Repository 'ncbi_blast_plus'
hg clone https://testtoolshed.g2.bx.psu.edu/repos/devteam/ncbi_blast_plus

Changeset 38:2be8f8cc13de (2018-10-23)
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Commit message:
planemo upload for repository https://github.com/peterjc/galaxy_blast/tree/master/tools/ncbi_blast_plus commit d6b8f7e6a7c316bb9a70aec22ad5767956d4ea11-dirty
modified:
tools/ncbi_blast_plus/README.rst
tools/ncbi_blast_plus/ncbi_blastdbcmd_wrapper.xml
tools/ncbi_blast_plus/ncbi_macros.xml
tools/ncbi_blast_plus/ncbi_tblastn_wrapper.xml
b
diff -r 996c3ef26f37 -r 2be8f8cc13de tools/ncbi_blast_plus/README.rst
--- a/tools/ncbi_blast_plus/README.rst Tue Oct 23 08:38:16 2018 -0400
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/README.rst Tue Oct 23 10:40:59 2018 -0400
b
@@ -264,6 +264,8 @@
           output format it must be mapped to different command line arguments.
         - Extend gzipped query support to all the command line tools.
         - Workaround for gzipped support under Galaxy release 16.01 or older.
+v0.3.2  - Fixed incomplete ``@CLI_OPTIONS@`` macro in the help text for the
+          ``tblastn`` and ``blastdbcmd`` wrappers.
 ======= ======================================================================
 
 
b
diff -r 996c3ef26f37 -r 2be8f8cc13de tools/ncbi_blast_plus/ncbi_blastdbcmd_wrapper.xml
--- a/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_blastdbcmd_wrapper.xml Tue Oct 23 08:38:16 2018 -0400
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_blastdbcmd_wrapper.xml Tue Oct 23 10:40:59 2018 -0400
b
@@ -131,7 +131,7 @@
 
 -------
 
-@CLI_OPTIONS
+@CLI_OPTIONS@
 
 -------
 
b
diff -r 996c3ef26f37 -r 2be8f8cc13de tools/ncbi_blast_plus/ncbi_macros.xml
--- a/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_macros.xml Tue Oct 23 08:38:16 2018 -0400
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_macros.xml Tue Oct 23 10:40:59 2018 -0400
b
@@ -1,5 +1,5 @@
 <macros>
-    <token name="@WRAPPER_VERSION@">0.3.1</token>
+    <token name="@WRAPPER_VERSION@">0.3.2</token>
     <xml name="parallelism">
         <!-- If job splitting is enabled, break up the query file into parts -->
         <parallelism method="multi" split_inputs="query" split_mode="to_size" split_size="1000" merge_outputs="output1" />
b
diff -r 996c3ef26f37 -r 2be8f8cc13de tools/ncbi_blast_plus/ncbi_tblastn_wrapper.xml
--- a/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_tblastn_wrapper.xml Tue Oct 23 08:38:16 2018 -0400
+++ b/tools/ncbi_blast_plus/ncbi_tblastn_wrapper.xml Tue Oct 23 10:40:59 2018 -0400
b
@@ -166,7 +166,7 @@
 
 ------
 
-@CLI_OPTIONS
+@CLI_OPTIONS@
 
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