diff test-data/contigs.trf_4_12.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip

planemo upload
author yating-l
date Wed, 17 May 2017 16:49:32 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/contigs.trf_4_12.fa	Wed May 17 16:49:32 2017 -0400
@@ -0,0 +1,84 @@
+>trf
+aatgatgcatttaaatgctgcatttaaatg
+>trf
+acagacagacggacgaacagacggacggacg
+>trf
+gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgactttgaga
+agtgccgccgaagtg
+>trf
+gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgacttcgaga
+agtgccgccgaagtg
+>trf
+ataatttgtttcatattatttcccacccaattttcggatcgttcctatga
+cagctatatgatatagtcgtcagattttgtaaaagtttaattcaaaacca
+aataaaaaatgctatttccaagcgtagaaggttatacgttaaaaaacacc
+gaagatataatttttccatattattttgccactaattttccgtttgttcc
+tatgggagctatatgatataggtatccgattttgataaaatgtaattcaa
+aattcagaactaatttaaaaatgttatatccatgcttagaaagctatatg
+tttaaaataacccaaagataattttttcttattattttaccactaatttt
+tcgatccttcatatggcagcaatatgatatagtcgtccgatttcgataaa
+aattgaattcgaaattctgaactaattaaaaatggttatctccaagctta
+gaaggttatatgttaaaaa
+>trf
+aacatttttaaattagttctgaatttcgtatcaaattttattaaaatcgg
+ccgactatatcatatagctcccatagcaacaatcggaaaattagtggtaa
+aataatattcaaaaattatatcttcggtgttttttaacttataacctcct
+acgcttggaaataacattttttatttggttttgaattacgaattacattt
+tatcaaaatcggacgactatatcatatagctgccataggaacgatggtaa
+aattagtagaaaaaacatgaaataaaaaaattatatctttggtgttttta
+acatataacttgaaagcttaaaaataacattttttaattagttctgaatt
+taaatttaaattttattaaaatcggaagaccatatcatatagctgtcata
+ggaacgatcggaaaattggtgggaaataat
+>trf
+atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata
+>trf
+gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag
+>trf
+atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata
+>trf
+gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag
+>trf
+TATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGT
+>trf
+CAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATA
+TAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCT
+ATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGT
+TTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAA
+AAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAAC
+A
+>trf
+TCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTT
+C
+>trf
+TTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTT
+CATATCATC
+>trf
+ttttaattacattttatcaaaatcggacgactatatcatacagctgccat
+tgaacgatcggaaaataagtggtcaaataatatgaaaaacttatatcttc
+ggtgactttaacatataacttccaatgcttggaaatacaatttttaattg
+gttttcaatttcgaattaaattttattaaaatcggacgactatatatata
+gctgccataaatacgatcggaaaattagtcggaaaatataaaaaaattat
+atctttggtgttttttaacatataaccttctaaacttgaaaataacattt
+tttaattagttctaaattttgaattaaattttatcaaaatcggttaacta
+tatcatatagctgtcataggaacgatcggaaaattggtgggaaaata
+>trf
+TATGTATAAACAATGTTCATACTTATGTGTAAACAATGTTCATACTTATG
+TGT
+>trf
+aatacaatacaatttttaatacaatacaatttt
+>trf
+TATAATTTTGGGAATATAATatattgggaatataatttt
+>trf
+aattatccgatcgttcctatgacagctatatgatatagtcgtccgatttt
+aataaaatttaattcgaaattcagaattaattaaaaaatgttttttttaa
+gcttataaggttatatgttaaaaaacactaaagatataattttaatttat
+gttttccgactaattttccgatcgttcctatggcagttatatgatataat
+cgtccgattttgataaaatgtaattcgaaattcaaaaccaaataaaaaat
+gttatttccaagcgtaggaggtcataagttaaaaaacaccgaagatataa
+tttttcaatattattcaccattaattttccgattgttcctatgggagcta
+taagatatagtcgaccgattttgataaaatttaattcgaaattcagaact
+aatttaaaagtgttatatccaaacttaaaaaagtatatcttataaaacac
+gaaagataataatttttttttttttttttaattttactcgatagttccta
+tgggagctataagatatagttgtccgat
+>trf
+ACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACA