Mercurial > repos > yating-l > bigbed_to_fa_340
diff test-data/contigs.trf_4_12.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip
planemo upload
author | yating-l |
---|---|
date | Wed, 17 May 2017 16:49:32 -0400 |
parents | |
children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/contigs.trf_4_12.fa Wed May 17 16:49:32 2017 -0400 @@ -0,0 +1,84 @@ +>trf +aatgatgcatttaaatgctgcatttaaatg +>trf +acagacagacggacgaacagacggacggacg +>trf +gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgactttgaga +agtgccgccgaagtg +>trf +gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgacttcgaga +agtgccgccgaagtg +>trf +ataatttgtttcatattatttcccacccaattttcggatcgttcctatga +cagctatatgatatagtcgtcagattttgtaaaagtttaattcaaaacca +aataaaaaatgctatttccaagcgtagaaggttatacgttaaaaaacacc +gaagatataatttttccatattattttgccactaattttccgtttgttcc +tatgggagctatatgatataggtatccgattttgataaaatgtaattcaa +aattcagaactaatttaaaaatgttatatccatgcttagaaagctatatg +tttaaaataacccaaagataattttttcttattattttaccactaatttt +tcgatccttcatatggcagcaatatgatatagtcgtccgatttcgataaa +aattgaattcgaaattctgaactaattaaaaatggttatctccaagctta +gaaggttatatgttaaaaa +>trf +aacatttttaaattagttctgaatttcgtatcaaattttattaaaatcgg +ccgactatatcatatagctcccatagcaacaatcggaaaattagtggtaa +aataatattcaaaaattatatcttcggtgttttttaacttataacctcct +acgcttggaaataacattttttatttggttttgaattacgaattacattt +tatcaaaatcggacgactatatcatatagctgccataggaacgatggtaa +aattagtagaaaaaacatgaaataaaaaaattatatctttggtgttttta +acatataacttgaaagcttaaaaataacattttttaattagttctgaatt +taaatttaaattttattaaaatcggaagaccatatcatatagctgtcata +ggaacgatcggaaaattggtgggaaataat +>trf +atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata +>trf +gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag +>trf +atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata +>trf +gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag +>trf +TATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGT +>trf +CAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATA +TAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCT +ATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGT +TTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAA +AAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAAC +A +>trf +TCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTT +C +>trf +TTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTT +CATATCATC +>trf +ttttaattacattttatcaaaatcggacgactatatcatacagctgccat +tgaacgatcggaaaataagtggtcaaataatatgaaaaacttatatcttc +ggtgactttaacatataacttccaatgcttggaaatacaatttttaattg +gttttcaatttcgaattaaattttattaaaatcggacgactatatatata +gctgccataaatacgatcggaaaattagtcggaaaatataaaaaaattat +atctttggtgttttttaacatataaccttctaaacttgaaaataacattt +tttaattagttctaaattttgaattaaattttatcaaaatcggttaacta +tatcatatagctgtcataggaacgatcggaaaattggtgggaaaata +>trf +TATGTATAAACAATGTTCATACTTATGTGTAAACAATGTTCATACTTATG +TGT +>trf +aatacaatacaatttttaatacaatacaatttt +>trf +TATAATTTTGGGAATATAATatattgggaatataatttt +>trf +aattatccgatcgttcctatgacagctatatgatatagtcgtccgatttt +aataaaatttaattcgaaattcagaattaattaaaaaatgttttttttaa +gcttataaggttatatgttaaaaaacactaaagatataattttaatttat +gttttccgactaattttccgatcgttcctatggcagttatatgatataat +cgtccgattttgataaaatgtaattcgaaattcaaaaccaaataaaaaat +gttatttccaagcgtaggaggtcataagttaaaaaacaccgaagatataa +tttttcaatattattcaccattaattttccgattgttcctatgggagcta +taagatatagtcgaccgattttgataaaatttaattcgaaattcagaact +aatttaaaagtgttatatccaaacttaaaaaagtatatcttataaaacac +gaaagataataatttttttttttttttttaattttactcgatagttccta +tgggagctataagatatagttgtccgat +>trf +ACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACA