# HG changeset patch # User yating-l # Date 1483115749 18000 # Node ID 86143078e98bf9c31dd405ed0fa180e284b9e12e # Parent 2219ff1964055e061dfe2306ee01f12dd7105304 planemo upload for repository https://github.com/goeckslab/hub-archive-creator commit e42ecb807fb34a8e4ddcf96944dd74d24c695352-dirty diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/all_datatypes/__main__.log --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/all_datatypes/__main__.log Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,120 @@ +DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### + +DEBUG:root:Calling faToTwoBit: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling twoBitInfo: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling sort: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:input_false_path: /home/galaxy/Dev/galaxy/database/files/002/dataset_2738.dat +DEBUG:root:data_value: {u'index': u'/home/galaxy/Dev/galaxy/database/files/_metadata_files/000/metadata_61.dat', u'order_index': u'10', u'name': 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+ The following has been generated by Hub Archive Creator: +

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directory /home/galaxy/galaxy/dependency_dir/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... +# fly version. Using default transition matrix. +# Looks like /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_2.dat is in fasta format. +# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. +# +# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 1 on both strands +# start gene contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS gene 553 34688 0.03 - . contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS transcript 553 34688 0.03 - . contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 553 578 0.41 - 2 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; +contig1 AUGUSTUS CDS 652 1047 0.25 - 2 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; +contig1 AUGUSTUS CDS 12541 12968 0.87 - 1 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; +contig1 AUGUSTUS CDS 32202 33826 0.89 - 0 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; +contig1 AUGUSTUS CDS 33880 34044 0.98 - 0 transcript_id "contig1.g1.t1"; gene_id "contig1.g1"; +contig1 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FEGCFKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEYPGCSKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKAPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGAEFYANKKHKGLPL +# NDANSRLHRDSGQGRHNLQEHNIDSSPCSEELQVGKLIGMSSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLP +# IVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINSSMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSN +# ITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRSSQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAI +# NKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLIATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQ +# SEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSSSNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNY +# MEKDDVAISTHHQSVNCTKESPAQLSSPSNDIVAQFNLPSITSASNYGNRSKGYNGENGEDSQSKNYFTHLSFDFMNNVLFAGATNKILKLNENLRVL +# SEAVTGPVNDSPQCHAGGCPEDIETSLVNNYNKILVVSYAHDGILISCGSIRQEERLLHEQVTHSVVILHILQDDLDEKVQCRVNDLDTISQVKLKIL +# DAIFKNTPFSMRPSVHEVDLEWRHGRGGHLTLQDEDLTTKTINGWKRLNTLAHYGVKESAVMSLIARQNDNYHIPYGKNQNQAPYHNFISNFQCY] +# end gene contig1.g1 +### +# +# ----- prediction on sequence number 2 (length = 45017, name = contig2) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 2 on both strands +# start gene contig2.g2 +contig2 AUGUSTUS gene 7855 39627 0.09 - . contig2.g2 +contig2 AUGUSTUS transcript 7855 39627 0.09 - . contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 7855 7969 0.61 - 1 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 17035 18659 0.78 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 18713 18877 0.99 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 18940 19452 0.98 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 19507 20144 0.39 - 2 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 39396 39481 0.69 - 1 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS CDS 39575 39627 0.77 - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +contig2 AUGUSTUS start_codon 39625 39627 . - 0 transcript_id "contig2.g2.t1"; gene_id "contig2.g2"; +# coding sequence = [atgccatcggccaagaagccgccctccattctccattggggaaccactggagaccatgacaacaccgttggcatattgg +# gaatcggagttgaatggccaggagaagatgtggaagcatccgcgacactagaagcaggacatccttatgttaactgtgcgtcagcttttcaccttgcg +# ggactggggttgggatcaggagattttttgggcacccgaggaatgggctcactgggtgatctccatcatgcggctgtagcagcagcggctgcaggatc +# tctagccagcactgattttcacttcagcattgatggcaacaggcgattaagtagtcctcggccgcccggcggaagtattcgtgcaagcatcagcagaa +# aacgagcgctttcctcatcgccttattcggattcgtttgacattaactcaatgattcgattttcaccaaactccttagccacaattatgaatggctct +# cgaggaagcagcgcggcaagtggttcatatggtcatatttcagctagtgctattaatcctatatctcatgcacattcaacattggcaccacgtctaca +# gcatttgttacgtgcaagtgcaggtcttttaaatccgatgaatacacaacaagcagctgcggccgggttttctataagccacgctgcaagcgctgcag +# ccttaagcctcaacgacgttcatggtaatctaaatgatttaccaggccaaataacaccatcttcaacagcaagactagtagcggatgaacataaaatg +# gcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagccctcatcaacatcaggaagcgt +# ggcccaagtagaagcggacagcgcatcgtcacatttgtctgatcgctgttataacaacatagcaagtactaccaaaagtattgttggtgatgtgaaaa +# caagcagacgctgtgaagactttataagtagtggatcagcttcgactccattaaatgaatatgattgtgccaacgctgatacgacggatattaaagat +# gaacctggagattttatagaaacaaattgtcattggcgaagttgttgtattgaatttaatacgcaagatgagcttgttaaacatatcaataatgacca +# tatccaaaccaataagaaggcctttgtctgtcgatgggaaaattgtacccgtggtgaaaaacctttcaaagcgcagtatatgctagttgtgcatatgc +# gtcgtcataccggcgaaaagccacataaatgcacatttgaaggctgttttaaggcatattcacgcttggaaaacctaaaaacacatttacggtcacac +# acaggtgaaaaaccctatatgtgcgagtatccgggatgcagcaaggcgtttagtaatgcaagcgatcgtgcaaagcatcaaaatcgtactcacagtaa +# tgagaaaccgtacatttgtaaagctcctggttgcacgaaacgttacaccgacccaagttctttgcgtaaacatgttaaaacagttcatggtgctgagt +# tttatgctaataaaaaacacaagggattgcccctaaatgatgcgaactctcgcctccaccgagacagtggccaaggtcggcataatcttcaagagcat +# aatattgactctagcccttgcagcgaagaacttcaggtgggaaaacttataggcatgtctagtcccagtattaaatctgaatctgatgaaagttcacc +# acatcatcagttgttaagtggagttcgagcttcagactgttttttaacatattcacaagatggtgccgccgaacatataactttagatgacggctggg +# attgtgacgatgacgttgacgtggccgacttaccaattgtcttgcgtgctatggtaaatgttggcagcggaaattcgatggccccgaccattggaggg +# ggtgttgttgcgaggcagcgatttagaagtcgtttgcaaactaaaggaataaactctagtatggttatgcttggcaacatccccgaaagcaatcgcac +# cattggaataagcgaacttaaccagcgtataacagaacttaagatggagcctggtaccgcttgtgatattacagttccattgaatacggggctggaaa +# ggatttcagaagacttatcacaaaatcaatcaaatataacattaaataagcaaagcttctttaccgcttccggctctctccaaggacattttcgtcgc +# gatagccagaactccactgcaagtacatattatggtagcatgcaaagtcgccgcagtagtcaatcatctcaggtgtcttctatatctacaatgcgtcc +# aggcccatcgtacaacacaaccacagcttccctctatgatccaatttccccaggatgctctcgacgctctagccaaatgtctaatgtagtcaactcct +# acgcacttacatcaacatcaggattgactgcaattaacaaggacttaaatgcaaacagcagcccaaatgcttctattaataaaccgggtcttggtggt +# cagtactttggtttttacaataacagtcttcctccacctccatcgtctcatttaattgccaccaatttgaagcatctgcaggacacagactctaggag +# ttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatggaccggctggagagcaggaaattg +# ataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaatgtttctcctttaagtggccca +# ctgcaaaatttgcagtttcccattggaaaggctaggaacgtgaatataacatcgtctagtaacgagaatactttaagaaagggaccttgccatgctac +# aatgaagactgaaatgacaatgaccagcgagcagcatccaaatgagagaataaatttggatgaagttgaagagcttatacttcccgatgagatgcttc +# agtatttaaatttggtgaaggacgatcaaaattatatggagaaagatgatgttgctataaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtg +# atagacgatccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaatag] +# protein sequence = [MPSAKKPPSILHWGTTGDHDNTVGILGIGVEWPGEDVEASATLEAGHPYVNCASAFHLAGLGLGSGDFLGTRGMGSLG +# DLHHAAVAAAAAGSLASTDFHFSIDGNRRLSSPRPPGGSIRASISRKRALSSSPYSDSFDINSMIRFSPNSLATIMNGSRGSSAASGSYGHISASAIN +# PISHAHSTLAPRLQHLLRASAGLLNPMNTQQAAAAGFSISHAASAAALSLNDVHGNLNDLPGQITPSSTARLVADEHKMAALSQKDFNDGNQRNRQRK +# STVTEQPSSTSGSVAQVEADSASSHLSDRCYNNIASTTKSIVGDVKTSRRCEDFISSGSASTPLNEYDCANADTTDIKDEPGDFIETNCHWRSCCIEF +# NTQDELVKHINNDHIQTNKKAFVCRWENCTRGEKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCFKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEYPGCSKAFSN +# ASDRAKHQNRTHSNEKPYICKAPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGAEFYANKKHKGLPLNDANSRLHRDSGQGRHNLQEHNIDSSPCSEELQVGKLIGM +# SSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLPIVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINS +# SMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSNITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRS +# SQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAINKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLI +# ATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQSEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSS +# SNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNYMEKDDVAIRFRLQMSSSSMRVIDDPSSSAGVDLRILSVQR +# HGKNPE] +# end gene contig2.g2 +### +# start gene contig2.g3 +contig2 AUGUSTUS gene 41706 42608 0.66 - . contig2.g3 +contig2 AUGUSTUS transcript 41706 42608 0.66 - . contig2.g3.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 41706 42171 0.93 - 1 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; +contig2 AUGUSTUS CDS 42268 42608 0.7 - 0 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; +contig2 AUGUSTUS start_codon 42606 42608 . - 0 transcript_id "contig2.g3.t1"; gene_id "contig2.g3"; +# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac +# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg +# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga +# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg +# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc +# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa +# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga +# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac +# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] +# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI +# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT +# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] +# end gene contig2.g3 +### +# +# ----- prediction on sequence number 3 (length = 40006, name = contig3) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 3 on both strands +# start gene contig3.g4 +contig3 AUGUSTUS gene 6691 7593 0.64 - . contig3.g4 +contig3 AUGUSTUS transcript 6691 7593 0.64 - . contig3.g4.t1 +contig3 AUGUSTUS CDS 6691 7156 0.95 - 1 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; +contig3 AUGUSTUS CDS 7253 7593 0.67 - 0 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; +contig3 AUGUSTUS start_codon 7591 7593 . - 0 transcript_id "contig3.g4.t1"; gene_id "contig3.g4"; +# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac +# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg +# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga +# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg +# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc +# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa +# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga +# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac +# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] +# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI +# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT +# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] +# end gene contig3.g4 +### +# start gene contig3.g5 +contig3 AUGUSTUS gene 29077 31134 0.18 + . contig3.g5 +contig3 AUGUSTUS transcript 29077 31134 0.18 + . contig3.g5.t1 +contig3 AUGUSTUS start_codon 29077 29079 . + 0 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; +contig3 AUGUSTUS CDS 29077 29111 0.4 + 0 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; +contig3 AUGUSTUS CDS 29169 29249 0.43 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; +contig3 AUGUSTUS CDS 30793 30942 0.65 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; +contig3 AUGUSTUS CDS 31113 31134 0.75 + 1 transcript_id "contig3.g5.t1"; gene_id "contig3.g5"; +# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt +# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat +# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaaggatcactag +# ccaagtcacctag] +# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV +# QDTTTNNRYPRITSQVT] +# end gene contig3.g5 +### +# +# ----- prediction on sequence number 4 (length = 55011, name = contig4) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 4 on both strands +# start gene contig4.g6 +contig4 AUGUSTUS gene 19075 51981 0.04 + . contig4.g6 +contig4 AUGUSTUS transcript 19075 51981 0.04 + . contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS start_codon 19075 19077 . + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 19075 19109 0.47 + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 19167 19247 0.44 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 20791 20940 0.57 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 31331 31523 0.57 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 36906 37059 0.52 + 0 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 37833 37902 0.74 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 50913 51073 0.7 + 1 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 51131 51361 0.58 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +contig4 AUGUSTUS CDS 51833 51981 0.41 + 2 transcript_id "contig4.g6.t1"; gene_id "contig4.g6"; +# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt +# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat +# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaagaaacttgga +# tacaaaaaattcatcgaatacacaatcaaacgacgctaaggagacatcaaatgataaaaaaaaaccgcatatcaaaaaaccactaaatgcgtttatgc +# tctatatgaaggaaatgcgcgctaaagttgttgccgaatgtacactaaaagaatcggctgctattaatcagattttgggaagacggtggcatgccttg +# gggcgtgaagagcaagcgaagtattacgagttggcgcgaagggagcgacaactgcacatgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctc +# tcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacgacggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaat +# ggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgttatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacac +# ggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacgatgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagctgtctaagtggattgtc +# cagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctcttttgatcgtcaacgcagatc +# cgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaaccccaaatacctcaagtaca +# gtttcgccagttacagctaaaatgattgagccgacaatgttgtcggtgagtactcatgctgtaaatagcactgagtgccataaaggatcagatccaca +# agcaaatgcatctgtaaagactacaagcgctggcgcttccgaaactggcgtcattagcgtttcataa] +# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV +# QDTTTNNRYPRNLDTKNSSNTQSNDAKETSNDKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALGREEQAKYYELARRERQLH +# MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDEHGSQLSDDDDDDYDDDKLGG +# SCGSADESCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVSTSGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTAKMIEPTMLSVSTH +# AVNSTECHKGSDPQANASVKTTSAGASETGVISVS] +# end gene contig4.g6 +### +# +# ----- prediction on sequence number 5 (length = 50018, name = contig5) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 5 on both strands +# start gene contig5.g7 +contig5 AUGUSTUS gene 43345 45058 0.19 - . contig5.g7 +contig5 AUGUSTUS transcript 43345 45058 0.19 - . contig5.g7.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 43345 44665 0.2 - 1 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; +contig5 AUGUSTUS CDS 44724 44948 0.88 - 1 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; +contig5 AUGUSTUS CDS 45006 45058 0.94 - 0 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; +contig5 AUGUSTUS start_codon 45056 45058 . - 0 transcript_id "contig5.g7.t1"; gene_id "contig5.g7"; +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt +# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt +# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg +# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt +# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac +# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc +# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt +# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata +# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg +# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt +# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct +# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag +# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] +# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV +# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV +# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG +# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM +# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT +# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] +# end gene contig5.g7 +### +# +# ----- prediction on sequence number 6 (length = 40015, name = contig6) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 6 on both strands +# start gene contig6.g8 +contig6 AUGUSTUS gene 13336 15049 0.08 - . contig6.g8 +contig6 AUGUSTUS transcript 13336 15049 0.08 - . contig6.g8.t1 +contig6 AUGUSTUS CDS 13336 14656 0.17 - 1 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; +contig6 AUGUSTUS CDS 14715 14939 0.91 - 1 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; +contig6 AUGUSTUS CDS 14997 15049 0.42 - 0 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; +contig6 AUGUSTUS start_codon 15047 15049 . - 0 transcript_id "contig6.g8.t1"; gene_id "contig6.g8"; +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt +# 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for sequence number 7 on both strands +# start gene contig7.g9 +contig7 AUGUSTUS gene 3332 5045 0.23 - . contig7.g9 +contig7 AUGUSTUS transcript 3332 5045 0.23 - . contig7.g9.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 3332 4652 0.41 - 1 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; +contig7 AUGUSTUS CDS 4711 4935 0.85 - 1 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; +contig7 AUGUSTUS CDS 4993 5045 0.52 - 0 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; +contig7 AUGUSTUS start_codon 5043 5045 . - 0 transcript_id "contig7.g9.t1"; gene_id "contig7.g9"; +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# 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AUGUSTUS gene 38941 46896 0.08 + . contig7.g10 +contig7 AUGUSTUS transcript 38941 46896 0.08 + . contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS start_codon 38941 38943 . + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +contig7 AUGUSTUS CDS 38941 39182 0.69 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +contig7 AUGUSTUS CDS 39248 39354 0.65 + 1 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +contig7 AUGUSTUS CDS 39978 40351 0.32 + 2 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +contig7 AUGUSTUS CDS 40423 40623 0.3 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +contig7 AUGUSTUS CDS 44971 46896 0.35 + 0 transcript_id "contig7.g10.t1"; gene_id "contig7.g10"; +# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac +# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat +# 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[MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN +# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ +# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG +# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM +# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ +# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR +# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV +# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY +# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM +# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIGKDINSTSLQNKIHKPG] +# end gene contig7.g10 +### +# +# ----- prediction on sequence number 8 (length = 35012, name = contig8) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 8 on both strands +# start gene contig8.g11 +contig8 AUGUSTUS gene 8930 26669 0.02 + . contig8.g11 +contig8 AUGUSTUS transcript 8930 26669 0.02 + . contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS start_codon 8930 8932 . + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 8930 9171 0.51 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 9237 9343 0.59 + 1 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 9967 10340 0.24 + 2 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 10412 10612 0.22 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 14960 16832 0.58 + 0 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +contig8 AUGUSTUS CDS 26515 26669 0.46 + 2 transcript_id "contig8.g11.t1"; gene_id "contig8.g11"; +# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac +# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat +# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga +# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag +# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata +# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat +# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta +# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct +# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt +# 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TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV +# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY +# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM +# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIDSWAFTEVDDDDMLIVKYADDTAVMVRS +# PSIDIATLGLPEYVTKNGQPKGK] +# end gene contig8.g11 +### +# +# ----- prediction on sequence number 9 (length = 60018, name = contig9) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 9 on both strands +# start gene contig9.g12 +contig9 AUGUSTUS gene 8930 48218 0.01 + . contig9.g12 +contig9 AUGUSTUS transcript 8930 48218 0.01 + . contig9.g12.t1 +contig9 AUGUSTUS start_codon 8930 8932 . + 0 transcript_id "contig9.g12.t1"; gene_id "contig9.g12"; +contig9 AUGUSTUS CDS 8930 9171 0.57 + 0 transcript_id "contig9.g12.t1"; gene_id "contig9.g12"; +contig9 AUGUSTUS CDS 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SNTLNRGRSRGRNRIEYPSDSPSIDNEVQTITVTHFLPSEVTIPVVSGHVTEYKNIVTAKTSTELLGPNEYMKVLGTNGLSSTYLNREVSSINIAGAT +# EHTKYLLHESITSAVIFTPTTIRGRKTSFSHIIPSTAYSVENVVTTIPPQISDNAPLANILLSQLLLGNLNLPAHPLIGAVGQPNAASVVIPTEPITE +# YRTHTSTYVTTIFDGKSTILPVTFQGKKILTTVYDTTAQTITATEYSVDTIVSTPPSVQNIQSVGPAAHVNNLLLQQLLIQQQQESLSLAQSITNTLP +# PPIFLGEHLQDLDDFSRSLLKKDGIDADIGSVSNESQFTKSHRKKSRKGNSGHKRNKENQMTKENPDPSVVTLYVSGRRPGEFSTILSTSSNDTSVSK +# GETASLKMDVGLTELSDRTASLESIVGDVDLWYAKSSRQPIRMSTTINSVDV] +# end gene contig9.g12 +### +# +# ----- prediction on sequence number 10 (length = 43013, name = contig10) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 10 on both strands +# start gene contig10.g13 +contig10 AUGUSTUS gene 850 15075 0.07 + . contig10.g13 +contig10 AUGUSTUS transcript 850 15075 0.07 + . contig10.g13.t1 +contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; +contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 0.57 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; +contig10 AUGUSTUS CDS 1132 1326 0.85 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; +contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 0.61 + 0 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; +contig10 AUGUSTUS CDS 14882 15075 0.44 + 2 transcript_id "contig10.g13.t1"; gene_id "contig10.g13"; +# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa +# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca +# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacaggaaaccattttacttcctcataattcttttattacaaacatttttctaac +# cacgtgcacctatatcacaacatatgtggaaaatggaagctcgaatgtagtaaaagaaaaaatggttatatcaaacaccattacgcaagatcgaaagt +# atttgcatgcaagtaatcctatgataatagacatcactttttcaaggccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcatgtcacc +# acatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggtcaacaa +# tcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgccatacatt +# tggaaatggccaccgatcttagcatagacacattcctggcatgtcttcggcgtttcatgtcccttcgaggaaagtgctcacagatcttcagcgacaat +# ggaacgaatttagttgatcccaaacacgctttagatgagatgcaccgcaggagcacaaagcaatgtaacacaatcgttggccaatga] +# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQETI +# LLPHNSFITNIFLTTCTYITTYVENGSSNVVKEKMVISNTITQDRKYLHASNPMIIDITFSRPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVKTT +# ALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNAIHLEMATDLSIDTFLACLRRFMSLRGKCSQIFSDNGTNLVDPKHALDEMHRRST +# KQCNTIVGQ] +# end gene contig10.g13 +### +# start gene contig10.g14 +contig10 AUGUSTUS gene 21687 22382 0.44 - . contig10.g14 +contig10 AUGUSTUS transcript 21687 22382 0.44 - . contig10.g14.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 21687 22382 0.44 - 0 transcript_id "contig10.g14.t1"; gene_id "contig10.g14"; +contig10 AUGUSTUS start_codon 22380 22382 . - 0 transcript_id "contig10.g14.t1"; gene_id "contig10.g14"; +# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag +# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa +# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag +# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact +# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat +# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa +# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc +# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] +# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH +# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM +# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] +# end gene contig10.g14 +### +# +# ----- prediction on sequence number 11 (length = 35013, name = contig11) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 11 on both strands +# start gene contig11.g15 +contig11 AUGUSTUS gene 682 1377 0.49 - . contig11.g15 +contig11 AUGUSTUS transcript 682 1377 0.49 - . contig11.g15.t1 +contig11 AUGUSTUS CDS 682 1377 0.49 - 0 transcript_id "contig11.g15.t1"; gene_id "contig11.g15"; +contig11 AUGUSTUS start_codon 1375 1377 . - 0 transcript_id "contig11.g15.t1"; gene_id "contig11.g15"; +# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag +# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa +# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag +# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact +# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat +# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa +# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc +# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] +# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH +# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM +# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] +# end gene contig11.g15 +### +# +# ----- prediction on sequence number 12 (length = 56019, name = contig12) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 12 on both strands +# start gene contig12.g16 +contig12 AUGUSTUS gene 11355 43960 0.01 - . contig12.g16 +contig12 AUGUSTUS transcript 11355 43960 0.01 - . contig12.g16.t1 +contig12 AUGUSTUS CDS 11355 11375 0.49 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 11608 11710 0.88 - 1 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 11851 11866 0.34 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 15468 16080 0.24 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 20121 20293 0.61 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 20564 20662 0.67 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 28341 28409 0.33 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 33475 33622 0.51 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 38609 42222 0.43 - 2 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS CDS 43900 43960 0.66 - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +contig12 AUGUSTUS start_codon 43958 43960 . - 0 transcript_id "contig12.g16.t1"; gene_id "contig12.g16"; +# coding sequence = [atgcctaaaacaagccagaactttcgaatcaaggttaaaaagcgatattattcagaaagagtccccaaccttttaaaaa +# aatcaaatggaggacaactaccaacaataccaatgtaccctggtgatattccatcttattctccgccgtctcgagcattctttacaccgccacttccg +# ccggagtatcaaaacccttttgctgacaagcctaccttgcgtggaaccaataatgagggtctaattgcaattaataggcgtccgatcccaccccctag +# tttgatgcctagtcaagatcggatcccaattcgaccaccagatctgggtggcaatagtaacgatgctattgtcaatccattagcggatttaagttacg +# ctaattctggttttgatgaaaagcactctcttgattctagtggagctgtgcctgatgtgtccacaacagatcgtaaaaaagctctcaatacaccggca +# cgtgccagcggcgaagacgtattaaacgaaaaggcaaacagggtaaagggacacggctctcttgaaccagatgccaatgatcctagtaagagacaaga +# agttttacccaatataagacgtattctgggatcaaatggaaagaacagtgatataccagctgtgttgttaaagcaagttactcagcgaccccaaataa +# acatgcgccaaccgccgtcttcgccagttgtactgattgaaaagcctttaacgaacgaggaaaaaacagatgctgatggatcctccatggttagtcct +# aatattaatcagagcaagtaccaccctggtcagttggactactacgacaattctaatcagactataggaaccacaccatcagcagctgctgctattgg +# ggaagtatcggccacctcattttcttacgctactacaaacgcggaccagccaggacatacaggaaaagatactgacgctgttaagagtttggttccga +# gcctaggcgatcgcgatgctgtcgctgcctcagctgctgctgcttcagcacacagtacatggacctgggcctggaatattcacatctatctgtcagtt +# gttctgtttaccattttatcggtatattcgctatacaaactgctgacctataacaagcttacacatttgtttgcacagtcgtattttgtgtgcatcca +# tctcatacttattttgacctgcataatgagaatattttttctttgttttgatgcatacaacgttcatggttcctttaacatttttagctcagaactct +# tgctgaatctaccttcaacattcttaacagtagctttctctgtacttatgttgttcctcttccttaagtctttgaaccacaaaaacaatagatattca +# gctctgataaggccgctgacggtgattgtgggctgcggcgttcacgttgtgctttgcattacattgcactacgttgaatcctataccctaaaaaatca +# tcatttatattttcagcaacagcagcaacagcaatattttcgcaggcagcatcttcataatcagcaaggccaacttattgctacaattactccttcgg +# ctattttgcctccgcctccccgagtcttgacccttatatgtcagataatttatatatttatatgtctaagcttgggactgctttatctctacttgtat +# cgcattttaaaacgcattcttcgcagcaaatctcaaaactatatacatggctatcagaatttatcctatgccatacacattacgattgccacagctct +# tctgtttgtactactggccgcccttcaaatattcggtgccatatgtatttcatcgtctcgtcaaaataatatagtagatgtcgactggcttcaatggg +# gatatcagttctctctacgtcttatagagatagcgataattactttaatatcgtgggtaactgggcttaaaaccagtgccgggcatgatacattaaat +# gctgtaaatgtggatgttcgaatggttggttccggagtgggacctatgggtgcgtatagcccggaaaatggcggctcaactaacaatgccatcagaga +# aaaaaatgttggaaacggcaccggcactcacaactcaaatatgacaaatttttttctgccgtgcacgtcaagctctagtcaggagcaatttgaaggcg +# actatccagctatttgcaatgctaataccaatcttcatacatacacaatgcgcacaggtaaactaatatatgacgacagctatgccctgaattctata +# gggcccacacccactggatcttcaaacagtcgcccctgcgaatatcaactgcaggagcctatgtatcagaggccttatgatacgggttcaattggaag +# tgctgtaaatagtcagaacgggacagattatggaaataaagctactcagaactacaagcaacaacatcaaatgcactttcacgagcagcccacgtata +# tgagtacagactacatgacggatgctgcatcagaccattacgaaaatccgaattttaatttgcgaaccgctaacagtacaaaagctgaacaaatgcaa +# 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catgcaaatgtaaacgcacaactgaatattcaaaatactggaaagcttcgttctgagttgtgcactgcctcatcagcttcggttgcttctgcatcttc +# gaactcatgcacaacgtccagtgcttctgatagtatgctagtagcagatcaaggttttcttcgatttcggtccatagaggatcaaaatagtgcacaaa +# atggaaacaatttagatggcgaaagggctgctatatcttcccttcgtcttaaaagttgcagtgcgactaaccgtcgcatgagcatcgctcaagagctg +# ttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggttataactggtgacgaatcatgggtatatggttatgatatcaaaaccaaagcccaatc +# gtcacaatggaagagcccagccttcgagaccaagacttggcaaccgtctaatcctgaggagctcccggtgaaaagggacaggccaaaaaaactcgact +# ggtacgtcactcatatcgtctttactttaaaaaccaaaattattatagagtatcgaatttggatggacgcattgaaaatgcggatcacaggaccggct +# ttatctgttggtgttattgctctaacagcccatatattacgaatcgtgtcaccgaagtttggacagttggtatcggaagaagccaataggtatggcta +# cttgaggcacattcactcccgcataataactaatgcagaagaaatcgccttttacggtggtcacaaagtggagatgcagcagctacggcaggcataca +# accgtctagtaaatcaaatgactacaatttttaaccaaaaactttggtttattatgcttgaacaattttttatgaaatatgtttggtccggtactgga +# 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AUGUSTUS CDS 54300 54525 0.42 + 1 transcript_id "contig12.g17.t1"; gene_id "contig12.g17"; +# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa +# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac +# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact +# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgtgagcatttacc +# aactgtaa] +# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ +# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSVSIYQL] +# end gene contig12.g17 +### +# +# ----- prediction on sequence number 13 (length = 45015, name = contig13) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 13 on both strands +# start gene contig13.g18 +contig13 AUGUSTUS gene 5833 21375 0.37 + . contig13.g18 +contig13 AUGUSTUS transcript 5833 21375 0.37 + . contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS start_codon 5833 5835 . + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 5833 5864 0.99 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 5926 6048 0.94 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 8287 8491 0.58 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 8553 8681 0.61 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 11775 11852 0.66 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 11914 12134 0.55 + 0 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +contig13 AUGUSTUS CDS 21090 21375 0.7 + 1 transcript_id "contig13.g18.t1"; gene_id "contig13.g18"; +# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa +# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac +# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact +# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgaccaagatgatc +# tgccgtttcaaagaggtgaaattcttactgtaattcgaaaagacgaagatcaatggtggactgcccgaaattcgtctgggaaaattgggcaaataccg +# gttccttatatatgtcggcatgatgatgatgaagatccccttaaaaatgttgacttaaattttcgtggaagcacactaaagaggacggatttaaaccg +# aaaactgcctgcatacgcccgcgtaaaacagtcaagagttccaaacgcctatgataagactgcattgaaattggaaattggtgatataattaaagtca +# ctaaaacaaatattaatggacaatgggagggggaattaaatggaagaaatggtcacttcccattcacgcacgttgaatttgtcgatgattgtgattta +# ggcaataactccacagaaatacgaagtgactcgggaagaaatgtgccaattcggcgtcacttctcggagtcacttcggcgaaacttccaaaatcattt +# cggcgatatcgcattcggatcgcagaaacgactaccgtcgggaaaaaaatttgcctcttcggcggcccttgtcgaagtcacgaagacacttccaggag +# ttacttttgcgacacttcttgaagtgacttcggtgacacttccaggagacttttctttccgacgggagtcacttccgaatgcgatatctcgtacgaca +# gttttcaccttttag] +# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ +# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSDQDDLPFQRGEILTVIRKDEDQWWTARNSSGKIGQIPVPYICRHDDDEDPLKNVDL +# NFRGSTLKRTDLNRKLPAYARVKQSRVPNAYDKTALKLEIGDIIKVTKTNINGQWEGELNGRNGHFPFTHVEFVDDCDLGNNSTEIRSDSGRNVPIRR +# HFSESLRRNFQNHFGDIAFGSQKRLPSGKKFASSAALVEVTKTLPGVTFATLLEVTSVTLPGDFSFRRESLPNAISRTTVFTF] +# end gene contig13.g18 +### +# +# ----- prediction on sequence number 14 (length = 45010, name = contig14) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 14 on both strands +# start gene contig14.g19 +contig14 AUGUSTUS gene 27307 36522 0.16 + . contig14.g19 +contig14 AUGUSTUS transcript 27307 36522 0.16 + . contig14.g19.t1 +contig14 AUGUSTUS start_codon 27307 27309 . + 0 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +contig14 AUGUSTUS CDS 27307 27336 0.34 + 0 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +contig14 AUGUSTUS CDS 33374 33489 0.69 + 0 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +contig14 AUGUSTUS CDS 34228 34577 0.82 + 1 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +contig14 AUGUSTUS CDS 35202 35415 0.67 + 2 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +contig14 AUGUSTUS CDS 35658 36522 0.9 + 1 transcript_id "contig14.g19.t1"; gene_id "contig14.g19"; +# coding sequence = [atgtccgtctgtccgtatgctggaggattgctgtacgatacaccgacatcaacttcaagcagtcgggattttttgggtt +# tccatgtgcctcccagtttggatacggtcttattgctggacttgactctgttggaggaaatggaatggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaa +# attagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggatggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcaga +# tgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacagctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccaga +# agatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaaatcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgag +# tttttcgctttctcttggaatccagttttggctgcccaagacaataatccaaatagtcgttttgagtcgttagcaaccgagtgcaccctcaaaataaa +# cgacaatattgtcctcgttggagccagagacgttggaggaacactctacagagcagcgatcgagcccatactttcagaacgaaacgtcgatgtcaacg +# tcgcaacttcaggaacttcaattctccaactctatcacgagaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcga +# cacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaattcgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactct +# tcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgtatactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcga +# gaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccagaagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaa +# tcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctgggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacat +# tccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctgaaaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagaga +# agcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaagagaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaag +# 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AUGUSTUS start_codon 36874 36876 . + 0 transcript_id "contig14.g20.t1"; gene_id "contig14.g20"; +contig14 AUGUSTUS CDS 36874 37842 0.96 + 0 transcript_id "contig14.g20.t1"; gene_id "contig14.g20"; +# coding sequence = [atggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtttgacgtcttgacagctt +# ttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgcagattgaagaagagtctc +# tacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgaggcagatccatgtctcta +# catcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaagatttggaagaatttttgg +# acgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatggactaaaaattagtcaa +# caaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttggaaattacgacagcaag +# gaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccagacttggctttcagcatcg +# gatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaacaatcaacgttgggata +# gtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatctacatcagggatcatcat +# catgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgtagcagccaatgaagctg +# caaaataa] +# protein sequence = [METIRSVLSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLR +# KHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVVYVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAV +# STPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQAIGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFG +# GCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQRQAMVAISTTEAEIVAANEAAK] +# end gene contig14.g20 +### +# +# ----- prediction on sequence number 15 (length = 50014, name = contig15) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 15 on both strands +# start gene contig15.g21 +contig15 AUGUSTUS gene 2942 6515 0.26 + . contig15.g21 +contig15 AUGUSTUS transcript 2942 6515 0.26 + . contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 2942 2944 . + 0 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +contig15 AUGUSTUS CDS 2942 2977 0.74 + 0 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +contig15 AUGUSTUS CDS 3367 3482 0.76 + 0 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +contig15 AUGUSTUS CDS 4221 4570 0.84 + 1 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +contig15 AUGUSTUS CDS 5195 5408 0.57 + 2 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +contig15 AUGUSTUS CDS 5651 6515 0.88 + 1 transcript_id "contig15.g21.t1"; gene_id "contig15.g21"; +# coding sequence = [atgaaagtaaagaacgcgttgcatcatattttcattctgtacgatacaccgacatcaacttcaagcagtcgggattttt +# tgggtttccatgtgcctcccagtttggatacggtcttattgctggacttgactctgttggaggaaatggaatggcgcgaccgattggccgatttggaa +# aagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggatggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagc +# agcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacagctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgt +# accagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaaatcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgc +# aacgagtttttcgctttctcttggaatccagttttggctgcccaagacaataatccaaatagtcgttttgagtcgttagcaaccgagtgcaccctcaa +# aataaacgacaatattgtcctcgttggagccagagacgttggaggaacactctacagagcagcgatcgagcccatactttcagaacgaaacgtcgatg +# tcaacgtcgcaacttcaggaacttcaattctccaactctatcacgagaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtg +# ctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaattcgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagaga +# aactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgtatactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaa +# tggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccagaagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacg +# ggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctgggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgt +# 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DEDKEEEDADLHKSEDEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] +# end gene contig15.g21 +### +# start gene contig15.g22 +contig15 AUGUSTUS gene 6867 7835 0.91 + . contig15.g22 +contig15 AUGUSTUS transcript 6867 7835 0.91 + . contig15.g22.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 6867 6869 . + 0 transcript_id "contig15.g22.t1"; gene_id "contig15.g22"; +contig15 AUGUSTUS CDS 6867 7835 0.91 + 0 transcript_id "contig15.g22.t1"; gene_id "contig15.g22"; +# coding sequence = [atggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtttgacgtcttgacagctt +# ttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgcagattgaagaagagtctc +# tacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgaggcagatccatgtctcta +# catcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaagatttggaagaatttttgg +# acgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatggactaaaaattagtcaa +# 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+contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42088 0.05 + . contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 0.86 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 0.44 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 0.74 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 1 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 26035 26127 0.97 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 0.78 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 0.68 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 0.94 + 0 transcript_id "contig15.g23.t1"; gene_id "contig15.g23"; +contig15 AUGUSTUS CDS 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PKEISLSSYAAPPQQYAGHDAHFESPNNGSASRPLSRTNFSTYQSSVGNNGTGQFPISKAFSPELGTVPPRQQLYAPSSYQRIPAFENVAPQVNFNPA +# PLTFDKMARYEQPNRNNSTSASSQYLNVKQNSRVRNVSPTPFGIMWTIAWQANFSTIEQSSNL] +# end gene contig15.g23 +### +# start gene contig15.g24 +contig15 AUGUSTUS gene 44931 45338 0.66 - . contig15.g24 +contig15 AUGUSTUS transcript 44931 45338 0.66 - . contig15.g24.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 44931 45338 0.66 - 0 transcript_id "contig15.g24.t1"; gene_id "contig15.g24"; +contig15 AUGUSTUS start_codon 45336 45338 . - 0 transcript_id "contig15.g24.t1"; gene_id "contig15.g24"; +# coding sequence = [atgagcatagctaaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcataactggtgacgact +# catgggtatatggttatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatggaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcaccccaagttcgatca +# aatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatctggagttcttaccatatggtcgtacggttaataaacagtattatct +# ggaagttatgcgccgtttgcaagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttagatcacgataatgcccctgatc +# 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sequence number 17 (length = 40013, name = contig17) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 17 on both strands +# start gene contig17.g26 +contig17 AUGUSTUS gene 3963 23615 0.14 + . contig17.g26 +contig17 AUGUSTUS transcript 3963 23615 0.14 + . contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS start_codon 3963 3965 . + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 3963 4227 0.84 + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 4327 5118 0.47 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 6881 7041 0.78 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 7101 7245 0.95 + 0 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 10797 10878 0.81 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 18063 18206 0.61 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 22448 22582 1 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 23025 23102 1 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 23159 23346 0.98 + 1 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +contig17 AUGUSTUS CDS 23413 23615 0.74 + 2 transcript_id "contig17.g26.t1"; gene_id "contig17.g26"; +# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag +# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt +# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg +# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc +# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat +# 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Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 19 on both strands +# start gene contig19.g27 +contig19 AUGUSTUS gene 29061 34294 0.14 + . contig19.g27 +contig19 AUGUSTUS transcript 29061 34294 0.14 + . contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS start_codon 29061 29063 . + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +contig19 AUGUSTUS CDS 29061 29126 0.74 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +contig19 AUGUSTUS CDS 29277 29928 0.98 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +contig19 AUGUSTUS CDS 31020 31348 0.59 + 2 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +contig19 AUGUSTUS CDS 33803 34126 0.31 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +contig19 AUGUSTUS CDS 34184 34294 0.34 + 0 transcript_id "contig19.g27.t1"; gene_id "contig19.g27"; +# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga +# 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NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ +# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] +# end gene contig19.g27 +### +# +# ----- prediction on sequence number 20 (length = 50014, name = contig20) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 20 on both strands +# start gene contig20.g28 +contig20 AUGUSTUS gene 24058 29291 0.09 + . contig20.g28 +contig20 AUGUSTUS transcript 24058 29291 0.09 + . contig20.g28.t1 +contig20 AUGUSTUS start_codon 24058 24060 . + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +contig20 AUGUSTUS CDS 24058 24123 0.79 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +contig20 AUGUSTUS CDS 24274 24925 1 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +contig20 AUGUSTUS CDS 26017 26345 0.53 + 2 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +contig20 AUGUSTUS CDS 28800 29123 0.36 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +contig20 AUGUSTUS CDS 29181 29291 0.28 + 0 transcript_id "contig20.g28.t1"; gene_id "contig20.g28"; +# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga +# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga +# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa +# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac +# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg +# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa +# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca +# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt +# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg +# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa +# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca +# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga +# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag +# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac +# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa +# tttcttactttcttctagctttgatgattag] +# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS +# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP +# 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+contig22 AUGUSTUS transcript 4664 35948 0.14 - . contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 4664 4885 0.97 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 25835 25973 0.99 - 1 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 28416 28567 0.98 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 28629 28840 0.91 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 29229 29369 0.65 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 30326 30413 1 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 30470 30914 1 - 1 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 31246 31924 0.76 - 2 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 35241 35451 0.98 - 0 transcript_id "contig22.g30.t1"; gene_id "contig22.g30"; +contig22 AUGUSTUS CDS 35580 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+# tatctctaagacgcaagcggcacatttatcaacaaatcatcgcaccaacttggagatatggaatccaaatttggggagtggcggctgcgtcccaccga +# aaacgtttccaaaccgtccagaacaaaacattaagacaaatcactggctttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacgg +# atgcgctgcttatggatttgttgtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactac +# aggccactaaatgggaatggaggaaaatgtatcctgagtcaccggatagtgggttgtcaccatgtcctcgattgggacacagttttaccatggttggt +# gaaaaaatatttttgtttggaggactagcaaatgaatcagatgaccctaaaaataatattccaaaatacttaaatgatttgtatatattggatactcg +# aggagttcacagtcataacggaaaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctcctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagta +# agggatctggaaatttaaatctcttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagatttgtggttattagatacagatacaatgacttgggac +# aatgtcacattagacactgtagaagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagttggtattcaaagtcgtctgtatgtttggtcagggcg +# ggatggttatcgcaaagcatggaacaaccaggttagggtttgttgtaaggacctatggtatttggaggtctctaagccactgtatgcagttaaagttg +# ctctagttcgtgcttctactcatgcacttgagctctcatggactgcaaccacttttgcagctgcatacgttttgcagatccagaaaatcgatcagcca +# ccaactgcaatttcgaaaccgttaaaccagaacagtctgcatcaaggcacagcagcccctgctgaaacttctgccactgtgacggaaaattgttctga +# aagtgccttgacttttggagtcgaagcaacttctacagcgttaaagttggaaaaaaatacgacgcaagcgagtggtccgcccgaaaccaacattcaac +# catctgttaatgacttgttacaatcaatttctcctccttcatcgccaatatcacgagtccataaaaaaacaagtgcctcagtgggcggaagttcactt +# tccatatcagccacttcagcgcatccccaaaaatctgtaatcagtagtactgccgtagttgccggtaacaacaccacaaccaatagtagcgctgtttc +# taacatattacaaaagtttcgaccagctctttcgagcgtaagatcatctactacaacaacgatagctggcggtttcagtgtagctgaccctctggcta +# tgcgagtaccaagtacgatggcgaacgtcgtccttagctccgtagcctcaagtagtgcattgcgtattgtccctagcgtaactgcttcccaagcagta +# cgcctagcttccgctcatcagagcagcaacagcggaagcggcagtgtagtcaatatattaaaaaccgtgccaagtgcggctgcacaatctcagcctac +# cgcacaagccaccacgtccattggtacaaagcaatacttcattcaaaagccgcttacacttgctccgaatgttcagctgcaatttgtgaagaccagca +# gtggtggaatgactgttcaaacgctgcccaaagttagctttaacgcaccaaagggaaatacctctcatggtatttcaattacaaacccacagtccgca +# tctggtactaatcaaattcagggatcgacattgcctggaaatcaactccagaaacctattgtatctggcaacgttctgaaattggtatcgccacatac +# aatggctagtggtaaactgattatgaagaattcaaacattttacaaatgggcaaggtcaccccgaatgtaatgggaggaaaaccagcttttgtcataa +# caaataaacagggagcgcaattaggtaaccagcagatcataattgtaacgactggtggcagtatgcgaaacgttccagccaacacgattatgactagt +# gctggcggtcctacatcagggacaaatattgttagtatagttagctcaacgtcgacaacggccactccgttgcaggcaataggagggcaaagaactgt +# aatatccaaccaaagtggggtaaagatggtgcgaaatatatcaacagtgcaagcatcgacttcagtagctgttgggcagaaaccaagcggcactccca +# ttcatcaaaaaactgccctgtttattggaggaacaagctcaactaacactcctgcttcttctgctgctctaagtaacagaaaaagttttgtttttaat +# gccggaggtagtcatcgtgctgtcaccttagcaactaaaagcgtgaatgcaaagcttacaccaccagcacaatcactaaaagatagcgtatcggaaac +# ttatatcccagtcactactataaaagacaccgatccaatggatgatattatcgagcagttggatggagccggagatctccgaaaactttctggaagtg +# aagctcaacacggatcgggagaggaagaaaatattaatgacaacgccacgtcatcatcagtctctgcgtcaatatctactgggggtgacatgacagga +# ctatcgggaactcaaaatactataactggggaacaatctgttgatattgttgaagatgtttccggcgtgagcagcacaacgggtgtaagggacacgga +# aaacacagggtgtaaaacaatagaaacatccagcatatccaaaaagcaaattgataagatggagtctatggttaagtcaataccaattcccgatgatc +# gccaacagcctacaacttcggagactgaagctgccaccatattgaccacaataaaatctgctgaggtattagtgatgggaaatacgaaaacaaacaag +# gactctttcgatacaactgatgaaatttgtagtgaagatgagaagtttaagcaaggaacaggatccgtgaagctagcgcccaagaatccacaccaata +# tcaaaatgtcgatggttcacacttagaggctctggcttcagctgcagtcttgcaagctgcgacggcagacgccacaacagtcgcaaactctggcctag +# caatgaaagagttgatagaacgatctgggtttgaaacacataccaaaattaacaacgttactgagaatcaatccaatattcaatccaactcagtggtt +# gtcgctgtaccaaacacgccgcaaaatgagaaccaaaaatggcatacagtgggcgtttttaaggatctctcacatacggtcactagctatattgattc +# gaattgcataagtgattcccttcttgacggtatcgatgtggataatcttccagatttctccaaatttccacgcacgaatttggatcctggaacggctt +# atcgctttcgtctcagtgccatcaacacatgtggtagaggagagtggggagagatatcaagttttaaaacttgtttaccaggctttccgggtgccccg +# tcggccattaagatttcgaaggatgttaaggagggcgcccacttaacatgggaaccaccgccagctcaaaaaactaaggagataattgaatattcagt +# atacctcgcagtaaaacctactgccaaggataaggcattgtccactcctcagttggcttttgttcgggtgtatgtcggtggcgcaaatcaatgcacgg +# tgcctaacgcttcactgtccaacgcacatgtagattgctcaaacaaaccagcaattatttttcggattgctgctcgaaatcaaaagggctatggacca +# gctactcaagttagatggctgcaggatcccgcaaccgcgaaactgcaagcaccctcaagtacaccaaatctaaaacgagtacaggagaaaacaactgt +# tggagccagcagcgcagccaattccttttgttcgccaaacaagcgtggacgcaacggattgcatgaataa] +# protein sequence = [MTYDNSKMLLASFADDVCFLSSSNSETESSQTLQTYLNEFEKWATANNIKINESKCVNVCFTLRRKTTPVVHINNVDT +# EQATKAKYLGLTLDKRLTFREHIARVVKMCNLKRNQLFWMLNKKSKLSLRRKRHIYQQIIAPTWRYGIQIWGVAAASHRKRFQTVQNKTLRQITGFTN +# QWYVPVLKGDVPNGCAAYGFVVEGTRMFVFGGMIEYGKYSNELYELQATKWEWRKMYPESPDSGLSPCPRLGHSFTMVGEKIFLFGGLANESDDPKNN +# IPKYLNDLYILDTRGVHSHNGKWIVPKTYGDSPPPRESHTGISFASKGSGNLNLLIYGGMSGCRLGDLWLLDTDTMTWDNVTLDTVEENVPRARAGHC +# AVGIQSRLYVWSGRDGYRKAWNNQVRVCCKDLWYLEVSKPLYAVKVALVRASTHALELSWTATTFAAAYVLQIQKIDQPPTAISKPLNQNSLHQGTAA +# PAETSATVTENCSESALTFGVEATSTALKLEKNTTQASGPPETNIQPSVNDLLQSISPPSSPISRVHKKTSASVGGSSLSISATSAHPQKSVISSTAV +# VAGNNTTTNSSAVSNILQKFRPALSSVRSSTTTTIAGGFSVADPLAMRVPSTMANVVLSSVASSSALRIVPSVTASQAVRLASAHQSSNSGSGSVVNI +# LKTVPSAAAQSQPTAQATTSIGTKQYFIQKPLTLAPNVQLQFVKTSSGGMTVQTLPKVSFNAPKGNTSHGISITNPQSASGTNQIQGSTLPGNQLQKP +# IVSGNVLKLVSPHTMASGKLIMKNSNILQMGKVTPNVMGGKPAFVITNKQGAQLGNQQIIIVTTGGSMRNVPANTIMTSAGGPTSGTNIVSIVSSTST +# TATPLQAIGGQRTVISNQSGVKMVRNISTVQASTSVAVGQKPSGTPIHQKTALFIGGTSSTNTPASSAALSNRKSFVFNAGGSHRAVTLATKSVNAKL +# TPPAQSLKDSVSETYIPVTTIKDTDPMDDIIEQLDGAGDLRKLSGSEAQHGSGEEENINDNATSSSVSASISTGGDMTGLSGTQNTITGEQSVDIVED +# VSGVSSTTGVRDTENTGCKTIETSSISKKQIDKMESMVKSIPIPDDRQQPTTSETEAATILTTIKSAEVLVMGNTKTNKDSFDTTDEICSEDEKFKQG +# TGSVKLAPKNPHQYQNVDGSHLEALASAAVLQAATADATTVANSGLAMKELIERSGFETHTKINNVTENQSNIQSNSVVVAVPNTPQNENQKWHTVGV +# FKDLSHTVTSYIDSNCISDSLLDGIDVDNLPDFSKFPRTNLDPGTAYRFRLSAINTCGRGEWGEISSFKTCLPGFPGAPSAIKISKDVKEGAHLTWEP +# PPAQKTKEIIEYSVYLAVKPTAKDKALSTPQLAFVRVYVGGANQCTVPNASLSNAHVDCSNKPAIIFRIAARNQKGYGPATQVRWLQDPATAKLQAPS +# STPNLKRVQEKTTVGASSAANSFCSPNKRGRNGLHE] +# end gene contig22.g31 +### +# +# ----- prediction on sequence number 23 (length = 50012, name = contig23) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 23 on both strands +# start gene contig23.g32 +contig23 AUGUSTUS gene 3228 18820 0.04 + . contig23.g32 +contig23 AUGUSTUS transcript 3228 18820 0.04 + . contig23.g32.t1 +contig23 AUGUSTUS start_codon 3228 3230 . + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 3228 3333 0.63 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 8387 8696 0.99 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 8762 8973 1 + 1 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 9738 9889 0.81 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 10040 11101 0.84 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 11763 12261 0.57 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 12343 12872 0.44 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 13476 13707 0.97 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 13769 13935 0.62 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 15540 15809 0.64 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 18249 18612 0.69 + 0 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +contig23 AUGUSTUS CDS 18678 18820 0.99 + 2 transcript_id "contig23.g32.t1"; gene_id "contig23.g32"; +# coding sequence = [atgagcgccgttatccgcggctgtgttcgtgcagaggccgcgtggaaaacgaaatttaaaaatggaaggcaaaacgcaa +# aaaacactcttaagacgccttcaggagttacaaatcaatggtacgtgcccgtgctaaaaggagatgtaccaaacggatgcgctgcttatggatttgtt +# gtggagggtactcgcatgtttgtcttcggtggaatgatcgagtacggaaaatattcaaatgagctctatgaactacaggccactaaatgggaatggag +# gaaaatgtatcctgagtcaccggatagtgggttgtcaccatgtcctcgattgggacacagttttaccatggttggtgaaaaaatatttttgtttggag +# gactagcaaatgaatcagatgaccctaaaaataatattccaaaatacttaaatgatttgtatatattggatactcgaggagttcacagtcataacgga +# aaatggatagtacctaaaacctatggcgacagtcctcctcctagggagtcgcacacaggcatttcgtttgccagtaagggatctggaaatttaaatct +# cttaatttatggaggaatgagtggatgccgcttgggagatttgtggttattagatacagatacaatgacttgggacaatgtcacattagacactgtag +# aagaaaatgtgccgcgggctcgtgctggccactgtgcagttggtattcaaagtcgtctgtatgtttggtcagggcgggatggttatcgcaaagcatgg +# aacaaccaggttagggtttgttgtaaggacctatggtatttggaggtctctaagccactgtatgcagttaaagttgctctagttcgtgcttctactca +# tgcacttgagctctcatggactgcaaccacttttgcagctgcatacgttttgcagatccagaaaatcgatcagccaccaactgcaatttcgaaaccgt 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taactggggaacaatctgttgatattgttgaagatgtttccggcgtgagcagcacaacgggtgtaagggacacggaaaacacagggtgtaaaacaata +# gaaacatccagcatatccaaaaagcaaattgataagatggagtctatggttaagtcaataccaattcccgatgatcgccaacagcctacaacttcgga +# gactgaagctgccaccatattgaccacaataaaatctgctgaggtattagtgatgggaaatacgaaaacaaacaaggactctttcgatacaactgatg +# aaatttgtagtgaagatgagaagtttaagcaaggaacaggatccgtgaagctagcgcccaagaatccacaccaatatcaaaatgtcgatggttcacac +# ttagaggctctggcttcagctgcagtcttgcaagctgcgacggcagacgccacaacagtcgcaaactctggcctagcaatgaaagagttgatagaacg +# atctgggtttgaaacacataccaaaattaacaacgttactgagaatcaatccaatattcaatccaactcagtggttgtcgctgtaccaaacacgccgc +# aaaatgagaaccaaaaatggcatacagtgggcgtttttaaggatctctcacatacggtcactagctatattgattcgaattgcataagtgattccctt +# cttgacggtatcgatgtggataatcttccagatttctccaaatttccacgcacgaatttggatcctggaacggcttatcgctttcgtctcagtgccat +# caacacatgtggtagaggagagtggggagagatatcaagttttaaaacttgtttaccaggctttccgggtgccccgtcggccattaagatttcgaagg +# atgttaaggagggcgcccacttaacatgggaaccaccgccagctcaaaaaactaaggagataattgaatattcagtatacctcgcagtaaaacctact +# gccaaggataaggcattgtccactcctcagttggcttttgttcgggtgtatgtcggtggcgcaaatcaatgcacggtgcctaacgcttcactgtccaa +# cgcacatgtagattgctcaaacaaaccagcaattatttttcggattgctgctcgaaatcaaaagggctatggaccagctactcaagttagatggctgc +# aggatcccgcaaccgcgaaactgcaagcaccctcaagtacaccaaatctaaaacgagtacaggagaaaacaactgttggagccagcagcgcagccaat +# tccttttgttcgccaaacaagcgtggacgcaacggattgcatgaataa] +# protein sequence = [MSAVIRGCVRAEAAWKTKFKNGRQNAKNTLKTPSGVTNQWYVPVLKGDVPNGCAAYGFVVEGTRMFVFGGMIEYGKYS +# NELYELQATKWEWRKMYPESPDSGLSPCPRLGHSFTMVGEKIFLFGGLANESDDPKNNIPKYLNDLYILDTRGVHSHNGKWIVPKTYGDSPPPRESHT +# GISFASKGSGNLNLLIYGGMSGCRLGDLWLLDTDTMTWDNVTLDTVEENVPRARAGHCAVGIQSRLYVWSGRDGYRKAWNNQVRVCCKDLWYLEVSKP +# LYAVKVALVRASTHALELSWTATTFAAAYVLQIQKIDQPPTAISKPLNQNSLHQGTAAPAETSATVTENCSESALTFGVEATSTALKLEKNTTQASGP +# PETNIQPSVNDLLQSISPPSSPISRVHKKTSASVGGSSLSISATSAHPQKSVISSTAVVAGNNTTTNSSAVSNILQKFRPALSSVRSSTTTTIAGGFS +# VADPLAMRVPSTMANVVLSSVASSSALRIVPSVTASQAVRLASAHQSSNSGSGSVVNILKTVPSAAAQSQPTAQATTSIGTKQYFIQKPLTLAPNVQL +# QFVKTSSGGMTVQTLPKVSFNAPKGNTSHGISITNPQSASGTNQIQGSTLPGNQLQKPIVSGNVLKLVSPHTMASGKLIMKNSNILQMGKVTPNVMGG +# KPAFVITNKQGAQLGNQQIIIVTTGGSMRNVPANTIMTSAGGPTSGTNIVSIVSSTSTTATPLQAIGGQRTVISNQSGVKMVRNISTVQASTSVAVGQ +# KPSGTPIHQKTALFIGGTSSTNTPASSAALSNRKSFVFNAGGSHRAVTLATKSVNAKLTPPAQSLKDSVSETYIPVTTIKDTDPMDDIIEQLDGAGDL +# RKLSGSEAQHGSGEEENINDNATSSSVSASISTGGDMTGLSGTQNTITGEQSVDIVEDVSGVSSTTGVRDTENTGCKTIETSSISKKQIDKMESMVKS +# IPIPDDRQQPTTSETEAATILTTIKSAEVLVMGNTKTNKDSFDTTDEICSEDEKFKQGTGSVKLAPKNPHQYQNVDGSHLEALASAAVLQAATADATT +# VANSGLAMKELIERSGFETHTKINNVTENQSNIQSNSVVVAVPNTPQNENQKWHTVGVFKDLSHTVTSYIDSNCISDSLLDGIDVDNLPDFSKFPRTN +# LDPGTAYRFRLSAINTCGRGEWGEISSFKTCLPGFPGAPSAIKISKDVKEGAHLTWEPPPAQKTKEIIEYSVYLAVKPTAKDKALSTPQLAFVRVYVG +# GANQCTVPNASLSNAHVDCSNKPAIIFRIAARNQKGYGPATQVRWLQDPATAKLQAPSSTPNLKRVQEKTTVGASSAANSFCSPNKRGRNGLHE] +# end gene contig23.g32 +### +# start gene contig23.g33 +contig23 AUGUSTUS gene 20555 32549 0.1 - . contig23.g33 +contig23 AUGUSTUS transcript 20555 32549 0.1 - . contig23.g33.t1 +contig23 AUGUSTUS CDS 20555 21022 0.69 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +contig23 AUGUSTUS CDS 21361 21933 0.97 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +contig23 AUGUSTUS CDS 22038 22105 0.88 - 2 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +contig23 AUGUSTUS CDS 22166 22501 0.51 - 2 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +contig23 AUGUSTUS CDS 32411 32549 0.31 - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +contig23 AUGUSTUS start_codon 32547 32549 . - 0 transcript_id "contig23.g33.t1"; gene_id "contig23.g33"; +# coding sequence = [atgaagagcttttccagtaaccaccaactcgtgcaacatatccgggtgcacactggagagaagccgtacaagtgctcct +# attgtgatcgtagatttaagcagctgtcgcacgtccagcagcacacgcgcctgcacacagccctatcccaattcagtgaaataaatccgggaactagc +# agtgggaacggaaatgggagtggaattgccaacgatcaaatttctgcgcacactacatcggattcgagctgcgcgcagagctccaatcaggccactgc +# cggtggccccaacttaatcgacagctatttgggaaagcgaaggacagcaaatcatccttgcccggtgtgcggtaaacattacgtcaatgagggatccc +# ttcggaaacatctagcgtgccacgccgagacctcccaactaacaaacagcctgcgaatgtggccttgtagcgtttgccaggcagtctttactcatgaa +# aatggccttcttacccacatggagtcgatgcgcatggatccaaaacatcagttcgcggctcaatacgttttgtctcgagcggctgcggagcagcgaga +# acgcgaatccatgctagcggtaaccttggccgccagcagtggcactagcgacagaatggggatttcagatgccgcgaacgtcctgacaatgggaacac +# acaactccgaggggtctaactcgaagtgtccttccccttcggtgaactccgaatgctcttctaacggacgtttaacgtcatcaacagcatctgatcag +# gaccaagacatcgaccatgggctgagtgaaaacgagaacagcaaccagaacatcaccagcagcacaaataacaacaataattgcaccaacaacaacag +# cacggcctctaataaaatggttgagcttcgacttcagagttctggccagtataccatggatacggatctgcacgtggctaaccgaatgtcgttgatgg +# ccgcggctgctgctgccgttgctgcgtcacgaccgcaggacggagtggacaccacagcagtgccgagcgcggcagtccaagctgctgtggtcaatttg +# 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SESSAAASIAMNMNVHMMRGSLEPDPGLGGMHAIEVLHQQQHHQQTSNYSQHAISPTNQQAHPHPQAHNTPHHLPDPETALRMHQAEAILRSHTEAAF +# RLATGTVPVPGSGVKSEADQQQNSNNGNTTSSATSNDQQHRFHSHSHQQEHQLPSSS] +# end gene contig23.g33 +### +# start gene contig23.g34 +contig23 AUGUSTUS gene 40426 45565 0.55 - . contig23.g34 +contig23 AUGUSTUS transcript 40426 45565 0.55 - . contig23.g34.t1 +contig23 AUGUSTUS CDS 40426 40485 0.63 - 0 transcript_id "contig23.g34.t1"; gene_id "contig23.g34"; +contig23 AUGUSTUS CDS 40546 40623 0.9 - 0 transcript_id "contig23.g34.t1"; gene_id "contig23.g34"; +contig23 AUGUSTUS CDS 44624 45565 0.85 - 0 transcript_id "contig23.g34.t1"; gene_id "contig23.g34"; +contig23 AUGUSTUS start_codon 45563 45565 . - 0 transcript_id "contig23.g34.t1"; gene_id "contig23.g34"; +# coding sequence = [atgttcaagatggacgccgcagacttctggcagcatgcacgtgccccgttcagcctgcagtacaattcgccgaatcagc +# cgcaagcaccccaccacaccctgcaccaatcccttccgcaggagcacgaggtgttggccgacgtccatccaggaggcccagccaccggctcgggcgta +# 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[MFKMDAADFWQHARAPFSLQYNSPNQPQAPHHTLHQSLPQEHEVLADVHPGGPATGSGVVNSSSSIGVSSPHSALGGK +# AESSHILQQHSGQQSYGGDSFRGSQSPQLSSHHLLFNAAAAAAAAAHLKSTAMQNNLSPMRDQAQSDHRNYGHSPLTALCGIKPKQEIDAKPTLQPLN +# ECRQPLAQAQSQSQPTYGTNFYDVGEATAGDVSEADGRALTIGLGIPSKRTSEETQAGLQTQQTTGADRGLHTPQCPSMSPGTGGSSNSGTGTRPDPI +# QINKTLSQGQQSPQHSTTASGGTTTPDIKYSNDKMANEIQLQLSRSSSAAAISERTLEECWSTLQRLQLQNSTSHHITEHLLTNN] +# end gene contig23.g34 +### +# +# ----- prediction on sequence number 24 (length = 40010, name = contig24) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 24 on both strands +# start gene contig24.g35 +contig24 AUGUSTUS gene 552 12546 0.12 - . contig24.g35 +contig24 AUGUSTUS transcript 552 12546 0.12 - . contig24.g35.t1 +contig24 AUGUSTUS CDS 552 1019 0.7 - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +contig24 AUGUSTUS CDS 1358 1930 0.97 - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +contig24 AUGUSTUS CDS 2035 2102 0.85 - 2 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +contig24 AUGUSTUS CDS 2163 2498 0.48 - 2 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +contig24 AUGUSTUS CDS 12408 12546 0.29 - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +contig24 AUGUSTUS start_codon 12544 12546 . - 0 transcript_id "contig24.g35.t1"; gene_id "contig24.g35"; +# coding sequence = [atgaagagcttttccagtaaccaccaactcgtgcaacatatccgggtgcacactggagagaagccgtacaagtgctcct +# attgtgatcgtagatttaagcagctgtcgcacgtccagcagcacacgcgcctgcacacagccctatcccaattcagtgaaataaatccgggaactagc +# agtgggaacggaaatgggagtggaattgccaacgatcaaatttctgcgcacactacatcggattcgagctgcgcgcagagctccaatcaggccactgc +# cggtggccccaacttaatcgacagctatttgggaaagcgaaggacagcaaatcatccttgcccggtgtgcggtaaacattacgtcaatgagggatccc +# ttcggaaacatctagcgtgccacgccgagacctcccaactaacaaacagcctgcgaatgtggccttgtagcgtttgccaggcagtctttactcatgaa +# aatggccttcttacccacatggagtcgatgcgcatggatccaaaacatcagttcgcggctcaatacgttttgtctcgagcggctgcggagcagcgaga +# 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+contig24 AUGUSTUS CDS 20543 20620 0.84 - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; +contig24 AUGUSTUS CDS 24621 25562 0.88 - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; +contig24 AUGUSTUS start_codon 25560 25562 . - 0 transcript_id "contig24.g36.t1"; gene_id "contig24.g36"; +# coding sequence = [atgttcaagatggacgccgcagacttctggcagcatgcacgtgccccgttcagcctgcagtacaattcgccgaatcagc +# cgcaagcaccccaccacaccctgcaccaatcccttccgcaggagcacgaggtgttggccgacgtccatccaggaggcccagccaccggctcgggcgta +# gtaaacagcagcagctctattggcgtatccagcccccactctgctctgggcggcaaggccgagtccagccacattctgcagcagcactcagggcagca +# gtcctacgggggcgactccttccgaggctcacagtcgccccagctaagcagccaccacctgttgttcaacgcagctgcggcagctgctgcggcggccc +# acctgaagtccacggccatgcagaacaacctctcgccgatgagggaccaggcccagagtgaccatcgcaactatggccacagccccttgaccgccctg +# tgtgggatcaagcccaagcaggagatagacgccaagccgaccctccagccgctgaacgagtgccgccagccgctggcccaggcgcaatcgcaatccca +# 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25 (length = 75023, name = contig25) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 25 on both strands +# start gene contig25.g37 +contig25 AUGUSTUS gene 63496 72888 0.14 - . contig25.g37 +contig25 AUGUSTUS transcript 63496 72888 0.14 - . contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 63496 64309 0.62 - 1 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 64370 65052 0.57 - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 65106 65290 0.97 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 65762 67777 0.42 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 70910 71131 0.95 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 72321 72656 0.99 - 2 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS CDS 72717 72888 0.63 - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +contig25 AUGUSTUS start_codon 72886 72888 . - 0 transcript_id "contig25.g37.t1"; gene_id "contig25.g37"; +# coding sequence = [atgctctcgacaacaatgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtg +# catctggagtagggatcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccggatcaa +# ataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtgataaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagt +# tgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggtacaccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcc +# tggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcctgctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgct +# aagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgaaacaggatctattaaagcgaaaggaatcgcttctggaagcggttgcggaacggggtcctc +# atctgctctttccgttggcattgttattaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaagggaaaatcactctc +# caaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgaccgatagtatcccc +# 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13481 22873 0.21 - . contig26.g38 +contig26 AUGUSTUS transcript 13481 22873 0.21 - . contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 13481 14294 0.77 - 1 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 14355 15037 0.73 - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 15091 15275 0.98 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 15747 17762 0.44 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 20895 21116 0.95 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 22306 22641 1 - 2 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS CDS 22702 22873 0.67 - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +contig26 AUGUSTUS start_codon 22871 22873 . - 0 transcript_id "contig26.g38.t1"; gene_id "contig26.g38"; +# coding sequence = 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gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 31905 31949 0.84 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 32205 32279 0.64 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 32354 32492 0.97 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 34887 35151 0.77 + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 35660 35786 0.95 + 2 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 35888 35975 0.99 + 1 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +contig26 AUGUSTUS CDS 36033 36266 0.98 + 0 transcript_id "contig26.g39.t1"; gene_id "contig26.g39"; +# coding sequence = [atgccgttgtttggcaaaaaggattccggcaagaaagccaaggcgaaggacataagggagctaaataagcaagtgtcaa +# tcgaggagaaatacaatcttcatgggcttttgggaactggggccttttcagaagtacgccttgccgaaagtaaagaaacccctggtgatcactttgct +# 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[atgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatggaacatgcaaatcggatcgagcccagtctta +# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg +# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc +# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga +# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt +# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat +# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag +# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat +# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat +# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt 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aaagaaaaaagtacaaactaaaatttgacacgggcttaccacaaaatgtaaaggacttcaacaacgtattttctgaaacaacatcctcaaccgtaact +# agttcaattcatcttatgaaacaaaaaaacgaagcgccctgtccggattcattaatgacagctcccaacactttgtctaatacatcattatatcctgg +# aaaccagacaggaatggttccattgcttccactattgcactttccaccgcgaccgggattgattccttctggacctggactttttcctgcagtaacag +# gtctggtcggctttggaaataataataacacagtcggtattgcaccattcatagcatttcctggtacagaaggatctgttgctgacaccgttagatgc +# ccaccaattaaagattctgctgatactgggaatgatcaactcctaagaagatccggacagatggacttacagattgatagaaactattgcaatgttgc +# tccgttggtgccagactcaatgaaattttctgagtgtaaaccagtatcttgcggtaatactgacatggaaaatacatttacaccttccaaatttaagg +# caaagccatcagtgcaggcttctggaaatcttggagatccgattgaggtatccgatgactcagacgaatcaatacaaaacagacaaattgttcaaaaa +# aaatctccattaacttctccaaaccacgctaaatcaagcttagtacaatcacagcaccaaacgtttgcaactccatcaccattatgcgaagacaagaa +# ccaaatggacttaaggaatgttttgccgaatacaagcccaagtgaatcaattaagaagttgaagaagtcagttaaactgaaccttcccgatgtaaaaa +# actttattcagatagctccttctcagtcgtcatttccgcaattcaacttgccaaattttataggaggtgataagttcagtttggccggtggagctgat +# cttattcctttggcaagaatagattgcgggtcggcatattcatcccataaggtgccatctagcagcttaacagggggagtggcttcaggcgtaatccc +# tattttaccaaatcacatatctgaggaccagcagtttatgcctacatttccaaactacgaggatattagcattactccgaccggagcgttgtcactag +# atcccaaagtgcgcaaacaccataaaaagcctaaaaagattaaagaaggaaaaattaaaaaaaaaaaggataaaaaggataaatcaaagagaaaagat +# cgagttgccttagcgtctaataaaagtgaccgaaaaataaaagggcttgacaaaaagcaaaaaaaggaaaaaaagaaggacaaggaaaaacagatttt +# aatccaaattccggaagtcgacgaattttctagggcaccttttattaacaacttagattatggcttcactcaaagtgtacccgcgagtacacctgtat +# tgaaaaccagtccaatgtcagtaaaaccgccactatcggccacttgtgcgatgtctccaaaaatacagcagtctccaagtcaaataccaaaactaaca +# ctgaaactaagtggcaagtccacaacgtgtcctgaaaaagagaaagacacaacggatgctgtcaaggtgtcacagccaactatgtttccagtagaaaa +# taaagagcgtgagcgagataattccccggaactagcccggttctctccactggttaccgggccaccgaagaacaaacaatctgatacacatttattag +# 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gene 33497 49889 0.02 - . contig27.g42 +contig27 AUGUSTUS transcript 33497 49889 0.02 - . contig27.g42.t1 +contig27 AUGUSTUS CDS 33497 33731 0.27 - 1 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 33795 33894 0.57 - 2 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 35330 35505 0.11 - 1 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 40308 40447 0.52 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 40671 41474 0.86 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 42417 42620 0.96 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 42683 43072 0.99 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 43389 43550 0.84 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 45545 46043 0.99 - 1 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS CDS 49867 49889 0.99 - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +contig27 AUGUSTUS start_codon 49887 49889 . - 0 transcript_id "contig27.g42.t1"; gene_id "contig27.g42"; +# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc +# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc +# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc +# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg +# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg +# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgaggg +# acaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaac +# tacaggggaaggagcatagcaacttttccgtgggtcgattgccttataattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtatacc +# actggtactggagaagtgcgttgtccaagagctgcagctggatttcgcggcaccgttcgctatgcttctataaatgcacatcgcaatagggaaatggg +# acggcacgacgatctgtggtctctgttctatatgctcgtggaattcgtaaacggacaactaccgtggcgaaaaataaaagacaaggaacaagttgggt +# tgacaaaagagaagtacgaccacagaatactgttaaaacatttgccgtcagatttaaagcaatttttggagcatattcaatctcttacctatgcagat +# cgaccggattacgcgatgcttatcggtttatttgagcggtgtatgaaaagacgcggcgtcaaggagtctgacccttacgactgggaaaaggtggactc +# tgcaactattggcaacataagtacatcaggcaatccgccagttcctgttaaaaatgattacattcacgggaatataacacaaatgaccgtggcagcat +# ctaacgcaagcggaacggaatattatctacaattggaagataaagcaccaaatatgtttttaccaacaaaaccaaatgcagagtccgaaagtacagtt +# gacgtcgctcctaaaagtatatttgaagagaaattcgtggattcaaatgacgctgagtgtgctaataaagctttcctgtctggggaacaacagcaaca +# aaaatcgcaagtgaaaaagctgaatttgccagagtccgccaaccagcaagtacagaaactggaaaacgtagcaaacgaaaagagctccgaagacaaac +# gagcatcgcaggaaccgaaatcaacctttgggcgactccgtgtgcttacagctcctccaatgagtgtacatgatctaacaacggggggccacatccaa +# caagggactgatttatcaataaaacaagatccctcaagctccaatgctggtccagccgccgggaacagctcgtcctccaaacttgccattaaccagca +# tggtcaaatttttggaataactctcatgccacaagttaatcgacgttcggcaacgtctaccaatttaagaccatcttcctctggcggaaacacaaatc +# caattcatagaatcaatattggatcagcaggtggtggaggtggaactggaagcaacaccgccagaagcagtgttgcaggtgatcattcggtgactcaa +# tttgctttaatagacgacgagaatgtctcagcattacaacaggtaaccaaaggcggagctcttacgctggcatcacaatggaagagccagtttgatga +# ctcagaggacactacagataacgaatggaacagagaaccacagtcgcaacccaatttggagcaattgattaaactggatattccattgcccttaaatg +# aagccaagcatttttgccaaaatgtcgtcactgatacaggcatattaactaaacctccaatcgaagggaacgaaaaaccgaaaagcaaaatcccaata +# cggcagtcaaaatgtgcatcttgggccggtgctgacactacagtatattcatctaagacactggagcccagagacgcccttccggaaattcccttcaa +# tccccaaacaaacacatactccactgctttagaatatcctcctaatataacggatcttaccccaggtttacgtcgtcgaagggaatctgctgaaggaa +# agtatgtcacagatcaaacgcaactgcaattaaaattccaaagacctcgatcacgaacttccagcaggacccgtggcatttccaatacaatgttagga +# aattttgatgataacaatactgttagcggggaaaaacaaagacttatcgggacccaagttgttcaaaacgaagaatcaaataatgtaccaacgagtat +# atattccgctgagctacaagataaatgcaacatttcaccaccaccgggagatccaaaaattgaaaacagcgcgcgccttcgacgttataggcataact +# tagaataa] +# protein sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA +# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKVV +# RKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTV +# RYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRG +# VKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAE +# CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA +# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG +# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK +# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPGLRRRRESAEGKYVTDQTQLQLKFQRPRSRTSSRTRGISNTMLGNFDDNNTVSGEKQRLIGTQ +# VVQNEESNNVPTSIYSAELQDKCNISPPPGDPKIENSARLRRYRHNLE] +# end gene contig27.g42 +### +# +# ----- prediction on sequence number 28 (length = 50013, name = contig28) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 28 on both strands +# start gene contig28.g43 +contig28 AUGUSTUS gene 2292 8820 0.12 - . contig28.g43 +contig28 AUGUSTUS transcript 2292 8820 0.12 - . contig28.g43.t1 +contig28 AUGUSTUS CDS 2292 2412 1 - 1 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 2470 2662 0.68 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 2762 2932 0.39 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 2992 3370 0.91 - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 4170 5011 0.87 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 5075 5185 0.67 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 6426 8108 0.49 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 8168 8686 0.89 - 2 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS CDS 8766 8820 0.7 - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +contig28 AUGUSTUS start_codon 8818 8820 . - 0 transcript_id "contig28.g43.t1"; gene_id "contig28.g43"; +# coding sequence = [atgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatggaacatgcaaatcggatcgagcccagtctta +# gagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaatgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtg +# ccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctgacacgtcccgtctatatatttgagtatttgcc +# gccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaagaattagtgtccaaggcagagttcaatgtga +# caagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaacttttcatcgaatttcttagactcggatgttggt +# cgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaaggaaaactgccagagccctttataccggatat +# aattgaaaaatttaaaggtttagacgcaccgcctccgtcgttgatagctgtcagccatttggaacattctgaaaaagaattgattacatctgaaaaag +# acgcagtaaacacacgaacaataaattcagaaactaaaaacttcaatcacaatgctgtattattgataagtgatagcgcagatgcatcgttgttatat +# tcttcgaatagccttccgatgtcatccgctttgactgctacaatatcaaagaagaacagaaaaccgaaaccggacctagcaatcgaacatggtcaaat +# cgttaaatcaaatatctctttcggaaagtctcaagaaaagtcccagcgaaaagctttaaaaatgtttcaaaaactttcgaagagccaaaatgacgctt +# caaatagtcaaattctgaacatgaaaaagtctaagaagcgagtcaatcatggaaacagcttatctgatccaagtaaagtaaatatagaaaagatgttc +# aaaaagcagaataggcataagcaaaagagtgttcaacttgaaactcaaactttgagcgactttcccattgaagcggacatgaatacagaaaattttat +# cgcagctgatatcccttgtgcggaacctgtagtgttaaagcagattgagattggatcccaaagttctgtttttccagtacaaccaggaggaatacaac +# aaacacaagtatcattgcagtcaaaaaaaaatgcatcagaaccggaacgaagtaagctggatatatttaaaaaaatttctaagccgcgcactccccgt +# caggatggtggagcaactcaggtacctcctggaataggcgtacgtgtatttggaagtaccatgcctgtttcgacgttaattagtcttccatctgggac +# tactataacacctacacccccagtaggccagactccggaggacgcaaataatcctaattcgaaaattaaccaatatggtgtattgggccaaaagctat +# cttctcctaaagatgacatagaaatgtcaactattaatcccataaaggcaaagaagcggggccgaaaacctggaggaaaaaatttggtaaaacaaact +# cattttacatcacattcccttattgaatcgtctaaaaaggaaaagtcaacgcgtgtaggtgcttttaagctagcgtcatctgagacgctggtatcaca +# aaattccttaagcgtatctatgccaacagagcctctgaacctcagcagcacagatcaggcttcaatcgaatatttaccaaactttcacgcaaaaaagg +# aaagaaaaaagtacaaactaaaatttgacacgggcttaccacaaaatgtaaaggacttcaacaacgtattttctgaaacaacatcctcaaccgtaact +# agttcaattcatcttatgaaacaaaaaaacgaagcgccctgtccggattcattaatgacagctcccaacactttgtctaatacatcattatatcctgg +# aaaccagacaggaatggttccattgcttccactattgcactttccaccgcgaccgggattgattccttctggacctggactttttcctgcagtaacag +# gtctggtcggctttggaaataataataacacagtcggtattgcaccattcatagcatttcctggtacagaaggatctgttgctgacaccgttagatgc +# ccaccaattaaagattctgctgatactgggaatgatcaactcctaagaagatccggacagatggacttacagattgatagaaactattgcaatgttgc +# tccgttggtgccagactcaatgaaattttctgagtgtaaaccagtatcttgcggtaatactgacatggaaaatacatttacaccttccaaatttaagg +# caaagccatcagtgcaggcttctggaaatcttggagatccgattgaggtatccgatgactcagacgaatcaatacaaaacagacaaattgttcaaaaa +# aaatctccattaacttctccaaaccacgctaaatcaagcttagtacaatcacagcaccaaacgtttgcaactccatcaccattatgcgaagacaagaa +# ccaaatggacttaaggaatgttttgccgaatacaagcccaagtgaatcaattaagaagttgaagaagtcagttaaactgaaccttcccgatgtaaaaa +# actttattcagatagctccttctcagtcgtcatttccgcaattcaacttgccaaattttataggaggtgataagttcagtttggccggtggagctgat +# cttattcctttggcaagaatagattgcgggtcggcatattcatcccataaggtgccatctagcagcttaacagggggagtggcttcaggcgtaatccc +# tattttaccaaatcacatatctgaggaccagcagtttatgcctacatttccaaactacgaggatattagcattactccgaccggagcgttgtcactag +# atcccaaagtgcgcaaacaccataaaaagcctaaaaagattaaagaaggaaaaattaaaaaaaaaaaggataaaaaggataaatcaaagagaaaagat +# cgagttgccttagcgtctaataaaagtgaccgaaaaataaaagggcttgacaaaaagcaaaaaaaggaaaaaaagaaggacaaggaaaaacagatttt +# aatccaaattccggaagtcgacgaattttctagggcaccttttattaacaacttagattatggcttcactcaaagtgtacccgcgagtacacctgtat +# tgaaaaccagtccaatgtcagtaaaaccgccactatcggccacttgtgcgatgtctccaaaaatacagcagtctccaagtcaaataccaaaactaaca +# ctgaaactaagtggcaagtccacaacgtgtcctgaaaaagagaaagacacaacggatgctgtcaaggtgtcacagccaactatgtttccagtagaaaa +# taaagagcgtgagcgagataattccccggaactagcccggttctctccactggttaccgggccaccgaagaacaaacaatctgatacacatttattag +# gcatatcaagtgcaggaccccttttaaacatatgttccggtaactctatgaaagtaatacaggaacctttcccaatggctacgcgaacttcacagata +# tccacaagtcaaaactcgtccagctcagccggttggatgtcgaaccctagtaacagaggtccaaaatcttgctcgcttagttcaccagcaaatgttcc +# agaagagaattcacatattgcagaaacaaatcgtccatcgtcatacgtcgacgccgagggtaaccgtatatggatttgtccggcttgtgggaaggtag +# acgacggttctgctatgattggatgtgatggctgtgatgcgtggtatcattggatttgtgtgggcattacttttgctcctaaggacaacgacgattgg +# ttctgtcgcgtctgtgtgacaaaaaaaagagttcatgtgtctgagaaaaaaaaaaggagaaataagaaaaagtaa] +# protein sequence = [MQKFTQEFARDLHCNMEHANRIEPSLRDAQLSMKNLNINIQELLDYIGNVEPVGFTRDVPHFPIRKAINMNFLKPGSA +# ETLTRPVYIFEYLPPMQDPEPRESQSEAQREFFQKQELVSKAEFNVTSSAEKLSTNQVDSSSPNAVINFSSNFLDSDVGRSVREMSSVVMTTGGFISP +# AIEGKLPEPFIPDIIEKFKGLDAPPPSLIAVSHLEHSEKELITSEKDAVNTRTINSETKNFNHNAVLLISDSADASLLYSSNSLPMSSALTATISKKN +# RKPKPDLAIEHGQIVKSNISFGKSQEKSQRKALKMFQKLSKSQNDASNSQILNMKKSKKRVNHGNSLSDPSKVNIEKMFKKQNRHKQKSVQLETQTLS +# DFPIEADMNTENFIAADIPCAEPVVLKQIEIGSQSSVFPVQPGGIQQTQVSLQSKKNASEPERSKLDIFKKISKPRTPRQDGGATQVPPGIGVRVFGS +# TMPVSTLISLPSGTTITPTPPVGQTPEDANNPNSKINQYGVLGQKLSSPKDDIEMSTINPIKAKKRGRKPGGKNLVKQTHFTSHSLIESSKKEKSTRV +# 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"contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; +contig28 AUGUSTUS start_codon 34882 34884 . - 0 transcript_id "contig28.g44.t1"; gene_id "contig28.g44"; +# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc +# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc +# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc +# cctgcagaggtcggccactttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttg +# atcccggttcagaacctgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatg +# acttctgaagatttgctgcagccgggacatgttgtaaaggaacgttggaaggtggtgcgtaaaatcggtggaggcggttttggagaaatttacgaggg +# acaagaccttataactcgagaacaagtcgcccttaaagtagaatccgcccgccagcctaagcaggtgcttaaaatggaagtagccgttctaaagaaac +# tacaggggaaggagcatagcaacttttccgtgggtcgattgccttataattgtcgacgcgtctatatgctagactttggattggcacgtcagtatacc +# 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+contig29 AUGUSTUS CDS 7403 7606 0.98 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +contig29 AUGUSTUS CDS 7669 8058 1 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +contig29 AUGUSTUS CDS 8375 8536 0.86 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +contig29 AUGUSTUS CDS 10531 11029 1 - 1 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +contig29 AUGUSTUS CDS 14853 14875 0.83 - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +contig29 AUGUSTUS start_codon 14873 14875 . - 0 transcript_id "contig29.g45.t1"; gene_id "contig29.g45"; +# coding sequence = [atgcatttacaagattacctcagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagc +# ctccttgcaatcaggagcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctc +# gcgggtgctatcctgcaatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgc +# 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CANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPA +# AGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGG +# ALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKSKIPIRQSKCASWAGADTTVYSSK +# TLEPRDALPEIPFNPQTNTYSTALEYPPNITDLTPEPICFIIVEGSSRSAETHQEGVRR] +# end gene contig29.g45 +### +# +# ----- prediction on sequence number 30 (length = 70018, name = contig30) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 30 on both strands +# start gene contig30.g46 +contig30 AUGUSTUS gene 28638 65517 0.02 + . contig30.g46 +contig30 AUGUSTUS transcript 28638 65517 0.02 + . contig30.g46.t1 +contig30 AUGUSTUS start_codon 28638 28640 . + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 28638 28655 0.18 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 33827 33869 0.95 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 33930 33948 0.96 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 44322 45962 0.97 + 1 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 47860 48041 0.96 + 1 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 49613 51223 0.99 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 57010 58428 0.87 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 58492 58712 0.89 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 58776 59129 0.92 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 59374 59514 1 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 59569 62496 0.74 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 64713 65304 0.85 + 0 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +contig30 AUGUSTUS CDS 65468 65517 0.64 + 2 transcript_id "contig30.g46.t1"; gene_id "contig30.g46"; +# coding sequence = [atgggtgtcactgagacggaatcgtgtataagtgatcgggactcacttaaccctgatcagggcaatcgttcctacggaa +# gctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaacttttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatac +# attattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttatgcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaa +# agatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatcaaagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctg +# gtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacattcctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgc +# caggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgcaagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgc +# gaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcgagtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagc +# cgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatgacaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgcccc +# 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+### +# +# ----- prediction on sequence number 31 (length = 40012, name = contig31) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 31 on both strands +# start gene contig31.g47 +contig31 AUGUSTUS gene 3754 25510 0.11 + . contig31.g47 +contig31 AUGUSTUS transcript 3754 25510 0.11 + . contig31.g47.t1 +contig31 AUGUSTUS start_codon 3754 3756 . + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 3754 3776 0.72 + 0 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 4315 5955 0.83 + 1 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 7853 8034 0.97 + 1 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 9606 11216 0.99 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 17003 18421 0.94 + 2 transcript_id "contig31.g47.t1"; gene_id "contig31.g47"; +contig31 AUGUSTUS CDS 18485 18705 0.89 + 2 transcript_id 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AUGUSTUS transcript 3187 7142 0.08 - . contig32.g49.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 3187 3584 0.79 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 3715 4119 0.52 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 4175 4290 0.3 - 1 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 4736 5311 0.94 - 1 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 5370 5518 0.85 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 5597 6019 0.37 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 6279 6334 0.36 - 2 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS CDS 6425 7142 0.44 - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +contig32 AUGUSTUS start_codon 7140 7142 . - 0 transcript_id "contig32.g49.t1"; gene_id "contig32.g49"; +# coding sequence = [atggccctttttgacgaggaggaggggtacgtcaatccagccatcgacaacgaaaggtacgaggacaagtacttgcagg +# caagtacattatttcgcaacctgattcgtacctgtgaagaagctcaggagaatggaagagaaggcaactttagacaatctggcaaccctgacgaggcc +# gcattaatggcgtcaggagtgggaagcgaaaacctagttcgttttcttgaacaacaacagcagctcaatgagcgtttggctgagcaacaagccacgct +# tttgagggcaaactcggcagcaactgtaatgcataataaactgccaaaaatcgacatcaagctgttcactggcgactacaaggagtggccacgcttca +# agaacatatacgagagcacaatccatagcaagcagcatttgacagcaatacaaaagttgcactacttaaaaacgtacatcactggagaagcggctgac +# ttgattcgccatatgcaaattacggatgcagcttacgaggctgcttggacttgcctgattgatcgctacaatagaccacgtcacattgttaacactct +# gctggagacatttgtcaacttaccttcgaccgccagagcagatgtaatagttctgcgcaaggtgacggacggagccaccgaaattgtacgcggcctgg +# atgcatcagggcaaactcagggggactgctgggttatacactttattctcgaccgacgttgcgaggaatttgagctcagcaaaagtgagtcagacttg +# aactctaaggttattggttcgcaagcagcagtgcctacaacacacctacgagatgaaaggcgcatcccaagcgcacccgaagatgctacggtcaccat +# cagccatattgcacgggtacaagttgctgccacagctgaagccttgtgcaagggatcaacaaccgcaacacagccacaagggctacgaaagggtgcat 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TKLILEYEHISNLHPGVSALFVIAPQKYWILGARNLIRNLVHSCIKCFYQPIHLELATDPSADSYLACLRRFMSLRGKCSQIFSNNEPNFVGAKRTLD +# EMQQLFSSQEHQRNVTQSLANGGIKWSFIPPHSPRWGGKWESSVRSVKLHLRRVVGKNVLTFEQMQTVIAQISAMVNSAAMLHT] +# end gene contig32.g49 +### +# start gene contig32.g50 +contig32 AUGUSTUS gene 9315 31071 0.09 - . contig32.g50 +contig32 AUGUSTUS transcript 9315 31071 0.09 - . contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 9315 9325 0.27 - 2 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 9382 9437 0.39 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 19927 22118 0.81 - 0 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 24947 25309 0.99 - 0 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 25407 25572 0.98 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 26120 26752 0.96 - 1 transcript_id "contig32.g50.t1"; gene_id "contig32.g50"; +contig32 AUGUSTUS CDS 29696 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cagtaacaacagcaacgagtgatattttgaataatgatcgaagggcttctttatgggcgcctcaccatgaccagtcgaggcaaacgcagcagcagtcg +# agtgagcctaagcaagagcctaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagcaccagcagcagccaccttctcaacatcc +# catggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatgaacggcagcaaattcatcaacaccagc +# atcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgaggagcctagcacagcgtttaaattaacg +# ctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaacaccaaattctcatagctcttccacaca +# ctctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccgatgagcttggattagcaaagaaccttc +# ttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacccagacacatctcgagctgagtggagac +# acacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattccccagtcaatcgacctatggagacggt +# aactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccctaagcggagaattataccaacacaccc +# 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gaggaggcagatgacaaactgatgccccatttgactggcaaaatgtctttttccaatactgctacggatcgtggaacattttcgtttacgggagacga +# tagatccatgctgccaataacaaatcacaacaccgcccccaatgaaagcacttacttgtctgtgtttggtgcgcagcaaaccctgccccagcaaccaa +# tagagaagaaaaaacgtggtcgtccaaagaagataaagggacaagagattattgatcattccgtgggcggcaaaatcagcattggtggacaacatatg +# cctcaacatgattttaataatattctaaacctttcggttatccctgccggcggctgcattgaaactccaaaaaaaaagaggggcaggccaaaaaaaat +# aaaacccgccattgacaatattctgtcagtaaaacagcttcagcacggaaactctaatccaaacacgacaaccggactgtcagtaaactcaatgcatc +# cactatcaatggagcatatagcagcgtccccgcagagcagtcatcaaatgccgcctagtttgtacaacacaccaccaccatcacaccttttgtacaac +# gcatcggcatcaccgatggcatcccccgccctcaattgcaattacaatcaagtgcacggccatggaactccaccagtgggacatgcgactcccgtcgc +# tcagggttcgtcacccaatatcgacccccaaaacgagcacctaactccccagaagcaaaatcagcagggaaatatggaggctggactagatatgcggg +# aacaccctcatttgggtgagacgcctcctccaagttcgccaaacatgtgtcctgctgtcgattttgatccaccaaacgagcactccgacccgcaagtg +# ggcgcaggggagccaaataaaacggttgagttgggtcaccagcaaccgccaacagtggaaaaggatcaatatggtagtcccgcacatgatgccgaggc +# aaacatagctcatccttccgagcactaccagcaatgggcttcgccgcataaccaacaaagtcttcagccagcgcagaaagtaacacatcagcaccttc +# atcaccccattcagcacttccagcaggagcagtccgacaactggcagcgctacgaacaacataattcgaatccttacatgctgatttctgctcaccac +# cagaatctcagtccgcgggtaggaaatcaaacccagcacaatactccccaaccaggacatatcgtctcagacgtttctcgcaagagcttgtgtggcct +# cgaatcgctggttgatcaaataccagcaataagggaacacgaatgcagcaatataccattggcaacagcagcggcagcagcggctgctgttgaaagtc +# gtcttttaggcttgcaacaacagcagcagcatcagcagcagcagcaacaacagcagcaggaacagcagcatatacagcagcaacaacaacaatcacaa +# caacagcaccagcagcaacaacaacatcaacaacagcaccagcaaccaaaacgctgcattccagagaattcggtgcaaacggaatcatgtagaccgtc +# aagagagaatagcaacgtcagcaacaacaatttttctgtaagcagtctagctgcatccgctttgactgcaagaactgagaacgaagctatatatggca +# acagtggagaaacccgagtcatcagtgaaagtagcaatagtaacaacaacaattgtggcaacagcatcgagtattctattcatagtccatccggatat +# catcatcatgcccctcacttaatgggcgctataggggcgaacattaacaactcagagcccaatccgcatcacctttcccatcctcatccacctcctca +# ctcacatccgcatacaattcatccctcacatcatctgagcgtatttgatcacttgaaaccgtccgacataagtgggtacggcggtttttga] +# protein sequence = [MASKRDVSLAQSDGTVPTVPLTPSTPYLSSSESGNNEQGKYISGLPNNRKRLKLSTLELNSSQGSDVDSPIEPDLDPN +# ARISESKADDYADMENHLPGNCNSVIEGASSGDISKIKGPEKLVQFEKNCYVPPDQALVTSVELVVPAPQNSSLSIQVGRSEETKQSALREPSEASSS +# TIDNKLQYSTSGPYNSSSSTNILANDKIDGCANDSSNLNLRTPTKLAVTTATSDILNNDRRASLWAPHHDQSRQTQQQSSEPKQEPNSPLFGTHQSDH +# IQRQHQQQPPSQHPMECHANLHQSASISQQHEQHLQHERQQIHQHQHQPTQQHHPLHENYHDIIMEEFHEEPSTAFKLTLSPSNAKPENQDDGYETSA +# GDVLTPNSHSSSTHSVTPQHQMQHPNIVLIHQNQKKPDELGLAKNLLTGEAHADPATCSSNGIQGQLHATQTHLELSGDTRCSSHTSAVNPYSFMGEE +# MRMHSPVNRPMETVTTETARYASVPAPMSTSNGNQESLSGELYQHTHHSTSILEPTESSQCDLHSKPTPKKRGRKKKLVADSTQISTPSSQQEMSAMT +# AICEDGGVDHIKAMKPKERKKHDRFNGMSEDEVIKRTIPDHLCDNLDIVIVGINPGLFAAYKGHHYAGPGNHFWKCLYLAGLTQEQMSADEDHKLLKQ +# GIGFTNMVARATKGSADLTRKEIKEGSRILLEKLQRFRPKVAVFNGKLIFEVFSGKKEFHFGRQPDLVDGTDTYIWVMPSSSARCAQLPRAADKVPFY +# AALKKFRDFLNGLIPHIDESECVFTDQRIRQCSEQQQVETSGKNKQTHQTSLGDPQASLTFVGNCGGTSTGATECGNVTEEADDKLMPHLTGKMSFSN +# TATDRGTFSFTGDDRSMLPITNHNTAPNESTYLSVFGAQQTLPQQPIEKKKRGRPKKIKGQEIIDHSVGGKISIGGQHMPQHDFNNILNLSVIPAGGC +# IETPKKKRGRPKKIKPAIDNILSVKQLQHGNSNPNTTTGLSVNSMHPLSMEHIAASPQSSHQMPPSLYNTPPPSHLLYNASASPMASPALNCNYNQVH +# GHGTPPVGHATPVAQGSSPNIDPQNEHLTPQKQNQQGNMEAGLDMREHPHLGETPPPSSPNMCPAVDFDPPNEHSDPQVGAGEPNKTVELGHQQPPTV +# EKDQYGSPAHDAEANIAHPSEHYQQWASPHNQQSLQPAQKVTHQHLHHPIQHFQQEQSDNWQRYEQHNSNPYMLISAHHQNLSPRVGNQTQHNTPQPG +# HIVSDVSRKSLCGLESLVDQIPAIREHECSNIPLATAAAAAAAVESRLLGLQQQQQHQQQQQQQQQEQQHIQQQQQQSQQQHQQQQQHQQQHQQPKRC +# IPENSVQTESCRPSRENSNVSNNNFSVSSLAASALTARTENEAIYGNSGETRVISESSNSNNNNCGNSIEYSIHSPSGYHHHAPHLMGAIGANINNSE +# PNPHHLSHPHPPPHSHPHTIHPSHHLSVFDHLKPSDISGYGGF] +# end gene contig33.g51 +### +# start gene contig33.g52 +contig33 AUGUSTUS gene 25242 27266 0.36 + . contig33.g52 +contig33 AUGUSTUS 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[MSDLGSGDEGISGSKYNVTNIEGSSSRNDFESSVKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEVSQTI +# TRGGPRSQIALPAQGMIEFRDALTDLLEEFGANDGG] +# end gene contig33.g52 +### +# start gene contig33.g53 +contig33 AUGUSTUS gene 33454 37281 0.72 - . contig33.g53 +contig33 AUGUSTUS transcript 33454 37281 0.72 - . contig33.g53.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 33454 34143 1 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS CDS 34200 34387 1 - 2 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS CDS 36532 36733 1 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS CDS 36795 36904 1 - 2 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS CDS 36967 37091 0.99 - 1 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS CDS 37184 37281 0.72 - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +contig33 AUGUSTUS start_codon 37279 37281 . - 0 transcript_id "contig33.g53.t1"; gene_id "contig33.g53"; +# coding sequence = [atggcgttcgccaatatttcgaggcgatttctaattccgggggtgtcccacttgaagctgcgaacgcaacttattccaa +# caggctcaagcgcgttaagtgggcatgaaagtcgccgtggagctgcaaaatggtacccagatcctgagttcatgaagcagtttagcggccctgtgatg +# tatcctgatgaggtgacatcgctttggaaagtacccccatggaacagcaaggttacgcctgtcgagaagtcagtgcgtaacttgaccctaaactttgg +# tccccaacatcccgcggcccatggagttctgcgcctggtactggagctggatggagagactgtgatgcgtgccgatccgcacatcggactgctgcacc +# gcggcacagagaagctcatcgagtacaagacgtacacccaggcactgccatatttcgatcggctagattacgtatccatgatgtgcaacgaacagtgc +# tattctctggctgtggaaaagcttctcaacatcgaggtgcccctgcgagcaaagtatattcgaactctgtttgccgagatcactcgaatcctgaacca +# tataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaacgccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgaga +# gagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtggtgtatcattggacatgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgca +# tcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgttgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcaga +# ggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcgaggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctgg +# tagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgctacgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaa +# tgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacgatgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttat +# ccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcctcccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtatacctta +# tatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaaagcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgctt +# gctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagtttttggggagatagatcgataa] +# protein sequence = [MAFANISRRFLIPGVSHLKLRTQLIPTGSSALSGHESRRGAAKWYPDPEFMKQFSGPVMYPDEVTSLWKVPPWNSKVT +# PVEKSVRNLTLNFGPQHPAAHGVLRLVLELDGETVMRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIEVPLRAKY +# IRTLFAEITRILNHIMAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLDMPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRI +# WVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYHLVDFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNKMPAGEIKTDDAKVAP +# PSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR] +# end gene contig33.g53 +### +# +# ----- prediction on sequence number 34 (length = 50012, name = contig34) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 34 on both strands +# start gene contig34.g54 +contig34 AUGUSTUS gene 230 2254 0.39 + . contig34.g54 +contig34 AUGUSTUS transcript 230 2254 0.39 + . contig34.g54.t1 +contig34 AUGUSTUS start_codon 230 232 . + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; +contig34 AUGUSTUS CDS 230 272 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; +contig34 AUGUSTUS CDS 322 384 0.95 + 2 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; +contig34 AUGUSTUS CDS 448 560 0.95 + 2 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; +contig34 AUGUSTUS CDS 2129 2254 0.6 + 0 transcript_id "contig34.g54.t1"; gene_id "contig34.g54"; +# coding sequence = [atgtccgatttgggaagcggagatgaaggcatctcaggatcaaaatacaatgtcacaaacatagagggttcctcaagta +# ggaacgatttcgaatcctctgtaaaaggtggaagtggtgtggagcaggaattggctaccaaaatgcttcaaatacaatccaagcgattttatttggat +# gttaaacaaaatcggagaggtcgttttataaaagtggctgaggtgtcacaaaccattactagaggtggacctagatcgcaaatcgctttaccagccca +# aggcatgatcgagttccgtgatgcccttacagatttgttagaagagtttggagctaacgatggagggtaa] +# protein sequence = [MSDLGSGDEGISGSKYNVTNIEGSSSRNDFESSVKGGSGVEQELATKMLQIQSKRFYLDVKQNRRGRFIKVAEVSQTI +# TRGGPRSQIALPAQGMIEFRDALTDLLEEFGANDGG] +# end gene contig34.g54 +### +# start gene contig34.g55 +contig34 AUGUSTUS gene 8442 12269 0.69 - . contig34.g55 +contig34 AUGUSTUS transcript 8442 12269 0.69 - . contig34.g55.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 8442 9131 0.96 - 0 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; +contig34 AUGUSTUS CDS 9188 9375 1 - 2 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; +contig34 AUGUSTUS CDS 11520 11721 1 - 0 transcript_id "contig34.g55.t1"; gene_id "contig34.g55"; +contig34 AUGUSTUS CDS 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tataatggctgtcggaacacacgccttggacgttggtgctttaacgccatttttttggctgttcgaggagcgggagaaaatgatggaattctatgaga +# gagtttctggtgcccgaatgcatgctgcctacattcgtcctggtggtgtatcattggacatgcctcttggtctgatggacgatatatatgagtttgca +# tcaaagtttgctgagcgtttagacgaagtggaggatgtgttgaccacaaaccgaatctgggtgcagcgaactgaggacattggcattgtaacggcaga +# ggaagctctgaactacggttttagcggcgtcatgctgcgaggctccggtataaagtgggacctccgcaaacagcagccgtatgatgcgtaccatctgg +# tagacttcgatgtgcccatcggcactaagggcgactgctacgacagatatctgtgccgcgtcgaggagatgcgccaatcgctgcggataatcgatcaa +# tgccttaataagatgcctgctggagaaataaaaacggacgatgccaaggtggcgcccccctctcgatccgaaatgaagacgtcaatggaggctcttat +# ccatcacttcaagttgtttactcagggctatcaagttcctcccggagcaacgtacacggcaattgaagctccaaagggagaatttggggtatacctta +# tatcagatggatcgagccgtccatatcgctgtaaaatcaaagcccctggattcgcccacttggcagctttggagaagattggaaagcagcacatgctt +# gctgacgtcgttgccattattggtactttggatgtagtttttggggagatagatcgataa] +# protein sequence = [MAFANISRRFLIPGVSHLKLRTQLIPTGSSALSGHESRRGAAKWYPDPEFMKQFSGPVMYPDEVTSLWKVPPWNSKVT +# PVEKSVRNLTLNFGPQHPAAHGVLRLVLELDGETVMRADPHIGLLHRGTEKLIEYKTYTQALPYFDRLDYVSMMCNEQCYSLAVEKLLNIEVPLRAKY +# IRTLFAEITRILNHIMAVGTHALDVGALTPFFWLFEEREKMMEFYERVSGARMHAAYIRPGGVSLDMPLGLMDDIYEFASKFAERLDEVEDVLTTNRI +# WVQRTEDIGIVTAEEALNYGFSGVMLRGSGIKWDLRKQQPYDAYHLVDFDVPIGTKGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIDQCLNKMPAGEIKTDDAKVAP +# PSRSEMKTSMEALIHHFKLFTQGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLISDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAALEKIGKQHMLADVVAIIGTLDVVFGEIDR] +# end gene contig34.g55 +### +# start gene contig34.g56 +contig34 AUGUSTUS gene 17778 33888 0.06 + . contig34.g56 +contig34 AUGUSTUS transcript 17778 33888 0.06 + . contig34.g56.t1 +contig34 AUGUSTUS start_codon 17778 17780 . + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 17778 18265 0.27 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 19470 19780 0.99 + 1 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 19851 20477 0.99 + 2 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 31647 31816 0.76 + 2 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 31870 31988 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 32298 32363 0.93 + 1 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 33140 33614 0.69 + 1 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 33680 33778 0.99 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +contig34 AUGUSTUS CDS 33859 33888 0.75 + 0 transcript_id "contig34.g56.t1"; gene_id "contig34.g56"; +# coding sequence = [atgtcagcgaatgttgagggtattcctagagctcgaaatcgggcaccagctactacgaataatcaacaaccagctatgc +# atcgaaagactaaaagcaaaagcaagcttgaaacatcaaaaaactttttcacgctacattcatcaaatgatagtgataaatatccatccgcagagaaa +# tcatcggcattagtggaaacagttgaaaaatgtaaaggaacttcttcgggaataggagtaaagacttcgcagcatttccaaattacaaaaaaccagag +# ctaccgcaacagcaggattaaaaacagaacccgctcctattctgcttctccaaccccagcggtgagatgcaaaatgatgattccattgccaacgtttg +# gcgcaacatcttttgttactctgctgactttaatttgtatggaaacggttttgctatcaaccatgtctagttgcgccaaaacgttctacatgcattgg +# aatacatcgaacagcatatttcggattgataataccgatcatataatcgatgttaataaaggcaatcttgcatttgagtttgaccaggttcatataat +# atgcccagtttatgaaccgggaacttttgaaaatgaaaccgagaaatatataatttacaatgtgtctaaagtggagtatgaaacatgtcgcataacaa +# atgcagatccgcgagtaatagctatatgtgataaacctcagaaattaatgttttttacaataactttccggccatttacaccgcagccaggtggcttg +# gagttcctacctggaaatgattattacttcatttcaacttcatctagggatgatttatatcggcgtattggaggtcgatgctccacaaacaacatgaa +# agtagttttcaaagtttgttgcgccgccgaagaaaagaacaaaaccactgcgataagcaaatctatatcaggtgcagacactggaggagccataaatg +# tcaatatagcagctaatgatgacagtcatgatcatagccaaggcaataataacattgctattggaaccagtattggtataaatggaggcataatttct +# ggaggacatcagtccgcgggaatgccaatcaatccaattaacggcaatgctaacataaatggcatagcaactactgttaattcaaacactgatcagtt +# 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gtctctagagttacaagtgtatgtcgcactgtctgagctttttggacggctccaggataacgataaaagcgcatcttatgcttctaaggcgtacgatt +# tatctcgttccttacagctgggtgaccttaactcatgccaccatagagccgcgttattgcgaatggctgcatctctgcgaaagaagggcgagctcgga +# gatgcacaggattattgcaaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccacatacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacattta +# ccggaagaaaatggatatggactctagaaacggtaaaaaacttgaagaatag] +# protein sequence = [MSANVEGIPRARNRAPATTNNQQPAMHRKTKSKSKLETSKNFFTLHSSNDSDKYPSAEKSSALVETVEKCKGTSSGIG +# VKTSQHFQITKNQSYRNSRIKNRTRSYSASPTPAVRCKMMIPLPTFGATSFVTLLTLICMETVLLSTMSSCAKTFYMHWNTSNSIFRIDNTDHIIDVN +# KGNLAFEFDQVHIICPVYEPGTFENETEKYIIYNVSKVEYETCRITNADPRVIAICDKPQKLMFFTITFRPFTPQPGGLEFLPGNDYYFISTSSRDDL +# YRRIGGRCSTNNMKVVFKVCCAAEEKNKTTAISKSISGADTGGAINVNIAANDDSHDHSQGNNNIAIGTSIGINGGIISGGHQSAGMPINPINGNANI +# NGIATTVNSNTDQFNRIPLQPNVIGSNAGTNAAIPGVVNGGGIILTPGHGHGNINMLQPGRGGMNMAYPGHHHIQTGIRINNVPTQHSYPPHKGNVNS +# NTNGNDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKIERGRRLYEQNNQTEAVRTWRSALKGTCQPEDCFQL +# LGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYNECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEG +# LQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLRMAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQ +# ATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] +# end gene contig34.g56 +### +# start gene contig34.g57 +contig34 AUGUSTUS gene 39193 45655 0.2 - . contig34.g57 +contig34 AUGUSTUS transcript 39193 45655 0.2 - . contig34.g57.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 39193 39600 0.8 - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; +contig34 AUGUSTUS CDS 41289 41467 0.85 - 2 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; +contig34 AUGUSTUS CDS 42321 43243 0.26 - 1 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; +contig34 AUGUSTUS CDS 43929 45655 0.33 - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; +contig34 AUGUSTUS start_codon 45653 45655 . - 0 transcript_id "contig34.g57.t1"; gene_id "contig34.g57"; +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga +# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg +# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat +# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat +# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc 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[MEGCTRVSELLCKRYSDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKIERGR +# RLYEQNNQTEAVRTWRSALKGTCQPEDCFQLLGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYN +# ECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEGLQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLR +# MAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] +# end gene contig35.g58 +### +# start gene contig35.g59 +contig35 AUGUSTUS gene 14188 20650 0.27 - . contig35.g59 +contig35 AUGUSTUS transcript 14188 20650 0.27 - . contig35.g59.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 14188 14595 0.87 - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; +contig35 AUGUSTUS CDS 16284 16462 0.91 - 2 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; +contig35 AUGUSTUS CDS 17316 18238 0.29 - 1 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; +contig35 AUGUSTUS CDS 18924 20650 0.38 - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; +contig35 AUGUSTUS start_codon 20648 20650 . - 0 transcript_id "contig35.g59.t1"; gene_id "contig35.g59"; +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga +# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg +# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat +# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat +# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc +# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc +# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga +# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta +# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca +# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc +# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct +# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac +# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca +# 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+ . contig35.g60.t1 +contig35 AUGUSTUS start_codon 24546 24548 . + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 24546 24620 0.37 + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 31579 31759 0.75 + 0 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 34131 34616 0.7 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 36623 37510 0.24 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 37571 37747 0.97 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 44148 44276 0.96 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +contig35 AUGUSTUS CDS 44340 44473 0.17 + 2 transcript_id "contig35.g60.t1"; gene_id "contig35.g60"; +# coding sequence = [atgaacgcaatagtcgagtgcctcgactatcagcctaagagatcaaaaaagaaagttggtgttcatgcaaataaatggg +# 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contig35.g60 +### +# +# ----- prediction on sequence number 36 (length = 45010, name = contig36) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 36 on both strands +# start gene contig36.g61 +contig36 AUGUSTUS gene 6039 42763 0.02 + . contig36.g61 +contig36 AUGUSTUS transcript 6039 42763 0.02 + . contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS start_codon 6039 6041 . + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 6039 6053 0.37 + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 0.93 + 0 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9609 0.76 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 0.27 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 12564 12740 0.92 + 2 transcript_id "contig36.g61.t1"; gene_id "contig36.g61"; +contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 0.99 + 2 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aggatatgatcggatactatcccacagtttggtggaaattctgttggtgtgttaccacccctgctatatgcttgggcgtcttcttctttaacatagtt +# cagtggaccccaattaaatatttggagtatagttacccatggtgggcgcacgcttttggttggtttacggctttgtcatccatgctatatataccaat +# atatatgttctggctgtggaaacgaactcctggtgacttgagtgaggtaccctaa] +# protein sequence = [MLFPNWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTIRDCSLFPGNALSCKETFSLL +# FYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTEVKSIAVNKKGVYFAFRDQGACISVLAVKVYYITCPAVTENFAHFNETPTGKEITI +# IEKQNGTCVENAEPYEAPTYLCKGDGKWTILTGGCRCKAGYEPNNLNKTCTECPLGTFKSPEVTKCTPCPPNSNSSKTASPFCKCMPGYYRHPSDGRH +# MPCYSPPSAPTNLTLLFVDQTSAIISWSAPTKNKTNTGKTLSNKYHSDIVYKIRCNMCSPNVMYNPSSDTFNETKITLTNLEPVTTYTVQVHATNSVS +# HLTDLSRHPNESSLITTNDTPFSNVSFFTIPLDLNEIKTSHAEIVFTTESVLLSTAFNLRILAITSKDADLEWDKPIQSDSPLEFYELRWFPKLELDV +# INKTALNTKETKAHIEGLMENTEYGFQVRCKTINGFGSYSNMIYAQTLQSVGSVYDDSVQLRFIAGAIVTGVLFLVIFIIATVYFMRSKHQDELDKKS +# TNHLPLPLDYATNEVTTPLFGNSRSYVDPHTYEDPNQAIREFAREIDANYITIEAIIGGGEFGDVCRGRLKIPPNFVQDIDVAIKTLKPGSSEKARCD +# 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contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS start_codon 8638 8640 . + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +contig37 AUGUSTUS CDS 8638 8643 0.95 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +contig37 AUGUSTUS CDS 8701 8987 0.52 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +contig37 AUGUSTUS CDS 11885 12254 0.97 + 1 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +contig37 AUGUSTUS CDS 12316 12519 0.99 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +contig37 AUGUSTUS CDS 12580 12756 0.79 + 0 transcript_id "contig37.g62.t1"; gene_id "contig37.g62"; +# coding sequence = [atgaagttggttaaaattgaacagctccccgaacgcggatcatggtcatccaaaatggatttcatactatctgtagtag +# gtctagcaattggcttgggaaatgtttggcgatttccttatttgtgctataaaaatggaggaggcgcatttatattaccgtacatcataacgttgttc +# ctagctggaattccaatgttttttatggagttagctcttggtcaaatgttgacaattggtggtcttggtgtatttaaaattgcacccatatttaaagg +# 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"contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; +contig37 AUGUSTUS CDS 48349 48396 0.86 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; +contig37 AUGUSTUS CDS 48508 49026 0.9 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; +contig37 AUGUSTUS CDS 49314 49385 0.56 + 0 transcript_id "contig37.g64.t1"; gene_id "contig37.g64"; +# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt +# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa +# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc +# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc +# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg +# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagat +# 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ttggagcaatcacataccttaaatctattgaacatgacctgcgatgcggaaattccatggaacggaggcctaagcttaattaattacttaaatgcggt +# tgaatggaaaggtcttaccggtcctattcaatttaaagaaggaaaacgagtacaatttaaattggacttaataaagctaaaacaacactccattgtaa +# aagtcggagaatggacccctcatggacatcttaacataaccgaaccatcaatgttttttgattctggttccatgaatgtgactctggtagtcataaca +# atactggaaactccctatgtaatgatgcactacggcaagaattttacgggcaacgaaagattttatgggttttgcgttgacatattggaaaccatttc +# tcatgaggttgggtttgactacatactggatttggtaccggatagaaagtatggcgccaaagatccggaatctgctgcctttcttacaactgaacgta +# tgattaaccccatcgaaaacgcagaagacttggcatcacaaacggagatatcttatggcactttggatagcggatctactatgactttttttcgggac +# tcaatgattgaaacctacaaaaaaatgtggagaagcatggacaataagaaaaccacagcgtttaccagtacatatgaggatggtataaagcgggttaa +# tcagggtaattacgcctatttgatggaatccaccatgcttgattatatcgttcaacgagattgtaatttaacgcaaataggcggattgttggatacaa +# aaggatatggaatcgctacaccaaaaggttcgccttggcgggataaaatttcgttggctatacttgagctccaggaaaaaggtgatattcaaatgttg +# tatgataaatggtggaaaaacacagatgaaacttgcattcggcgaagcacaatcaaacaatcaaaagcaaatgcgcttgggctggagagcatagagcg +# tattatgattcccgttagaagtttgcaacgcagtgaaggagacgttttcgaacccctagaataa] +# protein sequence = [MREALFSQDGWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSS +# NLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGSGSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDP +# REIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSSSDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSG +# IGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGVSGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSG +# GIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQTRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLA +# QNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSGWSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKED +# VERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDGWRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQ +# KYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQNTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIHTWSTGRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAA +# TAYTDLVQEFEPGKPWKIKSIEDDPSITPGSVARSPLSISSTPKDADIFANTGKNSPTDLPPLSLSSSTWSFNPNQNFPSWSDNSQQCAATSELWTSP +# LNKSSSRGPPPGLTANSNKSGNGGNSSTSTTSTITGGANGWLQARSGGVQTTNSTWTGNNTSWGSSWLLLKNLTAQIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLY +# LNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVSTPPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNG +# SSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGVSGTASGAIFSNKPGEYNSELAFRYAVHRLNLDKSLLPE +# TTVEYYIEYVNRLDSFEAVQKACKLVGVGVQAVFSPTDSVLATHINSICDALDIPSIGRSAHDFSINVYPSQQYINQAFNDVIHYLNWTRFGILHEKE +# YETYDLEDFKYNFVNITSFRLVDIGDVGVKQILKDLQSYSHHMIQKSFLNPHERKSIALESEPALMFDSVYVFAIGLQTLEQSHTLNLLNMTCDAEIP +# WNGGLSLINYLNAVEWKGLTGPIQFKEGKRVQFKLDLIKLKQHSIVKVGEWTPHGHLNITEPSMFFDSGSMNVTLVVITILETPYVMMHYGKNFTGNE +# RFYGFCVDILETISHEVGFDYILDLVPDRKYGAKDPESAAFLTTERMINPIENAEDLASQTEISYGTLDSGSTMTFFRDSMIETYKKMWRSMDNKKTT +# AFTSTYEDGIKRVNQGNYAYLMESTMLDYIVQRDCNLTQIGGLLDTKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGDIQMLYDKWWKNTDETCIRRSTIK +# QSKANALGLESIERIMIPVRSLQRSEGDVFEPLE] +# end gene contig38.g65 +### +# start gene contig38.g66 +contig38 AUGUSTUS gene 33346 45275 0.29 + . contig38.g66 +contig38 AUGUSTUS transcript 33346 45275 0.29 + . contig38.g66.t1 +contig38 AUGUSTUS start_codon 33346 33348 . + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 33346 33393 0.97 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 33505 34023 0.97 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 37278 37517 0.72 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 37750 38701 0.82 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 40192 40343 0.58 + 2 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +contig38 AUGUSTUS CDS 44952 45275 0.9 + 0 transcript_id "contig38.g66.t1"; gene_id "contig38.g66"; +# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt +# 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acttaaaagttcaaacttcttctctgccagacaaatttgtagaccaatccagcaagttgtgtggtaaaacaaagattcgtccggatgcaatccaaacg +# gataaccaaaaaactttaaagcaatctttaagcaaaaatcaagttcatctccaacatgagtacgacgaaagcgagcacatttacgagactattccaga +# agattctgagtctgaaccactttactgttccccgtatcaaagttcaaacggcaagtcgtcaatgggctgttgttcatccgcaatatcaacgactccgg +# ctgaagtattagaaacgacaatgcagcaacaaactcaacgagttgcacagtggttaggtttaaagccacaatatccgagaactattcacactcttgtt +# ggccgtcctgcgccactaaaattaacccaacaaccaaattgcagtcgtgtttttacattacgcagcacattgacaaacacaagccgatccagcagtag +# tggagttgcttacagtggttatggaccaaataatattcttggtgcaaacttagcttttggcgaagaggttgataactcctcaagtgcctataatactg +# gtggctcaaacaatagcgcctcgccgcatcaaaatactacaaatgctgatgatgatatcactgccaaccacaatctagagagcagagtgatcgatggc +# cgcagggaagctttagatacaactgctgtaagcagtatgttgcttttaccttttggtaaatccggtcgaatcggtctctgttcttcgaacatgtccac +# atcgtatgtcaacgagaaacaaggcaaggcaacctacgaaagtcaaattctcgttaaaagcaaccacaacgtattaggagtcaaacaaactgaggaat +# catatagccattgtccccagtttaacgcacccaatttgagtagctaccacttcgtaagtagtcaagaggttgcaaaccggtgtcatgattccacaaat +# tcaaaaccaaattctgcattgcttaacaatgaaaatagtgaagaaataccaatggtttggaaggttaagcggcgcccagatggaacgcgatacattgt +# aaagcggccagtacgtaatcgcccccaagttgctattcgaaaaaatgtgcgatgcaacgaacttacaacaacggaggaggatacagtatctgaagtaa +# aaattggtcgttattggacaaaggaagaacgaaagcgacacattgaacgagctcgagagaggcgtcaccatcagacacagcaacaacagctacagtaa] +# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES +# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH +# LFEQCLEPEIDIESTCIDTNKGDILCNDSEHCEDVFISGIQPESIAHRDGRLRQGDQILRINGVDVKNQEEVENQIAESSTAVTLLVSRILYPEDEDD +# EDIHFEYANSFIPDDYTNVVDKLDKVLLSHVQSFEELSNETGEHSSDLKVQTSSLPDKFVDQSSKLCGKTKIRPDAIQTDNQKTLKQSLSKNQVHLQH +# EYDESEHIYETIPEDSESEPLYCSPYQSSNGKSSMGCCSSAISTTPAEVLETTMQQQTQRVAQWLGLKPQYPRTIHTLVGRPAPLKLTQQPNCSRVFT +# LRSTLTNTSRSSSSGVAYSGYGPNNILGANLAFGEEVDNSSSAYNTGGSNNSASPHQNTTNADDDITANHNLESRVIDGRREALDTTAVSSMLLLPFG +# KSGRIGLCSSNMSTSYVNEKQGKATYESQILVKSNHNVLGVKQTEESYSHCPQFNAPNLSSYHFVSSQEVANRCHDSTNSKPNSALLNNENSEEIPMV +# WKVKRRPDGTRYIVKRPVRNRPQVAIRKNVRCNELTTTEEDTVSEVKIGRYWTKEERKRHIERARERRHHQTQQQQLQ] +# end gene contig38.g66 +### +# +# ----- prediction on sequence number 39 (length = 45019, name = contig39) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 39 on both strands +# start gene contig39.g67 +contig39 AUGUSTUS gene 1642 11470 0.04 - . contig39.g67 +contig39 AUGUSTUS transcript 1642 11470 0.04 - . contig39.g67.t1 +contig39 AUGUSTUS CDS 1642 2430 0.33 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 4470 4752 0.96 - 1 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 4821 5008 0.59 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 5076 5226 0.89 - 1 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 7553 7830 0.21 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 9005 10482 0.94 - 2 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS CDS 11035 11470 0.77 - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +contig39 AUGUSTUS start_codon 11468 11470 . - 0 transcript_id "contig39.g67.t1"; gene_id "contig39.g67"; +# coding sequence = [atgcgcgaagcgcttttttcccaagatggctggggctgtcaacatgtcaaccaggacaccaattgggaagtccccagtt +# cgccagaaccaaccaataaagatgcggccggaccaccaatgtggaagccaagcatcaacaatggaactgatctttgggaatccaatttaagaaacggt +# ggtcagccgaccgctcagcaagttccaaagccttcgtggggtcatacgccatcctctaatctaggcggaacgtggggagaggacgatgatggggccga +# cagcagtagtgtgtggacaggaggatcggttaacaacgccgggtctggatcggcagtgggagtgaaccaaggcggtgttaatgttggcccaggtggtg +# tagtctcatctggaggtcctcagtggggacaaggtgtggttggcgtcggactagggtcaactggtaacggatcaagcaatttatctggttcgactgga +# gttgtcgcaggtggcagcggaaactcaagcaatactggcaatggttggggagaccctcgcgaaattcgacctttagctggaggtggatctatggatat +# tcgaaacgttgatcatcgcggaggtaacggttcagggggatcttcgagcgatccccgcgacatccgaatgatcgatccacgggatccaattcgaggag +# atcctcgtggaatatccggtcggcttaatggaacatcggaaatgtggggccatcatccacaaatgtcgcacaatcaaatacaaaatattaataaaatg +# gttggccaaagcgtggcaactgctggtacgaatgttggaggaacatcaggatctggcatcggaccggggggacctggtcctggacctgtatcgaacaa +# tatcccaacacagtgggggccgtcccaagcggtaggcgttggtgtaagtggccccaaagacatatcgaagcagattagtggatgggaggaaccatcgc +# caccgccccagcgacgcagtattcctaattacgacgatggcacatccctctggggtcagcaaactcgtgttcccggtggaagcggtcactggaaagac +# atgactgattccattggtcgtagtggtcatctgatgcgaggtcaaaaccagtcgggtggcatcggtatcgcaggagttggcaatagcaatgttccagt +# tggagccaatcccaacaaccctttgaacagtgtagttggaccacagactcgcctgccatctgtgggaggcgtgcagcacaagcaagacggaggagcca +# tgtgggtgcattcgaacaatgttagcgccaggaataacgttgctgctgtcgccacttggggagatgacactcacaacgttagtgtgggcgcccccagt +# ggtggtggtgtaaccagcagtaattgggtggatgataaatctaacgccacactggctcaaaattcttggagcgacgcagcaccagttggagttggttg +# ggggaataagcaaagcaaactgccggccactagtacatcatctggttggagcactggagcaggtgtaggtgtggtggacggcgtagatctaggatctg +# aatggaactcacatggagggataattggaaaatctcagcaacagcaaaaactagcgggacttaatgtgggaatggtaaacgttatcaatgcagagatg +# attaagcaaagcaaacaatatcggatccttgttgagaacggatttaaaaaggaagacgtggagcgcgcattagtgactgccaatatgaatatcgaaga +# agcagccgatatgctgcgtaccaacacatctatggctatggatggttggcgtcgacatgatgaatcatcccttggctcatattccgaccacgcgagtt +# caacaagcagcagtgggtttgctggccgttacccagtgagcagtggacagccttcgatgtcttttcctcataataaccttatgaataacatgggtggt +# actgcagttactggaggaggaaacaataatgcaaacatgacagctttgcaagtgcaaaagtatttaaatcaaggtcaacacagcgttgctgtaggacc +# gcaaaacgttggcaacacttcagccgtatccgtcggatttggtcagaacacatcaaacgcagcagtggcagcagcagcttccgcaaatatagcagcaa +# atacaaacaatcaaccatcgggtcaacaaattcgcatgcttggacagcagattcatacatggtcaacaggacgcaacattggggatggttggccagat +# ccctcatctgataacgagaataaagactggtcagttgctcagccaacttcagcagcaactgcttacacggacctggtccaagagttcgagccaggcaa +# gccatggaagatcaaaagcatagaagacgatcccagtattactcctggaagcgttgctagatctccattatccattagttcgacgccaaaagatgctg +# acatatttgccaatactggcaaaaactcaccgactgatttgccgccactaagtttatcgtcgtctacatggagttttaatcccaaccaaaatttccca +# agttggtctgataacagtcagcaatgtgccgcaacttctgagctttggacaagccccctaaataaatcgtcatcacgtggtccgccgcctggattgac +# ggccaattcaaataaatctggtaacggaggaaatagtagtacgtcaacaacatctactattacgggtggtgctaatggttggctacaggctagaagcg +# gcggtgttcaaacaacaaattcaacttggactggtaacaatacctcttggggctctagttggttgcttcttaaaaatctaacagctcagattgatggt +# tctactttacgcacattgtgtatgcagcatggcccccttcttagctttcacctatatttgaaccaaggaattgccttatgtaaatataccactcgaga +# ggaggcgaacaaagcgcaaatggcgttaaacaactgtgtcctcgccaacaccactatatttgctgaatctccaagcgagaacgaggtacagaacataa +# tgcagcacttaccgcaaacaccatcgtctgcaagctgtactggaactagtgctggtaacggcggaggcgtcagcactccacccaatagtgggctcagt +# agctcaggatctaatctatccggaaacaatagcaacggcaatggtaacggcaatggaagcagcagcgccagtggtggcgtttccggcaataatggtaa +# caacagtggaaacaccagttgcgccggcggcagcaacccgaacaccagtgtggcaacttcgaatctacttaattctagtggagggtctgtctcaaatt +# catccggtggtgctgctagctctggtacaggctctggagtaagtggaacagcgagtggtaataccattaatggtggaacaggacctgcaaacactgct +# ggctcaaagagtagtgcaaacaatgtaactatagctggtgttcagtctagcgcttcaagcctagctaatagcaccaactcaacatggcgtcaaactag +# ccaaaaccaagctcttcagggtcaaagcaggccatcaggaagggaagctgactttgattatatatctctcgtttattccattgttgatgactaa] +# protein sequence = [MREALFSQDGWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSS +# NLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGSGSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDP +# REIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSSSDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSG +# IGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGVSGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSG +# GIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQTRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLA +# QNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSGWSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKED +# VERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDGWRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQ +# KYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQNTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIHTWSTGRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAA +# TAYTDLVQEFEPGKPWKIKSIEDDPSITPGSVARSPLSISSTPKDADIFANTGKNSPTDLPPLSLSSSTWSFNPNQNFPSWSDNSQQCAATSELWTSP +# LNKSSSRGPPPGLTANSNKSGNGGNSSTSTTSTITGGANGWLQARSGGVQTTNSTWTGNNTSWGSSWLLLKNLTAQIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLY +# LNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVSTPPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNG +# SSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGVSGTASGNTINGGTGPANTAGSKSSANNVTIAGVQSSAS +# SLANSTNSTWRQTSQNQALQGQSRPSGREADFDYISLVYSIVDD] +# end gene contig39.g67 +### +# start gene contig39.g68 +contig39 AUGUSTUS gene 18343 30272 0.16 + . contig39.g68 +contig39 AUGUSTUS transcript 18343 30272 0.16 + . contig39.g68.t1 +contig39 AUGUSTUS start_codon 18343 18345 . + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 18343 18390 0.93 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 18502 19020 0.99 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 22275 22514 0.72 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 22747 23698 0.81 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 25189 25340 0.52 + 2 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +contig39 AUGUSTUS CDS 29949 30272 0.53 + 0 transcript_id "contig39.g68.t1"; gene_id "contig39.g68"; +# coding sequence = [atgaataattgcattgtcgaggtggagtacgaatatgttgtgttaaaaattaacggttatgatattagccatttgccgt +# ggtatgaagcggttcaaaagttccttcaagccaaagaaacgatagtagttgaattgtgcagacagaagcacaatgagttagattgcaccaacgctaaa +# ctatcagatgtggataaaaccgttccgaatgctctgcaatcaaccacatgcgaatcagatttatctgcccaaactgaaaatacagccaatgcggtgcc +# tacagcaactgcaaatgactctcagctagtggacgctacgtcaataataccagcacctttggatgtaacagcaaaaaaaagtcctgttattttgactc +# tgcgtgctttaagccatgaagaacgtttgggcaatgctacagcattggccgcttcgaaggaaacgcaaacgcaacctgccaacgacacagatgttttg +# agggatcatgattttgttcagactataaccaaccacttcattgagcaggaacaccacttgtttgaacaatgccttgaaccggaaatcgatattgagtc +# gacatgcattgatacgaataaaggtgatatactgtgcaatgattcagaacactgcgaggatgtgtttattagtggcatacaaccggaaagtatagctc +# atagagatgggcgccttcgacagggtgatcaaattcttcgtattaacggcgtggatgttaaaaaccaggaagaggtagaaaatcagatagccgagagt +# agcaccgctgtaacgctcctagttagtcgaattctataccctgaagacgaggatgacgaagacattcattttgaatatgccaattcatttataccaga +# tgactacacaaatgtagtggataaattggataaggtattattaagccacgtacagtcttttgaagaactatcaaatgaaaccggcgagcattcatccg +# acttaaaagttcaaacttcttctctgccagacaaatttgtagaccaatccagcaagttgtgtggtaaaacaaagattcgtccggatgcaatccaaacg +# gataaccaaaaaactttaaagcaatctttaagcaaaaatcaagttcatctccaacatgagtacgacgaaagcgagcacatttacgagactattccaga +# agattctgagtctgaaccactttactgttccccgtatcaaagttcaaacggcaagtcgtcaatgggctgttgttcatccgcaatatcaacgactccgg +# ctgaagtattagaaacgacaatgcagcaacaaactcaacgagttgcacagtggttaggtttaaagccacaatatccgagaactattcacactcttgtt +# ggccgtcctgcgccactaaaattaacccaacaaccaaattgcagtcgtgtttttacattacgcagcacattgacaaacacaagccgatccagcagtag +# tggagttgcttacagtggttatggaccaaataatattcttggtgcaaacttagcttttggcgaagaggttgataactcctcaagtgcctataatactg +# gtggctcaaacaatagcgcctcgccgcatcaaaatactacaaatgctgatgatgatatcactgccaaccacaatctagagagcagagtgatcgatggc +# cgcagggaagctttagatacaactgctgtaagcagtatgttgcttttaccttttggtaaatccggtcgaatcggtctctgttcttcgaacatgtccac +# atcgtatgtcaacgagaaacaaggcaaggcaacctacgaaagtcaaattctcgttaaaagcaaccacaacgtattaggagtcaaacaaactgaggaat +# catatagccattgtccccagtttaacgcacccaatttgagtagctaccacttcgtaagtagtcaagaggttgcaaaccggtgtcatgattccacaaat +# tcaaaaccaaattctgcattgcttaacaatgaaaatagtgaagaaataccaatggtttggaaggttaagcggcgcccagatggaacgcgatacattgt +# aaagcggccagtacgtaatcgcccccaagttgctattcgaaaaaatgtgcgatgcaacgaacttacaacaacggaggaggatacagtatctgaagtaa +# aaattggtcgttattggacaaaggaagaacgaaagcgacacattgaacgagctcgagagaggcgtcaccatcagacacagcaacaacagctacagtaa] +# protein sequence = [MNNCIVEVEYEYVVLKINGYDISHLPWYEAVQKFLQAKETIVVELCRQKHNELDCTNAKLSDVDKTVPNALQSTTCES +# DLSAQTENTANAVPTATANDSQLVDATSIIPAPLDVTAKKSPVILTLRALSHEERLGNATALAASKETQTQPANDTDVLRDHDFVQTITNHFIEQEHH +# LFEQCLEPEIDIESTCIDTNKGDILCNDSEHCEDVFISGIQPESIAHRDGRLRQGDQILRINGVDVKNQEEVENQIAESSTAVTLLVSRILYPEDEDD +# EDIHFEYANSFIPDDYTNVVDKLDKVLLSHVQSFEELSNETGEHSSDLKVQTSSLPDKFVDQSSKLCGKTKIRPDAIQTDNQKTLKQSLSKNQVHLQH +# EYDESEHIYETIPEDSESEPLYCSPYQSSNGKSSMGCCSSAISTTPAEVLETTMQQQTQRVAQWLGLKPQYPRTIHTLVGRPAPLKLTQQPNCSRVFT +# LRSTLTNTSRSSSSGVAYSGYGPNNILGANLAFGEEVDNSSSAYNTGGSNNSASPHQNTTNADDDITANHNLESRVIDGRREALDTTAVSSMLLLPFG +# KSGRIGLCSSNMSTSYVNEKQGKATYESQILVKSNHNVLGVKQTEESYSHCPQFNAPNLSSYHFVSSQEVANRCHDSTNSKPNSALLNNENSEEIPMV +# WKVKRRPDGTRYIVKRPVRNRPQVAIRKNVRCNELTTTEEDTVSEVKIGRYWTKEERKRHIERARERRHHQTQQQQLQ] +# end gene contig39.g68 +### +# start gene contig39.g69 +contig39 AUGUSTUS gene 33944 38144 0.14 + . contig39.g69 +contig39 AUGUSTUS transcript 33944 38144 0.14 + . contig39.g69.t1 +contig39 AUGUSTUS start_codon 33944 33946 . + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; +contig39 AUGUSTUS CDS 33944 33959 0.4 + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; +contig39 AUGUSTUS CDS 35584 36216 0.38 + 2 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; +contig39 AUGUSTUS CDS 37575 37861 0.92 + 2 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; +contig39 AUGUSTUS CDS 38064 38144 0.36 + 0 transcript_id "contig39.g69.t1"; gene_id "contig39.g69"; +# coding sequence = [atgcagaagaaaaagtcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattcca +# tatcatccttcaacttttcatcggtttcggtgtcatcgagctcctcctcattgtgtaaaagtggtattgcacctgtgttcatttcgctccaaaaaaag +# gataagggtactattatgatgtcagcccaggtcaccccgaagatcttggctagcattaactcaaaggagtcaaatcttaaagcaaacaccgtacatca +# tcacgaaatggctaatcaagccaaagtcaatgcgtcatctctaccactgtcagacgatccgcggacactgcaattggcgttggaactatcactagtag +# gatttaacgacaatccaacttgctatgcgcaacctgctccacccctatcaatgcctttaagtgcacagagtgattttgaaataggtaccatcaatggc +# atgcccgcgttttctaaaacagacagcaccctgccacttccaccggcaccgagctccctcctattaccctgtgccggcaacgtcagcttagaagatcg +# atcaaagaagtcgcagaatatgaccgagtgtgttccagtccccagttccgaacatgttgccgaaatagtaggccgacaaggttgcaaaataaaggctt +# tgagagccaaaaccaacacttacattaaaacgcccgttcgaggagaggagccggtgtttgtagtaactggtcgaaaggaagatgtgaacaaggctaaa +# cgagaaattctttctgctgctgaccacttcagcttaatacgagcatcacgtaagcccttgagcgacggtcatagtggcagtttcgcaggaagtacgag +# tggatctggaggtagtgcaatgccgcgcatgcagtctggacctccatgtatgccaggacagataaccatacaggatctggaagtgtcgatggtaatac +# tgtgcaaggtggtgaaccggttgagggaaatgaatttgcgaccctgccgacaataa] +# protein sequence = [MQKKKSHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASI +# NSKESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSS +# LLLPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKP +# LSDGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQDLEVSMVILCKVVNRLREMNLRPCRQ] +# end gene contig39.g69 +### +# +# ----- prediction on sequence number 40 (length = 60015, name = contig40) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 40 on both strands +# start gene contig40.g70 +contig40 AUGUSTUS gene 560 57833 0.02 + . contig40.g70 +contig40 AUGUSTUS transcript 560 57833 0.02 + . contig40.g70.t1 +contig40 AUGUSTUS start_codon 560 562 . + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 560 1202 0.6 + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 2561 2847 0.58 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 34002 34022 0.06 + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 36185 36515 0.11 + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 38614 38793 1 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 42478 42643 0.98 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 45426 45606 1 + 1 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 47913 48579 0.88 + 0 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 55199 55372 0.97 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 55906 56181 0.97 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 56309 56669 0.96 + 2 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +contig40 AUGUSTUS CDS 57239 57833 0.99 + 1 transcript_id "contig40.g70.t1"; gene_id "contig40.g70"; +# coding sequence = [atgtctacagcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattccatatcat +# ccttcaacttttcatcggtttcggtgtcatcgagctcctcctcattgtgtaaaagtggtattgcacctgtgttcatttcgctccaaaaaaaggataag +# ggtactattatgatgtcagcccaggtcaccccgaagatcttggctagcattaactcaaaggagtcaaatcttaaagcaaacaccgtacatcatcacga +# aatggctaatcaagccaaagtcaatgcgtcatctctaccactgtcagacgatccgcggacactgcaattggcgttggaactatcactagtaggattta +# acgacaatccaacttgctatgcgcaacctgctccacccctatcaatgcctttaagtgcacagagtgattttgaaataggtaccatcaatggcatgccc +# gcgttttctaaaacagacagcaccctgccacttccaccggcaccgagctccctcctattaccctgtgccggcaacgtcagcttagaagatcgatcaaa +# gaagtcgcagaatatgaccgagtgtgttccagtccccagttccgaacatgttgccgaaatagtaggccgacaaggttgcaaaataaaggctttgagag +# ccaaaaccaacacttacattaaaacgcccgttcgaggagaggagccggtgtttgtagtaactggtcgaaaggaagatgtgaacaaggctaaacgagaa +# attctttctgctgctgaccacttcagcttaatacgagcatcacgtaagcccttgagcgacggtcatagtggcagtttcgcaggaagtacgagtggatc +# tggaggtagtgcaatgccgcgcatgcagtctggacctccatgtatgccaggacagataaccatacagtaccgtgtaggctatggtatcgtttttgatc +# accacaggacgcgaattgcaccgtcgccatctggacgaattcacttttcaaccttgattcgccctgcaaggacctgcgcagcgtgcatccggcggaaa +# acaatacattaccggattaagcttggatgggccaggcaaaagtcgatcacgaatagcagtgcatcgctcaaaaagttgagaatacaaggaggttcgag +# gagacctcgtcgtataatgtttacattgcaaccaactccgacggctataggcaccgtagttcctccctggtccgcgggaacattgatagagcgtcttc +# cgtccttggaagacatggctcacaaggacaatgtgattgctctgagaaatttaccatgtttgggtgccgctggtggaagcggactaggcggtattgcc +# ggaaagccttcccctacaatggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgcaacaacttactaccatttaac +# tgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacgacagaaaattgtcgaactgg +# cccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaagatactatgaaacgggcagt +# ataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaacgcgagtgcccgagtatatt +# tgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaaccgtgttttgcgaaacctgg +# cggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactggccgccaacagcagtggaaac +# atcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaactcttcggaaagcggcggcgc +# gagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccggatcgggatcgggatcgctgg +# acccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagctggtgcacggtaaccagcag +# gctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagtgaaattcccatatcatcggc +# ttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaagcctgggaagtgccggccacc +# tgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcctccggtgagggtgaaaactcc +# aatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaatcgaacatcttttacaaatga +# ccagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaagattggtttgccagaggcta +# ggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaaattccacaggagctagtgga +# acctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcgggatcagctgcgggtccttc +# agtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcattgagagtaccggcagtccaa +# caccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagtttgttcaccgggcccccatggg +# gttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgctatttcgcccagactcaattt +# taacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggtaacacccataccgagcttca +# accacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgccacatgagtctacgaccgccg +# ccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccggccaatctgggagcaaactg +# cagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatcaaacttctcaacatcatcca +# gtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaaccacctgggtgttggacacagc +# tcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgccaacaacgtgacatcttcctc +# ttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtataa] +# protein sequence = [MSTAHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASINS +# KESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSSLL +# LPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKPLS +# DGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQYRVGYGIVFDHHRTRIAPSPSGRIHFSTLIRPARTCAACIRRKTIHYRIKLGWARQKSITNS +# SASLKKLRIQGGSRRPRRIMFTLQPTPTAIGTVVPPWSAGTLIERLPSLEDMAHKDNVIALRNLPCLGAAGGSGLGGIAGKPSPTMEAVEASTASQPH +# STSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVV +# SKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPANSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLM +# QTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESIYEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPHSSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWY +# PSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGPSVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDGHQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLIL +# KRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERTHYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKLRNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLS +# ACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNSLPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRHGEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAH +# AHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNMHHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLTPPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAG +# GVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYALPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPSPCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMS +# YNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGKQQFFASCFYSPWV] +# end gene contig40.g70 +### +# +# ----- prediction on sequence number 41 (length = 60014, name = contig41) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 41 on both strands +# start gene contig41.g71 +contig41 AUGUSTUS gene 4006 27824 0.06 + . contig41.g71 +contig41 AUGUSTUS transcript 4006 27824 0.06 + . contig41.g71.t1 +contig41 AUGUSTUS start_codon 4006 4008 . + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 4006 4013 0.39 + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 6193 6506 0.34 + 1 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 8605 8784 0.99 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 12469 12634 1 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 15417 15597 1 + 1 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 17904 18570 0.83 + 0 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 25190 25363 0.96 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 25897 26172 0.98 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 26300 26660 0.98 + 2 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +contig41 AUGUSTUS CDS 27230 27824 0.48 + 1 transcript_id "contig41.g71.t1"; gene_id "contig41.g71"; +# coding sequence = [atggtatcgacgcgaattgcaccgtcgccatctggacgaattcacttttcaaccttgattcgccctgcaaggacctgcg +# cagcgtgcatccggcggaaaacaatacattaccggattaagcttggatgggccaggcaaaagtcgatcacgaatagcagtgcatcgctcaaaaagttg +# agaatacaaggaggttcgaggagacctcgtcgtataatgtttacattgcaaccaactccgacggctataggcaccgtagttcctccctggtccgcggg +# aacattgatagagcgtcttccgtccttggaagacatggctcacaaggacaatgtgattgctctgagaaatttaccatgtttgggtgccgctggtggaa +# gcggactaggcggtattgccggaaagccttcccctacaatggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgca +# acaacttactaccatttaactgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacg +# acagaaaattgtcgaactggcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaa +# gatactatgaaacgggcagtataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaa +# cgcgagtgcccgagtatatttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaa +# ccgtgttttgcgaaacctggcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactgg +# ccgccaacagcagtggaaacatcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaac +# tcttcggaaagcggcggcgcgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccgg +# atcgggatcgggatcgctggacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagc +# tggtgcacggtaaccagcaggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagt +# gaaattcccatatcatcggcttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaag +# cctgggaagtgccggccacctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcct +# ccggtgagggtgaaaactccaatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaat +# cgaacatcttttacaaatgaccagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaa +# gattggtttgccagaggctaggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaa +# attccacaggagctagtggaacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcg +# ggatcagctgcgggtccttcagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcat +# tgagagtaccggcagtccaacaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagttt +# gttcaccgggcccccatggggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgct +# atttcgcccagactcaattttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggt +# aacacccataccgagcttcaaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgcc +# 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gene_id "contig41.g72"; +contig41 AUGUSTUS CDS 53321 53548 0.56 + 0 transcript_id "contig41.g72.t1"; gene_id "contig41.g72"; +contig41 AUGUSTUS CDS 54373 54546 0.95 + 0 transcript_id "contig41.g72.t1"; gene_id "contig41.g72"; +contig41 AUGUSTUS CDS 58917 58958 0.36 + 0 transcript_id "contig41.g72.t1"; gene_id "contig41.g72"; +# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga +# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt +# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc +# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacacaaatcgacggtttcgcgccgacattcgcgaaaaaacccgctatacgacaggaagaaga +# tggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccacaacggagcagctgttaaggaatcaatacgcc +# ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat +# 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IKESNKIKTFIEQRGDQYYIKLELLDPQLEDSGLYKCNIKNTLGELNANLTLNIEIVPVIKDKPKIIKIIKKRTVIIECTVASKFEPKCTWYKETNTV +# KESKRHVYLVEQTKDGEFAVKLEINDVEESDKGAYKLVASNEKGQAVSQVVNLVDIPEEERKPSKPEISRKLVDQKVSESKTFELLISLAQSDRKCKI +# EWYKGSTLIRETKDITTTFDGTTARLTFSSARTEHTSNYKVIVTNEVGKAESSCKITVEKGTKKKEEQPKEKDKSKAEKEKEEKVNKNINTSKCVQDT +# HQVLESVTAQEIQSKERQVVAKMEEHYINQKSSTQLNTASIVSVEEEISAEVRRQSVVKMQDEITVDDKRVSSRRTSLAVIEEQKPAEELPKLRKTSI +# AQVKEDAKPEVAKPKAKAKAKPKPKYEELPEIPDYERPQLEKYERSDFTPTDFGRELEIPNKMEKPILDSGKKESEAPVQKNGIPKKSEIIEKPAEEP +# KGLKIGKGKLPDEDDSRDGAILKPVIIEPEQADKPSVLDIIKQRRRSSIRNLMTKEPIQNESFLGVVLKPVIKDAKEQVAPQQAIQLTKANATEQLSH +# TKAIKAKVSDLKKPEALATLEDDYERPVLEKCDPVNFDNNKSEKPTPAIITPDTKHPQVKLPVEEPKEEKPKVSRMQPPSPGEPPKIEVIREKRPSLA +# PEPPSRRGSLIPPADTGRRPSLIINDETLSIIEITALVKI] +# end gene contig41.g72 +### +# +# ----- prediction on sequence number 42 (length = 70020, name = contig42) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 42 on both strands +# start gene contig42.g73 +contig42 AUGUSTUS gene 5165 63391 0.01 + . contig42.g73 +contig42 AUGUSTUS transcript 5165 63391 0.01 + . contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS start_codon 5165 5167 . + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 5165 5477 0.8 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 9073 9235 0.38 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 10487 10687 0.89 + 1 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 10759 11030 0.75 + 1 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 13576 13799 1 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 13861 14263 0.95 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15241 0.54 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 0.99 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 1 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 0.68 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 22829 23005 0.6 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 23315 23542 0.48 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 24367 24540 0.99 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 30507 30654 0.95 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 31052 31425 0.95 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 33445 34090 0.3 + 0 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 34314 34667 0.62 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; gene_id "contig42.g73"; +contig42 AUGUSTUS CDS 35289 37001 0.84 + 2 transcript_id "contig42.g73.t1"; 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ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat +# aagcagtgtggtctcctctgaccaaggtgaatatcgcgcgcaagcgaaaaacaagcacggttctggagtcgcaactattaatcttaatttcgaaagtg +# gatcgaaaaaaattccagatggaaagtcgccacgctttccaaaaaaaccaacgatccgccaagaagaggacctactcatcatggaatgcgtattggaa +# gcgcatccggtcccagacattgtctggtattgctcagataaggaaatatccgataatcaaagaacgaaaatgacccgcaaggcaataactaaagacaa +# ctacgttttgaccctggaaatccaaaaccccacaaaagaagatggcggcaactatcgctgtaacgcaattaatatgtatggcgaaagtgcgagcgacg +# ccaatggttttgcaccatcatttatcgagaaaccaaggataatcccaaatgagtctggcacactaataacaatgaagtgcaagtgcaaggccaaacct +# gagccaaccgtaacttggtacaggggtcaagacatggtggagaagagtaagaagataaaaataaatacaacagttattgcggaagacacttacgaact +# gacattggaaataaaggatcccggggcaactgatggtggaacctacaggtgcaatgtcaaaaacgaatatggtgaatcaaacgccaatcttaacctta +# acattgaagcggagcctgagccggagggtgaggggccaacgttcattgaaaagccgcgcattgtatccgaaaacaacggtaaattggttataatggag +# 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Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 43 on both strands +# start gene contig43.g74 +contig43 AUGUSTUS gene 584 33383 0.01 + . contig43.g74 +contig43 AUGUSTUS transcript 584 33383 0.01 + . contig43.g74.t1 +contig43 AUGUSTUS start_codon 584 586 . + 0 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 584 646 0.75 + 0 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 983 1417 0.91 + 0 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 3437 4082 0.32 + 0 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 4306 4659 0.61 + 2 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 5281 6993 0.93 + 2 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 8576 9295 0.63 + 2 transcript_id "contig43.g74.t1"; gene_id "contig43.g74"; +contig43 AUGUSTUS CDS 9588 10351 0.57 + 2 transcript_id 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[atgagtcagggaaacttgatgaatacagtgcttacgattcaagtgcatcatgtagccgtctatctccttcaactgtcga +# ggataactgagtatttggaaaacacctcccagtctcaaattccaaaaagacggggtagaaaaaaaggatcgaaaggtgtggacgcacttatcgccaag +# gagtcttctagcctgtctcaacaaatattttttggtggttcaactgttaaaaaggttaaaaccacaaaggaacttttcaatgaaattcagagcagaaa +# gttaagtgtttccatgcaatcctcaacaagtaatctttcaaattcttcaacaaatcgggaactggctagccgtgctatttttccaagaccaacgtcgt +# cctgctcagacacttcaaatcattctccacaaattttggaaactttttcgggaaattctacttttaccagcaaaatagaagaacctccaatttcggat +# agtgatacgctcacttcagaaccatcgcacgatagtaataaatcacaagacattaaggaaactacttcattggacagcaatagtaattctcttcatac +# attggtcttagaaaggactccaaaaaacttgatgccgatgaattttaacgatgttaccactcaactaatgcacctaattcacagcttgaacagcccaa +# tgagtgaacttgaaattgaggaaatgtaccaagctcaaatagtaccatgtacttgcatagttatcgaggaagttcaaagttcattaaaagagcccaaa +# aaagaagcttcagactctgatatcaacgatccagcaacaagttcaaattgtgataagaatatttctcgccacaagaatgaagaccaagtttttaattt +# tgaaagtttggataatgttgaagtaggtgaaattcaaccaaaaacagtgaagtcaatatttgatctagattttgatgataacgacgatcctttgaata 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AUGUSTUS gene 1472 4761 0.08 - . contig44.g76 +contig44 AUGUSTUS transcript 1472 4761 0.08 - . contig44.g76.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 1472 1480 0.34 - 0 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +contig44 AUGUSTUS CDS 1698 2407 0.69 - 2 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +contig44 AUGUSTUS CDS 4148 4219 0.84 - 2 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +contig44 AUGUSTUS CDS 4279 4577 0.3 - 1 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +contig44 AUGUSTUS CDS 4679 4761 0.31 - 0 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +contig44 AUGUSTUS start_codon 4759 4761 . - 0 transcript_id "contig44.g76.t1"; gene_id "contig44.g76"; +# coding sequence = [atgagtcagggaaacttgatgaatacagtgcttacgattcaagtgcatcatgtagccgtctatctccttcaactgtcga +# ggataactgagtatttggaaaacacctcccagtctcaaattccaaaaagacggggtagaaaaaaaggatcgaaaggtgtggacgcacttatcgccaag +# 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"contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +contig44 AUGUSTUS CDS 18177 18286 0.39 - 0 transcript_id "contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +contig44 AUGUSTUS CDS 18378 18544 0.39 - 2 transcript_id "contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +contig44 AUGUSTUS CDS 18634 18650 0.19 - 1 transcript_id "contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +contig44 AUGUSTUS CDS 20178 20182 0.16 - 0 transcript_id "contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +contig44 AUGUSTUS start_codon 20180 20182 . - 0 transcript_id "contig44.g77.t1"; gene_id "contig44.g77"; +# coding sequence = [atgaggtacgtatcgttgaaagtgcgcaactgctgcgccctgagtgcctggaacaatcgattgttcagctccgccagcc +# acagcctcatattcgggtgctccagcgccgtcagcttcctcagttttccgcgatggctcgaccggagcagtagatgcagcagatgccaaggcggtggc +# gacgaggcgagccccatgtatgccgaacgctgcctcggagagcagcgagctctgagtgtcggtggatgtggacgtggaggtggaggtggaggaacgct +# gtcgcttggcagtgacgtttacgggattgacttgcttgctgtaatggcacaactcttgacgatgcgcgagacccattacgttagcatgaccgacattg +# 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+contig45 AUGUSTUS CDS 1628 2464 1 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 3943 4848 0.95 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 8005 8050 0.57 - 1 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 8173 8282 0.55 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 8374 8540 0.57 - 2 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 8630 8646 0.26 - 1 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS CDS 10174 10178 0.17 - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +contig45 AUGUSTUS start_codon 10176 10178 . - 0 transcript_id "contig45.g78.t1"; gene_id "contig45.g78"; +# coding sequence = [atgaggtacgtatcgttgaaagtgcgcaactgctgcgccctgagtgcctggaacaatcgattgttcagctccgccagcc +# 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QFFYPPESLSPSGFSSDEGELPSQRELDD] +# end gene contig45.g78 +### +# +# ----- prediction on sequence number 46 (length = 50012, name = contig46) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 46 on both strands +# start gene contig46.g79 +contig46 AUGUSTUS gene 42718 44481 0.73 - . contig46.g79 +contig46 AUGUSTUS transcript 42718 44481 0.73 - . contig46.g79.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 42718 44481 0.73 - 0 transcript_id "contig46.g79.t1"; gene_id "contig46.g79"; +contig46 AUGUSTUS start_codon 44479 44481 . - 0 transcript_id "contig46.g79.t1"; gene_id "contig46.g79"; +# coding sequence = [atggctcactctgacttgggtgcttcgcaggcgaccacggccgaccaggatcacggggccacatcgaacaacagtcatg +# tgcctaagcaaactgtgccgagcatatatccccttggaacctcgcgaaacccgcaagctcaagccacgacaatggctctagagcaataccggctgcag +# ctgtacaactacgcccttaatattgaacgatttagatgccctcaatacggtggcaccggaggcgccgccacaagtgctccatggctgcatttaagccc +# 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"contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS CDS 28179 29141 0.91 - 2 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS CDS 29810 32428 0.65 - 2 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS CDS 34008 34293 0.9 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS CDS 34351 34524 0.95 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS CDS 34579 34914 0.91 - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +contig47 AUGUSTUS start_codon 34912 34914 . - 0 transcript_id "contig47.g81.t1"; gene_id "contig47.g81"; +# coding sequence = [atgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttaca +# acgtcagcactggagccctaaatagttcgattgcagcgcacagcctgggccacaacgcgacagcctcttcatcgcgtaatttatttccagaataccgg +# tacggtcgcgaggaaatgctttccttgttcgatcggaactgtatgctgccgcagatcctgccttcattcaaaaagctttttgtggaaaaggtccagta +# 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[MTDSMKFGPEWLRNMSAEPSGSPSTYNVSTGALNSSIAAHSLGHNATASSSRNLFPEYRYGREEMLSLFDRNCMLPQI +# LPSFKKLFVEKVQYPLALTPSSEEDNNQNVLGNSSRPAWLQRSSGGFSTASRGTGRGGTVDRGRIRGKSVYHPIYQRPSGLYDEGLSVISIKAERTWS +# ERNGTGDSAVTNISSSSSGVLDWNGTPSSSPRKDFSSHHRNMENWRRSRNEDGSGDGPVGISGPDIGGWRSGGGAGSTNTSFGTNSHRWGRSTSWRDE +# DVHVDNPSTLQRSISTVGTVGPDRERPGNSKSSGIGAGEAAGSSNPSVRLLSSKTSPLWAVNNVVGNGGDDNLPEWAMENPSELGGSFDASGAFHGDA +# DPQNNKSLKAKGFNSDQSLSKSKSEPLNENDSVNDKTSEVSLTNLSASQELPESRLSPVNSTTKTDVIHGDISDRIKEVADEVEKLITEDDNKPFTNS +# NQLQSDSGHFPAALPSLTDNELSTTPISVNPSIVRQQVATTMPIQIATTISEATQPSHQHSTVPFSNLVAMQHHNMQHQPHFSMVPTPHLINPNLNEL +# WFYRDPQANVQGPFSAMEMTEWYRAGYFNENLFVRRFSDNRFRPLGELIKFCHGNMPFTHSHLLPSPMDLENLPVGQIPATLSAGLPISPRKQSPIAL +# PLTVVEQQLQQQRCDQLKANVTAAAESLSAAIKGNLGGNSITTTSQILAMRFQMLQDQYLQHQEYQILAELSKNECFQRLSAVEREAVVRRKVQVLVL +# PEYLTSLNGLSNSLSVLNPAAGSQLYTAVAEQAKKDQQHMFGNSNEQQRTGGNLLDANNFILNAQVLHQQAQSVVVPLAASVECVMESGSAGDLNKLE +# DQPRNDLDLINEYNLRMLLRGQPTVNQQQQPLLPTSGNENISGGDYITETQLLAAQNLMIPMWLPPSKQQQPDPQWPGLTNEKATLWEVGNLHEEPSE +# 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"contig48.g82"; +# coding sequence = [atggccaaaacgcttaaatctgtctgccgcccacataacatctactggaaaagccgcgtcaccgtaacattggaaaaga +# ggctactgaaaatgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttacaacgtcagc +# actggagccctaaatagttcgattgcagcgcacagcctgggccacaacgcgacagcctcttcatcgcgtaatttatttccagaataccggtacggtcg +# cgaggaaatgctttccttgttcgatcggaactgtatgctgccgcagatcctgccttcattcaaaaagctttttgtggaaaaggtccagtatccacttg +# ctttgacaccaagttccgaggaggacaacaaccaaaatgtgctcgggaatagctcgcgacctgcctggttgcagcgatcgtctggtggatttagtact +# gcctctcggggcactggacgtggtgggacagtcgatcggggccgaatacgcggcaaatctgtctatcatcctatataccaacgcccaagtggtcttta +# cgatgagggcttatcggtaatatctatcaaggctgaacgcacttggagtgaacgcaacggaactggtgattctgccgtgaccaacatctctagtagta +# gctcaggtgtccttgactggaacgggactccaagctcaagtcctcgaaaagacttctcaagtcatcatcgcaatatggagaactggcgacgatcacgg +# aatgaagacggctccggagacggtccagttggcattagtggtcccgacattggtggttggagaagcggtggtggcgcaggaagtactaatacaagttt +# 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QMKRDSFTNNSLHKLDTVVGESTSNLTGIIKEKMCSDLDERSEDINDQLSDLTDINKLTLLKKKSLLRGETEEVVGGHMQMIRQPEITARQRWHWAYN +# KIIMQLNVST] +# end gene contig50.g85 +### +# +# ----- prediction on sequence number 51 (length = 50015, name = contig51) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 51 on both strands +# start gene contig51.g86 +contig51 AUGUSTUS gene 1559 30331 0.01 - . contig51.g86 +contig51 AUGUSTUS transcript 1559 30331 0.01 - . contig51.g86.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 1559 1620 0.94 - 2 transcript_id "contig51.g86.t1"; gene_id "contig51.g86"; +contig51 AUGUSTUS CDS 1681 1782 0.75 - 2 transcript_id "contig51.g86.t1"; gene_id "contig51.g86"; +contig51 AUGUSTUS CDS 1917 2139 0.69 - 0 transcript_id "contig51.g86.t1"; gene_id "contig51.g86"; +contig51 AUGUSTUS CDS 2200 2346 0.99 - 0 transcript_id "contig51.g86.t1"; gene_id "contig51.g86"; +contig51 AUGUSTUS CDS 5174 5397 0.91 - 2 transcript_id "contig51.g86.t1"; gene_id "contig51.g86"; +contig51 AUGUSTUS CDS 5605 6079 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"contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; +contig51 AUGUSTUS CDS 42313 42446 0.87 + 1 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; +contig51 AUGUSTUS CDS 45674 45733 0.63 + 2 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; +contig51 AUGUSTUS CDS 45795 46090 0.82 + 2 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; +contig51 AUGUSTUS CDS 46765 47091 0.33 + 0 transcript_id "contig51.g87.t1"; gene_id "contig51.g87"; +# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta +# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca +# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat +# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca +# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca +# 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AUGUSTUS CDS 6895 7576 0.42 + 0 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 0.97 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 0.82 + 1 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +contig52 AUGUSTUS CDS 15666 15725 0.52 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +contig52 AUGUSTUS CDS 15787 16082 0.85 + 2 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 0.33 + 0 transcript_id "contig52.g88.t1"; gene_id "contig52.g88"; +# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta +# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca +# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat +# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca 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"contig52.g89"; +contig52 AUGUSTUS CDS 24806 25012 0.59 - 2 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; +contig52 AUGUSTUS CDS 27339 27713 0.95 - 2 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; +contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 0.94 - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; +contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30182 0.7 - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; +contig52 AUGUSTUS start_codon 30180 30182 . - 0 transcript_id "contig52.g89.t1"; gene_id "contig52.g89"; +# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc +# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct +# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc +# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt +# 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+contig52 AUGUSTUS transcript 32268 33026 0.91 - . contig52.g90.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 32268 33026 0.91 - 0 transcript_id "contig52.g90.t1"; gene_id "contig52.g90"; +contig52 AUGUSTUS start_codon 33024 33026 . - 0 transcript_id "contig52.g90.t1"; gene_id "contig52.g90"; +# coding sequence = [atgttgacagtggcatacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgcc +# gggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacgcccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgt +# cgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcggtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagc +# gaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaaaagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttac +# tcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggtatatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaaga +# ccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatgg +# tcgtacggtcaataaacagtattatctggaagttatgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggc +# 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"contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; +contig53 AUGUSTUS CDS 7332 7706 0.95 - 2 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; +contig53 AUGUSTUS CDS 7771 7900 0.97 - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; +contig53 AUGUSTUS CDS 9015 10175 0.58 - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; +contig53 AUGUSTUS start_codon 10173 10175 . - 0 transcript_id "contig53.g91.t1"; gene_id "contig53.g91"; +# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc +# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct +# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc +# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt +# atgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttgttgcccaga +# agtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgcaagcgttgc +# taatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttcaaaatgaca +# cgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgcaaactcctat +# cacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaacaatgaaga +# ccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaatagcaacgtca +# gtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactctgcaaacaa +# aatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttggataattccct +# aatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataataatgaacttc +# caggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattggtattccgagtgttaaggatttagaagcgcaaatgactaaagtagacatgcggccggattat +# 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[MSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSGTNN +# GETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNTETE +# KDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQLET +# IDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTESEFN +# FDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIGIPSVKDLEAQMTKVDMRPDYVNTVGGPFSQVVQAEKPIP +# RDTEGFKKLLQQLGYQSRQHHPGNDVYHIINHSNITNHDHLESNQQHKINNCHSQHSALSVHGPNIPSNSHIFAQKRLETHHLMQSLICGDVSLDFLE +# KELGNPSTAPSTKEVIASVLREYSHNKRNPVSIGDHKMFTHSTFLQAQPVHPHYSEVLRKMTADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTA +# PIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGVNFAMSVCLSYRMNAEISAT] +# end gene contig53.g91 +### +# start gene contig53.g92 +contig53 AUGUSTUS gene 12261 24119 0.04 - . contig53.g92 +contig53 AUGUSTUS transcript 12261 24119 0.04 - . contig53.g92.t1 +contig53 AUGUSTUS CDS 12261 12946 0.16 - 2 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; +contig53 AUGUSTUS CDS 23027 23128 0.76 - 2 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; +contig53 AUGUSTUS CDS 23180 24119 0.31 - 0 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; +contig53 AUGUSTUS start_codon 24117 24119 . - 0 transcript_id "contig53.g92.t1"; gene_id "contig53.g92"; +# coding sequence = [atgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaa +# ctcgaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtatt +# gagcgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagc +# cgccgctgtggttggcgtaacggcggtagcagccgctactgtcggtgttcctttcaacttgcacggttctactgtcctgtcccctttgcactcgcttc +# ggaatgatcgggacctttccctaatgcccatctccagaaactttgtagtggactacatgtggcagcagaaggacggacactaccaacatcagtattca +# aagaaactcagtggcggtgaacccagcgagcaaagcctggacttcgagtcctgctcccgatcatggactagacctgacacgaatgtttcaataccgac +# 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35008, name = contig54) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 54 on both strands +# start gene contig54.g93 +contig54 AUGUSTUS gene 470 4114 0.08 - . contig54.g93 +contig54 AUGUSTUS transcript 470 4114 0.08 - . contig54.g93.t1 +contig54 AUGUSTUS CDS 470 541 0.28 - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; +contig54 AUGUSTUS CDS 2726 3123 0.65 - 2 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; +contig54 AUGUSTUS CDS 3175 4114 0.36 - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; +contig54 AUGUSTUS start_codon 4112 4114 . - 0 transcript_id "contig54.g93.t1"; gene_id "contig54.g93"; +# coding sequence = [atgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaa +# ctcgaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtatt +# gagcgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagc +# cgccgctgtggttggcgtaacggcggtagcagccgctactgtcggtgttcctttcaacttgcacggttctactgtcctgtcccctttgcactcgcttc +# ggaatgatcgggacctttccctaatgcccatctccagaaactttgtagtggactacatgtggcagcagaaggacggacactaccaacatcagtattca +# aagaaactcagtggcggtgaacccagcgagcaaagcctggacttcgagtcctgctcccgatcatggactagacctgacacgaatgtttcaataccgac +# tggaagttctttaaggctttcggataatactccttttaatataaaaaacgagtcacactcatctatttgtggcattatcaaaaaccgaaagctatctg +# cagctacgagcagcgggttaagcctctctgattataacattccctcgattcttaactgctctgcgtttaaaccagtcgtcgcttcgactgcaattgtg +# tcaacctccttatacactagatccagtgactcaaagcgaactgattatataaacccaacacaatctacaaggacgacaactgttctaacgcataacag +# catttcgggttcgtcgcaccaaatagtaggtgagaccatttcgccaattttagaaaaagtgacacccaatatagaaaaaaagccaactgaatctgctt +# tagtcaactgcctacccaggaatgttaatgataccgacgatgacgacgaagtcgtggatattgagacaacggaagatgaaggtaaattcatggctcaa +# cacgttgacgcctctcgtacgccacccgacattgtgtttgaaagcgaaagtaccagcccttctccgtctacaagtacaaatattgatgtagaagcaga +# cattgatgtagatgtcattacaacagacgctgaggatcaactagagttcaatgccagtagatgcgcaatcgaaaatacaagtcattccctatcagttt +# ttcaaagtgaaacattacgaatgtgtggttcatctccaaatgcaaaaatcatgttaggcgataatgaagttacaatatccgagaggtcggcagcttct +# atgctgcggggcatggcagatagttctgcccactctctgccgctacaggtaaagtag] +# protein sequence = [MTLSGNTYDEKIIHAWEDVKAMFNGGTRKRLVGSSINNRNMGSPTPSAAVSSCGSPTSIERDPKEGDGESESPEFPQR +# QIDSQFNYSTVATAAAVVGVTAVAAATVGVPFNLHGSTVLSPLHSLRNDRDLSLMPISRNFVVDYMWQQKDGHYQHQYSKKLSGGEPSEQSLDFESCS +# RSWTRPDTNVSIPTGSSLRLSDNTPFNIKNESHSSICGIIKNRKLSAATSSGLSLSDYNIPSILNCSAFKPVVASTAIVSTSLYTRSSDSKRTDYINP +# TQSTRTTTVLTHNSISGSSHQIVGETISPILEKVTPNIEKKPTESALVNCLPRNVNDTDDDDEVVDIETTEDEGKFMAQHVDASRTPPDIVFESESTS +# PSPSTSTNIDVEADIDVDVITTDAEDQLEFNASRCAIENTSHSLSVFQSETLRMCGSSPNAKIMLGDNEVTISERSAASMLRGMADSSAHSLPLQVK] +# end gene contig54.g93 +### +# +# ----- prediction on sequence number 55 (length = 40015, name = contig55) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 55 on both strands +# start gene contig55.g94 +contig55 AUGUSTUS gene 6802 33037 0.13 + . contig55.g94 +contig55 AUGUSTUS transcript 6802 33037 0.13 + . contig55.g94.t1 +contig55 AUGUSTUS start_codon 6802 6804 . + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 6802 6809 0.33 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 12258 12438 0.74 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 29483 29737 0.99 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 29800 29948 1 + 0 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 32756 32875 0.53 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +contig55 AUGUSTUS CDS 32929 33037 0.43 + 1 transcript_id "contig55.g94.t1"; gene_id "contig55.g94"; +# coding sequence = [atgcttctatattatgaaacaggatcaattaaacctcgagcgataggtggttcaaaaccacgagtagctacaaccccgg +# tcgtacaaaaaattgcggactataaacgggaatgtcccagcatatttgcatgggaaataagggatagactgctgtccgagcaagtttgcaatagtgat +# aacattccaagtgtctggttctcaaaccgccgcgccaaatggcgtcgggaagaaaagatgagaactcagaggcggtcggccgataatgttggtggcag +# tggtcgagccagcacgacaaataatccttcggggacagctgtaaattccacagtagcaacgtcgaataactcaacacccggcattaccagctcaacac +# tcaacgtatcggaacgggcgtcatcggctataattagcaatagcatacccgagacaccgaatgggccaactgttctgggtggagacgctaacgccgca +# cacaccacctctgaaagtccaccacttcaggcagttgcaccgcggctacccttgaacactggctttaacgccatgtactcatctatcccgcaacccat +# agctacaatggctgaaaactacaagatctccatatgtaccaccacaccaccgaaacacagcttgcaatcctgcagctgcgcaccagcagccacctcag +# catggcgtttatgccaacagttctccaatgacatcatcaaatacaggggtcatttctgcaggcgtttcggtgcctgtccagatttcaacgcaaaatgc +# atcggacctcgcgggaagcaactactggccacgtcttcagtgatcgtcaatctttaa] +# protein sequence = [MLLYYETGSIKPRAIGGSKPRVATTPVVQKIADYKRECPSIFAWEIRDRLLSEQVCNSDNIPSVWFSNRRAKWRREEK +# MRTQRRSADNVGGSGRASTTNNPSGTAVNSTVATSNNSTPGITSSTLNVSERASSAIISNSIPETPNGPTVLGGDANAAHTTSESPPLQAVAPRLPLN +# TGFNAMYSSIPQPIATMAENYKISICTTTPPKHSLQSCSCAPAATSAWRLCQQFSNDIIKYRGHFCRRFGACPDFNAKCIGPRGKQLLATSSVIVNL] +# end gene contig55.g94 +### +# +# ----- prediction on sequence number 56 (length = 55020, name = contig56) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 56 on both strands +# start gene contig56.g95 +contig56 AUGUSTUS gene 1802 28037 0.09 + . contig56.g95 +contig56 AUGUSTUS transcript 1802 28037 0.09 + . contig56.g95.t1 +contig56 AUGUSTUS start_codon 1802 1804 . + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 1802 1809 0.26 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 7258 7438 0.76 + 1 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 24483 24737 1 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 24800 24948 1 + 0 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 27756 27875 0.59 + 1 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +contig56 AUGUSTUS CDS 27929 28037 0.49 + 1 transcript_id "contig56.g95.t1"; gene_id "contig56.g95"; +# coding sequence = [atgcttctatattatgaaacaggatcaattaaacctcgagcgataggtggttcaaaaccacgagtagctacaaccccgg +# tcgtacaaaaaattgcggactataaacgggaatgtcccagcatatttgcatgggaaataagggatagactgctgtccgagcaagtttgcaatagtgat +# aacattccaagtgtctggttctcaaaccgccgcgccaaatggcgtcgggaagaaaagatgagaactcagaggcggtcggccgataatgttggtggcag +# tggtcgagccagcacgacaaataatccttcggggacagctgtaaattccacagtagcaacgtcgaataactcaacacccggcattaccagctcaacac +# tcaacgtatcggaacgggcgtcatcggctataattagcaatagcatacccgagacaccgaatgggccaactgttctgggtggagacgctaacgccgca +# cacaccacctctgaaagtccaccacttcaggcagttgcaccgcggctacccttgaacactggctttaacgccatgtactcatctatcccgcaacccat +# agctacaatggctgaaaactacaagatctccatatgtaccaccacaccaccgaaacacagcttgcaatcctgcagctgcgcaccagcagccacctcag +# catggcgtttatgccaacagttctccaatgacatcatcaaatacaggggtcatttctgcaggcgtttcggtgcctgtccagatttcaacgcaaaatgc +# atcggacctcgcgggaagcaactactggccacgtcttcagtgatcgtcaatctttaa] +# protein sequence = [MLLYYETGSIKPRAIGGSKPRVATTPVVQKIADYKRECPSIFAWEIRDRLLSEQVCNSDNIPSVWFSNRRAKWRREEK +# MRTQRRSADNVGGSGRASTTNNPSGTAVNSTVATSNNSTPGITSSTLNVSERASSAIISNSIPETPNGPTVLGGDANAAHTTSESPPLQAVAPRLPLN +# TGFNAMYSSIPQPIATMAENYKISICTTTPPKHSLQSCSCAPAATSAWRLCQQFSNDIIKYRGHFCRRFGACPDFNAKCIGPRGKQLLATSSVIVNL] +# end gene contig56.g95 +### +# start gene contig56.g96 +contig56 AUGUSTUS gene 38038 53620 0.04 - . contig56.g96 +contig56 AUGUSTUS transcript 38038 53620 0.04 - . contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 38038 38205 0.98 - 0 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 38270 38415 1 - 2 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 38468 38598 1 - 1 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 38660 39046 0.99 - 1 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 39119 39314 0.99 - 2 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 46743 47855 0.2 - 2 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 49901 51146 0.62 - 0 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS CDS 52391 53620 0.35 - 0 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +contig56 AUGUSTUS start_codon 53618 53620 . - 0 transcript_id "contig56.g96.t1"; gene_id "contig56.g96"; +# coding sequence = [atgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaatagcaggtt +# ctcagacactggcagcaaatatttggtctgacaagacggctattcaaaatgaacccataaatatgactgatgttaatgcgacggtaaaggatgcaaat +# aaccatagtaccaccattacaaatgtagctacgtttgacacgaaattaaatcacttgttagtggacaccattactggacgagtctttgttggtggtgt +# taataggttgtatcagctatcgcctgatttggagctgtccgaaacggtaaaaacgggaccccaaaacgattcggtagagtgtagtatactcgactgcc +# cgttgaatgctgttcgcagtccgacggacaactataataaagttttgctcatagatcgtgcgacttctcgacttatttcatgcggatcactatttcag +# ggaacatgcacagttcgtaatcttcagaatgttagcataattgagcatgaagtgcccgatgcggttgttgcaaatgatgctaattcgtcaaccgtggc +# ttttatagcaccgggccctccacagcatccagtgacaaatgtgatgtatgtcggagttacttatactaacaattcgccataccgaagtgaaatcccag +# ccgtggcttcgcgctctcttgaaaaaacgaaaatgtttcagattgcttcttcggcggttacgactggaacgagaacttttattaattcttacgcacgt +# gaaacatattttgtgaactacgttttcggattcagctctgagcgattctcatattttcttaccacgcagttaaagcacagtcaccattcctctcccaa +# agagtatataacgaagcttgtgcgaatatgccaggaagattcaaactattattcatacacggaaattccagtcgaatgtataagtgatgcccagggcg +# gcactaaattcaacttggttcaggccggtttcttgggaaaacctagctcggatttggctcaaagtctgggtatatccattcaggatgacgtgttattc +# gctgctttttcaaaaggcgacggaaacacaccaactaacaactctgcactatgcatttactcattgaaatccattcgtcgtaaatttatgcaaaacat +# aaaatcctgttttaacggtaatgggatgaggggacttgactttatatcacccagcatgccatgtgttttaacgaaactacaaacaattggagaggatt +# tttgtggactcgatgtaaattctccgttgggaggagagaatcctattacttcagtgccggttgctatgtttaacacgaagttaacttcagttgctgca +# acgagcactagtggatataccgttgtattcgtgggcacagcagatggatacctcaagaaagttgtagtcgaatcttcatctgttgcgaatgagtacgc +# cagttttcctgtggacttgggctctgaaattaatcaggatatgcagtttgacaaccaaaacctttacatgtatgtcatgtccgaaactaaagtatcaa +# aagttaaagtgtttgattgctctgattacaagacatgtggagaatgcctaggtgctagagacccatattgcggttggtgctcattggagaataaatgt +# agcccacgatccaattgccaggacgacgccaacgatcctttatattgggtcagctataaaactgggaaatgtactacaataacaagtgttgtgcctca +# ccagctacagcgtactactgctcggactttagagcttatcatagatcacttgccgcaactaaaggagaatttaatatgtgcatttaccacagaggata +# aagcactcttcacaaatgccacgaaaaagagaaatggcgtgaactgtacaacaccgcgaacggacatgcttccccaaattgaacaagggaaacatcat +# tttacagccaaactatctgtgcgtaccagaaatggacctgacttagtgtcaacggattttactttctttgattgcagtacacactcatcgtgtacccg +# ttgtgtgtcctcggagtttccgtgcgattggtgtgttgaggcacaccggtgcacacacgacacggctgaaaattgtcgcaacgatattttggttacag +# gcgttagccggataggcccaagctatagatcaggtcctggattttgtccaacgatcaacgctacaggtgatggaagtgaagtactggtgtctggtgga +# 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gaactttatcctaatcccgaatattttatatttgaagaaagggttaagtacttcaagagtgaatatttgacaataaatggccgaaacctagatcgcgc +# ctgcaaagagactgatgtggaagtaaaaataggaaatggattttgcaatattacgtctctttcaagacaacaacttacatgtagacctcctcctgaag +# caacggcaactaaaagcatcaatggaccagaagtaattgttcgtattggaacttcgctggagtaccgtattggtatccttagctacgaatcatcaaac +# ataattttggattggggagaaaacgtaatatttgcagtaatagcgacaattgttatcttattgctgatttttgttgctttgctcgtggcatataaaaa +# gaaaagttcagagtctaaccgggtgcttcgaaacatgcaggaacaaatggatatattagagttacgtgtcgcagctgaatagtggcgaacaggtgcta +# caggtcgagtcattctgtacgatgaggatgtaacatctaaaaccgaaagcgaatggaaaaaacttaacacattgcagcactataacgttccagacggc +# gctgggctgagcctagtaccaaagcaaagttcaatttataactttagtattttgtcggataaaaatgaaaaatcgcacaagtatgaaactcttaatat +# atcgaaatacacctcctcctctccgacatttagccgcgccgggagccctctaaataatgatatgcatgataatggtctaagatactggcatctagtga +# aacaccatgatagtgacatgcagaaagaaggcgagcgggttaacaaattggtatcagagatttacttaaccagactgttggcaactaagggtacactt +# cagaaattcgtagatgatctttttgaaacgatatttagcaccgctcatcgaggatcggcactgcccctagctataaagtacatgtttgactttctcga +# cgatcaagctcagttacatggtataactgacccagaagttgtgcatacctggaaaagtaacagcttaccattgcgcttttgggtaaacttgattaaaa +# atcctaattttgtctttgacatacacaagtcaaatatagtggattcctgcttgtcagttgtggcacaaacatttatggactcttgttcaacttctgat +# caccggttgggtaaggactcaccaagctcgaaacttctatacgcgaaagacataccagagtatcgcaaatgggttgatcgttattatcgagacattcg +# cgatatgtccccaatatcagatcaggatatgaatgctatgcttgcagaagaatcaaggctgcacacaacagaatttaatacaaactgtgcactacatg +# agctgtacacatatgctgtgaagtacaatgaacagctaactgttacacttgaagaggatgaattttcgcaaaagcagagattggcttttaaattagag +# caagttcataacataatgtcggcagaataa] +# protein sequence = [MNFILSVLLIATLGDKYDHRLNLIAGSQTLAANIWSDKTAIQNEPINMTDVNATVKDANNHSTTITNVATFDTKLNHL +# LVDTITGRVFVGGVNRLYQLSPDLELSETVKTGPQNDSVECSILDCPLNAVRSPTDNYNKVLLIDRATSRLISCGSLFQGTCTVRNLQNVSIIEHEVP +# DAVVANDANSSTVAFIAPGPPQHPVTNVMYVGVTYTNNSPYRSEIPAVASRSLEKTKMFQIASSAVTTGTRTFINSYARETYFVNYVFGFSSERFSYF +# LTTQLKHSHHSSPKEYITKLVRICQEDSNYYSYTEIPVECISDAQGGTKFNLVQAGFLGKPSSDLAQSLGISIQDDVLFAAFSKGDGNTPTNNSALCI +# YSLKSIRRKFMQNIKSCFNGNGMRGLDFISPSMPCVLTKLQTIGEDFCGLDVNSPLGGENPITSVPVAMFNTKLTSVAATSTSGYTVVFVGTADGYLK +# KVVVESSSVANEYASFPVDLGSEINQDMQFDNQNLYMYVMSETKVSKVKVFDCSDYKTCGECLGARDPYCGWCSLENKCSPRSNCQDDANDPLYWVSY +# KTGKCTTITSVVPHQLQRTTARTLELIIDHLPQLKENLICAFTTEDKALFTNATKKRNGVNCTTPRTDMLPQIEQGKHHFTAKLSVRTRNGPDLVSTD +# FTFFDCSTHSSCTRCVSSEFPCDWCVEAHRCTHDTAENCRNDILVTGVSRIGPSYRSGPGFCPTINATGDGSEVLVSGGTSKSIKVKVHIIGQFIVQT +# RFVCQFNIEGRVTSLNAQLLGDTIYCDSMEFQYTSRSPNLTATFAVIWGGSKPLDNPHNIHEKLLKMSVYRLARAMKFFQILGMSRVSAKFVPKLLNF +# DQKNRRMSIAQELLDDVNDDPNLLKRVMTGDESXXXXXXXXGIIEGRLKMSFDNGPREFNDYNFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISV +# IGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCRVQSDTEMECSSPAIDVDSKIIEAERPMLLEYGFLMDNVLRVQNLSKIHNNHFELYPNPEYFIFEERVKYFK +# SEYLTINGRNLDRACKETDVEVKIGNGFCNITSLSRQQLTCRPPPEATATKSINGPEVIVRIGTSLEYRIGILSYESSNIILDWGENVIFAVIATIVI +# LLLIFVALLVAYKKKSSESNRVLRNMQEQMDILELRVAAEXWRTGATGRVILYDEDVTSKTESEWKKLNTLQHYNVPDGAGLSLVPKQSSIYNFSILS +# DKNEKSHKYETLNISKYTSSSPTFSRAGSPLNNDMHDNGLRYWHLVKHHDSDMQKEGERVNKLVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGS +# ALPLAIKYMFDFLDDQAQLHGITDPEVVHTWKSNSLPLRFWVNLIKNPNFVFDIHKSNIVDSCLSVVAQTFMDSCSTSDHRLGKDSPSSKLLYAKDIP +# EYRKWVDRYYRDIRDMSPISDQDMNAMLAEESRLHTTEFNTNCALHELYTYAVKYNEQLTVTLEEDEFSQKQRLAFKLEQVHNIMSAE] +# end gene contig56.g96 +### +# +# ----- prediction on sequence number 57 (length = 60013, name = contig57) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 57 on both strands +# start gene contig57.g97 +contig57 AUGUSTUS gene 8025 23607 0.02 - . contig57.g97 +contig57 AUGUSTUS transcript 8025 23607 0.02 - . contig57.g97.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 8025 8192 1 - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 8257 8402 1 - 2 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 8455 8585 1 - 1 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 8647 9033 1 - 1 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 9106 9301 0.99 - 2 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 16730 17842 0.27 - 2 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 19888 21133 0.66 - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS CDS 22378 23607 0.21 - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +contig57 AUGUSTUS start_codon 23605 23607 . - 0 transcript_id "contig57.g97.t1"; gene_id "contig57.g97"; +# coding sequence = [atgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaatagcaggtt +# ctcagacactggcagcaaatatttggtctgacaagacggctattcaaaatgaacccataaatatgactgatgttaatgcgacggtaaaggatgcaaat +# aaccatagtaccaccattacaaatgtagctacgtttgacacgaaattaaatcacttgttagtggacaccattactggacgagtctttgttggtggtgt +# taataggttgtatcagctatcgcctgatttggagctgtccgaaacggtaaaaacgggaccccaaaacgattcggtagagtgtagtatactcgactgcc +# cgttgaatgctgttcgcagtccgacggacaactataataaagttttgctcatagatcgtgcgacttctcgacttatttcatgcggatcactatttcag +# ggaacatgcacagttcgtaatcttcagaatgttagcataattgagcatgaagtgcccgatgcggttgttgcaaatgatgctaattcgtcaaccgtggc +# ttttatagcaccgggccctccacagcatccagtgacaaatgtgatgtatgtcggagttacttatactaacaattcgccataccgaagtgaaatcccag +# ccgtggcttcgcgctctcttgaaaaaacgaaaatgtttcagattgcttcttcggcggttacgactggaacgagaacttttattaattcttacgcacgt +# gaaacatattttgtgaactacgttttcggattcagctctgagcgattctcatattttcttaccacgcagttaaagcacagtcaccattcctctcccaa +# agagtatataacgaagcttgtgcgaatatgccaggaagattcaaactattattcatacacggaaattccagtcgaatgtataagtgatgcccagggcg +# gcactaaattcaacttggttcaggccggtttcttgggaaaacctagctcggatttggctcaaagtctgggtatatccattcaggatgacgtgttattc +# gctgctttttcaaaaggcgacggaaacacaccaactaacaactctgcactatgcatttactcattgaaatccattcgtcgtaaatttatgcaaaacat +# 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atcgaaatacacctcctcctctccgacatttagccgcgccgggagccctctaaataatgatatgcatgataatggtctaagatactggcatctagtga +# aacaccatgatagtgacatgcagaaagaaggcgagcgggttaacaaattggtatcagagatttacttaaccagactgttggcaactaagggtacactt +# cagaaattcgtagatgatctttttgaaacgatatttagcaccgctcatcgaggatcggcactgcccctagctataaagtacatgtttgactttctcga +# cgatcaagctcagttacatggtataactgacccagaagttgtgcatacctggaaaagtaacagcttaccattgcgcttttgggtaaacttgattaaaa +# atcctaattttgtctttgacatacacaagtcaaatatagtggattcctgcttgtcagttgtggcacaaacatttatggactcttgttcaacttctgat +# caccggttgggtaaggactcaccaagctcgaaacttctatacgcgaaagacataccagagtatcgcaaatgggttgatcgttattatcgagacattcg +# cgatatgtccccaatatcagatcaggatatgaatgctatgcttgcagaagaatcaaggctgcacacaacagaatttaatacaaactgtgcactacatg +# agctgtacacatatgctgtgaagtacaatgaacagctaactgttacacttgaagaggatgaattttcgcaaaagcagagattggcttttaaattagag +# caagttcataacataatgtcggcagaataa] +# protein sequence = [MNFILSVLLIATLGDKYDHRLNLIAGSQTLAANIWSDKTAIQNEPINMTDVNATVKDANNHSTTITNVATFDTKLNHL +# 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AUGUSTUS CDS 31048 31359 1 + 2 transcript_id "contig57.g98.t1"; gene_id "contig57.g98"; +contig57 AUGUSTUS CDS 31413 32554 0.99 + 2 transcript_id "contig57.g98.t1"; gene_id "contig57.g98"; +# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg +# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt +# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg +# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga +# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag +# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac +# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt +# 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"contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; +contig57 AUGUSTUS CDS 49898 50170 0.92 - 2 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; +contig57 AUGUSTUS CDS 51823 51917 0.97 - 1 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; +contig57 AUGUSTUS CDS 51994 52058 0.99 - 0 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; +contig57 AUGUSTUS start_codon 52056 52058 . - 0 transcript_id "contig57.g99.t1"; gene_id "contig57.g99"; +# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa +# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat +# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc +# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc +# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt +# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt +# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt +# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca +# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig57.g99 +### +# +# ----- prediction on sequence number 58 (length = 50011, name = contig58) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 58 on both strands +# start gene contig58.g100 +contig58 AUGUSTUS gene 5202 7547 0.98 + . contig58.g100 +contig58 AUGUSTUS transcript 5202 7547 0.98 + . contig58.g100.t1 +contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; +contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 1 + 0 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; +contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 1 + 2 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; +contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 0.98 + 2 transcript_id "contig58.g100.t1"; gene_id "contig58.g100"; +# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg +# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt +# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg +# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga +# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag +# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac +# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt +# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc +# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt +# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg +# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc +# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga +# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg +# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt +# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt +# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] +# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ +# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG +# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE +# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY +# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS +# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] +# end gene contig58.g100 +### +# start gene contig58.g101 +contig58 AUGUSTUS gene 20148 27051 0.14 - . contig58.g101 +contig58 AUGUSTUS transcript 20148 27051 0.14 - . contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 20148 20212 0.52 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 0.76 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 0.97 - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24617 0.89 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 0.92 - 2 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 0.97 - 1 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27051 0.66 - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +contig58 AUGUSTUS start_codon 27049 27051 . - 0 transcript_id "contig58.g101.t1"; gene_id "contig58.g101"; +# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa +# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat +# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc +# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc +# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt +# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt +# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt +# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca +# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig58.g101 +### +# +# ----- prediction on sequence number 59 (length = 40011, name = contig59) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 59 on both strands +# start gene contig59.g102 +contig59 AUGUSTUS gene 10148 17051 0.11 - . contig59.g102 +contig59 AUGUSTUS transcript 10148 17051 0.11 - . contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 10148 10212 0.53 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 12387 12479 0.65 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 14320 14446 0.98 - 0 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 14508 14617 0.88 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 14891 15163 0.94 - 2 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 16816 16910 0.96 - 1 transcript_id "contig59.g102.t1"; gene_id "contig59.g102"; +contig59 AUGUSTUS CDS 16987 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atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig59.g102 +### +# +# ----- prediction on sequence number 60 (length = 50013, name = contig60) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 60 on both strands +# start gene contig60.g103 +contig60 AUGUSTUS gene 22241 32526 0.14 + . contig60.g103 +contig60 AUGUSTUS transcript 22241 32526 0.14 + . contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS start_codon 22241 22243 . + 0 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 22241 22251 0.2 + 0 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 22372 29494 0.15 + 1 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 29560 29780 1 + 0 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 29847 31965 0.97 + 1 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 32025 32145 1 + 0 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +contig60 AUGUSTUS CDS 32204 32526 0.98 + 2 transcript_id "contig60.g103.t1"; gene_id "contig60.g103"; +# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg +# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt +# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa +# tattaagcgggcagttatatcattactgcaatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtcca +# ctgtaggcaatgcaaacataataacgaaggttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaac +# 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ICTEIFGIESPLALNYMTVDSRPYRKACDRAIAKIAEKDKEAAACTFALAYGSAVKQINKWVLLPPRCIKCAGPVGQRDLGDEFIVKLPNNKADVVFV +# VDINVTPVVLSNLVAPAINEIRESLKSRGFTDVQVGVVVFDESKRYPALLTSENGKINYKGNLADVKLNGVKNFCDDCIEQIITEKRILDIYNSLKEI +# VKGIAPQADEKAFQLALDYPFRAGAAKSIIGVRSDSLEYKNWWKFVRAQLTGSVTKFDGALLHLIAPVKALTLEGVPAEKLIGFNSRLVATIDGKDQK +# KRTKLQFDNDMGIDFVLNNGGWVFATQNFDKLKVADQKKMLSQITSSLADTLFKTEIVSECRCLPIHGLHGQHKCVIKSSTFVATKKPKAA] +# end gene contig60.g103 +### +# start gene contig60.g104 +contig60 AUGUSTUS gene 34064 36319 0.19 - . contig60.g104 +contig60 AUGUSTUS transcript 34064 36319 0.19 - . contig60.g104.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 34064 34702 0.47 - 0 transcript_id "contig60.g104.t1"; gene_id "contig60.g104"; +contig60 AUGUSTUS CDS 34764 34783 0.42 - 2 transcript_id "contig60.g104.t1"; gene_id "contig60.g104"; +contig60 AUGUSTUS CDS 35956 36319 0.36 - 0 transcript_id "contig60.g104.t1"; gene_id "contig60.g104"; +contig60 AUGUSTUS start_codon 36317 36319 . - 0 transcript_id "contig60.g104.t1"; gene_id "contig60.g104"; +# coding sequence = [atgttgaaaagtggagacgccaataatataaatggcattagcggcagacagataaatgcgaatgcgtacagaaaatcta +# catatctaatagatataaatcgtagtagtgatagtagcgccaatagtggcataaatggtgagatcaggcgcaatgcttatgattattttaacgattac +# agtgtttcgaccgatgagaaaaactattaccatgaaatctccagcaatggacatcattcaacggttcaaaacattgatgaagaaaaatcgaaaaggca +# ttacgagtcggttgttcatgaccaggaaattattgatcatgaagacttttttggaaatactcaggaaataattacatttgctgaagaagcgataaata +# ttacagagaagggaatagacaaagctattctgttccgggcttcttttgaagtcgacactaaacatttgggatggcaaaaattcgatttaaccgaaacg +# atccgtgagtggtataggcttagccgtaacgaaaaactgcgactattggttgattgcactggctgcaatggtcgatattcattacacctttttcaaac +# atcgaagctaagggacaactcatcagattcagataatttgagcccatatcccaatcgaccatttctcgtacttcacacagaatcagccaggacaagac +# gtgtaaggcgacgtgccgtggattgtggcggtgctttaagcggtcaatgctgcaaggagtccttttatgtatccttcaaggcacttggttgggatgat +# tggattatagcacccaggggatattttgcgaactattgccgaggcgattgcacggggtcgttcaggacaccagatactttccaaacattccatgccca +# ttttatagaagagtatcgaaaaatgggcctcttaaatggaatgcgaccctgttgcgctccaataaaattctctagtatgtcattgatttactatggtg +# atgatggaatcattaaaagagacttgccaaaaatggttgttgatgagtgtggttgcccttag] +# protein sequence = [MLKSGDANNINGISGRQINANAYRKSTYLIDINRSSDSSANSGINGEIRRNAYDYFNDYSVSTDEKNYYHEISSNGHH +# STVQNIDEEKSKRHYESVVHDQEIIDHEDFFGNTQEIITFAEEAINITEKGIDKAILFRASFEVDTKHLGWQKFDLTETIREWYRLSRNEKLRLLVDC +# TGCNGRYSLHLFQTSKLRDNSSDSDNLSPYPNRPFLVLHTESARTRRVRRRAVDCGGALSGQCCKESFYVSFKALGWDDWIIAPRGYFANYCRGDCTG +# SFRTPDTFQTFHAHFIEEYRKMGLLNGMRPCCAPIKFSSMSLIYYGDDGIIKRDLPKMVVDECGCP] +# end gene contig60.g104 +### +# +# ----- prediction on sequence number 61 (length = 40008, name = contig61) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 61 on both strands +# start gene contig61.g105 +contig61 AUGUSTUS gene 7236 17521 0.29 + . contig61.g105 +contig61 AUGUSTUS transcript 7236 17521 0.29 + . contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS start_codon 7236 7238 . + 0 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 7236 7246 0.37 + 0 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 7367 14489 0.32 + 1 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 14555 14775 1 + 0 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 14842 16960 0.95 + 1 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 17020 17140 1 + 0 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +contig61 AUGUSTUS CDS 17199 17521 0.97 + 2 transcript_id "contig61.g105.t1"; gene_id "contig61.g105"; +# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg +# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt +# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa +# tattaagcgggcagttatatcattactgcaatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtcca +# ctgtaggcaatgcaaacataataacgaaggttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaac +# gagaaagctggtatcacgtctagcctactattgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacaga +# aacatacaagtttgttggaactactaaaggaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagcta +# actcgccatctactggctccactgttagaagcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatct +# gatcttgtggatttgactggcgattatgtgaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagacttt +# attagagctggctgcatacccacatccaaacaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagag +# ttatattgaaacagcttcctaagtttgatgataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaat +# caagcagctgctcagctgctaccgaacgctcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaagg +# 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agcgcctgcaatcaatgaaattcgagagtcgcttaagagccgtggttttacagacgtccaagtcggcgttgttgtatttgacgaatcgaagcgttatc +# ccgctctactcacaagtgaaaatggaaaaatcaactacaagggaaacctggccgatgtaaagctcaatggagtaaagaacttctgtgacgattgcatc +# gagcaaattataacagaaaaacgaatcttggatatttacaactcattaaaggaaatagtaaagggcattgcacctcaagccgatgaaaaggcgttcca +# gttggcattggactatccattccgtgctggtgcggcaaagagcattatcggggtgcgaagcgattcgttggaatacaaaaattggtggaaatttgttc +# gagctcaattgactggatctgttaccaagtttgacggtgcacttctccatcttattgcaccagtaaaggcactcacactagagggagtgccggctgaa +# aaattaattggcttcaactctcgtttggtggctaccatagatgggaaggatcaaaagaagcgaaccaaactacaattcgataatgacatgggcattga +# cttcgtccttaataacggtggttgggtttttgcaacgcagaacttcgacaagctgaaagtagccgaccaaaagaaaatgttaagccagattacgtcat +# cactggcggatactcttttcaagaccgaaatcgtcagtgaatgtcgttgtctgccgattcacggattgcacggccaacacaagtgcgtcatcaagtct +# tcgacatttgttgcgaccaaaaagcccaaagctgcctaa] +# protein sequence = [MYEIILTIGLSSGAFSESDDTSLKVSGSAKIYSKGNCGYTLQLSSVKVSNTKESVEKRILNNIQKPVQFTLVSGHLEP +# QICSDSSDLDYSLNIKRAVISLLQSGTKTENEVDVFGQCPTHTSTSTVGNANIITKVRNLNRCAHREQINSGLVSGKVNEKAGITSSLLLQANYIKES +# KIVNSLLENVQLTETYKFVGTTKGNSEISAKVVTTLKLKNPTGTKANSPSTGSTVRSVIFQRPETYTSKNINALKTILSDLVDLTGDYVKKDSAKKFV +# EFIRLLRQSDSETLLELAAYPHPNKVLARKVYLDGLFRTSTAESARVILKQLPKFDDKEKLLAILSLNLVKSVDKETLNQAAAQLLPNAPKELYLAVG +# TLVAKFCLGKNCQGPEIDAISKKFTDGLKRCKPNTKKEEERIVYILKGIGNAKSLGGNTAAVLSECASTGRSNRIRVAALRAFSTIDCNGALRTKALE +# LLKNRNEDSELRIEAYLSSISCPNAEVANQISDIVNSETVNQVGGFISSNLKAIRDSTDASREQQRYHLGNIRVTKKFPADYRRYSFNNEVSYKLESL +# GLGASSDYQLIYSQHGFLPRSSRINVTTEIFGTNFNVFEASVRQENFEDVLEYYLGPKGLLNKDFNEIVKIIEVGNNAAASAGGRARRSIADDVAKIS +# KKYKTYGAKSVQDLNLDVSLKFFGSELAFLSLGDNIPSTLDDIINSISNSFEKAKQELSMFEKTLSSHHLFLDTDLSYPTSIGVPLELVAQGFAATKI +# DLAVTLDINAILEQNWQKAKYRLKLVPSVDVNVNLQLGFNAQVLSTGLRVVSSAHSATGSDITVAVINEGEGFNIDVELPREKLELIDVKIDTELYVA +# EQDKQRAVALKGNKKNKNSQPSEICFNQAEVVGLNICIESSTSFSDFQGGSGNDAEKGIAIPDQFHLSKPLSLAIYLTAERKFTFKGFHTNEPSGQKW +# 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+contig61 AUGUSTUS CDS 20951 21314 0.41 - 0 transcript_id "contig61.g106.t1"; gene_id "contig61.g106"; +contig61 AUGUSTUS start_codon 21312 21314 . - 0 transcript_id "contig61.g106.t1"; gene_id "contig61.g106"; +# coding sequence = [atgttgaaaagtggagacgccaataatataaatggcattagcggcagacagataaatgcgaatgcgtacagaaaatcta +# catatctaatagatataaatcgtagtagtgatagtagcgccaatagtggcataaatggtgagatcaggcgcaatgcttatgattattttaacgattac +# agtgtttcgaccgatgagaaaaactattaccatgaaatctccagcaatggacatcattcaacggttcaaaacattgatgaagaaaaatcgaaaaggca +# ttacgagtcggttgttcatgaccaggaaattattgatcatgaagacttttttggaaatactcaggaaataattacatttgctgaagaagcgataaata +# ttacagagaagggaatagacaaagctattctgttccgggcttcttttgaagtcgacactaaacatttgggatggcaaaaattcgatttaaccgaaacg +# atccgtgagtggtataggcttagccgtaacgaaaaactgcgactattggttgattgcactggctgcaatggtcgatattcattacacctttttcaaac +# atcgaagctaagggacaactcatcagattcagataatttgagcccatatcccaatcgaccatttctcgtacttcacacagaatcagccaggacaagac +# gtgtaaggcgacgtgccgtggattgtggcggtgctttaagcggtcaatgctgcaaggagtccttttatgtatccttcaaggcacttggttgggatgat +# tggattatagcacccaggggatattttgcgaactattgccgaggcgattgcacggggtcgttcaggacaccagatactttccaaacattccatgccca +# ttttatagaagagtatcgaaaaatgggcctcttaaatggaatgcgaccctgttgcgctccaataaaattctctagtatgtcattgatttactatggtg +# atgatggaatcattaaaagagacttgccaaaaatggttgttgatgagtgtggttgcccttag] +# protein sequence = [MLKSGDANNINGISGRQINANAYRKSTYLIDINRSSDSSANSGINGEIRRNAYDYFNDYSVSTDEKNYYHEISSNGHH +# STVQNIDEEKSKRHYESVVHDQEIIDHEDFFGNTQEIITFAEEAINITEKGIDKAILFRASFEVDTKHLGWQKFDLTETIREWYRLSRNEKLRLLVDC +# TGCNGRYSLHLFQTSKLRDNSSDSDNLSPYPNRPFLVLHTESARTRRVRRRAVDCGGALSGQCCKESFYVSFKALGWDDWIIAPRGYFANYCRGDCTG +# SFRTPDTFQTFHAHFIEEYRKMGLLNGMRPCCAPIKFSSMSLIYYGDDGIIKRDLPKMVVDECGCP] +# end gene contig61.g106 +### +# +# ----- prediction on sequence number 62 (length = 50017, name = contig62) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 62 on both strands +# start gene contig62.g107 +contig62 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[atgagaacggcgtcccggagtcaacgcgaaccgtttcgggtgggcggcgcggtggcgtcatattacgagactggtagtt +# ttaaggccggtgttattggaggttccaaaccaaaagtggccaccccgccggtagtagatgcaattgccaactataagcgcgaaaaccctacgatgttc +# gcttgggagatacgagatcggctcttggcagaagctatatgctctcaggataatgttcccagtgtttcttcgataaaccgcattgtaagaaacaaggc +# cgccgagaaggcgaaacatgttcatcatcaccaacagcatcatgtaccacagggtctgggtggcggacacattgccacagaaagtctagatagcagca +# caggaacgatcggcgaaccgcagcccccgagtggtggaactagcaatagcagtgctaattccgcaaacccaaacgcttctgcggcgacggttgcgacg +# cacgcatcaataccgacgtcaggctctgatactgtccaggtttcagtcggccaaatcaatgcaaacagcaatgacacaagcaatgggaatattaactc +# aacgactgagcaacgaacgactggatatagcattaatggaattctaggtatacaacatggacagcattctcacaacaataataacaacagtagcgtga +# gcaataacaataatacagatcccaccaattgtaaacgtaaaagaatcgaagctcatgacgaaaaccgtgacacaaatatacattccgaagatgatggc +# aaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatatttggcctgggaagtggtgtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagct +# aggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattttccacaaactcgatatctggatctggttcgggtc +# cgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctcaaagctcactttatacaccaacaattggaccatca +# attggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatggtggcgcatacggatcatatggctatggggctgg +# tgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgccagacctggtcaggtctcctttagctgcaactcggg +# ccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaagtgcgtgcacaaaatcagagtcctcagacatttttcttgtttaa] +# protein sequence = [MRTASRSQREPFRVGGAVASYYETGSFKAGVIGGSKPKVATPPVVDAIANYKRENPTMFAWEIRDRLLAEAICSQDNV +# PSVSSINRIVRNKAAEKAKHVHHHQQHHVPQGLGGGHIATESLDSSTGTIGEPQPPSGGTSNSSANSANPNASAATVATHASIPTSGSDTVQVSVGQI +# NANSNDTSNGNINSTTEQRTTGYSINGILGIQHGQHSHNNNNNSSVSNNNNTDPTNCKRKRIEAHDENRDTNIHSEDDGKRQRMGYSGDPLYPNIWPG +# KWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDTSMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYT +# QYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAASPGSGSACTKSESSDIFLV] +# end gene contig62.g107 +### +# +# ----- prediction on sequence number 63 (length = 55021, name = contig63) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 63 on both strands +# start gene contig63.g108 +contig63 AUGUSTUS gene 4369 17721 0.09 + . contig63.g108 +contig63 AUGUSTUS transcript 4369 17721 0.09 + . contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS start_codon 4369 4371 . + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 4369 4421 0.53 + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 4822 5122 0.55 + 1 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 0.77 + 0 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 11546 11653 0.84 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 11995 12117 0.56 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +contig63 AUGUSTUS CDS 17609 17721 0.4 + 2 transcript_id "contig63.g108.t1"; gene_id "contig63.g108"; +# coding sequence = [atgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatcgctctgggcagtatgattttttgtg +# gccgagttttatcggacgccgccggcttcctattttggtatgccggggcctgcgatggtttcagcatcctggacagtgatggatccacctccatgggt +# tctggagtgcctccacagtgcccatcgctgtgtggatcaaggtgcacctgtgccttgttctgtttagtaaagtgtggactttttccagcacttacttg +# cgtgtatgcctggcgggacgtttgttggcgttcatgcgcccttggatttgttttcgtatccttctgttacaagctgaatatttggcctgggaagtggt +# gtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattt +# tccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctca +# aagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatg +# gtggcgcatacggatcatatggctatggggctggtgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgcca +# gacctggtcaggtctcctttagctgcaactcgggccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaaagtccgagttttctgactcggaact +# atcctctgacaaagcatctgtttgcattggatttatagttatagtcaaagctgaatcatcccaaactaagccatcatcaacaatctaa] +# protein sequence = [MMANGSVWDTVAILFIQIALGSMIFCGRVLSDAAGFLFWYAGACDGFSILDSDGSTSMGSGVPPQCPSLCGSRCTCAL +# FCLVKCGLFPALTCVYAWRDVCWRSCALGFVFVSFCYKLNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDT +# SMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYTQYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAA +# SPGSGKSEFSDSELSSDKASVCIGFIVIVKAESSQTKPSSTI] +# end gene contig63.g108 +### +# start gene contig63.g109 +contig63 AUGUSTUS gene 20635 28361 0.05 - . contig63.g109 +contig63 AUGUSTUS transcript 20635 28361 0.05 - . contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 20635 20703 0.21 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS CDS 22334 22879 0.68 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS CDS 26229 26336 0.84 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS CDS 26403 26903 0.91 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS CDS 26957 27099 0.99 - 2 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS CDS 28214 28361 0.36 - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +contig63 AUGUSTUS start_codon 28359 28361 . - 0 transcript_id "contig63.g109.t1"; gene_id "contig63.g109"; +# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat +# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg +# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca +# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa +# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg +# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg +# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc +# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta +# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa +# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag +# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta +# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa +# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat +# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat +# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct +# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] +# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE +# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE +# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF +# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI +# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF +# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] +# end gene contig63.g109 +### +# start gene contig63.g110 +contig63 AUGUSTUS gene 36899 51455 0.1 + . contig63.g110 +contig63 AUGUSTUS transcript 36899 51455 0.1 + . contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS start_codon 36899 36901 . + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 36899 36901 0.99 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 36954 37086 1 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 37151 37311 0.95 + 2 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 40574 40738 0.92 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 40795 40953 0.7 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 42037 42240 0.97 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 45152 45256 0.84 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 50734 51124 0.8 + 0 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +contig63 AUGUSTUS CDS 51178 51455 0.33 + 2 transcript_id "contig63.g110.t1"; gene_id "contig63.g110"; +# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat +# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa +# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga +# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca +# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc +# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac +# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc +# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat +# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta +# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt +# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa +# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg +# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg +# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt +# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga +# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga +# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] +# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN +# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL +# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR +# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG +# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL +# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] +# end gene contig63.g110 +### +# +# ----- prediction on sequence number 64 (length = 40016, name = contig64) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 64 on both strands +# start gene contig64.g111 +contig64 AUGUSTUS gene 5630 13356 0.04 - . contig64.g111 +contig64 AUGUSTUS transcript 5630 13356 0.04 - . contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 5630 5698 0.11 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS CDS 7329 7874 0.63 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS CDS 11224 11331 0.83 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS CDS 11398 11898 0.92 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS CDS 11952 12094 0.98 - 2 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS CDS 13209 13356 0.44 - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +contig64 AUGUSTUS start_codon 13354 13356 . - 0 transcript_id "contig64.g111.t1"; gene_id "contig64.g111"; +# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat +# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg +# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca +# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa +# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg +# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg +# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc +# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta +# 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ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF +# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI +# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF +# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] +# end gene contig64.g111 +### +# start gene contig64.g112 +contig64 AUGUSTUS gene 21894 36450 0.08 + . contig64.g112 +contig64 AUGUSTUS transcript 21894 36450 0.08 + . contig64.g112.t1 +contig64 AUGUSTUS start_codon 21894 21896 . + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 21894 21896 1 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 21949 22081 1 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 22146 22306 0.93 + 2 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 25569 25733 0.9 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 25790 25948 0.74 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 27032 27235 0.91 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 30147 30251 0.84 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 35729 36119 0.71 + 0 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +contig64 AUGUSTUS CDS 36173 36450 0.27 + 2 transcript_id "contig64.g112.t1"; gene_id "contig64.g112"; +# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat +# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa +# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga +# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca +# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc +# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac +# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc +# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat +# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta +# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt +# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa +# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg +# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg +# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt +# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga +# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga +# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] +# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN +# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL +# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR +# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG +# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL +# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] +# end gene contig64.g112 +### +# +# ----- prediction on sequence number 65 (length = 45013, name = contig65) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 65 on both strands +# start gene contig65.g113 +contig65 AUGUSTUS gene 1885 42915 0.02 + . contig65.g113 +contig65 AUGUSTUS transcript 1885 42915 0.02 + . contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS start_codon 1885 1887 . + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 1885 1887 0.99 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 1940 2072 0.99 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 2137 2297 0.9 + 2 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 5560 5724 0.89 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 5781 5939 0.71 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 7023 7226 0.91 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 10138 10242 0.84 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 15720 16110 0.97 + 0 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +contig65 AUGUSTUS CDS 42380 42915 0.14 + 2 transcript_id "contig65.g113.t1"; gene_id "contig65.g113"; +# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat +# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa +# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga +# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca +# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc +# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac +# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc +# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat +# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta +# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt +# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa +# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg +# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg +# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattgatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggtt +# caaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattatcaatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgca +# 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SIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHLSAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKML +# EMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNW] +# end gene contig65.g113 +### +# +# ----- prediction on sequence number 66 (length = 45011, name = contig66) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 66 on both strands +# (none) +# +# ----- prediction on sequence number 67 (length = 44531, name = contig67) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 67 on both strands +# start gene contig67.g114 +contig67 AUGUSTUS gene 7489 44111 0.03 + . contig67.g114 +contig67 AUGUSTUS transcript 7489 44111 0.03 + . contig67.g114.t1 +contig67 AUGUSTUS start_codon 7489 7491 . + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 7489 7901 0.25 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 39029 39189 0.97 + 1 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 39387 40028 0.92 + 2 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 40093 40223 0.99 + 2 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 40277 40759 0.98 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 41210 41355 0.81 + 0 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +contig67 AUGUSTUS CDS 43946 44111 0.16 + 1 transcript_id "contig67.g114.t1"; gene_id "contig67.g114"; +# coding sequence = [atgcaattgcaagcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgatgacctaaaac +# taaaagaacagcaccaagctaaaaaaatggcagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgaggatcgtgatctc +# ttgcagggacattatgctactataacccaagaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttgaaatggaagt +# ttccgatttaaactctgagtttcaattggatagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaacaattggttt +# ataaatttaatccaagttttcaaaaaaatggaagaaactgacctgaaagctataacgttcatgatggaaacctatactgttctatgcactttaaatca +# atatttgcaccgaagatagtttgtgaagaatttacaccactaaagccagagcttataatacgagagaatcaaccaatagaattaccaccggatgtcgc +# aagagcttccgataagccaagtcttggacttgacgaacttcaacagctaaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaa +# tcgattacctacaagaacggcaagattctgcacttactcatagcaagtcaatagggtccacgataaccaaacttcataagctcggaataactaattca +# aaatttgatgaactagataatattgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgaaatggtttttttgtgctccagaaagaa +# tattgaaagggaaaggccagtgggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaaggtgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcg +# aagaaaggaaacaggaaatacagagcatacgttctcgactatttttgggcaaacaagcaaaaataaaagaaatgtatcaattagctgtggctgaatca +# gaacatggcgttacatcggcgggtaagacccccgatattaatgtcataaatgccactcatcttataaaggatcgatttgagaatggtgaggtttttaa +# cgataataaagttcaattaaaggaagcaattcaagcggatgcggatgtgtttgaatctggaataggcaaagcatcgcgaagtatcttcatggagctag +# 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sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG +# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHAFLKGETQIMADEAFQNAVQSYHD +# VFLKSERVLKMVQSGASSQHDFREVFRNNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLTSWMAKFDIILKGTGEEDSKRPSRMQQSLNSELILSKEQLYDMFQQILL +# VKKFEHQILYNALMLDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHR +# KLILRSHGSLSKLEGDSEDGSTQLTKLDVVLTFQLEVIVMEVKGLKSLAPNRIVYCTMEVENGEKLQTDQAEASKPMWDTQGDFTTTHPLPVVKVKLY +# TENPGMLALEDKELGKVILKPTPLSSKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASANLMFGIDL +# NGGRFFFNAVREGDSISFACDDENECSLWVMAMYRATGQSHKPTPPITQDKNSAMSKIQGESQDKSI] +# end gene contig69.g116 +### +# +# ----- prediction on sequence number 70 (length = 55020, name = contig70) ----- +# +# Constraints/Hints: +# (none) +# Predicted genes for sequence number 70 on both strands +# start gene contig70.g117 +contig70 AUGUSTUS gene 47 47328 0.01 + . contig70.g117 +contig70 AUGUSTUS transcript 47 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+AAAAAGAAATCATATATATTCATATACGTTTGACCGGTACCACCGGTCAT +ACATACATAAACATAAACACAAAAAGACTAGAATATAAATACCATATTTT +TGATTGGCTTAAAAATGGCACAAAAAAAAGATAAAAACTAGAGTGTCTAG +CTTTAAGTGACAATCGACTCGGAAAATGATCAAGAAATAAATGAAAAATT +TGTCTTGCGGCTTTTTGGTCGCAATTCTAAATCGGTTTGTATGTATGTCA +CTCTTCATGTATACAATTTGGTGGCTTTGTATTCCACAAAAGTCACAGTA +GTCACAAAAGTTTTTTTTACTGAAAATTACCATCAAGAGTCTATGGCCAA +ATCAGAATATTTTCACTGCGGTTTTTTATTTCAATTCTGCTAAATCGGGT +TTCCGTGCCAAAAAGCTTTTGCAGCCAACAACAATATTCAATTTTTTGGC +AAAAAATCGACAAAAAAATT diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/augustusDbia3.gff3 --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/augustusDbia3.gff3 Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,9513 @@ +##gff-version 3 +# This output was generated with AUGUSTUS (version 3.1.0). +# AUGUSTUS is a gene prediction tool written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de), +# Oliver Keller, Stefanie König and Lizzy Gerischer. +# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008), +# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding +# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013 +# No extrinsic information on sequences given. +# Initialising the parameters using config directory /home/galaxy/galaxy/dependency_dir/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... +# human version. Using default transition matrix. +# Looks like /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_2.dat is in fasta format. +# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. +# +# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 1 on both strands +# start gene contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS gene 641 23169 1 - . ID=contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS transcript 641 23169 . - . ID=contig1.g1.t1;Parent=contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS CDS 641 5409 . - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 13455 13545 . - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 17461 17543 . - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 23019 23169 . - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS start_codon 23167 23169 . - 0 Parent=contig1.g1.t1 +# coding sequence = [atgcacattcagttgtctactctcgcctttcaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtgatagacgat +# ccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaataggagctgtaggtgttgctgataaatgtagt +# gcggatgcagaagttttaccgctgcattttgttggtgcgccaggttcgaaactgatgtcgagtcatgcaattgcttttcctataagtagccgagaatt +# gaacttacagatatctctaagatttttaatatttgcttacgaatacgctagcgcatgcgaaatttacagccttccgcggtttccatcaacgcctcaat +# ttgtcgcagttccattggcggctaatgatgaaaatgcatcaacatatgcatttgtaggtcctgcacgatattcatggaaagaagaggatattttatat +# gtgggaacgacgttcacgaacgttggtgattatcgccatgacgttcctgccatttcgtcccgtcggcttgatgatttaaactacgcagagttttcaat +# acagcagtcaattataaatatcgatgtcaaatatcgggatcatttcttagtcgattatgtttatggctttaactcttctgaatatgcgtactttgtta +# ttgttcaaaaaaaatcacatttagctgatgaggcaggttatgtaacccgtttggctcgaatatgtattacagatcccaattatgacagttatactgaa +# ataacagttcagtgtacggccactgaaaatcatattgactacaatatactacgcgatgccaaagtaactccggcaagccaaaaattagctcagaaaat +# gggtataaaaaaggacgatcacgtgttagtaactgttttttcgccctcgaaagagataagcgatcagccagaaagcaaatcggctatgtgcatatata +# gcataaaagacattgaggacatgtttattgaaaatattcatctgtgctttaacggaaccataaaggatagaaatttgggttatatatcgggcactatc +# aatgacggccggtgcccaatagttggctcgctcggtaacatatacaacttttgttctgtaggacttaagataagcggagtttctcctatcactacaca +# cgctctctttcattttgataatgtatcagttacgtcaataactgcaacgtcaacgactgatcagcagcattctcttgcttttcttggaaccgacaagg +# gattgataaaaaaagttttattatctggtcagaatccaggtgagtacgaagaaatagttgtggatgctggaaatcggatactaccaaacactatgatg +# tcgcccaaaaaagatttcctttacgttttatcgcaacgtaaaataactaaactcagaatcgagcattgttctgtatacacaaattgttcagcttgctt +# ggagtctcgggaccctttttgtggatggtgttcattggaaaaacggtgcaccgtgcggtcaacatgtcagcgagatacgtcagcatcgcgatggcttt +# ctttgggcagtgggcaacagtgtattgagtttgaatcaattatccctgagaaaataccaattactgatctaacacacctgcacctaataattcgaaca +# ctgcccgaaccttttaatgcaaaataccgatgtgtctttggaaactctacccctattgacgccgaaatcctggacaatggactcggatgtgctacccc +# cccactagatgaaagaccagtaataccaactaatacagaccatgttttggtgccattgtccgttagaagttcagagacaaataaggactttgtatcaa +# gattttttgcattctttgactgttcgcatcatggaaattgccaggaatgtttacaaagttcatggggctgcaactggtgtatttttgacaataaatgt +# gtccatcaatcaatacaatgtcgtaatatagaaaattcggtaactagtgttggtcaatgcccccatttaaaaagcaatcgtccggcgattcttttacc +# ggtgcgggtgccaaaagaaattcgtttagagatagaaaacttaccaaaacccaaaagcgctcacgctggattcttgtgtacagttcatattgaagctg +# ctcagatgctattgcctgcccacattgagtcaaacaagattgttgtttgtgaaaaaacaccttatttctacgagactaatacacatgaataccaagca +# 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gaatggaggcatggaagaggaggtcatctcacattacaagatgaagacctaactacaaaaacaataaatggatggaaacgcctcaacacattggccca +# ttatggagtaaaagaatcggctgtgatgtcacttatagcacggcaaaatgataactaccacataccgtatggcaaaaaccaaaatcaggcaccttacc +# ataattgtaagttataa] +# protein sequence = [MHIQLSTLAFQVQTADEFVVDARDRRSFIQRRCRPANSLRTASREESGIGAVGVADKCSADAEVLPLHFVGAPGSKLM +# SSHAIAFPISSRELNLQISLRFLIFAYEYASACEIYSLPRFPSTPQFVAVPLAANDENASTYAFVGPARYSWKEEDILYVGTTFTNVGDYRHDVPAIS +# SRRLDDLNYAEFSIQQSIINIDVKYRDHFLVDYVYGFNSSEYAYFVIVQKKSHLADEAGYVTRLARICITDPNYDSYTEITVQCTATENHIDYNILRD +# AKVTPASQKLAQKMGIKKDDHVLVTVFSPSKEISDQPESKSAMCIYSIKDIEDMFIENIHLCFNGTIKDRNLGYISGTINDGRCPIVGSLGNIYNFCS +# VGLKISGVSPITTHALFHFDNVSVTSITATSTTDQQHSLAFLGTDKGLIKKVLLSGQNPGEYEEIVVDAGNRILPNTMMSPKKDFLYVLSQRKITKLR +# IEHCSVYTNCSACLESRDPFCGWCSLEKRCTVRSTCQRDTSASRWLSLGSGQQCIEFESIIPEKIPITDLTHLHLIIRTLPEPFNAKYRCVFGNSTPI +# DAEILDNGLGCATPPLDERPVIPTNTDHVLVPLSVRSSETNKDFVSRFFAFFDCSHHGNCQECLQSSWGCNWCIFDNKCVHQSIQCRNIENSVTSVGQ +# 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LVDAITHDARYSLSEERLLHEQVTHSVVILHILQDDLDEKVQCRVNDLDTISQVKLKILDAIFKNTPFSMRPSVHEVDLEWRHGRGGHLTLQDEDLTT +# KTINGWKRLNTLAHYGVKESAVMSLIARQNDNYHIPYGKNQNQAPYHNCKL] +# end gene contig1.g1 +### +# start gene contig1.g2 +contig1 AUGUSTUS gene 23330 23599 1 - . 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ID=contig4.g13 +contig4 AUGUSTUS transcript 36975 51981 . + . ID=contig4.g13.t1;Parent=contig4.g13 +contig4 AUGUSTUS start_codon 36975 36977 . + 0 Parent=contig4.g13.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 36975 37059 . + 0 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 37833 37902 . + 2 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 50913 51981 . + 1 ID=contig4.g13.t1.cds;Parent=contig4.g13.t1 +# coding sequence = [atgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctctcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacg +# acggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaatggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgt +# tatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacacggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacga +# tgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagtaataaaataggggatgacgacaccgagtctttaaatcaatctatgccaagcccag +# gctgtctaagtggattgtccagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctctt +# ttgatcgtcaacgcagatccgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaac +# cccaaatacctcaagtacagtttcgccagttacaggtacgacgggtccatcaccaagttcatcccatgaaagggccatgatgcttggaaatcgattta +# gtcacttgggaatggggttgagccctccagtagttagctcaagtagctgtaaccctgacacattttttcagcaacatcccacactttgtaataatgct +# ataatttcattgccatcgattggtaacagtagtttacaccactcttcaatgccaaacatttcccgaaaccctattggtgctaacccaagggatattaa +# taatccgttgagcattaatcagttaactaaaagacgtgaatatcaaaatgttgaattaatgaaagatagtagctcacagacgattgtcgctcatgcag +# ctacttctattattcatcatgtggcggcacatggctatcgcgcgaaccactctcttctaaatagcacttttagccaacatttccatcaacaattaact +# aaccatattgaaacagctaaaatgattgagccgacaatgttgtcggtgagtactcatgctgtaaatagcactgagtgccataaaggatcagatccaca +# agcaaatgcatctgtaaagactacaagcgctggcgcttccgaaactggcgtcattagcgtttcataa] +# protein sequence = [MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDE +# HGSQLSDDDDDDYDDDKLGGSCGSADESNKIGDDDTESLNQSMPSPGCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVST +# SGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTGTTGPSPSSSHERAMMLGNRFSHLGMGLSPPVVSSSSCNPDTFFQQHPTLCNNAIISLPSIGNSSLHHSSMPN +# ISRNPIGANPRDINNPLSINQLTKRREYQNVELMKDSSSQTIVAHAATSIIHHVAAHGYRANHSLLNSTFSQHFHQQLTNHIETAKMIEPTMLSVSTH +# AVNSTECHKGSDPQANASVKTTSAGASETGVISVS] +# end gene contig4.g13 +### +# +# ----- prediction on sequence number 5 (length = 50018, name = contig5) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 5 on both strands +# start gene contig5.g14 +contig5 AUGUSTUS gene 279 1979 1 + . ID=contig5.g14 +contig5 AUGUSTUS transcript 279 1979 . + . ID=contig5.g14.t1;Parent=contig5.g14 +contig5 AUGUSTUS start_codon 279 281 . + 0 Parent=contig5.g14.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 279 1979 . + 0 ID=contig5.g14.t1.cds;Parent=contig5.g14.t1 +# coding sequence = [atgctaaatcaacaaaaatgttcggagcagcagcttttggccacgcaacttttttatgcacggcttcttcacccacact +# tagcagaacaagaatccttttctgagaaattcactgatagcgccgcaaatatgattcatcacgcagaattaaaaaagcccatgattggacataatgaa +# cttccacgaacccaatcttcgcaagataataataacaatattgagttgacgaatgatttagaaaattgttcaagatgtggtgatcaaccaatatttaa +# atttactaaacttaaaaaaaatcagaaaactgtgcaaaagaatatgcaggaattggaaaattgtaattctattttaaataaagaacagaaaattagcc +# aaagtaaggaatccaaatgcacagatgactatgatctacaacacacgtgtgagtttatccgggaaaacaaaaacgtacttatcgacgttaaaaataga +# ctcgaaaaactttctgtactatcagctaaatttaggaaaagcctgagtgcgcgtcaatattatgttgatgtaaataatggttcggattcagcccttga +# ggcaactgtgggacgacaactagatgggaattgcaagtcaattgaaagcgtactggaacaagtaaaacggctttataataagtggagcagcgctgagc +# tctactaccgtcgaagtttacaacgcttaggactcacatcagaagaaggtgttgaatgcagtcctacgccaacgcacattattatggctttggctgca +# atagcattatcagaagaaaaggagctatcagtgaaggaaaccactggtattgactcaaagctcctcgaaattgaaagcgtgtctataaaacctaaaac +# actgaacgaaatagaggatataatattacaactatcttcagctgttaatatgcatcaatctagtgtaccttgcaccacacctgatgtatatagtgatg +# gagtcaagagcgatttcgtagaaacaactttaatacccaattgcatttggcatactaataagcagagatttcggcataaagaggagggtgagcattgt +# accaccgcagctgaaattattttagaatatgcttcattgtcttcatcatctaatgcaaacacgatacgcgtgcctgacacttttagatctgtttccaa +# ctttactgacgctatagaaaattttagtgtcacaacacagtctcctaatattttaaacaacaatcgtgaaggctcagctgtgtcaatcatttccgatc +# cttcattttttcctgagttttctactgcaccttctacaccttcgacaagtagtaatagtggctgctcgactggaatagtatctggaatttttggattg +# ggtcacaatcgcagaaaaccacgattcgcaaggcgtattgaaactcagacttcagattcttctaaacctaatgttataaaagagagtgacgatcagga +# attatctaaccatcttcttacttcgtcaaaatcaactaaaacagcaaataatttgtgccctcaaattcttacgactacaccttcaattaaaattgctg +# tgacaacgacgcaagaacgttcaataagtaacatgttcgaagcacggctttgtgcattatcgacagatactggatccctcgagtctgaaattgtacca +# atgctggatgctccgtatgacttaagtattggaaccaagataaaacccatgtaa] +# protein sequence = [MLNQQKCSEQQLLATQLFYARLLHPHLAEQESFSEKFTDSAANMIHHAELKKPMIGHNELPRTQSSQDNNNNIELTND +# LENCSRCGDQPIFKFTKLKKNQKTVQKNMQELENCNSILNKEQKISQSKESKCTDDYDLQHTCEFIRENKNVLIDVKNRLEKLSVLSAKFRKSLSARQ +# YYVDVNNGSDSALEATVGRQLDGNCKSIESVLEQVKRLYNKWSSAELYYRRSLQRLGLTSEEGVECSPTPTHIIMALAAIALSEEKELSVKETTGIDS +# KLLEIESVSIKPKTLNEIEDIILQLSSAVNMHQSSVPCTTPDVYSDGVKSDFVETTLIPNCIWHTNKQRFRHKEEGEHCTTAAEIILEYASLSSSSNA +# NTIRVPDTFRSVSNFTDAIENFSVTTQSPNILNNNREGSAVSIISDPSFFPEFSTAPSTPSTSSNSGCSTGIVSGIFGLGHNRRKPRFARRIETQTSD +# SSKPNVIKESDDQELSNHLLTSSKSTKTANNLCPQILTTTPSIKIAVTTTQERSISNMFEARLCALSTDTGSLESEIVPMLDAPYDLSIGTKIKPM] +# end gene contig5.g14 +### +# start gene contig5.g15 +contig5 AUGUSTUS gene 11973 36922 1 + . ID=contig5.g15 +contig5 AUGUSTUS transcript 11973 36922 . + . ID=contig5.g15.t1;Parent=contig5.g15 +contig5 AUGUSTUS start_codon 11973 11975 . + 0 Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 11973 12057 . + 0 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 12831 12900 . + 2 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 25911 26359 . + 1 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 30010 30157 . + 2 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 36067 36196 . + 1 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 36761 36922 . + 0 ID=contig5.g15.t1.cds;Parent=contig5.g15.t1 +# coding sequence = [atgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctctcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacg +# acggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaatggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgt +# tatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacacggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacga +# tgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagtaataaaataggggatgacgacaccgagtctttaaatcaatctatgccaagcccag +# gctgtctaagtggattgtccagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctctt +# ttgatcgtcaacgcagatccgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaac +# cccaaatacctcaagtacagtttcgccagttacaggaactggaaaaaaacccaaggcccaatacatacacatttcgtatcaaaataaaataggagaaa +# acgctatagtcgatgccatcgactatcaaacacccgttattcagctaatggtgcgatggagatatgcagcgaaacgactcattacgttgatattcgac +# cgtcacaatgtaatagtgctagaagaaatgcatagttggacccgaactttcgatgacaatgctttgctgttaatcttttaccttaccaaagtcaacag +# caagattctgcagaatgcggtaagcacacggcaaactacaggagcgatatacaaagagatgaatgaccgcatgcgaaaatcgacagtaaagcgtcatc +# agaatacccaacatgcgtacacttactcgcgtacgacgccgaaagtatttttcgacacggttgcaagatactcatttggttaa] +# protein sequence = [MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDE +# HGSQLSDDDDDDYDDDKLGGSCGSADESNKIGDDDTESLNQSMPSPGCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVST +# SGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTGTGKKPKAQYIHISYQNKIGENAIVDAIDYQTPVIQLMVRWRYAAKRLITLIFDRHNVIVLEEMHSWTRTFDD +# NALLLIFYLTKVNSKILQNAVSTRQTTGAIYKEMNDRMRKSTVKRHQNTQHAYTYSRTTPKVFFDTVARYSFG] +# end gene contig5.g15 +### +# start gene contig5.g16 +contig5 AUGUSTUS gene 41718 45058 1 - . ID=contig5.g16 +contig5 AUGUSTUS transcript 41718 45058 . - . 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ID=contig5.g17 +contig5 AUGUSTUS transcript 45583 49961 . + . ID=contig5.g17.t1;Parent=contig5.g17 +contig5 AUGUSTUS start_codon 45583 45585 . + 0 Parent=contig5.g17.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 45583 45635 . + 0 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 48673 48804 . + 1 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 49826 49961 . + 1 ID=contig5.g17.t1.cds;Parent=contig5.g17.t1 +# coding sequence = [atgttgactgactcgtccctagctacgcttcggtcttgcttaaatatgttaaggaacattgaaccagtggcatggttgg +# gctggaagacgtttctgagatgtgaagcaaaagtttcggtgcggacccagctgccagatgaacttcttatcggagtgactgtttcaattggagagctg +# agaattggattccggtctgaccggaacaacatgaaagtttccgtccccggtcagcgcaacaagtctgttgaccaaggcattcgagattttctccctaa +# tgagcctgttctgattcgttttctgctagaagcgcacatctattga] +# protein sequence = [MLTDSSLATLRSCLNMLRNIEPVAWLGWKTFLRCEAKVSVRTQLPDELLIGVTVSIGELRIGFRSDRNNMKVSVPGQR +# NKSVDQGIRDFLPNEPVLIRFLLEAHIY] +# end gene contig5.g17 +### +# +# ----- prediction on sequence number 6 (length = 40015, name = contig6) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 6 on both strands +# start gene contig6.g18 +contig6 AUGUSTUS gene 6556 38460 1 - . ID=contig6.g18 +contig6 AUGUSTUS transcript 6556 38460 . - . 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- 0 Parent=contig6.g18.t1 +# coding sequence = [atgacacttttgtttgctgcagtatgtagcctgccaggtttcaagacatcgatcgacatatgtatgattttgaggtatt +# tacgggtgtacaaaatttctagcgggataactaataaatcgggcaccactgatgaaatcgaagaaatattgatacggcagaatagcgatatctataat +# gatgcaacaatatcattcttacgtgctgcacgcagcggggacattaaaaagttaattgattatcttgaaagtggtgaaatatcaaatataaacagttg +# caatgcgaacggtttaaatgcacttcatttggctgctaaggatggatttgtggatatatgctgtgagttgctaaggagaggcatagcggttgataatg +# ctacaaaaaagggaaacacagcgttgcacattgcatctttggcaggccagcaagaggttatcaatcagcttattaaggccaatgccaatgtgaacgtt +# cagtcccttaatggattcacacctctttatatggcagcccaagaaaaccacgataactgttgtcgaatattattggcaaatggagcgaacccaacatt +# atctacagaagatggttttacaccacttgcggtagctatgcagcagggtcacgaaaaaatagtagctgtcttgcttgaaactgatgttcgcggtaagg +# ttcgcctcccagcacttcacatcgctgcaaaaaagaacgatgtaaacgcagccaaacttttactccaacacgatcaaaatgccgacattgtttccaaa +# tctggttttacaccgttgcatatagcagcgcattatggaaatgttgaaatcgccactttacttttaaataacgatgcagatgttaactatgttgccaa +# 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actaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactaggtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagc +# gcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgagagcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaa +# cacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgtatcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacg +# tgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagttttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttga +# ccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttggttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcact +# gtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagtattcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaa +# tggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattaccggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgcttt +# cttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagcccgtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagc +# gaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagtttgttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttg +# 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LYSQHHTTGVGFPSLIEGHRRMRRLSEYLVNQMSILQPCRKILSASYASEFWKSPQATQTFRSEHYATACGIRSDRNNMIISVPGQRNNSVDQAVRDF] +# end gene contig6.g18 +### +# +# ----- prediction on sequence number 7 (length = 50017, name = contig7) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 7 on both strands +# start gene contig7.g19 +contig7 AUGUSTUS gene 1705 33038 1 - . 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ID=contig7.g19.t1;Parent=contig7.g19 +contig7 AUGUSTUS CDS 1705 1865 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 3676 4652 . - 1 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 4993 5086 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 11778 12108 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 16017 16958 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 18912 19937 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 22700 22807 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 27446 27582 . - 2 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 28420 28523 . - 1 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 32797 33038 . - 0 ID=contig7.g19.t1.cds;Parent=contig7.g19.t1 +contig7 AUGUSTUS start_codon 33036 33038 . - 0 Parent=contig7.g19.t1 +# coding sequence = [atgtgccacttcggcggcacttccagaagtgacttcggcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcggtaa +# gaagtatcgcagaagaagttcactcctggaagtgtcaacgaagacacttcaagaagagtcgccgaagtgacttcccaaagtgtcgccgaagtgactcc +# aagaagtgccgccgaagaggcacatttctttccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgcgatctcctactcctacgtttttgtgcaccttttggc +# cttcgcaagtactctaaatcaagaattcgtgcagatgacacttttgtttgctgcagtatgtagcctgccaggtttcaagacatcgatcgacatatgta +# tgattttgaggtatttacgggtgtacaaaatttctagcgggataactaataaatcgggcaccactgatgaaatcgaagaaatattgatacggcagaat +# agcgatatctataatgatgcaacaatatcattcttacgtgctgcacgcagcggggacattaaaaagttaattgattatcttgaaagtggtgaaatatc +# aaatataaacagttgcaatgcgaacggtttaaatgcacttcatttggctgctaaggatggatttgtggatatatgctgtgagttgctaaggagaggca +# tagcggttgataatgctacaaaaaagggaaacacagcgttgcacattgcatctttggcaggccagcaagaggttatcaatcagcttattaaggccaat +# gccaatgtgaacgttcagtcccttaatggattcacacctctttatatggcagcccaagaaaaccacgataactgttgtcgaatattattggcaaatgg +# agcgaacccaacattatctacagaagatggttttacaccacttgcggtagctatgcagcagggtcacgaaaaaatagtagctgtcttgcttgaaactg 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gtgctcaactagacgctataaccaaaaaggggtttactccattgcatttagctagcaaatacggaaaggcgaaaatagtcacattactaatagaaaga +# ggatgcgcggttaattttcagggaaaaaatgatgtgacctcattgcacgttgcaacgcactatgaccatcatgatgtggtagagatactattaaaaaa +# cggcgctttaccaaatctgtgtgcgcgaaacggtcaaagtgctcttcacatcgctgcgaagcaaaataatctggaaattgcactgcagttactgcaac +# atggtgcagacgttgtggttataagcaaaagcggcttttctcccttacatttggcggcccaagaaggacacgttgatatggtagaactactcctagaa +# tatggcgctacaagtaccgctgccaaaagcggcctgacaccattacatttggctgcacaggggggccatgttcatgtatgccgcattttgctggaaca +# tggcgctaagatatcagagcgaactaaaaatggttattccccacttcacattgctgcgcataacggtcaccttgatcttgtgaaatttttgcttgaga +# acgatgctgacattgaaatgtcaaccaatgtcggctacacaccacttcatcaagctgctcaacaaggccacattatgattattaatctccttttacgc +# aacaaagcgaatccaaatgctttaacaaataacggtaatacagctctacacattgcaagtaatttaggatatataacggttatggaaacccttaaaac +# tgtcacatcaacatccattgttgataccaattcgggtgtgatacaagagaaatgcaaagtaatgtctccagaggttatgcatgaaactttgctttccg +# 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FVVFAKRLSKIEAKFSVFCMTDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTDDRPVGQVENKRLKEWLIDPWYQEVLFWRPKR +# FRDYGLYSQHHTVRSLLSKFA] +# end gene contig7.g19 +### +# start gene contig7.g20 +contig7 AUGUSTUS gene 40037 46896 1 + . 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ID=contig7.g20.t1;Parent=contig7.g20 +contig7 AUGUSTUS start_codon 40037 40039 . + 0 Parent=contig7.g20.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 40037 40351 . + 0 ID=contig7.g20.t1.cds;Parent=contig7.g20.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 44971 46896 . + 0 ID=contig7.g20.t1.cds;Parent=contig7.g20.t1 +# coding sequence = [atgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgatatttgataaaaccgaac +# atgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaataaacactggaaacata +# acagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaatttattcagttcctggcagt +# aattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggggggtggtgcccaaatcatcaa +# caaatcagtttcaaatacctttaaaaaccgtggaccgcctgccttacgatcattttctttttggcatggtaacgtgtcactctataacaataatgaac +# ggtatattgatgggggatcctttggatttgaaaatgtttaattctacgggttggacaatagaagattcaaataacataccagataatgaaaaatatgg +# tattctttatccaactattttaagacaaccaaggatttgctcttccgacttgagatcatcggattcaaaaaaaaagagtcaaatcagccgtcaatcgt +# ctgtagacgatttattagcaactgttggtatctcgcaaaatcaaaaaaattttgatcatggaattgttcgagaatttccatttacgtcgagtcttcag +# cgaatgtccgttattactcgttgtctcagcgaccaagtatttaatgtttactgcaaaggttccccagagatgttacagacactttgcacaccgcaaag +# cctacccgataactattccgaacagctatcgacatttgctaaaagaggataccgaattattgccattgcattcaaacctcttgtgcaaaaaatgaact +# attcaaaaatacagcgcctatcccgcgaagaggttgaaagcaacttggaatttcttggttttgtggtactcgaaaatcgccttaagccagatactgct +# aaagtaatcaaagcgttaaactcagcaaagattcgaactattatgattactggcgataatattttaactgctatgagtgttgcacgtgattgtggtat +# tgtaagtgcatcacaagctgttataacagtgcatgcagatccgcttggaaatagtggaaatatacaaagcaataatacagatagcattgttgataaga +# aaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaacaaagtgcaatagtaaccatatt +# cccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcattagttaacgaatcgagttccag +# ttatgcagaaagtattctgccgacgagcgatagtttggccagtgtaaagaccacagacacatggacccataatgagccaacagatgtagatgctgagc +# taggaataaaccgcactcaggacgaaagctggcgccaacactacatattcgcaatggatggcggaacttggcaaattataaaagatcactttccagat +# gaaatggccattcttttaacacggggatcgatttacgcccgaatgtcacccgatcagaaacaggcactagttatagaacttcaaaatttggactactg +# tgttgccatgtgcggtgatggtgccaacgattgcggtgcgctaaaggtggctcatgctggtatttcgctaagtgagaccgaagcatccattgcgtcgc +# cctttacttcacgtaatcccacgatttcggctgttttaaaagttattaaggaaggacgtgccgcattagtcacatcctttggaatttttaaatatatg +# gcagcatattcattggttcagtttatatctgttatggttctttattctatcgactcgaatttgacagacaagcagtatctttacgtagaccttggact +# tatatcaatttttgccttcttttttggtaaaactggatcatttgatggaaatttggtcgaacaagtgcctctcagttcattgatatcttctactccat +# tagcatcccttttacttcatctcactgttgtaactggatttcaagtaattggtaaggatattaatagtactagtttacaaaataaaattcataaaccc +# ggttga] +# protein sequence = [MLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQTRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYK +# FEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKMFNSTGWT +# IEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQVFNVYCK +# GSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIRTIMITGD +# NILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTVGDQTLFR +# LESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIYARMSPDQ +# KQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVMVLYSIDS +# NLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIGKDINSTSLQNKIHKPG] +# end gene contig7.g20 +### +# +# ----- prediction on sequence number 8 (length = 35012, name = contig8) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 8 on both strands +# start gene contig8.g21 +contig8 AUGUSTUS gene 2758 3027 1 - . 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ID=contig8.g23 +contig8 AUGUSTUS transcript 30531 32551 . + . 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ID=contig9.g24 +contig9 AUGUSTUS transcript 2758 3027 . - . ID=contig9.g24.t1;Parent=contig9.g24 +contig9 AUGUSTUS CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig9.g24.t1.cds;Parent=contig9.g24.t1 +contig9 AUGUSTUS start_codon 3025 3027 . - 0 Parent=contig9.g24.t1 +# coding sequence = [atgtgccacttcggcggcacttccagaagtgacttcggcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcggtaa +# gaagtatcgcagaagaagttcactcctggaagtgtcaacgaagacacttcaagaagagtcgccgaagtgacttcccaaagtgtcgccgaagtgactcc +# aagaagtgccgccgaagaggcacatttctttccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgcgatgtcgcggacgatagttttcatcttctag] +# protein sequence = [MCHFGGTSRSDFGDIAFGSRKSLPSVRSIAEEVHSWKCQRRHFKKSRRSDFPKCRRSDSKKCRRRGTFLSDGSDFRDP +# NAMSRTIVFIF] +# end gene contig9.g24 +### +# start gene contig9.g25 +contig9 AUGUSTUS gene 10026 26669 1 + . ID=contig9.g25 +contig9 AUGUSTUS transcript 10026 26669 . + . 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ID=contig10.g28 +contig10 AUGUSTUS transcript 850 16549 . + . ID=contig10.g28.t1;Parent=contig10.g28 +contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 2422 3884 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 5076 5185 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 5738 5987 . + 2 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 9378 9432 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 11823 12040 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 14155 14317 . + 1 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 . + 0 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 16317 16549 . + 2 ID=contig10.g28.t1.cds;Parent=contig10.g28.t1 +# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa +# 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actattcatctgagacacaaataaacttaaatactgacttttttgtatttcgaataccacaaattgttggtgaaagtcggccagctactgcaagttat +# actgtgtcaaacacgcttgactattctttaattcatgattgttctttcgactctttaaaaccaactttgtcttacatgacgcctatttctacattttc +# tacccttcaccaaattaaccttaaaaatgacgtcattagccatacaattaatatgcaagctcgccctctaacgtttaaaagggaatccgataatattc +# cgcacgcaacaaccgtaagaggtcatatggatagttttttaatttcacaaattaaaataccttttaatgacaaaaatgttgaagtccagttgacggcc +# aaccggaaaagagtttttcccgttcaatataaggacttaacgtcagatgagactaatattaaattggaacaacgaactaatatattaagcaactatga +# gaatgctcagcatttattttcctttaaggatattaaaacccatagcggattaaacaattatacttctatatacaaaaatgaatatttttctcaaacta +# cttctaacctcaatcattcagataatatgaatggtaaaccaataagacatgataatggaattcctaaagaaaatatagaacaatttacagagctagat +# caaaaagcagaaaactcaaacaaatcattgtactttttaagattgaacaaaaatgaattatgcgttacttatgctaataataccgagtcctcgagtct +# ttgtgaatgccgaccaagttttggacgcatgtttcccgaccgaccttgcagacattttgacgaatgtcgttacgaaaactttaacgactgttctactg +# atgccaactgttttaatttggttggcagctacacttgcagttgcaaagagggttacacagattcatctaataattatttatacccaggtcgacattgc +# tcaaataatataatcggctgcgatgattgtaactataatggcaaatgtatgaataagtcggatgaccacgggcatcaggggataaccttatgtaaatg +# cttttcttgattagatgagataacatttaatgagtacgcccataaacgaagcccattaaataaggtgcagatcaaacaagtgtctactcttatggaac +# aagcaacttgtgaacaattgatggtggctacaagctccagtttgtataaatatggaaagcgaacagcttcagaaattgttgccacacttaatacagat +# gagagtgctggacaacaaataaagaagtcattggacacaccagtgaaattacctgttcctttctcacctgatgaagcgcttgcactatgtggtggaat +# aaatgacgcaaagacctacacatactttgagatctgcgcctgccacggtttgtccaaaacaatgatgaaaacaattaatggattttcagatgcctcca +# tcaagccatattacgcagtcatctatagcccagtggtgcaagcagatggcactccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcat +# gtcaccacatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggt +# caacaatcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgtga +# cttcggcgatatcgcattcggatcgcggaagtcactcccgtcgggaagaaatgtgccacttcggaaagtcacttcggcgactcttcttgaagtgtcgc +# cgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgactttgagaagtgccgccgaagtggcacatttcttcccgacgggagtgacttccgcgatccgaatgc +# gatatctccgaagtcacttctggaagttacttaa] +# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQGTS +# SENWNLERFRPMLNVVANLIKNQLTNTQYTQLHTHSFIKGKSGTTTKNPIYIPLKRNVKGKPLNMTNAKPNTADLLGKLKIMALHIHPPMTYVLNKCL +# KHNLKKLSSSVGYKGTSMVYRNAFINPGIPIRPGEVITASANVIFGKPSIEQNIRTTITNRPLTSINSIYPSDERIHSTMVHSSFSYENEIMTEYATL +# LKPPPLPANRLLQYTSTFQSQMGRTRNAAKNWFSPITVLQNNPIYDYYSSETQINLNTDFFVFRIPQIVGESRPATASYTVSNTLDYSLIHDCSFDSL +# KPTLSYMTPISTFSTLHQINLKNDVISHTINMQARPLTFKRESDNIPHATTVRGHMDSFLISQIKIPFNDKNVEVQLTANRKRVFPVQYKDLTSDETN +# IKLEQRTNILSNYENAQHLFSFKDIKTHSGLNNYTSIYKNEYFSQTTSNLNHSDNMNGKPIRHDNGIPKENIEQFTELDQKAENSNKSLYFLRLNKNE +# LCVTYANNTESSSLCECRPSFGRMFPDRPCRHFDECRYENFNDCSTDANCFNLVGSYTCSCKEGYTDSSNNYLYPGRHCSNNIIGCDDCNYNGKCMNK +# SDDHGHQGITLCKCFSXLDEITFNEYAHKRSPLNKVQIKQVSTLMEQATCEQLMVATSSSLYKYGKRTASEIVATLNTDESAGQQIKKSLDTPVKLPV +# PFSPDEALALCGGINDAKTYTYFEICACHGLSKTMMKTINGFSDASIKPYYAVIYSPVVQADGTPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVK +# TTALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNVTSAISHSDRGSHSRREEMCHFGKSLRRLFLKCRRSHSWKCRRSDFEKCRRSG +# TFLPDGSDFRDPNAISPKSLLEVT] +# end gene contig10.g28 +### +# start gene contig10.g29 +contig10 AUGUSTUS gene 17334 17570 1 + . 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ID=contig10.g31 +contig10 AUGUSTUS transcript 22421 22711 . - . ID=contig10.g31.t1;Parent=contig10.g31 +contig10 AUGUSTUS CDS 22421 22711 . - 0 ID=contig10.g31.t1.cds;Parent=contig10.g31.t1 +contig10 AUGUSTUS start_codon 22709 22711 . - 0 Parent=contig10.g31.t1 +# coding sequence = [atggcactcaagagacttgtcgacattgaaagtaagataagacgggatgccaactttgggcgggcttacaacttgatca +# tggaggcctacgtcaacaagggttatgcacggcgcctgaagcagcataaaggatctctgaattcagttccactcaaaggcccacaacagttcaagtct +# ctgccagccgtgatcttccattttcgggaaggagcagtcggaccacacagacataaaggagaagttttatcaggtgctgagccccacgatagatacgc +# gcgagatttctgttga] +# protein sequence = [MALKRLVDIESKIRRDANFGRAYNLIMEAYVNKGYARRLKQHKGSLNSVPLKGPQQFKSLPAVIFHFREGAVGPHRHK +# GEVLSGAEPHDRYARDFC] +# end gene contig10.g31 +### +# start gene contig10.g32 +contig10 AUGUSTUS gene 24618 27471 1 + . ID=contig10.g32 +contig10 AUGUSTUS transcript 24618 27471 . + . 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ID=contig13.g40 +contig13 AUGUSTUS transcript 22152 43185 . - . 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ID=contig14.g42.t1;Parent=contig14.g42 +contig14 AUGUSTUS start_codon 33845 33847 . + 0 Parent=contig14.g42.t1 +contig14 AUGUSTUS CDS 33845 33923 . + 0 ID=contig14.g42.t1.cds;Parent=contig14.g42.t1 +contig14 AUGUSTUS CDS 34209 34843 . + 2 ID=contig14.g42.t1.cds;Parent=contig14.g42.t1 +# coding sequence = [atgaagcaaattatagcttcggtgttttttcacatatcattgtggacattccacgtcaagtggtgtgcgagaaaaagtg +# cacgttacgaagctctcaggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggat +# ggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacag +# ctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaa +# atcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgagtttttcgctttctcttggaatccaggtaacgatgtatcaacccacata +# gcaaaattgcgtagtctatggaacgatttaaatcaagctttgaaggctaaaaatgaaactgagctgccagatttaatacttgtttgtaaaacgctaca +# tattttgtcaaaaacctttgaaacgttccgtcaaagttggatgcttttgacaaaagaagaagaaaagactttcgacgaattaactaatcaaattgtca +# tgtttgagagaaatttcagaacaaaagaaaatgacgaaactgtataa] +# protein sequence = [MKQIIASVFFHISLWTFHVKWCARKSARYEALRRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKIVKPDPLPKGASAADEK +# QHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPGNDVSTHIAKLRSLWNDLNQALKAKNE +# TELPDLILVCKTLHILSKTFETFRQSWMLLTKEEEKTFDELTNQIVMFERNFRTKENDETV] +# end gene contig14.g42 +### +# start gene contig14.g43 +contig14 AUGUSTUS gene 35575 36522 1 + . ID=contig14.g43 +contig14 AUGUSTUS transcript 35575 36522 . + . ID=contig14.g43.t1;Parent=contig14.g43 +contig14 AUGUSTUS start_codon 35575 35577 . + 0 Parent=contig14.g43.t1 +contig14 AUGUSTUS CDS 35575 36522 . + 0 ID=contig14.g43.t1.cds;Parent=contig14.g43.t1 +# coding sequence = [atgtcaggcgatgtttgcggcccttttgaggattctttccagaagaagaggtatctggtagtttttaaggatcatttca +# ccaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaatt +# cgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgta +# tactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccag +# aagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctg +# ggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacattccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctga +# aaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagagaagcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaag +# agaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaaggacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttg +# caccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgaggacgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacac +# aaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaagaaaacaacaagagaaaaccgcaataa] +# protein sequence = [MSGDVCGPFEDSFQKKRYLVVFKDHFTRFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSDNGGEFDCAEVRET +# LQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRIKHLRIVGSTCYVH +# IPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDEDKEEEDADLHKSE +# DEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] +# end gene contig14.g43 +### +# start gene contig14.g44 +contig14 AUGUSTUS gene 36661 37842 1 + . ID=contig14.g44 +contig14 AUGUSTUS transcript 36661 37842 . + . ID=contig14.g44.t1;Parent=contig14.g44 +contig14 AUGUSTUS start_codon 36661 36663 . + 0 Parent=contig14.g44.t1 +contig14 AUGUSTUS CDS 36661 37842 . + 0 ID=contig14.g44.t1.cds;Parent=contig14.g44.t1 +# coding sequence = [atggacagggaaattgattccttacttcagaatgaaacttggaacttgacaagactccccagaggatcgaaagcacttc +# cgtgcaagtgggtctatcgagtcaaaacccaccccgacggaagtatcgacaaatacaaagctcgcttggtcatcaaaggattcgcccagagacgaggg +# attgattacgaccaaacttttagctctgtcgcaagaatggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtt +# tgacgtcttgacagcttttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgca +# gattgaagaagagtctctacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgag +# gcagatccatgtctctacatcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaaga +# tttggaagaatttttggacgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatg +# gactaaaaattagtcaacaaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttg +# gaaattacgacagcaaggaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccaga +# cttggctttcagcatcggatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaa +# caatcaacgttgggatagtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatct +# acatcagggatcatcatcatgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgt +# agcagccaatgaagctgcaaaataa] +# protein sequence = [MDREIDSLLQNETWNLTRLPRGSKALPCKWVYRVKTHPDGSIDKYKARLVIKGFAQRRGIDYDQTFSSVARMETIRSV +# LSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLRKHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVV +# YVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAVSTPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQA +# IGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFGGCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQR +# QAMVAISTTEAEIVAANEAAK] +# end gene contig14.g44 +### +# start gene contig14.g45 +contig14 AUGUSTUS gene 37866 44034 1 - . ID=contig14.g45 +contig14 AUGUSTUS transcript 37866 44034 . - . ID=contig14.g45.t1;Parent=contig14.g45 +contig14 AUGUSTUS CDS 37866 38116 . - 2 ID=contig14.g45.t1.cds;Parent=contig14.g45.t1 +contig14 AUGUSTUS CDS 43986 44034 . - 0 ID=contig14.g45.t1.cds;Parent=contig14.g45.t1 +contig14 AUGUSTUS start_codon 44032 44034 . - 0 Parent=contig14.g45.t1 +# coding sequence = [atgtacaatattgcagcttataaggttttggacgataatacagatctaatagagtccaatcttgttgcaaagaatccgg +# agacgagtattgaggatcggcttcatcatcatatctgcgagttgttcctcagtcgggatttgttcgatcccaaattctccctcagccattctttccct +# gatgaagaaatgcttgttggctatgtgcttggttctgcgatggaattcggggttttgggccagccttatggcagcagaattatcgacctggagaatcg +# gggctcggttcaatctatttcctga] +# protein sequence = [MYNIAAYKVLDDNTDLIESNLVAKNPETSIEDRLHHHICELFLSRDLFDPKFSLSHSFPDEEMLVGYVLGSAMEFGVL +# GQPYGSRIIDLENRGSVQSIS] +# end gene contig14.g45 +### +# +# ----- prediction on sequence number 15 (length = 50014, name = contig15) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 15 on both strands +# start gene contig15.g46 +contig15 AUGUSTUS gene 1547 3385 1 - . ID=contig15.g46 +contig15 AUGUSTUS transcript 1547 3385 . - . ID=contig15.g46.t1;Parent=contig15.g46 +contig15 AUGUSTUS CDS 1547 2032 . - 0 ID=contig15.g46.t1.cds;Parent=contig15.g46.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 2924 3385 . - 0 ID=contig15.g46.t1.cds;Parent=contig15.g46.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 3383 3385 . - 0 Parent=contig15.g46.t1 +# coding sequence = [atgtcggtgtatcgtacagctgttgataggtgtcaacgaatttggattattgattctggtattgtcaatgctacagtca +# atttaaatcagatttgtccgccaaagattgttgtatacgatcttaaaaaagatgaactaattattcggtacaatttagaagcttctcaagtcaaacaa +# gattccctgcactctaatattgttgtggatataggagatcattgcgacgatgcgcatgctattgtatcggatgtatggagattcgggctggttgtgta +# tagcctttcaaagaaccgaagctggcgtgtaacaaattataatttctatcctgatccagttgcatcagattttaatatttacggattgaactttcaat +# ggctggatggtgttttcggtatgactatatcttacaatgaaaatatgatgcaacgcgttctttactttcatccaatggcaagttttaaggagtttatg +# gtaccgatggacctcctcttaaatgaatctctgtggaaatcaaacaatcaagataatgcgaagtatttcttttcgattggggatcggggctacaatag +# ccaatcatccacttctgcaattacaaggagtggcgtaatgttttttacacaagttcatcaagataatattggttgctgggacacatcaaaaccatata +# ctcgagcacatatagaaagatttttggaaaacggcccaaatttaattcaatttccaaatgacttaaaagtagataacgaagacgaccaaagtatatgg +# attataagtaaccgactaccaatatttctgtacagcaatttggactatggagaaataaattttcgaattttaaaggtgaaagtaaaaacggctataag +# caatagcatttgtaatccagaaaataggtacattaatggatctaaatcaacatttgtattaattgaagaaggtcaatgttattaa] +# protein sequence = [MSVYRTAVDRCQRIWIIDSGIVNATVNLNQICPPKIVVYDLKKDELIIRYNLEASQVKQDSLHSNIVVDIGDHCDDAH +# AIVSDVWRFGLVVYSLSKNRSWRVTNYNFYPDPVASDFNIYGLNFQWLDGVFGMTISYNENMMQRVLYFHPMASFKEFMVPMDLLLNESLWKSNNQDN +# AKYFFSIGDRGYNSQSSTSAITRSGVMFFTQVHQDNIGCWDTSKPYTRAHIERFLENGPNLIQFPNDLKVDNEDDQSIWIISNRLPIFLYSNLDYGEI +# NFRILKVKVKTAISNSICNPENRYINGSKSTFVLIEEGQCY] +# end gene contig15.g46 +### +# start gene contig15.g47 +contig15 AUGUSTUS gene 3838 4836 1 + . ID=contig15.g47 +contig15 AUGUSTUS transcript 3838 4836 . + . ID=contig15.g47.t1;Parent=contig15.g47 +contig15 AUGUSTUS start_codon 3838 3840 . + 0 Parent=contig15.g47.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 3838 3916 . + 0 ID=contig15.g47.t1.cds;Parent=contig15.g47.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 4202 4836 . + 2 ID=contig15.g47.t1.cds;Parent=contig15.g47.t1 +# coding sequence = [atgaagcaaattatagcttcggtgttttttcacatatcattgtggacattccacgtcaagtggtgtgcgagaaaaagtg +# cacgttacgaagctctcaggcgcgaccgattggccgatttggaaaagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggat +# ggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagcagcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacag +# ctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgtaccagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaa +# atcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgcaacgagtttttcgctttctcttggaatccaggtaacgatgtatcaacccacata +# gcaaaattgcgtagtctatggaacgatttaaatcaagctttgaaggctaaaaatgaaactgagctgccagatttaatacttgtttgtaaaacgctaca +# tattttgtcaaaaacctttgaaacgttccgtcaaagttggatgcttttgacaaaagaagaagaaaagactttcgacgaattaactaatcaaattgtca +# tgtttgagagaaatttcagaacaaaagaaaatgacgaaactgtataa] +# protein sequence = [MKQIIASVFFHISLWTFHVKWCARKSARYEALRRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDGKIVKPDPLPKGASAADEK +# QHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPGNDVSTHIAKLRSLWNDLNQALKAKNE +# TELPDLILVCKTLHILSKTFETFRQSWMLLTKEEEKTFDELTNQIVMFERNFRTKENDETV] +# end gene contig15.g47 +### +# start gene contig15.g48 +contig15 AUGUSTUS gene 5568 6515 1 + . ID=contig15.g48 +contig15 AUGUSTUS transcript 5568 6515 . + . ID=contig15.g48.t1;Parent=contig15.g48 +contig15 AUGUSTUS start_codon 5568 5570 . + 0 Parent=contig15.g48.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 5568 6515 . + 0 ID=contig15.g48.t1.cds;Parent=contig15.g48.t1 +# coding sequence = [atgtcaggcgatgtttgcggcccttttgaggattctttccagaagaagaggtatctggtagtttttaaggatcatttca +# ccaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtgctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaatt +# cgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagagaaactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgta +# tactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaatggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccag +# aagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacgggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctg +# ggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgtacacattccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctga +# aaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttaccagagaagcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaag +# agaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttggatccaaggacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttg +# caccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagagcgaggacgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacac +# aaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttgacgaagaaaacaacaagagaaaaccgcaataa] +# protein sequence = [MSGDVCGPFEDSFQKKRYLVVFKDHFTRFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELLSDNGGEFDCAEVRET +# LQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKPRIKHLRIVGSTCYVH +# IPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSKDEDKEEEDADLHKSE +# DEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] +# end gene contig15.g48 +### +# start gene contig15.g49 +contig15 AUGUSTUS gene 6654 7835 1 + . ID=contig15.g49 +contig15 AUGUSTUS transcript 6654 7835 . + . ID=contig15.g49.t1;Parent=contig15.g49 +contig15 AUGUSTUS start_codon 6654 6656 . + 0 Parent=contig15.g49.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 6654 7835 . + 0 ID=contig15.g49.t1.cds;Parent=contig15.g49.t1 +# coding sequence = [atggacagggaaattgattccttacttcagaatgaaacttggaacttgacaagactccccagaggatcgaaagcacttc +# cgtgcaagtgggtctatcgagtcaaaacccaccccgacggaagtatcgacaaatacaaagctcgcttggtcatcaaaggattcgcccagagacgaggg +# attgattacgaccaaacttttagctctgtcgcaagaatggaaacaatccgctcagtgttgagcgttgcagccaaaaatgatatgtttttggtccagtt +# tgacgtcttgacagcttttctatacggagaattggacgacaaggagatttacatgcaacaacctgagggatacgagcaaggacaggggattgcttgca +# gattgaagaagagtctctacgggcttaagcaagggccgagatgctggcaagaaggcttcggaggtttcctgcggaaacacaatttcaaggtcagcgag +# gcagatccatgtctctacatcaggaaaagaaatggcaaaaaggttctactcgttgtttacgtagatgacggactcgccgcagcaacagatacgcaaga +# tttggaagaatttttggacgagttaaaatcagagttcaaaattgtctcaaacaaggctgagtgcttcttgggactcgaaatcaagaaacaagaaaatg +# gactaaaaattagtcaacaaggatatgccacaaggatattggagcgattcagattctcggattgcaaagctgtttcaaccccacttctcaagaatttg +# gaaattacgacagcaaggaaagtatcagagacgactgcgttcccttatcgccaagccatcggagctctcatgtacctcatgcttggaactaggccaga +# cttggctttcagcatcggatttctttcaagaacgcttgaaaatcctacaaaagaaaacattgcacaagtaaagagggttttccgttacatttccggaa +# caatcaacgttgggatagtctatcggaaacagaagaagggaatcctcgaatgctacagcgatgctgactttggtggctgcacgaagactgggagatct +# acatcagggatcatcatcatgtttgcctcaggagccatttcatggaaaagtcaaaggcaggccatggtggccatttctactacagaggctgagatcgt +# agcagccaatgaagctgcaaaataa] +# protein sequence = [MDREIDSLLQNETWNLTRLPRGSKALPCKWVYRVKTHPDGSIDKYKARLVIKGFAQRRGIDYDQTFSSVARMETIRSV +# LSVAAKNDMFLVQFDVLTAFLYGELDDKEIYMQQPEGYEQGQGIACRLKKSLYGLKQGPRCWQEGFGGFLRKHNFKVSEADPCLYIRKRNGKKVLLVV +# YVDDGLAAATDTQDLEEFLDELKSEFKIVSNKAECFLGLEIKKQENGLKISQQGYATRILERFRFSDCKAVSTPLLKNLEITTARKVSETTAFPYRQA +# IGALMYLMLGTRPDLAFSIGFLSRTLENPTKENIAQVKRVFRYISGTINVGIVYRKQKKGILECYSDADFGGCTKTGRSTSGIIIMFASGAISWKSQR +# QAMVAISTTEAEIVAANEAAK] +# end gene contig15.g49 +### +# start gene contig15.g50 +contig15 AUGUSTUS gene 7859 14027 1 - . ID=contig15.g50 +contig15 AUGUSTUS transcript 7859 14027 . - . ID=contig15.g50.t1;Parent=contig15.g50 +contig15 AUGUSTUS CDS 7859 8109 . - 2 ID=contig15.g50.t1.cds;Parent=contig15.g50.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 13979 14027 . - 0 ID=contig15.g50.t1.cds;Parent=contig15.g50.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 14025 14027 . - 0 Parent=contig15.g50.t1 +# coding sequence = [atgtacaatattgcagcttataaggttttggacgataatacagatctaatagagtccaatcttgttgcaaagaatccgg +# agacgagtattgaggatcggcttcatcatcatatctgcgagttgttcctcagtcgggatttgttcgatcccaaattctccctcagccattctttccct +# gatgaagaaatgcttgttggctatgtgcttggttctgcgatggaattcggggttttgggccagccttatggcagcagaattatcgacctggagaatcg +# gggctcggttcaatctatttcctga] +# protein sequence = [MYNIAAYKVLDDNTDLIESNLVAKNPETSIEDRLHHHICELFLSRDLFDPKFSLSHSFPDEEMLVGYVLGSAMEFGVL +# GQPYGSRIIDLENRGSVQSIS] +# end gene contig15.g50 +### +# start gene contig15.g51 +contig15 AUGUSTUS gene 18680 42191 1 + . ID=contig15.g51 +contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42191 . + . ID=contig15.g51.t1;Parent=contig15.g51 +contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 . + 0 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 36538 36768 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 37576 37938 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 39307 39606 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 41530 42191 . + 2 ID=contig15.g51.t1.cds;Parent=contig15.g51.t1 +# coding sequence = [atggatcccgcttcaaatattgtggaaaatgtagttgaaccaaaaaatgacagtgctggtgtaattcaaatggctcctg +# aaaatattgaccactctatcgaaaatcagagcactacatcaacagatgataaagacgatgccgatttaataattgatgatagcgaatctgatgaatat +# agttcagatagcaaaaaaactgcagatgtagcagaaactgaggatttaattaaggttacagaaactgctaagacctcattgttatcagatgcggatgg +# cacagttgaaataaatgaaaacacagaaatgaaatctgaggaccccatcatagaagccttatctattaaatcagaccaggaaacttcggtttcagcca +# atacaaaagtcgataaaagctccaccgtttcggaggagaatccaaaggtggatgtaatagatgcgaataccataagtgtaatcttacccaatgcttca +# aaagcaaatgttccacaagatacatcaacaattataattgaagacgacgaagttaaaagaactgaagaagtggaagccgatgaacctaaaacatgtga +# actggctgccgaaaactctaaaaatgaagttgcgtcctctattgaaaacgttaatgaatttaaagaagttggtaaaaatgctgttgaagacaaagact +# taaatgtatttaatgaggctgacttcaataaccaaattctggacattatatcggacattgatataaatataaaggcccaggaaaaaataactcaactt +# aaagagcaagaactgaagcttatacagaaacagaacgaattggcaaatcaaatacatcagcaacaaatcttagctcagcagctgaatgccaaaaatac +# aaataaacaaagtcaatgccaacaacaaaatgcgcgtgatgtactaacactacatcaaaataatttcgtcgttaaatgccgccagtacacacgggtac +# tgaatgctctcgaagacaaggcaagtcagcaagaggggtcaaacaatacgaagcttacggtgcctataggtaaagaatccacaaatatatcaaagaac +# attgatttgcgcaaaatatttactcctgcgaccgatgctactgaaatattgcctaaaaataggaatgagagctccagtgacgttgtagatccatataa +# agagaattccgaaacgaattccacattggaacttagaaagttggaaaaaatgccgctaaagcttataatgaacccaaacggaagagtccgtgattata +# attcgctcaaagatttaattaacgttgaaactggcctgttatcgcctgacaattgcgctgaactaataactgcacttcaacttcatcaaggacgaggt +# gccgaactgtttgcaaaacgccgcagaaaggctgataattggatagtcgatgaaaccaatttagagactcaaaatcctccgtctggtattccagatta +# ccagcagtatcaacaaaaaccggctacatcaccaaacattttgccagcatattctgatgcaggaaaacatcgcgttcagttgaatattcatcaaaatc +# agttaattgaaaaatattcaaagccaggattgcaggtggttcagtctccttgggatgcagctttacaaactggttcggccagtacggcgtttttggaa +# gataaggatagcaaaagtcaatgtctttcccctgctgccgtatcaccaacaccgtacttccaaagtgatgtgcaaagtcgattatatgaactcgaaaa +# atttcaaaaattatttttggaacaccagccacttgaaatagaagtgttacggaacagagatagagctcaagctcataatagctgtaaagatgtaatgc +# taaaatttgaagttgaattatgtgataatgacaaacaagtcaaagatgtcctagatgagaaattaaatgtgcgagaattaatacaatcttttgaacaa +# cagaatatatcggaactaagccattctcaaaacggcctcgcagcaccaataaaatacgacaataaaggcaagggcttatacgtaccgaaagagatatc +# tctttctagctatgcagcacctccacagcagtacgccggtcacgatgcacattttgagtcgccgaacaatggctctgcttcgcgccctttatcaagga +# ccaacttttctacataccaaagttctgttggaaataatggaactggccagttcccaatatcaaaggcgttctcacccgaattaggcactgtaccgcca +# aggcagcagctgtacgcgccgtctagctatcaaagaatacccgcatttgaaaacgtcgcgcctcaggttaactttaaccctgcgcctttgacctttga +# taaaatggcaagatacgaacaacccaacagaaataattcgactagtgcaagctcacagtatcttaatgtgaaacaaaattcgcgagtgcgtaatgttt +# cgccaacaccatttggaattgtacgtaatgagcatacgtctggatcttctttttcaactgggtcaattggatctcccaacagatgtggaccattgcct +# ggcaggccaacttctccactatcgaacaaagttccaatctttaaccaatgtgccagaggatggggctctatttcagacaaacaacagacctatcaaag +# tccattctcctcaccacaaactggaaacttaccatacactgatttttaa] +# protein sequence = [MDPASNIVENVVEPKNDSAGVIQMAPENIDHSIENQSTTSTDDKDDADLIIDDSESDEYSSDSKKTADVAETEDLIKV +# TETAKTSLLSDADGTVEINENTEMKSEDPIIEALSIKSDQETSVSANTKVDKSSTVSEENPKVDVIDANTISVILPNASKANVPQDTSTIIIEDDEVK +# RTEEVEADEPKTCELAAENSKNEVASSIENVNEFKEVGKNAVEDKDLNVFNEADFNNQILDIISDIDINIKAQEKITQLKEQELKLIQKQNELANQIH +# QQQILAQQLNAKNTNKQSQCQQQNARDVLTLHQNNFVVKCRQYTRVLNALEDKASQQEGSNNTKLTVPIGKESTNISKNIDLRKIFTPATDATEILPK +# NRNESSSDVVDPYKENSETNSTLELRKLEKMPLKLIMNPNGRVRDYNSLKDLINVETGLLSPDNCAELITALQLHQGRGAELFAKRRRKADNWIVDET +# NLETQNPPSGIPDYQQYQQKPATSPNILPAYSDAGKHRVQLNIHQNQLIEKYSKPGLQVVQSPWDAALQTGSASTAFLEDKDSKSQCLSPAAVSPTPY +# FQSDVQSRLYELEKFQKLFLEHQPLEIEVLRNRDRAQAHNSCKDVMLKFEVELCDNDKQVKDVLDEKLNVRELIQSFEQQNISELSHSQNGLAAPIKY +# DNKGKGLYVPKEISLSSYAAPPQQYAGHDAHFESPNNGSASRPLSRTNFSTYQSSVGNNGTGQFPISKAFSPELGTVPPRQQLYAPSSYQRIPAFENV +# APQVNFNPAPLTFDKMARYEQPNRNNSTSASSQYLNVKQNSRVRNVSPTPFGIVRNEHTSGSSFSTGSIGSPNRCGPLPGRPTSPLSNKVPIFNQCAR +# GWGSISDKQQTYQSPFSSPQTGNLPYTDF] +# end gene contig15.g51 +### +# start gene contig15.g52 +contig15 AUGUSTUS gene 44931 45401 1 - . ID=contig15.g52 +contig15 AUGUSTUS transcript 44931 45401 . - . ID=contig15.g52.t1;Parent=contig15.g52 +contig15 AUGUSTUS CDS 44931 45401 . - 0 ID=contig15.g52.t1.cds;Parent=contig15.g52.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 45399 45401 . - 0 Parent=contig15.g52.t1 +# coding sequence = [atgagtcgtgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgaattttgaccaaaagaaccgtcgcatgagcatagctaaag +# agctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcataactggtgacgactcatgggtatatggttatgatatcgaaaccaaagcc +# caatcgtcacaatggaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcaccccaagttcgatcaaatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgatta +# ccatggcgtggtgcatctggagttcttaccatatggtcgtacggttaataaacagtattatctggaagttatgcgccgtttgcaagaagcaatacgaa +# agaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttagatcacgataatgcccctgatcactcatctttgcttatgagcgattttttggcctaa] +# protein sequence = [MSRVSAKFVPKLLNFDQKNRRMSIAKELLDDVNDDPDLLKRVITGDDSWVYGYDIETKAQSSQWKSPGEPRPKKAPQV +# RSNVKVLITVFFDYHGVVHLEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLQEAIRKKRPELWKNNSWLLDHDNAPDHSSLLMSDFLA] +# end gene contig15.g52 +### +# +# ----- prediction on sequence number 16 (length = 45017, name = contig16) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 16 on both strands +# start gene contig16.g53 +contig16 AUGUSTUS gene 5832 6209 1 + . ID=contig16.g53 +contig16 AUGUSTUS transcript 5832 6209 . + . ID=contig16.g53.t1;Parent=contig16.g53 +contig16 AUGUSTUS start_codon 5832 5834 . + 0 Parent=contig16.g53.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 5832 6209 . + 0 ID=contig16.g53.t1.cds;Parent=contig16.g53.t1 +# coding sequence = [atgaacgctgaaatctcggaaactatacaagcaaacttggcaatcaaattcctgggcttcctgcgcagcgcaagtttgt +# ttcagcggcatgcgacgcccactctacacccacaattcgagaaaatctgtagcgcctacagtatgataggatcaaaatttaaagtgaattgtatttgt +# ctcatcaatacctatcgactgaccaaaaaaacatgtgacatttttcactcccactctaacttccacaaacggcttaaacggcttgttttaaaattgat +# ttccgatagttcctatgggatctataagatacagttgtccggttccgtcatatatactacatgcaatagaaaaaagacttttgtgaaagtttcagccc +# gatag] +# protein sequence = [MNAEISETIQANLAIKFLGFLRSASLFQRHATPTLHPQFEKICSAYSMIGSKFKVNCICLINTYRLTKKTCDIFHSHS +# NFHKRLKRLVLKLISDSSYGIYKIQLSGSVIYTTCNRKKTFVKVSAR] +# end gene contig16.g53 +### +# start gene contig16.g54 +contig16 AUGUSTUS gene 10302 20749 1 + . ID=contig16.g54 +contig16 AUGUSTUS transcript 10302 20749 . + . ID=contig16.g54.t1;Parent=contig16.g54 +contig16 AUGUSTUS start_codon 10302 10304 . + 0 Parent=contig16.g54.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 10302 10409 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 14837 14950 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 20531 20749 . + 0 ID=contig16.g54.t1.cds;Parent=contig16.g54.t1 +# coding sequence = [atggtgccgcctttgctcactccggacaacaaacgcaaccgtgagaccacttcagagcagtgtttgacgctgcacaatc +# cgaaggagtttctgcgtcgtttcgtgaccatcagtcaagatattaaagtgaagagtcacatcaagcccatcaacaatgagcaagatcgctacgccaac +# acgttcgggattgagttacaaggaatctccgaattgaaacaaaagaggagagaacttatacccgggattgcaagatggtggttacgtatccaggagtt +# cgacttatactcgtacatcgttcatcgagcaggaacacagatgaaccacttagacgcactcagtcgagctccattcgaaaatgctcgacgcataatcg +# acgaaatggattcaaatggaacagattcagagatttgccgcaggcataaaattgctaaattattctga] +# protein sequence = [MVPPLLTPDNKRNRETTSEQCLTLHNPKEFLRRFVTISQDIKVKSHIKPINNEQDRYANTFGIELQGISELKQKRREL +# IPGIARWWLRIQEFDLYSYIVHRAGTQMNHLDALSRAPFENARRIIDEMDSNGTDSEICRRHKIAKLF] +# end gene contig16.g54 +### +# start gene contig16.g55 +contig16 AUGUSTUS gene 23317 43120 1 + . 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= [atgacgaccttgagaaaacctgtggctgccataaaaaagaggtcaggaccgttgaataaggcccttgaagaggtgaatg +# ataatttatttggatcgccaccttcagatgttcttagcatacgtcagcaaaataattttgcaagcaagcactcaggaggagttgcatctggcaatagg +# ctacgccgtcgtagcacaaaagacagagaaaaaaaacgagagcgctggcttttaacacgaaaaacttggagatatatgacagatgccggtcgtaagct +# tatccccgatagctacccggcagggtcagataactttgacttacttgaagaacattttcaacgagtgtgcttatctgaaccaagttttattttatgga +# atcgacgaacctcttacccgggagcaatcaacagctctaggcgaagattaaagcaattgtctaggcacgcatgttccagccataaggaaaatagcatt +# gagacaaaaaatagttattataacgcagatcgaactatcgaactattgcagacgtttttaaaacttcgcgatgcatacaaaacaacaacgctacttgg +# tacaaaaacagttagacctgaccaaacatcatcgcctagtgcacagagacctatttttggcaaaaagagtgaaaaagatcagacaatgtcctcggaca +# tgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaagtgggaattaagttggaaattagcgatttatcc +# gagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaacttcatcggaccctacattccaaagaaccgaataa +# aaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaagtatgtctagtaaaacatctgaggaccaaaagctaaaaaatc +# aaaatttccaatgtgtaaaaatatgtgatactagctcgaaaaattcaattaatttagatctcaactgtgttataaaaagcatcgagtttccaaacaag +# tgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattcaacttagcgaactaaaaagtttggcggaaca +# gtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggatggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaa +# aaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggcaagaaagaaaagtgtacaaggttctgactca +# aatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatccaccagcactcaatgatggattgaataaggc +# tgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctatatatctgcaaaacgctcacttagaatggataa +# gatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaagaagagcatactcctcatgaaatcaatagggga +# aacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaaaagctataaggacttctagcgggttgctttc +# ttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaatcttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaat +# 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atgttatctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaatta +# gacgatccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacggtttgtataa] +# protein sequence = [MTTLRKPVAAIKKRSGPLNKALEEVNDNLFGSPPSDVLSIRQQNNFASKHSGGVASGNRLRRRSTKDREKKRERWLLT +# RKTWRYMTDAGRKLIPDSYPAGSDNFDLLEEHFQRVCLSEPSFILWNRRTSYPGAINSSRRRLKQLSRHACSSHKENSIETKNSYYNADRTIELLQTF +# LKLRDAYKTTTLLGTKTVRPDQTSSPSAQRPIFGKKSEKDQTMSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKK +# QQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSSLSSLKIGEHESMSSKTSEDQKLKNQNFQCVKICDTSSKNSINLDLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQT +# SFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDISQSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKG +# EINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQKQLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHS +# KLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQFDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEEL +# NIGNIDDLKKTSKKRRIAPKKKSLTTSFFDIGKKDDQTRDRKGSANIEDRSEHYVFRKSGSNPGSVMKLNDNVRSCESLPSKSLEFGYMDSSDCSSGS +# 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ID=contig17.g56 +contig17 AUGUSTUS transcript 517 741 . + . ID=contig17.g56.t1;Parent=contig17.g56 +contig17 AUGUSTUS start_codon 517 519 . + 0 Parent=contig17.g56.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 517 741 . + 0 ID=contig17.g56.t1.cds;Parent=contig17.g56.t1 +# coding sequence = [atgcagaggagagaacttatacccgggattgcaagatggtggttacgtatccaggagttcgacttatactcgtacatcg +# ttcatcgagcaggaacacagatgaaccacttagacgcactcagtcgagctccattcgaaaatgctcgacgcataatcgacgaaatggattcaaatgga +# acagattcagagatttgccgcaggcataaaattgctaaattattctga] +# protein sequence = [MQRRELIPGIARWWLRIQEFDLYSYIVHRAGTQMNHLDALSRAPFENARRIIDEMDSNGTDSEICRRHKIAKLF] +# end gene contig17.g56 +### +# start gene contig17.g57 +contig17 AUGUSTUS gene 3309 35477 1 + . ID=contig17.g57 +contig17 AUGUSTUS transcript 3309 35477 . + . ID=contig17.g57.t1;Parent=contig17.g57 +contig17 AUGUSTUS start_codon 3309 3311 . + 0 Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 3309 5118 . + 0 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 6881 6942 . + 2 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 7101 7245 . + 0 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 9064 9156 . + 2 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 9258 9361 . + 2 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 14330 14611 . + 0 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 16345 16376 . + 0 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 18063 18206 . + 1 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 22448 22582 . + 1 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 23025 23102 . + 1 ID=contig17.g57.t1.cds;Parent=contig17.g57.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 35297 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cacccttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttg +# atgttatctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaatta +# gacgatccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgttcttatggatatagttgtccgatccggctggttcc +# gacttatatactacctgcaatagaaagacttttgcgaaagtttcagcccgatggctttaaaactgagagactagcttgcttagaaacggacagacaga +# ctgacggacaaacggacagatggacaaggctagatcgactcgtctag] +# protein sequence = [MTTLRKPVAAIKKRSGPLNKALEEVNDNLFGSPPSDVLSIRQQNNFASKHSGGVASGNRLRRRSTKDREKKRERWLLT +# RKTWRYMTDAGRKLIPDSYPAGSDNFDLLEEHFQRVCLSEPSFILWNRRTSYPGAINSSRRRLKQLSRHACSSHKENSIETKNSYYNADRTIELLQTF +# LKLRDAYKTTTLLGTKTVRPDQTSSPSAQRPIFGKKSEKDQTMSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKK +# QQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSSLSSLKIGEHESMSSKTSEDQKLKNQNFQCVKICDTSSKNSINLDLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQT +# SFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDISQSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKG +# 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ID=contig19.g59 +contig19 AUGUSTUS transcript 3316 28946 . - . 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ID=contig20.g61 +contig20 AUGUSTUS transcript 1546 5884 . + . ID=contig20.g61.t1;Parent=contig20.g61 +contig20 AUGUSTUS start_codon 1546 1548 . + 0 Parent=contig20.g61.t1 +contig20 AUGUSTUS CDS 1546 1686 . + 0 ID=contig20.g61.t1.cds;Parent=contig20.g61.t1 +contig20 AUGUSTUS CDS 5687 5884 . + 0 ID=contig20.g61.t1.cds;Parent=contig20.g61.t1 +# coding sequence = [atgtcaatgttaaaattgagtttgatggatgatagcaaagcgaggaaagaagttcaccgcatttatccttcgcaggggg +# ctttaaagctttccaaaatgattgttttccagcgaagtcaaccttatataacaaacggattaatagtatatagtcggatcgagccggatcgggcaact +# ttatcttacagctcccataggaacaattgcaaggttatacaaactttggcagaaaatttgtttcgaagtcccctcggatttgactcatttttccgtgg +# gctgccccgtgcaagggacgcgtcccagggaaatcgcatcggaaattcgctatttttccattga] +# protein sequence = [MSMLKLSLMDDSKARKEVHRIYPSQGALKLSKMIVFQRSQPYITNGLIVYSRIEPDRATLSYSSHRNNCKVIQTLAEN +# LFRSPLGFDSFFRGLPRARDASQGNRIGNSLFFH] +# end gene contig20.g61 +### +# start gene contig20.g62 +contig20 AUGUSTUS gene 6767 29138 1 + . ID=contig20.g62 +contig20 AUGUSTUS transcript 6767 29138 . + . 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ID=contig21.g64 +contig21 AUGUSTUS transcript 2674 10166 . + . 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ID=contig21.g65 +contig21 AUGUSTUS transcript 14668 40830 . - . 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[MSAVIRGCVRAEAAWKTKFKNGRQNAKNTLKTPSGEIVGPTISLGVRESTSEDQKTEHVLQAEDHNCATRLSIDLEDN +# VDHHVANNFSGFRWKRVLNPTGPQPRPRHGHRAINIKELMVVFGGGNEGIVDELHVYNTVTNQWYVPVLKGDVPNGCAAYGFVVEGTRMFVFGGMIEY +# GKYSNELYELQATKWEWRKIYLNDLYILDTRGVHSHNGKWIVPKTYGDSPPPRESHTGISFASKGSGNLNLLIYGGMSGCRLGDLWLLDTDTMTWDNV +# TLDTVEENVPRARAGHCAVGIQSRLYVWSGRDGYRKAWNNQVRVCCKDLWYLEVSKPLYAVKVALVRASTHALELSWTATTFAAAYVLQIQKIDQPPT +# AISKPLNQNSLHQGTAAPAETSATVTENCSESALTFGVEATSTALKLEKNTTQASGPPETNIQPSVNDLLQSISPPSSPISRVHKKTSASVGGSSLSI +# SATSAHPQKSVISSTAVVAGNNTTTNSSAVSNILQKFRPALSSVRSSTTTTIAGGFSVADPLAMRVPSTMANVVLSSVASSSALRIVPSVTASQAVRL +# ASAHQSSNSGSGSVVNILKTVPSAAAQSQPTAQATTSIGTKQYFIQKPLTLAPNVQLQFVKTSSGGMTVQTLPKVSFNAPKGNTSHGISITNPQSASG +# TNQIQGSTLPGNQLQKPIVSGNVLKLVSPHTMASGKLIMKNSNILQMGKVTPNVMGGKPAFVITNKQGAQLGNQQIIIVTTGGSMRNVPANTIMTSAG +# GPTSGTNIVSIVSSTSTTATPLQAIGGQRTVISNQSGVKMVRNISTVQASTSVAVGQKPSGTPIHQKTALFIGGKAVTVMSTNASMATSGSISNKVMV +# LPGTSSTNTPASSAALSNRKSFVFNAGGSHRAVTLATKSVNAKLTPPAQSLKDSVSETYIPVTTIKDTDPMDDIIEQLDGAGDLRKLSGSEAQHGSGE +# 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ID=contig25.g81.t1;Parent=contig25.g81 +contig25 AUGUSTUS start_codon 544 546 . + 0 Parent=contig25.g81.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 544 561 . + 0 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 3018 3343 . + 0 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 8433 8517 . + 1 ID=contig25.g81.t1.cds;Parent=contig25.g81.t1 +# coding sequence = [atgacagcggcggcgcagaccattcgattccgagaatgtgtgcgagccaaatatgtctggcccatgccgcgcttcagat +# gcgttttcggtgcatcatcccttacgccaccccctgatagctttcgcatcggcagacatgcgaggggcagcaagtgctggtccggctgcactcggcgt +# tgctcgtcggctccgagtctggctccgggtccggtcatcgctgcactttccgcagtaacatcccttatatggcggcagggcggcagtgatgaccgctg +# caaccacccggtgaaccaccccacttaccccactgccgcctggctgcaaccaaagcagaccaggtcctgttcctatgaaaactataagatatacttgt +# ccgatccggctgtttccgacttatactctaaatgcaaagaaagaagacctttgtga] +# protein sequence = [MTAAAQTIRFRECVRAKYVWPMPRFRCVFGASSLTPPPDSFRIGRHARGSKCWSGCTRRCSSAPSLAPGPVIAALSAV +# TSLIWRQGGSDDRCNHPVNHPTYPTAAWLQPKQTRSCSYENYKIYLSDPAVSDLYSKCKERRPL] +# end gene contig25.g81 +### +# start gene contig25.g82 +contig25 AUGUSTUS gene 11809 55293 1 - . ID=contig25.g82 +contig25 AUGUSTUS transcript 11809 55293 . - . ID=contig25.g82.t1;Parent=contig25.g82 +contig25 AUGUSTUS CDS 11809 12192 . - 0 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 12779 12933 . - 2 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 17303 17364 . - 1 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 18914 18990 . - 0 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 44227 44302 . - 1 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 55154 55293 . - 0 ID=contig25.g82.t1.cds;Parent=contig25.g82.t1 +contig25 AUGUSTUS start_codon 55291 55293 . - 0 Parent=contig25.g82.t1 +# coding sequence = [atgtatggctcctttcgcccgtgtgtgagcttaaaatcaactgcggcggctcgaagcagaactcgaaatgagacagtgc +# gagggaaaatgcttgccaaaagctcatacgttccaaacacacatgtgagagaggatgtgtggtatcagaaagctttgtacaaacaatgcacccatgga +# gaacgacctgcaagtgtattgaaacttcggcttgccgtaatctgggtacagaaaagtattgaaccattcaaacggcatttaaattacctttcaattga +# agccaaagtctacaagaacgtatttgctcatgaaggtgggcttagtgctttgttttatgtgcttcggagcggcctgaaagaacgcaataatctgctgg +# ccaaatctctcttcctagcttttaaaggttccgagatctacgcattcatgcggacggacacgtttagtgatcctgatatccataacattaccgagaaa +# ggaatctgggctcggcagctagagattcctgaccttgcatgcctcttcctgacccttttgcagcgagctgtccgctttatgcataaattaaggagtac +# cagcgaccctaggcgcaaacagggcaccactgacactgatcgccgatcccggcgataccggtggcggtaccgttacgcactggagccgcgttcgcacc +# ggcgccggtgccatctggcactgcgtcccttgaaactcgaacgaaccgtccgtcgcatttgttctgcgcgggaatggattggaggggactggaccggg +# ttggggctggggctgggtgacctagccctgaaggggttgctgctgcagtgcctgcgctcgcgcctgcgcctgcgcaaccctgagctcacgtgtatctg +# tgcgctcgtacaccgagaaaaatcaatctaa] +# protein sequence = [MYGSFRPCVSLKSTAAARSRTRNETVRGKMLAKSSYVPNTHVREDVWYQKALYKQCTHGERPASVLKLRLAVIWVQKS +# IEPFKRHLNYLSIEAKVYKNVFAHEGGLSALFYVLRSGLKERNNLLAKSLFLAFKGSEIYAFMRTDTFSDPDIHNITEKGIWARQLEIPDLACLFLTL +# LQRAVRFMHKLRSTSDPRRKQGTTDTDRRSRRYRWRYRYALEPRSHRRRCHLALRPLKLERTVRRICSAREWIGGDWTGLGLGLGDLALKGLLLQCLR +# SRLRLRNPELTCICALVHREKSI] +# end gene contig25.g82 +### +# start gene contig25.g83 +contig25 AUGUSTUS gene 63496 72873 1 - . ID=contig25.g83 +contig25 AUGUSTUS transcript 63496 72873 . - . ID=contig25.g83.t1;Parent=contig25.g83 +contig25 AUGUSTUS CDS 63496 65052 . - 0 ID=contig25.g83.t1.cds;Parent=contig25.g83.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 66165 67777 . - 2 ID=contig25.g83.t1.cds;Parent=contig25.g83.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 70910 71039 . - 0 ID=contig25.g83.t1.cds;Parent=contig25.g83.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 71539 71597 . - 2 ID=contig25.g83.t1.cds;Parent=contig25.g83.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 72321 72873 . - 0 ID=contig25.g83.t1.cds;Parent=contig25.g83.t1 +contig25 AUGUSTUS start_codon 72871 72873 . - 0 Parent=contig25.g83.t1 +# coding sequence = [atgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtgcatctggagtaggga +# tcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccgggtaagtcttgtacctttctt +# ttcctttacgaagtcccataccaattgtctgtgcttccagatcaaataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtga +# taaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagttgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggta +# caccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcctggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcct +# gctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgctaagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgccgaaaaattggatat +# ctgttacgtagtcagaagaaaacaactattagacaacaaaaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaaggg +# aaaatcactctccaaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgacc +# gatagtatccccgaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattga +# atctttaaataacccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtg +# gggctggtaaccttttgacaggaactggcaatctaccatcctctggtggcagcaattgcttagattacatgcaacagcagaatcacatatttgtattt +# tcaactcaactggctaacaaaggagccgaatcagttttgagtggtcagtttcaaaccattattgcgtatcactgcacccagccagcgacaaaaaactt +# tctagaagactttttcatgaaaaatcctctaaagatgaacaagttgcagcgccacagtgccttgggtatgccatggataggcatgggacccggaggac +# aaactccccctaatcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaat +# agcaaacgtagttctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaag +# cagcggtgccagtggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctg +# gtgttgatttgggccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaac +# cttacaccacaacagcgtcagcaccgggaagagcagctcgcgaaactaaagaaaatgaatcaatttctttttccagaaaatgaaaattcagtaggaac +# aattgtaagttcacagatgcagaaaataccaggtgacctgatgatgggtattccgggtggcggaggatctataataaattctcaattgcggcaaatgc +# atatgccaggaaacgcgaagcaggaactttcgacgggtacaagctcagggctcccagaggaggttatgcttcctgtcgatgtcatatcagatataaat +# tctgcaatgggatgcaataacagtcaaaaaagcagtctgcaatgcggatctggaggagcagctggtcctgtgactggaacttctacaggggcgataaa +# cgtcaatatgcactgttcgagctctgtcacttcaagtggcaatatgatgggaagctcaacgaatatgctggcttcttttggtaacacaaactgcaatg +# ttaacgtcatcggatcggtaccagatatgtcaaaggagctttcaggtcaagatagcctcttgcatccactccaaggcactcaaattgagtggtcaaag +# atccaacagcaattctttgaagagcgcataaaggggggaaaagcgagacaagcgactggacctgtcgccccacctcagcacaccaactctgggacagg +# cagcaatgcgtcaagtagtcaaagacaagctcctgctcaaggaggttccgtacaatttagtaggcgttctgataatattccactaaatcccaacagtg +# gaaatcggcctccacaaaacaaaatgacacagaacttcgatccaatctcttctctggcgcaaatgtctcaacaattaacaagctgcgtgtctagtatg +# ggtagtccggccggttctagtggaatgtctatgatgggcggaccgacagatatcaatatggagcatgcaatgatttcaggattagaaggaccaggaat +# ggatgttattaatcaaaataactgtcatccaatgaatgccgtcatgaactccatgggtcagcgaatgatgaatccaaagatgtgcgttccaggcggtc +# cgagtagtctgcctggcttcaaccctaattctcccaatggtgtgttaagagagagtcccctggggcctggtccagttcctggtcctgggccaatgaac +# tctccaaactttcaaggggttttgcctcctggtgcaagaatgatgggtcgaatgccaatcggttttggttcgaatttcaatcctaatatacaggtaaa +# ggcaagtactccaaacaccatacagtacatgccagtaaggccgcaaaacgccagcaacaacaataacaatggtgctagcaacgttagaatgccaccta +# gtctagagtttttgcagaggtacgccaatccacaaatggcttctgtaggaaacggttctccgatctgtcctccatctagtggcgacggtggtccggga +# atgccgggaatgatggtgggctcagggtcagggccaatgcttatgaactcttccggcgaccaccagaacaagatttcgaacaaccctggagcgggcaa +# cggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatgatgtggcaatgaatattggccaaccgt +# ctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtcaacagacagattccgtttgcacatggg +# ccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccgcctatgtttactgcatcacaacagtc +# taatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagttggacctgcagtttcacaaggacaga +# tccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaatgcccactgctggaaatgtcgttcca +# acgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcacagtttccagcagcaattatacgcaac +# aaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaacttatctccaactccagcgttctttg +# tgaacaaatga] +# protein sequence = [MPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPGKSCTFLFLYEVPYQLSVLPDQIKVM +# PDEGAEKNGLSSSDKGVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKK +# NSVKDEDVAEKLDICYVVRRKQLLDNKKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMG +# IEGVNCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQT +# IIAYHCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLS +# NEGELMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKM +# NQFLFPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGG +# AAGPVTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQAT +# GPVAPPQHTNSGTGSNASSSQRQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDIN +# MEHAMISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMP +# IGFGSNFNPNIQVKASTPNTIQYMPVRPQNASNNNNNGASNVRMPPSLEFLQRYANPQMASVGNGSPICPPSSGDGGPGMPGMMVGSGSGPMLMNSSG +# DHQNKISNNPGAGNGINFFQNCNQMGIIDDEGGLASHDVAMNIGQPSMIRGMRPHGMRPHAMAPRMQASVNRQIPFAHGPDGLDCVGDTSAFFNNATC +# NSTGPPMFTASQQSNQAKPQHLKNIPTGLCQNQTGLGVGPAVSQGQIQLQGQGQGQGQGQTLIGPSNNNLMPTAGNVVPTNGVSGINFVGPSSNDLKY +# AQQYHSFQQQLYATNTRSQQQQQMHQQQQSNMLTMPPNLSPTPAFFVNK] +# end gene contig25.g83 +### +# +# ----- prediction on sequence number 26 (length = 40013, name = contig26) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 26 on both strands +# start gene contig26.g84 +contig26 AUGUSTUS gene 4225 5278 1 - . 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ID=contig26.g85 +contig26 AUGUSTUS transcript 13481 22858 . - . ID=contig26.g85.t1;Parent=contig26.g85 +contig26 AUGUSTUS CDS 13481 15037 . - 0 ID=contig26.g85.t1.cds;Parent=contig26.g85.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 16150 17762 . - 2 ID=contig26.g85.t1.cds;Parent=contig26.g85.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 20895 21024 . - 0 ID=contig26.g85.t1.cds;Parent=contig26.g85.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 21524 21582 . - 2 ID=contig26.g85.t1.cds;Parent=contig26.g85.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 22306 22858 . - 0 ID=contig26.g85.t1.cds;Parent=contig26.g85.t1 +contig26 AUGUSTUS start_codon 22856 22858 . - 0 Parent=contig26.g85.t1 +# coding sequence = [atgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtgcatctggagtaggga +# tcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccgggtaagtcttgtacctttctt +# ttcctttacgaagtcccataccaattgtctgtgcttccagatcaaataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtga +# taaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagttgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggta +# caccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcctggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcct +# gctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgctaagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgccgaaaaattggatat +# ctgttacgtagtcagaagaaaacaactattagacaacaaaaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaaggg +# aaaatcactctccaaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgacc +# gatagtatccccgaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattga +# atctttaaataacccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtg +# gggctggtaaccttttgacaggaactggcaatctaccatcctctggtggcagcaattgcttagattacatgcaacagcagaatcacatatttgtattt +# tcaactcaactggctaacaaaggagccgaatcagttttgagtggtcagtttcaaaccattattgcgtatcactgcacccagccagcgacaaaaaactt +# tctagaagactttttcatgaaaaatcctctaaagatgaacaagttgcagcgccacagtgccttgggtatgccatggataggcatgggacccggaggac +# aaactccccctaatcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaat +# agcaaacgtagttctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaag +# cagcggtgccagtggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctg +# gtgttgatttgggccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaac +# cttacaccacaacagcgtcagcaccgggaagagcagctcgcgaaactaaagaaaatgaatcaatttctttttccagaaaatgaaaattcagtaggaac +# aattgtaagttcacagatgcagaaaataccaggtgacctgatgatgggtattccgggtggcggaggatctataataaattctcaattgcggcaaatgc +# atatgccaggaaacgcgaagcaggaactttcgacgggtacaagctcagggctcccagaggaggttatgcttcctgtcgatgtcatatcagatataaat +# tctgcaatgggatgcaataacagtcaaaaaagcagtctgcaatgcggatctggaggagcagctggtcctgtgactggaacttctacaggggcgataaa +# cgtcaatatgcactgttcgagctctgtcacttcaagtggcaatatgatgggaagctcaacgaatatgctggcttcttttggtaacacaaactgcaatg +# ttaacgtcatcggatcggtaccagatatgtcaaaggagctttcaggtcaagatagcctcttgcatccactccaaggcactcaaattgagtggtcaaag +# atccaacagcaattctttgaagagcgcataaaggggggaaaagcgagacaagcgactggacctgtcgccccacctcagcacaccaactctgggacagg +# cagcaatgcgtcaagtagtcaaagacaagctcctgctcaaggaggttccgtacaatttagtaggcgttctgataatattccactaaatcccaacagtg +# gaaatcggcctccacaaaacaaaatgacacagaacttcgatccaatctcttctctggcgcaaatgtctcaacaattaacaagctgcgtgtctagtatg +# ggtagtccggccggttctagtggaatgtctatgatgggcggaccgacagatatcaatatggagcatgcaatgatttcaggattagaaggaccaggaat +# ggatgttattaatcaaaataactgtcatccaatgaatgccgtcatgaactccatgggtcagcgaatgatgaatccaaagatgtgcgttccaggcggtc +# cgagtagtctgcctggcttcaaccctaattctcccaatggtgtgttaagagagagtcccctggggcctggtccagttcctggtcctgggccaatgaac +# tctccaaactttcaaggggttttgcctcctggtgcaagaatgatgggtcgaatgccaatcggttttggttcgaatttcaatcctaatatacaggtaaa +# ggcaagtactccaaacaccatacagtacatgccagtaaggccgcaaaacgccagcaacaacaataacaatggtgctagcaacgttagaatgccaccta +# gtctagagtttttgcagaggtacgccaatccacaaatggcttctgtaggaaacggttctccgatctgtcctccatctagtggcgacggtggtccggga +# atgccgggaatgatggtgggctcagggtcagggccaatgcttatgaactcttccggcgaccaccagaacaagatttcgaacaaccctggagcgggcaa +# cggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatgatgtggcaatgaatattggccaaccgt +# ctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtcaacagacagattccgtttgcacatggg +# ccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccgcctatgtttactgcatcacaacagtc +# taatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagttggacctgcagtttcacaaggacaga +# tccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaatgcccactgctggaaatgtcgttcca +# acgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcacagtttccagcagcaattatacgcaac +# aaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaacttatctccaactccagcgttctttg +# tgaacaaatga] +# protein sequence = [MPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPGKSCTFLFLYEVPYQLSVLPDQIKVM +# PDEGAEKNGLSSSDKGVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKK +# NSVKDEDVAEKLDICYVVRRKQLLDNKKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMG +# IEGVNCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQT +# IIAYHCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLS +# NEGELMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKM +# NQFLFPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGG +# AAGPVTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQAT +# GPVAPPQHTNSGTGSNASSSQRQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDIN +# MEHAMISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMP +# 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sequence = [MHLQDYLRNDENASSPGDGNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANA +# ENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKVPSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKRY +# NDFSQKFATQWTRFRHHKVVRKIGGGGFGEIYEGQDLITREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHVCRFIGCGRNDRFNYVVMQLQGKNLA +# ELRRAQPRGAFSLSTTLRLGLQILKAIESIHSVGFLHRDIKPSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTVRYASINAHRN +# REMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLTKEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRGVKESDPYDWE +# KVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASNASGTEYLSLEARSFSIIDAVFLQYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKF +# VDSNDAECANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQVQKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPS +# SSNAGPAAGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSATSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSAL +# QQVTKGGALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQPNLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKRYTLNITGIENYEALRI +# SIPHCWSEPAMGNVLRKDLEPPAVQQAAFDDTVYRMDIARNVCVRETYSDITPLDKAKPATSLVSRVVLPSPFKEDATFQLNTSNNSQAKLKHRRSLP +# NVSVADLFDDQPIHSNSDAMLAEDANKPWKVQTMACQRSNVALSSAVQENNGCISGRLEIRVIPKDPGISDKANIFCDEIEENAAVIALPSNTANKCK +# KQTYTDKTEACIEANPCSIHATGVNNLKINGKSETCNALNDQPNYKSGLNILHPFQANKIKCIRMYGWYANAARPYWTLPITQTIGYSCTLSAPLELL +# QDIMQKFTQEFARDLHCNMEHANRIEPSLRDAQLSMKNLNINIQELLDYIGNVEPVGFTRDVPHFPIRKAINMNFLKPGSAETLTRPVYIFEYLPPMQ +# DPEPRESQSEAQREFFQKQELVSKAEFNVTSSAEKLSTNQVDSSSPNAVINFSSNFLDSDVGRSVREMSSVVMTTGGFISPAIEGKLPEPFIPDIIGT +# S] +# end gene contig27.g91 +### +# +# ----- prediction on sequence number 28 (length = 50013, name = contig28) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 28 on both strands +# start gene contig28.g92 +contig28 AUGUSTUS gene 2984 7899 1 - . 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ID=contig28.g93 +contig28 AUGUSTUS transcript 8157 40724 . - . 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AUGUSTUS CDS 28180 28545 . - 0 ID=contig28.g93.t1.cds;Parent=contig28.g93.t1 +contig28 AUGUSTUS CDS 29858 29917 . - 0 ID=contig28.g93.t1.cds;Parent=contig28.g93.t1 +contig28 AUGUSTUS CDS 30540 31038 . - 1 ID=contig28.g93.t1.cds;Parent=contig28.g93.t1 +contig28 AUGUSTUS CDS 40522 40724 . - 0 ID=contig28.g93.t1.cds;Parent=contig28.g93.t1 +contig28 AUGUSTUS start_codon 40722 40724 . - 0 Parent=contig28.g93.t1 +# coding sequence = [atggtcgctgcgtcgagccaccagaagaactgcaccagctccagctccacctccacggatcctcttccattgacaagga +# atgagaaccggaaatgcgcgcactgccgcaagtccttcatctcggctaagggattgagcagtcacgaagcgaagtgcactgcaggacgcaataatagc +# agtccaaaccatgttaaattttcaagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagcctccttgcaatcagga +# gcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctcgcgggtgctatcctgc +# aatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgccctgcagaggtcggcc +# 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cagcatggtcaaatttttggaataactctcatgccacaagttaatcgacgttcggcaacgtctaccaatttaagaccatcttcctctggcggaaacac +# aaatccaattcatagaatcaatattggatcagcaggtggtggaggtggaactggaagcaacaccgccagaagcagtgttgcaggtgatcattcggtga +# ctcaatttgctttaatagacgacgagaatgtctcagcattacaacaggtaaccaaaggcggagctcttacgctggcatcacaatggaagagccagttt +# gatgactcagaggacactacagataacgaatggaacagagaaccacagtcgcaacccaatttggagcaattgattaaactggatattccattgccctt +# aaatgaagccaagcatttttgccaaaatgtcgtcactgatacaggcatattaactaaacctccaatcgaagggaacgaaaaaccgaaaagatatacat +# taaacataactggaatcgagaattatgaagcgttgagaatctccataccgcactgttggtctgagcctgcaatgggtaatgtattacgtaaagacttg +# gaaccaccggctgtgcaacaagcagcatttgatgacacagtatatcgcatggacatagcaaggaatgtttgtgttcgagaaacatattcagatatcac +# tccattggataaagctaagcctgccacttctttagtttcaagggttgtccttccttccccttttaaagaggacgccacgtttcagttaaatacttcaa +# ataatagtcaagctaaattgaaacatcgaagaagccttcctaacgtgtcggttgccgatttatttgacgaccaaccgattcattcgaattctgatgca +# atgttggctgaagacgccaataaaccatggaaagtacagacaatggcttgccaaagaagtaatgtagctttaagttcagcagtccaagaaaacaacgg +# ttgtataagtggccgactggaaattcgtgttatcccaaaagaccctggcatttctgataaagcaaatattttctgtgatgaaatagaagaaaatgctg +# cagtgatagctttaccatcaaatacggcgaacaaatgtaagaaacaaacctacacggacaaaaccgaagcttgtatcgaagctaatccctgtagcata +# catgctaccggcgtcaataacctgaagataaacggaaaaagtgaaacatgcaatgcgttgaatgatcaaccaaattacaaatcaggcctaaacatttt +# acatccttttcaagccaacaagatcaagtgcattcgaatgtatggctggtatgcaaacgctgcgcgtccgtattggacgctgcctataacacaaacta +# taggttacagctgcacactgagtgccccattagagttgttgcaagacataatgcagaagtttacgcaggagtttgcccgagatctgcactgtaatatg +# gaacatgcaaatcggatcgagcccagtcttagagatgcacagctcagtatgaaaaatcttaacattaatattcaagaactgttggattacattgggaa +# tgtggagcctgtcggtttcaccagggatgtgccccattttcccatcagaaaagctataaatatgaactttctcaagcctggaagcgcagaaactctga +# cacgtcccgtctatatatttgagtatttgccgccaatgcaagaccctgagccgcgggagagtcagagcgaggctcaaagggaattttttcaaaaacaa +# gaattagtgtccaaggcagagttcaatgtgacaagttcggcggaaaaactaagcaccaatcaagtcgattcctcttctcccaacgcggtgataaactt +# ttcatcgaatttcttagactcggatgttggtcgttcagtccgtgaaatgagcagcgttgttatgactacaggcggatttattagtccagccatcgaag +# gaaaactgccagagccctttataccggatataattggtacgtcctag] +# protein sequence = [MVAASSHQKNCTSSSSTSTDPLPLTRNENRKCAHCRKSFISAKGLSSHEAKCTAGRNNSSPNHVKFSRNDENASSPGD +# GNHNHTCQPPCNQEQYISLNRDCQKNLFRLHPPPPSKPPPLAGAILQSRLLKQISSGANAENAEALEEHRYPNALQRSATLPAKHNRLGVRSRVTFKV +# PSSITPAVDPGSEPDPGQNQVVAAERDGIVLNPKERESCKMTSEDLLQPGHVVKERWKRYNDFSQKFATQWTRFRHHKVVRKIGGGGFGEIYEGQDLI +# TREQVALKVESARQPKQVLKMEVAVLKKLQGKEHVCRFIGCGRNDRFNYVVMQLQGKNLAELRRAQPRGAFSLSTTLRLGLQILKAIESIHSVGFLHR +# DIKPSNFSVGRLPYNCRRVYMLDFGLARQYTTGTGEVRCPRAAAGFRGTVRYASINAHRNREMGRHDDLWSLFYMLVEFVNGQLPWRKIKDKEQVGLT +# KEKYDHRILLKHLPSDLKQFLEHIQSLTYADRPDYAMLIGLFERCMKRRGVKESDPYDWEKVDSATIGNISTSGNPPVPVKNDYIHGNITQMTVAASN +# ASGTEYLSLEARSFSIIDAVFLQYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAECANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQV +# 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11029 . - 1 ID=contig29.g96.t1.cds;Parent=contig29.g96.t1 +contig29 AUGUSTUS CDS 20513 20715 . - 0 ID=contig29.g96.t1.cds;Parent=contig29.g96.t1 +contig29 AUGUSTUS start_codon 20713 20715 . - 0 Parent=contig29.g96.t1 +# coding sequence = [atggtcgctgcgtcgagccaccagaagaactgcaccagctccagctccacctccacggatcctcttccattgacaagga +# atgagaaccggaaatgcgcgcactgccgcaagtccttcatctcggctaagggattgagcagtcacgaagcgaagtgcactgcaggacgcaataatagc +# agtccaaaccatgttaaattttcaagaaacgacgaaaatgcatcatcaccaggcgatggtaatcacaaccatacatgtcagcctccttgcaatcagga +# gcagtacataagtcttaatcgtgattgccagaagaatctgtttaggcttcatccaccgcccccatcgaaaccaccgccgctcgcgggtgctatcctgc +# aatcccgtcttttaaagcagatcagctcgggggcgaatgcagaaaacgcagaagcactagaggagcaccgatatccaaatgccctgcagaggtcggcc +# actttgccagcgaagcacaaccgcctaggggttcgtagccgcgttacttttaaggttccatcgtccatcacccctgcagttgatcccggttcagaacc +# tgatccaggccaaaatcaggtcgttgctgccgaaagggacggaatcgtgctaaatcccaaggagagggaatcttgcaaaatgacttctgaagatttgc +# 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ASGTEYLSLEARSFSIIDAVFLQYLQLEDKAPNMFLPTKPNAESESTVDVAPKSIFEEKFVDSNDAECANKAFLSGEQQQQKSQVKKLNLPESANQQV +# QKLENVANEKSSEDKRASQEPKSTFGRLRVLTAPPMSVHDLTTGGHIQQGTDLSIKQDPSSSNAGPAAGNSSSSKLAINQHGQIFGITLMPQVNRRSA +# TSTNLRPSSSGGNTNPIHRINIGSAGGGGGTGSNTARSSVAGDHSVTQFALIDDENVSALQQVTKGGALTLASQWKSQFDDSEDTTDNEWNREPQSQP +# NLEQLIKLDIPLPLNEAKHFCQNVVTDTGILTKPPIEGNEKPKRYTLNITGIENYEALRISIPHCWSEPAMGNVLRKDLEPPAVQQAAFDDTVYRMDI +# ARNVCVRETYSDITPLDKAKPATSLVSRVVLPSPFKEDATFQLNTSNNSQAKLKHRRSLPNVSVADLFDDQPIHSNSDAMLAEDANKPWKVQTMACQR +# SNVALSSAVQENNGCISGRLEIRVIPKDPGISDKANIFCDEIEENAAVIALPSNTANKCKKQTYTDKTEACIEANPCSIHATGVNNLKINGKSETCNA +# LNDQPNYKSAKSQYGSQNVHLGPVLTLQYIHLRHWSPETPFRKFPSIPKQTHTPLL] +# end gene contig29.g96 +### +# start gene contig29.g97 +contig29 AUGUSTUS gene 20740 46459 1 - . 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ID=contig31.g103 +contig31 AUGUSTUS transcript 36347 37153 . - . ID=contig31.g103.t1;Parent=contig31.g103 +contig31 AUGUSTUS CDS 36347 37153 . - 0 ID=contig31.g103.t1.cds;Parent=contig31.g103.t1 +contig31 AUGUSTUS start_codon 37151 37153 . - 0 Parent=contig31.g103.t1 +# coding sequence = [atggccctttttgacgaggaggaggggtacgtcaatccagccatcgacaacgaaaggtacgaggacaagtacttgcagg +# caagtacattatttcgcaacctgattcgtacctgtgaagaagctcaggagaatggaagagaaggcaactttagacaatctggcaaccctgacgaggcc +# gcattaatggcgtcaggagtgggaagcgaaaacctagttcgttttcttgaacaacaacagcagctcaatgagcgtttggctgagcaacaagccacgct +# tttgagggcaaactcggcagcaactgtaatgcataataaactgccaaaaatcgacatcaagctgttcactggcgactacaaggagtggccacgcttca +# agaacatatacgagagcacaatccatagcaagcagcatttgacagcaatacaaaagttgcactacttaaaaacgtacatcactggagaagcggctgac +# ttgattcgccatatgcaaattacggatgcagcttacgaggctgcttggacttgcctgattgatcgctacaatagaccacgtcacattgttaacactct +# gctggagacatttgtcaacttaccttcgaccgccagagcagatgtaatagttctgcgcaaggtgacggacggagccaccgaaattgtacgcggcctgg +# atgcatcagggcaaactcagggggactgctgggttatacactttattctcggtaagatcgatgctgaaacccgtcgcaaatggatcgaaggaagccgg +# gatctggaatctccgtctgtggatgatcttcacaagttttaa] +# protein sequence = [MALFDEEEGYVNPAIDNERYEDKYLQASTLFRNLIRTCEEAQENGREGNFRQSGNPDEAALMASGVGSENLVRFLEQQ +# QQLNERLAEQQATLLRANSAATVMHNKLPKIDIKLFTGDYKEWPRFKNIYESTIHSKQHLTAIQKLHYLKTYITGEAADLIRHMQITDAAYEAAWTCL +# IDRYNRPRHIVNTLLETFVNLPSTARADVIVLRKVTDGATEIVRGLDASGQTQGDCWVIHFILGKIDAETRRKWIEGSRDLESPSVDDLHKF] +# end gene contig31.g103 +### +# +# ----- prediction on sequence number 32 (length = 40014, name = contig32) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 32 on both strands +# start gene contig32.g104 +contig32 AUGUSTUS gene 3187 3519 1 - . ID=contig32.g104 +contig32 AUGUSTUS transcript 3187 3519 . - . ID=contig32.g104.t1;Parent=contig32.g104 +contig32 AUGUSTUS CDS 3187 3519 . - 0 ID=contig32.g104.t1.cds;Parent=contig32.g104.t1 +contig32 AUGUSTUS start_codon 3517 3519 . - 0 Parent=contig32.g104.t1 +# coding sequence = [atgtccctgcgaggaaagtgctcacagatcttcagcaataatgagccgaatttcgttggtgccaaacggactttggatg +# agatgcagcaacttttttcttcgcaggagcatcaacgcaatgtaacacaatcgctggccaatggtggaatcaagtggagtttcatacctccccattcg +# ccacgttggggagggaagtgggagtcatcagtacgctccgtgaaattacatctgcgtcgtgtcgtgggaaaaaatgttctaacctttgaacagatgca +# aactgtgattgctcagatcagtgctatggtgaactcggccgctatgctacacacctga] +# protein sequence = [MSLRGKCSQIFSNNEPNFVGAKRTLDEMQQLFSSQEHQRNVTQSLANGGIKWSFIPPHSPRWGGKWESSVRSVKLHLR +# RVVGKNVLTFEQMQTVIAQISAMVNSAAMLHT] +# end gene contig32.g104 +### +# start gene contig32.g105 +contig32 AUGUSTUS gene 4591 5301 1 - . ID=contig32.g105 +contig32 AUGUSTUS transcript 4591 5301 . - . 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ID=contig32.g106 +contig32 AUGUSTUS transcript 6336 7142 . - . 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aacagcagccagggcagtgatgtggacagtccgattgagccagatttggatccgaatgcaagaatctcagaaagtaaggcggatgattatgctgatat +# ggaaaatcatctcccaggcaattgcaacagcgtcattgaaggggcatcatctggggacatctcaaagataaaaggtccagaaaaattagttcaattcg +# aaaagaactgctatgtgcccccggatcaggcgctggttactagtgtggaattggtagttccagctcctcagaactcatcgttaagcatacaggttggg +# cgctccgaggagacaaaacaaagcgcccttagagaaccctcggaagcttcgtcatcgaccattgataacaaactgcagtatagtacgtctggtcctta +# caactctagtagctccacaaatatattagcaaacgataaaatcgatggttgtgcaaatgactcttccaatttgaacttaagaactcctactaagttag +# cagtaacaacagcaacgagtgatattttgaataatgatcgaagggcttctttatgggcgcctcaccatgaccagtcgaggcaaacgcagcagcagtcg +# agtgagcctaagcaagagcctgtgagtgttagctccgaactgtcataccagctgcagcatcgtcaatcggaactacttctgcaagttgagaaggagat +# ctcaggaacgggtgctttttctcaggcaattccattgcagcatcaacataataatggtattcatgagcaatatggccaaggagaggcgtcttctatca +# tgggaaaccagatgcatcaaagtttttatacacaaatgatgcatcagcagaatctacatccaagtcagcatcaacaaagcatgcatgaacattgtcct +# cgacttcagcagcatacaggttatacaagctatatcccccattatcagaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagca +# ccagcagcagccaccttctcaacatcccatggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatg +# aacggcagcaaattcatcaacaccagcatcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgag +# gagcctagcacagcgtttaaattaacgctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaac +# accaaattctcatagctcttccacacactctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccg +# atgagcttggattagcaaagaaccttcttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacc +# cagacacatctcgagctgagtggagacacacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattc +# cccagtcaatcgacctatggagacggtaactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccc +# taagcggagaattataccaacacacccatcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaa +# 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cgacttcagcagcatacaggttatacaagctatatcccccattatcagaattctccgttgtttggtactcatcaaagtgatcatatccaacgacagca +# ccagcagcagccaccttctcaacatcccatggaatgtcatgcgaatttgcatcaatcagcatctatttcacagcaacacgaacaacatttgcaacatg +# aacggcagcaaattcatcaacaccagcatcaaccgacacagcaacaccatccactgcacgaaaactaccatgatattattatggaggaattccatgag +# gagcctagcacagcgtttaaattaacgctctccccaagtaacgctaaacctgagaatcaagatgacggttatgagacgagcgcgggcgacgttttaac +# accaaattctcatagctcttccacacactctgttacccctcagcatcaaatgcaacatcctaacatcgtgcttatccatcagaatcagaagaaacccg +# atgagcttggattagcaaagaaccttcttaccggtgaagctcacgctgaccccgctacgtgctcatccaacggtattcaaggacagcttcatgccacc +# cagacacatctcgagctgagtggagacacacgatgctcaagccatacctcggctgtcaacccctacagttttatgggtgaggagatgcgtatgcattc +# cccagtcaatcgacctatggagacggtaactactgaaacggctcggtacgcgtcggttccagcgccaatgtcaacttcaaatggcaatcaagagtccc +# taagcggagaattataccaacacacccatcatagtacaagtatcttggaaccaactgaaagctctcaatgtgacttgcattctaagccaacgccaaaa +# 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ID=contig34.g115 +contig34 AUGUSTUS transcript 13613 35714 . + . 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acggttttgctatcaaccatgtctagttgcgccaaaacgttctacatgcattggaatacatcgaacagcatatttcggattgataataccgatcatat +# aatcgatgttaataaaggcaatcttgcatttgagtttgaccaggttcatataatatgcccagtttatgaaccgggaacttttgaaaatgaaaccgaga +# aatatataatttacaatgtgtctaaagtggagtatgaaacatgtcgcataacaaatgcagatccgcgagtaatagctatatgtgataaacctcagaaa +# ttaatgttttttacaataactttccggccatttacaccgcagccaggtggcttggagttcctacctggaaatgattattacttcatttcaacttcatc +# tagggatgatttatatcggcgtattggaggtcgatgctccacaaacaacatgaaagtagttttcaaagtttgttgcgccgccgaagaaaagaacaaaa +# ccactgcgataagcaaatctatatcaggtgcagacactggaggagccataaatgtcaatatagcagctaatgatgacagtcatgatcatagccaaggc +# aataataacattgctattggaaccagtattggtataaatggaggcataatttctggaggacatcagtccgcgggaatgccaatcaatccaattaacgg +# caatgctaacataaatggcatagcaactactgttaattcaaacactgatcagtttaaccggataccacttcaaccaaacgtaatcggaagcaatgcag +# gtaccaacgccgctattcctggagttgttaatggtggaggcattattttaactcctggacatggtcatggaaacattaatatgctacaaccaggacgc +# ggcggaatgaatatggcttaccccggacatcaccacattcaaactgggatcagaataaacaatgtcccgacgcagcacagctacccacctcacaaggg +# taatgttaacagcaatacgaacggaaatgacctttgtcaattagatgaaagtttttcccgactggccggatatgggtccagtcctgacgtgggatccc +# gttccctctgggctggtcagggtgttttacggtcaggttctgtaatcagttgctttttgttctgccaacaaagcctcaagcagtacatagcaaaacgc +# aaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccacatacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacatttaccggaagaaaatggatat +# ggaccgtgcgttccggcaatacgaacaagctatgggtacgtcagccagtttgggggaccgcatggctcaaatggaggctatggacggagctgcccgtt +# gcctggaaacactacgtcttcaaaacaaaatctgcaactgcagaccgttggagtttaacactcggcttctggaagttgctagctcaattggcgcaaag +# tttctggttcgtaagatccgttgtcgcttggctttgatctaccgcgctttgggggacgaggatcaatacaatactcattttcgtttggcaaaccaaac +# ggacgctgcgcttggcttgaactgcggagcgtgtggggagttgttcggtcttcggccagaaaatttggaagctttgccatgtgcacatattcttcatg +# caaggtgtgcttacgaaatattacgacgtcgggacaaaagtacaccgcgatcatgccccgcctgtaataagatggtgagttcacgcacacatctttgc +# ggctccataccggtagagagtgaaagtaccgacggaggcagcgccgtcacggttaccctcaacgccaacgctctctcagtcgatggtctcctgggaat +# aggctccgacatcctcctaccctcggccgcgttttcccacgccaacaaaccggcaccggataacgagaactgctctttgttgtctcccaaagttatgt +# accacagcaacttatccttgacttcgttaagtatgcgcgcatctagcctgacgatcgacagcggtcaaaatgttacttcctctgtgtga] +# protein sequence = [MHIFYGVGNVSFTALHTDANTAAISRSVFVRRLSIVPGLLTYTIDLTLPTGNNLPASNRKTKRGLFRKIKWSKTHTEL +# DDSQQPLLLALSNYKTRHQQKHHKIHLNSGSPLNIELYMSANVEGIPRARNRAPATTNNQQPAMHRKTKSKSKLETSKNFFTLHSSNDSDKYPSAEKS +# SALVETVEKCKGTSSGIGVKTSQHFQITKNQSYRNSRIKNRTRSYSASPTPAVRCKMMIPLPTFGATSFVTLLTLICMETVLLSTMSSCAKTFYMHWN +# TSNSIFRIDNTDHIIDVNKGNLAFEFDQVHIICPVYEPGTFENETEKYIIYNVSKVEYETCRITNADPRVIAICDKPQKLMFFTITFRPFTPQPGGLE +# FLPGNDYYFISTSSRDDLYRRIGGRCSTNNMKVVFKVCCAAEEKNKTTAISKSISGADTGGAINVNIAANDDSHDHSQGNNNIAIGTSIGINGGIISG +# GHQSAGMPINPINGNANINGIATTVNSNTDQFNRIPLQPNVIGSNAGTNAAIPGVVNGGGIILTPGHGHGNINMLQPGRGGMNMAYPGHHHIQTGIRI +# NNVPTQHSYPPHKGNVNSNTNGNDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKEATKLSLISGDQATYTRS +# IRVMGDIYRKKMDMDRAFRQYEQAMGTSASLGDRMAQMEAMDGAARCLETLRLQNKICNCRPLEFNTRLLEVASSIGAKFLVRKIRCRLALIYRALGD +# EDQYNTHFRLANQTDAALGLNCGACGELFGLRPENLEALPCAHILHARCAYEILRRRDKSTPRSCPACNKMVSSRTHLCGSIPVESESTDGGSAVTVT +# LNANALSVDGLLGIGSDILLPSAAFSHANKPAPDNENCSLLSPKVMYHSNLSLTSLSMRASSLTIDSGQNVTSSV] +# end gene contig34.g115 +### +# start gene contig34.g116 +contig34 AUGUSTUS gene 39193 43230 1 - . 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ID=contig34.g116.t1;Parent=contig34.g116 +contig34 AUGUSTUS CDS 39193 39600 . - 0 ID=contig34.g116.t1.cds;Parent=contig34.g116.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 41289 41557 . - 2 ID=contig34.g116.t1.cds;Parent=contig34.g116.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 42321 43230 . - 0 ID=contig34.g116.t1.cds;Parent=contig34.g116.t1 +contig34 AUGUSTUS start_codon 43228 43230 . - 0 Parent=contig34.g116.t1 +# coding sequence = [atgcaccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagat +# ctcggcttaacatgccgcctgagcggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaag +# cacggcaacggaagcgttgttagtctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccgg +# actcaaactgaatgagcgactgtccccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcc +# cgaacatccacggtaccccgcactcagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaag +# atttctgtccctgcctcgccaaaatcgtccgtaacctgtgcgggcggaggatcgagccgcaatggacacaccagcgacatggaggagatcaacacgaa +# agatctggctcagcgcatctcggcagaactgaaacggtacagcattccacaggcgatctttgcacagcgtgttctctgtcgctcgcaaggtactttgt +# ccgatctactgcgcaacccgaagccgtggtcgaagctcaagtccggcagggagacatttcgaaggatgtacaaatggctccaggagcccgagtttcag +# cgtatgtctgctctacggatggccgctgcacaaattcctcagcgaactttggggcctgggctggcacttggaccaacaacgggctccacatccgtcat +# accgaccgatttggattctcatgccgggccagcaatgacaccaaatgttctttttaataaccaattaaattacttcttttattttattcaacaatgtt +# ctggaacggcgtccatttaccaacctgacaaaacatcagctccgcccaatgaatcggcctcttcgtctgcatctacacctgtcacaaacgtgtccgtt +# gcgaacgtcgttagttgtcgtcgaaaggaagagcctcagatcgagcaaatgcctcagccaaaaaaaccacgactggtctttaccgatcttcaacgacg +# aacactacaagctattttcaaagagaccaaaagaccttcgaaggagatgcaagtgacgatcgcgcggcagctgggactagagcctacaacagtaggca +# atttctttatgaacgcacgtcggagatcgatggataagtggcgggacgacgactccaaaaccagcatgcatttatcgcatagccgccaacaacaacgg +# gacgagcaggaagaggacgagagccacagtcaaagtcagattcaaattcagagccataatccggctagcttaacacaggaaaactactccagtctaca +# tacaacggccatgtcgcctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgacc +# atggagataccaatgatccaaactgcgacatgttgtga] +# protein sequence = [MHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSL +# TPTPPPVTDDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSS +# RNGHTSDMEEINTKDLAQRISAELKRYSIPQAIFAQRVLCRSQGTLSDLLRNPKPWSKLKSGRETFRRMYKWLQEPEFQRMSALRMAAAQIPQRTLGP +# GLALGPTTGSTSVIPTDLDSHAGPAMTPNVLFNNQLNYFFYFIQQCSGTASIYQPDKTSAPPNESASSSASTPVTNVSVANVVSCRRKEEPQIEQMPQ +# PKKPRLVFTDLQRRTLQAIFKETKRPSKEMQVTIARQLGLEPTTVGNFFMNARRRSMDKWRDDDSKTSMHLSHSRQQQRDEQEEDESHSQSQIQIQSH +# NPASLTQENYSSLHTTAMSPLGDFDEEADMDLELESHDFDLVDPDDHGDTNDPNCDML] +# end gene contig34.g116 +### +# start gene contig34.g117 +contig34 AUGUSTUS gene 43913 45655 1 - . ID=contig34.g117 +contig34 AUGUSTUS transcript 43913 45655 . - . ID=contig34.g117.t1;Parent=contig34.g117 +contig34 AUGUSTUS CDS 43913 45655 . - 0 ID=contig34.g117.t1.cds;Parent=contig34.g117.t1 +contig34 AUGUSTUS start_codon 45653 45655 . - 0 Parent=contig34.g117.t1 +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga +# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg +# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat +# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat +# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc +# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc +# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga +# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta +# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca +# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc +# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct +# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac +# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgtatgtataccgctaa] +# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS +# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK +# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE +# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA +# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC +# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES +# VPGVNGGTYVYR] +# end gene contig34.g117 +### +# +# ----- prediction on sequence number 35 (length = 48011, name = contig35) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 35 on both strands +# start gene contig35.g118 +contig35 AUGUSTUS gene 7306 10709 1 + . ID=contig35.g118 +contig35 AUGUSTUS transcript 7306 10709 . + . ID=contig35.g118.t1;Parent=contig35.g118 +contig35 AUGUSTUS start_codon 7306 7308 . + 0 Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 7306 7358 . + 0 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 8135 8609 . + 1 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 8675 8773 . + 0 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 9163 9354 . + 0 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 9921 10120 . + 0 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 10331 10709 . + 1 ID=contig35.g118.t1.cds;Parent=contig35.g118.t1 +# coding sequence = [atggactggggcaaatttcgtgaagctattgaatttggccaccagcagcttggaatttcagaagaactggattcgccaa +# atatgcgtgctgagacgtacctaaacctcagcagagctcacgcttgtttgggaggcctggagcgatcactgagctatgctaggcactcactttacaat +# gagtgcggcactaaatgccgaagtggacttgtccatttgacggttgcacgagtgtatcttgaaatgggtggattcaccagggcattggagggcttgca +# gggagcctacaagatagctacagccgttggagatccgtctctagagttacaagtgtatgtcgcactgtctgagctttttggacggctccaggataacg +# ataaaagcgcatcttatgcttctaaggcgtacgatttatctcgttccttacagctgggtgaccttaactcatgccaccatagagccgcgttattgcga +# atggctgcatctctgcgaaagaagggcgagctcggagatgcacaggattattgcaaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccac +# atacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacatttaccggaagaaaatggatatggaccgtgcgttccggcaatacgaacaagctatgggtacgtcag +# ccagtttgggggaccgcatggctcaaatggaggctatggacggagctgcccgttgcctggaaacactacgtcttcaaaacaaaatctgcaactgcaga +# ccgttggagtttaacactcggcttctggaagttgctagctcaattggcgcaaagtttctggttcgtaagatccgttgtcgcttggctttgatctaccg +# cgctttgggggacgaggatcaatacaatactcattttcgtttggcaaaccaaacggacgctgcgcttggcttgaactgcggagcgtgtggggagttgt +# tcggtcttcggccagaaaatttggaagctttgccatgtgcacatattcttcatgcaaggtgtgcttacgaaatattacgacgtcgggacaaaagtaca +# ccgcgatcatgccccgcctgtaataagatggtgagttcacgcacacatctttgcggctccataccggtagagagtgaaagtaccgacggaggcagcgc +# cgtcacggttaccctcaacgccaacgctctctcagtcgatggtctcctgggaataggctccgacatcctcctaccctcggccgcgttttcccacgcca +# acaaaccggcaccggataacgagaactgctctttgttgtctcccaaagttatgtaccacagcaacttatccttgacttcgttaagtatgcgcgcatct +# agcctgacgatcgacagcggtcaaaatgttacttcctctgtgtga] +# protein sequence = [MDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYNECGTKCRSGLVHLTVARVY +# LEMGGFTRALEGLQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLRMAASLRKKGELGDAQDYCK +# EATKLSLISGDQATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDRAFRQYEQAMGTSASLGDRMAQMEAMDGAARCLETLRLQNKICNCRPLEFNTRLLEVASSIGAKF +# LVRKIRCRLALIYRALGDEDQYNTHFRLANQTDAALGLNCGACGELFGLRPENLEALPCAHILHARCAYEILRRRDKSTPRSCPACNKMVSSRTHLCG +# SIPVESESTDGGSAVTVTLNANALSVDGLLGIGSDILLPSAAFSHANKPAPDNENCSLLSPKVMYHSNLSLTSLSMRASSLTIDSGQNVTSSV] +# end gene contig35.g118 +### +# start gene contig35.g119 +contig35 AUGUSTUS gene 14188 18225 1 - . ID=contig35.g119 +contig35 AUGUSTUS transcript 14188 18225 . - . ID=contig35.g119.t1;Parent=contig35.g119 +contig35 AUGUSTUS CDS 14188 14595 . - 0 ID=contig35.g119.t1.cds;Parent=contig35.g119.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 16284 16552 . - 2 ID=contig35.g119.t1.cds;Parent=contig35.g119.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 17316 18225 . - 0 ID=contig35.g119.t1.cds;Parent=contig35.g119.t1 +contig35 AUGUSTUS start_codon 18223 18225 . - 0 Parent=contig35.g119.t1 +# coding sequence = [atgcaccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagat +# ctcggcttaacatgccgcctgagcggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaag +# cacggcaacggaagcgttgttagtctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccgg +# actcaaactgaatgagcgactgtccccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcc +# cgaacatccacggtaccccgcactcagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaag +# atttctgtccctgcctcgccaaaatcgtccgtaacctgtgcgggcggaggatcgagccgcaatggacacaccagcgacatggaggagatcaacacgaa +# agatctggctcagcgcatctcggcagaactgaaacggtacagcattccacaggcgatctttgcacagcgtgttctctgtcgctcgcaaggtactttgt +# ccgatctactgcgcaacccgaagccgtggtcgaagctcaagtccggcagggagacatttcgaaggatgtacaaatggctccaggagcccgagtttcag +# cgtatgtctgctctacggatggccgctgcacaaattcctcagcgaactttggggcctgggctggcacttggaccaacaacgggctccacatccgtcat +# accgaccgatttggattctcatgccgggccagcaatgacaccaaatgttctttttaataaccaattaaattacttcttttattttattcaacaatgtt +# ctggaacggcgtccatttaccaacctgacaaaacatcagctccgcccaatgaatcggcctcttcgtctgcatctacacctgtcacaaacgtgtccgtt +# gcgaacgtcgttagttgtcgtcgaaaggaagagcctcagatcgagcaaatgcctcagccaaaaaaaccacgactggtctttaccgatcttcaacgacg +# aacactacaagctattttcaaagagaccaaaagaccttcgaaggagatgcaagtgacgatcgcgcggcagctgggactagagcctacaacagtaggca +# atttctttatgaacgcacgtcggagatcgatggataagtggcgggacgacgactccaaaaccagcatgcatttatcgcatagccgccaacaacaacgg +# gacgagcaggaagaggacgagagccacagtcaaagtcagattcaaattcagagccataatccggctagcttaacacaggaaaactactccagtctaca +# tacaacggccatgtcgcctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgacc +# atggagataccaatgatccaaactgcgacatgttgtga] +# protein sequence = [MHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSL +# TPTPPPVTDDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSS +# RNGHTSDMEEINTKDLAQRISAELKRYSIPQAIFAQRVLCRSQGTLSDLLRNPKPWSKLKSGRETFRRMYKWLQEPEFQRMSALRMAAAQIPQRTLGP +# GLALGPTTGSTSVIPTDLDSHAGPAMTPNVLFNNQLNYFFYFIQQCSGTASIYQPDKTSAPPNESASSSASTPVTNVSVANVVSCRRKEEPQIEQMPQ +# PKKPRLVFTDLQRRTLQAIFKETKRPSKEMQVTIARQLGLEPTTVGNFFMNARRRSMDKWRDDDSKTSMHLSHSRQQQRDEQEEDESHSQSQIQIQSH +# NPASLTQENYSSLHTTAMSPLGDFDEEADMDLELESHDFDLVDPDDHGDTNDPNCDML] +# end gene contig35.g119 +### +# start gene contig35.g120 +contig35 AUGUSTUS gene 18908 20650 1 - . ID=contig35.g120 +contig35 AUGUSTUS transcript 18908 20650 . - . ID=contig35.g120.t1;Parent=contig35.g120 +contig35 AUGUSTUS CDS 18908 20650 . - 0 ID=contig35.g120.t1.cds;Parent=contig35.g120.t1 +contig35 AUGUSTUS start_codon 20648 20650 . - 0 Parent=contig35.g120.t1 +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga +# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg +# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat +# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat +# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc +# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc +# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga +# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta +# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca +# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc +# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct +# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac +# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgtatgtataccgctaa] +# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS +# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK +# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE +# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA +# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC +# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES +# VPGVNGGTYVYR] +# end gene contig35.g120 +### +# start gene contig35.g121 +contig35 AUGUSTUS gene 24546 47870 1 + . ID=contig35.g121 +contig35 AUGUSTUS transcript 24546 47870 . + . ID=contig35.g121.t1;Parent=contig35.g121 +contig35 AUGUSTUS start_codon 24546 24548 . + 0 Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 24546 24620 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 31579 31759 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 34131 34297 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 34415 34616 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 36623 37510 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 37652 37747 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 44148 44276 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 44340 44435 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 44781 45151 . + 2 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 45999 46145 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 46210 46539 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 47862 47870 . + 0 ID=contig35.g121.t1.cds;Parent=contig35.g121.t1 +# coding sequence = [atgaacgcaatagtcgagtgcctcgactatcagcctaagagatcaaaaaagaaagttggtgttcatgcaaataaatggg +# tcgaggagtcgttcacagatttcgtaaagggcataaattggaggagctacgtggtatgcgatgtggcatatcacaatgtcaacaactggttgtggtcg +# cctttcatagatcgtggcccagcaaatcgactgtacattgaaatacaattcacaatacgagactgctctttgttcccaggaaacgctttgtcctgcaa +# ggaaacctttagtttactattctacgagtttgatgctgccactcgagagccgccgccctggcaaacagacagctacagacttattgctcgcatcgcag +# ctggagaaggtcgctttaatcaaaactctgatgtagatataaacacggagaattttgcccactttaacgagacacccacgggaaaagaaattactatt +# attgagaagcaaaatggaacatgtgtcgaaaacgcggaaccgtacgaggccccaacatatttatgtaaaggtgatggaaaatggaccattcttactgg +# tggctgtcgttgcaaggccggctatgaaccaaacaatttaaataaaacttgcacagaatgtccccttggtacgtttaaatcaccagaggtaaccaaat +# 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aacttgataaaaaatcgacaaatcatttacccttaccattggattacgctactaatgaagtgacgacacctctatttggaaatagtaggagttatgta +# gatccgcatacatatgaagaccctaatcaagccataagggaatttgctcgggaaattgatgcaaactatattactatcgaagctattataggtggtgg +# agaatttggagatgtctgccgtggccgcttaaaaatacctcccaattttgtacaggacattgatgtggcaataaaaactttaaagccaggatcttcgg +# aaaaagcgcgctgtgactttttgacggaggcttccattatgggacagtttgatcatcctaatgttatttatctacagggagtagttacacgctcaaat +# ccagtaatgattattacagagtacatggagaacggtagcttagacacatttcttcgtgtgaatgatggaaagtttcaaaccttacagctgatagtaat +# gcttcgaggtattgccagcgggatggcatatttaagtgatatgaattatgtacacagagacttggcggcacgaaatgttcttgtaaatgcccaattaa +# tttgcaagatcgcggacttcggtttgtcacgcgaaattgagaacgccagtgatgcctacacaacaaggggtggcaaaattccagtgcgttggactgcg +# ccagaagctattgcttttagaaaatttacttccgcatcggatgtatggtcttatggagtagttttatgggaggtcatgtcgtatggagagcgcccata +# ttggaactggtcaaatcaggacgtgataaagagtatagaaaagggctatcgtttaccagctccgatggactgtccagaagccctctaccagctaatgt +# tagattgctggcaaaagcaacgtactcatcgacccacatttgctagcatcgtttcaactctcgataacttggcaagacaaccgcagtcattattgact +# actcgaaactcaccggaatcagacggtactcatgttttagatacgcagcgtggtcaaaatattttcataagcaccgacctttggttggagaacattaa +# aatgtcaagatattgtcagcattttaaagaggctaatttaattaatgctcaacagagggtataa] +# protein sequence = [MNAIVECLDYQPKRSKKKVGVHANKWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTI +# RDCSLFPGNALSCKETFSLLFYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTENFAHFNETPTGKEITIIEKQNGTCVENAEPYEAPT +# YLCKGDGKWTILTGGCRCKAGYEPNNLNKTCTECPLGTFKSPEVTKCTPCPPNSNSSKTASPFCKCMPGYYRHPSDGRHMPCYSPPSAPTNLTLLFVD +# QTSAIISWSAPTKNKTNTGKTLSNKYHSDIVYKIRCNMCSPNVMYNPSSDTFNETKITLTNLEPVTTYTVQVHATNSVSHLTDLSRHPNESSLITTND +# TPFSNVSFFTIPLDLNEIKTSHAEIVFTTESVLLSTAFNLRILAITSKDADLEWDKPIQSDSPLEFYELRWFPKLELDVINKTALNTKETKAHIEGLM +# ENTEYGFQVRCKTINGFGSYSNMIYAQTLQSVGSATVYFMRSKHQDELDKKSTNHLPLPLDYATNEVTTPLFGNSRSYVDPHTYEDPNQAIREFAREI +# DANYITIEAIIGGGEFGDVCRGRLKIPPNFVQDIDVAIKTLKPGSSEKARCDFLTEASIMGQFDHPNVIYLQGVVTRSNPVMIITEYMENGSLDTFLR +# VNDGKFQTLQLIVMLRGIASGMAYLSDMNYVHRDLAARNVLVNAQLICKIADFGLSREIENASDAYTTRGGKIPVRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYG +# VVLWEVMSYGERPYWNWSNQDVIKSIEKGYRLPAPMDCPEALYQLMLDCWQKQRTHRPTFASIVSTLDNLARQPQSLLTTRNSPESDGTHVLDTQRGQ +# NIFISTDLWLENIKMSRYCQHFKEANLINAQQRV] +# end gene contig35.g121 +### +# +# ----- prediction on sequence number 36 (length = 45010, name = contig36) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 36 on both strands +# start gene contig36.g122 +contig36 AUGUSTUS gene 3802 22863 1 + . 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ID=contig36.g122.t1;Parent=contig36.g122 +contig36 AUGUSTUS start_codon 3802 3804 . + 0 Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 3802 3827 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 4448 4493 . + 1 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9290 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 9408 9609 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 12645 12740 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19333 19428 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19774 20144 . + 2 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 20992 21138 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 21203 21532 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 22855 22863 . + 0 ID=contig36.g122.t1.cds;Parent=contig36.g122.t1 +# coding sequence = [atgcaggtatatcggtatcaatgcagttgttctgttagatacaaccagagaagctacattggagtggaccagtgggtcg +# aggagtcgttcacagatttcgtaaagggcataaattggaggagctacgtggtatgcgatgtggcatatcacaatgtcaacaactggttgtggtcgcct +# ttcatagatcgtggcccagcaaatcgactgtacattgaaatacaattcacaatacgagactgctctttgttcccaggaaacgctttgtcctgcaagga +# aacctttagtttactattctacgagtttgatgctgccactcgagagccgccgccctggcaaacagacagctacagacttattgctcgcatcgcagctg +# gagaaggtcgctttaatcaaaactctgatgtagatataaacacggagaattttgcccactttaacgagacacccacgggaaaagaaattactattatt +# gagaagcaaaatggaacatgtgtcgaaaacgcggaaccgtacgaggccccaacatatttatgtaaaggtgatggaaaatggaccattcttactggtgg +# ctgtcgttgcaaggccggctatgaaccaaacaatttaaataaaacttgcacagaatgtccccttggtacgtttaaatcaccagaggtaaccaaatgta +# cgccatgtccgcctaactcaaattcttcaaaaactgcatcaccattttgcaagtgtatgccgggatactatagacatccaagtgacggccgacatatg +# ccttgttacagtccaccatctgcgcctacaaatctaacgttgttgtttgttgatcaaacgagtgccataatatcttggagcgctccaaccaagaataa +# aacgaacacgggcaaaacgctgtctaataagtaccacagtgatattgtgtacaagatccggtgcaatatgtgcagcccaaatgttatgtacaatccgt +# caagtgacacatttaacgaaacgaaaataacattaacaaatcttgaaccggttacgacatatacagtgcaagtacacgcaaccaatagcgtgtcgcat +# cttaccgacttaagccggcaccccaacgaatcgtcactaataacaaccaatgacacaccattttctaatgtgtcgtttttcaccattcccttggattt +# gaatgaaataaagaccagtcacgcagaaattgtgtttactacagagtctgttttgctatctacagcttttaacttacgtatattggccataactagta +# aagatgccgatttggagtgggacaagccaattcaaagtgattctccacttgagttttatgaactgcgttggtttcccaagttagaattagatgttatt +# aataaaacagctttgaatacaaaggagacaaaggcacatatagaaggactgatggaaaataccgaatatggatttcaagtccgctgtaaaacaataaa +# tggttttggttcttatagtaatatgatttacgcccaaactcttcaatccgttgggtcagctacggtatacttcatgagatccaaacatcaggatgaac +# ttgataaaaaatcgacaaatcatttacccttaccattggattacgctactaatgaagtgacgacacctctatttggaaatagtaggagttatgtagat +# ccgcatacatatgaagaccctaatcaagccataagggaatttgctcgggaaattgatgcaaactatattactatcgaagctattataggtggtggaga +# atttggagatgtctgccgtggccgcttaaaaatacctcccaattttgtacaggacattgatgtggcaataaaaactttaaagccaggatcttcggaaa +# aagcgcgctgtgactttttgacggaggcttccattatgggacagtttgatcatcctaatgttatttatctacagggagtagttacacgctcaaatcca +# gtaatgattattacagagtacatggagaacggtagcttagacacatttcttcgtgtgaatgatggaaagtttcaaaccttacagctgatagtaatgct +# tcgaggtattgccagcgggatggcatatttaagtgatatgaattatgtacacagagacttggcggcacgaaatgttcttgtaaatgcccaattaattt +# gcaagatcgcggacttcggtttgtcacgcgaaattgagaacgccagtgatgcctacacaacaaggggtggcaaaattccagtgcgttggactgcgcca +# gaagctattgcttttagaaaatttacttccgcatcggatgtatggtcttatggagtagttttatgggaggtcatgtcgtatggagagcgcccatattg +# gaactggtcaaatcaggacgtgataaagagtatagaaaagggctatcgtttaccagctccgatggactgtccagaagccctctaccagctaatgttag +# attgctggcaaaagcaacgtactcatcgacccacatttgctagcatcgtttcaactctcgataacttggcaagacaaccgcagtcattattgactact +# cgaaactcaccggaatcagacggtactcatgttttagatacgcagcgtggtcaaaatattttcataagcaccgacctttggttggagaacattaaaat +# gtcaagatattgtcagcattttaaagaggctaatttaattaatgctcaacagagggtataa] +# protein sequence = [MQVYRYQCSCSVRYNQRSYIGVDQWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTIR +# DCSLFPGNALSCKETFSLLFYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTENFAHFNETPTGKEITIIEKQNGTCVENAEPYEAPTY +# LCKGDGKWTILTGGCRCKAGYEPNNLNKTCTECPLGTFKSPEVTKCTPCPPNSNSSKTASPFCKCMPGYYRHPSDGRHMPCYSPPSAPTNLTLLFVDQ +# TSAIISWSAPTKNKTNTGKTLSNKYHSDIVYKIRCNMCSPNVMYNPSSDTFNETKITLTNLEPVTTYTVQVHATNSVSHLTDLSRHPNESSLITTNDT +# PFSNVSFFTIPLDLNEIKTSHAEIVFTTESVLLSTAFNLRILAITSKDADLEWDKPIQSDSPLEFYELRWFPKLELDVINKTALNTKETKAHIEGLME +# NTEYGFQVRCKTINGFGSYSNMIYAQTLQSVGSATVYFMRSKHQDELDKKSTNHLPLPLDYATNEVTTPLFGNSRSYVDPHTYEDPNQAIREFAREID +# ANYITIEAIIGGGEFGDVCRGRLKIPPNFVQDIDVAIKTLKPGSSEKARCDFLTEASIMGQFDHPNVIYLQGVVTRSNPVMIITEYMENGSLDTFLRV +# NDGKFQTLQLIVMLRGIASGMAYLSDMNYVHRDLAARNVLVNAQLICKIADFGLSREIENASDAYTTRGGKIPVRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGV +# VLWEVMSYGERPYWNWSNQDVIKSIEKGYRLPAPMDCPEALYQLMLDCWQKQRTHRPTFASIVSTLDNLARQPQSLLTTRNSPESDGTHVLDTQRGQN +# IFISTDLWLENIKMSRYCQHFKEANLINAQQRV] +# end gene contig36.g122 +### +# start gene contig36.g123 +contig36 AUGUSTUS gene 24771 35069 1 - . ID=contig36.g123 +contig36 AUGUSTUS transcript 24771 35069 . - . ID=contig36.g123.t1;Parent=contig36.g123 +contig36 AUGUSTUS CDS 24771 25509 . - 1 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 27520 27709 . - 2 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 27853 27936 . - 2 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 34603 34678 . - 0 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 34827 35069 . - 0 ID=contig36.g123.t1.cds;Parent=contig36.g123.t1 +contig36 AUGUSTUS start_codon 35067 35069 . - 0 Parent=contig36.g123.t1 +# coding sequence = [atgccacggactgccagatacccgttactaaacatagtgtcgggcgagggagagggagatatgcaagtaccaaagcgac +# gtagccaggatagcattttcagttactgcgatctttgcgttcatacagacggagacacggctatggctagatcgactctgctagcaatccccataaga +# atgtatatactcgatgggtatttcgatgatcttgcgagctgtacttacctgctgtttgttggacgtaaatcgactttaaatgtgaaggactacagtgc +# aaactactccagtttggtccgatccgataatttgtcgttcaaaagtgccacgcccactttaacgtccgcaaatcgccaaaaacgcttatatctttctg +# ccgcccacgtgacatctactggaaaagccgcaattgtcgatgcaattattcgtgtgcgattcgtcactacgtggactaccatcatactaataataatg +# ttcttcgtgcagacgtctgtgcgtttcgtcacgagatgtactgtggcagatgtactgcggcagtggattgtaagacatgttggaaacaaaacctatgc +# gtactcatattccaaagttacatgacgaaggcttttagcgtctcgtaaaatagaatttgaaaatattgaacacgaagaaacgcgaactcagtggatag +# aattcgacgtgacaaaagcagttcgtagttggatgaacaaaagtcatgaaaatttgggaatagaaattcaatgtgataaatgcaaaaatataggtgct +# cgtatacttagcgactcagattcttcgacacaatcatcatctggaaaaccagcaacaccaaacaacgaacgcttcaacctcatgccagttctgaatat +# tatcggacatggggccttaaaagcaaaaaaagaagatgactcggacgttcaccatatcgttttgtctaataatagaagcgatgaatatgtacatcatc +# gttcaaaccaagaaatagcgtggaagggaaaatggaataacaactgttacaaattacatcagcgatgctgcagaaatccgttggatgttgccttcaag +# gacatcaaagggtttgagtttatattacagccaaaagtattcgatgcaggttattgccacggcagatgtcctccgcgtcacaatcccgcccaccacca +# tgctctgttgcaaagtcttatatggcaggaagatcataaccgagcaccccgtccgtgttgcgctccttcaaaacttgagatgctcgaaatattacatg +# ttgacgaagaccacagcgataagctcaaaatttccacgtggagtgatatgcaggttgtagaatgtgcctgttcttaa] +# protein sequence = [MPRTARYPLLNIVSGEGEGDMQVPKRRSQDSIFSYCDLCVHTDGDTAMARSTLLAIPIRMYILDGYFDDLASCTYLLF +# VGRKSTLNVKDYSANYSSLVRSDNLSFKSATPTLTSANRQKRLYLSAAHVTSTGKAAIVDAIIRVRFVTTWTTIILIIMFFVQTSVRFVTRCTVADVL +# RQWIVRHVGNKTYAYSYSKVTXRRLLASRKIEFENIEHEETRTQWIEFDVTKAVRSWMNKSHENLGIEIQCDKCKNIGARILSDSDSSTQSSSGKPAT +# PNNERFNLMPVLNIIGHGALKAKKEDDSDVHHIVLSNNRSDEYVHHRSNQEIAWKGKWNNNCYKLHQRCCRNPLDVAFKDIKGFEFILQPKVFDAGYC +# HGRCPPRHNPAHHHALLQSLIWQEDHNRAPRPCCAPSKLEMLEILHVDEDHSDKLKISTWSDMQVVECACS] +# end gene contig36.g123 +### +# +# ----- prediction on sequence number 37 (length = 50013, name = contig37) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 37 on both strands +# start gene contig37.g124 +contig37 AUGUSTUS gene 959 27476 1 - . 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ID=contig37.g125 +contig37 AUGUSTUS transcript 28245 28706 . + . ID=contig37.g125.t1;Parent=contig37.g125 +contig37 AUGUSTUS start_codon 28245 28247 . + 0 Parent=contig37.g125.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 28245 28706 . + 0 ID=contig37.g125.t1.cds;Parent=contig37.g125.t1 +# coding sequence = [atggatcaaaggattttcatcatattttgtgtaaaaaataaaattaagtgctccgaaacacttgaaatgttgacagtgg +# catacggtgaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttccaagctggccgggaagatgccaatgacgagcttcgctctgga +# cgcccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcactgaacaaaattgttttggaaagtcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgt +# cggtatatcgcttggctcgtgccatgaaattctttcaaacgttttgggcctgagtcgtgtgtcagggaagtttgttctaaaattgctgaattttaacc +# aaaagaaccgttgcatgagcatcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaaagggtcataactggtga] +# protein sequence = [MDQRIFIIFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGETVLSKKNVYKWYKLFQAGREDANDELRSGRPSTSTTDENVQALNKIVL +# ESRRITIREVAEDVGISLGSCHEILSNVLGLSRVSGKFVLKLLNFNQKNRCMSIAQELLDDVNDDPDLLKKGHNW] +# end gene contig37.g125 +### +# start gene contig37.g126 +contig37 AUGUSTUS gene 31117 46261 1 - . ID=contig37.g126 +contig37 AUGUSTUS transcript 31117 46261 . - . ID=contig37.g126.t1;Parent=contig37.g126 +contig37 AUGUSTUS CDS 31117 31179 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 31900 32436 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 35082 35218 . - 2 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 36727 36982 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 37459 37836 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 39011 40488 . - 2 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 41041 41641 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 42133 42152 . - 2 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 43480 43584 . - 2 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 45463 46261 . - 0 ID=contig37.g126.t1.cds;Parent=contig37.g126.t1 +contig37 AUGUSTUS start_codon 46259 46261 . - 0 Parent=contig37.g126.t1 +# coding sequence = [atggcggcacatgagggaatttccgcatacttttcccagcttaattcactggctggaaagattacgcgcgacataaaca +# gagtaagatcttcatacagtcgagatgcctggcttgcgttaactttaaatgagcaggaaaaaatattggacactcattttataaatcctgatatatac +# actaagtattataaaacgtctgaaacaaaccgttcagaacaagaatcgccgttaaaaacagctattccaaaaagtgattttcaacaatttccttatag +# ggacgttgtatattcatttaacggacaagatctgcacacatatatctaccaaaatgttggattaaaagtattacatgacgaaaataccagagattgcc +# gcgatgaacattcttacccatttagttatcgaacaaaatctcaaataaacatactatccaaaaaacctgataatgtctctgttgtacgagctgctgtt +# gatgtatcgaaacccctttattcaaaatttacaaacaactcaaaaataccggctctccaaatttatgttaacgataagtcagacgttaaacaaacaaa +# aacacaaatgtgtaaggaagaaaattacgtaaaaagtaaatgtgattatgataatgacgaactgttggactataatgaaaaatttcatttgctgttta +# gatttgagtcaaaaagcagtgtgtccaacgatttgtctgattatgaaaatgaatttaaagatctacgtcaagacgaacatgcaaaacttttaacaccc +# gaactgcaagtcccgaaaggtttcgattttctaaggtataagtgggtaaatatcgattaccaaacgaaattatcggtaatctactatgaagccaatta +# tcgcttgtcgttcttccagaccaagagtgagcgagagcgagagagtgcgaaaatgctaaaggactcggaacacacaaggaataagtcattctttttta +# aacaagtcaaagagtttataaaaattgctataaatgcttacgataatgacgttgaaaatcaatttgatgctggaatagttgggaatgccacttttgaa +# gttgacgatcagttagaacatttgagcactatgcgcgaagcgcttttttcccaagatggctggggctgtcaacatgtcaaccaggacaccaattggga +# agtccccagttcgccagaaccaaccaataaagatgcggccggaccaccaatgtggaagccaagcatcaacaatggaactgatctttgggaatccaatt +# taagaaacggtggtcagccgaccgctcagcaagttccaaagccttcgtggggtcatacgccatcctctaatctaggcggaacgtggggagaggacgat +# gatggggccgacagcagtagtgtgtggacaggaggatcggttaacaacgccgggtctggatcggcagtgggagtgaaccaaggcggtgttaatgttgg +# cccaggtggtgtagtctcatctggaggtcctcagtggggacaaggtgtggttggcgtcggactagggtcaactggtaacggatcaagcaatttatctg +# gttcgactggagttgtcgcaggtggcagcggaaactcaagcaatactggcaatggttggggagaccctcgcgaaattcgacctttagctggaggtgga +# tctatggatattcgaaacgttgatcatcgcggaggtaacggttcagggggatcttcgagcgatccccgcgacatccgaatgatcgatccacgggatcc +# aattcgaggagatcctcgtggaatatccggtcggcttaatggaacatcggaaatgtggggccatcatccacaaatgtcgcacaatcaaatacaaaata +# ttaataaaatggttggccaaagcgtggcaactgctggtacgaatgttggaggaacatcaggatctggcatcggaccggggggacctggtcctggacct +# gtatcgaacaatatcccaacacagtgggggccgtcccaagcggtaggcgttggtgtaagtggccccaaagacatatcgaagcagattagtggatggga +# ggaaccatcgccaccgccccagcgacgcagtattcctaattacgacgatggcacatccctctggggtcagcaaactcgtgttcccggtggaagcggtc +# actggaaagacatgactgattccattggtcgtagtggtcatctgatgcgaggtcaaaaccagtcgggtggcatcggtatcgcaggagttggcaatagc +# aatgttccagttggagccaatcccaacaaccctttgaacagtgtagttggaccacagactcgcctgccatctgtgggaggcgtgcagcacaagcaaga +# cggaggagccatgtgggtgcattcgaacaatgttagcgccaggaataacgttgctgctgtcgccacttggggagatgacactcacaacgttagtgtgg +# gcgcccccagtggtggtggtgtaaccagcagtaattgggtggatgataaatctaacgccacactggctcaaaattcttggagcgacgcagcaccagtt +# ggagttggttgggggaataagcaaagcaaactgccggccactagtacatcatctggttggagcactggagcaggtgtaggtgtggtggacggcgtaga +# 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tgtttatgtcaaacagcagaacatgcaacagacttcgcaacaacagcaacagccccagcaacagcagcacccctctgtacatttaaataactcaggca +# acgactatttaagaggacacgatgcaataagacgcaacattggggatggttggccagatccctcatctgataacgagaataaagactggtcagttgct +# cagccaacttcagcagcaactgcttacacggacctggtccaagagttcgagccaggcaagccatggaagattgatggttctactttacgcacattgtg +# tatgcagcatggcccccttcttagctttcacctatatttgaaccaaggaattgccttatgtaaatataccactcgagaggaggcgaacaaagcgcaaa +# tggcgttaaacaactgtgtcctcgccaacaccactatatttgctgaatctccaagcgagaacgaggtacagaacataatgcagcacttaccgcaaaca +# ccatcgtctgcaagctgtactggaactagtgctggtaacggcggaggcgtcagcactccacccaatagtgggctcagtagctcaggatctaatctatc +# cggaaacaatagcaacggcaatggtaacggcaatggaagcagcagcgccagtggtggcgtttccggcaataatggtaacaacagtggaaacaccagtt +# gcgccggcggcagcaacccgaacaccagtgtggcaacttcgaatctacttaattctagtggagggtctgtctcaaattcatccggtggtgctgctagc +# tctggtacaggctctggaatctatacatatatttatggaaaattcaaattttcagtaacgactgaaatcgtgtgccggtag] +# protein sequence = [MAAHEGISAYFSQLNSLAGKITRDINRVRSSYSRDAWLALTLNEQEKILDTHFINPDIYTKYYKTSETNRSEQESPLK +# TAIPKSDFQQFPYRDVVYSFNGQDLHTYIYQNVGLKVLHDENTRDCRDEHSYPFSYRTKSQINILSKKPDNVSVVRAAVDVSKPLYSKFTNNSKIPAL +# QIYVNDKSDVKQTKTQMCKEENYVKSKCDYDNDELLDYNEKFHLLFRFESKSSVSNDLSDYENEFKDLRQDEHAKLLTPELQVPKGFDFLRYKWVNID +# YQTKLSVIYYEANYRLSFFQTKSERERESAKMLKDSEHTRNKSFFFKQVKEFIKIAINAYDNDVENQFDAGIVGNATFEVDDQLEHLSTMREALFSQD +# GWGCQHVNQDTNWEVPSSPEPTNKDAAGPPMWKPSINNGTDLWESNLRNGGQPTAQQVPKPSWGHTPSSNLGGTWGEDDDGADSSSVWTGGSVNNAGS +# GSAVGVNQGGVNVGPGGVVSSGGPQWGQGVVGVGLGSTGNGSSNLSGSTGVVAGGSGNSSNTGNGWGDPREIRPLAGGGSMDIRNVDHRGGNGSGGSS +# SDPRDIRMIDPRDPIRGDPRGISGRLNGTSEMWGHHPQMSHNQIQNINKMVGQSVATAGTNVGGTSGSGIGPGGPGPGPVSNNIPTQWGPSQAVGVGV +# SGPKDISKQISGWEEPSPPPQRRSIPNYDDGTSLWGQQTRVPGGSGHWKDMTDSIGRSGHLMRGQNQSGGIGIAGVGNSNVPVGANPNNPLNSVVGPQ +# TRLPSVGGVQHKQDGGAMWVHSNNVSARNNVAAVATWGDDTHNVSVGAPSGGGVTSSNWVDDKSNATLAQNSWSDAAPVGVGWGNKQSKLPATSTSSG +# WSTGAGVGVVDGVDLGSEWNSHGGIIGKSQQQQKLAGLNVGMVNVINAEMIKQSKQYRILVENGFKKEDVERALVTANMNIEEAADMLRTNTSMAMDG +# WRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQKYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQ +# NTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIQLAIHSGFISSQILTQPLTQTTLNLLNQLLSNIKHLQAAQQSLARGGNANPMAVNVAISKYKQ +# QIQNLQNQINAQQAVYVKQQNMQQTSQQQQQPQQQQHPSVHLNNSGNDYLRGHDAIRRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAATAYTDLVQEFEPG +# KPWKIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLYLNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVST +# PPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNGSSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGIYTYIYGKFKFSV +# TTEIVCR] +# end gene contig37.g126 +### +# start gene contig37.g127 +contig37 AUGUSTUS gene 48349 49385 1 + . ID=contig37.g127 +contig37 AUGUSTUS transcript 48349 49385 . + . 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ID=contig38.g128 +contig38 AUGUSTUS transcript 6308 12473 . - . 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WRRHDESSLGSYSDHASSTSSSGFAGRYPVSSGQPSMSFPHNNLMNNMGGTAVTGGGNNNANMTALQVQKYLNQGQHSVAVGPQNVGNTSAVSVGFGQ +# NTSNAAVAAAASANIAANTNNQPSGQQIRMLGQQIQLAIHSGFISSQILTQPLTQTTLNLLNQLLSNIKHLQAAQQSLARGGNANPMAVNVAISKYKQ +# QIQNLQNQINAQQAVYVKQQNMQQTSQQQQQPQQQQHPSVHLNNSGNDYLRGHDAIRRNIGDGWPDPSSDNENKDWSVAQPTSAATAYTDLVQEFEPG +# KPWKIDGSTLRTLCMQHGPLLSFHLYLNQGIALCKYTTREEANKAQMALNNCVLANTTIFAESPSENEVQNIMQHLPQTPSSASCTGTSAGNGGGVST +# PPNSGLSSSGSNLSGNNSNGNGNGNGSSSASGGVSGNNGNNSGNTSCAGGSNPNTSVATSNLLNSSGGSVSNSSGGAASSGTGSGIYTYIYGKFKFSV +# TTEIVCR] +# end gene contig38.g130 +### +# start gene contig38.g131 +contig38 AUGUSTUS gene 33346 45275 1 + . 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ID=contig39.g132 +contig39 AUGUSTUS transcript 1111 16255 . - . 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coding sequence = [atggcggcacatgagggaatttccgcatacttttcccagcttaattcactggctggaaagattacgcgcgacataaaca +# gagtaagatcttcatacagtcgagatgcctggcttgcgttaactttaaatgagcaggaaaaaatattggacactcattttataaatcctgatatatac +# actaagtattataaaacgtctgaaacaaaccgttcagaacaagaatcgccgttaaaaacagctattccaaaaagtgattttcaacaatttccttatag +# ggacgttgtatattcatttaacggacaagatctgcacacatatatctaccaaaatgttggattaaaagtattacatgacgaaaataccagagattgcc +# gcgatgaacattcttacccatttagttatcgaacaaaatctcaaataaacatactatccaaaaaacctgataatgtctctgttgtacgagctgctgtt +# gatgtatcgaaacccctttattcaaaatttacaaacaactcaaaaataccggctctccaaatttatgttaacgataagtcagacgttaaacaaacaaa +# aacacaaatgtgtaaggaagaaaattacgtaaaaagtaaatgtgattatgataatgacgaactgttggactataatgaaaaatttcatttgctgttta +# gatttgagtcaaaaagcagtgtgtccaacgatttgtctgattatgaaaatgaatttaaagatctacgtcaagacgaacatgcaaaacttttaacaccc +# gaactgcaagtcccgaaaggtttcgattttctaaggtataagtgggtaaatatcgattaccaaacgaaattatcggtaatctactatgaagccaatta +# 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ID=contig39.g134 +contig39 AUGUSTUS transcript 35574 39037 . + . ID=contig39.g134.t1;Parent=contig39.g134 +contig39 AUGUSTUS start_codon 35574 35576 . + 0 Parent=contig39.g134.t1 +contig39 AUGUSTUS CDS 35574 36216 . + 0 ID=contig39.g134.t1.cds;Parent=contig39.g134.t1 +contig39 AUGUSTUS CDS 37575 39037 . + 2 ID=contig39.g134.t1.cds;Parent=contig39.g134.t1 +# coding sequence = [atgtctacagcacacataagcacggaattcagtgggcttaaaagagtgagttcaacttctgcatcgaattccatatcat +# ccttcaacttttcatcggtttcggtgtcatcgagctcctcctcattgtgtaaaagtggtattgcacctgtgttcatttcgctccaaaaaaaggataag +# ggtactattatgatgtcagcccaggtcaccccgaagatcttggctagcattaactcaaaggagtcaaatcttaaagcaaacaccgtacatcatcacga +# aatggctaatcaagccaaagtcaatgcgtcatctctaccactgtcagacgatccgcggacactgcaattggcgttggaactatcactagtaggattta +# acgacaatccaacttgctatgcgcaacctgctccacccctatcaatgcctttaagtgcacagagtgattttgaaataggtaccatcaatggcatgccc +# gcgttttctaaaacagacagcaccctgccacttccaccggcaccgagctccctcctattaccctgtgccggcaacgtcagcttagaagatcgatcaaa +# gaagtcgcagaatatgaccgagtgtgttccagtccccagttccgaacatgttgccgaaatagtaggccgacaaggttgcaaaataaaggctttgagag +# ccaaaaccaacacttacattaaaacgcccgttcgaggagaggagccggtgtttgtagtaactggtcgaaaggaagatgtgaacaaggctaaacgagaa +# attctttctgctgctgaccacttcagcttaatacgagcatcacgtaagcccttgagcgacggtcatagtggcagtttcgcaggaagtacgagtggatc +# tggaggtagtgcaatgccgcgcatgcagtctggacctccatgtatgccaggacagataaccatacaggtacgtgtaccttatcgggtggttggacttg +# ttgttgggcctaaaggtgctacaattaaacacattcaacaagagactcaaacttacattgtaacaccgtcgcgcgaaaaggaaccaatttttgaagtg +# actggcttgccagacaatgtagatactgcacgaaagcaaatagaagctcatattgcccttcgaactggaacaggatctggaagtgtcgatggtaatac +# tgtgcaaggtggtgaaccggttgagggaaatgaatttgcgaccctgccgacaataaattcattaacccaaatattaaatgataatttgaattcagata +# ttttgtcgtctatatacaaaaatgcaattccatctgcacaggattatgcaaaaaatataataaaaattgctgagaacggtagccattccgtaaagaca +# atgcaaggccatcatactggcaattgctttaaaaaaactgagttttctgatatggaaatagcagcaactataaaagcaactcaaatatcagacaaaca +# ttttccggaaaatgaagtttccatgccatcatcgaaggctaatgttgtattccgtaatacgcctagcaaaacattatcctactgtcctcccacaccta +# catcagcatcgattcattccaactctaatgctaatattttaacaagatcttgttcatctgcttcttcaacaacttcaacaaagagtaccaacaatagc +# gccaacacacctccagaaatattaagtatatggaaaaatataagtgattcaattgacgtcgacgagggtataggggagtcgcctagtatttggaacca +# acagggtaacattatacccacagcacactgctcacctacagtctcaattagtcctacggattcgctcttaggttttggtgagcattctgtaaatcaaa +# aaaatctgcatcagactaaggagccgactacatgtagcaacaagcaaaagacgcaagctattcaattgcaacctatcccggataaatttatgattcac +# cgcgaatgttttgtttgtaacgaaaatgatgttacaactgctttggttccatgcggccacaatatgttttgcatggaatgtgcgaatcaaatatgcat +# ttctatggaagcagtttgtccggtttgtaattctattgtttaccatgcaatgcgcattttgggataa] +# protein sequence = [MSTAHISTEFSGLKRVSSTSASNSISSFNFSSVSVSSSSSSLCKSGIAPVFISLQKKDKGTIMMSAQVTPKILASINS +# KESNLKANTVHHHEMANQAKVNASSLPLSDDPRTLQLALELSLVGFNDNPTCYAQPAPPLSMPLSAQSDFEIGTINGMPAFSKTDSTLPLPPAPSSLL +# LPCAGNVSLEDRSKKSQNMTECVPVPSSEHVAEIVGRQGCKIKALRAKTNTYIKTPVRGEEPVFVVTGRKEDVNKAKREILSAADHFSLIRASRKPLS +# DGHSGSFAGSTSGSGGSAMPRMQSGPPCMPGQITIQVRVPYRVVGLVVGPKGATIKHIQQETQTYIVTPSREKEPIFEVTGLPDNVDTARKQIEAHIA +# LRTGTGSGSVDGNTVQGGEPVEGNEFATLPTINSLTQILNDNLNSDILSSIYKNAIPSAQDYAKNIIKIAENGSHSVKTMQGHHTGNCFKKTEFSDME +# IAATIKATQISDKHFPENEVSMPSSKANVVFRNTPSKTLSYCPPTPTSASIHSNSNANILTRSCSSASSTTSTKSTNNSANTPPEILSIWKNISDSID +# VDEGIGESPSIWNQQGNIIPTAHCSPTVSISPTDSLLGFGEHSVNQKNLHQTKEPTTCSNKQKTQAIQLQPIPDKFMIHRECFVCNENDVTTALVPCG +# HNMFCMECANQICISMEAVCPVCNSIVYHAMRILG] +# end gene contig39.g134 +### +# +# ----- prediction on sequence number 40 (length = 60015, name = contig40) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 40 on both strands +# start gene contig40.g135 +contig40 AUGUSTUS gene 560 4023 1 + . 