Mercurial > repos > yating-l > bigbed_to_fa_340
comparison test-data/contigs.trf_4_12.fa @ 0:512ed6da2367 draft default tip
planemo upload
author | yating-l |
---|---|
date | Wed, 17 May 2017 16:49:32 -0400 |
parents | |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
-1:000000000000 | 0:512ed6da2367 |
---|---|
1 >trf | |
2 aatgatgcatttaaatgctgcatttaaatg | |
3 >trf | |
4 acagacagacggacgaacagacggacggacg | |
5 >trf | |
6 gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgactttgaga | |
7 agtgccgccgaagtg | |
8 >trf | |
9 gaagtgtcgccgaagtcactcctggaagtgtcgccgaagtgacttcgaga | |
10 agtgccgccgaagtg | |
11 >trf | |
12 ataatttgtttcatattatttcccacccaattttcggatcgttcctatga | |
13 cagctatatgatatagtcgtcagattttgtaaaagtttaattcaaaacca | |
14 aataaaaaatgctatttccaagcgtagaaggttatacgttaaaaaacacc | |
15 gaagatataatttttccatattattttgccactaattttccgtttgttcc | |
16 tatgggagctatatgatataggtatccgattttgataaaatgtaattcaa | |
17 aattcagaactaatttaaaaatgttatatccatgcttagaaagctatatg | |
18 tttaaaataacccaaagataattttttcttattattttaccactaatttt | |
19 tcgatccttcatatggcagcaatatgatatagtcgtccgatttcgataaa | |
20 aattgaattcgaaattctgaactaattaaaaatggttatctccaagctta | |
21 gaaggttatatgttaaaaa | |
22 >trf | |
23 aacatttttaaattagttctgaatttcgtatcaaattttattaaaatcgg | |
24 ccgactatatcatatagctcccatagcaacaatcggaaaattagtggtaa | |
25 aataatattcaaaaattatatcttcggtgttttttaacttataacctcct | |
26 acgcttggaaataacattttttatttggttttgaattacgaattacattt | |
27 tatcaaaatcggacgactatatcatatagctgccataggaacgatggtaa | |
28 aattagtagaaaaaacatgaaataaaaaaattatatctttggtgttttta | |
29 acatataacttgaaagcttaaaaataacattttttaattagttctgaatt | |
30 taaatttaaattttattaaaatcggaagaccatatcatatagctgtcata | |
31 ggaacgatcggaaaattggtgggaaataat | |
32 >trf | |
33 atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata | |
34 >trf | |
35 gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag | |
36 >trf | |
37 atataTATATATATATATATATTTATATATATATATATAtata | |
38 >trf | |
39 gctgaggatgagctacagagctgaggatgagatacag | |
40 >trf | |
41 TATATATATATATCCTGTTCTATATATATAGAACCTGT | |
42 >trf | |
43 CAAATTTTTTGTTTAAAAGCGTTTTGGACTCTTAGGCTATGCAATGCATA | |
44 TAACGTTATAAAAAAAGTATTTATTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCT | |
45 ATAACATATAACAAGAATACCTTTTGTTTACATTTTACCAAATTTTTTGT | |
46 TTAAAACCGTTTTGGACTCTAAGGCTATGCAATGCATATTTCGTTATAAA | |
47 AAAAGTATTTACTTTTTTAACAAATTTATAACTTACCTATAACATATAAC | |
48 A | |
49 >trf | |
50 TCATCTTATCTTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTT | |
51 C | |
52 >trf | |
53 TTTCATATCATCTATATCTTTCATATCATCTCATATATTTCTTTCTGTTT | |
54 CATATCATC | |
55 >trf | |
56 ttttaattacattttatcaaaatcggacgactatatcatacagctgccat | |
57 tgaacgatcggaaaataagtggtcaaataatatgaaaaacttatatcttc | |
58 ggtgactttaacatataacttccaatgcttggaaatacaatttttaattg | |
59 gttttcaatttcgaattaaattttattaaaatcggacgactatatatata | |
60 gctgccataaatacgatcggaaaattagtcggaaaatataaaaaaattat | |
61 atctttggtgttttttaacatataaccttctaaacttgaaaataacattt | |
62 tttaattagttctaaattttgaattaaattttatcaaaatcggttaacta | |
63 tatcatatagctgtcataggaacgatcggaaaattggtgggaaaata | |
64 >trf | |
65 TATGTATAAACAATGTTCATACTTATGTGTAAACAATGTTCATACTTATG | |
66 TGT | |
67 >trf | |
68 aatacaatacaatttttaatacaatacaatttt | |
69 >trf | |
70 TATAATTTTGGGAATATAATatattgggaatataatttt | |
71 >trf | |
72 aattatccgatcgttcctatgacagctatatgatatagtcgtccgatttt | |
73 aataaaatttaattcgaaattcagaattaattaaaaaatgttttttttaa | |
74 gcttataaggttatatgttaaaaaacactaaagatataattttaatttat | |
75 gttttccgactaattttccgatcgttcctatggcagttatatgatataat | |
76 cgtccgattttgataaaatgtaattcgaaattcaaaaccaaataaaaaat | |
77 gttatttccaagcgtaggaggtcataagttaaaaaacaccgaagatataa | |
78 tttttcaatattattcaccattaattttccgattgttcctatgggagcta | |
79 taagatatagtcgaccgattttgataaaatttaattcgaaattcagaact | |
80 aatttaaaagtgttatatccaaacttaaaaaagtatatcttataaaacac | |
81 gaaagataataatttttttttttttttttaattttactcgatagttccta | |
82 tgggagctataagatatagttgtccgat | |
83 >trf | |
84 ACACTTAAGACATGTTTAACAACAACACTTAAAAAATGTTTAACAACA |