTGAACATTCTTACGTAGATAGCGTGTGGCGGGGTTGATATGAAGCGTCCCGTATATTAATAGATCCAATCTATATCATCGAGACATTTCGATATATTTAAATACAAATCTAAAAGGGGTGGCAAAGCTAGCTACTTTTCTTGTTTAACAAAATGCAAAGTTAAAATTGTATATATTTGAAAAATTTAAAAATATATATGAGTTTATAAATGTATAAAGTTACCTTAATATTGCTAAGAAGTTGATTTAATAGATTAAGGGTAGTTTGAGTAAGCGGTTGTGTCAATATCTGACTAGATATGAAACCACTATGAATGGCCAACTGAATCTGCTGTCCAAGCATGCGAATTTGTTGACCCGATGGTTGATTGTTTGTATTTGCTGCTATATTTGCGGAAGCTGCTGCTGCCACTGCTGCGTTTGATGTGTTCTGACCAAATCCGACGGATACGGCTGAAGTGTTGCCAACGTTTTGCGGTCCTACAGCAACGCTGTGTTGACCTTGATTTAAATACTTTTGCACTTGCAAAGCTGTCATGTTTGCATTATTGTTTCCTCCTCCAGTAACTGCAGTACCACCCATGTTATTCATAAGGTTATTCTGCAAAAGAAAATATTTTCAAACAAACCTTTTGTATTTTTACCAACCACGCCACATTAGTAAGTTTTTGTTAAGATTTCCTTAACCTTTTTAACCGTATAATTATGTTAGAACATTTGTGCGATTCTGCATAATGCAGCCAGATAATTATTAAGATAACTAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGCATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAGCTCTAGTAAATAAATTGTTTCCCGATCGTTTTTATGACAGCAATATGTATAGTAGTCCGACCTTATTAAAATTTAATTCGAAATTCAGAAGGTTATATGTTAAAAAGCACCAAAAGCTATAATTTGTTATTTATTATATTAACCAATTTCCCGATCGTTCCTATGACAGATATTTGATATAGTCTTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCCAAATTCAGAAATAATTACAAAATGTTAATTCCAAGCTTAGAAGATGTGTTAAAAACTCCGAAGATATAATTTTTTTTAAGTTTTTCCCCGATAGTTCCCATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCGGGCTTATTCCGACTTATATACTTCCTGCAATAGAAGGAAGACTTTTGGGAAAGCTTTAAAACTGAAAGACTAGTTAGCGTAGAAACGGACGGACAAACAGACGGATGGCTAGATCGACAAGAATATATTTACTTTAGGGGTCGGAAATGTTTTCTTCACTGCGTTGCAAACTACTGACTGAAATCATTACACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAACGCCGATAGACGGCCTCGACTTTTAGATACCCCTTTATTAACTAAAGGGTGTTTGAAAGAAATGTTAAAATGCATGCAGCACATCGGCTGTTTCAGAGATTGCTCACTTTATTTGCCTCTAATTTTTTATAGAATGGTCTGATCTTGGCATGTAAATGAGTTTTGATAACCAGAGCCAGATGCCACTTTCACTTTTACGAACGTTTAACCGCAAAGCAAGTTAATTTCAAAATGGTGAAGCCTAAATGTGTAATGCAATCTCGGAAAAAGTCGCTTTGTTGCTTGAGTCCCTTGCGCTTCCTTAAGCTCGGCAACGGGTCGAAGCACTTGACAATAGCAAAAGTCCTTGTCGTCGCGAAACACGTCTTAGTTTTAAATTGAAAACTTACATGAGGAAAAGACATCGAAGGCTGTCCACTGCTCACTGGGTAACGGCCAGCAAACCCACTGCTGCTTGTTGAACTCGCGTGGTCGGAATATGAGCCAAGGGATGATTCATCATGTCGACGCCAACCATCCATAGCCATAGATGTGTTGGTACGCAGCATATCGGCTGCTTCTTCGATATTCATATTGGCAGTCACTAATGCGCGCTCCACGTCTTCCTTTTTAAATCCGTTCTCAACAAGGATCCGATATTGTTTGCTTTGCTTAATCATCTCTGCATTGATAACGTTTACCATTCCCACATTAAGTCCCGCTAGTTTTTGCTGTTGCTGAGATTTTCCAATTATCCCTCCATGTGAGTTCCATTCAGATCCTAGATCTACGCCGTCCACCACACCTACACCTGCTCCAGTGCTCCAACCAGATGATGTACTAGTGGCCGGCAGTTTGCTTTGCTTATTCCCCCAACCAACTCCAACTGGTGCTGCGTCGCTCCAAGAATTTTGAGCCAGTGTGGCGTTAGATTTATCATCCACCCAATTACTGCTGGTTACACCACCACCACTGGGGGCGCCCACACTAACGTTGTGAGTGTCATCTCCCCAAGTGGCGACAGCAGCAACGTTATTCCTGGCGCTAACATTGTTCGAATGCACCCACATGGCTCCTCCGTCTTGCTTGTGCTGCACGCCTCCCACAGATGGCAGGCGAGTCTGTGGTCCAACTACACTGTTCAAAGGGTTGTTGGGATTGGCTCCAACTGGAACATTGCTATTGCCAACTCCTGCGATACCGATGCCACCCGACTGGTTTTGACCTCGCATCAGATGACCACTACGACCAATGGAATCAGTCATGTCTTTCCAGTGACCGCTTCCACCGGGAACACGAGTTTGCTGACCCCAGAGGGATGTGCCATCGTCGTAATTAGGAATACTGCGTCGCTGGGGCGGTGGCGATGGTTCCTCCCATCCACTAATCTGCTTCGATAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/b97/f91/4c/scaffold_37-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTCTTTGGGGCCACTTACACCAACGCCTACCGCTTGGGACGGCCCCCACTGTGTTGGGATATTGTTCGATACAGGTCCAGGACCAGGTCCCCCCGGTCCGATGCCAGATCCTGATGTTCCTCCAACATTCGTACCAGCAGTTGCCACGCTTTGGCCAACCATTTTATTAATATTTTGTATTTGATTGTGCGACATTTGTGGATGATGGCCCCACATTTCCGATGTTCCATTAAGCCGACCGGATATTCCACGAGGATCTCCTCGAATTGGATCCCGTGGATCGATCATTCGGATGTCGCGGGGATCGCTCGAAGATCCCCCTGAACCGTTACCTCCGCGATGATCAACGTTTCGAATATCCATAGATCCACCTCCAGCTAAAGGTCGAATTTCGCGAGGGTCTCCCCAACCATTGCCAGTATTGCTTGAGTTTCCGCTGCCACCTGCGACAACTCCAGTCGAACCAGATAAATTGCTTGATCCGTTACCTTTTAGAATAAGAAAAACAATCTTATCGTATGCATTCGAATTAAGAAGTTAAAGCTTTCGGATTTTTAAAAACTCAAAACTAATTATAGTTATAATATAAATATAATTATTAATAATATATTACTACCGTTTATCTTCACCAAAAACACTATTAGACAAAGTATCCGTACTATTTAGACAAAGTATCCGCAATATTAACTCACAAGAATAAAAAAATATTTATATTTAAAATTTTGAAAATTATAGATATAAAAAGAACGATATTGCAAAAAAGGTAACATGTCAAAATTATAACTAAATAATGATAAAACAGACAGACGGACATAACATAAAGCTTTGAACAAGTTCCCTCTGTGTTGCAAATTACTGACTGAAATCATTATGCATATTAGCCCATTATACCACTATAACAAGAAAAAAACTTGTATAAATACCAAGTGGTTTGATTTGCAGAAACGAATGTAAGTAATGGTTTGGTGCATATACCATTATAAGTGAAACAATAGTGTAGTAACGTGCCACGTGTTTGTTACCTAAAGCCTTAAACTTACCAGTTGACCCTAGTCCGACGCCAACCACACCTTGTCCCCACTGAGGACCTCCAGATGAGACTACACCACCTGGGCCAACATTAACACCGCCTTGGTTCACTCCCACTGCCGATCCAGACCCGGCGTTGTTAACCGATCCTCCTGTCCACACACTACTGCTGTCGGCCCCATCATCGTCCTCTCCCCACGTTCCGCCTAGATTAGAGGATGGCGTATGACCCCACGAAGGCTTTGGAACTTGCTGAGCGGTCGGCTGACCACCGTTTCTTAAATTGGATTCCCAAAGATCAGTTCCATTGTTGATGCTTGGCTTCCACATTGGTGGTCCGGCCGCATCTTTATTGGTTGGTTCTGGCGAACTGGGGACTTCCCAATTGGTGTCCTGGTTGACATGTTGACAGCCCCAGCCATCTTGGGAAAAAAGCGCTTCGCGCATAGTGCTCAAATGTTCTAACTGATCGTCAACTTCAAAAGTGGCATTCCCAACTATTCCAGCATCAAATTGATTTTCAACGTCATTATCGTAAGCATTTATAGCAATTTTTATAAACTCTTTGACTTGTTTAAAAAAGAATGACTTATTCCTTGTGTGTTCCGAGTCCTATATAAATAATAAGAGATACAAATTATTATTTGCAAAAAGCTATAAGTATTGAAAGTGTTTGAAGGACTCATAAATAATACGATTCAAAAAATTCTCTACAATTTTTTTTAAAGCACAAATATTCAGTGTACCATTTACAATTTACAATTTTTTAACAAGCTTTTAAAAGCCAGATCGCTGCACACCCAGGGCTGCTGCACAACAGGCGGTTTTCGCTTTCGAATATATTTTAATGAATGTGTGTATTGACTCTGCATACATGTGTGAATGTACATTTTGACGTGTAAGAACTAATTTACATTTAGATAATTTAAAGAAAGTATTGCAATGTTTAATGTGTACTTTAAATGATGGTACTTAAATCTTTCCGTGTACCTCAATATACCACTATTTTGGTATATATGTATACATATGTACATGCATGTAGAGAACTTATTTGACAACTCTGGTTAGCCATCATTGACGCAATCACCCTATTTTAATTCTACCTTTAGCATTTTCGCACTCTCTAGGAAGAACAAATAAAGTTGGCATTTTAAATTTATTTTGCCCAATAAAATAAATTTATTTTCAAGCTATATGAATGAACATGTATATACATGTATGCATTAATTTTCTGTATTGTATATGGCTGTATACAGCAGACATTTTCTATTAACTAGTGTATTCGCGAATCCATTTGCCTATGTAATCCAAAAAGGAAAAATTCATAAAAAATACAAAAAAAAGATCCAACGAGAACCTACCAACAGAAGAGGATAATAAAATCCTTTACTTAACACTTTTATATTAAGTTTAAGTACTCGCTTTTACGCCAATACCACAGAATATTTGCAAGAATTTTTGCTTATACCGAACGAGAAGTTGATTTTCTCTATATAAGTACTCATATAGGTATGTAAGTTTGAGTATGTATGCATGTCAAGCCACTTTGACGATTTCACAAAGTGTGTATGTGTAGTAAAACATACACACACATTCGACACTCAATTACAATTTTTCACATTTCACAAAGCATCTTCAAAGTTATTTGCAGATATTTAAAATTATCTTGAGAGTGAACAACAATTTTGAACAAATAATTATTTTATTTCGATGTAATTGAATTTAAATTTCGGTGCACGTTCAACAACGGGGACGGTACGAGTTACTAATGTATTAAATAAACGCATACACCTATAGCTGATATCAATATTGCCACCTAGTTGAAATGCAAACATTGGAAAGTAGTTGGGGTGTAAAGTGGCAATAGTTAATAATAAACATATGTACAATGATGTGAAGGCATATAGTCTTTATCAATATTTTTTACAGCTTGTCTGGAAACACTAAATTCGTGCCACAAATTAAACAATTGGCAGATGCTCTACGTCATTATGTAAAATTCTTAAAGCGTGGCAACTCTATAGATGGAACATATGTATGTACAGATGTATAAAAAACACTTTCCAATGCATGATACACAAACGAACAGAGTTAATTCTGCACTGATACGCGCATACATACAAACACGTATGACATACATACGCGAGACTATTCGCTTGTATTTTTACCACCATATAGGTTATGCATATTTAGGTTATGTCTGCCAGTTGGTTTTTAGTCACAAATATTCCTTCTCTTAGCATATGTACATCCCTTAATAAGTTTTATATTATCTATGTGCTGCAAGAAAAACCAACACAAAACACTGCTATTAGTATATCAGTACTGAGATTTCCAAAGCTTTTCTTTCAATGACAGCGCTTGTTAGTGGAAGAATACGCACACAAAAACATTCACTAATCGTGCTAATTCCTTTTAACACACGCGCTTGAATTAATGTGTACCTATACCTCGCTCTCGCTCACTCTTGGTCTGGAAGAACGACAAGCGATAATTGGCTTCATAGTAGATTACCGATAATTTCGTTTGGTAATCGATATTTACCCACTTATACCCTATTCACACAAAAAACGGAAAAAAGGAAGTGATTCTTTCGGACCAACTGAATTCTTACGTCCTCTCCGTTTGGATACAGTTTCTTATGCTATACTGATTCTCTATGTGAACAAGAATCCTCTCAGTTGTAATAACCTACCTCTCTCCCCTCAACAAAGCTATCGTTTCTTTTTTCTGTTGCGTTTGGACAATTTACAAAAATCTTTAAATCGGTTTTAATTTTTAGGTTCTTGAAGACCGTATTTATTAAAAATATGTTTATTAAATGTGATTTTAAATTTAAAAATTAGGTGACTCAAGGATATATTAGAAGTATCAGCTTCCCGTCCAATTTTACTGTTATGAGCCTATTTTAAAAATGTAAACTGTAAAAACAGAAGCAAACACAAACTTATTT'..b'TGTTCTGAACGGTTTGTTTCAGACGTTTTATAATACTTAGTGTATATATCAGGATTTATAAAATGAGTGTCCAATATTTTTTCCTGCTCATTTAAAGTTAACGCAAGCCAGGCATCTCGACTGTATGAAGATCTTACTCTGTTTATGTCGCGCGTAATCTTTCCAGCCAGTGAATTAAGCTGGGAAAAGTATGCGGAAATTCCCTCATGTGCCGCCATTTTTTACCTGAAAGTAAATGGGTAAATGCTCTTAGTATTAACCAAATAATTAACAAAAATCGATTTATGTGGTGGAGGTGGATGAGAGTGTGACGGCGTCAGTGCTACACCATGTTCATATGTCAGAAAATGTATGTTTGAATTGCGAGTCGCACTGGCTTTATTCAGAGTGGAGTAACCTAGCATAGGAGGGGGCCTTGACTCCGCTGAAACCAACCTTGTACTAGAATCTTTAGAACCTACGTGATAAATACAAACTTTTTAGCTATTATAGTTATTGAGATTTCAGCGTTCATACGGACGATTTTTATAAGGTTTTTGGTTAAGTAATAATATTGATAAGAGCATTTCACTCTAATTAATATTTTCTTTCCACATTATGGCGTTATGGTGGGAGTGGCGCTGTGCCAAAACAAACTTGCGATGCGCAGGAATCTGTAGAATCGACACCTTTAATTCCAACCTTTTGTCTTGGAAGACTCCCGAGATCTTGCCGCTCATACGGACAGGCGCCAGGCATGGCTAGACCCACATATGTACGTACAAATGTATATGTATTATTACAGATACATATATTCTTTACCATGATTCAAAATAACGCTTATAGATAGGCTATACCCTATAACTGCCATTGAGCTGTATCAGGACCATAATTTTCGAAATTGATTATTGGTTCAGGCGTGTAAAGTCTACCAAATTAATTCCACTGTCAGAACAGGTACCTTAAATTTTATACTTACATGGGAGAGGTGTTTGGAAATATATTTCAACTCCAACTAGGGTTCTAATTTGTTTTCCTTTTCTCCGGCGAGTTTACTAAAATAAAGGGCTGGAAAAACTTTAATAAAGCAAAAATAAAGAGAACAGATTTCATGTATTAAAAATAATACAATGTTCACACCAGAGACGCAATATCAATTGCAACCATAGTTATTTCCCACCAAATCCACCACTTTTCGGAAAACAAGCTAGTTTGCCGAAAAAACAGCTATAATACAGCTATATTTTTAATACTCATGACTTGTGAAAGGTATTTCGAAGTACTTGTATGCCTTTTAAACTCAATTTGTCTAAATACCACCGTTAAAAACTATGGCAAATGTTTTTTATAATTTAGATATTTTTAGTCTTTTTTTCTGATTTCGCAAAAACGGCACTAACGATTTCAAATAGAGAGATTTCTCAACTTTTGACATACGAAACATTCCTGTAAAAATACCCGTGTCAAAGATATAAAATAACAAAGATATTGTGAGTATTTAGTGAGTATTTAGTGGACGGACACCTGAGGTAAGCTGCTAGTTAAGATGTATTACAAGGCTTATTCTCAGAGGTAGAAATTCAATTTATGTATAAGTGATTTATTCATAAGTTCTTACTTGCTTATAGGTTTCGAAGTTTCGTTGATGGTAACAGTTTGCGTAGTTGGCTCGGCTGACACTGCAACAACGTTTTTAAATACCAGCGCTTAAAAATTATGATAAAAATATTTTTTATTCAAACTTTTTGTTTAGCTTTTTTTCTGATGTTTGATAACTGCTCAAACGATTTCAGGTAATAAATTTAAGTGGCTAGCCCAAAAAATTGTTGTAAAAAGTTACCCTATAAAGTTTATTAATCAACAAAAATGGTAGCAATGGCAGACAATATAACACACATATTATATGACTTGTGTTTAAAACAAAAACTTCTGATATCAAACAAAAACCTCTGAACGATTGATTTCAGATCTTCTGTTTGTTGAAGGTGGAATCGTCACTATATCTTTAACCTCGTTTTGAGGTGTTTTTGGTTGTAACAAAATACTTTTTTTTTTTTATTTCAAACATGAATCGAATTTGTTCTGATATGCATTACAAGACAGGAACGCCAGGAAAATTTAAAATTTTTAAATTTTAAAAAGCTGGAGTTTTTAGCAATTGTTGTGTATGGGGTCGATTAAATTTGACTATCGCCAATGCTTATCGAGCTGGACATTAAAGATGTCTTTAAAATAAAGTGACAGGCTGGTCACACTTTAAGCAGTCGAAAAATTATGTATACAATTAAATAAATATACAATGAGTTGTTGTTAATTAACCAGCAATATGAATAATTGCATTGTCGAGGTGGAGTACGAATATGTTGTGTTAAAAGTAAGTTTACAATTTGGGGAAAACATTTGTACGGTTCCTTTTGCCCTAGAAAATCTATATTGGTATCCTTAAAACATTGTACAAACCCTTTAAAAACCTTTTTTTTTATAGATTAACGGTTATGATATTAGCCATTTGCCGTGGTATGAAGCGGTTCAAAAGTTCCTTCAAGCCAAAGAAACGATAGTAGTTGAATTGTGCAGACAGAAGCACAATGAGTTAGATTGCACCAACGCTAAACTATCAGATGTGGATAAAACCGTTCCGAATGCTCTGCAATCAACCACATGCGAATCAGATTTATCTGCCCAAACTGAAAATACAGCCAATGCGGTGCCTACAGCAACTGCAAATGACTCTCAGCTAGTGGACGCTACGTCAATAATACCAGCACCTTTGGATGTAACAGCAAAAAAAAGTCCTGTTATTTTGACTCTGCGTGCTTTAAGCCATGAAGAACGTTTGGGCAATGCTACAGCATTGGCCGCTTCGAAGGAAACGCAAACGCAACCTGCCAACGACACAGATGTTTTGAGGGATCATGATTTTGTTCAGACTATAACCAACCACTTCATTGAGCAGGAACACCACTTGTTTGAACAATGCCTTGAACCGGAAATCGATATTGAGGTAGTTTGGTCACATATAAGCTTTAGCTTTTTTAGTTTAGGACTGTATAAACTTAAGTTCTTGACTGATTTAGGAACAATATATAAATATGATGTTATCTTTTGTCGATGACATGAATTGATTTTAAGGACCTTTTAGTTAGTGTAACATTTATCGGATGCTAAGGAACTCTGACTTCTTGCTAAGTATTTTTTCTTATGTTTTTGCTTATTTTACAAAACCCTACAAGGATGAAATTATTTAGTCTTGGATATTCTATCTTTATGTCACTATAGTTTATTGTTCAGATCACTGAGGATGGAGGTACACTCAGTGGCGAAGCGCACCAGAAAGTGTGCAAAGAAAACTACTGTATATAACTGCAGAATTGAAAATCTGCTAAGATGGTCCGAAAAAGTGATTATCCTATCGAAAGGAATCGCAAAAACTAAAACGATTGCACCAACCTTTTTAATTTGTTTTAGAAAAAAAGCGGTAAAAGTGTAAAAGTGAAAATGTAGAAAATTGGAGCTGATGCAGACTGTGGGGATACTGAGACTATGCGTCGAATGACACCTCATTTGTTGAAATCCGATGTCCCGTTCCAAAGTAATTCCAAAAAATAATTTTTTCTTCCTAAAATGAAAATGTTTGTCTCTTTGGTTGTGGCTTTGTATGCAATATGCATATGCATATCCTTTGGATATATAAAGTTGCTAGAGATAGAAAACTATTGTTCTACGACTTTTGAAAAAACACGCCAGTTTAGCGGGAATTAAAAAAGATTTGAAAGACTTATAGTTTCTAAACAACGGTAGACATGCTATAAGTCTCTAAAAAGATAAATCAATTAGCTAAATACTCTTCTATTAATTAAGTTGTCTTAATAAAACTACTTTTCTCAACATGGAATCGAATGATTTCTTTTTATACCCTTGCAGAAAGTATAATGATTTCAGTCAGAATTTTGCAATAGAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCTTAAAGTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAAAGGGAATCCTGTTCCTTGTTATCCTGTTTAACTCAATGCTTCCCTCTCAATGGAAGTGTGCTGTGATTACGATAATACCAAAGCCAGGAAAACCGGAGAACCTTGTCGAGTCTTACCGACCAATAAGTTAGCTGCCCACCTTCTCTAAAATATTCGAAAGAATATTCCTTAGCAGAATGATGGCAGTTAAAAGAGTACAGGAAGCCTTTACAGACCACCAGTTTGGTTTTAGACATCAAGCAAGCACATCGGGTTGTTGAACATATCCTATTTTTCTATGCTATTTTTCTCGACGTCAAGAAAGCTTTCGACCGCGTGTGGCATGATGGCTTACTTTACAAGTTGAAGTCCCTTCTCCCGACTGGCCAATTTCTCTTGCTCAAATCATACCTGCTTGATCGAAGTTTTATGGCCCTCTTTACATCCGGTCTGCCGTGTCCCATTGAGCCGGGCACGCTTCTACTTACGCTGATGACACTGCCTTCCTTGCAAACTACTCATGTCAAACCGAAACATGAAAGTGCAAAGAATTCAAAACCTGGCGCTACGTAGGATTGCAGATGAGCTAAAAAAAAAGGTGGTTTTCATCACATTTATTGTACTATCTAAAATTGATGTTTTATTTTTCAATGAATTTGTATTGTTCAACTCATTCACTTGTATATTGCGGATAACATCCTCCATGTTTTGTGCATACTGGAAGTCCAGCACCCCAAATAGTCCGTTGGCGATCTCGCCAAATCTTTCCCACCAGATTTAGAGCCCCTCTCCGGTGCCGATCGTGATCGAACAGCTGTTGATCATCATATAACTAGCTTGCCTCTTGTTCGAGAAAATTTTCTACCGTAAGGCAGGATTCTTCTGCTAATAACCGCAGATCGAAGTATGATATAATCGTCCCTTCTGCTGACGTCTCCTACGGCCACTGTGTTTTGCTTCCTTGTCCATCTTGACCGATTTTGAAACTTCTGTAGGTACGCTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTGAGACGAATCTAGTATACCCTATTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATATCTTTTAGCTCTTAAAAGAATAATCGGAAAATGCCGAAGTTAACTACTTTTCTTGATTTTTTCTTTGTTCATAAGTTATTAAAACAACCAAAAAAATTAGGTGTGTTTCATAAAAATCGGCATTGGGATCATAATAATTTAAAATTGTTTAAGAGAATCATGAATTGCAGTGAAATTTCGTATAAATATTAAAATGTTGTTTAATTATCAATAATTCGCCTAAGAATTTGTTTTTCTTCAGAACCAGGGCACCAACTGCTAAAATGTTATTTTTATTAAACACGAATATTAAACGAACACAATTGGAAAAAAATGTGTCCAGCACATAATAATATGCTTACTGTTCAATGCTCAAAAATATATAAAGTGTACTTTTGGGATATTTATCTGATCATTGCTGTACATAGTGAGATTAATAAAGTTATGCCCTTTTGATCTTGCTAACTAAATTGCTGAACAAATTAATAAGATTATCTAAAATAATATTTTAATGAACTTCTTATTGTTAAGTGCAGACATTACTTAAGAAAATGTGCCACAGAAACTTATAAAATATACATTCGCCAATATCTATGGAAGGTCCACTAAGAAATTTTGTTTAAATTTATTTTTGAATTTCGCTTACCAAAACATATTAAACAGCAATTTCTTATTATATATTTAATTGAAAACATGAAGCTTCTTTCAAATAGGGCTTGTGGTTAGAGGCTGGATATAGACTTTGGCCGTCCAGGGTATATCTATTATATTAAAAAGTTGTTTACACGAAATATACACAATTTGACACAGTCTTCAGTGTTACTTACATACGTATATTTTTTTATGTCACAATAGCGCTATTGAAGTATAATGCTAGGTTTCTTTAGAGCTTACGTGATCGGTTATTGCGTTGCTTTTAATCGGATACATATATAAATGTATCCACTTTATTATTGGTTAAATAAAAACCTTATTTAGAGATTAAAATAATTCAGGTATAATCTACACAGACAAGTAAAATTTATTTTATTTTAAACAATAAAAACCCGTAAAATGGATTAAAAAAAAAAAAACTATCACAGCGCAATATTCTGGTTGGCATAGGTATTTTGACGATACAAAAGCTAAATATATAAATAATTTTAACTTACTTATTTGGTATTAATTGAAAGGTAATTCACTTATTTAAAATTCCGAATTTGCCTGAAAATCTACTTTTTAACTTTTTTATTATATATATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATATTATATTTATTGGTACAAACAGTTTCTCCAGAAAAAAATAATAGTAATATTTTGTATTATTTTTTTAAAGGTAAGAAGTCGAAAAAGTGGGTACAAAAGAGAATTTTTGTAAACATCAAAAATTGTAAGCAAAATAACTTTTTTTACTGAGTAACAGCAAAAAGAATTTTTCAAAAATAATTTTGCTTGTATTTTTAATGATTTCTCTAAGGTCACAATGTCGGAAAGATTGTATAAAAAAAGAAAGCTATAAAAAAATTGAAAAAATCATAAATAATAAAGGCATAATATTTTTGTACAATTTGGGTTGCATTTACTATTAGTTTTGCTTGTTGTTGTTTGTTTAAAAAGTAGATTTTCACACAAGTTTGTACTTTTCAATAAGTACTGAATGGATTAAGAAACGATTTATACCATTAAAACGGCATTTAAATTACTTTTCCGTTGATGCAAAAGTTAACAACCAGTAAGTTCAAATTATGAATATATTTTACTTTTGTTTCTTCAAAATACTTTTGCCATCCAGTGTAAGTTATTGCTTAGTTAAATATGATACTTTTATTTTGATGATAATAAATTAAAATATTTTACTTAACTACCCAAAGTATGATTTGACAGTAGAACAAAAATTTGTATACGACATTTTTTTACTGGAAACTAATAAGTAACAACAATACAAGACTTTTATTTTATTAATTATATTTTTCATTCGATCAATATTTATTGCACCTTTCAAACTTTTTTTATTATTAGTTAATGCCTTGCTAATATTAGTTTTTAAATTGTAAATATACACAAAATTAAATGATTTTTCTATAAACCTAAAAAATGTGTAACTTACTTTAAATTCGCAGTATGCACAAGAATGCCTTTAGTTTAAATATTTAGTAAGCTTGTAGAGCAAAAGTGAATTTACATTAAGTTTATAATGTATCTAATTATATACATTAATATTAATAGTTTCTATTCTTAAATTCTATCTCGATGCTCATTCTTTGAATTACAACAACTATACGGCATATATTCTTCGTCTTCTTTTCCCCATCTGAGGAGAACGAAAATTTCAATTGAAAAAAATGGTGCTGACGCATTTTTGAGTGAAGAAAAGAATATTAATATTGAGAATGTCAATAAATTGGAAATCTATGACAATATATTTGCAGTATACAACTCTTGCATCATATAAATCTTTCAACCAACCAGTGTTATTGATAATTGATGTTCGTAAAAGCGCCTACTGAGTGTGTTTAATAGATATTTTCCTGAACGCCCTAATATGATTTTATTAAAAACAAATAAGGCCAAATCAAAAAACTTAAGAGCGAAATACGATGTTTTAGTTTTCAAATATCGAATTGTCTAATTAATACATAATAGATTTCCATTTACAAAAAATAAATAAAATTGAATACCAGCATCCGAGACTGCTTTTGAGCTGATTGTAAATCGATACATTAACCGACTGGCGAATACTGGAGCATGTTTTTTTGTGATCAAATTAAACCGTTTATTGACAAACAAAGATGATATAATTTTTCAAAACGTGTTTGATTACTCGGAGGAATTACTTATATTTGATCCTATTTTAACGAGACCTACTGCCAATATAGTTATGTATTTCCTTACAATAATAAAAACTTGCATAACCTAGAAGAA'..b'ATCTGACTGTGCCAAGCTGACATCACGCTTTGATGCCATTACAGTGTTAACAGGTTTCCTTGCCCTCTGCTCTATGGTTTGTTCAGTCAATGCAGATTTCAAAGTTTGCAAAACTCTTAAGATATCTTCTGGTGCAACAATAAATCTTTCTGATGTTATTGGAGCTATTCCTAAGACTAATGAAGCTACTGTAGGCGCGTGAGTGAAGGAACTACTTATCAGTGGGTGGTTTTTTCTTTCCACTTGCATCTCCTATTTATTAAATGTCCATTTAGGAGAAAAAATATGGTCGCATTCGATCAATTCTAATAACATCTCATTAAAGCAATATATGTTATTTGGAATCCTTAGTCGCAGACAAATTACTTTTGAAAATTGTGTTAAGTGCCAGATGCGCTGTAAGCATGCCTGAAAATAAATAATGAATAATAATTAAAACGGAAATGAGGAAAAAAGTCGTAATGATGAGATCTTTAAGATACAGTATTTTTATATCCTTGGTTTCCAACCCTATAAAGTAAATATATTCTTGATCACTAGCCAAGTCGATCTATCCATGCCTGTCTGTCCGTCCGTATGAGATCTCGGGAACTATATCCATCTTCAGGCCAAAAATGGTTTCAGCCAAATAATAGGCAAATTTTCATGAACTTTTACACACGATAAGACTAGATTAATTATTTTATTAGTATATCAAAATACATCATTTAAATTATGTTTTCATAAATTTTTATTGAAAAAAATAAATGAGACGTTGTAGCCAAGCTTCGTAGACGCCTCAAAAAAGGAGGTATCCCGGTAAACAGCATAACTCGTTACTGGATCATCAGAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAGGCCCCAAAAGCTATAATTTGTTTCACATTTCCCACCAATTATCTGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAGCCAAATAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATAAGTTAAAAAACACCGAAGATATCATTTTTTAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGACAAAATTTATAATATATGTTAAAAAACACGAAAGATATATTTTTTAAAATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACCCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTTTCCTTCTTGCCTGCTATACACTTTCGACGAATCTAGTATACTCCCTTACTCTAATAGTAATGGGTATAAAAAGTTCTGATATCAAACAAAATCACCTCGTATCGAGGCAAAAACCATTGACGATTTCACATACACCTAAAAAATTTATTACACAATCTACAAAACAAATACATTTTCCTATTTTTTTACATTTGCCGCAATGCTATTTAATATGCTTGGGTTTAGAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAGAACGAAAATGTATTTATTTCGTAGATAGTCTAATACATTTTGGCCATAAAATTTGATATCAGAACTTTTGAACAAACTTTAAATCACGATCGTGATCAAAATCAAAAGATTTATTTTTGCGAGCATTACAACAAATCCGAAAATTATAATTGTGTAATATTAACGAAACGAAACGATCGGGTCAGTGTAAAAGCTTGTGACACAAAGCGCATGTCAATTCTGATTGGGCTACAAACTGCGGTGGATCGGGTAGTATGGGACTATCGGTTCAAAAGAGATTTGAGAGAAAAAATAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGATTTTAAGAGATTTTGAAGCTGTTACCAAAAACCATGAGAGAACGTTATTGTGTATTACCTAGGATAGAAAGTCTTAGGTCGATAGGTATTTTTTGGATATTGTTATTAACTAAATTATTTATATGAGTTATGAAAAGTTCAAAAGCATTGTATTTTTTGGTACTTCTTCAAGAGGTATCCTAACTTTTCAATCAGTCAAAAGATATTTTTAAGCATCCTTTAATTCATAACTTTGTCGGACTGATTCCTTTGGGTCTTTTAAAAACCTATGATAGATATATGCATACACATAATGTTAAGCAAAACCCCAAAGCGCATCGAAGCGAAAAATGGCAGTGGCAAGCTCTGAATGTGTGCTCATTCCTCCATCTGTATAGACGTACACATGTATACTCCCCTATGTATGTGTTCAAACTAGTGTACCAGAAAGTTTAGCCAAATCAAAAACAACAGCCAAGTGAGAACGCACTCTCGAAAAAGCTCGAATTGCGAGTTTGTGTGAGAGTTTGTGAGATGGTTGTGTGAGACAAAATATACAGTTATATTGCAGTACACATTGCACGCGACCCAACACTGAAACAATAGCAAACTCACAACAGCCTGCGAAAATATTGTTCAATTTTAATTTAATTTATTTTTTTACGTCAAATTTGTTTTAAATATTAAATAAAAATTAATTGTTTATTAACGCATACTGCATAGTTGACCCGTTCTAGCTGCATAAAGCGTATAAATAATATGATTTTTAAGTTTTGTCAATAGCTTTTAAACTGCGCATATCGACTCGGCTAGTGTGGTGATCAACAACACATTTATAAGAAACTCTTAGAAAATTGTAAGTTAATAAATGCGTTCAGCAGAACAACATTGAAGGAATTCCTATGATAGGTTTGCTAAAAGCACATGCTTATTAATCTTAACAAGGAAGAACGCTATAGTCGTGTGCCTCGACTATCACATACCCGCTACTTAGCTAAAGGGAGCAAAAGGGAAATGAAGCAGCAAAGCGATATTGTAAGGTGCCACCTAACCGCTATTTAAGTATATGTTATGTGGGCGACAGACAAATTTAAGCGTTTAAACCGTTTGTGGCGTGACACACCGCTGAAACAAACTTTCGTTGCGTACGAAGCCGGAACCGGCACACCAAGTTTGACTGTTTTAGCTCTAAGTTTCTGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACGGACAGACTGACGGACAGGCGGAAATGGCTGTATACCCTTTTACCCTACGAGTATCGTGTATAATAAATAAATATATATAGCAAACAAAAGTTCTAATAATATATTTTCGTCACAAACGTTGATATCAGAACTTTTGTTTGCTGTAGGTGCGATCAAGTTTTTACCTTGTTCAGAGTTGTTTTTGTGTGATTTATGTTTTTGAAAAAATGAAATGAGATTTTCTTATGAATATCACTGCTATAGGCAAATAATTCTTGTAATCTTGGAAACACGCTTTTCTATACTAATGATTTCTCGAAATAAATATTATTCGTCTTAGTTTTTGCAATATCTTTCGGTTGATGTATCACTCGTAACCATCGGACGATTTCTGCACATTTTTATTTCTACGTGGACTTCCGTCCACAGTGATATGCTCGACAGGTTTTGTGGGCCATAAAGTAGGCGTGGCACCATTCTGATGCTAATTTCCAAAAATTTTTAAGAATCAACTAAAATCGGAAATAATTTCGATAATTGATCACTTATGTCATAATTATAAATGAACAAATTTTTTTATTATTTATAGCTTTAACCAACTAACTTATTAAATAATTATCAAATTTAAAACTTTTTTGGTTCTTTGATAGATATTAAATAAGTATAGTTAAGTAAAAAAAGTAATATTTTAACTATCATTAACATTTTCATGGCTAGGCGAGGAATCCTCCCAGCCATCTACATTGTGTATTCTCTCTGCAATATGGGAGAGCAGGATCTGCCCCATTCTGCGGGAGATCCGGCTGCTGCATTTTGGTAAGAAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGCTGCAACCGGGTGATGTCTACAATTCGCTAGATGGGAAATGTTGGTCTACTCTCTACAACTACACCAACCAGGCTCTGAAGTACCGAAACAACATTTTAACGGAAATCTTTTAAATACATAATATCTGACCCGAACTGGTTTCTTCACTAGAATTAGGGTGTAGTACTCTGTGCAGTTTGACACTAGAAAAGCGAGGATCGACAGACAGTTAAAATAACAAAGTCCATATTTTGTAAATCCTTTTTTGTTTGTATACAAATTTGTGAATGCGTTTTAATAGTACACATAAATGCAATTTATTTAATTTTTTTTATAATTAAAAAATTGTGCAACTATTTTTTTACAAAACTATATATTTAAATTTATTTAAATAAAAATTTTAATTTAATTTAAATAAAAACAATAAAGAAACTTTAGACGACAACCTCCACTATCTGATACCCTTATGCAGCTAAAGGGAATGCTAGAAAGATTGAGCTTTGCAGCAGCAATGTGGCTACATTTGAGAACGCATTTTATTTGCTTATAACCTTTAAGGAAATGGCTCGATTTTAAAAATGGGTGGCATAATCAGAAATAATTCAAATTAAACTTCTACATTATATTACAACTATTCAGTTTTTTTAAGTTATGGCAGCGGTTTTTGTGTGGGCGAGGCATCCTGCTGGTATAAACTTGCGCTGCGTAAGAGGACGAGGAATCATCGTATCGTATAATCTTTTACCTTACTTGAAATAGAGTTTTTCCCAACGAATTATATTTTTAATATACACAGAAATATCAAAGACCGGTAGAGGTCACAACTGTAAGGCAACAAAATATCTTTATTGAAATATTAGAAATCAATAAAAATATCAACAATACCCAATACTTTTCTACATTTTTAACAGCAAATATCATTGATACGATATTTTAAATAAAATCATATTCTTACACTTGCTTTATTTACTCCTCTGCAAAGAAAAAAGTTGCAGTAATCGTGCGATAGTTTCGAGCGATGCAGCAATCGAAAGGTATTGCAAAAACATAAAAAAAATCAACTGGTGTGGGAGAAAAAGTAATGAAAGTGTAAAAGCTAAAATTTGGAGAATTTGATCCATTGGGGCCGGTAGGGATAATTACCCCCCGCTATCAACCAAGTGGTATTCTCAATTAAAACACGCGTTGAATGACGCTGTCAAAATCGGATGCTCCGTTCAAAAGTAATACGCAAAACAAGATTTTCGGGGTATTCTCAAAGTAAAAATTGTATCTTGTTTGTCACCTTGTCAGTTTGTACCAAAACGTTATTTTAGAGTCAGAAAATTTCAGACGACAGACGACAAGAATCATTAGTTCTACCACTTTTGGAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAAAACAGCTATAAATACCCGTAACATGTGAAGTACTGAAACTACAGGGTTATGCTATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCGAAATACTGTGTACTCTTTTTAAAAACGATTTGTCTAAATACCACCGTTTAAAAATGTTTTCCGACGTTTTTTTTTATTTTTAGATTAATATATTAAACAATAAACCATAATTAATAAATACACTTTCTATATTTCTTACATTCGTCACGCTGTAATTTAATATGCTATTGCTTAGTTGTTTGATTTTAATTAAGCGTGCCGAATGTAAAAAATATAGAAAGTGTATTTATTTAGTAGGTCATATATTACATTTTCGTCGCAGAAGTTGATATCAGAACTTTTGGTTGTGAAAGGTGCGTTCGTCACTATATTTTAAACTCGTTAAGAGGTTTTTTTGTTTGATTGCCATTTTAACATAAAATCTTAAGAACGATCAGCGATTTAGGTTTTAAAAAGGTTTTGTGAAGGTTCCGTTTCGATGCGGTTGGAAAGGCATTTTCGTATTACTCACAAAATACTTAATGTACATATGTATATGAATAAGTTCACATATGAGATAAGTATATGCGTATTTATGTACATATGTATGTATCAATGTATTTTTACGTATAATATTCTTTATACGCTGTACGGTGCCCACCTATTCGGATTCAGATTCGAATTCACGGATACGAAATACAAGTGCACATTCCCGATACCAAAATAAAAGATAAAGACTAGTCGCTACTTGACTCGTTTTTTGTTCAGATGCATACACATACACATGTTCGGATGTGTGTATATACACTTATATCTGCTTTACATATGTATTCCTGTGGTTTTGCTAGAGATGCTGCTGTTTCTGTTTTCGCTTTCCACAGTGGATGTGGCAGATGGCAGAAAGAGAGGAGGATGAGGAGAAGAGAGCGACGAGACAACCAACAAAAATAAGTTTGTTTGCATGTATTTAAGTGGAGAATGTGCGAGTACATGGGCATGTACTCACGTTTCGCTTGACGGTTTGAGCACAGGATAAGTACAGTGGAATTCGCACGCACAGTACGTAGCAGTTACATTTCCGTCGATATCGCGTTTGAAGCACTGCTCCTTAACTGGACTGCCCAGTATATTGCACATTTTGCATAATTTCAATTTCGTATGTACATGCAGACATATGTATGTGCACACATTGTCGTGTGTGCATACATACACACACACACAGCAGAGTAGTTGAGGGGATTGGGAATCGGATTTGGATTGGGCACTCAACACAGCACCGCGCCGTATGGGTTCTCAGTTATATTGGACTGTATTGCACTGGACCGGACTCTGGACATAGCGCAGGAATCAAAACAGAACTCTGGATGAGATTTATGATAATTTTCCACTTTCTGCTCAAGCTCGACCACGAACAGCAACCGACACGAGTAAAGCCGCAAATAGGAATGATAGTGAGAAAAAAAGAAAAGCTCGTCTGAGCTTTTCGACCAGGCGACGTAATGGATGCTATGCGATACGTTGCTTCTTACGTCGTGTAGGTCGGAACAAAACGAAACTGTGAGAAATGCCCTAACGTGTTTAGGTCGGCTCTCCACCTAAATCAACTCATCGTGCCCGGATGGTTTACGACACCAGGGCGATACAATGGCTTAAAATACGTCCGCAGAAAAAGAATTCTTCAGCCAAATGACCAGGCTGTCTCTGTGACCCCACGCAAATTCAACACTGGCTTGCACCAGGCTCACCGCAATGCGTTAAGGTATTTCCAGTAACCTGTTCGTGGGAGAATCCCTCCCGCTCTCTTGTCTCGTCTCTCGATTTTGCAGTATCCGACGGATAAATAAAATGAGCGAGTGTCGATGCCAGTCGTAAGGTGCAGTGTGTGTGTGTGTCGCATTTGTACGTATTTTATTCTTATTTCCACTAGAACTTAAAAAGTGAAAATAATCCGAAATGCAACAACGAGTCAGTTTACGGCAAAAACGCTATCCTGTGGTGCTATGAAAACCTTAATGAAAACATCACACTTTTCGGTCTGCAATGCGCTGTGCAATATGTACACATGGAATGCTTTATTCAATGAATGGTCACTAATCATATTGACAGAGTATTTCCCAAATTAATTACATAAACTCTGTGCTATCTGATAATGACCCCAGGCTATGCTCTTAAGTTTAAGTATAGTAAGCCCACAAAACATATAAATATGTATCCAAATACACAGCTTACGTTTTTTCGAATGTTCATAAATACGCTTCAAAAAATGTAAATGTATGTCTGTGTAAAATAGCATTAACCCGTATTTATGCAAAAACCTTGAACCTTTTATGCCTTGTTAGACGAAGCAGTTGAACAGCTGATACATTTCAAGCTCACACACATAATAACATCACAAATTAATTATACTTTTTTAATATACTGAGCTAAACTAATTTTAACTTCTATTCCATTTGTTTACTCTGGCAAAGAGTTCATTTTACAGTCACATGTTCAAATACACTGGATGAAGCATCATTGTACGTATGTCTGTGCTTTATTCAAGCCTCTTTTTCCAACCGGAAATGTAGCTGAAGTTGTTAGGAAAATTGGTATCAAAGTTACGGATAGGA'..b'ACCATATGATTTTAAATTTGCCATTTCCTTGAAAGAATATTCTTAAATGCTAATAAAAAAGCCTTTTGGCAGTTAGTCACATTATTGCCAAAAAACTGTAATACCGGTTTTTTGTAATTTATAATAAGTATAGCCCTTGTAATTTCTGAATTTCTCAAGCTTAGCTCCTTGCGATAAATAATAAAAATTATGTATATTTAAATATTCCAACTTTTCTTATTAGGTAAAATATAGTATGATAGATTTACTTAATCATTTTGTAATTTATAAGTTTTAAAGTATTTTAAGACTGTTATGGAAAATAAATTATATAAATTTCCAAATTGTTGGGGCCTGACCCACTTCACCGTTATAATGGAATTGGTAAAAATACCTAGAATATGTTTGATGAATTCCAACATTCTTTCTGAATTTTCATTAGAAACTTACACCGTAAGGTTTTCTATTACAAACTTGCGAGGATTCAATGATCCCTTTATTTCGGCACTAGTTACTACTTACTTCGAATATACTTTGCTCGCAGGGGCACCTCGATGTTGAGAAGCTTTTCCACAGCCAGAGAATAGCACTGTTCGTTGCACATCATGGATACGTAATCTAGCCGATCGAAATATGGCAGTGCCTGGGTGTACGTCTTGTACTCGATGAGCTTCTCTGTGCCGCGGTGCAGCAGTCCGATGTGCGGATCGGCACGCATCACAGTCTAAAAAATAGGACGGTGGGATGTAGATCTAACTAGTAGAGCTACGATTACCAGCTCTAACCTCTCCATCCAGCTCCAGTACCAGGCGCAGAACTCCATGGGCCGCGGGATGTTGGGGACCAAAGTTTAGGGTCAAGTTACGCACTGACTTCTCGACAGGCGTAACCTTGCCTAATAGAGTAAGGATTTCAAAACATTAGATCACCGATCAGCTTGATAGGTTAGCAACTAACTGTTCCATGGGGGTACTTTCCAAAGCGATGTCACCTCATCAGGATACATCACAGGGCCGCTAAACTGCTTCATGAACTCAGGATCTGGGTACCATTTTGCAGCTCCACGGCGACTTTCATGCCCACTAAAAAGAGTGTTTAGATAAGTACGGTTAAAAGACGTACAAAATAAAAGTAAATCTCATATTTTCGCATTATGTAAGCAGATACTCAATACCTTAACGCGCTTGAGCCTGTTGGAATAAGTTGCGTTCGCAGCTTCAAGTGGGACACCCCCGGAATTAGAAATCGCCTCGAAATATTGGCGAACGCCATGCTGAAAGCCTATTTTCACTTTTAATGTTTTTAAATTATCGTTTCAATAGGCTAATACAACCAAAACCTTGCACACAAACGATATTTCCAAGAAATATCGAAAGTCAATTTACACAAGCAAAACAGCTGCACCTTATACACTATGCACACAGAGAGCGTTTTTGCTTTAGCTACCAAATTCTGCGTCGGCGTTTTTTTTGTTCTCTATAAAGCGCAGTACTCACATCGACGAAAACCGAGAGGTAACCATAGGTATGAGCGAGGGGCCATTAACGCTTGTCATCGGGTCTGTTTTTCAGCGCGGTACTCAGGTGTGCGACGCACACAGCCACAGATCAAATTTCTTCTCATCGAAATACAAAGGCTCGAAACTTAGCAATTGATCTGATCTTTAAAATAAACATTGATTTTTTATAAGGAGATGACCAACCTCAAGCAAATATTGCTTTTCTGGCGATCCTGTCATCTGTTGTAGTATTTATCTACAGAAAAAGACATTTGAAGGCGCATCCGGCATCCAAAATTGTTGCTTGAAAAGGTATTATAAGTATAAGTATATACATTACTTGTGAAAATTCACTGTTGGCTCACAAAATTCGCTGTTCATTTTACTACGCTTACCTGATCAGTTTACTAAAAGCAATAAAATAATCATTTGGCGATGAAAACATTTCACATGCTAGCGTTCATTATTTTGTTTTTTGCATTATTTTTGGAGAAACTCAATTTGATTGTCGTTTCCCTTCCCTCCCAAGCCCATGTTCACCCACCTTTTTTGCGAATTGCGTTACAATCGCTATTTCAATGCGATACCAAAATAGCTCTCTAGTAAACTTTATATTTATGATATAAGGTTTTCTTTATTTTCAATATCAGATCTGAACAAAAAAGTTGACAAAAGATAAAAAAGAAACGGAAAGTTTAACGTCGTTATGCAACGTTAAAACATTAAATTTCGACTTTTTAGTTTTCGTAATAATTTATTTTGTTTAGAAAACTAAAACTTTAAATAGTGATCTATTTTAATTTAAAACAAGAAATGAAGTTACCTTCGACAAGCTGACGTTTGTATACCCTTGCTGAAACTTAGCTAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTGTATAAGTCGAAACCAGCCGGATCGGACAACTATATTTTATAGCTGATAAATATATATATATGTCAAAAAAAATATATCTTCGATGTTTTTTAACATGTAACCATATAAGATAGGAAATAACATGTTTCAATTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAATCGGACGACTATATCATATACCTGCCATTGGCATCACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATGCATATATTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTTACTGCTTTGCATACGGGTATGATTATACCTGTATAAACGCTCAGATTTTGGAAATCATCAAAGTTGGAATGTAAGCCTTGTTTTCAGATCGGCAGTGTTTCATTTCTAAATTTACCGGTGATGAATATAGCATTATCTTATTGTCAAGCCGCGAAAAGTTGACTTTGACGCGGGTAAAGTTGAGAAATCTTAAGGGCTATACACCTTTACATTTTATGAAATCGTTGGAGCCGTCTTTAAAATATCAGACAAAATTCTAAAAAAATCGAAATAAAAAACACTTTTGGCCATAATTTTTTAAGAAAGCGTAGAAAAGTATTTCAAAATACCTTAACGACGTACAGCACCAGCCTGTAGCTTCTGTACTTCACAAGTTAGGTATACAACATTTAGCTATTTATAGCCACACTAGCTAGTTTAACATCGTCTAGAATTTTCAAACTGACAACCAACAAACAGAATACCATTTTCATTATGAGAGCACCCCGAAAATCTTGTTTTGCGTATTACTTTTGAACAGAGCATCCGATGTTGAGGAGGTGTCATTCGACGTGTAATTTATTTAAGAATACAACAAGGTTTATAGCGTGAAGTAATTATGCCCACCGGCCACAACAGATCAAATTTTCCAAATTTTAACTTTTACACTTTCACCACTTTTTCCCCCACAACAATTGATTTTATAGTCTTGGTATTCTTTAGTTTTTGGTATACCTTTCGATTTATGTATAACTCGAAGCAATCGGACTATTATTGTAGATTTTCATTTCTTCGTGTATATGCCGTACATATACACATCAGCTGTTATCACTCGGTTGGTTCTGTGCAAAAAGTATATTATTTTTGAAAATCACGATAATAATCGATGGTATGGGGAAGAATATCGATACCACAAAATTGTTTGAAACATCGGTATCATCGAATAAACATCGATTTTTGTTCCAGCTCTAGACAAGTTTTTTTATAAATAAAATAGCTCTAGAAATACAATATTTATACAAAATAATTGTATGTAATCCAATTATATAAACTTGCCGTTAAAATGAGTTGTTTTCGTGTACCTTTCTTCAGAAGCAAACCTGTTTGGGACCTAATTTAAACATCAAGTGAAAAATGTAATTGGTTAAAAAGTGTAAACTGAAAATTTTATGTGACACAGTGCTACTTATTGTTTCTGATTTGTATGCCTGCTATCGATCTTTTAACAGCTTAAACCTAATTCGTTTAAAAATGCAAAAAGAATGCGTGCCCGAAAGTGGTGATGTCTGTATATGCATACATACAGAGATGATTCCTTCTCCACTGGGGACTGTGTCGTCACTGTGTATGTATACAGAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/be1/255/55/scaffold_33-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CGTCTCTTTTGGTGTA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTTAACTACCTTTCTTCTTTTTCATATTTTATTTTAAAAAAATGTTACAGCTTAGTCATCATCGTAGGTATCCTAAAACTATATATGAGATATTTTATAATGTATGTTAAATATGAAAACAAATCGTCGTACAAATTAAAAAAAATAAATGATCAACTCTAAAAACGAAACGAGTAAACAAGTAAAATTTGGAAAAAAAATAAATAAAAATCGATTTGATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACATTTAATCGGAAAGAATGTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAGCCACCCAAAACTGTGATGGTCAAAGGTTTCATGCCAAAAATTTTTTTTGCTTAAATTTATTTGTCTCATTAAACTTTCGATTGACCTACAAAAATGTTTGCCACGCCCACTCTGTCGCCCCCAAAGGGCTAAAACGGTTAAAACGGTTTGCTTCCTCAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATATCGTTCTTCCTTCTTCTTTGTAAAATGACTTCTTTATTTTCGGTTACTCAGCCACTTGAAGTATAATACGGCCGTGCCAATCATAACTAATTTTGTTAGGTGTTATTTGAAATTTTGTTTTGTGTAGCAGCTAAAACGAAATGCAATTCTAATTCTATAGCTATCAGTTGGCCGTAAAATTGTATTACTAAATGCCAGAAAACTCGACTTTCTTAGGGATGGTTTCTTTGAAAACCAAGCAAAAGTCGGTATTAAACGGTCTATAGTTTTTTGAATATGTTAGTTTCGTTTAAAGTCGTCTACTTTATTTCAGAATGTTTTCTTTGACTGGAGATTTGGTTTAGGGAGAAATTGTATTTTTTGTCAGCCCTCTAAATATTTTAAAAGTATGTCGATTTAAGTTTTACGATTTTAATTCGTCAATTCGTTTTAAATAACTATAATCAATCTTATTCGTTTTCGTCAACTTGTAAAGATTTTACATTTTTTTGATAATTTCAGCATTGTAAGAAACAAGGCCGCCGAGAAGGCGAAACATGTTCATCATCACCAACAGCATCATGTACCACAGGGTCTGGGTGGCGGACACATTGCCACAGAAAGTCTAGATAGCAGCACAGGAACGATCGGCGAACCGCAGCCCCCGAGTGGTGGAACTAGCAATAGCAGTGCTAATTCCGCAAACCCAAACGCTTCTGCGGCGACGGTTGCGACGCACGCATCAATACCGACGTCAGGCTCTGATACTGTCCAGGTTTCAGTCGGCCAAATCAATGCAAACAGCAATGACACAAGCAATGGGAATATTAACTCAACGACTGAGCAACGAACGACTGGATATAGCATTAATGGAATTCTAGGTATACAACATGGACAGCATTCTCACAACAATAATAACAACAGTAGCGTGAGCAATAACAATAATACAGATCCCACCAATTGTAAACGTAAAAGAATCGAAGCTCATGGTAAGTTTCTATTATAACATCTCAGTTAAGCAATAATACATCTACAACTGTACAAATAGGTTACAAGTAAATAAAATTAGATCTAAAATTGGTTTTCATTCGCCATTGCGCCTTTTCGCAATAATGAATTATTAATATACTTATACCCATGGGTACTGTGAAGCTGTGCGCTTCTTAATTGTTTATTCGTCAAATCCCAGTCGGTTAATTTACATATCAGAAAACCAAGCCAAGCCCAGATTATATTGTTTGGAAGAAAACAATATTGCGTGCAAAAGCGAATAGTCTTCTGGTATCATTAAATCAGATGTCTTGTACCGCATGTTGGGCAGAGCAATTAGATATTATCTTAATTGATTGTGGGGGTTGCTGATGTAACCACCCATATCACCAATATCTTAGATGGGTTTTTGATAATAATGCCAAGCTGTTCAAATTATCTATTTCTCAGGAGTCCCTGCCGGTTTCAATAAATATCCCTTAATGCATCGTAGATGAGAAGACTTTGTGTCTGAGTCAGAGTTTTTACATATTTTTTAGAGTTATTACCAAGTTATCAGATCTTAAAAGGACTCTATCGTTGTGCCATTGAATGGGCAATAAAATTCTACATAAAAATCCCATATCGACTTATTGGTGATTTTATTCAAAGATCCCTAAAATTGGTATTTTACTCGCTTTAACTGTTGTTCACTTGTGGCATGTGAATAAAATAAAGCAGATCGATGCAGGAAACGTACCACAAAATGTGAAAAAGGGTTGGTTTCCAAGTGACCTACGTGTGGCCATATGTCAAAGTTGATTCAGCATCAACTTGTAAAAGAGCAAAATCAATTTAACCTTAATATATTTTGTTATAAAGAATAAAATAAATTATACCTAATATTTTTTATTTTATTTAGCCATTTTTTTTTTCTAGTTAAAACTAAACACTAAAAAATATACGATTAAGAAAATACCTGATTTGGGCAAAAAAGGCCTCCGTCTACCGGGTACATACATTCAAAAGAATAAACCTAAAACCAATAAAAATAGCATTACAATTAGCCTAACTACTAATTGGCTTGTTTTGTTTTTGGCTTAAATCATCATTATTCTCTTTAAGCGCCGACAGTTCTTTCGCTATCATTTTTCTTCCCCTGCTTATGTATAGACTACAAACATTTTTTGTCAACATAAACAATCTTAAAACGTATTGTGTATATTTTAACTAAATGTTTGCATTATTTGTTATATAAAGTAGATGGTCCGAATAGCTCTGTTTAAAAAAGTTATTTTTCCACAAGTATTTTTCCTAACTATTTAACAACGTAGTTTGCAGGTGTTGGACGTTGCTAGCTTTTATAGTATCCCAGGTCCCAGCGTTCGTACGAATAGACAGACTTGGTCGACTCGGCTTGTGACCATGATCAAGAATATTTATACTTTATAGAGTCAGAAACGCGTCTTTCTACCTGGTAGATTTTTTTCAATTAATCTTGTAAACCCTTTTACTATACGAGTAACCGGTATAAAAATGTAATAATTATACATTCGACCACTTGGTAACATTAGTTTACAAAATAAAATTTTTAAAATACTTCAAGAAGGTATATGGTAGTCACTGGTGGAGTAACCACCTAGATAACAAGAAAGAAACTTAACTTCGGAAAGCCGAAGGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAACTTCAGTAGCACCATGTGAAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTAAAAAAAATTATTTCATTCTTGTATTCAGACCATTTTTTTTGACATTACAGATGTATATGTATATGTTACAGTGTTCCGATTTTTATTAAATTGAATTCAAAATTCTTAAAAATATAAAAAAATAATATTCCCAATATTATAAGATAATACGTCAAAGAAGCCCCAAAGATAAAAATTTTATACCCTTGCAGAGCGTTTAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCACATATAATATAACAAAGTTCTTAAAAGGAACTAGGAAGAACACTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAGATACCCGATATTAAGCTTAAAAGAGCAAAAGAGAAATTGAGATATATAAGCAGCAAAGCGATATTGTAAAGCGCCCACTACACGCTATTTTAATATATTTTATTTAGGTCAATCAATATACATTTCAGAAAAAAAAGCATGAAAACTGTGTCCGGCACAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGCAACAAAGCTTTATTTGGTTGGTATAGGTATTGACGGTATTTTCGCATTAAAGATGCAGGCGCTACAGTCTGCCGCGAATTATAGGCGTTAGAGTGGGAATGTTACACTGCTGTAACAGACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGAAATCTGCATGCCAAGTCTTTCTTATCTAGCTTATATAGTTTTCGAGATCTCAGCGTTCATGTGGACAGACAGACGGACTTGGCTTGATCGCCTCGGCTTGTGATCCTG'..b'TTCAGTAAAAAGTAGTTTAAATGCAAAAAAAAATGAATAGGTTTTGAGGAGATCGACACATTAGCACAAAAGGTAGGGAGTCCCAGCTCTCTAACTTTGAAAGTTTTCGAGTTATCAGCGTTCATATTTAAGATTTTTTGAGGTTTGTGGGCGAGAAAACATTTTTCTAGGAGTGTAAATATGAAGTCACGGTTTTTACGAGCGAAAATAAGGAATTTTAATCTGAAATCTGCACTCTTACGCATTTCGAGATCACAGCGTTCACACGGACAGACGAATATAGTCATAAACAACAGTTAAATATATACTCATCATTTTAGCTTACTTCTTGTAAGTTTTGACATAAGTGGAAATATAACTTAAATGCAGTTTGAATGAATGTTTTAATTTTTAAACATATTTATATTTATTAATGCATTTAAAACTAGAAGTCATAATTTTATTTAACTTCTAAGAACAAACAAAAAATTAATAGAGCTTTAGGTAAAGGTAGGATATAGGATTTAAAATAAGAATACAAGAGGGGAAACTTTCATAATTAAAATTAATGTCATGAGTCGCCAAAAAGACAAAAAACTAATTTAAGGGTAAACATAATGAAATACTTAGCTGTATATATCAATTTCCTAAATGCTTTTCAGTGATTCAAATTTTCCAAATCTGAATCCAAAGTATCTATTTCTGTTTCAAACTTTTAGGTACGCCCGCAACCGTCTCCCTTAAATCGTATTCAGGATAATAAAAGTAAACTTAAATTAACAAATAAAGAGAATGTTTTTAATAGCACACTTTCAAGTTTACAAATTTAGAGCTTATACGGTCGATTTAAAAATTAAATGTTTACATATTTCGATATGTCTCTTAATCTAAGTTTTAATTTTATAAAATAATAAATCAACAACAACTTCTGCTTTATTAAATAACTCAAATGATTTGGCTATTTCAAATCCTTTAATTAATTTGTAAGCTTAAAATATGGGGACGGAGAAACCTCCTTCTATGCATTAGCGACAGAATGCTGTTGAAGTTTGTTAGACAATGTGCATGTTACATTCTTAAGTGAAGGTTGACAAATAATAAATTAGGGTAGGTCCTATTTGTATAAATTTGTATGTCTATATGCTTTTATTATGGTTATTATGGTTTATAATTGTACTATACCTTAGCTATAACTTGTGTTCGCGCTAATTTTACGTGTTCCTGCAAACTATATTGCGCACGTCCACTGACTTAGTTTTTACAATAATAAAAATGCAACATAAACATTTTTCGCAAAATCATATCGCGTCTTTACAATAATGTGTGCATGCATATATGCGGACTGTCATTTGAACTGATTTAACTGTTGGATAATTCTTGGTTTAGTAGTTTATATTTTAAAAGCACATTTACATATTTTAGTTCCAGTTTTGAGAAAAAATTCATGGCATTACGTAATTCATTGTTGAAATATATTGGTGTTATCCCATTCAAGTTGATTGATGTGTGCAAACCCGTCCTTTAAAGCTAAATAAAATAGTCTGTATCAAGCCATTAAAAAAAATATATTAGTAAATACTTTACCATCTTCGTCTTCAGAGTCCGAGTTTTCTGACTCGGAACTATCCTCTGACAAAGCATCTGTTTGCATTGGATTTATAGTTATAGTCAAAGCTGAATCATCCCAAACTAAGCCATCATCAACAATCTAAAAATTTAAAATGAAAATATATTGATCGTCAATTGTGTCAGTTGGGATCAATTAAATCAAGGGAAAACGCTATAGTCGAGCACTCGACTATCAGATACCCATTACTTCATCTTTTTAAGTCAATGTATTATATATAGGTATTTTTAGGACTAATACAATTAGAAAAAAATGTATCTGGCTTGAAACGTTAGTCTGGACGTTAGCCTGCTGAATCAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGAACCTGCGTGTGAAATCCGATTCCTCTAGCTCTTATAGTTTCCAAGTTCTGAGCGTTCATACTGTCAGACAAATAGACGGACAGACGTACGGACGGAAAGACGGGCATGGCTAGATTGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGATTATACCAATACTCTTTATGGGGTCAAAAACGCTTTCTTCTGCTTGTTAAATACATTCCGACAAATCTAATATACGCTAACGGGTGTAAATGTATTGGTTGAAAAAAGTTTTGTGGTTTGGACAACGCTCAATCTGCAACGAACTTGCTTGACTTAAGCTTAAAATCTAAAAGTCAATAATATGTGTTGTTTTTTGGCCTAAGGTAATTAATTTTCATATACCTTTATGTTTAAGCTCTAGTTAAATTACATATTTTTTTCTTCTAATTTTAAATTATAATTTGCTTAAATTTTAAATTGAGTTCTAGAATTTTTTTAGACAAACTAACTTTAATCTCATTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATATTTCAGTCAAAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCGACCCCATATAGTACCTATAGTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTTTCAATTCTAAAGCTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGCCGGAACCAGCCGGATCGGAGAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGAAAAAAAATATATCTTTTGGTTTTTTAACATATTTCTTTCTATGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAATTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGTTTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGATGGGAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGCGGCTTTTTAACATATTATCTTATAATATTGGGAACATAAATTTTTATATTTTTAAGAATTTTTGATTATTTTTACAACAGCAAGGGTATATAAAGTTCGGCTTACCGAAGTTATACTTGTATACTTATACCTTTCTTGTTATACTTACTTTTGGACATGGTTGGTGGCGATCAGTATATTTTTGGTTATTCTTTAAACGTGCAATCAAAACCCCACAAAGCAAAACGGCTAAAAAAACACTTACAAGAATTATAAGCATTGTAAGGTGTGAGCCTTCAGCTGAAAAAATTTGAATACATTAAAAAAACGTTTAGTTGACCATTATTATATTTGTTTATATTCTATTATTATTACAATTTACCTTTGTGTACGAAAGAATGAACGTGTGATTTCGGTTCTTGCACTTCATTTGTGTGCAATTGGGAATATGAATACACCTTTGAATCTAAATCGCATAAAAAATTAATGGTAAATATATATTTTATTTTTTCATACCATGTACATATTAAAACCCACCAGTTGCCTGATTGTCATTGTCACTTATTGCACCAGTATGTAGATGATAAGTTGTTTCAGTGTTGGTATTGCCAATAACATTTAGGTTGGATAAAGAGGACGAAGGTGGAAGATTGGTAGACTTAAACAATGTCTGTTTAGGATGCAGTACAGTGAGTGTGAGTGTATACTCAGCGCTTTTGTACTGAGAGCTTAGCTGAGCACAAGAAAGCTTAAATACTCGATTTAGATAATAAGCAGGTTTCTTATTACTGTAGACAAGGGATCGTAGCACATTCATATAATTGTGACTTGTATCCTTTCCTATCATTTCGACTCCATCCTTATTTATATTTGTCTTTATATCCATGCTGGATGATAATGAGTCATCACCATCTATTTGAATGTCTTCATGATCTGGGTTTAAAGAGGGAAATACAACAACGCTGCAGGAGTCGAGATAATTTTTGCCTTCAATTTTTTCACTTTTTTTAGATAGCGAGTCAATGTATATTTTATCTAATATGTGTACTCCTAATTTAATTTCCTGATATGATACTAATTTGTTTGACGTTCCTGGAAAAATGACATATGGAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATATTTGAATTAATAAAATTATAGATATTTTTTTTATTTAAGAGAAAATAATTCAAATATATGGAATTATATGACCATATGAGCTCAAAGAAAAAAAGAAAGGTTATTTGCCTATGATCAAGTCAAAATCACGCTAGAAGTATGTCAACTTTAAATAAAAACATTTTATATGTAAAGTTAAGCAATTTTTATTTTTGGCCTGTATCAGGGTTTTCCGCTTGGTTTCGAACCTATAACCACCATGAAATATGTGGATACACATTTTGTTCTAAAGTTGTAAAAAATGTGTTTTGCCGAAAGCGACCTCCGACGACTTAATCATCTCTGTATTCAAAACGGGTGTCCTTCCTTATAGGTACACTCAACAGGTCCAACATACACATTTTTTTAGAAAAACTAAATACATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATTATTGATCAGCGTGACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGCCTGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAATTAGTCTCTCAGTTTTGAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAATGTCTTCTTTCTATTGCAGGTTGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATAGGACAACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACTATAGGGGAAAAAATTAAAAAAAATTGTATCTTCGGTGTTTTTTATCATATAATCTTCTAAGCTGGGAAATAACATTTTATATTTAGTTCTGAATTTCGAATTAGATTTTATCAAAATTGGACGACTATATAATATAGCTGAAAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAAAAATTATATGTTCGGTCTTTTTAAAAATATATAACCTTCTATACTTGGAAATAACATTTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTGATTAAAATCGGAAGACTACATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTAGGAAAATAATATATAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTAAAATATAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAAATAAATTTTATCGAAATCGGACGACTATATCATATAGCGGTCATAGGAACAATCGGGAAATTAGTAGGAAAATAATATGAAAAAATTATTCACTAAAGTTGATTATTATATGACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTTGATGCAATAATCACGATCAGAAAAGCGGTCTCCAAGAAAAGGATTTAAAATAATTTGATTTTGAAAACCTAACAAGAGAAAACGCTATAGCCCAGTGTGTGGATTATTAAACACCCGTTACCCGTAACGCTATAAAAGTTAAGTTAAAACGTTTAGATGGCCGCTTTAAAATTGGACTAATGGGAAAACTATAATAAGCTAATTAAATGTCAGGTAAAATTTTTTTCTAGCATAAAAGCTGTAGGCGTTACAGATTTTCGCAAATTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCATCCTGCTGAAATAAAACTTTTGATTTTCAATGGGCGATTTGTCTTTCAGTTATTACTCAAAATTATAAAATTCCGATTTTGAGAGCTTTATGAGCTGAACTCCATTTTAAAGTGTTCCGTAAATAGCGATAAACTTACCAGATATTGTTATTTGTATGGAATCTGTTTGAATATCTTGTCCAGACGTCTCGAGCTGTAAGATTGATTTGAATTTTTTAATGCTGTCTGCCAAAGAGGCATTCATATTTTCATTTACCGACGCCGATCCGACATCAATATCGATGCCAATTGGAGCTATCGGTTCGTTAACCATAATGTAAGTCTCAATTGGCGGCAAGCGAATGGAACTTTCATTTCTACATGTCAGAGCTGTACGCACTTCTATGTTACGGCGTCCAACTGTAGGGTTTTGTTTAATATTTATATACTGTATTTTACGCATCAATTGTTCGATATCGTGTTTAGTCTTGGCTTCAATATATATTTCGTTCATTTGAGAGTTTGCTTGAATCTGAGCGCTTGCATTGCTCGATTTTGTATTTTTTGTCGATTGCTTGGGGGATAATAAGTGCTCAGAACATGTGGTTCCACATTTAATGTCTTCAATTGTCAATACACCATTGAGAGCGACTTTAACCTCAGAAATATCTCCACTAAAGCCATGTTTCAATCTATTTTCCAAACTTTGGTAACAGGCACCGATAGCTAAAGATGTATTTACTCCATGGGCAGCGTGTAAAGGCCAATCATCAATTACCTCCGGATTGCTATGTCGATCCTCAATAGAATTTTCAAAACGTACGCCATCGATAAATAAATCAACTTTGGACGGATCTTCAACATTAAGAACATAGTGATGCCATTCATTATCGCAAACCTCAGGTATTTTCCAACGCCATTCAGCAGGGCTAAAGATATTAAGATCACCCTCGTTAAAGTTTTTTCTTAATAAAAGTATAAGACGACAGTTGCGAACAAACAATGCCATATGATGGCGATTCATTTTGTGGTCATCAGCACTGCAGACAATATGTTCCTTAACATGTTTATTAGCCACACCTTGACTATTATGTCTAAACATGGTGAGAATGCTAAAAGGACGCGATGAGAAATCGTAATGATTGATAACAGTGTCAGGAACCACTACTCCAGTAGACCCGTCAAAGTGAAATATAGGTTCTACGCCTTCGTCGTAGCTCAATTCTTTGGTCCATTCTGCACCATGCGGCAAAAGGTCTTTCACTTTTTGGCTCGAAGTACAATTTGATAGGTCCCGATCGCATCCAAATGAGATGTGTTTTGTCTGAAAATAAAGTATAATTTTTTGCTTGCATATAAATCAAAACGGTAAATGCAATACTGAAACTATTTGCACAGAAAAATGTAAGTTTTCAAGACGAGGAAAAAAGTTTAAAAAGGAAATTTTTTTCATAAAGTATTGTATAGTATTGTATCACTCAAACGGCATTTAATTATCTTTACACTGATGCTACAGCTTACACAAAGTAAATTAAAACAAGTGCCTCGACTATCAGATACATGTTACTCAGCTTGAGGGAGAAAAATAAAAATGGAGATATATAAGCAGCAAAGAAATATTCTAAAGTGCCATCTACCGGCTATTTTGGTATATGTTATATGGGCGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTAGCCGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATATTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTGATTTTCGCGGGTTGTGGTCGTTAAAGCGTTCATACGTGCGGACAGAAAGACATAGGTATAGGATTGTTAAAGAGGACGCAATATTCGTGGGCTTGAAACACAGATACCGTTACTGAGCTAAGGAAGATGGTCTTTTGCGAGCACGCCGTCTAGCGGCAATTTAAAACTTATGTGTAAACAAGTTGTTCTATTCATGTCATTTGGGTATACTACCTTAAGGACTAACACTGAAATTGATAACATAAAATAGAAGGGTATATTAGATTAATCGGAAAGTGTGGAGCGTTTTTAAACCCATAGGGTATAAATATTCTTAATCAGGATCCCTAGCCAAGTCGGTGTAACGAACTGATTTGTTTGGTTTCTGCTCGCTACGGTATTTGTGCGGCTAGCTCAGTAGATTGTGTGTGTTCGTCCCACCAAATTTATATAAACGTGACCGCCCAGTAGTTCAGTGAAAAAGCACAGAATTCTCGGGTTCGGAGTGGGTTTATTGCGGGTATAACTGCAGTCGGCCTTATAACTTGCTCGTCTCGCTGTCTCCGACGGTGTGGGTTGTCTTGTCGCTCCTCGAAGATCCTTGACCGCTGATTGCTCCTGACGTGGCTGGCTCGGTGACTGCTCGGCCACGGTTCAGACTCGCTATGGGGTCAGCCGTGCGGGCTTAGGGAAGCGTCACCGTTCTCAGACT'..b'GAATTTCAATAGAATGGAATTGACAATAAGTGAACTCAAAGAAAAAGGAAAGGAAGATGTCGATTATGAAGTCGAATGTATCGATTATAGTACATTCGTCCCGACGACATCGCTTCAGTGTGTATTTCTCAAGCGGCGGCGGGCAGCTCTGCGTCATGCCGCGCCGCGCCTCGCTAGTGTGCGCTTACTTTAAAGGTCTGCGCACACTGGGGCGGTGCGGTGCGGCTCTGCTCCTTTCTGTTTTGGAAGCCCACACACTGACTCTGCGCATCTCGGTCCGACGTAGGGCTGAAGTTTGCCGCGCCGATATATTGTGTTCTTGGTATCTTCCGGCTGTTATCGACAATGGTCGGGGCATTAGTTCCGGGCCGAAAACAAATTGAATGGAATATACAATTGGCAATTATTGAATCCCAAGAAGAAAGCAAAGTGTGCGCAAACCTTAATGCTTTTTGAATATTACCTGAACTTAACGGAGAGACGCAACAATAAAGGAATAGCTGAAGGTTGTCTTTCTGAGAGGCGCAGGAAGGCAGACTTTCATATACTCTTCTACGCTGCGCCGGATTATCTGCTAACGTCGACAGCGGCACACAGTTTTAGGCACAAAAAAAAACAAAAAGCTTTTTGCCGACTGTCATGTCACTCCGAGCCTACCTCAGAACTGAAGAGAGGTACTCATTTTTTGGGCTTCTTAAAGCTTTAAGCTCAAAATATTGGGGTTGGTTTTTCTGTGTTTTCAGTGGTGGTTTTTCTTTACCTGTAAATGTTTACGTTTCTTCTGTTAGACACTAATGTTTTTTTTCAAACGTTAAGAATTTATCATTACGACTTGCGGAATGACTGATTGCCAATTTCATATAAAATAATGGTAAGCCACCCTCTAGACCCACTATTTTACTATAATATTTTTATATTATAAGGTACGGAAAAAACGCGACACTTTAGAAAAGAAAAACATAATAGACCGAAGCACCCTTAACAGGATATGTTTCTCATACATGATATTTTCAATGCTTATAATTGCAACCGCCCTTCCTCCAGTGATACGCGTAGGTAAGCTTAATGTAATTTTTTAGTTATCGAGAACTTCTTTTATTTACTGTTAATATCTTAATAGGTGCCATATTTACCGAAGATGAGCGTGAAAGCAGTATCGAATCGGCCTTTAAATACGCGATTTACCGGATCAACAAGGAAAAAAACCTTCTTCCCAATACACAACTTGTATACGATATTGAGTATGTGCCCCGAGATGATTCGTTTCGCACCACTAAAAAGGTTTGCCGCCAGTTGGAAGCTGGCGTTCAAGCTATCTTTGGTCCAACAGATGCTCTTCTGGCTGGTCATGTACAATCCATATGCGAAGCATATGATATACCCCACATTGAAGTTCGAATTGATCTTGAATATAGTTCAAAAGAATTTTCAATCAATTTGTATCCGTCACACACTCTCTTAACTCTAGCATATAGAGATATTATGATGTACTTGAACTGGACAAAGGTGGCAATTATTTATGAAGAAGATTATGGTAAATATAATTTCCATTTTTATTAGGTCCCTTGTACTTCGGTTTTAAAGCGTTTCCGAACCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATTACAAGCCGCGTCGATTTAGCCATTTCCGTCTGTCAAAGAGTCAGACTTGGCTTAGAATATGGTACAAAATTGAAAAAATTTATATTAAAAACTTCATCTTATAGGCTTAATAAAATCGGCCGCCATTTGAAAAATACTTGGCAGAGTCCTTGTCAGAGCTAGCGATTACTTTGATGATCGTGAAAATCTAATTTCTTTGTCCTCCCGATAAATGTGAACCTACTGAAGTGTGCGGTACCGATCGCAACTTTGACATGCAACAATTTTAATACCTATTTGTTTGACACAAACACAACATATACTTCTTATATCGTGGAGAGCAGATCTTTTTATACCCGTAGCTAACTACCTAATTTTCAATTGGATGTGTACATCAAAGCTTTATATGCAAAAGAATGAGAAAGCAATATTAAAACAAGAGCGCCTTGTCGCAGACACGGGAATGCTTAGATGGCAGGACGATCGCGTCACGGCGATGGACGTGTTGGCTGCTAGATGAGATGTGTTACGAGGCCTACTCCCAGAAGTAGGAAGTAGAACCGCGGAGTTATGAGTGCGTCGATAACTGATTTATTCTTAAGTTGGTACTTGCTTATATACTACTTGGAACACGGAAGTTTATTGACAGGTCAGTGGTTTTCGATGATGGTAGCAGTTAGCGTAGCTGACTCGACTGACACTGCAACAGTGTGCTGAACATTTGGTGGGTCAGCGTAGTGAGACGTAGAGTAAACCGTTGACATTGAATATAACATGTTGGTCAGCAATTTTCATAACCAGTGGGTGACGGTGAGCGCATGGTTCAGATTTGTTGGGTGCTGGTACTGATTTGTTGGGTGCTGGTCATGTTGAGCACCCTAGGGTGCGAACAACGCACTTCTGCAATCTATATTGAACAAATTTACTTTCTAACTTTAAAAAATTAAGTGACTGCTACCAATTTTGAAAACTGCTCAGTCTATCGAGGAAAACTTTTTTTTTTATAGTATTCTCGAATTTTCCCTTTTCTTCCTTTAGCTGAATATCGCGTTTTTCATAGTCGTCAGACTCAACTTAAGCGTATTTCCTTTTTCTTATTATCTTTCCAAGGAATTCCTCCTATTCCAGATAACTTCCGAAACGTAATAGTTTAAAAATATATAAGTTCATAAGATCATCAGCGACTCCACTAGGTGCGGTTTAGTCCGCATTAATATTTGATGAATTCCGCAAAGGGAAAACTGTAGACGGTGCACCTACAGAGAAATATTGAGCGATTGACGACGTCTGATTTGACTACATGTACGAATAAATGTAGTATTGTGTAAAATGCAAGGGTGAAACCAGAAGGTTGTTGGACAATCAACAATCTTTAAGTTCGTTTTGTTCTTGCTTTTGCATTTGCCGTTGCATTTTTAATTTTAAAAGGTAAAATACATTGTAAATTTTTTTTTTAATTCTGTAAAAATTTTACATTAATATTTTCACAGGTATGAAAAGTTTAAAATATATACAGCATATACAAAAAAAAACATTACCCAAAACAGGAGCCGTAAAGCGGTTCTTAGTTAAAAAATATTTTCGTCATTAAATATTAAAATAAATAAATAAATATGAAATTCAAATTTTGTTTTATGTTTCATTGGTGCGTACATGCACGTTCTAAGTAAATGCGTGTTGATAGCTTTTTTTCTCCCCACCTGGGTAAAAAAAATGAAAAAGCTTATAAATATATTTATTTATTTATATAAGACAAGAAGGCACTGCATTCCATGCCGACTGCTGCTTTAAAGGGAATGGTAAAATAAGAACACTATCTTTAGTCTTTTTTTAGGTGCTCAGTCAAATCTTTTTGAATTAATTTAAATTTTGTTTCTTTCTCTTCTAGGACTATTTAATTTAATGCAATCATCGACTGAGACCAAAGCTGAAATGTATATAAGGCAAGCAAGTCCGGACTCCTATCGTCAAGTCTTACGAGCAATCCGCCAGAAGGAAATTTACAAAATTATAGTGGACACAAATCCATCCAACATTAAAACGTTTTTTAAATCGGTGAGAAGACTTTTACATTTACATATTTTTATAACCTAAATAATAATTTTTTTATTCAAAATAAATTAATTTATGATAAATCATCAGAGCTTAAGCAGTAACAACAACGCCAACAGCGCCACCTAGCCTATATCTTTTCATGTGGTGTATAATTTTATTGGAGCTAGCTAATTATTCATTGGCTATAACTTATTTTGAATAATTTTTGGGAAGTAGTTGGGTTTAACAGTAAGAACAAAATGTCATTTCATTTTTCCGTCAGAAGTATTCAATGTAGTGAAGAGTGTTTAGATGTTTTCAAACCTTTCAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c36/5a1/10/scaffold_63-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTAGATATATTAAAGCCACCTGAATGGAGCTTACCCAAATATTTTTTTCATAAATAAGTGTAGGAATGAGCCGGATAAAAAACAATTTGTAGAATTTTGATAAAAAAAATGTCCTTTGTGGGAACATGGAAACAATTGCAGCATAAATGAGAATAAATTAAGAAGAAGAATCGTTTTTTTTTCTAGTTTACTTTGCGGTTTAGTAATAGTTTAGGATTTCAGAATTAAAACTAAGGCGGACGTCTTTATCATGTGCTGTCCTAGCAATTATTATTTTATAAACATACGTATGATTTAAATTGCCCGTACCTCAACTTTGGCTTGCCTAATTTAGCTTTGTTTCTTGTTTTTAATAATGTAGAAAAATTTTCTAACAAATTTTTTATAAAATAAATTTTTAGATTTTACAATTGCAAATGAATGATCACCGATATCACTATATGTTTACAACGTTCGTAAGTACATAAATATATATCGGTTTTCGCTTTATTATTATTTCATAGTGGTCTGCCATTTCTTATTTGCAATACCGAAATTTGGAATAATTAAATAAAAATGTAATACTTTTCACAGGACTTGGAAACGTATGATCTTGAGGATTTTAGGTATAACAGCGTAAATATAACTGCATTTCGTTTGGTCGATGTCAATAGCAAAAGATATCTAGAGGTTATTGATCAAATGCAGAGATTGCAGCATAATGGATTACAAAGAATCAATGGAATTCCTTATATACAGGTAAAATAAAAATATTGTTCCTGAATCAATTTTTAATATTTTTCTTTTACTTTTAGACAGAATCCGCTTTAATGTTTGATTCGGTATACGCCTTTGCTTCTGGGTTACACTTTTTAAATTTAGATAGCCGTCCCAATTTTTCTGTCAAAAACCTCTCATGCACCTCCGACCAAACTTGGGATGACGGAATTTCTTTGTATAACCAAATAAACGCTGTAAGTATTAAAGTAAAAATTGTTAATGTTAACAAAAATTTAATTTTATTTCAAGTAAAAGCACAACATTTATAAAAATAAATTAATAAAAATCGAATATCAACAAAAGCGCACTAGTAATATATCTTCTAAACTAAAGTTCTCTGTCGCAACTTATTCCACTCATACAAAACTGCTTAAGACAATATTTAAAGGATCAAAATCTTTAAAAGTACCACGCGACGCCTAATTATACAATTATAAAAAAATGTGTTAATGCTGGGCCCCATTACCCCTTTTTCTCACTGCACTTTCCTTCGCTCTATTCCGTAGTATCCCCCAAATTCTTAAATTATTATTGATTGGTTAAATAGGTTTTAAAATCAGAAGGTTCTTTAAAATTTTAAATCAAATTTAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCAAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAACTTTAGTAACACCATGTGAAATTTTTAAGGATTCTTGCTGACTTTAGTAATATTAAAAAAAAATAATTTCATTCCTTATTTAAAACTATTTTTTTTACATCTATGTGTTAGAGCAATAGCATATTTTAATTAGTTATTTAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATACCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGAGGTAAAATAATATGAAACAAATTATATCTTCGGAGTTTTATGGCATATTATTTTGTAATATGGGGAATATAATATTTTATATTTTTAAGACTTTCGAATAAATTTTATTAAAAATCGGACGACTTTAACATATAGCTGTCAAAGAAACGGTCGGAGAAATAAAGAAATAGTTTTAATATTACTGAAGCTATCAACTATCCTATCAACTATCACTAATGTTCAATAATTCTTATAACTGCAACGGTATATAAACTTCGGCTGGCCTCTTTTCTTGTTTTTTTCCTAGCAGAAATCCGTTGTTAGATCTAGATCCCTTATAAACTGTTGTAAGAAAAGTTGGTCTATGGCCAACTCCTTATTGTTCATTCCTAATTTTAAAAACTTGACATATTACTAAGAATTTTAAATTTTTTCCAGGCTATTACAGATGGTTTAACAGGAAATATTAATTTTGTGGAAGGTCGCCGAGACAAGTTTAAACTTGATATTCTAAAATTGAAGCAAGAAAAAATTCAAAAGGTGGGATACTGGCAGCCCGAGGTCGGTATTAACATTTCGGATCCAACGGCTTTCTACGATTCTAATATTGCAAATATAACATTGGTCGTTATGACAAGAGAGGTAGGTTCAACGAAAGTGCATAACTTTTAAAAATGTCAAACATTTCTTCTAGATTTACGTTATGATAGGTCTTTTGTTATAACCACAGTTTTTGCCCGAATTCGATTTTGAAGAAATCAATTAGTTAAATGGTAAATTAAAGATGGAAGCGCCTCTAATTTGAAATTCACTAGATCCAAGCAAAATGAATGAACAGAGGGAAAAGTATGTTAAAGGTAGAAGGAAGCGTCTACGGCCACATAAAGTACAAATATTATAAATCGGCATGACTAAACTAACCGATCTACCAATTTACGTGTGACCGTGCGAATGCTGTGATCTGAAACTCCATAGGTGGTAGAGGTCTGAGATTTTAGGCTATCAGATTCCTTATTTTGGTTTGCAGGGAAAGTTTATTACGCGATCTATTGATACATGCATTTGAATCAAACGGTTCAAATTAAATCATTTTTATACCCTTGCAGACGGTATCTTGATTTCAGTCTGAAGTTTGCAACGTAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTTTATGTATTCTAGATCAGCGTCACAAGCCAAGTCGACGTAGCCATGTTCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAATTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTACATCTTATAGCTCCTATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTTTTTAAAACATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATACCTTTTTTAGCTTGGATATAATATTTTTAAATTAGTTCTAAATTTCGGATTAAATTTATATAATAACATTTTTAATTAGTTATGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAAAGATCGGATAATTGGTGGGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACTTATTAAATTATAATATGGGAATATACATTTTTATTTTTTTAAGAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCCAAGTTAACTTCTTTTATTATTTTAGGAAATAATTAAGCAATCATCGTAACATTGCTAAAATTTTTAAAGCAAATCCCAAAATCCGGTACAAAAATTATGTTTAGAAACAAAAATTTCAAAATGACTTTTGTAGTACTTGTCCAATTTCAAAAAACAAAAAACTATTTGCTCTTGTTATAAGTTTATTATCCATTTAAACTCACACTCCCTAAAGAAGTGTTAGATATAAATATTAAATATGGTATTTAAAAAAATGTTGTAGTTTACAGATAAAACAAGAAATAACGCTATAGACGAGTGCCTCGGCTGTCAGATACGCGTTACTCAGCTTAAGGGTGCACAAGGGAAATGAAGACATATAAGAAGCAAAGCAATATTTTAGGGCGCCACCTATCGGCTTATTTAGTAGATGTTATGTGGGCAGCAGACAGATTTAAGCATTTAAACCGTTAGAGTGGGCGTGGCACTTTTTTTTAGTTAGTCGATAGGTATTGAGAAGACAAACACATTTATGTTGAAATTTTGTTTATATCATAAAAACTGTAGACGATACAAATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTAGAGTGAGCGTGGCATGGCGCTGACTTTTTTAGCTCTTGTAGTTTCGGAGATCTCAGCGTTCATACGGACGAACGAACAGACAGACAAACGGACAT'..b'ACGGGTGATGTTTGCAACAGAGACGATAAGAGCAAGGAGTCCAAGGCCAATGCACTAGGAGTAGAAAATATTGGTAAGATTTTTTAAGATTTTCAATGAAAAACAGTAATTATTATCGTATTTTAGGTGGAGTATTTGTTGTCCTTCTCTGTGGACTTGCACTTGCCGTTGTCGTGGCTATATTTGAGTTTTGCTGGAACTCCAGAAAAAATTTAAATACCGAAAATCAATCTCTGTGCTCAGAAATGGCCCAAGAACTTCGTTTTGCAATGCACTGCCACGGATCAAAATCAAAGCATAGACCACGTAAACGGAATTGCTTAAAGTGCTCATCAGGACCAACATACGTTCCGAGTAATATGAGTATTCCAAATGTCGGCGTTCACTATAATTATTTTAATTAAATTGGATTCTGCTGACAGATATTTATTGAAATAAATAGGAAAATTTAATTATTTTTTTATTTATACAACTTAAAATAAAATTTAACTTAAGAATTAATTAGTAATTTGATAAATTTTAAAACTGCAATTCAATTTTGGGACTTATACATTTTTTGTTACAGGTTTTTGACCTTTTACTGTTAGGGGCTGTTAGGTAAAAGCAAGGTTAACGTTGCTCCGCGTTGAAGTTGCAAGTGAGAAATCACACTTGGCGACTACATAAAAAAATGTACAAAACTTATTACCTAAAAAGGCCTGACAACTCTCGCTTCTGTTCAAACCATATCTAGAAGTTCACAATGTAGTCCCGGAAATTTTTTCGAGAACTAATAAGCGCTTCAACCGGATAACATTTGAAACTCATGAGATACTCTTCGATTTCTCCTACGCGTTCAATAGAGTGAATTTCTTATGCACCAAATTAAAATATGACTGCCTGTTTGCTCAGGGAACGGGAGTGTATGTATATGGAACTTCGCGAACCCACTGTTTTTAATTGTGCATTTATTTCAAGGGCTTTTTTATTCAACAATGTTACCAACTCTCTCTTTTTCCAGAACTTTATCCATATTACATTGGTATTTAGAGTTAGTATTTATGGTAATCTAGTATTATTTTTAATTTAGAATTTTGTTGTAATTTTAGTATGATCGTTGCTTGCCGACCTGTTAGAGGTAATTTATGTTTGCTGTTTTATGTTCCTTCTCACAAATTTGGATATTCGGGCATAGCAACGAACATAAAAAAACATACAAACAGTGAAATGACCAAACACTGTCAGAAAACACAGATATGTAACTGAACAGATATGTAGTACCTTTAGAGAGTATTCGAAGTGGGATGCAATGCAACAGCACTTATTGGGTGAAACATCCATGCTACAATTAGGTAAAGTATCGCATTGGGGGCTACTCCGTTTATCCAATACACTGCTGACTATTCAATATTTAGGCAATGCTATTTCATGGTTTCTTGAAAGCGTGAAATAAAATTTGCCCCTGTTTATGCGACACAGCCGAATTAATGCTTTTATTTAATCTTAGATGACAATCAAACGGTTATTTTCTCCATTCGTAAACTTGCATGTTATAGAGAAGAAGTTAGTTCATTAACATTTTTTTAATAGTCAAAATATGTCCTTCTATAGAGTTAACAACTCCGTAAATTATATAGACTTAACAGAGTTGAGTGGTCTCCGCTTTGCGGTTGAATTTATGAATATTCAACTTTCATGTGTTGTCGAAATTATGAAACGGAATTTATGCTCACACTTCGGCTCGTTTCATGAAATTAAAGCTTGAAGTGGCCATCTTATAAACGCAGTAATTGTTATCCGATCCGGCTCGTTTCGACTTATGTATGTATATACTACGTGCAATAAACGTAAAACTTTAGCGAAGGTTTCATCCCGTTTCCCTTAAAGCTTATAGACTATTTTACGTAAAAGCTGATAGACAGGCGGACTTGGCTAAGTTAATTTGGCTAGTGTTGCTGATCAAGAATGTATGTAGCTTACGGGGTTGGAAAGTCTCCTTAACTGTGCTGCAAACTTCTGACTGAAATTAAACTATTGACTATTATATACCAGCAAAAATAATTTTCATACTGTTTTCAGTATCAATTAAAATGGCCGCAATGTTAAGCTGGGATAATGCATAAGATAATGATAATAAATTAGAGGCCTATTATCCACTCAATATTTACTGACTATACCCTTTCTTACTTGTCCTTTGAATGTCCTACTTGCGGCACCTAGCCCACCAAGCATAAAGCACAAACTGGTGGCGACTCTAGCGGCTATTAGTGAAAACTGCTGATTTGTGCAAGCACAACTGAATTTGCAAAATATTGAATATATTTGGCTTTAACGATTCCAATCATATTTGACATGTATATGGGTATTGATAATAAGTACACAATATCAAATCAAGAAGCAAAAAGCTTAAGAATCACATACCAAGCCCCAACTTTCTAGCTTTTACAATTTCCAAGATTTCAGCGTTCATACGGACGGACAGACAGACGGAAATGGCTAGATCCACTCGGCTAGTGATCCTGGCCAAGAATGTATATTCTTATAACAGCCTTGATATTTGCTAGTTTAACTTATTTTTAAGCTTCGACATTGCATTTCTGAGACATTTGTCCGGGAACAAAATTAGGAAATGTGTTTAACAAAATGTGTTTTACTAGAATATTTGTACATTAAGCTTTTCAAACTGTGTATGTAAGAATTTCTAAGTTAATTTGTACAATACGCGTAAAATAATAGTAAAAGTAAATAGGTTTAAAAAATTTTAACGATAGATGCAATTTGTTCGAATGAGAGAGTTAGCAATATTGCTTATATACATGTATACAGGTATAGTCTTTATATATAGCGTTCTGTCTGGTTTCATTTCATTTGTGTAGTCATTTTTTTTATTAAATGGTGACATTATATTCGTATACTAAAACACTTATCACCTAAAAAGAGGTATTTTAACAAGAAAGGAAGCTAATTTCGCCAAGACTAAGTTTTTATCCCCTTAAACCGCCCAACACTGTGGTGTTCACGCTAGAACATTTTTTTTTGCTCAAATGTATTTGTCTCATCACAACCACTTTAACGCCTAAAAACGATTTAAACGCCCTTATTCGTCTGCCGCCCACGTAGCACATACTGATATAGCCGGTAGGTGGGGCTTTACAAAATCGCTTTAGTGCTTATATATCTCTCTTTTTTATTTGCTCCCTTAAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTACTTGCTTAAGCTTTAACTGTAAGAGCCACAGCCTTGGGCTGCTTGCGTGCCATGTTCGCATAACAAGCTTGGCGCTGATCAACAATTAAGGAAACTAATTCTGATTCAGCAATCACATGTTCAGATTTTAAATTTAAATTCCTTATCATACCACGCCGACAGTGACACACATAAACCAGTTACAAATGAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGACGAAGATTGTATACCCTTGCAGTTATAAGACATAATCAACGTTAGTAACACCATGAGCAATTTTTAAGGATTGTTGCCGGCTTCAGTGATATTAAAAAAATGTATTTCATTATTTTTTTTGACAGCTATATTTTAGTTCCCTCCGATTTTTATTAATTTTAATGCGAAATTCTTAAAAATATAACAAATTATATTCCCAATATTATAGAATAATATTTAAAAAACAACGAAGCTATAATTTGTTTTATATATTTCCCCTCCCATTTATGGATCTTTCCTATGAATTTAATTTTATCAAAATCGGATATATTTTGATAAAATTAAATTTGAAATTTATAAGTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTGTATGTTAAAAAACAAAGCTTAGGAGATTATATGTTAAAAAACACCAATGATATCATTTTCTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCCAATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGTCCGATAGCTTTCAAACTGAGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTAAATTTCAAGATATAAAATAATAATTTTATCAAAAATTATAAAGTAATAAAAGTTTAATTTAACCCATTCAGTCCTCGAAATATAAAATTAAAAAAAAATTGTGTAAGTGTTAGAGCACTCAAGTTAACACTCCACAAGCGGGCTTTAATGAAAGAAAACTTATTGTGTACCTGTAGTCAACAATTTTTACTACAACGTCTCTTACACACAGCAGATATTAAACTAAATACAAGTTGACTTGTATCGTATGCAGCTTGCAGCTAAATTCACGCATGCGCGAGCGCGAAGCTATTCAACTCGTAGCTCTCTTTTAAGTTTAACGTGTCCAATTATAAGGATAAGACTAGTGGGCTAAAAGCTTAAAGCTTACATTTTGTTGCACTAAAAGTAAAATTTCTTTTATTTATAACATTTGTGGTCGAATAGCTACTTAAATGTTAACGTTTACATGCCTCGTCTCGTTAAACCTCATGCTAATCAAACTATTTTATAATAGATGTAAAGTTAGGGCGGTTCACACCCGCATAGAATTTTAAAATCAGTTTAATAAGTCGTCTAAGGCATAATCAAATTACATTAAAAAAAGGACTTGAGAATAGGCGCTTTGGTTTCAAAATTTATTACTTCTGCGTACTCTTGCTTGTGATCAAATATATTATTTTTATATTGGTGGCGCTGGTTTGAGTTGAAAAAGGTCAAACCAATAAAATCAAGCTAAAATCCTATCTACATTTTCAGTAAATTGAGTAAGGTAACTTTTCAGATGTTTTATTCAGTGATCGACCCGTATCGATAGTCAGTTCAAACGTCGGGTAATGTGGGTATTTAGGTAACGTACCTGCAGAGTTTGTATCCACGCAAAGATAATTTGGATTAGAAACACAGCACAAGCCCAGTAAACTTACTAACAAATTTAATACATGGTTTGCTTGAGATAACGAATCATAAAGCAAACTGTCAATGAATGTTTCTACTGCGCACCATGTCGTTCTATGTAAATAAAAGTCACTTAAACCTATTAACATCAAATTGTTCATTGTCAATTTTGCTATAGTTATAGGTTTTGGTATCACGCATGTGACTGATTTGGTACCACACGATTAATGGGAGCTCTACCTGTTTCAGTCAATACTCCGGTCGTAACATGCCGCGTTGGAATCAGTACCTGTCGATAAATATATAAATATAAAATAAGAAAAAATATTTTTGCAGCTACTATTATTTTTGCAGTTACTATTATTTGCTTGTCACGACAAGACAAAAAATTTAAAAAGTCGATTTTCACAAAAATTTTGAGTTTTTATTAAGTATTGAATGGGTTAAGAAAAGAAGTGCATCATTTAAACGGCATTTAAAATACCGTTCCATTGATGCCAAAAGTTAAACGAAGCAAGTTAAAGTTACGAATATATTTCACTTTTATATATGTCAGAATACTTATGTCAGGGTTGTACGGCTTACCAATGAATTTGAAGTTATGGCTGATCTGTTAGAGCTCGTATTTGTCATGGTGCACAATGATCCGCCTTTTCTTGGTCCTTTTCCAAATTTTCACCTAAGATTGCAGTCAAATAAAATTGTGGTTTGCCACTGCTTCCACGAACTTTCGTATGATTTGGCTCGTCTTTGTACCTATCTTATAGCCGTTTTTTAAAGCATCAGAATTGTATCATTTAAAATTTATTTGCACCAATCCGCATGTATGCAGAAGAAAGAAATACCCAAAGCTGGCTGTATCTATCAAGGTATGTCACTCTTCCATTATCAGTTCACGCACTACATGGATGTTCTCTGGCGCAACAGTGTTAGGACAACCTTTACATTCTTCGACTTTGAGAAAGCGCTGTTTTAAATTCAATGAATCAATTCTTAAAGATTTAGGTACATAAATGCAATCTTGTGATAATCCAAACGTAAAAATGCGCACGGTGTGGTTGAAAATATGATAATTTCTCAGTGTTTGAAGAAACGGGGCAGTAGGTAGGGTGAGTTTTAGGGATATCTCTCATTTGGTTTTAGCACAATCTTTAAATAATAAATAAAATTCGAAGCTTTACCATAAGTTTTCAACTTAAAGCTTTTCGTAGCTTTTACATATAGTGCACATATTTTGAACACGCAATAAGACATGTTTTGACTAACGTACAAAAATGAGTGAAAATATTAAAGTTGTAGTTCGTTGCCGTCCTATGAACCGAAGTGAAAATGAAAATAAGTGTGAAGTAAGAACAATAAATACAATTGAAATAACTGTGATATTGGTTATGAAATCTAATCATTTCACAAATATTCTAAGCTATCGATTTTTATTGCTTTCCTTTTATAGGACAATAGAAAAGGATGTAGTTGTTGGCCGCGACTATCATATACCTGTTACTCAGCTAAGGGTAGTGCTAGGGAGGTGGAGTCATGAAAGCAGCAAAGCGACATTATTGTCGATTCCTTTTTATACCCTATGATTTCAGTCAGAAGTTTGTAACGCAGTGAAGGAGACGTTTTCAACACCATAAAGTATATATTTTCTTGATCACCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCTATGTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTTTGTACGCAAAATAGACTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCAGAAACATTCCCAAAAGGCCTTTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCTTATAGACCCATAGGAACTATCGGAAAAAAATGAAAAAAAAATATATTTTTGGTGATTTTTAACAAATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGATTTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAACCGGATGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGATTTATTGTCTTATAATATTGGTAATACAATTTTTTATATTATCAAGAATTTCGAATTCAATTTGATAAAAATCAGACTACTTTAACATATAGATGTAAAAAAAAAAGTCTGAAAAAAAAGAATGAAATAATTTTTTCTTATTTTAACTTAATACGGTCAGAAACGGACTCTACAAGGGTATAAAAACAAAATTGTAAAAAATAAAAGAAGAAAGAAAATTTTTTAGGTCAGTCTATAGATATTGATGAGACAAATACATTTCAGATACATTTTTTTCTATCATAAAAACTGCAGGCGCTACAGATTTTCGCGGAGAGTTGGCTCAAGAATATATATACTTTATTGGGGTCGGAAACACTTCCTTCTTACATACTATCCGAAAATCTAGTATATCTTTTTATTTTACGAGTAACGGGTTTAATTAGTTCAAATAATGTGCAGTATAGCTGTTATAATTTATAAACTATGTTATTTAATTTCAGAACATTGTTGAAATAAATGAGTTCGCAGTTTCCGTGACAAATCCTTCGGCTCGCCTCACTCCTAAAAAGAGGTTCTTATTTGATAGTGCTTATGATATAATCACAAAAACTGAAGTTATATATAACGAAATGTGCTATTCGTTAGTAGAGAGTACCATCGAAGGATATAATGGAACCATTTTTGCTTACGGCCAGACAGGTTGTGGAAAAACACATACAATGCAGGTACTAGTTTTAAAATATATGGCTAAGCTACGTTATTAGTGTGTATTCATTATATATAAATATATTTAACTAAATTGTGACCAGTGCAATTTTGACATTAAGTTTGATTTTAGTACTAACAATAACAGATTAATATAATAAAGACATTTAAATAAGTGTTTATACAAATATTTAGTTCCTTTATTTGAAAAGTAAATAGGAAGCGTAAACGTTTTCGAACATATAAAACATAGATTTCGTAATATCTTAAACTCGTGATATAAAATTTGCTTTCATTCAATCTCAGCTGACAGAGATGACGGACCAATGGAAAAAATGTGACCGATTATTAAACCGACTATTTTATCTCA'..b'AACTAAATTTTGTTCAAAATTCATTAAAATATATAAAAAAGCTATAATATGTTTCATATTATTGTCCCACCAATTTTCCTATTGCAGCTATATGATATAGTCAACCGATTTTATTAAAATTAAACTTCAAGATCCAGCACTAACTAAAAAAATTATTTTTTCAAGCTTAGGATAATATAATTTTTCCCGGTTATTTGTAACAAAATTATGCCGATTGGAAACTGCCGCGCTGCCTTACAACAACATGCAAGGAAATCCCTACACAACATGCGCACAACAATTCAGTAGGTAACTTACACTTTTCGACTCCCACCAGCCAGCTCAAGCCGCTAACAATTATCGATGACCGCGTTAGCACTCTCAATGACAGAACCGTTACGATCAATGGACAACTGGAAACCGAAACGTTACAATAAATTCGACGAGAAGGAAAAAGTAGGCAACATCATATACCGAAACTTGTATACCAAAAATTAAATATCTCTTAATTTAAACTTACAACATTACATACAAAATATATAATTTATATGTATAAATAATTATAATTATAATTTTTTTAAAGAACCTTTTTGCCTCAAAAAAATTAATATTCCAAGATTATGAAAGAAGTTTAAAAATAGATTTTCATACAAATTCTTTCTTTTCAATAGGTACTAAATGGGTTAAGAAAAGTATTGTATCATTCAAACGGCGTTTAAATTACCTTTCCATTGGTGCTAAGCCGTACAAAAAGAAAGTTTAAGCTATGAGTATATTTTATTTTATTTTTATTATATTCGACCAAATTCTCATGCCGACCAGTGAAAGACGAGTAAAAAAGAACGGAAAAACTGCTCGTTCGACAAGCGCAAGCAAAACTTTCAAAAAACAGACGATGATTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAATATATAAAAATTAATATTCCCAATATTATATGATAATATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAAATTCTTTCACATTATTTCCCACCAATTATCCGATCGTACCGATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATCTAATTCGAAATTCATATTTTCCGACTAATTTTCCGATTGTTCCTATGGAAGCTATATGATATAGTCGTCAGATTTTAATAAAATCTAATTCGAGTTTCAGAACTAATAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACCCCGAAGATATAATTTTTTTAATTTTTCCCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTTCGATCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAAAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTGAGCTAGTTTGCGTAAAAACGGAGACTGACGGATGGACAGACAGGCAGACGGAGTACCGGTATGTAAAAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCTTGGTCAGGATCACTAGCCCAGTCGATTAGCCATGTCCGTCTGACCGTCCGTCTGTCTCTGACTGAAACTGGTCACAGAGATAACAGCTTTAATAAATCGCCTAGGCTTTTCATTTTTATCAACTTATATTTAAAAGTAATTTTATTGCAGAACGGCAGTCTGATAAATAAATCGACACAGTTTTCATAATTTTAAAAACACAAAATAGTGTCCTATTTTTATTAATATGACGTGCTACATTACAAAGTATTTTTTAATTATAAATGGAATATACACCCCATTATACTGGTCTTCAATATCAATTACAATACAATACAAATACAAAAAAAAATGATTTCATTTTTATTTCATTTGTACACAGCATACTCTGAGAATAATGAGAGAGTCCTAAAAACAAATTGTTTTTAGTATACATCCCATTTTTGACCGAGGTGGCATTGGTAATGGATTGATATTAAGTTTTAGTCTGCATACACCACAAAGGGGGCATGGTTTTCTGAAACGCCATCTCGTAACTCCACCTTAATATAACCTGTAGAATTATCTTCACTTTGGCTGTTTGACTCAAGGTTTGAACAACCAATTTTCCGTGAAATGCTGGTATTCTTCCTTAAATGAAATTGAGCTAAAAATATTTAATTTAATAGTAGTTAAGAACTTACTTTGCTTTCGCATGAGTCAATATATGTGATTTTAAATTTGTGGATTGAGCAAACTTTTTATTGCAGGCATCAAATGGACAAACAAATGGCCTATCTCCAGTATGTATTCTTACATGAGTTCTGTAAATAAAAGTAATTTATTAAATATATTTATTAATATTACTAAATTGTAATTTATAACCAGTACCCAATAGTAAGATTGAAATCACTTTTGTCGCGCCTAACCAATTAAAAATAACATTTACAGTGAAATAAATTTAGCAAAACCAAACATATATATTAAAGCCAAAAAAAATCGTCATCAATATGCCATTATTTTGGTTTCTCGTAAATTGATACGGACTTGGGATATACAATTTAAGTATCAAAATAAAACGAACAAATTCTTAATTTCACGCCCCAAAATGAAACCAATAATTTCGGTTGCTTTTTTTATTTAATAAAACTTTGTTTTTTCAAATTAAATTTAAAATTAATTACATATTTGCTCCCACGGCTACGAAAATGTTTGATCTAAGCCTATGCAAACTGTAGGAAAACTTAAATGAAAAAAAACAAGATGCATTAAGAAATTTCAAGCGAAGTCATCGTCAGTGCTTATAAACACATATACGTGCAGTGTGTTTCTAAAATCCCAGTAACGAAAGATACACACTTCTGCGTAAATGTATGTATGTAACAATATAAATACTGTAAAATTAGTATAATTATATGAAAACTACTCACTTGACTTAATGAACACTAATAATTAAACTTAAAATATTGTTTACACTTGTATTCTTTTCACAACGTAAAGCTCACAATAATATATCGATAACTAAGCTTCCACGATAGGCGCAGTTCTAGTTTCGAATACAGAAAGACATTTATTGGTATCGATTAGATTTGGTCAAAATGATAAGATAAGTTTTTTATACAATAGTATGCTTTTGAAACTCACTTAGGATCAAAGAGAGACCAAAACTTTGTAATTTTTACACATTTGATAAGTTCCAATTGACAATAAAAGATTAGTTGGTGTACTTGTCAAAGTTTAAGAATTAACAAAAGATTTCGGTATTTTCAACTATATCAGATATCTGTTATTTAGCTAAATGGAGTATGAAGGGGATCGGGAAATGTAAGCAGCAATATTATAAATCTATATTTCCATACAGTTTTCACCCATCAAAATATAAATTTAAAATACAATATTTATTTTCTTGTTACTTTATTTTAATTAAATTGTGTTATTTAAGTTTTACTACTGTCGCCGCCTTTCTTAAACATTTTTCTGGGTATTCCGAATCCCTGCCCAACGCTCCTGAAAAATATAAGGGCATGTGTTTAAAAAAATGTGTTTTACTTGAATACTCGTATATTTACAACTGTGTAATGGCACAAAACCTTTGATCATGCCACCTTAGGGTAACGAAAGCGGAATTTCCTGAGTTATGGTATATACCTATAAAAAATATCTCAAAAAGAGAAGTACTTTAAACGTGTATTAACGTACAACATCTTGCACTTAAGATAGGACTTACCTGACTTTATTATTTAAAAAAACTTATCACTTTTATAACGGAGGGGCGCAAAAAAAAAGGACTGGCCGAAGGTTGTTTCTCCGGGCGCCGGGGATAGCCAGATTATAGGACACAGAAAGAGAGAAAAAGAACCAAAACACTTTTTTAGGGTTAACAAACTAAAGTTTCACACTGAAATTTTGTGACAACAAATATTATATGACTAAATCGGTGGTAGGCAGTATCACTTTTGATATATATGCACTTTCTCCATCACTGAACTTTCAGTATAGAGCAGCTGTCGCTACACAGTGTTTGTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTGGGGTTCCCCCAACTTTCCAAAAATAAAACTTCTTAGGTGCCCGCATTGCAATCAATTAAAGACGTAGAAAGCTACTTAGAAAGTAACCACTTTATGTAAGGCAGCGAAAAAAATAAAAGTGCATCCAATGTACACAAGAAATCGAAATCTGAGCATTGCCTTACAAAAGAACGCACTCAACATTATTACTGAGCAATTAACAAAAATAATGTACACGAACAGTAAATGGTTGACGATTGTTGTGGATACTATCACATTAAATGAAAGTCCAAGGCACCTAAAATTTTAAAATGTAATAATAATAGTATTACCCTTTCTAAATAAATAAGCAAAAAAATAAATTCTTAACCCCTTTTGCTTTGTGCACTTTAACTTTGTTGAAAACAAATTTTTGTTATCGTTAAGACCTTTAAGACATAATTATTTTTAAATTGATTAGCAAAGTAGCCTGTGTCTATTGGTTAAACAACAAACAAACTTATATGAAAACCAAAACTTTTTTGTACTGTACCTTAAGTTAAAATCCAAAGAAAATCGTTTTCCACATCCCTCGAACGTACACTGAAATGGTTTTTCTCCTGTGTGAACCAACTGATGTCTTTTAAGCTTGGAACTTTCTACAAAAGCTTTCCCACATTCTGCACAAACATGAACACGAGGACCGTGAGTGTGCAAATGCTTGCGCATCGCAGACGAGTCTCTGAAATTTTTATGGCAACCTTTATGGGGACAAGCTATTTTTTTATCATTTTGATGGGACACTGGGACATCGGAAAGATTAAAACTTGAATCAGAGCTTCCATTTGGTCCTATATTCAGAACAAAAATTAATATTAAACCAAAAAATTCAATATTTTGTAAATCTATACCAGCTGTTTTTACCTGTAATGCCGTGGTATGGTAGTTGTGATGGTGTTGATAAACAATCAGTTTGTTGTCTTTCCTGTGAGCTAAGACCAAATGCCACTGAGCTAGTCAATGTGTGCAGATCGCCAGTATTGTCAGGATTATCAATTGTCATGCCGGTAGTTTCATTCACCAGCTGTATACTTGAGGAATCCGAAATCAAAATGGGATCTTCGAAACTTAATGATGATTTACTTTGAACCTTTGTGGAAATATTATTTTCTCTAGAAAAAACTCCCTCCTCTTTCGTGAACTGTTTTATGATTGGAATAGAGTGTGGCTGCATTTCAATTGCCTGAGGTTCTTGAATAAATACATCTTCCTGTAATACAGATTCAACCTGCTCTATATCTTTCGTTCGCTGGGACGTGCCATGATCAAAATCAATGTTTTTTCCTTTCAAAAAATCTGAATCGCCAGCATGTTGGTCTGATCCGGAGTATTCATCATCAGATATTCCGGATGCCCACATTGTAACACTAAACTCCCCTTCCATAGTTTTAATTTGAACCAGCTTTTGCTCCCACCGTCTTGATTTCCCAGTTGAAGTAAGTATTGCTGTATCTGAGACCATGAAAGGTGAAGTTCTGCTGACAGTACCTAACTCTTCTGGTGCATTGCTATTGCTTGGCAGGCTATGTGTCACGTCCTTTGAAATTTTTTGATTTTCCTCATAGCCGATATTCTTATAACAATTGATATTCATTTGATATCCAAAGTTGGTATTCTTCTTTCTGTAAATTAACATATATCAACACTTTTATATGTTTAGATATTTAAATAAATGTACTTACATTTTAGAGGAAAATATAACTTCAGGTTTTAAGAGCGCCTTTTGACATACATTAGAATAACCTGCGTTATTACTTTCTTTTGGTTCTGACTGAATAACTGATTCAAATACTTTATTGTTGTGCAAGTTGATGTGATTGCTTAGCTGTATACCGTCTGAAAAGAAAAGTTATTTTAAAATTACTTAAAAGAGCGTAAATGGCAATGCTGAACCTGTTACACTAGTGGCTAAAGGACTAATAGATTTGAATTACGATTTTTATATTATTTGACTAAAAGGTCTACGAGCAATCTTCATGAAAACATCTTTCAATATATTTTCTGTTATTATAATGATACCGAAGCCCGAAAAACCACACAGTTCCGTCATTCTACAAACAAATTAGTTTATTAACAAGTTACTTGAGTCGTATCTGTACAACAGAACCTTCGCAGTAAGGTGCAACACAACAAGATCTGACGATTACATTATCGAAACAGAAGTCCCACAAGGAAGCGCAAAAGGGCATACTCCGTTCCTCCTATACACAGCGGATATCCCTACGAACAAGCGGATATCTCTACGTTCGCTCACGACACTGCAGTTTTAGGTCGCTCGAGGTGCCCAGGTCGAGCAACTACGCAGATAGCCAATCACTTCCTCGTAGAGGAAAGTGGTGGCAATCTGACTGGCGTATTTAAATAAGCATGCCCTCCACTGTCATTGAATAGTACGCAGATTCCCCATGTCAACAAGGTAACGTATCTCGGCGCCCACCTTGACAGACCACTACTCTGGACATCGAACGCAAAAAGTACATATATAACTAAAGATCAGAAACTTCCACAAGGTTCTGCTCTACAGTCCATCTGGACATATGTCTCCCAGCTATAGAGAAACGCGAGCACCAGCAACATAAAGAGCGCTTAATCGAAAATCCTGCGAACTATCACTAGGGCACCATGGTATATTCGCATCCAAAAGGGAACTGGGCATTCTTGTCAAGCTGGGTTTCCAGCAGATCCTGCCTACGACCTGCCAACCCAGCAATAACTTTCGGGCCCCCATACCACAATGCCAGTCTTATGTTAGTTAAATTAATTAGTCAGGGTATTCCCTAAACTGTTGAATTGCTGAATTGTTGAATTTTGGTCAGCTGTCAACGTCAAAGTCAAAGTCAACTTTCAGAAATTTCAGCCATTCGACTACCTCGGGGCTGTTGAAAGTTTTGTTAAATTGCTGAAAACCAGAGTGGTTGCTGTTCTTGGCTAAAAGTAAGAGGGTAATTCTGGTCATTTGTAAGCATGGAGGAATAGGTAAATACAAATAAAGGAGTTCTGATAAAATACTGCCTATACCAGTTCTAATAGTTTAGTTTTTTTGGCTTATTTTCGGAATTTTCTTATTTTAAACATAATCTTTGGTGAACACAGCCTGGCAATTTAACAATCTGACAAAAAGTTGACATCTTAAAATTGAAAATTTAACAGTCGTTGCCTTTATTGCTGAAATTTTCTTTTGCCTATGTATGTATCCAAAGAGAGAAGATTTCAATTATTATTAACTTAACGCAATCCTGGCACTTGTTGTAGCTTCGGGACCGATGTTCCAAAACATATATTATAAACACGGCTATAACAACATCTAACTTTTCAGATAAATAAAAATTATCTAAAACAAGAAAGGGATTCAACTTCGGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACGCTAGTAACACCATGTTAAATTCTTAAGGATATAACGGTGATATACAAAAAATTAATTTCAATATTTCACTGATCGTTTCTTTGTAAGTGTTGTCCGATTTTAATTAAACTTAATTCCAAAGTCCTAAAAATATAAAAATGTATATTCCCAATATTATAAGAAAACTCCAAAGCTATAATTTGATTCATATTATATATAATATAGTTGTCAGATTTTATTAAAATTAAATTCGAAATTCAGAACTCATTAAAAAATGTTATTTCCAAACGTAGGAGGTAATATGTTAAAAAACACCAAACATATAATTTTTTTATATTATTTTCCCACCAATTTTCCTGTTATTTCTATGACAGCTATATGATATACTTATCCCATTTTTATAAAATGAAATTCAAAATGTAGAACTAAAAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGTGATGTGTTCAAAAACACCAAATATATAATTTTCTTACTTTTTTTCCTAATATTCTTACTGGAAAAGAAATAAGACTTTTGGAAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCG'..b'TCCCAAAAGTCTTATTTTTATTGCAGGAAGTATACAAGTCGGATCAGCCTAATCGGACAACTATATTCAATAGCTCTCATAGGATTTATCATAAAAATATTTTTGAAAAAATTTAACAACATTTTAACTTTTGATGCTTTTAGACCTAGAATATCACTCTCTTTTTTTATACAAATTTCAAATTAAATTATTATGTACCTGTTAATCAGGTTAAAGTAGTGAGAGTCGGTAGATAGCAAAACTGTTTTTTTTTTCACTAACTCATAGCCACCACTAGCGGCGTAGTGGCGTAACACACCAGGAGGATGTGTGACTACTACACGAATAATCTACAGTAATCGTCCGATTGTTTCAAGTAAAGCATCAATCAAAGTAATAATCATTGGCTTGGGAGAAAGAGCGGTGAAAGTGTAAAAGTGAAAAGAATCACACCTCCTCAACTGTCAAAATCGGACGCTCTTAGAGCAATGCGCAAAAAAAATAATAAATGTTATTTTGCTTGAAGGTTTGTCCTAAAGCGTTATTTTGGAGTCCTAAAAATTCCAGAAGATGTTAAACAGCTCAATATAAGAAACATTAGTTCTATTACTTTTGGAAATCTAGCTAGCTTGACGAGAAAACAGCTTAACGGACAACTTGCTAAATAGCTAAATGTTTGATTTATATGTCGTTAGAAAGGTATTTTGAAATCCTATGCACGCCTTTCATATATGATTTGTCTAAAATTTTATTTTATTTAAAAATAATGGTCCAAAGTTTTTTTGTTACGATTTTTTTAAAGTTTTCTTTTCTGACTTCTTTACGATTTTGAACTAAATTTTATGTTGAATAGTCCTTATTAATAAACTTTTGACATACGACTCATTCTTGTAAAAATAACCGTGTCAAAGGTTTTAACAAAAATGGCAAAATTTACTACCTTTGATTTTTTTCTGCGTTTCCATACTCATTTAAATGATTTAAATTCTTATAAAAAGTTCCGCATAAGAAACTTAAATTCTAAGAGTTTTGGGCATATATGCGAGATGGGTTAAAAAATAAGGTGACTTTTCAAATTTCTCTACGTATTTTCGATCATCAATTTTTTGTTTCATTGTGTTGGAAGTTTAAAATGTATATAATTCCTTGTTTGGTTGTTAGAAGCGAAAAGGTTATATGTGTAATGCGCAATCACCTTACTTTTTTAAAAACGCTTGGTATGGACGATTTGATTTATTTTATTTGACGATCGCATCACTGACAAATTAAAGTTCTGATATCAACTTTTGTGACGAAAATGTATTAGTAGTAGTTTTTAGATTCGGCTCCCTGCTATTTAATATTCCTTGCTTAGTTGTTTGATTTTAATGAAGCGAGCCGAATGTAAAAAATTTAAAAAGTATAAAAATTAGTATTAAAATTAAAAGTATAAAAATTGTATCATTTTATTTTTTCCCAGGATAAACGACATTACCTGTCGTTAAACTACTTTTACTAAATCAACCAGAGTGCGTGCGATTTGCCATAATAATAATTTTAATCCGACACAACAGATAATGTGTCCTCGGAAAGGTATTTACCTGCAGATTTGCCTAACAGTTCTATAATTGAATTCTCAAATGTAAGCTTTTTTAGCAAAAACAAAATCGATTCTAAGAAAATATGTTTAAGTACACCACCTTGTATAGAAAGCTCAAATTAGTCAAGAAAATTCGATTTTAAAGTCAAAAAAGTTGTTTATATGCTTAAAATGGTCCCAGTTTGCCGAACCGTAATTTAATGTAGACTTTTTGTTATTACGGTTAAATATATACTAACTAAATTCGTAAAGCGTAACTCGATCAAATTCAACACCACGAAGATACCAACTTTTCTTGGTGAGTTAGGAACAGTTTTGTGATGATGATGACTGATGTTTATTTATCGCTTCCATTTATCCAAATGGATATAAATTTATAAAAAACATCTCACAAAGTCAATAATGATTTTTCAAAGGTAGAAGTCTTATTTCCAACATTGGGTTTAATGTTGCACTTTTATAGACAAAAGTTCATCCAACTTTTTCATGTGTCATAATGTTTTAAATCGATTAACGATTATTTACCTCTGAAGTAAAATTTATTTAACTCAAAATCCTTTTTTACAACTTTCGACGTGATTAATGAACTTAAATATATATATGGCGATGAAACATCATCCATATCACTGTAAAAACTGGTTTTATGCATGAAGTCTTCTGAAAAATTCGAAAAACGTAAAAGATAATTCGTATTCAATGTGAGATCTTACACATTAGCTAAAGCCATAGATGGGTCATCCGCTGTACAGCCCTGACTAGGCACCCAATGACTTTTTTTATTGCCGGTTTATCGAATGCAAACGGATTCGACCAAACTTTCTTCTTCGGATAAGGAGTTACGTATCGCAGATAGCACAAATTATACAAACGTCTGAAACGGAAATAAGTTGTATAAATTGATTTTGTAATGTTTATTTATTTATTTGACAGCGCTACGAGTGTACCCACACAGTTTTGAATGTATGTCGAAGCAAAATGAAGCTGCACCAATATTAAGATAACGTTCCATTTCGATTTACTGAAAAAGAATTATGTATCAAACAACACCAAAGTTATGTTTAAAAAAAATTGTTATCAATTTGTTTGATCTTGCTATGGGAGTTATATGATATAGTTGACCGATTCGGCTCGTACCGACTATATGCTTTAGAAATAAGACTTTTGAGTTCAGTTTGCGTAGAACGGACAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCTACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATCAAGATCCGTATGAATGCAGAGATCTCGGAAAATCGGACCATTCATTAAAAAGTTAAACAAAGTGTGAACTCTTGTGTACAGTCGTTTTGCCCTTGCCAAGTAACGGATATTGATAGTCTGTGGCATCGACTACGACCTTCTCTTTTATTTTAAAATATATTTTATGGCATTTTATGATCTTTTATAATATCCCACAGACCTGAAAGCTATAACGTTCATGATGGAAACCTATACTGTTCTATGCACTTTAAATCAATATTTGCACCGAAGATAGTTTGTGAAGAATTTACACCACTAAAGCCAGAGCTTATAATACGAGAGAATCAACCAATAGAATTACCACCGGATGTCGCAAGAGGTAAAATAAAACAATGAATACAATGAGCGGCCAGGCGCCGCCTTAATATGACTTTGTACATTTTGCCACAACTTTTCTTCCACGTTTTCTTACTCCAAAAACTAACAGACTTTACAACGTTTATACAAATTCGCTTTAACATTTCGTTATAATAAACAAATAAAAATTGTTTTGAATGTATTTATTTAACATTGCAGCTTCCGATAAGCCAAGTCTTGGACTTGACGAACTTCAACAGCTAAATGTGCGCTCAAAATTCAACGTTTTCGAAAATGGTTGTAAAGAAAAAATCGATTACCTACAAGAACGGCAAGATTCTGCACTTACTCATAGCAAGTCAATAGGGTCCACGATAACCAAACTTCATAAGCTCGGAATAACTAATTCAAAATTTGATGAACTAGATAATATTGAAAAGACCATTGATAAGATAAATTCGAGTACCGACGAGGAAAGCGAAATGGTTTTTTTGTGCTCCAGAAAGAATATTGAAAGGGAAAGGCCAGTGGGCTTGGGAGAAGCAATGAATGATATTAGATCAAAGTTCGAGCAAGGTGAAGTGATGACAAAAGAAGAACGTCGCGAAGAAAGGAAACAGGAAATACAGAGCATACGTTCTCGACTATTTTTGGGCAAACAAGCAAAAATAAAAGAAATGTATCAATTAGCTGTGGCTGAATCAGAACATGGCGTTACATCGGCGGGTAAGACCCCCGATATTAATGTCATAAATGCCACTCATCTTATAAAGGATCGATTTGAGAATGGTGAGGTTTTTAACGATAATAAAGTTCAATTAAAGGAAGCAATT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c40/865/09/scaffold_67-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CAAGCGGATGCGGATGTGTTTGAATCTGGTATGCGTATATTTACTACAAAACAATTTATATTCGATATATATTTGCTTTACCTCAATTGCAGGAATAGGCAAAGCATCGCGAAGTATCTTCATGGAGCTAGATGCAAATTTAAGTTCAAACTTAAATAACAGTCGTACCCAAAATAACCGTCCCGATAAAAAGATTGTGAGATGTAATCAATTGTTGAAAGAGGTTAGTCCATATTAACTTTAAAAATTGTGTACAATTAAATTTGTTTAATACAGAGTACCGGTGCTGACATTATCAAATGCGACTCAAAACCAGAAGAAGTTAAAGTCGCCACTGAAGAGTTAACAGAAAGATTTAAATTCTTTGAAAAATATGCCCCTGTCGAAAATAAAAAAAAGAAATTTCGCATGACTCCGCCACGTGACGGTGTTGTGAAGATGCCGTCTCCTGATTTCGACACAGAGGGTTCAATTCAAACGCCCTTATTCAATGATAACGTTTTACAAAAAACCAAAACAACGTCAACAATATTAAGCAAGTTTCGCGAAATGGAAGAGCAACAAATGAATGAGAAAAACAAGGAACGAAGCCCAAAACCATTAAAGTGTTTTACTCCGCCACCAGAAACTGTCGACCATTTCAATAGATCAGATACTGAGGAAGAAAATGATAGTGAAAGCGATCAGAACACTGATGACGACGAAAAAAGTTTTGCGAATGTGCTTAACGGTTGCAACGAAGATCAAGGGCTTTACGAGGTAAAACTTATGCTAATATCAACTTATGCTATTATAAATAACGAAAACAGAGATCATTTCGGCAAGCCTATGTATTAATACTTTATCTGACCATGCAAATAAAATATATATCTAAAATAGTATAGGAATAATTTAGTAATCAGGTTGACCAGCCGAGTCAATCTAACCATATTAGTCTGGTGGCTTCTGCGCTGTACCTACAAACAGTAATAACGTTATTTATTGTTAACCAATTAGTATTCTAAATTATCAACGACTCTAAGGTATATATAGTAGCCTAGGCATTAGTCTGATTGTCTGATGGTTCTCTCTTTATTCTTAACGGAATTCGAAAGGTTAAATTCTACATTAATTAATAAAATAATATTACGGAAAATAATATTCGAAAAGTTAAATTCAATAACTACATTAGTTAATAAAATAATAAAAAAAAAATTTATCGTTTTACAGGCCCAGAATGCAGCTCGTGCTAAACAGTTGCGGGCGAAGTTTGAAAAGTGGCAGATTAACGAAATAGAGCGCGAACTCAACGAAGGAAGTGGAGACACACAATCATCACAGCTTATTTCAAATGAGTCCATTGAAAGTGCAAGAAAGTGAGTTCCAACAAAAGGTGTCAAAAAAGAAGTTAAATAATTTCAAAAAAGAAGTTAAATAATTATGTCCTTAAATTTCAGAATTCGGGAACGCTTTGAAAATATGAATATTTCTGACTCTCAACTGGCGAACGCACCAAGAAGTCTAATCAAACGTTTTGTTGTATGTGTACAAAATTAATTAAAACTATTCGACTTATCAATTTATTTTAGTAACGCAATGAACGCCTGATGGTCTAGAACGACGAAGTATCATAATTATTGCGAATTAACCATAAATCACGTAATAAGAGGATCCCCAGAAGTTCGAAATAATATCGTATATTTTATATGTCTTATATAAATACATTTTTGACATTTTGAATGTGGCAAATACAATATGATTTTAATACTTTATATTATTGCTTTATCCATGAATTCCAAGAATCGTTTGGCATATTGTTCATGATCATGTCGATATGCCATTAACATTACTGCCATATTTAACATTTTTGGCTGCTTTTGCCGACAGAAATGTGAAACATTACCTTTAAGTCAGTTTTTACGCTATATTTAGTAAGAACGCCAATAATTAAAACACAAAATATTCACGTTTTTCTGCAATATAATTGAAACAACTATAGTTTCGAAGATAAATAATATATATAAAATAATTTGGTAGTCTATCTTTAACTAGAGGTATTTTGCTAAAAATATGTAGTTAGAAATTTAGAATACTTACGCTTTAGACAAAACGGCTTATATACATATGCATAGCGGGATAATAAATAGAAGTGTCGTTTTTCGTGCCAATTTTGAGATAAAGTTGAGGCAAAAAATGATTTCTGTGAGGTTAAGCTCCCTTATTAAAGCGGACAAACAAACTATATGTATCGGACAAATTTTTACTTCAAGGTGTGATAGTTATACCCTTTACTTATAGAATAAAAGGGTATACTAGTTTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAAAAGTTAGCGTTTCCGACCCCATAAAGTAATCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTATGTCTGACCGTCTGTCTGTCTATCAGTATAAACGCTGATATCTCGGACACTATAAAAGCTAGAACAGCATACCTATCAACTGATCCAAAATGTTCCACGCCCACTCTAACGCCCACACACGAAGTTAAAACGCTTAAATCTGTCTGCCGCCCACATAACGGTAGGTGGCGCCGTAAAATATCGCTTTGTTGCTTATATATCTCCATTTCCCTCTTCCTCCCTAAAACTGAGTAAGGGGTATCTGATAATCGAGGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTTATTTCTGTCATCAATGTCATAGTATTAGCAGTAAAATGTGTCTTCGGCCTAAACTCGAGGGAAAAATTACAAGAGATTTTTATCTATAGTCAATGCTATCAGCTAAATTTTAATGTTTTTAAATCTTTAAAAATTTGGGCGTGGCGCTATCCAAAAACCTCAAAAATCTTCACGCCAAATTTTAACTTTCTGGATTTTATGGTTTCTGAGATCTCAGCGTTCTTACGTATGGAGAGACCAACTTGGCTAGAACGACTCGGCTTGTGATGCTGAAAAAGTAGCGATTTGCCATAAAATAATTTTAATCCGACACAACAGATAATGTGTCCTCGGAAAGGTACATGTATTTACCTGCAGATTTGCCTAACAGTTCTATAATTGAATTCTCAAATGTAAGCTTTTTTAGCAAAAACCAAATCGATTCTAAGAAAATATGTTTAAGTACACCACCTTGTATAGAAAGCTCAAATTAGTCAAGAAATTCGATTTTAAAGTCAAAAAAGTTGTTTATATGCTTTAAATGGTCCCAGTTTGCCGAACCGTAATTTAATGTAGACTTTTTGTTATTACGGTTAAATATATACTAACTAAATTCGTAAAGCGTAACTCGATCAAATTCAACACCACGTAGATAACAACTTTTCTTGGTGAGTTAGGAACAGTTTTGTGATGATGATGACTGATGTTGTAAGTTGTATGAATTGATTTTGTAATGTTTATTTATTTATTTGACAGCGCTACGAGTGTACCCACACAGTTTTGAATGTATGTCGAAGCAAAATGAAGCTGCACCAATATTAAGATAACGTTCCATTTCGATTTACTGAAAAAGAATTATGTATCAAACAACACCAAAGTTATATTTATATTTATATTAAAAAAATTGTTATCAATTTGTTTGATCTTGCTATGGGAGTTATATGATAGAGTTGACCGATTCGGCTCGTACCGACTTATCAACTATCTGCTTTAGAAATAAGACTTTTGAGTTTAGTTTGCGTAGAAACGGAAGGACAGAAAGACGGACATGGCTAGATCTGTGATCTAGTGATGCTGATCAAGAATCAAGATCCGTATGAATGCAGAGATCTCGGAAAATCGGACCATTCATTAAAAAGTTAAACAAAGTGTGAACTCTTGTGTACAGTCGTTTTGCCCTTGCCAAGTAACGGATATTGATAGTCTGTGGCATCGACTATGACCTTCTCTTTTATTTTAAAATATATTTTATGGCATTTTATGATCTGTTATAATATCCCACAGACCTGAAAGCTATAACGTTCATGATGGAAACCTATACTGTTCTATGCACTTTAAATCAATATTTGCACCGAAGATAGTTTGTGAAGAATTTACACCACTAAAGCCAGAGCTTATAATACGAGAGAATCAACCAATAGAATTACCGCCGGATGTCGCAAGAGGTTAAATAAAACAATGAACAACAATGTGCGCTCAAAATTCAACGTTTTCGAAAATGGTTGTAAAGAAAAAATCGATTACCTACAGGAACGGCAAGATTCTGCACTTACTCATAGCAATTCAATAGGGTCCACGATAACCAAACTTCATAAGTTCGGAATAACTAATTCAAAATTCGATGAACTAGATAATATTGAAAAGACCATTGATAAGATAAATTCGAGTACCGACGAGGAAAGCGATATGGTTTTTTTGTGCTCCAGAAAGAATATTGAAAGGGAAAGGCCTGTGGGCTTGGGAGAAGCAATGAATGATATTAGATCAAAGTTCGAGCAAGGTGAAGTGATGACAAAAGAAGAACGTCGCGAAGAAAGGAAACAGGAAATACAGAGCATACTTTCTCGACTATTTTTATAAAATTATAATT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATATTATAGTATTAGTGCCATTTTGACGAAATCCAGGGTCTCTTCGATATCAATAATTCTCTTTCTATTTTCGAAATTCGAACTGCGCCTATGGTTTAAGCAATAGTTATCGATGTATCATGCATTATTTTTATAACTATGGATCTTAACGGTGACAGCGACGCGAGCAACGAAAGTGGATTTTGATTAAGAATTTTGATTAGTCAAGCCTGTGGCCCGATGAAATATTTTCTATGCTGCATCTTTTGTTTAATTAATTCGGATTGGCCAAAGCTTTTATGCTGACGAATGGGTTCCTAGACTTGACCCTTTGTTTAAATGTACAAATATTGTTTAGTCATTTTGAAATACTTCTTCAATTTTGTTATCTTTTGATTCCTTTTTTGTAATCCTTGAGCTCCTTCTTTAAGCAGAGAGTCATTGACCTGGCAATTTTTGCGAAACCTTTTATAAATTTACGATAAAATCCACAAAGGCTTACAAATGAATTTATTTGTTTTGAAGAGTTTGAAATTTTAAAATCTTGAATAGCTTTAATTTTATTTGGATTTGCTCTGATTCCTTCAGTTGAAATTATGTGACCTAAAAATTCAGTTTCCCGTTTCATAAACTCACATTTATCTTATTATAGTTTGATATTTGATGTATTTTTAAAGGTTAAAGATTCTCTTGGAAAGAGATTAAAAATATAACGATGTCGTCTAAATATACTAGAAAATGTGTACCTATTATGTCGTGTAATATATTATTCATACAACGAAATGAAATGTAGCGGGTACATTTTTAAGGCCGAAGGGCATTCTGGTATATTTATAGGGACCCTTCTTAGTGGAGAATGCAGTTTTGAATAGAGTCTTTAGCAAGATCTAAGGTTGTAAAGTATTGACATTTCCCTAAATTGTCTAATATTTCATGCCTGTTCGGAAAAGGGAATTTATCATTGATAGTTATTTCATTCAGTCGTCTGTGATCAATAGTCATACGAAATTTGGGTATGCCCACCATTACAATTGGACTTCAAAACGAGATTTGGATTTTCTGATAATACCTTTTCTGATAAATTCTTCAATTTGTTTTTCTACTTCTGTATCGTAAAAGCAAGGATAACTATATGGTCTACTATAAATTGGTTCTTTATGTTTTGTTTTTATGACGTGTTTGATTTCGTTCGTGAAAGTAAAATTTTCACCATCATGATACTGAATATCAAAATATTTTGACACTAAATAATATTACTGTCAGATAAGTCCGTTTGTAAGGCATAATTATATTCATCCTCATCTAGTACGTTTGAAGAAGTTTGATTACGTTTTTCCGTTATATTTACCATAGGGAATTCATAATTATGTAATTCAATAGTGTTTTTATTTTTAAATCAATTTTTTCTGACGATTTTTTCAGAGTTTGCCTTCTTATAATGTCATAATGTTTTGAAAAGTTTTTTATTAAAAATGTTTGCTTAGATGAAAATAATTTTGAAATGCTAAACGTAATATATTTATTCAAAGTTACAGATTCACCTATTGTTTCAATTTTAGTAAAATAATTTTTAATTGGGTAGTTAAAGAAGTTTTCGTTTATTAAGATAAGACAGAGGCATGGTTTATTATCAATTTTAATTTTTATGGCTGTGGCTTTTCGTCCGACGCTGTTGTCTGAAAATTTTCAAATGTGTCCATTGGCTCAGACCTACGTTATTGATCTGAATCTGAAACTCGGGAACGTCTTTGGGGAATATTGGTACTCTGAGTACTTTGGTTACCCTGTCCTTGATTGTTCTGAAAAGTTTTAGGATAATAATTATTTCCTATTAGAGTCGAACTTATTCTGTCTCTGCTGGTTCTTGTTTTATTTGAATTGATAATTGTTATTTGGAATCTACCCCTTGGTTATTATTTGAATGATAGTTGGGTTTTATATTTGAGTATGATTTTGATGTTTTAAAATCTTGCGATTCATCAACTTCCTGAGTGTTTTGGAACATATACGAACGATTATTTATGGCTTTATCTTCAAAGATTCCTACAGCTTGGGCATCTCGTTTTAATTTTAGAGGAGACGAAATATCAAATTTACTCATCATAAAAGAAAGTCTCAGTTTACAACAAATTCTACTCGTCTGTTCTTTTAATTCTTCAACAAATTTCTGTAAATTATTTTTTTATTTAGTCTCACGTCATTCTGCTATCATTCAATGTGAAGGTGTTGCTCTGTTGAACTCGCTGATAAGTAGGGTTCTCAATTACTTCCAGTCCTGTGGTATATTTCTCATCAAGAATGATCTGGCTTGTCCAACTAGGAGGTTCCTGATGGCTGCTTGGATAATTTGGTTTTTGACTTCTGATGTTGGTAGACTATTTCATCGACTTAATTTATAAATTTGCATCTTTTTTTAAGTCTTGTTTAGATTTTTTTAAGTCCTGTTTAGGTAGCCACTCGCGAGGATATTTCTTGTATCTGGCCGGATATATTAAAAAAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATTGGTGTAGAATAAAAACGTTTTATTTCCCGAATTTTTGAGTGGACTGTATTCTTTATTTCATTTCCTTCGCGTTCGATGCGTTCAATTGTAGTCTTAAAACTAAGTCCTAAAAAATCTCTAAGCAGCACCAAATAAAAATATATCAAAAAATGGCAAAGTTAGTATTTCATATACCGGGGGAATAATAAGATTTAAAATCAAATGAAACTGCAAAGCGTTCATCAACATCCCGGGCCGCCCTGAAACAAGGTTTCAGAACTAGGCAGAACAGCTAACTTGATGATGGTCCGGGTCATCTCTCCAGTAGACGTCTTAAGTTTTACGGCGCGTACAAGTCCATCTGGTCCGATGAGCTACCAGTACACGGGCTAATATCCAAGCTGCTGGAGGGAGATTTGAGTCCTTGACGAGGACTACGTTGTCTACTGCGATGTTACGTACCTTGCTGTTCCACTTTTGACGTTGCTGCAGGGATGTTAAATACTCTTGGTGCCAGCGTTTCCAGAACCCTTAGTACATTGCTTGCAAGTGCTGTCAATAGTCCAGACAATTGGTCGGTAAATGAGTCAGGCACCCCCTTTGGAACAGTTGTGAATGGGCGACCAATTAAAAAATGGGCCGGAGACAAATAGATGAGATCAGTGTCAGGTGTGTAGCATAGCGGCCGAGTTCACCATAGCACTGATCTGAGCAATCACAGTTTGCATCTGTTCAAAGGTTAGAACATTTTTTCCCACGACACGACGCAGATGTAATTTCACGGAGCGTACTGATGACTCCCACTTCCCTCCCCAACGTGGCGAATGGGGAGGTATGAAACTCCACTTGATTCCACCATTGGCCAGCGATTGTGTTACATTGCGTTGATGCTCCTGCGAAGAAAAAAGTTGCTGCATCTCATCCAAAGTCCGTTTGGCACCAACGAAATTCGGCTCATTATTGCTGAAGATCTGTGAGCACTTTCCTCGCAGGGACATGAAACGCCGAAGACAAGCCAGATATGAGTCTGCGCTAGGATCGGTGGCTAGTTCCAAATGTATGGCTGATGTTACAAGGCAAACAAAGAGACATATGTAGCCCTTAGTGAATGGTCCAGCGTAATCACAGGTAGAGTGCTTCTGTTATAAGGATGCCTGGTAAGTGGGCCATGAATTGGTGCTCCGTAAATTTACGTTGATAGAAACATTTAATGCAGCTGTGAACCAGATTTCTTATCAGGTTCCGTGCACCAAGGATCCAGTACTTTTGTGGAGCAATTACAAATAGTGCAGAAACTCCTGGGTGAAGATTTGATATATGTTCGTACTCCAAAATCAATTTTGTGATGCGGTTCGACTTTGGACGCAGTATAGGGTGTTTTGTCTCAGCTGGCAATTGTGAGTTGTCCAGTCGACCACCAACTCGAAGAAGGCCATCCTTGCAGATAATCGTTGAAAGCTT'..b'ATTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATATCTTTTAGCTCTTAAAAGAATAATCGGAAAATGCCGAAGTTAACTACTTTTCTTGATTTTTTCTTTGTTCATAAGTTATTAAAACAACCAAAAAAATTAGGTGTGTTTCATAAAAATCGGCATTGGGATCATAATAATTTAAAATTGTTTAAGAGAATCATGAATTGCAGTGAAATTTCGTATAAATATTAAAATGTTGTTTAATTATCAATAATTCGCCTAAGAATTTGTTTTTCTTCAGAACCAGGGCACCAACTGCTAAAATGTTATTTTTATTAAACACGAATATTAAACGAACACAATTGGAAAAAAATGTGTCCAGCACATAATAATATGCTTACTGTTCAATGCTCAAAAATATATAAAGTGTACTTTTGGGATATTTATCTGATCATTGCTGTACATAGTGAGATTAATAAAGTTATGCCCTTTTGATCTTGCTAACTAAATTGCTGAACAAATTAATAAGATTATCTAAAATAATATTTTAATGAACTTCTTATTGTTAAGTGCAGACATTACTTAAGAAAATGTGCCACAGAAACTTATAAAATATACATTCGCCAATATCTATGGAAGGTCCACTAAGAAATTTTGTTTAAATTTATTTTTGAATTTCGCTTACCAAAACATATTAAACAGCAATTTCTTATTATATATTTAATTGAAAACATGAAGCTTCTTTCAAATAGGGCTTGTGGTTAGAGGCTGGATATAGACTTTGGCCGTCCAGGGTATATCTATTATATTAAAAAGTTGTTTACACGAAATATACACAATTTGACACAGTCTTCAGTGTTACTTACATACGTATATTTTTTTATGTCACAATAGCGCTATTGAAGTATAATGCTAGGTTTCTTTAGAGCTTACGTGATCGGTTATTGCGTTGCTTTTAATCGGATACATATATAAATGTATCCACTTTATTATTGGTTAAATAAAAACCTTATTTAGAGATTAAAATAATTCAGGTATAATCTACACAGACAAGTAAAATTTATTTTATTTTAAACAATAAAAACCCGTAAAATGGATTAAAAAAAAAAAAACTATCACAGCGCAATATTCTGGTTGGCATAGGTATTTTGACGATACAAAAGCTAAATATATAAATAATTTTAACTTACTTATTTGGTATTAATTGAAAGGTAATTCACTTATTTAAAATTCCGAATTTGCCTGAAAATCTACTTTTTAACTTTTTTATTATATATATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATATTATATTTATTGGTACAAACAGTTTCTCCAGAAAAAAATAATAGTAATATTTTGTATTATTTTTTTAAAGGTAAGAAGTCGAAAAAGTGGGTACAAAAGAGAATTTTTGTAAACATCAAAAATTGTAAGCAAAATAACTTTTTTTACTGAGTAACAGCAAAAAGAATTTTTCAAAAATAATTTTGCTTGTATTTTTAATGATTTCTCTAAGGTCACAATGTCGGAAAGATTGTATAAAAAAAGAAAGCTATAAAAAAATTGAAAAAATCATAAATAATAAAGGCATAATATTTTTGTACAATTTGGGTTGCATTTACTATTAGTTTTGCTTGTTGTTGTTTGTTTAAAAAGTAGATTTTCACACAAGTTTGTACTTTTCAATAAGTACTGAATGGATTAAGAAACGATTTATACCATTAAAACGGCATTTAAATTACTTTTCCGTTGATGCAAAAGTTAACAACCAGTAAGTTCAAATTATGAATATATTTTACTTTTGTTTCTTCAAAATACTTTTGCCATCCAGTGTAAGTTATTGCTTAGTTAAATATGATACTTTTATTTTGATGATAATAAATTAAAATATTTTACTTAACTACCCAAAGTATGATTTGACAGTAGAACAAAAATTTGTATACGACATTTTTTTACTGGAAACTAATAAGTAACAACAATACAAGACTTTTATTTTATTAATTATATTTTTCATTCGATCAATATTTATTGCACCTTTCAAACTTTTTTTATTATTAGTTAATGCCTTGCTAATATTAGTTTTTAAATTGTAAATATACACAAAATTAAATGATTTTTCTATAAACCTAAAAAATGTGTAACTTACTTTAAATTCGCAGTATGCACAAGAATGCCTTTAGTTTAAATATTTAGTAAGCTTGTAGAGCAAAAGTGAATTTACATTAAGTTTATAATGTATCTAATTATATACATTAATATTAATAGTTTCTATTCTTAAATTCTATCTCGATGCTCATTCTTTGAATTACAACAACTATACGGCATATATTCTTCGTCTTCTTTTCCCCATCTGAGGAGAACGAAAATTTCAATTGAAAAAAATGGTGCTGACGCATTTTTGAGTGAAGAAAAGAATATTAATATTGAGAATGTCAATAAATTGGAAATCTATGACAATATATTTGCAGTATACAACTCTTGCATCATATAAATCTTTCAACCAACCAGTGTTATTGATAATTGATGTTCGTAAAAGCGCCTACTGAGTGTGTTTAATAGATATTTTCCTGAACGCCCTAATATGATTTTATTAAAAACAAATAAGGCCAAATCAAAAAACTTAAGAGCGAAATACGATGTTTTAGTTTTCAAATATCGAATTGTCTAATTAATACATAATAGATTTCCATTTACAAAAAATAAATAAAATTGAATACCAGCATCCGAGACTGCTTTTGAGCTGATTGTAAATCGATACATTAACCGACTGGCGAATACTGGAGCATGTTTTTTTGTGATCAAATTAAACCGTTTATTGACAAACAAAGATGATATAATTTTTCAAAACGTGTTTGATTACTCGGAGGAATTACTTATATTTGATCCTATTTTAACGAGACCTACTGCCAATATAGTTATGTATTTCCTTACAATAATAAAAACTTGCATAACCTAGAAGAATGGTTTTATCAGCTCTAATCAATAAAATTAAAGAAAAATATAAGATATTTTATATTTAAGCGCGAAATAGCTTTCAAACCAAAGCGGTGAGCCTGGTGTGGTGGATCGACAACTGAAAAATATATTGCTACATTGGAAACAGGTCTAACTCTGTTTTGAATATCGTTTTGATACTTTATTATTAAATAGTAAGTTATGCAATATTTATGTGTGGATAAAATAAAGTATTTTTAAATTATCTCATATTAAGTACAAACAAACGTTTCGGGATTGATCTTTCTTGTAAGTTACGTATATAGTTTAAGTAAACATTATCATATTTAGTTATTTGTAATTAAAGAAAGTAACGCTTAAATCATTCTATTAGGCAAAGTCTTTGGTTATCCTAATATATATATAAGATCTAAAAGTTCCTTAATTTAGAATCGGCAAAGCCGGAGATTGATAAATATTGCTGAGATGCGGCGGGACGCAAAATCTTATAAGATTTACATTTACATCAAGTCGCTGTATTCGGATAGTTGCGACTTTGATATTGGTAACGGTTACTGTGTATCCTCTTGATCTTCTTTTAATCAAAAACCGCCGTACCCACTTATGTCGGACGGTTTCAAGTGATCAAATACGCTCAGATGATGTGAGGGATGACTATGGTGTGAAGGATGATGAGTATGTGGATGAGTATAGCTTGGGTAATTTGCTTGGGGCGGAGTGTGACCATATGGGTGGTGTGAAAAAGGATAATTTGGACTCGGGACGTGTAAAGTTGCAGTGCTGGTTTGTCCGGTCGACTGAATGGTGCCGCCCAGACTATAGTGACTGTGTGATGCTGAATACTCCCCTGTAGTATGTTGTGGATGCGTTCCATATGCAGATGCACTGTACATTGAATTTACATTTACTGAAGGGATGTGAGCCATATGATGCGCTTGGTCCACGTACATTGTATGCGGATGTGAGTGAGGAGGTGGATGAGGATGGGAAAGGTGATGCGGATTGGGCTCTGAGTTGTTAAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GTTCGCCCCTATAGCGCCCATTAAGTGAGGGGCATGATGATGATATCCGGATGGACTATGAATAGAATACTCGATGCTGTTGCCACAATTGTTGTTGTTACTATTGCTACTTTCACTGATGACTCGGGTTTCTCCACTGTTGCCATATATAGCTTCGTTCTCAGTTCTTGCAGTCAAAGCGGATGCAGCTAGACTGCTTACAGAAAAATTGTTGTTGCTGACGTTGCTATTCTCTCTTGACGGTCTACATGATTCCGTTTGCACCGAATTCTCTGGAATGCAGCGTTTTGGTTGCTGGTGCTGTTGTTGATGTTGTTGTTGCTGCTGGTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTTGTTGCTGCTGTATATGCTGCTGTTCCTGCTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGATGCTGCTGCTGTTGTTGCAAGCCTAAAAGACGACTTTCAACAGCAGCCGCTGCTGCCGCTGCTGTTGCCAATGGTATATTGCTGCATTCGTGTTCCCTTATTGCTGGTATTTGATCAACCAGCGATTCGAGGCCACACAAGCTCTTGCGAGAAACGTCTGAGACGATATGTCCTGGTTGGGGAGTATTGTGCTGGGTTTGATTTCCTACCCGCGGACTGAGATTCTGGTGGTGAGCAGAAATCAGCATGTAAGGATTCGAATTATGTTGTTCGTAGCGCTGCCAGTTGTCGGACTGCTCCTGCTGGAAGTGCTGAATGGGGTGATGAAGGTGCTGATGTGTTACTTTCTGCGCTGGCTGAAGACTTTGTTGGTTATGCGGCGAAGCCCATTGCTGGTAGTGCTCGGAAGGATGAGCTATGTTTGCCTCGGCATCATGTGCGGGACTACCATATTGATCCTTTTCCACTGTTGGCGGTTGCTGGTGACCCAACTCAACCGTTTTATTTGGCTCCCCTGCGCCCACTTGCGGGTCGGAGTGCTCGTTTGGTGGATCAAAATCGACAGCAGGACACATGTTTGGCGAACTTGGAGGAGGCGTCTCACCCAAATGAGGGTGTTCCCGCATATCTAGTCCAGCCTCCATATTTCCCTGCTGATTTTGCTTCTGGGGAGTTAGGTGCTCGTTTTGGGGGTCGATATTGGGTGACGAACCCTGAGCGACGGGAGTCGCATGTCCCACTGGTGGAGTTCCATGGCCGTGCACTTGATTGTAATTGCAATTGAGGGCGGGGGATGCCATCGGTGATGCCGATGCGTTGTACAAAAGGTGTGATGGTGGTGGTGTGTTGTACAAACTAGGCGGCATTTGATGACTGCTCTGCGGGGACGCTGCTATATGCTCCATTGATAGTGGATGCATTGAGTTTACTGACAGTCCGGTTGTCGTGTTTGGATTAGAGTTTCCGTGCTGAAGCTGTTTTACTGACAGAATATTGTCAATGGCGGGTTTTATTTTTTTTGGCCTGCCCCTCTTTTTTTTTGGAGTTTCAATGCAGCCGCCGGCAGGGATAACCGAAAGGTTTAGAATATTATTAAAATCATGTTGAGGCATATGTTGTCCACCAATGCTGATTTTGCCGCCCACGGAATGATCAATAATCTCTTGTCCCTTTATCTTCTTTGGACGACCACGTTTTTTCTTCTCTATTGGTTGCTGGGGCAGGGTTTGCTGCGCACCAAACACAGACAAGTAAGTGCTTTCATTGGGGGCGGTGTTGTGATTTGTTATTGGCAGCATGGATCTATCGTCTCCCGTAAACGAAAATGTTCCACGATCCGTAGCAGTATTGGAAAAAGACATTTTGCCAGTCAAATGGGGCATCAGTTTGTCATCTGCCTCCTCGGTGACATTTCCACATTCCGTAGCACCTGTACTTGTACCACCGCAGTTACCTACAAAAGTAAGACTCGCTTGAGGATCTCCAAGTGAAGTTTGATGAGTTTGTTTATTTTTTCCGCTGGTTTCAACTTGTTGCTGCTCGCTACACTGTCGAATTCGCTGGTCTGTAAACACGCATTCGGACTCATCGATGTGGGGTATCAACCCGTTTAGAAAATCCCGAAACTTCTTTAGGGCCGCATAAAAGGGAACTTTGTCGGCAGCGCGAGGCAACTGTGCGCATCGTGCTGATGATGATGGCATCACCCAAATGTACTAAAATATAAAAATGTACTTATATGAGATGTCAAAAACATACTATAGGATAAATTTGCTTTAAAAAACTATGGTTTTCCATTAAACCAACAATTTTTGTTTCCAATTTTTGGCAACATCGTCTATTGATTTTAAATTTATTATATCTATAGAGTATAGTGATCTAAATAACAAACAGTAAACCAAATCAATTTTTGTATATTTTTAATAGGCGGCCCAAATTTAAACAATTTATCGATTATATGATCCTAGAAATTTAACAAGTAAAGATGGACATTGTCATTATTTATATTTTGTTCAGAAGTAAATGCCCATAATAGTCAGTAACGTTACTGCCAATAGCGGTCAATGGGGTTTAAAAGGGGCACACGACTAAGCCGTCTTCTCTTAGAAAATATTAGAAGTAAACGAAATTACTTCACAAAACTATAATAAACATAATGCCACGTTCTCGTCAAAAATGTCAAAATTTCAGCATAATAAAATCGTAGTTTTGCTTTGACTGCGTGTGGAATCGTAAGTGTTTTCGGATTTTAGAAAAATGGAGAAAGAGCAATATCGGAATATGGAATCGGCAATATGAAAGGGAAATCGCGAAGCGAAATTAAAGAGCGCTTGGATGCTGTGTACAATGACTCTTCTGCTTCGATAGCGACCGTCAAAAATTGGTTTGACGAGTATCAACGTGGTCGCACGTCGGTTTTAGATGAGCCACATCCAGGTTCCCCGAAAACGGCTACCACGAAGCAGTAGAATTCACAGGGCGAACCTGTTCCGAAGAAGGCTAAGACTGTCACATCGGCCGGAAAGGTGGTGGCCACCGTTTTTAGGGATTCACAAGGGTGTGATTTATATCGACTAACTGAAGAAGGGCAAAACGGTCACAGGGCAGAAAATACGGCCCCATTTGGCGAAGAAAAAAGTGCACTTCCATCATGACAACGGGCCTTCTTTGCAGACCTCGATAAAACGTTTTTTTCAGACGGGTTAAAGAAGTCGGAGCATCGGTGGGTTAAGTGTATCGAGCTAAAAAAAGATTATGTTGAGAAATAAATCGCCACTTTTCCAAAATGTTCTTTTTTTTTGAGGCTAATAACTAAATGGATTACACAGGTATGTATATATAGCCAAAGAATTAAATATCTGCAGTAATGGACCGCAAGAACTAACAAGGAAGAACACTATAGTCGAGCGCCTCGACCATCAGATACCCGTTACTCAGCTAAGGGGAGCCAAAGAGGGATGGAGATATATACGCAGCAAAGAGATATTGTAAAGCGTCACCTAGCCGCTATTTTATATATTTTCACATATGTTGTGGGCGTTGGCGCTTCCTTTTACCTGTTACCTACTTTCCGCCGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATTGTATACTAAGATTTTAATAATTGGTTGTAAGTGCTCTTATCTCAAAAAGTATAAAAACCTGACAGTTGGGACTTAAGGTTTTGCGTATCTTCGTACGCAGAAAAGTTTGTTAAATGCTATTTAAATTTTTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAATCAGAAGTTTGCAACGCAGCGACGAAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTACATATATTTTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCTATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTTCGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTCAAGCTAATAAGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTTTTTGCAGGTAGTATATAAGTTATAGCTCCCATAGGAATTATCGGGGAAAACATTTTAAAAAAATTATATCTTTCGTGTTTTTTAACGTATAAATTTATAAGCTTGGATATAACATTTTTAAGTTAG'..b'CATAAAAAAAATCAACTGGTGTGGGAGAAAAAGTAATGAAAGTGTAAAAGCTAAAATTTGGAGAATTTGATCCATTGGGGCCGGTAGGGATAATTACCCCCCGCTATCAACCAAGTGGTATTCTCAATTAAAACACGCGTTGAATGACGCTGTCAAAATCGGATGCTCCGTTCAAAAGTAATACGCAAAACAAGATTTTCGGGGTATTCTCAAAGTAAAAATTGTATCTTGTTTGTCACCTTGTCAGTTTGTACCAAAACGTTATTTTAGAGTCAGAAAATTTCAGACGACAGACGACAAGAATCATTAGTTCTACCACTTTTGGAAAAACTAGCTAGTTTGGCGAGAAAACAGCTATAAATACCCGTAACATGTGAAGTACTGAAACTACAGGGTTATGCTATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCGAAATACTGTGTACTCTTTTTAAAAACGATTTGTCTAAATACCACCGTTTAAAAATGTTTTCCGACGTTTTTTTTTATTTTTAGATTAATATATTAAACAATAAACCATAATTAATAAATACACTTTCTATATTTCTTACATTCGTCACGCTGTAATTTAATATGCTATTGCTTAGTTGTTTGATTTTAATTAAGCGTGCCGAATGTAAAAAATATAGAAAGTGTATTTATTTAGTAGGTCATATATTACATTTTCGTCGCAGAAGTTGATATCAGAACTTTTGGTTGTGAAAGGTGCGTTCGTCACTATATTTTAAACTCGTTAAGAGGTTTTTTTGTTTGATTGCCATTTTAACATAAAATCTTAAGAACGATCAGCGATTTAGGTTTTAAAAAGGTTTTGTGAAGGTTCCGTTTCGATGCGGTTGGAAAGGCATTTTCGTATTACTCACAAAATACTTAATGTACATATGTATATGAATAAGTTCACATATGAGATAAGTATATGCGTATTTATGTACATATGTATGTATCAATGTATTTTTACGTATAATATTCTTTATACGCTGTACGGTGCCCACCTATTCGGATTCAGATTCGAATTCACGGATACGAAATACAAGTGCACATTCCCGATACCAAAATAAAAGATAAAGACTAGTCGCTACTTGACTCGTTTTTTGTTCAGATGCATACACATACACATGTTCGGATGTGTGTATATACACTTATATCTGCTTTACATATGTATTCCTGTGGTTTTGCTAGAGATGCTGCTGTTTCTGTTTTCGCTTTCCACAGTGGATGTGGCAGATGGCAGAAAGAGAGGAGGATGAGGAGAAGAGAGCGACGAGACAACCAACAAAAATAAGTTTGTTTGCATGTATTTAAGTGGAGAATGTGCGAGTACATGGGCATGTACTCACGTTTCGCTTGACGGTTTGAGCACAGGATAAGTACAGTGGAATTCGCACGCACAGTACGTAGCAGTTACATTTCCGTCGATATCGCGTTTGAAGCACTGCTCCTTAACTGGACTGCCCAGTATATTGCACATTTTGCATAATTTCAATTTCGTATGTACATGCAGACATATGTATGTGCACACATTGTCGTGTGTGCATACATACACACACACACAGCAGAGTAGTTGAGGGGATTGGGAATCGGATTTGGATTGGGCACTCAACACAGCACCGCGCCGTATGGGTTCTCAGTTATATTGGACTGTATTGCACTGGACCGGACTCTGGACATAGCGCAGGAATCAAAACAGAACTCTGGATGAGATTTATGATAATTTTCCACTTTCTGCTCAAGCTCGACCACGAACAGCAACCGACACGAGTAAAGCCGCAAATAGGAATGATAGTGAGAAAAAAAGAAAAGCTCGTCTGAGCTTTTCGACCAGGCGACGTAATGGATGCTATGCGATACGTTGCTTCTTACGTCGTGTAGGTCGGAACAAAACGAAACTGTGAGAAATGCCCTAACGTGTTTAGGTCGGCTCTCCACCTAAATCAACTCATCGTGCCCGGATGGTTTACGACACCAGGGCGATACAATGGCTTAAAATACGTCCGCAGAAAAAGAATTCTTCAGCCAAATGACCAGGCTGTCTCTGTGACCCCACGCAAATTCAACACTGGCTTGCACCAGGCTCACCGCAATGCGTTAAGGTATTTCCAGTAACCTGTTCGTGGGAGAATCCCTCCCGCTCTCTTGTCTCGTCTCTCGATTTTGCAGTATCCGACGGATAAATAAAATGAGCGAGTGTCGATGCCAGTCGTAAGGTGCAGTGTGTGTGTGTGTCGCATTTGTACGTATTTTATTCTTATTTCCACTAGAACTTAAAAAGTGAAAATAATCCGAAATGCAACAACGAGTCAGTTTACGGCAAAAACGCTATCCTGTGGTGCTATGAAAACCTTAATGAAAACATCACACTTTTCGGTCTGCAATGCGCTGTGCAATATGTACACATGGAATGCTTTATTCAATGAATGGTCACTAATCATATTGACAGAGTATTTCCCAAATTAATTACATAAACTCTGTGCTATCTGATAATGACCCCAGGCTATGCTCTTAAGTTTAAGTATAGTAAGCCCACAAAACATATAAATATGTATCCAAATACACAGCTTACGTTTTTTCGAATGTTCATAAATACGCTTCAAAAAATGTAAATGTATGTCTGTGTAAAATAGCATTAACCCGTATTTATGCAAAAACCTTGAACCTTTTATGCCTTGTTAGACGAAGCAGTTGAACAGCTGATACATTTCAAGCTCACACACATAATAACATCACAAATTAATTATACTTTTTTAATATACTGAGCTAAACTAATTTTAACTTCTATTCCATTTGTTTACTCTGGCAAAGAGTTCATTTTACAGTCACATGTTCAAATACACTGGATGAAGCATCATTGTACGTATGTCTGTGCTTTATTCAAGCCTCTTTTTCCAACCGGAAATGTAGCTGAAGTTGTTAGGAAAATTGGTATCAAAGTTACGGATAGGATACATACGTAAAATATGACGAGAAGGAAAAGACTTGATCGTTTGTGTTGCAGCTTCGAAGAACACAGTAGTCGGTCATGGGCTAAATTGGTGATGTTGGTCAATAACACAATAGTCTTCTTGGGACAGTTTTTATACCCGTTACTGGCAGAGCAAAAGGGTATGCTAAGTTCGTAGGAAGGAAGCGTTTCCATTGTATGAATGAAGAAACCGGTATGGTCAATAGCCTCGACTGTTAGATACCCGTTACTCAGCTAAAAGGAGTGCGAATAAAATGGAGAATAGCTTTCAGAAAATTAGATCTTTTCACTAAAACACGTAGCCTATAGCGCCACCAAGCCTTTAGCACCAACTATCGTGCTAGACGGGTTCCAGTGTTATGGCACCCTGCTGAAACGAACTTTGGTTGCGCAAGAAGTTCAAGAAACATTTGCCAATTCCCAAATTTTAAGTTTTTATAGTTTCACAGATCCAAACGTTCAGAAAAAATAAAATTACAAAAACTTACCAATGTCCAACAGAGTGTCTCTAATAAAAGTGAATTCATAACTTCTTATTCTTTTTGTGTCGACATGCAATGTCTTAGGTACTTTTATTAAAACGGTGCGCATTTTATATTAGCCGTTTAGCCGCTTAGCCGCTTTAGGACCATACACAATCCTTGCTCCTTAACTATCATTACCTTTGATTGTTTTTTTTAACACAAACTAACATATTCCCTTCCAATAACAATCCAATCAATATTGTAATTTAAATAATTTATTATTCCGCGGTTGTTCTAAATGTACATTCCAAAGATAAGATTGTTGGTCATCGAAGATATTTTTATATAGCTGTTCTAGGAACTGTCCTGCTATAGAAACCATGCTCGGAGCAGGGAGATGTCTTAACGATTTCTCCCCTTCCTTTAGTAACTTATTTTTGCACCTATTTTTAAGTTGTTTTTCTCTTCTTCGCAAGTTACTACTTTTCCCTTAACAAGGATAAACAAAATGGAAAACATAAATTATTAAATAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/c91/565/c3/scaffold_32-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -ACATTGTATTGTGA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-CCAAGAAGCACTGTTTTAGATATACATATTTCTTGATCTTCAACTTCTCGATTTTCTTAAAAAATAGAAATTATCAAACCTCTTATAATTAAGATAGTTCTTTAAGACAACTGAAGTGTACTTAATCAATTAAAAAGCGAATAACAAATGAACAAATTATACCCTTCGTAATTAAGAATTTAAAATCAAACTGTAACTGTAACTTTAAGCCAGCCTAAAGCCTTAGTAGCTATGGCTGCGTATTCCTGCTGCTTTGGTTTTTAACTTTAAGCAAGCAGTATGTAAATAAATAAATAAATAACATTTTTCTTGAGAGCCAATGATGTGGTAATATCTGCGTTTAAATTTACGGCCACACTGAGTTGAATGCAATCAAAATTGTAAGCATCAAATATAATAAATATTTCACTTCTAAAAATAACAGAAACAAATGTAAAAGATACTGTTGTTCTCAAGGACGAGGAAAATAAGAAGCTACCTAGAATTTGTTGGGTTCATCCGCACTTAGCCCACATCTTAAGAAAGGACGAATTTCAACAGATCTTAGATTTGCAAAAACATAAACCGAATACATTATAAATATATGGTTTCGATTTCTTTTGTCCGTTGTCGCCTTTTGTTTTTAAGAATAGATTGATACAATGGTCGTCCAAATTCATAAGTCTCCAAAAATTTTAACTTGTAGCTAACCCGCCATACGACATTCGAAAACACCTCCCAGCCCTATCCGATACCAAGATAATACTCATCAGCTGGTCTAGTTTGACAGATCGGTGTCAGCTCAAAATATCGCAAACTTGGTTTCCTAGCTCAGGCGAGGCCCTTATCGTTTCTTTTCCGTTTCAAACACTCATCGGAGCAGACGCTTAATTTGGCAAGATAACCTATTGTTCTGTTGGGCATTGGTGCCATTCACTTTGATTGCACCTTAACCAAAGACATCCGCTGCCAAATCAGTAAATTTGGCAAATAAACTTCGTTCTCAGTTTTGGTGGAATCATTACGGTAAATATTTAATTGCTGGCGTTTCAATCGCACAGATTTAAAACTTACTTCCATTCCGCACAGATTGCTGCCTTTCACGGCTAAAAAGGGTCTGGCTATGCCGCCTAGTTGTGTATTAAGTCAATCAAAAGTTATATAACTTCATCAAAAGGTCGCGAGGTAAATTATATTGCTTTGAGCTTTAATATTCGGAGTTCTTGTGATATGGGGTCTGCCGGAACAATATTAAAATTGGCAAAGACATTGGCAGGGAGGGTAACGATTTCGTGTGAGTCAATTGCCATCTTCACCGATCGTTCTGATTTACTTGCCTTATTGCTCTCAATTATTTGTATTAAATTTGACTGATAGTTGTGTTTTCGGCCATGATCGTGTGGTTATTTAGTTTCAGTTAGTGACTCTAAAAATATTCCTAATGTCAGCAACTAACCCCCAATCCCGTAAGAGCTAGTATTGACATGGGTCCCGACCCGCTGAGTTTACTACTGTCTGATCCAGTTGAAATCGGCTTAGAGTAATCTAATTATTCGAAGTTTACTAAACCATTACTTTATATGGACGTTGATCCACTTCGAACAGTACAAACAAGTGTCCCAACGACAACAAGCACTTGCTTGTAGTAGACTACCCTGAGGCCCTCCAGATGTCACGTAGATCAATTTTGAAACAGCATTCTTGAGTCATACCATTCAAGTAACATGAAATCCAAGATAATAGATTACCAGGAAACCCAAGCTGATCTTATTTAAATAAAAAAAGTGAATGGGTAACGGAGTCGAAGGCCTTACTAAAATATGTATACACAATGTCAGTCTGCATTTTTTTCTTAAGCCCATTAATTGCAATAGATGACAATTCAAGAAGGTTGGTGGGGGTCGATCTTTGCTAAACAAAACCATGCTGACACGGTGATATAGGGGAGGGACATAAATGATGCAAATGAGAAGTGATAATACATTCAAATGCTTTGGGAATTGCCGACAATTTAGAAATACCTCTATAATTTTGGGAATCTGCCTTCGCACCTTTTTTATGGAGTGGAATAACAAAAGAGTCCTTCAAGATAGAAGGAAAAACTGATGATGAAATAGACAAATTAAAGAGTTTAAGAATCGGTTTACAAATGGTTGACGCACAAAACTTAAGCACACATCCGTGAAGTCCATCTGAACCGGGAGAACATGTTGGCGATGTTGTTGCTAAATCTCTTAAGAGAGAGCTTTCGGTGATTACAGGGGAAAAAATACAATTTGCCCTATTTAAGGGAATATAGTAGTTAGAATTTGACCAAGCTGTCGAACTATAAGTAGTTTGGAAAAACTCAGCAAATAAATCAGCAATTTCAGAATCCGTCGATGCCTTCATTGAGTTTAGACGTACCGATGCCTTACGCTTGGCATTAACAATGTTGTAAAACTGTTTCGGATCGTTTGAAAATTAAAATTTACATCGATTTAGATACATAGATACAAATATTGTTGAGAACATTAAAATCCGTTCGAGCCACCACATAATTCGAAAAATCTGCTTGTCTACCCGATTTTTTATACTTTTTATAAGTGTTAGATTTAAGGTTTTTAAGTCCTTGAAGCGCATTGGTAAACCAAGGAGGCCTGTTTAGGTTTGAAAGAACCCTATCAGGTGCGGATTTATTAAAAAACGTATTTTAAACACAGAACGACCCTTAGATGGTCCCCAATCAGCCCATATACGTGCATGTTGGTACATTTTTTATTAGTGGAGCCGTAGCTGATCTGATTTTAGCCCCCCTTTTATGTATGGAAAAAATTGGAGTCTGGTCTACTGTTAGGCGATTTTCTAAAAACCTTTGGGTTTTTTGACTTTCTGACAAAAAACTTGAATTAACGCTCATAAGCCTGGCTTTCACGATTTTTAGATAGAAAATTTAAAAAGAGATGGAAGGTCTATGTTCCAAATTCCACCATTCCACTTTCGTTGCTAACAGGCCGATGCTAGCTTGACGTACATTGCTTACAACCAAATGTGTTCCTATATTCGCCCGTCCTAATTCATTGGTAACTTATCGACTCTATTTTGATATATATTTGTATTTTACATATTGTCGTTTACAGTGCAGCCGCAGTCGATATCGCTGTTTTTAAAAACAAATATGCAAATTAATATAATCAAAGCAAATGAAATCCGTTAAGAATAAAACTTACTGAAGAAACTATTGCTTAGTTTTTTACCTTCATTTCAATTTCATGCATTTCGTACCTTGTTAACATCATCCGTTTATCTAAAATGCAAAACAGTGATATTTCTAAAAACTTGAACAACATCGACGAATCGATTCATCGATATTTCCTTTGATATATTTATGCGTCCAGGCCGCAGTCATTTATGTTGTTATCGATACCTAGTATATCAAATGAAAATTTCTTTTGACCGTTTAAAAAGGGTAGTGCTTATTTATAAAACCAAGAAGAAAAGGCATTGAAAATGATTTCCTTGTTGCCCATCAATTAAATGTCCCTAAAGACATTTTTACTAGAGCTATAGAGCCATATTTAATGAACTTATGTTTGAAAATACGCGAATGCCTGAAAATTTGATGTCAGTATCTACAAAGTGATGTGCTACAACATAATATGTCTAAACATGTTTGAAGATAGATTTAGTAGTGATTTTTGTAAATAATACAATGATTTTACACAATACCGAATGAATAATAACAGTTAGCGTCCCTTAAGTTTATGAGCATACAAACACACAATCAATTTGTGTACATGTACATAATAACGTATGTACGTATGAATGTAGCATCAGCGGAAAATGCAGGTATATCGGTATCAATGCAGGTACGTATGTATGTGCCTGCATTGATATACATACGTATGTATATATATCAGTGAGTACTGAATTAGGACCGCATAGAAGCGGGTCCTTGAATTAAACAGACAAATTTCCATCATTGTTAGAAAATGTTTATTAACACAAACTTTTTTTTCTTGAA'..b'ACTTCCGTGTTCTATGTAGTATATAAGCAAACCAACTTTAGAACAAATCAGTTATCCGCACTTATAACTCCGCGGTTCTACTTCCTACTTCTGGGTATTGACCTCGTAACACATCTCAACTAACCTCCGGTAGCTCAAACCTCAAAAGTTTTTGCTACCTTTAGTGATATTCAGAACTGATTAAAAAACCGTATTTCCAAGCGTATGTTAAAAAAAGGACCTTCAAAAAGAGTTTGGATACTCACAAAAAAGGGTCAATGCTTAGGCAGTGTTAGATGCTCAGAACTGGTAAATGTGGCAATTTGTTTTTATTTATAACTTTTACAAGAATGTGTCGTATGCCAAAAGTTGAGGAATCCCTTTCTGGTGCGCTGCGGTCCACGATGATTGTTGTCAGTGGAACTATGTAGGATCGGTTGAAAAAATCGAATCGTCGGTAGTGCTAACAGCTGACCAACCGGCCATGTCTTTTTGTAGGTTACTGCGTTATTCAACAGCTGACCCCAGAAATTATCCATTGTACATGTCGATGGCCAAAGCTGTAACAATTTTACTAGTTCCTTAAACCGAATTGGAAAAATAAATTTTAAATATTTGAACCTTTTTAGTTGACTTTGTGGTCGGCTTGCCGATTTAAGGTAATTTTAAAACTTAAAGGCCCAGTTGGGTATAAAAAAAGTCGGATGATCGACTAAATATTTTTTGATTTTTAAAACTATATCAATCCTTTTTTCAATATTATTCTTGTTTTTATTTTTAGTTAATTCTATGGATACTACTCCAATTGTCAAAACACTTCACTTAAACGGTATATCTTTTCGTCAATTTATATATTTCTCTTATCCTCTAAGTCGAATTAACTGGTTATTGGGGTTGCATGTTTTTATATACTACTATATATTTTATATTAACAAGTTTATTACGACATCTATTGTCAGATGTTTGACTAATTTGTCGAGCTCCTTCGGTGGAGTTACTTGTTTAATATAAGCATTCGCCTAAGTAACAAAGTAAACATGTGATCTAAAAATCAAACCAACCTGTCACGATTGTGGAATATAACTCGAGATTAAATTAGAAGCGGTATTTTTATCTTTTTTGTAATGTCTTAGAAGTAGTTCTATGAATGGTTATCCAGACTTCTTTGTGGACACGATAATCTTCTCACGCAAACACCGTGTCAACCTATATATGTCAATTAAAAAAAAGGATTTTTACTCTCTTCTCTATTCAAAAAGCTGCCTTGATTTAAGGTGCGTTTAGCAGTTAAGACGTTAACCATGTTTTTGTCTTACGTTGAACGTGAGCTGGCAAAGGCCAACCAGAGCAATTGCCTATGCTTTCCTCATAGGACGCTGGCGACCGCTACTTTAAAACAGAATATTTTCCATCACTACTCACAACAAGGTCGCCCACAGCTTTGCTGACGAATATCAAGATTGACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGGAAGCCGAAGTTTGTATTAAGAGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTCAATCTTGATATTCGTTATAAGAAATAAGCAACTTTAGTAACACCATGTACAAATTTTAAAGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTCAAAAAAAATTATTTCATTCTTTTTTTAGATTGAATTCGAAGTTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTATAAGATAATATGTCACAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTACACATAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAAATTAAATTAGGTATAATATTTTATTTATTTTATTCCTAGCCATATCTGTCTGTCCGTATGAACGCTGAGATCTGGGAAATTATAAGAGCTAGAACAGTCAAGCTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCTGAGCAGCGCATGTTTCTTGTTGCTTTAAACCTAAAGCGCCCACTCTAACGCCCACAATTCCCAAAAATCTGTATGATAGAAAAAAATGGTAACTAAAATGTGTTGTCTCATCAATACCTATTGACGCAAAAAAATGTGGCACGACCACTCTATATTATTTTATTATTTTACTGACCTTTTCTTTGACAGCTTTATGTTAGAGTCGTCCGATTTTTATTAATTTTTTTTTCGAAATTCAGAATAAATTAAAAAATGTTATTTTCAAACCTAGATATAAATATAAGATAGAATAAATTTTATATATTATTTTCCGACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTACGATTTTGATAAGATTTAATTCAATATTCAGAATTAATTAAAAAATTTGTAATGTTATAGGAGGTTATTTGTGGAAAACACCAAATATACAATTAAAAAGATTTTTTCGATTATTCCTTTGGGAGCTACATATAAGATATATATGTCCAATCCGTTTGGTTTTGACTTATATACTACCAGCAAAAGAAAGTAGACTTATGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTAAGAGAATAGTTTGCTTAGAAACGGACGGACAGATGGATAGACGGACAGACGGACGGACAGAAGGACATGATTAGATCGACTCGCCAGTGACGCTGATCAAGAATGAATATACTTTATGGGGTCGGAGACGTCTCCTTCACTGCTTTCCAAAAATGTAACTTTAAATCATTTCAATTTCTTTTGTATGACAGTCCTTTCTTTGTATTCATACTCTTTGGGAATAGCTTTTATACATACTTTCCGAGATCACAGCGCTCTTACGGAAATTGGTATTTGCCTCTTAGGGTCTAAGCAACAGCCGCTATTTTCGTTCCGTTCGCGCTCTTGGTCTCGGATTTTTGTTTGGACAGTAACACACAAATCGGTCCCTCAGAGACTGGTCAATACATTTTTTACAAGAAAATCATTAAAAAGAGGGAAAACATGAAAGTGATAGGCCGTTTTTTATATCCTTTCAATGCTATTGCATCATTTTTTATCTGCACGTATATTAAAATTAAAAAAAGTTTACGAAAAATAAAATGTAATGTAATATGTTATAAAAAAATACTTTTTTATTTATATTATTTAATCGGATTACTGGTAATTTTATAAAGCTTCTTATTTTCCATTGTCGTTTTCAGTGACGACACCTCTATTTGGAAATAGTAGGAGTTATGTAGATCCGCATACATATGAAGACCCTAATCAAGCCATAAGGGAATTTGCTCGGGAAATTGATGCAAACTATATTACTATCGAAGCTATTATAGGTAAGTTTTTCTCACAGGTCAAATGATTTTGAATTCATAATAATAAAAATACAAACTTCTTAGGTGGTGGAGAATTTGGAGATGTCTGCCGTGGCCGCTTAAAAATACCTCCCAATTTTGTACAGGACATTGATGTGGCAATAAAAACTTTAAAGCCAGGTAACGTAATTTTTCTAAGCTATAAGGGATACTTCTAGAGCTTTGAAAATAATGCTTTTTATGTCCTAAATGTCAAAAAAACATTATCAAAGAGACACTTCTAGACCGATGAAAAAAATAATTTTATGTCCCAAATGTCCTAAAAATTATTAAAGATGGCTTGAATAGGAGCTTATTAAACAACAAGGTATAAGCAATATTTTTGTTTAAGTAGTCTTTTAAAAAAAAGCTTAAATTAAACTTAAATGATTACAGCTAAAAGGTGTAAAACAAAAATAATTAAAACCAAAACACACAACACCTAGGAATGTTTTTCACAAATCTAATAAATACTTATTTAAACAGGATCTTCGGAAAAAGCGCGCTGTGACTTTTTGACGGAGGCTTCCATTATGGGACAGTTTGATCATCCTAATGTTATTTATCTACAGGGAGTAGTTACACGCTCAAATCCAGTAATGATTATTACAGAGTACATGGAGAACGGTAGCTTAGACACATTTCTTCGTGTGAATGATGGAAAGTTTCAAACCTTACAGCTGATAGTAATGCTTCGAGGTATTGCCAGCGGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATGGCATATTTAAGTGATATGAATTATGTACACAGAGACTTGGCGGCACGAAATGTTCTTGTAAATGCCCAATTAATTTGCAAGATCGCGGACTTCGGTTTGTCACGCGAAATTGAGAACGCCAGTGATGCCTACACAACAAGGGTATGTATAGGAAAAGGGATATTTTGATTTTTTTAAAGTATGTAATTTGTTAGAAATTAAAATTAAAGCAGAATTGAATCATTGGCATGACTGAAACAATTGCCAATTACCTCTTACCTAACCTAGCGATTACTCTTCCAACGCTCTTTATTTCTATATCTTTGCGAGGGTATAACGAGTTTAGCCGCACCGCACTGAAGGACACGTTTACGACCCCATACAATATGTATTTTCTGTCGTCTGTCCGTCTCTAGGTAAACTAGTATTTCAGTTTAAACTTGAAATTAAATGAAACCGTTTTAAAAGTCTTGCTCAGCTAGTTTAGTTGGATTGTACGGTAATTTTAAAATGAAGAAAGTCTATATTTCTTGTCGTATTTTTTCGTGTTTTCACAATATTAACAAATGTTATACAGTCACTAAGATGGTACAAATTTTAAAGTTTGCCGAGTTGGAGAATTCTTGGAGCATTTACAAAATATTATTTTGTAAACTTGTCTTTTTAATATTTCCATCTAATATCCATCTCTCCAGCCAACAATTTTTCAAATCTGAATCTAAAATGTTTCTTATAGATTATATTAGTGATTGTTCAGCCAATCATTTTTAACATTTTCTAATTAGACGTCTTTTTGGATTAAAAAAATTATAAACAAAAAATTTTTTTTCGGGTTTACTCCGATACACGCTATTACTTACTTACCGACTAGTATACGTAAAAAGGTTTCAGGCTAATTCAAAATGTGGCCAACAAAAGGGGGTCGATTTGTAAATGGACATTTGTGAATTTCCTCTTTTGATATATTTCCCATAAAAACCAGTAATTTGTATATTTTTGGTATCCAAAGGGTGGCAAAATTCCAGTGCGTTGGACTGCGCCAGAAGCTATTGCTTTTAGAAAATTTACTTCCGCATCGGATGTATGGTCTTATGGAGTAGTTTTATGGGAGGTCATGTCGTATGGAGAGCGCCCATATTGGAACTGGTCAAATCAGGTAAAAACTAAACCTAACAAAACTAAAGTATTGTACTTAAAATGACTTTATAAATTTTATATAGGACGTGATAAAGAGTATAGAAAAGGGCTATCGTTTACCAGCTCCGATGGACTGTCCAGAAGCCCTCTACCAGCTAATGTTAGATTGCTGGCAAAAGCAACGTACTCATCGACCCACATTTGCTAGCATCGTTTCAACTCTCGATAACTTGGCAAGACAACCGCAGTCATTATTGACTACTCGAAACTCACCGGAATCAGACGGTACTCATGTTTTAGATACGCAGCGTGGTCAAAATATTTTCATAAGCACCGACCTTTGGTTGGAGAACATTAAAATGTCAAGATATTGTCAGCATTTTAAAGAGGCTAATTTAATTAATGCTCAACAGGTAAGATAATCAAATTAAAATCTGCTCGGAAAAGTTACTTATTTAAATATGTAAATGCAGATTTCTAGGTTAACAGCTCAACAATTGTCGGATATGGGAATTACTTTGGTGGGTCATCAAAAAAAGATTTTACACCAAGCCCGCCAACTGGACACTATAATATAATCGTTTTATTTTGACTTAGTAGTCTATGATGTACATATAAATAATATGATATATATTATATACACTTCATATATATATATAAAAAGAACAAATAACACGTGTGAAATACAAAAACACAAGAACACATTAAATAGTTTAAGATTTTTATAGGTTCTTTTAACTAGAACTTTAGAATATATGATAGAGAAAAGTATTGATTTGCGTCGCTTATACAAAAAGCTTACTTTATTTATGAGTATCAATGGTTTATCATACAGTTTTCAGGCTTAATATATATGTATATCGTCGCTTTTAATTGCTCAGCTATTTTTTTAAGTTTTTTGTTGTGATATAAGTGACATAAACAAAATTATTAATTTTAACTAAACTTTAATTCATTGCTTATTTTGCATATAACATTAAAAACTCAATAAAAGTACATTCGTGCGTACGGTACGGTTTTCCGACCTAATGATTAGAATTATAACTATTTTTTTTACTAAAAGCTGTACAATTATGGTGGGCCGAAGATTAAGAGCTAATTAGTTTTTAGGACTCTGTCTTATAATTACACAAACTATACTTCCGATTTAAAGGGGATATTTTTGGATAATTGTGTGTAGAAATTATTCCCATCTTCTTCCCTTCATTTTCATCTCGATGTGTCACTCTTAATTTTGTTAAACATTTTTCTTTAAACTATATACAACTAAAGAAGCTAATCTTTGGTGAAGCTTAAATCACCAAGACATAAAAAATCGAGTTTTTAAAACATATATTTTGAAACAATTAACTATAGAACTAAATAATTTGAACTCCAAATTATATAAAGATGTTGAAAATTTAAAAAAAATTATTTTTAGGACTAAAATGAAAGGGTACAACAGTATTTTAATCAATAATTCATTAAAATAATAAAGGATGCATGTTTATAGTAAATAGTGGCAGTATAAATGATTATGCAAACACAAGACAAGTCGCAAAGCAAATAACCGTAGATGGATATAAAGCTGTAGATATTGATACACATCGGGCCAAGTCCAAGAAGAAGTGGTCCAGGGCTATATTGCTGGTATTGATATTGAAATAAATTTTGGCCCAGTAATGATATTAGTTTCACCGTTTTACAAATTAAAATTTCTGATGTTTTTATAACTAAAATTTGTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGATGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCCTGATCAGCATCACTAGACGAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGTTATCGGCCTGAAACTTTCCGAAAAGTTTTCTTTCTTTTGCAAGTAATATATATGTACATAAGTCGGAACCAGTCGGATCGGACAGATATGTCTTATAGTAAAAATTATATCTTTTGTGTTTTTTAATATATATTTCAATACGCTTGGAAATAACACTGTGTAATTACTTTTGAATTTTTAATAAAATTTATTGAAATCGGATGATTTTTCTATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTGGAAAATAATATGAAACAAGAAAGGAAGTTAGCTTCAAGCTGAGGTTTGTATACCATTACAGTTTTAAGAAATAGTCAACGTTGGTATCACCGTGTAACATTTTTTAAGGTTTTTGGCATCTATATGTTAGAGTAATAGAGTATGTAAAAATATAAAAAATTATATTTCCAATATTATAACATAATATGTCAAAGAGCCACAAAGCTATAATTTGTTTAATATTATTTTCCCACCAATTTCCCGATCGTAACTATGACAGCTATATGATATAGTCATCCGGTTCTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTGAAAAATGTTATTTCCAAACTTAGAAAGTAATACGTTAAAAAAACACCTAAGATATCATTTTTTCATATTTCCAGATTTAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTGAATTCAAAACCAATTAAAAAATGTTATATTCTAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGAGATATATATTTTTAAATTTTTTCCTCAATAGTTCCTATAGGTGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCTCGATATCTTTAAAACTAAGAGACCAGCTTGCTTATGAAAAGGACGGACAGACGGACATGGCTAGACCGACACGTCTAATGATGCAGATCAAGAATATATATATCTTATGAGGTCGAAAACGTCTCATTCACTACGTTGCAAATTTGTCTAAAAGCATATTACCCTCAGAAAGGGTAT'..b'AAATGTATTTGTCTCGGCAATACCTATCGATTGACCGCCTAAAACCGTGGTGCCCACAGTTGACATGCTAGAAATTTATTTTTTTCAAAAAAATTTCGTCTTATAAATACCTTTAGATTGACCCAAAAAATGTACAACGCCAACTTTAACGCCCACAAACCGCCCAAAACTGTGTTGGCCACAGTTCTCATGCCAATTTTTTTTTTTAGAATTTACACTTGGCCTAACTTAACACGGGAGTTACGTTCCTAGAAATGCACGTGCTAAGCAAAATCGTGTTACTTTCTTAAAATTCAAAATTGGCAGAAAACAAAAATCTGGTCTGTTTTTATCAAAGTTTTATACACTTTTTCAAAATAAATAGTTTGTATGTATATGCCTTTAATAAAGGGAAAGCATTCATATTTTCAAATTTAAGAGTTGATTTTAAATTATAAAAGCTGAATTATGTTGTTTAAAATATGCATTTACTTTTTGATTTAATCAAGCTGTATCACCTTTTTAATTACAACAAAATCGTCGACTTTTTTTTACGCATCGGCAAAGCTTACGATTTTTGCACGTACTAAAACACGCTTACATCTGACAGAACAAATGCGAATGACACAAGCACAATGGCACTAGCCCGTTAATTGACCAGAAAAAAATATATATATCGATATCATGCAATCGTGTAAGACTCTAACGCCCCCGAACGGCTAAAACGCTTAAAACTGACTGCCGCCCACATAATTTATACATATAAATAGCCACTAGGTGGCGCATTACAATATTTCTTTGCTGCTTATTTATCTCCATTTTAGTTTTGCTCCCTCAAGCTGAGTAATGGGCATCTGATAGTCGAGGCACTCGACTATAGCGTTTTCCCCTTTTTTTTCGATTAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGTTATAATCGTCCTATTTTTATTAAATTTATGTCGAAATTCAGAACTAATTAACAACTTTTTTTCAAGCGTAGGAGGTTATACGTCAAAAAACACCAAAGATATATTTTTTTCATAATATTTTCCAACCAATTTTCTGATCGTTCCTAAGGCAGCTAGATGATATAGTCGCCCGATTTCGATAATATTAAATTCGAAAATGAGATCTAATCAATAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGATGTTATATGTTGAAAAACACAAAAGATATAAGTTTCCAAACAATTTTTTCGGATTATTCCTGTGGATGGAGACTGATATGCTAATACCGCCTTCAAGGGTATAGCAAGAGAAAACGCTTTAGTCGATGGCATCGACTATTAGATAACCGTTAATCAGCTAAACGGATAAACGGAGGGATGAAGAAATGCTTCACTCACACAACTTCTAAATGAATCGTCTGACTTATAGATTTTTGTCATGTAGACCGGTTTTGATAATAAAAACATTTAAATTTTTTCAATATATTTACAAATTTGTGCTAGACGGCTTGTAGTGTTATGGTCGTTTTTAGGCTTTAGAGTGGGCGTGGCTCCCTGCTAAAACAAACTTGCGCTGCACTGGAAACCAATATATAGTGTTTAGGTACTTATTAGGGATATATTTCAGGGATTTTGATTATGTTGCTGTTTAAGAGACATAATTTGGAGAATCACATAAACTTTCAATTTTTGTGGTCTAAAACTTTTACAAAGTGCCTGAGGGCAGTAAATTTAAATCATCAAAAAAAATGTGTTACCTGCATAATGAGGGTTGATGCTATCTAGTTCACTTGTGAAGTGTTCCACAGAAGTCCTCAACTATAGGGAGCGTCATTTGTAGACTAAAATCTCGAAATTCGTTGGAAAATCTACCGTTCTGGCCGACCGAAACCACTCAGCACAGGAGAAGGGAGTTTTGGAAGAAAAAGGGAAACCCGATATTTATCGGTCCCAAAAATTAATCCCGCCCGCTCGACATTCCTATAACCACCGTTTCCACAAAAACTATCTGGAGGGTACGTAAAAGCCATTTTCTGTATGGGAGATACTCTAGGAAGAAAGCCATTACTTTCGGCTATTAACATTTCGAAGCGAATTTCCCTTTTCAAATCGTACTCAGACCCCGTTTTTGATTACTAGAAACACGAAGTTTTTATTGATAAGAGCAAACTTAACCTTTTCCGGTCTGATGGAGAAAGAAGAGTTTGCCTTATGCCATGTGAGGATCTCAAGAAAAGAAATGGTAGTCCGACAGTGAAGCTTGGCGGATGTCCGGAAAAATTATGATTGTCGAAATTTACCTAGGAAAATTAAGTGTCTAGTCTTGAAAAGGAGAACTGTTGTCCAGCATAGCATAATGTCAAGTATCTCGAAACTCCTGCTCAGAATCCTGACGTCAACTCCTTAGAAAACCTTTGGAGTCATTTGAAGCTTTAATGTGAAGCTTTAAGGTAATCTTATTTGCTCTGTTTAATCATCTTTGGGCTTAATTGTAACCTCAGTGTTCATATGAACAGATAGACATTGTATATAGACTAGATATACAATTAATACGGGTTTCCTTTCACCTGTTAAAAATACATCATACCCTTTTTGTCTTCATCTAATGAACATAAACAACACATAGATCCTGGGTGAACACCAAGGTAATGTTTTCGCAACATTATGAAGGTGAGCCTTATTCGGATATCTCACTTAAATTTATATTTGTATTATTGTTCTTTTCAGTTGGTTAAAATTGAACAGCTCCCCGAACGCGGATCATGGTCATCCAAAATGGATTTCATACTATCTGTAGTAGGTCTAGCAATTGGCTTGGGAAATGTTTGGCGATTTCCTTATTTGTGCTATAAAAATGGAGGAGGCGCATTTATATTACCGTACATCATAACGTTGTTCCTAGCTGGAATTCCAATGTTTTTTATGGAGTTAGCTCTTGGTCAAATGTTGACAATTGGTGGTCTTGGTGTATTTAAAATTGCACCCATATTTAAAGGTAAGGCCTTTTTCATATTGTAAGTTTGTTGTATAAGACAGCATAAATTGTTTCATATTTAAACTCAAAATATATTTCCACTTGCCTGCAAATCGATATATGAGGCGTTCCTTAGCATTATTTTTGAATTAACGAAATACTTTTAGTTACAATTTGAATTACACTCGTTACAAGAAAGCGGTTCCTATTATATTTAGTATAAAATATATAATCGGCATTCACTTTATCAGGCTCTGAGACAACCCAGGCTCATTTCAACGGAGTGACACTCTAATGCCCACACGCCCGCTCTAAAGGCAGTCTAGCGCCCACAAGATTTTGTAAAAGGGCAAATGCAAATTCAATTTCTATCTTCATTCTAAAAGCGATAAAAACTGGACCATCCATCAGGATCCGACAACAATATATTAAAGCTCCCTCAGGAATAATCGGAAGAACATTTTTTTTTATTAAATCTTTGGTGTTTTTACACCGTTGCAGAGGGTATTATGGTAATCAGCCATTAAGATATATATATACAATATATATTTTTGATCAGCACCAACAAAAACAACAAAATTTTCAATATTTTTAAAAATTTTGAATTAAATTTAATAAAAATCGGAGGTATCTCCCATATAGGTTTTAAAGAATCATTCAGAGAAATAACGAAACAATTGTTTAAAAAAAAAGTATTTTTAGTATCACTGAAGCTAACAACAATTCTTAATTTAAAATAGTGTTACTAATAATGATTATTCTTAGACCTGCAAGGGTATACAAACGTTGGCTGGCTGAAGTAAACTTCCTTTCTTGTTTTAAAATATTTCACTCATACCGAATTTTATTTTACAATTATCTCAAGTGATACTTTGTAAACACAAGCCATTATCACTAAGTATGTAAAGTGCTTATTTTAATTATTTTTAACATTATGTATAATAGGAATTGGATATGCTGCTGCCGTTATGTCTTGTTGGATGAATGTCTACTATATAGTCATTCTGGCTTGGGCAGTGTTTTATTTTTTCATGTCGATGAGAGCT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ce7/8a1/da/scaffold_36-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -GGTAAGTAACTTTTTTTAGTCTTTTTGTAATATAAATCGAATGATTTTTTCAGATGTACCTTGGAGAACGTGTAACAATTGGTGGAATACAGTCAGCTGTGTCAATCAATATGAAAGGAAAAATTTAAATTGTTGGGACACGATAATTAATGGCACCTCGAAAAGGATATGTTCCGTGTCTGCAGTAAACATTACTTCTTCAGAACTTACAGACCCAGTAAAAGAATTTTGGGAGTAAGCAATATACATGCAGCATGCATTCATTCATCATTTTATTGCTTCATTGAACTTTTTCGTTAAAGGCGTCGTGCACTACAAATTTCACAAGGAATTGAGGAGATTGGAAATATTCGCTGGGAATTGGCTGGAACTTTATTACTTGTGTGGATCCTCTGCTACTTTTGCATTTGGAAAGGAGTAAAATGGACTGGGAAAGTCGTCTATTTCACTGCTTTATTTCCTTATGTTCTTCTGACCGTTCTGCTAGTTCGTGGAATCACCTTACCCGGTGCTTTGGAAGGCATAAAATTTTATATTATTCCAAACTTTTCAAAGTTGTCTAACTCCGAGGTTTGTAAGCAAATTTATAATTATAATTTATAACTTTTTAATAAGTTTAAGATCATCGTATTTATCTTAAAAAAGTTATACAAAACAAGAGCAATCGCTTTAGTCGACATCATCGACTATTAAATACCCATTACCGAGCCAAGAAGCGACTGTTCACTATTTCACACCCTAACGGCGAATACTTCACTTGCTAATAACATTTTATGAATACAAGAAACTTTAGTTCTACCTATTACTTTCTACTTTTGGAAAGACTCGGTGGATTGGCGAAAAAGCAGCTATAAATTGCTATAATCTTATTACCGTAAGTGCCTCAATCTTGTGAAATATGTCGTTAGAAAGGTGTTTTGCAATATTATTTTCGGCTATCTAACATGATTTGTCCTTTTACCACCCTTAAAAAAGTAAGATCAAAAGCTATTTTGATTCAGATTTTGTAAGCTTTTTTTTCTTAAAAACGGTTCTAACGATTTCAGGTTAAACTTTTACTATGTTAACAAAAAATAGCAACATTTACCAGTCCAGAACACCTAACATTATATTTTAGGGTCTTGGAAGCATTTAATCAATCATAGTATTCATATACTTTCCCAAAAGTCCTACATTTTAAGCTACTGTATAGCTATTATATAACATAATGAAGGAAGCGTTTCCGAACGTATAAAGTAGTGGAATTTGTTTTCGTTCGCAAAGTTGCGGTGGCAACTGATATCGTTTTTACCAACGACATTTTAATTAAAAAATTAGTTCTTTATAACGTTATTGTCAAAAACATAACATAACTTTTAGTAGTATGGAAGTTAGATAGTATGGCCGTTAGCACCATTCCTTAAGTAACAACGTACATATGTTAACACATTTACTGCGAAGCTCAGTATGAAACCAAAAATGAAGTTTATTTACTCTTTTACAGAAACCGTGTAAACCAGATTTGTGTATAATTGGTGTGTTTTCACTGGACAGTGATCCTGAAGAAAATGTAGTATATACTTTATATACCAGCTAATTGGTATAGTCCGATTAAATAACGAAATGTAATTCAAATTTAAAAAAAACTATGAACTAGAATTTGTTGCTTTTATTTATTTATTAATTTATTTTTATTCGTCCTCATTTTATTAATATAATGAAATGTTTGTCCAAATTTTTTTCAGGTCTGGATTGATGCTGTTACGCAGATATTTTTCTCATATGGCCTTGGGTTAGGTACCCTAGTAGCATTAGGAAGTTACAACAAGTTTACCAATAACGTTTATAAGTACGTTACTAAGCGCAATAATAGGGGCCTATTAAAATGTCGTTATAATTCCATTATTTTCAGGGACGCGCTTATTGTCTGCACAGTTAATTCTAGCACCAGTATGTTTGCTGGATTCGTAATATTTTCTGTAATAGGATTTATGGCTCACGAACAGCAGAGACCAGTAGCTGAGGTAGCAGCATCAGGACCTGGACTGGCGTTTCTTGTTTATCCTTCGGCGGTTCTGCAGCTGCCAGGTTCTCCAATGTGGTCTTGTCTCTTTTTCTTTATGCTGTTGCTCATCGGATTGGATTCGCAATTTTGTACAATGGAGGGGTTCATCACTGCGATTATTGATGAATGGCCACAGCTGCTGCGGAAACGCAAAGAAATTTTTATTGCTATTGTATGCGCACTTAGCTATTTAGTTGGCTTAACCTGTATTACACAAGTAGGTTTTAAAATAAGTTTGGTTGCCTCTCCGATTTTATTGGGTATAATAATTTTTTTAGGGCGGCATGTATATATTTCAAATTTTGGATTCGTATGCAGTTAGCGGCTTCTGCTTACTGTGGCTCATATTCTTTGAGTGCGTCTCAATATCTTGGTGCTACGGAGTTGATCGATTTTATGATGGAATAAAGGATATGATCGGATACTATCCCACAGTTTGGTGGAAATTCTGTTGGTGTGTTACCACCCCTGCTATATGCTTGGTAAGAATTTTATAATTAAAATAACATATATTTTTTAGTAATGTATTTTTATTTGTATAGGGCGTCTTCTTCTTTAACATAGTTCAGTGGACCCCAATTAAATATTTGGAGTATAGTTACCCATGGTGGGCGCACGCTTTTGGTTGGTTTACGGCTTTGTCATCCATGCTATATATACCAATATATATGTTCTGGCTGTGGAAACGAACTCCTGGTGACTTGAGTGAGGTACCCTAATCTAAAATTTTTCACTTTACAAAAACTTGAAATTTTATTATAATTTTTTTTAGAAAATCCGTGCTATAGTTAGGATAGAGGAGGATGTAACTCGGTTACGCGAGAAAATGCAGAGAGAAGCTTATGCAAAGGAGATTGACTTCAATTCTTTATAGACGTATTTAAGTTATAAAATCGTACGTTTTAAGGCACTTTTTGTTAACACGTTCATTCAGCTAAATTTGAAATCATTCACAGCATCGACCACTCAATTAACAACGTTAGATCTTTTATTCGATTTTCCTGTCTTAATTCTAATCCTTGCAATAAACTTTGTAGTAATTTAATATTTTAAATAATTTATCTTTTTCAACACAAACGTTAGTCTAAATATTCAAACAAAACAAAATGAATCTACCTTGTTAACAATTATTGAAGTGTTTATATGGTACTTACTCAAGAGTAGTATGCTATCTAAAGTGATTAGAACCTTAAATTTCTTTAAATTCGGCTTCATTAGCAAAAGTGAGTACAGTGCAGGATTTTAAAATCAAATTTTCCATTCTTGCTTAGAAAATGAATTAATATGTTCTTGGCCTGCCAGTGCCAAGTTCTCATCCATTAGTTTAGGTTACTTGATATAATATATACAAAAAGAAATTATACTTTATATAGCAGATGTAAAAATTAAAGCCGAGACACAGAAACATTCACATAAGAAGAAATAGATAAATTCTCTGCCGTTCTAAAAGTCATTTGTCACTTATAATTCATAAGCTGAATAACCCCCTAGTCCCCAGGGCTGGCACTAATTTAACATGAAAGTTAAATAACTATACATTGGTTTCAAAATTGATACCGTAAAAGAAAATATTATGCAATATAGTATTGTTTAGAATTAAGAAATGGTATCCCACAATGAAATCGCATTCATGTAAAATAAGATTGTCGTATTTATATATACATTTGTTTTAATGTCCTGATGATGCTTCAGATATTGTTATGTAATTTACCTTTAAAATGTTTATATGTTGCTTAACGTATTAAATAAATCGAGTACTCACATAATATTATGCTACCTTTATGTAATATATATGTAAACGATCGGGATTTTTTTTAATTATAGCTTTCGTGTTTTTGACATAATAACTGCTACTATTGGGAATATCATTCTTTCTATATTTCATATAAAATTAAAAAAAATAGGACGACTATAACATTTAGCTCCCATATGATAATTAATGTACAAATAATACAAATTCATTTCTATTTCGTTTTCGGCAAAGTGGACATTATCTTAATATTTCTATTCTATATGACGACCTGCAAGGATTTTAAAACTATGGCTTGCGATGTTACGAACGTGGCTATATCAACTCGGCTTATGAGCCTAATCAAGCAAATATGTATATACTTTTCAAAGTGGGAATTTAGGAGGAAAATGCATTTGAAGTACTCCATTAGCCTAAAAGTAATTAAAAAGTTATTAAAGTCTTTAAAATTAAACTATTATTAGGTAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCTGAAGCTTGTCTACTCTTGCAGTTATAAGAAATAATCATGTTAGTAACACCATGTTAAATTTTTAATAATTGTTGATAACTTCAGTGATATTGAAAAAAAAAGATTTTAATACCTTTCATATTATTTCTTTGACCGTTTCTGTGATAGCTATTTGTTAGGGTCATTGGACTTTTATTAAATTTAATTTGAAGTTCTTAAACACCCAAAAATGATATTCTCAATAGTATAGGTTAATATGTCAAAAGATACCAATGTTTCTGTGCCAGCTTAAATCTTTGGTGTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCATAAAGTATATACATTCTTGTTCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCAAAGTCTTCATTCTATTGCAGGTAGTATTTAAGTCGGAACCAGCCGGATAGGACACCTATATCTTATAGCTCCCTTAGGAACTATCGGAGAAAAAATTAAAAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTCTTAACATATACCTTTCTAAGCTTGGATATTAACATTTTTAAATTAGTTCTTAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACAATCGGAAAATTAATGGAAAAATAATATTGAAAAAAAAAAACTTCGGTGTTTTTTTTCTTATAACTTCATTCGCTGGGAAATAACATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATCCCTCAAGAACAAGACACTACAAGTCGGTTTATTCGTCCGACAAAATATAACTCTGGTGTGACCTGCTACCAGAGGATGACGATTTGGAAGAGTCCACCACAAGAATTCTGCGAGGACGCAGAGAATTGTCAGAAAAGGCCGACTGTGAACGGCGCCTAATTTACTATATACTAATGCGTACTAGAATAGTGTCGATAAGTTCATTTTGGTAGTGTTATTAGACTCTGTAGTTATAAATGTGAATAGAACAATTAAAGTTACAGTATGATATCTAAAATATATTCAACATCATAATCCTAAATAAAACCTACACCACTGGTAAAGGTACCCCTTCCCACAAGTCAACGAGTGTCAAAGTCCCTTAGCGTGCAAATTAGTTTAGTAGAAAAGACCTTAATGCCGAAACTCATAAAAGGACTAAAAACATAAGACCATGGCTCCCTACTCTGTAGTGAGGTTTCCAAAAGAAATTGATAATAAAATGAATTGGCTAATCGCAGGACTTTTCAAAGTTCAAACACAGCAGCTTGATGAATCCTGTGTACGACAAGAAAAGAGGTTAGCTTTGGAAAGATTTAGTTTGTTTACCCTTGCAGTTATAAGCAATTATCACTTTCACCAATTTACCGATCGTTGCAGAGAGCCTGTCACCGAACTGCTAGTACTTGTTAATAAACTGATACATGCACTCCATACTTACTCGCTTATTAAAGTAATTAAAATTTGTACATTTACCATTTCAGTTTGCGTCGATCAATCAACTTAATTGTTATAAAACGTTGAGTATAAAAAGAAGGCAGAAACAATTAAGATTGCATTTTTTTAGGTGATTAATCATTTTTATAACAATTGAACAAAGAACAATTTTATAGCTTTAAGACTACATTTAGTTTTCTAGGCAAACTAGCTAGTTTTTTCCAAAGTTGGTCGATATAATGTTTTTATATTAGCCATTTAACATAGCCTAAAATTTCTAGGATCCTAAATCATAATTTTGGGACAAACGAACAAACAGAATTAATTTTTCATTTTGAGAAGTCTCCCAAAATCTCGTTTTGCGTATTACTTCTTAACGGAGCATCCGATTTGCCAGTTGAGGTGTCATTTGACCCGTATTTTAAGTGAGAATACAACTAGCAAATGTTCACTTTTACATTTTCAACACTCTTTCTCCCATCAAAAATTGGTTTTCTTTAAGTCTTGGAATACAATCCTGTTAGTTTTTGCAATACCTTTTGATTGATGAATGACTCGTAACCATCGGACAATTCCTGTAGATTTTAATGTTTTTGTGTATATATTGTAGTCGCCTTCGAACTGCCATCCTCAGTGATAGCAATTTGCTTGCGGGAGGGGATCTTATTGCGATGCTTAGGTGAAAGTATAGCATCGATTTGATAATGACAGCAGCACCGATACGATTTCTATCAGCTGCGTGGTTTGCTCACTAAACTGCATATCAATGGATTCCGAAGAAAGAAAAGAAAAATGCAAAATATCAATGTGAAATATCAATAAGAACTTGCCAACTAAATTTTTCGCGTTCCAAATTATAATATTTAACGTGTCCCAATCGCAGTCAACGCTATGGTGATGGCGTGCTTAGACATCACGATTTGTAGCATTTGGTAACACTGACATTAATTGATCATAGAGTGCCAGAAGCCGTCTAGGCATCATCTTAAATCGAAGCAATTCTTAAGAACAGTAAAGTGCATGCCCAGCAAATAATAATAAAATTTCACTGTAACCACTGCCATTTGCATTTGTAAGTAATTCAATAGGATAATTTGGGTCAAAAATAACAAGGACTGGTTCATCGGTAAGTATCAAAATAATTTGTTTCCGTATCTGTTCAAGTTCTGCTTTCCAAATAAATTTATATTTGTCTGAAGTTAAAAAATATATCGGTTTCAGCTGTGAAAGGCCCTTTATAAACTGCCGGAAGTACGATGCTAATCAAATAAATTGTCTAACTGCTGTTAGAGACTGTGGAGGGAGAAGGGCAGTGAACGCTACATTTTTCTGGGAGTTTGGACGAATTTCACCAGCACTAACACTGTAGCCTAGATATTGAACCGATGTTTTCAGAAATAAACACTTTGTAATGTGGAATGAGAATCCAGCGTCTGTCAAAACATTTAAAACAATCCTTAATCTTTCAAAAGCGTCGCATTGTGTTGAGTTAGTTATCATGATATAGACGATAACATAAGAATTTGATAAATCTCCTAGCGCCTGCATTACTAAGCGTTGAAAAACAGAAGGCTCGTTTTTAAGCCCAAAGGGCATAGACAGAAAATCATATTGGCCATCTGGCGTTACAAATGAATTTAATAGTATCCACTGGCCATATCTTAACAGGTAAAATAGTTGACTCTTTTAAGTCTATTTATTTGATCCTGTATGAGTGGGAGCGGGTATTTATCAGCGACTGTGTTTTATTTTAGCGCTCTATAGTCAACACAGAGTCTATCCGAACCATTTTTCTTTTTTACCAACAATGTGGGGCTAGCATAAGGTGAACAGCTTGGTTTATTATATTACACCTCAACAGCACCTCAATTTTCTCTCGAACTAAATCTCGCTTGCAAGGACTTAATCGATATCGCATTCTTTGAACTGTTTTTCTTGGATCAATCAATCTAATTTTCATTTCGCCAACTCTAACCTTAATCCATGAAATGCCGTTTGTAAAACAATTTGAGTACTTTGCCAACAATAAATTAAGTTTTATTTTATTTTCTCCGTCAAAGTCTGTATCAATATCGGCTGGCTCAGAACCGACACACAAATTAATTATTTTGGCTCTCGAAATTATAAATTTGTTTGATGAAATGACAATATCAAAACCCTGCTTAAGTATTTCACGCCAAATGACGATATCGTCTTGCATGTGATCATAGCCTATTACATAAAACCAAATCTCAAGAAAATGGTCATCAACCATTACTGCCTTTGCCTTTAATTTAATTATTGAATCTTTTACCATAAAACTGAGTTTTTCCCGATTTGAACGTCTTTTTCCTATCCGCTTCCTTCTTTGTTCATTGGGTAGATACTTGTTAATGTCTCCGCACTTGTAGCAAGTTATGTATGTTATGTAAAATGACGCTCTATCGAAGATTGCTTTTGCCGTTTTGGATAAACATCATATTAATGCTGCACAAAACCACTTTTCCTTTTATTAAGTGTGAACGCTTTTAATACGGACTGTAGATCGCCTCTGGTTTGAATATTTGAAGTGAAACTCAAACGCTGCACACGGTTATCAAAGCTTGCCAGCATTGCGAGAGTCACGGGCACAGCAATTTCTTCTTTTTACATTTCGCGCCACTTCGTCGTTAGTTTTCTAACCATGCGGCTTACGTGCAGTGCGAGACAGACGTTGACGCCTCGCTATTACGGCTCCTCTCAAAAGGGACAAGACATAATCATTTCAGGTGCTGTGTGTCGCGCAGTTTTGTGGCGTCGCACAGGGAAAGAGGATGACATAGGATGATGAAGTAATTCGAGCTTCTAGGAAACACAATCAGTCCAAGAAACTTGCAGTCCTTATACACTGAGATATACCATTCGACAAATACAATCGGTTGGCTTGACACTAGAGTCGATACTGCGAGTCAGTTTACCGGCGAGATGTTAAGTGACTTAGTCGGACGCCAAGCACATTAATACAGTTTTTGTTTAATAATTCCCTAAGAAAATATTGAAAGAACTATTTTCAAATTTACCAAACTATGCAAATTAAATTGTTTTCAAGAATCTTAGTCGTTACACCAAAGCAGTAAGTTGCATAAAAAATGAGTGCCCTCGTTAAAAATTGAGCTTTTTAAAGATTTTCGGCAGAATACCTTTAAATACTTATAGTGTTGCAACCTTATATGCAACAACCCTTAAGTAACATTTTTGTGTTTGTTTTGACGTATTCAATCACGTTAAAATTACAAAAATAAAGCTTACCAATTTTTTTTGCGTG'..b'TAGGTAAGCCGAGTAAGGCGAGTAATGCTTTGGACATTTTTAAACTATGTCCTTTCCAGATTATTAATTTTGCTGAGTTAGATCCTTAAATATCAACCTTCCCCTAAATACTTATACATGAATTGCACGTGGTAGTATTGCCTTTTAAGAAGATATTTGTGAGTATGTCTAAAAATAAGTTGCTTTAAAAAACATAAAATCTAACTATTTACAGTAGCAAACGAAGACATATATAAACAATAAACAAATAACTTTCTTTTCGTCATATATACAATTTGCATATATAAATTTTTAACGGTCTACTCCTATAATGGGTGTCAATTGATGCATATTTAGTTAAGGGGAACAAAGTAAAGTCTCGTCGATGTCAGGGTGCGAGTGTAAACGAGTATTAATTTAGAAAAATTTAACCAAAAATTCAATTATAAAAGATGACTGTGTTTTTTGTATAACGAAAGAATGTCTAGCTGCCAATACATTAAATGATGTACAATTCTTACCGGTACTGAAATCTGGTCGTTTGTTGAGTTTGCGCGTGAGTTTTCAATTGCAGTTAATGATGTTTATGACATAGGTCATACGTACAAAGATTATTGTTTATTTTGTATGTTTATATTTATATATTTTATCAATATTATTTTATAGTTATATAATTGGATATTATAATAATTTTTATAGGTTATAGGTTGATTCAATCGGGAATGGATTAGCAATTAGCATATTGAAAGGACGAAAAATATTAAATAATGTTAGAATGTTTTGCATTATACCTTGCAAGTCGCTCAAATAAACATTTTGTGGATTGTGTACTGCAGCATATATATATTTACAATAAAAAAACTCTTTACTCTCTGCAATAAAAACAAATATGTAGTCTACTCCCCAGTGTAATATTAATTATTAATAAAAAGTTATAATAAAACCATAATAAAACCAACTACAACCGCCTTTACGAGTTTTTATCTTTGATGGACAGCGAATTCTTAATAATTTTGTTCCTTAAAGTGTCGTGTTTTTATTCAAAAATACTGTAAAAATACAGATACAATAAAGCAATGCAGCAAAAGTGCATTTTTTACGGGTTGTTTTAAGATTTTTTTATTAAACACTGAAGCTTGACACAGTGAATACGGTGAGGTATGAAGGCTTGAGGGAACTTCGGTAGCATTCTTAAGTAAAAGTTCGCCTTGAAATGTTTTTTATTTCAATTAAGATTCATGAAAAGCCTCAGTTAATTTACTAATATATATAATCTTCAAAGCTTTTTAGAATTTATTTATATTGTACAGAAGTTCACTACATACATCATGTCAGTAAAATTGAGTGTTTGGTAGGCAGCGTAGCTTTGCTAGAAGTCTTACATTTACGCACACAAGTACAAAACTTATATTTCATTGTATGAGTGTGGGCACCACTGCATGTAAATGTTTGACCTATAAATGTTCATGCTAGACTTAAGGGACGATTGCTTTTTTTATGGTCAGTGCTATGAGGCCTGTATTCTGGCACCAATGAAAAATCCGAAAGTCTTGGAGTGTTAAAACTACTATCAACAATGTCAAATATTCAAAAATCATGCTAGTTGAATGCTTCGTTTCATAGAAAACTGACACTTAAATCAATCGACGAATGTTTTAAAAGGAATTAGTGCAAATATGAATTAATTAGCAATGCTTGAACCTCTGTAAGTGGAAGCAATGTTTCAAGTTTAACTTAAAAGTACAAGACAAGATATAGGATTAGGCCAATTTATTTTTGCGACATTTTTAATATTAATTTCCGCAGACTGTAAGCTACCTGGCAAGTGTGAATACATTTGAAGTATGTTAAAAAACAGTTACACGAACTTATAAATTAAAACCAAATAACACAAAGCAAACTTGGCCTAGCTCTTTAAAAACAAAACGCTGCGACTTACCTAAAGGGCATTTTTTTTAGAAATTCGTTCGAAAGCATATATATGTTTAGAAACGAATTTGTAAGTCGCCAGCATACGCGTGTCATGCTCGTGTAACAAAATTTTCTCTGTTTATAAAATTATAAAATCTTAACCCTCTATACTTTCCAAGATCACAGCGTTCACACAGACAGACGGACAATATGAGTTCGAAGTATTCAATTAAAGTGTCACAACTTTTCTACGAAGTACTATGTTTTAACTTTGGACATAAAAACTTGAACAAGCAGAGCTCGAACACATTTTCGCCATTTCTTTGATATTTTAATAAAAACGAGAGAGGAATTTAACTTCGACAAGCCGAAGCTTGTTACATTTTTAAGCATTGTTGCTAGCTTGAGTAATATTAAAAACACATTTTTTTAATAATTATTTCATTATTTTTCTGACTGTTTCTTTGACAACTATATGTTAAAATTGTCCGATTTTTATTAACTTTCATTTAAAATTCTTAAAAATACAGAAAATTACATTCTCAATAGAATATGATTATATGTCAAAAAACACCGAAGCTTAAATTTGTTTCATAATATTTTCTACAAATTTTCCGATAGGAACTATGGCAGCTACATATATGATATATTCTTCCGATTTTGATAAAATTCAAAATTCATTCGAAAACTGGATAGTTCCGAACTATATACTACCTGCAAAAGAAAAAAGACTTTTTGAAAAGTTTTAGCCCGATAACTTCAAAACTAAGAGACTAGGTCGCGTAAAATCGGACGGACGGACGGACATTGCTCGATAAACTCGTTTAGAGATGATGGTCAAAAAGTTATTTACTTTATTAAGTCGGAAAATGTCTCCTTGACGGCGTCGCAAACTTTTGATTGAAATCATAATACCCTTTGCAAGGGTATTATAAAACGTCTGCTCTTGAAAATTCGAAGTTATTTGAGACTTTTTTCCAGTCAACTTACTCTACTAATTCCTTGGTTTATGAAAGAGTTATCTATAATTTGTATATTATTTATGAAAGAGTTATCCAATATTCTTAATATTACCTTACTTTTCATACATTATTTAGGCTGGTATCTTTTTGATGCATACATAAACAACAACAAATACTTCTTTTTTACATCGTTTTAACCGTTCAAGATTTACATCTCGATTGCGCTTGCCTTTATTGAGGTCCAATTTCGCCCAACATGAACCTTATTGAGCTCTATGTAACAACTGCAATAGCTTATATTTCCCCACGCGAAATACTCATTAATCCAGTGACGAAGCGCACCCCCCGCTATTCACCTAGTTGTGTTCTCACTTAAAATACGCGTCAAAATACTTTAAAAATCGGATGCTCCGTTCAAAAGTAATACGCAAAACAAGATTTTGGAGGACTTCTCAAAATAAAAATTAAATGTTTTTGTCAGTTTGTCCCAAAGCGTTATTTTAGAGCCCTGAACATTCTGACGATGTTGAACAGCTCAATATAAGAAATATTAATTCTATTACTTTTATAAAAACTAGCTAGTTTGGCGATAAAACAGTAAAAAGGTACATTTCGTACCCCCGTAAACTGGGAACCACTACAGCCACAGGCTTATGCTATATGATATTAGAAAGATTTTTTAAAATGCTTTGTACACCTAAATACCACCGTTTAAAAATTTTGGCTCATTTATTAGTTCAAAACATTTTACACTGCCTGAGCATTGTTTTTGTGCGTATCCATACTCTACTTTCGGGTCTTGCAATCATGTAAAATCTTATAAACAGTTCCGCATATGAAACTATAATCCAACGAATTTTGGGAAAGTGTATGAACTCATGAAATCATGTAGATTTCTTTTTAAAACAAAAACTTTTGAATATAGTAACGATCGCACCTTCAGCTATCAACATTTTTGATATCAAGCTATACATATAAATAGGCATATTAAATTGCAGGGAGCGGAATGTTAAAATTGTAGAAAGTGTATTTATTCAGTAGATCGTATACTATATTTTCATCACAAAAGTTGATGTCTCAACTTTTTTTGTCGTCACTATCGTCACTACATTTTTACC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCGTTAACAGAAAGAGAACTAAATAAATGAGACTTAAACTTATTTTAGATTCCAGTATTAATTGAAAAATTTATTTAATATTCAAGGCAGAACGCTGTAGTTAAATGCCTTGACCAAAGATACCCGTTAAGAGGGGAAGAAGCATTGGTGTTTACATTGGTTACATTTGTACACTTTGCGACTTACATTGTTATCTACCACCACTGACCATATCCTGCTATATACGGCATTGACAAAAAATTTAATAACGCAAGAAGAATCGCTATAAACGAGGCACTCGATACCCGTACTATGCTACAAATAAAATAAAATTCTTCGGTGCGGTAGCCTAGCGGAGGGTGGAGGTACTGATCATGCCAAGGCAGAATTAACCTAGACAATCACTACTTCAAAGCGGCATACCACTGTACAAACACAAAACTTGATTGTTTTGCTATAAAATAGGAAAACAGAATAGAAAGGAGTAAATTCATGAACATAGGTAAAGGAAAAAAGTAAAGTATATTTTTTGTTTTCGATAACCATTATCCTTTTTTTACCCGTTATCGAGTTGTCAACGTGGTAAAAAGTATAGGATAACTTGTATTCTTCACCCAAAAATGCGAACGCACTACATCTCAAACTGTTTTCAATATTTTTTCATAAAGTATCTATATTTTTCATAAAGTGTATATATTCTTTACCATGTCCGTCTGTCTGTATGAACGCTATGATCTCGGAAACTATAAAGGCTAGAATATTCAAACTTGGCATGCAGATTTCTGGGCTTTCTGCGCAGCGCAGTTTGTTTCAGTTTGTTTCTAACGCCCACAATATATATTTTAGTTTTTGGAATTGGAGTGACACTTTCAGCATCAGCACTTTAAAAATATGATCAACAAAGCGACTGTCCCCGCACCTATCAGCTGAAGCTTTAATTCGTTAAACTTTGTTATGAATTGTCTAAAGTATAAAATGTTTGGCATATTTCACATATGGGCGTGTCATTTTGGCAATACCAACGAATACCATAATCACTTTTACAAAATATTAATTCTAAACATGATTTGTAATTTGTATAGAAAGACGATTTGAACAACTTTTGGCTTAAAAAATCTCGGATGGAAAATCCAAGTATTACCAAGAGAGGTATACAAGCGGCCGCAAAACTTTGACGTGAGATTTCTCGGTTTTTCGTCTTTACGCCCAATTGGCGGGACTATTGACTATTGACCTTAAAAAAATTACTATTTTATACTATAATGATTTCAGTCAGAAATTTGCAACGCAATCAGGAAACGTTTCCGACCCCATAAAATATATATATTGATCTAGCCTTGTCCTTCTGTTCCACGGTTTCCCACGGTTTCGGGATGAAACTTTCCCAAGAGTCTTCTTTCTTTTGTAGGGAGTATCTTAAAGCCTCCATAGGAATAATCGAAAAAAATAGTAAAAAAAATTTAATTTTAGGTTTTGTTTACCATATAACCTCCTACGCCAGAGAATAAAATTTTTTAACTTTATCAATATTGGACGACTATATCATACAGCTGCCATAGGATCGATCGGAAAATTGTGGGGAAATACTATGAAACAAATTATAGCTTCAGTGTATTCTGACATATTAACGTATACTATTGGGAATATAATTTTATGTATTTTTAAGAATTTTGAATTTAATAAAAATCGGACATAGCCAAAATTATAAAAAAAAGTATATATATATCTGTGAAGCTAGCAACAATCCTTAAAAAATTTAACATGGTGCTATTATGATTGTTTTGTATAGTATGCAAGGGTACAAAACCTTTGGGTTGCCAATACTAACGACCTTTCTAGCTTCAATTTAAAAAAAAAGTGGTGGAGTTTCCCACTTTTTGCTTAATATTTTAGGTAAACAAGAAGCTACACCATTAAAATTAAAAAAATTTGTTTGTTTTTTTTTTCGTCTGAAAATTGCGACTTGCGTCTTTCCCGCCGGAAGACATGCTCACTCGGACGTCTCGGAAAAATACTTGTACCATGCATAAAATGGCATTTATTTAATTTAAAATAAATGAGAAGATTGTTAAAAAATTTTAAAAATAAAACCTAAGTTTCTTTTCAATCAAATGGTTTCTAAAGGTTTCTAAATTTAGTTTGTAAACAGCATTTAAAATTAAAAAAAAACTTCTAAACTCTTTGTCACAAAAGTTAACTTGATTGACTAAATTTAACATTTACAGAAAATTTTAACTTTATGAAATGGTTAAAGAACCATTAAAGTTTCTTAGAATATTTTGGATTTTTTCAAATGGTATTTCCTACTTTGTTCACAAACAGGGTCCATACCTGTGACTATTTTTTTATAATAAATAAAACTTGTTCTTTGCTCAACCTGTTATTTCATTATGCTATTATAATGAATAGAAAACAACTGAATTTTATAACTTTAATATGTTTGTTTATTTTCATTTTGACAGAAAAATAAGTTAACTTTCATATAAATTTACGATAATCGAAAATATGATTGCGCATTTTCGATTTTCCTATTGTGCGTTGTCCGTATAAATCTTTGGTTGTGTTGGTGTATAAAAAAACGTAATTCCGCAATTGGTGCTCAATTGCAGAACTTCTCGGGCATAGTTCAATTCCGACTGGGAACATTTTTTATGTACAATCAGACATCGAAAAGCTAATTGCTTCAGATATATTTATCAATGTGTGTAAAATACTTTATCAAGGTTTTTTAAAAACATTTTCAATAACAATAAAAATCAGAACACAATAAGCAATTTATAATGAGTATATGAATAATGAATGAACAAATAAAGCGATTTATCATCGTGGTTTAATGACAATTGTGAGTACTATTCATATAAAATGATCATGTTTAATAAATTGATTAGAGTATTGGTGTACAAACATTATAAGTGGCTTTTTTTGAAAACAATTTAAAATGTTTTCCATAAACAGCCGATTGCAACCCAGTTGAGTCTTGCTTGCATACGGTTTCAAAATTACCGAATGCGTTTTCTCTGGTTCGCAAACGGCTCCAAGTTTTTATAAACTTTGATAACATTTACTTCAGACCAACATTTATATATTTATTATTACCGTTGAAAAGGGAATCATAATTCAGTTAGTAATAGTATAACATATATATTGTTTTAAATATCAGTATTGTTTATTTATGGCTATATTTTTTAATCTAATCGTGTCTTCAGCAATTATCTAGGTATGACACAGAAAGACAAAAAAAGGTAAATACCCTTTCTAGAAATGTTACTTATGGTCTTAAAAATCAAGAGATGAACAAAAAACGAAATAAATATAAAATTTAAACATACATAAAAAATGTGGCTTTTTATTAATTTTATTAAGTCTGGTCCAAAAGTCAAACATTACTGTTTTCATTTCATAAATTTCACATTGATGTAAAAAAAAACATACCAAGCTAAAATCTGTCGTAGTATCTTTATGTTTGCATATTTCATTTTTCATATTTAATTATAGATTTCGTTCATTTTTCGATTTAAAGGGTCATAGATACAATTCCTTGAAACGATGTTTGTTTGTTCCAAATTATTTCCAGTGCAATTAGTAAATAATTTGGAACGATCTTAATTAGCGCTCTAAATTTTTTGGTTCCTTAGGAATAAATATTTAAAAACAAATAGCTTCGTAGTTTTCGATAGTTTTTTACTTTGAAATTTTTTAATATAAAGTAAGTATGGTAATTTTGACAATTAAAAAATAAAAGGTGGTCAGTTTGAAAAGTAGCCAGCGAATTTTCTGAGGAGCTATGAGGACATGAAGTGCACTACAAGGTTATAAACACATCGGCATATATAAATAATACCAATTTAGATAAAACCACAAAAACAAAAATTTACACTTTTAAAATGGAGTTCGGTCGCACAGTCTTACAGTTGGATAAAAGTAATAGGGACTTGTCAAAAGTAGCTATACACAGTAACAAAATAATACCTTTTTAAATTTGGTCTCTACATTTTTTTAAGTC'..b'AGCCTCCCAGACTAGTGTCAAAAAGGTTTTTGGTGGCTTTGGTGGAATTACGTTTGAACCAAACGTTTCCCGCCTATGCTCTTCGTCAGCTTTCGATCCACTTAACCCTAAAGATACACTACGAACTGTAAAACGTATGTCTACATTATAGTGTGCATAACTTGCCTTCATTGGGAGATGTGTATAACTTTTTACATAGTTCATGAATACCACCAAATTCCGCAATTTTATTTACACCTTCCCGACCCCGATGCTCCATGAGCTCGCGCAGTTGTTTAAGTGAAATACCATATTGCGCCGGTCTTCCATCGATAGTGGCCATTTGTTATTGTCGAATCTGTAAGTAAAAATAAAGCTATAAGCTAGTAATGACAAAAAAGTGTCCTCCAAAACGTTATGTAGCTTATTCGCTTAATAAAATTAGCTTAATTTTAAACTAACTGACTAGACTTGGCAACCTAAGAGAGGGTTCTATTATTTTATAACAAAATTTCAGAGTTTAGAGGATTTCCTTTTAAACATTATTCACTACCCAACCCAACCACAAAATGGTTGGGACTTTTGATTTAATAGGTTTTTAGTAAACATTGCACTTTTATATCAAACAAGCGAGAACGATATAGATGTGTCCCCCAAAATTTCCGTTACTCAGCTAGGGGAAAAGAGATGGCGATATGTGAGCGGCAAAGCGACCGTTTTCGATTTTACGAAAGGGATCTAGCCTCACAAACAGAGATTTTTGCGTCCAGTCCAGAGACGCAATCTCTGCAAATGTTGCCATTGCAGCTGGCGTCCCCCAAGGAAGCGTCTTAGGACCGCTACTGTACTCCATCTTTACAGCAGACATCCCCAAGCCAAGCTATGAAGAAATGACCTACGACAACAGCAAAATGCTGCTGGCCAGCTTCGCTGACGACGTCTGCTTTCTCAGCTCCTCGAACAGTGAGACCGAGTCTTCACAAACGCTGCAAACCTACCTCAACGAATTCGAGAAATGGGCCACGGCGAACAATATCAAAATCAACGAAAGCAAATGCGTAAACGTTTGCTTTACGTTACGCCGAAAAACAACTCCGGTGGTCCACATTAATAATGTGGACACAGAGCAAGCGACTAAGGCGAAATACCTAGGCCTCACACTGGACAAACGCCTAACCTTCCGAGAACATATTGCCAGAGTCGTCAAAATGTGCAACCTAAAGCGGAACCAATTATTCTGGATGCTAAACAAGAAAAGCAAACTATCTCTAAGACGCAAGCGGCACATTTATCAACAAATCATCGCACCAACTTGGAGATATGGAATCCAAATTTGGGGAGTGGCGGCTGCGTCCCACCGAAAACGTTTCCAAACCGTCCAGAACAAAACATTAAGACAAATCACTGGCTGTGAGTGGTTCGTTAGCGGCCAAACGCTTCACAATGACCTAAACCTGAGTCTTGTTGAAGACCAAATATCGTTCTTCTCAAGCAGGTACAACGACCGTCTAACTGCCCACCGTACTCGTCTAGCCCGGAGATTACAGGGGGCTATCCCAATTCGCAGGCTCAAAAGAAGACATTTTGGGCTGCTCCTAAGAGACTAATATGAATATATTATTTACTTGAAACTAGTCGTAATTTGATCTACTCCTATATACTAAGTTGAAAACTATTTATAATTTATAATTAAGAGATTATTTACTTAAGAAAACATTTAGGTTAAAGGCTTTAATTAGATCTGTTCCTGGATTATATTAAATAAAGATGTTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAACTAGATCCACCTTGAGTTGACAATTTTTGTTTATACAACGCTGATAGGAAGCTAGCTTCTTTTCCCATTTTATAAGAAAAATATATTAATTTATTTATTTAACAACTTTAATAAATTATTTAAAATTAGGATGCGTTTAGCCTTGGTTGGTCGTAAACCAGGGTATGACGGGAATGACGCATTATGGATTTGATCAAGATAAGGAAATGACTGCATGAACCGTCGTAAATACGTATCTTGCTGAAAGTGGATTCCGTCCAAGTACAATTTCTTGGCGCACTGATAAGCCTTAGATAACATAATGACGTCAAAATAAGCAATACCAGTGAAATCCACATCTAACCGAAGTAATCGAAAAATTTGTTTTATAGTTGTTTTACTTATTATTACTCTATTGTAACTTTATTATATTAGTAAAGACAATAAACGTTGCTTTAAATTTTTATAAACCCGGTTCTCGTTCTTAATTAATCTATCTAGAATTCAATTTATTGAAAGTTCCACATCATCCTGGCCACTCCCGTTTATTTTTTACGCGTGCACAGTACCACCTGGAGATCAAAGGACATACTTCTTTAGACATCCTCATAAATATTTCGACAATATTACCACTCCATGTACGAAATACTCAGCGAAAGGATGGTAACATTTAGTTTACTTAAACTATTATATCTAGCCAAAGAGCCAATAAGGTCCCACTTTAACGCATTTTATTTTGCAGGTTTGTAAAGAGAAACTTTTATTGTTTAATAATTTTGTAAAAATACGATAGTAAATTGAAATGGAACATCATATTCATTTTACATTACTTTATTTACACTTTTACCGCTCTTTTTCCCAAACTTATTTACTTTCTTAAGGTCTTGGTTTGCAATCCTTTTAGATTTAGCAATACCTTTCGACTGATGTATACTTCGAAACAATTGGACGACTACTGCAGATTTTAATTTCTTTGTATGTATATGTATAGTAGTCGCCTTCGCATACCCTTCTGGTGCGCTTTGTCACTACTTGGACTGCAGTCCATATGGAACTCTGAACATAAAATGCTTCCACTGAAACGATCTTCCCACACACATAGAGCAAGAACATCTTCAATGACGTCTCGGGTAGTAAATAAATGTAAAATTGTAAATGTAAAATGGTACAAATGCTAACAAAAAGTTTCTTCGCCTTTACTGGAAAGTATATTTATGTTGAAGTTGATTTGCTGAGTATAGGTGAAGGGGACAGTGTCGGGAAGAATTTGTATGAAAAAGGGGAAAAAGTTGCTCAAGTGTTTATTACTAAACATTTTCAAAATATTATAAAAAATATAAGAAAAATGATTTTTGAAAATTTTTTTGCAGAGACTTTTATTTCTGTTTGGACAAACTTTATCCATCAAAAAATTTAAATTTGCAAGACTAGGAAAAAAATTCCAAAAGTAGATTTTCACAAAAATTCGGATTTCAAAATAATTATGCCGACTGGTGAACGTGTTTCTTTTAAAGCTTTAAGCCATTTTTTTACATTAAGTCATCCTATTTTTTTTTAAAGCTTTGTTCGTGTTCTGAATTATTAAAACAGTAACATTCCCAAAAAGTAGAAGTATATAAGTAAAAAAATAACAAAGTTAAAGGTTTTTACATTAGTTAAAATATTTTTTGTCTCGTTCAGACTTACATATATACTATACACATTAAAATAAAACATTTCCCGATAGCTTTTATACAGACAAACTAGTTTGGGTATCAAGAATATATATACTTTAAGGAGTTTGGAATGACCCCAAAGACATTAAAAAATGCCGGTAAAAGTGTACCTGAAAAGTTGGTTTGAGAAAAACGCCACTTCAGTACAAAATGGCGTGAAAATAAAGCTTTTAAACCCTTGCAGATGGTATAATAATTTCAGTCAGAACTTTGTAACTCAATGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTTTTGATCAGCGTCACTAGACAAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGTCTGTCCATTTCTACGCAAACTACTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGAAGTATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATTGGAACTATCGGGGAAAACATTTTAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AACATATACCTTTCTAAGCTTGGATATAACATTTTTAAATTAGTTCTGAATTTGTAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTCCCATAGGAACACTCGGAAAGTTAGTCGTAAAATAATATTGAAAAATTTACGCTTGGAAATAACATTTTTATTTTGTTTTGAATTTGGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAACATAAAATAAACATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAAATAATATTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATAAAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTCGGAAATAAATTATAGCTTTTGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATACATTTTAATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTACTGATTATTTTTTATAATTGCAATTGTGCAATACAAACTTCGGCTTACCGAAGTTAACTTTCTTTCTTGTTAAGAGTATAAGACGCGAGTACTTGAAATTACGGCCCTAAATTCTAGATGTATTAAAGGGTAATAAAAAATAGAAAACATATTTTAACATATTTTAAATAGTCGTCCGATTTAAAAACTTCTATAAAACACAACAAAAGTAGATTATATTTGGGAAAGTCTGTCGCAGGTATCTTAAAAACTGCAAGACCAACAAAAGGTTGCAAATAAGGAATATATATACGAATATACTTTATCGCTTCTCCTTTAGTGCAAAACTGCAAACAAGGATATAACGATTTTAAAAGGGTAATTTAAAATACCCAATTTCAATTATGTAAAAAAATATTTTTTCGCGTGCGCTATAAATTTTAAATTAAACAGTAAACTATCATATTTACTCGATAAGATTAACTTAAGAACTGTAAAAAAATTGGTGGGACATAGCAGCTATAAATAGCCTGTTTCTTTGGATATAATTTGTTTCTACACCATTTCAAAATTCAGAGTCTTCGAGATACTTTTTAAACCATCGTTGCCCCACTCTCCCCATTTAACTGGAAGTAAAAGTTTCAACCCAATGAGGGCTACTAGTATCATGAGCACAGCTGTGAAAGTCCTGAATGTTTATCAGAGTGATGAGGTATGAATAACTTCCATAAATAGATATACTCGCATTTATACGTCTTGAAGAACTTCTACTGATGCAAAATGCATATAATGCCTGCATATGCGTTTGTTTCAACCGAAGGGAATGTCATATTTGAACCATCGGCACAAGTTCTTGCGAACATAACAAGCGAGGTCCACCGTTCTTTTTCCTATACATATGTATACATATATTTAAAGTCTATATGCATACATATGTATGAAGGCACGCAGTTTTTCTTGTATACACTATACCACGCCTTGTAACAAAAAAAAACTATAGCATACCATTGAACTATAATTTAGCCATTTCTTGTTTAAATCCGAGGGGGAAAATATAAGACCGACAATAGTATGTTCATTTACGTATCAGAGCCTTGTTTAAAAAAGCAGGCACCATGTCATTTATATCAATGCTCCACAACCAGGAATCTTACGTCATACGTCACGACATGAGCGACATAGATATTTGCACTTGTATTGGCCACATTGGCAATGGAATAAGATATACATACGTCTGTATGGGGAACCAAACCTTCAAGCAAGAACACATTATTCTTATACACACTAATATATTGATTCTGGCTACCGTTGATGATATCAGTCAATCTTAAGATTTTTAAACAGGCGAATGGAGTAGGTGTGTATGATTGGATACGCTTACAATAGCATGATATCACTCCAGTGTTCTGATTTGATCATATTAAATGATATTTTCAATTATGTTTAATGTTTAACTTTTTTGTTGGTATACATACACAATTAGTAATTTCTTTAATTGTACACGACTCAAGTAATAACGCCGCGAAATGTAGCTAAATAATTAATCTAAATGCTGACACTCCACTCCGCCTTATTTTTCAGCAATATTTATACTCGACAGATTCAGGTATCGATACATCGAAACGATTCACTATCGAATCATTTTCGATCCACCGCAAGCTTAGTATCGATATATTTGCAGAGTACACTAGCAAAATAAAACTTAAGTGTTAAAATGCTTCACCTAGATTTTTTTGAAGAACTGACTGACCTCTGCGGCCTTAGAACCCAACGGTCTGCTGCTTCGACTGGACGGCAGCGCTATTTGTAGATGTGAGCGGTTTTTAAGAGTTTCTGACTGCCTGCTATCTGCAGCTCAGCTGTTTGTCTTGGTTATCGCAGATATCAAACTTAGCATTTGTTTGATTTTGTTACGTTAGCACTGCGGCGTCCATCTATTTGTGCGATAAGCAGCATGAACACTTCCATACACTCGCGGGTAATGTTTGTATATATTTCTCGTTTACAAAGTTAAACATTTTTCTATAGAAAATGTATGTAGCAATCATCGCACAATCTTAGTTTTTCGTCAAGAAGATCTTACCAATCGAAGCCCTAAGAAATTTACCTATTTCTTGAAACCCAACTTAGTATAATTTTTGTGAATTCTTTATTTAATATTTTTCTTTCGATAGTTAACATACATATTTCAATCTGTTGAGACTGAACAACTTGATATTTATGTTACATCTTCTAAGTATAGCACAGCTTTAGGCACAATAAACAATTTCTTATGACGTAACCGAATTGATTACGTTAAATCAAAGTGACGACACAGATGAAGCGGCTTGTTGCATTCAATTGTTTAGTGATGCCCAATTAAATATTTACATATACCAGGGCTCCACAGCAGTCAAAAAGTGTCCATTCAGAGTGAGTTTCTTTTATAAATCAATATACATTTTAGACAATTTAGCGATACATGTTTTTCTATTTATGTATATAAGTGTTATTAGATATGCACAAGACCACATCTTTAAAATAATAATAATTTTAAATATTTTATTTATCTTGTACAATTTAGGTAATTTAATTAGCTTTCATTTAATGTGTATAGCGAACCTATGGCGCCTCATAGCTCCACCAAGCCTGTTGCACTAGTTGGTGCCCCTAACGGCGATTAGTAAAACATCTGATTTGCGACATAATATGTAATTTGAATTTACATAACAAAAAATTAATTCAGCAAGTTAATTTCGATGAGCGCCGTTATCCGCGGCTGTGTTCGTGCAGAGGCCGCGTGGAAAACGAAATTTAAAAATGGAAGGCAAAACGCAAAAAACACTCTTAAGACGCCTTCAGGAGGTCAGTGCAGATTAAAACAGGACCCTAAGATGTTGCCCACAAAGAGTAATACCACAACAGGGTGAATCTGCAAAACAGTGGAAATGCTGGTGACAATCCAATCAAGAATGTTACATAGATTGAGGGTGACCTTAGAAATCTACGGTCACACCACTAGGAATACGATATGGTGACTAGTGAAAATCTTAGCGTCTGAGTACTACGCTTTCAAGATGCAAGGTTTGAGTCCTCACTAACTTTCGAAAACACGGCTCTATAGGTAATTCTCGAAAAATTGGTGAATAAATTGAAAAGTCAAACTGGTGGTTTTTCCGCGTTGTAATTTAAAAATCAGTTAGTTTTGTTATATCTGGTGATTTTAAAAAATAAATCGGGTTATTTATATTCATAAACATATTGTTTTCAGGATGTCCGTGTATTGGGGTGATTGTTCTTGAAACTAAAAGAATTCCTTTGAAATTGCGATTCCGAATTTTAGCAATTGAAGAAAGCTCTAATCAATTGTCTCTTTGTAATATTTTATAAGTATGGTGCTTAATTTATAAATATGGTAAGAAATAGTTAAAATCGACTTTCCTTAATGATTCCTTATTAAATATTGGTTACCGCTCGTACTAAAATGTTTCACTGTAGTCATGGATT'..b'AAAGAAGTAGTTGAACAGTAAAACTTAATGTTATATAATTAATGCTGTGTGGTTTGGCTGGTAGGTATGAACGAAGGTACGAACGAAGTATATTAAAAATTGAAAGTCCCGTATCTTGAGATGCTCCTGGTGTCACTCGCCTCTGGTCGTTCGCCCCTTAAATGTCAAAACCTGTCGACAGCTCGCCGTTTCTGGCTGGTTCTCTGTAACTCTGTGTTTCGGTCCGTTGCTGCTTTCTTGCTTTATCCCCTTGTTCTTTGGCGAAGACTTTTCACTGCTGATCCTCTTGTGGAATGTGGTAGGTAGGGGCGTCGTCCCGCTGCTGACAAGTGGCATTTCATCTCTTGTCCATGGCAAAGAGCAAAGTCTGTTGCACTCCGCCCTCCTACGCTTGGAAATATAATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTTGAATTTAATTTTATGAAAATCGGACGACTTTATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAACGAATTCAATTTCATAAAATTATTGATTATTTTTTACAACTGCAAGGGTATACAAACTTGGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTTTTAATATTTCAAATTTGTTTCCATACAAATACATAGATACATACATACACACGATATATAAACTTTTTTTAGATTACAAATTCTGATGTCAAAATCTACAACTTATCAAAAAGAATTTAAGTTTTTCAATGCATTTGTTGCATACTTTAATCAACTAGGTTAAGGGGTAGGAACAAGATTTCATTTTCTAGACCTTCCTAAAGTACATATTTCTAATTTTTAGAAAACTAACAAAAGCTACTTAAATTTTAAGTTATGTTACGTTTGGATTCCTCTGTGAACATTAGGATATTCGTGTCCTATCCAGCTCGTTCCAGCTCATATACTATCTGCAAAGATAGTAGCGATAGTTTTTAAACTGATAAACTCGTTTGTCTAAGAACTCAGAATAAAAGAATACTTAAGCATTGTAAAGATAAAATCGTTTTGATCAGAGCAGCAGTATAATGTTTATACCCGTTAGTCGTTGAGATACGAGATTCGTCGGATATGGAGCACCAAGCAGAAAGACGCGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATCCTTGATAATCGTGACTAGCCGAGTCGATTTTGCCACAACCACTTAACGTCCACAAACCGCCAAAAACTGTGGCGGTCACAGTTGTCATGTTAAAAAATGTTAGGTGAAATGTATTAGCCTTATCAATACCTATCGATTAACTTTAAAAAAGTTTTCCACGCCCACTCAGAACGCAATTGCTCAGAACGCTTAAATCTGTCTGCCGGATGGTGGCGCTTTACCATATTACCACATTTCCATGCCAATATATCCTTTTTTGTTCTCTTAAGCTGAGCCGACTATAGCATTCTTCCATGTTAAATATAAAAATGTTATATTACTTTTTCATTCCGAATGCTGGTGTATGGTATATTATATCAGTCGAGTAGTATGAACCGATCTTTTAAAGTATATATTTGTTATGTCCAGAATCACTATCCGCGCCATTTAGGTATGTCACTCTACGACCGTAACGAAAAACTTGTATAGCGCCCGCATTTTTAATGATGAGCATTTAAGAGCCTGAAAATTGAATGAGACATGGAGATTCCAGCTCAAAGCAAGTTTGTTTTGGATGAATGCCAAGCCCACCCTGTTTATTTTATTTGTAACCGTCTGTCTGTCTGTCCTTCTGTCCGTATGAACTACGGAAACTATAAAAGCTAGAACAGTCGGACTTAGCATGCAGATTCCTGGGCTTCCGCAGCGCAAGTTTGTTTTAGCGGGGTTCCACGCGCACAACGTCCACAATCTAAAGCGCCTACAGTTTTTATGATTAAAAAAATGTTAACTGAAATGTATTCGTCCCATCAACACCTGTCGGCTCACCCAAAAAACAATTTGCCACGCCCACAGACCGTCCAAAATTGATATCTGATAGTCGACGTGTATATCCTTGGCTGACGGCTGACTTACTAAAAACTTCTCAAATAATAAAGAGGTTGCTCAAACTAAACAAATATTTTTAAATTATATTTAACATCTTTTTATATCCGATTTAAAAAAAAAAACTCTTTTTTCTAAAGACGTCTTAGGAGAAGCGTAGTTACCATAATATCAGATCAAATAGTCTCAAAATTTGTTTTCTCTTTATTTGCCGTAGATATCAAGTTTTAAAACTTGTTTACCAGGCTTTCCGGGTGCCCCGTCGGCCATTAAGATTTCGAAGGATGTTAAGGAGGGCGCCCACTTAACATGGGAACCACCGCCAGCTCAAAAAACTAAGGAGATAATTGAATATTCAGTATACCTCGCAGTAAAACCTACTGCCAAGGATAAGGCATTGTCCACTCCTCAGTTGGCTTTTGTTCGGGTGTATGTCGGTGGCGCAAATCAATGCACGGTGCCTAACGCTTCACTGTCCAACGCACATGTAGATTGCTCAAACAAACCAGCAATTATTTTTCGGATTGCTGCTCGAAATCAAAAGGGCTATGGACCAGCTACTCAAGTTAGATGGCTGCAGGGTAAGGCCTCATTAAATTACAATTTTAAAGTGTTTGACTTGTGTGTTACTTCAATTTTTTTACAGATCCCGCAACCGCGAAACTGCAAGCACCCTCAAGTACACCAAATCTAAAACGAGTACAGGAGAAAACAACTGTTGGAGCCAGCAGCGCAGCCAATTCCTTTTGTTCGCCAAACAAGCGTGGACGCAACGGATTGCATGAATAACCGACCGATTAAGTATAGATTTAGATTTATATAGAAGTATAGCAATAATGGGATAATGTAAGCTCGATAATAATATTTAAATAATTACAGCTTCCCAGTAATGAAAAATAGATAGTTGGGCTCTATGCTGTATTCAAAGAGATTTACAACGATACTTGATTATTGATTGCAATTAATTAAGTGTTCTAAGAGTTGACAAGAAATTATGCATGTACATTAGGGCTGTTTGGCTATAACTATAACATTGAAATATAATTATTTATTGACAATTTTACATGAAACTTAAAAGATAAAAAAGCGACTTAAATACGTTTAATGAAGAATTTGTCCTCCGGAAAACAATAAATATATTATGAAACATCAGTTTTCTTTTAATTGAATGATTTACTACTTAGAGCTTCGTCAACCCTTATGTACATGCTGAACTACTGTAAAATGCTACGTGAAAAATTCCCATAAATTTTACCTTCAAAAAATGAGTTGTATCATACTTGTTAGATGGGATGACAAATTCAATTTCAACGTTTTAATTATTCGTGCATCGAACATGGCGAATGACACTAAAAAAGTATGACTTTTGCCGTAAAGAACGAAAATACACATTTGGGAAGTTTCGAAATTAAAAGGTTAACGTGACTAATATGGATTTCTGAAGAGAAACTTTTAGAACCCTGTATAGGACTCAATAGTCTTCTTCAGAAAGTTTAATGTTTTAGAGAAATATTCTATAAATTTCATCCCTGATGTATAATGGTGGTTGGTATGTTAAAAACTCAGGAAAAGATGTCTCTAAAGCAGTGGTTAGATATTCGCAGGCCTTACATTTTGGGCTAGTTCTTTTCTTCTTGAGATAGCAGAGCTGTTAATGACAACTCGGCCAAACTGCATCTCCATGTCATTGTCAGTAATATATTTACGTATGTGTTTATTTATAGACCAAGAGTGCATTTTACTATTGTACTTTGCACGATAAATTTAAAAAGGGGATTAAATCGATTTAGAAGAATAAATAAAGATTTATTAATTTACAAACAAATTTACCTTATTGTTGGACACAGCCTCAGAGCCTCCCAGACGTATAACATCCAATTTGGAAAATACAGCATTCTGGATTTCGATCTCTTTTAATGAATTAACCCCAAAACGTGTGCTAAAATGCTGAACTTTCTATTG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d00/e54/82/scaffold_22-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTCAATACAG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGAGTGGGCGTAACAAACATTTTTTAAGTCCGTCAATACGGGAAAATACAATCCAGAAAAAAAAACAAAAAAACAAAAAAACATAAAAAATCGAAAGGAATTACTCGGGAATGATCTCACTTTGAAACATGTGAAATAAAATGCGCTGAAAATTGAGCTTTTTTGGAAAAATATTATTGTATTTTTTTCTATCTAGCCTTTTGCCTGAAATCTTTCTTTTAGACCTTAAAAATGCTATTGGTTGGTTCTTGTCTGATCCGGCTGCAATGGAAATAAGTCTTTTGGCAAGGTTTCAGCCCGATAGCTTAAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATACGAGTATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTATACCCTCAGTAAGGGTATAAATATGTATATTCATGAATCACTAAGACAATTCAAAAAAACTGAATTTGTAATATCTTAATAAGTTTTGAAATTACAAAGCATCAAAGTTATTATTTATATACTTGTTTTAAAAGAATTAAACAAGACGTTACAAGTCGGTTGGGACAGATATATCCTTAGCTGTATATAGCTTTGTTCTTTATTTACACAATATTTTTCAACTCTGGGGAGTTGCATTATATAAAGATTCCAAATTGAATTTTTTTAAATAGAGTAGTAAAGTATACTGTGCTCTACTAATGCTAGAAGGAAGCATTTCAGGTGTCATTATTCTTCGTCAGGATCGTAGATGAGTAGATCTGGTCATGTCATCTGTCCGTGTGAACACTGTGATCTCGGTACACATAAGAGCTAGACAGTTGGGATTTGGGATTTATTTTGGAACTTCATCTTCAAGTTAACCGCGAGAAAGTAAATGCAGCAACGCTAGATCATTCAACCTTTCTTACCTAAGTCAAGTTTTAATCGTCGGAAAGCTATTTAAGCAACGTTTTGAAAATCAATGATCTAAAAATTATCATTAAAAGCAGTTAGGTCAACATTTTTATTGCAGCTCTCTATTTAAGGGCAACCCAACCAGAAAAAGGCAAAAGGAAACAGAAATTAATTTAAATTTTGAGGGCGAAGGCACTTTTTTATCTGTATCAGTTTCTATAAACTAATAATTTGGCTAGTAGCTTAATTAATAAATACTCATAAGTTTCATTTAAAGTAAAATAAATATACTTAAAGAATAGTTAAGTTCTACTCTACAAACGGACAAATATGTCTGCCGCCCACATGACCATGTATTGAAATAGTGGGTCGGTGTCCTCTACAATATCGCCTTACAATATCGCTTTGCTGCTTATATATCTCTATTTTCTTGTTGAGTATTTGATATCTGACAGTCGAAGTTTAACTTGCATTCCAAAATATATCAAAATCAGAGAAAACTCTATAGTCGATGACATCGGCTATTAGATACACGCTACTCATACGTCGATCTTTTTGGACATACTTCGCCGAAGACAAAATAGTATATATAAGTAACACCATGTTAAGTTTGTAAGGATTGTTGATAGATTCAGTGATAATAAAAAAGAAAGGATGTTAGCTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTAGCCGTTATAAGAAATAATCAACGTTAGTAACACCATGTAATACTAAAAACATTTTTTTATTACTCTATGACCGTTTCTTTGACAGCTATGTATATGTAAGAGTCGTCTAATTTTTATAAAATTTAATTCAAAATTCTTAAATTATACAGAATAAAAATACAATATACAATGAAAAACATTATCAGATAATATGTCAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATAGCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATAATTATTTCATAATATTTTCCCACTAATTTCCCAATTGTTCCTATGACAGCTATATGATATCACTATATATATCACTATATATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTTATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAAAACCGAAGGTATTATTTTTGTATATTATTATACCACTAATTTTCCAATTGTTCCTATGGCAGCTGTATGATTTTGATCATTTTTTTTTCGAAATTCAGAATTAATTAAAAAATGGTATATCCAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACCCAAGAAATAATTTTTTTTTATTTTTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATATAGTTGTCCGATCCAGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGTAATAGAAAGAAGACGTTTGAGAAAATTTTAGCCGGATAGTTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGAACGACTCGTCTAGTGACACTGATCAAGAATATATATACTTAATTTATACGTATCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGATTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAACAACCGAAGCTATAATTTGTTTCGTATTATTTTCCCAACAATATTGCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAATTAGAAATTCAGAATCATTAAAAAATGGTTTTTCCAAGCGTAGCAGTTTATATGTTAAAAACACCAAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTCCCACCCATTTATCAATCGTTCTTATGGCAGCTATAGGATACAGTCGCCTGATTTTGTTAAATCTGTCTGCAGCCGGTAGGGTGTGCAGTATATATATCTCCATTTCAATTTGGCTCCCTTAAGCTGCGTAACTGGAATCTTATAGTCGAGTCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTTACAACTGAGAAACTAGATTGCGTAGAAACGGACGGCCGGATAGACGGATGGACTGACGGACATGGTATATCGACTCGTCTGGTGATGCTGATCAAGAATGTATGTATATACTTTATGCGGACGGAAACGTCTCCTTTACGTTAAAAACTTCTGGCAAAAACCATAATAATAATATAATAGTTTTTTTTGTAGCCCGGAAAGCCTAAAAAGTTTGACGCAAATAAAAAAAACTTTTTAACTACTCAGCTTAAAAAACCGTATAGACCAACCAAGAAACGAAAAAAAAGTCACTAATTACATTTTCATATTTCCACAAAGAAAAATTTTTTTTTGTCGCTACAAAGTCAAAAAAAAAGATCGACGGAAATGCGAGGCTTGGGCAAGTGCTCCTATCACTAAGTTTAAAAAGCCGGACAGATAACTAAAAAAACGGAAAAACTATTAAAAACAGACAAAAGTTTATCATTTATATTGCGATATGTTAATGGCCGACTCAATTACTTTTTCATATTTCCGACAAAAGTCCATTTGGTTCTATTCAACTGTGTTGACACAATATAACATTTTTTGAAAACAAATACGTCCCTGTGTACATTTTTATTCTAGCCATAAAACTAAAAGCTCCACCGTTTCGGCGTTCGTGGGCGGTAAAGGAGGCACGGCACGTTCAAATAACATACTTACGCTAAATCAATAGCTAAGAAAACTAAAGATAAAGTTCCAACCCTCTAGCTCTAACAGTTTTCGAGATCATTGCGTTCAAAGGGACAGACATACTTTTCCGCACATACTATACTCGGATAAATAAAAGGAAAAGCAACCACCATTCAAGAGTTGCGTGGTGGAAATACTGTGCCCCAGGACCGATGGACCATCTCCCCCACCTGCCTTTTCGCAGAATCCTTTGTACCAAAAACCTCCTTCGAGACCAGCATTGGCTCTACCAAAGAAAATTGGTTTCCATCGCATTACGGCTCAACGTCCACGCTGAGCTGTGCTTCCACGACGTCATCATCAATATTTGAATTTAAAATTTCTTATTTTGCTCAACACGCGCCA'..b'GGTGAGGGCAGCGAAAGATTGTTTGGACTGGAGGGATTGGGCGATTGAGTGGCGATTGGGACTGAAGCAGATCGCTGGGTGGAATGGTATGGGGGTGGAGGGCCCTGCAGAGAACGCACTTGACTACTTGACGCATTGCTGCCTGTCCCAGAGTTGGTGTGCTGAGGTGGGGCGACAGGTCCAGTCGCTTGTCTCGCTTTTCCCCCCTTTATGCGCTCTTCAAAGAATTGCTGTTGGATCTTTGACCACTCAATTTGAGTGCCTTGGAGTGGATGCAAGAGGCTATCTTGACCTGAAAGCTCCTTTGACATATCTGGTACCGATCCGATGACGTTAACATTGCAGTTTGTGTTACCAAAAGAAGCCAGCATATTCGTTGAGCTTCCCATCATATTGCCACTTGAAGTGACAGAGCTCGAACAGTGCATATTGACGTTTATCGCCCCTGTAGAAGTTCCAGTCACAGGACCAGCTGCTCCTCCAGATCCGCATTGCAGACTGCTTTTTTGACTGTTATTGCATCCCATTGCAGAATTTATATCTGATATGACATCGACAGGAAGCATAACCTCCTCTGGGAGCCCTGAGCTTGTACCCGTCGAAAGTTCCTGCTTCGCGTTTCCTGGCATATGCATTTGCCGCAATTGAGAATTTATTATAGATCCTCCGCCACCCGGAATACCCATCATCAGGTCACCTGGTATTTTCTGCATCTGTGAACTTACAATTGTTCCTACTGAATTTTCATTTTCTGGAAAAAGAAATTGATTCATTTTCTTTAGTTTCGCGAGCTGCTCTTCCCGGTGCTGACGCTGTTGTGGTGTAAGGTTTTCGTCTGGAACCTTAACTCCTTGCAGTGAAACAATGTTGTTTTCGTGCGTCGAATTTGGGTCGCTTTCTTTTGTGCCTTGGCCCAAATCAACACCAGCTGCTTCCAGTATCTTTATCGCCTGGGACTCACTGGAAGTACTTATACTGTCTATATTGTTTCGTGAATTTTGTGCGGCACCACTGGCACCGCTGCTTCCGGGTCCACTCTCCCAGCACATTAGTTCACCCTCATTGGACAAGGGATCGGCTTGGTCGACAAAAGTGTTGCTTGGCACAGAACTACGTTTGCTATTTTCGTTATGATTGAACTGGTTTTTCAAGAGACTTGCAGGCTTTAGATTTGGCTGCTGTTGAGTTATCTTTGATACAGGAGGATTAGGGGGAGTTTGTCCTCCGGGTCCCATGCCTATCCATGGCATACCCAAGGCACTGTGGCGCTGCAACTTGTTCATCTTTAGAGGATTTTTCATGAAAAAGTCTTCTAGAAAGTTTTTTGTCGCTGGCTGGGTGCAGTGATACGCAATAATGGTTTGAAACTGACCACTCAAAACTGATTCGGCTCCTTTGTTAGCCAGTTGAGTTGAAAATACAAATATGTGATTCTGCTGTTGCATGTAATCTAAGCAATTGCTGCCACCAGAGGATGGTAGATTGCCAGTTCCTGTCAAAAGGTTACCAGCCCCACCTCCGGTTCCAGCTCCAACTCCCGTACCAGAAGTTGCTTGGGACGCATTCATGCCGATCGCTAATATGTTTGAGATAGGTGGGTTATTTAAAGATTCAATATCTGAGTTTAACGGATTGCAGTTAACTCCTTCAATGCCCATTTCGTCATTACTTATCACCAAGGAAGAAGGCTTCTTTTCGGGGATACTATCGGTCGAATTTCTTTCTGTTTTTACTAAATGAATTAAAAGAAAGGTATATTCTTTAAACATACATAGATATAATCTGTTAAATGTAAATTTTTTCTATCTCAAAAACATTATCGCATTGTCTAGTTGCTCAGTTAAAAATTATTTTCAAAAATTATTATCGATAAATAAGCAGTTATCAGTTATACCTTTTCAAAGGGCACTGCTACTAGTCAAACTGTTTAGCTTGGAAGGAGAACAACTAAAGCGCTCATAGGTATAATAAAAAAATTAATAGATCTTGGTGTTTATACCCTTGCTGAGGGTATAATAACTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAAGCCCCACAAAGTATATATATTCTTGATTAGCATCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTATGTCCGTCGGTCTGTCCGTCCTCTTTCTTTTGCAGGTAGTATAAAAGTCGGAACAAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCGCATAGGAATAACCGAAAAACAATTTTTTAAATTATATCTTTTGTGTTTCTTAGCATAAAACCTCCCACGATTTAAAACACAATTTTTTGATTAGTTATATTTTTGAATTAAACTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAACTGGCATACGAACAATCGGAAATATGGTGGGAATATAATATGAAACAAGAAAGGAAGTTATCCTCGGCAAGCCGAACTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTCAATCATTTTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATTTTTCCTATGACAGCTGTTATCATATAGCCGTCCGTAAAATTTAATTCGAAATTCAGAGAAAAATTAAAAAATGGTATTTCCAAGCTGAGTAGGTTATTTGTTATATATTTAATTTGTTTCATATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCTTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTATAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGAAGGATATATGTTAAAAAACAAAGATGATATAATTGTTTTATATTATTTATTTTAATTTAATTCGAAATTCATAACTAATTCAAAAATGTTATTTCCTAGCTTAGAATATATGTTAAAAAACACCAAAGGTATAATTTTTTAAAAATTTTATCCCCTATAGTTCCTAGTGTGTGCAACATATTTTGAGTTTTTTTAACATATAACCTTCTAGTTCAGAATTTCGAATTACATTTTATCAAAATCGGAAGACAATATCATATAGCTGTCATAAGAACGGAAAATTGGTGGGAAAATAATATATAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAGTTAAATTTTATCCAAATCGAACGACTATACTTATAGCTGCCATAGAAACGATTAGAAAATTAGTCGGTAAAAATGACAAAATTATATCCTTGGTGCTTTTTTCCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTACAACGCAGTGAAGCAGACTTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCGTTATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCCGTCTGTGTGTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAGGTCTTCTTTCTATTGCATGTAGTATATAAGTCGGAAGCTCTATATATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTTTAAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAACAACATTTTTAAATCAGTTCTGAACTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGCACAACTATATCATATAGCTGCCATAGGAACGATCGGTAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAACAAGAAAGGAACTAGACCATTTTTTTGACATCTATATGTTAGAGTAGTCAGATTTTTATTAAATTGAATTCGAAATTTTCAAAAATATAAAAAAGTATATTCCCTATATTATAAAATAATATGTCAAAAGCGCCAAAGCTATTATTTGTTTCATATTATTATCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTGGACCGAATTCGTTCGCAATTCAGAACTAATTAAAAAATGGTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATGTGTAAGAAAGCACAAAGTTATAATTTGTTTCATAATATTTTCCCACCAATTTTCCTAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GACAGCTATATGATTTAGTCGTCCAATTTTGATAAAATTTAATTCCAAATTCAGCACAATTAAAAATGTTATTTTCAAGCGTAGAAGTCTATATGTTAAAAAACACCGAACACATCATTTGAAATTTAAAACCAATTATTTCCAAGCGTAGGAGGTAGTATGTTAAAGAACACCAAAGGTATAATTTTTATTTTAATTTTTTCCCCGATCGTTCCTATGGGACATGTAGGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGGTTCTGACTTATATACTATCTGAAATAAAAAGAAAACTTTTGATAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGATAGGCTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACCCCGCTAGCAAACTTCTGACTAAAATCATTATACCTTCTGCAAGGGTATACAAATTGTTATATATGAACAGTAATTGTCTCAAATGGCTATTTTCAATAAAAGAGTTATGAATTCGGGTTTTCAATAAGTATCACAGTAACTACTTTTTTTTTATTTCAGAGCTTTTCAAGTTATTTACGGATAGCTTGTGGTATGTTACTCTCGTATACATACTTTTATTCTTGGTTCATATAGAAAGATAAAAACTATTTTTATATATTTATATTGCCTTTGGAAAAGTGTAATTCCTTGTCAGGCTCTGGGTGTTTTATAACCCGTTTTTAATGTAAGATTCTATTGATTTTTTTTAATTTAACAACTTTTTTACCAATTTAAATGACAATTTTAATAAATTTTAAAGTCCTCTGAAATGGTGTCCCCTTAAATAATTTAAAGACCATCTGTATTTTAAATAATTCCCTTTTAGGGAAATGTCTTTATATAGCTAATCTTAAATCAATAAGGCAACAATATTTAGTTGTTTGACATACCTGACGTAGCGGAGTTCTCCTGAGAGTTACCAATGGAACCAAATCCGACAGGTGACATGTTTGGAGAGTGATTTTCCCTTTCTTCTTTTTTCATATTTACTAAGTTGCTTAAAACGTCGGAAGGTTCTTCCTTAATAACAATGCCAACGGAAAGAGCAGATGAGGACCCCGTTCCGCAACCGCTTCCAGAAGCGATTCCTTTCGCTTTAATAGATCCTGTTTCTGTTGAGATATGATCAAACGCTATAATTGATAGCCTGATGGTAAGAATGCTCTCGGCAAATCTGGTTTTTTTTAGTAATACACGCAGCTTATAGCGCCCCTAACGGCTTGTGGTGTCATCTCAATTGAATTTGAAATATTGATTATTATTTGGTTAAACGCAGGTGGGTCTCAGTTTTAAAAGCGTTTTTGGGCGTTAGAGTAGGAAGTAAATAATGAAGGGGAAAAGGGAAGCAAAAAGCTCCAAAATTTGCAGGCCAAATTCCTACATTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGTGATCATACGAAAAGACGGTCTACTCAGCTTAATTGTAATATTATTTGCTAATATGTCATGACCTAGTCAATAAAAAAAGTCTTGGTACCAAATTTAAAGAGAAAAATATTACCTTTTTGTTGTCTAATAGTTGTTTTCTTCTGACTACGTAACAGATATCCAATTTTTCGGCTACATGTAATAGGAACAGTAAACATTAACATTAATGTGTTAAACTAACATAAAACTTGTTGGCGTCACAGTTTGTAGACGTTTGAATGGCGTGGCTAACATTTTTTACAATACATTTCTGTTGATTTTTTGTAACATAAAACTTTTGGGATCACAAGGTCGTTAGAGTATATCTGTCATTTTTCACTAACAAACTTGCTCTGCGTACAAAGCCAAGGAATCTTCGTATTAAATCGTAACCCTCCCTCTAAGCGTTACCCATATAGACGGACATAGCTAGATCGACTCGGCTAGTGATTCTGATCAAGAATATATTTATTTTTTTTAGGTCGGAAACACCATATTATTCCTATTTAAATTTATTTAAAAGGTATAAGCAATTAATAATTTATATTTTGCAAATTCAATTGGCTAATACGCCACCAAGCCGCTAGTCGCTTTATACTTGACTAGGTGTGTTAATTAAAAAAAAACAGATTTGATCAATATAGCTCAGCCCCCTTCGCAATTCTTTCAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGTCAATCGACTAAAACGTTTCTTGTTTTATATAGTATAACATGTAGCTAAAAGCCCAGGTTAAAACAAGAGAAACGTTATATATTTTAAGCCTTAAATAAATCATTTTGGAAAACAATATTACTAAAGACCAAAGCTGTTCTTGGTATTTAAGCTAGAGTAAATCTAAAGACCGGCTTACCGACATCCTCATCCTTTACACTGTTTTTCTTTTTCTTAGCATGCTCGTCACTATCGACCAATTGAGAAATTCCCATTGTAGCAGGCACACTACTGCTATTCGAGAGTTCACTGGTATTGTTCGGTGAGGCAGCCAGGCACGAGTTAACGCTGTTTGAGGAGTTCTGCCTCAGTGTCGGTGTACCAACAGCAGACGTCAAGGAAGAAGATTGTCCCTCGGATGGAATATTTGCAACTCCTCCGGCTCCGCTGCTGCCAGCCGAAGGGCCCACACCTTTATCACTACTTGAAAGTCCGTTTTTCTCTGCTCCTTCGTCTGGCATAACTTTTATTTGATCTGGAAGCACAGACAATTGGTATGGGACTTCGTAAAGGAAAAGAAAGGTACAAGACTTACCCGGAGACAGAGTGGAACAGGTTTCATTTTTAGTGGTCTTTGGAGAGCTCCTGCTGGTGCCGGCGACCCCATTCCCGATCCCTACTCCAGATGCACTTGTTGAAGCATCGGCGTTCGGATGCGACTGTGACTGTGTTTGGGCTGGACTGTGGGGCATTGTTGTCGAGAGCATTATGGTCAAGCCTTCATGGACCAAATGTATGTCTCCCTACAAATCGAACTTTCTTAGACCGCGGTGGTGTCTAAATGCTCGAGAACTTTAAGATAGCCATTGTTCTGGCTGTTTGGGGTTTCTGGTAGTTGGAAAAAAGTACATTAACTACTGACCGCACGCACACTATCGAACTTATGCGTGAGTTTTCCAATCCAAAATTTTACAGAAAACAGAGCACCATGTCTCAGTTTCGATCATTATAAGCGCTAGCAGTGGTCTATGACTTATTAATATGCTTTAAAATTCTTTTGTATTCAACTTGTGCAGTTTCACAATTTTATGTATACATATGTATGTTATCAACACGTTTAAACAACTTATTCGATCTTAGTTCAGTACGTAAAAATGATAAATCTCGTATTTTGCACACGGGCTTTAAATATTCACTGTCATAATTGGCAAAGCTCCTTGTAAAAACAAATTCATGTGCATAACTATCGAAAAAGTAAAATATAAAAATAAGAAATTACTGTCTTTAAGAGTGACCAGCCCACGAAAATGTACATAAACCAGGGTTGCTGATATACATCAAAATATCGATATTTGTTTCTAATAATTTATGTCGTGACATTTTTTGTCCAAATATCGAAATTGAAATAATTGACTGGTTAGCCGTGAGAAAAATGAATGTGAACTCGTATAATAAGAACAACAAAAAATACACAGCAAAATGCAAATAATAAATAATAGCCATAATTTCAAATCGCGTTCCCAACCTCCTCAAACCATTTTAATGAACGTATGTTGGACAGTTGTTTGTACCCTAGTTCATTTATATTTTATTTTCAGAAATGTCAGCAATTTAACTTTTTATTTCTTTGTATTTTTAAGTTTTGTAACGCAGTCTAACCCGATACTTGGTATTTGGAAGAAAAAAACCGTTCTTTTATCCTTTTCTCAATTCGTTCGAAATGGTTGGGATATTGACAAACGAAAGTCGAATGGTAGATGGTGGATGGATCTTTGTGGGAAGCCGCTATTAGAAGCTGCAGAAAAACGCCTGTCTGAACAGATTTATCTGGAATTAATAAGTGTAAAAGCTTATGCACACTGTCACTTTTTGTCGC'..b'AGCAAGCTTACTACGCGGCGACAGTGATCCGACAGATGCAGCGAATGGCGCTAAACAGCAATAGCAGTGCAAATTTTGATTCTACTGGTGATTTCAGTAACCAAAAAGACTCTAAAAACTCAACAGCAGCGTCTGGATCACACATTTCCAATGTTTTATCAGCGCAGAAATCAGCACAAAGTGATGCACAAGAAGATGGTGAGACGCTAGGCAGCACAAATGGAGCATCACAGTAGCAAAGTTGAATATCAAAATTATGTTACATATATGCTTGAATTACATTTTTGAATTTTAACGATTGTTCTAGTCTAGTAAATATGACCTATTTACTAATCGGATAATTTTTTCAATCGAAAATACGAAAAAAATAATAACATGAATGTGCGTACACCAGCACTAATGCATCTCTTTATAATATTTGAGATGTAAGGATACTGTTTAACCAACGCAATACACTACAAAAATTCAATCGGTCGTTTAACATGTCTATGAACACATTATTAAAGCGAGTATATCGCTGTAAAAAATATGCCAACAATGAGAACAATTTGGTTCCGTATCCAATCATGACTCTTGGATGGATTTATTGTATTATTTGCTCCCCTACATTCATTACAATTTTGAGGTGTCATTTGACAAACTAACGAATCGGATTGAAAAGTCCAACTACAGATGCAGTAAAACATCACTAGGGAATTTTATTTATTTTCTGAATGTTACAATTTATTGTGAAAAACTAAAATTATTTTTCGTTAATAAAGGCCCCTTCAGATGGAATCTTGTAAAAAAAAAATATGTTAATTTAAAACATAGTTCAAGGTATCTTTGACCAGATCTGCTGTTTATAGTTTCAAAGGTATTGCCAGTAATAGCAAGGAGGGAGAATTTAAGTCGTCGCCGTCGAATCAAGTTTAAGTATTAGCTAGTTGGTACGTCGGATAAAATTTGTTTAGCTAGTCTTTGCCGCCTTTTTGAAAAAAGTGAGCAGCATAGCGCATTACAAATACAAGCAATACTGCGTTTAAGAAGTAATCAAATTCCGCTGGTATCGTCGACGCACTTTTTCTACTTTTCAAATTTTTATTTAATTTGTTGCACTACTCTAAAGTGAACAACAAGAAAGGAAGTTACCTTCGGCAAGCCGAAGTTGGTATACCCTTGCAGCTATAAAAAACAATCAACTTTAGTAACACCATGTGCTATTTTTAATGATTGTTGCTGACTTCAGTGATATTGAAAAAAAAGTTCGTTCTTTTTTAAGACAATTTTTTTAACATCTTTTTATAATATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAACTAATTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTCAAATTTGTAAAACAAAAATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATTACAGCTATATAATATAGTCGTCTGATTTTTATAAAATTTAATTCGAAATTAAGAACTAATTAAAGAATGTTATTTCCAAGCCTAGAAGGTTATATGTTAAGAAAACCAAAGATAAAATTATGTAAACATTTCGACTAATTTTCCAATTGTTTCAATGGCAGCTATATGATATTGTTGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAATTAAAAAATTTTATTTCCAAGCGTTGGAGGTTATATGTTAAAAATTTTTTTGTTTTTCCCCCATAGGAACTGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGTTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAACTGAGGGACTAGTTCGACTCGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATATACATTATGGGGTCGGATACGTCTCCTTCACTGCCCTTTGCAAGGGTATAAAAAGTTGGTGACAAAAAATTGCTTTTGTGATTAACTTAAAAATAAAAATGTATTTATTTTTAATTTTTAAAATACAAAAATAAAAAATATACAAATCGACTTTGATATACCAACGAAAGTTTATTTATGTTTTTTGTGTTATTTATTTGATTAAAAATTAAAATTAATTAAAAATTTTCTCAAAAAGTAGTTAAGATTAAAATAAAAAAGATAAATTTACGCAGCACGCGGTTTTGAAATTCCGTAATAAACTTAAAAAATGAAAATCTAATGAGAAAATAGGGTAAAGGACACAGCTGCTGTCGTGAGCAGTTGCTAATTTCATCGAGCCGCCCCGTTACCTTTAAGTTCTGTTCCTTAAAGTTACCTTTATTAAAGATTTTCCCATTTATACCACCGTAAACGGCAGTCCAAGTAGTGACGAAGAGCACCAGAGCACCATCGAAAGGTATTGCTATATATGTAAATGCTCCCGACGTCGAATGACACCTCATTTAAAATCGAACGCTCCGTTTAAAAGAAGTAGGTAAAACAAGTTATGTGTAAGCAGCTTACTTTTGAAAAGCTAGCTAGTTTGGCGAGAAAACAGCTAGAAATAGCTACATTTTGTACAGTAGCACTACTTAAAATTATTGCCAAAAGTTTTTTATCTATTTTTTTTTTCATCTTTTTTCCGATTTCTCAAAAACTGTTTTAACGATTTTGCACTGAGTATTTTTGTCCATATCTATACTCTATTTTAGGGTTTGGAATCCTTTAAATTGTTATAATCAGATCCGCATAAGAGTTTTGGAAATCACCGTTAAAAGAACTCAAAACAATTAAGATACGTATTCCGCCTGATATGGTATGATATATTTAGTCGATCCCAACTTATCAAAATTCAATTAACCTGTTTCCCCCTTTTCACAAAAATGTATGTGGTGTTAAGGCTTTACAAAATATAAGAAATAAGAAAGGAAAGAGGAGTTGTATACCGTTGCAGTTATAAGAAATAATCAAAGTAAGTAACACCATGTTAAATTCTTAAGGCTTGCTGCTAGCTTCAGTGATATTAAAAAACAAATTATTTTATTATTTCCCTGACCGTTTCTTTGAAAGCTACATGTTAGAGTCGTCCGATTTTTTTTAAATTTAATTCAAAATTTTTAATATTTAAAAAAAAATGTATTTTCAATATTATACGATATGTCCAAAATCCTTGAACCAATAATTTGGTTCATATTATTTTCCCACAAATTTTCGTTCCTTTGACAGCTATGTCGATATGTAATATAGTCTTCCAATTTTTATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAATAAATTGTTTTTAAGCGTAGAAGCTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATAACATTTTGTCATATTATTTTCCCACCAATTTTCTGATCGTACCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATATAGATACAATTTAATTCAAAGTTCAAAACCAATTAGAAATCATTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGTTAAACAAAAAAGGAAGTTAACTTTGAAGTTCGAAGTTTATATACCGTTGCAGTTATGAGATACACCATGTGAAATTTTTAAAGATTGTGCCTGACTTCAGTAAAATTAAAAAAAAATATATTTTATTCTTATTTTTTAAATTTTTTTCCGATCATTTCTATGGGAGTTATAAGATATAGTTTTCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTCTGCAAAATAAATAAGACTTTTGACTAGAGAGACTAGGACGGATAGACAGACACACGGACGGAATATATATACTTTAAGGGAACGGATACTTCTTCACTGCGTTGCAATTTTCTGACAGAAATTAATATATCCTCTGCAAACGTCTAAAAATATAAGCCCCAAAATGTTTTACATGCATCAAGATACTTTTTTCAGAAACTTTAAGAACGTAATTTTTTAGACCACATTTTTTATTCAATTTGAGTAGTATTAAGTTTCTTGATGCCTGTGCTTTTGAAACGGGTACCGTTTGAGAAGGGCGATGATTTAGCATTAGGTTATGTAAATAATAAACCATA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/d76/390/9b/scaffold_26-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TTTTGCATTTCCT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGAAAAATATCGTCTAGATCATAATACCCTCTGCAAGGGTATGCACGTCTATTGGTAGACAATATAAAATTGTGCTCCAAGCGGAATGGAAGTTCTCGACAACCCAACGACAAATAACATCAAAATAAATAACAAATATATCAAAAGTTTTCTCATTGGTTAGGATATGCATAAAAAGTTCAACATGTATAATATGTGAGAAGTAGGATTACTGTTCCTATATATAAGGTTTGTTAACTATTGGGAAAGTTTTAAATCGATAACTTTTAAAATGGGTAAACGGCACAGAAACGAATAAAATATACTTTATAGGATCGGAATATTCGCCTTTATTATTTTACAAAATGTATAGAACAGCTGACGTATATAATTGCCATTATACCCTCTTTTTATATAAGAAAAAAATTGTAAACAATCTTTCAGTGGTAGTTTTTAGTATATGGGGTGCAAATTTTATTTATAAATAATAATCAAAATATATTCAGTTTACTTTACTACTAACTGGTATCAATGTGCACGGCGGCCCACGTAGTGACAAAGAGCACCAGGAGGGTGTGGGAAGGCGACTACTATATATACACAAAATGAAAACCTACTGTAGTCGTCCCATTGTTTCGCGTAATACATCAATCAAAATGTATTGCAAAAACTAAAAGAATTGCATACCAAGACGTTAAAAAAAATTAATTGGTTTGGGAGAAAAGGAAAATGAAAATGTAAAAGTTAAAATTTTAAAAATGTGATTTGTTGGGGCCGGTGGGGATAATTACCACCACCACCATTGCCCCCCTATCGACCTAGTTGTTCTACCACTTTTCGAAAAACTAGCTAGTTTGACAGCTATAAAAACTATTGAAAACTTTTAATAAAGCGTGCCGGATGAAAACAATGTATAAACTGTACTTATTTAGTGAATCGAAATAAGTACTTTTGTTTGTTGAAAGTGCGATCGTCACTATATTTATACCTCGTTAAGAGGTGTTTTTATATTAAATATATGTTTCTCAATAAACATGACACAATAAACTTTTTTGAAACACATTTGTGTATTCGATTGCCGGTGCATCTCTCCATATATCATTCTATGCCTAAGTTGTTGCCGTGACGGATGCTGCTGATGTTGCAAGAAAAGCTGATGCCATCCAACCGGAGATGGAATGTTTTGATGCACATGTTCCGTATTTAAAATTGATTCCACAGTGTGTTTATTAACTTATAAAGGATGGCTTTTAAGACCAATAAAAACGAAAACTGAAAAATTACAAAATATCAATTTAGTGGTAAAAATTTTAACTCAATAGGTTTGATATAAGTAAGATTTAAAACAAATCTAGAAAATTCGAATTCGCACGTATGTATTTAAAACTGGGATTGGCTTAACAGCTTTAAAATGAAAGTGTTCTCATTTCTGCCTCACTTTAAAAATAAAATGTTTTAATTACTTTAAAAAAATTTTATTTTTCTTTAGAGTTAATAACTAATTTAAAGCCATTATCATATCGTGTTTGTCTATAGATAATTACTCCTCTTAATGCTAGTCGTAGGTAAGCTGACCTTTAACGTAAGTATTATGTTCGTGTGTCGCACACACCTAATAACTTATATACAGACAGTTAAAAAATGTTAAACAATGGTGGAATTCCTATAAACGATTTGGATTTACCTACGATTAGTTTAAGGAAAAATCACTTTTTTTGCCATTTCAAAGTTCATAAAAAAGACAATTATATAACAGAAAATAAATGAACTTTCGCACAAAATAATTTAAACTATTGGGTTGGTGTTTTAAAATAAGCAAAGACTATAATGTGTAATCCTAACACTATCCAAGTACAAAAACATTATAAAAATATACAGTGAATGAAAAGCATACAATTTAATGTTAAGCTATCAGTTAGAACAAAATATTGTAATTTCTTTAACATTTTGTTATCATTTCCTTAAAGTAATTTTTTAGTTTCTATCTTTGTCAAACACATACTCTACATAAAATATTAATAAAACACCTATCATTAACGTATTTGTGCCACAAACTGGAGCATGAGCAGCGAAAATACCTCTTAAATAAAATGTGTAAAAATATTTAAGGCCTATTGACCCCGCTCAGACAAGGAATTAAAGTCCACATTTTTTTTTTAAGCTTATATAATTCATTGTGTACTATATACAGTAAAATATTTTTTTACAATATGATCAACTACAATCTTCAAATACATATTTTAAATAGTTTGAGTAAATTTGTATTAATTTTTAGAAAACTACAGTTATATGCTCCGAATTGAAATGCAAAAACCATTTTAAATAGAGTCGTGCAAGTATACACACATTTCTAAGCATAAACAAAAACTAATTTAAAACATTAAAATATTAGATTTAATTTAATTTCTAATTATACTGCTTTGAACTTCAATCTTTCTTAAAGAATTAATTGTGCACGACGGCTGAGGAATGTTGAATGCTACGTTCGAATTCTTCTAAACTTAGCGCTTGGTTCATATTCAGAAGAGGCAGTTTTCCAGCTGAAGCTTTTGCAAGAAGCTCTGGAGAAAACCATTGCGCCAACTGATTATTGGTTGGTGATGGCATCCGTTCATCTCTGGGGTAGCCGGGAGATGCGTTGCTATTATTTTTAATCACATTGCCAGAATCGGAACTGTCAGGAATACCTAAAAATTAAATACGATGTTTGGTGAACTAAACAAAGTGTAATAGCAAATTTTGAACCTGGTACTGGTGATGACATTTGTGGATTCGATTGCCGGTGCATCTCTCCATATAGCATTCTATGCCTAGGTTGTTGCCGTGACTGATGCTGCTGATGTTGCAAGAAAAGCTGATGCCATCCAACCGGAGATGGAATGTTTTGATGCACATGTTCCGTATTCAAAATTGATTCCACAGTTTGACCAGATTTAAATCTGTGTTGTGTTTGTTGTTGCTGCAGCTGCTGATGATGTGAGTGAACTGGCTGCATTTCGATTTTGTGTGTAGTAAAAGTTAATGCAGGATTTGGTTGTGGCATTGAATTAAGACCTCCTTTTAGTATAGGGCGACCTAAAATAATAGGAAGTGAATTGTAGTCATGTAAGTCAGTTAGTTACAAAACCAAAAAACCGTTTATTTGAGGTTCTTTCAATTTCCTATTTGCTTCCATAAGATCAGTAGTCAAAACTATAGCGTTTTTCTTTGATTTAACATCCATTTTTCCCTTAAATGTTCCTAGGGCACCTAATTTCTTTCTAACTTTTAAGTTGCCGAGATCTCAGCATTCATACGGTAAGACAGACAGACGGACATGGCAAAATTGACTCCTGATAATATAATAAAATAAATTATACTAAAGGTTCAATAAAATTTCTTTCTACTTACCAAATGATTTCCCTTGCACCATCTGCATATTACCAGGAGTCCATTTTATTCCCTGTTGATTTCGGCACTGTTGCAAATTGGGAGATATTGGTTGGTTATTTGGGCCAATGACAAAGTTTCCACCTCCCAATATCATTCGAGGCTGCACGGCTATAGGTGCTGTTGGCTGCGTCTCACTAAGTTGCTTGGCATGCTGTGGATGCATTTGATATTGTGGCTGTTGGCTATGAGAAGAACTCGGTGTTTGAGTTGTTTCCTTATCGGCTGTCATTTTCCTCAGTACTGATGTAGGAGTAAATGCCAAAGGAGTTGGCGAGTTGCCATGAGTAATTAACGGATTCATCGCATGGTTGGCAGTATTTTGCGAAATCAATTCTATAACAAAATAAGCAACCACGTTGTATAAGATCTATCAAAAATGATATTCAAGAAACGTACTAATGCATGTTGTAGGAATTCTTAAAGACCTTTTTTATATTCGTTTTAAGTTTTCATACCCTTGATTTTATGATTTTAGCATAGCACTGCAGTGGTGCTCATACATATATTCCAAAAACAAATGTTCAAGCCTAACGAGCGTTTACAGTGTCGTTGTAAGCAGTGCGTTGGCAGG'..b'AAATAAAAAACAAAACCTTTATTCATTTAGAAAATAAAAAATTTAATTAAAAATAAAAAAAAATTTTAAATTAAATGAGATCATAAATTTTATTAAAGAACATAAGTTGGTCGACGATGTTACTCTTTAAACGGGTACGGCGATCGAAATCCGCCTTGATAAAGGCTCGTTCGGACTCGCATTCATTTTCGGAGACGGACCTTCCATGTTTTCCTTGGTTGTACCTAACGTAAAAAAAGAATATAAATAAAAAATTTACATATAAGTATTTGCCGCTACACGTGGGACGTACCAAAGACATTAGAATATGAAGATAAATAACGCCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTGGTGCTGGCTCTAGAGCTGGCTCCAGGCTCTCTTGCTGAAAAGAGAGAGCGCTCTAGAGCCAGCTGCTCTCATACACGCATACAGCGATAAAACACGATTGGATGTGTGAACATGTATTCTCGTGCATTGTTATTGTTCATATTTCGCTGCAGCCCGCTTATTGAGCAGGTTGATTATTTTTGTATTTATTTTATTTCATATTTTGATTTTAGAATAAGTAAAATTATAATAATAACATTTATGTATGTATTTCTATAATAACTATTTAAATTATTTATGAAAAGGAGAATCAAAATGGGGTAACAAAAGTCATTATTAAATTAAAATTAAATGGCATAACATCATTTAACGAAACGTTATTTTAATTTGAAATACTGAAAATCTAAATTGTAAAATTTTTCACTTTACTAAATAATTTAAATAGTTAATATATTAATATGCTTTTTAATATCTAAAACAGTTATAAAATTAATTATACTAGTAAATACTTTGAATATTCAAAAATGGTAATATATTAAATATACGTACTATTAAATACATTTAATGATTAGAATTGTTAAAATAATAAATATGCTATTAAATATATTACAAATTTAAGATATACTACCAAAATATAAAAAAAATTTAATGGCACAAAATCATTCAACCAAATGGAAAAAAATAGCAAAGATCAGTGGCAACAGGTCCAGCCTGTCCCACTGCCAGAAATCTAGGCGCGACTTCCCCCGCCTTAAATTGTTTAGGTTTCCAGAAAAAGATCCAGCAATCTTAATGAAATGGGCGGAAATGTGCCAATTTTCTGAAGACTTTGTGGCGACCACTTCACTGTTTTTATGCCAAAGTAATTTCTCCCCAGGTGATATTGGGGTAAAATATCTAAGGAAAGGATCAGTTCCCGATCGCAACCTAATTAAAGATTGCAGTCCCGATAATGATGATATTGATTTTTATGTTCTTAGATGGCCCACACGAAAAAAACCTCACAGTCCCCGGCTGAAGTTTGTCGTCAGTGCCATAAAAGCACAAAAACGTTAAAAGAGTTTCAAAAAAAATATTTAACTTAATAAAAATTGTCTGATGAAAGACAAGCACGGATTAAGACGTTCAGAAAAGAAAATTTGAATTTAAAACGAAAGATGATCAGGTTGAAAGCCAAGTCTGAAAAAAACATACTTTCGGAAATAGACAAAAAAAAATAAACGTCAAATGAAAAAATACTATCAAAAATGCTTCCTAAGGAAAAAAAGGGAACAAATATGAGATGAAATGATTCTGAAAAATGGTTCGCTGAGAGCATTTATTACAGGTTGACATCGACATATATGTTTTTAAGCGACTCGTTACAATTAAATATTCCCAGTCCATCGTCGTTGCAAAAGTGGAACAGTACAAAAAAAGTACAGCCGGGAGACAATTAAGGAGATGACTGAATCTGATAAAGAATGCATACTGACTTGTGAAGTTGCAATAACGAAAAACTTAACTTATAACGTGTCTGTTGATATAATTGATGGCTTAGAGCATTCACATGAACGCTTAAATAAAATGGGAAGCTACATTTGGGTATTTGTTATATGGGGCATTTTAAAAAAATGGAAATTTATATTAAATTATTTCGTACCCGAAACAAACAGAAACATTAATATAGCTGAAAATATTGGGTTTAAAGTAAGGGTTGTACCTCATTGTGCACATGTACCTCAAGTCACTAATAAAAAACCTTGAAATGTGCACATCAAATTAACAATGTTGTTTGGAATAAACTGAAGGAAATGCAGGAATACCTAAGGAACATAAAATACCATGGAAATAATATATATTGTCTTGATGGCTTGATCCAAACTACTGAGGCTATGTTTGGACTCGTCGAAGATATATTTAAAGACCACAAGGACCACTTTTTCTTTTTAATTAGTCGAGTAAACCAGGACCCTCTTGTAGAAATTTTCAGTTAATGAATTTAATATAATCATTGCCAAACTAATATCTTTGGACATTTTTAAATTTTCCCAAAAGTCGAATTGCGAAGCAGATGATGTTATGTTACCAGTAGAGTTTGATTCAATTATATATAAACCTTGCATTGAAAACAAAGAAATACAGCAACAAGGCAATGAAAGGTACTTTGAAAAAAAAATGATACTTTTTTGTCCAAAGATGTACCTATTGAATTAACATCTAATAGATACTTAAATTAACATCTAACAGATACATTGTTGGATACATTGCAAAAGGATCAAGTTGCGATAAATGTATAAAGATCTTTCTAAAAGAGACAGAGGACTTAACAGCACCATCAGGGCTTTTTATAAATAATGAATGTTATGGGCATAAAGTAGATCTTTTAAACAAACTTATTAAAGTTTTACTATTTAAACGTTGCAAATAGACTGTGATAGCTGATAGACAAAAAAGCAAGCTAAACTCAGAATTCTATCTCATAAGTTAAAGATTAAATCATTTTTATGTACATATATAACTCATACCAAAAATAATATAACCGATTAAAAATTGAAAAAATAAAATAATAAATATATTTTTTATGTACTTTAATAATAAATTTAATAAATAAATAAATAAAAAGGAAATATTTTTTAATTATGTGTTTTACTCACTGTTCTTTTATCCATATCCTCCCCACCCCTTTTTTATTGCTTTGAATAAATTCGTTTAATAGTTCAGAATTGATTTCGGGCCGAAAATCGTTACTCATCTTAGACATTATATTGGTCTTTGGACGTACACATTATATTGGTCTTTGGACGTACACAAAAATAAAACATTATAAATATAATAATTGTAACAATGTTACAAACAAATTACAAACCTTTCGTGTGCCTTCTTCTTTAAACAGTGATGGCCCTAGAAACATCGATGGTCCAAAAAAACATAGATTTTTTGAAAATTTGGAAAAACATCGGTGCATCGATGATTCCATCGATGTTTCTGAACCTGTAGTGATGAAATCCCTCAAAGAGTCTTACACAGTTTGCAAAGTAAGTATAAATGTATACAAGTAAAACACATTTTTTTAAACACTGCCCATATTTTTTTCGGGAGCGTTGGACAGGGATTCTGGGGTCCCGGATCAATCTTTAAGAAAAGCTATGACAAACATTAAAAACGAATTATTAAAAAGAAACATAGATTTAAGAATAACTCTAATTCTACATAAAATTTAAATCATAAAATGTAAATAAAAAATATGAAAAAGTAAATGAATATGTTTGTATTTTAAATTCAATATTTGAAAAGGTAAAAACTCAATGGAAAAATCAAGAATGTTCGCTTTTAATACCAACGCAACCAGAGTGCATCGCGATTAATTAAACTAAATTATTTTGAATGCTCAGTGTAGACAAATAAATATAAATTTAAATTGGCGTCCAATTTATTAACACCTAGTAAGGCGCGAAAAAATTTGGGTATATCTTCAGCATCTTTTTATTCTTTGTGCAACCTCAATGAATTTTTGTCACAAAAGTTGTTATCAGAACTTTTGTTTGTTGAGGGTGCGTTTGTCATTAGATTTTTACCTCATTAAGAGGTGTTTTTGTTTGGTATCAGTTTTTGTTTTAAGCAGCAGCTGCTAATAAGCTGCTAATAATAATTTAAAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AATTCCAAGACTCTAAAATATGTTCTGCATACTCACAAAAACCAAATACAATAAACTTTTGTCCAAAAATTTTAAACGATTGTATAATATAATAATATATAACAAAAACGTACAAAGTACTAGCGATATATAGCACAAGCCTGTAGCTTTAGTAGTTACAGGTGTACAAAATATAGATATTTATAGCTGTATTCTCGAACTAGCAGTTCTCGCAGTTTTTTTCAAAAGTGGTTAATGTTGGTACGCAGTCCTTTTTTTTTGTGCAATACCTTTCAATTTTTCGGACGATCATAGATTTGCTTTCTTTCAAAGTACCACCACATGTACTACTGAAACTTTTTGTGCGTTCTATTCGCGGTCCCCGAGAGAGAACGCGTCGGTTTAGCTGCCTTTTCATTCGGCTCTGCCCAACGACTTCGTGATGAATTGTGAACCTGCGGGGTAACTTGCACGGGACTGCTTGTTGATGGGTGTCTACTTTACCTGTAGCGGCAGAGAGTGGGCAGAACTATCTGCCATGCCCCGCAGCATAGAAGCTGCCGACCTCTGAATTAATGATGTCTTACAGGTATTGTAAAGCAAGTTATTTATTTTTAATTTTATTTATTCTCAAATTATTTTAATTATATTTTCAGGCACCGATACTCTAGAAAATTAGCTTTCCCCGATCAGATTTTTATCATGAGCATTCGTGTGAAAGTTTAAATAATGCAATCAAGATGTTGCTGTAAATTGTCATACTTATTTATGATTTTATATAAAATTACTTAAAATCTAAACATTTTTCATTTGCGGAAGTTTCATAACAACATAAGGTTCCACTGCTGCCGACCGGATAATTCCACTTGTTAGACTCTGCCAGAGTGTTAGGGCTGAAGGTTGCTGGCCGAGAAGGTTGCGGGCGAAAAGCGTGCAAGTGTGACTTCAAAAAAACTGGAAAGGCAACACGCTGCTGTATTTCCATGCTCGATGATATTTCTTTTGCAGCTAAAGACTTGGAATGCGATTTATCGCTAACCAGTTTTGAAACTGTATTTTTAGAAAGACTTCGATCCTGCTGATTTTTTTCGTTTTTTCGGCGAGCTTTAGTTCTTAAATGAGCATTAAATCCTTTCGTGTTCTGAAACAAATATTATTAAGACAACGTAGCATTACAATTTCATTAATTTGATTTAATGTGTAGTACCTTAAAATGCGAAGTACTCTTGATTTATACGGACCTTCAACTAAATATAATTTTATATTTAGGCTAAAGTACGATTACAGTTCAAAAGTAGGATGAATGCTATAGTCGTGTGCCCCGTCTTGTAGATACCCGTTACTTAGCTTACTAACTTTAAAATAAAATGTACTATTCTCATGTTATTTACTTTAAAATTTTAGAGAATCAATCAATTTTAGGCGAAGCTTATTTTACATAACCACGTGCAGAATGTGTAACAAACTTTGTGAAACTCCGAAGGAAATGTTTTCCGACAACGGAAAGGAAATGTTTAACTCCTAAAGTCTGCCGCATCTTAAGCGAAGAAGACGAGAAACACCTCTTCCAAATAAAAACTCTCTTTTCGATTATTCACCTTTCCATCTCCCCTGCACTTCCTTTAGCTGAGTAACAGGTATGTGATAGTAGGGGCAGTCGACTATAGCGTTCTGTCTTGCTTTTAAAGAACTTTCCCCATTGATATAGAACATATGAACAACGAGAATAAATTATATGCCTTTAAATATAATTTTAAAAAGAAAATTAAATAATATGTTTCTATAAAGTTTTGGGAAATCTAACACGGTATACCTATTTTCAATGTATACGCAGAGCCAAAAATAAAATCAATCCCACTCAATTCTGTTTTGTTGGTTAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAACACCATGTGCAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGTTATTTTTTCAGAACATTTTTTGACATATATGTGTTAGAGTAGTCCGATTTTTATTAAACTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTCCCAATGTTATAAGATAATAAGTCAAAAAGCCCCAAAACTATAATTTGTGTCTTATTATTTTCCCACCAATTTTCCGATCGTTCCTATCACAGCTATATGATATAGTCGTCCGGTTTAGATCAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCTAAACTTAGAAGATTATATGTTTAAAAGCACCAAAGATATCATTTTTTCATTTTCTCTGACTTTCTCCGATCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTGAATTCGAAATTCAAAACCAATTAACAAATGTTATTTCCAAGCGCAGGAGGTTATATGTTAAAAAACTCCAAAGGTGTTAGTTAGAGTTATAATATATACTTGGCCGATCTGGCTGATTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTGTCAGCCCGATAGCTTTAAAATTGAGAGACTAGTTTGCTTAGAAACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGACTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATATTTTATGAGATCGAAAACAACTCCTTCGCTACGTTGCAAACTTGTGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAAGTAGCTTTCTCATTCTTACCTCGGATATTGTAACTTCATTATCGCCTAACATGATTTTTGCATTTGGAGATGAACCACACATTCGTAATGTTTCACTTTGAAAAACTGATAGGGAATGACTTGTATTTTCGATTGCGCATCTACTGGCATTGAACTCTAGTTGATCCTCAGCGTCTGTTGTAATGACATCTACATCAATGTCTGCTTCTACATCAATATTTGTACTTGTAGACGGAGAAGGGCTGGTACTTTCGCTTTCAAACACAATGTCGGGTGGCGTACGAGAGGCGTCAACGTGTTGAGCCATGAATTTACCTTCATCTTCCGTTGTCTCAATATCCACGACTTCGTCGTCATCGTCGGTATCATTAACATTCCTGGGTAGGCAGTTGACTAAAGCAGATTCAGTTGGCTTTTCTGAAAATGGTATTTTTTAATATGTTGACGGGAAGGAAATATTTGACTTACTTTCTATATTGGGTGTCACTTTTTCTAAAATTGGCGAAATGGTCTCACCTACTATTTGGTGCGACGAACCCGAAATGCTGTTATGCGTTAGAACAGTTGTCGTCCTTGTAGATTGTGTTGGGTTTATATAATCAGTTCGCTTTGAGTCACTGGATCTAGTGTATAAGGAGGTTGACACAATTGCAGTCGAAGCGACGACTGGTTTAAACGCAGAGCAGTTAAGAATCGAGGGAATGTTATAATCAGAGAGGCTTAACCCGCTGCTCGTAGCTGCAGATAGCTTTCGGTTTTTGATAATGCCACAAATAGATGAGTGTGACTCGTTTTTTATATTAAAAGGAGTATTATCCGAAAGCCTTAAAGAACTTCCAGTCGGTATTGAAACATTCGTGTCAGGTCTAGTCCATGATCGGGAGCAGGACTCGAAGTCCAGGCTTTGCTCGCTGGGTTCACCGCCACTGAGTTTCTTTGAATACTGATGTTGGTAGTGTCCGTCCTTCTGCTGCCACATGTAGTCCACTACAAAGTTTCTGGAGATGGGCATTAGGGAAAGGTCCCGATCATTCCGAAGCGAGTGCAAAGGGGACAGGACAGTAGAACCGTGCAAGTTGAAAGGAACACCGACAGTAGCGGCTGCTACCGCCGTTACGCCAACCACAGCGGCGGCTGTGGCTACAGTACTATAGTTAAACTGGCTATCAATCTGTCGTTGTGGGAACTCTGGAGACTCCGATTCGCCGTCGCCTTCCTTGGGGTCTCGCTCAATACTCGTTGGGGACCCACAGGAGCTCACTGCCGCAGAA'..b'ACAGTCGTAAATGTTTACCAAAAACGAAATTTGATATTAACTTTTTCATAAAAAATGTTGGAAAATTTTGCATGAGGAAATTTAAGTAAAAAGGGAATAGAAAAAATTCTGAATTTTATGTTATTTGAGCCATTAATTATTTACCAGTAAACATTCGCAATATAAATATTTTAACATATTTTCTGTTGGATGGTTTCTTAAATAATTTCTAAATTTGTAATTTGTTGTATCTTTTGTAACTACATAAGATTTTCATTTCTTCGGGTATATAAGGTAGTCGCGTAAGGTAGTTTCGTACACCCCTCTGGTGCGCTTCGTCACTACTTGTACTGCTGTCCACAGTGATGGTGCTGATGGTTACTAGAAAAATTGCTCGCAATCACTATAGACGTGTGTTTTTTTCCCACCGATTAGGTGATCGTTCCAAGCGTAGGAGATTATATGCTAAACAAGGAAAAACGCTATAGTCGAGTGCCTCGACTATCGGATACCCGTTACTCAGCTTAAGAGAGTAAAAAGGAAATGGTGGTATATAAGCAGAAGAGTGATATTGTAAAGCGCCACCTACCAGCTATTTCATATTCATATTGTGAGCGGCTGTCAGCGTTAAGCGTTTTAACCGTTTGTGGGAATTAAAGTGGGCGTAGCTTCCTTCGCTGCGCAGGAAGCTGAGGAATCTGCATGCCATGTCCGAATCTTCTAGCTTTTATAGTTTCATGCGGACAGACGGAAACGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGGTGCTGATCAAGAATAATAATTGCGAAACCAAACTTTGGCTTGATGAAGTTAATTTCCTTTCTTGTTTTACTTATTAATTGCCGCATTATTTGGTCCTTTTTGTTATGATGACTATCTAGTCTTTTCCCAAACCCATTGCTATGTGACAAAGAATTTTATGAAGCATTTTATTGTCCACTTTTTTTATCAGCTATCTTTATGCTGTACCGATAAGTGAAAACTAAGTGTCTCAACATTCTGAAATACTTTGCTGTCCGAAAAATTCTGTGCTAACTTTTTAAAGAAGTTAAAAAACGAGCCACCCGTTTAATCCAACGATTTGTAATCTGTAATACAAGTTGTCGTCTATACCAATTGATTGCAAGTTTGTTAAGCGATTATGTTACGAACACATCTTCAATCTCGAGTGTTTTATGGTGGGCGTGGAGTTCTGTGCTAATAAACTTGCGTTGCGCAGGGACCTCAAGAATGTGCATGCCAAAAAAGTGTATGTATTTATTCTGAAATTGGTAAGCACTAGACTATATCGCTCCCTCTTGTCTTGAGATCAACTAAGAAGTATTGACGAGATCATTTAATACATTTAAGTTAACAGTTTTTATTTTAGCATTAAAACTTGTGGGCGCCATCAGCACACCTAACTGGGTTTGCAAAACTGGGGAATTTGAATCTGAAATCCCGACCCTCTCGCTCTTTTAGTATTCGGGATCACAGGGTACACACGGACAGGGGCCAGACGGACATGGCTAGATATATACATAGATACTTCACCGCTACCTTTTACCTGTAACATAACACAACTGTTAACTGTAACTCCTCGTATAAAACTTGTGTAGAGGGAAAAATATACAGGTATCCATAACATTCTGGCTGAAAATGAACAATTAGCATAAGACTTACTTACCGATGTCATTTCTAAAGTATTGTCGTTTTTGCCTTCCTTGGGTGCACGTTTACAATTTTTAATCGTTTTTAACACTTTAGGCGTTTAACGGATCTAAGACCTTCTTATTTTATATTTGCAGTCCATCAAATAAATAATATTTTCAACTAATTTTAATAAACCAATTGCCCCAAATTTAAGCTTGGTTTAGTCGTAGGCGTAGTTTTTGACGCACCTAGTTACATTTTTTTTTAAGGTAAACGCGATTCAATGCACTTATGTACATTCACTTGCTCTCAAAGCTGATATTATATTTTTTCTTTAAAAATTTGCTTCCATTTTCATTATATTATATCTGGTATGAGTACCTGAATTTACAACGTATTGTTCTGAAAAAAGGAAATGTCCACTCAATTTTCACTAAAACTTTTAACACATGTTCGTTTTTTCTCTGAGCACTAGAACATCGCATCACATAAAAGGTACGAAAACTGAATAAGGAACACAGTTTTCGTTGATATTGACAAGCTTAAAGAAAATGTAGGATTGAGGAACGGAAACCGATGCTGACCTGTGAAATCGGGAAAACAAAATATACTTAGCCGTATTTCAGCCAATAAGAGACCGAAAACAAAGGAAGCACCACAGGAAAAGGGCGATATATATATACACGAAGTACAAACAACCCAATAAGATAGAGCTCTCCGATTCCGGGGGCGTTTCCGAAGGACCGCGCCTGCGCTCTTTTGTATTAAAAGTTAGTCAAATTCACCCTGCGCTGGATGTGGTGCAATTTTAAATATTTAACTGTTGAATGTTGGTTTTAATTAAATTAAATTTGCCTTAAGATATCGGATAATTTTAATACAAAAATGGTCTCGCAAGAGGCAACTGACTTTTCATATAACTTTTAGAAAGACAAATTATTTTTTCTCTAAAGTGGTGATTTAATTGCATAGAAACACGGAAGAACGTAATAGTCGAGTGCTTCGACTACCAGATACCTGCTACTCAACCCAAGGCCAAGCCTAAGAGCCAGCGGAAAATGGAAATGTATATATACTAATAGAAAACCGATTTTGGAAGGCGCCACCCACCCGCTTTTGTGGTCGTTAGAGTGGGAGTGCCACTCTTTTTTCAGGTCAATCGATAGGTATTGGTAATTTAAATAAATTTCAGTTAAATGTTCTTCTAGCATAAAAAACGTAGGCGCTATAGTTTTTCGCAAATTGTGGGCGTAAGGGCGTAACAACCTTGAAACAAACTTGCGCTGCGCACGTAGCCCAGGAATTTGCATGCCAAATCCCACCCTCTAGCTGTTATATTTTCCGAGATAGTTCACTCAAAACAAACTTAACGTACTTTAAGTAAGTGGTATAAAAAGTGCTGCTGCAAGTGATGCTTATCCAATCTCAGCTGACTCTGCAAGATATTGATCATATTGAGCTCTGCATTTTCAATGAATCTCCTCAATTTATTTAAATTTTTCCAAAATATTTAAAGTTGTGGGCGCCAGACGGCCTCTAGTGTTTTGATCGTTTGCGGGCTTTAGAGTGCGTATGGCACCCTGGTTAAACCAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCCTACGAGTCTCAATGCCAAATAACTAGCTCTTATATCTTCCGAGATCTCAGCGTTCATGGACTGATAAGGAATATATCGGAAAAGCTTTCTTATATCTGTTATACGGATCTCTCGGATCTAGAATACCCTTTAACTTTGTGAAATTAAAAAACTGTTTCATCTATTTCCTGGAAAAGCTTGCAGACACTTCAGTGTGGTGCATATAGGTGCATTCCTGTGTCCAGCTTACACTTGCATTCTGGAAAAATTCAACAGGTACCTTATTTTTGGTCCCGCACCAGTGTATATAGAACAGAAAGATTCTTTACCTCTTGCACACGTTTTTATGACCACTTCCACTTATATACAATGCTCGGTTTGGCGAACTTAATTTAAGTACTACATTGCCCATTGTTCTTTGCTCGCGCAGTAGATTCGGGATCGATGCCGCAGGCGGACTGTTAACCGTACGTTTTTTCAGAAATATAAGTAGCTAACTAATTAAAGCTGTCTACATTTCTCAACCCCTTACTACTGAAAATCTACCGTAACAGTCCGATTCCTAAGAGTAATACACCAATCGTACAATAGGGAATATGTCTTGGTACTAATAGATTTAATTAATTAAATTTGGGACGAATATATTTCGGGATTGCTCGTCTAATTGTAGCCTGCTTTCTGGCGCCGTAGAAAAGCAATAATGCCACAATAATACGTTTTATATTTCCTTCAGCGTTGCCACGTTTCGGCC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/e84/8f2/d3/scaffold_53-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATTTATATTGCGCCCTTAAGTTAAAAAAGGTAAAACATGGCAACGCTGAAAAAAAGTTAAAATTTCGTTCAAAGCGCGCGAATTAATTATTCACATTTAAATTATTATTGAATATTTTCTGTTATAGTGTGTGCGACCTTTCGATCGGACCATCACATCCTCGTGCGCTACACCACTACGTGCACTGCCGGCTTATACTCAGCGGTTTCAATTTCACCGTATTTTTGTTGCTGGCGGGAAACAAGAAAAATAGCCAATATTCAAACACAAGTACTGGTGTGAAACTAGGGAAAAATCGCCCTCAAGTGGTCGGTGGCAAAACTACCATAAGCTTGAAGGTACAAAAGTAGCATGCACGGTATATGGGTAGAAAGGGGATCGTCTATGGCATGTTTTGAGAAATTTGATTTAAAGTGAGGGGTGCTAAGCACATAGAATTTCCGAATTTGTTGTTTTTGCATGTAGTCGAGTGCCTCGACTATAAGACACCCGTTTCTGAAACATTTTTTTTAGGTCAGGTTAAAGGTTTTATTGAGACAAATACATTATACATATTACACAAATACAAAAACAAATTGTTCTTGTGGGCGTTAGAATGGGCGTGGCACGTTTCTTAGGTCAATCCATACAAATACATTTCAGTTAAAATTTTATTTCTGTTATAAAAACTGTAGGCGCTACATTCGAAAATTCCGGGCGTGGCAAACAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGCCCAGGAATGTGCATGCCAAGTCTGACTGTTCTAGCTCTTACAGTGTCCGAGATCTCAGTGTTCATACGGACAGACAGACGGACGGACTGTAATGGCTTGATCGACTCGGCTAGTTATCCTGATCAGGAATGCATTTAATTTATGGGATTGGAAACGCTTCCTTCTACGTGGTAGGTAATACACCTTTTTACTCTAAGAGCAACGGGTATAAAAGCCCCTTTTTTCCAAGTTCCACCATTCCTCCGTCGTTGGTAACTCTCGACGCTAATTTGACGAACATTAGTTTTCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAAACGGACATGGTTTAAAACATCGATGCTTTCATTTGTATCTATTTGATCAATCTATTCGCTGTTGTCTGCTTCCACCATTATATACATCGCCTCGGTTAGTGGTTCTGATTTGGAATATAGAGTTGCAAACGTTTTTTCTACCTGGTATATACTTTCAGACCCTTACTTAATACTTAATACTCGAATTTTGAGTAATAACGGTTGCTTTTGTTACATTTTTATTTTTTGACTGTAGAGTAAGTAAGGCAAGGCAGATAACATTTTAATTCGCCGTATTCATAATCTACATTCTTCGATTCTGTAAACTCGATGTATTCGTTTTATTAACATCTTTTTTGAAGACACCTTCCCCATTTGTGGAAAATGATTTTGTTTTGTCGGGAGTGTGTATCGGCTTTCTACGTGACAGCAAGTAAGCTTTTTACATTGTGGTTCGTGGCATAGTATCCAAGGGTTCAGTTTCTGGATAAAACAGCTGTTCTTATGTCCGTCAGCAATCGAAAAATCTAAACTGCAAATTTGTTAAGAAAAACTATCCATCGATCTACCTACTTAGATCTGGGACCCGAGGACTATTAGAATTTCAAAAATACATAGAAAAATCTTGTCCGCACAGTTCTCTTTTAACTGCCCCCCTCACAGAGAATGTGCCAATATGCACTATACGCGTTAAACTTCGTGTCAAAATCAACCCCACATCGCCTAACAGCGGAACCAATTTGTATTTTTCGCATATAACAAATCCCTTATACGAGCCGATTGGTGATCCCAACAACCCACAGTTTTTGAGAAAACAGCACTCAACAATACTCATAGAGAATGTGCCAATGTAGACGGCATATGGGCAGATTGGGGAGAAAATTTCTCAACAGAGGGAAATCAAAGGGAATTATATCGATATATCGTCAAGTGACGACGCAAAAACTCAATGGAGCCATCTGGCAACGTATTGGAGTCTAAAGTCGGAAAAGACATCTTTTTTGAATGTTCTCATTTTAAGGTATAATTCATCATTCTTCCGTCTGCATTCTCGCGCTTTCCTTATAAGTGGCGGTGACCAAATCACCGGATCGGATCGGAAAGCATATTCCAATTTAAAAGCGGTCACCATAACATTTTTAGCTAACTTGTGTAAGATGAGTAACGGGTACATCGACAGGCTTTTTTTTTGTTTTGTGAATGCTTAAATTATTATCTTCTGAACTTCAAAACGTAAATCCTTCAAGGTTGAAATGGATATTCATTCTTCAGGCATCTATTAAACGTTAAAACTTATTCATACTAATAATAATAAAATACGGAACTAATGTCTCGGTATAACTTCATGTATGACATTTCCATTTTCAATAGAGTTCACAAAAAATATTAAGAAATATTGTCTTAGACCATCTAGTGCTTTACTTCTAATTAAAGAAATCCAGTCTCAAAATGCGCTTTAGCGACTTCCTTCCGAAATTAAATTTATATATGCAGCAGTTTTAAAAATTATTAAAACTCGTTTTACGGACATCATTTTTTCCGTATAATAATCGAAAAAAGGAAGAATTCACAAGGATGAAAACCAATCTTAGCATAGATTAAATTGGAAACAAAAGAAAAACAAATTATAAAGTATATTAGTACACTCTAAGAAACTTTTGAAAAAATAGTCCAAGCAGCTAGGTATTTGAGGAGGAAGCACAAACGAAAACTAAGATTTATAAATCCGATGGACGAAGAAAGCAAAACAGAATTTGTGGTTTTCCAGACGTTGTTCAAAAGGGCACAGAGAGTTCGGATCGCAGCATTTTATCGTTGAATTATCCCATCGAATTATTATGCGACTTGAAACCTAAAGAAGAATTTTTAGGCGGTGCTGTCTGCAAAGAAGAAAGCGATTCTAACTCATCTTTATTTTTTTTTATAAAATTAAAAAAAATAAATAAAATATAACAAATAAGGAGAATAGTGAATAGTTCAGGTGTTTATAATTTATTCCAAAAAATACGTCAAAGTTCCCATAGTGCATTCGGTACCAAATAACTATTTTCGTTAGAGAACATCATTAGACATAGGGTAAAAGAAATCAAAGCCTCGATCATAAGATACCCATTACATAGTTAACTAGCGTTACAATAAATGTAAAGTCAACTTTTAGTTCAATCTATTGGCTGGAACGTCATTGAGGACTCTCTTGCTAGATAAAGGCGTAAATGTCTTAATAATAATAATGACCAACTTGAACAATTTTTCGGCGATCCGTATGGTACTGTCAAGTGTAATAAAATATAACTTTTATAAATGGTAATCTTTGAAAATGTAGGCGCTACACAATGGTTGTTTGTCAACCTTATGGTGGGCTGGCACCCGGGAGGTATATAAGCAGCAATGCTATATTTTAGGGCGCCACCTACCGGCTATTTCAGTCGATTTTATGTGGACGGCAGACAGACTTAAGCGTTTTAACCGTTTGAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATTGATGAGGCAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGCTTTTATCATAAACGCTGTGGTCGCTACAGATTTTCTCCGATTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCCCGCTGAAACCCAGGAATCCGCATACCAAGTTAGACTGTTCTAGCTCTTCTAGTTTCCGAGATCTCAGGGTTCATACGAAGAGACAGACGTGGCTAGATCGACTCGGCTTTATGGGGTCGGAAACGGATCATCCAAATTTGAGGTAATTATCCTCACCGGCCCCAAACGGTTCAATTTACTAATTTTCACTCTCCCAAACTAATTGATTTCCTTAATGTCTTGCTATGCAATTCTTATAGATTTTACAATACCTTTCGGTTGTTGTGTCAGTCGTAACAATCGGACGATTACTGCAGACTTTAATTTCTTCGTGTATCTATAGTAGTCGCCTTCGCA'..b'TCGTCCAGTGACGATGATCAAGAATATAATTACTTTATAGGGTCGGAAACGTCTTCCTCACAAATCATTATACCCTCTGAAAGGGTATACAAATATAAAGAGTTCTTAGATGATTCAAAGTCTTTTGAAGGGTACAAAAAGCATTGAAAGCAAAATATCGCTTTTTAAACATTGCGCTAATAAATTCATGGCCATGCCTGACCTGAACTACCAGAAGAACTTGTAAGCTTATTTCACGATAGAAGTTGTTCTGGATGTTTAGACCTTAAAGAGGGATGAAAAAAGCTAATTTCAAAATGAATAATATTTTAGCATTTTGAAGAAGGTAGTAAGCGTTGGAGCGGGCGGAATCTAAATCTGAAATTATAACCTTTTAGACCTTTTAGATTTCGAGATCTCAGCATACACACGGTCCGACGGACATGGCTAGATCAATTCGGCTGATCAAATATATATATATTCTTTTTATAAACTTGTACTCTGCGCGTCAAGAGTATTAAAAGCCAAGTTTTCGGCATTTTAAACAAAACATTTTTACAGGCCTGAGAATAAAATATACGCTGACAAAAAGTTTCAAACTTCGTCTTTCAAGTAAAGTCGTATAGTCCCAGGTCGGTCAAACATCGGTGGGCGGAGACCTTTAGAAGAAGCACGCGTTTCGTATTATTTGCCGGATACGGAAATATTATTTTAAATAACTGCGCACCATCACGAAGAAAACATGCAACCGTGGGTTCGTCAAGGGACTGAAAGTGTGTGTACATCGTTCCAAACTGCTCTTGGTCTTATTAAGTGGTAATGGTAAGGGTAAAGTGTGCGTGTGCACGGGAAATTAATAAAGGAGCGTGCAGAATCTGATTCGTAATATTTGCTTATTCTCGCTTATTAATTTATTGCTTGGATGAAAAAAATCTTGAAATGATGAAGTAATTTCGTTTATAGTCATACGATTTTTTCGAAAAGTCAGTAGTGGAAGGTCGAGGTATGGGCCATTATAAAACGTTATTTAGGTTTCATGTATAAAACGATGTACGAGTATAACATGGTAAAATTTAAAGCCCTATGATCGTTACTGATTTAGAAGGAACATTTCTATTCCTCTTTCGTTATACTTGAGTGCGTCTTTATTATTTCTTATTATTTCTAGTCGGTAGCGATTGAGAGATACAACCTTTGTCAATACATTTCGTTGCGTTGACAACGCAGCAGAAAAGTGGCCAGCCGATAGCAGTGCGAGCGTTTAAATCTCTATTTACTGCACCTCGTATCCAGCAGCGATTTGCGGGTGTGGAGGTTGCTTGAGTTGCTGTTTTTGAACAGGGCTTACGCTTTACATCATCATCATCATCGGCACACGGCTCTCGTCCATCCTCATCCTCGTTTATAATCGATGCTCTTGCACTCGTCCAACCACACTCAGGAAAATTTCGAATTCGCAAGTTCAAATTAATAACATCTGACAACTAAAATATTTTTTAACGGATAACTAGATTATTGTCTGCAGGCCAATGAAATCTTAAAAACTTTTGTGATTTTTGGGCGGCACAGTCGGCCTAAAACACGATCCAAATAAACTTGCGCTGCGCAGGAATACGTATAATAGGCATATTATTAACACATTAATAGTGGCCGAGATCGCAGAGACCCTTAGGAAGAATTGCCAGACAGACGCATAAATACTCTTTATGGACGAAAACGCTTTATACTACCTCTTCCGACAAAAACTGGTCTCATGGACTGCACGGTGTGTAATCTCCGACCTTCCGATTTTCGTATTGTTATTGGAACTAGCTTTTAAGACCAAGCACTTAATTTGCTATCCATTTATGGGTTGCTGGCATTTTTCTCTTAGTTTTTCTCAGTGTCCTCTAGCCAACGCCACCAGTCACCCACCACCCACCACCTCCTGCTGTTGCCAGCGAACTCCAAAGACCGCCTGAAACTGAAACAGCCGTCTGCCACGTGGCGCTGACAAACTGCTTAAACACGCCATTGATGATTCAAATATAGTCTGGTTGGGTCTCTAGCCGCCGCCTTTCTCCCCTTTTGCGCTCGACAAATTACACACTTTGCGGCATTTTGCGCTTTTAACAATTTTATTGTTATCGATCGGTGGTCACCAGGCTGCCAATTACCAAGTGCTGGAGCAGATAAATTCTAATTGTGCCAATGAAATTCAGAATCTGCATTGTGATCCGTTCGCGTTCTTAGTGACGATAAATATTTTGTTGGTGTGTATACAACGTACACAGAAATAGTTACATGTGTCAATTATGTGGGCTACGAAGTACTGGTCTTTGGTAAATATGCATATAGCTTAGACACTTACATAAATCGATTTGAGACTACACGTGTTGAAAGGGATTAATGTGTGGTCATCGAAGGTAGCGATGTTGTAGTCGTACTCATAAAGGATTACACGAGTGATTTCAAAGCATCAAATTGCATCGCTCAGAGAAAACACACTTCTCACTGTTCTCGATTTCAGTATTTTTGATCTCAAAAGTGAGCCAAGATTCATACTCGAGTTGTCGAATCCGAGATTGAAGTCTTTTTGGTTTGCGATCGGTTTTTGAGAATGAAGTTTTCTCGGTTTCCACACCGAAACGATATCGAGATCATCATCATTTCCGGATTCAAGCATAAATCATCATCTGAAATACAAATGCTACATTTTTTAAAAGTTATTGATAATTGCCGATATTTCTTATAACATATTTCGTTGTGGCGTGTTTCATCTCAATTCAGAAGGCTGTAACGTGATTGTGTTGTGCAACAGCGATAATATAAAAAAAATCTAATTTTTAAAGGTTGCGTTGTTTGAAAACTTAACGAAAAACCTCTTAACGGGGTAAGGGGTCGTGGAGATCACTTCATCAAAATACAAAAGTATCGAAATCGACTTTTGTGATGTGTAAATGTAAAGAATGAATCACTTTCTAAAATGTTATCATTCTGCTGCTTCAGCCAAATATTATAGCTTCTCGCATCGAAGGTATATTTTATTGAAACGTGTCGAATAAGAAAATGTTCGAAGGTGTATTTATCTAGTCGAATTTATCAGCATTATTATTCAGCATCACTACACAAGTCGATCGCACTATGTCCGTTTGTCAGTTTTGAAGCTATCGGGCTGAAAATTTCCCAAAAGTCTTCTCCCGGAAAGAGCCGGATCTATTGTTTCAAAGGTTTTGATTCGAATAAACGTTATTGCACCAAAAAAAAAACTTTGAGTGTTAACTTGATAAGAGTGGTTGAAAATGACAATACACCTAGGATCAATTTTAATTTAATTTAAATGAGTGTCAAAAGAAGAGTGCATCGTATGAAAAATCGTATTTGATCCTAATTAGTGTAGTTTTGTCTTTCTATTTTCGAAATTTGAACTGCGCCTATCTTGCAAGCGTACTTATCGGTAGAAAATTGTGAGCTCGACATTGTAAAAAGAAGACGAATGTGAATAATACCAAAATTTTTAGAATTACTGTTTTTTGAATCAGTTTAGTAGTTTTCATATAAATATACTAATCTTATAGGAATTAATATCTTAATGGTGTAATACAATTCTCATAAGCAGCACTTACATTTGTATGTATATTTAGAAAGCAGTTGGTAGTTACATATATGCATATATAAGTGTATAATTATGAAGCACTAACGGTGACATCGCTTGTAATTTTCTAATGCAATTTGTTTTTTTCATTTAAGTTTTTTATGTAAGGGGACAACGGTGGACGACGTTTTTGAGCAGCAACTGCTCAAGTGCTATATATTTGGACGGATACATATTGACATTATATTATGCAATAATAATATATAATAATAATACAAAAGTCTTTCATTTAGTCTCCAGGGATTGCCTAGGCTTAAAGCAAATATTTTTAACATTAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATAGCCTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAAC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GGGCGTTACAGTGTGGTGGGAAACGATAGGGATTGACAAGAACAATGCATGTCAGTAAAAATGTTGTTTCTAGCATTAAAGATGAAGGCACTACAGTCTTTCGCGAATTGTGCTATAATAACCTTTTAATCTACGAGTTATACCCGTTAAATAGCAGTAGAAATAACAAAAATACATTTGACATTCATTTTGTGGTCCTTCCTATTGCAGCAATATAATATAGAAACAAACTTGTTTCCTAACTATGAAATAATAATTGAAATATGCTACATATATATTGGAGTAGAAGAAGAAAGCTATAATTGTTTTCCTACGATTTTCCCGTTATTTATCCGATCGTTCCTATAGCAGGTATATAAAATAAAAGGTGTAAGTAATCAAGAAAAGAAGTATTTCTATACCCTTAAGCATTATATATACCAATCTTTCCGGTTTTTGAAATAATTTCAGAAATATTAAGATATTGTTCCATTTTAATTTACTGGCATATGTTTACCGAAAATGAAAAATCCTTTTGTATTTTTTTTTGACATTTATTTCTCATTCTGTTAGCTATATGATACAGCAGTCCGATTTGCAATATGTCAAATAACACATCATTTATCATTTATCATTTTTCATAATAATATTTATATATAATAATTATAATATTAATACATTTTTGTAATTCGGCATCGTGTATATATAAAATATAAATATTATATTAAAAGGCATTGAAAAGTCCTTAGCATATATGTTCTTGTGATATTTTAAATGATATAATATGTTGAATGACATTTTACAAAATAAATATAATTTTAAAACAAAAATTATGATAGATTTATCACAAAGTACCCAAGTGGTATTTCCCAAATTTTTCTTGAACACTGTTTTGGTCTTTAACTTACATAATAAAATTTTTTGAGATAGAAATTAAAAGTTATTTTCCTTGCTTAATACTCAGGCTCTCGTAGCATAATTTTTTTATATCGCATTTTTTTACGAAAAGAATATTATTTAATAATCCCTTGTGGATTATCCGACGCGGATACGGACAGTCTTAAATATGTATGTACCTATTTCAAAAATAGCTTGATTGCGAATGAAATTTTTTACCGCCTTTATTTATACCCTGCAGTTATGACCAAAATTCGCTAGTTTATAAGGCCAGATCTCAGATATATTTCTTAAACCTTTATCAAAACTACAAAGCGCCAAACAACAACGAAGTTATGAACACTAGTCCCTGTTAATAGGATTAAAATATCATGTATATTTTTCAAAATGCGCAAACCTGACAGCTAGTGTAGTTCAAAAATATGTATGTATACTTTGAAGGGAAGACATGTTTTTCGATGCCTTTCGACCGACATTATAATCCTAAAAATGTATAAAAATAACTTAAACTGGGTATACAATTATTTATAGGCATTGTAAATAAGTAACAACAACATATTAGTTATTAAGCAGCGTTTCCAATTTTTCCGGGTAGCATTAAGATAAAGTAATATATGGCTAAATTACTATTGCAATATAAAACGTAATTACACAATATCTATATTTTGAGTTTATGATGATTTCTGTTTTTCAATATTCTTCAATTATATTTTATGTTTTTAAAAACACGTAAAGTAACAAATTTATAAACATATACATGGATAAAAAAATTTTGTAATTGCGGATAATTGACGAACGAATGTAACAACAAACGAAGAGCATTGCATCGAATGAAGGAAATACACCAACATCTCATCCAAATACACACCTCCCCGAAAAAGCCTTCAGGTTTATACAACAAAAGTCGTATTTAATACTATATATGGTTCAAATTTATATTTAGAAATAATTATTGTAACATTTCAGAATATACGGATGTATATGATGTTCTTAAGAAAGATTTATTAAAATCGAACTTATATGTATGTCTTAATTTTTTATTTATTGAATCTTTAATGAAAAAAGGAAACGTTATAGGCCATGCCATCGACTATCAAGTACCCTTTACTCAGCTTAGGGGAGTGCGGGGGAAATGGATATAAAATCAAAGCGACTCTATACATGATTGCACAAATATTTGCATATAAATGCTTAAGAAATGACTAGCTAGCTATGTCCGTCTCACTGCGGCTGGTGACTCTGATCAAGAATATAAATACCTTTCACTCTACGAGAAATGGGTATAATAACAAAGCTACACCAAGTGTTATTTTGATAATTATGGGTGAATCTTGTACTTCACCTAGAATCAAGTTTTTGGAATCAATTTTATCCTAAATATGTGTCAAAAGTATACCACATTGTATGAAAGATGTTATTTCATCCTTTTAAGTGTCATTTGACCAAATCCACGGTCTCTCATTATTGTGTAGAAAAGGCGATAAATATTTCAGAGTTAAGGTTTATTAAATCAGGTAAGAAAAATCCATAAGCAAATAAAATAAAAAAATTTTAAAACAATTAGTTTACTTAACGTACCTGTGGTTCATGAAGAGGAGACGAGTAGGCGGCCTTGTAAGGATTACCAGTACGGGAGGCCTGTATAATCGGGAACAAACTTCGAGCCAAATCAAAGTCAGGCAGACACAGCCGTCTAGTCTAGACGTTCAGGACAACACAAGTTACCGAATTGGGAAAAAATCTGTTAAGTAGAAAATTGACAGGCATGGAACGCGAATCCTGCCGATCCAAACGTGAAGTTGACAGGTTGTGTCATCTAGGGTAAGCCTGGAAACCGCAGCCATTGGCTTCCTTGAGTCTGAGATGCGACCCAAATCAACGACAAGCCGAGTGCTTCGGAAAATTGTTCAGGGGAACAAGGACATTTCAGGAAGGCACAACGCACAGCAAGGTGATCTGAGTGATCGGGGTCACTAAGCAAGTCGATATAGCCATGTCCGTCGTCCTTTGTGAACGCTGTAAAATCGGAAACTTTAAAAGCTAGTGTGATATATCCGTGCTTAAATGATTTTAACTTCCTAATCGTCTGTTTGCATGTAGGTTTTAATGTGTAAGATCGTCACAAGGCATCCTTGACCGTTTTTTGTTGTTGCATGCCGCAAACTTTGACAATCGCTCTAAAAAAGGATCATGTCGATTGGAGCACGGAAAACGCCATTCCCCCGTATCTTTGAAGGCGTGCCAAATCTAATATAAATTTTCCCCCGTTTCTCGGGTAAAACTTGTCTTGTAGCGAAGAACAAGAAAAGAGCGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCGACATTGTGAGGGAGACATTTCTTGACCAGTAGCACTATACGAAATGATCTAGCCGCTCCCGTCTGTCTGTTTGTGTGCTAATCATTCTTTCAGTTTTAAAGTTTTAAGTTTTCAGACAACTACATTCTATAGCTCCCACATGTATGAACAAAAAATATTTTATTAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGACAAGCCGAAGTTATATATTTTTAAGGATTGTTGATAACTTCAGTTATATAAATAAAGTAGTCCGATTTTTATACCCTAGCAGGGGGTAGAATAATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCTGTCTGTCCGATGACTCGGGAGTAGAGTTTTTTCACTTATAATTTTTGTTAAGAGCTGATAAACAATAAAAAGTGCACTTAAAAATGTCACAAATATGGGTTGTTTGCGGAAAGACCTGTTCTCACAATTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAAAGGACAATTTTACACAGTTTACAATTGTATATTTGTTCAAATATATTACACGTACGTATACACACACATAGATTAAAATACCATAATTTTCATATAAACGTTACTTAGAGAATACAAGTAGAAAGACGTTTCGTTTTTAAAGTTAGTCCGGCCTTCTTATATATATATACCCTTGCAAAATATATATAGCCATTACGGAACAAACAAGAATTGTCAGAAAATTAGTATGCGAGTTTGTAATAAAATTATTCAATTTAACTTATTGTTCCACTCCGCTTATTGTATAGATACAT'..b'TTTCGGTATGGGGAGGCAACATATCTAAGTTATTGCAAAATATTGGCTGTTGTATAATGCTTGCATAAACATTCATTGGTCGAAAATCAATGGACTGGCGTATTAGTTTTTCTTCACTAAGAGAGTATCTCGCCTCATGTGTGCACGCATCAACAGGACCCTTATCTACCTGCCCCTTTACAGCGCGAAAAAGCATATATAACGGCTCTCCAGCACACTCCTTCAAAAACTTGTACAGAAGAAAGGTAAACCAAGCACTTAACATTTTTTCTGCCACACTTTCAGTTCGCCTTAATAAGAGTTTCGGGTGACTCTTTCCCTCTATACATTTTTCAATCAAGTCTCCCAATAAAGTTTTTAATATATCTGTGCAGTATTCCAATTTCGATTGTAGTGTGACCATAATTAATGAGGCCACATTTACTCGTTCACGCATAGAAAAGTATCGATTCGACTCTAAGGTTCGAATAAAAAGTAGCAGAAAAGTTTTGTTCATAATAAGTTGGCCAAAAATACGCAACCCTTTTTCCTTTCGAAGAAGCTCAGGTCGCTCCCATTGCAGTACAATGTGGTCTTCATGATTCGGAAAAAGAATCTTCATTGCATACGATCGATAATCCAAAAACGGAATGCCTCCAGAGGTAAGATCCCCTGTGAGGTCAGTCATCTCTGTTTGGAGTTCTGCAAACGCCTCCTTACATTCAGCTGCGACACGTAACTCTAATATATCCATTTGTTCCTGCATGTTTCGAAGCACCCGGTTAGACTCTGAACTTTTCTTTTTATATGCCACGAGCAAAGCAACAAAAATCAGCAATAAGATAACAATTGTCGCTATTACTGCAAATATTACGTTTTCTCCCCAATCCAAAATTATGTTTGATGATTCGTAGCTAAGGATACCAATACGGTACTCCAGCGAAGTTCCAATACGAACAATTACTTCTGGTCCATTGATGCTTTTAGTTGCCGTTGCTTCAGGAGGAGGTCTACATGTAAGTTGTTGTCTTGAAAGAGACGTAATATTGCAAAATCCATTTCCTATTTTTACTTCCACATCAGTCTCTTTGCAGGCGCGATCTAGGTTTCGGCCATTTATTGTCAAATATTCACTCTTGAAGTACTTAACCCTTTCTTCAAATATAAAATATTCGGGATTAGGATAAAGTTCAAAATGGTTATTATGAATCTTCGATAAATTTTGTACCCGCAAAACATTATCCATAAGGAACCCATATTCTAGAAGCATTGGCCTTTCTGCTTCAATAATTTTGCTGTCCACGTCGATAGCTGGAGATGAGCATTCCATTTCAGTATCCGATTGCACTCGGCATTGGCTTGCATATATCTCTCCATTGTATACTACGTAAATGTTGGGATTTTGAATACTGGTGAATTGGGTACCAATCACGGAAATTCGAATGCCCCCAGCTGGTATTCCTTTCGGTATCTTTATTTGTCCACTTGGCCCTGAACTAACGTGTTCAACTGTAGGATCCAGAACATATTTGAAGTTATAGTCATTAAACTCTCGGGGACCATTATCGAACGACATTTTTAGCCTTCCTTCAATGATACCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGATTCGTCACCAGTCATGACCCTTTTGAGTAAATTTGGGTCGTCGTTGACGTCATCCAACAGCTCTTGAGCGATGCTCATGCGACGGTTCTTTTGGTCAAAATTCAGCAATTTTGGAACAAACTTCGCTGACACACGACTCATGCCCAAAATTTGAAAAAATTTCATGGCACGAGCTAAGCGATATACCGACATCTTCAGCAACTTCTCTGATAGTGATTCGACGATTTTCCAAAACAATTTTCTTCACTGCTTGAACGTTTTCATCAGTTGTTGACGTGCTTGGGCGTCTATAGCGAGGCTCCTCATTGGCATCTTCCCGGCCATCTTGGAAGAGTTTGTACCACTTGTAAACATTTTTTTTACTCAGAACAATTTTACCGTATGCCACTGTCAACATTTTAAGTGTTTCGGAGCACTTAATTTTATTTTTTACACAAAATTTGATGCAAATCCTTTGATCCATATTTTTTGGTAGCAAAAAATCGCTGAGCACGCAAAACAACTTGTAAATTTACGCCTCTCACAACTAAACAAAAAAGGGGATTCAATTGAAACTTGGTACACATGTTAGGGAAGAGTGTACCAACATAACAAAACAAAACAATCGATAATCGAAAATATGTCGCCTGCGAAATTTGAAAAGTCACCTTACTTTTTGAACACACCTCGAACCTCAAGAAAAGAAGTATATGTGCATTGAAATTATTAAAAAACAAAAAAGGAAGTTAACTTCGACAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCCGTAATTTTATTACATTGAATTCGAAATATTATAATTCCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCTTAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTCCTCACCAATTATCCGATCGTAAGGCAATTATATTATTATTGAACACATAACATGGAAACCATAAAGTTACTAAATCCCATCTTAATGCTCTAAAAAAGTATAAAAATGCATTGCACTACCTTTCGTGCCCAAAGCGTACATTAAACTCTAAGAGAAAAGTCCTTATTCAAAAAGGGGGATTTCTACCGATTCTAATAACTTCATTGCTTTCTGGAATTTTTGGAAAAATATTAAAAAATGATTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATGGTTATTATGAATCTTCGATAAATTTTGTACCCGCAAAACATTATCCATAAGGAACCCATATTCTAGAAGCATTGGCCTTTCTGCTTCAATAATTTTGCTGTCCACGTCGATAGCTGGAGATGAGCATTCCATTTCAGTATCCGATTGCACTCGGCATTGGCTTGCATATATCTCTCCATTGTATACTACGTAAATGTTGGGATTTTGAATACTGGTGAATTGGGTACCAATCACGGAAATTCGAATGCCCCCAGCTGGTATTCCTTTCGGTATCTTTATTTGTCCACTTGGCCCTGAACTAACGTGTTCAACTGTAGGATCCAGAACATATTTGAAGTTATAGTCATTAAACTCTCGGGGACCATTATCGAACGACATTTTTAGCCTTCCTTCAATGATACCAGGAGAAGGTGAAGTGCGACATATAGCTTGTGAAGAATCTGTGCTTAGAATTTTGCAGGGCAAATGATCATTTATTGATGCTTGTATACGAGAGCCTGCATTTAAGTGCTTTCCAGTTATATGTATTTCAGTTCCACCAGAAGTTGGACCAAACTTAGGATTAAAATCCAAAATTTTCGGGTCAACAAATTCGTAGTCTTCCTTAGATTCACCTCGATAATCCCCTATTTGTACCACTATTTTGCCGTTTCTGTACATTTGTTCTCCAGGACTATCTACAGTACATACGATTTGCTTTGTGTCAATGTAAAATTGCGGAAACGGCATACAATTTATCCCAGCTATTCGAACGCCTGAATAAATATCGTTATAATTTTTGCCCAAATTGATACCACGAATTGTTATGTTAGTTCCTCCTTCCCAGGGACCCGTTTTCGGTTCGAAAGTGTGAATTTCAGGGTTTGGGCAAATTTCACTTCGATTTAACCAATCAGTTTTCCCCTCTTTGTTCTTATTACATTGCTCTTCAACTTCGCATGTATTAGTAGAAGAACACCATCCGCAATTGTACTTTTCGGCTAGGGCTAAACAAATTCCACAGCTATCGGCCATTTCTCGACATCGATAAATAACAACTGCAACACATAATATTTGAAAAGAATAGAAGGATGTTTATAAGGATCATACTTTATTATAAACTTACCATGTATATTATGAGGGTTGTCAAGAGGTTTGGAACCACCCCATATAACAGCGAATGTGGCTGTCAAATTGGGCGATCTTGAGGTGTACTGAAACTCCATGCTATCGCAGTAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATGGTATCACCCAACAATTGAGCATTTAAACTCGTTACACGTCCTTCGATATTAAATTGGCAAACGAAACGCGTTTGAACTATAAATTGTCCTATTATATGAACTTTAACTTTTATAGATTTGCTTGTTCCACCAGACACCAGTACTTCACTTCCATCACCTGTAGCGTTGATCGTTGGACAAAATCCAGGACCTGATCTATAGCTTGGGCCTATCCGGCTAACGCCTGTAACCAAAATATCGTTGCGACAATTTTCAGCCGTGTCGTGTGTGCACCGGTGTGCCTCAACACACCAATCGCACGGAAACTCCGAGGACACACAACGGGTACACGATGAGTGTGTACTGCAATCAAAGAAAGTAAAATCCGTTGACACTAAGTCAGGTCCATTTCTGGTACGCACAGATAGTTTGGCTGTAAAATGATGTTTCCCTTGTTCAATTTGGGGAAGCATGTCCGTTCGCGGTGTTGTACAGTTCACGCCATTTCTCTTTTTCGTGGCATTTGTGAAGAGTGCTTTATCCTCTGTGGTAAATGCACATATTAAATTCTCCTTTAGTTGCGGCAAGTGATCTATGATAAGCTCTAAAGTCCGAGCAGTAGTACGCTGTAGCTGGTGAGGCACAACACTTGTTATTGTAGTACATTTCCCAGTTTTATAGCTGACCCAATATAAAGGATCGTTGGCGTCGTCCTGGCAATTGGATCGTGGGCTACATTTATTCTCCAATGAGCACCAACCGCAATATGGGTCTCTAGCACCTAGGCATTCTCCACATGTCTTGTAATCAGAGCAATCAAACACTTTAACTTTTGATACTTTAGTTTCGGACATGACATACATGTAAAGGTTTTGGTTGTCAAACTGCATATCCTGATTAATTTCAGAGCCCAAGTCCACAGGAAAACTGGCGTACTCATTCGCAACAGATGAAGATTCGACTACAACTTTCTTGAGGTATCCATCTGCTGTGCCCACGAATACAACGGTATATCCACTAGTGCTCGTTGCAGCAACTGAAGTTAACTTCGTGTTAAACATAGCAACCGGCACTGAAGTAATAGGATTCTCTCCTCCCAACGGAGAATTTACATCGAGTCCACAAAAATCCTCTCCAATTGTTTGTAGTTTCTGAAAAAATATTAATATTATTAATATAAGGTGAATTTGTTTTGGATTTTCGTGGTATGGTGCACTAGAATTTCTTTGAGGATATCGGGATAAAATGGATTTGGAAAAATTTAAAAGATTTTTCATTTTACAAACAAAATTATCATACTTTTCGGTACATGTTATATGATGTTATATGGGCGACAGACAGTTTTTAGCGATTTAGCCGTTTGGGGGCGTTGGATTGGGCGTAGCAAACAGGTCAATCAAAAGGTTTTAATAACACAAATACATTTTAGCAAAAAACAAGAAGTTAAGTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACACTTGCAGTTATAAGAAATAATCAACTTTAGTAAATAATTGGTTCCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATATCGTCTTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCCAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGTTAAATGCTTAAAAAACACCGAAGATATTTTTTTTTTTTTAATTTTTACCCCGTTCCGGCTGGTTTTGACTTACATATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAATGTTTCAATCCGAAAGCTTCAAAACTCAGAGACTAGTTTGCATAGAAACGGACAGACAGACGGGCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAGTATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTTTTCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGAATACAAAATTGTATAGCATGACGACTGTGGATACCACAGTTTTGGGCGGTTTGTTGGTGTTAGAGTGGGCATGGCATATTTTTTTTTTTGCTGTGGGCGTTAGAGTGGGCTTGGCACCCTACTGAAATAAACGTGCTCTGCGCAGAAAGCCCTTTTATAGTTTCGGACAGACGGACATGGCTAGATCAACTCAGGTTGTGATCCTGATCAAGAATTTAGAGTAAGCTGGCAAAGGGACTCCATCGGATAATCAATGGACAAATAAGAGGAGAGTAATTATGGCTTCTGTCTCTTTAATTTTCTAAAAATTGTAAAGCTTTATTTATATATTATAGCATGTATAAACTTCGACTAGCCGAAATTAGTTTTCGTTTTTGTTTGTTGTATTCAGACAATCAAAAGTTACACTATCGATCATTTTGCAGCTCTATTTCATCATATTGAGATACATATGTAGTTTTTACTTACCGTTAAAACACATGGCATGCTGGGTGATATAAAGTCAAGTCCCCTCATCCCATTACCGTTAAAACAGGATTTTATGTTTTGCATAAATTTACGACGAATGGATTTCAATGAGTAAATGCATAGTGCAGAGTTGTTAGTTGGTGTGTTTCCGTCGCCTTTTGAAAAAGCAGCGAATAACACGTCATCCTGAATGGATATACCCAGACTTTGAGCCAAATCCGAGCTAGGTTTTCCCAAGAAACCGGCCTGAACCAAGTTGAATTTAGTGCCGCCCTGGGCATCACTTATACATTCGACTGGAATTTCCGTGTATGAATAATAGTTTGAATCTTCCTGGCATATTCGCACAAGCTTCGTTATATACTCTTTGGGAGAGGAATGGTGACTGTGCTTTAACTGCGTGGTAAGAAAATATGAGAATCGCTCAGAGCTGAATCCGAAAACGTAGTTCACAAAATATGTTTCACGTGCGTAAGAATTAATAAAAGTTCTCGTTCCAGTCGTAACCGCCGAAGAAGCAATCTGAAACATTTTCGTTTTTTCAAGAGAGCGCGAAGCCACGGCTGGGATTTCACTTCGGTATGGCGAATTGTTAGTATAAGTAACTCCGACATACATCACATTTGTCACTGGATGCTGTGGAGGGCCCGGTGCTATAAAAGCCACGGTTGACGAATTAGCATCATTTGCAACAACCGCATCGGGCACTTCATGCTCAATTATGCTAACATTCTGAAGATTACGAACTGTGCATGTTCCCTGAAATAGTGATCCGCATGAAATAAGTCGAGAAGTCGCACGATCTATGAGCAAAACTTTATTATAGTTGTCCGTCGGACTGCGAACAGCATTCAACGGGCAGTCGAGTATACTACACTCTACCGAATCGTTTTGGGGTCCCGTTTTTACCGTTTCGGACAGCTCCAAATCAGGCGATAGCTGATACAACCTATTAACACCACCAACAAAGACTCGTCCAGTAATGGTGTCCACTAACAAGTGATTTAATTTCGTGTCAAACGTAGCTACATTTGTAATGGTGGTACTATGGTTATTTGCATCCTTTACCGTCGCATTAACATCAGTCATATTTATGGGTTCATTTTGAATAGCCGTCTTGTCAGACCAAATATTTGCTGCCAGTGTCTGAGAACCTGCTATTAAGTTCAGCCTGTGGTCATATTTATCTCCTAGAGTTGCTATTAGCAGCACACTAAGAATAAAATTCATCTCCAAAATCGCTCCTTCAAAAGGGCGTCCAATTCACGTATTAAGTTAAAAGTCCAGATGCAGTTGACAGTATATTTCCCTTTTATGTTTCCAGTGATTTATTATTTATTATATTGTTTAAATTGCTGGTATTCCTGGTCTTTTGTATATCCACTTATCCACAATTGTTTTCCATTTGTAGCAGTGACTATTATTACAGAAAAGCAAGGAATTTATTTATTGTTATGAATAGCAACATCATTGAATCTGCAAAATCGTATAAAATTTAAAAAGGAATTAGAATTAAAAATATTGGTTGCACATAAAAGACAATTGTTTTTTATGTTCAAATTAATATTATTTCATTCTTACTTTGCAAAACTTATTTAGGGTACG'..b'ATCGCATATTTTTAGTTAATTTGACTTAATTTTATATTTCAGTTAGCTAATTTGTTTTGTTTTTCATATACTTATTTTTTATCGAAATTTATAATGCTACATTGTAGATACCTAATGCTTTACAGTTTTATAAATCGTTAATGCTAACTGGAGTAAATTTTATTCGCCTGTATTCACACATTTTAATAAGCTTTCATGTGTGTGTATGTATTTAAAGAACAAGTATAAGCGGACTGCATAAACAAATGATTATTTGTATCATAGTAGGCGATTATTTTAAAAGATTACGTAAAGTGGTTGGAATTATTTTATTTCTTATTCCAATAGATACAAAGGTATTCATTTTATTTAAGTTTGATATCAATTTAAGTTAAATGATAAACTTATTTCTCCCCTTGAGAACATTTAAATTTACAATCTTATAATTGGTACAAAGATATTTACAATAAATATTCCATGTACCAATATTATGTTCAATTTTGTATATTCGTGTTATTTGTTCTTTTAATTTATAAAGTGACTATAGTTTTCTAGGGGACATCTGAAATGCGGATACATGCTTTTAATTGTATATTATTTTTAAACATAGAATAACAGGGGACACAAAACACCTGAAAACAAAGAAGACAATAATAAAATTCGGACTAACAACTTTATTCGCAAATACTATTGCGCCCTCTAATTATAAATATAGCACTTTTATTCATGTGCATAATGACAGTTTATATTCCATTGACTAACGCCCACTACTTTTGGGGTATAAAATCGAATGTAGTAGCTCCGCTTATTTTGGCAGTTGCACTTCGATGAAAGTGAACATTTTGCCATTTGTTGTCGCGTTTGTGCCAGACGCGGGTCTCCTCAGACTGATGAGTGTGTGCATGTCCTTGCCTTTATATACAAAAAAAAACAATTAATTTAAAGTTGATCATATCTTTGTAAAGTACTTACTTGTCAATATACTGTGTAAGTCTGACATAGGCAATGCACGCGGCCTCTTCACCCAATAAGTGCACGTGGGGATTTAATATAGTTGTGTTTATAGCTTTGCAATTTTTACCAAGAACTGAAATGATAATTTAATAACTATCTAACTATTATCTTACGAATATAACTTTAACTCACCATTTTCAAAGTAAAATTTATGAAAATCAATTCCTTCGACTAGATTACCCAAAGCTTCTGGCTCAAAGGCAGTAAGATGGGGATCACATATTTTGCTAAAGAATATAAAAAAATTTATGTTGAACTATTTAAAAAAAATGTTCGATCAGTTTCTAGACTCGTAACCTAATATAATGTGTTTTAATTATTTTTGGGGCGCATCGGCTTAATTACTGAAAATTTGGAAAAGCTCTGTAAAAAAGGGTACGAAAACCCGGGGGTACTTTTCGGGTTGTTGCACTTGCAAATATGAACTACCTAAGCCTTGCTTAACTTAGGCGCACCAGAGCGAAGCGGAGACTTAGGGAAGAGAGGGAGGGAGAGCAGAGTTCAGTGCAACCGAGATGCAGAGGCAGTGATCCTAACATTCTATATATTAATCACGATTCAACTGCTTACAATAAGTGCATTAACCTCAAAAACATCAAAAATAGCTTAAGGGGGTAGTTTTTTTTTTAATTTGCGGACTTACGTGTATCCATCAAAGTCGCCACTATTAATCGCTTCTATTAACTGTTCAGTAATTTTTATTATTTCTTGTCGTCTAGCTGCTTTTTTGAAAGAAAATGTTGTATTTAGGTTATTTAGGGTTCAATCGTTTAGTTAATTGTGCTAAAACTAGATATATATCCGTCTCATATTTGCATACCAATTAATGTAATAACACCCTGATTGATTATACAGTAATACACAGAAGTTCCACAGAAATCTTTTCAGTAATGTAAAGTTTTATTGATGTATGTAGTCAATACACTCTCTACCATTCAGTTCTCTGCGGTTCCTGTGGCACCCCGGTGTTTATATATTCCTAACGTAGCATACTAAATTCTAGCCATTAAGAGCCTTGAAACATGCGAAATACAAAATACTATGATAGACCGTAAGTATTATATTTGATTAAACTCACAGTTTAATGACTCTTTTTATACCCTTGCAGAGGTTATAATGATTTCAGTTAGAAGTTTGCAACGCAGTAAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGGTCACTAGCCGAGTCGATCAAGCCATGTCCGTCTTTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTGAAGCTATCAGGCTGAAACTTTTCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGTAGGTAGTATATAAGTTGGAACCATATATATATATTTTATACCTCCCACAGGAACTGTCGGGGAAAAAATTAAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAGCATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTCATTTTTTATCAAAATCGGACGACTATATCAAATAGCTGCCATATGAAAAATTATTATTAATATTAAATTATTATTCGGAAAATTAGTTGTAAAATAATATGAAAAGATTATATTTTCGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGCAGATAACATTTTTAAATTATTTCTGAATTTCGAACTAAATTTTGTAAAAATCGAAAGATTGGCTTCCAAAAGTCTTATTAAATTTTTATCAAAATCGGACGACTATATCTTATAGCTGTCATGGAAACAATCGGGAAATTAGTGGGAAAATACTATGAAAAAAGTATTTACTATTTATAACTGCAAGGGTATACAAACTTCGGATTGCCAAAGTTAACTTAAAAGATAAAAAAAAATTTTATTTAAACTTTTAAAAACATTAGACAACTAAAAAAACAAAAAATAAAAAACAAGAAAAGCAGGTAACTTCGGCAAGACGAAGTTTTTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAACCAATGTTAGTAACACCAAAGATAATTTAAGCTAAGCTATTCTATGGTCTTTGGTAACACCATGTTCAATTTTAAAGGATTGTTGCTAGCTTCTTTCTTATTAAACAATTTTTTTTTTAAATTATTGTTTCATTATTTCTTTGATCGTTTCTTTGACATCTATATGTCAGAGTCGTCCGATTCAGAAATTATTCAGAGCTAATTAAAAAATGATATTTCCAAGCGTAGGAGTCAATATGTTTAAAAACACCAAAGAAATAATTTTTATACCCTTGCAGAGTAGTTAATGTTTTGAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGATGTTTTCGACTCCATGAAGGATATATATTATTGTTATTCTTAACTTTCTTTCTTGTTATTTGTCATTTCAAAGTATGCGCGAATTAATTTTGCTTTATTTGCGCCCTCTCTCGACTGAAACAAAAAAGGAAGTTAACAAGCATAAGAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAATGTGAAACCATGTGAAATTTTAACTGAACTGTTGCTAGCTACAGTGATATAAAAAACAAAATTACTTCATTATATTTTTGACCGTCTCTTTGACAGCTATATGCCGAGGTCGTCCGATTTTAATTAAATTTAATTCGAAATTCTTAAAAAATGATAGTCACAATATTATAAGATAATATTATAATAATTGTATCATATTATTTTCCCACCAATTTTCTGACCGTTTCTATGGCAGCTATATGATATAGTCGACCGATTTTGATAAAAAAAACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGTAGCTATTTGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAAAATGAATTCGAAATTCAGAACTAATTTAAAAATGTTATTTCCAAGCGGAGGAGGTTATATGTTTTTAAAAAACATCAAAGATATAATTTGTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTTTACTAGATTCGTCGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAAACGTTTCCGACCCCATAATGTATATATTCTTGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACTCTAAGATTTCGAAAACTATAGGAGCTAGGACAGTTAAACTTCCCATGCAGATTCCTGGGCTCCAGCGGGGTGCCATGCCCACTTTAACGTCCACTATCCGCGAAAATCTGTAGACCTAGTTTTTATAATAGAAACAACATCTTAACTGATATGGACCACGCCCACACTAACGCCCACAAACGATTAAATCTATCTGCCGCCCAAATAACTTCTACTGAAATAGCCGGTAGGTGGCGCCCTTAAATATAGCATTGCTGCTTATATATCTCTCTTCCCCATTTTTTCCATTAAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAAGCATCCGACTTTAGCGTTCTTTCTTGTTTGATATCATTATCTATCCCATTTTCCGATAAGCTATATGATACAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTAAATTCGAAAGTCAAAACTAATTAAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGCGGTTATATGTGAAAAACGTCAAAGGATATACTACTTGCAAATAAAGAAGAACGTTTTAGCTCCATAGCTTATAAACTGAGAGAATAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACACAGCTATATCGACTCATCTAGCAAGGCTAATCAAGAATATATATGCTTTGCGGTGTCAGAAATGTCTCCTTCTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTTTACCCTCTACAAAGGTATAAAAATAAACCAATTGCTAACATATTGCGAAAAATCTATACTAATAATTTTTCAGATTTAAGTTAGTTCCCACTCTTGGACGGAGTCGACAAAGCTTTATTCAAAATGAAAAAGTAGTTATAGTAGAAAAGTCACTTTCAATACCTATTGATTGACCTAAAACACTGTGCCACGCCAACTCTAACGCCCACAAACCTCCCAAAACTTTGGCGGCTACGGAGCTAGAAACAATAAGTATCTATCGATTGACCTTAAAACAAATTGGCCACGATTATTCCTGTCCGCCGCCCACAAAATCTTTGTTGAAATAGCAGGTAGGTGGCGCTTTACAATATCGCTTTGCTCCTTATATATCTCCAATTTCTTTTTGTTTTCTTAAGCTGAGGACCGGTATCTAATAGGCGAGGCTCTCGACTATAGTGTTCTTCTCTGTTAAATTTATTAAACAAAAACACCTCTTAACGAGGTGAAAATCTACTGACGATTGCAACTACAGCCAACAAAAGTTTTGATATCAGCTTAGGTGAAAAAAATGTATTATAAGACTTACTAAATACATACATTTTCTTAATTTTTTACATTCGGCACGCTGTTTTTAAATATGCTTCAATGAAATTTATTTATTTAGTAGATCGTATAATACAGTTTATTTTAAATCCGTAGATCCTTTTTTCTGCAAACAGAAAAGAAGTGTAATAAAATCGGAACAAAAAACTTTTGTTCATAATCTTTAAACGATTGTATTTAGACGAATAGAGTTAGGAAAACCTTCAAAATATTTCAATGTACCTTTTTAGATCTAGACCTGTAGATTTAGTAGTTCACAAGTTACGGGTGTACAAAATTTAGTTATTTATAAAATTGGTAGAACTAATGTTAATTATATTCATCTGTTTAACATCATTTAAAATTTACAGGATCCTAGAACATCACTTTAGGACAAACAGATTTATGTTTACATATGTATTGTTTTGCCAATTTTGCTTTTTACATTTTCGTCATTTTTTTTTCCAAATCAATTGATTTTTTTAGTCCTTTTAGTTTTTGCATGTATCACTCGTAACCATCGGACGATTTCTTTAGGTTTTCATTTTTTTTTGTTTATATAGTAGTCGCCTTCGCATACACTCCTGGTATGCGAGGACTTCGCTTTACATAAGAAAAAAAATATAGATGGAATAATATATTTTTAGAGTCACTACATATCAATATCTGTTTAAAAGAAGATTGTATTTTTGCACGTTAACACTATATTCTATTGTGGTTAGAAAGGTTTTTTGTAATATCTTTATCTATGGCGGTATTCATATCTTTGCAAGTCTTCACAAATTATTTTTAATCTTCTTAATTATGTTGTCCCCTTGGTACATTTAATTTCCTAATTTCTTTTAATTTTTTCACTTTTTTATTTTATTTCGAAAAATGTAATGTACTTCCTATTTATAGCACTTAATTTTATAATAAAAGTTCTAGTATGTCAGGCTATCTGAAAAAAATCTTCCTAAGTTTAATTTTTTGTTTGTACAAAAAACTTTAATATAAAATGGAGATTGGCTTGATTTATAATACAGAAATGTTAACGCAAAAAATAGAAGAAATCAAATAAATAGTTATGTTGTCCACCTGGTACATTTAATTTCCTAATTTCTTTTAATTTTTTCCACTTTTTTATTTTATTTCGAAAAATGTAATGTACTTCATATTTATAGCACTTAATTTTATAATAAAAGTTCTAGTATGTCAGGCTATCTGAAAAAAAATCTTCCTAAGTTTTATTTTTTGTTTGTACAAAAAACCTTAATATAAAATGGAGATTGACTTGATTTACAATAGAGAAGTGTTAACGGAAAAATTAGAGGAAATCAAATATATAGGAGAGAAGCGTCGTTTTTGCAGTAAATGCATTGAAAATTATTACGTTTCTAGTAATGATTCTTAACTCATCAGAAAAGTGCAAAAGGCATTATAAGTACATAGGTCATTGCATATAATTGGAACATGGTTAGCATGCACTTAAACAAGCAGGCGATTATAATTTTCTAATTGACAAATACATTTTTGTTGTGTATTCATGGATCTGGAACGTGCTTCTGAATTATAATTAGCTGAACAATTTTTCTTCGCTTTTCTTTTATGTTAAGACCACCTCAAAATGTGAATTTATTTTTTGATCATTTTGGACTTGGAACTCGAAATATTTTTTGGTATACATACATACCTGACGAGCACTGCGAATTTCCTGAATTTTGCTGGCATGTTTTTGCAGGACACAGTATCCTTATATCTAAAACGCACATTTAGTTTTGTATAAAAATCAATTTTTTATACAAATTGTAAGTGTTTTTAATAAAATCATCACAAAATTTTTCGTAATTAAAACAATAAAAATTATAATAAGTGGTTAGGAATATGGGATGAATTGTAGTCTACGAAGTGGGCGAAAATGGGTTTGCACTAAATACAATTTTCTTTTATGAACTTTTATAAATTTTAACACATTTTTAAAATTCTGCTTATAAGAATAATGGATGTCAAATACTTAAAATACTTGTATACTGACATTCATTCTTTATTAAAAGATGCCCGACTTAAGTCTTTACTGTAATCTTTTTTTATGAACTTGGTATATTTAAAAAAATATTTAGAAACTAGGTTTGAGCCAAACTTTTTTTTAAAGAAAACCTTAATTTAGCATTTCATAAGCTGAAGACATTCACCCGTATAAAATAAGTTTATAAATAATTTGAAGAACATTAGGACATGAAAGATAAATTAGAAAACTAATTAAATACTCACCAATAAGCGAGATAAAAACTTTGATTGATCTTTTTATTTAAATATGTAAGTATTTTTGTGTAGAGATAAACCAAAAACCAAAAAAGCAGAAAAAATGTAACTGTAACAATAATTTTTCGGTTATGCATCTAATTTGGAAGTTCACATTCTAAACATGAAAGGACGATATAGTCGACCACGTCTTGAAAGATAATTATTCCCCCAAAGATTAAAAGATCATAGTTATTTTCATAATAAAATCAATTGATGTGCCGTTGTGAGGCACCTTGGGCCTGCACAGACAAAAATTATAGCAACTGGCTTTAACAATTAGAGTAAAAATGAATTTCCTTTCACAAAACTCGTGAAAAATAGTGAATAAAACACTGAAATACTGC'..b'TTGATTGAGCTTAATGGTAAAACGCCCCTTCCCGTTTAGCGAGGATATTCCGGGGCATTAGGTAAAACTTGTTGCAAATAATTCACTTGTGTAAAATCGAAAAAAACGGGGGCTTACCCGTCAAAAATCAATTTGCAGAAACTTAAAAAGCTTATTATTTTAAACGTAATTTTATTCGAGAGACAACTTGACTAGTAGTCAAAACTCAATAAGTTACTTGCGGCATTGTGTTAAAATAAATACCTTTAACATAAGTCAAATGAATTTAAAAAATCTTAAAGAATTACTAAACATGTACATACGCAGAATTTGTAGCGTATGAAATATACATACATCCATATGCACATAAATGGATACATACAATCGCAAAAGAACTTTTTTAGCTTGAGGTGAGGCAAATAAAATTACTTATTAACTTAAATATAACAAATAAGACCCTTGGTACGCATAAAAAATGTTTTTAAATATTTGTAAGGTTGTGCACACTTATATATACATATGCAAAAAAATGAACATATTTTAGATCGAAAATATGTACGTTGGAGTATATTTTTGAATCTGTGTTGACCCAGAATTGTATCAGGAGAATAATACACCGTTATAGATATGTACGTATTTTTATAAATATATGTATATATAAGTATACACAATGAACATACATATACAGTTTTTTTTTATCAATTGGATACCTATTTACTTGATGTATACGTCAGACGTCTGCACTAAAATCAATGTTTTCAACGTCTTTGCAACCTAAGTGATGTGCCTAAATTATTGTAAGAATCTTTTGGAATGACAATATGGGAAAATAATGTTCCGAAATGCACATAAAAATATCTACATGTGTATATATATTTTTTTAACGAACTGGGAGAACACGACGCGTTAAAGTCAGAAACCGAAAATCTAAAAACGTCTGTTTGCTTGAAAATCGAATTCAATACTGACTAACAAGATTTTGTGGTCGCGTTTTATTCGATGAAGTGCCAAAACGAAAAGCTTTTTGCCGACTTTTCAAACTGTCGTTCAATTGAAAACTTGTGCCTACGAAGGTCTTATTCAGGAGTATGCGCACTATAATGAATATGTATCAGTGTCCCGACCTACAGTTTGAAAAGTATTGCATGCAGGAAACTTGCTACTTCACTACCAAATCCTTTACAAGGTCTTTTTGACATATTATAATATTGGGAATATACATTTTTATATTTTTAAGAATTTTGAATTCAATTTAATAAAATGTTTGATTATTTTTTAAAACTGCAAGGGTATGCAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAAGTTCCTTTCTTGTTTAACATATAACCTTCTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTTTGAATTTTAAATTAAATTTTATCAAAATCGGGAGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTAATGGGAAAATAATATATAACAAATTTTAGCTTTGGTGCTATTTGACATATAACCTTCTTAGCTTGCAAATAACATTTTTTAATAAATTTCGAATTTCACATTAAGTTTTATCAAAATCGGACGACTAAATCGTATAGCTGTCATAGAAACAATCGGGTAATTAGTGCAAAAATAATATAAAAAAATTATTTACTAAAATTGGTTATTATTTATAACTGCAAGGGTATACAAATTTCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTGTCTTGTTTATTGTCCTTTATAATCTGCGTTTAAATTTAGGATCCGACTGGCTTCAATAAAAACAAAAAATTGAAAACAACAAATAAAATGGATATTGCACTTTTAAAAAGAATAAAAGGAAATGCTGCAATAGCTACGGTGGCTACAGACTTTGTTATCAAGGACAAAGACAATGAGTAGCGACGGAGATCGTTTTTTTTCTTGGCCAGTATTTGTTAGGTTGAGTACTGGCCGTACACAGAAATTCCCTTAAAATTAAAAAAGGGATTTTAAGCGGCTTCGTTTAATAGGGTTGAAAATTCCTATAACGATTTTAAGCGGATGTGTGCAAAGACTATAAACAGCATAATTCTGTTGGCACATTCTCCGGAGGTCACTCGGCGGTCTTATACAAACTTGACCTCTAATAAAAATTAGCCAAAAAAATTTGCAAACCATTATTTTTTGAGGTGGCATTGTTGATATTTTAATAATATCGAAGTAATCGAACTTCCAATCTATTCTTAGAATGCTAACAGCTCCTGGACGAAGACAATAAGAAGCGATTTAGATATTTTTGAGTTAAATCGAATTTGGCCCAACGTTCATTTAAGGTTCATTTCAATAGATTTAAAAACAAAAATGCACTTTATTATAAATATATTATTTCGATTTCCTCTTGTCCGGTTTGTCCGGTTCAAGATGCCTGTGTAGAAAGGGATAGTTTCTTTAAGTGATCATACCATCCTGAGAAAACTCTTTATTTAATTGTTCTAAAACATCAACATCGTGGTAATAAATAGATATTGTTTGAGCATCTATTGGATTTCGTCTAAGCCACCATGTCGGATTTCATATTTACCTTAACGACCAGGTGTCCAAATTCGTATGGCTTTATTAAGCTTTTGCAATGAAAGCAATTTGTATAAGTCATTTTACTTAGAAATGTACTTTAGAAACTAATCTAAATCAAGAAATTTAATCCTACGATTTATAATAAGCGTTCCATACTAGACAAGAAAAACCACAATTTTTCGAGATTGGAATTTGTTCATATGTCAGTAAGACTGTATTGTTACTGTTACTGTTCGAAGTGCATGAACGTCCATATAATTATATATGTATATTCTATGTGCAAGGCCACGTCCAATTGGTTGGTGTAAACCTCTGAACCTTATTAAAGTATGATTAGTTTGATTATGATTACAGATTTTTGCGGATTGTGGGCGTGGTACCCAGCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCTAAAAGCCCAGGAATCTGCATGTCAGGTCCGAAATTTCTAGCTTTTATAGTTTCCGAATTCTCAGCGTCCATAAGGACAGATAGGCAGTACCCTCACATTTTCTTAGAACAGAGATCTTGGTTGTACTTATTAGATGCGATATTTTTTAAATTCTTTAATTTGTGTAACTGTAAATATTAACGGACACTTTTAATGCTTTATTAATCTACGGTGCAAAGAGCTAGGTTAGTCTAAGCTGGCTAGATTTTCGAAACTTCTTTCTTGCTTCGGAATGGAAACGTCCAAAACACATATATGTACAACCACCGTGGTGATATACCTATTTTTTTCAGTTTTTTATGAGTCCTGGAAACAGAAGAAGAAGTGATCAGAAGTTTTTATTTTAAATCAATTTGTATAATTCAGCTATTTTCACAAAAACCGTAGAATTTAAGTTTCTTATGTGTAACTGTTAATAACAATTTAAATGATTCTAAGGCCCTAAAATGAATGGATTGAGCTCAGGCAATTTTATAGGTTCTGAAAAAGTACATGTGGCCATTTTTGTTAAATACAAATTTTAAACGTCACGTTATGTTGCATGTAAAACGTTAAGGAATGTCAATGGGTAAACAGTTTAGCCCGAAATCGTTATTTCCGCTTTTGAGATATAGGAAAAAGTAAAAAAAAATCGGAATAAAAGAACTTTCGCCCATAAACGGTGATATTTAGGGAAATCATATTTGAAAGACTAAATAGTATTACGAAATACCTTTCTAACAACATATATCGACAATATCGATTTATCGTCGCTTGTGAACAGCTGTGTTTACTTTTGTGCTCCGAGTTTTTGTCTTTTCCAGTGATTTTTGTGCGAGTGTTCTGTGTGTATTTATTTACAAAGATTATTCTAACAATTGTGCTAGTAATTCTAAATAGATCTCCCAGTAACGGGTACGTGGTAATAGTTATTTTAACATTTCTATTAGATTTGTTTAATCCCATAGCTTTGTTTTTGTAACATACGCTCCTAAACTTGCTAAAACTCTTTTACTCTCTC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ef2/536/ca/scaffold_57-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TAAATCTCCCTCG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGTGTTGAACAAGTATATTTTTGTTAACAATATTCATTTACACATATGTCTAACCTTTAAAAAAAGTAGAATGTGCTTGTAGTTTTAGTTTTATGTTACATTGACAGTTTGGTGTAATTATCCTCACTCTGTCAGCCGAATGCATTTTGATTTTCGTTTATAAAAAAAGTTTATTCCTATCTTGTGAACTACAATTAAAAACATATGTATATTTAATAATCAGGCCTTTTCCGATCCTAAAGATTTGCTTTGAATATAAAGAATCCAATTACAAGAAATGTACATTAAATTGAATTTTTCTACTTTTACTACTTAGCTAAAATATCGGAACAAGTCAGATTATTTATTAAGCCTTATGAAGATCACATCTTCAATGTTATCCAGGCGTTGTAAACCACGTCGTTTCTCTTGATAAGTAGCCTTATATTCGATTATCTGTTTATATATTTCCCTGTTTCAACCGTCATCTGTCTCAATGTTTATGTGTTCGGTCAATAGCGGAGGAGACCGTCGATTGATGTACGCCGTCCAAGCGTGCAAGACCTAGAGGATCTTATAAACAAGCCATCCACACCATTACGTGATGTGGGTGATGGCGGTCCTCCTTCAATCGTTGATGTCCAAGAATCTTATTCTGTTGTTGAAGGTAAGTACGCATGGTGAACATTTTTATGTCGACGACACATACACATCTACCAGGATTCGTAATTATGCACTTTTGAATGCCTCACATTTAACATGCCTAAAAAAGCAAAAAGTAATAATAAACGGACGTCGTCAGATGCGTAGAAATAATTTTAAAAAATGCACAAAACTTCAAAAAATTGAGAAATACATGAAACTATTCAAAAAATAAACATTGTTTGCAACTTAGTTGTCCAATCTGTTCTACTTTTGGAAAAAAAAATTTTTTTTAGTTACGCATTTGGTTTTTATTTTGAGTGGTATTTTACGAGTCCTGATATCTGCACATTCTCTTCAGAGGAAACAGACTGACCGAGGTGTATATGTTAACGTGAGCATGCTTTGTAATTGTTTTCTAGACTCGACTGCTTACCTTACGGTTGGCATCGAAGGCAGTCCAGCACCTACATTCAAGTTCTACAAGGGAGTTAGTGAGATTCTTGAGGGCGGTCGGTTTAAGTTCCTCACAGATGGGCAGACAAACACAATTACCTTGTGTATGCGTAAGTGCAAGCCCAACGATGAGAGCAAGTACAAGATTGTTGTTTCAAACATTCATGGTGAGGATTCCGCCGAGATGCAGCTCTATGTATCAGATTCAAGTGGCATGGACTTCCGTGCCATGCTCAAAAAACGTCGTTATCAAAAATGGGACAAAGATGAACAGGATCCCAATTGGGGAGACCTAAAAGAAACGGAAAAACCGTTACCGGCCCTAAAAAAAGTTGAAAGGGTAAGAACCAATTTGTGCGCTTCTAACAGACTCGCTGATTATAGGGTGGAATTCTCTATCATTTATTGGCACTTTGATTCAATTTAATAGGCAATAGGTTATATATAGGCTATATTTAAAGGCTATATATATTCCGCTAGTTCAGGTGAAACAGATGTAAATGTTATAATTTGTTCATTACACTATACGATTATTATAACTGAAATTTAGGGTCCAGGATCGCGTAGACCATCTTTAGCCGAGTTGATTCCCGATTGGCCGACATTACACCCGTTTCGGCGTGAGGAGGTGCGCTCCGTTTATATTTATGTTATATATTTATATATATAATCATTTGTATTACCGAATTAATAACCTGACTGTAAACTTATATTATTTTCCAGTGGTGAAAACGATTATTGATTTTTGCTACTTTTTAAAGAATTTAGATACAATTTGGATATCGATTTTTCGAAATACATATTTTTGCCCTTGAAATTGATTTCCAACGTAAATCTTATCTGCAAAGTGACTTGATACCACTTAGCACTCTTAATCAAGTAGAAAGATTTTTTTTGAATTTTGTTTATTGTTTTTAAGCTATATATAATATGTGTCATTCCATGAAGAGTTTTCCACTTAAAAACATCGCATCTGTATAGCTCAATGTTTGGCCAAAATGCTCAAATATTTAATCAATCTTGCCCTGCATAAATCAATGCAAAATTTATGCAAACTCCGCTTTAAGTAATACAAAAAAACAAGGGATACATTTTAAATTTAAAAAATTTTTCCTTGGTAAATGTTCATAAGCTTAGTTAGTGTCAGAGCAAACAAACAGGTGTAACAGTTAGTGATTGATTTATTTTTACTCTTTACAAGAAAATTGCATGATCGGCTATGAGAAAACTATAGATTTTTAAAGGATATTTATTTGCTTCTGATTGGAACCTCTATTTGCCTTCAGGTGGCACTGACTAATTAAAATTGTTTGACTTAAGGTTTTTTAAATTTGTTGAAAACACGTTAAACAAAAGAGACACAAATTATTTAGCCAATGTCGACCTAATTAGTCAAAGCAGATATGATTCATGGTTTATCTCAACAAAGAGCTATGCATAAAAAAGCCTTATTTTTGGAAAAAAATAAAACAAATTTCTTTCAAAAGTAGAAACATTTGTTTTTTTGAGCGTCAATGTGTTCTCTTTAAGATCAAGTCTAGTCGCAAACATACATAAGCTGCTGATGCAAATATCAAAGTAGGCCCCGTGTTGAGTTGATTAGTTAAATTTTTTGCCATTCTTTCTAGTTCAGATAAACTAAATGAGTCGATTTGCTACAATAAATTTATACGGTCTTTAACTTTTTGGGTAGATGTCTATCTGGGGAAATAAAATGATTTAGTAACTTACACTTTTAAGTTTTACAATTTTTTGTTTATGTGATAAAAATAAAAGCCATCCTATGTAAAGCCAGTTTAATTCTATATTAATTGTTTGGTGTTTTGCAATAAGAATTTTTTTTAAATAAAAGCTAAATCGGCCTTTGTTTTTTGGGCTGGAAGCAATAAATAAAATAATATAACAAAAATAATTAAACTTATCAAATTACGCCTCTTATGTATATATTTTGTTATTTAAATTAAAATACATACATATATATGAGGGAATAATTTGGACAAACAAAGAACACTAAGTAATCGTATATCAAATTTGCATAACTTTACCCATTTTTGACAACGCATCAACTTACAATGTGTGAGCGCAGAAGGTTGAGTCATTTCTCAGCCCACTTATCGACCAATTCGCCAAAGAGGGAAAGGACAAAAAGGTTGTATTTGAAGCCAGATTCAGCAAGCCCAATTGCAAGCCAAAGTGGCTGTTTCGCAAGGACGTAAGTATAATTCTCCAGCTTAGCTGAGCTTCGAAAACTATTAAGAGCATTCGCTTTTTTTCTATATTTTCTAATACATACACATAATTATAGGAGGTGTTTACGGGTAGCAAATTTAAATTCAAACAAGAAAATGATACTTATCAGTTAATCATTACTACGCCAAAAGTCGAGGACACCGGCAAGTATACTATTGAAATTGGTGGTGTTTCAAGTACCGCATTTTTAAATGTCGAAGAAGCCGATCCCACCTACACATTTACAAAAGTCCTCAAAAAGAAACTTGAGGGATTTACTCAGCACGAGACTACTCTGGAGTGCTCCGTCAGTAGCAGTATGGCTAATGTGCATTGGTTCAAAGACAATAAAAAATTGGAGTCTGATGATCCTCGCTACCTTATATCCAAAGATATCAACGGCAACCTTAAACTTATTATTAAGGACTCTGTACTTGAGGATGCCGGCCTCTACAGATGTCAACTGGATAAGCAACCTGATAAGACTGAATGCCACCTAAAGGTTACGGAGTACCCATACAAGTTTGTTAAAGTTTTAAAATCTCAACAGTGTATAGAAAAAGACACTGTGACGCTTGCGTGTGAAATCGATGATGCTATGGGTGAAGTGCAATGGTTCCGAAACGGTGAAGAAATTCAACCTGACAAACGCATTCAAATAGTAAAAGATGGTCGG'..b'AGGATCGCCAATCACTGGCTACATAGTGGAGGTAAAAGATAAGTACAGCCCTCTTTGGGAGAAAGCGCTAGAAACCAACTCTCCAACTCCCATGGCGACTGTTCAAGGTCTTATCGAAGGAAATGAATATCAATTTCGAGTAGTTGCTTTGAATAAGGGAGGTCAATCGGAGCCTTCGGATCCAAGCAAAGTTCTTATAGCCAAACCACGTTATCTTGCTCCCAAGATAGACCGTAGAAATCTTCGTGATATAACGTTATCGTCCGGAACCGCTCTTAAATTAGATGCAAATATAACGGGCGAGCCTGCCCCAAAAGTGGAGTGGAAGTTCTCAAACTACCACTTGCAATCAGGAAAAAATGTGACCATCGATAGTCCTGACTACTATACGAAATTAGTTATTCGACCAACGCATAGGAGTGACTCTGGAGAATATTTGGTCACAGCCACTAATAGTTCTGGAAAAGATAGCGTACTTGTAAATGTGGTTATCACAGATAAGCCCACACCTCCTAACGGGCCCCTACAAATATCCGATGTACATAAGGAAGGCTGTCACCTTAAATGGAAGCGTCCCAGTGACGATGGTGGAATTCCAATTGAGTATTTCCAAATTGACAAATTAGATCCCGAAACTGGATGCTGGATTCCCTCTTGTCGTTCAACCGAACCCCAAGTGGATGTTACAGGTCTTACGCCTGGAAACGAATATAAGTTCCGAGTATCAGCTGTAAATGCGGAAGGTGAGTCGCAGCCCTTGGTTGGTGAGGAAACAATAATAGCTAAAAATCCATTTGATGAACCTGGCAAGCCCGAAAACCTTAAAGCAACTGATTGGGATAAGGACCACATTGACTTGGCGTGGACTCCACCACTGGCTGATGGTGGATCTCCCATTTCTGGTTATATTGTTGAAAAGAAAGATAAATATGGTAAATGGGAAAAGACCCTTGAGGTTCCAGCTGATCAATGCAAAGCCACTGTTTCTGATCTTGTCGAAGGCCAAGCTTATGAGTTCAGAGTTTCTGCGGTCAACGCTGCTGGAACTGGAGAGCCATCTGATGCCACTCCTTCGATAGTTGCCAAGGCTCGCAACAAGCCACCTATTATAGATAGATCAAACCTTATTGAAGTGCGTATTAAAGCTGGACAGGCATTTACATTCGACTGCAAGGTATCTGGAGAGCCAGCGCCTAAAACTAAGTGGCTGCTTAAGAAAAAAGAGTTGTATTCAACAGACAATATTAAGGTTACTAATGTAGACTACAATACAAAACTAAAGGTTACTGCTGCGACCCGATCTAACTCAGGTGTATACACAGTTCATGCAGAAAATGCAAATGGAGAAGACAGGGCAGAAGTTAAAGTAACTGTGATCGATAAACCTTCAGCGCCAAACGGACCTCTTGCAGTTGATGAGGTAAATGCCGAGTCTTGCTCTCTGCACTGGAGTCCACCAGACGATGACGGTGGGCAACCAATAGATAACTACGTCGTTGAGAAATTGGATGAAGCAACAGGTCGTTGGGTACCAGCTGGGGAGACTGAAGGACAAACTACAACCCTTAAGGTAAAAGGACTTACCCCAGGTCACAAATACAAATTTCGAGTGCGGGCCAAAAATCGTCAAGGAACTTCAGATCCACTCACGACAGCACAAGCCATTCAGGCCAAAAATCCGTTTGACGAACCTACAAAACCTGGTACTCCAACAATAAAAGACTTCGACACAGACTTCGTTGATTTGGAATGGAATAGACCAGAGAGTGATGGTGGATCTCCTATCTCTGGGTACATAATTGAGAAGCGGGACAAGTACTCTCCCGATTGGGAAAAGTGTGCTGAGGTCAGTGACGACATTACCAATGCTCATGTTCCCGATCTAATTGAAGGCGTTAAATACGAGTTCCGTGTTAGAGCAGTAAATAAGGCCGGTCCAGGTATCCCCAGTGATCCAAGTAAACCCCATCTTGCTCGACCCAAAAACATGCCACCAAAGATAGACCGAAACTTCATGTCCGATATCAAAATAAAAGCTGGTAATATATTCGAGTTTGATGTACCAGTTACTGGTGAGCCTTTTCCAAGCAAAGAATGGACTCACGAAGGAAATATGATCATAAACACAGATCGAGTAAAAATTTCCAATTATGATGACCGCACCAAGGTACGAATACTTGATGCAAAACGATCCGATACAGGAGATTATACTTTAATAGCTCGTAACATAAATGGTATTGATAGGCACACCGTCAAAGTTACTGTTCTGGATGTGCCAAGTGTACCGGAAGGCCCATTACGCAACGGTGATATAACCAAAAACTCTATAGTGCTGCGTTGGCGGCCACCAAAGGATGACGGCGGTTCAGAAATAACGCATTATATTGTGGAAAAAATGGATAATGATGCCATGCGATGGGTGCCTGTTGGTGATTGTACTGATACCGAAATTCGAGCTGATAATTTGATCGAAAATCATGACTACAGCTTTAGAGTAAGAGCTGTTAACAAGCAAGGCCAATCCCAACCACTTACGACCTCTCAACCAATAACTGCAAAAGATCCCTTTTCACATCCAGACAAGCCTGGTCAACCGCAAGCTGTAGATTGGGGTAAAAATTTTGTGGACTTGGAGTGGGCCGCTCCGAAGAGAGATGGCGGGGCACCTATTTCTTCATATATAGTTGAAAAAAGACCGAAGTTTGGTCAGTGGGAACGCGCTGCTATTGTGCCTGGGGAAGAATGTAAGGCCCACATACCTGAACTTACAGAAGGTGGGGAATATGAATTCCGTATAATTGCTGTAAACCGAGGAGGGCCTAGCGATCCATCAGATCCATCTAGCACTATTATTTGCAAGCCACGTTTTCTTGCACCATTCTTTGACAAGTCTCTTTTAAATGACATTACGGTCCATGCTGGAAAGCGTTTGGGATGGTCATTACCAATCGAGGCATCTCCTAAACCATCTATCAAATGGCTATTCAATGGAAAAGAAATAGTTTCGAGTACGCGCGGAGAGTCTAATCTTTTCCAAAACGAATTAACTTTTGAAATTCCTTCGTCACTTAGAAGTGATGAAGGTCGTTATACGTTAATGCTAAAGAATGAGCATGGATCATTTGATGCATCTGCTCACGCGACTGTTTTGGATAGACCATCACCACCGAAGGCTCCGCTGGATATAACAAAGATTACAAGAGACGGATGCCACCTAGCCTGGACTGTTCCAGAAGATGATGGCGGTTCGCCCATTTTGCACTATATTATAGAGAAAATGGACTTGTCCCGAAGCACTTGGTCCGATGCTGGCATGAGCACTCATACTGTTCATGATGTAACCCGTCTTGTTCATAAAAAAGAGTATTTGTTTCGAGTTAAGGCCGTTAATGCAATTGGGGAATCTGATCCTTTGGAAGCTGAAAAGAGTATAATTGCTAAAAATGAGTTTGATGAGCCTGATGCACCTGGAAAACCAATTATTACTGATTGGGATCGTGACCATGTTGACTTGCAATGGCCTGTGCCAAAAAGCGATGGCGGAGCTCCCATATTGGAATACATTATACAGAAAAGGGAAAAGAACAGCCCTTACTGGTCTAACGTATTGCATGTTCCGTCAAGCAAAAACACAGCCACAGTTCCAGAGCTAACCGAAGGTCAGGAGTATGAATTTAGAGTGATTGCTGTTAATCAAGCAGGGCAGTCTGAGCCGTCAGAGCCGTCTGATATGATTATGGCCAAACCACGGTACCTGCCACCAAAAATAATTACTCCACTTAATGAAATACGCATCAAATGTGGTCTTATATTCCACACAAATATTGATTTTATCGGTGAACCGGCACCAGAAGCAACATGGACACTTAATACTAATCCGCTTAAATCAAATGAAAGATCTACTATTACATCGATTGGTCACCACACCGTAGTACACACTGTTAATTGCCAAAGATCAGATTCCGGAATC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TACCACTTACTTTTGCGTAATAGTTCAGGAATTGATGAAGGCAGCTTTGAACTTATAGTACTCGACCGCCCAGGACCCCCAGATGGTCCAATGGAGTATGAAGAAATAACGGCAAACTCTGTGACTATTTCTTGGAAACCCCCTAAAGATAATGGAGGATCTGAAATATCGTCCTATATTATTGAAAAACGAGATCTGACGCATGGCGGTGGGTGGGTACCCGCAGTAAATTATGTCAATGCTAAATACAACCATGCCGTTGTCCCCAGACTATTGGAGGGAACAAAATATGAATTTAGAGTGATTGCCGAAAACCTACAAGGGCGCTCTGATCCACTTACATCCGACCAACCAGTAGTTGCCAAAAATCAATACACAGTACCAGGTGCACCGGGAAAACCAGAATTAACCGACAGCGATAAGGATCACATTTCAATAAAATGGAAACAACCAATAAGTAATGGAGGATCCCCCATAATTGGCTATGACATTGAACGCCGTGACATTAACACAGGCCGATGGATTAAAATAAATGGTCCACCAGTTGCCACCACTGAATACCAAGACGACAGAGTATCACAAAACCATCAATATCAATATAGAATATCCGCAGTTAACGCAGCTGGTAACGGAAAGACTTCCGAACCATCGAGCACATTTGATGCTCGGCCACTGCGTGAAAAGCCAAGACTTTATTTGGATGGTATTACAGGAAGACGTATTAAGGTTCGTGCAGGGGAGCCTGTTAACTTAAATATACCTATATCTGGAGCTCCCACGCCTACAATTGAATGGAAACGAGGCGATAGCAAGTTGGAGGAAAGTAAACGCGTATCGTATGAGACTAACTCTGAGCGTACTGTATTCCGCATAGACGATTCAAACAGGCATGATTCTGGAAAGTACACCTTAACTGCCATTAATGAGTTTGGCAAGGATACGGCTGACATTGAAGTGATTGTCGTGGATAAGCCATCGCCGCCTGAAGGACCATTAACTTATACTGATAGCTCCCCAGATCACATCTCTTTGCAATGGTACCCTCCCAAAGACGATGGAGGCAGCGACATAAGCGGTTATATCATCGAGTTAACTGAGCTTGGCGTAGATGACTGGAAGCCAGTACCAGGCTACTGTCCTAAGACGAACTACACCGTAAAGGGTCTAACAGAAGGAAAGAAATATATTTTCCGTGTAAGGGCTGAAAATATCTATGGAGCCTCCGAAGCTCTTGAAGGTAAACCGGTATTGGCCAAGTCGCCTTTTGATCCTCCTGGGGCACCATCTCAGCCAACAATTGCTGCTTATACGCCGAGCTCGGCTAGCTTAGAATGGCATCCACCAGACTATTGTGGTGGTAAGCCAATAACTGGGTACATTGTTGAGCGACGAGAACGCGGTGGTGAATGGATTAAGTGCAACAATTATCCAACGCCAAATACATCATATACTGTTCCCGATCTTCGGGACGGAGCTCGTTATGAGTTCCGCATAATCGCTGTGAATGAGGCTGGACCTGGCCAACCATCAAAGCCCTCTGATCCAATAACTGCTGAGCATCAACGCTATCGTCCAGATCCACCCGAACCACCAAAGCCAGATCGTATTTTCAAGGATAGTGTCACATTATCTTGGCGGCCACCCCGCAATGATGGAAAATCTAGAATCAGAGGTTATTATATCGAAGTGCGTCCCAAAAACGAAAAGGATTGGAAACTGATTAACGAATTACCCATTAATTCAACCGTATACACAGTACCAAACCTTAAGGAAGGAGAAGAATATTCATTCCGCGTTATCGCTGAAAACGAAGTTGGAAGATCAAATCCATCTAAGCCTTGTCAGCCCATTAGAATTGAGGAACAACCAAACAAGCCTTGCATGGAGTTGGGAGGCGTTCGAGATATAGTGTGCCGAGCTGGGGACGATTTTAGCATTCATATCCCCTACGTAGCTTTCCCCAAGCCTTGCGCCTTTTGGTATTCCAATGACAGTGTTTTGAATGACGATAATCGTTTGCATCAGCATTTGACTGATGATGCCGCATCGTTTGTCGTGAAGAACTCGAAGCGTTCAGATTCAGGTCAATATCGACTCCAGTTAAAGAACCCATCAGGTTTTGATACTGCTACCATAAATGTTAAGGTTTTGGATAGACCATCTCCACCAACCCACTTACGTGCTGATGAATTCGCTGGAGATTCTCTAACATTGTATTGGAATCCACCAAAAGATGACGGTGGATCTCCTATACAAAACTACATTATTGAAAAGAAAGAAGCTCGTTCTTCTACATGGACTAAAGTAAGCAGCTTCTGCACAGTTCCGTTTGTCAGAATTCGAAACCTTGTAATTAACAAAGAGTATGACTTCCGAGTGATAGCTGAGAACAAATATGGCCAATCCAATCCGACCAACACGTCGGAGCCTATACGTGCGAGGCATCCCTTTGATGTTCCTAATACTCCTGGTATACCTCATGGCATTGACTCCACAGAAGATAGTATAACGATAGCGTGGTCGAAACCAAAACATGATGGCGGTTCTCCTATAACCGGCTACGTTATAGAAAAACGATTGCTAAGCGATGACAAATGGACCAAAGCAGTTCATGCTCTTTGTCCAGATCTTACTTGTAAAATACCAAACTTAATTGAAAATGCTGAATACGAGTTCAGAGTAGCTGCAGTTAATGCTGCCGGACAATCCGCTTATAGCGGTTCCAGCGATCTCATCTTCTGCCGCCGTCCACCGCATGCACCAAAAATAACATCCGATTTATCGATTCGTGATATGACTGTAATTGCAGGAGATGAATTCCATATAACCGTACCTTATCACGCAAATCCACGGCCAACGCCGTCATGGAGTGTGAATGGTCTCCAAGTCACTCCCGACGAGCGAATAAGATTTGATTCGGACGATTATTCTTCAGTTTATTATAATAAATCAGCTAAACGAAGTGAGTCTGGATCGTACACGATCACACTTACCAACAACAAGGGTTCAGATACGGCATCATGTCATGTCACGGTGGTAGACAGACCAGGACCACCTCAGGGTCCCTTAAATGCCTACGATATTACTCCAGACACATGCACCCTGGCTTGGAAAACTCCTTTAGATGATGGTGGTTCTCCAATAACAAATTATGTCGTTGAAAAGTTGGACACTAGTGGCACATGGGTGAAAATCAGTAGTTTTGTTCGTAACACTCACTACGATGTCATGGGCTTGGAACCTCAACACAAGTACCACTTCCGTGTAAGAGCAGAAAATCAATACGGGTTGTCAGATCCTCTGGACATTGCCGAGCCTATTGTTGCGAAACATCAATTTACAGTGCCGGATGAACCTGGTCAACCAAAGGTGATTGACTGGGACTCTGGAAATGTCACATTGATTTGGACTCGACCAGCTAGTGATGGGGGATCCCGAATTCAAGGTTATCAAATTGAATATCGAGACATTGTTAACGACTCTTCGTGGAATACATATGACTACCTAATAAAGGACACTAAATACCAACTGTACAATTTAGCTAACGGCAGCGAATACGAATTCCGTATAAAGGCAAAGAACGCGGCTGGATTGAGTAAGCCTTCCCCACCGTCTCTAAGGTTTAAATTAAAAGGAAAATTCAATGTGCCTTCACCGCCTGGAACGCCGCAAGTCACAAGGGTCGGCAAAAACTATGTCGACTTGAAATGGGAAAAACCATTAAGAGATGGGGGCTCTCGTATTACCGGCTACATTATTGAACGAAGGGACATCGGTGGAGCCGTATGGGTAAAGTGTAATGATTACAATGTTTTAGACACCGAATACACGGTTATTAACCTGATCGAGATGGGGGACTACGAATTCCGTATATTTGCTGTCAATTCCGCCGGACGCTCGGAACCTAGCTTATGTACGATGCCAATCAAAATTTGCGAGGTACTTGGTGGCGAAAAACCCGAATGGATCACCCGACTTCAAG'..b'AGTGCCTCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTAAGGGAGCAAAAGGGAAATATGATGGACGTTAATGCACTTCAAACAGTACCAGCACGTGCTTGTTACGCGCGGAGCCCTATTATCAATTTGGGCAAAAAATGCGAGTTTGCGAGGAATATACAAATAACAAATGGAGACGGGACACAAATGAAAATAAAAGGCACAACTAAGAATGAATCAAAAATAAGTTAAAATATTAGTTTTTAATACCGGAATAGAAGTTGAAATGCAAATTAATTGATAAAGGTTGTTATAGTTATTTCAAAGAACGCGAAAGGGCTCGTGCAGACAAAAATTTGATGTACTCGTACATCGTGGCAAATTTAGAGGATAATAATTTCGTGTTAGTCTACGGGAGCGTTGAATGTTAGGCGGTTTAAAAGATCTGCAGAATCAATGTCATCTCTTATAAGATTTTGAATAAAATTAGTACCAAGCATTGTTCTACGATTAACACGTTTAGGTAAATTAAGCAATTGTAATCTACTCTGGTAGGAAGGTAGCCTTACGCTTTGACCTTAGTTAAAAACTAAACTAAAAACTAAACTTAAAAAGTAAACTACGCAGGGCAAATAAAAGAAATTTTTTGTACCGACTCAATACGGTCGAAGTGAAAATATTGTATCTCCAAACCGACGAACAATATTCCAAAATAGGACGAACAATGGAGGTAAAAAAAAATTTGGTCATCAAATTCTTTTGACCAACGCTTTATAAACCCAAGAACACTCATGGTTTTGTTAACAAAGGACATTACGTGGCAGTCAAATTTAAGTTTATGGTCCAGAAGAACACCTAAATCGTTAACTGAATATATACGGTCAAGTGGAGTACTTTTATGAAAGTACCTAATAAACGTAGGAGTACCCCTATAAAAAGTCATAACGTTGCATTTAAGACGGTTCAAAGTTAAAAGGTTGTACTCACACCATACATGAAAACAAATTAATATCTGACTATAAGTTAAATCCCGAAGCTATATCTTATATGATAAACAACGCTTAACACGAGAATGTATTATGATTGAGGGAAGATCGTTAATAAACAAAGTGAACAGCAAAGGGTCCAAAAGACTACCCTGAGGCGCTTCAGATGTCACGTAGATCAATTCTGAAACAGCATTCTTCAATATAACCCTCTGAGTCCTACCATTCAAGTAACAGGAAACCCAAGCTAATCTAAAAGAGAGTGTATGTATAGAGTATAAAAAAGTAAATAAATCAGCAATTTCAGAATCCGTCGATGCCTCCATTGAGTATAGACGTACCGATGAGGGTAATGCCGATGACTTGGCATTAACAATGTTGTAAAACTGTTTTGGATCGTTTGAAAATTAAAATTTACATCGATTTAGATACATCGAATAGCAATATTGTCAAGAACATTAAAATCCGTTCGAGCCACCATATATTTCGGAAAATCTGGTGGTCTACCCGCTTTTTTAATACTTTTTATAAGTCCTAGATTTAAGGTTTTTAAGTCTTTGAAGCCCATTGGTAAACCAAGGAGGCCTGTTTAGGTTTGAAAGAAACCTATCAGGTACGGATTTATTAAAAAACGTATTTTATTAAAAAACGTATTTTAAACTGTATAGAATAGTTCAGTAGCACTTTGAATGTCTGTACAATTTTACAAGGCTGTCCAATTATAATGAGAAATCATATCGTTAAGTTTATTATAGTCACATTTACGAAAACATCTCATTTTAGTTTGAGAAACTAAAGGAGAGAGGGTATCAGAGCAGAGGAAATTGTCAGTTCTATAGTTGGATGATATCCGTCTTCAGGTACAACAAGAGCGTCAATTCTACATACTGTGATTTCAGACGGGTCTGAAACAAACACAAGATCAAATTGTCTTTTTAAGGAGTTTTTTATAAAGCCTACTTGCTGAAACGATAATTCTAAAAGGCCATCCACAAAATCATGGGCGGATAAAGGATAGCGACAAATGAGTCAGTGGGAGGAGACCAAGAAATATCAGGTAGATTAAAGTTACCTAAACTATCAAAAGGTCTCTGTTAGAAAGAAGGGATAAAACTGATTTTATTGCAGACAGATGGTGCTTATAAATTACTAGGTTAGAGCCAGGTGGTCAGAGTCCCCAAACACTTTGATACGCCAAAATTAAACTTATTAGTTTTTTGGCACAGTGTTATTTCCTCTCGGTTTATTTGGAACAAATTTTTTAATTACTTAATCATCATTAAGTAAAAAGCTTTCAGAAAGTAAAACATTAAAAACATTAGGCAGAGCAAATATTTTAAAAGACGATATTCTACGAGCTTATGAAAGTCGAAATTGTTCAACTGCAATATCTTCTGATAAGAATTTTTCACGCATAAATCCCAAAACATCCTCAGATGTGGTATCTGAGGTAAATATAGAAACAAATAATTGCTTCCTTTGTGGACCAACTGAAAGTTTCTTACGCCCCCCAGCAGCAGTCTGAATCTCACCTATATATTCACTATATAGGCATGGTCGGCACCGATTTCTTTGACTTAGCCAGTACAGAAGCTTTTATTCCGGAAACAGGGACTAGCTGTATCAATACGCACAGTTGGTTCGCTTACCCTTGTGTCAACGGGAACTGCTATGGGTTGGATTCCATAGTCGTGTTAACGGCGGTTAAGCTGGCTTTTTTGCGTTTAGGCGACTCGGTTAATAATTTTTATACCCTTGCTGAGGGTATAAAGATTTCAGTCATTTGTCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGAGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCTTTGCAAACTTCTAACTGAAATCGGGTCTAATTATTTCAGTTAGAAGTTTGTTTCTGCAAGGGTATAATAGTTGTTTAGGTTTGTTTAATAGCTTGGTTCACGATGATGAGACACTATCGAAAGTCGAAATGTTATATTATCTGCTATCCTGTTTTGAAAATGAAGCGTTAGGAACAGTAAAAGTTTACCAGATCAAGCAGGGAAATAATGATATTCCGTTCCTTATGTTCTTCAAAACCAAGTCCCAACAATGCACGCGCCGTCTACGACAACGTTACGATTTCTAATCGAATCTCTCTACGAACAAATTATAGCTGTAATGTAATGTTATTAATTTCCGCGGTTGCCATTTATGAATTAGAATTTCTTACCCAAATTATTGAGAAACATATTAAATGTATAGCTAGTTTATTTACAGTTATTATACATTAGTTTGTTTTATTATTATCTTAAATATTTACTGAAAATGTTCAAATTTAAATCATATAAAATAATTTTTTTACTGTAGAATGTAACAAAAGTTCGTATTGCGTTCGCAATATTTTATAATTATTATGTTTATTTTTATCAAACGTATAATTAACCAACAGTGCTGTGATCTAATCAAAAGTGACTTATACGCAACAGAAGATTATAATTAAGTTGATAACTGTTTAAAGGTATTAAATTTTGCTACACGCTTTTACTTTTGTATCTTCTTGTATTGGAAATGCTATCACACAGCGTGAGGGAAACTTTGAATTTATTCAAGCAAAACGTAAGGCAAAACGATTAAGGGCTCATTGTTGTAGGATTTTAATTGGAGAACTTGATGCCATTCCTTAAATTGTTGAATCCTGGGTATGTCCTTATCCGCTAAACTTGTTGGAGCAGCGTCTGGAGATGGCCGAATTCCAGTACGATACTCCACGCCGAGTAATGGAAGTTTATTGGTTAACTCTGCCGACTCAGTGGATTTTTGGCTGATGTTACTGATTTCATTGGTTAAGCCAACATGTAAGTTATTATTAAAACATCTGTTACTATCATCACTATTATATTTTGTTTGTGATTCTAGTGATGCTATAGGCGGGGCTGATTTTATACTGGCAACAGTACTTTCAGCACATATTGAATTAAAAGATTGTAGCATGTTGTTGTTTCGAAAATCGTTGCACTCA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f15/3c3/92/scaffold_43-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCCACTGTATAATTTATTTCTTCACGTTCTCCTTCATCTGCTATATCGCTATCGTTTGAGGAAGTTAAAATAGAATCATTCTCACTTTCAAATTTGACCTGCACCGCTGCACCGGCACTCGTTTCAGTCTCAAATTCTAAGTTATGTGCACCAAAAGATGAACTTTTTTTAACTTTTTCTTCTTCCTCTGTGGAGGTGTTTTCCGCTTCGCTATCGTCGTCATAACTTGAGCTGCTGCTGCTATAGTTTATTATTTTTTCCTTTATACCTACATCATTCTCTATGCACAATTCGTGGTGGAAAAACAATTTATTGTGAAGCTTTAAATCTGAAATATGATTGTTGGCTTTTGGTTTTAAATGAAATAAATGTTTAAGTTCCAAATCAATAGTCTTAATGCGACCTTTTACGTTTTTTTGGACTGCTTGGCGATAGCGGGTGTTCCGGGACCGAAAAGCTGACCTGTGTGTTTTCGATATTGATTTCCCTTTTCCCATCGAAATATGAGTTGTATTTCGTATTTTAGTTGCATCTTTCACATAAGAATTGGGAATCGTCTTTTTTAAATTTCCAATATCTGATGTATTGGGTGAAACTTCATTCATAGAGTTTGCTGGAGAATTGACTTTGCTTGGAGTTTTCTTTATTGTTAATACAATATGATTGCTGGTAGCTCCACCATCACCTAGTGGGCGTTGAACAATGGCATATTCCTCCCTATTACTGTTTTCGTATTCGTTTTCATTATAATTCTCTGCTTCATTCTCGCTATCACTGCTGTTGTTATTACTACTCAGATTAAACAAATTTCCATTTAAAACAGTCTTTATCCGCTTGCCTGGAATATTAAATTCTTTTTGTAAATGTTTTTTTTTTTTCATATCATCGCCTGCATATATTCTTTTATTTCGATGATGTAACTTTGCTTTTGTGCCGAGTGATTCAATCCTCTTATTTTTAAGCTTTTCATTTATGGAGTCTTGAGTTTCTTTTAAACTAGAAAAGCTAAAAGTGCTTGAACTACTAGCACTATGAGGACTGTCACCTTGATAATCGTTATCACTACTTGTATCGCTTGTTTCAGGATTATTATCATTAGCCAATTTTAATAAACTATTACTGAAAGCATTCCCAGAGCTCGTATTAAATAAAGTTTCAGGTGATGGTAATATATTGATGTTGGGATTAACTTGTGTTGGCACGTGATTTTTAATATGGCTGTTGATACCAGAAATCGGAACATCAATGTTAACCTTTAGCGGACTGGAATTATTAAATTTATGTTCTGCTTTAATTTCGGAAACTTCAAAATGTTGTGAAATTTGTCCGAAGTGAATCGAAGAGTTAAGCCATTTCTTAACTTTGTGTTTAGCACGTCGACACGTTGGTAAACACTTTGCAACGCCAAGAAACGGTGAAATAAACGATTTAAAACGTTTCGCCTTGAAAGGTTTTATATATTTTAAAGAACTTAGATCTTTTTTTATTTTATCTGATGTAAGAAGACCATATTTAGGTACAACATCAGCTCCATTCGTCACTGTGTACGAGTCCAAATTGTGAAAACTAGGAGATGAGTCAACACTATCCCAATTGCCATTTATATTTGGTATGTAGAAATTATGCAATGAATTTATGTGAAAACTTGTCACTCTGTTGGTTTGTACATAAAACCTATTCTTTGCTACGCAATCAGGATCCTCATGAACCGTAAAAACAGGAGAAACTTCATTGTAGGTTTCGCTGTTCTCCTTTTCTAGATGATTTTTGTCAGCTTGAGCATCGGCGTTAATATGTAGCAAACTTAACGAAACGTTTTGTGCAGGCGAACTAAAAGATACATTTTTGGTATCCAAGTTTTTTTTTATATTTTCAAGTTTAACTATTGGCTTTTGAATTTCATCCATTATTGTATTCAAAGGATCGTCGTTATCATCAAAATCTAGATCAAATATTGACTTCACTGTTTTTGGTTGAATTTCACCTACTTCAACATTATCCAAACTTTCAAAATTAAAAACTTGGTCTTCATTCTTGTGGCGAGAAATATTCTTATCACAATTTGAACTTGTTGCTGGATCGTTGATATCAGAGTCTGAAGCTTCTTTTTTGGGCTCTTTTAATGAACTTTGAACTTCCTCGATAACTATGCAAGTACATGGTACTATTTGAGCTTGGTACATTTCCTCAATTTCAAGTTCACTCATTGGGCTGTTCAAGCTGTGAATTAGGTGCATTAGTTGAGTGGTAACATCGTTAAAATTCATCGGCATCAAGTTTTTTGGAGTCCTTTCTAAGACCAATGTATGAAGAGAATTACTATTGCTGTCCAATGAAGTAGTTTCCTTAATGTCTTGTGATTTATTACTATCGTGCGATGGTTCTGAAGTGAGCGTATCACTATCCGAAATTGGAGGTTCTGTAAAGTAAAAAACGTTTTTTGAAATTATAATTATAATTAATTATAATTAGGTATTTGCTACTTTTGTTGTATACTGTTTATCGCTAGACCGACTCTCTTTTCTTTATATTCCTTTATGCTTAAATACTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAGTCCGACCCATAACGTATATATATTTTTGATCAGATTCACTAGACGAGTCGATCTGGCCATGTGCGTCTGTCCGTCCGTCTGGCCGTCTGTCCGTTCGTTTCTACGCAAAGTAGTCTCTTAGTTTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCCGATCGGAGAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAATTTAAAAAAAAAATACATTTACATAATATGAAACAAATTATAGCCTTGGGGCTATTTGACATATTATCTTATAATATTGGAAATATAATTTTTTTTAGAGCTTTGAATTCAATTTAATAAAAATCGGACTGCCATAGGAACGATCGGAAAATTATTGGAAAAATAATACGAAAACATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATACAACCTCCTACGCTTGGAAATAAACTTTTTGCATTGGTTCTGAATTTGGAATTAATTTTAACAAAATAGGACGACTATATCATTTAGCTGTCATAGGAAGAATCGGAAAAGTTGTGGAAAAATAATATAAAAAAATGATATCTTTGGTGTTTTTATCCTATCCTCCTATGCTTGGAAATAACATTTTGTAATTGTTTCTGAATTTCGAATTTAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATTACACAGCTGTAGACCGACTCGTCTAATGATGCTGATCAAGAATATTTATGGGGTCGGAAAGTCTTCTTCACTGCATTGCTAACTTTAGACTGAAATCGAAATACCCTCTGCAAGGGTGTACAAAAAACATAAAAGAACGTAAATTTACTTTTAATTTAATTTTAAACTAAGTGAGAATGCTGTAGTCGATGCCATCGACTATCATATATCCATCACTCAGCTAATGGTAGTGCGAACGAGATAAATGCATAAAAATAGGAAAGCGTCTGCTCGCAAAATTATACATTTTATTTGCTTATAAATTAATCGTCCGAGCTTAACAATTGTTGGCATGTAGTACAAACAAAACAAAACGAAATCTCTCTAAAAAAAAGTGTGGGTGCTAGACGGGGTCTTAGCTTTTTCAGCGTTTGTTGGCATGACATCTTGCAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCTTAAAAATCTACATGCCAATCCCAAACTTTTTAGCCTTTGTAGTTTTCGAGATCTCACCGTTCATCCGGGCGGACATGGATAGATCGACTCGGTTAGTGACCCTGTTCAAGAATCAGAAACGGTTTTTTCTAGCGCACCGTATAAGATAAGATGGGGTCGAAAACACACTTTTGTAACCCTCTGCAAGGGTATACAAATTGTTGACTCAGGAGTGTGTGACTTTTGAGTCTGGAAGATATCGAAACAGTAAACGGTCGTTTGCTTTGGT'..b'AGCTATACGATAAGACATTGATAAGACTTTATCTCTATCTAGTTTGGGTAGGAACAGACAGAATATATTCTTAATGGGTCGAAAATGTTTTCCCCACTAAGTTGCAAGCTTCTGACTGACCCTCTCCAAGAGTATACAAATCATTAATACACCAAGTATAATAGCTCGACCCCTAAATAAGTTTTATTTAAGAAACTCGCCTTTATCAGGGACCCAAAAATGTCGAACGGAGGCAAATTTTGGTATATATATATATATATATATATATACTTTCTGAGATCACAGCTGTTCACAGCTAAATATGTAAATATCTGTTACATGCGTTCTAACTACTACAATATACGCTTTTACTCTACGAGTAACAGGTACAAAAATAAATACAATAATACAATACCTGAATCTGCTATGAGAGAAGACTGCACGAAAGCGTCGCTAACTTTTGTTCCAAATCTTTTGTTTTGTGCGACCTGCCCCTCTCTATCTTTACTTTTTTTGTCCTTTTTCAATTTTTTCTGTCGATAGCTTGGCGTGGTTGGAATTGCAAGGGGCACAGGAACTGTTAAGTTGGACTTTTCACGCTTCGATGCACAGTTATTGTCGTTTTCATCGGAATCGGATACAATGTCAATAACAACTGAAGCTTCGTTTATCTTCTCGGTGCTCACATGGGTTAGGTTAAATACGGAATTCACCGACTGCTCATTTACGATCGGCTGAGGAGAACCCACTTGCCTACTTAGTGCAGGATGGCGACGGTCCTTTAAATTTTGCAGTGTCGTTATATTGAATTTTTCCACGTGCTCGCAATCATGGATATTGTTGACCAGGTTCGTAAAGTTGGTCCGAAGCTCAGTATGCACATCCAAAGGCGGAGGCTCGGAAGTGTCGATATTTGCTTGCATATGTGGAACAACTTGCTGCGAAGGCAACGATTGAGTGAACGGCTCGCTTAAGTGGCTGTCTGGTACTAGCGCAGTAGATTTTGGAGAGTCTAAAGCTGGCTGCGTGGGCTGGGAACCAATTTGACTAAGATGTGGCACAAATTCAGCGGCCGTTTGCTGAATCCCAACCATTTCCCTCCACTTCTTCAACAACGACTTTGCACGTCGAGCTAGGTGTTCATTTTTGGTTCTCCTTCTGAGCTGATTTATGTACTTGGCCAGTCTGGTGGCCTCGAGCTGCTCCTTGGTGATTGTCGTGCCTTCCAGTGCACAAATAACAGAGAGCACAGCATCCATATTGACGACCTATAAACAAAGTTTATAAAGACCGATTTGTTGAAAAGATAACACATTTTCTTACATCGTAGTTTTGATCAAGTGCCTGCGATAGGTGAGTGGTAAGTTGCTGGATTTGGTTTTGGTTCATTTATATCTTCCGGATTCCAAGGCCTCTGATCCGCATTCAAGGAACATAAAAAAGGAAAGAAAAATGTACTTCACGAAAACGTTATTAATTTTGTTAGTAGTTTCTGTGTTAAACTTTTTTCTACAGAAAAGGAGAGTTATAGATCAAATGAATTTTAATTAAACATGTATGGACCAAGAGAGGTAGGTTTATTGAAGACCCATTTATTTAAATTTTTTAGATTTTTAATGTAATTAATGGATGCTATGAAAATCTATGAAACACGCACACTTTGGCACTATGTATGTTGGACAATCGTTTTGCTTACAAATTGTAGCTGCACAATTAAATTGTAATGTCCCTGATCCGCCGACACACCTCTTTGAGTATAAAATTGTTTAAACTCGTCACAAAATAAAGTAAGTTTTTAATTTAATATCAATTCTCCGACTCTATGACAATTCGCCATTTTCACCATTGACAGCTGCACTTTGCGGGTGGGAAAAAACCGATAGCTGAAAATATCGATAGTTTTCACGAGTATTCGTTATAGCAAAAAAGACTGTATAGAATGGGACGCGCATCTAAGTAAATAATAGCTTTTTCCCACAAAGATAATTTGGAATCCGTAATAACGGATTGATAAAAGGAGTTACTTTATCGAAATTTGACCGACCAAGAGCTTACCTTGGAAAAGAGAGAGAGGCAAATAAGTAGTTAACGCTTTTCGTTGAGACCCTTTTCCATCGCGGTATTCAGATGAGCACAGAAATAATCAGAAAAGCAAACGAACATTCATTTTGATGAATTTCAATTACAATGCTTTTAATATGGTCGTACTATCATGCATTTAAAATTTTGTATTCTTCGGGCTGCGACTAACGACGCTCATCGAAATTCAATCGCTAAATGTGGACGAAAAACGTTAGCCACATATTTGCCTCTCGCTCACTCCTGTAGTAGGCGAGTGATATTCGATGGACGCTGTAAGCCTCGGCCAAAAGAATATAAAATGTACTTTTGGGCTAGTTTGTGCGGAAGAGGAGTGGAATCCAAAATTTTGAAATGGAAGGAAAACCCAACCGATCTGTACTCAGGTCGTCTAAGAGTTTCACTTATCGAAAAATCGTATTCTTTGTAGTGTGACCAACGATTACAAAGTTCATCCGCAATACATGTAGCAGGGTCTTATTGTCAAGCCGAATACAATTGAAGCATATAAAATCTGCTGATGCAAAGGAAAAAAATTAAAAATAAATGAAATGCTTAGAGGAATTTTTAAATTAATGTTAATAATCAAGCTTCCTCCTTCACTTGCACTGCAGTACCGATTCCTAATATGCCAGCCTGGGCCTTGAGGGACGCGGGATGGCAACGCAGTTGCACCGCTGATATTGCAGGATGGCGGCCTTCCTCCTGGAAATGGTTGGTGTTCCTTTCAACTGCTAAAATTATTTCCTGCAAGGCGAAAGAGTTCCTGAAATATTTTATTTGCGCTCTAGTAGGAATCAAATAATACTTGTCTGTTTTCTAGCTCATATATGGTACGCAAATGCTGATCGATGTAATTGATCAATAGCATACTATATTATGCAATCCTCCACCACCTCCAGTTACTTAGCAGTTAATGCGAAGAGAGAGGAAAAACAAAGCTACCCGCTAAGGGAAAGTATGAGGTGCCGTTGCCGAGCTGCTGAGCACCTTCCTGCAGTTTCAGCGGTACAACTCCTTTCCAATCCCGGCTCCAATTCACCCAAGCCCATGTCGGCTTATTGGAAATCGGAACTGTATTGCATATGGCATGTAGAAAATGACGATTACTTGTTAACATAAATAAAAAGAGTTACCTTAAACATTCCTTTAATTTTTATTTATATCGGGCGATTAGTCTTTTTAAAACGGCTTGGAAATGGAAATCTTCGGTCACATTACAAAGATTTCGACTTGTAAAACTCTTAGTCGATCTGAGTACTAGGCCTTTCTTAGAACTTAGGTAAACCTCTATCACGGCTCATTCAGCTATTGTAAGAATCATGTTAAATTAAAATAACAAAAGCGAACACGATTTGAATAAAAACAAATAATTATTGGCAAACGCAAAAAAAGGAGTCTGGGCTCGGATACCAAAAGGACGGTCGATCTCTATCCATTGCACCAAAGCATCAACACTATTTACATGCACATTTCAAACCGTTGTTTAAAGAAAGATATAAAGAGTCTTTACTGATCTACCTATGCAAACGTTAGAAATGTGTAAAAGTGTAAGAAGCTCGCAAAAAAAGTGCTCGTTTAAAATATTTTCAAGGCCGAGAACATCCCATCGTATATAAAAACTCCACTGATCTCGTTTAGAAATGATGGTTTTAAAAACGGGTTTAAAATACTAAAGAAAATACTAAAATGATGGGTTTAAGGATTTGGTGTTGTTAACCTAAAAGCCAAGTGACAATTACTCTGCTTTATTTTTGGCAATCAATATGTGTTTATCAGACGTGCTCCAGTTTTCTATTTTTCTTCTTTTTCATTTTTACGAAATCTGGGTTCCGGAAAGTTTTGGTTACCGGTTCGTTATTGGTATATTTTATTTTCTTACCATTTCTTTTTTCTTAGACAGCTGTTTGCC\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTCGCTTCGATATTATTTACATTCTTACAAGGTTAGTGTATCAGCTTTCGAAGTATTGATACGGTCGTTGTCTTGGCTTGTGATTTTCGAAGAGGTGCTGTTATTGTCTATTACTACGTTTGTAAACATATAACCGAAATATATGGTTTGCAACATTATAGAAAGTGGAAACAGCAAGAACACATCAGCCCAGACGGAAACCGTTGCTGCTAGATAAGCCGAGACATGGGCCGGATGGGAGATAGGAACATCAGCCGAGACAGAAACCTTTTCAATGACCTAAAAAATACCCAAATTCATGGTAATTTTTGAAATAACTAAATTTACTCGTAGAGTAAAACGGTATCTAACAGGTAGAGGGAAGCATTTCAAAAAGGGTTTAAGACTACTAAGTAACAGATTATATAATAAACTTGTCTATTTGATCCCAGGCTGCCCGAAGCATTGCCAACCCTACCGATACCTAAGCGTTATACGCGATAGAGTAGGCGTGGCAAAAGTTCGATAAGTACACTATGTTTCAGCCAAAAAAGTAAAAACAGTCTCTAACTTGCTAATAATCAATAATAGCAGGACTGTGGGTAGACCCACTGGATGGGAATAATTTACCTTAAAGTCTAACCAACTGTCACATCGTTCGTTATCAAAACGCACTGTAACTAGGGCATCCATATATATCAAATACCACTTCCTATTCGCTTTCGATAATAATTTAATTACAGAGGGTTTTATGATTTCAGTCGGATGTTTTCGACCCCATAAAGTATACATATTCTTGATCAGCAGAGTCGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCTTTCAGTCTTAAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCAAAAGTGTTTCTTTTGCAGGTAGAATATACATAAGTAGAAGGCAGCCGGATCTGACAACTATATCTTATAGCTCCCATTGGATATTCGGAAAAAATATTTATTAATCTATGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTACGCTTGGAAACATAACTACTTCTTAATTAGTTCTGAATTGCAACTATCGTTTTATCAAAATAAAAAGAACAATTTAAAATTTGGTGAGAAGATAATATAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGTATTAACGTAAACGTAAGTTTACAATAAACAAGAAAGGAAGCTAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGCATACCCTTGCAGCTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAATTTATATTCCCAATATTATAAGACAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTGTAATTCGTTTCATATTATTTCCCACCAATTATCCCATCGTTCCTATGGCAGCTATATGATATACTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAAAACCAAATAAAAAATGTTATTTCTTCCACGCAATGGAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAAATATAATTTCTCAATATTATTTTACCACTAATTTTCCGATTGTTTCTATGGGAGCTATATGATATAGTCGTCTGATTTTGATAAAATTGTATTTGAAATTCAGAACTGATTTAAAAATGTTATATCGAAGCTTAGAAAGGTATATGTTAAAAAACACGAAAAATATACTTTTTTTTAATTTTTTCCCCGATAGTTCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCTGCTTCCGACCTATATACTATCTTCAATAGAAAAAAGACTTTTGGGAAAGTTTGCGAAGAAACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGGCTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCTGAAATGTTTCCTTCACTGCAAGGGTATAAAAATTACATCTCTGATGTTTTTTGACATATAACCTCAATTTTTTAGCTAGTTCGGAATTTAAAATTGGATCCTATGAAAATCAGACGACTATATCATATAGCTGCCATGGGAAAGATCTGAAAATTGGTGGAAAACAATATGAAACAAATCATAGAATCGGTGTTTTTGACATATTAGCTGGAAATATCGTTTTGTAGTTCTAAGAATTTAGAGTTCAATTTAATAAAAATTGGACGGCTCTAACATATACCTTTCAAAAAAACGCCCCGAAGTTAACTTTCTTTCTTGTTTATGTATTAACATATATTTGTAGGTGCTGTCACCCAATACATTCAGGATCTTTTGAGCAATCTTCAAGCATCTCTGTTTGATCAGGACTGCATCCAGTATGTACCTTAATCAGTAGTTAAAACATACTCGGAGGTGTCATAGAAATCTTTTCCAACCAAACACGGTTGGTTTAGTGCATTGATGTACGTAAGAAACATAACGCACTTGGGTTGGAAGAGATACCTGTGAATTACTCCAACTGGGGTCTTTCTGAAGATTGGGCTTTGTTACTTTATTATCGAAATGAGTAAGATTTACAGTAAACTGGATTTATACAAGATAAGTCACCTAATTTATTTTGCCATCTACGAAGTTTAACAATAGTTTAACATTTATTAATGCTTGTTAAAATACAAAACTACGTTGAAAGAACCCTAGTTAATAATTAGAGGTTTAGGTATGTACTTGTATTGCAGGGTGGGTCGTCAGTTTTTGTTATATATTTGGACATTGGCTCTCCACATCTTTGATTACGTTGCAACAGAATCTACTACGGTCTTTTACTTCCGTGAGACTACTTCGATTTTCGGAGGTGGCGTTATTGAGGATGGCCTTACTGCTTTCGACGCCTCTATACTAGCTCTTCGGGCAGCGGCGGCCATGTATGTCCCGTAGTACCTACTAAGCATGTGGGGATCAACATGGTTGAGTTCAATATATGCATTTGGAATGGCTGCTGTAAGGGTGGGCGGTCTCGCTACAGTCAAGGGCCCTGCAGTGGACTCTGCCAGTGGACATTCCTCTAGTGAGCTGGACTCCTCGTGTTGGCTACTGCTACTGCCCAAGGACCTTGCTGCCGAGCTGGAAATTGAATAGTTGTGCTGTTCAAGGTCTTCGGGATCGTGGTCGGGGTCGGCATCGAACGAAGACAGCCTGCCGTCGCTAAGGTACGAGTTATTGTCCTCCACGGAGAATATTTGCTTCACGGTTCCTCTGCCATTTTCTTGGTCATCCGTCTCCGGATAAGCATCGGGATCTGGATTGATGCTTTCGTCGACCACATCCACATTCACTTCTACATCGACATCAGTGTCAATGTCTGCCTCAGTCACAGGTTGTTCCAGTCCCAAGACCACTTCCCGGTGTATGGTTTGCTTGGTGATGACTGTGTGGTGCGTTTGAGTCGTAGTCCTCGCCGTGCTCGATGGCCTGACAGAGGACTCTTGATCTTCGGAGACAATGTCAACGATCTGCACATCGGGTGCCAGTAGCGACGCCACGTCGAACTGGCGCTTCCGTGTCTGCGAGAACATATTTGCAATGGTTGTTGTCGTGGTGGAGTTGATATAAGCAATGTGCTGATGCTGGCCATGTTGCTGCTGAAGTTGGGCTGGTTGGATCGCCTGATCCACCTGGTTGGCCTGCTGTCGTTGCATCACAATTGCAGGCTCTGCGCAGTACTGTGACAGGCCGGGTGCTGAGTTGCGGTTAAAGAACTGGCCTATATACTGATGGTGGTAAGGATATGCCAGAGACGACAGTTGCAGTGCCGACTGGGAATTGGGCGGAGGTGGGGTTGTGAGATCCAAGGGCGGCGGGCTGGGCGAGTCAGTGCTGGCATCATCTACCGACAGACCCATGTGTTTTCGGACTTTACGCTGAGCCTTGCGACGTCTGAAATCGCCTTTGCGAAAATCATCCATGTTTGCCGGGTGTATTGCCCAGTAGTGCCCCTTGCCGTTTGCACTGCGACCGGATTTGATGAAACAATCATTCAATGAGAGATTATGTCTGATGGAGTTCCTCCAACCCGGACCGCGGCTTCTAAAATACGG'..b'ATCATATTCTTTGATACTGGCTATCGCCGAACTCCATCTCACAGTACTTAAAATGTGTGAAATTTTTAGAAATTGATAAGAATCTTTTCTAAAAATTAATGTGCAGGTGCCGTAAAATTATTTAATTCTATTAAAGGCGCGGACAAGTACACCAACGTAAACTGAATTGTTGGCTAACAGAACTTAAATGAAAATGAATTTATTTATTCACTTAAACAGAGTCTACAACTTTAGTACAAAAACCTTAACAAACTTGATTTGGACAGACAAAATACTGGTTTGTTAAATACATACGACTAGTAAGTTACGGTGTCGTGAGGGTTAAATTAACATCATAGGTCTTTATACTTACGTATCCACAATTTAACTTAAAGAACGCTTTGGCGAGTGCCTCGACTGTTAGATATCCGTAACAGTAAAAGGGAAATGGATACACATATATAAGCAGCAAAGCTATATTTTATGGCGCCAGCTACCAGCTTTTTTAGTAGGTGTTATTTGGGCGGCATTGTTGCCATTTTATCTTATTTCAGGCTGGATCTAGGTTATTTGAAAATGATATAGCTTATAAGATTTGCAATTAGTTTATAGCCTGAAAACTAGCTTATTTTAAAATTAATTGAAATATTGATGATCGCAAATGTTATCGCAAATTGGCCAAATTCATCTCATTAGATGGGAGCAAATTAACACGGTCCAGTTTTGGGCAGAGGTCTTAGCGTATACAGACGCAGGAAACAATAAACCGTTTGATTCTGTTGCCTCTTTTGCCATTCAATTGCTGTCCTTACCGTAGTCTAATCTTGTCAAAACAAAACTACGGAACAGACTCTAGCTAAAATCGTTAAACGCTTTTTCAAGCAACATATTTGTTTTTGAATTTATAACTAGTTATTTCTAATTATAGTACAATGCGGAGGCACGGAGAGTGTTGTCACTCATACAACCTACCCGAAAAATATGTACGGCAAATTAAAAAAGCGAAGAATAGAGCGTTGAAGAAAATTGTGAAGTCTCAGATTTTCTGAAAGATCTAGTTTAAGAAAAAAAATAATACAAAAACTGAAAATTTCATTGGTTTTCTTGCATGTTGGGATATAGCTTGTTTTTAGCTTATTTATAGCTTATTCTATCTTATTTTCTAGCTTATTTGGCAGCTCATTGGGCGGCAGGCAGATTTAAGTTTTTTTAGGTCAGTCGATAGGTATGGATGAGACAAACACATTTCATTTTTCACATTTAAAATTTTATTTCTACCACAAGAACTGTAGGCTGTACAGATTTTCGCGGATTGTAGGCGAGAGAGTGGGCGTGGCATACCGCTAAAACAAACTTGCGATGCGCAGGAAGTCCAGGAATCTGCATGCCAAGTGACTTACTGACTGTTCTAGCTCTTCTAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATAGGGACAGACGGAACGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTGTGATCCTGGTCAAGAATATATATGTATACTTTATGGGGTCGGAAACGCTTTCTTCTGGCTGTTACATACTTTTTGACGAATCTAGTGTACCATTTTACCCTTTATATGAACGTTTTATATGAAAGTAGTAATATCGAGATTCAACCAGTTTCCATTTATAAATCATTAAAAAACACTTTTCAGATACAGATTTTAGAGTACCAATTGCTATAACTAATAACAAATAATTAATAACGTGCTTGTTTGAAGAAATGTGACTGCAGCTCCAGCTCCAATTCGCAGTTAGAGCTTCAATCAAATAATTCTGACACATATTTTCAGTGCGGAAACCGTTTTTATATCTGGTCTTAAAGTAATTCTTCAATCCAAATGCATACCAACTTTATGTAATGATAATTTGAATGATCCCAGTCAAACTTCAATCCGTAATGCGTGCAAATTGTTTGATAATCACCCGTCCCGAAGGAGTTAATGTATTTTGTGAAGTCCCATCTAACAATGCAAAATAAATACATATATTACGACCAACGAAATCGGATATGAGGGTAGTTTGGCTACACTCACAAAAATATTAACAGAAATTTTACAAAAAGTACAGGTTTGCTTAATTTTTTTTTTAAATATAGAAAAAAGAAAATTAATTTTTAATGTGGAACTCAAAAGTAACAGTTTGACGTAAGTTTTTTAAAAATCTTTTATAACTGTTTTTTAAGACTTCAAGATTAGAAGTCTTACATAAAAGTCTGACAAGGACTTTATGCTATAGTTGGTTATCTGAGAAACTGGTATCAAACTCGAATGTAGCGTTTTCCATGGTTTGCTTTATGGTTTTAAAATATTCTTGTCCATTTTAAATTTAAAATTTTTACTCCACAGCATTAGATGATTACTACAGCTAAGCTAAACAATTAGGCGAGTCCACGTTTGTATGCTTGTGGGACCAATAAATCCAAAGCAAAGACATTTTGAAGAGTGTAGCCTTTCTTGCTCATTTGCTATTAGCTCAAAGGCACAAACAAGATTGCCACTGCTCTCCGACGGGAAATTGTTAAACGGTATTTAAACAGCCAGCCGCACCAGGTCTGGGACAAGGACAAAGGCCAGCTAATCCCAAGACGCACGCACAACAGGAAGCAACCACAAAAATGTGTAATTTTAACAGTAACGGAGCAACAGCAACATCAGTCATGCAAGAATAACACCAACAATAAGGCGTATCAGCAATGTGAAGAAAGGGAAAGGACACTAATGAAATAAATGGAACGACGCTGCTGAGTACGGCGTGGGGATGGCTAGGGTGACTTTAAATATGGACAAGTGAAGTGGGTGGGTGGCGGCCACTGCCGGGTGACTACCAAAACAATTATTCTTATCTAGGGTGTGTCGGTCTGCCATTGGCGCTGGAATAGATTCTACGGGGGCCGGTGTAGAAGTACTCTGAGCGTCTAATCCGTTTACAACCAATAAATCCCATTGGGGAATAGAAGCCATTGAAACTCGCTAAGCTATATGAACACAGACTCATGCAGAGTGGTATCCACGTTGGTTATGGGCTTCATAATCCCAAGTCCCTCTCTCTAGAAAGAATAAAAAGGGATAGTCGAGTGCCTCGACTATCAAATACCTGCTATACAGCTAGCTTGTTTCGAAAACAACAAGAGTAAACGCTTTAGTCAATAGCATCGACTATTAGATACCCGTTCCTTTAAAGATATGCTTCCAGCAAATCTGTTTTTTCCCTAAAGCGCATCCTCGTCCCACCAAGTGCCACCAAGCTTATAGCACCAACTAGTTGAACTTCTAGCAGCTTATTAGAGAAGACATCTTATTTTTTGTTTTGCAAAAGCTAACAAGGCGTTGAAAGTGCATAAGTAAAAATTTAGAAAGTTTAATGTCTTAGGGCCAGTGACGACATGTACCACCGCTATTCACCTAGTTTGATTTTTACTAAAAATACGCGTCAAGTGACACCTCAAGTGTCAAAATCAGATGCTCCGTTAAAAGTATTACAAAAAACACAATTTTGATGGACTTTTTAAAATGAAAGCCTTATTTTGTTTGCCAGTTTGTCCCAAAACGTTATTTTAAAGTCTTTAAAATTTTAGATGATGCTAAACAGCCCAATGTAAGAAACATTAGTTCTAGTCGTAGCCAAATTTGGCTACATTTTGTACACCAGTAGCTGTATAACTGTTTAACAGTATTACTGCAATTCAAGATGCCTTTACTTGTTAAATTTTAATGAAGCGTGCCGAATGTAAAAAATGTAGCAAGTTAATTTATTTAGTAGGTCTATAATACATTTTCGTAACAATGGTTGTTTGTTGAAGGTGCGATCGTCACTATGTTTTTGCCTCGTTAAGAGGTGTTTTTTTATTTCTTATAAGAACAGAAATTTAAAACTATTTATAATATTTAAAATTGAATTATCATGCCAAGTCCCAACATTTTTGATCCTATAGTTTCCAAGATCTCAGCGTTCATACAGATCGACTAGGCTAGTTA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f63/e07/8b/scaffold_47-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCCTGATCAAGACTGTATACACTTAACGTTGTTAGAAACACTTCCTTCTACATACTTCCTGTGGTATCTAGGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGGGATTTGGCATGCATTCTTGAGGTTCTGGGACAGCGCAAGTTTATTTCTTATTCTCTTAGCCTGTCTAGCGCCCACATATTTTAAGATTTCTAAAAAGTGTAAATGCAACTTAATTTTGATTAATCAAAGCTTATATTGTTTAACTATATCCTAGGTCCAATTATTGTGGTTTAACTTTGTATCTGACCTGAAAGTCTTTAACAAACATTTCAAAAAAGTTTATTTTTGAGAAATAATTATCTTTTATTAAATTAAAAGGAATATCAAAGTCAGGATAAAAAGTATCTGAAGCGATTTCTTTTTTGAGAAAAGACTGCTTAATTGAGTTATACGAGCTTCGAACTGGTGTTGTAATTGGGAGGTTGCGACAGATGTTTGAGCAACACAATTGAAACCAGATACCTGTTTATTATCTGATAAAACTGGTTGCATTTTCACATCGAGGGTGTGCAGAATTTTATTCTTGGTGGTGTTTCTCAACAACTATGCTCAACGCCCAACGTTTTCGCACTTGAGAGCAAACACTTTACTTACATCCCTTAAACGACTTCTTCATAAAGTCATTATTGTTAATTAATAAAAAATATATACTCAGATAAAAAATTAATACATACTACTATTTTGCCTTGCGGTGAGTGACATGTGTCGCTCCTTGCGATATTTTGGATAATTTAATTGGAAATAGCTTTATGTAGTTAAAGTACACAAACAAAAAGGTGTTAAAATTAAGAAACAGTTATTTTTTGGTGGGGCATAACCTAAAATATTTATTAATTTAATTTGTTTAATTTTTAGGAAAATAAAAAAAATGTGTTTAGGGTTTAATGCAAAAGAAATTAGGTTAATCGGATGACTACAGCTGTAGATCAAAATTTCCAAACAAAATCACTTTTTTGGTCGTTTCTGCAAACATTCCCATTTTTATACCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGACGGGTTTCCAACCCCATACAGTATAGATATTCTTGATCAGAATCACTATCCGAAGCTATACAGTCATGTCCGTATGAACGCTGAAATCTTGGAAATTATAAAATATTGAAGAATTAAACTTGTCATACAGATTCCTGTTTGTTTAGGAGGATGCCACTCCCAACCACTTACCGGCCAAAACTACGGCACTCCAGTTTTCCAGCAAGGAAAATTTTTTTAGCTGAAATTTATTTTTCTTACGCCCACAAACGGCCAAACGCTTAAATCTGTCAAAACATGTACTGAAATAGAGGTTAGGTGGCGCTATACAAAATGGATTTGTTGGTTATATATCTCCATTTCCTTTTCGCTCCCTTAAGCTGAGTAAAGGGTAGCTGATAGTCGAGGCACTCGAACATAGCGTTCATCCAAGCGTTTCTGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACATTTTTTTAGGTCAGTCGATAAGTATTGATGAGACAAACACATTTCAGTTAAAATTTTGTTTTTATCATATTTTTATGTATAGTAGGCGCTAGAGATTTTCGCGGATTGTGAACGATCGAGGGGACGTGGCACCCCACTGGAACATACTTGGGCTGCGCAGGAAGCTCTTATAGTTTCCGAGATTTCAGCGTTCAAACGGACAAACGGAACGACGGATAGACGGACTCGGCTAGTGATCCTGTTCAAGAATTTATATACTTTATGGGGTCGGAAACGGTTCCTTCTACCTGTGTTACATACATTTCGACGAATTTAGTATACCATTTTACTCTACGCGTAACGAGTAAAACTAGAGAAAAGGATATAGTCGATGACATCGACTGTTCACAATTGCACACCCACAGTGGCGACGCCTAATGTCGAGTTTATAACTTTTTAACGGATGGTCCGATTTCGACCATTGGCATAAGTAGGTAAAATTGAATTTAAACTTGTGTGGGCTTAAGACAGGAATACGACTGGGCGTGTTGGTGTTGAATCTACACGCCAAGTCACAACTTTCTAGCTTTTATAGTGTTCGAGATCTCAGCGTTCATATGGACTGAAAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGGCACGGCTAATGATTCTTATTCAGAAAATATCTACTTTTTAGGGTCGGAAAGACCAATTCTACCAAATACATACTTTCCGGCCAATCTAGTATGTCACTGATAAGTTACCAGCTTTAGCGAAGATTACTAAACGATCGTTTAGAAATCTCCTCGCCTACACTCCCTCTGCGATTCTTAACCTCATGCACAACTTTGCACCTAGTTTAATCGGATAAAAGATTAAAATTTTCAAAACCCGTGTTTCTAATATCACAAAATTTCGGATGCATTCAGAGTTATTACCAAGAAGCCTTGACTCTGTGTTGTATTATTTTCCGTTCAAGTGGAAAAAGACAAAAGTCATTAATTTGTTTGATTGCGTACTGTATACATTTTTGAGTGCACAAATTTTATACAACAACGACAAAATAATAACGGCAACGATAATGCTTGTACCAGGCGGAAACAGTACCAGCTGAAAGCGACAGAGCCGCAACTATTGTACATTTTTCGAGACTCACCCTTCTTTTGTGCTTTATTGCCGGGGGCTGGGCAATACAACCCCAACAGCTCAGACCGACATAGCATACGAGAAGGGATCGCGTGACGAATATTTATTTGGTAATAATAATTGAGTAACAACGATTTTTTGTTCTGTGTATATATATATATATATTTTTTTTAGGTGTATCAGGGTTTAGCGCATATTCATTTGGGACTTAACATTTAAATTAATTCTGCAGTTTATAAGATTTGTAATTTTATATAAAATTAGTAGTTGTCGTTGTCCTTTCCAGAGTGGTTATGGTCCTTCGACATAATCACGTACGCCAACATTTATGCGACCCTCAGCGGCGGTGACTGAAAACCCCAGAATGCGGGCGTCCATTTTAGTCATCTTATTCTTCTTAACCTTTTTCTGCTTGTTCTTAAGTAAGGAACAATTAATAAGTTAAGTGAATTGAATTTTATTGACTCACCTTGCTGTCAGCATAGTCATTTGTCGATGGTGTTATGGCGGGTGCCGGTTTGCACATATCATCATTGTGTGCATTTTGGGCACGTTGCAAGCTTTTGTACTTGCTGCGCCGTTCCAGAAATTGTCTTGCGAAATCCAACGACTCTTTTCCTTCACCTAAAAGATTTAATTTGGTTAGCCAAATTGGTTTTGTTTGCTGTCCGCGTCCGTCTATCCGTCATGCTGTACTTTCCTAAATGTTGGACCTGACTATTTTGCAAACTTAATAAAATATACACGTTATTAAGCTAACCACTTAACTTATTAACTAACGGTATCAAATATGCAATGAAAGATTTTCTAATTAATAGAAGAGTATAAAATAAAAAACAGAACGTTACAGTCGATCACGTGCTAAAAACCGTAGTATCTCCTTAAAACAAAAATTAACCAATTTTAAACTAAAATCCCAGGGACATTCTTTTGAACCTGCACCTAGCAGGCAGCGCCACTACTACATTACACTGGGGTATTACTATCCGTGCTAGGCGCATTTAATTCTTTACTACTACATTTCTCTTCTTAATTTAGTTATTCATAACTTTTAAAGCAATATTGTGATTGGTATGATTAGGGGCATGTAAATAAACATAGATCAATACAACAACTCCAGAAAGACATAAGCGTCATGGGTGTGGAGTGGGCAAGTGAGCACTGAAATAAACTTGCGCTGCGCAAGAACCCCTAGTTTTTGTATATTTAATCCCAATCGTAACTATTTATAGATTCCGAGATCTTAGCGCACATGCAGGCAGACGGACATTATAGGGTAAACAAAGCAAAATAATTGAAATTTCCCCTTAATTTACAAGA'..b'TTGGTGCTGTAAGTATTGGTCCTGTAACATCTGAAATCGCATTGCAAGAATTTGGGACGTGGTGGTGATGCTATTTCCTCCTAAATTTCCTTTAATTGCTGCACTTAGAGATTCAGCGGCTGCGGTTACATTTGCCTTAAGTTGATCACATCTTTGTTGTTGCAATTGCTGTTCGACAACAGTCAGCGGGAGAGCAATTGGTGATTGCTTACGGGGCGAGATTGGAAGTCCCGCTGAAAGTGTGGCTGGTATTTGACCAACAGGAAGATTCTCCAAGTCCATCGGCGAAGGAAGTAGGTGGCTGTGCGTAAATGGCATGTTCCCATGGCAAAATTTTATAAGCTCGCCCAAGGGTCTAAACCTATTATCGGAGAATCGTCGCACGAACAAATTTTCATTAAAGTACCCAGCACGGTACCATTCGGTCATCTCCATCGCACTGAATGGACCCTGTACATTTGCCTGGGGATCCCGATAAAACCATAATTCATTGAGATTTGGATTGATCAAATGTGGCGTAGGAACCATTGAAAAATGTGGCTGATGTTGCATGTTATGGTGCTGCATAGCAACCAGATTTGAAAACGGAACAGTTGAATGCTGATGAGATGGTTGAGTTGCTTCTGAAATTGTAGTTGCGATTTGTATAGGCATGGTGGTAGCTACTTGCTGTCGCACTATAGAAGGATTCACAGAAATCGGTGTCGTGCTCAACTCATTATCTGTCAAGCTTGGCAGCGCAGCAGGAAAGTGACCGCTATCACTTTGAAGTTGGTTTGAATTCGTAAAGGGTTTATTATCATCTTCTGTTATAAGTTTTTCCACTTCATCGGCAACTTCTTTGATTCGATCTGAAATATCCCCATGGATGACATCCGTTTTTGTTGTTGAGTTTACTGGAGACAAACGGCTTTCGGGTAATTCCTGCGAAGCCGATAAATTCGTTAAAGAGACTTCAGAAGTTTTATCGTTTACACTATCATTCTCATTAAGGGGTTCACTTTTAGATTTTGACAAGCTCTGATCAGAGTTAAAACCTTTGGCTTTTAAACTTTTGTTATTTTGAGGATCAGCATCACCATGAAAGGCTCCACTAGCATCAAAACTACCACCCAACTCTGATGGATTTTCCATAGCCCATTCAGGAAGATTGTCATCGCCACCATTACCAACTACATTATTGACAGCCCACAATGGCGAGGTCTTCGAGCTTAACAGTCGTACAGAAGGGTTGGATGAGCCGGCTGCCTCTCCAGCTCCTATTCCGGATGATTTACTGTTTCCAGGCCGCTCTCGATCCGGGCCTACAGTCCCAACCGTTGAAATTGAACGTTGCAAAGTACTTGGATTGTCGACGTGAACATCTTCATCGCGCCAACTTGTAGACCTCCCTAAAAGTAAGGGATTAAAATTAATAACTTTGCTGGCAGATATGTTTAATTAGTTAGTTAAAGTCAGAATATTGTAATGAAAACGCCCATTTTTATGAGGAAAAAGCTTTGGCCACCCGAAGTTTATATGCCCTTGTAGCGAAATCCAAACCAGAAATAAATGTCATAAACGTATTCAAGAAACCATATACCGGTAGTCGTTTGACTCAGGTACTGAATATAAGTGATGAGTGTAAAAAAAAAAACAATAGTCCTAGACAGCGTCTTAGGATGGGTAAATATCACTTAATTTTATTTTTGGCAAAAAAAAAGGTTTAAAATTGTATAACGTAAACAAACTGTATATTTTATTAAAAAAAAGTCTTATTCCGCGGTTTTTATTAAAAATAATTCTTACTCTCTTGTCAGGTATTGCCAACACTTTTCATTTACAGCTACATTACGCATAGTTCTGGGCGGTATGTGTGCGTGTCATGTTCGCGTGACAGACCTACGCTGCGTAGAATTTTTTGTGAATATTTACGAGATATCTGCGTTATTATTTCCCGAAGTGTTTCGGCATATTGTATTCTTTTCAGGGAAATGTATTGACGAGAACACTTTACTTATGGAGTTGGAGAGATGTTTCCTATTACATAATTTTCCCCGAGTTCAAAATATATTCAAAGCTCCCATCTATTTAGAAAAGTTCTACCACCAAATCCACGGTCATCCGACGTTGGATTTAGAAAACAAGGATAAAATTATCCTACACATTTACATCGCATGTAAAGTCTTAAAGGGAAAGATTTTCCTTCATTTGAATAAAATTTTTTTCCAGAATGACGAGGATCTTGAAAATGTTGTCTTAACTAACCGTTGAGACTGTCGCGTAATTTTCAGGTAAACCTTTTTTTTATGTAAACCTTTTTTCCAACGAACCGATTCAATTATGTCCGCAAGGTCCTGAGTGAGTAAATGCTTCAAGTCACGTGGTAAAATTATTCGCAGGACTGTAATAGTGCTCAATACTTAGGTTTATCCAACTTTACCCAAGAAAGGATAAAATGTAACCCGCGAAATTATCTTAAGCTTGGCATTGCAACCCCCTATTAAGATCTAGCAACATAGAGTTCATTAATCGAATGCCAGCTAACAATTCTCAAACAGGTAAAGTACTTGCAAAAGAAATTTGGTTTTCTCGACCAATAAAGTCAAAGCTGCCAGCTAAGCTTGATAAAATGGATGCTCATTTCCCAATGACCACTAAAATAAAATTTTCATAATCTCAAACATATACAAAATATAAAAAGCTGGTGCAATAAGCAAAGCTAAGCCTGGCTTCTTTTTTAGGAAGTTAATGGATGAAAACTGTGTTCTTAGATTACTTATGCACCTCTGCAGCCGTTTATGATGTGGTCAACATTAGAACCTGGTCAAATTAGGGGCGTAGTTAGAGGGGTTTAAGCGGTTTTCCTAAACAGGATAAATCCCATGCAAAACATTATTTTAAGAGGTAGATAGGACCTGTCAAATTGTAGACAAACTTTTCTTCCTGTACTAATTATAGAATACTAAAATATAATGGAAAGTAACTGACCCCATCGATGACTGTTGGTACCAAAACTTGTATTAGTACTTCCTGCGCCACCACCGCTTCTCCAACCACCAATGTCGGGACCACTAATGCCAACTGGACCGTCTCCGGAGCCGTCTTCATTCCGTGATCGTCGCCAGTTCTCCATATTGCGATGATGACTTGAGAAGTCTTTTCGAGGACTTGAGCTTGGAGTCCCGTTCCAGTCAAGGACACCTGAGCTACTACTAGAGATGTTGGTCACGGCAGAATCACCAGTTCCGTTGCGTTCACTCCAAGTGCGTTCAGCCTGCAACAATAAAACTATAAGGTAGCAACGAATTTTTCATTAAATTTTTTCATTTACCTTGATAGATATTACCGATAAGCCCTCATCGTAAAGACCACTTGGGCGTTGGTATATAGGATGATAGACAGATTTGCCGCGTATTCGGCCCCGATCGACTGTCCCACCACGTCCAGTGCCCCGAGAGGCAGTACTAAATCCACCAGACGATCGCTGCAACCAGGCAGGTCGCGACTATTTGCAAAGTAAACTTCAATACTGGAAGGTAAGGGAAATCATTTGACCTACGCTATTCCCGAGCACATTTTGGTTGTTGTCCTCCTCGGAACTTGGTGTCAAAGCAAGTGGATACTGGACCTTTTCCACAAAAAGCTTTTTGAATGAAGGCAGGATCTGCGGCAGCATACAGTTCCGATCGAACAAGGAAAGCATTTCCTCGCGACCGTACCGGTATTCTGGAAATAAATTACGCGATGAAGAGGCTGTCGCGTTGTGGCCCAGGCTGTGCGCTGCAATCGAACTATTTAGGGCTCCAGTGCTGACGTTGTAAGTACTGGGAGAGCCCGAGGGCTCGGCTGACATATTGCGCAACCATTCCGGACCGAATTTCATTGAATCTGTCATTTTCAGTAGCCTCTTTTCCAATGTTACGGTGACGCTAAATTCAAAAAGAATATGTTTTCAATTTTTTAATTTATCAGAAGAAAACAAACGAAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTAATCGTAGGAAAGTAAAGAAAGGTAAATGATGTATGTATATATTGGGCGTTAGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCACCTTTTTTTTGGGAGTTAGGTATTGATGAGACAAATACATTTCAGATAAAATGTTGTTTCTTTCATAAAAACTGTAAATACTTTTAGGGGTTCTGAAACGTTTCCTTCTTGCAACGCAGTGAAAGTAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCACTTACGAGTCGATCTAGACGACTATATCATATAGCTGTCAGACGAAAGATTGGAAAATTAGAGGGAAAATAATATGAAAAAGTGATATCTTTGGTGTTTTTAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATAAGTTTTGAATTTTAAATTAAATTAGCTGCCATAAAAACTGGTGGGAAAATACTATGAAACAAATTATAGCTTCGGTGTTTTTGGACGAATTATCTTATAATATTGGGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTAAATTTAATAAAAATTGGACGATTATTTTTTATAAGTGCGAGGGTATACAAACTTCCTAACAAATCCAAATCAATAAAAATCAATCGAAAGTTTTTAAGAATTGATGTTTTAATATATATTCTTGCACAAATTTTTCATTGGTTTTGCTAGCATAACAAAACACATAAATCGTCTGAATAAAAATGCGAATACTTTAAATAACATAGCAAGTAATTTAAGATATATTATACAAAAATACTGTGCTTTGCTTATTGTCGCGAACTACAAACGTAACAAACGTATAATGGTTACATATGTATTGTGGTTTTTACTTAATTCATTGCAATAGAATTTTTTATGTATAAACTTAACCATGAATGACTTTAAGATAAAGTGTAACTATTTAAAAGTTTTAAGATGTGCACTTCCCCTTTAACCCCACAAATCGCAAAGAACAACAACATCAACGTTGAACTGAAATTTACTCAAAAACTATTGACTTTTGTAAAAAAAAGTTAGACCAGTTCCTTCCCTGCCAAATAAGACTCACAGCTAAAAACAGAGTTTTATACCAAATCGTGATACTGTAACTAAGCATTTCAGACCGCTTGCATATTTATAGAAAAGCAGCATTTTCTATAAATACAAACGAGAAATATTTAAAGGAATATTTATTTTTTAATTCCAGATATATTAAGTCGATGCACTCGATCGTAGATTTTTATTACTTTCTTGAAAATGTGATTTCGATTAAATATGTTTATTTCACTTTCTATTTCAGATAAATGCATTATCGTTAGGATAACAGCTATAAAACATAAGCTTTTGCATTGTTACTTATTACTATGCCTTTGTACGGTGTTCCCAATGAAATGAGTAATACCGTAAAATTTTATGACAAAAACATAACATACATTCGAAATATAGAAATGTTTATCATGTGGCGTTCTATTTTTAATTGTAAGTCAATTAACAATAAACAATAAAATTTGTGGTTCCGTACGACGGAGTAAAAATTGTTATTATATACAAAAACATAAGAAATCATAATATATTGACTTTGACATTGTCGTATAAATCACACCTGGCAAACTAAGAAATTGATCCAAGGCATTGCATCGTAATGAATTCACTTCAAAGTGCTATAAAGAAGAAACTCGAAAAAAGTGGGCTATTTAAAATAAATTGGCTCCAGCTGTTATACAGTGTATTCACATTAACGGCTAAAAGGTTGATTGACACGTTGCCCAGTGAGGCAAGATTAAAATTAGAGATTCTACAGAAAGAGTACATCAAGCAGTTCTTTTTTGAAAAGCGCGTGGGAAGCGGAGGAACTTGCTTAAAGTCATTTCCGTGCTTTGGATGATTAATAAAGAACCGGAGTAGAATCGTTGCAGCAGAAAGGCAGACTCTACATCTCTCAGTTCAATTTGTGTTCAGAGATCATCAGCGCAAGAAAACGCGTTTTAAACTATTAACGGCTTATCATGTTCCATTTAGAATTATTGCACTATCTTGTTTCAGATTTCTGCATAAATTGAAAAGACCAAACTGTGCTAAAATGATGCTAAAAATAATTCGTGGTTTTCTATATTGCTTAAGAAAGATATTTTATAAAGGCCAGATGTGCAGCTGACATTTCTTGGTGACTCAAATTTCTTAAGTCTTAAACCGAATAGCATTGCAATTTGTTCAAGCTTTCGTTTACTGCTGTCACTGGTAATTTGTAATTGTGTAAAAAATGTTTACTAGTCAGTACAAGTCTACAGATTCTCGCAATGAGACGTTGCAGCTTAATTCATTACCAAATTTAGATAAAAATTCAAAATTTGATGTTTTGGAATTTGAAACGGAGGAGGATCTTCAGTTCCCTCAAATTGCCGCTAAAAATAAACTTTTAAAACTAAGTTGGTGGAATTCGCCAGCTGAAGTCCATGAAATCGAGGCCAATTTAAAGCACCACAGAAAAAATGATAACGGACGCAACAATAAAACGGAAAAGCTAGAGAATAATAATTCGTTAGTTAATGGTTGTGTTAGCACTCCAGCAAGATCCGTTTCGTTACTCCAATATATTCGTCCAGACCAGGAACGCGTCAGTGAAGCACAGGAAACAAACATTCTCGAGCCCAGCGTTGATGAATTATATCCGAGGGATTCACACCGTCTTGTTGATGGTATGTATGAGTCCTAACAATTTATTTATATTTGAATATCCCCTGCCAGCATTTTCTATCGCGGAATACCCTTCTAAGTGACTTCTAGAAGATGAAAACTATCGTCCGCGACATCGCATTCGGATCGCGGAAGTCACTCCCGTCGGAAAGAAATGTGCCTCTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCACTTCGGCGACACTTTGGGAAGTCACTTCGGCGACTCTTCTTGAAGTGTCTTCGTTGACACTTCCAGGAGTGAACTTCTTCTGCGATACTTCTTACCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTCACTTCTGGAAGTGCCGCCGAAGTGGCACATTTCTTCCCGACGGGAGTGACTTCCGCGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTCACTTCTGAAGGTTACTTAGAAGCGACTTAACAGACGCTTGTAGAAGATACCAGAAGGGCCTTTCCCCATTGGAAATCTTGAATAAAAAAACTTGTTTTTACATGTTAGGCAATATTTTGCATTTATTTTTTCCATACGGTCTTTGAGCACTTGCAGACACGGTCTTTGGCATATCGGAAATGCTGCTTTATAATTTTATTTATGTCCAGCTCCGTTCACATAAGAAATTGAATAATAACCATTTCTAAAATAAACATAGCAACATTTTTTTTATATTTAAAATAAAAATAAATTTGGAGGAATTACCTTTTATAATTAGGTGGAGAATCTTTGAATGCTTATTTCACTGCAATCGAGCCAGGTAATGTAAAAATATCTTGAAGTAATCGTACAGCTTCACGTATATTCCCACTCTTCGTTGAGTTGGACATTTTAATGTGTTATAAAATTTTAAAAATTATGAAAAACAAAGCAACACACAAATTTTATACAAAACTCGACTGATAACAAGCAAAGTGCGAAATAAAGTGACGCTCGGTCGAAAAACAAAACCGTAGGTAAAAAGGAAGACTAATTTTCAGAAATAAACACTTATCGTGTTCTCCTTTTTCCCCAGTAACTTTGTTTTTGTATCGTCTAACTATCGTCCAGAAGTGACTCAGAATTTACTTCTTCGCGATCGAGACCCTTGTTTTTGTAAAATGTGTGCTATTTTCTAACTATCGCCCAGAAGTATCTCAGAAGTTACTTCTTCGAAATGTGTGCTATCGCATTTCTATCTTCTAGAAGTGACTTAGAAGTTACTTCTAAGCGATATATGCATATTTTGTTTTTGTAAAGTGGTTCTATCGTCTTTCTATCTCCAGAAGTGACTTCTGGACGACAGGCGATAGAATTATCGCC'..b'GTTGGTGATCAAACTCTGTTTCGCCTTGAGTCGACGAATTCATTAGTTAACGAATCGAGTTCCAGTTATGCAGAAAGTATTCTGCCGACGAGCGATAGTTTGGCCAGTGTAAAGACCACAGACACATGGACCCATAATGAGCCAACAGATGTAGATGCTGAGCTAGGAATAAACCGCACTCAGGACGAAAGCTGGCGCCAACACTACATATTCGCAATGGATGGCGGAACTTGGCAAATTATAAAAGATCACTTTCCAGATGAAATGGCCATTCTTTTAACACGGGGATCGATTTACGCCCGAATGTCACCCGATCAGAAACAGGCACTAGTTATAGAACTTCAAAATTTGGACTACTGTGTTGCCATGTGCGGTGATGGTGCCAACGATTGCGGTGCGCTAAAGGTGGCTCATGCTGGTATTTCGCTAAGTGAGACCGAAGCATCCATTGCGTCGCCCTTTACTTCACGTAATCCCACGATTTCGGCTGTTTTAAAAGTTATTAAGGAAGGACGTGCCGCATTAGTCACATCCTTTGGAATTTTTAAATATATGGCAGCATATTCATTGGTTCAGTTTATATCTGTTATGGTTCTTTATTCTATCGACTCGAATTTGACAGACAAGCAGTATCTTTACGTAGACCTTGGACTTATATCAATTTTTGCCTTCTTTTTTGGTAAAACTGGATCATTTGATGGAAATTTGGTCGAACAAGTGCCTCTCAGTTCATTGATATCTTCTACTCCATTAGCATCCCTTTTACTTCATCTCACTGTTGTAACTGGATTTCAAGTAATTGGTAAGGATATTAATAGTACTAGTTTACAAAATAAAATTCATAAACCCGGTTGATAGTAAATTTGGCTGTTCAATTTGTCATTTAAGCGCTTAAAAATATTTAAAAAAATGAATGTTTTCGAAAAAATTTACAGGTAATTTTTGTGATTCTGTGGGTCAATGCTAACCAAATTTGTTATCAATCGTATGGGAGCATATTGGGTGTACATTTTTTAAATTTATTATTACTTTTACTTTTATCCTATGATTCAAGGTTGGATTCATCTACACCAAGAGCCGTGGTTTAAACCGTTCCAACCTGCAGATGAGGACCATTTGGGTTGTTATGAAAACTACACCATGTTTTGCATATCTAGTTTTCAGTACATAATACTTGCTTTTGTTTTTTCCAAGGGTGCGCCATATCGAAAGCCACTGTGGTCAAATTTTCCACTATGCTTAGCATTTATTGTTAACTTATGCATTATTGTTTATTTGGTCATTTACCCAAGCGACTGGGTAGCAAACTTTTTTCAGCTCATTGTACCTCCTGTCATGAGTTTTCGATACATGATGCTTGTTTACGGAGCAGCAGCATTTAGTTGCCATATATTTGTCGAGTCTTTTTTGGTGGAATATATAGTGTTCAAAAAATACCAAGTTAAGCGGGATAAAAACTGGGTCACAGCAAAGCAAAAATACTTGCGTCTGGAATATGATATTTCCACAATAAAAAATTGGCCACCAATAACTGAAGTCTATGAACCTAATAATTGTTCCGACTGGGAAGTAGATCAGCCCACGTATGTCAGTTTGCATGCTGAACAAAATCATGACACGCAGTTTGGAAAATTTCCTGGATTTAATTAGTAAATTAATTTAAAAAAAAAGTAAAAAATAAAAAAATATGTATAATTCTGGCGAGATATCTTGTATATTTTAAAATAACTAATGGCTTAAATCTAAGAACTAGCATAATAACATTATATTGAATTTAGTCAAAATTGTTTAGTTCCTACTTAGATTATCCACATAGTTTTGGTAAATTACTTATATAAAAGATAACTTTATATAAACAGGTCAAAGCAATTTTTTTGTATTATAGTAGGTGTATAACGACGGTCATATATATTTGCTTATAATTAAGCGTTTAATATGTTATAAATTTCATTTTGGCTGTACATTGTACTTCATTTAAGTTTATTTATTTATTTTTAACTATTCACTTATCTTTACTATATGTATTAGAGTACGCTGTAATTAAAAAAAATGTAAATCTTAATATTTTTGCCTATCATAAAAAATAAAAATTAGCAAAAAGGTGATTATGCAATCGACGGAAAGGGGCGCCACGGACATTGTATATACAGATTTTAGTAAGGCCTTTGACTTCGTTAACCAGTCTCCTTTTGTATTTAAATTAGATTAGCTTGGGTTTCCTGGTAATCTATTATCTTGGATTTCATGTTACTTGGGTGGCAGGACTCAGGGTTATATTGAAGAATACTGTTTCAAAATTGATCTACGTGCCATCTGGAGTGCATCAGGGTAGTCATTTGGGCCCTTTGCTGTTTACTTTGTTTTTTAACGATCTTCCCTCAATCATAACACATTTTTGTGTACTAATGTGTGCTGATGATGTTAAGCTGATGATAAATATAATGATATAGCGTCAGATATTGATTGCTTTTATGGAAGATGTGAGTACAACCTTTTAAATTTGAACTGCCTTAAATGCAACGTTATGGCTTTTTATAGGGGTACTCCTACGTTTATTAGTTACTTTCTTAAAAATAAGCCACATTCACCGTATATATTCAGTTAACGATTTAGGTGTTCTTCTGAACCATAAACTTAAATTTGACGACCACATTATGTCTACTGTTAACAAAGCCATGAGTGTTCTTGGGTTTATAAACCGTTTGTCAAAAGAATTTTATGACCCTTTTATGATCAAATTATTATTTACCTCCCTTGTCCGTCCTATTTTGGAACATAGTTCGTCGGTTTGAAGTCCACAATAACAAGTGCACATCGACCGTATTGAGTCGGTACAAAAAAATTCTTTTATTTGCCCTGCGTAGTTTGAACTGGGATCAAAACGTAAGGCTACCTTCCTACCAGAGCAGAATACAATTGCTTAATTTGCCTACAGTTGTAAATTGTAGAACAATGCTTGGTACTATTTTTATACAACATCTAATAAGAGGTGACATTGATTCTGCAGAGCTTTTAAACCGCCTAACTTTCAATGTTCCTGTTGGACTAACACGAAATTATTATCCTCTAAATTTGCCACGATGTACATAAAATTTTTGTCTGCACGAGCCCTTTCGCGTTCTATGTAATAACTATAACAATCTCTATCATTTAATTTGCATTTCAACTTCTATCACGGTATTAAAAACTAATATTTTAACTCTTTTGCTTCATTCTTAGTTGTGCCTTTTATTGTCCCGTCTCTGTTTGTTTTATGTATCTTCCTCGCGAATTCGCATTTTTTTCCCAAATTGATAACCGCGCGTAATAAGCACGTGCTTGGTGTCGTTGGGACTCTTGTTTGTTCTGTTCGAAGTGCATCAACGTCCTTCATATATAATCTTTACTGTAAACTAAACCATTTGTCAATATGTTTCACTTCGTTTCTATATTTAATGCATCTCTAGCGACGTACTAATTGTCAGGACGTGTAACTATAAGGTATTAGTGGATATACAAGTTTTAGTTTTTTTTTACTTAAGAAAACTAGTTTTTTTAATATTGCAAATGGTACTATACTTTTGGTCAGAAGGCCGGAAAAGTCTACAATATCCTATAGCTCCCAAATGAACGATAAGATATAAACAACCAAATCATGTTGTTTTTTTTTAACCCATAAATTCTAAAAAGTTGGGGCTAAGCCTGCAACTGGCAGCACCAGTTTAATTCAGCAGGATGCCATGCTTAACCCTAACCCCACAAACGCACATACCACGATAAGAGCTGTCTAACGACCACATTTTTGAATTTAAATTAATTTTTTGATCTATGCTTACATAAAATTTAAATTCATTCGTATTCTTAGTTTTAAATTTATATTCAATTAAATTACAGCTATCATCCACTAGGTGCTGATATGTGTGGTGTGTGCCGTGCTTATAGAAAGGCATTTAATTGCATAAAATAATTTGTCATGCTTGCGTAAATCGAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTTTTGCATACCTTGAAAACGATAAAAGCACTTTACGTTCGGACATCTTATTCCTGTCGCATCCATACGAACGGATAAAACTAGATAAGCTTTTTTTGTTTATGCGTATTCTGATAAGGAAAAATGCGCTCTCTCGTCGTAGAAACAATCGGTTAAAATAAATAAATGCGAAAGTTAACCCTATTAGCATATTATAAAAAATCTTTAATAGCCTTTGCCGATACTAAACTTTAAAGAAAAATCTTCCGATCGGGCGACTATAAACTAAATATGACAAACTAAATAATTGTTATATAGTCGTTAATAGTTTTGGTCTGAAATTTGGAAGGCATTTACTCGACCGTAGAAAATATCAAAGCTATTGTTTTGCACCATGCAGATAAGATACAACAACTCCAACCAAAGAAAAGGGCATATACATACATACAGCGGATAAATACATTCGCTATTAACCCAGTTGTATACGTTTAAAATACACGTCGAATGACACCGTAACAGTCAAAATCGGATGCTCCTATCAAAGGAAATACGCAAAGAAAAATTTTATGGGATTTTCTACCACTTTTGAAAAAACTAGCTATAAAATAGCTACATTCTGTACACCCGTATCTGTGAACTATTAAATTAGAGGTATTTCGAAATCCTTTCTATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGTGTATACTAGATTCGTCGGAAAGTATTTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCCGACCCCAAAAAGTATATATATTCTTAATCAGAATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCTGAAATCTTGGAATCTATAAAAGCTAGAACAGCCAAACTTGGTATGTGGATTCCTGGGCTTCCTGCGCAGCGCAAGTTTATTTCAGCAGGGTGCCAATACCTATCGACTGTCCTAAAAAAAAGTGTGCCACGCCCACTATAACGCCCACAAACGGTTTAAAAGCTTAAATCTTTCTGCCGCCTACATAATATCTACTGAAATAGCCGATAGGCGGCGGCGAAAATATAGCTTTGCTGCTTATGGACTAACGATTTCAAATTACATTTTAAGGTGTTTGGGTGTTTCTTAGGGCCTTCGAGATTCCTCAACGTTTGACATACGAAACGTTTTTGTATAAAGTCCCGGTTTTAAGTTAATAATCAACAAAAACGGCTACATTTACCAGTTCAGAACATCTAACACTGTCTGACCATTGACCATTTTTATGCTTGAAATTTATGATGATGTTAACAGCTTAATATAAGTAAACTTAGTTCTACCATACTTAGAAAAACTTTTTAGTTTGGGGAAAACCGCTATCAATAGCTAAATGTTGTACACCCGTAACTTGCGAACTACTGAAGCTGCAGGCATGTGCTATAAATCGTTAAAATGGTATTTTAAAATATTTTGTACGCCTTTCTTACATGACTTCTCCAAATACCACCGTTTTAATTATGGCTAAACTAATTTTTTGTTCAGCAAATGTAAATTTTTTTTGAGTTCTCAAAAACGTTTCTAAAGATTTGGGGTTGAACTTCAAAGTTTATAGCTCTTGGAATAACTTAACTTTTGGCACAGACAACATTTTTTTTTATTTATTAATCAACAGATGGGGCTTGGAATCATTTAAACTGTTATAAACAGTTCCGCATAAGAGACTTAAATAGTACGAAGTTCGCTAAAGTATATGGGTTTTATATCAATAAACAAAAGTATTGATATAAACTTTTTTGACGAAAATATTCTTTACTATCCACTCAATAAGTCGAGTCCCATCATCTCGTCGTCGAATTTGAGCAAAAGCTAAACTTCGACACGGGTTAACCTTAAGTACTAAAGTGCCTCAACAACCTATCCGATAATGTATCTTCCTAGCAGGCACTTACTTTTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGAGAAACAAAAATTTAACTGAAATGTATTTGTCTTATCAATACCTATCGACTGACCTAAAAAAATGTGCCACGCCCACTCTAACGGCCACAAACGGTTTAAACGATTAAATCTGCCTGCCGCCGACCTAACATCCACTAATATAGCCGGACATCATAACTTTTGTATGCTGAAGGTGCGACCGTCACTTGATTTTTACCTCGTTAAAAGGTGTTTTTGATTGATGTGAGAAGTTTTTGATTTTAAAATTAATCATGTCATTTTGCTACCTTTACAAAAATCATATTCAAGTTTTTTATGTGGAACTGTTAATAACAATTTAAATGATTCTCAGACCCTTAAGTGAATGGAAAACGCTTAGGCAGTGTTAAAGGTTCTGAACTAATACATGTGGCCATTTTTGTTAAATACAAATTTTAAAACGTGACTTTATACAACAATGTGTTGCATGTATAACGTTAAGGAATGTCAATTAGTATACACTTTAAGGCTTAGCCCGAAATCGTTAATGCCGCCGTTGAAAAATGGAAAAGTATGAAAGGAAGTTAGCTTCGGCAATACCCTTATAATATATAATATACCCTTGCACATATAGGAAATAATCAACTTTATTAAATAATTTTTTCATATTGTTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCATCCGATTTTTATAAAATGTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTCCAAGCTAAGAAGGGAATATGTCAAAAAGCACCGTTTATGTATTTTTTTTTAAATTGTTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCCATCCGGCAGGTTTCGACTTATATATTGCCTGCCATAGAAAGGAGACTTTTGGGAAAGTTTCATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCGATCCGGCAGGTTTCGACTTATATATTGCCTGCCATAGAAAGGAAACTTTTGGGAAAGTTTCATCCCGAAAGCTTTAAAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACCGACGGACATGGCTAGATCGACTCTTCTGGTGACGCTGATCAAGAATATGTATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAATCTTCTAATTGAAACTATTATACCCTTGCAAGGGTATAAAAATCAGAACAAAACAACCTTTTCACATAATTTTTAAACGGTGGTATTTGGATAAATCATGTTTCAAAGAAGTAAATGGTATTTCAAAAAACCTTTTTACGATATTTAGCATGAGTCTGAATCTTTGGTAGTTAGCAAGTAAAGGGTGTATTAATTTTAGCTATTTAAAACTTTTTTCGCGCCAAACTAGGTAGTTTTTCCAAAAGTGGTGAAACTAAAGTTTCTTATATTAAGCTTTTTAACATCATCTAAATGTCCAGGACCAGGTCAAACGGAGTTTGGATACGCACAAAAAAGTTCAATGCTCAGGCATTGTTTTGAACTAGTAAATGTGGCCATTTTTTAATTCAAATAAGGAACCTCAAGACATTACAGCTTTAAGATTAATTTGAAGAGCTGTTTTTGAGTAATCTAAAAAAAAAACTGATAAAATCGGAATAAAAAAACTTTTTCCCATAATTTTTAAACGTCGGTATTTAGACAAGTCATGTTTGAAAGACGTAAATAGTTAAATAGTGAAATATTTTACGACATTTAATTTTAGTTTCCACTTTTATACAATTTTTTTTAAGCTCTTGCTCTTGCTTGAGGAGGACATTTTATAAGGTAAAATTTGAGTTATGGTCAGAAAATATTTAGCTTTTGCAAATTAATGTTAATTAACCAATGAGTAATGCATACTTTTTAATATTGCCTACTAGAAAGATTTTAGATCAAAGCAAGGAGGAAATCTCTAGACTTCCTAGTTTCCGAGATATCAGCGATAATTTAGACGGTTTTTTGAAGTTTGTTGGCACATAAAACTTGCGCTTCATACGAAAATAAGAAATTAAACTCTTAAACTACAACTCTCTTAAAATTTTTTGAACAA'..b'CACGCGAAACATACAGGATAACAGATTGGCACTTAAACAAAAAAAACTGTCTGCCCTGTAAAATAAACATGATATGTTATAAATATCACAATCAATACTGGAGCTTGGCTCTGCTTACCGCACTGATATTAATAATAGTCCACATTGAAGCCTCCCAAGGAATAAGTGAGTATGGCAAAAAACACTGTAGCCTTCGCAATTTGTAGCAATTTACATCTATACTATATACATTTTAATGACTACAACGACTAATCCATTCAAAAATAATTGAAGATTAAAGACAGCTGTGAAGATTTAAGCCAAAAGCTCATGAGAATAGTGAAATTTCAAAATCATATATGTATATGTATGTGTATATATATTAAAGGTATTCACAAGAAAAACCGGTTTTTAACTGGTGTTTTGGCTGAATTTGTTGTTTGTGGGCATAATATAAGAAAAAAAAGAGCGGCAAGTTAAAGCTATATATACTTTCGTTGCCACAAATCAAACAAAAATTTATTCGTAAATGCTTGTTTGTTATGCTCACTTTTAAGCCCTCCCATATGCTTTTGTAATACTATACAAAAGTTTGCAGAAACGAGATATATCCGTAAATATAAATATAATATATTTTTTTAAAATGCATCGACGTGCTTATAACGTCTGTCATTCTGTACCTTATAAGTTACTAGGGGAAAAAAAATTTGAATGTTACTTGTCGAATGCATCAACTGTCAGATACCCGTTACTCAACTTATGAAACAAATGGGGAATTCAGTTATATAAGCAGCTATTTTATTATATGGTGTGGTATGTGGTCGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTGGGCCTTTTGTGGTGGGCATGGCAAGATATTTAGGTTAATCGATAGGTATTGATAAGACAAATAAATTTCAGTTAACATTTGTTTTTATACCCTTGCAGAGAGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCCGTGAAGGAGACGTTTCCGATCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGCTATCGGCCTGAAACTTTCCCAAAAATCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTAACGGGGAAAAAATTTTAAAAAAATTATATCTTTCGTGTTTGGATATAACATTTTTAAATTTGTTTAGAATTTCGAGTTAAACTTTATCAAAATTGGACGACTATATCATATAGCTCCAATAGAAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAACATTGAAAAAGTATATCTTCGGTGTTTTTTAACATACAACCTCCTACGCTTGGAAATACAATTTTTTATTTGGTTTTGAATTTCGAATTAAATTTAATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCAGAGGAACAATCGGAAAATTAGTCGGAAAACATGAAATAAAAATTATATCTTTGGTGTTTCTTAACATATAACCTTATAAGCTTGAAATAACAATTTTTAATTAGTTCTGAATTTTATATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATGTAGCTGTAATAGGAACGATCGGATAATTGGTGGGAAATAATGTGAAAGAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATAATCTTATAATATTGGGAATATAAATTTATATATTTTTAAGAATTTCGAATTCAATTTAATAAAATTATTGATTATTTTTTATAACTGCAAGGGTATACAAACATCGGCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTCTAGCATAAAACCTGTAGGCTCTATAGTTTTTTATGATGGGGGGAACCTGCTGAAATTCCTATTCCTCTTGCTCTTGTAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACAGATCCTGATCAAGAATATATATAGTTCCTTGTATTTGCTATGTACTTTCCGACGATTCTATTATACCCTTTTTCTTTACGAGTATATAAATTCTTGAGCTTGATCGATTTAAATTGTGATCCTGAATATTTCTTTTCATTTTGTAGTTTTGGGTGGTGTGTGTCCGTCAGAGTGGACGTGGCATGTTCGCGTAAAAAATCTTACATATGAAGATAACGAATCGAAATCCACTTGTTATTCTGGCATTAGTTCCTTATCTAGCTTTTCTAGTTTCAGCGGTCACTGTGTTCACATGGACAGACCGTCCAGATAGACGGCTAGATTAACTCGGATAGTGGTGCTGATCAAGAATATTTAAAAATATAATCAGTTTTAGATCGACATATTTTTCGTTAGAATAATAATATTTTTTTGTGCTAATAAGTAAGTAAAACGCTCGATAAGCATCCAAATATTATTTTTATTTTACTTTCTTAGAGAATATAATTATTTGAGCCGGATGCTTTCAACGCATTTAGAGAATCGTTCCTACACCATCACTCCGCATCACTTGACGTGTCGACCTAGGCCGACTGGCCGACCGTCTATCTTTCCGTTTCCACACGAGCAAGTCTATCAGTTTAATAGCACTGAATGAAACCTTCCCAAAACTCTTTTTTTTTATTGCAGGAGCCGGATTGGAAAAAAAATGTTTTTTGTTCAAGAAAACAATTACTATCTAATACAGTTGTCATTAGAGAGCTTTAAATCAAAATTATACGAAAATTTGTATTTTTTGTATTCAGCAAAACATACACAAACTTATATGTAACATTATTTTAATATTTCCTCTGAAAGATCGAAAAATGCCTTGCCACATTCAAGAAACTGGACTGGACTGGAAACACCGGAAGAGTGTCATAGCAGTTATCAAGTAGAGCAGAGAAAGATCATTCCAAAGTTACCTATTTTTCTTACGCGTTTGGGGGGTCAAACACCTTTTAAGACCATAAGTTTGTTTGGCATTACTGCTTAGAATCCTTTAACTAATACCTCTATTTGAGGACAATTCTACCTGCTTTAATGGGTATTTAAATTTCGGCTTACCGAAGCTAGCTACTTTTCTTGTTTGTTATTTGTTTCCTGTTTTAATATAAATATTTGGATCAGATAACATTGATTAAATGGAACATGTTAGCTTGAAAGATTTTGGTCTCAGTTTCAATTTTTTAAAACCCATATCTCGTTGTCTTATTACGCTAGCAATAACAATATAAGTGCATCGCCAATCCTGCCCAATCGCAAGTGCTGCTCAAAAAGAAAACAAATATTTAAAAAAGAGATTATCCTTTCTAGAAAAAAATGACTGGCTTTTAAAAACTATAAAGTGTTTAAGGTCTTTATTAGTATGTTAAATAACTATTATTTTAAATTAATAATTGTGCCTGCCCAAGTTAGCTTCCGTCCTCGTTTAGTATCAAACATATTTTCTTATCGTTCAAGACACTCAAGTAATTTTTGATCGTTTAATACTAACCTCTAAATAATCAACTTTTTTAAGTATTGTTGCTGACTTCAGTGATTTTAAAAAAATTTATTTAATTCTCTTTTTCAGATCATTTTTTTTAAATCTATATGTTAGTGTAGCCCGTAGTTTGCGTAGTAACGGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCTTGTGCAAGGGTATAACAAACCTAGTTACACCAATAAAATGTTTGCAAATATTTGCATTCTACAATTTTTAGATTTACGTCCAGTAAAAGTATATTACCATTAAGTAATAACAAGGAATAAAACTATAGCCGAGTAAAAGGGAAATGCAGATATAAAAGCTGCAAAGCTATTTTGATAAGCGCCACCTATCCGCTATTGCAACTGATATATCTTAATTTCCCTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGAAACGGGTTTCTGATAGTCGAGGCACCCGACT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATAGCGTTCTTCCTCGTTTGTTTTTAAGATATTAAATTGTTTCTAACAAGACCTCTATTGTTACTACGAACGCACGATACGGGTGGTTATCTGAGTGATCTGCGACTCTGTGTCGCTGCAATTGTGAAAAGTGTTCGGGTAAAATGATGAGTGAAACATTCAATTACTAAGTTGATAAATACTCCTCGAGTTCAACTTACAAAAAGCCCGACTTTCCCTATAACGTAAGTAAAAACACATTTTTACAATATTTTGAAGAAAACAAAATAGGTAATGCTTTGATTTAAAACCTTTTCATAGATACACAACTATAATTAAATATAATTAATATTTTCATATGGTTTTAGGTCACGTAGTTTCTTACGAGTGTCTATGATACATTATCAAACTGGCTAAGCCACCGATTGGGATTCATCAAGGAAATAAATTTAAAGTTATCCGAATATGTAGTACCACCCCTCCATATATATCAACTCAACAATAAAATAAAAGCCGTTGGGCTCAAATTTATATCATTTTGATGATTTGATTTGATGTTGAAACTGAAAAGGATTTATCCTGAAATTTAGATGGAAAATTCTCAAAAGCCAGTTCGCAAGCCGAGAAGACTTCAATCTCGGTTTTGAGGATTTGAGTATGAATAGATCTTGGATCACATTTGAAAATGAAAACACAGAAATCGAAAACGTTAGGTATGGCTCTAAGGGTCAAAGATTTTCCTTTTTGAACGTCCTCCAAAGTCTTGTTTTTGGAAAAACAAATAAGCGAATTTTCAGCAAAAACAAAAACAGTAAGAATAAAACTAGGTAAATAACCGGAGGCATTTATCCCCATTGGTCCCATCAGCTCCAATTTTTAATTATACAGGCTTGCACTTCGAGGAACAGGACTTAACGGAATTTATTAACTGTTGACAACTTGACTTCTGCAAAACTTACAATGGACCTTTCCACGCACCATGCTTATACTCGGATTTGATTCCACAGCAAAGGACTTGATTCTTTTTAGCTATAATCTCCCAATGTTATCTCTTCTGTAGTTCAATTCTCTATATTCGTTCCACTTTTCTTGCCCCTGGCAAATTGCAAAAATTGAATTTATTTTTAACGTTTATAATATAATTTAGTTTATTGAATTTGATCTTTATTTACAGATCAACCTCTTTTTGTGAGTCCGACCCCAACTTTGCCAACACCAGCTGCGGATGGTAAGAATTTAGGAACAGAATGCGCTGTTCCCAGTCAATTATGTTCTTAATACACCATAATATTTGCAACCAAATTTTTTTGTACATAAGGACTCTAATTTTACCATACTTAAATAAAAAGGTATCAAAAAAAATTATCATTGTATATTAAATTATTTTAAAATATCTACATTGTTTCTTATAAATTTTCTTTATTTCTTTCTATGATTTCACCATCTTTTGGAATGTACATTCTGGAAATATTAATTTACTTTAACTTATCATACCTGTACCAATGATTGTGCCCTGTTTCTTATAATGTAAATATCTGATTTCTACGCTTTCGTTTGTTAATTACTGGTTAAAATTATTATCATGTCTTACAAACTATCTGGATTACAAGATATAACCACTGTACTTTTGTTAAATAACAAATCAGGACATGTAGGCGATATTCATGGACGTTTTTTGACAGTACGTCCAGAAATAGGTGTTTTGACATCAACAGCTAGGACATTTATACAGGATGGAACAACAACTGAATTTGCCACTAAAATTTTAGGAACTACATTAAATAGTGGTCGCCTTTACGCACAATATCTTCGAAAGAGTTCTAGAGTCCTGTATGAAAACGATAAGCTATTTCCATCTGTAGTTACTAGTTGGGTAGGTGAAGGTGACTCTCATCAGACCCCACTATTTTTACAAAGTCACAATGATCTTTTTAATTCCGATGACGCCGACTGGCAGGATATTGATGATAGCCTAGGTGTAAATCGTGGAGAATTTGTGGGCAACACGGATTATGTTATCCAACAAAGTACAAAAGTAAGAGAGCAAAGTAGTCCGGACTATCAGGATAAACCGTTAAGATATTTAAAACCTGTAGCCAGCAGCAATGTAACATTAATCTTTGACTCTAAAAGAAAAGATGAAATAAATAAATTGGTTGATAAGGTGTCATCAATTGAAAATTTGAAAACGTATACAATTAAAAGTCACTTTGCTGATTTTTCTGCGCCAAAACAAACAATAACTGTCTTAGATACTCTAAGGGAAGAACGAAAATATGAAATGAAATCACGTATAGAACAAAATGTTGAAGAACAAAAGCATAAAAGTCAATCTTTCAATAAACAAGTTTTAGCATCTATAACATATTATGGATTTGCGGAGTTTACCACTGTGGTTGGTGATAGTGTCATTGTATTTTCACCTAGTACTACACAGAGTACTCTTCATTTTGGACACGTTACATCAATTAAAGGGAAGCCTACTTTAAAACTTATGTCAATTCACGATTACAACAGTCAAACTACCCAAACATCACCGAGTCCTTTAAAGCCGGTTCCAACATTAAATAAAATCTTGTCCCCAATGTCAAGTTTTGGGGAAGATATTTTTACTAGTTCAAGTGAGGAAAAGAGTCATTTTAAGAACGTATTAGTTGCAACGTCAACTATTCTTTCAACGACAAAATTTGAAAATGTATTATCCGAGAAAATAGATAATAGTTCATTTTCTTTTGACGACAGTCTTATATCAAATTCAAATGAGTTTAAGAATCTTCAGTCTTCATTCTACAAAACTAACGATACCTCGAAAAATTTAACAAATCACATGGAGGCAAACATTCAAAAGCAGGAAGGCGCTACAACGGTATTCATTGATGATGATCCTTTCACAAATTTTGTTGAGCCTAAAAATTCTACTAGCTCAAAATTAAATACAGCTGACCAAGAAACAGTCTTAGAACAAACAGAAATATTTAAAAGAAATGAAATTCATGGAAGTTTGGTCTATCCAACTGTTACCGACGTCAATAGCGAAAGCTTTGGTAATAAACCAGTTGTTGGAACAAGTAATGAGAATAAGAATAACGTTGCAGAATTATGCAACCATACAACTTCACAAGTATTTCTTACCCAGATGCTTAAGACACCGAATGTTGGCGATGATAGGATTGTTATTGATGTCAATCCTCTTTTTGCTTATAACATTGTAGAAACTACTAAATACTATTGCATACAAGCTTCACAAACGGAAAAAAAGGTGGAACTAAATGATGGTAATACGACCCAAGAAACTGTTTTGGAGCCAAATAAAAAAGTAATGTCTGCTGAGTTAATAGATGATGTAGATGAAACTACAGTTCGAGAATCGGAAGACTACGATGTGACAACAGAAAATGATTATGAAAATGAAGAAGAGGACTACTATAGTGTTACTGATGATGTTGATTTATTATATAAAACGCTGTTTACTACTTATACATATTTGACAACATTCTTTGAAGGGTCTCGCACAACCATATCTAGCCACACAGAAATTATAACAAATATAGTTTCTTCAACACTGGCGTCTAATGTTGATTTTAAGTCAAAAATTTTAGATAATATTGCTGAAAACCAGAAATCTGAAAACACAATTCGGATGGCTGGCCAAGAAGCTTCACCTTTATTACACAAATTTACTATCCCTGTTGAGATTGCTAGTCTATTAAGCCAGGAAAGTAAAATAAATCCTGCCGAAAAAGAAATAACCAATCAGTTAATAACAACCTATCTAGACGATTTTAAATATAGTAAAACTTTGTACACAACATATACATATTATACATCGATTTTTACAGATAATGATACTGAAATACAAACTCGAACCGAGATAGTCACGAATTACATTACTGAAAAGATTTCGAACAATCAAACCAATTACATTATGAAAAGCAGTGACAAAACATCAAAGCTAAATACCTCAGCATCCGAAATAGAAAAAGAAAACCACATGACTTTTGAA'..b'TCTTGACATCGAAAATGAGAGGACATATTATTACATGAGTGGAAGCGCAATTCGAAAGGTCCCAGGTTCAAGTACGCTTCAAGGCAGAGTATGCTTTAAGTATTTAAGAATAATATCTAACATGTCCTTATAATGGTAATAACAATGATGCATTTAAATGCTGCATTTAAATGTCAGATTTCAATAAAAACAAGAAAGGACAAGACGAAGTTTGTATATCCTTGCAGTTATAAGAAACATCATGTGAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGTGATAATAAAAAAAATAATTATTTAATGTTTTTTTCGACCATTTTTTGAGATCTAAGTCTAGACTAGTCCGATTTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCAGAACCAATTAAAAAATGTTATTTCCAAACTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACAGTCGATATGATATAGTCTTTTTAATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTACAAAATATTATTTATAAGAAGGTTATATGTTAAAAAACATTGAAGATAAAAGTTTTTCCTATTATATTATCACTAATTTTTCGATAGTTACTATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTAATAAAATTTAATTCGAAGTTTAGAACTAATTAAAAAATGTTGTTTCTAAGCTTAGAAGGTTATATGTTTAAAAACACCAAAGATATAAATTTTTCATATTATTTCACGACTAATTTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGATAAGTAGTCCGATTTTGATAAAATTTAGTTCGAAATTCAGCACTAATTAAAAAATGTTATTTCTGAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCAAAGATAAAATTTTGTTTTCATTTTGTCCCCGATAGTTCCTATGGGAGCTATAAGATATAGTTGTCCAATTCGGTTGCTTCCGACTTATATACTACCAGCAATAGAAAGAAGTCTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGTCTTAGAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACAGACAGACGGACGAACAGACGGACGGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATAGAGTTACCTTATGGGGTCAGAAACGCTTCCTTCTACCTGTTACATACATACTTTCCAAAGAATTTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAATACAAATTACGTTAAAAATTGGACATGCAGGTTCTAAATAAAAAATTAACGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTGTCAGATATCCTTTACTCAGCATAAGGAAGCAAAAGGGAAATGTAGATATATAAGCAGCAAGGCGATATTGTAAAGTCACCTACTAGCTATTTCAGTATATGTTATGTGTGCGGCAAACATATTACAAGTTTTTGACTTTTGTGGAAGTGGCACATTTTTTTTAGGTCAATCAATAGGTATTAATGAGACAAATACACTTCAGTTATTTTTTTCTAGCACTAAAACTGTAGACGCCATAGTCTTTCGCGAGACCTGGTACCCTGCTAAAACAAACTTGCGGTGCGTTCATACGGTCAGAAGAACATAGCTAGATCGACTCGGCAGTGATCCTGATTAAGAATATATACACTTTATGGGGTCGGAAAACGCTTTTTTCTACCTTCTACATACTTTCGGACGAATATAGTATATCCTTTTATTCTACGAGTAACGGGTTAACAAGAGAGAGACGAGTGTCTCGACTATTAAAAACCAGTTTCTCAGCTTTTAAATTAAAAATTTATAAAACTTAACTAATTGTTAAGATGGCCGTTTTAAAATCGTATTAAGCACATGAGTTTCGACATATGTACGAGAGTTAGTCTGATTATAAGGGAAAACAAAAAAATTTACAGCACTGTAAAGATTACGTTCACGGTCCTTTACCTGCAATCTTGTGCTATTCAACACTGGGTAAACGATCTTCTGTCTCTATTTTTCTCATGTGAAAGGACTACGGGTCAGAATATAGAGAAGGGTGGGGTACAGCGAATTCACGAATTCGTGTGTTCAATTATCTATTTGTACGTATTACCATCCGTCTATACTTCTGTCTGCTTCTCTGTAAACAAGTCACTCAGTTTTAAAGCTATCCAGACAAAATCATTTTTTAGGCATTAAACATGGACACATGCTTATTAGGCAGTTCCTAGTACTTCCTAGTACTTATTAAGCACTTGAAATAACTTAAAAGGAAATCCTAACTGAAAACGAAAAATGTTTGTCAAAAGGCAGTGTACGTAACGGATGTTTGCAAGCTCAACCAAAATCTTACTTGTGAAAACTACTTTTTATATTATCGTTTACAAGATAATCTTAAATTTCTTTATTAAATAGATTAGATGAGATAACATTTAATGAGTACGCCCATAAACGAAGCCCATTAAATAAGGTAATTCAGAAATATAAAAGAGTAAATTGCGACTCAATTAAATACTTTATAAAAAAAAGGATGATAATACAAAGATGAGTGAAAGAGATATGGATTCAACTTTCTTGTTGCCACATACACATCTTTATAAGCCTGACGAGGTAATAACACTCTTATAATATGTTGTTTATAATCTCCAACAATTTAATTTATTTCAGATACCGCATGAATTTGCAGGATTAAGATCTACATAATCGTCTGATTTTTTAATGTTGTCAAAAATTCTCATAATAAGAAAGCACTTCTTAAAAAAATCAATAGATCTGAACATAAAAAATATTAATTAAAACATATTGAAGAAATCTTTCTGATTTATTTAACAAGGTTGATTACCGTATTAGACTCTTATCGAAAAGAATCAAGAGATAACACTCATGTCCAAATAAATACTTGTATATTTGATCTGATATAAAGTCTTCAAACAATTTTGATAGGTAAGGCAAAATGAAAATTGCTTGCCTTTTTAATGAGAATTATGTATTTAAATTTACTGTTACTCGTAATAATTTGCTGTTCAATAGTTTCTTGTTCAAAACATTTTTTAAATTGGTTTAAAAGTACTTTTTGGATATTATTATTATTATTATCTCTGACCGTTTCCTTGACAGCTATATGTTAGAGTATACCGAATTATATTAAATTTAATTCAAAATTTTTTAAAATATCAAAACCTATATTCCCAATATTTTAAGATAATATGTCGAAAAACACCGAATCTATAATTTGTTTCATAATATTTTCCCATCCATTTTCCGATCTTTCCTATGACAGCTATATGATGTAGTAGTCTGAATTTAATAAAATTTAGTTCGAAATTCAAAACTAAAAAGAAAATGTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTATATGATAAAAAAAAACACTAAAGATATAATTTTTCCAATTGTTTTTCCACCATTTTGACATATTAAAAAATAGTTAATATTGTATTTTGTTTCACCTACAACGTTAACTCAGTTTTTACCATTTGAAAAGGTTTTAAATGCTTGGGAAGAACAAATTTAAAAATATATATACTGATAAGGGCATTGCAGCCGTTATTTAAATTTGAATCTTATTATCCCTACGGTATATGAAATACTATCCTTACCATTTTTTGATATATTTTGGTGCACTTAGAGATTTTTTAGGATAATGCAATAAAGGAAATACAGTCCAATAAAAATTAATAAGTACAATTTTTTATTCAACACCATATCTGTGGTCATTTTCGCCAGATTTAGTTCCTAATTAACATGGATCAGCTGAAACTGTTGAAGGCAGCAAGAAGTCTTGCGAGGGCAAGCATTACGTGTTTGCTAACAGCGTCGCAGATGTAATAGTTCTGCGCAAGATGACGAACAAAGCCACTGAAATTGTACAAACTAAAAGGGATTGCTGGATTTTATCTTATTTTAAGAAAAAATCCCTGTAATGGCAAATTCACATGTAAGTTTTGCCACAATCGGCACCACTCTCTGCTTCACGCAGAGGTTATTGGTTCGCAAGCCGCTACATACGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-3.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f6f/adc/79/scaffold_9-3.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CACATCCTGCGCACCATT \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AAAACTAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTGCCATACGAACGATCGGAAAATTGGTAAGTAAATAATTAAAAATATTATATCTTTGGTGTGTTTTTGGAAATAACATTTTTTAATATGTTTTGAATTTTGAATTAAATTCTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATACAAACGATCGGAAAATTGGTGAATAAATAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTTATTTTTTAGACAAATAACCTCCAACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTATAAATTTGATATTTTAATTTTATCAAAATCGGACGAATATAGCATATAGCTGTTAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTCCGGTGTTTTTTACATATTATCTTATACTATTGGGAAAATAGTTTATTATATTTTAAAGAATTTCCAATTAAACTCTAACATATAGCTTTCAAAGAAACGGTCAAAAAAGTAAAGAAATCATTTTTTTTTAACATCACTGAAGCTAGAAACAATCCTTAAAAATGTAACATGGTGTTAGTAGCATTGAAAATTGCTTATAACTGCAAAGGGAAAACAAACATCGGCTTGCCGAATGTAATTTCCATTCTTGTTTGACTTGAGTTTATAACTTACAATTATGGTAAGGTGCCTGATTTTGGTTTTTGCCATACGGTATGTGGTAGTTATCATTTTGCCGTGCTATAAGTGACATCACAGCCGATTCTTTTACTCCATAATGGGCCAATGTGTTGAGGCGTTTCCATCCATTTATTGTTTTTGTAGTTAGGTCTTCATCTTGTAATGTGAGATGACCTCCTCTTCCATGCCTCCATTCTAAGTCAACTTCGTGCACAGATGGTCTCATAGAAAACGGAGTATTTTTAAAAATTGCGTCCAAAATTTTTAATTTAACTTGCGATATGGTATCCAAATCGTTTACACGACATTGGACTTTTTCATCAAGATCATCTTGTAAAATGTGCAAAATTACAACAGAATGGGTAACTTGTTCGTGGAGAAGTCGTTCCTCTGAAAGTGAATAACGAGCATCGTGGGTTATTGCGTCCACCAAACCCTTTTCAATTTGATGCTTAATTGCCTTGAACAGCAAAAATAAATTAGATCCAGCATATTCTTTTAGGTAGTCGTACATACAAATTGCTAAGTAGTTTGTTAACATTTTTTCAACTACGCTCTCAGTGCGTCGTAGCATTAGCTGAGGATGCTTGCTGGCGAGCGATTTGTCAATTAATCGCAATAAAAGGGACTTTAAAATTTCCGTCGCATATTCCATTTTGTTCATTAGAACAACCATAAGTAAAGAGGCGACGTTAACTCGATCGCGAATTGAGAAAGATGACCGTTGAGCTTCTAAAGTTTCTATGAACAATAGTAAAAAATATTTGTTTCCAATAAGTTGCTCGAATTGTATCATAGCTGCATCATAGTTAGTGTGCGGGCTACTTCCACAAAATTTTCGGGAGTTTAGAATAGGATGATCTGATACACCGGGAAAGAAAACTTTCATAATGTAATTGACGTGATCTAACGTTGGTATACCGGTGCTCTCCAAATCTGCTGTTAGATCGGTCATGTCCGTTTGGAGCTCAGCAAATGCCTGTTTACACTCAGAACGAACGTTGCTTTCCAATGTTATCATCTGTATCTGAATTCGTTTGTATTCCCGTTCTGCTTGGGTCGATTTCCTTCTAAATATTATTAGTACGACAACCAAAACGATGACAAGCACTGCAACTGTCAATATAACGACAAACATGGCATGTGAAAAAACATAGGGTTTATTTAAATCATATTTCAAATATCCTATGGCGAAACGAAGATTTCGCCCTACTTTAACCACAACTAGAGGTAAATCTGTCGATTGATCCACACCATTTTCATCAGTTGGGAGTGGTTGATGTTCCGGTGGAATGCACAAAAGTTGAGTTAGTGTAAGGCTTGTTATATTGCATTGAGTAGTACCAATGGTTACATTAACGTCGTATTCATCAGCTGCCAAATTTAGTAGCTCGCCTTCAATAACCAAGCTGTCACCCTTGTATAGTTTAATTCCGTCATTTGGAAATGGTAAATATTTTGGATCGGCTAAATAAACAATAGTGCTCCTGATATCATGAAAGTATTTATTTAGATCTCGAACAAGCTGTACATTGTCCATTACAAAACTAAGTTGTAAATTCAGTTGCGTTTCATGGACCTTTACAAAAGTTGTAACATCCATATTATTATTGACGAAATAGCTAGGCGCAGTTCCCCCTGTTGTGTATATATGAAAGTTGTCTACGAAGTCTGCTTTTCGCTTTCGTCTAGAATATTCGTTCTGATGCGCACTTTCATTTTTAAAGTCAAATTCCGAATCCATCACTCTGTTAGAACTTTTAAATGCTTGAAATTTATCATTTACCGGAGGAGATGGGCATTCCATTTGATTTGAATTGATTACTACGCAAGATGTTTTGTTTACTCTTTCATTATCAAAAAAAACTTCAAGTTCAGGCTTTTGAATTGAATTAAGATACATTCCATGAACGGTCAGAACGCGACCACCACTTACAAAACTGCGTAAAGGCTTAATCTGCATTATACGCGGGTCTTGGGTATAGTTAAAAATAGAACAGGGCTGCCTTGGTAACGTACGAAATTGGTATGAACCGAAATTACTTCGAGTTAGATTTTTATTGGGTATAGTTGCGGGTGAGATATGACATTCTAAAGTTCGGTTGGCACCGTCAATAAGAAGGTGTAGAGACCGTATTGGTTCTGGCTGGGTCGCCTCTGATGTAGTACTACTAACTTGAGTTGAAGAAGCTTGTGTAACGTTTATATGACACTCGTACTCATCTAAATATGCTCGCATGGTTGATCCAATGTTCAAAAACTTTCCTATTAACGACAATTGTGTTCCTCCCGACCTGGGCCCAATCGTGGGATATAATCCTGTTAGCAAAACATTCTTAAAGTGAAATTGTACACTAGATTCAGTATACCCTGCATCATTTGCAACCTTTATAGGCGCTGACATTTCATACATCACTGCTCCAGTGCGGCATTCGATCTTTACAGAAATTTGGTAGTTGACTAGTTCACAAGGCACAGACCCAATAAATATTTTTCCACGCACATCTCCTTCGCGAATGCCCAAATTACTGCCTTCAATTGTAATAAGGGTACCACCCTCAATAGGTCCAGATAACGGTTTAATAATATCGATCCTTGGTAAAGGGCACTCGTTTTCTTTAGTTGTTTTTGATCCTGCACTAATAGCACGATCACTGTCTGCTATGCAAGTCTCGTTATATACACATGAGTTGCTGCACCAAGCACATTGGTATTTTGGATCACGAGTGACACACAAACTGCAATCAGCATGATCCCGATGTGAGCCCAGTACGTCGCATTTATATAATGTAACAATCGCCGTGTCCACATAGTGCTGGAAATTCCATGTAATTACAACCTTTGCTTGGTATTCATGTGTATTAGTCTCGTAGAAATAAGGTGTTTTTTCACAAACAACAATCTTGTTTGACTCAATGTGGGCAGGCAATAGCATCTGAGCAGCTTCAATATGAACTGTACACAAGAATCCAGCGTGAGCGCTTTTGGGTTTTGGTAAGTTTTCTATCTCTAAACGAATTTCTTTTGGCACCCGCACCGGTAAAAGAATCGCCGGACGATTGCTTTTTAAATGGGGGCATTGACCAACACTAGTTACCGAATTTTCTATATTACGACATTGTATTGATTGATGGACACATTTATTGTCAAAAATACACCAGTTGCAGCCCCATGAACTTTGTAAACATTCCTGGCAATTTCCATGATGCGAACAGTCAAAGAATGCAAAAAATCTTGATACAAAGTCCTTATTTGTCTCTGAACTTCTAACGGACAATGGCACCAAAACATGGTCTGTATTAGTTGGTATTACTGGTCTTTCATC'..b'AGCTTAAAATGTTTTCGATACTGAACTGAAAGGGATTGCTTCTTTTATCGGTCAATATCTTCCAAACCGTAATTTGTATGACAGAATCTATATAGTTTTAAATTTTTATATCCTTGCAGAGAGTATATTGATTTCAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAAAGAATATATATTCTTGATCAGCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGCCATATCCGTCTGTTCGTACGTCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAAATAGTCTCTCAGTTTAAAAGCTTTCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGCCTTATTTCTCTTGCAGGTAGTACTTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCGGATATCTATATCTTATACTTCCCATAAAAATTATAATTATGTGTTTGGTGTTTTTTAACATATACCCTCCTACGCTTGGAAATAACATTTTTTTAATTAGTTCTGAATTTTGATTTCAATTTTATCAAAATCGGACGTCTATATCAAAGTCATAAATTGGTGGATCGAAAAATTGGTGGGAAAATAAAATGAAAGTTAGTAATCCCCTTCTAGTAATGCTGCGTCCAGCAGCTAGTGGCGTATTGCTAATTTTCAGCATGTGATGTGCAAGCTCAATTGAGATTGCAAAATATTGAATATATTTGGGTTTAACTTTTAAATGTGTAGTTCGATTATTTTTTGGCACGTAGATGGGTATTGATAATAAGAGAACAATGTAATTTACTTTTTAACATAATATTAAAAAATGTGCGAGCTAGATGGTTTCTATTGTTATGTTATTTGTGAGCGTTGGCACCCTGCTGACAAATTTGCGCTGCGCAAGAAGCTGAAAAATCTACATACCAAATGTCAAACTTATAGCTTTTATAGTTTCCAAGATCTCAGCGTTCATACGGACGGACGGACAAATGGACAGACGGACATGGATAGATCGACTATGCTATTGATCCTGAACAAGATTGTATACTTTACTGTATTGTACTCTGTCGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGTTATAAATATATACCTTAATATGATGTTTTCATTTTTTTTTCAGTTTTTTCTAATCTATTTTAATGAACAACAACGTAATTTCTACCAAAAAGGGCGTTTACCCGCCACTTTTCGTGACAGATGAAGAGAGCCGAAGTGTCTCGTGCGAACTTCGCGAGAAGTGCAATAAAGTCGATTAATTAAATGGAAACAAAACACAAAAACTAAACAGGCTAATTTCAAATAAGCAAATTTTATATTATAAAATATTAATTACTGAGCTATGAACAAAATAAAGAGCGACTAAGTAAGAAAAAACGACCCTACTGTCGGTCGAAAGCCAAATCATGCCAACGACGTGGAGTTAACAATGCGAAACCCCTCACCATCAGTTTCGAACCTGGCGCACCAACAAAATGCAGCGGTAAAACTTCTGCATCCGCACTACATTTATCAGCAACACCTACAGCTACGGCAAAAAAAAAAAAACAACAACATCCACAGCTGCAGCCGCAGGTCTAAATACAACTGCAACAAAAACCACGACAACGAATCAAAACAAAAACAAAATTCAGCAAGCGGGGGTGGACATATAGACCGGACTAGCTTTTACCAGAAAATGAACCAGGCTGTTTTCATTAGGGAGAAAATCTCGAATGCCTTGGTTAACGGGGACGGAAACTTTCATGTTGTTCCGGTCACAAAACGGGATATATGTACATGAAACCAAGCTGCAGACCAAATATGAAGAACATTTCCGAGTTGTATCACAATACCTGAAAAGAAAACTAGAAAAAGCTACTACACTTACCAAGTAAAAAGAAGCAAGGACCTGCAAGTGGTACTAAAAAAAAATCGAGCCCGACGTAATTGCCAAGGAAGTTATCGATACTCTCAAGGAAAACGGGTTTTCTACAAGGAACGTCAGTAACATTATTAACATGAAAAAGGAGCCGCACCTATTCTTCATGGTCGAGCTGGAGCCAGACAGCAAAGTCTTGAAGAAAAATGAAGTGCACCCCATTTATAACCCGGTAATACTTATTGAACCGAAGAATTAACGTGAAAGAGTAAAATAAAAGGAACGTCCCAGTGCAATGCACAAATTGTCAGGACACACCAGGGGATACTGTTCACTTTGAACAGTCTGAAAATTCGGCTTACTGCCCTGCCCCCAAACAAAAAAAGCGTTAACTGCCAAGGTAAGCACACTGCAAACGACAAGGGCGATATACAAAGAGATGAAGGACCGCATGCGAAAAGTGACAGCAACGAATCATCAGAATACCCAAAATACGTACACTTCCTCGCATGCACCGCTGTATGTATTTTTCGGCAAGGCTGCAAGATCCTCATTTGGTCAACTAAATACAGAAGGGCTTCTCATACGCCGACGTCCTTCGATCAGGGACAGAAAACCCTTTCCAGTTTAATCCAGGAAACGCTCAGCAGATCCAAGTACAGTCACAAAGCACTCTGGAATCTATGGTGGTCACCAAGTAACAAAGTATGATGGAATTTATGTCATTCATGAAAACGACCATGAAAACACTGGTACAACATCCTCGTAGTAGAGAGGGTGCTATCTGGCGGATTAAAAAAAAATTAACTGGACTACAAGGGTTTGCTCTACATCTTCACTCTCAATCCGTACATATGACTCCCACATATGGGGAACACAAACATTATTCAGCGCTTTCAAATTAAAATCCTGAGAACTATCATTGGGACACCATGGTATATTCGGAACCAAAACATCCACAGGGACCTCGGCATTCTTACCGAAAAAAAGAAATAGACAAACAAAAGCGTCCTACAATGAAAAACTCTCTGTGCACCTCAATCGCCTCGCAAGAGGCTTTACTTGGGTTTTCTGTCAATCCCGTTTAAAACGCAACGATCTGCCAAGCCAGCAATAACTTTTGGCCCCCTTTGGCACAATACCAGTAATATGACTGTTAATTAAATTAATTAGTTTAAGATTTGATATACTTATTGCTAGTATCCAAAGGGAGAAGATTTAATAAATAAATAGCATAACAAAATAGGTGCTTTTTTTTACAAATCTTTTTTTTTTGATTATACACAAATCTAAAAACCGAACACAAATTTTTGATTTCGCTTCGAAGGTTATAATTTTGTCCACAATAAATGGTCAGAAACGCCAGTCAAACAAAAGTAATGCACATTTTCTCAAATTTTTCAGTCACTCCCAGTCGTAAGTTCCGGAAGGTTTTTACAAAAAAAATAGTTCTGAGATGCAGTCTATTGCGGTGCCCTCTAGATGTGTTTCTAATTAGTGCTTTCAGGTGTATTTTACTGGGAGTTAAAAAAAAAATAAAATGAAAATCCGAAAGTGGCCAATCCCCTTTTTTTCTACAATCGGTTTCGTTCGAAAAGGGTACATGCAGAGATGCGCGTGGCTTTTATCGTCTCTTAGTTTTTCTAGTTAAATAAAAATTAAAACCACAAAGGCATATGTTCATAGGTGCGTAGTAAAAATTACGCAATACATTGTAATTCTTCCAAAATAAATTATTTGCATATTCATAATTAATATATGTTTATCAAAGTTTAACATTCGATATAAAGCTTTCAGAATCGCAAAAAAGAGATGAGCCCACCAAGGACTGGACTGGAGCTTAGGAGGTAATATATTCAAATACACCAAAGGTATAATTTTTTCATATTATTTCCCCACCAATTATCCGATCGTTCCTTTGACAGCTTTATGACATGGTTGTCCGATTATGTTAAAATTAAATTAAAAACTAACAAATGTTGTTTCGAAGTGTCAGAGGCTATTTATATGTTTAAAAACACAAAAAAAACCTTTTTTATTCCTATTGTTCCCATGGGAGCTATAAGATATTGTTGTCCGATCCGTCTGGTTCCGACTTATATACTACCCGAGAGTTTTAAAACT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-GAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGAAAAGAAGCATGGTGACGCGGCGCATTTAGATAGCCCTATAGCATTCCGTTTTCGACTTCTGCATGTTGTTGCTTTCCGCGTTTTTGGCATCTACATCTCTATAGTTCTGCTGTAGGCTCGGAGTAACATCCCTTAAGTTCCGAAGTAGACGCGCAGTGACATGTCAGTTACTGGTAGAGTATTGTAGGATTTTTACCGAAATCTGTTTGCCAAAAATATTTTGTTCCGTGCAGAACAAGTGGCAAAGGTCGCCACAATAAGTACAGAACAAATTGGGCTGCGGAGAAGTGAATACGCCATCATTTCTTTTCGTACTGATTTTATTGAGCATGGATTTTATATACATGATTTGGGTTTACAAGGATATTTATTTAGGTCTAATTTAGATAAAATGGACAAAATGTTTTATTATAATAACCATAGCCTAAATAAGCAATTACATCTACCAGATGGTATGAAGGCACATCCGTCGGTTGGGTGCATATTTATGACCTGATATAACATGCATATGTGCACAGACCATACCCAAAAATCTGTAGCGCGTACAGGTTTTTATGATGGAAACAAAACATTACCTGAAATGTGTTTGTCTCATCAATATCTATATCTATTTATCTCTTGCTCCCTTTTTATACCGTTACAGAGGGTATAATAATTTTAGTCAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGGGACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTTTTGAAACTAGTCTCTCAGTTTTGAAGCTATCGGGCTGAAACTTTCCCAAAAGATTTCTTTCTATTGCAGGTAGGAACCAGCCGGATCGGACCACTATATCTTATCCATAGAAACTATCGGGGAAAAAATTAAAAAACTAATTATATCTTCGGTGTTCTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTGGAAATAACATTCTTAAATTATTTCTGAATTTCGAATTATTTGATCAAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATTTGAAAATTGGTGGAAAATAATATATAACAAATTAAAGCTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCTCATCTTGGAAATAACATATTTTAATTAGTTCTGAATTTGGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATTTAGCTGTCATAGAAACAATCGGGAAATTAGTGGGAAAATAATATGAAAAAATTATTTACTAAAGTTGTTTATTTCTATAACTGCAAGTGTATACAAACTTCGGCATGCCGAAGTTAACTTCCTTCATGATTCTCGAGACACTCTACTGTAGCGTTCTTCGTGCCGACGAACTTCGGAGATTTCACTCTCTTTTTGTGTCTTATAATTGCCTATCCTCGGCGCTCGGAGAGACAACCTTCGGCCGGTCCTTTTTTTGCGTCTCTCCGATATGTTCAGAAAGAAACCTCTGTTTGAGTTATAAAAAGGGAAGCAGCAGGCTGCTTAAATTTTGCGCTGCGACACATTTTGATTTATTCATAAAGTGATACCTTTTAAAAATAATAAATTCAGTGTAAGTTTTTAATCGTTGATAGAAGTTTAAAGTACTTTCTTTTTTAAGATGTTTTAAAGGTTTTACAACATAAGAGAAAATTCTGGTTCCGTTACCCGAAGGTGGCATAGTGAAATGTTTTGTGCCAATGAAAATCCCTGAAATCCCTAAATATACAAGTAATATATACAAGTTGTCGCGGAACGGATTAGGGCTATCGATAGTTAAGTTTGAATTTAGCGACTCTAGAAGTCAGTATTATTTAAGTGACGATTTTTAGGGTTATATTATTGGGTCACACTAAATCGGGTGATGACGAGCTTAAAATTGGAGGCACGGTATACACCGATTCGCTCCATCACATTGGAGATGATGCCGGCAAAGCACTCGCCCCGGCGGAGCCTCAGACTGGATGTCTCGGGTACTCCCGCCACTGCGACCACCACAGCCACAGCAACTGGCAAGCAGGCCAGCTCGGAGAGGGTGGCTGGTGATCGGCAGTGGCCACAGACTCCGAAGGAAAGTGGAGTAGCCGCCAGGAAAGCGACAAGTAACGGGGCAGATTACGGACTCCACTACTGTAGAAGTGGCGACCCTAATGGAAAGGATCGCACATTTAGAATCGGAGCTGGTGAAGGCAAGGGCAAGTGAAGGACAAGCAGAGGCCGCCAGGGATCCCGTTGAAAGTGGGGCACGCGTCGTTGGAGTGAACGGTGTAGCGAATTTGAGTGCAGCCTGAAATAGGTTGTGTTCACCCTCCAAGGGAGCCGACACACAATAAGCGTCAATACCTAGATGGACGCCACGTAGATTGCCTGAACTTCCCGAGTTCAAGGGTCAGCCAGAGGAATGGCTAATATTCCTGTGCGCGTTCACGGAAACAATGGCAGCTCACCAGTGTACAGAATTGGAGAATAACCAGAGGCTAGTGAAAGCCTTTGAAGGGCGAGGCCCGAGCAGCAGTGAAGTCGCTGCTCATCCACCCCAGCAATGCGCAAGCTGTTATGGAGCAGCTACGATTCTGGTATGCACAACTGGAGAGCGTGCGCGTTGTGCAGCCAATTCAAGATGCCAAGTGAAGGGTTCTGCATGCGAATACTGTTCGCTAGGAGGAACGGTATGCAGACCGCCCCAGATGTTGCCATATATGTGGAGGACGCTTCTTCAACCACGCTTCTACAATGTCGCGAATCGAGTCCGCCAGGTAGTTAAGTTTATGTTTTTCATGTTTGGAGTATGGATGCCTATTCTACCTATCCCTGACGGTCGCCAGTCGCAGATGGAGGCCGCAGGAGGGAACAGAAGAGCAGCTGTACAGAGACGGCAGCCGACAGATACGAATGCCACAGTCAGTGGATTCCAGCAAGAAGAGCCTGCCTACGTCAGCCGCAGTTATAGACGCGGGACCCGATGAGGACGAGGGGCGACATGCGAACGCCAGGAATTATCGCACCGAAACTTGAGTTGTGTTGAATCGACTGGAGGTCACCTCCTATTCCGGATTCTTCCCGTGACGCTGTACGGAGAGAATTCGCAGGTCGACACCTGCGCTGGATGAAGGATCGTCTATCACGCGCATCGACGACGAACTCATCTGCAGTCTGAACCTGAAAGGCGAGAGTAGACAACTGAATGTGCATTGGTTTGGCGGAAAATCTGCCAAAGAGCGCACGAGAATGGTTAGCCTGCAGATCAGTGCAGCGGGCAAGCCAAATCGCCAAGTGGCCAATTTGAACCTTCCGATGCAGAGCTTGCGTCGACAGCCCTGCAAGCATTTTTATCGACACTTCTAAGTGACTTCTAGGAGATGAAAACTATCGTCCGCGATATTGCATTCGGGTCGCGGAAGTCACTCCCGTCGGGAAGAAATGTGCCATTTTGGCGGCACTTCTTGGAGTCACTTCGGCGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCATTTCGGCGACCCTTCGAGAAGTCAGTTCGGCGACTCTTCTTGAAGTGTCTTCGGTGCCACTTCCAGGAACGACATCTGAAAGTGTCGCCGAAGTGACTCCGAGAAGTGTCGCCGAAGTGGCACATTTCTTCCCGACGGGAGTGACTTTCAAGATCCGAATGCGATATCGCCGAAGTGACTTCTGAAAGTTACTTAGAAGTGAATCAGATAAAAACATTCCTAGGTCTGCGGCTATAACAAAACCAATAAAGAGACAATTAAAAGGATAAAAGGATCAAGAAGCAAAACCTTATAATGCAACAATACGATCTTACAGTTTCCCGATTTTGTCAAACCATTCATTCTTACTACGGATGCAAGCAACTATGCGATTTGCGCCGTATTATCGCAAGGAAATTTAGGAACGGACAGCCCGATAGCATACTAATTAACATAACTAAGAGACCATAGAAAGAGATATGCTGGTCATTATTTTTTATACTCCAAACTCGTAAGGTGGCGACTCCAA'..b'CATGACAAATTCCAAATGTGCCAAAATATCTAGCATTTGTAGTTTCCGAGCTCTCAGCGTTCATACGGACGGCAGACAGAATGCCAAACGGACATTACTCGACTGGGCCAGTGATCCCAACATTTTCAGGGAATAGAATATTATAAAAGACTGGAAGAAAGGTCCATATACAATTTATCGTTCTCTTTGTTTATTTCGGATCTTGATAGCGGCAGATGAAACCGAAAAGTTTTCATATTTTAGATATTTGCAGGAATTCTAGAATCTGCATACCAGTTAACGCCATTGCGAAGATGCACGTCGGTTATAACTCTACTTTTTAACTCACTCTTTTTAAATATTAGCGAATTTCGTATTCAATTTTGATAAGACTGACGACTATACCATATTGCTGCCATAGAAATCCGTAAAAATAATAAAAACAATTATTCGTTATTTTTAATTATTTTTACTAATTCTCCGGTACATATCATTTTCTTTAATATTTTAGAATTACTAATCAAATTTTTAAAGAATCACAATTTTAATAGGAAGGATTTGATCAATAATGTAAAAAGACCTAAAGCTTCGTCTTTTGTACACCCTTGCAGAGTTTGTAATGATTTGTAATGATTTTTTAAATGAATATGGTTCACTGAAATTAGTATTTAGTTTTTCTTTTATAAATTAGTAAGCCCTATACATACAAAAATCCCTTAGAATCGACCTACAACATTTTTCAAGGTTTCTGTATTATACGTATCTTCATTACTTGTCCAAAAGTACACACAATTTTATTAACTATAAAAAATTGTTTATATGGATATGTTTTTGCTATGCTTAATATTTAAAATAACTTTCAACTAATGTGTGTATTTTGTTTTTGTTAAAGAAAAGAATTGATTAATTATAAGAAATAGTTATCTTAACGTAAAGTTTTTCAAACAAGAGTGTGCAACCATAACATTACAAAATTTCAATGCTAAACAATCAATGTGTTTTTTATAACTCCCAACTGGGTCTTGGGTCTTGTACAAGAAAAACTCTGAAAAATAATGACTAAATCATATATTTTGGAAGTATCAATATTCTGGATGCAAATTTCAAAGTAAATTTTCAAAACTCTTTTGTTGTTTCCAAGCTTAGGAGAATTATGTTAGAAAACACCTAAGATATAATGCTTAAACATTTTTTTGGAGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGAAAAGTTTGCGTAAAAACGGACGGAAAGATGGACTTGGATAGAACGAGTCATCTAGTGAAGCTTAAGAAAAATATATATACTTTATGGGGTAGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATAATACCTCTGCAAGCGTATAACAAAGAAGAACGCTATAGTCGAGTGCTTCGACGATATGATAATGTTGGAGGCAGACAGTTTTAAGCGTTTTGGCCATTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGCAACAAAATTTTTTAAGTCGGGAAGCCCAGAAATCTGCATGCCGAGTCCCATTCCTCTAGCTTTAATAGTTTCCGAAATCTCAGCGTTTGTACGGACGGGCAGACGGACAGACGGACGGACGGACAGACTAACATGGCTTGATCGAATCGGCTATCTTTTATATGATTGATGTTTTAAACAAAAGCTATTATCACTGTGAACGGCACTCCACGTAGTCACGAAGCGCACCAGGAGGGTGTGCAAAGGCGACTACTATATATACGAAGAAATGAAAATCTACAGTAATAGTCCTATGGCATATACATCCATACAAAGGTATTTCAAAGGTATTGATACGAGGATATATCATAATACAAATAATGCATATTGAAAGGATTTAAAACAAAAAAGGAAGTTAACATCGGCAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGTAGTTATAGAAATAAACAACTTTAGTAAATAATTTTTTCATATTATTTTCCCACTAATTTCCCGATTGTTTCTATGACAGCTAATGATATAGTCGTCCGATTTTGATTAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATCTTACTTCCAAGCTGAGAAGGTTATATGTCAAAAAGCACCAAAGCTATAATTTGTTACATATTATTGTCCCACACCGATCGAATTTGAAATTCAGAACTAAATAAAAAATGTTATTTCTAAGATTAGAAGGTTATATGCTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTGACTACAGCTATATGATACAGTCGTCCGATTTTGATAACATTTAATTCGTAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATATCCTCCGAAGATATCATTTTTTTTTAATTTTTTCCCCCTATGGAAGCTATAAGACATAAGTGAAGGAGACGTTTCCGACCCCATAATGTACATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGGCGAGTCGATCTATCCATGTCCGTCTGTCCGTCGGTCCGTCTGTCCGTCCGCCTGTCCGTCTGTCTGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAACGCTATCGGGCAGAAACTGTCCCAATCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTTGGAAGCAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCTCATATGAACGATCGGGGAAAAAACTTTAGAAAAAATGTTATCTTTGGAAATAACATTTTTTGAATTAGTTTTGAATTAGGAATTAAATTCTATCAAAACAGGATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAACATGAAACAAGAAAGGAAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAACTGAATTAGAAATTCTTAAAAATATAAAATTTTATATTCCCAACATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACAAATTAATAAAAACTAAAGTTACTTATATTAGGATTAAACAAATTTTAACCTAAAATAGAGTTTGGGTATCGAGAACAAATTGGAGTGCTAAGTTACTTTAGTATATAGCATTTTTAATACAATTAATTTCCAAAAACCAATGTTTTATTTTTTAAATGAATATGGTTCACTGAAATTAGTATTTAGTTTTTCTTTTACAAATTAGTAAGCTTTATATATACAAAAATCCCTTAGAATCGACCTACAACATTTTTCAAGGTTTCTGTATTATACGTATCTTCATTACTTATCCAAAAGTACACACAATTTTATTAACTATAAAAAATTGTTTATATGGATATGTTTTTGCTTTGCTTCATATTTAAAATAACTTTCACGTAATGTGTGTGTTTTGTTTTTGTTAAAGAAAATAATTGATTAACTATAAAAAATAGTTCTCTTGTCGTAAAGTCTTTCAAACAAGAGTGTGCAACCATAACATTACAAAATTTCAATCAATGTGTTGTTTATAATTCCCAACTGGGTCTTGGGTCTTGTACAAGAAAAACTCTGAAAAATAATGACTAATTAATATATTTTGGAAGTATCAATATTCTGGATGCAAACTTCAAAGTAAATTTTCACAAATAACATTTTTTTAATTAGTTTTGAATTAGGAATTAAATTCTATCAAAACAGGATATCATATAGCTGCCATAGGAACAATCGGAAAATTAGTGGTAAAATAATATGAAACAAGAAAGGAAGCTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTACAGTTATAAAAAATAATCAATAATTTTATTAAATTGAATTAGAAATTCTTAAAAATATAAAATTTTATATTCCCAATATTATAAGATAATATGGTAAAAAGCCCCAAAGCTATAATTTGTTTCACATTATTTCCCACCAATTATCCGATCCTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATCTTAATAAAATTTAATTAGAAATTCGGAACTAATTATAGAATGTTATTTTCAAGCTTATAAGGTTATATATTAAAAAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/f82/154/4b/scaffold_1-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -TACAAAAGATATAATTTTTATTTCTTGTTTTCCTACTAATGTTCCGATCGTTCCTATGACAGCTATATGAATAGTCGTCCGATTTTGATCAAGTTTTTGGGAAAGTTTTAGCCCGATAGCTTTAAAACTGAGAGATTAGAGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTTGTCTTGTGACGCTAATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTTTGCAAGGGTATAAAAATTATATCTTCGGTTTTATTTAACATATAACCTCCTACGCTTGAATATAACATTTTTAAATTGGTCTTAAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATCATTTAGCTGGCATAGAAAGAATCGGAAAATTAGTCGGAAATATAAAACTTTGGTGTTCTTTAACATATTACTTTTTAAGCTTAGCAATAATATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATAATATAGCTGTCATAGGAAGGATCGGAAAATGGGTGGGAAAAAATATGACACAAATTATAGCTTTGGGGCTTTTTGACATATTATCTTATAATATTGGGAATATCATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATCAAATTTAATAAAAATCGGACGACTCTAACATATAGCTGCCAATGAAACGGTCAGAAAAATAATAAACTAAATTTTTTTTAATATCACTGAAAGCAGCAACAATCCTTTAAAATTTCACAGTTGATTATTTCTTATTACTGCAAGGGTATACAACCTTCGACTTGACGAATTTATTTTCCTTTTTTGTTATTTCAGTTATTTACCATTATATATTCAGTAAGCATCAAAAGCCGCAATTTTGTAGGTGTCGTTGTAGTAGCCGTGGTAGGATAGATGTAAATTGATATTGTTTTGTGTGTTTTTTGTCTTGGATATATATATCATAAAAACTTTTTCGAAGTATTTATTAAAAATCAATTTAAAAATCGTATTACTCATATCTACCCTGATAAAGGTTGAAATTACCCCGATCCCCGACTTAAGATAGCAAAAAACTATTGTTATTTTATTTAATGTTATTCCATTTATTCACAATTTTGGTAACACTTACATTGTTTTGCATTGACTTCGTGTAGAACTTACACTGCACGTCCACATAAAAAATCCAATTTCAGCGATAAACGATTTTTGAGGTACATATATTTAATGTGGCATATTGATATTCAATTTATTTTCCTTTCAAATTTAAGGTCCAACCACTTGCTTTATAAGGCAAATTTTTTGTAAAATATTTTTGAACCTTGCTTTAAACCTACCTTCGATATATAAGGTCTTTTTAATTGGGAATTTAAGCCTTGAGAAATTATTATTAAACTATCGCCCAAAGTAATAATTTTAATATAAATAATATAAACTTACGCAAGGGGAAAATATGTTGGTAAAGCGTAGGCGTCCATTTTATTAAAATTTGTCTCCATATATTAAAGACCGTTTCGATTTTACGAGTAACTCAAATCCTTTTATTTTGGATTCTCCGTCGGGAAATCGAACATTTTTAGGGGCACGTTTAATAGCACGTTTTATATAATATTTTAAACGAAATTTCACTTTTGATTGGAATCTTTTACAACTATTTTTAAAACTCTGGTCAACATTGAAACTTTTAATATAAAAGTATATTTTCTAGTATCAACCGTTTCTGTGCATGGGCTCGACTTTCCTCTTCACAATTTTTTTTTTATAAAATGCTATCAGTCACATTAAAAGTCGCGTATTTATACTTTTTCAGAAAATTTTAAGTTGCGAATAATAAAAATAATTTATCTATGATAAAGTCAATAATGTCTGTATGCTGCGTCTTAATGCTGTGTTTCCTGCGAGTGGACTGAACGATATTAACACTAGTTCTTGCAATGCTTCGTTGGTTTAGATGGAGCAGCTCAGATCTCCTCTCTTCTCACAAATATCTTTGTCCGAGCACAAATACTGGTATAGATGCTAACATAGATACGTATTGAATTACATACACTATCATGAAAACAATACAGTAACAAGTGTAATGCTGATTCCAGTGTCTGTGTGTACCTACAGATCACGAACAGTCGACGAAGGCGGGCAGATCGAAGATGGCTACACAATACATAAACATGAGCAAAGATACATTTCGGTAATAGTGTTGACAATTTAGCTATTTTCTAGTTTTAGTATACTTAAGCAAAGCTTCTATTATTTTACAATTTTCCTTTGATCCTAACTCTTAGAAGAAGGGGTACATTTTTAAACTTGATTTCACCATACGACCATTTTTTGGTACGCAGAAAGCGTACAAGATATTAGCCGCACCTACATCTACAGTGAAACAACAAACAACACTTACGCTCTCAGTCGCTTACTCTTCTCTTCTCTTATTTGGTATTTCAGTTCTCACTCTCCTCTGCCATTGTTTTTGAGAGGGTTTGGAGGCTTATGTATTATGTGTATACACACAAATGTAAATAGGTATATAAAAAAGTACTTGTATAGAGTTCGTCGGATTTCTTAATTATACCTTTGCGAAGGGGATACTTGATCACCACCGATAAAAGCAAGTCTTCCATAGTCTCGCACTTTTGACTGGCTAACTTTTGCACATGTTTTCTTAAGTCAGGACAAAAGTAGAAACGGCTATAGGGCCGCATAGGTTTGACATATACTAGGAGCCATGGTAGGTGGGTTGCGGGAATTTAGGAAAAGGTATTAGAAGTATTTACTTTTGCGGCTTCAGAGATACAAATTCTTTACATTTTTTTCCTTCTGAATTATGAAATATTAATATTGTAATTTTTCGTTCATTCCTATGGAAGCTATATGTTAAAGTAATCCGTTTTTTTTTAAGTTTTATTCGAAAAATTTTGACATATTAATAGAATGACATTCCCAAGTGTATAGGAATATATATTATTATAAGTCATTATTCGTATAGACGGGACGGTTTTTTACAGATTTAACGCTGGTAGACTAATTTGTGTAGAAACGACTGACATGGATAAATCGATTCGTCTAGTCAGAGTAGAATATATACAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATAGTGTATTATTATTATAATATCGGAATTTAGTTTTGTACCATTATCCCAATAATTATTCAATGCTTTCTATGACAACCATATTATATAGTCGTTTTAGTTTTAAGCCCGTTTATCTTAAATTAAAAAGGTTTCACTCTGAACGGCAGACCATGTGGTAACGAAGCGCACCAGGAGGGTGTGCAAAAGCGACCACTTTATACCGAGACTTTAGGAAAATCAATTGGCTTGGAAACGGTAAAAGTGTAAAAGGAAAATTTGGAAAATTTATTCTGTTAAGGCCCACAGTCTACATACAATACAATATACAATCGGCCCTTTGCTTAATTGTTTGAATTTGATGAAGCGTCCTGGATGTAAAAATTGTAGAATGTATATTTATTTAGTAATTCGTATTATACGCTTTCGTCACAATAGTTGATATCAAAACTTTTGTTTGTTGAAGATGCGATCTTCACTACATTTATTCCCATAAAGTATATCAGCATCACTAGACGATTCGATCTAGCCATGTCCGTCTATCCGCTCGTTTCTACGCAAACTAGTCACTCATTTTTAAAGCTATCGTGCGGAATGTTTCCCAAAGGTTTTCTTTCTTTTTCTGGTAGTATATAAGTCGAAGCCCGACGTATCACAAAACTATGTTTTATAGCTCCCATAGAAATCGTAACATTTTTTTTCAAAAATTACGCTTGGAATAACAAGCTATCTTCCTTTTTTGTTGATAATGAATGTATACGTGATTAGGTTATTAAGAAAATATTATAATATTGAAAAAAAAACCTTATGATCTAAGCCAAATAAAAAAAATTAAGTTAATAAATCCAATTGTACAGAGCCACCCTTTATCAGTCATATTTTATACGACTTTCTGAAAGATCGAAAAATGAGGTGTCATATTCAAGGAACTGAACGATGCATACAGCTTTTAACTAGTGCTTCTGGACGGCACACTGAAAAACATTGGGAGAGTAATGACTGTTATCAAAGAAAGCAGAAGGAATTTTCGTCGTGTGGAAAATAAATAGCATTTAAAAATGGAATACTAAAGATTTATAAAAAAAACAAACTTGAAAGTGACCTTTTATCAAAAAAATAGCAGTTTCCAAAATTAAATTTTTTTCTATATGTGTCGACTAATATGATATTTGTCAAAAAAAAAGTATTTTTCGGCAATGTTGCTTCGAAACTTCTTCTTCATAAGATACCGTTCCCCCTACGAGTTTTAGGCGCCCAATACAGATTTACTAGCCGAGTCGATCTAGGCATAGTGACAGTGAACGATTTATATTTTCAACTTCTTTCTTTTGCTTGGCATTGAGGATACCAAAACAAAATATTTAATAGCCTTAAAAAGTTTACAAAAAAGTTCAACCCAATTTACAGTCTGAGTTACTTACACATATATGTATGTACCTGTTATATCGTCTGTAAAATTTGTCAAAATAGGGGCGGTCATGATGTGTATAATAAAAGAACCTCTGGTAGCCTGGGGCAAACCGATTCTATAAGTCGAAAGCAACTGCATGCATACGTTAGCCGGCCTGAAAACAAGCAAAATACCTTTTTTGCCTGCAAGTGCACAGCAGGATTGAATCTGGGATCTGAAACTTTTATCTTGCTGTGCGCTTCTACGTTCGTATTTTGTATGTGCCCTTCGTAATTTAACGTCTTACTCAAGTCTTCTTTCTATGAAAGGAGCGAGCACATGCTGTGCGGCTGTAGTTGATACATACAAACATACCCATGTCTGTATGTTGGTATTCGTGCATTTGTGTGAATACGTTCAGACCTCTGTATGTATCCGCACATACTCCCACAAATATACAAACGTGGCTGTACGCACATGGTTATACCCATTCCTTTTTATGAGAAACGTTTTGTCGTTTCTCAGAAACAACCAAACCAGATTTTTTATAATGTGTATATATAGATGTGTGTACATATATGTACGTATGTATTCATAAATTTATATGTACTTCATTCCATAAATACCTATGTATACTTCTCAACA \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ACGTCTTGGCGCTCTCAAAGTACGCAGTTATTTTAGGTACGGGAATTTCTGAAAATTTGTGCTCCGGGTGCTTCCTCGTCAGATAGACTATCAAATTAGACGTATTTCCGCTGGTACGATACGACTTTGAACATATATTGCACCTAGCAGTCCCATCTGTATCACGTGTGAAGAACGTCCACACCTCGGACACCTCCTTGGCTTAGTCGTTGTACTGACGTCGTTGTTGTTGTCATCTATTAAACAAAACACACAAGAAATACTTACATATACGTACACTAATTAATTATATTGATTTACCTGCTTTTTTTTGCCAAAAACTTGTCAATTTTTCACTTTTCATCAATTTTTTGTTTTTTCTGGAACGACGCTTCTGCAACTCTGCAAAAAATCGAGGTAGAGCGCATCCCAGCCACTATCGATAATATCGATAGTACTATCGATGCTTTTACAGCTCTACCGAGTACTTGTCTCCAAACTTTTTGACCAAAGAAAAGACTCAATAATATTTGGAAGGATTAGAGAAATAAATCTTTTGTTGCAATTACTAATTACCTTACCATTATCTCCCCTAAAAATACAACACAAATTGGGTGGTATCCTCTAACCAATTTATTTGTTATTATCTGTGAAGAAAATGGCCGCTTTCAACAGAACAACACAATAAGTTTTTACTGTCGGAACAGTTATCAGTCATCAAGTTTGTTTTTCTTAGCGCTGATGATACATAATGATGACTACAATGTAAAATATTACACCTGGTAAATTCCACTATGCTAGTCAAGTGTTTTATATTTTGGTCCTAGAGTAAATTACCCTTTACTCGTTGTGCAGATTAATTATTCTATTGAAAGGTTAGTTCTTTAAGCCAAAAATGTATGATATTGTAGAGGAGGAACATTTTCTCTGCCATTTTTAATCTAAGGGTGAGAAAAAATTATATTTTTAAATAATAAATATTTCTATTAATTATTTACAAACTATAAACATATTTTTATTATAATTATAAAATAAATTAATAAAATTAAATTATTTTCAGTTGGTAATTACAGTCGAATAAAACTTCAATAAAATGCGCTTTTTTATTTATTTATGTAATTGTGCTAAATAAAGAAAATTTAAAAACACTGAACAGGCACATTCTATTAGTAAAGCTACAGTTTTTTCTTATGAGATTTATTAAGTTTCCGGCGTTTCAATATCATATCATAAAGAGCTTCTAGGCCTTCTTGAAGTCCCTCGCCAGTTATCGCACAGGTCGGTTGTATATACCACCCCCTAAAGTGCATCGAGTTGGAAAAGGTCCTGTTATGTTTTTTGTTATGAAAACAGTTTTTACCATCACGCGAATTTTTTTGGTCCTTCACATCAGAACCTTTGCCAGAATGCGGATATATGAATGTAGACAACGCCTCTCCACTTAACGTAGTCCTTTGTTCGTCACTTTCAGGAGCAGGTTTAATGTGAATCATTGATGAATGCAGGTGATTTGATCTTTGCTCTGTTAACGAGGTTTCTGTAATACTTTGGTTTGACTTGCTACATCCGATTAAATTGATGGTGGAAGAAGAGTCGGAACAAGTTAGCATCGATATGTTCGGCACTGGGTTATAAAGCTCGTTCAGTCCTAAAAGTTTTTCCAGCTCCATTGCACCACACGCGTTTGGAAGATCTTGCTTATTTGCTAATATCAGCACTGGAACACCCTTTGAAAAACATAAAAAATAAAGCATTTCGTTTTGTTATAGTTTTTATTTTATATTAACTTCGTTTTAGTGGTTTACTTTCTTTATATGTATGTACATAAAAGACTGAACCGCCCACTCAATTTAGCCGTATGTTTATGAATATCACTATGGACGGCAGTCCACGTAGTGACGACGCGCACCTTTGGGGAAGAAATAAAAATTTAGAGTAATCCGATTGTTTCGAGTCATACCTAAATCGGAATGTATTGCAAAAGCTAAAAGAATTGCATACCAAGACTTTTAAAAAATTTTATTGGTTTCGACAAAAGTGGTAAAAGGTTAAACTTGAAATTTGGTCTTTTGGGGCTGGTGGGGACAATTACCCCCGGCTATCCACCTAGTTGTTTTCTCAATTAAAATACGCGCCGAATGACACCTCAAAAGCGGGTGCTTTGTCAAAAGTAATACGCAAAATAAGATTTTCGCGGTCCTCTGAAAATTAAAATTTTATTTTACTTGTCAGTTTGTCCCAAAAGGTTATTTTAGAGTTTTGAAAATTCTAGACGATGTTAAACAGCTCAATATATATATATATATATATATTTATATATATATATATATATACGTTCTTAGAAAGGTATTTCGAAATACTATGTACGCCTTTTAAACACGATTTGTCCTAATACCACCGTTTAAAATTATGGTTCAACGCTTTTTTTTATATATATATTTTTTTGTCTTTTTTCTGATTTCTCAAAACGGCTCTAACGATTTCACCTTTAATTTTGAAGTGCAGAGCCCTTGAGATTCCTCAACTTATGACATACGACACGTTCTTGTATAAAAAACCATTTCTAAATAATTAACAACGAAAATATTAACATTTACCAGTTCAGATCATCTGACACTTACACCCTACTTGAAGAAACTAAAAATTTTAGATCATCTTAAATAGCTTAATAGAAGAAACTTTACTTCTAGCACTTTGGGGAAAACTTCATAGTTTGGCGTGAAAACAGGTATAAAAAGCTACATTTTGTACACCAGTAACAACGAACTGTTACAGCTACATGTGTTTAGAAAGGTATTTTGAAATGTGAATGCCTTTTTAACATGATTTGTTTAAATATAAAACAAAAAGTTCTGAAATCAAACAGGAATAATGAAGTAAATATAGTGACGATCGCACTTTCGAACAAACAAAAGCTCTGATATAATTTTCTGTGACGAATACACGATCTACTAAATATATATATATACATCTATCATCAAAGTCACCAAATGCATTGATAGACACTATTTATATTCCTTTAATTAGATTTTTATAAATGCAAACATTGCCGAGATTTATTGACGCTTCCCAATTTATAACAAACTGTTCCAAAAACGATTTTTTATTAATCTAGACACCAAACGCTTTTATTAACCGATAATCTCTTTTGCAAAAACAAAGACTAATCTTTTAACTTATTACAGAGCAATCAAAAATATTTTAAATGGATACGTTTTTTAAAAGACGTTTTCATAAAAAATTTGATTGGTAAATCTGTGTTTCAGTTATATCGCAAATTGCACCCAAACCAATTTAGGTGAAATTTAGAAAATATATATCTTCAACAATTATAATGTAACCGTTTAATTTCGCCCATTATATTAAAAACAGCATTAAGTATTTTGTGTAATTTTTTAACACTTTGGTGACTATGAGGCGTCTGTCTGTCCGACCACTAATCCAAACGTGCCCAGTTTAAAGTTAATGTTCATGGCATCCAAACTTGCGCTGCGAAAGAAGCTGTTATATAATAAGGCATAAATAATAATTTAATGAATTAAAAATGCCTTCGTAGGAAAAAAACTTTTTGTGCTTGCTTATGTCAACCCTTTTTATTTCCAAATATTTCCATCTCTATCTCCGCCTTGCAGCTCCCTCTGCTTCCTGAAAGAGATTATAGGATGCACATTTTTTGAAAACCTTTTTATAAAATAATTAAGGTTGTCGTGTACTTAACCAAATACCGAGAAACTAAATTCGGCTTTGTTCTCATTGAGAGCATTGTAGGTCAAGAGCTTTCCGATTTTTAGAAAACTAAAAACTAATTACATTTTAATTTATTAAAGTACATGTAAAGGAAAAAACGGGATTTATATTATTTTTAATCTTATTATGCGTTTGTTATGATGACAGCTATAACACAATGTCGTCCGATTTTTGAAAATTTGTTTTCGAAATTCTGAAATATTATAATATTGATATTTTCAAGAGTAAATCTATGTTATAAAACGTCAAAGTAATA'..b'ATTTGATTTACTAGACGGTTGTATGCCTGCCGTAGCTGCTGCATCTCCACCTAAAAATATAAAATTATAAAAAAGACCGTTGCAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATATAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGTTTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAAAAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAACAGGTTGTTTACATTACAATAAAATCACAGTAGATCTATCCCCCCGTTTCCACGCAGTCGAGTCTCTCAGTTTTAAAACTATTAGAATTAAACCTTCCCAAAAATTGTGTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACGACACGGATCAGGCGACTATATCCTAAGCTCCCACAGGAGTGATAAAAAATATTTTTTTAATGTAAAAAAATTATAACATCGGTGTTTTTTAACTTATTAACTAGGGAATATACATTTTTTAATATTTAAAAATTTATAATAAAATAAAAAGAGGAAAAACCAGCCTGCAAAATTTAAGAACAATGAAATGAAAAATGTATGCTTTCCTAGTGTAGGCACAAAAAAAATTGGCTGGTAAAATTAAAAAATATCACTGAAAACAATAACCAATTTTTCACTAATCAACTTTAAACAAAAATCTAAAATTGAATATCGTTGGGCGATGTGTTCAAGGCTGACCAACTTCAAAATGCATCTTATATCTTTCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTTCATATCATCCCGTGTGTCGGGGTATATTATTTGGTCGCAAAGACTACAAATTGACATGTATGGACGTTGTGGAATGTAAATCAAGGGACACGGTATTTGCAATTCTCCAACGTATATGGGCCAAAGACCACTTAGTATTTTAAACAAGCTGGATTACCGCAACCGTTCAGGCGACTATATCCTAAGCTCCCACAGGAATGATAAAATATAATTTTTTAAATGTAAAATACTTAAAACATCGTTGTTGCTTAACGTATTAGCTTCTACCCTAAAAAATATACATTTTTTTAAATTTTAAAATGTAGAATAAAATAAAAAAAAAGAAAAAACCAGCCAGAAAAATTTAAGAACAATGAAATGAAAAATGTATTATTTCCTAGTGTAAGCACAACAAAATTGCTGGTTAAATTGTATTTTACTATGTATAATGTTGTTACGTTCATGTGATATTTGAAAAAAATATTTATCCTAACGTAAAATCTTCTACACAAAAGAACGTAACAATAACTTTACAAATGTTCCTCAATATGTTGCATGTTCTATATCCTTGCAGGTCGTTTCCGTATAAGTATTGTGGTCTACAGCTTTACGATTTTTAGAAAACTAAAACTTAACACAGTTATATAAAGATAACCCCACATTTTAATTTAATGCCGTAAATGTTTGTCGAAAACAACATTACATTAAAAATCCGATCGTTTCTATAGCAGCTTTATTAGTTGTCCGATTTGTATACCCTTGCAGAGAGTAAAATGAGTTAAGTCAAGAGATTGCAACGCAGTGAAGACGTTTCCGACACCATAAAGTATATATATTTTTAATCAACATCACTATACGAGAAGATCTAGCCATGTACGTCTGATCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGAAAACTAGTCGCTCAGTTATAAAGCTATCTATTGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGAATCGGACTTCTCTTTACTATAATATTATTAAAATTAGAGGTTTCAGAAGATTTAATACAAATGAAATTAAAAAATAGGATAACTACAGCTGAAGACAAACATTTTTAAACCGAGCACTTTTTGAAAATTTTAGTTTTTTAATTAATTTTTAAAAAGTATATATAGAAAATATTTCATGCTAATCAAAAATGTGAAATAGTATTTTTGAGAAATCCGATTGGTTCTTTAGTGATTTTACTACTCTTTATACTTGCATCTATTGAAAGTATTGTTTTATGCTATATCAAAGTGAAATTTACTTCGGAAACAAAAGTTCTGAGGACAAGGCTCCGTGGAGCCAACTTAACTCATGAAAGTTTATTGGTATAGAAAACTATCACTTTAGATGAAAGGCTCATTTAATTTTGAACGAAACCACAATGTACATTTATAACTTTTAAAAGTTATTGATAATTATAGTTATAAAATGTTCAGTTAGACCAATACAATTTTACGATTTTAAAAACATCACAGTGAACGGCAGTCCCCGTAGAGACGAAGTGACAAAATGAAAAACTACAGTATTGCTTCGAGTGAAACATCAGTTGCATACCAAGACTTAAAAAATCAATTCGTTTGAAAAAAAGTGGTAAAAAAATGTAAAGGTAAAAATTATGAATATTTGCGTACATAGTATTTGGAAATACATTTCTAACGACGCACAGCACAAGCTTCAGTACTACACATTTTACGGGTATACAATGTTGCAATTTTAGCTGTTTCTCGCCAAACTAGTCATTCCAAAAGTAATAAAACTAATGTTTCTTATATTAAGATGTTTAACATCGTCTAAAATTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAATTTTAGACGATGTTAAACATCTTAATATAAGAAACATTAGTTTTATTACTTTTGGAATGACTAGTTTGGCGAGAAACAGCTAAAATTGCAACATTGTATACCCGTAAAATGTGTAGTACTGAAGCTTGTGCTGTGCGTCGTTAGAAATGTATTTCCAAATACTATGTACGCCTTTTAAACACGATTTGTCTAATTCCTACCGTTTAAAAATTATGGTACAATGTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATTATAAATTCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGAAAGAAGCGTTTTCGACCCCATAAAGTATATATATTCATGATCAGGAATACTAGCCGAGTTGATCGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCGGAAACTATAAGTGCTGGAACAGTCAAGCTTGGCATGCAGATTCCTGGGCTTTCAGCGGGGTGCCACGCCAACTCTAACGCCCACAATCCGCGAAAATCTGTAGCGCCTACAGTTTTTATGATAGAAACAAAATTTTAACTGAAATGTGTGTCTCATCAATACCTATCGATTGACTTAAAAAAAATGTGCCACGCCCACAATCGGTTAAAACTGTCTGCCGCCCACATAACATCGACTGAAGTGGCCAGTAGGTGGCGCCCTAAAATACTGCTTTGCTGCTTACAAAAGTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACGGATTGTTAAAACGCTTAATTTTGCCTGCCGCCCACATTACATCTGCTGGAAAAGCGATTCCAAACTATATATTAGAAGGTCCTGGAAGTTTCATATAATATCCAACATCTAAATGTAAGAAACATTAGTTCTACCAGTTAGTAAGTTAAAAACAATTTTGGAATGTAAAAAAATAAAGAAAATGTATTTATTTAGTAGGTTGTATAACACATTTTCGACACAAAATTTGATATCAGGACTTTTTATTGTTGAAGGTCGTCATTTTATTGTTGCCTCGTTAAGAGGTGTTTTTGTTTGATACGATAGTTAATTGAAATGGGACGTTTTAGTTTTCTAAAAATCGGAAACTTACAACCATCCTAAGACCGGCAAAAGTATAGAAACTTCGGCTTACTGATGTAAGATTTATTCTTTGTCTTCTTGTTTTTGTATAAGATATATTAACACATTAAAACCAATTTTACTTTTGAATCAGCTTGGTGTCTGTCATTGCTTGACTTTTTCGCTTATTTCTCTTTACAAGAGCTTTCTTTAACACCAAATACATGCGCCTTCCCAATCGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TCTTATAAGAAAGTAAAAGGTGACGTTAAAAACAGTCTTGTATAGTATTCTACATAAAACTTATGCTAAATGTTCCAAATGTGCAAAGGTGCAAACTTTAAATACAAACGATAAACTCACTTTGTGACCACCGTAAAAGGCGATTTCTTCTGCATTAGTTATTATGCGGGAGTGAATGTGCCTCAAGTAGCCATACCTATTGGCTTCTTCCGATACCAACTGTCCAAACTTCGGTGACACGATTCGTAATATATGGGCTGTTAGAGCAATAACACCAACAGATAAAGCCGGTCCTGCGTGTTGGAAAAAATATTCAGTTATGCATGATACATACTCATTAAATACGAATTAACCGGTTATAATGTTAGCTTTCATTTTTCTAGAGGATCTCATCAATGCCAAGCCAATAAGCATTAGATCGAAACATGGTTTTGTCAGGCTACTATACAAATGAGCTACAGAGCTAGCGAACACGGAAATATCTTCGGTAAGTCTATAAGAGAAATACATTTTTAAATAATTAATTAGCTGATGGATGTAAAGGTTGCAACCTTAAAACTTACCTGTGATCCGCATTTTCAATGCGTCCATCCAAATTCGATACTCTATAATAATTTTGGTTTTTAAAGTAAAGACGATATGAGTGACGTACCAGTCGAGTTCTACATAAAAGAGTAAAATTATGTATATACTTTCTTAAGGTTTCAAATATGTTATTTACCGAAAAGCCAGAGCAAGTTTACTTTCAAGAAACCGTATCATGGAATTAACAAACGTAGCAGGGATAGCAATCCCGAACCATTTCAGTAATACAAGAGCAAATTGTTTAACGTCTTTTCGTACTATGAATTTTACAAGGGCTCCCTCCAAAGCAGCCACATAAATACTAAGAAATGTGCGAGAAATTAGGCAAAATGTATGAACAGCCAGCAATCCAGTTTCGTAACATAAGGTCTGTGGGATCATTATTTTTGAAAGCATTTTCAGTTGTTTCAAAAATTCTTGGTTTAGTCCTGGCTCAACAAAATCATTTGATTTTTTTTTTTGCTGCTGAGCAACTAACAACTTTTCGGCCTCCGCTAGCTTTAAATCCTCCTCTGAAATATCTGCTTCCAATGGTGTAAGTGTCCCATTGTGGACTTTGGGTTTTCCATTTTGAGTTATTCCTTTCTTCGCGTAGGGGATAGTCACCTTGATAGTAAGTGCCAATATAGCACTAGTCACAAGAGCATAGCTGAAAACGTGTTTTGTTAGCCCATTATGTTCACATTTTTCTGCAAAACAGTCAACATATTTGGATAGGACACTCATTTTTGCATAAAATATAATTTTCCAGGGACGATTTGTTTCACTTAATGAAAGATCAAGGTAAATCTGAAAATAAAGTTATTTTAAAATATAGAACCAAACAGAAATTATTATCAAAATGTCAAAATTTCATAGAGTAGGTCTTAATTTCTATCAAACAAAAAAACCTCTTAACGAGGTAAGGGGTCGTGGCGATCGCGCACCATTAACGTACAAAAGTTCTGATATCGACTTTTATGACGAGTAATGATTGTTTATTCGACTAAAAGGTTTAGAGGTGTTTTTGTTTGATATCAGAAGTTTTGGTTATACCATTGCATAACAATAACTTCATTCAGAGCCCATAAAGTAAATATATTTTTTATCAGCATCACAAGACGAGTCGATCTAGCCAAATCCGTTTTTACGCAAGCTAGTCTCTCAGTTATTAAGCCTTCAGGATGAAACCTACCCAAAAGTCGTTCTTATAGTACAGGTAGCATATGTAATATCGTAACGAGCCGGATCGAACAACTAAATCGTATAGCTCACATGGGAATAATCAAAAAACTTTTTTTTAAAAATTAAATTTTAGTTCTACTCTTGGGAATATTATTATACCATTATACCGTTTATACGCAAACTAATCTCTCAGTTATGAAGCTATCGGCCTCAAACTTTCCCAAAAGTCTTCTATCTATTGCAGGTGGTATATAAGTCGGAACCAGCCAGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATCGGGGAAAAAACGAAAAAAAATGATATCTTCGGTGTTTTTTAACAAATAACGTTCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGAAATAAAATTTTGTTTATGGGTTTTAATTACATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATACAGCTGCCATTGAACGATCGGAAAATAAGTGGTCAAATAATATGAAAAACTTATATCTTCGGTGACTTTAACATATAACTTCCAATGCTTGGAAATACAATTTTTAATTGGTTTTCAATTTCGAATTAAATTTTATTAAAATCGGACGACTATATATATAGCTGCCATAAATACGATCGGAAAATTAGTCGGAAAATATAAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAACTTGAAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTAAATTTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGTTAACTATATCATATAGCTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGGGAAAATAACATGAAACAAATTATAGCTTTGGTCCTTTTTGGCATATTATTTCATAATATTGGGAATATAAATAGAAAAGTTTTAAATCTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGATGGACAGACGGACGGACGGACATGGCTAGATCGACTCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACATTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATCATACTCTCTGCAAGGGTATAAATATGGCTGTCAAAGAAATGGTCAGAAATAAGGAAATCATTTATATACTCGTTACTCGTAGAGTATAAAAGAATTCTAGATTCGTCAAAAAGTACGTAACAGGTAAAATGAAGCGTTTCCGACGTAGTAAAGTATATTTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATATAGCGTCTTGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGGGTCGGAAACGTGTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATCATTACTCTCTGCAAGGGTAAAAAAAAGGTTTGGTGCTTTTTGACATATAACCTTCAAAACTTGGAAATAACATTTCTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTGATCAAAAGCGGACGACTGTGTCATATAGCTGCCATAGAAACAATCGGTAATTTAGTAGGAAAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTTAACATATAACCTTCTAAGCTTAGAAATAACATTTTTAAATAAGTTCTGAATTTTGAATTAAATTTTATCACAATAGCTTTAAAACTGAGAAACTAGCTTGCGTAGAAACGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATTGTCTCGTCTAGTGACGCTGATCAAGAATATATATACTTTATGGTTGCTATCTTCTAATTGATATCAGGGTATAAAAAACATCAAACAGAATGCTGCTAACACTTTTTTTGTTTATAGGTTCGAGACAATTTAACAGGCAGGCTAAGACTCTGTCGCACGATTTTAACTGAACTATAGAGATCCAAAATAAAGTTTCGAAACTCGAAATAAGTTTAGGACAAACAACCTTCAAAATGTTAGCAATATAACTGATTGTCCATATAGGTCTTCTTAGATATTAACAGTCAATTAGACCAACCGACTTGTAAAGATCACTAAATAAAATAAAACTTAAAAAAATAATTAAATTTATTTTTTAGCAAAATAAAAACCAAAAAAAACTTCTTTTTTAATGCAATAGTAACTCTTGAAAGGTTACTGAAAACATCATAAAGATATCTTTAACCATTCCAAAGATATAGAATAATGACTGAGTGCAACAAAGATCGACGAAAATCAGACCTACGGAACGGGGTGGCACGCTTGGCAGATTTTGACTCAATAATAATGTCATTTAGATTTACGGCAAGTTAC'..b'CAAGGGTATACAAACTTCGGCTTGCCGAAGGTAACTTCCTTTTTTGTCTTATTTTGCTTGTGTTTATCTGTACAATTTTTATAAATAGTGTCGAATGTAAAAATTGAGAAAATGTATTTATTTAGCAGGTCGTACAATACATTTTCATCACAAATGTTGATATCACAACTTTTGATTGCTGTAGGTGCGATCATCACTAGATTTGTACCTCGTTCAGTGGTGTTGTTGTTTGATACTAGATTCGTCGTATGAACGCTGATATCTCGGAAAGTATAAGAGCAAGTTTATTTCAGCGTGTTACAGTTTTTATGATAGAAAAAAATTTAACTGAAATGTACTTATCTTGCGCCCACTAACTGTGTAATACGTACCATATACTTAAATAGCGGGTAGGTGTTTGTTGCTTATATATCTTTATTTCCCTTTCGCTCTCTTAAGCTGAGTAACGGAAACCTCAAAGTCGATGCACTCGACTATAGCGTTCTTCCTTGTTTTATTTTTCCTATGTGAGCTATACGATAAGATGAGGCTCGTTCCAACTTATATACACTCTTGCCTATTTTAAAGAATTTTTTCACACGATACGCCAACAACATTAAAACATGTAAGCTATGTTTTATAAAATTTTCATCGAAAAAATAAATAAAAAAGCCGTTGGAAGCCAAGATTTTTGGTATACAACATAACCTGTTATTGACTCATCAATAAAAAAAAAATAGTTCGTTGTTATAAAGTTTCCAAAGATAAACTACGTCAAGTTTTTTTCCCCCCAATTTTTGGTGTTCAAAATGTTGAAGTCAAAAACAAACAAAAACATGATTTAAGCCTTCAAATTATTAATTATTATCATCACTAATCTAATCACTAAAAAAAAACTCGTAGATTGTACACCGATTAAAAACACATTACGAGAACGATTTAAATTTTGGACGTTAGAGGACCAAGGACCGCCCCTCGTTCAAATGGTCACATCTTCCTCTAAAACATTTTCCTGAAAAATATAAGTTTGTAAGTTTAAAAATCCAAACACCGATAAGGAAGAACAACATTAGGAAATCATAATTCCTAATCATTCCAAGATCTAAGTAGATTCAGCAAAAATGAAAGGTATTTTTTAATTTAGTATTTTGTATTTATTTTCGCCTGGCTAGCTTTTAAATTTAATTACATTTAAGAATACGCATACATGTTGTTTCTTTGTTAATGTATACTAAGTAAAAGATAATTATAATTCGGAAATATTGTAAGTTTTTTGTAATTTTATTATTATGGAAATATATCCATATAGATATAAAAATATATTTACATGTTCTCTATTATAATAGTAATGTATGGCTTCCTAACAATTCATTGAACGTGTTGCATTGAAAGATTTAAACTATAATCTTATAGATAGTATCCTTAATGTATAAATATTTATATGAATACATTTATTTTTAATTATATCAACAATAGAAAATGCAAAAGCCCTAACTAATCAGTACTATGTAGTTAACGTTTTATTTATAACAGGCTGTTTTACCTTTAAGAAAAGCATTTTCTTTATAAATTCCTAAATAAATATTTAATCTTAATTTAAATTAATAAACTTTAATTTCACTTTAGCATAGGACAACTATGCCAAACAAAAAAAGGGGATATTATTTGCAGTATTAAGTTCGTCGTTAAAATCTACAAACTTTTTAAAACTTTTACTTTAACTTTATTTTAAAAATGATACCAAACCTTTTTTTTTCCCTCATTATTTTACGTGCGTCTTATGCGTAATAAAATATATCAAAGTTACTTATAAATTGGCTCTATATTTCGGTTTGTAAGAAATTTTATTTTGTTAAATTTCGAAAATAAAAAGTTTGTTGTTAAGGACATATGTAAAAGCAAATTATAAATAACATGTTTGAAAAATAAATTGTAAATCAATTTAATTTGAAATAGACCGCTTTTGTATGTGTAATTTTAACAGTAAAAGTGGGAGGTAAGCTATTATAAAGGATCGACACAGGACACATATTCAAATTTATAAATATGTATTTTCAAGGGTAATATTTATATAATAAAATCTTAAGTAAGTATATGTAATTATTTATATACATATTTACTAGGTAAATAATGGATTGTGGTGGACGAAATATACATTTATGATGCTTAAATCGATCTATGAGTTATTTAAGTTATATGAGTAATTCTTGAATAAAAATACATATATGTAATAAGTAAAGCATAAACTTGAATCTTCCCAGCTAAGCATAAAATGTTTTTTTTTTTACAAATAAATGTATAATTAATTAATTTGTTTTCAGTATGAGAATAAGATAATAATTTACCGAATGATTATTGGGTATACTGAAAATTCGTATATTTATTTATTCAATTCTGCTTTTCGCTATTTTTTGTTATATATATATCACAAGTTTGAAGATAGTAGAAAGTGGTGATTTAACTACTTTTATTGGCATAAACGGGCAATCAATGCAGTGTTTGATTAAAAGTGAGTTACAGAAACAAGGTGGTTATAGTTATGACATGCAAAGCTATGCATCGGGGACGTGCAAAAATCTTAGCAATCAATGCCACTTACAGTCGCACTGCAACTTTTAAGACGAAGGGAAGATATAGCAGCCCTTTCGCCATCTAAATTGTTTCCATTTTGTGCACTATTTTGATCCTCTATGGACCGAAATCGAAGAAAACCTTGATCTGCTACTAGCATACTATCAGAAGCACTGGACGTTGTGCATGAGTTCGAAGATGCAGAAGCAACCGAAGCTGATGAGGCAGTGCACAACTCAGAACGAAGCTTTCCAGTATTTTGAATATTCAGTTGTGCGTTTACATTTGCATGTAAAAGCGGGTCATTCGACAAATTTTTAGTTGCTGCTGTGCTGGTATATAATGACGTTTTGCCAATAATGGAAATAGAAGATGGAGCGCTGTCATCGGCAATGACAGAACCATTATCGTTGTTTATCAAGTTGGTACACTCTACATTGCTTCCTGATATTATATCGTCTTCCTCCTCTTCTTCTTCATCTTCCGAATTATGCTCATACGATAACGGTTTTAGTTGATGCTGCCTTACGGGTACACTTGTAAAACTGTCAGTTCCAGTACCATCCTGCAATGATCTTAAATTGGAAGTACGTCCACTTACTCTCTGATAATATTGGGCTCTGTCTCTATCTGATATCCCTAACGTCTGTGCTCCATTGGCTATTATTCGTTGAGATCCAGTAGGAGGACTTGGTACTTCTAGACTACGACCTGGAACAGCTCCGCTCAATGTTATTCCACCACCAGCAATACTGCCTAAAGTTCCACTCTTACAAACGCCGTTGAAAAATCCGCGCTCATACGAACTATAGCTTGCATATCGCCCTCCTCCATTTGATGAGGAGCAGGAATTTTTGGAGTTAGAACTGCGGCGCTCGGGATGCTTGTTTTCGTAAAAATTACGTTCCAGCGTCCCATTACCAGCAAATTTCCTTTCACATACTCGACCATTCGTTATCTTTTGACGGTCTTCAAAGCAGTCACTGTTGGACTGTATGTTGTGACCTGATTTGTCTTTAAACACAGGACGCTCAAAGATGTTAAATTCATACCTCTTGTTTTCCTGCTCATGTGGTTCAGAATAGCAATTGTCATTTTTCAAAAGTACCACTTGGTGCTGTGTAGATCCGGATCCTAAGGTAGAACCAACTCCATTATTATCATACATTTCTTTTTGCATTTGTTCAGCTTTTGTACTGTTAGCGGTTCGCAAATTAAAATTCGGATTTTCGTAATGGTCTGATGCAGCATCCGTCATGTAGTCTGTACTCATATACGTGGGCTGCTCGTGAAAGTGCATTTGATGTTGTTGCTTGTAGTTCTGAGTAGCTTTATTTCCATAATCTGTCCCGTTCTGACTATTTACAGCACTTCCAATTGAACCCGTATCATAAGGCCTCTGATACATAGGCTCCTGCAG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fb2/307/41/scaffold_12-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTGATATTCGCAGGGGCGACTGTTTGAAGATCCAGTGGGTGTGGGCCCTATAGAATTCAGGGCATAGCTGTCGTCATATATTAGTTTACCTGTGCGCATTGTGTATGTATGAAGATTGGTATTAGCATTGCAAATAGCTGGATAGTCGCCTTCAAATTGCTCCTGACTAGAGCTTGACGTGCACGGCAGAAAAAAATTTGTCATATTTGAGTTGTGAGTGCCGGTGCCGTTTCCAACATTTTTTTCTCTGATGGCATTGTTAGTTGAGCCGCCATTTTCCGGGCTATACGCACCCATAGGTCCCACTCCGGAACCAACCATTCGAACATCCACATTTACAGCATTTAATGTATCATGCCCGGCACTGGTTTTAAGCCCAGTTACCCACGATATTAAAGTAATTATCGCTATCTCTATAAGACGTAGAGAGAACTGATATCCCCATTGAAGCCAGTCGACATCTACTATATTATTTTGACGAGACGATGAAATACATATGGCACCGAATATTTGAAGGGCGGCCAGTAGTACAAACAGAAGAGCTGTGGCAATCGTAATGTGTATGGCATAGGATAAATTCTGATAGCCATGTATATAGTTTTGAGATTTGCTGCGAAGAATGCGTTTTAAAATGCGATACAAGTAGAGATAAAGCAGTCCCAAGCTTAGACATATAAATATATAAATTATCTGACATATAAGGGTCAAGACTCGGGGAGGCGGAGGCAAAATAGCCGAAGGAGTAATTGTAGCAATAAGTTGGCCTTGCTGATTATGAAGATGCTGCCTGCGAAAATATTGCTGTTGCTGCTGTTGCTGAAAATATAAATGATGATTTTTTAGGGTATAGGATTCAACGTAGTGCAATGTAATGCAAAGCACAACGTGAACGCCGCAGCCCACAATCACCGTCAGCGGCCTTATCAGAGCTGAATATCTATTGTTTTTGTGGTTCAAAGACTTAAGGAAGAGGAACAACATAAGTACAGAGAAAGCTACTGTTAAGAATGTTGAAGGTAGATTCAGCAAGAGTTCTGAGCTAAAAATGTTAAAGGAACCATGAACGTTGTATGCATCAAAACAAAGAAAAAATATTCTCATTATGCAGGTCAAAATAAGTATGAGATGGATGCACACAAAATACGACTGTGCAAACAAATGTGTAAGCTTGTTATAGGTCAGCAGTTTGTATAGCGAATATACCGATAAAATGGTAAACAGAACAACTGACAGATAGATGTGAATATTCCAGGCCCAGGTCCATGTACTGTGTGCTGAAGCAGCAGCAGCTGAGGCAGCGACAGCATCGCGATCGCCTAGGCTCGGAACCAAACTCTTAACAGCGTCAGTATCTTTTCCTGTATGTCCTGGCTGGTCCGCGTTTGTAGTAGCGTAAGAAAATGAGGTGGCCGATACTTCCCCAATAGCAGCAGCTGCTGATGGTGTGGTTCCTATAGTCTGATTAGAATTGTCGTAGTAGTCCAACTGACCAGGGTGGTACTTGCTCTGATTAATATTAGGACTAACCATGGAGGATCCATCAGCATCTGTTTTTTCCTCGTTCGTTAAAGGCTTTTCAATCAGTACAACTGGCGAAGACGGCGGTTGGCGCATGTTTATTTGGGGTCGCTGAGTAACTTGCTTTAACAACACAGCTGGTATATCACTGTTCTTTCCATTTGATCCCAGAATACGTCTTATATTGGGTAAAACTTCTTGTCTCTTACTAGGATCATTGGCATCTGGTTCAAGAGAGCCGTGTCCCTTTACCCTGTTTGCCTTTTCGTTTAATACGTCTTCGCCGCTGGCACGTGCCGGTGTATTGAGAGCTTTTTTACGATCTGTTGTGGACACATCAGGCACAGCTCCACTAGAATCAAGAGAGTGCTTTTCATCAAAACCAGAATTAGCGTAACTTAAATCCGCTAATGGATTGACAATAGCATCGTTACTATTGCCACCCAGATCTGGTGGTCGAATTGGGATCCGATCTTGACTAGGCATCAAACTAGGGGGTGGGATCGGACGCCTATTAATTGCAATTAGACCCTCATTATTGGTTCCACGCAAGGTAGGCTTGTCAGCAAAAGGGTTTTGATACTCCGGCGGAAGTGGCGGTGTAAAGAATGCTCGAGACGGCGGAGAATAAGATGGAATATCACCAGGGTACATTGGTATTGTTGGTAGTTGTCCTCCATTTGATTTTTTTAAAAGGTTGGGGACTGTAAAATTCGATATATTGAAGAAAAACAAAAGAAAACGCTATAGTCGATATTCATCGACTATTAGATACCCGTTACTAAGCTAAAAGGAGTGGGAGAGGGATGGAGATATGCTTTCAGGTTTATGTGTTTTTCACTAGGACACCTATAGTGCCAAGCCTGAAGCACAGACTAGTGGCTCCCCTAGCGGAGTAATAATGAAAGCATCTGATTTGAACGAATCGTCCGATTAATTAATAATAGTAAGAATAGAAACTCATTTAAATTGTTCCAAAATATTAAACATGTGAGCTCTAGATGGTTTCCTAGTGTTATGGTCGTTTGTGGGAGTGGTAGCCTGCCAAAAGAAAACTTGCGCTGCGCAAAAAGCTCAAAAATCGACCTCTACGGACGGACAGACCGAAATAGCTAGACAGACCGACTCGGCTAGTGATCCTGACCAAGAATATATATACTCTATGGGGTCGGAAACCCGTTTTTTACCAGTTACATACTTTTCGACAAATCTATAATACGAGTAACGAGTATAAAAAGTATACAAAAATATGTACTCACTAGATGGTATCGGAGTGGAATACTGAACGGTATTCCTGTGGCGGTCTCTATCATGCGAATGATGCCGGTTTGGATTTGGGTAAGTCGGATTATTATTACTTTTTAGTATATCAGCATTGGGGGCAGATGTTGGCAATGCATGATCTCTCTCTAAGTCTATTTCATAATTTTTTTGACGACCACTGACTCCATTTTGTTTATGTACGGAGGGATATCTGAAAAAATTAAATGTAAACTAGGCTGTGTCTCAGCATTTCATGTATTGAATATGAATTTATGTCCGATTTTGAAAAAATTAATTCGAAATTCAGAACAAATTACTATATGATATAGTCGCTAGGAAGGTTGACAAATAACAAAAAGCACCAAAGTTCAATTTGTTATAATTTTGGGAATATAATATATTGGGAATATAATTTTTTATATTTTTAAGAATTTCGAATTAAAATTAGTAAAAATGGGACGATAAACCTTACCTTTGTGTCGTCAGAAATGGTGTGGCAACAGTAGTTGGACCTAAGGAATAACTAGTTTCCGGTATGCTTCGCTTTGTTGTAGATGTTGTCCCATAAGCGACTTTTATTAATACAGCTGCAACACTACGCTCGAAGTTATTTAACTTTTCCAAATAATCCTTTTGAACTATAGGTGACGTTCCAGAAATCATGTTACTTCCAGTGCTGTTACTAAAGTTATCATTTCTATTGGACTTTTCTTGCAAATTTGTTATATTGTCCTTAGAACTTAATTCTTCTAATGATATAGACTGCGACAAAGACATTTGATTAATTGCAATCAATAATATAAATAAAAAGTGGACATGATGGCGTAGACGTGAAAGCATTTTTTGAGGCAAGAGTGAGTCGAATATGGATCCCATAAGTCTGGGCATAACCTTAGCGTTGGTTTTACATTCAAAACTGTCAGTGTATGTTGTATGTAAAGTAGCTGGTTCGAAAAAGTGGTTATAAAATACTGCATAGGTGTTTTTTTTGGGGGTTTTGTTTTTAATGCATTGTCCCCTTGGGTTTATTTTAATTTCCCTTTTATATTCATATTTGTAACCTAAAATAAAGAATACGAAATTCAGTAAAATGGTATTAAACTATTATTAACACTTACCTCTTTCTGAATAATATCGCTTTTTAACCTTGATTCGAAAGTTCTGGCTTGTTTTAGGCATGGTATTGCACTTTTAAATGTGA'..b'CCTTTGCGTAAGGTAAGTCGAAAACATAAATTCATTTGCACTTGTCAGAATGTTCTCCGTGTAAATAAGCAAAGAAATGTAAATTCTGAACTCGGTTGATTTGTTTAAAAGGTATTTTCTCACAGATTTTCTCACTAATTAGTAAAAAAAAAGAAAAAAGTGAGTCTGGAGATGACAAATTTATCGATAATCCATTGCAAAACTATGAAAGTGAATTCCAGGAATTGTTTAAGTTAGAAGTTTGCCTGCTTAACTTATATTTTTTGATATATTCCTTGGATAATTATTATATAAAATAAAAAAAATGTTATTAAATTATTGATCACCGATTTTTTGGGATTCTTAAAAACTAGATATTCGATTTTAAAAAACCTTCATAACTTGAAAGCGTTTTAGATTCCTCAACTTTTGACATATTACACGTTATAAAACTATTGAAGAGGGGATCTGGAGCCGGTAGGGGTTAATGGCCCAGGCTATTGACCTATTTGTATTCTTTCTAAAAACACGCGTTGACTCAGACCAATAATGCAAAATAAGGTTATGGTGTTGTTTAAAAAAAAAAAAAATTGATGTTTGTGAGTTTGGTGCACCCCGTTAAAGTTTTAGGGTCCTACACTTTAGATTATTGTTTGAGATAGAAGACATTAGTTATACCAGTTTTGAGAAGAGCGATTTTTATATTTATACTCTCTTAATGCTATATATACCTGCTATATTTCGCTGAATAAGTAATTCAATATGCTCGTCACGATGCCTTTGCTTGAAATGTCTAAATACAAGAGTATTAAAGTGATAAATGTGTGAACTTTGTTTCTACGCCTTTATTGAAGGATATTCGATAACGTTTTCACTTCTACAAAGTTAGATTCAACCCTATTAAAATATTTATATTTTTAAATGTCATTTAAAATGAAATAGTTTTTTTTTTAATTTGTTTTATTAAAACTATATATTTTTTTAAATATTACTCTTTGTTTCAGTTTTTATTTCCGAAAGATTCAAATGGATTCACTTTCGAAAAAATTGCATGGATTCGATTTTCCTCCCGTTTCGCGATGCATTTGGTTGCCGGATAGAAATGCGAAAGCACGAACACAAATTATTAAAAAAAATATTTTGAGATATCATCATCATATTTCATGATATTTAATGTTCAAAATTGCATTATCAAAATTAAATTAATTCCTTATTTGATTTAATTCGAGGATGCATCTTAAAATACTCTGGTTTCTTACCTATACAATTTATGCAAATTCGACACCCGTATTCATTTCGTTTGGATTTGGCTAAAAAGGGATCGGTCGTCATTGTATGCATAAAAAATGTATCTTGTTTAGATGAGATATGAATATTCTAATATAAAATGGATTACACTGTGTAAAATATTTAAAACTTTATTTACGTCGATGTGTTTACAAAAAAATTCCGCAAATCAAGGATTCTGAGAAAAATGACTTAAGGAAGGACATTAAAGCAAAATAAAACTGTTTTTTTTGTCAACCGCAAATATAGGTGAATGGATTATTGGTTTGTTAGTTAGTCAATAAATCTAAAAAGAGTTTCTTTAGGTTTTTTAACGGAGTTACAAACAATAGAAGACTTTAACTAACAGTCACTTGTACATTCATTGGACGAATTACAGAAAGTAACCATTAAAATGATGGTGATTTTTTTTTGTATTTTTATATAAAACCACAATTTTTCAACATTGATGTCTTTTCTATCCGTATACTTGCAAGGAAAACTTTTTGTTAGACAAAATTCAAAATGACGGTTCAATACGAATAAAATTTCTTTATTGTCATTGAGGTACCTTTTTTATTATACACAGTTTAATTGATCCGAATTATTTAAAAACAGTATTTGCTTATTAAACTTTGTCTAAATCCGACAACGTAAACGACTTCACTTACGAGTGGAAACTGGAAGATGTCAGAATCAAGACACTTCAGACATATTTTAAACGAAACCATGATAAACATGTGTATACAACCCTTAACCTGAACTTAAAATATACATCTGAGTAGATTTTGATAACATTACAATTTATTTTTTCTGCTTTGCTTGACTATTGACTACAAACTGACCAAAATGCTAAAAAGCCTTTATCACCTTAGCCTTTATTTGCTTGAGAAGATGAATGATATATATTCTGTTAAAGTTGTGATTAACTGACACCTGTAAACTATAAAAAATATTAAAAATATTATATTAAAAAATATAATGATTTATTTTGTGTTTATCCAGAGAAGATACAAAAGTTAGCAACTACATCATTAACAAAGTTCAACAACAGGATCACTTCGTTTACCGCATAGGGGATCAATCTTTTGATAATCTACCGAAACTATTAACATTTTACACACTTCATTACTTGGATACAACCCCTCTAAGAAGACCTGCTCTCAAAAAAGAGGAAAAAGTTATAGGAAAGTTCGATTTTCATGGCAGCGTGAGCATTTACCAACTGTAATATTTGTCTAAGTATTCAAATAAATTTTATTTTTTTGAAGGACCAAGATGATCTGCCGTTTCAAAGAGGTGAAATTCTTACTGTAATTCGAAAAGACGAAGATCAATGGTGGACTGCCCGAAATTCGTCTGGGAAAATTGGGCAAATACCGGTTCCTTATATATGTCGGGTACGTAGAAGAATATTTTACAGTTTTTTAAGTGCTCTAATAGCTTAATAGTTTAATAAGTCGACTTATATACCTGAAATAAAAATATCACTTGTAGACTTTTCATCGCGATAGCTTTAAGTTGACAGTGATCCTGGGCTAGTGATCCTGAGCATGAATATGTATAAGGGAGTGTAGGGTATAGTGACGAATGATTTGTTTTTTTAATTGTAACGTTCCCAAAAAAAAGTTTTTGTATATTCTTGCAGAGGGTATTATTATTTCAGTCGGAATTTGCAACGCATTGAAGGAGACGTTTTCGACCCCATAAAGTATACATATTCTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTATTCATGTCCGTCTTACCGTATGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTTTCAATTGTAAGCTATCGGTTTGAAACTTTCATAAAAATCTTCGTTCTTTTGCATTTGATATATAAATCGGAAAGAGCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGAAACTATCGAGAAAAAATATTTAAAAATTACACCTTTAGTGTTTATCAACATATAACCTCCTACGCTTGGAAAGAACATTTTTAATGAGTTCTGAATTAGCTGCCCTCGCTTTTAACCTAGTTGTGTTCTCACATAAAATAAGTGTCAAATGACACCTCAACTGTCCAACAAAAGTTCTGATATCAACTTTTGTTTAGAAAATGTAATATACATTCTACTAAATAAATACACTTTCTACATTTTTACCCGTTACTCGTAAAGTAAAAGCGTATAATTAAATCGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGGAGTAAGCGTTTCCGATCCAATAAAGTACATATATTTAGCGGCAACAGCTTTTATGATAGAAACAAAATTTTAACTAAAATTTGTGTGTCTCATCACCGGCTAATCTAAAAAAATGTGGCACGCCCACAATGGCAAACGCTTAAATTTGTCTGCCGCCCACAACATCTACTGAAAAGTTAGTCGCCACAAAAATGTCGTTCGCTGCTTTTATATCTCTATTTCCCTCTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATGGTCACAAGTGTTGATATCAGAACTTTGGTTTGCTGTAGGTGCGATCGTCACTAGATTTTTAACTCGTTAAAAGGTATATTTGTTTGAACTGTACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACACAAATTATGTGGTTTAGTTTCTAGTTCACAAAAATAAGCAAAATATTTTTTTTTAGATATCGACTGTAGAAAAGGAAGAAAACCCGATATCAACAAATTTAGCAA\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTAATATGAGAAAAGTGCAAGAAAAGTATAACAAGAAAGGAAGTAAACTTCGGCAAGCCGAAGTTTTTATACCCTTGCAGATATCTGCAAGGATTATTGCTAGCTTCAGTGGTATATGATATAGTCTTAATCAAATTTATTTCGAAATTCAAAACTAATTAAACAATTTTATTTCCAAGCGTAGGAGGTTCAAGGTTAAAAAACCTCAAATATATTTATTTTTTGTTCCGCACCCCGCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCTGGAAGCCCAGGAATCTGCATGCCAAGTTTGAATGTTCTATCTCTTATAGTTTCCGAGATCTCAGCGTTCATACGGACAGACAGACGGACATGACTAGATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCATGAATATATATGGGGTCTGAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTCCGACGAAAGTAGCATACTTATATAAGTTTTACTTATTGGTTTATTAACATATTTGGATACAATAACAATAGCCATTTGTAGCATACTTTGTATAATATGTATGTATCGTCCAATCGTGTGCAAATAAAATATTCCGGAACCAAAAAGTAAAAAAAACCGTAAAAAAGCATGTAAAAACTAAGTTTTTCTTTTTGTTTTATCAATTAATAGGTTAAGGAAGATGGTTAGCCTACCTATTTCGTCATTCTTTTTTATTTGCCATTTCAATATAAAAAATCCAAAATAATCATTATGAATGAAAAAATAATTAAAAAGAACAGCAATAAACATGTTTTTAATAGATTAGATTAGATAATAGAGTTCTTAAATTCACAAGAAGTCAAGGAAACGTATTCTTCTTCATGTCTTTATGAAACCAATATCAGAATAAGTAGCCTAGTTCATTTAGTCATATCCGTCGGTCCAAGCGAATGCTAACATCTCCGAAATTATAAAAATAACTAGTTTGGATATGGGTCATGCAGATTCTTACATTTCCTGTACAGCACAAGTTTGTTTCGTCGAAGTGCCACGCCCACTATTTCTTCTAATACGCGAACTCAATCTGTCTGGAGCCCAAACTTTTGAATATTGTGTCAACATTTAATTTTGTTTTGAATATCAACATGAGAATTATTCTTGGTGAATATCTTTATAAAGGTGTGCCAATGGTTTTAACTTGACCATTTATTTAAATTGATTACCTGAGTAAAGGTTATCTTAAATTCGAGGCACTCAACTAAAGCGATCTCCCTTACTTACCCTTAAACTATTAATTGTTATTCTGAAAACTTAAATTCGATAGCTAAATGCCTTATTCAAAGTTCTCGTAATGTTATTTTTAACAGAAAGATTCCGTAAATATTTATTTTAAGTGACGACCAGATTATCTCGTTAAAGTTCGAGACGTGTAAAACTTTCTGAAAGTTTAAGAGCTGAACCAGGGAAGGTCTTCTTTATAGAATCGAAAACACTTTCTTTCACCTATTGCACTATTAAGTCAAGAACATATATAGTTTATGGGGTTGGAAACGTTTCCTTTACTGCGTTGCAAGCTTCTGACAGAAATTATAATACCCTCTGCAAAAATAAAAAATTGCGGTTACAGTGTTGCACTATGATAAACACAGTGGGAAGTACGTAAAAACATGGTTACTAAATCGAATCGGTCCGAAAGGTTTCCCTTTTAAGGCCCATACTGCACACTGGTGCAAACATATTTTTAAACATCTTTACTTTGTTAAACAAAAACAGAAGTCCCATAATTGCCCATTTATTTGGAAATATGTTTAAAATATATTGATATATACATAATACATGAATATTTATTAAAGTTATTTATTTCATATGACTATAGGAATTACATTTAATTTTTGTATTTAATATAGCTTGTGTTACAAGGGGTCCTTTGGAACACGCTGTGATCTGAAAATAGTATTTAAATAGTTTATAAATGCATTAGTTAAACAAGAAAGGACGTTGGCTTTGGCAAGCCAAAGTTTGTATACCCTTGCAGCTATAAGAAATACTCTATATTAGTAACAGCATGTTAAATTTTTAAGGATTGTTCCTGGCTAGTGATGCTGATCAAGAATATATGTACTTTATGTGGTCGGAAACGTGTCGTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGAATGAAATCATTATACCCTCTGCAGGCGTTTATAAATTTGTACAAATGGTACAGACTCTTCCAAGGGAAGATGCCAAGAGCTAACGAATGATGAAAACGTTAAGAAGTAAAGAAAATTATTTCGCAATACGCATCACTATCACTGAGGATGTCGATATATCGCCAGGCTCGGACCATGATATTTCCTCTAATCGAAATTGCTAAATTTAGACCAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGCTGAAGTTTGTATACCCTTGCAGACATAAGAAATAATAAGCTTTAGTAAATAATTTTTTCATATTATTTCCCACTAATTTCCCGATTGCTCCTATGACAGCTATATGATATAGGCGACCGATTTTGATACAATTTAAGTAGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATTTTATTTCTATGCTTACAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTACTACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGACCTAACTATAAAATGACATTTCCAAGCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAAACACCGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTAATACTAACTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAATCACAGAAGATATAATTTTTTCATATTATTTTAATACTAATTTTCCGATCTTTCATATGGCAGCTATATGATATAGTCGTCCGATTTTGATAAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTTATTTTCAAGCTTAGAAGGTGATATGTTAAAAAACAGCGAAGGTATAATTTTTTCATATTATTTTAATTCTATTGATATAGTGGTCCGATTTTGATTAAATTTAATTCGAAATTCAGAACTAATTAAAAAATGTCATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGCTACAAAACACCGAATATATAATTTTTAAAAATTTTTCCCCTATAGTTCCAATGGGAGCTATAAAATATAGTTGTCTGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATACAAAGAAAACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCCGATAGCTTCAGAACTGAGGGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACGGCCAGGCGGACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGAATCGTCTAGTGACGTTGATTAAGAATGTATATATTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCAAACTTCTGACTGAAATTATTATACCCTCTGCAAGGGTATAATGAACATCACATAAGCACCGCACAAGAACTATTCAATGACGTCAACGACGATCCAGATTTACTCAAAAAAGTCGTAGCTGGTCCCGAATTCTGGGTTTTTGCTTATAATTTCGGTACCAAAGCCCAATCCTTCTAACGGAAGAGCACAGATGAGCCAAGACCGAAAAAGCTAACCTTTACGCCTCTAACAACCGAACAAAGAATGATATAAACTTGAAACAAGGTACAGGTGTTTTGGAAAAAGTGTACCTATATACCAAACCAAAAAAATTGATAATCGAAAATACGTGGCCCTCGAAGTTTGAAAAGTCACCTTTTTTTTTGAACACACCTCTTAGGTATTCACTAGTCGGCATAATTATATTGACAAAACAAAAGTTAAATATACTCATAAATAAAACTTACTTCTTTTAACTTTTGGCATCAATGTAAATGTAATTTAAATGCTTGAACGCTTGCACTATACAATACG'..b'TGGCTGCTTAGCACCATCTAAAATTTCTAGGATCAAACAAAATTTTGGGACAAACTGACAAACAATAAATTTGTACTAGGTTGGTCGGAAAGTATGTAACAGGTAGACCCCATAAAGTATGTATATTCTTGATCAGGATCACTAGCCGAGTCCATCTAGCCATGTCCTTCTGTCCGTATGAATGCTGAGATCTCGGCTACTATAAAGGCTAGAACAGTCAATCTTGGCATGCAAATTCAAATAGCTGGTAGATGCCGCCCTAAAATATCGCTTTGCTGCTTGTATATCTCCATTTACCTTTTGCTCCCTTAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGACGCACTAGCGTTCTTCCTTGTTTTTTCACTTTGAGAATTCCCCCAAAATCTTGTTTTGCGTATTACTTTTGAACGGAGCATTCGATTTTGACAGTTGAGGTGTCATTCATCTCTAACTTCTCAATACCAATTTTAATAACCTAGTACCATTAGGTTAATGTTAGCTTTAAATTGCTAAAAATCGGATTTTATCATATGACCCCTCATTCGACGCGTATTGTCAATAAGAATACAAATAGACGATCACGAGGGACATTTATCGTCACTGGCCCCAACAGATCTAATTTTCTAAATTTTCACTTTTTACATTTTCACCGCTCTTTTTCCCAAATCAATTAAAATTGTAATCAATTTAAATTGTAATCAATTAAAACACTCAGTAATATCGGAGTATCACAGCAGAATTTCATTTCTTCCTGTATATATAGTAGTTGCCATCGTCCCTGGTGCGCTTCGTCACTACGTGTACTGCCGTCCACAGTGATTTTATCATGAAAACTATAAGCGCAACAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTGAAATGTTCTAGTAAATGCTTAGATAGCTATGGATTCTAATTCTGAAAGCCGAATTCTCTGTCTTAAAAAGTTTGCGAGTTATAAGCGGTCAAATTAGTATTCACTTTTTTAGCTCTGCGAATTACTTTAAATTGGATCTCGGAAACGTATGTACGTATGTCCTAAATATAATACTCCGTGATGGTTGTAAAACTGTTAGTCCATATATAGTCAAATAAAGGCAATAAAAATGTCAGACATTATTTAGTATAATAAAATTTCTTCTTTTACACAAACCCGAACACGAATATTTATAATTCGAAAATAAATTGTCTTACAGTGCGATTTCCTTTATTTTTGACACGACATCTCAAAATTGCAATTTCGTCAACAACAGCAGACACGTTTCTTGGGCTTATATCATCAAAATAAGGTTTATCAGAACTGGTCAAATCTGAAAACAATTTAAAAATGAAAAATTAATTTAAAAAAGCCTTTTTGGGGACTACAATTATATCTTACCGTTGAAATTTAAAAATGAAGATGCATTAATTTGCTGAAGGCATATGTTAAAATTTAAGATCAAAATAATGAATGGTTTTATTTTGATTGAGGAATTATCCGAGTAAGTGGCATTGTTGCCACGCGGCATGTTGTATTAATTCATTTACAACGATAAGTTTTAAAATTGTATTATTTTAATACACCTTTTCTCCCACGAAAAATGTCACATAGTCGCGAAAGATTTATACATAAGTTAACACGAAATTAATATCGGAAAACTTTTTTTAACACTCTATATATAGGCTTCCAATGAATGCTAAGTTCAGCTTATAAATAAAGTTAGGTTTTTAAGGTTTAAGGCTTTTTCGAAAAGTACTTCTTATATATGTACTGAAAAGAATATTTGATTGCTTGTATTTTTATAAAAAGCTTTCAACTCCTCTACTTCTGTAGTTGGTATCGATAATATTTTTTCAGCATTAAGCTTTTTTCATCCCCTAAGCAGTGCTTTGAAAAGTTTTGTTAGTTGACTTTTCACCGAACTTTTAGATGTCCTGCATCCCTGAAAATATTTGCGCATGTCTACTGTTATAGCCACCCTTAACCCGTAAGTCACCTAGTTTATCACCGGTGACTTATCATATGTCTCTCGTGAGGCACGCGTGACACTTCATATAGACATTTGCTATTTGTTCAAAGTCGTGTATGCCGGATACTAATTTGTCGTCAGGGTCGTTCAGGCAGTGTTTTAATAATACTGCAATGTGTATACATACGTTTTTAATATACTTTAGTTATATATTACATTTGTTTCACAGCGCTGCTGTTGATAAAATATTTATATAATTTAAATGGTTGTTGTCAATTTAAAATTATAAACGCATTTTTACACACAATAAAATGATCGACCAAAAGAATGATCGATGACAAGCCTTTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATAATTTCAGTAAGAAGTTTGCAACGCAGTGAAGGAGACGTTTCCGAACCCATAAAGTATATATATTCTTGATCATCGTCACAAGACGAGTCGATCTAGACATGTCCATCTGTCCGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCAGTTTACTCAGTTTTAAAGCTATCCAAAAGACTTCTTTTTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGTCGGATCGGACATCTAAATCTTATAGCTCCCATAGGAACTACCGGGAAAAAAAATAAAAAACAAAAAGGAAAGCTAAGGAAAACTTCGGCAGTCCGAAGTTTGCATACCCATGCAGTTATAAGAAATAATCACCGTTAGTAACACCATTTGAAATTTTTAAGGATTGTTGCTGGCTTCAGTGATATTAAAAAAAAATATATTTTATTATTTCTCTCACCGTTTCTTTGGCAGCCATATGTTAGCGTTAGAGTACCTCAAAATTTTTAAAAATTTTAAGATTATATTCCCCATAAAGTAGAATATGTAGAATATATAGAATGTCAAAAATCACAGAAGCTATAATTTGTTTCATATTATTTTCCCAGCCATTTCCGGATGTTTCCTATGACAGCTAGATGATTCAACATTTACAACTAATTAAAAACTGTTATTTCCAAGAGTAAGAGGTTTTATGTTAAAAACACCAAAGATATTATTTTTATACCCTTGCAGAGGGTATAATGATTTCAATCGGAAGATTATAACGCAGTAAAGAAAACGTTTCCGACCCCATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCACTAGACGAGTCGATCTAGCCATGCCCGTCTGTAAGTCCGTCGCCCGGATCGGACAACTATATCTTATAGCTCCCATAGGAACTATATGGGAAAAAATTAAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTTAGCATATAACCTAAGCTTGGAAATAACATTTTTTGATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATATGAAAGATCGGAAAAATAGTATTAAAATAATATGAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTAAACATATCACCTTCTAAACTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAAATTTGAATTAAATTTTATCAAAATCGGACGACTGTATCATTTAACTGTCATAGGAACGATCGGAAAATTGGTGAGAAAATAATATATAACAAATTATAGCTTTGGTGCTTTTTGACAAATAACCTTATTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTATATATAAATAAGATCGGATAAGATAAGATATAGCTGTCATAGGAACGATCGAGAAAAAAGTTGATTATTTCTTGTAACAGCAAGGGTATGAAAACTTCGGCTTGCCGAAGTTAGCTTCCTTTCTTGTTTTAAATTTTTTCCCGATAGTTCTTATTGAAGCTATAAGATATAGTTATCCGATCCGGCTGGTTCCGACTTATATACTACCTGCAATAGAAAGAAGACTTTTGGGAAAGTTTCAGCCTGATAGCTTTAAAGCTGAGAGACTAATTTGCGTAGAAAAGGACGGACAGACGGACTTTATGGTGTCGAAAACGTCTCTTTCACTGCGAGTGCCTCGACT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-ATCAGATATATAAGCGGCAAAAAAATATTGTAAAGCGTCACCTACCGGCTATTTCGGTATATGTTTCGGGGCATAAGAGTGAGCTTAGCAAAACATTTTTTAGGTCAATCAAAAAAAAAAAAAAATTTTAACAAAAAAATTTTTTTTTGGCATGTCAACTGTGGCCACCGCAGTATTGGGCGGATGGTGGGAGTAGCACTTTTTTTGGGTAGTTCCAAAGCCATTGTGAAGGCTATTGCGCAAGGATCAGCCGTTTTCTTGCAAAACGCCACAAGATAAAATCTAAATCGTAATCTAAATTCCAGTTGTCACCAGTTATCGTCTAGACGCAGAGCCTGAATTTAGCTAGAGCATAGGGAGGATCAGCTGAAACCAATCGCTTAATATGGCCGAGCGACTTCCAAGCGGGAGAAGAACTATTACAGCTATGAACTTGAGGCTCTAGCCGTCGTGAAATCGTTGGAGCGATTTAAATGCTTCATTTATGGCAAAAAGGTACAAGTTATCACCGACTAAAAACGTCGATGCAGAGGAGAGAACTTATACCCGGGATTGCAAGATGGTGGTTACGTATCCAGGAGTTCGACTTATACTCGTACATCGTTCATCGAGCAGGAACACAGATGAACCACTTAGACGCACTCAGTCGAGCTCCATTCGAAAATGCTCGACGCATAATCGACGAAATGGATTCAAATGGAACAGATTCAGAGATTTGCCGCAGGCATAAAATTGCTAAATTATTCTGACACTGACGAGTATGTAATCGAGAAAGATCGCTTGCTTCAAAAACATAACAACAATTTGTTATGGGTTGTCCGGAAGCACAGGAGGTAATATCCCCACCGGCTCCAACAGATCCAGTTTTCCAAATTAAACCTTTTACACTTTCACCACTTTTTCTCCCACACCAAATGATTTTTTTTAAAGTCTTTGCAATACCTTTCGATTAATGTATCACTCGAAACAATCGGACGATTACTGTAGATTTTCATTACTTCGTGTAAATATATAGTTGTCTCTTTCAGACACCCTCCTGGTGCGCTTCGTCACTACGTGGACTGCGGTCCACGGTGATAAGAAATCAAAACGTTTTTGTAAGTACAAATTAAGAAATAAATAATAATAAATTAAAATAAATCAACACAATTTTGTTTTAGTTTCAAGCAAAATTTTTCTTGTGACTCATTTAAATTAGCTTTGTTTTTTTCAATTGTTAATTTATTTGTATTCATATTTTAGGATACCTCCGATAAATTAAATTTCATTTATCCACTGTTTGCTGGCAAAAATGTGCCAACTACGATTTTGGTAGTCGTCTACATAGGCCCCTGTGCTGAAAAAATCGAGAAAAAATTACCCTCGATGGACCGAGATTTTTTAGGAATATACGTGCAGAAGATTATCGGCTGAAATGAATGGTTCTTTTGCAATAGAACTTAAAGTTTCGTGTTTTGCTATAAAACCAAGTAGCATTTTTTAGAATTATAAGGTTTGTGCTATAAAAAACAAGTAGGATGTTGCGGTGTTTTGCTTTCCATTCGTTGTTAAAAAAAAGAAGCATTTAAAGCAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCATCTTCAAACGCTTTAATCGAGTGCCTCGACTATTAGATACCCTTTACTCAGCTTAAGGGAGAAAAATAAAAATGGATATATATAAGCAGCAAAGAAATATTCTTAAGCGCAACCTACCGGCTATTTTGGTATATGTTATGTGGGCGACAGACCGTTTAAAGCGTTTTAGCCGTTTGGGGGCATTAGAGTGGGCGTGGAAAATACTTTTTTAGGTCAATCGAAAGGTTTTATTGAGACAAATACATTTTAGCAAAAAAAATTTCTAGCATGACAACTGTGGCCACCTCAGTTTTCGGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGTCGTTGCAAATATCGATAGGTATTGATGAGACAAATACATTTCATTTTGTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGTATTGTGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCACCCCTGAAACAAACTTGCGCTGCGCAGGAAGTCTAACGCTTCTAGCTTTTACAGTTTTCGAGAGCTCAGCGTTTATACAGACAGACAGACGGACATGGTTAGATCGACTCGGCTAGTGATCAAGAATATATATACTTTATGGTGTCGAAAACGCTTCCTTCTACCTTTTACATACTTTTCGACGAATCTAGTATACTTTCTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATGTAGAAATGTAACATTTTTGTCGTAAAAGTTGATATCAGAACTTTTTTTTGGTGCGACAATCACTATATTTTTACATCATTACGAGGTGTTTTTGATTACTAAATAAACCAGTAATTTCTATAAAATAAATATATTAAAATAAGTTAAATAAGAATAATAATAAAAATGTATCCAAAATTCGGAAATTCTAACGAATACCTGTACTGAAATCAAAATTCCCTCTCCAAAGTGTATAAAAAAATAAGTCAAAAAAAAAATTTTTGTAAAACACAAGTCAGGTACGCTAGAAAATATATTGTAAAACTATCTGTTAAACAAGAATATTTTTGTGTATGTCCGCAAAAATCTTGTTTATAAATATAAAACATGTTCCATGCTCTTAAGTGTGTTTTTCAGAAACAAAAATTTTATATGTATGTGGCTATATTCGTACATATGCTTGTCGGTTGTATACCAAAAATAATGTCTTGTGAACTTCGGAATCTCTTCATGTGTTTTCAGAAAATAATTTTCCTTCTTTTCATATGTACATGCTCTCTCGCCAGGCATTTGATGTTATTTTGAGTGCTCTTATGTTTAACACTGTTAAAAGTTGTAATATAAAATCACTGAACCATTAAAAATGTTATAATAATTACACTTTATAATTTTTCGGGACCTAAAAAATTACATATAATATACACGTACATATCAATTTTGTTGTATATCGCAATCGCACATAAAAAACATGCATTTATAAATAAACGAGTGTGCTTACATAGCTTCTTTACTGGTGTCGGAATAAAATCATTTTTAAATCTCCGTTCAAAAATTTGAAAATATTTTTAGTGTTTAGTCATCTAAAAATTAGTGAAATTAATTTATTGTTCTCTTATGTGTTAAGCATATATGATTATATAAAATTGTTCAAACACAATAGATTATACTACTTCACGCCTTTACAAAGAATATACTGCAGAAAGGAAGTATTTATTGTCACTAAATTATATAATTCACAACGGACTTTATGTGTCAACATAATATGGACTTTCCAAAAAAAAACGAAGAACCCGCCAAGTACATGACGACCTTGAGAAAACCTGTGGCTGCCATAAAAAAGAGGTCAGGACCGTTGAATAAGGCCCTTGAAGAGGTGAATGATAATTTATTTGGATCGCCACCTTCAGATGTTCTTAGCATACGTCAGCAAAATAATTTTGCAAGCAAGCACTCAGGAGGAGTTGCATCTGGCAATAGGCTACGCCGTCGTAGCACAAAAGACAGAGAAAAAAAACGAGAGCGCTGGCTTTTAACACGAAAAACTTGGAGATATATGACAGATGCCGGTCGTAAGCTTATCCCCGATAGCTACCCGGCAGGGTCAGATAACTTTGACTTACTTGAAGAACATTTTCAACGAGTGTGCTTATCTGAACCAAGTTTTATTTTATGGAATCGACGAACCTCTTACCCGGGAGCAATCAACAGCTCTAGGCGAAGATTAAAGCAATTGTCTAGGCACGCATGTTCCAGCCATAAGGAAAATAGCATTGAGACAAAAAATAGTTATTATAACGCAGATCGAACTATCGAACTATTGCAGACGTTTTTAAAACTTCGCGATGCATACAAAACAACAACGCTACTTGGTACAAAAACAGTTAGACCTGACCAAACATCATCGCCTAGTGCACAGAGACCTATTTTTGGCAAAAAGAGTGAAAAAGATCAGACAATGTCCTCGGAC'..b'GGTAAAGCTAAACAATTAAAAACAACATTTCGCGGGCACGTCCGATTCCATACCCAGTCAAAACAAAACCGCCATCGGGCGGTGAGCCTAAATACTTATCGGACTACCCTCGTATCACAATACTATTTACAGTAGATTTTCATTTCTTTGTGTATATATACACTAGCAGGCTTTATGGTGCAAACTGCACGAAAAGTCTTTTGTAACTAAAATCGATCCTGAGCGTACTTATACTTCGTGATACTCGATCTTTGTAGTCCCAGACTTTTCAACAAATTAATTAATAAGGTTTTTCCAGAAATGGCTTTTGACTTTTTTATAGCTCCAAACAACATTGATCAAAACCATCAACAGGTAAATTCTTTTTTTGAAACGATCCGTACTTATAAGCTTCTCAAAGTACGTCTCCGAACAGTACAGAAGCAAGTCATTTTTTTCTTACACTAAATATCATATCTAAAATTAAGTACATTTAAAATAGTTTTTTTATTTTGTCGAATATAAAATCATTTTCGTCACAAACGTCCACTATCGAATTAGAAATAATTAGGTGTACACAAGTACTTTGTCTTGCCTGGTTATCGTCTTATCCTTTTCTTTGCCTTTTCTGAACACAATGATTCCTTGGCGAATATATTGTGCGTGTTCTATTTACCATTATGTCATCGCTGTCTAAGATTTTGTGGAACTTCATATCATCATCTGGTATAACAGTGATACTTGACTGAATTGTCAATCATATTCCGAATGATGAAACCTACGTCAGGTTTAGCGATTTCTCTCAAAACTATCTGAGGACCAATTTGACTCCCAACTCCTACGTAGCCTTAAGAGCACACGCCTACGAATCAAACACAATTCAGCAACAAGTCCTTTTAATTCTCAATTTATGCAAATCACCGCTTTTAATTTCAAGCTCGAAGAAAAACACTCTCACGATGGGCTTAAAAGGCTTTATCATTCTGAATGACATTGGTTGCTCTATCTGTTTTGACCTATACTTGTGCCTTACACTGTGCTACTGGTTATTTTGGATGATCACATTTGAAACCTTACCAGTCTCTCTTTTTGCAAAGAAATTGGTTGTGCTATTTCCATAAATGTATGCAGGAATTCCTGCACGGATCTACTCTTTTGCTTCTGTGGATAAACTTCTTTTGAGAATAACTTTATTCCTAACTGCTCGAACAAACCAATTTCCAATTACCTCAGTCTTTGATATTCCTTGTCAACGCACAAAAATACATGTAAGATTTGTTAATAGTTTAAGAATTACCACAGCAGAAAGCGTGAGGAACATATGGAAGAATGTCAAGAAAGTGGGGAAAAATGGCAGCAAAAAAAGGAAAATAAGAAGATTTCGCCAATGATTAAAACCCAATCGATTGCTGGAAATACAAGAACTCTTCAGGAACTTATTCATCAGCTTTCTTTAAAAATAGATGAACAAAGTAATAACAGTTGAACTATTACGGCTGAAGGTTTTGCAAAAATCATCCATGAGTTCCAGTAAAACATTTGTTTGACAATTTCGAGAAGAACGCTCAAGCCTATGATCTGAACATCAAGCAATGTATATACAGGTTCTTGCCAAGATGACAAAAAAAGCAATGTTGTTCTTGGATGTAACCTATGTACGCCAATACTGGGAGCTCTGCAATTTGCTAGAGGCTGAATTCACTATTCACACAATTCGTCAATATATGTTCAGCGCCTACGTTCGGGATCAAAAAAATATAAGCAGGAAACATATTTTGAGTATATTCTGCAGATGAAATTGAATTATAAATGTACGGTCTGTAGTTCGCTACATCATGGATGGCTTAATGTTCAGAAGTGACTTTAAAAACACGCTCTACAGTTGGAATTCCTTCAGAGCTGCAGGAGCCGTATGATGTTTTCGAATGCGTCGGCGCGAAGAGCCCGAATCTGTTTCAACCAAGAGAAGGTATTTGGACGTCAACTCAGAAAGTCTAACACCAAATAAACGAAAGAAAGAGTCACTGATATAATTGTGGATGCTTCAATAATTTGCGAAAGGATTGTAGACATGAAAATCATAGAGGTGGATTGCCTGGTGGATACCGGAGCTGCTGTCTCCATATTGAGCAACAGGGTCTTTGATCAAATTCCGAACGTCACCCTTGAGGGATGTTCGTCAAAGCTGCGCAGATTGGTAAAAAGGTTGGTTGCTTTTTGTGTGACGTTGCATTGGATGAGTAAATAACTCAGCACAAGTTCTTACGAGTAGTTGTTCAGGTTGAGGACATCGAGTATGACGTTCTGCTTGGATTTTACTTCGTTTCGAAGCCAAAGGGTGTAGATTCCCAGCCAGAAAACAAATGAGTATTTATAACAATAATAATACAATTTACGAAATCGATGTTACTCTCCAGTCCTCATAGAAAGTGTTGACGCTTATTAAAACCTATACGACCTCTACATAGAAAGATTCACATATAGAAACAACGAAGAATCTTAAGTCGGTGGGAGTGATGCATTTGACTAGTCAGACTCAGATTGCTGAAGGCAGAAGAAAATGAAATTTGGGAATTCGTTTCCAGAAAAACGGCCACGATCGACCTGCTGGTAACCTACTCTAGTAGCTAGCAAAGTGCAACAGTCGGCCGTTGACTTCCAAGATAACTGATAACGAGGAATAGTAATCCAAGGTGTCTTGCTGACGGAAGCCGCAAAACTCCGAGGAAAGGCTACTTTCCCAGGGGCAGTCGTCCACGGAGTCCTATGCCACCAGGATCCGACAGCCGACAGCTGTGTACATCAAATCAATCTAAGCTAAAGTGAACCAAACGGCAATAGACTCATATATTGCAACCGGAAAAGAAATGAAGATTAAAAACATTAGAGGCATTCAAATGCATTGAAACACATTAAAATAAAGTGAATCGATAGACGAAGTACGGATCCTGATGCAAAATTATACAAAAAAAAAATTTCTCCACCATTAAAAAGGGGAAGCCGGTTCCTTTCTTAAACCATACTTCTATAAATATTCGTACAGTCTCATACAGTTTTATAGGCTCCTATTAAGTTTTCAGCGGTGAATATCAACCTTGTAGTCATGTGCTCAATTGTGGTAAATTCGTTTCTTTCCGATAGTAACAAAATTTTCAATTAAATTAATTTCATGTGCCGACATACATATTACGCATAAATTTATAATGTGTAAAAGAAATCAAAACCATTGTATGCTAGAACTTTAACAAGGGGGGTGTGCTGATGCGAGAAGAGAAGCAGGACAAGAACAATGACCAAACTTTCGACGGACAACCTTGGCAATAGGCACGATCCATTGTCACACGAATGTGTGAAGGGGAGGGAATATGGCCGAACCATTGCGATCAAGCGACAGCTAAGCTTGTGGGCAGTGTGGACTAATTTTATTTTTCAGGCACTATAAATATTTATTCTCAATATGTTGGGGAGGAGAGAGAAATCAATATCCCAATGAAGCTTAAGATCGTCCGGATGGTGAGATTCTTCCGTTTCGTCCGTCGCCAAGCCGTTTTGCAATATCCGAGGAGAAGGATGTGTAAGAACAGATCGACGAGTTGTTAGCTACGGGAATCATACACCCATCTACATCAAACTTTACCAGCCGAATAGTTTTGGAAAACAAAAAGGATGGCACACGTCGTTATACGTTGATTTCCGGAAATTAAATTCAATGGTAGATGAACAAAGATATTCTCGCTTTATACATGAATGTTATTCCGCTGATACCGTGGAAAGTTGTTTACAGAAAATGGCTCTAGTCTTGAATACAGCTCGAGCCTTTGGACTGCAGAATAAATGTAATTTTCTGCAAACTCAAATTTTGTTTTTGGTTCGCAACATTGAGAAAGGAAATCTTTGGCCAGGCGAAGACAAAACGGCAGCGGTCAGCAAGTTTTCGAATACCTAAAAACGTCGAGGCAGTTTAAACATTTCCGGCATGGACGGCATTTTT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/fc4/ec3/58/scaffold_16-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -CAGAAAATTTGTTTTCGTTTCGCCATCAAGAAATTCAGACACGATTTGCGGTTAGTCACAGATTGCATTTAAACTCAGTGAGTATGAGCCTCGACTTTGAGAGTGATTGAAGTCAACGTGTTTTGCCTTAGTCGTTGCCCCGACCGGGTATTGCTGGTATCTTTTGCGCTTAAAGTGGGCATCAAAAATGCTGAAGGAAGATACGAAATGTTAAAGGAAATTGTGGAACCTTTATCCGATCGACCATATGAAGAGTTTTAAGGATGTTAATGAAAATTTCTTTTTGGTAGTACCGAAAGCTATGCAGAAGGAAGTTACCACCATACTGTTCATTTTGCTCTCAAAACAACTGTGCACGCTGTACAACAACTTTATTGGATTCCTCATTTCGAGCAAAAATTACACCATATTGTTAAAAACTGTGTTAAGTGCATGCTGTTTAATAGGAAACTTGGCAAAAAGGAAGGACTCCTTAACTGATCATTTGGGTCCAATGGATGCCACCGGAAAACAGTATAAGTACATATTTGCGATGGTAGATGCTTTTACAAAATGTATCTGGCTTTTTCCTACGAAAACCACCATCTGTGAGCAAATCTATATATGCTTATATCTAACAGCAGTAATACCATCAGAAGCAGGAAAATACCAAAAAGAAAGCGTCAGGAAGATATGGAGGAATGTCAAGATAAAGGCGCAAAAATGACAGCAAAAAAAACGGCAGTTGGGAAGATAGAAAAAAAGGGAGTGCAAGTGAAGTAAAAGAAAAAGCACTGACTTGTGTCTTTTTATTTAAGTTTAATCTAATATTTGAATAAAACCGAGTCGAGTAAAACACCTCGCCTCACAAGTATATATTTAATTTAAATGTATAGCTAAAATTGCATTCCGTTATTTTACATTTTTAACTTTTCTTGAAAAAAACTAAATAATTCTGAAAGCTGCATAGAGTTTTAGTATGTACTTAAGAATTCTCCTTGACATTCAACTTTTAAAACTAAAAAAAATGTGGTTCGCCAAGAGTTGTAGGATCAATTTACGCTGAAATTTAACAATTAAACTCTTACAGAAATAAGCCCTTAAATCTTTTAAAAATATTGATTCTTGCAAAGTAACATCGAATCTTAAGTCACTCTATACTGCCCTCTATGTATATACAGTGAATAACTTCATCTTAAACTATTCATGATTATTCAGTTCTAATTGTTAGGAGAGCATTTTTATTTTCCAACTAACGAAAACATAATTTTCAAACGCTGGCTCACCATTTCTTGAAAGTTGATTAGGAAATTTTTTAGACACGATTTTGGATTATATAGGTAAACTTCTATGCAAGCAGGCATCAGGAAAAGATCAATGAAATACCTTTCTAACGACTTATACAATCCTGTAGCTTTAGTAGTTCACAGGTTACGGGTGTACAAAGTTTATTTATACCTGTTTATTTTGCCAAACTTACAAACTATAAGTTTTATTTCGAGAAATCACCCAAAATCTTGTTTTGCGTTTTACTTTTGAACGATGTTGAAAGTTGAGGTGTCATTTGACGCGTACGTTGATTGAAAATACAACTAGTTGAATAAAACGCAGTTTATATATCCACTGGCCAAAACAGATTACATTTTATAAATTTTCACTTTTACACTTTCACAGCTCTTCTTAAACTAATTGATCTTCCTAAACTCTTGGTATGCAATCCTTTTAGTTTTTGCAATACCTTTATAACAATACCTTTATAACAATACCTTTCTAACAATTGGACGATTACTGTAAATTTTTTATAATAACTTTTTGTATTTTAAAGAATTTTACATTGAATTTAATACAAATCGTATGACTCCGACTTATAGCTGTCATAGATACAGTCAGTAAAAAAATAAAACAACTATTTTTAAAAATATTTAAAAAATTGTCCTTTGTTGATTTTGCTCATATTTGCATTGTAAAACTCTGAGATATAGAACATTTTAACGTTTCAGAAATGTATAGCAACAATCCCAAACAATTTATAAAAGTGTTACTAACATTGATTATTCCTTATGACTGCAAGGGTATACAAACTTCCGATTGCCGAATTAAACTTCCTTTATTGTTTTATTTAAAGTCTGAAATCGTTTAAATGCAACTTTGTATTGGAACTGATAAGGAAATTTGAGATATTATTCTTAAATACTTAAAGCGTACTCTGCATCGGAGCGTATTTGAACCTGGAACCCTATCGCACAACATTTCCCGCGCACAATCCAGCTTTTATTAGTATCGAAGTAACTATGGCTTTTTGATTTTTCATTCAATCTAGTATACTCTTAGGGTAAAATTGATCCCAAAAACTTGATCCTATGTGTGGTGTCATTTTCACGAACATTAACTTAATTGACACTTAAAGATTTTTGTTGGGTTTACTAGTGGTATTGGTATAATTTTACATTTGTTTTAATTTGTATGTTTTTGTCAGGACCATGATCAATCACTATGAAGAAATTTTTAAGATATCAGCAGAATTGCTTGATGTTATCTATACCCGAGTGATGGAAGCTTGCCCCGAACAGTTATACGAGTTGATATCAATGAAATTAAATGGATACGAATGGTAAGATCTGTTTGGTATATAATGTTAATAGCAGTGTACATAACCTTGTATCAAGTTGCTTTCCTTTGGATTGGTTGGCTTTCATCTATTAAATCCATTTTTTGAAATTGGGTTTCTATTATTTACTCCTATATACATGCCAACAATGATTAAAATTGAACAATTCACTTAAAATAAGATCAATATTTTGCAAAGTCAATCGAAATTGTACACCGCTAAGCCGCTAGGAACGCAAGAATGGCGGTGGCGCTATAGCTGTTTTGGTAAAAAAAAAATAATTAGCTGGAAGCATAAGTTCAACTTCCCTCCCGCACTGCATGTTGTGAGTAACGGATATCTTTTAGTCGATGCCATCGACTATAAAGTTCTCCCTTGTATGGATTACTTTTATATCATTTCAAGGTTTTAAAAACCATTTTTAACATATTATCGTTTTTTTTAGGAACCTAAATCAATTAGACGATCCGCAGCCAAGCAGTTTAGGAGATGTCATGTTTGAGCCTGCAGTTCAAGAAAAACGGTTTGTATAATTTATTTAACTTTTAAGATTACATCTTCTAAACAATATAACCATAGCCTGGATCATATTAATCATTTAAATGGAAATCAAGAAAAAAAGAATGTTCTAAAAAAATCTTCTAAAAGTAGTTTAATTAATACAAAGAGATGTCAAGAAGAAAACTTTGAAATTTTCACCGCTAGTCTGAAAATACCTGTGCCGGAAAAAGCGCACATACATAGTAAAGAGTCTATAGAATGTAGAGGTCAGTATTCTATAAACTATTTTTTAGTAGCTCATTAAGAACTGTCTTTATACATTTCAAACTTAGATGATAAAACGGCACGCCGAAGAATTTGTCAGCCTCGAATACCAACAGACATTACTACAATGAGTTCAGATGTCGTCGAACTGGAAAAAAAAACGAAAGCAGCTACATCAGATGATATCTATCAATCAGAATTGCGGGAAAAGGCCATTTATAAGCAGCAGCACTTAAAATCTAGCACAAGGCCAGTAAATCAAGGGCTCTAAAAAATCATTATTTAAGACCACTGCAGTCAGCATGGAATTCCACGGACAAAAATTTCACCTTTAAATGCAAGGATAAGGGTCTGGCTATTCACTACGTAATCAAGTTTTCGGTGATGATAGGGTTGCATTCAATACTTAAAACAGGAATTGAAGCGAAATACATTTTTGAATAAATTCTGTAAATAAAAAATATATTTATAAAATGATTATGTAATCATTGTGCTATGATAAATGATAAATCCAATAGCAATGTTTGCAAATTAAAGAGCTTTTTGAAAAATAAATGCAATATCTTAAAAAATATTACTTACTTCCAAAAGGAGTACGTGCTTTTTTCTTACTATTACGATACTTACTATTTTAGTAACTATCGAATAGAAAGGCAGCGGAATCTCTGATAGCTCTCCGGTCATAGCCTTTCAGATTCAAATCATTTTGTGATCACCACTTTTTATGTATACTAGCTTCAAAAGAGCAGATAGTTATATGGTTGACGGCGACGACTTATAGTGTCCTTCGTAGTTGGGTCCATGTAATTAAGATGGCTGGGAAGTGTTAACGGCTTATTCAGATATTACTCCTTCTAAAATGAGATTCGTGTAGCATGGGTTTGAGGGTTTCCTGGCCATCCCCGTGTCTTCTCGAGATAGTCGAGCAGGCGGTCTGAGATTATGTTGTGGTGGTTTGTGACTGACTGCTGTAAGGTCTTCTTTGCTAGGCTGTGTGAGAATAAAGGCAAGGGTGTCTTGGATCGACGCAGGTACCAGGTTTATTCTTACCCATAATATAAGTCGCTTGAGTGGAGACTACGTATGCTTTGACTGTTTCCGCACCGATGAGGACGGTTGTCGATGCTGCCGCATGGTACAGGTTAATTTGTGGGTTCTAGATGATAGTTAGGTTGGTTAGCCCCCGTATAATCCGTTATGACTCAAAGCGTCCTACGATTGTCTTGGTTACACATTGGTGGCTTAATTGTCTATCGCTGAATGTTTAACGTGCAGTTTTAAACTATGTTCTAGCAAAGTCTTCCGCAGCTTCATCTGCAGAAATTTCTTAGAAAGATCGCTATATAATTTTACTTGCTTCTACATTCCCCATTTCCACACTACCATAAAGGTTTTGGGGCGTTTGAATACCCTTGCAGAGGGTATTATATTTTCAGTCAAAAGCTTGCGATCCGGCGAAGGAGGCGTATTATTTTAATTTTATTCAAAATTCTGAATTGAATCTGAAATAAGAACGATATTTCCAAGAGTAGAAGTCCATATGTGAAAAAACACCAAAATTATGATTTTTTTACATTTTTTTAAAGGTATATATTTTACAATAGTAGTCTGCGCAGGCGATGCTTATTAAGAATAAAGATACTTTATGGAATCGGAAACGTCTCG \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-0.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-0.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-AGCAACATAAGAAATTCTTTAATAATTTAAAAGCGGTTCAGGACAATCTTGGTAACTCCCGTGATCAATATAAGGTATCCACTAACAACAGTACTAGTGATGATTTTGAAAACATCTTTGTTGTTCCATCAAGAAGTTCGGCAGGAATAGCATCGTCGTTATCCGAACTGCTCTTAAGCCAGCATTGGCAAAACAGAAAGACACCAGAAACAGATAGTTATCAAGAAGAGGTTTTTCGCAATCATAATGAACTATTTTCCTGCATATACACTAATAGTATGCTAAATCAACAAAAATGTTCGGAGCAGCAGCTTTTGGCCACGCAACTTTTTTATGCACGGCTTCTTCACCCACACTTAGCAGAACAAGAATCCTTTTCTGAGAAATTCACTGATAGCGCCGCAAATATGATTCATCACGCAGAATTAAAAAAGCCCATGATTGGACATAATGAACTTCCACGAACCCAATCTTCGCAAGATAATAATAACAATATTGAGTTGACGAATGATTTAGAAAATTGTTCAAGATGTGGTGATCAACCAATATTTAAATTTACTAAACTTAAAAAAAATCAGAAAACTGTGCAAAAGAATATGCAGGAATTGGAAAATTGTAATTCTATTTTAAATAAAGAACAGAAAATTAGCCAAAGTAAGGAATCCAAATGCACAGATGACTATGATCTACAACACACGTGTGAGTTTATCCGGGAAAACAAAAACGTACTTATCGACGTTAAAAATAGACTCGAAAAACTTTCTGTACTATCAGCTAAATTTAGGAAAAGCCTGAGTGCGCGTCAATATTATGTTGATGTAAATAATGGTTCGGATTCAGCCCTTGAGGCAACTGTGGGACGACAACTAGATGGGAATTGCAAGTCAATTGAAAGCGTACTGGAACAAGTAAAACGGCTTTATAATAAGTGGAGCAGCGCTGAGCTCTACTACCGTCGAAGTTTACAACGCTTAGGACTCACATCAGAAGAAGGTGTTGAATGCAGTCCTACGCCAACGCACATTATTATGGCTTTGGCTGCAATAGCATTATCAGAAGAAAAGGAGCTATCAGTGAAGGAAACCACTGGTATTGACTCAAAGCTCCTCGAAATTGAAAGCGTGTCTATAAAACCTAAAACACTGAACGAAATAGAGGATATAATATTACAACTATCTTCAGCTGTTAATATGCATCAATCTAGTGTACCTTGCACCACACCTGATGTATATAGTGATGGAGTCAAGAGCGATTTCGTAGAAACAACTTTAATACCCAATTGCATTTGGCATACTAATAAGCAGAGATTTCGGCATAAAGAGGAGGGTGAGCATTGTACCACCGCAGCTGAAATTATTTTAGAATATGCTTCATTGTCTTCATCATCTAATGCAAACACGATACGCGTGCCTGACACTTTTAGATCTGTTTCCAACTTTACTGACGCTATAGAAAATTTTAGTGTCACAACACAGTCTCCTAATATTTTAAACAACAATCGTGAAGGCTCAGCTGTGTCAATCATTTCCGATCCTTCATTTTTTCCTGAGTTTTCTACTGCACCTTCTACACCTTCGACAAGTAGTAATAGTGGCTGCTCGACTGGAATAGTATCTGGAATTTTTGGATTGGGTCACAATCGCAGAAAACCACGATTCGCAAGGCGTATTGAAACTCAGACTTCAGATTCTTCTAAACCTAATGTTATAAAAGAGAGTGACGATCAGGAATTATCTAACCATCTTCTTACTTCGTCAAAATCAACTAAAACAGCAAATAATTTGTGCCCTCAAATTCTTACGACTACACCTTCAATTAAAATTGCTGTGACAACGACGCAAGAACGTTCAATAAGTAACATGTTCGAAGCACGGCTTTGTGCATTATCGACAGATACTGGATCCCTCGAGTCTGAAATTGTACCAATGCTGGATGCTCCGTATGACTTAAGTATTGGAACCAAGATAAAACCCATGTAATTTTTTATTAACTATATACTTTTATACCCTTGCAGGGTATAATGATTTCAGTCAGAAGTTTGAAACGCAGTGAAGGAGGCGTTTCCGACCCCATAAAGTAGATATATTCTTGATCAGCATCACTAGACATGTCGATCTATCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCTGCCCGTTTCTTAGTTGTAAAGCTATCGGGCTAAAACTTTCCCAAAAGTCTACTTTCTTTTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGACGGATCGGACAAGCTCCCATAGGAATAATCGAAAAATCATTTGTTTAATAATATCTTTGGTGTTTTTTCACATATTTAATTCTAAATTTCGAAGTAAATTTTTCAAAATCGGAAGTCTGTATCATGTAGCTGTGCGGAATATACCATGAAAAATGTATATCTTTGGTGTTTTTGGACATATAACCTTCTACGCTTGGAATAACCATTTCTTAATTAGTTTTGAATTTGGAATTTATTTTATTAAGATCGGGCGACTACAACATATATCTGCCATAGGATCGGTTGAAAAATTGGTGGGAAAAAAATATTGAAGAATTATATCTTTATTGTATTTTAGCATATAACCTCCAACGATTGGTAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAAATTCGAATTTAATTGTATGAAAATCTGTAAAATCTAACATGTAGCTGTCAAAAAAACGGTCAGAAAAATAATGAAATATTTTTTTTTTGTTTTAATATCACTGAAGCTGGCAACAATCCTTAAAAATTGTACATCGTGTTACTAACGTTAAATTTTTCTTATAACTGCAAAGGTATCCAAACTTCGGCTTGCTGAAGTTAACTTCCGTTCTTGTTTCTTTTTATAAAGATCGCATGTAAATTTGTGCCCTCATAGGAACAACCATCAAAGTAACCCAAAAAAGAGAACGCTATTGTCGATGTCGTCGACTATGAAGTAGCCTTTACTTAGCTCAATGGAGATGGTCTATAGTTATAGGTTTGGAAACGCTCCCTTCTACCTGTTACATGTTGTCCGATCAATGCAATATAGCTTTTTACTTTTCAGTAAAAACTACATTTCTACAAAAACGAAAAAAACCTAGCACAACACAATTAATCTGTAAAGTATAGAAACTCAGTTTCATGATTTTATTTTAAAAACTCTGAAAAGAATGCTCTAAAACGATTATTTATATACCCGTTATTCGTAAAGTAAAGGGGTATTTATTGATATTGATGTGGGCAATCTTACCATTCTCCCAAATTTCAAAATAGTACATTTGACCTTAATATCTCAAAAGCTATCAAAGATTCAAAATTTTGATTTTTGATTTAGCTTCGTAAGCAGCGCACTTTTGTCTCGTCAATATCTATTGATTCATCTAAAAAAGTTTACCATCCCACTCTAATCCCACAAACGTCCATAACACTTTTATCTGTCTTGCATCATATATTAAAATCGCGGGTAGGGGGCGCTTTACAATCTCTCATTGGTGCTTGTATATCTCCGACTCTCTTTTGCTCCATTTGGTTGAGTAAGGCGTGTTTGATAGGTGAGAAACTCGACTTTAGCGTTCTTCCTTAGCCAAAAATCGTCGGCGGTTTGTGTGACACCCTTGATTGAGAAAGAGATTCCGTAAGAACTTAATGATATTGGAAATTTTAATAACTTGAAATTTGGGATTTAACAAGCTTTTCTATTGGTGCCTACTCAACGAGTTCCACGTTCACTCTCACCAATCGCATAACCCGGTAGAAATTAAATGCTTCTATATTTATTTATTTAAATTTATTTAAATTATTTAAATTTATATATACTTGATCAGCATCACTAGACGAGTCGATCTTGCCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTAAAGACTTTCCCAAAAGTCTTCTTTCTATTGCAGGTAGTATATAAGTCGGAACCAGCCGGATCTTACAGCTCCCATAGGAATTATGGAAAAAAAATGTAAAAAGAATTA'..b'TATCTAAGTGTCTTAAATCTAATATCAGTTTCTTTTTTAGACAAAAAATAAAAAGCTTGCGTGAATTTTGTTTACATTAAGTGATATACTTTTTAGAAAATATGCACCTATTAGAACTATTATAAAACCGTCCACATTTAAACACACTGACACAAGAACATAGTAGGTATACACCATCATATATACTAAAAAGTTAATTATTACAACCAAGTTCAGGAACATTACTAATAGCACGAAATTCAACCCTCTAGAAAATTTTAATTTGCTTCTAGTATACATTTTTAAGTTATAAATTGTATCAGAAAAACGTCCCTCATACTTTTAACTAGATACTATATATAGATTATAAGTTATTCATATGTTCCCCATTTTTTATTTTAGTAATTTTGGCAAACGCTTACAAGGGTCTAGAGAATGGCAATAATTGGTTATAAATGTATAACTGTTCGGCAGGTTCGGTTTTCTACTAGGCACCGAAAACCTTTTTTGAATTGCTTGAAACTTTTAAAATATTCTCTGAACTTATTTACTGAATAGTAAATGTAGAAAAGTAGATTTATAACCCGTGCAGTTTATCAAAACTTTTAAAGAGGGTTCAATGATTTCAGTCAGATGTCAGAATGTGTACCATGTTCCACAGTGGAGGTAAGGGTTAGGTTTTATGAAAAACCAGTTTTAAGATTAATTTATCCCCTAAGAGCTCTGCGGCACATTGCTTCCTCCTTTAATCCTTTTACCGACATACACTGGTCGGAATTAGAATTTTGACGAAACAAAAGTTAAATATATTCGTAGTTTTAACTTACTTCTTGTGCATCATTTAAAAGATAAGTTAAATACCGTTTGAATGATACAATACTTTTTTAAACCCATTCACTTATCGAAAAAGACAACATTTTTGTAAAAATCGAATTTTTATTTTTTTTTCTCGCCCTAAAACTTAAATTTTTTTAATGCAAAAATAGTAAGTGCAAAAAAATATTTCATAAATCAGTTTGTTTTAAAAAAAAAATGGGTTAAATGAATTTTTCTAAACATTTTCAAAAAAAAAAATATTTTTCACTTTCACGTTTGTACCGTCAAAATACTTATGCCGACCAGTTCATTAACAAAGGATATTTCCGATGCCAAACTGAGACATGTCATGGGTCAAACCCTTATGTACTTAATGTGGGGAAAAAATGACATAATTTTTTTTGGAAAAAGGATTTTTTTTTATTTAAATTTATTGTAATTCACTCCCGATAAAATTCCACTTAAAACGCGTTTGCCTGAGTGGTTTTTGAACAACATACACCCATGCTCGTTTGGGAAACAAGCTAATTTAAATGAACAATTCTCCGCTCAACAAGTAAAATTCAACGATCGCTATTTTGTAGTGGGGTTTAACATAAATCTATTTTATGTTTCTGTTACGAATAGGATATAAAGAGTGTCCTTATTAAGAGAAAAGTTATTATCAAAAAAAGCCTAGTAACAAATATAAAAAATTATTAAATGTATGTTAAAAAAAAGATTGCGTACTATTTTTGTATTGGCTTTTTACTTTTATATCCATGATGTTTGATTTCATTCTTAGCATACACCTTTTGGGACCAGTGGCAAAAAAGGGAAATTCCTCGTTAAAATTAAGTTGGGGTCAAATATAAAAAGAAATTTGAAAACAAATTTTTAGGTAGAGAAGGGAAACACAATAACATATTTTTTCCGCAGCAGTTAAAAGTTTTATTTACCATATCATATGAAATCATATCTTTCACATAACATTAAATTACTGTAATACTATACACGTTTAAAGCGCTAGAAGGAAAGATAGTATTTTATAGCTTATTTTATCTGCAGGTACAGAAGCAGAAAACTTTTAACAAGGTTATCTGACAACGGATTTGATAAAAAAATGGCTTTGCGGGGTATACGATTCTGGGAGGTAAATGAGTTTGTTTGCTTGATCTACCTATTTACCAAAAAAGATTATATTGTTGTTAAAGGATTTTTTACTTTTCATTTATTTTGTGTCTCTGTTTTTGTCCAAAATTGTAAGAACGCTAAAGTCGAGTGCCTCGACTTGGGTCTCTGTTTTTGTCAAAAAATTTTAGGATCGCTATAGTCAAGTTCCTCGACTACCAGATACCCGTTTGTTTCTATCATAAAAACTGTAGGCGCTACAGATTTTCGCGGATTGTGGGCGTTAGAGTAGGCGTGCCACCCCGCTGAAACAAACTTGCACTGCGTAGGAAGCCCAGGAATCTGCATACCAATTATGAATATTCTAGCTCTTATAGTTTCCGATCTCAGCGAGATCTCATCTATAACGACTCCGCTAGTGATCCTAATCAAGAATATATATACTCTATGGGGACAATTTCGACAACAATTATTAAAAATGTAGCATGGTGTTACTAACATTAATTATTTCTTATAACTGCAAGGGTATGCAAACTTCTTGCCGAAGTTAACTTCCTTTCTTGGTTATAATATTTATACGCGTTCCTTATAGAGTAAAAGGGTATACTAGAAGGGAGCGTTTCCGTTTTTTATTTTTGGCTCTCTTTATCAGCGTGCCGAATGTGGTGGTAATGACGTCATGTTTAAAAGGCGTTCATAGTATTTCAAAATACCTTTTTTAACGACATATAGCACAAGCTTAAGTAGTTCACAAGTTAAGGGTGTACAAATTGTATCTATTTATCAGGGACCGTAATTATTGTAAGATTTATTTTAAAACTTAAAAAGTAATCATTAATTTTGTCTATCAAATATAATATTTTTTTCTGATTTGCATTTTTATACCCTTGCGAGGATATAATGATTTCAATTTGCAACGCAGTAAAGGAAACCTTTACCACCGACCCTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCGTCTCTAAACGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCATTTCTACGCAAACTAGTCTCTCAGTTTTGAAGGTACCGGCTGAAACTTTCCCAAAAGTCTTTTTTCTATTGCAGGTAGTATAGAATTCGGAACCAGCCGGATCGGACAAAAATATATATCTATGATGTTTTTAAACACGCTACGTTTGGAAATAACATTTTTTAATTGGTTTTGATTTTCGAATTAAATTTTATAAAAATCGGATGACTAAATCATATATCTGCCATGGGAACGATCGGAAAATTAGTGGTAAAAAAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTGTTTTTCAACATATAACCTTCTTAGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTCTGAATTTCGAATTAAAATTTATCAAAATCGGAAGACTATATCATATAGCTGTCATAGGAGCAATCGGTAAATTGGTGGAAAAATAGGTCCTTTTTTTTTACAAATTATCTTGTACTAATTCGTATAAACCGATGTGTTTTGGATTCCAATTTTCGCCTTAAGTTGTGGACGAAGTTGCCGGTAAAAGTAGTTTTGCAAATTATTGAAAATGGACATATAGTCGTCCATTCGCAAAATTACCTTTACCGGCAACAACAGCTGCCATAGGAACGATTGCAAAATGGGAAAATAATATGAAAAAAAATGATATCATTGGACGAAATAACGTTTTTAGATTAGTTCTGAATTTCGAATTTTGTTTTTCAAAATCGATCGATCGGTAAAATGGTGGAAATTGAGGGGTTTTTATCTTTTACTATTGGGAATATAATTTTATTATTTTAAAGATTACAATTACATAACATATAGCTGTGAAAAAATCGGTAAGGAAAATAATAAAACAACTATTTTTAAAAAAGTCTTGCTTTGTTGTTTAAATATCACTGAAGCTAGCAAGAAGAAAATGTATAATGGCGTTAATAACATTGATTATTTTTTATAGCTGCAAAGGTATACAAACTTCGACTTGCCAAAGTTAACTTCCTTTCTTGTTTTCATTGAGGTGTTTAGCATCATCTATAATTTTCAGGACTCTAAAATAACGGAGCATCTGAT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-1.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-1.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TTTGAGAGTTAAGATAAAATGACTAAGGTACTCTAAAAAAATGTTGTACGTCAGAATGTACGCGCTTTTGTTATCAAGTTGGGTACAACATATTGTTGTATTTACAAGACCAAATTAGTAAAGAATTCGATTTATTTCCGAAACTCAGCGCCAAGAAAAATAGGCGGAGAGCGTTTAAAACAATCAATCAAAAGCATAAGTTAATGAGATATGACCAATGAAAATCTCTGCCCATTTTCATAATTTCCATAGAACTATAAAAAATTAATTTCATAATTTAAAAAGATATCGATAACCCAATACCACTGTGATCATGGTTTCATGTTGTAGAGTCGTTATCCGTTTATAAAATGCATATTCTTAAAATAATTATCCACTCTTATGACTATCCTCCAAAAATTCTGAAAGTAACTTTAACCTTTTTTTTAAACAGAATAATATTACATCTCCTTTGAAATTATTAGACATTGTGTTTTACATAACCGGAGAGATTTTTATTTAAAACTCATCATGTAATCATTTTTTGTGAACTTTATTTTAAATTTGGCAAATAAAACTTATTCTTTGAGTTTTACCTTCTGCTTGTAAGTTAGCTTATTTTAAGAGTTTTTGAGTTGTTACAAAATACTCAAGTCTATGAACCTGCGTCATCAACTTCAAACCAATCAAGTACTCTTCTAATGTCATTTTCGTTTGACGAATTACAAAGCGAAAAGAACTATTATGAAGACAAAAAAGGCGTATAGTGAAATTGAAGATTTTTTTTCAAGAGTACCTTTTTCTCTGAAACATATTCTAACGGGCATCTCATGCGAACATTCGCCAGAGATTCAAATTAAACACAACTTAAAATTAATGATTTTATATCAGCCATTTTCCTTATTGCAATCTTACGCTATAAGTGGTTGCAAGCATTATATAAAACTAAAAAAAATTTGTTTCACCTGGAACAAGTAGCGAAATCTTATTCCACGTTTTCGGAACTAACTCTAATCCACTAGGCCATTTGGACAGTTTCTTTTGTTAGTTAAAAGCGTTCTCTTAATAAAATAATTATACTTACCGTGGGCTATAAAATAAAAAAATAGACAACCGCCCATTTAGTGTTCTAAATTTGTGGTAACATATCTGTGAACAACAAAATCACCGCATTATGATTTCAAGTTTTATTTTTACTCAAAAAAAAATACAACTCAGAAAATAAGTTTAATTATTTCATTTTTATTTAAAACTTAAAGAATAACTTTTTTTTGTCAAGCGGAAAATAAAACTTGGACATTAAGGTTTATTTGTCAAGTTTAACATAAAACACACAGAGTACGGTATTTTTTAAAATAAAACTTAAAACATTTAAGATCGCTGCCTTAAATGTTCTTTGAATTTATTTCAAAACCAAAGTGATTTTTGTAGCTTGCTTATTAATTGCCAATATGTTTACATTTAGTTTCTGAGTTGAGTACTGGTTAGCTTATTGTCGGCCTATTCGACTATAACGTGCCTAATATAAAATTAAGAGACCAAAGCACATGAACACTGATATAGAGTATTCTAAAACAGTTAATTCAAACTTTGATGTCTTTAATTACATCTTTCTCTTTTTTATAATGACGGTTAATTACATTAATTTTTGACATTTTATTGACTTTCGCCTTGACCAATAATTAAGTCCCAGTTTGGGTGTCATTTCATCTGTAAGCAACAATGGCAGCAGCGTTGGCATCTCCAGTAGTTCAACAGTCAACAGCATTGGTGTTGGCATGCTAGCACCCATTGTAAGTGGCATAGGGGGTACGGTAATGTTGCCCAACTCGTCATCTTCGTCCTCCTCATCATCATCCACCTCGTCTTCTCATACACATGTACAATTGATGGCTACCAGTAATGGAAACGCAGTAGCATCTTTAAATGGCATAACATGCGCAGGAGGAGGTGGTGGTACAGCAAGCGCATGTTCACAACAGCTATCGCCTCAGGCACCACCGACTTATGTCAATTTATAGATAAATGAATGCGGCAGCGAAACGAAAACATCTGGAATCAATAACCTACCAATGATGATGAGTTTTTACACCTTAAGGTTTCGTCAACATCCAAACCAGTAAATAAACAAATCCAAAAATTAAAGTAAATGCATATCAGGGCTTACAAAAAAACTTATTTGTGTATATATTTACTTACAGAACTATATACATGAATTTATTGCATGAACAATTTTTTTTATTATTAGCAAAATTAAATAAAAGTTCAGTTGACTAAAATTAGTTTTATATTGAATATTTTAGATTACAAAAATTTTTTGTTCACAACTTTTTGATGTTATATAGTGCAATAATTACATTTGCTTATGTGTCAGAATATTGAAAATACTAATACGAAGCTTGATAAGCCCATTCTTGTTTTATAGAATTTCTTATTTCGAATTTTCTTAGGATATAATTGTAAAGGTTTAAATACATTTTGTATATTTAAATTAATGTTTATGCCCAGCATTACTGAATTTGGTTATCAAAAGGTTTGGTATTTCGAATAGATTTAAAAAAGGGCCCTGCTAAACGCTTTAGTTTAAAAAAATTACATACCTTACCTCGTACGTTAAAATGGTATATTTGTTTGCATCACGCTGAATAAAGTGGTTTCTGACTAGAAAATCAATGCATTGAATAAGTTAAAAAATAAATGGTTAGTTAGAAACATAAGCATATCGAATTGAGTGTTAGTGTAACCATTGAACATTTTAAGTTTCAAACGATATTCAGATATATTTTATAAAAAATATATATATATTATATATTTTTAAAGTTTTTGAAAACACTTACTTTGTTAAACCCTGATATACGATTTAAATAAGGTCTTCATTGTTGTTTGATCTATTTGTTGTGCGTAGCCCAAAAAAATATTTATATTAAGTGTTAAAATTTCTTAATATTGATTTGTCTTGTTTTATTTGTTGGTAATGCGTTATTGTGCCTTACTTAATGCCATGATTTCTATTTTTTATGTTATAACAAGTGTTAATTGGCTTTAAAATTAATTTTTTTTTGCTTAAATGCACAGGTGTACTGATAAAATAAAAACAATTTTAGCACTATACACTGTTGATTATGCAAGATTTTAGTTAGTGTATTACCCAATCAATTCAGTAACCAACATTTTATGCCCTTAATTAATTTTTTGCCAGAGTTCACCATTCCGTTTGCACTGTGACCATCATTAAAAATTAAAGTCGGGACGCTTATTGTGGAAAATCCGAATCTGCTTATATATTATTGTAGAAAGTCAGAAATTTGAAACAAAGTAAAGATAAAGTTATTCAAAGTCTCCCACCTATTGAAGCTTGCTGCATGAAACATTGCCAAAGTGATATTTACAATACAGTTAGTGTAGCCGCCAATTCGACTATTAGCAGATAGATCAAAAATAGTATTTAAATATATAAGCTTAGGAAGATCGTTTAATTATTATTCTTCTTATTCAGAAAACTACTTTTAACAATTAAAGAAAAGCGCTGAAGATATTTAGTTTTTTTGTTTTATGTCGCCTAAGAAATAATTTAGAAATGCGGTCGCATGTTTCGTACAAATGAAAAATAAAACATCATAACTACGGGATTCATTTAAGGAGTCTGATGAAAAAAAAAACGAATGTGCATTTTATATTTTTAACGATAGGAATAATAGCTTATTATATTTAAAGTGGAAACAAAGCCCTATAAACATGATGATACAAATTATAGCTACGATTACAAAAAAAACAATGTTTGCCATCATATTGAATTAAATGGCCTACATCATTAGACTTATCTTAGATATTTTTGCTGAAACGCACTCTCAATACATTACGACTTAACTGAAAAGTAGTCTCTTCATAAACTATGTTTGTAAGTTTATTCAAAGACAAAAAAGGGGTTTAAAAAGATTATTTTATTTAGGCTTTAAACAAATTTAAAAAAAAACTAATTTTTTTATATTTATTCAAGGAAATA'..b'TTTCGTATGGTTTGACCTTACCCCCTTGAATGATAGGTTGATATTCGACCGTCACAATGTAATAGTGCTAGAAGAAATGCATAGTTGGACCCGAACTTTCGATGACAATGCTTTGCTGTTAATCTTTTACCTTACCAAAGTCAACAGCAAGATTCTGCAGAATGCGGTATGGTTCGGTATTAAAACCGTATGCCCCACTTAGGTCAGAATGGGATCCTTCATATATTACATGTTTGTAAACATTGATTCCCCTTGGCTCATTCGTCCTTTCGAACCAAATAGTTCTTGGTACTACCAATTGATTTTCTTAACGGGTTGGTAATTCGTTTAGTTTTTGCAATACCTTTCAATTTATGTATCGATTTATTTTCATTTCTTCGTGTATATATAAATCAAAATGTATTGCAAAGACTAAACGAATTACCAACCCGTTAGGAAAATCAATTGGTAGTACGAAGAACTATTTGGTTCGAAAGGACGAATGAGCTAAGGGGAAGAATCAATGTTTACAGAGATGTAATATATGAATACCAGTCAGAAATCTCGAACGGCCTGGTCAACAGAATTGTTGCGTTGACCGGGGACGGAAATTATCATGTTGTTCCGGTCAGACCGGATGCCACACGCCGTGGCATAATGTTCACTTCGAAAAGTCTGTGTAGCTTGTGGAGACTTCCAAAATTCGCCTTACTGCCCTGCCCCCCAAACAAAAAAAGATTTAACTGCCAAGGTAAGCACACGGCAAACTACAGGAGCGATATACAAAGAGATGAATGACCGCATGCGAAAATCGACAGTAAAGCGTCATCAGAATACCCAACATGCGTACACTTACTCGCGTACGACGCCGAAAGTATTTTTCGACACGGTTGCAAGATACTCATTTGGTTAACTAAATACTCAGAAAGTCTTCTCATACGCCGATGCCCTTCGATCAGGGACGGGAAACCCACTCCAGTCTAATCCAGAAAACGCTCATTTGATCCAAGTACAGTCACGATCTGGAATCTATGATGGTCACCATGCAACAAAGTATGATGGAATTCATGTCATTCATGAAAACGACCATGCATGCTACTTGCAGCTAAGCAGTCCAAATAACAGATGGCAAATCCACGAATAACAATGTATAACGCCAATGGCGTTTCACGGCACAACCTTGAAGTAACACAGTTCCTGAATGATAATCATGTCGACATTATGCTACTGGTAGATAAGCACCTGACAAACAAATACAACTTCCAAATAAGAGGCTACATTTTCTACCGCACTTGCAATCATAAAACCGAACAACAAATTTGACTATGTCTCCCCTGGCAGCCCCACATACTGGCCAACAGACCCTAGGAACGTTCCAGACCTAATAGACTTTGCGGTGACAAAAACATTCCCCGCAATATAATAAGAGCCGAAGCGCTTTCGGACCTGTCGTCAGACCATTCGCCAGTGCTAATAACTCTTCTTCGAAGCACACGAACTATAGATCACCCCGTCAGGCTGACTTCGCACACAACCAATTTTTTAAAATATTAAAAGTATGTAAGCTCACACATCAATTTAACCCCTCACTTAAACATCGATGCGGACATCGACTCTACCGATGCTCTTGAACAAGTATTTCTAAAGGCAGCCACTATATCAACAACCCAAGGCACGGGCTGCAATTGAACGGCTAGTCCTAGAAAAGAGGCGCCTGGCAAACTAACAGATCGCCGTCATCAAACCAAATCGAGCTGTAAAGCAAGAAACAGAAAATGCATAGCTACGGAACATTAAAAAACTTTCACCAACTAGTACAAAACATCCTTTGTGGAGGGCTCACCCAATTCTCAGCTCTCCAATTGAAACAGTCACTCCGATAAGAAGTTCATCTGGCAGCTGGGTCCGCACCGAAACTTTTGCTTCACATCTCAGAAACGTCTTCCAGCCGAACCATGCCACTGGTTCAATGTTCCTACCACAAATCAAATCTGAATCTGTTTCCCTGCCACCATTGTTTCAGCCAAAGGATATCGCGAAAGTCATTGGGGAACTGAAACCGAAATTGAACTTCCAAACAATGCCATTGAGGTTATTTGTAAAATCTTCAATGGGATCATAGCTCTCGGCTACTATCCGAAAAAATAAAAAAAAATCTATTATCATTATGATACCGAAGCCCGGAAAGGACCATACAATTCCGTCATCTTACATGTTACTATGTTATCCCTGCTCATCAGTTTGGCTTTCGTCAAAGCCATGGAACAATCGAACAAGTTAACAGAAAAAATCAGAAGTACGCACAGCCTTTGAGCATCGGGAATACTGCAGTGCAATATTCCTTGATGTATCTCAAGCCTTCGTATGGCTAAATGGCCTCATGCACAAAATCAAAACACATTTGATTGATTACATTCACAAGCTTCTTGAGTCGTATCTATACAACAGAACCTTCGCATTAAGGTGCAACGCAACAACATCCGACGACTACATTATCATAGCTGGAGTCTCGCACGGATGCGCGCGTAGGCCCTAGCCTACTCTGTTCCTCCCATAAACAGCAGATATTCCCACGAACGAGCAGCTAACAACAACTACGTTCACTGACGACACCGCAATTTGAAGTCGCACGAGGTGCCCAGACCGAGTGATAAGACAGCTAGCAAACCACCTCCTCATTGTAGAGAGGTTGCTATCTGATTGGTGGATTAGAATAAATGAACAAAAATGGAAACGCAGCGTTTACTCTCAACAGGCACAAATGCCCCCAGGGGGAGGCACATGCCCTCAATGAATAATACGCAGATTCCCCATGTCAACGACGCAACGTATCTCGGTGTCCACCTTGACAGACGACTAACCTGGAGAAGACACATCGAACGCAAGAAAGTACATCTGGAACTAAAAGCCAGCAGCTTCCACTGAATTCTTAACGCTCGTTCTCCCCTGCGACTGCACTACAAGGTTTTGCTCTACAACTCCACTCTCAAGCCCATCTGGACTAATTGCTCTCAGCTATGGGGGAACGCCAGCAGCAGCAACATAGATATTATACAGCTCGTTCAATCGAAAATCCTGCGAACTATCACTGGGGCAACATTGTATATTCGCAACCAAAACATCCACAGGGATCTAGGCATTATTACCGTAAAAGATAAAATAGACAAACAAAAAGCGTCCTACAATGAACAAATCTCTGTGCTGCCCAATTGCCTTGCAAGAGGCTTGACTTGGGTGTTCTCCCGATCCCGTCTGCAACGCAACGACCTGCCAAGCCAGCAATAAATTTCGGGCCTTCAGCACAATATCAGTCATATGACTGTTAGAGTAATTAGTTAAAGATTTGATATACTTATTGTTAGTATACAAAGGGATAAGATTCAAAAAATAAAAAGCGAACCAAAAAAAAGTCACCATAACCAATTGCAAACGAATATTAACCGTTTGCAAATCCAGACTTTTGGCAACATTGACCTATACTTAAGGCTGGTCTATATCCCGTTTATAACGGCTAAACTTCTTAAAGTAGAACCTTATTCATCGCTTGCGCACGGTTCATGGTTTGTCCTTATTTATGTACCCAAGTCATAATTCTTGCGCAAGCACTCTCTTGGTCATGTCAATAGGACGTAAATTAAAAAGATATGATTATTATAAAAAATATCTTTTCAAAATGTTATAACGATCATACTGAAATTTAGCACACTGTTTCTCTACCTTAATCCACAGGTACTGGCATCAAGTTTTTTATTTATTTTTTATTTTACAATCACGAATATATCTAATTTTTAGACTAAAATGAGGTTCTTTAACTTTAAAGTGCAACCGAAAACCAAAAATAAAAAAAGGAGGAGTTACTTTCGACAACATTGTCTTGCACAATGATTACGTATCATTATATTTATTTATTTAAAGAATTATAAAGGAAAATTTCCTTTTTTTGACCGAATTAACCATACAACATTTTAAAAATGTGATCTGTAGTGACTGG\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-2.txt --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/ff4/c90/52/scaffold_5-2.txt Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| b'@@ -1,1 +0,0 @@\n-TGGGGATAATTACCTCTCCCTTTTAACCTAGTTGTATCTCACATAAAATACACGTCAAATGAAACCTAAACTGTCAAGATCGGATAATACGAAAAACAGGATTTTGTGGGACTTCTGAAAATGAGAAACTAATTTTGTTCTTGGGTTTGTCAGTTTGTCCGTTTCTCTTAACAGGATGTTTAGAATTTTAGAAATTTAAGAAGTGTTAAACAACTCATTATAAACAATAAAGAGAGTTTACTTCGGCAAGCCGAAGTTTGTATACCCTTGCAGTTATAAGAAAGACTGAAGACCTTTAGTAACACCATGTACAAATTTTAAGGATTGTTGCTGACTTCAGAGATATTAAAAAAAAAATTTCATTTTAGGACCATTTTTTTACATCTATATGTTAGAGTGGTCCGATTTTTATTAAATTGAATTCGAAATTCTTAAAAATATAAAAAATTATATTTCCAATATTATAAGATAATATGTCAAAAAGCCTTAAGCTATATTTTTTTTTCATATTATTTTTCCACCAATATTTCGACCGTTCCTATGACAGCTATATGATATAGTCGTCCGATATTGATAAAATTTAAGTAGAAATTTATAACTAAAAAATATTATTTCCAAGCTTATAAGGTTATATGTCATAAAGCACCACAGCTATAATTTGTTTCATATTATATTCCCACAAATTTTCCGATTGTTCCTATGACAGCTATGATATAATCGATGCAAACAAGATAGGGACCATTTTTTAGTAATTCCGTCAATTATTGAGAAAATTGAAAAGATAAGTCTAGTAATTCTATCGGTTTCTTTTTTTCTTAGCTGTACCGCTGAGGCTATAGGGACTTTTAGGCATGGCAAAATATGAACCATTTATTAAATCGGACCATTGCTTTTGTGCTTCTCTCTCTATGTATCTTTCTCCCTAAAACTCCGCTTAGCTGAGTAAGGCGTGTTTGACGATCGATGCCATACACTAAGGTGCCATAGCCATGCCGACATACGGAGGTGAGGCAATCCAAAGGCGAGCATACTGCGTTCAGAGACACATACTCGCTGAGAAAAAAACGACGAGACAGATAAAATTGACTTGTTGGCTTCTTCAGATTTAATGCAAGAACAAAATGTATTGCTCTCGTCAATAACTATTAACTGGCCTAAAAAACAGCAGTGAAATCGCGAAAGCTATAAATGCTTCAATTTTGGGAGCACGAAACAGATTTAAAAAAGTTTATTTTAGTAGGGTGCCACGACCACCTATGCAGATCAAAGCTGAAATGCTCATTTAAAGCACTAAATTAAAAACTTATTGGAAGATTCGAGTTGGATTAAGGATTATTCCTTTTTGTCGCAATGTTATTTTAGGTAGGCAAGAAATCTGTCTATTAGGGTGAAAGCGGCTCCTTTATCATCCAACGCAAACTCTGCGCAGCAATTTTACTCATATAATATATAGAAAGGCACTTCTAGACGACTTGAAAATCCTGCACGCCTTCCTAATGTACCATTATGTTCAGGATACCTAGAAAGAGGTCCGTGGAAAACGAGAGCGTAACTTCCAGATGCACTACAGGGGTTGTCCCTTGATGTTTCATTTCAATGACGCCAATTTCATTGGGAATTTGGTACCCACCTTGGACTTTTTCAATCGCGTTTGTGTAGACTCAAGTGTTACTTTTAGATTAATAAGTATTCTATAATTGTATAAGGTACTCGGCCCTTATGCGAACTTGGACAATAAAGAACGCACCGTATGATGTTGCGAATACAAGCCATAATCTCGGAATCGCTTCGGTCTCCAGAACAACACCTCTTGATACCACGGATCGATCAACCACTCTTTCAACCGCTTATTTTCAACTTGACCGACCGGGCGGTCGTCTGAACACCACGCAGAAGCTGACACCTTGCGCTAGTCTGCTATCTTGCCCCGTTTTACTCCTTTTCCTTCGCTTTTAACTTGAAAAAACCTTAACACAAGATATCAAATCGCTTTACTGTTTTATTTTTATATATAAGTGTGATAAATTGTGTAGAATACATAAGCATATGCATCGGGTGGTCAACCATATCCCTATTATTGCAGAGTAATTTTAAACGTCATGCATTGGGCTTACCTTTCCAGCTTAACCATATTCTTTCCTCTTTGAGACTCGACTTGATTTTTAAAATCAACTTTACCACCATTGAAGCAACGTTTTTTCACTTTCAAGAATTGAAAATCTGCCATCGAAGTAGACATTGTGTATTCAAGGGGTAATTTTATGAAGTAAAAAATATAAAGTTGTCAGTCAAGTCCCTGTCAGAGTGAACTCTCCCATTAAGGCCTGAGAAAAACAAATTTTTTAATAGGATGAACCACACAGATTATCAGGACTGTCTGTTTTCCTCCAACTCTTTTTATGTTATGAGCTTTTAATGGCTTGAAACAACTATATGTTGGACCATATTACCCAATTTCCCCGTAAGATTAAAAACTATAAGACGATTTAAAGATGTATATTATTATTGGTTTAACAATTTAACAGATTAGTAATATAATTTTTACACCGAACAAGATATAAAAACTTAGATACAGACCATTAGATATAAATATTTTTCAAATAATAAGAGCAATGATTAAAGTCAATTTAAATATAAAAAAAACACATGTTATAAATAATAACTGCAAAATAATTAATTATAAGTGCAAGTATTTTGAATGATGTTTACCACCGGTTTTGGACAAACTCAATATTCATTTGTTGAAATATATTTTCCTGCAAGTAAAACAGTTTTTTAATACGATTTACAGTACGATATTACCTTTTATTACCTGGCTACTTTTTTCCTGAACTTAAAATTTAGTTTAATGCAAGCGACAATGTATTTTTTGCAGTGCTGAAATTATCTATGTATTCAAAAAATATCCTCATTAAATGGATGTACCAGTCGAATTAAGTTTTTATAAGAAAGCATACCTTATTCCTTTTGAAAGTTATCTGTTTTTGCTTCTGAAGTCGTCGTGGTTGGCTCTCTACAATCCACAGAGTTTTCTATTCCGGACGTTGCCATTTCTTGTTCCAACTTATCTGTCAAAAACCTTACATTATGTATACAATTTTCCACTATGTCCGTACGTCCAATTTTGCCAAGGGCTTCAGCTAATACATTTCCTGTGGAAATGCCCCCTTGTTTAAGCCATAATTGCAATGTTACCATGCTCTGCTGCATGCAATCATCACTATTGTACTCAGCTTTGACAAGCTCGATATCGGTCTCGGGAACACCCAATTCTTTAGCTAGCTCAGGCCAGTCACCACCTATTTGGCTACACACATCGATTAATGTTATATCAGCACTTTGAATCATTTCGCTGAATTTCTTATAAACTCCGGTAAAATCAATTTTTTTATATCTTTCTCAGACGGCGCTGTTTCTGTTCTTTTTTCTGAACTTAGCAGATCATTATAGTTCATGTTACCACTCAAACTCACACTCTCATTTATGTTTTCCAGATGCTTTGTCATAGTTTTTAAATCTACTGACACATTCAAAGTACAAAGAGGATTCTGTGGCAATTCATCAGGCCCAGCCTTTGGATTGGTCATAAAACAGATACGACCTTGTGGAAATTCTGGATCTTTAATATGAGCAATAAATGAGAGACGATTTTCGCAAAATGCTTGGAATTTGGTACTAAGTTGCTCACCGGTTTTTAAAACAGGGACGATACTACCAGCAAATTCTAGGTATATATTTTGATCCTGCAATACTTCAATATCCCTACTTTTTGCAACCTCTGTAAAGTATTCCTGTTGTTCAAGCGTCTTGTCCTCTTTATCATCTGTCATACAAAACACTGAAAATTTTGCTTCTATTTTAGAGAGACGTTTAGCGAAGACAACAAACTTTACAAGAAAAGGAACTTTGGTCAAATGACTGTAAAGTTCGCTTGCCATTCGTCCGGCGTCTACAACATTGCGACAATCCATCAGCCAAAAAC'..b'CAAATAAATAGTAATTAAGTTTTTTATGAGGAGCGTACACCCTAAAACTTATGGATAGACAAAAAAAAAGTTAACCGCTGAGGCAGTGTACAGTGTACAGAAACCGTATATTTGCAAAATATTCATAAAAATAAATAAATAGTACCTATAAAAGCTATATGTATGATACAGTCATCCGATTTTAACATAAACCAAGAAAGGAAATTAACTACAGCATTCTCACGTTTTTATACCCTTGCAGTTATAAGAAATAGTCAACGTTAGTAATACCATGTTTAATTTTCCATTGTTGCTAATAGCTTCAGTGATACATAAAAAAAAATTTTTTAATTATTTAATTAGTTTTCTAAACTTTTTATCGACAGCCTAAAATTAGAGTCGTCCGTTTCTTGTTAAATTTAATTCGAAATTGTTATAAATAAAACAAGAAAGGAAGTTAACTTCGGCAAGACGAAGTTTATATACCCTTGCAGTTTTAAGAAATACAATTTAATTCGAAATTCACAACTAAATAAAAAATGTTATTTCCAAGCTTAGAAGGTTATATGTTAAAAAACACCGAAGATATACTTTTTTTTTATATTTTTCCCGATAGTTCCAATGAGAGCTATAAGTTATAGTTGTCCGGTACGGCTGGTTCCGACTTATGTACTACCTGCAATAGAAATAGACTTTTGGGAAAGTTTAAGCCCGATAGCTTTATAACTGAGAGACTAGTTTGCGTAGAAACGGACAGACAGACGGTCATGGCTAGATCGACTCGTCTAGAGACGCTGATCAAGAATATATATCCTTTATGGGGTCGGAAACGTCTCCTTCACTGCGTTGCTTATGACTGAAATCATTATACCCTCTGCAAGGGTATAAAAATTATAAGATAATATGTCAAAAAAATGCGCGAAGGCGACTACATATATACGAGTACAAAAAGAAATGTAATCTCACTTAAAATACGCATCGAATGAATCTTCAAAATCGGATGCTCCGTTGAAAAGTAATATGCAAAACAAGATTTTTGGAATCTTTCAATATGAAAATTTTATTTTGTTTTTAAGTTTATCAATTTGTAACAAATCCTTATTTAAGAGTCCCGAAAATTCTAAACGATGTTAAACAGCTTAAAATAAGAAACAATAGTTCTAATACTCAAAAAAAAAAACTGGTTTAGCGAGAAAACATATACTCGTATAATTAGCTGCATTTTGTATACCCGTAGTCTCTGAAGTACTGAAGCTACAAGCTTGTGCTATACGTCGTTAGAAAGGTATTTCAAAATAATATGTACGCCTTTTCTCATGCTGAACCAATAGTAGCTATTACAGCATTCGTTTTAATTCTTTTTCGAAGTGCAATATACATTTTATTAGTTGTTTACAATTTTTTGTTTGTATTCAAGCCTCTGTGACCGTAAATAATGATGATTGACCTCATGATACTTAACAAAAAGTTTAGAATTTCCGTTTAATTCCATAAATCATCTTGTATATAAAAAACATTTTTATCGAAAAGAAACCACCAAACGGTCGCACACCCACATGAACACAGTTAAGAAAAAGCAAAAAAAAATTACGTCTAACCTTCGCTTTATTATTTATTGATTTGACACCTTTATCTTATTTTAAACTCATTGACATACATTTTTATACGTGAACGTATACATAATCAATAAAAAAAAAACGAGTTAAAAATTTATTGACGATCGAGCCTGTGTTCTTGCGTTCGATGTGTCTTCTCCAGGTTAGTCGTCTGTCAAGGTGGACACCGAGATACGTTGCGTCGTTGACATGGGGAATCTGCGTATTATTTATTGAGGGCATGTGCCTCCCCCTGGGGGCATTTGTGCCTGTTGAGAGTAAACGCTGCGTTTCCATTTTTGTTCATTTATTCTAATCCACCAATCAGATAGCAACCTCTCTACAATGAGGAGGTGGTTTGCTAGCTGTCTTATCACTCGGTCTGGGCACCTCGTGCGACTTCAAATTGCGGTGTCGTCAGTGAACGTAGTTGTTGTTAGCTGCTCGTTCGTGGGAATATCTGCTGTTTATGGGAGGAACAGAGTAGGCTAGGGCCTACGCGCGCATCCGTGCGAGACTCCAGCTATGATAATGTAGTCGTCGGATGTTGTTGCGTTGCACCTTAATGCGAAGGTTCTGTTGTATAGATACGACTCAAGAAGCTTGTGAATGTAATCAATCAAATGTGTTTTGATTTTGTGCATGAGGCCATTTAGCCATACGGAGGCTTGAGATACATCAAGGAATATTGCACTGCAGTATTCCCGATGCTCAAAGGCTGTGCGTACTTCTGATTTTTTTCTGTTAACTTGTTCGATTGTTCCATGGCTTTGACGAAAGCCAAACTGATGAGCAGGGATAACATAGTAACATGTAAGATGACGGAATTGTATGGTCCTTTCCGGGCTTCGGTATCATAATGATAATAGATTTTTTTTTATTTTTTCGGATAGTAGCCGAGAGCTATGATCCCATTGAAGATTTTACAAATAACCTCAATGGCATTGTTTGGAAGTTCAATTTCGGTTTCAGTTCCCCAATGACTTTCGCGATATCCTTTGGCTGAAACAATGGTGGCAGGGAAACAGATTCAGATTTGATTTGTGGTAGGAACATTGAACCAGTGGCATGGTTGGGCTGGAAGACGTTTCTGAGATGTGAAGCAAAAGTTTCGGTGCGGACCCAGCTGCCAGATGAACTTCTTATCGGAGTGACTGTTTCAATTGGAGAGCTGAGAATTGGGTGAGCCCTCCACAAAGGATGTTTTGTACTAGTTGGTGAAAGTTTTTTAATGTTCCGTAGCTATGCATTTTCTGTTTCTTGCTTTACAGCTCGATTTGGTTTGATGACGGCGATCTGTTAGTTTGCCAGGCGCCTCTTTTCTAGGACTAGCCGTTCAATTGCAGCCCGTGCCTTGGGTTGTTGATATAGTGGCTGCCTTTAGAAATACTTGTTCAAGAGCATCGGTAGAGTCGATGTCCGCATCGATGTTTAAGTGAGGGGTTAAATTGATGTGTGAGCTTACATACTTTTAATATTTTAAAAAATTGGTTGTGTGCGAAGTCAGCCTGTCGGGGTGATCTATAGTTCGTGTGCTTTGAAGAAGAGTTATTAGCACTGGCGAATGGTCTGACGACAGGTCCGAAAGCGCTTCGGCTCTTATTATATTGCGGGGAATGTTTTTGTCACCGCAAAGTCTATTAGGTCTGGAACGTTCCTAGGGTCTGTTGGCCAGTATGTGGGGCTGCCAGGGGAGACATAGTCAAATTTGTTGTTCGGTTTTATGATTGCAAGTGCGGTAGAAAATGTAGCCTCTTATTTGGAAGTTGTATTTGTTTGTCAGGTGCTTATCTACCAGTAGCATAATGTCGACATGATTATCATTCAGGAACTGTGTTACTTCAAGGTTGTGCCGTGAAACGCCATTGGCGTTATACATTGTTATTCGTGGATTTGCCATCTGTTATTTGGACTGCTTAGCTGCAAGTAGCATGCATGGTCGTTTTCATGAATGACATGAATTCCATCATACTTTGTTGCATGGTGACCATCATAGATTCCAGAGCGTGACTGTACTTGGATCAAATGAGCGTTTTCTGGATTAGACTGGAGTGGGTTTCCCTTCCCTGATCGAAGGGCATAGGCGTATGAGAAGACTTTCTGAGTATTTAGTTGACCAAATGAGGATCTTGCAACTTGAACAGTAAGCCATGGTGTGTCCATACCCCTAACAATTTGTGCATTGCATTGGGTCGTTCTTCAGATTCCGGTCTGACCGGAACAACATGAAAGTTTCCGTCCCCGGTCAGCGCAACAAGTCTGTTGACCAAGGCATTCGAGATTTTCTCCCTAATGAGCCTGTTCTGATTCGTTTTCTGCTAGAAGCGCACATCTATTGATGCTGGATCTCCCGAGTAATTTATTTTCTATTTGGACACGGTTTATTTCAGAGTTGT\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/refSeqs.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/seq/refSeqs.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,1 +0,0 @@ -[{"name":"scaffold_1","end":45179,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"end":43013,"name":"scaffold_10","start":0,"seqChunkSize":20000},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_11","end":35013},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_12","end":56019},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":45015,"name":"scaffold_13"},{"end":45010,"name":"scaffold_14","seqChunkSize":20000,"start":0},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":50014,"name":"scaffold_15"},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_16","end":45017},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_17","end":40013},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":40012,"name":"scaffold_18"},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_19","end":45013},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_2","end":45017},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":50014,"name":"scaffold_20"},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":50011,"name":"scaffold_21"},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_22","end":60010},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":50012,"name":"scaffold_23"},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":40010,"name":"scaffold_24"},{"end":75023,"name":"scaffold_25","seqChunkSize":20000,"start":0},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":40013,"name":"scaffold_26"},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_27","end":50016},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_28","end":50013},{"end":50006,"name":"scaffold_29","seqChunkSize":20000,"start":0},{"name":"scaffold_3","end":40006,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"name":"scaffold_30","end":70018,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"end":40012,"name":"scaffold_31","start":0,"seqChunkSize":20000},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_32","end":40014},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":40016,"name":"scaffold_33"},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_34","end":50012},{"end":48011,"name":"scaffold_35","start":0,"seqChunkSize":20000},{"name":"scaffold_36","end":45010,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":50013,"name":"scaffold_37","start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":50017,"name":"scaffold_38","start":0,"seqChunkSize":20000},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":45019,"name":"scaffold_39"},{"end":55011,"name":"scaffold_4","start":0,"seqChunkSize":20000},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_40","end":60015},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_41","end":60014},{"end":70020,"name":"scaffold_42","seqChunkSize":20000,"start":0},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":50016,"name":"scaffold_43"},{"name":"scaffold_44","end":50013,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":50013,"name":"scaffold_45"},{"name":"scaffold_46","end":50012,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"end":35007,"name":"scaffold_47"},{"end":65012,"name":"scaffold_48","start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":30003,"name":"scaffold_49","seqChunkSize":20000,"start":0},{"end":50018,"name":"scaffold_5","seqChunkSize":20000,"start":0},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_50","end":40009},{"end":50015,"name":"scaffold_51","start":0,"seqChunkSize":20000},{"name":"scaffold_52","end":40012,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":50013,"name":"scaffold_53","start":0,"seqChunkSize":20000},{"name":"scaffold_54","end":35008,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_55","end":40015},{"name":"scaffold_56","end":55020,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"name":"scaffold_57","end":60013,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_58","end":50011},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_59","end":40011},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_6","end":40015},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"end":50013,"name":"scaffold_60"},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_61","end":40008},{"end":50017,"name":"scaffold_62","seqChunkSize":20000,"start":0},{"start":0,"seqChunkSize":20000,"name":"scaffold_63","end":55021},{"name":"scaffold_64","end":40016,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":45013,"name":"scaffold_65","start":0,"seqChunkSize":20000},{"end":45011,"name":"scaffold_66","start":0,"seqChunkSize":20000},{"name":"scaffold_67","end":44531,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"name":"scaffold_68","end":25628,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_69","end":44962},{"name":"scaffold_7","end":50017,"seqChunkSize":20000,"start":0},{"end":55020,"name":"scaffold_70","seqChunkSize":20000,"start":0},{"name":"scaffold_8","end":35012,"start":0,"seqChunkSize":20000},{"seqChunkSize":20000,"start":0,"name":"scaffold_9","end":60018}] \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/Dbia3/trackList.json --- a/test-data/only_genome/myHub/Dbia3/trackList.json Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| [ |
| @@ -1,21 +0,0 @@ -{ - "names" : { - "type" : "Hash", - "url" : "names/" - }, - "formatVersion" : 1, - "css" : { - "url" : "data/css/custom_track_styles.css" - }, - "tracks" : [ - { - "chunkSize" : 20000, - "storeClass" : "JBrowse/Store/Sequence/StaticChunked", - "urlTemplate" : "seq/{refseq_dirpath}/{refseq}-", - "category" : "Reference sequence", - "key" : "Reference sequence", - "label" : "DNA", - "type" : "SequenceTrack" - } - ] -} |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/0.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/0.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"cont":{"exact":[],"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]},"contig24":{"exact":[["contig24",40010,"contig24",null,0,"40010",null]],"prefix":[]},"contig13":{"exact":[["contig13",45015,"contig13",null,0,"45015",null]],"prefix":[]},"contig45":{"prefix":[],"exact":[["contig45",50013,"contig45",null,0,"50013",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/1.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/1.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig2":{"prefix":["contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27","contig28","contig29"],"exact":[["contig2",45017,"contig2",null,0,"45017",null]]},"contig55":{"exact":[["contig55",40015,"contig55",null,0,"40015",null]],"prefix":[]},"contig34":{"exact":[["contig34",50012,"contig34",null,0,"50012",null]],"prefix":[]},"contig62":{"exact":[["contig62",50017,"contig62",null,0,"50017",null]],"prefix":[]},"conti":{"exact":[],"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/2.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/2.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig5":{"prefix":["contig50","contig51","contig52","contig53","contig54","contig55","contig56","contig57","contig58","contig59"],"exact":[["contig5",50018,"contig5",null,0,"50018",null]]},"contig":{"exact":[],"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"contig52":{"prefix":[],"exact":[["contig52",40012,"contig52",null,0,"40012",null]]},"co":{"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}],"exact":[]},"contig65":{"prefix":[],"exact":[["contig65",45013,"contig65",null,0,"45013",null]]},"contig33":{"prefix":[],"exact":[["contig33",40016,"contig33",null,0,"40016",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/3.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/3.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig42":{"exact":[["contig42",70020,"contig42",null,0,"70020",null]],"prefix":[]},"contig23":{"exact":[["contig23",50012,"contig23",null,0,"50012",null]],"prefix":[]},"contig14":{"exact":[["contig14",45010,"contig14",null,0,"45010",null]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/4.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/4.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig32":{"exact":[["contig32",40014,"contig32",null,0,"40014",null]],"prefix":[]},"contig53":{"exact":[["contig53",50013,"contig53",null,0,"50013",null]],"prefix":[]},"contig64":{"exact":[["contig64",40016,"contig64",null,0,"40016",null]],"prefix":[]},"contig4":{"prefix":["contig40","contig41","contig42","contig43","contig44","contig45","contig46","contig47","contig48","contig49"],"exact":[["contig4",55011,"contig4",null,0,"55011",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/5.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/5.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig22":{"exact":[["contig22",60010,"contig22",null,0,"60010",null]],"prefix":[]},"contig43":{"exact":[["contig43",50016,"contig43",null,0,"50016",null]],"prefix":[]},"contig15":{"prefix":[],"exact":[["contig15",50014,"contig15",null,0,"50014",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/6.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/6.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig12":{"prefix":[],"exact":[["contig12",56019,"contig12",null,0,"56019",null]]},"contig44":{"exact":[["contig44",50013,"contig44",null,0,"50013",null]],"prefix":[]},"contig25":{"prefix":[],"exact":[["contig25",75023,"contig25",null,0,"75023",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/7.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/7.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig35":{"prefix":[],"exact":[["contig35",48011,"contig35",null,0,"48011",null]]},"contig63":{"prefix":[],"exact":[["contig63",55021,"contig63",null,0,"55021",null]]},"contig3":{"prefix":["contig30","contig31","contig32","contig33","contig34","contig35","contig36","contig37","contig38","contig39"],"exact":[["contig3",40006,"contig3",null,0,"40006",null]]},"contig54":{"prefix":[],"exact":[["contig54",35008,"contig54",null,0,"35008",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/8.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/8.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig30":{"exact":[["contig30",70018,"contig30",null,0,"70018",null]],"prefix":[]},"contig18":{"prefix":[],"exact":[["contig18",40012,"contig18",null,0,"40012",null]]},"contig6":{"exact":[["contig6",40015,"contig6",null,0,"40015",null]],"prefix":["contig60","contig61","contig62","contig63","contig64","contig65","contig66","contig67","contig68","contig69"]},"contig66":{"prefix":[],"exact":[["contig66",45011,"contig66",null,0,"45011",null]]},"contig51":{"exact":[["contig51",50015,"contig51",null,0,"50015",null]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/9.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/9.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig41":{"exact":[["contig41",60014,"contig41",null,0,"60014",null]],"prefix":[]},"contig9":{"exact":[["contig9",60018,"contig9",null,0,"60018",null]],"prefix":[]},"contig17":{"exact":[["contig17",40013,"contig17",null,0,"40013",null]],"prefix":[]},"contig20":{"prefix":[],"exact":[["contig20",50014,"contig20",null,0,"50014",null]]},"contig69":{"prefix":[],"exact":[["contig69",44962,"contig69",null,0,"44962",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/a.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/a.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig46":{"exact":[["contig46",50012,"contig46",null,0,"50012",null]],"prefix":[]},"contig27":{"prefix":[],"exact":[["contig27",50016,"contig27",null,0,"50016",null]]},"contig10":{"exact":[["contig10",43013,"contig10",null,0,"43013",null]],"prefix":[]},"contig59":{"exact":[["contig59",40011,"contig59",null,0,"40011",null]],"prefix":[]},"contig38":{"prefix":[],"exact":[["contig38",50017,"contig38",null,0,"50017",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/b.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/b.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig61":{"prefix":[],"exact":[["contig61",40008,"contig61",null,0,"40008",null]]},"contig49":{"exact":[["contig49",30003,"contig49",null,0,"30003",null]],"prefix":[]},"contig1":{"exact":[["contig1",45179,"contig1",null,0,"45179",null]],"prefix":["contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19"]},"contig56":{"exact":[["contig56",55020,"contig56",null,0,"55020",null]],"prefix":[]},"contig37":{"prefix":[],"exact":[["contig37",50013,"contig37",null,0,"50013",null]]},"contig28":{"exact":[["contig28",50013,"contig28",null,0,"50013",null]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/c.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/c.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig70":{"exact":[["contig70",55020,"contig70",null,0,"55020",null]],"prefix":[]},"contig39":{"exact":[["contig39",45019,"contig39",null,0,"45019",null]],"prefix":[]},"con":{"exact":[],"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"hitLimit":1,"name":"too many matches"}]},"contig47":{"exact":[["contig47",35007,"contig47",null,0,"35007",null]],"prefix":[]},"contig58":{"prefix":[],"exact":[["contig58",50011,"contig58",null,0,"50011",null]]},"contig11":{"prefix":[],"exact":[["contig11",35013,"contig11",null,0,"35013",null]]},"contig26":{"exact":[["contig26",40013,"contig26",null,0,"40013",null]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/d.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/d.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig60":{"prefix":[],"exact":[["contig60",50013,"contig60",null,0,"50013",null]]},"contig29":{"prefix":[],"exact":[["contig29",50006,"contig29",null,0,"50006",null]]},"contig48":{"prefix":[],"exact":[["contig48",65012,"contig48",null,0,"65012",null]]},"contig57":{"prefix":[],"exact":[["contig57",60013,"contig57",null,0,"60013",null]]},"contig36":{"exact":[["contig36",45010,"contig36",null,0,"45010",null]],"prefix":[]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/e.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/e.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig67":{"exact":[["contig67",44531,"contig67",null,0,"44531",null]],"prefix":[]},"contig19":{"exact":[["contig19",45013,"contig19",null,0,"45013",null]],"prefix":[]},"contig7":{"exact":[["contig7",50017,"contig7",null,0,"50017",null]],"prefix":["contig70"]},"contig31":{"prefix":[],"exact":[["contig31",40012,"contig31",null,0,"40012",null]]},"contig50":{"prefix":[],"exact":[["contig50",40009,"contig50",null,0,"40009",null]]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/f.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/f.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"contig68":{"prefix":[],"exact":[["contig68",25628,"contig68",null,0,"25628",null]]},"contig21":{"prefix":[],"exact":[["contig21",50011,"contig21",null,0,"50011",null]]},"contig8":{"exact":[["contig8",35012,"contig8",null,0,"35012",null]],"prefix":[]},"contig40":{"exact":[["contig40",60015,"contig40",null,0,"60015",null]],"prefix":[]},"contig16":{"exact":[["contig16",45017,"contig16",null,0,"45017",null]],"prefix":[]},"c":{"exact":[],"prefix":["contig1","contig10","contig11","contig12","contig13","contig14","contig15","contig16","contig17","contig18","contig19","contig2","contig20","contig21","contig22","contig23","contig24","contig25","contig26","contig27",{"name":"too many matches","hitLimit":1}]}} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/names/meta.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/names/meta.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,1 @@ +{"hash_bits":4,"format":"json","lowercase_keys":1,"track_names":[],"compress":0} \ No newline at end of file |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| b'@@ -0,0 +1,66784 @@\n+>contig1\n+AAAACTAATTTTATCAAAATCGGACAACTATATCATATAGCTGCCATACG\n+AACGATCGGAAAATTGGTAAGTAAATAATTAAAAATATTATATCTTTGGT\n+GTGTTTTTGGAAATAACATTTTTTAATATGTTTTGAATTTTGAATTAAAT\n+TCTATCAAAATCGGACGACTATATCATATAGCTGCCATACAAACGATCGG\n+AAAATTGGTGAATAAATAATATGAAAAAATTATATCTTTGGTTATTTTTT\n+AGACAAATAACCTCCAACGCTTGGAAATAACATTTTTTAATTAGTTATAA\n+ATTTGATATTTTAATTTTATCAAAATCGGACGAATATAGCATATAGCTGT\n+TAAAATAATATGAAACAAATTATAGCTCCGGTGTTTTTTACATATTATCT\n+TATACTATTGGGAAAATAGTTTATTATATTTTAAAGAATTTCCAATTAAA\n+CTCTAACATATAGCTTTCAAAGAAACGGTCAAAAAAGTAAAGAAATCATT\n+TTTTTTTAACATCACTGAAGCTAGAAACAATCCTTAAAAATGTAACATGG\n+TGTTAGTAGCATTGAAAATTGCTTATAACTGCAAAGGGAAAACAAACATC\n+GGCTTGCCGAATGTAATTTCCATTCTTGTTTGACTTGAGTTTATAACTTA\n+CAATTATGGTAAGGTGCCTGATTTTGGTTTTTGCCATACGGTATGTGGTA\n+GTTATCATTTTGCCGTGCTATAAGTGACATCACAGCCGATTCTTTTACTC\n+CATAATGGGCCAATGTGTTGAGGCGTTTCCATCCATTTATTGTTTTTGTA\n+GTTAGGTCTTCATCTTGTAATGTGAGATGACCTCCTCTTCCATGCCTCCA\n+TTCTAAGTCAACTTCGTGCACAGATGGTCTCATAGAAAACGGAGTATTTT\n+TAAAAATTGCGTCCAAAATTTTTAATTTAACTTGCGATATGGTATCCAAA\n+TCGTTTACACGACATTGGACTTTTTCATCAAGATCATCTTGTAAAATGTG\n+CAAAATTACAACAGAATGGGTAACTTGTTCGTGGAGAAGTCGTTCCTCTG\n+AAAGTGAATAACGAGCATCGTGGGTTATTGCGTCCACCAAACCCTTTTCA\n+ATTTGATGCTTAATTGCCTTGAACAGCAAAAATAAATTAGATCCAGCATA\n+TTCTTTTAGGTAGTCGTACATACAAATTGCTAAGTAGTTTGTTAACATTT\n+TTTCAACTACGCTCTCAGTGCGTCGTAGCATTAGCTGAGGATGCTTGCTG\n+GCGAGCGATTTGTCAATTAATCGCAATAAAAGGGACTTTAAAATTTCCGT\n+CGCATATTCCATTTTGTTCATTAGAACAACCATAAGTAAAGAGGCGACGT\n+TAACTCGATCGCGAATTGAGAAAGATGACCGTTGAGCTTCTAAAGTTTCT\n+ATGAACAATAGTAAAAAATATTTGTTTCCAATAAGTTGCTCGAATTGTAT\n+CATAGCTGCATCATAGTTAGTGTGCGGGCTACTTCCACAAAATTTTCGGG\n+AGTTTAGAATAGGATGATCTGATACACCGGGAAAGAAAACTTTCATAATG\n+TAATTGACGTGATCTAACGTTGGTATACCGGTGCTCTCCAAATCTGCTGT\n+TAGATCGGTCATGTCCGTTTGGAGCTCAGCAAATGCCTGTTTACACTCAG\n+AACGAACGTTGCTTTCCAATGTTATCATCTGTATCTGAATTCGTTTGTAT\n+TCCCGTTCTGCTTGGGTCGATTTCCTTCTAAATATTATTAGTACGACAAC\n+CAAAACGATGACAAGCACTGCAACTGTCAATATAACGACAAACATGGCAT\n+GTGAAAAAACATAGGGTTTATTTAAATCATATTTCAAATATCCTATGGCG\n+AAACGAAGATTTCGCCCTACTTTAACCACAACTAGAGGTAAATCTGTCGA\n+TTGATCCACACCATTTTCATCAGTTGGGAGTGGTTGATGTTCCGGTGGAA\n+TGCACAAAAGTTGAGTTAGTGTAAGGCTTGTTATATTGCATTGAGTAGTA\n+CCAATGGTTACATTAACGTCGTATTCATCAGCTGCCAAATTTAGTAGCTC\n+GCCTTCAATAACCAAGCTGTCACCCTTGTATAGTTTAATTCCGTCATTTG\n+GAAATGGTAAATATTTTGGATCGGCTAAATAAACAATAGTGCTCCTGATA\n+TCATGAAAGTATTTATTTAGATCTCGAACAAGCTGTACATTGTCCATTAC\n+AAAACTAAGTTGTAAATTCAGTTGCGTTTCATGGACCTTTACAAAAGTTG\n+TAACATCCATATTATTATTGACGAAATAGCTAGGCGCAGTTCCCCCTGTT\n+GTGTATATATGAAAGTTGTCTACGAAGTCTGCTTTTCGCTTTCGTCTAGA\n+ATATTCGTTCTGATGCGCACTTTCATTTTTAAAGTCAAATTCCGAATCCA\n+TCACTCTGTTAGAACTTTTAAATGCTTGAAATTTATCATTTACCGGAGGA\n+GATGGGCATTCCATTTGATTTGAATTGATTACTACGCAAGATGTTTTGTT\n+TACTCTTTCATTATCAAAAAAAACTTCAAGTTCAGGCTTTTGAATTGAAT\n+TAAGATACATTCCATGAACGGTCAGAACGCGACCACCACTTACAAAACTG\n+CGTAAAGGCTTAATCTGCATTATACGCGGGTCTTGGGTATAGTTAAAAAT\n+AGAACAGGGCTGCCTTGGTAACGTACGAAATTGGTATGAACCGAAATTAC\n+TTCGAGTTAGATTTTTATTGGGTATAGTTGCGGGTGAGATATGACATTCT\n+AAAGTTCGGTTGGCACCGTCAATAAGAAGGTGTAGAGACCGTATTGGTTC\n+TGGCTGGGTCGCCTCTGATGTAGTACTACTAACTTGAGTTGAAGAAGCTT\n+GTGTAACGTTTATATGACACTCGTACTCATCTAAATATGCTCGCATGGTT\n+GATCCAATGTTCAAAAACTTTCCTATTAACGACAATTGTGTTCCTCCCGA\n+CCTGGGCCCAATCGTGGGATATAATCCTGTTAGCAAAACATTCTTAAAGT\n+GAAATTGTACACTAGATTCAGTATACCCTGCATCATTTGCAACCTTTATA\n+GGCGCTGACATTTCATACATCACTGCTCCAGTGCGGCATTCGATCTTTAC\n+AGAAATTTGGTAGTTGACTAGTTCACAAGGCACAGACCCAATAAATATTT\n+TTCCACGCACATCTCCTTCGCGAATGCCCAAATTACTGCCTTCAATTGTA\n+ATAAGGGTACCACCCTCAATAGGTCCAGATAACGGTTTAATAATATCGAT\n+CCTTGGTAAAGGGCACTCGTTTTCTTTAGTTGTTTTTGATCCTGCACTAA\n+TAGCACGATCACTGTCTGCTATGCAAGTCTCGTTATATACACATGAGTTG\n+CTGCACCAAGCACATTGGTATTTTGGATCACGAGTGACACACAAACTGCA\n+ATCAGCATGATCCCGATGTGAGCCCAGTACGTCGCATTTATATAATGTAA\n+CAATCGCCGTGTCCACATAGTGCTGGAAATTCCATGTAATTACAACCTTT\n+GCTTGGTATTCATGTGTATTAGTCTCGTAGAAATAAGGTGTTTTTTCACA\n+AACAACAATCTTGTTTGACTCAATGTGGGCAGGCAATAGCATCTGAGCAG\n+CTTCAATATGAACTGTACACAAGAATCCAGCGTGAGCGCTTTTGGGTTTT\n+GGTAAGTTTTCTATCTCTAAACGAATTTCTTTTGGCACCCGCACCGGTAA\n+AAGAATCGCCGGACGATTGCTTTTTAAATGGGGGCATTGACCAACACTAG\n+TTACCGAATTTTCTATATTACGACATTGTATTGATTGATGGACACATTTA\n+TTGTCAAAAATACACC'..b'CCACTGGACCCGTTGGATAGCGTC\n+GGCACTTTTCTGTTTGGTGCCATTCACTGGTCACTAGTAGGACCGCTCTG\n+CCTATTAAAATAGGAGTGCTGCTTAGAATTTATTTCAGCAAGACAGCCGT\n+AAGATATATATGAATAGTATTTAACGGCAGTGGCAGAGGCCTTTACAATA\n+TAAGGCTTTACGGGATTTTAAACAATGAAAAACAAAAATATTTTTATAGA\n+GTCGAGATAAAATACTTTTTACAATAAATACTAAGTATTTTTAAAAGATA\n+AAAATATTTAAAAGTAAATACTGAATATTTTAACAGGTGTTAAGTACTGG\n+GAACTGTGACTAAGGACGGCGGTATATCGCTACCATAATATTTTTAAAGG\n+AACTGAATACTGAAAGATGTGACCAAAATGGTAGAATATCGCTAACGAAA\n+ATCACAGACGCAAATATCGATAGTGGCCTAGAGACCCGATATCGCCGCCG\n+TGATTATCGATGAAACTACAGCTGAGCTGCTTGTTTACATTCTAAAGTTA\n+AAATTTTTAAAAATTTCCAATACAAAAAAAAATTCTTCGTATTAACACGG\n+CTGTTTGCCGGTAAGATCTGAAGTGGATTCAAGTTGCAGCACCCTCAGGA\n+AAAGAATAAATTATTATAATATAATAATATAATATAAAGAATTTAAATTC\n+GAACCAAACGCGGTATGTCACTCTTCATTTAGAGAATTTGTGGCTTTGTT\n+TTGTACAAAAAACTATTCTTTTTTCTTGAAAATTAGCATCAAGAATTTAT\n+TGCCAAAACAGAACGCAATTCTGCTAAATCTGGTTACCCTGCCAAATGGC\n+TGGCCGTTCTGTGCATTCAATAACACAAGCTAACGGCTTACGGCACATTC\n+GGAAAGATCCAAAAGAATTTCTATTCCGGCATTTTTTATGTATTATCGTC\n+CAATTTTTGTATGTGTATTCATTCTTTTGGCTGTCCGTTATTAAGCTTTT\n+CTTATCCACATAAGCTGACCAGCTGCCAAAAAGCCGACCGTTTTGTGCAG\n+CCAATAACCCAAGCTAACTATCAACAGCAATTTCGAAAAATCCAGAAGAA\n+GCTATCCTTCGGCAATTTTTTCTTATATTATAATTTTTTTGTCACAATTT\n+TTTGTCAAAAAATCGACAATAATTAAGTGTTTACATTTTAATGCGATTTA\n+ATTGGAAATTTGAATTCGAATCAAACGCGGTGTCACTCTACATATGGACA\n+ATTTGTGGCTACAAAATTAGTTGAAAGTGCATGTTTTTTTTTAAGTGAAA\n+TAAAACAAAAACAGCAATAACAGGCCAAAATGTTGTTTTATAAATAAATA\n+CTTACATATCCGCATATAAATATGAATGAAAAAAAAAACAGCAAGACTGG\n+GCCAAAATATTGTTCTTTAATATGTAAATAAATACATATCTACATATACA\n+TATGTGGACAAAAGTGTTAAAATTAGTTAATAGTGCATGTTTTTTAAATG\n+AAAAAATAAAACAAAAAAAGCAAGCAAATATAAATTATATTCCACACACA\n+TTTACAATAATTTCAAACTACGCTAAAAATACCCAACAGAAAAAACATAG\n+AAAGGTAAACAAAATACAAGAATATCAAAAAAAATCTAATTTTCACGTTG\n+TTGTGGCCGGTACCACCGGTCATACATACATATAGATACATATTTAGATT\n+CTCACAAAAAGAATAGAAAATTACCGCTAATTTCCTTATATACGTTTTTG\n+TTTTCAGTGTTTTGAAATAGTATTTTTCAAACAAAAAACAATACAAAAGG\n+GTTAAAAAAATTGTTCGATTGGCTTTAACATACTAATTAAAAAAAATCAC\n+AATTTTTTGGCAAAATATCGAAAAAAATTAAGTGTTTACATTTTTATGCG\n+AATTATTTGGAAATTTAAATAAGAACCCAACGCGGTTTGTCACTCTACAT\n+ATGGACAATTTGTGGCTTTGTTTTGAACAAAAAATGAATTTTTTTTTACT\n+CAAAATTAACAAGAAGAAACAGTAATGCGGGTTTTGATCGCAATTCTGCT\n+AAATCGAATTTCCGTGCCCAAAGGCTGACCTTTTTGTGCAGCAAATAGCC\n+CAAGCTAATAATCTACAGCAATTTCTTAAAGACCGAAAATGTATCAACTT\n+CGGCAAAATATGAAAATTTAACATTTATTTTTCAACATTTTTTGCCAAAT\n+AATCGACAAAAATTTCAGTGTCCCGATTTGGATGCGAATTAATTGAGGAC\n+AATTGTGACTTTGTTTTGTAAAAAAACTATTTTTTTTACTGAAAATTACA\n+ATCAAGAATCTAAGGCCAAATCAGAATATTTTCACTGCGGTTTTTTGATC\n+GCAATTCTGCTAAATCGGGTTCCGTGCCAAAAAGCTGACTATTTTTTTTA\n+CTGAGAATTAGCATCAAGAATTTATTGCCAAAACAGAACGCAATTCTGCT\n+AAATCGGGTTGCCCTGCCAAAAGGCTGGCCGTTTTGCGCATTCAATAACA\n+CAAGCTAACGGTTTACAGCACATTCGGAAAGATCCAAAAGAATTTCTATT\n+TCGGCATTTTTTATGTATTATCGTCTAATTTTGGTATGTGTATTCATTCT\n+TTTGGCTGTCCGTTATTAAGCTGCTTTTCTTATTCACATATTCAATGGCG\n+CAGTACATAAAAAGAATGAACCGTGGTTTTCTTGCCCTCTCCATCTCCCT\n+CTACCACTTCCCCTCTCAACAACTATCTCACGCACTCTGTCCCTTCTCGT\n+CTCTGTCACCCTCTCTTTACCTACCTCACTCTGGCACACTCTCTCTACCT\n+ATCTCACTCTGTCACCTTCTTCTACCTAATTCTCTCTGTCGCGCTCGCTC\n+TCTCAACATGCCTTTCGCACCGTATCTCTTCGTTTCTCTGTATGCTTGCT\n+CTCTTAATTTAAGTTTCTCTTTCTTTGTGTTCAATATCTTTCGCGCTCGT\n+GACTCCTATTGACCGGACTCTGAGCGGTGCTCATTAAGAGTGGAGTTTTC\n+GATGATGGCGGGTGGCGCGAACGAGAATTTTTTACATAAAGGTAAGTTGC\n+CAATTCTTTTTTAAATGTGACATACAGCATGCATATTTTATTTATTGTAA\n+TTATATGTGAAAGAATAAAATTATATGTACTTTTATCTAATCTATTGCAT\n+CTATTTTTTCACAGGTAAACGAGTCACACGAGAAGTAAAACACAAACACA\n+AGGATCAAAATAAAATTCAGGTGAGTGAACGAACGTGTTGAAAGTAGTTA\n+ATAGTGCATGTCTATTTAAGTGTAAGAAACAAAAAAGACACAAATGGGCC\n+AATAATTCGTTTCTTTAATAGATAACTGCCTATATTATGTTCAAACTATG\n+CTAAAAAGACCCAAAAGGAAAACATAAAGTATATACCTTGCAAAATGAAT\n+AAAAAGAAATCATATATATTCATATACGTTTGACCGGTACCACCGGTCAT\n+ACATACATAAACATAAACACAAAAAGACTAGAATATAAATACCATATTTT\n+TGATTGGCTTAAAAATGGCACAAAAAAAAGATAAAAACTAGAGTGTCTAG\n+CTTTAAGTGACAATCGACTCGGAAAATGATCAAGAAATAAATGAAAAATT\n+TGTCTTGCGGCTTTTTGGTCGCAATTCTAAATCGGTTTGTATGTATGTCA\n+CTCTTCATGTATACAATTTGGTGGCTTTGTATTCCACAAAAGTCACAGTA\n+GTCACAAAAGTTTTTTTTACTGAAAATTACCATCAAGAGTCTATGGCCAA\n+ATCAGAATATTTTCACTGCGGTTTTTTATTTCAATTCTGCTAAATCGGGT\n+TTCCGTGCCAAAAAGCTTTTGCAGCCAACAACAATATTCAATTTTTTGGC\n+AAAAAATCGACAAAAAAATT\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta.fai --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/seq/dbia3.fa.fasta.fai Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -0,0 +1,70 @@ +contig1 45179 9 50 51 +contig2 45017 46101 50 51 +contig3 40006 92028 50 51 +contig4 55011 132844 50 51 +contig5 50018 188965 50 51 +contig6 40015 239993 50 51 +contig7 50017 280818 50 51 +contig8 35012 331845 50 51 +contig9 60018 367567 50 51 +contig10 43013 428796 50 51 +contig11 35013 472680 50 51 +contig12 56019 508404 50 51 +contig13 45015 565554 50 51 +contig14 45010 611480 50 51 +contig15 50014 657401 50 51 +contig16 45017 708426 50 51 +contig17 40013 754354 50 51 +contig18 40012 795178 50 51 +contig19 45013 836001 50 51 +contig20 50014 881925 50 51 +contig21 50011 932950 50 51 +contig22 60010 983972 50 51 +contig23 50012 1045193 50 51 +contig24 40010 1096216 50 51 +contig25 75023 1137037 50 51 +contig26 40013 1213571 50 51 +contig27 50016 1254395 50 51 +contig28 50013 1305422 50 51 +contig29 50006 1356446 50 51 +contig30 70018 1407463 50 51 +contig31 40012 1478892 50 51 +contig32 40014 1519715 50 51 +contig33 40016 1560540 50 51 +contig34 50012 1601367 50 51 +contig35 48011 1652390 50 51 +contig36 45010 1701372 50 51 +contig37 50013 1747293 50 51 +contig38 50017 1798317 50 51 +contig39 45019 1849345 50 51 +contig40 60015 1895275 50 51 +contig41 60014 1956501 50 51 +contig42 70020 2017726 50 51 +contig43 50016 2089157 50 51 +contig44 50013 2140184 50 51 +contig45 50013 2191208 50 51 +contig46 50012 2242232 50 51 +contig47 35007 2293255 50 51 +contig48 65012 2328973 50 51 +contig49 30003 2395296 50 51 +contig50 40009 2425910 50 51 +contig51 50015 2466730 50 51 +contig52 40012 2517756 50 51 +contig53 50013 2558579 50 51 +contig54 35008 2609603 50 51 +contig55 40015 2645322 50 51 +contig56 55020 2686148 50 51 +contig57 60013 2742279 50 51 +contig58 50011 2803503 50 51 +contig59 40011 2854525 50 51 +contig60 50013 2895347 50 51 +contig61 40008 2946371 50 51 +contig62 50017 2987190 50 51 +contig63 55021 3038218 50 51 +contig64 40016 3094350 50 51 +contig65 45013 3135177 50 51 +contig66 45011 3181101 50 51 +contig67 44531 3227023 50 51 +contig68 25628 3272455 50 51 +contig69 44962 3298606 50 51 +contig70 55020 3344478 50 51 |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/seq/refSeqs.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/seq/refSeqs.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| b'@@ -0,0 +1,1 @@\n+[{"end":"45179","length":45179,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig1","offset":"9","start":0},{"end":"43013","length":43013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig10","offset":"428796","start":0},{"end":"35013","length":35013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig11","offset":"472680","start":0},{"end":"56019","length":56019,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig12","offset":"508404","start":0},{"end":"45015","length":45015,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig13","offset":"565554","start":0},{"end":"45010","length":45010,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig14","offset":"611480","start":0},{"end":"50014","length":50014,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig15","offset":"657401","start":0},{"end":"45017","length":45017,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig16","offset":"708426","start":0},{"end":"40013","length":40013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig17","offset":"754354","start":0},{"end":"40012","length":40012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig18","offset":"795178","start":0},{"end":"45013","length":45013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig19","offset":"836001","start":0},{"end":"45017","length":45017,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig2","offset":"46101","start":0},{"end":"50014","length":50014,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig20","offset":"881925","start":0},{"end":"50011","length":50011,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig21","offset":"932950","start":0},{"end":"60010","length":60010,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig22","offset":"983972","start":0},{"end":"50012","length":50012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig23","offset":"1045193","start":0},{"end":"40010","length":40010,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig24","offset":"1096216","start":0},{"end":"75023","length":75023,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig25","offset":"1137037","start":0},{"end":"40013","length":40013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig26","offset":"1213571","start":0},{"end":"50016","length":50016,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig27","offset":"1254395","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig28","offset":"1305422","start":0},{"end":"50006","length":50006,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig29","offset":"1356446","start":0},{"end":"40006","length":40006,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig3","offset":"92028","start":0},{"end":"70018","length":70018,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig30","offset":"1407463","start":0},{"end":"40012","length":40012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig31","offset":"1478892","start":0},{"end":"40014","length":40014,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig32","offset":"1519715","start":0},{"end":"40016","length":40016,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig33","offset":"1560540","start":0},{"end":"50012","length":50012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig34","offset":"1601367","start":0},{"end":"48011","length":48011,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig35","offset":"1652390","start":0},{"end":"45010","length":45010,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig36","offset":"1701372","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig37","offset":"1747293","start":0},{"end":"50017","length":50017,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig38","offset":"1798317","start":0},{"end":"45019","length":45019,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig39","offset":"1849345","start":0},{"end":"55011"'..b'","length":50016,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig43","offset":"2089157","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig44","offset":"2140184","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig45","offset":"2191208","start":0},{"end":"50012","length":50012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig46","offset":"2242232","start":0},{"end":"35007","length":35007,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig47","offset":"2293255","start":0},{"end":"65012","length":65012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig48","offset":"2328973","start":0},{"end":"30003","length":30003,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig49","offset":"2395296","start":0},{"end":"50018","length":50018,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig5","offset":"188965","start":0},{"end":"40009","length":40009,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig50","offset":"2425910","start":0},{"end":"50015","length":50015,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig51","offset":"2466730","start":0},{"end":"40012","length":40012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig52","offset":"2517756","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig53","offset":"2558579","start":0},{"end":"35008","length":35008,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig54","offset":"2609603","start":0},{"end":"40015","length":40015,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig55","offset":"2645322","start":0},{"end":"55020","length":55020,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig56","offset":"2686148","start":0},{"end":"60013","length":60013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig57","offset":"2742279","start":0},{"end":"50011","length":50011,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig58","offset":"2803503","start":0},{"end":"40011","length":40011,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig59","offset":"2854525","start":0},{"end":"40015","length":40015,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig6","offset":"239993","start":0},{"end":"50013","length":50013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig60","offset":"2895347","start":0},{"end":"40008","length":40008,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig61","offset":"2946371","start":0},{"end":"50017","length":50017,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig62","offset":"2987190","start":0},{"end":"55021","length":55021,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig63","offset":"3038218","start":0},{"end":"40016","length":40016,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig64","offset":"3094350","start":0},{"end":"45013","length":45013,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig65","offset":"3135177","start":0},{"end":"45011","length":45011,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig66","offset":"3181101","start":0},{"end":"44531","length":44531,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig67","offset":"3227023","start":0},{"end":"25628","length":25628,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig68","offset":"3272455","start":0},{"end":"44962","length":44962,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig69","offset":"3298606","start":0},{"end":"50017","length":50017,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig7","offset":"280818","start":0},{"end":"55020","length":55020,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig70","offset":"3344478","start":0},{"end":"35012","length":35012,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig8","offset":"331845","start":0},{"end":"60018","length":60018,"line_byte_length":"51","line_length":"50","name":"contig9","offset":"367567","start":0}]\n\\ No newline at end of file\n' |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/myHub/trackList.json --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/only_genome/myHub/trackList.json Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| [ |
| @@ -0,0 +1,20 @@ +{ + "formatVersion" : 1, + "names" : { + "type" : "Hash", + "url" : "names/" + }, + "tracks" : [ + { + "category" : "Reference sequence", + "faiUrlTemplate" : "seq/dbia3.fa.fasta.fai", + "key" : "Reference sequence", + "label" : "DNA", + "seqType" : "dna", + "storeClass" : "JBrowse/Store/Sequence/IndexedFasta", + "type" : "SequenceTrack", + "urlTemplate" : "seq/dbia3.fa.fasta", + "useAsRefSeqStore" : 1 + } + ] +} |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 test-data/only_genome/only_genome.html --- a/test-data/only_genome/only_genome.html Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 |
| b |
| @@ -1,11 +0,0 @@ -<html> - <body> - <p> - The following JBrowse hub has been generated by JBrowse Archive Creator: - </p> - <ul> - <li> Genome name: Dbia3 </li> - <li> Track settings: myHub/Dbia3/trackList.json </li> - </ul> - </body> -</html> |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 util/Reader.py --- a/util/Reader.py Fri Apr 13 18:21:35 2018 -0400 +++ b/util/Reader.py Fri Apr 20 12:29:32 2018 -0400 |
| b |
| @@ -37,7 +37,7 @@ data_file = codecs.open(self.inputFile, 'r', 'utf-8') return json.load(data_file) except IOError: - print "Cannot find JSON file\n" + print ("Cannot find JSON file\n") exit(1) def getToolDir(self): |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 util/__pycache__/Reader.cpython-35.pyc |
| b |
| Binary file util/__pycache__/Reader.cpython-35.pyc has changed |
| b |
| diff -r 4a69515eed63 -r b1553f2a4942 util/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc |
| b |
| Binary file util/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc has changed |