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ID=contig40.g137 +contig40 AUGUSTUS transcript 38703 57833 . + . ID=contig40.g137.t1;Parent=contig40.g137 +contig40 AUGUSTUS start_codon 38703 38705 . + 0 Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 38703 38793 . + 0 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 42478 42643 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 45426 45606 . + 1 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 47913 48579 . + 0 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 55199 55372 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 55906 56181 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 56309 56669 . + 2 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +contig40 AUGUSTUS CDS 57239 57833 . + 1 ID=contig40.g137.t1.cds;Parent=contig40.g137.t1 +# coding sequence = [atggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgcaacaacttactaccatttaa +# ctgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacgacagaaaattgtcgaactg +# gcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaagatactatgaaacgggcag +# tataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaacgcgagtgcccgagtatat +# ttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaaccgtgttttgcgaaacctg +# gcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactggccgccaacagcagtggaaa +# catcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaactcttcggaaagcggcggcg +# cgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccggatcgggatcgggatcgctg +# gacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagctggtgcacggtaaccagca +# ggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagtgaaattcccatatcatcgg +# cttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaagcctgggaagtgccggccac +# ctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcctccggtgagggtgaaaactc +# caatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaatcgaacatcttttacaaatg +# accagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaagattggtttgccagaggct +# aggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaaattccacaggagctagtgg +# aacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcgggatcagctgcgggtcctt +# cagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcattgagagtaccggcagtcca +# acaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagtttgttcaccgggcccccatgg +# ggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgctatttcgcccagactcaatt +# ttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggtaacacccataccgagcttc +# aaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgccacatgagtctacgaccgcc +# gccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccggccaatctgggagcaaact +# gcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatcaaacttctcaacatcatcc +# agtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaaccacctgggtgttggacacag +# ctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgccaacaacgtgacatcttcct +# cttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtataa] +# protein sequence = [MEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNG +# CVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPA +# NSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESIYEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPH +# SSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGPSVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDG +# HQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERTHYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKL +# RNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNSLPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRH +# GEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNMHHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLT +# PPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYALPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPS +# PCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGKQQFFASCFYSPWV] +# end gene contig40.g137 +### +# +# ----- prediction on sequence number 41 (length = 60014, name = contig41) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 41 on both strands +# start gene contig41.g138 +contig41 AUGUSTUS gene 8694 27824 1 + . ID=contig41.g138 +contig41 AUGUSTUS transcript 8694 27824 . + . ID=contig41.g138.t1;Parent=contig41.g138 +contig41 AUGUSTUS start_codon 8694 8696 . + 0 Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 8694 8784 . + 0 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 12469 12634 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 15417 15597 . + 1 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 17904 18570 . + 0 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 25190 25363 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 25897 26172 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 26300 26660 . + 2 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 27230 27824 . + 1 ID=contig41.g138.t1.cds;Parent=contig41.g138.t1 +# coding sequence = [atggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgcaacaacttactaccatttaa +# ctgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacgacagaaaattgtcgaactg +# gcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaagatactatgaaacgggcag +# tataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaacgcgagtgcccgagtatat +# ttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaaccgtgttttgcgaaacctg +# gcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactggccgccaacagcagtggaaa +# catcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaactcttcggaaagcggcggcg +# cgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccggatcgggatcgggatcgctg +# gacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagctggtgcacggtaaccagca +# ggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagtgaaattcccatatcatcgg +# cttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaagcctgggaagtgccggccac +# ctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcctccggtgagggtgaaaactc +# caatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaatcgaacatcttttacaaatg +# accagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaagattggtttgccagaggct +# aggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaaattccacaggagctagtgg +# aacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcgggatcagctgcgggtcctt +# cagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcattgagagtaccggcagtcca +# acaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagtttgttcaccgggcccccatgg +# ggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgctatttcgcccagactcaatt +# ttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggtaacacccataccgagcttc +# aaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgccacatgagtctacgaccgcc +# gccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccggccaatctgggagcaaact +# gcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatcaaacttctcaacatcatcc +# agtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaaccacctgggtgttggacacag +# ctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgccaacaacgtgacatcttcct +# cttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtataa] +# protein sequence = [MEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNG +# CVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPA +# NSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESIYEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPH +# SSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGPSVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDG +# HQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERTHYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKL +# RNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNSLPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRH +# GEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNMHHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLT +# PPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYALPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPS +# PCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGKQQFFASCFYSPWV] +# end gene contig41.g138 +### +# start gene contig41.g139 +contig41 AUGUSTUS gene 35171 40419 1 + . ID=contig41.g139 +contig41 AUGUSTUS transcript 35171 40419 . + . ID=contig41.g139.t1;Parent=contig41.g139 +contig41 AUGUSTUS start_codon 35171 35173 . + 0 Parent=contig41.g139.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 35171 35483 . + 0 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 37496 37526 . + 2 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 39079 39241 . + 1 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 39536 39677 . + 0 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 40202 40419 . + 2 ID=contig41.g139.t1.cds;Parent=contig41.g139.t1 +# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga +# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt +# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc +# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacatggtaagttttcaattcttgaaaacgaacgacaaatcgacggtttcgcgccgacattcg +# cgaaaaaacccgctatacgacaggaagaagatggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccac +# aacggagcagctgttaaggaatcaatacgccataagcttactgttgataaagacgtccattcatattttgcaacacttgagatactaaatgtaacagt +# tgaggatgctggcaaatacaaagtgaatgcaaagaacgaattgggcgaaagcaacgctacaataagcctgaatttcgacagcgacgaagcccccgtgc +# cggaaagcgcagaaggcattaagccaacttttactgaacgaccagtaattcgtcaaagcgaagatggcggaaatgtaacgttcgaatgtagatgcgtc +# ggagatcccactccaacagtcacatggtacgaaactaatattataataaatatctttaccatacgaaagagatcaaataaacagatccgaagtacccg +# gtag] +# protein sequence = [MGVAEDFAPSFVKKPQLHQEDDGNRLIFECQLLSSPKPDIEWFRSDNKLVEDGRTKFKIQPVEDNKYTVVLELDDVVE +# TDAGLYKVKAKNKSGEVSASINLNFTHGKFSILENERQIDGFAPTFAKKPAIRQEEDGKRLLFECRVNADPIPTIIWFHNGAAVKESIRHKLTVDKDV +# HSYFATLEILNVTVEDAGKYKVNAKNELGESNATISLNFDSDEAPVPESAEGIKPTFTERPVIRQSEDGGNVTFECRCVGDPTPTVTWYETNIIINIF +# TIRKRSNKQIRSTR] +# end gene contig41.g139 +### +# start gene contig41.g140 +contig41 AUGUSTUS gene 40727 55462 1 + . ID=contig41.g140 +contig41 AUGUSTUS transcript 40727 55462 . + . ID=contig41.g140.t1;Parent=contig41.g140 +contig41 AUGUSTUS start_codon 40727 40729 . + 0 Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 40727 41066 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 42768 42957 . + 2 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 43899 44269 . + 1 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 44418 45343 . + 2 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 46703 47044 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 47580 47624 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 47876 47998 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 48304 48399 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 50623 50937 . + 0 ID=contig41.g140.t1.cds;Parent=contig41.g140.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 52323 52448 . + 0 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tcttaaccttaacattgaagcggagcctgagccggagggtgaggggccaacgttcattgaaaagccgcgcattgtatccgaaaacaacggtaaattgg +# ttataatggagtgcaaggtcaaggcagatccaaaaccagatgtaatttggttccgcaacggagaagtcataaaggaaagcaacaaaatcaaaacgttt +# attgagcagcgtggtgaccaatactacattaagctggagctattagatccccaactagaggactctggcctttacaagtgcaacattaagaacaccct +# cggcgagctgaatgcgaatcttacattgaatatagaaattgttcccgtcattaaagataaacctaaaattattaagattatcaaaaaacgaactgtta +# ttatcgagtgcacagttgcatcaaagttcgaacctaagtgtacttggtataaggaaacaaacactgtaaaagaaagcaagagacacgtttacctggtg +# gagcaaactaaggacggagagtttgctgtcaaactagagataaacgatgttgaagagagtgataagggcgcttacaaattggtggctagtaacgaaaa +# aggacaagctgtatctcaagttgtcaatctcgttgatattcccgaggaggaacgcaagcccagcaagccggaaatctcccgaaagctcgttgatcaaa +# aggtttccgagtcaaagactttcgagcttttaatcagtctggcccagtcagatcgcaagtgcaaaatcgagtggtacaagggcagcaccttaatacgc +# gaaaccaaagacattaccaccacgttcgatggaacaactgcacgactcacatttagctcggcaagaacggaacacacttcaaactataaagtcattgt +# 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ID=contig42.g142 +contig42 AUGUSTUS transcript 10721 63391 . + . ID=contig42.g142.t1;Parent=contig42.g142 +contig42 AUGUSTUS start_codon 10721 10723 . + 0 Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 10721 11060 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 12762 12951 . + 2 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 13893 14263 . + 1 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15337 . + 2 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 16697 17038 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 17574 17618 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 18298 18393 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 . + 0 ID=contig42.g142.t1.cds;Parent=contig42.g142.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 . + 0 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agattttataagaaaattgcttgttgccaacaaagaaaagcgtatgactgcacacgaatgtcttctgcatccttggcttactggagatcacaggtcta +# tgacacgggcaattaaccgtgatcgttatctcgcctaccgtgaaaaacttagaaagaaatatgaagattttgagagatatctgttgccaatcggacgc +# ctatcagaatactcatctctgagaaagttgcttatggagaaatataaaatacatgacgccgttttcgatcgtcgtcaagcagcgccacgttttgtgat +# tcgaccatcgtcccagttctgctacgagggtcaaagcgtgaagttctactgccggtgcattgccattgctactcccactcttacctggtctcacaata +# atattgagttgcggcagagtgtcaagtttatgaagcgctatactggggatgactactactttgtcatcaaccgagttaagttagatgatcgaggagaa +# tatattattcgtgcagaaaatcactatggctccagagaagaagtcgtcttcctgaatgttcagcccttaccaaaagaacagccacggtatcgaacgga +# atcaactccggttcgcagacgtgaaccgttgccgtacactttctggcaagaagagtccgagacggcgcccagtttcacattccttttgcggccacgcg +# tcatgcaggcccgcgacacatgcaaactactttgttgtttgagtggcaagccagtgcctactgttaagtggtacaaggacggcagagagctcagcaaa +# tatgagtatgcgatgactcactctgatggagttgtcaccatggaaataatcgactgcaagccatccgattcaggaaaatacagctgtaaggcaacaaa +# ctgtcacggatcagacgaaacagagtgtgtcgtgattgttgaagttcccccagatgattcattaatgtgtaagccagagtttacgaagcccctacacg +# atctaactatccgtgacggtgaacagttgattcttacatgtcacgtgaaaggcgatccagagcctcaaatcacttggtcaaagaatgggaagtcgata +# tcatcttctgatattatggacttaaagtataaaaatggaattgcaactttaaccatcaacgaagttttcccggaggacgagggagtatttacttgtac +# agccacaaattctattcgtgctgtggaaactaaatgcaaactaacaataaagccgctggataagagctcttccaaacgaaaagtagtttccggcgata +# aagcgccaaaaattgtaagtcacttggagtcgagatttgttagggatggcgacgcagttaccttggcctgtcgcattattggagctgaacacttcgat +# gtggtatggttgcacaataacaaagagataaagccaagcaaggatttccagtataccaacgaagccaatatataccgattgcaaatcgccgaaatttt +# ccccgaagatggcggcacctacacctgcgaggcctttaacgatgtaggcgaatcgttcagtacctgcactataaatgtaacagtgcctggagacgagc +# ctaagcatccggcatttgtgaaattccccacatcagtttcacttcttgaaggagaggctaccacattcgagtgcgaattagattcagagcttcttaat +# ttggtttgggttaaagatggcaagcccattgacgaaactctttcacgatactcatttacaaaagatgacaaccgatacgcttttacagttgcgaaatg +# taacatggacgatgttggccaataccaggcgaaggccgttgccagaaagggagaaagtatatgtgcattctcgataaacgttcacaacgccgatgcct +# aa] +# protein sequence = [MISKVILLPTQYRIPDGKSPRFPKKPTIRQEEDLLIMECVLEAHPVPDIVWYCSDKEISDNQRTKMTRKAITKDNYVL +# TLEIQNPTKEDGGNYRCNAINMYGESNANIALNFQVSEISAYTQIDIPTDRRRIEIQIDSASDPDQEYIYFMGLGTLPSTIYIVSDELDDYNIYLSKK +# RCNVKNEYGESNANLNLNIEAEPEPEGEGPTFIEKPRIVSENNGKLVIMECKVKADPKPDVIWFRNGEVIKESNKIKTFIEQRGDQYYIKLELLDPQL +# EDSGLYKCNIKNTLGELNANLTLNIEIVPVIKDKPKIIKIIKKRTVIIECTVASKFEPKCTWYKETNTVKESKRHVYLVEQTKDGEFAVKLEINDVEE +# SDKGAYKLVASNEKGQAVSQVVNLVDIPEEERKPSKPEISRKLVDQKVSESKTFELLISLAQSDRKCKIEWYKGSTLIRETKDITTTFDGTTARLTFS +# SARTEHTSNYKVIVTNEVGKAESSCKITVEKGTKKKEEQPKEKDKSKAEKEKEEKVNKNINTSKCVQDTHQVLESVTAQEIQSKERQVVAKMEEHYIN +# QKSSTQLNTVSVILSDESTSTEVLDEFSQSRKRSLFTLDSTAIEEEENSSDRSIINTEKQEKEGRNVEEEVKSGKKNNKGDEDEKSKVKENPVEPQET +# EALETREPNKTNTKPKSEQTKPKLTDKKDKVAQPEAKTKKDKSTAEPSKDNKQDPNEQRATEQIGLKKVERKASIVSVEEEISAEVRRQSVVKMQDEI +# 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CDS 11722 14394 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 15580 25413 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 25485 26463 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 26524 26865 . + 1 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 27561 28603 . + 1 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 31746 32048 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +contig43 AUGUSTUS CDS 32749 33383 . + 2 ID=contig43.g143.t1.cds;Parent=contig43.g143.t1 +# coding sequence = [atgtccaagaatcttattctgttgttgaagaggaaacagactgaccgaggtgtatatgttaacgtgagcatgctttgta +# attgttttctagactcgactgcttaccttacggttggcatcgaaggcagtccagcacctacattcaagttctacaagggagttagtgagattcttgag +# ggcggtcggtttaagttcctcacagatgggcagacaaacacaattaccttgtgtatgcgtaagtgcaagcccaacgatgagagcaagtacaagattgt +# 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aattcaatatgtgctgaaagtactgttgccagtataaaatcagccccgcctatagcatcactagaatcacaaacaaaatataatagtgatgatagtaa +# cagatgttttaataataacttacatgttggcttaaccaatgaaatcagtaacatcagccaaaaatccactgagtcggcagagttaaccaataaacttc +# cattactcggcgtggagtatcgtactggaattcggccatctccagacgctgctccaacaagtttagcggataaggacatacccaggattcaacaattt +# aaggaatggcatcaagttctccaattaaaatcctacaacaatgagcccttaatcgttttgccttacgttttgcttgaataa] +# protein sequence = [MVVNMDAVLSVICALEGTTITKEQLEATRLAKYINQLRRRTKNEHLARRAKSLLKKWREMVGIQQTAAEFVPHLSQIG +# SQPTQPALDSPKSTALVPDSHLSEPFTQSLPSQQVVPHMQANIDTSEPPPLDVHTELRTNFTNLVNNIHDCEHVEKFNITTLQNLKDRRHPALSRQVG +# SPQPIVNEQSVNSVFNLTHVSTEKINEASVVIDIVSDSDENDNNCASKREKSNLTVPVPLAIPTTPSYRQKKLKKDKKSKDREGQVAQNKRFGTKVSD +# AFVQSSLIADSDIFSLSNSSMSSIFSGDATLGNSQHKTRLSSSELTFTGRFKSVNQLDVSNYSNSSLLTGQNCVLRNNESGKLDEYSAYDSSASCSRL +# SPSTVEDVRKSENVINARLNNATANQMPTPVTSMGYDTNCRTEYLENTSQSQIPKRRGRKKGSKGVDALIAKESSSLSQQIFFGGSTVKKVKTTKELF +# NEIQSRKLSVSMQSSTSNLSNSSTNRELASRAIFPRPTSSCSEPPISDSDTLTSEPSHDSNKSQDIKETTSLDSNSNSLHTLVLERTPKNLMPMNFND 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number 44 (length = 50013, name = contig44) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 44 on both strands +# start gene contig44.g145 +contig44 AUGUSTUS gene 125 9977 1 - . ID=contig44.g145 +contig44 AUGUSTUS transcript 125 9977 . - . 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acacctcccagtctcaaattccaaaaagacggggtagaaaaaaaggatcgaaaggtgtggacgcacttatcgccaaggagtcttctagcctgtctcaa +# caaatattttttggtggttcaactgttaaaaaggttaaaaccacaaaggaacttttcaatgaaattcagagcagaaagttaagtgtttccatgcaatc +# ctcaacaagtaatctttcaaattcttcaacaaatcgggaactggctagccgtgctatttttccaagaccaacgtcgtcctgctcagaacctccaattt +# cggatagtgatacgctcacttcagaaccatcgcacgatagtaataaatcacaagacattaaggaaactacttcattggacagcaatagtaattctctt +# catacattggtcttagaaaggactccaaaaaacttgatgccgatgaattttaacgatgttaccactcaactaatgcacctaattcacagcttgaacag +# cccaatgagtgaacttgaaattgaggaaatgtaccaagctcaaatagtaccatgtacttgcatagttatcgaggaagttcaaagttcattaaaagagc +# ccaaaaaagaagcttcagactctgatatcaacgatccagcaacaagttcaaattgtgataagaatatttctcgccacaagaatgaagaccaagttttt +# aattttgaaagtttggataatgttgaagtaggtgaaattcaaccaaaaacagtgaagtcaatatttgatctagattttgatgataacgacgatccttt +# gaatacaataatggatgaaattcaaaagccaatagttaaacttgaaaatataaaaaaaaacttggataccaaaaatgtatcttttagttcgcctgcac +# aaaacgtttcgttaagtttgctacatattaacgccgatgctcaagctgacaaaaatcatctagaaaaggagaacagcgaaacctacaatgaagtttct +# cctgtttttacggttcatgaggatcctgattgcgtagcaaagaataggttttatgtacaaaccaacagagtgacaagttttcacataaattcattgca +# taatttctacataccaaatataaatggcaattgggatagtgttgactcatctcctagttttcacaatttggactcgtacacagtgacgaatggagctg +# atgttgtacctaaatatggtcttcttacatcagataaaataaaaaaagatctaagttctttaaaatatataaaacctttcaaggcgaaacgttttaaa +# tcgtttatttcaccgtttcttggcgttgcaaagtgtttaccaacgtgtcgacgtgctaaacacaaagttaagaaatggcttaactcttcgattcactt +# cggacaaatttcacaacattttgaagtttccgaaattaaagcagaacataaatttaataattccagtccgctaaaggttaacattgatgttccgattt +# ctggtatcaacagccatattaaaaatcacgtgccaacacaagttaatcccaacatcaatatattaccatcacctgaaactttatttaatacgagctct +# gggaatgctttcagtaatagtttattaaaattggctaatgataataatcctgaaacaagcgatacaagtagtgataacgattatcaaggtgacagtcc +# tcatagtgctagtagttcaagcacttttagcttttctagtttaaaagaaactcaagactccataaatgaaaagcttaaaaataagaggattgaatcac +# tcggcacaaaagcaaagttacatcatcgaaataaaagaatatatgcaggcgatgatatgaaaaaaaaaaaacatttacaaaaagaatttaatattcca +# ggcaagcggataaagactgttttaaatggaaatttgtttaatctgagtagtaataacaacagcagtgatagcgagaatgaagcagagaattataatga +# aaacgaatacgaaaacagtaatagggaggaatatgccattgttcaacgcccactaggtgatggtggagctaccagcaatcatattgtattaacaataa +# agaaaactccaagcaaagtcaattctccagcaaactctatgaatgaagtttcacccaatacatcagatattggaaatttaaaaaagacgattcccaat +# tcttatgtgaaagatgcaactaaaatacgaaatacaactcatatttcgatgggaaaagggaaatcaatatcgaaaacacacaggtcagcttttcggtc +# ccggaacacccgctatcgccaagcagtccaaaaaaacgtaaaaggtcgcattaagactattgatttggaacttaaacatttatttcatttaaaaccaa +# aagccaacaatcatatttcagatttaaagcttcacaataaattgtttttccaccacgaattgtgcatagagaatgataggaagaagaaaaagttaaaa +# aaagttcatcttttggtgcacataacttag] +# protein sequence = [MVVNMDAVLSVICALEGTTITKEQLEATRLAKYINQLRRRTKNEHLARRAKSLLKKWREMVGIQQTAAEFVPHLSQIG +# SQPTQPALDSPKSTALVPDSHLSEPFTQSLPSQQVVPHMQANIDTSEPPPLDVHTELRTNFTNLVNNIHDCEHVEKFNITTLQNLKDRRHPALSRQVG +# SPQPIVNEQSVNSVFNLTHVSTEKINEASVVIDIVSDSDENDNNCASKREKSNLTVPVPLAIPTTPSYRQKKLKKDKKSKDREGQVAQNKRFGTKVSD +# AFVQSSLIADSDIFSLSNSSMSSIFSGDATLGNSQHKTRLSSSELTFTGRFKSVNQLDVSNYSNSSLLTGQNCVLRNNESGKLDEYSAYDSSASCSRL +# SPSTVEDVRKSENVINARLNNATANQMPTPVTSMGYDTNCRTEYLENTSQSQIPKRRGRKKGSKGVDALIAKESSSLSQQIFFGGSTVKKVKTTKELF +# NEIQSRKLSVSMQSSTSNLSNSSTNRELASRAIFPRPTSSCSEPPISDSDTLTSEPSHDSNKSQDIKETTSLDSNSNSLHTLVLERTPKNLMPMNFND +# VTTQLMHLIHSLNSPMSELEIEEMYQAQIVPCTCIVIEEVQSSLKEPKKEASDSDINDPATSSNCDKNISRHKNEDQVFNFESLDNVEVGEIQPKTVK +# SIFDLDFDDNDDPLNTIMDEIQKPIVKLENIKKNLDTKNVSFSSPAQNVSLSLLHINADAQADKNHLEKENSETYNEVSPVFTVHEDPDCVAKNRFYV +# QTNRVTSFHINSLHNFYIPNINGNWDSVDSSPSFHNLDSYTVTNGADVVPKYGLLTSDKIKKDLSSLKYIKPFKAKRFKSFISPFLGVAKCLPTCRRA +# KHKVKKWLNSSIHFGQISQHFEVSEIKAEHKFNNSSPLKVNIDVPISGINSHIKNHVPTQVNPNINILPSPETLFNTSSGNAFSNSLLKLANDNNPET +# SDTSSDNDYQGDSPHSASSSSTFSFSSLKETQDSINEKLKNKRIESLGTKAKLHHRNKRIYAGDDMKKKKHLQKEFNIPGKRIKTVLNGNLFNLSSNN +# NSSDSENEAENYNENEYENSNREEYAIVQRPLGDGGATSNHIVLTIKKTPSKVNSPANSMNEVSPNTSDIGNLKKTIPNSYVKDATKIRNTTHISMGK +# GKSISKTHRSAFRSRNTRYRQAVQKNVKGRIKTIDLELKHLFHLKPKANNHISDLKLHNKLFFHHELCIENDRKKKKLKKVHLLVHIT] +# end gene contig44.g145 +### +# start gene contig44.g146 +contig44 AUGUSTUS gene 11632 17081 1 - . ID=contig44.g146 +contig44 AUGUSTUS transcript 11632 17081 . - . ID=contig44.g146.t1;Parent=contig44.g146 +contig44 AUGUSTUS CDS 11632 12468 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 13947 14852 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 16977 17081 . - 0 ID=contig44.g146.t1.cds;Parent=contig44.g146.t1 +contig44 AUGUSTUS start_codon 17079 17081 . - 0 Parent=contig44.g146.t1 +# coding sequence = [atgctcagcagcaccggaaccagtatcatacgctgcgcccgaagccgggtcggaaacctctttaaacttctgaatgaaa +# tacgacttattataccatctgaaaagacccattacgttagcatgaccgacattgatgcaagtgctcaacagcaacaacatctccaaaacgtgcagagg +# ttgcaacacgaaaactgccttcaggagttacacaatcaactgaacagccagttcggggcagctcgatttgcggccccaaatcctcaccaggcagtttc +# aattacttccggaaacttggttccatttcttccggccttcctacagcccccgatgcctgctcaacaacttttgcagttgattcccggccatgcgggtc +# cccaaactgtcgcccaccacggtcacccgcaaactgactcatccagcgcacacaaaatggctctagctcctatgtggtccactgcggcggtggcggct +# gcgcacattcaggccgctctggcggctgcagcggtagcggctgcaagtaatagtaatttttccagcaacaacaacgtgctggcttcatcgactagtgt +# taatgagccatcgagcacagactcctccgcatctgtaccattaatggagatcggagaaatgagaagaggcggaattggaggagccagcttgtcaaggc +# cagagtccccgggttacgaaaatccaccttactcaatcctctcttatagccacaacacacctccggaatcgccgcatggtcgaacagctgaatgttcc +# aagaactttgcaccttcgccggcggacaatcacagcatggcaagcctatccgaagcccaagactcggaaatggatgcaccattgaatctcagcaagcc +# aaagggatcgcccagttcttcgccaaacagctcttctcaaaaggaccacagtgaaagccttgctcctgtggtgtccagtccacccctaagctggcatc +# aagggcaaaaacattatgccgagatagaatcgcctcttttaaagagtcatggaagattatggaactcaacagtcgtcggttctgggggatcacgtgca +# acgcgcatgagtcgcgactcgttaaacagctgtggcacaaattcagaacgatctgctgccctggaacgtgaaggcaacaacgcaagtcaacttggccc +# tgtacctcggtcgccgtcatctcacccactgaggcaaggcaatggtcatgggcatggacacggccatagccacgggcacggacacagcaagccccata +# ttaaaagacccatgaatgcattcatggtgtgggcaaaggatgagcgaagaaagatattgaaggcatgcccagatatgcacaactcgaatatatcaaaa +# attctgggtgctcgctggaaggcaatgtctaatgccgacaaacagccatattacgaagaacagtcaaggctttcgaagcttcacatggagcagcatcc +# cgattaccgctacagaccacggccgaagcgcacctgtattgtggatggcaaaaagatgcgtatttccgagtataaagtcctgatgcgtaatcggcggg +# ctgagatgagacagctatggtgccggacaagcggagtcagtggtagctcgggaagtgcctgcgccgatgcctgtccaaagggacaccccggcggatca +# aatgcccaggcagcagtcgcagccgctgcagctgtgtaccacttgcaggatatggcatctgcagcagcgtccaccgttcatggcaatgactgtgggca +# cacacccccccaacagttcttctatcctccagaaagcttgtcaccgtctggtttttcatccgacgaaggagaattgccgtctcagcgtgagctggacg +# actaa] +# protein sequence = [MLSSTGTSIIRCARSRVGNLFKLLNEIRLIIPSEKTHYVSMTDIDASAQQQQHLQNVQRLQHENCLQELHNQLNSQFG +# AARFAAPNPHQAVSITSGNLVPFLPAFLQPPMPAQQLLQLIPGHAGPQTVAHHGHPQTDSSSAHKMALAPMWSTAAVAAAHIQAALAAAAVAAASNSN +# FSSNNNVLASSTSVNEPSSTDSSASVPLMEIGEMRRGGIGGASLSRPESPGYENPPYSILSYSHNTPPESPHGRTAECSKNFAPSPADNHSMASLSEA +# QDSEMDAPLNLSKPKGSPSSSPNSSSQKDHSESLAPVVSSPPLSWHQGQKHYAEIESPLLKSHGRLWNSTVVGSGGSRATRMSRDSLNSCGTNSERSA +# ALEREGNNASQLGPVPRSPSSHPLRQGNGHGHGHGHSHGHGHSKPHIKRPMNAFMVWAKDERRKILKACPDMHNSNISKILGARWKAMSNADKQPYYE +# EQSRLSKLHMEQHPDYRYRPRPKRTCIVDGKKMRISEYKVLMRNRRAEMRQLWCRTSGVSGSSGSACADACPKGHPGGSNAQAAVAAAAAVYHLQDMA +# SAAASTVHGNDCGHTPPQQFFYPPESLSPSGFSSDEGELPSQRELDD] +# end gene contig44.g146 +### +# start gene contig44.g147 +contig44 AUGUSTUS gene 21455 44459 1 + . ID=contig44.g147 +contig44 AUGUSTUS transcript 21455 44459 . + . ID=contig44.g147.t1;Parent=contig44.g147 +contig44 AUGUSTUS start_codon 21455 21457 . + 0 Parent=contig44.g147.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 21455 21722 . + 0 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 27693 27777 . + 2 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 38180 38239 . + 1 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 +contig44 AUGUSTUS CDS 44339 44459 . + 1 ID=contig44.g147.t1.cds;Parent=contig44.g147.t1 +# coding sequence = [atgagcgctgagatctcggaaactataagagctagaaaagtcagacttgacatgcagattccgggcttcctgcgcagcg +# caagtttgtttcagcggggtgccacgccaactctattacgccgatccgcgaaaatcagtagcgcctacagtttttatgatagaaacaaaattttaact +# gaaaaaatttgcaacgtccactctcacgctcacaaacggtttaaacgcttaaatctgtgtgccgcccatataacatctactgaaatagccggcgagtg +# gcgagtcttgcctgacgagtttatgtttcgaccatgtctaatgctcaacctatttgacgtatattgtcgagtgtgttgaaacgaaattttaactgtcg +# atacctatcgtttcgtcaaaacatttttccacacccactggacagcaaactcaaaccggaaaattcagaattcattagatcttttgcgcattgacaat +# aacaagcagcccatcatcatcgtcaatcatccccttcttttcagcgccgcattggacagataa] +# protein sequence = [MSAEISETIRARKVRLDMQIPGFLRSASLFQRGATPTLLRRSAKISSAYSFYDRNKILTEKICNVHSHAHKRFKRLNL +# CAAHITSTEIAGEWRVLPDEFMFRPCLMLNLFDVYCRVCXNEILTVDTYRFVKTFFHTHWTANSNRKIQNSLDLLRIDNNKQPIIIVNHPLLFSAALD +# R] +# end gene contig44.g147 +### +# +# ----- prediction on sequence number 45 (length = 50013, name = contig45) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 45 on both strands +# start gene contig45.g148 +contig45 AUGUSTUS gene 1628 7077 1 - . ID=contig45.g148 +contig45 AUGUSTUS transcript 1628 7077 . - . 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ID=contig46.g150.t1;Parent=contig46.g150 +contig46 AUGUSTUS CDS 2792 2902 . - 0 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 12474 12591 . - 1 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 18426 18548 . - 1 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 18842 19001 . - 2 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 19456 19528 . - 0 ID=contig46.g150.t1.cds;Parent=contig46.g150.t1 +contig46 AUGUSTUS start_codon 19526 19528 . - 0 Parent=contig46.g150.t1 +# coding sequence = [atgcggctgctccagcacgtgctggcattaaaaatgaatatagctcgaaagggccaaatggagaagtccacaatccgag +# ctgcgcggctaacttattctactaaatggacggcagtacacgtagtggcgaagtggcgcaagaagcgagcgaagacaagtactatatatagccgcaga +# attgaaaatctgatattatggtccgatcgtaaggatacaccaatcgtaaggttaagcgtcacaagaagagtcgacctagccatgtccgtccgtctgtc +# cgtccgtttctacgcaaacttgtctctcagttttgaagctatcgggctgaaactttcccaaaagtcttctttctattgcagagaccgccgatatgccg +# atatgccgcctcctgaggaagaacaaacaaatgagaaggaacgctccgatctagagatgattaaacaacttcaaataatacaaagtcgattactttgt +# cagcataaagatattcggaaagtttttgtggcgcaagatagaaataaagttcgcaaagatgtcttatatatgaagatatgtgttcagatgtgttccgt +# ttcttctgcggtatga] +# protein sequence = [MRLLQHVLALKMNIARKGQMEKSTIRAARLTYSTKWTAVHVVAKWRKKRAKTSTIYSRRIENLILWSDRKDTPIVRLS +# VTRRVDLAMSVRLSVRFYANLSLSFEAIGLKLSQKSSFYCRDRRYADMPPPEEEQTNEKERSDLEMIKQLQIIQSRLLCQHKDIRKVFVAQDRNKVRK +# DVLYMKICVQMCSVSSAV] +# end gene contig46.g150 +### +# start gene contig46.g151 +contig46 AUGUSTUS gene 20080 35855 1 - . ID=contig46.g151 +contig46 AUGUSTUS transcript 20080 35855 . - . ID=contig46.g151.t1;Parent=contig46.g151 +contig46 AUGUSTUS CDS 20080 20212 . - 1 ID=contig46.g151.t1.cds;Parent=contig46.g151.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 35704 35855 . - 0 ID=contig46.g151.t1.cds;Parent=contig46.g151.t1 +contig46 AUGUSTUS start_codon 35853 35855 . - 0 Parent=contig46.g151.t1 +# coding sequence = [atgctgcaaatagcgtcgatccgccgggacgacataagacgacagtcgacgggaatgcagcagggaaaactagttgtat +# tgtcgacgctaatgctgttgctttttttagccgatgcaacaaaaaaggaacaagacactcgaaataacaacagcatcgaccgattacattttttgaat +# tgtattccaatttctcaagagcggaagttaatatgtaggaaagcacagcagctaaatttccgcggtgtccggtacggcttcttccgacttttgtacta +# cctgcaatag] +# protein sequence = [MLQIASIRRDDIRRQSTGMQQGKLVVLSTLMLLLFLADATKKEQDTRNNNSIDRLHFLNCIPISQERKLICRKAQQLN +# FRGVRYGFFRLLYYLQ] +# end gene contig46.g151 +### +# start gene contig46.g152 +contig46 AUGUSTUS gene 37008 37634 1 + . ID=contig46.g152 +contig46 AUGUSTUS transcript 37008 37634 . + . ID=contig46.g152.t1;Parent=contig46.g152 +contig46 AUGUSTUS start_codon 37008 37010 . + 0 Parent=contig46.g152.t1 +contig46 AUGUSTUS CDS 37008 37634 . + 0 ID=contig46.g152.t1.cds;Parent=contig46.g152.t1 +# coding sequence = [atgtgcatgcgatctgccgaatcatacggaaagacttgggcaagtactgcaatattgttgcggttgcactcgaatctac +# atacatgcacggacttagaagaacatgcgtactcaaaaaccagtccgctgcgagccatcgcatacaagatctccaactcctctgagccagctactgat +# gagatactcctcccttgccgcgcctcctcgagcatcgagcagcgcgagcagcgaatttcgattccagttctgatcgcagacagcccctggcccctggc +# ccctggcccccggcccccggccaccttcccgaagacattctcgcgtggcaatgcacctgtcgcgaccaatgcttgtatgctgcagcaaccggcaccag +# agactacgatgaatcaggacggctggccgggccatgggccagagatctcagagcgttgggagaagctaacgacgtggcaagaggaaacattttacgac +# cgtcatggggagttcgtatactgccactgcgtaggtacacactgtactcacctttccttgcagagcccggttgagcctgagagattgcgcatctccga +# ggtgtactcctgtgaccaggcgcaagaaagaccgctttataagccgtttgcatgttag] +# protein sequence = [MCMRSAESYGKTWASTAILLRLHSNLHTCTDLEEHAYSKTSPLRAIAYKISNSSEPATDEILLPCRASSSIEQREQRI +# SIPVLIADSPWPLAPGPRPPATFPKTFSRGNAPVATNACMLQQPAPETTMNQDGWPGHGPEISERWEKLTTWQEETFYDRHGEFVYCHCVGTHCTHLS +# LQSPVEPERLRISEVYSCDQAQERPLYKPFAC] +# end gene contig46.g152 +### +# start gene contig46.g153 +contig46 AUGUSTUS gene 38592 42084 1 + . 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ID=contig51.g167 +contig51 AUGUSTUS transcript 30365 47091 . + . 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ID=contig52.g168.t1;Parent=contig52.g168 +contig52 AUGUSTUS start_codon 357 359 . + 0 Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 357 541 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 6203 6297 . + 1 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 7178 7576 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 . + 1 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 13105 13211 . + 2 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 15206 15454 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 . + 0 ID=contig52.g168.t1.cds;Parent=contig52.g168.t1 +# coding sequence = [atgtttcaagacttcaaggcccagctccttatattcaaacctccagccgagtgtatgtctcggacttttgaggtaaccg +# tgtgggtgctcatccgattccgcatgtcggggctgtacatcattgtagccgattcatatcagctgattcgtgacaacacgctctgttttaagtgcggt +# ttgtggacgatcagaaaccgagtcgatctagccatgtccgtctgtccgtccgtccgtatggacgctgagatctcgaaatctagagctagagcagtcag +# acttggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggacactt +# ctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttcagtg +# tctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttgatct +# atttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacactcgg +# agggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgcagca +# gacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccgcat +# tcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttggagg +# atattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaaagg +# aacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccactga +# gataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttgttg +# tggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcaccac +# cataatcttgccggcagcgaagtcaagtttgatcgtcagggcgatggattggcaaggtatgatattttaaattatcaacgtctggaaaactcatctgg +# atatcagtataagggagatacctgttgctggatatgcgacagctgcgaatccttcgaatacgtatatgacgagtttacatgtaaggactgcggtccag +# gactttggccttatgcagacaagctttcctgctttgctttagatattcaatacatgcgatggaactccttatttgctctaatacccatggccatagca +# atattcggtattgctgtgacaattatagtaatgctactatttgcaaaaaatcacgatactccattggtgtacatcctcgtctttcacccggataaaaa +# cgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacacagg +# caggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggccaa +# tcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaatta +# a] +# protein sequence = [MFQDFKAQLLIFKPPAECMSRTFEVTVWVLIRFRMSGLYIIVADSYQLIRDNTLCFKCGLWTIRNRVDLAMSVCPSVR +# MDAEISKSRARAVRLGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISPA +# STAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNAR +# GVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEPV +# SDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHNLAGSEVKFDRQGDGLAR +# YDILNYQRLENSSGYQYKGDTCCWICDSCESFEYVYDEFTCKDCGPGLWPYADKLSCFALDIQYMRWNSLFALIPMAIAIFGIAVTIIVMLLFAKNHD +# TPLVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPEE +# CECAEAFCNRVKN] +# end gene contig52.g168 +### +# start gene contig52.g169 +contig52 AUGUSTUS gene 22432 33438 1 - . ID=contig52.g169 +contig52 AUGUSTUS transcript 22432 33438 . - . ID=contig52.g169.t1;Parent=contig52.g169 +contig52 AUGUSTUS CDS 22432 22673 . - 2 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 23377 23751 . - 2 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 . - 0 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30399 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 31600 31650 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 32272 33084 . - 1 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 33335 33438 . - 0 ID=contig52.g169.t1.cds;Parent=contig52.g169.t1 +contig52 AUGUSTUS start_codon 33436 33438 . - 0 Parent=contig52.g169.t1 +# coding sequence = [atgtccatgccaaaagtcgaattgagtatcagtatcgcccaatctgaacttcgtaaacacgttttccgctggagcgaag +# ttatagatttcctcgtctctttatatagtatttgtatgaaattttgtgtaaaaaataaaattaagtgctccgaaacacttgaaatgttgacagtggca +# tacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgccgggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacg +# cccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcg +# gtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaa +# aagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggt +# atatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtca +# aagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatggtcgtacggtcaataaacagtattatctggaagtt +# atgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttgcatcacgataatgcccctgctcacggcca +# aaaacaacaccacaataatgcctcagccaccatatttaccggatttggtcccatcgctgttccgctcacgctgcaggaagtcaccaagcatcctgaga +# atggctggtacaccagagcagatcttttagctctacgatatgaaggtaaaagtcgacagcgcccgcactgtagaaatcgaactgagttacatacattg +# 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atgcagatggtgcaagggaaatcatttggtattcctgacagttccgattctggcaatgtgattaaaaataatagcaacgcatctcccggctaccccag +# agatgaacggatgccatcaccaaccaataatcagttggcgcaatggttttctccagagcttcttgcaaaagcttcagctggaaaactgcctcttctga +# atatgaaccaagcgctaagtttagaagaattcgaacgtagcattcaacattcctcagccgtcgtgcacaattaa] +# protein sequence = [MSMPKVELSISIAQSELRKHVFRWSEVIDFLVSLYSICMKFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGKTVLSKKNVYKWYKLFP +# DCREDANDEPRSGRPSTSTTDENVQAVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMGRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIVQELLDDVNDDP +# DLLKRVIAGDESWVYGYDIETKAQSSQCKSPGEPRPKKARQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHQEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLREAIRKKRPELWKNN +# SWLLHHDNAPAHGQKQHHNNASATIFTGFGPIAVPLTLQEVTKHPENGWYTRADLLALRYEGKSRQRPHCRNRTELHTLGFWKVNLNAVSLSVANNYS +# NQNKNRLSPEADSSSLNCSNSASMSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSG +# TNNGETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNT +# ETEKDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQ +# LETIDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTES +# EFNFDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIELISQNTANHAMNPLITHGNSPTPLAFTPTSVLRKMT +# ADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTAPIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGIPDSSDSGN +# VIKNNSNASPGYPRDERMPSPTNNQLAQWFSPELLAKASAGKLPLLNMNQALSLEEFERSIQHSSAVVHN] +# end gene contig52.g169 +### +# start gene contig52.g170 +contig52 AUGUSTUS gene 34926 35273 1 - . ID=contig52.g170 +contig52 AUGUSTUS transcript 34926 35273 . - . ID=contig52.g170.t1;Parent=contig52.g170 +contig52 AUGUSTUS CDS 34926 35098 . - 2 ID=contig52.g170.t1.cds;Parent=contig52.g170.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 35222 35273 . - 0 ID=contig52.g170.t1.cds;Parent=contig52.g170.t1 +contig52 AUGUSTUS start_codon 35271 35273 . - 0 Parent=contig52.g170.t1 +# coding sequence = [atgccaacgtttccaaagcggtttatgggaacatttagacgggatggctccgacaactcctcgaaagttaaggctgacg +# atcccattatcctctccatatctagcttgatggaccgaactctggtttcccagattcctttgaaatgtggacggtataagatggcacaagattcttcg +# ttggcgaagaagtttcgttcttgcgttgctccatggctagcagcctaa] +# protein sequence = [MPTFPKRFMGTFRRDGSDNSSKVKADDPIILSISSLMDRTLVSQIPLKCGRYKMAQDSSLAKKFRSCVAPWLAA] +# end gene contig52.g170 +### +# start gene contig52.g171 +contig52 AUGUSTUS gene 36108 39112 1 - . ID=contig52.g171 +contig52 AUGUSTUS transcript 36108 39112 . - . ID=contig52.g171.t1;Parent=contig52.g171 +contig52 AUGUSTUS CDS 36108 36261 . - 1 ID=contig52.g171.t1.cds;Parent=contig52.g171.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 39006 39112 . - 0 ID=contig52.g171.t1.cds;Parent=contig52.g171.t1 +contig52 AUGUSTUS start_codon 39110 39112 . - 0 Parent=contig52.g171.t1 +# coding sequence = [atgtctaagatgagtaacgattttcggcccgaaatcaattctgaactattaaacgaatttattcaaagcaataaaaaag +# gggtggggaggatatggataaaagaacagtacaaccaaggaaaacatggaaggtccgtctccgaaaatgaatgcgagtccgaacgagcctttatcaag +# gcggatttcgatcgccgtacccgtttaaagagtaacatcgtcgaccaacttatgttctttaataaaatttatgatctcatttaa] +# protein sequence = [MSKMSNDFRPEINSELLNEFIQSNKKGVGRIWIKEQYNQGKHGRSVSENECESERAFIKADFDRRTRLKSNIVDQLMF +# FNKIYDLI] +# end gene contig52.g171 +### +# +# ----- prediction on sequence number 53 (length = 50013, name = contig53) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 53 on both strands +# start gene contig53.g172 +contig53 AUGUSTUS gene 2425 13431 1 - . ID=contig53.g172 +contig53 AUGUSTUS transcript 2425 13431 . - . 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tacggtaaaactgttctgagtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttcccagattgccgggaagatgccaatgacgagcctcgctctggacg +# cccaagcacgtcaacaactgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcgaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcg +# gtatatcacttggctcgtgccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgggtcgcgtgtcagcgaagtttgttccaaaattgctgagttttgaccaa +# aagaaccgtcgcatgagcatcgttcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcatagctggtgacgaatcatgggt +# atatgggtatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatgtaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcacgccaagttcgatcgaatgtca +# aagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatcaggagttcttaccatatggtcgtacggtcaataaacagtattatctggaagtt +# atgcgccgtttgcgagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttgcatcacgataatgcccctgctcacggcca +# aaaacaacaccacaataatgcctcagccaccatatttaccggatttggtcccatcgctgttccgctcacgctgcaggaagtcaccaagcatcctgaga +# atggctggtacaccagagcagatcttttagctctacgatatgaaggtaaaagtcgacagcgcccgcactgtagaaatcgaactgagttacatacattg +# ggtttttggaaagtaaacttaaacgcagtttcactaagtgtagccaacaactactcaaatcaaaataagaaccggctatctccggaggcggatagctc +# gagcctaaattgctccaatagcgcttcaatgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacag +# aatcccttcaaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcata +# tcatcatctcaccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtg +# tgatgctgcaccaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacac +# gcttgaattatgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttg +# ttgcccagaagtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgc +# aagcgttgctaatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttc +# aaaatgacacgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgca +# aactcctatcacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaa +# caatgaagaccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaata +# gcaacgtcagtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactc +# tgcaaacaaaatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttgga +# taattccctaatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataata +# atgaacttccaggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattgaattgatttcgcaaaatactgccaaccatgcgatgaatccgttaattactcat +# ggcaactcgccaactcctttggcatttactcctacatcagtactgaggaaaatgacagccgataaggaaacaactcaaacaccgagttcttctcatag +# ccaacagccacaatatcaaatgcatccacagcatgccaagcaacttagtgagacgcagccaacagcacctatagccgtgcagcctcgaatgatattgg +# gaggtggaaactttgtcattggcccaaataaccaaccaatatctcccaatttgcaacagtgccgaaatcaacagggaataaaatggactcctggtaat +# atgcagatggtgcaagggaaatcatttggtattcctgacagttccgattctggcaatgtgattaaaaataatagcaacgcatctcccggctaccccag +# agatgaacggatgccatcaccaaccaataatcagttggcgcaatggttttctccagagcttcttgcaaaagcttcagctggaaaactgcctcttctga +# atatgaaccaagcgctaagtttagaagaattcgaacgtagcattcaacattcctcagccgtcgtgcacaattaa] +# protein sequence = [MSMPKVELSISIAQSELRKHVFRWSEVIDFLVSLYSICMKFCVKNKIKCSETLEMLTVAYGKTVLSKKNVYKWYKLFP +# DCREDANDEPRSGRPSTSTTDENVQAVKKIVLENRRITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMGRVSAKFVPKLLSFDQKNRRMSIVQELLDDVNDDP +# DLLKRVIAGDESWVYGYDIETKAQSSQCKSPGEPRPKKARQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHQEFLPYGRTVNKQYYLEVMRRLREAIRKKRPELWKNN +# SWLLHHDNAPAHGQKQHHNNASATIFTGFGPIAVPLTLQEVTKHPENGWYTRADLLALRYEGKSRQRPHCRNRTELHTLGFWKVNLNAVSLSVANNYS +# NQNKNRLSPEADSSSLNCSNSASMSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSG +# TNNGETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNT +# ETEKDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQ +# LETIDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTES +# EFNFDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIELISQNTANHAMNPLITHGNSPTPLAFTPTSVLRKMT +# ADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTAPIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGIPDSSDSGN +# VIKNNSNASPGYPRDERMPSPTNNQLAQWFSPELLAKASAGKLPLLNMNQALSLEEFERSIQHSSAVVHN] +# end gene contig53.g172 +### +# start gene contig53.g173 +contig53 AUGUSTUS gene 14919 15266 1 - . 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ID=contig53.g174.t1;Parent=contig53.g174 +contig53 AUGUSTUS CDS 16101 16254 . - 1 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 +contig53 AUGUSTUS CDS 20270 20483 . - 2 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 +contig53 AUGUSTUS CDS 23027 23128 . - 2 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 +contig53 AUGUSTUS CDS 23228 24410 . - 0 ID=contig53.g174.t1.cds;Parent=contig53.g174.t1 +contig53 AUGUSTUS start_codon 24408 24410 . - 0 Parent=contig53.g174.t1 +# coding sequence = [atgataacccgaagggaagcggagcgactctgcaagagttttctgggcgacaacacacctccgcggctccctgacgact +# tcgccttcaacgtccagcacaaatgtgcttggggctgccgcggatcgtttttaccttctcgctacaactcgtctagggccaaatgcatcaagtgctca +# tattgtgggatgtttttttcgccaaataagtttattttccactcacaccgcataacgaccaatgacaggtatgttcagcccgatgcggcgaactttaa +# ttcctggcgtcgacacatgacactgagtgggaatacttacgacgagaagataatccacgcgtgggaagatgtcaaggccatgttcaatggcggaactc +# gaaagcgacttgttggcagcagcattaataatcgaaatatgggctcgcccacgccttctgcggcagtgagctcctgtgggtccccaacgagtattgag +# cgagaccccaaggaaggcgacggcgaatcggagtctccagagttcccacaacgacagattgatagccagtttaactatagtactgtagccacagccgc +# cgctgtggttggcgtaacggcggtagcagccgctactgtcggtgttcctttcaacttgcacggttctactgtcctgtcccctttgcactcgcttcgga +# atgatcgggacctttccctaatgcccatctccagaaactttgtagtggactacatgtggcagcagaaggacggacactaccaacatcagtattcaaag +# aaactcagtggcggtgaacccagcgagcaaagcctggacttcgagtcctgctcccgatcatggactagacctgacacgaatgtttcaataccgactgg +# aagttctttaaggctttcggataatactccttttaatataaaaaacgagtcacactcatctatttgtggcattatcaaaaaccgaaagctatctgcag +# ctacgagcagcgggttaagcctctctgattataacattccctcgattcttaactgctctgcgtttaaaccagtcgtcgcttcgactgcaattgtgtca +# acctccttatacactagatccagtgactcaaagcgaactgattatataaacccaacacaatctacaaggacgacaactgttctaacgcataacagcat +# ttcgggttcgtcgcaccaaatagtagaaaagccaactgaatctgctttagtcaactgcctacccaggaatgttaatgataccgacgatgacgacgaag +# tcgtggatattgagacaacggaagatgaaggtaaagtagacacccatcaacaagcagtcccgtgcaagttaccccgcaggttcacaattcatcacgaa +# gtcgttgggcagagccgaatgaaaaggcagctaaaccgacgcgttctctctcggggaccgcgaatagaacgcacaaaaagtttcagtagtacatgtgg +# tggtactttgaaagaaagcaaatctatgatcgtccgaaaaattgaaaggtacaaccaaggaaaacatggaaggtccgtctccgaaaatgaatgcgagt +# ccgaacgagcctttatcaaggcggatttcgatcgccgtacccgtttaaagagtaacatcgtcgaccaacttatgttctttaataaaatttatgatctc +# atttaa] +# protein sequence = [MITRREAERLCKSFLGDNTPPRLPDDFAFNVQHKCAWGCRGSFLPSRYNSSRAKCIKCSYCGMFFSPNKFIFHSHRIT +# TNDRYVQPDAANFNSWRRHMTLSGNTYDEKIIHAWEDVKAMFNGGTRKRLVGSSINNRNMGSPTPSAAVSSCGSPTSIERDPKEGDGESESPEFPQRQ +# IDSQFNYSTVATAAAVVGVTAVAAATVGVPFNLHGSTVLSPLHSLRNDRDLSLMPISRNFVVDYMWQQKDGHYQHQYSKKLSGGEPSEQSLDFESCSR +# SWTRPDTNVSIPTGSSLRLSDNTPFNIKNESHSSICGIIKNRKLSAATSSGLSLSDYNIPSILNCSAFKPVVASTAIVSTSLYTRSSDSKRTDYINPT +# QSTRTTTVLTHNSISGSSHQIVEKPTESALVNCLPRNVNDTDDDDEVVDIETTEDEGKVDTHQQAVPCKLPRRFTIHHEVVGQSRMKRQLNRRVLSRG +# PRIERTKSFSSTCGGTLKESKSMIVRKIERYNQGKHGRSVSENECESERAFIKADFDRRTRLKSNIVDQLMFFNKIYDLI] +# end gene contig53.g174 +### +# +# ----- prediction on sequence number 54 (length = 35008, name = contig54) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 54 on both strands +# start gene contig54.g175 +contig54 AUGUSTUS gene 759 4405 1 - . 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ID=contig55.g178 +contig55 AUGUSTUS transcript 22643 33180 . + . 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tttaaatgctcaattgttgggtgataccatttactgcgatagcatggagtttcagtacacctcaagatcgcccaatttgacagccacattcgctgtta +# tatggggtggttccaaacctcttgacaaccctcataatatacatgttgttatttatcgatgtcgagaaatggccgatagctgtggaatttgtttagcc +# ctagccgaaaagtacaattgcggatggtgttcttctactaatacatgcgaagttgaagagcaatgtaataagaacaaagaggggaaaactgattggtt +# aaatcgaagtgaaatttgcccaaaccctgaaattcacactttcgaaccgaaaacgggtccctgggaaggaggaactaacataacaattcgtggtatca +# atttgggcaaaaattataacgatatttattcaggcgttcgaatagctgggataaattgtatgccgtttccgcaattttacattgacacaaagcaaatc +# gtatgtactgtagatagtcctggagaacaaatgtacagaaacggcaaaatagtggtacaaataggggattatcgaggtgaatctaaggaagactacga +# atttgttgacccgaaaattttggattttaatcctaagtttggtccaacttctggtggaactgaaatacatataactggaaagcacttaaatgcaggct +# ctcgtatacaagcatcaataaatgatcatttgccctgcaaaattctaagcacagattcttcacaagctatatgtcgcacttcaccttctcctggtatc +# attgaaggaaggctaaaaatgtcgttcgataatggtccccgagagtttaatgactataacttcaaatatgttctggatcctacagttgaacacgttag +# ttcagggccaagtggacaaataaagataccgaaaggaataccagctgggggcattcgaatttccgtgattggtacccaattcaccagtattcaaaatc +# ccaacatttacgtagtatacaatggagagatatatgcaagccaatgccgagtgcaatcggatactgaaatggaatgctcatctccagctatcgacgtg +# gacagcaaaattattgaagcagaaaggccaatgcttctagaatatgggttccttatggataatgttttgcgggtacaaaatttatcgaagattcataa +# taaccatttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttaa] +# protein sequence = [MNFILSVLLIATLGDKYDHRLNLIAGSQTLAANIWSDKTAIQNEPINMTDVNATVKDANNHSTTITNVATFDTKLNHL +# LVDTITGRVFVGGVNRLYQLSPDLELSETVKTGPQNDSVECSILDCPLNAVRSPTDNYNKVLLIDRATSRLISCGSLFQGTCTVRNLQNVSIIEHEVP +# DAVVANDANSSTVAFIAPGPPQHPVTNVMYVGVTYTNNSPYRSEIPAVASRSLEKTKMFQIASSAVTTGTRTFINSYARETYFVNYVFGFSSERFSYF +# LTTQLKHSHHSSPKEYITKLVRICQEDSNYYSYTEIPVECISDAQGGTKFNLVQAGFLGKPSSDLAQSLGISIQDDVLFAAFSKGDGNTPTNNSALCI +# YSLKSIRRKFMQNIKSCFNGNGMRGLDFISPSMPCVLTKLQTIGEDFCGLDVNSPLGGENPITSVPVAMFNTKLTSVAATSTSGYTVVFVGTADGYLK +# KVVVESSSVANEYASFPVDLGSEINQDMQFDNQNLYMYVMSETKVSKVKVFDCSDYKTCGECLGARDPYCGWCSLENKCSPRSNCQDDANDPLYWVSY +# KTGKCTTITSVVPHQLQRTTARTLELIIDHLPQLKENLICAFTTEDKALFTNATKKRNGVNCTTPRTDMLPQIEQGKHHFTAKLSVRTRNGPDLVSTD +# FTFFDCSTHSSCTRCVSSEFPCDWCVEAHRCTHDTAENCRNDILVTGVSRIGPSYRSGPGFCPTINATGDGSEVLVSGGTSKSIKVKVHIIGQFIVQT +# RFVCQFNIEGRVTSLNAQLLGDTIYCDSMEFQYTSRSPNLTATFAVIWGGSKPLDNPHNIHVVIYRCREMADSCGICLALAEKYNCGWCSSTNTCEVE +# EQCNKNKEGKTDWLNRSEICPNPEIHTFEPKTGPWEGGTNITIRGINLGKNYNDIYSGVRIAGINCMPFPQFYIDTKQIVCTVDSPGEQMYRNGKIVV +# QIGDYRGESKEDYEFVDPKILDFNPKFGPTSGGTEIHITGKHLNAGSRIQASINDHLPCKILSTDSSQAICRTSPSPGIIEGRLKMSFDNGPREFNDY +# NFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISVIGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCRVQSDTEMECSSPAIDVDSKIIEAERPMLLEYGFLM +# DNVLRVQNLSKIHNNHXXXXXXXX] +# end gene contig56.g182 +### +# +# ----- prediction on sequence number 57 (length = 60013, name = contig57) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 57 on both strands +# start gene contig57.g183 +contig57 AUGUSTUS gene 8025 17828 1 - . 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tgactataacttcaaatatgttctggatcctacagttgaacacgttagttcagggccaagtggacaaataaagataccgaaaggaataccagctgggg +# gcattcgaatttccgtgattggtacccaattcaccagtattcaaaatcccaacatttacgtagtatacaatggagagatatatgcaagccaatgccga +# gtgcaatcggatactgaaatggaatgctcatctccagctatcgacgtggacagcaaaattattgaagcagaaaggccaatgcttctagaatatgggtt +# ccttatggataatgttttgcgggtacaaaatttatcgaagattcataataaccattttgaactttatcctaatcccgaatattttatatttgaagaaa +# gggttaagtacttcaagagtgaatatttgacaataaatggccgaaacctagatcgcgcctgcaaagagactgatgtggaagtaaaaataggaaatgga +# ttttgcaatattacgtctctttcaagacaacaacttacatgtagacctcctcctgaagcaacggcaactaaaagcatcaatggaccagaagtaattgt +# tcgtattggaacttcgctggagtaccgtattggtatccttagctacgaatcatcaaacataattttggattggggagaaaacgtaatatttgcagtaa +# tagcgacaattgttatcttattgctgatttttgttgctttgctcgtggcatataaaaagaaaagttcagagtctaaccgggtgcttcgaaacatgcag +# gaacaaatggatatattagagttacgtgtcgcagctgaatgtaaggaggcgtttgcagaactccaaacagagatgactgacctcacaggggatcttac +# ctctggaggcattccgtttttggattatcgatcgtatgcaatgaagattctttttccgaatcatgaagaccacattgtactgcaatgggagcgacctg +# agcttcttcgaaaggaaaaagggttgcgtatttttggccaacttattatgaacaaaacttttctgctactttttattcgaaccttagagtcgaatcga +# tacttttctatgcgtgaacgagtaaatgtggcctcattaattatggtcacactacaatcgaaattggaatactgcacagatatattaaaaactttatt +# gggagacttgattgaaaaatgtatagagggaaagagtcacccgaaactcttattaaggcgaactgaaagtgtggcagaaaaaatgttaagtgcttggt +# ttacctttcttctgtacaagtttttgaaggagtgtgctggagagccgttatatatgctttttcgcgctgtaaaggggcaggtagataagggtcctgtt +# gatgcgtgcacacatgaggcgagatactctcttagtgaagaaaaactaatacgccagtccattgattttcgaccaatgaatgtttatgcaagcattat +# acaacagccaatattttgcaataacttagatatgttgcctccccataccgaaaatgtatccgtaaaggttttggattgtgacacaattggacaagtaa +# aagagaaatgcttggaaacaatttataaaaacattccatcaagccaaagaccgcgaaaagatgacttagacttagtggcatttggtgaaactgttctg +# agtaaaaaaaatgtttacaagtggtacaaactcttccaagatggccgggaagatgccaatgacgagcatcgctctggacgcccaagcacatcaataac +# tgatgaaaacgttcaagcagtgaagaaaattgttttggaaaatcgtcaaatcactatcagagaagttgctgaagatgtcggtatatcgcttggctcgt +# gccatgaaattttttcaaacgttttgggcatgagtcgtgtgtcagcgaagttttttccaaaattgctgaattttgaccaaaagaaccgtcgcatgagc +# atcgctcaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcacaattgagtggcgaacaggtgctacaggtcgagtcattct +# gtacgatgaggatgtaacatctaaaaccgaaagcgaatggaaaaaacttaacacattgcagcactataacgttccagacggcgctgggctgagcctag +# taccaaagcaaagttcaatttataactttagtattttgtcggataaaaatgaaaaatcgcacaagtatgaaactcttaatatatcgaaatacacctcc +# tcctctccgacatttagccgcgccgggagccctctaaataatgatatgcatgataatggtctaagatactggcatctagtgaaacaccatgatagtga +# catgcagaaagaaggcgagcgggttaacaaattggtatcagagatttacttaaccagactgttggcaactaagggtacacttcagaaattcgtagatg +# atctttttgaaacgatatttagcaccgctcatcgaggatcggcactgcccctagctataaagtacatgtttgactttctcgacgatcaagctcagtta +# catggtaaggactcaccaagctcgaaacttctatacgcgaaagacataccagagtatcgcaaatgggttgatcgttattatcgagacattcgcgatat +# gtccccaatatcagatcaggatatgaatgctatgcttgcagaagaatcaaggctgcacacaacagaatttaatacaaactgtgcactacatgagctgt +# acacatatgctgtgaagtacaatgaacagctaactgttacacttgaagaggatgaattttcgcaaaagcagagattggcttttaaattagagcaagtt +# cataacataatgtcggcagaataa] +# protein sequence = [MSVYRLARAMKFFQILGMSRVSAKFVPKLLNFDQKNRRMSIAQELLDDVNDDPNLLKRVMTGDESXXXXXXXXGIIEG +# RLKMSFDNGPREFNDYNFKYVLDPTVEHVSSGPSGQIKIPKGIPAGGIRISVIGTQFTSIQNPNIYVVYNGEIYASQCRVQSDTEMECSSPAIDVDSK +# IIEAERPMLLEYGFLMDNVLRVQNLSKIHNNHFELYPNPEYFIFEERVKYFKSEYLTINGRNLDRACKETDVEVKIGNGFCNITSLSRQQLTCRPPPE +# ATATKSINGPEVIVRIGTSLEYRIGILSYESSNIILDWGENVIFAVIATIVILLLIFVALLVAYKKKSSESNRVLRNMQEQMDILELRVAAECKEAFA +# ELQTEMTDLTGDLTSGGIPFLDYRSYAMKILFPNHEDHIVLQWERPELLRKEKGLRIFGQLIMNKTFLLLFIRTLESNRYFSMRERVNVASLIMVTLQ +# SKLEYCTDILKTLLGDLIEKCIEGKSHPKLLLRRTESVAEKMLSAWFTFLLYKFLKECAGEPLYMLFRAVKGQVDKGPVDACTHEARYSLSEEKLIRQ +# SIDFRPMNVYASIIQQPIFCNNLDMLPPHTENVSVKVLDCDTIGQVKEKCLETIYKNIPSSQRPRKDDLDLVAFGETVLSKKNVYKWYKLFQDGREDA +# NDEHRSGRPSTSITDENVQAVKKIVLENRQITIREVAEDVGISLGSCHEIFSNVLGMSRVSAKFFPKLLNFDQKNRRMSIAQELLDDVNDDPDLLKRV +# TIEWRTGATGRVILYDEDVTSKTESEWKKLNTLQHYNVPDGAGLSLVPKQSSIYNFSILSDKNEKSHKYETLNISKYTSSSPTFSRAGSPLNNDMHDN +# GLRYWHLVKHHDSDMQKEGERVNKLVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDDQAQLHGKDSPSSKLLYAKDIPEY +# RKWVDRYYRDIRDMSPISDQDMNAMLAEESRLHTTEFNTNCALHELYTYAVKYNEQLTVTLEEDEFSQKQRLAFKLEQVHNIMSAE] +# end gene contig57.g183 +### +# start gene contig57.g184 +contig57 AUGUSTUS gene 18753 29841 1 - . ID=contig57.g184 +contig57 AUGUSTUS transcript 18753 29841 . - . ID=contig57.g184.t1;Parent=contig57.g184 +contig57 AUGUSTUS CDS 18753 19819 . - 2 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 19888 21133 . - 0 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 22378 23621 . - 2 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 29751 29841 . - 0 ID=contig57.g184.t1.cds;Parent=contig57.g184.t1 +contig57 AUGUSTUS start_codon 29839 29841 . - 0 Parent=contig57.g184.t1 +# coding sequence = [atgggcgagaggaaaacaggcggcaaacgcttttcgtcgggactgtgtttcagcgacccatattcaaacaatgtacaag +# agttagaaagaagagcgattttggagatgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaata +# gcaggttctcagacactggcagcaaatatttggtctgacaagacggctattcaaaatgaacccataaatatgactgatgttaatgcgacggtaaagga +# tgcaaataaccatagtaccaccattacaaatgtagctacgtttgacacgaaattaaatcacttgttagtggacaccattactggacgagtctttgttg +# gtggtgttaataggttgtatcagctatcgcctgatttggagctgtccgaaacggtaaaaacgggaccccaaaacgattcggtagagtgtagtatactc +# 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gttacaggcgttagccggataggcccaagctatagatcaggtcctggattttgtccaacgatcaacgctacaggtgatggaagtgaagtactggtgtc +# tggtggaacaagcaaatctataaaagttaaagttcatataataggacaatttatagttcaaacgcgtttcgtttgccaatttaatatcgaaggacgtg +# taacgagtttaaatgctcaattgttgggtgataccatttactgcgatagcatggagtttcagtacacctcaagatcgcccaatttgacagccacattc +# gctgttatatggggtggttccaaacctcttgacaaccctcataatatacatgttgttatttatcgatgtcgagaaatggccgatagctgtggaatttg +# tttagccctagccgaaaagtacaattgcggatggtgttcttctactaatacatgcgaagttgaagagcaatgtaataagaacaaagaggggaaaactg +# attggttaaatcgaagtgaaatttgcccaaaccctgaaattcacactttcgaaccgaaaacgggtccctgggaaggaggaactaacataacaattcgt +# ggtatcaatttgggcaaaaattataacgatatttattcaggcgttcgaatagctgggataaattgtatgccgtttccgcaattttacattgacacaaa +# gcaaatcgtatgtactgtagatagtcctggagaacaaatgtacagaaacggcaaaatagtggtacaaataggggattatcgaggtgaatctaaggaag +# actacgaatttgttgacccgaaaattttggattttaatcctaagtttggtccaacttctggtggaactgaaatacatataactggaaagcacttaaat +# 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ID=contig57.g185 +contig57 AUGUSTUS transcript 30209 32554 . + . ID=contig57.g185.t1;Parent=contig57.g185 +contig57 AUGUSTUS start_codon 30209 30211 . + 0 Parent=contig57.g185.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 30209 30272 . + 0 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 31048 31359 . + 2 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 31413 32554 . + 2 ID=contig57.g185.t1.cds;Parent=contig57.g185.t1 +# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg +# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt +# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg +# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga +# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag +# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac +# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt +# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc +# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt +# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg +# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc +# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga +# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg +# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt +# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt +# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] +# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ +# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG +# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE +# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY +# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS +# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] +# end gene contig57.g185 +### +# start gene contig57.g186 +contig57 AUGUSTUS gene 45155 52595 1 - . ID=contig57.g186 +contig57 AUGUSTUS transcript 45155 52595 . - . 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ID=contig58.g187.t1;Parent=contig58.g187 +contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 Parent=contig58.g187.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 . + 0 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 . + 2 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 . + 2 ID=contig58.g187.t1.cds;Parent=contig58.g187.t1 +# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg +# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt +# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg +# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga +# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag +# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac +# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt +# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc +# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt +# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg +# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc +# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga +# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg +# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt +# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt +# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] +# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ +# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG +# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE +# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY +# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS +# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] +# end gene contig58.g187 +### +# start gene contig58.g188 +contig58 AUGUSTUS gene 20148 48374 1 - . 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ID=contig58.g188.t1;Parent=contig58.g188 +contig58 AUGUSTUS CDS 20148 20212 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 20860 20916 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24630 . - 0 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24708 24802 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 26616 26675 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 . - 1 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27139 . - 1 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 41472 41724 . - 2 ID=contig58.g188.t1.cds;Parent=contig58.g188.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 41873 42167 . - 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. 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ID=contig60.g192.t1;Parent=contig60.g192 +contig60 AUGUSTUS start_codon 18066 18068 . + 0 Parent=contig60.g192.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 18066 18087 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 22314 29494 . + 2 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 29560 29780 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 29847 31965 . + 1 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 32332 32526 . + 0 ID=contig60.g192.t1.cds;Parent=contig60.g192.t1 +# coding sequence = [atgctcatcttttcctttgttgcggatgatgaatttttgaaatatttacctggacatttctatgactactccttcgaca +# gtattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccgggtcagcaaaaatttattcgaagggaaac +# tgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggattttgaacaacattcaaaaaccagttcagtt +# cacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaatattaagcgggcagttatatcattactgc +# aatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtccactgtaggcaatgcaaacataataacgaag +# gttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaacgagaaagctggtatcacgtctagcctact +# attgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacagaaacatacaagtttgttggaactactaaag +# gaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagctaactcgccatctactggctccactgttaga +# agcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatctgatcttgtggatttgactggcgattatgt +# gaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagactttattagagctggctgcatacccacatccaa +# acaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagagttatattgaaacagcttcctaagtttgat +# gataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaatcaagcagctgctcagctgctaccgaacgc +# tcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaaggacctgaaattgatgccatatctaaaaagt +# 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agcacatattcacattcgacggtcagaatttcgcgtaccctggaaactgcaaatatattatggctcaagacagtgtggataataatttcacaattatc +# gtccagcttgcaaatggaaagcttaagggcattacgctcgtagatcgggatggtaactatgctgaagtagccgacaacctggcactgaagataaatgg +# aaaccttcttgagtacccacaacaattgtctggtcttcacgcatggcgtcggttctacaccgttcatttgcattcggaatatggagtaagcgtattgt +# gcaccacggatctaaaggtttgtcattttaatataaacggcttctacacaagcaaaacacggggacttctcggcaacggcaatgcggagccatacgac +# gactttttgcgaattgatggtactatagcaacagactcggccactctggggaacgattacggagttggtaaatgtgcagcagttgcttttgacaaaga +# ccaagtagaaagcccgaaaagagaggaaatatgtactgaaatatttggcattgaatcaccacttgccctcaactatatgacggttgactccaggcctt +# accgtaaggcatgtgacagggccattgctaaaatcgctgaaaaggataaggaggctgctgcatgtacgtttgctctggcctacggttccgcggtcaaa +# cagattaacaagtgggtgctattaccaccgcgttgcatcaagtgcgctggacctgtgggacagcgtgatcttggagatgagtttattgtcaagctccc +# aaacaacaaggcggacgtggtatttgtcgtcgatatcaatgtaacacctgtagtcctgtccaaccttgtagcgcctgcaatcaatgaaattcgagagt +# cgcttaagagccgtggttttacagacgtccaagtcggcgttgttgtatttgacgaatcgaagcgttatcccgctctactcacaagtgaaaatggaaaa +# atcaactacaagggaaacctggccgatgtaaagctcaatggagtaaagaacttctgtgacgattgcatcgagcaaattataacagaaaaacgaatctt +# ggatatttacaactcattaaaggaaatagtaaagggcattgcacctcaagccgatgaaaaggcgttccagttggcattggactatccattccgtgctg +# gtgcggcaaagagcattatcggggtgcgaagcgattcgttggaatacaaaaattggaacttcgacaagctgaaagtagccgaccaaaagaaaatgtta +# agccagattacgtcatcactggcggatactcttttcaagaccgaaatcgtcagtgaatgtcgttgtctgccgattcacggattgcacggccaacacaa +# gtgcgtcatcaagtcttcgacatttgttgcgaccaaaaagcccaaagctgcctaa] +# protein sequence = [MLIFSFVADDEFLKYLPGHFYDYSFDSILTIGLSSGAFSESDDTSLKVSGSAKIYSKGNCGYTLQLSSVKVSNTKESV +# EKRILNNIQKPVQFTLVSGHLEPQICSDSSDLDYSLNIKRAVISLLQSGTKTENEVDVFGQCPTHTSTSTVGNANIITKVRNLNRCAHREQINSGLVS +# GKVNEKAGITSSLLLQANYIKESKIVNSLLENVQLTETYKFVGTTKGNSEISAKVVTTLKLKNPTGTKANSPSTGSTVRSVIFQRPETYTSKNINALK +# TILSDLVDLTGDYVKKDSAKKFVEFIRLLRQSDSETLLELAAYPHPNKVLARKVYLDGLFRTSTAESARVILKQLPKFDDKEKLLAILSLNLVKSVDK +# ETLNQAAAQLLPNAPKELYLAVGTLVAKFCLGKNCQGPEIDAISKKFTDGLKRCKPNTKKEEERIVYILKGIGNAKSLGGNTAAVLSECASTGRSNRI +# RVAALRAFSTIDCNGALRTKALELLKNRNEDSELRIEAYLSSISCPNAEVANQISDIVNSETVNQVGGFISSNLKAIRDSTDASREQQRYHLGNIRVT +# KKFPADYRRYSFNNEVSYKLESLGLGASSDYQLIYSQHGFLPRSSRINVTTEIFGTNFNVFEASVRQENFEDVLEYYLGPKGLLNKDFNEIVKIIEVG +# NNAAASAGGRARRSIADDVAKISKKYKTYGAKSVQDLNLDVSLKFFGSELAFLSLGDNIPSTLDDIINSISNSFEKAKQELSMFEKTLSSHHLFLDTD +# LSYPTSIGVPLELVAQGFAATKIDLAVTLDINAILEQNWQKAKYRLKLVPSVDVNVNLQLGFNAQVLSTGLRVVSSAHSATGSDITVAVINEGEGFNI +# DVELPREKLELIDVKIDTELYVAEQDKQRAVALKGNKKNKNSQPSEICFNQAEVVGLNICIESSTSFSDFQGGSGNDAEKGIAIPDQFHLSKPLSLAI +# YLTAERKFTFKGFHTNEPSGQKWKLDYSTPGSKVSHDTSIVFELGSKPKTYGRLAFDNSQYHFGVEAGINNDKSELVIYGQYEQDKDIKKSKIGLSKH +# GNEFKPLIEIQDNNGISNSINGYRADGKIVVEKTSDKITRYNFENFQVSNANNERIIVNGWTDFGQSSFNSELRFASDQKSFLIKGNFELENGQYAAG +# FFINDERTPENVYGSSVHLTIADQSYAIKANGKAAAWSINSEAGFNFKKDDESSSLRAGSLLQNVEIYHKNKQVGAVKVKSTFDVNKLDLDVEISRDQ +# 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aatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtccactgtaggcaatgcaaacataataacgaag +# gttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaacgagaaagctggtatcacgtctagcctact +# attgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacagaaacatacaagtttgttggaactactaaag +# gaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagctaactcgccatctactggctccactgttaga +# agcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatctgatcttgtggatttgactggcgattatgt +# gaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagactttattagagctggctgcatacccacatccaa +# acaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagagttatattgaaacagcttcctaagtttgat +# gataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaatcaagcagctgctcagctgctaccgaacgc +# tcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaaggacctgaaattgatgccatatctaaaaagt +# ttacggatggcctaaaacggtgtaagccaaatactaagaaggaagaagaacggattgtctatattttaaagggaataggaaatgcaaagagcttaggt +# ggcaacactgctgctgtccttagtgagtgcgcctccacgggccgttccaatcgtatacgtgtagcggctttgagagcattttcaacaattgattgcaa +# tggagcactgcgaactaaggctttggaactacttaagaaccgcaacgaggactcagagttacgtattgaagcctatttgtcttcaatttcatgtccca +# acgcagaggtggccaaccagatttcagatatagtcaattccgaaacagttaaccaggtaggaggatttatttcatctaatttaaaagccattcgggac +# tcgacagacgccagccgtgagcagcaaaggtaccatttagggaacattcgagtgactaagaaatttcctgcggattacagacgatacagtttcaacaa +# tgaagtttcctacaaactggaatcccttggccttggagctagttctgactatcaattaatttattcgcaacatgggttcttaccccgatcatctcgta +# tcaatgttacaactgaaatttttggaactaacttcaacgtatttgaagcaagcgtacgtcaggaaaattttgaggatgtgctggaatattatctggga +# ccgaaggggttgttaaacaaagatttcaatgaaatagttaagatcattgaagttggaaacaacgcggctgctagtgctggtggtcgagcccgacgctc +# aattgccgacgatgttgctaagatatcgaaaaagtataaaacttacggtgctaaaagtgtgcaagatctcaatttagatgtatcgttgaaattctttg +# 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ID=contig62.g198 +contig62 AUGUSTUS transcript 22556 43045 . + . 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ID=contig63.g199 +contig63 AUGUSTUS transcript 42 8033 . + . ID=contig63.g199.t1;Parent=contig63.g199 +contig63 AUGUSTUS start_codon 42 44 . + 0 Parent=contig63.g199.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 42 67 . + 0 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 1003 1469 . + 1 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 4336 4421 . + 2 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 . + 0 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 7498 8033 . + 2 ID=contig63.g199.t1.cds;Parent=contig63.g199.t1 +# coding sequence = [atgttacagcttagtcatcatcgtagcattgtaagaaacaaggccgccgagaaggcgaaacatgttcatcatcaccaac +# agcatcatgtaccacagggtctgggtggcggacacattgccacagaaagtctagatagcagcacaggaacgatcggcgaaccgcagcccccgagtggt +# ggaactagcaatagcagtgctaattccgcaaacccaaacgcttctgcggcgacggttgcgacgcacgcatcaataccgacgtcaggctctgatactgt +# ccaggtttcagtcggccaaatcaatgcaaacagcaatgacacaagcaatgggaatattaactcaacgactgagcaacgaacgactggatatagcatta +# atggaattctaggtatacaacatggacagcattctcacaacaataataacaacagtagcgtgagcaataacaataatacagatcccaccaattgtaaa +# cgtaaaagaatcgaagctcatgacgaaaaccgtgacacaaatatacattccgaagatgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctct +# ttatccaaatatttggcctgggaagtggtgtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcat +# catcatattatgaggcttcaaacggattttccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtac +# gacagtatttcaacaatttcgcaatctcaaagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattgctttagcatttgacggaaactacacatcaat +# gactagcttggaaaatgacacctcatcagtcgcacaagtaaatattgacgttccagaaagcaccgatccggctaacctttgcacgataagtacaagga +# ttgtgcaagaccactcggataataatagtaaccgtgttaaggagccgcagccgaacattgatggggccagagaggaaaacaataaggaattggacaaa +# cacaataccaattcggaatccagcgatcatatttcattgccgcatctaaatcagatagcagaagatcagttgatcagaggaaacagacgtcctcattt +# aaacaccatcacgcacccttctcctctaatactcctgcagccttcaacttcgtcacttagtggtcacgacgatcgatcagacattgaaccaaatctgc +# gtaataatgtaggcctttactcaacacctacagtgctaccaagttttaatcattactccgcaggcaagttgaaaatatttgcaagcaacgcacatgag +# aaagttattccatga] +# protein sequence = [MLQLSHHRSIVRNKAAEKAKHVHHHQQHHVPQGLGGGHIATESLDSSTGTIGEPQPPSGGTSNSSANSANPNASAATV +# ATHASIPTSGSDTVQVSVGQINANSNDTSNGNINSTTEQRTTGYSINGILGIQHGQHSHNNNNNSSVSNNNNTDPTNCKRKRIEAHDENRDTNIHSED +# DGKRQRMGYSGDPLYPNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDTSMLYDSISTISQSQSSLYTPTIG +# PSIALAFDGNYTSMTSLENDTSSVAQVNIDVPESTDPANLCTISTRIVQDHSDNNSNRVKEPQPNIDGAREENNKELDKHNTNSESSDHISLPHLNQI +# AEDQLIRGNRRPHLNTITHPSPLILLQPSTSSLSGHDDRSDIEPNLRNNVGLYSTPTVLPSFNHYSAGKLKIFASNAHEKVIP] +# end gene contig63.g199 +### +# start gene contig63.g200 +contig63 AUGUSTUS gene 14454 29828 1 - . 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ID=contig64.g204 +contig64 AUGUSTUS transcript 20925 21182 . - . ID=contig64.g204.t1;Parent=contig64.g204 +contig64 AUGUSTUS CDS 20925 21182 . - 0 ID=contig64.g204.t1.cds;Parent=contig64.g204.t1 +contig64 AUGUSTUS start_codon 21180 21182 . - 0 Parent=contig64.g204.t1 +# coding sequence = [atgacgcagagctgcccgccgccgcttgagaaatacacactgaagcgatgtcgtcgggacgaatgtactataatcgata +# cattcgacttcataatcgacatcttcctttcctttttctttgagttcacttattgtcaattccattctattgaaattctacagaaattgcactccgtc +# actctgttttcaacccaatacttatctccccacgattgccgataccagccgaaagattccgaattcttcttcgagcagtaa] +# protein sequence = [MTQSCPPPLEKYTLKRCRRDECTIIDTFDFIIDIFLSFFFEFTYCQFHSIEILQKLHSVTLFSTQYLSPHDCRYQPKD +# SEFFFEQ] +# end gene contig64.g204 +### +# start gene contig64.g205 +contig64 AUGUSTUS gene 21371 39243 1 + . ID=contig64.g205 +contig64 AUGUSTUS transcript 21371 39243 . + . 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ID=contig65.g209 +contig65 AUGUSTUS transcript 41742 43862 . + . 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ID=contig66.g211 +contig66 AUGUSTUS transcript 21735 29975 . + . ID=contig66.g211.t1;Parent=contig66.g211 +contig66 AUGUSTUS start_codon 21735 21737 . + 0 Parent=contig66.g211.t1 +contig66 AUGUSTUS CDS 21735 22034 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 +contig66 AUGUSTUS CDS 22096 22904 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 +contig66 AUGUSTUS CDS 23502 23700 . + 1 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 +contig66 AUGUSTUS CDS 29826 29975 . + 0 ID=contig66.g211.t1.cds;Parent=contig66.g211.t1 +# coding sequence = [atgaatgaaaaaagctcccgttcgcacactatatttactattactttggaacaatctccattttttaatagcattggga +# cagaaaatgacttaggaggaatacgacgtggaaaattaagcttagttgacctagcgggctcagagagacagcgtaaaactggagctcaaggggatcga +# ctcaaagaagcgtctaaaataaatttatcactttctgccttgggaaacgtaatttcatctttggttgatggtaaagcaaagcatgtaccgttcaggga +# ctcaaaacttacacgtctgctccaggattccttaggaggtaacacaaaaactttaatgatatcttgtatatcaccatcagacataaattatgatgaaa +# cgatatctacactcagatatgcaagtagagcaaagaatatttctaatagacccacaattaatgaagatcctaaagatgccaagcttcggcagtaccaa +# aaggaaatattaaatttgaaaagaatgcttgaagagactcaacaaaaaatgatttacagaaatgatgaacaaattaatttaattgaattatctatggc +# gaatttagatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggttcaaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattat +# caatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgcaagcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgat +# gacctaaaactaaaagaacagcaccaagctaaaaaaatggcagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgagga +# tcgtgatctcttgcagggacattatgctactataacccaagaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttg +# aaatggaagtttccgatttaaactctgagtttcaattggatagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaa +# caattggtttataaatttaatccaagttttcaaaaaaatggaagaaactggactccggatattgtattgcgtaattcttcatggaatgatgatcttaa +# aatttggaggattccagagatcgatttatttaaacttccccctactccgaaaacgggatttcatcgtattcattgttcaattagcgataataataatt +# ggaaacatactaactttcaaatcaaccgggatgcaaagaaatctgaaatatatgagaaaaatgaaaacctttctaaagaaaaatacaacatcgatgta +# caaagaaactattttagaaccagtcgacctaagctcaaagagtttggagaatttaagaacactttaatgcgatttaaaggagtatacgatacaactgg +# tagctaa] +# protein sequence = [MNEKSSRSHTIFTITLEQSPFFNSIGTENDLGGIRRGKLSLVDLAGSERQRKTGAQGDRLKEASKINLSLSALGNVIS +# SLVDGKAKHVPFRDSKLTRLLQDSLGGNTKTLMISCISPSDINYDETISTLRYASRAKNISNRPTINEDPKDAKLRQYQKEILNLKRMLEETQQKMIY +# RNDEQINLIELSMANLDVKSLNSKKEVQIIESGKNSDVPRKTTNSLSIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHL +# SAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKMLEMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNWTP +# DIVLRNSSWNDDLKIWRIPEIDLFKLPPTPKTGFHRIHCSISDNNNWKHTNFQINRDAKKSEIYEKNENLSKEKYNIDVQRNYFRTSRPKLKEFGEFK +# NTLMRFKGVYDTTGS] +# end gene contig66.g211 +### +# start gene contig66.g212 +contig66 AUGUSTUS gene 31363 40249 1 - . 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ID=contig67.g214 +contig67 AUGUSTUS transcript 16360 25246 . - . ID=contig67.g214.t1;Parent=contig67.g214 +contig67 AUGUSTUS CDS 16360 16422 . - 0 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 16734 16746 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 18179 18298 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 20515 20812 . - 2 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 20886 21643 . - 1 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 21704 21857 . - 2 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 25120 25246 . - 0 ID=contig67.g214.t1.cds;Parent=contig67.g214.t1 +contig67 AUGUSTUS start_codon 25244 25246 . - 0 Parent=contig67.g214.t1 +# coding sequence = [atggatcaaagcattgtaaatatggcatacgaacgttacggcatacttcttcaaaatgaacaatacgaagaagatatag +# tcaacgcaaaaggcattcaagcagtaaacgtccataataatagcaacgacggtatacagctaagcaatcacatcaacttgcacaacaataaagtattt +# gaatcagttattcagtcagaaccaaaagaaagtaataacgcaggttattctaatgtatgtcaaaaggcgctcttaaaacctgaagttatattttcctc +# taaaataaagaagaataccaactttggatatcaaatgaatatcaattgttataagaatatcggctatgaggaaaatcaaaaaatttcaaaggacgtga +# cacatagcctgccaagcaatagcaatgcaccagaagagttaggtactgtcagcagaacttcacctttcatggtctcagatacagcaatacttacttca +# actgggaaatcaagacggtgggagcaaaagctggttcaaattaaaactatggaaggggagtttagtgttacaatgtgggcatccggaatatctgatga +# tgaatactccggatcagaccaacatgctggcgattcagattttttgaaaggaaaaaacattgattttgatcatggcacgtcccagcgaacgaaagata +# tagagcaggttgaatctgtattacaggaagatgtatttattcaagaacctcaggcaattgaaatgcagccacactctattccaatcataaaacagttc +# acgaaagaggagggagttttttctagagaaaataatatttccacaaaggttcaaagtaaatcatcattaagtttcgaagatcccattttgatttcgga +# ttcctcaagtatacagctggtgaatgaaactaccggcatgacaattgataatcctgacaatactggcgatctgcacacattgactagctcagtggcat +# ttggtcttagctcacaggaaagacaacaaactgattgtttatcaacaccatcacaactaccataccacggcattacaggaccaaatggaagctctgat +# tcaagttttaatctttccgatgtcccagtgtcccatcaaaatgataaaaaaatagcttgtccccataaaggttgccataaaaatttcagagactcgtc +# tgcgatgcgcaagcatttgcacactcacggtcctcgtgttcatgtttgtgcagaatgtgggaaagcttttgtagaaagttccaagcttaaaagacatc +# agttggttcacacaggagaaaaaccatttcagtgtacgttcgagggatgtggaaaacgattttctttggattttaacttaagaactcatgtaagaata +# catactggagataggccatttgtttgtccatttgatgcctgcaataaaaagtttgctcaatccacaaatttaaaatcacatatattgactcatgcgaa +# agcaaacaccaatggaaagttgtccattgatcgtaacggttctgtcattgagagtgctaacgcggtcatcgataattgttag] +# protein sequence = [MDQSIVNMAYERYGILLQNEQYEEDIVNAKGIQAVNVHNNSNDGIQLSNHINLHNNKVFESVIQSEPKESNNAGYSNV +# CQKALLKPEVIFSSKIKKNTNFGYQMNINCYKNIGYEENQKISKDVTHSLPSNSNAPEELGTVSRTSPFMVSDTAILTSTGKSRRWEQKLVQIKTMEG +# EFSVTMWASGISDDEYSGSDQHAGDSDFLKGKNIDFDHGTSQRTKDIEQVESVLQEDVFIQEPQAIEMQPHSIPIIKQFTKEEGVFSRENNISTKVQS +# KSSLSFEDPILISDSSSIQLVNETTGMTIDNPDNTGDLHTLTSSVAFGLSSQERQQTDCLSTPSQLPYHGITGPNGSSDSSFNLSDVPVSHQNDKKIA +# CPHKGCHKNFRDSSAMRKHLHTHGPRVHVCAECGKAFVESSKLKRHQLVHTGEKPFQCTFEGCGKRFSLDFNLRTHVRIHTGDRPFVCPFDACNKKFA +# QSTNLKSHILTHAKANTNGKLSIDRNGSVIESANAVIDNC] +# end gene contig67.g214 +### +# start gene contig67.g215 +contig67 AUGUSTUS gene 30493 43488 1 + . 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ID=contig67.g215.t1;Parent=contig67.g215 +contig67 AUGUSTUS start_codon 30493 30495 . + 0 Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 30493 30636 . + 0 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 35387 35532 . + 0 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 39029 39189 . + 1 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 39387 39956 . + 2 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 40093 40196 . + 2 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 40277 40759 . + 0 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 41210 41355 . + 0 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 42426 42559 . + 1 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 43418 43488 . + 2 ID=contig67.g215.t1.cds;Parent=contig67.g215.t1 +# coding sequence = [atggaccaaatggacgaaaaaaaaggaatgagcactttaaactctgatatttcaaaggggccttctggaaatggtatac +# cctcgaaaagatgcaaatcgaaaagatcaaaaacgtatgaatatgatacacagaatataaacatgtttaatgactcatgcccagctcttgatcgatgc +# tacggctgctactataccaaactctttcaattcagcgattttatcgcaacttccgacgaagcgtggcgcatcctcgactacttttacaccaaaactaa +# aacgttgaaaccatcacctgaaagctataacgttcatgatggaaacctatactgttctatgcactttaaatcaatatttgcaccgaagatagtttgtg +# aagaatttacaccactaaagccagagcttataatacgagagaatcaaccaatagaattaccaccggatgtcgcaagagcttccgataagccaagtctt +# ggacttgacgaacttcaacagctaaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaatcgattacctacaagaacggcaaga +# ttctgcacttactcatagcaagtcaatagggtccacgataaccaaacttcataagctcggaataactaattcaaaatttgatgaactagataatattg +# aaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgaaatggtttttttgtgctccagaaagaatattgaaagggaaaggccagtgggc +# ttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaaggtgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcgaagaaaggaaacaggaaatacagag +# catacgttctcgactatttttgggcaaacaagcaaaaataaaagaaatgtatcaattagctgtggctgaatcagaacatggcgttacatcggcgggta +# agacccccgatattaatgtcataaatgccactcatcttataaaggatcgatttgagaatggaataggcaaagcatcgcgaagtatcttcatggagcta +# gatgcaaatttaagttcaaacttaaataacagtcgtacccaaaataaccgtcccgataaaaagattagtaccggtgctgacattatcaaatgcgactc +# aaaaccagaagaagttaaagtcgccactgaagagttaacagaaagatttaaattctttgaaaaatatgcccctgtcgaaaataaaaaaaagaaatttc +# gcatgactccgccacgtgacggtgttgtgaagatgccgtctcctgatttcgacacagagggttcaattcaaacgcccttattcaatgataacgtttta +# caaaaaaccaaaacaacgtcaacaatattaagcaagtttcgcgaaatggaagagcaacaaatgaatgagaaaaacaaggaacgaagcccaaaaccatt +# aaagtgttttactccgccaccagaaactgtcgaccatttcaatagatcagatactgaggaagaaaatgatagtgaaagcgatcagaacactgatgacg +# acgaaaaaagttttgcgaatgtgcttaacggttgcaacgaagatcaagggctttacgaggcccagaatgcagctcgtgctaaacagttgcgggcgaag +# tttgaaaagtggcagattaacgaaatagagcgcgaactcaacgaaggaagtggagacacacaatcatcacagcttatttcaaatgagtccattgaaag +# tgcaagaaatataaacgctgatatctcggacactataaaagctagaacagcatacctatcaactgatccaaaatgttccacgcccactctaacgccca +# cacacgaagttaaaacgcttaaatctgtctgccgcccacataacgcgctacgagtgtacccacacagttttgaatgtatgtcgaagcaaaatgaagct +# gcaccaatattaagataa] +# protein sequence = [MDQMDEKKGMSTLNSDISKGPSGNGIPSKRCKSKRSKTYEYDTQNINMFNDSCPALDRCYGCYYTKLFQFSDFIATSD +# EAWRILDYFYTKTKTLKPSPESYNVHDGNLYCSMHFKSIFAPKIVCEEFTPLKPELIIRENQPIELPPDVARASDKPSLGLDELQQLNVRSKFNVFEN +# GCKEKIDYLQERQDSALTHSKSIGSTITKLHKLGITNSKFDELDNIEKTIDKINSSTDEESEMVFLCSRKNIERERPVGLGEAMNDIRSKFEQGEVMT +# KEERREERKQEIQSIRSRLFLGKQAKIKEMYQLAVAESEHGVTSAGKTPDINVINATHLIKDRFENGIGKASRSIFMELDANLSSNLNNSRTQNNRPD +# KKISTGADIIKCDSKPEEVKVATEELTERFKFFEKYAPVENKKKKFRMTPPRDGVVKMPSPDFDTEGSIQTPLFNDNVLQKTKTTSTILSKFREMEEQ +# QMNEKNKERSPKPLKCFTPPPETVDHFNRSDTEEENDSESDQNTDDDEKSFANVLNGCNEDQGLYEAQNAARAKQLRAKFEKWQINEIERELNEGSGD +# TQSSQLISNESIESARNINADISDTIKARTAYLSTDPKCSTPTLTPTHEVKTLKSVCRPHNALRVYPHSFECMSKQNEAAPILR] +# end gene contig67.g215 +### +# start gene contig67.g216 +contig67 AUGUSTUS gene 44120 44521 1 + . ID=contig67.g216 +contig67 AUGUSTUS transcript 44120 44521 . + . ID=contig67.g216.t1;Parent=contig67.g216 +contig67 AUGUSTUS start_codon 44120 44122 . + 0 Parent=contig67.g216.t1 +contig67 AUGUSTUS CDS 44120 44521 . + 0 ID=contig67.g216.t1.cds;Parent=contig67.g216.t1 +# coding sequence = [atgaacaacaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaatcgattacctacaggaacggc +# aagattctgcacttactcatagcaattcaatagggtccacgataaccaaacttcataagttcggaataactaattcaaaattcgatgaactagataat +# attgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgatatggtttttttgtgctccagaaagaatattgaaagggaaaggcctgt +# gggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaaggtgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcgaagaaaggaaacaggaaatac +# agagcatactttctcgactatttttataa] +# protein sequence = [MNNNVRSKFNVFENGCKEKIDYLQERQDSALTHSNSIGSTITKLHKFGITNSKFDELDNIEKTIDKINSSTDEESDMV +# FLCSRKNIERERPVGLGEAMNDIRSKFEQGEVMTKEERREERKQEIQSILSRLFL] +# end gene contig67.g216 +### +# +# ----- prediction on sequence number 68 (length = 25628, name = contig68) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 68 on both strands +# start gene contig68.g217 +contig68 AUGUSTUS gene 2750 3151 1 + . ID=contig68.g217 +contig68 AUGUSTUS transcript 2750 3151 . + . ID=contig68.g217.t1;Parent=contig68.g217 +contig68 AUGUSTUS start_codon 2750 2752 . + 0 Parent=contig68.g217.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 2750 3151 . + 0 ID=contig68.g217.t1.cds;Parent=contig68.g217.t1 +# coding sequence = [atgaacaacaatgtgcgctcaaaattcaacgttttcgaaaatggttgtaaagaaaaaatcgattacctacaggaacggc +# aagattctgcacttactcatagcaattcaatagggtccacgataaccaaacttcataagttcggaataactaattcaaaattcgatgaactagataat +# attgaaaagaccattgataagataaattcgagtaccgacgaggaaagcgatatggtttttttgtgctccagaaagaatattgaaagggaaaggtctgt +# gggcttgggagaagcaatgaatgatattagatcaaagttcgagcaatctgaagtgatgacaaaagaagaacgtcgcgaagaaaggaaacaggaaatac +# agagcatactttctcgactatttttataa] +# protein sequence = [MNNNVRSKFNVFENGCKEKIDYLQERQDSALTHSNSIGSTITKLHKFGITNSKFDELDNIEKTIDKINSSTDEESDMV +# FLCSRKNIERERSVGLGEAMNDIRSKFEQSEVMTKEERREERKQEIQSILSRLFL] +# end gene contig68.g217 +### +# start gene contig68.g218 +contig68 AUGUSTUS gene 4505 14628 1 - . ID=contig68.g218 +contig68 AUGUSTUS transcript 4505 14628 . - . ID=contig68.g218.t1;Parent=contig68.g218 +contig68 AUGUSTUS CDS 4505 4621 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 6427 6521 . - 2 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 6621 6732 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 7104 7179 . - 1 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 9040 9119 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 13979 14068 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 14386 14628 . - 0 ID=contig68.g218.t1.cds;Parent=contig68.g218.t1 +contig68 AUGUSTUS start_codon 14626 14628 . - 0 Parent=contig68.g218.t1 +# coding sequence = [atgccatcgcatttcaaagtaaaagaatattgcccccttgtgtttcggaatctacgtgaaagatttggagttgatgatg +# tggactaccgcgagtcgttaactcgatcccaacctatacaaatagactcatctggaaagtccggggcacaattttaccagagttatgataggtttttt +# ataatgaaaagtttaacatcggaagaaatcgagcgtatgcacgcttttttgaagcaatatcacccggacaatgattttataaaacaaaaagtgaaatt +# ggacattggaaaggaagctaaagaaaagctgatgaacaccctaagcaacgatgtggattttgtgcgggacggtaaaacaacgaaagcttttgtcgaaa +# ttgaacgattgtgtgggaaagagtttaaattattagtaagggccggcttctcgattcttagacgaagttatagatacctgtttgtccgacaaatctta +# aggcagggtaaacttgaactgctaaccaagttgcacatcatggactactctttattggtcggcgtgcatgactgtgtgcgtgccgaagaagaagcgct +# acaaggagataatgttacagctgccggtcgcactggacgtataacacgcctcccgattccccaagaggtgcacagtataaagaagtcgtttacgaagt +# tgacatatatgacattccaagcattgaaggcggcaaaagcagccaaaactgttaaatatggcagtaatgttgatggtatatcgacatgtgaccctgaa +# caatatgccaaacgattcttggaatttatggataaagcaatagaataa] +# protein sequence = [MPSHFKVKEYCPLVFRNLRERFGVDDVDYRESLTRSQPIQIDSSGKSGAQFYQSYDRFFIMKSLTSEEIERMHAFLKQ +# YHPDNDFIKQKVKLDIGKEAKEKLMNTLSNDVDFVRDGKTTKAFVEIERLCGKEFKLLVRAGFSILRRSYRYLFVRQILRQGKLELLTKLHIMDYSLL +# VGVHDCVRAEEEALQGDNVTAAGRTGRITRLPIPQEVHSIKKSFTKLTYMTFQALKAAKAAKTVKYGSNVDGISTCDPEQYAKRFLEFMDKAIE] +# end gene contig68.g218 +### +# start gene contig68.g219 +contig68 AUGUSTUS gene 17114 17867 1 - . ID=contig68.g219 +contig68 AUGUSTUS transcript 17114 17867 . - . ID=contig68.g219.t1;Parent=contig68.g219 +contig68 AUGUSTUS CDS 17114 17391 . - 2 ID=contig68.g219.t1.cds;Parent=contig68.g219.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 17804 17867 . - 0 ID=contig68.g219.t1.cds;Parent=contig68.g219.t1 +contig68 AUGUSTUS start_codon 17865 17867 . - 0 Parent=contig68.g219.t1 +# coding sequence = [atgaagctcgcaaacggtattgcaagggcatttgactcactgcggtttcttcggtacaccgatacttataacattgccc +# tggcctaccgcgatgccaatggcattcagtacaacgaggccgtcgacgacggtctggatggcgaaaccttgatcgagaccggaaccgccaacgacagc +# aacatcgactacgattgggtgccccaggagacgctgcgggcgctgcagaagtcgccgcccaagtccaagacgcccaagacctcgcccaagcccggcaa +# gcaggccagtcccaaggcagccagccagcagagtcccaagcagcgcaaggtcaagcgctggcgatga] +# protein sequence = [MKLANGIARAFDSLRFLRYTDTYNIALAYRDANGIQYNEAVDDGLDGETLIETGTANDSNIDYDWVPQETLRALQKSP +# PKSKTPKTSPKPGKQASPKAASQQSPKQRKVKRWR] +# end gene contig68.g219 +### +# start gene contig68.g220 +contig68 AUGUSTUS gene 18414 22745 1 + . ID=contig68.g220 +contig68 AUGUSTUS transcript 18414 22745 . + . ID=contig68.g220.t1;Parent=contig68.g220 +contig68 AUGUSTUS start_codon 18414 18416 . + 0 Parent=contig68.g220.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 18414 18589 . + 0 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 20787 21050 . + 1 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 21149 21485 . + 1 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 +contig68 AUGUSTUS CDS 22542 22745 . + 0 ID=contig68.g220.t1.cds;Parent=contig68.g220.t1 +# coding sequence = [atgacggaatctggaattgatttaggctttgatatggagttcgatctaaatattagtctgttaaatgataacgaaaata +# tggattttttacctaatgttaccgtagcaggtagttccgaaaatgtggagttttatgaattaaaatcatcaactcgctgtttacggtctgacgaaatt +# tccatggctattgaagtcggagaggaaccgccgactatacaaccaactgataatattggtaaagcatgttctgcatcagttctaagttcaactgaatg +# tgataatatgccttcggctactacaaatattagagtaactgttggtatcgacaaagatttagaaatgattctcgaaatggatccaagtattgtagatt +# taggagatattagcattgcagaaacaacagaaccgcggatagtgggtttacctccactttcgggtggaccaacatttaaaactgccacccccacttca +# cgaacccaactgaaacttcagttacaaagggagcaacatcaacagcagcagcagcaaatgatacagcaacagaccctgggttcgccagactcgaaaat +# gcacctattgtttggcaatgcacagggatccatggaatcggaattcattgacagcggtagtaccagcgcatgtggcagcgggtcatctagtttagaac +# aaatgtcccaattagtgcaaattgataatttaattgacacgtcaagtgcagttaaacttaaagttcctcttcaaagtattggtgtagatgtgcctccc +# caagtactgcagcagtataaactgttacacgaattaaataactttattagacttgaccgttctcttttacttcttattcgcaattgcctggttttaca +# tagcgtcgggtttaacatacgattacttgaagttggctgcgatcaatatcgatacttaacattataccagagttgccagattggtcgctttatcacag +# aagatacttgtagatgctag] +# protein sequence = [MTESGIDLGFDMEFDLNISLLNDNENMDFLPNVTVAGSSENVEFYELKSSTRCLRSDEISMAIEVGEEPPTIQPTDNI +# GKACSASVLSSTECDNMPSATTNIRVTVGIDKDLEMILEMDPSIVDLGDISIAETTEPRIVGLPPLSGGPTFKTATPTSRTQLKLQLQREQHQQQQQQ +# MIQQQTLGSPDSKMHLLFGNAQGSMESEFIDSGSTSACGSGSSSLEQMSQLVQIDNLIDTSSAVKLKVPLQSIGVDVPPQVLQQYKLLHELNNFIRLD +# RSLLLLIRNCLVLHSVGFNIRLLEVGCDQYRYLTLYQSCQIGRFITEDTCRC] +# end gene contig68.g220 +### +# start gene contig68.g221 +contig68 AUGUSTUS gene 23109 24707 1 - . ID=contig68.g221 +contig68 AUGUSTUS transcript 23109 24707 . - . ID=contig68.g221.t1;Parent=contig68.g221 +contig68 AUGUSTUS CDS 23109 24707 . - 0 ID=contig68.g221.t1.cds;Parent=contig68.g221.t1 +contig68 AUGUSTUS start_codon 24705 24707 . - 0 Parent=contig68.g221.t1 +# coding sequence = [atgagttgttttctcacgttaaaggaaaaacttattgagtcaccagtactggcgttatataatcacaaggacgatacgg +# aattacattgtgacgcaagcgctctaggatttggtgctgtactgttgcagaggaaagatgatggcaagttacatcctgtgttctatttctctaagcgt +# actacagcagatgaggctaagttacatagttttgagctcgagactttggcggttatctatgctcttcgtagatttaggatatatttgcaagggaaaca +# tgtaaaattggtaaccgactgtattgcacttaagttaacactccataaagcagaacttaacccgaagatatcaagatgggctttggagatggaaaact +# atgatcttgaaatatgtcacagagcgggaaataaaatgcagcatgtggatgctctcagcaggtacaataatattctaatagtggagaccaacagcttt +# gaggaaaatttagtcatctgtcaaggaaaggatttaaaaattaagaagcttaaaacgattttagagaaggcagaacttaaattatttgaaatgagaaa +# tggggtagtgtacagaaaagcaaatgacgataggatactattctatgtgccagaagaaatggaagatcaggtactatataaataccacaacgaaatag +# gacatataggaagagataaaatgatggacataatttcaaaaacttattggtttccaaatttaaaagaaaagtgcgttgcacatatagaaaattgttta +# aagtgtgtagcgttttcaccaaaatcaggtaaaggagaaggttttttgcacagtattcccaaaggaaacaaaccattcgagttaatacacattgacca +# ttatggtccagtagactcgtcaagagcaaaaaaacacatttttgtggtagttgacggattcacaaagtttgtaagactttattcaactaaatcaacaa +# gcactagggaggttataacggcattgaaagattactttagggcctatagtaggccaaaatgcataatttcagaccggggtagttgttttacatctaaa +# gacttcgaagaattcatggaagaatataatgtgaagcacatcaagatagccacaggctcaccacaagccaatggtcaagttgaaaggattaacaggag +# ccttggaccaatgatagcaaaattagttgatcaaagtaaaggtgtatactgggacaatgttatagataaaatagaacatgctttaaataatacgttgc +# acagaagtataagacaacttccgagtaaaatgctgtttggagtagaacaaaaaggaaagattgtggatgaacttaaggaaaagctagaggacataaat +# gaaaataagaaattagatagtttaacaaagataaggaaaaaagctgaggcccaccaaaagcaagttcaagattataatgaaaaattgtataacaaaag +# tcgagtaaaggctagaaattataaaaaaggagactatgtaatggtgaaaaattttgactcgactgttggaactgctaggaaactgattcccaaacata +# aaggaccatatgtgattgcaaaagcgatgcgcaatgacagattctattaa] +# protein sequence = [MSCFLTLKEKLIESPVLALYNHKDDTELHCDASALGFGAVLLQRKDDGKLHPVFYFSKRTTADEAKLHSFELETLAVI +# YALRRFRIYLQGKHVKLVTDCIALKLTLHKAELNPKISRWALEMENYDLEICHRAGNKMQHVDALSRYNNILIVETNSFEENLVICQGKDLKIKKLKT +# ILEKAELKLFEMRNGVVYRKANDDRILFYVPEEMEDQVLYKYHNEIGHIGRDKMMDIISKTYWFPNLKEKCVAHIENCLKCVAFSPKSGKGEGFLHSI +# PKGNKPFELIHIDHYGPVDSSRAKKHIFVVVDGFTKFVRLYSTKSTSTREVITALKDYFRAYSRPKCIISDRGSCFTSKDFEEFMEEYNVKHIKIATG +# SPQANGQVERINRSLGPMIAKLVDQSKGVYWDNVIDKIEHALNNTLHRSIRQLPSKMLFGVEQKGKIVDELKEKLEDINENKKLDSLTKIRKKAEAHQ +# KQVQDYNEKLYNKSRVKARNYKKGDYVMVKNFDSTVGTARKLIPKHKGPYVIAKAMRNDRFY] +# end gene contig68.g221 +### +# +# ----- prediction on sequence number 69 (length = 44962, name = contig69) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 69 on both strands +# start gene contig69.g222 +contig69 AUGUSTUS gene 2436 4481 1 - . ID=contig69.g222 +contig69 AUGUSTUS transcript 2436 4481 . - . ID=contig69.g222.t1;Parent=contig69.g222 +contig69 AUGUSTUS CDS 2436 4481 . - 0 ID=contig69.g222.t1.cds;Parent=contig69.g222.t1 +contig69 AUGUSTUS start_codon 4479 4481 . - 0 Parent=contig69.g222.t1 +# coding sequence = [atgccaatgggtatcaaaaatgcaccagctgtttttcaacgctttgttaataaaatcttcgatgatatgattagagaaa +# gcaaagtagtagtgtatatggatgatataatggtcgccagcaaagatattaatgaacatttagaaacattagatgaaatctttaaaaggcttacacag +# aacagattagaacttagaatggataaatgtgagtttttgaaagcaaatataaagtatttgggatttttgatttctgagaatggcattagggcagatga +# taagggcattgaagccgtaaaaaattttccagttcccacgaaggttcaggcagtacaaagttttttgggactttcttcatattttcgaaggtttataa +# aagatttctctacaatagcaaaacctttgtatgacttgttaaagaaggacaaaccatttcaatttggtgaagaagagatgagttgttttctcacgtta +# aaggaaaaacttattgagtcaccagtactggcgttatataatcacaaggacgatacggaattacattgtgacgcaagcgctctaggatttggtgctgt +# actgttgcagaggaaagatgatggcaagttacatcctgtgttctatttctctaagcgtactacagcagatgaggctaagttacatagttttgagctcg +# agactttggcggttatctatgctcttcgtagatttaggatatatttgcaagggaaacatgtaaaattggtaaccgactgtattgcacttaagttaaca +# ctccataaagcagaacttaacccgaagatatcaagatgggctttggagatggaaaactatgatcttgaaatatgtcacagagcgggaaataaaatgca +# gcatgtggatgctctcagcaggtacaataatattctaatagtggaaaccaacagctttgaggaaaatttagtcatctgtcaaggaaaggatttaaaaa +# ttaagaagcttaaaacgattttagagaaggcagaacttaaattatttgaaatgagaaatggggtagtgtacagaaaagcaaatgacgataggatacta +# ttctatgtgccagaagaaatggaagatcaggtactatataaataccacaacgaaataggacatataggaagagataaaatgatggacataatttcaaa +# aacttattggtttccaagtttaaaagaaaagtgcgttgcacatatgtttaaagtgtgtatgtgtttaaagtgtgtagcgttttcaccaaaatcaggta +# aaggagaaggttttttgcacagtattcccaaaggaaacaaaccattcgagttaatacacattgaccattatggtccagtagactcgtcaagagcaaaa +# aaacacatttttgtggtagttgacggattcacaaagtttgtaagactttattcaactaaatcaacaagcactagggaggttatagcggcattgaaaga +# ttactttagggcctatagtaggccaaaatgcataatttcagaccggggtagttgttttacatctaaagacttcgaagaattcatggaagaatataatg +# tgaagcacatcaagatagccacaggctcaccacaagccaatggtcaagttgaaaggattaacaggagccttggaccaatgatagcaaaattagttgat +# caaagtaaaggtgtatactgggacaatgttatagataaaatagaacatgctttaaataatacgttgcacagaagtataagacaacttccgagtaaaat +# gctgtttggagtagaacaaaaaggaaagattgtggatgaacttaaggaaaagctagaggacataaatgaaaataagaaattagatagtttaacaaaga +# taaggaaaaaagctgaggcccaccaaaagcaagttcaagattataatgaaaaattgtataacaaaagtcgagtaaaggctagaaattataaaaaagga +# gactatgtaatggtgaaaaattttgactcgactgttggaactgctaggaaactgattcccaaacataaaaggaccatatgtgattgcaaaagcgatgc +# gcaatga] +# protein sequence = [MPMGIKNAPAVFQRFVNKIFDDMIRESKVVVYMDDIMVASKDINEHLETLDEIFKRLTQNRLELRMDKCEFLKANIKY +# LGFLISENGIRADDKGIEAVKNFPVPTKVQAVQSFLGLSSYFRRFIKDFSTIAKPLYDLLKKDKPFQFGEEEMSCFLTLKEKLIESPVLALYNHKDDT +# ELHCDASALGFGAVLLQRKDDGKLHPVFYFSKRTTADEAKLHSFELETLAVIYALRRFRIYLQGKHVKLVTDCIALKLTLHKAELNPKISRWALEMEN +# YDLEICHRAGNKMQHVDALSRYNNILIVETNSFEENLVICQGKDLKIKKLKTILEKAELKLFEMRNGVVYRKANDDRILFYVPEEMEDQVLYKYHNEI +# GHIGRDKMMDIISKTYWFPSLKEKCVAHMFKVCMCLKCVAFSPKSGKGEGFLHSIPKGNKPFELIHIDHYGPVDSSRAKKHIFVVVDGFTKFVRLYST +# KSTSTREVIAALKDYFRAYSRPKCIISDRGSCFTSKDFEEFMEEYNVKHIKIATGSPQANGQVERINRSLGPMIAKLVDQSKGVYWDNVIDKIEHALN +# NTLHRSIRQLPSKMLFGVEQKGKIVDELKEKLEDINENKKLDSLTKIRKKAEAHQKQVQDYNEKLYNKSRVKARNYKKGDYVMVKNFDSTVGTARKLI +# PKHKRTICDCKSDAQ] +# end gene contig69.g222 +### +# start gene contig69.g223 +contig69 AUGUSTUS gene 7121 7887 1 + . 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ID=contig69.g224 +contig69 AUGUSTUS transcript 14534 25353 . - . ID=contig69.g224.t1;Parent=contig69.g224 +contig69 AUGUSTUS CDS 14534 14700 . - 2 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 14885 15025 . - 2 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 22869 22908 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 24478 24531 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 24631 25353 . - 0 ID=contig69.g224.t1.cds;Parent=contig69.g224.t1 +contig69 AUGUSTUS start_codon 25351 25353 . - 0 Parent=contig69.g224.t1 +# coding sequence = [atggaaaacgttaacttctcatttcatgagcaaattataatgtctggacaacaaaaaagcgagttacaggaaaaaccaa +# aagtactcgtcgtttccccacaacaagtaatgattttatacatgcataagctgactccgtacgaacgtacggaaatactcagttacccacaaatatat +# tttattggtgccaatgcaaagaagcgccctggagtttacggcccaaataattctgactatgataatgagcaaggtgcttatattcatgtaccgcatga +# tcacgttgcatatcgttatgaaatgcttaagataattggaaaaggcagttttggacaggttattaaagcgtatgatcacaagactcacgagcatgttg +# ccttaaaaatagtacgcaacgaaaagcgttttcatcgtcaggcacaagaagaaattcgcatacttcatcatttacgtcggcatgataaatataatact +# atgaacattatacacatgtttgattactttacatttcgtaatcatacttgcattacgtttgagctgcttagcattaatctttacgaactgattaagaa +# aaatggattcaagggcttcagtttgcagttagtacgaaagtttgcacactcacttcttcaatgtttggatgcactgtataaaaatgacattattcatt +# gcgatatgaaaccagaaaatgtgttattaaaacaacagggtcgttctggtataaagtctatctcgaaagaaaacattcgactgccgcgagtaacatat +# gtccgatatcgaagtaaaaagtatactagatttgtggtaaagtatgcaacagttgcgtcaccccgtttaccatcaacgcattctgctggctccggcgg +# aataaatagtcaaagcactgaggacgtcgaggcatctaattattatccatcttcactttcatatttaccaaatatgaataaaaatgaaaataagcata +# ccggctatgcttttgattcgggttcgatggccatagatattgcacaagaatccttggttactctagctagctcgtatgcaatggagaagtcgatcgac +# attattgggaaaacgaatttgtctcttcattctaataagataaaagtgcagtcgaatgatttgtag] +# protein sequence = [MENVNFSFHEQIIMSGQQKSELQEKPKVLVVSPQQVMILYMHKLTPYERTEILSYPQIYFIGANAKKRPGVYGPNNSD +# YDNEQGAYIHVPHDHVAYRYEMLKIIGKGSFGQVIKAYDHKTHEHVALKIVRNEKRFHRQAQEEIRILHHLRRHDKYNTMNIIHMFDYFTFRNHTCIT +# FELLSINLYELIKKNGFKGFSLQLVRKFAHSLLQCLDALYKNDIIHCDMKPENVLLKQQGRSGIKSISKENIRLPRVTYVRYRSKKYTRFVVKYATVA +# SPRLPSTHSAGSGGINSQSTEDVEASNYYPSSLSYLPNMNKNENKHTGYAFDSGSMAIDIAQESLVTLASSYAMEKSIDIIGKTNLSLHSNKIKVQSN +# DL] +# end gene contig69.g224 +### +# start gene contig69.g225 +contig69 AUGUSTUS gene 30000 33463 1 + . 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ID=contig69.g227.t1;Parent=contig69.g227 +contig69 AUGUSTUS start_codon 36877 36879 . + 0 Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 36877 36942 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 37429 37596 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 40859 41109 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42238 42349 . + 1 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42438 42544 . + 0 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42702 42781 . + 1 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 44690 44787 . + 2 ID=contig69.g227.t1.cds;Parent=contig69.g227.t1 +# coding sequence = [atggggaacgcgagcagaagcaacatacgcaaccaaaacatccacaggggcctaggcattcttaccgacaaacaagaac +# gggaagaagaagaacgcaaacgacgaattcaactatatgtgtttatatcacgatgtatttcgtatccctttaatgctaaacagcctacggatatgact +# aagcggcaaacgaaaataactaagcagcaattagaaataataactcaacgatttcaactagactctgccgatgaacaagcagcggctataagacggga +# attagatggaagaatgcaacgtgtaggagaaatggagaaaaatcgcaaacttatgccaaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgagg +# aacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcgaaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaa +# cgatataatcacaggtgggatacgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgct +# ggcattggaagataaggaactgggaaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacggattaagatagctt +# gccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatggatatacagtagat +# tacatagaagccgccagtgttagttctgaatttcgaattaaatttgatcaaaatcggacaactatatcatatagctgccatagtaacgatcggaaaat +# tagtgggaaaataatatga] +# protein sequence = [MGNASRSNIRNQNIHRGLGILTDKQEREEEERKRRIQLYVFISRCISYPFNAKQPTDMTKRQTKITKQQLEIITQRFQ +# LDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHRWDTQGDFTTTHPLP +# VVKVKLYTENPGMLALEDKELGKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASVSSEFRIKFDQNR +# TTISYSCHSNDRKISGKII] +# end gene contig69.g227 +### +# +# ----- prediction on sequence number 70 (length = 55020, name = contig70) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 70 on both strands +# start gene contig70.g228 +contig70 AUGUSTUS gene 47 3510 1 + . ID=contig70.g228 +contig70 AUGUSTUS transcript 47 3510 . + . ID=contig70.g228.t1;Parent=contig70.g228 +contig70 AUGUSTUS start_codon 47 49 . + 0 Parent=contig70.g228.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 47 381 . + 0 ID=contig70.g228.t1.cds;Parent=contig70.g228.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 1375 1495 . + 1 ID=contig70.g228.t1.cds;Parent=contig70.g228.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 3412 3510 . + 0 ID=contig70.g228.t1.cds;Parent=contig70.g228.t1 +# coding sequence = [atgattgatccaagttcgagtgaagaagaaggcgaagatgaccccattgctaatgtgtcatcgaaaggacgtcttacac +# atgcacccaagggcacaaacaccgtttccatattaggtggggtttcaggtcccggtgtaggatcaaatatggctatttctggttctaatggtgatttg +# gccgggaatcaaagacaatctaatataagttctattagtaaccgaaatgatgctggaaacgtggcaggagttggaggctcctctaacaaaaatgagca +# aatacatggtagccgagttgacggcggcaatcttgaggtgcccaacagctgtattcccagcggtgtttcgcaagaaactttaaatcaaagtattggat +# cgtcgagggccaactctttgccacggccattgtcaccatcaccatctttaaccagcgaaaagcctgacactggagatccacatgataagattccggag +# caggccaccaatcttcgtcacttcctaatttatttatcaactttagcccaaaagaagttcattggcagcaacatagtgtcgtag] +# protein sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG +# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHDKIPEQATNLRHFLIYLSTLAQKK +# FIGSNIVS] +# end gene contig70.g228 +### +# start gene contig70.g229 +contig70 AUGUSTUS gene 5331 5933 1 - . 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ID=contig70.g235.t1;Parent=contig70.g235 +contig70 AUGUSTUS start_codon 24505 24507 . + 0 Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 24505 24577 . + 0 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 27274 27411 . + 2 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 28524 28636 . + 2 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 33015 33225 . + 0 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 38419 38560 . + 2 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 45726 46035 . + 1 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 46098 46478 . + 0 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 46932 47068 . + 0 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 47124 47263 . + 1 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 50403 50605 . + 2 ID=contig70.g235.t1.cds;Parent=contig70.g235.t1 +# coding sequence = [atgattaaaaaaagtttagagacggcagcgcttgtaaattacacccgtctctccaataaagctaagattgaaggcactt +# ttccgttcaagggacacgtgccagggaaatcctatcggaatttcaaaatttttccaagcactttcctgtacacgggaaacgtcccagggaaagcctat +# cggaaaggtcccagggaaatcccgtcggatattcaggatttgcgaggagaggttattgttccgcccccaaaaaaactagaggacctaattcacttagc +# agaactttgtgttgatctgttgcaacaaaatgaagagcactatggagaactgcgcaaacatgacaaaatggataaaattaaaatgcgtaaggaagatg +# atgatgtaccaaaaggccacaatgaaagcgatattgatttaaccgccaatactggactcagtagcacatcagacctggcttctgcagcatcaactaat +# ggatcgtcatttcgttattgtatgccgacacatgcagtatacaccacgccagtaccaacggcatataatttgaggaatgggcgttttcatcagcacct +# gcgagacacattcgcaccattagtcgtgcggtacgtggatctgatggaatcttcaatagctcagtcgattcataagggatttgaaaaagaacgctggg +# aaagtaaagggaacggatgtgccacctctgaagacttattttggaaactagatgctctacagtcgtttataagagacctgcactggccagacgcagag +# tttcgacaacatttagaacagcgtcttaaaatgatggccgtcgatatgatagagcaatgtatacaacgaactgattcgtcttttcagtcgtggctaaa +# aaaaaacattgccttcatatcaactgattatattttaccttcagaaatgtgcgctatggtcaatgtgatattagatgctaaaaatcaaagctttaaat +# tgactactattgacggcattgatttgtataaatttcatgcaaaaattgacgaccaaatcgacaaagcgaatgtagctatgacacaaggtctaactggt +# aaacttatgtcagtgctagagtcgactttgtcaaaattagcacgatacgacgaaggtagcctaatcggctcgattcttagttttacaaatgtatcgag +# ctcgggaaaggatctcgggcaaggatatgtaaatttctttagaaataatatggatcaagtacgaggaaaaattggcgacgatttatggaccctgaatt +# tctttgagcagtggtactcgcagcagattaacatgctatgtaattggctttcggaacgtttggaccacgctctgcactacgctcaagtttcatctatt +# tctcacattatcaagaaaatatattcagacttcgaattacaaggtgtattagaagataaattaaactctaaagcatatcaagcagtcgcacagcgaat +# ggcgacagaggaagcgacatgtgctttgacaatgcctgatgttagcgaagatgaaccctgtgacgacattcgagaaggggaagaagaagatactggcg +# acgaatctacctctaacataccaaggggcttaccaaaaccaaaaattgctgccgctcaagctgctgctgttaccaacgttgttgccggccgtgtggca +# accggaacatcaccagcaggtagtgccacattaatccgccttgaccagcaacaacaagagcgatacagacggcagcaggatcagttgcacgatgagca +# gcaagaaagccatgcccgacaaaagcaggaacttgctcttgcatcttacaccccagggacggtcgtcaatggattgggtcaatcatcagtcacggcaa +# gttag] +# protein sequence = [MIKKSLETAALVNYTRLSNKAKIEGTFPFKGHVPGKSYRNFKIFPSTFLYTGNVPGKAYRKGPREIPSDIQDLRGEVI +# VPPPKKLEDLIHLAELCVDLLQQNEEHYGELRKHDKMDKIKMRKEDDDVPKGHNESDIDLTANTGLSSTSDLASAASTNGSSFRYCMPTHAVYTTPVP +# TAYNLRNGRFHQHLRDTFAPLVVRYVDLMESSIAQSIHKGFEKERWESKGNGCATSEDLFWKLDALQSFIRDLHWPDAEFRQHLEQRLKMMAVDMIEQ +# CIQRTDSSFQSWLKKNIAFISTDYILPSEMCAMVNVILDAKNQSFKLTTIDGIDLYKFHAKIDDQIDKANVAMTQGLTGKLMSVLESTLSKLARYDEG +# SLIGSILSFTNVSSSGKDLGQGYVNFFRNNMDQVRGKIGDDLWTLNFFEQWYSQQINMLCNWLSERLDHALHYAQVSSISHIIKKIYSDFELQGVLED +# KLNSKAYQAVAQRMATEEATCALTMPDVSEDEPCDDIREGEEEDTGDESTSNIPRGLPKPKIAAAQAAAVTNVVAGRVATGTSPAGSATLIRLDQQQQ +# ERYRRQQDQLHDEQQESHARQKQELALASYTPGTVVNGLGQSSVTAS] +# end gene contig70.g235 +### +# command line: +# augustus --strand=both --noInFrameStop=false --gff3=on --uniqueGeneId=true --protein=on --codingseq=on --introns=off --stop=off --stop=off --cds=on --singlestrand=false /home/galaxy/galaxy/database/files/000/dataset_2.dat --UTR=off --genemodel=complete --species=human diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/augustusOutput.html --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/augustusOutput.html Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,1 @@ +

The following generated by Hub Archive Creator:

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  • myHub/dbia3/description.html
  • myHub/dbia3/tracks/augustusDbia3.bb
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/home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/000/dataset_285.dat +DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Repeating_Elements_by_TrfBig', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} +DEBUG:root:Calling sort: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpJsUz0x.sortedBed +DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpPbCGNa.chrom.sizes +DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/923/dataset_1291_files/myHub/Dbia3/tracks/Repeating_Elements_by_TrfBig.bb +DEBUG:root:typeOption: bed4+12 +DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/trf_simpleRepeat.as +DEBUG:root:tab option: False +DEBUG:root:Calling bedToBigBed: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- 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      + The following has been generated by Hub Archive Creator: +

      + + + + + + diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/bed_simple_repeats/inputs/Repeating_Elements_by_TrfBig --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/bed_simple_repeats/inputs/Repeating_Elements_by_TrfBig Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,602 @@ +contig1 9130 9428 trf 163 1.8 164 86 2 438 36 12 13 37 1.82 AAAAAAAATTATATCTTCGGTGTTTTTCAACATACAACCTCCTAAGCTTGGAAATAACATTTCTTAATCAGTTCTGAATTTCGAATTAAATTTTTATCAAAATCGGACAACTATACCATATAGCTGTCATAGGAAGGATTGGATAATTAGTGGTAAAATAATAT +contig1 15707 15757 trf 20 2.5 19 83 9 55 32 12 2 54 1.49 TATATCATTTATATCTCAG +contig1 16261 16302 trf 12 3.4 12 89 0 64 2 36 24 36 1.69 TCCGTCTGTCCG +contig1 23387 23483 trf 45 2.2 45 92 1 158 19 22 30 27 1.98 TCGGCGAAGAAATGTGCCACTTCGGCGGCACTTCTTGGAGTCACT +contig1 23451 23520 trf 24 2.9 24 80 0 75 15 26 27 30 1.96 TTCGGCGACACTTCTTGAAGTCAG +contig1 24200 24233 trf 15 2.2 15 94 0 57 51 12 15 21 1.75 AAACAATGGAATGCT +contig1 29159 29628 trf 162 2.9 160 80 8 518 37 12 11 38 1.80 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      + + + + + + diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3.html diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/Dbia3.2bit Binary file test-data/default_color/myHub/Dbia3/Dbia3.2bit has changed diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/description.html diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/groups.txt --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/default_color/myHub/Dbia3/groups.txt Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,5 @@ +name default_group +label Default group +priority 2 +defaultIsClosed 0 + diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/trackDb.txt --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/default_color/myHub/Dbia3/trackDb.txt Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,11 @@ + track HISAT2_Accepted_Hits.bam + longLabel HISAT2 Accepted Hits.bam + shortLabel HISAT2 Accepted + bigDataUrl tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam + type bam + visibility pack + thickDrawItem off + priority 10 + color 0,0,0 + group default_group + diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam Binary file test-data/default_color/myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam has changed diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai Binary file test-data/default_color/myHub/Dbia3/tracks/HISAT2_Accepted_Hits.bam.bai has changed diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/genomes.txt --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/default_color/myHub/genomes.txt Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,10 @@ +genome Dbia3 +trackDb Dbia3/trackDb.txt +groups Dbia3/groups.txt +description Dbia3 +twoBitPath Dbia3/Dbia3.2bit +organism Dbia3 +defaultPos contig25 +orderKey 4500 +scientificName Dbia3 +htmlPath Dbia3/description.html diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/default_color/myHub/hub.txt --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/default_color/myHub/hub.txt Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,6 @@ +hub gonrampDbia3 +shortLabel Dbia3 +longLabel Dbia3 +genomesFile genomes.txt +email rmarenco@gwu.edu +descriptionUrl Dbia3.html diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/gff3/__main__.log --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/gff3/__main__.log Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,38 @@ +DEBUG:root:#### Welcome in HubArchiveCreator Debug Mode #### + +DEBUG:root:Calling faToTwoBit: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling twoBitInfo: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling sort: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:input_false_path: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/001/dataset_1184.dat +DEBUG:root:data_value: {u'order_index': u'10', u'name': u'Augustus_Gene_Predictions', u'track_color': u'#000000', u'group_name': u'Default group'} +DEBUG:root:Calling gff3ToGenePred: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling genePredToBigGenePred: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:Calling sort: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:sorted_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpIyQfQ1.sorted.bigGenePred +DEBUG:root:chrom_sizes_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/tmp/tmpALSFpV.chrom.sizes +DEBUG:root:big_bed_file_name: /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/909/dataset_1277_files/myHub/Dbia3/tracks/Augustus_Gene_Predictions.bb +DEBUG:root:typeOption: bed12+8 +DEBUG:root:autoSql: /home/svc_galaxy/new/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/rmarenco/hubarchivecreator/d786bca6a75d/hubarchivecreator/bigGenePred.as +DEBUG:root:tab option: True +DEBUG:root:Calling bedToBigBed: +DEBUG:root:--------- +DEBUG:root: +DEBUG:root:----- End of all_datatype_dictionary processing ----- +DEBUG:root:all_datatype_ordered_dictionary keys are: [] +DEBUG:root:----- Beginning of Track adding processing ----- +DEBUG:root:We just added in /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/jobs_directory/000/909/dataset_1277_files/myHub/Dbia3/groups.txt the group Default group +DEBUG:root:We just added track Augustus_Gene_Predictions.bb (in group default_group) +DEBUG:root:----- End of Track adding processing ----- +DEBUG:root:#### End of HubArchiveCreator Debug Mode: Bye! #### diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/gff3/gff3_trackhub.html --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/gff3/gff3_trackhub.html Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,70 @@ + + + +

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      + + + + + + diff -r 2219ff196405 -r 86143078e98b test-data/gff3/inputs/Augustus_Gene_Predictions --- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/gff3/inputs/Augustus_Gene_Predictions Fri Dec 30 11:35:49 2016 -0500 @@ -0,0 +1,6937 @@ +##gff-version 3 +# This output was generated with AUGUSTUS (version 3.1.0). +# AUGUSTUS is a gene prediction tool written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de), +# Oliver Keller, Stefanie König and Lizzy Gerischer. +# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008), +# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding +# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013 +# No extrinsic information on sequences given. +# Initialising the parameters using config directory /home/svc_galaxy/new/galaxy/tool_dependency/augustus/3.1/iuc/package_augustus_3_1/24009970003a/config/ ... +# fly version. Using default transition matrix. +# Looks like /home/svc_galaxy/new/galaxy/database/files/000/dataset_98.dat is in fasta format. +# We have hints for 0 sequences and for 0 of the sequences in the input set. +# +# ----- prediction on sequence number 1 (length = 45179, name = contig1) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 1 on both strands +# start gene contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS gene 553 34688 0.03 - . ID=contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS transcript 553 34688 0.03 - . ID=contig1.g1.t1;Parent=contig1.g1 +contig1 AUGUSTUS CDS 553 578 0.41 - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 652 1047 0.25 - 2 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 12541 12968 0.87 - 1 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 32202 33826 0.89 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 33880 34044 0.98 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 34107 34619 0.99 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS CDS 34674 34688 0.45 - 0 ID=contig1.g1.t1.cds;Parent=contig1.g1.t1 +contig1 AUGUSTUS start_codon 34686 34688 . - 0 Parent=contig1.g1.t1 +# coding sequence = [atggcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagc +# cctcatcaacatcaggaagcgtggcccaagtagaagcggacagcgcatcgtcacatttgtctgatcgctgttataacaacatagcaagtactaccaaa +# agtattgttggtgatgtgaaaacaagcagacgctgtgaagactttataagtagtggatcagcttcgactccattaaatgaatatgattgtgccaacgc +# tgatacgacggatattaaagatgaacctggagattttatagaaacaaattgtcattggcgaagttgttgtattgaatttaatacgcaagatgagcttg +# ttaaacatatcaataatgaccatatccaaaccaataagaaggcctttgtctgtcgatgggaaaattgtacccgtggtgaaaaacctttcaaagcgcag +# tatatgctagttgtgcatatgcgtcgtcataccggcgaaaagccacataaatgcacatttgaaggctgttttaaggcatattcacgcttggaaaacct +# aaaaacacatttacggtcacacacaggtgaaaaaccctatatgtgcgagtatccgggatgcagcaaggcgtttagtaatgcaagcgatcgtgcaaagc +# atcaaaatcgtactcacagtaatgagaaaccgtacatttgtaaagctcctggttgcacgaaacgttacaccgacccaagttctttgcgtaaacatgtt +# aaaacagttcatggtgctgagttttatgctaataaaaaacacaagggattgcccctaaatgatgcgaactctcgcctccaccgagacagtggccaagg +# tcggcataatcttcaagagcataatattgactctagcccttgcagcgaagaacttcaggtgggaaaacttataggcatgtctagtcccagtattaaat +# ctgaatctgatgaaagttcaccacatcatcagttgttaagtggagttcgagcttcagactgttttttaacatattcacaagatggtgccgccgaacat +# ataactttagatgacggctgggattgtgacgatgacgttgacgtggccgacttaccaattgtcttgcgtgctatggtaaatgttggcagcggaaattc +# gatggccccgaccattggagggggtgttgttgcgaggcagcgatttagaagtcgtttgcaaactaaaggaataaactctagtatggttatgcttggca +# acatccccgaaagcaatcgcaccattggaataagcgaacttaaccagcgtataacagaacttaagatggagcctggtaccgcttgtgatattacagtt +# ccattgaatacggggctggaaaggatttcagaagacttatcacaaaatcaatcaaatataacattaaataagcaaagcttctttaccgcttccggctc +# tctccaaggacattttcgtcgcgatagccagaactccactgcaagtacatattatggtagcatgcaaagtcgccgcagtagtcaatcatctcaggtgt +# cttctatatctacaatgcgtccaggcccatcgtacaacacaaccacagcttccctctatgatccaatttccccaggatgctctcgacgctctagccaa +# atgtctaatgtagtcaactcctacgcacttacatcaacatcaggattgactgcaattaacaaggacttaaatgcaaacagcagcccaaatgcttctat +# taataaaccgggtcttggtggtcagtactttggtttttacaataacagtcttcctccacctccatcgtctcatttaattgccaccaatttgaagcatc +# tgcaggacacagactctaggagttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatgga +# ccggctggagagcaggaaattgataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaa +# 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SEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSSSNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNY +# MEKDDVAISTHHQSVNCTKESPAQLSSPSNDIVAQFNLPSITSASNYGNRSKGYNGENGEDSQSKNYFTHLSFDFMNNVLFAGATNKILKLNENLRVL +# SEAVTGPVNDSPQCHAGGCPEDIETSLVNNYNKILVVSYAHDGILISCGSIRQEERLLHEQVTHSVVILHILQDDLDEKVQCRVNDLDTISQVKLKIL +# DAIFKNTPFSMRPSVHEVDLEWRHGRGGHLTLQDEDLTTKTINGWKRLNTLAHYGVKESAVMSLIARQNDNYHIPYGKNQNQAPYHNFISNFQCY] +# end gene contig1.g1 +### +# +# ----- prediction on sequence number 2 (length = 45017, name = contig2) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 2 on both strands +# start gene contig2.g2 +contig2 AUGUSTUS gene 7855 39627 0.09 - . ID=contig2.g2 +contig2 AUGUSTUS transcript 7855 39627 0.09 - . ID=contig2.g2.t1;Parent=contig2.g2 +contig2 AUGUSTUS CDS 7855 7969 0.61 - 1 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 17035 18659 0.78 - 0 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 18713 18877 0.99 - 0 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 18940 19452 0.98 - 0 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 19507 20144 0.39 - 2 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 39396 39481 0.69 - 1 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 39575 39627 0.77 - 0 ID=contig2.g2.t1.cds;Parent=contig2.g2.t1 +contig2 AUGUSTUS start_codon 39625 39627 . - 0 Parent=contig2.g2.t1 +# coding sequence = [atgccatcggccaagaagccgccctccattctccattggggaaccactggagaccatgacaacaccgttggcatattgg +# gaatcggagttgaatggccaggagaagatgtggaagcatccgcgacactagaagcaggacatccttatgttaactgtgcgtcagcttttcaccttgcg +# ggactggggttgggatcaggagattttttgggcacccgaggaatgggctcactgggtgatctccatcatgcggctgtagcagcagcggctgcaggatc +# tctagccagcactgattttcacttcagcattgatggcaacaggcgattaagtagtcctcggccgcccggcggaagtattcgtgcaagcatcagcagaa +# aacgagcgctttcctcatcgccttattcggattcgtttgacattaactcaatgattcgattttcaccaaactccttagccacaattatgaatggctct +# cgaggaagcagcgcggcaagtggttcatatggtcatatttcagctagtgctattaatcctatatctcatgcacattcaacattggcaccacgtctaca +# gcatttgttacgtgcaagtgcaggtcttttaaatccgatgaatacacaacaagcagctgcggccgggttttctataagccacgctgcaagcgctgcag +# ccttaagcctcaacgacgttcatggtaatctaaatgatttaccaggccaaataacaccatcttcaacagcaagactagtagcggatgaacataaaatg +# gcagcactctcgcaaaaggactttaatgacggaaaccagagaaatcgtcagaggaaaagtactgtcactgagcagccctcatcaacatcaggaagcgt +# ggcccaagtagaagcggacagcgcatcgtcacatttgtctgatcgctgttataacaacatagcaagtactaccaaaagtattgttggtgatgtgaaaa +# caagcagacgctgtgaagactttataagtagtggatcagcttcgactccattaaatgaatatgattgtgccaacgctgatacgacggatattaaagat +# gaacctggagattttatagaaacaaattgtcattggcgaagttgttgtattgaatttaatacgcaagatgagcttgttaaacatatcaataatgacca +# tatccaaaccaataagaaggcctttgtctgtcgatgggaaaattgtacccgtggtgaaaaacctttcaaagcgcagtatatgctagttgtgcatatgc +# gtcgtcataccggcgaaaagccacataaatgcacatttgaaggctgttttaaggcatattcacgcttggaaaacctaaaaacacatttacggtcacac +# acaggtgaaaaaccctatatgtgcgagtatccgggatgcagcaaggcgtttagtaatgcaagcgatcgtgcaaagcatcaaaatcgtactcacagtaa +# tgagaaaccgtacatttgtaaagctcctggttgcacgaaacgttacaccgacccaagttctttgcgtaaacatgttaaaacagttcatggtgctgagt +# tttatgctaataaaaaacacaagggattgcccctaaatgatgcgaactctcgcctccaccgagacagtggccaaggtcggcataatcttcaagagcat +# aatattgactctagcccttgcagcgaagaacttcaggtgggaaaacttataggcatgtctagtcccagtattaaatctgaatctgatgaaagttcacc +# acatcatcagttgttaagtggagttcgagcttcagactgttttttaacatattcacaagatggtgccgccgaacatataactttagatgacggctggg +# attgtgacgatgacgttgacgtggccgacttaccaattgtcttgcgtgctatggtaaatgttggcagcggaaattcgatggccccgaccattggaggg +# ggtgttgttgcgaggcagcgatttagaagtcgtttgcaaactaaaggaataaactctagtatggttatgcttggcaacatccccgaaagcaatcgcac +# cattggaataagcgaacttaaccagcgtataacagaacttaagatggagcctggtaccgcttgtgatattacagttccattgaatacggggctggaaa +# ggatttcagaagacttatcacaaaatcaatcaaatataacattaaataagcaaagcttctttaccgcttccggctctctccaaggacattttcgtcgc +# gatagccagaactccactgcaagtacatattatggtagcatgcaaagtcgccgcagtagtcaatcatctcaggtgtcttctatatctacaatgcgtcc +# aggcccatcgtacaacacaaccacagcttccctctatgatccaatttccccaggatgctctcgacgctctagccaaatgtctaatgtagtcaactcct +# acgcacttacatcaacatcaggattgactgcaattaacaaggacttaaatgcaaacagcagcccaaatgcttctattaataaaccgggtcttggtggt +# cagtactttggtttttacaataacagtcttcctccacctccatcgtctcatttaattgccaccaatttgaagcatctgcaggacacagactctaggag +# ttgttatcacaacacaactggcggtcgattttccattcccaattgtacgccatctctacatttagactacaatggaccggctggagagcaggaaattg +# ataaagaaatcccgaataacatattacgacgtcaatctgagccaatgccaaacataagtttggatacactaacaaatgtttctcctttaagtggccca +# ctgcaaaatttgcagtttcccattggaaaggctaggaacgtgaatataacatcgtctagtaacgagaatactttaagaaagggaccttgccatgctac +# aatgaagactgaaatgacaatgaccagcgagcagcatccaaatgagagaataaatttggatgaagttgaagagcttatacttcccgatgagatgcttc +# agtatttaaatttggtgaaggacgatcaaaattatatggagaaagatgatgttgctataaggttcagactgcagatgagttcgtcgtcgatgcgcgtg +# atagacgatccttcatccagcgcaggtgtcgacctgcgaattctctccgtacagcgtcacgggaagaatccggaatag] +# protein sequence = [MPSAKKPPSILHWGTTGDHDNTVGILGIGVEWPGEDVEASATLEAGHPYVNCASAFHLAGLGLGSGDFLGTRGMGSLG +# DLHHAAVAAAAAGSLASTDFHFSIDGNRRLSSPRPPGGSIRASISRKRALSSSPYSDSFDINSMIRFSPNSLATIMNGSRGSSAASGSYGHISASAIN +# PISHAHSTLAPRLQHLLRASAGLLNPMNTQQAAAAGFSISHAASAAALSLNDVHGNLNDLPGQITPSSTARLVADEHKMAALSQKDFNDGNQRNRQRK +# STVTEQPSSTSGSVAQVEADSASSHLSDRCYNNIASTTKSIVGDVKTSRRCEDFISSGSASTPLNEYDCANADTTDIKDEPGDFIETNCHWRSCCIEF +# NTQDELVKHINNDHIQTNKKAFVCRWENCTRGEKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCFKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYMCEYPGCSKAFSN +# ASDRAKHQNRTHSNEKPYICKAPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGAEFYANKKHKGLPLNDANSRLHRDSGQGRHNLQEHNIDSSPCSEELQVGKLIGM +# SSPSIKSESDESSPHHQLLSGVRASDCFLTYSQDGAAEHITLDDGWDCDDDVDVADLPIVLRAMVNVGSGNSMAPTIGGGVVARQRFRSRLQTKGINS +# SMVMLGNIPESNRTIGISELNQRITELKMEPGTACDITVPLNTGLERISEDLSQNQSNITLNKQSFFTASGSLQGHFRRDSQNSTASTYYGSMQSRRS +# SQSSQVSSISTMRPGPSYNTTTASLYDPISPGCSRRSSQMSNVVNSYALTSTSGLTAINKDLNANSSPNASINKPGLGGQYFGFYNNSLPPPPSSHLI +# ATNLKHLQDTDSRSCYHNTTGGRFSIPNCTPSLHLDYNGPAGEQEIDKEIPNNILRRQSEPMPNISLDTLTNVSPLSGPLQNLQFPIGKARNVNITSS +# SNENTLRKGPCHATMKTEMTMTSEQHPNERINLDEVEELILPDEMLQYLNLVKDDQNYMEKDDVAIRFRLQMSSSSMRVIDDPSSSAGVDLRILSVQR +# HGKNPE] +# end gene contig2.g2 +### +# start gene contig2.g3 +contig2 AUGUSTUS gene 41706 42608 0.66 - . ID=contig2.g3 +contig2 AUGUSTUS transcript 41706 42608 0.66 - . ID=contig2.g3.t1;Parent=contig2.g3 +contig2 AUGUSTUS CDS 41706 42171 0.93 - 1 ID=contig2.g3.t1.cds;Parent=contig2.g3.t1 +contig2 AUGUSTUS CDS 42268 42608 0.7 - 0 ID=contig2.g3.t1.cds;Parent=contig2.g3.t1 +contig2 AUGUSTUS start_codon 42606 42608 . - 0 Parent=contig2.g3.t1 +# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac +# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg +# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga +# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg +# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc +# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa +# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga +# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac +# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] +# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI +# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT +# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] +# end gene contig2.g3 +### +# +# ----- prediction on sequence number 3 (length = 40006, name = contig3) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 3 on both strands +# start gene contig3.g4 +contig3 AUGUSTUS gene 6691 7593 0.64 - . 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ID=contig3.g4.t1;Parent=contig3.g4 +contig3 AUGUSTUS CDS 6691 7156 0.95 - 1 ID=contig3.g4.t1.cds;Parent=contig3.g4.t1 +contig3 AUGUSTUS CDS 7253 7593 0.67 - 0 ID=contig3.g4.t1.cds;Parent=contig3.g4.t1 +contig3 AUGUSTUS start_codon 7591 7593 . - 0 Parent=contig3.g4.t1 +# coding sequence = [atggcagtcggcaaaaataaaggtctttccaagggtggcaagaagggtggtaaaaagaaggtagtggaccccttttcac +# gcaaggattggtacgatgtgaaagccccgaatatgttccaaacccgtcaaatcggtaaaacgcttgtgaaccgcacccagggccaaagaatagcgtcg +# gactatctaaagggtcgcgtttttgaagtgtctctggcagatttgcaaaaggatatagatccggagcgctcattccgcaagttccgtcttattgccga +# agacgttcaagaccgaaacgtgctttgcaacttccatggcatggatctaactacagacaagtacaggtcaatggttaaaaagtggcaaactcttattg +# aagcgattgttgaagccaagactgtcgatggttaccttctgcgagtgttttgcattggatttactgccaaggatcagcagtctcagcgcaaaacatgc +# tatgctcaacagtcgcaggtccgcaagattcgcgctcgcatgactgacattattactaacgaagttagtggtgctgatttgaagcagcttgttaacaa +# actggcattggattccattgcaaaagatattgaaaaaagctgccagcgtatctatccattacatgatgtttacattcgtaaagtcaaggtattgaaga +# agccgcgtttcgatgtctcaaagctcttggagttgcatggtgatggtggcggcaaatctgtcgatgccgtcgtttccaccgaaggagccgtagttgac +# cgccccgagggttatgagcccccagtgcaggaagctgtctaa] +# protein sequence = [MAVGKNKGLSKGGKKGGKKKVVDPFSRKDWYDVKAPNMFQTRQIGKTLVNRTQGQRIASDYLKGRVFEVSLADLQKDI +# DPERSFRKFRLIAEDVQDRNVLCNFHGMDLTTDKYRSMVKKWQTLIEAIVEAKTVDGYLLRVFCIGFTAKDQQSQRKTCYAQQSQVRKIRARMTDIIT +# NEVSGADLKQLVNKLALDSIAKDIEKSCQRIYPLHDVYIRKVKVLKKPRFDVSKLLELHGDGGGKSVDAVVSTEGAVVDRPEGYEPPVQEAV] +# end gene contig3.g4 +### +# start gene contig3.g5 +contig3 AUGUSTUS gene 29077 31134 0.18 + . ID=contig3.g5 +contig3 AUGUSTUS transcript 29077 31134 0.18 + . 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ID=contig4.g6 +contig4 AUGUSTUS transcript 19075 51981 0.04 + . ID=contig4.g6.t1;Parent=contig4.g6 +contig4 AUGUSTUS start_codon 19075 19077 . + 0 Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 19075 19109 0.47 + 0 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 19167 19247 0.44 + 1 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 20791 20940 0.57 + 1 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 31331 31523 0.57 + 1 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 36906 37059 0.52 + 0 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 37833 37902 0.74 + 2 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 50913 51073 0.7 + 1 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 51131 51361 0.58 + 2 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +contig4 AUGUSTUS CDS 51833 51981 0.41 + 2 ID=contig4.g6.t1.cds;Parent=contig4.g6.t1 +# coding sequence = [atgctaagttctgatatgtctcaagtggcttcatggcacacgccctctgtatactctgcatctagttttaggactcctt +# atccttcctccttaccgataaatactacactttcaagtgacttccctttccgattttcgcctagccttttaccttcagtgcacgccacgtcgcaccat +# gttttaaatgcgcatactgctattgtgggagttaactccaaacaagaatgtggtgttcaggatacaacaacgaacaatagatatccaagaaacttgga +# tacaaaaaattcatcgaatacacaatcaaacgacgctaaggagacatcaaatgataaaaaaaaaccgcatatcaaaaaaccactaaatgcgtttatgc +# tctatatgaaggaaatgcgcgctaaagttgttgccgaatgtacactaaaagaatcggctgctattaatcagattttgggaagacggtggcatgccttg +# gggcgtgaagagcaagcgaagtattacgagttggcgcgaagggagcgacaactgcacatgcaaatgtatcccgattggagctctcgtacaaatgcctc +# tcggggcaagaaacggaagcggaagcaagataccaacgacggaggtaacaatatgaaaaaatgccgagctcgatttggtctggatcaacagaatcaat +# ggtgcaaaccttgcaggcgcaaaaagaaatgcattcgttatatggaagcactaaatgaaaatgggcccaccgaagacgggagcggtattgatgaacac +# ggaagccagctaagtgatgacgacgatgacgactacgatgatgataaactgggaggaagttgtggaagcgctgacgaaagctgtctaagtggattgtc +# cagtttacagagcccatcgacaacaatgagtttggcgagcccacttaatatgaataccaacactgcaactaatgctcttttgatcgtcaacgcagatc +# cgccgacttcacaacaacggccaacatctgtgtctacatcaggatcgagtagtgggtcaactagtagcatcagcacaaccccaaatacctcaagtaca +# gtttcgccagttacagctaaaatgattgagccgacaatgttgtcggtgagtactcatgctgtaaatagcactgagtgccataaaggatcagatccaca +# agcaaatgcatctgtaaagactacaagcgctggcgcttccgaaactggcgtcattagcgtttcataa] +# protein sequence = [MLSSDMSQVASWHTPSVYSASSFRTPYPSSLPINTTLSSDFPFRFSPSLLPSVHATSHHVLNAHTAIVGVNSKQECGV +# QDTTTNNRYPRNLDTKNSSNTQSNDAKETSNDKKKPHIKKPLNAFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALGREEQAKYYELARRERQLH +# MQMYPDWSSRTNASRGKKRKRKQDTNDGGNNMKKCRARFGLDQQNQWCKPCRRKKKCIRYMEALNENGPTEDGSGIDEHGSQLSDDDDDDYDDDKLGG +# SCGSADESCLSGLSSLQSPSTTMSLASPLNMNTNTATNALLIVNADPPTSQQRPTSVSTSGSSSGSTSSISTTPNTSSTVSPVTAKMIEPTMLSVSTH +# AVNSTECHKGSDPQANASVKTTSAGASETGVISVS] +# end gene contig4.g6 +### +# +# ----- prediction on sequence number 5 (length = 50018, name = contig5) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 5 on both strands +# start gene contig5.g7 +contig5 AUGUSTUS gene 43345 45058 0.19 - . 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ID=contig5.g7.t1;Parent=contig5.g7 +contig5 AUGUSTUS CDS 43345 44665 0.2 - 1 ID=contig5.g7.t1.cds;Parent=contig5.g7.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 44724 44948 0.88 - 1 ID=contig5.g7.t1.cds;Parent=contig5.g7.t1 +contig5 AUGUSTUS CDS 45006 45058 0.94 - 0 ID=contig5.g7.t1.cds;Parent=contig5.g7.t1 +contig5 AUGUSTUS start_codon 45056 45058 . - 0 Parent=contig5.g7.t1 +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt +# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt +# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg +# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt +# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac +# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc +# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt +# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata +# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg +# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt +# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct +# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag +# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] +# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV +# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV +# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG +# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM +# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT +# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] +# end gene contig5.g7 +### +# +# ----- prediction on sequence number 6 (length = 40015, name = contig6) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 6 on both strands +# start gene contig6.g8 +contig6 AUGUSTUS gene 13336 15049 0.08 - . ID=contig6.g8 +contig6 AUGUSTUS transcript 13336 15049 0.08 - . ID=contig6.g8.t1;Parent=contig6.g8 +contig6 AUGUSTUS CDS 13336 14656 0.17 - 1 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 +contig6 AUGUSTUS CDS 14715 14939 0.91 - 1 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 +contig6 AUGUSTUS CDS 14997 15049 0.42 - 0 ID=contig6.g8.t1.cds;Parent=contig6.g8.t1 +contig6 AUGUSTUS start_codon 15047 15049 . - 0 Parent=contig6.g8.t1 +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt +# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt +# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg +# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt +# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac +# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc +# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt +# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata +# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg +# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt +# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct +# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag +# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] +# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV +# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV +# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG +# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM +# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT +# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] +# end gene contig6.g8 +### +# +# ----- prediction on sequence number 7 (length = 50017, name = contig7) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 7 on both strands +# start gene contig7.g9 +contig7 AUGUSTUS gene 3332 5045 0.23 - . ID=contig7.g9 +contig7 AUGUSTUS transcript 3332 5045 0.23 - . ID=contig7.g9.t1;Parent=contig7.g9 +contig7 AUGUSTUS CDS 3332 4652 0.41 - 1 ID=contig7.g9.t1.cds;Parent=contig7.g9.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 4711 4935 0.85 - 1 ID=contig7.g9.t1.cds;Parent=contig7.g9.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 4993 5045 0.52 - 0 ID=contig7.g9.t1.cds;Parent=contig7.g9.t1 +contig7 AUGUSTUS start_codon 5043 5045 . - 0 Parent=contig7.g9.t1 +# coding sequence = [atggaactaaaacccgataatgtccccattgcccgaccccgggtgcaactagggttcctcgtatcatttttagtagacg +# cacgtggtggatcaatgcgcggatatcggcacagtggcgtgagaataatcgttcccccaaaggcctgtgctgaacccacaagactaacatgtcgttat +# gttaaaccgcatagggtagtcaaccctcctcctttaatggagggggaagcacttgtgagtcgtatattggaaatgtcacctgttgatggaattttttt +# aagtccgatcactctagaagttcctcatttcggcacccttagagaaaacgagcgcgaaattattatactgcgttccgacgacggagaaagttggcgag +# agcataacctatacgaaagtgagggaaatataaacgatttttataaaggcgaacacgttggcgactttaatcaaatggatgaattacatacagatcgt +# atcgttcgaatagtaacgcaaaacataccgcacttttttgctgttgtttcacgtgttcgtcaagaagtccacgctatcggacctgatggtggcacagt +# tttctctacagcagtaccgcaggttcaagctatatttccacctcatgccttgaccaagaaaattcgagtcggccttcaggcacagccggtggacttgg +# ttggatgttctaagctgcttggccaaggtgttgctgtctcaccaatagtcactgtggaaccacgccgaagaaaatttcataaggcaattacacttagt +# attcctgctccaaaagcttgtaccaaaagtatggttaatgcatgctacggtaatggaaattcgaattcgcctactcttagactactgtgttccattac +# cggtggtcaaacgcgtgcaacttgggaggatgttactggatcaactccgctttcttttgttaaagatagtattacatttacaactacagtttcagccc +# gtttttggctgatggattgtcgcaatgttgtagacgccggacgaatggcaagcgaactttacagtcatttgaccaaagttccttttcttgtaaagttt +# gttgtcttcgctaaacgtctctctaaaatagaagcaaaattttcagtgttttgtatgacagatgataaagaggacaagacgcttgaacaacaggaata +# ctttacagaggttgcaaaaagtagggatattgaagtattgcaggatcaaaatatatacctagaatttgctggtagtatcgtccctgttttaaaaaccg +# gtgagcaacttagtaccaaattccaagcattttgcgaaaatcgtctctcatttattgctcatattaaagatccagaatttccacaaggtcgtatctgt +# tttatgaccaatccaaaggctgggcctgatgaattgccacagaatcctctttgtactttgaatgtgtcagtagatttaaaaactatgacaaagcatct +# ggaaaacataaatgagagtgtgagtttgagtggtaacatgaactataatgatctgctaagttcagaaaaaagaacagaaacagcgccgtctgagaaag +# atataaaaaaattgattttaccggagtttataagaaattcagcgaaatga] +# protein sequence = [MELKPDNVPIARPRVQLGFLVSFLVDARGGSMRGYRHSGVRIIVPPKACAEPTRLTCRYVKPHRVVNPPPLMEGEALV +# SRILEMSPVDGIFLSPITLEVPHFGTLRENEREIIILRSDDGESWREHNLYESEGNINDFYKGEHVGDFNQMDELHTDRIVRIVTQNIPHFFAVVSRV +# RQEVHAIGPDGGTVFSTAVPQVQAIFPPHALTKKIRVGLQAQPVDLVGCSKLLGQGVAVSPIVTVEPRRRKFHKAITLSIPAPKACTKSMVNACYGNG +# NSNSPTLRLLCSITGGQTRATWEDVTGSTPLSFVKDSITFTTTVSARFWLMDCRNVVDAGRMASELYSHLTKVPFLVKFVVFAKRLSKIEAKFSVFCM +# TDDKEDKTLEQQEYFTEVAKSRDIEVLQDQNIYLEFAGSIVPVLKTGEQLSTKFQAFCENRLSFIAHIKDPEFPQGRICFMTNPKAGPDELPQNPLCT +# LNVSVDLKTMTKHLENINESVSLSGNMNYNDLLSSEKRTETAPSEKDIKKLILPEFIRNSAK] +# end gene contig7.g9 +### +# start gene contig7.g10 +contig7 AUGUSTUS gene 38941 46896 0.08 + . 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ID=contig7.g10.t1;Parent=contig7.g10 +contig7 AUGUSTUS start_codon 38941 38943 . + 0 Parent=contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 38941 39182 0.69 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 39248 39354 0.65 + 1 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 39978 40351 0.32 + 2 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 40423 40623 0.3 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 +contig7 AUGUSTUS CDS 44971 46896 0.35 + 0 ID=contig7.g10.t1.cds;Parent=contig7.g10.t1 +# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac +# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat +# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga +# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag +# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata +# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat +# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta +# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct +# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt +# ttgcatttcccctcggtccataaatgtagccggaggcataaattgctgctgttttgacaagaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggg +# gggtggtgcccaaatcatcaacaaatcagtttcaaatacctttaaaaaccgtggaccgcctgccttacgatcattttctttttggcatggtaacgtgt +# cactctataacaataatgaacggtatattgatgggggatcctttggatttgaaaatgtttaattctacgggttggacaatagaagattcaaataacat +# accagataatgaaaaatatggtattctttatccaactattttaagacaaccaaggatttgctcttccgacttgagatcatcggattcaaaaaaaaaga +# gtcaaatcagccgtcaatcgtctgtagacgatttattagcaactgttggtatctcgcaaaatcaaaaaaattttgatcatggaattgttcgagaattt +# ccatttacgtcgagtcttcagcgaatgtccgttattactcgttgtctcagcgaccaagtatttaatgtttactgcaaaggttccccagagatgttaca +# gacactttgcacaccgcaaagcctacccgataactattccgaacagctatcgacatttgctaaaagaggataccgaattattgccattgcattcaaac +# ctcttgtgcaaaaaatgaactattcaaaaatacagcgcctatcccgcgaagaggttgaaagcaacttggaatttcttggttttgtggtactcgaaaat +# cgccttaagccagatactgctaaagtaatcaaagcgttaaactcagcaaagattcgaactattatgattactggcgataatattttaactgctatgag +# tgttgcacgtgattgtggtattgtaagtgcatcacaagctgttataacagtgcatgcagatccgcttggaaatagtggaaatatacaaagcaataata +# cagatagcattgttgataagaaaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaaca +# aagtgcaatagtaaccatattcccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcatt +# agttaacgaatcgagttccagttatgcagaaagtattctgccgacgagcgatagtttggccagtgtaaagaccacagacacatggacccataatgagc +# caacagatgtagatgctgagctaggaataaaccgcactcaggacgaaagctggcgccaacactacatattcgcaatggatggcggaacttggcaaatt +# ataaaagatcactttccagatgaaatggccattcttttaacacggggatcgatttacgcccgaatgtcacccgatcagaaacaggcactagttataga +# acttcaaaatttggactactgtgttgccatgtgcggtgatggtgccaacgattgcggtgcgctaaaggtggctcatgctggtatttcgctaagtgaga +# ccgaagcatccattgcgtcgccctttacttcacgtaatcccacgatttcggctgttttaaaagttattaaggaaggacgtgccgcattagtcacatcc +# tttggaatttttaaatatatggcagcatattcattggttcagtttatatctgttatggttctttattctatcgactcgaatttgacagacaagcagta +# tctttacgtagaccttggacttatatcaatttttgccttcttttttggtaaaactggatcatttgatggaaatttggtcgaacaagtgcctctcagtt +# cattgatatcttctactccattagcatcccttttacttcatctcactgttgtaactggatttcaagtaattggtaaggatattaatagtactagttta +# caaaataaaattcataaacccggttga] +# protein sequence = [MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN +# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ +# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG +# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM +# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ +# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR +# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV +# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY +# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM +# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIGKDINSTSLQNKIHKPG] +# end gene contig7.g10 +### +# +# ----- prediction on sequence number 8 (length = 35012, name = contig8) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 8 on both strands +# start gene contig8.g11 +contig8 AUGUSTUS gene 8930 26669 0.02 + . ID=contig8.g11 +contig8 AUGUSTUS transcript 8930 26669 0.02 + . ID=contig8.g11.t1;Parent=contig8.g11 +contig8 AUGUSTUS start_codon 8930 8932 . + 0 Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 8930 9171 0.51 + 0 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 9237 9343 0.59 + 1 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 9967 10340 0.24 + 2 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 10412 10612 0.22 + 0 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 14960 16832 0.58 + 0 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +contig8 AUGUSTUS CDS 26515 26669 0.46 + 2 ID=contig8.g11.t1.cds;Parent=contig8.g11.t1 +# coding sequence = [atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac +# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat +# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga +# 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accagataatgaaaaatatggtattctttatccaactattttaagacaaccaaggatttgctcttccgacttgagatcatcggattcaaaaaaaaaga +# gtcaaatcagccgtcaatcgtctgtagacgatttattagcaactgttggtatctcgcaaaatcaaaaaaattttgatcatggaattgttcgagaattt +# ccatttacgtcgagtcttcagcgaatgtccgttattactcgttgtctcagcgaccaagtatttaatgtttactgcaaaggttccccagagatgttaca +# gacactttgcacaccgcaaagcctacccgataactattccgaacagctatcgacatttgctaaaagaggataccgaattattgccattgcattcaaac +# ctcttgtgcaaaaaatgaactattcaaaaatacagcgcctatcccgcgaagaggttgaaagcaacttggaatttcttggttttgtggtactcgaaaat +# cgccttaagccagatactgctaaagtaatcaaagcgttaaactcagcaaagattcgaactattatgattactggcgataatattttaactgctatgag +# tgttgcacgtgattgtggtattgtaagtgcatcacaagctgttataacagtgcatgcagatccgcttggaaatagtggaaatatacaaagcaataata +# cagatagcattgttgataagaaaacagccagactctataagctgcagtacacattagatttggggagtaaaatatcttctccatctcttttaacaaca +# aagtgcaatagtaaccatattcccaaggaaaatcgtgaggataaatttagtaccgttggtgatcaaactctgtttcgccttgagtcgacgaattcatt +# 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[MNVSGYRRSHIRTAICWACIILTGGLLRLVLHWWRHLYLYATCSRCPLEEAEQVLVTEDYQGKHKVYHVKQIRVLTAN +# HFEALLKKERPDAELMNVGSDAEHAVQLSVHFTSAQFKRCTMQCDAVLLSGNCILDESMLTGESVPVTKTPLPSKRDMIFDKTEHARHTLFCGTKVIQ +# TRYIGSKKVLAFVINTGNITAKGELIRSILYPPPVDYKFEQDSYKFIQFLAVIACVGFIYTLVTKIMRGTDPVKIAVESLDLITIVVPPALPAAMTVG +# RFYAQKRLKASEIFCISPRSINVAGGINCCCFDKTGTLTEDGLDMWGVVPKSSTNQFQIPLKTVDRLPYDHFLFGMVTCHSITIMNGILMGDPLDLKM +# FNSTGWTIEDSNNIPDNEKYGILYPTILRQPRICSSDLRSSDSKKKSQISRQSSVDDLLATVGISQNQKNFDHGIVREFPFTSSLQRMSVITRCLSDQ +# VFNVYCKGSPEMLQTLCTPQSLPDNYSEQLSTFAKRGYRIIAIAFKPLVQKMNYSKIQRLSREEVESNLEFLGFVVLENRLKPDTAKVIKALNSAKIR +# TIMITGDNILTAMSVARDCGIVSASQAVITVHADPLGNSGNIQSNNTDSIVDKKTARLYKLQYTLDLGSKISSPSLLTTKCNSNHIPKENREDKFSTV +# GDQTLFRLESTNSLVNESSSSYAESILPTSDSLASVKTTDTWTHNEPTDVDAELGINRTQDESWRQHYIFAMDGGTWQIIKDHFPDEMAILLTRGSIY +# ARMSPDQKQALVIELQNLDYCVAMCGDGANDCGALKVAHAGISLSETEASIASPFTSRNPTISAVLKVIKEGRAALVTSFGIFKYMAAYSLVQFISVM +# VLYSIDSNLTDKQYLYVDLGLISIFAFFFGKTGSFDGNLVEQVPLSSLISSTPLASLLLHLTVVTGFQVIDSWAFTEVDDDDMLIVKYADDTAVMVRS +# PSIDIATLGLPEYVTKNGQPKGK] +# end gene contig8.g11 +### +# +# ----- prediction on sequence number 9 (length = 60018, name = contig9) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 9 on both strands +# start gene contig9.g12 +contig9 AUGUSTUS gene 8930 48218 0.01 + . 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[atgaacgtaagcggatatcgtcgttcccatatacgaactgcaatttgctgggcctgtattattttaactggtggcctac +# tacgcctcgtcttacattggtggcgtcatttgtatctatatgccacatgctctcgatgtcccttggaggaggcagaacaagttttggtaaccgaggat +# tatcaaggaaagcacaaggtgtaccacgtaaagcaaattcgagtacttactgcgaaccactttgaggccctattgaaaaaggaacggccggacgcaga +# actcatgaatgtagggagtgatgcagaacacgccgtgcaactatcggttcatttcacctcagcgcaattcaaaaggtgtactatgcagtgcgatgcag +# tattactatcaggaaattgcattttagatgagtctatgcttaccggcgaaagtgtgccagtcacgaaaactcctttaccatcaaagcgtgacatgata +# tttgataaaaccgaacatgccaggcatacacttttttgtgggacaaaggtcattcagactcgctatattggatcaaaaaaagtattggcgttcgtaat +# aaacactggaaacataacagctaagggagaactaatacgatctattctttatcccccacctgttgactacaaatttgagcaagattcctataaattta +# ttcagttcctggcagtaattgcttgtgtcggatttatttatacgcttgtaacaaaaataatgcgtggcacggatcccgtaaaaatagcagtagaatct +# ctggaccttattactatcgtagtcccaccagcactgccagctgcaatgaccgtcggtcgtttctatgcacaaaagcggttaaaggctagtgaaatatt +# ttgcatttcccctcggtccataaatgtagccggaggcataaattgctgctgttttgacaagaccggtactctgacagaagatggacttgatatgtggg 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ID=contig10.g13 +contig10 AUGUSTUS transcript 850 15075 0.07 + . ID=contig10.g13.t1;Parent=contig10.g13 +contig10 AUGUSTUS start_codon 850 852 . + 0 Parent=contig10.g13.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 850 1074 0.57 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 1132 1326 0.85 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 14537 14774 0.61 + 0 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 +contig10 AUGUSTUS CDS 14882 15075 0.44 + 2 ID=contig10.g13.t1.cds;Parent=contig10.g13.t1 +# coding sequence = [atggaagaagcaaggtataatcttgccactcacgttatgtcaaatggagtagaactaattattgcctgtgaaagggaaa +# aacctatggaaaagatcgtggcaactacccaaaaacttacaaatgttattagtcgactgataatacaacaattcgacaagccctcgactctggctcca +# agtacattaaaaaatcagatgattttaacattgccttcaattaaacaggaaaccattttacttcctcataattcttttattacaaacatttttctaac +# cacgtgcacctatatcacaacatatgtggaaaatggaagctcgaatgtagtaaaagaaaaaatggttatatcaaacaccattacgcaagatcgaaagt +# atttgcatgcaagtaatcctatgataatagacatcactttttcaaggccaatagaacctcagaaatactcgaagccttactgcgcaacgcatgtcacc +# acatatgtaaacacaaaggagaatccggcggactgcgccactcgagtgaagaccaccgcattaaccaaccactcaggaagtgtgctcatggtcaacaa +# tcgaagcacaaaactggtacgcgttgtagcttacgccttacgcatcatccaaaagaccaaggacattaaatctctaacgctgacaaatgccatacatt +# tggaaatggccaccgatcttagcatagacacattcctggcatgtcttcggcgtttcatgtcccttcgaggaaagtgctcacagatcttcagcgacaat +# ggaacgaatttagttgatcccaaacacgctttagatgagatgcaccgcaggagcacaaagcaatgtaacacaatcgttggccaatga] +# protein sequence = [MEEARYNLATHVMSNGVELIIACEREKPMEKIVATTQKLTNVISRLIIQQFDKPSTLAPSTLKNQMILTLPSIKQETI +# LLPHNSFITNIFLTTCTYITTYVENGSSNVVKEKMVISNTITQDRKYLHASNPMIIDITFSRPIEPQKYSKPYCATHVTTYVNTKENPADCATRVKTT +# ALTNHSGSVLMVNNRSTKLVRVVAYALRIIQKTKDIKSLTLTNAIHLEMATDLSIDTFLACLRRFMSLRGKCSQIFSDNGTNLVDPKHALDEMHRRST +# KQCNTIVGQ] +# end gene contig10.g13 +### +# start gene contig10.g14 +contig10 AUGUSTUS gene 21687 22382 0.44 - . ID=contig10.g14 +contig10 AUGUSTUS transcript 21687 22382 0.44 - . ID=contig10.g14.t1;Parent=contig10.g14 +contig10 AUGUSTUS CDS 21687 22382 0.44 - 0 ID=contig10.g14.t1.cds;Parent=contig10.g14.t1 +contig10 AUGUSTUS start_codon 22380 22382 . - 0 Parent=contig10.g14.t1 +# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag +# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa +# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag +# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact +# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat +# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa +# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc +# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] +# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH +# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM +# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] +# end gene contig10.g14 +### +# +# ----- prediction on sequence number 11 (length = 35013, name = contig11) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 11 on both strands +# start gene contig11.g15 +contig11 AUGUSTUS gene 682 1377 0.49 - . ID=contig11.g15 +contig11 AUGUSTUS transcript 682 1377 0.49 - . ID=contig11.g15.t1;Parent=contig11.g15 +contig11 AUGUSTUS CDS 682 1377 0.49 - 0 ID=contig11.g15.t1.cds;Parent=contig11.g15.t1 +contig11 AUGUSTUS start_codon 1375 1377 . - 0 Parent=contig11.g15.t1 +# coding sequence = [atggtggtgatgacgttcggagcggcttgttcgccgtgctcagtgaagaccataaatccttcaagatacgtccaagcag +# aacattgcgcggtgcaggccatcagtgcgtatcactggcacccagcgacggatgactttaaattcagcgtaaaataccaccaagaccaccaagagcaa +# attcttaagtctagctatgacgacattcgacccgataggattcttgagcttcttcatggtaaccgccaaattgctgatgaacgaggtttggaggagag +# gagtttaatgagacgagccgctgataagttagccaaagcgtttgagaactggaggcttgaaatgaattacgtgagcgatttccgctgtccactctact +# tctttggcacgggatgcgtacgtgaactgcagctacatttgtttgtggactccagccgatcggcgttcgcagcagttgcattttgtagggcgacttat +# gacgacaatgatgtgccgtcttacttcatgtgttccaagacgaaatgcttcccgatgaactatcccacgcctggagctccaagcagccgtattaggaa +# ccaggcagacggtcaggttcatacgatcctaatcctcaggtttatacgacggtgtcgtggattaaaggacgagtgtgaggtcgaggtcttacagcttc +# tgagtgcttggaggcagaacggaaactga] +# protein sequence = [MVVMTFGAACSPCSVKTINPSRYVQAEHCAVQAISAYHWHPATDDFKFSVKYHQDHQEQILKSSYDDIRPDRILELLH +# GNRQIADERGLEERSLMRRAADKLAKAFENWRLEMNYVSDFRCPLYFFGTGCVRELQLHLFVDSSRSAFAAVAFCRATYDDNDVPSYFMCSKTKCFPM +# NYPTPGAPSSRIRNQADGQVHTILILRFIRRCRGLKDECEVEVLQLLSAWRQNGN] +# end gene contig11.g15 +### +# +# ----- prediction on sequence number 12 (length = 56019, name = contig12) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 12 on both strands +# start gene contig12.g16 +contig12 AUGUSTUS gene 11355 43960 0.01 - . 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tctgtttgtactactggccgcccttcaaatattcggtgccatatgtatttcatcgtctcgtcaaaataatatagtagatgtcgactggcttcaatggg +# gatatcagttctctctacgtcttatagagatagcgataattactttaatatcgtgggtaactgggcttaaaaccagtgccgggcatgatacattaaat +# gctgtaaatgtggatgttcgaatggttggttccggagtgggacctatgggtgcgtatagcccggaaaatggcggctcaactaacaatgccatcagaga +# aaaaaatgttggaaacggcaccggcactcacaactcaaatatgacaaatttttttctgccgtgcacgtcaagctctagtcaggagcaatttgaaggcg +# actatccagctatttgcaatgctaataccaatcttcatacatacacaatgcgcacaggtaaactaatatatgacgacagctatgccctgaattctata +# gggcccacacccactggatcttcaaacagtcgcccctgcgaatatcaactgcaggagcctatgtatcagaggccttatgatacgggttcaattggaag +# tgctgtaaatagtcagaacgggacagattatggaaataaagctactcagaactacaagcaacaacatcaaatgcactttcacgagcagcccacgtata +# tgagtacagactacatgacggatgctgcatcagaccattacgaaaatccgaattttaatttgcgaaccgctaacagtacaaaagctgaacaaatgcaa +# aaagaaatgtatgataataatggagttggttctaccttaggatccggatctacacagcaccaagtggtacttttgaaaaatgacaattgctattctga +# accacatgagcaggaaaacaagaggtatgaatttaacatctttgagcgtcctgtgtttaaagacaaatcaggtcacaacatacagtccaacagtgact +# gctttgaagaccgtcaaaagataacgaatggtcgagtatgtgaaaggaaatttgctggtaatgggacgctggaacgtaatttttacgaaaacaagcat +# cccgagcgccgcagttctaactccaaaaattcctgctcctcatcaaatggaggagggcgatatgcaagctatagttcgtatgagcgcggatttttcaa +# cggcgtttgtaagagtggaactttaggcagtattgctggtggtggaataacattgagcggagctgttccaggtcgtagtctagaagtaccaagtcctc +# ctactggatctcaacgaataatagccaatggagcacagacgttagggatatcagatagagacagagcccaatattatcagagagtaagtggacgtact +# tccaatttaagatcattgcaggatggtactggaactgacagttttacaagtgtacccgtaaggcagcatcaactaaaaccgttatcgtatgagcataa +# ttcggaagatgaagaagaagaggaggaagacgatataatatcaggaagcaatgtagagtgtaccaacttgataaacaacgataatggttctgtcattg +# ccgatgacagcgctccatcttctatttccattattggcaaaacgtcattatataccagcacagcagcaactaaaaatttgtcgaatgacccgctttta +# catgcaaatgtaaacgcacaactgaatattcaaaatactggaaagcttcgttctgagttgtgcactgcctcatcagcttcggttgcttctgcatcttc +# 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LTHLFAQSYFVCIHLILILTCIMRIFFLCFDAYNVHGSFNIFSSELLLNLPSTFLTVAFSVLMLFLFLKSLNHKNNRYSALIRPLTVIVGCGVHVVLC +# ITLHYVESYTLKNHHLYFQQQQQQQYFRRQHLHNQQGQLIATITPSAILPPPPRVLTLICQIIYIFICLSLGLLYLYLYRILKRILRSKSQNYIHGYQ +# NLSYAIHITIATALLFVLLAALQIFGAICISSSRQNNIVDVDWLQWGYQFSLRLIEIAIITLISWVTGLKTSAGHDTLNAVNVDVRMVGSGVGPMGAY +# SPENGGSTNNAIREKNVGNGTGTHNSNMTNFFLPCTSSSSQEQFEGDYPAICNANTNLHTYTMRTGKLIYDDSYALNSIGPTPTGSSNSRPCEYQLQE +# PMYQRPYDTGSIGSAVNSQNGTDYGNKATQNYKQQHQMHFHEQPTYMSTDYMTDAASDHYENPNFNLRTANSTKAEQMQKEMYDNNGVGSTLGSGSTQ +# HQVVLLKNDNCYSEPHEQENKRYEFNIFERPVFKDKSGHNIQSNSDCFEDRQKITNGRVCERKFAGNGTLERNFYENKHPERRSSNSKNSCSSSNGGG +# RYASYSSYERGFFNGVCKSGTLGSIAGGGITLSGAVPGRSLEVPSPPTGSQRIIANGAQTLGISDRDRAQYYQRVSGRTSNLRSLQDGTGTDSFTSVP +# VRQHQLKPLSYEHNSEDEEEEEEDDIISGSNVECTNLINNDNGSVIADDSAPSSISIIGKTSLYTSTAATKNLSNDPLLHANVNAQLNIQNTGKLRSE +# LCTASSASVASASSNSCTTSSASDSMLVADQGFLRFRSIEDQNSAQNGNNLDGERAAISSLRLKSCSATNRRMSIAQELLDDVNDDPDLLKRVITGDE +# 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ID=contig12.g17 +contig12 AUGUSTUS transcript 51846 54525 0.42 + . 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ID=contig13.g18 +contig13 AUGUSTUS transcript 5833 21375 0.37 + . ID=contig13.g18.t1;Parent=contig13.g18 +contig13 AUGUSTUS start_codon 5833 5835 . + 0 Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 5833 5864 0.99 + 0 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 5926 6048 0.94 + 1 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 8287 8491 0.58 + 1 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 8553 8681 0.61 + 0 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 11775 11852 0.66 + 0 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 11914 12134 0.55 + 0 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +contig13 AUGUSTUS CDS 21090 21375 0.7 + 1 ID=contig13.g18.t1.cds;Parent=contig13.g18.t1 +# coding sequence = [atggatccgttcgatgtttcagataggaacagctggtactttggtcccatgtcccgacaagaagccactgaagtattaa +# tgaatgagcgtgaacgaggggtatttttggttcgcgacagtaactcaatagcaggggattacgtcctttgcgtaagagaagatacaaaagttagcaac +# tacatcattaacaaagttcaacaacaggatcacttcgtttaccgcataggggatcaatcttttgataatctaccgaaactattaacattttacacact +# tcattacttggatacaacccctctaagaagacctgctctcaaaaaagaggaaaaagttataggaaagttcgattttcatggcagcgaccaagatgatc +# tgccgtttcaaagaggtgaaattcttactgtaattcgaaaagacgaagatcaatggtggactgcccgaaattcgtctgggaaaattgggcaaataccg +# gttccttatatatgtcggcatgatgatgatgaagatccccttaaaaatgttgacttaaattttcgtggaagcacactaaagaggacggatttaaaccg +# aaaactgcctgcatacgcccgcgtaaaacagtcaagagttccaaacgcctatgataagactgcattgaaattggaaattggtgatataattaaagtca +# ctaaaacaaatattaatggacaatgggagggggaattaaatggaagaaatggtcacttcccattcacgcacgttgaatttgtcgatgattgtgattta +# ggcaataactccacagaaatacgaagtgactcgggaagaaatgtgccaattcggcgtcacttctcggagtcacttcggcgaaacttccaaaatcattt +# cggcgatatcgcattcggatcgcagaaacgactaccgtcgggaaaaaaatttgcctcttcggcggcccttgtcgaagtcacgaagacacttccaggag +# ttacttttgcgacacttcttgaagtgacttcggtgacacttccaggagacttttctttccgacgggagtcacttccgaatgcgatatctcgtacgaca +# gttttcaccttttag] +# protein sequence = [MDPFDVSDRNSWYFGPMSRQEATEVLMNERERGVFLVRDSNSIAGDYVLCVREDTKVSNYIINKVQQQDHFVYRIGDQ +# SFDNLPKLLTFYTLHYLDTTPLRRPALKKEEKVIGKFDFHGSDQDDLPFQRGEILTVIRKDEDQWWTARNSSGKIGQIPVPYICRHDDDEDPLKNVDL +# NFRGSTLKRTDLNRKLPAYARVKQSRVPNAYDKTALKLEIGDIIKVTKTNINGQWEGELNGRNGHFPFTHVEFVDDCDLGNNSTEIRSDSGRNVPIRR +# HFSESLRRNFQNHFGDIAFGSQKRLPSGKKFASSAALVEVTKTLPGVTFATLLEVTSVTLPGDFSFRRESLPNAISRTTVFTF] +# end gene contig13.g18 +### +# +# ----- prediction on sequence number 14 (length = 45010, name = contig14) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 14 on both strands +# start gene contig14.g19 +contig14 AUGUSTUS gene 27307 36522 0.16 + . 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ID=contig14.g20 +contig14 AUGUSTUS transcript 36874 37842 0.96 + . 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ID=contig15.g21 +contig15 AUGUSTUS transcript 2942 6515 0.26 + . ID=contig15.g21.t1;Parent=contig15.g21 +contig15 AUGUSTUS start_codon 2942 2944 . + 0 Parent=contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 2942 2977 0.74 + 0 ID=contig15.g21.t1.cds;Parent=contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 3367 3482 0.76 + 0 ID=contig15.g21.t1.cds;Parent=contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 4221 4570 0.84 + 1 ID=contig15.g21.t1.cds;Parent=contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 5195 5408 0.57 + 2 ID=contig15.g21.t1.cds;Parent=contig15.g21.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 5651 6515 0.88 + 1 ID=contig15.g21.t1.cds;Parent=contig15.g21.t1 +# coding sequence = [atgaaagtaaagaacgcgttgcatcatattttcattctgtacgatacaccgacatcaacttcaagcagtcgggattttt +# tgggtttccatgtgcctcccagtttggatacggtcttattgctggacttgactctgttggaggaaatggaatggcgcgaccgattggccgatttggaa +# aagaaaattagggacctgatagattatcacgacggagctctcgacgcgttggatggaaagatcgtcaaaccggatccattgccaaaaggtgcctcagc +# agcagatgaaaagcagcacaaggagaagagcgacttttttcgtaaggccaacagctatgcaaaatccatgattaccactgcggtcacggactcggtgt +# accagaagatcatggacaaggagacagcacacgatacgtgggaagccctgaaaaatcagtttgaagcaacagcgaaagaccaggtattcaggatatgc +# aacgagtttttcgctttctcttggaatccagttttggctgcccaagacaataatccaaatagtcgttttgagtcgttagcaaccgagtgcaccctcaa +# aataaacgacaatattgtcctcgttggagccagagacgttggaggaacactctacagagcagcgatcgagcccatactttcagaacgaaacgtcgatg +# tcaacgtcgcaacttcaggaacttcaattctccaactctatcacgagaggtttcgatatgggtacatcgtcaagcagaaatcagaggtcaaggacgtg +# ctgcgacacatggtttttcacgccaagcaacaagggcacacaattcgagaactcctgagcgacaatggaggagaattcgactgtgcagaagtgagaga +# aactcttcaggaagctggtataacttttcgactcaccgctccgtatactccagaacaaaatagtggtgtcgagagagagaatcgaacgatagtcaaaa +# tggcgagaactttcaagtattctaatccagaaataaaatttccagaagcaatttgggccgagttggtcagcacagcagtctacgttctcaataggacg +# ggcaaatcttcgttgaagggtctgagcccttaccaactttggctgggcaagaaaccaagaatcaaacatcttcgaatcgtaggatcgacgtgctacgt +# acacattccatgccaaaaaaaggagaatatggacgaaaaagctgaaaaagggtacctggtgggttacgagggcgatgagagatatcgtatttacttac +# cagagaagcacaaagtagtcgtgtcgagggacgtaaaatttcaagagaaattcagcaattgtgaaccaggcgtcaacctaccattccaagattttgga +# tccaaggacgtcgtagaagacaaggaagaagaagacgtgagcttgcaccagagcaaggacgaggataaggaagaagaagacgcggatttgcacaagag +# cgaggacgaagacacacttcatgagcaagacttgaaagaagacacaaccgaaacaggaagcgaagacaattacgaaaccggagtagaaacaagctttg +# acgaagaaaacaacaagagaaaaccgcaataa] +# protein sequence = [MKVKNALHHIFILYDTPTSTSSSRDFLGFHVPPSLDTVLLLDLTLLEEMEWRDRLADLEKKIRDLIDYHDGALDALDG +# KIVKPDPLPKGASAADEKQHKEKSDFFRKANSYAKSMITTAVTDSVYQKIMDKETAHDTWEALKNQFEATAKDQVFRICNEFFAFSWNPVLAAQDNNP +# NSRFESLATECTLKINDNIVLVGARDVGGTLYRAAIEPILSERNVDVNVATSGTSILQLYHERFRYGYIVKQKSEVKDVLRHMVFHAKQQGHTIRELL +# SDNGGEFDCAEVRETLQEAGITFRLTAPYTPEQNSGVERENRTIVKMARTFKYSNPEIKFPEAIWAELVSTAVYVLNRTGKSSLKGLSPYQLWLGKKP +# RIKHLRIVGSTCYVHIPCQKKENMDEKAEKGYLVGYEGDERYRIYLPEKHKVVVSRDVKFQEKFSNCEPGVNLPFQDFGSKDVVEDKEEEDVSLHQSK +# DEDKEEEDADLHKSEDEDTLHEQDLKEDTTETGSEDNYETGVETSFDEENNKRKPQ] +# end gene contig15.g21 +### +# start gene contig15.g22 +contig15 AUGUSTUS gene 6867 7835 0.91 + . ID=contig15.g22 +contig15 AUGUSTUS transcript 6867 7835 0.91 + . 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ID=contig15.g23 +contig15 AUGUSTUS transcript 18680 42088 0.05 + . ID=contig15.g23.t1;Parent=contig15.g23 +contig15 AUGUSTUS start_codon 18680 18682 . + 0 Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 18680 18703 0.86 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 20847 21365 0.44 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 22142 22216 0.74 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 25912 25977 1 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 26035 26127 0.97 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 28671 28925 0.78 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 29386 29481 0.68 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 31952 32036 0.94 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 36538 36768 0.63 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 37576 38003 0.64 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 38052 38166 0.94 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 41530 41966 0.76 + 2 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +contig15 AUGUSTUS CDS 42029 42088 0.72 + 0 ID=contig15.g23.t1.cds;Parent=contig15.g23.t1 +# coding sequence = [atggatcccgcttcaaatattgtggaaaatgtagttgaaccaaaaaatgacagtgctggtgtaattcaaatggctcctg +# aaaatattgaccactctatcgaaaatcagagcactacatcaacagatgataaagacgatgccgatttaataattgatgatagcgaatctgatgaatat +# agttcagatagcaaaaaaactgcagatgtagcagaaactgaggatttaattaaggttacagaaactgctaagacctcattgttatcagatgcggatgg +# cacagttgaaataaatgaaaacacagaaatgaaatctgaggaccccatcatagaagccttatctattaaatcagaccaggaaacttcggtttcagcca +# atacaaaagtcgataaaagctccaccgtttcggaggagaatccaaaggtggatgtaatagatgcgaataccataagtgtaatcttacccaatgcttca +# aaagcaaatgttccacaagatacatcaacaattataattgaagacgacgaagttaaaagaactgaagaagtggaagccgatgaacctaaaacatgtga +# actggctgccgaaaactctaaaaatgaagttgcgtcctctattgaaaacgttaatgaatttaaagaagttggtaaaaatgctgttgaagacaaagact +# taaatgtatttaatgagacacagcaaggcaaggaggcggaacaagtcactaaccaatctgaccttttaaatgacgacactacagaaagggatctaaga +# ttgtctagtcaggctgacttcaataaccaaattctggacattatatcggacattgatataaatataaaggcccaggaaaaaataactcaacttaaaga +# gcaagaactgaagcttatacagaaacagaacgaattggcaaatcaaatacatcagcaacaaatcttagctcagcagctgaatgccaaaaatacaaata +# aacaaagtcaatgccaacaacaaaatgcgcgtgatgtactaacactacatcaaaataatttcgtcgttaaatgccgccagtacacacgggtactgaat +# gctctcgaagacaaggcaagtcagcaagaggggtcaaacaatacgaagcttacggtgcctataggtaaagaatccacaaatatatcaaagaacattga +# tttgcgcaaaatatttactcctgcgaccgatgctactgaaatattgcctaaaaataggaatgagagctccagtgacgttgtagatccatataaagaga +# attccgaaacgaattccacattggaacttagaaagttggaaaaaatgccgctaaagcttataatgaacccaaacggaagagtccgtgattataattcg +# ctcaaagatttaattaacgttgaaactggcctgttatcgcctgacaattgcgctgaactaataactgcacttcaacttcatcaaggacgaggtgccga +# actgtttgcaaaacgccgcagaaaggctgataattggatagtcgatgaaaccaatttagagactcaaaatcctccgtctggtattccagattaccagc +# agtatcaacaaaaaccggctacatcaccaaacattttgccagcatattctgatgcaggaaaacatcgcgttcagttgaatattcatcaaaatcagtta +# attgaaaaatattcaaagccaggattgcaggtggttcagtctccttgggatgcagctttacaaactggttcggccagtacggcgtttttggaagataa +# ggatagcaaaagtcaatgtctttcccctgctgccgtatcaccaacaccgtacttccaaagtggtaggagggatataacggatactgtggaacctacgc +# actatagtcctctgaaagattataaaaatgccaatgcttctacaccgcaatcaatcaatgtaccctcgaatccccaaagggatcttgcatatacacca +# gccgttgctcagggctggggaggtcgcaatgtgaaactacctaaaggcttatacgtaccgaaagagatatctctttctagctatgcagcacctccaca +# gcagtacgccggtcacgatgcacattttgagtcgccgaacaatggctctgcttcgcgccctttatcaaggaccaacttttctacataccaaagttctg +# ttggaaataatggaactggccagttcccaatatcaaaggcgttctcacccgaattaggcactgtaccgccaaggcagcagctgtacgcgccgtctagc +# tatcaaagaatacccgcatttgaaaacgtcgcgcctcaggttaactttaaccctgcgcctttgacctttgataaaatggcaagatacgaacaacccaa +# cagaaataattcgactagtgcaagctcacagtatcttaatgtgaaacaaaattcgcgagtgcgtaatgtttcgccaacaccatttggaattatgtgga +# ccattgcctggcaggccaacttctccactatcgaacaaagttccaatctttaa] +# protein sequence = [MDPASNIVENVVEPKNDSAGVIQMAPENIDHSIENQSTTSTDDKDDADLIIDDSESDEYSSDSKKTADVAETEDLIKV +# TETAKTSLLSDADGTVEINENTEMKSEDPIIEALSIKSDQETSVSANTKVDKSSTVSEENPKVDVIDANTISVILPNASKANVPQDTSTIIIEDDEVK +# RTEEVEADEPKTCELAAENSKNEVASSIENVNEFKEVGKNAVEDKDLNVFNETQQGKEAEQVTNQSDLLNDDTTERDLRLSSQADFNNQILDIISDID +# INIKAQEKITQLKEQELKLIQKQNELANQIHQQQILAQQLNAKNTNKQSQCQQQNARDVLTLHQNNFVVKCRQYTRVLNALEDKASQQEGSNNTKLTV +# PIGKESTNISKNIDLRKIFTPATDATEILPKNRNESSSDVVDPYKENSETNSTLELRKLEKMPLKLIMNPNGRVRDYNSLKDLINVETGLLSPDNCAE +# LITALQLHQGRGAELFAKRRRKADNWIVDETNLETQNPPSGIPDYQQYQQKPATSPNILPAYSDAGKHRVQLNIHQNQLIEKYSKPGLQVVQSPWDAA +# LQTGSASTAFLEDKDSKSQCLSPAAVSPTPYFQSGRRDITDTVEPTHYSPLKDYKNANASTPQSINVPSNPQRDLAYTPAVAQGWGGRNVKLPKGLYV +# PKEISLSSYAAPPQQYAGHDAHFESPNNGSASRPLSRTNFSTYQSSVGNNGTGQFPISKAFSPELGTVPPRQQLYAPSSYQRIPAFENVAPQVNFNPA +# PLTFDKMARYEQPNRNNSTSASSQYLNVKQNSRVRNVSPTPFGIMWTIAWQANFSTIEQSSNL] +# end gene contig15.g23 +### +# start gene contig15.g24 +contig15 AUGUSTUS gene 44931 45338 0.66 - . ID=contig15.g24 +contig15 AUGUSTUS transcript 44931 45338 0.66 - . ID=contig15.g24.t1;Parent=contig15.g24 +contig15 AUGUSTUS CDS 44931 45338 0.66 - 0 ID=contig15.g24.t1.cds;Parent=contig15.g24.t1 +contig15 AUGUSTUS start_codon 45336 45338 . - 0 Parent=contig15.g24.t1 +# coding sequence = [atgagcatagctaaagagctgttggatgacgtcaacgacgacccagatttactcaaaagggtcataactggtgacgact +# catgggtatatggttatgatatcgaaaccaaagcccaatcgtcacaatggaagagcccaggtgagccaagaccgaaaaaagcaccccaagttcgatca +# aatgtcaaagttttgatcactgtattcttcgattaccatggcgtggtgcatctggagttcttaccatatggtcgtacggttaataaacagtattatct +# ggaagttatgcgccgtttgcaagaagcaatacgaaagaaacgtccagaattgtggaaaaacaattcatggcttttagatcacgataatgcccctgatc +# actcatctttgcttatgagcgattttttggcctaa] +# protein sequence = [MSIAKELLDDVNDDPDLLKRVITGDDSWVYGYDIETKAQSSQWKSPGEPRPKKAPQVRSNVKVLITVFFDYHGVVHLE +# FLPYGRTVNKQYYLEVMRRLQEAIRKKRPELWKNNSWLLDHDNAPDHSSLLMSDFLA] +# end gene contig15.g24 +### +# +# ----- prediction on sequence number 16 (length = 45017, name = contig16) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 16 on both strands +# start gene contig16.g25 +contig16 AUGUSTUS gene 23971 43623 0.15 + . ID=contig16.g25 +contig16 AUGUSTUS transcript 23971 43623 0.15 + . ID=contig16.g25.t1;Parent=contig16.g25 +contig16 AUGUSTUS start_codon 23971 23973 . + 0 Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 23971 24235 0.79 + 0 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 24335 25126 0.53 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 26889 27049 0.75 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 27109 27253 0.91 + 0 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 30805 30886 0.81 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 38071 38214 0.61 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 42456 42590 0.98 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 43033 43110 1 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 43167 43354 1 + 1 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +contig16 AUGUSTUS CDS 43421 43623 0.94 + 2 ID=contig16.g25.t1.cds;Parent=contig16.g25.t1 +# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag +# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt +# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg +# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc +# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat +# ggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaaaaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggc +# aagaaagaaaagtgtacaaggttctgactcaaatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatc +# caccagcactcaatgatggattgaataaggctgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctata +# tatctgcaaaacgctcacttagaatggataagatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaaga +# agagcatactcctcatgaaatcaataggggaaacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaa +# aagctataaggacttctagcgggttgctttcttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaat +# cttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaatcaaaatcactatctaatgttggacaatttgtaagtaaaaaaatttggggaagtcgtttcaaaagcca +# aagtaaacgcaatttttcgaaaggactaaaggatttgccttctgtaaaatggcatccttcggacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggt +# ttcaaattgttgatactttattgataaggctgtcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattgga +# aatattgatgcggatatccgaaccggggacctctcgcatcagaggcagatgccataccagttgagctatcgcgtcatgttacgcgcggtcgtgattgt +# agacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgtcaccc +# ttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttgatgtt +# atctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaattagacga +# tccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgcctggatcatattaatcatttaaatggaaatcaagaaaaaa +# agaatgttctaaaaaaatcttctaaaagtagtttaattaatacaaagagatgtcaagaagaaaactttgaaattttcaccgctagtctgaaaatacct +# gtgccggaaaaagcgcacatacatagtaaagagtctatagaatgtagagatgataaaacggcacgccgaagaatttgtcagcctcgaataccaacaga +# cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca +# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] +# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS +# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS +# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK +# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ +# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY +# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM +# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK +# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] +# end gene contig16.g25 +### +# +# ----- prediction on sequence number 17 (length = 40013, name = contig17) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 17 on both strands +# start gene contig17.g26 +contig17 AUGUSTUS gene 3963 23615 0.14 + . ID=contig17.g26 +contig17 AUGUSTUS transcript 3963 23615 0.14 + . ID=contig17.g26.t1;Parent=contig17.g26 +contig17 AUGUSTUS start_codon 3963 3965 . + 0 Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 3963 4227 0.84 + 0 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 4327 5118 0.47 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 6881 7041 0.78 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 7101 7245 0.95 + 0 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 10797 10878 0.81 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 18063 18206 0.61 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 22448 22582 1 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 23025 23102 1 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 23159 23346 0.98 + 1 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +contig17 AUGUSTUS CDS 23413 23615 0.74 + 2 ID=contig17.g26.t1.cds;Parent=contig17.g26.t1 +# coding sequence = [atgtcctcggacatgactcttcaaaaagagctcatttgccgtctgaaacttctgtctagttgcattaattttgcacaag +# tgggaattaagttggaaattagcgatttatccgagactatacttgaggacaaagttctattgaaaaaaatctacagcgccctcaagaaacaacaactt +# catcggaccctacattccaaagaaccgaataaaaaaagtgttaacaggtcttcttcattgtctagcctaaaaattggtgaacatgaaaatctcaactg +# tgttataaaaagcatcgagtttccaaacaagtgtcttttgagcgatcaaaaaattgaaagaagcgtgaaaacttgtggaactcaaactagttttattc +# aacttagcgaactaaaaagtttggcggaacagtataagtgtatggttcaaaactgcgataataatttacaagtattccaagaatttgataaacaggat +# ggtttaacttcttcacgctcgacctgtagaaaaagttcgatagacgaagacatttctcagtcagtaagcgatacgattaagcgttatctaaaaatggc +# aagaaagaaaagtgtacaaggttctgactcaaatcgatttaagtcagttaactatgatcaaaatctcaaaaatattaaagcaaagggcgaaattaatc +# caccagcactcaatgatggattgaataaggctgtacaaactttagatgcttggccagttattgcattggattttattaagggaaacgaaagttctata +# tatctgcaaaacgctcacttagaatggataagatctgaagatgaacgagaacagaaacaattagaatggaacaaaaaacaaaaacaaattgataaaga +# agagcatactcctcatgaaatcaataggggaaacgcctcacattattcaacctgcacatctgctcccacatcgccaaccagccattccaagttggaaa +# aagctataaggacttctagcgggttgctttcttcaagttctcagtttatttcgagcattttgcacgggcatagcagtgcaggaagtcagtactcgaat +# cttgggaatgactcagtaaatatgcaaaaatcaaaatcactatctaatgttggacaatttgtaagtaaaaaaatttggggaagtcgtttcaaaagcca +# aagtaaacgcaatttttcgaaaggactaaaggatttgccttctgtaaaatggcatccttcggacaattgtatatggatttccgaagatggcgaaaggt +# ttcaaattgttgatactttattgataaggctgtcgaaaagagaaacagatttagttaaagattttgcattagaaaaaattgaggaactaaatattgga +# aatattgatgcggatatccgaaccggggacctctcgcatcagaggcagatgccataccagttgagctatcgcgtcatgttacgcgcggtcgtgattgt +# agacatgaaaatcatagaggtggattgcctggtggataccggagctgctgtctccatattgagcaacagggtctttgatcaaattccgaacgtcaccc +# ttgagggatgttcgtcaaagctgcgcagattggtaaaaaggaccatgatcaatcactatgaagaaatttttaagatatcagcagaattgcttgatgtt +# atctatacccgagtgatggaagcttgccccgaacagttatacgagttgatatcaatgaaattaaatggatacgaatggaacctaaatcaattagacga +# tccgcagccaagcagtttaggagatgtcatgtttgagcctgcagttcaagaaaaacgcctggatcatattaatcatttaaatggaaatcaagaaaaaa +# agaatgttctaaaaaaatcttctaaaagtagtttaattaatacaaagagatgtcaagaagaaaactttgaaattttcaccgctagtctgaaaatacct +# gtgccggaaaaagcgcacatacatagtaaagagtctatagaatgtagagatgataaaacggcacgccgaagaatttgtcagcctcgaataccaacaga +# cattactacaatgagttcagatgtcgtcgaactggaaaaaaaaacgaaagcagctacatcagatgatatctatcaatcagaattgcgggaaaaggcca +# tttataagcagcagcacttaaaatctagcacaaggccagtaaatcaagggctctaa] +# protein sequence = [MSSDMTLQKELICRLKLLSSCINFAQVGIKLEISDLSETILEDKVLLKKIYSALKKQQLHRTLHSKEPNKKSVNRSSS +# LSSLKIGEHENLNCVIKSIEFPNKCLLSDQKIERSVKTCGTQTSFIQLSELKSLAEQYKCMVQNCDNNLQVFQEFDKQDGLTSSRSTCRKSSIDEDIS +# QSVSDTIKRYLKMARKKSVQGSDSNRFKSVNYDQNLKNIKAKGEINPPALNDGLNKAVQTLDAWPVIALDFIKGNESSIYLQNAHLEWIRSEDEREQK +# QLEWNKKQKQIDKEEHTPHEINRGNASHYSTCTSAPTSPTSHSKLEKAIRTSSGLLSSSSQFISSILHGHSSAGSQYSNLGNDSVNMQKSKSLSNVGQ +# FVSKKIWGSRFKSQSKRNFSKGLKDLPSVKWHPSDNCIWISEDGERFQIVDTLLIRLSKRETDLVKDFALEKIEELNIGNIDADIRTGDLSHQRQMPY +# QLSYRVMLRAVVIVDMKIIEVDCLVDTGAAVSILSNRVFDQIPNVTLEGCSSKLRRLVKRTMINHYEEIFKISAELLDVIYTRVMEACPEQLYELISM +# KLNGYEWNLNQLDDPQPSSLGDVMFEPAVQEKRLDHINHLNGNQEKKNVLKKSSKSSLINTKRCQEENFEIFTASLKIPVPEKAHIHSKESIECRDDK +# TARRRICQPRIPTDITTMSSDVVELEKKTKAATSDDIYQSELREKAIYKQQHLKSSTRPVNQGL] +# end gene contig17.g26 +### +# +# ----- prediction on sequence number 18 (length = 40012, name = contig18) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 18 on both strands +# (none) +# +# ----- prediction on sequence number 19 (length = 45013, name = contig19) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 19 on both strands +# start gene contig19.g27 +contig19 AUGUSTUS gene 29061 34294 0.14 + . ID=contig19.g27 +contig19 AUGUSTUS transcript 29061 34294 0.14 + . ID=contig19.g27.t1;Parent=contig19.g27 +contig19 AUGUSTUS start_codon 29061 29063 . + 0 Parent=contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS CDS 29061 29126 0.74 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS CDS 29277 29928 0.98 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS CDS 31020 31348 0.59 + 2 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS CDS 33803 34126 0.31 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 +contig19 AUGUSTUS CDS 34184 34294 0.34 + 0 ID=contig19.g27.t1.cds;Parent=contig19.g27.t1 +# coding sequence = [atgattattactataaaaaatcttcaacagcaaacttttactattgagtttgcgccagaaaaaacggttttggacctga +# agaaaaaaatattcgacgagcgcggtgcggaatatgttgccgaaaagcagaaactcatttatgcaggcgtcattttgactgatgagcgtactattgga +# tcatacaatgtcgatgaaaagaagttcatagtagtgatgttgacacgcgattcatctagtgtaaagcacaatcaaaattgtccaaaggaaactgagaa +# gttgacaaccactaagaatgtaaagtccccagaaaacttaaacactaataacgcttctgccactgggattacagaagatcagttacctgtcccaacac +# gtgaaacaatagctccagttccaagaccaatttcccgtaacgatttgattggcgagttggccaatgcttccttacagtcgcgcgctgaatctaacttg +# ctaatgggtgacgaatacaaccaaactgttctgtcaatggtggaaatgggttacccccgcgagcaggtggaacgtgcgatggccgctagctacaataa +# cccagaaagagccgttgagtacctcattaatggaatacccgctgaggaggaagctatatataatgttgtggatgaatccacaaatccaagagtaatca +# cctccggacctcaagcgtcatctgtcgatcgtccaccagaatcaaattcagctgaacaggagaaacgtggaagaaagcgatccacttctacaaaattt +# gacacgagccttataaggaagtcgaaaaaggagccattcctttcttcgaaggatcttaaaaactacatgaacgcatccgtaacgagtcgcaccattcg +# caacagactgattgagcacggtttaaaagcgcattcagcaaggagagttccttttatgagcaagaggcatacagaaaggcgactctgctttgccaaaa +# accaccagacccgccagaactggaaaaatgtcctttggtccgatgaaacaaaaattgatttgtttggatctgatggtagaccccatattggtcagaca +# aacccagctcttttacaacttatttctgagaaccaagatgcgtttcttaacatgctaaatcaaccgattgaaagcgaatcagaaacaaatgagtcaga +# agcgcgcggttcaaacgctcgtacgcagtcgaattctgctgagattgaaagcctgttttcgtcagaattggaaggagctgttgcagcacaaagaacag +# ccgctggcggaagtgtgattcaaagagataacgcacataatattgaagatttggaacaaccttcaggagtctcaaccattcgtctaaatcgccaagac +# caggacgcaatagaaaggctgaaagcacttggattcccagaggctcttgtactgcaagcttacttcgcgtgtgaaaaggatgaggaacttgcagctaa +# tttcttactttcttctagctttgatgattag] +# protein sequence = [MIITIKNLQQQTFTIEFAPEKTVLDLKKKIFDERGAEYVAEKQKLIYAGVILTDERTIGSYNVDEKKFIVVMLTRDSS +# SVKHNQNCPKETEKLTTTKNVKSPENLNTNNASATGITEDQLPVPTRETIAPVPRPISRNDLIGELANASLQSRAESNLLMGDEYNQTVLSMVEMGYP +# REQVERAMAASYNNPERAVEYLINGIPAEEEAIYNVVDESTNPRVITSGPQASSVDRPPESNSAEQEKRGRKRSTSTKFDTSLIRKSKKEPFLSSKDL +# KNYMNASVTSRTIRNRLIEHGLKAHSARRVPFMSKRHTERRLCFAKNHQTRQNWKNVLWSDETKIDLFGSDGRPHIGQTNPALLQLISENQDAFLNML +# NQPIESESETNESEARGSNARTQSNSAEIESLFSSELEGAVAAQRTAAGGSVIQRDNAHNIEDLEQPSGVSTIRLNRQDQDAIERLKALGFPEALVLQ +# AYFACEKDEELAANFLLSSSFDD] +# end gene contig19.g27 +### +# +# ----- prediction on sequence number 20 (length = 50014, name = contig20) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 20 on both strands +# start gene contig20.g28 +contig20 AUGUSTUS gene 24058 29291 0.09 + . ID=contig20.g28 +contig20 AUGUSTUS transcript 24058 29291 0.09 + . 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ID=contig21.g29 +contig21 AUGUSTUS transcript 14668 45952 0.09 - . 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ID=contig22.g30 +contig22 AUGUSTUS transcript 4664 35948 0.14 - . ID=contig22.g30.t1;Parent=contig22.g30 +contig22 AUGUSTUS CDS 4664 4885 0.97 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 25835 25973 0.99 - 1 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 28416 28567 0.98 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 28629 28840 0.91 - 2 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 29229 29369 0.65 - 2 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 30326 30413 1 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 30470 30914 1 - 1 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 31246 31924 0.76 - 2 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 35241 35451 0.98 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 35580 35855 0.46 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 35943 35948 0.49 - 0 ID=contig22.g30.t1.cds;Parent=contig22.g30.t1 +contig22 AUGUSTUS start_codon 35946 35948 . - 0 Parent=contig22.g30.t1 +# coding sequence = [atgcgcgaggaagaggaacatcatggttggattgaaggattggccattcttatttctgttattgtagtagttatagtaa +# cagctttcaatgattactcaaaggaaagacaattccgaggtctgcaaaatcgtattgagggcgaacataagttttcagttatccgaggaggggaggtg +# tgccaaatttcagttggagatattctggttggagatattgctcaggtcaaatatggagacttgttgccggcagatggttgtctcattcaaagtaacga +# cctaaaggtggacgaatcgtccttaactggcgaatccgatcatgtcaaaaagggtgcagacgttgatcccatggttctatcaggcacgcatgttatgg +# aaggaagcggtaaaatggttgttactgccgtaggggttaactcccaagcaggcataatttttacgcttcttggcgccgcagttgatgagcaagaagca +# gaaattaaaaagatgaaaaagggtgaaaacgacggtcgcgcccaaacaaaagggacccaagcgctaactcaacgccaaccagtaccaagcgaaggaac +# aaaatctgaatctgagggaaatcatgtgccgcaatcctcctcgtcgtcagcagctgtagaaacaggacataagaaggaaaaatctgtgctacaagcaa +# agttgacaaaactagctatacagattggatatgctgggtctactattgccgtacttacagtcataattttgattattcagttttgtattaagacattc +# gttattgacgaaaaaccatggaagaacacttatgccaataacttggttaagcatttgataattggtgttacagtattagtagtagctgtaccagaggg +# acttcctctggccgttaccctatctttagcatactcggtcaagaaaatgatgaaggacaataatttagttcgccatttggatgcttgtgaaacaatgg +# gtaatgctactgccatttgctctgataaaaccggaactcttacgaccaatcgtatgactgttgtacaatcctacatatgtgaaaaattatgcaaggtt +# ttgccaacgctaagcgacataccacagcatgtgggaaacttgattacaatgggaatatctgttaactcagcttatacttcaaatataatggtaatagt +# ttttatttcatcccggtgtgcttttatctatggccatgagggtaccctggaaaagtttacaagggatatgcaggagcgtctaatacgggaagttattg +# aaccaatggcttgtgacggtctgcgcacaatatctgtggcgtaccgcgactttgtgcctggtaaagctgcaattaatgaagtgcatattgatggcgag +# cccaactgggacgacgaggaaaacattatgacgaatcttacgtgcctctgtgtggttggtatagaagatccagttcgtcccgaagtacctgacgccat +# tcgtaaatgccaacgagctggtataacggttcgcatggtaactggagacaacatcaacacagcacgatcaattgccagcaaatgtggtattttgcgtc +# ccaatgacgactttcttattctggaaggcaaagagtttaacaggcgtattcgggatagcaatggagatatccaacaacatcttattgataaagtatgg +# ccaaaattgagggttttagcacgatcatcaccaaccgacaagtatacgttggttaaagcaacagagtttccaactccagatctattactccgtaaacc +# ctatggccgcacaaaacccttaatatctcgcacaatgatgaaaaacatacttggtcaggcgctttatcagttggtaataatatttggactgctctttg +# tcggcgatttaattcttgatattgaatctggacgtggacaagaacttaatgctggaccaacacagcactttactattatctttaatacatttgtcatg +# atgacattatttaacgaaataaacgcaagaaaaattcacgggcaacgtaacgttattgaaggacttcttacaaatcccatattttacaccatatggat +# cttcactatgatatcacaggtgttaataattcaatatggaaaaatggctttctcgaccaaggctttgtctttagatcagtggctctggtgtatatttt +# ttggaatcggtactcttgtctggggtcagctgattacctcagtgcctaccagaaaattaccaaaaatattatcatggggtcgcggccatccagaggag +# tacacggatgccatgaacttgggcgaggaacgttttgattcaattgattctgataagaagccaagggctgggcaaatcctatggattcgtggacttac +# gcgcttgcaaactcaaattcgtgtggtgaacgcattccggcaaggtctggacgcccgttacggtgatcataccaacacgtccctggcagaggtactgc +# gtaagcagacttctctgagcaaacgcctttcggaaacatcctccattgagtatgccgacaatatacccgatgagctgaccataccagaaattgatgtc +# gaacgtttatcatcacacagtcacactgaaaccgctgtttaa] +# protein sequence = [MREEEEHHGWIEGLAILISVIVVVIVTAFNDYSKERQFRGLQNRIEGEHKFSVIRGGEVCQISVGDILVGDIAQVKYG +# DLLPADGCLIQSNDLKVDESSLTGESDHVKKGADVDPMVLSGTHVMEGSGKMVVTAVGVNSQAGIIFTLLGAAVDEQEAEIKKMKKGENDGRAQTKGT +# QALTQRQPVPSEGTKSESEGNHVPQSSSSSAAVETGHKKEKSVLQAKLTKLAIQIGYAGSTIAVLTVIILIIQFCIKTFVIDEKPWKNTYANNLVKHL +# IIGVTVLVVAVPEGLPLAVTLSLAYSVKKMMKDNNLVRHLDACETMGNATAICSDKTGTLTTNRMTVVQSYICEKLCKVLPTLSDIPQHVGNLITMGI +# SVNSAYTSNIMVIVFISSRCAFIYGHEGTLEKFTRDMQERLIREVIEPMACDGLRTISVAYRDFVPGKAAINEVHIDGEPNWDDEENIMTNLTCLCVV +# GIEDPVRPEVPDAIRKCQRAGITVRMVTGDNINTARSIASKCGILRPNDDFLILEGKEFNRRIRDSNGDIQQHLIDKVWPKLRVLARSSPTDKYTLVK +# ATEFPTPDLLLRKPYGRTKPLISRTMMKNILGQALYQLVIIFGLLFVGDLILDIESGRGQELNAGPTQHFTIIFNTFVMMTLFNEINARKIHGQRNVI +# EGLLTNPIFYTIWIFTMISQVLIIQYGKMAFSTKALSLDQWLWCIFFGIGTLVWGQLITSVPTRKLPKILSWGRGHPEEYTDAMNLGEERFDSIDSDK +# KPRAGQILWIRGLTRLQTQIRVVNAFRQGLDARYGDHTNTSLAEVLRKQTSLSKRLSETSSIEYADNIPDELTIPEIDVERLSSHSHTETAV] +# end gene contig22.g30 +### +# start gene contig22.g31 +contig22 AUGUSTUS gene 36900 58827 0.07 + . ID=contig22.g31 +contig22 AUGUSTUS transcript 36900 58827 0.07 + . ID=contig22.g31.t1;Parent=contig22.g31 +contig22 AUGUSTUS start_codon 36900 36902 . + 0 Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 36900 37419 0.7 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 48394 48703 0.99 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 48769 48980 1 + 1 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 49745 49896 0.78 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 50047 51108 0.88 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 51770 52268 0.6 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 52350 52879 0.45 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 53483 53714 0.96 + 0 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 53776 53942 0.77 + 2 ID=contig22.g31.t1.cds;Parent=contig22.g31.t1 +contig22 AUGUSTUS CDS 55547 55816 0.78 + 0 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ID=contig23.g34 +contig23 AUGUSTUS transcript 40426 45565 0.55 - . 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ID=contig24.g36 +contig24 AUGUSTUS transcript 20423 25562 0.54 - . ID=contig24.g36.t1;Parent=contig24.g36 +contig24 AUGUSTUS CDS 20423 20482 0.64 - 0 ID=contig24.g36.t1.cds;Parent=contig24.g36.t1 +contig24 AUGUSTUS CDS 20543 20620 0.84 - 0 ID=contig24.g36.t1.cds;Parent=contig24.g36.t1 +contig24 AUGUSTUS CDS 24621 25562 0.88 - 0 ID=contig24.g36.t1.cds;Parent=contig24.g36.t1 +contig24 AUGUSTUS start_codon 25560 25562 . - 0 Parent=contig24.g36.t1 +# coding sequence = [atgttcaagatggacgccgcagacttctggcagcatgcacgtgccccgttcagcctgcagtacaattcgccgaatcagc +# cgcaagcaccccaccacaccctgcaccaatcccttccgcaggagcacgaggtgttggccgacgtccatccaggaggcccagccaccggctcgggcgta +# gtaaacagcagcagctctattggcgtatccagcccccactctgctctgggcggcaaggccgagtccagccacattctgcagcagcactcagggcagca +# gtcctacgggggcgactccttccgaggctcacagtcgccccagctaagcagccaccacctgttgttcaacgcagctgcggcagctgctgcggcggccc +# acctgaagtccacggccatgcagaacaacctctcgccgatgagggaccaggcccagagtgaccatcgcaactatggccacagccccttgaccgccctg +# tgtgggatcaagcccaagcaggagatagacgccaagccgaccctccagccgctgaacgagtgccgccagccgctggcccaggcgcaatcgcaatccca +# gcctacgtacggaacaaacttttacgacgtgggcgaagcgacggcgggcgatgtctccgaggcggatggacgagcgctgaccattgggctcggcatcc +# caagtaagaggacctccgaggagacgcaggccggtctgcagacccaacagacgacgggggcagaccggggcttgcataccccgcagtgcccttctatg +# tctcccgggactgggggcagttccaactcaggtacgggaaccagacccgatccaatacagatcaacaagaccctgtcgcagggtcagcagtctcctca +# gcactccacaacggcgtccggcggcaccacgactcccgacattaagtacagcaacgacaaaatggctaacgaaattcagcttcagctatcccggtcga +# gcagcgcagccgcgatcagtgaacgcacccttgaagaatgttggtcaaccctgcaacgacttcagctgcagaacagcacatcccatcacatcaccgaa +# cacttacttaccaataactag] +# protein sequence = [MFKMDAADFWQHARAPFSLQYNSPNQPQAPHHTLHQSLPQEHEVLADVHPGGPATGSGVVNSSSSIGVSSPHSALGGK +# AESSHILQQHSGQQSYGGDSFRGSQSPQLSSHHLLFNAAAAAAAAAHLKSTAMQNNLSPMRDQAQSDHRNYGHSPLTALCGIKPKQEIDAKPTLQPLN +# ECRQPLAQAQSQSQPTYGTNFYDVGEATAGDVSEADGRALTIGLGIPSKRTSEETQAGLQTQQTTGADRGLHTPQCPSMSPGTGGSSNSGTGTRPDPI +# QINKTLSQGQQSPQHSTTASGGTTTPDIKYSNDKMANEIQLQLSRSSSAAAISERTLEECWSTLQRLQLQNSTSHHITEHLLTNN] +# end gene contig24.g36 +### +# +# ----- prediction on sequence number 25 (length = 75023, name = contig25) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 25 on both strands +# start gene contig25.g37 +contig25 AUGUSTUS gene 63496 72888 0.14 - . ID=contig25.g37 +contig25 AUGUSTUS transcript 63496 72888 0.14 - . ID=contig25.g37.t1;Parent=contig25.g37 +contig25 AUGUSTUS CDS 63496 64309 0.62 - 1 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 64370 65052 0.57 - 0 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 65106 65290 0.97 - 2 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 65762 67777 0.42 - 2 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 70910 71131 0.95 - 2 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 72321 72656 0.99 - 2 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS CDS 72717 72888 0.63 - 0 ID=contig25.g37.t1.cds;Parent=contig25.g37.t1 +contig25 AUGUSTUS start_codon 72886 72888 . - 0 Parent=contig25.g37.t1 +# coding sequence = [atgctctcgacaacaatgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtg +# catctggagtagggatcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccggatcaa +# 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ID=contig26.g38 +contig26 AUGUSTUS transcript 13481 22873 0.21 - . ID=contig26.g38.t1;Parent=contig26.g38 +contig26 AUGUSTUS CDS 13481 14294 0.77 - 1 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 14355 15037 0.73 - 0 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 15091 15275 0.98 - 2 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 15747 17762 0.44 - 2 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 20895 21116 0.95 - 2 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 22306 22641 1 - 2 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 22702 22873 0.67 - 0 ID=contig26.g38.t1.cds;Parent=contig26.g38.t1 +contig26 AUGUSTUS start_codon 22871 22873 . - 0 Parent=contig26.g38.t1 +# coding sequence = [atgctctcgacaacaatgccccacagtccagcccaaacacagtcacagtcgcatccgaacgccgatgcttcaacaagtg +# catctggagtagggatcgggaatggggtcgccggcaccagcaggagctctccaaagaccactaaaaatgaaacctgttccactctgtctccggatcaa +# ataaaagttatgccagacgaaggagcagagaaaaacggactttcaagtagtgataaaggtgtgggcccttcggctggcagcagcggagccggaggagt +# tgcaaatattccatccgagggacaatcttcttccttgacgtctgctgttggtacaccgacactgaggcagaactcctcaaacagcgttaactcgtgcc +# tggctgcctcaccgaacaataccagtgaactctcgaatagcagtagtgtgcctgctacaatgggaatttctcaattggtcgatagtgacgagcatgct +# aagaaaaagaaaaacagtgtaaaggatgaggatgtcgaaacaggatctattaaagcgaaaggaatcgcttctggaagcggttgcggaacggggtcctc +# atctgctctttccgttggcattgttattaaggaagaaccttccgacgttttaagcaacttagtaaatatgaaaaaagaagaaagggaaaatcactctc +# caaacatgtcacctgtcggatttggttccattggtaactctcaggagaactccgctacgtcagtaaaaacagaaagaaattcgaccgatagtatcccc +# gaaaagaagccttcttccttggtgataagtaatgacgaaatgggcattgaaggagttaactgcaatccgttaaactcagatattgaatctttaaataa +# cccacctatctcaaacatattagcgatcggcatgaatgcgtcccaagcaacttctggtacgggagttggagctggaaccggaggtggggctggtaacc +# ttttgacaggaactggcaatctaccatcctctggtggcagcaattgcttagattacatgcaacagcagaatcacatatttgtattttcaactcaactg +# gctaacaaaggagccgaatcagttttgagtggtcagtttcaaaccattattgcgtatcactgcacccagccagcgacaaaaaactttctagaagactt +# tttcatgaaaaatcctctaaagatgaacaagttgcagcgccacagtgccttgggtatgccatggataggcatgggacccggaggacaaactcccccta +# atcctcctgtatcaaagataactcaacagcagccaaatctaaagcctgcaagtctcttgaaaaaccagttcaatcataacgaaaatagcaaacgtagt +# tctgtgccaagcaacacttttgtcgaccaagccgatcccttgtccaatgagggtgaactaatgtgctgggagagtggacccggaagcagcggtgccag +# tggtgccgcacaaaattcacgaaacaatatagacagtataagtacttccagtgagtcccaggcgataaagatactggaagcagctggtgttgatttgg +# gccaaggcacaaaagaaagcgacccaaattcgacgcacgaaaacaacattgtttcactgcaaggagttaaggttccagacgaaaaccttacaccacaa +# cagcgtcagcaccgggaagagcagctcgcgaaactaaagaaaatgaatcaatttctttttccagaaaatgaaaattcagtaggaacaattgtaagttc +# acagatgcagaaaataccaggtgacctgatgatgggtattccgggtggcggaggatctataataaattctcaattgcggcaaatgcatatgccaggaa +# acgcgaagcaggaactttcgacgggtacaagctcagggctcccagaggaggttatgcttcctgtcgatgtcatatcagatataaattctgcaatggga +# 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atttcgaacaaccctggagcgggcaacggcataaacttttttcaaaattgtaatcaaatgggtataatagatgatgaaggaggtttagccagccatga +# tgtggcaatgaatattggccaaccgtctatgatacggggcatgcgtccgcatggcatgcgaccacatgcaatggctccgcggatgcaagcttcagtca +# acagacagattccgtttgcacatgggccggatggtttggactgcgtcggagatacctctgcgttttttaataacgctacgtgcaacagcacgggaccg +# cctatgtttactgcatcacaacagtctaatcaggctaagccgcaacacctaaaaaacatacccaccggattatgtcaaaatcaaactggattgggagt +# tggacctgcagtttcacaaggacagatccagctccagggtcaaggtcaagggcagggccagggtcagacattaattgggcccagcaataataatttaa +# tgcccactgctggaaatgtcgttccaacgaacggagtttctggcattaatttcgtaggcccctcgtcaaatgatctgaagtacgcacagcaatatcac +# agtttccagcagcaattatacgcaacaaacaccaggagtcagcaacaacagcagatgcatcagcagcagcagagtaacatgttaaccatgccgcccaa +# cttatctccaactccagcgttctttgtgaacaaatga] +# protein sequence = [MLSTTMPHSPAQTQSQSHPNADASTSASGVGIGNGVAGTSRSSPKTTKNETCSTLSPDQIKVMPDEGAEKNGLSSSDK +# GVGPSAGSSGAGGVANIPSEGQSSSLTSAVGTPTLRQNSSNSVNSCLAASPNNTSELSNSSSVPATMGISQLVDSDEHAKKKKNSVKDEDVETGSIKA +# KGIASGSGCGTGSSSALSVGIVIKEEPSDVLSNLVNMKKEERENHSPNMSPVGFGSIGNSQENSATSVKTERNSTDSIPEKKPSSLVISNDEMGIEGV +# NCNPLNSDIESLNNPPISNILAIGMNASQATSGTGVGAGTGGGAGNLLTGTGNLPSSGGSNCLDYMQQQNHIFVFSTQLANKGAESVLSGQFQTIIAY +# HCTQPATKNFLEDFFMKNPLKMNKLQRHSALGMPWIGMGPGGQTPPNPPVSKITQQQPNLKPASLLKNQFNHNENSKRSSVPSNTFVDQADPLSNEGE +# LMCWESGPGSSGASGAAQNSRNNIDSISTSSESQAIKILEAAGVDLGQGTKESDPNSTHENNIVSLQGVKVPDENLTPQQRQHREEQLAKLKKMNQFL +# FPENENSVGTIVSSQMQKIPGDLMMGIPGGGGSIINSQLRQMHMPGNAKQELSTGTSSGLPEEVMLPVDVISDINSAMGCNNSQKSSLQCGSGGAAGP +# VTGTSTGAINVNMHCSSSVTSSGNMMGSSTNMLASFGNTNCNVNVIGSVPDMSKELSGQDSLLHPLQGTQIEWSKIQQQFFEERIKGGKARQATGPVA +# PPQHTNSGTGSNASSSQVRSLQGPPPPYHSTQRSASVPIATQSPNPSSPNNLSLPSPRTTGAAMGLPTNSPSMDGATSLSGSAPPAISTTSQGGTTGV +# LSVNKNCFQSDAPSPSNQNRNRNNGSSGVLTHNLNSNPSTPLSHLSPKEMESFGDNIKSRRPSPQGQRSPGNGLTEANTEARFAAASPGVIFNPHQHM +# QNNTNTYKIGTPNMQIERQAPAQGGSVQFSRRSDNIPLNPNSGNRPPQNKMTQNFDPISSLAQMSQQLTSCVSSMGSPAGSSGMSMMGGPTDINMEHA +# MISGLEGPGMDVINQNNCHPMNAVMNSMGQRMMNPKMCVPGGPSSLPGFNPNSPNGVLRESPLGPGPVPGPGPMNSPNFQGVLPPGARMMGRMPIGFG +# SNFNPNIQVKASTPNTIQYMPVRPQNASNNNNNGASNVRMPPSLEFLQSGDGGPGMPGMMVGSGSGPMLMNSSGDHQNKISNNPGAGNGINFFQNCNQ +# MGIIDDEGGLASHDVAMNIGQPSMIRGMRPHGMRPHAMAPRMQASVNRQIPFAHGPDGLDCVGDTSAFFNNATCNSTGPPMFTASQQSNQAKPQHLKN +# IPTGLCQNQTGLGVGPAVSQGQIQLQGQGQGQGQGQTLIGPSNNNLMPTAGNVVPTNGVSGINFVGPSSNDLKYAQQYHSFQQQLYATNTRSQQQQQM +# HQQQQSNMLTMPPNLSPTPAFFVNK] +# end gene contig26.g38 +### +# start gene contig26.g39 +contig26 AUGUSTUS gene 29102 36266 0.39 + . ID=contig26.g39 +contig26 AUGUSTUS transcript 29102 36266 0.39 + . ID=contig26.g39.t1;Parent=contig26.g39 +contig26 AUGUSTUS start_codon 29102 29104 . + 0 Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 29102 29217 0.99 + 0 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 29275 29409 1 + 1 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 31905 31949 0.84 + 1 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 32205 32279 0.64 + 1 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 32354 32492 0.97 + 1 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 34887 35151 0.77 + 0 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 35660 35786 0.95 + 2 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 35888 35975 0.99 + 1 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +contig26 AUGUSTUS CDS 36033 36266 0.98 + 0 ID=contig26.g39.t1.cds;Parent=contig26.g39.t1 +# coding sequence = [atgccgttgtttggcaaaaaggattccggcaagaaagccaaggcgaaggacataagggagctaaataagcaagtgtcaa +# tcgaggagaaatacaatcttcatgggcttttgggaactggggccttttcagaagtacgccttgccgaaagtaaagaaacccctggtgatcactttgct +# gttaaaattatcgacaaaaaagctcttaagggcaaggaggaatctctggagaatgaaattcgggttttaagaaggttcagtgcaaatcatttcgatgg +# caaatgtccaaacggaacgcgattaactcatccaaatatagtgcaactcctggaaacgtatgaagacaagtcgaaggtgtacctagttatggagttgg +# ttactggtggcgaactttttgaccgcattgtggaaaaggggtcctacactgaaaaggacgcttctcatctgataagacagattctagaagcggtagat +# tatatgcatgagcaaggtgtcgtccatcgtgaccttaagccggaaaacttactatactatagtcctgacgatgatagcaaaattatgattagcgactt +# tggattatctaaaatggaggattctggaattatggctacagcatgcggaactcccggatatgtcgctccagaagtgctggcacaaaaaccatatggaa +# aagccgttgatgtgtggagtattggagtaatatcgtatatcttattatgtggttaccctccgttttatgatgaaaatgatgctaatctgttcgctcag +# attttaaaaggagaatttgaattcgattcaccatattgggatgaaataagcgagtccgccaagcattttattaaaaatttgatgtgcgtatcagtaga +# gatgagatatacatgcaagcaagctctggctcatgcttggatttctggaaatgaggcaagtagcagaaacattcacggaaccgtgtcagagcaactaa +# agaaaaatttcgcaaaatcccgttggaagcaagcttactacgcggcgacagtgatccgacagatgcagcgaatggcgctaaacagcaatagcagtgca +# aattttgattctactggtgatttcagtaaccaaaaagactctaaaaactcaacagcagcgtctggatcacacatttccaatgttttatcagcgcagaa +# atcagcacaaagtgatgcacaagaagatggtgagacgctaggcagcacaaatggagcatcacagtag] +# protein sequence = [MPLFGKKDSGKKAKAKDIRELNKQVSIEEKYNLHGLLGTGAFSEVRLAESKETPGDHFAVKIIDKKALKGKEESLENE +# IRVLRRFSANHFDGKCPNGTRLTHPNIVQLLETYEDKSKVYLVMELVTGGELFDRIVEKGSYTEKDASHLIRQILEAVDYMHEQGVVHRDLKPENLLY +# YSPDDDSKIMISDFGLSKMEDSGIMATACGTPGYVAPEVLAQKPYGKAVDVWSIGVISYILLCGYPPFYDENDANLFAQILKGEFEFDSPYWDEISES +# AKHFIKNLMCVSVEMRYTCKQALAHAWISGNEASSRNIHGTVSEQLKKNFAKSRWKQAYYAATVIRQMQRMALNSNSSANFDSTGDFSNQKDSKNSTA +# ASGSHISNVLSAQKSAQSDAQEDGETLGSTNGASQ] +# end gene contig26.g39 +### +# +# ----- prediction on sequence number 27 (length = 50016, name = contig27) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 27 on both strands +# start gene contig27.g40 +contig27 AUGUSTUS gene 4094 11258 0.32 + . 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+contig31 AUGUSTUS CDS 25461 25510 0.28 + 2 ID=contig31.g47.t1.cds;Parent=contig31.g47.t1 +# coding sequence = [atgtttaattgtgcagctatacgctccaataatggtaatgactacggctctccaatgtccagttctgatgtggaaactt +# ttaacggcaaaatagtttacaatctcgatggcagtgcatacattattgccacagacaatgccaatggaagtgcatcggggtctgctaaaagttgttat +# gcctcaatttcgacatcagtaaaaaaacttttgaaggtcaaagatcgtggacaggaagaaaacgaaaaggaacaccagcatcaatatcatcaagatca +# aagcgaaacacaggagcaggaactagctgatgtggacgctggtcctggtgtcgaaaccttgggaggagcttcctacaaatcgagtccaaaaatacatt +# cctttcgtgttgtgtccgcgcaagatgcaaactctacttgccaggatcaaatcagagcatttaaaatccaaaaaccaattttaatgtgctttatttgc +# aagttgtcctttggcaacgttaagtcctttagcttgcatgcgaacagtgaacacagactcaacctggaagagctggaccagcagctacttaatcgcga +# gtactcgagtgccattattcagcgaaatatggatgaaaagccgcagatatcctttctacagcccttggataacaatgctgcctgtgctaccagcgatg +# acaccgataaggttcaaatagcccctgagggaagttgccccactcttactccatctccgcatccagttctcggtaatgaggatgaggtggagctagag +# 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ID=contig32.g50.t1;Parent=contig32.g50 +contig32 AUGUSTUS CDS 9315 9325 0.27 - 2 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 9382 9437 0.39 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 19927 22118 0.81 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 24947 25309 0.99 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 25407 25572 0.98 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 26120 26752 0.96 - 1 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 29696 29964 0.86 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS CDS 30286 31071 0.8 - 0 ID=contig32.g50.t1.cds;Parent=contig32.g50.t1 +contig32 AUGUSTUS start_codon 31069 31071 . - 0 Parent=contig32.g50.t1 +# coding sequence = [atggcatcaaagcgtgatgtcagcttggcacagtcagatgggacagtgccgacggtgccattgacgccatcaaccccat +# 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ID=contig33.g51 +contig33 AUGUSTUS transcript 4558 16069 0.21 - . ID=contig33.g51.t1;Parent=contig33.g51 +contig33 AUGUSTUS CDS 4558 4630 0.27 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 4925 7116 0.72 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 9945 10307 0.99 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 10405 10570 1 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 11118 11750 0.96 - 1 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 14694 14962 0.86 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS CDS 15284 16069 0.82 - 0 ID=contig33.g51.t1.cds;Parent=contig33.g51.t1 +contig33 AUGUSTUS start_codon 16067 16069 . - 0 Parent=contig33.g51.t1 +# coding sequence = [atggcatcaaagcgtgatgtcagcttggcacagtcagatgggacagtgccgacggtgccattgacgccatcaaccccat +# acttaagtagttcagaaagtggcaacaatgaacaaggcaaatatatatctggcctgccgaataatcgtaaacgcctgaagctgtccactcttgaacta +# 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cagaatctcagtccgcgggtaggaaatcaaacccagcacaatactccccaaccaggacatatcgtctcagacgtttctcgcaagagcttgtgtggcct +# cgaatcgctggttgatcaaataccagcaataagggaacacgaatgcagcaatataccattggcaacagcagcggcagcagcggctgctgttgaaagtc +# gtcttttaggcttgcaacaacagcagcagcatcagcagcagcagcaacaacagcagcaggaacagcagcatatacagcagcaacaacaacaatcacaa +# caacagcaccagcagcaacaacaacatcaacaacagcaccagcaaccaaaacgctgcattccagagaattcggtgcaaacggaatcatgtagaccgtc +# aagagagaatagcaacgtcagcaacaacaatttttctgtaagcagtctagctgcatccgctttgactgcaagaactgagaacgaagctatatatggca +# acagtggagaaacccgagtcatcagtgaaagtagcaatagtaacaacaacaattgtggcaacagcatcgagtattctattcatagtccatccggatat +# catcatcatgcccctcacttaatgggcgctataggggcgaacattaacaactcagagcccaatccgcatcacctttcccatcctcatccacctcctca +# ctcacatccgcatacaattcatccctcacatcatctgagcgtatttgatcacttgaaaccgtccgacataagtgggtacggcggtttttga] +# protein sequence = [MASKRDVSLAQSDGTVPTVPLTPSTPYLSSSESGNNEQGKYISGLPNNRKRLKLSTLELNSSQGSDVDSPIEPDLDPN +# 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ID=contig34.g57 +contig34 AUGUSTUS transcript 39193 45655 0.2 - . ID=contig34.g57.t1;Parent=contig34.g57 +contig34 AUGUSTUS CDS 39193 39600 0.8 - 0 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 41289 41467 0.85 - 2 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 42321 43243 0.26 - 1 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 +contig34 AUGUSTUS CDS 43929 45655 0.33 - 0 ID=contig34.g57.t1.cds;Parent=contig34.g57.t1 +contig34 AUGUSTUS start_codon 45653 45655 . - 0 Parent=contig34.g57.t1 +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# 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tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc +# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct +# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac +# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca +# ccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagatctcggcttaacatgccgcctgagc +# ggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaagcacggcaacggaagcgttgttagt +# ctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccggactcaaactgaatgagcgactgtc +# cccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcccgaacatccacggtaccccgcact +# cagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaagatttctgtccctgcctcgccaaaa +# tcgtccgtaacctgtgcgggcggaggatcgagccgcaatggacacaccagcgacatggaggagatcaacacgaaagatctggctcagcgcatctcggc +# agaactgaaacggtacagcattccacaggcgatctttgcacagcgtgttctctgtcgctcgcaaggtactttgtccgatctactgcgcaacccgaagc +# cgtggtcgaagctcaagtccggcagggagacatttcgaaggatgtacaaatggctccaggagcccgagtttcagcgtatgtctgctctacggatggcc +# gctgcacaaattcctcagcgaactttggggcctgggctggcacttggaccaacaacgggctccacatccgtcataccgaccgatttggattctcatgc +# cgggccagcaatgacaccaaatgctccgcccaatgaatcggcctcttcgtctgcatctacacctgtcacaaacgtgtccgttgcgaacgtcgttagtt +# gtcgtcgaaaggaagagcctcagatcgagcaaatgcctcagccaaaaaaaccacgactggtctttaccgatcttcaacgacgaacactacaagctatt +# ttcaaagagaccaaaagaccttcgaaggagatgcaagtgacgatcgcgcggcagctgggactagagcctacaacagtaggcaatttctttatgaacgc +# acgtcggagatcgatggataagtggcgggacgacgactccaaaaccagcatgcatttatcgcatagccgccaacaacaacgggacgagcaggaagagg +# acgagagccacagtcaaagtcagattcaaattcagagccataatccggctagcttaacacaggaaaactactccagtctacatacaacggccatgtcg +# cctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgaccatggagataccaatga +# tccaaactgcgacatgttgtga] +# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS +# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK +# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE +# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA +# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC +# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES +# VPGVNGGTNWLQMHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSLTPTPPPVT +# DDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSSRNGHTSDM +# EEINTKDLAQRISAELKRYSIPQAIFAQRVLCRSQGTLSDLLRNPKPWSKLKSGRETFRRMYKWLQEPEFQRMSALRMAAAQIPQRTLGPGLALGPTT +# GSTSVIPTDLDSHAGPAMTPNAPPNESASSSASTPVTNVSVANVVSCRRKEEPQIEQMPQPKKPRLVFTDLQRRTLQAIFKETKRPSKEMQVTIARQL +# GLEPTTVGNFFMNARRRSMDKWRDDDSKTSMHLSHSRQQQRDEQEEDESHSQSQIQIQSHNPASLTQENYSSLHTTAMSPLGDFDEEADMDLELESHD +# FDLVDPDDHGDTNDPNCDML] +# end gene contig34.g57 +### +# +# ----- prediction on sequence number 35 (length = 48011, name = contig35) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 35 on both strands +# start gene contig35.g58 +contig35 AUGUSTUS gene 5595 8883 0.09 + . ID=contig35.g58 +contig35 AUGUSTUS transcript 5595 8883 0.09 + . ID=contig35.g58.t1;Parent=contig35.g58 +contig35 AUGUSTUS start_codon 5595 5597 . + 0 Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 5595 5643 0.26 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 6642 6811 0.31 + 2 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 6865 6983 0.72 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 7293 7358 0.7 + 1 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 8135 8609 0.57 + 1 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 8675 8773 0.97 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 8854 8883 0.72 + 0 ID=contig35.g58.t1.cds;Parent=contig35.g58.t1 +# coding sequence = [atggagggctgtacccgagtttctgaactgttatgtaaacgttactcagacctttgtcaattagatgaaagtttttccc +# gactggccggatatgggtccagtcctgacgtgggatcccgttccctctgggctggtcagggtgttttacggtcaggttctgtaatcagttgctttttg +# ttctgccaacaaagcctcaagcagtacatagcaaaacgcaagattgagcgaggaagacgtttatatgagcaaaacaaccaaacagaggccgtgcgtac +# ttggcgtagtgcccttaaaggaacctgtcagccagaggactgcttccagctactaggatacttgtaccaggcccacatggactggggcaaatttcgtg +# aagctattgaatttggccaccagcagcttggaatttcagaagaactggattcgccaaatatgcgtgctgagacgtacctaaacctcagcagagctcac +# gcttgtttgggaggcctggagcgatcactgagctatgctaggcactcactttacaatgagtgcggcactaaatgccgaagtggacttgtccatttgac +# ggttgcacgagtgtatcttgaaatgggtggattcaccagggcattggagggcttgcagggagcctacaagatagctacagccgttggagatccgtctc +# tagagttacaagtgtatgtcgcactgtctgagctttttggacggctccaggataacgataaaagcgcatcttatgcttctaaggcgtacgatttatct +# cgttccttacagctgggtgaccttaactcatgccaccatagagccgcgttattgcgaatggctgcatctctgcgaaagaagggcgagctcggagatgc +# acaggattattgcaaggaagccacaaagctgtcccttatatctggagatcaggccacatacacgcgaagtattcgcgttatgggtgacatttaccgga +# agaaaatggatatggactctagaaacggtaaaaaacttgaagaatag] +# protein sequence = [MEGCTRVSELLCKRYSDLCQLDESFSRLAGYGSSPDVGSRSLWAGQGVLRSGSVISCFLFCQQSLKQYIAKRKIERGR +# RLYEQNNQTEAVRTWRSALKGTCQPEDCFQLLGYLYQAHMDWGKFREAIEFGHQQLGISEELDSPNMRAETYLNLSRAHACLGGLERSLSYARHSLYN +# ECGTKCRSGLVHLTVARVYLEMGGFTRALEGLQGAYKIATAVGDPSLELQVYVALSELFGRLQDNDKSASYASKAYDLSRSLQLGDLNSCHHRAALLR +# MAASLRKKGELGDAQDYCKEATKLSLISGDQATYTRSIRVMGDIYRKKMDMDSRNGKKLEE] +# end gene contig35.g58 +### +# start gene contig35.g59 +contig35 AUGUSTUS gene 14188 20650 0.27 - . ID=contig35.g59 +contig35 AUGUSTUS transcript 14188 20650 0.27 - . ID=contig35.g59.t1;Parent=contig35.g59 +contig35 AUGUSTUS CDS 14188 14595 0.87 - 0 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 16284 16462 0.91 - 2 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 17316 18238 0.29 - 1 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 +contig35 AUGUSTUS CDS 18924 20650 0.38 - 0 ID=contig35.g59.t1.cds;Parent=contig35.g59.t1 +contig35 AUGUSTUS start_codon 20648 20650 . - 0 Parent=contig35.g59.t1 +# coding sequence = [atggagtccataagtgaaataattgaccaccagacttttagccaggatctggttgaagatgcaacagatttcatctctg +# tggggcacaactcggagcgtcagtctcatccgcaccacgaacatcaggagggagaacctgattccggcgaggacctggcgatttccctgcaaacgatg +# acttcctgcccaagaacggacggatctagtggagggaagaagcaccggcctggatctggatctggatccgggttggtttcgggatcgggatctgattc +# tgttgtgatggttatcgactcaatgggccacagcaatagacagacaacatttcaaattgtgtcccagcagatgcatccgagaatgccattgcccttcg +# ggttgctccagcaaaatagtcaaaacacgcagcaatgcccgcagcgcatagtgagtagcagcccagtggactttgtagcgtccgacattagcttggat +# ggtctgacagtagattcgatgtcccaatcggttctctcccaagagatggcgataaagcaggagcagaagctacttattgcccaatcgaagagcgtgga +# tcaaggccataagcgcattcgaatgcacgtggaagtggcgaatgtaaatgcaagtcttggcgtggacgtggatgaaatggatgatatttcctccgacg +# acgtcggctgcgacgatgaggggataacgctgaaccagcatcatcagcagctcttggaacagcagcagcaatacggcctaactagccaccatccgcat +# caccaagctcattctcaggcgcttcacggtctacaccacagatcagctcagctggaaatgggattggaggcggatcatggcgaggttctgtcggtcat +# cgtccactcgcaggacagcgacaaagaggtggacggcgaaggagatgccgatggagagggagacggggatccagaggacgacgatgatcgggactctc +# gcagtcgagggcagatgcttagccacagctcgtatcagacgctgacctcggtaaatgatcgactatcaccgcctgggttcagtcagacatcttacgcc +# accctgacccctatccaaccactcccgcctatatcgacaatgtccgaaaagttcgcgtactccggccacatctctggaggagacagcggcgacgcgga +# tgtcaatggtggagaaggagttggaggagtggtcgacggtggagaggttaccaaccattccaccgatgctgctgggacgggtttaatcattagtggta +# atccggcgtcctcctcattccctgcccttaccatgcccatgggaagtgggcacttaagtctgggcgtgttgagcggtgtacaatctccatattcctca +# tatgagaagctatcgtcaatgatttcacccccacccaatagctacttggtctcgtgcgatctgcatgcctcggcttcggcacgcgtctctaactcatc +# tcaactgcagctaaaccacaacgggcaaaaaaaagaatcagcaatagctcacgaacacccccatggtcatgccgatgtcaatggggggaagtttccct +# acaccggccacatatctggaggagatagtgcagataccgatgtcaatggcgagaagttttcatactctgatcacatctctggaggagacagcggagac +# gcagatgtcaatgcagaaaaattcgtttactctgatcacatctctggagcagaaagcgttcccggtgtcaacggaggaacgaattggctccaaatgca +# ccctgagcaggaggtgcggcttcatatgccggctgacctggaggctcggttccacattccgctagaacgaagatctcggcttaacatgccgcctgagc +# ggggacacatgaatcgccacctccctacggccactcctatttgccctgcggactggaagtcagatgattggaagcacggcaacggaagcgttgttagt +# ctgtctgccgatctgccagttgtagtgtctctcactccaacccctccccccgtaacagacgattcaggggccggactcaaactgaatgagcgactgtc +# cccagggcaaagaacaccttttttcctggacaaagatcaagaaagcaacaccgtgacgacagaacagtgtagcccgaacatccacggtaccccgcact +# cagtgtgtgccatccgcaaccagccccaatcagctctcctaaacggctttcaaggttccagccagcaggccaagatttctgtccctgcctcgccaaaa +# 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cctcttggagactttgacgaagaagctgatatggacttggagcttgaaagtcatgacttcgatttggtggacccagatgaccatggagataccaatga +# tccaaactgcgacatgttgtga] +# protein sequence = [MESISEIIDHQTFSQDLVEDATDFISVGHNSERQSHPHHEHQEGEPDSGEDLAISLQTMTSCPRTDGSSGGKKHRPGS +# GSGSGLVSGSGSDSVVMVIDSMGHSNRQTTFQIVSQQMHPRMPLPFGLLQQNSQNTQQCPQRIVSSSPVDFVASDISLDGLTVDSMSQSVLSQEMAIK +# QEQKLLIAQSKSVDQGHKRIRMHVEVANVNASLGVDVDEMDDISSDDVGCDDEGITLNQHHQQLLEQQQQYGLTSHHPHHQAHSQALHGLHHRSAQLE +# MGLEADHGEVLSVIVHSQDSDKEVDGEGDADGEGDGDPEDDDDRDSRSRGQMLSHSSYQTLTSVNDRLSPPGFSQTSYATLTPIQPLPPISTMSEKFA +# YSGHISGGDSGDADVNGGEGVGGVVDGGEVTNHSTDAAGTGLIISGNPASSSFPALTMPMGSGHLSLGVLSGVQSPYSSYEKLSSMISPPPNSYLVSC +# DLHASASARVSNSSQLQLNHNGQKKESAIAHEHPHGHADVNGGKFPYTGHISGGDSADTDVNGEKFSYSDHISGGDSGDADVNAEKFVYSDHISGAES +# VPGVNGGTNWLQMHPEQEVRLHMPADLEARFHIPLERRSRLNMPPERGHMNRHLPTATPICPADWKSDDWKHGNGSVVSLSADLPVVVSLTPTPPPVT +# DDSGAGLKLNERLSPGQRTPFFLDKDQESNTVTTEQCSPNIHGTPHSVCAIRNQPQSALLNGFQGSSQQAKISVPASPKSSVTCAGGGSSRNGHTSDM +# 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ID=contig36.g61.t1;Parent=contig36.g61 +contig36 AUGUSTUS start_codon 6039 6041 . + 0 Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 6039 6053 0.37 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 6572 6752 0.93 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 9124 9609 0.76 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 11616 12503 0.27 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 12564 12740 0.92 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19141 19269 0.99 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19333 19428 0.8 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 19774 20144 0.54 + 2 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 20992 21138 0.65 + 0 ID=contig36.g61.t1.cds;Parent=contig36.g61.t1 +contig36 AUGUSTUS CDS 21203 21532 0.57 + 0 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gttaccgagaattttgcccactttaacgagacacccacgggaaaagaaattactattattgagaagcaaaatggaacatgtgtcgaaaacgcggaacc +# gtacgaggccccaacatatttatgtaaaggtgatggaaaatggaccattcttactggtggctgtcgttgcaaggccggctatgaaccaaacaatttaa +# ataaaacttgcacagaatgtccccttggtacgtttaaatcaccagaggtaaccaaatgtacgccatgtccgcctaactcaaattcttcaaaaactgca +# tcaccattttgcaagtgtatgccgggatactatagacatccaagtgacggccgacatatgccttgttacagtccaccatctgcgcctacaaatctaac +# gttgttgtttgttgatcaaacgagtgccataatatcttggagcgctccaaccaagaataaaacgaacacgggcaaaacgctgtctaataagtaccaca +# gtgatattgtgtacaagatccggtgcaatatgtgcagcccaaatgttatgtacaatccgtcaagtgacacatttaacgaaacgaaaataacattaaca +# aatcttgaaccggttacgacatatacagtgcaagtacacgcaaccaatagcgtgtcgcatcttaccgacttaagccggcaccccaacgaatcgtcact +# aataacaaccaatgacacaccattttctaatgtgtcgtttttcaccattcccttggatttgaatgaaataaagaccagtcacgcagaaattgtgttta +# ctacagagtctgttttgctatctacagcttttaacttacgtatattggccataactagtaaagatgccgatttggagtgggacaagccaattcaaagt +# 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attgtctgcacagttaattctagcaccagtatgtttgctggattcgtaatattttctgtaataggatttatggctcacgaacagcagagaccagtagc +# tgaggtagcagcatcaggacctggactggcgtttcttgtttatccttcggcggttctgcagctgccaggttctccaatgtggtcttgtctctttttct +# ttatgctgttgctcatcggattggattcgcaattttgtacaatggaggggttcatcactgcgattattgatgaatggccacagctgctgcggaaacgc +# aaagaaatttttattgctattgtatgcgcacttagctatttagttggcttaacctgtattacacaaggcggcatgtatatatttcaaattttggattc +# gtatgcagttagcggcttctgcttactgtggctcatattctttgagtgcgtctcaatatcttggtgctacggagttgatcgattttatgatggaataa +# aggatatgatcggatactatcccacagtttggtggaaattctgttggtgtgttaccacccctgctatatgcttgggcgtcttcttctttaacatagtt +# cagtggaccccaattaaatatttggagtatagttacccatggtgggcgcacgcttttggttggtttacggctttgtcatccatgctatatataccaat +# atatatgttctggctgtggaaacgaactcctggtgacttgagtgaggtaccctaa] +# protein sequence = [MLFPNWVEESFTDFVKGINWRSYVVCDVAYHNVNNWLWSPFIDRGPANRLYIEIQFTIRDCSLFPGNALSCKETFSLL +# FYEFDAATREPPPWQTDSYRLIARIAAGEGRFNQNSDVDINTEVKSIAVNKKGVYFAFRDQGACISVLAVKVYYITCPAVTENFAHFNETPTGKEITI +# 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ID=contig37.g62.t1;Parent=contig37.g62 +contig37 AUGUSTUS start_codon 8638 8640 . + 0 Parent=contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 8638 8643 0.95 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 8701 8987 0.52 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 11885 12254 0.97 + 1 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 12316 12519 0.99 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 +contig37 AUGUSTUS CDS 12580 12756 0.79 + 0 ID=contig37.g62.t1.cds;Parent=contig37.g62.t1 +# coding sequence = [atgaagttggttaaaattgaacagctccccgaacgcggatcatggtcatccaaaatggatttcatactatctgtagtag +# gtctagcaattggcttgggaaatgtttggcgatttccttatttgtgctataaaaatggaggaggcgcatttatattaccgtacatcataacgttgttc +# ctagctggaattccaatgttttttatggagttagctcttggtcaaatgttgacaattggtggtcttggtgtatttaaaattgcacccatatttaaagg +# taaggcctttttcatattggacgcgcttattgtctgcacagttaattctagcaccagtatgtttgctggattcgtaatattttctgtaataggattta +# tggctcacgaacagcagagaccagtagctgaggtagcagcatcaggacctggactggcgtttcttgtttatccttcggcggttctgcagctgccaggt +# tctccaatgtggtcttgtctctttttctttatgctgttgctcatcggattggattcgcaattttgtacaatggaggggttcatcactgcgattattga +# tgaatggccacagctgctgcggaaacgcaaagaaatttttattgctattgtatgcgcacttagctatttagttggcttaacctgtattacacaaggcg +# gcatgtatatatttcaaattttggattcgtatgcagttagcggcttctgcttactgtggctcatattctttgagtgcgtctcaatatcttggtgctac +# ggagttgatcgattttatgatggaataaaggatatgatcggatactatcccacagtttggtggaaattctgttggtgtgttaccacccctgctatatg +# cttgggcgtcttcttctttaacatagttcagtggaccccaattaaatatttggagtatagttacccatggtgggcgcacgcttttggttggtttacgg +# ctttgtcatccatgctatatataccaatatatatgttctggctgtggaaacgaactcctggtgacttgagtgaggtaccctaa] +# protein sequence = [MKLVKIEQLPERGSWSSKMDFILSVVGLAIGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFILPYIITLFLAGIPMFFMELALGQMLTI +# GGLGVFKIAPIFKGKAFFILDALIVCTVNSSTSMFAGFVIFSVIGFMAHEQQRPVAEVAASGPGLAFLVYPSAVLQLPGSPMWSCLFFFMLLLIGLDS +# QFCTMEGFITAIIDEWPQLLRKRKEIFIAIVCALSYLVGLTCITQGGMYIFQILDSYAVSGFCLLWLIFFECVSISWCYGVDRFYDGIKDMIGYYPTV +# WWKFCWCVTTPAICLGVFFFNIVQWTPIKYLEYSYPWWAHAFGWFTALSSMLYIPIYMFWLWKRTPGDLSEVP] +# end gene contig37.g62 +### +# start gene contig37.g63 +contig37 AUGUSTUS gene 18828 41476 0.01 - . 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sequence number 41 on both strands +# start gene contig41.g71 +contig41 AUGUSTUS gene 4006 27824 0.06 + . ID=contig41.g71 +contig41 AUGUSTUS transcript 4006 27824 0.06 + . 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coding sequence = [atggtatcgacgcgaattgcaccgtcgccatctggacgaattcacttttcaaccttgattcgccctgcaaggacctgcg +# cagcgtgcatccggcggaaaacaatacattaccggattaagcttggatgggccaggcaaaagtcgatcacgaatagcagtgcatcgctcaaaaagttg +# agaatacaaggaggttcgaggagacctcgtcgtataatgtttacattgcaaccaactccgacggctataggcaccgtagttcctccctggtccgcggg +# aacattgatagagcgtcttccgtccttggaagacatggctcacaaggacaatgtgattgctctgagaaatttaccatgtttgggtgccgctggtggaa +# gcggactaggcggtattgccggaaagccttcccctacaatggaagctgtggaagccagcacagcgtcacagccccattcgacatcgtcctacttcgca +# acaacttactaccatttaactgatgatgaatgtcacagtggagtaaatcagttgggtggagttttcgttggcggaagacctttgccagactcgacacg +# acagaaaattgtcgaactggcccattctggagcaaggccctgtgatatttctcggattcttcaagtgtccaatggatgtgtgagcaaaattctcggaa +# gatactatgaaacgggcagtataagaccacgggctatcggtggttccaagccacgtgtggccacagccgaagtggttagcaaaatatcacaatataaa +# cgcgagtgcccgagtatatttgcttgggaaattcgggatagattacttcaggagaacgtttgcaccaacgataatattccaagtgtatcctccataaa +# ccgtgttttgcgaaacctggcggcccagaaggagcaacaaagctcgggaactagtagctctggagccggccccgcaaactcgagcagcggaaaactgg +# ccgccaacagcagtggaaacatcaccaacggctcgaacggcacgagagtcacattgacctcctccactgatctcatgcagacggccacgccgttaaac +# tcttcggaaagcggcggcgcgagcaattccgccgaggggagcgagcaggagtcgatttacgagaagcttaggctcctaaacacacagcacgccgccgg +# atcgggatcgggatcgctggacccagccatagcagtcccgttagtgggtcagtcgcccagccatttcggaccccattctagccacccactcaaccagc +# tggtgcacggtaaccagcaggctcttcagcagcagcagagctggccgccgcgccactactcctctgtaccttggtacccttcctccctgagtggcagt +# gaaattcccatatcatcggcttccaatgtcgcgccgatggcgtacacgtcggggccttcagtcgcccagcctctaagtccgtcgaacgacatcgcaag +# cctgggaagtgccggccacctgagaaactgccccgtgatcacggaggacattcatctaaagaaggaactcgatggtcatcagtccgatgaaacagcct +# ccggtgagggtgaaaactccaatggtggcgcttcaaatttaggaaacaatgaggatgatcaagctcggttaatattgaaaagaaagttgcaacgcaat +# cgaacatcttttacaaatgaccagatagacagtctagaaaaagagtttgaacgaacacactacccagatgtttttgcacgtgaacgattggctggaaa +# gattggtttgccagaggctaggattcaggtttggttctcgaaccgccgtgcaaaatggcgtcgagaggagaagctccgaaaccagagaagaacaccaa +# attccacaggagctagtggaacctcttcctcaacatcagccactgcctccttaacagatagtcccaacagcctaagtgcttgttcctctttgctgtcg +# ggatcagctgcgggtccttcagtcaataccattaatggtttatcctcgccgaattcattgcccaccgttgccagtgtcccagcggttggtactggcat +# tgagagtaccggcagtccaacaccgaccttgcatattcgatctgcctgctcctctgacacagccgctggacgtcacggtgaagactgtagaagagttt +# gttcaccgggcccccatggggttggaggccagcaaagtagccatcatcaccagagcaacgggcacgcccatgcccatgcacatgcgcttgttcctgct +# atttcgcccagactcaattttaacagtggcagttttggcgcgatgtattcaaacatgcatcacacggccttatctatgagcgacacttacggaacggt +# aacacccataccgagcttcaaccacgtcggatcgttggccccaccatcaccaatatcgcaacaaggcgatcttacgccaccatctttgtatccgtgcc +# acatgagtctacgaccgccgccaatcgcaccgccacaccaccacatagtggcgggtgagatgggaaaccctgcgggaggcgttggcaacgtccaaccg +# gccaatctgggagcaaactgcagtggatcgggatacgaagttctgtccgcctacgcgttgccccctcccccgttaccatcgagcagtgcatctgcatc +# aaacttctcaacatcatccagtactagcgctaatgtgacctcccatcacaacatgccccaagaaccatgcccctcaccatgcaactcaaactcaaacc +# acctgggtgttggacacagctcagtattcgcgaccgactcgatttcgccggctgtatcttcatatgcacatatgagctacaactacgcttcggctgcc +# aacaacgtgacatcttcctcttccggcgaagctccagcgcatgttgctccaggaaagcaacagttctttgcctcatgcttttattcaccttgggtata +# a] +# protein sequence = [MVSTRIAPSPSGRIHFSTLIRPARTCAACIRRKTIHYRIKLGWARQKSITNSSASLKKLRIQGGSRRPRRIMFTLQPT +# PTAIGTVVPPWSAGTLIERLPSLEDMAHKDNVIALRNLPCLGAAGGSGLGGIAGKPSPTMEAVEASTASQPHSTSSYFATTYYHLTDDECHSGVNQLG +# GVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQEN +# VCTNDNIPSVSSINRVLRNLAAQKEQQSSGTSSSGAGPANSSSGKLAANSSGNITNGSNGTRVTLTSSTDLMQTATPLNSSESGGASNSAEGSEQESI +# YEKLRLLNTQHAAGSGSGSLDPAIAVPLVGQSPSHFGPHSSHPLNQLVHGNQQALQQQQSWPPRHYSSVPWYPSSLSGSEIPISSASNVAPMAYTSGP +# SVAQPLSPSNDIASLGSAGHLRNCPVITEDIHLKKELDGHQSDETASGEGENSNGGASNLGNNEDDQARLILKRKLQRNRTSFTNDQIDSLEKEFERT +# HYPDVFARERLAGKIGLPEARIQVWFSNRRAKWRREEKLRNQRRTPNSTGASGTSSSTSATASLTDSPNSLSACSSLLSGSAAGPSVNTINGLSSPNS +# LPTVASVPAVGTGIESTGSPTPTLHIRSACSSDTAAGRHGEDCRRVCSPGPHGVGGQQSSHHHQSNGHAHAHAHALVPAISPRLNFNSGSFGAMYSNM +# HHTALSMSDTYGTVTPIPSFNHVGSLAPPSPISQQGDLTPPSLYPCHMSLRPPPIAPPHHHIVAGEMGNPAGGVGNVQPANLGANCSGSGYEVLSAYA +# LPPPPLPSSSASASNFSTSSSTSANVTSHHNMPQEPCPSPCNSNSNHLGVGHSSVFATDSISPAVSSYAHMSYNYASAANNVTSSSSGEAPAHVAPGK +# QQFFASCFYSPWV] +# end gene contig41.g71 +### +# start gene contig41.g72 +contig41 AUGUSTUS gene 35171 58958 0.01 + . ID=contig41.g72 +contig41 AUGUSTUS transcript 35171 58958 0.01 + . ID=contig41.g72.t1;Parent=contig41.g72 +contig41 AUGUSTUS start_codon 35171 35173 . + 0 Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 35171 35483 0.31 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 39079 39241 0.23 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 40493 40693 0.94 + 1 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 40765 41036 0.55 + 1 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 43582 43805 1 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 43867 44269 0.95 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 44418 45247 0.49 + 2 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 47876 47998 0.99 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 50623 50937 0.99 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 52323 52448 0.65 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 52835 53011 0.57 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 53321 53548 0.56 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 54373 54546 0.95 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +contig41 AUGUSTUS CDS 58917 58958 0.36 + 0 ID=contig41.g72.t1.cds;Parent=contig41.g72.t1 +# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga +# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt +# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc +# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacacaaatcgacggtttcgcgccgacattcgcgaaaaaacccgctatacgacaggaagaaga +# tggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccacaacggagcagctgttaaggaatcaatacgcc +# ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat +# aagcagtgtggtctcctctgaccaaggtgaatatcgcgcgcaagcgaaaaacaagcacggttctggagtcgcaactattaatcttaatttcgaaagtg +# gatcgaaaaaaattccagatggaaagtcgccacgctttccaaaaaaaccaacgatccgccaagaagaggacctactcatcatggaatgcgtattggaa +# gcgcatccggtcccagacattgtctggtattgctcagataaggaaatatccgataatcaaagaacgaaaatgacccgcaaggcaataactaaagacaa +# ctacgttttgaccctggaaatccaaaaccccacaaaagaagatggcggcaactatcgctgtaacgcaattaatatgtatggcgaaagtgcgagcgacg +# ccaatggttttgcaccatcatttatcgagaaaccaaggataatcccaaatgagtctggcacactaataacaatgaagtgcaagtgcaaggccaaacct +# gagccaaccgtaacttggtacaggggtcaagacatggtggagaagagtaagaagataaaaataaatacaacagttattgcggaagacacttacgaact +# gacattggaaataaaggatcccggggcaactgatggtggaacctacaggtgcaatgtcaaaaacgaatatggtgaatcaaacgccaatcttaacctta +# acattgaagcggagcctgagccggagggtgaggggccaacgttcattgaaaagccgcgcattgtatccgaaaacaacggtaaattggttataatggag +# tgcaaggtcaaggcagatccaaaaccagatgtaatttggttccgcaacggagaagtcataaaggaaagcaacaaaatcaaaacgtttattgagcagcg +# tggtgaccaatactacattaagctggagctattagatccccaactagaggactctggcctttacaagtgcaacattaagaacaccctcggcgagctga +# atgcgaatcttacattgaatatagaaattgttcccgtcattaaagataaacctaaaattattaagattatcaaaaaacgaactgttattatcgagtgc +# acagttgcatcaaagttcgaacctaagtgtacttggtataaggaaacaaacactgtaaaagaaagcaagagacacgtttacctggtggagcaaactaa +# ggacggagagtttgctgtcaaactagagataaacgatgttgaagagagtgataagggcgcttacaaattggtggctagtaacgaaaaaggacaagctg +# tatctcaagttgtcaatctcgttgatattcccgaggaggaacgcaagcccagcaagccggaaatctcccgaaagctcgttgatcaaaaggtttccgag +# tcaaagactttcgagcttttaatcagtctggcccagtcagatcgcaagtgcaaaatcgagtggtacaagggcagcaccttaatacgcgaaaccaaaga +# cattaccaccacgttcgatggaacaactgcacgactcacatttagctcggcaagaacggaacacacttcaaactataaagtcattgtgaccaacgaag +# taggcaaggccgaatcgtcgtgcaagattacagtggagaaaggcacaaagaagaaagaggaacaacccaaagaaaaggataagtcgaaggcagaaaag +# gaaaaagaggaaaaggtaaataaaaatataaatacatctaaatgtgtgcaggacacgcatcaggtcttagaatctgtaacggcacaggagattcaaag +# caaggaacgccaggtcgtagctaagatggaagagcattatataaatcagaaatctagcactcaactaaacactgcaagtattgtgtctgtcgaagaag +# agatctcggcagaagtacgacgccaatcagtagtcaaaatgcaggacgagatcacagtcgatgataaaagggtatcgtcgagaaggacatccctggct +# gtaatagaggagcaaaaacctgccgaagaactgccaaagctgcgtaaaacatctatcgctcaagtaaaagaagatgcaaagcctgaagttgcaaaacc +# aaaagcgaaagctaaagcaaaaccaaaaccaaaatacgaagagctcccagaaattccagactacgaacgtccacagctagaaaagtatgaaagatctg +# attttacgcccaccgactttggtcgtgaacttgaaataccaaacaaaatggaaaaacccatattagatagtggaaagaaggaatctgaggcaccagtc +# cagaaaaatggaattcctaaaaagtcggaaataattgaaaagcctgcagaggaacccaagggcttgaaaatcggcaaaggtaaactacccgatgaaga +# tgacagtcgagacggcgctattcttaagccagtcattattgagccagagcaggccgataaaccatctgtactagatattataaagcagcgacgtcgat +# cctctatcagaaatctgatgactaaggaaccaattcaaaatgaatcattccttggggtagttttaaagcccgtgataaaggatgctaaagagcaggtt +# gcgcctcagcaagctatacagttaacgaaggcaaatgcgacagagcagttatctcatacaaaggcaatcaaggcgaaagtttcggacctaaaaaagcc +# agaagctctagcgacccttgaggatgattatgagcggcccgtgttagaaaaatgtgaccctgtcaacttcgataacaacaaatcagagaaacctacac +# cagcaattatcacaccggacactaaacacccacaagtaaaattgccggtagaagaacctaaggaagagaagccaaaggtttccaggatgcaaccgcct +# tccccaggtgagccaccgaagatagaagtaatacgggagaagcgaccatctctagcaccggagccgccaagtcgccgtggatctcttatcccgccagc +# cgatactggacgtcggccgtctctgatcatcaatgatgagacccttagcatcatcgaaatcactgcgttggtcaaaatttag] +# protein sequence = [MGVAEDFAPSFVKKPQLHQEDDGNRLIFECQLLSSPKPDIEWFRSDNKLVEDGRTKFKIQPVEDNKYTVVLELDDVVE +# TDAGLYKVKAKNKSGEVSASINLNFTHKSTVSRRHSRKNPLYDRKKMENDYYLSAALTLIQYPPLFGSTTEQLLRNQYAIRSHGETILNESKRYKMSL +# TMDQKLYHMACLEISSVVSSDQGEYRAQAKNKHGSGVATINLNFESGSKKIPDGKSPRFPKKPTIRQEEDLLIMECVLEAHPVPDIVWYCSDKEISDN +# QRTKMTRKAITKDNYVLTLEIQNPTKEDGGNYRCNAINMYGESASDANGFAPSFIEKPRIIPNESGTLITMKCKCKAKPEPTVTWYRGQDMVEKSKKI +# KINTTVIAEDTYELTLEIKDPGATDGGTYRCNVKNEYGESNANLNLNIEAEPEPEGEGPTFIEKPRIVSENNGKLVIMECKVKADPKPDVIWFRNGEV +# IKESNKIKTFIEQRGDQYYIKLELLDPQLEDSGLYKCNIKNTLGELNANLTLNIEIVPVIKDKPKIIKIIKKRTVIIECTVASKFEPKCTWYKETNTV +# KESKRHVYLVEQTKDGEFAVKLEINDVEESDKGAYKLVASNEKGQAVSQVVNLVDIPEEERKPSKPEISRKLVDQKVSESKTFELLISLAQSDRKCKI +# EWYKGSTLIRETKDITTTFDGTTARLTFSSARTEHTSNYKVIVTNEVGKAESSCKITVEKGTKKKEEQPKEKDKSKAEKEKEEKVNKNINTSKCVQDT +# HQVLESVTAQEIQSKERQVVAKMEEHYINQKSSTQLNTASIVSVEEEISAEVRRQSVVKMQDEITVDDKRVSSRRTSLAVIEEQKPAEELPKLRKTSI +# AQVKEDAKPEVAKPKAKAKAKPKPKYEELPEIPDYERPQLEKYERSDFTPTDFGRELEIPNKMEKPILDSGKKESEAPVQKNGIPKKSEIIEKPAEEP +# KGLKIGKGKLPDEDDSRDGAILKPVIIEPEQADKPSVLDIIKQRRRSSIRNLMTKEPIQNESFLGVVLKPVIKDAKEQVAPQQAIQLTKANATEQLSH +# TKAIKAKVSDLKKPEALATLEDDYERPVLEKCDPVNFDNNKSEKPTPAIITPDTKHPQVKLPVEEPKEEKPKVSRMQPPSPGEPPKIEVIREKRPSLA +# PEPPSRRGSLIPPADTGRRPSLIINDETLSIIEITALVKI] +# end gene contig41.g72 +### +# +# ----- prediction on sequence number 42 (length = 70020, name = contig42) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 42 on both strands +# start gene contig42.g73 +contig42 AUGUSTUS gene 5165 63391 0.01 + . ID=contig42.g73 +contig42 AUGUSTUS transcript 5165 63391 0.01 + . ID=contig42.g73.t1;Parent=contig42.g73 +contig42 AUGUSTUS start_codon 5165 5167 . + 0 Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 5165 5477 0.8 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 9073 9235 0.38 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 10487 10687 0.89 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 10759 11030 0.75 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 13576 13799 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 13861 14263 0.95 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 14412 15241 0.54 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 17870 17992 0.99 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 20617 20931 1 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 22317 22442 0.68 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 22829 23005 0.6 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 23315 23542 0.48 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 24367 24540 0.99 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 30507 30654 0.95 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 31052 31425 0.95 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 33445 34090 0.3 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 34314 34667 0.62 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 35289 37001 0.84 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 38584 39303 0.66 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 39596 40359 0.57 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 40445 40580 1 + 0 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 40773 41663 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 41730 44402 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 45248 45529 1 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 45588 45887 0.77 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 45951 50220 0.4 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 50278 54041 0.5 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 54225 55421 0.91 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 55493 56471 0.51 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 56532 56873 1 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 57569 58611 0.9 + 1 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +contig42 AUGUSTUS CDS 62757 63391 0.99 + 2 ID=contig42.g73.t1.cds;Parent=contig42.g73.t1 +# coding sequence = [atgggggtggctgaagatttcgctcccagctttgttaaaaagccgcaactgcatcaagaggatgatggcaatcgtttga +# tttttgagtgccagttattgtcgtctccaaaaccggacattgaatggtttcgaagtgacaataaactagtagaagatggccgaaccaaattcaaaatt +# caacccgttgaagataataaatatacggtagtattagagcttgacgatgtggttgaaacggatgctggactgtacaaagtcaaagccaagaacaagtc +# gggggaagtctctgcgtctattaatttaaatttcacacacaaatcgacggtttcgcgccgacattcgcgaaaaaacccgctatacgacaggaagaaga +# tggaaaacgactattatttgagtgccgcgttaacgctgatccaatacccaccattatttggttccacaacggagcagctgttaaggaatcaatacgcc +# ataaggtcccatggcgagactatactaaacgaatccaaacgctacaaaatgtcactgacaatggatcaaaaactatatcacatggcgtgtctcgagat +# aagcagtgtggtctcctctgaccaaggtgaatatcgcgcgcaagcgaaaaacaagcacggttctggagtcgcaactattaatcttaatttcgaaagtg +# gatcgaaaaaaattccagatggaaagtcgccacgctttccaaaaaaaccaacgatccgccaagaagaggacctactcatcatggaatgcgtattggaa +# gcgcatccggtcccagacattgtctggtattgctcagataaggaaatatccgataatcaaagaacgaaaatgacccgcaaggcaataactaaagacaa +# ctacgttttgaccctggaaatccaaaaccccacaaaagaagatggcggcaactatcgctgtaacgcaattaatatgtatggcgaaagtgcgagcgacg 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SDIGNLKKTIPNSYVKDATKIRNTTHISMGKGKSISKTHRSAFRSRNTRYRQAVQKNVKGRIKTIDLELKHLFHLKPKANNHISDLKLHNKLFFHHEL +# CIENDVGIKEKIINYSSSSSSYDDDSEAENTSTEEEEKVKKSSSFGAHNLEFETETSAGAAVQVKFESENDSILTSSNDSDIADEGEREEINYTVDEC +# NDFRNNNMLQSFNSICAESTVASIKSAPPIASLESQTKYNSDDSNRCFNNNLHVGLTNEISNISQKSTESAELTNKLPLLGVEYRTGIRPSPDAAPTS +# LADKDIPRIQQFKEWHQVLQLKSYNNEPLIVLPYVLLE] +# end gene contig43.g75 +### +# +# ----- prediction on sequence number 44 (length = 50013, name = contig44) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 44 on both strands +# start gene contig44.g76 +contig44 AUGUSTUS gene 1472 4761 0.08 - . 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ID=contig44.g77 +contig44 AUGUSTUS transcript 11632 20182 0.11 - . 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ID=contig45.g78 +contig45 AUGUSTUS transcript 1628 10178 0.11 - . 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ID=contig46.g79 +contig46 AUGUSTUS transcript 42718 44481 0.73 - . ID=contig46.g79.t1;Parent=contig46.g79 +contig46 AUGUSTUS CDS 42718 44481 0.73 - 0 ID=contig46.g79.t1.cds;Parent=contig46.g79.t1 +contig46 AUGUSTUS start_codon 44479 44481 . - 0 Parent=contig46.g79.t1 +# coding sequence = [atggctcactctgacttgggtgcttcgcaggcgaccacggccgaccaggatcacggggccacatcgaacaacagtcatg +# tgcctaagcaaactgtgccgagcatatatccccttggaacctcgcgaaacccgcaagctcaagccacgacaatggctctagagcaataccggctgcag +# ctgtacaactacgcccttaatattgaacgatttagatgccctcaatacggtggcaccggaggcgccgccacaagtgctccatggctgcatttaagccc +# ctacggaccccatatatcgggcaatattccagcagtcaatcgaatggccgcgctctcaacgatttcactcttcccccaatcgcaacggatctttcaac +# ccgaggagcctaaaccgcaacacagttacattggtcttatagccatggccattttgagctcaacagagatgaagttggtcctgtcagacatttaccaa +# tatattttggataattatccgtattttagaagccgcggtccgggttggaggaactccatcagacataatctctcattgaatgattgtttcatcaaatc +# cggtcgcagtgcaaacggcaaggggcactactgggcaatacacccggcaaacatggatgattttcgcaaaggcgatttcagacgtcgcaaggctcagc +# gtaaagtccgaaaacacatgggtctgtcggtagatgatgccagcactgactcgcccagcccgccgcccttggatctcacaaccccacctccgcccaat +# tcccagtcggcactgcaactgtcgtctctggcatatccttaccaccatcagtatataggccagttctttaaccgcaactcagcacccggcctgtcaca +# gtactgcgcagagcctgcaattgtgatgcaacgacagcaggccaaccaggtggatcaggcgatccaaccagcccaacttcagcagcaacatggccagc +# atcagcacattgcttatatcaactccaccacgacaacaaccattgcaaatatgttctcgcagacacggaagcgccagttcgacgtggcgtcgctactg +# gcacccgatgtgcagatcgttgacattgtctccgaagatcaagagtcctctgtcaggccatcgagcacggcgaggactacgactcaaacgcaccacac +# agtcatcaccaagcaaaccatacaccgggaagtggtcttgggactggaacaacctgtgactgaggcagacattgacactgatgtcgatgtagaagtga +# atgtggatgtggtcgacgaaagcatcaatccagatcccgatgcttatccggagacggatgaccaagaaaatggcagaggaaccgtgaagcaaatattc +# tccgtggaggacaataactcgtaccttagcgacggcaggctgtcttcgttcgatgccgaccccgaccacgatcccgaagaccttgaacagcacaacta +# ttcaatttccagctcggcagcaaggtccttgggcagtagcagtagccaacacgaggagtccagctcactagaggaatgtccactggcagagtccactg +# cagggcccttgactgtagcgagaccgcccacccttacagcagccattccaaatgcatatattgaactcaaccatgttgatccccacatgcttagtagg +# tactacgggacatacatggccgccgctgcccgaagagctagtatagaggcgtcgaaagcagtaaggccatcctcaataacgccacctccgaaaatcga +# agtagtctcacggaagtaa] +# protein sequence = [MAHSDLGASQATTADQDHGATSNNSHVPKQTVPSIYPLGTSRNPQAQATTMALEQYRLQLYNYALNIERFRCPQYGGT +# GGAATSAPWLHLSPYGPHISGNIPAVNRMAALSTISLFPQSQRIFQPEEPKPQHSYIGLIAMAILSSTEMKLVLSDIYQYILDNYPYFRSRGPGWRNS +# IRHNLSLNDCFIKSGRSANGKGHYWAIHPANMDDFRKGDFRRRKAQRKVRKHMGLSVDDASTDSPSPPPLDLTTPPPPNSQSALQLSSLAYPYHHQYI +# GQFFNRNSAPGLSQYCAEPAIVMQRQQANQVDQAIQPAQLQQQHGQHQHIAYINSTTTTTIANMFSQTRKRQFDVASLLAPDVQIVDIVSEDQESSVR +# PSSTARTTTQTHHTVITKQTIHREVVLGLEQPVTEADIDTDVDVEVNVDVVDESINPDPDAYPETDDQENGRGTVKQIFSVEDNNSYLSDGRLSSFDA +# DPDHDPEDLEQHNYSISSSAARSLGSSSSQHEESSSLEECPLAESTAGPLTVARPPTLTAAIPNAYIELNHVDPHMLSRYYGTYMAAAARRASIEASK +# AVRPSSITPPPKIEVVSRK] +# end gene contig46.g79 +### +# +# ----- prediction on sequence number 47 (length = 35007, name = contig47) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 47 on both strands +# start gene contig47.g80 +contig47 AUGUSTUS gene 2708 4471 0.7 - . 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ID=contig47.g81 +contig47 AUGUSTUS transcript 22954 34914 0.22 - . ID=contig47.g81.t1;Parent=contig47.g81 +contig47 AUGUSTUS CDS 22954 23079 0.9 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 23132 23286 1 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 28046 28120 0.96 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 28179 29141 0.91 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 29810 32428 0.65 - 2 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 34008 34293 0.9 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 34351 34524 0.95 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS CDS 34579 34914 0.91 - 0 ID=contig47.g81.t1.cds;Parent=contig47.g81.t1 +contig47 AUGUSTUS start_codon 34912 34914 . - 0 Parent=contig47.g81.t1 +# coding sequence = [atgacagattcaatgaaattcggtccggaatggttgcgcaatatgtcagccgagccctcgggctctcccagtacttaca +# 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ctgtacgactgttaagctcgaagacctcgccattgtgggctgtcaataatgtagttggtaatggtggcgatgacaatcttcctgaatgggctatggaa +# aatccatcagagttgggtggtagttttgatgctagtggagcctttcatggtgatgctgatcctcaaaataacaaaagtttaaaagccaaaggttttaa +# ctctgatcagagcttgtcaaaatctaaaagtgaaccccttaatgagaatgatagtgtaaacgataaaacttctgaagtctctttaacgaatttatcgg +# cttcgcaggaattacccgaaagccgtttgtctccagtaaactcaacaacaaaaacggatgtcatccatggggatatttcagatcgaatcaaagaagtt +# gccgatgaagtggaaaaacttataacagaagatgataataaaccctttacgaattcaaaccaacttcaaagtgatagcggtcactttcctgctgcgct +# gccaagcttgacagataatgagttgagcacgacaccgatttctgtgaatccttctatagtgcgacagcaagtagctaccaccatgcctatacaaatcg +# caactacaatttcagaagcaactcaaccatctcatcagcattcaactgttccgttttcaaatctggttgctatgcagcaccataacatgcaacatcag +# ccacatttttcaatggttcctacgccacatttgatcaatccaaatctcaatgaattatggttttatcgggatccccaggcaaatgtacagggtccatt +# cagtgcgatggagatgaccgaatggtaccgtgctgggtactttaatgaaaatttgttcgtgcgacgattctccgataataggtttagacccttgggcg +# 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NSTKQTQGQQMDPTPTFITTSAENFSSESSTANVTMTSPPRLYKNAEDTLYAATVSNITDVNHFYSEGLIDSNSALEGNISDTYDESYNEMILTDKLV +# DEQIVGRDSGYGLTENPYSYHVSCVGQDDTTKACSQLHDIPIDTSFVIEQAEIKSGLVHFPESTTKKGGTTSGGMFGSILGKAAAAVQSATHAVNQGA +# SSVASVVSQKQSVVPTAHNIRDLSPNAIKRDSNRDSVGFNVMNVDYSYQLGNEESLSSHYENTGDDYENSNIKMHEYGTYTDNKAFVNYHSNGNQSQF +# QDDTAIFGQSKVIGNGTKILPTVPPAGSTGKKLPTVNGKSGLLIKQMPTEIYDDESELDELDGSPLIGKKPSYHIDSEQDDYYLGLQQTTPSNQANGY +# YEHVNNGYDYREDYFNEEDEYKYLEQQREQEKLHQPKNKKYLKQTKGVLSTTQPQSSLDFIDEGQDDDFMYENYHSEEDSGNYLDESSSGSVGPSEGR +# NLKMDSNGDASLASTSNQMKRDSFTNNSLHKLDTVVGESTSNLTGIIKEKMCSDLDERSEDINDQLSDLTDINKLTLLKKKSLLRGETEEVVGGHMQM +# IRQPEITARQRWHWAYNKIIMQLNPLGQGIPKEKSQFQKRDSKPNTEERFAFAENALRSQIQIKEQLRHQQQSTMYATSLANTPAAASVEAQFLNQPT +# ERPNYPLRVNSLHHKNLTAAEKQQSQMQPPICKSPMGMDASYSSYQNTNGSMVSIKSEQQLCQIYNSQQHSDYIISDYMDKIATRISLLETELKFAWR +# ALDLLSTEYGKIWVRLEKLENISIEQQSVVSNLMDLIGAANQEQQQSDFEGLDYPLFQDEDQLLPLVMNDTMGLAMVLEAEQSDPDYNKELHFGDHNH +# 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ID=contig49.g84.t1;Parent=contig49.g84 +contig49 AUGUSTUS CDS 1470 1532 0.77 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 1598 1672 0.97 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 4928 5059 1 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 6707 12505 0.93 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 20638 24656 0.44 - 2 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 24717 25701 0.61 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS CDS 25755 25760 0.96 - 0 ID=contig49.g84.t1.cds;Parent=contig49.g84.t1 +contig49 AUGUSTUS start_codon 25758 25760 . - 0 Parent=contig49.g84.t1 +# coding sequence = [atgacgcactatgcaaggcatgattactttcataatacccaaaacggtgccttatcctctgacaccggtcgatcacctt +# atagtcatattccttacagagcacagaacagcagagaatattatgccgagccgtacgatttaggcaatcatggactagaggaatatagtagtgagtgc +# 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ccatatttcaacacgtggacgactagcggtggcaattacctaccattcgaagttggacaaggtgctaatatttcaactcaatcctacacagtcacgac +# taaagctgaatcagtaatgtcaccattaacaagtttcatccctcctctgttcatatcttcgaattttaattccaagaatttaacggaagatatcgtat +# tttcaacaacaagttctcctcacgacaaaaacacaactgttagttacagttcatctaacaacgcgttcacaaaaactgtttacgtaaataatcccgaa +# gaggtgccagttaccacaagcgaaaacgctataccgccgtcatcggacttaacgttaaggtcaccatcgtcattagttcctattctatcttacacgga +# ttacatgaagcaatttgagttaccagatttgcctcagccaatcatggaactttcagaaaatatacctgttactcacagtgattctaattctgttccta +# tcaatgatattgctactaatgccgaattttcctgtcctcccaatgagttggatgttacaagtaaatgtagtgacccattaccttcgtatttgggtgaa +# ctttttgatgcatataacgtgcccagcctttcgattgagaatcaagaatctcccatcaagggtcaaattggcgatttatttaacattgcaatcgtacc +# ccaggtaccaattaacaccatagaatgttcagtagaccctccgaatcgatttaatttattgccagaggctgatgcggtagaaaaccatgcggtagcat +# tcgatgataatttttacgatagttttaatgttgacataaaagaactgacggcatctgttgcaaacattgaaccagaaaatggttcacgcaacttccca +# 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cgccgcggctgtaacctgtcggactctgaattagatatgccggactttactccatcggataacgataaaagctctataaccggaagtaaaattttaag +# aaatcatttcgaggatgaagtggatgaagattttgaccaatccacctgtgcctatgaggataacaaggaattgggtggttcaatggaggagttaaagg +# acagtatgccacataatttgtttgctgttctaggcgacctcaaaaaagttcaaagccccacaacaactattgctgtctcggcgacaattcccgttaag +# aacagttccattacaaatagtaataaaataagcactctggaaaatgtaaccattaaaatgccagagattctcttggagacaaaatcacaggcgtgcct +# tcaaaaactgaactcagtttatgctgacgactttggcgatgagaacgtacttggaaactcggtcagcatggatgcgaatgtccccaccctaagcattc +# tggaaacaactgaagatgtcggggatacagcattaagtacattcctgacaacgccaacagcaacaacaacaacaacagtccctcgtaatctcagttcc +# aatggtgttttgtgggtcacgcagcagtgtttagaccttccaaacaatactggctatgggtcgcgggaagatgacgataatcgaagccagcattctgc +# tcgcactctctcttcttcgcgcaggcaaagcactgaggatagcatagacacagacgacgaatacttttattatgagcttcggcagctggaggagcagg +# aacagcgctgtgcggaactttctggaattgcatctgccgaatcgcatgatgataacgaggtgctattttcccagatagggcaacttgtccaaaacgat +# tttaacggaggagcccgatgtcgatctgatgtctgtgaaaatgacctagaaactattaatttttctccaagtgaaagtgtgaagttacggatgtctga +# agtatttattgagcttaaaagcgtcgttaaattacagtcagacgtatttgctgacgctgctgttaaagagttggttgttgcaaaggcagcaggtgaaa +# aatttgcggcagtatgtgacatgcatagtgcttggcaggacgtaaacggcgatttccaagagacagcctcagaaatggattcgactgacgatgccgag +# atcgaaaataaaaaccatcgaaagttgcgacgattaaagaaaacacgcgatcgaaatgttaatatttctgacgatgcagccagttcaagttcgtcatg +# cctttctgaaaatgaatgtgaacacaagagtaaaaatagacctattgatcattgtattaataaatccgatggagaaaaggatgaaataaatagaccaa +# tcaaatcgacggcttctagtgagacatctggacctgatacgccggcagagataagcgatgttgagataagcgagacagaaaatgatctgagagatgat +# ggaaacccattgcttgacaatccagagtttctattggatgtaaatgaaaaatcgaatccacaatctggaaacaatttaaaaaaagaggccctagaacc +# ggctcagagtaatatgcagtcaatggagaatattaaaaccgaaccagttccacctaacacccctaaaatgttaattagtcaagaatcagattttgatg +# gatcccaggttataggtagcaatggtgaagcgggtcttggcagtagcaagtggaaattattaaaaactttaaaggagcgcaagatcgaggagaaaaat +# aatcaagataaaattaaagaagatgaaatgaccaaggacagggagaagaatggcggtggtactggagatattggattacgtaccaatggacatcctgg +# tgacaatcctttctacagtaatattgacagcatgccggatattcggcctcgcagaaaatcaattccccttgtttctgagctgacaatggctgctacaa +# aacgaaatgctggacttacatctgctgttccacgtgcaacgcttaacgacgaagaactgctatcacacaccattttattttactacaatatcactgaa +# gcggtgcgacgcgaagcggcatga] +# protein sequence = [MTHYARHDYFHNTQNGALSSDTGRSPYSHIPYRAQNSREYYAEPYDLGNHGLEEYSSECHLTSDRVLTTIDKRNNSYE +# YDYIECYEAQEQRDVESESIDNWNENHSGVGAQYGFEYANQKCTSAKVLPTLPVNKTGSGPSKPSATQMDIIFKTKGMCIEKDQRFGVCMAKADEYDL +# RILPGDYQNIYADNLNGYAGFAYPSTFLNNAVPAAPSRALPQTNRSSFYLGQDIFGLNADEAQREEQSKCDFGMDQAVTMDSGSTSYDVLEKMSRPYT +# SMLPLDYSDYHDSYYNTDNLSTYSDTPPTTNSQLKLQKQRKLSLMMAMTTASVIASDSILGNNISTNAATKASDRFLETECSGGIVTLSGPGAVTGTP +# PVALSTIIKTRKLPKVLPAPQFNSSLHLNSSTANALSSPVYSSDTAAEKSHRPKQLPKLPTSLPQIKPYSIHNSNLTTLSAADELPSYSLKSNTASSP +# LAITETVATTSYLSSTETKTCPSKKPNEVYLTKSIDDGLTPPWTPSPPTQLKQYFSPSAELPSQIVQKNSPTSHLPDIEKAKSDIKPDLHENLNESIL +# 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+# ttgtactggagttggaatcactaataacagccaaattacattgaccagttcgcatataggaacaactatgggagtcgctctgggcacgactgcagcag +# gcacaacctacatgcacgagaaaaatattgttggcgttagcgtcagttgtgttgataccagtagaaagtatgatttcaaaaacagtagtttgataaaa +# aataatagcttccaagcagcggcagagtatgtttcaacgggaaacaatagttctggtaatagccgttcaaatccacaaagtggggcaatatttcgtgg +# accacctccaacggcgaataccccacgcggtgccaccagcggtgcaacacgccatgttcatgttcaacccatgtactcacagccccttcaccaaaata +# tggtgatacaacaatacacacaatataacccgcgacaacaaacatttccaacttctcacttgcaatatgcaccagccccaatgccctactaccagtac +# caatacgtgccaactattcaacagcagcctccgccacatactcgtagtgccgtatcggttagtacgaacgtcaatgtgggaaacactttgcaaccagt +# ccagtccggaccaaatgggcctctgacagctccaggatcaacttcgtcgcagctacaattgatcactagcacagtgcagccaggaacaaacaatgtaa +# tgggtgttggtggtcctggcagtggaatgggacagacaaactctaacacagataatgacttttcggagcaggttactcttccaaacactcccacagtt +# gtcttgtcagaaggtcaaatacgtattccacagcaagatactgttggaataaataatttaagcaatacaacatcacaaggatccgaaacacggacaaa +# 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number 51 (length = 50015, name = contig51) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 51 on both strands +# start gene contig51.g86 +contig51 AUGUSTUS gene 1559 30331 0.01 - . 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contig51.g87 +contig51 AUGUSTUS gene 36903 47091 0.01 + . ID=contig51.g87 +contig51 AUGUSTUS transcript 36903 47091 0.01 + . ID=contig51.g87.t1;Parent=contig51.g87 +contig51 AUGUSTUS start_codon 36903 36905 . + 0 Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 36903 37584 0.49 + 0 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 39880 40423 0.97 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 42313 42446 0.87 + 1 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 45674 45733 0.63 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 45795 46090 0.82 + 2 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +contig51 AUGUSTUS CDS 46765 47091 0.33 + 0 ID=contig51.g87.t1.cds;Parent=contig51.g87.t1 +# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta +# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca +# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat +# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca +# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca +# gtgtctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttga +# tctatttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacact +# cggagggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgca +# gcagacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccg +# cattcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttgg +# aggatattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaa +# aggaacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccac +# tgagataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttg +# ttgtggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcac +# caccatactcagcgccttaagtatattagtccacaatcccaggtggtaataacagcctctttaatcgcaatacaggttcttatcaccatgatttggat +# ggtagttgaacctccaggaactcgtttctattatccagaccgaacagaagtgatccttaagtgcaaaatacaggacatgtccttccttttttcacagt +# tgtataatatgattctcataacaatatgcacagtttatgctattaaaacgaggaaaataccagaaaattttaatgagtcaaagtttattggattcact +# atgtacaccacttgtataatctggctagcttttgtacccatatactttggaactggaaattcttatgaggtgtacatcctcgtctttcacccggataa +# aaacgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacac +# aggcaggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggc +# caatcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaa +# ttaa] +# protein sequence = [MKLTRDKIIILAIMLMLSPVANLKSLNNVHTQDTVSVSLPGDIILGGLFPVHEKGEGAPCGPKVYNRGVQRLEAMLYA +# IDRVNNDSNILPGITIGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISP +# ASTAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNA +# RGVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEP +# VSDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHTQRLKYISPQSQVVITA +# SLIAIQVLITMIWMVVEPPGTRFYYPDRTEVILKCKIQDMSFLFSQLYNMILITICTVYAIKTRKIPENFNESKFIGFTMYTTCIIWLAFVPIYFGTG +# NSYEVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPE +# ECECAEAFCNRVKN] +# end gene contig51.g87 +### +# +# ----- prediction on sequence number 52 (length = 40012, name = contig52) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 52 on both strands +# start gene contig52.g88 +contig52 AUGUSTUS gene 6895 17083 0.02 + . ID=contig52.g88 +contig52 AUGUSTUS transcript 6895 17083 0.02 + . ID=contig52.g88.t1;Parent=contig52.g88 +contig52 AUGUSTUS start_codon 6895 6897 . + 0 Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 6895 7576 0.42 + 0 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 9872 10415 0.97 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 12305 12438 0.82 + 1 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 15666 15725 0.52 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 15787 16082 0.85 + 2 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 16757 17083 0.33 + 0 ID=contig52.g88.t1.cds;Parent=contig52.g88.t1 +# coding sequence = [atgaaactaacaagagacaaaattataattctggccatcatgctgatgctgagtccagtagccaacttaaagagtctta +# ataacgtacatactcaggacactgtgtcggtgtctttgcctggcgatataatacttggtgggttatttcccgtccatgaaaaaggtgaaggtgctcca +# tgtggaccaaaagtatataacagaggagtacaacgcctggaggcaatgctctatgctatagatcgcgtaaataacgactctaatattcttcccggaat +# aacgataggggtgcatatacttgacacctgttcgagggacacatatgcccttaaccagtcacttcagtttgtaagagcttccctcaacaacttggaca +# cttctgtgtttgagtgttcagattcgtcaagcccacaaataagaaaaaacgcttcatcgggacccgttttcggagttattggtggatcctacagttca +# gtgtctctgcaagtagccaacttgctgcgtctgtttcatattccccaaatatcaccggcatcaactgctaaaacgctatcggacaaatcacgatttga +# tctatttgctagaacagtaccgccagacacttttcaatccgtagcccttgtagatatactcaaaaattttaattggtcctatgtatccacgatacact +# cggagggatcttatggtgaatatgggattgaagcttttcacaaggaagccaccgaacggcacgtatgcatagcggtagccgagaaagtgccaagcgca +# gcagacgataaagtttttgacttaataattggcaaacttcaaaagaagcccaacgcccgcggagttgtactctttacaagagccgaggatgcgcgccg +# cattcttcaggcagctaagcgcgctaatttatcacaaccgtttcactggatagcaagtgacggttggggcaagcaacaaaaacttcttgaaggcttgg +# aggatattgccgagggcgctataactgtagaactacagtcggaaataatcgaagattttgatcactatatgatgcagctgacgccggaaacaaatcaa +# aggaacccgtggtttgctgagtactgggaggacacgttcaattgcattctcgaaccagtgtcggatcaaacaaattccccaaccagtatcgattccac +# tgagataaagatcgctaccaagtctaaaacaacatgcgaagatagctttcggttatctgagaaagttggatacgaacaggagtccaaaactcaatttg +# ttgtggatgctgtatacgcatttgcctatgcacttcataatttacataatgatcgttgtaatacacaaagcgaccaaacgtcggaacaacgaaagcac +# caccatactcagcgccttaagtatattagtccacaatcccaggtggtaataacagcctctttaatcgcaatacaggttcttatcaccatgatttggat +# ggtagttgaacctccaggaactcgtttctattatccagaccgaacagaagtgatccttaagtgcaaaatacaggacatgtccttccttttttcacagt +# tgtataatatgattctcataacaatatgcacagtttatgctattaaaacgaggaaaataccagaaaattttaatgagtcaaagtttattggattcact +# atgtacaccacttgtataatctggctagcttttgtacccatatactttggaactggaaattcttatgaggtgtacatcctcgtctttcacccggataa +# aaacgtccgtaagttaaccatgaacagcaccgtctacaggcgttcagctgcaactggagctcagggtgcgcccagcagctccgtatatagtcgcacac +# aggcaggcaacactgtaccgacaggaggggcgttgggtactacagcatcaagtgcccttcaaacacaaaacagctctaatcttgacgagccttcgggc +# caatcagctgttgttcacaaaagcagtgattatagtaatggcgaattcatgcccgaggaatgcgaatgtgctgaggcattctgcaaccgagtaaaaaa +# ttaa] +# protein sequence = [MKLTRDKIIILAIMLMLSPVANLKSLNNVHTQDTVSVSLPGDIILGGLFPVHEKGEGAPCGPKVYNRGVQRLEAMLYA +# IDRVNNDSNILPGITIGVHILDTCSRDTYALNQSLQFVRASLNNLDTSVFECSDSSSPQIRKNASSGPVFGVIGGSYSSVSLQVANLLRLFHIPQISP +# ASTAKTLSDKSRFDLFARTVPPDTFQSVALVDILKNFNWSYVSTIHSEGSYGEYGIEAFHKEATERHVCIAVAEKVPSAADDKVFDLIIGKLQKKPNA +# RGVVLFTRAEDARRILQAAKRANLSQPFHWIASDGWGKQQKLLEGLEDIAEGAITVELQSEIIEDFDHYMMQLTPETNQRNPWFAEYWEDTFNCILEP +# VSDQTNSPTSIDSTEIKIATKSKTTCEDSFRLSEKVGYEQESKTQFVVDAVYAFAYALHNLHNDRCNTQSDQTSEQRKHHHTQRLKYISPQSQVVITA +# SLIAIQVLITMIWMVVEPPGTRFYYPDRTEVILKCKIQDMSFLFSQLYNMILITICTVYAIKTRKIPENFNESKFIGFTMYTTCIIWLAFVPIYFGTG +# NSYEVYILVFHPDKNVRKLTMNSTVYRRSAATGAQGAPSSSVYSRTQAGNTVPTGGALGTTASSALQTQNSSNLDEPSGQSAVVHKSSDYSNGEFMPE +# ECECAEAFCNRVKN] +# end gene contig52.g88 +### +# start gene contig52.g89 +contig52 AUGUSTUS gene 23254 30182 0.17 - . ID=contig52.g89 +contig52 AUGUSTUS transcript 23254 30182 0.17 - . ID=contig52.g89.t1;Parent=contig52.g89 +contig52 AUGUSTUS CDS 23254 23318 0.81 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 23377 23658 0.38 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 24806 25012 0.59 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 27339 27713 0.95 - 2 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 27778 27907 0.94 - 0 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS CDS 29022 30182 0.7 - 0 ID=contig52.g89.t1.cds;Parent=contig52.g89.t1 +contig52 AUGUSTUS start_codon 30180 30182 . - 0 Parent=contig52.g89.t1 +# coding sequence = [atgagctcgcgtcgtgccatgagaaatagggagcgggcaaataactactatcagcgttttgtacctacagaatcccttc +# aaatgtgcggagaagataaagataaggataaggatgcgacgacgcaagggcagtcttttaagtcgcccgtcatcgatcatcgcagcatatcatcatct +# caccttatgccggcatttgcgaaaagacgtattgctgcatcgagcggtaccaacaacggggaaacaaacgaaacttcagtcagcacgtgtgatgctgc +# accaagtgcacatcaaagaagggaaagcaagggaaaagtccccagttcacctaatcgaaagagcagcgaacttgatatggcagaaacacgcttgaatt +# atgttcatcaggagcacgatcaatacatgtcatcatcgccaacgttttcgacttcccggcaggaaaggcggattggtagtggtcgcttgttgcccaga +# agtgataattgggaattcaaaagccaaaagactaaggagcccaacaccgagactgagaaggatgcgtctccaaatggaagtggaggtgcaagcgttgc +# taatcaacagaatcaaaaccaacaccaccaacgcgtattcagtgggaggttggtcgatcgtgttactgaacacacagatcgccgttttcaaaatgaca +# cgaagaggtcagttgaccgacagggcgtaggtaatcgacgcatatctaataaggagccttgtagtaatcaaaatcgtggcaagcgcgcaaactcctat +# cacgttcacgaagagccagaatggttcagtgcaggaccaacatcacagcttgaaactattgacttacacggctttgacgacctggacaacaatgaaga +# ccgttccgaaatggataatgaaaaatttctacaaattgatacaaatttagctgcgcaaacgacgattgatgaagcttcgagaagaaatagcaacgtca +# gtttaaatttgagcgacgcatatcaaagtgatgatataatagacactggtgaaaatatactgaaatgcattcaaaactcatcggaactctgcaaacaa +# aatcagaacgaacaaagtcaattccaatgcagccaaagtactgaaagtgaatttaattttgatgcctttcttaacatgcatcctttggataattccct +# aatgaataatgatgaaaacgaaaaaggtgaagcaacggggacatcacgctttagccgatggtttcgacataaggaaactgcaaataataatgaacttc +# caggtttgcaagactttaatgctcaagaaaaaattggtattccgagtgttaaggatttagaagcgcaaatgactaaagtagacatgcggccggattat +# gtaaacactgtaggaggaccattctctcaagttgtgcaagcggaaaaacctattcctagggacactgagggattcaaaaaattactgcaacagttggg +# ctatcaatctaggcagcatcatcctggcaatgacgtttaccatataataaatcattcaaatataactaatcatgaccatcttgagtcaaatcaacagc +# ataagataaacaactgccattcccaacactcagcgttaagtgtccacgggccaaacataccgagtaatagtcacatatttgcgcaaaaacgtttggaa +# acccatcacctaatgcaaagccttatttgcggggacgtttctctggacttcttggaaaaagagttgggtaatcctagcactgcaccttccacaaagga +# agttattgcgtcagtcctccgtgaatactcccataacaagagaaatcctgtgtccattggggatcacaaaatgtttacacattcaacgtttcttcaag +# ctcaaccagttcatccgcattattctgaagtactgaggaaaatgacagccgataaggaaacaactcaaacaccgagttcttctcatagccaacagcca +# caatatcaaatgcatccacagcatgccaagcaacttagtgagacgcagccaacagcacctatagccgtgcagcctcgaatgatattgggaggtggaaa +# ctttgtcattggcccaaataaccaaccaatatctcccaatttgcaacagtgccgaaatcaacagggaataaaatggactcctggtaatatgcagatgg +# tgcaagggaaatcatttggagtcaattttgccatgtccgtctgtctgtcttaccgtatgaatgctgagatctcggcaacttaa] +# protein sequence = [MSSRRAMRNRERANNYYQRFVPTESLQMCGEDKDKDKDATTQGQSFKSPVIDHRSISSSHLMPAFAKRRIAASSGTNN +# GETNETSVSTCDAAPSAHQRRESKGKVPSSPNRKSSELDMAETRLNYVHQEHDQYMSSSPTFSTSRQERRIGSGRLLPRSDNWEFKSQKTKEPNTETE +# KDASPNGSGGASVANQQNQNQHHQRVFSGRLVDRVTEHTDRRFQNDTKRSVDRQGVGNRRISNKEPCSNQNRGKRANSYHVHEEPEWFSAGPTSQLET +# IDLHGFDDLDNNEDRSEMDNEKFLQIDTNLAAQTTIDEASRRNSNVSLNLSDAYQSDDIIDTGENILKCIQNSSELCKQNQNEQSQFQCSQSTESEFN +# FDAFLNMHPLDNSLMNNDENEKGEATGTSRFSRWFRHKETANNNELPGLQDFNAQEKIGIPSVKDLEAQMTKVDMRPDYVNTVGGPFSQVVQAEKPIP +# RDTEGFKKLLQQLGYQSRQHHPGNDVYHIINHSNITNHDHLESNQQHKINNCHSQHSALSVHGPNIPSNSHIFAQKRLETHHLMQSLICGDVSLDFLE +# KELGNPSTAPSTKEVIASVLREYSHNKRNPVSIGDHKMFTHSTFLQAQPVHPHYSEVLRKMTADKETTQTPSSSHSQQPQYQMHPQHAKQLSETQPTA +# PIAVQPRMILGGGNFVIGPNNQPISPNLQQCRNQQGIKWTPGNMQMVQGKSFGVNFAMSVCLSYRMNAEISAT] +# end gene contig52.g89 +### +# start gene contig52.g90 +contig52 AUGUSTUS gene 32268 33026 0.91 - . 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ID=contig53.g92 +contig53 AUGUSTUS transcript 12261 24119 0.04 - . 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ID=contig55.g94 +contig55 AUGUSTUS transcript 6802 33037 0.13 + . 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ID=contig56.g95 +contig56 AUGUSTUS transcript 1802 28037 0.09 + . 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ID=contig56.g96 +contig56 AUGUSTUS transcript 38038 53620 0.04 - . ID=contig56.g96.t1;Parent=contig56.g96 +contig56 AUGUSTUS CDS 38038 38205 0.98 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 38270 38415 1 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 38468 38598 1 - 1 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 38660 39046 0.99 - 1 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 39119 39314 0.99 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 46743 47855 0.2 - 2 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 49901 51146 0.62 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS CDS 52391 53620 0.35 - 0 ID=contig56.g96.t1.cds;Parent=contig56.g96.t1 +contig56 AUGUSTUS start_codon 53618 53620 . - 0 Parent=contig56.g96.t1 +# coding sequence = [atgaattttattcttagtgtgctgctaatagcaactctaggagataaatatgaccacaggctgaacttaatagcaggtt +# 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ID=contig57.g99.t1;Parent=contig57.g99 +contig57 AUGUSTUS CDS 45155 45219 0.46 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 47394 47486 0.71 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 49327 49453 0.99 - 0 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 49515 49624 0.85 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 49898 50170 0.92 - 2 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 51823 51917 0.97 - 1 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS CDS 51994 52058 0.99 - 0 ID=contig57.g99.t1.cds;Parent=contig57.g99.t1 +contig57 AUGUSTUS start_codon 52056 52058 . - 0 Parent=contig57.g99.t1 +# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa +# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat +# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc +# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc +# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt +# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt +# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt +# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca +# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig57.g99 +### +# +# ----- prediction on sequence number 58 (length = 50011, name = contig58) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 58 on both strands +# start gene contig58.g100 +contig58 AUGUSTUS gene 5202 7547 0.98 + . 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ID=contig58.g100.t1;Parent=contig58.g100 +contig58 AUGUSTUS start_codon 5202 5204 . + 0 Parent=contig58.g100.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 5202 5265 1 + 0 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 6041 6352 1 + 2 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 6406 7547 0.98 + 2 ID=contig58.g100.t1.cds;Parent=contig58.g100.t1 +# coding sequence = [atgttcgcgttacgtgctgcctccaaagccgataagaatttgcttccatttttggggcaactgtctcgtggccatgctg +# ccaaggctgcaaaggctgcggctgccgccaacggaaagattgtcgctgtaattggtgctgtcgtcgacgtgcagttcgatgataatttgccgccaatt +# ctgaacgccttggaagtcgacaaccgctctcctcggctcgtgctcgaagtggcccagcacctgggagaaaacactgtgcgcaccattgccatggacgg +# cactgagggcttggttcgcggacagaaggttctcgatactggttatccaattcgtattccagttggtgctgaaaccctgggtcgcattatcaatgtga +# ttggcgagcccatcgatgagcgtggaccaatcgaaaccgacaagaccgcagctattcacgctgaggcccctgaattcgttcagatgtccgttgagcag +# gagattctggtcactggaatcaaagtagttgatctcctggctccttatgcgaagggcggaaaaattggtttgtttggcggtgccggcgtgggtaaaac +# tgtgttaatcatggagttgattaacaacgtggctaaggcccacggtggatactctgtttttgctggagtcggcgaacgcacccgcgaaggaaacgatt +# tgtacaatgagatgatcgagggtggtgtcatttcactgaaggacaagacttccaaggtggccctggtttacggccaaatgaacgagccccctggtgcc +# cgtgcccgtgttgctcttactgggctgaccgttgccgagtacttccgtgatcaagaaggacaggatgtgttgctgtttatcgacaacattttccggtt +# tactcaagctgggtcagaggtgtccgctttgttgggccgtattccctccgccgtcggttaccaaccaactttagccactgatatgggttctatgcagg +# aacgtattaccaccaccaaaaagggatctattacttccgttcaggctatctatgtgcccgctgacgatttgactgatcctgctccagccactactttc +# gctcacttggacgccactactgtcctgtcgcgagcgattgccgaactgggtatttaccctgctgtggatcctttggattccacgtcaagaattatgga +# ccctaacattattggacaggaacattacaacgttgctcgtggtgtgcagaaaatcctacaggattacaaatcccttcaggatatcattgccattctgg +# gtatggatgagttgtctgaggaagataagctcacagttgctcgcgctcggaagattcagcgtttcttgtcgcagccattccaagttgctgaagtcttt +# actgggcatgctggtaaactggtgcctctggaacaaaccataaaaggtttttcatcgattctggctggggattatgatcatctgcctgaagttgcttt +# ctacatggttggcccaatcgaagaagttgtggagaaggctgaccgtctggcaaaggaagcagcttaa] +# protein sequence = [MFALRAASKADKNLLPFLGQLSRGHAAKAAKAAAAANGKIVAVIGAVVDVQFDDNLPPILNALEVDNRSPRLVLEVAQ +# HLGENTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDTGYPIRIPVGAETLGRIINVIGEPIDERGPIETDKTAAIHAEAPEFVQMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKG +# GKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYNEMIEGGVISLKDKTSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQE +# GQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGSMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIY +# PAVDPLDSTSRIMDPNIIGQEHYNVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVARARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHAGKLVPLEQTIKGFSS +# ILAGDYDHLPEVAFYMVGPIEEVVEKADRLAKEAA] +# end gene contig58.g100 +### +# start gene contig58.g101 +contig58 AUGUSTUS gene 20148 27051 0.14 - . ID=contig58.g101 +contig58 AUGUSTUS transcript 20148 27051 0.14 - . ID=contig58.g101.t1;Parent=contig58.g101 +contig58 AUGUSTUS CDS 20148 20212 0.52 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 22387 22479 0.76 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24320 24446 0.97 - 0 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24508 24617 0.89 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 24891 25163 0.92 - 2 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 26816 26910 0.97 - 1 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS CDS 26987 27051 0.66 - 0 ID=contig58.g101.t1.cds;Parent=contig58.g101.t1 +contig58 AUGUSTUS start_codon 27049 27051 . - 0 Parent=contig58.g101.t1 +# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa +# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat +# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc +# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc +# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt +# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt +# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt +# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca +# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig58.g101 +### +# +# ----- prediction on sequence number 59 (length = 40011, name = contig59) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 59 on both strands +# start gene contig59.g102 +contig59 AUGUSTUS gene 10148 17051 0.11 - . ID=contig59.g102 +contig59 AUGUSTUS transcript 10148 17051 0.11 - . ID=contig59.g102.t1;Parent=contig59.g102 +contig59 AUGUSTUS CDS 10148 10212 0.53 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 12387 12479 0.65 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 14320 14446 0.98 - 0 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 14508 14617 0.88 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 14891 15163 0.94 - 2 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 16816 16910 0.96 - 1 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS CDS 16987 17051 0.55 - 0 ID=contig59.g102.t1.cds;Parent=contig59.g102.t1 +contig59 AUGUSTUS start_codon 17049 17051 . - 0 Parent=contig59.g102.t1 +# coding sequence = [atggctgcaccagcagcctgtacgcgtttttcggacaactacgacatcaaagaagaactgggaaaaggggcattttcaa +# tagtgaaaagatgcgtccaaaagtcaactggatttgaatttgctgcaaaaattataaatacaaaaaagttaactgcaagagaggctgatgcatcacat +# tgtattcaacaaatattggaatcggtcaatcactgccaccaaaatggtgtggtgcatcgagatctgaaaccagagaatttactattagctagtaaggc +# aaagggtgcagcagtgaaactcgctgactttggtctagccattgaagttcaaggcgatcatcaggcttggtttggatttgctggcactccaggatatc +# tgtcgccagaggtattgaaaaaggagccctatggcaaatcggtagatatatgggcatgtgaatgggatacggtcaccccagaagcaaaaaatcttatt +# aatcaaatgctcacagtaaatccaaacaaacgaataaccgccgccgaggctttaaagcacccatggatttgtcaacgagaacgcgttgcttccgttgt +# gcatcgacaagaaactgtggactgtctcaagaagttcaatgcgcgccggaagctaaagggagctatacttacaaccatgttggctaccagaaattttt +# ccagcagaagtatgatcaccaagaagggtgacggatctcaagtcaaggaatctaccgattcttctagcactacccttgaagacgatgatattaaagca +# atccagtattcgtcaacgaaaacagatattaccgatattacagatatcaccaagcggtggtag] +# protein sequence = [MAAPAACTRFSDNYDIKEELGKGAFSIVKRCVQKSTGFEFAAKIINTKKLTAREADASHCIQQILESVNHCHQNGVVH +# RDLKPENLLLASKAKGAAVKLADFGLAIEVQGDHQAWFGFAGTPGYLSPEVLKKEPYGKSVDIWACEWDTVTPEAKNLINQMLTVNPNKRITAAEALK +# HPWICQRERVASVVHRQETVDCLKKFNARRKLKGAILTTMLATRNFSSRSMITKKGDGSQVKESTDSSSTTLEDDDIKAIQYSSTKTDITDITDITKR +# W] +# end gene contig59.g102 +### +# +# ----- prediction on sequence number 60 (length = 50013, name = contig60) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 60 on both strands +# start gene contig60.g103 +contig60 AUGUSTUS gene 22241 32526 0.14 + . ID=contig60.g103 +contig60 AUGUSTUS transcript 22241 32526 0.14 + . ID=contig60.g103.t1;Parent=contig60.g103 +contig60 AUGUSTUS start_codon 22241 22243 . + 0 Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 22241 22251 0.2 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 22372 29494 0.15 + 1 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 29560 29780 1 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 29847 31965 0.97 + 1 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 32025 32145 1 + 0 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +contig60 AUGUSTUS CDS 32204 32526 0.98 + 2 ID=contig60.g103.t1.cds;Parent=contig60.g103.t1 +# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg +# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt +# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa +# tattaagcgggcagttatatcattactgcaatctggaacaaagaccgaaaacgaagttgacgttttcggccagtgccccactcatacttcgacgtcca +# ctgtaggcaatgcaaacataataacgaaggttcgcaacttaaacagatgtgcacatagggagcagattaacagtggtctggtgtccgggaaagtgaac +# gagaaagctggtatcacgtctagcctactattgcaggcaaattatataaaagagtcaaagattgtgaacagtcttcttgaaaatgttcagctgacaga +# aacatacaagtttgttggaactactaaaggaaattcggaaattagtgcaaaggtagtcacaacattaaaactaaaaaatcctaccggaacaaaagcta +# actcgccatctactggctccactgttagaagcgtgattttccaaagaccagaaacctacacatcgaaaaatataaacgctctgaaaacgatactatct +# gatcttgtggatttgactggcgattatgtgaaaaaagatagcgctaaaaagtttgtagaatttattaggttgcttcgccaatctgatagtgagacttt +# attagagctggctgcatacccacatccaaacaaagtcttagcccgcaaggtatacttagatggattgttccgtactagtaccgcagagtcagccagag +# ttatattgaaacagcttcctaagtttgatgataaggagaaactactagcgatactgtctttaaacttggttaaaagtgtggacaaggagacactcaat +# caagcagctgctcagctgctaccgaacgctcctaaggaattgtatctagctgtgggtaccttggttgctaaattttgtttaggaaaaaattgccaagg +# acctgaaattgatgccatatctaaaaagtttacggatggcctaaaacggtgtaagccaaatactaagaaggaagaagaacggattgtctatattttaa +# agggaataggaaatgcaaagagcttaggtggcaacactgctgctgtccttagtgagtgcgcctccacgggccgttccaatcgtatacgtgtagcggct +# ttgagagcattttcaacaattgattgcaatggagcactgcgaactaaggctttggaactacttaagaaccgcaacgaggactcagagttacgtattga +# agcctatttgtcttcaatttcatgtcccaacgcagaggtggccaaccagatttcagatatagtcaattccgaaacagttaaccaggtaggaggattta +# tttcatctaatttaaaagccattcgggactcgacagacgccagccgtgagcagcaaaggtaccatttagggaacattcgagtgactaagaaatttcct +# gcggattacagacgatacagtttcaacaatgaagtttcctacaaactggaatcccttggccttggagctagttctgactatcaattaatttattcgca +# acatgggttcttaccccgatcatctcgtatcaatgttacaactgaaatttttggaactaacttcaacgtatttgaagcaagcgtacgtcaggaaaatt +# ttgaggatgtgctggaatattatctgggaccgaaggggttgttaaacaaagatttcaatgaaatagttaagatcattgaagttggaaacaacgcggct +# gctagtgctggtggtcgagcccgacgctcaattgccgacgatgttgctaagatatcgaaaaagtataaaacttacggtgctaaaagtgtgcaagatct +# 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ID=contig61.g105.t1;Parent=contig61.g105 +contig61 AUGUSTUS start_codon 7236 7238 . + 0 Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 7236 7246 0.37 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 7367 14489 0.32 + 1 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 14555 14775 1 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 14842 16960 0.95 + 1 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 17020 17140 1 + 0 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +contig61 AUGUSTUS CDS 17199 17521 0.97 + 2 ID=contig61.g105.t1.cds;Parent=contig61.g105.t1 +# coding sequence = [atgtacgaaattattctaaccattggactgagtagcggggctttcagtgaatccgatgacaccagtctgaaagtatccg +# ggtcagcaaaaatttattcgaagggaaactgtgggtatacgttgcagctaagttccgtgaaggtgtccaatacaaaagagtccgtagagaaaaggatt +# ttgaacaacattcaaaaaccagttcagttcacgctggttagtggacatctggagccacaaatttgttcagactccagcgacttggattactcgctgaa +# 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ID=contig62.g107 +contig62 AUGUSTUS transcript 22556 47173 0.03 + . 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ID=contig63.g108 +contig63 AUGUSTUS transcript 4369 17721 0.09 + . ID=contig63.g108.t1;Parent=contig63.g108 +contig63 AUGUSTUS start_codon 4369 4371 . + 0 Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 4369 4421 0.53 + 0 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 4822 5122 0.55 + 1 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 5190 5442 0.77 + 0 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 11546 11653 0.84 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 11995 12117 0.56 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 17609 17721 0.4 + 2 ID=contig63.g108.t1.cds;Parent=contig63.g108.t1 +# coding sequence = [atgatggcaaacggcagcgtatgggatacagtggcgatcctctttatccaaatcgctctgggcagtatgattttttgtg +# gccgagttttatcggacgccgccggcttcctattttggtatgccggggcctgcgatggtttcagcatcctggacagtgatggatccacctccatgggt +# tctggagtgcctccacagtgcccatcgctgtgtggatcaaggtgcacctgtgccttgttctgtttagtaaagtgtggactttttccagcacttacttg +# cgtgtatgcctggcgggacgtttgttggcgttcatgcgcccttggatttgttttcgtatccttctgttacaagctgaatatttggcctgggaagtggt +# gtatcaaggatgagcacaagctacttgccgagctaggcaacttgacagcaggcaccggaaactgtgcatcatcatattatgaggcttcaaacggattt +# tccacaaactcgatatctggatctggttcgggtccgacgccgtctagcagtgatacgtctatgttgtacgacagtatttcaacaatttcgcaatctca +# aagctcactttatacaccaacaattggaccatcaattggctgtagttcagttgtgcccagcacagattacgcctacaaccccgcctatacacaatatg +# gtggcgcatacggatcatatggctatggggctggtgggggcttgataaattcatcctactactacgagagcggacaacctcagtcgacattgacgcca +# gacctggtcaggtctcctttagctgcaactcgggccaactccctggcttccgctgcgtcgccaggaagtggaaagtccgagttttctgactcggaact +# atcctctgacaaagcatctgtttgcattggatttatagttatagtcaaagctgaatcatcccaaactaagccatcatcaacaatctaa] +# protein sequence = [MMANGSVWDTVAILFIQIALGSMIFCGRVLSDAAGFLFWYAGACDGFSILDSDGSTSMGSGVPPQCPSLCGSRCTCAL +# FCLVKCGLFPALTCVYAWRDVCWRSCALGFVFVSFCYKLNIWPGKWCIKDEHKLLAELGNLTAGTGNCASSYYEASNGFSTNSISGSGSGPTPSSSDT +# SMLYDSISTISQSQSSLYTPTIGPSIGCSSVVPSTDYAYNPAYTQYGGAYGSYGYGAGGGLINSSYYYESGQPQSTLTPDLVRSPLAATRANSLASAA +# SPGSGKSEFSDSELSSDKASVCIGFIVIVKAESSQTKPSSTI] +# end gene contig63.g108 +### +# start gene contig63.g109 +contig63 AUGUSTUS gene 20635 28361 0.05 - . ID=contig63.g109 +contig63 AUGUSTUS transcript 20635 28361 0.05 - . ID=contig63.g109.t1;Parent=contig63.g109 +contig63 AUGUSTUS CDS 20635 20703 0.21 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 22334 22879 0.68 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 26229 26336 0.84 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 26403 26903 0.91 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 26957 27099 0.99 - 2 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 28214 28361 0.36 - 0 ID=contig63.g109.t1.cds;Parent=contig63.g109.t1 +contig63 AUGUSTUS start_codon 28359 28361 . - 0 Parent=contig63.g109.t1 +# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat +# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg +# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca +# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa +# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg +# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg +# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc +# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta +# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa +# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag +# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta +# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa +# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat +# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat +# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct +# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] +# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE +# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE +# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF +# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI +# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF +# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] +# end gene contig63.g109 +### +# start gene contig63.g110 +contig63 AUGUSTUS gene 36899 51455 0.1 + . ID=contig63.g110 +contig63 AUGUSTUS transcript 36899 51455 0.1 + . ID=contig63.g110.t1;Parent=contig63.g110 +contig63 AUGUSTUS start_codon 36899 36901 . + 0 Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 36899 36901 0.99 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 36954 37086 1 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 37151 37311 0.95 + 2 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 40574 40738 0.92 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 40795 40953 0.7 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 42037 42240 0.97 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 45152 45256 0.84 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 50734 51124 0.8 + 0 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +contig63 AUGUSTUS CDS 51178 51455 0.33 + 2 ID=contig63.g110.t1.cds;Parent=contig63.g110.t1 +# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat +# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa +# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga +# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca +# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc +# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac +# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc +# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat +# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta +# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt +# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa +# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg +# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg +# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattggtggagtatttgttgtccttctctgtggactt +# gcacttgccgttgtcgtggctatatttgagttttgctggaactccagaaaaaatttaaataccgaaaatcaatctctgtgctcagaaatggcccaaga +# acttcgttttgcaatgcactgccacggatcaaaatcaaagcatagaccacgtaaacggaattgcttaaagtgctcatcaggaccaacatacgttccga +# gtaatatgagtattccaaatgtcggcgttcactataattattttaattaa] +# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN +# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL +# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR +# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG +# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIGGVFVVLLCGLALAVVVAIFEFCWNSRKNL +# NTENQSLCSEMAQELRFAMHCHGSKSKHRPRKRNCLKCSSGPTYVPSNMSIPNVGVHYNYFN] +# end gene contig63.g110 +### +# +# ----- prediction on sequence number 64 (length = 40016, name = contig64) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 64 on both strands +# start gene contig64.g111 +contig64 AUGUSTUS gene 5630 13356 0.04 - . ID=contig64.g111 +contig64 AUGUSTUS transcript 5630 13356 0.04 - . ID=contig64.g111.t1;Parent=contig64.g111 +contig64 AUGUSTUS CDS 5630 5698 0.11 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 7329 7874 0.63 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 11224 11331 0.83 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 11398 11898 0.92 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 11952 12094 0.98 - 2 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS CDS 13209 13356 0.44 - 0 ID=contig64.g111.t1.cds;Parent=contig64.g111.t1 +contig64 AUGUSTUS start_codon 13354 13356 . - 0 Parent=contig64.g111.t1 +# coding sequence = [atgggcgagggccattgtttatcacctataatcatgactgtacacaaatacatgggctgcatttacattgcagtgatat +# tgtctgcacatctgtttgctggagttgtaacttcaagtgaaaatgatgatgaatacttaacacaaaaagaggtcatattagaaaagtcgtatcatggg +# ttgattcgagaaaacgaaacactagtggaaataactccattaataaaagtggatgaagaaaaaatttgcaactttcatattcttaaaaagccatatca +# tgagattccatttgaaattgaactggttaataacctggggattttaaaagctcgccggacgttaaattgcgagaaacgaaagagctatcatttcgaaa +# tcgttgcggtatattgcgatggaacaccttcaaatacagctaatgttcatattactgttatcgacataaatgaatatgcaccaacatttatagaaccg +# tcttacgtaacagaagtagacgaaggtcgtctttacaatgagatcttaagagtggaagctactgataaggactgtactccactttttggcgatgtttg +# caaatatgagatactaaacaatgacgaaccattctcaatagataacgagggcttaatcaaaaatactgaaccactttctcataaggcatcacataacc +# acatactatctgttgttgcgtacgactgtgcgatgaaagaatctgccgcaataatggttagcatcaaagttcgacgagtgtgtgagacgaagttctta +# ggcatgccagaacgtattgattatacgtccggtagcactgaaagccttcaactttttcccaacgcccgattggatttgtgtgatatttcttgtaagaa +# tgaataccttagtattcatgcatcgatagctcttaagacaaaacacatctcatttggatgcgatcgggacctatcaaattgtacttcgagccaaaaag +# tgaaagaccttttgccgcatggtgcagaatggaccaaagaattgagctacgacgaaggcgtagaacctatatttcactttgacgggtctactggagta +# gtggttcctgacactgttatcaatcattacgatttctcatcgcgtccttttagcattctcaccatgtttagacataatagtcaaggtgtggctaataa +# acatgttaaggaacatattgtctgcagtgctgatgaccacaaaatgaatcgccatcatatggcattgtttgttcgcaactgtcgtcttatacttttat +# taagaaaaaactttaacgagggtgatcttaatatctttagccctgctgaatggcgttggaaaatacctgaggtttgcgataatgaatggcatcactat +# gttcttaatgttgaagatccgtccaaagttgatttatttatcgatggcgtacgttttgaaaattctattgaggatcgacatagcaatccggagttcct +# atgggagctatatgatatagttgtcctatccggctggttccgacttatatacaacctgcaatag] +# protein sequence = [MGEGHCLSPIIMTVHKYMGCIYIAVILSAHLFAGVVTSSENDDEYLTQKEVILEKSYHGLIRENETLVEITPLIKVDE +# EKICNFHILKKPYHEIPFEIELVNNLGILKARRTLNCEKRKSYHFEIVAVYCDGTPSNTANVHITVIDINEYAPTFIEPSYVTEVDEGRLYNEILRVE +# ATDKDCTPLFGDVCKYEILNNDEPFSIDNEGLIKNTEPLSHKASHNHILSVVAYDCAMKESAAIMVSIKVRRVCETKFLGMPERIDYTSGSTESLQLF +# PNARLDLCDISCKNEYLSIHASIALKTKHISFGCDRDLSNCTSSQKVKDLLPHGAEWTKELSYDEGVEPIFHFDGSTGVVVPDTVINHYDFSSRPFSI +# LTMFRHNSQGVANKHVKEHIVCSADDHKMNRHHMALFVRNCRLILLLRKNFNEGDLNIFSPAEWRWKIPEVCDNEWHHYVLNVEDPSKVDLFIDGVRF +# ENSIEDRHSNPEFLWELYDIVVLSGWFRLIYNLQ] +# end gene contig64.g111 +### +# start gene contig64.g112 +contig64 AUGUSTUS gene 21894 36450 0.08 + . 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ID=contig65.g113 +contig65 AUGUSTUS transcript 1885 42915 0.02 + . ID=contig65.g113.t1;Parent=contig65.g113 +contig65 AUGUSTUS start_codon 1885 1887 . + 0 Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 1885 1887 0.99 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 1940 2072 0.99 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 2137 2297 0.9 + 2 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 5560 5724 0.89 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 5781 5939 0.71 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 7023 7226 0.91 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 10138 10242 0.84 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 15720 16110 0.97 + 0 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +contig65 AUGUSTUS CDS 42380 42915 0.14 + 2 ID=contig65.g113.t1.cds;Parent=contig65.g113.t1 +# coding sequence = [atggtacggaaaaaacgcgacactttagaaaagaaaaacataatagaccgaagcacccttaacaggatatgtttctcat +# acatgatattttcaatgcttataattgcaaccgcccttcctccagtgatacgcgtaggtgccatatttaccgaagatgagcgtgaaagcagtatcgaa +# tcggcctttaaatacgcgatttaccggatcaacaaggaaaaaaaccttcttcccaatacacaacttgtatacgatattgagtatgtgccccgagatga +# ttcgtttcgcaccactaaaaaggacttggaaacgtatgatcttgaggattttaggtataacagcgtaaatataactgcatttcgtttggtcgatgtca +# atagcaaaagatatctagaggttattgatcaaatgcagagattgcagcataatggattacaaagaatcaatggaattccttatatacagacagaatcc +# gctttaatgtttgattcggtatacgcctttgcttctgggttacactttttaaatttagatagccgtcccaatttttctgtcaaaaacctctcatgcac +# ctccgaccaaacttgggatgacggaatttctttgtataaccaaataaacgctgctattacagatggtttaacaggaaatattaattttgtggaaggtc +# gccgagacaagtttaaacttgatattctaaaattgaagcaagaaaaaattcaaaaggtgggatactggcagcccgaggtcggtattaacatttcggat +# ccaacggctttctacgattctaatattgcaaatataacattggtcgttatgacaagagagcgtgctgatctggctgtagcctcaatgacaattaacta +# tgctcgggaaagtgttatagactttacaaaaccatttatgaatttgggcattggtatcctttttaaggattctaaaattggtatatatcaaaaaatgt +# ggcgttatatggagaatcggaaagcagctgtatttgttaaaacgtacgaagatggaattaagcgtgtaatggaaggcagctatgcatttttaatggaa +# tccaccatgcttgactatgcagttcaacgcgattgtaatttaactcaaataggtggcttactggattctaaaggttacggcatcgccacaccaaaagg +# atctccttggagagataaaatttcactcgccattttagagctacaagaaaaaggtattattcaaatattatatgataaatggtggaaaaatacgggtg +# atgtttgcaacagagacgataagagcaaggagtccaaggccaatgcactaggagtagaaaatattgatgttaaaagtctaaattcaaagaaagaggtt +# caaataattgaatcaggtaaaaattctgatgttccgcgcaaaaccacaaattcattatcaatagagacaatacaattcaaggaagaaatgcaattgca +# agcccgaaatcgcatagactctattaaacgcactctagttggaggtgaacgtgttgatgacctaaaactaaaagaacagcaccaagctaaaaaaatgg +# cagcacaacgtcacttaagtgctatcgcctatgcattaaacagagttcaatgtgaggatcgtgatctcttgcagggacattatgctactataacccaa +# gaaataaatataaaaaataatcacattaagaagtgtaaagaaaaaattaaaatgcttgaaatggaagtttccgatttaaactctgagtttcaattgga +# tagagaggattatttggacgaaatacgaaatcttggtcgtcaaataaagttttatcaacaattggtttataaatttaatccaagttttcaaaaaaatg +# gaagaaactggtaa] +# protein sequence = [MVRKKRDTLEKKNIIDRSTLNRICFSYMIFSMLIIATALPPVIRVGAIFTEDERESSIESAFKYAIYRINKEKNLLPN +# TQLVYDIEYVPRDDSFRTTKKDLETYDLEDFRYNSVNITAFRLVDVNSKRYLEVIDQMQRLQHNGLQRINGIPYIQTESALMFDSVYAFASGLHFLNL +# DSRPNFSVKNLSCTSDQTWDDGISLYNQINAAITDGLTGNINFVEGRRDKFKLDILKLKQEKIQKVGYWQPEVGINISDPTAFYDSNIANITLVVMTR +# ERADLAVASMTINYARESVIDFTKPFMNLGIGILFKDSKIGIYQKMWRYMENRKAAVFVKTYEDGIKRVMEGSYAFLMESTMLDYAVQRDCNLTQIGG +# LLDSKGYGIATPKGSPWRDKISLAILELQEKGIIQILYDKWWKNTGDVCNRDDKSKESKANALGVENIDVKSLNSKKEVQIIESGKNSDVPRKTTNSL +# SIETIQFKEEMQLQARNRIDSIKRTLVGGERVDDLKLKEQHQAKKMAAQRHLSAIAYALNRVQCEDRDLLQGHYATITQEINIKNNHIKKCKEKIKML +# EMEVSDLNSEFQLDREDYLDEIRNLGRQIKFYQQLVYKFNPSFQKNGRNW] +# end gene contig65.g113 +### +# +# ----- prediction on sequence number 66 (length = 45011, name = contig66) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 66 on both strands +# (none) +# +# ----- prediction on sequence number 67 (length = 44531, name = contig67) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 67 on both strands +# start gene contig67.g114 +contig67 AUGUSTUS gene 7489 44111 0.03 + . 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ID=contig68.g115 +contig68 AUGUSTUS transcript 4505 24961 0.03 - . 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ID=contig69.g116.t1;Parent=contig69.g116 +contig69 AUGUSTUS start_codon 30000 30002 . + 0 Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 30000 30334 0.73 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 31328 31448 1 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 40335 40510 0.93 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 40569 40800 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 40859 41109 0.67 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 41958 42188 0.57 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42238 42382 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42438 42544 0.99 + 0 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42702 42781 0.98 + 1 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 42839 43045 0.24 + 2 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +contig69 AUGUSTUS CDS 43387 43409 0.22 + 2 ID=contig69.g116.t1.cds;Parent=contig69.g116.t1 +# coding sequence = [atgattgatccaagttcgagtgaagaagaaggcgaagatgaccccattgctaatgtgtcatcgaaaggacgtcttacac +# atgcacccaagggcacaaacaccgtttccatattaggtggggtttcaggtcccggtgtaggatcaaatatggctatttctggttctaatggtgatttg +# gccgggaatcaaagacaatctaatataagttctattagtaaccgaaatgatgctggaaacgtggcaggagttggaggctcctctaacaaaaatgagca +# aatacatggtagccgagttgacggcggcaatcttgaggtgcccaacagctgtattcccagcggtgtttcgcaagaaactttaaatcaaagtattggat +# cgtcgagggccaactctttgccacggccattgtcaccatcaccatctttaaccagcgaaaagcctgacactggagatccacatgcttttcttaaaggt +# gaaactcaaataatggcggatgaagcctttcaaaatgctgtacagagttatcacgacgtgtttcttaaatcggagcgagttttaaagatggtccaatc +# tggagcatcatcgcaacatgattttcgcgaagtttttcgtaacaacatagaaaaacgagtcagatctttacctgagattgatggtcttagtaaggaaa +# ctgtactaacttcttggatggcaaaattcgacataatattaaaaggaactggagaagaggactcgaagcgaccatctcggatgcagcaatcacttaat +# agcgagttaattctttcaaaagagcaattgtatgatatgtttcaacaaatattgttagtaaagaaatttgagcatcaaattttgtataacgccttgat +# gctagactctgccgatgaacaagcagcggctataagacgggaattagatggaagaatgcaacgtgtaggagaaatggagaaaaatcgcaaacttatgc +# caaaatttgttcttaaagaaatggagtcactttacgtcgaggaacttaagtcgtcaatcaatcttttaatggctaatcttgaatctcttccagtatcg +# aaaggaaatatggatagtaaatatggacttcaaaaacttaaacgatataatcacaggaaattgatactgcggtctcacggatccttgtccaagttgga +# gggtgactctgaagatggttctacacaattaacaaagttggatgttgtacttacctttcaattggaagtgatcgttatggaggttaaaggtcttaaat +# cattagctcctaatcgcattgtgtactgcacaatggaagttgaaaatggagaaaagcttcaaacggatcaagcggaagcatcaaaaccaatgtgggat +# acgcaaggtgattttacaaccacacatccactgccagttgtcaaggtcaaattgtacacagagaaccccggaatgctggcattggaagataaggaact +# gggaaaagtaatccttaaacctacccctctttcatccaaatcacctgagtggcatcgaatggtcattccaaaaaaccttcctgaccaagatatacgga +# ttaagatagcttgccgacttgataaacctttaaatatgaaacactgtggttataaggaaaaaaaatccgagccgtctgagatgatgcagcttgatgga +# tatacagtagattacatagaagccgccagtgcaaatttgatgtttggcatcgatttaaacggtggacgatttttcttcaacgctgtacgtgagggtga +# tagtatttcctttgcttgcgatgatgagaatgaatgcagtttatgggtaatggccatgtacagggcaactggtcaatcccataagccaactccaccaa +# taacacaagataagaattcagcaatgtcaaaaattcaaggtgagtcacaagacaagtcgatctag] +# protein sequence = [MIDPSSSEEEGEDDPIANVSSKGRLTHAPKGTNTVSILGGVSGPGVGSNMAISGSNGDLAGNQRQSNISSISNRNDAG +# NVAGVGGSSNKNEQIHGSRVDGGNLEVPNSCIPSGVSQETLNQSIGSSRANSLPRPLSPSPSLTSEKPDTGDPHAFLKGETQIMADEAFQNAVQSYHD +# VFLKSERVLKMVQSGASSQHDFREVFRNNIEKRVRSLPEIDGLSKETVLTSWMAKFDIILKGTGEEDSKRPSRMQQSLNSELILSKEQLYDMFQQILL +# VKKFEHQILYNALMLDSADEQAAAIRRELDGRMQRVGEMEKNRKLMPKFVLKEMESLYVEELKSSINLLMANLESLPVSKGNMDSKYGLQKLKRYNHR +# KLILRSHGSLSKLEGDSEDGSTQLTKLDVVLTFQLEVIVMEVKGLKSLAPNRIVYCTMEVENGEKLQTDQAEASKPMWDTQGDFTTTHPLPVVKVKLY +# TENPGMLALEDKELGKVILKPTPLSSKSPEWHRMVIPKNLPDQDIRIKIACRLDKPLNMKHCGYKEKKSEPSEMMQLDGYTVDYIEAASANLMFGIDL +# NGGRFFFNAVREGDSISFACDDENECSLWVMAMYRATGQSHKPTPPITQDKNSAMSKIQGESQDKSI] +# end gene contig69.g116 +### +# +# ----- prediction on sequence number 70 (length = 55020, name = contig70) ----- +# +# Predicted genes for sequence number 70 on both strands +# start gene contig70.g117 +contig70 AUGUSTUS gene 47 47328 0.01 + . ID=contig70.g117 +contig70 AUGUSTUS transcript 47 47328 0.01 + . ID=contig70.g117.t1;Parent=contig70.g117 +contig70 AUGUSTUS start_codon 47 49 . + 0 Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 47 381 0.82 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 1375 1495 0.97 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 10382 10557 0.95 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 10616 10847 0.99 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 10906 11156 0.58 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 12005 12235 0.46 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 12285 12429 0.99 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 12485 12591 1 + 0 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 12749 12828 0.93 + 1 ID=contig70.g117.t1.cds;Parent=contig70.g117.t1 +contig70 AUGUSTUS CDS 12886 13092 0.66 + 2 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      + The following has been generated by Hub Archive Creator: +

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ID=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1 +contig4 GlimmerHMM CDS 3984 4148 . + 0 ID=contig4.cds1.1;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=initial-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 6591 6636 . + 0 ID=contig4.cds1.2;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 7276 7394 . + 2 ID=contig4.cds1.3;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 8392 8432 . + 0 ID=contig4.cds1.4;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 9291 9307 . + 1 ID=contig4.cds1.5;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 9588 9685 . + 2 ID=contig4.cds1.6;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 13122 13233 . + 0 ID=contig4.cds1.7;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 13464 13533 . + 2 ID=contig4.cds1.8;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 18109 18283 . + 1 ID=contig4.cds1.9;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 18722 18782 . + 0 ID=contig4.cds1.10;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 19022 19109 . + 2 ID=contig4.cds1.11;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 20791 20940 . + 1 ID=contig4.cds1.12;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 24938 26941 . + 1 ID=contig4.cds1.13;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 28563 28613 . + 1 ID=contig4.cds1.14;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 31331 31523 . + 1 ID=contig4.cds1.15;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 31759 31924 . + 0 ID=contig4.cds1.16;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 35604 35644 . + 2 ID=contig4.cds1.17;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 36906 37059 . + 0 ID=contig4.cds1.18;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 37833 37902 . + 2 ID=contig4.cds1.19;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 39954 40085 . + 1 ID=contig4.cds1.20;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=internal-exon +contig4 GlimmerHMM CDS 50913 51981 . + 1 ID=contig4.cds1.21;Parent=contig4.path1.gene1;Name=contig4.path1.gene1;Note=final-exon +##sequence-region contig5 1 50018 +contig5 GlimmerHMM mRNA 408 37153 . + . ID=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1 +contig5 GlimmerHMM CDS 408 1939 . + 0 ID=contig5.cds1.1;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=initial-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 3561 3611 . + 1 ID=contig5.cds1.2;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 6329 6521 . + 1 ID=contig5.cds1.3;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 6757 6922 . + 0 ID=contig5.cds1.4;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 10602 10642 . + 2 ID=contig5.cds1.5;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 11904 12057 . + 0 ID=contig5.cds1.6;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 12831 12900 . + 2 ID=contig5.cds1.7;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 14952 15083 . + 1 ID=contig5.cds1.8;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 25911 26859 . + 1 ID=contig5.cds1.9;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 36466 36760 . + 0 ID=contig5.cds1.10;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=internal-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 36969 37153 . + 2 ID=contig5.cds1.11;Parent=contig5.path1.gene1;Name=contig5.path1.gene1;Note=final-exon +contig5 GlimmerHMM mRNA 43345 44908 . - . ID=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2 +contig5 GlimmerHMM CDS 43345 44665 . - 1 ID=contig5.cds2.1;Parent=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2;Note=final-exon +contig5 GlimmerHMM CDS 44724 44908 . - 0 ID=contig5.cds2.2;Parent=contig5.path1.gene2;Name=contig5.path1.gene2;Note=initial-exon +##sequence-region contig6 1 40015 +contig6 GlimmerHMM mRNA 6658 7144 . + . ID=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1 +contig6 GlimmerHMM CDS 6658 6751 . + 0 ID=contig6.cds1.1;Parent=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1;Note=initial-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 6960 7144 . + 2 ID=contig6.cds1.2;Parent=contig6.path1.gene1;Name=contig6.path1.gene1;Note=final-exon +contig6 GlimmerHMM mRNA 13336 36917 . - . ID=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2 +contig6 GlimmerHMM CDS 13336 14656 . - 1 ID=contig6.cds2.1;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=final-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 14997 15090 . - 2 ID=contig6.cds2.2;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 18113 18398 . - 0 ID=contig6.cds2.3;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 19779 19872 . - 1 ID=contig6.cds2.4;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 20931 21078 . - 2 ID=contig6.cds2.5;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 21782 22112 . - 0 ID=contig6.cds2.6;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 26021 26962 . - 0 ID=contig6.cds2.7;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 27027 27130 . - 2 ID=contig6.cds2.8;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 28828 29941 . - 0 ID=contig6.cds2.9;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 32704 32811 . - 0 ID=contig6.cds2.10;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=internal-exon +contig6 GlimmerHMM CDS 36864 36917 . - 0 ID=contig6.cds2.11;Parent=contig6.path1.gene2;Name=contig6.path1.gene2;Note=initial-exon +##sequence-region contig7 1 50017 +contig7 GlimmerHMM mRNA 3332 26913 . - . ID=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1 +contig7 GlimmerHMM CDS 3332 4652 . - 1 ID=contig7.cds1.1;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=final-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 4993 5086 . - 2 ID=contig7.cds1.2;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 8109 8394 . - 0 ID=contig7.cds1.3;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 9775 9868 . - 1 ID=contig7.cds1.4;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 10927 11074 . - 2 ID=contig7.cds1.5;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 11778 12108 . - 0 ID=contig7.cds1.6;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 16017 16958 . - 0 ID=contig7.cds1.7;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 17023 17126 . - 2 ID=contig7.cds1.8;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 18824 19937 . - 0 ID=contig7.cds1.9;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 22700 22807 . - 0 ID=contig7.cds1.10;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 26860 26913 . - 0 ID=contig7.cds1.11;Parent=contig7.path1.gene1;Name=contig7.path1.gene1;Note=initial-exon +contig7 GlimmerHMM mRNA 32769 33038 . - . ID=contig7.path1.gene2;Name=contig7.path1.gene2 +contig7 GlimmerHMM CDS 32769 33038 . - 0 ID=contig7.cds2.1;Parent=contig7.path1.gene2;Name=contig7.path1.gene2;Note=single-exon +contig7 GlimmerHMM mRNA 37329 49928 . + . ID=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3 +contig7 GlimmerHMM CDS 37329 37570 . + 0 ID=contig7.cds3.1;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=initial-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 38750 38793 . + 1 ID=contig7.cds3.2;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 38894 39182 . + 2 ID=contig7.cds3.3;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 39248 39354 . + 1 ID=contig7.cds3.4;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 39429 39655 . + 2 ID=contig7.cds3.5;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 39848 40351 . + 0 ID=contig7.cds3.6;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 40423 40623 . + 0 ID=contig7.cds3.7;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 44971 46843 . + 0 ID=contig7.cds3.8;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=internal-exon +contig7 GlimmerHMM CDS 49915 49928 . + 2 ID=contig7.cds3.9;Parent=contig7.path1.gene3;Name=contig7.path1.gene3;Note=final-exon +##sequence-region contig8 1 35012 +contig8 GlimmerHMM mRNA 2758 3027 . - . ID=contig8.path1.gene1;Name=contig8.path1.gene1 +contig8 GlimmerHMM CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig8.cds1.1;Parent=contig8.path1.gene1;Name=contig8.path1.gene1;Note=single-exon +contig8 GlimmerHMM mRNA 7318 33446 . + . 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ID=contig9.path1.gene1;Name=contig9.path1.gene1 +contig9 GlimmerHMM CDS 2758 3027 . - 0 ID=contig9.cds1.1;Parent=contig9.path1.gene1;Name=contig9.path1.gene1;Note=single-exon +contig9 GlimmerHMM mRNA 7318 38632 . + . 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ID=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2 +contig10 GlimmerHMM CDS 17334 17563 . + 0 ID=contig10.cds2.1;Parent=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2;Note=initial-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 17910 17940 . + 1 ID=contig10.cds2.2;Parent=contig10.path1.gene2;Name=contig10.path1.gene2;Note=final-exon +contig10 GlimmerHMM mRNA 21687 22382 . - . ID=contig10.path1.gene3;Name=contig10.path1.gene3 +contig10 GlimmerHMM CDS 21687 22382 . - 0 ID=contig10.cds3.1;Parent=contig10.path1.gene3;Name=contig10.path1.gene3;Note=single-exon +contig10 GlimmerHMM mRNA 24696 27471 . + . ID=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4 +contig10 GlimmerHMM CDS 24696 24708 . + 0 ID=contig10.cds4.1;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=initial-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 25731 25835 . + 2 ID=contig10.cds4.2;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 27079 27199 . + 2 ID=contig10.cds4.3;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 27285 27471 . + 1 ID=contig10.cds4.4;Parent=contig10.path1.gene4;Name=contig10.path1.gene4;Note=final-exon +contig10 GlimmerHMM mRNA 30099 42172 . - . ID=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5 +contig10 GlimmerHMM CDS 30099 30244 . - 2 ID=contig10.cds5.1;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=final-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 31348 31714 . - 0 ID=contig10.cds5.2;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 34057 34150 . - 1 ID=contig10.cds5.3;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 36047 36093 . - 0 ID=contig10.cds5.4;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 41616 41718 . - 1 ID=contig10.cds5.5;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 41777 41874 . - 0 ID=contig10.cds5.6;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=internal-exon +contig10 GlimmerHMM CDS 42107 42172 . - 0 ID=contig10.cds5.7;Parent=contig10.path1.gene5;Name=contig10.path1.gene5;Note=initial-exon +##sequence-region contig11 1 35013 +contig11 GlimmerHMM mRNA 682 1377 . - . ID=contig11.path1.gene1;Name=contig11.path1.gene1 +contig11 GlimmerHMM CDS 682 1377 . - 0 ID=contig11.cds1.1;Parent=contig11.path1.gene1;Name=contig11.path1.gene1;Note=single-exon +contig11 GlimmerHMM mRNA 3691 6466 . + . ID=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2 +contig11 GlimmerHMM CDS 3691 3703 . + 0 ID=contig11.cds2.1;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=initial-exon +contig11 GlimmerHMM CDS 4726 4830 . + 2 ID=contig11.cds2.2;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=internal-exon +contig11 GlimmerHMM CDS 6074 6194 . + 2 ID=contig11.cds2.3;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=internal-exon +contig11 GlimmerHMM CDS 6280 6466 . + 1 ID=contig11.cds2.4;Parent=contig11.path1.gene2;Name=contig11.path1.gene2;Note=final-exon +contig11 GlimmerHMM mRNA 9094 32965 . - . 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ID=contig15.path1.gene4;Name=contig15.path1.gene4 +contig15 GlimmerHMM CDS 44931 45401 . - 0 ID=contig15.cds4.1;Parent=contig15.path1.gene4;Name=contig15.path1.gene4;Note=single-exon +##sequence-region contig16 1 45017 +contig16 GlimmerHMM mRNA 5783 6209 . + . ID=contig16.path1.gene1;Name=contig16.path1.gene1 +contig16 GlimmerHMM CDS 5783 6209 . + 0 ID=contig16.cds1.1;Parent=contig16.path1.gene1;Name=contig16.path1.gene1;Note=final-exon +contig16 GlimmerHMM mRNA 10493 17535 . - . 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ID=contig16.path1.gene3;Name=contig16.path1.gene3 +contig16 GlimmerHMM CDS 20474 20749 . + 0 ID=contig16.cds3.1;Parent=contig16.path1.gene3;Name=contig16.path1.gene3;Note=single-exon +contig16 GlimmerHMM mRNA 23317 43623 . + . ID=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4 +contig16 GlimmerHMM CDS 23317 25126 . + 0 ID=contig16.cds4.1;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=initial-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 26889 27049 . + 2 ID=contig16.cds4.2;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 27109 27253 . + 0 ID=contig16.cds4.3;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 29072 29164 . + 2 ID=contig16.cds4.4;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 29221 29331 . + 2 ID=contig16.cds4.5;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 30805 30886 . + 2 ID=contig16.cds4.6;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 33017 33107 . + 1 ID=contig16.cds4.7;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 34338 34619 . + 0 ID=contig16.cds4.8;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 34685 34835 . + 0 ID=contig16.cds4.9;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 34991 35174 . + 2 ID=contig16.cds4.10;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 42456 42590 . + 1 ID=contig16.cds4.11;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 43033 43110 . + 1 ID=contig16.cds4.12;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 43293 43354 . + 1 ID=contig16.cds4.13;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=internal-exon +contig16 GlimmerHMM CDS 43421 43623 . + 2 ID=contig16.cds4.14;Parent=contig16.path1.gene4;Name=contig16.path1.gene4;Note=final-exon +##sequence-region contig17 1 40013 +contig17 GlimmerHMM mRNA 466 741 . + . ID=contig17.path1.gene1;Name=contig17.path1.gene1 +contig17 GlimmerHMM CDS 466 741 . + 0 ID=contig17.cds1.1;Parent=contig17.path1.gene1;Name=contig17.path1.gene1;Note=single-exon +contig17 GlimmerHMM mRNA 3309 23615 . + . ID=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2 +contig17 GlimmerHMM CDS 3309 5118 . + 0 ID=contig17.cds2.1;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=initial-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 6881 7041 . + 2 ID=contig17.cds2.2;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 7101 7245 . + 0 ID=contig17.cds2.3;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 9064 9156 . + 2 ID=contig17.cds2.4;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 9213 9323 . + 2 ID=contig17.cds2.5;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 10797 10878 . + 2 ID=contig17.cds2.6;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 13009 13099 . + 1 ID=contig17.cds2.7;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 14330 14611 . + 0 ID=contig17.cds2.8;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 14677 14827 . + 0 ID=contig17.cds2.9;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 14983 15166 . + 2 ID=contig17.cds2.10;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 22448 22582 . + 1 ID=contig17.cds2.11;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 23025 23102 . + 1 ID=contig17.cds2.12;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 23285 23346 . + 1 ID=contig17.cds2.13;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 23413 23615 . + 2 ID=contig17.cds2.14;Parent=contig17.path1.gene2;Name=contig17.path1.gene2;Note=final-exon +contig17 GlimmerHMM mRNA 26312 36998 . - . ID=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3 +contig17 GlimmerHMM CDS 26312 26334 . - 2 ID=contig17.cds3.1;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=final-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 28963 29116 . - 0 ID=contig17.cds3.2;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 30713 31824 . - 2 ID=contig17.cds3.3;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 31877 32056 . - 2 ID=contig17.cds3.4;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 33479 34076 . - 0 ID=contig17.cds3.5;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 34131 34286 . - 0 ID=contig17.cds3.6;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=internal-exon +contig17 GlimmerHMM CDS 36948 36998 . - 0 ID=contig17.cds3.7;Parent=contig17.path1.gene3;Name=contig17.path1.gene3;Note=initial-exon +##sequence-region contig18 1 40012 +contig18 GlimmerHMM mRNA 1303 11989 . - . ID=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1 +contig18 GlimmerHMM CDS 1303 1325 . - 2 ID=contig18.cds1.1;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=final-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 3954 4107 . - 0 ID=contig18.cds1.2;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 5704 6815 . - 2 ID=contig18.cds1.3;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 6868 7047 . - 2 ID=contig18.cds1.4;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 8470 9067 . - 0 ID=contig18.cds1.5;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 9122 9277 . - 0 ID=contig18.cds1.6;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=internal-exon +contig18 GlimmerHMM CDS 11939 11989 . - 0 ID=contig18.cds1.7;Parent=contig18.path1.gene1;Name=contig18.path1.gene1;Note=initial-exon +contig18 GlimmerHMM mRNA 18320 30118 . - . 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ID=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7 +contig20 GlimmerHMM CDS 46751 46866 . + 0 ID=contig20.cds7.1;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=initial-exon +contig20 GlimmerHMM CDS 46977 47075 . + 1 ID=contig20.cds7.2;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=internal-exon +contig20 GlimmerHMM CDS 47706 47868 . + 1 ID=contig20.cds7.3;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=internal-exon +contig20 GlimmerHMM CDS 49661 49963 . + 0 ID=contig20.cds7.4;Parent=contig20.path1.gene7;Name=contig20.path1.gene7;Note=final-exon +##sequence-region contig21 1 50011 +contig21 GlimmerHMM mRNA 2380 2466 . + . ID=contig21.path1.gene1;Name=contig21.path1.gene1 +contig21 GlimmerHMM CDS 2380 2466 . + 0 ID=contig21.cds1.1;Parent=contig21.path1.gene1;Name=contig21.path1.gene1;Note=final-exon +contig21 GlimmerHMM mRNA 6741 11405 . + . 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ID=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2 +contig22 GlimmerHMM CDS 36288 36369 . + 0 ID=contig22.cds2.1;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=initial-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 36871 37530 . + 2 ID=contig22.cds2.2;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 38296 38457 . + 2 ID=contig22.cds2.3;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 44786 45091 . + 2 ID=contig22.cds2.4;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 48394 48703 . + 2 ID=contig22.cds2.5;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 48769 48980 . + 1 ID=contig22.cds2.6;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 49038 49226 . + 2 ID=contig22.cds2.7;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 49745 49896 . + 2 ID=contig22.cds2.8;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 50047 51108 . + 0 ID=contig22.cds2.9;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 51770 52879 . + 0 ID=contig22.cds2.10;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 53483 53714 . + 0 ID=contig22.cds2.11;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 53776 53942 . + 2 ID=contig22.cds2.12;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 55547 55816 . + 0 ID=contig22.cds2.13;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 58256 58619 . + 0 ID=contig22.cds2.14;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=internal-exon +contig22 GlimmerHMM CDS 58685 58827 . + 2 ID=contig22.cds2.15;Parent=contig22.path1.gene2;Name=contig22.path1.gene2;Note=final-exon +##sequence-region contig23 1 50012 +contig23 GlimmerHMM mRNA 3228 17635 . + . ID=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1 +contig23 GlimmerHMM CDS 3228 3333 . + 0 ID=contig23.cds1.1;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=initial-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 4779 5084 . + 2 ID=contig23.cds1.2;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 8387 8696 . + 2 ID=contig23.cds1.3;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 8762 8973 . + 1 ID=contig23.cds1.4;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 9031 9219 . + 2 ID=contig23.cds1.5;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 9738 9889 . + 2 ID=contig23.cds1.6;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 10040 11101 . + 0 ID=contig23.cds1.7;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 11763 12872 . + 0 ID=contig23.cds1.8;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 13476 13707 . + 0 ID=contig23.cds1.9;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 13769 13935 . + 2 ID=contig23.cds1.10;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 15540 15809 . + 0 ID=contig23.cds1.11;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 17576 17635 . + 0 ID=contig23.cds1.12;Parent=contig23.path1.gene1;Name=contig23.path1.gene1;Note=final-exon +contig23 GlimmerHMM mRNA 20555 32675 . - . ID=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2 +contig23 GlimmerHMM CDS 20555 21226 . - 0 ID=contig23.cds2.1;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=final-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 21361 21933 . - 0 ID=contig23.cds2.2;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 22038 22105 . - 2 ID=contig23.cds2.3;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 22166 22501 . - 2 ID=contig23.cds2.4;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 23512 23677 . - 0 ID=contig23.cds2.5;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 23850 24034 . - 2 ID=contig23.cds2.6;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 26014 26138 . - 1 ID=contig23.cds2.7;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 29840 29955 . - 0 ID=contig23.cds2.8;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 30045 30130 . - 2 ID=contig23.cds2.9;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 32411 32675 . - 0 ID=contig23.cds2.10;Parent=contig23.path1.gene2;Name=contig23.path1.gene2;Note=initial-exon +contig23 GlimmerHMM mRNA 38390 42829 . - . ID=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3 +contig23 GlimmerHMM CDS 38390 38648 . - 1 ID=contig23.cds3.1;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=final-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 40546 40623 . - 1 ID=contig23.cds3.2;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 42558 42829 . - 0 ID=contig23.cds3.3;Parent=contig23.path1.gene3;Name=contig23.path1.gene3;Note=initial-exon +contig23 GlimmerHMM mRNA 45599 48088 . + . ID=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4 +contig23 GlimmerHMM CDS 45599 45652 . + 0 ID=contig23.cds4.1;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=initial-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 47100 47148 . + 0 ID=contig23.cds4.2;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=internal-exon +contig23 GlimmerHMM CDS 48036 48088 . + 2 ID=contig23.cds4.3;Parent=contig23.path1.gene4;Name=contig23.path1.gene4;Note=final-exon +##sequence-region contig24 1 40010 +contig24 GlimmerHMM mRNA 552 12672 . - . ID=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1 +contig24 GlimmerHMM CDS 552 1223 . - 0 ID=contig24.cds1.1;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=final-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 1358 1930 . - 0 ID=contig24.cds1.2;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 2035 2102 . - 2 ID=contig24.cds1.3;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 2163 2498 . - 2 ID=contig24.cds1.4;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 3509 3674 . - 0 ID=contig24.cds1.5;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 3847 4031 . - 2 ID=contig24.cds1.6;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 6011 6135 . - 1 ID=contig24.cds1.7;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 9837 9952 . - 0 ID=contig24.cds1.8;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 10042 10127 . - 2 ID=contig24.cds1.9;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 12408 12672 . - 0 ID=contig24.cds1.10;Parent=contig24.path1.gene1;Name=contig24.path1.gene1;Note=initial-exon +contig24 GlimmerHMM mRNA 18387 22826 . - . ID=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2 +contig24 GlimmerHMM CDS 18387 18645 . - 1 ID=contig24.cds2.1;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=final-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 20543 20620 . - 1 ID=contig24.cds2.2;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 22555 22826 . - 0 ID=contig24.cds2.3;Parent=contig24.path1.gene2;Name=contig24.path1.gene2;Note=initial-exon +contig24 GlimmerHMM mRNA 25596 28085 . + . ID=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3 +contig24 GlimmerHMM CDS 25596 25649 . + 0 ID=contig24.cds3.1;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=initial-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 27097 27145 . + 0 ID=contig24.cds3.2;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=internal-exon +contig24 GlimmerHMM CDS 28033 28085 . + 2 ID=contig24.cds3.3;Parent=contig24.path1.gene3;Name=contig24.path1.gene3;Note=final-exon +contig24 GlimmerHMM mRNA 30126 38563 . + . 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ID=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3 +contig26 GlimmerHMM CDS 13481 15037 . - 0 ID=contig26.cds3.1;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=final-exon +contig26 GlimmerHMM CDS 15091 15275 . - 2 ID=contig26.cds3.2;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=internal-exon +contig26 GlimmerHMM CDS 15747 17762 . - 2 ID=contig26.cds3.3;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=internal-exon +contig26 GlimmerHMM CDS 20895 21116 . - 2 ID=contig26.cds3.4;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=internal-exon +contig26 GlimmerHMM CDS 22306 22641 . - 2 ID=contig26.cds3.5;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=internal-exon +contig26 GlimmerHMM CDS 22702 22858 . - 0 ID=contig26.cds3.6;Parent=contig26.path1.gene3;Name=contig26.path1.gene3;Note=initial-exon +contig26 GlimmerHMM mRNA 25946 38735 . + . 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ID=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2 +contig31 GlimmerHMM CDS 35323 35808 . - 0 ID=contig31.cds2.1;Parent=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2;Note=final-exon +contig31 GlimmerHMM CDS 35835 35987 . - 0 ID=contig31.cds2.2;Parent=contig31.path1.gene2;Name=contig31.path1.gene2;Note=initial-exon +contig31 GlimmerHMM mRNA 38034 39914 . - . ID=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3 +contig31 GlimmerHMM CDS 38034 38140 . - 2 ID=contig31.cds3.1;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=final-exon +contig31 GlimmerHMM CDS 39393 39448 . - 1 ID=contig31.cds3.2;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=internal-exon +contig31 GlimmerHMM CDS 39745 39914 . - 0 ID=contig31.cds3.3;Parent=contig31.path1.gene3;Name=contig31.path1.gene3;Note=initial-exon +##sequence-region contig32 1 40014 +contig32 GlimmerHMM mRNA 5312 5976 . - . ID=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1 +contig32 GlimmerHMM CDS 5312 5797 . - 0 ID=contig32.cds1.1;Parent=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1;Note=final-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 5824 5976 . - 0 ID=contig32.cds1.2;Parent=contig32.path1.gene1;Name=contig32.path1.gene1;Note=initial-exon +contig32 GlimmerHMM mRNA 8023 9903 . - . ID=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2 +contig32 GlimmerHMM CDS 8023 8129 . - 2 ID=contig32.cds2.1;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=final-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 9382 9437 . - 1 ID=contig32.cds2.2;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 9734 9903 . - 0 ID=contig32.cds2.3;Parent=contig32.path1.gene2;Name=contig32.path1.gene2;Note=initial-exon +contig32 GlimmerHMM mRNA 12268 14868 . + . ID=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3 +contig32 GlimmerHMM CDS 12268 12400 . + 0 ID=contig32.cds3.1;Parent=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3;Note=initial-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 14432 14868 . + 2 ID=contig32.cds3.2;Parent=contig32.path1.gene3;Name=contig32.path1.gene3;Note=final-exon +contig32 GlimmerHMM mRNA 19560 21269 . - . ID=contig32.path1.gene4;Name=contig32.path1.gene4 +contig32 GlimmerHMM CDS 19560 21269 . - 0 ID=contig32.cds4.1;Parent=contig32.path1.gene4;Name=contig32.path1.gene4;Note=single-exon +contig32 GlimmerHMM mRNA 23284 39594 . - . ID=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5 +contig32 GlimmerHMM CDS 23284 23340 . - 0 ID=contig32.cds5.1;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=final-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 24947 25309 . - 0 ID=contig32.cds5.2;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 25407 25572 . - 1 ID=contig32.cds5.3;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 26120 26752 . - 1 ID=contig32.cds5.4;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 29696 31284 . - 0 ID=contig32.cds5.5;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 35135 35187 . - 2 ID=contig32.cds5.6;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=internal-exon +contig32 GlimmerHMM CDS 39492 39594 . - 0 ID=contig32.cds5.7;Parent=contig32.path1.gene5;Name=contig32.path1.gene5;Note=initial-exon +##sequence-region contig33 1 40016 +contig33 GlimmerHMM mRNA 4558 6267 . - . ID=contig33.path1.gene1;Name=contig33.path1.gene1 +contig33 GlimmerHMM CDS 4558 6267 . - 0 ID=contig33.cds1.1;Parent=contig33.path1.gene1;Name=contig33.path1.gene1;Note=single-exon +contig33 GlimmerHMM mRNA 8282 22510 . - . ID=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2 +contig33 GlimmerHMM CDS 8282 8338 . - 0 ID=contig33.cds2.1;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=final-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 9945 10307 . - 0 ID=contig33.cds2.2;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 10405 10570 . - 1 ID=contig33.cds2.3;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 11118 11750 . - 1 ID=contig33.cds2.4;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 14694 16282 . - 0 ID=contig33.cds2.5;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 20938 20956 . - 1 ID=contig33.cds2.6;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 22380 22510 . - 0 ID=contig33.cds2.7;Parent=contig33.path1.gene2;Name=contig33.path1.gene2;Note=initial-exon +contig33 GlimmerHMM mRNA 25242 30390 . + . ID=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3 +contig33 GlimmerHMM CDS 25242 25284 . + 0 ID=contig33.cds3.1;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=initial-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 25460 25572 . + 2 ID=contig33.cds3.2;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 25920 26022 . + 0 ID=contig33.cds3.3;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 26958 27076 . + 2 ID=contig33.cds3.4;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 27141 27262 . + 0 ID=contig33.cds3.5;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 30074 30179 . + 1 ID=contig33.cds3.6;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 30235 30390 . + 0 ID=contig33.cds3.7;Parent=contig33.path1.gene3;Name=contig33.path1.gene3;Note=final-exon +contig33 GlimmerHMM mRNA 33024 37281 . - . ID=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4 +contig33 GlimmerHMM CDS 33024 33029 . - 0 ID=contig33.cds4.1;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=final-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 33092 33183 . - 2 ID=contig33.cds4.2;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 33492 34143 . - 0 ID=contig33.cds4.3;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 34200 34387 . - 2 ID=contig33.cds4.4;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 36532 36733 . - 0 ID=contig33.cds4.5;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 36795 36904 . - 2 ID=contig33.cds4.6;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 36967 37091 . - 1 ID=contig33.cds4.7;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=internal-exon +contig33 GlimmerHMM CDS 37184 37281 . - 0 ID=contig33.cds4.8;Parent=contig33.path1.gene4;Name=contig33.path1.gene4;Note=initial-exon +##sequence-region contig34 1 50012 +contig34 GlimmerHMM mRNA 230 5378 . + . ID=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1 +contig34 GlimmerHMM CDS 230 272 . + 0 ID=contig34.cds1.1;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=initial-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 448 560 . + 2 ID=contig34.cds1.2;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 908 1010 . + 0 ID=contig34.cds1.3;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 1946 2064 . + 2 ID=contig34.cds1.4;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 2129 2250 . + 0 ID=contig34.cds1.5;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 5062 5167 . + 1 ID=contig34.cds1.6;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=internal-exon +contig34 GlimmerHMM CDS 5223 5378 . + 0 ID=contig34.cds1.7;Parent=contig34.path1.gene1;Name=contig34.path1.gene1;Note=final-exon +contig34 GlimmerHMM mRNA 8012 12269 . - . 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ID=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3 +contig39 GlimmerHMM CDS 35574 36216 . + 0 ID=contig39.cds3.1;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=initial-exon +contig39 GlimmerHMM CDS 37575 38992 . + 2 ID=contig39.cds3.2;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=internal-exon +contig39 GlimmerHMM CDS 40979 41017 . + 0 ID=contig39.cds3.3;Parent=contig39.path1.gene3;Name=contig39.path1.gene3;Note=final-exon +##sequence-region contig40 1 60015 +contig40 GlimmerHMM mRNA 560 1677 . + . ID=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1 +contig40 GlimmerHMM CDS 560 1202 . + 0 ID=contig40.cds1.1;Parent=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1;Note=initial-exon +contig40 GlimmerHMM CDS 1580 1677 . + 2 ID=contig40.cds1.2;Parent=contig40.path1.gene1;Name=contig40.path1.gene1;Note=final-exon +contig40 GlimmerHMM mRNA 4227 16682 . - . 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ID=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3 +contig41 GlimmerHMM CDS 28424 28598 . - 1 ID=contig41.cds3.1;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=final-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 30447 30602 . - 1 ID=contig41.cds3.2;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 31183 31508 . - 0 ID=contig41.cds3.3;Parent=contig41.path1.gene3;Name=contig41.path1.gene3;Note=initial-exon +contig41 GlimmerHMM mRNA 35171 58924 . + . ID=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4 +contig41 GlimmerHMM CDS 35171 35483 . + 0 ID=contig41.cds4.1;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=initial-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 36372 36508 . + 2 ID=contig41.cds4.2;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 37207 37228 . + 0 ID=contig41.cds4.3;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 37496 37526 . + 2 ID=contig41.cds4.4;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 39079 39241 . + 1 ID=contig41.cds4.5;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 39536 39677 . + 0 ID=contig41.cds4.6;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 40202 40343 . + 2 ID=contig41.cds4.7;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 40493 40693 . + 1 ID=contig41.cds4.8;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 40765 41066 . + 1 ID=contig41.cds4.9;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 41145 41247 . + 2 ID=contig41.cds4.10;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 41508 41608 . + 1 ID=contig41.cds4.11;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 42768 42957 . + 2 ID=contig41.cds4.12;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 43159 43291 . + 1 ID=contig41.cds4.13;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 43867 44269 . + 0 ID=contig41.cds4.14;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 44418 45091 . + 2 ID=contig41.cds4.15;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 45128 45343 . + 0 ID=contig41.cds4.16;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 46167 46307 . + 0 ID=contig41.cds4.17;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 46703 47044 . + 0 ID=contig41.cds4.18;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 47580 47624 . + 0 ID=contig41.cds4.19;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 47876 47998 . + 0 ID=contig41.cds4.20;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 48076 48135 . + 0 ID=contig41.cds4.21;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 48304 48399 . + 0 ID=contig41.cds4.22;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 50623 50937 . + 0 ID=contig41.cds4.23;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 52323 52448 . + 0 ID=contig41.cds4.24;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 52639 52674 . + 0 ID=contig41.cds4.25;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 52835 53011 . + 0 ID=contig41.cds4.26;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 53321 53548 . + 0 ID=contig41.cds4.27;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 54373 54546 . + 0 ID=contig41.cds4.28;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 58116 58263 . + 0 ID=contig41.cds4.29;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=internal-exon +contig41 GlimmerHMM CDS 58917 58924 . + 2 ID=contig41.cds4.30;Parent=contig41.path1.gene4;Name=contig41.path1.gene4;Note=final-exon +##sequence-region contig42 1 70020 +contig42 GlimmerHMM mRNA 1140 1502 . - . ID=contig42.path1.gene1;Name=contig42.path1.gene1 +contig42 GlimmerHMM CDS 1140 1502 . - 0 ID=contig42.cds1.1;Parent=contig42.path1.gene1;Name=contig42.path1.gene1;Note=single-exon +contig42 GlimmerHMM mRNA 5165 63391 . + . ID=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2 +contig42 GlimmerHMM CDS 5165 5477 . + 0 ID=contig42.cds2.1;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=initial-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 6366 6502 . + 2 ID=contig42.cds2.2;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 7201 7222 . + 0 ID=contig42.cds2.3;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 7490 7520 . + 2 ID=contig42.cds2.4;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 9073 9235 . + 1 ID=contig42.cds2.5;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 9530 9671 . + 0 ID=contig42.cds2.6;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 10196 10337 . + 2 ID=contig42.cds2.7;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 10487 10687 . + 1 ID=contig42.cds2.8;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 10759 11060 . + 1 ID=contig42.cds2.9;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 11139 11241 . + 2 ID=contig42.cds2.10;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 11502 11602 . + 1 ID=contig42.cds2.11;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 12762 12951 . + 2 ID=contig42.cds2.12;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 13153 13285 . + 1 ID=contig42.cds2.13;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 13861 14263 . + 0 ID=contig42.cds2.14;Parent=contig42.path1.gene2;Name=contig42.path1.gene2;Note=internal-exon +contig42 GlimmerHMM CDS 14412 15085 . + 2 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ID=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1 +contig43 GlimmerHMM CDS 593 646 . + 0 ID=contig43.cds1.1;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=initial-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 983 1417 . + 0 ID=contig43.cds1.2;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 1628 1705 . + 0 ID=contig43.cds1.3;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 3383 4082 . + 0 ID=contig43.cds1.4;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 4306 4659 . + 2 ID=contig43.cds1.5;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 5281 6993 . + 2 ID=contig43.cds1.6;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 8396 9295 . + 2 ID=contig43.cds1.7;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 9588 10351 . + 2 ID=contig43.cds1.8;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 10437 10572 . + 0 ID=contig43.cds1.9;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 10765 11655 . + 2 ID=contig43.cds1.10;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 11722 14394 . + 2 ID=contig43.cds1.11;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 15580 25413 . + 2 ID=contig43.cds1.12;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 25485 26463 . + 2 ID=contig43.cds1.13;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 26524 26865 . + 1 ID=contig43.cds1.14;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 27561 28603 . + 1 ID=contig43.cds1.15;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 29343 29399 . + 2 ID=contig43.cds1.16;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 31746 32048 . + 2 ID=contig43.cds1.17;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 32749 33383 . + 2 ID=contig43.cds1.18;Parent=contig43.path1.gene1;Name=contig43.path1.gene1;Note=final-exon +contig43 GlimmerHMM mRNA 39583 49156 . - . ID=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2 +contig43 GlimmerHMM CDS 39583 42419 . - 2 ID=contig43.cds2.1;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=final-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 44160 44231 . - 2 ID=contig43.cds2.2;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 44291 44971 . - 2 ID=contig43.cds2.3;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 46441 47293 . - 0 ID=contig43.cds2.4;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 48708 48891 . - 1 ID=contig43.cds2.5;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=internal-exon +contig43 GlimmerHMM CDS 49050 49156 . - 0 ID=contig43.cds2.6;Parent=contig43.path1.gene2;Name=contig43.path1.gene2;Note=initial-exon +##sequence-region contig44 1 50013 +contig44 GlimmerHMM mRNA 395 9144 . - . ID=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1 +contig44 GlimmerHMM CDS 395 520 . - 0 ID=contig44.cds1.1;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=final-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 1242 2407 . - 2 ID=contig44.cds1.2;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 4148 4219 . - 2 ID=contig44.cds1.3;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 4279 4959 . - 2 ID=contig44.cds1.4;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 6429 7281 . - 0 ID=contig44.cds1.5;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 8696 8879 . - 1 ID=contig44.cds1.6;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 9038 9144 . - 0 ID=contig44.cds1.7;Parent=contig44.path1.gene1;Name=contig44.path1.gene1;Note=initial-exon +contig44 GlimmerHMM mRNA 11632 14837 . - . ID=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2 +contig44 GlimmerHMM CDS 11632 12468 . - 0 ID=contig44.cds2.1;Parent=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2;Note=final-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 13947 14837 . - 0 ID=contig44.cds2.2;Parent=contig44.path1.gene2;Name=contig44.path1.gene2;Note=initial-exon +contig44 GlimmerHMM mRNA 16854 18627 . + . ID=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3 +contig44 GlimmerHMM CDS 16854 16926 . + 0 ID=contig44.cds3.1;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=initial-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 16985 17067 . + 2 ID=contig44.cds3.2;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 18082 18627 . + 0 ID=contig44.cds3.3;Parent=contig44.path1.gene3;Name=contig44.path1.gene3;Note=final-exon +contig44 GlimmerHMM mRNA 21455 27740 . + . ID=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4 +contig44 GlimmerHMM CDS 21455 21722 . + 0 ID=contig44.cds4.1;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=initial-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 21925 22013 . + 2 ID=contig44.cds4.2;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 25199 25326 . + 0 ID=contig44.cds4.3;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 25564 25722 . + 1 ID=contig44.cds4.4;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 25885 25941 . + 1 ID=contig44.cds4.5;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 27123 27162 . + 1 ID=contig44.cds4.6;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 27693 27740 . + 0 ID=contig44.cds4.7;Parent=contig44.path1.gene4;Name=contig44.path1.gene4;Note=final-exon +contig44 GlimmerHMM mRNA 30550 47582 . - . ID=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5 +contig44 GlimmerHMM CDS 30550 30677 . - 2 ID=contig44.cds5.1;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=final-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 37567 37756 . - 0 ID=contig44.cds5.2;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 37808 37912 . - 0 ID=contig44.cds5.3;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=internal-exon +contig44 GlimmerHMM CDS 47484 47582 . - 0 ID=contig44.cds5.4;Parent=contig44.path1.gene5;Name=contig44.path1.gene5;Note=initial-exon +##sequence-region contig45 1 50013 +contig45 GlimmerHMM mRNA 1628 4833 . - . ID=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1 +contig45 GlimmerHMM CDS 1628 2464 . - 0 ID=contig45.cds1.1;Parent=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1;Note=final-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 3943 4833 . - 0 ID=contig45.cds1.2;Parent=contig45.path1.gene1;Name=contig45.path1.gene1;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM mRNA 6850 8623 . + . ID=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2 +contig45 GlimmerHMM CDS 6850 6922 . + 0 ID=contig45.cds2.1;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 6981 7063 . + 2 ID=contig45.cds2.2;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 8078 8623 . + 0 ID=contig45.cds2.3;Parent=contig45.path1.gene2;Name=contig45.path1.gene2;Note=final-exon +contig45 GlimmerHMM mRNA 11451 17736 . + . ID=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3 +contig45 GlimmerHMM CDS 11451 11718 . + 0 ID=contig45.cds3.1;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 11921 12009 . + 2 ID=contig45.cds3.2;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 15195 15322 . + 0 ID=contig45.cds3.3;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 15560 15718 . + 1 ID=contig45.cds3.4;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 15881 15937 . + 1 ID=contig45.cds3.5;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 17119 17158 . + 1 ID=contig45.cds3.6;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 17689 17736 . + 0 ID=contig45.cds3.7;Parent=contig45.path1.gene3;Name=contig45.path1.gene3;Note=final-exon +contig45 GlimmerHMM mRNA 20546 37578 . - . ID=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4 +contig45 GlimmerHMM CDS 20546 20673 . - 2 ID=contig45.cds4.1;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=final-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 27563 27752 . - 0 ID=contig45.cds4.2;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 27804 27908 . - 0 ID=contig45.cds4.3;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 37480 37578 . - 0 ID=contig45.cds4.4;Parent=contig45.path1.gene4;Name=contig45.path1.gene4;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM mRNA 42096 44534 . - . ID=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5 +contig45 GlimmerHMM CDS 42096 42122 . - 0 ID=contig45.cds5.1;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=final-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 43859 44007 . - 2 ID=contig45.cds5.2;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=internal-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 44462 44534 . - 0 ID=contig45.cds5.3;Parent=contig45.path1.gene5;Name=contig45.path1.gene5;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM mRNA 47223 48562 . + . ID=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6 +contig45 GlimmerHMM CDS 47223 47380 . + 0 ID=contig45.cds6.1;Parent=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6;Note=initial-exon +contig45 GlimmerHMM CDS 48457 48562 . + 1 ID=contig45.cds6.2;Parent=contig45.path1.gene6;Name=contig45.path1.gene6;Note=final-exon +##sequence-region contig46 1 50012 +contig46 GlimmerHMM mRNA 1660 12572 . - . 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ID=contig48.path1.gene3;Name=contig48.path1.gene3 +contig48 GlimmerHMM CDS 50694 50838 . - 1 ID=contig48.cds3.1;Parent=contig48.path1.gene3;Name=contig48.path1.gene3;Note=final-exon +contig48 GlimmerHMM CDS 50968 51077 . - 0 ID=contig48.cds3.2;Parent=contig48.path1.gene3;Name=contig48.path1.gene3;Note=internal-exon +contig48 GlimmerHMM CDS 55647 60710 . - 0 ID=contig48.cds3.3;Parent=contig48.path1.gene3;Name=contig48.path1.gene3;Note=internal-exon +contig48 GlimmerHMM CDS 62293 62424 . - 0 ID=contig48.cds3.4;Parent=contig48.path1.gene3;Name=contig48.path1.gene3;Note=initial-exon +##sequence-region contig49 1 30003 +contig49 GlimmerHMM mRNA 535 12520 . - . 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ID=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3 +contig52 GlimmerHMM CDS 31544 31650 . - 2 ID=contig52.cds3.1;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=final-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 32567 32953 . - 2 ID=contig52.cds3.2;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=internal-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 33271 33333 . - 2 ID=contig52.cds3.3;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=internal-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 33606 33713 . - 2 ID=contig52.cds3.4;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=internal-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 36161 36261 . - 1 ID=contig52.cds3.5;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=internal-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 39006 39121 . - 0 ID=contig52.cds3.6;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=internal-exon +contig52 GlimmerHMM CDS 39218 39328 . - 0 ID=contig52.cds3.7;Parent=contig52.path1.gene3;Name=contig52.path1.gene3;Note=initial-exon +##sequence-region contig53 1 50013 +contig53 GlimmerHMM mRNA 2425 9302 . - . ID=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1 +contig53 GlimmerHMM CDS 2425 2666 . - 2 ID=contig53.cds1.1;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=final-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 2725 3054 . - 2 ID=contig53.cds1.2;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 3370 3778 . - 0 ID=contig53.cds1.3;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 4799 5005 . - 0 ID=contig53.cds1.4;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 6122 6185 . - 1 ID=contig53.cds1.5;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 6277 6351 . - 1 ID=contig53.cds1.6;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 6471 6621 . - 2 ID=contig53.cds1.7;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 7332 7706 . - 2 ID=contig53.cds1.8;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 7771 7900 . - 0 ID=contig53.cds1.9;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=internal-exon +contig53 GlimmerHMM CDS 9015 9302 . - 0 ID=contig53.cds1.10;Parent=contig53.path1.gene1;Name=contig53.path1.gene1;Note=initial-exon +contig53 GlimmerHMM mRNA 11537 30690 . - . 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ID=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2 +contig54 GlimmerHMM CDS 17196 17269 . + 0 ID=contig54.cds2.1;Parent=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2;Note=initial-exon +contig54 GlimmerHMM CDS 20123 20333 . + 1 ID=contig54.cds2.2;Parent=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2;Note=internal-exon +contig54 GlimmerHMM CDS 20670 20812 . + 0 ID=contig54.cds2.3;Parent=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2;Note=internal-exon +contig54 GlimmerHMM CDS 21379 21449 . + 1 ID=contig54.cds2.4;Parent=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2;Note=internal-exon +contig54 GlimmerHMM CDS 21680 21870 . + 2 ID=contig54.cds2.5;Parent=contig54.path1.gene2;Name=contig54.path1.gene2;Note=final-exon +contig54 GlimmerHMM mRNA 23941 33010 . - . 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ID=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2 +contig56 GlimmerHMM CDS 34254 34259 . - 0 ID=contig56.cds2.1;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=final-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 38270 38415 . - 2 ID=contig56.cds2.2;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 38468 38598 . - 1 ID=contig56.cds2.3;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 38660 39046 . - 1 ID=contig56.cds2.4;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 39119 39314 . - 2 ID=contig56.cds2.5;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 42325 42642 . - 2 ID=contig56.cds2.6;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 42829 42845 . - 1 ID=contig56.cds2.7;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 43625 43782 . - 0 ID=contig56.cds2.8;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 44006 44091 . - 2 ID=contig56.cds2.9;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 45924 47736 . - 0 ID=contig56.cds2.10;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 47840 47992 . - 0 ID=contig56.cds2.11;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 48826 49832 . - 2 ID=contig56.cds2.12;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 49901 51146 . - 0 ID=contig56.cds2.13;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=internal-exon +contig56 GlimmerHMM CDS 52391 53620 . - 0 ID=contig56.cds2.14;Parent=contig56.path1.gene2;Name=contig56.path1.gene2;Note=initial-exon +##sequence-region contig57 1 60013 +contig57 GlimmerHMM mRNA 4241 23607 . - . 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ID=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2 +contig60 GlimmerHMM CDS 6088 6219 . - 0 ID=contig60.cds2.1;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=final-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 6286 6406 . - 1 ID=contig60.cds2.2;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 6466 6814 . - 2 ID=contig60.cds2.3;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 6867 7161 . - 0 ID=contig60.cds2.4;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 8050 8303 . - 2 ID=contig60.cds2.5;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 8356 8755 . - 0 ID=contig60.cds2.6;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 12696 12743 . - 0 ID=contig60.cds2.7;Parent=contig60.path1.gene2;Name=contig60.path1.gene2;Note=initial-exon +contig60 GlimmerHMM mRNA 18443 31744 . + . ID=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3 +contig60 GlimmerHMM CDS 18443 18518 . + 0 ID=contig60.cds3.1;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=initial-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 22222 22251 . + 2 ID=contig60.cds3.2;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 22314 29494 . + 2 ID=contig60.cds3.3;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 29560 29780 . + 0 ID=contig60.cds3.4;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 29847 31557 . + 1 ID=contig60.cds3.5;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=internal-exon +contig60 GlimmerHMM CDS 31589 31744 . + 0 ID=contig60.cds3.6;Parent=contig60.path1.gene3;Name=contig60.path1.gene3;Note=final-exon +contig60 GlimmerHMM mRNA 33955 38754 . - . 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ID=contig61.path1.gene4;Name=contig61.path1.gene4 +contig61 GlimmerHMM CDS 38215 38467 . - 1 ID=contig61.cds4.1;Parent=contig61.path1.gene4;Name=contig61.path1.gene4;Note=final-exon +contig61 GlimmerHMM CDS 39745 39764 . - 0 ID=contig61.cds4.2;Parent=contig61.path1.gene4;Name=contig61.path1.gene4;Note=initial-exon +##sequence-region contig62 1 50017 +contig62 GlimmerHMM mRNA 1379 1393 . + . ID=contig62.path1.gene1;Name=contig62.path1.gene1 +contig62 GlimmerHMM CDS 1379 1393 . + 0 ID=contig62.cds1.1;Parent=contig62.path1.gene1;Name=contig62.path1.gene1;Note=final-exon +contig62 GlimmerHMM mRNA 8271 8417 . - . ID=contig62.path1.gene2;Name=contig62.path1.gene2 +contig62 GlimmerHMM CDS 8271 8417 . - 0 ID=contig62.cds2.1;Parent=contig62.path1.gene2;Name=contig62.path1.gene2;Note=single-exon +contig62 GlimmerHMM mRNA 10810 49021 . + . 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ID=contig63.path1.gene1;Name=contig63.path1.gene1 +contig63 GlimmerHMM CDS 1003 1486 . + 0 ID=contig63.cds1.1;Parent=contig63.path1.gene1;Name=contig63.path1.gene1;Note=final-exon +contig63 GlimmerHMM mRNA 4369 12161 . + . ID=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2 +contig63 GlimmerHMM CDS 4369 4421 . + 0 ID=contig63.cds2.1;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=initial-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 4822 5122 . + 1 ID=contig63.cds2.2;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 5190 5442 . + 0 ID=contig63.cds2.3;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 5599 5697 . + 2 ID=contig63.cds2.4;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 7498 7920 . + 2 ID=contig63.cds2.5;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 11546 11653 . + 2 ID=contig63.cds2.6;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 11995 12161 . + 2 ID=contig63.cds2.7;Parent=contig63.path1.gene2;Name=contig63.path1.gene2;Note=final-exon +contig63 GlimmerHMM mRNA 15926 33054 . - . ID=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3 +contig63 GlimmerHMM CDS 15926 15960 . - 2 ID=contig63.cds3.1;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=final-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 17594 17717 . - 0 ID=contig63.cds3.2;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 19057 19187 . - 2 ID=contig63.cds3.3;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 19270 19353 . - 2 ID=contig63.cds3.4;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 19425 19979 . - 2 ID=contig63.cds3.5;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 21715 22879 . - 0 ID=contig63.cds3.6;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 24636 24897 . - 1 ID=contig63.cds3.7;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 25155 25472 . - 1 ID=contig63.cds3.8;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 25711 25784 . - 0 ID=contig63.cds3.9;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 26229 26336 . - 0 ID=contig63.cds3.10;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 26403 26903 . - 0 ID=contig63.cds3.11;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 26957 27099 . - 2 ID=contig63.cds3.12;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 28214 28374 . - 1 ID=contig63.cds3.13;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 31124 31349 . - 2 ID=contig63.cds3.14;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=internal-exon +contig63 GlimmerHMM CDS 32955 33054 . - 0 ID=contig63.cds3.15;Parent=contig63.path1.gene3;Name=contig63.path1.gene3;Note=initial-exon +contig63 GlimmerHMM mRNA 36087 52795 . + . 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ID=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1 +contig64 GlimmerHMM CDS 921 955 . - 2 ID=contig64.cds1.1;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=final-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 2589 2712 . - 0 ID=contig64.cds1.2;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 4052 4182 . - 2 ID=contig64.cds1.3;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 4265 4348 . - 2 ID=contig64.cds1.4;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 4420 4974 . - 2 ID=contig64.cds1.5;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 6710 7874 . - 0 ID=contig64.cds1.6;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 9631 9892 . - 1 ID=contig64.cds1.7;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 10150 10467 . - 1 ID=contig64.cds1.8;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 10706 10779 . - 0 ID=contig64.cds1.9;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 11224 11331 . - 0 ID=contig64.cds1.10;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 11398 11898 . - 0 ID=contig64.cds1.11;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 11952 12094 . - 2 ID=contig64.cds1.12;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 13209 13369 . - 1 ID=contig64.cds1.13;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 16119 16344 . - 2 ID=contig64.cds1.14;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=internal-exon +contig64 GlimmerHMM CDS 17950 18049 . - 0 ID=contig64.cds1.15;Parent=contig64.path1.gene1;Name=contig64.path1.gene1;Note=initial-exon +contig64 GlimmerHMM mRNA 21082 37790 . + . 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ID=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1 +contig65 GlimmerHMM CDS 1073 1364 . + 0 ID=contig65.cds1.1;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=initial-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 2137 2550 . + 2 ID=contig65.cds1.2;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 4510 4676 . + 2 ID=contig65.cds1.3;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 5388 5441 . + 0 ID=contig65.cds1.4;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 5560 5724 . + 0 ID=contig65.cds1.5;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 5781 5939 . + 0 ID=contig65.cds1.6;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 7023 7226 . + 0 ID=contig65.cds1.7;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 9847 9945 . + 0 ID=contig65.cds1.8;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 10138 10242 . + 0 ID=contig65.cds1.9;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 10357 10614 . + 0 ID=contig65.cds1.10;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 10747 11244 . + 0 ID=contig65.cds1.11;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 11392 11408 . + 0 ID=contig65.cds1.12;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 13020 13269 . + 1 ID=contig65.cds1.13;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 13705 13902 . + 0 ID=contig65.cds1.14;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 15720 16110 . + 0 ID=contig65.cds1.15;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 16164 16391 . + 2 ID=contig65.cds1.16;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 20682 20716 . + 2 ID=contig65.cds1.17;Parent=contig65.path1.gene1;Name=contig65.path1.gene1;Note=final-exon +contig65 GlimmerHMM mRNA 23382 33004 . - . ID=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2 +contig65 GlimmerHMM CDS 23382 23414 . - 0 ID=contig65.cds2.1;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=final-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 23537 23954 . - 1 ID=contig65.cds2.2;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 24021 24422 . - 1 ID=contig65.cds2.3;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 27407 27523 . - 1 ID=contig65.cds2.4;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 27589 27830 . - 0 ID=contig65.cds2.5;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 31753 31776 . - 0 ID=contig65.cds2.6;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 33002 33004 . - 0 ID=contig65.cds2.7;Parent=contig65.path1.gene2;Name=contig65.path1.gene2;Note=initial-exon +contig65 GlimmerHMM mRNA 37164 44203 . + . ID=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3 +contig65 GlimmerHMM CDS 37164 37235 . + 0 ID=contig65.cds3.1;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=initial-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 38418 38642 . + 0 ID=contig65.cds3.2;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 38929 38999 . + 0 ID=contig65.cds3.3;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 39651 39735 . + 1 ID=contig65.cds3.4;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 41433 42041 . + 0 ID=contig65.cds3.5;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 42103 42911 . + 0 ID=contig65.cds3.6;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 43509 43707 . + 1 ID=contig65.cds3.7;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=internal-exon +contig65 GlimmerHMM CDS 44192 44203 . + 0 ID=contig65.cds3.8;Parent=contig65.path1.gene3;Name=contig65.path1.gene3;Note=final-exon +##sequence-region contig66 1 45011 +contig66 GlimmerHMM mRNA 3375 12997 . - . ID=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1 +contig66 GlimmerHMM CDS 3375 3407 . - 0 ID=contig66.cds1.1;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=final-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 3530 3947 . - 1 ID=contig66.cds1.2;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=internal-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 4014 4415 . - 1 ID=contig66.cds1.3;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=internal-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 7400 7516 . - 1 ID=contig66.cds1.4;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=internal-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 7582 7823 . - 0 ID=contig66.cds1.5;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=internal-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 11746 11769 . - 0 ID=contig66.cds1.6;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=internal-exon +contig66 GlimmerHMM CDS 12995 12997 . - 0 ID=contig66.cds1.7;Parent=contig66.path1.gene1;Name=contig66.path1.gene1;Note=initial-exon +contig66 GlimmerHMM mRNA 17157 30648 . + . 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